Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR214950 | Mycoplasma gallinaceum strain NCTC10183 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR214950_1 | 978512-978695 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR214950_1
|
2 spacers
spacers of LR214950_1
>1.1|978536|41|LR214950|PILER-CR ACAACCTCAGTTAACTACAAAAAAAGCATAACAAGGCATAA >1.2|978601|71|LR214950|PILER-CR TTTATTTAAAACAAAAGAGAAAAACATCAATTTAAAGCCATTTTACACTACAAACTATCATTTTTAATTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR214950_1
The CRISPR arrays of LR214950_1 >merge|LR214950|1|978512-978695|PILER-CR AATTTAAGTTGCAGCAAGTTGCAAACAACCTCAGTTAACTACAAAAAAAGCATAACAAGGCATAAAATTTAAGTTGCAGCAAGTTGCAATTTATTTAAAACAAAAGAGAAAAACATCAATTTAAAGCCATTTTACACTACAAACTATCATTTTTAATTTTATTTTAAGTTGCAGCAAGTTGTAA >LR214950|1|1|978512-978695|PILER-CR AATTTAAGTTGCAGCAAGTTGCAA ACAACCTCAGTTAACTACAAAAAAAGCATAACAAGGCATAA AATTTAAGTTGCAGCAAGTTGCAA TTTATTTAAAACAAAAGAGAAAAACATCAATTTAAAGCCATTTTACACTACAAACTATCATTTTTAATTTT ATTTTAAGTTGCAGCAAGTTGTAA
>LR214950.1|VEU58987.1|973300_977932_+|Uncharacterised-protein MNKATVDSLNEKIKNSIDALNGQERYNAEFARLNELSAATAKVKDNPKATDTASEISVDEIEFNNDTIPEDTKPVDLSITNRNEATGKLDLNYKYQSTKENLETVQSSKTYTLNNDNALSTLTEQERLDQLVQDQTVTKTVEFNGADKKSVAVSDLNKDNFTTGINPANNAKVIINTITPDPNDPRGAIVVYKLESTKDNLGDQKVVSSKNLTTKITGFMTSEEKEEKSNAASNFVGTADPLKQASEFVNNLSDVNISFDPNDNLDHSNETIVVKSIESWDDRTGTLVANFVVQSNKNGEVVTSELKTITINGYMTEEQRLNNLLNKAKNFEFNGDKPQNKTTVDEVKLSELSGYLRGRNDETGEFIDLNSENKVKLIIDEITQRDGQYGAISFKYHFLSTRTDIPNNDIVSKTRTYTLNLFQTDGEREKEESNAKNINDLDINVTKNKLASEYDANEITLSAKDPDFSVIDKEIIGYNDITGEIKLSYKLKNNQTNDESETKEIILSGFKTESQRLNELLDSLSKEDIDFNGTKKDQLPSVAPANNKNNYSYDETKKTDNKANIRINSITPDNQAGENTLNLKLISTKRQSELVSNWQIDNFVTPESNNKNLVIDEFRTEVDQDKIDQDIEKQRLNDLSATLDFPNKDKTIASAALKEKFTSNPNTFDNAKLVIDSITEINNEAGTLKVNYHFESTKDGMNKVISETHSQEFSGFKIPSKELNNINNLDASFNGDNSKLPSYFDNSTSEKTLPGTVEQDPDGIYNRVVKVTEVVNANDKDGNLTIKYVIVSTNKNDPSDTYASNEKEVEVPRFKTEAERLDELSSQVSYPGKEKTSPSEIDLNNITFTNNLEDANVELIPDSITKNDLTNSVTGKYKITSTKEGAEDVFVEKEFTISNFQSEVERLNKLVNSKEATKTVTYNDPSQEQRSVKASEFAAKENLFELISTNISTPELVVNKSKIEINPDDIVIDDEDGTITFKYHLVSTKDEFANADKAVKTSTTEGTLVLSGFSVDLEPRKNELINKINELVDSNNEGNPGLTREQADELINLINSDDTDSVAKFNELKKQADITVIKNDLAKLTHLNPKQRSDADSKINNQDLTAQEAKEIYNSYVEIDAKMEKLGELVDKYNKLISDSNNKKYTSANEETKTQFDNNLNYAKELLKSDKYNGSNEDLALEQVPFNLLDKLIGDVNTINSLDYDYEHLNNNSKFPKELIDNLSYLNDQEKQKYKDAIEPKETYSEGQAIYNYSVIVNNHKKGAIDYIDSLKYLNEAEKQVFKDKVIAANGEDFDLVDKIKNDAYEADLSVKKLIDAAKGDTKLTNDEINQIINNLHNLGVNNPNYNNLANELINYNDFADALERYRKDNVSSDTFLENERLLKEQIAKLAENNSYNQNNISEAAQALQDRLDLLKKDSQSEINLVHSLLDLRETTFKNEIAHDNLVNQNRYQNFAKNVANAKYFKLAIKGKATKEEIEILKAIAKSDASNVIYSALIKKLDAIKVYIPRKVTSFKWWLLVSLTLLTLGFWTFMLGRKKNKDL >LR214950.1|VEU58986.1|970552_973174_+|ECM-binding-protein-homolog MKKSRKIFLSFGGIITSSLVLVSVINVANQENWNDSQRAAAEELKTFIESQKKGRTSSSTRNNLYVPEMYKKPRGEYKDKIIDFGIDQNQLQSVYDFFIQLPSFNQINDENSKNEWIKEIKMWFWERPDLYFATFRKHETGSIEWRFMPNKAITDEDDAAEKTIEAFDKKIKNLITFKTLSEYRGRFNTFEEFKSYVLNELQEELKKEVYNAPRAYYDNFVTILKNATVDPNDSNNSNRNIPQDLSNTLLNWLKYSQDLNRDEKARGGNYDKALELLGDNGLIGINNKIAQIRAKLATYQEKKASFDYKFEPEEPEKADFDSEKAKLTTQLQELQKKLNELNTAIEGKIESTGWNSKRQEKLNLTTTNEELATGLNTYIVAEEKLEGLLKYREKVTELQKILSDSSLSDEQKKHYTERIDSLGEDADNYAQLQAIGDEIKNSIEADSKPEEIINKFSLWTNEQQKDPYREQIKNVYKDSTLDDEAKNEKIKEIEQQIFSKMKENANNLIDQTSLGNTEKDTYKNLINSENMDENNNPYDFLLLKTITKAKIDNLDSLNPAQKESLKNRIDEQNTDDATKINAIFTEAELVNQKMNDYKNTFKDETNSDETNVATIKKSTDYTEADNDKKTAFDNGLNQRNTDLSSQSDNLTIDQINQKIAALKQAKEELNGDENLAEAKKQAKNKLNTAYTYLNDAQKTDAINKIDALTTVNDVTNQDAKNNKLDDAMKVYSESPANIETIRTSTDYTQADNQETLENLITAKENDINKTSGPNLTLDQVNRKTAALNNAVTALNGEERLKAAKDEAIRKINSDYSYLTSKQKEKAIQLINSQNTIEDVNNQDKSNKALDSSMKTLKDYISNQATVAEGNNYT >LR214950.1|VEU58985.1|968806_970378_-|Uncharacterised-protein MGVFKITTHKKMSYYEERKAQIIAGIIRFWNKRTNKELARMYHVSVRTIIRYKQEIKPFIENGTFNVAHKGRKNENALKYNDETINKIMCDYYDFSEEFFPKKATINTAPFWLYYYEKVKQSFNISYSQAFRRVKKQGFINIQMTRKGKRESRKIRRLLEQEIGEKTSLFTRIGSLEIDEREKKRKSVYQAKNIHLKFGENVELDACQEIFFGDKKVFIYHAIDSATGKLLELQCEEQETNVGYQKLIDKLFKKYGFPSNITTDRRRTFWGSEKTYTMFEEALIDRGITLFVSSNPKDKPNVERSFASAQNYYPYLFKNKGIDSIEKLNKRSEEIIDEYNRHFQKTEGNKESKFIKNDPSSNIYDFSLRIRRRVNNGVVMYKNKMLAPYDEHNKRLMFFSQSGKDINLCLDVNQNLYFEINNKKYIAKVVEESELNETEIYALAKGLDISIPQVHVIAKAIVNSRKFTLAQSQLRHFPDEILKNENAQKIIKILERSEEILLKLYNLLEKDIEWKDKVAFIDN >LR214950.1|VEU58984.1|966907_968182_-|Integrase-recombinase-protein MDTTIFRVFIYLGGIMRQLKAHEWLELFGSYEDYKNNLISKNDFELKYYSIRGFSFFDRKFNDAKKYFVLKYNRYNLGMINIESQTGKSPKKGKGSGRPRKQKITPIEIVKKEWEKMPKEQLIEILEIYKDSFDRNNIEVDISKIKKSSLSTRKLGLCFNKSKSTIHNLKNKDQQARKKSVNTKYDELIIESFKKNKGLFGRKRLESYIRTKFQIALNYRTIGRAMRRLNLFCLTRRKKRDREQKNTNVKFIDLVNRDYHGETNQIIATDVTYISAPKDCLNNFVFLSVAIDHKSKFVVNYNLSKRNDLELVMEHMSKIKMDKKWIAHSDHGFQYSSKTYVDLIQKNNGVVSMGRVGNSLDNREAEYFFSILKSECLKLIDITKITFNELKSLIDDFVFWYNNERIQSVLNWKTPQECWGVLPN >LR214950.1|VEU58983.1|961971_966843_+|Uncharacterised-protein MLSPNQTSLINSKAKIEITNVKVDPKNNQQVIVTYNLTSTKDNLGDVTSSVNKEITISGFQSPIDREKEIIDAYNSDEFVGLGDATKLASVFDDATKYNDINLTFKTPDNHADERISITNVIGYNDVIGALKVQFKVISNKNSQDVVSEPKEIIIDNYLTEKGRLNNLRQEMYNQNINVDYPQKSLSIPSKATDDNDDLNNFYYTQSTENKAELINVSKESVDDAAGIVNIEAELRSTKTQAELISNWEVDPNTPFVDPVSDNTDLGSISVSGFRTKAEQDKIDREAEKERLNDLTVTLDYENKNTILPSEAVIKKVIATIKEANPEARVVIDEINARHEIEGYIGVTYHLVSQKSDEIYKNVTSKNKYAQIKGFKTEQMRLDEIIQNLAIEAGIKNVASDQYNKWAASKLLKDLILNKLASNQDASYNLKVVDKSADDNIGQISYTWQIISNRGVVNSQNLNTVTSSSEHNKSDTLSGFKTLTQIEKERLDALDFTDKVENGVLYNIDYPNKANEQASSLTDATTNWTWDTFNKDNYEFINQQIIGYNDLTGEIRLSFQIRSTKPEFSSVVSDTKEIILNGFETELQRLNKLVDTDPYNISLNSTVNKENQKASTLNKDNFSSSVKENGDSTTSHISDLLLTDSNDNTGEIGVKYKLISNRQVNTDQDNLKKLVSNWKETFNEQEVISKESNPVNFDGFLTNTEEEERRIEGLLPQIVLDFENRNQYLPLYNQSDVIASKVIVKLNNNETLEQNHMKIKDNSLTITERDDREGYIKVTYTLQSTKPGLENAEIIVNETRSANTNKLSGFKTELQRLKDLAFDFNNNVSDKNQKQASDTAIVIDNLNQNDAKTANITINNKTRDDRNGTLSGTYSIYSTREGLNDIHVDDKAFTVNGFLTEQARIDALLADDTIQAHVEYKLDNQAEILPSELLANKEEVLNNLSKYFDTNLDNEAINQANLKIIDLTANDIDGSISFKYKIASTKENLTDIESASSETITLNGFLNQLDKYKKEAKKTVDALDNLNENEKAQFKDNIDKSVTKEAVDNIIDKAKITDLINQIDKTYPYLNPKQKADLKDSLINEPDYNQALKNFETYSPINKKMKKLSDLINHYHQLIADQSNAKYHKADDKTEFDRILNKAKELSQSTTDNGLDNNNQFNLDNLIDNHINNNSLDGAYQRLNGKEVALIEKIKANDYLTNNEKNQLITQVNKVAEDNKTNNIEQEQKALDKIQSQIDDIQKQKQALIDYVNQDVINNQSNLINQSQKDHLINQIINNDLNEAKTNKDVANQLNNLINQIKELTDKYPDVVNTYAYQRADQAKKDAYDKAIDNGKKLINNQTPNGYNSPNTSVAETQEILDKIKQAFKAIDDEAKKINDLYEKLNAKIIEYQKDVDNKELPKEIQDILDELANYGEDVNGIDKLIELIEQGKLLKSLHEQWNNSDVKNPDTEKAIQDLNAKINSITELINSVESSNLNSKLDTSKDFVLNHNQYNLNFAEAEISYFDALKNVDKNKFIDATNKLEQLNQTKFVEFANSILNTSYFDTYKPESNLNKKLIKELLKLNYDPLNKIEKSLFETLLKEKAGVEEKLSWLWYLALGLSTTLAAIMIGVLVKKVKNNS >LR214950.1|VEU58982.1|956127_961716_+|Uncharacterised-protein MNKKNIFKLLGATLSSTAFLIPFSGLVPIYMGKDTADTKYDSFFYEDTDIYSNSRYSPYGSWDNSADYRFEGYIGTQNFVTVGDPTITDNRNPNFLNTNYYDRFSQKANWVDPKSLDGRRRKWKLIYHKQQPSSFRENRYLGGFYFSEDMILADNSVVKFSFYPADINQIDYANVSTREIPVSWSQLPTNKNNYTFINPLYSQNPYFEDKWQNIVNWVNPQNTSTTGAAGYNNNSEIRLRGLWTNSAYPWTAEELAVAERNGLTRDNRSVIANRLINDPVTALGRGNPGFYHKSTKKINNFDNGNVAARLKQDGLYDEELLNNEGAGFWDLLNKNAGYMFTFFIDAPNARNRGWSNNVVVVEFETVDNPNFQWNGKNSVPTFLGGAYTLFDVGFNSGFEGESGFIIRSERAKSSQYKFRIKERVESSDANFYLPKSFKRREDNEIDNKLYEVGVYYTNQSGTEIKLFDLDRNQYNKINNAREYYSEYNLNLALEDINPSSLKIKATIKDPNFRNQWQIAEAPLSSTNKDSQGFYVFNDLVYKPLVTDRLKIEQMLQTEFPNLSGWVSDLVQKFISNEFKSRGENSNESDVWFNDHNTPGARKYVDIFMNYLRTMIPMIQFASEVDQTYYSDTNKALSNDENKLISQLNFAYSSTQNLKDMVVEIHNYLSTGKNALKNDQPLPQGQKSVTEWGHKLNSILGDERQRGVNHQKYDQEVAKLDGYKVVDNTVSGNIYKIATSEFQTNYSELYDSLSTNEKDNLYKLFKDKAIEIINNQFKLTATNGGIDNLIETDSTANLTKLREFQATVADAIQKRKYLNDYVTWIQDNLKTDDGEWKETVSKNALSTRQGEEGQEEYNKFIDAFDNAEYQQIFLNDPSKEFLSNYDKFNNFKTKLENALTTLTETSQALDGNKNQAKKAVDSFVFVESNETERQGFDTFVNELPSNYQVNNGTITDTNWTSNNEKLANKINTIFAKAKSNLTDKLNELTNLKDEERNKYIQLVNDAQLNPISEEFSQFGSDANLKPIYDKAVLNNHINSLTNLTDKQKKALINQINITDNNDSNYVSPENYETFKTNATNLDTQMKALKDYYDGLSNSLKPNENGEITDELYVYERTKSEKDDYKNFIEQTKTVIDDSAATPITNSKEIETLLSDLEKAKSKLDGSSSYLPRQNELKHMTVELKQQLLKEIDKTITNDSDKEDQFKKVQALDQYIGLELNKIEEWQTNYVVDTNAGYKNAIESLKTTADNLTNKLITGFNLNLEDNNENKNKFNQVEQTDPNNYSGLYTKALANFKALKDELSKLKSKLDESARLYNLTINHTNNKPELFATNVAKNYTNDKTPFTVAINSNDPQATIENIQVIAANDVEGKLEITYEIVSTKTNLTDVKTKVQTYIFKADTKDNYQTEKRRLNTIANSINQGQSKINLNFTTSNELADSTTAKNKANYSYSNATNDKLTFDITNINPEADFGRSTLNFTLTSTKAKEELFWRNDNNLADITYTAPKSDANSVIITGFKNGEKTRLDGLSAYSIDRNDKSKILASEVDLNDLNSDKWTWSPERDGQYTFVDKRVVAYNDITGEIKLGFKLQSAKENLQTIKSEEKFVTISGFKTELDRINELVTNTSPTSVISQKSGTTNKKPSALTSADFVTNNPNPLANSNVEIDSNLTLVPNDDSGEIKVAYTLTSTRNDLVSDNWEPAVTNSDPIQSKQSKTSTFTGYLTNRLEEINRLNGLEVSYQNKNKQLMPSEISATNINSALAVILPENSEAEVVGLTVTNKDDRNGNVTISYKLRSTKANLTNAETAVKTYTFKSATNDKYKTEQERIDALSYQPTLSENAKLNKTASEIKPSDIIFATSQTD >LR214950.1|VEU58981.1|951284_955694_+|ECM-binding-protein-homolog MKRFNRICLLSSTFIGSSILPAVLLSASSNPVIASENTSGEVAANVVTDNNITVPEFLAEPDQVIKGNSNGLSFVFSNEQSYKYNLKYGQGTRTNYYFNPGAQPEVYQGKDKTIANLKMLNPNGWQDEEQEWELTLNRNATFAKEDIGGYSSLGDRWSRNPRFGILISRALELVPDTFEIITYKTTWTEEELSRTKVARMDNKPENLQFSQDVVVNSFPHPASGYRSGKIKDLYRWTSYYHDGQLVPTWKVIDEYKKRAYSWDPGYGVGSDPVRASFLNNWQLPSAYNNGNYGYPLSNERYKILNDIGTIIGMKFDTPYGLGFGYGYTDQNWFKIKFKTRLNELLFTKSRPNPAADNLGIKNAYVLGAFTTYDWSYFVQSVDYKIATVTSQDIRNYSVDLKEFKQNPDISYQLPNASFVLKYNGKIVDGSSFNNSKDENASKWWTRKYGSIDISKSREVYDNLDKWELEVTFKNTDQDFWIVKQNKVYDPATKNVTFNLEYVIDEVKHERNEAIKALESFENLNQAQKNFYKAKINEANTIDDLRNLIDVNNDNIGEIKNLDDKMVSLKLKKQEARDFLDNRANLINQTERATLENLIGQINADLTSETNAIDNEKINSYIKQVDDIIAKVFDAKFKKYLKTLNNLNDAQKQLLISKFDEEVAAGKRSNNDIYEEYQQKASSLDKAMEALNQKVASADDVKNNSNYINASENKKEALDNALNNAASKLNNPLDLNEVNSLTTAIETAKNNLDGNINLAKAKNDINAKIDAIDSSVLSEADKAKLKEKVNAATVINNNNSSDSTNWNSTNSINEFVDKLASKLSELKVNLDKDASVKASKNYTNSNENKRQAYDNAASEAKTWANNVNKTASQSFEEILNKVSSLNNNLETALANLDGNDELTNAKAEAISLLESKKYLNSAQKQALKKKINATSNLDELNTLKNNINSLDNAMHELINAVDMHSGRDANDAKGLEAIDKASSRDKTDKFLKATNKAAYLAALDKSKSIIASSPELSLSKLNQAKDKINLTCQALNGDNVKALSDAKEKALNTIINLPYLNNYQKEALKEKVRFESSLEKVKEIESGALKLNSAMKSLQDSLKLDPSRKASDKYRYATNASDYDQALAKAQKINQGSRLINELDPVNVLKAQSNLEKTYSLLNGQTVKNLIDAKENANEFLENNSSNLNNSQKEELKHLIDNANSVDQIAKIKDLISKLNDAMDKLNESLNLDSNRQTEDKFIEASNQNDYLDAISKAKEIKDSNSLNASAILEAKDKIENAYNNLDGNVAKEIRDAKESASNDINNLPVINNAQKEALKDKINSATTKEEIDAIIDLANKVNEATKDLINSVDAHSGREANPEKGLEAISEEQARKNSDNFKNAKDPQSYLDALKEGQELLNSSDVDLILNVDKIKDVASKIENAYKKLAPVKFDRKSLWYIWLILGLVLVPFFVLIFIAWKRSRNKNS >LR214950.1|VEU58980.1|950585_950870_+|Uncharacterised-protein MIYARATLYKVDEEKLKGFIDYLYIFAKKVCIQNTNLSFEYGLENKGDVYVIERWSTEEEYKKFIAEKEFKTELATLSKMAKNVHILYQMTTKR >LR214950.1|VEU58979.1|949026_950577_+|Methionine--tRNA-ligase MKKTFYITTPIYYASGNLHIGHLYTTTVAWVIANYKKTLGYDVKMLTGSDEHGQKIAQKAAESKMDPQSFVDNLVVKYHQLWKDYQIDFDIFSRTTNPKHKDSVSKIFEFFKEKGFIYKGEYQGLYSVSDEEFVLETQAVKKDGKFFHPLSGHELVLVSENTYFFKMSLFTDWLINYIKEHPNFLAPLKTVNEIENNFLNKGVEDLSVTRTNVSWGIPVSSDPEHTLYVWLDALCNYITMLGYDPTNPSGSEEFNKYWASENAEVVHILGKEIARFHMIYWPIFLKGLNLKMPTRIQSHGWIVTPTGKMSKSKGNVIDPYELLESFHPEMVKYYLVAHMSLGEDGIFDLEHFVDVINSELINNYGNLISRTIKMYRNSFDSPIKYNVSNLEIDQKIEESIKNSKVEFISLFDEYKIDKALKVAINLSSELNKYIDETAPWTLKENLPRLEQVLIRLLNGIYAISSYLQVVLKSKTQEVSKVLNIDSFDMDKIDDFHKFDNVLPEDSYILFKRIVKK >LR214950.1|VEU58978.1|948242_949016_+|DNA-methylase MEKTRKLVKNYLGYDGKLFIYQDKSMFNYSVDTILLGNFIYLHKKHKRALEIGTNNGALSIFVAARKKDLKIDAVEIQEKAIEVAKINVSENNLEDQINLICQDFNDFVSWHTKNAQRKYPVIFCNPPFYPYDKTKLRKNVSEEMLIATHEIKLNLDQLISGCAKIIEQKGFLTLVLPVERMVDVFESMRKYKFEPKRIQFLTPRIGDKPKLVLIEARYQSGWGVHFLPTIYLHDLDKNDHEYTEEVKKLYRPLIVE >LR214950.1|VEU58988.1|978969_979392_-|Transposase MFFFFLEITSKNNFSIWKFLKKEKNPPNKVIKLGTKYWHIHISCFYIFRRYYETIKGHFLICFLALTIQRCLEFVLDCCGYLLPKNKIIDAIKNQKLSIIPEINTYIKTEESEDFKSILKFLGIKPIETIGKYEDIKFTI >LR214950.1|VEU58989.1|979593_987687_+|ECM-binding-protein-homolog MKERIRKIAKKSKRSIIFGSSSLIFAPLAIISTTPSDANAETNQFDPNDWTYNNRFNMFSNVERFGYQGMQSRNQRTEGWKTTSIDDTNRYVKMENTFSIDTDSTVNDSSDNIYNFRSDREKVKVTFGETDNIVNGVIGFALSPDIDIVNGTMKYKVSVINTTDDTVESTEEITIANDLLVSKNQGTYFNSANANQRRNLLSSTSNVELSHFWVRRNYVVEGDGGENAGGFLHNRFLINNHEANGDANGGAKKYGVLYLNRMRQQPDYGEFGGSTGSMFTTYVTNSLPQGKRLKIEAEFETFKRQNPDLNFNNDNKDWNQTSYWKYSRFQTHIMAAYRMTSSPAGTTNVFGQFVRAQRPKYMRIETGVKFNTDVLEERQYTGSNKLPNYTMPDTVLKIYQTVNDEKKLIATKDFTNISGRESEGDAASNKNGTLIDALYFDYDFDSFNRKVSAGEISYEFTLKNESDARFFKVNPGSIKFNGIPWRDKSMEYHDYRLRSNTLTSTSGDFDLDKFGISLSDDELKRNQIRDNLANKTNLSDAQKAAYEQWIAAQENLTDTQVEEANQNVDSLDAAQENAFINIGNLRNLTNEEKQALKDQILSKTDFLPTGTISDGATVPTAKSGTFVNPRLDEIVDLATAKNEIKNPNSNIASEELTSVNEGEEGYEEYKAKKDLNDLKEQARTSLDNKLNELQSQIDTLDNANNATSTNNNLEKQIQNEEAKLAALNNLFDAYRYNDLTLEQKQDFVNRINALDPSQDQDAFNEALESIKTDINRQEALHDLGKLKDLNDAQKQAALTAINNPDATSEEIATALENATNQNEKMTALKELVKTQLNALSSGDDASTYEGAIAQNKDEKAYEFATVATKTAYDTDLTNATSAATNNGENLSPEQIEALINSLTNSYETLTNESTQKQEDIANRIAALNNLSEAQRDALTNSINENTNLEAALAQLEKAEALNSAIPDLKQAISDAEDKKQESIYSNDSSEKQTALDNAIEAAKAKLAEIQADTNMSSDNLESLSNDITPNDDNRADNTIEALTKAVEALDGNRQVLRDKVDALSDNFSEEDKEALKEQISALSENPTEEEINNFYEGLKQAATQKAKDAIDALENLSDAEKTAYKAQIDKAAENLDLANSETNPIDKVLSDVVANAKGQDQERQDALDAIDALANLSEAQKAAFKNNVKNAITPEEIKAELNKAKDYNALDAATGLAAKRAESAKESDDYKFADPEKQKAYNDALEALQNAIGDDATNTDPEDLKSLNKALNEAKAALNGDENLEAIKNNIDALENLSDAQKQAMKDKVDASSSLEDAQNIEEQAANLDEAISSLKDTIDAAKSRTGDENANPAIPADSIYTLDDPARKEAVDNALAEAETKLAQLQNLDLGDENTNIDSAVEAADSDSTALNDATEALDGNRHALKQDIADKFGTLSSEALAIAKNDVNDLDREFTEEDKQNLLNNIFADAQVEAKNAIDNIEGLSPAEVKAFKDAIDAATINNAEGENFDKDLADILEQAKNAKALKDAAIAKIDALENLNDAQKQALKNSVLDLPATDAEAISEKAVALDEAMKAYKDETFADNPISKTDNDYVLADENNKAAFDNALENRDELFGQNGANLDLEAVKTAHEALKAAREALNGDEKLQAAKDAAIAKINGDNPEYASLTDAQKQAAIDAINAANNLDEVSAADAANSAANAATKRLKDYINNADTVKAQELYTGSEENLRNAYDQSIEDAKAALAKLENPDTENLLDVIVPKTASDDVHSAVAALNGDTNIAQEKQAAIDAINALENLNDAQKAALIEQVDSAIHPEDVRGIKDKAEILDTKMGELKAALKANANVKQSIDYLNSDNTNENPLKNNYDQALNNADLMADAENGGAQLDEAEVQKLIEALNNAKDALNGQEKFDEAKSEAIAAIDALENLNDAQKAAAKAALENKNLIADLEDIASDAKTLDTAMDQLKDSLDAYNAELENNPNYTEASEEPKQAYDDANNAARNATDKASGTALDLASVVALQKQLSDAKNNLDGHQNFLDKKAALIEEIQNDPNLNQNQKDELVKAAKAAETSDNLNNVQDNKDQLSEAMAELRKVREKAKDLLDKPVYANSSEEAQNALNDAITNNEPALDADEPVAYDLAKIQELIQATNNAIDNLDGNDRLDAKKQEAKDAIDALENLNDAQKAALKEDIDNAELISDIDDILDNASEFNDTMGDLINYNDNRLGDAYKDKTSRNYLDADKELKDAYDAALEAFNNALNNENANITDSEALSKLLDDLKAAKAALNGEAKRKIAAEELAKLLAESDSVKAQDLYAKNSDEKQNAYDLAIAEGTFDYRDRDNLSLEEIQAAAQQIKDAKEALKDNSDALKGLIDNLENLNDAQKAAFKAEIDKYDNYQDRIAAYDKALALDKAKADLNSYIDSLNNLSDADKALFKEKLANEDFSAPGAIENFKDQITNANNLLEKLTNPDLNKDLSNEDLDNIKNALSNLGLNDDSYAKLADALKVRNDINDALEAFRNSDYGSENYAANKDKLNDLIAKTVEFSSDNATVQNAISNLEEDLDKHQMAAEAEMGIVDSILNGDKEEFERCMVMLDKSNSPLYDKLSEALATSGFFENSNNNFKGLTKEQITILKNLSLGNVSHLIRSAYDQALKGATNNGIFRWWLLLSLALLTLGFWAFMLGRKKNKDL >LR214950.1|VEU58990.1|987848_989477_-|transposase-domain-containing-protein MSYSLCKKKQNGKYYLVLAISKGFKKGYGNQVGLGYWEDIKEKYGLSSIEDMKEIAKKVDTSLDKAIAKEEFFKLLKPTSVKTSIQNIGVDLIYKVIKELDLFSVLPKSKHKSLEEVLEFFIATRIILPRSYMSQYKNKSDFINDINVKKSSIYNYLDVIFENKNSVLVNLFQKINEFTNRNNKVIHFDNTTVYFESFTREGMRKNGFSKDGKHNEDQVVIAMAVDENGIPIHYKVFPGNTADGKTMLSFVLELQSIYKIKDITIVADRGINNNANLRFLEQKGIKYIFQKRLDTLSIGMKKFILEDKHYVFRDEMFWKEQIVESVWNKNRFNGKYRKWCVFFSPGKKTLDKLKRNNFIDKLNKKTVNGELPLSSLVPEYKKKYMDIDGKTVGKLNWEKIKKKESEDGFYIIETNILDLTPEKANEIYRKQWKVEENFRTLKSSLQVRPVFVHNEQHILAHLLLCFIALVVLKYCLYKLKKYYEINGEIQKVTLDLFVDSLRMMTITKKEVNGKVVQEIINDLDENHKENIKIYKDFIACMS >LR214950.1|VEU58991.1|989735_990896_-|putative-phosphotransferase MQREFLVENKWFQKIINGQKVYEIRLDYPSRQDLKVGNLIRIKNQDSGDFEVAQIEQIQKFDSFKKLFAAIDNLKLGFENNHPNNYLEIEKYYSKEQQKEHKAVAYKIKLVKFNLDEIDNFVFDMDGTLLNEKNDIFKENIAAIEKLQQMGKKVIIATGRPYYTLQTTIGDIKPDFPMITSNGAMIYDNQNHELIHYDSMPSKDAQQMFDKLMELNYEFLIYTTNGMFGHPTGATNFFPERDNYSFLAPGVYTEIDASFDINKYHVCKFLILTDSAESSLIKQIEELSASLSGIHGLYSRKTMYDVMENTATKGKGLMYLASKYNLDLNRTIAFGDGENDISMFDVVKYSVSMDNGFEITKKSAVYPGYNNNSPWIEKLLLFLESK >LR214950.1|VEU58992.1|991240_1003822_+|ECM-binding-protein-homolog 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>LR214950.1|VEU58993.1|1003905_1005477_+|Uncharacterised-protein MGVFKITTHKKMSYYEERKAQIIAGIIRFWNKRTNKELARMYHVSVRTIIRYKQEIKPFIENGTFNVAHKGRKNENALKYNDETINKIMCDYYDFSEEFFPKKATINTAPFWLYYYEKVKQSFNISYSQAFRRVKKQGFINIQMTRKGKRESRKIRRLLEQEIGEKTSLFTRIGSLEIDEREKKRKSVYQAKNIHLKFGENVELDACQEIFFGDKKVFIYHAIDSATGKLLELQCEEQETNVGYQKLIDKLFKKYGFPSNITTDRRRTFWGSEKTYTMFEEALIDRGITLFVSSNPKDKPNVERSFASAQNYYPYLFKNKGIDSIEKLNKRSEEIIDEYNRHFQKTEGNKESKFIKNDPSSNIYDFSLRIRRRVNNGVVMYKNKMLAPYDEHNKRLMFFSQSGKDINLCLDVNQNLYFEINNKKYIAKVVEESELNETEIYALAKGLDISIPQVHVIAKAIVNSRKFTLAQSQLRHFPDEILKNENAQKIIKILERSEEILLKLYNLLEKDIEWKDKVAFIDN >LR214950.1|VEU58994.1|1005728_1007264_+|Uncharacterised-protein 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MKKLKTLFLGSLALISPLSFISCDDKTKNEVDLYQEITKDASVASLYETSFKQINDLLISSVDEVISNIKNDENIKERFKDKQEEFETELARIQTELLNKEKMAEFYENGLTLIKEDLAKNNNKYQLSIILGKINNYTFSNGSYPTAILNFAYNYLNKDTAKKIDALVKKYDLRKLWLQVNNNFNYFKEEMDLFLDKFAQKETGEFTITPKDLLNKTVASLDEFATGFKTVVAIKDDAEQNQKMNELLQNIAAKYQEIVKQFQDNFANIIYKNGEQYQNRPFSLTTLHSTYEKMNESGSVLIKKIPFVTKEDVQSLLSVFAKQNPSLDTDEKRQEWINGTNEKLNQILADNADKLDLENVDTLDDLVPFQAMSVTLKLSNNANEETPILIYKKNDQNEFDKHNLDPKLDPKLDPKSIAGKKLLSTQIADKVKEKYLVKMDLDYLKFFSKNSTFNPSFIEFFKKLNADSIKDNNGRFIFPQTPLAFVSYLDLKVVSLNVQDNNLNLEFKFFDHGNERIIDTIGATFYESSKARLFDFSTTSQNASLPITNTTLYFELSEEQYDKLIGSKILEDKTFENVQPARDPQNPDRILPHPGLAPVAPEAPTRPNEHAHDNENISEEEKQAKYQAELEQYNQELEAYNQKKDEYDKLMEKYNSDLVQYNELNAKYIEVQKQKEEYRKAQLAKFAEIVIDLSMN >LR214950.1|VEU58996.1|1009712_1012205_+|Valine--tRNA-ligase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
7826 : 83655
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR214950|7826:83655|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_phage(11.11%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
398143 : 430870
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR214950|398143:430870|DBSCAN-SWA 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24 | Mycoplasma_phage(50.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
886299 : 894969
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR214950|886299:894969|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR214950|886299:894969|886299_888474_+|VEU58928.1|DBSCAN-SWA MYKFKFADIGEGLHEGVVAEIYKKVGDVVKEGDSLFSVETDKVTSDIPSPVDGKIVQVLMNQGDTIHVGQEIYVIDDGSGDDAEAAAPAQESQAESAPASEGAHEFYSFKFADIGEGLHEGVVAEIYKKEGDTVKEGDSLFSVETDKVTSDIPSPVDGKIVKVLMNQGDTIHVGQEIYVIDDGKKHSNAAAPAAAKASGGGASVVGVMEVNDDLLDFSSLSASSSSTKAEVSAPKQEAALASSDASFDEGKAYTGAIEEEFDVIVVGSGPGGYLAAEEAGKSGLKTMIVEKKYWGGVCLNTGCIPTKSLLKSTEIISDIKHAEKYGVVATSSIDNEATWKSMHERKTGVVSKISKSVEMLMKSSKVKSLFGEAKFVGAREIEVNSKVYRAKNIILATGSTANQLAMLPGFKEGYENLEIITSEEAINWDKSLPKKVTIIGGGVIGLEFATVFATAGAEVTILQNTDKLLPMNEPEVAQESAKMLDKMGVKVLYNAQSQKYEGKKLYVLVDGKETVLEQDIILTATGRSANSKGLAEVGVKLGQRGEVIVDKHQRTNVRNVYAIGDVTGQNMLAHVAYAHALVAVSHILGDEEKGTYKPKGIPGCIYTTPEIAFVGLTEAEAKKQGRNVFASKYLFEYLGKAIAASHTEGFIKLIVDKEFGEILGATIVGANATDYITEVLLAMEQEVTVHEIAHTIHPHPTYNEIIWEAARSASLKLDLEKHKK >LR214950|886299:894969|890870_891539_+|VEU58931.1|DBSCAN-SWA MKNSFLEILQSEGKKDYFQNILVSLKESEKNGPIYPHQINIFHPFEFFQVNETKVVILGQDPYHGYDQADGLAFSSKNLKTPPSLRNIFKELKKEYPKTKIETNDLSAWAKQGVLLLNTILTVNYNMPLSHKHFGWETFTKEVLKQVALQAPKAIFVLLGKHAQKFAQDLNLDPSRVIATSHPSPYSYKKGFENSGIFKLINKKLKQNGLEPIKWDLKKESK >LR214950|886299:894969|891538_893692_+|VEU58932.1|tRNA|DBSCAN-SWA MVFSLNYLNKFLPNKKLDASVEIALNELGFEVEEIKPFSDVKGVIFAKVISKELNPNTPKLDVVLVETKLGNLTIQTNNQILNPGDLTVIFPIGSSKADHVFGEATIKGVNSQGMFGAFSELGYDWELLEKENQVLKLPSYFASLEDDPMQILGLDDLMVEVSTTANRNDANSYYVLARELAAYYKTDFVFDFKKPSKTFASQIKVQRGDADELNFLETKGKVVLNFEDKLLLAKSGIDTKHPDAVNLTNLTLLITGAPTHVYNKDLIGDNLTAKMFSGSLTIFGNKEVDVKDILAIYDENGPISIASVMGLEVFKVEQEATNLCFEIGIFKNELVRHAAKEIKLLSNSASQGSRVISKEATLLGIKFIQSYLSNLEQSNLITTIDKVEQKQIQIDNNKLKTYAQVEELSIFSPAIEQLKMLGYIFDEKVVTVPNYRYDVVLFEDIIEEIFRFYSYANFKPITIKNKPIKVKPINKDKAFLLAQGYNEARTFTLVSKERNTLNPFNFESSIDLLTFVSKERETVRNSIITSLSEIVLYNQKRKMSEINFFEKGMINYNVQVYGLASTTKGFFEIKRDIVNLLKDDALTFVPWKDCEFIHPNVSAKIYKGDKLIGWIGKIHPRYDETGAFYAEILDLEHKASNKFEAFDQNPLKTLDLTFQIGLHHYIGDKVAEIKALANVFDIKQIDNYLKEDSRSVTLRIFANEEAITLLDSHYNK >LR214950|886299:894969|889927_890881_+|VEU58930.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTFDKNKFNSFEDLKQFKAKVYSSEGEIAALQLKLRTAPNEEKKEIGKQINVLKTQYEALFEEIGAYLKEKQIKEKVASEFIDVTIPAAKNPSLNPISLVENKLREWFFENGYYEQQAGEIVSDLYNFERLNIPKNHPARAMHDSLYLNASTLLRTHNTGITATVLEECANSEVSTFAIGKVYRNDEDDATHSHQFTQLDFVSVGKVSFPNLIWTLKSMLSYVLEEEVEVRLRPSYFPFTEPSVEVDVFYKNRWIEILGAGMLHPNVLKMAGYTNDINGFAAGLGIERITMIKYGFSDIRDLYRNDLRALEQFNNEK >LR214950|886299:894969|893700_894969_+|VEU58933.1|DBSCAN-SWA MYSKIKLHDKVVSDAINNELVRQEDFIQLIASENFVSEDVLIAQGSVLTNKYGEGYPGRRYYGGCENVDVVETAAIERLKAIFGVKYANVQPYSGSVANAAAIASVVPHGGKIMGLSLSSGGHLTHGYKISFSGIFYNAVSYDLGKDEKLDYDAIEAFAMQEKPDLIICGYSAYSQIIDFKRFKEIANKCGAKLLADIAHIAGLIAGGVHPSPVGYADIITSTTHKTLRSGRGGIIMTNDEEIAKKMDRWVFPGYQGGPLFHAIAGKAVGLYEVMQPMFKEYAENIVKNTKTLCEFFKSKGARIISGGTENHLFLMDVNQTYSITGKEAEALLDKVNITINKNSIPFDTLSPMVTSGLRFGTAAMTSRGFTKWIELGEIIHHCLSNHAKLSSDTPEAKAELAQIKSKVLALTKEFPIKKSYL >LR214950|886299:894969|888711_889917_+|VEU58929.1|DBSCAN-SWA MKNLANEIRPMQIDQLVGQNNIKKLLKEVVKNNLTTSFLFFGESGIGKTSAAFALANEMGKKFGYFNATVQSKKELVELLDSCEIIIIDEIHRLNKDKQDILLSYLEFDKIIVYATTTENPYFKVNPAVRSRMQVIQFSKLSEEDIVFGLRNIIDSKYSEMQISDNLLLSLARQSSGDFRMSINNLQMLYFMKKDSTITENDLKIIIPNINFYSDMNSSSHYNNLSAFHKSLRGSDPHAALYYGMLILKSGDIDGLFRRMLCVAYEDIGLANPNITLRVKTAIEAFERLGLPEGKLPIAFAIIDLCLSVKSNSVIVAIDNVEKQIETGGIYEIPKHLRDAHYASAAKLGDGIGYKYPHNYVNNWVDQEYLPKKIHHLKFYIPQNNDMELKYQNYWKKVKNK |
6 | Erysipelothrix_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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