Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_007984 | Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata), complete genome | 0 crisprs | cas3,DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. NC_007984
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
192397 : 199924
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_007984|192397:199924|DBSCAN-SWA CTTAAATATCCGGCGTTAAGTAATCCAATCCACCACATGTATCAAGATCGCATAGATCATCAAATCCCCCAATATGTTCGCTATTGATGAATATTTGTGGGACGGTAGTCCGTCCGCTACGCTTAATCATTTCTTCTCGTAGGTCAAACTTGCCATCAATCTTTATTTCTTGAAAAGGTAATTGCTTACTAGTTAACAATGCCTTAGCCCGATGACAATAGGGACAGCTGAATTTTGTATATATTTCAATCTTAGCCATACTAGTCTACCTGATAGCTCAACTAAAAATTAGTTATTTACTCCTAATCAGGGGTAAATTATCCTCACACCAACCGGTAATGCCTTCTTTGAGTACATAAACCTTTTCAAAACCAGCTTTATATAGCTTATTCGCAGAATTACGAGAGGCAATATGATTATTATTAATAACTACTACTGGTCGATTCTTAGCTAGTTCGATAGAACTAAGGTTACCATTTTTCAGTACTGTCTCCGTCAGATTCAAGCTATTAGTAATATGCCCATGACGGTAATCATCTTTGCTTCTTAAATCAAGAATCACTGCATTTTCTTTGTTAATTAAGCGAATTGCTTCGGAGTTAGCAATTTCTTTAATTTTAGAAAACCAACTCTGAATAGTTATAACTATTACTGTACTAAATAATATAAACCATGCCAAACTTAACATAAAATGTTTACTAATAAACTGTATTATTTCAGGCATAGCGTGAAAAACTCCTGTTCAGCAGTCAATTATAAAAACTATACTAACCTTACTTACAGCTGTATAGCACTAGTAAGTAGCTGTTTAAAATGTCATCATTATTTCCATGAGGGAAAAAACACCGCGGAAAACATTATTGCTTATACAATTTTCTGGCAGTAAGAAGAAGAAATTAAAGCATGGTATTTGCTCTTGTATGCTCTATGCTTGTGTTATTTTTTATCTTAGCATGAGTCATGCGAACGACAATAAACAACAGATCAAAAAGTTGCAACAAGATATTTTGCAAAAGGAGAAAAGCGTACAACAGCAGCAACAACAGCGTATAATTCTGCTGAAACAGTTAAAGCAGCAGCAACAAGTTATTGATCAATCAACTAAAGCCTGGCGTAATACTAAGCATAGTTTAAACATACTTAACCACGATATTAAGCTGTTAAATTCTTTAATTAATAAGTTACAACAGGATTCTATTATACAACATAAATTATTAGGACAGCAGCTAGATACTGTCTTCCGTCAGAAGCTAAAAGCTAATCGACAGTGGATATTCAGTAATCATAATCATAGAGATGGTGAACGAAACAAACATATTCTAGTATATTTAATATCTCTTAATAAAGAGAGGGAAAAAAAAATACGATATTTACAACTAACCAGCATTCAACTAGTAGCCAAAAAAGAAGAGCAACAGCAAAAACAGCATCAACAAAATACATTGTTACAACAGCAGCAAAGGGTACTACGTACTGCCCGTAATACTGACCAGAAAATTCTCCATGATCTAAATACATCGATAAAACAGAACAAAGAGAGGATAACTAAATTACGTACTTATGAGACCCAGCTACGTAATACTATTGCCTGTGCTCAAATTGAATTGAAGGCTAAGGTTACAGCAGTAGAAAAACCAACACCACTAGTAGCACGCTTATACGGTGGTCTAACTGTTGGACAGGCCATATGGCCTGTTATAGGACGTAAAATTCATAGCTTCGGTGAACCACAAAAAGGTGATTTACGATATAAAGGACTAGTGATTGCAGCACCTCAAGGCAGCAGAGTACAGGCTATTGCAGACGGTAAAGTTATAATTTCTGATTGGTTGCAAGGCTATGGTCTAATAATTGCGATAGAACATGGAAAAGGAGATATGAGTATTTATGGCAACAACCAAAGTACATTAGTTCATGTAGGTGATCAGGTTAAAGCTGGACAAGTAATTGCTTTAGTAGGATCTACTAGTAGTAAAATATCATCACTATACTTTGAAATAAGACGCCAAGGTAAAGCGGTAAATCCTATACCCTGGTTAAGAAAGTAGTTGTAGGTAGATTAAGCACTACACTTGCATTGATAATTAAATTTATCATTATTCTTTATATTTTATTATAAGAAAATATATATTATTTATTTGACAAATCCGTTACCTAGTTATTTTTATAGAAAAAACTCTATATATAGTTCAGGATACTTCCTTAAGTTAGTGGTAACAATGAAACTAACCATGAATATTCTCCATATAATTTCATGATTCATTATTCATATCGAGGATAGTTTAAAGGTAGTTAATATTTTTTACTAAGACAAGCGAGATGAAAAGTATGAACCAAAAAGCTATCTATCCTGGTACATTTGATCCATTAACTAATGGTCATCTAAATCTAATAACACGTGCAGCACATATTTTTGATGAAGTTGTACTAGCTATAGCAGCTAGTCCCAGCAAACAACCTTTATTTGATCTAAAGGAAAGAGTAAAATTAGCTATTCAGGTTACATTACATTTACCTAATGTAACAGTACGGGGATTTATTGGTTTAATGGCTCATTTTGCCCACCAACAACAAGCTAATATTATTATACGAGGTATTAGAGCAGCAGCAGATTTTGAGCATGAGATGCAGATGATGAAAATGAATCGTTATTTTATGCCTAATCTAGAGATAGTGTTTATGATGCCAGATGAAACTTTGGCTTATATTTCCTCTACCTTAGTAAAGGAGGTAGCGCTGCATGGCGGTAGCATTGATCACTTTCTTCCGGCATTAATTGCAAATGAAGTGAAAGCAAGGTTACACCCTTAGTTTTGGCACGATGGACAGAAAAAGCTACTCCGCTGACCATATTTAGCTATTTGTATGAATTCACCGCATGTATAACAAGGTTCACCATGTCTACCATAAACTTGTAACTTTTTTGCAAACAAGCCATCCCTACCATCTGATTGTAAAAAATCGCGCAATGTAGTACCTCCTTCCTCAATAGAGCTTAGTAGTATAGCTTTGATACTACGAGCTAATAGTAGAGCTTCTTGTTCTTTTAATGAACACGAAGCTCTACTTGGCAGAATACCAGCAGCAAAGAGAGCCTCATTAGCATAAATATTACCAATGCCAACTACGAGTTTATTCGTCATTAAGAATTGCTTAATCAGCAGACTTTTATTACGTGACTTAGTGAATAACCAGTGACCATCGAATTGATCACTGAGAGGTTCGACTCCTAAATTATTTAGAATACTCATCTTGTCTAGATTATTACTCCAAAGCCAAGCCCCGAATCTTCGTGGATCAGTGTAGCGAAGAATACAATTATTACTCATAATTAAATCAATATGATCATGTTTTTCTGGTGGGAGCATGTGTGCTAATATTCTCAGCCTACCTGACATGCCAAAATGAATAATAATCCAGCCATGATGGAGCTGCATGAGTAAATATTTAGCCCGGCGTTTTAGACTAATAACCCTGCGCTGATGTATAGAAATTATTTCTTGATCAATTGGCCAGCGTAGCTGGTTATTACGTATTTCAGCCCGCTGAATAATATGACCAACGACCCAAGGTTCAATGCCTCTACGAATAATTTCTACTTCTGGTAATTCTGGCATCTAATTGTTATCCATTATATCTCGTAATATCTTTATTCTTGTTTTTAGTCATATGCAACATTATTTAATCTTCGCTTCTTTATAAATCACATGTTTACGTACTACTGGATCGAATTTCTTCAATTCTAGCTTTTCAAGCTTAAGACGTTTATTTTTCGTTGTAGTATAAAAGTGATGAGTACCAGCAGAAGAAACTAACTTAATCTTTTCGCGAACACCTTTAGCCATAAGAACATTATACCTTCAAGAGGAATGATAATTTAATTTATCATATTAGTTAGTAACGGATGCAGAGATTTGCTAAACAATTCTCTATACCCTTCTTATCAATTACCCGCATACCTTTAGCAGATACGCGTATTTTAATAAAGCGTTTTTCTGCTTCAATCCAGAAGCGATGAAAGTGCAAATTAGGTAGAAAACGGCGTTTAGTAGCATTCATTGCATAGGAGCGGTTATTACCACTAACTGACCGTTTTCCTGTGACTTGACAGAATCGAGACATATTTATTCACCTTGTTAAACTTGTTAAAAAGGACATAATACTTATATAATTAGTAATGATATCATCAATTTTACTTACTTAAACGAGTATTATAGCGGTTACTCAATATTTTGAATCTGCTCACGCATCTGTTCAATTAAAACCTTCAGCTCAATTGCTGATTTTGTTACACTGGCATTAATTGATTTTGATGCTAAAGTATTTGACTCACGGTGCAATTCTTGCATCATAAAGTCTAGACGACGACCAACAGCATCTTTGTTGCTGAGAATAAGAAGATGATATATTTCTTTCACATGTATTTCCAAACGCTCTAGTTCTTCGGCTACATCTAATCTTTGAGCTAAAAGAACAAACTCTTGCTCTTGACGATAGTTATCTAGCCTAATTTGTACTTCTTCTAACTTACCTAGTAATTTTTTCTTTTGCCATACCAGGATATCGGGCATTTGTTGACGAATCTTAGTAACTTCAGTACTAACACCGGCTAAGCGTTGTTCAATAATCGCTTTTAAAGCTATACCTTCTGTTTCACGAGCATGAAGAAAATCACGCAACGTAGTATCGAAACTATAAAATAATTGGGTAATAATAGTGTCATCAATATCGTGCTCTGGCGTAGCTATTACACCTGGCCAACTTAGAATAGCGATCGGATTAATCTCTCCTTCACCACTATACTGTTTGACTAACTTAGCTGCCTGAATTAGTTGTTTTGTTAGTATTGTATTTACATGGAACGCACTTTGTGTTTGGAGATTAACATACAGATAGCACTCTACTTTACCGCGTGTTAAACATGAGCGGATACGATCCCGAATAATTGGCTCTAGCCTACGTAACTGCCCTGGCAAATTGATGTCGACTTCTAGATAGCGTTGATTAACTGAACGCAGCTCCCAGGTTGCAGTGCCCCAATTTTCTTTAATATAATGCCGTGCATAAGCCGTCATACTGTATATCATACACTCTTAGTGCCTATTTTTTCTAATATTTGCTGCTATTATATATTAATATTCGGTTATATTAGTTAGATTTAGATTGCTTAACAGTTATTTTTACATGAAAGAGTATAAACATCAATTTATCGAGTATGCTTTAAATACAGCAGCATTACAATTCGGCAAATTTACGTTAAAATCAGGCAGAATTAGCCCATACTTTTTTAATACCGGGCTTTTTAACACGGGCCTTGATCTATCATTTCTAGGCCGAATTTATGCAGCAGCTCTTATAGATGCCAGTATCGAGTTTAATGTATTATTTGGACCAGCTTATAAAGGTATCCCAATTACAATAACAACTGCAATTGCTTTAGCAGAGCTATATGATCGTAATGTTCCGTATTGTTTTAATCGTAAGGAAAACAAGAATTACGGTGATGGTGGTATATTAGTCGGCAGCAAATTACAGGGGAAAATTATGCTATTAGATGATGTAATTACTTCTGGTATAACTATACATGAATCGATGGATATGATTATAAATCATCAGGCGACACCTGCAGGAATCTTGATTTCTCTTAATCGACAAGAGAAAAGCTGTGGTGATATTTCTGCTATTCAAGCCATTGAACTTACTTATAATTGTCAAGTAATGGCGATTATTACTCTCAAGGATATTATTGAGTATTTGGCTCTTCAAAGAAATATGGAAGCTAATCTTACTGCAGTATTAGCTTATCAGCAGCAATACGGTATTTAGACTTTTTACTCCTACCAACATATCATCTATCTCACTAACAAAGCTCCTTTACTACTACACTCTTCCTGAGTGACCAAAACCTCTTTCTCCGCGCTTACTTTTCTGGAAGTTATCAACAATATTAAAGTATACTTGTACAATCTGCACAAAAACTATCTGAGCTATGCGCTCATTAGGTTGAATAGTAAATATTTCTTTTCCACGGTTCCATAATGACACCATTATAGAACCTTGATAATCTGAATCAATTAGACCGACTAAATTGCCTAGTACAATACCATGATGTCCTAATCCGGAACGAGGGATAATGATCCCTGCTAGACCGGTATCGGCAATATGTACAGCTAACCCAGTGGAAATAAGATTAGTTTCTCCTGGTTCTAGAGATATAGTATTATCAATACAAGCGCGTAAATCTATTCCAGCAGATCCAGGGGTTGCATACTTTGGTAACTTAAAACAATCGCCAATGCGGCTATCTAGTATTTTAATGTCTATTTTTTTCATCATAACAACTGATAATTTGGTCTATTAGTTTTTGAGCTAGGACTTTTTTATCGCTTCGTGCTAACATTAGTTCACCATCTTGCCAAAACAAATGTAAAGCACTTTTATTGCTATTTAAGTCCTTATTATAGTATGAAACATCGTTAGCGCAAATTAGATCTATGTTTTTTTTGATACGCTTTTGCCGGGCATATTCTTCTACCTTATTTGTTTCAGCAGCAAATCCTACAACGTAAGGTCGGTTTTTCGTTAGAGCACCAACTCCTGCAATAATATCAGGATTTTTCGTTAAAGCTATCATAATCTTATCACTATGTTTTTTAATTTTGTTCGGCGAAAAACGGTAGGCACGGTAGTCAGCAACTGCTGCACAACCAATAAAAATATGTTGTAGCTGTACACTATGCATTACCGCATCCTGCATTTCTAATGCACTAGTTACATTGATACGCTTTACACCTGGTGGTGTATTAGCATTTACAGGACCAGCAATTAAGGTAACTTGCGCTCCTCTAGCAGCTGCAGCATAAGCAATAGCAAAGCCCATTTTGCCTGAACTATAATTACTAATAAAACGAACTGGATCTAATTCTTCACGGGTAGGACCAGCAGTAATCATTATCTTCAAATGAGTTAGGGAGTAAGATGTTAGAAAATAGCTACGCACTTGTTCGACTAGTACCAAAGGATCTAACATTCGGCCTAATCCTATATCACCACAGGCTTGGCTACCATTATCTGGCCCCCAAAGCAGGATTCCCCTCTTACGTAATGTAGTTAAATTAGCTTGCGTAGCTGCTGCAAGGTACATATGCTGGTTCATTGCTGGTACAGCAGCAATAGTAGCTGGAGTTGCTAGACAAATAGCACTAAGTAAGTCATTAGCAAAACCGGCTGCTAAACGTGCAAGTAAGTCAGCAGTAGCTGGAGCTAATATGACAAAATCAGCCCATTTTGCTAGTTGAATGTGCTTCATAGCCGCTTGATATGATTGATCTAACATCTCATTAGCAACATAGTTACTAGATACTACCTGTAGACTTAATGGCGTGATAAAAGCTTTGGCGGCTGAAGTCATTACCACGCGTACTTCAGCTCCCAATTCACGTAAACGGCGTACTATTTCAGGTGCTTTATAAGCTGCAATACCTCCTCCTATGCCAAGGATAATTTTTTTACTGGTTAGTTCTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_007984|192397:199924|198709_199924_-|WP_011520377.1|DBSCAN-SWA MTELTSKKIILGIGGGIAAYKAPEIVRRLRELGAEVRVVMTSAAKAFITPLSLQVVSSNYVANEMLDQSYQAAMKHIQLAKWADFVILAPATADLLARLAAGFANDLLSAICLATPATIAAVPAMNQHMYLAAATQANLTTLRKRGILLWGPDNGSQACGDIGLGRMLDPLVLVEQVRSYFLTSYSLTHLKIMITAGPTREELDPVRFISNYSSGKMGFAIAYAAAARGAQVTLIAGPVNANTPPGVKRINVTSALEMQDAVMHSVQLQHIFIGCAAVADYRAYRFSPNKIKKHSDKIMIALTKNPDIIAGVGALTKNRPYVVGFAAETNKVEEYARQKRIKKNIDLICANDVSYYNKDLNSNKSALHLFWQDGELMLARSDKKVLAQKLIDQIISCYDEKNRH >NC_007984|192397:199924|197580_198222_+|WP_011520375.1|DBSCAN-SWA MKEYKHQFIEYALNTAALQFGKFTLKSGRISPYFFNTGLFNTGLDLSFLGRIYAAALIDASIEFNVLFGPAYKGIPITITTAIALAELYDRNVPYCFNRKENKNYGDGGILVGSKLQGKIMLLDDVITSGITIHESMDMIINHQATPAGILISLNRQEKSCGDISAIQAIELTYNCQVMAIITLKDIIEYLALQRNMEANLTAVLAYQQQYGI >NC_007984|192397:199924|196616_197483_-|WP_011520374.1|DBSCAN-SWA MIYSMTAYARHYIKENWGTATWELRSVNQRYLEVDINLPGQLRRLEPIIRDRIRSCLTRGKVECYLYVNLQTQSAFHVNTILTKQLIQAAKLVKQYSGEGEINPIAILSWPGVIATPEHDIDDTIITQLFYSFDTTLRDFLHARETEGIALKAIIEQRLAGVSTEVTKIRQQMPDILVWQKKKLLGKLEEVQIRLDNYRQEQEFVLLAQRLDVAEELERLEIHVKEIYHLLILSNKDAVGRRLDFMMQELHRESNTLASKSINASVTKSAIELKVLIEQMREQIQNIE >NC_007984|192397:199924|194724_195207_+|WP_041574884.1|DBSCAN-SWA MNQKAIYPGTFDPLTNGHLNLITRAAHIFDEVVLAIAASPSKQPLFDLKERVKLAIQVTLHLPNVTVRGFIGLMAHFAHQQQANIIIRGIRAAADFEHEMQMMKMNRYFMPNLEIVFMMPDETLAYISSTLVKEVALHGGSIDHFLPALIANEVKARLHP >NC_007984|192397:199924|195203_196013_-|WP_011520371.1|DBSCAN-SWA MPELPEVEIIRRGIEPWVVGHIIQRAEIRNNQLRWPIDQEIISIHQRRVISLKRRAKYLLMQLHHGWIIIHFGMSGRLRILAHMLPPEKHDHIDLIMSNNCILRYTDPRRFGAWLWSNNLDKMSILNNLGVEPLSDQFDGHWLFTKSRNKSLLIKQFLMTNKLVVGIGNIYANEALFAAGILPSRASCSLKEQEALLLARSIKAILLSSIEEGGTTLRDFLQSDGRDGLFAKKLQVYGRHGEPCYTCGEFIQIAKYGQRSSFFCPSCQN >NC_007984|192397:199924|196290_196518_-|WP_011520373.1|DBSCAN-SWA MSRFCQVTGKRSVSGNNRSYAMNATKRRFLPNLHFHRFWIEAEKRFIKIRVSAKGMRVIDKKGIENCLANLCIRY >NC_007984|192397:199924|193226_194444_+|WP_011520369.1|DBSCAN-SWA MREKTPRKTLLLIQFSGSKKKKLKHGICSCMLYACVIFYLSMSHANDNKQQIKKLQQDILQKEKSVQQQQQQRIILLKQLKQQQQVIDQSTKAWRNTKHSLNILNHDIKLLNSLINKLQQDSIIQHKLLGQQLDTVFRQKLKANRQWIFSNHNHRDGERNKHILVYLISLNKEREKKIRYLQLTSIQLVAKKEEQQQKQHQQNTLLQQQQRVLRTARNTDQKILHDLNTSIKQNKERITKLRTYETQLRNTIACAQIELKAKVTAVEKPTPLVARLYGGLTVGQAIWPVIGRKIHSFGEPQKGDLRYKGLVIAAPQGSRVQAIADGKVIISDWLQGYGLIIAIEHGKGDMSIYGNNQSTLVHVGDQVKAGQVIALVGSTSSKISSLYFEIRRQGKAVNPIPWLRK >NC_007984|192397:199924|198276_198732_-|WP_041574885.1|DBSCAN-SWA MMKKIDIKILDSRIGDCFKLPKYATPGSAGIDLRACIDNTISLEPGETNLISTGLAVHIADTGLAGIIIPRSGLGHHGIVLGNLVGLIDSDYQGSIMVSLWNRGKEIFTIQPNERIAQIVFVQIVQVYFNIVDNFQKSKRGERGFGHSGRV >NC_007984|192397:199924|192397_192655_-|WP_041574883.1|DBSCAN-SWA MAKIEIYTKFSCPYCHRAKALLTSKQLPFQEIKIDGKFDLREEMIKRSGRTTVPQIFINSEHIGGFDDLCDLDTCGGLDYLTPDI >NC_007984|192397:199924|196073_196241_-|WP_011520372.1|DBSCAN-SWA MAKGVREKIKLVSSAGTHHFYTTTKNKRLKLEKLELKKFDPVVRKHVIYKEAKIK >NC_007984|192397:199924|192688_193120_-|WP_011520368.1|DBSCAN-SWA MPEIIQFISKHFMLSLAWFILFSTVIVITIQSWFSKIKEIANSEAIRLINKENAVILDLRSKDDYRHGHITNSLNLTETVLKNGNLSSIELAKNRPVVVINNNHIASRNSANKLYKAGFEKVYVLKEGITGWCEDNLPLIRSK |
11 | Rhizobium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
273548 : 281328
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_007984|273548:281328|DBSCAN-SWA ATTGATAAATCCCCTCTATAGAAAACATATTATTTCTATCAATGATATGAGCAGCAACGAACTAGAATTAGTTTTAAACATAGCAGCTCATCTAAAATTCAAACCACAGCCAGAATTACTGAAAAACAAGGTAATAGCTAGCTGTTTTTTTGAGGCTTCTACCCGTACTAGATTATCGTTTGAAACAGCTATTCATCGCCTTGGAGCATCAGTAGTAGGCTTTTCTGATGCTCATAGTACCTCTTTAAGCAAAAAAGGCGAAACATTAGCAGATACTATTTCCGTCATTAGTACCTATGTAGATGCAATAATAATCCGCCATCCACATGAAGGTGCTGCAAGATTAGCAACTGAGTTTTCCGGTACAGTACCTATCCTTAACGCCGGTGATGGAGCTAATCAACATCCAACGCAAACCTTACTTGATCTTTTCAATATTTATGAAACCCAAGGTAAATTAAACAATCTTCGTATTGCTATGGTTGGTGATTTAAAATATGGTCGTACGGTACATTCCCTCACGCAAGCATTGATAAAATTCGATAGTAATCACTTTTATTTTATTGCACCTGATACGTTAGGTATGCCTTCTTATATTTTACATACTCTTATAGATCACGATATTAAGTATAGTATGCATCTTAATCTCGCAGAAGTTATACCCGAGTTAGATATTTTATATATGACTAGAGTACAAAAAGAACGTTTAGATCCTACTGAATATATTAACGTTAAAGCACAATTTGTACTACAGATTCATCATCTGCTCCATGCACGCGCGAACATGCGTATTCTTCATCCTTTACCAAGAGTTGATGAAATAGCCTATGAAGTAGATCAAACGCCCTATGCGTACTATTTTCAACAAGCAGGCAATGGTGTGTTTACTCGCCAAGCTTTACTCGCACTAGTATTAAATAAATATTTAACTGAATAATGGAGCATAATTTATGCATCAGTATCATAAATTGCAGGTAGAAGCAATTTATTGCGGTACAGTAATCGACCATATACCAGCACAAGTTGGTATTAAACTACTTAGTTGGTTTAAACTGACAGCTACGGATGAACGTATTACTATTGGTTTAAATTTGCCTTCAAATAAGCAGGGTAAAAAAGATCTAATAAAAATAGAAAATGTATTATTAACTGAGGAACAAGCTAACCAGTTAGCAATTTATGCTCCTTATGCTACAGTAAATCGCATTGCCAATTATAATGTAGTATGTAAACGTACCTTAACGTTGCCTGAAAGTATCGCAAATGTATTTATTTGTCCTAATAGCAACTGTGTTAGCCGTAGTGAACCTGTAGCATCAGGATTTATTATTAAAACTAGAGGCAAACAGATACATTTAAAATGTAAGTATTGCGAAAAAGTTTTTGAGCGTAGAGCAGTAGAATCAAGTAATTTAAAATAAAATATAACTACATAACCTAAATTCAATTAGGTTGAGGAAAAATAAATGAACCATATTATTCATACGCAAAATGCACCAGCAGCAATTGGTCCATATGTACAAGCTAGAAATATTGGTCTGATGACTTTTATCTCGGGACAGATTCCTATTTGTCCGTTAAGCGGCAAAATAGCCGATAACATTATCGATCAAACAAAACAGTCATTGCAAAATATCAAAGCAATAGTTGAAGCTATAGGTAGTAATGTTACTATAGCTAATATTATCAAAACAACTATTTTTCTTATTGATATAAATCAACTTTCCGTTGTAAATACCATTTATGAAAGTTTTTTTACAGAGCATCATGCACCATTTCCAGCACGCACTTGTGTAGAAGTTAGTAGGCTACCTAAAAACGTCAACATTGAGATTGAAGCTATTGTAGCAATATATTCATAAACCTACTACCTATATCCCTAAGGATATAGGAATATATTAGTTATAGCAAAAAACCCGCAAACAGCGGGTTTCAGGATAAAAGCTACTAACTAGTATTAGATAGCAATAACGTCAGCAGCTGATGGGCCTTTGGCGCCATTAGTAATTTCAAACTCTACACGCTGACCTTCAGCTAATGTTTTAAAACCGTTACTCTGAATGGCAGAGAAATGTACAAAAACATCTTTACTACCATCTTCAGGGGTAATAAAACCGAATCCTTTGGATTCATTAAACCATTTAACGTTACCTTTAATCTTAGACATCAAACTAACCCTTAAATAAATGAGAGACACTATTCTCTGTGTCAAATAATAGTACAGCAACTAACATGCTTTTTGTCCAGCATTCAATGGTTAAACCGTGATAAATATTACTAAAAATTACTGTTAGTAATTACTAACACTGGACTAATTTCCTATTCTAGAAAACTAGAATACTTCTTATTATATAAAATATTTATCTATAAATATAGCGACAAAGTGGTTACTCTATGACAAAATAATACTATTAATTTTGTAAATATAATTGAGCAATATAGTTTACATATGGTATGCCACATAACCAACAGATAAAAAAAACGGTAGTTGTTTTTAGCGGTGGACAAGACTCAACAACCTGTCTAATTCAAGCTTTAACCCAATATGATCAGGTATATTGTATCACCTTTGATTATGGTCAACGCCATCGTGCTGAAATCTGCATTGCTCGTAGACTAACTATTACTTTAGGCGCTTATGATCATCAAATAATAGATACTAGTGCACTTAATGTATTAGCAGCAAGCAGTTTAACAAGAGAAAATATTATCGTACCATTAGCTGAAAAAAATCATATGAATAGTTCTCTTAGTACTTTTGTTCCTGGACGTAATATTGTATTTTTAACGTTAGCTGCTATTTATGCATATCAGGTTAAAGCAGAAGTAATCATTACCGGAGTGTGTGAAACAGATTTTTCTGGTTATCCAGATTGTCGGGAAAAATTTATTCAGGCACTAAATAAGGCAGTTAATCTTGGGATGGCGTATAATATTCATTTTATTAGTCCACTAATGTGGCTAAATAAAGCAGAAACTTGGGCACTAGCAGATTATTATCAAAAGTTAGATCTAGTTTGTAATGAAACTCTTACTTGTTACAATGGTATTCAAGGTAAAGGTTGTGGTTTTTGTACGTCGTGTTCGTTACGTGCCCGTGGCTTAGAAACGTACAAACAGCAACCAAAATTAACTATGTCTTCACTTAAAGCTAAGACTGGATTACCCTAAATATTAGATTAGTTAGAATACGGAGAGTTAAGATTTGGTAACTCTATTGATATTAAATGGAGAATATTGTAATGCTAAAGTTAGTACTTCATCAATACGTTGTACTAGTTTTATATTTAGATCATGAATAACAGTAGCTGGCATTTCTTCTAAATCACGTTTGTTTTCGTCCGGTATTAATACCGTTCGAATACCACCACGATGAGCAGCTAATAACTTTTCCTTTAACCCTCCAATTGGCAAAACTTGACCACGTAGTGTTATTTCCCCTGTCATAGCAACAGAAGCTATAACAGGATTACCTGTTAGACAGGAGACTAAAGCAGTACACATAGCTATGCCAGCACTCGGACCATCTTTCGGTGTAGCTCCTTCTGGGACATGCACATGTATATCGCTTTTTTCATAAAAAGCTGGAGAAATACCTAGTTTTTCGACTCTAGCTCGTACAACAGTTAGGGCCGCCTGAATTGATTCTTGCATGACTTCGCCTAACGAACCAGTATAAATTAATTTCCCTTTACCAGGAACACAGGCAGTTTCAATTGTTAGTAACTCTCCACCTACTTCTGTCCATGCAAGGCCAGTAACTTGCCCAATATGATTTTTTCCTTCTGCACGTCCATAGTCAAAACGTTGTACACCAAGAAATGCCTTAAGATTAGCAGCATCAATTATTATCTGTTTGATACTCTTATCCATAATTAGCGTTTTAACCGCCTTACGACATAATTTAGAAATTTCACGTTCTAGATTACGTACTCCTGCTTCACGAGTATAATAACGGATTATATTAACTATTGCGCAATCTTTAATAAACAATTCACCATTTTTAATGGCATTACGTTCGAATTGTTTATTCAATAAATGTTGACGTGCAATATTGAGTTTTTCATCTTCGGTATAACCTGATAATCGTATTACTTCCATTCTATCGAGCAATGGCGAAGGAATATTCATAGAATTAGATGTAGCTACAAACATTACATCAGAGAGATCATAATCTACTTCTAAATAGTGATCATTAAAGGTAATATTTTGTTCAGGATCTAATACTTCTAGTAAAGCTGAAGCTGGATCACCACGCATATCAGATGACATTTTATCAATTTCATCAAGCAGAAAAAGCGGGTTTTTAACACCTACTCGAGCAATTTTTTGGATAAGCTTACCTGGCATAGAACCAATATAAGTCCGGCGATGACCACGTATTTCGGCTTCATCTCGTACTCCACCAAGTGCCATTCTCACATATTTACGTCCTGTTGACCTTGCAATAGATTGACCCAAAGATGTTTTTCCTACCCCTGGTGGTCCAACTAAGCACAATATTGGACCTTTAATCTTGCTCACACGGCTCTGTACAGCAAGGTATTCTAAAATACGGTCTTTCACTCTATTTAAACCATAATGGTCTTTATCAAGAATCTCTTGTGCCTTTATTAGATCTTTTTTTACTTTACTGCGTGCGTGCCATGGTACTGATAACATCCATTCTATATAACTACGAACCACAGTTGCCTCAGCTGACATAGGTGACATCATCTTAAGTTTTTGTAATTCTACCTCTGTTTTTTCCCTTGCTTCTAATGACATTTTAGCAGCTTCTATCTTACGTCTTAGCGTTTCATATTCGTCAGGTATATCCTCCATTTCTCCTAGTTCTTTTTGAATCGCTTTCATCTGTTCGTTTAAATAATATTCTCGCTGGCTTTTCTCCATTTGTTTTTTTACTCTATTACGGATACGTTTTTCTACCTGTAATAAATCTATTTCTGACTCCATCATGGCCATAAGGTATTCTAGCCGTTCGGAAACATTTGTCATTTCGAGCACTGACTGTTTGTCAATCAGTTTTAATGGCATATGAGCAGCGATAGTATCAGCTAATCTAGCTGCATCTTCAATGCTATGAAGCGAAGTAAGAACTTCAGGTGGAATTTTTTTATTTAGTTTAATATATCCTTCGAATTGATTAATAGCTGTACGGACAAGTACTTCTTGTTCGCGCTCGTCTATCTCTGTAACATCAAAATAGTCTGCTTCAGCGGTAAAATGATTACCACTATCTGCTAATTTTATGATACGAGCACGCGTTAATCCTTCGACCAAAACTTTTACTGTACCATCAGGTAATTTTAGCATCTGTAAAATACATGATACGGTTCCTATGGAAAATAGGTCATTAGTATTTGGTTCATCAGTTAAAGCTTCTTTCTGTGCTACTAGCATGATCTTTTTATCATTATCCATAGCTGCTTCAAGACATCGAATGGATTTTTCTCGGCCGACAAATAATGGAATAACCATATACGGGTATACTACAACATCGCGTAGAGGTAAGACGGGGATTTCTATACGTTCGGAACGCTCAATATTCATATTCATAGAGCTTTCTCTTATTTTATCTTCCGCAAGGTTTGTCGAACACGTAAAAGTTAGCTGTTACTAATTTGTATCATATAGTAATTTGAGTATATTGGGTCAAATTACTAACATTCAATATTAAATAATAATGAAAAGAGAATAAAGCATTTATGTTGTAAGATACCTTAATTTTTCTAGATAAATTTATCTAAATATCTAACTATCAACTTACTTTGTTATCTGGCTCACGATAAATAATTTTTGGTTTAGTATTACTAGTAATTACAGCTTCATTAATAATTACTTTTTCTACATGTAACTGAGATGGTAATTCATACATAGTTTCTAACAATATACCTTCGACAATAGAACGTAAGCCACGGGCACCAGTTTTTCTAGCCATAGCTTTTTTAGCTATAGCTATTAAAGCTTCTTCGCTAAATTCTAGTTCTACTCCTTCCAAATTAAATAATGCCTGGTACTGCTTAGTAAGCGCATTTTTAGGTTCACGTAATATCCTAATTAATGCTTCTTCACTTAGTTCATTGAGTGTAGCTACAACAGGTAAGCGACCTATGAATTCAGGAATTAAACCAAATTTTACTAAGTCTTCAGGTTCTACTTGAGTTAATAACTTATCTTCATTTAGTTGGTCTGATCCTAATTTAATTATTGCGCTAAATCCTATGCTATTATTTGTATCCATCCTTCGTTCGATAACTTTATCTAGGCCATCAAAAGCACCACCACAAATAAAAAGAATTTTTGAAGTATCGACTTTTAAAAAATCTTGCTGAGGATGCTTACGTCCTCCATGTGGAGGTACTGCTGCAACTGTACCTTCAATTAGCTTAAGTAATGCCTGTTGTACCCCCTCACCAGATACATCACGGGTTATTGATGGATTATCTGATTTACGGGAAATTTTATCTATTTCATCAATATATACTATGCCATGTTGTGCTTTCTGCACATTATAATCACATTTTTGTAGTAATTGATGTAGAATATTTTCTACATCTTCACCGACATACCCAGCTTCTGTTAAAGTAGTAGCATCTGCCATAGTGAATGGCACATGCAAGAAGCGTGCTAGTGTATCTGCTAGCAGTGTTTTACCACTACCAGTAGGTCCAATTAGCAAAATATTGCTTTTTCCTAGCTCAACATTGTTGTGAGAAGTATCATGATGCAAGCGTTTATAGTGGTTATATACAGCTACAGCTAATACTTTTTTTGCTTGTTCCTGACCAATTACATAATTATTCAAGTGATTATTAATATCATGAGGTGTAGGTAGTATCTGAATGTCGCTATTCTTTACTACGTCCTTAATTTCTTCGCGGATAATATCGTTACATAAATTAACACATTCATCGCAGATACAAACTGATGGTCCAGCAATAAGTTTCCTTACTTCATGTTGTTTTTTACTGCAAAAAGAACAATATAAAAACTGTTTTGAACTATCTTTATGCTTATCTGTCATCAGTAAACCTCTGTTGTTTCTATCTCCTACTCTTAAAGTTATGAGTTAGAGCTAAACTGTTACTACTAAATTCAAAACAATTAGTAGTAGGAGATCTACTAGTAGCCTTTTTAATATTAAAATTTAAACTACTACCTTAAATACGATGGCTTAATATAGCATCAACTAGTCCATAGTCTACAGCTTCATTCGCTGATAAAAAACGATCCCGCTCTGTATCTTGTTCTATTACTTGGAGAGTTTTTCCTATATGTTTTGCCATTAACTCGTTCATGCGATTTTTAACTTTTAATATCTCTTTAGCATGGATTTGAATATCAGTTGCTTGACCTTGGAAACCACCCATTGGTTGATGAATCATCATCCGTGCATTGGGTAAGCAAAAACGCTTACCTTTAGTCCCAGCAGCAAGCAAGAATGCACCCATGGAAGCTGCTTGACCCATACAAAAAGTGCTAACGTTTGGTTTTATAAATTGCATCGTATCGTAAATCGACATTCCAGATGTAATGTTTCCACCAGGGGAATTGATGTATAGATAAATATCTTTTTCTGGATTTTCTGCTTCTAGAAATATCATTTGTGCTACAATGATATTAGCCATATAATCTTCAACTTTACCAGTCATAAAGATAATTCTTTCTTTAAGAAGTCGCGAAAAGATGTCGTATGAACGTTCTCCGCGCAAAGTACGTTCAACAACCATAGGTACTAAGGCCATATTTAATGGAGTATATTCACAACTATATGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_007984|273548:281328|280710_281328_-|WP_011520448.1|DBSCAN-SWA MSYSCEYTPLNMALVPMVVERTLRGERSYDIFSRLLKERIIFMTGKVEDYMANIIVAQMIFLEAENPEKDIYLYINSPGGNITSGMSIYDTMQFIKPNVSTFCMGQAASMGAFLLAAGTKGKRFCLPNARMMIHQPMGGFQGQATDIQIHAKEILKVKNRMNELMAKHIGKTLQVIEQDTERDRFLSANEAVDYGLVDAILSHRI >NC_007984|273548:281328|276745_279100_-|WP_011520446.1|DBSCAN-SWA MNIERSERIEIPVLPLRDVVVYPYMVIPLFVGREKSIRCLEAAMDNDKKIMLVAQKEALTDEPNTNDLFSIGTVSCILQMLKLPDGTVKVLVEGLTRARIIKLADSGNHFTAEADYFDVTEIDEREQEVLVRTAINQFEGYIKLNKKIPPEVLTSLHSIEDAARLADTIAAHMPLKLIDKQSVLEMTNVSERLEYLMAMMESEIDLLQVEKRIRNRVKKQMEKSQREYYLNEQMKAIQKELGEMEDIPDEYETLRRKIEAAKMSLEAREKTEVELQKLKMMSPMSAEATVVRSYIEWMLSVPWHARSKVKKDLIKAQEILDKDHYGLNRVKDRILEYLAVQSRVSKIKGPILCLVGPPGVGKTSLGQSIARSTGRKYVRMALGGVRDEAEIRGHRRTYIGSMPGKLIQKIARVGVKNPLFLLDEIDKMSSDMRGDPASALLEVLDPEQNITFNDHYLEVDYDLSDVMFVATSNSMNIPSPLLDRMEVIRLSGYTEDEKLNIARQHLLNKQFERNAIKNGELFIKDCAIVNIIRYYTREAGVRNLEREISKLCRKAVKTLIMDKSIKQIIIDAANLKAFLGVQRFDYGRAEGKNHIGQVTGLAWTEVGGELLTIETACVPGKGKLIYTGSLGEVMQESIQAALTVVRARVEKLGISPAFYEKSDIHVHVPEGATPKDGPSAGIAMCTALVSCLTGNPVIASVAMTGEITLRGQVLPIGGLKEKLLAAHRGGIRTVLIPDENKRDLEEMPATVIHDLNIKLVQRIDEVLTLALQYSPFNINRVTKS >NC_007984|273548:281328|275504_275714_-|WP_011520444.1|DBSCAN-SWA MSKIKGNVKWFNESKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIQSNGFKTLAEGQRVEFEITNGAKGPSAADVIAI >NC_007984|273548:281328|273548_274484_+|WP_041574888.1|DBSCAN-SWA MINPLYRKHIISINDMSSNELELVLNIAAHLKFKPQPELLKNKVIASCFFEASTRTRLSFETAIHRLGASVVGFSDAHSTSLSKKGETLADTISVISTYVDAIIIRHPHEGAARLATEFSGTVPILNAGDGANQHPTQTLLDLFNIYETQGKLNNLRIAMVGDLKYGRTVHSLTQALIKFDSNHFYFIAPDTLGMPSYILHTLIDHDIKYSMHLNLAEVIPELDILYMTRVQKERLDPTEYINVKAQFVLQIHHLLHARANMRILHPLPRVDEIAYEVDQTPYAYYFQQAGNGVFTRQALLALVLNKYLTE >NC_007984|273548:281328|276019_276718_+|WP_041574929.1|DBSCAN-SWA MKKTVVVFSGGQDSTTCLIQALTQYDQVYCITFDYGQRHRAEICIARRLTITLGAYDHQIIDTSALNVLAASSLTRENIIVPLAEKNHMNSSLSTFVPGRNIVFLTLAAIYAYQVKAEVIITGVCETDFSGYPDCREKFIQALNKAVNLGMAYNIHFISPLMWLNKAETWALADYYQKLDLVCNETLTCYNGIQGKGCGFCTSCSLRARGLETYKQQPKLTMSSLKAKTGLP >NC_007984|273548:281328|275013_275409_+|WP_011520443.1|DBSCAN-SWA MNHIIHTQNAPAAIGPYVQARNIGLMTFISGQIPICPLSGKIADNIIDQTKQSLQNIKAIVEAIGSNVTIANIIKTTIFLIDINQLSVVNTIYESFFTEHHAPFPARTCVEVSRLPKNVNIEIEAIVAIYS >NC_007984|273548:281328|274497_274968_+|WP_011520442.1|DBSCAN-SWA MHQYHKLQVEAIYCGTVIDHIPAQVGIKLLSWFKLTATDERITIGLNLPSNKQGKKDLIKIENVLLTEEQANQLAIYAPYATVNRIANYNVVCKRTLTLPESIANVFICPNSNCVSRSEPVASGFIIKTRGKQIHLKCKYCEKVFERRAVESSNLK >NC_007984|273548:281328|279308_280574_-|WP_011520447.1|protease|DBSCAN-SWA MTDKHKDSSKQFLYCSFCSKKQHEVRKLIAGPSVCICDECVNLCNDIIREEIKDVVKNSDIQILPTPHDINNHLNNYVIGQEQAKKVLAVAVYNHYKRLHHDTSHNNVELGKSNILLIGPTGSGKTLLADTLARFLHVPFTMADATTLTEAGYVGEDVENILHQLLQKCDYNVQKAQHGIVYIDEIDKISRKSDNPSITRDVSGEGVQQALLKLIEGTVAAVPPHGGRKHPQQDFLKVDTSKILFICGGAFDGLDKVIERRMDTNNSIGFSAIIKLGSDQLNEDKLLTQVEPEDLVKFGLIPEFIGRLPVVATLNELSEEALIRILREPKNALTKQYQALFNLEGVELEFSEEALIAIAKKAMARKTGARGLRSIVEGILLETMYELPSQLHVEKVIINEAVITSNTKPKIIYREPDNKVS |
8 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_3 |
403875 : 411689
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_007984|403875:411689|DBSCAN-SWA TTTATTTTAGATTATTTAGTAGCTCATGTAACGAGCAAATTGTTAGTATGCGACGTCCTTCATAATATGAATGATTCCAATAATTATCATTTAGGTTAGAAATGATAATACCACTGCTAGAAGATGCATGTAAAAATATATCATAGCTAATATACATTCCTATATGACGGCCAGTAGCATGATTATAAAATAATACTAAATCACCTGGTAGCAGGTTATTTCGTTGAACTGTGACACCTATTGCTTTCTGATATTGAGTAGTACGTGGTAAATTAATACCAAACTGTTCCCTGAACGTATTTTGCACAAAAGCAGAGCAATCTATACCACTTTTATCAAGTCCTCCTAACTTGAATGTTACACCTTTCCAGTTAATATATTGATTAAGTATCTGAGATTTAATTTCTAAGAACTTTAATATTTCTTCAACTACTAATAGTTTTTGACTATTAGTAGTTAACAATTGTCTATTGTTCGTTACTTGATAGTAACATGGATAATGATGCTGATTACTACAGGTAGACAAAAAAAATATTAATATTAGGATATGTTTGTGAACAAACTGATATTTAAGCATTTGCAGAAACAAATATATTGAATGAATATTAGTAACATTTTTTTTAAAATACCATATTCGTAGTAGTTGATGCAGTTGCCATTCTTTTTAGCCAAATTATTTCCTGTGACCAAATAGTAGGGTTAATTGTTTCTAAAATAATCGGAATATTATTGAAACGGTTATCAGCCATAATCCAATTAAATGCTGTATATCCTATTTTACCTTGACCCAAGCTTTGGTGGCGATCAATTCTGCTCCCACAAGAAGTTTTAGTATCGTTTAAATGTAAACCACGTAGGTATTTAAAACCTATAGTATCTGCAAACTGCTTAAAAGTAGCAATACAACTCTGTTCTGTACGTAAATCATAACCTGCTGCAAAAGCATGACAGGTATCAATACAAACCCCAATACGACTTTTATCATCTACTTGCCTTATAATTTCCGCTAGTTGTTCAAACCTAAAACCCATATTGCTACCTTGGCCAGCAGTATTTTCAACTACGGCTGTAACGCCTGTAGTTTTCTCTAGTGCAATATTAATCGAATCAGCTATACGAGTAATACTATTATCTTCGTCTATTTGTTGTAAATGACTACCTGGATGGAAGTTAAGCAGACTAAGACCTAATTTTTCACAACGGTGTAGTTCTTCAATAAAAGCTATCCTTGACTGTTTTAGTTTATCTTTAATTGGATGGCTTAGGTTAATAAGATAGCTATTATGAGGTAAAATTTGTGCTGTAGTATAATTATATTTGTTACAGGCAACACGGAAATTCTTGATTAAATTAATCGTTAGTGTAGATGCTTTCCACTGAAGCTGATTTTTGGTAAAAAGAGCAAAAGCATTAGCATGTAATGCATGAGCACGTATAACAGCTTTATCTATACCACCATTTATACTAACATGTGCACCAATCCACTTTTTTGCGCTCATTTCTTTATATCCTATATACTTTGATAAGTAAGGCTTAATAATTAAGCTTATTACTATTTATCTTGCTTATGTTTGCTTATTAGTGATAAATATCTTAATTATGTTAGTTATTAATAACTTTTATCTTTGATAATGTAAATTATTTAAAATATATGTTAGAACAAAAGATTGATCAGCATACTAATGTCTTACGTCGTGAACTAAAAACACGTCATCTTACTATGATTACAATAGGTGGTTCTATCGGGACTGGTTTGTTTGTTGCTTCAGGTGCTTCAATATCACAAGCTGGTCCTGGTGGTGCATTACTATTATATATAGTAATAGGTCTTATGGTTTATTTTCTAATGACTAGTCTAGGTGAGCTAACTGCTTACATGCCTGTATCTGGTTCTTTTGTTACTTATGGTAACCTTTACGTAGAAGAAGGCTTTGGTTTTGCATTAGGTTGGAACTACTGGTATAATTGGGCAGTAACTATTGCTGTAGATCTTGTAGCAGCACAAATTGCCATGAGTTACTGGTTTCCAACAACACCAGGTTGGGTTTGGAGTATATTATTTATAAGTATTATCTTCCTACTTAATGTTATTTCAGTAAAAGGTTTTGGTGAAGCTGAATACTGTTTCTCACTCATTAAAGTAGCTACCGTTTTTATGTTTATTGTTGTTGGGATACTTATGATACTTGGTGTATTGTATGGAGGTGCACCAACCTATTGGTATAACTGGCAAGTTGGTGATGCGCCTTTCGTTGGTGGTTTTACTGCAATAATAAATGTAGCTATGATCGTTGGTTTTTCCTTTCAAGGGACGGAGATAATTGGTATAGCTATTGGTGAGTCAGTCAATCCTAGTGCAAATATTCCACGTACTATGCGGCAAGTGTTCTGGCGAATTTTATTCTTTTATGTCCTATCAATATTCATTATTGGTTTTTTGATTCCATATGATAGTGCGGCTTTATTACAAGAAGATATAAATAAAATCACTATCAGCCCATTCACTTTAGTATTTCGTAATGCTGGGCAGTTTTCAGTAGCAACAATAATGAATATTGTTATTCTTACTGCCGTATTATCAGCAGGTAACTCAGGTATGTATGCCTCAACACGTATGCTGTACACTTTAGCACGAGAAGGTCAAGCTCCTAATATTTTCGCCCGTTTATCGAAAAGAGGGATACCGTGTAATGCGTTGTATATGACAACAATTATGGCAGCATTGTGTTTTCTTTCAGCAATATATAGTAATCAAAAAGTTTATTTGTGGCTGCTGAATATTTCAGGAACTACTGGTTTTATTGCTTGGTTAGGTATAGCTATTAGCCATTATCGTTTTCGCCGTGGTTTAAAAAAACAGGGATATAGCTTGAATAGTTTACCGTATCGCGCTGGATTATTTCCGTTTGGACCTATTTTTGCTTTTAGTCTATGCATAGTAATTATTTTAGGCCAAAATTATCAAAACTTTCTTGCAGAAAGTCTTAATTGGAACAGTATTATTACTACTTATATTGGTATTATATTATTTCTTTTAATTTGGTTTAGTTATAAATGGTATCATGGTAGTAGCTTAGTACGTTATGATCAGATGATTTTTAAAAAAAATTTAACTAAAAATACTTATTAAGTAAGTAATAATTAATGAAGATCAGAGAAATATATGTAAAACAATTTAATTAATTACTTATTCTTTAGCTATTTAATAGAGTTAAAAGTATCTAAATACTTGCAATTATTTGCTGGTCTACTGGAGGTAGATAAATAAATTACATGGTCATACTTACAAAAGAAGCATCGATGGTACGTCAGGCGCTACTAGCAAATGGACTAGAACCTTTCCTACGAGGAGAGGAAAGACTAGGTATAGAAGCACGTAAACGTCGTATTGCTGCACATATGAAGAAAATTATGACGTTACTCAACTTAGATTTAGCGGATGATAGTTTAGCAAAAACACCCTATCGTATTGCTTACATGTATATAGAAGAAATATTTCCTGGCTTAGATTATGCTAATTTTCCACAAATTACCCTAATATCGAATAAAATGAAAGCTGATGAAATGGTTACAGTACGTAATATAACTCTTACTAGTACTTGTGAACATCACTTTTTGATGATTGATGGTAAAGCTACCGTTTCTTATATACCAAAAAGTAACGTAATAGGTCTATCTAAGATTAACCGTATAGTTCGTTTTTTTGCACAGCGTCCACAAGTTCAAGAACGACTTACACAACAAATTTTATTAGCATTACAAACTATTTTAGGTACAAATAATGTAGCAGTATCTATATATGCTGTTCATTATTGCGTAAAAGCACGTGGTATTTGTGATAGTACGAGTACTACTACTACTACTTCATTAGGAGGAATATTTAAATCCAGCCAAAATACACGCCAGGAATTTTTGCGTACTATTAATCAAACATAATAATTAATTTATACCATCCTTTTATAAGGTTAATCTTGATCAATTCTGCTTGCAACAGCTCCCTGTTGGTAGCAATATTTAGCACTCTCACGTTTATGATATGGACGTGATGCTGGTCCACTGAGTAGTTCAAAGCTTAGTGCGGCAATTAACATACCTGGACGTAGTCCTAGTGGTAACTTACCAGCATTATAAATTTCTAGTACAATTTTTCCTTGCCATCCAGGATCAATTCGTTGTGCAGTGATATGCACCATTAGTCCAAGCCTTGCTAAGGAAGAACGACCATCTAGCCAACCAATTAAGTTATTAGGTAGTGTAATTGACTCCATAGTTACTGCTAAGGCTAGTTCTCCAGGATGAAGAAAAAATGTATCGTCTTCAGTTAATTGGATTTCATTACTCATAATGAGATTTATAGCATCAGTTACATTTTTTTTCGGTCCACTTAAATCAACAAATGCTGTAGTATGACCGCGAAAAACCCTAAATTTATCGCCTAAAAGTATATCTACACTAGCACCGTTAATTCTTTCTATTGGTGGCCGTGGAATAATATCTAGTTTTTCTTCATCCATCCATAGTTCTATATCACTATCACATAATATCATGGTATATTTTCTCTATGCATAGTATAAATAGCATAACAAGAATATGATTAATCTTAGTAACAATTTGTTAGATTATCATAAAACTTAATTATGATAATATTTTATATTCGTCGTGATAGTAATACGTAGGCTTATTTATCTTATCTTAATAAGCTATTATATGTTTTAATTTTGTTACAAATATAAATAATAATGATACAAGTAGCCTCTAAAATTTTAGTAACCTGTGCATTACCATACGCTAATGGTTCTCTCCATCTAGGCCATATGTTAGAACATATTCAAGCTGATATTTGGGTGCGTTATCAGCGAATCCGTGGTAAACAAGTGTATTTTATTTGTGCTGATGATGCACATGGGACACCTATTATGCTGAAAGCAAAGCAATCAGGTATTACACCGGAAGCTATGATAAATAAAATTAATCAAGAACATCAGACTGATTTAGCGCAGTTTGAAATTAGCTATGATAATTATTACTCAACTCATAGTGATGAAAATCGTGAATTGGTCATATCTATCTATAATACACTAAAAGAAAATGGCTTAATCAAAAAGCGCATGATTTCTCAGTTATATGATCCCATACATAATATATTTTTACCTGATCGTTTTGTAAAAGGATACTGTCCAAGATGTAAATTACCAGATCAGTATGGTGATAACTGTGAAATATGTGGTGCTACTTATCATCCCACTGATCTCATTGATCCAAAGTCAACGTTATCTGGTGTAACACCAGTAATTTCAAAGTCAAAGCATCTATTTTTTGATTTACCGGTTTTCAGTGAAGTACTACGGGCATGGACCCGTTCTGGTGCACTACAAGAGCAAGTTGCTAATAAAATGCAGGAATGGTTCGATATGGGATTACAACAATGGGATATTTCCCGAGATGCACCCTATTTTGGTTTTGAAGTCCCAGATACACCTGGTAAATATTTTTATGTTTGGTTAGATGCACCTATCGGCTATATAGGTGCATTTAAAAATCTATGTAACAAACGTAATGATATTATTTTCGATGAATTTTGGCACCTGAGTTCTAAGGCCGACCTATATCATTTTATAGGTAAAGACATTACATATTTTCACGGTATTTTCTGGCCTGCTATACTAGAAGGTAGTAAGTTACGTAAACCAACTAATTTATTCGTTCATGGTTATGTCACAATAAATGGGGCCAAAATGTCTAAATCACGGGGTACGTTGATTAAAGCTAGTACTTATCTTGCTCATTTAGACGCTAGCTATCTACGTTATTACTATGCAACAAAACTTTCATCAGATATTAATGATATCGATCTTAATTTCAATGATTTCGTTAACAGAGTAAATGCAGATATTATCAATAAAGTTATTAACTTAGCAGCACGGAATGCTAGTTTCATACAAAAATATTTTGATAATAAGCTGTCTGCTACCATTGAAGATCAGTATTTATATGATTACTTTGTTACAGCCTCAGTATCTATTGGTGAAGCATTTAATAATCGCGAAACTAGCCGTGCTATTCGTGAAATTATGATACTCGCAGATCGAGCTAATGTTTATATTCATAAAAAAGAACCATGGGTAGTAGCTAAAAATAAGTACTATCAGCAAGATTTACATAATATTTGCTCGATGGGTATTAATTTATTCCGCTTATTAATGACTTATCTACAACCAGTATTACCAAATTTAGCTATACAAGCAGAAGCATTTTTAAATACTAAGCTTAATTGGGATTCAATGGTTATACCATTAACAAATCATAAAATTTCTCCATTTAAAACCTTACTTCAGCGTATTACACTTAGTCAAGTAAAAGCTATGATAGATGCTACACATTAATATCAATATATACTCTATTTTAGAGTTACGTTAGCCATTCAGTATGGAAAATACCCTCTTTATCGATACGCTTATAGGTATGTGCTCCAAAGTAATCACGCTGTGCTTGAATTAAATTAGCTGGCAACATCAGCGAACGGTAACTATCGTAGTAGGTAATAGCTGCAGATAAAGTTGGTACTGGAATACCATTATGAATAGCATGAGTCACAACTTCACGTAAAGCCTGATGATAATCATTAGCCTTTGCTTTGAAATAAGGTGATAATAAAAGATTAGTAATAAAAGTATTTTGGGTGTAAGCATCAGTTATGTTCTGTAAGAACTGGGCACGAATAATACATCCAGAACGGAATATTTTAGCAATATCGCCATAATTTAGATTCCAGTTAAATTTAGCTGATGCAGCTTTGAGCTGCGAAAAACCTTGAGCATAAGAAATGATTTTACCTAAATATAGTGCTCGACGCATATTTTCAATAAATGCTGGTTTATCAATACTGAAGTATTTTGTTGTTGGGCCTTTGAGTACTTTACTAGCACAAATTCTCTGCTGTTTTAACGATGATAAATACCGGGCAAAAACCGCAGTAGTAATTAAGTTTAGTGGTTCTCCTAGATCTAGTGCACTTTGGCTAGTCCATTTACCTGTCTCTTTATGAGTAGCTTCATCGGCGATAACATCGATCAAATATTTACCTGTGATATCTTTCTGAGTAAAGATCTTATGGGTAATATCCATAAGATAGCTACTTAACTCACCTTGATTCCACTCGTAAAAAATATTTGCTAATTCATCATTATTCATACCAAGTATTATTTTTAATAAAGCATAAGTTTCTGCAATAAGTTGCATATCGCCATATTCAATACCGTTATGAACCATTTTTACATAGTGTCCGGAACCATCAGGACCAATATAAGCAACACATGCTTCACCATTAGCACGAGCAGCAATTGTTTCGAAAATAGGTGATATAAAATTATAAGCTTCTTTCTGACCACCAGGCATAATTGAAGGTCCTTTCAGTGCACCTTCTTCGCCACCAGAAATACCTGTGCCTATGAAATAAAAACCATCTTTTGATAGCTCTTGGTTTCTACGTATAGTATCATGATAAAAAGAATTACCACCGTCAATCAGAATATCTCCTTTATCGATAAAGGATTTTAGTGCATTAATTGTTTGATCTGTTGCTTCTCCTGCTTTTACCATTAACAAAATACGACGTGGTTTTTCTAGTGAATTAATAAATTCTCTGAGTGAAAAATAAGGAAAAAGATTAATCCCAGGATTTTCTGCCATGACATGTTCAGTTTTTTCTCGTGAACGATTAAAAATCGATACCCGAAAGCCATTTTTTGCCATATTAAGTGCTAAATTACGCCCCATTACCGCCATACCAACTACACCAATCTGTTGTCTTAGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_007984|403875:411689|407839_408421_-|WP_011520571.1|DBSCAN-SWA MILCDSDIELWMDEEKLDIIPRPPIERINGASVDILLGDKFRVFRGHTTAFVDLSGPKKNVTDAINLIMSNEIQLTEDDTFFLHPGELALAVTMESITLPNNLIGWLDGRSSLARLGLMVHITAQRIDPGWQGKIVLEIYNAGKLPLGLRPGMLIAALSFELLSGPASRPYHKRESAKYCYQQGAVASRIDQD >NC_007984|403875:411689|405525_407004_+|WP_011520569.1|DBSCAN-SWA MLEQKIDQHTNVLRRELKTRHLTMITIGGSIGTGLFVASGASISQAGPGGALLLYIVIGLMVYFLMTSLGELTAYMPVSGSFVTYGNLYVEEGFGFALGWNYWYNWAVTIAVDLVAAQIAMSYWFPTTPGWVWSILFISIIFLLNVISVKGFGEAEYCFSLIKVATVFMFIVVGILMILGVLYGGAPTYWYNWQVGDAPFVGGFTAIINVAMIVGFSFQGTEIIGIAIGESVNPSANIPRTMRQVFWRILFFYVLSIFIIGFLIPYDSAALLQEDINKITISPFTLVFRNAGQFSVATIMNIVILTAVLSAGNSGMYASTRMLYTLAREGQAPNIFARLSKRGIPCNALYMTTIMAALCFLSAIYSNQKVYLWLLNISGTTGFIAWLGIAISHYRFRRGLKKQGYSLNSLPYRAGLFPFGPIFAFSLCIVIILGQNYQNFLAESLNWNSIITTYIGIILFLLIWFSYKWYHGSSLVRYDQMIFKKNLTKNTY >NC_007984|403875:411689|408613_410257_+|WP_011520572.1|tRNA|DBSCAN-SWA MIQVASKILVTCALPYANGSLHLGHMLEHIQADIWVRYQRIRGKQVYFICADDAHGTPIMLKAKQSGITPEAMINKINQEHQTDLAQFEISYDNYYSTHSDENRELVISIYNTLKENGLIKKRMISQLYDPIHNIFLPDRFVKGYCPRCKLPDQYGDNCEICGATYHPTDLIDPKSTLSGVTPVISKSKHLFFDLPVFSEVLRAWTRSGALQEQVANKMQEWFDMGLQQWDISRDAPYFGFEVPDTPGKYFYVWLDAPIGYIGAFKNLCNKRNDIIFDEFWHLSSKADLYHFIGKDITYFHGIFWPAILEGSKLRKPTNLFVHGYVTINGAKMSKSRGTLIKASTYLAHLDASYLRYYYATKLSSDINDIDLNFNDFVNRVNADIINKVINLAARNASFIQKYFDNKLSATIEDQYLYDYFVTASVSIGEAFNNRETSRAIREIMILADRANVYIHKKEPWVVAKNKYYQQDLHNICSMGINLFRLLMTYLQPVLPNLAIQAEAFLNTKLNWDSMVIPLTNHKISPFKTLLQRITLSQVKAMIDATH >NC_007984|403875:411689|404494_405373_-|WP_011520568.1|DBSCAN-SWA MSAKKWIGAHVSINGGIDKAVIRAHALHANAFALFTKNQLQWKASTLTINLIKNFRVACNKYNYTTAQILPHNSYLINLSHPIKDKLKQSRIAFIEELHRCEKLGLSLLNFHPGSHLQQIDEDNSITRIADSINIALEKTTGVTAVVENTAGQGSNMGFRFEQLAEIIRQVDDKSRIGVCIDTCHAFAAGYDLRTEQSCIATFKQFADTIGFKYLRGLHLNDTKTSCGSRIDRHQSLGQGKIGYTAFNWIMADNRFNNIPIILETINPTIWSQEIIWLKRMATASTTTNMVF >NC_007984|403875:411689|410282_411689_-|WP_011520573.1|DBSCAN-SWA MLRQQIGVVGMAVMGRNLALNMAKNGFRVSIFNRSREKTEHVMAENPGINLFPYFSLREFINSLEKPRRILLMVKAGEATDQTINALKSFIDKGDILIDGGNSFYHDTIRRNQELSKDGFYFIGTGISGGEEGALKGPSIMPGGQKEAYNFISPIFETIAARANGEACVAYIGPDGSGHYVKMVHNGIEYGDMQLIAETYALLKIILGMNNDELANIFYEWNQGELSSYLMDITHKIFTQKDITGKYLIDVIADEATHKETGKWTSQSALDLGEPLNLITTAVFARYLSSLKQQRICASKVLKGPTTKYFSIDKPAFIENMRRALYLGKIISYAQGFSQLKAASAKFNWNLNYGDIAKIFRSGCIIRAQFLQNITDAYTQNTFITNLLLSPYFKAKANDYHQALREVVTHAIHNGIPVPTLSAAITYYDSYRSLMLPANLIQAQRDYFGAHTYKRIDKEGIFHTEWLT >NC_007984|403875:411689|407147_407810_+|WP_011520570.1|DBSCAN-SWA MVILTKEASMVRQALLANGLEPFLRGEERLGIEARKRRIAAHMKKIMTLLNLDLADDSLAKTPYRIAYMYIEEIFPGLDYANFPQITLISNKMKADEMVTVRNITLTSTCEHHFLMIDGKATVSYIPKSNVIGLSKINRIVRFFAQRPQVQERLTQQILLALQTILGTNNVAVSIYAVHYCVKARGICDSTSTTTTTSLGGIFKSSQNTRQEFLRTINQT >NC_007984|403875:411689|403875_404451_-|WP_081425153.1|DBSCAN-SWA MLKYQFVHKHILILIFFLSTCSNQHHYPCYYQVTNNRQLLTTNSQKLLVVEEILKFLEIKSQILNQYINWKGVTFKLGGLDKSGIDCSAFVQNTFREQFGINLPRTTQYQKAIGVTVQRNNLLPGDLVLFYNHATGRHIGMYISYDIFLHASSSSGIIISNLNDNYWNHSYYEGRRILTICSLHELLNNLK |
7 | Hokovirus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|