Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_006086 | Streptococcus pyogenes MGAS10394, complete sequence | 1 crisprs | DinG,csm6,cas3,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 9 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_006086_1 | 878447-878536 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_006086_1
|
1 spacers
spacers of NC_006086_1
>1.1|878471|42|NC_006086|CRISPRCasFinder TAGTGGTATTGCCGCAGAAACCGTTGAAGAAAAGTGGCAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_006086_1
The CRISPR arrays of NC_006086_1 >merge|NC_006086|1|878447-878536|CRISPRCasFinder ATCCAAAGATGCTGTTGAAGTTTATAGTGGTATTGCCGCAGAAACCGTTGAAGAAAAGTGGCAAGATACCAAAGATGCTGTTGAAGTTTA >NC_006086|1|1|878447-878536|CRISPRCasFinder ATCCAAAGATGCTGTTGAAGTTTA TAGTGGTATTGCCGCAGAAACCGTTGAAGAAAAGTGGCAAGA TACCAAAGATGCTGTTGAAGTTTA
>NC_006086.1|WP_011054497.1|877222_877636_+|VOC-family-protein MKLNAIHHVAIIVSDYNLSKNFYVNKLGFEIIRENYRPDRHDYKLDLSCGRIELEIFGKVTSDPYYQAPPKRVSQPEFKSEACGLRHLAFRVTNIESYVDDLKSLGIPVEPIRHDDYTGEKMTFFFDPDGLPLELHE >NC_006086.1|WP_002984641.1|876390_877140_+|sortase MVKKQKRRKIKSMSWARKLLIAVLLILGLALLFNKPIRNTLIARNSNKYQVTKVSKKQIKKNKEAKSTFDFQAVEPVSTESVLQAQMAAQQLPVIGGIAIPELGINLPIFKGLGNTELIYGAGTMKEEQVMGGENNYSLASHHIFGITGSSQMLFSPLERAQNGMSIYLTDKEKIYEYIIKDVFTVAPERVDVIDDTAGLKEVTLVTCTDIEATERIIVKGELKTEYDFDKAPADVLKAFNHSYNQVST >NC_006086.1|WP_002984643.1|873884_876371_+|DNA-gyrase-subunit-A MQDRNLIDVNLTSEMKTSFIDYAMSVIVARALPDVRDGLKPVHRRILYGMNELGVTPDKPHKKSARITGDVMGKYHPHGDSSIYEAMVRMAQWWSYRHMLVDGHGNFGSMDGDGAAAQRYTEARMSKIALELLRDINKNTVNFQDNYDGSEREPVVLPARFPNLLVNGATGIAVGMATNIPPHNLAESIDAVKMVMEHPDCTTRELMEVIPGPDFPTGALVMGRSGIHRAYDTGKGSIVLRSRTEIETTQTGRERIVVTEFPYGVNKTKVHEHIVRLAQEKRLEGITAVRDESSREGVRFVIEIRREASATVILNNLFKLTSLQTNFSFNMLAIENGVPKILSLRQIIDNYISHQKEVIIRRTRFDKDKAEARAHILEGLLIALDHLDEVIAIIRNSETDVIAQTELMSRFDLSERQSQAILDMRLRRLTGLERDKIQSEYDDLLALIADLSDILAKPERIITIIKEEMDEIKRKYANPRRTELMVGEVLSLEDEDLIEEEDVLITLSNKGYIKRLAQDEFRAQKRGGRGVQGTGVNNDDFVRELVSTSTHDTLLFFTNFGRVYRLKAYEIPEYGRTAKGLPIVNLLKLEDGETIQTIINARKEETAGKSFFFTTKQGIVKRTEVSEFNNIRQNGLRALKLKEGDQLINVLLTSGQDDIIIGTHSGYSVRFNEASIRNMGRSATGVRGVKLREDDRVVGASRIRDNQEVLVITENGFGKRTSATDYPTKGRGGKGIKTANITPKNGQLAGLVTVDGTEDIMVITNKGVIIRTNVANISQTGRATLGVKIMKLDADAKIVTFTLVQPEDSSIAEINTDRENSISKNKDN >NC_006086.1|WP_002984645.1|872710_873694_-|L-lactate-dehydrogenase MTATKQHKKVILVGDGAVGSSYAFALVTQNIAQELGIIDIFKEKTQGDAEDLSHALAFTSPKKIYAADYSDCHDADLVVLTAGAPQKPGETRLDLVEKNLRINKEVVTQIVASGFKGIFLVAANPVDVLTYSTWKFSGFPKERVIGSGTSLDSARFRQALAAKIGVDARSVHAYIMGEHGDSEFAVWSHANVAGVGLYDWLQANRDIDEQGLVDLFISVRDAAYSIINKKGATFYGIAVALARITKAILDDENAVLPLSVFQEGQYEGVEDCYIGQPAIVGAYGIVRPVNIPLNDAELQKMQASANQLKAIIDEAFAKEEFASAAKN >NC_006086.1|WP_011184515.1|871181_872552_+|FAD-dependent-oxidoreductase MSKIVVVGANHAGTACIKTMLTNYGDANEIVVFDQNSNISFLGCGMALWIGEQIAGPEGLFYSDKEELESLGAKVYMESPVQSIDYDAKTVTALVDGKNHVETYDKLIFATGSQPILPPIKGAEIKEGSLEFEATLENLQFVKLYQNSADVIAKLENKDIKRVAVVGAGYIGVELAEAFQRKGKEVVLIDVVDTCLAGYYDRDLTDLMAKNMEEHGIQLAFGETVKEVAGNGKVEKIITDKNEYDVDMVILAVGFRPNTTLGNGKIDLFRNGAFLVNKRQETSIPGVYAIGDCATIYDNATRDTNYIALASNAVRTGIVAAHNACGTDLEGIGVQGSNGISIYGLHMVSTGLTLEKAKRLGFDAAVTEYTDNQKPEFIEHGNFPVTIKIVYDKDSRRILGAQMAAREDMSMGIHMFSLAIQEGVTIEKLALTDIFFLPHFNKPYNYITMAALGAKD >NC_006086.1|WP_011184514.1|869214_870942_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKTDHHLLKRVLQDLLKKPLPVCILVIASFVQVGLSVYLPVLIGKAVDMSLSVNSWQTLKWLLGQMLVVIVVNTLIQWVMPLVYSRLLYQYSQQLKDKLLEKIHRLPFAYLDRQTIGDLVSRVITDTEQLINGLQMVFNQFILGLLTILCTIIAMAQIDWLMLILVLVLTPSSLFLARFIAQKSFHYAQAQTKSRGNLAQFTEEILRQEGLVQLFNAQEQSICDYHVLNKTYCEASQKAIFYASTVNPATRFINSVIYALLAGLGAVRIMAGLFSVGQLTTFLNVVVQYTKPFNDISSVLAEIQSSLACAQRLYDLLDIEIKEQEHFLTFKASAVKGQIDFEEVSFSYQKDRPLLKDINFSVPAGSKVAIVGPTGAGKSTLINLLMRFYELDAGSIKLDKVPIKCYAKEELRSITGMVLQETWLKDATVHELIAYGSEEASRDEVVAAAKAAHAHFFIMQLPKTYDTYLSASDDALSQGQLQLLAIARMFLKKPKVLILDEATSSIDIRTEAVIQEVLKELMRGRTSFIIAHRLSTIQSADLILVMDQGRLVEWGTHASLMSKNGCYARLQKIE >NC_006086.1|WP_011184513.1|867493_869212_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKRLRPCVKGYLKESILGPLFKLLEALFELLVPLLVANMIDLSISQHNSQGILRVVLTLFGLATIGLLLSVTAQYFSSKAAVGFTRQMTDDLFKKIMFLSKEDQDHLGYASLLSRLTSDSFQIQTGINQFLRLFLRAPIIVCGAMVMAYWISPSLTLWFVMMVIVLLTLVFVMSHLLGPLYLLIRRETDHLVRLTSQQLQGIRVIKAFNQTQKELQAFKQQNMLLSRHQYQAATLANVLNPMTFLVVNLTLLILIWQGSWQVAHRSLSQGMLVALINYLLQILAELLKMTMLMGTINQSVTAAKRINQVFVLADEAPLPLLKDGPISTHLLTIRHLTFTYPGAAEPSLYDIQLSADQGEWIGIIGGTGAGKTTLIDLICQTYSQYSGEVSLNWQGEVPKTLTEWRNVIALVPQKAQLFKGTIRNNLLLGQSMPISDEELWRALELAQAKEFVAALPEQLEAPVEAFGRHFSGGQRQRLAIVRALLKPKPILILDDASSALDNETRGRLFKALKEELSDVLVILVTQSIKNLQFADKILVLEQGHQLDFASHDQLKVSNALYQEMLALYVKGE >NC_006086.1|WP_011184512.1|866884_867484_+|lysozyme-family-protein MFRLLKRACSFLLFFVIYQSFVIHHNVQRVLAYKPMVEKTLAENDTKANVDLVLAMIYTETKGGEADVMQSSESSSGQKNSITDSQASIEHGVNLLSHNLALAEEAGVDSWTAVQAYNFGTAYIDYIAKHGGQNTVDLATTYSKTVVAPSLGNTSGQTYFYYHPLALISGGKLYKNGGNIYYSREVHFNLYLIELMSLF >NC_006086.1|WP_011184511.1|865906_866884_+|nucleoid-associated-protein MLDSYIKRIVIHQFSPNDTELLLSDRLVSITPRIDEYFRKKLAKVFSDEAKRGQFEANNTFFTTIGDDLLETSVTIAQLWKEAFVISEDQKTNDLVFVQFDKDGDPFFAFLRIALKEQFAHLSDNYEHPFTVTQNNLPSPTQTPDEALVINLKSGQYYLIEKRVKHNGSFANYFSEHLLKVTPEQSVKKSIKMIEQTAQKIAEHFNQDDFTFQSKMKSTLFKQLEADDILSPEKLADQLFDDNLTARLTFVDQVKDVIPEPIKISDIDHSRQIKKLENQKLSLSNGIELTVPNAIYQDAEAVEFLLNDDGTYSILIKNIEDIKTK >NC_006086.1|WP_021340492.1|864643_865900_+|serine-hydroxymethyltransferase MIFDKGNVEDFDKELWDAIHAEEERQEHHIELIASENMVSKAVMAAQGSVLTNKYAEGYPGNRYYGGTECVDIVETLAIERAKKLFGAAFANVQAHSGSQANAAAYMALIEAGDTVLGMDLAAGGHLTHGSPVNFSGKTYHFVGYSVDADTEMLNYEAILEQAKAVQPKLIVAGASAYSRSIDFEKFRAIADHVGAYLMVDMAHIAGLVAAGVHPSPVPYAHIVTSTTHKTLRGPRGGLILTNDEALAKKINSAVFPGLQGGPLEHVIAAKAVAFKEALDPAFKDYAQAIIDNTAAMAAVFAQDDRFRLISGGTDNHVFLVDVTKVIANGKLAQILLDEVNITLNKNAIPFETLSPFKTSGIRIGCAAITSRGMGVKESQTIAHLIIKALVNHNQTVILEEVRQEVRQLTDAFPLYKK >NC_006086.1|WP_011184516.1|878733_879645_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MKTVRIFYNPNSGKKEDQLAGQVKDYFCQHGFSEDSVEIITPKDADQAFQLAKQAAKDKIDLVIPLGGDGTLNKIIGGIYEGGAHCLIGLVPSGTVNNFAKAMHIPLQITEALDTILTGQIKQVDICKANQQYMISSLTLGLLADIAADVTAEEKRRFGPLAFLKDSIRILKRNRSYAISLISHNHRIHLKTKFLLITMTNTIAGFPSFSPGAQADDGYFQVYTMKKVSFFKFLWHINDFKQGDFSKAEEISHFQANTLSLLPQAKKQAILPRARIDGDKSDYLPIQLDIIPKAISIIVPTED >NC_006086.1|WP_002984629.1|879761_880412_-|hemolysin-III-family-protein MNQTFKQSLPLSFSEEVANSVTHAIGAFAMLILLPISASYAYQTYDLKAAIGISIFVISLFLMFLSSTIYHSMAYGSVHKYILRIIDHSMIYIAIAGSYTPVALSLVSGWLGYIIIVLQWGITLFGILYKIFAKRINEKFSLMLYIVMGWLVVFILPVIIQKTSLAFGLLMLFGGLSYTIGAVFYAKKRPYFHMIWHLFILLASALQFIAITFFML >NC_006086.1|WP_011017769.1|880408_880849_-|DUF1836-domain-containing-protein MIFPSLPYWKDLPDLDLYLDQVLLYVNQCTDFSEVSDNKSLTASMINNYVKHGYVTKPIKKKYQKQQLARLIAISLFKTVFPIQDISRVLEELQAQADSESLYNTFVTCWNQKAPIEEDIPPIVQVACQTVKDYHKTIYLSQEVTQ >NC_006086.1|WP_011184517.1|881067_881916_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAMIQWFPGHMSKARRQVQENVKHVDFVTILVDARLPLSSQNPMLTKIVGDKPKLMILNKADLADATRTKEWKAYYESQGIKTLAINSKEQSTVKKVTEAAKELMADKIQRLRERGIQKETLRTMIIGIPNAGKSTLMNRLAGKKIAVVGNKPGVTKGQQWLKSNKELEILDTPGILWPKFEDELVGLKLALTGAIKDQLLPMDEVTIFGLNYFKTHYPSRLTKRFKNIPLEEEAPEIIMTLTRQLGFKDDYDRFYTLFVKEVRDGKLGQYTLDQVGDMDVD >NC_006086.1|WP_011184518.1|881905_882697_+|ribonuclease-HII MSTSIKAIKESLEAVTSLLDPLFQELATDARLGVQKALKSRQKAIQTDLAEEERLEAMLSYEKALYKKGYQAIAGIDEVGRGPLAGPVVAACVILPKYCKIKGLNDSKKIPKAKHETIYQAVKEQALAIGIGIIDNQLIDEVNIYEATKLAMLEAIKQLEGQLTQPDYLLIDAMTLDIAISQQSILKGDANSLSIAAASIVAKVTRDQMMANYDRIFPGYGFAKNAGYGTKEHLQGLKAYGITPIHRKSFEPVKSMCCDSTNP >NC_006086.1|WP_011184519.1|882761_883598_+|DNA-protecting-protein-DprA MNHFELYKLKKAGLTNKNILNILDYQEHQEKSLSLRDMAVVSGCKHPSHFIEAYKQLDIQKLKMEFKQFPSISILDKHYPMALKEIYNPPVLLFFQGNLDLLEKPKLAIVGSRRSSDTGVKSVRKILKELGNRFVIVSGLARGIDTSAHLACLKNGGQTIAIIGTGLDRFYPKENRELQTFLGKNHLVLTEYGPREEALSYHFPERNRIIAGLSRGILVVEAKNRSGSLITCQIGIEEGRDIFAVPGNILDGKSEGCLQLIKEGATCVTSGMYILSEY >NC_006086.1|WP_011184520.1|883704_885834_+|type-I-DNA-topoisomerase MGTKTTTKPKTGTKKSTTKKKSTAKKNLVIVESPAKAKTIEKYLGRSYKVVASVGHIRDLKKSSMSIDFDNNYEPQYINIRGKGPLINSLKKEAKAAKKVYLASDPDREGEAISWHLSHILGLDPEDKNRVVFNEITKDAVKNAFVEPRQIDMNLVDSQQARRVLDRIVGYSISPILWKKVKKGLSAGRVQSVALKLIIDRENEIKAFVPEEYWSIDGLFKKGTKKFQASFYGLDGKKMKLSNNDDVKAVLAKLKGDDFLVSKVEKKERRRNAPLPYTTSSLQQDAANKINFRTRKTMMVAQQLYEGIHLGENGTQGLITYMRTDSTRISPVAQNDAAQFISNRFGANYSKHGNRVKNTSGAQDAHEAIRPSSVNHTPEAIAKYLNKDQLKLYTLIWNRFVASQMTAAVFDTVKVNLEQNGVLFVANGSQMKFDGYMAVYNDSDKNKMLPEMEEGENVKKVSTSPEQHFTQPPARYSEATLIKTLEENGVGRPSTYAPTLEVIQRRYYVKLSAKRFEPTELGEIVNKLIVEFFPDIVDVAFTAEMEGKLDQVEIGEEEWQHVIDQFYQPFVKELNKAESEIEKIQIKDEPAGFDCDVCGHPMVIKLGRFGKFYACSNFPECRNTKAITKEIGVTCPICHKGQVIERKTKRNRIFYGCDRYPECDFTSWDLPVGRDCPKSGDYLIEKKVRGGKQVMCSNETCDYKEEKIK >NC_006086.1|WP_021340038.1|885968_887315_+|methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)--C(5))-methyltransferase-(FADH(2)-oxidizing)-TrmFO MSQSTATYINVIGAGLAGSEAAYQIAKRGIPVKLYEMRGVKATPQHKTTNFAELVCSNSFRGDSLTNAVGLLKEEMRRLDSIIMRNGEANRVPAGGAMAVDREGYAESVTAELENHPLIEVIRDEITEIPDDAITVIATGPLTSDALAEKIHALNGGDGFYFYDAAAPIIDKSTIDMSKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTKEEFMAFHEALTTAEEAPLNAFEKEKYFEGCMPIEVMAKRGIKTMLYGPMKPVGLEYPDDYTGPRDGEFKTPYAVVQLRQDNAAGSLYNIVGFQTHLKWGEQKRVFQTIPGLENAEFVRYGVMHRNSYMDSPNLLTETFQSRSNPNLFFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGINAARLFKREEALIFPQTTAIGSLPHYVTHADSKHFQPMNVNFGIIKELEGPRIRDKKERYEAIASRALADLDTCLASL >NC_006086.1|WP_011054504.1|887467_888874_+|pyruvate-carboxylase-subunit-B MIQFGGFSMQQQVAITETVLRDGHQSLMATRLSIEDMLPVLTILDKIGYYSLECWGGATFDACIRFLNEDPWERLRTLKKGLPNTRLQMLLRGQNLLGYRHYADDIVDKFISLSAQNGIDVFRIFDALNDPRNIQQALRAVKKTGKEAQLCIAYTTSPVHTLNYYLSLVKELVEMGADSICIKDMAGILTPKAAKELVSGIKAMTNLPLIVHTHATSGISQMTYLAAVEAGADRIDTALSPFSEGTSQPATESMYLALKEAGYDITLDETLLEQAANHLRQARQKYLADGILDPSLLFPDPRTLQYQVPGGMLSNMLSQLKQANAESKLEEVLAEVPRVRKDLGYPPLVTPLSQMVGTQAAMNVILGKPYQMVSKEIKQYLAGDYGKTPAPVNEDLKRSQIGSAPVTTNRPADQLSPEFEVLKAEVADLAQTDEDVLTYALFPSVAKPFLTTKYQTDDVIKVTAFIKA >NC_006086.1|WP_009881173.1|888916_889231_+|membrane-protein MTYSFIDILQVTLVSLFLVLTCLTGIMGLMMLSGKLLSQEKKTLSQQASSIPQEQEADKLSGEALETLLAKDELARIAVMTSLAYASQEESGKRFEVIAVERKS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4634 : 90071
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_006086|4634:90071|DBSCAN-SWA TATGGTAAAAATGATTGTTGGTCTGGGAAATCCAGGCTCTAAATATGAAAAAACAAAGCACAATATTGGTTTTATGGCTATTGACAATATTGTCAAGAACCTTGACGTTACCTTTACAGATGATAAAAATTTTAAAGCACAGATAGGAAGTACTTTTATTAATCATGAAAAAGTTTACTTTGTGAAACCTACTACTTTTATGAATAATAGCGGCATAGCAGTAAAAGCATTACTAACCTACTATAATATTGACATAACAGATTTAATTGTTATCTATGATGATTTAGACATGGAAGTCAGTAAATTACGTTTACGTAGTAAGGGTTCAGCAGGAGGACATAATGGCATTAAGTCAATCATTGCCCACATTGGAACTCAGGAATTTAACCGAATCAAAGTTGGTATTGGACGACCTTTAAAAGGTATGACTGTTATTAGCCATGTGATGGGCCAATTCAATACCGAAGATAATATTGCTATTTCGTTAACTCTTGACAGAGTTGTCAATGCTGTCAAGTTTTATTTACAAGAAAATGATTTTGAAAAAACAATGCAGAAATTTAATGGATAATCATGGATATTTTAGAATTATTTAGTCAGAATAAGAAAGTCCAATCCTGGCACTCTGGATTAACCACCTTAGGAAGACAACTGGTAATGGGGTTATCGGGTTCAAGTAAAGCATTGGCTATAGCTTCCGCTTATTTAGATGATCAAAAAAAAATAGTTGTGGTTACATCAACTCAAAATGAGGTTGAAAAATTAGCCAGCGATTTATCTAGTTTACTTGATGAAGAACTTGTTTTCCAATTTTTTGCAGACGATGTGGCTGCAGCGGAATTTATCTTTGCGTCAATGGATAAAGCTCTATCAAGAATAGAAACCCTGCAATTTTTAAGGAATCCTAAATCTCAGGGCGTTTTAATTGTTAGTTTATCAAGCTTAAGAACTTTATTGCCAAACCCAGATGTTTTTACAAAGAGTCAGATTCAACTAACAGTTGGAGAAGATTATGATAGTGATACTCTTACTAAACAACTGATGACAATTGGCTATCAGAAGGTCTCACAGGTCATTAGTCCGGGAGAATTTAGCCGTCGAGGGGATATTTTAGATATCTATGAGATTACACAAGAATTGCCTTATCGATTGGAATTTTTTGGCGATGATATTGATAGTATTAGGCAATTTTATCCAGAAACTCAAAAATCTTTTGAACAACTAGAAGGTATTTTTATTAATCCAGCAAGTGATCTTATTTTTGAGGCTAGTGATTTTCAACGTGGCATTGAGCAATTAGAAAAGGCTCTACAAACAGCACAAGATGATAAAAAATCTTATTTAGAAGATGTATTAGCTGTTTCAAAAAACGGTTTTAAACATAAGGATATCCGTAAATTTCAATCATTATTTTACGAAAAAGAGTGGTCATTATTAGATTATATTCCTAAGGGAACGCCAATCTTTTTTGATGATTTTCAAAAACTAGTTGATAAAAATGCAAGATTTGATTTAGAGATTGCTAATCTCTTGACAGAAGATTTACAGCAAGGAAAGGCTCTTTCCAATCTTAACTACTTTGCAGATAATTATCGAGAGCTTAGGCACTATAAGCCAGCGACCTTCTTTTCAAATTTTCATAAGGGACTTGGAAATATCAAATTTGATCAGATGCATCAGCTAACTCAGTATGCCATGCAGGAATTTTTTAATCAATTTCCTTTGTTGATTGATGAGATTAAACGGTATCAAAAAAATCAAACAACGGTTATTGTACAGGTAGAGTCTCAGTATGCTTACGAACGACTTGAAAAATCTTTTCAAGATTACCAATTTCGCCTTCCTTTAGTGAGTGCTAATCAAATTGTTTCACGTGAATCACAAATTGTAATTGGAGCTATCTCCAGTGGTTTTTATTTTGCTGATGAAAAGTTAGCGTTAATCACAGAGCATGAAATTTATCATAAAAAGATCAAACGACGCGCTAGACGATCTAATATTAGCAATGCTGAGCGTTTGAAAGATTACAATGAGTTAGCAGTAGGTGATTACGTGGTTCATAATGTCCATGGTATCGGTCGCTTTCTTGGAATTGAAACGATTCAGATTCAGGGAATCCATCGAGATTACGTTACTATTCAATATCAAAATTCAGACCGTATTTCTCTTCCAATTGACCAAATTGGTAGCTTATCAAAGTACGTTTCTGCTGATGGAAAAGAACCTAAAATTAATAAACTCAATGATGGTCGTTTTCAAAAGACAAAGCAAAAGGTCGCTAGACAAGTAGAAGATATTGCTGATGACCTTCTAAAATTATATGCTGAAAGAAGTCAGCAAAAAGGATTTTCATTTTCACCAGATGATGACTTGCAGCGCGCTTTTGATGATGATTTTGCTTTTGTAGAAACAGAAGATCAACTTAGGTCTATAAAGGAAATTAAAGCTGATATGGAGAGCATGCAACCTATGGATCGTCTTTTAGTAGGCGATGTAGGATTTGGTAAGACAGAAGTAGCTATGAGGGCAGCCTTTAAAGCGGTGAATGATCACAAACAAGTAGCTGTCTTAGTTCCAACCACAGTCTTGGCCCAGCAGCATTATGAAAACTTCAAAGCACGCTTTGAAAATTACCCTGTTGAGGTTGACGTCTTAAGTCGTTTCCGTAGTAAAAAAGAGCAAGCTGAAACACTAGAACGTGTACAAAAAGGTCAAATTGACATTATTATCGGAACCCATCGACTCCTATCAAAAGATGTGGTCTTTTCTGATTTAGGATTAATTGTGATTGATGAGGAACAACGGTTTGGTGTTAAGCATAAAGAAACTTTAAAGGAATTAAAAACTAAGGTTGACGTCTTAACCTTAACAGCTACTCCGATTCCTAGAACCTTACACATGTCTATGTTAGGTATCCGAGATTTATCGGTTATTGAGACCCCACCAACCAATCGTTATCCTGTTCAAACCTATGTTTTGGAAAATAATCCAGGTCTCGTTAGAGAAGCTATCATTCGTGAAATGGATCGTGGAGGACAAATTTTTTACGTTTACAATAAAGTTGACACTATTGAAAAGAAAGTTGCAGAGCTACAAGAATTAGTCCCAGAAGCTTCTATCGGTTTTGTTCATGGGCAAATGAGTGAAATTCAACTTGAAAATACCTTGATTGACTTTATAAATGGTGATTATGATGTCCTTGTGGCTACAACAATCATCGAAACAGGAGTTGACATTTCTAATGTAAACACTTTGTTTATTGAGAATGCTGATCATATGGGATTGTCAACTTTATATCAACTGAGGGGGCGCGTCGGAAGAAGTAATCGTATTGCCTATGCTTACCTGATGTATCGTCCTGATAAGATCCTAACAGAAGTCTCTGAAAAACGTTTAGAGGCTATTAAAGGCTTTACTGAATTAGGTTCAGGCTTCAAGATTGCTATGCGAGATTTGTCTATACGAGGAGCAGGTAATATTTTAGGAGCTTCTCAAAGTGGCTTTATTGATTCGGTCGGTTTTGAAATGTATTCTCAGTTATTGGAACAGGCTATTGCTAGCAAGCAAGGAAAAACGACTGTTCGCCAAAAAGGTAATACTGAAATCAATCTTCAGATTGATGCTTATTTACCAGATGATTATATTGCAGATGAGCGCCAAAAAATTGACATTTACAAGCGTATTCGAGAAATTCAATCAAGAGAAGATTATCTCAATTTGCAAGATGAGCTGATAGATCGTTTTGGAGAGTATCCTGATCAAGTTGCCTATTTGTTAGAGATAGCTCTGCTAAAACATTATATGGACAATGCCTTTGCGGAATTAGTTGAACGCAAAAATAATCAGGTCATTGTTCGATTTGAAGTAACTTCTTTAACTTATTTCTTGACTCAGGATTATTTCGAAGCCTTATCGAAAACCCATCTTAAAGCTAAAATTAGTGAACATCAGGGGAAAATCGATATCGTCTTTGACGTTCGCCATCAAAAAGATTATAGAATTTTAGAAGAATTGATGTTATTTGGAGAAAGGCTTAGTGAGATAAAAATCAGAAAAAACAATTCAGTTTTTAAATAATAATTTGAAACAACTTTTAGACTGAATAGTATTAATGACAATGGAACGAACTAGCTCTTTATACTTTTGTCAAAAATCTAAGATCTTTGCTGCGAAATTAGGATCTTTTCTACCATTTAAAAAATAAAAATGATAAAATGAAGAGGATTGTAGGAGAAATTATGAGACTAGATAAATATCTAAAGGTATCGCGCCTTATTAAACGTCGTTCAGTAGCAAAAGAAGTTGCGGATAAGGGACGAATTAAAGTTAATGGGATACTTGCTAAAAGTTCAACGAATGTAAAACTAAATGATCACATTGAAATTAGTTTTGGAAATAAATTACTGACAGTAAGAGTCATTGAAATAAAAGATAGTACAAAAAAAGAAGATGCTCTTAAGATGTATGAGATAATCAGTGAAACAAGGATAACATTAAATGAAGAAGCCTAGTATTGTTCAATTAAATAATCATTATATTAAGAAAGAGAATCTCAAAAAAAAATTTGAAGAAGAAGAATCTCAAAAAAGAAATCGTTTTATGGGATGGATCCTTGTAAGTATGATGTTTTTATTTATTTTGCCAACTTATAATCTTGTCAAAAGTTATGTTGATTTTGAAAAGCAAAATCAACAGGTGGTTAAATTAAAAAAAGAGTATAATGAATTGTCAAAGAGTACAAAAAAAGAAAAACAATTAGCAGAACGACTAAAAGATGATAATTTTGTCAAAAAATATGCTAGGGCAAAATACTATTTATCGCGTGAAGGAGAAATGATTTATCCTATTCCAGGACTATTACCAAAATGATGATGGACAATATTATAAAAAAAATAGAAGCATTTCTTGCTTTTTCTGATAAAAAATTAGCAGAGCTGCAACAGGAAAATCAAAAAGTTAAAGAAGAAAGTCAGTATATTCAAAAAAACTAGAAAGGAGTC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72 | Streptococcus_phage(67.24%) | tail,capsid,holin,transposase,head,protease,tRNA,integrase,terminase,portal | attL 25149:25165|attR 52445:52461 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
364839 : 422898
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_006086|364839:422898|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(31.58%) | bacteriocin,protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
640248 : 650851
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_006086|640248:650851|DBSCAN-SWA 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CTTTCCATTAATGCTTTTAAAGGGGTGGAATTTGGAGTTGGGTTTGATATGGGATTCCAAAAGGGCTCTCAGGTAATGGATGAAATCACCTGGACACCTACCCAAGGCTATGGTCGTCAAACGAACCACTTAGGTGGCTTTGAAGGTGGCATGACCACAGGACAACCTCTTGTTGTTAAAGGGGTTATGAAGCCCATTCCTACTTTGTATAAACCACTCATGTCGGTAGATATTGATAGTCATGAACCTTATAAAGCAACGGTGGAACGCTCTGATCCGACGGCCTTACCAGCTGCAGGGGTTATCATGGAAAATGTGGTGGCGACGGTGCTTGCCAAAGAGATTTTAGAGACTTTTTCTTCTACTACCATGTCTGAATTGCAAAAAGCTTTTTCGGACTATCGTGCTTACGTCAAGCAATTTTAGATAGCGAGATACTGGCTTTTATGGTATCATACAGGTATTAATGAACAAAAGGAGACTGTCATGTCACAAGAAATTTATGACTATGCTAATCAACTTGAAAGAGCAGTTCGTGCTCTGCCAGAATACCAAAAAGTGTTAGAAGTAAAAGAGGCCATTCAAGCAGACGCTAGTGCTAGCCAACTGTTTGATGAGTTTGTCGCTATGCAAGAAAAAATCCAAGGGATGATGCAATCAGGCCAAATGCCAACGGCTGAAGAACAAACAAGCATTCAAGAACTTAGCCAAAAGATTGAAGCTAATGACCAGCTAAAAGCTTATTTTGAAGCGCAGCAGGCCTTATCTGTTTACATGAGTGATATTGAGCGTATTGTATTTGCTCCGTTGAAAGATTTAGTCAAGTAAGCCAATTAAGATAGGAAAAAAACAGATTGCTGGCAGCTCGTCAGGATCTGTTTTTTAGTGTTTATTTTCTTTGTATCAGAAAGTTGAGCCTCTTTCTTATTTGTGATATAGTCAAATAAAGTGACCAAAATAGCAGGCCAGTAGTGGCTTTAATGAAGGCAAGTTGTCTGCTAACTGGCTATGCTAAAACATCAGTATTAGAAAGTAAAAGGTGATAAAAATGGTTATTCCTTATGATTATATTGTTATTGGTGGAGGGAGTGCAGGTATTGCTTCTGCGAACAGGGCAGCCATGCATGGGGCCAAAGTATTGTTAGCTGAAGGTAAAGAGATTGGGGGAACCTGTGTTAACCTAGGCTGCGTTCCTAAAAAAGTCATGTGGTATGGCGCTCAAGTAGCAGATATTTTAGGGACTTACGCTAAGGATTATGGATTTGACTTTAAAGAGAAAGCATTTGATTTTAAACAATTGAAAGCAAATCGTCAAGCTTATATTGATCGGATTCATGCTTCTTATGAGCGAGGCTTTGAGCAGAATGGTGTTGACCGTATTTATGATTATGCTGTTTTCAAAGATGCTCATACGGTAGAAATTGCAGGGCAGCTTTATACCGCACCGCATATTTTGATTGCCACAGGAGGACATCCTGTTTTTCCAGATATTGAGGGGGCACAATACGGTATCAGCTCGGACGGCTTTTTTGCCTTAGATGAGGTACCAAAACGTACGGCTGTGGTTGGGGCAGGCTATATTGCTGTGGAACTTGCTGGTGTTTTGCATGCTTTGGGATCGAAGACGGATTTGTTTATCCGTCACGATCGACCTTTAAGAAGTTTTGACAAAACCATTGTTGATGTCTTAGTTGATGAAATGGCAGTTAATGGGCCGCGTTTACACACTCATGCAGAAGTGGCAAAGGTTGTCAAAAATACTGATGAGTCCTTGACCCTTTACCTCAAAGATGGCCAAGAAGTTGAGGTTGACCAGCTCATTTGGGCTATCGGTCGCAAGCCTAATCTAGAAGTTTTTAGTCTTGACAAAACTGGAGTGACGTTAAATGATAAAGGTTATATTGAGACAGATGCCTATGAAAACACGTCTGTCAAAGGTATTTATGCCGTGGGAGATGTTAATGGGAAACTGGCTTTAACTCCAGTTGCTGTGGCAGCTGGACGTCGCCTATCAGAGCGTCTTTTCAATAGCAAAACAGACGAGAAATTGGACTACCAAAACGTTGCTACTGTGATTTTTAGTCACCCTGTTATTGGCTCTGTTGGCTTGTCAGAAGAAGCAGCAGTCAAACAGTATGGGCAAGAAGCAGTTAAAACATATCAATCACGTTTTACGTCTATGTTTACTGCTATCACTAACCATCGCCAACCTTGTCTGATGAAGTTGGTAACAGTCGGAGATACCGAAAAAATAGTTGGTCTTCACGGAATCGGATACGGGGTTGACGAAATGATTCAGGGCTTTGTAGTAGCCATCAAAATGGGAGCAACCAAGGCGGATTTTGATAACACCGTTGCTATTCACCCAACTGGCTCAGAAGAATTTGTCACCATGCGCTAAAAAATGTAGCCTAAGGCAATAAAAAATGATGTTAACAGTTTTTGAGGAAAGTCTTCTAAACTGCTAGCATCGTTTTTTGTTAGGTGATTAGGGGAATATGTTTTTAAAGATATTTGCGTTGCTCAGACAATATTGCCTTACCTCGGAGATAAAATAAAGTGACCCTGTAACAACAAAGAGTTCATCAGATGTTACGGAACCTTGTAACCAGTCTCTGTAATCTTTTACCTGTGGGTATTTATCAGGATAATCCTCTAAAAGATTTGCTTCAGGGAAATCAAAAGTCGTGACAGATACTTCAAAAGTATCTAGTTGAGCCAGCAAGTCGGCTAAAGGCTTACGTTTGAGACCTGCAAAGAGAATATGAATAGGACGTTTGGGAAATTCTTCTTGCAGTAGAGACTTTAATTTAGCAATGGAATCTGGATTGTGAGCGCCGTCTAATAGAAGATTAGGTTGAATAAATTCGGACCGGCCAGGCCAAGTTGTTGCCTCAATTCCTTTTTGAATCGTTTTTGGAGATATTTTAGGAAAGGATTTTCTAAGTAATTGAGCTGTCATAATGGCTAAACAGGCATTCGCTTTTTGATGTTGACCTAATAGTTTGAGACGGAGTTTGGTTAAATTCAAGTTATCGTGTTGAAAGGAAAACGTCTTTTCTGAAGGATTGAGCAAAAAATCTTTTCCTAATTGATATAAGCGTGAACCGGCTTTTTGGGTAACTTGTTGAAAGACTTGACTAGCCTCCTGCTCAAGTTGACCGATAATAACGGGTTCTTTAGCTTTGATAACTTCTGCTTTTTGGTGAGCAATTTCTGCTAGGCTATAACCTAAACGTTCTTGGTGATCAAAACTAATAGAAGGGCATACGACGGCCAGAGCATGAAAAACATTGGTTGCGTCGGTTTTCCCACCAATCCCTGCCTCAATAATGGCAATATCAACAGGTTTAAGATTGGCAAAGTAGCAAAACATTATGAGCGTCACTAACTCAAACTCGGTAGGTCTATCCCAATTTGTTTCAAGGGACATTTTAGTGAGAATGGGTCTAATCACGCTCACACATTGCGCCAATTCTAGGTCTGAAATGGGCTGGCCATTAAGGCAAATCCGATCGTGAAAAGAGATAATAAAAGGAGATGTAAAGGTTCCGACCTGATAACCAGAAGTTGACAGGATATGCTGTAAGTAGGCTGTCACAGAGCCCTTGCCGTTAGTTCCAACAACGTGAATAGCAGGGAATTTGTCTTGTGGCCGGCCTAGTGCCTCAAGTAACCAAGCCATTCTGGCCAAATCGGTCTTGCGACCATTAGCCTTAAAGGTATGAATCCAGGAAATGCTATCATAGGTAGTCATTACTATTTCTTGTCCTTCTAACAATGCTTTTAAGGGTTCGTAGGAAGACCAGTATTAGCATCTTCAGCTCCAGTTGCATTAGGAAGTTGCGTCCCTTCAGTGGTTGATGGTGTCTCAGGAGCTGTAGGAGTAGTCTCGTTGTGAGAAGGTGCGGTAGAAGATGACGGAAGAGTTGTCTTATTATCATCTGTGGTTTCTGAAGTACCTGTATGGTTTTGATTACCCTGAGAAGACTCTTTTTCAATAATCTTGACAATGGTATTACTCGATTCTTTGGGTGTATCATTAGAGGTCTTATCTGGTACAGGCTGCAGTGCTCTTGAAATGGTAATGGTTGCCACGATGATACTCAAAATACTACCAATAAGTGCAATGGATTTTTGGAAAGCTGTAAAACCTGTTTTAATATGCTCGGTAGGGACACCTCCTGATTTACGAGGTTTTTGTTGACGGGAATAACGTGATGACATATTTTTCTCCTTTAAAATCATCGTAATGCCAAGATTAAGGAGGAGGAAACAGAAGTCCTAGCTCCTCTTTAACACTTCATCTATCAGTATAATCTAGAAAAAAAGTGAAGTCAACGGTTTACCTTATGTCTAGGACAAGGAAGTCCTTTGGGCTTATTGTAATACGAATATTCTTGATTTCATTTTAGCTATTTTGTGATAGAATAAAGTATTGAGTAAAAATGAAGGTGACACATGATTTATTTTGATAATGCAGCCACAACCATACCTTATGGAGAGGCTCTTAAAACTTACCAAGAAGTAGCAACAAAAATATATGGCAATCCCTCAAGTCTGCACCAATTAGGGACAAATGCGTCTCGTATTTTAGAAGCTTCCCGTAAACAGATTGCTGGTTTGTTGGGTGTTAAGTCAGAAGAAATCTTTTTTACGTCTGGTGGGACTGAAAGTGCTAATTGGGCTATTAAGGGAATTGCTTTTGAAAAAACTGCTTTTGGCAAACATATTATTATCTCAGCCATTGAACACCCTGCCGTGAGTGAAAGTGTCAAATGGCTTCTCACACAAGGATTCGAAGTTTCTTATGCTCCAGTGACAACACAGGGAGTTGTTGATGTGAATGCTTTAGCTGAGCTGATTAGACCAGACACCATCTTAATCTCGATTATGGCTGTTAATAATGAAATGGGAGCTATCCAACCGATTAGAGCCATTTCAAACCTATTGGCTAACCAACCAACGATCACCTTTCACGTTGATGCTGTTCAAGCCATTGGTAAAATACCACTCTGTGATTATATGACTAATCGTGTGGATTTGGCTTCTTTTTCAGGGCACAAATTTCATAGTGTTCGTGGTGTTGGCTTCCTTTATAAAAAAGCAGGCAAGCGACTCAATCCTCTCTTGTCAGGCGGCGGCCAAGAGCAGGAGTTACGTTCAACCACTGAAAATGTTGCAGGAATTGCTAGCATGGCCAAAGCATTAAGAATAGTCACTGAAAAACAAGTGAGCGTCTTACCTAAACTAACAGCGATGCGAGATGTGATTTACAAAGCTTTGTCCGCTTACCCAGATGTGACAGTATTTTCAGCTCAAGAAGGCTTTGCGCCCAATATTTTGACCTTTGGGATTAGAGGGGTTCGAGGAGAAGTTATTGTCCACGCCTTTGAAAAATATGAGATTTATATTTCGACCACAAGTGCATGTTCGTCCAAAGCAGGTAAGCCAGCAGGAAGCCTAGTGGCTATGGGGATTCCTGTAAAAACTGCCCAGACAGCCGTTCGTATTAGTCTAGACGATGACAACGATATGGGACAAGTAGAGCAATTTTTGACCATATTCAAACAGATTTATGATAAAACACAGAAAGTTAGGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_006086|640248:650851|649708_650851_+|WP_011184383.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTIPYGEALKTYQEVATKIYGNPSSLHQLGTNASRILEASRKQIAGLLGVKSEEIFFTSGGTESANWAIKGIAFEKTAFGKHIIISAIEHPAVSESVKWLLTQGFEVSYAPVTTQGVVDVNALAELIRPDTILISIMAVNNEMGAIQPIRAISNLLANQPTITFHVDAVQAIGKIPLCDYMTNRVDLASFSGHKFHSVRGVGFLYKKAGKRLNPLLSGGGQEQELRSTTENVAGIASMAKALRIVTEKQVSVLPKLTAMRDVIYKALSAYPDVTVFSAQEGFAPNILTFGIRGVRGEVIVHAFEKYEIYISTTSACSSKAGKPAGSLVAMGIPVKTAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYDKTQKVR >NC_006086|640248:650851|647735_649004_-|WP_002990257.1|DBSCAN-SWA MTTYDSISWIHTFKANGRKTDLARMAWLLEALGRPQDKFPAIHVVGTNGKGSVTAYLQHILSTSGYQVGTFTSPFIISFHDRICLNGQPISDLELAQCVSVIRPILTKMSLETNWDRPTEFELVTLIMFCYFANLKPVDIAIIEAGIGGKTDATNVFHALAVVCPSISFDHQERLGYSLAEIAHQKAEVIKAKEPVIIGQLEQEASQVFQQVTQKAGSRLYQLGKDFLLNPSEKTFSFQHDNLNLTKLRLKLLGQHQKANACLAIMTAQLLRKSFPKISPKTIQKGIEATTWPGRSEFIQPNLLLDGAHNPDSIAKLKSLLQEEFPKRPIHILFAGLKRKPLADLLAQLDTFEVSVTTFDFPEANLLEDYPDKYPQVKDYRDWLQGSVTSDELFVVTGSLYFISEVRQYCLSNANIFKNIFP >NC_006086|640248:650851|649033_649474_-|WP_021340089.1|DBSCAN-SWA MSSRYSRQQKPRKSGGVPTEHIKTGFTAFQKSIALIGSILSIIVATITISRALQPVPDKTSNDTPKESSNTIVKIIEKESSQGNQNHTGTSETTDDNKTTLPSSSTAPSHNETTPTAPETPSTTEGTQLPNATGAEDANTGLPTNP >NC_006086|640248:650851|646295_647648_+|WP_021340090.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHASYERGFEQNGVDRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKTIVDVLVDEMAVNGPRLHTHAEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEVFSLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNSKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFVVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >NC_006086|640248:650851|644506_645673_+|WP_002992640.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGLSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEEEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >NC_006086|640248:650851|640248_642459_-|WP_011889006.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYENSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNTKNRE >NC_006086|640248:650851|643726_644413_+|WP_002985140.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >NC_006086|640248:650851|645733_646075_+|WP_002985134.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADASASQLFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK >NC_006086|640248:650851|642566_643730_+|WP_011184379.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFNVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE |
9 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
955006 : 1054576
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_006086|955006:1054576|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_006086|955006:1054576|1012309_1012777_-|WP_011184601.1|terminase|DBSCAN-SWA MGRNLKLVETTKKHLTKEEKIVRETAQNKASDGFKKLQKTPPEHFNNVAKYEYRRIIEDLQNLPLRNLDRGLLELYCTWYAIYKETSRKLDEVGYFTNDPDKGIIPSPLILTLEKATANIRSSASQLGLTVDSRMKMFIPKEEEKPKSIFDKFGG >NC_006086|955006:1054576|1023877_1025371_-|WP_011184615.1|DBSCAN-SWA MNKRASGILMHISSLPGKFGIGTFGKSAFEFVDFLAETKQTYWQILPLTTTSFGDSPYQSFSAIAGNTHFIDFELLVADGYLQEADLVGVDFGSDPEVVDYAQIFQARRPLLEKAVQAFLATKEGIKELAAFEAEASWLGDFAEFMSLKEHFQNKALQEWDDRAIVKREEAALHHYRELLAKKITYHKVCQYFFYQQWSALKIYANHKGIEIIGDMPIYVSADSVEVWTMPELFKVDSDKKPLFIAGVPADGFSEDGQLWGNPTYNWSAHEKSNFAWWIYRIQESFKLYDQLRIDHFKGFSDFWEIPAGDKTARNGHWASAPGIALFSAVREALGELPIIAENLGYIDEKAEQLLVSTGFPGMKILEFGLFDITSQSIDLPHYYDRNCVAYTGTHDNEVVNGWYDNLSEEQVHFVNNYLHKHADESITKAMLRTIFASVCDTAILCIQDLLDKDGKSRMNMPNTIGGNWQWRMLDGELNQDHKDYLIYLTDLYGRAR >NC_006086|955006:1054576|1005462_1005888_-|WP_011184592.1|DBSCAN-SWA 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96 | Streptococcus_phage(53.06%) | tail,holin,capsid,transposase,head,tRNA,protease,integrase,terminase,portal | attL 987286:987345|attR 1020383:1020478 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1072475 : 1182430
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_006086|1072475:1182430|DBSCAN-SWA 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98 | Streptococcus_phage(83.08%) | tail,holin,capsid,transposase,head,protease,tRNA,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1197867 : 1234599
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_006086|1197867:1234599|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(69.77%) | tail,holin,capsid,transposase,integrase,terminase,portal | attL 1200072:1200091|attR 1231972:1231991 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1296824 : 1355481
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_006086|1296824:1355481|DBSCAN-SWA 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52 | Temperate_phage(70.0%) | tail,capsid,tRNA,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1491259 : 1563331
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_006086|1491259:1563331|DBSCAN-SWA 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58 | Streptococcus_phage(28.12%) | tail,holin,head,tRNA,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1816763 : 1836495
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_006086|1816763:1836495|DBSCAN-SWA 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MAKTNISPGMQQYLDIKKDYPDAFLLFRMGDFYELFYDDAVKAAQLLEIGLTSRNKNAENPIPMAGVPHHSAQQYIDVLIELGYKVAVAEQMEDPKQAVGVVKREVVQVITPGTVVDSAKPDSANNFLVAVDFDGCRYGLAYMDVSTGEFCVTDLADFTSVRSEIQNLKAKEVLLGFDLSEEEQTILVKQMNLLLSYEETVYEDKSLIDGQLTTVELTAAGKLLQYVHKTQMRELSHLQALVHYEIKDYLQMSYATKSSLDLVENARTNKKHGSLYWLLDETKTAMGMRLLRSWIDRPLVSKEAILERQEIIQVFLNAFIERTDLSNSLKGVYDIERLSSRVSFGKANPKDLLQLGHTLAQVPYIKAILESFDSPCVDKLVNDIDSLPELEYLIRTAIDPDAPATISEGSIIRTGFDERLDHYRKVMREGTGWIADIEAKERQASGINNLKIDYNKKDGYYFHVTTSNLSLVPEHFFRKATLKNSERYGTAELAKIEGQMLEAREESSSLEYDIFMCIRAQVETYINRLQKLAKILATVDVLQSLAVVAETNHYIRPQFNDNHVITIQEGRHAVVEKVMGVQEYIPNSISFDQQTSIQLITGPNMSGKSTYMRQLALTVIMAQMGSFVAADHVDLPLFDAIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMMEANQAIKRASDNSLILFDELGRGTATYDGMALAQAIIEYIHDRVGAKTIFATHYHELTDLSTKLTSLVNVHVATLEKDGDVTFLHKIAEGPADKSYGIHVAKIAGLPKSLLKRADEVLTRLETQSRSTEIMSVPPQVESSSAVRQGQLSLFGDEEKAHEIRQALEAIDVMNMTPLQAMTTLYELKKLL >NC_006086|1816763:1836495|1828026_1829715_+|WP_011185074.1|DBSCAN-SWA MLKQNTEKEGRTIEQEDLKNLENEITEARENEDKYFSTFKGVRGQLIKECQEMKDEAFKIAYDGVMADSKHLENVKAGRLTEVQHEELAKEKGQEASEKALPKTPLGVAIMLKHYLRFIRVKPEAQGQKAPLYFFHPDHGVWLEDNEFLQDLISVIFPNATEKQAFDTLYKIARQSQLKEIQREYTVIGNQLYNYKTGQFEELTPDITVTRKIKTGYNKKAKEPTIKGWKPTAWLLELFDGDAELYNLAIQIIKASITGQSLQKIFWLFGEGGTGKGTFQQLLINLVGMDNVASLKITELAKSRFTTSILLGKSIVIGDDIQKDAVIKDTSDIFSLATGDIMTIEDKGKRPYSIRLNMTVVQSSNGLPRMNGDKSAIDRRFRILPFTKVFKGKPNKAIRNDYINRKEVLEYLLKLAIETPITDINPKASIEILEEHHKEMNPVIDFVSKFFTDELTSEFIPNSFVYHVWKGFLEYYDIKQIKSERGLHKEIKSNLPEGFEAGQKVIPVGRQLHTGFYPKEDLPLFASASYANGRASPEKRKKPKNERGYYNHWPTHKKQKKT >NC_006086|1816763:1836495|1830001_1830175_+|WP_000694577.1|DBSCAN-SWA MKIKLFYQKHNESLDDFEYRVNLFTLSVSVIDIKFSEATYGNYEDMSTTTSLLVLYR |
24 | Streptococcus_phage(58.82%) | integrase,holin | attL 1819962:1819982|attR 1833796:1833816 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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NC_006086.1|WP_003051628.1|1333021_1333615_-|GNAT-family-N-acetyltransferase |
1333021_1333615_-
Protein sequences of NC_006086.1|WP_003051628.1|1333021_1333615_-|GNAT-family-N-acetyltransferase>NC_006086.1|WP_003051628.1|1333021_1333615_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNYRTISLDEIMKYLEKEEIQQLLKSFKGFNDGTSTPHDVEVFLHQKAVEFERSAIASTYLVFSTDSRELVGFFSLANRPLYFSKQNYQTLTKSQRKKISRSGRTLKGSGSFLMNSFLIGQLGKNYKSNTSISGKELLTLACDKVKKASKIINTKYIWLECDNNPKLIQFYQNFGFTPIDNFESENGLKVFVMKIQK |
197 aa aa |
89
gnl|BL_ORD_ID|89 information
|
NA | NA | 1296824-1355481 | NA |