Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_007146 | Haemophilus influenzae 86-028NP, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,WYL | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1146915 : 1155983
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_007146|1146915:1155983|DBSCAN-SWA 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TGTCTCTTTAGCCATTACATTGAAAGGTAAAGTAAGATTTGAAACTGCCAGTGCAGCTCCCGCAGATGACGCCTTGACAAAATCTCGGCGACTTATTTGATTAAAGTTACTCATAATATCGTCCCCCACAGTAAGATCGAGTAATAACTAAAACGAGTTAATTATAATCTTTGTATAGAAGTTTTACTTGAGCCAAATCAACTAATTATTAATAGGTACATTATTTATAGGGTATTTTAGTAGGTTGATGTTTTTATAAATTTTGGAATAACAAATTGACTATAGATTTAAAAATCCGTTAGCATAGTGGCGTATTAGTTTATCTAATATGTTAAGTTTAACTATTATTAACTAGAGGATCTTTTCATGAAGAAACTTATCGCGGTTGCGGTGTTTTCTGCGTGTGGCTCGTTAGCTCATGCAAACACCATTATTCCAAACTACAATACAGACGCCCATCTTTACGAATTCACGCAAACCTATGATTTAGTTGTGCCAAAAGGCTCGCAAGGACAAACCAATTTATGGGTTCCATTACCATTTAATGGGGAATACCAACAAGTGAAATCGATTCACTTTGAAGGTAATTACATGAATGCCTATGTAACAGAAAACAATAAATACGGAGCGAAAACCTTATTTGCCACTTGGGATAAAGATGCACAAAAACGTGATTTAAAAGTCACGATGGTCATTGAAACAAAAGACCGTGAACCGATGGTGAAAGGTGCTTTAGAGAATTATACTCCGCCAAAAGATATTCAGTATTCCGTGGATGTACAAGAATACTTAAAAGCTACTCCACATATTAAAACTGATGGCATTGTGAAAGAATTTGCTGACAAAATCCTAGGTAAAGAAACTAATCCATTGAAGAAAGCAGAACTTATTCACCACTGGATCGTAAAAAATATGGAACGTGATAATTCTGTATTAGGTTGTGGTGACGGCGATGTAGAAAAAATTCTTACCACTGGCGTGTTAAAAGGTAAATGTACCGATATTAACTCTGTATTTGTGGCACTTGCTCGTGCTGCAGGCATCCCTGCTCGTGAAATTTTTGGTATTCGCTTAGGTACGGCAGAGAAAATGGGCAAATATTCAAAAGGTGCCTTCGGTAGTGCAAATGAACAAGGCATCGTAAACGTAAGTGGCGGTCAGCACTGCCGCGCTGAATTCTACCTTGCAGGATTTGGATGGGTACCAGTTGATTCCGCAGACGTTGCCAAAATGCGTTTAGCAGAGAAAAAATCTGTTGAAGATAAAGATACACAAGCCGTAGCAAAATATTTGTTTGGTAACTGGGAAGCAAACTGGGTGGGATTTAATCATGCCCGTGACTTCGATTTATATCCACAACCAGAACTGGCTCCAATCAATAACTTCGGCTATCCATATGCAGAAGTAGGTGGCGATCCGTTAAATTCCTTTGACCCAAAAGAATTTAAATATGACTACGTATCTAAAAAACTCTAATAAATCCTTTTGGGTTGCCATAGCCGCCGCACTAAGTGCTGCGGTGGCATCAACCTTGTGCTGCATCGCACCATTAATTTATTTAGTATTTGGTGTGTCGTCCACTTGGTTGATTGGCTTAGGCGAATATGATTATTTGCGTATTCCTATGCTTATCATTTCATTATGTGCCTTTGCCTATGGATTTTGGCTGTTGATGTTTTCCAAAAAAATCATTTGTAGCAAATATATTTCCCGTAAAAAACTTATCGTTTTATATTGGATTGTATTTATCGTGATGATTTTTTTCTTAACCTATCCAACAATTTTACCTTGGATTTTAGAATTAGCTAATTAGGAATAAAAATGAAGAAATTATGTACCGCACTTTTGCTTTCGCTGTTTGCAATTTCTTTCGCTCATGCGAATGAAACCAAACAAATTGTGCTAAAAGTAAAGGAAATGAATTGCCAGCTTTGTGCTTACTTAGTCAATAAAGAACTGCGTAATATTGATGGCGTTATTTCAACAAAAGCATCTATTAAAGATGGTTTAGTGACGGTTGTGGAAGATCCAAAAGTCACAAACCAACAATTATTCGATGCAATTCACAAGCTGAAATATACTGCTGAAGTCGTGAATTAAACGCTAAATATCTAGCAAAAAAGTGCGGTGAAAATTCACCGCACTTTTCTTTAGCTATTAAATTAGACTAATTTTTTAATTAGCTTGATTACAGTACAATTAATTAAATATGATAAACGCAATATTATTCAGCACTTCCGCTTAAAAATCCGCCACTTTGATGATTCCAAAGTTTAGCGTACAGACCATTGAGCTCTAGTAATTCGGCGTGCGTACCTTGTTCGACAATTTGTCCTTTATCAAGCACAATCAGGCGATCCATCGCTGCGATGGTGGATAAACGATGGGCAATGGCAATCACAGTTTTATTTTCCATCATCTTATCTAGACTTTCTTGTATTGCCACTTCCACTTCTGAATCCAATGCACTTGTGGCTTCATCTAACAATAGAATTGGTGCGTCTTTTAACATTACACGAGCAATGGCAATTCTCTGACGCTGACCACCAGAAAGTTTTACCCCGCGTTCTCCCACATGGGCATCATAGCCTTTTCTACCTTGAGAATCACTGAGAAATGGGATGAAATCAGCGGCTTCCGCTCGTTCAGCAGCTAAAACCATTTCTTCATCAGTAGCATTCGGGCGACCATAAATAATATTGTCACGTACAGAGCGATGTAGCAACGAAGTGTCTTGAGTGACTAAACCGATTTGGCGACGTAAGCTTTCTTGTTGCACATTGAGTACATTTTGTCCATCAATGGTAATTTCGCCTTGTTGTGCTTCATAAAAGCGAAGTAATAAGTTCACAATCGTAGATTTTCCTGCACCAGAACGACCGATTAACCCAACCTTTTCCCCTGGTTTGATAGTGAGATTGAAATGATTGAGTAATGGTTTTGTCGGATCGTAAGCAAAGGTAATATCGTTAAACTTAATTTCCCCTTGTTTCACTTGTAACGGTGACGCTTGTGGTTTGTCCACAATGGTGTGGGGTTTAGTTAAAGTATTCATTCCGTCGTTTACGGTTCCGATATTCTCAAACAAACGGGCAGATTCCCACATAATCCAGCGAGAAAGCCCATTTACGCGTAATGCCATGGCCGTTGCCGTTGCTATTGCACCCACGCCAACTTGACCATTTTTCCATAAAATAATACCAAGTATTGCAGTACTTAACGTAAGTAGAATATTTGTAGCGTAAGTGAGTGTATCTAGTGATGTTGCTAAGCGCATTTGGGCGTGTACTGTTACCATAAAATCTTGCATAGAACGCTTGGCATAAGTAGCTTCGCGTGAGCCGTGAGAAAATAATTTTACTGTAGCAATATTAGAATAAGCATCTGTAATGCGTCCTGTCATTAAAGAACGAGCATCAGCTTGTCGTTGTGCGGTTTTTGATAGTTTAGGAATTAGGGTTCGTAGGATCAAACCGAAGAGTATAATCCAAGTAATAAATGGTAATAAGAACCAAGAATCTAATGCCACTAGCACTACGCCAGAGGTAATAAAATATACCAATACATAAACGAACATATCTGCAAGTGTAAGTACTGTGTCACGTACTGCAAGGGCGGTTTGCATTACTTTTGCGGATACTCTACCTGCAAATTCGTCTTGATAAAAACTTAAACTTTGTCCAAGCATTAAACGATGGAAATTCCAACGTAATCGCATTGGAAATACGCCTTGTAAGGTTTGTAAATGCACGGCCGAAGCTAAAAATCCCCACACAATACTAATAAGTAATAGAGCAGCCATTCCAATTAATAAATGACTTTTTTCTTGCCATAATCTTTCAGGTGTAAATGTGCCTAACCAATCTACAAGCGTTCCCATAAATTGGAATAATACAGCTTCCATTACACCTGTACCTACGGTTAAAATTGCGAGCAAAAAAATCCAGCCTTTCATTCCTGTAATACTAGACCAAATAAAACGGAACAAACCTTTTTTAGGTGTTGTTGGATTGCTTTCTGGATAGGGATTCAAACGATTTTCAAACCACGAAAAAATTTTGTTAAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_007146|1146915:1155983|1149607_1152028_-|WP_011272357.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQHLNENSQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVSALAYVMIQENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPADAPKNGHYKAYILGYGNDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYEQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIANTWKLAEDEIIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAEPRNIKNGDMIRIFNDRGEVRINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL >NC_007146|1146915:1155983|1152280_1153390_+|WP_011272358.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVFSACGSLAHANTIIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWDKDAQKRDLKVTMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKILGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAAGIPAREIFGIRLGTAEKMGKYSKGAFGSANEQGIVNVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >NC_007146|1146915:1155983|1146915_1147416_-|WP_011272353.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHIFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACTQQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >NC_007146|1146915:1155983|1153735_1154014_+|WP_005651690.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNIDGVISTKASIKDGLVTVVEDPKVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >NC_007146|1146915:1155983|1147415_1148027_-|WP_011272354.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNINEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLIEFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTLKTLQQWQVDLHINIPTVRFYR >NC_007146|1146915:1155983|1148979_1149597_-|WP_011272356.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYSRVKSGQKPICADACPLRALDFAPIDELRAKYGTQASIAPLPPADITQPNLVVKPNKHARLSGDTSGFLGNPREV >NC_007146|1146915:1155983|1154138_1155983_-|WP_011272359.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKSHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLADMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFGLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNDITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAEAADFIPFLSDSQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSGSAE >NC_007146|1146915:1155983|1153364_1153727_+|WP_005656013.1|DBSCAN-SWA MTTYLKNSNKSFWVAIAAALSAAVASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >NC_007146|1146915:1155983|1148138_1148978_-|WP_011272355.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIATGAIFFALAGFYWLIAILGKMPASLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVLLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRVKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMAIGG |
9 | Escherichia_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1282773 : 1291282
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_007146|1282773:1291282|DBSCAN-SWA 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CGTTCGAAGAAACGCATACCGCCATAAATACGGTATGGAATTTGACAACGAATTAAAGCTTCTTCAATAACCCGTGATTGGCTATTACTACGATAAAGTACAGCGCAATCATCAAGTTTTCCGCCATGTTCCACCCAATCCTGAATTTGTGAGGCGACAAATTTTGCTTCGTCTAATTCATTAAAGGCAGCATAGATGCCCACAGGATCGCCTTTTTCACCCTCTGTCCATAAATTTTTACCAAGACGATCACTATTGTTTGCAATTAATTCATTTGCGCTGTTTAGGATATTGGCGGTAGAACGATAGTTTTGTTCAAGGCGAATTGTTTCGGCTTTGAAATCTTTCAAGAATTTTTGGATATTTTCTATTTGTGCACCACGCCAACCGTATATAGATTGATCATCATCGCCCACAATCATGACTTTGCCTGTTTTTCCAGAAAGAATTTTGATCCATTTATATTGGATTTTATTGGTGTCTTGAAATTCATCCACCAAAATATGCTGAAAACGTTGTTGATAACGTTGCAAAATTAATGGTTTTTTCTCAAATAATTCATAGACCCGAATTAATAATTCAGCAAAATCGACCAACCCTGCGCGATCGCAAGTGTCTTGATAGATCTGATAAATTTTAATCCATTCACGTTCTTGGCGATCATTAAAATCTTCAATATCATTTGGTCGCAAGCCTTCATCTTTTTTGTTATTGATGTACCAACAAGCCTGTTTAGGCGGAAAAGCTTTTTCATCAAAATTATGTAATTTTAATAATCGTTTAATTAAACGAAGTTGATCTTCTGAATCTAAAATTTGGAAATCTTGTGGCAATCCCACATCTAAATGATGAGCTCGTAATAAACGATGGGCAATGCTGTGAAAGGTGCCAATCCACATACCAACTAATTGATGTTGTGCGTGTTTGGCAAGGGTAGATTGAATACGATGACGCATTTCTGCTGCGGCTTTATTGGTAAAGGTCACCGCCATAATGCTGCCTTCAGAAATATTTTCGACCGCAATTAACCAAGCAATACGGTGCGTCAATACACGCGTTTTGCCCGATCCTGCACCAGCTAGCACTAGGTGATTACCAAGAGGAGCAGCTACGGCTTTGCGTTGTTTATCGTTAAGCCCGTCAAGTAATTCAGAAATATCCATCATAAACTATCTTTAATCTGTTTAAATTTACAGTTATTATAGTCTCATCTATCTTGTGAAACAATAAGATTTGTGAGTATATCAAAAGTAGGGTAGAACATTTTAAGAATAATATTAAGCGGGATTCTCCTATATCCTTAAACTCAACATCAAAACCATATGCTTTGAAAGCTATTTTTATACTATCTATAAACAAATTTTTAATTCGTTTACCTCTCATTCCTAAAATGCAAGGTTTCTCATTTTTCCAAAAATACCCATGATGTAATAGTATAGGAATGTTGTTTAATGACTTAATCAATACTTGATTTGCTAGGATTCCTGTAATGATTTTATAAACATTTGCTTTTCCTTCTACTTGCACGCCATTTTACGCATAGTCGGTGATTTTGTCCGAATTAAGTTTTAGGTTAAAAAGTTACTCAAATTCAATGTTATTCATAATTAATACAAATAAGAAAGAGTGAGATATGGTACAAAATTTCAAAAAATGGTTAGCACAAAGGAATGGGAGAAGTGTGCTATCCAAGTTTCATTATGATCACTCTCTAAAGTAGAAAACGTCATATACTAAATTATATACTGATCAAAAAATAATATTTCCTTCTATTACTCAATACCAATCAATTTATGTGTTTGTAAACTTAGCTGCCATTTAGGTTTATTTGAACGTTGATTCAATTGACCAAGTAAAGTGATAGTCTCAAGTAAATTCATTTTCCCATCAATTTCACAAGGTGAAAGATAGTAATTCTTTGCTTTTATTTTTTGCTCGATCAATTCACAAAATGATGGCATATTACTGTCCATTACAATACGTACTTCATTTGCAAATGGAATGCAACGCTTTTCATACTTATGAGCATAAAGGCTCTTAGGACTCGTCGCAATATAATCTATTTGTGCAGGAATTGCTTTTAGACCATTGGTTTCAATTGCAAGAAAATAGCCATCTGATTTAAATTGCTCAAGTAAGTATTCAATTTTTGGTACAATTGTTGGCTCACCACCTGTGATGATAATATTCTTTGACGAAAATGACCGCACTTTTTCTAGAATTTGTGATACAGACCAGCGTTTAAAATTATTATAAGGTGTATCACACCAAGGACAGTCTAGATTGCATTTACCAAATCGTACAAAAACACTTGGCATTCCCGTATTGAAGCCCTCCCCTTGCAGACTTTCAAAAATTTCGACTATGTTAAAGTTCGGTTCAAAATCATGATATTTTTCCATCAACATTTACTCCTGATACTCGCAAAATGAAGCTGGGGTTTCCCATAAACGAATGGATGATATGGACAGTTGTTCATCATGTTTTAAACGATTAAAAATAAAACGAGCTATTTCTTCTGCCGTAGTTCTAAAGGGAACACCAAAAGTTTTTGAGTTTAACTTTTGCAATAGAGTGGCAATTTGGCTTTCTCGCTCATTGGTTTGATCATAAATAAAGGCGTGATCCATCGGATCTAAAATAACTTTTTTCACAATAGACTTTAGATCTGAAAAATCAATGACCATTGCTTTTTTTGCACCTGATTCATATAAGTCACCCGAAATTTCAACTTGTAATTTATATGTGTGTCCATGTAAATTTTGACATTTCCCATCATGTCCATCTAATAAATGTGCCATGTCAAAGCTAAATTCTTTGGAAATTTTAAACATTTTTTCTACCTTTTTGAGTCAAATATTTCTTTAGACCTTTATTGCGTAAAATACAGCTTGGGCATTTTCCGCATCCACCTTCGATGCCTTCATAGCAAGTGTGAGTATGTTTTTGTACATAATCTAATACGCCTAATTCATCAGCAAGCTGCCAAGTTTGGGCTTTAGTGAGATACATTAATGGTGTTTTGATATTGAATTGATAATCCATAGCTAAATTTAATGTGACATTCATTGACTTGATAAACACATCTCGGCAATCTGGATAACCGCTGAAATCTGTTTCACATACGCCAGTGATAATATCTTGAATGCCTTGGCCTTTCGCATAAATCGCTGCATAAAGTAAAAATAGGGCATTGCGACCATCAACAAAAGTGTTTGGCAATTCATTCTCTTTTTGCTCAATATGCGCCTGTTCATCCATTAATGCATTATGTGTGATAGCTTTCATAACAGATGTATCAATCAAGGTTTGTTTAATGCCGAGATCTTGCACAATGGCGCGCGCCTTTTCTAATTCAATAGCATGACGCTGCCCATATTGAAAGGTAATGGCTTCTATGTTTTCTTTGCCGTATTCAGCAATAGCTTGGAATAAACAAGTCGTGGAGTCTTGTCCACCTGAAAAGATGACAATCGCTTTACGATCGTGGTTTGGATTGAAAATATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_007146|1282773:1291282|1285663_1286665_-|WP_005647473.1|DBSCAN-SWA MFKFVFKRILMVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEILMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGMPGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH >NC_007146|1282773:1291282|1290598_1291282_-|WP_011272434.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARAIVQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKENELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >NC_007146|1282773:1291282|1290180_1290606_-|WP_011272433.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYESGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPASFCEYQE >NC_007146|1282773:1291282|1282773_1283757_-|WP_005663823.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCIEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQYTDGKLIACFHID >NC_007146|1282773:1291282|1283759_1284752_-|WP_005647479.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSHKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >NC_007146|1282773:1291282|1284761_1285649_-|WP_005653671.1|DBSCAN-SWA MSDTPLTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFIIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ >NC_007146|1282773:1291282|1289544_1290180_-|WP_005686506.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >NC_007146|1282773:1291282|1286754_1288935_-|WP_041174785.1|DBSCAN-SWA MDISELLDGLNDKQRKAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLVGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILSGKTGKVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYAAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDNAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR |
8 | Planktothrix_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1408505 : 1460251
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_007146|1408505:1460251|DBSCAN-SWA 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71 | Mannheimia_phage(16.28%) | terminase,integrase,tail,plate | attL 1397462:1397479|attR 1436056:1436073 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1581560 : 1597851
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_007146|1581560:1597851|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_007146|1581560:1597851|1585235_1585994_+|WP_011272607.1|DBSCAN-SWA MSMRLMVQAMNCKVGNPARKLVLLKLADNANDDGICFPSYQYIADKCEMTRRSAINHIEYLIKMGLVSKKERKNKDGSISNLYFLHLEQGSENFALGSENISLGSENFALGGSENISPRTSHSLEPVNEPKKTTQKSEAEMLLEQFGITGQLAKDFIAHRKAKKGVINQTQLNRLQKQADKAGISICEAVEICIERNWQGFNASWDWRDEKLRPNSPHLGQSHRNKPKFDDTQTGWSAGMNFIVDGTQWQIP >NC_007146|1581560:1597851|1591118_1591256_+|WP_015702297.1|DBSCAN-SWA MFRILFAVALLWAAYELNLNQDCDGYICDTSSLITALHKPLDSAH >NC_007146|1581560:1597851|1585978_1586620_+|WP_011272608.1|DBSCAN-SWA MANSITQNQINTLPPERTQRAEETINWLFQELKSIFPGWRAAFETGADYLSAKKTWLRVLVREKITRPQLENGICEAEKSLDKFLPSVGLFVYWCKAYDYHALGLPNEAELYQRYNTFLGYARFNRDEFQYRSKVEFWLLKNLYEKCKKKSEEDTLKAIPKLLTKAAEKVRSNFPFEDIPKMIPEKPSFYDKAKADKARDSLMAMMKGKGALQ >NC_007146|1581560:1597851|1586616_1586841_+|WP_005633909.1|DBSCAN-SWA MTSYKCPKCGAELEDFYTPDYFISSSEWDDDRFRCNGHLIEPIPFPQVSKYSAVNRTKSCGYFGLEDLGVEYKE >NC_007146|1581560:1597851|1596218_1597529_+|WP_075913359.1|capsid|DBSCAN-SWA 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MDIRLWRSIVRQRTLRALTSKEKKIRQRGGKPKYKHLAHKSFNLFEVIAPYKIILAKEIGYEFVAFKEELEEKAKLAARSRSRLKLNFRDTDIIDAAACSVLIAVLDTIKSQYRTLKFQIVRPKSKPADHRKHIPYDVDAIFCHIGLYKSLGFNYTSSSSQENVKCWHYVYSDSADGEITKPLLDELKSMGVKGIYPSYIEAIANAVEHAYAQNIYSEREFPIKRWWMLLAILEGKLSLFVCDLGHGIPNTLEKTQKANVLSAIWNRLKQLGKPTKDCLYIKASTLIKETRTGLGHRGKGGSDIRAFIDKTPGSRLIIRSNRGMYVYNGKDKPDLTKESRYSINGTVVQWNIPLQEIKE |
25 | Haemophilus_phage(42.86%) | terminase,capsid,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1605939 : 1618008
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_007146|1605939:1618008|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_007146|1605939:1618008|1609233_1610664_-|WP_041174767.1|DBSCAN-SWA MITQDFTKPIDSATVLQKIVLDKAQWVKAKEKEFPLSQFKQNIQNSDRSFYDALAKGTHQKPAYILECKKASPSKGLIRAEFNLEEIANVYKHYASAVSVLTDEKYFQGNFEFLPLVRGIVSQPVLCKDFMISEYQVYLARYYQADAILLMLSVVNDETYRVLAELAHSLGMGVLTETSNEEEFERALALGAKIIGVNNRNLHDLTVDLNRVVKLTEKYADRIPADVRIISESGIYNHKQIHQLQKVAHGFLIGSSLMGNQDLNNAVRSVIFGENKVCGLTRTQDVKIVYENGALYGGLIFVEHSKRCVSLRQAQELVTAAPLRFVGVFQNQEIDFIVKIANQLQLYAVQLHGAETEAFITALRQQLPKNTQIWKAISVNTEAQSTVDFTDDLNVDRYIFDSQTANQQGGTGKTFDWSLIPEHLKHKIILAGGISPNNVEQAIQQNCLGLDLNSGVESSVGVKDQEKVRLVFNNIY >NC_007146|1605939:1618008|1615997_1616486_-|WP_005650594.1|DBSCAN-SWA MLNQIIINKLNDQINLEFYSSNVYLQMSAWCSKHGYEGAATFLLRHADEELEHMQKLFNYVSETSGMPILGKIDAPKHDYSSLREVFEITLEHEKLVTSKINELVEVTFESKDYSTFNFLQWYVAEQHEEEKLFSGIIDRFNLVGEDGKGLFFIDRELATLE >NC_007146|1605939:1618008|1612193_1612781_-|WP_005687195.1|DBSCAN-SWA MANILFLDNFDSFTYNLVDQFRVLGHNVTIYRNDCDLEKLVETALNINTLDTILALSPGPGTPSEAGILLPLIERLKNQVPIIGICLGHQALIQAFGGKVVHAGEVLHGKVSRISHDNEAMFKDLANPMPAARYHSLMGQDLPKEFIVNAEYNGIIMAIRHRDLPICAFQFHPESILTVQGSQLLQQSIEWLLNR >NC_007146|1605939:1618008|1605939_1608804_+|WP_011272624.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTQKFEMADRFNPSAVEQALYQHWEESGYFKPSENENAPSYCIAIPPPNVTGSLHMGHAFQQTLMDTLIRFNRMEGHNTLWQAGTDHAGIATQMVVERKIAAEEGKTRHDYGREAFINKIWDWKAYSGGTISQQMRRLGNSIDWERERFTMDDGLSNAVKEVFVRLHEEGLIYRGKRLVNWDPKLHTAISDLEVENKESKGSLWHFRYPLANGAKTADGKDYLVVATTRPETMLGDTAVAVHPEDERYQSLIGKTVVLPLANREIPIIADEYVDREFGTGVVKITPAHDFNDYEVGKRHNLPMVNVLTLNANIRDEAEIIGTDGKPLAGYEATIPADYRGLERFAARKKIVADFEALGLLDEIKPHDLKVPYGDRGGVPIEPMLTDQWYVSVKPLADVAIKAVEDGEIQFVPKQYENLYFSWMRDIQDWCISRQLWWGHRIPAWYDAEGNVYVARNEEEVRSKYNLDSAVELKQDEDVLDTWFSSGLWTFSTLGWPEQTKELKMFHPTDVLITGFDIIFFWVARMIMFTMHFVKDENGKPQVPFKTVYVTGLIRDEQGQKMSKSKGNVLDPIDMIDGISLEDLLEKRTGNMMQPQLAEKIAKATRKEFADGIAAHGTDALRFTLAALASNGRDINWDMKRLEGYRNFCNKLWNASRFVLTNEKLDLSEGEIEFSLADRWIQSEFNRTVETFRNSLSQYRFDLCANAIYEFTWNQFCDWYLELTKPVFANGNAAQIRAASQTLVHVLEKLLRLAHPLIPFITEEIWQKVKGFVGITADSIMLQPFPQVEENGFDLEAEAEIEWLKEVIVAVRNIRAESNIAPSKGLDLLFRNLSAENAKILEKQTALLKAMAKLDNVQVLAANEAAPLAVAKLVGNAELLVPMAGFINKEAELARLTKEIEKYQNEVKRIENKLSNESFVAKAPEAVIAKEREKQAEYQSGLEKIQEQYKAIEAL >NC_007146|1605939:1618008|1610704_1611706_-|WP_005687194.1|DBSCAN-SWA MQHNQLLEQLYSGHSLSTSESTALFNAVIQGELSNEQIAAMLIALKVREANTEEITGAVAASLQNAKVFPRPDYPFADIVGTGGDGQNTINISTASAIVAASMGAKVAKHGNRSVSSKSGASDVLTALGVNVNVTPEQARQALDEIGVCFLFAQQYHSGFRHVAPVRTALKTHTIFNILGPLINPARPTYHLLGVYAPELVKTYAETAVALEHQHSFVVHGSGLDEVALHGETQVAEIKNGKIEYFTLTPEDFGLKTQSLESLRGGEPQENTQYLTALLQGKGKAEHANAVAANTALLLKLFGYDDLKQNVQNVLAHLASGNAFKTLQKLTTY >NC_007146|1605939:1618008|1615484_1615982_-|WP_005656740.1|DBSCAN-SWA MLSENVVKLLNDQMNLEFYSSNLYLQMSAWCDQQGFEGTAKFLSVHAAEEMQHMRKLFTYLNETGSLAVISAIEAPAHEYKSLKEVIEATYEHEKLITSKINELVGKTFEEKDYSAFNFLQWYVEEQHEEEKLFSSILDKLNFLGEDGKGLFLIDKDLGNLSTKA >NC_007146|1605939:1618008|1611758_1612145_-|WP_005662273.1|DBSCAN-SWA MITVFGLKSKLAPRREQLAEVIYNSLHLGLDIPKGKHAIRFLCLEKEDFYYPFDRSDDYTVIEINLMAGRMEGTKKRLIKMLFSELEYKLGIRAHDVEITIKEQPAHCWGFRGMTGDEARDLDYDIYV >NC_007146|1605939:1618008|1614451_1615216_-|WP_005688459.1|DBSCAN-SWA MAIKSVQNQTYPCKHYVFVDGNIFWDKAKSILEQFPDVIPIYLPMNTGKNGILNGAINAVAAFLVEEDIICYLDDDNQLREDHVESLVNVIEQGADFAYSLRSFYDSNHQFICNDDFDSLGNWNTKSDIFVDVKIEDIQKQIHFTFNEVNGHIDTNCYAVPREIAQKTSYSWNTPLIGDRSFLSALKSLGLIGQTSGKYTVKYRADFNKLIAVRRVFPQLSLSDEDNNNISAKILEVINQQNIEYYGGRPWAKE >NC_007146|1605939:1618008|1617003_1618008_+|WP_074031221.1|DBSCAN-SWA MKKNLIIVLTLGTLPFAQANSITGAGASFPYPIYAKWASLYEKETGNKVNYQSIGSGGGQQQIIAKTVDFGASDDPMKSELLQQHQLVQFPAVIGGIVPVVNLPEIKPGKLKLSGKLLAEIFLGKIKKWNDPDLVALNPTLPLPNKNIIVIHRSDGSGTTFGFTNYLSKVSNDWKNQVGEGKSVKWLTGQGGKGNEGVASYVRQMKYSIGYVEYAYAKQNQLAWISLQNQAGQFVQPSNESFMAAASHAKWHEKAGMGVILTNETGEKSWPITAASFILLNKYSDNPETTKNVLAFFDWAFSRGQDAATELDYVPIPADVVSTIKSQWKTELKQ >NC_007146|1605939:1618008|1612793_1614350_-|WP_005687196.1|DBSCAN-SWA MNIQTQAFIAVTAQSIPYYADTTAIFNTLCQPNSNSLLLDSAEIGSKNSLQSLILVNAAVKITCLGHNVTFKALNKNGKQVLKEIHPKLTALGKISAVNFEDEFSVQFSPLDNQLDEDNKLQSATIFDGLRVVSTLYQHSQTPIFLGGLFAYDLVANFIPMDGITLKNDGINCPDYSFYLAEHLITIDHQNQQATLKSFCFAQEEQVNIAKTSLSIAQKLKNIDHVLSIKSASDEVKTNFDDPEFTGIVKALKHHINIGDVFQIVPSRRFSLACPNTLASYAQLKQNNPSPYMFYMNDEDFILFGASPESALKYAPENRQLEIYPIAGSRPRGFDAHGNIDPELDARLELELRLDHKEQAEHLMLVDLARNDIARVCQNGTRKVAELMQVDRYSHIMHLVSRVVGKLRPELDALHAYQACMNMGTLTGAPKIKAMQLIYQFEQQKRHSYGGAVGYLTSDGHFDTCIVIRSAFVQNGIAHVQAGCGEVLDSDPQMEADETRHKAAAVLKAIRQVNTQAK >NC_007146|1605939:1618008|1615248_1615362_-|WP_105893990.1|DBSCAN-SWA MKRIYTDEPTNQPTNQPTNQPTNQPTNQPTKIIKPLR |
11 | Acinetobacter_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1665024 : 1753859
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_007146|1665024:1753859|DBSCAN-SWA 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80 | Mannheimia_phage(37.5%) | terminase,capsid,portal,tail,head,holin,plate,tRNA,lysis,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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