Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134536 | Staphylococcus epidermidis strain NCTC13924 genome assembly, chromosome: 1 | 5 crisprs | csa3,WYL,cas3,DEDDh,DinG | 1 | 2 | 10 | 0 |
1. LR134536
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134536_1 | 431984-432067 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134536_1
|
1 spacers
spacers of LR134536_1
>1.1|432009|34|LR134536|CRISPRCasFinder GGGTTCGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCACCGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134536_1
The CRISPR arrays of LR134536_1 >merge|LR134536|1|431984-432067|CRISPRCasFinder GAAATTCTACGGACAAGGCAAGTTGGGGTTCGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCACCGAGAAATTCCACGGACAAGGCAAGTTG >LR134536|1|1|431984-432067|CRISPRCasFinder GAAATTCTACGGACAAGGCAAGTTG GGGTTCGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCACCGA GAAATTCCACGGACAAGGCAAGTTG
>LR134536.1|VEJ60538.1|431322_431430_+|Uncharacterised-protein MHAYACVLFFVEILLQLKAENIFDYYTKIYLSGEK >LR134536.1|VEJ60537.1|429807_431301_+|aldehyde-dehydrogenase MTNINVRNYIDESYGLFINNEFQASDSGETLTVSNPANGEDLAKVARAGKKDVDKAVQAAHDAFDSWSKISKEERADYLLEISRRIHEKTEHLATVESLQNGKPYRETSTIDVPQAANQFKYFASVLTTDEGSVNEIDQNTMSLVVNEPVGVVGAVVAWNFPILLASWKLGPALAAGNTVVIQPSSSTPLSLIELAKIFQEVLPKGVVNVLTGKGSESGDAIFHHEGVDKLSFTGSTDVGYGVAQAGAERIVPTTLELGGKSANIIFDDANLEQVIEGVQLGILFNQGEVCSAGSRLLVQSSIYNELLPKLKEAFENIKVGDPFDEDTKMSAQTGPEQLDKIESYIKIAEEDDKANILTGGHRITDNGLDKGYFFEPTIIEINDNKHQLAQEEIFGPVVVVEKFDDEQEAIEIANDSEYGLAGGIFTTDIHRALNVAKAMRTGRIWINTYNQIPAGAPFGGYKKSGIGREVYKDAIKNYQQVKNIFIDTSNQTKGLY >LR134536.1|VEJ60536.1|428761_429430_+|NAD(P)H-flavin-oxidoreductase MIMNQMNQTIIDAFHFRHATKEFDPTKKISDEDFNTILETGRLSPSSLGLEPWHFVVVQNKELREKLKAYSWGAQKQLDTASHFVLIFARKNVTAHTDYVQHLLRGVKKYEESTIPAVENKFDDFQESFHIADNERTLYDWASKQTYIALANMMTSAALLGIGSCPIEGFDLDKVTEILSDEGVLDMEQFGISVMVGFGYRAQEPKHGKVRQNEDDIISWIE >LR134536.1|VEJ60535.1|427528_428521_-|D-lactate-dehydrogenase MTKIMFFGTRAYEKDMALRWGKKNNIDVTTSKELLSVDTVDQLKDYDGVTTMQFGKLESEVYPKLESYGIKQIAQRTAGFDMYDLELAKKHGIIISNIPSYSPETIAEYSVSIALQLVRKFPTIEKRVQAHNFTWASPIMSRPVKNMTVAIIGTGRIGAATGKIYAGFGAKVVGYDAYPNHSLSFLEYKETVEDAIKDADIISLHVPANKDSFHLFDNNMFKKVKKGAVLVNAARGAVINTPDLIEAVNNGTLSGAAIDTYENEANYFTFDWSNQTIEDPILLELIRNENILVTPHIAFFSDEAVQNLVEGGLNAALSVINTGTCDTRLN >LR134536.1|VEJ60534.1|426532_427342_+|HAD-superfamily-hydrolase MIKAIAVDMDGTFLDTNKQFDRNRFETIFKELIDKNIKFVAASGNQFAKLKSIFGDREMFFISENGAVIYKGNQLYNYRSFDQYIFQKVVNYLNLNQKINNLIICGVKSAYILKETSEAFKQDARTYYHQLIEIDSLQTLPDDDYVKIAFNINRQTHPDLDEKLALKFKEDIKLVSSGRDSIDVIMPNMTKGQALSRLLKEWQMPASHLMAFGDANNDKDMLELAEHSYVMANSEDKSLFNIARHVAPSNDEQGVLSTIENVVLGYSNK >LR134536.1|VEJ60533.1|425577_426189_+|sortase MKQWMNRLITLIGVLLIILAIYLFSKPYIDNYLHEKDNDHKIENYDKKEKEQTKTSKSTPKIPSDKSKMAGYIEVPDAQIKEPVYPGPATPEQLNRGVSFAEGDESLNQQNISIAGHTFTDRSHYQFTNLKSAKIGSKVYFKTGNQTRKYKITKIRDVKPTEVKVLDEHPNKKNQLTLITCDDYNEETGVWETRKIFIATQIN >LR134536.1|VEJ60532.1|424917_425412_-|N-acetyltransferase MIRFARLEDLQDILTIYNDAILNTTAVYTYKPQQLDERLQWYQSKAKINEPIWVYEKEGKVVGFATYGSFRQWPAYLYTIEHSIYVHQQYRGLGIASQLLENLIRYAKEQSYRTIVAGIDASNMDSIALHKKFDFSHAGTIKNVGYKFGRWLDLSFYQYDLSDS >LR134536.1|VEJ60531.1|424196_424352_-|truncated-IS1272-transposase MYKEYNMTQHTLPMESSVLIPTNNISRHVNDIAETIPDTEFDEFRHYRGLI >LR134536.1|VEJ60530.1|422893_423967_+|Transposase MNDLHHPQLIFESTGIYSRGMERFCCVNQINYIQMNPLEAKFKTSALRSWKTDQADAHKLACLGPTLKQTGNLPIHELIFFELRERVRFHLEIENEQNRLKFQILELLHQTFPGLERLFSSRYSIIALNIAEIFTHPDMVLDIDKDVLITHIFNSTDKGMSMDKATKYALQLRVIAQESYPNVDRHSFLVEKLRLLIQQLKQSIHHLKQLDDAMIQLAQQLDYFENIHSIPGIGKLSTAMIIGEIGDIKRFKSNKQLNTFVGIDIKRYQSGHTHCRDTINKRGNKKARKLLFWVIMNIIRGQHHYDNHVVDYYYKLRKQPNEKPHKTAIIACINRLLKTIHYLVMNHKLYDYQMSPH >LR134536.1|VEJ60529.1|421507_422407_+|L-serine-dehydratase MFDSIRETIDYSVENNISFADMMINDEMEREGKSREEVRDLMRQNLNVMREAVEKGTTGDGVESVTGYTGHDAAKLRDYNENNHALSGHEMIDAVKGAVATNEVNAAMGIICATPTAGSSGTIPGVIFKLEKTHNITEDQMIDFLFTSALFGRVVANNASVAGATGGCQAEVGSASAMAAAAAVSIFNGSPEQSGHAMALAISNLLGLVCDPVAGLVEIPCVMRNAIGSGNALISADLALAGVESQIPVDEVIGAMDRVGRNLPASLRETGLGGLAGTPTGEEIKRKIFGEADNMVKNK >LR134536.1|VEJ60539.1|432129_432918_-|glyoxalase MTNFHSIDATQVTNVTLNVKDLNKSTDFYSNVLGFSIEKQTNQQTVFNIGNLGYTLTLNELNNGRQPEFREAGLFHVAYLLPTRSDLADFLYHANNLNIAMGGGDHLVSEALYFTDPEGNGIEVYHDRPSEDWVWRDGFVKMDTLEVNVNDLMAQRSNEGWPEEGKIGHLHLKTHNLESAYEFYVEKLGLEHISNFPQALFMSTQKYHHHIATNTWQSNKIRTQNEQTYGLCHFDIYQPNANTTHVTSPEGFDITIHGNETK >LR134536.1|VEJ60540.1|433179_433461_-|acetyltransferase MAAEIKQGDHKFYVGNDENNPKAVITFKEVDNNEIDIDHTGVSDELGGQGLGKKLVNRVVEHARENNLKIIASCPFAKNVLEKDDHAQDVYLG >LR134536.1|VEJ60541.1|433627_434575_+|adhesion-lipoprotein MKKLIIVSIIILMLSGCSSFDHRKRESINDKNKMKVYTTVYAFQSLTQQIGGKYVDAQSIYPAGADLHSYEPTQKDMIDIAKSDLFVYSSHQLDPVAAKITNSMTNNSMKLALAEGLKQSDFIHSKDHDENHEHHSHHEESNQDPHVWLDPVLNQKFAFMIKEKLIEKDPKHQAYYNKNYKIVNKDIVHIDQQLQSITKHYKRDKVVISHDSLGYLAHRYGFKEQGVKGMNDEEPSQKEILNIVKDIQHSHAPYVLYEQNITSKITDVIKKETDTKPLSFHNLAVLTKEEQNDDSISYQSLMKKNIYVLNRALNN >LR134536.1|VEJ60542.1|434645_436070_-|glycine-betaine-aldehyde-dehydrogenase-gbsA MTNQLFINNEFIESQSKETMDVINPATGEAFDTITLATEEEVNDAIEKSQQAQLEWERVPQPTRAEHVKLLIPLLEKNRDQIAQLYVKEQGKTLAQAYGEIDKSISFIDYMTSLSMSDKGRVLQNSIANETIQIINKPIGVTAGIVPWNAPILVLMRKVIPAIVTGCSVVIKPSEETTLLTLRLAELFRASTIPAGLIQIVPGTGETVGTQLASHKDIQLISLTGSMRAGKSVYENAAQTVKKVNLELGGNAPVIVTSNADLDKAVNYIVTARINNAGQVCTCPERIFVHEDVHDDFLNKVTSKMKSLTVGDPFDENTDYGAIINQKQLDSIHEKVQDAIKNGATLMTGGHQLKRHGFFYAPTVLDNVRKDYNVFKDEIFGPVLAITTYRDFEQVIEDANDTNAGLSSYIFSENLTEVMTATERLKFGEVYANCEAEEVVNGYHAGWRESGLGGADGIHGFEEYYNTTVSYIRY >LR134536.1|VEJ60543.1|436318_437368_-|membrane-protein MSNVKESIIVAFAFVGVVVGAGFATGQEIFQFFTSHGIYSIGGIFITGLIITLGGIFVLNTGFRLRSQNHSESIRYYLHPTIAKLFDIILTVFLFSLAIIMTAGGASTINESFGLPFWLSSLILVILILLTLFLKFDRLIAVLGGVTPFLVAVVVMIAVYYFITGDLNFSDVSQYSNQNKSISPGWWFDAINYASLQIAAAFSFLTVMGGKLRYQSSTIYGGLIGGIIVTLLLLLINFGLVTEFNQIKEVALPSLLLAKQISPSIGIIMSVIMVLVIYNTVVGLMYAFASRFSRPFTKRYYILIVMMAIITFACTFVGFISLIGKVFPIMGLFGFILLIPVIYKGILRK >LR134536.1|VEJ60544.1|437715_439503_+|sodium/hydrogen-exchanger MSLELPVMLTIVLFLALGIFSQWLASRIKWPSIVVMAIVGLLVGPIFGLANPKEALGPEAFSSIVSLAVAIILFEGSSNLDFRELKGISKAVIRIITIGAGIAWILGAIALHVTMNFPLSISFVIGGLFLITGPTVIQPLLKQAKVKRNVDSVLRWESIILDPIGPIIALTAFYVFQIFEEGIGFVVIILFILKLLAAILIGFGAAFLFNWLIGQDKIPQSLMPPIQFVFILLTFSICDEILSESGLLAVTIFGLMMARKKRHDLIFKESDHFIDNASSILVSTVFILITSSLTKDVLLNVLSWQLILFSLVMIVLVRPISVLLSTLGTEITKKERAVVALMAPRGIVVLTVAQFFSSLFMDDKIPMAQYITPVTFGLVFITVVIYGFGFTPLSKLFGVASTEPPGVIIVGESEFSFHLGINLRDHGIPVMMFNLFENTSEKAHEAGFEVFKGNLLSSNDRIYSDLLRYNKCILMTQSFIFNSLAFNELVPEFGLNNVDMMPVSFNDEQARNNLNGPIRNHILFDENHTPRWFNQFITQHNIVEVPAEDYEKITENDMLIYHINEDKEVTFKRSNRDIPEHETGVYGILKNAYLT >LR134536.1|VEJ60545.1|439731_441696_-|fructose-bisphosphatase MTHITESEMKQKYLDLLSQKFDSAEKLATEIINLESILELPKGTEHFVSDLHGEYESFQHVLRNGSGNVRAKINDIFKDKLSQQEINDLAALVYYPEEKLKLVKNNFDSIGTLNIWYITTIQRLIDLITYCSSKYTRSKLRKALPEQYVYIIEELLYKSNEFHNKKPYYETLVNQIIELEQSDDLIIGLSYTVQRLVVDHLHVVGDIYDRGPKPDKIMDTLINYHSVDIQWGNHDVLWIGAYAGSKVCLANLLRICARYDNLDIIEDAYGINLRPLLTLAEKYYDAENPAFKPKKRPDKDVSLTKREESQITKIHQAIAMIQFKLEMPIIKRRPSFEMEERLVLEKIDYDNNEITIYNKTYPLKDTCFQTVNPNNPAELLAEEKEVMDKLLLSFQQSEKLRRHMSFLMRKGKLYLPYNGNLLIHGCIPVDENGEMESFEIEGERLSGRELLDVFEYHVRKAFDHKESTEDISTDLVWYLWTGKYSSLFGKRAMTTFERYFIEDKASHKEEKNPYYYLREDVDMIRKMLKDFGLNPDEGRIINGHTPVKEIDGEDPIKANGKMLVIDGGFSKAYQSTTGIAGYTLLYNSFGMQLVAHKEFNRKEKVLSMGADELSVKRVVDEELQRKKIRDTNIGKQLQDQIDILKILMHDRYLT >LR134536.1|VEJ60546.1|441869_442484_-|alkaline-phosphatase MEQIITDFISKWGYTAIFILILLENVLPVVPSEIILTFAGLLSVKSHLSIWTLLIIATIASFIGLLILYYICRLISEEKLYRFVDRHGKWMKLKSKDLKRANDWFKKYGAWAVFLCRFVPVLRVLITIPAGINRMNVIQFTTLSLIGTTIWNFALILLGRLLSDSFDALMNGIHTYSRIMYVIIIIAVIYFVIRYLMKRRRSVK >LR134536.1|VEJ60547.1|442591_443590_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-moeB MSRYERQTRFAPFGEEGQQKLSSSQILIFGAGALGSHIVDQLARMGAHHIAIVDMDIVEISNLHRQTLFDEEDAHTLISKVEAIKHKVNQININVNLTTYDLEVTSSNIENLIKNVEPDIIIDGMDNFKIRYLINEVCHKYQIPWVYGAAVGSKGSVYGIDHQGPCLKCLLQTIPDTGESCAINGVIPPVISMIASYEVAEAVRYLSGKGFSKQLITIDAFNINYKSMNVDALKNKDCPVCEKHEYTLLESQQERTIEDLCGNAYLFRFPPKAFKHAAHFPGNMVKSTSFAKLIQYQTYEFTLFKDGRMNAYGIHNDEEAHHLYNTLLKSIR >LR134536.1|VEJ60548.1|443591_444359_-|thiazole-synthase MFKIGNLELQSRLLLGTGKFENEEVQSKAIEASETNVLTFAVRRMNLYDRNLPNPLANVNLKDFITFPNTAGAKTAQEAIRIAEIANHAGVCDMIKVEVIGDDETLLPDPFETYEACKVLLEKGYTVCPYISNDLVLAQRLEELGVHAVMPLASPIGTGRGINNPLNLSYIIENASVPVIVDAGIGSPKDACHAMELGADGILLNTAISAAKDPVKMAEAMKLGINAGRLSYEAGRIPVKYTAQASSPSEGLGFL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134536_2 | 912918-913019 | Unclear |
NA
Consensus repeat of LR134536_2
|
1 spacers
spacers of LR134536_2
>2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder AAAAGAGGAACACATGAGCTTGAGGT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134536_2
The CRISPR arrays of LR134536_2 >merge|LR134536|2|912918-913019|CRISPRCasFinder TCATGTATAAGAAACACTAAATACCTATGTATTAAGTGAAAAGAGGAACACATGAGCTTGAGGTTCATGTATAAAAAACACTAAATACCTATGTATTAAGTG >LR134536|2|2|912918-913019|CRISPRCasFinder TCATGTATAAGAAACACTAAATACCTATGTATTAAGTG AAAAGAGGAACACATGAGCTTGAGGT TCATGTATAAAAAACACTAAATACCTATGTATTAAGTG
>LR134536.1|VEJ60985.1|912144_912879_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MNKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKDKAEAVVEEIKAKGVESFAIQANVAKGDEVKEMIKEVVSQFGSVDVLVNNAGITKDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKVTPQMLRQRSGAIINLTSIVGAMGNPGQANYVATKAGVIGLTKTAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTNALSDDLKDQMLEQIPLKRFGEDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >LR134536.1|VEJ60984.1|911225_912152_+|malonyl-CoA-ACP-transacylase MGKIAVVFPGQGAQKVGMASDLYNEEERSTRVLNLAQETVDFDLLETMFTDNDGKLGETENTQPALLTHSVALLESLNHLKVDYTMGHSLGEYSSLVSSGVLSFEDAVRIVRKRGQLMAQAFPNGVGGMAAVLGLDYDDVDKICQTLSTKEQLIEPANINSPGQIVVSGHKSLIDELVEKGKELGAKRVLPLAVSGPFHSSMMKVIEEDFANFINQFEWHNANYPVVQNVNAKGETDAEVIKRNMVKQLYSPVQFIQSTEWLINQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKITSIQTLEDVKGWNNHE >LR134536.1|VEJ60983.1|910246_911224_+|glycerol-3-phosphate-acyltransferase-PlsX MVKIAVDMMGGDDAPGIVLDAVKKAVEDFKDLEIILFGDESQYNLSHERIEFRHCTEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTTDGKGFVFLDVGANADAKAEHLLQYAQLGNIYAQKIRGIQNPSVSLLNIGTEAAKGNSLTKKAYDLFEKNQSFNFTGNIEAKTLMDGNVDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKETIMSSFKNKLAGAVLKKDLETFAKKMDYSEYGGSVLLGLDGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEENIVQIMKDTVGE >LR134536.1|VEJ60982.1|909684_910245_+|fatty-acid-biosynthesis-transcriptional-regulator MKLKKNDRRVAIKEAIELNPFITDYELCEKFDVSIQTIRLDRTHLNIPELRKRIKLVAEQNYGRIKSIEANEIIGDLIQVNPDVSAQSLIEITIDSVFAKSEIARGHVLFAQANSLCVALIHKPIVLTHESQVEFKEKVKLNDTVRADARVIDITDKHYIIEVNSYVSDMLVFKGKFKMYYTSEDE >LR134536.1|VEJ60981.1|907477_909526_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MSKVHLIESPYALDKIKGIGPKRLALLEELNIKSVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQADDQATVTVQGEVYSSPTVAFFGRNKSKLTVHLMINHIAVKCVFFNQPYLKKKLELNSIVTIKGKWNRNKQEINGNRIFFKDQKNQEDTHLEPIYRIKEGIKQKQLRDNIRQALSDVTIHEWLTDDLREKYKLETLAYTIQTLHHPINKQNLLRARRTYAFTELFMFELRMQWLNRLEKTSDEAIEINYDINKVKQFIDSLPFELTDAQKVSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLIQLFGNTMNVALLTGSVKGKKRRLLLEQLENGTIDCLIGTHALIQDDVVFNNVGLVITDEQHRFGVNQRQILREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIKTSWAKHEQYDQVLAQMSNELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQSDYGNEKVGLLHGKMSAEDKDQVMQKFSEHEIDILVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSEHQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANVVEDYRMLEVARDEAAELIQSGQFFEQQYSHLREFIKQNLRHIRFD >LR134536.1|VEJ60980.1|905615_907274_+|DAK2-domain-containing-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTITSGREEVENNLSQNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIEEEKEISVQQFAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAKAAMDYVDQAEDCVDLMAHLIEAASESLDNTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKGLKGEKIEAQAPKLDTESFVNDDHDFHGVINTEDIVYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRNDMSEFGDSLLVINDDEIVKVHVHTEHPGDVFNYGQKYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQDGLQSKEANESKTVETAIVTISVGDGIAELFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSQCKRAIILPNNKNIMMASEQAASIVEAETVVIPTKSIPQGISALFQYDLESSLEDNKRHMSDALETVQSGSITFAVRDTKIDGIEIKKDEFMGLAEDKIVTSDVNQFHAVKGLLSKLLNEDSEILTMISGEDADNSITNQIINWIESEYPDVEVEQHEGGQPIYQYFFAVE >LR134536.1|VEJ60979.1|905226_905601_+|general-stress-protein,-Gls24-family MTLEISNDYGKIDISNDVIASVVGGKAVESYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHDNYAKGIKVREDNGIIDVDMYIIVSYGVKISEVASNLQSTVKYTLEKTLNVKVNSINIFVQGVRVNETVKKV >LR134536.1|VEJ60978.1|904680_904869_-|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNHRSHALNANKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >LR134536.1|VEJ60977.1|903962_904598_+|thiamin-pyrophosphokinase MKINLLCSQRLLPNHIFEKEKDSNWAGIDRGALILVKQGIQPIFSVGDFDSVNNEERLMLMKNLQIEPVEAEKDDTDLALGVAQAVERGYTEITIYGATGGRLDHFMGVLQILQKPQYLHQSIKIKVIDQQNHIQLLNEGKYVINRDSTYPYISFIPLNDKTILTLQGFKYNLNQEHLNLGSTLTISNEVKVNEAIIRVEQGTVLKIRSRD >LR134536.1|VEJ60976.1|903313_903958_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MVKILPSLLSIDFLNLKEELQLLETAKVDGLHFDVMDGKFVPNISIGIPILDAVRQQSHLPIDVHLMIEQPENYINLFAEHGADMISVHVESTTHIHRAIEQIKQLGKKAGVVINPGTSVETILPILSIVDYVLVMTVNPGFGGQTFIEQCVTKIEQLNQLKHENHLTFDIEVDGGINDQTSKRCVEQGATMLVTGSYFFKQEDYAKVTSLLKE >LR134536.1|VEJ60986.1|913106_913340_+|Acyl-carrier-protein-/-HmrB-protein-involved-in-methicillin-resistance MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKYINSLEK >LR134536.1|VEJ60987.1|913454_914192_+|ribonuclease-III MANQKKKEMVHDFQQKFTDKMKSLGLHFKNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLEHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDRHPHLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIKLNELILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFVGALYLDQGLDSVWTFAEKVIFPYVEDDELVGVVDFKTQFQEYVHSQNKGDVTYQLIKEEGPAHHRLFTSEVILENKAVAEGKGKTKKESEQKAAEQAYKLMKNKKSL >LR134536.1|VEJ60988.1|914318_917888_+|chromosome-segregation-SMC-protein MVYLKSIDAIGFKSFADHTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGAKMEDIIFSGAEHRKAQNFAEVKLKLDNHSQKLQIDSEELVVTRRLYRSGESEYYLNNDRARLKDIIDLFLDSGLGKEAFSIISQGRVDEILNAKPINRRQIIEESAGVLKYKKRKAESIQKLDHTEDNLNRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKQLSKEMEQSDVIVTVSDIDHYTEDNQRLDERLNHLKSQQAEKEGQQAQINQLLQKYKGKRQQNDYDIEKLNYELVKATENYEQLSGKLNVLEERKKNQSETNARYEEELDNLESQIDSIKNEKAQNEKLLADLKNKQKQLNKEVQELESLLYISDEQHDEKLEEIKNSYYTLMSEQSVVNNDIRFLEHTINENEAKKSRLDSRLVEAFNQLKDIQQNITQTQKEYQSSKKSMEKVEQNIQQLEQQLTDSKRLLSEYENKLYQAYRYNEKLKSRIDSLATQEEDYTYFFNGVKHILKAKDKELRGIHGAVAEVINVPSEMTQAIETALGASLQHVIVDNEKDGRQAIQYLKQRGLGRATFLPLNVIQPRHVAADIKDVARGSQGFINIASDAINVSAKYQNIIENLLGNTIIVENLKHANELARAIRYRTRIVTLEGDVVNPGGSMTGGGARKTKSILSQKDELSTMRNQLEDYQRQTAEFERQFKEQKTQAEQLSEQYFSASQQYNNLKEQVHHHELELDRLKTQEAHLKNEHEEFEFEKNDGYQSDKSKETLKEKQNHLIEIQQQLKQLESDIERYTQLSKEGKASTHQTQQQLHQKQSDLAVVKERIKSQKQVYERLDKQLSDSERQKIEVNEKIKLFNSDEMMGKDAFEKLKEQIQQQENVRQNLNQQLSEIKQQRKDLNEKIEINESQLQKCHQDILFIENHYQDIKAKQSKLDVLINHAIDHLNDTYQLTVERARMEYDSDETIDNLRKKVKLTKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLNEQRTDLREAKETLEQIIHEMDKEVEGRFKTTFHAVQDHFTTVFKQLFGGGQAELRLTEDDYLSAGVDIIVQPPGKKLQHLSLLSGGERALSAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAQYLNELSTETQFIVITHRKGTMEFSDRLYGVTMQESGVSKLVSVNLNTIDEVMKEEQA >LR134536.1|VEJ60989.1|917884_919111_+|signal-recognition-particle MSFFKRLKDKFSSKSEDDIQKDLDETVDSNANSDSDSMDPNDSDEQVKPKKKPKKLSEADFDEDGLISIEDFEEIEAQKIGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMKLTDELRTEAQRRNIQETEDLREVIVEKIVEIYHQEDDYSEAMNIEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYQQEGKKVMLAAGDTFRAGAIQQLNVWGERVGVEVVSQNEGSDPAAVVYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKSNLMQELDKMKRVINRAIPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARSFKEVTNVSGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEKMDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEDIPEEISRNSSVESEEGN >LR134536.1|VEJ60990.1|919112_919445_+|DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQKNYLELFYLQDYSLSEIADTFEVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYESKLRLYQRFEKRRELYNLMKQSLNQPELLKQYITQLEELE >LR134536.1|VEJ60991.1|919475_920843_+|Signal-recognition-particle,-subunit-FFH/SRP54 MAFEGLSDRLQATMQKMRGKGKVTEADIKTMMREVRLALLEADVNFKVVKEFVKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQEELTSLMGGENTSIKMANKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPLLVAGDIYRPAAIDQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVSPQQIVENALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELQEVKEISKPDEIMLVVDAMTGQDAVNVAQSFDEQLDVSGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSDKQIDHIKAIIQSMTPKERSNPETLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKAKRNQMQNMLKGMNLPF >LR134536.1|VEJ60992.1|921150_921426_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQLGTYNPAHVNAPEVKIDEELALKWLHDGAKPTDTVHNILSREGILKKFDEQKNAK >LR134536.1|VEJ60993.1|921552_922056_+|16S-rRNA-processing-protein-RimM MEVEVGQIVNTHGIKGEVKVKSNSDFTETRFQPGEQLLVKHNNTEIVYTVASYRIHKGFHMLRFEGINNINEIEHLKGDYIYQERDHQDIELGEHEYYYSDIIGCTVFKDDDTPIGRVINIFETGANDVWVVKGEKEYLIPYIEDVVKDIDIETKTIKITPMEGLLD >LR134536.1|VEJ60994.1|922055_922793_+|tRNA-(guanine-N(1)-)-methyltransferase MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYSINKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMEDINHNEHTRVILMCPQGRPFTQEIAQELSEAKHIVFICGHYEGYDERIRKHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQASHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREYKNMSVPEVLLSGNHAHIDQWRHEQKLIRTYEKRPDLLEQYPLTEKDREILETYKKKLKND >LR134536.1|VEJ60995.1|922898_923249_+|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPTFRSGDTLRVHVRIVEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134536_3 | 920950-921045 | Unclear |
NA
Consensus repeat of LR134536_3
|
1 spacers
spacers of LR134536_3
>3.1|920984|28|LR134536|CRISPRCasFinder AGAGTAGTGGAACGCCTGAGCTAAAGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134536_3
The CRISPR arrays of LR134536_3 >merge|LR134536|3|920950-921045|CRISPRCasFinder CATGCATAACCAAAAGTACGATTTACTTCGTAAAAGAGTAGTGGAACGCCTGAGCTAAAGCACATGCATAACCAAAAGTACGATTTACTTCGTAAA >LR134536|3|3|920950-921045|CRISPRCasFinder CATGCATAACCAAAAGTACGATTTACTTCGTAAA AGAGTAGTGGAACGCCTGAGCTAAAGCA CATGCATAACCAAAAGTACGATTTACTTCGTAAA
>LR134536.1|VEJ60991.1|919475_920843_+|Signal-recognition-particle,-subunit-FFH/SRP54 MAFEGLSDRLQATMQKMRGKGKVTEADIKTMMREVRLALLEADVNFKVVKEFVKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQEELTSLMGGENTSIKMANKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPLLVAGDIYRPAAIDQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVSPQQIVENALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELQEVKEISKPDEIMLVVDAMTGQDAVNVAQSFDEQLDVSGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSDKQIDHIKAIIQSMTPKERSNPETLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKAKRNQMQNMLKGMNLPF >LR134536.1|VEJ60990.1|919112_919445_+|DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQKNYLELFYLQDYSLSEIADTFEVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYESKLRLYQRFEKRRELYNLMKQSLNQPELLKQYITQLEELE >LR134536.1|VEJ60989.1|917884_919111_+|signal-recognition-particle MSFFKRLKDKFSSKSEDDIQKDLDETVDSNANSDSDSMDPNDSDEQVKPKKKPKKLSEADFDEDGLISIEDFEEIEAQKIGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMKLTDELRTEAQRRNIQETEDLREVIVEKIVEIYHQEDDYSEAMNIEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYQQEGKKVMLAAGDTFRAGAIQQLNVWGERVGVEVVSQNEGSDPAAVVYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKSNLMQELDKMKRVINRAIPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARSFKEVTNVSGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEKMDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEDIPEEISRNSSVESEEGN >LR134536.1|VEJ60988.1|914318_917888_+|chromosome-segregation-SMC-protein MVYLKSIDAIGFKSFADHTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGAKMEDIIFSGAEHRKAQNFAEVKLKLDNHSQKLQIDSEELVVTRRLYRSGESEYYLNNDRARLKDIIDLFLDSGLGKEAFSIISQGRVDEILNAKPINRRQIIEESAGVLKYKKRKAESIQKLDHTEDNLNRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKQLSKEMEQSDVIVTVSDIDHYTEDNQRLDERLNHLKSQQAEKEGQQAQINQLLQKYKGKRQQNDYDIEKLNYELVKATENYEQLSGKLNVLEERKKNQSETNARYEEELDNLESQIDSIKNEKAQNEKLLADLKNKQKQLNKEVQELESLLYISDEQHDEKLEEIKNSYYTLMSEQSVVNNDIRFLEHTINENEAKKSRLDSRLVEAFNQLKDIQQNITQTQKEYQSSKKSMEKVEQNIQQLEQQLTDSKRLLSEYENKLYQAYRYNEKLKSRIDSLATQEEDYTYFFNGVKHILKAKDKELRGIHGAVAEVINVPSEMTQAIETALGASLQHVIVDNEKDGRQAIQYLKQRGLGRATFLPLNVIQPRHVAADIKDVARGSQGFINIASDAINVSAKYQNIIENLLGNTIIVENLKHANELARAIRYRTRIVTLEGDVVNPGGSMTGGGARKTKSILSQKDELSTMRNQLEDYQRQTAEFERQFKEQKTQAEQLSEQYFSASQQYNNLKEQVHHHELELDRLKTQEAHLKNEHEEFEFEKNDGYQSDKSKETLKEKQNHLIEIQQQLKQLESDIERYTQLSKEGKASTHQTQQQLHQKQSDLAVVKERIKSQKQVYERLDKQLSDSERQKIEVNEKIKLFNSDEMMGKDAFEKLKEQIQQQENVRQNLNQQLSEIKQQRKDLNEKIEINESQLQKCHQDILFIENHYQDIKAKQSKLDVLINHAIDHLNDTYQLTVERARMEYDSDETIDNLRKKVKLTKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLNEQRTDLREAKETLEQIIHEMDKEVEGRFKTTFHAVQDHFTTVFKQLFGGGQAELRLTEDDYLSAGVDIIVQPPGKKLQHLSLLSGGERALSAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAQYLNELSTETQFIVITHRKGTMEFSDRLYGVTMQESGVSKLVSVNLNTIDEVMKEEQA >LR134536.1|VEJ60987.1|913454_914192_+|ribonuclease-III MANQKKKEMVHDFQQKFTDKMKSLGLHFKNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLEHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDRHPHLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIKLNELILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFVGALYLDQGLDSVWTFAEKVIFPYVEDDELVGVVDFKTQFQEYVHSQNKGDVTYQLIKEEGPAHHRLFTSEVILENKAVAEGKGKTKKESEQKAAEQAYKLMKNKKSL >LR134536.1|VEJ60986.1|913106_913340_+|Acyl-carrier-protein-/-HmrB-protein-involved-in-methicillin-resistance MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKYINSLEK >LR134536.1|VEJ60985.1|912144_912879_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MNKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKDKAEAVVEEIKAKGVESFAIQANVAKGDEVKEMIKEVVSQFGSVDVLVNNAGITKDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKVTPQMLRQRSGAIINLTSIVGAMGNPGQANYVATKAGVIGLTKTAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTNALSDDLKDQMLEQIPLKRFGEDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >LR134536.1|VEJ60984.1|911225_912152_+|malonyl-CoA-ACP-transacylase MGKIAVVFPGQGAQKVGMASDLYNEEERSTRVLNLAQETVDFDLLETMFTDNDGKLGETENTQPALLTHSVALLESLNHLKVDYTMGHSLGEYSSLVSSGVLSFEDAVRIVRKRGQLMAQAFPNGVGGMAAVLGLDYDDVDKICQTLSTKEQLIEPANINSPGQIVVSGHKSLIDELVEKGKELGAKRVLPLAVSGPFHSSMMKVIEEDFANFINQFEWHNANYPVVQNVNAKGETDAEVIKRNMVKQLYSPVQFIQSTEWLINQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKITSIQTLEDVKGWNNHE >LR134536.1|VEJ60983.1|910246_911224_+|glycerol-3-phosphate-acyltransferase-PlsX MVKIAVDMMGGDDAPGIVLDAVKKAVEDFKDLEIILFGDESQYNLSHERIEFRHCTEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTTDGKGFVFLDVGANADAKAEHLLQYAQLGNIYAQKIRGIQNPSVSLLNIGTEAAKGNSLTKKAYDLFEKNQSFNFTGNIEAKTLMDGNVDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKETIMSSFKNKLAGAVLKKDLETFAKKMDYSEYGGSVLLGLDGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEENIVQIMKDTVGE >LR134536.1|VEJ60982.1|909684_910245_+|fatty-acid-biosynthesis-transcriptional-regulator MKLKKNDRRVAIKEAIELNPFITDYELCEKFDVSIQTIRLDRTHLNIPELRKRIKLVAEQNYGRIKSIEANEIIGDLIQVNPDVSAQSLIEITIDSVFAKSEIARGHVLFAQANSLCVALIHKPIVLTHESQVEFKEKVKLNDTVRADARVIDITDKHYIIEVNSYVSDMLVFKGKFKMYYTSEDE >LR134536.1|VEJ60992.1|921150_921426_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQLGTYNPAHVNAPEVKIDEELALKWLHDGAKPTDTVHNILSREGILKKFDEQKNAK >LR134536.1|VEJ60993.1|921552_922056_+|16S-rRNA-processing-protein-RimM MEVEVGQIVNTHGIKGEVKVKSNSDFTETRFQPGEQLLVKHNNTEIVYTVASYRIHKGFHMLRFEGINNINEIEHLKGDYIYQERDHQDIELGEHEYYYSDIIGCTVFKDDDTPIGRVINIFETGANDVWVVKGEKEYLIPYIEDVVKDIDIETKTIKITPMEGLLD >LR134536.1|VEJ60994.1|922055_922793_+|tRNA-(guanine-N(1)-)-methyltransferase MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYSINKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMEDINHNEHTRVILMCPQGRPFTQEIAQELSEAKHIVFICGHYEGYDERIRKHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQASHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREYKNMSVPEVLLSGNHAHIDQWRHEQKLIRTYEKRPDLLEQYPLTEKDREILETYKKKLKND >LR134536.1|VEJ60995.1|922898_923249_+|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPTFRSGDTLRVHVRIVEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >LR134536.1|VEJ60996.1|923778_926382_-|integral-membrane-protein MIKNIWNKPIKRFTLIVLVSCILSFILYGPFLYQFITKGIVFSGSGDGFRQMMPFQMYLYEHFTSLKGFYDASFGLGGDYVKSLAYYYSLSPLMWINFSMIWILEQTINVNPHDISFWPINQLIMAYVRTVITFIFSFYLFSYLRLKPAPMFIATILYGMSTVVTYYNFTWSFYGNLLIMLPMSLWAIERFFKERKIGWFIFAIAYTLFSNFYFSYYEAIVIGFYFIYRFAIPHEKDIVNRWQKLYILVCATLLSVLVSIYGLYTGISSFLDNDRAQNPNFKITFFTNLFETNYNIFADGFYITISFIAIIALFCFKLYQHYYYKLFAIATWILLIGSFSQWFDSAFNGFSLPQRRWVYFLALSTSVLIALFIQHLSEISIKEYTFVAIPVFIYGFIFIALSERSVKWMFVALILIIVLFIFIKYKSLLTRTSMMVLLVVLFLAQQVLMTNDSRKITIEPYQTTIKTINDSNYRSPVLNKKIKYMHQSSTDPLKRLDYFSYYALNSPLIYHYNGTSLYSSIFDGDILKYYDQTLQINMPVDKNSTYRYLNNRANLMSLWDVQDRLRHPDDLNMPYGFKKKELITDKKDQWIHSVNTINYPSAHITNKIYDARKLKSPLDREQAMLKGVVLNHKSQANTDFKPNPNLLSNAKQNLNHANWIDSKHLKVKQHNGGVTLNLPRNIVKNYKDMYIEMDVELLSPDKEHKVGVNEYSQERNRLSYKYRRFVSPVTMRAKASNQLNIKMSKGVYRFKVKGIYGENYQTLKKASQQLQPVKVKKERNGFTIIKKKKEHGYLVLPMVYAKGMHAMANGKPLKVQQGNGIMTTIPVKEGQTKIKLSYTPPYFYLLITVSCIGIILSILFTHYVKRK >LR134536.1|VEJ60997.1|926374_928975_-|membrane-protein MRRKACFIILLITLSLIGHSYIIFRFHHDGVLSTGPNDGMEQMIPIQMYLYHQWTQGNLFYSTHLGLGGDFFTDLSYYFSTNLIFILNVPIIKLCEIFFSLNTNQILLWMYNALIVSIIKSTIALFCTYLFSYYISKNKIISLLISFIFVMSPLYFRFTIYWPFFSDTFIWLPLLLLGIERLLRDFKAGLFILTVSLILINNFYFAYYFLIIGIGYTLIRIIYRHPKDSLTRWQASLTIICSALLALGNSMFVFFHGVQSFLNNRRQSFTGQVNWIEHLNKDTNIFFDNYLIVVIFLSIQALLTIKLYKHFYYKLFALLLLATIIFAFLPFVDQLFNGFSAPQKRWHFILAFNSSILIGLFVKYFKTIRPKTYIYTNLIAQSVIYISSISYNTFLPWLSLVPVVSVIGLLILLIKEKKVRYYLTYLYSISIAALSLMITFVFIKNQIFFQDHINRANKRYINSSFYNSAIQRSLVKEMNQTKNDDQRINWRVDEQDNTPMYQNFKGLSIYSSIFHHNILDFYYDALKINLAEESVSRYQSTNARQNIESLFSVKYLMMKDYQNFIPSYFKKVKSRGQYIIYKNQLPLPSVKVTQNIYNHKSLKKPIDREHAMINGAIVTSKGTAYHSKVKNLLDQTRVSTQNITRYSNNELTVNKESGIIKLHLPKNIRDKYKDFYLTMNIKRGDPDSNYTVSINQYHNHRLYNDSIYRTGISKVLYRSLPDKNGDITIQLSPKGKFNLELLELNGENYDTLKQAHHHANFNMRYKDIKNGVKVNLDHHSKGLAVINIPYRKGMRAYVDDRQSNIKKVNYMMTGVPVNKNDKTITIQYRPPFLKTMFSISIFSIVVSIVFIRLKNIRKRKMRIRHD >LR134536.1|VEJ60998.1|929303_930167_+|ribosomal-biogenesis-GTPase MAIQWYPGHMAKAKRQVSEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDDVIKQKPRVVILNKKDMTNLKELEKWEIYFKNEGFYPVAVDAKHGKNLKNVEVEAIKATQEKFDREKAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLAKRSIAETGNKPGVTKQQQWIKVGKSLQLLDTPGILWPKFEDEEVGKKLSLTGAIKDSIVHLDEVAIYGLNFMIKHDVSALKRHYNIDTHEDAEILDWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYESVIELIINDMRNAKIGTYCFDILKEMKSE >LR134536.1|VEJ60999.1|930171_930942_+|ribonuclease-HII MSLTIKEIKEKLSRIETLEELHKHEANNDSRKGVINAIKSREKNILKQQALEEHYLSMNQYENNIMSSNRDALICGIDEVGRGPLAGPVVACAVILEKNHHYIGLDDSKKVSPKNRARLNQNLKENVYQYAYGIASSVEIDELNIYRATQLAMLRAINQLDVTPTHLLIDAMTLDIDIPQTSIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDQYMRQLSKQFPEYGFDKNAGYGTKQHLKAIDQVGIINEHRQSFEPIKSMMK >LR134536.1|VEJ61000.1|931049_932216_+|Succinyl-CoA-ligase-[ADP-forming]-beta-chain MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAEEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIEEGCDIQKEYYVGFVIDRATDKVTLMASEEGGTEIEEVAAQTPEKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESVGKATKFLLALYNVFIEKDCSIVEINPLVTTGDGQVLALDAKLNFDDNALFRHKDILELRDLEEEDPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVERGKAILNESGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >LR134536.1|VEJ61001.1|932237_933146_+|Succinyl-CoA-ligase-[ADP-forming]-alpha-chain MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTQIVAGVTPGKGGQVVEGVPVYNTVEEAKNETGANVSVVYVPAPFAADSIIEAADADLDMVICITEHIPVVDMVKVKRYLQGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNEDSETKAVVMIGEIGGTAEEEAAQWIKENMNKPVVGFIGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTASEKIKTLNDCGVETADTPSEIGTTLIDAAKKAGIYEELLTIKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134536_4 | 2160582-2160677 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134536_4
|
1 spacers
spacers of LR134536_4
>4.1|2160615|30|LR134536|CRISPRCasFinder CTTGAGCTTTGCTCAGGCGTTCCTCTTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134536_4
The CRISPR arrays of LR134536_4 >merge|LR134536|4|2160582-2160677|CRISPRCasFinder CACTGCAATTTTTAATTGCTTGTGTCACTTATGCTTGAGCTTTGCTCAGGCGTTCCTCTTTTTCACTGCAATTTTTAATTGCTAGTGTCACTTATG >LR134536|4|4|2160582-2160677|CRISPRCasFinder CACTGCAATTTTTAATTGCTTGTGTCACTTATG CTTGAGCTTTGCTCAGGCGTTCCTCTTTTT CACTGCAATTTTTAATTGCTAGTGTCACTTATG
>LR134536.1|VEJ62214.1|2160116_2160503_-|TOPRIM-domain-containing-protein MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPANIICTHGTMSIDKIDNMIETLYDKQVYVLADSDDEGEKIRKWFKRYLSESEHIYVDKTFCEVAKCPKNYLAHVLSRYGFNVKKEKKLMNNLKTERLVLVNE >LR134536.1|VEJ62213.1|2159827_2160124_-|thioredoxin MNKLKDIEDITVNFNKEKHLIFGYTPMCGTCKISERMLDIANEILQLPIKKIDLNFYPEWSKEKQIMSVPVLLLMRREEEIKRIYAFQSVTYLLENLK >LR134536.1|VEJ62212.1|2158549_2159575_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKLNQIVKRYHTKDKDVLAVDHVDLNIESGSIFGVIGFSGAGKSTLIRMFNNLESPTSGEIIIDGNNISQLSKSQLRKKRQKVSMIFQHFNLLWSRSVLKNVTFPLEIAGVPSGLAKQKALELIELVGLKGRESAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPDVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKVREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMENGKVIEQGAVSKVFENPQHEVTKRFVKDDLNDDFEDSLEYLEPLDHDAYIVRLNFTGENTTEPIISYMTKTHNIDVNILEADIKNTKNGSLGFLVIHIPHISEEHFKQFKHNLHEQHVNVEVLKHG >LR134536.1|VEJ62211.1|2157861_2158557_-|ABC-transporter-permease MGKSYGEIFHEMVTMPNVQWPEVWQAILETLYMTVVSTLFAFVFGLILGVLLFLSAKSNSLAAKIFYTIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSILLGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTSIVVRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAIAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFLGDWLTNKIDKR >LR134536.1|VEJ62210.1|2157028_2157841_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGIILVLALTIALAACGGGKDKEKTITVGASPAPHAEILEKAKPLLKKKGYDLKIKPINDYTTPNKLLDKGEIDANFFQHTPYLNTESKEKGYKIESAGNVELEPMAVYSKKYKSLKDLPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDEGLIKLKKGVKIENAKFDDITENKKDIKFNNKQSAEYLPKIYQNQDADAVIINSNYAIDQKLSPKKDSIALESPKDNPYANLIAVKKGHKDDKNIKVLMEVLQSKEIQDYIKDKYDGAVVPAK >LR134536.1|VEJ62209.1|2156600_2156759_+|Uncharacterised-protein MKFITIKAITEKGLDKKVNQFLKSHPQIEIIKFDYQMGYSGVSVGILYRDNI >LR134536.1|VEJ62208.1|2156234_2156426_-|CsbD-like-protein MAEDKFEQAKGNIKETVGNATDNKELEKDGKGDKASGKAKEAVENVKEKANDVIDKFKGNKGD >LR134536.1|VEJ62207.1|2155308_2156169_+|membrane-protein MKKFKWINIFKGFGMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYDDFISSISGLFSRRFWPSLKFLLPILVGMLIAIGLLSQLFNYLLSQHHIPTMLFFTGLILGIIPYLLTISNFKKNFSIIHYFILLLGIAIIVVFALLNHGDKHSGETLTLSFSLIIKYFIAGVFASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTLMYAISELLHFNLNALPIILIVGFGIVTGFMISSRLIQYCLHQHPTMTFALIIGFVIGSLYAVFPGFPKDLIQWIISFFLLITGFLVSYVLGKITAKNEASF >LR134536.1|VEJ62206.1|2154225_2154987_-|iron-sulfur-cluster-assembly-ATPase-SufC MSSTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTGEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTQGEVLLDGVNILELDVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKQMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGEEFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYGGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGAAE >LR134536.1|VEJ62205.1|2152823_2154131_-|FeS-assembly-protein-SufD MTTKTLNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDTFKQHHTTGDAYTQLTDLPKSVKEIIDVENSENLIIQHNNELAYTQVSDQAKHDGVIIEGLSEALVNHSDLVQKYFMTKAVDVDEHRLTALHTALVNGGIFVYVPKNTVVEHPIQYVVLHDDEQASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSTTSGEDNQLNIVSEVIAGANSNVTYGSVDYLDKGFTGHIIRRGSADADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLNGDRSTSALKSVVVGTGDQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKENASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSENARGDANPILLIDEDDVEAGHAASVGRVDPEQLYYLMSRGISRAEAERLVIHGFLDPVVRELPIDDVKRQLREVIERKVSK >LR134536.1|VEJ62215.1|2160762_2161143_-|glycine-cleavage-system-protein-H MAVPSEFKYSKEHEWVKIENNVATIGITEYAQNELGDIVFVELPETDDELNEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKIVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKIEISDDSQLEELLSADQYSEMIGE >LR134536.1|VEJ62216.1|2161316_2161670_-|arsenate-reductase MIKFYQYPKCTTCKKAAKFLDEHDVNYESIDIVQHTPTKKEFKNIVDKTGVNINKLFNTHGIKYRELNLKEKLKNMSDDEKLELLASDGMLVKRPLAISGNHLTLGFKENEYQHQWL >LR134536.1|VEJ62217.1|2161812_2162136_+|thioredoxin MKNIHQTEEFNSTIGSTDPVIIKFEADWCPDCKAMDMWIDPIVEKYNNYQWYVVDRDELEDVTTENDVMGIPSILIFQNGKKLAHLHSANAKSPEQVESFLTEHLDQ >LR134536.1|VEJ62218.1|2162318_2162861_-|nitroreductase MELQEAISNRRSVKKFKHDMVVDDQTVYDAIYKATDAPNHGMREPWRLVHISKDKLGDFSRDITRFAFPDSPDKREDHFHAVTNLGGMLLLILKDDPRQRQSRENYFAFGAFAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPQYIFDPKIRKALGVKDNEILAGFLYLTDLEEVPTKAKRKNKNLITEFE >LR134536.1|VEJ62219.1|2162941_2163658_-|3-dehydroquinate-dehydratase MTHVDIAATIAPEDKLSKTLLKDIKVNEESIDIIELRIDQWPSFNKALLNEVIKQLKIFHLKILVTYRTSVQGGKGAVNEQEYLNILGELIECPQFDMIDIEWSSAVKIEKYTHLVQRAQQKGLEVVLSHHNFQETPALDELKFIYFKMQKLNPEYLKLAVMPKCQEDVLHLLEAMSLTAKHTTCRIVGISMSSLGKVSRIAQGVFGGTLSYGCIEEPQAPGQIHVSKLKSMVSFYED >LR134536.1|VEJ62220.1|2163815_2164241_+|OsmC/Ohr-family-protein MMAVQYETKATNVGGRKGHVHTDDNAINVDVLPPQQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAEPEVTLTVRLEDDPDAESPKLSVDIHAKVKNVLSQEDAEKYLQDAHDFCPYSKATRGNIDVNLNVEVVE >LR134536.1|VEJ62221.1|2164424_2164580_-|truncated-IS1272-transposase MYKEYNLTQHTLPMETSVLIPTNDISRHVNDIVETIPDTEFDEFRHHCGLI >LR134536.1|VEJ62222.1|2165165_2165666_+|lactococcal-prophage-ps3-protein-05 MNNIRLLNQNDLDSYIELMKFGHHNYEWDRYYLENVSIDRLKTILSNHTDYWNIFGAFEDDELVATCTLKQMNYVGKCHKAILENNFVKNNDEIVNRELINHIIQYAKEQNIETLMIAIASNNISAKVFFSSIGFENLAFEKNASKIGNEYFDENWLIYSTTESSD >LR134536.1|VEJ62223.1|2165936_2166524_-|phosphoglycerate-mutase MVKTLYLMRHGQTVFNLKGKIQGASDSPLTALGVQQANAAQQYFKTKNIHFDYLYSSPQQRACDTLENAVPNQQYWCVKDLKEWGFGLFEGESIELLRAIKQPRYLYGDAVVPFGGESRSEVEHRVYRALYEMMDTTDGETILAVSHGSTIGLFVRNILGYDKGSKFEIGNCNIVKFEYDGEEFIFKDLINPIKK >LR134536.1|VEJ62224.1|2166737_2166974_+|Uncharacterised-protein MSTHSQCNYVNPNSISLDWECLIISKTDMLLDGVPKELINTWLDQNVIEPFCVRNNEINFKTKDVWNALKTHNWYYSN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134536_5 | 2312289-2312379 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134536_5
|
1 spacers
spacers of LR134536_5
>5.1|2312321|27|LR134536|CRISPRCasFinder GGGCCCCGAACCCCAACTTGCTTTGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134536_5
The CRISPR arrays of LR134536_5 >merge|LR134536|5|2312289-2312379|CRISPRCasFinder TGTTGAATTTCCCGGTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGAACCCCAACTTGCTTTGCCTGTTGAATTTCTCGGTGAAATTCTCTATGTTG >LR134536|5|5|2312289-2312379|CRISPRCasFinder TGTTGAATTTCCCGGTGAAATTCTCTATGTTG GGGCCCCGAACCCCAACTTGCTTTGCC TGTTGAATTTCTCGGTGAAATTCTCTATGTTG
>LR134536.1|VEJ62367.1|2311508_2312183_+|cell-wall-biosynthesis-protein-ScdA MITKEDIVADVVTDYPKSADIFRNAGIDFCCGGQESIASAVNHKPNIDLNSLLNKLNHIDNTEGNSTINPKFLNVESLIQYIQSAYHETLKEEFKNLTPYMTKLAKVHGPSHPYLLKLQDLYREFRDSMLDHIRKEDEEDFPKLIQYSQGQDVQNIKIILEDLINDHEDTGQLLNVMNQLTSDYQTPEEACGTWKLVYQRLQNIERQTHQHVHLENHVLFKKVS >LR134536.1|VEJ62366.1|2310191_2311337_-|flavohemoprotein MLTEKEQDIIKQTVPLLQDKGTEITSIFYPKMFEANPELLNMFNQTNQKKGMQSAALAQAVLAAAMNINNLGAIKPAIMPVAHKHCALQVYPEHYPIVGENLLAAIQDVTGLESDDPVIQTWAKAYGEIADVFIKLEQEIYNHMLWKGFKPFKITNITQETSDIKSFTVESEEYDLSQFEPGQYITVDVSSEKLPYRAKRHYSIIDGDENHLVFGVKRDVTTEHEGEVSTILHDEISEGDMINLSAPVGGFSIENTERPQLFIGSGVGMTPLVSMFKKAASLNVPTQMIQAVVTEDERPFAQKLDSITDNYEQAQLHLHVKDKEGYLEAKELEQYLSEQPEIYICGGTKFLHSIINSLKELNYDMNHVHFETFIPRLSVQV >LR134536.1|VEJ62365.1|2309986_2310172_-|membrane-protein MKMNPRYVKVFFLYLVSTFISNRLTTNKSLCKTLMQGILGYGLFALGLKYLTIKKKQHQAQ >LR134536.1|VEJ62364.1|2309104_2309698_-|Protein-of-uncharacterised-function-(DUF402) MKVKYIDKRHWRRLVEREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVREPLEVTVVGQNIIVADDNYKWLQILPDKKRYSMTVMFDNKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTIDLCLDVLVLPNGEYELVDEDDLMYALQNKQISKKQYHEAYIIAHQLMIEIEDNFSEIQDKVMRCYHKINHKAQKMKHKRPYKAKKKSHRRH >LR134536.1|VEJ62363.1|2308169_2309024_-|LysR-family-transcriptional-regulator MKIDDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIEAAFGVEIFIRTKKQLITTTEGSMIIEHARDMLKRERLFFDKIQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNSQFPNVEIQVQVGSTEQIKAHHRDYHVMITRGNKVMNLSNTHLFNDEHYFIYPKDRKEDVTKLPFIEFQADPIYINQIKQWYNDHLGHDYHATITVDQVATCKEMLLSGVGVTILPKIMMKNIDKNMFEFEKVTIDKKPLIRSTYMSYDASMLQLPQVDAFVNLMLNFIR >LR134536.1|VEJ62362.1|2306903_2308112_-|sugar-efflux-transporter MFTALLQIKNYKLFVVNMLLLGMGIAVTVPYLILFATKDLGMTTTQYGLLLALAAISQFIVNSIIARFSDTHHLNRKILIITALFMGAVSFSIYFYVHQIWLFIVLYALFQGLFAPAMPQLYASARESINASSSRDRAKFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIELKGYSGLFGGTIAIILFTLILQVFFYKNLPVKNQISEQQHIEKIAPNMFKDKSLFIPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLNEKERYVGYLASLCAGLEVPFMVILGILSAKLPTRTLLIIGSVFGGAFYFSIGVFKNFHMMLVGQICLAIFLAILLGLGISYFQDILPDFPGYASTLFANAMVIGQLGGNLLGGVMSHWVGLENVFFVSASSIFVGMILILFTKDQKITIEDVE >LR134536.1|VEJ62361.1|2306408_2306897_-|putative-glycine-zipper-protein MTAILWILIIIAFALAFIGLIKPVIPSLLMLWIGFLIYQFGFHEGRLSWIFYVAMIIFTIMILVADFVMNKYFVNRFGGSKIGEYTALIGVIVGCFVFPPFGIIIIPFVAVFIVELVQGFNFQQAIKVSFGSVIAFLASTIAQGLIMIVMVIWFFLDVFLIN >LR134536.1|VEJ62360.1|2305663_2306353_+|membrane-protein MKSTAQLTKENNVKALRLNNTDREIFENYMTYVRADLRVNPHDSELMLNRTLKHLIRAGDTGMLAMEFFNHDPKAHAKKEIRELPNETFKNIFKYISHNFILLIGIFCFLKGLIGFFIGGDSNLLYLYTFPLTVIIGLVIIFLFIWMNFKTVQLQCFNNSYWTWWLTYGVIALLLITLFYVFFIPQSFLAFGPYIKVSNWTFIIIAIIIIPISFYVNHHFYNKEANTRI >LR134536.1|VEJ62359.1|2304802_2305225_-|lipoprotein MRKWLTLLLITTLVLTACGKSNEKASLEKSIDQLKKENKDLKKQKKKLQEQKDKLKHKQDSLQEDVNDLPAKSTSRDKKNKDNHDAKEKSSDNQSTSANHDDQTNKIKSNQDEHDSQSSKPHTQQKPSQNDRKNNHRQER >LR134536.1|VEJ62358.1|2304374_2304671_-|Uncharacterised-protein MHEQDFNILEGKKMTLVELGRELENLTGRTIKDTTSDIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYHLNHQNDFIDATFVAPKNQSDRLKEIPVHIKLISYISKN >LR134536.1|VEJ62368.1|2312493_2312970_-|cupin-superfamily-protein MMTANDWIDRLELISHPEGGYFKETMRGDGKGRASFSSIYFLLTQRDISHFHRIDADEVWYYHAGQTLKIHMITPKGEYHTVKLGRDIDCGECLQYCVPKGTIFASTLDSAEGYSLVGCMCQPGFEYEHFELLTQEYLIRQYPQYESIIKRLAISQED >LR134536.1|VEJ62369.1|2312969_2313686_-|putative-DUF28-containing-protein MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQTLRLVLERAKTYSVPNHIIDRAIDKAKGAGDENYDHLRYEGFGPNGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHTATFGVEGKSVDEVLETLMEQDIDVRDVIDDNGLTIVYAEPDQFAQVQDALREAGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSEEDQAIFEKLIDALEDLEDVQNVFHNVDLK >LR134536.1|VEJ62370.1|2313938_2314298_-|accessory-regulator-A-like-protein MNEQKLIKLLEFYKQYKALSGYIDKKYKLTLNDLAVLYLAKKYCLDERILMQTFLKLATGELDISRTKILMSIRRLIDKEKLNKVRSNRDERKIFLYMDENNMSEFDALFEDVEKFLSY >LR134536.1|VEJ62371.1|2314412_2316587_-|AraC-family-transcriptional-regulator MANSCLHILSKKEYTATRCQDGILLFWPIEGSMHFQQFMKERILSDELYIVNNMDVFSISDNGITLEVYISSDWFTELGYSFFNYHYISDLIQSKNEIKELVAQLTLNFLDNDVDKEQDIINKIVHILANEAIIDKKIAEDQYMYDYYGELKDELNYIYNHIEERLTLKDISNKLYVSKSNLSTQFHLLLGMGFKKYIDTLKISKSIEMLFTTTKTISQISETLGFSNVSTYSRQFKNYLSVTPNAYRAMKKYDKYNGCSDDDVSEHLKSRVQSLICSKMPTNELDNYDEIVIDQYPISNVSTFYSVVQINSIDEIKMLFLQGIHKKIGYEGSNIIFCIMPNLCQYKNSFSQEEMNDIIKIIIEYRLHVAFSIDKIEQIYELNQLFTYQYENLKIMNKCSVSDYNVQFIFNLNEKSIREIYRNILKIQNIELEYKIGLDISCMFNDTAQFKSLASQIKRLKFDYLYIDNARLKSPYLLDNEEGLLLKNILQFKHLIDDLKQFDFSSENLIFLNLYNHQLLNNNEIDLSNSAPLLFKTISKLKKHFKGYGLNVFSNPKVFNAVHLFDENGFKTTFGLIFNHLSWMTNQNQIEQRFYNIIENADQYYLYLYDWRVIESESNESDFKDVDIWINFEDEALIDEYICVIAKVDDEGGNINHMISQNLRHKYVWSTPFLMRVEENFRPYMHIMEHDFKKGPLKIRMKYNAVYLVEIYKKDKINKRRSTT >LR134536.1|VEJ62372.1|2316850_2317510_-|transporter MSQSTHQSTDHKRQSQDKNQTHAYAKVWLYFMYYWMIFGIGCYFGQYLPMSWRKPLSLGLLILILATLFIKRARKYGLVISHIYAIIVGLLSYALFTTYLQNLGAEVFYKNIILAIGAFIAFGIIGYFLIKDASSMGKYLFVTLIALIIAGIIGIFINNPIFHTVITIVSLLLFLLYTLYDFNRMKRGQFSPREMGFNLFINLLNIIEDILSLANRFKN >LR134536.1|VEJ62373.1|2317920_2318721_+|secretory-antigen-SsaA-like-protein MKKLAFAITAASGAAAVLSHHDAEASTQHKVQSGESLWTIAQQYNTSVESIKQNNNLSNNMVFPGQVINVGGSASQNTSSNTSSSSASSHTVVAGESLNIIANKYGVSVDALMQANHLNGYLIMPNQILTIPNGGSGSGSGGTATQTSGNYTSPSFNHQNLYTEGQCTWYVFDKRSQAGKPISTYWSDAKYWASNAANDGYQVDNTPSVGAIMQSTPGPYGHVAYVERINGDGSILISEMNYANGPYNMNYRTIPASEVSSYAFIH >LR134536.1|VEJ62374.1|2318913_2319924_-|low-affinity-inorganic-phosphate-transporter MSYILIVTIAIVIFSLIFDFINGFHDTANAVATAVSTRALTPRRAILLAAVMNFIGALTFTGVAGTITKDIVDPFKLQHGLVVVLAAIIAAIIWNLITWLYGIPSSSSHALIGSIAGAAIASQGSFAVLHYQGFTKIIIVLIISPIIAFCVGYMMYTIVKIVFKNSNLTRTNRNFRFFQIFTAALQSFSHGTNDAQKSMGIITLALIVGNLQDGSNVEPQVWVKVACATAMGLGTAVGGWKIIKTVGGNIMKIRPANGAAADISSALTIFVASSLHFPLSTTHVVSSSILGVGASNRAKGVKWSTAQRMVVTWVITLPISAVLAAIIYFIIHLFLK >LR134536.1|VEJ62375.1|2319938_2320556_-|phosphate-transport-regulator,-putative MFSKKKDKFMVQLEEMVFNLDRAAIEFGKMDFNTHLDLKAYSDNIKTYESHGDELMHQVISDLNQTFITPIEREDILSLCNAIDDVLDAMEETSAMFEMYSIEYTDEYMAEFVENIQKAVAEMKLAVGLLVDKKLSHMRIHSINIKEFETNCDGILRQSMKHIFNSETDPITLIKIKDIYQSMEEIADKCQAVANNFETIIMKNS >LR134536.1|VEJ62376.1|2321077_2322967_-|ABC-transporter-permease MSFNEIIFKNFKQNVTHYAIYLLSLVISVVLYFSFVTLKYAHHLHGNQSFPAIKEGSQVGSYFLFIIIVVFLLYANFLFLKRRGRELSLLQIIGLTKKDIMKMIMLEQLMTFMMTTIVGIILGIFGSKILLMIVLRLLGINVSVSIIFNYHAILETLLLIAVSYVLIVFQSYVYLLKRSIKELASDVNKKEFSHTRTTLGEVVLGLLGIIMIVSGYIMSTKLVDNVETIIQPFAILFLTVIGSYFFFRSTVSLIFKAIQRLRNGTVSVTDVMFTSPIIYRVKKNAFSLTVMTVVSAITVSVLCFAALSRSTLTNEVLLSSPHDVTLKNQKQANELAFKLNNRNIEHYYNYKEVVYAKVYKDHLFSEGVYRPKEITVTSDKYIPNVSTKKGQTDIIIPRGSLKDVVKTDKKRTAYVGSKKFRLKVSLRKGINKVYFMSDVDRGRPTLILNDEDYQKIREHIKEKNIVSQYGFDLKNKNDLPELEKLVSSINEDIETRSEAASEISSLTGILLFVTSFLGITFLIAAGCIIYIKQIDETEDELENYTILRKLGFTHQDMSKGLKLKVIFNFGLPLIIALLHAYFASLAYMHLMNVTNQIPIFIVMAVYTATYAVFAIIAYNHSKRTIKHSI >LR134536.1|VEJ62377.1|2322956_2323718_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSILEVRQLSKVYGDKQAFQEVLKEINLDVDEGEFISIMGPSGSGKTTLLNVLSSIDYMTKGSITINGKQLEKLSNKQLSDIRKKDIGFIFQDYNILNTLTVKENIMLPLSVQKLDKQIMHERYQRIVEALNISDISDKYPSELSGGQRQRTSAARAFINLPSIIFADEPTGALDSKSTLDLLKRLKYMNEEFNTTILMVTHDPVAASFSNRVVMLKDGQIFTELYQGDDDKQTFYKEIIRTQSVLGGINYEL |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134536_1 | 1.1|432009|34|LR134536|CRISPRCasFinder | 432009-432042 | 34 | LR134536.1 | 1394512-1394545 | 2 | 0.941 |
| LR134536_1 | 1.1|432009|34|LR134536|CRISPRCasFinder | 432009-432042 | 34 | LR134536.1 | 1394571-1394604 | 2 | 0.941 |
1. spacer 1.1|432009|34|LR134536|CRISPRCasFinder matches to position: 1394512-1394545, mismatch: 2, identity: 0.941
gggttcggggccccaacaaagagaatttcaccga CRISPR spacer gggttcggggccccaacaaaaagaatttcactga Protospacer ********************.**********.**
2. spacer 1.1|432009|34|LR134536|CRISPRCasFinder matches to position: 1394571-1394604, mismatch: 2, identity: 0.941
gggttcggggccccaacaaagagaatttcaccga CRISPR spacer gggttcggggccccaacaaaaagaatttcactga Protospacer ********************.**********.**
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | MN369743 | Streptomyces phage Tribute, complete genome | 80738-80763 | 4 | 0.846 |
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | MT310865 | Streptomyces phage Bmoc, complete genome | 78515-78540 | 4 | 0.846 |
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | MH576968 | Streptomyces phage Wofford, complete genome | 80704-80729 | 4 | 0.846 |
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | MF358542 | Streptomyces phage Sushi23, complete genome | 80852-80877 | 4 | 0.846 |
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | MK494112 | Streptomyces phage EGole, complete genome | 81544-81569 | 4 | 0.846 |
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | MF347639 | Streptomyces phage Samisti12, complete genome | 81875-81900 | 4 | 0.846 |
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | NC_042011 | Streptomyces phage Peebs, complete genome | 80496-80521 | 4 | 0.846 |
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | NZ_CP020749 | Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed6, complete sequence | 9314-9339 | 5 | 0.808 |
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | CP024687 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence | 200447-200472 | 5 | 0.808 |
| LR134536_2 | 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder | 912956-912981 | 26 | MF358541 | Streptomyces phage Warpy, complete genome | 80974-80999 | 5 | 0.808 |
| LR134536_4 | 4.1|2160615|30|LR134536|CRISPRCasFinder | 2160615-2160644 | 30 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 1051845-1051874 | 6 | 0.8 |
1. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to MN369743 (Streptomyces phage Tribute, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aagagaggaacacaggagcttgagcc Protospacer **.*********** ********* .
2. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to MT310865 (Streptomyces phage Bmoc, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aagagaggaacacaggagcttgagcg Protospacer **.*********** *********
3. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to MH576968 (Streptomyces phage Wofford, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aaatgaggaacacaggagcttgagca Protospacer *** ********** *********
4. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to MF358542 (Streptomyces phage Sushi23, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aagagaggaacacaggagcttgagcc Protospacer **.*********** ********* .
5. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to MK494112 (Streptomyces phage EGole, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aagagaggaacacaggagcttgagcc Protospacer **.*********** ********* .
6. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to MF347639 (Streptomyces phage Samisti12, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aagagaggaacacaggagcttgagcc Protospacer **.*********** ********* .
7. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to NC_042011 (Streptomyces phage Peebs, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aagagaggaacacaggagcttgagcc Protospacer **.*********** ********* .
8. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020749 (Bacillus mycoides strain Gnyt1 plasmid unnamed6, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer tatcaaggaactcatgagcttgaggt Protospacer * .****** **************
9. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to CP024687 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-3-257K, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer tatcaaggaactcatgagcttgaggt Protospacer * .****** **************
10. spacer 2.1|912956|26|LR134536|CRISPRCasFinder matches to MF358541 (Streptomyces phage Warpy, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
aaaagaggaacacatgagcttgaggt CRISPR spacer aaatgaggaacacaggagcttgaacc Protospacer *** ********** ********. .
11. spacer 4.1|2160615|30|LR134536|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cttgagctttgctcaggcgttcctcttttt CRISPR spacer tttgctttttgctcaggcgttcctgttgtt Protospacer .*** .***************** ** **
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
759222 : 767692
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134536|759222:767692|DBSCAN-SWA AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCCTCAGATTGGAAAATTATGAAAGAAAGTTGTTCGATGCTTGAAGAATTTGAAATACCGTACGAAAAGAAAGTCGTTTCAGCTCATCGTACGCCTCAAATGATGTTCAATTTCGCTAGTCAAGCACGCCAAAATGGTTTTGATATTATCATTGCCGGTGCAGGGGGAGCAGCACACTTACCTGGAATGGTAGCTTCCATGACAACATTACCTGTGATTGGTGTGCCAATTGAATCTAAAAGTCTAAAAGGATTAGATTCATTACTATCTATCGTCCAAATGCCTGGTGGTATCCCAGTTGCAACCACAGCAATTGGAAAATCAGGTGCTAAAAATGCTGGGATATTAGCGGCAAGAATGTTAGGAATAACAAATGAATCAGTTCAAAATAATTTGGAAAATTATGAAAAATCTTTAGTCGCAAAAGTGGAGGAAATGCAAAATGAACTTCAGTAAACTTAAATTTGGCGCGACAATAGGAATCATTGGCGGAGGGCAGTTAGGAAAAATGATGGCTCAGTCTGCACAAAAAATGGGTTATAAGGTGATTGTCCTAGATCCTAATGAAGACTGTCCTTGTCGTTATGTCGCACATCAGTTTATTCATGCAAATTATGATGATGAGCAAGCTTTAAATCAGTTAGGTGAAAATTCTGATGTTGTTACTTATGAGTTTGAAAATATTTCGTCTGAACAATTAAAAAAACTCACTCAGTTATATCATATTCCCCAAGGGTACCAAGCTATTGAACTATTACAAGATAGGCTAACCGAGAAGCAAACATTACTAGAAGCAAATACTCAAATTGTTCCTTTTGTACAAATTCAAACAAATCAAGACTTATTAAAAGCCATAGAAAAATTAGGCTTTCCGTTCATAGTGAAAACACGTTTTGGTGGATATGATGGTAAAGGACAAATTTTGGTAAGAAATGATTCGGAATTAGACGAAGCATACCAGCTAGTTGAGAAGCAAGAATGTGTTGCTGAACAATATCTTGATATTCAAAAGGAAGTATCTCTTACAGTAACAATTGGAAATGAACAACAAACAACATACTTTCCTCTTCAAGAAAATGAACATCAAAATCAAATATTATTTAAAACAGTCGTTCCAGCAAGATCTGATAAAGAAAATGAAGCACGTAAGGAAGTTGAGAAAATCACTCGCGCAATTCATTTTGTGGGAACCTTTACAGTAGAATTCTTTATTGATAAAGAAAATAACTTATATGTAAATGAAATTGCACCAAGACCACATAATTCTGGACACTATTCTATAGAAGCTTGTGATTATTCACAGTTTGATACACATATTTTAGCCATAACTGGTCAAAAACTTCCGCAAGCTATTGAATTATTAAAGCCAACAGTAATGATGAATTTATTAGGTCGCGATTTGGATTTACTTGAAAATGAATTTAGCAGACATCCAGATTGGCATATTCACATTTACGGTAAGAAAGAAAGAAAACCTGATAGAAAAATGGGACACATGACTTTACTGACGGATGATGTCAATCAAACAGAACAATATATGTTAATGAAATTTGAAGGGAGAGACAAGTAAGTGTCATTGTTATATGAAGGTAAAGCTAAAAGAGTATTCACGACAAATATTGATGGACAATTACGAGTTGAATATAAAGATGAGGTAACAGCAGGAAACGGTGCAAAAAAAGATACTATGATTGGCAAGGGTAAGTTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTGATTATTTAACTCATAATCATATTGACAATCACTTTATTAAACAACTTTCACAAACAGAACAACTCGTCCAACAAGTTGATATTATACCTTTAGAAGTTGTTGTTAGAAACATTGCCACTGGTTCGATCACAAAACGTCTTGGTTTTAAAAAGGGGCATACATTTGAAGAACCTCTAGTAGAATTCTTCTACAAAAAAGATGAACTTAATGATCCGCTTATTACTGATGACCATGTAAAATTACTCGGCATAGCGAACGATGAAGAAATAAAACAACTTAAACAAATGGCAAAAGATATTAATCAAGTACTGATTCAATTGATGAATGAAATGAGTTTGAGACTTGTAGATTTTAAGGTTGAATTTGGTAAAACCAATGGTGGAAAAATTTTACTTGCAGATGAAATCTCTCCTGACACTTGTAGAATATGGGATAAAAATACGGATACTAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAACAACACTGGCTCGTTGATTGAAACTTATCAAACATTTTTAAATAAATTGGAGGATCTTAAATAATGAAAACGATTGAACTACATATCACTTTACAACCACAAGTTTTAGATACACAAGGACAAGCTTTAAACCGAGCAGTACACGATCTCGGTTATGAACAAGTGAATGACATTCGAGTAGGTAAAGTTTTATATATGACAGTTAATGAACCAACTGACGAGGCTGTTGATAATATTATTACGACACTAAGTGAAAAGTTATTTGCTAATACAGTCATTGAAGAATATAGCTATAAAGTTATCGATGAAAAGGAGAAAGCATAATATGAAATTTGCAGTTCTTGTGTTCCCTGGTTCAAACTGCGATAGAGACATGTATAACGCAGCTATTAAATCAGGTGTTGATGCAGCGTATGTCGATTATCGTGAAACGACTTTAGATGGTTTTGATGGTGTTTTAATACCTGGTGGTTTTTCATTTGGCGATTATTTGAGATCGGGAGCTATGGCAAGTGTTGCTCCGATTATTAAAGAAGTTAAGCGATTTGCGAAAGAAGGTAAGCCTGTTTTAGGAGTATGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAGATTGGATTGTTACCAGGCGCATTACTTCATAATGATTCACATTTATTTATAAGTAGAAACGAAACTTTAAAAATTACTAATAATCAAACACCTTTTACGCATTTATATGTGAAAAATGAGAATGTTGTTTATCCTGTAGCACACGGTGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCGTGAACTCAACGATAACAATCAAATTATCCTTAAATATACGAATAACCCTAATGGCTCTTATGAGGATATTGCAGGAATAGTTAATAAAGAGGGAAACGTTTGTGGGATGATGCCACACCCTGAACGCGCACTTGAAACATTATTAGGAACAAATAGTGGTGTGAAATTGTTTGAATCAATGGTGAAAAGTTGGAGGGAACAAAATGTCTAAATTTATCGAACCAAGTAATGAAGAGATTAAACTTGAAAAACTTTATCAAGATATAGGATTAAGTGATAAAGAATATGACAAAGTGGTTGAAATTCTTGGTAGAGAACCCAACTTCACAGAAGTAGGAATTTTCTCAGTGATGTGGAGCGAACATTGCTCATATAAACATTCTAAACCATTTTTAAAACAATTTCCTACGACAGGAGAGCACGTATTAATGGGACCAGGAGAAGGTGCAGGTGTTGTAGATATAGGCGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTTGAGTCTCACAATCATCCATCTGCAATTGAACCATATCAAGGTGCGGCAACTGGAGTCGGAGGTATTATTAGAGATATTGTTTCAATTGGTGCCCGTCCAATTAATTTACTAAATAGTCTTCGTTTTGGTGAGTTAACTGTAAAACAAAATCAACGATTACTTAAAGGTGTTGTAAGTGGTATTGGTGGATATGGCAACTGTATTGGTATTCCTACTACGGCTGGTGAGATTGAATTTGATGAACGCTATGATGGCAATCCATTAGTCAATGCTATGTGTGTAGGAATCATTGATCATGATATGGTCCAAAAAGGAACAGCTAAGGGTGTTGGTAATTCCGTTATATATGTAGGTTTAAAAACTGGGCGTGACGGTATTCATGGTGCAACATTTGCATCTGAAGAACTTACTGAGGAAAGTGAAAGTAAAAGACCTTCAGTACAAATTGGAGATCCATTTGTAGGCAAAAAGCTAATGGAAGCAACATTAGAAGCAATTACTTTTGATGAACTAGTAGGTATACAAGATATGGGAGCAGCTGGTTTAACTTCATCTTCATCTGAAATGGCAGCTAAAGGTGGTAGTGGTTTACATTTAAGACTTGATCAAGTTCCAACAAGAGAACCTGGAATTTCCCCATATGAAATGATGCTTTCAGAAACGCAAGAAAGAATGCTGTTAGTTGTAGAAAAAGGTACAGAACAAAAGTTTTTAGATTTATTCAATAAACACGAACTAGATAGTGCAGTAATCGGTGAAGTAACAGACACTGATAGATTCGTGCTTACATACGATGATGAAGTGTATGCAGACATTCCTGTGCAACCTCTTGCTGATGAGGCACCAGTGTATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAGGAATATAATACATCAAAAAACGATTACAGCAATATAGATGTACATGATACATTTATCAAGTTATTACAACACCCAACAATAGCATCTAAACATCATTTATATGAACAATACGATCAACAAGTAGGAGCAAATACAATTATTAAGCCAGGTTTACAAGCTTCAGTTGTGCGCGTAGAAGGAACACAAAAAGCTATTGCTTCAACTATAGATGGTGAAGCACGTTATGTTTTCAACCAACCTTATGAAGGTGGAAAAATGGTTGTTGCTGAAGCCTATCGAAATTTAATTGCAGTAGGGGCGACACCATTGGCTATGACTGATTGTCTAAACTATGGTTCTCCAGAGAAGAAAGAAATCTATCAACAATTAATAGATTCAACAAAAGGTATGTCAGAAGCTTGTAAAGTGCTTCAAACTCCTGTAGTTTCAGGAAATGTTTCATTATATAACGAGACACGTGGAACCTCTATCTTCCCTACACCTGTCGTAGGTATGGTTGGTCTTATTGAAGACGTGAGCTATCTAAAAGAGTTTAAACCTAAAGCAGGAGATAAGATTTATTTAGTTGGTGAAACGCGTGATGACTTTGGTGGTAGTCAATTGGAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134536|759222:767692|762449_764639_+|VEJ60848.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSNEEIKLEKLYQDIGLSDKEYDKVVEILGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELTVKQNQRLLKGVVSGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGIIDHDMVQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFNKHELDSAVIGEVTDTDRFVLTYDDEVYADIPVQPLADEAPVYILEGEEKEYNTSKNDYSNIDVHDTFIKLLQHPTIASKHHLYEQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACKVLQTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIEDVSYLKEFKPKAGDKIYLVGETRDDFGGSQLEKLLYGSVNHEFESIDLSDEVSKGKLIKQAIRNGIASHVQTVGKGGLLVTLAKISAHYDLGMQAQLDVTNAQLFSETQGRYIVVVKEGQTLDIDQAQEIGHLTHQQLFDISNSDVKIKENVSDIKQKWEGAIVQCLTTQD >LR134536|759222:767692|764617_766102_+|VEJ60849.1|DBSCAN-SWA MSNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNHETLKGERGLGLLTEAIKDEHMSNIKGYPHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEEQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRLIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMENGAYILASETCAIDVLGAEFIQDIHAGEYVVITDEGIEVKTYTRQTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKRLAQENPAKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKDIVLVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGANRIHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKNHIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYHGLCVESFTGDYPAGLYDYEKNYKKHLSERQKSYIANNKHYFDSEGNLHV >LR134536|759222:767692|760819_761524_+|VEJ60845.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRVFTTNIDGQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMIGKGKLNNQITSIIFDYLTHNHIDNHFIKQLSQTEQLVQQVDIIPLEVVVRNIATGSITKRLGFKKGHTFEEPLVEFFYKKDELNDPLITDDHVKLLGIANDEEIKQLKQMAKDINQVLIQLMNEMSLRLVDFKVEFGKTNGGKILLADEISPDTCRIWDKNTDTNFDKDVYRNNTGSLIETYQTFLNKLEDLK >LR134536|759222:767692|767125_767692_+|VEJ60851.1|DBSCAN-SWA MTNIAIFASGSGSNFENIVKHIQTGQLSGINVTALYTDNEGVPCIDRAKNLNIPIHINKPKDFSSKSLYEQHLLKLLSSEEVQWIVLAGYMRLVGQDLLQAYEGRILNIHPSLLPKFKGLDAIGQALESGDTVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQQQCDIKPDDTKEQLEDRVKHLEYELYPRVIAKIIK >LR134536|759222:767692|759222_759705_+|VEJ60843.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMKESCSMLEEFEIPYEKKVVSAHRTPQMMFNFASQARQNGFDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARMLGITNESVQNNLENYEKSLVAKVEEMQNELQ >LR134536|759222:767692|761785_762457_+|VEJ60847.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKSGVDAAYVDYRETTLDGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIIKEVKRFAKEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKITNNQTPFTHLYVKNENVVYPVAHGEGHYYCTDEIYRELNDNNQIILKYTNNPNGSYEDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETLLGTNSGVKLFESMVKSWREQNV >LR134536|759222:767692|759691_760819_+|VEJ60844.1|DBSCAN-SWA MNFSKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVIVLDPNEDCPCRYVAHQFIHANYDDEQALNQLGENSDVVTYEFENISSEQLKKLTQLYHIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLLEANTQIVPFVQIQTNQDLLKAIEKLGFPFIVKTRFGGYDGKGQILVRNDSELDEAYQLVEKQECVAEQYLDIQKEVSLTVTIGNEQQTTYFPLQENEHQNQILFKTVVPARSDKENEARKEVEKITRAIHFVGTFTVEFFIDKENNLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAITGQKLPQAIELLKPTVMMNLLGRDLDLLENEFSRHPDWHIHIYGKKERKPDRKMGHMTLLTDDVNQTEQYMLMKFEGRDK >LR134536|759222:767692|761523_761784_+|VEJ60846.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYEQVNDIRVGKVLYMTVNEPTDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVIDEKEKA >LR134536|759222:767692|766094_767126_+|VEJ60850.1|DBSCAN-SWA MSKAYEESGVNIQAGYEAVERITSHVERTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLKMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPSIIEQIVKGISDGCEQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDIAGFAVGAVEKEDYIDGSNVEEGQAIIGLASSGIHSNGYSLVRKMIKESGVQLNDQFNGQTFLETFLAPTKLYVKPILELKKHIDIKAMSHITGGGFYENIPRALPKGLSAKIDTQSFPTLEVFNWLQKQGNISTNEMYNIFNMGIGYTIIVDKKDVQTTLTTLRAMDTTAYEIGEIIKDDDTPIHLLEVE |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
986726 : 1066500
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134536|986726:1066500|DBSCAN-SWA 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94 | Staphylococcus_phage(41.86%) | portal,holin,protease,integrase,capsid,tRNA,tail,terminase,transposase,head | attL 1006985:1007044|attR 1039354:1039476 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1495264 : 1565338
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134536|1495264:1565338|DBSCAN-SWA 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62 | Staphylococcus_phage(78.95%) | protease,tRNA,integrase,transposase | attL 1523876:1523893|attR 1577015:1577032 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1583960 : 1656229
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134536|1583960:1656229|DBSCAN-SWA 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82 | Staphylococcus_phage(28.57%) | portal,holin,protease,integrase,capsid,transposase,terminase | attL 1585890:1585949|attR 1657437:1657518 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1751595 : 1767831
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134536|1751595:1767831|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134536|1751595:1767831|1761470_1761779_-|VEJ61787.1|DBSCAN-SWA MDWELRNLFDDLEVVQEKINDVVTSFVWFDDEYFTHEPNHMLTKKEIYTHGWKYHEHRIKNTQVIDLMLMYMKDFDDIMKQIREIEKASSDMNSLATRSDNA >LR134536|1751595:1767831|1757740_1758208_-|VEJ61782.1|DBSCAN-SWA MNMINKRPTQTFALNKQRLNHMDINQLKANNKPICHIYKTQGKYHYLEIDFITCDWCLSSLGQATLQSRLNTESIFLWLRGYNLKLNYNSVGHMTIYLRGDHLAIYYLLDEINKLTADAKYWQKYRDGKRMLEIDRNSHYVMPTHHIKGNTQKIS >LR134536|1751595:1767831|1763607_1763769_-|VEJ61793.1|DBSCAN-SWA MYLTVKEVSELLRLNEHHTYKLIREKEIPSIRLGRKILVPKQALMNMLKEKEA >LR134536|1751595:1767831|1762398_1762623_-|VEJ61790.1|DBSCAN-SWA MQQQVVITKSVVGWFNVKDVEGKLLLNIAPDVFKKYFPEVSPDISIACMELELNRIVELKEKKKEESERVGNGN >LR134536|1751595:1767831|1756920_1757559_-|VEJ61780.1|DBSCAN-SWA MVKTVQDKTINIFDNQIYDKGVKAKEVKQKYHQITKRIKQINGKITHYQNNDEFAEATKLKRQQADLEQELLKLDEQLKTSDYSITDDEFTSFYDAYDSEMKDIEKTHEQYRKEMKNKLQEVATIYRKMIENKNEAGRRISRERYVKQEKNNPGNIHNRYKGQMLAHEINLGDGDKYNEQTTPRGYAWRVEQALDAVSRDEFQKYHYGKKQW 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MDEVSLYKKHFEFHSNLDYINTANLSRIKEISKRINFASISTDKQVFDNKGNVYHRKKDDFAGDYINNLTLNYTIKPKEIGLVYGRIFVKTNDQDEKEAHFKSDHFNNYARFIADLISDKVIYSKELDNFLIVKNNQYEVIDDTNFKLSYPVEPKHQIDDFLDIMLELYRERLNLDHNYKIYPYSVAGNDFIYSCKTLKLTKDKPQDNELYAIKYDVNYKDLDFKTPNDFYDLVTDNDKSKHNLKLVHAYTMYRKMKLIQAEKWFLFKDFGRSGKGLFITTFNKLLHVNKVNFDGLVSGGFEAANEWMNFYGADIAHANETGEITKPMMRILRKIATGETISGRGIGRNAFTFKNKSVLILDTNESVDTGEITANTTRTIKIAFKDRPHGETDDERYKIFEPYWNFVQPNDEDSEVASVSFLITSLEYLKEIGREFRFKDVTLKHYFSEEELTETQVVMLKVLKQQGFILSGDETLKRLIEDDYTSLKYKNARQDMKKIGVGINKQMKIEGVNTKIHKVENAELFNMALSLITD >LR134536|1751595:1767831|1762962_1763604_-|VEJ61792.1|DBSCAN-SWA MIKQIFNDKEIRFIEKDDEYWAVASDVANVLGFRDAFNATKYLPEHVRGTLKGSTTSDKKKSRKFQNYTVINEKGIYRLVMRSNKPEAVDFQDWICDVLVELRQSTGLKGYEAFRMLDKEKQKEAMDNLKNGIEVISKKDYCKAQAISNKAVSNVFGFPKMIKKQDMTQEMLELRQQVLNDTVEFMVFVDKYNLPLSVKKHIYDKYNDKQQMA >LR134536|1751595:1767831|1759443_1759626_-|VEJ61785.1|DBSCAN-SWA MQRLIEEDYKSLRYNKAKIDMKKIGVGINNQKWIDGINMKVHEIENSELFNMALDLLDKG >LR134536|1751595:1767831|1751595_1752246_-|VEJ61774.1|DBSCAN-SWA MSYDDELNFLKKIISVIYERMTNYADTFVELRNNKINFKKKCVCDFLDDKNTYIDSELLDNVVVFKEIVKKENRILLIDEELELEIDKRIKNERSIYNKLLKYQAKNGKGKYPIIKCLNDLLGYRFTLQSDIDLNNVYNILNEYVYENFNGKIKIVDASKNDYKAIHLYFKIDNFCFPCELQIWLNKDHKNNKKSHKIYKQDYLNWEEYESELEKK >LR134536|1751595:1767831|1757518_1757728_-|VEJ61781.1|DBSCAN-SWA MNHRRIAHQILARLPTHVNNVSVRYIDSLVRRYARKKKDFSEIKRIINQKRKKAFNYGKNSTRQDNQYL >LR134536|1751595:1767831|1762634_1762949_-|VEJ61791.1|DBSCAN-SWA MFNINIDEDEARELLEQAINQRVDELAREKFFMTYKELAEYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEKITSHMDIHNNDLKQINVKKLLSTK >LR134536|1751595:1767831|1756452_1756908_-|VEJ61779.1|DBSCAN-SWA MLTTIKQSDNNVKYNKQKNRITVQALTTDKPVEMGTTQTVDPNYQTFKTYELDNNVFQALKDNDNLCVMLDNNKDSNILASIHRGNLTVVVNKGLYGLSIEVDDKPIMQEFIKLVQQNKVKSVQIYTDEVTSMNKLIEKIGKIKAISINTR >LR134536|1751595:1767831|1758207_1758483_-|VEJ61783.1|DBSCAN-SWA MQAVNEEYNLDEQAERIGLIVGISEEIYFCSISKVSTVYVEYINNRWVAWRESYVPNTNQRTSYKLITQGNFELVMARVKNYLTYIKRNKG >LR134536|1751595:1767831|1753353_1753644_-|VEJ61775.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYEPPKEELPLHEENINNFFSLDKPTTSIETSDNFEEHIFFNELSSVIENIGTDKEFVVFDLLAHGWSYEKIGEMLMVTGGRVRQIFSRLLDKLP >LR134536|1751595:1767831|1764581_1765757_+|VEJ61795.1|integrase|DBSCAN-SWA MASYDQISKNNWRYRISLGKNAETGKYEYISKTGFKRKSDAKHQAEMIERQLRNGEYIPPSSSTFKQVADDWLKQYANDVKVSSVRAREKAIQHAIEYFNTKPIQTIKKHDYQRFVDDMSTQYSKNYVDSIVASTNMIFKYAYDMKLIRVLPSEGIKRPKKKVSVEELEDSEINKKFLEKDELFQFLEVAKNHHSPLNSFEVFTTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTISITKTYYNPNNNKKHYQILTPKTESSIGKISVDPHVIQLLKDYKVNVQDTWKNEFYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASHKFSQLMENVSKELF >LR134536|1751595:1767831|1767546_1767831_-|VEJ61797.1|DBSCAN-SWA MLKPLGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIIAVGQGRLLDNGTQVAPQVSEGDTIVFQQYAGTEVKRGDKTYLILNEEDILAIIE >LR134536|1751595:1767831|1765871_1767491_-|VEJ61796.1|DBSCAN-SWA MAKDLKFSEDARQAMLRGVDKLANAVKVTIGPKGRNVVLDKDYTTPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQSMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVQVAIEALHEISQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMDKVGNDGVITIEESNGFNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMIAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQASRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLELKDASLDMLGTANKVEVTKDHTTVVDGNGDENNIDARVGQIKAQIEETDSEFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYQKVSEIKAEGDVETGVNIVLKALQAPVRQIAENAGLEGSIIVERLKHAEAGVGFNAATNEWVNMLEEGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEPENNEQPGMGGMPGMM >LR134536|1751595:1767831|1761793_1762000_-|VEJ61788.1|DBSCAN-SWA MAAKLDVNKQNIMHAINWIIKNEEEIIFESQSQLSFFSREDLEKIDYCKRTLESLIEAKEIYNKQKIS >LR134536|1751595:1767831|1763921_1764569_+|VEJ61794.1|DBSCAN-SWA MEHFNLGSFLRRKREEKGLTTRDLGKKIGYSYSYIAGVEKGHKVNPSVAFLENYIYAISKNIHEISQIKEEISKGTKGKYYPDFLNVKKNSAQEIESNQSMIKAILNESSPNVMFYEENGLIIDKYFKLPMNDVAFHLNDKYNEKYFRKIKMTDEDRKYIYNLINEYFIRKVEIQLQEIKHNKRNKNIDGEVADNYIKEYEELIKKLNDPNDLKY >LR134536|1751595:1767831|1762004_1762409_-|VEJ61789.1|DBSCAN-SWA MEIKQKYQLSKVVKVLEKVLYEKDKDVFLSAKDRFHSITDYRYDDTAFYEHILKLIHKELFNILVELDFEDEAFYILDEVTMTLSDVMNEDKEIYYYTVTDSTGEHEHTTDREGHVIGILEWALDYIVGNIEVE >LR134536|1751595:1767831|1753676_1753994_-|VEJ61776.1|DBSCAN-SWA MRGLKSFDYKILSGYMENYQTLVDEYKTKASQMTEQRYNRVNSIIKGITQVYNNATLQEQQLINMLWWNKQPYDIIADVLGITEYTIKHAREVLLRRVAKRSIYL >LR134536|1751595:1767831|1753990_1754524_-|VEJ61777.1|DBSCAN-SWA MLKKSKNTFSDEREERISEYELLVKYNPQFINRKCQALEEQINAMYHLNISHMTCDEAMGVVFTSYPLDKLVIWIVEKKEKLERYKNQSLERMNLLKSIVNTYPYHEQQEIMHYMRTNGVYKPYRSIEKLCEDLYKATYKARLIRQRDHLKEQRKYFDEEVEKVRTTLQTQREELVI |
24 | uncultured_Caudovirales_phage(63.16%) | integrase,transposase,terminase | attL 1749197:1749215|attR 1765871:1765889 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1778676 : 1850520
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134536|1778676:1850520|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134536|1778676:1850520|1781466_1783005_-|VEJ61811.1|DBSCAN-SWA MRTNEHNFHNIEEEIKHVAVYLRLSRGEDESELDNHKTRLLNRCELNNWSYELYKEIGSGSTIDDRPVMQKLLTDVEKNLYDAVLVVDLDRLSRGNGTDNDRILYSMKVSETLIVVESPYQVLDANNESDEEIILFKGFFARFEFKQINKRMREGKKLAQSRGQWVNSVTPYGYIVNKTTKKLTPSEEEAKVVIMIKDFFFEGKSTSDIAWELNKRKIKPRRATEWRSSSIANILQNEVYVGNIVYNKSVGNKKPSKSKTRVTTPYRRLPEEEWRRVYNAHQPLYSKEEFDRIKQYFECNVKSHKGSEVRTYALTGLCKTPDGKTMRVTQGKKGTDDDLYLFPKKNKHGDSSIYKGISYNVVYETLKEVILQVKDYLDSVLDQNENKDLVEELKEELMKKEDELETIQKAKNRIVQGFLIGLYDEQDSIELKVEKEKEIDEKEKEIEAIKMKIDNAKTVNNSIKKTKIERLLSDVQSAESEKEINRFYKTLIKEIIVDRTDENEAKIKVNFL >LR134536|1778676:1850520|1789277_1792187_-|VEJ61822.1|DBSCAN-SWA 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>LR134536|1778676:1850520|1805475_1805571_-|VEJ61847.1|DBSCAN-SWA MNLVKIYIITNLENNMVYNGQINMLLNSKNS >LR134536|1778676:1850520|1797716_1797908_-|VEJ61834.1|DBSCAN-SWA MFDNPEDFDWSKLHWQADWNGEDLGFPDRNVVGHYTYHDLNLYIDTENLEILQAWFGDEEDEL >LR134536|1778676:1850520|1832055_1833822_-|VEJ61899.1|DBSCAN-SWA MKVKLKGEYTPNLDPLEYILSNRGIKEEDYEKYISPTEELQPDWKKLEDIEEGVKSLKSKIDDDNAKIGILIDADQDGLASGSIMYKFLTKQLQFDKERIIVIPPLNKSHGINIERVLEHGMTSGDILITPDSASSDFEQHEELYNKGINTLVIDHHLAPKNKDSKAIIINNQLSDEFENKALTGSAMTYLFCVAYCELLGIDLTVNLKDLAAIGLVADRANFAHDLGAYYMMRDGLRKENIDSLMLKMIINKSSNLEQGVDLNAKDIGFNVAPTINAVFRMGTQDELTQVIHGMCEFDYTIHNKRKKMDLHISEEAYLRAMAVKRRQKKQENEVLDKIKERIKEKGSDKHKILIVNSTGIVENNGLNGLIAMKLAREYGRPVLMVKRIGEYFKGSGRNINNSPIPDLNKMLTDTGLFTCKGHANAFGVEFHVSDALEVLKAIESELIDVNLSDIEYEADFQWTNNLDSNIIHTLANNKDMWCNGIDEPLIHLKNILVRKENIKLIGKTGNTLKINVNGIDCVKFFLKEEQKNEIVTAPDIMYFDLICTASVNSFRGMNTPQLMIEEYSISDAKDHVENYLCEDELPF >LR134536|1778676:1850520|1807793_1808354_+|VEJ61850.1|DBSCAN-SWA 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115 | Staphylococcus_phage(98.23%) | integrase,transposase | attL 1800068:1800089|attR 1850540:1850561 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1854414 : 1910906
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR134536|1854414:1910906|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(97.5%) | holin,integrase,tail | attL 1852337:1852355|attR 1915713:1915731 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2236363 : 2246796
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LR134536|2236363:2246796|DBSCAN-SWA ATTAAACTGAGTCAAAAGTAGTTTCATCATAATATAGACAAATACGTTGTCCCCTTATCTCCTCTATACGTACTTCCATTTCATATAAACTTTTTAAAATGTCAGACTGAATAACATTATCTTTATCATCAGCTTTAACTAGCTCACCTTGTTTAAGCGCAATGATGTCGTCTGAATAACAAGAAGCAAAGTTGATATCATGTAATACGATAATGATTGTTTTATTTAACTGACGACATAAATCTCGTAACGTTTGCATAATCTGTACTGAATGTTTCATATCTAAATTATTTAAAGGCTCGTCTAATAATATATAATCAGTATCTTGTGCTATAGTCATAGCAATATATGCACGTTGTCGCTGACCTCCAGATAGTGTTTTAATATTACGATGTTTAATTTCATTAAGCTGTAATAAGTCAAGAGCATATTCCACTTTGTCATAGTCTTCTTGCTTCATTCGACCTTTTGAATATGGAAAACGACCAAATTTAACTAGTTGCTCGATAGTTATGTTCATATCAGTGTGATTAGATTGTTTTAAAATACTTAATTTTTTAGCTAAATCGTCAGTTTTATATTCTGAAATTTCTTTGTCTTCAATCAAAATTGAACCGTTCTCATAACTAAATAAGCGACTGATAGCAGATAATAATGTACTCTTACCAGCACCGTTAGGACCTATGAGTGAAGTCAATTTTCCCTTTTTAATATCTACGCTAATATCTTTTAAAATAGGTTTATTGTCTATCGTTTTATCTAAATTTCGAATTTGAATCAATTTGCATTTCTCCTTTTGACAAGCAAATATATGAAGTAACTTCCACCAACTAAATCTACTATCAAACTGAATTCAGTTGTTGCTTCGAATAGATTTTCAACTACCCATTGCGCTATAAATAAACTAATCCAGCTGAATAATATTGTTGCCGGTAAAATAAATTTGTGTTCATAGGTCTTCATAAATTCGTGTGCTAAGTTGACAGTTAATAAGCCAAGAAATGTTACAGGACCTATTAATGCAGTAGATATAGAGACGAGTAAAGCAACCAAAATAAGAAACATACGCGTCATATTCTCATAAGAAACACCTAGATTAATTGCTTGTGCTCTACCTAACAAAAGAACATCTAAATATGGTCGAAGTATTATTGTAACAATTATTAATATAACTAATAATATGCCTGAAACAGTTACTAATTTAGAATTTGATGCTTCAAAGCTAGCAAACATAACATTTTGAACTGCTAAAAAAGATTCAGGATTCATTATAAGTTGGAGAAAACTTGTAATACTACGGAAGAAAGTTCCTAATATTACACCAACTAGTAATATGAAATAGACTGAAAAGTGACCTAGTTTAAATATAACTTGAAATAATAGCAATGAAAAAAACACCATTGCGATCAAAGTGATTAAAAAATTAAGGTAGATATTTGTAACAACAGTTGCTTGTTCACCTAAAATAAAAATAGGTAAGACTTTGACAAATAAATACACAGAATCAAGTCCCATAATAGAAGGAGTTAATAATCTATTTGTAGTAATAGATTGGAAAATAACTACGGACGTTCCTATCGATGCTCCTACTAATAATATAAGAATAAATTTTTGAAACGGCTTTGGAATTGATATTCAAATATATCAAAATCTAAACCTACCAATAAATAAAAAATTGCCATACAAATTGCCATAACGACCAGTATACTTATTTTTTTATTAGCGCTCATTTGCATAATTTTTCCTACCTTTCATTAGCAAGATTAGGAAAATAATTGTGCCAAATACACCTATCGTCAATCCAATATTAATTTCGTAAGGGTAAACAATTATTCTACCAATAATATCAGCAATTAAAACAAAAATTGCACCGAGCATAAGCGTGTGTGGTAAAGCATTTTTCAAATGATCGCCTCTATAGATAGATATGATATTCGGTACGATTAAACCTAAAAATGGTAATGTTCCAACAGTAACAACAACTAATGCTGTTAGCGTTGCTGTTATGAATAATGCTATTTTAATGATTTTTTCATAACTTACACCTAAATTATGACTAAAGTCTTTTCCCATACCTGCAATAGTAAAATGATTTGCAAATACAAATGCCAAAATAAGTAATGGTATTGTGAGATACAACACCTCAAAACGACCACTCGTTATAACTGCAAAGTTACCAGTTAACCAGTTTCCAATGCTTTGTAAAGCATTGGTTCTCAACGCTACAAATGTAGTAAAACTGGATAAAATACCACCAATCATAATGCCTAAAAGTGGAACAAAGATTACATCTTTTACACGGATAAGATTAATTAATTGGACAAATAAAAACGTTCCAACAATACTTAGAACAACAGCAAATAATAATTTGATTAAAATGGGACCATTAGGAAAGAACAACAATGACATTAAAATACCTAATTTTGCCCACTCCATAGTACCAGCAGTCGTTGGGCTTACAAATTTATTTTGCATCATCTGTTGCATAATTAATCCTGATAAAGCTAGTGAACTACCCGAAAGTAGAATACTAACTGTTCTGGGAATTCGACTCGAAAACAAAATGTTTATTTGTTCATCACTTAAATGGAAAATATCTATTAGAGAGAGCTGACTCACCCCTATAAATAAAGAGACAATAGTTAAAATCACTAATAAAATAAATAAGGTATAACCTTTAAAAATAAATTTCATTAGTTAATCTCCTTGCTAAATATTAAAGATGTATAAGGTCAATATACGAAAGTAATGATAATGATAATGATTATCATTAACATCAATATTATAGACTCTATTTTCTTTTTTCAATAGTTTTTTCATATTTTTTGGGAATTTTATAAATGTTTTATCCAGCAGTAATAATACATCAAAATATTTTATAATACCAACTTTCATAAAAAAAGAGATTCCTACTAATTTTAATAGAAATCTCTTTAAAAGTACTATATTAATTATCAAAAACAAAGTCTTCATCACGTAGAGGCTCAACATTTAAAGCCAATGTATAGCCATCACCTTTAACAGAGAAGAAATCGTGGTTCTTTGTAGATGTATCTAGTGCATTTTCAATAATAGGGTTAAACTCTCTCTCTTCGAAATATGGTTCAAAACCTAAATTCGATAATGCTTTATTTCCATTATATCGAACATAATTTAATACATCTTCAGCAAGACCAATATCATCATATAATAAATGTGTATATGAAACTTCATTATCATAAAGTTCATTTAATAATTTGTACATTTCTTGATCAGCTTTTTGTTTCTCACTTTCAGATAACTCATTACGTAGACTTTGTGCATCTAAACCTGTGAACACTCCATGTATAGATTCATCTAAAAGTATCTTACGTATAATTTCACCTGACGTAGTCATTTTTCCTTGTCCTGCGAGATATAATGGATAATAGAAGCCAGAATAGAATAGAAATGTTTCTAAGAATACACTAGAAACACGAGCAATATATTGATCGTAAATCGATGCTTCTTTACCCCAAAGTTTGTGGTAATTTTCTACAATTTTATCTGATTTATATTTTAAATGTGGCTCTTCAATAACCCAAGTATCCAATAAATAGTTGGTTTCACTAGATGGTAATAATGTAGTGAAGATATGAGAATAACTTTTCGCATGGATTTGTTCCATCATAGCCATAAATGAATAAACAGCTTTCTTTCTTAAATCAGTAGTATGAAGCATGATTAATGGCATACCATCATCAGCTTGATGTGTATCTAAACCTGTTAAACCTGCAAGCGCTTTTTTAAAAGTATTTTTCTCAGAATCTGTTAATGTTTTCCAACTTGCTATATCTTTTGATACTTTAAATTCTGTTTCCACCCACATTTGTGAGATATTTTGACGCCAGAACATATTAGTCATATCTTCTTGGGTGTTCCAATTTACCGCCTTCATTAAAATCCTCCTGTCATATTTATGTATAAAATAAAGAGTTTTGAACCAATGTAAATCTATAATTTAAAGAAATACATCAATTCATCACTCTACTCTAAAATCTTTACAACTTAATCAATTAAATCGCACAACTTGTACATTCTTCCACACTTAATAATTTATTACGTGTATAGTATAAAGATTTAAGGCCTTTATGGTGTGCATATACATATAATCTTGAAAGTTCACGTGTTGAAATTTCTGAATTAACATAAAGTATCGTTGAAATACCTTGGTCTACGTGAGTTTGAATTGTAGCTACTAAGTCAATAAGTTTCATTTGGTCAGTATTAAATGCTGATTTGTAGTACCACATTGTTTCTGGTGATAAAAATGGCATTGGATAAAATGTTTCCGCATTTCCATACGTACGACGTTCAATTTGGTCAACAATAGGCATAACAGAACTTGTCGCATTTTGAACATAAGAAATACTTTGAGTCGGAGCAATAGCTAATCTATAAGCGTGATAAAGTCCATATTGTTCTACTTTATTTTGCAATTCTTTCCAATCATTTGAAGTAGGTATATCGATACCATCAAAAAGTTGGCGAACCTTTTCAAATTTTGGTTCAAATTCTTGAGATGTATAGAATTCAAAATATTTACCATTTGCATAGTCTGATTGCTCAAAGTCTTGATACTTTTCTCCACGCTCTTTTGCAATTTCCATTGAACGTTCGATGGAATAATAGTTCATAATCATAAAGAATATATTAGCAAAGTCTTTTGCTTCTTCAGATTCATAGCCAATTTTATTTTTAGCTAGATAACCATGTAAGTTCATTACTCCTAGTCCAACAGAATGTAGTTCACTATTCGCTTTTTTTACACCTGGTGCATTTTGAATATTTGCTTCATCACTTACAACTGTAAGAGCATCCATACCTGTGAACACAGAATCTCTGAATTTACCTGATTCCATAACATTCACTATATTCAATGAGCCTAAGTTACATGAAATATCTCTTTTAATTTCATCTTCAATTCCATAGTCGTTAATTACTGATGTCTCTTGTAATTGGAAAATTTCAGTACATAAATTACTCATTTTAATTTGCCCAATATTTGAATTCGCATGTACTTTGTTTGCATTATCTTTAAACATAAGATATGGATAACCAGACTGTAATTGTGTTTGTGCAATCATATTTAACATTTCACGTGCGTCTTTTTTCTTTTTATCGATATTAGGGTTTGCAACCATATCGTCGTAATACTTTTCTAAATCAATATCATCTAAAGTCACACCGTATTCTTGTTTAACTGTATGAGGTGCAAACATATAGAAATCTTTACCCTCTTTAGCCAAATCAAAGAATTTAGAAGGTACAATAAGACCAGTCGAAATAGTAGATAAACGTAAATCTTCATCTGCATTCACTTTCTTAGTATCTAAAAACTCTTCAACATCGTAATGGAAAATATTTAAGTACACTGCCCCAGCGCCAGGACGTTGTCCTAATTGATCTGCATAACTAAATCCACCTTCAAGTGCCTTAGCAACAGGTAAAACACCTTTAGCTACACCTTTAATTCCTTTAATTGCTTCTCCACGTGCACGAAGTTTCGATAAATTAATGGCCACACCACCACCAATTTTACTAAGTTGTTTTGCAGTTGAATCAATGAAATTGATAGAATTTAAGCTATCGTCTACTTCTAATAAGAAACATGAAACAAGTTCTCCACGTCTTGCTCTACCTGCATTCAAGAATGTTGGTGTCGCCGGTTGATAACGTTGTTCCACCATTGCAGAAATAAATTGTTTTGCTTGTTTAACATTACCATTCGCTAAATAAAGTGCAACGATTGCGACGTGCTGATTATAATCCTCAAGAAACTTAGTTTTATCATTCGTTTTTAAAGCGTAATCCTTATAAAACTTACTTGCCGACATATAACTAGCAAATTGGAAGTGAATTGATTTTGCGTATTCAGTAATTTCAATTAATTCTGCTTCGCTATATTTTTCGAAAACATTAAAATAAAAATTATTATCAACAAGATAATGAAGTCTTTCGATTTCATCATCAAAAGAAATCATTTTATCATGGATTTCTTCAAGATACACTTTCAATGCTTCTTGATCTTTCTCTAAATCAAAGAAACCATTGTCTTTTCTCTTGGTCACTTCATTATTTAATTCAATATGATTGTATTTCTTTTCTTCCATGGTTTTCATTGAAATTGCCCACCTTATCCTTAAATTCAATAATGTCTTTATTTGTCCCTTGTACTTCAAACTTCATCATTAATGGAACTTTATATTCCTCAGAAATTGTATGGCCAGCTTTAGCGAAATTTTGTCCCCAATTTCGATTTCCACTCGCAGCAACAGCTTGTAACTGAGTATGATTTACATTTAAAAAAGATTGAACCGGCTGCGGCACCTCTCCAAATCCAATAGTGCCAGTAACTAAAATGTAGGGTTCATTAACTGATTCGTTACAATTATCTTGAGTAATTTCAAATGTATCTTTAATACCAGCACGACTAATAAATCGTCTAACATTACCAGAAAATGAATAATATACTACTTTCATTGAATCACCTTCTTTCGTCAACCATTGATTCAGCCAAAAGTAGATTAGAAATGATTAAATATCTTTAATATAATTTAAATCATCTACTTATAAAAACAGTTGAAAATAGTTACTTTTACGTAAAATTTTTTCAATCTGTAAATAGCCTTTAAAATATATAAATAACCACAATATATAGTGGTTAAAACTTAAATTTGCACTACATGATAAATTATCTTTTTAGTAGGGTTTTACTATAATTGCAATATTTTCGAGATAAAAGTAGTGTCAAATTGCATTAAAATGATTAAATTCTACAACGTTAAATTCTCAGCTAAACACTATATATAGTGTTTGCATTTCTAATTTGATACTATATTCTGTGTTTCATTATACATAACTCATATCACTAATGAAAGTTAAAAATTGATGGCAGAAACAACCTATCATTTGGAAAGTGCATCACTACGAGATTAGTGTCATTATTTTAAAATAAAAAAATTTTTTTGAGTGTCTTTACTTGCTTTTCTATTGAAATTAGACATATAGGGTTAAAAGAATAGTTACGTAAATTTCTACAATAACAGATATAAATTACATTTTTAAAAACATGATTCTAGCTTTTTATTAAATTGCGCATAAGAAATAACAATCTTTAAAAGCGAACATTTGTTCGTTTTTTATTATAGCTCGTTTCCATTGAATTATCAAGAACTTATGCATAGTTAGATTTTATATGCTAATATAATGTCGTTAATCATATAATATTGAGGCGATGATATTGAATTCAAAAGTTAAAGGTATTATTGCTATATTGATTTCAGCTGTGGGTTTTAGTTTTATGTCAGTCTTTTTTAGATTGGCCGGTGATTTACCAGTCTTTCAAAAATCTCTAGCTAGAAATTTTGTAGCCATGTTTATACCATTATTTTTTATTTATAAATATAGGCAACCTATGTTTGGAAAATTAAGTAGTCAACCCCTACTCATCTCACGTTCAACACTTGGGTTAATTGGTGTCTTACTTAATATCTACGCAATTGATCACATGGTATTAAGTGATGCTGATACATTAATGAAATTAAATCCTTTTTGGACAATTGTTCTTAGTTTAATTTTTTTACATGAAAAGGTACGAAAATATCAAATCACGGCGATGATTATTGCTATAATAGGGATGCTATTAATTGTTAAACCAGAATTTTCATCATCAGTTATTCCTTCAATAGCAGGATTACTATCCGGTATTTTTGCAGCTTCTGCCTACACATGTGTTAGAGCACTCAGCACTCGTGAAAAACCTTATACGATAGTGTTTTATTTTTCATTATTCTCAGTTGTAGTTCTTATACCTTTTTCAATATTTACTTATACACCTATGACAACAATTCAAATTCTTTTCTTACTCGGCGCTGGATTATCAGCAGCTGTAGGACAAATTGGTATAACATTGGCTTATAGTTTTGCTCCAGCAAAAGATATCTCCATCTTCACATATGCGTCTATAATATTTACTGCATTATTTGGATTTATTCTGTTTGGAGAATCACCTGATATGTTTGCAACAGTAGGATATATTGTCATTATCGGAGCAAGTTACTATATGTTTGATAAAGCAAGACGTGAAACAACTATAAATCAAAATAATTAAAGGAGCTAGAAAATTGACACAAGGACGTCAAAAAGATGAATTAAAAGATATTACTTTATTAGGCAATCAAAATAACACTTATGAATTTGATTATAGACCGGAAGTTTTAGAAACTTTTGATAATAAGCATCAAGGTCGTGATTATTTTGTTAAGTTTAATTGTCCTGAATTCACATCACTATGCCCTATTACGGGTCAACCAGATTTTGCGACAATTTATATCTCGTATATCCCTAATATCAAGATGGTGGAATCTAAATCATTAAAGTTATATTTATTTAGTTTTAGAAACCACGGAGATTTTCACGAAGATTGTATGAATATTATTATGAATGATTTAATTAATTTAATGGACCCACATTATATTGAAGTTTGGGGTAAATTTACTCCGAGAGGTGGCATTTCCATAGATCCTTACACGAATTATGGTCGTCCTGATACAAAATATGAAAAAATGGCTGAACATCGATTAATGAATCATGACATGTATCCAGAAAAAATAGATAATCGTTAATATATATTTTATAAAAATCTCTACTGTTATATTTGATGGTAGAGATTTTTTGTTGCACTTTGCTGCATTAAAGCGTATTTTATATATAGCGCGTCATTGAATAAATATAGTAATAAAATTATTGAAATTATATCATCGGATTAAATGTTACAGATTATATCAATTGACAGAATTTTCTTTTTTTAAATTTTTTGAAAATTATTGAAATTTTTTTATCACAATAGTAAAATCACCTTAAAACAATTTAATAAGGTGATTTGGGCAAGAAAGGTTGGGATGATTTATGACTTCAAATAAGTCCCATGAAAAAGCAGTTCAAGAAATACCACAACATGGATTCTTCGGGCATCCAAAAGGATTAGGCGTTCTCTTTTTCGTAGAATTTTGGGAGAGATTCAGCTATTACGGAATGAGAGCAATGCTTATTTTTTATATGTATTTTGCACTCCAGGAAAACGGACTTGGAATGGACAAAACAACAGCCATGTCTATCATGTCTGTATATGGATCATTAATTTATATGTCTTCAATTCCAGGTGGCTGGATAGCTGATAGAATTACAGGTACCCGAGGTGCCACATTAATCGGAGCTATATTAATTATTATAGGTCACATATGTTTAAGCCTTCCTTTTGCAATGGTAGGTTTATTCACTTCTATGTTCTTTATTATTGTAGGATCAGGTTTAATGAAACCAAACATTTCAAATATTGTTGGTAGACTCTATCCAGAAAACGACGTACGCATGGATGCTGGATTTGTTATCTTCTATATGTCAGTGAACATGGGTGCACTCGTTTCACCAATTATTTTACAACACTATATTGATATTAGAAATTTCCATGGCGGCTTCTTGATTGCAGCAATAGGGATGGCTCTTGGATTAGTTTGGTACTTACTATTTAACCGAAAAACTTTGGGTAGTATCGGTATGAAACCGACAAACCCATTATCTTCTTCTGAAAAGAAAAAGTACGGAACAATCATCGGAATCGTTGTTATAGCAATAGTATTAATCCTTATGATTGCTTACTTTACGCATACGCTATCATTTAATTTAATCAGTAATACTGTTTTAATTTTAGGTATTGCTTTACCAATCATTTACTTTACAACAATGATTAGAAGTAAAGAAGTTACTGATACTGAAAGATCAAGAGTAAAAGCATTTATTCCGTTATTCATTTTAGGCATGTTATTTTGGTCAATTCAAGAACAAGGATCTAATGTATTAAATATCTATGGTATTGAAAACTCTGATATGAAATTAAATTTATTTGGTTGGAAAACACATTTTGGTGAAGCTATTTTCCAAACCATTAACCCATTATTTATTTTATTATTTGCACCCGTGGTTACTCTTTTATGGCAAAAGCTAGGAAAGAAACAACCTAGCCTACCTATTAAGTTTGCAATTGGTACTATTTTAGCAGGCGCATCCTACATACTTATGGGAGCAATCGGTCATATTTATGGGGATACACAATTCTCAGTTAACTGGGTTATTCTTTCATACGTTATCTGTGTTATTGGTGAGCTTTGTCTCTCTCCAACTGGTAGTAGTGCAGCAGTTAAATTAGCACCTAAGGCATTTAACGCACAAATGATGAGCCTTTGGTTATTAACTAACGCTTCAGCTCAGGCCATTAACGGTACATTAGTTAAATTAATTAAACCACTTGGTCAAACCAATTACTTTATCTTCTTAGGTGTTGTTGCAACCGTGATTACGTTAATTATATTAGCGTTTATTCCTAAGATTTCTAAAGCAATGAAAGGTATTCGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >LR134536|2236363:2246796|2240396_2242502_-|VEJ62300.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRKDNGFFDLEKDQEALKVYLEEIHDKMISFDDEIERLHYLVDNNFYFNVFEKYSEAELIEITEYAKSIHFQFASYMSASKFYKDYALKTNDKTKFLEDYNQHVAIVALYLANGNVKQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKALEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNIDKKKKDAREMLNMIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSVINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVFTGMDALTVVSDEANIQNAPGVKKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMIMNYYSIERSMEIAKERGEKYQDFEQSDYANGKYFEFYTSQEFEPKFEKVRQLFDGIDIPTSNDWKELQNKVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLVATIQTHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >LR134536|2236363:2246796|2245290_2246796_+|VEJ62304.1|DBSCAN-SWA MTSNKSHEKAVQEIPQHGFFGHPKGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYFALQENGLGMDKTTAMSIMSVYGSLIYMSSIPGGWIADRITGTRGATLIGAILIIIGHICLSLPFAMVGLFTSMFFIIVGSGLMKPNISNIVGRLYPENDVRMDAGFVIFYMSVNMGALVSPIILQHYIDIRNFHGGFLIAAIGMALGLVWYLLFNRKTLGSIGMKPTNPLSSSEKKKYGTIIGIVVIAIVLILMIAYFTHTLSFNLISNTVLILGIALPIIYFTTMIRSKEVTDTERSRVKAFIPLFILGMLFWSIQEQGSNVLNIYGIENSDMKLNLFGWKTHFGEAIFQTINPLFILLFAPVVTLLWQKLGKKQPSLPIKFAIGTILAGASYILMGAIGHIYGDTQFSVNWVILSYVICVIGELCLSPTGSSAAVKLAPKAFNAQMMSLWLLTNASAQAINGTLVKLIKPLGQTNYFIFLGVVATVITLIILAFIPKISKAMKGIR >LR134536|2236363:2246796|2242464_2242863_-|VEJ62301.1|DBSCAN-SWA MKVVYYSFSGNVRRFISRAGIKDTFEITQDNCNESVNEPYILVTGTIGFGEVPQPVQSFLNVNHTQLQAVAASGNRNWGQNFAKAGHTISEEYKVPLMMKFEVQGTNKDIIEFKDKVGNFNENHGRKEIQSY >LR134536|2236363:2246796|2244506_2245007_+|VEJ62303.1|DBSCAN-SWA MTQGRQKDELKDITLLGNQNNTYEFDYRPEVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLINLMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDTKYEKMAEHRLMNHDMYPEKIDNR >LR134536|2236363:2246796|2243623_2244493_+|VEJ62302.1|DBSCAN-SWA MNSKVKGIIAILISAVGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNFVAMFIPLFFIYKYRQPMFGKLSSQPLLISRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADTLMKLNPFWTIVLSLIFLHEKVRKYQITAMIIAIIGMLLIVKPEFSSSVIPSIAGLLSGIFAASAYTCVRALSTREKPYTIVFYFSLFSVVVLIPFSIFTYTPMTTIQILFLLGAGLSAAVGQIGITLAYSFAPAKDISIFTYASIIFTALFGFILFGESPDMFATVGYIVIIGASYYMFDKARRETTINQNN >LR134536|2236363:2246796|2238081_2239056_-|VEJ62297.1|DBSCAN-SWA MKFIFKGYTLFILLVILTIVSLFIGVSQLSLIDIFHLSDEQINILFSSRIPRTVSILLSGSSLALSGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILMSLLFFPNGPILIKLLFAVVLSIVGTFLFVQLINLIRVKDVIFVPLLGIMIGGILSSFTTFVALRTNALQSIGNWLTGNFAVITSGRFEVLYLTIPLLILAFVFANHFTIAGMGKDFSHNLGVSYEKIIKIALFITATLTALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKNALPHTLMLGAIFVLIADIIGRIIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYANER >LR134536|2236363:2246796|2239309_2240278_-|VEJ62299.1|DBSCAN-SWA MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTDSEKNTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKSDKIVENYHKLWGKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQSLRNELSESEKQKADQEMYKLLNELYDNEVSYTHLLYDDIGLAEDVLNYVRYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTSTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEPLRDEDFVFDN >LR134536|2236363:2246796|2236363_2237143_-|VEJ62294.1|DBSCAN-SWA MIQIRNLDKTIDNKPILKDISVDIKKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAISRLFSYENGSILIEDKEISEYKTDDLAKKLSILKQSNHTDMNITIEQLVKFGRFPYSKGRMKQEDYDKVEYALDLLQLNEIKHRNIKTLSGGQRQRAYIAMTIAQDTDYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRDLCRQLNKTIIIVLHDINFASCYSDDIIALKQGELVKADDKDNVIQSDILKSLYEMEVRIEEIRGQRICLYYDETTFDSV >LR134536|2236363:2246796|2237139_2237862_-|VEJ62295.1|DBSCAN-SWA MYLFVKVLPIFILGEQATVVTNIYLNFLITLIAMVFFSLLLFQVIFKLGHFSVYFILLVGVILGTFFRSITSFLQLIMNPESFLAVQNVMFASFEASNSKLVTVSGILLVILIIVTIILRPYLDVLLLGRAQAINLGVSYENMTRMFLILVALLVSISTALIGPVTFLGLLTVNLAHEFMKTYEHKFILPATILFSWISLFIAQWVVENLFEATTEFSLIVDLVGGSYFIYLLVKRRNAN >LR134536|2236363:2246796|2237951_2238098_-|VEJ62296.1|DBSCAN-SWA MQMSANKKISILVVMAICMAIFYLLVGLDFDIFEYQFQSRFKNLFLYY >LR134536|2236363:2246796|2239071_2239257_-|VEJ62298.1|DBSCAN-SWA MKVGIIKYFDVLLLLDKTFIKFPKNMKKLLKKENRVYNIDVNDNHYHYHYFRILTLYIFNI |
11 | uncultured_Caudovirales_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2268224 : 2278760
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LR134536|2268224:2278760|DBSCAN-SWA ATTATAACCGCTCCAAAATTTTAGTTTTATCGTGAAATTCCTGAACTTCATTTTCGGGTACTGAATCAATTGTTATACCAGCACCCACCCCATAAACCGCTTCTTCATGATTATACTCAATTGTCCGTATAGGGATATTAAATATCATCCTTTGGTTTGGAAGTAATAAGCCAATTGTTCCACAGTAAATGGATCTTGGCATGTCCTCCAACTGAGCTATATATTGCATTGTATTTATTTTTGGTGCACCTGTAATAGAACCACAAGGAAAGAGCGCTCGCATCATATCTATCAATTGAATGTCATCTTGTAATCGGCCACACACTGTACTGGTCATTTGGAAAACTGTGTCATATTTCTCAATCGAAAACAATTCAGGTACATCTATAGTTCCACTTTGAGCAATTCTTGTAATATCGTTACGTAATAAGTCTACAATCATCACATTCTCCGCCATATCTTTAGAGGAGGTTTTTAAATTATTATAATATAGCTCATCTTCTTTAACATTTTTCCCTCTAGGCATAGTCCCTTTCATCGGCTTACTAACAATCATATTTGATTTACCTTTATAGTCACCTTTTTGAAAGAAAAGTTCAGGCGATATTGATGCTACTTTTATATCAGGTGTGTCCATTAAAACGGTATAATTACCATTTTGTGACATAGTAAGTTGATAATATAAGTGACTTATAGGACAGAAAACTTCTGCTTTTAAGCGGGTTGTGTAATTCACCTGATACGTTGCCCCTTCAATAATGGCTTTATGAATCGATTTGATCTTGTTAATCATCGCTTTATCACTTTCACAAAAATAAAATCCTTCAGTTTTTATATGATTTTTATTGGGCATTACTTTTTTTATATTTTTTATCGAATTGACCGATTTAAATGAATAAGCTGCAGCAAAAATATGGGATTGTTTCACATTATTGACCACCATTTCCTTATTAAAAAAAGGTGCTGCTTCATAAGTAACATAAAGTGCAACATAGCTTCCGTTACGTTGTTCTTGTTCTGCAAAGTGAATGACATCCCCTACTTCATCAAGACGATATGCAATTTTAGAATCTTGAAAGTTATCCATTTCTAATTGATAGTCTTCATAGTCCTTTTCATTTTCATAATAGCGATACTTAAATTCAATGTGCATATTTAACCCCTACCTCGGTTAAGAATAAATTTAATTGTTCGTGACCATATTCACTTAGTATAGATTCAGGATGATACTGTAAACCATAAATAGGATACTTATGATGTGCAACAGCCATAATAACATTCTCGTTGTTCAGAGCTGTGACTTTTAATGCGCTAGGTATTGTAGAGGGGTCAGCCATAAGTGAATGGTATCGCATCACGTTAAAATACGATGGTAGACCTTTAAAAATACCCTCATTGCTATGCCTTATCTTGGTAATATGTCCATGAATAGGTTTATCATTATGAATAATGTTTCCTCCAAAGTATTCAATGATTAATTGAAAACCTAAACAGACGCCCAAAATGGGAACGTGACGGTGAAATATTTCTAATACGGATGATAGTATTGGATAATCACTAGGTTTCCCAGGTCCAGGTGAAATGACAATCGCTCTCGGATTCAATGCATCGAGATGCTGTGTCATCAAATCATTTACAGAAATGATTTTCACTTCTTCAGTAGTTTGTACTTTAATATAATCTATTAAGTTATATGTAAAGGAATCTTGATTATCTATCATTAAAATCATATTCATACCTCAATTATCGATAAAGATTGTTAATTATTATAGTTGTTACTCTCTATTATCACAGAACATGACTTGATTTTATATAGCATTTCGTTTATTCTATGTTCCGTGCAAAATAATAACAGAGGTTCCTAGCCGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATGAAAATTTCAACAATGAATTTCTTCATATTTATAATGTTAAGACTATATATGTCTTTAATATTTCTGTCTATCTTTTTTATAGAGATAGACTTTTTTTATGCAAAATTATCACAATGATGAGGAGTCATATCAATGTCACAAAATGACTTAAATAAAGAAAAAGCACTTGTCGTATTTAGTGGTGGTCAAGATAGTACGACATGCTTATTTTACGCTAAAAAACATTTTAAAGAAGTAGAACTCGTTACATTTAATTACGGACAAAGACATGATAAAGAAATTGAAGTTGCAAAAAAAATTGCAAAAGAACAAAATTTGAAACATCATATTTTAGATATGTCATTACTATCTCAACTTACTCCCAATGCACTTACACAACATGAGTTAAGTATTGAAGATAATGATGATGGTATTCCTAATACTTTCGTACCAGCTAGAAATCTATTGTTTTTATCTTTTGCTGGCGCGTTAGCCTATCAAATTCATGCTAAACATATTATTACTGGTGTTTGTGAAACAGATTTTTCAGGTTATCCAGATTGTAGAGATAGCTTTATCAAATCTATGAATGTAACTTTAAGTCTTTCAATGGATAAAGACTTTGTCATTCATACACCATTAATGTGGTTAGACAAAGCACAGACATGGGCACTCAGCGATAAGCTAGGTGTGTTAGATTATATTCGCCACAACACATTAACATGTTATAACGGTATCATTGGTGATGGTTGTGGTGAATGTCCAGCATGTCACTTAAGAGCTCGAGGTTTAAAACATTATCTTGAACATAAAGGAGAAGAATAAGGAAATGCAACAAATATATCCAAGTGTCACTCACCCATATCAATTCGAACTTAACAAAGATTTTAACTTTTCAGCTGCACATTACATTCCCTTTGAAGAAGCGGGAAAATGTATTCGTACACACGGTCATACGTATTACGTCAACTTAACAATCGCTGGTAATACACTAGATAAATGTGGATTTTTAGTTAATTTTAGAGATTTAAAAAAGCTAGTTCATGAACAATTTGACCATTATTTGCTTAATGACTTACCTGCTTTTAAGGATAAAAGTCCCTCAACAGAAATTGTCGCACAAACGATTTACCACATTATTCAAAAAGAGTTAAATCAAAGAGAGAATCAACCGAAATGTGTTCAAGTTTATCTTAGAGAAACACCTTCAAGTTACGTAGTTTATAGACCAAAGGAAGATCAAGTGTAAATGGCTAAAATACCCGTTTTAGAAATATTTGGACCAACGTTTCAAGGTGAAGGTCGTGTAATAGGAAGAAAAACAATGTTTGTGCGTACAGCTGGTTGTGATTATCGATGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGACGGTAGTGCTAAAGAAGATATCAAATTAATGACTGCTGAAGAAATTTATGATGCGTTACTTTAAATAGGTGGTCATCGATTTAATCACGTAACTATATCCGGAGGTAACCCTGCGTTAATCAAAGGTATACAGGAATTAGTAGATTTATTTGAAGACAAACATATTTATACAGCTTTAGAAACACAAGGTAGTCGTTTCCAATCATGGATGACACAAATTGACGATTTAACGATTAGTCCAAAACCCCCTAGTTCGGGAATGAAAACTAATCTAGAAATATTAGATTCTGTTATAAATCAATGTACATTTCATTCACTTAATTTGAAAGTGGTGATTTTTGACGATGCAGACTATGATTTTGCAAAATTAATTCATCATCGCTACCCTAACATCCCATTCTATCTACAAGTAGGTAATCCTTATCTTGATGATAACGTTGACCAACATACAGATAAATTACTTGAAAGGTATGAGCAATTAGTGGATCGTGTAATGCAAAGTAGTGATATGAATCATGTCTATGTACTACCGCAATTACACACATTATTATGGAGTAATAAAAAAGGTGTCTAATATTGAAAAAACGTTTAAAAAAATTTCTGAGTGTTATGAAATGATTAAGTTAATGTTAATTGATATAATGAAGAGATGAAGATTTACGAATAGGAGTTCAACATGATTATATATATATTAATTAACATCGCCATCGTCTTGCTAATTCTTGGCTTCGATTTATACCGACATCGTTTCAGACAGCTTAAGTTTAGCTCCATATTATTATCTGTTTTAATCAATAGCATGATTGATATTTTTGCGATTAATCAATTCAATTTTATTACGATGTTTACCGTCACGCTATTTATGATATGGACACTTTTACAAATATATTTAAATTTCAAGCTATATCCTTTTGTAATTTCTGACCAAAAGTTTATTGCTATAATACTAGCCATTGTTATAAGCTTATTGCAATTTATTACAGATAAATCGAGCACACAATCGGTGTACATGTCCATCCCATATTTATCACCCACGATATTTATAATAGGGGCGATTTTACTTTTTGTAGGTACTTTCAAAATAGACGAAGTTGAACGTCTTTCACTATTTCGTAAAATTAAAAGACCAATGACAACAGGTACAATTATTATTATCCTATCTCTCATATCAACGATGATTTTAACGCCCTTTTGGTATGTCTTTTTAATCATTTATAGCTTACTCATTGGTTTTATATTATGGCAAGGTGTTTTCTTCATAAAAGATAAAAAATAATTATCCTTGCTACAGTTAAAATAATGCTTTCACATTAAAATACGATACATCATCCAAACTTTACATTGATTTATAAGATAGAGGTTGGGACATAATTCCTAGCAAAATAGCCAGTAAATGAGTTTTCATAAATTCATTTACTGGCTTCTTTATTTACAATACTTCGTATTGTTGGCTCGCTTTCTTATCGGACAGCTTCAGCCTGTAGTCTTCAGCTTGTCCTGTTCCCTCAAGAGTCTCGCCAAAATACTTTGTGCTTATATGTAATTTTATATTAAAATACTTTAAAAAATATGGCCCTTTCGTATAATTTAATAAATACCAATAAACTAATTTAACGAGGTGCTTTATGTGTAAAGAATATAACATGACTCAACATACTCTACCAATGGAAAGTTCAGTTCTTATCCCTACAAATAATATTTCACGACATGTAAATGATATTGTAGAAACAATTCCCGA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TTCATCACAAAAGTCTTGTACATCTTGTTGGTTAAAGTACGGATGTAACTCAATTTGATTCACCTGTGGTGTAATTTTAGTTTCTTTCATTAACTTTTCTAAATGATGTATCTTAAAGTTACATACACCAATGGCTTTTATTTTACCTTCTTCATATAAATGTTCTAAGGCTTTATATGATTCAATATACAATTGATCATTTTCACAAGGCCAATGAATTAAAAATAAATCTAAATAGTCTAACCCTAAATTGTCCAATGATTTATTAAAGTACTCTATTGTTTGGTCATAACCTTGATAATCATTCCAAAGTTTAGATGTTATGAATAACTCGTCCCTCTCAACATTTGAATGTTTTAATGCACTACCTAAGGCTTTTTCATTTCCATAAAAGTATGCCGTATCAAATGCACGATATCCTGCATCTAAAGCTGTACGGACAACCTCTTCCATCTGCTCATCCGCTATCTTATAAACTCCTAATCCAACTGCAGGCATTGGATAACCGTTATTTAAAATTTGGACATCATTTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >LR134536|2268224:2278760|2269365_2269953_-|VEJ62321.1|DBSCAN-SWA MILMIDNQDSFTYNLIDYIKVQTTEEVKIISVNDLMTQHLDALNPRAIVISPGPGKPSDYPILSSVLEIFHRHVPILGVCLGFQLIIEYFGGNIIHNDKPIHGHITKIRHSNEGIFKGLPSYFNVMRYHSLMADPSTIPSALKVTALNNENVIMAVAHHKYPIYGLQYHPESILSEYGHEQLNLFLTEVGVKYAH >LR134536|2268224:2278760|2270249_2270921_+|VEJ62322.1|DBSCAN-SWA MSQNDLNKEKALVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDKEIEVAKKIAKEQNLKHHILDMSLLSQLTPNALTQHELSIEDNDDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIHAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLSMDKDFVIHTPLMWLDKAQTWALSDKLGVLDYIRHNTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRARGLKHYLEHKGEE >LR134536|2268224:2278760|2271693_2272059_+|VEJ62325.1|DBSCAN-SWA MTQIDDLTISPKPPSSGMKTNLEILDSVINQCTFHSLNLKVVIFDDADYDFAKLIHHRYPNIPFYLQVGNPYLDDNVDQHTDKLLERYEQLVDRVMQSSDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >LR134536|2268224:2278760|2271345_2271549_+|VEJ62324.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTFQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKEDIKLMTAEEIYDALL >LR134536|2268224:2278760|2276611_2277718_-|VEJ62332.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCYNEGEVVLKTYDKLTEIMKKDSLIKNYEYDLLFINDGSTDTTIHHIKNIVAYDNHVKYLSFSRNFGKEAAMIAGYQHSTMHDAVIMIDGDLQHPPEYIPQMIEGYIEGYDQVVAKRNRQGENFVRKTLSRCYYKLINAFVEDIQFEDGVGDFRLLSRRAVQALTTLDEYNRFSKGLFEWIGYETKVFQCENVTREDGESKWTFRKLLNYGIDGLISFNNKPLRMMIYLGMFTFSISILYIIYLLINILINGINIPGYFTTIAAILLLGGIQLMSIGVVGEYIGRIYYEVKHRPKYIVENSNIQTENLDMRYNALNLNKNRNNKRSNDLYKLSSFYKVKTYSDTYASNYSQDEGFKERVH >LR134536|2268224:2278760|2277920_2278760_-|VEJ62333.1|DBSCAN-SWA MTNDVQILNNGYPMPAVGLGVYKIADEQMEEVVRTALDAGYRAFDTAYFYGNEKALGSALKHSNVERDELFITSKLWNDYQGYDQTIEYFNKSLDNLGLDYLDLFLIHWPCENDQLYIESYKALEHLYEEGKIKAIGVCNFKIHHLEKLMKETKITPQVNQIELHPYFNQQDVQDFCDEHDIKVTAWMPLMRNKGLLDDPVITDIAHRYDKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSQTPKRIKENFDIFDFNLELTDVAEIDSLNKNARQGKDPDDVSIGDLK >LR134536|2268224:2278760|2268224_2269376_-|VEJ62320.1|DBSCAN-SWA MHIEFKYRYYENEKDYEDYQLEMDNFQDSKIAYRLDEVGDVIHFAEQEQRNGSYVALYVTYEAAPFFNKEMVVNNVKQSHIFAAAYSFKSVNSIKNIKKVMPNKNHIKTEGFYFCESDKAMINKIKSIHKAIIEGATYQVNYTTRLKAEVFCPISHLYYQLTMSQNGNYTVLMDTPDIKVASISPELFFQKGDYKGKSNMIVSKPMKGTMPRGKNVKEDELYYNNLKTSSKDMAENVMIVDLLRNDITRIAQSGTIDVPELFSIEKYDTVFQMTSTVCGRLQDDIQLIDMMRALFPCGSITGAPKINTMQYIAQLEDMPRSIYCGTIGLLLPNQRMIFNIPIRTIEYNHEEAVYGVGAGITIDSVPENEVQEFHDKTKILERL >LR134536|2268224:2278760|2273861_2274299_+|VEJ62328.1|DBSCAN-SWA MNTKYLLAVGAIVTSLTLGACGNSNSESDHANHKDKQQEDSNVKTDTTKKLSGNFESKNGEKVEGKAKIENGKLMLENYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKSGKKISTVDYNKSKQTFDLKNVDLEKYNEVTIYCEKAHVIFGGAKLK >LR134536|2268224:2278760|2274797_2275487_+|VEJ62330.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEKDIVDICQTYFEYEGYQVTTTTCGKEALKLLSSDIDIMILDIMMPEVSGYDIVKKMKDMQLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYIKKPFSPRELVLRTNNLLARMSKSNHSNKIEQLEFDGLVLKNLSKTLTINNIEIPMRIKEFELLWYLASREGEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKHDFLPYTITTVWGLGYKFERSR >LR134536|2268224:2278760|2275576_2276542_+|VEJ62331.1|DBSCAN-SWA MWFNGHMTLTLAITTMITSCLTLSICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFINHEKFIDDETFQSPREIKELNDSFNKMAYEINNQMNMIKNEQQEKTEIIQNLAHDLKTPLAGIRSYSEGLRDGVISDPQEVHEAYEILIKQANRLSILFDDITHVINLNTGRSYPLELIQLDQLLVNILQPYEQHIKQENRTLEVNFCTDIDAFYQYRPPIERILTNLLDNALKFSNSGSRIDIIISECKENDVISISIKDEGIGIVPELQSRIFERTFRVEDSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQIDASITVQSDLDIGTTMTLTLKKFQFKK >LR134536|2268224:2278760|2273110_2273266_+|VEJ62327.1|transposase|DBSCAN-SWA MCKEYNMTQHTLPMESSVLIPTNNISRHVNDIVETIPDTEFDEFSHHRGLI >LR134536|2268224:2278760|2272161_2272761_+|VEJ62326.1|DBSCAN-SWA MIIYILINIAIVLLILGFDLYRHRFRQLKFSSILLSVLINSMIDIFAINQFNFITMFTVTLFMIWTLLQIYLNFKLYPFVISDQKFIAIILAIVISLLQFITDKSSTQSVYMSIPYLSPTIFIIGAILLFVGTFKIDEVERLSLFRKIKRPMTTGTIIIILSLISTMILTPFWYVFLIIYSLLIGFILWQGVFFIKDKK >LR134536|2268224:2278760|2270925_2271345_+|VEJ62323.1|DBSCAN-SWA MQQIYPSVTHPYQFELNKDFNFSAAHYIPFEEAGKCIRTHGHTYYVNLTIAGNTLDKCGFLVNFRDLKKLVHEQFDHYLLNDLPAFKDKSPSTEIVAQTIYHIIQKELNQRENQPKCVQVYLRETPSSYVVYRPKEDQV >LR134536|2268224:2278760|2274349_2274823_+|VEJ62329.1|DBSCAN-SWA MKKISLFIIFLIRVISGIVIFRQGWEKFTGDFTLNGLVPVIRDNTDSPQWYKWFFEHIVAHTTGLFNIIVPLGEMAIGLGLILGIFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLAFFIILLMSHSLLAKVSLKEIIAYFRDRNNRGEDKHDPLTNRG |
14 | Streptococcus_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
2371559 : 2429210
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LR134536|2371559:2429210|DBSCAN-SWA 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MKKVIFFILSCLLVLGACSNSGNKSTTVNENKPQFKNDTLVLDQAVLYIKDAFIIKDKESGNKEIAIKYEVKNKTNKEEITPSSVWTAGVTVKQDEGSTESELDTGMTVVDNGKYKEWLEHYNDTIKKGEKAKGLATYQLKNDNKVVLHFSKGIGGDKLGTKEYDLSKLKTVDYSSNEDLENAYQESSANENNTDNNQSSEVANNTESKDANTNVQSNTQKQGNTNKEQTQQSAPREHSGGHPSAFGGGDVPVGTEKVDDQGESYIDATGE >LR134536|2371559:2429210|2422702_2423188_-|VEJ62497.1|DBSCAN-SWA MSNLFELKDSYQQVYDLIAEQEDEQILKDTLASINDAIEDKADGYVAVIKSLEADNNAIDEEIKRLRQRKTSNQNGVKRLKESLQEVMEQTGKEKFKTALNSYSIANNPPSLDVTDESLIPKQYYVEQEPKLDKKELLKAVKDGLELNGVELKQSRSLRVR >LR134536|2371559:2429210|2416863_2417055_-|VEJ62486.1|DBSCAN-SWA MANREETITVEATMKVRCKYPVWVNNQITASDEKERILDLISKNPEKELMSEDFELVELIEVE |
85 | Staphylococcus_phage(45.71%) | portal,holin,capsid,tRNA,tail,terminase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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