Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_008791 | Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 plasmid pYVe8081, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_008800 | Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas3,RT,DinG,csa3 | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_008800_1 | 4035993-4036093 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_008800_1
|
1 spacers
spacers of NC_008800_1
>1.1|4036016|55|NC_008800|CRISPRCasFinder CGGTGGGATTTTTTGTCTGATTAACCCATTAGCTTCCGGTGTCGTTTTGAGCAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_008800_1
The CRISPR arrays of NC_008800_1 >merge|NC_008800|1|4035993-4036093|CRISPRCasFinder GTCATTGCCATATTACTGCTGCTCGGTGGGATTTTTTGTCTGATTAACCCATTAGCTTCCGGTGTCGTTTTGAGCAAGGTCATTGGCATATTACTGCTGCT >NC_008800|1|1|4035993-4036093|CRISPRCasFinder GTCATTGCCATATTACTGCTGCT CGGTGGGATTTTTTGTCTGATTAACCCATTAGCTTCCGGTGTCGTTTTGAGCAAG GTCATTGGCATATTACTGCTGCT
>NC_008800.1|WP_011817233.1|4034587_4035826_+|MFS-transporter MSTVKESAKNRIQLLPKPAFTPHLSSIMVLLFAMVSAMAVANVYFAQPLLDIMAGELNVSPSTIGLVVTLTQAGYALGLIFIVPLGDLWDRRKLIIGQLLLSAAALILASFAPTFSLLLMAMLIIGLMAVVVQVVVAFAATLAPEQQRGKVVGKVTSGIVLGILLARFISGAMADFAGWRSVYFCSAAMMLLMAIVLYFVMPPAAKSAPSSYRQLLLSLCELFINERELRIRATLALLIFMAFSVLWTAMVLPLSSPYYALSHSQVGLFGLAGVAGALAASHAGQRADRGLGAKTTQIALALLLLSWLPIAFLPHSLWWLVLGVVILDFAVQAVHVTNQSIIFALRPDAQSRLVAGYMLFYSIGSAIGAIATTWVFAHAGWSGVCMLGATISAVAILFLHLTYRKDSTCVIN >NC_008800.1|WP_011817232.1|4034020_4034479_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSKMSEDQAEAEECPVARILEILGDRWSLMIIRDAFDGIRRFGEFRHNLGLAKNILAGRLRNLVEHGILRVVPASDGSAYHEYVLTEKGHQLFPIIVSLRQWGEEHLFSAGEKHSILVDNLSGQPISKLAVSSQQGQVLDARDCHREKVIKR >NC_008800.1|WP_011817231.1|4032295_4033696_-|glutamate-decarboxylase MTRKSLDDYRSDLLDSRFGSKAIRNISENKVFPKEEMREDIAFQIISDELFLDGNARQNLATFCQTWDDDNVHKLMDLSINKNWIDKEEYPQSAAIDMRCVNMMADLWNAPTPKGAQGVGTNTIGSSEACMLGGMAMKWRWRKKMEAAGKPTNKPNFVCGPVQVCWHKFARYWEVEIREIPMIPGQLFMDPQRMIEACDENTIGVVPTFGVTYTGNYELPKPLHDALDKLQKDTGLDIDMHIDAASGGFLAPFVAPDIEWDFRLPRVKSISTSGHKFGLAPLGCGWVIWRDAAALPEELIFNVDYLGGQVGTFAINFSRPTGQVISQYYEFIRLGREGYTKVQSACYQVAEFLAKEIAPLGPYEFYCSGGPYEGIPAICFRIKKGAKAGYTLYDLSERLRLRGWQVPAFTLSGKMSDVVVMRIMCRRGFEMDFAGLLLDDFKSSLKYLSEHPSLGGEASQNSFSHT >NC_008800.1|WP_005174157.1|4030665_4032222_-|amino-acid-permease MSNNSSGTGKSAVPVKKLSIATLAIMNIVAVVSLRGLPAEAEYGLSSIFYYLFAAVFFLIPVSLVAAELATGWPEKGGVFRWVGEAFGPRLAFLAMFMLWVEVTVWFPTALTFAAVSLAFIGPEQRWDEALSANKFFVLGIVLFIYWLATFIAFKGVDTFAKVSKWGGIIGTIIPAVILIVLGFSYLIGGGTPQIELSWEQVVPDFTNFDNVVLAASIFLFYAGMEMNAIHVKDVDNPNRNYPIAIMLSAVGTVLIFVLGTLAIAFVIPQSDISLTQSLLVAYDDMFKWAHLEWLGPVVAFALAIGVLAGVVTWVAGPSSGLLVVAKAGYLPRWWQHTNKNGMATHILLLQALLVSLLAILFVVLPSVQAAYQIMSQMTVILYLIMYMLMFSSAIYLRYSQPNRPRPYHIPGGAIGMWIIGGAGLIGSILAFVFSFIPPSQITVGSPTEYVGILIASTLFFVILPFLIYIVRKPHWRDENSDFAPFTWQAENSHPGIPSTSATHTNDVTAAAAKAPKS >NC_008800.1|WP_011817230.1|4029654_4030596_-|glutaminase-A MTIDLARLNHVVKDSYSQYSTLAGGANASYIPYLASVPSQLAGLAIVTIDGDIISQGDTDFRFALESISKVCSLALALEDIGPQAVQDKIGADPTGLPFNSVIALELHNGKPLSPLVNAGAMSTVSAIKASNREDRWARILDMQQQLVGAPIALSDEVNHSEQTTNFHNRAIAWLLYSAQAMYCDPMEACDVYTRQCSTLLNTIELATMGATFAAAGVNPVTKKQVLTASNTPFILAEMTMEGMYGSSGDWAYTVGLPGKSGVGGGILAVVPGVMGIAAFSPPLDPVGNSVRGQKMVASVAQQLEYNLYKGSL >NC_008800.1|WP_011817229.1|4028153_4029605_+|PTS-N-acetylmuramic-acid-transporter-subunit-IIBC MAKITSTTIDQILFLIGGSKNIIVCGNCMTRLRLTLKDRQLIQHENLKKIPGVMGIVNGDDQLQIILGPGKAQTASEMMNKVLSSEPQPQHESTQDEDLHVLASQTKQQMKAKQQSAVHNFLTKFATIFTPLIPGFIAAGLLLGIATLLQQTLALEGVIQSPWLAALIAYMKIFSIGLFTFLSILIGFNTQKAFGGTGVNGAIIASLFILRYVPEGSVGYYGGMESFFGLAIDPRGNIIGVLLACMLGAWIERQVRRCIPDNLDMILTSAITLLITGAITFVAIMPVGGELFKGMSWLFMHLNGNPFGTAILAGLFLIAVVFGIHQGFVPVYFALMDAQGFNSLFPILAMAGAGQVGAALALYARSPKGSVLRTQIKGAIFPGLLGIGEPLIYGVTLPRLKPFITACLGGAVGGFFIGLVAWLGLPVGLNTVFGPSGLVSIPLMTSAQGIFAGMMVYVVGLLISYAAGFILTWFFGHKDIDLS >NC_008800.1|WP_011817228.1|4027242_4028151_+|N-acetylmuramic-acid-6-phosphate-etherase MTINLSSMVTESRNPASSQIDTLSALEILKVINHEDKKVPFAVEEKLSEIAQAVSLIAEAFTRGGRLIYCGAGTSGRLGILDASECPPTYGTPREMVVGLIAGGNTAILQAVENAEDSREMGEQDLRDLHFNARDVLVGIAASGRTPYVLGAMAYARSVGASVVAISCNQNSEMSKAADIAIEALVGPEVVTGSSRMKAGTAQKLILNMLTTGAMIRSGKVYSNLMVDVEATNAKLVQRQVDIVVQATECSPKEAQAALDECNRHCKTAIMMILSGMSAEEAADILIKNKGFIRKALKEIKV >NC_008800.1|WP_011817227.1|4026154_4027015_-|SIS-domain-containing-protein MSILNEITWLLPELAENQKKIAKCILDNPESILSISSSQFAEDAGVSQSAIVKFSQKIGMKGFPALKIAISEELSRNNLFKSYPHKALHNSISPEDSLMVMAQKLAHEKTASIMETTRKINFSVFQQVVSLINAAQRVQIVGIWGAGLTAKDLSYKLQKIGIMTLVEADLHVQIAAALTLTPKDVQIVLSFTGRRKDMKIAATVAKAQGATVIAITGSKVSPLAKIADYVLESISDENEWRSSSISSRTAQNTLTDLIFLALMQQRKEMAKPLILNASMTINNLDD >NC_008800.1|WP_042661534.1|4023949_4025815_-|glycoside-hydrolase-family-3-protein MKKVISAILLFSSCTYADVIPDAQLKEMWLSPKISAEKITSKMSFEEKLGQILMVDIRSWSHSDNSDKTAFIEINDSVSKMIRDYHLGSIILFRENLIDTPQIVELINNLQNARSNLPLFISTDQEGGYVTRLRVGTEMPGNMALGATGSSKFAQQAGSIHGYELSSLGFNFGPVVDVNNNQNNPVIGVRSYSNDPVLVAELARSYISGIHKYNVLTSLKHFPGHGNVTSDTHFSLPAVNIDKAAWQQVELKPFVEVMPVTDAIMTAHVVVPALDNSMLTNIKGEKVGTPATLSKPILTDILRNQLKFDGLILTDAMDMGAITSNFERNWSIKQAIMAGNDIVLMPMEIKNRASIEQLDALYDYLKTEATKDPELKQRIEDSAQRVIYTKLNKRISPEPHDIAIAEKVVASKNHKNIENFISEQAITLIKNDNVLPYQVKPQNKIIVFSDEIPRNELITKHLDDIANKFNVDFIVKNKVIKLDKSDADPEDIAKQIKGQDLIILATYNLKLEPINAQRIIDEANKANIPLVVISSRNPYDIAYLSGVKANIAIYGITGFDVTNNVRNSLETNIRSGLRTLFQGPKGKLDVLAEPHGKLPVDIRTPDNSQILYPRGYGLTTL >NC_008800.1|WP_011817225.1|4022846_4023932_-|hypothetical-protein MNILKGIVVFSTLTMCTPVLADEFETDYDQEIYKLNKRIQQIEKEKKEVQDKLRQKAWSFETYIGAEQEIDSDESWKFIKGSMATSPYVGAYIYQNNSLWLYDVQFLKTYLDNNPEYDRTRWQAGVTRTFPFTYDGKSGNTKLRLGYRNDNWHYPSISNPALADPEYKGDVRKGEERHEIWIRPQAYYQYSENLSFNASFSFRLIDRKLDYARAKGNYGVYKRDWSQINEHFAGANITFNQKNSLWLNYLYIDEQLVNTLYNKEHFLWGIYRHKFDNGLLFMPYTRLALVKGSQSFRDSNNHEIVHKEKNRSRYGLQVLYPLTKQTSIFADTYYRPEQTWTNSHKTSNNFWFWAVELRHNF >NC_008800.1|WP_011817235.1|4036642_4037542_+|EamA-family-transporter MKLTDFLIALLITAIWGVNFSIIKLGLITADPLILAGIRFTLCALPAVFFIKKPDTSWRYIIGYGLLFGIGLWGIVNLGIKAGVSAGIASLVLQFGAFFTLVLGALLFHENLSKYQYIGIIVALLGLTSIIFISDGSVTFIGLALVLCGAVVWGLVSIIIKKSDTKQVFSFLVWSSLFSPVPLFILSYLFNGPSGFTELAIHFNTTTLFSILFQVYPNTLFAYWVWNSLLTKYPVSVVAPLSLLVPIFGMLGSVMIFNERIPSGKVIAMIFIISGLIIGLYGKRLMGLLKRKSSVALIE >NC_008800.1|WP_011817236.1|4037691_4039713_+|NADPH-dependent-2,4-dienoyl-CoA-reductase MLAYPHLLAPLDLGFTTLKNRVLMGSMHTGLEELPDGSQRLAAFYAERAAGGVGLIVTGGIAPNKKGVVYQGASVLNDASQVPHHQIVTDAVHRAGGKIALQILHAGRYSYQKQPVAPSALQAPINPFTPQELSHDEVLQTIADFAHCAQLARQAGYDGVEVMGSEGYLINQFLTARTNHRNDEWGGDFTRRMRFAVEIVRAVRAAAGPDFILIYRLSMLDLVEDGSSWDEIELLARAVEQAGATLINTGIGWHEARIPTIATMVPRAGFSWVTRKLMGKVNIPLITTNRINDPAVAEQVLTDGCADMVSMARPFLADAAFVQKAAQDRADEINTCIGCNQACLDQIFDGKLTSCLVNPRACRETEMPILPTEAPKRLAVVGSGPAGLAFAVTAASRGHQVTLFDTATDIGGQFNIAKQIPGKEEFYETLRYFRRQLVLHGVIQQLNTPVQPEQLADFDEVILACGIQPRLPAIKGIEHPKVLTYLDVLRDKKPVGERVAIIGAGGIGFDTAEYLCQSGDSSSLDSRVFSHEWGIDQDLAHRGGLSPAGGKVHPSPRQIFLLQRKSSKVGEGLGKTTGWIHRTSLAMRGVKMLNSVSYERIDDEGLHIIRAEQASCLPVDTIIICAGQEPRRELHQPLLDMGKTVHLIGGADIAAELDARRAIDQGTRLALAI >NC_008800.1|WP_011817237.1|4039978_4041169_-|23S-rRNA-(guanine(1835)-N(2))-methyltransferase-RlmG MSQVLLGTQSFELERFPPQENSNTLQAWEAADEYLLQNIDLNQIDGRPVLVFNDQFGTLTCALHAYRPFSVSDSYMSQLATAHNLRLNHLDEDVVTLLSSMDALPEAPKLVVIKIPKALALLEHQLRALRRVVAPDTVIIAGAKSRDVHNSTLQLFEKILGPTKTTLAWKKARLIHCEVADIPLAEEAPETVDWPLANTEYVIHNHANVFSRNNLDIGARFFMEILPYDVEGKIADLGCGNGVVGLIALEQNPLAEMLFVDESYMAVASSELNITYNRPQDLSRCEFMVSHGLAGVERESLQLVLCNPPFHQQHAVSDHVAWQMFCDAKRCLKVGGELMIVGNRHLDYFHKLKRLFGNCETLDSNQKFMVLKAVKTASSRSEGGGSGSLDMSYSDF >NC_008800.1|WP_162484222.1|4042294_4043575_+|autotransporter-outer-membrane-beta-barrel-domain-containing-protein MVNKLLSNKTSTQDTPTQKNDNKDNKKVDNDSLSTEVDNALAEVGNLGQIIVSNPISNLLFAAEPEATETAQKALSSPESAVPAQVPKAAPKAVSKPPLNISHNPQAGSYLANQMAAQQMFITDNLQHRQRETRYIDPITGKEKVSSMWLNTTGAKSRFNSGNGQLQTKSHRYAIQLGGTLNEWSSGGDDKGILGITAGLGKSTSHSHSTSSQHKSDGSVNGYNLGLYSIWYADNQTQLGPYIDLLAQYGWFHNQVKAPAGITGANYKSYVFTTALESGYKFQLLEKADARLFIQPKAKVSWQRMSGVQDKGSAGAQVILEENNVVATQLGMRTSLELDIDTLSSNRTLQLSPSFEANWIHNGNNKGVWLESTNITPQGNNNIADLKLGIEANIDSNLQLWTHLGHQFGGHNYSDTQAMLGANYRF >NC_008800.1|WP_011817239.1|4043816_4044320_+|M48-family-metallopeptidase MQELTYLQGYPQHLQSQVQQLISEQRLGSVLRQRYPQPHDYNTDKMLYQYTVDLKNQYLRNAQPLSKVAYDSKIQVMKHALGLHTAISRVQGGKLKAKAEIRVATVFKNAPEAFLKMIVVHELAHLKEKDHNKAFYSLCCHMEPQYHQLEFDTRLYLTHLDLFGTIY >NC_008800.1|WP_011817240.1|4044391_4045393_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MIRFAVIGTNWITARFVDAAHESGKMKLAAVYSRKVEQAKEFGDNYNVTECFDNLEAMAASDQIDAVYIASPNALHYSQAKLFLSHKKHVICEKSLASNFAEVEALVACAREHQVVLFEAFKTAYLPNFTQLKQSLPRVGKLRKAFINYCQYSSRYQRYLNGENPNTFNPAFSNGSIMDIGYYCLASALALWGEPKSVLASASLLPSGVDAHGTVCLNYGDFDVVIIHSKVSQSDIPSEIQGEDGSLVIESISECLSVAFTPRGSHSQDLTQPQHINTMLYEAEVFANLVETNQVEHDGLQLSLLTSRIQTDIRRQTGVIFPADSQPPAVYPK >NC_008800.1|WP_162484223.1|4045745_4046729_+|TerC-family-protein MNTVGTPLLWGCFAVVVTIMLAIDLLLQGRRGSQTMTLRQAACWSLVWVSLSLLFNAGFWWYLTETMGREIADKQALAFLTGYLIEKALAVDNVFVWLMLFSYFAVPANLQRRVLIYGVLGAIVLRTIMIFAGSWLVSQFSWILYLFGAFLLFTGIKMALAKEDNTPIGEKPLVRWIRNHLRMTDELHGDRFTVRKNGLLYATPLVLVLILVELSDVIFAVDSIPAIFAVTTDPFIVLTSNLFAILGLRAMYFLLANVAERFSMLKYGLSVILVFIGVKMMIIDLFHIPIGISLSVVAGILALTLLINTLANHRADKRLAADNTTDK >NC_008800.1|WP_005174187.1|4047046_4048303_+|serine/threonine-transporter-SstT MENTQSGFIGFIIRGSLVKQILVGLIAGIILALVSTQAALAVGLLGTLFVGALKAVAPVLVLMLVMASIANHKQGQKTSIRPILFLYLLGTFSAALIAVAVSFMFPSTLVLATQNSDIAAPGGIVEVLKGLLNSVIANPIHALLNANYIGILAWAVGLGIALRHAADTTKALINDMSNAVTVVVRVVIRFAPLGIFGLVASTMAETGFGVLLGYAHLLVVLIGCMLLVALVVNPLIVYWKIRRNPYPLVFACLRESGVTAFFTRSSAANIPVNMEMCKKMNLNEDTYSVSIPLGATINMAGAAITITVLTLAAVHTLGIAVDLPTALLLSVVAAICACGASGVAGGSLLLIPLACGMFGIPNEIAMQVVAVGFIIGVLQDSAETALNSSTDVIFTAAACQADDARLANPDPLASRKSV >NC_008800.1|WP_005174190.1|4048352_4048889_-|YgjV-family-protein MTFYWFAQAVGVLAFFVGITMFFNRDEQRFRLQLSAYSAIIGCHFFLMGASAAGSSAMLNALRNLVAAKTRSSIAMLVFIVLTLAFGLWRMQHAVEILPIFGTVISTWAIFRTTGLTTRCVMWVSTVCWVIHNVWLGSIGGSLIEGSFLLLNGFNIIRFYRLQRQGIDPFLVENKATK >NC_008800.1|WP_005174191.1|4049058_4050549_-|altronate-dehydratase MQSIIKIHPLDNVAVALQDLAADDVLEIGEFSVKLAQPVARGHKFALTAIAPGQMIVKYGLPIGHALTLIQPGEHIHSQNAKTNLSDLDEYQYQPEFSELPPQMADREVQIYRRANGDVAVRNELWIIPTVGCVNGIARQIQQRFLKETQDAEGIDGVYLFSHPFGCSQLGQDHENTRTMLQNMVRHPNAGAVLVIGLGCENNQVDVFQTTLGPVDEDRVHFMVCQQQDDEVEAGLEHLHALYQVMRHDQRVAGKLSELKFGLECGGSDGLSGITANPLLGRFSDYVIANGGTSVLTEVPEMFGAERILMSRCRDEATFEKTVSMVNDFKQYFIAHNQPIYENPSPGNKAGGITTLEEKSLGCTQKAGQSKVVDVLKYGERLQHPGLNLLSAPGNDAVATSALAGAGCHMVLFSTGRGTPYGGFVPTVKLATNSELAAKKPHWIDFDAGKLIHGTSMDDLLTEFVDLIVDIANGKPARNEVNDFRELAIFKSGVTL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
957484 : 1011295
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_008800|957484:1011295|DBSCAN-SWA 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>NC_008800|957484:1011295|1000374_1000689_+|WP_042661606.1|holin|DBSCAN-SWA MPNGETSFIRIVLMLGGIGAVISLAKVLVGNEAITLRLIVGRTILGSGTSLLAGMALIHFPDIHILALVGVAAALGIMGSSVIEMALTRLLVRYLGRLKKENES |
57 | Cronobacter_phage(50.0%) | head,transposase,tail,tRNA,portal,terminase,integrase,plate,capsid,holin | attL 981208:981230|attR 1012603:1012625 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1577851 : 1585634
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_008800|1577851:1585634|DBSCAN-SWA GCTAGATTCTGAATTGGTTGACGGCACTGGTCAAATCAGCCGCCTGAGCTTGTAATGCTGCAGAGGCTGCGGTCGATTCCTGCACTAATGCGGCATTTTGTTGCACCATAGTATCTAATTGCGTCACCGCACTGTTGATCTCATGAATACCGCGCATTTGCTCATCAGCAGCGTTAGTGATTTCTGACATAATTGTGGTGACATCAGATACGCTGCTCACAATTTCAGTCATGGTATTACTCGCCTGGCGCACTTGACCAGAGCCAGAGGCGACACTGCTAACCGTCGAGTCAATCAGGGTTTTTATCTCTTTCGCCGCTTGCGCACTCCGTTGGGCTAATGTACGAACTTCCCCTGCGACTACAGCAAATCCACGGCCTTGCTCACCAGCCCGAGCCGCTTCTACCGCTGCGTTCAGTGCCAGAATATTAGTCTGGAAAGCAATACCATCGATAACACTGGTGATATCGCCGATTTTGCCCGAAGCAGCCTCAATAGATTCCATGGTAGTAATTACTTTAGCGATAACCTCGCCACCACGAGAAGCATCATTAGCCGCAGAAAGCACCGCTGTATTGGCTTGTCTTGCCGCACTGGCAGACTGTGCCACGGTTGCTGAGATTTGTTCTAATGCCGCCGAGGTTTGTTGCAAACTGGCGGCGGCTGATTCTGTTCGGCCCGACAAATCCTGATTACCCGCTGCAATTTCATTAGCGGCAATACTGACAGACTCGCTGGTATTGCGGATTTGCGCCATGACGCCACTGAGCTTGTCAGCAAAATTATTGAATGAAAGGGCTATTTTAGCGACTTCATCGTGACCTTCGACCGGTAAGCGCTGAGTTAAGTCTTCGGTACCTGAACTGATGGCATCCATCGCTTTGTGTACATGTGTCAATGGCGTCAGCGCACGTTGCGTAATCAGACTAATAATGACTACAGCAATTAAGATAATGACGATTAGGGTTACTAAAGATGTCGTCAACAATGAGCGCATACCCGCAGTAGCATGGGCTTTGTCCAGGGCGACCACGGTAAACCACTGGGTTCCAGGTACCGCTTGTGCGAGCAACAACTTAGTGCTGCCACCGATCTCTGCTGCGGTAGGGGAGATTGCAGTTAGCAGCGTTTTAAGATCCAATGTTGGCGCTATCTCACTCAACGGCTTAAGGGTTAACTGTGAATCTGGGTGTGCGATAATGGTGCCATCCGCATCAATTAACATACCAAAGCTATCATCCGTTGGATGGATGGATTTCACGTTTGCAATCACGCTATCCATGGTGACATCAGCTGCTAACACGCCTTTCACACTGCCATCTTGAATAATAGGCAATGCAAAGGTCACAACTAATTGATTAGTCCCTGCATCAATATAAGGGGGAGTCACCACCGGGCTACCCGCTTTCACTGCTTGTAAATACCAAGGGCGCCCGGTGGGATCGTAGCCAGCAGGAATACCATCAGGATTAGAAAAAACGGCCGTCTTATTTGCGTAACCAATATAAACGTTAATGAAGTTACCTGCGGCAGCAACCTGGCGTAAGGCTGCAATAGGGTCCGCTGCCAGTGCGCTCTCTTTAAGAGACACGATCATTTGTGTCTTCATCGCTACCCAATCGGCAATTCCAACCCCATGACTGGCGGTGACCGCCTTCAAGGTGTTATCGATTGCGCTACTGTTATATTTGTTGGCAACGGAGTAATTAAAGTAAGTGTTAATGGCAAGGGAGCCCGCCACGATGATAACGCAGGCAGCCAAGATACGTGAACGAATGGAATCAAGCATAGAGCGTCCTAAATAAAGGGGAAGGCGTAATTCAAGTAACGGCTTGGCTGAGATAAACTTGAGCTGAGTCACAGTAACAAACTGTAATTAGTGCGCTATTGTTAATACTTCTTTATGTAACAGTAACGGGATGGAGGTTTTTTGTTGATCTCGATATCTAATAAAAACAAAAGCTTGGTAATCAATTTAATCTTAACTTAGTGGTAAAAATTCAAATAAAGTTGAAAAAAATAGTGACATTTAAACTGCAAAATCAGCATCAATCTCGCTGAAAGGGGGCGTGTCAGCGAGATTGATGCTGTAATTGGTGATGACGAGGTGAGGGGTTAAAACTTATACAACAGACCAAAGCCGATGGTGTGGTTTTTCTGAGCGATACCGGAGCTATCAGCATGGTTCTGAGATGCACCGGTGCTACGGTCGAGGGTTTGTGTTGCTCCTTTACCTCCGGTGTACTGGTTCCAGGTTGCTTCCACAAATAATTTGGTGCTTGGGGTGATGTAATATCCAGCATCCACCACTATGGCGTAATAGCGAGAGTTTTTGTTGCTGTCTTTGAATGAAAGTTTGCGTGAATAGTGTTCGTCATGCCCATTGGCATTTACCCAACGGCTGTATTTTAGCAAGGTATTAAACTCAAATTTTTGATAATGGTAGCTTCCCGCCAGGCCAAGATAGGTCATATCAAACTTTTGTTTATATCCGATAACGGTAACAGTATCCGAAGTTGTAAAAATACTTTTACCATTATCGTAATTATAGTTTCCACCATAAGCGGTCCAACTGCTGTTATTACGTTGATAACCGGACATCATCGCAATACGATAATTTTTTTGCTTTAAAAACCAAAATTTCGGATTAAGATCAATTTCGTTAGCATAATTCAAATTGGTTTTGTCATGGTGAGACCAATCAGTCCATTTGGTTTGATCAGACTTTAGCCATCTAATCATCCATGGTTCCTGTGCCGGAAGATAATGTAGACCATCCACGAGCCGTTAAGGTTAAACGTGATAACAGATCCCATGATACAGCCATTTTAATAATAGGGGTGTTTTCCGCTTTCCAGTCTAATTGGCTAACTTTCCGATTATTTCTGTCATAAACATATTCATTTGCTTCTGTATTTAATAAGCCTGGCGAGGTACTGACAGTCAAGCTATCAGTAATATTGGTATGATGACTGGCGACAGCAGAGTGAGACAGTGCGAGAAGAATTGATGCGCTCAGAATTTGTTTTACTGCAATATTAGCTTCCATGATTAACCTTTAATTTGTTTAAATCCTCATGGAGAAAGCTAACATTGCTAAGAATTTAAAGGCGTTAATTAAAGATTAAAAAAAAATTAAAAAGATTAAATTCCAGCATGACAATTTTATCAAACTTAATATGAGCCGGGCTTGGTTACCCGGCTTAATTGTGTTTAAAACTCATGGACTAGCCATTCATCGGCTTGTTCAAACATTTCTTCTACTAAACGGTTGAGCACTGATTTTTCTTGTTTAGTTGCATCAGTATTAATGCCATTGGCTTGCATTGGCTTGACCTTAACCTCGGCACCGGGAAACACTTGATGCACACGTTTAGTCAATTCAGCTTTAATCATTTCATTGGCGTTAGTCAGGCCGGCGACATTCCGCTTGTCATAAATTAATTCTACTCGCATGATTTCTTTCCTGGGTGATTAATACTGTATTAATATACAGTTGAGGTTAATGACAAAGTGCCCGTAACGGTGAAAACAGGCAGATCGTAAAGACGCCGTAAACCCCTCCCTGGGGGCTCGAGCCGCGCCGTCCCTGGCGCGGACGCTTTACTCTTCTACCTGCCTTCACCTTGCAAGATCGAGTTATCGAGGTTTGTCAGTAGTCTATACTGTATTAATATACAGTTCTATTCAGCATAAAACAACCGAGTTTTAGCTATTTTAATGTGAAATGAGGTTAAATGGTTGTTTTAGTGATATAAAAAATAACCGCAGGTGATTTTATGGCTAATCACTTGCGGTTATTTTTATGCGAGATTTTATCTTCTTGTTTATACAAATGATTTAGGTTTTTTGACACGCTAATACAAATCTAAGAATAGGTGGCTTTGGCTAATCTATCTCTAACCAGCGGGCATCAACCACCACGCCAAGTATCTTACAGTTGCCATTCAGCTCAATTAAACGGTAAGCAGGATTCAATGGTTTCAAATACTTAACGCCAGCATCAACAATTAATTTTTTAAATGTCGCTTCATTATCGTCAGTTAATTTGGCGACAACAAAGTTACCCGGCATGGGTTCTTTTTCCGGATCGACCAGAATAATCATTCCTTCCGGAAAACTGATTCCTGACGGTGAAGTCATGGAGTCGCCTTTTACGCTCAACCAAAATGCACTGTCATGCGCATTTTTGGTCGACTCAGGCCAAATTTCTATATCACGTAATTGATAGGGTTCTATGGCCTCATACCAATTTCCTGCGCTAATCCAACTGATTAACGGGTAACTGTTAGCAACTGTTCCTGTGGGTTTGTCATTGAGTCGGTTTGGGGATGAGATAGACAAACTTTCAGCCATTTTTGCCAATTCTGTTGCCAAAGAAGGACTAAAGCTACTAATAGGCTCATTAAGCACTTTGGCAAAAGCAGCTGCATTGGTCACATTGAGCGGGTTTATACCGTTTAGGAATTGGTTCACCGCACTTTGGCCCACCCCTAACTCATGCGCGACAGACTCCTGGGAGATACCCAGTGCTTTTTTCTTGGCGTTAAACAGCTCTTTCAGCCGTTTAGCGTCGTCTAACTGTTCTGGCGTCAATGGCTTCTTTTTCATGAGTCGATTTTATTACCGTTAGCAATAATATCCAATCACCTGCGGTGTTGACTATAAAATCACTTGCGGTAATAATCAATCAGAATGTATAAGAGAAACGCATGTAATCGCATCGGCAACAGGCTCTGTCATCAGTGTCAGAGGCATCTGCGACATGAGTTGCTCTGGTTCGCACAAGAGGACGGCAGCCAGATTTATCGGTGGTTTCCGTTGTTGAGCAATCGATAGGCTGAGGCGTCATTCCTTGACCCCGCCTTTTGTGGAGTAGTTATAAATGAGTTCAATAAACGGCAACGCCGCTGGCAGCCATAGCCAGAAAAGCCAGAGCATGAGAGACATTCAATTGGTGTTGGCGCGCTGGGGAGTATGGGCAAGGTACAGTTCTGGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_008800|1577851:1585634|1581738_1582461_-|WP_011815980.1|DBSCAN-SWA MKKKPLTPEQLDDAKRLKELFNAKKKALGISQESVAHELGVGQSAVNQFLNGINPLNVTNAAAFAKVLNEPISSFSPSLATELAKMAESLSISSPNRLNDKPTGTVANSYPLISWISAGNWYEAIEPYQLRDIEIWPESTKNAHDSAFWLSVKGDSMTSPSGISFPEGMIILVDPEKEPMPGNFVVAKLTDDNEATFKKLIVDAGVKYLKPLNPAYRLIELNGNCKILGVVVDARWLEID >NC_008800|1577851:1585634|1577851_1579639_-|WP_011815979.1|DBSCAN-SWA MLDSIRSRILAACVIIVAGSLAINTYFNYSVANKYNSSAIDNTLKAVTASHGVGIADWVAMKTQMIVSLKESALAADPIAALRQVAAAGNFINVYIGYANKTAVFSNPDGIPAGYDPTGRPWYLQAVKAGSPVVTPPYIDAGTNQLVVTFALPIIQDGSVKGVLAADVTMDSVIANVKSIHPTDDSFGMLIDADGTIIAHPDSQLTLKPLSEIAPTLDLKTLLTAISPTAAEIGGSTKLLLAQAVPGTQWFTVVALDKAHATAGMRSLLTTSLVTLIVIILIAVVIISLITQRALTPLTHVHKAMDAISSGTEDLTQRLPVEGHDEVAKIALSFNNFADKLSGVMAQIRNTSESVSIAANEIAAGNQDLSGRTESAAASLQQTSAALEQISATVAQSASAARQANTAVLSAANDASRGGEVIAKVITTMESIEAASGKIGDITSVIDGIAFQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFAVVAGEVRTLAQRSAQAAKEIKTLIDSTVSSVASGSGQVRQASNTMTEIVSSVSDVTTIMSEITNAADEQMRGIHEINSAVTQLDTMVQQNAALVQESTAASAALQAQAADLTSAVNQFRI >NC_008800|1577851:1585634|1581063_1581306_-|WP_005159352.1|DBSCAN-SWA MRVELIYDKRNVAGLTNANEMIKAELTKRVHQVFPGAEVKVKPMQANGINTDATKQEKSVLNRLVEEMFEQADEWLVHEF >NC_008800|1577851:1585634|1584440_1585634_+|WP_011815982.1|transposase|DBSCAN-SWA MLVRKVCQNFFQNALAPFHRYRQSALMDATVALINGASLTLTSIGRFLPGQAQVKNKIKRVDRLLGNESLHRDIPLIFNNIIAMLTRKLSLCVVAVDWSGYHSHEYHILRASLICDGRSIPLLSQIVPSAEQQSEQIHKTFLNALARAVNPDARVIIVTDAGFQNAWFKHIKSLGWDFVGRIRGYTRLRLHREGDIWYKPQELQARSQPEYLGPGTLSRTQYARCEGHFYLYKKAPKGRKNRRSRGRIKRYKQERDGCSSAKTPWLLFTSSDDFRPREVIKIYSRRMQIEQNFRDEKSERFGFGLRASRSRTTERMQVLSLLATLSTIVMWLMGYHFENKGLHVRYQANSVKSRRVISYLTLAENVLRHSPLILRRIALNSALNHLARAYRNMVLVY >NC_008800|1577851:1585634|1583324_1583603_+|WP_005171486.1|DBSCAN-SWA MNEQSQLPYWWTGALALFSALSLQDYIFILGTLVSVIFTVKTYYVNLREKDAIIKEEQRRTEILRDFLRDKAVDSIPAAIAVCHDTLRKMED >NC_008800|1577851:1585634|1582735_1583215_+|WP_011815981.1|DBSCAN-SWA MSSINGNAAGSHSQKSQSMRDIQLVLARWGVWARYSSGLDYSSIAAGFKGLLAETSKSKASCCDDDGLVVDGCVARLKQYRPDEYELIIRHYVLNQSKRAIARQQKRDERLIRINIQMAEGFIDGCLAMLNVKLEMDPFIENLHFYEKTLARSAKSVLV |
6 | Enterobacterial_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1791979 : 1889063
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_008800|1791979:1889063|DBSCAN-SWA AATGGGTAAAAGAAAATACACAACTGAATTCAAGCGGCAGGTTGTTCTCCACTTCCTCAACAGTGATGATGGAGCCAGGCGTACCGCCCGACTATTTGGTCTTGACCACGGCACGGTTCGCCTCTGGACCGAGCACTGGAAAGCCAGCGGAGAGAATGGCTTCACCATTACGACCAAAAAATATTCCGCTGCCTTCAAGGGGGCGGTACTTCTCTGGATGCAGGATAATCATCAGTCCTCCCGCAAAGCGGCCGCAAAATTCAACATTGCGACAGCCTGCACCATCAACAGATGGGCGCGACTTTACCGCGAAGGGGGTATTATTGCGCTTCGCAACAAACCCAGAGGACGACCGACTATGTCAGGGAAGAAAAAGCATTCTGCTCAGGAAGCAACGGCCCCTTACCCGGAGTTCCGTAGCATAGAAGAAGAGCTGGAATATCTGCGTGCAGAGAACGCCTACTTAAAAAAGCTGCGTGCCTTGATTCAGGAGAAGCAGCGGAAAAAACGCGAATAATCACTGAATTAAGGCATCTGTATAAACTGGCGACCTTGCTTTACGTGGCCGATCTTCCGCGCAGCACCTTCTACTGGCAGGTAAAATCCAGTGGTCGTGAAGAGACTTATGCGGATGAGAAACAAAGAATAAAAACCCTGTTTCACCATCATAAAGGTCGCTATGGTTACCGCAGAATAACGCTGGCCCTACGCAATGAGGGCGGGAGTCTTAACCATAAAACCGTACGAAAACTCATGCGGCAACAGCAGCTTGCATCTAACCTGCGTCGTAAAAAATATCAGTCATATCAGGGTGCCTACGGTAAAGTGGTCCCTAATATACTTGCTCGAAAATTTACTGCCGAAGCCCCTAACCAGAAGTGGGTAACGGATGTGACCGAGTTCAACGTCAGGGGTAAAAAGCTGTATCTGTCACCCGTGCTGGATCTGTATAACAGCGAAGTCGTTGCCTGGCAGATGGATACGCATCCCGGAATGAACCTGATTGATAAAATGCTTGATGATGCGCTACAGAAGTTGAACTCAGGCGATGAACCTGTACTTCACTCGGATCAGGGCTGGCAATATCAGATGGCAAGCTATCAGAAAAGGCTGGGGTCTGGCGAAGTAAAGCAAAGTATGTCGCGCAAGGGCAACTGCCTGGATAATGCCGTGATAGAAAACTTTTTTGGTCTGCTGAAGACTGAATGCTGGCACAATGAAAAATACGAAGATGTAGAACAACTGAAAAAAGCGGTGGATGAGTATATCCATTACTACAACAACGAAAGGATCAAAGTAAAATTAAACGGCCTGAGTCCGGTGCAGTACCGAAATCAGGCCATGTCAACCGCCAGGAAAAGTGTCCAATAAATGGGGTTCACTTCAACCAGTGCCGGGTTTTATCAAGAAATTTTAACATCTAGTTACGCAGACGCGGAGCCTGCAACTGATGGCGGATAGAGGCTGCCAGTTCATCTAATGAAGGCTGTTCAGGATGGGCATCCATATCTTCATAAGTCAGCTGTGCCTCTGCCAGATAAGTATGTACCGGTTGCCCTTCATCATCTTCAATCACCACGTGATACCAAGGCGACAAACGCAACGTATCATTGTTTGCCACCTCATCTGGTGCTGGTGGCTCAAGAGAGTATTCAGGATCGATATCAATTACTACACCTAAGTAGCCGTGGAGGCGGTGGCGAACCTGCTGCCCGATACCGAATTTGCTCGCGATCATGATAACCTCCTGGGAAACTATTACGCTGCTTTATATATGAGGGCAACGCAGGGCATTTCAAGTCACATTATCCGACACGCAAATCCTTTCAGATACAAACCTTCAGGGTATGTTGCGATAACCGGGTGATCCGCTGCCTGACGGAACTGCTCTATAAATTGTATATCATGGCCTGCATCTAACGCAGCATCGGCTAAAATTTTCTGGAATAAATCTGTAGGCATCAAACCAGAACAAGAGAAACTTAATAAGATGCCGCCAGGGCGTAAAAGCTGTATCGCTAACATATTGATATCTTTATAGCCGCGACAAGCACTGGCCAGTTGGCTTTTATTTTCCACAAATTTCGGTGGATCCATGATGATCATGTCAAACTTTTCCCCTTGTGCGCGATAGTTGCGCAGCAATTGGAATACATCATCACGAATAAATTCGGCTTTACTTAGATCTAGCTGATTAAGCTCAACATTTTGTTTAGCGATATCCAACACGGATTGTGAAGTATCAACACTGATAACTTGTTGGCAATTTCCCATCAGCGCTGCCACGGCAAAGGCCCCGGTATACGAGAAGCAGTTCAGAACGCGACGGCCATCGGCATAATTACGCGCCGCCAGGCGGCTATCTCGCTGGTCTAAATAAAAACCTGTCTTATGACCATGCTGAATATCTACCAGCAATTTCATACCGTGCTCAGTGATAGGTAATAGAGCCGGAGGCATCTCGCCCCAGACAGTACCTTGGGTCAGTTCCAGACCTTCTTTTTTACGCACCGAAACATCGGAGCGATCATAAATTGAGCATTCTGGATAGCACTGTTGTAATGCACTGACCAGCGCTGCACGCTGATGTTCAGCACCTGCCGATAGCAATTGCAACACCAGAAAGTTTTGGAAACGGTCGATGGTAATACCCGGCAAGCCGTCGGATTCACCGGCAATAAGACGATAGCCATTCAAACCATCACGCTGTGCCAACCAATCACGCCAGCTCTGCGCCTGCTGTAGACGGCGAACAAAGAATTCGCTATCGATAACTTCATCTTGTTGGAACGTCCAGACTCGGGCCACAATTTGTGACTCAGGTGAGTAGGCCGCACGAGCCAGCCATTTTCCCTGGCTATCAAGAATATCGATGGTTTCACCCGCGCTTGCATTGCCTTCAAGGCGTTGCACTGCCCCAGAGAAAATCCACGGATGGCGACGAAGTAAGGATTTTTCACGTCCTCTAGCAAGAAATAGGCGCATTATAATATTCTTTTAAAATCAAATGGTTGAAATTGATAAGTTATTATCAATCAAAATAAGGTCACAATGATATAGCAATATCATGCCACTCACTACCACGACGGCCTTGCTAGCTCGCTCTCACTTGGGCAATTTAGCCTGTTATCAACCGCTCTCTCAGATTCAATCGAAAGGTCGAAAATTTTTCACTAACATATTCATAGAGCTATAATTACTTTCTTGGTTCAAACTTTCTTCATCGCAGGAATAGCATATATGACTAATAAGCAAACTCACTTAGAACTCACCGAAAAGCAAAAAGAAGAAATTGATTTAATTGCGTTACAGCGGGTTAACGCCATGAATAGCGATGAGTTTCTTTGTAACACCATTGACCAAAAAATTCATTCGATGGAAGAACACCTTAAATCCTATTTCCAGTCGCGTTTTTCGTTCCATTTGAAACAAAAGAACGGCGAGAAATAGAGGTAAATTTCGTTGGAAAACATAAAAGAAATCATCATTTATCTCTCTCAGTCATTACAGCTATTGCTGGAGTTCTTGTCTGTTATTTGTGTTTTTGTCGGGTTGGTAAAGTCACTGCCCACTGCAATAACAAATTTTAAGAATCAGTCGATACTCCACTTAATGAGAACGCGTTTTGGTACCTGGCTGGCTTTGGCGCTAGAGTTCCAATTAGCGGCTGATATCTTGGCGACCACAATTAACCCAAGTATGGAGGAATTGATCAAGCTGGCCATCATTGCTGTTATACGAACATTCCTTAATTACTTCTTATCTAAAGAGTTAGAGTCGGCGGAAAGTAATTTTGCCAACGCCAGCGCGCATCATGGGAAAAAGTAACAATAGATGAGGAACTGATATGGCAAAAGTATGCATTGCTGCTTATGTTTATGGCGTCGTTCAAGGTGTGGGCTTTCGCTATAGCACACAACGTCAGGCACTGGCACTAGGGGTCACAGGGTATGCCAGAAATTGTGATGACGGCAGTGTAGAGGTTGTGGCTTATGGTGAGCAACAAGCGGTCGAGCAATTGATGGAGTGGATTAAGCAGGGCGGACCACGCGGGGCGAGGGTTGATCGCCTGCTGACCGAGCCTTATCCAGCCACTCCATTTGAGACATTTAAAATTCGCTATTAGTCCATCAACCTGACTGATTCATTAGCATTAAATACATTTCACCGGCTTTGGCAATCCGGCAATTTTTGTGGCTTGTTTTGCCGGCCCTTGGGGAAATAGACGATAGAGATAGCGGCTATTGCCTTTTTCTTCACCGTATTTCTGCGCCATGGCTTTAACCAGCATACGGATTGCCGGTGACGTATTGAATTCCTGATAAAACGCACGCACAAAGCGCACCACTTCCCAGTGCGGTTCGGTGAGTGTGATGCCCTCTTGTTCAGCCAGTATTGGGGCCAGTGCTTCGCTCCAGTCGGCGCTGTCTTTCAGGTAACCCTGCGCATCGGTCTCAATAGTGCGTCCTTCAAACTCCAACATATAACCTCAATTATCCCATCAATGAAACGGCTGCTAATTTAGCAAATATTTGCCTGTCTCCCAAAGAAGTCTATGCTTTTAGCTCGGCAAAGTGACAGAAACGTCATTGAGAGCCAAGAGGCGCGACTGTTGTACAGTGAATCATCATCGTGATGATTAATTCATCATTCAATAATCATATGGTGGCTTTTTGCCCGATTAAACACAAACAAGCTTTACAAGCGGCAGAGCTCTGTTTATAGTTCGGCTCGTTGCGGAGGGGTGGCCGAGTGGCTGAAGGCAACGGTCTTGAAAACCGTCGACGGGTAACCGTTCGAGAGTTCGAATCTCTCCTCCTCCGCCATCTTCTCTTCGTATTTCTTATCTTTTCAGTACATTCCCCAGATAATCATTCAGCATTTCTCAGCGTAACAAGCTGGTAAGGCGTTTTTATTTCGTCTGTCTCCGACGTTCAGCGGCTGAGGTGCGGCTAGCAATAATTCCTCTTTATCAGCCCACAGATGGAACTCCCCTTTAC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102 | Salmonella_phage(41.03%) | head,transposase,tail,tRNA,portal,terminase,integrase,lysis,plate,capsid,holin | attL 1785404:1785419|attR 1898791:1898806 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1985628 : 2006431
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_008800|1985628:2006431|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_008800|1985628:2006431|1998215_2000696_-|WP_005170304.1|DBSCAN-SWA MLEEVDEIRVKANANLDVNKKGELGQFFTSSSICIFMASLFNELKGDISLLDPGCGPGSLTAAFTEEVIRRGSARSLELHAIDIERKIKPFLDVVLDKCVSASNAAGIKCKIYPQINDYITAASVTKHDFGTEMYTHCIINPPYKKITSASDYRKILSAIGIEAVNLYAGFVALAIMQLKKQGEMVAIIPRSFCNGPYYLPFRNFIFQHCAIKHVHIFDSRSHAFSEDDVLQENIIIHLVKNGIQESVKITSSPNSDFFFDQESNSVSASDMTVRNIPFESLVNMLDKDKFIHIAANNRDQSIIDRLNVFYTSLNELGISVSTGPVVDFRLKSDLRENIEPGAVPLIYPVHLNGVVDWPKKSKKPNAINVSERSRSWLWSNQGYFVIVRRFSSKEEKRRIVATVYDGSLPGEWIGFENKLNVFHINKSGMDKDIAYGLSAFLNSMLLDKYYRLFGGHTQINATDLRSLHYPDRKSLQRIGSYISSQGLSQENINEAINTEIKRLSKNDDKNPLAAQEKLDQALEIITLLGMPKSQQNERSALTFLALVNLRPEGSWQELEKPLVGVTPIMDWCRDIYGKEYAPNTRETFRRQTLHQFIDGGLVLYNPDKPNRAVNSPKACYQIAPELFDVLNTYGTPLWNKALGEWLMQRETLVEQYAMKREMHMIPLTIDNGTEIHLSPGDHSQLIHDIVTEFGPRFAPGSQVIYLGDTGAKEDFFRKDALADLGVTVNRKGKLPDVVLYWPQRDWLILIESVTSHGPVDGKRHSELANLFKDARPGLVYVSAFPDKKTMSKFFSEISWETEVWIAEAPTHMIHLNGDRFLGPHN 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MTKLLTLEEWAEETYRSKQPTPQTLQRWARGGNIYPAPEKHGREYRVQPGAIYIQPKSYRLAKEILKTSPSTSSSLIEKINHGIKAKTI >NC_008800|1985628:2006431|2003308_2003704_+|WP_011816186.1|DBSCAN-SWA MYEPLTLPVGVTTASAGVTFAAMFPEATPAVVVCSLAGAALYVLSSRPHRLWRQVLFALISFIGGVYCADTASEIIAALINAGLNQLSPPVTIRVTPAIGALVASTVCVSVLLRVMSKYHLNSDSNRKEGD >NC_008800|1985628:2006431|2003703_2004000_+|WP_005166766.1|holin|DBSCAN-SWA MEWQKWILAANALVCLLIVVRLMFYQKTGRYRFFYSALAYLVILAAGWIGIRICYGQYSGADPAELLLNLSFCLAIWGAGGNIAKLTHWREDASHDKK >NC_008800|1985628:2006431|1989692_1990079_+|WP_005170441.1|DBSCAN-SWA MFIHKVRSSCRMLSALIVLFVGLSSQQALAHAHLKIESPAADATIGSAPEAVTLGFSEGIELNFSGVKVTGPDNDVVKTGELKLDPANNTQLILPIDSALKAGKYNVSWHVVSVDGHKTKGTYSFTVK |
22 | Escherichia_phage(37.5%) | lysis,transposase,holin,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2009674 : 2053968
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_008800|2009674:2053968|DBSCAN-SWA TATGGAAAAGCCACAGACTATTGTTGGTTTTAAAATCGGCAATGCGATGGTGGATGAACTTGATATTCTACCCGTCGCAAAAGCTCGGTTGGCATGGCGAAAAATCATTGCGCGTATGCGTTATAAACTAAAAGGTGTACGAAACGGCATTGATGTTACGACAACACCTGAAGGCTTCAAATTTGTCTATCAGCAATTTGTCAAAGCTGTCAGGGACAAACCTGAATTGGCAACCTTATACGGTTTGGTTCAGGCATCTACATTTGATAATGAAGCTAATCTACCGGATGACTATATTCCGTCGCTCCTTGAGTCATATCCTGAGGAGTTGATTAAAGCCTATCTGCGCGGACAATTTACCAACCTGACCAGTGGTACGATTTACCATCAATTCGACCGTAGACTGAATCATTGTGATGAAGTTGAACAGCCAGGCGAACCCCTTTATATCGGAATGGACTTTAACGTCGGGAAAATGGCGGCAATTGTTCATGTTCTGCGGTTGGGTTTGCCATGCGTGGTTACAGAGATTATCAACGCCTACGATACGCCAGACATGATCCGGATTATCAAAGAGCGGTTCTGGCTGTATGACGGAAATAATTATCGCAAGGTGCGAGAAATTTATATTTATCCTGATGCATCTGGTGACTCCCGTAAATCAAGTCATGCCAGCACAACAGATATTGTCCAGCTTAAACAGGCGGGTTTTAACGTAGTCGTCAATGACTCAAATCCACCAGTAAAAGATCGCATCAATGCCATGAATGCGATGTTCTGTAATGGAGACGGGGAGCGTCGCTATAAAGTTAACGTTATGCGTTGCCCTGTATATACGGAAAGTTTGGAGCAGCAGGTTTGGGCTGATAACGGTGAGCCGGATAAATCTGCTGATAACGATCATCCCAACGATGCTGGTGGGTATTTCATCGTAAAACAATTCCCAATCGTAAAACCAACCGGAAGAGTGACATCACTTCGGATCTAATCATATGGCTGATATCTCTACCCCAAATTTAGATTACAACAATATGTTGGAAGCGTGGGAAATCAATGATGCTCTGATGGGTGGGACGCTGTATATGCGCACACAGCAGCAGTATATGCCGCGTTGGCCTAACGAGGCTGATGATGGTTACAGAAATCGGCTGGCAGTGGCAACACTATTACCGGTTTACCGTGAGACCATCTCAAACAATATTGGCCGTGTGTTTGCCGAACCGACCAGGTTGAGCGAGGACACACCAGACCCGATTGTGGAATATTGCAAAAACATTGATTTAGAGGGAAACCGGCTTGATGTCTGGGCGCAAGAATATTTCTCTCATGCTCTACAGTACGGACTGGCCCACGCGTTGGTTGATTATCCTAAAGCCCCGAAAGTTAAGACTGTGGCCGAGAAAAAAGCCCTTAACCTCAGACCTTATGTCACCCTGATTAATCCGCGTCAAGTTATCGGGTGGAAGTCAGAAATCAGCGGAGGCAAGCGTGTATTAACTGAGCTGCGTATCAAGGAAATCGTGATTAAGGATAATCATGACTATTCTCAGGAAAAAATTGCTCAGATCCGCCGTTATACCATCGGCAAGGTGGAAATTTATCGTCGCGCTGCGCCGCGTGGCGGTGAAAAACTGGGTAAGAGGGTGAAAGTCGATGGCTGGAAAACCTCACGCGACGACATCCCGTTAGTGACCCTTTACACGCATCAAATCGGTTTTATGCGGGGTACTCCACCGTTGATTGACCTTGCGATGTTGAATATTAAGCACTGGCAAAGCCAATCTGAGCAGGACAACATTCTTCATGTTGCGCGTGTTCCACTGCTTAGTGTCTTTGGCCTGGAAGATAAGGAGGAGCTGACAGTAGGTGCGTCTGTAGCGACCCGATTCGATGACAGGACTAAACAGGGATTGGAGTACACCGAGCATTCAGGGGCTTCTATCGAAGCTGGCAGGCAATCGATCGAGGACTTGGAAGCGCAAATGAGAATGGCAGGAGCCAGGTTGTTGCAGGTGAACAACACCGCTACCAAAGGGATTGATCAGGTTGGCGAGGAACGGCTACAGGAACAATCCCCGCTCTACACCATGGCAAACGCCCTTGAAGATGCGCTTGATAACATTCTGCAAATCATGGCCGAGTGGATAGGTGTAACGGTCAACTAAAACCGGACACGGATTTAGGCACATTGTTGTAATCGGCGTTCATATTCATCCGGCGATATATTTCCCAGCCGATAATGCCGCCTTTTCAGATTATAAAAGCTGTCGATATAATCGATAACATCAGCGATACCCTGACTTCGGGTTTCATAACGACGATAGTTAACCCTCTCTGCTTTCAGGCTGCGGAAAAACCTTTCCGTAACAGCATTATCCAGGCAGTTACCTTTTCGACTCATACTACCTGTAACATCCAGTTCTTGCTGGCAGGACTGGAACTGCGCGCTGGTATATTGCGCCCCTTGATCGCTATGGAACACCACTGACCCTGTGGGTCGGCGTTTATTTACGGCCAGCCTTAAGGCCCGGACAGTCAAGTCGCTGTCCGGTTTGTCTGAGAAGGCCCAACTCACTATTTTTCTTGAACATAAGTCCATCACGATAGCCAGATATAACCAGCCCTGAGCGGTATGCAGATAGGTAATATCACCTGACCACCAGGTATTCAATGTCTCTGGATTAAACTGCCGGTTCAACAGATTAGCGGCCACGACAGCGGGTTTTCCACCGCGTGGATAGCGATGACGCCCAGGTCGTTTAGCTACCAGTAATAAGTTTTTCATTATCTGCCGAACGCGGTATCTGCCCACGTTAAAACCTTGCTCCCGTAACTCGATGCACATGCGCCGGCTGCCATATGTGGCATCCATTTCAGCGTGAACATGCTTAGCCGCCGCGTGCAACATCAGAACATCGGGCTTGATCATTAGCCGACGACTACGGGCATAAAACACGCTGCGCGTGAGCGACAAGCAGCGGCATACCTGTTGGATATTTGCACCAGCCTTCTTCAGTTTTACCGCGACTTTTTGTCGTTGTTCATTTCCATGGCGAAGAAGGCCGAAGCCTTTTTTAACAGGTCATTGTCGCTCTGTAACTGCCGCACCTGCTTTTCAAGTTCTTGTATTCGGCGTTGTTCCGGTGTTATAGCACTGGCTATCGGTGTATTTCCGCGGCTCTCTCCGCGATACTGCCGTAGCCAGCGTTGTAAGGTTGAAAGGCCAATATTCATTGTTTCAGCAGCCTGAGTCACCGGGTACTTATGTTGAAGAACCAGGTTGACGCACTCTTGTTTAAACTCATGAGTAAATGATTTTTTTCGCATTCTCACCTCGTTAGTGTTGCTCATTATATCTCTAACAAAATGTCCGGAATGATTAGACCATTACAAGTGCACCAATATTAATTGCGGCAAAACTTTTAAGACCCATGAAACTATCGTTGAAACGATAATGGAACCGGGAATAATTAATGCTGTACCGCCCCACCCTAAAGGGAATCAAGGCGTGTTGTGGATGTAATTAAAGAAGCCTGCGAATTGCAGGTTTTTTTATATCAAAATTCTGTGTAATTAATATCTTGTTGGGGGATAACTGGCTGTTTATCGTGCTTGCGTGGGGGGGAGCCTTGAGGGTGTGAAAAGTGCCGTAGACACAATGTAGTCATTTTGTAGTCACTTTGCTGCCACTTGCCAAATCTCAGGCGCAAAAAAACCGCCTCTCGGCGGTTAACGACATACTCATACTACTTTGTTTTACTTAGATTTTGTTTCCATGGTGCCCGGGGCGGGACTTGAACCCGCACAGCCATAAGCCGAGGGATTTTAAATCCCTTGTGTCTACCGATTTCACCACCCGGGCTCTGGAAAACTGGAGGCGCGTCCCGGAGTCGAACCGAGGTAGACGGATTTGCAATCCGTAGCATGGCCACTCTGCCAACGCGCCTTTTTTCTTTGCCTTACTACTGAGGTTCGCTTGAAGCCAACCTACTAATTTGGAGCGGGAAACGAGACTCGAACTCGCGACCCCGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCAACATCAGAACTTACTGATTCTTTTGCTATCTTTCGGCATTTCGTTGCTGCCGTCTGATGCGATGCATTCTACTTACCTGACGCGATGAGTCAATAAAATTATCAGACTAATTCGTTCGTTTGCTGCTTTTTCCGGCGCTTCGATCAAGGTTCGAGCAAATCTTTCCAGGCAGCGTTTAAATATTGAAACATTGACCAAAATGTCAGGACCGCGGCAATGTAGAGGAGAACAAAACTCGCCAGTTCAATATTATGATCTGGTCGCCAAAGTAGCCCAACTAATGAGCCCATTTGAGCAGTTGTTTTGACTTTACCAATCCATGAGACCGCAACACTGCTACGTTTACCAATTTCGGCCATCCATTCACGGAGGGAAGAAATGATAATCTCACGAGCAATCATTGTTGCTGCTGGCAAAGTGATCCACCAAACATGGTAATGTTCAGCAACCAAGACCAACGCAATGGCCACCATCACTTTATCCGCTACTGGATCAAGAAAAGCTCCAAAGCGGGTTGTCTGTTTCCAGCGCCGAGCTAAAAAGCCATCGAACCAATCGGTTGCAGCTGCAAACACAAATATGATGGCGCAAACCATCGGAGCCCAGACGAATGGCAGATAGAACGCCAAAACGAAGAATGGGATGAGTACTACACGAAACAGGGTAAGCCAAGTCGGTATATTCAATTGCATCATGCTACGATAACTATCTGGCTGGTGTGGATATTATGAGTATGGTGCAACATTAGCTTCAGTGTTTCAATGCATTGTAGATTTTTTCTGCCAATGCTTGTGAAATACTCGGCACTTTTGCAATTTCCTCGACGCTAGCGTTAAGTAAAGGTTGCAGTCCTCCCATATACTTCAGCAATATTTGCCGCCGTTTAGGGCCTACTCCTTCTATTAGTTCTAATGCGCTAGTATTTTT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42 | Shigella_phage(25.0%) | transposase,coat,protease,terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2092184 : 2103647
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_008800|2092184:2103647|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_008800|2092184:2103647|2095424_2095472_+|WP_152414234.1|DBSCAN-SWA MMHAVTFRFFFYFSA >NC_008800|2092184:2103647|2100788_2101721_-|WP_011816229.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTTPTPHDALFKNFMTQPATACDLLEFHLPPELRQLCDLSTLRLESGSFIENNLRACYSDVLYSLKTTAGDGYVYALIEHQSSPDKHMAFRMMRYAIAAMQSHLEAGNDQLPLVIPMLFYHGMVTPYPYPMSWLHAFNQPALAGRLYSRDFPLIDVTVIPDNEIMTHRRIALLELLQKHIRQRELSELSDQLVMVIASGYTTEDQLKAAINYIIQVGDTADPEAFLRSLANRLPQHEESLMTIAQKLEQKGEARGEARGEARGEARGEANGLKKGKLEVARTMFANGLDRATVMKMTGLREEELAQICH >NC_008800|2092184:2103647|2094764_2094962_+|WP_004713020.1|DBSCAN-SWA MPKIKTVRGAAKRFKKTGAGGFKRKHANLRHILTKKATKRKRHLRPKGMVSKNDLGLVVACLPYA >NC_008800|2092184:2103647|2101982_2102270_+|WP_011816230.1|DBSCAN-SWA MIKTWKHKGLQQFFMTGNPKGVLSDKKDVERIRQRLYVIDSAETLDEIAAFSHYKLHPLTGNRKGTYSITVRANWRITFEFKDGDAYILDLEDYH >NC_008800|2092184:2103647|2102269_2102584_+|WP_011816231.1|DBSCAN-SWA MTMFNPPHPGGIIAESLEDLALSINAAARALGVAPSTLSRVMRGESAISPEMAVKLEAAGIGTARHWLAMQSGYDLWHAQQDTDVSAIKTLFKAPDMPAQPNPL >NC_008800|2092184:2103647|2092184_2094113_+|WP_011816225.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPVITLPDGSQRQYDHAVSVLDVALDIGPGLAKACIAGRVNGELVDASDLIESDAQLAIITAKDAEGLEILRHSCAHLLGHAIKQLWPDTKMAIGPVIDNGFYYDVDINRTLTQEDLDLLEKRMHELADKDYDVIKKKVSWQEARDTFAARGEDYKVAILDENISRDDHPGLYHHEEYVDMCRGPHVPNMRFCHHFKLQKTSGAYWRGDSKNKMLQRIYGTAWSDKKQLNAYLQRLEEAAKRDHRKIGKQLDLYHMQEEAPGMVFWHNDGWTIFRELETFVRMKLKEYQYQEVKGPFMMDRVLWEKTGHWENYAEHMFTTSSENREYCIKPMNCPGHVQIFNQGLKSYRDLPLRMAEFGSCHRNEPSGALHGLMRVRGFTQDDAHIFCTEEQVRDEVNSCIKMVYDMYSTFGFEKIVVKLSTRPEKRIGSDDLWTRAEDDLAAALTENGIPFDYQPGEGAFYGPKIEFTLHDCLDRAWQCGTVQLDFSLPGRLSASYIGENNDRQVPVMIHRAILGSMERFIGILTEEYAGFFPTWLAPVQVVVMNITDSQSDYVQQVTKKLQDAGIRAKADLRNEKIGFKIREHTLRRVPYMLVCGDKEVESGKIAVRTRRGKDLGSLDVNVVVDQLLAEIRSRSLHQLEE >NC_008800|2092184:2103647|2096818_2099206_+|WP_011816227.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKFSELWLREWVNPAISSDALAHQITMAGLEVDGVEAVAGEFNGVVVGEVVECGQHPNADKLRVTKVNVGGDRLLDIVCGAPNCRQGLKVAVATVGAVLPGDFKIKAAKLRGEPSEGMLCSFSELGISEDHDGIIELPVDAPIGANLRDYLNLDDKTIEISVTPNRADCLGIIGVARDVAVLNKLPLTEPEMTPVASSLKDSLPIRVDAPQACPRYLGRVVKGINVKTATPLWMREKLRRCGIRSIDPVVDITNFVLLELGQPMHAFDLDRIDGGIIVRQATEGEDLTLLDGTKVKLSADTLVIADQQKPLAMAGIFGGEHSGVNEETRNVLLESAFFNPLSITGRARRYGLHTDASHRYERGVDPELQYKAIERATRLLLDICGGEAGPVIDVTSAENLPKRATITLHRAKLDRLIGYPVPAEQVSDILRRLGCQVTEQGSDWQAIAPSWRFDMEIEEDLVEEVARIYGYDNIPNVPIKANLVMTKHREANLSLKRVKTALVDRGYQEAITYSFVDPKVQALLHPQQDALILPSPISIEMSAMRLSLLTGLLSAVVYNQNRQQSRLRLFESGLRFVPDNKADLGVRQDVMLAAVITGHRYDEHWDLARQPIDFYDLKGDLEAILELTGKLSDVQFRAEAHPALHPGQSAAIYLSGEHIGFIGVVHPELERKLDLNGRTVVFEVQWNKLADRAVPQASEISRFPANRRDIAVVVAENVPAEDILAECKKVGANQVVGVNLFDVYRGKGVAEGYKSLAISLVLQDTARTLEEEEIAATVARCVEALKQRFQASLRD >NC_008800|2092184:2103647|2095820_2096804_+|WP_005161570.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPHLAELVAKAKAAVEDAQDVAALDLVRVEYLGKKGHLTLQMTSLRELPAEERPAAGAVINQAKQEVQEALNARKEKLESVVLNARLAAETIDVSLPGRRMENGGLHPVTRTIDRIETFFGELGFSVESGPEIEDDYHNFDALNIPAHHPARADHDTFWFDTTRLLRTQTSGVQIRTMKAQQPPIRIIVPGRVYRNDYDQTHTPMFHQMEGLIVDKDISFTNLKGTLHDFLRNFFEEDLQIRFRPSYFPFTEPSAEVDVMGKNGKWLEVLGCGMVHPNVLRNVGIDPEVYSGFAFGMGMERLTMLRYGVTDLRAFFENDLRFLKQFK >NC_008800|2092184:2103647|2102750_2103647_-|WP_011816232.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTTPTPHDALFKNFMTQPATACDLLEFHLPPELRQLCDLSTLRLESGSFIENNLRACYSDVLYSLKTTAGDGYVYALIEHQSSPDKHMAFRMMRYAIAAMQSHLEAGNDQLPLVIPMLFYHGMVTPYPYPMSWLHAFNQPALAGRLYSRDFPLIDVTVIPDNEIMTHRRIALLELLQKHIRQRELSELSDQLVMVIASGYTTEDQLKAAINYIIQVGDTADPEAFLRSLANRLPQHEESLMTIAQKLEQKGEARGEANGLKKGKLEVARTMLANGLDYATVMKMTGLSEEELAQICH >NC_008800|2092184:2103647|2099210_2099507_+|WP_002211830.1|DBSCAN-SWA MALTKAEMSEHLFEKLGLSKRDAKDLVELFFEEVRRALENGEQVKLSGFGNFDLRDKNQRPGRNPKTGEDIPITARRVVTFRPGQKLKSRVESATPKE >NC_008800|2092184:2103647|2094999_2095356_+|WP_004393357.1|DBSCAN-SWA MARVKRGVVARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNDMSYSKFINGLKKASIEIDRKILADIAVFDKVAFSALVEKAKAALA >NC_008800|2092184:2103647|2094116_2094668_+|WP_011816226.1|DBSCAN-SWA MKGGKRVQPARPNRINKEIRATEVRLTGVDGEQIGIVSLNEALEKAEEAGVDLVEISPNAEPPVCRIMDYGKFLYEKSKSTKEQKKKQKVIQVKEIKFRPGTDDGDYQVKLRNLIRFLEDGDKAKITLRFRGREMAHQQIGMEVLNRVKKDLTEDSDLAVVESFPTRIEGRQMIMVLAPKKRQ |
12 | Tupanvirus(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2477459 : 2554665
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_008800|2477459:2554665|DBSCAN-SWA 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96 | Salmonella_phage(16.67%) | terminase,transposase,tail,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2779705 : 2791835
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_008800|2779705:2791835|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_008800|2779705:2791835|2782624_2783323_-|WP_005168749.1|DBSCAN-SWA MALTPFVVNLLLAMCLGALIGAERQWRQRMAGLRTNALVATGAAVFILSSYATSPDSPGRIAAQVVSGIGFLGAGVIMREGMNIRGLNTAATLWCSAGIGVLCGLGLYWNAVAATAVILCANILLREAAQRINMQPQQQAVDLEVRYRIQVTCGAEDEVLVRTLILQALNGVALRLQSLCSADIAKPGQLEVCAEIMATPAAQKEIESIVCRVSLERSVSAIHWRIASELPV >NC_008800|2779705:2791835|2783886_2784135_+|WP_042661459.1|DBSCAN-SWA MKISQTATMTHQLWGSLGYADSPDTSLLFTGEGQLPSAFPVTSLACASIATAGLARGFDSLVQMSCGIAASPLGNATAQWLQ >NC_008800|2779705:2791835|2786332_2786524_-|WP_004701013.1|DBSCAN-SWA MKVNDRVTVKTDGGPRREGVVLEVEQFSEGVMYLVSLEDYPAGVWFFNEIDSHDGTFVEPLHK >NC_008800|2779705:2791835|2779705_2782408_-|WP_005168752.1|DBSCAN-SWA MTKFQKTGTARSNNNKKPFTIALEAKNSLDQTLSKLNANLNGLTEEDAKERLELYGLNEVAHEKAPPALIQLLAAFNNPFIFVLMILAAISFVTDYWLPLQRGEETDLVGVSIIVTMVLISGLLRFWQEYRTNKAAEALKSMVRTTATVLRRSSHSAQPAKQEIAIKQLVPGDIILLSAGDMIPADLRLIKSRDLFISQAILTGEAIPIEKYDAMGAIAPKSVEADASSESELLELSNICLMGTNVASGTAMAVVVATGGHTYFGSLAKSIVGNRAQTAFDRGVNSVSWLLIRFMLVMVPIVLLINGFTKGDWSEAALFALAVAVGLTPEMLPMIVSSNLAKGAIAMSRRKVVVKRLNAIQNFGAMDVLCTDKTGTLTQDRIILEHHLDTRGSNDGRILQLAWLNSFHQSGMRNLMDQAVIKFSRGKPEIDALRSFNKVDELPFDFIRRRLSIVVKDEQQHQTLICKGAVEEMLSICTHVREGDAIYPLDETRRTSLLALATQYNEDGFRVLLLATRELGTQLSELPLNIDDERELVVQGLLTFLDPPKESAEAAIAALRENGVAVKVLTGDNPIITAKICRDVGLEPGEPLSGLDIENMDDVTLAREVELRTVFTKLTPLQKSRVLKMLQSNGHTVGFLGDGINDAPALRDADVGISVDTGTDIAKESADIILLEKNLMVLEEGVIKGRETFGNIIKYLNMTASSNFGNVFSVLVASAFIPFLPMLAIHLLLQNLMYDISQLSLPWDKMDKEFLRKPRKWDAKNIGRFMLWIGPTSSIFDITTFALMWFVFAANSVEHQALFQSGWFIEGLLSQTLVVHMLRTQKIPFIQSTAALPVLLTTGVIMAIGIYIPFSPLGTLVGLQPLPWQYFPWLAGTLISYCVVAQLMKQFYIRRFGKWF >NC_008800|2779705:2791835|2787471_2788506_+|WP_011816625.1|DBSCAN-SWA MKPKSATLDDVARQAGVSYQTVSRVLNRAPHVSLKTRHKVELAMVELNYVPNRVAQQLAGKHSLTLGLATTDLSLHAPSQIAAAVKRKARELGYNVVIAMADDHSEHACQLAINELLAQRVDGILVNVPLKPKRSQKITEQCADTPVLFLDVDPQSAAFSVLFDPKIGAIQGANHLIALGHQQIVLIGGPKDAISAQLRHQGWLQALNNASLTPQAVYYGEWSALSGYQATQTLIASNTPFSAILVANDQMALGVLRALHEINVDIPREVSVIGYDDTADSAYFQPPLTTIRQNFRLLGEECVSRLIVRLHHTIEPPSHSLSLATELIIRQTTAPVNPTWHKNE >NC_008800|2779705:2791835|2788682_2791835_+|WP_011816626.1|DBSCAN-SWA MTAQQEVKPQATPALSQILFRRDWENPQITQYNRLEAHPPFYSWRHLDAAQNDTPSPQRQLLNGQWSFSYFTQPESVPDEWVEHDLPEAISMPVPSNWQLHGYDIPIYTNVQYPIPVDPPRVPQNNPTGCYSYNFTLEPDWILSGQTRIIFDGVNSAFYLWCNGRWVGYSQDSRLPAEFDLTPYLKAGNNRIAVLVLRWSDGSYLEDQDMWRMSGIFRDVSLLHKPDIHLRDIHISTHLSPEFSSAHLEVMAAVNIPLLDINNSQVTKAYQIQVQLWLADSLVASLRQPLGTQPIDERGHYTDRTHLSLRVEHPLLWSAEQPALYRTVVSLLDSQQKLIEAEAYDVGFRQVAIHQGLLKINGKAVLIRGVNRHEHHPQTGQAIDEESMLQDIILMKQHNFNAVRCSHYPNHPLWYRLCDRYGLYVVDEANIETHGMQPMRRLADDPQWFSAFSERVTRMVQRDRNHPCIIIWSLGNESGHGATHDALYRWIKTNDPTRPVQYEGGGANTQATDIVCPMYARVDEDQPFPAVPKWAIKKWIGLPNESRPLILCEYAHAMGNSFGGFARYWQAFRQYPRLQGGFVWDWVDQSLTRNDENGQPYWAYGGDFGDSPNDRQFCMNGLVFPDRTPHPCLYEAQCAQQFFQFSLVSTSPLIIKVTSEYLFRNSDNEHLYWRIELAGKSVLEGSFPLDLLPESTQQFSLTERLPAICGPGDLWLNVEVRQVEETPWSPSHHRCAWFQWRLPHSLAVLSRGLSDSATSNNLKLHQDIQHITVTHQQQHWQFNRQTGLLEQWCVGGENRLLTPLRDQFVRAPLDNDIGISETTRIDPNAWVERWKKAGIYQLEQRCLSLHADTLSQAIQISAEYIYEFAQEQLLHTHWLYRFDQQGHMTIDVRVQIATSLPSLARVGMCCQLSDIYENVEWLGLGPHENYPDRQLSAQHSHWSQPLDQMHTPYIFPSENGLRCNTSMLSYGNWQLTGQFHFGISRYSTQQLMAASHQHLLRSEAGTWLNIDGFHMGVGGDDSWSPSVHADNLLTNEIYQYQVCWQYKDSI >NC_008800|2779705:2791835|2784460_2786200_+|WP_011816624.1|DBSCAN-SWA MKRGSTHKPLDIKITPEHHKDTKVFFVNNMRLVTLFIAILAGILLLFAAAIGTSGYFLKQSNQSLEEATQELDIRLGLSNSSNHLRTARLILIQAASSARIGDATGYQQGLKNAENRISQSQQMFNLYYNRPIKSETDTALDGPLKKAYEQYRDDGMKLMLEATKEGHFEEVISLEAEKLNQLDDAYNEPLLKAVKYRTERANEINQSAQQEARLGYMLMGGAFILAILLTLIAFLVISKVIIKPINRLVARIQRIAQGDLTQHPAPFGRNEIGVLGNNIQQMQDSLSSTVEAVRSSAESIYQGSSEIALGNTDLSARTEQQAASLEQTAASMEQLTATVKQNAENAHHASQLAANASGKAAQGGDIVNDVVSTMDKISLSSMKIAEITNVINSIAFQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFAVVASEVRNLAQRSADAAKEIESLIEVSVDLIGDGSILVSDAGKAMNEIVTAVTHVTDIMGEIASASDEQSRGISQVAQAVSEMDNVTQQNASLVQEASAAAASLEQQAEILTQAVAVFHLNGRNPAPALKTPAPTSIGQNKTGGNKRPTDDSLNWETF >NC_008800|2779705:2791835|2786777_2786990_-|WP_002210893.1|DBSCAN-SWA MSNMMKGQVKWFNESKGFGFITPADGSKDVFVHFSAIQDQGFKTLAEGQNVQFSIENGAKGPSAANVTAI |
8 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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