Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_006578 | [Bacillus thuringiensis] serovar konkukian str. 97-27 plasmid pBT9727, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NC_005957 | [Bacillus thuringiensis] serovar konkukian str. 97-27, complete sequence | 4 crisprs | cas3,cas14k,csa3,WYL,DinG,DEDDh,cas14j,c2c9_V-U4,Cas14u_CAS-V | 0 | 1 | 6 | 0 |
1. NC_005957
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_005957_1 | 1200160-1200268 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005957_1
|
1 spacers
spacers of NC_005957_1
>1.1|1200185|59|NC_005957|CRISPRCasFinder GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005957_1
The CRISPR arrays of NC_005957_1 >merge|NC_005957|1|1200160-1200268|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAAGAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGATTGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA >NC_005957|1|1|1200160-1200268|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAA GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT TGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA
>NC_005957.1|WP_001079106.1|1198569_1199463_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MNRFTLKWDIESAEEGTLVREFLKTKGISKAALTDIKFHGGAIEVNGQHASVRHQLQVGEELRIFFPVEERSEGMIAEDIPLCIVYEDDAVLVINKEANMSTIPSREHPSGSVANALLSHYDKQYLASTVHIVTRLDRDTSGLMLIAKNRFVHHLLSKQHQQKAVKRTYEAIVHGEMVEREGTIDAPIGRKSDSIIERTVCEEGQRAVTHFRVIDSANHKTHVSLELDTGRTHQIRVHMAHIGHPLLGDNLYGGKRDEMKRQALHSTSLTFYHPILEKEMSFTAMIPSDMQEVLRQT >NC_005957.1|WP_000673194.1|1197756_1198554_+|NAD-kinase MKFTIMSKGDQSSDTLASTMKEYLLDFGFIMDEQEPDIVISVGGDGTLLYAFHRYYNRLDETAFVGVHTGHLGFYADWLPTEVEKLVIAIAKTPFQVVEYPLLEVIIRYMNGSKESQYLAMNEATVKSAEGTLVTEVEIRGEYFETFRGDGLCISTPSGSTAYNKALGGAIIHPSIEAIQIAEMASINNRVFRTVGSPLVLPKHHTCVLKPTAGMNLQITVDHLTMVHQDVKSIQYRVANEKVRFVRFRPFPFWKRVRDSFVADK >NC_005957.1|WP_001081482.1|1197099_1197738_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MNRNWEEFLAPYHQAVAELKVKLKGMRTQFAMLTEHSPIEFVTGRVKSVASIIDKAEKRNVPLDRLREDMQDIAGLRMMCQFVDEIKPVVEYLRKRNDFEIVEERDYVTQKKDSGYRSYHVVISYPVQTIQGEQKVLVEIQIRTLAMNFWATIEHSLNYKYSGRFPEDIKIRLQRAAEAAFLLDEEMSSIRLEIQEAQKAFSRKQETKDSES >NC_005957.1|WP_001180009.1|1196697_1197069_+|hypothetical-protein MQNKIQVKSVEKRENALIFCAENSEIEVKGLSARNHVLVDSDNLSFLYILENESSFIYVSIPHTCWEAMHEAMNNDVVMFVRVNDIEMELEGLKEEVEYLVENIEGNANYGEELVTAVEKVFL >NC_005957.1|WP_000191105.1|1195972_1196551_-|CYTH-domain-containing-protein MTQEIEIEFKNIVTEEEFHALCKSFSIEVFTKQVNHYFETPNFSLKEAGSALRIRHKGETYTLTLKQPAEVGLLETHQVVTENEAKMMMETNVIISGAVMNQLCKLQIPVSALTYMGSLTTERAETLFEGGTLVFDHSFYYNHDDYEIEFEVQDEETGKAAFIHLLKQHNIPIRHTNNKVKRFFLAKQNKAR >NC_005957.1|WP_000043381.1|1195393_1195792_-|hypothetical-protein MSKQPMTPFEAIGGEQCIAILVDTFYSYVSKHPDLSPIFPDDLTETARKQKQFLTQYLGGPNLYTEEHGHPMLRARHLPFEITPKRAEAWLSCMEQAMDDTGVHGHIREFVFERLALTAQHMVNTPNETGEI >NC_005957.1|WP_000360638.1|1194500_1195394_-|DsbA-family-protein MDKQEAKHINMPSPSACEHKSVEAYLFIDPLCKDCWEIEPFIIKLWLEYGKYFSIRHIVTGKVDGTNASSHKWNKPANIRFVWEKTTSLHGFSCDGKVHMQEASSTPYLVSMAIKAAELQGRKAGSKFLRKLQEYIFLENVSNPDCELLLACAKDSDIDVEEFKKDLYSASAKKAFQCDLKFTNEMHITEIPSLVFFHANSDEEGIKIAGTYSYDVYVQLLKELVKCEIEPEPLPPLEVLLEATQFISSKEVAFIYDCSKQEIERELKKLQLKRKVQMIDVKCERYWKWIAKEKDLV >NC_005957.1|WP_001984995.1|1194097_1194271_-|hypothetical-protein MKKTYIFLIILAVIVSFFLYILSLLQAFPKMIAFPLLFGVIVIALSYFNHKKRFKGF >NC_005957.1|WP_000003393.1|1192151_1193978_+|oligoendopeptidase-F MSEQNTAKTLPDRNEIEESSTWRLEDIFQTDTEWEKEFQAIKELLPKLTEFKGKLGDSANNLLEALQYEDEISMRLGKLYTYAHMRYDQDTTNSVYQALNDRATNLYSQVSSSTAYIVPEILSISEDTLQTFLKENRDLSVYEHALEEITRQRPHVLSEAEEALLAEASEVMSASSNTFGMLNNADLKFPSIKGEDGEEVEITHGRYIQFLESDDRRVREDAFKAVYETYGKYKNTFASTLSGAVKRNNFNARVRKYDSARQAALSNNNIPEAVYDQLIESVNDNLHLLHRYIDIRKRALGLDELHMYDLYTPLVPEVKMNVKYEEAQDMLLKSLHVLGDEYVDILKEAYENRWVDVYENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWHDNVNNLFTLAHEFGHSVHSYYTRKTQPHVYGDYSIFVAEVASTCNEALLNDYLLKTTEDKKERLYLLNHYLEGFRGTVFRQTMFAEFEHIIHKKVQEGHAVTPDMLTEIYYDLNKKYFGDALVIDEEIGLEWSRIPHFYYNYYVYQYATGFSAATALSKQILEEGQPAVERYINEFLKAGSSDYPIEVLKKAGVDMASPEPVKEALQVFEEKLNELEALLFEEK >NC_005957.1|WP_000612272.1|1190855_1192100_+|competence-protein MIPIFIAKRENGEKIHLLDHHDEELLHHMRKRESFFCIACGKEVLMRLGKQKRWHFAHKKVDSCLAFYEAESTYHMYGKELLYRWFKRQNVHVEIEHYLPEIQQRPDIFIERAGRKIAIEYQCANLSIEQLCKRTYSYWQAGIQVIWIIGGNQLKKHSAYWMKFSSIMAFSLQSYPQPLLIFFCSKQKSFMKCTFITSFSTSVAFSHIIYLPIETTTFEMLFSPVPFQREVLNREWKRRKDYFRQNALPILNYNHKSLLRLLYQCKCNPANFPSEIGVPLPSSFAFQTNSFIWQAFLYMKCIGELAVGDCISLKYVCSYIKKYTKRRMLPYFSQHIWKVAVTEYMTFLCYAGVLYKVGIYTYRKIRDAVPLKTGGEIIKHDEICLAHALSLFEAKFNMRGGKGDIIKTDREGIT >NC_005957.1|WP_000872716.1|1201040_1201781_-|bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase-PrpE MKYDIIGDIHGCLQEFQNLTEKLGYNWSSGLPIHPDQRKLAFVGDITDRGPHSLRMIEIVWELVIHKKVAYYAPGNHCNKLYRFFLGRNVTIAHGLETTVAEYEALPSHKQNMIKEKFITLYEQSPLYHVLDEKRLLVCHAGIRQDYIGRQDKKVQTFVLYGDITGEKHADGSPVRRDWAKEYKGTTWIVYGHTPVKEPRFVNHTVNIDTGAVFGGKLTGLRYPEMETVSVPSSLPFVPEKFRPIS >NC_005957.1|WP_000654695.1|1201855_1203016_-|rod-shape-determining-protein-RodA MKDPNSQYQIDYVLLCILFAIGTVSCFAIASAQASLPPFLQNVNFVLKQIQWYFIGFIAIGVIMIIDFDRYQKIAWYLYSFALVLLIGLELQVPGAITIKGATAWYRLPGIGNFQPSEIMKLFLIIVTGRIIANHNEKYFYRTIHDDFLLLGKICSTSLPPLLLIAKEPDLGNTMVISAMLAAMILVSGIRWRFIFGLASGIFAAGVTLTYIFFTHTKFFKAHILQEYQLNRFYGWLAPYKYDAQGYQLRQAFLATGSGEMQGKGWENGQVYFPEPHTDFIFTNVAEQFGFLGASVIIALFFLLIFRMIHIAIESNDPFGSYICAGTIGMFTFQVFQNIGMTIGLLPITGITLPLMSYGGSSLLTYMIAIGFVLNVRSRTKIFMFN >NC_005957.1|WP_000427734.1|1203158_1204094_-|glycosyltransferase-family-2-protein MENIKNVPLVSILIPTYNRPHYFKIALESALAQTYSNIEIIVGDDSTNNETEKLIYRDYLHKHKHITYIRNPSTLGQFHNALMLLEQSNGEYINFLMDDDIFYNNKIEKMMFYFQKDLDQNLALITSYRTWINDDGDIIEQHPSMKKLYDEDTLLNGKDFGNRMLILGQNIIGEPTTVLFRKRLLTEPFGTLNGRNYNCSVDMASWISLLSKGDAIYITEPLSSFRLHTGQQVHHKYLEGCEDFSHLVLHSKKYGFLQDIDYYKTSLLKACEWYKNATTFYQLYPELIPTTDTHTRLSHCLNIVTKELHAI >NC_005957.1|WP_001004735.1|1204100_1204859_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNENEKKITLIPPPEFVQYVGGHFEEVGKEFMQYFIEIGNLKSNETVLDVGCGIGRMAVPLMNYLSDDGTYYGFDLFNKGITWCKNNISTRRNNFHFEHVDIYNQFYNPDGKEDASQYKFPYEDESFDFIFLTSVFTHLLPKELEHYVREIARVLKKDGRCFITFFLINPESSYYLNAGLSPLGFYHQIDNCYVLNKDIPNFAVAYPEEDIRTLLNKYGLEMQTPPHYGSWCGRTEHTSYQDIILAQKISER >NC_005957.1|WP_000428855.1|1204995_1205841_-|O-methyltransferase MENKSAVQLYLELLKKTILFEIWLEYEPYLPASLHISKELSYEPVTVPLPLFLKQYVENHNLKIVNPNVSNNERQGGKDWPRAAHSMVGRKRMNQLQEAMETVVKENIEGDFIETGVWRGGSCIFMNGFLQANNITDRTVWVADSFEGLPAPNLEQYPKDYGDYLHTFDYLRVSLETVQENFRKYDLLNDQVKFLKGWFKDTLPSAPIEKIAIARLDGDMYESTMDSLVNLYDKVSIGGFIIIDDYGLITCAEAVTDFRSERNIKTPMTQIDDFGIFWRKE >NC_005957.1|WP_000069738.1|1205963_1206842_-|hypothetical-protein MSNNNYSNGLNPDESLSASAFDPNLVGPTLPPIPPFTLPTGPTGPTGPTGPTVPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGDTGTTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGDTGATGLTGPTGDTGATGLTGPTGATGLTGPTGPSGLGLPAGLYAFNSGGISLDLGINDPVPFNTVGSQFGTAISQLDADTFVISETGFYKITVIANTATASVLGGLTIQVNGVPVPGTGSSLISLGAPIVIQAITQITTTPSLVEVIVTGLGLSLALGTSASIIIEKVA >NC_005957.1|WP_000932921.1|1207007_1208108_+|glycosyltransferase-family-2-protein MLNKQGITISLCMIVRDEEKTIARCLDSVEKIVDEIIVVDTGSIDRTKEIVEKYTSNIYDFQWIDDFAAARNFSFSKATQEYILWLDADDVLLEDAQEALKLLKRELDPKIDAVSMPYHLAMDSNGKPLYCTKRNRLVKREKQFQWFGKVHEYLAISGETFSSNVAITHKKEKKVTNRNLKIFQDAVAAGEELSPRDLFYYANECMDNQKYDDAVLLYETFLNQDEGWYEEKIYACGKLGDCYAKLGLWEKAVESCVKSFRYAIPRGENCTRIGYIYMEQQKYNEAIFWFKLATEVPMATESPFHSPASYTWLPYLQMCICYSKLGEQDKAYYYNELAASYVPNNAAIEYNRKYFRSIFDQQKKSL >NC_005957.1|WP_001087865.1|1208259_1208949_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNSPKNSLYEEKSGHYYNAVNPNLLKHIKKEWKEVLDIGCSSGALGAAIKENGTRVSGIEAFPEAAEQAKEKLDHVVLGDIETMEMPYEEEQFDCVIFGDVLEHLFDPWAVIEKVKPYIKHNGVILASIPNVAHISVLAPLLAGNWSYTEYGLLDKTHIRFFTFNEMLRMFLKAGYSISKVDRVYIDHKMYEPLIEELYGVCKKHRLGSGFMAETVVFQYIIEAEKSSL >NC_005957.1|WP_001271203.1|1208945_1209632_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MSAAEKTILFVTCINDSKMYAQCVRHILRLAVPPGYVVQFMPIRNAKSMTSGYNQAISHPAKYKVYIHQDVFIMNVAFLHGLLQLFNEHEHLGMIGMIGAQYVPPNGVWNEGKGVVGKVIGYMNDLFYMASQEQPYHESKTFMPVECIDGLLMATQYDIPWREDLFDGFDYYDVSQSFEFRKAGYTVGVPVQRDAWCIHYHIDVNMTNYEKYRKIFVEHYMSDVNQDE >NC_005957.1|WP_000651510.1|1209644_1210325_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MKDHTILVVVCINNEELFEQCERQIRNLFVPPGYVVQIFPIRDAKSMASAYNRALSYPAKYKVYIHQDTFLINREMFYTLISLFKDNEKLGLIGVAGAQFLPSNGIWWEGKNLVGKVIEYRRQNYQLLNLDQLFYGNQSFMSVQAIDGLLMATQYDIPWREDLFQGFHFYDVSQSLEFQKAGYLIGIPNQANLWCIHYNGDEFDADTYEKYRKVFVEHYKDILSPS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_005957_2 | 2759296-2759478 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005957_2
|
2 spacers
spacers of NC_005957_2
>2.1|2759345|30|NC_005957|PILER-CR AATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGG >2.2|2759424|41|NC_005957|PILER-CR GTACAGATTGATCATCTCCTGCTTTTCTTTTTCACACCCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005957_2
The CRISPR arrays of NC_005957_2 >merge|NC_005957|2|2759296-2759478|PILER-CR ATTTTGAAAACACCTTTTCGGAATGAACGTTCATTCCTTTCATTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGATTTCAGAATGAATATTCATTCCTTTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTGCTTTTCTTTTTCACACCCTCATCGGAATGAATGTTCATTCCTGTCCTTATAAT >NC_005957|2|1|2759296-2759478|PILER-CR ATTTTGAAAACACCTTTTCGGAATGAACGTTCATTCCTTTCATTCTATT AATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGG ATTTCAGAATGAATATTCATTCCTTTAATTGTACAGATTGATCATCTCC TGCTTTTCTTTTTCACACCCTCATCGGAATGAATGTTCATT CCTGTCCTTATAAT
>NC_005957.1|WP_000040250.1|2756117_2759234_-|MMPL-family-transporter MSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADNMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKDLEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPFVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQAGELNTGLGDANGGIKEINDGLTIAKDKMDSKDSNSLSNVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLLNGINDGAKGAQQIESGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQTKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGATGSKQIANKSSELQTGLTKINDGQGQLLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTAKMTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKAIGGTTARNVDLKKVTGQDFLRTATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLLLAYFASLGISEQISTHVLHVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNELEGDPAMKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLTLIQVASVVGVALLLLAIIVMPILLPALIGLTSKMKNYAKKLSERK >NC_005957.1|WP_001093217.1|2754933_2755782_-|hypothetical-protein MNTKLIIVEGLPGFGKSTTAQLISDILSQNKIEVELFLEGNLNHPADYDGVSCFNKFEFDRLVSNSGDFKEVLLKRVLKKGSNYLLPYRKIKNEFGDQFPDELFNDISRNDIYELPFDKNVELIADKWNEFAEIALEDNKVYIFECCFIQNPLTIGMIKYGEQKEKIINYVMKVAKIIENLNPMLFYVEQDNLEFSFRKALKERNPEWATGIVDYYTNQGYGKEHNHSGVEGAIKVLEARRNLELEIFDMLKMKKEKINNTKYEIDSYRSMLKDKLTIQMVK >NC_005957.1|WP_000633861.1|2752942_2754568_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSNVSLRFADRKLFEDVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPSTGDIHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTQLYKVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEDLHDKKLSELTGAEKVKVLLAQALFGKPDILLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWYESSQLALKLTQDANKKKEEKVKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIRPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSKYFENSDLNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVITLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTILFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKEATYDEFLENEELQKQVDAMYKGQ >NC_005957.1|WP_000808767.1|2750452_2752426_-|LTA-synthase-family-protein MKQFLLKSKSVLSNHFGFFLFAVILFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAVLFLGLALFAKGKRSYIWLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGDLGGSIVALLHLYDSLYFLDTIILIVLVTTKFANPKPIRVAKYKVSLVFVAGILLFSVNLGLAESDRPELLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSAKASTERALADGDNMTEVRNYLTSTYASPNPEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFLNSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQSAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETLKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPANTGDSSVDTYFQTARYLDESVKGFIDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNAAMSKVMGKEINSFENAQLQRVPLIVRVPGVKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGTDTKNYVQFGSDLLSPDHKQVVAFRNGNFVSPTVTALNGKYYDTTTGKPVEFTDEIKQNEQMVQNSLKYSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPIDRSKYNYNNRDKNKTKVKTAPEGEAK >NC_005957.1|WP_000346925.1|2749721_2750393_+|TerC-family-protein MDFLSAEYLSALLAIIVIDLVLAGDNAIVIGLAARRLPKDQQKKVIIWGTIGAIAIRALATLIVVWLLKIPGLLLIGGVLLIWIAYKLIAEGKDHDIKAEEGFWSAIKTIIIADALMGIDNVLAVAGAAHGNFSLVIIGLLVSIPVVVWGSTLILKWVDRYPIIITIGAAVLAYTAAKMIVDEKWFAAFFESNPFIKWAFIIIIIAGVVFFGKTKQKATDGSI >NC_005957.1|WP_000551418.1|2747961_2748789_+|polysaccharide-deacetylase MHNGIRMTTLMKRAMLICAGVLFTYEAALGSAHTALASTEDEAKSVQLVSEIQSSLAPKEAPKQYNGQVRKVAYLTFDDGPGKYTAELLDMLKKENAKATFFLIGSNVKAFPDLVKREDAEGHYVGMHSMTHNYKKLYTEGHYVDEMKEDQGLIAGVLGKSPVLTRPSYGSMPGLNEALRNKVVENGLKVWDWTIDSLDWRYNKMPVDAASAKIVENVINGANKPTEVILMHDIHPQSVKAVPGIIKGLKEKGYELEAYSENEHFPLNFWHDNRM >NC_005957.1|WP_001106987.1|2747483_2747744_-|hypothetical-protein MNYKKMLSILMTSIFTVGLLMGCNPAPKDEKEPDPTEEPSEQRQEEKNEKQDPAKEQNNELNKKDEQEPDPTEEPSEEKKKKKENE >NC_005957.1|WP_000923440.1|2746434_2747118_-|DNA-alkylation-repair-protein MLLEEVMQQLEEYGTEQNRKTYKNHGAKEPLFGVSFANLKLLKKKIKKDHDLAISLWETKNMDAMTLATMILDPKKVTTELLNKWVQEVDYYCLMDVLMTAICTSPIAIERMEEWTKSDDEWIGRAGWSLLANIAIKNKTLQDDFFSPYLEEIKENIHNEKNRKREAMNSALIAIGIRNEDLEQTAIEIAREIGKVQVDHGATSCKTPDAESYIKKARERAEKKKVK >NC_005957.1|WP_000646306.1|2745716_2746418_-|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MKAMEAAQSIITSHFPDCDVALLGGSVARGEATKTSDLDIVIVDQSLTSCYRESFYSNGWPVEVFVHNFETYKTFFKMDCDRGRPSLPQLVSEGIVLKGENEIVEKLKREANDLLNKGPAKWTEEMMKQKRYFITDTLDDFIGASKREEELFIANLLADLLHEYVLRVNGKWLGNSKWFIRVLRKYDEQYADQFVAAFDHFYTTGEKSKLITFVEKTLEQYGGRMFEGFSIGK >NC_005957.1|WP_001102425.1|2745155_2745701_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVPFVQLRELTLDDVEDRYQWSLDTKVTKHLVVPDQYPPFTLEDTKQWIEACINRKNGYEQRAITAENGIHIGWVDLKNFDKTNKNAELGIAIGNKEYWGKGYGIAALYSMLHVAFFEFELEKVWLRVDEDNLQARKSYEKAGFVCEGLMRNDRLRKGRFIHRYRYSMLREEYQSLISSL >NC_005957.1|WP_001107293.1|2759487_2760054_-|TetR-family-transcriptional-regulator MAKNKQEDIFDAAIQLFAERGYDGTTIPMIAEKAKVGAGTIYRYFENKEALVNSLFTKSVLQLSELIKTDFPVNANIREQFSHTYNRLFEFARQNADAFLFTNSHCDSYFLDEHSNEIFEDFMGFFMDLIEDGIEKGFLRPLPPIALIIIVYQPIEKLIKVMETGQLEYTEELVKELEESCWNAIRII >NC_005957.1|WP_001100961.1|2760363_2761521_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVIRLKEDKFREALRLSEYAFQYKVDEDRLQQQLTKMKESHEVYGIMEGENLAAKLHLIPFHIYIGKEKFKMGGVAGVATYPEYRRSGYVKELLQHSLQTMKKDGYTVSMLHPFAVSFYRKYGWELCANLLICHMTKSDLVMKKQVNGTVKRFNKENHQEEVEKLYETFAERFSGMLVRNEKWWLQAVYDDLTLAIYYDENKTAAGYMLYKIEKSKMTVEEFVPLHNEARNGLWNFICQHDSMIKDFEMTVSENEPFLYTLQEPRVKTEIKPYFMGRIVDVEQFLKQYELNWNNVQQEVILHITDSFAQWNNITVRLANHEITIIEEPIDKGIKLDINALSTILFGYKRPLELNELELISGSEEEIRAFENVVPVRKPFIYDFF >NC_005957.1|WP_000664618.1|2761808_2763098_-|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MKERTIQPVNNGLNGNITIPGDKSISHRAVMFGAIAEGTTTIKGFLPGADCLSTISCFKEMGVDIVQDGDEVTVVGKGLEGLQEPKAVLDVGNSGTTIRLMSGILANTPFFSCVQGDASIAKRPMKRVTNPLKQMGANIDGREEGTFTPLTVRGGDLKAIEYTSPVASAQVKSAILLAGLRAEGVTAVTEPHISRDHTERMLEAFGVKVTREGKTVKLAGGQKLTATDVQVPGDVSSAAFFLVAGAIIPNSKLVLENVGMNPTRTGIIDVLEKMGATFTVEPINEGASEPAANITIETSSLKGIEIGGDIIPRLIDEIPVIALAATQAEGITVIKDAHELKVKETNRIDTVVAELTKLGARIEATDDGMIIYGKSALKGNTVNSYGDHRIGMMLAIAGCIAEGKTIIEDAEAVGVSYPTFFEELQKLAK >NC_005957.1|WP_001228123.1|2763114_2764215_-|prephenate-dehydrogenase MRKKVVLIGTGLIGGSLALAIKKDHDVTITGYDIFQEQVERAKELYVVDEIAVDLQHACEEAHLIVFASPVEETKKLLHKLASFHLREDVIVTDVGSTKGSIMNEAEALFSKEISFIGGHPMAGSHKTGVESAKAHLFENAFYILTPMHHVPNEHVEELKDWLKGTGSHFLVLNTEEHDYVTGIVSHFPHLIAAGLVKQVEKHAGDNPLIHQLAAGGFRDITRIASSSPKMWSDIVKQNREHLMVLLKEWISEMEDLYDTVSSGDAGEIQNYFADAKEYRDSLPVRKRGAIPAYHDLYVDVLDKVGALAHITSILAREEISITNLQILEAREGLLGVLRISFQREEDRMKAKLALGEEKYQTYETI >NC_005957.1|WP_001197241.1|2764207_2765308_-|histidinol-phosphate-transaminase MQVKDQLSSLQPYKPGKSPEQMKEVYGDHSFVKLASNENPFGCSPRVLDELQKSWLDHALYPDGGATTLRQTIANKLHVKMEQVLCGSGLDEVIQMISRAVLKAGDNIVTAEATFPQYRHHAIIEGCEVKEVALNNGVYDLDEISSVVDNNTKIVWICNPNNPTGTYVNDRKLTQFIEGISENTLIVIDEAYYEYVTAKDFPETLPLLEKHKNILVLRTFSKAYGLASFRIGYAIGQEELIEKLNVVRLPFNVSSLAQKAATIAFGDDEFIEEIVRVNTEGLRQYESFCKENEIPFYQSQTNFIFLPVENGGEIYEACAHAGFIIRPFPNGVRITVGTREQNEGVISVLQQHFENKKRKSRDEANA >NC_005957.1|WP_001269404.1|2765325_2766498_-|chorismate-synthase MRYITAGESHGPQLTVILEGVPAGLTLAAEHINKELLRRQKGHGRGRRMQIETDTVEIVSGVRHGMTLGSPITLIVKNDDFKHWTKVMGAEPISEKESKEMKRTITKPRPGHADLNGAIKYGHRDIRNVLERSSARETTVRVAAGAVAKQILKELGVEIAGHVLEIGGVKAKHISNLSIEEIQIITENSPVRCLDKTVEQEMMDAIDNAKSSGDSIGGIVEVIAEGMPIGVGSYVHYDRKLDAKLAGAIMSINAFKGAEIGVGFEAARQPGSKVHDEILWDEEQGYTRKTNNAGGLEGGMTTGMPIVVRGVMKPIPTLYKPLASVDIDTKEAFQASIERSDSCAVPAAGVVAESVVAWELAHALVEQFGKDRMELIQQNITQHNKYAKEF >NC_005957.1|WP_001273580.1|2766780_2767857_-|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MANHELDQLRKQVDEINLQLLHLLNKRGEIVQKIGEQKQVQGTKRFDPVREREVLDMIAENNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGELIGNGTQTFIMGPCAVESLEQVRQVGQAMKDQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFINAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYERATRNTLDISAVPILKKETHLPVIVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMDELKGFKNKLS >NC_005957.1|WP_011181718.1|2768688_2772201_-|DUF4020-domain-containing-protein MTFLGKGESSVWITSEVEIPDELIDHLEKGKLVLFVGAGVSMKGKSNLPNFDDLVDEIAKTLYVEKREITEPHDYYLGKIAKTKDVHQVARDLVHIEKSKPNPLHYAIPRLFPLDTEVRIVTTNFDRHFTTAMKEMNRELNVYYAPALPTGRAFKGLAYIHGNIEQEKEALILTDGDFGRAYLTEGWARRFLVDLFSNYTVLFVGYSHNDPVMKYLATGLPPSTRRYAFVAQGENTYHWEHLGIRPIVYPNKGNNHQSLVKAVKRWAELMGDNYITKRMRIRDIVTVPPSVEQEQLSYIKQSIKKIETVRYFVEFAHDYEWVEWLEAEGKLQNLFLITSNYNEVDELLAKWLVEQFLFSHQKELFQLIFKNHSKLSPLLWRTICSYLNETKMKMDPLLFARWTLLLLETAEKDSKSIETISYLLQKCSFPEHKEIALLLLTFILDGKLKLKRERKWGNDNGESIELEESSRLPVSTFSFVEQIWNEKMKPHISYYAVPIMMMGIEKMRMLSLRQAALKKRDKENVEKEFQQNDLAFLIQIVKECLAYLCENNEKKANYYITEMIEANSVLQNRIAIDAMNKNVFVSADEKMKWLLQEGILLDVTYKHEVFQLIKNHFALSLEKTKEEVIQIVLKDLAEERAFDVCFVLDLLFTCDSNSPSTAKGYELMKQKHPHFHSERYSVQKKEAAEQSITCNVTADGLLQLKDEEIMKQVQQFSQDGVFEQRHFLEMLSKACKLNTEWSISFAYQLVGMHEISNEVWFVCIREWRNNRGLTNEQIQKVIPLLQKFVRNTAFHWLISSFLYEISNRLEELEENSIRNVKRFAFSVFPQVMKSDTNFKLAKQDFYNESIQHPVGKMTAVLLKLLSYDHLYDRNVYEYLFLFEEQVRISTERTNFMIARLVADITFLYHIEKQWCRKYLLPYLELKKENEITKYAWAGLCYTQINLPLFTEMKRFIKYAVEHLEVLHPHTREAFLKWLSFVFIKCVLYWEQKTDWLYPLLIRENEENKIKFMQFLCYYVKTLSAKEQQKFWAAWLSIFLRERPKMGGITAREYVMLLRIILFMDEIVERGLSIICKSFSDVGGKGNQTELKQLFHEILEKTESIKMYKELYANVFFTLLQALQEANLLETEIIQIKELLIGYRVEKCVINAIDNEIIRIGIVLENLQEEM >NC_005957.1|WP_000997708.1|2772351_2772789_+|YndM-family-protein MNDFTVVLIKFISCIIAFSIGLALFFPATFVQIISFSLFVTIVSYMFVDKIILNRIGNTGAIMSDFLLTYLSVWIFGNILLDNYMQIAWGSILSAIVFTLSEVIVHRFSSSRTRHHNDNIHINRRFAYGTEFAEEQNILDKDKKK >NC_005957.1|WP_000287749.1|2772958_2773453_-|cysteine-hydrolase MYTAGMSVHNGEKFLETLQELIGECRSNDIPVIYVQHNGPKDHPLEKGTDGWKIHAAITPLEGDSIVEKTTPDSFYKTNLNEVLQDKGITHVIISGMQTQYCVDTTTRRACSEGYKITLVSDAHSSTFDTEVLRAEDIVKHHNVVFGAFADVVTLKDLKVTASK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_005957_3 | 4488699-4488849 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005957_3
|
2 spacers
spacers of NC_005957_3
>3.1|4488730|29|NC_005957|CRISPRCasFinder GCGCACCTCGATTTATATCAGCGATTCCT >3.2|4488790|29|NC_005957|CRISPRCasFinder GCGATTTCCCAATTATATCGGCGCATCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005957_3
The CRISPR arrays of NC_005957_3 >merge|NC_005957|3|4488699-4488849|CRISPRCasFinder AAATTATATCGGCGATTTTTCGAATATATCGGCGCACCTCGATTTATATCAGCGATTCCTCATTTATATCGGCGCATCTCCATTTATATCGGCGATTTCCCAATTATATCGGCGCATCTCCATTTATATCGGCGATTCCTCATTTATATCG >NC_005957|3|2|4488699-4488849|CRISPRCasFinder AAATTATATCGGCGATTTTTCGAATATATCG GCGCACCTCGATTTATATCAGCGATTCCT CATTTATATCGGCGCATCTCCATTTATATCG GCGATTTCCCAATTATATCGGCGCATCTC CATTTATATCGGCGATTCCTCATTTATATCG
>NC_005957.1|WP_000118540.1|4488331_4488643_+|peptidase-M4 MSWKGLVAGLGVGFAAGYFVANKVQEQSHISSEKALKMVKQALSHKGEITGSWVHMVPETFEKYDVAYEVYRGGLTTMLNDIQERFEFLVDAKTGTVLEVIAA >NC_005957.1|WP_001031503.1|4487109_4488183_-|M42-family-metallopeptidase MNKETLQLFRTLTELQGASGFEHDVRRFMKQELSKYADEIVQDGLGSVFGLKKGDETGPRVLVAGHMDEVGFMITQITKNGMLRFQPLGGWWSQVLLAQRVQVMTKNGPVIGVVGSIPPHLLSDAQRAKPMDIKNMLIDIGADSYEDAIEIGVKPGQQIVPICPFTPMANEKKIMAKAWDNRYGCGLAIELLKELKDETLPNTLYSGATVQEEVGLRGAQTAANMIQPDIFYALDASPANDASGDKTQFGQLGKGALLRIYDRTMVTHRGMREFILDTAETNNIPYQYFISQGGTDAGRVHTSNSGIPSAVIGVCARYIHTHASILHVDDYAAAKELITKLVRATDKTTLETIKNNA >NC_005957.1|WP_000869966.1|4486359_4486869_-|DUF84-family-protein MKVVVGSKNKTKVGAVEKVWSDAEITSLSVPSGVAAQPFSDEETMQGAINRAKRALEKGEAQIGIGLEGGVMKTEYGLFMCNWGALATSDGKIFVAGGARITLPDDFLAPLEEGKELSEVMEEFVQRKDIRSHEGAIGIFTDDYVDRTELFVHVVKLLVGQYKYDEKQA >NC_005957.1|WP_000838193.1|4485961_4486276_-|thioredoxin-family-protein MKSLESMEQFQQLKNEENVVFMFSAEWCPDCRFVDPFMPEVEEKYSDFSFYYVDRDEFIDLCVKLDVFGIPSFVAYNKGEETGRYVNKDRKTQEQIEEFIEGLK >NC_005957.1|WP_000784593.1|4485069_4485882_-|DUF1444-domain-containing-protein MKMTSKKMKDELMKKLSRPEWDFHYDSEKEVLRIEQKDSKKGINVSLPGVVAKWEVNKEKAIEEVAYYVQEALIAMHKEENSAAKILPVIRSTSFPKQAEEGNPFIMTDHTAETRIYYALDSNKTYRLIDERLLQKLGLTEQQVREMALFNARSLSYEFKQDTVAGNTFYFLNTNDGYDATRILNESLLQSMREKISGDMVVAVPHQDVLIIADIVNEIGYDIIAQMTMKFFAEGHVPITSLSFVYEDGDFEPIFILAKNRKKTDGKEKG >NC_005957.1|WP_001006759.1|4484458_4485073_-|DUF4479-domain-containing-protein MNEVNVFYNLEGIGDTLIVALQDITLENRTFDRKGDVARVYDRESNETAGFNIFNASSYLEVKETGNLTLTKELVEKINEILAKNGFEETVEADLSPKFVVGYVAEKEKHPNADKLNICKVEIGTETLQIVCGAPNVDAGQKVVVAKIGAVMPSGMLIKPAELRGVPSAGMICSARELELPDAPQEKGILVLEDSFEVGQEFKF >NC_005957.1|WP_000813285.1|4483802_4484147_-|hypothetical-protein MKQQLKIAELLKRIETSKQQDIELGSYEIYLFSENELEKGQIGYRYDKHQNSLISEEHGKWKDEWIVIGYETDMGDPVFVNIDDDAYPVYTAERGTEVWQPVHIGNIDEIIKQL >NC_005957.1|WP_000888064.1|4479564_4483581_-|DNA-translocase-FtsK MLDWMKKLFNKEEEQTAMNKEVPKQVESQPKIPRVNHYTEAREAQMASRNAGKCRFPLVPDNGFDEEDVIETGRFEEQPVQAVTYENEPVQRGIKVERSRRPYVEKVVSTYEEPEMQYEPERESVVKKASAPAQESNRRPFRPTEMISPIYGYNRPSVEKKEEKQEEVKEREDLEISVEGKSVVDAWLEKKGYTLSDFSDGQAPTSSSHRAANEQGERQYEESKKEEKSVVDQWLEKNGYEIERQEPIVEEKEVVQEMSAPQEVPAAELLHETIAERMEGAKQESDVVDKNILQEELVDSKVEHEDTILSEEIKRSTEIEQPTIEVEKQAPEESVIVKAEEKLEETIVVEIPEEVEVIAEAEEREEVEVIAETEESEEVEVIAETEELEEVEVVAETEELEEVEVTAETEELEEVEVVAETEELEEVEVIAETEELEEVEVIAEAEESEEVEVIAETEAPEEVEPVALEEMQQEMVLNEAIEQKNEFIHVAVADEQTKKDVQSFADVLIAEEQSVVEETPIVEEQPVAEEAPVVEEQSVVEETPIVEEQPVAEEAPVVEEQSVVEETPIVEEQPVVEEAPVVEEAPIAEEQSVVEEAPVVEEQPVAEETSIVEEQPAAEETSVVEEQPVAEETSVVEEQPVAEETSIVEEQPVAEEAPVVEEQPVVQKEEPKREKKRHVPFNVVMLKQDRARLMERHASRTNAMQPSMSERVENKPVHQVEEKPQVEEKPVQQVVEPQVEEKPMQQVVVEPQVEEKPVQQVVEPQVEEKPMQQVVVEPQVEEKPVQQVVEPQVEEKPMQQVVVEPQVEEKPVQQVVEPQVEEVQPVQQVVAEQVQKPISSTEVEEKAYVVNQRENDVRNVLQTPPTYTIPSLTLLSIPQQAALDNTEWLEEQKELLDTTFNNFHVGAHVINVSQGPAVTRFEVQPDPGVKVNKITNLSDDIKLSLAAKDIRIEAPIPGKSAIGIEVPNKESKPVFLREILRSPVFTKSESPLTVALGLDISGDPIVTDIRKMPHGLIAGATGSGKSVCINAILTSILYKAKPHEVKLMLIDPKMVELAPYNSVPHLVAPVITDVKAATAALKWAVEEMERRYELFAHAGARDLTRYNTIVSGREIPGETLPYIVIVIDELADLMMVAPGDVEEAICRIAQKARACGIHLLVATQRPSVDVITGLIKSNIPTRIAFTVSSQVDSRTIIDIGGAEKLLGRGDMLFLGNGTSKPVRVQGVYVSDDEIEKTVDHVKKQMKPNYLFKQEDLLAKTEQAESEDELFLDACQFVVEQGGASTSSVQRKFRIGYNRAARLIEEMESQGIISEGRGTKPRDVLISEDEFAAMQETNV >NC_005957.1|WP_000658369.1|4478384_4479503_-|nicotinate-phosphoribosyltransferase MKEIELKLKGEINRLTNKTFKFDERVGEGWFSAVYFLKTREIIEEFRPKSVVTMQFFQKENAVLCGTDEVIALLQTFAKNPEELEINSLKDGDKISPFETVLTIHGPYENFGFLEGVIDGILARRTSVATNVYNVVQAARSVDKEKPVIFMGDRDDHYTQQAGDGYAAYIGGMSAQATHAMNEWWGKSGMGTMPHALIQMFNGDVVEAAKAYHKKFPEDELVVLIDYNNDVITDALRVAREFGSTLKGVRVDTSRTMIDQYFIRHPEVLGTFDPRGVNPSLVFALRKALDEEGFQHVDIVVTGGFDEKRIREFEAQNVPVDIYGVGSSLLKMNIGFTGDNVELNGKPEAKAGRKYRPNPRLERVQLEKREDM >NC_005957.1|WP_000219470.1|4476821_4478132_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MTVYHFVGIKGTGMSSLAQILHDMKHTVQGSDYEKRFFTQTALEKRSISILPFDKSNVKEGQVIIAGNAFPDTHEEIVAAKELNIPVHRYHHFLGDLMNQYTSVAVTGAHGKTSTTGLLAHVMQGAHPTSYLIGDGTGHGVENSKYFVFEACEYRRHFLSYNPDYAIMTNIDFDHPDYFTDINDVFSAFQEMALQVKKGIIACGDDEELQKIQAKVPVIFYGFGEDNDFQARNIQKRTDGTIFDVFVRNTYYDTFKITGYGNHSVLNALAVIALCHYENVDVEAVKHQLTTFEGVKRRFNEKPMGEQVIIDDYAHHPTEINATIEAARQKHPEREIVAVFQPHTFSRTEKFLDEFAESLSKADQVYLCDIFGSARENKGELTIEDLQKRIDGAELITDTTTDVLKKHKNGVLIFMGAGDIQKFEAAYVKEVQVAEK >NC_005957.1|WP_000436857.1|4488938_4489793_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MEQLQIGDIKVTWLKGGNTHLDGGAMFGVVPKVLWSRKYKHNDTNHIYLRTDPLLLQTKDGNMLIDSGIGNGKLNEKMKRNQGVTEESSVYESLEKLGLKPEDIHYVLMTHLHFDHASGLTKGESNHLVPAFPNAKIYVSETEWNEMRNPNIRSRNTYWKENWEPIVDQVVTFQQEIEITDEIKMAHTGGHSDGHAVIALESKGETMLHLADLLPTHAHQNVLWVMAYDDYPMTSIENKQKWMKYGAEKDAWFTFYHDAYYRAVKWNEEGHIVEKIERKTSIEA >NC_005957.1|WP_001239380.1|4489862_4490516_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MRLRHKPYAMDRINEYSHIVIGNPEERAGNWKEVFGNEQPIHIEVGTGRGRFMYDMAKANPHINYIGIEKFTSVVVDALDKLIEEELPNLKLINKDAEDLTVFFAKGEIDRVYLNFSDPWPKKRHTKRRLTYKTFLRNYEEVLVEGGEIHFKTDNQGLFEYSLMSMAEYGMLLTYLSLDLHNSDFEGNIMTEYEEKFSSKGHRIYRVEAKYRTEPMQ >NC_005957.1|WP_001122234.1|4490748_4491027_+|hypothetical-protein MPINQQHQLEVLKDILVNHQSDCCGTVSECEQLERLIQSLLANDNISSDAKAMLNDVYSYSQSGKSSSNLDNHISNNQEQLTQWIAGMDNFS >NC_005957.1|WP_001055736.1|4491030_4491828_-|phosphotransferase-family-protein MNMEWLEQLLGKEWSLVPAGGVTGDAYIAQNGQQKLFLKRNTSPFLAVLSAEGIVPKLLWTRRVTNGDVISAQKWLPGQKLEPEDMKLERVAKLLKKIHSSKALVQMIQRLGKQPLHAQELLQQLQLVLRGDIRDEETIQQGLQYLMDSLKDIEYNEFVVCHCDVNHNNWLLSDEDELFLIDWDGAVIADPALDLGMLLYWYIPRQEWSEWLGYYDIEMDESLLKRMRWYVIAQTILSIQWHTTKKQQAEAEYWHQYLQQLLASE >NC_005957.1|WP_000921725.1|4492057_4494199_-|type-I-pullulanase MLKVKRPFDAYLDEMNKITILLPHAYGTSRTFRLQEGSNVKDLPIAHTIALPDATKYECFIEEPLDVGKYYTVRDERNEETDLQIGAVIRTEIFDEKYYYEGTDLGAVYQEEATTFKVWAPTARLAKVRIYKSDKEYTDHEMHREENGVWAHTLQGDLAGEKYTFLVCINLIWNEAVDPYAKSVTVNGKYGVVIDLEKTNVTKQEQLPPLQAMTDAILYELHIRDATIHEGSGVSKKGTYKGLMEEGTKGQNGTLTGLSHIKDLGVTHVELLPLYCFGGVDEANPSSAYNWGYNPLYYNAPTGFYATNPSDPYNRIVECKELIETFHEHGIRVIIDVVYNHVYERELSSFEKLVPGYYFRHGENGMPSNGTGVGNDIASERKMMRKFIVESILYWLTEYNVDGFRFDLMGILDVDTINIIEKEVRNIKRDALLLGEGWDLQTPLPLEEKATLNNANKMPHIAQFNDQFRDGIKGSTFHINKRGFAFGGHVDRNHLQYIVSGSLLSMKETGLFLEPVQSINYVECHDNMTMWDKLMRSNEESEEILKKRHVLATAMAILSQGIPFLHAGQEFYRTKQGNENSYNANDEINQLDWDRKEKEIETVNYIKGLIAIRKEHGAFRLQNADLIKKHMTFLQTSPEVLAYHLEHVESFGPWKEIVVLFNSSLEAKTVQLPKEETWHVLVNEKQAKIEPISSFRGKELRLSPISTYILTIM >NC_005957.1|WP_000433233.1|4494336_4494882_-|RNA-2',3'-cyclic-phosphodiesterase MEPHYFVAITLPNHIKEVLSNYREEMQEELPFRSWVHKEDYHITLSFLGSATEEQLEGIKNGLQTLIETKELSFTLQGFSTFGMEDRPRIFWAKVSENQDLFPLQKQVHAICEGNGFSLETRPYHPHITVARKWVGEEKFNLEHIKEVPEISFQADTITLYESHVKETPKYKAIAEIKLQK >NC_005957.1|WP_001274265.1|4494985_4496392_-|dipeptidase-PepV MSAINWTEEVAKRKDDLIRDTQQFLQIKSVWEEESAKEGAPFGEGVEKALSFMLHKGETEGFTSKNLEGYAGHLEMGQGEELVGILCHVDVVPEGDGWTTPAYSADIRDGKIFARGAIDDKGPTMAAYYAMKIVKELGLPLSKRVRMILGTDEESNWKCVDHYFKNEEMPTIGFAPDADFPIINAEKGISDIQVVQNGSEEKKGAYELVSFESGRRLNMVPDFAEAVVTGEDVNALTVAYEEYLQTAKKIGEAIVEGNTVTLQIKGISAHGSTPEKGENAGLLLANFLTTVALDGKANAFATFATETFTGDIFGEKATIAYKDEVSGPLTVNVGRLSYAKENGGNLGLNVRYPVTTNFEEMIAKLKEYVGTHGFAVADYSNSRPHHVDKDHVLIRTLQRVYEEQTGEKAELLAIGGGTYARSLKAGVAFGPLFPGKEELAHQKDEYIEIEDLLKATAIYAQAIHELAK >NC_005957.1|WP_000805512.1|4496749_4496971_+|DeoR-family-transcriptional-regulator MKPTTTRMLTRIKSIYMYINENGTVTTKDLVDEFGITPRTIQRDLNVLQFNELVYSPCRGKWTTTGKKVRMTS >NC_005957.1|WP_001234935.1|4497052_4497781_-|rRNA-pseudouridine-synthase MRLDKLLANMGYGSRKEVKKLLKDGVVKIDGISVKDAKVHVNVEEQEVMIHGEVVEYKEFVYLMMHKPQGVISATEDDNHETVIDLLELEDAIFNPFPVGRLDIDTEGFLLITNDGKLSHQLLSPKKHVPKKYYAHVAGVVTEEDVKEFAKGVILDDGYETKPGALTILKSDDISEIELVITEGKFHQVKRMFEAVGKKVVYLKRTEMGPLVLDEELELGQYRELTDEEVEMLKTYQVDTEK >NC_005957.1|WP_001284049.1|4497822_4499475_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MSDSKFLRGTLIVTLGTFLVKFLGMIYVFPFHALVGTEGGTLYTYGYIPYTIFLSIATAGVPLAVSKFVSKYNALGDYKTSRRMFRSGMVMMIVTGVLSFLVLYMTAPLFAEAMLGKQSVHSNIGEVTTIIRLVSFALIVVPAASLIRGYFQGHQSMGPTTVSQIIEQIIRIVFLLAGSFIVIKVLGGTVATAVGVATFAAFVSAVGALGVLIWYWLKRKKHLDQYLIEQTVPESTVSTVQLFKELFAYAIPYVVIGLTIPLYQQIDTLTFNSIMQAIGQGDIAERALGIFTMWTHKLIMIPVSLATAFSLTLVPAITKSFTEKQYRYLKLQITQTFQANMFLTLPAVVGISSLAYPIYTAFYDSDPLGGQVLMWYAPVALLFALFTVTAAILQGINQQKHAIIALIMGVILKFVCNVIFIRYFGTVGAILATAVGFLASVWYTNQQIKKYAHYSFGVVYKRTFQIAVLTLVMVVTVKLSQWILSFMISPDSRIGALITVAICAGLGGLVYGLLAIRTGVLERVFGGEALEKIQRKLGNRFKIKLKSKGA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_005957_4 | 4642807-4642893 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005957_4
|
1 spacers
spacers of NC_005957_4
>4.1|4642833|35|NC_005957|CRISPRCasFinder TTTTAAGTATCGGTCGATAAAATGTGAAAATCGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005957_4
The CRISPR arrays of NC_005957_4 >merge|NC_005957|4|4642807-4642893|CRISPRCasFinder GATATATCTTAAAAATCGCCGATATATTTTAAGTATCGGTCGATAAAATGTGAAAATCGCCGATAAAAGTTAAGAATCGCTGATATA >NC_005957|4|3|4642807-4642893|CRISPRCasFinder GATATATCTTAAAAATCGCCGATATA TTTTAAGTATCGGTCGATAAAATGTGAAAATCGCC GATAAAAGTTAAGAATCGCTGATATA
>NC_005957.1|WP_001260128.1|4641799_4642522_+|lipase-family-protein MRTPLSFDKDTAILLASCCELTYEQYKQNGIFEIPNGFQYVQGFQGKTIQTTEWFGFILESEDTIIVAFRGTQTDTDWIIDSLVNQKPYPYALNSGNVHNGFLSIYESCRDSIMDMLVSLPAHKKLLATGHSLGGALATLHILDARINTAFAQYGLYTFASPKVGDIAFRNYYKLQVASSFRFVNLFDVVPLLPPRNVHFNEQDWEYAHVHHNMTFTKNTKSIANNHAMTTYKTCLTSHF >NC_005957.1|WP_001147838.1|4640852_4641635_+|TIGR00266-family-protein MQAHEIEYKLYGDDMQFVEIELDPEESVIAEAGAMMMMEDYIEMETIFGDGSGPSGGLFGKLMGAGKRLVTGESMFMTVFTNTGHGKRHVSFAAPYPGKIIPVDLTEYQGKVVCQKDAFLCAAKGVSIGIEFTKKIGTGFFGGEGFIMQKLEGDGLAFMHAGGTVYKRELKPGEKLRIDTGCLVAMTKDVNYDVEFVGKVKTALFGGEGLFFATLEGPGTVWIQSLTLSRLSARLTSPAAQGSGEGSVLGGLGRLLDGKE >NC_005957.1|WP_001193054.1|4640325_4640526_-|cold-shock-protein MQTGKVKWFNSEKGFGFIEVEGGDDVFVHFSAIQGDGFKTLEEGQEVSFEIVEGNRGPQAANVTKN >NC_005957.1|WP_000957385.1|4639549_4640281_+|yteA-family-sporulation-protein MLTPQQINQFKSVLEKQKQELEQTIQTHENEDRASERESVGELSSYDNHPADMATELYERQKDFGLIELWHKQLEDTKHALQKIEAGTYGICEVSGEEIPFERLEAMPTATTCIQHTTNKLNMETRPVEEEVLSPSFHKHDEDHSVEYDAEDAWQDVANYGTSETPSDLERQDSKNYNGMYVNSEENVGYVEDFENFIGTDMYGKNPQVFATEEHEEYEQMLDDFEERTFKGELSSNESSSKE >NC_005957.1|WP_000425747.1|4638486_4639440_+|1,4-dihydroxy-2-naphthoate-polyprenyltransferase MEMNVETNSSPTAPKPSKQTGWRIWWSLLRPHTLTAAFVPVFIGTAYAMQVGGINQIHLPLFLIMLLACLLIQAATNMFNEYFDYKRGLDHEGSVGIGGAIVRDGIQPKTVLNLAFGFFGIAILLGVYICMNSSWWLAAIGLVCMAVAYLYTGGPLPIAYTPFGELTAGLFMGVIIIGISFFIQTGTVTSEVVLLSIPSSILIGAILLANNIRDLDGDKENGRKTLAILVGRERAVGVLASMFIVSYIWTIALIIVGIVSPWMLIVFLSAPKAFKATKGFIGKSIPMEMVPAMIATAKTNTIFGLLMGIGLLLGYFL >NC_005957.1|WP_000616720.1|4636897_4638292_-|isochorismate-synthase MIQTKQIGLQEVLSAAIKRATDEKILVSFVKQIDWMDPLLFYAAGKRISFENRCYFADPAQHVIFAGIGSVFTIATASHKRFQTARDEWDKVKEKAFVQREKYEFGTGPLLFGGFSFDQEKEKTDLWKEFDDTTFSLPAFLLTVKNEKAWLTMNTFVSATDCAETLYNEIVSLEEKIFEESKCALEGSKLTVTSKVEVDPKGWMKAIEKVQDEMKQGNVQKVVLARELKVEMDHHIDSALVLEALRIGQPDCYVFSFDYKGACFLGATPERLIRKEDEKFTSMCLAGSTGHGQSIEESKRNSNALLHDEKNLAEHGYVVNMIRSVLNEHCEFVNIPESPGLLTTKNLIHLYTPVEAKGDASLLTMVEELHPTPALGGTPRLEAMKLIRDVELLDRGLYGAPIGWIDDEGNGEFAVALRCGLLNGEKASLFAGCGIVIDSVPQLEYEETSLKFRPMLGALEELMK >NC_005957.1|WP_001059249.1|4635146_4636901_-|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase MNNHIEALSYYLGAFVDELTRLNVCDVVISPGSRSTPIALLMEQHEGMNTYLHVDERSAGFFALGIAKAKKRPVALLCTSGTAAANYYPAVCEAFHSRVPLIVLTADRPHELRDVGAPQAMNQINLYGTFVKQFTEMALPEASEAMYHYARMTTQRMIASACLAPQGPVHLNFPVREPLIPDFSLESLWDKGRGEYTGVVQQGNAVMPSEYVDSLVGRLSHMKKGLIICGDDSHSEIATFATQLAEKTGYPILADPLSNIRSGHHDKTMVIDCYDTFLRNELLKETWKPDVLIRFGGMPVSKALTQFIKKQTKAVHIVVDESGQWRDPALVATEVVQASDIAFCSALIEKMPVMKKNDWFRMWQHINEKTKETLREMETYDTAFEGRVITDIVRVLPEGATLFASNSMPIRDTDSFFFTSDKTIQVMANRGVNGIDGIISTALGASMICDPLVLVIGDLSFYHDLNGLLAAKLHELNITIVVVNNDGGGIFSFLPQYEKKEHFESLFGTPIGLDYEHVVTMYGGSFSRVNGWEQFREEVQKGATTEGLHVVEICTNRDENVTLHRKLWAKTQDVITTSLQGESK >NC_005957.1|WP_001103366.1|4634337_4635150_-|2-succinyl-6-hydroxy-2,-4-cyclohexadiene-1-carboxylate-synthase MNVTLQGVSYEYEVVGSGEPLLLLHGFTGSMETWRSFVPSWSEQFQVILVDIVGHGKTESPEDVTHYDIRNAALQMKELLDYLHIEKAHILGYSMGGRLAITMACLYPEYVRSLLLENCTAGLEREDERKERCEKDERLADKIEREGIESFVTMWENIPLFETQKSLAQNVQEAVRKERLANNSKGLANSLRGMGTGAQPSWWNELQNLKMPVLLMNGEYDEKFFRILKNIEKCVSDAKFVKIDGAGHAIHVEQPEKFDTIVKGFLKTMQ >NC_005957.1|WP_000963873.1|4633449_4634268_-|1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA-synthase MAIEWVKEGNYEDIIYSTYNGIAKISINRPEVHNAFRPKTVMELIDAFAHARDDANVGVIILTGEGGRAFCSGGDQKVRGHGGYVGDDQIPRLNVLDLQRLIRAIPKPVIAMVAGYAIGGGHVLHIVCDLTIAADNAVFGQTGPKVGSFDGGYGAGYLARMVGHKKAREIWYLCRQYNAQEALDMGLVNTVVPLEELEAETVQWAQEILANSPMALRFLKAAFNADTDGLAGIQQLAGDATLLYYTTDEAKEGRDAFKEKRSPDFGQFPRFP >NC_005957.1|WP_011181900.1|4631928_4633377_-|o-succinylbenzoate--CoA-ligase MMETMPNWLKQRAFLTPDRTAIEIEEEKVTFMQLHEKVVSVCEHLTHVGVKRGQKVAVLMKNGMEMITVIHALSYVGAVAVLLNTRLSREELLWQMDDAEVICLVTDQDFEAKDIPVYSFAEVMNGPKEEASIQEEFSLREAMTIIYTSGTTGKPKGVILTYGNHWASAVGSSLNLGLRDDDCWLACMPMFHVGGLSLLMKNIMYGMRILLVPKYDADFIHKALQTRGVTIISVVSKMLTDLLERLGEGTYPSSLRCMLLGGGPAPKPLLETCVDKGIPVYQTYGMTETSSQICTLSADYMLTKVGSAGKPLFQCQLRIEKDGVVVPPFAEGEIVVKGPNVTGGYFNREDATRETIQNGWLHTGDLGYLDEEGFLYVLDRRSDLIISGGENIYPAQIEEVLLSHPMVAEAGVVGMTDDKWGQVPAAFVVKSGEVTEEEILHFCEEKLAKYKVPKKACFLEELPRNASKKLLRRELRQLVEEM >NC_005957.1|WP_000494076.1|4642948_4645357_-|glycogen-phosphorylase MFTHVESFKSAFLEKLETMYGKSFKDSTTRDQYNTLGYMVREYMNSQWIATNESYRSGERKQMYYLSIEFLLGRLLGSNILNLGIKDVCEQGLSELGISLQQLEEVEADAGLGNGGLGRLAACFLDSLASLNLPGHGCGIRYKHGLFDQKIVDGYQVEFPEQWLLHENVWEVRRHDQAVEVSYFGNVEPLYIDGRLEFRHTNAEVIMAVPYDVPVVGYETSTVNTLRLWNAEPVPFPQNCKDILKYKRETEAVSEFLYPDDTHDEGKILRLKQQYFLVSASLQNIVRMHRERYGDLRQLHEKIAIHINDTHPVLAIPELMRILLDEEKLAWEEAWHITTQTISYTNHTTLSEALEKWPIHIFKPLLPRIYMIIEEINERFCHELWERYPYEWHRIEEMAIIAHDLVKMAHLAIVGSHSVNGVAKIHTEILKQREMRLFYEFYPDKFNNKTNGIAHRRWLMKANPQLTNLISEAIGTEWKKEPIKLQELQLVQYDASFQEKFAEVKQERKEILAERIHNTMGITIDPNSIFDVQVKRLHAYKRQLLNVLHILYLYNRLKEDASFTFYPRTFIFGAKASPGYYYAKKIIKLINELARKVNNDPYVSQYMKVIFLENYRVSLAEDIFPAADVSEQISTASKEASGTGNMKFMMNGAITLGTLDGANIEIKDRVGDDNCFIFGLTAEEVLHYYQNGGYRASDYYHHNGHIKKVVDQLTNGFFAQSGAEFEAIYDSLVIQNDEYFVLRDFGPYAERQEAVGRAYENRTKWLEMSILNIAQSGHFASDRTILQYSNEIWGIGNTVTQI >NC_005957.1|WP_042515450.1|4645375_4646806_-|glycogen-synthase-GlgA MNILFAVSECVPFVKSGGLADVAGALPKELKKLGVEVRIILPNYSLIPQKLRDGCTLHKVINVPLGWRNQYCGILKGEQDGITYYLIDNEYYFKRDSLYGHYDDGERFSYFSKAVLECIPHLDFEVDVLHSHDWHTAMVNFLLREKYQDNPSYEHIKTVYTIHNLQFQGVFSPEVMYDLLELGDEYFHSEQLEFYGNVNFMKGGIIASDQITAVSPTYKEEIQYEFFGEKLDGLLRKYNDKLSGIVNGIDTSVYNPETDSYITAQYDADSLYEKNENKRALQRYFGLPEKEDTPIISMVTRLTKQKGLDLVRTVFREIMEEDVQCIILGSGDSEYEQFFEWMAYEYPEKVKVYIGFNEELAHQVYAGSDLFLMPSLFEPCGLGQLIALAYGTIPIVRETGGLNDTVQSYDEETGEGNGFSFTNFNAHDMLHTVLRAIEFYHDKPVWDQLVKQAMTEDYSWEKSALAYKKLYKSLME >NC_005957.1|WP_000504155.1|4646918_4647953_-|glucose-1-phosphate-adenylyltransferase-subunit-GlgD MGEKMLGIINATGSFPSLKKVTGHRSLAALPFGGRYRLIDFMLSNMVNSNIHSVAVFTSHKNRSLMDHVGSGKQWDLDRKRDGLFLFPPNCQCDQDEFGSFAHFRRHIDYFLRSREEYVVITNSHLVTALNFQAVLERHIHTAADITEVCHEGVSLQTYVLKKQLLLDLFEAYKDMEQYSLFDVVREKRGKSLHIATYEHTGYVAIIDSIESYYKHSLEILQPAIWKQVFKKEAPIFTKVKDEPPTRYVKGAAVKNTMIANGSIIEGEVENSVVSRSVKIGKGSIVRNSIIMQKSQIGDNCIIDGVIIDKDVKIGDGVVLKGNADEPYVVEKGSVQNSTINSYS >NC_005957.1|WP_000057611.1|4647971_4649102_-|glucose-1-phosphate-adenylyltransferase MAQKQKCVAMLLAGGKGSRLSALTKNLAKPAVPFGGKYRIIDFTLSNCANSGIETVGILTQYQPLELHNYIGIGNAWDLDRVSGGVTVLPPYAESSGVKWYTGTASAIYQNLNYLSQYEPEYVLILSGDHIYKMDYSKMLDYHIEKEADVSISVIEVPWDEASRFGIMNTNEEMEIVEFEEKPQFPRSNLASMGIYIFNWAILKEYLEMDARNPESSNDFGKDVLPLLLDEGKKLMAYPFEGYWKDVGTVKSLWEANMDLLRDETSLNLNDRDWRIYSVNPNEPPQYIAEKAKVEESLINEGCVIEGDVKHSVLFQGVTVEEGSMVIDSVVMPGAKIGKNVVIERAIVGSEMVIEDGTIIRPEKNVDDVVLIAEGK >NC_005957.1|WP_000111383.1|4649049_4650987_-|1,4-alpha-glucan-branching-protein-GlgB MSVINCEEVKRDEFHTEKYYESYNIFGAHIVTEDEMRGVRFTVWAPHAKAMSVVGDFNEWDYEQHKMLQVTEEGIWSLFIPHIEEREIYKYAIETMAGDVIFKADPYAVYAEVRPNTASVVFDIKGYEWNDKNWSRKKKKKSVYKEAMTVYELHFGSWKKKEDGTLYSYREMAEELIPYVVEHQFTHIEIMPLVEHPYDRSWGYQGTGYYAATSRFGTPYDLMHFVDECHKYGIGVILDWVPGHFCKDAHGLYLFDGTPTYEYKDKDVQENPVWGTVNFDLGKREVRNFLISNALFWMRYFHIDGFRVDAVANMLYWNKEGQEQSNEHAVSFLRELNEAVFAEDEDFLMTAEDSTAWPLVTAPTYEGGLGFNYKWNMGWMNDVLKYMECAPEYRKYIHDKMTFSLLYAYSENFILPLSHDEVVHGKKSLLNKMPGDYWDKFAQLRLLYGYFFTHPGKKLLFMGGEFGQFDEWKDLEDLDWNLHDFEMHRYMHDYFKELIALYKRSKPLWQLDHSREGFQWIDANNNEQSIFSFIRQGDKQEDALVVVCNFTKATYENYKVGVPDFEYYNEILNSDAEQYGGSGQVNKKRLKTIQEPYHNQTAHVEITIPPFGVSILRPVKTRKGSKKQDGSKTKVRSNVTSRGKR >NC_005957.1|WP_000715339.1|4651977_4652922_-|L-lactate-dehydrogenase MKKGINRVVLVGTGAVGCSYAYSMINQGVAEEFVLVDVNEAKAEGEAMDLSHAVPFSPSPTKVWSGSYADCKDADLVVITAGLPQKPGETRLDLVEKNTKIFKQIVRGIMDSGFDGIFLIATNPVDILTYVTWKESGLPKERVIGSGTTLDSARFRYMLGDYLDVDPRNVHAYIVGEHGDTELPVWSHATIGVQKLETILANNEQYKQEDLDKIFENVRDAAYHIIERKGATYYGIGMSLLRVTKAILNNENSVLTVSAYLEGQYGEKDAYVGVPAVINREGVREIVELELNEEEKAKFAHSVKVLKETMAPVL >NC_005957.1|WP_001030881.1|4653498_4654527_-|DUF4179-domain-containing-protein MNKEEFNYHINDIPIPEDRLIQREKTAILQAKKNQYRRTKTIKYSSLVACGICVSLLGFGFISPTMAKTLSSVPVIGPIYAQFKDIASHKIEKDELATSIERQDNHSGLTMKVKEAVYDGGRLVITVEYKGANTISNTNEEKPGFSYVTINGKEVKAAIASTSQKSKEGNTIIEQHEFTLANYGEFGDKIDVSVHGKDLFGKTGTWNVAFPLTKVEGEIRKFIPNIKTLTKDNLYALTVDQITFSSLSTRIDLTFDYPKEMEANDSWPALDYTVTDDKGKIYEGVSLQVGSTGLYGHHIVLALPPMDNPPRSLTIEPAYLSGLNDILKNGGAEDLKTTVLLQ >NC_005957.1|WP_000355429.1|4654519_4655050_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MDISYLVKQAARGNDQAFEQLITFVRPKLYRTAYSYVRNEQDALDIYQETIYEAYLSLKKLKNPEKFQSWITKILVFKSIDFVRKSSRQFVVDDEIFTNLCTEESMNKLEQSLDLTEAFNFLDPTYKTIILLRYYHDLSIKEIAEVLNSPEGTVKSQLHRAKQALRPILKEGYSYE >NC_005957.1|WP_000386684.1|4662526_4663207_+|MgtC/SapB-family-protein MDYTDLLIKLGLSAILGFAIGLERELKRKPLGLKTCLVISIISCLLTIVSIKAAYNLPHTDHMNMDPLRLAAQIVSGIGFLGAGVILRRGNDSIAGLTTAAMIWGASGIGIAVGAGFYIEAIFGMCFLMISVELIPLTMKFVGPRSFRQRDIVVKLVVRKMDNIPVVIEEIKEMDIKVKNMKLKTLENGSHYLHLKLCIDQKRHTADVYYSLQHLESVQQTEVESM >NC_005957.1|WP_000842311.1|4663302_4664298_+|potassium-channel-protein MKSRPKLVDAFRDSIIFRLICFIVVLTAFSGFLIHILEPSHFTTWFDGIWWSIVTIFTVGYGDFAPHTLIGKLIGMGIILFGTGFCSYYMVLFATDMINKQYMKVKGEEAATSNGHMIIVGWNERAKHVVKQMHILQPNLDIVLIDETLSLLPKPFHHLEFIKGCPHHDQTLLKANITTAHTILITADKEKNESLADTQSILNILTAKGLNPNIHCIAELLTSEQIQNATRAGASEIIEGNKLTSYVFTASLLFPSISGVLFSLYNEISDNKLQLMELPSSCTGQTFANCSYTLLKQNILLLGIKRDEQYMINPVHSFVLIQSDILIVIHH |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_005957_2 | 2.1|2759345|30|NC_005957|PILER-CR | 2759345-2759374 | 30 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 246467-246496 | 7 | 0.767 |
| NC_005957_2 | 2.1|2759345|30|NC_005957|PILER-CR | 2759345-2759374 | 30 | MG557979 | Lactobacillus phage Lpa804, complete genome | 58521-58550 | 8 | 0.733 |
| NC_005957_2 | 2.1|2759345|30|NC_005957|PILER-CR | 2759345-2759374 | 30 | NZ_CP018141 | Acinetobacter larvae strain BRTC-1 plasmid pRW1, complete sequence | 10876-10905 | 8 | 0.733 |
1. spacer 2.1|2759345|30|NC_005957|PILER-CR matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatttactttttagctctattaaactatgg CRISPR spacer gatttacttataagctctattaaatgttgt Protospacer .******** * ************. **
2. spacer 2.1|2759345|30|NC_005957|PILER-CR matches to MG557979 (Lactobacillus phage Lpa804, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttactttttagctctattaaactatgg CRISPR spacer cggatactttttagttctattaaactaact Protospacer . **********.************
3. spacer 2.1|2759345|30|NC_005957|PILER-CR matches to NZ_CP018141 (Acinetobacter larvae strain BRTC-1 plasmid pRW1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttactttttagctctattaaactatgg CRISPR spacer aatttactttgtagcactattaattcctac Protospacer ********** **** ******* .. *.
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
264478 : 272427
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_005957|264478:272427|DBSCAN-SWA CATGCTAAAGCCATTAGGTGATCGCGTTGTAATTGAGCTTGTTCAAGCGGAAGAAAAAACAGCAAGTGGTATTGTATTACCAGACACAGCAAAAGAAAAACCACAAGAGGGTAAAGTTATTGCAGTAGGTACTGGTCGAGTGCTTGAAAATGGTGAGCGTGTTGCTTTAGAGGTAGCAGCAGGTGATCTTATCATCTTCTCAAAATATGCAGGTACTGAAGTGAAATATGAAGGTACAGACTACTTGATTTTACGTGAAAGTGACATTTTAGCAGTTATCGGTTAATTATATAAATCTTAAAAAATCCAAGGGGGTCAATTATTATGGCAAAAGATATTAAATTTAGTGAAGAAGCACGTCGTTCGATGCTTCGCGGTGTCGACACTCTTGCAAATGCAGTAAAAGTAACGCTTGGACCAAAAGGTCGTAACGTTGTTCTTGAGAAAAAATTCGGTTCACCACTTATTACAAATGACGGTGTAACAATCGCAAAAGAAATTGAATTAGAAGATGCATTCGAAAACATGGGTGCGAAATTAGTAGCAGAAGTTGCTAGCAAAACAAATGATGTAGCTGGTGACGGAACAACAACTGCAACTGTATTAGCACAAGCTATGATTCGTGAAGGTCTTAAAAACGTAACAGCTGGTGCGAACCCAATGGGTCTTCGTAAAGGTATCGAAAAAGCTGTAGTTGCTGCAGTAGAAGAATTAAAAACGATTTCTAAACCAATCGAAGGTAAATCTTCTATCGCACAAGTAGCTGCTATTTCTGCTGCTGACGAAGAAGTAGGTCAATTAATCGCTGAAGCAATGGAGCGCGTTGGTAACGACGGCGTTATTACTTTAGAAGAATCTAAAGGTTTCACAACAGAATTAGACGTAGTAGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGATATGCATCTCCTTACATGATTACTGATTCTGACAAAATGGAAGCAGTTCTTGATAACCCATACATCTTAATCACTGACAAAAAGATTTCTAACATTCAAGAAATCTTACCAGTATTAGAGCAAGTGGTACAACAAGGTAAACCGCTTCTTATCATTGCTGAAGATGTAGAAGGCGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTGAACAAACTTCGTGGTACATTCAATGTAGTAGCTGTTAAAGCTCCTGGATTTGGTGACCGTCGTAAAGCAATGCTAGAAGATATCGCAATCTTAACTGGTGGCGAAGTAATCACTGAAGAATTAGGCCGTGACTTAAAATCTGCTACAGTTGAATCTTTAGGACGCGCTGGTAAAGTTGTTGTAACGAAAGAAAACACAACTGTAGTTGAAGGTGTAGGAAGCACAGAACAAATCGAAGCTCGCATCGGTCAAATCCGTGCGCAATTAGAAGAAACAACTTCTGAATTCGATCGTGAAAAATTACAAGAGCGTCTTGCAAAACTTGCAGGTGGCGTAGCAGTAATTAAAGTAGGTGCAGCAACTGAAACTGAGTTGAAAGAGCGCAAACTTCGCATTGAAGATGCACTTAACTCAACTCGTGCAGCAGTAGAAGAAGGTATCGTTGCAGGTGGTGGTACTTCACTTATGAACGTATACACAAAAGTAGCTTCTATCGTAGCTGAAGGCGACGAAGCAACAGGTATCAACATCGTACTTCGTGCACTGGAAGAGCCAGTTCGTCAAATCGCAATCAACGCTGGTCTAGAAGGATCTGTAGTTGTAGAGCGTCTAAAAGGCGAAAAAGTAGGCGTTGGTTTCAACGCAGCTACTGGCGAATGGGTTAACATGCTTGAAACTGGTATCGTAGATCCAGCCAAAGTAACTCGTTCTGCACTTCAAAACGCAGCATCTGTTGCAGCTATGTTCTTAACAACTGAAGCTGTAGTAGCTGACAAGCCAGAACCAAATGCACCAGCAATGCCTGACATGGGCGGCATGGGCATGGGCGGTATGGGCGGAATGATGTAATTCCATTTGCCCTAAAAAACATCCATTTCTATATAGAAATGGATGTTTTTTTATGTTTTTTAGAAAAGGAAATGAATTTCTGTAGAATTTTGTCGCTTTCTCTCTTGACCATATTGATACTTCATTGTTAGAATCTAGGAAGATAATATAAAACGATCCTTCATATATCCTCAAAGATATGGTTTGAGAGTCTCTACCGGGTTACCGTAAACAACCTGACTATGAAGGCAGTGTGTCTTATATTTATAAAGAACGGAAGACTATCTTTCTTTATAAAGCCAGACCCCTGCCTTTTCTTTGTTATGAGACTAGAGGCGGAGGACTGGCTTTTTTTATTATATTGGTAATGCTTTTCGCCTAATTGGTGAAAATATTTATATACGAGAACTAACGTTGGGGTGATTATTTTGAAGAAGCAGCATGATACAATTATCGTTTTAGATTTTGGGAGTCAATACAATCAGTTAATAGCACGTCGAATTCGTGAGTTCGGTGTATACAGTGAACTTCATCCACATACAATTACTGCAGAAGAAATTAAAGCAATGAATCCAAAAGGGATTATCTTCTCTGGTGGACCGAATAGTGTATACGGTGAAGGTGCATTACATTGTGATGAAAAAATCTTTGACCTAGGATTACCGATCTTCGGTATTTGTTACGGTATGCAACTTATGACACAACAATTCGGTGGTACAGTAGAACGTGCAAACCACCGTGAGTACGGAAAAGCTGTTCTTAAAGTAGAGAACGAATCAAAATTATATGCGAACCTTCCAGAAGAGCAAGTTGTATGGATGAGCCATGGCGACTTAGTAACTGGTTTACCTGAAGGATTCGTAGTAGACGCAACAAGTGAGTCTTGCCCAATTGCTGGTATGAGCAATGAAGCGAAAAATTTATACGGTGTACAATTCCACCCAGAAGTACGTCACTCTGAGCACGGTAACGATTTAATTAAAAACTTCGTATTCGGCGTATGTGGTTGTTCTGAAGGATGGAACATGGAAAACTTTATCGAAGTAGAATTAGAGAAAATCCGTGAAACTGTTGGAGACAAAAAAGTACTATGCGCACTTAGCGGTGGGGTAGACTCTTCTGTTGTAGCAGTATTAATTCATAAAGCAATCGGTGATCAGTTAACATGTATTTTCGTTGACCATGGTTTACTTCGTAAAGGCGAAGCAGAAGGCGTTATGAAAACATTTAGCGAAGGCTTCCATATGAACGTTATTAAAGTGGATGCAAAAGAACGCTTTATGAACAAGTTAAAAGGTGTAGAAGATCCAGAACAAAAACGTAAAATTATCGGTAACGAATTCATTTACGTATTTGATGATGAAGCTTCTAAATTAGAAGGAATGGACTTCTTAGCACAAGGTACACTGTACACAGATATCGTTGAAAGTGGTACAGCAACTGCACAAACAATTAAATCTCACCATAACGTTGGTGGACTTCCAGAAGACATGCAGTTCAAATTAATTGAGCCTTTAAATACGTTATTTAAAGACGAAGTACGTGTATTAGGATCTGAACTAGGAATTCCTGATGAAATCGTATGGCGTCAACCATTCCCAGGCCCTGGTCTTGGTATTCGTGTATTAGGTGAAATCACAGAAGAGAAATTAGAAATCGTTCGTGAATCTGATGCGATTTTACGTGAAGAAATTACTAAAGCAGGATTAGACCGCGAAATCTGGCAATACTTCACTGCGCTTCCTGGTATGCGTAGCGTAGGTGTTATGGGTGACGAGCGTACTTACGATTACACAGTAGGTATCCGTGCAGTAACATCTATTGACGGTATGACAGCTGACTGGGCACGTATCCCTTGGGACGTATTAGAGAAAATCTCTGTACGTATTGTAAACGAAGTAAAACACGTTAACCGTATCGTGTATGATGTAACGAGTAAGCCACCAGCAACTATTGAGTGGGAATAGTATTATAATAAAAGATCCATCTATTGCTCATGCAATAGATGGATCTTTTTTAATTTGAGTTTAATACGAACGAAAATATAAAAGTTAATAAAAATGTTCGTATTTAAATTGACAAAAATACGTTCAAGGGTTAATATGAGTATGTAATTCAAACGAAAAGTGAATATTATGCCGTCGTATAATATCGGGGATATGGCCCGAAAGTTTCTACCTAGCTACCGTAAATGGCTTGACTACGAGGCGTTTTTATAAAGGTGAGGGGAATCTTATCTTTATTCATAGAACGCTTCCATGTATGTGCAATGGAAGCCTTTTTTATTTTTAATAAATAAAAGAGGGCTAGGGGAATTACGGCGAGTAATCATATAACGGGGGAAACGTAAGATGAAACGCTATTTTCAGTTTGATGAACTCGGCACGAATTATAAAACAGAGTTCATAGCAGGTTTAACGACATTTTTATCTATGGCGTATGTGCTATTTGTCAATCCTGCTACGCTGTCACTTGGAAATGTTAAAGGGTTACCGGCAGGCACAGGAATGGATCCAGGTGCAGTATTCGTTGCTACAGCATTAGCAGCAGCGATCGGTTCGTTAATTATGGGTATTTTCGCAAAGTATCCGATTGCTTTAGCGCCAGGTATGGGAATTAACGCATTCTTTGCTTATACGGCAGTGTTAACGATGGGTATTCCGTGGCAAACAGCAATTGCTGGAACGTTAATGTCAGGTATTATCTTTATTATTCTTACTGCTTCAGGTATTCGTGAAAAAATCATTAACGCAATTCCATCAGAGTTAAAGTTCGCAGTAGCGGCAGGTATCGGATTATTCATTGCTTTCCTTGGATTCCAAAATGCCGGAATTATCGTGAAAAATGATGCTGTCCTTGTTGGGTTGGGGGATTTAACAAAGGGCACAACGTTACTAGCAATCTTCGGAGTTGTTACGACAATCATCTTCATGATTAAGAAAGTTAATGGTGCAGTGTTCTACGGTATGATTCTTACAGCAATATTAGGAGTAGCAACAGGATTAATTGATACTCCAAAAGCTGTAGTGGGAGCAATCCCGAGTCTAGAACCAACGTTTGGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_005957|264478:272427|268766_270092_+|WP_000833093.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNVKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGMGINAFFAYTAVLTMGIPWQTAIAGTLMSGIIFIILTASGIREKIINAIPSELKFAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGTTLLAIFGVVTTIIFMIKKVNGAVFYGMILTAILGVATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGAALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVANQAGLMKNNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVVTPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIDWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEIHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >NC_005957|264478:272427|264801_266436_+|WP_001029999.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVVAAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGEVITEELGRDLKSATVESLGRAGKVVVTKENTTVVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYTKVASIVAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLETGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEPNAPAMPDMGGMGMGGMGGMM >NC_005957|264478:272427|270236_270938_+|WP_000929888.1|DBSCAN-SWA MAHETILVVDDEKEIRNLITIYLKNEGYKVLQAGDGEEGLRLLEENEVHLVVLDIMMPKVDGIHMCMKVREEKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELIARIKSQLRRYMKMNGFAIQNEDELEIGEMKINISTHKVIVEGEEVKLTPREFSILELLARNPGMVFSAEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKVREKIEENPRKPRYIKTVWGVGYKIEKDI >NC_005957|264478:272427|270921_272427_+|WP_000719242.1|DBSCAN-SWA MKKIFNPFTYVRKIRELIGKIMKSVKRSIRIQLITAFTACALLGLFVSTKIVAPVFEDASRHAEINYRDGMEQINRKAQSTAEMMVDANELDAVQSMIELENEHLEQGQDAFKILVTDENGKVLYKTKQAQEEQINLHNTIRNATSFAINYSNNTDIERSRKEFITFSPITIEDKNLYMFVSGIPQGEVVYYKVEGPFPFLIGVLVFIFSFFYITKRKMKQIEAMAQGVKEIEKGNLAYRIEKKGEDEIASLTENINNMAEELMNNIEKERKLEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTKIAFAKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEQVVLEKQEVCVNELLEQLIEELVPQAEEHGLTFVKKFPEERAYAAIDSEKMVRVFDNLLMNAIKYSKDDGEIKVSLQRQRRDIQIVIANHSEEFTREELASLFERFYKKDQSRSRVTEGSGLGLAIAKSIVELQGGSIRAEYKDGIIQFIVSLPIIER >NC_005957|264478:272427|266840_268382_+|WP_165450126.1|DBSCAN-SWA MLKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGEGALHCDEKIFDLGLPIFGICYGMQLMTQQFGGTVERANHREYGKAVLKVENESKLYANLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEAKNLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKVDAKERFMNKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEASKLEGMDFLAQGTLYTDIVESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEITKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRIVYDVTSKPPATIEWE >NC_005957|264478:272427|264478_264763_+|WP_000917306.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDLIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
311365 : 319742
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_005957|311365:319742|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_005957|311365:319742|316595_318011_+|WP_000879029.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNEVDHAICSMEYIYFARPDSNIAGINVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NC_005957|311365:319742|314391_316611_+|WP_000055546.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQLDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQQMKMETPKVENYKETLFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEVGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRMLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYVIGETKAEFGGSELQKMLHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLAAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGANGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKAVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEKNEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >NC_005957|311365:319742|319154_319742_+|WP_000088592.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRANYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILNKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGRIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSTKEPTVN >NC_005957|311365:319742|311365_312673_+|WP_000625683.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >NC_005957|311365:319742|313724_314408_+|WP_000666779.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKDEVINIPIAHGEGNYYCDEETLKQLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NC_005957|311365:319742|313473_313728_+|WP_000278823.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDSKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ >NC_005957|311365:319742|318117_319158_+|WP_001262435.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKNHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWKIQPIFSLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDIVRLLEEQGETARIIGRTVKGAGVTFNGGKAL >NC_005957|311365:319742|312761_313481_+|WP_001170550.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVLAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTDEGAIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTDAYEEILKRLGGISHV |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1875345 : 1884080
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_005957|1875345:1884080|DBSCAN-SWA 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ATCTAGTATATTGGATGCCCTTGCAATACATTTATCTCCTTTTGTTACTTACCTCATTAGTGACATACTCAGTTTTATATTTATGATTCTTCTTTGGATATTAATTGCAGTATTAATGAGACCGAAGCGAGAGGCGATGATTTGGACTATTATTGAACCGATACAAAAAATTGCAAAAGGGGACTTTTCGGTAAAAATACGAAATGAAGAGAAATATGATGGGGAAATTGGTGTGCTCGTAAAAAGTATAAACGATATGACAGATGAACTGAATGCGATGGAGAAAATGCGCCAGGAATTTGTTTCGAATGTTTCTCATGAAATACAGTCACCATTAACTTCTATAAAAGGATTTGCTAGAGCACTACAAGATACTAATCTTCCTGAGGAAAAAAGAAAGCATTATCTTACCATTATTGAAACAGAAACGACGAGATTATCTAAACTAAGTCAAAATTTACTGAAACTCACCCTATTAGAGTCGGAAGAATATACACCAGAAAGAGTTACTTATCGATTAGATCAACAGTTAAAGCAAATTGTGTTAAATAGTGAACCGCTTTGGGCTGAGAAAGAAATTGAATTAGACCTTGATTTAGAAAAAGTGCATATAACTGCTGACCAAGAAAGTATGAGTCAAGTTTGGATTAATTTAATTCATAATAGTATTAAATTTACTCCAAGTAGCGGTACGATTTCAATCAAGCTAAAAGAATATGAGACATTAGTAGAAGTACGTATACGTGATACGGGAATTGGTATTTCAGAAGAACAAAAACAACATATATTTGAACGGTTTTTTAAAGCTGATTCTTCACGAAATCGAGCATATGGAGGAAGTGGCTTAGGATTAGCGATAGTAAAAAAAGTAGTCGATCTACATCAGGGAGAAATAAAAGTTGAGAGTGAGGAAGGGAATGGGACGGAATTTATTGTTTGTATTCCAAATTATGAAGAGAAATAGTGTTAGGAGGGAATCCTTCTAACACTATTTCTCTTTAAGAATACATTTCCCATTACTGCAGCTATACTGATAAGCTTTTCCTTCGCTATTCATACGGTATGAATAATCAGATTCTTTATCTTTTTTAAAGTCAACGTATGCTTCTGCACCGTTTTTATCATCATCTATATCAATGAAATGAACGTGTCGTATAGAATAATCCCTTTTTTCACTTAAACCTCTTTCTTGTAAGTTTGTATGAATCCCTTGTATTAGTTGATCGAACAGTGACCAATTTAAATTAAGATGCTCAAATGATTCAGTATGTCTTCCTAAAATGCCATTGTCTTGTATTATTTTTTTATTATTATCGTATGTATAAGAGTATGTAAAATAAGGTTCGTCTTTATATACGACTTCTGCATAATAGCCGATATTATAAAGGGGAGTATATTTTCCGGCTATACTTTGTATTTCTTTTTGCTTATATCCTTTTATAGTATGGAGATATTCGTTAGTATCTTTTTCTATTACTTTATAATGTAATGGATTACCAAATATAAAGTACATAGCCAAAAATATGCTAAATAGTCCGACTGCAGCTAGTGACAAGTACCATTTTTTTCTTTTCATACACAAACACTCTCCTATGTGGAATTTATTTCTATTTTACATGAATTATGGAAAAACATGAGAGTTATAAATAAAAACTTTTTATAGTTACCTACAAGTAACCTACGCACATGAAAGTGCATCATTGCCTTTTTACATAAACATAGATACAATTTTAATATAATACATAACTGAGATGATTAAGGAGTGTTATACTTGGCAGAATTATTACAAGGCAAAAATGCTTTAATTACAGGAGCAGGTAGAGGGATTGGTCGCGCTGTAGCGATCGCATTAGCGAAAGAGGGCGTAAATGTAGGTCTTTTAGCTCGCTCAGAAGAAAACTTAAAAGCTGTAGCGAAAGAAGTAGAAGCAGAAGGCGTAAAAGCTGTTATTGCAACTGCTGATGTTTCTTCATACGAAGAAGTGACTACTGCGATTGAGACATTAAAAAACGGTTTAGGATCTATCGATATTTTAATTAATAACGCTGGTATTTCTAAGTTCGGTAAGTTTTTAGAATTAGACGTTGCTGATTGGGAAAAAATCATTCAAGTAAACTTAATGGGTGTATACTATGCAACTCGTGCAGCTTTACCAAGCATGATTGAACAACAATCTGGTGATATCATTAACATTTCATCTACAGCAGGACAAAAAGGTGCACCTGTAACAAGTGCATATAGTGCTTCTAAATTTGGTGTTCTTGGCTTAACAGAATCGTTAGCGATGGAAGTTCGTAAACATAATATTCGCGTAACTGCTTTAACTCCAAGTACAGTAGCAACTGATATGGCTGTAGATTTAGGGCTAACTGATGGAAATCCTGATAAAGTTATGCAAGCAGAAGATATTGCAGAGTTTATCGTAGCGCAGCTGAAATTAAATAAACGTACATTTATTAAATCAGCAGGACTTTGGTCTACTAATCCGTAAGGGATACATGTATAAACAAAAGAAGGGACATCTATTTTGTAATGAAGTAGATGTCCCTTCTTTATTTTTTGTATATGAGACAGAATTTTCGGTATAATTGAAAGCGAATAGTAGAAATGCATTGGAAAATTGAAGGGGATGGTATTTACATGAGTACGATTGAGAAATGGACGGCTGTTGATCAATATGTGAGTGACATATTAATACCGAAAGATTCTACATTTTCGTAAAAGAATAACGAAAGGAGATAAATAGAATGAAAAAGATGTTTGAAAAATTATAACATGTATCGTGTATAACGAGATTAGCTCGTGGACCTCCAGTTATACATAGCGTTATATTATATATTAAAAAATTGGAGGCTATAAGTAGATGAGAACTGAAAAAGAAATGATGGACTTAATTATAAATACAGCAAAAGAGGATGAAAGAATCCGAGCGGTTATTATGAACGGATCACGTGTAAATCCGAATGTAAAAAAAGATTGTTTTCAAGACTTTGATATTATTTACGCTGTAAAAGATATACGATCTTTTACGTCTAATCATAATTGGATTCATAGATTTGGAGCAATAATGATGGTACAAATGCCGGAAGAAATGTCATTAATTCCAGCAGATGAAGACGGGAAGTTTCCGTATTTAATGCAGTTCATGGATGGAAATCGGATTGATTTAACACTAGTCCCAGTTGAATTAATAAATAATTTCGTTAGACAAGATAGTTTAAGTAAATTACTTCTTGATAAAGATAATTGTATGGAAGGATTCCCGCCAGCAAGTGATAAGGATTACTTAATAAAAAAGCCTACAGAAAAAGAGTTTTTGGATTGCTGTAATGAATTTTGGTGGTGTAGTACGAATGTGGCAAAAGGGTTATGGCGAGAGGAACTTTCTTATGTGAAAGGGATGCTTGATGGCCCAGTGCGAGATATGTTAATTGTAATGCTAGAATGGCATATTGGTATGAAAACAGATTTTATAGTTAATGCAGGGAAGTTTGGAAAGCATTTCGAGAAATATATTGAAAAAGATATGTGGGTGCAATTTAAGAGGACATTTTCTAATGCAGAATATGAAAACATATGGGAATCATTCTTTGTCATGGGTAATTTATTTAGGGAAGTGGCGAACGAAATTGCTAACGCTTATGGATATCCGTACCCGCAAGGTGATGATGACAGAGTGACAAGTTATTTAAAACATGTGAAAGCTTTACCGAAAGATAGTACATCAATTTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_005957|1875345:1884080|1877711_1879472_+|WP_000453764.1|DBSCAN-SWA MEVRDEIKKKGNWRQFLRLIQDTKPPKGILVFALLMSLLSTGASLFIPMLTKGLVDNFSLSSISTGQIVGLVAFFIMQTIAAGLSIYLLNYIGQKIVAGLRERLWKKVLILPVSYYDQNRTGDTISRMTNDTGVVKTLISEHLSNLLTGGISIVGSLIVLFVLDWKMTLLLLTVIPLSVLILVPLGRKMYKISKALQDETASFTSVLTQVLSEIRLVKSSNTEKREYETGNKGIEKLLQFGLKEGKVQALISPVMSFVLMALLVIIVGYGGMRVSSGALTTGELVAFILYLVQIIMPMSQLSMFFTQFQKAIGATERIYTILEYEVEDHETGVNVTNAKQPIVLENVYFEYNEEEQVLKNIDFTIESGKVTAIVGPSGSGKTTLFSLLERFYEPTTGAIKLGEEPITAYSLPSWRRQIGYVSQDSPLIDGTIRDNICYGVEGEVTDEEIEKVAAMAYVDAFIHDLPNGYATEVGERGVKLSGGQRQRIAIARALLRNPQILMLDEATSSLDSKSESVVQKALNNLMKGRTTLVIAHRLSTVVDADKIIFIEKGNLTGSGTHDELLRTHDMYREFATQQLKIKEAAL >NC_005957|1875345:1884080|1880234_1881308_+|WP_001231492.1|DBSCAN-SWA MRKRERMSKFKMLKVTGAIIALFSFLTIIWSTAFYVSSSILDALAIHLSPFVTYLISDILSFIFMILLWILIAVLMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYDGEIGVLVKSINDMTDELNAMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDTNLPEEKRKHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYTPERVTYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELDLDLEKVHITADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSSGTISIKLKEYETLVEVRIRDTGIGISEEQKQHIFERFFKADSSRNRAYGGSGLGLAIVKKVVDLHQGEIKVESEEGNGTEFIVCIPNYEEK >NC_005957|1875345:1884080|1881332_1881920_-|WP_000823556.1|DBSCAN-SWA MKRKKWYLSLAAVGLFSIFLAMYFIFGNPLHYKVIEKDTNEYLHTIKGYKQKEIQSIAGKYTPLYNIGYYAEVVYKDEPYFTYSYTYDNNKKIIQDNGILGRHTESFEHLNLNWSLFDQLIQGIHTNLQERGLSEKRDYSIRHVHFIDIDDDKNGAEAYVDFKKDKESDYSYRMNSEGKAYQYSCSNGKCILKEK >NC_005957|1875345:1884080|1882951_1883065_+|WP_002036196.1|DBSCAN-SWA MHWKIEGDGIYMSTIEKWTAVDQYVSDILIPKDSTFS >NC_005957|1875345:1884080|1875345_1876608_+|WP_000755548.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAAASVVGVAVPGMDSAQAQVSNEALKEINGQTQTQTTVTETKTVETKSDLKYTVTADVLNVRSGAGTGHSVISKVKQGQVLQVIGQENGWFKVTVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVSEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNQTQQPTTNNNTTTVQTGGSYVVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGTVLNVTGAENGWYKINHNGRTGYVSADFVKFVKGGVNNVTNNVQQPVKDVQKPTTGGNTSSIAGFARSLNGSPYRTAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHLLGYTKAY >NC_005957|1875345:1884080|1883207_1884080_+|WP_001258548.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMMDLIINTAKEDERIRAVIMNGSRVNPNVKKDCFQDFDIIYAVKDIRSFTSNHNWIHRFGAIMMVQMPEEMSLIPADEDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLVPVELINNFVRQDSLSKLLLDKDNCMEGFPPASDKDYLIKKPTEKEFLDCCNEFWWCSTNVAKGLWREELSYVKGMLDGPVRDMLIVMLEWHIGMKTDFIVNAGKFGKHFEKYIEKDMWVQFKRTFSNAEYENIWESFFVMGNLFREVANEIANAYGYPYPQGDDDRVTSYLKHVKALPKDSTSIY >NC_005957|1875345:1884080|1876706_1877471_-|WP_001194301.1|DBSCAN-SWA MQTNIHSEKETIIFIHGLVGNRRAFKKEHKRFSTSYNIITYDLLGHGDDKGEAIEFSLQRLVDQLLNLYEKEGIQKAHICALSYGCYISTIFAQMHPEKVLSICHIGGHYNNPSLLYSVFQNFWEKRGDDYSKWLSQYANTIFPSGILKANPFAVISRNIYYRFGLQLHSSIIAQSLRHRLEFDLKSKLKSLPHPILWVMGEHDHLYKSCLFDLKSILPNVLYKEIPLAGHAANLFRPNYFHDLYDRFLNGKLK >NC_005957|1875345:1884080|1879551_1880238_+|WP_128294964.1|DBSCAN-SWA MVSLIPNILIVDDDPHIRELVSVFLEREGFQIYEAIDGLDALQKMNEVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYEIPILMLTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGTVLLNRKTFEVTIGEQTVTLPLKEFELLFTLGSKAGRTCSREQLIEDVWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEKSKFSIKTIRGLGYRLEVSK >NC_005957|1875345:1884080|1882115_1882835_+|WP_000818985.1|DBSCAN-SWA MAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP |
9 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2175733 : 2182835
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_005957|2175733:2182835|DBSCAN-SWA ATTACTTTTTAAAAATTTCTCTTGAGATACTGTCCTTAGCGTGTATACCACCTTGATGTTCATCAGGGTATTTAGCTGGGTGCATATTCCACCATTCATGTTCTCCGCCATGTGCATTTTCAATAAAATGATGTGCATCAAATGGCTTATCAATTCTCCGTGATACTTTACCTCTTCTAGAAATAACTTCCTCCGTATATGTAGGCCATGTTTGGCCTGTTTCTTTTTCCCATTCAGCTATCAGCTTATTTTTTATAGTATTGAACTCAGCCCTTCTTTGATCTACTTCTTCCTTGCTTAATCGTTCATAAGCATTCTTTTCTAAAGCTTCCTGAAGCAATTCTCTTTGATTTTCAGGGATTTTTCTGTTTGTTATTTCTTCTACTTGGCTAAGATATTCTTGGAATCTAGGTGTATTTAAATTACCAGGGTCAGCAAACATAAATGTATTACGTGCATCTTCTAAAGAATTAAAAGAAGTTTTTGGAATATCTCTAAACTCACTAACGCTAGCATATGCAAAGCGATCTCCCATTTGCAATTTATTCGTAAAATGCGAAATACCTTCTGAGAATTTTGCTACACTCGCACCCTTTGCGAGTGTAGTGACTTTGCTTATTCCTTTATCACCAATAAGTCCTAAACCAACTTGAGTTAAAGCATAACTTCCCCATTTTGCACGACTTTCTGCGTCACCATTTATTACATCATTAATAAATGAATCTGACAATACATTATACATGGTACTAAGGGTATCAATAGGGTGCAGGGCGGCATTCCCCATGTTTTCCCACGTCTCCCATTTACCAAGTGCCTTAAAGCCTTCTACTGTATCTTCAACAGCTTGTCCCGTACCTTCTACAATACCGTCCCACACCTTTTTTATTGTAGATTTTTCAGGGGGTTTACCACACATTGCACCTTCTTCCATTGTAACATCTTGATTATCTGCATTGCGGAATTTTTCAGCAATCCGTTTCAAGTCTTCTTCTACTTTTACAAGTGAATTAATAGATGTAAAAGCTTTTGGTCTCGCATCATTGAACATTTGAATGAACTGTTGATTAGAGGCACCAATCCATTGAAAACACAATTGATCTATTTCGTTACATAAATTATTATGTATAGATTCTAATGCGATTCTGGTATTATTTGCACGATTAGCCACTTCTTCTAGCATTTCAGGTGTTACTTTGATTTGAACCATTTTTTTCCTCCCTTTCCCAATTAAAATTATGAGATAAAAAGAAAAAAATGTAAACATGGAAATTTTAGATTAGTATAATAATATTTATGTGAAGTAAAATCTGTTTAATTATAAATAAACCCTATGTGTACGTGAAGTAAAAAGAGCCGCCCTGTTGGGCAGCTTTTTTAATATCTATCAATTATTTTCTTTTAATACCTATGAATAATGAATCATAGCCTTTTGTTTGAGGACTTGTGCCTAACTCGATTTGGTATTTCCCTTTATCTAAGTAAGTGTGATAATCTCGCCCTCTTGCTTTTTGGGAAGGCATTGCTATAACATCATTAATTTCTTTATCTAGATTAAGATCTGAATTTATTAAAGTAATCCAACTTTTTGCTAATTCAACAGTTGCGTTATCAATTATAAACATAATATAGAAATCATGTTCATTTTCACCTTGTACAAAGAACTGTCCTTGTCCTAAATCATAAACCCTTCCCAAATTAGGGTTAGAAGTACGTAACTGTACACTTTCAGGAAGGCCCATACTACTGACAGATGCGCTTTCGTATTTATAATCTTCATTATATTTCTTGTTTATCTTTGTAATTAGATTTTGCGCTTCATTAGATACAGATTTTTTTAGCACCGGTGAAGCATTTTTCCAATTGTTACTGTTGTAATAAAAATCATTTGTAATCATAGAGCTAGGGATACCGAAAGGTGTTAATTCAGGTTTAACTTCTACTGTATTCATTGCATTATATAGAAATTGTGCATACTGCTCACGAGTTACAATATTTTTAGGTTCAAATAGATTATCTCCTGTGCCAGCAGCAATTTTATTTTCTTGTAATGCACTAATAGCATTTGTCGCCCAGTAATTTTTATCTACATCTTTGAAAGTGGTAGTAGATGTCGCTTTGAAGTTAAAAGCCTTTGTTAATACAACAGCTAATTGTTCACGTGTTAAAACATTATCTGGACCAAATTTTCCATCGCCAAAACCGTTCATAATACCTGCTTTACTAAGACTTAAAATTTCTTTTTCAAACATATGTCCTTTGACATCAGTGAAAGGATTTGGTGCATTATGTTCATCTGCTGGTTTCAAGTAGGCATATATCAGTCTAGCTACTTGTCCTCGTGTGATATTATCCCCAAAACCAAACATTCCGTTTCCATAGCCAGCCACAATATTTTTCTCTTTTAAACCATAATTGCATTATAAGACCAATGATCTGAAGGAACATCGCGAAATCCAGTCTCAGCTTGTGCGTTTGTTAAAGAGGTAAACGTTGATGTAGCAAGAACAGCGCCTGCTAAAATAATTTGTTTGAATTTCATTAGTGAGCTCCTTGTAATTAATTTTTTACAAATTAATTACTTATTTTATTAGTAAATTTAAATATAATAATTAATAGTATATTTGTGTTTGTAAATTAAATCAATATTTAGTTGTAAATGGATATTGAGATAGATGTTATAATTTAAAATAAAGAGATGTAGCGATGTAAAGGAGAGGGACAATATGAAACAAAAGATTTCAAATGTCACAGGAGAAATAATTTTATCTTATAAAGAAAATGGCTATCAAGTAGTACTAGATGAATTTAAACATGCAAAATGTATTAATATTGTGACTTATAATATTAATACATATGAATCTAATTCGGTACTAATCAAAGAACTTAGAAAGTTGAATAAAACTACAAAGATAAACATTATCTTGAATATTCCAAACGGTAGTTACGTGAAAAATTTCAAAAATAGGATAGACCAAAAAGAGTTTGATAAGGTTGAAAATTAAAAACGCTTTGAGTGTTTTGGAACAAGAGAAATTCGGAAATTTAGAAGTGTATATCAATCTTGAGAATCACGCAAAATTAATTATGACTGATCACATCGCCTATATTGGTTCACAGAATTTTTCTGATGCTAGTGAAGGTAATTTTGAATTAGGTTTTTTAGTAAAAGATTCAAAAGTAATCAGAGACATTGAGAGAAATATTTTTGCAGAAATTAAGAACAAATCAATATACTGTATCATTTCTGAATATAGGGCTACAATGGAAGAGATATCTGTAAAATTGGCAAATAAGTTACAAAATATTCGAGAAGATATTTTAACATGGGTTGGAGATCCACCTTTTACTTTTAGGCAAGAGGTCTTTTTTATTGATGACGCATATTTTCATAAAGAAAGATGGGAAGAATTTAAGGAGTTTCACTCTGAATTTGAAGTTATAACCGAAAAACTAATAGATGAGTATCCTTCTGAATTTAATAAAGAAAGCGCAAGGGAAACAGTAAAACATTTAAGAAAACTAGTAAAGCTACTTGTTTCTGAATTGGACGAACTGGCTAAATTTAAAACAAATCAAGAAGAGAGTATGATGTGGGATAAGTTTCATCAACTTGATGTGGGTGAAAATATGGAAGAAGCTTTAGAAGACGCCCGATATTATGTAGAAAATTATAAAGAAAAGAATTACCGAGAAATAGAGTATAAAGGGAAAGAGTTAATTAAAACATTTGATTATATAAAAGAATCTATTCAAGGTATTGAAACAATTGTTGATGAAATAAAGGATTCTATGATTAGAAAAGCTCTCAATCAAAATATAGAGAGAATCTTACAAGATATAAAAAAACAATAACAAAAAACGACTGTAAAAACGGTCGTTTTTTTTATGACTTCATCATATGAATGAGCGCTTCACCATCAATGAGCTCAATATTTTTGTTCGCAGCATATTGCCTTGCGTTCTTATTGAAATTACTCAGTGTAACGAAATATCCTCCAACTGCATCACCATCAATAATAGCACTATGTAATTTTTGAATGTATGGCCTTCCGATAGATTCTTTTGTATATCTTTTCACTTCAACAAATTTCACTTCATCGTCTTTCCAAAGGATAATGTCTTTTCCACCATCATTAGAGCCAGGGGTAACTTGTGCTCGATACCCAAGAGAATTAAACAAATCAGCAATTAAGTATTCAAAATTTCGTGGATCCATTTTCTCTAGATATTCACGATTAGCCTGCTCTCTTAAGTGGTTCATACGAATTTCCTCTTCTGAAACTTGTGGTGCTTTAAGGATAATTCCTAATGCAAAAACGACGACCAATGAAAGAATAGCCCAAATCATACAATTCACCTCAGTATGAGTATAACCAGCTTATGGCTATTCTATTTCCTCTTCAATCCAAATGTCTTCTACAGATAAATCAAGTGTTTTTGCAATGCGCATTGCAACTCTCAATGTTGGTTCACTTTTTCCTCTTGCTATTAAGCTAAGTGTTTGGTCTGTAATACCTACGATTTTAGCGATATCGGATTGCTTTATCATTCTCTCAGCCAAGATTACTTTTAATTTGCATTTCATAAATTTATCACCGTCCTAGTTTTATTGTTCAATTTAAATTTTAAAAAACCTTTTTGATTTTTTATGGTGGACAAACAAGATTTTTAATTTTAGGTCATATACCTATATCAAGACCACGAGGAATACCAAGTGGAATCAAGGACAACAGGAGGGGAGAGGGCGCGCATGCGTTGGCAATATTCACATTTAAACGAAACGCCTTACCTGTATCCATCGAAGGAATTAAGAAAAATGTATAGAGATTCTAATGGTAAAAAAGAAACAAATGCGATAGTGGACCACATGGAAAGATATGAGGTTTTTAACAATCGTGAATATAAAGGCTATTACCGTTTATCGAACGATATTATGGATGATTTATATGAAGATGAGGACGAAGTGCTTGATTGGGGAGATGTCATTAATGAGTATCAACCGGTTATGACACCGAAGGGATTACAACTCATTAGAAAAGAGGGATTCAAATGACAATCGTTGGTGAAGCGGTAATAGTATGGACGGCAACAGGCTTGTCAGTGATTACAATGAAAGTTGCAGAAAAAATGGGGCTGAGTGTTCCACATTGGCTTCCACGTATGACCATGTACACAACGCTCACAGGCTCGTTCTTGTATCTTCTACGTTATGTGCTTTTCGCGTTTCTATAAGGGAATATCAAACTGGAATTGTAGGACATTTACTGGTCATTGATATAAAACATGTACGGGATTCTTCCAAAAATAAGGGATATATACCCTTTATAAGGGTATATGGGGAGTGGAGAAAATGATTGAATTATTACTCGTTCCAGCTGCAGGTTTGACAGTGGCATTATTCGGTGAAAAGTTCAAAAGTAAAAATGATGATAAACGAAAGATACAGGTGTTCTTTGAGGTAGCTGGAATTGCAATTAAAAGAAATAATGAAGAAAAATTGCAATATCCAAAATTTCAAAAGCAAATTGATGATGATCGTAGTACGACTTATGTATACACCTTACCATTAGGTATGCCGAGTAAAATCATACAGAAGGTGGAGGATGTAGTTTCAGAAGGGCTAAATAAACCAGTACGTATTCAGTACGATAATTATAAATTGAACATTCGTGTATTCCGTAGAGAAATACCGAAGAATTGGTCATGGTCAATGGATTTAGTAACGAAAGGGAAATGGTGTATTCCAGTTGGCCAGAGTTTAGAAACAATTGTTTATCATGATTTCGATGAAACACCGCATATGGCTGTAGGGGGATTGATTCGTATGGGGAAAACAGTCTTCCTTAAAAATATGTTCGCTTCCTTATCATTAGCAAATCCTGATCATGCTCATTTTTATTTGATTGATTTAAAAGAAGAAGGACTTGAATTTAGTGAATATAAAAAACTGAAACAAGTCGAACAAATCGCAGAAACTTCAGAGCAAGCACACGGCATGCTGCTGAAAGTGATGGAAAAAATGCATGAACGTGGGAAGTACATGAAAGAACGTGGTATCAAGAATATTGTTCACACGAAAGAAAAGGATCGGTATTTTATTGTAGTGGATGAAGGGGCAGTACTTGCACCTGCAAAAGGGCTACCGAGAGCTCATAATAAAATGCTGGAAGAGTGCCAATACATGCTAAGTCACATCGCACGTGTTGGAGGGGCACTTGGGTTTCGTATTGTCTTTTGTACACAATATCCGACAGGGGACACATTGCCGAGGGTAGTCAAACAGATGGCAAATGCAAAACTTGGTTTTCGTTTACCAACTCGTACCGCATCAGAGGTTGTTATTGATCAGTCCGGATTAGAACAACTACCATCTATTCCAGGAAGAGCTATATATATGAAGGAAAGATTCACCGTACTGCAAGTGCCGTATATCGATGACGTGGTTATGTGGAAACATCTAAAAGAATACGAGGTGGAAAAATATGAACATCCAGAGCCATATGAAAATCAACCGTCAGATGGCGATACTTGCGACGATTAGGAAGTTGCAGTTTGCAACGAGAAGACATTTAATGAGTGTGCATAATATGGGTGGTATACGTAATGCAAACCGTATTTTGGGAGATTTAAAACCATACGTGAATAAAACGATGCAAGGGAAAGAATACGTGTATTATCTCAATAAAGAAGGGCACGCGATGTTTGGTGATGATGGTAAGGTTGTTTCGAGAGGGAAGCTTGCACATGCGTTATTACGGAATGAAGCATGGTTACATTTATTTTGTCCAGATGACTGGCAGATTGAAACGGATATACGTTATATAAAGAATAAAGAGAAAATGAAAATAGTTCCGGATGTGAAGTTTCGGGATGAAGAAAATATACTTCATGCAGTTGAGGTAGATCGCTCGCAGAAAATGAAAGTGAATGAAGAGAAGATAAAAAAATATGAAGAGTTTACGCAAATTTATAAACAGAAGCATAACGGGAAAATGCCAGTGATTCATTTTTTTACAGTGACGAAATATAGAGAAAAGAAATTGGAAGAGTTAGCTGCTAAATATGATGTTCTTGCGAGTGTGTATGTAATAGAAGAAATATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_005957|2175733:2182835|2180116_2180317_-|WP_000649834.1|DBSCAN-SWA MKCKLKVILAERMIKQSDIAKIVGITDQTLSLIARGKSEPTLRVAMRIAKTLDLSVEDIWIEEEIE >NC_005957|2175733:2182835|2180482_2180785_+|WP_001267637.1|DBSCAN-SWA MRWQYSHLNETPYLYPSKELRKMYRDSNGKKETNAIVDHMERYEVFNNREYKGYYRLSNDIMDDLYEDEDEVLDWGDVINEYQPVMTPKGLQLIRKEGFK >NC_005957|2175733:2182835|2182214_2182835_+|WP_009879947.1|DBSCAN-SWA MNIQSHMKINRQMAILATIRKLQFATRRHLMSVHNMGGIRNANRILGDLKPYVNKTMQGKEYVYYLNKEGHAMFGDDGKVVSRGKLAHALLRNEAWLHLFCPDDWQIETDIRYIKNKEKMKIVPDVKFRDEENILHAVEVDRSQKMKVNEEKIKKYEEFTQIYKQKHNGKMPVIHFFTVTKYREKKLEELAAKYDVLASVYVIEEI >NC_005957|2175733:2182835|2179615_2180080_-|WP_000637735.1|DBSCAN-SWA MIWAILSLVVVFALGIILKAPQVSEEEIRMNHLREQANREYLEKMDPRNFEYLIADLFNSLGYRAQVTPGSNDGGKDIILWKDDEVKFVEVKRYTKESIGRPYIQKLHSAIIDGDAVGGYFVTLSNFNKNARQYAANKNIELIDGEALIHMMKS >NC_005957|2175733:2182835|2180781_2180964_+|WP_000156980.1|DBSCAN-SWA MTIVGEAVIVWTATGLSVITMKVAEKMGLSVPHWLPRMTMYTTLTGSFLYLLRYVLFAFL >NC_005957|2175733:2182835|2175733_2176939_-|WP_000249923.1|DBSCAN-SWA MVQIKVTPEMLEEVANRANNTRIALESIHNNLCNEIDQLCFQWIGASNQQFIQMFNDARPKAFTSINSLVKVEEDLKRIAEKFRNADNQDVTMEEGAMCGKPPEKSTIKKVWDGIVEGTGQAVEDTVEGFKALGKWETWENMGNAALHPIDTLSTMYNVLSDSFINDVINGDAESRAKWGSYALTQVGLGLIGDKGISKVTTLAKGASVAKFSEGISHFTNKLQMGDRFAYASVSEFRDIPKTSFNSLEDARNTFMFADPGNLNTPRFQEYLSQVEEITNRKIPENQRELLQEALEKNAYERLSKEEVDQRRAEFNTIKNKLIAEWEKETGQTWPTYTEEVISRRGKVSRRIDKPFDAHHFIENAHGGEHEWWNMHPAKYPDEHQGGIHAKDSISREIFKK >NC_005957|2175733:2182835|2181082_2182273_+|WP_000571537.1|DBSCAN-SWA MIELLLVPAAGLTVALFGEKFKSKNDDKRKIQVFFEVAGIAIKRNNEEKLQYPKFQKQIDDDRSTTYVYTLPLGMPSKIIQKVEDVVSEGLNKPVRIQYDNYKLNIRVFRREIPKNWSWSMDLVTKGKWCIPVGQSLETIVYHDFDETPHMAVGGLIRMGKTVFLKNMFASLSLANPDHAHFYLIDLKEEGLEFSEYKKLKQVEQIAETSEQAHGMLLKVMEKMHERGKYMKERGIKNIVHTKEKDRYFIVVDEGAVLAPAKGLPRAHNKMLEECQYMLSHIARVGGALGFRIVFCTQYPTGDTLPRVVKQMANAKLGFRLPTRTASEVVIDQSGLEQLPSIPGRAIYMKERFTVLQVPYIDDVVMWKHLKEYEVEKYEHPEPYENQPSDGDTCDD |
7 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
4714810 : 4758658
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_005957|4714810:4758658|DBSCAN-SWA TTTACAGTTGAAAATTTACTAATAAATAAAATAAATTGTTTAATACATGAATTCCAATTGGAACGAGTAAATTATTTGTTTTCTTATATGTATAAGCTAGGCATATACCCATACCAAAAATATATAACACACTAGCTAAAGTAAGGGAATGCCCTAAAGTAAATATAAACGCACTTATAACAGCACCAATAAGTGTAGAAAAACGCTGAGATAATTTCGTAAAAAACATACCTCGGAATACAATTTCTTCCCAAACAGGTGCAAAAATTGTAAGCACAACTACATATAGAATTAGTTCATTTATAGTAGGCTCTATTACTATATTAGACTCATCCATACTAAATTCCGTTGGTAAAACTAAATTTAATACTGCGAGATATATAAGCAGTACAATCATCGTCATTACTATCGTTACATAATGTTTAAAGTGATTGAACTGTATTGATTTTAATAACTGCAAACAGTAATTTCTTGCTGGCGCATATATTAAAATAATAGTAAGAAATGTTAAAGGCGGAATAAGATGATCTACATACCACGGATATAATGAGGAGTCATATAAAAAGTTCAAATAACCAATTCCGTACATGATCCCAAAAATAATTACTATCATGCTGATTACTTCTAACATACTCATTTGTACATTCTTTTCTTTATATGTAACTAATTCCGTGTCCATCTCATCCCCTCCAGTATAATTAAACCTTTTTAACTATTATATTCCAAATTAAATATAAAAAAAGACAATACACCCAACTGTATTGTCCGTTTTCTGCCCTACCATTTCTCTCTGCATGTTTCAATTAAATGCAGTAAGTACCTCTTCGTCATATCTGCCCTTCTCCACCTTGAGAGCATTCTCTTTTCTTTTGGGTTCTGCCGTATTCTCGCTACTTCTTTTAATAAAAGCTCCCATTCTTCCGATGAACGTTCTAATAAGTATTGTAATCCTCTATCTTTTGAAACGATTGTTTTATAATTTAGTGTATATAAAATGCGCCCCATCGTAACAACCGCTGATTCTACCCATTCTTCTATAAAGAATAAATATGGCTGCTTCGCCTTCCCGCTCCAGTACTGTTCTACGTTGTATTTCATCGTATTGACTACATCATCCCACCTTATTTGGACCGAAAGTTCTTCTGCTTCTTTCCCGATTACTGTAATACCTTGATTTTTCAATGTCCACCATGTGACCGCATTAATATCCCAATGACCTACATTCGCTTTACCATCTGCACAATACACGTACTCATTCAGTTCATCATTGTATTTCCCTAAATCAGCAAGTGGAATATACATACCATCCATTCTTTTCCCTAACGTACTACCACTAAGTTTCTTATGAAGTTCTACAAGTTGCTGTTTTTCAGCTTTATTCACGGAATCACTTATTACCGTAACAAAATCAACATCGCTCGTTTCTGCATGAAATGCACCGAGTGCGATGGATCCGTAAATATATACGCCAACTATTTTTTCATCTAAAAAAATTTCTTTTAACCCTACTATGTACTGCTCCATCAACTGCTCTACTTCTTTTGGTAACGCATGCTTTACTACATTCTCCACATCTATCCCTCCAATAAAAAAAGCCTTTGCAAATTCGCAAAGACTTCCTGCTTTATAAGTATTTCTCGATTTCTTCGTAAACATCCTTCAAACGAGGATTTCCTTCTCCAACAATTTCTCCATTTACAAGAACGACCGGGTAAAATAAATCTTCCTCCACTACGCGCTCTGCGAATGCTTTTTTCTCTTCATCTTCTTGTTCTTCTTGAAAATCAATATACTCGAAATTAAATTTATTTTCTTGTCCTTCATATTTACGACCAATCGCCGCTTGTAACCACTCAAATGTTTCTGTTGAAGATGGCATTCCAACGCAGCTCGCACAAATTACTTTCGTCCCATACACTTGCACATTAACCATTTCTTCTCCCCCACTTCTTGTTCTAACAGTATATTCAGATACCTTATTACATAAGCACATCATTTTACAAACTTATTCCATACCCCTATACTGAAAAAACACGTTGTAAACATGATAAAAAATTTCGGCAATAAAACAAGAACAGAAAAAATAGATTTTCCCCTCTATCTTGATTATAATAAAACTGATGAAAGGAGTCGATAAAAATGGAAAACCCACATATGCAAGAACAAGTACTAGAAGTATTAGATAAATTACGTCCATTCTTACTTCGCGATGGCGGAGACGTTGAGTTAGTAGACATTGAAGAAGGTATCGTAAAATTACGTCTTATGGGTGCATGCGGAAGCTGCCCAAGTTCTACAATCACACTAAAAGCTGGTATCGAGCGCGCATTACTTGAAGAAGTACCAGGCGTTATCGAAGTAGAACAAGTATTTTAATCTAAAAGCAGAAGCGGCTCGTTCAAAATGTGAGGGGGATGGAGCTTCTGACATAGAGGCGCTTTTTGCCTCGGCGGAAGAAGCGAAGCCACCGAACATTTTAGCCGCTGGAGCTAGATATTATCTAGCGGCTCGTTCAAAGTCACTTGCTAAAAGGAGACCAAATTTGGTCTCCTTTTTTTATTTAAATAACAATCATCCGTTAACATCATAAAACAAAATTGGAAATCCTTCTCAAAAAATGCGATAATTGATACTATATAGTGAATCGTTCACACATATACAATCAAAAAAACATAGGGGGACGACACATGCCAAAAATGGGGAACACTTTTTTAACAATGCAAGAACTAGAAAAGAAAAAAGAGTATTTATTAGACCTTTCATCCGTTATACCGACATGGAATGCGAGCTACCAATTTTTATTTAAAGAAATCCAGCAAGAATTATTGGGTAAAGTAAATGAAAAACTCGAAAAACATCAATTCATTTTAAATATATGTGCAGAGCAACAAGTAGGGGCATAATCTATTACATACAGTTGTGGTATATAAAAAAGAGACCTCACTCGGTCTCTTTTTTATATTTTTAAGATAACCAATCTAATTTTCTAATCCCGAGCTTATCAACTGGTAAACGAAGTGAGCTATAAAAATGCTTCATAAATTGCTCTGAGCGGTTCACATCGTGTAAAATGACTTCTAAGCGATCTCTATATATGCTTTTTTGTTCTTCGTTTCCTGTTTGGTAGTACCGTTCAACTGTTTCAAAATAGTAAAGCGGGAACAAGAGCCTTGCAAATAATAGGCGCCAACCAAATGAGGATAGCGAATAATTTCGTTCGTAATCTGTAACAAATTGAACGATTGTTTTCTCCCAGTCTTTCTTTTTTTCAATCATCATATAACGGATTAATTCTGCTATATCTCGAGTTGGGTGATCATACACCCAATCAAAAGGGAGTTTGAGACGCTTCGTTTGATGCCATAATAAAGGTGTGAATCGTTCTTGGCAAATTGTTGCTGCATCAGTTAGTTGCGGCGTATCATCCATTTCTGTATCAACAACATATTGAATGGCATTTTCTGCAACCCCTAAGTAATACGGGAAGGATTCAATAAACAATTGATCGAATACGTCTGTAGGGTGGTTCATCACTTTTGATTGCCAAAACTTTTCTAATTGATCGAGCCTTTTTTCCCATAATGCTTTCCATTCACCAATGCGGCTTAGTTGCTCAATTTCTTCTGGAAAGAATGCACCTCGTTTATGGAATATAGAAAGCTCACTACCTAATGATATAGCATGTCGTTCTAACGCTCGCATACCTTTTAATAAGCAGTAATTTTGTTCTTCTATCTCACTTACATAGTAGCCGTGTATAGTTGGAACGAAAGTCGCTACAGTTATATCCCCTTGCTGGTTCATATAGTCACTGAGCTTTTTCATCTCTACAAGTACTTCTTCCTCCATTTCTCCAATTGGAACAAGTACATAAATTTTGTTGCGAATCCAAAAGCTTTTATAGGGGCCAAGGGGGATTAATTCTTTAACATGCATATGATAATGCTCATAAATATGATGAATCATCGCAGTCGCCACCTATGGTTTTTCTTTATATATATGAGCTTGTGCTCGCCTTTCATTCCTATGCACATGATAAAGCAACGAAACGTATACAAATACTAAAAAGAAAAAAAGGTGATAAACATGAAAGAATCAAATCAACTACAAGAAAAAGCATTACAACTATTACAAGAACGCGGTGTAACAATTGACGATATTGCTGAACTTGTTCATTTTCTTCAAAAAAAATATCATCCAAATTTAGAGATGTCAGAATGCCGTTATAACGTTGAGCGTGTATTATCAAAACGTGAAGTACAAAACGCACTAATTACTGGTATCGAGCTCGATGTCCTTGCTGAAAAAGGAATGTTAAGCGAGCCGTTACAAGATATTGTAAAACGTGATGAAGGCTTATACGGAATTGATGAAGTGATCGCACTTTCTATCGTTAATGTGTACGGCTCTATCGGTTTCACGAACTTTGGATATATCGATAAATTAAAACCTGGTATTTTAGAATACTTAAATGATAAATCGTCTGGAAAAGTGCATACATTCCTTGATGATATCGTTGGCGGAATCGCTGCCGCTGCTTCAAGCCGTTTAGCGCATAGAGCTGAGCATTCGGAATAAAATATGAAAGACCGTCAGTGTCATACTGACGGTCTTTCGTATTCCATGAGCATAAATTCTCTTCCTCGGCTCAAAAAAATAGGTCCTTGCTGAAAACCTATGTTTTTATATAGCTTAATCGCTCTTATATTAAATGTCGCTACGCTAAGGCGAAACGTTTGCGGCTTACATTCTTTAACAGCAAACGCTATCCCAGCTTGCAAAAACATTTTCCCTAGCCCTTTCCCTGTTAACGCCGGCTTCATGCCAAGTCCGATATCCATTACATCTTCTCCACCATATAAATGAGCATCTCTTCCCCCTGGCACTTGTGCATTTTCCCCAAAACAAAAATAGCCGATAAACTCTCCCTTATCGTCACAACAACCATAATACGTCCCATCTAATAATTCTTCTATTACTTCTTCCTCGCCTGAAAAACT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55 | Planktothrix_phage(22.22%) | tail,protease,transposase,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
5183166 : 5236915
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_005957|5183166:5236915|DBSCAN-SWA 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50 | Streptococcus_phage(15.0%) | integrase,holin,tRNA,transposase,protease | attL 5232323:5232338|attR 5237031:5237046 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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