Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_006833 | Wolbachia endosymbiont strain TRS of Brugia malayi, complete sequence | 1 crisprs | cas3 | 0 | 1 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_006833_1 | 99455-99537 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_006833_1
|
1 spacers
spacers of NC_006833_1
>1.1|99484|25|NC_006833|CRISPRCasFinder GGAACCACCACCGGTGCCGCCTAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_006833_1
The CRISPR arrays of NC_006833_1 >merge|NC_006833|1|99455-99537|CRISPRCasFinder CCAAATTTAAAGTGTGTTAATTTACAAAAGGAACCACCACCGGTGCCGCCTAAGCCAAATTTAAAGTGTGTTAATTTACAAAA >NC_006833|1|1|99455-99537|CRISPRCasFinder CCAAATTTAAAGTGTGTTAATTTACAAAA GGAACCACCACCGGTGCCGCCTAAG CCAAATTTAAAGTGTGTTAATTTACAAAA
>NC_006833.1|WP_011256277.1|96703_98269_+|penicillin-binding-protein MWIKNKVFNRRAFILGGIQLTISTIFSCRLYSLQIRNRQKYEKLADNNRIRVAAIMPKRGRILDRNGIELAVDKISYIVLFDKQKISSEEVDWETLSEIESNVTKSSETKITALYKRHYPFGSICSHTLGYTKKQQGINEAGISGIEYTYDHILKGKPGRSEQEINSKKRIVRELSSIPQQDGQDVQLTIDIDLQEKIAEIFKGHKGSVTAIDVGNGEILTLYNSPSYDNNLFANKLSNEAWEGLNTPSLPLVNRALSYQIPPGSIFKIIVALAGLKDGIITPEEKFSCVGYMKIGERRFCCLKSKVHGYVSLNEAMALSCNTYFYNIGKKISVDSLVEMARKFGIGSGPLIGAFKEEAPGLLPDKDWRTRKLYSEWYLGDTVNLVIGQGYVLTTPLQLAVLAARIATGKEVIPRIEMSKTMQDFPDIDIAHEHLSIVRKAMFNMVNIKAGTYRKGLSSIRIAGKTGTPEINSKGESHKLFIAYGPYHDPRYAISVFIEYGKAPRQDVAMANEILRYMLKG >NC_006833.1|WP_011256276.1|95918_96713_+|polysaccharide-deacetylase-family-protein MGLKAWLITTFLLLYPSATFCDDCNFNLPYRGLSCNLDLSHKNLSNIKKLLNNSDKFVALTFDDGPSSNRVNNIINILENYKAKATFFLLGERINKKTSEIVKKIYNAGHELGNHSWSHKKLTSLSSEKQLQELEKTNMVIKNAIERDVKWFRSPYGCHDDNLIKNTNQLNMCSILWTVDSLDWQGDKPEILVDRVVGNVHNGAIILFHDHDNKSNTVEALPQIIKILKKLGYEFVTLSEWEERVCKAKGVSMGEGVFKKILCG >NC_006833.1|WP_011256275.1|94980_95868_+|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase-FolD MTIIIDGKKIASGLCEKLSQRIDVLKREHSIFPCLKVIFVGNNPASQVYVRNKQKKAESIGISSETIVLPDNILENELIEKINELNNDRFVNGILVQLPLPNHINASKVINTVSVEKDVDAFHRENVGKLVKGEKNCLVPCTPKGALHLIKLVETNLSGKNAVVIGRSNIVGKPMFHLLLQENCTVTILHSQSKDLAEYCSKADVVVTAVGKPNFVQEGWIKEGAIVIDVGINSVSIEGKTKLIGDVDFDRVKEKTKAITPVPGGVGPMTIAFLMINTVIAACLQKKVDASDFVS >NC_006833.1|WP_011256274.1|94413_94977_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MNNRIVIGISGASGSIYGMHILKALKGADCETHLVISRAGKTTIAHEITERLEDITSLADFYYSEEKIGEKIASGSFKTSGMIVAPCSMKTMSEIASGVTSNLLTRAADVTLKERRKLVLIVRESPLHLGHLQNMLKLTEMGAIIAPPMPAFYTKPKSLEDIISHSISKVLSLFDIKLPDFKEWQGV >NC_006833.1|WP_011256273.1|94155_94413_+|DUF2312-domain-containing-protein MGDAVKVIAEELKGYIERIEKLEQEKKNVQDQIHDVYAKAADKGWNIKVMKQIIRLRKMEDGDRAEQEILLNTYKRALGMSCEEN >NC_006833.1|WP_011256272.1|92859_94146_+|DUF21-domain-containing-protein MDWLLVSILSIIFVLLILSFLFSGAEIGLTSVSRSRVNKLKLDGNKRAKIIDHLLNKKELTIGTILLGNTIINITCSVLFTAIFINLFGNESVFLSTIVMTFCILLFCEVLPKTYAMQNPEKFTSFSAYFVLFFVKIFSPLTLGIQFIVNFILKLCGFHKNREAISAADAMRNMIALHRSEGTMLQQDLDMLSSILDLAETEISEIMTHRRNLFSLDIDRNKEELIKEILTSSHSRVPLWQKELDNIVGVVHVKNLINALREKDNKIEEVDIAQVMSKPCFLPESTPLSVQLHNFRKNRKHLAFVIDEYGALQGIVTLEDILEEIVGEISDEHDLITENFIKKMSDNVYHIEGKSTIRDINRQLHWDLPDEEATTLAGMIVNEIERIPDEGEEFSMFGFYFRILKKDKNIITVIEVQVKTDNTVTAID >NC_006833.1|WP_011256271.1|90507_90753_-|hypothetical-protein MEEKDSNFAMEKPGNNYVGCISSENGECKNFYDLKLNFVKYNSGNNSSLYPYYYNLENFGNFLEVDVKLRELIGLKKGLKD >NC_006833.1|WP_136132027.1|90083_90362_-|hypothetical-protein MELGAEVADQFLSEMNQTKIKIQDAKEATETARNVSKSFAQNAKDKNTELHDKVVNFTKKAETASENAEDFAREAFLSKQSTKTLKQETKEL >NC_006833.1|WP_011256269.1|89237_89459_-|hypothetical-protein MKQYTFRIDNKDPLYKKLIKLPTAYYRLKHDGNKHNIHSNNNVILEIGNNTNGVKLRWENDKIVLHKGSSALY >NC_006833.1|WP_011256268.1|89016_89241_-|hypothetical-protein MKNIEGQDFGVGLLFYNSGNPLTGVLKFINFYDENNLVLQKDQRRNRQALLDRGRLFSNYLHIKQGWCLCHNVW >NC_006833.1|WP_011256279.1|99666_100944_+|proline--tRNA-ligase MRLSQYYLPTLKEKPAHARIISHQYSLRAGLIKQIASGIYTWLPLGLRVLKNIEGIIRDEMNKSGAIEALMPCVQPASLWRESGRYDDYGKTMLRIRDRHEEDMLFGPTHEEVATDLIRDIVKSYKNLPLCLYQIQWKFRDEVRPRYGVMRGREFLMKDAYSFNVNYESALNSYNLMYKTYIKIFKRMGLIPIGVRADTGLIGGNLSHEFHILASTGESTLYYDNKFFELLESEDVKSLKSIYAVADDIHDPKTCPVPQEQLNVSKGIEIGHIFYFGDKYSKPMNAKVTAQDGKNVNIHMGSYGIGVSRLVGAIIEAFHDDKGITWPEAVAPFRVGLINLQTKTAEYVEIANKIYSTLKSDEVLYDDTEGSIGVKFAKMDLIGLPWQIIVGKKAVSENIIEIKNRATGKVEEVQIEEAINYFNVK >NC_006833.1|WP_011256280.1|100940_101318_+|holo-[acyl-carrier-protein]-synthase MIRGIGTDIVYIPRILRILQKYGKKFLNKIYTEQEIEISRKYNSQEMQAKYLAKRFAAKEAFVKALGGFSHGIIMKDIEIYNDVRGKPHLTVSKNFIFKDHMIHLSLSDDGDCATAFVIICSSLP >NC_006833.1|WP_011256281.1|101340_102132_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MSLSPAIFSIGPVSIHWYSLAYVLGIVFAYWHLHKLDEQKIFTKNFYDSLLTATIIGIILGGRLGFVLIYDPISYINNPIEILKTWKGGMSFHGGAIGVLCAVIISCRRYNIPIFYTLDLISCGVPIGLFLGRIGNFVNGELFGRVTTMPWGMVFPESGDNLLRHPSQLYEAFFEGLLFFAIANSLFFLTRIRLYHGTLTGIAVIWYGTVRFVVEFFREPDYQVGYLWLDLTMGQLLSIFMTLLGIIVYLSALNSKFNTKSVA >NC_006833.1|WP_011256282.1|102138_102588_-|SsrA-binding-protein-SmpB MEVIAENRKARFEYFILEEFEAGMVLLSSEVKSLRERKVNISDAYVTEKNGEIWLHNMHIAEYKAANKKKHKPKRERKLLLHKKEINKLISQIKTAGVTIVPLSIYFNDKGLVKTRIAIVKGKKLYDKRATIKQREWNRAKSRLSKNNL >NC_006833.1|WP_011256283.1|103117_103330_+|hypothetical-protein MEKIENPRENIAYELVNNGSKLTNENKQKILELAKKIKKEENIASILKKSGNNAKKILTITVSFNDQEEK >NC_006833.1|WP_158676317.1|103880_104030_+|hypothetical-protein MKKVKKIISLTSTETADQELNTFKVSSSTGIKPCFDSGSSKGNPTDEEP >NC_006833.1|WP_011256284.1|104273_104864_-|CvpA-family-protein MLFDCLIIFIIVVCIIISITRGFIKELCALMFLFLSAFLTANHYDFFTINYSKYFNSKAMQNIFSTISVFIIFNLIFMIVNNWLMYILTPIRLGLIDRVTGTFVGALRGVLLSYVLFFAMHLYCYTVHDKKEEQSKIEAEDILPNWIINSYSYQALFATVEDIVDVYVPESLILKIKEIGEGMANQEKLKGDKKEE >NC_006833.1|WP_011256285.1|104920_105517_-|riboflavin-synthase MFKGIITNIGTIINTTIRSNSDQIFHIKAQNLSSIHEGDSIACSGVCLTVVDIINDIFTVQISQETMKVSNLGAWKVGKKINLEQAMRLSDKIDGHLVHGHVDETAKILTINQNLGSHEIKLSCPQELIKFVAKKGSVTLDGVSLTVNSVIGREFTVNIIPYTWQNTTFQYNKVNDYLNLEVDMIARYLDQLIQYKYN >NC_006833.1|WP_011256288.1|106981_107209_-|hypothetical-protein MHSSNDETKKKHEIDDLPKFFKEKSKEIGKAFSNKVVEISIIRSISVTSDEQEFSFKLRLLTIVDKDTHSIWILR >NC_006833.1|WP_011256289.1|107353_108397_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MNEELLNEIPLLEDKAVFEIESASSLQDLEKVRLSYLGRKGVIKAYFDDLRKVEDTEKKRDLGAIINVLRNKLDQLIMNKESILKAEEVNFKLQNEAIDITLPVRPEKIGRAHPLSKVMNEVKLIFAHMGFRAVNGPDIEDEFHVFDALNTPSHHPAREEQDTFYLKNKINDKRMMLRTHTSSMQIRAMKKAKTFPIKIVAAGRVYRNDFDATHTPMFHQMEGLYVNENVNMGQLKFTIHHFLNKFFGDKELKIRFRNSFFPFTEPSAEVDISYKESKWIEVLGCGIVHPNVFQNVGIDHTKYSGFAFGIGIERLAMLKYQISDLRNFYDNKISWLSHYGFHFSSLR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_006833_1 | 1.1|99484|25|NC_006833|CRISPRCasFinder | 99484-99508 | 25 | NZ_AP014579 | Burkholderia sp. RPE67 plasmid p1, complete sequence | 391607-391631 | 4 | 0.84 |
NC_006833_1 | 1.1|99484|25|NC_006833|CRISPRCasFinder | 99484-99508 | 25 | MN693183 | Marine virus AFVG_25M360, complete genome | 20205-20229 | 5 | 0.8 |
1. spacer 1.1|99484|25|NC_006833|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP014579 (Burkholderia sp. RPE67 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
ggaaccaccaccggtgccgcctaag CRISPR spacer ggaaccaccaccgttgccgccgccg Protospacer ************* ******* *
2. spacer 1.1|99484|25|NC_006833|CRISPRCasFinder matches to MN693183 (Marine virus AFVG_25M360, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
ggaaccaccaccggtgccgcctaag CRISPR spacer cgaaccaccaccggagccgccttga Protospacer ************* ******* ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
287110 : 299892
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_006833|287110:299892|DBSCAN-SWA ATTAACCACTTACTGAAGAATGTTCATCTTCTGTGGTATTTGATGATGAAGCAACTAATTTACTCAAAATCTCATCCCTTGGTCCCATAGTGTAAATAACACCGTCTGACATGAGTATTACTTTATCAGCCAAAGATAATAACGGTAATTTGTGAGTTATGATGATGGTAGTTGTATTTTGCTTCCTTGCAACATTGATTGCGTTAATTAAGCATGCCTCTCCATTACTATCTAAGTTAGCATTTGGTTCATCGAGCACCAAAAGTTTTGTATTCCCATAAAAAGCTCTTGCAAGACCGAGTAGCTGTTTCTGCCCACCAGAGAGCGTCACTCCAAAATTCCCTATCGTTGTATCATACCCATTTGGTAGACTTAGTATTAATTCATGTATTCCTGCGATTTTTGCTGCTTTGATTATTTCTTCAGTGTTTGGATCTGGTCTCATACGAGCAATGTTAGCTTTAACACTGGTGTTAAATAACTCAATATCTTGAGGTAAGTAACCAACATAATTACCAAAAATTTCTCGATTCCAAGTGTATACATCAGCGCCGTCCAGTCTCACTACGCCAGATATGGGTTTCCATACACCAACAGTTAGCTTTGCTATGGTTGACTTGCCAGAGGCACTTGGACCAATGACACCAACTACATCACCTGGTTCTATTACAAATGATACGCCCTTTATCGTTGATTTGTTGCTTCCATAAGGAGTAAAAAATACTCTATCAAATTCCAATTTTCCTGCAGGTTCTGGTAGAGCCATGGTTTGCTCTCTCTTTGGTGACGTTAATATAAGCCTTTGCAGTCTTTCATATGACATCCTTGCCTGATTTAAAAATTTCCAAGTGTGAACTGCTGCATCAAATGGAGCTAATACTCTACCCATTAAAATCGAAGCGGCAATGATACTACCAGCAGTCTTATGAGCTGTAATTGCAAGTAATGCACCTGTTCCAATTACCGATATTTGCAGAGTTGAGCGCAAAAACTTAGTGATACCAGTAATCACGTTAGAACGATTTTGTGCTTTAATTTGCATTGCTCGGTTTTGGTCGTTTCGTTTACACCAATCAGAGACTATGAATTCTGACATACCCATAGCTTCAACTACTTCTGCATTTCTTGTTGCAACATCTATGGCATTGATGTTACGTATAGTTTCTTCATTGGTTTCTTGTAATATGCGTTTAGTGGCAAGCTCATTCCACACTGCCATAGAGACTAATATAATAATTCCGATAGTAGCTATGAACCCTGTGGAAGTATGTATCATAAAGATCACAACAAGGTAAATTAACGACCATGGAGTGTCGAACAGTGAGAATATACTATTTCCTGTAATAAAATTTTTTATCACTCCAAGATCCCGTATTGCTTCACCACTAGAAGCTGAGCTTTGTACTGATGTTAGCCTAATTGACCTTACTATCAGGTCTGGTGTTACAGCTTTATCAATCCAATCACCAATTTTTGCCATAGCTAAATATCGGCAAGTTTCAAGCATTGCAGAGCACGCAAACGCGGATAAGGTGATGATTGTTAGCATAGTTAGTGTTGATACGCTTTCGCTTGATATCACTCGGTCAAGCACTTGAGAGGTGTAAAGTGGCAGAAATAACATTAATAAATTGATTCCTGAACTGAACCAAAAAATAAACCAAAATGCACTTTTACATTTTCTTAGGCAGACATACAGTGTGCTTTGCTTCAATTCTTTTTTTATTGATGGAGTAATTTCCACAATTTCTCTCTTAATCTGATTAATGCACCGTATACAATTTTTATTACAAAAATATTAATAAAGGTAGTTATTTTACTTTAAGTTAATATAATAAAATATTAACATATGTAAATAGAAAATATAAACGACAATAAGAAAGAAATAAAATTGATATTTTCTTCATTACCTAATTCAGAGTTGGAAATTTTTAATAACTTCCCAATTCCCACCTTGGTCTTGGTGCAAAATTGAGGGAGTCTATGTAATCCTTCTGTAATATTTCAATTCCTGTCCACCCAACCATTACTGCATTGTCTGTACATAGATTAATTGGGGGAAAAAGTATGTTTAAATTTATGTGTTTTTTTAATTTTTTTCTTAGGAAATTATTTGCTGCAACTCCACCAGTAACTACAAAGTCATTGATCTTGATATTTAAAGATTCGGCCATAATAACCGCATTTTTGACTCTATCCAATAATATTTCACTAATACACTCTTGAAATGAAGCGCATACATCACACACATCTTGTTCACTCATTTCAAGTTCTTGTACTAAGTTTTTTACTGCAGTTTTGATTCCAGAAAATGAAAAATTACACCCAGGACGTTTTCTCATTGCCCTTGGAAGCTTAAATCTTGTGCCATTGCCTTTTTTAGCTAGCTTTTCGATTAATGGACCTCCTGGATAGCTTAACCCCAACATCCTAGCAACTTTGTCAAATGCTTCACCTAACGAGTCGTCAAGTGTTTCTCCAAGTTTAATATATTTACCTACATTCTGTGCAATTAAAAATTGGCAGTGACCACCTGATATTAAAAGGACTAGAAATGGAAATTTGACTTCATATAGTAACCTAATAACCAACACATGCGCTTCTAGGTGATTAACGGCAATGAATGGTTTTTGTGTTACATGTGCAATTGCTTTTGCCATCATTGTGCCAACTATTAATCCACCTATGAGTCCTGGTCCTGATGTTGCTGCAGTCGCGTCCAGATTACAAAAATTGAGGTTAGATTTTTCTATAGAGTTTTTTATTAGACTGCTTAGATGCTCCATATGGGCACGTGACGCTATCTCAGGAATCACACCACCGCGTTTTTTGTGTTCTGTTTGAGAAAGAATTTCTTGAGCAAGGACTTGCTTTTCACTATTTACAATCGCCACTGCAGTTTCATCGCAGCTTGTTTCAACGGCCAGAATGGTTTTCATTTATATCCAGTTATGTATTACTGAAACTATACTTTAAAATATTGTGAAAGTTAATTGTATTCTGCTGAGTTAATCATCATTTCCAAATATAGAGCTAATCTTTTTGCCTCTAGGAGAAAATTTGTTAATCCAGCTGCTTTGCACTTTGGTTACGTCTTTAAAAGCAGTTTTATTGCTGTATTCCTTGATTTCCTTATCCACTGCGTCCATTATTTGTGGATCTAAGCAGCTTTTTTTCCACTGGTCAGTAGCAAAAGACACTTTGTTAAATCTCGGGTGCGAATTAAGTATTCTTTGCCTTTAAGATAAACCTCTTGCGCCTAAGCAAATAGCTCAAAATAGTGCAAATAACTCAGATGTGCGTGGTTTTGCAGCTTGATAAGCTTGTATTTCTTTAAAGATAACTTGACCAATAATTTTCTGTACAAAAATATTTGCCTGCTTTAAGTTCCGCTCAATATCTTGATAAACTTTATAGAGAAACTCCTGCTCTAGACTTAAGTTAAGCTCATTTTCAACCATATGTGAAAGTTCATGCACTATAACGTACGGGTTTAACCTCTTAGTACAATAACATACCTACTTTACACCACAGACAGACCTAATTGTCTTACATACCCCTTCCTCGATGTCCACTAGTTCCTTTTGATATATTTTAAACGAAAGCCTATTTTACTTTATTAGCGACAAAGTAAGGTTCAATGTGCTTCCAAACTTCTCAAATTGATAGAGATATTCAATATATTGTACTACATTTTCACTGTTCTCTACCTGAGTTGCCCGTTTTATTAAATTTCTGATTATCATACCTTATATTATTAAGGGAATATTTTTTATATTCAAGAATTGAGTAGGTATAAAATGCTTTCCATTTACTTGGGTAACACCTTTTCTAAAAGGCCCATGACTAAACATCAAAGTCATGTACATTATATTATGTAGATTAGCTATGCAATAGCATTCTCGTCAAGAAGGCCTTTAGTAGGCTCAGGTTCTTTTACTCCACTCAATTTACTTGACACTTTATCAACAATCCAAGTCAGTGGTGTCATAATTAACGCAGCAGTTCAGATAACAGCTGAAACAATGTAAGATAGGAGTGAACCAAAGAAATCGGCACATTTTCCACCATATCGTTCCGCTGTGTGCTGCCAATCATTTGAATATTCTACGAGAGATTTCGGGCCTTCTGTTCCTTTGAAATATGAAAATAATTTTTTTGGCAAGTACATAAGATATGCAACTCCTGTATAGAGTACAAGTAATAAATTTGCAAAGCCAGAATAGCAATCATTGCGTCCGTGCCCCAAACTACTTTCTCTCTTCTTCCCATAGTTATTCCTGAAGTGTTAAGATCATGCTTTACTCCTACGAGCATGCCCTTAATTGGCCATAAAACGCTATTGATATAGTAAACGGATTTATAAAAACTATTTTGTAGAACTTTGCTGCCATTATTTTGTTCTACAGCAGGAACAGTTCCTTGTTGAGCATATTGCTTAAAATTGTTATATGTTAATGTAATCAACACATTAATCTCCTAAAAAATTATATAATGAAAAATGTAATTATTATTTACATTACTATATTAGTATAACCTTTTTTTAAGTAATTGCAATGGATGCTCAATATTTTAACTAAATTATATATTGCACAGGAGCACATATTATCCTACTATAGAAGTAGGTCAAAAATGAAGAGTTTAGCATGAATTTTACTTTACCTGAGTTACCATATGATAAAACAGCTTTAGAACCTTACATATCTGCAAAAACCTTAGATTTTCATTATGATAAGCATCATAAGGGATATTTAAATAAGCTCAATGAACTAATTGAGAATACAGATTATCAAAATGTGAAAATTGAGGAATTAATAATGAAAGTTCACGGCAATAGTGACGAAGTTCCTGTGTTCAACAATGCTGCACAAGTTTGGAACCACACTTTTTATTGGAATTCAATGAAAAAAAGTGGTGGTGATAAGCCTAAAGAAGATGGTCTTTTAGCAAAAAAAATTCAAGATGATATTGGTGGCTTTGATAAGTTCCATGAGGAATTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_006833|287110:299892|298134_299169_+|WP_041571547.1|DBSCAN-SWA MNTYAKSGVDLKLYNKLMKEVKLVVDENKREEVISEVGSFSALFDFAALSKKYDHPVLVSSTDGVGTKLLIAQEVDKHDTIGIDLVAMCVNDLLAQGATPLFFLDYFATGALNKDVLLSVVQGITEGCKQAKITLVGGETAEMPGMYGNNHYDLAGFVVGVVDKSKILPNYGVMRAGDYIVGLESSGIHSNGFSLVRHIFEDLGISYNDLSPWDNQLWGEVLLKPTKIYVDSLLPIMSQVKGIAHITGGGLIDNVPRILPKNLFADVDISSLEWPDIFLWLTKEGKVEKREMLRTFNCGIGMILIIDPENMQGVKNHFQKLGEKIEIIGKLNEKYNPSFNGVVS >NC_006833|287110:299892|294803_296624_+|WP_011256424.1|DBSCAN-SWA MCGIFGAVSDGDSVIPTLLAGLRKLEYRGYDSSGIAIINNEGKIEVQKSEGKVERLCEVVGNSRMSSSTVGIAHTRWATHGIPDLKNAHPIRTNNVVVAHNGVIENYNLLKKGLEERGIPFHTDTDTEVIPNMLTLYLNEGLSPIDSLFKCLSNLHGSFALVLLFAEYPDVLFVAKRSLPLAIGYNYNTVFAASDSNTLNTLVERISYLEDNDVAVIKSSGVSIYNNGAQVKRSIENNSSSSFLISKNGYSSFMLKEIFEQPCVLNKTINQFYKKYTEVISTSKKLFSKLSYITIVGCGSSYFAGLIAKYWLESVAQVRVYLEISSEFRYSNIRLEEGSIGLFISQSGETADTMEALRYAKSQKQTTISITNTFNSGIEKISDVVLHTLAGPEIGVASTKTFSTQLAILACFTLELAKIKDTIDEKRTKQLSNAINSIPEYVEYVLNVIKIQHIPDIILEHNSIILIGRGSSYGVAMEGALKIKELSYINTIGIAAGEMKHGSIALIDSSVLVIAIIPYDNLFFKTLSNIQEVIARKGKVIAFSDKQGVPFLREICKEVIQLPDIDNFISPIIYSVAMQFLAHSVAIEKGLDADCPRNLAKSVTVE >NC_006833|287110:299892|291755_292364_+|WP_011256421.1|DBSCAN-SWA MNFTLPELPYDKTALEPYISAKTLDFHYDKHHKGYLNKLNELIENTDYQNVKIEELIMKVHGNSDEVPVFNNAAQVWNHTFYWNSMKKSGGDKPKEDGLLAKKIQDDIGGFDKFHEEFFNHGIGQFGSGWVWLVLERGKLKITKTPNADLPLIYDQVPLLTMDVWEHAYYLDCQNRRIDYIKIFLDHLINWDFAEENLKKNT >NC_006833|287110:299892|289040_290048_-|WP_011256418.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKTILAVETSCDETAVAIVNSEKQVLAQEILSQTEHKKRGGVIPEIASRAHMEHLSSLIKNSIEKSNLNFCNLDATAATSGPGLIGGLIVGTMMAKAIAHVTQKPFIAVNHLEAHVLVIRLLYEVKFPFLVLLISGGHCQFLIAQNVGKYIKLGETLDDSLGEAFDKVARMLGLSYPGGPLIEKLAKKGNGTRFKLPRAMRKRPGCNFSFSGIKTAVKNLVQELEMSEQDVCDVCASFQECISEILLDRVKNAVIMAESLNIKINDFVVTGGVAANNFLRKKLKKHINLNILFPPINLCTDNAVMVGWTGIEILQKDYIDSLNFAPRPRWELGSY >NC_006833|287110:299892|294344_294779_+|WP_011256423.1|DBSCAN-SWA MFISEVFAADAASNVSSIGAPFANFVPLILICIVFYFFIIRPNHKKLKEHRKMIDQIKRGDIVVTSGGIMGEVNKVDEANAQLIIEIAPKVEIKVLKTAISEVSNKETQTKSIEKGQTEKDSKKSQNQSEKNKKGKDSKGKNTS >NC_006833|287110:299892|291216_291579_-|WP_011256420.1|DBSCAN-SWA MLITLTYNNFKQYAQQGTVPAVEQNNGSKVLQNSFYKSVYYINSVLWPIKGMLVGVKHDLNTSGITMGRREKVVWGTDAMIAILALQIYYLYSIQELHILCTCQKNYFHISKEQKARNLS >NC_006833|287110:299892|287110_288853_-|WP_041571405.1|DBSCAN-SWA MEITPSIKKELKQSTLYVCLRKCKSAFWFIFWFSSGINLLMLFLPLYTSQVLDRVISSESVSTLTMLTIITLSAFACSAMLETCRYLAMAKIGDWIDKAVTPDLIVRSIRLTSVQSSASSGEAIRDLGVIKNFITGNSIFSLFDTPWSLIYLVVIFMIHTSTGFIATIGIIILVSMAVWNELATKRILQETNEETIRNINAIDVATRNAEVVEAMGMSEFIVSDWCKRNDQNRAMQIKAQNRSNVITGITKFLRSTLQISVIGTGALLAITAHKTAGSIIAASILMGRVLAPFDAAVHTWKFLNQARMSYERLQRLILTSPKREQTMALPEPAGKLEFDRVFFTPYGSNKSTIKGVSFVIEPGDVVGVIGPSASGKSTIAKLTVGVWKPISGVVRLDGADVYTWNREIFGNYVGYLPQDIELFNTSVKANIARMRPDPNTEEIIKAAKIAGIHELILSLPNGYDTTIGNFGVTLSGGQKQLLGLARAFYGNTKLLVLDEPNANLDSNGEACLINAINVARKQNTTTIIITHKLPLLSLADKVILMSDGVIYTMGPRDEILSKLVASSSNTTEDEHSSVSG >NC_006833|287110:299892|297348_297711_-|WP_158676336.1|DBSCAN-SWA MKFTWKTNEYFAKCKVSLIEKINKIISNMVITIASAVAEVERMSILLSQVKHETLLTMQVLNEHKSLSRSLVEKLNKKEDDNLSTKDISIYMTHLLLEHYNVKMHCICENNLLEIGLTLT >NC_006833|287110:299892|297707_298001_-|WP_011256426.1|DBSCAN-SWA MSKNIKNILSITELLSGWLLHDFANSMNGIMFGLEELEAGNQNDASTHREALLLLKESSDDLIYKHKVMKQAYSSSADNRSFSQTKLNIENYLLKKK >NC_006833|287110:299892|299169_299892_-|WP_011256428.1|DBSCAN-SWA MLPDKIIYEGKAKFIIETKDPLTVIQYFKDEVTAFNKEKYKIIEGKGTINNRISTFIMETLEKAGINTHFIKTLSEREQLVKKLKIIPLEIVVRNIAAGSFCKRFNIKEGEKLAFPIIEFFYKNDGLADPMVNENHVLYFGWLSYEEMEEIKTITIKINTVLIDLFLNAGIDLVDLKLEFGRPINDNTKITLADEISPDNCRLWDKNTHKKLDKDVFRLNLGNLKEAYLEVAKRLSVKLC >NC_006833|287110:299892|292365_293637_+|WP_041571407.1|DBSCAN-SWA MNVPEVTKLDNGLRIITEQMRDIDSVALNIRVGVGSRAESANQNGISHFLEHMAFKGTKTRTAFEIAKTFDDIGGVFNASTGRERTSYYAKVLKKDVKIGIDILIDILMNSTFPKDELEREKGVVIQEIFQINDSPSDIIFDKYFEAAYKDQPFGRSILGTQDTVKSFAQGDLNNYINEHYFGENIIFAVAGNVEHEEIAQLTKDFLSKVSSQKLKESQNANCTGGEYLEHRKLDQVHLLIGFPSVSCHDDRYHTFQVLDSILGSGMSSRLFQEVREKQGLAYSVYSFNSSYTDTGMLSIFAGTDSSNLDKLLKSITTELKKLSTNDLREEEVNRVKERIKSQILMSRESVSSCAEALEHYYGNYNRYISKDELIEKTSAVTTADVKRAVEELLSKHEKTTLAAIGEIKSLPGYDKVVSMLRA |
11 | Cyanophage(25.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
943957 : 1011533
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_006833|943957:1011533|DBSCAN-SWA 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48 | Erwinia_phage(10.0%) | protease,integrase,tRNA | attL 950753:950773|attR 1013102:1013122 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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