CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
LR215041	Mycoplasma columbinum strain NCTC10178 genome assembly, chromosome: 1	0 crisprs	DEDDh	0	0	1	0

1. LR215041

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	91525 : 98817	6	Bacillus_phage(16.67%)	tRNA,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>LR215041|91525:98817|DBSCAN-SWA
TATGAAAAATTTAGCTAATGAACTCCGTCCACAAACTTTAGATGAAATAATAGGACAAAAACATGTGATTGAAACTTTGAAAAAAGTGGCCAAAAATAAATTAAACACAAGTTTTATTTTTTTTGGAGAAAGTGGCACAGGTAAAACCTCTACAGCAATTGCATTAGCTAATGATATTGGATATTCTTATGGATTATTTAACGCTACTTTACATTCGAAAAATGACCTATTAAAATTGTTAAAAGAACATGATGTTGTTATTATTGATGAAATACACCGACTAAATAAAGATAAGCAAGATATTCTTCTTTCTTATTTGGAATCAGATTTGACAATAGTTTATGCAACAACAACGGAAAATCCTTATTTTAGAGTCAATCCAGCGTTAAGAAGCAGAATGCAGATAAGGCAGTTTAATAAACTTTCAGAAGATGATATTTTTCAAGGGCTAAAACTAATTCTAGAGAAACATTTTTCTCATTTAGAAATTGAAGATGATGTATTAAAAAACTTAGTGAAATTTTCAAATGGTGACTATCGTAATTCAATTAATAATCTACAATTAATTTCTTTATTGTCAGATGATAAAAAAATTACAGAAGATAATTTGAAAAAGTTTATACCTAATATTAATTTTTATAGTGATATGGATTCCAATGCTCATTATAATAATTTATCCGCTTTTCATAAGTCACTAAGAGGTAGCGATGTGGATGCTGCCTTGTACTATGGTAGTTTGATTTTAAAAACTGGAGATTATCAGGGTTTATATAGAAGACTAATTTGTGTCGCTTATGAAGATGTTGGTTTAGCAGATCCTAATCTAGCTTTAAGAATATCAACGGCGTTTGATAATGTTGAAAAATTAGGATTTCCAGAAGCAAATTTACCAATTTACTATTCAATAATTTCTGCTGCTTTAGCACCTAAAAGTAATTCTGTTTATTTAGCTTTGAGCAAAGTTCAGAATTTTATAGACCAAGGAAATATTTACGAAGTCCCAAAACATTTGCGTGATTCACACTATGCAGCTGCTAAGAAATTAGGTGATGGAATTGATTATTTATATCCACATAATTTTCCCAATTCAATTGTTAAACAGGATTATTTGCCAAAAGAAATAAGAAATATAAATTTTTTTGAATTTAAAGAAAATGATCTAGATAAATTAAAACAATATTATGAACAAATAAAAAATCTTAAGGAGAAACATGAACATTAATTGAGATGAAATTTTAACACTAGAAGATTTAAAACAAGCCAAAAATAAAATCTATGCTAAAGGAAGTGAACTTTTTGAACTTCAACAACAAATAAGAAGTGCCTCACCAGAAGAAAAAAAAATAATAGGGCAAAAAATTACAGAACTAAAAAGTTTTTTTGAAAACAAATTTAAAGAAGCAGAGTTAAAAATTGAAAATGAAAAAATTAACAAAATTATTAACTCTGAATACCATGATGTTACTAAACCATTACATTTTACTGGATCACTCCATCCAATAACAATTATTGAAAATAGATTAAGAGATTGATTTATTCAAAACGGATATTTTGAATCAAAAGCAGGAGAAATTACTAATGATCTTTATAACTTTGAAAGATTAAATATTCCTAAAGATCATCCAGCGCGTGATATGCAGGATTCACTTTATATAGATTCATCTTTACTTTTAAGAACTCATAATACTGGAATAAGTGCATATGAGTTAGAAAAAAGAAATAACAAACCAATTAATACTTTTGCTATTGGAAAAGTGTATAGAAATGATGAAGATGATGCAACACACTCACACCAATTTACCCAATTAGACTTTGTTAGTGTCGGAAAAGTAAGTTTTCCTAATTTAATTTGAACATTAAAATCTTTACTTAGTTATGTATTTGAAACAGACTTAGAGTTAAGATTAAGACCAAGCTACTTTCCTTTCACAGAGCCAAGTGTTGAAGTAGATATTTACTACAAAAATAGATGAATAGAAGTTTTAGGTGCTGGTATGCTCCATCCTAATGTTTTAAAAATGGCCGGTTACGATGTTAAAAAATATAATGCCTTCGCAGCTGGTTTGGGTCTCGAAAGACTTGCAATGATCAAATATGAAATTAAAGATATTCGTGAATTCTATAAAAATGATTTGCGAACTTTAAATCAATTCAATGATGAAAAATAGTTTTTTAGATTTTCATTTACAAGAAATCCAAAAAAGCTATTTTAAAGAACTATTAGAAAAAATAAAAAGAGAAGCAAAAACAAATACCATTTTGCCTGCACAAGATAAATGATTTAGAGCATTAGAGTATTTTGCTCCCGATGAAACAAAATTAATAATTTTAGGACAAGATCCTTATTATTTAAAAAATCAAGCAGATGGTTTAGCATTTAGTTCAAATTTTTCACAAACTCCTAAAAGTTTACAAAATTTGATGCTTGAAATTAAAAAGGACTATCCTAGTGCAATATTTGAAACTAACAAGCTAGTTTCATGAGCAAGACAAGGTGTTTTATTACTTAATACTATCTTGACGGTAAATGAAAATAAGCCACTGAGTCATAAAAATTTTGGATGAGAAATTTACACTTCTAATCTAATTAAATTTATTTATAGGCAAAATCGTAAATTTATTTTGCTTTTGTTAGGAAATGAAGCGTTAAATTTCTATAAAGAATATTTGCAAGAAATAAATTTAGAGAAAATTATTTTCAGATCGCATCCTTCGCCTCTTTCATATGCTAGAGGTTCAAAACCTTTGAAAAATTCTTCTCTTTTTAAAGAAATAAATAGTTTATTACCTGAAAATCAACAAATTGATTTCAGTATTAGAAAGGATAAAAAATGTTAGTTTCATTAAAGACATTAAATAAATTCATAAAAGGCATCAAATTAGATTTAAGTGTCGAAAAAGCCATAAATAATTTAGGATATGAAGTAGAAAGCATCACTAAATTTTCGCAAGTTGAAGGGATTAAATTTGCAAAAGTATTAGATGTTTATAAAAATGAAAAATCAGAAAATTTAAACGTCGTACACCTTCTAACTAATAATGGAGAAATTACCATTCAAACAGTAGCTAAAAATGCGCAAAAAGGAATGTGAGCTGTTGCTTTTGTTGAAGGTGCTAAATTAGGAGATATTGTTTTTGGAGCCAAAAAAATGGCAGGTGTTTTATCACAAGGAATGTTATCAGGATATCCAGAATTAGGTTTTGATGTTAAGTACTTACCATACGATGAAGATGATTTAATTATGTTAGATGATTCAAAAATAACTTTAGATATGGATCCTGTGGAATATTTTGAATTAGATGATTACATAATTGACATAACAACACCATCAAATAGAGCAGACATTAATTCTTATTATGTTTTAGCATTAGAATTAGCCGCTTACTATCAAAAAGAATTTACTTGATACAAATGAGATGTCGAATATAAAGCAAAGTTTAAAAGCAAAATGAGAATCAATAAAAATGCTGCAAAAGCATTAAGTTTTTTTGAAGTTAAATTAAAAAATACAGAAACTTCTTTAAACGATCAATTATTTTTAGCTAAACACAAAGTGGAAGCAAAAAATAATTGAGCAATTGATATTACTAATATGAATTTATTATTAACTGGTGTGCCAACGCATGCTTATGATAAACAATTAATTGGAAATGATATTTCTTGTGATTACTTTACTGGAAAAGTTACAATTTTGGGTAATAAAGAAGTTGAAGTTGAAAATGTTTTAGCAATCAAAGATGACAAAGATGTTATTTCATTAGCTTGTGTTATGGGATGTGAAAATTCTTCAGTAAATGACAAGACAACTCATATAGCTTTTGAAATAGGTTCATTTGACCCTAAAAGCGTAAGAAAAGCAGCAAAACAAATCAAAATAGATTCTAATTCATCAATTCAAGGTGCTCGTGGTGTTAATAATGAAATGGTGAGAATGGGAATTAAGTTTCTTCAATATATGGTTCACAAATATAAACAAGATTATAGTCAAGTTTTGAAACTACCGAAAGCTAAAAAAAGAACTTCAATTATCCAAAATCGTCATAAATTAGCTACATATGCAAATTTAAATATCAAAAATTTAGATGTTTTTAAAAAAGTAGAACAACAATTAGAATACATTGGATTTGAGCAAAATAAAAATAGAATTTTAACTCCTATTTATAGAAGTGATATTCATACTTATGAAGATATCATTGAAGAATATTTTAGATTTTATGGTTATGATCATTTTAAACCTGAAGCACCATATTTATATACAACAGAAGTTGTTTCCAAAGACATTAATAAAGAAATGTTAAAACATATGGGTTATCAAGAAATTAGAACCTTCACTTTAGTAAGTAAAAATAAAAATATTTTTAATCCATTTGCTTTTGAAAAAAATATAGATTTAGAAACTTTTGTTTCTTTGGAAAGAGAAGCAGTAAGAAATTCAATTGTACCTTCAATGCTTGAAGTTGCAGAATACAATATTAAAAGAAAAATTGCAGATTTTAATTTATTCGAAAATGGAATGATTAATAATAATGAATATGTTTATGGTTTAATTTCAACTATTAAAGACATAGATCAAATGAAACAAGATATTGCAAACTTCTTAAATAGTAAGAATTTAGAATTTATACCATATACAGATAATGATTATGTTCATCCTAATTTATCTGCAAAAATTTACCAAAATGGTCAATTTATTGGATGAATAGGAAAAGTTAGTCCTAAATATTCTTCTTTAAATTTAATTGTTGCAGAATTTAAACAAGTAAAAATTAACAAAAATAAAAAAACTTTTAAAGAATATTCAAGTGATCCATTGAAAACTCTAGATTTAACATTTGCATTAGAATTAAGAGAAACAATAGGAACAAGAATTGTCGAAATTCAAGAAAATTTTGCACTTTACAATATTAAACAAATAGATAGTTTTGAAAAAGAAAACCAAAAATATATTACTCTAAGAATAGTAGCTGAAAGTGAAGTAATTAAAGCAATAAATGAAAAATATAACAAATAATGTGAGGTTAAATGTATAGACTTAGATTAAAAGATAAATTAGTTGAAGCTTCGATTAATAAAGAAGCAAAGAGACAAAGAAATCACATTGAATTAATAGCAAGTGAAAACTTTGTTAGTCAAGATGTTTTAAAAGCCGTTGGATCCATAATGACTAACAAATATGCAGAAGGTTATCCTGGTAAAAGATATTATGGTGGTTGTGAATATGCTGATGAAGTGGAAGACTTGGCAAGAGAACGTCTAAAAAAATTATTTGGTGTTAAATTTGCAAACGTTCAACCTTATTCAGGATCAACAGCAAATGCAGCAGCAATTTCTTCTATTTGCCAACCTGGAGATAAAATTATGGGATTATCTCTTTCTTCAGGTGGTCATTTAACTCACGGTTATAAAATTAGTTTTAGTGGTATTTATTTTAACGCAATTACCTATGATACAGATGAAAACGGTTTACTAGATTATGAAGCCATTAAGGAAAAAGCCATTAAAGAAAAACCAAAATTAATTATTTGTGGTTATTCAGCTTATTCAAGAGTAGTTGATTTTAAAAAATTTAGAGAAATTGCAGATGCTTGTGGTGCTAAATTAATGGCAGATATAGCTCATATTGCAGGATTAATTGTTGGCGGAGTTCATCCTTCTCCTGTTGGTTATGCTGATATTATTACTTCTACAACTCATAAAACTTTAAGAGGTGCAAGAGGTGCAATCATAATGACTAATGACGAAGAATTAGCAAAAAAAATTGATCGTTGAGTTTTCCCTGGTTATCAAGGAGGGCCTTTAGTTCACCAAATAGCAGGAAAAGCGGTAGCTTTTGGTGAAGCACTAAAAGATTCATTTAAAACTTATGCTCAAAATATAATTAGTAATGCTAAAAGATTTTCAAATAGATTTCTCGAAAAAGGTATCAAAATAGTTTCGGGCGGAACGGACAATCATTTATTTACCCTTAATGTTTATGATTCATACAATATTACAGGTAAAGATGCCGAAAAATTATTGAGTTATTTCAATATAACAACAAATAAAAATACAGTTCCTAATGATACTTTGAGTCCAATGATTTCTTCAGGCCTAAGATTAGGTACTGCCGCAATGACTTCTAGAGATTTTGATGAATGAGAAAATTTAGCAGATTTAATTGATGAAATCTTAAAAACAGGGCCAACTATTTTAGAAAATCTAGAATTATTTAACAAAATTAAGAAACAAATTAAAAAATGAACTAAAAAGTATCCTATTAAAAAATATTATAATTAAGCACACAAAATGTGCTTTTTTATTTTTACCCTTTTTTATAGTAAAATAAGAATATTATTTACAAGAGGTAACTTATGAAAATTTTAGGCATAGAAACAAGCCATGATGATACTTCTATTGCACTTTTAGAAGATGGAAAAATTTTAGATTTAATAACTATTTCACAAATTGAAATTTTCAAAGAGTTTGGTGGCACGATTCCAGAACTAGCTTCGAGAGAACACGTAAAAAATATTCATTTAATTTTGCAACTTCTCTTAAAAAAATGAAATTTAACTGAATTAGATTATATTGCCTATACAGAAAAACCTGGATTAATTGGAACTTTACAAATTGGATTTCTTTTTGCCAACGCTTTAGCTTTAAGTTATAAAAAACCTTTAATTCCAATAAATCATTTAGAAGGTCATTTTTATTCTGCTGCAATAGATTCTGAAATAAAATATCCTGCTTTATGTTTATTAGTGTCAGGCGGACATACACAGCTAATGTATATTCGAAACCCCTATGAAATAGAGATAATTGGCCAAACACAAGATGATGCAGTTGGTGAAGCGTTTGATAAAGTTGCAACAAAACTAAATTTAGGTTTTCCAGGCGGACCTATTATTGATAAATTATTTAAAAACAAAAATGACAATTCATACTATAAATTAACAATACCTAAAACAGAAAATGATTTAGATTTTTCATTTAGTGGACTAAAATCTCAAGTAATTAATCTTTATCGTAATTCCATTGATAGAGGTGAAAAACTCGATGAAGTTAAATTGGCTTGTAGTTTTCAAAAAACAGCAGTGCAGTATCTAATTGAACAAACGAAAAAAGCTATAAAAAAATATGAATTTGAAACACTTGTATTGGCGGGTGGTGTTAGTGCAAATAGTTTATTAAGAGAAGAATTTCTTAAATTAAGTACAAAAGCAATTATTCCAAATTTAAAATATGCAACAGATAATGGTGCAATGATTGCAATGTGTGCCTATGAACAGTTGAAATTTAAGAAAAATAAATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>LR215041|91525:98817|94355_96536_+|VEU76685.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MLVSLKTLNKFIKGIKLDLSVEKAINNLGYEVESITKFSQVEGIKFAKVLDVYKNEKSENLNVVHLLTNNGEITIQTVAKNAQKGMWAVAFVEGAKLGDIVFGAKKMAGVLSQGMLSGYPELGFDVKYLPYDEDDLIMLDDSKITLDMDPVEYFELDDYIIDITTPSNRADINSYYVLALELAAYYQKEFTWYKWDVEYKAKFKSKMRINKNAAKALSFFEVKLKNTETSLNDQLFLAKHKVEAKNNWAIDITNMNLLLTGVPTHAYDKQLIGNDISCDYFTGKVTILGNKEVEVENVLAIKDDKDVISLACVMGCENSSVNDKTTHIAFEIGSFDPKSVRKAAKQIKIDSNSSIQGARGVNNEMVRMGIKFLQYMVHKYKQDYSQVLKLPKAKKRTSIIQNRHKLATYANLNIKNLDVFKKVEQQLEYIGFEQNKNRILTPIYRSDIHTYEDIIEEYFRFYGYDHFKPEAPYLYTTEVVSKDINKEMLKHMGYQEIRTFTLVSKNKNIFNPFAFEKNIDLETFVSLEREAVRNSIVPSMLEVAEYNIKRKIADFNLFENGMINNNEYVYGLISTIKDIDQMKQDIANFLNSKNLEFIPYTDNDYVHPNLSAKIYQNGQFIGWIGKVSPKYSSLNLIVAEFKQVKINKNKKTFKEYSSDPLKTLDLTFALELRETIGTRIVEIQENFALYNIKQIDSFEKENQKYITLRIVAESEVIKAINEKYNK
>LR215041|91525:98817|92735_93692_+|VEU76683.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MNINWDEILTLEDLKQAKNKIYAKGSELFELQQQIRSASPEEKKIIGQKITELKSFFENKFKEAELKIENEKINKIINSEYHDVTKPLHFTGSLHPITIIENRLRDWFIQNGYFESKAGEITNDLYNFERLNIPKDHPARDMQDSLYIDSSLLLRTHNTGISAYELEKRNNKPINTFAIGKVYRNDEDDATHSHQFTQLDFVSVGKVSFPNLIWTLKSLLSYVFETDLELRLRPSYFPFTEPSVEVDIYYKNRWIEVLGAGMLHPNVLKMAGYDVKKYNAFAAGLGLERLAMIKYEIKDIREFYKNDLRTLNQFNDEK
>LR215041|91525:98817|97875_98817_+|VEU76687.1|protease|DBSCAN-SWA
MKILGIETSHDDTSIALLEDGKILDLITISQIEIFKEFGGTIPELASREHVKNIHLILQLLLKKWNLTELDYIAYTEKPGLIGTLQIGFLFANALALSYKKPLIPINHLEGHFYSAAIDSEIKYPALCLLVSGGHTQLMYIRNPYEIEIIGQTQDDAVGEAFDKVATKLNLGFPGGPIIDKLFKNKNDNSYYKLTIPKTENDLDFSFSGLKSQVINLYRNSIDRGEKLDEVKLACSFQKTAVQYLIEQTKKAIKKYEFETLVLAGGVSANSLLREEFLKLSTKAIIPNLKYATDNGAMIAMCAYEQLKFKKNK
>LR215041|91525:98817|96547_97801_+|VEU76686.1|DBSCAN-SWA
MYRLRLKDKLVEASINKEAKRQRNHIELIASENFVSQDVLKAVGSIMTNKYAEGYPGKRYYGGCEYADEVEDLARERLKKLFGVKFANVQPYSGSTANAAAISSICQPGDKIMGLSLSSGGHLTHGYKISFSGIYFNAITYDTDENGLLDYEAIKEKAIKEKPKLIICGYSAYSRVVDFKKFREIADACGAKLMADIAHIAGLIVGGVHPSPVGYADIITSTTHKTLRGARGAIIMTNDEELAKKIDRWVFPGYQGGPLVHQIAGKAVAFGEALKDSFKTYAQNIISNAKRFSNRFLEKGIKIVSGGTDNHLFTLNVYDSYNITGKDAEKLLSYFNITTNKNTVPNDTLSPMISSGLRLGTAAMTSRDFDEWENLADLIDEILKTGPTILENLELFNKIKKQIKKWTKKYPIKKYYN
>LR215041|91525:98817|91525_92746_+|VEU76682.1|DBSCAN-SWA
MKNLANELRPQTLDEIIGQKHVIETLKKVAKNKLNTSFIFFGESGTGKTSTAIALANDIGYSYGLFNATLHSKNDLLKLLKEHDVVIIDEIHRLNKDKQDILLSYLESDLTIVYATTTENPYFRVNPALRSRMQIRQFNKLSEDDIFQGLKLILEKHFSHLEIEDDVLKNLVKFSNGDYRNSINNLQLISLLSDDKKITEDNLKKFIPNINFYSDMDSNAHYNNLSAFHKSLRGSDVDAALYYGSLILKTGDYQGLYRRLICVAYEDVGLADPNLALRISTAFDNVEKLGFPEANLPIYYSIISAALAPKSNSVYLALSKVQNFIDQGNIYEVPKHLRDSHYAAAKKLGDGIDYLYPHNFPNSIVKQDYLPKEIRNINFFEFKENDLDKLKQYYEQIKNLKEKHEH
>LR215041|91525:98817|93681_94362_+|VEU76684.1|DBSCAN-SWA
MKNSFLDFHLQEIQKSYFKELLEKIKREAKTNTILPAQDKWFRALEYFAPDETKLIILGQDPYYLKNQADGLAFSSNFSQTPKSLQNLMLEIKKDYPSAIFETNKLVSWARQGVLLLNTILTVNENKPLSHKNFGWEIYTSNLIKFIYRQNRKFILLLLGNEALNFYKEYLQEINLEKIIFRSHPSPLSYARGSKPLKNSSLFKEINSLLPENQQIDFSIRKDKKC

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
VEU76682.1|91525_92746_+	ATPase	A0A127AWE7	Bacillus_phage	5.3e-62	34.4
VEU76683.1|92735_93692_+|tRNA	phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha	A0A2I2L4E3	Orpheovirus	2.2e-31	37.2
VEU76684.1|93681_94362_+	uracil-DNA glycosylase	O39497	Bovine_herpesvirus	1.2e-23	34.1
VEU76685.1|94355_96536_+|tRNA	Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit	A0A1L3IZU3	BeAn_58058_virus	2.1e-13	32.8
VEU76686.1|96547_97801_+	Serine hydroxymethyltransferase	A0A240F3L3	Aeromonas_phage	6.6e-100	50.4
VEU76687.1|97875_98817_+|protease	o sialoglycoprotein endopeptidase(Glycoprotease)	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.7e-56	39.1