Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011837 | Clostridium kluyveri NBRC 12016, complete genome | 6 crisprs | cas3,WYL,csa3,RT,DEDDh,cas14j,PD-DExK,PrimPol,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7b,cas8b1,cas6,c2c9_V-U4 | 1 | 12 | 9 | 0 |
NC_011836 | Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011837_1 | 1304217-1304318 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_011837_1
|
1 spacers
spacers of NC_011837_1
>1.1|1304240|56|NC_011837|CRISPRCasFinder AATCCCAGTTAAATTTGGGACAAGGAGGTAGGCTCATGGAGAATAATAACAGTGTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011837_1
The CRISPR arrays of NC_011837_1 >merge|NC_011837|1|1304217-1304318|CRISPRCasFinder TTTAAGATTACTAAAAATTTAACAATCCCAGTTAAATTTGGGACAAGGAGGTAGGCTCATGGAGAATAATAACAGTGTATTTAAGATTACTAAAAATTTAAC >NC_011837|1|1|1304217-1304318|CRISPRCasFinder TTTAAGATTACTAAAAATTTAAC AATCCCAGTTAAATTTGGGACAAGGAGGTAGGCTCATGGAGAATAATAACAGTGTA TTTAAGATTACTAAAAATTTAAC
>NC_011837.1|WP_012101651.1|1303193_1304186_+|RnfABCDGE-type-electron-transport-complex-subunit-D MAEAQTKKDIFTVSTSPHIRCDESISKIMWNVNLALAPAAIFAIYNFGIPALKTMVVGILAAVITEYAVQKIRKKPVTIKDGSAFLTGLLLAMCLPPGIPAYMVAIGAFIAIAIAKHSMGGLGYNIFNPAHIGRAALMLSWPVAMTTWTKLTTSVDTVTSATPLGILKLDGYSKLVDTFGGTGALYKALFIGTRNGSIGETSTILLVLGGLYLIYKRYINWQVPVVMIATVGILTWAFGGTSGFFTGDPIFHMMAGGLVFGAFFMATDMVTIPMTVKGQIIFAIGAGALTSLIRLKGGYPEGVCYSILLMNAVTPLIDRFIQPVKFGARK >NC_011837.1|WP_012101650.1|1301815_1303174_+|electron-transport-complex-subunit-RsxC MLKSFLGGIHPNDNKKYTANKPIEAAPIPDKVFIPVRQHIGAPTSPIVKKGDEVKKGQLIAKSDAFVSANVHSSISGKVVDVAEYPHPGFGKCLTIVIENDGKDEWIEGIPISRNWQDLSDKDIMSIIREAGIVGMGGATFPSHVKLSPPADKKVEFFILNGAECEPYLTSDYRSMLEYTDRIVSGVKIIMKILKAEQGFVGIEDNKKDAIEVMEKAFEGTGVQVVALPTKYPQGAEKMLIKVLTGREVPSGRLPMDVGAVVQNVGTCIAVSDAVEKGIPLIQRVTTLSGGALKEPKNLLLRIGTTFKYAVDLCGGFKETPVKVVMGGPMMGFAQSNLEVPILKGVSGILSLSESDANTGTETACIRCGRCFNACPMSLNPSMLSILGQNNLYREAKEDYNLLDCVECGSCVYVCPAKRNIVQYVKYLKAENAAQAARDKAEAEKNKEKVAK >NC_011837.1|WP_012101649.1|1301166_1301580_+|SoxR-reducing-system-RseC-family-protein MKKESEGIVIETTEGFARVKASRHGDCKNCGACPGDNATVLDAKNPIGAKAGEHVILEMREQNMIRAAFVVYIMPIISIFLGVLVGTWIFNAVGYYEMAFKVVGGIVFFVISLVYIKVFDKATAKNDASKPVIKKVL >NC_011837.1|WP_012101646.1|1298978_1299455_-|hypothetical-protein MKISEKTFFKNVCKYCIDKYTISNNGPLMASLINQLCNRIDMDVPAVQGIVRLRINDNYSRSFAHCFNVYNGNIIDASIYQYALIYRSIENLFPTYVVQNTPDYIDYRIDNKMSIKHKVKFNKELLENILKNIEDKDLPEIKRFNLNEDSKKENLFYL >NC_011837.1|WP_012101645.1|1297769_1298966_+|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MKSMGLKKVSIIIFFIILNNICCYNVFAEGEQGAVKEPNVNARCAVALDSNSKVVVYEKNAYELVPMASTTKIMTALVAMKYGDLNKKIDISPKAASVRGSTVGYKKGESILLKELLFGLMLRSGNDAAIAIAEGISGSVEEFAKLMNEYAGELGVINTQFQTPHGLDSEGHYSTAYDLALVTSAAKKEPLFNEIVSSKDVDGEKNKFSRSYHNINKILWQIPEANGVKTGYTGKAGKCLVTSVAIEKNDIIIVVLNSPGRWEETDKIYEYVNKNYKFVKLFSKGDIAAELKINRNNLKLECEDDIVLPIKNGFKYTTKIIKPQKIAYNVKKGDKIGMLCVYENDKKIYSAALIASRDVKIRGFMHRIFGFRGNVNSPEVSIDFQLPKYKNSNILSDF >NC_011837.1|WP_172634751.1|1297080_1297461_-|DUF2953-domain-containing-protein MNYPEVKNRLPFFIKIIKNSLNFVNEIKFKSTLKIDIKIAYGLEDAAHTALVYGFISLINILTLNILSKIFIIKQNQIYVTPNFNNLHLKIQINSIIYISLAKIIYTGILLAKYRKKLKKLNPLHT >NC_011837.1|WP_012101643.1|1296374_1296839_-|sporulation-protein-YtfJ MDNHPIENLLKSTMENLKDMIDVNTIVGDAVESKDGSFIIPISKVSLGFISGGSEFNSNNQDTSNLEYPFGGGSGAGVTVKPVAFLVTKGDSIRLLSLNQNNTYDKIVDSIPQIMDLIKGMGSSKCKNPENTHRKEDGKDNKKEEDTGKEKTSS >NC_011837.1|WP_081427964.1|1295673_1296276_+|segregation/condensation-protein-B MEENLNEIMYKIGESNSISKDNYFSIIESLLFVSGEPLTLKQIAAIIGCNLEYTRDLINEMAFEYENCSRGIKILNSNDKYSLVTKSENSGYVEKLLKNNLRQSLSRAALETLAIIAYMQPVTRIDIDEIRGVKSDRALMTLMEKKLIEENGRLSVPGRPILYVTTEEFLKYFGLDSIKEIPGIDDLIDNYESVYKSNES >NC_011837.1|WP_012101641.1|1294928_1295693_+|segregation/condensation-protein-A MPLNIKIENFQGPFDLLLHLIKKNKMNIYDIKIHDITEQYIQYINNMKDMDLEVTSEFIVIAASLIEIKSKVLLPKPKLDESAADDEKDPRKQLVDKLLQYKRFKAAAEFFKERALNIGKMYGKMPEIIEVKNKPENVEEILRDTDMEKLHEIYKKLIDLYTNKLNKENTVNKNITVDKFKLEDKMQYIVEILEGKKKIRFSTVVESCSFKIETIITFVALLELVKLRTISIMQYKNFSEIYIERVIEYGGESQ >NC_011837.1|WP_012101640.1|1293738_1294938_+|CCA-tRNA-nucleotidyltransferase MNILKSFTKGEIAIIEAIRDLCIKKGVKAYIVGGAVRDAILKNKIKDIDICVNYNPNSIVTQLKGIKYYKYYKNFQTAAVTFQNGVCIDLIRCRKEYYKRHGDLPKVEPSDIYDDLYRRDFTINSLAYDIVGNSILDIYGGIGDIKNKVLKKIHFNSYREDPTRIFRAVKYCVRYGFYLEDKWEIEKCIKEGIFNTISNDRIMKEIYSLCSEINWIENIRLCNDLKIFNIDGQALEVEYSNCEKDLIFVYKNIDMRILRLFYSLRDKVYVNILIENSILNRKLKNTIKYFSEELHMVINSIKNTLDNYKLYQLLRSMNDYKLIFLSWHYELNYKIYNYINNMSTYKLSLNGNDIIDLGIKEGKSIKKILNGVMKIELNTALKWEKEYLLKNIGEMYKCL >NC_011837.1|WP_012101653.1|1304825_1305467_+|electron-transport-complex-subunit-E MKGLWNIFKKGLVSENPILVLALSLCPALATTSSAVNGLTMGLCVLFVITCNNTVVSIIKKFVNPKVRVPVYITCIATIVTVVELVLEAYAPELYSQLGIYLALVVVFAIILARAETFASKNPVIPSFFDGLGMGCGFTLALVLISIIRELFGAGTVFGIHVMWASYNPALIMILPPGAFILIGYLVSLVKVYNQHVEKVKMKKLEQLSGGEA >NC_011837.1|WP_012101654.1|1305466_1306048_+|RnfABCDGE-type-electron-transport-complex-subunit-A MSAYLTLFISAVIVNNFVLTRFLGLCIFFGVSKNLDASLGMGMAVTSVITLSSMLAWVVYNFVLVPFNLVFLKTVVFVLLIASFVQLLEIIIKKQAPALYNMWGIYLLLIATNCVVLGVPLINAESNYGFVESVVNSIGSGLGFALAIVLMASLREKLRLADVPKPLEGLGVAFILAGMLALSFMGFSGMISL >NC_011837.1|WP_012101655.1|1306063_1306921_+|Fe-S-cluster-domain-containing-protein MQTAIMVLIVMTIIGLLFGLILAYVDKKFAVEVNPLIELVEDVLPKGQCGGCGYAGCKAYAEAVVLDESVSPNLCVPGKEEVAKAVAELTGKSAGDVEAKVAHVRCLGDLSNTVKKYDYKGIKDCTAANLLQGGPKACEYGCLGFGTCVKHCPFDALTMGSKGLPIVDTFKCTGCGSCTIVCPKSVIQLRPLGSKVQVNCNSKDKGAQVRKSCKVGCIGCGLCMKNCSYGAIKLENNLAVVDHHICIEKCSEATCLAKCPTGAIKKITSAMDLQEQSKEEAAANS >NC_011837.1|WP_012101656.1|1306996_1307515_-|Gx-transporter-family-protein MNKTKKLVFLSFLVGMALVIYIIEAQIPVLFPGIKLGLSNTVSLATLILLGWREALLVMLLRTLLGSMFNGTMTAFMFSIAGGILSNLVMIILYKYLKNSMSLWTISICGAIFHNIGQLLIASIIIQDFKIYIYLPVLLISAIITGYFIGWCTKFLMDNLSKIPIFKSFLDS >NC_011837.1|WP_012101657.1|1307639_1308296_-|DUF4397-domain-containing-protein MFICPYCARNFYRAPKFRAVSHIRFLNASPNSPAIDVYLNDRLMFRNLLYKYFSDYVTIPSGTYHIKVFPSGNTVNPLIDKSLFIPPEKIFTLAAINEYPNMDLLSIEDVRHPKIPDKAFIRFGHLSPEAPTLNVVLPNGNTLFSNVSYKQITPYIPVDPGTYTIEARSSSSDERILYVPNIRLRGDRFYTIYAVGNLSKPPELQVLIPLDGNSYIGS >NC_011837.1|WP_012101658.1|1308391_1308859_-|DUF4883-family-protein MKKFLLILIPVIFLAGLSYKLNNEVFNPQKPNNFYYTNLLAKNLTLSSPLKCTMEENNFHDEINLDKDNIVDIKNMLSSLKKKNFISKPKNLPEKSAYRITFTFDKEKLLIDIYNEKYVCIYPWDGKYSMDYIDISDIPVSLNLYYLGKYLFKQY >NC_011837.1|WP_012101659.1|1308969_1309794_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MNYKIIAVDMDGTLLDDERLIPEYNKDMIYKAVKLGVKFVICSGRPPMALKFYSEIIFPDEPVICCNGGVIIGENKNVIKSVPLNKYSLLKVIDILREEKDTYYHFYDDFGLYSEQFRYTTKKFYDINNSLSEKFKMKITIVKNSKTFIKHCRCNITKIVVIDEDVEYLERLRNKIAKVPGITTTKSDLYNIEIVSRGVSKGSALEFLAHYYDIPMEQCIAVGNDENDKSMIKTAGLGVAVFNSREILKKSADYITETDNNSGAVGEVIKKFIL >NC_011837.1|WP_012101661.1|1310217_1311648_+|anthranilate-synthase-component-I MLNLNESEFNLLKNNKDAFPVICKLNGDEITPINIFYNLKGENKIIMESVEFNEQKGRYSFITCNPYMEIKSFKNDIFVEYKNSKFKFHGKIMDFIQKYMDINYNTNSVDIPFIGGAIGYAGYDVIKQYENIKDDNEDDLNIPESYFMFYKNLICYDHLKHRLILIYNVFPEDDISYGEINSYFERLYGQITEKIKVHNISNSSKKAEITSNYTKDEFCRNVEKAKEYIKSGDIFQVVISQRLKCSTEIKAFDIYRKLRYENPSSYLFYMDFKDFQIVGSSPERLVSVYGDRVSTNPIAGTRKRGTSREEDEKLKNELINDEKERAEHVMLVDLGRNDIGKVSEFGTVEVTKFMEVQKYSHIMHLVSEVSGKLKSGISSFDAFISCLPAGTVSGAPKIRAMEIIDEIEDRKRLLYAGAVGYFSYNKNMDTCIAIRTVVIKEGYAYMQAGGGIVYDSDPESEYEESLNKAKALMEVV >NC_011837.1|WP_012101662.1|1311648_1312233_+|aminodeoxychorismate/anthranilate-synthase-component-II MILMIDNYDSFTYNLYQYIGELHEDIVVVRNDEISAEDIEKFENLQGIVISPGPGVPEDSGICIEVIKKYGKDIPILGICLGHQAIAVAYGGDVVRAKEIRHGKTSMVEHVENELFKGIKSPIRAMRYHSLIVDEESIIPTHIFKIAESDDGVLMGIKHSVYPVYGLQFHPESILTECGRGIIKNFLQEVCHVK >NC_011837.1|WP_012101663.1|1312222_1313230_+|anthranilate-phosphoribosyltransferase MLNEAIKEVLSGKDLSESQSEQVMENIMNGQESSALIAGFLIALKMKGESIPEITGCAKAMRNMAVPVKLKSQYAIDTCGTGGDGGRTFNISTAAAIIAASAGVKVAKHGNRAVSSQSGSADVLKELGININLEKSKVEHCIDNVGMGFLFAPSYHSAMKNVAGIRRDLGVRTIFNILGPLTNPAFVKGQVMGVYDRKLLEPAAKTLLNLGCERAMVVHGGDGLDEITTTTVTYVCEVKDGEIRKYTLSPGDFGIKTTFYKNIAGGTARENAAIIMDILKGKTGPERDIVVLNSAAAIYIGKKAEDLKEGILRANELIDSGKAYAKYEEILNYNN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011837_2 | 2298663-2299412 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NC_011837_2
|
11 spacers
spacers of NC_011837_2
>2.1|2298693|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT AAGCAGTAAAGATAAATCTTTAAGGATTAAAAATGG >2.2|2298759|33|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAACCACCTTCTTAACCTTATAAAATTGTGTTC >2.3|2298822|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATACTGCCTGAAAAGCCAAATATCCATAAGCATT >2.4|2298888|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTACCAATATTTTTACCTAAAGTTTTTAATCTT >2.5|2298953|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTAGTAAGAGGACTTAACCATTTTGGCAGCTCT >2.6|2299019|37|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACACTATATTTTTGAATATCACCTTGTAGTATTTTAG >2.7|2299086|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTATCCCCATCAATTCCTCTATTCTTTATAGAT >2.8|2299151|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGCAAAGATTATGGAATTATAAGGAGGAAATTTAA >2.9|2299217|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCCTATATTAATCAACATTTTATTTTCTCATGTT >2.10|2299283|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGTGGTATTAAAACAATCCTGTCTGGTACTCC >2.11|2299347|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAGGATATGCATTTTTATTCTTTTTAATAATTCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011837_2
The CRISPR arrays of NC_011837_2 >merge|NC_011837|2|2298663-2299412|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTTTGTCAAATCTTGTTAAGGTTCAACAAGCAGTAAAGATAAATCTTTAAGGATTAAAAATGGATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACCAACCACCTTCTTAACCTTATAAAATTGTGTTCATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTTATACTGCCTGAAAAGCCAAATATCCATAAGCATTATTTAAATACAATCCTTGTTAAGATTCAACAATTACCAATATTTTTACCTAAAGTTTTTAATCTTATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTTTTTAGTAAGAGGACTTAACCATTTTGGCAGCTCTATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACACACTATATTTTTGAATATCACCTTGTAGTATTTTAGATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTTGTATCCCCATCAATTCCTCTATTCTTTATAGATATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACCAGCAAAGATTATGGAATTATAAGGAGGAAATTTAAATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTTTCCTATATTAATCAACATTTTATTTTCTCATGTTATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACCTTGTGGTATTAAAACAATCCTGTCTGGTACTCCATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACCTAGGATATGCATTTTTATTCTTTTTAATAATTCTTATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC >NC_011837|2|2|2298663-2299412|CRISPRCasFinder TTTTTTTGTCAAATCTTGTTAAGGTTCAAC AAGCAGTAAAGATAAATCTTTAAGGATTAAAAATGG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CAACCACCTTCTTAACCTTATAAAATTGTGTTC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTATACTGCCTGAAAAGCCAAATATCCATAAGCATT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGATTCAAC AATTACCAATATTTTTACCTAAAGTTTTTAATCTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTTTTAGTAAGAGGACTTAACCATTTTGGCAGCTCT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC ACACTATATTTTTGAATATCACCTTGTAGTATTTTAG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTGTATCCCCATCAATTCCTCTATTCTTTATAGAT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CAGCAAAGATTATGGAATTATAAGGAGGAAATTTAA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTTCCTATATTAATCAACATTTTATTTTCTCATGTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CTTGTGGTATTAAAACAATCCTGTCTGGTACTCC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CTAGGATATGCATTTTTATTCTTTTTAATAATTCTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC >NC_011837|2|1|2298663-2299412|CRT TTTTTTTGTCAAATCTTGTTAAGGTTCAAC AAGCAGTAAAGATAAATCTTTAAGGATTAAAAATGG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CAACCACCTTCTTAACCTTATAAAATTGTGTTC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTATACTGCCTGAAAAGCCAAATATCCATAAGCATT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGATTCAAC AATTACCAATATTTTTACCTAAAGTTTTTAATCTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTTTTAGTAAGAGGACTTAACCATTTTGGCAGCTCT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC ACACTATATTTTTGAATATCACCTTGTAGTATTTTAG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTGTATCCCCATCAATTCCTCTATTCTTTATAGAT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CAGCAAAGATTATGGAATTATAAGGAGGAAATTTAA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTTCCTATATTAATCAACATTTTATTTTCTCATGTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CTTGTGGTATTAAAACAATCCTGTCTGGTACTCC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CTAGGATATGCATTTTTATTCTTTTTAATAATTCTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC >NC_011837|2|1|2298729-2299412|PILER-CR ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CAACCACCTTCTTAACCTTATAAAATTGTGTTC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTATACTGCCTGAAAAGCCAAATATCCATAAGCATT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGATTCAAC AATTACCAATATTTTTACCTAAAGTTTTTAATCTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTTTTAGTAAGAGGACTTAACCATTTTGGCAGCTCT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC ACACTATATTTTTGAATATCACCTTGTAGTATTTTAG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTGTATCCCCATCAATTCCTCTATTCTTTATAGAT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CAGCAAAGATTATGGAATTATAAGGAGGAAATTTAA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TTTCCTATATTAATCAACATTTTATTTTCTCATGTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CTTGTGGTATTAAAACAATCCTGTCTGGTACTCC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC CTAGGATATGCATTTTTATTCTTTTTAATAATTCTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC
>NC_011837.1|WP_148204886.1|2297789_2298548_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MDKELNEIQKEIFDKESSEKIISDKIIKTKLKCGRSKILFIHVEVQSYSSGYEVFGERMFRYFYRIWDRFRYKYDDKSEIVAAVIYTYKRERGKDKRYVYKLPELSEDVLVYNFRTMDVEQIELESIRNENPLKLVFKMGKKLLNTGVTDEEICNAKIELAGELKSYDKVKNNEQVKVLVDFLEYLFLIEDSELENKYKQLKKYQGGVFNMSVDEIRKIHYTQKGREEGRKEEKIKIAKSLLDILDIKIISD >NC_011837.1|WP_012102655.1|2296552_2297404_-|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MDIVFILKAIIIGIVEGITEFIPVSSTGHMILVGWAIGFNGEFAKMFEVVIQLGAIMAVVVLYWGKIKDSIIEFFTFIGTKGEKGKTGFRFGINIITASIPMGIVGLIFYSEIKSKFTPEAVIAGFIAGGLLLLAVEKIHANRKFRVKSIDSITSIQAFKVGLLQILAVWPGMSRSASTIMGGWIAGLSTPIAAEFSFFIAIPAMIGTTGKDLFEFNYSIMSTTLWISLILGFVVSFIVALIVMKKFIDYLKRKPMKIFAIYRIIAGLLLGILVFTGVIKLTV >NC_011837.1|WP_012102653.1|2294910_2296281_-|tetratricopeptide-repeat-protein MNTYYDILEIGQDANSAQIKKSYFKMVRKYPSERFAKKSMEIRKAYEILSNEKTRKEYDSFINIPGNAKERFDASNELFKEGKNQKAIKILEELHKEFPSILVIQSFLGEVCIENNNNGKAIKIFEELVKAEPDNASFAGYLAKTYLMRGWHKKAIKSFEKAIELDEDNISLWMGLSQAHMEGNNIKEAKEVLYELIERKENENFIISAYLAIFIIDLKEGNFESMKENLEKLSEEVIKQEDEKEHVAWILLMISKRMVEAEMFGLAEEILEKAEKITPGNEEIRKLKFKVDRFCKFQEELLSLEKDEEYHEDFVSFVSSKILPEESMGSELYIRGAEHQFLTHINKYRKYVISLSKKYSNLYEELKDFFEKAFNGSERNKMIKEHEKYFKSRGGRLEMALEGIGGEKLFNNVGNNGDCDLWQGIQDTYIREEPKVGRNDPCPCGSGKKYKKCCGK >NC_011837.1|WP_012102652.1|2293234_2294824_+|asparagine-synthase-B MCTIMCYTGTDMKHGKFAEALQRTESRGPDMMEILTLPSGILGFQRLSIMDLSFSGMQPFTRKMDAAICNGEIYGFREIKKDLIKKGHKFISDSDCEILLPMYYEYGLDMFSKLDAEFATVIYDGKKDSYIAARDPIGIRPLFYGYSESGKIIFASEAKNLIGLTDKIMPFPPGHYYTDGKFTCYCDIAAKESDYCKDDLDVIFNKIHDKLVAAVKKRMDADAPVGFLLSGGLDSSLVCAIAQKMNPKKPIRTFSVGMTEDAIDLKYAKEVADYIHSDHTVVYMTKEEVLNSLDEVIKILGTYDITTIRASMGMYLICKKIHEISDIRVLLTGEISDELFGYKYTDFAPNAEEFQKESQKRIRELYMYDVLRADRCISSNSLEARVPFGDLDFVKYVMSIDPEKKLNKYNMGKYLLRRSFEGSYLPHDILYREKAAFSDAVGHSMVDYLKEYAETFYSDEEFEKICENYEYHARPFTKESLLYREIFEKYYSGQAEMIVDFWMPNKEWEGCDVNDPSARVLSNYGASGK >NC_011837.1|WP_012102651.1|2290889_2292584_+|M3-family-oligoendopeptidase MKFSEFKYERPDYDEVKKSINSLVDELKSANRCEKQLECINHINNIRNHLQTVGTLAQIRHSINTKDNYYDKEKSYWDKYSPLYDELDSTFYKELVQSKFRKELEEKLGRQFFTLAEFSLKSFSPKVIEDLQLENKLSSEYTKLLASAKIPFMGETRNLSGLTPFIQSKDRQIRKNASDAKYKFFTDHEDEIDKIYDDLVKVRTKIAQKLGFKSFVELGYIRMKRSDYTPEMVAKFRKQVEKYLVPAASKLYDRQIKRLGLETLTYYDEKFEFTTGNAKPKGSPQWIVSNASKMYSELSAETGEFFSFMLEGELLDLVTKENKAGGGYCTYIPEYKAPFIFSNFNGTSGDVDVLTHEAGHAFQTYLSRWIEIPECIFPTYESCEIHSMSMEFFTWPWMNLFFQEDANKYRFAHLESAVKFIPYGVTVDEFQHYVYENPEATPEDRKKAWRNIEKKYLPHKDYTGCDFLENGAWWFQQSHIFNVPFYYIDYTLAQICALQFWKKAMNNRKSAWEDYIRICKVGGTKSFLELVEIANLKSPFHDGCISSIIKAINNWFNSIDDKKL >NC_011837.1|WP_012102650.1|2290194_2290719_-|peptidylprolyl-isomerase MKNPIVTIEMENGKFIKIELYPDIAPNTVNNFISLAEKGFYNGTIFHRVIPGFMIQGGDPEGTGMGGPGYSIKGEFSSNNFKNDLKHEKGVISMARTMAPDSAGSQFFIMANNAPHLDGQYAAFGKVIEGIEEVYKIVSQKRDYNDKPYEDQRMKSLTVENFDKKYDEPQKVND >NC_011837.1|WP_012620631.1|2289363_2289984_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MMNNKNTFKENSRMNFDKQAENYDDGFDGRFVRVMYDEIIKRIDKFQNGILLDVGCGTGNILSRLYENKKLHLCGLDISNKMIEVARRNLNDDILLKVGDAEFIPWPDNTFDIILCNASFHHYPNPQKVLLEMKRVVKADGKLIIGDPTAPPLIRQVLNFIFGICHNGDYKIYSLKEMKKLLRRCGFRPFEFKKINYKSFVISASA >NC_011837.1|WP_012102648.1|2288880_2289342_-|MarR-family-transcriptional-regulator MDKKYEKQIRELSSIWHSMIMVSDYKNAESRFSRIQGLSTTEIGVLRIIFEKEDVIIRDIVEVLNIPKSTLTSMINRLEKRNLIKRTISSRDKRSYRLVLTEDGILAQKEHVELEEKVYNKIMGCLDTWEEREELLKLMRKIVRNFTGENSIK >NC_011837.1|WP_012102647.1|2288350_2288884_-|CDP-alcohol-phosphatidyltransferase-family-protein MKSIPNIISILRMVLSVILLFLKPFSPLFWIVYSICGFSDIVDGYIARKTNSTTKLGTILDSIGDIVFMSSALIALLPIIRIPMKILIWIIWIFFIRVISLLIVYLKYHTFAILHTYANKITGLLLFCFPYLYRFLDINIIGYVICVIASIAAVEELIIHIKSRELSRDIIGIFSKF >NC_011837.1|WP_012102646.1|2287129_2288239_-|metallophosphoesterase MDYKLKEKVKAPLQKEISREAKREGIILDLSDLHYILDLDEKNEAYLLIIDLKKVYFDSPENSLSLNDIDYIVFSGDFVEGGNSEASFEKAFHFIDILSKQLNVPYKNIIIVPGNHDLSWNVTMNSYHLAIGTPRPKDKVVTNIGTDLFYLRRDSKEWYKKFTNYSKYLYERLYKVPFPENPKEQLKVILGDFIDNKKLAFFMLNTSAQIDHFHRKITYFDTEGLIKASRQLPQNNVIKIAVGHHPVNIISGYDNNIPFANVLQNENFKIYLHGHVHRSISLDYLNPQNINPNMIMIGAGALSVGKNGLWPGVPGRYNIIKISKTDIPNKILVSVNTRQREYIGNYWQPAYIYYEDNGKRLTNVWSNII >NC_011837.1|WP_012102658.1|2299619_2300456_-|DNA-adenine-methylase MKYDKLVEPVVKWAGGKRQLLPELKKYIPKNISTYYEPFLGGAAVLFDIQPKKAVVSDINEELINLYMAIRDNVDELIEDLKKHKNTPDYFYKIRGLDRETSIYSKLTKVERASRIHYLNKTCYNGLFRVNMAGQFNSPFGNYKNPNITNEITIRAVSKYLNEANIKLKYCDYEETLKSIRKGAFVYFDPPYDPVSNSSNFTGYAKGGFNRDEQWRLRNVCDKLNSKGIKFLLSNSSTDFILDLYKDYNTKIIQAKRFINSNGNKRGEIDEVLVRNYG >NC_011837.1|WP_172634797.1|2300686_2300899_-|HAMP-domain-containing-protein MIQEVEEGDFSVKTVIKGNNEIAYITKSFNDMIGNISKLIAGVKSSIQNISRSIESLRKMAKDLEKNAFN >NC_011837.1|WP_041700814.1|2301094_2301292_-|hypothetical-protein MYLFKSFQDSHKSAAFTYLGPNKILLGNKKLVTWLDSTNELAKSPDWLAEKRGWYKDAVEKDGQK >NC_011837.1|WP_012620634.1|2301671_2303456_+|DUF2207-domain-containing-protein MKKFLLGLFVLFFIISVNPLNVSASSEEIALSKFNIETTIKEDGSIDMVELITYNFKKKFNGAYRDISIRNTDGIYDIKVSFISEAGQETPFRKVTDAKNGDNNVFEISKQNKDLYRLKIYSPSKNEEKTFKIVYTMKNVATKYKDTAELFYEYWSDYNETKIDNLKIHINLPYNMKNQDIKAYYHTVSAGNISVKNGTVEYIFPHINSKELVEARVLFPASSIPLSPKTKNENALNRILNEEADYREKQQQKIALALARKKTFNYVSIISVLFFLIFILIVWRKFRNNNQDIYSIYSPPELPEECTPAVAAYLVNRTATGRTIYATLLDLWRKGYLTIKKAEPENKKDKINFSINKVEKDSGELLNHERYFMNWLFDKLGNGKSVTTSSIKKANKKSPFYHDSQEWSNLIREEVKSRNYYDKKANCAGIWLIAFSIIGIIISIVSLAFGAGMGILSLLASVITMICGVYYCVKKSPKGQSRYNNWMKFIKYIKNTDFTYDLNTHYIESYIPYAEALNIKKESMSNLTASFHNPSQNMGWIYYYLLFDSMNLNRKEQFSYYIYASFNTGSSGSSSSGSSSSSSGSSGGGGAGGF >NC_011837.1|WP_081427981.1|2303546_2303861_-|TfoX/Sxy-family-DNA-transformation-protein MGKEIERQLNEVGIFTYDELKDIGAEQAWLKIQEIDASACIHRLLALDRTPALFDIICCKRHRRRWNKACVRSLWNYMNFIYLRKLNLLIYDKPVDSKREENKR >NC_011837.1|WP_012102662.1|2303905_2305099_-|MFS-transporter MNQHADINIHKEVKMSRFLIVLMSIACGVSVANLYYSQPLLEELSRFFNVSSSMIGISAMLIQIGYALGLISLVPLGDIKERKGLIITMLFCSAISLISLSFASNIYWLLGSSLLVGLTSIIPMLIVPLAAHLANPVERGKVIGTVMSGLLIGILVSRVFSGIIGSTLGWQVVYRIAAGMMGLLIIIFNLWLPKSVPDTSMGYGKLLKSLIGLLKNQPVLRESSLIGAMMFGTFSIFWTTLSFLLKSPTYNLGAQAAGMFGLVGVLGALAASIVGRIADKKSPQFTLTIAIILSLLSYICFLIFGYQIWGLVIGVVLLDLGIQSGQISNQARINALDAAARSRNNAVYMTFYFCGGALGSLLGTLLWGLSGWIGVCAVGIIFQIIAALTHVLSIKRR >NC_011837.1|WP_012102663.1|2305128_2306031_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MLYIVCILLVITILCVIKYYFTRMNIHALISQTNKLNKLISESNEQIKLAAPDKTTEKLAIEINHLVDCYKALQLKNIKEKQQYKKILANFSHDLRTPLTSIMGYIDIILHLDLSEKDKEKYLETVQYKLKTLNNLVDSLYDLSLIDAKEYPVQLNPHSLYQLLCDSLLLFYQDFEDRGILLQLSLDEKVPLVLLDEKITNRVLLNLLQNVIRYAKSYCKVDLGVTDEYVNISISNDCEPLSEEDVLQLFNRTYKADSNRSKYSSGLGLAIAKELMELQLSTINADYHDNTLTFILCFKR >NC_011837.1|WP_012102664.1|2306047_2306800_-|hypothetical-protein MLNLIRSEFYRLIRSKPYYGLIIVSTFLVMAAAGVLQHFRFKEPTFPYGTRMFYYSNVLGMPTLIIILCLLVILILTRKSKTKMCAAVSFGHSRQAVFWAKLITLSFGVIIMGTIILSVTILSGNVIFDLANNSTLGQFLIAFSNIFPIVASSFILGYVLAVNGVSEILNLLILLFIYRILGVSINTLVGRVSALKTISKWTPATLFDNNLVHYMSNNVYFDVKCWVLGLMIIFISLIIGQTIFKKKDLA >NC_011837.1|WP_012102665.1|2306783_2307710_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKTPILKTTNLEKRYKDQVALESTNFELYKGEICAIIGKNGAGKSTLFKMIAEEIFPTKGEITLFGEPYGKHNSRRRMGVMIETDVFFDNFNAHQNLEYYRLLRGIPEKAVIGKVLNRVGLAEHNRKKFSQYSLGMKQRLSLALALLSSPDFLLLDEPTNGLDAEGMVEMRQLFLKLNQEHQITILISSHILSQLQSIATRFVFLNKGKVVQDLSRKELLGMSQQFIFLRVNDAKKACFILENHFVDMDYRVLAGEQLEIYNYIPQRQKINRLLNEGNVDILEMTVKSKNLEEYFLGLVGGDENVESN >NC_011837.1|WP_012102666.1|2307796_2308471_-|response-regulator-transcription-factor MKQIEILIVEDDNDINKILELIVKEQGYKATCCFSGTEAQLRLQQQSFNLILLDIMLPGLTGEELLREIRKQSSIPVIIISAKSIIEDKVNLLKLGADDYMVKPFAREEVAARIEVQLRKNYLQQTGDCLSWKELTLDESQHRVMVKKSELNLTNVEFDILKIMLRHPKQVFSKAKLYELLWNDIYQGNDNSISVHVSNIRKKISAITSEEYIKTIWGIGFSLV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011837_3 | 2754450-2755268 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_011837_3
|
12 spacers
spacers of NC_011837_3
>3.1|2754480|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT GAGTTTCTTACCAATGCTCCAGAATATTGCAATGCA >3.2|2754546|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATATGCTATAGACGCAAATTCCCTTATACCTTTC >3.3|2754611|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATAAAAGAATACATAAAACAAAAGAAGATAGTTGT >3.4|2754677|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATGTACTGGTAATAGATAACAAACAAGCTGTAGA >3.5|2754743|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGATAAATAGATGAATCAATATGCATTACTTATTT >3.6|2754808|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTTTACGAATAACAATATAATTTCCTCTATCTAAA >3.7|2754874|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGATAGCTGCGGCGCTAGGGCCATTACTTTTAATTT >3.8|2754940|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTATAAATCACTTTGTATCACCAACACTCCTTTCT >3.9|2755006|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTTTCATCTAATTCAAATTCATCTGGATAAATCA >3.10|2755072|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTGCAGAGGGAATTATGTATATAGCATACCTTT >3.11|2755137|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCCGAGGAAGACCAATGTCCCCTTCGGTATTTTG >3.12|2755203|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATTTACACAGTTCTACTTCTATATTGTTAAGATT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011837_3
The CRISPR arrays of NC_011837_3 >merge|NC_011837|3|2754450-2755268|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCTAAATATAAACCTTGTTAAGGTTCAACGAGTTTCTTACCAATGCTCCAGAATATTGCAATGCAATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTATATGCTATAGACGCAAATTCCCTTATACCTTTCATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTATAAAAGAATACATAAAACAAAAGAAGATAGTTGTATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTAATGTACTGGTAATAGATAACAAACAAGCTGTAGAATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACGGATAAATAGATGAATCAATATGCATTACTTATTTATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACCCTTTACGAATAACAATATAATTTCCTCTATCTAAAATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACGGATAGCTGCGGCGCTAGGGCCATTACTTTTAATTTATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACCTTATAAATCACTTTGTATCACCAACACTCCTTTCTATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACTATTTTCATCTAATTCAAATTCATCTGGATAAATCAATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACTATTGCAGAGGGAATTATGTATATAGCATACCTTTATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACTTTCCGAGGAAGACCAATGTCCCCTTCGGTATTTTGATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACATATTTACACAGTTCTACTTCTATATTGTTAAGATTATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC >NC_011837|3|3|2754450-2755268|CRISPRCasFinder ATCTAAATATAAACCTTGTTAAGGTTCAAC GAGTTTCTTACCAATGCTCCAGAATATTGCAATGCA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TATATGCTATAGACGCAAATTCCCTTATACCTTTC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TATAAAAGAATACATAAAACAAAAGAAGATAGTTGT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TAATGTACTGGTAATAGATAACAAACAAGCTGTAGA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC GGATAAATAGATGAATCAATATGCATTACTTATTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CCTTTACGAATAACAATATAATTTCCTCTATCTAAA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC GGATAGCTGCGGCGCTAGGGCCATTACTTTTAATTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CTTATAAATCACTTTGTATCACCAACACTCCTTTCT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TATTTTCATCTAATTCAAATTCATCTGGATAAATCA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TATTGCAGAGGGAATTATGTATATAGCATACCTTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TTTCCGAGGAAGACCAATGTCCCCTTCGGTATTTTG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC ATATTTACACAGTTCTACTTCTATATTGTTAAGATT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC >NC_011837|3|2|2754450-2755268|CRT ATCTAAATATAAACCTTGTTAAGGTTCAAC GAGTTTCTTACCAATGCTCCAGAATATTGCAATGCA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TATATGCTATAGACGCAAATTCCCTTATACCTTTC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TATAAAAGAATACATAAAACAAAAGAAGATAGTTGT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TAATGTACTGGTAATAGATAACAAACAAGCTGTAGA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC GGATAAATAGATGAATCAATATGCATTACTTATTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CCTTTACGAATAACAATATAATTTCCTCTATCTAAA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC GGATAGCTGCGGCGCTAGGGCCATTACTTTTAATTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CTTATAAATCACTTTGTATCACCAACACTCCTTTCT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TATTTTCATCTAATTCAAATTCATCTGGATAAATCA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TATTGCAGAGGGAATTATGTATATAGCATACCTTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TTTCCGAGGAAGACCAATGTCCCCTTCGGTATTTTG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC ATATTTACACAGTTCTACTTCTATATTGTTAAGATT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC >NC_011837|3|2|2754516-2755268|PILER-CR ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TATATGCTATAGACGCAAATTCCCTTATACCTTTC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TATAAAAGAATACATAAAACAAAAGAAGATAGTTGT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC TAATGTACTGGTAATAGATAACAAACAAGCTGTAGA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC GGATAAATAGATGAATCAATATGCATTACTTATTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CCTTTACGAATAACAATATAATTTCCTCTATCTAAA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC GGATAGCTGCGGCGCTAGGGCCATTACTTTTAATTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CTTATAAATCACTTTGTATCACCAACACTCCTTTCT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TATTTTCATCTAATTCAAATTCATCTGGATAAATCA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TATTGCAGAGGGAATTATGTATATAGCATACCTTT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TTTCCGAGGAAGACCAATGTCCCCTTCGGTATTTTG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC ATATTTACACAGTTCTACTTCTATATTGTTAAGATT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC
>NC_011837.1|WP_012103090.1|2753935_2754196_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MKLNIRRLTIIPLNLEQFKVLFDVIYMTEVVKSMCQWALSDKKVLRVIAGTDKNNIASQRVLKKCSFIIYDEDHENYLWQLNNKLS >NC_011837.1|WP_012103089.1|2752470_2753643_-|Ig-like-domain-containing-protein MKKITGSNLFTIFLAFIFVFMSTISISSVKADEISSVNMSQTSSSINYLALGDSISCGMSADSGKGYVDLFHKHLETLGRYGEVNLQNLSVSGDKSSDLLTKFQTDEYKEAVKDAKIITISIGGNNLLSPVIEAVCQAFGVNKDDNPNYQTELALAVASNPNKDAILAGIVSSGTLLQSLNSGILQFQSDFPKIIKTIKEIAPESEIYVLTLYNPFNSKDPMYSAFDSIINRINKTIKIQTNNCNIVDVYEKLKTTSGAVNFSLSNMMIDPHPTTIGHAAIYDLLVDAKVKKDGLVAADKKWTITFTGEVEFDDSTKDAIIVTGSKGNEVNTTLELGQNNKSIIVYPPTVGYTPGESYTLTVRKQCHDKNGKQMKQDRTLNFSIEADTAD >NC_011837.1|WP_012103088.1|2751881_2752118_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKNRLKELRESLGLTQEQLGKLVGVSRQAINAIETEKFEPSIWLAYDISNIFNCFIEEVFLFKKSKRKSRAQQSRGVV >NC_011837.1|WP_012103087.1|2751428_2751881_-|peptide-deformylase MALRQIRLFGDDILRKKSKEVKAVDNKIRQILNDMADTMYDTENGGGLAAPQIGILKRLAVIDMGQGLIKLVNPKIIKCAGEQEVIEGCLSIPNVFGKLKRPAKVIIEALNEEGSKIILKGTKDLAKCFCHEIDHLKGILFTDLVTEYMK >NC_011837.1|WP_012620767.1|2751073_2751280_+|TOBE-domain-containing-protein MTLSARNQLKGKVTKITQGDVVSQILVDTGCKNLVSSVITTASLKDLEIKVGSEVKAVIKSTDAMIMK >NC_011837.1|WP_012103085.1|2749349_2750225_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MNFAQQLVNGLALGGVYALIAIGYTMVYGIVKLMNFAHGDIYMAGAFFGFLAVKNLNSGFIPTLIIAMVGSALLGIIIEKIAYKPLRNSSRITLFITSMGISLLLENGFRVIFGPNPRPFPELLKVKLYKIGDFQINNLQIVTLLICFILVILLQIIVYRTKMGKAMRAASFDTEATELMGINVNNTISLTFAIGSALAAAAGVLIGMSYPKIDPYMGMIPGLKAFIAAVVGGIGLIPGAMVGGIVLGISEIFTKAFISTKLSDGIAYIILIIILIFKPSGLLGKKVNEKV >NC_011837.1|WP_012103084.1|2748361_2749336_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MKRRKNILFILAAVLIVFGLIQTLISLEMIDEYIVQILIIIGINIILAVSLNMIVGYTGQLALGHAGFMSIGGYTAAILTLKLDAPFFLVLIAGGLMAAFFGVIIGIPTLRLKGDYLAITTLGFGEIIRIAIVNSNTLGGAEGLAGIPKKTSFAMVFFITILIIIIAYNIKKSSYGRAMLSIREDELASSSIGINTTKYKMIAFVTASFFAGIAGVLYAHYFMFLDPKSFDYLKSFDIVTYVVFGGMGSISGCILSTAILTSLPEILRPVADYRMVIYSAALVALMIFRPEGVFGMKEISFKKIVSSAKKKISHKKEGKYDVPA >NC_011837.1|WP_012103083.1|2747604_2748375_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSLLSAKDLTIKFGGLTAVSDFNLDIDENEIVGLIGPNGAGKTTVFNMLTGVYQPTDGYIEILGRKVINLKPHELAKKHIARTFQNIRLFKHMSVLDNVKISFSYLDKYNFWQCILRMPKYYREEKFMDENAERLLKIFGLLDKKDELAMNLPYGQQRKLEIVRALATEPKVLLLDEPAAGMNPQETLNLMELIKWVRDEFKISILLIEHDMKLVMGICERLVVLDHGQMIAKGSPQEIKKNPKVISAYLGEEVKI >NC_011837.1|WP_012103082.1|2746902_2747604_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKLNNVNLYYGVIHALKDISLEVEEGEIVTLIGANGAGKTSILRAISGLNPCRSGEVIFKGKSLNKVPAYKIVSRGISHVLEGRRVFSNLTVFENLQLGAYIRKDKAGIKKDYETIFEVFPILKERKEQPAGTLSGGEQQMLAIARALMVKPQLLLMDEPSMGLAPIIVQQIFNIIKEINEKGTTILLVEQNANMALSIASKAYVLETGRIVLKGSAGELLVNESVKSAYLG >NC_011837.1|WP_012103081.1|2745690_2746827_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MLKKFLSISMALVLGSVVLAGCGKQSESEEIKLGAVFPLTGDVSVMGQACKNALQMLEEETNASGGINGKKVKFYFEDDENKPSNSANAIQKLINNNKVVGVVGSYASKCSISMGPIAASNKIPMISVSTSPKVTKNGGEYVFTSTFNDTFQGTIIADIAAKDVKAKTAAVLYDVGNDYDKGLNEFFTTNFEKSGGKVLASLTFNAGDQDFSAQLTNIKKLNPDVLVIPDYYGTVALIAKQARNLGITSTFIGGDGWDSPALFEIAGDAVNGSYFSNFFSTGDTTPAYVKFKENYEKKYNKAPDAISASSYNAGSLLIAAVKEAKSTEGDKIKDALKNISFEGVAGTTKYDSNRNAIMGGDVIKIENQKQIFVRKVSQ >NC_011837.1|WP_148204824.1|2755679_2756633_+|IS3-family-transposase MKPSIKEKVEIAKKYIEQGYNAVFVLKVVKLGRSTYYYNLSVEGKEKTRPKGGKPKGYSINRDGEKVCDDQIKEFILEAIDGDAINYGYRKITYHLRKYCNLVINHKKVYRLCKELRILKDQRIIRTKIKRNIAINRTITGSNQLWEMDIKYGYIEGEDKFFYLLNLIDIFDRSIIDYHMGLHCEAKDAAALLRKCLIRRNLFEEDSKKPVIRTDNGPQFISHKFDECCEELKIEHERIPVKTPNKNAHVESFHRILEDECLKINEFQSYGEAYKIVNEFMEFYNNRRLHSSLRFMAPHEFYNLYFEENLTNIQIRV >NC_011837.1|WP_012103091.1|2757296_2757581_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MGKNFNFNYAFVFYDVNEKRVNKVFKICKKYFHHHQNSVFRGAITPSKLIKLKSELNKIVQDKDFVTIIKLINDSCFDEETLGINEKNTENLIL >NC_011837.1|WP_012103092.1|2757595_2758600_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MARGVKYLMSMGELKRKDNSIVFHNDKGNSYLPVEAVRELYCMNEITVNSKFLDFAAKAGIVIHFFNYYGYYSGTFYPKKNLVSGRVIIKQVEAFSNNRDNIAKSFVQGIADNIYEVLYHYYRHDKKEVRSTLDWIKVKLPEYMKYDDLGIKHILRIEGEIWRRFYENFKYILPEDFVLDKRVKRPPDNPINALISFGNSILYSKTVSEIYNTHLNQTISYLHEPSEGRFSLSLDLSEVFKPIIVYRTIFELVNTKQIQVNKHFDKKYNYCLLNEKGKMIFVQAIEERFESVFNHKKLKRKISYKTAIRLDGYKLKKHVVEGEDFIPFNLKNMM >NC_011837.1|WP_012103094.1|2758626_2759121_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKINGTLINYYFHCKRQCWLHGNRMNMEDNSEDVHIGKAIHELKLEGKKDTEISIDNVKIDKITKDYLVEIKKSDADVEATKWQVIFYLYILKNKGIERQGKIEFQEKNKQKNKIIYVELTEENELELRQLIGDIEKLLEKEVPPKIEKVKGCRKCAYYEYCYI >NC_011837.1|WP_012103095.1|2759380_2761963_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFDRVKLFDFQSNVDNISHMYAHRDKSNKKRKEKLLEHVNLTYEYMNFICAEKNLNNVFQNFQDKILISKNSDVIILWKEMMVNTIYMHDVGKINPSFQYNKMLNKLYEDNSDGGSEHSLLSSYIYVSYFNNRIKDMEFELKDSLYLKYFMYLNGYIISKHHGYLDNMGNYKLKLEDFQEDCDKDEYYPDLTMTTLRESVIRNSFNNSKEYLDECIRHNNELEFSIYIYSKFLFSLLTASDYYATSEFMSGEKVDSLGIINDDLKDRFNEDIDSYSTFKSIREYSNNPVKDGQYISINQLRSEITIESEKSYRDNRDKNIYYLEAPTGGGKTLTSINLAKLILNSNSNINKLFYVFPFNTLVEQTEIEFMKIFGNDSSIKENIAVINSITPIKTEDKNEECNEVMDLNTKKKWNYAKAFINRIFINYPFVITTHINLFNSFFGTSREEVFPLVNLCNSVIILDEIQSYKNSIWKEIINFLNIYSEILNVKIIIMSATLPRLNKLVHNCSDNFVYLIKNREYYFKNPFFKNRVKFEIIDIGEEQEEQFENLLEDIEKESKSNNKILIEFIFKKSADKFFDYMNRNFSKKYLREVVIMTSDDNKSDRNKVIKKAKEINKKIIIVATQIIEAGIDIDMDLGYKNISILDAEEQFMGRINRSCFNEGRVKFFKMDDCKVIYKKDVRREAELTLSSEEIQKLLEEKNFEKYYEKVIAKIERNKKELNENGYGHFLKIVKDLNFKEIGEYMKLIEDDNQHKYTIFLSRRIEDEKNNVLLGDEIWKEYKSLLFDNKMDYSEKKVRLSRVNSKVNYFIYKVKKIPEVYQELLGDIYYIADGEKYIVDGRFNQEIFIGETANKANLFM >NC_011837.1|WP_012103096.1|2761981_2762722_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAVRFKLSGRTAFFKKPDVNTYYYFTYGNIHKIALLGIIGSVLGLPGYNSQSRDFKNNIYPEFYNRLKDSKVAVVMLNHQGYITKKIQTFNNSVGYASLEAGGNLVVKEQWLQEPKWMVYVKVDEITEKFAHMLLHKKAIFLPYLGKNDHFADITEIKEVELEKSENYIKINSLFESRYFQVEKYQEEEDDTAWKYMEYLPVELDEELNQYRFEHFTATNMRVKLNDKNVNIYRDLDEKNNLYFF >NC_011837.1|WP_012103097.1|2762724_2763654_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MNRIYGVIGIKAIMANWNADFSGYPKTIGDGSIFGSDKALKYSIKKYWDDLGEKILYIKSFKTDKDKIRPRSLEERYNQVFDTTLTKKDKSEDVIKNLFSTLDVKSFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNVHKPSNSEEQQILSPFRSDKKSNTKEEAKEANQSTLGTKIVSDEAHYLYPFYINPISYKDYVQMGLTDGYTEEDYKKFKEGALIGATALNTNAKAGCENEFALFVETDEKTYLPNLTQFMDFDKVDGKCILKLNLDQVLEGIKDSIKNIEIYYNDYKLKVENMPQGATVFNIFTRKEV >NC_011837.1|WP_012103098.1|2763654_2765424_-|hypothetical-protein MINEIYDIFSREYVEKGEGLVVDKHLLAPGDYIKFTLEDTWNSIQIFSVDKKTDNSLEVYKEFVRRDYLSRLVSMNKPIDPNKIIHSNNIYTFYVKKENLHQSKGKLSSKVIEEYYNILKNPEVKYKSKSKSRKLYLNIEEKYGKPDIELIENIQSWVQKNIMEIAKKLDLNKTYLKLFYDTNLNNYEKESERYIIPNIYNSTDYNVTINKKVYGLSDFNMGLNSKKPYLENKTRKSKLPMLVDSEKILIEKKLFDYLMNYASEGRNYIYAQQDCVDGIEAKENKKSDFKGYFFRVNKGKEVEIADYDSITDYRYKFKRAIKITPILKQGFGKEFILIRGNMKNISELSDKVNEVFFNKYLKSNFFTEAKDIKLNDSKVKESLLKYRYGFYTWFYKGEELLVKGFWNKMTLDLLCNSIDNGNANKAINQFNLRHTLLDYFNKESRGENMANTIKYIRKNVDEKINIKEDKDYKVEIEEVGEYYFCIGQLLQYFYSLNKSSSKNFSFLSPVLNASDDKTVKEKLRRLFIKYSYAIKSSFRFSNMYYMILAYSSENEVDKDSIIAGFLCPSLIYKKSEEDSDDENKNEEES >NC_011837.1|WP_012103099.1|2765440_2766151_-|hypothetical-protein MEVYEINVKIYTLEDIFKEASLELLSKLLDQSFYKNERMKEFHTENRIKNYCFNNLYPLASNNEMYKKGEIYNFQVRCIGEDLINHFEKFLPNEYTSGIKVLTCNIKKIPKRTIERIYSITPLIIKISDEDKTQYWRNIHNESDFFEYMRNSTIKKYELVTGEIVDSNLQIFNYERIDNRKPIATKFKDKSILGDKVTLTIDTSEKAQNIAYTILGTGLADMCPRGYGFMNYQYVK >NC_011837.1|WP_172634766.1|2768392_2769553_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein MDKLELLNIIKSGENSYIEFKEEGIKAKELAEEIVAFANSEGGIILIGISDDGNIKGVQDKNIEEKIMNICRNNCIPNIIPIYEDIELKGLKIAIVSIPKGLNKPYYTTDHKYYVRVGTTKRIASREELMRLFQANGSIHFDISPVYNTSIRDLNLDIIRDYFSKYNTFDLYEEDNDSVERILINADILKEADGKIVCSAGGLLIFGKNVENIMVQNGISFAHFRGDEITDKLIDKKIICGRLQDIAEQTLVVLKNNMKNPSIIKELKRKEEEEYPILVLREAIINALVHRNYSILGSKIRIFMFDNRIEFHSPGKLPNTVTIEKMKIGVSYARNPFLVKYMENMRYIDQLGRGVPMILKTMKDLGAREPLLQESGEEFVLTVYKK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011837_4 | 2756697-2757118 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_011837_4
|
6 spacers
spacers of NC_011837_4
>4.1|2756727|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTACATAGTTACTAGGGTTGCCCCGTTTATGG >4.2|2756791|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATCTGCAAACTCTCCTAAAACTGCGGTTGTGTCC >4.3|2756857|35|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCGCAAAGTTCTTTTCAAACATCTCAAGAGCCTG >4.4|2756922|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGAATTAACTACAAATATAACGTTGTCTCTTATG >4.5|2756988|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAAGGATTTAATAGAAGAAATACATAATTTAGA >4.6|2757052|37|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTAGTTGCTGTAAGAGGTGCCATATCAATATTAGGT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011837_4
The CRISPR arrays of NC_011837_4 >merge|NC_011837|4|2756697-2757118|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACTTGTACATAGTTACTAGGGTTGCCCCGTTTATGGATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACGCATCTGCAAACTCTCCTAAAACTGCGGTTGTGTCCATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACCTCGCAAAGTTCTTTTCAAACATCTCAAGAGCCTGATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACTCTGAATTAACTACAAATATAACGTTGTCTCTTATGATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACCCAAGGATTTAATAGAAGAAATACATAATTTAGAATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAACAGTAGTTGCTGTAAGAGGTGCCATATCAATATTAGGTATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC >NC_011837|4|3|2756697-2757118|PILER-CR ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TTGTACATAGTTACTAGGGTTGCCCCGTTTATGG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC GCATCTGCAAACTCTCCTAAAACTGCGGTTGTGTCC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CTCGCAAAGTTCTTTTCAAACATCTCAAGAGCCTG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TCTGAATTAACTACAAATATAACGTTGTCTCTTATG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CCAAGGATTTAATAGAAGAAATACATAATTTAGA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC AGTAGTTGCTGTAAGAGGTGCCATATCAATATTAGGT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC >NC_011837|4|4|2756697-2757118|CRISPRCasFinder ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TTGTACATAGTTACTAGGGTTGCCCCGTTTATGG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC GCATCTGCAAACTCTCCTAAAACTGCGGTTGTGTCC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CTCGCAAAGTTCTTTTCAAACATCTCAAGAGCCTG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TCTGAATTAACTACAAATATAACGTTGTCTCTTATG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CCAAGGATTTAATAGAAGAAATACATAATTTAGA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC AGTAGTTGCTGTAAGAGGTGCCATATCAATATTAGGT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC >NC_011837|4|3|2756697-2757118|CRT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TTGTACATAGTTACTAGGGTTGCCCCGTTTATGG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC GCATCTGCAAACTCTCCTAAAACTGCGGTTGTGTCC ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CTCGCAAAGTTCTTTTCAAACATCTCAAGAGCCTG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC TCTGAATTAACTACAAATATAACGTTGTCTCTTATG ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC CCAAGGATTTAATAGAAGAAATACATAATTTAGA ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC AGTAGTTGCTGTAAGAGGTGCCATATCAATATTAGGT ATTTAAATACAATCCTTGTTAAAGTTCAAC
>NC_011837.1|WP_148204824.1|2755679_2756633_+|IS3-family-transposase MKPSIKEKVEIAKKYIEQGYNAVFVLKVVKLGRSTYYYNLSVEGKEKTRPKGGKPKGYSINRDGEKVCDDQIKEFILEAIDGDAINYGYRKITYHLRKYCNLVINHKKVYRLCKELRILKDQRIIRTKIKRNIAINRTITGSNQLWEMDIKYGYIEGEDKFFYLLNLIDIFDRSIIDYHMGLHCEAKDAAALLRKCLIRRNLFEEDSKKPVIRTDNGPQFISHKFDECCEELKIEHERIPVKTPNKNAHVESFHRILEDECLKINEFQSYGEAYKIVNEFMEFYNNRRLHSSLRFMAPHEFYNLYFEENLTNIQIRV >NC_011837.1|WP_012103090.1|2753935_2754196_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MKLNIRRLTIIPLNLEQFKVLFDVIYMTEVVKSMCQWALSDKKVLRVIAGTDKNNIASQRVLKKCSFIIYDEDHENYLWQLNNKLS >NC_011837.1|WP_012103089.1|2752470_2753643_-|Ig-like-domain-containing-protein MKKITGSNLFTIFLAFIFVFMSTISISSVKADEISSVNMSQTSSSINYLALGDSISCGMSADSGKGYVDLFHKHLETLGRYGEVNLQNLSVSGDKSSDLLTKFQTDEYKEAVKDAKIITISIGGNNLLSPVIEAVCQAFGVNKDDNPNYQTELALAVASNPNKDAILAGIVSSGTLLQSLNSGILQFQSDFPKIIKTIKEIAPESEIYVLTLYNPFNSKDPMYSAFDSIINRINKTIKIQTNNCNIVDVYEKLKTTSGAVNFSLSNMMIDPHPTTIGHAAIYDLLVDAKVKKDGLVAADKKWTITFTGEVEFDDSTKDAIIVTGSKGNEVNTTLELGQNNKSIIVYPPTVGYTPGESYTLTVRKQCHDKNGKQMKQDRTLNFSIEADTAD >NC_011837.1|WP_012103088.1|2751881_2752118_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKNRLKELRESLGLTQEQLGKLVGVSRQAINAIETEKFEPSIWLAYDISNIFNCFIEEVFLFKKSKRKSRAQQSRGVV >NC_011837.1|WP_012103087.1|2751428_2751881_-|peptide-deformylase MALRQIRLFGDDILRKKSKEVKAVDNKIRQILNDMADTMYDTENGGGLAAPQIGILKRLAVIDMGQGLIKLVNPKIIKCAGEQEVIEGCLSIPNVFGKLKRPAKVIIEALNEEGSKIILKGTKDLAKCFCHEIDHLKGILFTDLVTEYMK >NC_011837.1|WP_012620767.1|2751073_2751280_+|TOBE-domain-containing-protein MTLSARNQLKGKVTKITQGDVVSQILVDTGCKNLVSSVITTASLKDLEIKVGSEVKAVIKSTDAMIMK >NC_011837.1|WP_012103085.1|2749349_2750225_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MNFAQQLVNGLALGGVYALIAIGYTMVYGIVKLMNFAHGDIYMAGAFFGFLAVKNLNSGFIPTLIIAMVGSALLGIIIEKIAYKPLRNSSRITLFITSMGISLLLENGFRVIFGPNPRPFPELLKVKLYKIGDFQINNLQIVTLLICFILVILLQIIVYRTKMGKAMRAASFDTEATELMGINVNNTISLTFAIGSALAAAAGVLIGMSYPKIDPYMGMIPGLKAFIAAVVGGIGLIPGAMVGGIVLGISEIFTKAFISTKLSDGIAYIILIIILIFKPSGLLGKKVNEKV >NC_011837.1|WP_012103084.1|2748361_2749336_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MKRRKNILFILAAVLIVFGLIQTLISLEMIDEYIVQILIIIGINIILAVSLNMIVGYTGQLALGHAGFMSIGGYTAAILTLKLDAPFFLVLIAGGLMAAFFGVIIGIPTLRLKGDYLAITTLGFGEIIRIAIVNSNTLGGAEGLAGIPKKTSFAMVFFITILIIIIAYNIKKSSYGRAMLSIREDELASSSIGINTTKYKMIAFVTASFFAGIAGVLYAHYFMFLDPKSFDYLKSFDIVTYVVFGGMGSISGCILSTAILTSLPEILRPVADYRMVIYSAALVALMIFRPEGVFGMKEISFKKIVSSAKKKISHKKEGKYDVPA >NC_011837.1|WP_012103083.1|2747604_2748375_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSLLSAKDLTIKFGGLTAVSDFNLDIDENEIVGLIGPNGAGKTTVFNMLTGVYQPTDGYIEILGRKVINLKPHELAKKHIARTFQNIRLFKHMSVLDNVKISFSYLDKYNFWQCILRMPKYYREEKFMDENAERLLKIFGLLDKKDELAMNLPYGQQRKLEIVRALATEPKVLLLDEPAAGMNPQETLNLMELIKWVRDEFKISILLIEHDMKLVMGICERLVVLDHGQMIAKGSPQEIKKNPKVISAYLGEEVKI >NC_011837.1|WP_012103082.1|2746902_2747604_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKLNNVNLYYGVIHALKDISLEVEEGEIVTLIGANGAGKTSILRAISGLNPCRSGEVIFKGKSLNKVPAYKIVSRGISHVLEGRRVFSNLTVFENLQLGAYIRKDKAGIKKDYETIFEVFPILKERKEQPAGTLSGGEQQMLAIARALMVKPQLLLMDEPSMGLAPIIVQQIFNIIKEINEKGTTILLVEQNANMALSIASKAYVLETGRIVLKGSAGELLVNESVKSAYLG >NC_011837.1|WP_012103091.1|2757296_2757581_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MGKNFNFNYAFVFYDVNEKRVNKVFKICKKYFHHHQNSVFRGAITPSKLIKLKSELNKIVQDKDFVTIIKLINDSCFDEETLGINEKNTENLIL >NC_011837.1|WP_012103092.1|2757595_2758600_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MARGVKYLMSMGELKRKDNSIVFHNDKGNSYLPVEAVRELYCMNEITVNSKFLDFAAKAGIVIHFFNYYGYYSGTFYPKKNLVSGRVIIKQVEAFSNNRDNIAKSFVQGIADNIYEVLYHYYRHDKKEVRSTLDWIKVKLPEYMKYDDLGIKHILRIEGEIWRRFYENFKYILPEDFVLDKRVKRPPDNPINALISFGNSILYSKTVSEIYNTHLNQTISYLHEPSEGRFSLSLDLSEVFKPIIVYRTIFELVNTKQIQVNKHFDKKYNYCLLNEKGKMIFVQAIEERFESVFNHKKLKRKISYKTAIRLDGYKLKKHVVEGEDFIPFNLKNMM >NC_011837.1|WP_012103094.1|2758626_2759121_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKINGTLINYYFHCKRQCWLHGNRMNMEDNSEDVHIGKAIHELKLEGKKDTEISIDNVKIDKITKDYLVEIKKSDADVEATKWQVIFYLYILKNKGIERQGKIEFQEKNKQKNKIIYVELTEENELELRQLIGDIEKLLEKEVPPKIEKVKGCRKCAYYEYCYI >NC_011837.1|WP_012103095.1|2759380_2761963_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFDRVKLFDFQSNVDNISHMYAHRDKSNKKRKEKLLEHVNLTYEYMNFICAEKNLNNVFQNFQDKILISKNSDVIILWKEMMVNTIYMHDVGKINPSFQYNKMLNKLYEDNSDGGSEHSLLSSYIYVSYFNNRIKDMEFELKDSLYLKYFMYLNGYIISKHHGYLDNMGNYKLKLEDFQEDCDKDEYYPDLTMTTLRESVIRNSFNNSKEYLDECIRHNNELEFSIYIYSKFLFSLLTASDYYATSEFMSGEKVDSLGIINDDLKDRFNEDIDSYSTFKSIREYSNNPVKDGQYISINQLRSEITIESEKSYRDNRDKNIYYLEAPTGGGKTLTSINLAKLILNSNSNINKLFYVFPFNTLVEQTEIEFMKIFGNDSSIKENIAVINSITPIKTEDKNEECNEVMDLNTKKKWNYAKAFINRIFINYPFVITTHINLFNSFFGTSREEVFPLVNLCNSVIILDEIQSYKNSIWKEIINFLNIYSEILNVKIIIMSATLPRLNKLVHNCSDNFVYLIKNREYYFKNPFFKNRVKFEIIDIGEEQEEQFENLLEDIEKESKSNNKILIEFIFKKSADKFFDYMNRNFSKKYLREVVIMTSDDNKSDRNKVIKKAKEINKKIIIVATQIIEAGIDIDMDLGYKNISILDAEEQFMGRINRSCFNEGRVKFFKMDDCKVIYKKDVRREAELTLSSEEIQKLLEEKNFEKYYEKVIAKIERNKKELNENGYGHFLKIVKDLNFKEIGEYMKLIEDDNQHKYTIFLSRRIEDEKNNVLLGDEIWKEYKSLLFDNKMDYSEKKVRLSRVNSKVNYFIYKVKKIPEVYQELLGDIYYIADGEKYIVDGRFNQEIFIGETANKANLFM >NC_011837.1|WP_012103096.1|2761981_2762722_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 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MINEIYDIFSREYVEKGEGLVVDKHLLAPGDYIKFTLEDTWNSIQIFSVDKKTDNSLEVYKEFVRRDYLSRLVSMNKPIDPNKIIHSNNIYTFYVKKENLHQSKGKLSSKVIEEYYNILKNPEVKYKSKSKSRKLYLNIEEKYGKPDIELIENIQSWVQKNIMEIAKKLDLNKTYLKLFYDTNLNNYEKESERYIIPNIYNSTDYNVTINKKVYGLSDFNMGLNSKKPYLENKTRKSKLPMLVDSEKILIEKKLFDYLMNYASEGRNYIYAQQDCVDGIEAKENKKSDFKGYFFRVNKGKEVEIADYDSITDYRYKFKRAIKITPILKQGFGKEFILIRGNMKNISELSDKVNEVFFNKYLKSNFFTEAKDIKLNDSKVKESLLKYRYGFYTWFYKGEELLVKGFWNKMTLDLLCNSIDNGNANKAINQFNLRHTLLDYFNKESRGENMANTIKYIRKNVDEKINIKEDKDYKVEIEEVGEYYFCIGQLLQYFYSLNKSSSKNFSFLSPVLNASDDKTVKEKLRRLFIKYSYAIKSSFRFSNMYYMILAYSSENEVDKDSIIAGFLCPSLIYKKSEEDSDDENKNEEES >NC_011837.1|WP_012103099.1|2765440_2766151_-|hypothetical-protein MEVYEINVKIYTLEDIFKEASLELLSKLLDQSFYKNERMKEFHTENRIKNYCFNNLYPLASNNEMYKKGEIYNFQVRCIGEDLINHFEKFLPNEYTSGIKVLTCNIKKIPKRTIERIYSITPLIIKISDEDKTQYWRNIHNESDFFEYMRNSTIKKYELVTGEIVDSNLQIFNYERIDNRKPIATKFKDKSILGDKVTLTIDTSEKAQNIAYTILGTGLADMCPRGYGFMNYQYVK >NC_011837.1|WP_172634766.1|2768392_2769553_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein MDKLELLNIIKSGENSYIEFKEEGIKAKELAEEIVAFANSEGGIILIGISDDGNIKGVQDKNIEEKIMNICRNNCIPNIIPIYEDIELKGLKIAIVSIPKGLNKPYYTTDHKYYVRVGTTKRIASREELMRLFQANGSIHFDISPVYNTSIRDLNLDIIRDYFSKYNTFDLYEEDNDSVERILINADILKEADGKIVCSAGGLLIFGKNVENIMVQNGISFAHFRGDEITDKLIDKKIICGRLQDIAEQTLVVLKNNMKNPSIIKELKRKEEEEYPILVLREAIINALVHRNYSILGSKIRIFMFDNRIEFHSPGKLPNTVTIEKMKIGVSYARNPFLVKYMENMRYIDQLGRGVPMILKTMKDLGAREPLLQESGEEFVLTVYKK >NC_011837.1|WP_012103103.1|2769754_2770657_-|EamA-family-transporter-RarD MNNQKTVGVIYAAAAYTLWGILPVYWKMIDSVFSMEILANRIVWALVFMILIITVTKKWDELKRIAKYKGQMLYIFIASILITINWGLYIWAVSSDKIVDASLGYYINPLLAVALGVVIFKEKLSYWTGAALIVAFVGVIIKTIQYGKIPWISLGLAISFALYGAIKKSVKASSIIGLTLETAIITPAAAIYIALRHVSGVGAFETQGTLVILLLIGGGVVTAIPLLLFASGAKRLPLSLIGFTQYISPTISLAIGIFVYNEGFTAVDMIAFCFIWVAITIYSFSQMSLAKSLKNLEHTN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011837_5 | 2766591-2768194 | TypeI-B |
III-B:NA
Consensus repeat of NC_011837_5
|
24 spacers
spacers of NC_011837_5
>5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder ATAAATTTAAACATTTACCATTAAAAT >5.2|2766678|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR TCATATTGAATCATATCATCAGTTTTTTCTATGGCA >5.3|2766744|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTATCCAAAGCTTCTGGAGCTGCATCTATTACCATT >5.4|2766810|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR TATTAAGAGATGCCTTGAGTTATGGAGCAATCCTAA >5.5|2766876|37|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTAAGTCAATATAGTTTTGTATTTCAGGTATCAGCTT >5.6|2766943|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTGACCTGTAATTGCAAGTGCAGCAGCCAGCCATTG >5.7|2767009|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR CCTGTACAAAATGTGCTTTTGGTTGTAAACCCATC >5.8|2767074|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTTAGGATCAATATTAAATATCTCCTTTCTGGAGT >5.9|2767140|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTCGATCTTTTCAATGTCTGTTACTGCTATTTTGTC >5.10|2767206|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR TCCTGTGTTCTTCTATTTTACTTTCGTTATAGGCCT >5.11|2767272|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR TACTGTATTTCAAATTATCACAGGATATTCTAACAA >5.12|2767338|37|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTAGTCATTTCAGTTGGATAGTGTTCAGCATAACTTG >5.13|2767405|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR TATAACATTTTTAGTGCTTCATATCTTCTTTCCCC >5.14|2767470|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR TATGGAATTTAGCAAAGGCAGAAGAATCAATACTTT >5.15|2767536|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTATGTTTTTTATCTTTGTGTTTAATTCCTCTAC >5.16|2767600|37|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTGAAGCAAAAGAAAATACTAACACACCAGAAAGTAA >5.17|2767667|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR CCTAGTTGGGTTATTAATGCCTCCTTTTTCTTTT >5.18|2767731|37|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR GCTTATAGTCAAGGAAAATCCGTACTTAGAAAAGAGG >5.19|2767798|37|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR CCAGTACCGCCTGTATTAAATGCTATTTTACCTTCTG >5.20|2767865|37|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR GATTTAATCCATTGTTTTAGTGTCAATTCATCTTTAG >5.21|2767932|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTTCCAGAGTGGAAAACAGCAGACATAATTATACC >5.22|2767998|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTTCCTCACCTATAATAGTTACTATGGGGTCTATGC >5.23|2768064|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTACAAAAACTTCCTTCTCGCAGAGGTCACCCTCTA >5.24|2768130|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR TAAATAGTAAAAATTATAAAAATTGAATACGTTCA >5.25|2766614|34|NC_011837|CRT GTTCAACATAAATTTAAACATTTACCATTAAAAT >5.26|2766671|43|NC_011837|CRT GTTCAACTCATATTGAATCATATCATCAGTTTTTTCTATGGCA >5.27|2766737|43|NC_011837|CRT GTTCAACGTATCCAAAGCTTCTGGAGCTGCATCTATTACCATT >5.28|2766803|43|NC_011837|CRT GTTCAACTATTAAGAGATGCCTTGAGTTATGGAGCAATCCTAA >5.29|2766869|44|NC_011837|CRT GTTCAACCTAAGTCAATATAGTTTTGTATTTCAGGTATCAGCTT >5.30|2766936|43|NC_011837|CRT GTTCAACCTGACCTGTAATTGCAAGTGCAGCAGCCAGCCATTG >5.31|2767002|42|NC_011837|CRT GTTCAACCCTGTACAAAATGTGCTTTTGGTTGTAAACCCATC >5.32|2767067|43|NC_011837|CRT GTTCAACATTTAGGATCAATATTAAATATCTCCTTTCTGGAGT >5.33|2767133|43|NC_011837|CRT GTTCAACCTCGATCTTTTCAATGTCTGTTACTGCTATTTTGTC >5.34|2767199|43|NC_011837|CRT GTTCAACTCCTGTGTTCTTCTATTTTACTTTCGTTATAGGCCT >5.35|2767265|43|NC_011837|CRT GTTCAACTACTGTATTTCAAATTATCACAGGATATTCTAACAA >5.36|2767331|44|NC_011837|CRT GTTCAACTTAGTCATTTCAGTTGGATAGTGTTCAGCATAACTTG >5.37|2767398|42|NC_011837|CRT ATTCAACTATAACATTTTTAGTGCTTCATATCTTCTTTCCCC >5.38|2767463|43|NC_011837|CRT ATTCAACTATGGAATTTAGCAAAGGCAGAAGAATCAATACTTT >5.39|2767529|41|NC_011837|CRT ATTCAACCTATGTTTTTTATCTTTGTGTTTAATTCCTCTAC >5.40|2767593|44|NC_011837|CRT ATTCAACCTGAAGCAAAAGAAAATACTAACACACCAGAAAGTAA >5.41|2767660|41|NC_011837|CRT ATTCAACCCTAGTTGGGTTATTAATGCCTCCTTTTTCTTTT >5.42|2767724|44|NC_011837|CRT ATTCAACGCTTATAGTCAAGGAAAATCCGTACTTAGAAAAGAGG >5.43|2767791|44|NC_011837|CRT ATTCAACCCAGTACCGCCTGTATTAAATGCTATTTTACCTTCTG >5.44|2767858|44|NC_011837|CRT ATTCAACGATTTAATCCATTGTTTTAGTGTCAATTCATCTTTAG >5.45|2767925|43|NC_011837|CRT ATTCAACATTTCCAGAGTGGAAAACAGCAGACATAATTATACC >5.46|2767991|43|NC_011837|CRT ATTCAACCTTCCTCACCTATAATAGTTACTATGGGGTCTATGC >5.47|2768057|43|NC_011837|CRT ATTCAACGTACAAAAACTTCCTTCTCGCAGAGGTCACCCTCTA >5.48|2768123|42|NC_011837|CRT ATTCAACTAAATAGTAAAAATTATAAAAATTGAATACGTTCA |
cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011837_5
The CRISPR arrays of NC_011837_5 >merge|NC_011837|5|2766591-2768194|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATATTTTACAACACTTGTTAAGGTTCAACATAAATTTAAACATTTACCATTAAAATATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTCATATTGAATCATATCATCAGTTTTTTCTATGGCAATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACGTATCCAAAGCTTCTGGAGCTGCATCTATTACCATTATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTATTAAGAGATGCCTTGAGTTATGGAGCAATCCTAAATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCTAAGTCAATATAGTTTTGTATTTCAGGTATCAGCTTATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCTGACCTGTAATTGCAAGTGCAGCAGCCAGCCATTGATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCCTGTACAAAATGTGCTTTTGGTTGTAAACCCATCATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACATTTAGGATCAATATTAAATATCTCCTTTCTGGAGTATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCTCGATCTTTTCAATGTCTGTTACTGCTATTTTGTCATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTCCTGTGTTCTTCTATTTTACTTTCGTTATAGGCCTATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTACTGTATTTCAAATTATCACAGGATATTCTAACAAATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTTAGTCATTTCAGTTGGATAGTGTTCAGCATAACTTGATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACTATAACATTTTTAGTGCTTCATATCTTCTTTCCCCATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACTATGGAATTTAGCAAAGGCAGAAGAATCAATACTTTATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCTATGTTTTTTATCTTTGTGTTTAATTCCTCTACATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCTGAAGCAAAAGAAAATACTAACACACCAGAAAGTAAATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCCTAGTTGGGTTATTAATGCCTCCTTTTTCTTTTATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACGCTTATAGTCAAGGAAAATCCGTACTTAGAAAAGAGGATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCCAGTACCGCCTGTATTAAATGCTATTTTACCTTCTGATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACGATTTAATCCATTGTTTTAGTGTCAATTCATCTTTAGATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACATTTCCAGAGTGGAAAACAGCAGACATAATTATACCATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCTTCCTCACCTATAATAGTTACTATGGGGTCTATGCATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACGTACAAAAACTTCCTTCTCGCAGAGGTCACCCTCTAATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACTAAATAGTAAAAATTATAAAAATTGAATACGTTCAATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC >NC_011837|5|5|2766591-2768194|CRISPRCasFinder TATATTTTACAACACTTGTTAAGGTTCAAC ATAAATTTAAACATTTACCATTAAAAT ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC TCATATTGAATCATATCATCAGTTTTTTCTATGGCA ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC GTATCCAAAGCTTCTGGAGCTGCATCTATTACCATT ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC TATTAAGAGATGCCTTGAGTTATGGAGCAATCCTAA ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC CTAAGTCAATATAGTTTTGTATTTCAGGTATCAGCTT ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC CTGACCTGTAATTGCAAGTGCAGCAGCCAGCCATTG ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC CCTGTACAAAATGTGCTTTTGGTTGTAAACCCATC ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC ATTTAGGATCAATATTAAATATCTCCTTTCTGGAGT ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC CTCGATCTTTTCAATGTCTGTTACTGCTATTTTGTC ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC TCCTGTGTTCTTCTATTTTACTTTCGTTATAGGCCT ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC TACTGTATTTCAAATTATCACAGGATATTCTAACAA ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC TTAGTCATTTCAGTTGGATAGTGTTCAGCATAACTTG ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC TATAACATTTTTAGTGCTTCATATCTTCTTTCCCC ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC TATGGAATTTAGCAAAGGCAGAAGAATCAATACTTT ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC CTATGTTTTTTATCTTTGTGTTTAATTCCTCTAC ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC CTGAAGCAAAAGAAAATACTAACACACCAGAAAGTAA ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC CCTAGTTGGGTTATTAATGCCTCCTTTTTCTTTT ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC GCTTATAGTCAAGGAAAATCCGTACTTAGAAAAGAGG ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC CCAGTACCGCCTGTATTAAATGCTATTTTACCTTCTG ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC GATTTAATCCATTGTTTTAGTGTCAATTCATCTTTAG ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC ATTTCCAGAGTGGAAAACAGCAGACATAATTATACC ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC CTTCCTCACCTATAATAGTTACTATGGGGTCTATGC ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC GTACAAAAACTTCCTTCTCGCAGAGGTCACCCTCTA ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC TAAATAGTAAAAATTATAAAAATTGAATACGTTCA ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC >NC_011837|5|4|2766591-2768187|CRT TATATTTTACAACACTTGTTAAG GTTCAACATAAATTTAAACATTTACCATTAAAAT ATTTAAATACAATTCTTGTTAAG GTTCAACTCATATTGAATCATATCATCAGTTTTTTCTATGGCA ATTTAAATACAATTCTTGTTAAG GTTCAACGTATCCAAAGCTTCTGGAGCTGCATCTATTACCATT ATTTAAATACAATTCTTGTTAAG 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>NC_011837.1|WP_012103099.1|2765440_2766151_-|hypothetical-protein MEVYEINVKIYTLEDIFKEASLELLSKLLDQSFYKNERMKEFHTENRIKNYCFNNLYPLASNNEMYKKGEIYNFQVRCIGEDLINHFEKFLPNEYTSGIKVLTCNIKKIPKRTIERIYSITPLIIKISDEDKTQYWRNIHNESDFFEYMRNSTIKKYELVTGEIVDSNLQIFNYERIDNRKPIATKFKDKSILGDKVTLTIDTSEKAQNIAYTILGTGLADMCPRGYGFMNYQYVK >NC_011837.1|WP_012103098.1|2763654_2765424_-|hypothetical-protein MINEIYDIFSREYVEKGEGLVVDKHLLAPGDYIKFTLEDTWNSIQIFSVDKKTDNSLEVYKEFVRRDYLSRLVSMNKPIDPNKIIHSNNIYTFYVKKENLHQSKGKLSSKVIEEYYNILKNPEVKYKSKSKSRKLYLNIEEKYGKPDIELIENIQSWVQKNIMEIAKKLDLNKTYLKLFYDTNLNNYEKESERYIIPNIYNSTDYNVTINKKVYGLSDFNMGLNSKKPYLENKTRKSKLPMLVDSEKILIEKKLFDYLMNYASEGRNYIYAQQDCVDGIEAKENKKSDFKGYFFRVNKGKEVEIADYDSITDYRYKFKRAIKITPILKQGFGKEFILIRGNMKNISELSDKVNEVFFNKYLKSNFFTEAKDIKLNDSKVKESLLKYRYGFYTWFYKGEELLVKGFWNKMTLDLLCNSIDNGNANKAINQFNLRHTLLDYFNKESRGENMANTIKYIRKNVDEKINIKEDKDYKVEIEEVGEYYFCIGQLLQYFYSLNKSSSKNFSFLSPVLNASDDKTVKEKLRRLFIKYSYAIKSSFRFSNMYYMILAYSSENEVDKDSIIAGFLCPSLIYKKSEEDSDDENKNEEES >NC_011837.1|WP_012103097.1|2762724_2763654_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MNRIYGVIGIKAIMANWNADFSGYPKTIGDGSIFGSDKALKYSIKKYWDDLGEKILYIKSFKTDKDKIRPRSLEERYNQVFDTTLTKKDKSEDVIKNLFSTLDVKSFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNVHKPSNSEEQQILSPFRSDKKSNTKEEAKEANQSTLGTKIVSDEAHYLYPFYINPISYKDYVQMGLTDGYTEEDYKKFKEGALIGATALNTNAKAGCENEFALFVETDEKTYLPNLTQFMDFDKVDGKCILKLNLDQVLEGIKDSIKNIEIYYNDYKLKVENMPQGATVFNIFTRKEV >NC_011837.1|WP_012103096.1|2761981_2762722_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAVRFKLSGRTAFFKKPDVNTYYYFTYGNIHKIALLGIIGSVLGLPGYNSQSRDFKNNIYPEFYNRLKDSKVAVVMLNHQGYITKKIQTFNNSVGYASLEAGGNLVVKEQWLQEPKWMVYVKVDEITEKFAHMLLHKKAIFLPYLGKNDHFADITEIKEVELEKSENYIKINSLFESRYFQVEKYQEEEDDTAWKYMEYLPVELDEELNQYRFEHFTATNMRVKLNDKNVNIYRDLDEKNNLYFF >NC_011837.1|WP_012103095.1|2759380_2761963_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFDRVKLFDFQSNVDNISHMYAHRDKSNKKRKEKLLEHVNLTYEYMNFICAEKNLNNVFQNFQDKILISKNSDVIILWKEMMVNTIYMHDVGKINPSFQYNKMLNKLYEDNSDGGSEHSLLSSYIYVSYFNNRIKDMEFELKDSLYLKYFMYLNGYIISKHHGYLDNMGNYKLKLEDFQEDCDKDEYYPDLTMTTLRESVIRNSFNNSKEYLDECIRHNNELEFSIYIYSKFLFSLLTASDYYATSEFMSGEKVDSLGIINDDLKDRFNEDIDSYSTFKSIREYSNNPVKDGQYISINQLRSEITIESEKSYRDNRDKNIYYLEAPTGGGKTLTSINLAKLILNSNSNINKLFYVFPFNTLVEQTEIEFMKIFGNDSSIKENIAVINSITPIKTEDKNEECNEVMDLNTKKKWNYAKAFINRIFINYPFVITTHINLFNSFFGTSREEVFPLVNLCNSVIILDEIQSYKNSIWKEIINFLNIYSEILNVKIIIMSATLPRLNKLVHNCSDNFVYLIKNREYYFKNPFFKNRVKFEIIDIGEEQEEQFENLLEDIEKESKSNNKILIEFIFKKSADKFFDYMNRNFSKKYLREVVIMTSDDNKSDRNKVIKKAKEINKKIIIVATQIIEAGIDIDMDLGYKNISILDAEEQFMGRINRSCFNEGRVKFFKMDDCKVIYKKDVRREAELTLSSEEIQKLLEEKNFEKYYEKVIAKIERNKKELNENGYGHFLKIVKDLNFKEIGEYMKLIEDDNQHKYTIFLSRRIEDEKNNVLLGDEIWKEYKSLLFDNKMDYSEKKVRLSRVNSKVNYFIYKVKKIPEVYQELLGDIYYIADGEKYIVDGRFNQEIFIGETANKANLFM >NC_011837.1|WP_012103094.1|2758626_2759121_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKINGTLINYYFHCKRQCWLHGNRMNMEDNSEDVHIGKAIHELKLEGKKDTEISIDNVKIDKITKDYLVEIKKSDADVEATKWQVIFYLYILKNKGIERQGKIEFQEKNKQKNKIIYVELTEENELELRQLIGDIEKLLEKEVPPKIEKVKGCRKCAYYEYCYI >NC_011837.1|WP_012103092.1|2757595_2758600_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MARGVKYLMSMGELKRKDNSIVFHNDKGNSYLPVEAVRELYCMNEITVNSKFLDFAAKAGIVIHFFNYYGYYSGTFYPKKNLVSGRVIIKQVEAFSNNRDNIAKSFVQGIADNIYEVLYHYYRHDKKEVRSTLDWIKVKLPEYMKYDDLGIKHILRIEGEIWRRFYENFKYILPEDFVLDKRVKRPPDNPINALISFGNSILYSKTVSEIYNTHLNQTISYLHEPSEGRFSLSLDLSEVFKPIIVYRTIFELVNTKQIQVNKHFDKKYNYCLLNEKGKMIFVQAIEERFESVFNHKKLKRKISYKTAIRLDGYKLKKHVVEGEDFIPFNLKNMM >NC_011837.1|WP_012103091.1|2757296_2757581_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MGKNFNFNYAFVFYDVNEKRVNKVFKICKKYFHHHQNSVFRGAITPSKLIKLKSELNKIVQDKDFVTIIKLINDSCFDEETLGINEKNTENLIL >NC_011837.1|WP_148204824.1|2755679_2756633_+|IS3-family-transposase MKPSIKEKVEIAKKYIEQGYNAVFVLKVVKLGRSTYYYNLSVEGKEKTRPKGGKPKGYSINRDGEKVCDDQIKEFILEAIDGDAINYGYRKITYHLRKYCNLVINHKKVYRLCKELRILKDQRIIRTKIKRNIAINRTITGSNQLWEMDIKYGYIEGEDKFFYLLNLIDIFDRSIIDYHMGLHCEAKDAAALLRKCLIRRNLFEEDSKKPVIRTDNGPQFISHKFDECCEELKIEHERIPVKTPNKNAHVESFHRILEDECLKINEFQSYGEAYKIVNEFMEFYNNRRLHSSLRFMAPHEFYNLYFEENLTNIQIRV >NC_011837.1|WP_012103090.1|2753935_2754196_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MKLNIRRLTIIPLNLEQFKVLFDVIYMTEVVKSMCQWALSDKKVLRVIAGTDKNNIASQRVLKKCSFIIYDEDHENYLWQLNNKLS >NC_011837.1|WP_172634766.1|2768392_2769553_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein MDKLELLNIIKSGENSYIEFKEEGIKAKELAEEIVAFANSEGGIILIGISDDGNIKGVQDKNIEEKIMNICRNNCIPNIIPIYEDIELKGLKIAIVSIPKGLNKPYYTTDHKYYVRVGTTKRIASREELMRLFQANGSIHFDISPVYNTSIRDLNLDIIRDYFSKYNTFDLYEEDNDSVERILINADILKEADGKIVCSAGGLLIFGKNVENIMVQNGISFAHFRGDEITDKLIDKKIICGRLQDIAEQTLVVLKNNMKNPSIIKELKRKEEEEYPILVLREAIINALVHRNYSILGSKIRIFMFDNRIEFHSPGKLPNTVTIEKMKIGVSYARNPFLVKYMENMRYIDQLGRGVPMILKTMKDLGAREPLLQESGEEFVLTVYKK >NC_011837.1|WP_012103103.1|2769754_2770657_-|EamA-family-transporter-RarD MNNQKTVGVIYAAAAYTLWGILPVYWKMIDSVFSMEILANRIVWALVFMILIITVTKKWDELKRIAKYKGQMLYIFIASILITINWGLYIWAVSSDKIVDASLGYYINPLLAVALGVVIFKEKLSYWTGAALIVAFVGVIIKTIQYGKIPWISLGLAISFALYGAIKKSVKASSIIGLTLETAIITPAAAIYIALRHVSGVGAFETQGTLVILLLIGGGVVTAIPLLLFASGAKRLPLSLIGFTQYISPTISLAIGIFVYNEGFTAVDMIAFCFIWVAITIYSFSQMSLAKSLKNLEHTN >NC_011837.1|WP_012103104.1|2770875_2771703_-|GyrI-like-domain-containing-protein MYTIGQFSKIAKLSSKVLRHYDKIDLLKPKYVNEENGYRYYDLKQIKDVIIINKLKSYGFLLEEIREILLENNLEKLKRLMEIKIKSLTQELNYNQFLLNQMKYEFEKLAKGEDIMNENREFNIILKEREPLTVLSIRDNISMDYIGSLIGKIYENVYKNGLKPIGNIMSIYYLQNEEEDFNHDNADVEVCIPVDKEFSSNEISTRIMEGGLHAYTTFVGPYSEISQAYGAMMEWVKHNKYKISRPPFEKYIKGPEEGCNPQDFVTEVYFPVVKM >NC_011837.1|WP_012103105.1|2771915_2773397_+|spore-germination-protein MELDNKINSILESCGNSQQVIVRRFSIGKDTPLDAALIYKDGLVNQDIINRDILNPLMHKVNEDLSKAQSINQEICNKYISMSKIVIQTDINMAIKDIRRGKTAVLVHKEDTFIVADTQGTKHRNISEPMDEIGIRGSKEGFIEDIEINLSLIKKGLKDKNLIIEPFIIGRRSQKDVALIYIKDIADKDLIEDTRNKLLSIDVDTFTSAGMLEQYIENHPYSVFPQAHASQRPDVVQQNLSEGRIAILMDGTPFALTIPALFMEFFQAVEDYSQRTLLSNFNRILRVFGTFIVILLPSIYLDLIRFNSELIPIKFIIPIVQSRRGIALPPLLEILSMYVVIELLREGGLRLPTKIGQTLSVVGGFIIGSAALEAKLVSPATLVVVGVATIGTFIIPNYDMSSSIRLIGFPFLFLTNFLGAVGLIAGWYFLFIHLLSLDSFGVPYMPLDKYGDFKDTFIRVPLWKMNNRPEGIPNNNPKRQTNFRNKLWRNKNE >NC_011837.1|WP_012103106.1|2773389_2774484_+|GerAB/ArcD/ProY-family-transporter MNKLESNNITPGEFTCLLIGSMIGVGILSLPNDLVNVAKQDSWISAAIGAVYPLYMVIVASLLWKKHPQENILFLSKKYLGKYLGNILNLIFLLYFVLFTTSVAFGVSLILETLISNFLSTSKILLIIFFLAAYTSMKGLKLLGRLNQLMFLYTIFLSFILAVALLRGTYLNICPILGSGILNIIKASKNSAFAYGGIEVLFLIYPYVTDKKRITKSSLLSVIITALIYSWVTFITIYYLGIDIVPKIEWSVNSVTKTLEIPVINNFRFIFTILWATIIYKTISNHYFITAFILKDFFKKIPIKKIIYALYPLMLYLSLRYKNSADRLNFLNYIIPKYTLFNMIYVALITIIIYLKKDNLHEKQ >NC_011837.1|WP_012103107.1|2774470_2775592_+|Ger(x)C-family-spore-germination-protein MKNNKTKYISIILLCIIITIFFSIGLDDQQPVEELDIISGLGADLIIKNNKVAEHIVPMSIYLFESENKINSTLKTGTAKTKGETRQNRQLSNDKQNILGLEKVFIISEEQAHYGLQDWTDILFRNPYLNDTAYVAVCKGEASDILSTNIKGYPSSSDFIGGLIKNSIFYNFFSDKYRVMNLFLSIGSEGYNPVLPYIEITNKGITITGMALFNGNKMISKINVGELRAMNIMRENNVKGMFTIQKSTCKYTNYYATSKRKVHCTKEDNKYKFTINISLEGDLITDTLYKNLQNNPKKVEEFSTKMSEDIKKECTNFINKMKYTYKVDCLELGKFAAAKYGRHMEKDWNSVVCNSEIDVNVKVKLNKIGRGDY >NC_011837.1|WP_012103108.1|2775658_2775922_-|SoxR-reducing-system-RseC-family-protein MGKDYNQKKKSTNMLIAAFMLFIFPIMLVFLGVFLGGYLGKLMEGSIRTYEIIGGIIALVLAVVFVKLFDKSTVVDKEQEKFYWEDM >NC_011837.1|WP_012103109.1|2776220_2776619_+|lamin-tail-domain-containing-protein MSTNVKIAFINNNIKERNGELHLNDEWIRIENVSNRRINMFGWELWHWKPSKQYSLIYRFPKRIDNLFWTLDPGEIIILFTGYGSNKFIEETSDHKSEFHFYCGKNSFIWNNAGDIACLFDTESMTSTLAVP >NC_011837.1|WP_012103110.1|2776812_2777922_+|Ldh-family-oxidoreductase MTYSKVKYEGLKKLCDIVFEKFGFSPEDSGTITDVLLLSDLFGIESHGIQRLVKYYSEIKNGLIKVDSKPKIIKETPVSAILDAQAGMGQLAGRKAMNMAIEKAKTSGMGMVVVRNSNHYGIAGYYAKMAEEEGLLGISMTNSPAVIIPTFGKDAMLGTNPIAISMPAKPYPFLMDIATSVVTRGKIEVYNKRHEPLPLGLALDKNGEDTEDPYDILYNLPKKLGGGLVPLGGSKELTGGHKGYGLALAVEIFTAILSGGITGNYVTLQGSSGSGTCHYFCAVDYSIFGDKNSIEDKLSEYLNELRNSKKAKGALRIYTHGEKEIESYKDKMENGIPMNEVTLKEIDEICKYFNIKTSEYIKKFPTDNI >NC_011837.1|WP_012103111.1|2777961_2778498_+|macro-domain-containing-protein MIKIGNKKILIKTGDITKEDSDAIVNPANSALQHGGGAALAIARAGGSKIQSDSNELIKKIGSLPVGKAVITYGHDLNCKFVIHTVGPIMGEGNEDEKLKKAVKSVLNLAESYNLSSISVPAISSGIFGFPKERCAKILLETSVEFLKGGDIYLKTIVMCNHDQQTTDLFLKEELKYI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011837_6 | 3510143-3511358 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NC_011837_6
|
18 spacers
spacers of NC_011837_6
>6.1|3510173|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATGTTAAATTCGAATATGAAACTTTTGTAGAAGA >6.2|3510239|35|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAAACTAAGAAGGTACAGTATGGAAAATGAAAT >6.3|3510304|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTACCAAAGATGAAATATCTAATGCTGGTTATGG >6.4|3510370|37|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGATGTTGACATAAAAAACCTTCAAACTTCTACAGGG >6.5|3510437|38|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAGACTTGATGTGTTCAATTCTCATGGAAAGATATA >6.6|3510505|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGACTTATTTATACCTAAAGACATTGCTAAATCAC >6.7|3510571|35|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAATTGGCTTAATACTATAGATTATAAAGTATA >6.8|3510636|38|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAATACTGATACTTCTGCTAATCAATTTTACATCTA >6.9|3510704|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAAAGCTTTTTTACTTTACCAATAACTTTAGGTA >6.10|3510770|35|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGATGATTTTATTAATTCTCAAGGTTTTATTTA >6.11|3510835|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGCAACAACATCTGTAATGGTCTTTCTTTGCCAT >6.12|3510901|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAATTCAGTTTCTACAACTCCACATTCTTTTATA >6.13|3510967|35|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAGTTAAGCACAAGAGAACTTGCAAAAAAAGC >6.14|3511032|35|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGCATCAAACTTATTATCAGGTATCCATAGGTCA >6.15|3511097|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGCTTTCCATGGGACTCCAAACAGTTTTGCTGTT >6.16|3511163|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCCTACAAGAAAAGAAAGACGATACCCCACAAGA >6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGAAATTATATAATTTAGGGAGGAAATTAAA >6.18|3511293|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGAAAATGCTCATAAGATTAGTTGTACCAACAGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011837_6
The CRISPR arrays of NC_011837_6 >merge|NC_011837|6|3510143-3511358|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTTAATACAGCCCTTATTAAGGTTCAACAGATGTTAAATTCGAATATGAAACTTTTGTAGAAGAATTTAAATACAAATCTTATTAAGGTTCAACGCAAAACTAAGAAGGTACAGTATGGAAAATGAAATATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAACTGCTACCAAAGATGAAATATCTAATGCTGGTTATGGATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAACGGATGTTGACATAAAAAACCTTCAAACTTCTACAGGGATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAACTGGAGACTTGATGTGTTCAATTCTCATGGAAAGATATAATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAACTAGACTTATTTATACCTAAAGACATTGCTAAATCACATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAACAGAAATTGGCTTAATACTATAGATTATAAAGTATAATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAACAAGAATACTGATACTTCTGCTAATCAATTTTACATCTAATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAACTAAAAAGCTTTTTTACTTTACCAATAACTTTAGGTAATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAACATAGATGATTTTATTAATTCTCAAGGTTTTATTTAATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAACAATGCAACAACATCTGTAATGGTCTTTCTTTGCCATATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAACGGTAATTCAGTTTCTACAACTCCACATTCTTTTATAATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAACTTAAAGTTAAGCACAAGAGAACTTGCAAAAAAAGCATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAACGTGCATCAAACTTATTATCAGGTATCCATAGGTCAATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAACATGGCTTTCCATGGGACTCCAAACAGTTTTGCTGTTATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAACAAGCCTACAAGAAAAGAAAGACGATACCCCACAAGAATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAACTTTGGAAATTATATAATTTAGGGAGGAAATTAAAATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAACATGAAAATGCTCATAAGATTAGTTGTACCAACAGTTATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC >NC_011837|6|5|3510143-3511358|PILER-CR ATTTTAATACAGCCCTTATTAAGGTTCAAC AGATGTTAAATTCGAATATGAAACTTTTGTAGAAGA ATTTAAATACAAATCTTATTAAGGTTCAAC GCAAAACTAAGAAGGTACAGTATGGAAAATGAAAT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TGCTACCAAAGATGAAATATCTAATGCTGGTTATGG ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC GGATGTTGACATAAAAAACCTTCAAACTTCTACAGGG ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TGGAGACTTGATGTGTTCAATTCTCATGGAAAGATATA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TAGACTTATTTATACCTAAAGACATTGCTAAATCAC ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC AGAAATTGGCTTAATACTATAGATTATAAAGTATA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC AAGAATACTGATACTTCTGCTAATCAATTTTACATCTA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TAAAAAGCTTTTTTACTTTACCAATAACTTTAGGTA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC ATAGATGATTTTATTAATTCTCAAGGTTTTATTTA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC AATGCAACAACATCTGTAATGGTCTTTCTTTGCCAT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC GGTAATTCAGTTTCTACAACTCCACATTCTTTTATA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC TTAAAGTTAAGCACAAGAGAACTTGCAAAAAAAGC ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC GTGCATCAAACTTATTATCAGGTATCCATAGGTCA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC ATGGCTTTCCATGGGACTCCAAACAGTTTTGCTGTT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC AAGCCTACAAGAAAAGAAAGACGATACCCCACAAGA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC TTTGGAAATTATATAATTTAGGGAGGAAATTAAA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC ATGAAAATGCTCATAAGATTAGTTGTACCAACAGTT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC >NC_011837|6|6|3510143-3511358|CRISPRCasFinder ATTTTAATACAGCCCTTATTAAGGTTCAAC AGATGTTAAATTCGAATATGAAACTTTTGTAGAAGA ATTTAAATACAAATCTTATTAAGGTTCAAC GCAAAACTAAGAAGGTACAGTATGGAAAATGAAAT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TGCTACCAAAGATGAAATATCTAATGCTGGTTATGG ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC GGATGTTGACATAAAAAACCTTCAAACTTCTACAGGG ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TGGAGACTTGATGTGTTCAATTCTCATGGAAAGATATA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TAGACTTATTTATACCTAAAGACATTGCTAAATCAC ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC AGAAATTGGCTTAATACTATAGATTATAAAGTATA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC AAGAATACTGATACTTCTGCTAATCAATTTTACATCTA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TAAAAAGCTTTTTTACTTTACCAATAACTTTAGGTA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC ATAGATGATTTTATTAATTCTCAAGGTTTTATTTA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC AATGCAACAACATCTGTAATGGTCTTTCTTTGCCAT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC GGTAATTCAGTTTCTACAACTCCACATTCTTTTATA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC TTAAAGTTAAGCACAAGAGAACTTGCAAAAAAAGC ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC GTGCATCAAACTTATTATCAGGTATCCATAGGTCA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC ATGGCTTTCCATGGGACTCCAAACAGTTTTGCTGTT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC AAGCCTACAAGAAAAGAAAGACGATACCCCACAAGA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC TTTGGAAATTATATAATTTAGGGAGGAAATTAAA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC ATGAAAATGCTCATAAGATTAGTTGTACCAACAGTT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC >NC_011837|6|5|3510143-3511358|CRT ATTTTAATACAGCCCTTATTAAGGTTCAAC AGATGTTAAATTCGAATATGAAACTTTTGTAGAAGA ATTTAAATACAAATCTTATTAAGGTTCAAC GCAAAACTAAGAAGGTACAGTATGGAAAATGAAAT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TGCTACCAAAGATGAAATATCTAATGCTGGTTATGG ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC GGATGTTGACATAAAAAACCTTCAAACTTCTACAGGG ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TGGAGACTTGATGTGTTCAATTCTCATGGAAAGATATA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TAGACTTATTTATACCTAAAGACATTGCTAAATCAC ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC AGAAATTGGCTTAATACTATAGATTATAAAGTATA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC AAGAATACTGATACTTCTGCTAATCAATTTTACATCTA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC TAAAAAGCTTTTTTACTTTACCAATAACTTTAGGTA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC ATAGATGATTTTATTAATTCTCAAGGTTTTATTTA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC AATGCAACAACATCTGTAATGGTCTTTCTTTGCCAT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC GGTAATTCAGTTTCTACAACTCCACATTCTTTTATA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC TTAAAGTTAAGCACAAGAGAACTTGCAAAAAAAGC ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC GTGCATCAAACTTATTATCAGGTATCCATAGGTCA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC ATGGCTTTCCATGGGACTCCAAACAGTTTTGCTGTT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC AAGCCTACAAGAAAAGAAAGACGATACCCCACAAGA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC TTTGGAAATTATATAATTTAGGGAGGAAATTAAA ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC ATGAAAATGCTCATAAGATTAGTTGTACCAACAGTT ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
>NC_011837.1|WP_012103852.1|3509239_3509608_-|hypothetical-protein MYKLEIKPEKNIFLITFKGLLSKKEGEEFLSELLRELKTFDTSKYNLVVDTRELKVSTQDSTDNIKSTIELLVKTPFKERYNIAPKSIIAELQAKRVVKNDIFSKITPIKSYESLLKSPAIL >NC_011837.1|WP_012103851.1|3508922_3509117_-|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MTRNNKLVVPEAREALNRFKMESAREVGVNLKDGYNGDLTAREAGAVGGNMVKKMIKAYEEDLK >NC_011837.1|WP_012103850.1|3508288_3508651_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MLDVMIFITIGIAAGILSGLFGVGGGIIIIPALMFFKGFSQLKAQGTSLIAMLPPVGILAFIEYYKKGNTDLVGGIIICSAMLLSAKFGGQLANMLPMNVMKRAFGIFVILVGIKTFFGK >NC_011837.1|WP_012103849.1|3506414_3507623_+|tyrosine--tRNA-ligase MKTVEEQLRIIAKGVSILVDEDELRNKLTEFIQNNRPLIIKLGLDPSAPDIHLGHAVVLRKIKQMQDLGHEAVIIIGDFTGKIGDPSGKSKGRNALTDEQVRENARTYFEQIFKVLDKKKTTVRYNSEWLSKLNFEDVLRLAATTTVARMMERDDFQNRFTNNIPIGIHEFFYPLMQAYDSIELNADIELGGTDQTFNILMGRTLQKTMGQSQQVAMFMPLLEGLDGVEKMSKSLENYIGVYESAKVMFKKVMEVPDELILKYFELATDEHPDRIEAIRQELVQGKNPRDIKYALAEIITSLYHTEQEVIEAKEYYDKAFIKKAIPDQIPELAVKAQSHLVEIIPLLVENGFIKSNSEFRRLVQQNGVQLNQHKLKHIDSILLYGDVLKIGKKRFVKIIWEG >NC_011837.1|WP_012103848.1|3504157_3505519_-|amino-acid-permease MSENENLSRGLKNRHVQLLAIGGAIGTGLFLGSGRSIHLAGPSILFAYTITGVVCFLIMRALGELLLSNLNYHSFVDFVQEYMGNGAAFITGWTYWFCWISLAMADLTASGLYIQYWLPNIAQWVPSLVVLIILLIMNLTTVKLFGEMEFWFALIKIVAILALIIIGTFMIIKGFSTNVGASSFTNLWNHGGWFPNGTSGFILSFQMVVFAFTGIELVGLTAGETENPEYVIPKAINNIPIRIIIFYIGALTVIMSIYPWNSINADKSPFVQVFAAVGIAAAASIVNFVVLTSAASACNSGIFSTSRMVYSLAKENNAPNSMKRLTSNKVPSNALMFSAAVILISVILSYIMPEGVFVLITSISTFCFIFIWGIMVVCHLKYRKTNPKLASKSKFKMPLYPITNYIVLAFIVFVLAVLALNKETRVALFVTPVWFIMLGIIYKILKSRVKKEK >NC_011837.1|WP_012103847.1|3503570_3503987_-|YjdF-family-protein MKVSIKFTVFFEDIFWVGVFERIYFNKYEVSKVVFGSEPKDYEIYDFILKHFCDLKFSNSLSTSELKYKKVNPKRVQREIKKQTRTNGIGTKAQLAMKLQYERNKSEKRKDLKEKSHKEKEWKFQLYQRKKKEKHKGH >NC_011837.1|WP_012103846.1|3502649_3503321_+|lactate-utilization-protein MEEKNSAIKTRNELLATKLIKNLQSRKFEAYYCDNAIDAAEKALSLIPESSSVSWGGSVTLEEIGLIERIYQGNFIIIDRDKAQTMDERYDLMRQSLLCDTYLTSFNAISEDGVLINIDSVGNRVAAITFGPKNVIAVIGMNKVCKTVEDAVARARTYAAPINAQRCSSNPFLHPPKKTPCVINGACGNCKAEDCICSYVIETRMCKTPGRIKIILVGESLGF >NC_011837.1|WP_012103845.1|3501856_3502513_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MDDLDILVQSHLFSGIEPNDIEKMLICLSAMRKEYEKGEMVVCEGDSVNDIGIILKGSARSTKLSITGKQIIVSLHYPGGYTAILTAASGKRKCPMSVQALESLAVLFIPVRNVLSRCKKLCIAHEQLLLNFFDSIAERALELHDRNDCLIMPTIRDKVLTYLTKVCHESKARIVRIPFNREAMAGYLNVDRSALSRELAQMKRDGLIDFYKNKFELL >NC_011837.1|WP_012103844.1|3501071_3501695_+|response-regulator-transcription-factor MDKNVVLIVDDDENIRELLTIMLKNQNIDYLCAKDGVEALEILKTNKIDLILLDIMMPRMDGMMACMKIREDLNLPIIILSAKIDDADKIMGLTIGADDYISKPFNPMLLIAKVKSHLRRYKDFNLNFHGNSNFIKIQDMLIDTDKHIVKIDNNEINLTPHEFEILAFLAKNKNNVLSIKQIYENVWKEPYMELNRTVTVHIRRKYS >NC_011837.1|WP_012103843.1|3500176_3500902_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEVLKLENVSKSIGKREIVKNLNLTVNEGEIFGFLGLNGAGKTTTIKMIVGFLKPTRGEIYVYGKSIKNNRISFISNIAAVVETPDMYPYLTGIENLKQLARMDRNIAQSDIEEAVKLVGLGDRIDDKFKKYSLGMKQRLGVAQVLMGNKRVWILDEPTNGLDPSGMIHFRNIFKKYSREKKVTIFISSHILGEMESMCDRVAFLNEGEIKGIEEINNMKGNLEKRYVEVVGGEKDDFCNN >NC_011837.1|WP_012103853.1|3512323_3512644_-|hypothetical-protein MSINASNDNSNEKVENSYDFEAPMYCPYCLMPYNRPIQNEYTYVDPYDEDFDENFDYDFNPEYRHRGHRRRRRRRRRRRHRRRCRRDICEFPLFPLFYDYDDWYWY >NC_011837.1|WP_012103855.1|3514643_3515414_-|ABC-transporter-permease METVKKHFFSDMGVMLGRSMRHVTRSMDTIITVTIMPIAFMLLFVYVFGGAIQTGTDNYVNYLLPGVLLIAIASGIAYTAYRLFMDMQRGIFERFHSMPIARSATLWGHVLTSLVSNAISVVVIILVALIMGFRSSAGVLSWLAVAGILMLFTLALTWIAVIAGLSAKSVDGAGAFSYPLIFLPFISSAFVPTESMPSVVRAFAENQPVTSIVEAIRALLAGQPVGNDIWVALAWCLGILIVAYLFAIRVYKRKAA >NC_011837.1|WP_012103856.1|3515414_3516173_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MEKAIQVKGLQKSYKKFHVLKGVDFEVEKGSIFALLGSNGAGKTTIVKILTTLLKQDSGAATVNGFDVAARPDYVRQSISLTGQFAAVDEILTGRENLIMIAKLRHLANPRQIADDLLKRFGLIDAGDRRVSTYSGGMHRRLDIAMSLIGNPQLIFLDEPTTGLDPEARIKVWKTVKELAEGGTTVFLTTQYLEEAEQLADRIAILHEGKIIANGTLDELKRLFPPAKVEYVEKQPTLEEIFLAIIGKKEEK >NC_011837.1|WP_012103857.1|3516188_3516539_-|DUF1048-domain-containing-protein MSIQDIIEGKKEWRAHMVRVKALPQDYQIVYKEIQKYIFKVGPVELTDGTGLLSGIIDLFEEGAALGKSVLEVTGSDVAAFCDDLIKGSKTYADIYQESVDQEVNKAVKKVTDKTK >NC_011837.1|WP_012103858.1|3516548_3516896_-|DUF1048-domain-containing-protein MNLWEKITGSDMTKELKIFESRAKKLPADYQVAWGKIFANLLPHSDFTGRNLMPILDGVLGLLEEAAADGQSVQEALGDDIKGFCSALAGEEGAKSFRDKWREQLNNNVAKKLGK >NC_011837.1|WP_155814044.1|3517350_3517494_-|hypothetical-protein MIIYSCLSIAYTWMIISGADCSKNKKSKIIGATKKYAIVVTVDLLAG >NC_011837.1|WP_012103861.1|3517820_3518174_-|DUF1048-domain-containing-protein MLEFFKKVVGDKKEYKQQMARVKALPEDYQFVFEKIQRYMWNFAAGDGYDMLKIQYELIDLFEAGVVEGRQVLEITGEDVAAFCDELLLNAKTYTENWREKLNHDIIKKFGKGNDSK >NC_011837.1|WP_012103862.1|3518176_3518503_-|PadR-family-transcriptional-regulator MLENLTEMLKGVLEGCVLEIISRKETYGYEITRRLNALGFTDVVVGTVYTILIRLEKNKLVEITKKPSDMGPPRKFFTLNDAGREELRRFWEKWEFVASKINQLKEGQ >NC_011837.1|WP_012103863.1|3518783_3520880_-|ABC-transporter-permease MTFWHIVGKNLKYNFGHFLSYLFVNSFVVAVLFLYGSLLFNEILARNGSFRAASAYIQAAAYAILLFSIVFVAYTGIYFVKSRSREFALYLTLGMTDRDLIRMIHIESLAIVAGSMVFGMLSGLLLSKLFYMILGRILGFTGFSYNDIYYIDYRTFLLSFGVFILVFFLNMLFTNIFIRRLSIVQMMKSSSTKGVSKSRPVVGAVATAACVFSTFFLHEFLARSEWARGITTNCPVLIPLLTFAVVIVSLYFVIAFGIDIVRYFSKQFPAFYNRNILTFGSLSHRFFSYKVTLYIVSLLIFVAIYFMGMGISIYTYNNKTIEEFVPYDFMIETSGNINNISPDEIKELVGGADGVLDTFSTLKFASCQNYRNTKEGFVNYYLENYKDSMFISESEFNRHMGLHIDVKPDELLLVYNSSAKAQEPIDFDTVITIEPWREGVTHAEAFGGNSTDMDTFVRKLGNTKHLVYSGEKTKSMYAPFIDSYGNIEYAGVLADVVDDKVYSELKAKTETAYLFNLKSGDGKKVFNAILDGLRKINGADENLWKSSSLVFGAKDDITNLRPIYKQERFDMAFGIGGFTFFAFSFIGFLFLLSSGIVLYYKIVTDIDEEKEQIVMLKRIGLNSKECRRYLTTHLAILFFTPLIIGAILGTVYMHAELVFSPYVDYMMSFILIIIGVVAILDVLLYLTLRKGFFRGVEV >NC_011837.1|WP_012620961.1|3520876_3521638_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDDIIKVENLTKVYRSFKGAKEVQALQDVNLTVSKGEFIGIMGPSGSGKTTLLNILSGIDTATSGKVIIDGKPIDRLKKDELALLRRQRIGYVFQDFNLLESLTLKENIALPLILDKVPPQKIEDRVNELMSFFGISDLAEKYQYHASGGEKQRAAAARALSTDPAVCFADEPTGNLDSKSSANIMEMMTRMNTQKHCTILMVTHDAFAASYCQKIIFIKDGKINVQIQSSGDRKAFFDKILETLSIVGGDKE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011837_3 | 3.11|2755137|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2755137-2755172 | 36 | NC_011837.1 | 453440-453475 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.11|2755137|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 453440-453475, mismatch: 0, identity: 1.0
tttccgaggaagaccaatgtccccttcggtattttg CRISPR spacer tttccgaggaagaccaatgtccccttcggtattttg Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011837_2 | 2.1|2298693|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT | 2298693-2298728 | 36 | NZ_CP018336 | Clostridium kluyveri strain JZZ plasmid unnamed, complete sequence | 17489-17524 | 1 | 0.972 |
NC_011837_5 | 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder | 2766621-2766647 | 27 | AP014331 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C30, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 16717-16743 | 5 | 0.815 |
NC_011837_5 | 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder | 2766621-2766647 | 27 | MN693180 | Marine virus AFVG_25M318, complete genome | 12880-12906 | 5 | 0.815 |
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NC_011837_5 | 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder | 2766621-2766647 | 27 | NZ_CP010123 | Escherichia coli strain C5 plasmid A, complete genome | 135983-136009 | 6 | 0.778 |
NC_011837_5 | 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder | 2766621-2766647 | 27 | MF403008 | Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome | 321420-321446 | 6 | 0.778 |
NC_011837_5 | 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder | 2766621-2766647 | 27 | NZ_CP026690 | Nostoc sp. 'Peltigera membranacea cyanobiont' N6 plasmid pNPM8, complete sequence | 27067-27093 | 6 | 0.778 |
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NC_011837_5 | 5.24|2768130|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2768130-2768164 | 35 | MK250027 | Prevotella phage Lak-B8, complete genome | 517029-517063 | 7 | 0.8 |
NC_011837_5 | 5.24|2768130|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2768130-2768164 | 35 | MK250026 | Prevotella phage Lak-B7, complete genome | 516060-516094 | 7 | 0.8 |
NC_011837_5 | 5.25|2766614|34|NC_011837|CRT | 2766614-2766647 | 34 | NZ_CP021438 | Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB172, complete sequence | 130021-130054 | 7 | 0.794 |
NC_011837_4 | 4.5|2756988|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2756988-2757021 | 34 | NC_020292 | Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p, complete sequence | 42490-42523 | 8 | 0.765 |
NC_011837_5 | 5.15|2767536|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2767536-2767569 | 34 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 629619-629652 | 8 | 0.765 |
NC_011837_5 | 5.25|2766614|34|NC_011837|CRT | 2766614-2766647 | 34 | AP014331 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C30, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 16717-16750 | 8 | 0.765 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NZ_CP014152 | Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence | 67487-67520 | 8 | 0.765 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 150626-150659 | 8 | 0.765 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 36620-36653 | 8 | 0.765 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NZ_CP013710 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence | 211865-211898 | 8 | 0.765 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 3653-3686 | 8 | 0.765 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 136079-136112 | 8 | 0.765 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 24381-24414 | 8 | 0.765 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NC_012654 | Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence | 90994-91027 | 8 | 0.765 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NZ_CP031095 | Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence | 21132-21165 | 8 | 0.765 |
NC_011837_5 | 5.15|2767536|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2767536-2767569 | 34 | MN693675 | Marine virus AFVG_250M630, complete genome | 13333-13366 | 9 | 0.735 |
NC_011837_5 | 5.15|2767536|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2767536-2767569 | 34 | MN693578 | Marine virus AFVG_25M520, complete genome | 13571-13604 | 9 | 0.735 |
NC_011837_5 | 5.17|2767667|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2767667-2767700 | 34 | NZ_CP017199 | Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum strain TMW 2.1619 plasmid pL21619-2, complete genome | 625-658 | 9 | 0.735 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | DQ535032 | Lactococcus lactis phage KSY1, complete genome | 26781-26814 | 9 | 0.735 |
NC_011837_6 | 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3511229-3511262 | 34 | NC_009817 | Lactococcus phage KSY1, complete genome | 26781-26814 | 9 | 0.735 |
NC_011837_2 | 2.4|2298888|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2298888-2298922 | 35 | NZ_CP035936 | Acinetobacter cumulans strain WCHAc060092 plasmid p1_060092, complete sequence | 47002-47036 | 10 | 0.714 |
NC_011837_2 | 2.4|2298888|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2298888-2298922 | 35 | CP040041 | Acinetobacter baumannii strain VB958 plasmid unnamed1, complete sequence | 274743-274777 | 10 | 0.714 |
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NC_011837_2 | 2.8|2299151|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2299151-2299186 | 36 | NZ_CP031095 | Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence | 229164-229199 | 10 | 0.722 |
NC_011837_4 | 4.5|2756988|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2756988-2757021 | 34 | MG869623 | Polaromonas sp. W10N plasmid pW10NP1, complete sequence | 2521-2554 | 10 | 0.706 |
NC_011837_4 | 4.5|2756988|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2756988-2757021 | 34 | NZ_CP022346 | Bacillus thuringiensis strain c25 plasmid unnamed1, complete sequence | 105153-105186 | 10 | 0.706 |
NC_011837_5 | 5.15|2767536|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2767536-2767569 | 34 | NZ_CP053316 | Bacillus circulans strain GN03 plasmid unnamed, complete sequence | 149754-149787 | 10 | 0.706 |
NC_011837_6 | 6.12|3510901|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3510901-3510936 | 36 | NZ_CP015325 | Bacillus filamentosus strain Hbe603 plasmid pBEH3, complete sequence | 84187-84222 | 10 | 0.722 |
NC_011837_2 | 2.11|2299347|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2299347-2299382 | 36 | NZ_CP015111 | Acinetobacter sp. TGL-Y2 plasmid unnamed1, complete sequence | 269568-269603 | 11 | 0.694 |
1. spacer 2.1|2298693|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018336 (Clostridium kluyveri strain JZZ plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
aagcagtaaagataaatctttaaggattaaaaatgg CRISPR spacer aagcagtaaagataaatctttaaggattgaaaatgg Protospacer ****************************.*******
2. spacer 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder matches to AP014331 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C30, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
ataaatttaaacatttaccattaaaat CRISPR spacer taaaatttaaaaatttacaattaaaaa Protospacer ********* ****** *******
3. spacer 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder matches to MN693180 (Marine virus AFVG_25M318, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
ataaatttaaacatttaccattaaaat CRISPR spacer gtaagtttaaacatttacgattaatgt Protospacer .***.************* ***** .*
4. spacer 4.5|2756988|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
ccaaggatttaatagaagaaatacataatttaga CRISPR spacer taaataatttaatggaagaaatacaaaatttaga Protospacer . ** .*******.*********** ********
5. spacer 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010123 (Escherichia coli strain C5 plasmid A, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ataaatttaaacatttaccattaaaat CRISPR spacer taaaatttaaacatttaatattaaata Protospacer *************** .******
6. spacer 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder matches to MF403008 (Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ataaatttaaacatttaccattaaaat CRISPR spacer tccaaattaaacatttaccattaataa Protospacer . ** ****************** *
7. spacer 5.1|2766621|27|NC_011837|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026690 (Nostoc sp. 'Peltigera membranacea cyanobiont' N6 plasmid pNPM8, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ataaatttaaacatttaccattaaaat----- CRISPR spacer gtaaatttaaacatttacc-----aatttcca Protospacer .****************** ***
8. spacer 5.24|2768130|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK250028 (Prevotella phage Lak-B9, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
taaatagtaaaaattataaaaattgaatacgttca CRISPR spacer gaaatagaaaaaattataaaaaatgaataattttt Protospacer ****** ************** ****** **.
9. spacer 5.24|2768130|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK250027 (Prevotella phage Lak-B8, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
taaatagtaaaaattataaaaattgaatacgttca CRISPR spacer gaaatagaaaaaattataaaaaatgaataattttt Protospacer ****** ************** ****** **.
10. spacer 5.24|2768130|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK250026 (Prevotella phage Lak-B7, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
taaatagtaaaaattataaaaattgaatacgttca CRISPR spacer gaaatagaaaaaattataaaaaatgaataattttt Protospacer ****** ************** ****** **.
11. spacer 5.25|2766614|34|NC_011837|CRT matches to NZ_CP021438 (Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB172, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
gttcaacataaatttaaacatttac---cattaaaat CRISPR spacer tttcaacctaaatttaaacatgtacttacactaa--- Protospacer ****** ************* *** **.***
12. spacer 4.5|2756988|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020292 (Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ccaaggattt------aatagaagaaatacataatttaga CRISPR spacer ------atttagaggaaatagaagaattaaataatttaga Protospacer **** ********** ** **********
13. spacer 5.15|2767536|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ctatgttttttatctttgtgtttaat-tcctctac CRISPR spacer ttatcttttttatctttttgtttaatattagata- Protospacer .*** ************ ******** *. **
14. spacer 5.25|2766614|34|NC_011837|CRT matches to AP014331 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C30, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
-gttcaacataaatttaaacatttaccattaaaat CRISPR spacer tcttctgta-aaatttaaaaatttacaattaaaaa Protospacer *** ..* ********* ****** *******
15. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014152 (Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttggaaattatataatttagggaggaaattaaa CRISPR spacer actataatatatataatttacggaggtaattaaa Protospacer .*. ** *********** ***** *******
16. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttggaaattatataatttagggaggaaattaaa CRISPR spacer actataatatatataatttacggaggtaattaaa Protospacer .*. ** *********** ***** *******
17. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
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18. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttggaaattatataatttagggaggaaattaaa CRISPR spacer actataatatatataatttacggaggtaattaaa Protospacer .*. ** *********** ***** *******
19. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttggaaattatataatttagggaggaaattaaa CRISPR spacer actataatatatataatttacggaggtaattaaa Protospacer .*. ** *********** ***** *******
20. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttggaaattatataatttagggaggaaattaaa CRISPR spacer actataatatatataatttacggaggtaattaaa Protospacer .*. ** *********** ***** *******
21. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
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22. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttggaaattatataatttagggaggaaattaaa CRISPR spacer actataatatatataatttacggaggtaattaaa Protospacer .*. ** *********** ***** *******
23. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tttggaaattatataatttagggaggaaattaaa CRISPR spacer actataatatatataatttacggaggtaattaaa Protospacer .*. ** *********** ***** *******
24. spacer 5.15|2767536|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693675 (Marine virus AFVG_250M630, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ctatgttttttatctttgtgtttaattcctctac CRISPR spacer ttctgttttttatttttgggtttaattcaaaaaa Protospacer .* **********.**** ********* *
25. spacer 5.15|2767536|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693578 (Marine virus AFVG_25M520, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ctatgttttttatctttgtgtttaattcctctac CRISPR spacer ttctgttttttatttttgggtttaattcaaaaaa Protospacer .* **********.**** ********* *
26. spacer 5.17|2767667|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP017199 (Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum strain TMW 2.1619 plasmid pL21619-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
cctagttgg------gttattaatgcctcctttttctttt CRISPR spacer ------tggcaaaatgttattaatgcctattttttctttc Protospacer *** ************* .*********.
27. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ535032 (Lactococcus lactis phage KSY1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttggaaattatataatttagggaggaaattaaa CRISPR spacer gtctaattatatataatttaaggagaaaattaaa Protospacer *. .* ***********.****.********
28. spacer 6.17|3511229|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009817 (Lactococcus phage KSY1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tttggaaattatataatttagggaggaaattaaa CRISPR spacer gtctaattatatataatttaaggagaaaattaaa Protospacer *. .* ***********.****.********
29. spacer 2.4|2298888|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP035936 (Acinetobacter cumulans strain WCHAc060092 plasmid p1_060092, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aattaccaatatttttacctaaagtttttaatctt CRISPR spacer catcaccaatatttttacctaatgtttcagcatct Protospacer **.****************** ****. . ..*
30. spacer 2.4|2298888|35|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP040041 (Acinetobacter baumannii strain VB958 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aattaccaatatttttacctaaagtttttaatctt CRISPR spacer catcaccaatatttttacctaatgtttcagcatct Protospacer **.****************** ****. . ..*
31. spacer 2.8|2299151|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cagcaaagattatggaattataaggaggaaatttaa CRISPR spacer aattatgatttatggaagtataaggaggaaagttat Protospacer * .* .. ******** ************* ***
32. spacer 2.8|2299151|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cagcaaagattatggaattataaggaggaaatttaa CRISPR spacer aattatgatttatggaagtataaggaggaaagttat Protospacer * .* .. ******** ************* ***
33. spacer 4.5|2756988|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG869623 (Polaromonas sp. W10N plasmid pW10NP1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ccaaggatttaatagaagaaatacataatttaga CRISPR spacer ggttgcatttaatagaagaaatagatattttgac Protospacer * ***************** *** ***..
34. spacer 4.5|2756988|34|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022346 (Bacillus thuringiensis strain c25 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ccaaggatttaatagaagaaatacataatttaga CRISPR spacer ttcattaaataatagaagaaactcataatttagt Protospacer .. * * ************. **********
35. spacer 5.15|2767536|34|NC_011837|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP053316 (Bacillus circulans strain GN03 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ctatgttttttatctttgtgtttaattcctctac CRISPR spacer gatcctgatttatctttctgtttatttcctctat Protospacer . * ********* ****** ********.
36. spacer 6.12|3510901|36|NC_011837|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015325 (Bacillus filamentosus strain Hbe603 plasmid pBEH3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ggtaattcagtttctacaactccacattcttttata CRISPR spacer tcttcttcagttgctacaactccagattcttggctt Protospacer * ******* *********** ****** *
37. spacer 2.11|2299347|36|NC_011837|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015111 (Acinetobacter sp. TGL-Y2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
ctaggatatgcatttttattctttttaataattctt CRISPR spacer agtaaaaatgcatttttattctttttagcaatttcc Protospacer ..* ********************..****...
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1803314 : 1839422
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011837|1803314:1839422|DBSCAN-SWA AATCAAACCCTCAATTAAGGAAAAAGTAGAAATAGCTAAAAAGTATATAGAGCAAGGATACAATGCAGTATTTGTACTTAAAGTAGTTAAACTCGGAAGATCAACATATTACTATAATTTAAGTGTAGAAGGCAAAGAAAAGACTAGGCCTAAAGGTGGAAAGCCAAAAGGATATAGTATAAACAGAGATGGTGAGAAAGTATGCGATGATCAGATTAAGGAATTTATTTTGGAGGCCATTGACGGGGATGCTATTAACTATGGATATAGAAAAATAACTTACCATTTAAGAAAATATTGTAATCTTGTGATTAATCATAAGAAGGTTTATCGGCTTTGCAAAGAGCTCAGAATACTTAAAGATCAGAGAATAATTAGAACTAAAATAAAGAGAAATATTGCAATTAACAGAACTATAACAGGCTCAAATCAACTATGGGAAATGGATATAAAATATGGCTATATAGAAGGTGAGGATAAATTCTTCTACTTACTAAATTTAATTGATATCTTTGATAGGAGCATTATAGATTACCACATGGGTTTACACTGTGAGGCTAAAGATGCTGCAGCACTACTGAGGAAGTGCTTAATAAGAAGAAACTTGTTTGAGGAAGACTCTAAAAAGCCAGTAATAAGAACAGACAACGGACCCCAGTTTATAAGTCATAAATTTGATGAATGCTGTGAAGAACTTAAAATTGAACATGAGAGAATACCAGTGAAGACGCCAAATAAAAACGCACATGTAGAATCATTTCACAGAATACTTGAGGATGAGTGTTTAAAAATTAATGAATTTCAAAGCTATGGAGAAGCATACAAAATAGTAAATGAATTTATGGAATTCTACAATAATAGGAGATTACATTCAAGTTTAAGATTTATGGCTCCACATGAATTTTATAACCTTTATTTTGAAGAAAACCTAACAAACATTCAAATAAGGGTCTAAATTTAATAGAAATGAAGAATTTATTAGATTCTGTCCAAAACGAGGGGGTTAATCCGTTTCCAACTGCACAAATGTTAGTTGAAAATGGTGCAGGGTATATGCAGATAGGGGCATTTGTATCAACTCTCATGATGGTAGGAATAATTACTATGCCTGTTGAGATGAAATATTTTGGGAGAAAACTTACTATATGGAGAAATGTACTTGCATTTATATTTTCATTTTTTATTTCTCCCTGAATTGTGATCTATAAATTTATTTAGGATATAATGTTACATAGTAACATCATATCCTAAGATTATGTAACATTCAATAGCATTGTTTTTATGTAATCTCTTTTAATCCCTATTGTTGGTCCATTCTGAATGTTACAAAAATAAGTTGTGTAACATTGAAAATACTCAGAATGACTATTAATAATTTACTTTGCCCCCGGTTGCAGAGCTACTGGTGTTATCTCTTATCGTACATAATTGTAACTGTCCAAACTAGTTTAGGAATTTATTAAGGTACAAAGTTTTATTTTTTAGTGTGTAAGATTAACTGGATATTATGAATTTATTGTATCATTATATTTATAATGTTAAATATATGCTAAATAATTGTTATAATTATTGATAACTAATATAATCTATCATATGATTATGAATGATTACATAAAAGAATTAGGGAGTGATATTATGCAAAAGAAAGTATTATTTTTATGTACTCAAAATTCTGCAAGAAGCCAAATGGCAGAGGCTATATTAAATGACAAGGGTAAAGATAAATTTATTGCTTTTAGTGCAGGAAGTCAGCCAGCCGATGATATTAATATTCATGCCAAAATTGTCATGAAAGAAATGGGTATAGATATTAGTAATTACAAACCTAAGTCAGTAGAACAATTTTTAAATGAAGAGTTTGATTTTGTTATTACATTATGTGATAAGGCTAAAAATGAATGTCCTATTTTACCCAATGATGCAATTTATGTACACTGGGGAATAACTGACCCAAGAGACTTTAAAGGTAACGAGGAAGAGACAATTACTCACTTTAAAAAAATAAGAAATGAGTTAAATACAAGAATTAATTTACTTATTGATCTACCAGTAGATAAATTAGACAAAGCAACTTTGAGGAAAAGATTAGATGAAATAATTTCAAAATAATATCTTATACTTTAGTACATAGTTATAATAGAAGACCAATGTATTTTATTTAAGAAATGTTAAGCTGGTGATGTTCATAAATTCACATAGAATATTGTGTAACAAAAAATATCATAGATTTACTTTTTAATATACAAAAAATATATCCTTAAACAATATTCACATTATCAGTTTCAGGTTTTATAAGTGCAAAAATTATTAATCCCCATATTGCAGATAAAAGCGAAGCTGCTATTATACTTATCTTTGCTGTAGATAATATAGCTTCATCTGAAAATGATAAAGATGAAATAAATATTGACATTGTAAATCCAATGCCTCCAAGCACACTTGCACCATATAAGTGTTTTTGGTTTACTCCTAAAGGAAACTTAGCAATACCTAATTTTACTAATATTGTTGAAACTCCAAATATACCCAATTGTTTTCCTAAGAAAAGTCCTAAAATAATTCCTACGCTAACAGGTGTTGACATAATTGTTGAAAGACTGATCATATTTATAACTACTCCTGCATTAGCTAATGCAAATATAGGCATAATTAAATAAGAAGAACATGGTGATATTGCATGTTCAAGTTTATTTAGCATTGATTCTTTAAATACTTCTTCATCTCTTGAACCAGGTATTATCATTCCAAGTAATACTCCTGCCAATGTAGCATGTATACCTGATTTGAACATAGTAAACCATAGTACAATTCCAATAATAATAAAAATAGCTGAAGATTTCACTTTAAATTTATTTGCTAATATAAGCACACCAACAATAGCTAAGCTTAATAAAAAGTAAAACCATGATATTTCAGTGCCGTAAAATATTGCAATTACAATAATTGCTCCCAAATCATCAACTATAGCCAAAGCTGTAAGAAAAACTACAATCCCCTTAGGTGCTTTTTTATCAACTAAAGAAATTACCCCTAATGCAAATGCAATATCCGTTGCCATAGGAATTCCGAAGCCATTGATAGTTAGTTGATTATAGTTAAATAATGCATAGAGAATTGCAGGTACAACTATTCCACCTATAGCAGCAGCAATTGGCAGTATAGTTGTTTTTAAGGATTTAAGCTCCCCAATTAACAGCTCTTTCTTAATTTCCATACCAATTACAAAGAAAAATACTGCCATTAATCCATCATTAATCCAACGAGAAATTGGCATTGATACAGATGTTGCTTTATATCCAATTGTTATATTCTTATGTAATATTTCATTGTAAATTGGAACAAAATTAAAATTTGCTAGTAGGATTGCAATAACAGTGCAAGTTAATAATATTATTCCACTAAAAGATTCGCTTCTAAAAAAGTTTAAAAAACTATAAGTTCTATTGTTTGTGTTATTTTTCATACCTCGTATCCTTTCTTATATCATTAAAATTATCTTACAAAAATAAAAAGAGAGGGAAAGCCCTCGTTTATGGGATTAATTTTCTTAACGTGGGCTTTGTCGGTTTTGTTGGCTGCACCCCAAGAAGGGTATATTAAAAAAGTCATTAATTGTTTTGTTTCCTTGTATCATCCGTCTTTCCTGAAATGGTACAATGAAATTTTAATTCAATGAATTTTTATATCTAATCATATTTACCCATTTACCCATCAATTATACCTCTCACCCACACCCATAGTACAGGTACATTTTGAAACTCTAATGATTTTCACAGAAAAACATTTATACCTAAAACAGTTTTAGAATAAATTAACGTAATCATTTATGGAATAAAGGTAATGATAAGTTTGAGGTATAAATTTATATTTTTAAACTAAAGAAGGTGTTTTTTTTATGAAAAAGTTTTGTGGTTTACGCTGTGGTATCCTCATAATTACAATACTATTTATATGTTCAAATTGTTCGAGTGTTGGATATACCGATAATTTAGCTCTATCCAACAATAAGTCTAAAAATATTCAGGAATGCCCTAAAGAAGTATTCTTAACTTTTGATGACGGGCCAAGCGTAAATAATACAGGAAAAATATTAAAAATATTAAATGACAACAATATAAAGGCTACCTTTTTTGTGGTTGGAATAAAGGCTGAAGAAAATCCTGAAGCACTAAAAGAATTAAGTAATAGTGGTATGTGTATAGGAGTTCATACTTATTCTCATAATTATAAAAAAATATATAAAAGTTTAGATGCTTATATTAATGATTATGAAATGTGTAAAAGTACAATAAAAAAGATAACAAATAAAGAACCTATAAATTATACTCGATTACCAGGCGGCTCAACTAATCTGATAATCAGTAAAACAAACTTAAATTTAATAAAAAAGACTTTAAATGATAAGGGAATAAAATATGTAGATTGGAATGTTTGTTCAGGTGATGCAGACAGTCATGAAGTATCTGTTGAGAAAATAAAAAGAAATGTTAAAACTCAATGTCAGAATAAAAAAATTGCAGTAATACTTATGCATGACACATATTATAAGCATTTTACAGTAGAATCTCTGCCTGAAATAATAGCATACTTGAAAAACCAAGGATTTGTCTTTAGAACTTTTGGAGATTTAACTGAAGTAGAACAGAAGGAAATGATAGACCTTGAAATAATAAATAAAAATAATGTCCGATAATAAGGCTAGTAAATTAACTACTAATCTTTTATTTTGTTTTGAAATATTTAATAAAAAAACTTTATTATTGGTAAAAATTATCAACTTTATGCCTATCGCACATACCTTGATATTTTACCTACTTAGAGGTATAAAACTATAAATTTGATTATTGAAAATAATAGGTTTTTAGCCTCTAGTATATAGGGGTACAAATCTAAAGTAAAAAAATAAGCACCTATGCCAGGCACCTATTTTCGGAGTATTAATATCAAATACTAATTAATGTTAATCATTGAAAATACATCATTTTCCCTAAAAATTTAAA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23 | Leptospira_phage(28.57%) | transposase,integrase | attL 1800085:1800105|attR 1839901:1839921 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1932517 : 1988836
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_011837|1932517:1988836|DBSCAN-SWA 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>NC_011837|1932517:1988836|1942864_1943089_+|WP_041700796.1|DBSCAN-SWA MQITLTYNFSSECPYLNEPHCISIDYIKFDMTGTGMPGYKKGSYFCNKVKNCPYPSKDRWGRCPVYLDAPCPPE |
91 | Clostridium_phage(36.17%) | plate,tail,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2603262 : 2679121
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_011837|2603262:2679121|DBSCAN-SWA 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79 | Erysipelothrix_phage(62.96%) | tail,protease,capsid,integrase,head,portal,terminase,transposase,holin | attL 2597746:2597761|attR 2676799:2676814 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2683522 : 2695592
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_011837|2683522:2695592|DBSCAN-SWA TCTAAGGCTTCACATATAATACCGTAGCTACGGTTCTCTCTCCATTCCAATCGCAAGGATCGTTTATTACTTCCCCATTAAAATACATAGTAGTAGAAGAACCTCCATCTAAATTGCTGGCATTAACTACCCCCTGCTGCAAGAGTATGTTTTGTATTTCTTTTAAGGAGGCACCTGTTTTCAATCCCTTTCTTCCATCTACAACTAGCATTACTATAGTCCCATCTGCTTTCTGTCCTATGGCTGTTCTGGGATTCAAACCTTCATTTTCTACGGATACAGTCTTTCCATTTATTATTAGAGAATTTCTGAAAGAAATTGCCTCCTGTACATTTTTATCTAAAAGTTCCTGCAGGGTATGATCTCCAACTATAAGTCTGCCATCTGAAGTAAAAGCTGTAACATTTATTTTCTCTGAATAGTTAACATCACTATATATTAGCTTTCCCCCAGATATTACAATTCCCTCAGGATAAGCTCCCGTTCCCACCCACAGCTTGCCGCTGGTGGTTTTATCTGTAAATCCTCCTCCATTTATAGCAGCTACAGCCCCATTACGCTCTGCTATTTCACTTGTTCTCTCCCCTACTTCTTTTAACTTGCTGGTATATCCCACCTTTATTCTCTTTGGATCATTTATTTCAAGAATATAACCATCAAATTTCCTATTACTTATATCATATCTTTTAATATCATTATCACCCTCATGACTTATATTTACACCATTGGGATTTTCTTTTTCCGCACTGGTAGTTTCTCCGCTTTTTCCCTGATTGAGTATTTTAGTTATCTCATCATCAGACAAAAAGATAGTAGCTATATACTGATGGCTGAAAGTTGCCATGGCGGTGCCTACTACCTGGCTTTTTACATTCTTAAAAGGTCCATAAAATACCAATATAGGACCTGCAATAATAAATACTATTAATTCATATATTAGAAATAAAATAAGTGATTTTAAAACACTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTCTTTCTACGCCTATTTTCTGAATTACCCATAAAATTATACCTCCATACAATATAGGTACTATTTTACTATTATTTTAAAATTATTTCCACTGGAAAAGATACGGGTACTAAATTTGTAACATAATATTTATAAAATTTACATTGATAATTTATAAATCTAAATAGAAAAGCTGACCCCCCTTACAAAAACAAGGTGGTCAGTTTTTAATCTAAATTATCGTCCTATATCAGTTCTAAAATACATTCCTTGAAAACTTACTTCCTTCAAATTATTATACGCTGATTCAATTGCTTTATCTAAATTATTTCCAAGTCCATAGACAGATAAAACTCTTCCTCCAGAGGTTATAAATTCTCCATTTTTTATTTTAACTCCTGCTGCAAAAATATTATTTGAGTTTTCCATACCTTCTATGGTAAAACCAGTACTATATTTCCCCGGATAGCCTTTAGAGGCGGCTACTACCGAGCAGCAGGCACCCTTTTCCCACTGTAAATCAAATTTGTCAAGCTTTCCTTCAAGGGAAGCTTCTATAAGCTCTACCAAATCACTTTTCATTAAAGGAAGTACTGCCTGGGTCTCAGGATCTCCCATTCTTACATTGTACTCCAGAAGATAAATTCCTTTTTTAGTTATCATAATTCCAAAAAAAATTATTCCTATATAATCCAAGTTTTCCTGCTGTATTCCCTTTAATGTGGGATTCATTATATTTTTCTCAAAATCCTTTAATACTTCCTTACTACAATAAGGGTTTGGAGATATAGCTCCCATACCTCCAGTATTTGGCCCTTTCCCCCCATCATAAATCTGTTTATGATCCTTTGCAGACATAAATGGAATAATGCTCTTTCCATCTGTTATTGTGAGTATGGAAGCTTCCACTCCCTCCAAAAACTCTTCAATAACTACATTTTTTCCTGCCCCATTGAATATGTCTTTAACCATAAAATCCTCTATTGTAAACCGGGCTTCTTTATAATTTTTACATATGGATACACCTTTTCCCGCTGCTAATCCATCTGCCTTTATAACCACCGGATATTCACATTCTTTAATGTATTTCAAAGCCTCATCTTTATCATTGAATACACCATATTCTGCAGTTTTAATCCTATACTTTTTCATGAAATCCTTAGAATAAATTTTGCTTCCTTCAAGCATTGCAGCCTCTGACGTAGGTCCAAATATATTCAATCCCTTACTTCTAAATTTATCTACCATACCTTCTATAAGCGGGTTTTCAGGTCCTACTACAGTTAAATCTATTTCTGACTCCAGTGCAAAGTTTACAAGTTCCTCTATGTCTGTTATATCTATGTTAGTACATTTATCTTCTGCATGGGTTCCACCATTTCCAGGAGCACAAAATATTTTATCTACTTTTGGATTTTGTGATATTTTCCAGCAAATAGCATGTTCTCTTCCTCCTGAACCAATTACGAGTACTTTCACTATATACACCCCTTTTCAATTCACAATTCACAATTCACATTTTATAATTTAATGTTTAAAATGTCTTACCCCTGTAAATACCATTGATATTCCATTTTTATTGCATTCTTCTATGGAGTCCTTATCTCTTACAGAACCTCCTGGCTGAATTATTGCCTTTATTCCGTATTTTGCGGCTTCACAAACTACATCATTAAATGGGAAAAATGCATCAGACGCAAGTACTACTCCATCTCCTGCCCTATCCAGTGCATGACAAGTAGGCCATATTCTGTTCACCTGGCCTCCTCCAATACCTTTGGCCATGAAGTCCTTAACTACTACAATGGCATTTGATTTTACATATTTACATACTTTCATTCCAAAGATCAAATTATTTATTTCCTCTTTTGAAGGTTTTTTATCTGTAACTACTTCCATGTTTTCTACCAGTTTGTCGTCCGCAGACTGCACCAGTATTCCTCCATCTACTTTAGCTATTTCCATACTATTAGTAGGTTTTACACTGCATTTAATTATTCTCAAATTTTTCTTTTCCATCAATACTTTTAAAGCTTCTTCATCAAAATCCGGTGCAATAACTATTTCAACAAAAATTTTTGATATCTCCTCTGCAGTTTTTACATCCAATTTTCTATTTACAGCTATAATTCCTCCAAAAATTGAGGTAGGGTCACATTCATAGGTTTTAACATAAGCTTCATACAAATCTTTTCCAAGTGCCACACCACAAGGAGTGTTATGTTTAACTGCCACACAGCATATTTCTTCAAATTCATTTACTACTTTCCAAGCTATATCCATATCCTTTATATTGTTATATGAAAGCTGTTTACCATTTAGCTGGGTAAAATCTTTCATAGGGGCAGTTCCTGCTGTAGCAGTATAGTAAGCTGCACTCTGATGTGGATTTTCTCCATATCTTAAATTATCCATCTTTTTGTAAGAAAGACTTAAATATTCGGGATAATCTTCTTCCAGAAGGAAATTGCTTATAGCCCCGTCATAAGCAGACATTAGATTAAACACCTTTCCCGCTAGTTTTTTTCTAAAATCATAGGGTACATCTCCCTTTGAATCTATTTCTTCAATTAATTTTGAGTAGTCTCCCACATCTGTAACTACTATTACGTCCTTAAAATTTTTAGCAGCAGCCCTTATCATTGTGGGACCACCTATATCTATAAACTCCACCTTTTCTTCAAAAGTAATATTGTCATCTACTTTATCAAAGAAAGGATACAGGTTTACTACTACCATATCTATGGGAAGAATATCCTTTTTAGCTATGGTATCCATATGTTCTTTATTATCTCTTTTAGCAAGTATACCTGAATGTATAACTGGATGAAGAGTTTTTACCCTTCCATCTAATATTTCATCAAAACCTGTAATTTTTGACACTTCTGTAACCTGTATATCATTTTGTTCCAGGTACTTATAGGTACCTCCTGTGGATATTAGCTCCACTCCTTTATTTTTTAAAAATTGTGCCAACTCCAATAAGCCTTCTTTATTATAAACACTTATTAATGCACGATTTATCATATTTAAACCTCCAATTACTTTATTTATAAATTTTTACTCTTTTCCCTTCCACTACTACCTTATCCTCAGAAATCAGCTTAATTACCTTTGGAAGCGCTTTATGCTCCTCTTTTAGCACCCTCTGTTGAAGCTCCTCCGGAGTATCTTCAAAATATACAGGTACTGCCTCCTGAAATATTATAGGTCCGCTGTCTGTACCTTCATCTACAAAATGTACGGTACACCCTGATATTTTAACTCCATGTTCCAGTACCTTTTCATGAACCTTTATGCCATACATGCCATCTCCACAGAAGGAAGGTATAAGGGAAGGATGTATATTAATCATTTTATTTTTAAATTGTGAAATCAAATCACCCTTTAGTATAGAAAGCCAGCCTGCACACACTATTAATTCAACTCTATTATGTAAAAGTTTCAGTATTTCATCGGAAATATTGGATTTATAAATTTTTCTATCCAATACGTGATATTCAATATTATTTTTTTTTGCCCTTTCCAGAGCATACACTCCCGGCCTGTCACTTATTAAAATATCTATAATACAATTTTTTAAATACCCACTATGAACAGCATCTATTATGGACTGAAAATCAGTACCTCCCCCGGAAGCTAAAACTGCTATTTTAAACATACCCTTTTTTCCCTTCTTTTCACATGTCCAATGATATAGGCTTTTTCCCCCATCTCATTCAAATCCTTTATTATATCTGGAGCATCTTTACTATCTACACAGAGTACAAAACCTATTCCCATATTATAAGTATTGTACATATGTTCCTCATCCACACCTAAATCCATTATATATTTAAATATCTCAGGCATCTCAAAACTATTTTTATCTATAACCGCTGTAAAATCTTCTTTAAACATTCTCGGTATATTCTCATAAAAACCGCCCCCTGTTATGTGAGCCATGGCTTTTATTTTAAACTTCTCCAGAAGTTTTAAGACCGGTTTTACATATATCCTTGTAGGAGTTAAAAGCACTTCACCCAAGGCACTTCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_011837|2683522:2695592|2686013_2687513_-|WP_012103026.1|DBSCAN-SWA MINRALISVYNKEGLLELAQFLKNKGVELISTGGTYKYLEQNDIQVTEVSKITGFDEILDGRVKTLHPVIHSGILAKRDNKEHMDTIAKKDILPIDMVVVNLYPFFDKVDDNITFEEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVIVVTDVGDYSKLIEEIDSKGDVPYDFRKKLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLEEDYPEYLSLSYKKMDNLRYGENPHQSAAYYTATAGTAPMKDFTQLNGKQLSYNNIKDMDIAWKVVNEFEEICCVAVKHNTPCGVALGKDLYEAYVKTYECDPTSIFGGIIAVNRKLDVKTAEEISKIFVEIVIAPDFDEEALKVLMEKKNLRIIKCSVKPTNSMEIAKVDGGILVQSADDKLVENMEVVTDKKPSKEEINNLIFGMKVCKYVKSNAIVVVKDFMAKGIGGGQVNRIWPTCHALDRAGDGVVLASDAFFPFNDVVCEAAKYGIKAIIQPGGSVRDKDSIEECNKNGISMVFTGVRHFKH >NC_011837|2683522:2695592|2689143_2690595_-|WP_012103029.1|DBSCAN-SWA MSGLNEQFNECSCIDMEEDKFKDECGVFGVFSKNNIDVASLTYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGSELKYHKEMGLVSDVFHRELLNGLKGNSAIGHVRYSTAGASSLNNAQPLIAQYKLGSIAIAHNGNLVNADIIRDLLEEAGYIFQTSIDTEIILSLIARGSKKDIGKAVVDAVQAVKGSYATVILTENELIGVRDPNGIRPLCMGELNGDYILCSESCALDSIGANFIRDVEPGEIVIINKDGIKSINFAEKTKCQTCSFEYIYFARPDSTIDGINVYTSRLKAGRILYRENPVEADVVIGVPDSGIPAAIGYSEESGIPYSIGFIKNKYVGRTFISPSKELRSKAVAVKLNPLKVNVEGKRVIIVDDSIVRGTTSKKLVEILRRAGATEVHLRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRNELIGSNAKLEEIRDEIGADSLGYISIDGILEALDYGDDENKGYCLGCFSGVYPISAPMEKNKNYLE >NC_011837|2683522:2695592|2694185_2695592_-|WP_012103035.1|DBSCAN-SWA MNVEKTKLDSFFKLTENNTSVKTEIIAGITTFITMAYIIFVNPNILMQAGMNSRGLMGDAAVKAGLSVANDPLVASVFAATCIAAAIGTLIMALYANLPFAQAPGMGLNAFFTYSVCLGMGYTWEQALSAVFVSGVIFIIITVTSIREKIVDAIPRNLKFAISGGIGLFIALIGLKNSGIIISDAATLVAFGKLTSPGVLLAIIGILITAVLMARNVKGSILIGIILTTIIGIPFGVTHLAGIKVISAPPSLAPTFLAFDFKGLFSVEAGVIGAITSVLTVIITFTLVDLFDTIGTLVGTAEKAGMVDENGKFKNMHKALFSDSIATTVGSVLGTSTVVTYVESTSGVSTGGRTGLTSVTVGILFILALFFSGIVGIVPTQATAPALIIVGVLMMGAVTKIDFNDFSEALPAFFAIAFMPFSYSIANGIAAAVIFYPIVKIATGKYKEVHPIIYVLAILFIFRFAMLA >NC_011837|2683522:2695592|2693130_2693322_+|WP_012103033.1|DBSCAN-SWA MNTTYCLSHIPEEIKKQVTDLISKSGIPAEDFIKGLADYYNVKNAKADSIVLDYSNYWNSFVD >NC_011837|2683522:2695592|2691345_2691825_-|WP_012103031.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDIEKMKGAAKALKEFNIDYEAFILSAHRVPEELLQTIEKLERENCECIIAGAGLAAHLPGVIASKTVIPVIGVPLNAALSGLDSLFSIVQMPKSIPVATVGINNSYNGGMLAVQILALKYPEIREKLVEYRKNMKKKFIMENGEGVEL >NC_011837|2683522:2695592|2692307_2692895_+|WP_012103032.1|DBSCAN-SWA MKLVCLGDSLTSGYGVFKEDCWVSLIRDLLKIEVLNKGINGDTMPGMLSRSYRDVVKNHPTHVIILGGSNDFMAGRRLKLVTDNLTEIIKESLNEGIIPIVGTEPIIDKTLAERKWDGTVDYDKINILLNHYRNWILDFCTKNNIHYIDFHHCFLEKSKISSNNSLFIDGIHPTKTGHKLIAECIIKFFNETPIK >NC_011837|2683522:2695592|2683522_2684539_-|WP_012103024.1|DBSCAN-SWA MGNSENRRRKKKRKKKKSVLKSLILFLIYELIVFIIAGPILVFYGPFKNVKSQVVGTAMATFSHQYIATIFLSDDEITKILNQGKSGETTSAEKENPNGVNISHEGDNDIKRYDISNRKFDGYILEINDPKRIKVGYTSKLKEVGERTSEIAERNGAVAAINGGGFTDKTTSGKLWVGTGAYPEGIVISGGKLIYSDVNYSEKINVTAFTSDGRLIVGDHTLQELLDKNVQEAISFRNSLIINGKTVSVENEGLNPRTAIGQKADGTIVMLVVDGRKGLKTGASLKEIQNILLQQGVVNASNLDGGSSTTMYFNGEVINDPCDWNGERTVATVLYVKP >NC_011837|2683522:2695592|2687532_2688147_-|WP_012103027.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLASGGGTDFQSIIDAVHSGYLKNCIIDILISDRPGVYALERAKKNNIEYHVLDRKIYKSNISDEILKLLHNRVELIVCAGWLSILKGDLISQFKNKMINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHEKVLEHGVKISGCTVHFVDEGTDSGPIIFQEAVPVYFEDTPEELQQRVLKEEHKALPKVIKLISEDKVVVEGKRVKIYK >NC_011837|2683522:2695592|2693375_2693966_-|WP_012103034.1|DBSCAN-SWA MKKCIKFVLYFIIVIFLLALITEIQIIYFGENAKPKKSDCIIVLGCRVYGSTPSPFLIWRLNKGLELYDKGYGDYIIVSGGKGPGENISEAKAMKNYLVYKGIDSSRVIMEDKSMSTMENLSNSKRVMEEKGLKTAVIVSNKYHLKRASLMAESHGIEGSYSGVFVYTYKNREITGYIREIPALWKYYLYKLFKVY >NC_011837|2683522:2695592|2684723_2685965_-|WP_012103025.1|DBSCAN-SWA MKVLVIGSGGREHAICWKISQNPKVDKIFCAPGNGGTHAEDKCTNIDITDIEELVNFALESEIDLTVVGPENPLIEGMVDKFRSKGLNIFGPTSEAAMLEGSKIYSKDFMKKYRIKTAEYGVFNDKDEALKYIKECEYPVVIKADGLAAGKGVSICKNYKEARFTIEDFMVKDIFNGAGKNVVIEEFLEGVEASILTITDGKSIIPFMSAKDHKQIYDGGKGPNTGGMGAISPNPYCSKEVLKDFEKNIMNPTLKGIQQENLDYIGIIFFGIMITKKGIYLLEYNVRMGDPETQAVLPLMKSDLVELIEASLEGKLDKFDLQWEKGACCSVVAASKGYPGKYSTGFTIEGMENSNNIFAAGVKIKNGEFITSGGRVLSVYGLGNNLDKAIESAYNNLKEVSFQGMYFRTDIGR >NC_011837|2683522:2695592|2690635_2691343_-|WP_012103030.1|DBSCAN-SWA MKKGEMIYQGKAKKVYETDDKDKVIIYYKDDATAFNGEKKGQITDKGILNNNITSSLFELLEKNNIPTHFEKKLNDREQLCKKVDIIPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGTPLKTTVFELSYKDDSLGDPIINDYHAVAIGIATWDELKTIYDMTASINDILELFFRKLGIKLIDFKLEFGKFKDKIVLADEISPDTCRLWDAVTNEKLDKDRFRRDMGNVKEAYEEILRRISDN >NC_011837|2683522:2695592|2688134_2689130_-|WP_012103028.1|DBSCAN-SWA MVTYKDSGVNIEEGYKSVKLMKEYSAQTFIPGVLNGLGSFAGMFELGKYKNPVLVSGTDGVGTKLKIAFEMKIYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYLACSNLEAEVAAELVKGISKGCMDAGCALIGGETAEMPGFYSKGEYDMAGFAVGVVEKDNIINGSTVEEGDVLVGIASSGVHSNGYSLVRKLVDNFQVDFFGSALGEVLLTPTRIYVKPVLKLLEKFKIKAMAHITGGGFYENIPRMFKEDFTAVIDKNSFEMPEIFKYIMDLGVDEEHMYNTYNMGIGFVLCVDSKDAPDIIKDLNEMGEKAYIIGHVKRREKRVCLK |
12 | Synechococcus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2860415 : 2897701
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_011837|2860415:2897701|DBSCAN-SWA TTTGGTAAGTAGTATATTTGATGTATTTAATCATTTCTTTTTAGATTTGCAAATAGATTCTATTAAAACAAGTGAAAGTGAGCTAGCAAAGAAAAATATTAATGCCATAAGAAAGATACTGCCGAATACAAATTTTATTGTTGTATTTGACCGTGGATATCCGTCAATAGAATTAATTCACTTTTTAGAGAAAAATGGAGTTCAGTATTTGTTTAGACTATCCAGCAATGATTATAAAAAAGAACGGGAGTTTATGATTACAGAAGATAAAGTTGTAAAGCTTACGCATACAAATCCAAGGCTAACAAAAATAAAAAAGAATCATCCTGAAATTGTGGAGGAATTAAGGGTAAAAAAGTATACTTCATCGAGGATTGTTTTATCCAAATTACCATCTGGAAATGAACTTGCACTGATGACAAATCTCCCGACTGAATTCAGTGGAAAAGAAATAGAGAATCTATATTTTAAGAGATGGGAAATTGAAAAAAATATCATACCCTGAAGAATAAAATGAAGCTAGAAAGTGTTACAGGAAAAGCAGCATTATATGTATATCAAGACTTTTGGGCACAAATAGTTGTTTACAACATGATACAGGACATCTTACATTCATCAAATAAAACTATAGAAAAAGAAACAGAGAAGCGTAAATATAAGTATCCTATCAGGATCAATGAAAATATAGCGATAGGACTATTTAAAGAAAAATTTATAAAATTGTTAATTGAACCAAATGATAGAATTAGAGAGGAAAAATTAATCCAATTACAAAATCCATAGAAAAATATGTTGTTCCCATAAGAAATCTTAAAAGTCAAGATAGGAAGCATAATATTTCTAACAAATATCAGAATAACCACAAAAGTAGTTTTTAAAAGAGCAAAAAATCTATCTTTATTGAAATAGGATCCTTTTGCTCTTTTTTTGATTTCAAATAATTAATTAACACTTTATTCAATAAAAAATGTCAATGTGAATACTAAAGAGTTCTTAAGTTTATGATGTTGGGTTTTACCTGTGGTTCCGAAAAGCTTATAGCTATGAGTAGAAAAAAGAAAAACTCCAATATAAAATAGAAGTGGGTTTGCCAACCACAACTAAAATATATTGGAGGTGTGTCCCAAATGGACAATAGTAGTTTAGCACACAGCAAAGTACAGTTTACAAGGGACTACACAGGGTAAGGGTCTGACGGGTGATGTGTTGCCCGTCAGATTTTCCATGTAATGTTCATCTTTTCGCTGATGGCTTCCACGGTAGTAACCAGCAAATCCAACACCCGCCGCTTATCGTCAAAGCTTACGGTTTCCCATGCGTCCAAGTAGCCGGAAATCTGCTGCACCTGTTCCGGGGATATGGTGTCCACCGTCAGTTCCGCAATCTCCTTGACAAGAGCCTGCTTACGGCTGTCCAGTTCCGCAATCTTCACATTCACATAGGAGAGCAGGACATTGTTTGCCCCGGTCAGGCTATCCACCAGCTTTTCAATTTCGGTGTTCACCTGTGCAAGCTCCACCTGCAAAGCGGTGATTTTCGGGTTGCCCTTTATCGCTTTTTTCCGTCCTGTCAACGTCTTATAGCTTTCCAGTTTTTTTACCATCTGCTGATACACAAGGGTTTCCAATTCGGCGGTGAAAATCTTGCCGCACCCGACACAACTTTTGTTGTCCAGCCGTTTGGTACAGCGGAGATATTGCGTCCCCACTCGGTTAATGATACTCATAAGGGCATAACCGCAGTTGCCGCATTTGATTTTCCCCGCCAGCCATGTATGGGTAGCCTTTCTTGCAGACTGGATTTTCATGTTGTTCATCAGCTTCTTGCGGCAGGCAAGCCATGTGTCGGCGGGAACAATTCCCTCATGGGGAGCCAGCACCAGCATTTGGTCTTTCAGGTCATTTTTCTTGCAAGCCTTTACGTCCCGCCCCTGATACAGATAGCACCCGTTTGTGCCTGTGAAGTCGGCAGCGTCATTGACAATAATTGTCCCCTGACTTTTGAAAAACTCATATACGTCAAGGTCTGCCTGTACATAAACCGGGTTGCGTAACATCTGCGCCAGCGTGGGGCGTATCAGTTACTTGCCGTAGAACAAAATTCCCTGCTGGGCAAAATGCCGGGTAATATCCCCGTAGGAGGTTTTCGGGTCGGCGTACATCTCGAAAATCAGCCGGATATGCTCCACTTCGTCCGGGTTCGCTATCAGCTTTTTTGTGTTGATACCGTCCATTTTGATTGGCTCCGAATGAAAGCCGTAGGGCGGTCTGCCGCCCATCTTGAAGCCCCGCTGGCTCCGGGAGTAGTAAGCGTCCTGTACCCACTTCTGGATTGTTTCCCGTTCCAGTTGGGCGAACACGATACAGATATTGAGCATGGCCCGCCCCATCAGGGTAGAGGTATCAAACTTTTCGGTAGAAGACACAAACTCCACGTTGTACTGCTGGAACAATTCCATCATGCCCGAAAAATCCAGAATGGAACGGCTGATACGGTCGAGCTTGTAAACGATGACCTTTGCAATCAGTCCCTTTTTGATGTCCCGGATAATCTCCTGAAACTTCGGACGGTCTGTATTTTTGCCGCTGAAACCCTTGTCTGTGTATTCCCTGCAACTACCGCCTTTCAGTTCGTATTTGCAAAACTCAATCTGGCTTTCAATGGATATGCTGTCCTTTTTGTCAACCGATTGTCTTGCATAGATAGCGTCTATTCGATTGTTCATTTCGTAGCTCCTTTTCTTAAAAAAGAAACGGAGCTGCTGACAGTTTTATTATACCGCCAGCAGCCCCGCAAATCAATGTTGTAAAGTCCTACTCCCCGGATTCCTGCCGCCTGTCTGCGTATTTGCGGAACACCTCATAAAGCTGTTGTTCCAGCTCCCGGCGTTTTGCCGCTTCCTGCCTTGGCGTAAAAATGGGGGTCAGGTTTTCCAGCATGATTTTCTTTCCCTGAAAAGAAACGGTTTCGGTTTCTTTTTTGTAGTTGATATGCTCCATAGGCTCTCCTTTTCCATATGAAATTTTCAAGGTACAAGCCGCTCATTGCGGCGAAAAGTATTTACTAAAATCATCACCTTGCCTTTGTATTGATTTTCTGTTCCCGCCGTACCTGTTCCAGAATATCGGCGGGGATACGGTCAACAAGACGCTGGATATTATGTAGTTCACTTTCCAGCCTTGCCTGTTTCGCTGGCTTTGGCCCGGACTTCCAGCTTCTTGTTTTCCGCTATCAAATCGTCAATCGTAACCCGGTATTTTTTAAGCTGACCGCTGAAATTTTCCATCTGCGGGAACCACTTTTTCAGCAGGGTGAGGGCTTCCTCCTTTTTCTTTCCGGCGTTGATAGGATTGATACCGTCCAGCGCCATTTCAATGGCTCTTGCCTGTTTGGAGAGGGAAACGGCCTGTTTGAATAATCGTGTCGGGATATGCTTACGACCTGTTTGAAATGCGCTTTCTCCACACTCCAATTCCGGGTATTTCTCCACCATGTAAGCGTAAAAATCGTCCTGCCATCTGGATAGGCTGGCCCGGTTGCCTAAAATCTCTTTGGCAGATAGGCGGTTATCCTCCGTCAGCGGTACAAAGGTGAGGTGCATATGGGGCGTTCGCTCGTCCATATGTACCACCGCCGACACGATATTGTCCCGGCCTACCCGCTGGATAAGGAAGTCAGCCGCCCTCTGGAAAAACGCCGCCGTTTCTCTTGGGGATTTCCCCTTAAAAAATTCCGGGCTGGCAGTTATCAGGGTATCCACAAACCGAGTGCTGTCCTTGCGGGTGCGGCACCCGGCCTGTTCGATACGGTTTTGAATGAAGTGGTAATAGCGTCCCTCCGGTTTTACGATATGGAAGTTGTACCTGCTCCGGCTGGTGTCTATGTCCGGGTTGCTGGCGTACTGTTCTTTCTGGCGTTCGTGGTGGGCTTCCAGCGGCCTTGCCGGGTTGCCCTTGTGCTTTTCAAAGCGTAAGATTGCGTGTTGCGGCAATATCTATCAATCCTCCCTTCGGTGACGGTTAGAAGCCTGTTTTCCGGGGTGGGAGTACAAACATACAGCCCACCCCGGAACGGCTTCCAGAAACCTTGTGATACCGGGCTTTTCCAGCCCTTATTTGTCCGCTTTGTTCCGTTTGTTTCGATTGCTTTTGTTCTTCTGCTTGCGGTGTACCTCTTTGGCACAGACTTCACAGTATTTTGCCCGGTTGGAGCCGGGGACGAAAGCCGCCCCGCAAACGGCGCACCGCTTCACATCACCGCTATGGAAAAACTCTGTTTCCAGCGGCAGAACCGCATGGCGGAACCATGTACAGCAGACGGAATAGGAAATGCTTTGGACGCAGACACATTCCTCCCCATCGTCCAGCATAAGGCAGTTGCCGTTATCGTAATTGCAGCACTCCCGGCGTATCAGGGCGTTGACCCTCTTGCGCTGTCCCGGCGTCATGCGGGGCAGAGAGCCGTCCGGCCTGCGCTCGATTGGCTTTAGTTTATCTCTCATGGGTATCCTCCGTTTTCATTGTCCTTTGCCGTTTTTCCCGAAAGCCGTTCCTGCCCCATTCCTGCGGCGTATTTCCTGCATTGGCACGCTCCCCAGCAACTTCGGACCAACGTGGCCCGAAGTGCGGTTCATGGCAGTGCTTCCCCTGCGGGTGGTATCCCTTTCGGACGGTCATTCACTTGTATTGTCCATCGATGAACTAACTCAAGTGTATACTTTTTTGACCGCCCCTCCCGTATATCCACAAGGTTGGAAAACGGGCCGAAAATGAAAAAATTCCATGCTTGTGGAAAGGTATGGTATAATGAGAACAGGCAGAAAACTGAAGCAGGGAAAGGAGGATACGGTTATGAATGTGGCCTTGACGATACAGGAACGGTTAAAGGATTTGCGGGTGGAACGGGGCCTTACGCTGGAGCAGTTGGAACAGCGGACAGGCATTTCAAAATCCGCTTTGGGCAGCTATGAAACAGAGGATTACAAGGACATCAGCCACACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_011837|2860415:2897701|2892104_2892266_-|WP_012103240.1|DBSCAN-SWA MLMFLFNKSQSRIEMWLFIIVTVLFINGRVKQGIAALLGGGSVIALIEVYLKI >NC_011837|2860415:2897701|2871579_2871786_+|WP_012103216.1|DBSCAN-SWA MDTAKAKKALKKLTKQKGVSEGAVRREIEIAIAEAMKSLEPQAQAFWKSIPHNGEQPTPEEVTTYISG >NC_011837|2860415:2897701|2865944_2866085_+|WP_155814035.1|DBSCAN-SWA MSFHMGTSATRRVGGVPEVERLWIPCGTSGQVGPKNLDCEGNENDV >NC_011837|2860415:2897701|2884866_2885067_-|WP_012620802.1|DBSCAN-SWA MVVTGSLRNKILEVLIWTGTVKWFNGNKGFGSITGEDGKDIFAHFSQINSEGYKTLGEGQKVSFDE >NC_011837|2860415:2897701|2868372_2869017_-|WP_012103212.1|transposase|DBSCAN-SWA MADEHDLFIKREIDKIYTTHPEFGYRRIAVWLKKYNNMTINKKAVLRHMREMGIQAIYPRKNASKAESGHIIYPYLLKGLVIGRPSQVWRIDITYVPIHKSWLYLAAIIDWHSRFVVSWEIDDNLEIRFVLNACKNALKQAYPEIMNGDQGSHFTSFKYTNLFIEAGSRKVLNIILLLKYILKVRIFLLPSNKIILSDKYYVKDAAHHLKMASP >NC_011837|2860415:2897701|2877696_2877894_-|WP_012103222.1|DBSCAN-SWA MTGTVKWFNGNKGFGFITGEDGKDVFAHFSQINSEGYKTLEEGQKVSFDEGRGQKGTQAENITVL 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MRDKLKPIERRPDGSLPRMTPGQRKRVNALIRRECCNYDNGNCLMLDDGEECVCVQSISYSVCCTWFRHAVLPLETEFFHSGDVKRCAVCGAAFVPGSNRAKYCEVCAKEVHRKQKNKSNRNKRNKADK >NC_011837|2860415:2897701|2866170_2866455_+|WP_012103208.1|DBSCAN-SWA MEYSAIALVFVAGLLAYNEISTLKKVIRNQEKRLNQLAKLTGHEDLSSYSVSDQLKEQVIQLKREGKTIQAIKKIREQTQMDLVEAKQYVDELD >NC_011837|2860415:2897701|2862494_2863139_-|WP_012103202.1|DBSCAN-SWA MNNRIDAIYARQSVDKKDSISIESQIEFCKYELKGGSCREYTDKGFSGKNTDRPKFQEIIRDIKKGLIAKVIVYKLDRISRSILDFSGMMELFQQYNVEFVSSTEKFDTSTLMGRAMLNICIVFAQLERETIQKWVQDAYYSRSQRGFKMGGRPPYGFHSEPIKMDGINTKKLIANPDEVEHIRLIFEMYADPKTSYGDITRHFAQQGILFYGK >NC_011837|2860415:2897701|2869269_2870235_-|WP_172634767.1|DBSCAN-SWA MSRVKEIAYSGRNHGSFEQEWLSHKKASEWWYATGFVKDEAGNEYSYQYTVIKASIPMMTPWISHVAITDFNNKKHYFTKKTEINDKNVVVDENTVKYGEMISLTKNENGMHLIANGDGFSYDVYLDYGKGAFWHCDNGYLLMGSDSFTDKDSTIYYSYPSMPAKGTMTLGDKTFSITGTAWFDKQGGIYNLVNAERHWEWFSLRFFDDEQIMLFSFPQHDYVDGTYIMKNTAQRMNNYTIKSHKYIEVDGLKFTSGWDVSMPGIKEETYTITPIMEGQMHNMYFEELCNLTNSAGEIVGKAFVELLPGVWNKKFANKLMD >NC_011837|2860415:2897701|2886545_2886650_+|WP_081427991.1|DBSCAN-SWA MNIKLVPGLNNSGTDHWQSTWEKRYGFGRVNQEE |
38 | Clostridium_phage(30.0%) | terminase,transposase,integrase | attL 2884495:2884512|attR 2899248:2899265 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2914184 : 2956497
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_011837|2914184:2956497|DBSCAN-SWA 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49 | Bacillus_phage(25.0%) | terminase,capsid,transposase,integrase | attL 2914004:2914049|attR 2950160:2950205 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3021807 : 3027541
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_011837|3021807:3027541|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_011837|3021807:3027541|3025749_3026469_-|WP_012103389.1|DBSCAN-SWA MYDEILDKKILLIDDEIELLKLMETVLRKEGFKRIFKALKGTDGINLCKNEKPDIVVLDVMMEDMDGFEVCRAIREFSYVPVIFLSARGDHIDKILALGLGADDYVTKPFSPKEVVFRIKAHLRRNIYIKNELTMKKEKICFGDLIIDFKKGEVLKSGKNITLTPKEYHLLCYMTQNANQILTKEMICDEVWNDNYEGYDNTIMVHMRKLRQKLESNPSKPQYIVTVKGLGYKFNIPQD >NC_011837|3021807:3027541|3026629_3027541_+|WP_012103390.1|DBSCAN-SWA MSEKIIETKNLTKEFKDFKAVDKLSLTVKKGRVYGFLGPNGAGKSTTIRMLLGLITPTKGQIKIFDKNLKENRLTILRKIGSLVESPSYYGNLTAYENLEVTAKLLELDYKYIDEVLDFVKLTEWKDRQCKKFSLGMKQRLGIAQALISKPELLILDEPTNGLDPSGIHEIRELIKNLPKIYNMTVIISSHNLSEIELTADDIGIINRGNMLFQGTLEELHSRSKGEICIGVKDLKKAAHTLNDHGYKYKIKDDDIFVKPLEVEPYEILKQLILNDNRVFKFIEVQKSLEEIFLLLTEGGKNI >NC_011837|3021807:3027541|3024310_3025723_-|WP_012103388.1|DBSCAN-SWA MKFMNKIKTNWSLTTKFLVTLVFIIMIEFIVVMFVWRSAIIYTKSNLPGFNPEKFTWTFSKYIDIEDNKPVLNDEGKNELVKNKAWIQIIDESFKEIYSFKKPQEVPKVYTPIKMAHIYKYDIANYSIFISEKEYDNESFAYIIGFPTWRIAKHTVIFNPTALRNFFGGGFIVLLAVNVTIAVIASYFIFGKRMGRPLETIINSINELSRGHYETNHMEQGVYKNVFANLNNLGKTLKENKNKREEMEKVRENWISSISHDVKTPLSSIKGYAEIMKDSDYTFSQDEILDYSKIIYDKSSYIQGLVEDLNFTYKLKNRTIPLKKENVNVVILIQNIIVEILNHPLYSNRNINLYFERENINILTDKNLFRRAISNLIFNAIIHNPQEVRVDVSVYKKDRVHILIKDNGRGISQNDLKYIFERYYRGTNTNVSVEGSGLGMAISKQIIDVQGGSINVESTLGKGTNIDIVL >NC_011837|3021807:3027541|3023598_3024288_-|WP_012103387.1|DBSCAN-SWA MKRILIVEDNIALSTGLSFDLEREGYKVDTVCSSGQAREAVRETEFDLIVLDINLPDGSGFELCRWIKELKDIPLIFLTACDMEKDTIKGFELGADDYITKPFSVGIFRRRVAAVLKRCEKENIGNIYNDGYLMVDFDKLMVIRENKAFMLTSSEYRLMKIFVANSGKVLTRQILLQKLWDNDGNFVDEHALTVNVNRLRSKIQNKGHKYIKTVYGMGYMWVGEKCNVL >NC_011837|3021807:3027541|3022580_3023609_-|WP_012103386.1|DBSCAN-SWA MFYSSSSKGIYISWAVLWIFTFICFCCVTFQITEKWSLRLLLLGFAALFQFIALLAVAALRGKIVYFSESMSVYLDNMIKGSEEVYFNLETETLMAKLQIKLKRLYDIMKNNSNKNISEKMAIQRLVSDISHQVKTPIANIKMYNTILRERSMSWKKQQEFLKSCDIQINKLDFLLQSMVKISRLETGVLQICPKSYPIYNTLAEALGEVLVNAEKKNIHISVQCDSLLVVNHDKKWTSEALYNILDNAVKYTEKGGSIEIKVDKWEFYTKIDIKDTGKGICEKNQGAIFKRFYREPEVHDEEGIGIGLYLSREIITLQKGYIQVKSKPGQGSVFSVFIPNY >NC_011837|3021807:3027541|3021807_3022485_-|WP_012103385.1|DBSCAN-SWA MNAVVQISDLKKYYGREPNLVKALDGVNLCVEPGEFIAIVGTSGSGKSTLLHMMGGLDKPTYGSVIIEGRELSEMNDEDLTIFRRRQIGFVFQNYNLVPILNVYENIVLPVELDGNKVDKDYVDKVISMLHLEDKLNSLPNNLSGGQQQRVAIARALVSKPAIILADEPTGNLDSRTSQEVMGLLKMSNNEFHQTLVMITHNSEIAQLAHRIIRIEDGKIMDREV |
6 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3081152 : 3128467
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_011837|3081152:3128467|DBSCAN-SWA 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39 | Tupanvirus(20.0%) | tRNA,transposase,integrase | attL 3075923:3075939|attR 3103297:3103313 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3219856 : 3289288
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_011837|3219856:3289288|DBSCAN-SWA 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|
92 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | tail,plate,capsid,portal,tRNA,terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 29193
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011836|0:29193|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011836|0:29193|0_7686_+|WP_011930403.1|tail|DBSCAN-SWA MPENEDVGSLAVKIAMEDSSFQAGLQNLRRNMSVIDSSFKESVAGLKDWGKNLDSLQSNASALGEKIELQKQIIEKYQQQLEKSKSNLDNNSKAMMDLKSKVDEAKTAWQEAAASEDKNSESTKKLKQTYDELNKQYTDSEQKVRNNAKSIDGYTIQVNNATSKLKGLENQLQETNNKINNFKWASVTSSLEENSKKFESVSVGASKVGDGLLRLSAPLVGVGIAASKIGNDFETSMSQAAGALEKPIAQMGSLRELALKTGQDTQFSATQAGNAITELAKGGLTEAQIKGGALKSTMDLAASSGMELGVSANTVVQAMGAFGLSADQASQAVNALAGAAAASSTDVEPLSQGLAQCSAQAKLVNWSIQDTVAVLGEFADAGVVGSDAGTSLKTMLQRLGAPTDDAATKMESLKINVWDSNGHMKNAAGIAEELQSKMSGLSDAEKQAAMNTIFGSDATRAASILMANGAKGLEKYTNATNDQSAASRLAASQMGETSKSIEQMLGSLETAGIKLQEALAPTIKSVADSVGNLADSFGNLSPGTQKLIVDFAGITLAAGGTLKVFGGLAKSGSNILDFLGKFTGKAAAASAAAGAAATAVEGVAAAEAGAGAAAGVAATGGLGAFAASLGSAALAVGPYVLAIAGVAAAGYGVYKAYKYATDQTIPQVDLFADKVEQTSKRVQLAQGQTSQSFQKQTITISESTQKAVSAYVKLNDSVTKTQQSISVNSEKFTTQTKNTVIKNFTDIVNQSNKLDSEMKTNKIKAFTDMVNNTNNLTAKNKTSIVNQYKQMLSQVGNISEQQKNELVKDFQDTLTKSVGITQQQVNQVKSKYDQMTQMVNAAVDERTQHETKTLQDLFSKSTSITDKEQQTILQSVSQKGEEKKQKISDLENQILTIYQTASNNHRDLSSAEKQLVNQIQTEMEQNAVQTLSKSEVESKVILERLKEYNGSITLQQASDTIQNAEKARQGSVKAANDKYNETVAAIIQERDGAHSISADQADKMIAEAERQRKDSVQKANDLKEGVVEKVKGMNHDVEENINTSTGNMLSPWEKLTENIKKKWEGLKTWFTNNPIVAAVKAISGASNTGILGNILGGFAEGTDYAPPGWHWVGEEGPELFNFAGGEQVINAKDSKDIMEQMQNGGKTKTASTTTSTATQMKSTEQYAENLNTSLGTGITNSINDVVAPLNELITKLNTLMTNFATQYTEYGEQNVKNLGDGITQSQGTATAPLNALTEKLGNNLDAFSTSASKYGVQTSNNIGDGITDNSDAVINAGNNITDTLDASLTKFVSDSGDYGINTDTNISNGITSNLNMVTGAVEDMADTLNSNLTAFASDALNYGLDSDTSIGNGITNNLNAVIGAQSNLTDTLDKNLDTFASNSINYGLNTDTNIGSGISNNANAVINAQNNVTTTLGNNLTAFASAATQYGQSTDTSIANGITNTAGNVTGAGNNLTSTLGNNFNTFAQGCTQYGTGVTNSIAEGMRSAEANAVSIAKELTQKIIEALTGPDGFDIHSPSRKTTWIGEMAIEGLINGLDSQDALAFFQNKIGSAISGVGGNVTNWLSAALAITGTPMNWLPGLERLVQAESGGDPMAVNPQSVNGEHASGLLQTLYSTFESYRLPSLPDNMFNPIADAAAAIEYIKATYGSVYNTPLFTSGGAYVGYETGTDNATAGVHPVAENGFEIVMNKTLGLFSGGETVLNNSDSTELLNSIGALSSGSTTLGADIVKNIASGITSNMDVLKNAIQGLTGTVSQDLDTGLAKAATSESDFMQLLADTMNQNSDKPAEVTKKVADLVSQRVNAIKDNLAAQVKDLNNQLYNLGQQEDVSLRGVKGADKYAIQDEYEAKKKTIKDEIALRKEQADKEIDEIQKIGKMSKEQIQEEIDAKKQAVTDIDKLNDVLVKSIERKLNAEKEAAIESANLKAKEEKLTKDQLSNLLEYVNNYYAEKLDKDAIAAQAEQLITSKSQDTIINLLSQYGNLYEDSGLTLGQRLTTGVKSWTDLIPGIVGNAMQNVQAEVQTAAVNVQSTLGNIMQNISTVGAAGAQLAGVDTSSFDDIFSKWKDSGMGSLDIEEDPVQKIEDKYKDAFNEIELEMIKLGKDTYSTTEELEKQQDTIDLQNKKLSEMQKEYKEVVNAVGSTDDSAIQLEKDIASLTVEIENSTKKLQQDTITNEYQSAIDSIDDAISKLDVDTKSLSDELDKQNNIYDENMKKLSFMKEEYSELVKIFGENSDAALGLGEDIKDLTSTITGNVTEARQNISDGIDDFTAKVKDALKEMYTQQQQDFEDSINSQLEDLDTWKDTSIDNINSVYDAKIKALETQTEAEDRAATDAEELANINSLQESIDYEHNEYNKQQLQKQLDTAITDRNKRLHEQEIEDQKAALEVEKQNQLDSLDTIYEAKKKDLEKQLQDIKDFYAKKLDATNLEAEAEKMVMEGNQEEIIEILKSYSSDYESAGKTLGEKLFEGFRSKIEGITDMISNITAQINAARDEAIQIAQDSIVSDYVSVTAPTYPGTPRQVSGSQTIVNNITYNSPTVLSPSEQNRQVDSMLTKIAFSI >NC_011836|0:29193|9674_12425_+|WP_011930400.1|DBSCAN-SWA MEKSFCFNSINGDRKYKAEDFREYFATFIGNGVFPNPSTNLQVIGENGDMTVTLKVGNGWINGALYINDNDLILPIDVADGVLNRIDRIVLRMDTVGRAINAKVKKGAFASSPVAPVLQRDADGYEIGIADIYIAAGATQITQANITDLRLNTSLCGIVHGTVEQVDTTTLFNQYLSWLTQKKAQYDADMLSWTAQKQTDFNTWYNNITSASQTEIDNMEADFQQDWDSWFSAVQNVLDGDTAGNLLNMINNLAGEGRTTETVKGNADDIASLEEEYNAHDMRAATGNILGHVKVDNDSVKIDSNGVISVRKPLDYGRYQAEFGLEDAELSYCKLNNGTAFLSGFIVTTPLPTATVNNYPTNSGYQYGERLDSTYTANIDEINYVDISLAKHGSPTKNVTLTVYDDTSKAILGSASVVPSNITVSTASTSTMIRFTFETPIIVTRGHVLQLRLYADTISDGTVDYYVFGHTTNDAIASAYVLQTDSTGNWSGTLTSITGADLYFAINYTNYHILSGTATKTVTPSDIKKWGNIKWTQNTPANTSVVCDVINKSFLYNHTAGTSGTAGMVYGTTQWFAQKFIPNKNSSKQAIAVKLKRVGTILSDLQVHVYNDNSGKPGTSLGNTTIPYSQIPTTESYVNIETNVNLVNGQTYYILFKTTSGDSGNTYYLSTENVSSGGGYSSDGGTSWSFSYTLTCSIEDEVIVKSNIQSLQDLSDIDVIQYPSLTLRWTLSRNSVEDSSPTVSDVSVTWEGKGYNGDGAWEKIADITLTSNTAQIDFMNLGLENYKCLRLIGIAKSTTQGQNLSMIFNDDTTSSYPFVLFKTPNTQSQSTNTSILLPSVMVAPSDTQTFLFETTISNLPNLIKSSSTKSGSTYFNEIRLQIANWNKTSQITKITLKPATDGLIATGSTFKIMGVK >NC_011836|0:29193|19168_19588_+|WP_011930388.1|DBSCAN-SWA MDSDFLEFRDKTESLRNKAEAILGNYKREGFENIKCYGEIEKFVEHLDDCIKTINYYNKPTIEGTLHKNKNGRFDLVFANHQFTSGSSIEVLVDGEWCVGRVEYGSVEYTHGENEGYYFYNYDGNNIMLENGMTARIRN >NC_011836|0:29193|17140_17725_-|WP_011930391.1|DBSCAN-SWA MDRKEFDNLGVEEQIKYINKELVSGYTLTKVCGLIGVGRSTIRDRAKKLGYFYNTKFNQYVCGKNETKVTNVNDNSKTLVACDRDDSLNNMEVDKSIIFNKNIMKNLIGLSENYDKIMDFIKWFENDKGKTNVIEVTEGIKIDLPEETDKEFRKTIRVNDVVWELFSEFCDKHKEFKQKDLHSQALLEYIKKYS >NC_011836|0:29193|15553_16309_+|WP_011930394.1|DBSCAN-SWA MNSFIGWIGGKKLLRKEIVKRFPENFNRYIEVFGGAAWVLFSKEKLANMEVYNDVNGDLVNLFRCVKFHCGELQRELSFMLNSRELFYDFISQYSTRGMTDIQKAARFFMLIKTSYGSDCRSYGCVKKDVNVMVKYLTEIQERLSRVVIENKDFQDLLKVYDKDDSLIYLDPPYYGTERYYQVQFSEKDHERLYEVLKGEKGKFILSYNDCEFIRQLYKDFNMDEVERNHNLLGKYKDKKHIYSELIITNY >NC_011836|0:29193|21171_21678_+|WP_012620006.1|DBSCAN-SWA MKLTNRDIEIISFIEKVTGATIVQIQKAFFPSYDMAAKRLKKLSDNKFIKVQVHPILGKKVYYIKKLPSFHSLVITNVAIAFKDKIKFMQREYKVKNNKVDCIFILEDGRIIILEVDIYNRTKETKIKEVLNTLAETKAKIEFWIVCKHERRVRMQEVKYIKIDDVEI >NC_011836|0:29193|21810_22206_+|WP_011930385.1|DBSCAN-SWA MTKKTHVAVGIAATLPIVMKCEPIAFIGLLGAVIPDWDIILGMKHRTTTHSLTALFISTIIITLLNHQVGLIWGLNYSIHLLLDSFTKMGVPLFYPFRKEYYGFKLIYTGKSEDLFICLLAIFFITCMYLY >NC_011836|0:29193|16634_16844_+|WP_011930393.1|DBSCAN-SWA MLEKFLVIVNKDFDNEEIYYCGINQISAFKKFKELPDNIYKQIVKANVKMVEIEGAKLIYTYEVIERIA >NC_011836|0:29193|8575_9673_+|WP_011930401.1|DBSCAN-SWA MKKVPMRIIDKDFNLLGEIDDYESLQFIRRFYKVGEFELHINMDKANTDTLVKNNLIILGSSLNKVGIIMHRENSVDDNGVDELIIKGPTLKGIMSRRLIVPPVNGNGYDSQTGSIETILKAFVNNHVINPTDADRKILQAAIAPDQQRGKQDKWRSRFEVLSDKLAEIGEYASMGWDVVLDIYNNKWIFDVVEGRDLTVDQDTLPPVIFSTDFDNITNPHLIQSLINTANVGYAGGHGDDADRLIQQMGSSTGVERMETFLDCSQAEDVAELTSMAQQKLNELKEIKTFEFEIIPDNTFIYEQDYDLGDTVTAQSRKWAVTINCQIIEVKEIYEVSGFKLQATFGTNIPSLLTVFKRNSKKVVR >NC_011836|0:29193|24913_26239_-|WP_011930380.1|DBSCAN-SWA MNNSTASKSDDLQHELEQYSQSLIKAKRNAKIFGILEFIFLIPGFMNPVLAIFVFIFAILFFSNYIKSKKITKIINSLNNNTNKTIVSTNKENIIPKNLSNNINKPDDIYLKKLTGKNKSINKSQGVFDNFVVVDLETTGLEPTRDYIIEIAAAKYENNEIIDTYTTLVNPEVFIPPNITNINHIDNDMVKDCPEIKEVLPGFMNFIGQLPLVAHNAPFDIKFLNANLALLGLYLNNPIIDTLPISRKLFSEIENHKLGTIKEYLNIDVQDSHRALPDCYVCGQIYLEYSTKEKNKKALANIKLHSDIGLNKEECYSIVKEILKKHNKDLTYVRYGFTSNYFDIRAFYNFLRLKLKGKKYYALLDNSLAEINSMIPDLTLKYEVAPKSESNKIRILINSPEDLYILEPIIIQAFDKCIDSMEYYRNNVSVAEKNIAEYLNT >NC_011836|0:29193|19878_20016_+|WP_155814049.1|DBSCAN-SWA MDLFVIDKLVVTFIKNIFTDTYTQFTTLVGLFVVSHAIFPEKVKK >NC_011836|0:29193|17948_18860_+|WP_011930390.1|DBSCAN-SWA MVILGLDNGYHFTKTSEGVMFSSTVRKGKDIDINADTIQTNIDGQDYVVGAPNGEYVADSNKIDSIVTEICTFTAIAKSFPENKLIDCNIVAGLPVSYYSKQKSDFKEKLLGYGNKKVKLNKHNFQINIVGAEIYPQSAGVVFVNSKDVKSDDSLVVDIGGGTVDVSAFHGLRLTNMATYNLGMLVLYSKLAQKLNSEYECKFMDYELYDKLKKGYITSNKFGRIDLEILNDDIEEHTNVILNNIKRDFNYNSMDNIFVIGGGGVELYDRIKQKFKNAILCDDAQFVNANAFELMGQMKFATK >NC_011836|0:29193|13602_13995_+|WP_011930397.1|holin|DBSCAN-SWA MDHQRVFNLSISTFGGIMTFIFGGWDICLYVLAAFMVLDYGTGVFSAYITGKVNSQTGFKGILRKSEIFVVLAVGTLLDRLLNEGTWIFRTVVCYYYIANEGISIFENCGKSGLPLPKKIVEALEQLKNK >NC_011836|0:29193|23149_23551_+|WP_011930382.1|DBSCAN-SWA MDKYMYPALFEAYEDGGYTVSFPDLPGCITEGDSLTEALTMAKEALELFLWNMEDDNEEIPEPTPPEKIETKKGNFIVPVEADMALIRAKMNNKTVNTTVTMPQWLKYQAEKKKINFSQVLQAALKEQLNIKN >NC_011836|0:29193|15046_15463_+|WP_011930395.1|DBSCAN-SWA MKEQILSMGVQFIIGVVGIIGTFVLKKVADAVEVQKQALAAKKEATSYNRALSVAKGLYYVLEDEFKSLAKAGDAKRAEMEKRLLEIVPGLTQSELDAINKEVCNGAIKIGEGILTPIQVSQGTKENTAVAEDKTAQN >NC_011836|0:29193|28008_28155_+|WP_011930376.1|DBSCAN-SWA MKNTKTERIIEMIKDFQELSRDDQIYVSGIVKGIYLQKQSIEKEQQSA >NC_011836|0:29193|14007_14928_+|WP_011930396.1|DBSCAN-SWA MIKGVDISNLNGSIDINKIKNAGHNFLIAKATEGSTFIDKFYNANIAKAKALGFITGAYHFARFTTIAKAIQEANFFKQIAAGASPDFVVLDFEQQCSGDMTDACLAFLEIVATIAPALIYCNPSYIKAYLNSRITKYPLWVAHYGVSSPSTVLWPDYAMWQYTEKGQIPGISGYLDLNYMTESFYNSIATGEPVKPNPLVEQIKALQYNLNIDYNAGLVIDGVAGKNTLAALKGIQDIIIKGHKSHVVLWIQQKLEQYEYLKENSYTQMLYDEPTFQAVTELQKNWERPTDGVLRPETWNIFLNN >NC_011836|0:29193|22913_23096_+|WP_011930383.1|DBSCAN-SWA MTPKELIKILKKDGWIQKNQEGSHKHFVHPTKKGKIQVPYHNKDLKPGTLNKILKDAGLK >NC_011836|0:29193|27482_27842_-|WP_011930377.1|DBSCAN-SWA MNDRLKKIRKELDLTQEEFASKIDLTRSGLASIEYGNVTLTERNIKKICRQFNVNENWLRTGDGKMFNTKEEDKELLDFVINILAEKDEFIRNTFLTLARLDEKEWDVIKKIMNGLKNK >NC_011836|0:29193|23984_24860_+|WP_011930381.1|DBSCAN-SWA MATIRVQKNENYSTINNTGLNDCNLSFKAKGILAYLLSKPDNWKCQVSDLIKKSKDGRDSVYAGLRELRENGYMIKRPVKNEKNIITEWEEVLYETPQLEAKEVFKEQKIKNEIAALKRAKTIKSKKINPLPENPYMEESTSGISVSGKPVNIISTNLPSTDLVVVVNSLIKEFEENICDLKKTTKPKFIKYCQEYSKEYIMTILEVCAESGIKSFAGFRTVIETHIKNKNDTPEKIRAAVEKYRQDKKNKQKVPANRKQNTSENFKQRDYNFGDLEKMLLNHMNYEEDEE >NC_011836|0:29193|7699_8572_+|WP_011930402.1|tail|DBSCAN-SWA MQQIIYINSRGQSITLGNSCPFVLEKIDGTGGTKSTLLTTKAPGQDGKSHHGTLLEERTLNITGYICGNSLEDMDTKKQQLCSIFNPKFKGKLIYTNNIGEHTTGCIVQDSPTFKDRTSTIQQFLIQLFCPEPYWKELEEIKNEMAQWVGDFMFPLEIPEETGIEMGHRVSTLIANCLNVGDAECPIRVEFKALATVVNPSILNVYTQDFIKVKRTLTVGDMLVIDTSFGNKRVEMIKTNGVIQNVFNYITLDTTFLQLDVGDNLLRYDAEEGIDNLEVGIYYTPKYVGV >NC_011836|0:29193|28212_28362_+|WP_155814050.1|DBSCAN-SWA MDRTLRKMRKDLKESGLTISQVLELLNRCKSEILSEMPIDENMKSKLTW >NC_011836|0:29193|22259_22589_-|WP_011930384.1|DBSCAN-SWA MNREDLKAIKDLLKEELEPIKDQLNKNTIILEEMRTDIKTIAEVQKSHMDQNEKAHIEVVKPLNEKVDVIELAVKDISKDAKELKEKFDKVEKVTIQNTYDVAYLKTIK >NC_011836|0:29193|12425_12914_+|WP_011930399.1|DBSCAN-SWA MADKLVVTSQGVQESDFTEEEKQAIERQRQNDFGNLKQQKLTELSQSCQNAITGGFNSTAYQNTNKIYDSTLEDQSNITGNALSAVSKVSGVPGCENDTFYYHARGEEFVEWQPEECLQLARDFKIFKEQQLIRNKQLQAYVETLATTEEVQAITWDTVIPT >NC_011836|0:29193|18871_19138_+|WP_011930389.1|DBSCAN-SWA MAASRVKSVSFKDSEKDLLEFAEKKGDFSNYVKKLIKEDKEKGYKFTEQQKEEIIRLIQKYAPTTKTEDIKTDFDKDALDALGQFDNM >NC_011836|0:29193|16845_17028_+|WP_011930392.1|DBSCAN-SWA MDKNPQTIANQKWESKNKEYASYLKSRSSARSFVRNKATLEDLEELKELIKNREELLKQA >NC_011836|0:29193|12889_13348_+|WP_011930398.1|DBSCAN-SWA MGYSYSNLKKNLILIFIMGSIYMVLEGLWRGWTHISMLVVGGIAAFFIGKLNEQPTFYNRKMWQQCIIGTLIILILEFVSGAILNIWLQIEIWDYSNIWGNILGQICIPYAVIWFLLVPFNIYIDDYLRYKFFGEKEPEGLLKNYKDLILGK >NC_011836|0:29193|28401_29193_+|WP_011930375.1|DBSCAN-SWA MENTASLIIGKREIAVKEYRHQRVVTFKDIDTVHERPSGTANKRFLDNQKHFKENLDYFELANNDLKIIKRLPDFGISSKASKIILITESGYLMLVKSFTDDLAWQIQRQLVNTYFRAKEMAENAKHKLQERRLSLRETKMKIDALREVNRTVKTLCAKTTQSYRNNVATKLMQNFGIDIPEEVFETTGIQCDMAVKEFVDNQCEKTGKVKIAELHETYMKWCKTEGVKPLTKVKFGKEVELLGFEKAAFGIGRCWTGIQLKI >NC_011836|0:29193|26832_27084_-|WP_011930378.1|DBSCAN-SWA MELIIRYYRIRQGLTVKQLANSTGYTPGYINMLENNSRNPSLGTLEIIGSHLEICPKFLIVNCLSIRCDTCCYNPKNRFLFLE >NC_011836|0:29193|26372_26711_-|WP_011930379.1|DBSCAN-SWA MSIDLRKCIGDKIYNLRMELELSQEDFVARLTPSFSRGNLSNIEKGLTIPSSEFVKAVCEAFNISSDWLLDINSTINITLKEKQLLNIYNKLDLEIRQNILNLMESIVKQNS >NC_011836|0:29193|20012_21188_+|WP_011930387.1|DBSCAN-SWA MITEALILGCIGYTYKNTDKLKIRRKWKQITFSKSQFTNKLDKTLKIHSIKRTEYGHEIIVELPYSYTFKQLEGDIDIFKEGLGYKSIQLKSEGNIVHMYCVKEFKFKDYASLKLPANKLLIADGLMEPIIVDMNKFPHMLIGGDTGTGKSRILLLILTNLIKYCSNVELYLLQVRKNDLGVFQNCSQVKVNSKTLEEVLESLKKIDIECRRREKLIDNIKGYYNIEDYNNVAYNKLKYIYVVIEEFSFLNTSRGDSKAEKQLKAQCLKHIKTIVNVGRSSGVFLVTALQKPTNDSIPSDIKAQLCTRVSLKIADEPAAIVILGNGKASKLQERELICRTLREQQGYSYTIDHAMVMENIKHRIIEKPKKTAPKPENDVNNILSILNEINQ |
31 | Clostridium_phage(70.59%) | tail,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
41996 : 58952
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_011836|41996:58952|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_011836|41996:58952|55858_56227_+|WP_011930409.1|head|DBSCAN-SWA MHYSNQAQTAQLNNRIILQKYVTVTNDNDFSIKEWQDYKPIWAAAKNLHGEEYYAAGEEQSKKTAIFTIRYRRDIDESMRIKFGKRIVDEKEIDRIYEITFIDDIKYQREFMEIKVLEIFPE >NC_011836|41996:58952|54103_55291_+|WP_011930412.1|capsid|DBSCAN-SWA MAKTLFEMKQDLITIGTQLQKVENEIAEKAVDPKVTTDDLNKLTATKADLKTRFDLLKAQHDQLEAEQKTALAAKQASTKKVLDGADDEKAKIIKAKAFLIKAVMTKQPIPDDVKAILGTNVQNALGAGSSLGNGDKLLPSTMTQELLTEPMATNPLRGISTFTNITNLEIPKLLFTLDDDDFLADDSATAKELVAEGDTVSFIRNKFKVFCDITETVLNGTETNLVATVQAGLQSGLAKKEKKVAFESTTPTDMSFYKKNEAGTDYLITKKTGSTMYEAIMAALADLEDDYAENAKIVMKKADYFTMIKELANNNTALFVAPPEQILGAPVVFCDLATVPVVGDFRYSHYNYDLNMIYDQDKNVKTGIESFVLTAWIDHKIKLKSAFRLAVVTP >NC_011836|41996:58952|46479_46677_+|WP_172634807.1|DBSCAN-SWA MLLKMLLSGKKVENMKFNIDEINKDRIEQIEADLMKEYRKGKRKDKCKIHTLLNEKYRLLKLSSS >NC_011836|41996:58952|46810_47260_+|WP_011930420.1|DBSCAN-SWA 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MARPRDEYDNIYKSRRWQRVRKIVLIRDNYLCQPCLRRGLIKEANTVHHIVELRKDLSKAFELDNLESICPACHNKEHPERNGSKKKKKRRDIYKFYNNDIV |
21 | Bacillus_phage(21.43%) | terminase,tail,head,capsid,protease,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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