Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_007205 | Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
587973 : 595425
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_007205|587973:595425|DBSCAN-SWA AATGAAAAAATATTACACAAGAGCGTGTAATTTTGCTTATGGTCAATTTTCAATTGAATTAGTTAGAAAAAAAAAAAATCTTCCACTAAATGGTAATAAGAAAATTTCTTTTGGACAAATTGAAATTCTTACACGAACTTCTATCAAAAAAATTGATCTTAAAGATATAAAAAAATTACCCAAACTACTGAAAAAAAAAATTAATAAAGATCTCAAGACTATCGTTAAAAAAAATAAAAACTTTTCAAGTTTAAATTTTAATAAAATACCTAATATAATGGGTATATTAAATTTAACACCAGATAGTTTTTCTGATGGGGGTAAATTTAATAAAAAGAAAAAAGGAATATCTCATGCAAAGAATTTATTTAAATCTGGAGCAGATATTATTGATGTTGGTGGAGAATCAACAAGACCTGGATCTAAACCTGTAAGTAAAAAGGAAGAATGGAATAGAATAAAAGAAATATTAAAAGATGTTAATAAAAAAATTCCACTATCATTAGATACAAGAAAATCAGAAATTATGATTAAAGGGATTCATTTAGGAGTTAAACTTATAAATGACGTGTCAGGTCTAAGTTATGACCCTAAAACAGTTAAGGTATTGATAAAAAGCAAAACTCCATTTGTCATTCAACATTCACAAGGTACACCAGAAAAAATGCAAAAAAACCCTAAGTACAAAAATGAATTATTAGATATTTATGATTTTTTTGAACAAAAGATTAAATTTTTAAGATCCATGGGTATAAAACATAATAATATTGTAATTGATCCAGGAATTGGTTTTGGAAAAAATTTGAAACATAATATGAATTTAATTAGAAGCGTTTCTATTTTTCATACTCTTGGTTTTCCTATATTACTTGGACTTTCTAGGAAAAAATTTATTAAGGATTTATCTGGAAAAAATGATAGCAAGGAAAGATTAGGTGGAACAGTATCTTCTTCCATGTATGCAATAATGCAAGGAGTTCAAATTCTAAGAATTCATGATGTGAATGAATTAAGACAAAGTATAAAAGTGTTTAAAGAATTAATTAAAAACTAATGGCAAAAAAATATTTTGGAACAGATGGAATAAGAGGTGCCGTTAATAGTAAAAATATTAATGGAGACATGTTTTTTAAATTTGGTCTTGCAACAGGAACTTACTTTAAAACTCAAAAAAAAAAGAAACAAATAGCAATAATTGCTAAAGATACGAGACTCTCAGGGTATAGTTTGGAACCTGCGTTAGTATCAGGACTTACATCGGCTGGTATGCACGTTTATACATTAGGCCCACTTCCAACTAATGGCTTAGCAATGCTCACAAAGAGTATGAAAGCTAACATGGGAATTATGATTACAGCATCTCATAATCCATATCATGACAATGGGTTAAAATTATTTGGACCAGATGGGTTAAAACTGTCAAATAAAATTGAAAAAAAAATTGAAACTTTAATTGATCAAAAAATTGAAAAATCTTTATCAAAACCAAAAAAATTGGGTCGTGTAAAAAGGTTAGAAACTGCAAATAAAGATTATATAAAAATTTTAAAAAATAATTTACCAAAAGATTTTAACCTAAGAGGTTTAAGAATAGTGATTGATTGTGCAAATGGGGCTGGATACAAGGCTGGGCCTGAATTATTAAAATCTTTAGGTGCTAAAGTATTTTCAATCGGAATAAATCCTAATGGTCTTAATATTAATAAAAATTGTGGATCTACTTTTCCAAATAAAATCAGATTAGCAGTAAAGAGATATAAAGCACATATAGGAATTTCACTTGATGGAGATGCCGATAGAATTATTATGTGTGATGAAAAAGGTATTGTAATTGATGGAGATCAAATAATTGCTGCAATAGCAATGAGGTGGAAAAGAAAAAAAATGTTAAAAGGAGGTGTAGTTGGCACTTTAATGTCTAACTATGGATTAGAAAAGTTTTTTAAACTACATAATATAAAATTCTTAAGATCAAATGTAGGAGATCGCTTTGTAAAAGAGAAAATGCAAAAAAATAATTTTAATTTAGGTGGTGAACAATCAGGGCATATTATTCTAGGCAAATTTGCAACTACTGGAGATGGCTTATTAGTTGCTTTAGAAGTTTTATTTTCATTAAGAAAAGGAAAAAAAGCTAGTAGTTTTTTTAATACCTTTAATAAAACTCCACAAATATTAGAAAATATTGATGTTAAAGACAAAAATATAATTAAAAATATTGATATTAAAAATTCTATAAAATTAGCAGAAAAATTAATTAAAGGTCAAGGTAGAATATTAGTTAGAAGCTCAGGAACGGAGTCTAAAATCAGAGTAATGGGAGAGAGTGATAATATTAAATTACTTCAAAAATGTTTGAAAATCGTTTTAAGAAAAATTAAGTAAATTGAAACCAAAATCTAAAATATTAGTTATTGCCGGATCAGATTCATCTGGTGGTGCTGGCATCCAAGCTGATATTAAAACTATCACAGCTTTAGGTTCGTATGCCATGACAGCAATAACAGCTGTCACAATCCAAAATACAACAGGTGTAAAATCAATAGTACCAATTGATCCTAAGGAAATTTCAAATCAAATAGAATTTACCTCAAAAGACATTAAACCTGATGCCATAAAAATTGGAATGTTGCATTCTACAAAAGTAATAAAATCAGTAATTCATTCATTAAATCTTATTAAAGTAAAAAAAATAATTTTAGATCCTGTTATGGTAGCTAAAGGTGGCGCAAAACTTATTGATGATAAGGCAATTCAGTTATTAAAAAATGAACTAATTAAAAAAGTTAGCCTAATTACTCCAAATATTCCAGAAGCGGAAATATTAACTAAAACTAAAATAAGAACAAAAGAAGATATGATTTTTGCTGCCAGCATACTAATAAAATTAGGAGCAAAAAATGTTTTTATAAAAGGTGGTCATTTAGAATCTAAAATCGTCCAAGATATTTTTGTAAACAAAAATGAAATTTTCATTATAAAAAATAAAAGAATTACAACCAGGAATACACATGGCACTGGTTGCACCCTTTCTTCTGCTATTTCTACATTCTTTTCATGTGGAAAAACCTTAAAGAGATCTTGTGAGCTTGCAACTAAGTATGTACACAATTCAATAAATTCAAACCTTAAATTCGGTAAAGGTCATGGGCCTATCAACCATTTAAGTTCAGTAACAATAGAAAAAAAATTTAGATAATGAAAAATGTTGTAGTTGTTGGATCTCAATGGGGTGATGAAGGAAAAGGTAAAATAGTCGACTGGCTATCAGACCAAGCAGATGTTGTTATTCGTTTTCAAGGAGGACACAATGCTGGACACACATTAGTAATTGATGGAACAACTTATAAATTAAGATTACTACCTTCTGGAATTGTAAGAAAAAATAAAATTTCTATTATAGGAAATGGAGTTGTTGTTGACCCGTGGGCACTATTAGAGGAAATAGAGGAAATTAAATCTAAGGGTGTTGAGGTTAATGTGGATAATTTTATAATTTCAGAATCTGCAAATCTTATTTTACCATTTCATAGAGAGATGGATGAAATAAGAGAAGATGCTGCTGGAAAAGGAAAAATTGGAACAACAAGAAGAGGAATTGGGCCAGCCTATGAAGATAAAGTGGGAAGAAGATCAATCCGTGTTATGGATCTAAGATCTGAGACTAATCTAGACCATAGATTGGAAACAGTGCTTCTTCATCATAATGCAATTAGAAAAGGGTTAGGTAAAAAAATTTTTGAAAAAGATAAACTTAAAGAAGAACTCTTAAAAATTGCTCCAGAAATATTAAAGTTTTCTCAACCTGTTTGGCTTAGAATTGATGAATTTAAGAAACAAAAAAAAAGAATATTATTTGAAGGTGCACAAGGAATACTACTAGATGTGGATCATGGAACCTACCCTTTTGTAACATCATCCAATACTGTTGCATCTGCGGCTGCAACAGGAACTGGTTGTGGTCCTAATTCTATTCATTATGTTCTTGGAATAACAAAAGCTTACACTACCAGAGTTGGTGAAGGACCTTTTCCAACTGAGTTAACAGATGATATTGGAGAATTGCTTGGTTCAAGAGGAAAAGAATTTGGGACGGTCACTAGTAGAAAAAGAAGGTGTGGTTGGTTTGATGGTGTTTTGGTTAGACAAACAATTAAAATTTCAGGCATAGACGGAATAGCATTAACTAAATTAGATGTTTTAGATGAATTAGATGAAATTAAGATGTGTGTCGAGTATGAGCTTGATGGCAAAAAAATGGATTACTTACCTGCTGCAGTTGAGGATCAGTTAAAAATTAAACCAATTTATAAAACTTTTCCTGGATGGAAAAGTTCCACACAAGGAATAAAGAATATTGAAAATTTACCAGAAAATGCAAAAAATTATATTTATGCATTAGAAGATTTTATTGGAACAAAAGTTTCAAGTATTTCAACAAGCCCTGAACGAGAAGATACTATTCTTTTAGAAAACCCCTTTGAGGTTTAGTTTACTGGAAGTAGATTTTTAGATTTAGCAGACAATAACATGTGTTTTTGAAGCTTCTCAAATGCTTTATTTTCAATTTGTCTAACTCTTTCTCTACTAATTTTGTATTTTTTACTTAAATCTTCAAGTGTTGTAGGTTCATCATTTAATCTTCTAGAGTATAAAATCTCTTTTTCTCTTTCATTAAGAATTTTTATAGAATCTTTAAGTAAGTTTTGTCTTTGACCCATTTCTTCTTGATGTGCAAATTTAAGATCATGATCAAGCTCTTTATCTACCAACCAGTCTTGCCACTCATCACCATCTTCTCCAACTTGTGCATTTAAAGAAAATTCTTTGCCAGATAGTCTTCTGTTCATTGAAATTACTTCATCTTTGTTGACATCTAACTTGTTTGCAATTTCAGTTACATGTTCAGGTCTTAAATCACCTTCAGATTGAGGAGCGATTTGATTTTTAATTTTCTTTAAATTGAAAAATAATTTTTTTTGAGCAGTTGTTGTTCCTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_007205|587973:595425|594492_595425_-|WP_011281810.1|DBSCAN-SWA MKSNQSNIKKAKKYLDKNYCIGVPTETVYGLAANAYKNSAVKKIYNLKKRPKNNPLIVHYHDIDSLKKDCLINDNFIKLYKKFSPGPITYVLQLKKNSKISKYVTNNKKSLAVRFPKHTIFKNLLKQLDYPLAAPSANITTKVSAVKAKDVKEEFGNKIKYILDGGTCAIGIESTIVNLTAKPTILRLGGLDISKIQKALGFKMNISTNPKKKIAPGQSRLHYSPGIPLRMNVTKPKNNEAFILIKKKKTKLKSYFYLTSKSNLDEAAKNLYSCLRKIKNKGYKSIAVEKIPNIGLGKTINDRLRRASKY >NC_007205|587973:595425|587973_589026_+|WP_011281805.1|DBSCAN-SWA MKKYYTRACNFAYGQFSIELVRKKKNLPLNGNKKISFGQIEILTRTSIKKIDLKDIKKLPKLLKKKINKDLKTIVKKNKNFSSLNFNKIPNIMGILNLTPDSFSDGGKFNKKKKGISHAKNLFKSGADIIDVGGESTRPGSKPVSKKEEWNRIKEILKDVNKKIPLSLDTRKSEIMIKGIHLGVKLINDVSGLSYDPKTVKVLIKSKTPFVIQHSQGTPEKMQKNPKYKNELLDIYDFFEQKIKFLRSMGIKHNNIVIDPGIGFGKNLKHNMNLIRSVSIFHTLGFPILLGLSRKKFIKDLSGKNDSKERLGGTVSSSMYAIMQGVQILRIHDVNELRQSIKVFKELIKN >NC_007205|587973:595425|589025_590357_+|WP_011281806.1|DBSCAN-SWA MAKKYFGTDGIRGAVNSKNINGDMFFKFGLATGTYFKTQKKKKQIAIIAKDTRLSGYSLEPALVSGLTSAGMHVYTLGPLPTNGLAMLTKSMKANMGIMITASHNPYHDNGLKLFGPDGLKLSNKIEKKIETLIDQKIEKSLSKPKKLGRVKRLETANKDYIKILKNNLPKDFNLRGLRIVIDCANGAGYKAGPELLKSLGAKVFSIGINPNGLNINKNCGSTFPNKIRLAVKRYKAHIGISLDGDADRIIMCDEKGIVIDGDQIIAAIAMRWKRKKMLKGGVVGTLMSNYGLEKFFKLHNIKFLRSNVGDRFVKEKMQKNNFNLGGEQSGHIILGKFATTGDGLLVALEVLFSLRKGKKASSFFNTFNKTPQILENIDVKDKNIIKNIDIKNSIKLAEKLIKGQGRILVRSSGTESKIRVMGESDNIKLLQKCLKIVLRKIK >NC_007205|587973:595425|591170_592463_+|WP_011281807.1|DBSCAN-SWA MKNVVVVGSQWGDEGKGKIVDWLSDQADVVIRFQGGHNAGHTLVIDGTTYKLRLLPSGIVRKNKISIIGNGVVVDPWALLEEIEEIKSKGVEVNVDNFIISESANLILPFHREMDEIREDAAGKGKIGTTRRGIGPAYEDKVGRRSIRVMDLRSETNLDHRLETVLLHHNAIRKGLGKKIFEKDKLKEELLKIAPEILKFSQPVWLRIDEFKKQKKRILFEGAQGILLDVDHGTYPFVTSSNTVASAAATGTGCGPNSIHYVLGITKAYTTRVGEGPFPTELTDDIGELLGSRGKEFGTVTSRKRRCGWFDGVLVRQTIKISGIDGIALTKLDVLDELDEIKMCVEYELDGKKMDYLPAAVEDQLKIKPIYKTFPGWKSSTQGIKNIENLPENAKNYIYALEDFIGTKVSSISTSPEREDTILLENPFEV >NC_007205|587973:595425|593395_594376_-|WP_011281809.1|DBSCAN-SWA MEKNINLIVGEDENNLRLDVFINKRENLISRTRIKNLILKEKLKINDQIINSPSKKVLSGDEINLQIPEPKEASLKPYNFKLQIVYEDDDLLIINKPAGIIMHPGAGNYDETIVNALMHYNKDSLSTIGDELRPGIVHRIDKDTSGLIVIAKNNETHENLSHQFSEHTITRVYQLLIWGKLRPSSGKIDTFITRSSKNRQMMEVSNSKGKRAITNYKTIEIFENDKTPTLSLVECRLETGRTHQIRVHMTHMGNSIMGDGKYKKKYKKLKNIDTNLENLIYKLDRQFLHAQTLGFIHPRTNEEMVFTSILPQELENILVLLRNTGK >NC_007205|587973:595425|592459_593341_-|WP_011281808.1|DBSCAN-SWA MNSNLPALSNEGGLSAYLEQIKKFPMLAAEEEYMLAKNWKATGNVKAAEKLVTSHLRLVAKIAMGYRGYGLPVNEMISEGNVGLMQAVKKFEPEKGFRLATYAMWWIRASIQEYILRSWSLVKIGTTTAQKKLFFNLKKIKNQIAPQSEGDLRPEHVTEIANKLDVNKDEVISMNRRLSGKEFSLNAQVGEDGDEWQDWLVDKELDHDLKFAHQEEMGQRQNLLKDSIKILNEREKEILYSRRLNDEPTTLEDLSKKYKISRERVRQIENKAFEKLQKHMLLSAKSKNLLPVN >NC_007205|587973:595425|590358_591171_+|WP_006997300.1|DBSCAN-SWA MKPKSKILVIAGSDSSGGAGIQADIKTITALGSYAMTAITAVTIQNTTGVKSIVPIDPKEISNQIEFTSKDIKPDAIKIGMLHSTKVIKSVIHSLNLIKVKKIILDPVMVAKGGAKLIDDKAIQLLKNELIKKVSLITPNIPEAEILTKTKIRTKEDMIFAASILIKLGAKNVFIKGGHLESKIVQDIFVNKNEIFIIKNKRITTRNTHGTGCTLSSAISTFFSCGKTLKRSCELATKYVHNSINSNLKFGKGHGPINHLSSVTIEKKFR |
7 | Pandoravirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
954687 : 972989
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_007205|954687:972989|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_007205|954687:972989|956383_957085_+|WP_011282077.1|DBSCAN-SWA MTKIKKETNNNIVTFPSKMNDGEREVEAIIFAAAEPLDIDTIESKISKKIDVLKSLQKLQKEYSLRGINLVCISNKWSFRTSENLSNLMSQEKTVEKKLSRAAVETLAIIVYHQPVTRAEIEEIRGVAFGTNTLEILMELNWVKPQGRKDVPGKPIQYGTTDDFLSHFSLQKLSDLPTVDELGSAGLIDSSNIDNAIFGTGKFYKEKQVEKKEDIYENIDEMLGGTLSPDEEK >NC_007205|954687:972989|961461_962349_+|WP_011282080.1|DBSCAN-SWA MINFNKFYKLFNLISLSLVVASVLLLFFKGLNFGVDFKGGTLIELRSNDKNINVTSLRQSFNKMKLGDFNIKKFGNENDFLIKIEKKDTSANAIEVIKKDLTSSLGSSFNFRRVENVGPKVSSELLKSGIIAIALSLAAMLFYIWIRFEWQFSLGAILALFHDVIITLGLFSLFSLEINLSIVAAVLTIVGYSMNDTVVIYDRVRENLRKFSDIKIYELTNISINETLSRTIITSVTTLLALVSIYLFGGEILKGFSLAMIMGVVFGTYSSIYIANPILVKLRVSQKTILKEETE >NC_007205|954687:972989|971423_972251_-|WP_027306947.1|DBSCAN-SWA 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MKDTEIPKDKNIKLISMHDEMSSSYLSYAMSVIVSRALPDVRDGLKPVHRRILFAMYKGGYDWSKQFRKSARIVGDVIGKYHPHGDQSVYDALVRMVQDFSMSLPLVQGQGNFGSIDGDPAAAMRYTETRLAKVSQYLIDDIEKDTIEYKSNYDETEKEPSVLPAQYPNLLVNGAGGIAVGMATSIPPHNLGEIIDGTLALIENKDIKIKELMKHIPGPDFPTGGVIIGKEIIKAGYNVGRGSFKIRGEISVEAQKNGRERLVITSVPYQVNKSVLNERIAQLVREKKIEGIKDIRDESNREGIRVAIDLRNGVEPETIKRLLYKNTSIESSFGFNTLAIVDGKPKICNLKEFLTNFLTFREDVVIKKTKFDLKKAEDRAHILIGLSVSVENLDKIIKIIRSSKTPDDAKKSLLNTKWKINKSLKLISLVEDKKEKNLYSLSDPQVIAILELRLQKLTALGINEIEVEIKKLADLIKGYKKIINSKKELLNVISEELKTIKEKFAVPRRTKIIDAILNYDIEETIQKESVIITVTLQGYIKRGALSSVKQQKRGGKGKSGITTRDEDSVVQTLSVNTHTSVLFFSTEGLVYKIKAWKIPEGSTTSKGKSLFNILPLKNHQSISSIMPFPDEESDTKNLQIVFATAKGKVRKNSLEDFSSINSAGKIAIKLDPNDKIVGVEICKDDQDVMLSTKNGKCIRFESKKLRIFKGRSSKGIKGIELSPNDEIVSLSITNKEKIKKDTKSDGRFVLSITENGYGKKTLNNEYRVTNRGGKGIIGIVNSPRNGSICSSFPVIEGDDVMISTNKGRVIRVAVKEIRTAGRNTQGVRIIKLSGDEKVVSAIKIDDNLE >NC_007205|954687:972989|957333_957555_+|WP_006996942.1|DBSCAN-SWA MPTIGWFEILIVVAVAIIVIGPKDFPYMLKKVGSWIGTTKRYISNIQNEVADLDINSNEIQKPIEEKKDNDKI >NC_007205|954687:972989|972374_972989_+|WP_011282090.1|DBSCAN-SWA MSIKKKKSFALRLRNYFFTGVIVLIPIGFTLYLSKFLINFSTKLVPSGLNPNTYLPYAIPGIEIILTIIFITVVGGLSLTFIGKKFLQIIDDLFKRMPILRTIYSAIGQMTDSFRAQEGNKKSVVLVEYPRKGSWAVGFATKENTGEIKAKININLVNVFVPTTPNPTSGFLLMIPKDDLIYLDMTFEEASKFIVSAGTSKPKS >NC_007205|954687:972989|962351_962945_-|WP_011282081.1|DBSCAN-SWA MGNLLSSLPRTIHASLALAIILFLGLFYGNGGFDFDTIFWSWLTRFIHVTVAIMWIGLLWYFNFVQIPNMPKIPDEQKPAIGKVIAPAALFYFRWAALLTVLSGLILAYLNGYLHDAMTLGGGGKSTAIGIGMWLGLYMAFNVWFIIWPNQKRALGIVECEPDLKAKSARTAMLFSRTNTLLSLPMLLTMVAAQNLY >NC_007205|954687:972989|970014_971127_+|WP_011282087.1|tRNA|DBSCAN-SWA MALKNFKFNVIESNKFARVGVIETHRGNIQTPAFMPVGTQATVKACLIDDVIKTGSEIILSNTYHLMIRPGVDRIISAGGLHKFMNCKLPILTDSGGFQVMSLSKLNKVDREKGAIFNSHVDGKKFILSPEESIRVQKGLDSDIVMIMDECPKKTTDYKVINKSMELSIYWAERSKIAFGLNPHKALFGIIQGGLFKDLRTKSLNNLIKIGFDGYAIGGLAVGESQNEMFSVLDDLKNIMPDDKPRYLMGVGTPADILGAVKRGVDMFDCVMPTRSGRTGLAFTWNGRVNIKNNKYKNDNEPLDPNCSNLNLNKYSKNYINHLFNTNEILGSTLLTLHNINFYQELMSSIRENIKKGTFDKFHDEYIDKL |
19 | uncultured_Mediterranean_phage(94.12%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
978120 : 985610
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_007205|978120:985610|DBSCAN-SWA AATGATTAAATCAAGACTTATAACGATTTTATTGACCCTCTTACTAACAACTAATGCTAATGCAGCATTTGATGTAAAGGCTAGAACAGCAATATTACAAGATTATCTTTCTGGTGAAATATTATTTGAAAAAGATGCCGATAAATCAATTTATCCTGCATCAATGACAAAAATTATGACAGCCATTATTGCGTTTGATTTAATTAGAAGCGGTGATCTAAGTTTAGATGAAAAATTTTTAGTATCAGAGAATGCCTGGAGACTTTCATCAGCTGGCTATTCTTCAATGTTTATAATGGTTGGTGATGAAGTTAGTGTGGAAAATTTACTTAAGGGAATAATTATTGCATCTGGTAATGATGCTTGTGTTGCGTTAGCTGAAGGTATTGCTGGAACAGAAGATGAATTTGCAGTGATGATGACGGCTAAAGCTAAAGAAATAGGAATGAATAATACTAATTTTGCTAATTCATCAGGCATTAATGATACTGAAAACCTATCAACTGTAAGAGATATTATGCTTATGTCTAATTATCTTATTAAAGAGTTTCCTGAAGAATATAAGTATTTTGCAGAAAAAGAATTTACTTGGAATAGAACAGGGGGTGACCCCATTACTCAAGGTAATAGAAATCCGTTATTATATAAAAGCCTTGGGGCAGATGGAATTAAAACTGGTTATTTAGCAGTTGAAAAATACTCACTAGCATCATCTGTTGAAAGAAATGGAAGACGACTAATAGCTGTAGGTAGTGGCTTTAATACTAAAAATGATAGATCTCGTGAAAGTGCCAAACTTTTAACATGGGGTTTAACTAATTTTGACCTGGTTGAAATTACAAAAGCAAACACACCAATAGAAGACATTGATGTTTGGTTGGGTAAAAAAGATACTGTTAAAACTTATATAAAAAATGATATCTACAAAACTATTCCTAAAGCAAAAAAAAGACTATTGAAGGTATCATTGAATTATAATGGTCCAATTCAAGCACCTATTAAAAAAGATGATATCTTAGGAAAATTAAAGCTAATCTTTGATGGTGAACTTATCGAAGAATATGATCTACTTGCTTATGAAGATGTTAAGAAATTAAATGTTTTTTCACGGTTAATGAAATCAATTAATTTTTTAATTTGGGGTGATGTCTAAAAAACCAATAATTGTATTTGAAGGTATAGAGGGGACAGGCAAATCTCATCATATTAAAAATGTTGCTAACTACTTAACACGTAAAAAAATTAAATTTATTCAAATTAGAGAACCTGGTGGCAGTGCAAATTCAGAAAAAATAAGAAATCTTATTCTTAATAATAAATCTACATTTAATAAAGAAACTGATTTACTGCTTTATCTTTCGGCAAGAAGTGAAAATATAGAAATTATAAGAAAAAATGTTGGTAAAAAAATAATATTAATAGATAGATTTTCAGATTCAACTATTGCCTACCAACATTATGGTATGGGTGTAAACCTCAAGTTTATACAAAATATTAACAATCATCTTTTAAAAAATATTAAAATTGATTTTACTTTTTTAAATACAGTAAATTTATCAAATATGAAAAAAAGGCTTAAACTAAGAAAAAAGCTTAACAGATATGATAAATTTAACAGTAAATTTTATGAAAAAGTACAAAATGGTTTTATAAAGATATTAAAAAAAAATCCTAAAAAATATATTAGAATAAATTCAAATCTAGATATAGATCTTAATGAAAATATAATATTAAATAAAATTAAAGACTTAATTTAGATTTATGAATTTAAAACCATCTGAGAACACTAAAATTTATGGTATGGAAAATTTTTTTCATGAATTAAGTGGACTATATAAGCACAAAAAATTGCCTAATAAAATTTTACTGTCTGGAAAAAAAGGATTAGGAAAATCAACATTAGCCTATCATTTAATCAACTATATTTTATCCGAAAATGAGGATTATAAATATAATTTAGAAAATTTTTGCATCCATAAGGACAATAAATCTTATAAACTTTTGCAAAATAACTCCCATCCAAATTTCTATTTAATAGATTTATTAACAGAAAAAAAAAGCATTGATGTAGGTCAAATACGTGAAATGATTAGTTACACAAATAAATCAACATTTAATAATATGGCAAGATTTATTTTAATAGATAATGTTGAAAATCTAAATAAGAATTCTGTCAACGCATTACTTAAAATTATTGAAGAACCAAATGAAAATGTTTTTTTTATCTTAATAAATAATAGTGAAAAAAATATACTACCCACACTAAAATCAAGATGTTTAACATTCAAGATTAATTTTACATTTAATGAGTCCTTAAGTATTTCAAATTTAATACTGGATAAAAATGTACTTGATTTTATTAATTATGACTTACTAAGTTTTTATAATTCACCCGGTGAAATTATTAGTTTGTTTAATTTTGCAGAAGAAAAATCTATTAATTTAAAGGATCACACTATTTCAAGTTTTATAAGTTCGATAATAGATAATAATTATTATAAGAAAAATAAACCTGTCAAAATTTTATTAATAAATTTAATCGAGCTATTCTTTTTGAAAAAATATCTGATAACCAATTCAAAGGTTACATTAATTAATTTTTATCAAAAATTTATAAAAAAAATTTATAATACAGAAAAATTTAATCTAGACGAAGAAAGTTTATTTTTAGAATTTAAATCAAAATTGTTATAAATGGATAAAAATTACTATATAACTACACCAATTTATTATCCTTCAGCGAGACCCCATATGGGTCATGCATACTCAAGTATTGTTGCTGATTTTTTTGCAAGATTTAAACGTATAGATGGGTTCAATGTTCATTTTTTAACAGGTACGGATGAGCATGGTTTAAAAATACAACGAGCAGCAGAGAGAAAAAAAATTGATCCTCAAACTTTTTGTGATGAAATTAGTCAAACGTTTAGAGATCTTTCAAAAACATTAAATTTATCTAATACTGATTTCATTAGAACTACTGAAGAAAGACACAAAAAAACAGTTCAACATCTGTGGAATGAACTTGAAAAAAATGACGATATTTATTTATCAAAATATTCTGGTTGGTATTCTGTTTCTGATGAAGCTTATTACAGTGATGAAGAAATTAGTGAAAAAGAAAACGTTAAAATTGCCATTTCATCTGGTTCTTCGGTTGAATGGATAGAGGAAGAGTCTTATTTTTTTAGATTATCTAAGTGGCAAGATGAACTACTAAAATATTATGAAAAAAATCCAGACTTTATTTCACCAAAATCCAGAAAAAATGAAGTAATTAGTTTTGTAAAAGGTGGGTTAAAAGACTTATCCATAAGCCGTAAAGCATTCTCTTGGGGCATCAAGGTTCCTAATAGTCAAGATCATGTGATTTATGTTTGGCTTGATGCTCTAACAAATTATTTAAGTGCTTTAAACTACCCAGATACAAATGATGAACTGTTTAAAAAATTTTGGCCTGCATCTGTTCATTTAATAGGTAAAGATATATTAAGATTTCATTCTGTATATTGGCCAGCATTTTTAATGGCTGCAAAAATACCTTTACCTAAGAAAGTATATGGTCATGGCTGGATTTTATCTGGTGATGAAAAGATGTCAAAATCAAAAGGAAATATTCTTGATCCATTAGATATTATTGAAATTTATGGACTTGACCCATTAAGATATTATTTGATTAAAGAAGTTTCATTTGGAAATGATGGTAATATTTCTCAAGATAGATTAGAGGATTGTATCAATAGTGATTTGGCTAATAATTATGGTAATTTATGTCAAAGAGTGACTGCATTTGCTGAGAAGAATTGCTCTTCATTAGTACCAGATAATACAAAATTTAATGATGAAGATTTAGTGATGCTAAATAAATTTACTGATAATTTAGATCTAATAAGAACTGAAATTGATAATCAAAATATTAATTATTATATTAATTTCATTGTTAGCGCTTTATTTGAAGCAAATAAGTATTTTAACGATCAAGAGCCTTGGAAAAAAAAAGATGATAAAGATAGATTAAATACCATTGTCTATACATCTTTAGAAATGATTAGAAAAATTTCATTTATGCTTTATCCAATAATTCCAAGCTCAATAGAAAAAGCCTTAAAGATTTTTAATTTAAATATTGATGCGATTAATTTGGAATCTATTGCAAAACATGACTATCTAATATCTGGTAAACCTATCAACAAAATAGATATTTTGTTTAAAAAAATTGAAAAAAAACATGATTGATTCTCATTGTCATTTAGATCATGAACCTTTACTTGAAAATTTAAATGAAGTTATAAAAAGATCTAAAGAAGCTGGTATCTCAAAATTATTAACCATATGCACTACACCTGAAAGTTTTGATAGGATCAAAAAAATTATTATAACCGACCCAATGATTTTCGGAACTTTTGGTATTCACCCTCACGAGACTGAGAAAAGTCATTTAATTGATAAAAATTATATAACAAGTCAAGTAAATCAAAATGAGCGAATTATTGGTATTGGTGAAACAGGCTTAGATTTTTTTTATAATCATAGCAATAAAGAAAGACAAATCGATAGCTTTAAAGCTCATATAGAGGCTTCTATAGAGCTTAATATGCCTATTATCATACATTCTAGAAATGCAGAGAGTGAAACATATGAAATTTTAAAATCATATAAATCAGAAAAACTTAAAATTTTGATGCACTGTTTTACTGGTTCGTTAAATTTTGCAAATAAATTAATAGAATTAAATGCTTTTTTTTCAGCAAGTGGAATAATTACTTTTAAAAATAGTTTAGAGCTTCAGAAAACTTTTAAAAGTATTCCCTTAAATAAACTGCTTGTTGAAACAGATAGTCCATTTTTAGCGCCCATACCAATGAGAGGGAAAAAAAATGAACCAAGTTTTATTAAATATACTTTAGAAAAATTATCTATTTTAAAAGAAAAAACTAATCAAGAAATGTCAGATTTAACTACTCAAAATTTTAATAAACTTTTTAATCTATAATGTCTCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_007205|978120:985610|980813_982355_+|WP_011282099.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDKNYYITTPIYYPSARPHMGHAYSSIVADFFARFKRIDGFNVHFLTGTDEHGLKIQRAAERKKIDPQTFCDEISQTFRDLSKTLNLSNTDFIRTTEERHKKTVQHLWNELEKNDDIYLSKYSGWYSVSDEAYYSDEEISEKENVKIAISSGSSVEWIEEESYFFRLSKWQDELLKYYEKNPDFISPKSRKNEVISFVKGGLKDLSISRKAFSWGIKVPNSQDHVIYVWLDALTNYLSALNYPDTNDELFKKFWPASVHLIGKDILRFHSVYWPAFLMAAKIPLPKKVYGHGWILSGDEKMSKSKGNILDPLDIIEIYGLDPLRYYLIKEVSFGNDGNISQDRLEDCINSDLANNYGNLCQRVTAFAEKNCSSLVPDNTKFNDEDLVMLNKFTDNLDLIRTEIDNQNINYYINFIVSALFEANKYFNDQEPWKKKDDKDRLNTIVYTSLEMIRKISFMLYPIIPSSIEKALKIFNLNIDAINLESIAKHDYLISGKPINKIDILFKKIEKKHD >NC_007205|978120:985610|979880_980813_+|WP_011282098.1|DBSCAN-SWA MNLKPSENTKIYGMENFFHELSGLYKHKKLPNKILLSGKKGLGKSTLAYHLINYILSENEDYKYNLENFCIHKDNKSYKLLQNNSHPNFYLIDLLTEKKSIDVGQIREMISYTNKSTFNNMARFILIDNVENLNKNSVNALLKIIEEPNENVFFILINNSEKNILPTLKSRCLTFKINFTFNESLSISNLILDKNVLDFINYDLLSFYNSPGEIISLFNFAEEKSINLKDHTISSFISSIIDNNYYKKNKPVKILLINLIELFFLKKYLITNSKVTLINFYQKFIKKIYNTEKFNLDEESLFLEFKSKLL >NC_007205|978120:985610|979264_979876_+|WP_011282097.1|DBSCAN-SWA MSKKPIIVFEGIEGTGKSHHIKNVANYLTRKKIKFIQIREPGGSANSEKIRNLILNNKSTFNKETDLLLYLSARSENIEIIRKNVGKKIILIDRFSDSTIAYQHYGMGVNLKFIQNINNHLLKNIKIDFTFLNTVNLSNMKKRLKLRKKLNRYDKFNSKFYEKVQNGFIKILKKNPKKYIRINSNLDIDLNENIILNKIKDLI >NC_007205|978120:985610|984437_985610_-|WP_006996915.1|DBSCAN-SWA MIKNLSKPFKWFFQLEAASGLVLLIAAIIALVISNSSLSNLYFDTLNQYLFIGINDFGLKLSVHHWINDLLMAIFFFFVTLEIKREFIQGELSNLKKALLPIIGAVGGMVVPALVYVFINLGNSETLNGWAIPSATDIAFSLGILSLLGSRVPISLKVFLTALAIIDDLGAILIIAFFYSGDLSISYLSLILISYILLLTLNKFGVKKFIPYLIIGAFMWFFTYKSGIHATIAGVLLASTIPHRIKEKDFSLLIKLEHAISPYVAFIIMPIFAFANAGVSLEGLSLTSLLEPVPLGILLGLFVGKQVGVMVVSFIAVKFGVAQMPDKSSWLSLYGVSILTGVGFTMSLFVGNLAFAENIQYIDGVKIGVLAGSLLSTVFGYFILLYASKK >NC_007205|978120:985610|983111_983891_+|WP_011282101.1|DBSCAN-SWA MSLKFVILGSGSSMGVPRADGYSGDCDLKNKKNFRTRCSALIKFNDQNILIDTSPDLRSQLLKNKIKSISKVFYTHLHADQTHGINDLRPFFLINKKQIPVYADINTKKYLLSTFKYCFKSSFGYPSTLNINSLKKKHEFIIKDKKIKIESIPVQHGKIKSICYLINNKLAYASDISLFFKKDYKKLKNLEYLIIDCLWYRNHSAHFNLDQVLEIVKILTPKKTILTNMHSDLDYAKLKKKLPKNIIPGFDGLTVSLKN >NC_007205|978120:985610|983879_984434_-|WP_049752873.1|DBSCAN-SWA MVYKNNLLILLILSMFTFFEKVDAKYEKLFFDHSIKNINNETIDLNQYKGKTILLVNVASKCGFTKQYTGLQELYEKYKDRGFYVIGVPSNQFGGQEPGTNSEIKDFCETNFNITFPITDKTDVKGNNAHDLYKWAKKNYGNSTVPKWNFHKILINKEGKIQDTFNSFITPMSDKITKQIDLIL >NC_007205|978120:985610|982347_983112_+|WP_011282100.1|DBSCAN-SWA MIDSHCHLDHEPLLENLNEVIKRSKEAGISKLLTICTTPESFDRIKKIIITDPMIFGTFGIHPHETEKSHLIDKNYITSQVNQNERIIGIGETGLDFFYNHSNKERQIDSFKAHIEASIELNMPIIIHSRNAESETYEILKSYKSEKLKILMHCFTGSLNFANKLIELNAFFSASGIITFKNSLELQKTFKSIPLNKLLVETDSPFLAPIPMRGKKNEPSFIKYTLEKLSILKEKTNQEMSDLTTQNFNKLFNL >NC_007205|978120:985610|978120_979272_+|WP_011282096.1|DBSCAN-SWA MIKSRLITILLTLLLTTNANAAFDVKARTAILQDYLSGEILFEKDADKSIYPASMTKIMTAIIAFDLIRSGDLSLDEKFLVSENAWRLSSAGYSSMFIMVGDEVSVENLLKGIIIASGNDACVALAEGIAGTEDEFAVMMTAKAKEIGMNNTNFANSSGINDTENLSTVRDIMLMSNYLIKEFPEEYKYFAEKEFTWNRTGGDPITQGNRNPLLYKSLGADGIKTGYLAVEKYSLASSVERNGRRLIAVGSGFNTKNDRSRESAKLLTWGLTNFDLVEITKANTPIEDIDVWLGKKDTVKTYIKNDIYKTIPKAKKRLLKVSLNYNGPIQAPIKKDDILGKLKLIFDGELIEEYDLLAYEDVKKLNVFSRLMKSINFLIWGDV |
8 | Stx2-converting_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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