CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_007332_1 | 883138-883247 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_007332_1
|
1 spacers
spacers of NC_007332_1
>1.1|883164|58|NC_007332|CRISPRCasFinder GGTAAAAGAACAAGAAAAATCTGAGACTAAAAAGGTAGTTCCTATAAAAAAACCGGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_007332_1
The CRISPR arrays of NC_007332_1 >merge|NC_007332|1|883138-883247|CRISPRCasFinder AAAATTGAAAAAATTGAAATTAAAACGGTAAAAGAACAAGAAAAATCTGAGACTAAAAAGGTAGTTCCTATAAAAAAACCGGAAAAAGTTGAAAAAATTGAAATTAAAAC >NC_007332|1|1|883138-883247|CRISPRCasFinder AAAATTGAAAAAATTGAAATTAAAAC GGTAAAAGAACAAGAAAAATCTGAGACTAAAAAGGTAGTTCCTATAAAAAAACCGGAA AAAGTTGAAAAAATTGAAATTAAAAC
>NC_007332.1|WP_011290432.1|881869_882907_+|aminopeptidase-P-family-protein MNRKYLEKAFFDNHLDVIISFSFQSRLWLTKIAASDGILFIEKDQAFLFVDGRYIEKAEKDAKNCHVFLTTKANLEDFFKKKPYQKIGIESEYLTIEQFDKIKSWFPNADFVKLQAQLFRIIKTEEEIKNIEKAVEISLAAYNKIFPKIKPGMTEKSIDVNLNYQMKLLGAEKESFDSIIATGSNSAMPHWRASETEILDNDLLKIDFGALFNGYCADITRTSYLGQISEKKLEILEIVEKAAEIGRKKVAPGVKACEIDLACRNFITEQGYGKYFIHSTGHGVGIDIHELPVVSSTSQTILEPGMVITVEPGIYIPGLGGARIEDVVLVTENGFRTLSRKSEKI >NC_007332.1|WP_011206510.1|881715_881868_+|50S-ribosomal-protein-L33 MAREGLTLRCTDCKMENYITKKNKKTKPEKIEVKKHCHKCNKHTLHREKK >NC_007332.1|WP_011290431.1|878654_881594_+|AAA-family-ATPase MKLIKIEIEGFKSFAEPVSIKFDGSIVGIIGPNGSGKSNINDAIKWVLGEKSVKQLRGQNMDDVIFAGSKTVMPVNKAMVKLTFLDETREDSAQIFTISRVIKRGQGTNEYFYNDQLVRYKDIRNLAIQAGISKSSLAIISQGTISEIAESSPEQRKQVIEEVAGTAKYKIDKTEALTKLDQTLIAIEKIEIRTKELEKQVKQLEKQAENAKIYLEKSKQLESVEVGLIVSDIKKYQTELDQVQEKLNDLKFQEPKFISEIEANEKIIITNTQKRSEIEAEINTKNREIHRLKEQINTLNLAYAKATQLQEMILSSEISVNFEQKMAALRQKYSLISAQKDNFAKLISQNKLKKLEIEEKLNTFRTQKSEIERNLYSLNSEKIISQTRISELKKSLESMSFLPKGTKIIIENSFLFPGYCGLVSDLIKIFPKYTGAIEAALGPTLKQIVVEQPETAVSAINFLKKNYAGSATFIPLSTLKPRFIPDLYLEHLNSQKGFINLASNLVDFEKKYKILADFLLGGIIVADTIDSANQIANFLNHKNMIVTLDGDVIRTSGIISGGHKIKNDSSFSIQYKIDELTNNLNFFEEKIQEFKVKSNEFEQLITRESVFLQQININLNDLEQKFSNSENELIEIKAQNEGLEESLNQKDDLNLSLNRTLKEKIELENVVLELENQCKILKTEKKQLDNQISELTVLVQELNQKQRKINADLNQNQNYKDKYEFLITNLRNNLSQKYSLTFESAAQKYELEIQEKDAREFVNSLNLEIKALGNVNLDAINDFETTSQRLEKLKKSQNELETARSKILEVISDLDKIIIGKTQEIVDLVNSEFNLVFQNMFGGGSAKIYFSDKNDILNSGIEISAQPPGKTIKNIRLFSGGEKAIIAISLLFSIIKARPIPLCILDEVEAALDESNVIRYVEFLKQLKQKTQFLIITHRHGTMSRVDQLLGITMQKRGVSSIFSVELSKAKDLLKEQLQ >NC_007332.1|WP_011290430.1|876572_878456_+|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MKKKARKFLRLTSLTLAPFSVFTTLISAGCLQKNSLLSEVNYLALGDSLTAGFNEETYRDFQGTLDKDGNLSGQSYPAYFAYYLQKLNKNSLVSYDNLAISGTTTENWLYLLNPTKYPNGKMSDNPLVTNYSGNEKYNEIGSVFGDFNKDSYPGLVEKVKKANLLTMSVGANDPFLAIFNEFKKWASIIKPKSEEAKKLLDPNERANFLAEKGMLLKAEVNKKIEEINTNLDNLIKELKALNPKLSINLIGYKLPNSGFIKILKYLLYTYAKIETDFINEIPEKINKIIRETAIKNKVNYIDVYDKSIWNDSDKNLMAKNFDFHPSIQGYKKIAHQLLLKLTLDQEEKDDSNAEELKNTTNFDDFDENKPTYSKVIDLSVFAKSNKEFLEKLNENKQTSEFIAQKSTFDTDQEAAIKDDKRTFGNIVREIVSLPIFDNFDFRELIPVSNPFVKAIINSYLGKPAGSLIKDIEQLENKVKDYAKPNIKIFDTIIDSFIRKMVAFFAELNTDQEIKEFKMSPQILFLTLRNAILSPFDLTKLKDSATFKILMNLKPEQILTLLGLGKTPSVPKPEKPKDQGSMPQTDTSSQKQESGTSSTDSTKATTENQKPAEQTNSSEQSSTEPKSN >NC_007332.1|WP_011290429.1|875830_876439_+|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MYKRLVQEFFPKLDFENLEKYVNLIEFSNKNFNLTAFSGDILWKEGIFESIFTMNFIVGLVNNKENKKLKILDIGAGSGFPSIPFLITNPEIELTISESMQKRCQFLKDISEKLDLKFNLICKPVQEIDPQKFDIITARAVANLEKLEKITKKIHFPKTLLAFIKGPKVFNEVQNCKNCNYKIIKVNNNINKKIFIAFKQVS >NC_007332.1|WP_044272671.1|874815_875808_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MNIDAKKNIILFGMENSLDLAKKISKITGIPLSGIERIVYADGEVLLKSKETIRNSTVFVVANTSRPVNENIMELLIFIDSLKRGYAQEIIVILSYYGYARQDRKSSGRQPITAKLVANLLEKAGLTKLILVDIHNPSIQGFFDFSVDEIHGQYILANELVGKNKDYVVVSPDHGGAVRARILAEILGKQTNVAVIDKRRTGANKSEVLGLIGDVDGKDCIIIDDIIDTGGTIINAANVVREKGAKSVVLAATHGVFSHGFEKFQENHNIDKVIITDSIDNKKLAKKFPKLLITSLAEFLSKSILACIFSTSITSIYEETKQKLIKKNLN >NC_007332.1|WP_044272669.1|873472_874720_-|TatD-family-hydrolase MYLKIQQFLPRYLELFQKTIKKFSLELNVVTKKGKNKISNFAYYQNFEKNYEFLVVDEHKQADFIFAFFVLSRKGQTFYLNLPFFSQFLDKNWINIIGEFILDFIEENYHFETFYVQISNFDIKINNFFQKFAISFDDNSNTFKFNLVKRYEFIDIHCHPFSEYFQDSKAQVDNWFKKNIGLIFVVGTSWEYLEEIKKIGNYSKKIYKIIGIHPTLVAENDNFSLLENHIDDKVLAIGEVGLDFYYENNPPKDVQIKALLDQIQIAKSKKIPVMLHIRDKSGENQAMKLISEIVTKFSEINFIFHNFSTNYEIFQKLVKKNNCFFSFSGVITFKKSIELRRIIKETPLEKIFTETDVPYLSPEPNRQLWPNVSPQIQWTYQTIANLKNLTKIELSEIIYRNVRKIFKVKNAKTGS >NC_007332.1|WP_020835915.1|872712_873492_-|16S-rRNA-(adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))--dimethyltransferase-RsmA MQKPVPKKHLGQNFLKDRKIAEKIVENIDLKNKEIIEIGCGTGFLTNFLLERAKFVTCYEIDRNLIPILEKKFKNKNLRIINEDFLLAELEFKEKKTIIANLPYYITSKILFKIFANFEKFDKIILMVQNEVADRIVAKPKTPTYSKLSLASQYIADVKKLFVVGPDSFFPKPKVNSAVVLFDFRENLEAKKMEEFFWFTKKCFQFKRKTLYNNLIFFLNKQQIEKIYNFFQFAQNIRPQQLDLVTYIRLADFYFNNIF >NC_007332.1|WP_011284373.1|872136_872571_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTTFVKHQEVKQKWFVIDAESKILGRLAAFVASRLRGKHYPHFTPNVDMGDKIIIINAEKILLTAKKEEQKLYYNHSGYPGGLRVRTAREMRAKKPIALLERAIYGMIPHTKLGDKQRKNLYVYSGSEHPHLGQNPEKLEVK >NC_007332.1|WP_011206502.1|871734_872133_-|30S-ribosomal-protein-S9 MNQPELSYYGTGRRKSSVARVTLKHGNGQFKINNRVAKEYLKSDILIKDALQPLSITNTVSEFNIRVNAHGGGISGQAGAIRLGIARALLKVSADYRPGLKVAGMLTRDARAKERKKFGLRKARRARQFSKR >NC_007332.1|WP_081420855.1|884709_886272_+|LppA-family-lipoprotein MKSKKTKKYIFLLLNPLALLFLSASCSNTAPATTKISKDQKEDKGTIRKEVENPKKSEEKPSTEKSEVSTKKSESSEEKIEENPKNKPVEKKDEIGKQKDEISKPKDENPQTELDKPQAEEDHQVEKIDVKPFNPKEDQKDDDIKLARLKGYLSTLPNTLYVTTSLQNDLPLTIIHSGKGEKKDFGYVNFVKPIQDFNDTEYEAKLDFSDAQQKENKTKNPIENVGLVLSLKDNKKITSSKKIRLLYTEEQENKSHLKAKSLPESFKHIFPSFLAFALLNKEKEVISLPFFNESGYVLNNQNFGAGLKSIFAEFNNSENNSQKNKFGFDVVSAQPDDEKGELKLNFQLWKINETNGDQKEIFPKIESLTFSNLAKNSDNNYEIQLDEATTNTNLNNEDFGLKNAGENLNTSKFKKNEFIKKIIDNIRVNIKAENINNKWLKVSEAKYKNWLIFPQIQYANLDSTKLINNLKLEKQQENKISWTLKLESYLLDNNQILTPDSDFVFGKQKTITIKGEMQLS >NC_007332.1|WP_044272675.1|886721_890363_-|P110/LppT-family-adhesin-N-terminal-domain MNQFDEKEKQHNKAKAILSTGFSVTSIATTVVAVPIGLTIFEKSFSSQVSGGVDKNKVVDLKSDSDQIFSEEDFIRAVENLKLFDKYRHLTARMALGLAREAANAFNFLDTYDYTPITKHSFKISLDISDAFAANKEVKAVVVSAYSQKYQVTYSRLTSLKGWKEEDGFGDDIIDYQINQELSGLSLSSLAPESAHLLASEMAFRLDNDFQAAYKKTGSRAEAFRQALIKNYLGYNLVNRQGLPTMLQKGYVLAPKTIENKNASEEKLVNINENDRARVNKLQKVENLAFKNLSDPNGTLSITFELWDPNGKLVSEYDFKIKGIKKLDFDLKKQEEKVLQKVTEFVEIKPYVQLGLIRDNLSLSEIIYKNDNNPEYLRKILAKLKEHNNNKSVDNNTSTTKFQEEDLKSDPNSNGSEQDSFEKAKENFLSFFGLRSRLIPIPDLPLYYLKVNSINFDKNIEENEKEKLLKNEQVVLKVDFSLKKVVSDIRAPYLVSSQVRSNYPPVLKASLAKIGKGSNSKVVLLDLGNLSSRFKVQLDYSAKQREIINTLLKENPEREKELQAKIESKTFSPIDLNNDDLLAIEFQYEDNPEGDWITLGRMEKLVKEVIQYKKEGKTFLDDEVAKTLYYLDFHHLPQSKKDLEEYKEKHKNKFISEIKPATPASQAKTSQAKNEKEVKPESAQAEASSSNSNDSNSKTTSSSSMMAGTTQTNNSSTETTNSNSTTTSSATTSTTSTTSTTNSTSTTTTSTQAATTSASSAKVKTTKFQEQVKEQEQKQEKAKETNQLSDTKRNKEDSGLGLILWDFLVNSKYKILPGTTWDFHVEPDSFNDRLKITGILKENTSQAKSNPDSKNLTSLTRNLIIKGLMANKYIDYLVQEDPVLLVDYTRRNQIKTEREGQLIWSQLASPQMASPEPEKTKLEITEEGLRVKKGGTKIKEGIKNGSSRGNTNTNSKPNKKLVLLKGSIKNPGTKKEWILVGSGNNNNNKKNGGSNNNSNTQIWITRLGTSVGSLKTEGETVLGISNNNSQGEVLWTTIKSKLENENQSDNNQIQYSPSTHSLTTNSRSNTQQSGRNQIKITNTQRKTTTSPSQNLSQNPDPNQIDVRLGLLVQEKKLHLWWIANDSSDEPEHITIDFAEGTKFNYDDLNYVGGLLKNTTNNTNTQAQDDEGDGYLALKGLGIYEFPDDESIDQAATVEKAERLYKHFMGLFRE >NC_007332.1|WP_011290436.1|890391_894372_-|hypothetical-protein MAKNNKNSLLVTATAIVGVAVFATTVGLVTRIRYKGENPRAELESLVSKVQNVAFKSDVFDNSTTYKQIKALLFDETGKLRPGIDLNKFISFYTAVNSKIQKFEVTFAPNKPFFEFINLIPDDKNQTFTLQFRAKHQLDNNYTAYSSILSKKIAYAQRSQFALADFNANHRKITKSFQTNIQNLRETDFSVDFSSSQTSLASQKIPFLTRVEDFAADINKSGNQEEAISRISKYFPDFQRYIHELKDDPNNVLPFKKGKIFDFSITRRAGTNDFISLSANYEPSFLIKARLTNEAKFELRGLNIEEAEMLEEIKLVPVNQFVVNLETDLKPGQAPEKSQKPQSEQTEIKKTYFAEIDKILSKITMRKLQLSDFKVAPQTSSSQPKQVKASVSAWSNLDQGQENRILVPVSQQSSNPQQQPQQPQPQPQSQPQPKAQTQPKAQTQSSPKAPVQKPATPDPSKSFKIRTKRARDFLKEFNKTFYRSNKLKSQKLEEKINSEYLSNKIGIDLGVLKKYISNNQGIEYTFDIANAKIRDAQDGITSHIEIPVTISLWSSFFGDSDNVLLRSKTETFIIPYFQKETTSESKDQKVGHTQKELDLNQKLIYQLSELPGTSTQASSGSSPQAEQIKEVKLPTLTAFISKQELEALIDGDKNLASQPTSQAVSVSQEAKTTEFQQQEANSTNSSPTSPSPSPSPSSPSPSPASPTSPKNVDENIGVPNPRFEEIKKIISSEFTYKYNFRANEALLDAWVGKQNFPSLKDISQFRSDQRLAKDYKLVNLKSNKFLKEDYDVLAFYANLVQKDPREVLQYLFEIAKANNLIGPEEKLDLNQIEEDGIFRRAKAIKLIDKSSNNQGIYGFSFNNQFLKFHERGWMSTLYLPNEAKTKLADYQNLLSAGISDTKIFSELNKIQPLDLKVQSSDSSDSKSDSSDSSDSKTTPTNQDLLSKLTSLKSQIEAIVKKYETESKKYLATENNNGGGSSGTEQKGSSIPEENKKFILENTAKLDNLADLLLAFYYQAKRLNFASWSQLQDEDLDYQIQFEKEANNTESSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSETDTNKPENAVEYKLTYYYKIYNKTTKKVVYTTPKTIIKLYLASSNIGVKEKQERELMNKLVLSIPSAYSIFYLKQNEWDQVKTTNNGQQMGQTGSSQGFESLEPFKKIQEIVHKNNKDYDLKVVTIRDDAYAENAKIVHLRVVRKEEQKEEQKEKEMEKEKEKEQKEKSSQGQVPQSAFFFQVRLIKDDYQGAEASNQQTNKQEMQMPNMESQNSGSSSSAPAAAAAKAAAR >NC_007332.1|WP_011290437.1|894931_896536_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MRFNRLFSLAKLKFTIIFLVIFIKEAGFLTHIFSYKFIFEYFTEKNPTFNLTWSLILLLMPLAIFIIFTFLKGWIFSYLEMEVRNKLSDIIIKKIQKSNYSDLKYNKNAMLSWFNYDLKLGLNAIENLLNIISPLVSIITGISLMIVLSPQWGWILIVTTLILSLILLIFQGKISNAASKPVMKLSSDSEAFSNYNLGLLNSFKSFFFHNKNEKFKQLFYKSYENLSKDQIKQYKKLTKLNVILTVLFSISIVIVLTELAVLTSFKFYSLAIFLSLLLYSNRFSTDMGNIVLGLFGYKQSSVLLDKILEKKDLTEQKTVLEEPINKIDFENVSFSYKDIKVLENFNFSFEKNKKYLVSAPNGTGKSTLIKLISGVYDNYLGKILINDSYDQKELDQKYLRKQIGFIGNQNLIFESSLKNNITLFDENPDYKKLNSILKSLKIEFDVEEEISASKLSEGQKQKIAFARLKYSPIKFWLIDEAFDNIQKEYSQILISQLLENPEFTVVFISHHINEWQKLKFDQIIELGGEKIWIN >NC_007332.1|WP_044272733.1|896688_898137_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MISTFLSVIHNSLLTRIFGQAGALKLIKEKMQIFSNLTYKEYVKNTPGNYFSLFFNEGFNNGESFFAFLFHIISLIFPITAILGTIFYINPIIGAVIIGLTLIWITFPVFFRKFFSRKIAERLNMLENFNGEFSEKLNKFEAFLFFGKINLLKNFLSPTAKKASIGQKSYRFWNEFNANINLSIRKLFLILTDLAIILLGIYYENSVQTVIVLVTINSANQMFINDFNTFIVTLTNYLSFKTQFKNSKLNEKREKNILNFQDFNEKIEKINIKNLSFNYQNNQVLKNVNLEIKKGKKYLLQGDNGTGKSTFLKILMGIEREYAGKINFNSRELKTISDQNIIENIAYIDNNPVLIPGNLAENISFYSDYDSKKIDELIELINLSELKSENLLTLDEKTDLSMGQKQLVNFASHLAEAKPIIILDEAFSNLDKKNLENLVSFLLDQQVTLLFILHNLDQELVAKFDFCLNFSENQIFLQPVTD >NC_007332.1|WP_011290440.1|903907_904522_+|hypothetical-protein MQNWKIILLATGISALITSFVSIFWTRYRKNQLIKKYTSESEGEKIEKFPNLKEQVLELKSEIWLFESLEVVLYKISKEDYRKNLFLENDGLVACLIQKNIENTANTVAVEYLNQEKFDKNLEKLAVSGLNFASFFEPFFDFILISVKIEITEILKFLKILKTDGILIWKYQKNQRRKILRYLKSQKIVFDEYFYYDFLLIKKK >NC_007332.1|WP_011290441.1|904562_905045_+|transcription-elongation-factor-GreA MKSIVNDKILLTQQKLEEIEKELEHLINVERVNVIQEIKDARSQGDLSENAEYDVAREKQGIIESRIRELETIISKAKIIKADLGSSRVSIGSKVSLENVESGEIQTFQIVSSIDADPFKSKISNFSPIAQALLGQHQGDEVEVDVNEKYSVRILEVINE >NC_007332.1|WP_044272678.1|905044_906607_+|MATE-family-efflux-transporter MRLSVRQFFPDSAEKWKKFAKIVIPVIFATLFISINNFIDNFMVSQISGGITAVGIANVWTAIIFSFIVSINSIGSIIFSQYWGKKQRKLARQVNNIRYILAVTTVLIFAIFAWIIPDQMLSAVQRNKNLTNLDKNIFEEAKSYLFIIAFSWILFAYIVTSSAILREIGIMKIALFFTLLTLISNVSLNLALIPKMGVAGSALATVISRCISAILMTFYIFFYKKDIRISILKLFKIEKKIWKQYFRRFFGMNLVIITSLIISIRSILWAQSLPPGSIGSDDGTGFYKYWGIGFLTISGIVMTIVNILLATFTSIQTSVSIVVSRNLGQDKIEKARKNAAMLKGFLFIVSLAMSILALIVVIIITKTNLITKGLEIQVQKGMENYFTEHNLAINLEIIQKQQGLATNFYLSQIFWICLLIVFLNPIWVQINSSLNIIQAGGRANFASLCDFFIGISQFLWQLLVIFVFLPLLKDVKTKLFFSMLIFYFSDIIKWIIYEILYLKTNWAINLTLEKTAKKIL >NC_007332.1|WP_011290443.1|906687_907653_+|ECF-transporter-S-component MPRLTNMKISFVAIFISIAVIMLIIGVRLAPFAILPNFRLSIIGLPIKITGFIFGPIVGFLTGLLADLITFLFIPGVYSWYYTLHLSLAGFIPGIFFWFFVIKGKKWFEKKSILTRLDQKIFEQKQKIFDFTYYRIANNQKDENLERKMKQKLLFLQKKVKKVESWQEEKSLLNFYWIASNLILISIVITTIYVVMFSSSIDFSQSRFISSKLSFLILTLFGTVSMIIFLLLARFINFFRKNERYLTIAPIVVFSALHEPIASIIGARGDVQSGALNNFDTAFLSHIIVSPVKIWINLSVIYFTAKAVVPLVYKKFSYSIT >NC_007332.1|WP_011290444.1|907665_909579_+|hypothetical-protein MTNLHKEKRKKLLFHNIKNKYWNYFSLELEANQGSFIYSSDKNFFNEFKKILEDENSYNGFILENNEPYEYQKNTCFSDFLTKKFFEKNKNKLVIEVLLSLWRIEPFKIKTNTTRRYIQYLSIKNVENFLKMFENELNYLLENRAQAFKFIEKIAKIKEEYQILNKNFYNLYLKTELKPNIEQEKLNEKLKLSIPYPETKFENLKFSQTYAQIALQTIKNDIKNVINHHNSLINSFDSDPYKIKIFITGYNCFLDLIKKSDNFRWLSSLQIYEIYFKFEQWLIKLLNQKALENILGTQNFFNNTFAEEFWGFWKQNSQQKILEERNKKAQKHFKVKKINSFHKENPYYQNLKTNSKTLLRANILWQHEVIKMEKKLRNKNFQNSFFIKRIWVSSIENKLKKLKEKISKVEYENHFIFLKDALSDLKNFFYLKNLKKIDVFLKKNQFFIFCFDNKINFDILYKKYGVLTNDDLFFLETKKMQMGNYSRFLFDEYSFLLETNYKQKLFQHFFNNGENSAQLFIYSRRTIKPIRDFSIIFIENGTLVEYIREIDLPLTPKTSFGKFFYQNGTFERTNLPLLETQLYKQLQNEVFQNNSGGIKNNFESFINSWIPIKEFKLEFDSENKKYSLKKDILVIDL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
309980 : 320639
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_007332|309980:320639|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_007332|309980:320639|312216_312498_+|WP_011205960.1|DBSCAN-SWA MNFQKLLKQAQKIQKDQKVKKNALAKMDFDFENQGISLTITGDFELKKIKISPILVDKDDIETLEDLLSITLNQALLKIKEENEKITDYPNQV >NC_007332|309980:320639|313703_314576_+|WP_044272699.1|DBSCAN-SWA MQADQNNWSSFLYNLDKNGKIPHAILLISNYPNLLDSKINEFLEIFEHKYEIFLYDIFDKNLSKQEFLEDINKLYFSTFADSQSKIFILKNIEKTHISLLNSLLKILEDPPKSTYFLLIAKSQNLVIPTIVSRCQVFWFTEFDRQKDLKKKLDQWKETPYNSVYAKIFSNFETAITSIAKISENDLVKFESLFNNLAKKKFEFLIFLNNILTKENALILVKMLVFYSKSIFLNKPKKNSKNSKKGTFMPENFKKITKVMQSSHKFLTTLDQNENFNVQKSAFLVRLNIIL >NC_007332|309980:320639|309980_312146_+|WP_044272395.1|DBSCAN-SWA MEIRKDYIAFYRKYRPKKFSDIVGQKFLLESLKNIIKSGNFFHAYLFSGPHGTGKTTVAKIFANAINCTHKTDLIEPCQNCIKNFNNSLDIIEMDAASHNGVKEIREIIENSINFPQISPYKIYILDEVHMLSTSAFNAFLKTLEEPPKHMIFILATTEVHKIPLTILSRVQRYNFLALKEDEICHRLEFILEKERIKYEKNALKSVFLLSQGSLRDAISILEQVATFGSGYVNQKNINELFGLVNKEILVNFVNALFLADSKISYEILEQISFQSKNFQLFLESLINLVKEWIIWKSTKTNELLEFYSNFDLENLKISQDFAFKFLEIAFSSLKDINFADFQNLTLEIFIMRILSLSNLEISDQNNIKFKKIEENKVDKIDIPEKITEKVSEKVSEIKSTPTNFYKIEDRLEKLGKFDLKNLEEDMQTKQNKNYSSIFNRKLEQNLERPPLKTEVFSKSTTEFNQFGQIGNPFIETENHKKIENQNLKNNGEFDGEIDFSNSFMPENCTKIDENINSVSDFSDISANLSEDKTNFAQSFNNKDTNLINLDTNFGNNSSKFLKKIGSKDYLSAEEVLNFILLAKNFHSQNQVEYENLVQNWRKNLPLFEYNVEFMEIVSVLKYAKILSLGANFVFFMAGRDEYEDLLIETIKEKYQVNELLLQIFNVEMHPLVASKNLINKTKILLNKMRNDGKRIVAKPFEIPKKTTISKEDLEKLFFDK >NC_007332|309980:320639|312500_313085_+|WP_011290114.1|DBSCAN-SWA MIKETFKNLAEDLRKIPGISKKQAMRILSFLVDVPIEKIENFVRAICDLKKNTQYCEKCGYLNTNPVCEICLDFQRSFKILVVENTEMIAKFEEYGKYDGQYFVFGKYDIKNLENHNAQIKKLADLAANKSEIILGLSSTMEGLIFANYLAKHEFLSGLKITRLATGIPFGAIIDYIDNITLDQALKNRQEMEK >NC_007332|309980:320639|317594_318557_+|WP_011205952.1|DBSCAN-SWA MQISVAKYVAQNTIIHKMDPRLKIAFNILFAVLFFVTSHLITILILLFAALVFFYITTKKIKQIFTLMKLPLIIFLIMIIIYGFIIDQKNINIILGITAPDKAPQYRVLGLNEQQTNDFISWYLVKPTVLFSNLKFSIGTVSIIRSFVLAIRIYAMIISTTILTYSTKPFLLTRAIEDLILPLKLLFIPTHIIAMIISIAIRFIPTLLLEATRIMKAQSSRGVDFKHGKIKDKVKSLITLIIPLFVLAFSRAEDLSNAMDVRNYDVYAKRSRYRRLVFNKMDYLFALIFISLIILTVLMELNIIPISHLPKWWLYTNQKI >NC_007332|309980:320639|318560_320639_+|WP_020835646.1|DBSCAN-SWA MKKNSQIRAKIIELREKIEKWNHHYYQLQNPLVDDLVYDKTLRELEKLERENFFLFSLEELNQSPSQKVGSKITSKFEKVAHSSPMLSLNKAYSNEELEKWAKKAREILKTVTFFVEPKIDGIALSLFYQNGNLIKALTRGDGVFGENVLVNALKINDEFIPKKINYLEDLEVRGEIYIDNSTFASLQLETKKFKNPRNAASGILRRYKNHKPKIDAKSIKFLEEESDFRYLKSFFYTLVNPEKHKINSQFDSINFLRNLGFQVNPFQKKCSDLKDVFNFISIIKQKRDFLNYNIDGVVVKVNEFSIYEKLGSTSKFPHSAIAFKFEDDIAKTKLLAIFATIGRTGKVTYNAKIEPVTLAGSKISSAILPNYSYIENLKLNLNTEVYIKKAGEIIPQIIGSVHNYPKTNFSIVKNCPKCNSELVNSESGLDQFCQNQFCPEIILQKIVHFCSKNALNIESLAQKRIEKFLEKGLISSACDIFYLKDKLELIYERLSNKNQLLTKQNASQSMQIKSIMKLLNEVERAKNIDFYRLIFGLGIRNVGLKAAKILSRYASNLSELRNLDFNLLKNQHDFGPVIIESLIDYFNNQKNSEQLNCLETVGFNFKTTFLTNQSNSWASFAISGKLSKPRDEYVRIIEESGASFHESVTKKTDFLLLGQSAGSKIEKAKKAGIKIINEVQFFDLIKNSKKT >NC_007332|309980:320639|313087_313723_+|WP_044272399.1|DBSCAN-SWA MFISFEGIDASGKSTVMDLFAKYLKIKFPEKDIVTTFEPGGKNLKEALLIREFLLSKNNQISPYVEMLLFATARRIHLERLIWPALKAGKIVLCDRYIDSSIAYQGFGNGLDIDLVTSLNSLISENTFPDLTIFLDIKISKSFERMGIFRDHNRDRLENKGVEFYERVINGYEFLTKKNKNFFKIDGNGTYDEVLDLIIDFFEKYYASWPK >NC_007332|309980:320639|314579_315314_+|WP_011205956.1|DBSCAN-SWA MSAKITVLATPIGNLKDISLRGIEALREAELILCEDSRVSRKLLNFLEIYDKKLISYHKFNENSVISKISPLIFSGKKVLLISDAGSPLVSDPGQFLINWAHKNEIDVDFLPGPCAFVSAFVLSGFDSPLIFMGFFNSRKQQIIKQITIFKPNFSYIFYISPHKLINILEVIKEIYGDNIEIFLVKEMTKLHQKYFFGTPISIINQLKDSLKGEFTMVLRLKNEKDLQIKKKKNKYQKFSKNNV >NC_007332|309980:320639|315911_316730_+|WP_011205954.1|DBSCAN-SWA MIKVSDVCFSYTNNMDQLVLKNINVVFEKGKYYAILGHNGSGKSTFSKILSGIFKPQKGSIEVDGVLLNKENLTKIRKKIGIIFQNPDNQFVGATVEDDIAFSLENINEDPKKMSQIIANLAAKVQMESYLDREPQFLSGGQKQRVAIASVLALNPEIIIFDEITSMLDPRGKYDVVKILDDLRKDKTKTLISITHNMNEAILADEIIVFANGGIIAQGDPKLILNDKNIIEKAKIDSPFIYKISSALKLVSPTYDENELLEQLWKLKQKTS >NC_007332|309980:320639|316702_317605_+|WP_011290118.1|DBSCAN-SWA MKIKAKNIVKIYDQKLPSELKALDKVTTEINQGEFIAIIGQTGSGKTTFIQHMNALLLPDQGEVEYLYFDSKNQEKKLVVQKPRFFRKKLKFINEIRRRVGVVFQFAEYQLFEQTIEKDIIFGAVSMGTPKNEAKKIAAEIIELVGLDQSFLQKSPFELSGGQKRRVAIAGILAMDPDIIFFDEPTAGLDPQGTLKMLEILDTLYKKGKTIILATHDLDSVLEWTKRCIFFKDGRIIYDGDTYSILANNKFLIENKMLPTNLLNFREKLIKIGYPISNVRSVSELISEINMLIQKETNAD >NC_007332|309980:320639|315346_315883_+|WP_011290117.1|DBSCAN-SWA MINKHISQILYNRDQIKARIVEIGKWINETYKDSNEIVFIGVLKGSLIFLTELIQSVDVDSMVDFVIAKSYFGGSESTGELKVITDIDIQIQNKDVILIDDILDSGITLSKIRDHLKLKNPKSLRVITLFDKKVKRKYDIQADVSGFVVPDAFLVGYGLDYQDKYRNWPFVAIFDPNK |
11 | Streptococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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