Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR216023 | Streptococcus pneumoniae strain 2245STDY5699475 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DEDDh,PrimPol,RT,cas3,DinG | 0 | 0 | 16 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR216023_1 | 94861-94956 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR216023_1
|
1 spacers
spacers of LR216023_1
>1.1|94885|48|LR216023|CRISPRCasFinder TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCTCTGTCAAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR216023_1
The CRISPR arrays of LR216023_1 >merge|LR216023|1|94861-94956|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAATTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCTCTGTCAAGAGAAATGTGTAAAATTTTTATATATAA >LR216023|1|1|94861-94956|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAA TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCTCTGTCAAGAGA AATGTGTAAAATTTTTATATATAA
>LR216023.1|VFH55498.1|94516_94843_-|transcriptional-regulator MYFPTSSALIEFLILAVLEQGDSYGYEISQTIKLIANIKESTLYPILKKLEGNSFLTTYSREFQGRMRKYYSLTNGGIEQLLTLKDEWALYTDTINGIIEGSIRHDKN >LR216023.1|VFH55494.1|93936_94530_-|membrane-protein MTRTEYLTQLELYLKKLPEADRIEAMDYFRELFDDAGVEGEEELIASLGTPKEAAHEVLSNLLDKKINEAPAQKNNRQILHIALLALLAAPIGIPLGIAILVTLFAILVAALTVILAFFAVSILGIIGGFLFLVESFTVLAQAKSAFILIFGSGLLAIGASSLVLLGISYVARFFGLLIVRLVQFVLKKGKRGNQHA >LR216023.1|VFH55491.1|93032_93944_-|Uncharacterised-protein MRKWTKGFLIFGVVTTVIGFILLFVGIQSDGIKSLLSMSKEPVYDSRTEKLTFGKEVENLEITLHQHTLTITDSFDDQIHISYHPSLSAHHDFITNQNDRTLSLTDKKLSETPFLSSGIGGILHIASSYSSRFEEVILRLPKGRTLKGINISANRGQTTIINASLENATLNTNSYILRIEGSRIKNSKLTTPNIVNIFDTVLTDSQLESTENHFHAENIQVHGKVELTAKDYLRIILDQKESQRINWDISSNYGSIFQFTREKPESRGTELSNPYKTEKTDVKDQLIARSDDNIDLISTPSRR >LR216023.1|VFH55488.1|91906_92971_-|Acyl-CoA-cholesterol-acyltransferase MKQEWFESNDFVKTTSKNKPEEQAQEVADKAEETIADLDTPIGKNTQVEEEVSQAEVELESQQEEKIETPEDSEARTEIEEKKASNSTEEEPDLSKETEKVTIAEESQEALPQQKATTKEPLLISKSLESPYIPDQAPKSRDKWKEQVLDFWSWLVEAIKSPTSKLETSITHSYTAFLLLILFSTSSFFFSIYHIKHAYYGHIASINSRFPEQLAPLTLFSIISILVATTLFFFSFLLGSFVVRRFIHQEKDWTLDKVLQQYSQLLAIPIFLTAIASFFAFFDSLRFTALLCVISIGIILLASLHIITRPSQASETDSFYQLFLSVLVNGVIILLFFVAEVALIGDYLRILAFL >LR216023.1|VFH55485.1|90869_91730_+|Uncharacterised-protein MAKTFFIPNKQSILGEQEILTAKSILALLDGLESHSYDVVYLRQPLNRLEYIECAIVGQSQFLFKVSYADGQKAYRVDLPDLLTKTDWQIIKSFLDALLAYTGTDIEGLDGFDFEAYFQASIQAYLADPVARFTICQGIFNPIFFSRENLKSFLEADGLAQFEARVRAVQETDAYFARVSFYQDGEGKVHGVYHLAQGVKTVLPREPFVPAAYIEQLVDKEVQWEIDLVQITGDGSKPEDYEAIARLDYAKFLEVLPLSFYHQLDANQIEVQPILDKDFKTLAQEK >LR216023.1|VFH55482.1|89761_90748_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MAKDIRVLLYYLYTPIENAEQFAADHLAFCKSIGLKGRILVADEGINGTVSGDYETTQKYMDYVHSLPGMEDLWFKIDEENEQAFKKMFVRYKKEIVHLGLEDNDFDNDINPLETTGAYLSPKEFKEALLDKDTVVLDTRNDYEYDLGHFRGAIRPDIRNFRELPQWVRDNKEKFMDKRVVVYCTGGVRCEKFSGWMVREGYKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGELWDGKMYVFDERIAVDVNHVNPTIVGKDWFDGTPCERYVNCGNPFCNRRILTSEENEDKYLRGCSHECRVHPRNRYVSKNELTQAEVIERLAAIGESLDQAATV >LR216023.1|VFH55479.1|88014_89490_+|extracellular-solute-binding-protein MKNWKKYAFASASVVALAAGLAACGNLTGNSKKAADSGDKPVIKMYQIGDKPDNLDELLANANKIIEEKVGAKLDIQYLGWGDYGKKMSVITSSGENYDIAFADNYIVNAQKGAYADLTELYKKEGKDLYKALDPAYIKGNTVNGKIYAVPVAANVASSQNFAFNGTLLAKYGIDISGVTSYETLEPVLKQIKEKAPDVVPFAIGKVFIPSDNFDYPVANGLPFVIDLEGDTTKVVNRYEVPRFKEHLKTLHKFYEAGYIPKDVATSDTSFDLQQDTWFVREETVGPADYGNSLLSRVANKDIQIKPITNFIKKNQTTQVANFVISNNSKNKEKSMEILNLLNTNPELLNGLVYGPEGKNWEKIEGKENRVRVLDGYKGNTHMGGWNTGNNWILYINENVTDQQIENSKKELAEAKESPALGFIFNTDNVKSEISAIANTMQQFDTAINTGTVDPDKAIPELMEKLKSEGAYEKVLNEMQKQYDEFLKNKK >LR216023.1|VFH55476.1|86881_87805_+|ABC-transporter-permease MAKKKIKKEKIDNVGIHSFSKKADIFFSIISGLIALSCILPFVFVIIISVTDEKSLLQYGYSFFPSQFGLDGFEFLAQFKDKILQALFISVFVTVVGTLTNVFITTTYAYAISRTTFKYRRFFTIFVLLSMLFNAGLVPGYIMVTRVLQLGDTVWALIVPMLLSPFNIILMRSFFKKTIPEAILESARIDGASEARIFFQICLPLSLPGIATITLLTALGFWNDWFNALLYIKSDNLYPLQYLLMQIQQNMDYIAKAVGLTGQLGVALPKETGRMAMVVVATLPIAILYPFFQRYFVKGLTIGGVKE >LR216023.1|VFH55473.1|85938_86868_+|ABC-transporter-permease MKKFSKTLRDNWIFLLMVLPGALWLILFFYIPVFGNVVAFKDYHMTSNGFIDSIINSKWVGLDNFRFLFSSRDAFIITRNTVLYNLGFIFLGLVVSVGIAIILSELRSKRMVKIFQTSMLFPYFLSWVIISFFTDAFLNIDKGVFNHLLESLGLKEVNFYADLGIWPYLLLFLGIWKGFGYSSVMYYATIMGIDPTYYEAATVDGASKWQRIRNVTIPQLTPLVTVLTILAVGNIFRADFGLFYQIPHNAGQLYNVTNVLDVYVFNGLTQTADIGMAAAAGLYQSVVGLILVILSNLLARRVDPNSALF >LR216023.1|VFH55470.1|85389_85620_+|surface-anchored-protein MRSLTGVSNPTTDSAPLVLAEAKKAFADDSLIEQGLRDILQTVKDAIASLESIKESQSATKIDNLKEVITKLKANA >LR216023.1|VFH55501.1|94982_96149_-|cyanate-permease MKKQSLFFVPGIILIGVSLRTPFTVLPIILGNISQGLEVEVSSLGVLTSLPLLMFTLFSPFSTRLAQKIGLEHLFTYSLFFLTIGSLIRLINLPLLYLGTLMVGASVAVINVLLPSLIQANQPKKIGFLTTLYVTSMGIATALASYLAVPITQASSWKGLILLLTLLCLATFLVWLPNHRYNHRLAPQTKQKSQIKVMRNKQVWAIIIFSGFQSLIFYTVMTWLPTMSIHAGLSSHEAGLLTSILSLISIPFSMTIPSLTTNLSTRNRQLMLTLVSLAGVVGISMLFFPINNFIYWLAIHLLIGTATSALFPYLMVNFSLKTSAPEKTAQLSGLSQTGGYILAAFGPTLFGYSFDLFHSWVPSVAALLLIDILMTVALFTVDRADKIL >LR216023.1|VFH55505.1|96299_97364_+|glycosyl-transferase MTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTYPKENIEILFINAMSTDGTTAIIQQFIKEDTEFNSIRLYNNPKKNQASGFNLGVKHSVGDLILKIDAHSKVTESFVMNNVAIIQQGEFVCGGPRPTIVEGKGKWAETLHLVEENMFGSSIANYRNSSEDRYVSSIFHGMYKREVFQKVGLINEQLGRTEDNDIHYRIREYGYKIRYSPSILSYQYIRPTFKKMLHQKYLNGLWIGLTSHVQFKCLSLFHYVPCLFVLSLVFSLALLPITFVFITLLLGAYFLLLSLLTLLTLLKHKNGFLIVMPFLLFSIHFAYGFGTIVGLIRGFKWKKEYKRTIIYLDKISQINKNML >LR216023.1|VFH55509.1|97405_99256_+|nucleoside-diphosphate-sugar-isomerase MNKKLTDYVIDLVEILNKQQKQVFWGIFDIFSMVVSIIVSYILFYGLINPAPVDYIIYTSLAFLFYQLMIGFWGLNASISRYSKITDFMKIFFGVTASSVLSYSICYAFLPLFSIRFIILFILLSTFLILLPRITWQLIYSRRKKGSGDGEHRRTFLIGAGDGGALFMDSYQHPTSELELVGILDKDSKKKGQKLGGIPVLGSYDNLPELAKRHQIERVIVAIPSLDPSEYERILQMCNKLGVKCYKMPKVETVVQGLHQAGTGFQKIDITDLLGRQEIRLDESRLGAELTGKTILVTGAGGSIGSEICRQVSRFNPERIVLLGHGENSIYLVYHELIRKFQGIDYVPVIADIQDYDRLLQVFEQYKPAIVYHAAAHKHVPMMERNPKEAFKNNIRGTYNVAKAVDEAKVSKMVMISTDKAVNPPNVMGATKRVAELIVTGFNQRSQSTYCAVRFGNVLGSRGSVIPVFERQIAEGGPVTVTDFRMTRYFMTIPEASRLVIHAGAYAKDGEVFILDMGKPVKIYDLAKKMVLLSGHTESEIPIVEVGIRPGEKLYEELLVSTELVDNQVMDKIFVGKVNVMPLESINQKIGEFRTLSGDELKQAIIAFANQTTHIE >LR216023.1|VFH55512.1|99516_100149_-|phosphatase MTSITAIFFDLDGTLVDSSIGIHNAFTYTFKELGVPSPDAKTIRGFMGPPLESSFATCLSKDQISEAVQIYRSYYKAKGIYEAQLFPQIIDLLEELSSSYPLYITTTKNTSTAQDMAKNLEIHHFFDGIYGSSPEAPHKADVIHQALQTHQLAPEQAIIIGDTKFDMLGARETGIQKLAVTWGFGEQADLLNYQPDYIAHKPLEVLAYFQ >LR216023.1|VFH55516.1|100170_101043_-|L-serine-dehydratase,-alpha-subunit MFYSIKELVEQADLDFQGNVAELMITTEFELTGREREEVFLLMERNLEVMKASVQLGLNENKSRSGLTGGDAAKLDHYIENGKTLSDYTILSAARNAIAVNEHNAKMGLVCATPTAGSAGCLPSVLTAAIEKLDLSHEQQLDFLFAAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMSAAALTLAAGGTPYQASQAIAFVIKNMLGLICDPVAGLVEVPCVKRNAMGASFAFIAADMALAGIESKIPVDEVIDAMYQVGASMPTAFRETAEGGLATTPTGRRLQKEIFGE >LR216023.1|VFH55520.1|101051_101723_-|putative-L-serine-dehydratase-beta-subunit MKSLRFQSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAVRIGKIVSSIFDDTPTEVEFQLFNSFAKTYRGHGTDLALVAGILGMDTDDPEIPNSLEIAHKRGIKIVWTIQKDSNAPHPNTTKITVKNAHKTISVTGISIGGGNIQVTELNGFAVSLNMNTPTIIIVHQDIPGMIALVTEALSRYGINIAQMNVTREKAGEKAIMIIEVDSRNCDDAIEEIRKIPHLHNVNFFK >LR216023.1|VFH55524.1|101964_102552_+|LysM-domain-protein MKSITKKIKATLAGVAALFAVFAPSFVSAQESSTYTVKEGDTLSEIAETHNTTVEKLAENNHIDNIHLIYVDQELVIDGPVAPVATPAPATYAAPAAQDETVSAPVAETPVVSETVVSTVSGSEAEAKEWIAQKESGGSYTATNGRYIGRYQLTDSYLNGDYSAENQERVADAYVAGRYGSWTAAKNFWLNNGWY >LR216023.1|VFH55528.1|103374_103626_+|bacteriocin,-putative MVCSILASTSVLAVWVDGGQWNYGVGWSGNFGYSDYLHSTRSHTATVKDGNKFSKDRAEAEAWARASLTKIPPTGMEYFYGFE >LR216023.1|VFH55532.1|103677_105786_+|bacteriocin-immunity-protein MKKISNFCMLLLLLCTTFFVFNVNYTREVVRIQEMGKTVDSLDLYLKDINEPAASVLRFFEDVSKEYKVSIIKTDSGDEVVKSGVFDKDTFPYQEFGISSLDFTTDGEGVYSNKEISNKLGTIPTFLKAKPIQLMTFQTYIKDTSRSLNGRYTITSTQEMDKDRIVQKWSDFFKIDQATLLEPTYKSAVEVINRDLLLSAIVFVLAILLLVLVTVYQPMMEMKRVGVQKLLGFQDRAVLADVVKGNLYLLLGGALVINLGVFFLLDYKPKDLFPMLWLSHFLLLQLYLFISWLTYLLIQKMTISSLLKGFSSFKFGLIFNYVMKIGTTILLTALLIGVGRSLEQENKELAYQQQWVSQGNYLTLETFKLNDNLWQEELAGSGKSTDYFYRFYQDLVEKTQAGYVQSSSLPVKNFVQSEQIQQYQLTDTVDVYYANRNFLKSKGFKLPDTGIKKVILMPASTKGEEDKNQLLGKLIAFHSMKYEEQQKRTIEEMDVEIAYYEGDWSFFPYSDKRKENLSNPIISLVNDSDMMWDEKASLSTTGLNNPIKIENTVQHQKEITELVEKLSDGNYLKFSSIQAIQQEKVDSYRDAVRNFNLLFALFGLLSMMISYFLLVTTFLLKRRDIITKKFMGWKLVDRYRPLLVLLLLGYSFPLLVLIFFAHAFLPLLLFAGFTCLDILFVLGLASRMEKRSLVELLKGGIL >LR216023.1|VFH55536.1|105782_106424_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKNITKTIGGKVILDNLSLRIDQVDLVAIVGKSGSGKSTLLNLLGLIDGDYSGRYEIFGQTNLAVNSAKSQTIIREHISYLFQNFALIDDETVEYNLMLALKYVKLPKKDKLKKVEEILERVGLSATLHQRVSELSGGEQQRIAVARAILKPSQLILADEPTGSLDPENRDLVLKFLLEMNREGKTVIIVTHDAYVAQQCHRVIELGEGK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4185 : 52812
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR216023|4185:52812|DBSCAN-SWA AATGACCAAATTACTTGTAGGCTTGGGAAATCCAGGGGATAAATATTTTGAAACAAAACACAATGTTGGTTTTATGTTGATTGATCAACTAGCGAAGAAACAGAATGTCACTTTTACACACGATAAGATATTTCAAGCTGACCTAGCATCCTTTTTCCTAAATGGAGAAAAAATTTATCTGGTTAAACCAACGACCTTTATGAATGAAAGTGGAAAAGCAGTTCATGCTTTATTAACTTACTATGGTTTGGATATTGACGATTTACTTATCATTTACGATGATCTTGACATGAAAGTTGGGAAAATTCGTTTAAGAGCAAAAGGCTCAGCAGGTGGTCATAATGGTATCAAGTCTATTATTCAACATATAGGAACTCAGGTCTTTAACCGTGTTAAGATTGGAATTGGAAGACCTAAAAATGGTATGTCAGTTGTTCATCATGTTTTGAGTAAGTTTGACAGGGATGATTATATCGGTATTTTACAGTCTGTTGACAAAGTTGACGATTCTGTAAACTACTATTTACAAGAGAAAAATTTTGAGAAAACAATGCAGAGGTATAACGGATAAATGGTGACCTTATTAGATTTACTCTCAGAAAATGATCAGATTAAAAAATGGCATCAAAATTTAACAGATAAGAAAAGACAACTAATACTTGGTTTATCAACATCTACTAAGGCTCTTGCAATTGCAAGCAGTTTAGAAAAAGAAGATAGGATTGTGTTATTGACGTCAACTTATGGAGAAGCAGAAGGACTTGTTAGTGATCTTATATCTATCTTGGGTGAGGAACTCGTCTATCCATTTTTGGTAGATGATGCTCCTATGGTGGAGTTTTTGATGTCTTCACAGGAAAAAATTATTTCACGGGTTGAAGCCTTGCGTTTTTTGACTGATTCATCTAAGAAAGGGATTTTAGTTTGTAATATCGCAGCAAGTCGATTGATTTTACCGTCTCCCAATGCATTCAAAGATAGTATTGTAAAAATCTCAGTTGGTGAAGAATATGATCAACACGCGTTTATCCATCAGTTAAAGGAAAATGGCTATCGAAAAGTTAGTCAAGTACAAACTCAGGGCGAATTTAGTCTTCGAGGAGATATTTTAGATATTTTTGAAATATCCCAGTTAGAACCTTGTCGAATTGAGTTTTTTGGTGATGAAATTGATGGTATCAGGTCATTTGAAGTAGAAACACAATTATCGAAAGAAAATAAGACAGAACTCACTATCTTTCCAGCTAGTGATATGCTTTTGAGAGAAAAGGATTATCAACGAGGACAGTCAGCTTTAGAAAAACAAATTTCAAAAACTTTATCACCTATTTTGAAATCATACCTAGAAGAAATTCTTTCAAGTTTTCACCAAAAACAAAGTCATGCAGATTCTCGGAAGTTTTTATCTTTGTGCTATGATAAGACATGGACTGTCTTTGATTATATTGAAAAAGATACTCCAATATTCTTTGATGATTATCAAAAATTGATGAATCAGTATGAATTCTTTGAAAGAGAATTAGCGCAGTACTTTACAGAAGAATTACAGAATAGTAAAGCATTTTCTGATATGCAGTATTTTTCTGATATTGAACAAATCTATAAAAAACAAAGTCCAGTGACCTTTTTCTCTAATCTTCAAAAGGGTTTAGGAAATCTCAAATTTGACAAAATTTATCAATTCAATCAATATCCTATGCAGGAATTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTAAAAGAAGAAATTGAACGATATAAAAAAATGGATTACACCATTATTCTGCAGTCTAGCAATTCAATGGGAAGTAAAACATTGGAGGATATGTTAGAGGAATATCAGATTAAATTGGATTCTAGAGATAAGACAAGTATCTGTAAAGAATCTGTAAATTTAATAGAGGGTAATCTCAGACATGGTTTTCATTTTGTAGATGAAAAGATTTTATTGATAACTGAACATGAGATTTTTCAAAAGAAATTAAAGCGTCGTTTTCGAAGACAACATGTTTCAAATGCAGAGAGATTAAAAGATTACAATGAACTTGAAAAAGGGGACTATGTTGTCCATCATATCCATGGGATTGGTCAATATCTAGGAATTGAAACCATTGAAATCAAGGAAATTCATCGTGATTATGTCAGTGTCCAGTACCAAAATGGTGATCAAATTTCTATTCCCGTGGAACAGATTCATCTACTGTCCAAATATATTTCAAGTGATGGTAAAGCTCCAAAACTCAATAAATTAAATGACGGTCATTTTAAAAAGGCCAAGCAAAAGGTTAAGAACCAGGTAGAGGATATAGCTGATGATTTAATCAAACTCTACTCTGAACGTAGTCAGTTGAAGGGTTTTGCTTTCTCAGCTGATGATGATGATCAAGATGCCTTTGATGATGCTTTCCCTTATGTTGAAACGGATGATCAACTTCGTAGTATTGAGGAAATCAAGAGGGATATGCAGGCTTCTCAGCCAATGGATCGACTTTTAGTTGGGGATGTTGGTTTTGGAAAGACTGAAGTTGCTATGCGTGCAGCCTTTAAAGCAGTCAATGATCACAAACAGGTTGTCATTCTAGTTCCGACGACGGTTTTAGCGCAACAGCACTATACGAATTTTAAGGAACGATTCCAAAATTTTGCAGTTAATGTTGATGTGTTGAGTCGCTTTAGAAGTAAAAAAGAGCAGACTGCAACACTTGAAAAATTGAAAAACGGTCAAGTCGATATTTTGATTGGAACACATCGTGTTTTGTCAAAAGATGTTGTGTTTGCTGATTTGGGCTTGATGATTATTGATGAGGAACAGCGATTTGGTGTCAAGCATAAGGAAACTTTGAAAGAACTGAAGAAACAAGTGGATGTCCTAACCTTGACCGCTACGCCAATCCCTCGTACCCTCCATATGTCTATGCTGGGAATCAGAGATTTGTCTGTTATTGAAACTCCGCCGACTAATCGCTACCCTGTTCAGACCTATGTTTTGGAAAAGAATGATAGTGTCATTCGTGATGCTGTCTTGCGTGAAATGGAGCGTGGAGGTCAAGGTTACTATCTTTACAACAAAGTTGACACAATTGTTCAGAAGGTTTCAGAATTACAGGAGTTGATTCCAGAGGCTTCGATTGGATATGTTCATGGTCGAATGAGTGAAGTCCAGTTGGAAAATACTCTATTAGACTTTATTGAGGGACAATACGATATCTTGGTGACTACTACTATTATTGAGACAGGGGTGGACATTCCAAATGCTAATACTTTATTTATTGAAAATGCGGACCATATGGGCTTGTCAACCTTATATCAGTTAAGAGGAAGAGTCGGTCGTAGTAATCGTATTGCTTATGCTTATCTCATGTATCGTCCAGAAAAATCAATCAGTGAAGTCTCTGAAAAGAGATTAGAAGCGATTAAAGGATTTACAGAATTGGGCTCTGGCTTTAAGATTGCAATGCGAGATCTTTCGATTCGTGGAGCAGGAAATCTTTTAGGAAAATCCCAGTCTGGTTTCATTGATTCTGTTGGTTTTGAATTGTATTCGCAGTTATTAGAGGAAGCTATTGCTAAACGAAACGGTAATGCTAACGCTAACACAAGAACCAAAGGGAATGCTGAGTTGATTTTGCAAATTGATGCCTATCTTCCTGATACTTATATTTCTGATCAACGACATAAGATTGAAATTTACAAGAAAATTCGTCAAATTGACAACCGTGTCAATTATGAAGAGTTACAAGAGGAGTTGATAGACCGTTTTGGAGAATACCCAGATGTAGTAGCCTATCTTTTAGAGATTGGTTTGGTTAAATCATACTTGGACAAGGTCTTTGTTCAACGTGTGGAAAGAAAAGATAATAAAATTACAATTCAATTTGAAAAAGTCACTCAACGACTGTTTTTAGCTCAAGATTATTTTAAAGCTTTATCCGTAACGAACTTAAAAGCAGGCATCGCTGAGAATAAGGGATTAATGGAGCTTGTATTTGATGTCCAAAATAAGAAAGATTATGAAATTTTAGAAGGTTTGCTGATTTTTGGAGAAAGTTTATTAGAGATAAAAGAGTCTAAGGAAGAAAATTCCATTTGATATTTTTCTTCTATAAAATAGATAAAAATGGTACAATAATAAATTGAGGTAATAAGGATGAGATTAGATAAATATTTAAAAGTATCGCGAATTATCAAGCGTCGTACAGTCGCAAAGGAAGTAGCAGATAAAGGTAGAATCAAGGTTAATGGAATCTTGGCCAAAAGTTCAACGGACTTGAAAGTTAATGACCAAGTTGAAATTCGCTTTGGCAATAAGTTGCTGCTTGTAAAAGTACTAGAGATGAAAGATAGTACAAAAAAAGAAGATGCAGCAGGAATGTATGAAATTATCAGTGAAACACGGGTAGAAGAAAATGTCTAAAAATATTGTACAATTGAATAATTCTTTTATTCAAAATGAATACCAACGTCGTCGCTACCTGATGAAAGAACGACAAAAACGGAATCGTTTTATGGGAGGGGTATTGATTTTGATTATGCTATTATTTATCTTGCCAACTTTTAATTTAGCGCAGAGTTATCAGCAATTACTCCAAAGACGTCAGCAATTAGCAGACTTGCAAACTCAGTATCAAACTTTGAGTGATGAAAAGGATAAGGAGACAGCATTTGCTACCAAGTTGAAAGATGAAGATTATGCTGCTAAATATACACGAGCGAAGTACTATTATTCTAAGTCGAGGGAAAAAGTTTATACGATTCCTGACTTGCTTCAAAGGTGATAAAATGGAAAATTTATTAGACGTAATAGAGCAATTTTTGAGTTTGTCAGATGAAAAGCTGGAAGAATTGGCTGATAAAAATCAATTATTGCGTTTACAAGAAGAAAAGGAAAGGAAGAATGCGTAAATTCTTAATTATTTTGTTGTTACCAAGTTTTTTGACCATTTCAAAAGTCGTTAGCACAGAAAAAGAAGTCGTCTATACTTCGAAAGAAATTTATTACCTTTCACAAT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43 | uncultured_virus(12.5%) | bacteriocin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
103374 : 193606
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR216023|103374:193606|DBSCAN-SWA 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96 | Streptococcus_phage(39.13%) | bacteriocin,transposase,tRNA,protease,integrase | attL 183877:183901|attR 196440:196464 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
288701 : 337681
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR216023|288701:337681|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(28.57%) | protease,integrase,transposase | attL 279418:279437|attR 329526:329545 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
356456 : 401378
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR216023|356456:401378|DBSCAN-SWA 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38 | Aeribacillus_phage(16.67%) | integrase,holin,transposase,tRNA | attL 385547:385562|attR 391627:391642 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
414652 : 483091
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR216023|414652:483091|DBSCAN-SWA 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60 | Planktothrix_phage(22.22%) | protease,integrase,transposase,tRNA | attL 480371:480430|attR 484448:485247 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
505062 : 534869
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR216023|505062:534869|DBSCAN-SWA 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34 | Bodo_saltans_virus(25.0%) | protease,bacteriocin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
601199 : 653813
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR216023|601199:653813|DBSCAN-SWA 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43 | Staphylococcus_prophage(25.0%) | bacteriocin,transposase,tRNA,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
729888 : 812012
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LR216023|729888:812012|DBSCAN-SWA 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90 | Streptococcus_phage(23.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
851134 : 886555
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LR216023|851134:886555|DBSCAN-SWA 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MIRFLVLAGYFELTIYLHLSGKLNQYINMHYSYLAYISMVLSFILAIVQLYIWMKQVKTHSHLNSRLAKMTSISLLAIPLVIGLTFPTVNLDSQTVSAKGYHFPLSEGTDLAIQTSEGTTSQYLKPDTSSYFSKSAYEKEMRTAADKYLSQDSIQITNENYMEVMEAIYDYPDEFEGKTIQFTGFVYNDPSHANSQFLFRFGIIHCIADSGVYGLLTKGNTRQYENNTWITAKGKLVNHYHKELKQNLPTLEIDSFTKVDKPENPYVYRAF |
39 | Streptococcus_phage(57.14%) | protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
952805 : 1036545
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LR216023|952805:1036545|DBSCAN-SWA 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88 | Streptococcus_phage(21.05%) | holin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1076788 : 1120915
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LR216023|1076788:1120915|DBSCAN-SWA 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28 | Bacillus_virus(20.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1151509 : 1211134
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LR216023|1151509:1211134|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(20.0%) | protease,bacteriocin,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1325878 : 1367087
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LR216023|1325878:1367087|DBSCAN-SWA 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49 | Streptococcus_phage(21.43%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1431384 : 1438138
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >LR216023|1431384:1438138|DBSCAN-SWA TATGTCTCAACTCTATGATATTACCATTGTGGGTGGTGGTCCTGTCGGGCTTTTTGCAGCCTTTTATGCCCACCTACGCCAAGCCAAGGTTCAAATCATCGACTCTCTTCCCCAGCTAGGTGGACAACCTGCTATTCTCTACCCTGAAAAGGAAATCCTAGACGTACCAGGCTTCCCAAACCTGACTGGAGAAGAGTTGACTAACCGCTTGATTGAACAGCTAAATGGATTTGATACCCCTATTCATCTCAATGAAACGGTTCTTGAGATTGACAAACAAGAAGAAGAATTTGCCATCACAACTTCTAAAGGAAGTCACCTGACTAAAACAGTCATCATCGCTATGGGTGGCGGTGCCTTCAAACCACGTCCGCTGGAACTTGAAGGTGTTGAGGGCTATGAAAATATCCACTACCACGTTTCTAACATTCAGCAATACGCTGGTAAGAAAGTGACGATTCTTGGTGGGGGAGACTCGGCTGTGGATTGGGCTTTGGCTTTTGAAAAAATCGCACCAACTACCCTTGTTCACCGCAGAGATAATTTCCGTGCCTTGGAACACAGTGTTCAAGCCTTGCAAGAATCATCTGTAACCATCAAGACACCATTCGCCCCTAGCCAACTCCTTGGAAATGGAAAAACACTTGATAAACTTGAAATCACAAAAGTCAAATCTGATGAAACTGAAACCATTGACCTAGACCACCTCTTTGTCAACTATGGTTTCAAATCTTCTGTCGGTAACCTTAAAAACTGGGGGCTCGACCTCAACCGTCACAAGATTATCGTCAACAGCAAACAGGAATCCAGCCAAGCAGGTATCTATGCTATCGGTGACTGCTGCTACTATGACGGAAAAATTGATCTGATTGCGACAGGCCTCGGAGAAGCTCCAACTGCTGTCAACAACGCTATCAACTACATTGACCCTGAACAAAAAGTACAACCAAAACACTCTACCAGTTTATAAAAAAGAACCACGAGTCACATAGGATTCGTGGTTTTATAATTCATCCGCTATCTTATTGATTTTTCTGAGTCTGTGATTGACACCACTTTTGGTCAGAGGGGTGCTGAGACTATCTGCTAACTGCTGGATAGAGTAGTCTGGGTGCTGAATCCTCAGTTGCGCCACTTCCTGCAAATCTACTGGCAAATTTTCTAAGCCCATGATATCTTTGATTTTACTGATATTGTTAATGGTCTTCATGCTGGCAGAAACTGTCCGAGCGATATTAGCTGTCTCGGCATTATTAGCCCGATTGAGGTCGTTACGGGTTTCTCGCAAAATCTTAACCCGCTCAAAATCATCACGTGCCTGCATGGCTCCGATTACTATCAAGAAGTCCATAATGTCTTCTGCTCGCTGGAGATAGGTCACAGCCCCCTTCTTGCGCTCAAGCACCTTGGCATCCAGTAAAAACTGTTGGAGAAGGGAGGCAATTCCTTGCGCGTGGTCCAGATAAACAGAACTGATTTCCAACTGGTACTTGCCTGACTCAGGGTCACGAATGCTCCCATTTGCCAAGAAAGCGCCACAGAGATAGGCACGACCTGCTTCCTCGTCCGATAAAATCGCCTCATCAATACCTGTTTCCAGGCCAAAGAAAGAGTCTGCCAAGTGCAAATCACTTAACAAATCCTGCACCTTTTCATCTGTAAAAACGGTATAGACGCGATTCTTGCGAAGATTGCTCCGTTGGTGGTGACGAATTTCAGATTTGATTTCATAGAAATGGAGAAAGGACTCATAGAGGTGACGGGCCAGTTTGGCATTTTCTGTCACAACTGACAAAGTCAAGCCCGAAGTCGAGAGACCGATGCTACCAGACATTTTGATAATGGCAGATAATTCATGCCGGCTCAGATGGTGTTGGCCCAGGATTTCTTCTTTTACTGCTACTGTGAAACTCATTTTTTCACCTGTATAATGCGCATCAACTCGTCCACAATCAAATCTCCATCGTGGAAGGCACCGCCATTTTCCAGACGAAGGAAGTTAGATGAAATCACGCGCGAAACTTGCTTACAAAGACCTACAAAATCGTGTTCCACTTGCACTAAGTATTCATCAAAACGGTTGGAATTCATGTATTCCTGAGGCACTTTTTCAATATTCACCAAGACAGTGTCGATAAAAGGGCGACCAAGGTGACGATGCAAGACTTCCACGTGGTTGCTATCTGTAAAGTGTTCCGTCTCCCCACGTTGGGTCATGATATTGCAGACATAGGCAATTTCTGCCTTGGTTTCCAAAAGAGCCCGCCCAATTTCCTTAATCACGATATTGGGCAAAATAGAGGTAAAGAGGGAACCTGGCCCTAGGACAATCATGTCACTTTCAAGGATGGTCTGCACTACTCGACGGCTGGCCAGAGGCGTATCATCGTTTAGGGCATTGGTCACATAGACATTGTCAATTATGCCTCGATGGTCTACAATATGACTCTCTCCAGCCACTTCTGTCCCATCCTGAAAGACTGCATGAAGGGTCAAAGGATGGTCACTGGAAGGATAAATTTTCCCTGTTGTATGGAAAAATTTGCTCAATAACTGCATGGCATTATAGGTTGAACCCTGCATTTCTGACAAGCCAGCAATGATGAGATTTCCCAATGGATGGCCAGCAAAGGCTCCGGCATCCTCAGAGAACCGATACTGAAAGACCTTCTCATAAAACTTAGGCATATCCGACATGGCCACAAGGACATTACGAAGATCACCTGGCGGTGTCAACTGTTGCATATTTTTTCGGAGTTCACCTGAAGAACCACCATCATCTGCCACCGTCACGATAGCTGCGATTTCCACATCTTTTTCCCGCAGACTTTTTAGAATGACGGGAATTCCAGTCCCTCCACCAATCACCGTTATCTTTGGTTTTCTCATGAACGGTTTACCGTTTCCTTTCTGCGGTCTTTGTCGCGATGCCCTTCATTAACAGACCAATTCTTGGATAAGTCCTGCACCAAGCGTTTAGCAAATGCCACACTACGGTGTTGTCCACCCGTACATCCCATGGCAATGGTCAAAACGGACTTACCTTCCTTTTGGTAACTTGGCAGAATCGGCTCAATCAAGGCCAATAAATGTTGATAAAAGTCTTCTGACTCAGGATGGTTCATGACATAATCATAAACAGGTTCATCCACACCCGTTTGGTTTCTCAGTTCTGGTAAATAATAGGGATTTGGCAAGAAACGGACATCAAAGACCAAGTCCGCATCAATCGGGATTCCATACTTAAATCCGAAAGACATGACTTCGATACGGAAAGACTGAGCTTGTTCTTGGTCTGAAAACTGCTCTGCAAGGGTTTTGCGCAGCTCACGTGGAGTGAGTTCAGTCGTATCCACCACATTTTGGCTCATATTTTTCAAAGGTGCCAAGAGTTCACGTTCCAACTTGATTCCATCTAAAATACGACCGTCTGCTGCTAGTGGGTGACTCCGTCTGGTTTCCTTGTAACGAGCGACCAATTCCTTATCAGCCGCATCCAAAAAGAGGATTTTGAAATCCAAACCATCTTGATTTTCCAACTCATCCAAAACAGCTTGAATCTCTGAAAAGAAAGAACGACTACGCATATCCACTACCAAGGCCAACTTAGGATTGTCTTCCTTAATTTCAACCAGCTGCAAAAACTTAGGCAAGAGAGCTGGCGGCATATTATCAATGGTGAAATAACCTAGATCCTCGAAGGACTGAATGGCTACAGTTTTCCCTGCGCCACTCATCCCTGTCACAATCACCAAGTGAAGTTGTTTCTTTGTCATCTTTTTCTCCTTATATCAAAAGAAGTTTGGCAACACCAAACTTCAACTAGCTTATCCAATCTCTGCGATGACTTCAATTTCGACTTTTACATCACGAGGAAGACGAGCTACCTCCACAGCTGAACGAGCTGGGAATTCCTCTTTGAAGGCCGTTTGGTAAACCTCATTAAAAGGAACAAAGTCGTTCATATCGCTCAAGAAGCAAGTTGTTTTGACAACATGGTCAAAGTCTGTTCCTGCTTCTGCCAAAATAGCACCGATGTTTTTCAAGACTTGCTCTGTCTGTTCTTGGATATTCTCTCCTACAATTTCCCCAGTTTCAGGGGATAGGGGAACTTGACCGCTAGCAAACAAAAGGTTGCCAACGATTTTTCCTTGAACATAGGGCCCGATAGCCTTTGGGGCCTTATCTGTATGAATTGTTTTTGCCATTTTCTTTTCCTCACAATTTTTCTAAGATTGCATCCCAAGCCTCATCCATCCCTGCCTTGCTGACAGATGAAAAGAGGATGAAATCGTCACTTGGGTCAAAGTTTAATTTCTTTTTGATTGCTGATTCATGCTTGTTCCATTTACCACGAGGAATCTTGTCCGCCTTGGTCGCCACAATGATGACTGGAATCTCATAATACTTGAGAAATTCGTACATCTGCACATCATCTGCTGACGGGTCATGACGAAGGTCAACTAGACTGACAACCGCACGGAGATTTTCCCGAGTCGTTAAGTACTCCTCAATCATGCACCCCCACTTTTCACGTTCCTTTTTAGAAACACGAGCATAGCCATAACCAGGCACATCCACAAAGCGCATCTTGTCATCAATGTTAAAAAAGTTCAGGAGCTGGGTTTTACCAGGTTTTCCTGATGTACGGGCGAGATTCTTACGGTTCAACATAGTGTTGATAAAGCTGGATTTACCAACATTTGAACGCCCTGCTAGGGCAATCTCTGGCAGTTCATCCTGCGGATAGTGGGACTTATTAGCTGCACTGAGCAAGATTTCAGCATTGTGTGTGTTAAGTTCCATAGTCACCTCTAGGCTGTTTCTAGAATCGGTTTATCCGTTCCATCGACAGTTTCTTTAGTGATGCGAACCAATTTCACATTTTCCTGACTCGGCACCTCAAACATAACATCTAGCATGGTTTCTTCGATGATGGAGCGAAGTCCACGCGCCCCTGTCTTCCGTTCGATTGCTTTATTAGCAATCTCTTGAAGGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14 >LR216023|1431384:1438138|1435601_1436189_-|VFH63215.1|DBSCAN-SWA MELNTHNAEILLSAANKSHYPQDELPEIALAGRSNVGKSSFINTMLNRKNLARTSGKPGKTQLLNFFNIDDKMRFVDVPGYGYARVSKKEREKWGCMIEEYLTTRENLRAVVSLVDLRHDPSADDVQMYEFLKYYEIPVIIVATKADKIPRGKWNKHESAIKKKLNFDPSDDFILFSSVSKAGMDEAWDAILEKL >LR216023|1431384:1438138|1434268_1435159_-|VFH63202.1|DBSCAN-SWA MTKKQLHLVIVTGMSGAGKTVAIQSFEDLGYFTIDNMPPALLPKFLQLVEIKEDNPKLALVVDMRSRSFFSEIQAVLDELENQDGLDFKILFLDAADKELVARYKETRRSHPLAADGRILDGIKLERELLAPLKNMSQNVVDTTELTPRELRKTLAEQFSDQEQAQSFRIEVMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPYYLPELRNQTGVDEPVYDYVMNHPESEDFYQHLLALIEPILPSYQKEGKSVLTIAMGCTGGQHRSVAFAKRLVQDLSKNWSVNEGHRDKDRRKETVNRS >LR216023|1431384:1438138|1431384_1432353_+|VFH63179.1|DBSCAN-SWA MSQLYDITIVGGGPVGLFAAFYAHLRQAKVQIIDSLPQLGGQPAILYPEKEILDVPGFPNLTGEELTNRLIEQLNGFDTPIHLNETVLEIDKQEEEFAITTSKGSHLTKTVIIAMGGGAFKPRPLELEGVEGYENIHYHVSNIQQYAGKKVTILGGGDSAVDWALAFEKIAPTTLVHRRDNFRALEHSVQALQESSVTIKTPFAPSQLLGNGKTLDKLEITKVKSDETETIDLDHLFVNYGFKSSVGNLKNWGLDLNRHKIIVNSKQESSQAGIYAIGDCCYYDGKIDLIATGLGEAPTAVNNAINYIDPEQKVQPKHSTSL >LR216023|1431384:1438138|1436197_1437430_-|VFH63222.1|protease|DBSCAN-SWA MSTNRKNDMMVYCSFCGKNQEEVQKIIAGNNAFICNECVELAQEIIREELVEEVLADLSEVPKPIELLHILNHYVIGQDRAKRALAVAVYNHYKRINFHDTREESEDVDLQKSNILMIGPTGSGKTFLAQTLAKSLNVPFAIADATALTEAGYVGEDVENILLKLLQVADFNIERAERGIIYVDEIDKIAKKSENVSITRDVSGEGVQQALLKIIEGTVASVPPQGGRKHPQQEMIQVDTKNILFIVGGAFDGIEEIVKQRLGEKVIGFGQNNKAIDENSSYMQEIIAEDIQKFGIIPELIGRLPVFAALEQLTVDDLVRILKEPRNALVKQYQTLLSYDDVELEFDDEALQEIANKAIERKTGARGLRSIIEETMLDVMFEVPSQENVKLVRITKETVDGTDKPILETA >LR216023|1431384:1438138|1437461_1437632_-|VFH63229.1|DBSCAN-SWA MERSLFGLFTAFLCFICFLAGAQAFRKKRYGLSILLWLNAFTNLVNSIHAFYMTLF >LR216023|1431384:1438138|1432386_1433298_-|VFH63186.1|DBSCAN-SWA MSFTVAVKEEILGQHHLSRHELSAIIKMSGSIGLSTSGLTLSVVTENAKLARHLYESFLHFYEIKSEIRHHQRSNLRKNRVYTVFTDEKVQDLLSDLHLADSFFGLETGIDEAILSDEEAGRAYLCGAFLANGSIRDPESGKYQLEISSVYLDHAQGIASLLQQFLLDAKVLERKKGAVTYLQRAEDIMDFLIVIGAMQARDDFERVKILRETRNDLNRANNAETANIARTVSASMKTINNISKIKDIMGLENLPVDLQEVAQLRIQHPDYSIQQLADSLSTPLTKSGVNHRLRKINKIADEL >LR216023|1431384:1438138|1433294_1434272_-|VFH63193.1|DBSCAN-SWA MRKPKITVIGGGTGIPVILKSLREKDVEIAAIVTVADDGGSSGELRKNMQQLTPPGDLRNVLVAMSDMPKFYEKVFQYRFSEDAGAFAGHPLGNLIIAGLSEMQGSTYNAMQLLSKFFHTTGKIYPSSDHPLTLHAVFQDGTEVAGESHIVDHRGIIDNVYVTNALNDDTPLASRRVVQTILESDMIVLGPGSLFTSILPNIVIKEIGRALLETKAEIAYVCNIMTQRGETEHFTDSNHVEVLHRHLGRPFIDTVLVNIEKVPQEYMNSNRFDEYLVQVEHDFVGLCKQVSRVISSNFLRLENGGAFHDGDLIVDELMRIIQVKK >LR216023|1431384:1438138|1437631_1438138_-|VFH63236.1|DBSCAN-SWA MTKKIVAIWAQDEEGVIGKENRLPWHLPAELQHFKETTLNHAILMGRVTFDGMGRRLLPKRETLILTRNPEEKIDGVATFQDVQSVLDWYQDQEKNLYIIGGKQIFQAFEPYLDEVIVTHIHARVEGDTYFPEELDLSLFETVSSKFYAKDEKNPYDFTIQYRKRKEV >LR216023|1431384:1438138|1435210_1435591_-|VFH63209.1|DBSCAN-SWA MAKTIHTDKAPKAIGPYVQGKIVGNLLFASGQVPLSPETGEIVGENIQEQTEQVLKNIGAILAEAGTDFDHVVKTTCFLSDMNDFVPFNEVYQTAFKEEFPARSAVEVARLPRDVKVEIEVIAEIG |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1720215 : 1776677
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >LR216023|1720215:1776677|DBSCAN-SWA ATCATTTCTTCAACAAACCTTGTTCTTGGAGAAACTCCTTGGCTACTTGCTTTGCTGACTTGCCTTCAACACCGACTTGGTAGTTGAGCTGGCTCATCTGGCTTTCTGTAATCTTACCAGCCAATGTATTAAGAACTCTTTCCAACTCTGGGTGTTTCTTGAGAAGAGCTTCTTTCATGAGTGGAGCCCCTTGATAAGGTGGGAAGAGTTGCTTGTCATCTTCCAAGACCTGTAAATCATAACGCTCCAATTCCGCATCAGTCGAATAGGCATCCGTGATTTGAATATCCCCTGACTGAATTGCCTGATAACGAAGAGCTGGCTGCATAGTCGCCACATTGAGATTGAGACCATACATTGATTGCAAGCCCTTATTTCCATCTTCACGGTCGTTAAACTCAAGCGTAAAGCCTGCCTTCAGCTGCCCTTCCACTTTTTTCAAATCCGAAATGGTCTTCAAGCCATATTCTTGAGCAATCTTTTTCGGAACAGCTACAGCATAGGTATTTTGATAAGACATAGGTTTGAGATAGGCTAGATGATCCTGCTTGGCAATGCCATCACGCGCCACTTGATAAACCTGCTCTGGCTCATGACTCACCTTGGGTGATGGTTGAAGCAAACTTTCAGTCACCGTACCGGTAAATTCAGGATAAATGTCAATATCACCTTTTTTCAGAGCTTCATAAAGGAAACTTGTCGTCCCAAAATTCGGTTTAACAGTCGCAGTCATGCTGGTATTTTCTTCAATCAGCAATTTATACATATTAGCCAAAATTTCTGGTTCTGGGCCTATTTTTCCAGCAATAATCAAGTTTTCTTTCTCTTTTTGAGCCAAAAGGGCTGGACTATAAGACAGACCCAGTAATAAAGCCACCAAGGCAAAACCAGAGAAAATCGTCCGCAATTTCGCTTTTTCCATTACTTTTAGTAGGAAGTTAAAGGCAATAGCTAGCACTGCAGAAGAAAGGGCCCCAATCAAAATCAAACTGGCATTATTACGGTCAATTCCCAACAGGATAAAGGAACCCAGTCCCCCTGCCCCAATCAAGGTCGCCAAGGTAGCCGTACCGATAATCAAGACCGCTGCCGTCCGAATTCCAGACATGATAACAGGCATGGCAAGTGGAATTTCAAACTTCTTGAGACGCTCCCATCTGGTCATCCCAAAGGCAATCCCAGCCTCTTGAAGACTCGGATCAATTCCCTTCAGCCCAGTAATAGTATTTTGTAAAATCGGAAAAATCGCATAAATCACTAGAGCTGTCAAAGCCGGCAAGGTCCCAATTCCCATCAAAGGGATAAAGAGCCCCAACAAGGCCAGAGACGGGATGGTCTGGAAAATACCTGCAATCTGCAAGACCCAGTCGGCCAGCTTCTCATGATAGCGAAGAAAAACAGCCAAGGGAATCGCAAGCAAAATAGCTAGTAACAAGGTCAAAAGTGACAACTGCAAATGTTGAGATAGAGCTGTCAACCAATCACTAAAACGATCCTGAAAAGTTGCAATTAAATTAGTCATGAACACTACCTCCAAACAAGTCTGCTACAAAGTCTGTTGCAGGCACTTTTAAAATTGTCTCGGGATTCGCTACCTGGCGAATTTCTCCATCCTGCAAGACAGCAATACGGTCCGCCAACTTCAAGGCTTCATCCGTATCATGGGTTACAAAAATCGTTGTCATCCCAAACTCTTTATGCAATTCTTTTGTCAGAACCTGCAACTGTTTTCTCGAAATAGCATCCAAGGCCGAAAAGGGTTCATCCATGAGGAAAATCTTGGGCTGACCAATCATAGCTCGGACAATACCGACCCGTTGCTGTTCTCCACCAGATAATTCACTAGGTAAGCGATGCCCATACTCGGCTACTGGTAAACCAACCTTAGCCAAAAGCTCTTCTGTTTTCTTCGTAATTTCTTCCTTGCTCCACCCCTTCATTTCAGGAATGAGAGCAATATTTTCCGCAACTGTTAGATTTGGAAAAAGAGCAATAGCCTGTAAAACATAACCAGTAGAAAGACGAAGTTCACGCTCATCATAGTCTTTGATGCGCTTCCCATCCATATAAATATTTCCATCAGTTGGTTCCAAAAGACGGTTAATCATCTTGAGCATGGTCGTCTTACCTGACCCAGAAGGCCCTACTAAAACCATAAATTCCCCATCCTCAATCTGTAAGTTGACATCTCTCAAGACATCCTTTTCTGTGTAGCGCAGTGCTACATTTTTGTATTCAATCATTCTTTGTCCTCAATTTAAAACTTCCCTCGATTGGTCAAGTCTTCTACCTTAGGCATGACTTCCTTATTATCCCAATGCTCCACAATTTTCCCGTTCTCTAAACGGAAGATATCGTACTGGGCATAAGCAACGCCATCAATCTGAGTCTGACCATAGCTAACCACATAGTTTCCTTGTCCTAAGAGTTGGAAAACAAAGTCAAAAGTGACACTATATTCAGCCACATAGTTTTTATAAGCAGCACTTCCTTGTCCAATCTCATGATTATGCTGAATCAAATCGTCTGCCACATAATCACTCCACTGCTCTAGCTCCCCATTTTGGAAAATTTCTGTCAAGAAACGGCGAACCAGCTTTTTATTTTCTGCTTTCTTGTCCAAATCCTTGATTTCAAAATCTCCAAAAATTTGATCTAGTTGGTCATTTTCAGGTGTTCGATAGTAGTCAATGACATCCCAATGCTCAACAATACGACCATTCTCATCCGCACGGAAAGTATCCGTCGTCACCCATTGAGCTTCTCCACCATTCAGATATTGATGAACATGAACAAAGACCAGATTGCCATCCTCAATGATGCGGACAATCTTAATCTGACGCTCTGGATGACGCTCAAAGAAATCTGCAAAGAAGGCTGCAAATCCTTCTTTCCCGTCAGGAACACCTGTCGAATGTTGGATATAGGTATCCCCTACAGACTGGGCTTGAGCCTCAGCAACTCGTCCGTCTTGAATGGCATGGATGTATAGGTTGTGAGCATTTTTCACTTGTTGTGACATATTCTAAACCTCATTTCCCTTCTCTTTCAGATTCGCCAAAATTCTTTCTTGAAAACCTTCAAATTGGTGAATTTCTTCCTCTGAAAATCCTTTGTAAAAGATAGTATCCAATTTCTGACTGACACGATGCCCCACTTCTTTCTGGGACTTGCCTAACTCCGTTAAAACTAAATACTTCTTACGCTTGTCTTTTCCACACGGACTAACAATTACAAGCTTTTGTTCCTCTAGCTTTTTTATCATAGTCGTCAGCGTATTATTCGCAAGTCCAGTCGCAAGCGCGATATCTGTCGCAGTTGCGCAGCCAGTTTCACTATTCCATAAAACCGCTAAAATCTTGCCCTGTTCACCCCTATAAAGAGCCTCAGGATCTTGACTCAGTAACTTTTGAAAAATCCGCCCATTCAACAAACGAATATGATGGGCTAGCAAATGACCATCTTTCATAACACCTCCAATTTATTTCGATATCGAAATGAATAAAACAATTGTAACACTCATCGTTCTAACTGTCAACTATTTCGATTTAGAAATAATTTTTGATAATTATCCACACCACCATACTCCGGCTCAACTAACTTTTAACGAGAGTTTCTAAACTCCTTCGTCCTCCAGTCTACAAAAGCCTTCCATTCGTACTATCCTATATTTTATGAGGGGACACATTTTTCCTATCAGACCATTTATTTTAAAGATAGAAGTAAATCATAATTGCTTCCATCTGTTCTTTTATAGTATATTGAAGTTAGACTAGAGCACTGTATCTTCTAAAACATTGATAGAAAGCGATTTGAATTTCCCAATCAATTTGTTCGTCTTTATAGCATTTCGAAACTGGAATAGGACACCATGACTGCTAAAAGATTTCTATAAATTCATTTGATTTCCCTAATCAATTTGTTCATATCTTATTTCATTCCGCTATAATTTCACCTTACCCTATCTTTTTCGTAGCACCCTTCAAACAGCCTATCCCCTACCGTTTGACGATTCCTCACTTCGCTCCACTTCCATTACAGAAGTTTCTTCACTACTATGGGCTCGGCTGACTTCTCATGATTCCTTGTTACTACTATTTGAACGCTCACGAGATAGGTCTTATAAAAAATGCTTTGATCCACAATGGAATCAAAGCATTTTAAAGAGTTCCTCATACATAAGCGCAGAAGTCGCAGTTCCTCTGTACTTGGCTTCTTCTCTTTTGATAAAGCGAGCCAAGTTGAGCAACTCAGGTGCTGGATGTTTGGGATTTAGGAGCAATTCACGATTGACCAGGCCTGAGAGACGAACTGCCTGCAATTGCTCATTTGTAGTAGGCAGTTTTTTAGCAGTCTCTAGGAGAGCAGCAACTAAATCTTCACTCAAATCATGTCGAGCATGATTGTAAAGATCTTTTATAAGGCTTTCTAGGTTTGGTTCTGCCATCCCTACCACCTCCCTTATGGTTTAATAATGTTTAATCAAATCAACCGTTGAACGATCCAATTTCTTCACCAAGGCTTGTAAGAAAGCTTGCGCTTCTAGGAAGTCATCCATTGCATAGAGGGTTTGGTGAGAATGGATATAACGAGCGCAGACACCGATAGTTGTTGATGGGACACCACCATTTTTCAGATGAGCTGCACCTGCATCTGTTCCGCCTTTACCACAGTAGTATTGGTACTTGATACCAGCTTCTTCAGCCGTTGTCAAAAGAAAATCCTTCATCCCTGGGAGAAGCAAGTGACCTGGATCATAGAAACGAATCAAGGTTCCATCTCCAATCTTGCCTTGACCACCGTAGACATCACCTGCTGGTGAGCAATCAACTGCGAGGAAGACTTCTGGGTCAAACTTGGTTGTAGAGGTATGAGCGCCACGCAGACCAACTTCTTCTTGGACGTTAGAACCCAGATAGAGTTCATTGCTGAGTTTTTGACCTGATAAAGCTTCAGCTAGCTCGCTTACCATGAGGACACCGTAGCGGTTATCCCAAGCT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53 | Streptococcus_phage(40.0%) | integrase,holin,transposase | attL 1731096:1731123|attR 1753712:1753739 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
2053393 : 2090962
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >LR216023|2053393:2090962|DBSCAN-SWA 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37 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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