Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_003485 | Streptococcus pyogenes MGAS8232, complete sequence | 2 crisprs | DinG,csm6,cas3,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 7 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_003485_1 | 931383-931472 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_003485_1
|
1 spacers
spacers of NC_003485_1
>1.1|931407|42|NC_003485|CRISPRCasFinder TAGTGGTATTGCCGCAGAAACCGTTGAAGAAAAGTGGCAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_003485_1
The CRISPR arrays of NC_003485_1 >merge|NC_003485|1|931383-931472|CRISPRCasFinder ATCCAAAGATGCTGTTGAAGTTTATAGTGGTATTGCCGCAGAAACCGTTGAAGAAAAGTGGCAAGATACCAAAGATGCTGTTGAAGTTTA >NC_003485|1|1|931383-931472|CRISPRCasFinder ATCCAAAGATGCTGTTGAAGTTTA TAGTGGTATTGCCGCAGAAACCGTTGAAGAAAAGTGGCAAGA TACCAAAGATGCTGTTGAAGTTTA
>NC_003485.1|WP_011017766.1|930158_930572_+|VOC-family-protein MKLNAIHHVAIIVSDYNLSKNFYVNKLGFEIIRENYRPDKHDYKLDLSCGRIELEIFGKVTSDPYYQAPPKRVSQPEFKSEACGLRHLAFRVTNIESYVDDLKSLGIPVEPIRHDDYTGEKMTFFFDPDGLPLELHE >NC_003485.1|WP_011017765.1|929326_930076_+|sortase MVKKQKRRKIKSMSWARKLLIAVLLILGLALLFNKPIRNTLIARNSNKYQVTKVSKKQIKKNKEAKSTFDFQAVEPVSTESVLQAQMAAQQLPVIGGIAISELGINLPIFKGLGNTELIYGAGTMKEEQVMGGENNYSLASHHIFGITGSSQMLFSPLERAQNGMSIYLTDKEKIYEYIIKDVFTVAPERVDVIDDTAGLKEVTLVTCTDIEATERIIVKGELKTEYDFDKAPADVLKAFNHSYNQVST >NC_003485.1|WP_011017764.1|926820_929307_+|DNA-gyrase-subunit-A MQDRNLIDVNLTSEMKTSFIDYAMSVIVARALPDVRDGLKPVHRRILYGMNELGVTPDKPHKKSARITGDVMGKYHPHGDSSIYEAMVRMAQWWSYRHMLVDGHGNFGSMDGDGAAAQRYTEARMSKIALELLRDINKNTVNFQDNYDGSEREPVVLPARFPNLLVNGATGIAVGMATNIPPHNLAESIDAVKMVMEHPDCTTRELMEVIPGPDFPTGALVMGRSGIHRAYDTGKGSIVLRSRTEIETTQTGRERIVVTEFPYGVNKTKVHEHIVRLAQEKRLEGITAVRDESSREGVRFVIEIRREASATVILNNLFKLTSLQTNFSFNMLAIENGVPKILSLRQIIDNYISYQKEVIIRRTRFDKDKAEARAHILEGLLIALDHLDEVIAIIRNSETDVIAQTELMSRFDLSERQSQAILDMRLRRLTGLERDKIQSEYDDLLALIADLSDILAKPERIITIIKEEMDEIKRKYANPRRTELMVGEVLSLEDEDLIEEEDVLITLSNKGYIKRLAQDEFRAQKRGGRGVQGTGVNNDDFVRELVSTSTHDTLLFFTNFGRVYRLKAYEIPEYGRTAKGLPIVNLLKLEDGETIQTIINARKEETAGKSFFFTTKQGIVKRTEVSEFNNIRQNGLRALKLKEGDQLINVLLTSGQDDIIIGTHSGYSVRFNEASIRNMGRSATGVRGVKLREDDRVVGASRIRDNQEVLVITENGFGKRTSATDYPTKGRGGKGIKTANITPKNGQLAGLVTVDGTEDIMVITNKGVIIRTNVANISQTGRATLGVKIMKLDADAKIVTFTLVQPEDSSIAEINTDRENSISKNKDN >NC_003485.1|WP_002984645.1|925646_926630_-|L-lactate-dehydrogenase MTATKQHKKVILVGDGAVGSSYAFALVTQNIAQELGIIDIFKEKTQGDAEDLSHALAFTSPKKIYAADYSDCHDADLVVLTAGAPQKPGETRLDLVEKNLRINKEVVTQIVASGFKGIFLVAANPVDVLTYSTWKFSGFPKERVIGSGTSLDSARFRQALAAKIGVDARSVHAYIMGEHGDSEFAVWSHANVAGVGLYDWLQANRDIDEQGLVDLFISVRDAAYSIINKKGATFYGIAVALARITKAILDDENAVLPLSVFQEGQYEGVEDCYIGQPAIVGAYGIVRPVNIPLNDAELQKMQASANQLKAIIDEAFAKEEFASAAKN >NC_003485.1|WP_002984646.1|924117_925488_+|FAD-dependent-oxidoreductase MSKIVVVGANHAGTACIKTMLTNYGDANEIVVFDQNSNISFLGCGMALWIGEQIAGPEGLFYSDKEELESLGAKVYMESPVQSIDYDAKTVTALVDGKNHVETYDKLIFATGSQPILPPIKGAEIKEGSLEFEATLENLQFVKLYQNSADVIAKLENKDIKRVAVVGAGYIGVELAEAFQRKGKEVVLIDVVDTCLAGYYDRDLTDLMAKNMEEHGIQLAFGETVKEVAGNGKVEKIITDKNEYDVDMVILAVGFRPNTTLGNGKIELFRNGAFLVNKRQETSIPGVYAIGDCATIYDNATRDTNYIALASNAVRTGIVAAHNACGTDLEGIGVQGSNGISIYGLHMVSTGLTLEKAKRLGFDAAVTEYTDNQKPEFIEHGNFPVTIKIVYDKDSRRILGAQMAAREDMSMGIHMFSLAIQEGVTIEKLALTDIFFLPHFNKPYNYITMAALGAKD >NC_003485.1|WP_011017763.1|922149_923877_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKTDHHLLKRVLQDLLKKPLPVCILVIASFVQVGLSVYLPVLIGKAVDMSLSVNSWQTLKWLLRQMLVVIVVNTLIQWVMPLVYSRLLYQYSQQLKDKLLEKIHRLPFAYLDRQTIGDLVSRVITDTEQLINGLQMVFNQFILGLLTILCTIIAMAQIDWLMLILVLVLTPSSLFLARFIAQKSFHYAQAQTKSRGNLAQFTEEILRQEGLVQLFNAQEQSICDYHVLNKTYCQASQKAIFYASTVNPATRFINSVIYALLAGLGAVRIMAGLFSVGQLTTFLNVVVQYTKPFNDISSVLAEIQSSLACAQRLYDLLDIEIKEQEHFLTFKASAVKGQIDFEEVSFSYQKDRPLLKDINFSVPAGSKVAIVGPTGAGKSTLINLLMRFYELDADSIKLDKVPIKCYAKEELRSITGMVLQETWLKDATVHELIAYGSEEASRDEVVAAAKAAHAHFFIMQLPKTYDTYLSASDDALSQGQLQLLAIARMFLKKPEVLILDEATSSIDIRTEAVIQEALKELMRGRTSFIIAHRLSTIQSADLILVMDQGRLVEWGTHASLMSKNGCYARLQKIE >NC_003485.1|WP_011017762.1|920428_922147_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKRLRPYVKGYLKESILGPLFKLLEALFELLVPLLVANMIDLSISQHNSQGILRVVLTLFGLATIGLLLSVTAQYFSSKAAVGFTRQMTDDLFKKIMFLSKEDQDHLGYASLLSRLTSDSFQIQTGINQFLRLFLRAPIIVCGAMVMAYWISPSLTLWFVMMVIVLLTLVFVMSHLLGPLYLLIRRETDHLVRLTSQQLQGIRVIKAFNQTQKELQAFKQQNMLLSRHQYQAATLANVLNPMTFLVVNLTLLILIWQGSWQVAHRSLSQGMLVALINYLLQILAELLKMTMLMGTINQSVTAAKRINQVFVLADEAPLPLLKDGPISTHLLTIRHLTFTYPGAAEPSLYDIQLSADQGEWIGIIGGTGAGKTTLIDLICQTYSQYSGEVSLNWQGEVPKTLTEWRNVIALVPQKAQLFKGTIRSNLLLGQSMPISDEELWRALELAQAKEFVAALPEQLEAPVEAFGRHFSGGQRQRLAIARALLKPKPILILDDASSALDNETRGRLFKALKEELSDVLVILVTQSIKNLQFADKILVLEQGHQLDFASHDQLKVSNALYQEMLALYVKGE >NC_003485.1|WP_002984653.1|919819_920419_+|lysozyme-family-protein MFRLLKRACSFLLLFVIYQSFVIHHNVQRVLAYKPMVEKTLAENDTKANVDLVLAMIYTETKGGEADVMQSSESSSGQKNSITDSQASIEHGVNLLSHNLALAEEAGVDSWTAVQAYNFGTAYIDYIAKHGGQNTVDLATTYSKTVVAPSLGNTSGQTYFYYHPLALISGGKLYKNGGNIYYSREVHFNLYLIELMSLF >NC_003485.1|WP_002989793.1|918841_919819_+|nucleoid-associated-protein MLDSYIKRIVIHQFSPNDTELLLSDRLVSITPRIDEYFRKKLAKVFSDEAKRGQFEANNTFFTTIGDDLLETSVTIAQLWKEAFVISEDQKTNDLVFVQFDKDGEPFFAFLRIALKEQFAHLSDNYEHPFTVTQNNLPSPTQTPDEALVINLKSGQYYLIEKRVKHNGSFANYFSEHLLKVTPEQSVKKSIKMIEQTAQKIAEHFNQDDFTFQSKMKSTLFKQLEADDVLSPEKLADQLFDDNLTARLTFVDQVKDVIPEPIKISDIDHSRQIKKLENQKLSLSNGIELTVPNAIYQDAEAVEFLLNDDGTYSILIKNIEDIKTK >NC_003485.1|WP_011017761.1|917578_918835_+|serine-hydroxymethyltransferase MIFDKGNVEDFDKELWDAIHAEEERQEHHIELIASENMVSKAVMAAQGSVLTNKYAEGYPGNRYYGGTECVDIVETLAIERAKKLFGAAFANVQAHSGSQANAAAYMALIEAGDTVLGMDLAAGGHLTHGSPVNFSGKTYHFVGYSVDADTEMLNYEAILEQAKAVQPKLIVAGASAYSRSIDFEKFRAIADHVGAYLMVDMAHIAGLVAAGVHPSPVPYAHIVTSTTHKTLRGPRGGLILTNDEALAKKINSAVFPGLQGGPLEHVIAAKAVAFKEALDPAFKDYAQAIIDNTAAMAAVFAQDDRFRLISGGTDNHVFLVDVTKVIANGKLAQNLLDEVNITLNKNAIPFETLSPFKTSGIRIGCAAITSRGMGVKESQTIARLIIKALVNHNQETILEEVRQEVRQLTDAFPLYKK >NC_003485.1|WP_011017768.1|931669_932581_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MKTVRIFYNPNSGKKEDQLAGQVKDYFCQHGFSEDSVEIITPKDADQAFQLAKQAAKDKIDLVIPLGGDGTLNKIIGGIYEGGAHCLIGLVPSGTVNNFAKAMHIPLQITEALDTILTGQIKQVDICKANQQYMISSLTLGLLADIAADVTAEEKRRFGPLAFLKDSIRILKRNRSYAISLISHNHRIHLKTKFLLITMTNTIAGFPSFSPGAQADDGYFQVYTMKKVSFFKFLWHINDFRQGDFSKAEEISHFQANTLSLLPQAKKQAILPRARIDGDKSDYLPIQLDIIPKAISIIVPTED >NC_003485.1|WP_002984629.1|932697_933348_-|hemolysin-III-family-protein MNQTFKQSLPLSFSEEVANSVTHAIGAFAMLILLPISASYAYQTYDLKAAIGISIFVISLFLMFLSSTIYHSMAYGSVHKYILRIIDHSMIYIAIAGSYTPVALSLVSGWLGYIIIVLQWGITLFGILYKIFAKRINEKFSLMLYIVMGWLVVFILPVIIQKTSLAFGLLMLFGGLSYTIGAVFYAKKRPYFHMIWHLFILLASALQFIAITFFML >NC_003485.1|WP_011017769.1|933344_933785_-|DUF1836-domain-containing-protein MIFPSLPYWKDLPDLDLYLDQVLLYVNQCTDFSEVSDNKSLTASMINNYVKHGYVTKPIKKKYQKQQLARLIAISLFKTVFPIQDISRVLEELQAQADSESLYNTFVTCWNQKAPIEEDIPPIVQVACQTVKDYHKTIYLSQEVTQ >NC_003485.1|WP_011017770.1|934003_934852_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAMIQWFPGHMSKARRQVQENLKHVDFVTILVDARLPLSSQNPMLTKIVGDKPKLMILNKADLADATRTKEWKAYYESQGIKTLAINSKEQSTVKKVTEAAKELMADKIKRLRDRGIQKETLRTMIIGIPNAGKSTLMNRLAGKKIAVVGNKPGVTKGQQWLKSNKELEILDTPGILWPKFEDELVGLKLALTGAIKDQLLPMDEVTIFGLNYFKTHYPSRLTKRFKNIPLEEEAPEIIMTLTRQLGFKDDYDRFYSLFVKEVRDGKLGQYTLDQVGDMDAD >NC_003485.1|WP_011017771.1|934841_935633_+|ribonuclease-HII MPTSIKAIKESLEAVTSLLDPLFQELATDARLGVQKALKSRQKAIQTDLAEEERLEAMLSYEKALYKKGYQAIAGIDEVGRGPLAGPVVAACVILPKYCKIKGLNDSKKIPKAKHETIYQAVKEKALAIGIGIIDNQLIDEVNIYEATKLAMLEAIKQLEGQLTQPDYLLIDAMTLDIAISQQSIIKGDANSLSIAAASIVAKVTRDQMMANYDRIFPGYGFAKNAGYGTKEHLQGLKAYGITPIHRKSFEPVKSMCCDSTNP >NC_003485.1|WP_011017772.1|935697_936534_+|DNA-protecting-protein-DprA MNHFELYKLKKAGLTNKNILNILDYQEHQEKSLSLRDMAVVSGCKHPSHFIEAYKQLDIQKLKMEFKQFPSISILDKHYPMALKEIYNPPVLLFFQGNLDLLEKPKLAIVGSRRSSDTGVKSVRKILKELGNRFVIVSGLARGIDTSAHLACLKNGGQTIAIIGTGLDRFYPKENRELQTFLGKNHLVLTEYGPREEALSYHFPERNRIIAGLSRGILVVEAKNRSGSLITCQIGIEEGRDIFAVPGNILDGKSEGCLQLIKEGATCVTSGMDILSEY >NC_003485.1|WP_011017773.1|936640_938770_+|type-I-DNA-topoisomerase MGTKTTTKPKTGTKKSTTKKKSTAKKNLVIVESPAKAKTIEKYLGRSYKVVASVGHIRDLKKSSMSIDFDNNYEPQYINIRGKGPLINSLKKEAKAAKKVYLASDPDREGEAISWHLSHILGLDPQDNNRVVFNEITKDAVKHAFVEPRQIDMDLVDSQQARRVLDRIVGYSISPILWKKVKKGLSAGRVQSVALKLIIDRENDIKAFVPKEYWSIDGLFKKGTKKFQATFYGINGKKTKLDNNNDVKEVLAKLTNEDFLVSKVDKKERRRNAPLPYTTSSLQQDAANKINFRTRKTMMVAQQLYEGIHLGENGTQGLITYMRTDSTRISPVAQNDAAQFIINRFGANYSKHGNRVKNTSGAQDAHEAIRPSSVNHTPDSIAKYLNKDQLKLYTLIWNRFVASQMTAAVFDTVKVNLEQNGVIFVANGSQMKFDGYMAVYNDSDKNKMLPEMAEGETVKKISTSPEQHFTQPPARYSEATLIKTLEENGVGRPSTYAPTLEVIQRRYYVKLSAKRFEPTELGEIVNKLIVEFFPDIVDVAFTAEMEGKLDQVEIGEEQWQHVIDQFYQPFVKELNKAESEIEKIQIKDEPAGFDCDVCGHPMVIKLGRFGKFYACSNFPECRNTKAITKEIGVTCPVCHKGQVIERKTKKNRIFYGCDQYPDCEFISWDLPIGRACPKSGDYLIEKKVRGGKQVMCSNETCDYKEEKIK >NC_003485.1|WP_011017774.1|938904_940251_+|methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)--C(5))-methyltransferase-(FADH(2)-oxidizing)-TrmFO MSQSTATYINVIGAGLAGSEAAYQIAKRGIPVKLYEMRGVKATPQHKTTNFAELVCSNSFRGDSLTNAVGLLKEEMRRLDSIIMRNGEANRVPAGGAMAVDREGYAKSVTAELENHPLIEVIRDEITEIPNDAITVIATGPLTSDALSEKIHAVNGGDGFYFYDAAAPIIDKSTIDMSKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTKEEFMAFHEALTTAEEAPLNAFEKEKYFEGCMPIEVMAKRGIKTMLYGPMKPVGLEYPDDYTGPRDGEFKTPYAVVQLRQDNAAGSLYNIVGFQTHLKWGEQKRVFQMIPGLENAEFVRYGVMHRNSYMDSPNLLTETFQSRSNPNLFFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGINAARLFKREEALIFPQTTAIGSLPHYVTHADSKHFQPMNVNFGIIKELEGPRIRDKKERYEAIASRALADLDTCLALL >NC_003485.1|WP_072135501.1|940404_941811_+|pyruvate-carboxylase-subunit-B MIQFGGFSMQQQVAITETVLRDGHQSLMATRLSIEDMLPVLTILDKIGYYSLECWGGATFDACIRFLNEDPWERLRTLKKGLPNTRLQMLLRGQNLLGYRHYADDIVDKFISLSAQNGIDVFRIFDALNDPRNIQQALRAVKKTGKEAQLCIAYTTSPVHTLNYYLSLVKELVEMGADSICIKDMAGILTPKAAKELVSGIKAMTKLPLIVHTHATSGISQMTYLAAVEAGADRIDTALSPFSEGTSQPATESMYLALKEAGYDITLDETLLEQAANHLRQARQKYLADGILDPSLLFPDPRILQYQVPGGMLSNMLSQLKQANAESKLEEVLAEVPRVRKDLGYPPLVTPLSQMVGTQAAMNVILGKPYQMVSKEIKQYLAGDYGKTPAPVNEDLKRSQIGSAPVTTNRPADQLSPEFEVLKAEVADLAQTDEDVLTYALFPSVAKPFLTTKYQTDDVIKVTAFIKA >NC_003485.1|WP_009881173.1|941853_942168_+|membrane-protein MTYSFIDILQVTLVSLFLVLTCLTGIMGLMMLSGKLLSQEKKTLSQQASSIPQEQEADKLSGEALETLLAKDELARIAVMTSLAYASQEESGKRFEVIAVERKS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_003485_2 | 1031263-1031364 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_003485_2
|
1 spacers
spacers of NC_003485_2
>2.1|1031287|54|NC_003485|CRISPRCasFinder CCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_003485_2
The CRISPR arrays of NC_003485_2 >merge|NC_003485|2|1031263-1031364|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATACCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACATAAAATTGGTATAGTCTAATTATA >NC_003485|2|2|1031263-1031364|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATA CCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA TAAAATTGGTATAGTCTAATTATA
>NC_003485.1|WP_011017833.1|1029397_1031212_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKALSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSRESTYTMLIHAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLATTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >NC_003485.1|WP_011017832.1|1028866_1029202_-|alkylphosphonate-utilization-protein MSLPNCLQCQSEYVYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVLDSNGVRLSDGDTITVIKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >NC_003485.1|WP_002984455.1|1028118_1028760_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKVPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTAANRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >NC_003485.1|WP_002984457.1|1027479_1028109_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKADAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >NC_003485.1|WP_011017831.1|1026627_1027464_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKSLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGKCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKERQNKVAFTDSYMRNEQIIVVTKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVVTANIKS >NC_003485.1|WP_011017830.1|1025485_1026259_-|CAMP-factor-pore-forming-toxin-Cfa MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANLQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIEATVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDTGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKSFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQNALETALKS >NC_003485.1|WP_011017829.1|1023880_1025116_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLLLSAAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVAVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMILEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLVDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQHTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKRQLHHTHYRIVKM >NC_003485.1|WP_011017828.1|1022438_1023761_+|sodium:alanine-symporter-family-protein MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGVYLTSRLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYAEGVLAIKYRTKDASGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFASSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQMVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLTVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNEPVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFVLMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >NC_003485.1|WP_011017827.1|1019589_1021908_-|DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALALNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLVKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANILGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTGYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEASEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPLGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >NC_003485.1|WP_002984469.1|1018978_1019227_-|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
36828 : 49143
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_003485|36828:49143|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_003485|36828:49143|40714_42169_+|WP_004218736.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSNFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTENKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >NC_003485|36828:49143|48651_49143_+|WP_023079557.1|DBSCAN-SWA MKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKHAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVIGVPVKSRALLGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >NC_003485|36828:49143|42196_43219_+|WP_011017231.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGVLGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYVATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVNGIGHITGGGFIENIPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADDSVVIK >NC_003485|36828:49143|47107_48373_+|WP_011017234.1|DBSCAN-SWA MKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFVNGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVETIVRPVLEGMVAEGRPYLGVLYVGLILTADGPKVIEFNLRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQNDGVTLGVVVASEGYPLDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGAKFAENSKALLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDTTGLFYRNDIGSKAIRE >NC_003485|36828:49143|44124_45672_+|WP_011017232.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIIDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDNAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDVDSHLQAAKDNNIELIDLVVINLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVIALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEVAAAGVKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >NC_003485|36828:49143|36828_40554_+|WP_041174219.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDRLLTEAEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAELYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKAEQGLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGEVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPSDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVIDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTVSVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEGLTVPPTLVAFGVTTADSRKILSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKFEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEIAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANANSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK >NC_003485|36828:49143|43386_43941_+|WP_002986700.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI >NC_003485|36828:49143|45730_46855_-|WP_011017233.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYDHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGNQILRVGEYFTVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
282193 : 463360
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_003485|282193:463360|DBSCAN-SWA TATGCTTTATCAACAGATTTCACAAAATAAGCAACGAACAGTTGTTTTATTAGTTGTTTTCTTCGCTCTCTTAGCACTTATTGGAGCTTCAGCAGGCTATCTGCTGTTAGATAATTATGCCATGGGCTTGGTTCTTGCTCTTGTCATTGGGGTGATTTATGCTACCAGTATGATTTTTCAATCCACCAGTCTTGTAATGAGTATGAACAATGCTAGAGAAGTTACAGAAAAAGAGGCTCCAGGCTTCTTCCATATTGTCGAGGATATGGCTATGGTGGCTCAGATTCCGATGCCGAGAGTTTTTATTATTGAAGATCCTTCTTTAAATGCTTTTGCGACAGGATCTAGCCCTCAAAATGCTGCTGTTGCAGCAACGACAGGTTTACTTGAAGTCATGAATCGTGAAGAACTTGAAGGTGTTATCGGCCATGAAATTAGCCACATCCGAAATTATGATATCCGTATTTCGACTATTGCTGTCGCTTTGGCGAGTGCTGTTACCGTTATTTCTAGTATCGGTGGGCGTATGCTATGGTATGGTGGCGGTTCTCGCAGGCAAAGAGATGACGGAGATGATGATGTTTTAAGAATCATTACGTTACTTTTGTCGTTATTATCTTTGCTTTTAGCGCCCCTAGTAGCAAGTTTGATTCAGTTGGCTATTTCTCGTCAAAGAGAATATCTAGCTGATGCTAGTTCTGTTGAACTAACAAGAAATCCCCAAGGTATGATTAAGGCTCTTGAAAAATTGCAGTTATCTCAGCCAATGAAGCATCCTGTTGATGATGCTAGTGCAGCCTTGTATATTAATGAGCCTCGCAAAAAAAGGAGCTTCAGTTCATTATTCAGCACCCATCCTCCTATTGAGGAGAGGATTGAAAGGTTAAAAAACATGTGAGCGTTTGGGGTTTTTGCTCAAGCCTCACTTTTTTATGTCTTTGGGCAGATAATCTAAAATGGCAGGAATTATCAAAAATATCTGAACAAAAAGAAAAAAATGAGTGAAACAATGGTTAAAAATAGAATGATTTAAATCTTAAAATTAAAAAACGTCAGAAAATAAATGCAAAACTATTGACAAATCTTTTAGATAGTAGTAAAAATAAATGAGAGTTTTATTAGGAGAAGATGATGTTAGCTATTTCCGAAATCAGAAAACACCCAGACGGTCTCTCGTTTGATCGTTTATGTGATGTCAAAAGTATGTTACTTGAGCGTGACCAACAGATTATTGACATAAAGGCAGTTAAAGCTGTCGGTAATGTTCGCTATGATAGGGGACTTTATCTATTAGATTATCAATTGAGTTACGAAGTGATATTACCGTCTAGCCGTTCTATGGTTCCGGTCTGTTTAAGTGAAGTCCAACACATTCAAGAATTATTTATAGAGGCGACAGATTTAGCTGATAAGAAAGAGTTGGTTGAAGACAATCTGGTATTAGTTTTAGACAAAGACGCTATTAACCTCGAAGAAAGTATTGTGGATAATATCTTACTTGCTATTCCGCTACAGGTCTTGACAGAGGAAGAAAAGAAATCAAAAGAGTTGCCAGCAGGTCAAAATTGGGCAGTTTTGACAGAAGAAGACTACCAGTGTCTAAAAGAAGAAAAGCAAAAAGAAAATAATCCTTTTGCTAGCTTGCAAGGGTTGTTTGATGAATAAAACTGAATATTAAAGATGTCTGTAATTTTTATTTGAAAAAACAGCTATTCTTTGATATACTCTTTAGAGAATATGGTTACTTATCTAAAGTAGAAGGTATTTTGACCATAGAGGGCAAAGAAGGTAATGACTATTAGATGCTTCATATTTTATTCGCTAGAAGACTATTTGACCATTAGAACTGAAATAGTCTAGGATATGAGATGGATTTCATAGTTTTCTTTCTGGGAGAAAAAGATAGATTAAGAGGATAAGGGTTGGTATAAATGACAAAGAAAATTTTAATTATTGAAGATGAAAAGAATCTGGCTAGATTCGTTTCTCTTGAGCTGCAACATGAGGGTTATGAAGTCATTGTTGAGGTCAATGGTCGTGAAGGGTTAGAAACTGCTTTGGAAAAAGAGTTTGATTTAATCCTGCTTGACTTAATGTTACCAGAGATGGATGGTTTTGAAGTGACCCGTCGTTTGCAAACCGAAAAAACAACGTATATCATGATGATGACTGCGCGTGATTCTATTATGGATGTGGTTGCAGGTTTAGACCGCGGTGCAGACGACTATATTGTTAAACCGTTTGCCATTGAAGAACTACTTGCCCGTATTCGTGCTACTTTCCGCCGTCAAGATATTGAATCTGAGAAGAAAGTGCCTAGTCAAGGCATTTATCGAGATCTAGTTTTAAATCCACAAAACCGTTCAGTTAATCGTGGCGACGATGAGATTCCTCTCACTAAACGTGAATATGATTTGCTTAATATTTTGATGACTAACATGAATCGTGTCATGACACGTGAAGAATTATTGTCAAATGTTTGGAAATATGATGAAGCCGTTGAGACTAATGTTGTAGATGTCTATATTCGTTATCTCCGCGGCAAAATTGACATTCCAGGCAAGGAATCTTATATCCAAACAGTGCGTGGCATGGGATACGTTATTCGTGAGAAATAAGTCATATGGAAAATCAGAAACAAAAACAGAAGAAATATAAAAACTCGTTACCAAAACGACTATCTAATATCTTTTTTGTTCTTTTTTTCTGCATTTTCTCTGCCTTTACACTGATTGCCTATAGTTCAACAAACTATTTCTTATTGAAGAAAGAAAAGCAGTCAGTCTTTCAAGCTGTAAATATTGTTAGAGTTCGTCTTTCTGAGGTGGACTCTAATTTTACATTAGAGAACTTAGCAGAAGTTTTGTACAAAAACGATAAAACACATCTGAGAATTGATGACAGAAAGGGCAGTCGAGTCATTAGGAGTGAGCGCGATATCACAAATACTCTAGATGCGAATCAAGATATTTATGTCTATAACATTGATAAACAGATGATTTTTACCACAGATAACGAAGAATCATCTCCTGGCTTGCATGGTCCTATCGGTCGGGTGTATCACGACCATATCGAAGATCAGTATCGTGGGTTTTCCATGACACAAAAGGTATATTCTAATCGGACTGGAAAATTTGTGGGCTATGTTCAAGTCTTTCATGATTTAGGCAATTATTATGTCATTAGAGCAAGACTGCTGTTTTGGCTACTAGTTGTTGAGTTATTTGGCACAAGCTTAGCCTATTTAATCATCTTAATTACTACGCGGCGCTTTTTGAAGCCTTTACACAATTTACATGAAGTGATGCGTAATATCTCTGAAAATCCTAATAATTTAAACCTGCGCTCAGATATTTCGTCAGGAGATGAAATCGAAGAATTGTCTGTTATCTTTGACAATATGTTAGACAAATTGGAGACACATACTAAGTTGCAATCACGTTTTATTAGTGATGTCAGCCATGAATTACGAACACCGGTTGCGATTATTAAAGGGCATATTGGTCTCTTACAACGTTGGGGTAAAGATGACAGTGATATACTTGAAGAAAGCTTGACAGCAACAGCGCATGAGGCTGACCGTATGGCAATCATGATTAATGATATGTTAGACATGATTCGCGTACAAGGCTCATTTGAGGGACATCAAAATGATATGACAGTTTTGGAAGATTCTATTGAAACTGTTGTTGGTAATTTTAGAGTTTTAAGAGAAGATTTTATCTTTACATGGCAGTCAGAAAATCCAAAAACGATAGCCCGTATTTATAAAAATCATTTTGAGCAGGCTTTGATGATTCTTATTGACAATGCTGTGAAGTATTCCCGTAAAGAAAAGAAAATCGCGATTAACCTTTCAGTGACTGGCAAACAAGAAGCTATTGTTAGAGTTCAAGATAAAGGCGAAGGAATTTCTAAAGAAGATATTGAACATATCTTTGAACGCTTTTATAGAACGGATAAATCACGTAATCGAACAAGTACTCAGGCTGGATTAGGGATTGGCTTGTCTATTCTCAAGCAAATTGTAGATGGGTATCATTTACAGATGAAGGTTGAAAGTGAATTAAATGAAGGTTCAGTGTTTATCTTACATATTCCTTTGGCCCAGTCTAACGAGAGTTAGAGTAGCTTAAGGCATTGTTAATGTGACAGGTATAGTATGTAATCATTAGATAATAGTAGCAGTCTTTTGCCACAACTGGTTAGAAGCTGATGCTATTTTTTTAGCAATGATGGATGATATGAAAGAAATACTGTCAATCGCGATGCCTTTTGTTATCCTTGAGAATATGGTAAAATAGTGTATTAGATTAATTTGATAGAATTGGGGTGTTTGCGTGCGTTGTCCAAAATGTAATTACCATAAATCGAGTGTTGTTGACAGTAGACAGGCTGAAGACGGCAACACCATTCGTCGTCGAAGAGAATGTGAACAGTGTCATACTCGCTTTACTACCTTTGAGCGTGTTGAAGAACTCCCTTTATTAGTCATCAAAAAAGATGGCACACGAGAGCAATTTTCTAGAGATAAAATATTAAATGGGGTTGTCCAAAGTGCGCAAAAACGACCTGTCTCGAGCACAGATATTGAAAATGTCATTTCTCGTATTGAACAAGAAGTTCGAACAACCTACGAAAATGAAGTGTCAAGTACTGCTATTGGTAATTTAGTGATGGATGAGTTGGCCGAACTCGATGAAATCACATATGTACGCTTTGCTAGTGTCTACAAGAGTTTCAAGGACGTTGATGAAATCGAAGAACTTTTGCAACAAATTACGAATCGCGTACGCGGAAAGAAAAAACGTTTAAATAATGATGAAACCAATTGATACTTTTACATATCTAAAACGCAACAAAGTAACTCTTGATTCGGTGACTTTAATACAGTTGTACTTTCCAATTATTGGAAGTGACGCGGTCTCTATCTACCAATACTTTATTCACTTTTTTGACGATGGTTTACAACGTCATAAATTCAGCGAAATTTTAAATCA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201 | Streptococcus_phage(52.13%) | terminase,bacteriocin,integrase,transposase,portal,holin,tRNA,tail,protease,capsid | attL 298070:298087|attR 461275:461289 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
563360 : 617896
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_003485|563360:617896|DBSCAN-SWA 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71 | Streptococcus_phage(60.0%) | terminase,head,portal,tRNA,holin,tail,protease,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
702893 : 710293
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_003485|702893:710293|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_003485|702893:710293|705211_706375_+|WP_002985142.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >NC_003485|702893:710293|708940_710293_+|WP_011017639.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHASYERSFEQNGVDRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKAIVDVLVEEMTVGGPCLHPHSEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFGLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNNKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >NC_003485|702893:710293|702893_705104_-|WP_050579048.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAASAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYENSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNTKNRE >NC_003485|702893:710293|706371_707058_+|WP_002985140.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >NC_003485|702893:710293|707151_708318_+|WP_002992640.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGLSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEEEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >NC_003485|702893:710293|708378_708720_+|WP_002985134.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADASASQLFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK |
6 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1007788 : 1091243
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_003485|1007788:1091243|DBSCAN-SWA 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97 | Streptococcus_phage(37.1%) | terminase,integrase,head,holin,tRNA,portal,tail,capsid | attL 1041142:1041201|attR 1087782:1087880 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1165696 : 1244130
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_003485|1165696:1244130|DBSCAN-SWA 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92 | Streptococcus_phage(59.32%) | terminase,integrase,holin,tRNA,portal,tail,protease,capsid | attL 1206171:1206190|attR 1241503:1241522 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1416707 : 1493373
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_003485|1416707:1493373|DBSCAN-SWA 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MSKHWKHLFIRYTFTALATLFLGLFPISKTTNSIIYAETTDISNVWNIVQHPNYYIVEGKSHLNKEKFPQIYHTTEKVYRKSGQSTKRVTVSDIQYSILDGYGRSGEAYGVITKDMIDMSAGYREKWESKPEPSGWYSYFFKNTNQRATESDYKHSPKNVSKISNNIKASIPLSNGRTRHGYLFDRSHLIADSLGGRPFRNNLITGTRTQNVGNNDRKGGMQYIENKVLDHIKKNPKVHVYYKATPVYQGSELLPRVVLVSALSSDGTIDETVRVFNAVAGFNIDYQNGGLLTESPVSEIGNIEDSTTDEIENSVDDSEEIVYNDITTEEVN >NC_003485|1416707:1493373|1453404_1453998_-|WP_003051628.1|DBSCAN-SWA MNYRTISLDEIMKYLEKEEIQQLLKSFKGFNDGTSTPHDVEVFLHQKAVEFERSAIASTYLVFSTDSRELVGFFSLANRPLYFSKQNYQTLTKSQRKKISRSGRTLKGSGSFLMNSFLIGQLGKNYKSNTSISGKELLTLACDKVKKASKIINTKYIWLECDNNPKLIQFYQNFGFTPIDNFESENGLKVFVMKIQK |
96 | Temperate_phage(52.31%) | terminase,integrase,portal,tRNA,tail,capsid | attL 1482074:1482089|attR 1501690:1501705 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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NC_003485.1|WP_003051628.1|1453404_1453998_-|GNAT-family-N-acetyltransferase |
1453404_1453998_-
Protein sequences of NC_003485.1|WP_003051628.1|1453404_1453998_-|GNAT-family-N-acetyltransferase>NC_003485.1|WP_003051628.1|1453404_1453998_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNYRTISLDEIMKYLEKEEIQQLLKSFKGFNDGTSTPHDVEVFLHQKAVEFERSAIASTYLVFSTDSRELVGFFSLANRPLYFSKQNYQTLTKSQRKKISRSGRTLKGSGSFLMNSFLIGQLGKNYKSNTSISGKELLTLACDKVKKASKIINTKYIWLECDNNPKLIQFYQNFGFTPIDNFESENGLKVFVMKIQK |
197 aa aa |
89
gnl|BL_ORD_ID|89 information
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NA | NA | 1416707-1493373 | NA |