Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NC_006570 | Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas9,cas4,csa3,cas3 | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
208860 : 270249
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_006570|208860:270249|DBSCAN-SWA 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58 | Morganella_phage(23.53%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
351204 : 384445
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_006570|351204:384445|DBSCAN-SWA 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31 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
900246 : 909410
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_006570|900246:909410|DBSCAN-SWA AATGATTTTAATCGATGGTAAGTCTCTCTCAAAAGACCTTAAAGAGAGATTAGCAACTCAAGTTCAAGAATATAAGCATCATACAGCAATCACCCCAAAACTTGTCGCAATAATTGTTGGTAATGATCCGGCAAGTAAGACATATGTTGCCTCAAAAGAAAAAGCCTGTGCCCAAGTTGGTATAGATTCTCAAGTGATTACACTACCAGAGCATACTACAGAATCAGAACTTTTGGAGCTGATCGATCAGCTAAATAATGACTCTAGTGTTCATGCGATTTTAGTGCAGCTACCATTACCAGCACATATCAACAAAAACAATGTAATATATAGTATAAAACCAGAAAAAGATGTCGATGGTTTTCATCCTACAAATGTTGGTAGACTACAACTTAGAGATAAAAAATGCTTAGAATCTTGTACACCTAAAGGTATCATGACTATGCTAAGAGAGTATGGTATAAAAACAGAGGGGGCCTATGCAGTGGTTGTCGGCGCAAGTAATGTTGTTGGTAAACCAGTATCACAATTGCTGCTAAATGCTAAAGCTACAGTGACGACTTGTCATAGATTCACAACTGATCTTAAATCACATACTACAAAAGCAGATATCCTAATTGTTGCTGTTGGTAAGCCTAACTTTATCACAGCTGATATGGTCAAAGAGGGTGCTGTAGTTATTGATGTTGGTATTAATCATGTTGATGGTAAGATAGTTGGTGATGTTGATTTTGCTGCTGTAAAAGATAAGGTCGCAGCAATTACCCCAGTACCTGGAGGGGTTGGACCAATGACAATTACTGAACTGTTATATAATACTTTTCAGTGTGCTCAGGAGTTGAATAGGTAGTTTATAGATTTGATTTTATCATGGGTAGTCATACCCGCGTAGGCGGGTATCTCTAAACTAATGGGTTAAATCGAAAGGATTCCCGCCTGTGCGGGAATGACAAGTGTTTTTAGAAACATGTTAATGCTAGAGGTTTTAGAAGTATAGGATCTCTTGACAGGAACAATTAAGTAATAAGATTCTGGATCAAGTCCGGAATGACAAATATTTTTAATTGATTAAAAGGAAATAAAATGGCAGGCTTAAAATATGAAGATGCTGGCGTAAATATCGAAGCTGGTAATCAAGCTGTAGAAAGAATGAAGCAGCATGTCAAAAAAACTTTTACCCAAGATGTTTTGACAGGTTTGGGTAGCTTTGGTTCTTTATACTCACTAAAAAATATTATAAATAATTATGATGATCCTGTCTTAGTACAGTCGATTGATGGTGTTGGTACAAAGACAAAAGTCGCGGTAATGTGTGGTAAGTTTGAAAACCTTGGTTATGATCTTTTCTCAGCTGCGACAAATGATATTGTTGTAATGGGTGCCAAGCCAATTACGTTTCTAGATTATGTCGCGCATGATAAGCTTGACCCTGCAATTATGGAAGAGCTCGTCAAAGGGATGTCAAAAGCTTGTGCTGAGTGTGGGGTTTCGCTGGTAGGTGGCGAGACTGCGGAAATGCCTGGAGTATATCAAGCTGGTGAGATTGACATGGTTGGAGTTATCACTGGTATCGTTGATAGAAAAAGAATTATCAATGGTGAGAATATCAAAGAGGGTGATATTGTCTTTGGGCTTAGTTCATCAGGATTACATACAAATGGCTACTCTTTTGCACGTAAACTATTTTTTGATGTAGCAGGCAACAAACATACTGATACTTATCCAGAGTTAGAGGGTAAAACTATCGGTGATGTGCTACTTGAACCACATATCAACTATACTAATATCATCCATGATTTCTTAGATAATGGTGTTGATATCAAAGGTATGGCACATATCACAGGTGGCGGGTTTATCGAGAATATTCCACGCGTATTACCACAAGGTTTAGGTGCCCAAATTGACAAAGATAGTTTTGCAACTCCAGCTATTTTTAAGCTAATGCAGAGAATCGGCGATATAAGCGAGTTTGAAATGTATCGCTCATTTAATATGGGTATTGGTATGACGATAATTGCTAGCCAAGATCAATTTGACAAGATGCAAGAATTAGCTAAAAAACATACTAATACAAAACTATATCAAATTGGTAAAATCACAAATTCAGGAAAGGTAGAAATTATCTAATGCTTGATAAACAAATCATTGCTAATAATATAAAAAATGTTCTAAAATCAACAAATCTTGATATCAAGAATAAATATATAGGTAAAGTAAGAGATATGTACTTTACTGATGACAAAAGTATTTTGATATCTACAGATAGACAATCTGCTTTTGATAGATCTTTGGGTTTTATACCATTTAAGGGGCAAATCCTTGCACAATCATCAGTATGGTGGTTCAAAGAAACAGCACATATTGTCAAAAACCACTTTATAGACTCTCCAGATCCAAATGTTGTCATCGCGAGAAAGGCAAAAGTATTGCCAATTGAGTTTGTCGTTAGAGGTTATATAACTGGTTCAACTTCTACATCATTGTGGACACATTATAAAAACGGTAGCCGTGACTATTGTGGCAATATCCTGCCAGAAGGTTTAAAAAAGAATCAAAAATTACCACAAAATATCCTTACACCAACTACCAAAGAGCAAGATCATGATCGCCCAATTTCAGCTGAGGATATTGTCAAGGAAGGTTGGCTAACTCAGCAGCAGTGGGATTTTGCTTCACAAAAGGCTCTAGAACTTTTTGAGTTTGGACAAAAAAAAGCCTTAGAACATGGCTTAATTTTGGCGGATACTAAATATGAGTTTGGTATTGATGAGCAAACTGGAGAGATTATTTTGATCGATGAGATCCATACTCCAGATAGCTCAAGATTTTGGCTAAAAGATAGCTATGCTACAAGATTTGAAAATGGTGAAGAACCAGAGAATATTGATAAAGAATTTTTTAGATTATGGTTTGCAAAAAATTGTGACCCATATAATGATGAAGTTTTACCACAAGCACCACAAGAGTTAGTTGTCGAATTATCTCAAAAATATATAGCCCTTTTTGAAATGATAACAGGGCAAAAGTTTGAAGTACCAAGAGATTTAGAAAATATAAATCAACGTATTGTTAAAAATGTTACAGATTACTTAAATATGGAGAAGCCAGTGAATATTCTTCTAGTAGGATCAGGAAGTAGAGAGCATGCGATAGCAGAAGCAGTCAAAAGAAGCTCTATTGCAAATAAGCTTTTTTGTATAAGCACAGCGATTAACCCTGCGATAGATAAGATAACGCAAGGGTATCAAATCGCTGATATTTGTAATTGTGATGAAGTACTAGAGTATGCAAAATCACAAAGTATTGATATTGCGATTATCGGTCCTGAAGCACCACTTGAGGCTGGTCTAGCTGATGCACTTAAGACAGCAGCAATTGGCGTAGTTGGTCCAACCAAAAAGTTAGCACAGCTTGAAACATCAAAAGGTTTCACTAGAGATCTGATCCGTGATTATGATATAGGCGCTAATCCTTTCTTTAGAAAGTTTAACTCGATGGATGGAGTCGAAGAGACTCTCAAAAAATATCAAAATCAATTTGTCATAAAAGCTGATGGTTTATGTGGTGGTAAAGGAGTGCTTGTTTGGGGCGATCATTTGCACAGCCTTGATGAGGCGATTAGACACTGTCAGTCATTAGTAGATGCTGGCAAAGAGTTTGTTATCGAGGAGAAGCTTGTTGGCCAGGAGTTCTCGCTGATATCATTTGCTGATGGCAAAAATTTTATCCATATGCCAGCAGTCCAAGATCATAAGCGTGCCCATGAAGGTGACAAAGGTCCTAATACCGGTGGTATGGGTACTTATTCTGATGCTAATCATAGTTTACCGTTTTTATCAGCTGCTGATATCGAAAGAGCAAAACAAATAAATGAGAAAGTTGTCAGAGCTTTAGCTGATAAATTTGGTGAACCATATCAAGGTATCCTTTATGGTGGCTTTATGGCGACAAAAGATGATACTAAAGTGATCGAGTATAATGCACGTTTTGGTGATCCAGAAGCGATGAATCTACTTACACTGTTAGAGACAGATTTTGTTGAGATTGCTCAAGCTATTACACAGGGTAAACTTGATACGGTCAAAGCTAAGTTTAAAAATCAAGCAAGCGTATGTAAATATCTAGTACCGCTTGGCTATCCAAACCAATCAGTTAAAAACTTTGAGATAGATATTTCACAATGCCCTGATAATGTCGAGCTTTTCTTAGGTGCTGTTGATTATAAAGATGGTAAGCTAATTGGTACAGGTTCTAGAGCTATAGCTGTACTTGGTTTAGGTGATACAATAGCTGAAGCAGAGCAAAAAGCCGAAAATGCTGTCAAAAATATTTATGGTAAACTATTTCATCGTCCAGATATTGGTACTAAAGAGCTTATCAATAAGCGTATCAAACACATGAATTTGTTGCGTGGTGATAAATATCAGGAGCTTAAATAAATAATGTCTAAGCTAAATCTTGTTATATTAGGCTCTACGCGTGGGACTAATATGCAAGCTATAATAGATGCAATAGCAAATAAGCAGCTAAATGCTCAGATAAGCCTAGTAATTTCAAATAAGTCAGATGCTTATATATTACAAAGAGCAGCAGATTATAATATCCCAACTAAATATATAGCAGCTAAAGGTTTGACTAGAGAGCAGTATGATGAGCTAGTTGTTGCTGAAATCCAAAAATATAATCCAGATTTGATTTTGCTGATAGGCTTTATGCGTATTTTAAGCTCGGTGTTTATCAAAGCTTTTGAAGGTAAGATCTTAAATATTCATCCATCACTATTGCCAAAGCACCGAGGATTAATGGATTTGGCAGTGCATCAGTCAGTTATCGACGCTGGAGATAGTATATCTGGATGCACTATCCATCAAGTAAGTGAAGAAGTCGATGGTGGTGATATAGTTTTGCAGTTAAAATGTGATGTGGTGAAAGAAGATACGGCTGATAGCTTAAAAGAAAAAGTACAAGCCTTAGAGAGTAAAGCTTGGATAGAAGTTATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_006570|900246:909410|906968_907322_-|WP_003020901.1|DBSCAN-SWA MQTIEIGNKAELQACKFLHTQALEILAHNFKALPYGEIDIIALDKDTLIFIEVKYRSKTKFAQAEEMLTYSKQQKLVNSASIYLQHNPQYQDYQCRFDLIAINESNINWIKNAFGVI >NC_006570|900246:909410|902371_904684_+|WP_003020892.1|DBSCAN-SWA MLDKQIIANNIKNVLKSTNLDIKNKYIGKVRDMYFTDDKSILISTDRQSAFDRSLGFIPFKGQILAQSSVWWFKETAHIVKNHFIDSPDPNVVIARKAKVLPIEFVVRGYITGSTSTSLWTHYKNGSRDYCGNILPEGLKKNQKLPQNILTPTTKEQDHDRPISAEDIVKEGWLTQQQWDFASQKALELFEFGQKKALEHGLILADTKYEFGIDEQTGEIILIDEIHTPDSSRFWLKDSYATRFENGEEPENIDKEFFRLWFAKNCDPYNDEVLPQAPQELVVELSQKYIALFEMITGQKFEVPRDLENINQRIVKNVTDYLNMEKPVNILLVGSGSREHAIAEAVKRSSIANKLFCISTAINPAIDKITQGYQIADICNCDEVLEYAKSQSIDIAIIGPEAPLEAGLADALKTAAIGVVGPTKKLAQLETSKGFTRDLIRDYDIGANPFFRKFNSMDGVEETLKKYQNQFVIKADGLCGGKGVLVWGDHLHSLDEAIRHCQSLVDAGKEFVIEEKLVGQEFSLISFADGKNFIHMPAVQDHKRAHEGDKGPNTGGMGTYSDANHSLPFLSAADIERAKQINEKVVRALADKFGEPYQGILYGGFMATKDDTKVIEYNARFGDPEAMNLLTLLETDFVEIAQAITQGKLDTVKAKFKNQASVCKYLVPLGYPNQSVKNFEIDISQCPDNVELFLGAVDYKDGKLIGTGSRAIAVLGLGDTIAEAEQKAENAVKNIYGKLFHRPDIGTKELINKRIKHMNLLRGDKYQELK >NC_006570|900246:909410|907388_909410_-|WP_003020904.1|DBSCAN-SWA MNSIIEDSKLPKLAEFKVNEVKPAIDKLFSLAQSNLENALQTQNPNWQTLLKLEEDDEKISQAFSTISHMNAVCNSKELRESYEYAIAKLTDYYTKLGQNKDLYDLYKQIQKDNLTNEQAQAVRKAIIGFEQSGVNLDEAKRKRLQQISQELAQLSTKFENNVLDATMDWLYTTDDEKELKGLSQHTIESAKAKANQKNIAEKYALGIDIPTYLAVMQQADNRKLREKFYKAYCTKASKEADNKNFDNDENIEKILKLRIEKSQILGFDNYAENSLFTKMAETPEQVLELLNKLLEKSLPQAKKELNELRRFAEDAGLVDALQPWDSAYYSEKLKKAKFDFTEEELREYFPLEKVQDGLFKILKQIYNLDVKENTQYTKYVPEQQTFDFFKNDQYVGSIICDFFARDNKRGGAWMDDSRTAFTTSSGSKQNPVAYVNCNFLPPSKDGANLTHNDVVTLFHEFGHALHHILSQVTIPSISGTNGVEWDAIELPSQFMENFCWCQEGLAVISGSRDGKVLSSKQIDKLVGTRHFHSALMMVRQLEFGIFDMNIHYKKLTSATEVQKELDSIREKINLIKTPSYNKFQNGFSHIFAGGYAAGYYSYKWAEILSSDVFSRFEQEGILSHKVGNELLENIISKGSSRDAMDNFVAFMGRKPNEDALLRHSGINYKIYI >NC_006570|900246:909410|905874_906972_+|WP_003020898.1|DBSCAN-SWA MKIGIIGAGQLARMLSLAGTPLGLEFHCLGKNGDCAEEVVKTVTDIELTKVNDVVAWAKQFDVITFENENISHELIKAINHEVSVYPSAKAIAISQDRLLEKSFMQDHGIATAKFVNIDSLAKLQSAVDDHGLPAILKTRRFGYDGKGQFVIRSQEDITKAWDVLKDAPDGLIYEAFVDFDYEVSQICTADLKGNIAFYPLARNTHKQGIIVESEAPFENVVLAEKAQQIAKILVKEFAYVGTLAIEFFVKGDELIVNEIAPRVHNSGHWSIDGAVTSQFENHVRAIAGLILGDTTSRKTVMLNCIGGMPATKDLAALDRVKIHSYNKEPRKGRKVGHLNLNLNDETDEYQLLQVKKLIALSEEI >NC_006570|900246:909410|904687_905263_+|WP_003017844.1|DBSCAN-SWA MSKLNLVILGSTRGTNMQAIIDAIANKQLNAQISLVISNKSDAYILQRAADYNIPTKYIAAKGLTREQYDELVVAEIQKYNPDLILLIGFMRILSSVFIKAFEGKILNIHPSLLPKHRGLMDLAVHQSVIDAGDSISGCTIHQVSEEVDGGDIVLQLKCDVVKEDTADSLKEKVQALESKAWIEVIKNWDK >NC_006570|900246:909410|900246_901095_+|WP_003020886.1|DBSCAN-SWA MILIDGKSLSKDLKERLATQVQEYKHHTAITPKLVAIIVGNDPASKTYVASKEKACAQVGIDSQVITLPEHTTESELLELIDQLNNDSSVHAILVQLPLPAHINKNNVIYSIKPEKDVDGFHPTNVGRLQLRDKKCLESCTPKGIMTMLREYGIKTEGAYAVVVGASNVVGKPVSQLLLNAKATVTTCHRFTTDLKSHTTKADILIVAVGKPNFITADMVKEGAVVIDVGINHVDGKIVGDVDFAAVKDKVAAITPVPGGVGPMTITELLYNTFQCAQELNR >NC_006570|900246:909410|901328_902372_+|WP_003020889.1|DBSCAN-SWA MAGLKYEDAGVNIEAGNQAVERMKQHVKKTFTQDVLTGLGSFGSLYSLKNIINNYDDPVLVQSIDGVGTKTKVAVMCGKFENLGYDLFSAATNDIVVMGAKPITFLDYVAHDKLDPAIMEELVKGMSKACAECGVSLVGGETAEMPGVYQAGEIDMVGVITGIVDRKRIINGENIKEGDIVFGLSSSGLHTNGYSFARKLFFDVAGNKHTDTYPELEGKTIGDVLLEPHINYTNIIHDFLDNGVDIKGMAHITGGGFIENIPRVLPQGLGAQIDKDSFATPAIFKLMQRIGDISEFEMYRSFNMGIGMTIIASQDQFDKMQELAKKHTNTKLYQIGKITNSGKVEII >NC_006570|900246:909410|905379_905871_+|WP_003020895.1|DBSCAN-SWA MSVQVGVIMGSKSDWSTMKECCDILDNLGIGYECEVVSAHRTPDKMFDYAETAKERGLKVIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVLGVPVKSSTLNGQDSLLSIVQMPAGIPVATFAIGMAGAKNAALFAASILQHTDINIAKALAEFRAEQTRFVLENPDPREH |
8 | Enterococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1625039 : 1684221
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_006570|1625039:1684221|DBSCAN-SWA AATGCAAGTACAAACGATACAAAAAATATATGCTTGGCTAGTGCATCTTTTTACATCATTAGGTGCCGTGTTCGGTATCTTAGCTATTATATTTTCAATAGAGGCTGCTAAAACAATTGTATTAGGTCAAACAGATCTACATCACTACTATATTAAGCTTTCTATGTTTAGTATTATAATGGCGATATTTATTGATTCGATAGATGGTAGCTTAGCAAGACTAGTTGATATCAAAAAACTTGCTCCTATAGATGGCGCCCTTCTTGATAATATTATAGACTTTACAACATATTCAATTGTTCCTTGTATCTGGATATATGTATCAGCAGTAGTTAGCCAACAATGGCTAATCCCAATAATAATAATGATAACTATCTCCTCCTCATATCAGTTCTGTCAGCTAAATGCAAAAACTGATGATTATTTTTTTGTCGGTTTCCCAAGCTACTGGAATGTAATTGTAATGTATATGCTATGTTTTCAGTCAAACCAATTAATTAATGAAATAATGATAACGATATTATCAATATTTTCTTTTATACCAATTAAATATATTTATCTATCAAGAACTGAACATATCAGTAAGAGTAAACTTGTCAAAATATTCACTTTTATTTTCACAATGTTAGCAGCTATTGCAACTTTCCTAGCGGTATTACTTTATCCATTAAAAACGCCAACACCACTGGTAACAATAATATTAGTGTTTACAATATTTTATATAATCTTTAGTCTAAAACTAAATATTAAACCTGTAAAAAGTTAATCTGTTTACCTCTTAATCACTTCTATATGATAATATATTAAATAAGTTAAGCTGTTTTTATAATTCTATATGAAAGTTTTAAGTCAAGAAGAGCGCCAAAAACTCTTTTTAGAAAATATTTTCCCATATAAACATAAGATTCCTCGTAATGTATATGAAAAACAAAAGCATTATCTTCAGATAGAACTATTAAAATTTCAGAAATGGGTAAAAGAGAATAATAAAAAAGTTCTGATAATTTTTGAAGGTAGAGATGCAGCTGGTAAGGGTGGAACTATAAAAAGAATGATGGAGCATCTAAATCCACGTGGCGCCAAGGTAATTGCTCTAGAGAAACCATCAGAACAAGAGAGAAATCAATGGTATTTTCAACGATACATAGAACACCTACCATCTGGTGGTGAAATCGTACTTTTTGATAGGTCTTGGTATAATCGAGCTGGTGTTGAAAGAGTTATGGGCTTTTGTACTGAGAGAGAATATTTCTTATTCCTTGAACAAGCACCCCAACTAGAAAAAATGCTAGTTGATAGTGGTACTATGATAATAAAATTTTGGTTCTCAGTTAGCCAGCAAGAACAAAAAAATAGATTTGCTGCTAGAGAAAGTCATCCCTTAAAACAGTGGAAACTTAGCCCTATAGATAAAGCATCCTTAGATAAATGGGATGACTATACTGAAGCTAAAGAAAGGATGTTTATATATACTGACAAACCATATGCACCATGGGTAATCGTTAAGTCTGATGATAAAAAACGTGCCCGCCTAAATGCAATAAGATATATACTTAACAATGTTGACTATGATAACAAAGATCATGAAGTAGCAATACCTCCTGATCCTCTTATCGTAGGCACTTCTTCAAAAATATATAAATAAGCGCAAAACAAAAATAGTCCTTGACTAACAGTTCTATTTAAAATATAATCGTCTCTAAGTTTTGGGCCTATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCGGACTCATAATCCGTAGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGGGCCCACCAAAAATATTTTTCATACTTTTTACATGGTATACTGACAAAACTAACGATCTAGATTTACCCAAAACATCAGATATAATTAGCTAAGATAATCAATAAATAAGAATATTTAAAAAATCTAGCTTAATATTTCGACTAAATTTTAAAATACAACTTAAGCACATACCTATAAAAATTACTTGTTTGTTATTCATGCATATTCAAAAAATGTTATAGTTATTTTTTATAGATGATCATAAATAGTTACAACAACACTTACTAATGTTATTTGATATTGTTTCTTCTGTCAAATAGTTCTGCTTATAGGTCACAATATTCTCATATGATTGTTTTATCGTTGCTTCTGCAACCTCTCCGGATTCTACAAGTTTTGCGATATTATCTATTATAGTATCTGGATTACCATCACTGAATATAAATATATTAACACCTGCATTAATAGCTAGTTTCAATGACTCTAATTCTCCATAATATTCTGTCACAGCCTTCATTTCCATAGCATCTGAGATTATAACTCCATCGAATTTAATATCTGTTCTTAATATTTTAATTATTTTATTAGACAGTGTTGCTGGATTAGTTTCATCGATGTTTCTGTTCATAACATGTGCAGTCATAACCATACAATGCTTATTTTCTGGTAATAACCTTATATATGGAATAAGTTCTTTTTCTGTCCATGTGTTAGTAATATCAGCAGCACCTAAATGAGAGTCATTAGTAGAGCTGCCATGTCCAGGGAAGTGTTTTAATACAGAACCTATTTTATATTTTTCAGTAGCTTTACAAAAAAGATTAGCACAATCTACAATAGTATTAACATCAGTAGAAAAACTACGCTCATATTTACCAATAACGGGGCAATTATCGTTGTGAATGTCTACACAAGGAGCTAAATTTAAATTAATTCCTACCTTATACATGGTTTTAGCCATTTCCCTAGCAACATGAGCTTGTTCTTGTATATCTAGCTCTGAAAATTTTTTTGCAGTAAAAGTTTCAGGAAATCCATATTTTGTTTTCAATCGATTTACTTTACCGCCTTCATAGTCAATAGCAATTATTAATGGTACCTGTGGACGCATATATAAATCATTATAAATCTTAGTATATTTCTGTAAGTCGCTATTTAAAGTCTTTAACTGTTCTGGACTTTTTATGTTGTCCTTGTCTTTTCTATCAAACAATATTACACCACCGATATTATTATCTTTAATATGTTGAACAATTTCCGATTTTTCGTCAATTGCTTGACCGAAGAAACCTACAATCAACATCTGACAATCATTTCCTTTAAAGAAACGGCATATATAGTGTCCGTAAAAATTAAAAAAAATATTGTAATAATAAACCTTACTTGTCTACACATAAAATATACCTCATAAATTTATTTATTTTTATTATAAATTAATAATTATTTATAATAATTTAAATTTACAGAAAATATGAATAAATATTTACTTATAACCTACTAGATATAAAAGTAGTACTAACTGAAATAGCTTAAAACTAAGTTGTTTTAGTGGGTTCCGTACAGAATGACGTACTACTTTTTAGTATAGTTAGTTATATGCTATTCTAGGAAGCCACACTACAATGTATTAGCTTAACTTTAAGGTTTTTAAATTGAACTGATGAGGTTAATATAACAATAGTAAAAATCTAGCTATTGTATTTCAAATATTAACTGGGGTATAAAATTGAATTTTTTAAATTAGGCTTATCCCATATCTCTTCATCTGATAAATCAGTTTCTATAAACTCTATTATTGCGCCATTTTCTTCAATAATTGCAACCCTAAAGCCTTCTATAGGGAAGTATGGTTTTAGCAAAATATTTTTATCTTTTATAGCTTGGTCAAGATCGGAGACCTTATAAGCAATATGAGGCATAGTTTGTATAAGTTTATCTAATGAACATTTCGGACCAAAGCGATGATATTGTACTCTTCCCGGCAACTCCCCTCCTGATGTATACATATATCCATGCTAGGGCTATAACGCTCTCCTGGTCTTGGCTCAGTAACTGGAATCCCAATATGATGATATTTATATTCCATAAATTCCCCTTAGGAAATATCTGTTTTACAAATTATGATATAACTTCTCAAACTAAAGTATTGAAATAAAAATCAAGGATAAAAGTAATGTTATAAAATAGCTGCTAGGTAATTTTGTTTATCTTTTTTTGTAAGTCTGACTTTATGTTCATTCATTAATGTTCCATGGAAAGCTTTGGCTAAAGCCTCTAGGATATCTAACATTAATTCGTAACATGTTTTAACATCATAATCCATACTAGCAAGCTTTCTATAATTCATTACGGCAATAATACCGGTTACACTCCCATCTGTAGCACTAGAAAATTCTTGCTCTTGATTATCAGGTAAGATACTAAATATAACATCCTTGTAGTTAACTTTCTGGAAAGCTTTATCATCAGTATATTTAATTCCATAGTATTTTAAAAATGTAGCTAAATCTTTTACTTGAATTGGTTCAATCGCTTCAAAATAAAGTAGCAAAAAACCATCTCTTAAGAGTGGATATTCTTGTTGAACATTTTCGATATTAGCCGCATACTCTGGGAAACTTTTAGCTTGAGTTATAAGCTCCTGAGCATTATTCTGTTCGATGTTCCTAAGTATTTCTACTTGTTTAAGTCGCAAACTTTTACGATATAGATCTATTATTATTAATACCACTAAAACTAAAACTAATGCCAATATCAATGTCATTTATCTAATACCTATACTTTTTTATACTGATGTATTATATATATAAAGATTATAAAAATTAAGATTTTTCTATCATAGTATCTAATACTTGAATGATCTTACTCTCAGTATCGATAACCATTTCTTTGTGAATTTTTTCAAATTCTTCTACTATATAATCATTACGCCGCTTATCATCAAACAACCTTTTTAACTCGCTAAATAAATTATCTACTGTACAGTCTTCTTGTATTAATTCTTTGATAATTTCATTTTTATGCAAAATATTAGGGAAAGCCCAATAACTATGATTACCAATAAGCATCCTACCAATTAAAGCCGATAGCCATGATAGTTTATAGCCTACAACCATAGGTAATTTGCATAACATAGCCTCCAATGTAGCTGTTCCTGATGCCAATAAACTTAAATCAGATGCTTTTAAAACATCATGTGAATTCGTTTCAAAAACTTCGATACCTAAACTATCAATTTGTTCTT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58 | Erysipelothrix_phage(33.33%) | tRNA,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1739580 : 1748400
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_006570|1739580:1748400|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_006570|1739580:1748400|1744510_1745503_+|WP_003022628.1|DBSCAN-SWA MEFSMRNIFKKTLLILLLSVIIASCGMLSNDQFVYLGHGENSPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKDDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDVRLAKDDYGNYAIEELRKAGVTTVNKPIKTKKVFATPVKQIVLDRKQQYHLVRKEYEIDSNLVAMVVNDKEGKKRIKVAYTVDFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDAVHEAQFMQRDVMKSQTNVKKKVDDYLKDVVDSDKKDTGYTHQEVASSVAALDNDLITKADEQREDKETTLASGSSISTIAKKPINQESSGSTIQTATKTASTTQVDSNDTPKTTLASDNK >NC_006570|1739580:1748400|1745522_1746602_-|WP_003022640.1|tRNA|DBSCAN-SWA MENKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFAAEYWDNVFEHFLIEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLSYVHLLGGDYIATGHYAQTRLAADGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGNIEKSKVREIAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPLLFKQSLQAIELSWVAGMAPADKFRCAAKVRYRQKDQSCEVEVNQDGSVNVTFDQPQRAITPGQSVVFYIDDVCLGGGVII >NC_006570|1739580:1748400|1739580_1740195_-|WP_014551217.1|DBSCAN-SWA MSEYSLFVMLCVIAAISSYFNLRFLKLPKAIGLTVVSALISLMLVVLIKLEPKLFYPAYHMLNSIDFKILVLKVLLGYLLFAAAMHLNFLEIKNFLASIFVLSSLGVVVSTFIIGTLCWLAAPIVIKHDVSYIYCLIVGAIFSPTDPITVFAVFKTSKSVPMRVKSILSGEAMFNDVFSIVIFLILLSLVISGKSDIVNPRVFC >NC_006570|1739580:1748400|1741645_1742251_+|WP_003022624.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITTKDSLKTFCIKFDNSLQCSIGDSVAINGTCLTVTKLDKQNLTANFDAVPETLKKTNLDTLKENQLVNIELAMRYGDHIGGHMVQGHIDEPGQIKSIQNVGGAWLIEISASREFLKYLVKKGFVTIDGMSITVINVLKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYSNGSMVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV >NC_006570|1739580:1748400|1743910_1744429_+|WP_003014032.1|DBSCAN-SWA MSLEILKYPHPVLKEVAKEVTKDEINDDLRATIAEMHELMLEANGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEQNGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATVVKIKALNEFGEEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENAKS >NC_006570|1739580:1748400|1742243_1743455_+|WP_003022626.1|DBSCAN-SWA MFEQIKNNVENAIEALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGQKATEENIAFMLEHTSGIICLAMDSKKARELNLTPMVAADQNNSTFTTPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKADSKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAAELEAFAKKHDLPLLTIAELYQYRLATENFVTKMASSTIPFKKIGELEMSVYKDNFSGDEVVVLSKPYSGNNPLVRMHSSCITGDIFGSLRCDCQDQLHKGIEMISEEGGFFIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMNENMDTLEANLALGLPADARKYDLAIQVLKYNNVNRCRLISNNPEKLAALRNVDIETQPVYCEAFVNSHNRNYLITKKIKAKHTIKGI >NC_006570|1739580:1748400|1740585_1741653_+|WP_003022623.1|DBSCAN-SWA MKNIDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIIVKNGAIISEGWHETVGEAHAEVHALTKAVDKAKGATAYVTLEPCCHCGRTPPCTDTIIKAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVERLKNAGITVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQTTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNDGDSKKISSHQAFVNTHELRNICDAILIGKQTLIDDNPSLDVRININKIKHPTRFILANHLTTINHNWRVLDQRHAKTIFVCSKISARVATKLNQLGIEYWLLPQSQHQVCLDTLLEKMGKIGITSLLVEGGNKTLNSFINQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQISVREDIIINSCFKENSNV >NC_006570|1739580:1748400|1746615_1748400_-|WP_003022642.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPSAEPDRVAQEIEEIIGIDATGATTCSAKIGIGVEDVLETIVAKVPAPEGDVNAKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRVKNGTIKKGEKFKVMSTGVAYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNLSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICIEKRGVQVDLNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPANMVCLDVLINGDKVDALASIVHKDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGGTIVARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK >NC_006570|1739580:1748400|1743464_1743908_+|WP_003017614.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVPGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSIQAAITMAKMKKDILEQGV |
9 | Indivirus(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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