Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR216060 | Streptococcus pneumoniae strain 2245STDY6178787 genome assembly, chromosome: 1 | 2 crisprs | DEDDh,PrimPol,cas3,DinG | 0 | 0 | 22 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR216060_1 | 107283-107378 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR216060_1
|
1 spacers
spacers of LR216060_1
>1.1|107307|48|LR216060|CRISPRCasFinder TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR216060_1
The CRISPR arrays of LR216060_1 >merge|LR216060|1|107283-107378|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAATTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGAAATGTGTAAAATTTTTATATATAA >LR216060|1|1|107283-107378|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAA TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA AATGTGTAAAATTTTTATATATAA
>LR216060.1|VFI33574.1|106938_107265_-|transcriptional-regulator MYFPTSSALIEFLILAVLEQGDSYGYEISQTIKLIANIKESTLYPILKKLEGNSFLTTYSREFQGRMRKYYSLTNGGIEQLLTLKDEWTLYTDTINGIIEGSIRHDKN >LR216060.1|VFI33572.1|106358_106952_-|membrane-protein MTRTEYLTQLELYLKKLPEADRIEAMDYFRELFDDAGVEGEEELIASLGTPKEAAHEVLSNLLDKKINEAPAQKNNRQILHIALLALLAAPIGIPLGIAILVTLFAILVAALTVILAFFAVSILGIIGGFLFLVESFTILAQAKSAFILIFGSGLLAIGASSLVLLGISYVTRFFGLLIVRLVQFVLKKGKRGNQHA >LR216060.1|VFI33570.1|105454_106366_-|Uncharacterised-protein MRKWTKGFLIFGVVTTVIGFILLFVGIQSDGIKSLLSMSKEPVYDSRTEKLTFGKEVENLEITLHQHTLTITDSFDDQIHISYHPSLSAHHDLITNQNDRTLSLTDKKLSETPFLSSGIGGILHIASSYSSRFEEVILRLPKGRTLKGINISANRGQTTIINASLENATLNTNSYILRIEGSRIKNSKLTTPNIVNIFDTVLTDSQLESTENHFHAENIQVHGKVELTAKDYLRIILDQKESQRINWDISSNYGSIFQFTREKPESRGTELSNPYKTEKTDVKDQLIARSDDNIDLISTPSRR >LR216060.1|VFI33568.1|104328_105393_-|Uncharacterised-protein MKQEWFESNDFVKTTSKNKPEEQAQEVADKAEETIADLDTPIEKNTQLEEEVSQAEVELESQQEEKIEAPKDSEARTEIEEKKASNSTEEEPDLSKETEKVTIAAESQEALPQQKATTKEPLLISKSLESPYIPDQAPKSRDKWKEQVLDFWSWLVEAIKSPTSKLETSITHSYTAFLLLILFSASSFFFSIYHIKHAYYGHIASINSRFPEQLAPLTLFSIISILVATTLFFFSFLLGSFVVRRFIHQEKDWTLDKVLQQYSQLLAIPIFLTAIASFFAFFDSLRFTALLCVISIGIILLASLHIITRPSQASETDSFYQLFLSVLVNGVIILLFFVAEVALIGDYLRILAFL >LR216060.1|VFI33566.1|103397_104258_+|Uncharacterised-protein MAKTFFIPNKQSILGEQEILNAKSILALLDGLESHSYDVVYLRQPLNRLEYIECAIVGQSQFLFKVSYADGQKAYRVDLPDLLTKTDWQIIKSFLDALLAYTGTDIEGLDGFDFEAYFQASIQAYLADPVARFTICQGIFNPIFFSRENLKSFLEADGLAQFEARVRAVQETDAYFARVSFYQDGEGKVHGVYHLAQGVKTVLPREPFVPAAYMEQLVDKEVQWEIDLVQITGDGSKPEDYESIARLDYAKFLEVLPPSFYHQLDANQIEIQPILGQDFKTLAQEK >LR216060.1|VFI33564.1|102136_103123_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MAKDIRVLLYYLYTPIENAEQFAADHLAFCKSIGLKGRILVADEGINGTVSGDYETTQKYMDYVHSLPGMEELWFKIDEENEQAFKKMFVRYKKEIVHLGLEDNDFDNDINPLETTGAYLSPKEFKEALLDKDTVVLDTRNDYEYDLGHFRGAIRPDIRNFRELPQWVRDNKEKFMDKRVVVYCTGGVRCEKFSGWMVREGYKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGELWDGKMYVFDERIAVDVNHVNPTIVGKDWFDGTPCERYVNCGNPFCNRRILTSEENEDKYLRGCSHECRVHPRNRYVSKNELTQAEVIERLAAIGESLDQAATV >LR216060.1|VFI33562.1|100389_101865_+|extracellular-solute-binding-protein MKNWKKYAFASASVVALAAGLAACGNLTGNSKKAADSGDKPVIKMYQIGDKPDNLDELLANANKIIEEKVGAKLDIQYLGWGDYGKKMSVITSSGENYDIAFADNYIVNAQKGAYADLTELYKKEGKDLYKALDPAYIKGNTVNGKIYAVPVAANVASSQNFAFNGTLLAKYGIDISGVTSYETLEPVLKQIKEKAPDVVPFAIGKVFIPSDNFDYPVANGLPFVIDLEGDTTKVVNRYEVPRFKEHLKTLHKFYEAGYIPKDVATSDTSFDLQQDTWFVREETVGPADYGNSLLSRVANKDIQIKPITNFIKKNQTTQVANFVISNNSKNKEKSMEILNLLNTNPELLNGLVYGPEGKNWEKIEGKENRVRVLDGYKGNTHMGGWNTGNNWILYINENVTDQQIENSKKELAEAKESPALGFIFNTDNVKSEISAIANTMQQFDTAINTGTVDPDKAIPELMEKLKSEGAYEKVLNEMQKQYDEFLKNKK >LR216060.1|VFI33560.1|99208_100132_+|ABC-transporter-permease MAKKKIKKEKIDNVGIHSFSKKADIFFSIISGLIALSCILPFVFVIIISVTDEKSLLQYGYSFFPSQFGLDGFEFLAQFKDKILQALFISVFVTVVGTLTNVFITTTYAYAISRTTFKYRRFFTIFVLLSMLFNAGLVPGYIMVTRVLQLGDTVWALIVPMLLSPFNIILMRSFFKKTIPEAILESARIDGASEARIFFQICLPLSLPGIATITLLTALGFWNDWFNALLYIKSDNLYPLQYLLMQIQQNMDYIAKAVGLTGQLGVALPKETGRMAMVVVATLPIAILYPFFQRYFVKGLTIGGVKE >LR216060.1|VFI33558.1|98265_99195_+|ABC-transporter-permease MKKFSKTLRDNWIFLLMVLPGALWLILFFYIPVFGNVVAFKDYHMTSNGFIDSIINSKWVGLDNFRFLFSSRDAFIITRNTVLYNLGFIFLGLVVSVGIAIILSELRSKRMVKIFQTSMLFPYFLSWVIISFFTDAFLNIDKGVFNHLLESLGLKEVNFYADLGIWPYLLLFLGIWKGFGYSSVMYYATIMGIDPTYYEAATVDGASKWQRIRNVTIPQLTPLVTVLTILAVGNIFRADFGLFYQIPHNAGQLYNVTNVLDVYVFNGLTQTADIGMAAAAGLYQSVVGLILVILSNLLARRVDPNSALF >LR216060.1|VFI33556.1|97725_97947_+|surface-anchored-protein MSLQIKLKKLAKELSKLLKDSNLETVDKDVLENSQKELQKAVLFLADEKGSEHTEAEVIDNLKEVIAKLKANA >LR216060.1|VFI33576.1|107403_108570_-|cyanate-permease MKKQSLFFVPGIILIGVSLRTPFTVLPIILGNISQGLEVEVSSLGVLTSLPLLMFTLFSPFSTRLAQKIGLEHLFTYSLFFLTIGSLIRLINLPLLYLGTLMVGASVAVINVLLPSLIQANQPKKIGFLTTLYVTSMGIATALASYLAVPITQASSWKGLILLLTLLCLATFLVWLPNHRYNHRLAPQTKQKSQIKVMRNKQVWAIIIFSGFQSLIFYTVMTWLPTMSIHAGLSSHEAGLLTSILSLISIPFSMTIPSLTTSLSTRNRQLMLTLVSLAGVVGISMLFFPINNFIYWLAIHLLIGTATSALFPYLMVNFSLKTSAPEKTAQLSGLSQTGGYILAAFGPTLFGYSFDLFHSWVPAVAALLLIDILMTVALFTVDRADKIL >LR216060.1|VFI33578.1|108720_109788_+|glycosyl-transferase MTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTYPKENIEILFINAMSTDGTTAIIQQFIKEDTEFNSIRLYNNPKKNQASGFNLGVKHSVGDLILKIDAHSKVTETFVMNNVAIIQQGEFVCGGPRPTIVEGKGKWAETLHLVEENMFGSSIANYRNSSEDRYVSSIFHGMYKREVFQKVGLVNEQLGRTEDNDIHYRIREYGYKIRYSPSILSYQYIRPTFKKMLHQKYLNGLWIGLTSHVQFKCLSLFHYVPCLFVLSLVFSLALLPITFVFITLLLGAYFLLLSLLTLLTLLKHKNGFLIVMPFLLFSIHFAYGFGTIVGLIRGFKWKKEYKGTIIYLDKISQINQNMLQ >LR216060.1|VFI33580.1|109826_111677_+|nucleoside-diphosphate-sugar-isomerase MNKKLTDYVIDLVEILNKQQKQVFWGIFDIFSMVVSIIVSYILFYGLINPAPVDYIIYTSLAFLFYQLMIGFWGLNASISRYSKITDFMKIFFGVTASSVLSYSICYAFLPLFSIRFIILFILLSTFLILLPRITWQLIYSRRKKGSGDGEHRRTFLIGAGDGGALFMDSYQHPTSELELVGILDKDSKKKGQKLGGIPVLGSYDNLPELAKRHQIERVIVAIPSLDPSEYERILQMCNKLGVKCYKMPKVETVVQGLHQAGTGFQKIDITDLLGRQEIRLDESRLGAELTGKTILVTGAGGSIGSEICRQVSRFNPERIVLLGHGENSIYLVYHELIRKFQGIDYVPVIADIQDYDRLLQVFEQYKPAIVYHAAAHKHVPMMERNPKEAFKNNIRGTYNVAKAVDEAKVSKMVMISTDKAVNPPNVMGATKRVAELIVTGFNQRSQSTYCAVRFGNVLGSRGSVIPVFERQIAEGGPVTVTDFRMTRYFMTIPEASRLVIHAGAYAKDGEVFILDMGKPVKIYDLAKKMVLLSGHTESEIPIVEVGIRPGEKLYEELLVSTELVDNQVMDKIFVGKVNVMPLESINQKIGEFRTLSGDELKQAIIAFANQTTHIE >LR216060.1|VFI33582.1|111701_111887_-|chlorohydrolase MKIKEQTRKLAAGCSKHCFEVVDRTDEVSNHTYGKATLTWFEEIFEEYKSLHNKTHITKVV >LR216060.1|VFI33584.1|111936_112569_-|phosphatase MTSITAIFFDLDGTLVDSSIGIHNAFTYTFKELGVPSPDAKTIRGFMGPPLESSFATCLSKDQISEAVQIYRSYYKAKGIYEAQLFPQIIDLLEELSSSYPLYITTTKDTSTAQDMAKNLEIHHFFDGIYGSSPEAPHKADVIHQALQTHQLAPEQAIIIGDTKFDMLGARETGIQKLAITWGFGEQADLLNYQPDYIAHKPLEALAYFQ >LR216060.1|VFI33586.1|112590_113463_-|L-serine-dehydratase,-alpha-subunit MFYSIKELVEQADLDFQGNVAELMITTEFELTGREREEVFLLMERNLEVMKASVQLGLNENKSRSGLTGGDAAKLDHYIENGKTLSDYTILSAARNAIAVNEHNAKMGLVCATPTAGSAGCLPSVLTAAIEKLDLSHEQQLDFLFAAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMSAAALTLAAGGTPYQASQAIAFVIKNMLGLICDPVAGLVEVPCVKRNAMGASFAFIAADMALAGIESKIPVDEVIDAMYQVGASMPTAFRETAEGGLATTPTGRRLQKEIFGE >LR216060.1|VFI33588.1|113471_114143_-|putative-L-serine-dehydratase-beta-subunit MKSLRFQSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAVRIGKIVSSIFDDTPTEVEFQLFNSFAKTYRGHGTDLALVAGILGMDTDDPEIPNSLEIAHKRGIKIVWTIQKDSNAPHPNTTKITVKNAHKTISVTGISIGGGNIQVTELNGFAVSLNMNTPTIIIVHQDIPGMIALVTEALSRYGINIAQMNVTREKAGEKAIMIIEVDSRNCDEAIEEIRKIPHLHNVNFFK >LR216060.1|VFI33590.1|114384_114957_+|LysM-domain-protein MKSITKKIKATLAGVAALFAVFAPSFVSAQESSTYTVKEGDTLSEIAETHNTTVEKLAENNHIDNIHLIYVDQELVIDGPVAPVATPAPATYAAPAAQDETVSAPVVSETVVSTVSGSEAEAKEWIAQKESGGSYTATNGRYIGRYQLTDSYLNGDYSAENQERVADAYVAGRYGSWTAAKNFWLNNGWY >LR216060.1|VFI33592.1|115760_116048_+|bacteriocin,-putative MRKLVKIGVASLMVCGILATTNALAVWVEGGQWNYGVGWTGTFGYSDYLHSTRYHTATVRHGGRTSKDYAKPEAWARASLTKIPPTGMEYFYGFE >LR216060.1|VFI33594.1|116099_118208_+|bacteriocin-immunity-protein MKKISNFCMLLLLLCTTFFVFNVNYTREVVRIQEMGKTVDSLDLYLKDINEPAVSVLRFFEDVSKEYKVSIIKTDSGDEVVKSGVFDKDTFPYQEFGISSLDFTTDGEGVYSNKEISNKLGTIPTFLKAKPIQLMTFQTYIKDTSRSLNGRYTITSTQEMDKDRIVQKWSDFFKIDQATLLEPTYKSAVEVINRDLLLSAIVFVLAILLLVLVTVYQPMMEMKRVGVQKLLGFQDRAILADVVKGNLYLLLGGALVINLGVFFLLDYKPKDLFPMLWLSHFLLLQLYLFISWLTYLLIQKMTISSLLKGFSSFKFGLIFNYVMKIGTTILLTALLIGVGRSLEQENKELAYQQQWVSQGNYLTLETFKLNDNLWQEELAGSGKSTDYFYRFYQDLVEKTQAGYVQSSSLPVKNFVQSEQIQQYQLTDTVDVYYANRNFLKSKGFKLPDTGIKKVILMPASTKGEEDKNQLLGKLIAFHSMKYEEQQKRTIEEMDVEIAYYEGDWSFFPYSDKRKENLSNPIISLVNDSDMMWDEKASLSTTGLNNPIKIENTVQHQKEITELVEKLSDGNYLKFSSIQAIQQEKVDSYRDAVRNFNLLFALFGLLSMMISYFLLVTTFLLKRRDIITKKFMGWKLVDRYRPLLVLLLLGYSFPLLVLIFFAHAFLPLLLFAGFTCLDILFVLGLASRMEKRSLVELLKGGIL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR216060_3 | 1340116-1340198 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR216060_3
|
1 spacers
spacers of LR216060_3
>3.1|1340145|25|LR216060|CRISPRCasFinder CGTCCAAGATTGCTATCGGATTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR216060_3
The CRISPR arrays of LR216060_3 >merge|LR216060|3|1340116-1340198|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTTGGCCCTTACGTCCAAGATTGCTATCGGATTTCGTTCTGGTGTCCGCCACCGCTTGGCCCTTA >LR216060|3|3|1340116-1340198|CRISPRCasFinder TTCTGGTGTCTGCCACCGCTTGGCCCTTA CGTCCAAGATTGCTATCGGATTTCG TTCTGGTGTCCGCCACCGCTTGGCCCTTA
>LR216060.1|VFI38671.1|1339520_1339931_-|OmpA-domain-containing-protein MEAIYQRDSDQDGLTDAQELALGTNPLSADSDGDGRSDLVEVEEGSNPLEKDLQDIDQTSITEPSSVFMEMKQKISDMMESHYKEFIQALISIETGIENQQDLEDLYTYYMRTDSVSLLSSDLETSPQEVEMEIEL >LR216060.1|VFI38663.1|1333254_1339473_-|SNF2-family-protein MEVIQLLAMFRGTIPKDREKMDLFLRYQAQHFDEKWQDLVESFLAEEGKIEEIPHVYSFDQDIVSFLEASSENNEQDLESYTRNFGQAGLSKLSQLSNFEKNLVLEVATYNLSTRFYIQSDKEKLEPLSELVFHQNQDVNLVNVYRVANNLSDRISRDIEEFLLMIDSKELKKEVFEIHFEEKEGDVLAYLGSELMATLDTVTDLVHHEENYTQLPLTQKLKIITHFDEVKAIREKSKQVTEAVLPLDNIDQVEENVEVHSLSKVDKIVEEALREYPIGSQVSYKGQVFQLVSIENAHLNDLVRLELFNDSNQLFEENPILYLNSLEEIEQVLSLVELEKEDSDIENELPSESQEIDLFSYLEEDNEKDKETETLIVGIEETDVPVQDFDFPDDLEDFYPKTNREKIETNIAAIELVKRLEKEGRQAKPEEQELLGKYVGWGGLANEFFDELNPKYEAERLTLKSLVSKSEYSTMKQSSLTAYYTDPMIIRQIWQKLLDDGFEGGRILDPSMGTGNFFAAMPRSIREKSELYGVELDSVTGAIAKQLHPNTHIEVRGFEEVAYQNNSFDLILTNVPFGNFRIADKNYDKPYMIHDYFVKHSLDLVRDGGQVSIISSIGTMDKRTDNVLQEIKYNTHFLGGVRLPDTAFKKIAGTRVTTDLLFFQKDQAKNLNEEELVFSGSIPFEEDKRVWINPYFDGKYNTQVLGQYEVRNFNGGTLNVKGVSETLTTDIMEALENVEEPKPIDNSLKAPVFIQEEVDNSIPSRIREDLALYSFGYEGNQIYYRDTHGIRKSSKVDEISYYVDEKGDFRAWDSSLSEHKIDRFVQLHLTDEEALDVYKSEEASKRGKYKGLFKKTVFYESPLSDKDISRIKGMVDLRETYQALIEIQRHQDYSRTDFQVLLSKLNHDYDRFVSQFGYLNASVNRNLFDSDDKYSLLASLEDEYIDSKDQKVKYKKSLAFEKALVRPERVIARVSTALDALNSSLSDGRGVDLDYMVSIYPEHSQAAILDELGDQILMDPESYLRGERKYLSKNQFLSGDILNKIEIVQLLVEENNQEYDWNHALDLLESVRPPRIHLADIEFKIGSRWIPQSVYGKFAFECFTNREFELSSPDVEQVIEVNPVDGQVHLRTSFAYRYPSAKDSSLGVSGSRYDTGRKIFENLLNSNQPTITMTVTEGEKKKTITDLEKTSVLRAKEQHLQELFQDFVSRYPEVQQVIEESYNRLYNRTVSREYDGSHLVIDGLAQNISLRPHQENAIQRIVEEKRALLAHEVGSGKTLTMLGAGFKLKELGMVHKPLYVVPSSLSAQFGQEIMKFFPTKKVFVTTKKDFVKARRKQFVSRIITGDYDAIVIGDSQFEKIPVSKERQMNYIEDKLNELREIKTHSENKYTVKEAEQSISGLEKQLEELQRFNRDSFIDFENLGIDFLFVDEAHHFKNIRPITGLGNVAGITNTTSKKNVDMEMKVRQIQEEHDFKNIVFATGTPVSNSISELYTMMNYIQPDILKRYQVDYFDSWVGAFGEIQNSMELAPTGDKYQPKKRFKKFVNLPELMKIYKETADIQTQDMLDLPVPEAHIIPIESELTENQKLYLEELVMRSDMVKCGTVDPSQDNMLKITGEARKLAIDMRLLDSSYSLADNHKLLQVVDNVERIYREGMENKATQMIFSDIGTPKKKDNGFDVYSEIKALLVDRGIPSKEIAFVHDANSDEKKNSLSRKVNAGEVRILLASTEKGGTGLNVQSKMKAVHHLDVPWRPSDIQQRNGRIIRQGNENKEVDIYHYITKGSFDNYLWATQENKLRYIKQIMTSKEPIRAAEDIDEQTMTASDFKALATGNPYLKYKMELENDLTLLENQRRAFQRSKDHYRHTISYCEENMPILEKRLSKYEGDIQQSEMSKDQAFSMTVGKQAFDQRAEAGESLHRIIRHNQADSKEFRTLASYRGFDIKMLSLPTNQPLPETFSVKIVGENQYSVSLDLYSPLGTIQRLQHTIDHIKEDQVKTQNLLDELKDKWTTAKVEIGKNFPKEEEYQTKKAEYDVLAPLIETETDLDIIDQALRQFHEKGNEKQEQLSFELD >LR216060.1|VFI38655.1|1332895_1333180_-|Uncharacterised-protein MMEDTYYQLEEALVQGFQTPEEYQAYKELKEHYEEVTGDYSFSKRELTSQLEIALQDHRGVDFEEYEKEEYLDLVQKLEEFDSSLATHYRQLID >LR216060.1|VFI38648.1|1332594_1332882_-|Uncharacterised-protein MNDLLLIPVIFLAVGGILILLWRFFLIASGLFLIGLISFLIFVEVYGIYLFFTETELYTEDLAQNGLFGFTTFFIIFNLALLVLAGWAGYKRKIR >LR216060.1|VFI38641.1|1332203_1332551_+|SboK MIEKFLITRVIHNIIYNSVLHNEKGCTIRINLFKKDTNVIVEIKDNGQGASPEKIAELNELSFKNIDISKIRTTGIGLKISKQIVDLHQGSISFASVQNEFFESIISLPIFNITN >LR216060.1|VFI38634.1|1331263_1331818_+|TetR-family-transcriptional-regulator MTIGTHENIINAFFRIAAKKDARLITMAEIAAEAHISRQAIYQKHFRTIDEIIDEIHQIIHQNTYSILNNFDPSHSTLNEYIAYELLPRLYQYRDWLKILHSSNIDYNWQHFVSKQYLPIIYPHLNKISNQLKLSIDFLALFTVKYYVAIISSWLLQDLPMPPELFGKYFLQLVDIPFADYFDF >LR216060.1|VFI38627.1|1329725_1331078_-|beta-lactamase-TEM MGKSILDGYTTYTTPAEVQKSAIEDNQLGNVGTSVTISVSYSLTVSWTFSWSFYKLYILECCLHKLSIILAYHLVSLVFRKKMKKSTKGEFLFLIVKQELLEHSLTILRSEQKVELSYVNDILSDNLNQKSKRQFVDLINCLRDQSIRKVINPHDNIIYLYVNNIKALLLINTDECSKLTRLEILPMVNNSEDSKSLYDCLLDLDAKTYLCFHEIDEEVRTNSAGEEFAIASLIKVFVGVIILEAVKTGVITLEDTYQISQYDLSYLSSGITEKNIGQDISIQELLSYLFLASDNTAMDILLTVISDKKFVELGEKISHEFKIRIVPTKEILRRAWCKPNLSEEVWRENAVRDVKWLEGLDYFINPKLLNIFIEKLMSYKWTPYTELSSIIYKGGNAPGVLSGFWGNKYTGKFVYFILNRDRAFNIIEEMYCYKCVFNFLERNIEEKNHG >LR216060.1|VFI38619.1|1328749_1329733_-|Phosphotransferase-enzyme-family MDNTKLIGRNYNHIEIIDNIKCIKKKLLGNSTDVKRRQRNLEQWQLELPDKFNTPTLVKQDSINAEYAYEWIDESSTVQEIFQNSLGLPFTKNLYDIFSEISKILARVHKISPTKTENVNSIKLLSRPLIALTPEEYAEASGAELECLSLLQKDLELIQTLNNYLPQDKYKVMIHGDIRLDQFLSSLTNEVWIIDFEEYSFGDALKDLGGIIGSVLFDVYIKIFCDTWELNDEGANEQIINDYLLKKETALIREVSPLLKHFLQEYQLECRQNIDIELLSMNLGAFLLERILSRAKLSFRLSAVDKAILGIGREFIISKYKLSQILS >LR216060.1|VFI38610.1|1327868_1328723_-|Uncharacterised-protein MTNVNQLASIINLDIDLDLVSIGNEKFKNCSLRRSSDLSQWLYCVLHTGNPSLLHGDNRELLTEQIQKTVVNDKSILCGDAENILGLSCVNIGGVRIHSEDGETVAISKCRPNLTPGFFLYMNSVTDGRLLSNTDRYYIYADEPSKAIEIWRSIVEKLENSSIPFTTKVLSQSSSYPRTDAVVVYSTREFSDEIRKVILEVAASKYPNDFEQHTSPLCKTLTNVVSFAQQPKYRGKNVSFGESRCENIAYAIKDSFMTGLDFQMLLKKRFENAGINPDKIFEEL >LR216060.1|VFI38603.1|1327131_1327446_-|Bacterial-protein-of-uncharacterised-function-(DUF961) MELKFVIPNMEKTFGNLEFAGEDKVVQRRINGRLTVLSRSYNLYSDVQRADDIVVVLPAEAGEKHFGFEERVKLVNPRITAEGYKIGTRGFTNYLLHADDMIKE >LR216060.1|VFI38678.1|1340393_1340558_+|Uncharacterised-protein MATISLTRDIKLTNEDALKILNHKPSKKLQAVLKSIESQDATAPTKNKLISKYL >LR216060.1|VFI38685.1|1340559_1341168_+|phage-protein MTFQVTPLKQYLENIQVLAPDKTEKQVQELFKTIILENVDFNGNEEMLTYLSDKAPNFEKQHRSRNFIVEETETNNIIGFFSLSLKVVDISDLEKSLKKKLVLKGKSPKNIDYLPVLLIGQFGKNTKLNKLSGQELFEIVIQKIEEFRAIVGTQMVFLDSINHPKVIQFYEQFGFVAYSQLIKDDHQVSYQPMALNMSLYKK >LR216060.1|VFI38688.1|1341202_1341577_-|CHAP-domain-containing-protein MAYAYGQCTWGVAARMNQLGLKLKGRNGEKISIINTMGNGQDWVATASSLGGETGSTPKAGAIVSFVGGTHGTPADYGHVAFVEKVYDDGSFLVSETNYGGNPNYTFRKISQADSAISFAYTTK >LR216060.1|VFI38695.1|1341670_1344016_-|CHAP-domain-containing-protein MKDKREIIRARKAFRRSLKDEKKFLKQGKKEVRKQKKDSAVLDENAWKKEIKEKLEEMREASKAKVKQANEDYNHILQNSPPSLLNRKELRDRRLPHARKRLKIAKKQFKEAKVEAKSERKESRKERKTNQKFLYGQESKAKSNFFFHGKNLEELKAKKEVKVAKENLKSTKQAYKSKKVSRKAKTFLYVLGREGGELASENEDLEGYRTLQETIRKGKRYSRLSYNLGKASVKTGQATGRFTKKRLTNTKERYHHFKDGKGWKLAKENPSSFKNRFRKLKKQGLTSVRNIYQKLKAAFSFFTFAAGNPATWIVGGLVFLLLLMMSFFLGFSSASLIQQDEFELTKAYTHLTWEDAEHTRTNDKGITYYTKVDDVMGYMNFKFHDYELHKPVYLFSSETYKDYLSTLWHDLNDGEDLKSMQDLYETPKYKLSKDDQEEMKELKEEGVYASMQELDNPFEGKSNEDSLTMTYRYGYYDLDGKPTLQEYILLEAKAHQTIVAPMDGVVSLDGDNVILTNGKGENESRLTLYSIHNGRAIEGTRVLTGDIIGETPDDTGLKVSYQKYKNKKEKLVYVNPQFYFPKVIQLQTTILPAIGQFGGDEFERAKHIYDFLKSQGVSTQAIAAILGNWSVESSINPKRAEGDYLSPPVGATDSSWDDESWLAIGGSAIYSGAYPNILHRGLGLGQWTDTSDGSTRYTALLNYAHSKNKKWYNLDLQLDFMLHGDSPYYQSWLKDFFKNTGSAANLAQLFLTYWEGNSGDKLLERQTRATEWYYQIEKGFS >LR216060.1|VFI38702.1|1344027_1346385_-|Type-IV-secretion-system-protein MKRKSNTLKKQKTSMTNKKEVVKGKKEEVLPSTANTLYYQALYQNGLMQVKEDYFSQSYLLGDVNYQTVGLEDKGAIIEKYSDLINSLDDQTNFQLTIFNKRLNLEKFRQSVLYEEKEDGYDSYRKELNRMMNQNLDSGENNFSAVKLITFGRKDSNPKQAYRSLSQIGEYFKSGFSEIDARFESLAGENRVNLLADMLRREHHLPFSYRDLTRSGQTTRHFIAPNLLDFKNKNYLQINDRLLQIVYVRDYGMELGDQFIRDLMQGDLELIVSLHAQSSTKADAMKKLRTKKTLMESQKIGEQQKLARTGIYLEKVGHVLESNIDEAEELLKTMTETGDKLFQTVFLIGVFGQDEEELKQALDTIQQVAGSNDLMIDKLPYMQETAFNSLLPFGCDFLEGVSRSLLTSNVAVNSPWTSVDLQDRSGKYYGINQISSNIITIDRSLLNTPSGLILGTSGAGKGMATKHEIITTKIKESGENTEIIIVDPEAEYSVIGRAFGGEMIDIAPDSQTYLNVLDLSEENMDEDPVKVKSEFLLSFIGKLLDRKMDGREKSIIDRVTRLTYQSFKEPSLEEWVFVLSQQPEEEAQNLALDMELYVEGSLDIFSHKTNIQTGSNFLIYNVKKLGDELKQIALMVVFDQIWNRVVRNQKLGKKTWIYFDEMQLLLLDKYASDFFFKLWSRVRKYGASPTGITQNVETLLLDPNGRRIIANSEFMILLKQAKNDREELVQLLGLSKELEKYLVNPEKGAGLIKAGSVVVPFKNKIPQGTQLFDIMSTDPDKMASN >LR216060.1|VFI38709.1|1346335_1346695_-|PrgI-family-protein 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MYSGKKFLLFSLLGILLGYLFHRLTLLYDSYTGNTLDKWTHLLMEGQDEVLQSPWNISFTGKSSAFFLLGFVMMLLVYLYLETGKKQYREGVEYGSARFGTLKEKKLFYGKEFSHDTILAQDVRLTLLDKKSPQYDRNKNIAVIGGSGSGKTFRFVKPNLIQMNSSNIVVDSKDHLAEKTGKLFLEHGYQVKVLDLVNMKNSDGFNPFRYIETENDLNRMLTVYFNNTKGSGSRSDPFWDEASMTLVRALASYLVDFYNPPKTREQLIEESRLSQTEYQNLLKRQKKEVEERKKRGRYPSFAEISKLIKHLSKGENQEKSVLEILFENYAKKYGTENFTMRNWADFQNYKDKTLDSVIAVTTAKFALFNIQSVMDLTKRDTLDMKTWGKEKSMVYLVIPDNDSTFRFLSALFFSTVFQTLTRQADIDFKGQLPLHVRVYLDEFANIGEIPDFAEQTSTVRSRNMSLVPILQNIAQLQGLYKEKEAWKTILGNCDSLVYLGGNDEDTFKFMSGLLGKQTIDVRNTSRSFGQTGSGSLSHQKIARDLMTPDEVGNMKRHECLVRIANMPVFKSKKYNSTKHPNWKYLANQETDERWWNYQINPLNQRQENHLEGLRIRDLTFESSLK >LR216060.1|VFI38738.1|1349759_1350248_-|Uncharacterised-protein MSSEQQERMAVQYAERSLLFTVKSLLKILEWSRRQALAQDSAYKVGVQKLEELLQSPYSIDTINLKKDFLDKPIDIEKFKDFLEKEEIPLAIAWQGDSLHFYTKDRSILDNHLDHLLEKMVNDPEKLADFTMDKSLDDAIDEAKSQITFRQEGAVKQKEMVR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
780 : 43624
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR216060|780:43624|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(91.67%) | transposase,tail,holin,integrase,portal,protease,terminase,head,capsid | attL 967:1026|attR 42402:42473 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
53224 : 64680
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR216060|53224:64680|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR216060|53224:64680|57818_61544_+|VFI33491.1|DBSCAN-SWA MDKRIFVEKKADFQVKSESLVRELQHNLGLSSLKSIRIVQVYDVFDLAEDLFAPAEKHIFSEQVTDHVLDEVSVQADLANYAFFAIESLPGQFDQRAASSQEALLLLGSSSDVTVNTAQLYLVNKDIDATELEAVKNYLLNPVDSRFKDITTGIAKQEFSESDKTIPKLTFFESYTAEDFARYKAEQGMAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKHIDFSASKFQKQLQSTYDKYIAMREELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITAPISETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKGNVVREKPEAGDVIILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRNGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLNKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMAVVVRPEDVDTFVAECNKENIDAVVVATVTEKPNLVMHWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDVKLPEERQTSAETLESDTLTVLSDLNHASQKGLQTIFDCSVGRSTVNHPLGGRYQLTPTEASVQKLPVQHGVTHTASVIAQGFNPYVAEWSPYHGAAYAVIEATARLVAAGANWSKARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVAALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLAAFGVTTADSRKVLSPEFKAVGENIYYIPGQALSAEIDFDLIKKNFTQFEAIQADHKVTSASAVKYGGVVESLALATFGNYIGAEVTLPELKTALTAQLGGFVFTSPEEIAGVEKVGQTKADFTLTVNRVKLDGHKLDSAFQGTLEEVYPTEFTQAKELEEVPAVASDVVIKAKEKVEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEKEGAEVNLVPFVTLNEEAIVKSVETMVDNIDKTNILFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRVAIDSFIARGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEDANSTSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVQVGDIHAIPVSHGEGKFVVTAEEFAELRDNGQIFSQYVDFNGKPSMDSKYNPNGSVHAIEGITSKNGQIIGKMGHSERYEDGLFQNIPGNKDQHLFASAVKHFTGK >LR216060|53224:64680|53224_55378_+|VFI33485.1|DBSCAN-SWA MKFGKRHYRPQVDQMDCGVASLAMVFGYYGSYYFLAHLRELAKTTMDGTTALGLVKVAEEIGFETRAIKADMTLFDLPDLTFPFVAHVLKEGKLLHYYVVTGQDKDSIHIADPDPGVKLTKLPRERFEEEWTGVTLFMAPSPDYKPHKDQKNGLLSFIPILVKQRGLIANIVLATLLVTLINIVGSYYLQSIIDTYVPDQMRSTLGIISIGLVIVYILQQILSYAQEYLLLVLGQRLSIDVILSYIKHVFHLPMSFFATRRTGEIVSRFTDANSIIDALASTILSIFLDVSTVVIISLVLFSQNTNLFFMTLLALPIYTVIIFAFMKPFEKMNRDTMEANAVLSSSIIEDINGIETIKSLTSESQRYQKIDKEFVDYLKKSFTYSRAESQQKALKKVAHLLLNVGILWMGAVLVMDGKMSLGQLITYNTLLVYFTNPLENIINLQTKLQTAQVANNRLNEVYLVASEFEEKKTVEDLSLMKGEMTFKQVHYKYGYGRDVLSDINLTVPQGSKVAFVGISGSGKTTLAKMMVNFYDPSQGEISLGGVNLNQIDKKALRQYINYLPQQPYVFNGTILENLLLGAKEGTTQEDILRAVELAEIREDIERMPLNYQTELTSDGAGISGGQRQRIALARALLTDAPVLILDEATSSLDILTEKRIVDNLIALDKTLIFIAHRLTIAERTEKVVVLDQGKIVEEGKHADLLAQGGFYAHLVNS >LR216060|53224:64680|63115_64138_+|VFI33495.1|DBSCAN-SWA MTNKNAYAQSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGALGGFGGMFDLSKTGVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYVATGKNEPAKLEQVVAGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVVEGDVLLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGEEVLPELEGKKLKEVLLEPTRIYVKAVLPLIKEELVNGIAHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDESKVPVLPIFKALEKYGQIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVERVKELLDEAVYEIGRIVKKENESVIIK >LR216060|53224:64680|55390_56740_+|VFI33487.1|DBSCAN-SWA MKPEFLESAEFYNRRYHNFSSSVIVPMALLLVFLLGFATVAEKEMSLSTRATVEPSRILANIQSTSNNRILVNHLEENKLVKKGDLLVQYQEGAEGVQAESYASQLDMLKDQKKQLEYLQKSLQEGENHFPEEDKFGYQATFRDYISQVGSLRASTSQQNETIASQNAAASQTQAEIGNLISQTEAKIRDYQTVKSAIETGASLAGQNLAYSLYQSYKSQGEENPQTKVQAVAQVEAQISQLESSLATYRVQYAGSGTQQAYASGLSSQLESLKSQHLAKVGQELTLLAQKILEAESGKKVQGNLLDKGKITASEDGVLHLNPETSDSSMVAEGALLAQLYPSLEREGKAKLTAYLSSKDVARIKVGDSVRYTTTHDAGNQLFLDSTITSIDATATKTEKGNFFKIEAEINLTSEQAEKLRYGVEGRLQMITGKKSYLRYYLDQFLNKE >LR216060|53224:64680|61636_63079_+|VFI33493.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPDAAKLTYFGLHSLQHRGQEGAGILSNDQGQLKRHRDMGLLSEVFRNPANLDKLTGAGAIGHVRYATAGEASVDNIQPFLFRFHDMQFGLAHNGNLTNAASLKKELEQRGAIFSATSDSEILAHLIRRSHNPSLMGKIKEALSLVKGGFAYILLFEDKLIAALDPNGFRPLSIGKMANGAVVVSSETCAFEVIGAEWIRDLKPGEIVIIDDEGIQYDSYTDDTQLAVCSMEYIYFARPDSNIHGVNVHTARKRMGAQLAREFKHEADIVVGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLIKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVQLLKEAGATEVHVAIGSPALAYPCFYGIDIQTRQELIAANHTVEETRQIIGADSLTYLSIDGLIESIGIETDAPNGGLCVAYFDGDYPTPLYDYEEDYRRSLEEKTSFYK >LR216060|53224:64680|64134_64680_+|VFI33497.1|DBSCAN-SWA MKKIAVFASGNGSNFQVIAEEFPVEFVFSDHRDAYVLERAKQLGVLSYAFELKEFESKADYEAALVELLEEHQIDLVCLAGYMKIVGPTLLSAYEGRIVNIHPAYLPEFPGAHGIEDAWNAGVGQSGVTIHWVDSGVDTGQVIKQVRVPRLADDTIDRFEARIHEAEYRLYPEVVKALFTD >LR216060|53224:64680|56909_57617_+|VFI33489.1|DBSCAN-SWA MSKQLIYSGKAKDIYTTEDENLIISTYKDQATAFNGVKKEQIAGKGVLNNQISSFIFEKLNAAGVATHFVEKLSDTEQLNKKVKIIPLEVVLRNYTAGSFSKRFGVDEGIALETPIVEFYYKNDDLDDPFINDEHVKFLQIADDQQIAYLKEETRRINELLKVWFAEIGLKLIDFKLEFGFDKDGKIILADEFSPDNCRLWDADGNHMDKDVFRRGLGELTDVYEIVWEKLQELK |
7 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
115760 : 150135
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR216060|115760:150135|DBSCAN-SWA 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35 | Planktothrix_phage(33.33%) | bacteriocin,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
238930 : 337909
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR216060|238930:337909|DBSCAN-SWA 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92 | Staphylococcus_phage(15.79%) | integrase,protease,transposase,tRNA | attL 269731:269750|attR 329823:329842 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
354042 : 408058
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR216060|354042:408058|DBSCAN-SWA 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45 | Aeribacillus_phage(16.67%) | transposase,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
421446 : 465622
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR216060|421446:465622|DBSCAN-SWA GATGCTCTTTATCTTTGAGAAAAAGAGCTGGAACTGGTCATTTGTCTTCTCCTTATTTGCAACTTATGTGGTTTATCAGATTCTCGGTAATTTTTGGGCACGCTATGCTCATTTGATTAATCATAGGAATATTCATGATGAGTATTTTACCGTGGTTCTTTCAAATGGACAACCAACCTTTTTATCGACTATCTTATCTTTTGTCCTGCCTGTAATCATCGGTCCTGTTTTTGAGGAGACTCTTGATAGAGGGTATTTTATGAATACCTTCTTTCCCTAGTCCAAGTATTATTTGGATGTTATCCTATCTGCTATCATCTTTGGGATTAGCCATTTGATACTATCTCACAGAGATCCAATTAGTTTATTATATTATAGTCTGATTGGTTTCTTTTTTGCCCTTGTTTATCGTTCTACCGACAATCTGAGATTAACGATTCTCTGCCATAGTTTTTTTAACTTTCTCAATCATGCAAAACCTATCTGGATTTTTGTTTACAATTATATCTATTATCATTTTTTTAGATAGTGGGAGGCAAAGAAAAAAGTGTTTGATATCTATCAAACACTTTTTCTTTTTATTGTTCTTCTGTTACAAACTGGCTGAGCAGTCCATTGATAAAACGGGCAGATTTTTGATCGGAGAAGTCCTTTGCAAGCTCGATAGCTTCATTAACAGCAACCAGCTGAGGAGTGTCAAATGAAGTGATTTCAAAGACTCCCAAGCGAAGGAGGTTTCTCTCCACGAGCGTTAAGCGTTCAATGGTCCAACCTGCTTTTAAATGCTGAGTGATTTGCTTATCTAGTTCTTCCTTTTTAGCTTGAACACCAGAAACGAGGTCTATCAAAAAGGCTGGAAGTTGTACATCCGTATATTCACGATCATGAGTATAGGCGAAACGACAAGCAGTTTCGACATCCGTACCGAACTCAAGGCTCATGAGAGCTTGAAAAGCGCATTTACGGAGTTGGCGTCTAGATTCTAATAGTGGACTAGTCATTGAGGAAGTCCTCGTCAAATAGATCTTTCAATTCTGGTTTTGGTGTTTTATCTGGGACGATACCTGCAACGTGAATATTGATAGCAGCGAGTTCTACATCAGCCATATTACGGACGGCATCTTTGACAGCTTTCTGGATAGCAACCGCTACCTTAGGAACTTTTACTCCGTACTCAAGGTAGAGATAGATATCTGCTGTGAGTTCTTCGTCCACGTTTTTAAGATAAATGCCACGGCCGAGTGAAAGTTTTGAAAGGGTATCAGACACTGATCTGTTTGAAAAAGAGTGAACACCCTCTACCTTTGCAGTAGCGATAGCAATGATTTTTTCAAGTACACGTGGGGCGATAACGATTTCGCCAAGTTGTTCTTCAATTCCCATAGAATGACCTCTTTCTAGAGATTAGGCACGAGAAACGTAAGTTCCTTCTGCAGTGTTGATAACGAGTTTTTGTCCTGCTTCGATGAAGTCTGGAACGTTTACGACAAGTCCAGTTTCCATCGTTGCTGGTTTACCAGAACCTGTAACAGTAGCACCTTTGATAGATGGTTGAGTTTCAGCAACTGTCAACTCAACAGTAGTAGGAACGGTGACACCGATCACTTCAGTTCCGTAGAATTGGATTTTCACATCAGAGTTTTCAAGGATGTAAAGCAATTCGTTTTCAACATTGACTACAGGGATTTCGTACTGGTCGTAAGTTTCTGTATTCATGAAGTATGCTGTGTCATCCATTTTGTACAAGTATTGAGCTGGGACAGTCTCGATAATAGCTTGTTCAAATTTTTCCTCTGGACGGTAGCTTGTGTCAAATGTAGAACCAGTACGGACATCACGCAATTTCATACGCATGATCGTGTTTCCTTTACCTGGTTTGTGGTGACTAGCTTCCAAAACGCGAATCAATTTGCCGTCAGCTGTTTCAAAGGTCATACCAGCTTTTAATTTACTTGCTTCAATCATGTTTTTACCTCTTTAACAAATATTATTACTCTTCATTTTACCATAAAATACTCTGGAAATAAAGCCAAAATAGTTATTGGGAGTTGGTAGAGAAGAAAAAACCAACCTTAGGGCTGGTTTTGTTCTGTCTAGTTTTCTTTCAACTTCGCCAATTCCTGTGCAAGTAGTTTAAGGGCAACTTGTGGGTTGGCTTGGCCTTTGGTTGCCTTCATAAGGAATCCTGTAAAGGCCTTGTCGGCGTTACGTTTGCCTGACTTGAAGTCGGCAACAGCAGCTTCGTTATCGGCAAAGACTTGGTGGATGATTGGGATCAAGATAGCTGGATCTGAAATTTGAACCATACCTGCTTTTTCCACGTATTCACGCGCGCCACCGCCATTTTTAGCTAGATGGACAAAGACTTTCTTGGCAATCTTAGATGAAATAGTACCGTCTTCGATGATGGCAATCATTTCAACCAAGTTTTCTGGTGTCAATTCGATTTGTTCCAGTGTTTTACCTTCAGCATTCAAGAACTGAGCGACTTCCCCTTGGAGCCAGTTAGAGACTTGTTTGGCATCACCACCTAGGGCAACAGCTTTTTCAAAGAAGTCAGAAGTGACTTTATTAGCAGTCAACTGACTAGCATCGTAGTCTGATAAACCAAGGTCAGATACATAACGCGCACGACGTTCTTTTGGAAACTCTGGCAACTCAGTCCGCATTTCCTCAATCCACTCGTCAGAAATTTCAAAGAGGGGTAGGTCTGGTTCTGGGAAGTAGCGGTAGTCAGCAGCCCCTTCCTTGACACGCATGAGGATGGTTGCTTTATTCGCTTCATCGTAACGGCGTGTTTCTTGGCGGATTTGACCACCTGAGCGAAGAATTTCAGCCTGGCGTTGGACTTCGTATTCAAGACCTTTACGAACGTTTGAGAAGGAGTTGAGGTTCTTCAATTCAGTCTTGGTACCGAATTTCTCTTGACCATAAGGACGAAGGGAGATGTTGGCATCCACACGCATCGAACCTTCCTCCATCTTAACGTCAGAAATGCCAGCGTACTGGATAACTTCCTTGAGGGCTGTCAGATAAGCATAGGCTTCTTCAGGAGAACGCATATCTGCCTCAGATACAATCTCAATCAAGGGAACCCCTTGGCGGTTGAGGTCAACATAAGAGTAGCCATCTGTACCATGGGTGTTTTTACCAGCGTCTTCCTCTAGGTGGGCACGTTCGATACCGATTTTCTTGGTCGTACCGTCTTCTAGTTCGACTTCAATCCAGCCGTTATAACCGATTGGCTCATCAAACTGAGAAATTTGGTAGGCTTTGGGATTATCAGGGTAGAAGTAGTTCTTGCGGTCAAAGTGCATCTTTTTGTGGATGTCCATGTTGAGGGCAAGAGCAGCCTTGATTCCGGCATCGACAACCCCTTTATTGAGAACTGGCAGAACTCCTGGGAAAGACCAGTCAATCACGTTAGTGTTGGCATTTTGATCATTTCCGAAGTGGGCAGAAGTAGGTGAGAAGATTTTTGAATTGGTGTTGAGCTCTACGTGGACTTCAAGTCCGATGACTGTTTCAAAGTTCATTAGTTGTCACCTCCAAAAATCACGGGTTGTTGTTTGTGGTAGCCTGTTGTTGCTTCAAAGGCAGCAGCAACTTGGTAAATGGTTTCCTCAGAGTGCTTGGGACCAATCAATTGCAGACCGACAGGTAGACCTTGAGAGAATCCAGCAGGAATCGAAATTCCAGGCAGTCCTGCCAAGTTTACAGGTATGGTCAATAGGTCGGCTAAGTACATGGCAACTGGGTCATGGTTGAGAGAATCCAAGTCATAGGCAACACTTGGAGCAGTTGGACCCAAAATCAAATCGTAATCCGCGAAGACTTTTTCGAAATCTTGAATGATAAGTGTACGGACCTGTCCAGCCTTCTTATAGTAGGCATCGTAGTAACCTGATGAAAGACTGAAAGTACCCAGCATGATACGGCGCTTCACTTCTTCACCAAAACCTTGGCTTCGGCTGTTTACATAGATTTCATCAAGGTTGGTTGCATCTTCTGCGCGATAGCCGTAACGGATACCGTCAAAGCGTTGCAAGTTTGATGAAGCTTCTGATGAAGCGATGATGTAGTATACGGCAACTCCGTATTTAGAGTGAGGAAGGCTGACTTCTTCGACAATAGCACCCAATTTTTCAAAGTGTTTAGCGGCATTTAGAATGGTTTCCTTAACCTCTGGGTTAATTCCTTCACCGAGGTATTCCTTAGGCAAAGCGATTTTCATACCCTTGATGTCTTGGCCGATTTTTGAAGTAAAGTCGGCGATGCGGACAGGAGCAGAAGTAGAGTCTTTAGCATCTTCGCTGGCAATAGCGTTGAGCAAGAGGGCATTTTCCTTAACAGTAGGAGCAAAAGGTCCAATCTGGTCTAATGAGCTACCAAAGGCAATGAGACCGAAACGTGAAACTGTTCCGTAGGTTGGTTTGAGACCAACGATTCCGTTGAAGGCAGCAGGTTGGCGGATGGAACCACCAGTATCAGAACCAAGTGACAAGCGAACTTGTCCTGAGGCTACAGCTGCGGCAGAACCACTTGATGACCCACCAGGAACCTTGCTGTGGTCCCAAGCGTTTTTAGTTGCTCCGTAGTGTGAAGTTTCACCTGAACCACCCATAGCAAATTCGTCCATGTTGGTCTTTCCAACGACAATCATGCCCTTGGTTTTTGCATTGGCAACAGCTGTCGCATCAAAGATTGGCTCATAGTTGTAGAGCATTTTTGAGGCAGCAGTTGTGAGAATACCGTCTGTAGAGATGTTATCCTTAACAGCAAGTGGAATTCCTGAAAGGACATTGTCAGCATCAATTCCAGCTTCATCAATGGCTTTAGCTTGAACAAGAGCTTGCTCCTCAGCGATGGTGACAAATGAATTGAGGGCTTCCTCACGAGACTTGATATTTTCAAGTGTTGCTTGGGTCAATTCTGTTGCAGAAATTTCCTTAGAGACAAGGAGATTGTGCAACTCTTCAATAGTTTTATTGTTAAAAGTC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43 | Streptococcus_phage(72.73%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
493263 : 525219
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR216060|493263:525219|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR216060|493263:525219|523792_524587_+|VFI34489.1|DBSCAN-SWA MDLGDNELTLTPIPGKSGKAYMGSYPDGKRIFVKMNTSPILPGLAREQIAPQLLWSRRLADGRDMCAQEWLTGKILTPYDMNRKQIVNILTRLHRSRPLMTQLSRLGYAMETPVDLLQSWQETAPDALRKNHFISEVMADLRQTIPGFREDHATIVHGDVRHSNWIETDSGLIYLVDWDSVRLTDRMFDVAHMLCHYISEHQWKEWLTYYGYKYNQTVLSKLYWYGQLSYLSQISKYYMNQDLENVNREIHGLRHFRDKYGKRR >LR216060|493263:525219|510917_511247_-|VFI34430.1|DBSCAN-SWA MTDTDPIKRAHTLITDLNKAYQACKQASADDVRFQEQLNSILGFLAKAETVDNRFLIELEKFYQTSSLLMGLSALDPDAPTRAAWRAYDRFHFDQVKTKLILNENQRAN >LR216060|493263:525219|519537_519702_+|VFI34462.1|DBSCAN-SWA MKKKILIIFILYLIMSIFLYPLRESIWYQLFYTIAYVIAVMIYFALTKKKGAKK >LR216060|493263:525219|508494_508905_-|VFI34421.1|DBSCAN-SWA MSDCIFCKIIAGEIPASKVYEDEQVLAFLDISQVTLGHTLVVPKEHYRNLLEMDATSASQLFAQVPKVAQKVMKVTKAAGMNIISNCEEVAGQTVFHTHVHLVPRYSADDDLKIDFIAHEPDFDKLAQVAETIKNA >LR216060|493263:525219|518760_518964_+|VFI34459.1|DBSCAN-SWA MEKIDYITLNEVELETISGGDDCFIGDIGCIGWGLLKSIGGMIKPAPYVPPVCIPKSSWNPAPPVPC 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MSKIIGIDLGTTNSAVAVLEGTESKIIANPEGNRTTPSVVSFKNGEIIVGDAAKRQAVTNPDTVISIKSKMGTSEKVSANGKEYTPQEISAMILQYLKGYAEDYLGEKVTKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLEVERIVNEPTAAALAYGLDKTDKEEKILVFDLGGGTFDVSILELGDGVFDVLSTAGDNKLGGDDFDQKIIDHLVAEFKKENGIDLSTDKMAMQRLKDAAEKAKKDLSGVTSTQISLPFITAGEAGPLHLEMTLTRAKFDDLTRDLVERTKVPVRQALSDAGLSLSEIDEVILVGGSTRIPAVVEAVKAETGKEPNKSVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIDRNTTIPTSKSQVFSTAADNQPAVDIHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPAAPRGIPQIEVTFDIDKNGIVSVKAKDLGTQKEQTIVIQSNSGLTDEEIDRMMKDAEANAEADKKRKEEVDLRNEVDQAIFATEKTIKETEGKGFDAERDAAQAALDDLKKAQEDNNLDDMKAKLEALNEKAQGLAVKLYEQAAAAQQAQEGAEGAQATGNAGDDVVDGEFTEK >LR216060|493263:525219|508197_508485_-|VFI34418.1|DBSCAN-SWA MKLSNLLLFAGAAAGSYLVTKNRQTITDEVLNTTDRVQAIKDDVDIIQNSLQIINQQKELIKEYQEDLTYKFKVLEKDIQTRLAVIKEMQGTEDK >LR216060|493263:525219|521652_521874_+|VFI34477.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MMSQFSVMDNEMLVRTEDGDVSDIYRGYANQRSPFASYPSILKNSGPFPVSGYCLRGYHDRGYIGAGFHLCGI >LR216060|493263:525219|515808_517434_-|VFI34451.1|DBSCAN-SWA MVTIINIGGSYYLQGILDEYIPNQMKSTLGIISVGLVITYILQQVMSFSRDYLLTVLSQRLSIDVILSYIRHIFELPMSFFATRRTGEIISRFTDANSIIDALASTILSLFLDVSILILVGGVLLAQNPNLFLLSLLSIPIYMFIIFSFMKPFEKMNHDVMQSNSMVSSAIIEDINGIETIKSLTSEENRYQNIDSEFVDYLEKSFKLSKYSILQTSLKQGTKLVLNILILWFGAQLVMSSKISIGQLITFNTLFSYFTTPMENIINLQTKLQSAKVANNRLNEVYLVESEFQVQENPVHSHFLMGDIEFDDLSYKYGFGRDTLTDINLTIKQGDKVSLVGVSGSGKTTLAKMIVNFFEPYKGHISINYQDIKNIDKKVLRRHINYLPQQAYIFNGSILENLTLGGNHMISQEDILRACELAEIRQDIERMPMGYQTQLSDGAGLSGGQKQRIALARALLTKAPVLILDEATSGLDVLTEKKVIDNLMSLTDKTILFVAHRLSIAERTNRVIVLDQGKIIEVGSHQELMQAQGFYHHLFNK >LR216060|493263:525219|501867_502902_+|VFI34402.1|DBSCAN-SWA MVTERQQDILNLIIDIFTKTHEPVGSKALQESINSSSATIRNDMAELEKQGLLEKAHTSSGRMPSVAGFQYYVKHSLDFHRLAENEVYEIVKAFDQEFFKLEDILQEAANLLTDLSGCTVVALDVEPSRQRLTAFDIVVLGQHTALAVFTLDESRTVTSQFLIPRNFLQEDLLKLKSIIQERFLGHTVLDIHYKIRTEIPQIIQRYFTTTDNVIDLFEHIFKEMFNENIVMAGKVNLLNFANLAAYQFFDQPQKVALEIREGLREDQMQNVRIADGQESCLADLAVISSKFLIPYRGVGILAIIGPVNLDYQQLINQINVVNRVLTMKLTDFYRYLSSNHYEVH >LR216060|493263:525219|505768_506122_+|VFI34412.1|DBSCAN-SWA MSVNKNNLSDIADYHEKIKFFEELFNLDYNPTEMLVTVERNGNVIYKEFTEVAVGKSKYDYTSVFKDVMIYFSDHICQELHLYKTQDPHYNKFEFDLAKRSLKITTRDNTTIFISNE >LR216060|493263:525219|508972_509704_+|VFI34424.1|DBSCAN-SWA MLEIKNLTGGYVHVPVLKDVSFTVESGQLVGLIGLNGAGKSTTINEIIGLLAPYSGSININGLTLQGDATSYRKQIGYIPETPSLYEELTLREHIETVAMAYGIEQKVAFERVEPLLKMFRLEQKLDWFPVHFSKGMKQKVMIICAFVVDPSLFIVDEPFLGLDPLAISDLIQLLEVEKQKGKSILMSTHVLDSAEKMCDAFVILHKGEVRAKGNLLQLREAFDMPEASLNDIYLALTKEEDL >LR216060|493263:525219|521905_522595_+|VFI34480.1|protease|DBSCAN-SWA MKKYQLLFKISAVFSYLFFVFGLSQLTLIVQNYWQFSSQIGNFVWIQNILSLLFSGVMIWILVKTGHGYLFRIPRKKWLWYSILTVLVVVLHISFNVQTAKHVQSTAEGWNVLIGYSGTNFAELGIYVTLFFLTPLMEELIYRGLLQHAFFKHSRFGLDLLLPSILFALPHFLSLPSLLDIFVFATFGIIFAGLTRYTKSIYPSYAVHVINNIVATFPFLLTFLHRVLG >LR216060|493263:525219|494965_495265_+|VFI34387.1|DBSCAN-SWA MSFKLSIGKVAILDIPATHNEAIISIFPYANKENIIRDYLMIFLPLISTLGDSKDAIKGKTLNSTSISELLIPISNHEEMKRIISKVDLLFQKVSQLFE >LR216060|493263:525219|511865_512603_+|VFI34436.1|DBSCAN-SWA MRIFVLEDDFSQQTRIETTIEKLLKEHHITLSSFEVFGKPDQLLAEVHEKGAHQLFFLDIEIRNEEMKGLEVARKIRDRDPYALIVFVTTHSEFMPLSFRYQVSALDYIDKALSAEEFESRIETALLYANGQDSKSLAEDCFYFKSKFAQFQYPFKEVYYLETSTRPHRVILYTKTDRLEFTASLEEVLKQEPRLLQCHRSFLINPANVVHLDKKEKLLFFPNGGSCLIARYKVREVSEAINNLH >LR216060|493263:525219|511522_511861_+|VFI34433.1|DBSCAN-SWA MKHMIIQTQKTVYKVNVDDIYYIQTHPTKAHTVQIVTEEASFNMLQNLSNLENQYGETLMRCHRNCLVNLDKLKSIDFQERILFLGEEGQYAVKYARRRYREIRQKWLKEGE >LR216060|493263:525219|519966_520326_+|VFI34465.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYEGSKQLTDARFKCLVGVQRTTFEEMLAVLKTAYQLKHAKGGRKPKLSLEDLLMATLHYVREYRTYEEIAADFGIHESNLLRRSQWVEVTLVQSGVTISRTPLSSEDTVMIIDATEV >LR216060|493263:525219|502928_503453_+|VFI34405.1|DBSCAN-SWA MAQDIKNEEVEEVQEEEVVETAEETTPEKSELDLANERADEFENKYLRAHAEMQNIQRRANEERQNLQRYRSQDLAKAILPSLDNLERALAVEGLTDDVKKGLGMVQESLIHALKEEGIEEIAADGEFDHNYHMAIQTLPADDEHPVDTIAQVFQKGYKLHDRILRPAMVVVYN >LR216060|493263:525219|506326_507463_+|VFI34415.1|DBSCAN-SWA MNNTEFYDRLGVSKNASADEIKKAYRKLSKKYHPDINKEPGAEDKYKEVQEAYETLSDDQKRAAYDQYGAAGANGGFGGAGGFGGFNGAGGFGGFEDIFSSFFGGGGSSRNPNAPRQGDDLQYRVNLTFEEAIFGTEKEVKYHREAGCRTCNGSGAKPGTSPVTCGRCHGAGVINVDTQTPLGMMRRQVTCDVCHGRGKEIKYSCTTCHGTGHEKQAHSVHVKIPAGVETGQQIRLAGQGEAGFNGGPYGDLYVVVSVEASDKFEREGTTIFYNLNLNFVQAALGDTVDIPTVHGDVELVIPEGTQTGKKFRLRSKGAPSLRGGAVGDQYVTVNVVTPTGLNDRQKVALKEFAAAGDLKVNPKKKGFFDHIKDAFDGE >LR216060|493263:525219|493263_494061_+|VFI34381.1|integrase|DBSCAN-SWA MKDFELHLKKAGLAENTVRSYLYGVRFFLENYELKMEDLFEYKGYLLDNFKPKTVNLRLQGVNKYLAFIGHDDLKLKFVKVQQKPFLEDVISHADYLFLKRSLKKDGILKWHFVVWFLGATGARVSELIKLKVEHVEIGYFDIYSKGGKIRRLYIPKKLRNSCLSWLESENRRSGYLFLNKFNEPITARGVAQQLKNYADKYKMNPKVIYPHSFRHLFAKNFLAKYNDIALLADLMGHESIETTRIYLRKTATEQQNIVDKIVNW >LR216060|493263:525219|521193_521397_+|VFI34474.1|DBSCAN-SWA MNTYCNINETMLSEVYGGNSGGAAVVAALGCAAGGVKYGRLLGPWGAAIGGIGGAVVCGYLAYTATS >LR216060|493263:525219|498253_500587_-|VFI34396.1|DBSCAN-SWA MVEFIKSKKEMSEEDIKANFITPAIVSKGWKNGEHIAYEEYFTDGRIEVRGDKARRKEGKKSDYSLYYQFGTRIAIVEAKDNKHSVRAGLQQAIEYGEILDVPFVYSSNGDGFIEHDRITREERELELDEFPTREELFSRMTKEKGLTYEITEAISTPYYTDAFSMKTPRYYQQIAINRTIETVARGQKRVMFVMATGTGKTFMAFQIIHRLRKAGLAKRVLFLADRNILVDQTMAEDFKPFEKVMTKITPKLLTAPEKLNSFEIYLGLYQQLTGEDGTETHYQKFDKDFFDLIVIDEAHRGSAKENSNWRKIIDYFSSATQIGMTATPKETKNASNTEYFGEPIYTYSLKQGIEDGFLAPYRVMRVNLDVDVDGYRPETGKVDANGQLIEDRYYGRKDFDKTIVIDDRTQRVAKFVSDYMKQNNARFDKTIVFCVDIDHAERMRAALVKENLDLVQEDYRYVMQVTGDNAEGKAQLDNFMDVNSNFPAIVTTSKLLTTGVNAKTCRLIVLDSNIQSMTEFKQIIGRGTRLYPQKGKEFFTIIDFRNVTNLFADPDFDGDPVKVLETGAKTVSGSTPGFVSEEGDPVEKYIVTDKQVTILNSTVQVLDENGKLITESLTDYTRKNILGSYATLNDFITVWHTADKKKLILDELYKKGVYLDAIRESEGISEQEIDDFDLLLKLAYGQKELTKTERINKLKQSGYLYKYSEEARAVLEILLNKYMDKGIGELESIETLKLPEFQIYGGTFKIINTYFGDKKRYLQAIKELEQELFTVA >LR216060|493263:525219|512616_513957_+|VFI34439.1|DBSCAN-SWA 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>LR216060|493263:525219|522636_522870_+|VFI34483.1|DBSCAN-SWA MYKHLFFLDSKTLDRLTPYILVLASDTIAFNVFVLTFVSAVVFNFLNSMLALMAIFIGAGYVVGFWLLILNENQRAN >LR216060|493263:525219|514000_514156_-|VFI34442.1|DBSCAN-SWA MDKKQNLTSFQELTTTELNQIIGGGWWEDFLYRFNIIEQKNTKGFHQPIQL >LR216060|493263:525219|501194_501704_+|VFI34399.1|DBSCAN-SWA MNSRVEFRIFTIVDLDKEEEYLHEMHLKGWRYRTSRFGLFYFDQCQPDDVIYRIYDSRFLKKYKHELQDFRDRGWELIGAGSCSILRKSSSDLLPEDQVYMSKGLKWEVMRSRLRSCTATFLGGLVVCTSLFREDLSMSFFLIFVLYAFLISYLIHGYFRLKRKYRVDE >LR216060|493263:525219|523020_523632_+|VFI34486.1|protease|DBSCAN-SWA MEFFDKFHALCFGFLVLIIVITVPYTINHGDFFQNESALIIVSLLVTSLSVAYARKFEMISFGMLSKKQLLLFIAIFLLSVLETLVYIHFFAVSSGSGVQHLAEVSRGISLSLILTTSVFGPIQEELIFRGLLQGAVFDNSWLGLVLTSSLFSFMHGPSNVPSFIFYLLGGLLLGLAYKKSQNLWVSTLVHMFYNSWPLLYYL >LR216060|493263:525219|517378_517966_-|VFI34453.1|protease,bacteriocin|DBSCAN-SWA MTSYKRTFVPQIDARDCGVAALASIAKFYGSDFSLAHLRELAKTNKEGTTALGIVKAADEMGFETRPVQADKTLFDMSDVPYPFIVHVNKEGKLQHYYVVYQTKKDYLIIGDPDPSVKITKMSKERFFYEWTGVAIFLATKPSYQPHKDKKNGLLSKLPSSDFQTKISHCLHCSLKLIGHYYQYRWFLLSPRNLG >LR216060|493263:525219|494131_494677_+|VFI34384.1|DBSCAN-SWA MNWVVIKIKDIFSMNTGLSYKKGDLSINNKGVRIIRGGNIKPLEFSLLDNDYYIDTQFISSEQVYLKHNQLITPVSTSLEHIGKFARIDKDYDGVVAGGFIFQLTPFESSEIISKFLLFNLSSPLFYKQLKAITKLSGQALYNIPKTTLSELLIPLAPFEEQELITQKVEKLFEKVNQLWK >LR216060|493263:525219|518239_518443_+|VFI34456.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MNTKMMEQFSVMDNEMLDRIEGGIFGVDDALFWAGLGYVAGSIVDTAIDDFTNQCRKNPHQWFCVRV >LR216060|493263:525219|520309_520852_+|VFI34468.1|transposase|DBSCAN-SWA MRRKYKSIALKKELANYSGKKKCHAMKAQAIVTSQGRIVSLDITVNYCHDMKLFKMSRRNIGQAGKILTDSDYQGPMKIYPQAQTPRKASKLKPLTAEDKACNHALSKDRSKVENILAKVKTFKMFSTTYRNHRKRFGLRMNLIAGIINHELGFWFRRKSNVIFAIQDVSMTIQDLDEKF >LR216060|493263:525219|524583_525219_+|VFI34492.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRVRNRKGATELLEANPQYVVLNPLEAKAKWRDLFGNDNPIHVEVGSGKGAFVSGMAKQNPDINYIGIDIQKSVLSYALDKVLEVGVPNIKLLWVDGSDLTDYFEDGEIDRLYLNFSDPWPKKRHEKRRLTYKTFLDTFKRILPENGEIHFKTDNRGLFEYSLVSFSQYGMKLNGVWLDLHASDFEGNVMTEYEQKFSNKGQVIYRVEAEF >LR216060|493263:525219|520923_521178_+|VFI34471.1|DBSCAN-SWA MDTKIMEQFHEMDITMLSSIEGGKNNWQTNVLEGGGAAFGGWGLGTAICAASGVGAPFMGACGYIGAKFGVALWAGVTGATSGF >LR216060|493263:525219|514212_514704_-|VFI34445.1|DBSCAN-SWA MENQLTELKVQLDQATQRLENNTLTAPSKGIVHLNSEFEGKNRIPTGTEIAQIFPVITDTREVLITYYVSSDYLPLLDKGQTVRLKLEKIGNHGTTIIGQLQTIDQTPTRTEQGNLFKLTALAKLSNEDSKLIQYGLQGRVTSVTTKKTYFDYFKDKILTHSD >LR216060|493263:525219|515138_515798_-|VFI34448.1|DBSCAN-SWA MNPNLFRSVEFYQRRYHNYATVLIIPLSLLFTFILIFSLVATKEITVTSQGEITPTSVIASIQSTSDNPILANHLVANQVVEKGDLLIKYSETMEESQKTALETQLQRLEKQKEGLGILKQSLEKATDLFSSEDEFGYHNTFMNFTKQSHDIELGISKTNTEVSNQANLTNSSSSAIEQEITKVQQQIGEYQELRDAIVNKRARLPTGNPHQSIDLFGI >LR216060|493263:525219|495212_496778_-|VFI34390.1|DBSCAN-SWA MTPEQLKASILQRAMEGKLVPQNPNDEPASELLKRIKAEKEKLISEGKIKRDKKETEIFRGDDGKHYGKFADGSTQEIDVPYDIPDTWEWVRFSTLVEIVRGGSPRPIKDYLTSEVDGINWIKIGDTEKGEKYINNVKEKIKKSGLNKTRFVKKGTFLLTNSMSFGRPYILNVDGAIHDGWLAISNYENSLNKDYLFYILSSNVVYSQFLSLISGAVVKNLNSDKVASILIPLPPLSEQQRIIEAIESALEKVDEYAESYNRLEQLDKEFPDKLKKSILQYAMQGKLVEQDPNDESVEVLLEKIRAEKQKLFEEGKIKKKDLDISIVSQGDDNSYYGNIPMNWVVIKIKDIFSMNTGLSYKKGDLSINNKGVRIIRGGNIKPLEFSLLDNDYYIDTQFISSEQVYLKHNQLITPVSTSLEHIGKFARIDKDYDGVVAGGFIFQLTPFESSEIISKFLLFNLSSPLFYKQLKAITKLSGQALYNIPKTTLSELLIPLAPFEEQELITQKVEKLFEKVNQLWK |
38 | Bacillus_phage(28.57%) | transposase,tRNA,integrase,bacteriocin,protease | attL 491848:491907|attR 496528:496612 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
553586 : 682751
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LR216060|553586:682751|DBSCAN-SWA TATGCTTGTATCTTATAAATGGTTAAAAGAATTGGTGGACATTGATGTGCCATCACAGGAGTTGGCTGAAAAAATGTCAACCACAGGGATCGAGGTAGAGAGTGTCGAATCACCAGCTGCTGATCTCTCAAAAATTGTTGTCGGTGAGGTCTTGTCTTGCGAAGATGTGCCAGAGACTCACCTCCATGTTTGTCAGGTTAACGTTGGCGAAGAAGAAGCCCGTCAGATCGTTTGTGGTGCCCCAAATGTGCGTGCTGGGATCAAGGTCATGGTGGCTCTTCCAGGAGCTCGTATCGCTGATAACTACAAAATCAAAAAAGGAAAAATCCGTGGTTTGGAGTCACTTGGAATGATCTGTTCACTTGGTGAATTGGGAATTTCTGACTCAGTTGTGCCTAAGGAATTCGCAGATGGCATCCAAATCTTGCCAGAAAATGCCGTGCCAGGTGAGGAAGTCTTTTCTTACCTAGACTTGGATGATGAAATCATCGAACTTTCCATCACACCAAACCGTGCAGATGCCCTTTCTATGTGTGGAGTGGCTCACGAAGTGGCAGCCATCTATGACAAGGCAGTCAACTTTAAAGAATTTACTCTAACAGAAACTAATGAAGCTGCGGCAGATGCCCTTTCTGTCAGCATTGGGACAGACAAGGCGCCTTACTATGCAGCTCGTATCTTGGACAATGTGATTATCGCACCAAGTCCACAATGGTTGCAAAACCTTCTCATGAACGAAGGCATCCGTCCCATCAATAACGTTGTAGACGTGACAAACTACATCCTGCTCTACTTTGGTCAACCTATGCATGCTTTTGACTTGGACACATTTGAAGGGACTGACATCCGTGTGCGTGAAGCGCGTGCTGGTGAAAAATTGGTGACCTTGGACGGTGAAGAACGTGACTTGGACGTGAATGACCTAGTCATCACTGTTGCAGACAAGCCAGTAGCCCTTGCAGGTGTCATGGGTGGTCAAGCAACAGAAATCTCTGAAAAATCTAGTCGTGTTGTCCTTGAAGCTGCTGTTTTCAATGGTAAATCTATCCGTAAGACAAGTGGTCGCCTGAACCTTCGTTCAGAATCGTCTTCTCGCTTTGAAAAAGGCATCAATGTGGCAACAGTCAATGAAGCCCTTGATGCGGCAGCTAGCATGATTGCAGAACTTGCAGGTGCGACGGTGCGTAAGGGTATCGTTTCAGCGGGTGAGCTTGATACCTCTGATGTGGAAGTTTCTTCAACCCTTGCTGATGTTAACCGTGTCCTCGGAACTGAGCTGTCTTATGCTGATGTCGAAGACGTCTTCCGTCGTCTTGGTTTTGGTCTTTCTGGAAATGCAGACAGCTTTACAGTCAGCGTACCACGTCGTCGTTGGGATATCACAATCGAAGCTGACCTCTTTGAAGAAATCGCTCGTATCTATGGATATGACCGCTTGCCAACTAGTCTACCAAAAGACGATGGTACAGCTGGTGAATTGACTGTGACACAAAAACTCCGCCGTCAAGTTCGTACCATTGCTGAAGGAGCAGGTTTGACAGAAATCATCACCTATGCTCTAACAACTCCTGAAAAAGCAGTTGAGTTTACGGCTCAACCAAGTAACCTTACGGAACTCATGTGGCCAATGACTGTGGATCGTTCAGTCCTCCGTCAAAATATGATTTCAGGTATCCTTGATACCGTTGCCTACAACGTGGCTCGTAAGAATAAAAACTTGGCCCTTTACGAGATTGGAAAAGTCTTTGAACAAACAGGTAATCCAAGAGAAGAACTTCCAAATGAAATTAACAGTTTTGCCTTTGCCTTGACAGGCTTGGTTGCTGAAAAAGATTTCCAAACAGCAGCAGTTCCAGTTGATTTCTTCTATGCTAAGGGAATCCTTGAAGCCCTATTTACTCGCTTGGGACTCCAAGTAACCTATACAGCAACATCTGAAATCGCTAGCCTTCATCCAGGTCGTACAGCAGTCATTTCACTCGGTGACCAAGTTCTTGGTTTCCTTGGCCAAGTGCATCCAGTCACTGCTAAGGCTTATGATATTCCAGAAACGTATGTAGCTGAGCTTAACCTTTCAGCTATCGAAGCTGCGCTTCAGCCAGCGACTCCATTTGTAGAAATCACCAAATTCCCGGCAGTCAGCCGTGACGTTGCCCTTCTCCTCAAGGCAGAAGTGACTCATCAAGAAGTTGTAGATGCTATCCAAGCTGCCGGCGTGAAACGTTTGACAGATATCAAACTCTTTGACGTCTTCTCAGGTGAGAAATTGGGACTTGGTATGAAGTCAATGGCTTATAGCTTGACCTTCCAAAATCCAGAAGATAGCTTAACGGACGAAGAAGTCGCACGCTATATGGAAAAAATCCAAGTATCGCTCGAAGAAAAAGTCAATGCAGAAGTGCGTTAAACGATAGTAGGATACAAATTCCCCCTCTAGTTTATGAACACTAGAGGGGTGATTTTATGGTTCTATAATATTTGTAGTGGGTAAATCCACTATAGATATTATGGAGCCTATTTTATTGTAGAAAAAAAGTCCCATATGACCTATAATGAAAAGCGACAAAACAACTCATTAGAAAGAATCATATGGAACAATTACATTTTATCACAAAATTACTAGACATTAAAGACCCTAATATCAGTTTGAACAAAAATCTCATGAATACAAGGCTATCAAGCGTTACTGGAAACTCATCCAACAGGATAGTCGTAAATTGAGCGATAAACGTTTTTATCGCCCTACTTTTCGTATGCATTTAACCAATAAAGAGATTTTAAACAAGCTTTTGAGCTATTCACAAGACTTGAAACATCACTATCAGCTCTATCAACTCTTGCTGTTTCACTTTCAGAATAAGGAACCGGAGAAATTTTTCGGACTCATTGAGGACAATCTAAAGCAGGTTCATCCTCTTTTTCAGACTGTCTTTAAAACCTTTCTAAAGGACAAAGAGAAAATCGTCAACGCCCTTCAACTACACTATTCTAACGCCAAATTGGAAGCGACCAATAATCTCATCAAACTTATCAAGCGCAATGCCTTTGGTTTTCGGAACTTTGAAAACTTCAAAAAACGGATTTTTATCGCTCTGAATATCAAAAAAGAAAGGACAAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTGACTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCCGATTTTATATAAAATAATTAAAATGTGATTTCTGTAAAAATACATCTATGATCAGAGTTTTGAAAACTTACAATGTCTAAATCTTTAACATAGTAGTGGTTTTTAGGCAATAAAATATGATCTATTGTTGCATTAAAAAGTTTTGGACTTTGGCTATTCCAAGTTCCTCTTTCAAAAGGTGGCAGTACATTTAATGCGTCCCTATGAGAGCTTATTTTTGCAAGTGCTCCATGACGCATAGTTGCATTAAAATCACCTGCAATAATAGCCTTTGGATATTTTGAAGCCAATTGATTATGAATGATGTTTAAGTCTTGCTTCCAGATTTCCATTAAACCTGGCAGAGGAGGAGCAGTATGCAAGGCAATGATATCTGGTATATTTTGTTTTCTCGAATGTAATACAATTGTCCCGAACCGTGTTGTATGAAAAGTTTTAGCTTCTGTATAGAAACCATAACTTTTCTTGACAATCACAGTCACAGGAGCTATTCCACTATTGGTAGGTGGAGAAGTGAAAATATCATAGTTGGCCATAGAAAGTCCAACTTGATGAAACAATAGTTTGATTCTCTGGTTTTCTTGCTCACCTCTGATATTGGTAGCTAGTTCAGGGAATATAGCCATATCGGCGTCAAAATGGCTAAAAATTCGCTCAATATGTTGTGCTTCTATTTGATTAGCGACGTTCCAAGTTACTAATTTTAAGGTTTTAGTCTTATTTGATGCAGAAGAAAGGGTTTTATCTGTTCCGAATAATAGTAATATGAGCGATAGTAAGAGCAAAATGCTAGAGTAAAACCGTATTTGTTTATTTTTCTTGTAAAAAGATAGGGAAAAAAATACGAAACTTAAAATAGAAGCCATAGTTGCAGTAGCTAAGGGGAAGGCATAAATCTGTGCCAAGATAGGTTGGGTAGATAGCCAAATATTAAGATTAGAAGATGGAAAAAAAGAATAAGCTATGATAGGGATAACAAAGAGAATGACCGAAAGGGCAGAGAGAAATGTTTTAATCATTGTGTGAGTACCTCAATTTGCAATGGTTGCTCGGAGCTAATGTGACTTTACTTGATTGATATTCTTTTTCTTGTCTTCCTTATAGATTAAGTACAACCCAAGTAAAAAAAGTCCAATTTAAGATTGAAATGATTAAAAGGCACAGAAATGCAAGACAATTATACTACAAAAGGCAAACATTTGACAATCGATAGCCGTCGCTTAATCGAACGATGGAAAAAAGAAGGAAAATCAAATAGAGAAATTGCCTCTCTACTTGGAAAAGCTCCTCAAACTATCCACACTGAAATAAAGCGTGGGACAGTCCGACAATGTCTTGGAAAAGGGCGCTTCAAAGAGATTTATTCTGCCGACTACGCTCAACAGTCTTAAGAAACTAAAGGAAAAGATTCTCCACTATACATAACCAAAAATTTTCGCCTGAAATGATGGTTATGGCTAAAGGGGTTAACGTGGGAATTTCAACCATTTACTATTGGATTCATCGTGGAAAATTGGGGTTAAGCAAGCAGGATCTGCTCTATCCTAGAAAAGGAAAATCTGTTAAGAAACAAGCTAGCACCAATTTTAAACCCGCTGATCAATCTATCGAATCATAATTCGCTCATTATATATAGACTTAAAAGAAAGAGGGGTAAGTGATGAAGAATAGTGCTATCGGGAGTAACTGGAAGGATGTCCGATCAGAACTCTTTACCAAGGAGGAAATACTTGAAAGTGATATGCGAGTAGCTATCATGAGTGAGTTGATTGAAGCCAGACATGAGCAAGGAATCAGCCAGAAAAAGCTAGAAGAACTTAGTGGAGT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117 | Staphylococcus_phage(17.39%) | transposase,tRNA,bacteriocin,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
698611 : 776668
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LR216060|698611:776668|DBSCAN-SWA 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83 | Streptococcus_phage(19.23%) | transposase,integrase,protease,tRNA | attL 739344:739392|attR 772696:772744 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
798139 : 860147
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LR216060|798139:860147|DBSCAN-SWA 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MITGELKNKIDQLWEILWTEGNANPLTNIEQLTYLLFMKDLDSVELGRESDAEFLGIPYEGVFPKDKPEYRWSTFKNIGDAQEVYRLMTQEIFPFIKNLKGDTDDTAFSRYMREAIFQINKPATLQKAISILDVFPTRGLDVDFDNDKQSITDIGDIYEYLLSKLSTAGKNGQFRTPRHIIDMMVELMQPTIKDIISDPAMGSAGFLVSASRYLKRKKDEWETNTDNINHFHNQMFHGNDTDTTMLRLGAMNMMLHGVENPQISYLDSLSQDNEEADKYTLVLANPPFKGSLDYNSTSNDLLATVKTKKTELLFLSLFLRTLKPGGRAAVIVPDGVLFGSSKAHKGIRQEIVENHKLDAVISMPSGVFKPYAGVSTAILIFTKTGNGGTDKVWFYDMKADGLSLDDKRQPISDNDIPDIIERFHHLEKEAERQRTDQSFFVPVAEIKENDYDLSINKYKEIEYEKVEYEPTEVILKKINDLEKEIQAGLAELEKLLK |
56 | Streptococcus_phage(27.78%) | transposase,integrase | attL 836851:836893|attR 857187:857229 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
884952 : 894591
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LR216060|884952:894591|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGAAATTAACTAGTTTAGCACTTGTAGGCGCTTTTTTAGGTTTGTCATGGTATGGGAATGTTCAGGCTCAAGAAAGTTCAGGAAATAAAATCCACTTTATCAATGTTCAAGAAGGTGGCAGTGATGCGATTATTCTTGAAAGCAATGGACATTTTGCCATGGTGGATACAGGAGAAGATTATGATTTCCCAGATGGAAGTGATTCTCGTTATCCATGGAGAGAAGGAATTGAAACGTCTTATAAGCATGTTCTAACAGACCGTGTCTTTCGTCGTTTGAAGGAATTGAGTGTCCAAAAACTTGATTTTATTTTGGTGACCCATACCCACAGTGATCATATTGGAAATGTTGATGAATTACTGTCTACCTATCCAGTTGACCGAGTCTATCTTAAGAAATATAGTGATAGTCGTATTACTAATTCTGAACGTCTATGGGATAATCTGTATGGCTATGATAAGGTTTTACAGACTGCTGCAGAAAAAGGTGTTTCAGTTATTCAAAATATCACACAAGGGGATGCTCATTTTCAGTTTGGGGACATGGATATTCAGCTCTATAATTATGAAAATGAAACTGATTCATCGGGTGAATTAAAGAAAATTTGGGATGACAATTCCAATTCCTTGATTAGCGTGGTGAAAGTCAATGGCAAGAAAATTTACCTTGGGGGCGATTTAGATAATGTTCATGGAGCAGAAGACAAGTATGGTCCTCTCATTGGAAAAGTTGATTTGATGAAGTTTAATCATCACCATGATACCAACAAATCAAATACCAAGGATTTCATTAAAAATTTGAGTCCGAGTTTGATTGTTCAAACTTCGGATAGTCTACCTTGGAAAAATGGTGTTGATAGTGAGTATGTTAATTGGCTCAAAGAACGAGGAATTGAGAGAATCAACGCAGCCAGCAAAGACTATGATGCAACAGTTTTTGATATTCGAAAAGACGGTTTTGTCAATATTTCAACATCCTACAAGCCGATTCCAAGTTTTCAAGCTGGTTGGCATAAGAGTGCATATGGGAACTGGTGGTATCAAGCGCCTGATTCTACAGGAGAGTATGCTGTCGGTTGGAATGAAATCGAAGGTGAATGGTATTACTTTAACCAAACGGGTATCTTGTTACAGAATCAATGGAAAAAATGGAACAATCATTGGTTCTATTTGACAGACTCTGGTGCTTCTGCTAAAAATTGGAAGAAAATTGATGGAATCTGGTATTATTTTAACAAAGAAAATCAGATGGAAATTGGTTGGGTTCAAGATAAAGAGCAGTGGTATTATTTGGATGTTGATGGTTCTATGAAGACAGGATGGCTTCAATATATGGGGCAATGGTATTACTTTGCTCCATCAGGGGAAATGAAAATGGGCTGGGTAAAAGATAAAGAAACCTGGTACTATATGGATTCTACTGGTGTCATGAAGACAGGTGAGATAGAAGTTGCTGGTCAACATTATTATCTGGAAGATTCAGGAGCTATGAAGCAAGGCTGGCATAAAAAGGCAAATGATTGGTATTTCTACAAGACAGACGGTTCACGAGCTGTGGGTTGGATCAAGGACAAGGATAAATGGTACTTCTTGAAAGAAAATGGTCAATTACTTGTGAACGGTAAGACACCAGAAGGTTATACTGTGGATTCAAGTGGTGCCTGGTTAGTGGATGTTTCGATCGAGAAATCTGCTACAATTAAAACTACAAGTCATTCAGAAATAAAAGAATCCAAAGAAGTAGTGAAAAAGGATCTTGAAAATAAAGAAACGAGTCAACATGAAAGTGTTACAAATTTTTCAACTAGTCAAGATTTGACATCCTCAACTTCACAAAGCTCTGAAACGAGTGTAAACAAATCGGAATCAGAACAGTAGTAGAAAAGAAGGTTTTAGGGCCTTCTTTTTCCTATCAACTCTTTTCTATTTCCTGTTATTCATGTTATAATGGATAAATATGAATAATCGGAGTGAGACTATGAAATACAAACGGATTGTCTTTAAGGTGGGTACTTCTTCTCTGACAAATGAGGATGGAAGTTTATCACGTAGTAAGGTAAAGGATATTACCCAGCAGTTGGCTATGCTGCACGAGGCTGGTCATGAGTTGATTTTGGTGTCTTCAGGTGCCATTGCGGCTGGTTTTGGAGCCTTAGGATTTAAAAAGCGTCCGACTAAGATTGCTGATAAACAGGCTTCAGCAGCGGTAGGGCAGGGGCTTTTGTTGGAAGAATATACGACCAATCTTCTCTTGCGTCAAATCGTTTCTGCACAAATCTTGCTGACCCAAGATGACTTTGTGGATAAGCGTCGTTATAAAAATGCCCATCAGGCTTTGTCGGTTTTACTCAACCGTGGGGCAATTCCTATCATCAATGAGAATGATAGTGTCGTTATTGATGAGGTCAAGGTTGGGGACAATGACACTCTAAGTGCCCAAGTAGCGGCGATGGTCCAAGCAGACCTTTTGGTTCTCTTGACAGATGTGGACGGTCTCTATACTGGAAATCCTAATTCAGATCCAAGAGCCAAACGCTTGGAGAGAATAGAGACCATCAATCGTGAGATTATTGATATGGCTGGTGGAGCTGGTTCGTCAAACGGAACTGGGGGTATGTTAACCAAAATCAAGGCTGCAACTATCGCGACGGAATCAGGAGTTCCTGTTTATATCTGCTCATCCTTGAAATCAGATTCCATGATTGAGGCGGCAGAGGAGACCGAGGATGGTTCTTACTTTGTTGCTCAAGAGAAGGGGCTTCGTACCCAGAAACAATGGCTTGCCTTCTATGCTCAGAGTCAAGGTTCTATTTGGGTTGATAAAGGGGCTGCGGAAGCTCTCTCTCAACATGGAAAGAGTCTTCTCTTATCTGGTATTGTTGAAGCAGAAGGAGCCTTTTCTTACGGTGATATCGTGACAGTATTTGACAAGGAAAGTGGAAAATCACTTGGAAAAGGACGCGTGCAATTTGGAGCATCTGCTTTGGAGGATATGTTGCGTTCTCAAAAAGCCAAGGGTGTCTTGATTTACCGTGACGACTGGATTTCCATTACTCCTGAAATCCAACTACTTTTTACAGAATTTTAGAGGTAAACTATGGTGAGTAGACAAGAACAATTTGAACAGGTACAGGCTGTTAAAAAATCGATTAACACAGCTAGTGAAGAAGTGAAAAACCAAGCCTTGCTAGCCATGGCTGATCACTTAGTGGCTGCTACTGAGGAAATTTTAGCGGCTAATGCCCTCGATATGGCAGCGGCTAAGGGGAAAATCTCAGATGTGATGTTGGATCGTCTTTATTTGGATGCAGATCGTATAGAAGCGATGGCAAGAGGAATTCGTGAAGTGGTTGCCTTACCAGATCCAATCGGTGAAGTTTTAGAAACAAGTCAGCTTGAAAATGGTTTGGTTATCACAAAAAAACGTGTAGCTATGGGTGTCATCGGTATTATCTATGAAAGCCGTCCAAATGTGACGTCTGATGCGGCTGCTTTGACTCTTAAGAGTGGAAATGCGGTTGTTCTTCGTAGTGGTAAGGATGCCTATCAAACAACCCATGCCATTGTCACAGCCTTGAAGAAGGGCTTGGAGACGACTACTATTCATCCAAATGTGATTCAACTGGTGGAGGATACTAGCCGTGAAAGTAGTTATGCTATGATGAAGGCCAAGGGCTATCTAGACCTTCTCATTCCTCGTGGAGGAGCTGGCTTGATCAATGCAGTGGTTGAGAATGCGATTGTACCTGTTATCGAGACAGGGACTGGGATTGTCCATGTCTATGTGGATAAGGATGCAGACGAAGACAAGGCGCTGTCTATCATCAACAATGCTAAAACCAGTCGTCCTTCTGTTTGTAATGCCATGGAGGTTCTGCTGGTTCATGAAAACAAGGCAGCAAGCATCCTTCCTCGCTTGGATCAAATGCTGGTTGCAGAGCGTAAGGAAGCTGGACTGGAACCAATTCAATTCCGCCTAGATAGCAAAGCAAGCCAGTTTGTTTCAGGTCAAGCTGCTCAAGCACAAGACTTTGATACCGAGTTTTTAGACTATATTCTAGCTGTTAAGGTTGTGAGCAGTTTAGAAGAAGCGATTGCGCATATTGAATCCCACAGTACCCATCATTCGGATGCCATTGTGACGGAAAATGCTGAAGCTGCAGCATACTTTACAGATCAAGTGGACTCTGCAGCGGTGTATGTTAATGCCTCAACTCGTTTCACAGATGGAGGACAATTTGGTCTTGGTTGTGAAATGGGGATTTCTACTCAGAAATTGCACGCGCGTGGTCCAATGGGCTTGAAAGAGTTGACCAGCTACAAGTATGTGGTCACTGGTGATGGGCAGATAAGGGAGTAAGAGATGAAGATTGGATTTATCGGTTTGGGGAATATGGGTGCTAGCTTGGCAAAATCTGTCTTGCAGACTAGGACGTCAGATGAGATTCTCCTTGCCAATCGTAGTCAAGCTAAGGTAGATGCTTTCATTGCAGACTTTGGTGGTCAGGCTTCCAGCAATGAAGAAATGTTTGCAGAAGCAGATGTGATTTTTCTAGGTGTTAAGCCTGCTCAGTTTTCTGAACTGCTTTCTCAATACCAGACCATCCTTGAAAAAAGAGAAAGTCTTCTTTTGATTTCGATGGCAGCTGGATTGACCTTAGAAAAACTAGCAAGTCTTATCCCAAGCCAACACCGAATTATTCGTATGATGCCTAATACCCCTGCTTCTATCGGGCAAGGAGTGATTAGTTATGCCTTGTCTCCTAATTGCAGGGCTGAGGACAGTGAGATCTTTTGTCAGCTTTTAGCCAAGGCTGGTCTCTTGGTTGAATTAGGAGAAAGCTTAATCAATGCAGCGACAGGTCTTGCAGGTTGTGGACCAGCCTTTGTCTATCTCTTTATTGAGGCCTTGGCAGATGCAGGTGTTCAGACGGGATTACCACGAGAAACAGCCTTGAAAATGGCAGCCCAAACTGTGGTAGGAGCTGGGCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >LR216060|884952:894591|886936_888046_+|VFI36019.1|DBSCAN-SWA MKYKRIVFKVGTSSLTNEDGSLSRSKVKDITQQLAMLHEAGHELILVSSGAIAAGFGALGFKKRPTKIADKQASAAVGQGLLLEEYTTNLLLRQIVSAQILLTQDDFVDKRRYKNAHQALSVLLNRGAIPIINENDSVVIDEVKVGDNDTLSAQVAAMVQADLLVLLTDVDGLYTGNPNSDPRAKRLERIETINREIIDMAGGAGSSNGTGGMLTKIKAATIATESGVPVYICSSLKSDSMIEAAEETEDGSYFVAQEKGLRTQKQWLAFYAQSQGSIWVDKGAAEALSQHGKSLLLSGIVEAEGAFSYGDIVTVFDKESGKSLGKGRVQFGASALEDMLRSQKAKGVLIYRDDWISITPEIQLLFTEF >LR216060|884952:894591|893319_893838_+|VFI36054.1|DBSCAN-SWA MRTYENKEELKAEIEKTFEKYILEFDNIPENLKDKRADEVDRTPAENLAYQVGWTNLVLKWEEDERKGLQVKTPSDKFKWNQLGELYQWFTDTYAHLSLQELKAKLNENINSISAMIDSLSEEELFEPHMRKWADEATKTATWEVYKFIHVNTVAPFGTFRTKIRKWKKIVL >LR216060|884952:894591|892223_893093_+|VFI36049.1|DBSCAN-SWA MQIQKSFKGQSPYGKLYLVATPIGNLDDMTFRAIQTLKEVDWIAAEDTRNTGLLLKHFDISTKQISFHEHNAKEKIPDLIGFLKAGQSIAQVSDAGLPSISDPGHDLVKAAIEEEIAVVTVPGASAGISALIASGLAPQPHIFYGFLPRKSGQQKQFFGSKKDYPETQIFYESPHRVADTLENMLEVYGDRSVVLVRELTKIYEEYQRGTISELLESISETSLKGECLLIVEGASQDVEEKDEEDLFLEIQARIQQGMKKNQAIKEVAKIYQWNKSQLYAAYHDWEEKQ >LR216060|884952:894591|891903_892221_+|VFI36044.1|DBSCAN-SWA MDKKELFDALDDFSQQLLVTLADVEAIKKNLKSLVEENTALRLENSKLRERLGEVEADAPVKAKHVRESVRRIYRDGFHVCNDFYGQRREQDEECMFCDELLYRE >LR216060|884952:894591|884952_886836_+|VFI36014.1|holin|DBSCAN-SWA MKKKLTSLALVGAFLGLSWYGNVQAQESSGNKIHFINVQEGGSDAIILESNGHFAMVDTGEDYDFPDGSDSRYPWREGIETSYKHVLTDRVFRRLKELSVQKLDFILVTHTHSDHIGNVDELLSTYPVDRVYLKKYSDSRITNSERLWDNLYGYDKVLQTAAEKGVSVIQNITQGDAHFQFGDMDIQLYNYENETDSSGELKKIWDDNSNSLISVVKVNGKKIYLGGDLDNVHGAEDKYGPLIGKVDLMKFNHHHDTNKSNTKDFIKNLSPSLIVQTSDSLPWKNGVDSEYVNWLKERGIERINAASKDYDATVFDIRKDGFVNISTSYKPIPSFQAGWHKSAYGNWWYQAPDSTGEYAVGWNEIEGEWYYFNQTGILLQNQWKKWNNHWFYLTDSGASAKNWKKIDGIWYYFNKENQMEIGWVQDKEQWYYLDVDGSMKTGWLQYMGQWYYFAPSGEMKMGWVKDKETWYYMDSTGVMKTGEIEVAGQHYYLEDSGAMKQGWHKKANDWYFYKTDGSRAVGWIKDKDKWYFLKENGQLLVNGKTPEGYTVDSSGAWLVDVSIEKSATIKTTSHSEIKESKEVVKKDLENKETSQHESVTNFSTSQDLTSSTSQSSETSVNKSESEQ >LR216060|884952:894591|889321_890119_+|VFI36029.1|DBSCAN-SWA MKIGFIGLGNMGASLAKSVLQTRTSDEILLANRSQAKVDAFIADFGGQASSNEEMFAEADVIFLGVKPAQFSELLSQYQTILEKRESLLLISMAAGLTLEKLASLIPSQHRIIRMMPNTPASIGQGVISYALSPNCRAEDSEIFCQLLAKAGLLVELGESLINAATGLAGCGPAFVYLFIEALADAGVQTGLPRETALKMAAQTVVGAGQLVLESQQHPGVLKDQVCSPGGSTIAGVASLEAHAFRGIVMEAVHQAYKRTQELGK >LR216060|884952:894591|893946_894591_+|VFI36059.1|DBSCAN-SWA MDFEYFYNREAERFNFLKVPEILVDREEFRGLSAEAIILYSILLKQTGMSFKNNWIDKEGRVFIFTVEEIMKRRNISKPTAIKTLDELDVKKGIGLIERARLGLGKPNIIYVKDFMSIFQVKENDLQKSKNLTSEVKDFNLRSKENELQEVKNLDSNYIENNKSKYSKREYSFGENGLGTFQNVFLAAEDISDLQIIMNSQLENYIRLPAKLES >LR216060|884952:894591|890973_891864_+|VFI36039.1|DBSCAN-SWA MKQDQLKAWQPAQFDRFVRILEQDQLNHAYLFSGFFGSLEIAQFLAKSLFCTDKVGVLPCEKCRSCKLIEQEEFPDVTLIKPVNQVIKTERIRELVGQFSQAGIESQQQVFIIEQADKMHPNAANSLLKVIEEPQSEVYIFFLTSDEEKMLPTIRSRTQIFHFKKQEEKLILLLEQMGLVKKKATLLAKFSQSRAEAEKLANQASFWTLVDESERLLTWLVAKKKESYLQVAKLANLADDKEKQDQVLRILEVLCGQDLLQVRVRVILQDLLEARKMWQANVSFQNAMEYLVLKEI >LR216060|884952:894591|890338_890977_+|VFI36034.1|DBSCAN-SWA MSKGFLVSLEGPEGAGKTSVLEALLPILEEKGVEVLTTREPGGVLIGEKIREVILDPSHTQMDAKTELLLYIASRRQHLVEKVLPALEAGKLVIMDRFIDSSVAYQGFGRGLDIEAIDWLNQFATDGLKPDLTLYFDIEVEEGLARIAANSDREVNRLDLEGLDLHKKVRQGYLSLLDKEGNRIVKIDASLPLEQVVETTKAVLFDGMGLAK >LR216060|884952:894591|888055_889318_+|VFI36024.1|DBSCAN-SWA MVSRQEQFEQVQAVKKSINTASEEVKNQALLAMADHLVAATEEILAANALDMAAAKGKISDVMLDRLYLDADRIEAMARGIREVVALPDPIGEVLETSQLENGLVITKKRVAMGVIGIIYESRPNVTSDAAALTLKSGNAVVLRSGKDAYQTTHAIVTALKKGLETTTIHPNVIQLVEDTSRESSYAMMKAKGYLDLLIPRGGAGLINAVVENAIVPVIETGTGIVHVYVDKDADEDKALSIINNAKTSRPSVCNAMEVLLVHENKAASILPRLDQMLVAERKEAGLEPIQFRLDSKASQFVSGQAAQAQDFDTEFLDYILAVKVVSSLEEAIAHIESHSTHHSDAIVTENAEAAAYFTDQVDSAAVYVNASTRFTDGGQFGLGCEMGISTQKLHARGPMGLKELTSYKYVVTGDGQIRE |
10 | Streptococcus_phage(88.89%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
961204 : 1009369
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LR216060|961204:1009369|DBSCAN-SWA CTTATTTTCCTAAACAGAATTGGCTAAAGAGTTGGGTGATGAGTTCATCTGGAGCAGCATCCCCAGTGATTTCTCCTAGAATTTCCCAAGTATGGGTCAAGTCAACTTGAAGCAAGTCAACTGGCATCCCTAGTTCAAGACCTTGGTTAACAGCTTGTAGGCTTTCAACTGCTTTTTCAATCAGGGAAATGTGACGGGCGTTTGACAAGTAAGTAGCATCTTGCTCGACCAAGCCAGCATTTTCAAAGAAGAGGTTGTTGATTCGCTCTTCAATCTTGTCGATGTTTTGGTTTTTAAGGACTGAAATACGGATAACGTCTTCAGGTAGTTTCGAAGTTTCAATCGTTTCTGGCAGGTCGGTTTTATTAAGTAGAATAATGCGATTGGTATCTTGGCTAATTTCAAGAAGTTGTCTGTCTTGCGCAGTCAGTGGTTCACTGGCATTTAGCACTAGTAGAACCAAGTCGGCTTCCTTGAGGGCTTTTTTCGAACGCTCAACACCGATTTGTTCCACTATGTCATCTGTTTCACGAATACCGGCTGTATCAATCAATTTGAGAGGTACACCATTGATGTTGACGTACTCTTCGATGACATCACGTGTGGTACCAGCAATATCTGTAACGATAGCCTTGTCCTCACGCAAGAGATTGTTGAGGAGGCTAGATTTCCCAACGTTGGGACGTCCGATGATGGCAGTGGAAATTCCTTCACGAAGGATTTTACCGCGACGGGCTGTCCTAAGGAGATTGGTTAGCAATTGTTCAAATTCCATAGTTTTCTCGCGGACAACAGCAGTAGTCGCTTCCTCAACATCATCATACTCAGGATAGTCGATATTAACTTCGACTTGGGCAAGTGTATTGAGGATTTCTTGACGGGTATTGTTAATGAGGTCAGAAAGAGAACCATCTAGTTGTTTGACCGCAATGTTCATGGCTTTATCTGTCTTAGCACGGATGATATCCATTACTGCCTCAGCCTGAGTCAAGTCAACACGTCCATTTAGGAAGGCACGTTTAGTAAATTCACCAGGTTCAGCCAATCGAGCTCCTTCACGGATAGCTAGCTGGAGAATTTCATTAGTCACCGCAATCCCACCGTGGGTGTTAATCTCGATAATATCTTCACGAGTGAAGGTTTTTGGAGATTTCATAGCCCCAATCATGACCTCGTCCATGACTTTACCAGTCAGAGGGTCAACGATGTGACCGTAGTTAAGTGTATGGCTAGCAACCTGACTCAAGTCTTTTCCTTTGAAAATCTTTTGCGCAATAGCAAAACTGTTTGTTCCGCTCAGGCGGACAATACCAATAGCCCCTTCACCTAGTGGAGTAGAGATAGCAGCGATGGTATCAAATTCACGTGTAATCATAATGTTTCCTTTAATAAATAGCTCTTTTCTTGGAAATTTTTCCAAGTATCCTTTCAAATTGTAACAAATTTAGGCTATTTCTTCAATGGATGTTACTTGGAGATTGAAAAAGCCTAAGCAATTCTGCTTAAGCTAGCTTATTTGGTACGCATTTCCCCTTGTGGGAAGTAAGTTCCTTCTGGCATGTCGTTGATGATGACATGGACAGCAGATTGGGGGGCTCCAGTATTACGGACAATAGCTTCCGTTACTTCCTTAGCAAGAGCTTTCTTTTGCTCGAGCGTGCGTCCTTCAAATAAATCGATGCGTACAAATGGCATAATAGCTTCCTCCACTAGTTTTTGATTTCTTCTATTTTACCACATTTTGCCGTTTAAAGCTTCAGAAAATTATGATATACTAGAATGTAGCAAAAATTTAGAAATGGACGTGAAGCAAGAAACATGGCACAGTTGTATTATCGTTATGGGACCATGAACTCTGGTAAGACGATTGAGATTCTCAAAGTGGCCTATAACTACGAGGAGCAAGGAAAAGGTGTTGTCATTATGACTTCGGCTCTGGATACGCGTGACGGTGTTGGCTATGTGTCGAGTCGAATTGGCATGAAACGCCCTGCCCTTGCGATTGAGGAAACAACGGATATCTTTGGCTATATCCGAGACCTACCAGAAAAACCTTACTGTGTTTTGGTCGATGAAGCCCAGTTTCTCAAACGCCACCATGTTTACGACCTAGCTCGTGTTGTGGACGAGTTAGACATACCCGTCATGGCTTTTGGCTTGAAAAATGACTTTCGCAATGAATTGTTCGAAGGTTCCAAATATCTCTTGCTTTTAGCGGACAAGATTGACGAAATCAAGACCATCTGTCAGTATTGCAAGAAAAAGGCGACCATGGTGTTGCGAACACAGGATGGACTGCCCGTTTACGATGGAGAACAGATCCAGATTGGTGGTAATGAAACCTATATCTCGGTTTGCCGTAAACATTATTTTGCCCCTGAAATCAATAAGGAGAATGAAGAAAAATGAACATCTATGATCAACTACAAGCTGTAGAAGACCGTTATGAAGAACTAGGAGAATTGCTGAGTGACCCTGATGTCGTTTCAGACACCAAGCGTTTTATGGAGCTTTCAAAAGAAGAAGCCTCCAATCGTGACACCGTAATAGCCTACCGTGAGTATAAACAAGTCCTTCAAAATATCGTCGATGCCGAAGAGATGATTAAGGAATCAGGTGGAGATGCGGACTTGGAAGAAATGGCCAAGCAAGAACTCAAAGATGCCAAGGCTGAAAAAGAAGAATATGAAGAAAAACTGAAAATTTTGCTCCTTCCAAAGGATCCAAACGATGACAAGAATATCATCCTTGAAATCCGTGGAGCAGCTGGTGGAGACGAAGCGGCACTTTTCGCTGGAGATTTGCTAACTATGTACCAAAAGTATGCTGAAGCCCAAGGCTGGCGCTTTGAAGTCATGGAGGCTTCTATGAATGGTGTCGGTGGTTTCAAAGAAGTGGTTGCTATGGTTTCAGGTCAGTCTGTATACTCTAAGCTTAAGTATGAATCAGGTGCCCACCGTGTGCAACGTGTTCCTGTGACAGAAAGCCAAGGCCGTGTTCATACTTCGACAGCGACAGTTCTTGTTATGCCAGAAGTTGAAGAGGTTGAATACGACATTGATCCAAAAGACCTTCGTGTCGACATCTATCACGCCTCTGGTGCTGGTGGACAGAACGTCAATAAGGTTGCGACTGCCGTGCGTATCGTTCACTTGCCAACCAATATCAAGGTTGAGATGCAGGAAGAACGTACCCAGCAGAAGAACCGCGAGAAGGCTATGAAGATTATCCGTGCACGCGTCGCTGACCACTTTGCTCAGATTGCTCAGGATGAACAAGACGCTGAGCGTAAGTCGACAATCGGTACTGGTGACCGTTCAGAACGGATCCGAACTTATAACTTCCCACAAAACCGTGTCACAGACCACCGTATCGGCTTGACCCTCCAAAAACTAGATACGATTTTGTCTGGTAAATTGGACGAAGTTGTGGATGCCCTGGTGCTTTATGACCAAACACAAAAACTAGAAGAATTAAACAAATAATGAAATTAGCTCAATTATTTTCAAATTTTGAAGAAGAGTTGATAAGACAAGGAGAGGAAGCGGAAAGCCTCTCTTTTGTCTATCGTAGTCTGAAAAATCTATCTTTTACAGACTTTATTTTTGCCCTCCAGCAGGAGGTGACAACAGAGGAAGAAAAACAATTTGTAGAAGATATTTACCAGCAACTAGCAGCTCACAAGCCAGCTCAGTACATCATTGGACAGGCAGATTTTTATGGAATGCATTTAAAGGTGGATGAACGGGTTTTGATTCCTCGTCCAGAAACAGAGGAGTTAGTGGAGCTTATTCTAACTGAAAATCTTGAGACGAATCTCTCAGTTCTGGATATTGGAACAGGTAGTGGAGCTATTGCTCTCGCTCTAGCAAAAAATAGACCAGATTGGTCAGTGACAGCAGCAGATGTTTCTCAAGAGGCCTTAGAGCTTGCATCAGAGAATGCTAGCAATCAAAATCTTAATATATTTTTTAAAAAATCTGATTGTTTTGCAGAAATTTCTGAAAAATATGATATAATTGTATCCAATCCACCCTATATCTCTCGTGAAGATGAGTCAGAGGTAGGCTTGAATGTTTTGCATTCGGAGCCTCATCTAGCTCTCTTTGCAGACGAGGATGGCCTAGCTATTTACTGTAGAATTGCGGAAGATGCAAAAGACTATCTCAAAGATGGTGGTAAGATTTACCTTGAAATTGGATACAAGCAAGGTCAAAGTGTTCCCGAACTTTTTAGGAAACATCTTCCTGAAAAAAGAGTTCGAACACTCAAGGACCAATTTGGTCAAAATAGGATGGTCGTGGTTGATGATAGACAGGATTAGACAAGAGTTGGAAAATGGTGGAGCTGTCGTTCTACCTACAGAGACTGTTTATGGTCTTTTTGCCAAGGCCTTAGATGAAAAAGCAGTTGACCATGTTTACCAACTCAAACGTCGTCCTAGAGATAAGGCACTCAATCTCAATATCGCCTCTTTCGAGGATATCTTGCACTTTTCTAAGAATCAGCCAACTTATCTACAAAAACTTGTAGAGACCTTTTTGCCAGGTCCCTTGACCATTATTCTCGAAGCCAATGACCGAGTTCCCTATTGGGTAAATTCTGACCTTGCAACTATTGGATTTCGGATGCCCAGTCACCCTATCACACTGGATTTAATTCGAGAGACAGGTCCCTTGATTGGGCCGTCTGCCAATATCTCAGGTCAGGCAAGTGGTGTAACCTTTGAACAAATTCTGAAGGATTTTGACCAAGAGGTTCTGGGTCTGGAAGACGATGCTTTTCTAACTGGACAGGATTCAACTATTGTGGATTTGTCTGGAGACAAGGTGAAAATCTTACGCCAAGGCGCAATTAAACGAGAAGATATTCTTGCTCGGTTGCCAGAGATTTCTTTTGAGGAGGCTTGAAATGCTAAGAGATTTGCAAGAAACAGATGTGAAAGCGATATGTGACATCAACCAAGAGGCTTTGGGTTATACTTTTAGTCTAGAGGAAAC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55 | Streptococcus_phage(18.75%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1024482 : 1074307
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LR216060|1024482:1074307|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(45.45%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1147888 : 1204704
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >LR216060|1147888:1204704|DBSCAN-SWA 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>LR216060|1147888:1204704|1162893_1163598_-|VFI37551.1|DBSCAN-SWA MKKILIVDDEKPISDIIKFNMTKEGYEVVTAFNGREALEQFEAEQPDIIILDLMLPEIDGLEVAKTIRKTSSVPILMLSAKDSEFDKVIGLELGADDYVTKPFSNRELQARVKALLRRSQPMPVDGQEADSKPQPIQIGDLEIVPDAYVAKKYGEELDLTHREFELLYHLASHTGQVITREHLLETVWGYDYFGDVRTVDVTVRRLREKIEDTPSRPEYILTRRGVGYYMRNNA >LR216060|1147888:1204704|1177093_1177834_+|VFI37632.1|DBSCAN-SWA MAKLKIDVNDLHKHYGKNEVLKGITTKFYEGDVVCIIGPSGSGKSTFLRSLNLLEEVTSGHITVNGYDLTEKTTNVDHVRENIGMVFQHFNLFPHMSVLDNITFAPIEHKLMTKEEAEELGMELLEKVGLADKANANPDSLSGGQKQRVAIARGLAMNPDIMLFDEPTSALDPEMVGDVLNVMKELAEQGMTMIIVTHEMGFARQVANRVIFTADGEFLEDGTPDQIFDNPQHPRLKEFLDKVLNV >LR216060|1147888:1204704|1160407_1160650_-|VFI37531.1|DBSCAN-SWA MTTITLKVSEADKTFMKAMAKFEGVSLSELIRTKTLEALEDEYDARVADLAYQEYLEDLEKGVEPITWEEMMHDLGLKDE >LR216060|1147888:1204704|1196513_1196873_-|VFI37737.1|DBSCAN-SWA MRLIYLIIGFLSLALAIVGVVLPLLPTTPFLLLSIACFSRSSKRFEDWLYHTKLYQTYVADFRETKSITRERKKKIIVSIYVLMGISIYFAPLLPVKIGLGALTIFITYYLFKVIPDKE 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55 | Bacillus_phage(20.0%) | transposase,tRNA,bacteriocin,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1208307 : 1242592
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >LR216060|1208307:1242592|DBSCAN-SWA AATGAAACAACTAACCGTTGAAGATGCCAAACAAATTGAATTAGAAATTTTGGATTATATTGATACTCTCTGTAAAAAGCACAATATCAACTATATTATTAACTACGGTACTCTGATTGGGGCGGTTCGACATGAGGGCTTTATCCCTTGGGACGACGATATTGATCTGTCCATGCCTAGAGAAGACTACCAACGATTTATTAACATTTTTCAAAAGGAAAAAAGCAAGTATAAGCTCCTATCCTTAGAAACTGATAAGAACTACTTTAACAACTTTATCAAGATAACCGACAGTACGACTAAAATTATTGATACTCGAAATACAAAAACCTATGAGTCTGGTATCTTTATCGATATTTTCCCTATAGATCGCTTTGATGATCCTAAGGTCATTGATACTTGTTATAAACTGGAAAGCTTCAAACTGCTGTCTTTCAGTAAACATAAAAATATTGTCTATAAGGATAGCCTTTTAAAAGATTGGATACGAACAGCCTTCTGGTTACTCCTTCGACCGGTTTCTCCTCGTTATTTTGCAAATAAAATCGAGAAAGAAATTCAAAAATATAGTCGTGAAAATGGGCAATATATGGCTTTTATCCCTTCAAAATTTAAGGAAAAGGAAGTCTTCCCAAGTGGTACCTTTGATAAAACAATCGATTTACCCTTTGAGAATTTAAGCCTTCCTGCACCTGAAAAATTTGATACTATTTTGACACAATTTTATGGAGATTATATGACCCTACCACCAGAAGAAAAACGCTTCTACAGTCATGAATTTCACGCTTATAAATTGGAGGATTAGGATGCAATATTTAGAAAAAAAAGAAATTAAAGAAATTCAACTAGCCCTGCTGGACTATATTGATGAAACTTGTAAGAAATATGATATTCCTTATTTTCTCAGTTATGGAACCATGCTTGGAGCCATCCGCCACAAAGGTATGATTCCTTGGGATGATGATATTGATATTTCCCTTTATCGTGAGGATTATGAGCGTTTACTGAAGATTATTGAAGAAGAAAATCACCCTCGCTACAAGGTTCTTTCCTACGATACATCTTCTTGGTACTTCCATAATTTCGCATCGATTTTGGACACTTCTACTGTTATAGAAGACCATGTTAAGTACAAGCGTCATGATACCAGCCTTTTCATCGATGTCTTCCCAATTGATCGATTTACAGACTTGAGCATTGTCGACAAGAGCTATAAGTATGTAGCCCTTCGTCAACTAGCTTATATCAAAAAATCACGAGCAGTTCACGGTGATAGCAAACTAAAAGATTTTCTTAGATTATGTAGCTGGTACGCTCTCCGGTTTGTCAATCCTCGCTACTTTTACAAGAAAATTGATCAACTAGTCAAAAATGCTGTAACCAACACTCCTCAATATGAAGGAGGAGTTGGGATCGGTAAGGAAGGGATGAAAGAAATCTTCCCAGTTGATACCTTTAAAGAACTGATTTTAACTGAGTTTGAGGGCCGTATGTTGCCTGTTCCCAAAAAATATGACCAATTTTTAACCCAGATGTATGGCGATTATATAACACCACCATCAAAAGAAATGCAAGAGTGGTATAGTCATAGCATTAAAGCTTATCGCAAAAACTGATTGAGGGGGATTATACAAACTACTAAGATAGAGGTTATTCAAAAACATAATTTTAGTAGAAAATGAAATACATATTCCCACAATAAAACGCATCATATCAAGGTTTTTGAAAAACCTTGATATGATGCGTTTTATAATTTTAAAGACTTTTTTCTATAGTAGATTGAAATAAGATGCGAACAAATCAATTAGAAAATTCAAATTAATTTCTAGAAATATTTTAGTATTCCTGTGTACTGTTCTAAATTCAGTCTGCTATATCTTATTTTTCTATTTAAATCGCTTCTGTAACAAAGCTACGACTTTCAAGTACCTTAAGCATGGCATTAGCTGTATCTAGCGCTGTGAAGAGGGGCACCCCGTGTTCAATGGCTGAACGACGAATTTGCTCACCATCTTCGTCAGCAGTTCGTTTTGTTCCTACTGTGTTAATGATAGCTTGAATTCTTCCTTTGCGTACAAAACTTGGGATATCCTTATCGTCATCACCAATCTTACCAACAGGTTGGGCTTGCAAGCCATGACTAGCAAAGAAGGCTGCTGTCCCTTCTGTCGCAAGGATTCCATAACCAATGTTTTGGAAACGACGAGCCAAGTTCAAGGCTTCTTCTTTGGCATCATCAGCGATGGTAAAGACGACATTACCAAAAGTTGGCAAGTGTAGATAAGAAGCTTCAAAGGCTTTATAGAGAGCTTTTTCCAAAGTAGCATCAGAACCCATAACTTCACCTGTTGACTTCATTTCAGGACCGAGCAAGCTGTCTACCTTAGCTAGTTTGGTAAAGGAGAAGACAGGTGCCTTGATATGAACACGGGTGCTTTCAGGGTAAAGTCCATTTTGGTAGCCAAGTTCTGATAAACTTTGACCAAGAATGAGTTTGGTCGCTACTTGAGCCATAGGAATATTGGTTACCTTAGATAGGAATGGAACAGTACGGCTGGCACGTGGATTGACCTCAATAACGTAGACTTTTTCATCCTTGATAACAAACTGGATGTTCATAATTCCAAGGCAGTGAAGACCGATTGCTAAGCGTTTGGTGTAGTCTGCGATGGTCTCCTGAACCTTTTGCGACAAGGTTTGTGGTGGGTAAACAGCCATTGAGTCACCTGAGTGGACACCAGCACGTTCGATATGCTCCATGATACCAGGAATGAGTACATTTTTACCATCTGAAATGGCATCAACTTCGCACTCTTGCCCAACGATATAAGAGTCGACAAGAACTGGGTGGTCTGGACTAGTCTTAACAGCAGTTCGCATGTAAGAACGAAGGTCTTCTTCGTTTTCAACGATTTCCATGGCACGTCCACCAAGTACATAAGATGGGCGGACAAGAACTGGGAAGCCAATCTTGCGAGCTGCAAGAGCTGCTTCTTCTTCATTGGTAGCCGTTTGTCCTGGTGGCTGTGGAATATCCAATTCTTTGAGAGCTTGCTCGAAGAGGTCACGGTCTTCGGCACGATCTAGGTCAGCAACCTGTGTACCAAGGATGGTCACACCTGCTTTTGCCAATGGCTCCGCAAGGTTGATGGCTGTTTGACCACCGAACTGAACGATAACTCCCTTTGGTTGTTCCAAGTCAATGACGTTCATAACATCTTCGAATGTCAATGGCTCAAAGTAAAGCTTATCTGATACAGAGAAGTCTGTTGAAACGGTCTCTGGGTTTGAGTTCATGATGATAGCTTCATAACCAGCTGCCTGGATAGCCTTAACAGAGTGAACGGTTGCGTAGTCAAACTCAACCCCTTGACCGATACGGATTGGACCTGAACCTAGGACAAGTACAGATTCTTTATCAGATCTGATAGATTCATTTTCCCAACCATAGGTTGAATAGAAATATGGCGTTTCGGAGTCGAACTCTGCCGCACAAGTGTCTACCATCTTATAAACTGGAACAATCTTGTTTTCCAAGCGAAGTTGGCGAACTTTATCATCAGTCGTTCCCCAGAGTTCAGCAATCTTACGGTCTGAAAAACCATTAAGTTTGGCTGTTTTCAAAACTTCTAAATCTTGTGGATGAGCACCCAATTCTTGCTCAATTTCAAAGATATGCAAGAGTTTATCAAGATAGAAGATATCAATTTTTGTAAGCTCTGCAATTTCTTCAGGTGTGTAGCCACGACGAATGGCTTCTGATACGTAGAAGAGACGGTCATCTTGGGCTTTGACAACCTTTTCAATCAAGGCATCATCAGAAACTGCTGCAAGTTCAGGTATTTCATTGTGGTGCACCCCAATTTCAAGGGAGCGGCAGGCCTTGAGAAGAGATTCCTCGATGTTACGACCGATTGCCATGACTTCTCCAGTCGCCTTCATTTGTGTACCGAGACGGCGTTCACCCTTTTCAAACTTGTCAAATGGGAAACGTGGAATCTTAGCAACTACGTAGTCAAGGGCTGGTTCAAACATGGCATAGGTTGAACCTGTAACTGGGTTTATAACCTCATCCAAGGTCAAACCTACTGCAATCTTGGCAGCCAACTTAGCAATCGGATATCCTGTCGCTTTAGAAGCAAGGGCTGACGAACGTGATACACGAGGGTTTACTTCGATAACATAATACTTGAAGCTGTTAGGATCAAGAGCTAGCTGAACATTACATCCACCTTCAATCTTGAGGGCACGAATAATGCTCAAGCTCGCATCACGAAGCATTTGGTTTTCATAGTCTGACATGGTTTGCGCAGGGGCAAATACAATGGAATCCCCTGTGTGAATCCCAACTGGGTCAAAGTTTTCCATGTTACAAACAACCAAGGCATTGTCAGCTGAGTCACGCATGACTTCGTATTCAATTTCCTTGAAACCGGCAATCGAACGCTCAATCAAACATTGGGTAACAGGTGACAATTTCAAACCATTTTCAGTGATTTCACGCAATTCTTTCTCGTTGGCACACATACCACCACCAGTACCACCAAGGGTAAAGGCTGGACGAACGATGACTGGGTAGCCAATTGTCGCTGCAAAGGCAACTGCTTCTTCTACTGTGTTAACAATTTCAGATTCTGGAATGGGTTGTTCAAGCTCTTCCATCAATTGTTTAAAGAGGTCACGGTCCTCCGCTTGGTCAATGGCAGATAATTTGGTACCCAGAAGTTCAACGCCAAGCTCGTCTAGGATACCATTTTTAGATAATTCCATGGCCATGTTGAGACCTGTCTGACCACCGAGTGTTGGTAGCAAGGCATCTGGACCTTCCTTACGAAGAATACGTGTCACAAACTCAAGTGTAATCGGTTCAATGTAAACCTTGTCAGCAATTTCCTTGTCCGTCATGATGGTTGCAGGATTTGAGTTAACCAAAACAACCTCATAACCTTCCTCTTTCAACGACAAGCAAGCCTGAGTCCCAGCGTAGTCAAACTCAGCAG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41 | Indivirus(20.0%) | transposase,bacteriocin,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1304228 : 1371199
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >LR216060|1304228:1371199|DBSCAN-SWA TCTATCCATGGATGTATCCCCCAATAATTCTAAAATATATTTCTTTAACTGTCTCAGTTGCTTTATAAACACCATAAATATCATTTCCTTTTAGAACTACAGTTTTGACAATATCAGGTACCTTATCATCATTATCTATTGAGATAGTAAATTCATCATTAAGATTCCCAAATAGTTCGCCGTACGAAATCAACTCCTTGATATCTTTAGGATTAAATTTACCTTTAAAATGGACTTTATTTTCTTGACGACGTAACTCATCAACCTCATCACTGATAAGTAGAGTTCCTTCAAATATAATACCTATACTATCGACAACATCATCCATCCCATATAAATAATGGGTGGACATGATAATTGTAACACCATCTTTTTTTAATTTCTTAATGAACTGATAAAACTCATCAATTGCAGCAGGATCTAGTCCTGTTGTCGGTTCATCTAAAATCAAAACATCTGGACTATGAAACATAGCTCTAGCTAGCATCACTTTCTGCCTATTTCCTTTACTGAGATTGCCTACAGTCATGTCAGTATACTCTTCTAAATGGAACATCTTCTTCAAATCATCTATTCGTTTTTTTATAGTTCCTTGATCTAGACCATATATTTCACCCCATAAAGCTAGATTCTATTCAACAGATAGATTTTCATATAGATTACCATCATTTTGAACTCCAATACGTAATAGTAAATCAGATCTTGATTGATCTGTCAGCTTCTCTCCAAAAAGTCTAACATTCCCCTTATCAGGTTTTAACAACCCTAAGATTATACGAATCAGAGTAGTCTTACCCGCTCCATTCGGCCCTAGCAGTGCAAAGACTTGCCCCTTATCAATGCTTAAAGAAACATCATTAATTACTTTTTTTGAACCAATTATTTTATTGATTCCAATTATCTCAATTACCATTTTTCACTCCTCTTACGACATCAATCAACCACACTAAAACTATAAAAGCTACTACACAAATCGTTAAACATATTAACATTTTTACGTTGTCACTATTAAATACTTCTTGATAATGTATTAGCTTTTTGGGGAGTAAAAAATCCATCCCAGTATATTTATTAAATGAATCAATCATTGTTAATGACGAAAAAACAAGTATTAATATTTCAGCTAAACCTGAAATCACAAAAGGCATATTGAAGATAATGTTAATAAAAAAACCGAATATTACAATAAAGGAAACCATTATCAAATGTAATATAGAGGTAGCAAGTATTCTTTCCAGACTAACTTCTGTATATAACATCATCGTTACGTAGATTGTACTCAGTAGACCAAATAGCCAAGAAATGATAAAAAAGAACAACGAACTACATAATTTAGGAAAATAGATTTTAAAACTACTTTTTGTTCTTGTTAAATAAAACAGTTTCAATGATTCAGATTTTTCAATATTACTCATTGACAATATCAAATAAAGTCCTACAAATATTCCCATTTGAGCAGAGTTCTTAAAAAATGAATTAACTAAACTTTCCCAAGTAATATCAGGAAGAATTATTTTTCCATTATTTGCTGAAGCCATACTTTCAATTAAATCATTAGCATAATATGCAGCTAACGTTGAGGATACTGATAAAATTATAAAAAACATAGGTAAAAGTATTGCTTTTTTACTTCGTATCCATCTTTTAATCTCTATAACTAACATTTGGGTACTCGTTCCTTTCAATTAGATTAGCAAAACTCTGTTCCAAGCTAATTTGATCCCTCTCTATAGATACTATTCCACTACAAATATCCTTATTCAGCAAACTAAGAAAATCATATAATTCTAATCCACTAAATTGTAAAGTATTATTATCTTGTAAACAAAAACACTTTTTATTAACTAGTCTTTCTTTCAGTTTATTTAAGCTTGATTCTCTATTCAACGTAACTAAAATTTTAGGATCATTATGAATCAATAAATTCAAAATGTTATCATCAAATATTTTTTTACCTTTATGGATAACAATAATACGATTAGCTATTTTTTCAACATCATTTAGAATGTGACTAGAAAAAATTACTAGTTTAGTTTTTCCTAAATTTCTTAGTATCTCAATAATTTCCTCTCTTCCTTTAGGATCCAATGCACTTGTTGGCTCATCAAAAAATATTATTTGAGGCTCTAACACCAAAACCGATGCAATCCCCAATCGTTGTTTCATACCTCTTGAAAAATGTGATGTTTCCCTATTTATATATTTAGACAACCCCACCAATTGAAGTATATTTTTATAAAATTCTAGTTTTTTTCTTTTCTTATTAGAAAGCATTCGTGAATATTCTAATACTTCTAAAGTAGTCATATCTGTTGGAAAATCAGGAACATCAGGACAATATGCTATCTCATCCGTGAATCTTAAAATTTTTCCAGATGTAATAGAATAACAACCAAAAAGAGACTTGATAAATGATGTCTTACCAGCTCCATTTAATCCAACTAAGCCAATCACACCTGTTTCATCAGAAAAACTAATAGAAAAGTTTTCAAGAATACAACGTTTCTTTATACAAATAGAGACATCAGATAGTTCTATCAATTTCTTCATCATGGTCATATTCCTCTTTTCTTCCAATTACAAAATATGCTATTCCACCCAACGGAACTGAAATCAAACAAATAATAAACCATATAATTTTAGAAAAATATCTAACTTCATTGTTTTTTATTCAAAACAAAGTATAAATTTCTAATTATCTTTTTATATTTTCTTAAATGCTCGTAAAGCCTTATTCTATGTGCTTTCGAGTATTTTTACTGTAGGAAGATACTTCACGTTTCTTTGCATATTTCCTCATGTCTTAGCTGTCAGAAGTGGTAAATAAGTAGTAAATTCATTTGTACTACTAAGCAACAAGACGCTCCTGTTGCTTCTCTTTATTCAAGCGTTTCATTTCTGCCATTGCAGAATCGAATGTTGCATGTGCGTAATAGTTCAGCGTCATGGCTATATTAGCATGTCCCATAATGTACTGTAATGCCTTTGGATTCATTCCTGCATTTGCATAGTTGGTACAGAATGTATGTCGCAAACTATGTGGAGTGATGTGTGGCAATTTATCCTCGTTATACTTATTGTATTTCTTAACAAGACCTTTCATCATGCCGTTGTAATCACTTGCCACTTTTGGATAGTTCTTTCTATTAAGAAAGAGGAAATCACTATATCCATCAATCTCAACACGCTTATCATTCTTTCGATTCGCTAACACTCGCTTAAATGCTTGATAGGCTTCTTCAACCATAGGAACTTGACGTTCGCCACTTTTGGTCTTTGGTGTTTCAATGTAGTACCCAATTTCAGTATCTCTCAATAGCTGATGGTCTATATTGACAAGACGATTCTCAAAATCTAAATCTGGAAGTGTCAAACCACCAAACTCTGAAATACGAAGACCTGTTTTTAAGAGTATCAGAATTTCATCATAATTTTTGCTGTAGGTTTTATCAGCTTTTGCAAAGGCTAACAGTTTTTCTTCCTGTTCTTCTGTTAGTACGGTCTTAGGGACAGTATCATCATCAAGAACTGCTTTCAGTTGAAAGTCAAATGGATTCTTCCGAACACAATCATCTTGTATAGCAATATAGAATGAAGCCTTTAAAGAACGTTTGTAGTTATTGATGGTTTGATAAGCATAACCATTTTCACTCATTCTAATAGCCCATTCTTTAGCGTCTGATGGCTTAATACTGTCAATACTTCTTACACCTAACTTGTCTTTCTTCAAAATATCCATAAGATATTTGCGTCCAGTTTCAGTGTTTTTTCTAACCTTTGGTCTTTGAGCGTTCTGTTTTGCGTAAAGCTGGCAGAGTGTCATTTTCTTTCCTACAACATCAATACCATCATGAATGTCTTTCTGTAACTCTGCGATTTTCTCTCTAAGTGAGATACAATCACGCTTTCCTGCTGGTACTCGGTCTGTAGCCACAAGTTTCCACGAGTAAACAAATTGCGGTTCTCCAAATGAATCTATATATTTGTATAAGTATCTTCCGTCTTTTCGTTGGCTCTCTCCAGTCTTTAAGATTCGACCTTTATTGTCACGTCTTTTTTCTGACATGGCATTTGCTCCTTTCCTTTATGGAAAGAGCCTTGATACGACTTAATACTATTTTATCATATACAAGACCCTTTGGCGACGCTAGATTGCGTCCAATGTATCTATAATTTTTTCAAATTGTTTTCGTTTAATCTGAATACGATTGCCATTCATAATCAGCCAATTTGCATTTTTATTTTCCTCTGCCAAGCGTCGTAGCTTGTTTTCGCCAATACGAAAATATTTTGACGCTTCTTCAATGGTTAGGGTATAACGTTCCCAAATAGGAATGTCAGTCTGCTTCATAAAATCCTCCTTTCCAAATCACTTATTTGGATTTCATAAAAGTTGTTTTACCAGCAATCGAACAGCTTTAGCAAAGCTCACGGGAGTTCCACCCCTGCATGGTTCTCATGTAGCCATACTCATTGCCTGCGACGGTTTTATCACGCTCGGACTATTGACTGTATGGGAGTATCATTATCACGATAAGAATGTCGTTGCAGGCAATCCTGCTAAAGATTGCTTCTCGGATCACTAACATGAATCGCTCGCTATCTTTATAAGATAGGTCATGGCGGTTAGTTCCGTTGGCTCTTTTCTTATCGAAACGTATTCGATTACTTTTATTCAGTTTTCAAAGAACAATGGCTCGTTAGCCTATCAAAACACATTGAAAGCTCAATATGCTTTGGTGGAATAACAAACCTCCCTGTTCGGGAAGCGTGGAATGGTTTAGCACGCTTCCACGAAAGGAGAGAGGATATTACTTAATTTCAAATGACAAAATCTTTGTAATCAGTCTGGTTTCCATTCTTCCACGTAAGACTTCATCAACGACCATACTTTGATTGCCATATTCATCTTTCATAAGTCGTAGGGAACGCTTCGTTATGTACCCTCTGTAATGATGTAGAATCTGGTTAATCGCTTCGGTATCGCCATCTGTTGCCTT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MTFQVTPLKQYLENIQVLAPDKTEKQVQELFKTIILENVDFNGNEEMLTYLSDKAPNFEKQHRSRNFIVEETETNNIIGFFSLSLKVVDISDLEKSLKKKLVLKGKSPKNIDYLPVLLIGQFGKNTKLNKLSGQELFEIVIQKIEEFRAIVGTQMVFLDSINHPKVIQFYEQFGFVAYSQLIKDDHQVSYQPMALNMSLYKK |
58 | Streptococcus_phage(75.0%) | transposase,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1419891 : 1468765
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >LR216060|1419891:1468765|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(31.25%) | integrase,bacteriocin,transposase,tRNA | attL 1415644:1415666|attR 1469103:1469125 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1539294 : 1546048
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >LR216060|1539294:1546048|DBSCAN-SWA TATGTCTCAACTCTATGATATTACCATTGTGGGTGGTGGTCCTGTCGGGCTTTTTGCAGCCTTTTATGCCCACCTACGCCAAGCCAAGGTTCAAATCATCGACTCTCTTCCCCAGCTAGGTGGACAACCTGCTATTCTCTACCCTGAAAAGGAAATCCTAGACGTACCAGGCTTCCCAAACCTGACTGGAGAAGAGTTGACTAACCGCTTGATTGAACAGCTAAATGGATTTGATACCCCTATTCATCTCAATGAAACGGTTCTTGAGATTGACAAACAAGAAGAAGAATTTGCCATCACAACTTCCAAAGGAAGTCACCTGACTAAAACAGTTATCATCGCTATGGGTGGCGGTGCCTTCAAACCACGTCCGCTGGAACTTGAAGGGGTTGAGGACTATGAAAATATCCACTACCACGTTTCTAACATTCAGCAATACGCTGGTAAGAAAGTGACGATTCTTGGTGGGGGAGACTCGGCTGTGGATTGGGCTTTGGCTTTTGAAAAAATCGCACCAACTACCCTTGTTCACCGCAGAGATAATTTCCGTGCCTTGGAACACAGTGTTCAAGCCTTGCAAGAATCATCTGTAACCATCAAGACACCATTCGCCCCTAGCCAACTCCTTGGAGATGGAAAAACGCTTGATAAACTTGAAATCACAAAAGTCAAATCTGATGAAACTGAAACCATTGACCTAGACCACCTCTTTGTCAACTATGGTTTCAAATCTTCTGTCGGTAACCTTAAAAACTGGGGGCTCGACCTCAACCGTCACAAGATTATCGTCAACAGCAAACAAGAATCCAGCCAAGCAGGTATCTATGCTATCGGTGACTGCTGCTACTATGACGGAAAAATTGATCTGATTGCGACAGGTCTAGGGGAAGCTCCAACTGCTGTCAACAACGCTATCAACTACATTGACCCTGAACAAAAAGTACAACCAAAACACTCTACCAGTTTATAAAAAAGAACCACGAGTCACATAGGATTCGTGGTTTTATAATTCATCCGCTATCTTATTGATTTTTCTGAGTCTGTGATTGACACCACTTTTGGTCAGAGGGGTGCTGAGACTATCTGCTAACTGCTGGATAGAGTAGTCTGGGTGCTGAATCCTCAGTTGCGCCACTTCCTGCAAATCTACTGGCAAATTTTCTAAGCCCATGATATCTTTGATTTTACTGATATTGTTAATGGTCTTCATGCTGGCAGAAACTGTCCGAGCGATATTAGCTGTCTCGGCATTATTAGCCCGATTGAGGTCGTTACGGGTTTCTCGCAAAATCTTAACCCGCTCAAAATCATCACGTGCCTGCATGGCTCCGATTACTATCAAGAAGTCCATAATGTCTTCTGCTCGCTGGAGATAGGTCACAGCCCCCTTCTTGCGCTCAAGCACCTTGGCATCCAGTAAAAACTGTTGGAGAAGGGAGGCAATTCCTTGCGCGTGGTCCAGATAAACAGAACTGATTTCCAACTGGTACTTGCCTGACTCAGGGTCACGAATGCTCCCATTTGCCAAGAAAGCGCCACAGAGATAGGCACGACCTGCTTCCTCATCCGATAAAATCGCCTCATCAATACCTGTTTCCAGGCCAAAGAAAGAGTCTGCCAAGTGCAAATCACTTAACAAATCCTGCACCTTTTCATCTGTAAAAACGGTATAGACGCGATTCTTGCGAAGATTGCTACGTTGGTGGTGACGAATTTCAGATTTGATTTCATAGAAATGAAGAAAGGACTCATAGAGGTGACGGGCCAGTTTGGCATTTTCTGTCACAACTGACAAAGTCAAGCCCGAAGTCGAGAGACCGATGCTACCAGACATTTTGATAATGGCAGATAATTCATGCCAGCTCAGATGGTGTTGGCCCAGGATTTCTTCTTTTACTGCTACTGTGAAACTCATTTTTTCACCTGTATAATGCGCATCAACTCGTCCACAATCAAATCTCCATCGTGGAAGGCACCGCCATTTTCCAGACGAAGGAAGTTAGATGAAATCACGCGCGAAACTTGCTTACAAAGACCTACAAAATCGTGTTCCACTTGCACTAAGTATTCATCAAAACGGTTGGAATTCATGTATTCCTGAGGCACTTTTTCAATATTCACCAAGACAGTGTCGATAAAAGGGCGACCAAGGTGACGATGCAAGACTTCCACGTGGTCGCTATCTGTAAAGTGTTCCGTCTCCCCACGTTGGGTCATGATATTGCAGACATAGGCAATTTCTGCCTTGGTTTCCAAAAGAGCCCGCCCAATTTCCTTAATCACGATATTGGGCAAAATAGAGGTAAAGAGGGAACCTGGCCCTAGGACAATCATGTCACTTTCAAGGATGGTCTGCACTACTCGACGGCTGGCCAGAGGCGTATCATCGTTTAGAGCATTAGTCACATAGACATTGTCAACTATGCCTCGATGGTCTACAATATGACTCTCTCCAACCACTTCTGTCCCATCCTGAAAGACTGCATGAAGGGTCAAAGGATGGTCACTGGAAGGATAAATTTTCCCTGTTGTATGGAAAAATTTGCTCAATAACTGCATGGCATTATAGGTTGAACCCTGCATTTCTGACAAGCCAGCAATGATGAGATTTCCCAATGGATGGCCAGCAAAGGCTCCGGCATCCTCAGAGAACCGATACTGAAAGACCTTCTCATAAAACTTAGGCATATCCGACATGGCCACAAGGACATTACGAAGATCACCTGGCGGTGTCAACTGTTGCATATTTTTTCGGAGTTCACCTGAAGAACCACCATCATCTGCCACCGTCACGATAGCTGCGATTTCCACATCTTTTTCCCGCAGACTTTTTAGAATGACGGGAATTCCAGTCCCTCCACCAATCACCGTTATCTTTGGTTTTCTCATGAACGGTTTACCGTTTCCTTTCTGCGGTCTTTGTCGCGATGCCCTTCATTAACAGACCAATTCTTGGATAAGTCCTGCGCCAAGCATTTAGCAAATGCCACACTACGGTGTTGTCCACCCGTACATCCCATGGCAATGGTCAAAACGGACTTACCTTCCTTTTGGTAACTTGGCAGAATCGGCTCAATCAAGGCCAATAAATGTTGATAAAAGTCTTCTGACTCAGGATGGTTCATGACATAATCATAAACAGGTTCATCCACACCCGTTTGGTTTCTCAGTTCTGGTAAATAATAGGGATTTGGCAAGAAACGGACATCAAAGACCAAGTCCGCATCAATCGGGATTCCATACTTAAATCCGAAAGACATGACTTCGATACGGAAAGACTGAGCTTGTTCTTGGTCTGAAAACTGCTCTGCAAGGGTTTTGCGCAGCTCACGTGGAGTGAGTTCAGTCGTATCCACCACATTTTGGCTCATATTTTTCAAAGGTGCCAAGAGTTCACGTTCCAACTTGATTCCATCTAAAATACGACCGTCTGCTGCTAGTGGGTGACTCCGTCTGGTTTCCTTGTAACGAGCGACCAATTCCTTATCAGCCGCATCCAAAAAGAGGATTTTGAAATCCAAACCATCTTGATTTTCCAACTCATCCAAAACAGCTTGAATCTCTGAAAAGAAAGAACGGCTACGCATATCCACTACCAAGGCCAACTTAGGATTGTCTTCCTTAATTTCAACCAGCTGCAAAAACTTAGGCAAGAGAGCTGGCGGCATATTATCAATGGTGAAATAACCTAGATCCTCGAAGGACTGAATGGCTACAGTTTTCCCTGCGCCACTCATCCCTGTCACAATCACCAAGTGAAGTTGTTTCTTTGTCATCTTTTTCTCCTTATATCAAAAGAAGTTTGGCAACACCAAACTTCAACTAGCTTATCCAATCTCTGCGATGACTTCAATTTCGACTTTTACATCACGAGGAAGACGAGCTACCTCCACAGCTGAACGAGCTGGGAATTCCTCTTTGAAGGCCGTTTGGTAAACCTCATTAAAAGGAACAAAGTCGTTCATATCGCTCAAGAAACAAGTTGTTTTGACAACATGGTCAAAGTCTGTTCCTGCTTCTGCCAAAATAGCACCGATGTTTTTCAAGACTTGCTCTGTCTGTTCTTGGATATTCTCTCCTACAATTTCCCCAGTTTCAGGGGATAGGGGAACTTGACCGCTAGCAAACAAAAGGTTGCCAACGATTTTTCCTTGAACATAGGGTCCGATAGCCTTTGGGGCCTTATCTGTATGAATTGTTTTTGCCATTTTCTTTTCCTCACAATTTTTCTAAGATTGCATCCCAAACCTCATCCATCCCTGCCTTGCTGACAGATGAAAAGAGGATGAAATCGTCACTTGGGTCAAAGTTTAATTTCTTTTTGATTGCTGATTCATGCTTGTTCCATTTACCACGAGGAATCTTGTCCGCCTTGGTCGCCACAATGATGACTGGAATCTCATAATACTTGAGAAATTCGTACATCTGCACATCATCTGCTGACGGGTCATGACGAAGGTCAACTAGACTGACAACCGCACGGAGATTTTCCCGAGTCGTTAAGTACTCCTCAATCATGCACCCCCACTTTTCACGTTCCTTTTTAGAAACACGGGCATAGCCATAACCAGGCACATCCACAAAGCGCATCTTGTCATCAATGTTAAAAAAGTTCAGGAGCTGGGTTTTACCAGGTTTTCCTGATGTACGGGCGAGATTCTTACGGTTCAACATAGTGTTGATAAAGCTGGATTTACCAACATTTGAACGCCCTGCTAGGGCAATCTCTGGCAGTTCATCCTGCGGATAGTGGGACTTATTAGCTGCACTGAGCAAGATTTCAGCATTGTGTGTATTAAGTTCCATAGTCACCTCTAGGCTGTTTCTAGGATCGGTTTATCCGTTCCATCGACAGTTTCTTTAGTGATGCGAACCAATTTCACATTTTCCTGACTCGGCACCTCAAACATAACATCTAGCATGGTTTCTTCGATAATGGAGCGAAGTCCACGCGCCCCTGTCTTCCGTTCGATTGCTTTATTAGCAATCTCTTGAAGGGCTTCGTCGTCAAATTCCAACTCAACATCATCATAAGAAAGCAAGGTTTGGTACTGTTTCACCAAGGCATTTCTTGGCTCTTTCAAGATGCGAACCAAGTCATCAACGGTCAATTGCTCAAGAGCCGCAAAAACAGGCAAGCGTCCAATCAACTCAGGGATAATACCAAATTTTTGAATGTCTTCAGCGATGATTTCTTGCATGTATGAGCTGTTTTCGTCAATCGCCTTATTGTTTTGACCAAATCCGATAACTTTTTCACCCAGACGTTGTTTGACAATTTCTTCAATACCATCAAAAGCACCACCCACGATGAAGAGGATATTTTTTGTATCCACTTGAATCATCTCTTGTTGTGGATGTTTGCGTCCACCTTGAGGCGGCACGCTAGCAACAGTTCCCTCAATAATCTTGAGAAGGGCTTGTTGCACCCCTTCACCAGAAACATCACGTGTGATAGACACATTCTCACTCTTCTTGGCAATCTTGTCAATTTCATCCACATAGATAATGCCACGCTCTGCACGTTCGATGTTAAAGTCAGCAACCTGCAAGAGTTTGAGGAGGATATTTTCCACGTCCTCACCCACATAACCAGCCTCCGTCAGAGCTGTCGCATCCGCAATAGCAAAAGGTACATTCAAGCTCTTAGCCAAGGTCTGGGCAAGGAAAGTTTTCCCTGAACCAGTTGGGCCAATCATCAAAATGTTTGACTTCTGCAAATCTACATCTTCTGACTCTTCGCGTGTATCGTGGAAATTGATGCGTTTGTAGTGGTTATAAACCGCCACTGCCAAGGCACGCTTGGCACGATCTTGACCAATTACATAGTGGTTCAAGATATGGAGGAGTTCAATTGGTTTTGGCACCTCAGACAAGTCTGCCAAGACTTCCTCAACCAATTCTTCTCGAATGATTTCCTGAGCTAACTCCACGCATTCATTACAAATAAAAGCATTGTTGCCAGCAATTATTTTTTGTACTTCTTCTTGGTTTTTGCCACAAAATGAGCAATAAACCATCATATCATTTTTTCTATTTGTAGACATGATTTCCTTCCATTCTATACTGTCATTCTATCTAAAATAAGGTCATGTAAAAAGCATGAATACTATTGACCAGATTGGTAAAGGCATTTAACCAAAGGAGGATAGAAAGCCCGTAACGCTTTTTACGAAAAGCCTGTGCTCCTGCCAGAAAGCAGATGAAACACAGAAAAGCCGTGAATAGACCAAATAAACTCCGTTCCATTAGACTTCCTTTCTCTTGCGGTATTGGATGGTAAAATCATAAGGATTCTTCTCATCTTTGGCGTAAAATTTGCTTGAAACTGTCTCAAAAAGAGACAAGTCAAGTTCTTCAGGGAAATAGGTATCTCCTTCCACCCGAGCATGAATGTGAGTGACAATCACTTCATCAAGGTAAGGTTCAAAAGCCTGAAAAATTTGCTTCCCACCGATAATGTAGAGATTCTTTTCTTGAGCCTGATACCAGTCAAGAACAGACTGGACGTCCTGAAAAGTAGCAACCCCATCTATCTTTTCTTCCGGATTACGCGTCAAAATCAGGGTTTCCCGTTTTGGAAGCAAGCGACGCCCCATCCCATCAAAGGTCACACGCCCCATCAAGATAGCATGATTCAGAGTTGTTTCTTTAAAGTGCTGCAATTCTGCTGGCAAATGCCAAGGCAGACGATTGTCCTTACCAATCACACCCTCTTCATCCTGGGCCCAAATAGCTACGATTTTCTTAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_18 >LR216060|1539294:1546048|1539294_1540263_+|VFI40110.1|DBSCAN-SWA MSQLYDITIVGGGPVGLFAAFYAHLRQAKVQIIDSLPQLGGQPAILYPEKEILDVPGFPNLTGEELTNRLIEQLNGFDTPIHLNETVLEIDKQEEEFAITTSKGSHLTKTVIIAMGGGAFKPRPLELEGVEDYENIHYHVSNIQQYAGKKVTILGGGDSAVDWALAFEKIAPTTLVHRRDNFRALEHSVQALQESSVTIKTPFAPSQLLGDGKTLDKLEITKVKSDETETIDLDHLFVNYGFKSSVGNLKNWGLDLNRHKIIVNSKQESSQAGIYAIGDCCYYDGKIDLIATGLGEAPTAVNNAINYIDPEQKVQPKHSTSL >LR216060|1539294:1546048|1543511_1544099_-|VFI40148.1|DBSCAN-SWA MELNTHNAEILLSAANKSHYPQDELPEIALAGRSNVGKSSFINTMLNRKNLARTSGKPGKTQLLNFFNIDDKMRFVDVPGYGYARVSKKEREKWGCMIEEYLTTRENLRAVVSLVDLRHDPSADDVQMYEFLKYYEIPVIIVATKADKIPRGKWNKHESAIKKKLNFDPSDDFILFSSVSKAGMDEVWDAILEKL >LR216060|1539294:1546048|1545371_1545542_-|VFI40165.1|DBSCAN-SWA MERSLFGLFTAFLCFICFLAGAQAFRKKRYGLSILLWLNAFTNLVNSIHAFYMTLF >LR216060|1539294:1546048|1541204_1542182_-|VFI40129.1|DBSCAN-SWA MRKPKITVIGGGTGIPVILKSLREKDVEIAAIVTVADDGGSSGELRKNMQQLTPPGDLRNVLVAMSDMPKFYEKVFQYRFSEDAGAFAGHPLGNLIIAGLSEMQGSTYNAMQLLSKFFHTTGKIYPSSDHPLTLHAVFQDGTEVVGESHIVDHRGIVDNVYVTNALNDDTPLASRRVVQTILESDMIVLGPGSLFTSILPNIVIKEIGRALLETKAEIAYVCNIMTQRGETEHFTDSDHVEVLHRHLGRPFIDTVLVNIEKVPQEYMNSNRFDEYLVQVEHDFVGLCKQVSRVISSNFLRLENGGAFHDGDLIVDELMRIIQVKK >LR216060|1539294:1546048|1542178_1543069_-|VFI40137.1|DBSCAN-SWA MTKKQLHLVIVTGMSGAGKTVAIQSFEDLGYFTIDNMPPALLPKFLQLVEIKEDNPKLALVVDMRSRSFFSEIQAVLDELENQDGLDFKILFLDAADKELVARYKETRRSHPLAADGRILDGIKLERELLAPLKNMSQNVVDTTELTPRELRKTLAEQFSDQEQAQSFRIEVMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPYYLPELRNQTGVDEPVYDYVMNHPESEDFYQHLLALIEPILPSYQKEGKSVLTIAMGCTGGQHRSVAFAKCLAQDLSKNWSVNEGHRDKDRRKETVNRS >LR216060|1539294:1546048|1545541_1546048_-|VFI40175.1|DBSCAN-SWA MTKKIVAIWAQDEEGVIGKDNRLPWHLPAELQHFKETTLNHAILMGRVTFDGMGRRLLPKRETLILTRNPEEKIDGVATFQDVQSVLDWYQAQEKNLYIIGGKQIFQAFEPYLDEVIVTHIHARVEGDTYFPEELDLSLFETVSSKFYAKDEKNPYDFTIQYRKRKEV >LR216060|1539294:1546048|1544107_1545340_-|VFI40157.1|protease|DBSCAN-SWA MSTNRKNDMMVYCSFCGKNQEEVQKIIAGNNAFICNECVELAQEIIREELVEEVLADLSEVPKPIELLHILNHYVIGQDRAKRALAVAVYNHYKRINFHDTREESEDVDLQKSNILMIGPTGSGKTFLAQTLAKSLNVPFAIADATALTEAGYVGEDVENILLKLLQVADFNIERAERGIIYVDEIDKIAKKSENVSITRDVSGEGVQQALLKIIEGTVASVPPQGGRKHPQQEMIQVDTKNILFIVGGAFDGIEEIVKQRLGEKVIGFGQNNKAIDENSSYMQEIIAEDIQKFGIIPELIGRLPVFAALEQLTVDDLVRILKEPRNALVKQYQTLLSYDDVELEFDDEALQEIANKAIERKTGARGLRSIIEETMLDVMFEVPSQENVKLVRITKETVDGTDKPILETA >LR216060|1539294:1546048|1540296_1541208_-|VFI40121.1|DBSCAN-SWA MSFTVAVKEEILGQHHLSWHELSAIIKMSGSIGLSTSGLTLSVVTENAKLARHLYESFLHFYEIKSEIRHHQRSNLRKNRVYTVFTDEKVQDLLSDLHLADSFFGLETGIDEAILSDEEAGRAYLCGAFLANGSIRDPESGKYQLEISSVYLDHAQGIASLLQQFLLDAKVLERKKGAVTYLQRAEDIMDFLIVIGAMQARDDFERVKILRETRNDLNRANNAETANIARTVSASMKTINNISKIKDIMGLENLPVDLQEVAQLRIQHPDYSIQQLADSLSTPLTKSGVNHRLRKINKIADEL >LR216060|1539294:1546048|1543120_1543501_-|VFI40145.1|DBSCAN-SWA MAKTIHTDKAPKAIGPYVQGKIVGNLLFASGQVPLSPETGEIVGENIQEQTEQVLKNIGAILAEAGTDFDHVVKTTCFLSDMNDFVPFNEVYQTAFKEEFPARSAVEVARLPRDVKVEIEVIAEIG |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1788074 : 1836527
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >LR216060|1788074:1836527|DBSCAN-SWA ATCATTTCTTCAACAAACCTTGTTCTTGGAGAAACTCCTTGGCTACTTGCTTTGCTGACTTGCCTTCGACACCCACTTGATAGTTAAGTTGGCTCATCTGACTTTCTGTAATCTTACCAGCCAATTTATTAAGAACTCTTTCCAACTCTGGGTGTTTCTTGAGAAGAGCTTCTTTCATGAGTGGAGCCCCTTGATAAGGTGGGAAGAGTTGCTTGTCATCTTCCAAGACCTGTAAATCATAACGCTCCAATTCCGCATCAGTCGAATAGGCATCCGTGATTTGAATATCCCCTGACTGAATTGCCTGATAACGAAGAGCTGGCTGCATAGTCGCCACATTGAGATTGAGACCATACATTGATTGCAAGCCCTTATTTCCATCTTCACGGTCGTTAAACTCAAGCGTAAAGCCTGCCTTCAGCTGCCCTTCCACTTTTTTCAAATCCGAAATGGTCTTCAAGCCATATTCTTGAGCAATCTTTTTCGGAACAGCTACAGCATAGGTATTTTGATAAGACATAGGTTTGAGATAGGCTAGATGATCCTGCTTGGCAATGCCATCACGCGCCACTTGATAAACCTGCTCTGGCTCATGACTCACCTTGGGTGATGGTTGAAGCAAACTTTCAGTCACCGTACCGGTAAATTCAGGATAAATGTCAATATCACCTTTTTTCAGAGCTTCATAAAGGAAACTTGTCGTCCCAAAATTCGGTTTAACAGTCGCAGTCATGCTGGTATTTTCTTCAATCAGCAATTTATACATATTGGCCAAAATTTCTGGTTCTGGGCCTATTTTCCCAGCAATAACCAAGTTTTCCTTCTCTTTTTGAACCAAAAGAGCTGGACTATAAGACAGACCCAGTAATAAAGCCACCAAGGCAAAACCTGAGAAAATCGTCCGTAATTTTGCTTTTTCCATTACTTTTAGTAGGAAGTTAAAGGCAATAGCAAGCACTGCAGAAGAAAGTGCCCCAATCAAAATCAAACTGGCATTATTACGGTCAATTCCCAACAGGATAAAGGAACCCAGTCCCCCTGCTCCAATCAAGGCCGCCAAGGTTGCCGTACCGATAATCAAAACAGCTGCCGTCCGAATCCCAGACATGATAACAGGCATGGCGAGTGGAATTTCAAATTTCTTGAGACGTTCCCATCTGGTCATCCCAAAGGCAATCCCAGCCTCTTGCAGGTTCGGATCAATTCCCTTCAGCCCAGTGATAGTATTTTGCAAAATAGGGAAAATCGCATAAATCACTAGAGCTGTCAAAGCCGGCAAGGTCCCAATTCCCATCAAAGGGATAAAGAGCCCCAACAAGGCCAGAGACGGGATGGTCTGGAAAATACCTGCAATCTGCAAGACCCAGTCGGCCAGCTTCTCATGATAGCGAAGAAAAACAGCCAAGGGAATCGCAAGCAAAATAGCTAGTAACAAGGTCAAAAGTGACAACTGCAAATGTTGAGATAGAGCTGTCAACCAATCACTAAAACGATCCTGAAAAGTTGCAATTAAATTAGTCATGAACACTACCTCCAAACAAGTCTGCTACAAAGTCTGTTGCAGGCACTTTTAAAATTGTCTCGGGATTCGCTACCTGGCGAATTTCTCCATCCTGCAAGACAGCAATACGGTCCGCCAACTTCAAGGCTTCATCCGTATCATGGGTTACAAAAATCGTTGTCATCCCAAACTCTTTATGCAATTCTTTTGTCAGAACCTGCAACTGTTTTCTCGAAATAGCATCCAAGGCCGAAAAGGGTTCATCCATGAGGAAAATCTTGGGCTGACCAATCATAGCTCGGACAATACCGACCCGTTGCTGTTCTCCACCAGATAATTCACTAGGTAAGCGATGCCCATACTCGGCTACTGGTAAACCAACCTTAGCCAAAAGCTCTTCTGTTTTCTTCGTAATTTCTTCCTTGCTCCACCCCTTCATTTCAGGAATGAGAGCAATATTTTCCGCAACTGTTAGATTTGGAAAAAGAGCAATAGCCTGTAAAACATAACCAGTAGAAAGACGAAGTTCACGCTCATCATAGTCTTTGATGCGCTTCCCATCCATATAAATATTTCCATCAGTTGGTTCCAAAAGACGGTTAATCATCTTGAGCATGGTCGTCTTACCTGACCCAGAAGGCCCTACTAAAACCATAAATTCCCCATCCTCAATCTGTAAGTTGACATCTCTCAAGACATCCTTTTCTGTGTAGCGCAGTGCTACATTTTTGTATTCAATCATTCTTTGTCCTCAATTTAAAACTTCCCTCGATTAGTCAAGTCTTCTACCTTAGGCATGACTTCCTTATTATCCCAATGCTCCACAATTTTCCCGTTCTCTAAACGGAAGATATCATACTGGGCATAAGCAACGCCATCAATCTGAGTCTGACCATAGCTAACCACATAGTTTCCTTGTCCTAAGAGTTGGAAAACAAAGTCAAAAGTGACACTATATTCAGTCACATAGTTTTTATAAGCAGCACTTCCTTGTCCAATATCATGATTATGCTGAATCAAATCGTCTGCCACATAATCACTCCACTGCTCTAGCTCCCCATTTTGGAAAATTTCTGTCAAGAAACGGCGAACCAGCTTTTTATTTTCTGCTTTCTTGTCCAAATCCTTGATTTCAAAATCTCCAAAAATTTGATCTAGTTGGTCATTTTCAGGTGTTCGATAGTAGTCAATGACATCCCAATGCTCAACAATACGACCATTCTCATCCGCACGGAAAGTATCCGTCGTCACCCATTGAGCTTCTCCACCATTCAGATATTGATGAACATGAACAAAGACCAGATTGCCATCCTCAATGATGCGGACAATCTTAATCTGACGCTCTGGATGACGCTCAAAGAAATCTGCAAAGAAGGCTGCAAATCCTTCTTTCCCGTCAGGAACACCTGTCGAATGTTGGATATAGGTATCCCCTACAGACTGGGCTTGAGCCTCAGCAACTCGTCCGTCTTGAATGGCATGGATGTATAGGTTGTGAGCATTTTTCACTTGTTGTGACATATTCTAAACCTCATTTCCCTTCTCTTTCAGATTCGCCAAAATTCTTTCTTGAAAACCTTCAAATTGGTGAATTTCTTCCTCTGAAAATCCTTTGTAAAAGATAGTATCCAATTTCTGACTGACACGATGCCCCACTTCTTTCTGGGACTTGCCTAACTCCGTTAAAACTAAATACTTCTTACGCTTGTCTTTTCCACACGGACTAACAATTACAAGCTTTTGTTCCTCTAGCTTTTTTATCATAGTCGTCAGCGTATTATTCGCAAGTCCAGTCGCAAGCGCGATATCTGTCGCAGTTGCGCAGCCAGTTTCACTATTCCATAAAACCGCTAAAATCTTGCCCTGTTCACCCCTATAAAGAGCCTCAGGATCTTGACTCAGTAACTTTTGAAAAATCCGCCCATTCAACAAACGAATATGATGGGCTAGCAAATGACCATCTTTCATAACACCTCCAATTTATTTCGATATCGAAATGAATAAAACAATTGTAACACTCATCGTTCTAACTGTCAACTATTTCGATTTAGAAATAATTTTTGATAATTATCCACACCACCATACTCCGGCTCAACTAACTTTTAACGAGAGTTTCTAAACTCCTTCGTCCTCCAGTCTACAAAAGCCTTCCATCCGTACTATCCTATATTTTATGAGGGGACACATTTTTCCTATCAGAGCATTTATTTTAAAGATAGAAGTAAATCATAATTGCTTCCATCTGTTCTTTTATAGTATATTGAAGTTGGACTAGGGCACTGTATCTTCTAAAACATTGATAGAAAGCGATTTGAATTTCCCAATCAATTTGTTCGTCTTTATAGCATTTCGAAACTGGAATAGGACACCATGACTGCTAAAAGATTTCTATAAATTCATTTGATTTCCCTAATCAATTTGTTCATATCTTATTTCATTCCGCTATAATTTCACCTTACCCTATCTTTTTCGTAGCACCCTTCAAACAGCCTATCCCCTACCGTTTGACGATTCCTCACTTCACTCCACTTCCATTACCCCCAATTATTCACCCCTAATCTAAAAACCATCCAGAATCCTTGCCTTAGCTTAGATCCTGGATGGTTTCTTTTTTCACCCAATGGGTGTTTTTTACTAGACAAAAAAGAGTTTCCCTTTGAGGAAATCTAGCGAGGAAAAACGATACTGGAACAGCAGAAAGTAAAACTGACCTCATGAGGAGGAAGAAAGTGGCTCATGAGGTCAGGGGTTTTGTAAGTTACATCTAGTTGAGAGAGGTATGAATGATTTGGGTTTACAGAAGTTTCTTCACTACTATGGTCTCGGCTGACTTCTCATGATTCCTTGTTACTACTATTTGAACGCTCACGAGATAGGTCTTATAAAAAATGCTTTGATCCACAATGGAATCAAAGCATTTTAAAAAGTTCCTCATACATAAGTGCAGAAGTCGCAGTTCCTCTGTACTTGGCTTCTTCTCTTTTGATAAAGCGAGCCAAGTTGAGCAACTCAGGTGCTGGATGTTTGGGATTTAGGAGCAATTCACGATTGACCAGGCCTGAGAGACGAACTGCCTGCAATTGCTCATTTGTAGTAGGCAGTTTTTTAGTAGTCTCTAGGAGAGCAGCAACTAAATCTTCACTCAAATCATGTCGAGCATGATTGTAAAGATCTTTTATAAGGCTTTCTAGGTTTGGTTCTGCCATCCCTACCACCTCTCTTATGGTTTAATAATGTTTAATCAAATCAACCGTTGAACGATCCAATTTCTTCACCAAGGCTTGTAAGAAAGCTTGCGCTTCTAGGAAGTCATCCATTGCATAGAGGGTTTGGTGAGAATGGATATAACGAGCGCAGACACCGATAGTTGTTGATGGGACACCACCATTTTTCAGATGAGCTGCACCTGCATCTGTTCCGCCTTTACCACAGTAGTATTGGTACTTGATACCAGCTTCTTCAGCCGTTGTCAAAAGGAAATCCTTCATCCCTGGGAGAA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46 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,integrase,holin | attL 1799718:1799736|attR 1822459:1822477 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1860260 : 1907397
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >LR216060|1860260:1907397|DBSCAN-SWA 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45 | Streptococcus_phage(11.11%) | transposase,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
2118528 : 2155865
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >LR216060|2118528:2155865|DBSCAN-SWA 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36 | Streptococcus_phage(53.85%) | transposase,holin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
2182306 : 2190592
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >LR216060|2182306:2190592|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_22 >LR216060|2182306:2190592|2185321_2185990_+|VFI45123.1|DBSCAN-SWA MTYSQNYLDDILVRMAYHSSGIEGNTISLPETVSIILESTLPRNGKSIREFYEIENHKQAFSYLLDSLANHQALTVGLVQDFHALLVDRLQHDRGQFKQVQNAIIGAEFQTASPAETPYLMTQWADNTAYRLEHAQNEKEVLEILADTHIQIERIHPFSDGNGRTGRLILMYLAMKYLNAPIIIPKDSRAHYMELLANQNVTGLADLFKKSLDYERIRKKQF >LR216060|2182306:2190592|2184514_2185183_+|VFI45116.1|DBSCAN-SWA MKFCPECGNSVVGCKFCPNCGYSINASLKTTPQKVATPSSRPSTVRSKRTDKVGPLEIDKNHRTYRIHGARKAKGSSGLIGGTAKVVGKTTLALGTGGLSLIPSLIKKDKNDTDWYSFDDLVSYELVINDQSVVSGGVGQALVAGAVFGVIGAVAGGIVAKRKATTKILNMTIRITSNDFTKPVVFIDLIKKPVKNTSKEYKEAIENAQKIIGALDVITHNS >LR216060|2182306:2190592|2183385_2183577_-|VFI45101.1|DBSCAN-SWA MRLTLKALRANSNMKQSEVAQKLGISTTTWSKWENGKSFPDVAQVKEIEKLFGVAYDDIIFLS >LR216060|2182306:2190592|2188346_2188652_+|VFI45146.1|DBSCAN-SWA MEKWENQDKILLDKNKRGKDRNWRGRKLLSLKLADIFKELGYRETLIERVETCGDTLRFIRREDGSLRLYQAYFCKNKLCPMCNWRRSMKYSYQTILVRLN >LR216060|2182306:2190592|2183755_2184496_+|VFI45108.1|DBSCAN-SWA MSLGNKQIMADNIKRLLSAKGLNPRQLAIALDFKYTTVNDWVNAKTYPRIDKIEMLANFFNVSKSDLVENKNAETPTTSLIQSIYDQLTPPRQAKALTYLKKQLLEQKNENIVSENIISLDDYRESKTLPVIGVVTAGNGITQDDNLNIEKCFYTDEIPDDYDAIAYVVGNSMEPKIKNGDYLFIKNTPQVDYNTIGIFQVDGANYVKKLRQGYLESLNPDCADIQLDESNDIRTIGEVVGIYREK >LR216060|2182306:2190592|2189752_2190592_+|VFI45160.1|integrase|DBSCAN-SWA MKITEYTKKDGSTVYRSSVYLGIDTVTGKKVKTTISGRTKRELKAKALQAQIDFEKDGSTVYKAVEIKTYAELVENWLETYCHTVKKSTLMGTKFKIDKYLLPAFGNYRLDKLTPPIIQKQVNQWAKDYNQLGKGFQEYPLLHSLNKRILKYAVSLQAIPFNPARDVIVPRRKEKEGQKLKYLDDDNLKKFLTYLEQLPNTYKNFYDTVLYKTLLATGLRIRECLALKWSDIDLKNGTLDVNKTLNIIKEITGPKTKSSIRVIDLDNKTVLMLRLYKAR >LR216060|2182306:2190592|2188756_2189317_+|VFI45153.1|DBSCAN-SWA MELQQYDELTFENIKHIDENGVEFWYARDLQKTLEYTEWRNFLLVIDKAKIACDTAKNPIVEHFVDVNKSIPNGYNTTRDIKDFKLTRYACYLIVQNGDPRKEVIALGQTYFALKTRQQELQENFDNLTEEQKRLAIRDEIKHHNKSLSESAESAENATYSLPRATMFNNPEARAFSGFSKSSDLV >LR216060|2182306:2190592|2187866_2188064_+|VFI45139.1|DBSCAN-SWA MNKAWLFWSVIVLYFFIKFFDKVLDIKLFGSIQIWLDNLPIPMKILLTIALVLFLFIVFPYRGKR >LR216060|2182306:2190592|2182306_2182912_-|VFI45086.1|DBSCAN-SWA MELVYMDGKKEPYTTSEIIAECAGVTHHTIQELLRKHKADFESYGIIAFEMRKLDGRGRPMKIYRLNEQQATLLITYLRNTEPVRKFKMNLVKAFFEMRDELSKRYLQRELEKPKRKTLTEAIKSWEKAPQHAYSTLTNLLLKGATGKNKAQLMQERESENGIDSLTSAELTNYQRLEDMAIAMINLNMRYSEIKELIFKV >LR216060|2182306:2190592|2186452_2186911_-|VFI45130.1|DBSCAN-SWA MVTDIEQARKNYMADYTPVDLTDAHKLLELAEKLQNEDISINTYELYKHPEAREKLFWQIAEATYMLLEDTGELQGATPTDEHLKTFVDYLEEKFNNIIKKLIAGTDVAKLQGFLEAVEKDNPHLTKQQKGQLLKDTVVTELFKLWIKRRSK >LR216060|2182306:2190592|2182933_2183242_-|VFI45093.1|DBSCAN-SWA MNNKQVYQAQTTDHGIARALGEEIRMITDVEETTYNGHGEIIVEYTSDVALTKLFDRIKALYEKGESYETKPFLHFKVLEDDIEPSPNGVFTAKEVAEFLGI |
11 | Streptococcus_phage(57.14%) | integrase | attL 2182537:2182551|attR 2197401:2197415 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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