Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR214947 | Mycoplasma hyorhinis strain NCTC10121 genome assembly, chromosome: 1 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| LR214949 | Mycoplasma hyorhinis strain NCTC10121 genome assembly, plasmid: 3 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
| LR214948 | Mycoplasma hyorhinis strain NCTC10121 genome assembly, plasmid: 2 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
1. LR214949
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
121662 : 136932
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR214949|121662:136932|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR214949|121662:136932|133521_134193_-|VEU57635.1|DBSCAN-SWA MKTIVEKVYENLKNNEINHSMKILEDYISTSKARNKNSITKAFNYKNDDEWYTTREDVQFFIDNANIPKDKVIWCPFDVEDSNFVTVFKKNGYKVLHSHIWDQQDFYEYEPKEKWDIIISNPPFKGKHRLLARLLEFNKPWALIFGIQALNSEKFCHELQKFKRVQYIHLKRRMCFTKDHLNYDIKNLQRPSFASMWIANDLFDKDILVWNGVNYKKDGKEFF >LR214949|121662:136932|127024_127573_+|VEU57629.1|DBSCAN-SWA MEQDYRVEKILYTQEFIENKIKEVAQWINETYKDSKDLVLVGLLKGSILFLAQLIKSVKVDHTIDFIVASSYYGASKSTGTIKIVTDLAHDIKGKDVLIIEDIVDSGITIVKVIEYLKTKQPTSIRVASLLNKSAKRKVEFTPDKIGIEVPDLFLIGYGLDYQEKFRNLPYIGILKKEFIKD >LR214949|121662:136932|127589_128390_+|VEU57630.1|DBSCAN-SWA MIKLEKVSFSYSEKQHTWALQDISLNIKKGKYYAVLGHNGSGKSTLSKIISGIYKPQKGKVFIDNIEMSSKTLPEIRKKIGIIFQNPDNQFVGATVEEDIAFSLENKCVDPKKMKDIITELATKVNMLKYLDNEPQFLSGGQKQRVAIASILALNPDIIIFDEITSMLDPKGKYDVVKIINELRKQGDKTLISITHNMNEAVLADELLVFSQGRLIAQGEPKHILNNKEIIEKAKIDSPFIYKLSSLIQGISPTYDEDELLDILCK >LR214949|121662:136932|129284_130244_+|VEU57632.1|DBSCAN-SWA 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14 | Streptococcus_virus(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
574328 : 586923
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR214949|574328:586923|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR214949|574328:586923|580114_581455_-|VEU58010.1|DBSCAN-SWA MTNFKKDEILISLVDVEKEFDGKKILNQINLDIKKGEFVTLLGPSGSGKTTILRLIGGFEWTTRGEIKFNGVDIKDVPPHKRDTATIFQDYALFPHLSVKGNIKFGLKLKRYPLNKEEIKPATLLRLEENKKQWALKAKQKMNELNKIQIEYEKHIEDPSVDAKTKKKYQNWLDDSDFKYSYWENFVSSKVEAFEKKYLTRKITKEEMEKEIAEIIELVGLKGNENKSIFELSGGMKQRVALARSLVIEPEIVLLDEPLSALDAKIRQKMQVFLKDIQQKLGLTFVFVTHDQDEALELSDRIAVIRNGKIEQYDKAKNIYDYPVNKWVANFIGDSNFFHAKFLGNNKVLLLDKEIKTIHSEFKTNQIVDALIRPEDIDIDLNFGFFKGIVVKNSYKGSYYFVDVKVNEKIIFVETNDNYDVGQEVFLKWDLDAIHLMTKEDESLTN >LR214949|574328:586923|576715_578440_-|VEU58007.1|DBSCAN-SWA MKFKLKSRYKWTIFSLILLLISSLMIAFKVNLPFRPLIMNYESYLSEPGKEELEKDFDYREFGDVSEFTKAIEDKRTIGGVGSDFQIARLVQKNLIQKIDWSKLFQNSQNEKLKKGFKTPANYYSLTKKEKEVVLARKRRTFESLIRPEVVSHIDEYDKFLVDEKGNKIDSDKDGIADRFWEFFVPYYTQDKVIAYTVGDYKNKNNEIVEIKPELLKNEKYRENKAFIQEKGIKFLDQTVAEIGKTLREYGYKYFEWTEAMRDNLLLGSEKIGNYTGIVTKDNYKQQIDDFVSYIKDITNKNFADLRFNYYSSSGLDLTTNLIDIEKKPEVGFIYNGDALDAHYSKDNFDWLKDGKTINIIRPKNNLTLLDGWILLKDISSDVVDKFYNSLYNSVYKGEDLSEDQMFKMALEKARYKDPEDDQIKSGYYLDYEKLPNLANFDFINYTPSFTNTFEFFKKTYFNDNVETVNALDDNNVETGDEIDLIKDKNGIVAANEATPTIAFEQLAATAEERASLFGLNIYLSQQPKQTIYGQRPEDFPNDTTYDIHYSFIAPVDENLDSNIRTYYIIKTKS >LR214949|574328:586923|579249_580134_-|VEU58009.1|DBSCAN-SWA MNHLLTKLKTKVINFVLDFKSSWNLRLSLSLPYIIFSFIFIVIPLLLLFIKSVSPVEFENNYQSIKTNFSVVREASTWLIIWRSVYLGILTALICLIFALPYAFFVSTNKSKAFKIYAISLIVSPLVIFTIAKVFSLRALFVAIFDDEELNNQGFMLLGLVFLNFPFMVIPLYTVFRDMSKNLLEASADLGYNKFQTLIKVALPYGLKAIFSGIALVFLMAATSIVISDKLLPSGQQNQLIGNFINNSANLANPFDLAKTSSLVLITILVLLGIYGLIYFVPLAIMKFKGVEHD >LR214949|574328:586923|585480_586923_-|VEU58015.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKKLEKITPWNEDFSRWYVDVIKQAEFMEYGPIKGTIYFKPNSFALWEKIQENLNKYFKRENVKNVYFPLLIPQSFITKEKSHVEGFAPELLTITHAGEKKLSEELYVRPTSEVLFADCFKKELANNNQLPLIYNQWTSVLRWEKNTNPFLRTTEFLWQEGHTVHSNAEEAKRLAKKMIGIYKDFIENYLAIPVIIGNKTERERFAGAEQTYTVEAMMKDGKALQSGTSHYLAQNFSKSFDIVFKNDKNEFENPYQTSWGVSTRLIGGLIMTHGDDRGVILPPKIAPIQVDILELFAIKNPIVSIVAKQIFEKLKIKFTLRIDSTDNQPGYKASRSEVLGTPLRIEVGPRDLEKNQVAIVRRDTLEKHQVEVEKVFEKVEFLLEEIQNNLYNQAKSRLVNNIVTAFDYEEFKTKIAQNKFVIIPFEGDEELEKQIQAETGATTRCIPLDKEFINVLQSVKSECMFTKKTTNRFVIFAKAY >LR214949|574328:586923|582187_583540_+|VEU58011.1|DBSCAN-SWA MSKISKIKAREVLDSRGNPTIQVEVWTEAGGHGSAIVPSGASTGTREALELRDGGTVYESNWFGGKGVQTAVDNVNNKIAVLLKGHCVLNQRKLDNMMLQLDKTENKSALGANAILGVSLAIAKAAADELKIPLYRYLGGTNAHQLPVPMLNVINGGEHASNTLDFQEFMIMPLGAKTFKQALQVANKIFHTLAKLLKKAGHGTQVGDEGGFAPNLKSHEEALDFLVKAIEEAGFRPATEGENAVAIAIDAAASELYHDGIYTFKKLKKAIEEKRQGFEPTRVQFTTEEMIQYFGHLFHTYPIISVEDGLAESDWKGFVRFTQKFGKTHQIVGDDLTVTNAKILAEAIEKKAINSILIKLNQIGTVSETLDTIELAHKAGYTTVISHRSGESEDTTIADLAVAVNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNRLLAIEEAIQSTAQYKGEKVFFNIKK >LR214949|574328:586923|574328_576413_-|VEU58005.1|DBSCAN-SWA MQINNEQLFAFLKQPKSFIEIARKFNITFNENAQLSSYLSHLLESHLIFKNHKGLYFSPKILSSHIGVFHSTQKGFGFVELKDHQNSVFIPAKFTSSAQDYDEVKINVFQDELKPDKTYGVVTKVISRKLKFLIGKVIKNGDYFDFEPYNSFKNEVFFRWVSTKNLVLGEFVKVEILEYQKKFLKIALVQNIANENEKFWYLKVPIVDSGVEVEFNSNIEEELKQIPDAIETIEPNRVDLRSSTIVTIDGDDTKDFDDAISVEKLENNNYKLGVHIADVSYYVKEDTFLDDEAATRGTSIYLPNMVIPMLPEKLSNGICSLNPNVDRYTITMEAEIDKYGNNLSVKIYPSVINSKARLTYNQVNKYYENQEISFTNEVKLLLDDALELAKILRKYKENQGYVNLEIEETKVILDEEGYTKDLQIKKSGISEALIEDFMVRANENVSEFLAKRKFPVIYRIHDKPDIERIEEFNGVLKSLGVNVVIPYQLDSKSFADAVEKIKEQRLDNFIKIMILRTMQKAVYSPVNHGHFGLASKFYSHFTSPIRRYPDLLLHRIIRHFLFEHKKDLLHFERILEFQSKSTSELEQRAQTLERKVVSIKKTEYFSSRIGQKYRGQITSIKKFGFFVELENNVDVLVHISDLQTNEQEEFILSDDSFTLANKFYKYQLGQFVEVEILSIDIPFGKISAKVVLKN >LR214949|574328:586923|583621_583846_+|VEU58012.1|transposase|DBSCAN-SWA MKYSLEFKLECVKKYKKGIEIKKPDFANTSQKNFLNPVNFWEKIYNKLGVEGLKKKPRNKKWTIDQRLNIVKRF >LR214949|574328:586923|584625_585045_+|VEU58013.1|DBSCAN-SWA MFNGEVIAWDLSTSANNQQIRKMLQRAFFKHKNLEGLIFHSDQGWQYQHRQFSEKLKQKGITQSMSRKGNCLDNSIIESFFGTLKRECFYGREKEFLTFKQFHKAIANYIYYYNYKRIKDKIKWMSPIKFWETFISNYN >LR214949|574328:586923|585121_585427_-|VEU58014.1|DBSCAN-SWA MSTKIKDVTKSQIFPAINSDKLALVVFHQKNCGACIMLEPVLEKLVEKMDVVVYKVDIHADMSYTREVGIQGTPTILVYKHGVLSNTLVGYRSLDQLQKAL >LR214949|574328:586923|578429_579257_-|VEU58008.1|DBSCAN-SWA MTRILDYIKEKEIWKKSYVWLILILFYIPIIFGAFFSFNAPSKKGFISTTWNSFSLQAFRDLSTKNFASALVNSIIIALVTALIVIIISLITVFALWKQRNKTVKSYVNISSNIPLINPDVITAVAMAIILSLLFGTLVATKEGLLRSIVSHIVMTLPYGILLLYPRSEKFSKTLFEASQDLGYNKFKTWFLIYLKYMIPAIILASVVIIFLSFDDFIITKITSNAQTVGTLLYQGTFKTWALLLGAIMLTMIVIGNVIWIRYKLNKSKRGKNEI >LR214949|574328:586923|576439_576673_-|VEU58006.1|DBSCAN-SWA MLKELLLGIIILISLCIMILSLLMSPHSNSFSGALVGSSDLDLFKVSKERGFRKFTKWAMFICGLLFLTIALIIRLL |
11 | Mycoplasma_phage(50.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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