Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_007171 | Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 plasmid pSHaeC, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_007170 | Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 plasmid pSHaeB, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_007169 | Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 plasmid pSHaeA, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_007168 | Staphylococcus haemolyticus JCSC1435, complete genome | 3 crisprs | csa3,WYL,DEDDh,cas3,DinG | 2 | 2 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_007168_1 | 2130983-2131110 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_007168_1
|
2 spacers
spacers of NC_007168_1
>1.1|2131001|29|NC_007168|PILER-CR TACTATAAAAAATTATAAGTTCTTCAAAA >1.2|2131048|45|NC_007168|PILER-CR ACAAGTTAATAATAATGTCTTTAGTTAAAAAAGTCAATAAAAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_007168_1
The CRISPR arrays of NC_007168_1 >merge|NC_007168|1|2130983-2131110|PILER-CR TTGAACTTTTTAGAACTGTACTATAAAAAATTATAAGTTCTTCAAAACAGAACTTTTTAGAACTTACAAGTTAATAATAATGTCTTTAGTTAAAAAAGTCAATAAAAACATTGTACTTTTTAGAACTT >NC_007168|1|1|2130983-2131110|PILER-CR TTGAACTTTTTAGAACTG TACTATAAAAAATTATAAGTTCTTCAAAA CAGAACTTTTTAGAACTT ACAAGTTAATAATAATGTCTTTAGTTAAAAAAGTCAATAAAAACA TTGTACTTTTTAGAACTT
>NC_007168.1|WP_011276364.1|2130749_2130968_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MANLNYPMLYIARKEKGDTQRKVAQKLGISPQRYQLKESGKAHFTLPEAKILSEMYGMSIDDLFSKNIKVGS >NC_007168.1|WP_011276363.1|2130536_2130737_-|hypothetical-protein MKQQVVITKSIVGWFNVKDVKGNLLLNIAPDVFKKHFPEVSPNISIACMELDINRIVELKDKKVSV >NC_007168.1|WP_011276362.1|2130329_2130533_-|hypothetical-protein MEQEQKDVIQDIYTTLGTTVGDKATEYEHHFKEGHNEWTETVNREEHLQAMIEWAIQQIENNFDGVK >NC_007168.1|WP_011276361.1|2130073_2130328_-|hypothetical-protein MDISENLKGMKQVTFKYGETKYSLGRALAHNEMLNALATYMDTYLLNEREIEALEQFQRIIRDDLEIEETNVQTLMNELDELLR >NC_007168.1|WP_011276360.1|2129857_2130061_-|hypothetical-protein MAAKLDVNKQNIMHAINWIIKNEEEIIFESQSQLSFFSCEDLEKIDYCKRTLESLIEAKEIYNKKIS >NC_007168.1|WP_011276359.1|2129537_2129843_-|DUF1474-family-protein MEWELRNLFDDLEVVQEKINDVVTSFVWFDDEYFTHEPNHMLTKKEIYTHGWKYHEHRIKNTQVIDLMLMYMKDFDDIMKKIREIEKCASDVSLPTESDNA >NC_007168.1|WP_011276358.1|2128579_2129449_-|primase-alpha-helix-C-terminal-domain-containing-protein MNKIKLEHDTQVSVVWYNNLDSRSFKNFSQPKWSELINRLSIPQNNTNKYARGVAVYGDIKDSTDEDGKEYKKYRNNDNVIYRDVLVLDYDDIPKLRPLHDAITDALKGIAWFWHTTFNHQTESPRIRLYVPLNEHLNADDYRKYIKVLVNKIGHPVDEGSFQPSRAMALPVYQQDKYPFLYQHSDAPILGTKMLEEWFEKYKSQHKGSTKFKYPKRRDNDFWKSIAFGVSTGNRNQTLTSLIGVLLNRRVPDPLVYAYCYMWNENCNPPMSSREFNATFESIYKREHR >NC_007168.1|WP_011276357.1|2127200_2128568_-|DNA-primase-family-protein MATFPDYLENKTIFDEKDFFDGNRFKFYEFSLFLYEEYHGCYIDNRPHVFTGKKYEPLNIDVVRKMTIKYIPSLREQQNKEVFQKLKTLCLGNYQEQCSARYIGLKNGIYDTLEEKLKSFSPQYYITNIIDVDFDKDAQSDLIEKFIKDISNEDEEVEQLIYEMIGYGLYRDNFLQVAFFYYSPGGNGKTTLLKLLHHFYNPENTTALSFNDLNDKFKPANLQGKLVNIADDIDPNRIRDTGNFKIIVTGNYITLEFKGQDAFEFKPYVKLIFASNELPMSNDKSEGFYRRMVIIPMLRKFGKDGQKKDPMLLNKLITPHNMSALLNLALKGLKRTLENNEIIEPQIARKTKEEYQHDNNPVLQFIEDAEDKDYRQLPVVEGRNTDKAYEIYQIWCANNGYHNMNKMNFSKELSKLGYKSVAYWSKAQEKTKRFYVKDTTNVIYDSNGIILKTLR >NC_007168.1|WP_011276356.1|2126606_2126957_-|hypothetical-protein MKNIQSKLIDYIKDNAGTSFVEIEKVFDENGFDYKGQGAYTSLENSNIVFWYGWNKQAFDVVSELVNDGVIEMKQCESIIYMVDGKGLNFPILKSDNVDTYHWLPVTFAINKNEKE >NC_007168.1|WP_011276355.1|2125956_2126601_-|hypothetical-protein MNIEIIANEFETRAATLLRYFTGLCESSYKLPFAFKIYNDPFNVVYLVSKGKMYAHVLIKDCEVRKTFEIASEKHTEKLIESIEGHYTGYDLHDGTHDTISDMMASFMFDNEYFMYGLETFAESNNSDMFDYMSRDFNIDELEGVQSSNADVIGNMEALYQLATGINEPAPELVEGLKIITEFIQNEKANEVDSKALIKRLNELKQSYYDGVKA >NC_007168.1|WP_011276365.1|2131155_2132073_+|transcriptional-regulator MYDKASIGKRIKEIRLKIGKTQTQFGDLFSASKGNVATWEKGVSLPNAKRLKEIARLGDMTTDQLLYGYNKDVYITIYNNLLENNPKETSVGKALRYPEKAVINELLKSAIEYTSEVPIFKDKIKSEEDILKNEFYYFIEKTFLDYYVKNHKSNNNILILAEDSITNIKSNISEYQFYDFNLQLPKIFNEATLLFDEYENSVSLELLKEIEKLSTNFLEEINKLKAKYPDNTPQRIINAQVFQNEPLKPLANYSFDIPDIKNNKDKQNYIFENLNTTINELIKDNPQLIKWINKNYIHKCDLNES >NC_007168.1|WP_011276366.1|2132062_2133151_+|site-specific-integrase MNHNLNLSHNIHKDGKRGTYYFRITYYDRTNKRKEIKRSGFKQRKEAVKKCNEIMNELEGIGHINKLPFNELANEYLDWYSARRKSSSVKSLKTHLNNHLIPYFKSIDVFEMTTQDIMKFQNRKLKENHSGEYLKKMHIFIVSLLNHAMKYHGLQNNVASLVGNFEVESNKRFNYWTLDQFNQFYEVLPTLEQKVFFKLLFYSGARKGEVRALTWEDINFKEEYIHINKTDYHGEVTSPKTKAGIRDIYLPTHMMNDLKNYHSWYKEHNMYKDSYVLFGTFFKAFSESKIDRWFTNAYKLLPTDFPKIVIHEIRHSHASLLINHGASLMVIAQRLGHSSIEEVSTRYGHLYPSTQKEIVKYL >NC_007168.1|WP_148233672.1|2133170_2133881_+|hypothetical-protein MFKTILSVISIIISIFCLIVLIRFCFDTTFRHWFIENDYLEMLKVLTPILVAIFVYKYTTDNHKRTLLNELDSKSEWRKTLFEIAGSSENKMKNLYQFRAALRFTYKNEDKYFKHKYFDCMNIIIIKYCENLISQKRTEDNEKNENKQSNLENYEMDSIRLFCIYMLADHWEKNQNKNFKFADPEKEIELCIDTLQKFLTINDKNYCYKSHKNNLDRDNFICLYKQSLNFINSMTS >NC_007168.1|WP_011276368.1|2134542_2135013_-|SsrA-binding-protein-SmpB MAKKKTKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIALKGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKRGEMFINNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKKEIIKLGERTREIGYSLIPLKLYLKHGQCKVLLGVARGKKIHDKRQALKDKAMKRDVDRAIKDRY >NC_007168.1|WP_011276369.1|2135037_2137416_-|ribonuclease-R MNLKQSIEEIIKQPDYEPMSVSDFQDALGLNSADSFRDLIKVLVELEQAGLVERTKTDRYQRKQSHKSSNSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPELEDMDDIFIPPTKINRALDGDIVIVEIQKSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEAKHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGTDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDNVLKEAEAVPEEIKPDEIKGRTDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLKNGHTELTVSIADVSYYVKEDSELDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPEVDRLTLSCRMEINERGEVVNHDIFDSVIHSNYRMTYDAVNQIITEKAPDVRKQYQEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNNEGLPTDVVLRERGEGERLIESFMLAANETVAEHFNKLEVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPSTLQSIQEEVEGRSEQMVISTMMLRSMQQAHYDDTNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIDNSMNNKELHKWEDKLPELAEHTSQRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHISNMTDDYYQFDERQMALIGERQAKVFRIGDQVTVKVTHVDVDERMIDFQIVGMPLPKNDRSQRPSRGKTIQAKTRGKSLDKSKDDDHKGKKKKRKQRKGKNQRSRDKQGKTNHKPFYKDKSVKKKSRRKKK >NC_007168.1|WP_011276370.1|2137458_2138199_-|carboxylesterase MQIKLPQPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILKSSPHVWFKDVIDGYDYLVDQGYEEIAVAGLSLGGVFALKLSLNRPVKGIITMCAPAEGKTQGAIYEGFLEYARNFKKYEGKDQATIDKEMEDFHPTETLKELSETLNNVRNEIDEVLDPILVVQAENDEMINPQSANYIYENVDSDEKDIKWYANSGHVITIDKEKEQVFEDVYSFLETLDWSE >NC_007168.1|WP_011276371.1|2138423_2138657_-|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTLFIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSNGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLHRLTIILAVIFFLIMIGISYFGL >NC_007168.1|WP_011276372.1|2138724_2139195_-|hypothetical-protein MENQLNQPSQRERNAGKLIGYSSLILCILLIIHNFIALDTLTAKTLLSQAGQKASDSAVANILNSFRYTGIMYILAYLAGVIALWNRHKYLWWFMFAVYVSNVLFTLVNVTMVINAIITAKSMLFIIPIIIVIVGSTVLALYMLVISIIRKSTFNR >NC_007168.1|WP_011276373.1|2139460_2140765_-|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYSGKGVTKAVENVNEIIAPEIVEGEFSVLDQVSIDKMMIQLDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPTGAESFKEALRWGAEIFHNLKSILSERGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIKAIEKAGYKPGEDVFLGFDCASSEFYENGVYDYTKFEGEHGAKRSAAEQVDYLEELIGKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTDRIGDKVQLVGDDLFVTNTEILSRGIEQGIGNSILIKVNQIGTLTETFEAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTISDIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKFDGIKSFYNLDK >NC_007168.1|WP_011276374.1|2140919_2142437_-|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKQPTALIILDGFANRESEHGNAVKQAHKPNFDRYYSKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIADGDFFENDVLNNAVQHVNEHDSALHVFGLLSDGGVHSHYQHLFALLELAKQKGLDKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFKSLGVGEFASISGRYYAMDRDKRWDREQKAYNAIRNFEGPAYASAKEGVEANYANDLTDEFVEPFIVEGQNNGINDGDAVIFFNFRPDRAAQLSEVFTNKAFDGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNVDTEVVFEKVDLTNTIGEVAQNNNLKQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFEGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELDKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMNGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVGQPSDMTGESLIKH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_007168_2 | 2402179-2402266 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_007168_2
|
1 spacers
spacers of NC_007168_2
>2.1|2402208|30|NC_007168|CRISPRCasFinder CTGGGGCCCCGAACCCCAACTTGCTTATCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_007168_2
The CRISPR arrays of NC_007168_2 >merge|NC_007168|2|2402179-2402266|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTAGGAAATTCTCTTTGCTGGGGCCCCGAACCCCAACTTGCTTATCTTGTAGTATTTCTTTAGGAAATTCTCTTTG >NC_007168|2|1|2402179-2402266|CRISPRCasFinder TGTAGAATTTCTTTAGGAAATTCTCTTTG CTGGGGCCCCGAACCCCAACTTGCTTATCT TGTAGTATTTCTTTAGGAAATTCTCTTTG
>NC_007168.1|WP_011276657.1|2400704_2401628_-|mevalonate-kinase MVQRGYGESNGKIILIGEHAVTFGEPAIAIPFTSGKVKVLIESLEKGNYSAIQSDVYDGPLYDAPEHLKSLIGHFVENKKVEEPLLIKIQANLPPSRGLGSSAAVAVAFIRASYDYLGLPLTDKELLENADWAERIAHGKPSGIDTKTIVTNQPVWYQKGEVEILKTLDLDGYMVVIDTGVKGSTKQAVEDVHQLCDNDKNYMQVVKHIGSLVYSASEAIEHHSFDQLATIFNQCQDDLRTLTVSHDKIEMFLRLGEENGSVAGKLTGGGRGGSMLILAKELQTAKNIVAAVEKAGAQHTWIEKLGG >NC_007168.1|WP_011276656.1|2399716_2400700_-|diphosphomevalonate-decarboxylase MKKNGKARAHTNIALIKYWGKADEALIIPMNNSLSVTLDRFYTETRVTFDETLTEDQLILNGEAVNAKESAKIQRYMEMIRKEAGISEHALIESENFVPTAAGLASSASAYAALAGACNEALQLGLSDKDLSRLARRGSGSASRSIYGGFAEWEKGNDDETSFAHRVEADGWENELAMVFVVINNKSKKVSSRSGMSLTRDTSRFYQYWLDNVEPDLKEIKEAIAQKDFKRMGEVIEANGLRMHATNLGAQPPFTYLVPESYDAMRIVHECREAGLPCYFTMDAGPNVKVLIEKKNQQAIVDKFLQEFDQSQIITSDITQSGVEIIK >NC_007168.1|WP_011276655.1|2398627_2399704_-|phosphomevalonate-kinase MIQVKAPGKLYVAGEYAVTEPGYKSVLIAVNRFVTASIEASNAVTSTIHSKTLHYEPVTFNRNEDKIDISDANAASQLKYVVTAIEVFEQYARSCNVKLKHFHLEIDSNLDDASGNKYGLGSSAAVLVSVVKALNEFYDMQLSNLYIYKLAVISNMRLQSLSSCGDIAVSVYSGWLAYSTFDHDWVKQQMEETSVNEVLEKNWPGLHIEPLQAPENMEVLIGWTGSPASSPHLVSEVKRLKSDPSFYGRFLDQSHTCVENLIYAFKTNNIKGVQKMIRQNRMIIQQMDNEATVDIETENLKMLCDIGERYGAAAKTSGAGGGDCGIAIIDNRIDKNRIYNEWASHGIKPLKFKIYHGQ >NC_007168.1|WP_011276654.1|2398078_2398420_-|DUF1450-domain-containing-protein MKNKFLICDECQAVNIKTLKRKLEKLDPEAEIEIGCQSYCGPGRRKTFAFVNNRPLAALTEDELLEKVTAQLKKPRDPEEEERLRKRNEERKRRKEEQDRKLKEKLAKRKAIK >NC_007168.1|WP_011276653.1|2397744_2397948_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEREDGSDVFVHFSGIAGEGYKTLEEGQKVDFDITEGQRGEQATNVVVLS >NC_007168.1|WP_011276651.1|2394907_2396293_+|recombinase-family-protein MKVAVYCRVSTLEQKEHGHSIEEQERKLKSFCDINDWTVYDTYIDAGYSGAKRDRPELQRLMNDINKFDLVLVYKLDRLTRNVRDLLDLLEIFEKNDVSFRSATEVYDTTTAMGRLFVTLVGAMAEWERETIRERTQMGKLAALRKGIMLTTPPFYYDRVDNKFVPNKYKDVILWAYDEAMKGQSAKAIARKLNNSDIPPPNNTQWQGRTITHALRNPFTRGHFDWGGVHIENNHEPIITDEMYEKVKDRLNERVNTKKVRHTSIFRGKLVCPVCNARLTLNSHKKKSNSGYIFVKQYYCNNCKVTPNLKPVYIKEKEVIKVFYNYLKRFDLEKYEVTQKQNEPEITIDINKVMEQRKRYHKLYASGLMQEDELFDLIKETDQTIAEYEKQNENREVKQYDIEDIKQYKDLLLEMWDISSDEDKEDFIKMAIKNIYFEYIIGTGNTSRKRNSLKITSIEFY >NC_007168.1|WP_011276650.1|2394606_2394744_+|hypothetical-protein MESDFEQEPKHWDELIKVPVYSMKQLEYMVKNDIPLTENKDVYKD >NC_007168.1|WP_011276649.1|2393914_2394589_+|LexA-family-transcriptional-regulator MTFGSRIKKLRKQKGMTLQQLSDDLHEQFPAKDKRNSFTKGKLSNWENDKSEPIAKTVSQLATYFGVSMDYLIGLEDDIVPIEKIDKYYQVPYYGQVSAGNFETVEVDTKELEVPDIAFNGRNPKECIALQVNGDSMNKVLSNGSYIIIHDYRRNQDYRLNNNDILVLRLGGEYTVKRVRRTETKLHLDPVSYSDEFKTNTYDIDSTDEIEVIGKVIYNYQIFE >NC_007168.1|WP_011276648.1|2393486_2393726_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKGYSKLKGLLKERGINHDVLADLLDVHRVTVSNKLNRSHGADFTMTEVRKLCLYLDVSADIYFLNVSSENTTKEPQTT >NC_007168.1|WP_173354400.1|2393308_2393473_-|hypothetical-protein MQAEKLEGILEAIDGMPKYEWDRIVQEVNKAYSYKTVKVELDSRSCEVIKKSLS >NC_007168.1|WP_011276658.1|2402437_2403280_-|lipoate--protein-ligase-family-protein MDLASKYFNDIDWRYVDHSSGLAPMQSFAFDDTFSESVGKDLSCNVVRTWIHQHTVILGIHDSRLPFLKDGIKYLTDEIGYNAIVRNSGGLGVVLDQGVLNISLIFKGQTETTIDEAFTVMYLLICKMFENEDVEIDTREIEHSYCPGKFDLSIDGKKFAGISQRRVRGGIAVQIYLCVEGSGSERAEMMRVFYEHALKGEVTKFKYPDIHPECMASLETLFEREIKVQDVMFQLLHAIKDLGGNLNMDPITEDEWTRYEGYFDKMIDRNEKMNRSIEAD >NC_007168.1|WP_011276659.1|2403279_2404269_-|phosphate-acetyltransferase MSSLLDVLQEKLSGKNVKIVLPEGEDERVLTAATQLQATDYVTPVVLGDYDKINLLAKDKGLDVSDIEIINPSTSELKPELVKSFVERRKGKATEEQADELLNNVNYFGTMLVYAGHADGLVSGAAHSTGDTVRPALQIIKTKPGVSKTSGIFFMIKDDQQYVFGDCAINPTLESSDLAEIAVESAKSAKSFGMDPRVAMLSFSTKGSAKSDDVDKVANAVKLAQEKVESEGLTDVVIDGEFQFDAAIVPSVAEKKAPGAKIQGNANVFVFPSLEAGNIGYKIAQRLGGFDAVGPVLQGLNSPVNDLSRGCSTEDVYKLSIITAAQTLQ >NC_007168.1|WP_011276660.1|2404442_2405192_+|heme-dependent-peroxidase MSEAAETLDGWYSLHLFYAVDWATFRLVPEDEREAMINEFKTFINDKASAREQQAGDYALYNITGQKADILLWYLRPEMKELNEIENELNKLRIADFFIQTYSYVSVIELGNYLAGKSDEDPYQNPHVRARLYPELPRTEYICFYPMDKRRNETYNWYMLPMEERKKLMYNHGMIGRQYAGKIKQFITGSVGFDDFEWGVTLFSDDVLQFKKIVYEMRFDETTARYGEFGGFYIGHILKTDDFEHFFAI >NC_007168.1|WP_011276661.1|2405941_2406709_+|threonine/serine-exporter-ThrE-family-protein MDNTQIHENADEKLIKDVVMMAGRILLESGAEGTRVEDTMTRIARKLGYPESNSFVTNTVIQFTLHNESYPRIFRINSRDTNLIKISQTNEISRLITKGAITLEEAKLKLENIYVAKRDSSLLFKGIAAAIIAISFLYLQDGKLVDVITALLAGGLGYLVVEILDRRLHAQFIPEFLGSLVIGIISVLGHYLLPTGDLATIIIASVMPIVPGVLITNAIQDLFGGHMLMFTTKSLEALVTAFGIGAGVGSVLILV >NC_007168.1|WP_011276662.1|2406721_2407174_+|threonine/serine-exporter-family-protein MFWILNLIFSYTASLFFCVIFDAPRKLYLSCGFVGACGWMVYILFYQGLNTHTIYSSFFGSLALGLISHYMARTKREPAIIFMVPGIIPLVPGGLAFDATKNLVLLDFSKAINTMLEVTLIAGAIALGLLFADQISKIILSGFARTRKRI >NC_007168.1|WP_011276663.1|2407244_2408723_-|APC-family-permease MSKNNQNQDIDRGDLKQNLSEKFVWAIAYGSCIGWGAFILPGDWIKQSGPIAASIGIVIGALLMILIAVSYGALVEKFPVSGGAFAFSYLSFGRYVSFFSSWFLTFGYVCVVALNATAFSLLVKFLLPDLLNNGKLYTIAGWDVYITEIIIATVLLLVFMLVAIRGASVSGSLQYYFCVAMVIVVLLMFFGSFFGNNFAFENLQPLANPKSGWFTSIIMIVAVAPWAYVGFDNIPQTAEEFNFSPNKTFKLIVYSLLAASLTYVVMILYAGWLSTNNASLNGNLWVTGAETQSAFGYIGLGVLAIAIIMGIFTGLNGFLMSASRLLFSMGRSGIMPTAFSKLHSKYKTPYVAIIFLVAVTLIAPWLGRTALTWIVDMSSTGVSIAYFITCLSAAKLFSFNKESNTYGPVYKTFAIFGSIVSFIFLLLLLVPGSPASLSMPSYIALGGWLVIGLIFFVIRYPKLKRMDNDELSRLILNRSEKEVEDMVDDTYK >NC_007168.1|WP_160380486.1|2408849_2409218_-|DUF423-domain-containing-protein MKLFIILGALCTMMSVGTGAFGAHGLEGKLSDKYMSVWEKAVNYQMYHGLGLIIIGVISGTTSINVNWAGWLLFLGVVFFSGSLYILALTQIRILGAITPIGGLLFIAGWLMLIISTFKFVG >NC_007168.1|WP_011276665.1|2409245_2409629_-|DUF5327-family-protein MNRAQVIQLIEHELVQADEATNEQQFEKHMYAIHTLTSIYANNESKTASSKSQGQDFTNTVATSFSKVNQSSNISSLQGKSKVTAAEIEAMGGKVPDSMKSSQNNSLPSNTMVTDDEIGNGESIFDF >NC_007168.1|WP_011276666.1|2409629_2410289_-|uracil-DNA-glycosylase MEWSEIFHDITERHDFKEMHDFLEKEYTTQTIYPDRDNIYQAFDLTPFEDVKVVILGQDPYHGPNQAHGLAFSVQPSAKFPPSLRNMYQELEDDIGCHRTSPHLQDWAREGVLLLNTVLTVRQGQAHSHKDIGWETFTDEVIQAISKYRDDVVFILWGKPAQQKIKLIDTSKHYIIKSPHPSPLSAYRGFFGSKPYSKTNDYLVSKGKSPINWCENGED >NC_007168.1|WP_011276667.1|2410430_2411261_+|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MALKKVLTIAGSDTSAGAGMQADLKTFQELNTYGMVALTAVVTMDKETWSHDVTPLPMDVFEKQLETVISIGPDAVKTGMLGTQEIIKRAGEAFEESGAQYFVVDPVMVCKGEDEVLNPGNTDAMIEYLLPKATVVTPNLFEAGQLSGLGKLTSIEDMKKAADIIFNQGAQHVIIKGGKALDQDKSYDLYYDGNTFYQLTTDMFQQSYNHGAGCTFAAATTAYLANGKSPKEAVISAKAFVASAIKNGWKMNDFVGPVDHGAYNRVEHIDVDVTEV |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_007168_3 | 2473072-2473159 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_007168_3
|
1 spacers
spacers of NC_007168_3
>3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder CTTAAAGTTGCTTAATCTCAATATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_007168_3
The CRISPR arrays of NC_007168_3 >merge|NC_007168|3|2473072-2473159|CRISPRCasFinder GGACTCATCAGTCCGATTTGACATAGAGCCACTTAAAGTTGCTTAATCTCAATATTTGGACTCATCAGTCCGATTTGACGTAGAGCCA >NC_007168|3|2|2473072-2473159|CRISPRCasFinder GGACTCATCAGTCCGATTTGACATAGAGCCA CTTAAAGTTGCTTAATCTCAATATTT GGACTCATCAGTCCGATTTGACGTAGAGCCA
>NC_007168.1|WP_011276721.1|2470724_2471225_-|50S-ribosomal-protein-L10 MSAIIEAKKQQVDVIAEQLKNSVSTVIVDYRGLTVAEVTELRSQLREAGVEYKVYKNTMVRRAAEQAGIEGLDEFLTGPTAVATSTEDVVAPAKVIAGFAKEHEALEIKTGVMEGSVISAEEVKTVGSLPSHDGLVSMLLSVLQAPVRNFAYAVKAVGEQKEESAE >NC_007168.1|WP_011276720.1|2470316_2470685_-|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MANQEQIIEAIKEMSVLELNDLVKAIEEEFGVTAAAPVAAAGAAGGGDAAAEKTEFDVELTSAGSSKIKVVKAVKEATGLGLKDAKELVDNAPKVIKEGVAKEEAEKLKEQLEEVGATVELK >NC_007168.1|WP_011276719.1|2469535_2470144_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MGHYYDENPDVQSDERVIQYHYHSHQLNLTTDAGVFSKAQVDFGSDTLVQTFLNEHPPGPSKTIADVGCGYGPIGLMIAKVSPHHQITMVDVNKRALNLAEKNKKANQIDNVIIKESDGLSQLKDSHFDYVLTNPPIRAGKEVVHRIFEEAYQQLNSQGELYVVIQKKQGMPSAKKKMEEIFNNVEVVNKNKGYYILKSRKG >NC_007168.1|WP_011276718.1|2465777_2469329_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta MAGQVVQYGRHRKRRNYARISEVLELPNLIEIQTKSYDWFLKEGLLEMFRDISPIEDFTGNLSLEFVDYRLGEPKYDLEESKNRDATYAAPLRVKVRLIIKETGEVKEQEVFMGDFPLMTDTGTFVINGAERVIVSQLVRSPSVYFNEKIDKNGRENYDATIIPNRGAWLEYETDAKDVVYVRIDRTRKLPLTVLLRALGFSNDQEIIDLLGDSEYLRNTLEKDGTENTEQALLEIYERLRPGEPPTVENAKSLLYSRFFDPKRYDLASVGRYKANKKLHLKHRLFNQRLAEPIVNSETGEIVAEEGTVLDRRKLDEIMEVLETNANSEVFELEGTVIDEPVEIQSIKVYVPNDEEGRTTTVIGNALPDSEVKCITPADIIASMSYFFNLLNGIGYTDDIDHLGNRRLRSVGELLQNQFRIGLSRMERVVRERMSIQDTDSITPQQLINIRPVIASIKEFFGSSQLSQFMDQANPLAELTHKRRLSALGPGGLTRERAQMEVRDVHYSHYGRMCPIETPEGPNIGLINSLSSYARVNEFGFIETPYRKVDLDTNSITDQIDYLTADEEDSYVVAQANSRLDENGRFLDDEVVCRFRGNNTVMAKEKMDYMDVSPKQVVSAATACIPFLENDDSNRALMGANMQRQAVPLMNTEAPFVGTGMEHVAARDSGAAITAKYRGRVEHVESKEILVRRLVEENGTEHEGELDRYPLAKFKRSNTGTCYNQRPIVSVGDVVEYNEILADGPSMELGEMALGRNVVVGFMTWDGYNYEDAVIMSERLVKDDVYTSIHIEEYESEARDTKLGPEEITRDIPNVSENALKNLDDRGIVYVGAEVKDGDILVGKVTPKGVTELTAEERLLHAIFGEKAREVRDTSLRVPHGAGGIVLDVKVFNREEGDDTLSPGVNQLVRVYIVQKRKIHVGDKMCGRHGNKGVISKIVPEEDMPYLPDGRPIDIMLNPLGVPSRMNIGQVLELHLGMAAKNLGIHVASPVFDGANDDDVWSTIEEAGMARDGKTVLYDGRTGEPFDNRISVGVMYMLKLAHMVDDKLHARSTGPYSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEILTYKSDDTVGRVKTYEAIVKGENISRPSVPESFRVLMKELQSLGLDVKVMDEQDNEIEMADVDDEDATERKVDLQQKDVPETQKETTD >NC_007168.1|WP_161772885.1|2461986_2465580_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta' MKIGLASPEKIRSWSYGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCERIFGPTKDWECSCGKYKRVRYKGMVCDRCGVEVTKSKVRRERMGHIELAAPVSHIWYFKGIPSRMGLLLDMSPRALEEVIYFASYVVVDPGPTGLEKKSLLSEAEFREYYDKYPGQFVAKMGAEGIKDLLEEINLDEELKSLRDELESATGQRLTRAIKRLEVVESFRNSGNNPAWMILDVLPIIPPEIRPMVQLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPGIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGRRGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIAVGPSLKMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVQREIATNIKNAKSKIERMDDEVWDVLEDVIREHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVTTAYNADFDGDQMAVHVPLSKEAQAEARMLMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNYYLTLERKDAMNTGTIFNDTNEVLKAYANGYVHLHTRIGVHAKSFNNPTFTEAQNNKILATSVGKVIFNEIIPDSFAFINEPSQTNLEGKTPDKYFIDSTQLGEGGLKAYFEEQELIEPFNKKFLGNIIAEVFNRFSITDTSMMLDRMKDLGFKFSSKAGITVGVADIVVLPDKQDILDEHEKLVERVSKQFNRGLITEDERYNAVVEIWTDAKDQIQGELMQSLEKTNPIFMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGLMAAPSGKIIELPITSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYLTRRLVDVAQDVIVREEDCGTDRGLLVSDIKEGTEMIEPFIERIEGRYSKETIRHPETDEIIIRPDELITAEIAKKITDAGIEQMYIRSAFTCNTRHGVCEKCYGKNLATGEKVEVGEAVGTIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGSDITQGLPRIQEIFEARNPKGQAVITEIEGVVEDIKLAKDRQQEIVVKGANETRSYLASGTSRLKVEVGQSVERGEVLTEGSIEPKNFLAVAGLNATESYLLKEVQKVYRMQGVEIDDKHVEVMVRQMLRKVRIIEAGDTKLLPGSLVDIHSFTDANREAFKERKRPATAKPVLLGITKASLETESFLSAASFQETTRVLTDAAIKGKRDDLLGLKENVIIGKLIPAGTGMRRYSDVKYDKAETPVTETEEAEIIE >NC_007168.1|WP_011276716.1|2461528_2461789_-|ribosomal-L7Ae/L30e/S12e/Gadd45-family-protein MSNEKVARFNKQHYVVGLKETLKALNRDQVASLIIAQDVEVHLLARVFSLINHKNIPITYFQSKHALGSYVGINVNATIVALLNEN >NC_007168.1|WP_011276715.1|2461025_2461439_-|30S-ribosomal-protein-S12 MPTINQLVRKPRQSKSKKSDSPVLNRGFNSKKKQFTNLNSPQKRGVCTRVGTMTPRKPNSALRKYARVRLSNNIEINAYIPGIGHNLQEHSVVLVRGGRVKDLPGVRYHIVRGALDTSGVDGRRQGRSLYGTKKPKN >NC_007168.1|WP_001137495.1|2460484_2460955_-|30S-ribosomal-protein-S7 MPRKGSVPKRDVLPDPIHNSKLVTKLINKIMLDGKRGTAQRILYSAFDLVEQRSGRDALEVFEEAINNIMPVLEVKARRVGGSNYQVPVEVRPERRTTLGLRWLVNYARLRGEKTMEDRLANEILDAANNTGGAVKKREDTHKMAEANKAFAHYRW >NC_007168.1|WP_011276714.1|2458281_2460363_-|elongation-factor-G MARDFSLKNTRNIGIMAHIDAGKTTTTERILYYTGRIHKIGETHEGASQMDWMEQEQDRGITITSAATTAQWDGHRVNIIDTPGHVDFTVEVERSLRVLDGAVTVLDAQSGVEPQTETVWRQATTYGVPRIVFVNKMDKLGANFDYSVSTLHDRLDANAAPIQLPIGAEDEFEAIIDLVEMKCFKYTNDLGTEIDEIEIPEDHKERAEEARSNLIEAVAETNDELMEKYLGDEEISVAELKNAIRQATTDVEFYPVLCGTAFKNKGVQLMLNAVIDYLPSPLDVKPIVGHRAENPEEEVIAKPDDSAEFAALAFKVMTDPYVGKLTFFRVYSGTLTSGSYIKNSTKDKRERVGRLLQMHANSRQEIDTVYSGDIAAAVGLKDTGTGDTLCGEKNDIILESMEFPEPVIHLSVEPKSKADQDKMTQALVKLQEEDPTFHAHTDEETGQVIIGGMGELHLDILVDRMKKEFNVECNVGAPMVSYRETFKQSAQVQGKFSRQSGGRGQYGDVHIEFTPNETGAGFEFENSIVGGVVPREYIPSVEAGLKDAMENGVLAGYPLIDVKAKLFDGSYHDVDSSEMAFKIAASLALKEAAKKCDPVILEPMMKVTIEMPEEYMGDIMGDVTARRGRVDGMEPRGNAQVVNAYVPLSEMFGYATSLRSNTQGRGTYTMYFDHYAEVPKSIADDIIKKNKGE >NC_007168.1|WP_011276713.1|2456892_2458077_-|elongation-factor-Tu MAKEKFDRSKEHANIGTIGHVDHGKTTLTAAIATVLAKNGDTVAQSYDMIDNAPEEKERGITINTAHIEYQTDKRHYAHVDCPGHADYVKNMITGAAQMDGGILVVSAADGPMPQTREHILLSRNVGVPALVVFLNKVDMVDDEELLELVEMEVRDLLSEYDFPGDDVPVIAGSALKALEGDAQYEEKILELMQAVDDYIPTPERDSDKPFMMPVEDVFSITGRGTVATGRVERGQIKVGEEVEIIGIHDTSKTTVTGVEMFRKLLDYAEAGDNIGALLRGVAREDVQRGQVLAAPGSITPHTKFKADVYVLSKDEGGRHTPFFTNYRPQFYFRTTDVTGVVNLPEGTEMVMPGDNVEMTVELIAPIAIEDGTRFSIREGGRTVGSGVVTEIIE >NC_007168.1|WP_011276724.1|2473227_2473923_-|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKGKKYQEAANKVDRTKHYSVEEAISLAKETSIANFDASVEVAFRLGIDTRKNDQQIRGAVVLPNGTGKSQRVLVFAKGDKITEAEEAGADYVGESEYVQKIQQGWFDFDVVVATPDMMGEVGKLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVKKAVEEIKAGKVEYRAEKAGIVHASIGKVSFSDEKLVENFKTLQDVLAKAKPSSAKGTYFKSVAVTTTMGPGVKIDTSSFKL >NC_007168.1|WP_001832298.1|2474147_2474570_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKVVKLQIPAGKANPAPPVGPALGQAGVNIMGFCKEFNARTQEQAGLIIPVEISVYEDRSFTFITKTPPAPVLLKKAAGVEKGSGEPNKTKVATVTKDQVREIAQTKMQDLNAADEEAAMRIIEGTARSMGITVQ >NC_007168.1|WP_011276725.1|2474757_2475306_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MSEEVGAKCWYAVHTYSGYENKVKKNLEKRVESMNMTEQIFRVVIPEEEETQVKDGKAKKQLKKTFPGYVLVELVMTDESWYVVRNTPGVTGFVGSAGAGSKPNPLLPEEMRFILKQMGLKEKTIDVELDVGEQVRIKSGPFANQVGEVQEIEPDKFKLTVLVDMFGRETPVEVEFDQIEKL >NC_007168.1|WP_011276726.1|2475323_2475524_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MAKDKGTNKEKDSFFQGVKSEMEKTSWPTKEELFKYTVIVVSTVIFFMVFFWVLDIGIGNLIELFR >NC_007168.1|WP_011276727.1|2475823_2476414_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MAHQFIQLEKTFKAFQNSRSSHEQDRLFIDIVNHIQPKLFIKFKSYGIQNEDIEDLVQETLIRIYLALHTFDFSTDVPFEHYLNCIVRSMRNDFWRRKYIETDKHDSIINDYVIDYKLNQSSKYIEDICMIKEKRELLASSLTVLSRFERNVAELLMSDYTPSEIAKQLGIKDKVVYNSIQRCKMKMKYYLLKRLY >NC_007168.1|WP_011276728.1|2476484_2477012_-|NYN-domain-containing-protein MKDKYLIIDGYNMIGQSPELGKIAKDNLQEAREQLLDAIANYNAVVADEIVCVFDAYEQSGIEREYIYHGVKTVFTKEKETADSYIERYVYNLYNKHTTHITVVTSDMSEQHAIFGAGAYRVSSREMWRDLRENEITVSKSLDDFTESKPRTRISLSNDVLAEFEKIRRGNHNKD >NC_007168.1|WP_011276729.1|2477008_2477758_-|23S-rRNA-(guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase-RlmB MEDIVIVGRHAVKEAIVSGHTINKIWIQEGIRKQQINDILQNAKEQKLIVQTVPKSKLDNLANAPHQGVAALIAPYEYADFDQFIQSQKDKEGLSTVVILDGLEDPHNLGSILRTADASGVDGVIIPKRRSVALTQTVAKASTGAIQHVPVMRVTNLAKTIDELKEHGYWVAGAEADNATDYRDMAADMPLAIVIGSEGQGMSRLVKDKCDFYIKIPMVGHVNSLNASVAASLMMYEVYRKRHQVGDNA >NC_007168.1|WP_029376688.1|2477766_2478153_-|Mini-ribonuclease-3 MDIKLLNPLTLAYMGDAVLDQHVREYIVLKLQSKPNRLHQVSKSYVSAKSQAQTLETLFEMGWFTDEELDIVKRGRNAKSHTKAKNTDIQTYRKSSGLEAVIGYLYLDHQEERLENLLDMIVQTVNER >NC_007168.1|WP_011276731.1|2478154_2479555_-|cysteine--tRNA-ligase MITLYNTLTRQKETFEPIEPGKVKMYVCGPTVYNYIHIGNARPAINYDVVRRYFEYKGYEVIYVSNFTDVDDKLINRSKELNESVPDIADRYIKAFYEDVGALNVKKATSNPRVMNHMDEIIDFIKELVDEGYAYESDGDVYFRTRKFEGYGKLSHQSLDDLKVGARIEAGEQKEDALDFTLWKKAKPGEISWESPFGEGRPGWHIECSVMAFHELGKTIDIHAGGSDLQFPHHENEIAQSEAHNHAPFANYWMHNGFINIDNEKMSKSLGNFILVHDIIKEVDPDVLRFFMISVHYRSPINYNLELVNAAKSGLERIRNSYQLIEERETIATDIVDQSKYIEQIDAIIEQFETVMDDDFNTANAVTAWYDLSKLANKYVLENNTSTQVISRFKEVYQIFSDVLGVPLKGNKSDMLLDEDIEKLIEERNEARKNKDFARADEIRDMLKEQNIILEDTPQGVRFKRG >NC_007168.1|WP_172458793.1|2479538_2480168_-|serine-O-acetyltransferase MRDDVKMVFEQDPAARTTFEVITTYAGLHAVWSHLIAHKLYNKKRYVLARIISQVSRFFTGIEIHPGAKIGKRLFIDHGMGVVIGETCTIGDNVTIYQGVTLGGTGKEKGKRHPDIGDNVLIAAGSKVLGNIQIDSNVNIGANSVVLQSVPSYTTVVGIPGHIVKQEGKRIGKTFDHRNLPDPLYEQIKQLEKQLEKAKNGEIKDDYII |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_007168_3 | 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder | 2473103-2473128 | 26 | NC_007168.1 | 780553-780578 | 0 | 1.0 |
NC_007168_3 | 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder | 2473103-2473128 | 26 | NC_007168.1 | 1548206-1548231 | 0 | 1.0 |
NC_007168_3 | 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder | 2473103-2473128 | 26 | NC_007168.1 | 2627962-2627987 | 0 | 1.0 |
NC_007168_2 | 2.1|2402208|30|NC_007168|CRISPRCasFinder | 2402208-2402237 | 30 | NC_007168.1 | 2238094-2238123 | 2 | 0.933 |
1. spacer 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder matches to position: 780553-780578, mismatch: 0, identity: 1.0
cttaaagttgcttaatctcaatattt CRISPR spacer cttaaagttgcttaatctcaatattt Protospacer **************************
2. spacer 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder matches to position: 1548206-1548231, mismatch: 0, identity: 1.0
cttaaagttgcttaatctcaatattt CRISPR spacer cttaaagttgcttaatctcaatattt Protospacer **************************
3. spacer 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder matches to position: 2627962-2627987, mismatch: 0, identity: 1.0
cttaaagttgcttaatctcaatattt CRISPR spacer cttaaagttgcttaatctcaatattt Protospacer **************************
4. spacer 2.1|2402208|30|NC_007168|CRISPRCasFinder matches to position: 2238094-2238123, mismatch: 2, identity: 0.933
ctggggccccgaaccccaacttgcttatct CRISPR spacer ctggggccccgcaccccaacttgcttagct Protospacer *********** *************** **
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_007168_3 | 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder | 2473103-2473128 | 26 | NZ_CP031668 | Staphylococcus aureus strain 199 plasmid pPS00120.1A.1, complete sequence | 6787-6812 | 2 | 0.923 |
NC_007168_3 | 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder | 2473103-2473128 | 26 | NZ_CP031671 | Staphylococcus aureus strain 64 plasmid pPS00119.1A.1, complete sequence | 6788-6813 | 2 | 0.923 |
NC_007168_3 | 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder | 2473103-2473128 | 26 | NZ_LR130510 | Staphylococcus aureus strain BPH2760 isolate BPH2760 plasmid 2 | 7283-7308 | 2 | 0.923 |
NC_007168_3 | 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder | 2473103-2473128 | 26 | MN855764 | Siphoviridae sp. isolate 508, partial genome | 30063-30088 | 4 | 0.846 |
NC_007168_1 | 1.1|2131001|29|NC_007168|PILER-CR | 2131001-2131029 | 29 | NC_008014 | Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3, complete sequence | 148528-148556 | 5 | 0.828 |
NC_007168_1 | 1.1|2131001|29|NC_007168|PILER-CR | 2131001-2131029 | 29 | NC_020130 | Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3, complete sequence | 148550-148578 | 5 | 0.828 |
NC_007168_1 | 1.1|2131001|29|NC_007168|PILER-CR | 2131001-2131029 | 29 | NZ_CP016842 | Brochothrix thermosphacta strain TMW 2.1572 plasmid pL21572-1, complete sequence | 14645-14673 | 6 | 0.793 |
1. spacer 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031668 (Staphylococcus aureus strain 199 plasmid pPS00120.1A.1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.923
cttaaagttgcttaatctcaatattt CRISPR spacer cctaaggttgcttaatctcaatattt Protospacer *.***.********************
2. spacer 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031671 (Staphylococcus aureus strain 64 plasmid pPS00119.1A.1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.923
cttaaagttgcttaatctcaatattt CRISPR spacer cctaaggttgcttaatctcaatattt Protospacer *.***.********************
3. spacer 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR130510 (Staphylococcus aureus strain BPH2760 isolate BPH2760 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.923
cttaaagttgcttaatctcaatattt CRISPR spacer cctaaggttgcttaatctcaatattt Protospacer *.***.********************
4. spacer 3.1|2473103|26|NC_007168|CRISPRCasFinder matches to MN855764 (Siphoviridae sp. isolate 508, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
cttaaagttgcttaatctcaatattt CRISPR spacer tttcaagttccttaatctcaatatct Protospacer .** ***** **************.*
5. spacer 1.1|2131001|29|NC_007168|PILER-CR matches to NC_008014 (Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tactat-aaaaaattataagttcttcaaaa CRISPR spacer -attctgaaaaaaatataaattcttcaaaa Protospacer *.* * ****** *****.**********
6. spacer 1.1|2131001|29|NC_007168|PILER-CR matches to NC_020130 (Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tactat-aaaaaattataagttcttcaaaa CRISPR spacer -attctgaaaaaaatataaattcttcaaaa Protospacer *.* * ****** *****.**********
7. spacer 1.1|2131001|29|NC_007168|PILER-CR matches to NZ_CP016842 (Brochothrix thermosphacta strain TMW 2.1572 plasmid pL21572-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tactataaaaaattataagttcttcaaaa CRISPR spacer tttcatcaaaaattataacttcttcaaac Protospacer * ..** *********** *********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
282435 : 355927
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_007168|282435:355927|DBSCAN-SWA 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57 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
947596 : 1022290
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_007168|947596:1022290|DBSCAN-SWA 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68 | Staphylococcus_phage(21.74%) | transposase,tRNA,protease,integrase | attL 942570:942586|attR 1021823:1021839 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1142094 : 1179453
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_007168|1142094:1179453|DBSCAN-SWA 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32 | Staphylococcus_phage(92.86%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1446277 : 1456132
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_007168|1446277:1456132|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_007168|1446277:1456132|1449142_1449880_+|WP_011275719.1|DBSCAN-SWA MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGQTVTELGTKVKSSDTVEVEGIKIEQEDKMYILFYKPTQVITSVSDDRGRTVVTDYFKDLETRIYPVGRLDYDTSGLLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIQKKYVAKLKGYLMREEVKALENGIELEDGFTQPAQVKVKKQDKDKNITLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHQVDKLTRIEFGNLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKVLRHMAENGK >NC_007168|1446277:1456132|1447882_1448614_+|WP_011275717.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFNGPLDLLLHLIQKYEIDIYDIPMKSLTEQYMQYVHAMKQLEINVASEYLVMASELLMIKSKLLLPQHDVDDNLEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTQLLTEKKEEREHYFTKHPTDLSHLEKNVTWDECQTLDLTDLIVAYQRVKSRLALNKPKTVEIIKESFTIQQATEKVTTQLRHHTSFNFFSLFTFSEPIEQVVTHFLAILEMSKSGVINIEQVRSFDDIRIIRGVNFNIG >NC_007168|1446277:1456132|1446277_1447165_+|WP_011275715.1|DBSCAN-SWA METIIEEYLKFIQIEKGLSENTIGAYRRDLKKYQLYMQEQKIAHIDFIDRQTIQECLGSLIDQGASAKSIARFISTIRSFHQFALREKYAAKDPTVLIETPKYEKKLPDVLDVEEVIQLLETPDLTKNNGYRDRTILELLYATGMRVTELIQIEIDDVNLIMGFVKVFGKGNKERIIPLGDTVIEYLDTYINNVRSQLLKKTVTNVLFLNLHGRPLTRQGIWKLIKQYGLRANINKTLTPHTLRHSFATHLLENGADLRAVQEMLGHSDISTTQLYTHVSKTQIRQMYNQFHPRA >NC_007168|1446277:1456132|1453806_1454760_+|WP_011275724.1|DBSCAN-SWA MHSIITYASNHSFDYKTNKSIYNILNGKKSHQTFFDACSQQLLSLYHSLPKLKYPSFERFLDTYDNQNTDISIHPRYTYDSMIQTFSCIQLLIQTITHFKNNHLNFIPITQQITVQSRVKQIYSKILEQNLVDDFEKEIEQIFHFIDEKCSNNCLIHYYLQGYEEPMYTRQQVSLIEGIPVTKLFVLELNNLVQMMFALENDKQFPILTQTIILPTLLNKTTITYHQLLKGLSMDEVAVTQNVKINTIEDHVLELFIKGYFSEYQTFVNGPQTSEFIAFYDQNRGQRLKLYKEEFDQLTYFQIKLLIVGIERGELIA >NC_007168|1446277:1456132|1454752_1456132_+|WP_011275725.1|DBSCAN-SWA MLEEKLKEWFGFSSFNPGQKEIIESIVNKKDTLGILPTGSGKSLCYQMPTYMKGKPTLIISPLISLMDDQVMQLKAQGEKFVTSIHSGMDENEKQQNINSLHKSRFVFLSPEFILQTQNFKLIRNIDFGLIVLDEAHCLSEWGYDFRPHYALIGEITSHYKNASILALTATAPPHLENDLNLILSRKLNVIKTSMNRENISFSHLNFENDAEKIKWLLNFLDQSGPTIIYVSSKKVCLELANMIYHHGYLTGIYHGDLSYQERHTVQNQFMENFIPVIVATSAFGMGVNKKDIRTVIHFHLSTSPSNYLQEIGRAGRDNLQSQAISLYQPDDSYILETLLFSDAITTEDIDAFDIGAFLPPQKQEILTILSQRYSSNVLKTIFDNSLIRKKLGYQRMIGYTSLDQCRRRYLLEFFGDNPTQPQQCCDIDSNLMTIKVTNRKKVKRKLSYTEKLKYLFKV >NC_007168|1446277:1456132|1450737_1452495_+|WP_011275721.1|DBSCAN-SWA MTNRLNSVVIKLWLTILFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTQQTENAIREDASRISHLVEQADNKTLAIEHSQQLIDGSGGVIIMANKSSSIKSSNSNTKDKMLEEIHKNSQFQRVFSQGKSTTQNITISNNGNSHSYILLGYPMKAQENANSKYSAVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFIAVSTVFAFFLSNRITKPLRQLRTQAINISKGDYSKQTSVSTKDEIGELSHTFNNMSSEIQENIEALSTQKNIRDSLINSMIEGVLGLNDKREVILSNKMADDIIKSIDKTVYKEIEKQIEATFVSKDTEFQEYEINNKYYVIIMSYVERIQQDGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIRDSLSIVLDETKRLNRLVNELLNVARMDAEGLTVNKEKQPIKPLLSKMQMKYRQQAEDLELNMSLEPNIDDELWEYDADRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDSISITTTTDDSYQTLHIKDTGSGISPEHLELVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTIKVESKVNKGTTFIIKLPKPKN >NC_007168|1446277:1456132|1450031_1450757_+|WP_011275720.1|DBSCAN-SWA MTNEILIVDDEDRIRRLLKLYLKRESFTIHEASNGKEAYNLAIENDYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSSKPEQSEPHARDVIEFNHLIIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAHMIQTVWGVGYKFEVKSNDEPTK >NC_007168|1446277:1456132|1448606_1449146_+|WP_011275718.1|DBSCAN-SWA MDKHGIIESLLYTAGDEGLDEKQLLEILEINQAKLSELISSYTSSGLIIQKFGSTYILTSKKEASPYIEQLIEQKSNMKLSQAAMETLSIIAYNQPLSRSDIELIRGINSDGAVRTLIARGLIEAKDVENSRSHALQTTDLFLNVFGIEKIEDLPTTEEDEEEMDDFFSNLVNQKGDTK >NC_007168|1446277:1456132|1452834_1453377_+|WP_011275723.1|DBSCAN-SWA MQQNKRLITISMLSAIAFILTFIKFPLPFLPPYLTLDFSDVPTLLATFLLGPVAGILVALIKNILNFLFNMGDPVGPVANFLAGVSFLLSAYYVTKRQGDTPRSLVVGLAIGTIVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLGDVFNNLKIIIISGVIPFNIIKGIVISIIFALLYRRLKRVLS >NC_007168|1446277:1456132|1447267_1447789_-|WP_011275716.1|DBSCAN-SWA MDRALIDFYYYFHKQQHYFLCHDILEEAWKSNINFSKKDGIVSLILFSTAMYHYRRGNTKGAFVTLKKSLSTFEKARDKALLQLNEQDYKILILSQIKSIEDSKSFKPVYIPVNNVFEKQIINTYPDYKFTTLSTQDEYIVNHHKNRDRSDVISARHQAMIKKQNIRSGKDLK >NC_007168|1446277:1456132|1453448_1453697_-|WP_002449743.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE |
11 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1648069 : 1715366
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_007168|1648069:1715366|DBSCAN-SWA 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56 | Staphylococcus_phage(23.53%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1783656 : 1874039
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_007168|1783656:1874039|DBSCAN-SWA 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100 | uncultured_Caudovirales_phage(49.12%) | transposase,tRNA,portal,terminase,capsid,head,integrase,holin,tail,protease | attL 1806792:1806851|attR 1855730:1855840 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1931374 : 2009039
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_007168|1931374:2009039|DBSCAN-SWA 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70 | Streptococcus_phage(27.78%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2122929 : 2137416
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_007168|2122929:2137416|DBSCAN-SWA 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21 | uncultured_Caudovirales_phage(63.16%) | terminase,integrase | attL 2117673:2117691|attR 2133973:2133991 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2189006 : 2203175
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_007168|2189006:2203175|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_007168|2189006:2203175|2196303_2197188_+|WP_011276426.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAVGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNFVAMFIPLFFIFKYKQPMFGKLSSQPLLISRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADTLMKLNPFWTILLSLIFLNEKVRKYQIIAMIVAILGMLFIVKPEFSSTMITSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVVVLIPFSIATYEPMTTIQMVYLLGAGLSAAVGQIGITLAYSFAPAKDISIFTYASIIFTAIFGFILFGETPDFYALIGYVIIIGASYYMFEKARRQTAITKQQSNTKE >NC_007168|2189006:2203175|2201411_2201945_-|WP_011276430.1|DBSCAN-SWA MSRKSIAIDMDEVLADTLGAIIEAVNVKTELGITVESLNGQKLKNVIPEHDGLVRDILRAPGFFRNLTVMPHAQEVVKKLTEQYDVYIATAAMDVPTSFHDKYEWLLEFFPFLDPQQFVFCGRKNVVKTDYLIDDNPRQLQIFEGEPIIFTASHNVSEERFKRVNGWKDVEAFFLGE >NC_007168|2189006:2203175|2189006_2189789_-|WP_011276420.1|DBSCAN-SWA MIEIKNLDKAIQNKPILKNINVDIQKGRLTSLIGPNGAGKSTLLSAVSRLFEYEKGTIKIEGKAVVDYKNDDLAKKLSILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRMKKEDYEQVEYALDLLQLQSIRHRNIKTLSGGQRQRAYIAMTIAQDTDYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRRLCKDLNKTIVIVLHDINFASCYSDDIIALKNGEIVKADTKDNVIQAEILKQLYEMDVHIEEIRGQRICLYYDEDTFDSLL >NC_007168|2189006:2203175|2193048_2195154_-|WP_011276424.1|DBSCAN-SWA MKIMNEKKYNHIELNNEVTKRKDNGFFNLEKDQEALAVYLEEIHDKTIYFDSEIERLHYLVDNNFYFNVFDKYSEEDLVEITEFAKSINFEFASYMSASKFYKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLADGNKQQAKQFILAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKALEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNIVKKKKDAREMLNMIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSVINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMETGKIKDSVHTGMDALTVVSDEANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANTFFMMMNYYSIERSMEIAKERGEVYQDFEQSDYASGKYFEFYTSQEFEPKFEKVKRLFDHIDIPTAKDWKALQEQVQQHGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >NC_007168|2189006:2203175|2191952_2192921_-|WP_011276423.1|DBSCAN-SWA MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTEDEKNTFKRALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKSDKIIENYHKLWGKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQSLRNELSENEKQKADKEMYKLLEDLYANEVSYTHMLYDDIGLSEDVLNYVQYNGNKALSNLGFEPYFEEKEFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEALQDEDFIFDN >NC_007168|2189006:2203175|2200412_2201339_+|WP_011276429.1|DBSCAN-SWA MGQKFNHGVLFYHEHSGLKDIYEGLGEVTKSLTTMCKHLSIQLSENEGDIIKYCERIKNQEYSSDVDIVFILGGDGTVNELVNGVLANDLNVPIGIIPGGTFNDFTKTLNLNPNFSKASEQLKTSHLESYDVMKVNGTYVLNFVGLGLIVQNAENVQEGRKDIFGKLSYVGSTVKTLMNPEDFDYTLTVDDKELNGNTSMLVVANGPNIGGSRIPLMDLSPQDGKLNSFIFDKQSFTILNDVFKKRDSMDWNEITNGIDHIAGKHITLSTDPVMKVDIDGEISLETPITIEVLPKALQILTFPENAEQ >NC_007168|2189006:2203175|2197193_2197694_+|WP_011276427.1|DBSCAN-SWA MTQGRQKEELQDITLLGNQNNKYEFDYTPEVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIDLMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NC_007168|2189006:2203175|2190734_2191703_-|WP_011276422.1|DBSCAN-SWA MKFLFKGYVLLILLVCLTIVSLFVGVSQLSLSDIFHLSEEQQNILFSSRIPRTVSILLSGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILISLIFFPKGHILIKLLFSVGLSLAGTYLFVKLINLIRVKEVIFVPLLGIMIGGIVSSFTTFIALRTNALQSIGNWMNGNFAIITSGRYEVLYLVVPLLIIAFIFANHFTIAGMGKDFSHNLGVSYEKIINIALFITAALTALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISMYRGDHLKNALPHTLMLGSIFVLFADIIGRLIVYPYEINIGLTIGVFGTVIFLILLMKGRKHYAN >NC_007168|2189006:2203175|2195116_2195515_-|WP_011276425.1|DBSCAN-SWA MKVVYFSFSGNVRRFIKRSEISDVMEITKDNCTDPFEEPYILVTGTIGFGEVPKEVQSFLEINHHNLRAVAASGNRNWGQNFAKAGRTISEEYHVPLLMKFEVQGSNKDVIEFKNKVGHFNENYEREKVQSY >NC_007168|2189006:2203175|2197994_2199500_+|WP_011276428.1|DBSCAN-SWA MATNNSHEQAVQTIPQRGFFGHPSGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYDQIKNGGLGIDQTTAMSIMSVYGALIYMSSIPGAWVADRLFGTRGATLIGAVLIIIGHVCLSLPFAMFGLFASMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDTRMDAGFVIFYMSVNLGALISPIILQHFLDVKNYHGGFLIAAIGMALGLVWYMIFNKKNLGSVGMNPTNPLSSEEKKKYGLIVGIIVAVIAIVLLVTYFTNTLSFNLISNTVLVLGIALPIIYFTTMIRSKDVTDVERSRVKAFIPLFILGMLFWAIQEQGSNVLNIYGLERSDMKMNLFGWTTDFGEAWFQSINPLFILLFAPIVSAIWLKMGKKQPSLPVKFGLGTLLAGASYILMGLIGMSYGDTHFSVNWVILSYVVCVVGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSVWLLTNASAQALNGTLVKLINPLGQTNYFIFLGSVAIVITVIILAFTPKISKAMKGIH >NC_007168|2189006:2203175|2202119_2203175_-|WP_011276431.1|DBSCAN-SWA MKQQLNQLAAYQPGLSPQALKEKHGIEGELYKLASNENLYGPSPKAKQAVQAHLDELFYYPETGSPSLRKAISEHLNVDPSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDKIVTSEGTFGQYYHNAIVESAEVVQVPLLNGGFDLENIIKEVDEETALVWLCNPNNPTGTYFNHDELESFLERVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLKLQERFDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVATNEAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAIAALEDQAYLKDVTAKNAKEREKFFEIPQSEHFLPSQTNFVFVVTEKAQELYEALLKVGCITRPFPTGVRITIGFPEQNDRMIEVLKHFDY >NC_007168|2189006:2203175|2189785_2190745_-|WP_011276421.1|DBSCAN-SWA MQISSNKKIIILIIATICMAAFYLLVGLDFEIFQYQFQSRLRKLILILIVGGAIGASVVIFQAITTNRLLTPSIMGLDSVYLFVKVLPVFLVGTQAAVITNVYLNFFVTLIAMVLFSLLLFEGMFKLGHFSVYFILLVGVILGTFFRSITSFIQLIMDPESFLAVQSAMFASFEASNSRLVLVSTCLLLVLIIITVIMRPYLDVLLLGRAQAINLGVSYESMTRLLLILVALLVSISTALVGPVTFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILPATILISWISLFMAQWVVENLFEATTEFSLIIDLIGGSYFIYLLVKRRSAN |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2219380 : 2227528
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_007168|2219380:2227528|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_007168|2219380:2227528|2225318_2226635_+|WP_011274424.1|transposase|DBSCAN-SWA MCKSILNTLRIKDKNLNFSDEVIEKKHKGRMSLFYYAELTYQPTHCENCSTKNENFSIVKNGKKTSTITLLKIMEMPAYLELQKQRFYCKSCDSHFTAKSNIVDAHCFISNKTKLAVLDKAQEYRSQKSIAKSCLVSSMTVSRVINQAASDVGQSSFDALPEHLMMDEFKSVKNVIGKMSFIYADAVSHRIVDVVADRKLKSLKDHFYRYSLKLRQKVKTVTIDMYEPYMSLIKQLFPNAKIIIDRFHIVQSLNRALNMSRVHVMNCYRTSNRPLYNKYKSYWKLFLKPFETLEAFNYHKVHLFKEWKTEKGIINYLLGVDVELFNTYHYVHELRRLLKENQIEKFNHKLFSIHLSDVCPKLRPVIRTLRRLAAFIENTMTYSNLTNGPLEGINNKIKLIKRVSFGYRNYDNLRNRIIITSRLFASTTKKEIKQPKVA >NC_007168|2219380:2227528|2221465_2222137_+|WP_011276447.1|DBSCAN-SWA MTNQNLNKDKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKDVELVTFNYGQRHDAEIEVATRIAKEQNLKHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMDIETGEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQRNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLSMDKDFVIHTPLMWLDKAQTWELSDELGVLDYIRHNTLTCYNGVIGDGCGECPACQLRQRGLQHYLEAKGAN >NC_007168|2219380:2227528|2223378_2223990_+|WP_011276450.1|DBSCAN-SWA MIIYVLINIAVVLGVLGLDLYKHQFKQLKFSSVLIAITINALINAIVIDKFNFITLCSIAFFICWLGLQFYLNHQHYTLVIYEYKSIALIFSIIISCSLFITYGSSDQSIYMSVPYLAPTIFLIGASAIFLGTFSRGELGIFKFIKKLKFPITIGYMLIIISIVLLTILTPFWYIFLIIYILLGIYLAWQLKNTNLKHHIENK >NC_007168|2219380:2227528|2226688_2227528_-|WP_011276452.1|DBSCAN-SWA MVNDTQILNNGYPMPRLGLGVYKVTDEEMETAIQAALDDGYRAFDTAYFYNNEEALGKALKNSGVPREDLFITTKLWNDHQGYDSTLEYFNRSLNNLGLEYIDLYLIHWPCEKNELYIETYKALEKLYEEGKIKAIGVCNFKVHHLEKLMRETNIVPQVNQIEVHPYFNQQEVQDFCDKHDIVVTAWMPLMRNRGLLDDPTITKLAKAYDKTPAQIVLRWHVAHNRVVIPKSKTPSRIRENHDIFDFNLELTEIAEIDSLNRNARQGKDPDEVSIGDLK >NC_007168|2219380:2227528|2219380_2220526_-|WP_011276445.1|DBSCAN-SWA MNIAFNYRYYTTPDHFETIALNFDTYVSKKVAYTLNDIGAVVRFAQDEQSNGRYVALYLTYEAAKFFNQEMATHELDNNQVIALAYSFNPNMAKHPSNNLSQSYIPKHQFRFLESDAEMQDKIKQVQDAITDGETYQVNYTTRLVSDIHYPISDLYYYLTQTNNGGYTALLDVEEIKVASISPELFFQKGAFNNQENVVVSKPMKGTMPRSINKDEDLMNYEILKNSLKDRAENVMIVDLLRNDISRISKPGTIHVNKPFFIESYKTVYQMTSMVSGRLEAETSLTDILKALFPCGSITGAPKLNTMSYIKALEVNPRYIYCGTIGLLCPDDKMIFNIPIRTLEYRNEKVHYGVGAGITIDSIPEKEVQEFRDKTKILEML >NC_007168|2219380:2227528|2222557_2223274_+|WP_011276449.1|DBSCAN-SWA MAAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKEDIKLMTAEEIYNQLKKIGGDRFDHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFEEKQIYTALETQGSKFQPWMRQINDLTISPKPPSSNMKPNIDILDSVIEQCIESTLNLKVVIFDDDDYEFAKMIHHRYPNIPFYLQVGNPYLDDDVDNHTEKLLSRYEALVDRVMASNDMNQVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NC_007168|2219380:2227528|2224040_2225030_-|WP_011276451.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCFNEGEVVTKTYDKLTEILMEDSLDKGYDYDLLFVDDGSKDNTIDHVQHLASLDQHVKYISFSRNFGKESAMIAGFQHSVKCDAVVMVDGDLQHPPEFIPQMIEGFQEGYDQVIAKRDRTGENIARKSMTKLYYKLINSFVEDIEFIDGVGDFRLLSQRAVKAMSSLKEYNRFSKGLFEWIGYNTKIFTYQNVEREAGHSKWTFTKLLNYGIDGLISFNNKPLRAMIYLGMTIFSLSIVYILYLLIGIMVNGINNPGYFTTIAAVLLIGGIQLISIGVVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNLKEPTHDLKVVEQEKEKVH >NC_007168|2219380:2227528|2220509_2221103_-|WP_011276446.1|DBSCAN-SWA MIIVIDNKDSFTYNLIDYFKTETDKEIVVYEVDDVSVDLLRSSNVEAIVISPGPGKPSDYPILTEIMNQFEGEIPILGVCLGFQFIYEYYGGTIIHGLKPVHGHTTTLTHRGTGLFKGLPKSFEVMRYHSLIADKNHIPTVLNMTAYNEEGIIMAFEHNQYPIYGVQYHPESILSEYGHEQIRLFLEKVRIDYEHRI >NC_007168|2219380:2227528|2222138_2222558_+|WP_011276448.1|DBSCAN-SWA MIQQLYPSVAHPYSFELNKDFNFSAAHYIPSEDAGKCMRTHGHTYFVNLTIAGDKLDHNGFLINFSDLKKLIHDQFDHYLLNDLPQFKDKSPSTEVVAQTIYKMVQTHLQNCDNQPECVQVYLRETPTSYVVYRPKEYK |
9 | Pandoravirus(12.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2303170 : 2397948
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_007168|2303170:2397948|DBSCAN-SWA 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120 | Staphylococcus_phage(63.89%) | transposase,tRNA,portal,terminase,capsid,head,integrase,holin,plate,tail | attL 2302659:2302675|attR 2324143:2324159 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2583857 : 2618339
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_007168|2583857:2618339|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_007168|2583857:2618339|2587875_2589048_-|WP_000195429.1|transposase|DBSCAN-SWA MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >NC_007168|2583857:2618339|2615341_2615944_+|WP_011276850.1|DBSCAN-SWA MHEYSVDVENNKVIFYLSIVSIFISSVLTMIINLWIEKIPYIEITISITTISIFGILYSLFDKFIWKWKILHKLGIIKIPNLNGKWKGNFQSSYHDFKENLPVILIIEQSWSKICIKGKFNHSKSSSDTASIKVNLGKEIMLHYSYYNDKKPEYYKMGTSNHRGYANLEINGNSMEGNYFNDPSNNKNWGKLNLKKVIES >NC_007168|2583857:2618339|2592133_2593348_+|WP_011276827.1|integrase|DBSCAN-SWA 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35 | uncultured_Caudovirales_phage(38.46%) | terminase,transposase,integrase | attL 2613710:2613727|attR 2623744:2623761 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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