CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
LR215042	Mycoplasma meleagridis strain NCTC10153 genome assembly, chromosome: 1	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. LR215042

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	584721 : 592336	7	Bacillus_phage(28.57%)	tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>LR215042|584721:592336|DBSCAN-SWA
TTTATTTCTTGTTTAAATTTTCTAATTCTTTTTCAATTAACCCTTTAAGTTTAAGCATTTCTCCAAGGGTTAATGTGATTCCTTTACTTGCTCTTGTGTGATCGTTATTTCAATCTCTGATGTCATATTTAGGTTCATTGTTGTTTCACGAAACATAGTTTAATTCTTTTGTATATTCGCCTTCAATTTCAGAAATATCACCCAATTGTCTTACTATTTCATATTGAAGGCCTTTTTCTTTTTTACTACTCGCTGGCATTGATACTCCTTTCTTTTTATAAGCTCGATATTTTTAAATTATATATTAACATTTAAATTAATGAATATTAGTAGTTTCTATTTATTTTTAATTTTAAAATAGGCACAAATAGCGATCATTGCGCCATTATCTGTGGCGTATTTTAAATTAGGAACAATAGCATTTTTACTAAGCTTTAAAAATTCTTCTCTTAGTTCTTTATTAGCGCTAACGCCGCCTGCTAAAACTAATGAATTTAACTTATATTTTTTAATTGCTAATTTAACTTTCGAAATTAAATAATTAACAACACATTTTTGAAAAGAAGCAGCTAACTGTGTTTCGGAAATTTTTTGATTTTTTTCTATAGAATTTTTATACAAATTAATCACGTTTGATTTTAAACCGCTAAAAGAAAAATCAAGATCATTAATAGTTTTGGGATTTTTTAATTTTATATATTCCCCTTGATAATTTTGACTTATTTTATCAATTATAGGTCCGCCAGGAAAACCTAAATTAAGTCTTGTAGAAACTTTATCGAAAGCTTCGCCTACTGCATCATCTAATGTTTCACCTAATATCTTTATTTTATGAGGGTTTTCAACATATAATATTTGCGTATGTCCACCAGAAACCAATAAACAAATTGATGGATATTTAATTTTGTTTTCAATAGCATTTGAATAAAAATGACCTTCTAGATGATCAATTCCCATCAAAGGTTTATTTAATGCTAATGAAAGAGCGGAAGCAAATAAATAACCTATTTGTAAAGTACCTATTAATCCTGGTTTTTCTGTATAAGCAATATAATCAATTTCATTTAGATCATATTTTTTCATTAAAATAGTTTGAATTAGATTAATGTTTTTAACATGTTCTCTTGAAGAAATTTCAGGAATAGTTCCACCAAATTCTTTAAAAATATCAATTTGGCTAATAGTAATTAGATCAAGAACTTTTGTATCTTCGATTATTGCTATAGAAGTATCATCGTGACTAGTTTCAATTCCTAAAATTTTCATATTGCTCCGTTTTATGGATAAATTAGTTAATTAATAATATTTTAAGATGGGATATTTTTTCATTCATTTGGCGATTTGTTTTTTAATTTTTTTAACTTCTTCTTTATTTTCTAAAATTTTATAACCCGTTGAGAGAATTTTATGAATTATATTAGCTAATTCAACTCATTTATCAAAATTTCTTGAAGTCATCGCCGGAGTACCTAAACGTATTCCAGAAGCAATCATAGGGCTCAAAGTATCATGAGGAACTGTATTTTTATTAACGGTTATATTAAATTCGGCCAATAAACTGCTTGCTTCTTTTCCTGTTAAGTTATATGTTTTATAAACGTTGATAGTAAATAAATGATTATCTGTTCCTCCCGCCACAATAGTAGCACCATTATTTTTGAAAGCCTGGGCAAAAGTTTTGGAATTTTTAACAACATTATGAGCATAAATTTTAAAAGAAGGTTTCAATGCTTCATTAAAAGCAACAGCTTTACCAGCTATTTGATGCACTAAAGGGCCACCTTGAAAACCCGGAAAAACTCATCTATTCATTTTTTTGGCTATTTCTTCGTCGTTAGTCATAATTACTGCCCCTCTTGCTCCTCTTAACGTTTTATGAGTAGTAGAAGTAATAATGTCAGCATAAGGAACAGGTGTAGGATGAGCACCTGCAGCAATTAAACCTGCAATATGAGCAATATCAGCCATTAATTTCGCACCGCATTCATCTGCAATTTCTCTAAATTTTTTAAAATCAATCATTCTCGAATAAGCAGAATAACCGGTAATTATTAATTTAGGTCTTTCTTTTAAAGCTATTTCCTTAATTTTTTCATAGTCTAAATAACCGTTTTCATCTGTTTCATAAGCAATTGCATGAAAATAAGTTCCACTAAAAGTAATTTTATAACCATGAGTTAAATGCCCTCCCGAAGAAAGAGAAAGCCCCATTATTTTATCTCCTGGTTCACATATTGTTGCTAAAGCGGCAGCATTAGCAGTTGAACCTGAATATGGTTGAACGTTAACATATTTCACATTAAAAAGTTTTTTTAATCTTTCCTTTGCTGTTTCTTCAATAATATCAACAAATTCACAACCATCATAATATCTCTTTGAAGGATATCCCTCAGCATATTTATTTGTTAAAATAGAACCAACAGCTTTTAAAACATCAACACTTACATAATTTTCGCTAGCAATTAATTCTATATGACTTTGTTGTCTTTTTTGTTCATCTCTAATTGCTTTTTCTATAACTTTATCTTTTAACGAAAACATTATTCTCCTTTATTATGGAAAGAATCATTAATTTGATTAATAACATTGTTTTTTGCTGTTATTCTTATAGTAATATTTTTTGTATTTTCTAGGTTATAAACATCAATAATTCTGCAGTCAAAAATTTCATAATTTTCTTTTAATTCATTAATTTTTTTGCCTATCATTTCTTCATTTTTAAGACTAAAGGTTATGTCTGTTGTTTTTAAAGGAGAATTATCATATTCCTTAAATAAAAATTTATTTTTAATTTCTGAATTATTATTTTTTTCCCCGTTTAAAGTGAAATAATCATTTTCTTTTTCTAAATTTTTGAATTCAGCAACAAAACAATTTAATGATGTATATCTAGGATTAATTTTTCCTAATCAACCTATTAAAACATTATTTTTATAAATTTGTGCTGATACATTAGGATGAACAAATTCATTATTTTTAAAAGGTTTAAAATCAATTGAATCATCGCCAATTAAGTTAATAATATCTTGCTTCATTTGTTCAAATGTTTTTGTAGTTGACAATAGTCCATAAACAAAAGTTTCTTTATTTATTAACCCGTGTTCAAAAATACTAAAGTTTTTTATTTTTCTTTTATCGTTATATTCTGCGACCTCTAAAAGAGAAGGAATAATTGAATTTCTTATTATTTCTCTTTCTAGTGAAACAAAAGTTTTTAATTTAACAGTATTATCAAAATTTAAAAAATTAAACTTTTTATTTTTTTCGCTTGTTAAAGTAAAAGTTCTTACTTCTTGGTAACCCTGTGAAGATATTTTTTCTTTTGTTATTGTTTTAGGAATTATTTTATTATTCAATAAGAAAGGTGCTTTAGGAATAAATTTGTCATATCCATAAAATCTAAAATATTCTTCAATAACATCCTCATAACAGCTTATATCACTTCTATATGAAGGAATAGTAACTCTGTTTTTATCCATTTTAAAACCTAAATATTTTAGTTTTTTTTCTACTTCTGAAAAAATAGATAAATTTTTAATGCTTAAGTTTGTATAGGTTGCTAATTTATGCTTACTAATATTTACGTAGTTATTAGCCTTTTTTCTTGGTAAATTAATTGCATTGCTAAAAAATTGTTTATCCTCATTAGCTTTGTAAATTAGAAATTTCATACCATTGATAATCATTTGATAATTAATGCCTCTTGAGCCTTGAATTGATGATTGACTTTCTAACTTAATATTTTTAGCTGTTTTTCTTATTATTCTAGGATTAAATGCGCCTATTTCCAAAACAATTTTTTGACTTGAATTATCAACTGCTGTTTGTTCTAAGCCCATAACTGAAGCAATGGATATAGGTTTATTTTCATCACTTATTACCAAGGAATTATCAAGAATAACTTCTTTATTACCCAAAATATTTAATTTTCCATTAAAAAATTCACACTTTAATTTGTTTCCAATTTTATTCTTGTCGTAGGCATGAGTAGGAGTGCCGTTTAATATTAGGTTCAAATTAGTTATATCAATAGCTCAATTATTCTTTGCTTCAATATTATGTTTTACTAAGAAAAGCATATCTTTAAGTCTTGTTTCTTTATTTACTAACTCTACTTCAAGAAAAGTTAATTCTTCTGCTTCTTTTTTATCTACTTGTAATTTTGAAATTAGCTTAGCTTCTTTTCTAATATCTAAATTAAATCATTTGAACTCTGTATTCAAATATGCAGCAATTTCTAATGCCAAAACATAATAGGAATTAATATCTGCTCTATTTGAAGGAGTAGTAATGTCAAGAATATAATCATCTAATTCAAAATACTTAATAGGGTCTGTATCTAAAGTAATTTCTTTATCTTTAATCATTATTAAATCATCTTTATCAATAGGCATCAATGATTGATTAAAACCTAATTCACTATAACCTGATAACATTCCTTGAGAAGCTATTCCTGCAATTTCTTTTGATGAATAAACTATTCCATTTGCTTTAGAATTTTCAACAAAAGCAACTGTAAAATAACCTTTTTTGACATTATTTGCTACTGTTTGAATAGTTATATTTCCTTTGTTAGTTTGTAAATCAACAACATTTAATTTTTTAGAATTAGGATTCTTATAAACATTTAGAACTTTAGCAAATTTTATTCCTTTAACGTCACTAAATTTAGTAATAGATTCAACTTCATAACCTAAATTGTTGATTACTTTTTCTATTGATAAATCTAACTGGATTTTGGGCAAAAATTTATTTAATTCTTTTAAGGAAACAATCATTTTACTCCTTTCTAATAGAAAAATCAATTGGTTCTTCTAATAGATCATTTATTAATTTAAAGCAGTGAGAATTATAAAAAGGTTTTTTGCCCGTTTTATAACTTAATGGTGAAGGATGAGAAAAATTTAATATTTTAAAATTGTTATTTTTATTTATATTGTTTTCATAAAACTGTTTAGCTTTTTCTCCTCATAAAACTAAAACAATTGGTTTTTTAAGTTCAACAAATTTATTTAACAAATTGCTTGTAAAAATTTCTCATCCTATATTTTTGTTTGACAAAGGTCTATTTTCTATGACAGTTAAAATTGTATTTAATAATAAAATCCCTTGTTTTGCCCAAGAAACTAATGAATTAGTCTCAAAAATTGCTTCTGGATAATCTTTTCTTATTTCCTCTTTAATGTTGATTAAACTTTTAGGAGTTATATTCAAATTTGAACTAAAAGCTAAACCATCCGCCATATTATCAATGTAGTATGGATCTTGTCCTAAAATTATTACTTTTATATCATTAATTTCGCAATAATTAAATGCTCTAAATCATAATTTTTTTACTGGCAAAATTTTCTTTCCAGATTTTTCTAAATGCTCTATTTTATGAAGCATTTGAGCAAAATATTCTTTTTTGCATTCCTCTTTAAGAAATTCTAAAAAACTATTTTTCATTTTTAAACTGATTTAATGTTCTTAAATCATTACGATAAAACTCTCTAATATCTTTAATACCATATTTAATCATTGCTAATCTTTCTAAACCAATTCCAGCAGCAAAACCATTAAAAATATTAGTATCATATCCAGCCATTTTTAAAACATTAGGATGAAGCATACCAGCACCTAAAACTTCAATTCAACGATTATTATAATAAATATCAACTTCAACGCTTGGCTCTGTAAAAGGAAAATAACTAGGACGTAATCTTAATTCAATTTCAGTTTCAAAAACATAGCTTAACAAAGATTTTAAAGTTCAAATTAAATTAGGAAAACTTACCTTTCCAACACTTACAAAATCTAGTTGAGTAAATTGATGAGAATGAGTTAAATCATCTTCATCATTTCTATAAACCTTACCTATTGAAAAAGTATTTATTTCTTTATTTTTATTTTTATCTAAAATTAATGCGCTTATTCCAGTATTATGTGTTCTTAATAACAATTCATCATCGACATAAAGAGAATCTTGCATATCGCGTGCAGGATGATCTTTTTGAATATTGAGTCTTTCAAAATTAAACCTATCTCATTCTAATTCTCCAGCTTTAGCTTCAAAATAAGAATTTTGCATAAATCAATCACGCAATCGATTTTCAATTATTGTAATAGGATGTAATGATCCTGCTCTATTAACTGGAAAAGAAACATCAAGCTTTTCCTTATTAATTAAATTTTCAATTCTTTTAATTTCTATATTTTCTTCTGCTAGTTTGATAAGTTTTTCATACTTTTCATTTAATTCGCTAAGTTTTTGACCAATTATTTTTTTTCGTTCTATAGAAGAATTTTTAATTTCTTGTTTAAGTTTAAATAATTCTCCATCCTTTGAATATATTTTATTTTTAGCTTTCTTCAAATCTTCTAAAGTATTGATTTTATCTCATTCTATATGCATAATATATTCCTTATTTTTTATTAATTTCTTGAATGAATTGATAATATTTTTTCATTTTTTCACTGTCATTATCTTTAAAGTTAAAAAACTTATAATTTTCGATTTCATTTGGTAAATAAGTCTGTTTTACAGCGGAATATGAAAAATCATGAGGATATTTATAACCTAAACCAAAACCCAATTTGGTAGCTGATTTATAATGGTTATCTTTTAGATGCTTTGGTATTTCAAAAACATTACCTTGATCAATAAAACTATTCGCTTTATTAAAAGCTAAATATGCACTATTGCTTTTAGGAGCTAAAGCTGCATTTATAATAGCAAAAGCAATTGGTAAATTTGCTTCAGGAAAACCTAATTTTTCTACGGCATTAAAAGCTGCTTCAATTTTTAATCCTAATAATGTATCTGCTAAAGCAACATCTTCATAAGCAACACACATTAATCTTCTAAATAAACCATGATAATCACCAGTTTTTAAAATCAAAGCTCCATAATAAAGAGCAGCATCGACATCACTACCTCTTAAAGATTTATGAAAAGCTGACAAATTATCATAATGTTTTGATGAATCTTTATCACTATAAAAATTCATATTAGGAATAATTTTTTTTAAATCACCATTTGTAATTATTTTTTCATTGTTCAATAAAGCAACTAGTTGTAAATTATTTAATGCATTTCTATAATCACCATTAGAAAATTTGACTAAATTAAATAAAACGTCATCATTTATATTTAAATTAGGAAAGTGTTTCACTATTATTTTTCTTAATCCTTTTTTTATATCATCTTCTTTTAATTTGTTAAATTGTAAAATTTGCATTCTACTTCTTAACGCAGGATTAACTCTAAAATAAGGAACTTCTGTTGTTGTAGCATAAATAATTGCTTCATCGTTTTCTAAATATGAAAGTAAAATATCTTGCTTATCTTTATTTAGTCTATGAATTTCGTCAATAATGACTATTTCTTTTTCTTTAATTAAAGCCAATAAATCATTTTTAGAATCGATAGTTGAATTAAAAATACCATATGATTTACCTAAATCATTAGCTAAAGCAATAGCTGTAGAAGATTTACCAGTACCACTTTCTCCAAAGAATATAAAACTTGTAGTTAAATTATTTTTCACAATATTTTTTAATAAATCAACTATATTTTCTTGTCCGATAATATCATCCAACGTTTTGGGTCTTAATTTATTGGCTAAATTTTTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>LR215042|584721:592336|587260_589498_-|VEU77692.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MIVSLKELNKFLPKIQLDLSIEKVINNLGYEVESITKFSDVKGIKFAKVLNVYKNPNSKKLNVVDLQTNKGNITIQTVANNVKKGYFTVAFVENSKANGIVYSSKEIAGIASQGMLSGYSELGFNQSLMPIDKDDLIMIKDKEITLDTDPIKYFELDDYILDITTPSNRADINSYYVLALEIAAYLNTEFKWFNLDIRKEAKLISKLQVDKKEAEELTFLEVELVNKETRLKDMLFLVKHNIEAKNNWAIDITNLNLILNGTPTHAYDKNKIGNKLKCEFFNGKLNILGNKEVILDNSLVISDENKPISIASVMGLEQTAVDNSSQKIVLEIGAFNPRIIRKTAKNIKLESQSSIQGSRGINYQMIINGMKFLIYKANEDKQFFSNAINLPRKKANNYVNISKHKLATYTNLSIKNLSIFSEVEKKLKYLGFKMDKNRVTIPSYRSDISCYEDVIEEYFRFYGYDKFIPKAPFLLNNKIIPKTITKEKISSQGYQEVRTFTLTSEKNKKFNFLNFDNTVKLKTFVSLEREIIRNSIIPSLLEVAEYNDKRKIKNFSIFEHGLINKETFVYGLLSTTKTFEQMKQDIINLIGDDSIDFKPFKNNEFVHPNVSAQIYKNNVLIGWLGKINPRYTSLNCFVAEFKNLEKENDYFTLNGEKNNNSEIKNKFLFKEYDNSPLKTTDITFSLKNEEMIGKKINELKENYEIFDCRIIDVYNLENTKNITIRITAKNNVINQINDSFHNKGE
>LR215042|584721:592336|585056_585986_-|VEU77690.1|DBSCAN-SWA
MKILGIETSHDDTSIAIIEDTKVLDLITISQIDIFKEFGGTIPEISSREHVKNINLIQTILMKKYDLNEIDYIAYTEKPGLIGTLQIGYLFASALSLALNKPLMGIDHLEGHFYSNAIENKIKYPSICLLVSGGHTQILYVENPHKIKILGETLDDAVGEAFDKVSTRLNLGFPGGPIIDKISQNYQGEYIKLKNPKTINDLDFSFSGLKSNVINLYKNSIEKNQKISETQLAASFQKCVVNYLISKVKLAIKKYKLNSLVLAGGVSANKELREEFLKLSKNAIVPNLKYATDNGAMIAICAYFKIKNK
>LR215042|584721:592336|590157_591114_-|VEU77694.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MHIEWDKINTLEDLKKAKNKIYSKDGELFKLKQEIKNSSIERKKIIGQKLSELNEKYEKLIKLAEENIEIKRIENLINKEKLDVSFPVNRAGSLHPITIIENRLRDWFMQNSYFEAKAGELEWDRFNFERLNIQKDHPARDMQDSLYVDDELLLRTHNTGISALILDKNKNKEINTFSIGKVYRNDEDDLTHSHQFTQLDFVSVGKVSFPNLIWTLKSLLSYVFETEIELRLRPSYFPFTEPSVEVDIYYNNRWIEVLGAGMLHPNVLKMAGYDTNIFNGFAAGIGLERLAMIKYGIKDIREFYRNDLRTLNQFKNEK
>LR215042|584721:592336|591124_592336_-|VEU77695.1|DBSCAN-SWA
MKNLANKLRPKTLDDIIGQENIVDLLKNIVKNNLTTSFIFFGESGTGKSSTAIALANDLGKSYGIFNSTIDSKNDLLALIKEKEIVIIDEIHRLNKDKQDILLSYLENDEAIIYATTTEVPYFRVNPALRSRMQILQFNKLKEDDIKKGLRKIIVKHFPNLNINDDVLFNLVKFSNGDYRNALNNLQLVALLNNEKIITNGDLKKIIPNMNFYSDKDSSKHYDNLSAFHKSLRGSDVDAALYYGALILKTGDYHGLFRRLMCVAYEDVALADTLLGLKIEAAFNAVEKLGFPEANLPIAFAIINAALAPKSNSAYLAFNKANSFIDQGNVFEIPKHLKDNHYKSATKLGFGLGYKYPHDFSYSAVKQTYLPNEIENYKFFNFKDNDSEKMKKYYQFIQEINKK
>LR215042|584721:592336|586016_587261_-|VEU77691.1|DBSCAN-SWA
MFSLKDKVIEKAIRDEQKRQQSHIELIASENYVSVDVLKAVGSILTNKYAEGYPSKRYYDGCEFVDIIEETAKERLKKLFNVKYVNVQPYSGSTANAAALATICEPGDKIMGLSLSSGGHLTHGYKITFSGTYFHAIAYETDENGYLDYEKIKEIALKERPKLIITGYSAYSRMIDFKKFREIADECGAKLMADIAHIAGLIAAGAHPTPVPYADIITSTTHKTLRGARGAVIMTNDEEIAKKMNRWVFPGFQGGPLVHQIAGKAVAFNEALKPSFKIYAHNVVKNSKTFAQAFKNNGATIVAGGTDNHLFTINVYKTYNLTGKEASSLLAEFNITVNKNTVPHDTLSPMIASGIRLGTPAMTSRNFDKWVELANIIHKILSTGYKILENKEEVKKIKKQIAKWMKKYPILKYY
>LR215042|584721:592336|584721_584979_-|VEU77689.1|DBSCAN-SWA
MPASSKKEKGLQYEIVRQLGDISEIEGEYTKELNYVSWNNNEPKYDIRDWNNDHTRASKGITLTLGEMLKLKGLIEKELENLNKK
>LR215042|584721:592336|589499_590168_-|VEU77693.1|DBSCAN-SWA
MKNSFLEFLKEECKKEYFAQMLHKIEHLEKSGKKILPVKKLWFRAFNYCEINDIKVIILGQDPYYIDNMADGLAFSSNLNITPKSLINIKEEIRKDYPEAIFETNSLVSWAKQGILLLNTILTVIENRPLSNKNIGWEIFTSNLLNKFVELKKPIVLVLWGEKAKQFYENNINKNNNFKILNFSHPSPLSYKTGKKPFYNSHCFKLINDLLEEPIDFSIRKE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
VEU77689.1|584721_584979_-	Uncharacterized protein conserved in bacteria	A0A172JI00	Bacillus_phage	9.9e-11	41.3
VEU77690.1|585056_585986_-	O-sialoglycoprotein endopeptidase	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	1.6e-55	38.0
VEU77691.1|586016_587261_-	Serine hydroxymethyltransferase	A0A240F2Y9	Aeromonas_phage	4.4e-96	50.3
VEU77692.1|587260_589498_-|tRNA	Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit	A0A1L3IZU3	BeAn_58058_virus	3.8e-13	33.1
VEU77693.1|589499_590168_-	uracil-DNA glycosylase	B5LRM7	Anatid_alphaherpesvirus	3.2e-29	37.7
VEU77694.1|590157_591114_-|tRNA	phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	1.8e-28	36.0
VEU77695.1|591124_592336_-	ATPase	A0A127AWE7	Bacillus_phage	4.3e-56	34.9