Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_004061 | Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum), complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 4 | 0 |
1. NC_004061
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
18622 : 29500
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_004061|18622:29500|DBSCAN-SWA AATGGGCGCTAAAGATGTAAAATTTGGTAATGAAGCTCGAATTAAAATGCTTCGTGGAGTAAATGTATTAGCAGATGCAGTTAAAGTAACTTTAGGGCCAAAAGGTAGAAATGTAGTATTAGATAAATCTTTTGGAGCACCTAGTATTACTAAAGACGGAGTATCAGTAGCTCGTGAAATTGAACTAGAAGATAAGTTCGAAAATATGGGAGCTCAAATGGTAAAAGAAGTTGCATCAAAAGCAAATGATGCAGCAGGTGATGGTACAACAACAGCTACATTATTGGCACAATCTATAGTGAATGAAGGCTTAAAAGCTGTAGCAGCCGGTATGAATCCTATGGATCTAAAACGTGGAATTGATAAAGCCGTAATTAGCGCTGTTGAAGAATTAAAAAATTTATCTGTACCGTGTTCAGATTCTAAAGCTATTACTCAAGTTGGTACTATTTCTGCAAATGCAGATGAAAAAGTTGGTGCTTTAATTGCAGAAGCAATGGAAAAAGTTGGCAACGACGGAGTTATTACAGTAGAAGAAGGGACAGGTCTTCAAAATGAACTTGAAGTTGTAAAAGGTATGCAGTTTGATAGAGGTTATCTATCTCCTTATTTTATTAATAAACCAGAAACAGGTATTGTTGAATTAGAAAATCCGTATATTTTAATGGCTGATAAAAAAATTTCTAATGTTCGTGAAATGTTACCAATATTAGAATCCGTTGCAAAGTCTGGAAAACCATTATTAATAATTTCAGAAGATTTAGAAGGAGAAGCACTAGCTACTCTAGTAGTAAATTCTATGCGAGGAATTGTTAAAGTTGCAGCTGTTAAAGCGCCTGGATTTGGTGATCGACGTAAAGCAATGTTACAAGATATTTCTATTTTAACGGGTGGTTCTGTAATATCTGAAGAATTAGCTATGGATTTAGAAAAATCTACCTTAGAAGATTTAGGACAAGCAAAAAGAGTTGTAATTAACAAAGATACTACAACTATTATCGGTGGTTCTGGAGAAAAACAAGCTATTCAAAGTCGTATTGGTCAAATTCGTCAAGAAATTCAAGAAGCTACTTCTGATTATGATAAAGAAAAATTAAATGAACGTTTAGCTAAGTTATCTGGCGGTGTTGCAGTACTTAAAGTAGGTGCAGCTACAGAAGTAGAAATGAAAGAGAAGAAAGCTCGTGTAGAAGATGCCTTACATGCTACTCGTGCTGCTGTAGAAGAAGGTGTTGTTGCAGGTGGAGGTGTTGCTTTAGTTCGTGTAGCTGGAAAAATATCTAATCTACGTGGTCACAACGAAGATCAAAATGTTGGTATTAGAGTAGCTCTTCGTGCCATGGAAGCTCCATTGCGTCAAATTGTTTCAAACTCTGGTGAAGAACCTTCCGTAGTTACTAATAATGTGAAAGATGGAAAGGGTAATTATGGTTATAACGCTGCTACTGACGAATATGGCGACATGATTGATTTTGGTATATTAGATCCTACTAAAGTTACTAGATCAGCTTTACAATATGCAGCTTCTGTTGCTGGTTTAATGATTACAACAGAATGTATGGTAACAGATTTACCAAGAGAAGATAAATCTTCTGATGTCGCTTCATCTCCTGCTGGTGGAATGGGTGGTATGGGCGGAATGATGTAAAAATTTTTAGTTAATACTTTTTTAAATTAATTTAAAGATATCTTTCCTCAGATATATTTGTCTGAGGAAAGATTTTAATTTTTTTATTAAGAATAAAAAAATTAAAATTAACTATTTATACTAAATGATAATTAACTTGTTATCTTTCGATCCATTATCAAAAACTAATCTCGGTACTAAAAAACCTGATATCATTTTCATTAAATCTGATATGATAGATTTAGCTTTTTTATTTGAAACTAAAAAATGTGACGTTCCTTTAACTTTATCTAAAATATGTAAATAATATGGAATAATATTATTTTCACATAAACGACTGCTCAGTTCTGCTAAAATAATAGCATTATCGTTTATGTTTTTTAGTAAAACACTTTGATTAAGTAAAATAACGTTAGATTTTTTTAATTTCAATAGACTATCGCTTAATTGTTCATTAATTTCTTGAGGATGATTAATATGAGTAACAATAATGATTTTTAAAACAGAATTTGAAAAAATTTGACAGAGATCAGAAGTTATTCGATTTGGTATTACAATAGGTAGTCTGGTATGAATTCTTAATCTTTTTATGTGTTTTATTTTAGATAAAGATGTAATAAGCCATAGTAATTCATGATCTTTTGCCATTAACGGATCTCCTCCTGACAAAATGACTTCATTTAACTCTATGTTTTGACTAATATAATGAAGTATCTGAATCCAGTTTTTTTTATTCCCTTTATTTTTTTCATATGGAAAATGTTTTCTAAAACAATATCTACAATTAATAGCACAATTTGTTTTTAATATCCATAATACTCTATCTTTATATTTATGTAATAGTCCTGGTAAAACAATGTCTTTTTTTTCTTTTACAGGATCTTCGTTAAATTGTAAATTATTTAAAAATTCTTGATTTTTTGTAATAACTTGTAATAATAATGGATCTTTAGGGTCGTTTTTTTTCATTCTTGATGCAAAAGAATAAGGAACACGAAATGGAAAAACTTTTTTTGGTTTAGAATCGTAATATTTTGGATACTTTTCTAAATGAAGAAATTTTAACAGTTTTTTTGGTTCAACAATAGAATTTGAAATTTCATATAACCATGAATCTTTTTCTCTATTTAATTTTTTTGTGTTGTAATGTTTCATAAATTTATTAAAAGTAGAGGTTTTTATGAGAGTATATCATAGTAATAACTTTCGTTCAGGTCGTAAAATTATTTTTGAAAAAGAACCTTGTTTAATAGAGTCTAGTGAATTTGTTAAACCTGGAAAAGGTCAATCTTTTGTTCGTGTAAAATTAAGAAAATTGTTAACAAAGCAATTAATAGAAAAAACATTTAAATCTACAGATTCTTTAGAAATAGCTGATGTTTCAGAATATACATTATCTTATTTATATAACGATGGTCATTTTTGGTATTTTATTAATAATAATTTTGAAGAATTATCAGTAGATAAAAAAATTGTTGGTGTCAATAAAAAGTGGTTATCAGAACAAGATACATGTGTTATTACTTTTTGGAATAATCAAGCAATTTCTATTACACCTAACATTTTTGTGGAACTTAAAGTGATAGATACAGAGATAGCATTAAAGAGTGATACAATAAACACTACTACTAAATTAGCAACATTAAGTACAGGTGCAATCCTAAAAGTTCCTTTATTTATACAAATTGGATCATTAATTAAAGTAGACACTAGATCTGGTGAATATGTGTCTAGAATTAAATAAAAAAATTATTTATTTCTGATTATTAATATTCATCCCCCCTTACGTATTGTCTATAGCTATCCCATTCAAAAGTTAACCATAGACTATTACCTAAACGCATTCTATCAATTACTCTTTCTCCTAATAAATTTTTCATACCTCTGTGATCTAAATTAGATAACATCCCAGTAGAACGCTTAGAAGATGATCTCCTATCAACTATTTGATTGATAATTACCTTCTCATAACGTGATTCAGTTTGCATACCAATTTCATCAATCATTAACAAATCAACACTACTAAGATTATGTAATAAATTTTCTTCAGTGATATTACTAGTACCACTAAATGTACCTTTCATATTAGACATTAAATCTGCTACTGTTACAATTAAAATACTTTTTCCATGTAAAATTAAATAATTACCTATAGCTGATGCTAAATGATTTTTTCCAGTTCCTGGTCTTCCTGAAAAAATAAAACTTGCAATGTTTTCATTAAATTCTTCAGCATAACGTTTTGCTGCTTTCAGTACCTTTCTTTGTCCATCATGTTCAATTTTATAGTTTTCAAAAGAACAATTCATATATAATTCACGTATTCCTGATCTTCCTAAAACGCGTTGCATTTTCATAGCTTTGTTTTCACGTAATATAGATTCTGAAGATAGCCTACCTTGTTCTTGATTCCAAGCTAATAAATCTTGATCACTTTCAAATTTTGGTTTTACATTACTAGGCATAAGACGTTGAAGGCGTTTAAAAAATTCATTATAAAATGTCATTACTTGCCTCGAAATCCATCAGGTGTTTTTTGATCAGGTACTGGTATATAAGTAATATCTTTTTTTTGTTGTATTGCATTATTCATAGATCGACTTCGTTCTAAACTTCTAGCTAATTTCTGTTGCCATTGTATATGATGAAAAAATAAACCTTCTGCTTCCCAATAGGAAATAAAGGAAGCAAGTTCATATTTTGAAACTTCTTCGTTTAATGATATTCCCCATAATGCAGCTTTTTGTATAAAATCTTTGTCGGGAATCCAATTAGTATGCATTGGAAACTTTTCTATGATTTTTTTTTCTTTTTTTGTTATTTTACTTTTTACAAAATATTCTTTAATATCAAATAATTTTTTTAAAGCTTTTGGCTGTATTACATAAAATACAGTTTTTTTGTTTTTTGATATAGATATAATTTCATTTTTTTCTTTTTCTATAATTTGAATTGGATTTTTGCAAAATAAGTCAAGAGTTATTTTTTTTGAAACTAAAATTTTCATGAATATTTGATCCTATTTGCTTTTATTACAATGACTTTTATTTTTTAAATTTTAAAAAAGTAAAGATAACATGCTATTCTATTTGTAGTTTTCTTCTTATATAAAGTCCAATTTTTAGATATAAAAAAAGAATTTGTATTTTCTTTTTCTATATAAATCAATGATTTTTTTCTCACCCACTGTTTTTGTTCTAATAAAAAAAGAGTTTGGTCAACTAATTTTTGATTATATGGTGGATCTATAAATATTATATCATACGGTTTTTTTTTTTTTTAAGCCAATCAAGAGTGTTAGTATGTATAATTTCTGAATTAGATATATTTAATCTTGTTATATTATTTTTTAATGAAAATATTGTTTTCTTTTCTATTTCCAATAAGGTTACAAATTTTGCATTTCTAGATATAGCTTCTATTCCTAATGCACCGCTTCCTGCAAAACAATCTAAACAATGAGCATTTTCAATATATGCAGATAACCAATTAAAAAGTGTTTCTCGTATTCGATTTGTCGTTGGTCTTATATTTACATTATTTGTAATTAATATTTTTTTTCCCTTTAATTTTCCAGAAATAATACGAATTTTTCCGTTTTTTTTTGCAAAAGAATTGTGCATTTTATTAGATTTTCTTATTTTTTTAATATAATTTATTTTATTATTAAATATAATTTAAATAAATATTTAATTTCTAGTTTTTTAAGTTATAAATAAAATAATTATTATTTGTTTAAATTAGGAGTAACAAGATGAATTTTGATAAAAAAAACAGTTTTTTTTCTTGGATAAATTCTAAGATAAAAAAAAATAATAAAAAAGAAAAAAAAGAAAATATACTGTTAAAGAAAGAAAAAGAAGGTATTCATACAATACAAAATATTGACAATAAAAAAATAGATTTTCTTTTTAAATTGAAAAATAGTTTAAATAAAACTAAACAATTTTTTGGTGACAGCATTAGTCGTATTTTTTTATCAAAAAAAATAGATGATGCTTTTTTTGAGGAATTAGAAGACACGATGCTTCTTTCTGATATTGGTGTTCATACTACAGATCAGATTATCAGTAAATTAATTAATGATGCAACACATAAAGAATTAAAAAATCCTGAAAAAGTTTATTTTCTCTTAAAAGAACACATGTATTCTATTTTAAATAGAGTAGAAAAACCTTTAAAAATATCTAATCATACCCCTTTTGTTATTTTGGTAGTAGGGATAAATGGAACTGGAAAAACAACAACAGTTTCTAAATTAGCAAAAAAATATAAATTAGCAGGAAAATCTGTAATGTTAGCAGCAGCAGATACATTTCGTGCTGCTGGTATAGAACAGTTGCAAATTTTGGGAAAACGTAACAATATTCCTGTTATATCTCAATCTTCTGGTTCAGATCCAGCTTCAGTGGCTTTTGATGCAGTAAAATCTGCTATATCAAAAAAAATAGATGTTCTAATTATTGATACAGCTGGAAGATTACACAATAAATTACATTTGTTAGAAGAATTAAAAAAGATGGTTAGAGTTATTAAAAAATTAAATTTATCTGCTCCACATGAAATTATGTTGATTATTGATGCTTGTAATGGTCAAAATACTATTAAGCAAACAGAAATGTTTCATAAAGCAATAAACTTAACTGGATTAGTTATTACTAAACTAGATGGAACAGCAAAAGGAGGAGTTATTTTTTCTTTAGCTAATCAATTTTTAATTCCTATTCGTTATATTGGTATTGGTGAAAAAACAACAGATTTAGTTGTTTTTAATAGTAATGATTTTATTAAATCTATTTTTGTGAAATAGTAAACTGAAAAATTGTTTATTTTCAAGTGACAGTTTAATTTTTTCATAATTAGTATTTTTATAAATTTTTGATTTTAATTTTTAATTAAAGTATGATTAAATCATCCCATATATTTATAATTCATTAAATATATTTTCTTAATACGGGAATTAAGATGACCAATAAAGTACAGATTTTATCTGTAACAGCACTAGGTAATTTAGATGCTTATATTCGAATAGCTAATCTATGGCCAATGTTGTCGATTAAAGAAGAAAAATTATTAACTAAACGTTTACGCTATCACGATGATTTAGATGCTGCAAAAACTTTAATTCTTTCTCATCTTCGTTTTGTTATTCATATTTCACGTAATTATTCGGGATACGGTTTACTCCAAGCTGATTTAATACAGGAAGGTAATATAGGTTTAATGAAAGCAGTACGTAGATTCAATCCAGACATAGGAGTACGTCTTGTTTCTTTTGCTGTACATTGGATTAAATCAGAAATACATGAGTATGTATTGCGTAATTGGCGAATTGTAAAAGTAGCAACAACTAAGTCTCAAAGAAAATTATTTTTTAATTTAAGAAAAAACAAAAAAAGATTAGGTTGGTTTAATCAAGAAGAAATTGAAATAGTTGCTCGAGAATTAGGTGTAAGCAGTGAAGATGTCAGAGAGATGGAGTCTAGAATGTCAGCTCAAGATATAACTTTTAATCCTTTTCCAGAAGAAGATTTAAAAGATGGAAAAATTAATGGAAATATGTTTTATTTACAAGATAAAACATCTAATTTTGCAAATGGATTAGAACAAGATAATTGGAATAAACATACTACAAGCAAACTAAGTAATGCTTTGTTAAGATTAGATGAGCGAAGTCGAAATATTATTCGTGCACGTTGGTTAGATAAGAAGGAAAAAAACACTTTGCAAAAAATTGCAAATAATTATGGAATATCTGCCGAGCGTGTTAGACAATTAGAAAAAAATGCTATGAAAAAATTAAAAATAGCGATAGAAAATTAATTTTATAATAGTATCAAGTTTTAAAAATTAATAATCTTAAAATTAAGATAATGATCTACATAGAGTATGAGATTAAGTTTTTAAAATTGATCGCTCATACTCTTTTTTTTGATAAAAAAGTTATGTTTGTTAAAGATAAAAATAAAAAAAATTTTATTCTACTGTAACTGATTTTGCAAGATGTCTTGGTTGATCAATATTTTTTCCTTTACTCAATGCAATATAATAAGCAAGCAATTGCAATGGAATTATATATAAAATAGGTGCTATTATTTCTTCTACGTAAGGAATTTTTATAATAGTCATGTTTTTTTCTAAATCAATTTCTTGATCTGAAAAAACGTAAATTATACCACCTCTCGCGCATATCTCTTTAATATTTTTTTTTGTTTTTTCAAGTAATGAATTTTTTGGTGCTGTAATAATAACTGGTATATTTTTATCAATTAATGCAAGAGGACCGTGCTTCAATTCTCCAGAAGGATAAGCTTCAGCATGAATATAAGAAATTTCTTTTAATTTTAAAGCTCCTTCCATAGCAATAGGATATTGATCTCCTCGTCCGAGAAATAATATATTTTTTTTGTTACATAATTGATTTGCAAGAGTTTTAATTAGAGTGTTTTTTTTTAAAATTGCTTCTACTTTAGACGGTAGAAGACTTAGTATTTGTGCAATTTTTTTTTCAATATTATTTTTTTGTTTTTTTAATTTTGTTATTTTTGCTATTAACATTAGTAAAACAGTTAACTGTGTAGTAAAAGATTTTGTTGAAGCTACTCCTATTTCTATTCCTGCTTTAGTTAATAAATAACAATCAGATTCTTGAACTAAAGATGAACCTTTCATATTGCATATAGTTAAACTTCCTAGATAACCTAGTTTTTTTGAAATTCTAAGCGCTGCTAATGTGTCTGCTGTTTCACCAGATTGTGATAAGGTAATAAAAACACTTTTTTTTCTAACTGCTAATTTTCGTGAAGAAAATTCAGAAGCTATTTCAACATCACATGGAATGTTAGCAAGTGATTCAAACCAATATCTAGAAACCATTGCAGCATGATAAGATGTACCACATGCTACTATTTGAATATGTTCTGCATTTAAAAAAAATTTTTTTTCTCTATCTCCTAATTCGGAAAAATTAATTGTGTCTTTTTTTATACGATTATTTAATGTATTTTGAATTGAAATAGGTTGTTCATATATTTCTTTTTCCATATAATGTTTATACTTACCTTTATTTATTGATTTATATTTTACATTAGATGTAATTTCTTTTCTTTTAATTATAAGATTATTTTTATTAAAAATATTTATTTTTTTGGTTTCAACAATAGCAGTATCTCCTTCTTCTAAATATATAAAACGTTTAGTGATATTTAATAATGCAATTTGATCTGAAGCTATAAAGTTTTCTTTGATACCTAATCCAATAACTAAAGGACTTCCAGAGCGAACGGCTATTAATCTTGATGAATTGTAGGCATCCATAACAACCATACTATAATTTCCGTTTAATTTCATTTTGCTCCTTTGTATAACTTCTACTAGTGATTCTCCTGTTTTAGTTTGTTCCCAATGCAATAAATGTGCGATTACCTCTGTATCTGTATCTGAATAAAATATATAGCCTTTTTTTTCTAAAAAATGTCGTAATTTTGTGTTGTTTTCAATTACTCCGTTATGGACTACTGCAATATGTGAAGATATGTGAGGATGTGTATTTTTTTCTGAAACTTGTCCATGAGTAGCCCATCTAGTGTGAGCAAGACCAATATTACTGAATAATTTTTTTTTCTTAACTTTTTTTAAAAGCTTATTTACTCTTCCTACGCATCGGATCCGAACAATATTTTGGTTTTTATTTATTATAGCTAATCCTGAAGAGTCATATCCACGATATTCTAATTTTTTAATACCTTCGAGAAGAAAATCAATTATGTTACGTTGTGTTACTGCAGCAACAATACCACACATAGAAATATACCTTTTTAATTTTTATTGAATAGTTTCACAATGAAATATATCAATTGTTTAATATTATTGATCAGTTTTTTTTATGATTTTTTGAGGACGTTTCCAGTTTTTTTTTTGTTTTTGTTCTTTATTATTATAAATCAAACATGGTGTATTAACGTCTTGAGTTAAGGTAGTTCCTGCTGCTATCGTCGCATTTTTCGTAATTTTAATGGGTGCAATTAACTTTGTGTTAGCACCTATTAAAACGTTATCACCAATAATAGTTTTGAATTTATTGACACCATCATAATTGCATGTGATACTACCTGCTCCAATATTAACTTGAGAACCAATTTCAGAATTTCCAAAATAACTTAGGTGTTTAATCTTAGATTCTTTTTTTATGATACTATCCTTAATTTCAACAAAATTACCTACATGAATTTGATCATCTAATACAGTTTTAGGTCGTAAATGCGCAAAAGGACCTATAATACATTTTTTGCCTATTTTGACGTTTTCTATAATTGTATATTCTTTAATTTCAGTTTGATCGTCAATAAAGCTATTTTTAATCACAGATCCAACTCCAATTTTGATATTATTTCCTAAAATTATATTTCCTTCTAATATAACACCAGTATCGATTTCTATATTTTTTCCATGTTTTAATATTCCTCTTAAAATAAAATGATTTGGATCTTTTAACGTTACACCTGAAAGAAGTAAATCATTAACCTGTTTTTTTCGAAAAATTTTTTCTAAAATAGATAATTGTAGTTTATTATTTACACCTAATATTTCTTTACAGTTTAAAACTTGTACTGTTTTAATAGTACTGTTTTCTAAATTAGCAAAATGGACAATATCGGTTGCATAAAATTCTTTTTTAATATTTTTATTATTAATTTGATTTAGCCATCTTTTTAGATCTTTTCCATTTGCTATGAAGGTTCCAGAATATACTTCTTTAATTTTTTTTTCGTGAAAATTAGCATCTTGTTCTTCTATTATTTTAATAACTTTCCCATTTTTTTTAAAGACTCGTCCGTATCCATCAGGATTTTTAACGTATGCAGTCAATAAGCTAATATCAGATTGTTTTTTAGAGGTAAATAATTTTTTTATTGATTCAATTGAAATATATGGCATATCTCCATAAAGAACTACTATATCGTCTTTATCTGAAAATTTTTTAGATGCTTTTAGTATAGCATCCCCTGTTCCCTTTTGTTCTTTTTGAATAACCCAATCTATAGAAGTGTCACTAATTTTAGATTTTATTTCTTTTTCTTTATTGTTATAAACTAATATAATTTTTTTAGGTTTAACAGATTTTGCTATATTTATAACATGTTCTAAAATTGTTTTTCCACCTAATTTATGTAATACCTTAGGATAGCTAGATTGCATTCTTGTTCCTTTTCCAGCTGCAAGTATTACTACATTTATTTCTTTTTTTAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_004061|18622:29500|21428_21992_+|WP_011053559.1|DBSCAN-SWA MRVYHSNNFRSGRKIIFEKEPCLIESSEFVKPGKGQSFVRVKLRKLLTKQLIEKTFKSTDSLEIADVSEYTLSYLYNDGHFWYFINNNFEELSVDKKIVGVNKKWLSEQDTCVITFWNNQAISITPNIFVELKVIDTEIALKSDTINTTTKLATLSTGAILKVPLFIQIGSLIKVDTRSGEYVSRIK >NC_004061|18622:29500|28114_29500_-|WP_011053565.1|DBSCAN-SWA MLKKEINVVILAAGKGTRMQSSYPKVLHKLGGKTILEHVINIAKSVKPKKIILVYNNKEKEIKSKISDTSIDWVIQKEQKGTGDAILKASKKFSDKDDIVVLYGDMPYISIESIKKLFTSKKQSDISLLTAYVKNPDGYGRVFKKNGKVIKIIEEQDANFHEKKIKEVYSGTFIANGKDLKRWLNQINNKNIKKEFYATDIVHFANLENSTIKTVQVLNCKEILGVNNKLQLSILEKIFRKKQVNDLLLSGVTLKDPNHFILRGILKHGKNIEIDTGVILEGNIILGNNIKIGVGSVIKNSFIDDQTEIKEYTIIENVKIGKKCIIGPFAHLRPKTVLDDQIHVGNFVEIKDSIIKKESKIKHLSYFGNSEIGSQVNIGAGSITCNYDGVNKFKTIIGDNVLIGANTKLIAPIKITKNATIAAGTTLTQDVNTPCLIYNNKEQKQKKNWKRPQKIIKKTDQ >NC_004061|18622:29500|20389_21403_-|WP_011053558.1|DBSCAN-SWA MKHYNTKKLNREKDSWLYEISNSIVEPKKLLKFLHLEKYPKYYDSKPKKVFPFRVPYSFASRMKKNDPKDPLLLQVITKNQEFLNNLQFNEDPVKEKKDIVLPGLLHKYKDRVLWILKTNCAINCRYCFRKHFPYEKNKGNKKNWIQILHYISQNIELNEVILSGGDPLMAKDHELLWLITSLSKIKHIKRLRIHTRLPIVIPNRITSDLCQIFSNSVLKIIIVTHINHPQEINEQLSDSLLKLKKSNVILLNQSVLLKNINDNAIILAELSSRLCENNIIPYYLHILDKVKGTSHFLVSNKKAKSIISDLMKMISGFLVPRLVFDNGSKDNKLIII >NC_004061|18622:29500|24002_25058_+|WP_011053562.1|DBSCAN-SWA MNFDKKNSFFSWINSKIKKNNKKEKKENILLKKEKEGIHTIQNIDNKKIDFLFKLKNSLNKTKQFFGDSISRIFLSKKIDDAFFEELEDTMLLSDIGVHTTDQIISKLINDATHKELKNPEKVYFLLKEHMYSILNRVEKPLKISNHTPFVILVVGINGTGKTTTVSKLAKKYKLAGKSVMLAAADTFRAAGIEQLQILGKRNNIPVISQSSGSDPASVAFDAVKSAISKKIDVLIIDTAGRLHNKLHLLEELKKMVRVIKKLNLSAPHEIMLIIDACNGQNTIKQTEMFHKAINLTGLVITKLDGTAKGGVIFSLANQFLIPIRYIGIGEKTTDLVVFNSNDFIKSIFVK >NC_004061|18622:29500|25213_26071_+|WP_011053563.1|DBSCAN-SWA MTNKVQILSVTALGNLDAYIRIANLWPMLSIKEEKLLTKRLRYHDDLDAAKTLILSHLRFVIHISRNYSGYGLLQADLIQEGNIGLMKAVRRFNPDIGVRLVSFAVHWIKSEIHEYVLRNWRIVKVATTKSQRKLFFNLRKNKKRLGWFNQEEIEIVARELGVSSEDVREMESRMSAQDITFNPFPEEDLKDGKINGNMFYLQDKTSNFANGLEQDNWNKHTTSKLSNALLRLDERSRNIIRARWLDKKEKNTLQKIANNYGISAERVRQLEKNAMKKLKIAIEN >NC_004061|18622:29500|18622_20269_+|WP_011053557.1|DBSCAN-SWA MGAKDVKFGNEARIKMLRGVNVLADAVKVTLGPKGRNVVLDKSFGAPSITKDGVSVAREIELEDKFENMGAQMVKEVASKANDAAGDGTTTATLLAQSIVNEGLKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVISAVEELKNLSVPCSDSKAITQVGTISANADEKVGALIAEAMEKVGNDGVITVEEGTGLQNELEVVKGMQFDRGYLSPYFINKPETGIVELENPYILMADKKISNVREMLPILESVAKSGKPLLIISEDLEGEALATLVVNSMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDISILTGGSVISEELAMDLEKSTLEDLGQAKRVVINKDTTTIIGGSGEKQAIQSRIGQIRQEIQEATSDYDKEKLNERLAKLSGGVAVLKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGVVAGGGVALVRVAGKISNLRGHNEDQNVGIRVALRAMEAPLRQIVSNSGEEPSVVTNNVKDGKGNYGYNAATDEYGDMIDFGILDPTKVTRSALQYAASVAGLMITTECMVTDLPREDKSSDVASSPAGGMGGMGGMM >NC_004061|18622:29500|26224_28051_-|WP_011053564.1|DBSCAN-SWA MCGIVAAVTQRNIIDFLLEGIKKLEYRGYDSSGLAIINKNQNIVRIRCVGRVNKLLKKVKKKKLFSNIGLAHTRWATHGQVSEKNTHPHISSHIAVVHNGVIENNTKLRHFLEKKGYIFYSDTDTEVIAHLLHWEQTKTGESLVEVIQRSKMKLNGNYSMVVMDAYNSSRLIAVRSGSPLVIGLGIKENFIASDQIALLNITKRFIYLEEGDTAIVETKKINIFNKNNLIIKRKEITSNVKYKSINKGKYKHYMEKEIYEQPISIQNTLNNRIKKDTINFSELGDREKKFFLNAEHIQIVACGTSYHAAMVSRYWFESLANIPCDVEIASEFSSRKLAVRKKSVFITLSQSGETADTLAALRISKKLGYLGSLTICNMKGSSLVQESDCYLLTKAGIEIGVASTKSFTTQLTVLLMLIAKITKLKKQKNNIEKKIAQILSLLPSKVEAILKKNTLIKTLANQLCNKKNILFLGRGDQYPIAMEGALKLKEISYIHAEAYPSGELKHGPLALIDKNIPVIITAPKNSLLEKTKKNIKEICARGGIIYVFSDQEIDLEKNMTIIKIPYVEEIIAPILYIIPLQLLAYYIALSKGKNIDQPRHLAKSVTVE >NC_004061|18622:29500|22014_22755_-|WP_011053560.1|DBSCAN-SWA MTFYNEFFKRLQRLMPSNVKPKFESDQDLLAWNQEQGRLSSESILRENKAMKMQRVLGRSGIRELYMNCSFENYKIEHDGQRKVLKAAKRYAEEFNENIASFIFSGRPGTGKNHLASAIGNYLILHGKSILIVTVADLMSNMKGTFSGTSNITEENLLHNLSSVDLLMIDEIGMQTESRYEKVIINQIVDRRSSSKRSTGMLSNLDHRGMKNLLGERVIDRMRLGNSLWLTFEWDSYRQYVRGDEY >NC_004061|18622:29500|22754_23255_-|WP_011053561.1|DBSCAN-SWA MKILVSKKITLDLFCKNPIQIIEKEKNEIISISKNKKTVFYVIQPKALKKLFDIKEYFVKSKITKKEKKIIEKFPMHTNWIPDKDFIQKAALWGISLNEEVSKYELASFISYWEAEGLFFHHIQWQQKLARSLERSRSMNNAIQQKKDITYIPVPDQKTPDGFRGK |
9 | Salmonella_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
59047 : 67683
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_004061|59047:67683|DBSCAN-SWA GCTAATCGTCTAAAAAACTACGTAGTACCTCTGATCTGCTTGGATGACGAAGTTTTCTTAATGCTTTTGCTTCTATTTGTCTTATTCTTTCTCGAGTTACATCAAATTGCTTTCCGACTTCTTCTAAAGTATGATCAGTATTCATGTCAATTCCAAAACGCATGCGAAGTACCTTTGCTTCACGAGCTGTAAGACCTGATAAAACATCATGTGTTGCTGATCTTAGACTTTCAGATGTAGCTGAATCAAGAGGTAGTTCTAATGTAGTATCTTCTATAAAATCACCTAAATGTGAATCATCATCGTCTCCAATAGGTGTTTCCATAGATATTGGTTCTTTAGCTATTTTTAAAACTTTTCTAATCTTATCTTCAGGAATTAACATTTTTTCAGAAAGTTCTTCTGGAGTTGGTTCACGTCCTATTTCTTGAAGCATTTGTCTAGAAATACGATTAAGTTTATTAATCGTTTCTATCATGTGTACGGGGATTCGAATAGTTCGTGCTTGATCTGCGATAGAACGAGTAATTGCTTGTCTGATCCACCAAGTTGCGTAAGTTGAAAACTTGTATCCTCGACGATATTCAAATTTATCTACTGCTTTCATAAGGCCAATATTACCTTCTTGAATTAAGTCTAAAAACTGAAGTCCTCTGTTAGTATATTTTTTTGCAATAGAAATTACTAATCTTAAATTAGCTTCGACCATTTCTTTTTTTGCTCTTTTTGCTTTTGCTTCTCCAATAGACATTCTTTTGTTAATATCTTTAACTTGCTCGATTGTTAAACCAGTTTCTTTTTCTATTTGTTTTAATTTTTTCATGCTAGAAAAAACTTTTTCTTTGATTTCTTCTAATTTTTTAGACCAAGATTGATTTGAACTTTGTTCTTTTTTAAACCAATTTTGATCAGTTTCTTTTCCTGAAAAAATTTTTAAGAAAATTTTTTTAGGGATTTTGCATTCTTCAATACATAGTTTCATAATTTTTCTTTCTTGTTTTCTAACTCTGTTCATCATATTACGCATGTTATTAACTAAGTGATCAAATTGTTTTGGAACTAACCTAAATTGTTTAAAAATTTCTGAAAGATTATAAATTTCTAACAATGAATCTTGATGATTTCTATTTTTATTTTTAATTGTATTGCTTGTATTAGTATATTGTTTTCTCAATTCTCTAAATTTTTCATTAGCTAGTTCTGGGTCAATGCTATTTTCATCTTCATCTTCGTTTTCATCTTCGTTTTCATCTTCGTTTTCATTACTATCATTTGTTATATTATCTAAAATTTCAGAACCAATGTGAATTGCTGAGGTAGAATGAGAAAAAATTTCTTCTGCATTTGGATCCACAAATCCTGTTATTATATCAGATAATCGTATTTGACCAGTTTTAATTCGATCATATTGTTCTAAAAGATAAGTAATAGCTTCTGGATATTCTGATACGGAAGATTGAACTTGATTAATGCCTTCTTCAATGCGTTTAGCTATATCAATTTCACCCTCTCTTGTTAGTAATTCAACAGTTCCCATTTCTCGCATGTACATGCGAACAGGATCAGTAGTTCTTCCTAATTCAGATTCAACACTTGATAAAACTTGTGTAGCAGCTTCCACTGCATCTTCGTCTGTATCTGTATTTATTTCATTCAAAATTAAATCGTCTGCGTCGGGTGCTTCTTCTACAACTTGAATTCCCATATCATTAATCATCTGAATAATGTCATCGATTTGTTCAGAATCAATAATTTCTTCTGGTAGATGATCATTAACTTCGGCATAGGTTAAATACCCTTGCTCCTTACCATGCGTAACAAGCAGCTTAAGTTGTGACTTTGGGTTATGCTCCATAGGAAAATATCCAAATTTTGTTGATATAATGAATATTAATTGACTTTTTAGTCAATAAATGAATAATAATTTATTTTTTAATTGATATTTAAAATTCTTTTTATATAAAAAAACTATTTTTTTGATAGCTTTTTATTAATAGACCAGATCTCTTTTTTTTCGTCTATTGTTAATCCTTGAATTCTTTCTTTTGCAATTAATTTTTCTTGTCTTTTTTCTAGAATTTTACTATATGTATTTTTTAATAAATCTAAAAACATATTTTGAATTTTTTCTTTAATTATCATATGATCCCATTTAGATAAAATTTTTAAAATATTAATTATTTTACTATATCTGTAAAACTCTAATAATTGACCTGTATTAAAATTGGGATTATCAGAACATGTTTTTAAAATTTCTAAAAAAATAGGAAGTCCTTGTATTTTTTCATTTTCAAATTTTTTTGTTGAAGGTACTAATCTTGCTAAATTAGGATTTTGAATAAGTAAACCTATAAGAGTTCGCATAGGAGTATGTTTAATTTGAAACTGTAAACTTTTCTTTTTTCTTTCTTTTTCGTATAAAAATTTTTCAAATTGATAGTCATCTACAATCCCTATTGTTCTGGCTAATATTTGTCTCAAGTAAATCCTTATTGTATCACTAGATATGCAATTTATTAAAGGTAAAGCACGTACACTAAGGTGAAACTTATCATCATCAGATGACAAGTCAACGTTTTTTAAAATATTTTTAAAAAAAAATTTTGACATAGTAAGAGCGTTGTCAATTCGTAATTGAAATTTTTTTTGGCCTTCTTTTTTTATAATTGTATCAGGATCTTCATTATTAGGTAATATTATAAATTTTATATTTTTTTTGTCAGATATATATGGTAATGCAATTTTTAAAGTCCTCCAAGAGGCATTTCTTCCTGCATCATCACCATCATAACAATATATGACTGTATTAGTATGACGAAAAAGTATTTGTATGTGTTCTTTTGTTATAGATGTGCCTAATGATGACACTACATATTCAATGTTATATTGTGTTAACATGATAACATCTATATATCCTTCTACAACTAGTAGATATTTTGGTTTGGAATGTTTTTTTTTAACTTGATATAATCCATAAATTTGTTTTCCTTTATGGAAAATATCATTTTCATGTGAATTAAGATATTTTGGCAAAATATTATTTGTTATTGAACGTCCTCCAAAACTTATAATTCTTCCATGTTGATCATGTATAGGAAAAACGATACGTCCTTGAAAAGTATCATATATATATCCGTTTTTATTAGTAGAAATTATTTTATAATGTAATAAATCTTTCTCAAAATCTTTTTTTATATTGAATTGTTTAGAAAATAAATCCCATTTATTACTTGAAAATCCAATACAAAAAAAATCAATCATATTTTTATTAATTCCTCTTTCAGTTAAATATTTGTTTGCTGAATTAGTAAAAATAATATTTTTTTGATATAATTTAGACATTTTATCCATTAAAAAGTATAATTTTTGTTTTTTTAGATAGATTTTTTTTTCAATTGTACCTTTTTTATCAAATGGAATCTCAATACTATGAATTGTAGCAAGTTCTTCAATACTTTCTACAAAATTTAAATTGTCGTAGTTGATTAAAAAATCAATTGCATTGCCATGCGCACTGCATCCAAAACAATAATAAAATTGTTTTTCGTAACTTACAGTAAAGGATGGAGTTTTATCATTGTGGAAAGGACAATGAGTTTGATAATTTTTACCATTTTTTTTTAACTTTATTCGTGTCTCTATAAGTTCAACGATATTAGTTCGAAATAATAGTTCATTAATGAAATATTTAGGTATTTTTCCAGACATATATTTTTATATGGTAGAATAAAATTCCGTTCTTAAGTAAAGAACGGTTTTTTAATTTTTTTATTTTTAAGAAATATCTTAGTACATACGAATACGTCTTGCATTTTCTCGTGTAAGCTTTTTTGCAAGACGTTTAATAGCAGAAGCTTTAGCACGTTTTCGTTCAGTAGTGGGTTTCTCGTAAAATTCTCTTCTTCGAATTTCAGCTAAAATACCAGCTTTTTCACAAGATCTTTTAAAACGGCGAAGTGCTACATCAAAAGGTTCATTTTCACGTACTTTTATTATTGGCATTTAGATTTTACCTCTATTATTTATTTTTGATAAGTGTAAAAATTAATAATCAATATTTTTTGAATTATAAGATAGATCCTATCTTAATTAAGATTATTTTGTAAAGTACCATTATCTTTTATTTTAATTTTTTAATTTTTCTTAAAAACTTAGTAAATAAATGATTTTTAATAGTATCTAACTTCAGCAGTGTTAATGATTTTAAATTAATTTTATAGGTGTATGAAAAAAAATGAAAGTTTTAGGTATTGAAACATCCTGTGATGATACTGGTATAGCTATTTATGATGTTTCTAAAGGTTTGTTAATTAATGAATTACATAGTCAAAAAAAAATACATGCTAATTATGGAGGTATTATTCCAGAATTAGCATCTCGTGAACATACAAGGAAAATAATTTTTTTATTAGATAAAATTTTTAAAGAAAAAAATATTATGAAGGAAATTGATCTTATTGCATATACTGCGGGACCTGGTTTAGCTGGTTCTTTATTAGTTGGTGCTACATTTGCATGTTCTTTAGGTTTTTCTTTAAATATTCCTGTTTTACCTGTTAATCATATGGAAGCGCATTTATTATCACCAATGTTAGAGTATAAGTCAATGCAATTTCCATTTATCGCATTGTTAGTTTCCGGAAAACATACACAAATAATCGCTGCTTATGAATTAGGAAAATATGAAATATTAGGAAATTCTTTAGATGATGCAGCAGGTGAAGCTTTTGATAAAGTATCAAAAATGTTAGGATTGAAATATCCGAGTGGACGTGAACTATCTAGTTTAGCTGCTCAGGGAATAAAAAATTATTTTTATTTTCCTCGACCTATGATACATCATTCAAGCTTAAATTTTAGTTTTTCAGGTTTAAAAACTTTTACTTCTAAAGTTATTAGTAATAATACTTTAAATATTCAACAAAAAGCTAATATTGCAAGAGCTTTTGAAGATGCAGTAATTGATGTACTATTAATTAAAACTAAAAAAGCGTTATACAAGAAAGGATGGAAACGTTTAGTTATAGCAGGCGGTGTCAGTGCAAATACTGTATTACGCAAAAGATCGAAAGACATGATGGAAAACGTTTTTCATGGAAAAGTTTTTTATTCTTCATTAAAATTTTGTACAGATAATGGTGCCATGATTGCCTATCTTGGATCTCTACGTTATAAAGAAGCAAGCGTTTCTCAATTGGAGATAATTGTGAAACCAAAATGGTCTATAGATAAGTTATCTTATATTTAATAAATATTAGTGTTTAACAATTTCTTTTTTTTATAAAATTTTTTATTTTTTATTTTGAACATAGAGAATTAAGTCTTTAATAGTTAATATTTTCATTTTTTTAGATTTTGAAAATTTTATAATTTCAGGTGTTCGAGACATTGATCCATCTTTGTTTGTTAGTTCACAAATTACTCCATATGGTTTAAAACCTGCAAGCGATACTATTTCGATAGCTGCTTCTGTATGTCCTGCTCGTGCTAAAATCCCGCCTCCATTTGCTCTAAGAGGAAATACATGTCCTGGTCTATTTAAGTCACTAGGTTGAGCATCATCTGCTGTAGCAGTTTTTATAGTAGTTAATCGATCTTTCGCTGATACACCAGTGGAAACACCTTTTGAGGCTTCTATTGTTACTGTAAATCCAGTACGATAAGTACTAGTATTATGTTTAACCATCATAGGTAAGTTTAATTTTTTACGTTTAGATTCTGTTATACATAAACATACTATACCACTACCATATCTAATTGTTAAAGCCATCTGTTCGACTGTCATTGTTTCAGATGAAAAAACAAGATCTCCCTCATTTTCACGTTTTTCATCATCTAATATAATAATCCCCTCACCTAATTGTAAAGCAGATATAGCTTTTTTAACTCGTTCTATAGGGTTTCCAAATTCAGAAAGCAGTGTTTGATTCATTTTGAAAACCTTCTTAAATTATTAAACAAATAAAAATTCTTGAAAATTGAATAATATTAAATTAAATATTGTAAATTATTTTATTATATATCGAATAAAATTTAAGAGCAATCTAGAAATGTATAGTTTTGATTATTGTATATCTTATTTTATACCTAAGTATTACAAATAATATTTAGATATAAAAGTATTTTAAAAATTTTTTAATTGTTCTTTAATATAAAAAAAATTTAATAAAATTTAATTAAATTTTATTAATTTAAAAAATATATTATTAAATGTTTAAGACTGTATTTAATTGATTGATTGTTAGTGTTTCAGTACCTATCTTTTGTATTACTATACTGGCTCCTACATTTGCGTAGAAGCAAGCTTCTTCTAACGAATATCCTGTAGCTAAAGAAGAAGCTATTATTGAAATTACAGTATCTCCTGCACCTGTTACGTCCGATGCTGTTTTAGATAAAGCTGGAAAATGTATAGGTTGTTTTTCAGGTTGAAATAAAGTCATACCATTTTTCGAACGAGTGACTAATAATGCCGATAGATTTAATTCAGATACTAATTTAATTCCTCGTTGTAATATTTGTTTTTCTTGATGACATTTACCTACTATTTGTTCAAATTCAGAAAGATTTGGTGTTAATAAAGTTGCACCGGAATATTTTTTAAAATCTAATCCCTTTGGATCTATAAGTATAGGAATAGACATTTTTTTTGCTAAAGTGATAATTTTTTTTACATTAACTAATGTGCCTTTTGCATAATCCGAAAGTACTAAAACTTTATAGTACGTTAATGAACTAATAATTTTTTCATATAATAAATTAAATTTTTTTGAAATATATTTTTCTTGAAAATCTAATCTAATTAATTGTTTTTTTTCTGATAAAATTCTAATTTTTGTGATTGTTTTATTTTTTTTTATACTGATTAAATCAGGATAAATTCTGGTATGATTAAGAAGTTTTTTTAATGTTAACCCTTCATAATCCATACCAATAAAACCAATAATTTTAGAATTTCCTCCAATTTCAGCGATATTTTTAGCAACGTTTGCTGCTCCACCTGGTTGTTTTTTTATTTTGTTAATTGATGCAATTGGTAGTGATTCTTCTAATACTACATAGTAATTTTTACTGTACCAGTAGCAATCTAATATAAGATCTCCAACAACAAGAACAAGTGCGTTTTTAAAATTAATTAATTTTTTTTTCATGAAATTCTCTTTAAATTATATGAAATTATTAATTTTTATTTTTAAAAATATATAGTGTCTTAAAAAAATGAGTATTTTTTTAATTATTTTACAAAATTCTAATCTTAAAAATTATTTAATTTTTTTTATATATTATATAAAAAATTATTACAAGATTTTATTTTATAAAATTATAAATAATTATTTAATATATTTTATTTTTTCTATTATAGAATAGAATTTTACTTTTTAGTATGAGAAAATTTTTATGAAAGTATATTTAGTAGGAGGGGCTGTTCGTGACAGTTTATTAAACTTACCTATTAAAGATAGAGATTGGGTAATAGTAGGAGGTACAAAGGAAATATTATTAAAAAAAAATTTTCAACAAGTAGGAAAAGATTTTCCTGTTTTTTTACATCCAGAAACACATGAAGAATATTCATTAGCAAGAAAAGAAAGAAAATCTGGTAGAGGATATACCGGTTTTCATACTGAATTTAGTTCTGATGTTACTCTAGAAGAAGACTTAATTAGACGTGATTTGACAATTAATGCTATTGCTCAAGATGAAAACGGTAATTATATTGATCCTTTTCAAGGTAGAAAAGATCTAAATCTTAGATTATTGCGTCATGTTTCAGAGTCTTTTACGGAAGATCCATTACGTATTTTACGTACAGCAAGGTTTGCAGCTAATTTGATGCATTTAGGTTTTCATATTGATAAAGATACTATGATTTTAATGTGTAAAATGGTAAAAAAAAATGAACTTTTATATTTAACTAAAAATAGAATTTGGAATGAAACTGAAAAAGCTTTTAAAACTCTAAATCCTCATGTTTATTTTCAAATTTTACATGCCTGTAAAGCATTAAATTTTATTTTTCCAGAAATTTTTTTTCTATATGAAAGAAGAACATTTTTTTCTATACTTTTTACAAATTTTTACAGTATTTCTTTTCTTTCAATAGGTTTATCTAAGATATCTACTTTAACTAAAGATGTTTCTATACGATTTTCTTATCTATGCCAATTTTTGTCTGAAAAAATTGATTTTTCTTCTACGAAAGAAAATTATGATGATGATTCTGCTAAACTTGTAAAGAAATTATGTAAGCGTTGTAACATTCCATCACACATTGAAGAATTAGCTGTTTTAAATACTGGTTTTTGTGTATTTTTGAGTTCAATTCATTATCAATCTTCTAGTAACATTATCAAGATGTTTTCAAAAATTGATGCTTGGCGTAAACCAGATCGAATTTATAAATTATCCTTTTTATGTGATTTTAATTTATTTTATCATCAAAATAAAATAGATAATTCTAAGTTAAAAACTGGTTTTTTAAAAAAATGTTTTTTTATTATTAAAGATATTTCTGTTAAAAAAATTTTAAATCAAGGTTTCAAAGGATATCAGATTAAAAATGAATTGAATAAATTAAGAGTTAACAAACTTAAATTTTGGCGTATGAAAAAAAAATGTTTTTTTTTTAAAGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_004061|59047:67683|65252_66197_-|WP_011053594.1|DBSCAN-SWA MKKKLINFKNALVLVVGDLILDCYWYSKNYYVVLEESLPIASINKIKKQPGGAANVAKNIAEIGGNSKIIGFIGMDYEGLTLKKLLNHTRIYPDLISIKKNKTITKIRILSEKKQLIRLDFQEKYISKKFNLLYEKIISSLTYYKVLVLSDYAKGTLVNVKKIITLAKKMSIPILIDPKGLDFKKYSGATLLTPNLSEFEQIVGKCHQEKQILQRGIKLVSELNLSALLVTRSKNGMTLFQPEKQPIHFPALSKTASDVTGAGDTVISIIASSLATGYSLEEACFYANVGASIVIQKIGTETLTINQLNTVLNI >NC_004061|59047:67683|63280_64294_+|WP_011053592.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKVLGIETSCDDTGIAIYDVSKGLLINELHSQKKIHANYGGIIPELASREHTRKIIFLLDKIFKEKNIMKEIDLIAYTAGPGLAGSLLVGATFACSLGFSLNIPVLPVNHMEAHLLSPMLEYKSMQFPFIALLVSGKHTQIIAAYELGKYEILGNSLDDAAGEAFDKVSKMLGLKYPSGRELSSLAAQGIKNYFYFPRPMIHHSSLNFSFSGLKTFTSKVISNNTLNIQQKANIARAFEDAVIDVLLIKTKKALYKKGWKRLVIAGGVSANTVLRKRSKDMMENVFHGKVFYSSLKFCTDNGAMIAYLGSLRYKEASVSQLEIIVKPKWSIDKLSYI >NC_004061|59047:67683|62832_63048_-|WP_011053591.1|DBSCAN-SWA MPIIKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGILAEIRRREFYEKPTTERKRAKASAIKRLAKKLTRENARRIRMY >NC_004061|59047:67683|61014_62754_-|WP_011053590.1|DBSCAN-SWA MSGKIPKYFINELLFRTNIVELIETRIKLKKNGKNYQTHCPFHNDKTPSFTVSYEKQFYYCFGCSAHGNAIDFLINYDNLNFVESIEELATIHSIEIPFDKKGTIEKKIYLKKQKLYFLMDKMSKLYQKNIIFTNSANKYLTERGINKNMIDFFCIGFSSNKWDLFSKQFNIKKDFEKDLLHYKIISTNKNGYIYDTFQGRIVFPIHDQHGRIISFGGRSITNNILPKYLNSHENDIFHKGKQIYGLYQVKKKHSKPKYLLVVEGYIDVIMLTQYNIEYVVSSLGTSITKEHIQILFRHTNTVIYCYDGDDAGRNASWRTLKIALPYISDKKNIKFIILPNNEDPDTIIKKEGQKKFQLRIDNALTMSKFFFKNILKNVDLSSDDDKFHLSVRALPLINCISSDTIRIYLRQILARTIGIVDDYQFEKFLYEKERKKKSLQFQIKHTPMRTLIGLLIQNPNLARLVPSTKKFENEKIQGLPIFLEILKTCSDNPNFNTGQLLEFYRYSKIINILKILSKWDHMIIKEKIQNMFLDLLKNTYSKILEKRQEKLIAKERIQGLTIDEKKEIWSINKKLSKK >NC_004061|59047:67683|64336_64978_-|WP_011053593.1|DBSCAN-SWA MNQTLLSEFGNPIERVKKAISALQLGEGIIILDDEKRENEGDLVFSSETMTVEQMALTIRYGSGIVCLCITESKRKKLNLPMMVKHNTSTYRTGFTVTIEASKGVSTGVSAKDRLTTIKTATADDAQPSDLNRPGHVFPLRANGGGILARAGHTEAAIEIVSLAGFKPYGVICELTNKDGSMSRTPEIIKFSKSKKMKILTIKDLILYVQNKK >NC_004061|59047:67683|66444_67683_+|WP_011053595.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKVYLVGGAVRDSLLNLPIKDRDWVIVGGTKEILLKKNFQQVGKDFPVFLHPETHEEYSLARKERKSGRGYTGFHTEFSSDVTLEEDLIRRDLTINAIAQDENGNYIDPFQGRKDLNLRLLRHVSESFTEDPLRILRTARFAANLMHLGFHIDKDTMILMCKMVKKNELLYLTKNRIWNETEKAFKTLNPHVYFQILHACKALNFIFPEIFFLYERRTFFSILFTNFYSISFLSIGLSKISTLTKDVSIRFSYLCQFLSEKIDFSSTKENYDDDSAKLVKKLCKRCNIPSHIEELAVLNTGFCVFLSSIHYQSSSNIIKMFSKIDAWRKPDRIYKLSFLCDFNLFYHQNKIDNSKLKTGFLKKCFFIIKDISVKKILNQGFKGYQIKNELNKLRVNKLKFWRMKKKCFFFKE >NC_004061|59047:67683|59047_60901_-|WP_011053589.1|DBSCAN-SWA MEHNPKSQLKLLVTHGKEQGYLTYAEVNDHLPEEIIDSEQIDDIIQMINDMGIQVVEEAPDADDLILNEINTDTDEDAVEAATQVLSSVESELGRTTDPVRMYMREMGTVELLTREGEIDIAKRIEEGINQVQSSVSEYPEAITYLLEQYDRIKTGQIRLSDIITGFVDPNAEEIFSHSTSAIHIGSEILDNITNDSNENEDENEDENEDEDENSIDPELANEKFRELRKQYTNTSNTIKNKNRNHQDSLLEIYNLSEIFKQFRLVPKQFDHLVNNMRNMMNRVRKQERKIMKLCIEECKIPKKIFLKIFSGKETDQNWFKKEQSSNQSWSKKLEEIKEKVFSSMKKLKQIEKETGLTIEQVKDINKRMSIGEAKAKRAKKEMVEANLRLVISIAKKYTNRGLQFLDLIQEGNIGLMKAVDKFEYRRGYKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKLNRISRQMLQEIGREPTPEELSEKMLIPEDKIRKVLKIAKEPISMETPIGDDDDSHLGDFIEDTTLELPLDSATSESLRSATHDVLSGLTAREAKVLRMRFGIDMNTDHTLEEVGKQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSEVLRSFLDD |
7 | Vibrio_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_3 |
109557 : 118231
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_004061|109557:118231|DBSCAN-SWA CATGATTATTCCAGCATTTGATTTAATTAATGGCGAAATAGTTCGCTTGTATAAAGGAAATTTTTTTAATCGAACAAAATATGACATAAATTTATATAAACGTTTGAAAGATTATGAAATTAAAGGAGTAAAAAAAATTCATTTGGTAGATTTAGATGGTGCAAAAAATATTAAAGACAGACAAATAAAAGTTTTTAGGGATATTATTTCTTATACAAATATTCCTATACAAATAGGTGGTGGAATAAGAAACGAAGAAGACATTAATATGTTTCTTAATTTAGGAGTTAAGAAAGTTGTAATTGGTTCTTCTGCAATAAAAAACAAAACAAAAGTGAAAAAATGGCTAAAAATATATGGCCCCAATGTTATTATTTTGGCACTAGATATTATTATTAAAAATAATAATAAAGAGATAGCAATACATGGTTGGCAGGAGACAACGAATATAACTTTAGAAGAAATTATTGAGTATTTTTCACCAATTGGTTTAAAACATGTTTTATGTACTGATATATCGAAAGATGGAACGTTATCTGGTCCTAATAATATATTATATAAAGATATTGTGAAAAAATTTAAACATATATCGTTTCAAGCGTCAGGAGGAGTTTCAAGATTAAAAGATCTTCTATCTTTAAAAAAAACAGGTGTTAAAAGTGTTATTATTGGTCGTAGTTTGTTAGAAAATAAGTTTACAATAGAAGAGGCATTAAAATGCTGGCAAAGCGAATAATTGCATGTTTAGATGTTAACAATGGAGTTGTAGTAAAAGGCATTCAATTTAAAAACCATGAAATTGTAGGTGATATTATATCTTTGTCTAAACGTTATACAAAAGAAGGTATAGATGAATTAGTATTTTATGACATAACAGCTTCTACTAATAATAAGCTAGTTGATAGAAGTTGGATAAAGAAAGTAGCAGAAATAATTAATATTCCATTTTGCGTAGCCGGAGGTATTAAAAGTGTAGAAGATGCACAGAATATTCTATCTTTTGGTGCAGATAAAATATCAATTAATTCTTCAGCATTAATAGATCCTGATTTAATAACTAAAATTGCTAATCGTTTTGGTGTACAATGTACAGTTGTTGGCATTGATTCTTGGTTCGACTCAGACAAGAAAAAATACATGGTCCAACAATATACAGGTGACGCTAATCGTACTTATCAAACTGATTGGGAAACAATAGATTGGGTTGAAAAAGTGCAAAAAAAAGGTGCTGGAGAAATTGTTTTAAACATGATGAATCAAGATGGATTACAAAATGGATATGATTTATCACAGTTAAATGAAATAAGAAAAAAATGTAAAGTACCTTTAATTGCATCAGGGGGGGCAGGGTGCGCAGATCATTTTTATCAAGCATTCGATCATGCTAATGTAGACGGTGTTTTAGCTGCTTCCGTTTTTCATAAGAAAATCGTTAACATAAAAGATTTAAAATATTTTTTAATTCAAAAAGGTTTGGAAATTAGAATATGTTAAGTAAAAAAGAAAATTTATTGAAGCTTGATTGGATAAAAACAAATGGTCTAATTCCAGCAATAATACAAGATTTTGCATCTAATTTAGTTTTAATGCATGGATATATGAATAAAGAAGCTTTTTTAAAAACTCAAAAAGAAGGTTTTGTTACTTTTTATTCTCGTACTAAAAAGCGTTTATGGACTAAAGGAGAAGAATCAGGTAACTTACTAAAAGTTATAGATATTGTTACAGATTGTGATTATGATACTATATTAATTATAGTTGAACCTCTTGGAAAAACATGTCATTTAAATAGAAAAAGTTGCTTTTTTTTAAAAGAAAATACATTAAATTTTCTTTCTAAATTAGAAGATCTTATAGAAGATAGAAAAAATTTTAATACAGATAATTCATATACTGCTAGATTATATAAATCTGGTACGAAACGTATTGCACAAAAAGTTGGTGAAGAAGCTATAGAAACAATATTAGCAGCAATGAAAAACGATGGAGATGAGCTTATAAATGAATCTTCAGATTTAATTTATCACTTAATTGTTTTATTGCATGATCAAAATTTAAATTTTAATTTAATTATTGAAAACTTAAAAAAAAGAAAAACAGAAAAATTATAAATTTGTAATATGAAATTTTAATTTTAAGTAAGAGAAAATATTTCTGTAAGTCATTATTTGTTGTTTTTTTAAAAATATTGTTTTGAACAATATTTAACTTATATACACAATATTTCAATTTCAAAAAAATTTCAATAGAACTAAACATATATATTACCTATATATGGATAAGTTCTTCTTTTTTAAATTTAAAAATCAAAAAAAATTATCTAGCAAATATCTTTGATAACAAAGACACAATTGTACTATTAACAATTTCGAATAAATTTTGTATTTTTTTTCAAAAAATATTCTTTTATTGAAAAAATGATAAATTGAAAATAGTTGTAATATCATTTATTGTGTAAGAATATAGAATGAAACATAAATAGAATTTAAAAAATATTTTTTTTGTAAATTATAAGATGTAAAATTGGAGAAAAAAATGTTAAAGCAACAAGTTGGTGTTATAGGAATGGCAGTAATGGGAAGAAATTTAGCATTAAACATTGAAAGTAAGAAGTATACGGTATCTATTTTTAATAGAACTCAATCTGTAACCGAAGAAGTTATCAATAATAACAAAGAAAAAAAAATTTTTCCATATTTTTCTATTAAAGATTTTGTAAATTCATTAAGAAAACCTAGATGTATTTTACTCATGGTAAAATCAGGGCAACCTACAGATGAAACTATTCAATTTATTCTTCCTTATTTAAATAAAGGAGATATATTGATTGATGGTGGAAATACCTTTTATAAAGACTCTATTAGAAGAAGTAATGATTTAATGAAATGTGGCATTAATTTTATCGGAATGGGTGTATCTGGAGGCGAGTTAGGAGCATTAAATGGTCCATCTATTATGCCAGGTGGATCCAGGGAAGCATATGATCTAGTTTCTTCTATGTTAAAGAAAATATCTGCGAAATTTAAAAATGAACCATGTGTTAGTTATATTGGTCCAAATGGCGCTGGTCATTATGTTAAAATGATTCACAATGGTATTGAATATGGTGATATGCAATTAATATCAGAATCATATTTTATATTAAAAAATGTATTGAATATGAAAAATGAGGAATTATCTAATACATTTTCTCAATGGAATAAAGGTGAGTTAAATAGTTATTTAATTGAAATAACAAAAAATATTTTTCTTAAAAAAGAAAAAGATGGTATTCATTATTTAATAGATTCTATATTAGATCACGCAGAAGATAAAGGCACCGGTAAATGGATTAGTCAAGATGCTTTAGAACTTCATGAACCGCTCTCACTCATTACTGAATCTGTTTTCGCAAGATATTTGTCTTCTCTTAAAGATCAACGTCTTATTGCATCAAAAATTTTAAAAGGTCCGATTTTAAAATGTATATCTTCTCAGAATAAAGAACTTTTTGTTGAAGAAGTACGAAGAGCTTTATATTTAGGTAAAATAATTTCCTATGCACAAGGTTTCTCTCAATTAAAAAAAGCTTCAGAAAAATATTCTTGGAATTTACAATATGGTAAAATTGCTAAGATTTTTAGAGCTGGTTGTATTATTCGCGCTGATTTTTTAGAAAGAATAACTGATGCATTTAAAAGTAACAATGTAACTAACTTGTTATTGACACCTTATTTTTCAGAAATATCTAATAAATATGAAAAATCTTTACGTTATATTACCTCATATGCAATAAAATACGGTATTCCTGTTCCTACTTTTGCATCCGCTATATCATATTACGATAATTATCGAACAATGTCTTCGTCTGCAAATTTAATTCAAGCTCAAAGAGATTATTTTGGAGCACATACTTATAGAAGAACTGATAAAAAAGGATATTTTCATACGAATTGGTTAACTAAAAAAGAGCTTTAATTGTTAATTTAAAATTAATTGTAGAACTATTTTTTAGTTTTTTATTATAGAATAGCAGAAGATAATAAAATACATCTCTCTGCTATTAATAAAAATTATTTCTAATTTTTTATAAGATATTTTATGTTTACAACATATATAAATTAATTTTAGGAAAAAAAATGCGTTTATCTGATACAGATATTGAAGAATGGTTAAGTAAAAAAAAATTGGTTATCCAGCCTTATCCTAAAAAACAATTAATTAATGGAATTACCGTTGATATACATCTTGGTAATAAATTTCGTTTTTTTTATGATCACACCACTTCTTGTATTGATTTAAGCGGTTCAAAAGAAAAAATAGCTTTAGATTTAAATAAAATTGTAAGTTGTGAAACTATTTTTTCTAAAAAGGAACCATTTTTTTTAAAACCAGGAGCTTTAGCATTGTTTTCAACTTTAGAAAATATTACCTTACCAAATAATTTAGTTGGTTGGTTAGATGGACGTTCCTCGTTAGCTCGTCTTGGTCTTATGGTTCATGTTACATCACATCGAATTGATCCTGGTTGGCATGGTAATATTGTTTTAGAATTTTTTAATGCAGGAAAATTAACTTTGGTTTTAACTCCTGGAATAAAAATTGCAGCACTGAGTTTTGAATTACTTTCAAAACCAGTTTTACGACCTTATAATTCTCGTAATGAATCTAAATATAAAAGACAAAACGGAGTTGTACCTAGTCGAATTTATGAAGAATAAATACCTTTATATATAGTAATTTTTAAAAATGAAAAAGTTTACGATGAATCATATTTTGTATATGATATTACCTATTTAATTAAGTAAAAAATTATGTCTAATAAATTCAAAAAAATTTTAGTTACTTGTGCATTACCATACGCTAATGGTCCTATTCATATAGGTCATATGCTTGAGCACATTCAAGCAGATATTTGGGTTCGTTATCAAAGAATGAGAAATAATGAAGTTTGGTTTATTTCTTCTGACGATGCACATGGTACAGCTATTATGTTAAAATCTGAAAAATTAGGAATAACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_004061|109557:118231|117604_118231_+|WP_011053640.1|DBSCAN-SWA MFTGIVNGIARVVSINKKKNFHTYTVNFSSILLKNLKIGDSVAHNGCCLTVKYINCPHVVFDIMKITIANTNLGVLNIGDYVNIERSLKYGDEMGGHIISGHIMNTGEISKISKLDKNYILWCKVKDLSLMKYIFYKGFIAIDGISLTINNIIKNEFCVSIIPETLSSTTIGFKKIGQLVNIEIDFYTQIIVDTTKRLIKKDISTLFK >NC_004061|109557:118231|109557_110292_+|WP_011053633.1|DBSCAN-SWA MIIPAFDLINGEIVRLYKGNFFNRTKYDINLYKRLKDYEIKGVKKIHLVDLDGAKNIKDRQIKVFRDIISYTNIPIQIGGGIRNEEDINMFLNLGVKKVVIGSSAIKNKTKVKKWLKIYGPNVIILALDIIIKNNNKEIAIHGWQETTNITLEEIIEYFSPIGLKHVLCTDISKDGTLSGPNNILYKDIVKKFKHISFQASGGVSRLKDLLSLKKTGVKSVIIGRSLLENKFTIEEALKCWQSE >NC_004061|109557:118231|112091_113513_+|WP_011053636.1|DBSCAN-SWA MLKQQVGVIGMAVMGRNLALNIESKKYTVSIFNRTQSVTEEVINNNKEKKIFPYFSIKDFVNSLRKPRCILLMVKSGQPTDETIQFILPYLNKGDILIDGGNTFYKDSIRRSNDLMKCGINFIGMGVSGGELGALNGPSIMPGGSREAYDLVSSMLKKISAKFKNEPCVSYIGPNGAGHYVKMIHNGIEYGDMQLISESYFILKNVLNMKNEELSNTFSQWNKGELNSYLIEITKNIFLKKEKDGIHYLIDSILDHAEDKGTGKWISQDALELHEPLSLITESVFARYLSSLKDQRLIASKILKGPILKCISSQNKELFVEEVRRALYLGKIISYAQGFSQLKKASEKYSWNLQYGKIAKIFRAGCIIRADFLERITDAFKSNNVTNLLLTPYFSEISNKYEKSLRYITSYAIKYGIPVPTFASAISYYDNYRTMSSSANLIQAQRDYFGAHTYRRTDKKGYFHTNWLTKKEL >NC_004061|109557:118231|116021_117359_-|WP_011053639.1|tRNA|DBSCAN-SWA MIEKIINQYQKKLFLIAYSGGIDSTVLLYKMLKIKEKNPQIKIRAIHINHNLHPSSKKWEEHCIKICHKYKIPIITKEIKILLKKNIEETLRIKRYNTIYNYLLNDEILLTGHHLNDQCETLFLSLKRGSGPTGLSGMSIENFLGKKRIVRPFLTKTKKELQKWACENNLESIEDFSNFNIDYDRNFIRHKLIPILEQRWPFFLKNCFRTTVICREETKLKNIFLKEKIQNLINFDESLNIQNFKNINKEVCKALIRYWISLKNIKMPSYKTIECIYNEIICSKKDSNPKIIIDKNEIRRYKTSLYFIKIQKDISNIFLFWHNTDKKLLLPEDLGYLIKNDKGFILPSPKKNELINIRFQLEGKILILGREKRRKIKKIWQEHNIPPWLRNKIPLLFYNNRFISAIGLFVIKEKIINKEKEIQKNWKISWINNVHFNRKNFFLFY >NC_004061|109557:118231|114349_115987_+|WP_011053638.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSNKFKKILVTCALPYANGPIHIGHMLEHIQADIWVRYQRMRNNEVWFISSDDAHGTAIMLKSEKLGITPIKLIKKIKEEHIIDFSNFNISHDNYHSTHCVENLFLLRKIFLSLSEQKLINEKKIFQFYDNTKKMFLPDRFIKGTCPFCSSKNQNGDNCEICGSIYEPTDLVNPISVISNSVPILKNTTHLYFNLPLFTNMLNKWIHSGILEKSVAKKTEEWLKSGLKEWGISRDAPYFGFKIPKFDKKYFYVWLDAPVGYISAFKNFCTKNKKVDFNEFWKKESKCELYHFIGKDIIYFHTLFWPAILEASSYRKPNGIFVHGHLTINGLKLSKSRGFLIKASDWIKCFDSDSLRYYYASKLSNNINDIEINLEDFIQKINSDIVNKLVNLASRNASFIHKYFDGYLADSLGDCNLYQDFIDISKKIANFFENRQFSSVIRECMKLLDLANQYINQREPWKIKQDNFNKLHTICTVGINLFRLVVIFLKPIIPDLAKKTEYFLISDLTWKGIDKPLLSHKIKKFKKLYNRINHDKILQLSLLCK >NC_004061|109557:118231|111043_111667_+|WP_011053635.1|DBSCAN-SWA MLSKKENLLKLDWIKTNGLIPAIIQDFASNLVLMHGYMNKEAFLKTQKEGFVTFYSRTKKRLWTKGEESGNLLKVIDIVTDCDYDTILIIVEPLGKTCHLNRKSCFFLKENTLNFLSKLEDLIEDRKNFNTDNSYTARLYKSGTKRIAQKVGEEAIETILAAMKNDGDELINESSDLIYHLIVLLHDQNLNFNLIIENLKKRKTEKL >NC_004061|109557:118231|110273_111050_+|WP_011053634.1|DBSCAN-SWA MLAKRIIACLDVNNGVVVKGIQFKNHEIVGDIISLSKRYTKEGIDELVFYDITASTNNKLVDRSWIKKVAEIINIPFCVAGGIKSVEDAQNILSFGADKISINSSALIDPDLITKIANRFGVQCTVVGIDSWFDSDKKKYMVQQYTGDANRTYQTDWETIDWVEKVQKKGAGEIVLNMMNQDGLQNGYDLSQLNEIRKKCKVPLIASGGAGCADHFYQAFDHANVDGVLAASVFHKKIVNIKDLKYFLIQKGLEIRIC >NC_004061|109557:118231|113674_114256_+|WP_011053637.1|DBSCAN-SWA MRLSDTDIEEWLSKKKLVIQPYPKKQLINGITVDIHLGNKFRFFYDHTTSCIDLSGSKEKIALDLNKIVSCETIFSKKEPFFLKPGALALFSTLENITLPNNLVGWLDGRSSLARLGLMVHVTSHRIDPGWHGNIVLEFFNAGKLTLVLTPGIKIAALSFELLSKPVLRPYNSRNESKYKRQNGVVPSRIYEE |
8 | Bodo_saltans_virus(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_4 |
385983 : 408936
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_004061|385983:408936|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_004061|385983:408936|396170_397181_+|WP_011053870.1|DBSCAN-SWA MFYYLIRKLLFLIDPEKAHTLVLMYLNSKKIQILRKIFIKPIPLKQIKCMGLTFNNKIGLAAGMDKNGDYIDSLSKIGFGFIEVGTVTPLPQYGNPKPRIFRVPSIEGIINRMGFNNLGIDYLVNNVKKSKFKGIIGINIGKNKDTKIEDAIKDYLICIEKIYFYASYIAINISSPNTINLRKLQYGILFENLLRDIKKKQSEMHSKYSKYVPIVIKISPDLSKKELIHISNKLIHYKIDGVIATNTTLDHSSIPKIKNNKEEGGLSGLPLQKKSNDVISILYKNLKRKIPIIGVGGINSINSAREKIMCGANLIQVYSGLIYHGPNFIREIIRNL >NC_004061|385983:408936|408000_408936_+|WP_011053877.1|DBSCAN-SWA MRNSLYKKNIISISDLNQNELELVLKKSAFLKVKAQPNLLKNKIIASCFFEASTRTRLSFETAVHRLGASIIGFSDGSNISLGKKGETLSDTISVISSYVDAIIIRHPQEGSARLAAQFSNGVPIFNAGDGANQHPTQTLLDLFTIKETQNKLNNLNIAMVGDLKYGRTVHSLTQALAKYKNNQFFFVSPDSLTMPNYINDMLYKKEIHWKRYKNIEEIISEIDILYMTRVQKERLDSTEYASAKSKFVLQTSTLKNARNNLKILHPLPRIDEIDNNVDFTPYAWYFKQAANGIYARQAILSLVLIEKHFE >NC_004061|385983:408936|402180_405063_-|WP_011053874.1|tRNA|DBSCAN-SWA 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>NC_004061|385983:408936|391984_393094_-|WP_011053867.1|DBSCAN-SWA MKNHKSLAILIPMLFAGSTAVNAIEIFNKNGNKLELYGSINPNHNFSNEFLSTKISSKEDNTNAILGLSGKIKITDKLSSYAQIEYKNNFFMPEDLMNKQQPNTVRLGYAGLKYGNLGSIDYGRNYGVIHDAQSLTDHVPYINKKSIFAYNDNYMVGRNHSLLTYRNNNVFGLVDGISFALQYQDEIKNRDLNKGKSSSGWGASLKYESDSGLTAVGSCFTSERMISSNKKDLKNTSVDSYGLGFKYDANNVYVAAFYGSARNLMPYNMHISDSFINETQNIEAIAEYSFDSGFHPSLSYLDSKGQNSNSPKKELDLAKQINISTRYEFNKNVSTYMNYKINLLKENDFISQNQIPTDNTIGAGVVYQF >NC_004061|385983:408936|387087_387726_+|WP_044006053.1|DBSCAN-SWA MIKSKFIVIEGLEGAGKTHACICVQRILKENNIKNVILVRQPGSTPVAEKIRKLIKNNTYIEDFEKETELLLMYAARIQLVKKIIQPALKKGTWVISDRHDLSSLAYQGGGLGIKRKLINKLKYLFLQDFIPDLTIYLDVYPEIGLKRASKRNHLDRIEHRSLTFFKKTRASYLKNIKLDKKIIKINANLNIKIVTQNIKNQILKWLQQKVV >NC_004061|385983:408936|397314_399408_+|WP_011053871.1|DBSCAN-SWA 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18 | Vibrio_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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