Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_010609 | Lactobacillus reuteri JCM 1112, complete genome | 0 crisprs | RT,cas14j,cas3,DEDDh,DinG,csa3 | 0 | 0 | 11 | 0 |
1. NC_010609
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
261274 : 319703
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010609|261274:319703|DBSCAN-SWA TGTGGTGATAACAAGAGAATTAGATAGAAATCAGCATTCAGTATACTTACTTAATTACCATTTGGTAATGGTGGTTAAGTATCGTCGAAAAGTAATTAACGATGAAATATCTGAATATCTTAAACATTGTTTTGTAGTTGTGGGACAAGCATACGGCATTAATTTGCAAGAATGGAATCATGATCAGGACCACGTACATGTTTTGTTTAGAGCAACGCCTCATACGGAAATGGCTAAATTTTTAAATGCTTACAAATCGTCTAGCTCCAGAATGGTCAAAAAACAATTTCCAGAAATCAAGCAGTATCTTTGGAAATCAGCCTTTTGGACACAAAGCTATTGCTTAATTAGCACTGGTGGAGCGCCTTTAGAAGTTTTAAAACGATATATTGAAAGTCAAGGGAGAAAATAATGGTTCTAAAAGCCGTTAAAATGCGCATCTATCCAAATTCAGCACAACGAAATCAGCTCTGGCAAACCTTCGGTTGTGTTCGTTTTGTATGGAATCAAATGCTTAATATGCAAATTGAACGGCGCAAGAACAATCCGGAAGCTAAATTTGTGAATGCCTTTGGGATGAATAATCTGTTGAAACAACTTAAGGTTGAGTATCCTTGGTTGAAACAAGCAGAATCAACTGCTTTGCAAAGTGCTAATCGCAATTTAGCCGATGCTTTTCAACGCTTTTTTAAAGGTCAAAATAAGTTCCCTCGATTTAAATCCAGAAAATATTCTCAGAGCTACAATTCAAAGTACGTTAATGGCAATATTAAAGTTTTAGATTGCCATCATATAAAGTTACCAAAACTCGGTATCGTCTATTTTAGAGCTGGTCGATTGCCAATGGGTAAAATTAAGAATGTCACTGTTCGTCTGAACGTTGCTGGTCAATATTACATTACTGTTTTAGTGGAAAGCGAAAACCAAACTCTTCCTAAAACAAGTAAATATATTGGTGGCGATTTAGGACTTAAGTCATTACTTAATCTTTCAGATGGATGCAAGGAACCGATCAATCATTTTGAAGACAAATACCGTAAAAAGTTGTATCGTTGGGAGAAATTGCGTAGTCGTCGGTTCTTAAAGGCCCAGCAGGAAATCACCTGGGATCATCATAATAAAGTGTTAGTTCCACGGCAATTAGACGATTTTAAGAATTATCAGAAAGCTCGTATTATGGTGGCGAAGTATCGGCAAAAGATTGCCAACCAACGGTTGGATCAGCTACAAAAATTCACTACTAAATTGGTCAAAAAGTACGACATCATTGTGTTGGAAAAACTTAATACTAAGGGAATGATGAAAAATCACCATTTAGCTAGAGGAATCGCTAACGCTAGCTGGTCAAAATTAGTAGATATATTGCAATATAAGTGTAACTGGTACGGTAAAAAGCTTATTCAGGTCAATCCGTCATATACTAGCCAAATTTGTGCTAATTGTGGGAAGAATAATCATCGGTTAGGATTAAATAAATTGGAATGGTTAGCGGTACGTGAGTGGGATTGTCCAAACTGTGGTAAACATTTAGATCGTGATATTAACGCTGCACAAGTTATCTTGCAAAAAGGATTAGCTATCCGATAGATAAAGTTAGGCTCGGGACGAGCCTTGGTTAATAGTCGTAACCTCTGCTTGAAGGTTCGTTCAGAATCGGTAGGGTAAGTATGTGATGTTTCCAGAATCTCCCACTTCAAGCATTAAACCGTAGGTTTAGATAAGCGGGAGTAGTTCAATAGTAAAAAGAGTATAATAATGACGATAAGCAAAGTGAAAGGAGGAGTTTATTATCAAGAGCGTAATTCCTGTTCATGTGAATCTCTCAACGATCATTGATCAAAGTGGACAGCAAGAAAAATTTACCTTTACTGAAGAAGGTACTTTTGTCGAAATGAATGGTAAGTATTATTTAAGGTACATTGAACACCAAGACGGGCAAGAAACGCCGGTGCAAATTAAATTTGAGGATGAGCTGATCCGCTTAAGAAGGCGTGGAAATGTCGAAACAAACCTATTTTTGGACCCGACACAAGAAACTATCATGCGGTACCAAACAGAATACGGCATGATTAAAATTGATGTGTTGACAGAAAGTTTGGAAAAAGACGTTGATGTAAAGGCTCCGGCTGGTCACCTTTCTGTTAAGTATCAACTAAAACAAGCGGGACAATTAATAGGGAGTTACCAACTAGAATTGCAATTTGCTGCTTAATATTGTATGATGTAGTTTAGACTTTTTGAAGGGATGTGCACCAATTTGGATTTAAAGGTTTTTGACGGTCAGGACAAATCAGAACTTTCAATGATTGAAGTCGCACACGCTATTTTAGCTCACCATGGAAAAGCAATGGCGTTTGTTGATTTGACCAACGAGGTTCAGCAATATCTGGGTAAGAGCGATGAGGAAATTCGTGAACGTCTTGCACAGTTCTATACTGACTTAAATGTTGATGGCAGTTTTATTTCCCTTGGTGACAACACCTGGGGTCTGCGTGCTTGGTACCCATTCGAATCTATCGATGAAGCCACAGTTGGTGAAAACGAAGAAGATGAAGAGGATGATCGTCCAAAGAAGAAGCGGCGTAAAGTCAATGCCTTCCTCGCAGACACCGATGACGATGACGATGTAATTGACTATGACAATGATGATCCTGAAGATGAGGATCTTGATACTGACGATGATGCCGATTCTGAGGATGATTATGATGACGACACTGATGACTTCAGTGACGACGATGATGATCTTGATGATGGTATTGAAGGTCAGCTATCAGAATTACATGATGAAGAAGATGAAGACGAGGATGACGAATAATTTTCAACTTTGTGCTTGACTATTATTTATTGACCCTGTATTATCTTTCTTGGGCGCCTGTAAAGACAGGCCAATAAGTTCGTAGATAAATAAGCTCCCTGTTTCAGTGTTTTATTTGAAATAGGGAGTTTTTTCTATTATCACACCCGCCAAATATAAAAAAGGAGTAGACGACAATGACGAAATACATTTTTGTAACCGGTGGAGTTGTATCATCATTAGGAAAGGGAATCGTTGCTGCCTCTTTAGGACGATTATTAAAAAATCGGGGCCTAAAGATTGCGATCCAAAAATTCGATCCTTACATCAATGTTGACCCCGGTACGATGAGTCCATACCAACACGGTGAAGTTTTTGTGACTGATGACGGCACAGAAACTGATTTGGACCTTGGTCACTATGAACGTTTTATCGATAATGATCTCAATAAATATTCAAATGTTACAACGGGTAAAATCTACTCTGAAGTTCTTCGTAAGGAACGCCGTGGGGATTACCTTGGTGGGACAGTCCAAGTTATTCCACACATCACTAATGCCATTAAGGATAAGATTAAGCGCGCTGGTGAAAGTACTGATGCTGAAGTTGTAATTACTGAAATTGGTGGTACAGTTGGGGACATTGAATCACAACCATTCATGGAAGCTATTCGCCAAATGAAAGAAGAAGTTGGTAGTGAAAATGTGTTGTACATCCACACTACCTTAGTCCCATATCTTCGTGCTGCTGGTGAAATGAAGACTAAGCCAACTCAACACAGTGTTCGCGAATTACGTGGTTTAGGAATCCAACCTAACATTTTGGTGGTTCGGACAGAGCAACCAATTACTGATGATATGCGGAAGAAGATTGCCTTATTCTGTGATGTTGATCCTAAAGCCGTTGTTGAATCAATGGATGTTCATACTCTTTACGAAATTCCGTTAAACTTACAAAAGCAAGGTATGGATCAATTGGTTGTCGACCACTTTGGTTTAGAAGTACCAGAAGCTGACATGACAGAATGGACAGAAATGGTAAATCATATCGAACATGACTTAACTAAGACCGTTAAGATTGCGATGGTTGGTAAGTATACTGACTTACAGGATGCTTATATTTCAGTTAATGAATCATTACGTCATGCTGGTTATCCTGTAAATGCAAAGGTAAAGATTGACCACTTTAATGCTGAAAACATTACTCCAGAAAATGTTGAAGAGACCTTGAAAGATTACGATGGGATTCTTGTTCCTGGTGGTTTTGGAAACCGGGGAGTAGAAGGAATGATCACTGCAATTAAGTATGCTCGGGAAAATGATGTTCCTTACCTCGGTATTTGCTTAGGGATGCAAACAGCATGTATTGAATTTGCACGAGATGTATTAGGTTACACTGATGCAAACTCAACTGAATTTGATCCAAATACTAAACACAATATTATTGACTTGATGGCAGACCAAGCAGACATTGAAGATATGGGAGGAACACAACGGCTTGGTGCATATCCATGTAAGCTTAAGCCAGGAACAGTTGCTGCAGCGGCTTATGGTAACCAATCAATGATCAGTGAACGTCACCGTCACCGTTATGAATTTAACAACGACTACCGTCAAGAAATGGAAAACCATGGCTTGGTTATCTCTGGGGTGAATCCAGATCGGAATTTAGTTGAAGTAGTTGAAATTCCTGATAAAAAGTTCTTCGTGGCTGCTCAGTACCACCCAGAATTCAAGTCTCGTCCTAATCACCCAGAAGGATTATTTGCTGCATTTGTGAAAGCAGCTGCTGAGGACAAATAAAAATTTAAATTGTATAATATATTTAATACAAGAGATGGGGGCAAGAATGTCACTTCTCTTGTTTTTTGTGTGCGCCCGGCATGGGTATTAGCTAGGCGGTGAGAGTCCGCTATGGGCCGTAGTAGTCGGAACCATGAGCTGAGGACAAGGGTGTCCACTGTGAGGTGGAATCTGAAGGAAGTCTAAGGCAAAGTACTGCACCGATGAACAAGAAGTAGCTATAAGGCTGGAACTAACTGGATAAGACTGCATGACAAGTTAAAGTCCAACACTACTCGAAGTTACTTTCAGTAAAGCTACCGGTGACATGGTACGAAAGTTAATATCCTTACCCGGGGGGATCTGGCCTACACGTTTCCGACAAGAGGAATAAGTTTAATTTCCACAGAAACAAGCGGTGCAGT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49 | Pseudomonas_phage(18.75%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
731821 : 752088
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010609|731821:752088|DBSCAN-SWA 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23 | Staphylococcus_phage(27.27%) | tail,protease,head,capsid,portal,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
782032 : 791236
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010609|782032:791236|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010609|782032:791236|784026_785178_+|WP_003665811.1|DBSCAN-SWA MAEQDYYDILGVSKDASEKDIKRAYRRLAAKYHPDVNHEPGAEEKFKKINEAYETLSDSQKRAQYDQFGSAGPQGAGGQGFGGFGGGQAYSNFGGGFDDIFSQFFGGGGRTRRDPTAPRQGRDLQYAMTLDFMDAVFGKTTTIKYDRDAECKTCHGTGAKPGKSPITCPRCHGAGVITSVRQTPLGNMQTQTTCPECNGTGKIIKPEDRCDTCHGAGHVHERHELEVKVPAGVDDGQQMRLQHQGDAGENGGPAGDLYIVFRVTPSREFRRDGSTIYVDRDISFAQAALGDEVKVKTVHGDVNLKIPAGTQSETNFRLRGKGVPHLNGNGNGDEHVTVHVKTPKSLNKRQREAMLAFAAASGEDVKGVKKTVLDKLRDAFEDK >NC_010609|782032:791236|791074_791236_-|WP_080502980.1|DBSCAN-SWA MGRNSICDYLKGKYEAKQDKLHSLVKALNVDEGWLMGYNINQEKIAILKCQLI >NC_010609|782032:791236|785308_787144_+|WP_003668167.1|DBSCAN-SWA MNLEEMKERQKHIRNFSIVAHIDHGKSTLADRILEMTDSISKREMKNQILDDMPLERERGITIKLNAVALTYHAKDGEDYIFHLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGAVLVVDATQGVEAQTLANVFLALDNDLEILPVINKIDLPSADPEGTKKQIEDEIGLDPDEAVDISAKTGMGVDEVLEKIVKDVPAPTGDLTAPLKALIFDSKYDDYRGVVLSVRVVEGTVKKGDRIKLMNGGTEYEVAEVGINSPKPLARDVLMAGDVGYITAAIKDIKDTRVGDTVTSADNPTDKPLEGYRQMTPMVYAGLYPTDNAKFNDLRDALEKLQLNDAALTFEPESSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNLDLITTAPSVTYHVELADGTTKEVENPAEMPDASSIKAIKEPYVRASIMVPNDYVGPVMELCQRKRGDFDTMEYLSDTRVNVIYHIPLSEIIFDFFDKLKSSTRGYASLDYEIDGYRPSNLVKIDILLNGDKVDALSFIAHRDFAAERGREITAKLKKIIPRQNFEIPIQAAIGSKIIARTNIKAYRKDVTARIHTGDPDRRAKLLDKQKRGKKRMKAVGKVDIPQAAFMAVLKTDEQLDEK >NC_010609|782032:791236|787294_788455_-|WP_003668165.1|integrase|DBSCAN-SWA MNGNVRKRGKKWYYRFDIADKDGKRRQYERVGGDSYKEAMHRLRVALELYENTGAVTNTDKISTHDYFEFWYDNYVKTNLSKNTQLNYRHVLDKYVQPTLGIYQLSKVTPELIQKTINKIADSTEYKPDHSRLHGHTVEIILMVIKEGFRQAVHPWHILTQSPAEYVRQPKYNHPKTTREDLKIITLQQFNQLLEQFPLGHPFHLPLLISFYTGMRRGEVAGLEWDNVSLPDAEINVTQQMKQYSKTDVRLGKLKTAASYRTIAIGDQLIHALKVQRRLQNENRLRYGKNYHESNFVCTKENGKPVTPNSIKYYASTVTKELGFPFNFHSLRHTHATMLLEAGASAKEVQVRLGHNKIATTLDTYVHLSNKKKHQTANLLDQIAKM >NC_010609|782032:791236|789605_790055_-|WP_003668161.1|DBSCAN-SWA MNKGFKIMLAVGLAGVSLATTTVVVNTNSSNITVVQASKRSRINKAVSIMQEEYGDSADVYYDKENDVIAIKPTDEEFEDEMIAVLDGDESEHDWNKLTKSIDDLSETIYDDCHIKTPIAIVNPENTDKVLYMSYDGESLYDVMHDDNN >NC_010609|782032:791236|788578_789313_-|WP_003668163.1|DBSCAN-SWA MVNRKIRRSQSEYYDAFIEQLKFLNYAAKLYDSGERTAIKMATPQLRTLFYQQSYGDILINLIPEVNKDQFLSTCQFGEKPIIYGGSVTNAFVAGKYVYLPSCYEKNLEIGHYISFEHWWNGRILIASDTSFTRKELVRFIVNKDGGAHIDPELNEKYYNLKNDIYSLQATKMPNMPGIPFKELHLALLRQVVHETLMSFKKMNFIKDYDPGKNCFNMKNNIFPLHVTQMTINEGKSATPTIYY >NC_010609|782032:791236|782032_783898_+|WP_003668169.1|DBSCAN-SWA MASNKIIGIDLGTTNSAVAVMEGNEPKIITNPEGSRTTPSVVSFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTISSIKSHMGEAGYTVEVDGKKYTPQEISAMILQYLKKYAEDYIGDTVTQAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLDVKRIINEPTASSLAYGLDKKDKDEKILVYDLGGGTFDVSILELGDGVFQVLSTNGDTHLGGDDFDQKIMDWLIDGFKEEHGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVQEAQISLPFISAGENGPLHLEKTLSRAQFNQLTNDLVERTKQPVLNALKDADLTFDDIDEVILNGGSTRIPAVQEMVKELTGKEPNHSINPDEAVALGAAIQGGVLTGDVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIDRNTTIPTSKSQIFSTAADNQPAVDIHVLQGERPMAADNKTLGNFQLTDIPAAPRGVPQIKVTFDIDKNGIVNVSAEDQGTHKKQNITIKSNSGLSDEEIERMKKDAEEHAEADKKKKEEVDLKNEVDQELFQVDKTLKEVKGKVPEDDIKKAESARDELKKAKESGNLDEMKAKKDALNKVIQDLSVKLYQQAQGAQGGAANGQPGDSQQNGNDNGNDDNTVDGDFKDVTPDDKK >NC_010609|782032:791236|789317_789554_+|WP_003668162.1|DBSCAN-SWA MTPLNKNIIIVNDKKDIDNITELESFYSEFPTDSNIGIDELKTLMTGKALIDVSDGEYIHWLQLDKHALRFAKTILEK >NC_010609|782032:791236|790153_790612_-|WP_003668160.1|DBSCAN-SWA MKFKNIIALSLLGICGGTVTTSLANNNYVYAASTNDDYPDITSKFDVNNMNQYDDSDLFTDVSIKKFYVQSISYDKHHNERIIFTNTPESTNYYFTVLQGRKHKKRIAVGDPITIKGQLNGRLEIEKTQANSWFAKKYFGKNAIMVLTDSYK |
9 | Lactobacillus_phage(28.57%) | integrase | attL 775527:775541|attR 789290:789304 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
847594 : 855659
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_010609|847594:855659|DBSCAN-SWA CATGGCAAACAAAGCAGAATTAGTAAGCAATGTTGCTACTGCAACTGGCTTAACCAAGAAGGATGCTACTGCAGCTGTAGATGCTGTTTTCAGTTCAATTCAAGCATCTTTAGCTAAGGGTGAAAAGGTTCAATTGATCGGCTTCGGTAACTTCGAAGTACGTCAACGTGCTGCACGTAAGGGCCGCAACCCACAAACTGGAGAAGAAATCAACATTCCTGCAAGCAAGGTACCAGCATTCAAGCCTGGTAAAGCTTTAAAGGACGCTGTTAAGTAATTAACAGTTAAATGTTAAAAAGAGACTAGGAAAGAATTTATCCTTCCCAGTCTTTTTTCTTTTTAAAGACTTGTTCAATGCTTAAAATCATCGATTGTGATATATTTAAAAGTGATAGTAAAAGGAGGGCATAATATGACCTACTCAGAACAAATGCTTGATCAATTAGAAGCAGGAAAGTTAAAAGAAGCCCAAAACTCATTTAAACTCGCACTAATTAATGATGATGATGATATGTTATTTAGCCTTGCAGAAGAATTATATGCATTAGGCTTTCTTCAACAGGCACGAACGATTTACTTAAAATTATTAGATCGTTATCCAGATGAAGACGAATTAAAGACTAATTTAGCGACGATTGCAATTGATGAAGGACATAATGACGAAGCTTTATCATACTTAGCCCAGATTAAACCAGACTCGCCAGCTTATGTTCAATCATTACTGGTTGCTGCGGATTTATATCAGACTGAAGAAGAATTTGAAGTGACGGAGGAAAAGTTAAAAGAAGCTTACGCCTTGGCTCCCGATGAACCAGCTGTTGAATTTGCGCTCGGTGAATTTTACTTTATGGTTGGCCAATATTCTGAAGCAATCCAATATTACTTTCAACTAATTAAAAATGGATATACTGACTTTGCGAAAGTTGATATTGCGGGACGTCTAGGGATTTGTTACGCTCAGAGCGGTCAGTTTAAGAAGGCTTTAGGGTACTTCAATCAGGTTAAACCGGAATACCAGACTAGTGATATTCGTTTCCAAAAGGGATTGACCCAACTTCAATTAGGAGATACTGAAAAGGCAATAAAGACTTTAGAGGATCTTATCAACGATGATAACCAATATGCATCCGCTTATCCTGAACTAGCAAAGGCGTATGAAAAGGAAAATAAGTATCAGCAAGCATTACGGGTTGTCCAAGAAGGGCTCAGTGTTGATCAATACAATGAATACCTTTATTCATTAGCAGCTGAAATTACCAGCCACCTTGGCGATCAAAAGTTAATGAAGAAATACTTGGTAAAGGCGCATGAACTTGCTCCAGAGAATATGACGATTACTTTGCAATATAGTAATTTCTTGCTTCACCAACACGATGATGAGGCAAATATTAAACTCCTGAGTCCATTGGTAAAAGAAGATGAAACAGATCCACAATTATATTGGAATCTAACGCGGTCATATCAACGAACTGATCAGCTTGAATTAGCCGGAAAATATTATGAAGCTGCTTTGCCGGCATACAGTGAAAATCCAACATTCTTAAAAGAATTAATTAATTACTACCGCGAAACTGGTGAAACTGATAAGTTAATGGATGAATTGGAACACTATCTTCGGTTAGTCCCAACAGACACTGAAATGCAAGATCTTTATGACCAATATGAAGATTACAAATAATTTTTAATTTAAATGAGACAGGAAACGTTAACGATTTTAACCGTTCTTTACGCTTCCTGTCTCTTTTTAGTAGTAACTTAATTTGTTATAATCAACTTTGATTATCAAAATGAGGACATGATTAAATGAAAATAAAACAATTACCAGCTATATTTGAACCAGCACGACCTGTCTTACAAAAAATAGAGGAGGCTGGCTACGAAGCATATTTTGTTGGCGGTTGTGTCCGTGACACTATCTTGCATGATGAGATTCATGATATAGATATAGCGACGAGTGCTTACCCTAGTGAAATAAAGGCGATTTTTAACCATACTGTTGATACCGGAATTGAACATGGTACAGTTATGATTCTCGACCATGGAACGGGATATGAAACAACTACTTTTAGAACCGAGTCAGGTTACCAAGACTACCGCCGTCCTGATAAAGTAACTTTTGTTCGTTCATTAAGTGAAGATCTCCAGCGTCGAGACTTCACAATCAACGCCCTCGCCTTACGTGAAGATGGGGAAGTTATTGATCTATTTGACGGACTAGAAGACCTGCAAAAACATCTTATTAAAGCGGTTGGCAACCCTAATGAACGTTTTCATGAAGATGCTTTACGGATGATGCGGGCCGTGCGTTTTGCAAGTAAGCTTGATTTTGTCATTGATACTGCAACGTTAAAAGGAATCAAAGAAAATGCACCATTATTAGAAAAAATTGCAGTTGAACGAATCCGGGTTGAGTTAGAAAAACTATTGTTGGGTCAAAATCCAGTAGCGGGCTTAAAAGATTTTATTGCGACTGGATTGTATCAATATTGTCCAGGGTTGGAAAATGCTCAAGCTGCTTTATCGGCTTTATTAATCCTTAACCAATGGCATTTGGAAAATGAGGCTCAATTATGGTCAGTTTTAGGCTTACAACTCCAGCTTGATCAAAAAGAAATTGGTAAATTCTTAAAGAAGTGGAAGACAGCAAATGATTTAATTGCACAGGTCAAAAAAGTAGTTCCAGCAGTCCAAGCAATTCGTCAACGTGCGCTTACACCAACACTAATGTTTAATACCGGTGAAACAGCCCTCCATGATGCTAACCAAGTAGCTAAGTTATATGGATGGGCAATTGATGATGAAGAATTGCAAAAAGCTTATCAAAAGTTACCAATTAAAAACGCTAAAGAATTAGCAATTGATGGTCGAGTATTAATTACCAAAGCGGGGGTAAAACCAGGACCATTGATGGGGAAGATTCTTCAGCAATTAACGCTGGCAGTGGTAAATGGTGAGATAGCTAACAATGCAACAGTCTTATTAGAAAAAGTAGAAGAGATAACGAAAGAGGGATAATATGCAAACAATGCGTGCAGAGGGTCTAACCAGCACATACGGTGAGAAGACCTTATTTGATGATATTTCGTTTATTATCAATGAAAATGATCGAATTGGACTGATTGGTGTTAATGGAAGTGGAAAAACCAGTCTTCTTAACGTAATTAGTGGGGAAGTAAATCCAGAAGGCGGCGGGCAGATCACTAAGCCTAATGATTACACGATCGGTTATTTAAAACAGCAGCCTGAACTTGATGAAAATAAAACAATCATGGAAGCTGTTTTTGAAGGTAAACAACCAGTCTTTGAAACAATTCGTCAATATGAGCTGGCTCTTGAACGTTTTACAAAGCATCCAGAAGATCCACAAGCAATCGACCGTTACACAAAAATGCAGGCACGGATGGACCAAGAAGATGCATGGGAGGCAGATAGTCGGGTGAAGACGATTCTGACCCAGTTAAAGATAAAAGATGTAAGTCAAAAGATTGCTCAACTTTCTGGAGGACAAAAGAAACGGGTTGGGTTAGCGCAAGTCTTAATTCAACAGCCAGACCTCTTATTGCTCGATGAACCGACTAACCACTTAGACCTTGATTCGGTAGTTTGGCTCCAGGATTTCCTTCGCAGTTATAAGGGTGCTGTCCTCGTTGTTACCCATGATCGGTACTTCCTTGATCAAATTACAAATCATATCTGGGAGCTATCTTTTGGTAAACTTTATCACTACGAGGGAAATTATCAGGACTTTGTAGCAAAAAAGGCGGAACGAGTAGAGTTAGCTAAAGATACTGAGAAAAAGAATCAACAGCTGTATAAAAAAGAATTAGCCTGGATGCGGACAGGTGCAAAAGCCCGTTCTACAAAACAAAAGGGACGGATCAATCGGTTCCACGAATTAGAAGGAAAAATCGGTAATCTTAAAACCGATGAAGATATTGCTATCAATCTTGGATCACAACGTCTAGGGAAAGATGTTATTCAATTTAAGGATGCTAACTTAAAATTTGATAATCACCAAATCCTCCATGACTTCAATTGGCTTGTTCAGGCAGGCGATCGAATTGGAATTACTGGTGAAAACGGAGCGGGTAAGACGAGTTTATTAAATGTGATTGCCCAACGTGTTCCCCTAGATAGTGGTGTCCTTAAGATTGGGGAAACCGTTAAGTTAGGGTATTATACCCAGCAAACAGAAGGAATTGACAATGATAAGCGGATGATTAGTTTCTTGTCTGAAATTGCTGATAATGTTACTGATAAAGATGGCAATAAGCTCAGCGTTACCCAATTATTAGAACGCTTCTTATTCCCTCGTTTTATGCATGGTACTTTGATCCGAAAACTTTCTGGGGGTGAAAAGCGGCGATTATACCTCTTAAAGATCTTAATGCAGCAGCCCAATGTCTTATTACTAGATGAGCCAACTAACGACCTTGATATTGGAACATTGACAGTTCTTGAAGATTACCTAGATAATTTTGCGGGAACTGTAATTACGGTTTCTCATGATCGCTATTTCTTAGATAAAGTGGCTGACAACTTGCTAGTCTTCAACGGGAATGGAGATATTGAGCGTTATACGGGACGCTTTACTGATTATCTAACTGCTAAAAAGGAAGAGGCAGATAAGGATAAAGGGCTTAAAAATGATCAAAAAGCCCTTGCCAAAAAGCAGGTAAATAAGCAAGAACCAGCTAAGAAAGAAAAAACAAAACTTACTTATGCTGAACAACTTGAGTGGGATCATATTGATGAAGAATTAGATGCCCTTGATCAACAGCATCAGCAATTAGAAAATGAAATGGCTGAAGCAGCAAGCGATTATACGAAAATTGCTAAGTTACAGAAGCAGCTAAATGAAATACAAGAAAAAATTGATGAAAAGACAGCTCGTTGGGAGTATTTAAGCACATACGTTGACGAGTAAAGGAAGGGACAAATAAGGATGGCAACAAATGTAAATGAAGAGCAATACTTAGACTTAATCCGTTATGTTTTGGCGAATGGACATCAAAAGGGTGATCGGACAGGAACAGGTACTAAATCTGTTTTCGGATATCAGATGCGATTTGACCTAAGCAAAGGTTTTCCTATTTTAACGACTAAGAAAGTCCCATTTGGCTTGATTAAGAGTGAATTACTATGGTTTTTACGCGGTGATACCAACATTCGCTTCTTACTTCAACACAAGAATCATATTTGGGATGAATGGGCATTTAAGAAGTGGGTGGAAAGTGATGAATATCAAGGTCCAGATATGACGGACTTTGGTCACCGCTGGCTTAAAGATCCAGAGTTTAAGCAGGTCTATCTTCAAGAAAAGAAGGCTTTCTGTCAGCGAATTCTTGAAGATGATGATTTTGCCCAAAAATATGGCGACTTAGGACTTGTTTATGGAAGTCAGTGGCGAAAATGGAAGACGAGTCAAGGCGACACAATTGATCAAATTGCTAATGTTATCCAGCAGATTAAAACTACTCCGGATTCACGACGGATGATTGTTTCGGCTTGGAATCCAGAAGATGTTCCTTCTATGGCTCTCCCTCCATGTCACACCATGTTCCAATTTTATGTTAATGATGGAAAGCTTAGTTGTCAGCTCTATCAACGGAGTGCCGACATCTTTTTAGGGGTTCCATTCAATATCGCTAGTTATGCCTTATTGACGCATATGATTGCTCACCAATGCGGTTTAGAACCTGGCGAGTTTGTTCATACATTAGGGGATGCTCACATTTATCTGAACCATCTTGATCAAGTTAAAGAACAGCTGACAAGAACACCTCATGAAGCTCCTAAATTGATTTTACCTGCTGAACCAAAACCAATCGATCAATATGAAATGACTGATATTAAGTTAGAAGGCTATACTCATGAGCCGGCAATCAAGGCTCCCGTAGCAGTTTAAAAGGAGTGGTTCAAAATGAGTGAGCTGAATTTAATCTGGGCCGAAGATTTAAATGGCTGGATTGGCAAAGATAATACAATTCCATGGCATGTTTCTGCTGATATGAAGCATTTTAAGACAAAGACTACTGGTCACCCAATTATAATGGGGCGAAGAACTTTTGCCTCACTTGGCAATAAACCGTTGCCTAAGCGGGAAAATATTGTGCTTACCAGTAGGAACATAGATGCTGAAGGAGTGGAAGTCGTTCATTCTTTAGCTGCCCTTAAAGAATATCTTAAAGCAAATCCAAACGAATATTTTGTAATCGGTGGGGCAACGATCTATCAGCAATTACTTCCAATGGCGACAAAGCTAACACGAACGGTGATAAATAAGCAAATTGTTGGAGATACAAAAATGCCAACGATCGATTATGACCGTTGGCACTTAGTAAATCACAATAATTATGAAAAAGATGACCAGCTAATTTGTCGTTTTGAAGAATGGGAACTAAACGTATAAAAGAATTGAAAAATACATTAATATCGTGCCGATGAGGACAAAAATATGCCAAATCAAATGGGTATATGCCGTTGGACGACTGTAAAAGAGGGCCCCAAGAGTAAAGGAAAGTCCTCCTAGTAAAAGCAAGCCGAAGCCAACTGGACCAAGTGCACGCCAGAGAGGCATGAAGGCGACTAGACATAGCCAGCCCATAAGAATGTAAATAATGGTTGAATATTTACTTTTATGTTTTAACCAAATACATTTATACACGATTCCGATAACGGATAGGCCCCAAATCACTCCGAAAATTGTCCAACCTAACCAGCCGCGAATGCTAACTAAGCAATAGGGGGTATAAGTTGCGGCAATAAGCACAAAGATCATTGAATGGTCGAGAATTTGAAAAACCCGTTTGGCTCGTGTAAAGATCAAGGCATGAAATAAGGTTGACGAAAGGTAAAAAAGAATTAAAGCACTTCCGTAAATAGTAAAGGTAACAATTCGCATGGGACTACCAGTATGAACAGCTCTAATAATTAACAAGATCAAGCCAGCGATCGATAGTCCTGCCCCGATCCCATGAGTAACCGCATTACCTATTTCTATTAACAAAGTACGCCGATCTCTTGTCTCTTTTTGTGTATCCATCAAAAAACCCCTTTCCAAAGACCAATGAATTTTTAAAATATTTTTGTTATACTAAATAAATAGTAATTGATCCTACAAAATTAGATAAAATTTAGTATAATAGTACTTGAAATAAAATATCTAGTTCTCAATACTAGATAATTATAGCACAAATTGTTCAGGAAGAGTGGTAAGTTTCATGGCAAAGATAAAAATTGTTTGTGACTCATCAGCAGGATTAACTGATGAAGAAATTAAAAAATATGACATTACAATTATACCATTAAGTGTAATGATCGATGGGACGGTATACGTTGAGCGTGAAACAATTACAAACGAACAGTTCCCTGAAATGATGAAGAATGCTAAGTCACTACCAAAGACTTCCCAACCACCAATTGGAAAGTTTGTCGATGCGTTTGATAAGCTAGGCGAAGATGGTAGCGAAGTATTATGCGTTACAATGATGGAATCAATTAGTGGGACCGTCCACGCGGCTGAACAAGCGGCTGGAATGACGAAGACAAAAGTTACAGTCTACGATTCTCAAACGACTGATCGGGCAATGGCTTTTCAAATCATTGAAGCGGCAAAGGTAATTGAAAATGGTGGCTCAGTTCAAGAGGCTATTGAACGAATGAAGTATATATTTGATCATTCAAAAGTTTATTTGGCAATTGATAACTTAGATAATTTAGTTGCTGGGGGCCGAATTAGTAAGTTTGCTGGTGCTTTGTCTAACTTACTAAATATCAAAGTGATGCTTCAAATTGCTGATGGACAAATCCATATTATTATGAAGGGACGAGGAAAGAAAGCTCTTCATAAGGAATGGGATCGAATCTTGAATGAAATGAAGAATGGGCCAAAAGTTATGGGTGCCGGAATCTCCCATGTTGAAGGGAATAGTGAGGTTAATCGTCTTCTAACAAAGATCAAGGCATTTGAGCCTAACTTAGACATCGTTGTTCGAGAGACAGTGCCAATTATTGCAACCCACACTGGAATGGGTGCTTGTTGTTTGCTATACTATACGGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_010609|847594:855659|849396_850608_+|WP_003668104.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKIKQLPAIFEPARPVLQKIEEAGYEAYFVGGCVRDTILHDEIHDIDIATSAYPSEIKAIFNHTVDTGIEHGTVMILDHGTGYETTTFRTESGYQDYRRPDKVTFVRSLSEDLQRRDFTINALALREDGEVIDLFDGLEDLQKHLIKAVGNPNERFHEDALRMMRAVRFASKLDFVIDTATLKGIKENAPLLEKIAVERIRVELEKLLLGQNPVAGLKDFIATGLYQYCPGLENAQAALSALLILNQWHLENEAQLWSVLGLQLQLDQKEIGKFLKKWKTANDLIAQVKKVVPAVQAIRQRALTPTLMFNTGETALHDANQVAKLYGWAIDDEELQKAYQKLPIKNAKELAIDGRVLITKAGVKPGPLMGKILQQLTLAVVNGEIANNATVLLEKVEEITKEG >NC_010609|847594:855659|852538_853501_+|WP_003668102.1|DBSCAN-SWA MATNVNEEQYLDLIRYVLANGHQKGDRTGTGTKSVFGYQMRFDLSKGFPILTTKKVPFGLIKSELLWFLRGDTNIRFLLQHKNHIWDEWAFKKWVESDEYQGPDMTDFGHRWLKDPEFKQVYLQEKKAFCQRILEDDDFAQKYGDLGLVYGSQWRKWKTSQGDTIDQIANVIQQIKTTPDSRRMIVSAWNPEDVPSMALPPCHTMFQFYVNDGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTHMIAHQCGLEPGEFVHTLGDAHIYLNHLDQVKEQLTRTPHEAPKLILPAEPKPIDQYEMTDIKLEGYTHEPAIKAPVAV >NC_010609|847594:855659|853993_854638_-|WP_003666062.1|DBSCAN-SWA MDTQKETRDRRTLLIEIGNAVTHGIGAGLSIAGLILLIIRAVHTGSPMRIVTFTIYGSALILFYLSSTLFHALIFTRAKRVFQILDHSMIFVLIAATYTPYCLVSIRGWLGWTIFGVIWGLSVIGIVYKCIWLKHKSKYSTIIYILMGWLCLVAFMPLWRALGPVGFGLLLLGGLSFTLGALFYSRPTAYTHLIWHIFVLIGTILMYFSILLYV >NC_010609|847594:855659|848005_849271_+|WP_011953444.1|DBSCAN-SWA MTYSEQMLDQLEAGKLKEAQNSFKLALINDDDDMLFSLAEELYALGFLQQARTIYLKLLDRYPDEDELKTNLATIAIDEGHNDEALSYLAQIKPDSPAYVQSLLVAADLYQTEEEFEVTEEKLKEAYALAPDEPAVEFALGEFYFMVGQYSEAIQYYFQLIKNGYTDFAKVDIAGRLGICYAQSGQFKKALGYFNQVKPEYQTSDIRFQKGLTQLQLGDTEKAIKTLEDLINDDNQYASAYPELAKAYEKENKYQQALRVVQEGLSVDQYNEYLYSLAAEITSHLGDQKLMKKYLVKAHELAPENMTITLQYSNFLLHQHDDEANIKLLSPLVKEDETDPQLYWNLTRSYQRTDQLELAGKYYEAALPAYSENPTFLKELINYYRETGETDKLMDELEHYLRLVPTDTEMQDLYDQYEDYK >NC_010609|847594:855659|854816_855659_+|WP_003668100.1|DBSCAN-SWA MAKIKIVCDSSAGLTDEEIKKYDITIIPLSVMIDGTVYVERETITNEQFPEMMKNAKSLPKTSQPPIGKFVDAFDKLGEDGSEVLCVTMMESISGTVHAAEQAAGMTKTKVTVYDSQTTDRAMAFQIIEAAKVIENGGSVQEAIERMKYIFDHSKVYLAIDNLDNLVAGGRISKFAGALSNLLNIKVMLQIADGQIHIIMKGRGKKALHKEWDRILNEMKNGPKVMGAGISHVEGNSEVNRLLTKIKAFEPNLDIVVRETVPIIATHTGMGACCLLYYTE >NC_010609|847594:855659|850609_852520_+|WP_003668103.1|DBSCAN-SWA MQTMRAEGLTSTYGEKTLFDDISFIINENDRIGLIGVNGSGKTSLLNVISGEVNPEGGGQITKPNDYTIGYLKQQPELDENKTIMEAVFEGKQPVFETIRQYELALERFTKHPEDPQAIDRYTKMQARMDQEDAWEADSRVKTILTQLKIKDVSQKIAQLSGGQKKRVGLAQVLIQQPDLLLLDEPTNHLDLDSVVWLQDFLRSYKGAVLVVTHDRYFLDQITNHIWELSFGKLYHYEGNYQDFVAKKAERVELAKDTEKKNQQLYKKELAWMRTGAKARSTKQKGRINRFHELEGKIGNLKTDEDIAINLGSQRLGKDVIQFKDANLKFDNHQILHDFNWLVQAGDRIGITGENGAGKTSLLNVIAQRVPLDSGVLKIGETVKLGYYTQQTEGIDNDKRMISFLSEIADNVTDKDGNKLSVTQLLERFLFPRFMHGTLIRKLSGGEKRRLYLLKILMQQPNVLLLDEPTNDLDIGTLTVLEDYLDNFAGTVITVSHDRYFLDKVADNLLVFNGNGDIERYTGRFTDYLTAKKEEADKDKGLKNDQKALAKKQVNKQEPAKKEKTKLTYAEQLEWDHIDEELDALDQQHQQLENEMAEAASDYTKIAKLQKQLNEIQEKIDEKTARWEYLSTYVDE >NC_010609|847594:855659|853516_854005_+|WP_003666061.1|DBSCAN-SWA MSELNLIWAEDLNGWIGKDNTIPWHVSADMKHFKTKTTGHPIIMGRRTFASLGNKPLPKRENIVLTSRNIDAEGVEVVHSLAALKEYLKANPNEYFVIGGATIYQQLLPMATKLTRTVINKQIVGDTKMPTIDYDRWHLVNHNNYEKDDQLICRFEEWELNV >NC_010609|847594:855659|847594_847870_+|WP_003666054.1|DBSCAN-SWA MANKAELVSNVATATGLTKKDATAAVDAVFSSIQASLAKGEKVQLIGFGNFEVRQRAARKGRNPQTGEEINIPASKVPAFKPGKALKDAVK |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
870310 : 908993
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_010609|870310:908993|DBSCAN-SWA ATTAGAAAAAAGGTGAAAGTTGTTCTTCTGTGACATGACTCAAGAATACTTCTAATGGTGTACGATAATTAAGAGATTTTCGTGGGATATTGTTGCGACGATGCATTAGCTGAGTGACTAGTTCGTCTGGTAAATCGCGAAAATCTAGCTTTTTACTAAGACCATCACGACGCAAGAGGCCGTTATTATTTTCGTTTAACCCTCGTTGATTGGGAGCACCGACTTCCGCAAAATAGGTGTGAAGATCATACTTATTGGCTATTTCTCGCCATCCAGCAAATTCTTTCCCGTTATCAAAAGTAATTGATTTAACAAAGTGACGTGGCAGTTTAGCGAGCCATTGATCAAGCTGGCAATTCACTGCTTCGTCTGTTTTATGATGAATATTAAGGACAATCATTACTTTGGATTGTCGCTCTACTAGCGTCATTACCGCTCCGCGGTGAGCTTTACCTTGAACTGTATCAGCTTCAAAGTGCCCAAATTCATGTTGGTAATGCGGAAAATCACGATATCGTTGATAGATACTGCGTCCTAATTGGCCAGCTTTACCACGATGTTCCACATAGCCATTGGGATGGCGTTTTCCTTTCATCGGTAGCTGTTTAACGGAAAAGCCATACTGATTGCGGGCAAACATGCGATAAAGGGTGCGCATACTGCAGCTAATTGGGTGTTCATGACGACCAATAATAGTATCAGGAGTCCAACCTGCCTTGATTTGCGCATGGATATAGTTAACTTCGATAGTTGGCAGTTGGGTCTGCTTCCGACCACAACGACGCTTATGTCGCTGATAAGTCTGAAGATATTGGTCGATGGTTTTACCGTCGTTGAGGAAACGATAAACACGATAGATGGTTTCTTGACTACGCTGAAGTAATTTAGCAGCCCGATAAGCTTTAGTACCTTGATACCAAAAATCAGCTATGAGAGTTAATTCACGTGTGGTAAGATGTTTATAGGTCATTTGTGATTGCCTTTCTTTTGATTAGGGATATTCAAAAGTCTATCACAAATGGCTTTTTATTTTTTCTAACTTAATTTTACAAACGACGAAATTAAAAACTGAGGAAAATCGCAAAATTTTTCTCAGTTTTTTTGAGCTTTAAATTTCAAAGCTTATTCTTAATTAGTTAAAATATAAGTACTGATTTTAAGAAATGGGGTTGATATTAATGAATATCACATTTACTGATCAAGCTATTGAACGTTTACAGCGTTATGAATTATCTTCTAAGAAGATGCTCCTAGATTTTGATGATGGGGTGGGCCCATTTTCTGCCGTTGGGAGTTGCAGTTTAGATGGTGATTATCGACTAATCCTTGTTAAAGAGGATTTAGATACCCCAGATTATAATGAAAAAATTACCTCTAATTTGGGGGATGTTTTTATTAAAGACCATACAGCAGTTCAATTTGATGATGAAATGGAAGTAAGGTTTAATCCGCGATACTTTACAATGCCACTTGTCAGTCCTAAACGCGTTTTAACGGATAATCTTGAAGTTCTGGATCTTAGTAAGACAGACTTAAATTCTCAAATTGATCGAGCGCATGATTGCTAACAATATAATAAGGGAGCGTGATAGAAGCCAGATACGACTTCATGATCATGCTCCCTTATTGCTTTTAAAGGATAATCCTGAAAATAAAAGTGATGATAATTGCAAAAATTCCAATAATCGTTGCATAGGAAAAATGTTTACGTTGAGCTGGTTTAATTAATGCTTGCCTCCCCCATGAAAATTGTGAATAAAGCCCATAAAAAAGCGGCAATAAGCAAAATATATAATTTCCAGTTAATTGGAAGATGATGGTAAAAATCGCCATAAAATACCATCATGCCGATAAACATCACAATAGCATAGGCATAGTTATCGCGGTGAAAGTTAAAATTAAAAAGATAAGCAAACGCGCAAAATAATAAAATACTAATAATATCGTTTAAAATCATACCCTCTACACACTTCCTTATGGTTTTTATTATAGTCATTAACAGGATAAAGATAAAATATTAAGAAGCAATCGCAAATAATATGATATGATGGTCTTGTTAGAATTAATGAAGGCGGTGCTTACAGTGAAGAAAAAAGCTATGCGACGAGAAATAAAATTATTAACTGAAGAAAATCAACAATTACGTCGATATACCTTACTAGCATCAATCGGAATTTTATTAAGTATGATGATTGGGTTAGTTCGAATGGTTCAAAAAAATTAGTTAGGAAATTTTTTAGAGGGAAGTATAGTGGAGTTAGGATACCGAAAAGCGACACTTGAAGATTTACCAAAAATTGTTGAAATTTATAACCAAATTATTCCGTCAAGGTTAGCGACTGCAGATCTTACTCCGATAACGGTTGAGAAACGGAAAGAGTGGTTTGAAGCGTTTGACGAAAATTATCCAATCTGGGTAATTGAATATCAAAAAGAGGTTCTCGGGTGGGTTGCCCTTGAGCACTTTTATGGTCGTCCAGCCTATGATCATACTAGTGAAATTGCCATTTACCTTGATCAACGGTTACGGAAACAAGGGGTTGGTACAAAAACCATGGAATTTATTATCGGTCAATTGCCTAAATTAACAGTTGATACAATCGTGGCTTATATCTTTGGTCATAATATTCCAAGCCTAAAGTTATTTAAATCGTTTGGTTTTACGCAATGGGGGCTTTTACCACAAGTAGCAGAGCTTGATGGGATTAAACGTGATTTAGTTATTTTAGGACGTCATTTTAAATGATTATTGTGTAAATATGACATAAGTAAAGCCACGTCCATAAGAAGTAACCAGAATAGGCCTCCAACGCCCGGTAAAGCCGAATGCTGGAGGCCTATGGTGCATATGAGAGCTTCGTATTGAAAACGAAGGTGCCCGTGATGCTTTGCTCGTTCCCTTATTTTGTATCTTTTTTTACTTCTTCTTTTGTTTTAACATCATTGATATGTAGCTCAAACTTAACTAAATTTAAACCAGTCATCTTATCGATTGCACGCTGCACCTCAGAACAAACAGCCTTAAAAATTTCTGGAGCACTTTTACCATATTCGATGGTAGCTTCCATTTTTAATGCGACTTGCTTTTCACCAACATCAGCATCGATTCCCTTTGTTGGATTGCTTCCGGAAGTTACTTTATCTGCTAATTCACTAAACATATTTCCGTCGAGGGAAAGGATCCCAGGGACTTTGCTAGCGGTAATTCCAGCAATTTTTTCAATTACCTGATCATCAAATGTTAATTGTTCATCAATTGTTTTATTATTTGTAGTGGTTGTCATATTAATTCCTCCTTGAATTAGTTGGCAAATTTATCTAACATTTTTATCGCGAGTTTATTTAATGAATAGCCTTTTGCATCAAGAACATAGCCAATTCCGCCTAAGATAGTGACAGCTAACAGAATGCCAATCATTGGGAAAAAGCCCCACATAATCCAACTAATGCTGATAAGCAGTCCTAAGATAACGCCAATTGTAGCAAGTTTCATAGTGTACCTCCTTTTTAGACAATGTTAACTGATTCTTTGTTTGAGTATGGACTTAACTTAATATGTAATTTATTAAGATCAATGTCGAAGTCTCGTTTAAGGTTTTCTTTAATTGTCTGGAGTAGTACTGTATGAATTAGTTTTGGATTGGTTCTATTGGACATCATTCCGTGAATGGTAACATCTGCATTATGATTGTTACGGTGCATTTTGAGTTTAATTACTGGGTTATAAAGGTCAAATTTAGCAATTGAAGTAGTTAAGCTATGTTCAACTGCATGTTGATCAATTTGAACTTTATTAGCACCATCCTTAGCGATTGTCATTTGTTTAGTCGTTGTTGGGCGAAAAACGGCAATTGCTATTACGGTTAAAGCAACGATAATTAAAAATACTGCGACTCCGGCTGAGAAACTTTGACCGATGGGGCTGTGAAGCCAATCGTTAACTGGAATCGTCCAAGTTTGGTCACGATAAAACCATAATGATACGACAACGATTCCAATAATTACCTGAAGCATCATCACAAATGAAACCCACCATTTTTTCCATGCGGCCATTAGTACCACTTCCTTTCTATAAATGTTTTTTTGCTATGAATTAATAATAACATAAGAGAAAGCGTTTTACGTTGATTACAAAAATGCTAAAGGTAATATTAAGAACCTATTAACAGAATAGTCATAATTAAAAATCGATCTTACAATCATGTTCCGATGTAAGATCGATTTTTAATTCTTTAATTATTTTGGCGCTCTTGTAGTTTGGCAATTTCAGAATAAGCAGGGGCAAGCATATCTTCAATTTGTTGGAAGAGTGGAGTATAACGTTGATATACTTTTACTGCGGTTGGATCTGGTTGGTAAGAACTGACCTTACCAATGAACTTTTGTGGTGTATCAAGACTATCGATCATTCCCAAACTTTGCATAGCCATAACTACTGATCCAAGGCAGCCTGATTCAAATGAGTCTGGAACATTAACAGGACAGTTTAAGATATCGGCAAGCATTTGACGCCATACTTTTGAACGGGCAAAGCCACCTGTTGCGGTAACGCTTGCTGGTTCGCCAACTAAAGCCCGTACTGCTTGGAAGACTGTTGCAATATTCATGCTAATTCCTTCCATGACTGCCCGTAGCATATCAGCCCGTGTATGAATATGAGAAAGGCCAAAGAAACTACCGCGCGCTTTGGCATTCCACAATGGCGCCCGTTCACCGCCCAGGAAGGGATGGAAGAGAAGTCCATGTGCCCCTGCTGGTACTCCTTCAATAACGTGATTTGCTAAAGTATAAGGATCCACCTGTTCGTTCTTAACAGCGCTACTATCGACAAGGTGTTTTACTGCCCATTCATAGACATCGCCACCGTTATTAAGCGGGCCACCAACGACCCACAATCCTTTATTAATAGCATAGCAGAAGAGGCGTCGTTCTGGATCAATAACAGGATGGTCAGTTACGACTCGTACAGCTGCAGAAGTGCCAATTGTAATTGCTACTGT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58 | Lactobacillus_phage(46.67%) | transposase,tail,head,capsid,portal,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1040141 : 1096361
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_010609|1040141:1096361|DBSCAN-SWA 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50 | Lactococcus_phage(20.0%) | integrase,transposase | attL 1032355:1032372|attR 1105916:1105933 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1100369 : 1173327
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_010609|1100369:1173327|DBSCAN-SWA 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56 | Lactobacillus_phage(21.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1192521 : 1226789
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_010609|1192521:1226789|DBSCAN-SWA 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37 | Lactobacillus_phage(69.23%) | transposase,tail,plate,head,protease,capsid,portal,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1233368 : 1241084
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_010609|1233368:1241084|DBSCAN-SWA TCTATACCTCGATTTCACTTGCATGTATAAATCCGCTTAACATCTTCGTTTCACGGCAATAATCACATTTGCCACAATGAACAGGTTCTTCTTCTCCAGTCATCACTTTCCAAAAATGCGGTTGTAGTTCTTTCACTTTGTCTAAATCGGCTTGCATTTGGTAATCATCATCAACGCCGTTAAAATCAATTGCCATTTTGTCAGGAGGCGTTTGCTTGCTGATCGCAAAGATAAGTGGCTGGCACTTTTTACCAAAGGTCTGCTTGATTAATTCACGATAAACGGCCATCTGTAGGTCATATTCTCGGTCTTGAATAAATGGCACATATCTATGTTCATAAGTGTTCCAGTGACCCTTGTGGATGTCGTCAACGGTCTTCAAATCACAGAAGTAGCCTTTATCAAGCACAAGGCTGTCAATCTTGCCTTTCCACAAGTAGCCGTCAATCTCACCTGTTACGATTACTTCCTTGTCGCCTGGAGCGTAGAAGTAATTGAACATATCATCGGCTTGCAACGTTTGAATCATGCTATTAGCACCCTTAAATTCAGCTCTAAGGTGTCCGTTTGGATTAGTTTTTGTTGGGTGGGTCATAAGTGCTTTCTTATTCTCTTCGATAAAGTCTTGGTGACTCTTAGCGCTCTCAAAGTAAGAATGTACGTAATTACCAACAAGAAGAGGAACAGGGCTAGAAACGGGTTGCCAATCCTCCTTGAGCTTAGCTAATGCACGAGCTTCACACTTCTCAAAATCCTTGAATAGTGAGACACTCATATATTGCCAATCGGTCTCATGAGAGTAGTAATTATCAGCTGTCAGCTTCATCGGCTGGCTTGATTGTTCTCTCGTTGAAGAGTTCTGTTTGTCCGTCTGCAATTTCTTCACTTGATTCTTCATTGCTGTTGCCACTATTGCTTACCCCTTTAGCCTTTGCTTCTTGTGACTTTTGAAATCCTTCTAGTAATTCATCAGTACTTTGTTTTTCATCCTCAACAGGTGTGACATCTCGGCGCTCATCATCGTATTCGTTGCTTGTTGTATCGTTGATAGCACCCGTTAAGAGGTGGTCGCTATCATCAGAAGTGTTAATGAACATCTTAGCGGCACGATTAAGCACAGTACGCTTTGCCATTTCTGAGCCGAACTTATTCTGTACGTCATGCGTCTTAGATTGATTCCAACTAACTTTGATCTGTTTTTTTGTCATAATTGTTAAATGATCCACACCATCAGCAGTTGTAATAATGGCATAAGCTCCAATTAATTCATTGTCTTGGTTCGTCCAATCAAGATGAGTGTTTTCAGTATCAAGGACTAAATGTCCATGACGATCAATCGAAGTATTTACTTGATCTCCTTCATAAATTGCTTGAGCATCTACATCAGTAATGTTCTCTAGCCTTAGAAGAGCAGCGGTTGTTCCAAAATAACTGCGTCGCAACTGTAATTCGTTGCCATAAGCGATAAAATAGCATTGATCTTTTGCGGGGCTTAATCCTTGCACCACCATATCCATCAAGGATTGAATAATTGAATTAGGCGTACATGCTTGTAACACAGGAGTTTTACCTTTAGTTTTGACAGCTTGGAGCCTTAAAAGTGCTTGTGTTAGCGCATTTGGAACACTGTAATTCGCTGGTAAATCTAAGCCTTGATTTTGCTGTTTATTTATACGTGCATCTATTACGGTTCTTAATTGACCAACAGCTAATGCACCAGTTTGATTGATATTAACGCTACTAAGAATACTATTTGCTTTGTCTTGCAATTCTTGATTAATCGCTACTTGATTATTCATGAACTAGTCCCTCCTCATCAGCTAGGCGATATGCCTCAGCTTCTACTTCTTTTGCATCTTGCTTAAAATCGCTCTGATTATCTAGATCGTCTAACAGATATGTCATTGCCCGTGCTATGTCATAATCATAAGCGCCATCGCTTAAAATCAGATTCACGTTATAGAGGTTTCTTGCTAAAACTTTCTGCATTCTTTTAAGTCGTTGTTTATAAAATTCATTCATGTGTTATAATCTCCTTAGTGTTATAATTTTCTTAGTTACTTATTGCCATCGGCTGTGTCAGAGCCGGTGGCTTTTTTAGTCTTTAAATCCCATAACATCAGCAGGTAGAAAAATAGTAGGAATACTGCTCCTCCATAATCTCCTAAGCCTGTGCAATAGGTTATCCATGCGCCTATCAGCATTGCTGTTACTTTGGAATTAACGATCTTTGTTAGTGTCATTTGTTTCACCTCCTTTCACTGATATAATCATCTCGTTAGGAGGTGATTATTTATGCAAGATAAAATTGTTGTTAGCTCTTTTTGGGCAACCGTATTAGTAATAGGCACATTACTTTCTCCTATAGTGACAATTATTCTTAATCGGATTTTTGATCTCGTTGCGAAACGCCTTAACAATCAACACGAAAGATATGAATCTTATAATTCTCGGAGAAGAGAATTACTTGAGCAATATTTAGTTGGTTTAGTAGAAGCAGAGAGAGCAGAAACTCCTGAAGAACGAAAAAACTTAAAATTGATTGAAGTGTCTTACTTACTGATTCCATATTTACCAAACTATATGCAAGAAACTTTTCAACGTTATGCTCTTGAAGCTGCTAACCGAAAACATGACGCAAAAAGTAATGCAGATTTTCAAACGGTTACCATTTTTATTAAAGAGTTGCTAGACCCACGAGGACGCAGATGGATATACTCCACAAAGCATAAAAAATGGATTTGGAAGCGTCCAAATAAAGCATTATCATGTTTCCGACAATGGCGGTCAAAATGGAAATAGTTAGTAAACTCATCTACCTATTCCTCCTTAACAAACGTAATTCTTGAAATAGCTGATTTACTTCTTCAGGAGCAGGTCGGCTATTTTTATCCGACAAAACTTTTAAGATGTAAGTTGCTAATGCTTTGTATAATTCTTTTTGCACGTCACTACCTCCTAATGCTTCTTCTGATAACGTGGCTTAAGCACGTTTAGCTTCTCACCTTCGATAACGTTGACAATTGCTCCAATTAAGAAGCAGCCAATAATCGTCAACACGCACCACGCTAGATACGCCATTTAATCACCTCTCAACGCTTTTACATATGGACTTTCATGATCTTCGTAGTATCTTTCTGATCGAAATGTTTCAAACTTTTGATATTCCTTCAGATCAACGCGACCACTGGCAAGAAATACTTTTTGCCAATCTGGATAGTTTTCTTGTGCCCATGACCTGCGTCTGTTAAAGGTTGATAATGACATAGGAACTTCAATTTCCTTATTTCCAACCTTTTTTATTGACTTCCAAACATTGCAAAACTCTAGCCTGTTCATCTGGTATAAATATGGGCTCATCTAATCACCTCCTAAGCCTCAATTACTGGTGCATTTAAGAACTTATTAATGAAATATTGTTGTCCTTTGCCAGTCACTTTCGTTGTAATGTTGACAGTTGTATGCCCATCAGAATGATTAATTACTGTTTCTTTAGTCTTAAACAGGCCTAATTCCATCGAACGCTGAGTAGGAACATTACGATTACTTCCTCTTGTTCCCAAGTAGCCATTCTTTCTCATCCAAGCAAACAGTCTATTTTGCCCAATATTTACTCCGTTTTGGCGAAGGATTTTGGCAAGCTGTCCAATTAGAATGCTTGAGTTGCTTGTAGAAACCGCGTCCGCAAACAGTGCCTTTGGCTTCATCTGCTCGTTCTCTGCTTGAAGTTGCTTACGTTGCTCTTGTTCCCTTTTTAACTGAGTAGCAAGATTAATGATTGTATCTGGATTAAGCAGCGCTTTTTCAATCGTTTGTGGTGTCATATAGGCACCATGCTTACGGATGGCTGGTAGCACTTCACTTGTTACCCAGTGCTTGAATTCTTTGGCGGTTGGTAACTTGCTACCAAGGATTAATGAATAAAGACCCGATTCATTGATGAGTGTTACCTCTCGATGTTGGCCTGCCAGAACGATTCGTTCAGTCAGCTTGTCATCTGCATCAACGTGGTCTCGGATTGCCTTTGGACCATTTGAATACTGGAGGATAGCCGTAAGATCACGTCCAATAAAATATGGTTCATCGTTAAGCGTCATTGTCCGGACTTGTTGTCCATGAAAATTAAATAATTGTGGTTCGTTCACACGAGTCATCTCCTTTTCAGTAAAGTTCATTTCGATAATCGCAATATTTTATTTAAAAATTTTTTCAATAGGTATCCCTAGTTTCTTTGCTAAAGGCGGTAATTCGGTAGCTTGAAATCTATATTTCCCTTGTTCACGACGATAATATTTTTCTGGTTCCTTAAGGCCTAAAGCAGAAGCCATATCACCATACGTAAAGCCCTTTTTTGACCGTAATTGTTTAATTAAATTAAGATTTATAGTACCTGGCATTTATTAACCTCCTTCCATTACATTGCGATAAGCGCAATTAATTTACGATTATTATATTACATTGCTATTTTCGCAAAGTCAAGGTTTTTATTGCAAAAATAGCAATATATATTAAAAACATTTGCGAATTGCGCTATACTTATTGCGTAAAGCGCAACAAGAAAAGGAGGCCATCCGTTTGAACGATGACATTTTACGAGAAAAGATAATAAAGCTACGAGAAGAACGTGGTTGGAGTCAGGCAGAACTCGCTCGACGCATAAACATGAATAATACTGCCTTAAACAAAGTTGAAAAGGGAACTCGCAAATTGTCTAGTTCTGAACTCAGTGAGTTGGCTTCTGCTTTTAACGTTACTACTGATTATCTCCTCGGTCGGACACCTACACCTCAATTTACTCGGCGAGATGAACGTGACGTACAAAAAACACTTGAAGAAATGTTCAACGGTTTAAGCGATAAAAACGCCCTTTCCTATATGAAAAACGGCGACCAAGAAATTGATGAAGAAGATGCTGAACTATTACGGGCTTCTCTTGAAAATGCAATTCGTATGTCAAAAATTCTTGCAAAAAAGAAATTCACCCCTAAAAAGTATCGAAAGAACGATGACTAGGGGTGAATGTGAATGCGTAATGCTGATTGGATAAAACAAAAAGCGTTAGAAGTTGTATATGATGCTGGTACAAATAATCCTATGAAAATTTGTGAAGAGAATGGGATCTACGTTTGTCACCAAGATCTTGGCAAAGCTTTTCTTGGACACTATACAAATATAAGACGCATCCCATTAATCACGCTTTCATCGCAAAATAGTGAATTTGAAAATACTTATACATGTGGTCACGAATTAGGTCATCATTATTGTGATCATGGGAATAACACCGAGTGGCTTTCAAGGCAGAATTTAAAATTTAATACTTGGGGTTCAGAATATGAAGCCAATCTTTTTATGGTTAATATTATGTTAGCTGACGTTGACTTATCTGAATTTGAAACAAAGGAACAACTACTAAAAACATATGGTATTCCACTCTGGGCATCACGATACGTTGATCTTTTAAAGTAAAACTTTTCAAACAAAGGCGAAGAACGAAAAGAAATTATCAACTGGGTTAAAGAGGATGACTAACTTTTATGACCAAAATCTGATGTCGTTAAAAGCTGAATTTTATTTATATTAAGGAGTGTCATTTTATGGCTAAGAAAATTACGGATAAAGATGGAAATGTCTATGTGCAGAAAAAGGCATGGTATAAACGTTGGTGGGTATGGGTAATAATTGTACTTGTACTATTATTTGGAATCGGATCAATGGGAAGCGATGACAATAGTACTTCTTCATCATCAGATGCAGCTACCGAAAGTTCAACTAAATCTTCAAGTAGTAGTACCCATGCAACTTCACAGCAAACTGCTGCACTTCATTCAGCCGAAACATACGCTAATGATATGAATATGTCTAAAGCAGCTATCTTAGATCAATTAACTTCAGATGCTGGCGACAAATTTGCCCAATCAGATGCTCAATATGCTGTTGATCATGTAAAAGCTGATTGGAATAAAAACGCCTTAAAATCTGCAGAATCCTATCAAAAGGATCAAGATATGTCAACCGAAGAAATCCGCGATCAATTAACATCCCCTGATGGAGATCAATTTACTCAGGAACAGGCTGACTATGCTATCAATCATTTATCAAAATAAGCAATAATTTATATATTATTACCGGCATTATGCCGGATACATAGTTGTCCAACCAAATTGATGACATTAAAAGCTATTTAATATTCAAGTTTTAAACCGGTCGAAATCGACCGGTTTAAAAAGCACTATAAAAGAACGTATGTACGGGAAGGACTGTTTATTATGAATAAAAATGAACTGCTGGAATATATAGATACTAACTCCACCGCCATTACTATTTTCAAGGATAAGGTACGAACTGAGCAGGAAGCCAAAAATAAAAAGCGTCAACCCGCTAAGCGATGGAACGAAGCTAAGATTGAGCGCACCGTAGATAAATTTACCGATGATTTTATCAGTAATGTTTACGACAAGTTATATAAGGGGGTGAAAGCCAATAGAAATACACCAAGAAATAAATGGATTGAGTTTATCGAAACTAACGAAATCCTTGATAGTTTAGAAGAATCAGTAAGTATGATGGAGATTGGAGAAGATTAATTATGTGGATGCAAGAACGCAATGGGAAATTCCGCTTCTTTGAGCAATATAAAGATCCTCTAACTAATAAGACTAAAATCATTAGTATTACAATGAAAGACCATAAAAAGAGTACTGCTAAGCAAGCTCAAATTATTCTAGATAATCGCATATCCAAAGCTTTATCAAAAGTCGGTATCGGAAAAATAATTCATGGAATTACACTCAAACAGTTACTTGGTGAATATACTAAATATGAAAAGCCGCGAATTAGGAGATCAACGTATTATAGCCATCAAACAATGGTTAATACCTTACTAGATATTTTTGGCAACGATGCCTTAGTTGAAAAATTTACCCCGCTTATCATTACTGAAAAACTAGAAAGTCTAATGTATGGGGATAGAGAGTTGTCCAGTGGCTATGTATCACGATATAAGTACTATCTACACAAGTTATTTGATTATGCCGTAAAACACTCATATACAAAAGATAACCCAGTTGATAACGTTAAAATTGATTATAAGGCCCCTGCTAATGGTCAACAAATTAAAGATAAGTTCCTCGAAGCTGACGAACTGAAAGCCGTGCTCAAGTATCTATATAACAATACTAGAATCTACGGAGAACTTTGCGAATGGTTATATCTCACCGGGCTACGTTTTGGTGAAGCAGCCGCTTTAAGTTTTGATGACGTTTACCAAAAGGACAATCATTGGTTTGTAGATATAACTGGCACATTAGAGTATAAACGAATTAAAATCAAAGAACAAAAAAAGAGTGACGCACCTAAAACCTCATCCTCAGTCCGTAGCGTTGTACTACCAAAGAAAGCCGTTCAAATTTATCTTGATCTGAAGAAAAAATCTAATGGCAAAGGTTTTATCTTCGCAACCGAAAACGGCACACCGATCCAAACGGCATCAGTAAATACTGTTTTAAGATCAGCAAAGAAGAAACTTAAACTTAATAAACCACTAAGTACTCATGTATTCAGACATACCCACATCTCGAAAATGGCCGAGTTAGGAATTCCGCTATATGTAATCCAACAAAGAGTTGGTCACTCCAGTAGTAAGATTACCTCCCAGATATATCTTCATGTGACACAAAAAGCAATTGAAAAGGAAGCGTCAAAACTTGATGAACTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_010609|1233368:1241084|1234176_1235166_-|WP_003668360.1|DBSCAN-SWA MNNQVAINQELQDKANSILSSVNINQTGALAVGQLRTVIDARINKQQNQGLDLPANYSVPNALTQALLRLQAVKTKGKTPVLQACTPNSIIQSLMDMVVQGLSPAKDQCYFIAYGNELQLRRSYFGTTAALLRLENITDVDAQAIYEGDQVNTSIDRHGHLVLDTENTHLDWTNQDNELIGAYAIITTADGVDHLTIMTKKQIKVSWNQSKTHDVQNKFGSEMAKRTVLNRAAKMFINTSDDSDHLLTGAINDTTSNEYDDERRDVTPVEDEKQSTDELLEGFQKSQEAKAKGVSNSGNSNEESSEEIADGQTELFNERTIKPADEADS >NC_010609|1233368:1241084|1237942_1238380_+|WP_011953501.1|DBSCAN-SWA MNDDILREKIIKLREERGWSQAELARRINMNNTALNKVEKGTRKLSSSELSELASAFNVTTDYLLGRTPTPQFTRRDERDVQKTLEEMFNGLSDKNALSYMKNGDQEIDEEDAELLRASLENAIRMSKILAKKKFTPKKYRKNDD >NC_010609|1233368:1241084|1235662_1236169_+|WP_003666973.1|DBSCAN-SWA MQDKIVVSSFWATVLVIGTLLSPIVTIILNRIFDLVAKRLNNQHERYESYNSRRRELLEQYLVGLVEAERAETPEERKNLKLIEVSYLLIPYLPNYMQETFQRYALEAANRKHDAKSNADFQTVTIFIKELLDPRGRRWIYSTKHKKWIWKRPNKALSCFRQWRSKWK >NC_010609|1233368:1241084|1238392_1238833_+|WP_003666963.1|DBSCAN-SWA MRNADWIKQKALEVVYDAGTNNPMKICEENGIYVCHQDLGKAFLGHYTNIRRIPLITLSSQNSEFENTYTCGHELGHHYCDHGNNTEWLSRQNLKFNTWGSEYEANLFMVNIMLADVDLSEFETKEQLLKTYGIPLWASRYVDLLK >NC_010609|1233368:1241084|1237560_1237764_-|WP_003666967.1|DBSCAN-SWA MPGTINLNLIKQLRSKKGFTYGDMASALGLKEPEKYYRREQGKYRFQATELPPLAKKLGIPIEKIFK >NC_010609|1233368:1241084|1233368_1234193_-|WP_003668359.1|DBSCAN-SWA MKLTADNYYSHETDWQYMSVSLFKDFEKCEARALAKLKEDWQPVSSPVPLLVGNYVHSYFESAKSHQDFIEENKKALMTHPTKTNPNGHLRAEFKGANSMIQTLQADDMFNYFYAPGDKEVIVTGEIDGYLWKGKIDSLVLDKGYFCDLKTVDDIHKGHWNTYEHRYVPFIQDREYDLQMAVYRELIKQTFGKKCQPLIFAISKQTPPDKMAIDFNGVDDDYQMQADLDKVKELQPHFWKVMTGEEEPVHCGKCDYCRETKMLSGFIHASEIEV >NC_010609|1233368:1241084|1239633_1239951_+|WP_003666960.1|DBSCAN-SWA MNKNELLEYIDTNSTAITIFKDKVRTEQEAKNKKRQPAKRWNEAKIERTVDKFTDDFISNVYDKLYKGVKANRNTPRNKWIEFIETNEILDSLEESVSMMEIGED >NC_010609|1233368:1241084|1235424_1235610_-|WP_003666974.1|DBSCAN-SWA MTLTKIVNSKVTAMLIGAWITYCTGLGDYGGAVFLLFFYLLMLWDLKTKKATGSDTADGNK >NC_010609|1233368:1241084|1236738_1237542_-|WP_003666968.1|DBSCAN-SWA MNFTEKEMTRVNEPQLFNFHGQQVRTMTLNDEPYFIGRDLTAILQYSNGPKAIRDHVDADDKLTERIVLAGQHREVTLINESGLYSLILGSKLPTAKEFKHWVTSEVLPAIRKHGAYMTPQTIEKALLNPDTIINLATQLKREQEQRKQLQAENEQMKPKALFADAVSTSNSSILIGQLAKILRQNGVNIGQNRLFAWMRKNGYLGTRGSNRNVPTQRSMELGLFKTKETVINHSDGHTTVNITTKVTGKGQQYFINKFLNAPVIEA >NC_010609|1233368:1241084|1238961_1239471_+|WP_003666961.1|DBSCAN-SWA MAKKITDKDGNVYVQKKAWYKRWWVWVIIVLVLLFGIGSMGSDDNSTSSSSDAATESSTKSSSSSTHATSQQTAALHSAETYANDMNMSKAAILDQLTSDAGDKFAQSDAQYAVDHVKADWNKNALKSAESYQKDQDMSTEEIRDQLTSPDGDQFTQEQADYAINHLSK >NC_010609|1233368:1241084|1235158_1235389_-|WP_003666975.1|DBSCAN-SWA MNEFYKQRLKRMQKVLARNLYNVNLILSDGAYDYDIARAMTYLLDDLDNQSDFKQDAKEVEAEAYRLADEEGLVHE >NC_010609|1233368:1241084|1236448_1236727_-|WP_003666969.1|DBSCAN-SWA MSPYLYQMNRLEFCNVWKSIKKVGNKEIEVPMSLSTFNRRRSWAQENYPDWQKVFLASGRVDLKEYQKFETFRSERYYEDHESPYVKALRGD >NC_010609|1233368:1241084|1239953_1241084_+|WP_003666958.1|integrase|DBSCAN-SWA MWMQERNGKFRFFEQYKDPLTNKTKIISITMKDHKKSTAKQAQIILDNRISKALSKVGIGKIIHGITLKQLLGEYTKYEKPRIRRSTYYSHQTMVNTLLDIFGNDALVEKFTPLIITEKLESLMYGDRELSSGYVSRYKYYLHKLFDYAVKHSYTKDNPVDNVKIDYKAPANGQQIKDKFLEADELKAVLKYLYNNTRIYGELCEWLYLTGLRFGEAAALSFDDVYQKDNHWFVDITGTLEYKRIKIKEQKKSDAPKTSSSVRSVVLPKKAVQIYLDLKKKSNGKGFIFATENGTPIQTASVNTVLRSAKKKLKLNKPLSTHVFRHTHISKMAELGIPLYVIQQRVGHSSSKITSQIYLHVTQKAIEKEASKLDEL |
13 | Lactobacillus_phage(28.57%) | integrase | attL 1236578:1236593|attR 1246588:1246603 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
1380682 : 1454520
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_010609|1380682:1454520|DBSCAN-SWA ACTATTTTGCAACGATGTTAACGATCTTGTTAGGGACAACAATGACTTTTTTAATATCCTTGCCATCAGTAAACTTCTTAACATGTTCGTTTGCTAAAGCAAGTTGTTGTGCTTCATCGCGGTCAGTATCCTTGGCCATCTTAATCTTAGCCCGTACCTTACCGTTAACCTGAACGATCATTTCAACTTCATCTTCAACTAAAGCTTTTGGATCGTAAGTTGGCCATGGTTGGTAAGTGATTGTATCACTCTCACCAAATTGACTCCAGAGTTCTTCAGCCATGTGCGGCATGATTGGTGCAATCATCTTTACAAAGCCTTTCATGTATTCAACTGGTAAATCATCAACCTTGTAGGCTTCGTTTACAAAGACCATCAATTGAGAAATAGCCGTATTGAAGTGCATCCGTTCGTAGTCTTCGGTAACCTTCTTAACAGTTTGATTGTAAACCTTGGTAAGCTTACCATCATTGAAAGTGGATACCCGGTCACGGAGGTGGTTATTATCATCCATCAACAACCGCCATACACGTTGAACCCACTTATTAGCACCATGAAGTCCTTTTTCATCCCAAGGTACCGATTCTTCAAGTGGTCCCATGAACATTTCGTAAAGACGTAAAGTATCAGCCCCATATTGGTCAACAATGTCATCAGGGTTAACAACATTACCTTTGGACTTCGACATCTTTTCATGGTTTGAACCAAGAATCATCCCCTGGTTAACAAGCTTCATGAATGGTTCTTTAGTTGGTACGAGACCGAGGTCATAAAGAACCTTATGCCAGAATCGAGCATAGAGCAAGTGAAGAACAGCGTGTTCAGCTCCACCAACATAGAGATCAACTGGTGACCAGTAATCCAGGGCTTCTTTTGAGGCAAATTCCTCGTCATTATGAGGATCAGTGTACCGAAGCCAGTACCATGATGAACCAGCCCATTGTGGCATGGTGTTAGTCTCACGAAGACCATGACGACCATTTTCGTCATAAACGTTAACCCAATCTTCAACATTTGCTAATGGACTTTCACCAGTTCCTGATGGTTCAATGTTATCAGTCTTTGGCAATTCAAGTGGAAGTTCATCTTCTGGAACTAATGAGGTTGTCCCATCATCCCAGTGGATAACTGGAATTGGTTCACCCCAGTAACGTTGCCGACTGAAGATCCAGTCACGAAGACGGTAGTTAACCTTCTTGTGCCCAGCATCGTGTTCTTCAAGCCAATCGATCATCTTTTGCTTTGCATCAGCAATGTTTAAACCATCAAGGAAGCCAGAATTAATGTGTTTACCATCGCCATCAAAAGCACCTTCTGAAATATCTGCACCTTCAATAATAGGCTTGATTGGCAAGTTAAACTTAGTAGCAAAGTCATAATCCCGTTGATCACCGGAAGGAACAGCCATTACTGCTCCGGTTCCGTAAGAGGCAAGCACGTAATCACTGATCCAAATTGGCAGTTTTTCACCGTTAACTGGATTAATGACGTAAGAACCAGTAAATACCCCGGTCTTATCCTTATTTAAATCAGTCCGTTCAAGGTCAGACCGCCGTGATGCTTCTTCCTTGTACTTTTCAACTTCCGCCTTGTGTTCTGGCGTCGTCAATTGATCTACTAATTCTTGTTCGGGAGCAAGAACAACATAAGAAGCACCAAAGAGCGTATCTGCCCGCGTCGTAAATACTTCAATCTTAGTATCTTCATCCCCCACAACTGGGAAAAATACTGAAGCACCTTCTGAACGACCGATCCAGTTACGTTGCATTTCCTTAACGCTTTCTGGCCAGTCAACAAGGTCAAGGTCATCAATCAAACGGTCCGCATAAGCAGTAATCTTTAAAACCCATTGACGCATTGGCTTACGGTAGACGGGGTAACCACCACGTTTAGTCTTGCCGTCTTCAACCTCTTCGTTGGCAACAACTGTTCCACCCATAAAATCAGGGGCCCAGTTAACCATAATTTCACTTTCGTAAGCAAGCCCCTTCTTGTAGAGCTGTTCAAAAATCCATTGAGTCCACTTGTAGAACTTAGGATCAGTCGTATTTACTTCGCGGTCCCAGTCATATGAGAACCCAAGTGATTGGATTTGGTCACGGAAATGGTCAATATTTTTGTTCGTAAAGTCCTTAGGGTTGTGGCCGGTCTTTAATGCATATTGTTCGGCTGGTAAACCGAATGCATCCCACCCCATTGGATGTAATACATTAAATCCTTGCATCCGTTTCATCCGTGACATTACATCCGTAGCGGTATAACCTTCTGGGTGACCAACGTGGAGTCCTTGACCAGATGGATATGGGAACATGTCTAGTGCATAGTATTTCTTTTGGTCCTTATTAAGGTCGGCCTTGAAAGTCTCATTCTTCTTCCAAAACTTTTGCCACTTTTTTTCAATCGTCTTATGATCGTAAGCCATATTTTCTACTCCTTATTCTGATTTTGATGATCGTAATAAAAAAGTCCCGTAGAAATCAATCTACGAGACGAAATAACTCCGCGGTACCACCCGTTTTCCATGGAATCCATGGCGCTTAAGACCTTAACGCGGTAAACGTCATTACCTACTAAAATTCAGTAATAATCACATTTAGATGAGTTCGTAAATGACCAGTCTCCTGTTCACACCACCACAGGATCTCTGCTGACCTCGTCAAATACTACTATTTCTATTACGATCAAATATTTAACGCTTATTTTAACAACCACTGTTAATGATTGCAAGTGTGTAACTAAATTATTAGCCTAAAATTTCTTTTAATTCGTCAACTTTATCAAGGTGTTCCCATGGTAAGTCCACATCAGTCCGGCCAAAGTGACCATAAGCAGCAGTTTGCTTGTAAATTGGCCGCTTCAAGTCGAGCATTTCAATAATTCCAGCTGGACGTAAATCAAATGCTTTTCGAACAGCGGCAATTAATTCTTCTTCTGAACGGGTACCAGTACCATAAGTATTAATCATGATTGATACTGGTTCTGCGACACCGATGGCATAAGCAACTTGAATCTCGGCCTTCTTAGCATAACCAGCTGCGACAATGTTTTTAGCAATATAACGCGCAGCATAACTAGCAGAACGGTCAACCTTAGTAGCATCCTTTCCAGAAAAGGCTCCACCACCGTGATGAGCAGCCCCACCATAAGTATCAACAATAATCTTCCGTCCCGTTAAACCGGCATCCCCTTGCGGTCCACCGATTACAAACCGACCTGTTGGATTAATGAAGTACTTAGTTTGGTCATCAAGGTACTCAGCTGGAATGACAGCTTCAATCACTTGTTCTTTAATATCCTTTTTAATTTGATCAAGTGAAACCTCTGGATCATGCTGGGTACTTAAAACAACGGTGTCAACACGTAATGGCTTGTCATTCTCATCGTATTCTACGGTTACTTCGGCCTTTGCATCTGGACGAAGGTAAGAGATAACGCCATCCTTACGTAGTTGAGCAATCTTACGCATTAACTTATGGCTTAAAACCAATGTTAATGGCATATATTCAGGTGTTTCGTCAGTAGCGTAACCAAACATCAATCCTTGGTCACCGGCACCAATCTTATCAAGCGGATCAGCTTCACCTTCACGCGTTTCTAAGGAGTCATCAACCCCTTGCGCAATGTCTGGTGATTGTTCATCAATCGCAGTGATAACAGCACAGTTATCAGCATCGAAACCGTACTTGCCATCTGTATAACCGATCTTACGAATTGTGTCCCGCACAATCTGTTGGATATTAACGTAGGCCTTAGTAGAAACTTCACCAAAGACTAATACTAGTCCAGTAGTAACTGAGGTTTCAACTGCAACCCGTGAATCAGGATCCTTCTTAAGCAATTCATCTAAGATCGCGTCACTGATTTGGTCAGCAATCTTATCTGGATGTCCTTCTGATACTGATTCGGATGTAAATAAATGTCGTTCTGCCATTTTCTAATTCCCCCATATTCTATTGAAACTTTCAAATAGTTTGTAGTTGCGGTTACAAGGCATCTTCACGTTCAGACGTGAATCCTATCGGGAATTGCTTTATAACGAGAATAATCTTAGCATAATTGTTAACCAACAATCAATGTTAATCCAGACATTCTTACTTCAAACGGGCATTGACCATCCCTACCGCTGTCATGAAAGAGTAAATAATTGTCGGACCAACAAATTTAAATCCATCCCTCCGCATTTGCTTAGCTATTTCTTCCGAAGCAGGTGTTTTAGGAGCTAATTCAACATCGGTAGTTAACCCCAAGTCTTGTGGCTGATCATCAACAAAGTGCCACACATAATTATCAAACGTCTTTCCCGTTTTCAGTAATCTTAAAATCACTTGTGCATTATTAATTACTGCTACTATTTTACGACGATTACGAATAATAGTTTCATCCTCACATAATCGATTAATATCTTCATCGGTAAAGGATGCCACTTTTTCAATATTAAAGTTCGCAAATGCCCGATTAAATGCTTCTCGTCGCCGCCAGATTGTTTGCCAAGTTAAACCGGCCTGAAATAATTCTAAAGAAAGCATTGCAAATAACTGCTGGTCATCATGAACTGGAAATCCCCAGTAGTGATCATAATAGTTTTGCATTTCCAGTGTCGAATTTGCCCATTGTGGTCGTTTAAGTGTCATTATTAATACCTCTTTTTTGATTTTAAAATAATAGAATCTTAAGCATAATTGCCGGATGCGATGAAGGGCGGCCGGTAGCCGCTCCTGAATCTTCTAATAGCACATCTTGTGGAATCGAGTCGACAAAATCACTAATTAGTCGCGCAACATGATTCTGTGGTAAATCATAGTTATAGTTTAGTACGAATTCGGTTTGCCCTATGGTATAATTTTGATACATGGAAATCGCTCCCTTTGGTTGTTTTTAGGGGTAATTACATCATATCAGGAACGATTTCCTGTGTACATAAAAACCGGATAATGAATTGTTTGAACAATTCATCATCCGGTTTTTATTTTGGACTAGGAGTTTTTTCCCAGCCTCGGTTT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54 | Staphylococcus_phage(18.75%) | tRNA,integrase,protease,transposase | attL 1430670:1430689|attR 1440576:1440595 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1683071 : 1702298
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_010609|1683071:1702298|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_010609|1683071:1702298|1694962_1695427_-|WP_003668976.1|DBSCAN-SWA MQKKTKVIISVLVAVMVVIGGFYLYASRTVAKRLPGHVYEYTSVSGNQNAYMTFATSGDQVVVTPDKDTAIKASNSASDFQQAYQDNAEDGKWNYKAQGNRLTLSKLQDGKVSMWQYNHMLALGKKMRSGNFTYQIANAGQGIDHKATKFEQIR >NC_010609|1683071:1702298|1701080_1702298_-|WP_003668983.1|integrase|DBSCAN-SWA MIVLAKTKYPDVYVDNKGHYYYLVELGHDLLTGKRIQKKSRRDANNNRFRSAHDAYKECLRIKNEYQSQNGYANYGLLYGDFMENYYIPSYKSDVEHSTFKSRQSIFKHLINWFGQYKLRSIRSIDCEKFRVYLLNKSGYSQGFSSMVYGLFRNTLDYAVRMDFLTKNPSRKTKAINKGKSNVEFWTKSEFEKVLSVIYTKDYYQHMCFTILYLYFTCGMRVSEGLALTYDDVDYKRHRLRINKTLDMTNKEHYTIKPYTKTINGIRTISLDNDTIRVLKSWQKDQQAHGVYHFIMSYDDTPMSRTTIPLIIKRFAKIAGVKPIQAKGLRHSNVSYLINEFNADVLTVSRRLGHSGPDITLKYYSHLWPHNDESIADKMEGNIIFKNAKENKLAFNGNQHLHSTK >NC_010609|1683071:1702298|1695439_1696507_-|WP_003668977.1|DBSCAN-SWA 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19 | Streptococcus_phage(40.0%) | protease,integrase,transposase | attL 1685806:1685820|attR 1713462:1713476 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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