Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_008506 | Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_008507 | Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_008504 | Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_008527 | Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11, complete sequence | 1 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,RT,DinG | 0 | 0 | 16 | 0 |
NC_008503 | Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_008505 | Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_008527_1 | 2176974-2177069 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_008527_1
|
1 spacers
spacers of NC_008527_1
>1.1|2176998|48|NC_008527|CRISPRCasFinder CCCAATTCTTTTAAAATAAACATTTACGCAAGTTATACTTAGTAATAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_008527_1
The CRISPR arrays of NC_008527_1 >merge|NC_008527|1|2176974-2177069|CRISPRCasFinder TTTGCCAGAATCTTCCTCAATCTTCCCAATTCTTTTAAAATAAACATTTACGCAAGTTATACTTAGTAATATTCTTCCTCAATTTTCCCAATTCTT >NC_008527|1|1|2176974-2177069|CRISPRCasFinder TTTGCCAGAATCTTCCTCAATCTT CCCAATTCTTTTAAAATAAACATTTACGCAAGTTATACTTAGTAATAT TCTTCCTCAATTTTCCCAATTCTT
>NC_008527.1|WP_011677113.1|2173799_2176904_-|SNF2-helicase-associated-domain-containing-protein MSRMMPARVRSEGIALYAKGFLNDPIETDFKLTAEIDGEEVSYDLDGAQDSCTCSIFQQNHRYCKHIAAIEEYLKNQDKGSLETKDKETKGAERGLYNENIAFLDAVNGETQLNFSTDQYSIEVQIEDNSQLYDYFSMDYFLYFDLKLKSKNLGRSYVIKDIPYFLRALKNYSQYSLGSLHYIDLFFDNFDEASQEFLSFLLKIDGKSDEALTKSLYIKNGRYLNIPFLFLEEAMDLVSALEVYQLKIIGRTVNYFTFIPLDNDSEIFKFKVESQQDYIELSLFSEDYHNFYDYSLLYDNNVFYKLSQEQRRLLLVLDKQFAQKSKIKFSYSEKDKLAQALQQLSTLGKIEAPEHFVVKPFDAKFTFDLLDEKTLSLAMKFDYGTFSIDSFHDLETLEFSRDLRKEQKIFALMERLQFAKAFNSTLEITEHLSENFFLKILPSFQKLGQIELSPTLRNMRMDEVPEIHIDSQGGLLDISFNIPHVEDGEFANVIAKLQENAEFYISESGKFYHFNEKFDRLKAALHELDDQFVIQGSSLHVNINRSFQISKIFEKISGASFSEKFKSLYQHLTHPEEFPYEKPEHIKASLRSYQETGVRWMSMLSHYNLGGILADDMGLGKTVQAITFILSNLKKDESVLITAPASLTYNWASEFEKFTDEIDFVVIDGNKADRTKEIQENHQIYITSYGSFLKDFEDYQDKKLNYLLLDEAQVVKNYSSKTNKSLSALNVEHTFALSGTPLENRIEEIWAIFQVVMPGFLPKREKFNKMEPSVISRLIQPFIMRRKKEDVLEELPEKMEITVYNQLADDQKVIYLAQLELMQKQVLEMDNAALSRSRIEILAGITRLRQICNTPALFMDDYKGSSGKLERLRELLAQIKDSGHRPLIFSQFTKVFPHIEKLMEEQEMTAYKLTGSTPIKDRLSMVQAFNAGSRDAFLVSLKAGGVGLNLTSADVVILVDLWWNPAVEEQAIARAHRMGQKNTVEVIRLITQGTIEEKIMEIQERKKDLIANVLEGDTVDKVLSEAEIREILGV >NC_008527.1|WP_011677112.1|2173036_2173636_-|hypothetical-protein MVERRVVFPVIGDDEVLQKDTRVIFTNQQLLTRNPSLQDEASIETSKSKTDAKRPESFKPYKAKTSFSTQHRPLNSNHAGVSSYDKMPKKTSVDESKERAKRAAATLPKPPKQYVSPLERDKEDLTVRRSTSAILNKRPSTNDNPIRDMKKQGMNVSDAVAKNGSGMKKATPHGGAANDTQKGSYFENKRKNIFDRGIV >NC_008527.1|WP_011677111.1|2171504_2172836_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MEKTYHFTGIKGSGMSALALMLHQMGKNVQGSDSTDYFFTQRGLEQVGVPLLPFDEKNIKPEFELIIGNAFRDDNNVEIAFAHKNGFPFKRYHEFLGHFMEDFTSIGVAGAHGKTSTTGMLAHVMSNIVDTSYLIGDGTGRGNAGSEYFVFESDEYERHFMPYHPEYTIMTNIDFDHPDYFEGIEDVTSAFQDYANNIKKGIFAYGEDVNLRKLSAKAPIYYYGFEANDDYRAENLIRNTRGSSFDAYFRGEKIGHFVVPAYGKHNVLNALSVVAVCHNLGLDMTDVADHLLTFRGVKRRFTEKKVGETVIIDDFAHHPTEIEATLDAARQKYPDREIVAVFQPHTFTRTIAFADEFAEVLDHADTVYLAQIYGSAREVDHHEITAQDLADKVRKPAKVIELDNVSPLLDHDRGVYVFMGAGNIQKYEIAFEKLLSQTSTNLQ >NC_008527.1|WP_004254487.1|2170886_2171345_+|arginine-repressor MKRDKRLEIIKEIVTNNKISTQEELQSLLLERGVEVTQATLSRDIRKLNIIKKRDKGESFYSFLTSGNSKINSDLQLYFYNFVISAKSVGALVVIRTKLGEADVLANALDDERDSRTDILGTIAGADTLLVICASEKAANILTAEIKYILLG >NC_008527.1|WP_011677109.1|2169124_2170819_-|arginine--tRNA-ligase MDEKQLVSQALSAAIDGVLGVEQIAAIIEKPKSSDLGDLAFPAFQLAKTLRKSPQIIAGEIAEKIDTKGFEKVIAVGPYVNFFLDKNATASEVIREVLTEGEHYGDANIGEGGNVPIDMSAPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSIAKIYEKLGYQPIKINHLGDWGKQFGLLITAYKKYGDEATITANPIDELLKLYVKINAEAKEDPEVDEEGRQWFLKMEQGDEEALRIWKWFSDVSLIEFNRIYGKLGVTFDHFMGESFYSDKMDAIVEDLENKNLLHESKGALIVDLEKYNLNPALIKKTDGATLYITRDLATAAYRKKTFNFVKSLYVVGGEQTNHFKQLKAVLKEAGYDWSDDMVHVPFGMVTQGGKKFSTRKGHVVKLEMALDEAVDRAEKQIEAKNPNLENKEEVAKQVGVGAVKFYDLKTDRNNGYDFDLDEMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKANRKVNIDNISLVVSDAEAWEIVKALKEFPNIVKRAADNYEPSIIAKYAISLAQAFNKYYAHVRILEDDAQLDGRLALISATSIVLKEALRLLGVAAPENM >NC_008527.1|WP_011677108.1|2166362_2167427_-|ornithine-carbamoyltransferase MTSPLITKAEVNSVFQGRSLLAEKDFTPAEINYLVDFGLHLKALKQQNIPHHYLEGKNIALLFAKTSTRTRAAFTTAAIDLGAHPEYLGANDIQLGIKESTEDTARVLGSMFDAIERRGFSQKEVEDLAKYSGVPVWNGLTDDWHPTQMIADFMTVKENFGYLKGLTLVYVGDGRNNMANSLIVTGSMLGVNVHIVAPDSLHPSKEVMDIANKFAEKSGAKPLATSNIEEGVKGANIIYSDVWVSMGESNWEERVKLLTPYRITMDMLKMTGNADNGKLIFMHCLPAFHDTETEYGKEIKEKYGLTEMEVTDEVFRSKYARQFEEAENRMHSIKAIMAATLGNLFIPAVPEDFK >NC_008527.1|WP_011677107.1|2164651_2166232_-|amino-acid-permease MDAENKKGIGLAALVAIIVSGAIGGGVFNLSNDLATNASPGGVVISWIVIGFGILMLVLSLNHLVVNKPELSGVSDYARAGFGNMVGFISGWGYWLSAWAGNIAFAVLMMTAVDYCFPGVFQAKNGSLTILSVIVVSIVSWGLTLLVMRGVEGAAAINAIVLVAKLIPLFVFVIAGIVTFKAGVFSAHFWQNFVANTNADGVIKSLTWSNMTGGDLFSQVKGSLMVMIWVFVGIEGAAMMGDRAKRKSDAGKASIIGLIALLVIYILLSLLPFGFMSQQELANTGQPGLVHILNAMVGGWGGSLMAIGLVISLLGAWLSWTMLPVEATQQLSEQKLLPSWFGKLNDKGAPKNSLLLTQLIVQIFLIVTYFVADAYNVFVYLCTAVIMICYALVGLYLFKLGIQEKKTSNIIIGFIAAAFQILALYYSGWQFVWLSLILYAVGFILYALGKKEYGTKMSTAELIATFILTVLGILAVFGVYGNWLGLQDALGIDGNTLLVAVVPLIVVTFIVYFVVRSDINKKGIKN >NC_008527.1|WP_011677106.1|2163689_2164634_-|carbamate-kinase MVSRIVVALGGNAILTKDPSAAAQKKALEVTAEQLMPLIKDNDRQMVVTHGNGPQVGNLLLQQLGSDSEKNPAMPLDTVGAMTQGEIGFWTVQAFTRAMANNGLERYPVISAVTQTLVDENDPAFKNASKPIGPFYTEEQLPEIKKQFPDWELMEDAGRGYRRVVPSPKPLEIIEAKAFGPILESGSLLIASGGGGIPVIKDGNGYKGVEAVIDKDFSAAKLAEMVGADELLILTSGGDVYLNYGKEDQVHLETVKVSEMRKYVDEERFAKGSMGPKVEAAVSFVERTGKVATITSLDNVENFVKSGSGTRIVP >NC_008527.1|WP_011677105.1|2162712_2163657_-|carbamate-kinase MVRRMVVALGGNAILTDDPTAKAQERALETTAEQLIPLIRNNDVEMVVTHGNGPQVGNLLLQQLAADSPKNPAMPIDTAVAMTQGQIGFWMGQAFTRALIKNKMERVPVISVVTRTVVDKDDSAFEKPTKPIGPFYDEKGLAEMKAQYPDWTFVEDSGRGYRRVVPSPKPTRIVEAEEIKPLISSSVLVTVSGGGGIPVIETQEGYEGVEAVIDKDFSAAKVAELVEADNLLILTAVDNVFVNFNKPNQKKLETVTMAEMKAYIKEGQFAAGSMLPKVEAAMEFVTRTGRPATITSLENLEDFLNNDSGTKIIP >NC_008527.1|WP_011677104.1|2161318_2162449_-|aminotransferase MELVQFGCEDWLNVWEKSATIDIAQSTIDSLSLEEVLAFEEDKGEAFMSQMMKEKFSYGWIEGSPAFKSEVAKLYKRVSEDNILSTNGATGANFLTILGLIGQGDHVIAQYPSYQQLYDWPKTLGAQVDYWKIKEENHWLPQIEDLRRLVKPNTKLICLNNAAQPTGAIMSPDFLAEVVEIARSVDAYILCDEVYLPLDEETPYAPIADLYEKGISTNSISKTYSVPGIRVGWVATQDRDLCNEFRKIRDYTLICTGVFDDALASLVLKHKDKVLARARDIVKGNLSILKEWVENEPLVSMVYPNAVSISFVKFEQLDPMKTEDFAIQLLREKGVLIIPGNHFDLPGYARIGYCTDEKTLRQGLQLLSEFLREYKG >NC_008527.1|WP_152023941.1|2177241_2178254_+|IS3-family-transposase MQKRYSKEFKETLIAFYHSGQSVTQLSKEYDVAPATIYKWIDLYSKSNESSVSKADFLELKRQLAKVKEERDNLKKSIDHIRREKEVSAADMAQTIQPLALNVRLSCQLLDVPESSYYQRINRHPSKTQLRRQYLSLKISQLFNANRGIYGAPKIHHLLLKQGEKVGLKLVQTEPTKKNKVWSTDITYIPTQQGWAYLSTIMDRYTKKVIAWDLGKRMTVELVQRTLNKAIKSQDYPEAVILHSDQGSQYTSLEYEELLKYYGMTHSFSRRGYPYHNASLESWHGHLKREWVYQFKYKNFEEAYQSIFWYIEAFYNSKRIHQSLGYLTPNQFEKVSA >NC_008527.1|WP_011677116.1|2180723_2181680_-|serine-hydrolase MKNQQEFLAMIEDYLERDVFPGVNFAILEGEEVSEYLFGKAALIPEPIALTPGKKWDLASLTKVIGTGTAVIDLVLAGKLELDAPLQKYYAKFTDSTVSLRQLLTHTSGIDPYIPNRDKLGFFELTEAINQIRVTDDKSFKYTDINFILLGFLLEEYYDESLDYIFNKNIFKNWEMKQTSFGSVENAVPTSQNIPLGTVHDPKAQVLKNHCGSAGLFSTLSDMILFSQAYFREDKYLELLKNYADGAKERSLAWDLPAENNDWLLHTGYTGTFILINPRIKKAVVFLSNRVHLKDNREKWIEERDRLIKFLINHLSLD >NC_008527.1|WP_011677117.1|2181752_2182532_-|VOC-family-protein MSEIINHITAFQPVYRVLHREENLDFYRGVLGFKVLVEEGAMVWLGGHEAKKDRFQLEESPGFHPVEGLKKHGQTVIKANSSEIEQLIVRNLDKIAKIYQGKNGLAFTALSPEAGLFLVSSDSLTDLPALTEINKSEIKLNLDKNFKGLSDFEITAMNLNVADKSIIEFYESVFDLKAIDGKIEFPFVTLTLNVEESEDLTAGTDEVLDLEFLIFMIDKDFDLKAFANQFSEANGTYIDASAKTFSLEVPDHAELWFVK >NC_008527.1|WP_011677118.1|2182760_2182922_-|hypothetical-protein MKNKQLQKDLLNILYFFIILIVGALVMIGLVLLLVTACEYDLSLNKFPTAKNW >NC_008527.1|WP_011675534.1|2182981_2184157_-|IS256-like-element-IS905-family-transposase MTQFTTELLNFLAQKQDIDEFFRTSLETAMNDLLQAELSAFLGYEPYDKVGYNSGNSRNGSYSRQFETKYGTVQLSIPRDRNGNFSPALLPAYGRRDDHLEEMVIKLYQTGVTTREISDIIERMYGHHYSPATISNISKATQENVATFHERSLEANYSVLFLDGTYLPLRRGTVSKECIHIALGITPEGQKAVLGYEIAPNENNASWSTLLDKLQNQGIQQVSLVVTDGFKGLEQIISQAYPLAKQQRCLIHISRNLASNVKRADRAVILEQFKTIYRAENLEMAVQALENFIAEWKPKYRKVMESLENTDNLLTFYQFPYQIWHSIYSTNLIESLNKEIKRQTKKKVLFPNEEALERYLVTLFEDYNFKQSQRIHKGFGQCADTLESLFD >NC_008527.1|WP_011677119.1|2184314_2184644_-|DUF1801-domain-containing-protein MEFEEFFINNQLMKLIRETVLSIFPEAQERISYGMPAWFNGKTVLIYAQPQKHHLGIYPRPNFIEKHLEVLKQQYECSKGTIKVPYGIEHGELRKLVSDVINWNLTHFT >NC_008527.1|WP_011677120.1|2184678_2185185_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein MRRAKRQVTDIDLIKKFVDEVEVVRIAINGEKYPYVVPVNFGYSWNDEALSLYIHGASEGKKVSMIRENPLVAVEMDQPDKIIEGNKNASTYSYAYQSLIGFGEAKIIEDLEEKRNALHLLMAHAAKGKTFDPIPEKTLERVGVIKIIIDSYTVKQNIHPDKKREEHK >NC_008527.1|WP_011677121.1|2185553_2186336_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MNIEKLQFLAKYRWIIVLILALIFSGLSVSIFHLPFLMTALVLSVIGLIFAYHKSVWLVLFILSNLPMLVSTIFASQHHFSTLDTIIFFIIFIFTIISSYLIARKAELIPKLSWKYFPPLRIILGFVLLFLVSILTGIFAQIFNQSPTTTNQESLNELQKVIPIAVFATQTLAASFLEELVYRVGIFELIFKNQKYFAFLTTMLLFAFMHGPTDVYSWLTYGLMSLVLTGLYAKYRNFYLNMSVHFLWNLFGLVIALMVK >NC_008527.1|WP_011677122.1|2186371_2187241_-|aquaporin-family-protein MDVTWTVKYITEFVGTALLIIMGNGAVANVELKGTKAHAQSWMIIGWGYGLGVMLPAVAFGNITSQINPAFTLGLAASGLFPWAHVAQYIIAQVLGAMFGQLLIVMVYRPYYLKTQNPNAILGTFSTIDNVDDNSEKTRLGATINGFLNEFLGSFVLFFGAVAATNIFFGSQSITWMTNYLKGQGADVSSSDVMNQIWVQASGASASKMIAHLFLGFLVMGLVVALGGPTGPGLNPARDFGPRLVHSLLPKSVLGEAKGSSKWWYAWVPVLAPILASLAAVALFKMIYL >NC_008527.1|WP_011677123.1|2187412_2189704_+|Xaa-Pro-dipeptidyl-peptidase MRFNHFSIVDKNFDEQLAELDQLGFRWSVFWDEKKILKDFLIQSPSDMTDLQATAELDVIEFLKSSIELDWEIFWNIALQLLDFVPNFDFEIGKAFEYAKNSNLPQIEAEMTTENIISAFYYLLCTRRKNGMILVEHWVSEGLLPLDNHYHFFNDKSLATFDSSLLEREVLWVESPVDSEQRGENDLIKIQIIRPKSTEKLPVVMTASPYHLGINDKANDLALHDMNVELEEKASHEIHVEQKLPQKLSAKAKELPIVDKAPYRFTHGWTYSLNDYFLTRGFASIYVAGVGTRSSDGFQTSGDYQQIYSMTAVIDWLNGRARAYTSRKKTHEIKASWANGKVAMTGKSYLGTMAYGAATTGVEGLEVILAEAGISSWYNYYRENGLVRSPGGFPGEDLDVLAALTYSRNLDGADFLKGNAEYEKRLAEMTAALDRKSGDYNQFWHDRNYLINTDKVKADVLIVHGLQDWNVTPEQAYNFWKALPEGHAKHAFLHRGAHIYMNSWQSIDFSETINAYFVAKLLDRDLNLNLPPVILQENSKDQVWTMMNDFGANTQIKLPLGKTAVSFAQFDNHYDDETFKKYSKDFNVFKKDLFENKANEAVIDLELPSMLTINGPVELELRLKLNDTKGFLSAQILDFGQKKRLEDKARVKDFKVLDRGRNFMLDDLVELPLVESPYQLITKGFTNLQNQNLLTVSDLKADEWFTIKFELQPTIYHLEKADKLRVILYSTDFEHTVRDNRKVTYEIDLSQSKLIIPIESVKN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
66496 : 123762
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_008527|66496:123762|DBSCAN-SWA 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54 | Bacillus_phage(33.33%) | bacteriocin,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
278488 : 288398
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_008527|278488:288398|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_008527|278488:288398|280610_280841_+|WP_011675322.1|DBSCAN-SWA MIANNFSILLLKNNFKAKSFSAYTGIAESTLSSLVNIAENGKDIKLSTLIKICNHLNCTLSELIEYFPEEQLINNK >NC_008527|278488:288398|282676_284374_+|WP_011675328.1|DBSCAN-SWA MTEVKTDYGDLEKQRKAWERLENNLKKVINLPWEKFGNIDGAKIPQSLDLVHILHRDIYEYPYLSVKSTGENKRIKRPSLHLNNGQNTVSIFYGGVNKKAEKTDDGEDKEVVTLKSSKSIPRFVNVILDYLFGKLALHHGYLYDISTSQFKRLSEMDIAHEYKLGKRSDFTASEVVEIISFIDEQIKLKPLKEIKASIIACHDFQMDLHQKKILKDCSIKDNECYFKVFDCQLSDVIEMSILNANYLGMVIDDVDSLHNAQLQPIYQMLVACREITKTRFFVSKSGTRTGKGLRHKVISSIFDTKHVNLDELSNKATAAMAWAGFDGGEMLLVTESGEIGKSLERYLKILATESTYRGRGIGQNYADINLTGVLSIDSNEKVLFSSEMNSRAVNIAFKNRPKGETDSERESIFAPYWEAFTEQRVSETSREATALAGVAALYSSFVYWRQNKFKFNFKQVEMDNFSSDHFDFDDVQIYIIEEHIKGNKTIIKTDEVQKLLKETYYGAGSPKRRKEALDIIGYFETTRKLPTFEGERRTFRVIAIGNPRRASKAVAAFLESMYEPP >NC_008527|278488:288398|281996_282251_+|WP_011675325.1|DBSCAN-SWA MQSSTFKIEDLEKARTFENKHFLILSVKMNSEIGHQVFLKSVKNKKTVIIFNQNKAPLCIKVSHEFAQSWKLKKQAEIKKRDKV >NC_008527|278488:288398|287264_288398_+|WP_041167514.1|DBSCAN-SWA MDDQIIIEEEIVRNENRIDDEKYGDNGLFQINSWGADLSFRELINMYAEDELQKPELQRYYVWDKREASRFIESILLGLPVPSIFLARTQEENYLIIDGYQRIMTVVDFVNGVFTKDGSSFKLSPTVNELWANKTFSQLSSEEQKRLRRTTIHSIIFEQKRPTNDDTSMYQIFERINTGGRTLFPQEIRNCVYHNEINTLLIELNVNPAWRTLFGQSEKDSRMRDMEFILRFLMFSNKKFSETTAISLKKELNLFMDITKNKDGKYRCEDYKKQFLETMELLVNTDKDAFRNINEEGSILSRFHPTIFDSIAVATKMAIENGVDILWKNDREAFLKAKRNLLKDFQFIEYTTTRTTNTASINGRIDLAYKYLFEEVQ >NC_008527|278488:288398|284735_284918_+|WP_003132807.1|DBSCAN-SWA MSFNFTKTVVFTVNEKMPFNIPYDEEEFEKFSHALLVDKNAEWLGGYLFNIKNIVSIKRV >NC_008527|278488:288398|286808_287039_+|WP_011675333.1|DBSCAN-SWA MQRKNLKNDTDYPLIMTRELAAEFIGVSGPTFDKYYRYAHNFPVVKNGDVEEAFPRDPIIKWVADNWQSLEKRRKK >NC_008527|278488:288398|281057_281726_+|WP_011675323.1|DBSCAN-SWA MTPLVLFDSLDLSKANNESFYTTTEIIAERSDNSYKVVSDLVRKYRFELEKIAPLNSFFKKLNVNNVGRSRKIYKLNEQQTLFFIPLLGNTPAVVQFKFDLAAAFVAMRNELQARKIERATEKVTTRSLTDAVHDWDNKSKHSYIHIRNLLVKVATGESHTYVKNRDPSNKTSMVDLLTSDEMEEYNYMKSLVIPMLSKSGEKAMDYHDIKEKLEFLTTKKP >NC_008527|278488:288398|285892_286255_+|WP_011675331.1|DBSCAN-SWA MTETIKDNSQQHTGNWVEDIRKGAEIERKEREETSRQRSKEAFDKMRDKANAERDEMNGLMKQVAERNYNDNKLKRDKEIKVAKQKAMQQIESEYESKYGVNTDKTERTKQALSNLLKGL >NC_008527|278488:288398|278488_279718_-|WP_080513938.1|integrase|DBSCAN-SWA MRTANAKRRVNMNKLNIKEYKTKSGEVRYILRGAYIGTDVLTGKQVRTDVRGRTKKDVKTKLQRLQNDFIKNGCMKKEKQLKTFAEVAESWFDMYQHTVKSHSIEIMRSNLNRYILPAFGNTKIDRLTTSQIQLQVNRWAKNAGQPLNGAMRRNKGNAKGYKLLLNVTNRIFKYAISMGLVSSNPCLTVIVPNVKMETTEREVKHFNKEQLQSYFDYMESLPNTWVNNELRAICRLLTASGLRIGEATALSWSDIDFEKQTISVSKTTTGHQTIQDTPKTKHSKRVVIIDSKTISHLQRWHLYQKSYFLKLGQPNQSLIFPTNQGKILDYQRLRKSLQATFKATELHDIGFHGFRHSHASLLLNAGVSYKEIQTRLGHASIKMTMDIYSHLEKEKESEAVELFAKYANF >NC_008527|278488:288398|286436_286607_+|WP_011675332.1|DBSCAN-SWA MSVIRCKTCKNLFNTTKQERYCSEECRKEARKKVRKKWETKNPEYMKNYMRGYREK >NC_008527|278488:288398|284936_285143_+|WP_011675329.1|DBSCAN-SWA MSDKVIMVYTVNDASAFVFNQTLDNMKVIGKWQDDPDQLFKLGTTVFNGSHVVAIKVAKRGPLGTVPE >NC_008527|278488:288398|282396_282666_+|WP_011675327.1|DBSCAN-SWA MSILSFEAEQELTQSVLSHVDKLVEARIEQSRLFPYVQQAELLKELNISTTYLAKLRAHGLKQVILEDGDRTVWYKKSQLESLMDSLAE >NC_008527|278488:288398|281824_281995_+|WP_011675324.1|DBSCAN-SWA MTEFISIDEAKLLFTECLARARHHIEVDDVTDKLFDGKSVATFTFMGNGYQVELEA >NC_008527|278488:288398|279777_280455_-|WP_011675321.1|DBSCAN-SWA MIINRLSVLLAERNVRANRLAVETGIAPSTLTRINNNRSSQIDYETLNSICNFFKITPNDFFDYSPFDFEVVLSTKEEIKASDELTIFIQVQKFNSYIGTFEFTGKYKNSEDYVPTEFASDGTPENFMEVEILEVVFPDELTSFVKFINNQPLLEDASLSLKMNTEIYKKVEEALKEFTKDYYNDEFNDFLTNYVSILEPNQVDKEIKSKVSEIESRLRTNIMPF >NC_008527|278488:288398|285304_285877_+|WP_011675330.1|DBSCAN-SWA MKTFEEIESELINQKDGNLLEIDKFKNNKEKAERALKIANEELIKAEETADLVAYDKAKGDIWTSQHAIELYQKQLDKLESTPLVTKDDYNQLVSDIEKAADKLQDELNIKGAKLMAELKALADESNAVYHKADELLRIAQYDVYKDADCLVASNGTRITRAVEYKRNNSVRNVYNFKYLGNTFLDDMNA |
15 | Lactococcus_phage(90.91%) | integrase | attL 278368:278391|attR 289552:289575 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
408919 : 421076
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_008527|408919:421076|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_008527|408919:421076|410130_411471_+|WP_011675462.1|DBSCAN-SWA MKIVVIGTNHAGIATANTLLEQYPGHEIVMIDRNSNMSYLGCGTAIWVGRQIEKPDELFYAKAEDFEAKGVKILTETEVSEIDFANMKVYAKTKSDDEIIEAYDKLVLATGSRPIIPNLPGKDLKGIHFLKLFQEGQAIDAEFTKEKVKRIAVIGAGYIGTEIAEAAKRRGKEVLLFDDENTSLASYYDEEFAKGMDENLAQHGIELHFGELAKEFKANEEGYVSQIVTNKATYDVDLVINCIGFTANSALASDKLATFKNGAIKVDKHQQSSDPDVYAVGDVATIYSNALQDFTYIALASSAVRSGIVAGHNIGGKELESVGVQGSNGISIFGYNMTSTGLSVKAAKKLGLEVSFSDFEDKQKAWFLHENNDIVKIRIVYETNSRRIIGAQLASKSEIIAGNINMFSLAIQEKKTIDELALLDLFFLPHFNSPYNYMTVAALNAK >NC_008527|408919:421076|411561_411951_+|WP_011675463.1|DBSCAN-SWA MNKTMLIGHLTNAPEISKTTNNKSYVRVTLAVNRRFKNEKGEREADFISIILWGKSAETLVSYAKKGSLISVEGEIRTRNYTDKNEQKHCITEILGLSYDLLESRATLALRESAVNFEELLLEADELPF >NC_008527|408919:421076|408919_409237_+|WP_011675460.1|DBSCAN-SWA MIIPENIENLAELVKGPEKTVFFFTAGWCGDCNFIKPKMPEIETENPEFRFVEVDRDEYMDLAIEWGIMGIPSFVVIEDGQEKARLVNKLRKTKEEVNTFLASAK >NC_008527|408919:421076|419099_419882_+|WP_011675471.1|DBSCAN-SWA MIYEIKFTHGESNIFATSEAELVPQSEVIIRSEKGTFYGKIIRSFSDDANLETHHTIEREVTDEDLEVILKLEELSKKAKDKVRQLVVEQELEMKIIDVAYTFDQMQLFISFTAENRVDFRLLLRELATTFRIRIELRQIGPRDAAKIHGGLGPCGRPLCCSEFVYEFPNVSIKMAKNQNLSLKQNKLNGLCGRLMCCLTYEDSFYKEAQQLFPDFGEFVTTSEGKGKVVGLNVLKNRVKIRFGEYSKDFELAEIEVNHG >NC_008527|408919:421076|409342_409969_+|WP_011675461.1|tRNA|DBSCAN-SWA MIATYNTNVGDVLMLITANDRGEKVNFERKGKVARIFIEETGATVAWNIFEAKSLLTDLSGNGQVKLSSDDVEILNKELGKSGFSDVLVHDSQPKFVVAEIVEMQDHPDSDHLHICKVNVGFADPVQIVCGAPNASLGLKTVAALPGAMMPNGALIFPGALRGVQSYGMLCSARELELPDAPDVRGIIELSSALAAGTAFDSETMWQA >NC_008527|408919:421076|416542_417244_-|WP_003131580.1|DBSCAN-SWA MKKILVVDDEKPISDIVKFNLTKEGFEVFTAFDGEEALEAFKEVQPDLILLDLMLPKLDGLDVAREIRKTSDTPIIMVSAKDSEFDKVIGLELGADDYVTKPFSNRELLARIKANLRRINVAPAESTDNVKKELIIGNLRINPAHYAAYKNDKQLDLTHREFELLYYLAQHLGEVITRENLLETVWGYDYFGDVRTVDVTVRRLREKVEDTPSRPQYVSTRRGVGYYMSNPHD >NC_008527|408919:421076|420200_421076_+|WP_011675473.1|DBSCAN-SWA MENKFNIQRSFKGVKTAGSLYLVPTPIGNMQDMTLRSLETLKTVDLICSEDTRNTLRLLNHFEIKVPQESFHEHNSQEKIPKLIDFLKSGQSIAQVSDAGMPSISDPGHDLVLAAIKEEIDVVALPGASAGITALIASGLVPQPHIFYGFLPRKKGEQQKFLKTKLAYPETQIFYESPFRVADTLSNMQEIYGDREVVLVRELTKIYEEYRRGKISEVLNSLVEQPIKGECLIIVSGADELVQEIQEPELTALEAVKNLVAQNVKPNVAIKEISKERGLNRQDLYAEFHDL >NC_008527|408919:421076|412069_412354_+|WP_011675464.1|DBSCAN-SWA MLKPLENRVVLRVKEEEEKSMGGIVLTSASQEKPQTAEVIAVGEGKTTNHGTLISPLVKVGDTVIFEKFSGTTVKMDGEEFLILKDSDLLAIVE >NC_008527|408919:421076|417421_418057_+|WP_011675469.1|DBSCAN-SWA MNGILISLEGPDGAGKTTVLQEILPEIQKMKREVVPTREPGGVRVAEEIRQIILDPKNTEIDSKTELMLFEAARRLHMQEKMLPALRAGKVVIVDRFIDSSVAYQGYGRDLGVEVVDWLNYFATDGLKPDLTLYFDIDTDVALERIMKNRADEVNRLDLERAEMHRKVREGYLEIVAKEPERFVKIDASQSLEKVVADTLEVLKKRFVSEF >NC_008527|408919:421076|415122_416478_-|WP_031286625.1|DBSCAN-SWA MSNFDYNLIHLSTFIGYYLFSLVFVLVFLNQQHRMIVNVSKQMNDIKNGYLNRDKIPKGTSEINELYEEILKLGEDIVRTQNNLENQRNQLDSILAYMVDGVIATDRRGNIIMANKSALHYLNTSNELLMEKNIVDVLKIADQYNFYDLLEKEPEITIETHDAGNKSISLHIKFALFRRESGFISGIIAVLHDMTEQDKAERERRLFVSNVSHELRTPLTSVKAYLEALEDGAIDDKETASSFIGVSLTETNRMIRMISDLLTLSRMDQDRIVLNKEIINLIAFLDYQINRLDQILETESNDLISSNFTLVRKYSDKPIWVEIDTDKIAQVIDNIIGNAIKYSPKGGTITISIETRERDVLISIKDEGMGIPKSDLLKIFDRFYRVDNASRNSKVGGTGLGLSIVHDIVKIHGGTIFASSEGEGKGTTFSFTLPYSSETAEYWDDAADDFE >NC_008527|408919:421076|414120_414933_-|WP_011675466.1|DBSCAN-SWA MTEQNGFKYSILASGSTGNSFYLETPKKKILVDAGLSGKKIESLLSEIDRDIHDIDALLITHEHSDHIKGIGVLARKYGINLYANEDTWSELDGKNALGKIPLEQKHLFEMGKTMTFGDIDIESFGVSHDAIAPQFYRFMKDDKSFVMLTDTGYVSDRMRGTIENADAYLMESNHDIEILRMGAYPWRTKQRILSDQGHLSNEDGAEAAFNIHGNKTKKIFLGHLSLNNNIKELAHLTMDGYLQQHDVDTKNELKILDTSHEHASPLYDI >NC_008527|408919:421076|419874_420201_+|WP_011675472.1|DBSCAN-SWA MADKYDVFDQLGELENTLNTTLTQISGIRQVLEASMTENATLRMELEKLRDRLAEFEKKEVKKETPKDQPNPNLIQIFNEGFHVCHLHYAERLAEGESCLDCLELLYR >NC_008527|408919:421076|418189_419050_+|WP_011675470.1|DBSCAN-SWA MEIVDIQPQLYKQFSTILQHGKLSHAYLFSGGFGSFELAIWLSQALFCENPENSLPCGHCRSCRLVAQQEFADLHIVEPDGQTIKTAQIRDLTQVFSESGYEGKQQVLLFREAEKMHPNAANALLKSIEEPETEIVVFLLTDNENMILQTIKSRTQIINFRKNVQFLQDFLEKNGILKTQAELLAEICNSTDRALELAQQSWFNEGLQRIQHFVKLLKKSADEAFLYLKDLVEIFDDKEKQNQAFELLLQLFNQERMSQELLKTFQAIKMWKSNVRFESSLTFIVL >NC_008527|408919:421076|412440_414069_+|WP_011675465.1|DBSCAN-SWA MSKEIKFSSDARTAMMRGIDILADTVKTTLGPKGRNVVLEKSYGSPLITNDGVTIAKEIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVREGLKNVTAGANPVGIRRGIELAAETAVASIKEMAIPVHDKSAIAQVATVSSRSEKVGEYISDAMERVGSDGVITIEESKGMQTELDVVEGMQFDRGYLSQYMVSNTEKMVAELDNPYILITDKKISNIQEILPLLEQILKTNRPLLIVADDVDGEALPTLVLNKIKGVFNVVAVKAPGFGDRRKAQLEDLAILTGGTVITEELGLDLKDATLEALGQAAKATVDKDHTTIVEGAGSVDAISDRVAIIKAQIEKTTSDFDREKLQERLAKLAGGVAVVKVGAATETELKAMKLLIEDALNATRAAVEEGIVSGGGTALVNAIAALDKLSEEGDIQTGINIVRRALEEPVRQIAANAGYEGSVIIDKLRSEKVGTGFNAATGQWVNMIEEGIVDPAKVTRSALQNAASVAGLILTTEAVVANKPEPAAPAMPPMDPSMGMGGMM |
14 | uncultured_virus(30.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
552374 : 680994
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_008527|552374:680994|DBSCAN-SWA 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114 | Bacillus_phage(27.27%) | bacteriocin,tRNA,transposase,protease,integrase | attL 553487:553544|attR 621008:621065 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
864025 : 905079
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_008527|864025:905079|DBSCAN-SWA 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41 | Streptococcus_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 886090:886106|attR 911525:911541 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
929536 : 995917
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_008527|929536:995917|DBSCAN-SWA TATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAGATATTGATGAATTTTTCCGTACTTCTCTTGAAACTGCTATGAATGATCTGCTTCAAGCAGAGTTATCAGCCTTTTTAGGGTATGAACCTTACGATAAAGTAGGCTATAATTCTGGGAATAGTCGTAACGGAAGCTATTCACGGCAATTTGAAACCAAATATGGGACTGTTCAGTTGAGCATTCCTAGAGATCGTAATGGGAACTTTAGTCCAGCTTTGCTTCCCGCTTATGGACGTCGAGATGACCACTTGGAAGAGATGGTTATCAAACTCTATCAAACCGGTGTAACGACTCGAGAAATTAGTGATATCATCGAGCGAATGTATGGTCATCACTATAGTCCTGCCACAATTTCTAATATCTCAAAAGCAACTCAGGAGAATGTCGCTACTTTTCATGAGCGAAGCTTAGAAGCCAATTACTCTGTTTTATTTCTTGACGGAACCTATCTTCCATTAAGACGTGGAACCGTTAGTAAAGAATGTATTCATATCGCACTTGGCATTACACCAGAAGGACAGAAGGCTGTTCTTGGATATGAAATCGCCCCAAATGAAAACAATGCTTCTTGGTCCACCCTGTTAGACAAGCTTCAAAACCAAGGAATCCAACAGGTTTCTCTTGTAGTGACCGATGGCTTCAAGGGGCTTGAACAGATTATCAGTCAGGCTTACCCATTAGCTAAACAACAACGTTGCTTAATTCATATTAGTCGAAATCTAGCTAGTAAAGTGAAACGAGCAGATAGAGCGGTTATTCTGGAGCAATTTAAAACGATTTATAGTGCTGAAAATTTAGAAATGGCAGTGCAAGCTTTAGAGAACTTTATCGCCGAATGGAAACCAAAGTATAGGAAAGTCATGGAAAGTCTGGAGAATACGGATAATCTTTTAACTTTTTATCAGTTTCCCTACCAGATTTGGCACAGCATTTATTCGACAAACCTCATTGAGTCTCTTAACAAAGAAATCAAACGTCAAACGAAAAAGAAGGTTCTTTTTCCTAACGAGGAGGCTCTGGAACGTTACTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCATGGAGAAGAAAAAATGCAACAAAATAAATATGACGATGACCAGTTTTTTAAAAATTATGCAGCAATGCCAAGGTCTAAAGAAGGTTTGAAAGCCGCTGGAGAGTGGTATGAATTAGAAAAAATACTACCAAACTTTCAAGGAAAGAAAGTTTTAGATTTAGGATGTGGCTATGGTTGGCATTGTAAATATGCGGCTAACCATGGAGCGCTAGAAGTAGTAGGAATAGACCTTTCTCATAAGATGCTCGAAGTGGCAAACAAAGTGAATCATGATGCCCGAATTAAATATCGACAGTCTGCAATAGAAGAGATAGATTTTTCAACTGATTCTTTTGATATTGTTTTTAGTTCTTTAGCCCTTCATTATATTTCAAATTTTGAGGAGCTAGTGAAGAAGATTTCAAAATCTCTTAAAAAGAATGGTGAATTAATTTTTTCAGTCGAACACCCCTTGTTTACTTCTTCTGGAGAACTGGTCTTATGATGAGAACGGTAATATCCGCCATTTTCCAGTTGATTATTATTATTATGAAGGTGCGAGGGAAGTCAATTTTCTAGGAGAGTCAGTGATTAAATATCATAGAACAGTGACAACCTATTTGATGACTTTATTAAATGCAGGATTTGAACTTACTAATGTTATTGAACCTAAACCTCCGATTGAAATGAGAGAACTTGAGGAAATGAAAAATGAAATGAGGCGTCCGATGATGCTTATCATTTCGGCTAAAAAAATTAGTCGCTAATTTCTTGATGTTAAAAGTCCCTAACTGAATCTAGGGGCTTTTATTTACTATATACAGTATTATTAATATTTGACGATACTTGGCTTTAGTGATCTTTAAAATTTAATACTTTTTTAGGATATAAATAGTTTTTTTATTACTTTTAAGGTAGAATAAAATTAGGAGAAAATAAATGAAAAGTATATATATGGTTACGATTCTATTAGTAACGGCATTTGGAATGTCAGCTTGCAGTTCAAAACAAACTAAAGAAGTTTCAAAAACGACTTCTGAAAGTAGCTTCATCTCTCAGCAAAGTTCTACCTCTCAAAATAATTCAAGTACAAAAAGTCAAACTAGTAGTTCAAAAACAACAACAACTGACGAATCAAGTTCAACGATTCAAACAGAAATAAAATGGAATTCAGAAAAGAAGTTCCGACTTGCAGAGTTTATGAGTGCATGGGGGAAAGAAATGAATCAAAACTATAGTCAATATGATCCTACGCATGGAAGCACAGCTTAAAGCTGACCCACAAAAAGCAGCACAACTTGCTGCCCTCCAAAAATCAAATCCAACAGAATATGCTAAAATGCAAGTCAAACAAATTAAGCAACTTCTTGGAATTACAGAATAATAATAAAAAGACTTCAAAATTATTTGGAGCCTTTTTATTACATATAAATTAAGTGAATATAAATAACGTAAAGTGAATGACTTTACGTTATTTTTATTGACAATAATTGAAGTAAATAATACAATTGACAAATAAAAGAAATTTAATTTTCATACATCACAAAATATCTTTTAAAAGATAACAAATAATAAATTTAAGCGTTGTAAGGTAAGCCGTTTTTACTAAATATTTAAAATTTTCTTAGATATATCAAATTTAGAACCCGAATTGCTAGTTGATTATTTAGGCATGACTTGATACCCGATAGAATATCTTAAAGTCTCTGGTTCCAGTGATTTAGCTGATTTTAACAGTAAAGAATACGCTAAAAGTATCATCTCTAATTTCAATTGAAAACCTTGAGGCGAACGACTTTTACAACGCTCAGCTCCTAGATTTGTCAAAAAAGAGAAAACTCGCTCAATCACTTTTCTACGTTTTAAAAAATTAGGGAAAAGGATTTTCTTTTGCTTCATGTTCTTCCTGACAGGTGTCATTAGATCAATTCCTTTTAATTCCAGCCTATCATGCAGTGACTGACCTAGATATCCCATATCTCCAAGGACTGTTGGTGTCCCAAATTGACTCAACACTTCCTCGATCATTGAACTATCAGCCATTGAAGCAGGAGTAATTGTGTAGTCTATGACATAGCCTGATTCACTGACTAAAGCATGACATTTACATCCATAGAAGTACTGTCCCTTTGTAGCATTGTAGCCAACATTTGCATAATCTCCAAGACCTTTGCTTCTGAAATTACGAATAGGCTGACACAAAGGAATGGGGAAGCTGTCAATAATGGATACACTCATTCCTTCAACCTCTTTAAAGACGAGTGCTTGGCGAATGACTTGGATACTCGGTAAGAGGGCATTACAACGGGGGACAAAGCGATAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGATTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAATTTAGAGTGATATAATATGAAAGATTTAATCCAAATTAGACTAGAAAATCATTATAAAGAAAGAGGGGCAAATGGTAAAGAATAATTTTCCGAAAAAAATATTGGTTTCATCACTCATCCTAATCTTTTTTATTTTGTTAATAATGGTAGGAAAATACATTTTTGATAAAGCGACATATATTCCTCCAACGACCAGCCAACAGGTTACAAAAACTTCTGAATCAAATGGTTATCTTTCTTCAAGTTCTCAGATATCAAAAAGCCAAAGTTCTACAGAAAAGGCTCAAGCGATTGTTCCAGTAGAAAATACTGGCGTATCAGATTGGCTTCAAGTAAAATCTCAAGGAAGTGGAGAAAAATTTACAGATCTTTCAACAGGAAATTTTAAAATTTATAAAGTTCATAGTCCGCAAGTTCTAAAAACTGCAACTTCGACTGATAGTCCTGTATTGAGCATGACAGAAGTGGTCAGTAAGTATCCAGATAGCTTAATTATGAATGCTTCTGGCTTTAACATGACAACTGGGAAAATCACGGGTTTTCAAATTAACAATGGAAAGCTGTTCAAAGATTGGAACTCTGACCAAAGAGCCAAATATGCTTTTGTATTTAATAAGGATGGTTCATCAGAGGTTTATGATTCAACTACACCAGCAAGTGAAATATTAAAAAAAGGCGCTGATATGAGTTTTAGTTTTGGTTCCATTCTTATAAAAAATGGGAAAAGTTTACCAAGCGATGGAACTGTTAATTGGGAAATTCATTCTTTTTTAGGAAATGATAAAGACAATAACATCTATCTTATTATCTCAGATACCAATACAGGTTATCCGGCAATTATGTCAGAACTTGAAAGTCTTCATTTAGAAAATGCTCTCGTAATGGATGGGGGCGGCTCCAGTCAAATGTCATTAAACGGGCAAGCAATTTATGCTAGTCAAGATAATCGGTCAGTAAATGACTATATTGTTTTGAAATGATGTAGAACTTGGGAAGGATTAGTAACAGAAACAACAATTTAAAGAGAATAGAAAAAGATATCTTAATATAAACTTCCAGTTTCTTTTGTTTTGAAAAAAGAAGAACTATCTTTTAATTTTCTTTACTTTATAGAGAAGAGGTTTATGGATACTAGCCTCTCGACACGAA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52 | Staphylococcus_phage(23.08%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1000066 : 1013695
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_008527|1000066:1013695|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_008527|1000066:1013695|1003058_1005227_-|WP_011675985.1|DBSCAN-SWA MSLKQLKDVTYFKLNNEINIPVNGSIPLAKDKEAITAFFKENVEPNRYEADTYIDKLNWLVKEEYLEAEFLEKYKPEFITNLRKELSKFEFHFDSFMAAYKFYNQYAMKNNDGSLYLEDFEDRVLMNALYMADGDEKLANNLAFAMINRRYQPATPTFLNAGRKRRGEFVSCFLLQLTDDMNSIGRTINSALQLSKNGGGVGLNLTNLRAAGAPIKGYDGVAAGVVPVMKLFEDAFSYANQLGQRQGAGVVYLSLFHPDIMEFLSTKKENADEKIRVKTLSLGVTVPDKFYELVKKGETMYLFEPYFVEKYYGKPFAEVDITAEYDKMVANPEIRKTPINARELEQELSKLQQESGYPYIVNVDTVNQANPVDGVISMSNLCSEILQVQTPSVLNDDQTYKVVGTDVACNLGSTNVLNMMTSSDEFGTSVESMVRALTFISETSNLDTVPTVRKGNDEMHAIGLGAMGLHSFLAQNQIHYDSKEAVEFTSVYFMLLNYYTLVASNKLAVEKGASFKNFEKSAYADGSYFDKYLTHDYFAAVSPKVQELFKGIAVPTIADWTELRDTVKTSGLYNSYRMAVAPNGSISYINDCSSSIHPIVNRIEERQEKKVGKIYYPAAGLATETIPYYKSAYDTDMRSVIDVYAAATEHVDQGLSLTLFMRSTLPEGLYEWKVANNKMTTRDLSILRNYAYKKGIKTIYYIRTFTDDQEEVGANQCESCVI >NC_008527|1000066:1013695|1006179_1006821_-|WP_011675988.1|DBSCAN-SWA MLIIILLLIASYLLGAIPFGLWIGKIFFKKNLHDYGSGNTGTTNTFRILGVKAGIAVFIFDLLKGTLATLLPLIFHINGVSPLIFGLLAVIGHTLSIFDHFKGGKAVATSAGVVLGFSPFFLLYLLVIFILVLWLFSMISLSSVVAAIFALLGILIFPSFGFILTSYDLLFSIIIFALAIIIIFRHKTNLKRIKNHCESLVPFGLNLSGQKEK >NC_008527|1000066:1013695|1005787_1006006_-|WP_011675987.1|DBSCAN-SWA MVTVYSKNNCMQCKMVKKWLSEHEIAFNEINIDEQPEFVEKVIEMGFRAAPVITKDDFAFSGFRPSELAKLA >NC_008527|1000066:1013695|1000066_1000759_+|WP_011675982.1|DBSCAN-SWA MSIIKLSNVSKKYSNGTTALRNISLEIEAGEFTYIVGPSGAGKSTFIKLLYRELKIDRGSGTVAQYDLSKLRRRDVPLLRRSVGVVFQDYKLLSKKTVYENIAYAMEVIGKSPREIKKRVNEVLDLVGLKHKIRSFPNELSGGEQQRVAIARSIANAPKVLIADEPTGNLDPENSWEIMNLLEKINLQGTTILMATHNSQIVNTLKHRVIAIENGRIVRDQEEGVYGYDD >NC_008527|1000066:1013695|1000751_1001687_+|WP_011675983.1|DBSCAN-SWA MIRNFFKHILESLKNLKRNGWMTVAAVSSVTITLVLVGLFLSIILNTQRLTKGIENNVRIVAYMKLDVHDQEAKIQDPKNNKKIINNPDHLNIYDSIKEIPNVKTVTFSSKEAQLQELTKALGNNWNLFKGDANPLYDAYIVEADKPINVKAVTSKISKLSGIEKATYGGANTAKLFQIARGVQTWGTAAAILLIFVAVFLISNTIRITILSRQREIQIMRLVGAKNGYIRWPFFLEGAWVGLLGSIIPSLIVAWAYRLAFVSLTPSLQSQKLSMYETSEFIPAIVGLMAIIGILIGSFGALLSMRRFLKI >NC_008527|1000066:1013695|1010498_1010948_+|WP_011675993.1|DBSCAN-SWA MTAIWKLKNFNQLTTDEMYQLLSLRTAVFVVEQNYPYQELDGKDQVAQHLWLENDKGELMALCRLLPQGISFNEASIGRVLVNPEFRGQNLGRGLIDKALEVLKENGEAAVTIEAQYYLRDFYASFGFVENSEPFYEDDIKHVNMILNF >NC_008527|1000066:1013695|1005363_1005786_-|WP_011675986.1|DBSCAN-SWA MKLAYFSVTGQTRRFVSKTDLPNVEITPDDDLEMDEPFLLITPSYAEESPTVSKSIDVMDPVFDFMAYNDNYKHCRGIIGTGNRNFAGIYIFTAKEVSAKYQIPLLYDFEFNGTPADVAAVEKLAAQLDQGAKVTFKNPL >NC_008527|1000066:1013695|1009668_1010502_+|WP_011675992.1|DBSCAN-SWA MSEKYVVFDFETTGFSAQKNEIIQIGAVKYDENNQELARFNQLVKNQRSYVSTEITQLTGIKPADLLNQPTIEEILPDFLDFIKGHLLVAHNAPFDISFLYQAIIDCAITDVEAFRVYDTLAESKKLLTMSSYALENFKDLLEMNDLRSHDALNDCLITAKLYQYLQKIEEVERSVESEVADELGQLDLFGDSSDEITDSIRRKLNLPITKALVYYQQNLERKWERFEVLGISVEREYSTGSSLKIRLHNSEKVKIHSDFLKEMQKANFVTIMEEEK >NC_008527|1000066:1013695|1007099_1009034_+|WP_011675989.1|DBSCAN-SWA MVIDINNYDDSAIQVLEGLDAVRKRPGMYIGSTDGTGLHHLVWEIVDNAVDEALSGFGNKITVTINADGSLSVEDEGRGMPVGKHAMGIPTVEVIFTILHAGGKFGQGGYKTSGGLHGVGSSVVNALSTWLEVEITRDGTVYRQRFENGGHPATTLEKIGKAPKSKTGTKVTFMPDSTIFSTTEFKYNIISERLNESAFLLKEVTISLEDKRTDEKEEFHYENGVQDFVAYLNEDKDSLTPVLYFEGKQDGFEVEVALQYNDGYSENILSFVNNVRTKDGGTHEAGLKTAITKAMNEYARKVNLLKDKDKNLEGSDYREGLTAVLSVLIPEEHLQFEGQTKDKLGSPLARPVVDSLVSEKLSFYLMENGELAQNLIRKAIKAREAREAARKAREDSRNGKKSKKDKGLLSGKLTPAQTKNPNKNELYLVEGDSAGGSAKQGRDRKFQAILPLRGKVINTEKAKMQDILKNEEINTMIYTIGAGVGADFTLADRNYDKVIIMTDADTDGAHIQTLLLTFFYRYMKPLVEAGHVYIALPPLYKMSEGKGKKEKIEYAWTDGELAELRKQFGKNANLQRYKGLGEMNADQLWETTMDPETRTLIQVTIDDAAQAEKRVSVLMGDKVEPRRKWIENNVKFTMEEDTAF >NC_008527|1000066:1013695|1011220_1013695_+|WP_011675994.1|DBSCAN-SWA MSNIQTLPLEDIMGDRFGRYSKYIIQERALPDIRDGLKPVQRRILYSMNKDGNTFDKSYRKSAKSVGNVMGNFHPHGDSSIYEAMIRMSQDWKMGEPLIEMHGNNGSMDGDPPAAMRYTEARLSEISGYLLSDIEKDTVSQAWNFDDTEKEPTVLPAAFPNLLVNGSTGISAGYATDIPPHNLGEVIDATIHMIDHPKADVEKIMEFLPGPDFPTGGIIQGKGEIRKAYEKGKGRIVVRSKVDIEPMKGGREQLIVTEIPFELNKANLVKKIDDVRVNAKVPGIAEVRDESDREGLRIAIELKKEADSQLVLNYLFKNTDLQVNYNFNMVAIDNMTPVQTGVLQMLRSYVKHREDVIIKRSQFDLNKAEKRLHIVEGLIRMVSILDEVVATIRASENKADAKENIKVSFGFTEEQAEAIVTLQLYRLTNTDIVTLQNEQAELEQKILELKAIINDERTLFNLMKRELREVKKKFAKPRRSELQDEVQTIEIEASELIVAEDTVVSVTRSGYIKRTSPRSFASSALEEIGKRDDDELLYYANAKTTQHLLIFTNLGNVIYRPIHELSDVRWKDIGEHLSQSLSNFSSDEKVIYVQIVDAFAGENLVVVTRNGQIKQIERESFSPWRTYRSKSTPYAKLKGNDDEIVLISPVQFTDLMIISENGYALRFNLDDVPVLGARAAGVKAMNLKNDDKIKAAFFVNSNSWYLLTQRAFIKRVKTEDIPATSRANRGLQVLRTLKTNNHTVFAAGLINSTADLSALTEELDLFSQAKAPATKETDEQVLEVISETGKKYDINLCDLSLSDRTSNGHPIADDLEKIASVKIK >NC_008527|1000066:1013695|1001796_1002774_-|WP_011675984.1|DBSCAN-SWA MSETENLTVPTYYSAIDWNSIEDSIDKYTWEKLTSQFWLDTRVPVSNDLDDWRKLPQLERDTFAKAFAGLTLLDTLQSVDGAEVLKHDARTPQEIACFNNIQFMESVHAKSYSTIFSTLNTKKEIEELFNWVDTNVYMQTKAEIINKIYESGTALQKKVASVFLETCLFYSGFYTPLLYLGNNKMINSAEIIKLIIRDESVHGTYIGYKFQLGFNELSEDEQSEFRDWMYELLYKLYENEENYSHLLYDKVGWTDEVLTFLRYNANKALMNLGQDPLFPDTAADVNPVVMNGISTSSSNHDFFSQVGNSYLLGEVEAMSDEDYDI |
11 | Enterococcus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1021267 : 1110680
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_008527|1021267:1110680|DBSCAN-SWA 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108 | Lactococcus_phage(70.83%) | head,portal,tRNA,holin,transposase,protease,plate,tail,capsid,terminase,integrase | attL 1029703:1029719|attR 1059802:1059818 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1202345 : 1271426
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_008527|1202345:1271426|DBSCAN-SWA 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58 | Staphylococcus_phage(27.27%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1516437 : 1526750
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_008527|1516437:1526750|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_008527|1516437:1526750|1522363_1522912_-|WP_011676469.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQRLAEQFPKVVKFVFSDHHDAYVLERADKLGVANASLELKEFTSKVDYEKALVEILEAQEIDLILLAGYMKIIGSTMLARYKGKIINVHPSFLPDFAGSPHAIEESHEAKYGLGITIHYVDEGVDTGEIIAQIPVAYHESLEVYEERVHEAEHELYPKVVRQIILHQQ >NC_008527|1516437:1526750|1518170_1518713_-|WP_011676466.1|DBSCAN-SWA MHPHLKEVLFTREQIAERVKELAEVVSRDYEGKNPLVVGILKGSIMFTVDLLKELSIDAEVDFMDVTSYGYGISSSGEVRILKDLSTVAHGRDILIVEDIIDTGNTLLYLKKLLTGRQAKSVKIISLLDKPSGRKVDIDADYVGFEVPDAFIVGYGIDYAERYRQLPYIGVFNEEFLIKE >NC_008527|1516437:1526750|1516437_1517994_-|WP_011676465.1|DBSCAN-SWA MSKRALISVSDKEGIVEFAKKIQELGWEIISTGGTKAVLDQEEIPNIAIDEVTGFPEMMDGRVKTLHPLIHGALLGRRDLDSHMKSLAEHHISPIDLVVVNLYPFKETLLAGGSQAEMIEKIDIGGPSMLRSAAKNHAAVTVVCDPMDYEKVEKELSADGETSLELRQQLAAKVFRHTASYDALIAQYLTEEFPVEDTKPEKLTLTYDLKQGMRYGENPQQSADFYESGLPTTYSIAQSHQLHGKELSYNNVRDADAALQIARDFDEPTVVALKHMNPCGIGTAKNIEQAWDYAYEADPVSIFGGIIVLNREVTEETAQKMSKIFLEIIIAPSYSKEALEILSKKKNIRLLTVDFSKKEQSEKEALVTGVLGGLLVQNQDVIVENPKEWTVATKVQPTDRQMEAMKFAWKAVKFVKSNGIIVTNDHQTLGVGPGQTNRVGSVKIALEATADKDALLQENAVLGSDAFFPFADNIDEIAKAGIKAIVQPGGSVRDQEVIEACDKYGIAMVFTGLRHFRH >NC_008527|1516437:1526750|1520583_1522173_-|WP_011676468.1|DBSCAN-SWA MVKYLKEFKFENFMVFLLITIDIALAVLSSVFLANVLNSLIAREMNQFFLWLAIDIVLWVVDSFVQGVRDVWKEIAIQKQLNAVRRDIIEPLTEISYSDFEKNSKEDYNSWLNNGTKLLYDNGFHQIYFVYTGIVAMLFSGIAIIFFHWVLLLTTLLVGAILFYFPKVFKKSVERDTEQVSDVANDALATSTDYLRGYEVLYHNKQLGLMQERTMGKFNQLATANVKLIFTRAWMQYSLLGASMLGQFLILAVAGFLIMNGQIGIGVVMSVGNLSGTVTNYSKSVVNSLILLNATGKLLEKYGKIADESKVTDGEEVTDFESKLELKNLSVAFPDGQKIEYPEIVIEKGKKYAIIGDSGSGKSTLINLLVGNKRDYEGEILLDGKDYKGINRKSLPHVMSVIMQFPYLFRETVEENLTLGRKISPDIFDKSIRIACADDFVFNKLDTIYDKNLSGGQQERLSVARELMGTKPILVMDESTASVDKKTALAVEKNILENPDLTVIMITHHLYDETQNYLDEVIHLGQGIA >NC_008527|1516437:1526750|1520001_1520532_+|WP_011676467.1|DBSCAN-SWA MAATNYSQTIKNDTKDFITTAILQLSGIQKKSEKPKTLDQLTVSNVCQRAGVSRMAFYRNFDSINQVIYQYYQPRISESFEIIRQNVSATIKIENQLEFFEDFKNDLYLSESQGYEPIIRQIYIEEIEKFYEETNDEYFITFVATGVYAVWRKWLMNGQDKPIEEIHELIRKIVTI >NC_008527|1516437:1526750|1522940_1523963_-|WP_153927091.1|DBSCAN-SWA MTVSENAYAKSGVDVEAGYEVVSRIKKHVAKTERLGVLGALGGFGGGFDLSVLDVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIRADKHDTIGIDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNIPEKLEQVVAGVAEGCLQAGAALIGGETAEMPGMYDEDDYDLAGFAVGVAEKSQLIDGEKDVEAGDVLLGLASSGIHSNGYSLVRKVFADFDLNESLPELDQSLIDTLLTPTKIYVKELLPLIKQNKIKGIAHITGGGFHENLPRMFGNSLSAEIVEGSWDVLPIFKALEKYGSIKHEEMYEIFNMGIGMVIAVAPENAAALKKELNAFEIGQMVNRQEAPVVIKK >NC_008527|1516437:1526750|1524146_1526750_-|WP_011676471.1|DBSCAN-SWA MDIEKMTTTMQEALGSAQQIAQVRHHQVIEVPHLWRIFVQPNSFGANFYKDLGIDLDDFTNLIEKEIDKINSVEGSNITYGQNLSPDLFQVFTEADKIAQKMGDEYLSTEIILLALFELKQNPLTEYLVSHGLTKAKAQAAIEKLRGGDKVTSQNAEETYKALEKYGVDLVAQVKSGNQDPVIGRDEEIRDVIRVLSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVRKDVPENLKDKTIFSLDMGALIAGAKYRGEFEERLKAVLNEVKKADGQIILFIDELHTIVGAGKTEGSMDAGNLLKPMLARGELHLIGATTLDEYRKYMETDKALERRFQKVLVTEPTVEDTISILRGLKERFEIHHGVTIHDNALVAAATLSNRYITDRFLPDKAIDLIDEASATIRVEMNSLPTELDQANRRLMQLEIEEAALKKERDDASKKRLEIIRGEIAELREENNQLKAQWEAEKKEVGNISEKRNELEHARHELEEAQNEGNLEKAAALRYGKIPEIEKELKAIEEKAKSDDLSLVQESVTEEQIAEVVGRMTGIPITKLVEGEREKLLHLPETLHQRVVGQDEAVEAVSDAIIRARAGIQDPNRPLGSFLFLGPTGVGKTELAKALAENLFDSEEHMVRIDMSEYMEKHSVSRLVGAPPGYVGYDEGGQLTEAVRRNPYTIILLDEIEKAHPDVFNILLQVLDDGRLTDSKGVLVDFKNTVLIMTSNVGSQYLLDNVGENGEISEETTENVMSQLRAHFKPEFLNRIDDTILFKPLALEDIKNIILKMTSQLAHRLEEMEVELELSEEVKVWIAENAYEPAYGARPLKRYLTKVIENPLAKLIIGGQIPPKSKVIVRLIDNKVDFDIQSIAE |
7 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1607738 : 1619255
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_008527|1607738:1619255|DBSCAN-SWA ATCACATTTTTGGAAATTTTAAGGTAAAAGTTGAACCAATCCCAAGCTCAGAACTAACTTCAATCTCCCCTTGATAATTTTCGGCTAAACGAGCAAGAATTGGTAAACCTAAACCAGTTCCGCCAATCTCACGGTTACGTGCCTTATCCGCTCGAAAGAATCGCTCAAAAAGATGATTAATATCTTCTTCGGCAATTCCGATTCCTTTATCAGAAACACTAGTAATGACAAACTGTTCATCTTCTGAAACAGTAATCACAATCTCCTTTCGATCATCCGGAGAATACTTAACAGCATTATCTAACAAAATGCGTAATCCTTGTTCAAAATGATTTTCAGATATCCGGGCATGGACAGGGTAGATAAGCTGATTATCAAGCACAATCTCAAAATCCTCATGTAGAAGTTGGAAGTTTTTAAGCGCATGATTAGATACTTTCCCAACGTCACAATCCAATTCTTCACTGGACAAATCTACATTTTCAAGCCTAGCTAAAGCAAGCATTTCTTCAAGCATTTTCTTCATTCGGTCTACTTCATCCAAACTCGCCTGCAAAGATTCATCCAAAACTTCTGGATCATTTTTTCCCCAACGATTTAAGAGATTAATATGACCGTCCAAAACTGCTAACGGAGTCCTTAATTCATGTGAAACATCAGAGACAAACCGATTTTGCTGTTCAAGGTATGCTTTCATTTTCAGCATCATATCATTATAAACATGAGCTAATTCTTCAATTTCATCACCACTTTCAATTTCGATAGGTTTGAAATCATTCGTGGGGTCGCTCGCCATTTCCTGCATTCCCTGATAAAGTTTTTCTAAAGGCTTCATAAAATAATTCGCCATAAAATAACCAATCATTTGCGCAACGATTAAAGCGACAATTTCTAAAATTAACAAGACGACTAAAAGGAGATTGGAAATCCGATGATAAGTTGTCGTGTCATAAAATGCCTGTAAATAGCCTACAACCTGTCCCGTCCCTTTAGAAACAATCTTCCTTTGGACTAAATAACCTGGATTCTCACCTTGAATTTCTTTCATCTCATTATTGCCTTGCTTTTGAAATCCAAAATCATGTCGATTAGTTGAATATAGTAATTTATGATTTAAATCATAAATATAAAATGCTTTCCGAGTCCCGATGATACTTCCCAGACTCATTCCTTCCGATTCCCCATTTTGAATCTTTGATGTCGCTTCAATATAAGTATTCAAATTAGTTGAATTTAAAGGAGCATCCGCTTGTTCTAATACCTCTTCAACGCTGTCCATTGAACCTGTCAATAACCTTTGTTCCTCCTTGATGAAAGAACTTATGGTCAGTTGATAAGTTAATGTTGCAAAAAGAGTAAAAGTAATAAAACAAAAAACGGTGTTAGCAAAAGCCCATCTAAGCATAATAGACCGCTTAGCCGAACTTTCTTCTACCGTTTCCTTTTTCTTGTTGAAAGTGAATAATTTTTTCATTTTTTTTATTTGCGTTCACGCATCACATAACCCAAACCACGAACGGTTTGAATATAGCTGTCTTGTCCTTCAACATCAATTTTATTTCTAAGATAGCGGATATATACATCAACAACATTTGTTTCCGTTCCTTCTTCATATCCCCAAACTTGTGAAACTAAATGTTCGCGAGTGACAACATCCCCAACATTTTGCATCAACGTCAAAAGAAGATCGTATTCACGACGCGTCAAATCAATTACTTTTTTACCGCGGTGAACGGTACGATTTGTTTTGTCAATTACAAGATCACGAAAAGAAGTGTTTTCAGCACGTTCTACAGCATGACCATGTTCTTCACGACGGAAGAATGCACGAACACGAGCCAAAAGTTCTTCAATCGCAAAAGGCTTAGTAATATAATCATCTGCTCCAATATCAAGACCGGCAACACGGTCCATTGTTGAATCACGCGCGGTCATCATAATAATTGGAGTATCTTTTTCTTTGCGCAAACGGCGGGCAACTTCAAAACCATCAAGTTCAGGAAGCATCAAATCAAGCAAGATTAAATCATAATCTTTTGAAGTTGCTTCTTCAAGCCCAGAACGTCCGTTATCTTTAATCTCAGTGGCATAGCCTTCATGCTCTAATTCTAATGAGACGAAACGAGCTAAATTCTTTTCATCCTCAATAATCAAAATTTTCTTTGATGCCATATTATTCTCCTTTGTTAAAAAAACTGCATAATTCGATTTCTTATAATACTATTATAAGATAAATTTAATTTATGTACAAACTATTTAACGCTTTTTTTTAAATTGTTTTCGCTTTCTTATGCTTAACAACAGAAATTGTTAAAAAATGAGAGCCATCTAATCAAATAATCCGTTCAAACTATCAAAAGGAGATTTCTTTTCTTCCTTTTTATCTTCTTGTTGCTTGGCATAGTCTTCTTCACTCAAAACAGACCAAAACTTCCCGCTTGGCAATTCTTCTGCTTCTTCATTTTCAGCTAAAATTTGCAACGGAATTTCCAATAGAATATTATCAGTCACTGACTCATCTAAACTAATGATATCTTTATCTAAAACAATAATTAAATCATTATCTAGTAATTCCTGATTTCCTTTTAGCGTTTCCTCGGTTGCAAAAATTTCGTTGACTAGGATATCAATTGGATATTTGACTGGTTTCAAACTTCTTGAAGAAGGTAGGGTTAAAGTCGTTTTTATTTGATAATCCAAATAGAACAACTCATCATCATAAGCAATTTCACCACTAACTTCAATTGGTAGACAATCTAAAATTTCTGCGGAAAGTTTCACAAGTTCCTCGCGAAGGTCTAAATTCTCATTGAAAGCAATCTGTTTTTTTTTTGTTAATTCATTTAAAGACCATTTCATCTTTTAATATTCTCCCACAATTTAATCATTTTTCTTTATTTTATCTTATTTTTACATTTTTTCATAATAAAAAGCTGTCTAAAGACAACTTTGATATTTCTAAAAATAAAAATGGTCGAATGACCATTTTTATTATTGTTTGCCGTATTTCTTTTCGAAACGAGCGATACGTCCGTCCGCTGCTTGGAATTTTTGACGACCTGTGTAGAATGGATGTGAATCTGAAGAGATTTCAACACGAATCAATGGATAAGTGTTTCCGTCTTCCCATTCAACAGTTTCTTTAGAACCTTTAGTTGAACCAGTCAAAAATTTGTAACCAGTTGTTGTGTCCATGAAGACTACTGGTTGGTAATTTGGATGGATATTTTGTTTCATCGTTAGAATTTCCTTTCTGCCTTGGACTGTTTGCCAGACCAAAGTTGTACGAATACTTAAACATTCTATCAAAATTCGAAGTAAATTTCAAGCTAAAATAATCTTTTGTCAAGAAAAAAACTTTACAAATTATTTCTGTCTCTAAGTAAGGTTAAAAACCAAGTATTTTCAGGCTAAAAGTTTCTTGGCAAAAAGTAAATTTACTTTTTAAATCATTTCATAAGCAAGCTTTGACTAGTCTCTTTTAGTCAAATAATTAACCACACGTTCAAACTTCTTGTTTTATATTCATGACTTTTGAAAGTTTTAAAAGTAGTTTTCTCTTAGATTATTATACCTTTTTCCTTTAAATTTTCTCTACAGGATTCAAGATAGGATTCATTATGCTCTGGATATATGGGCAAAGTCTGAGTAATCTTTTTTAATTCTAGATAAGCTTCACATTTTTGACCTCTATACAACGGATCAAACCAGCTTTCATCAGGATGATATCCTCTTATTTTCATCTCATTCATCACTTCCAGATGATATTGAAAAAGTTTATATGGAGAATAATTGAAGACGTAATTTACCATCGAATGTTTTTTCGCCCAGCCCTTTCCACGTAAGGCACAACACTCTCGATGTTGACCCAATAATTGTGCTCTTGGAAGTTTTTCAATTAAAGCTTCATGCCATAATCTCATTGCTTGTCATCCTTTTCTCTTATCTTTTTAGTCCATTAATCACTTTTTAATCAAAAAATTCCCCCGAAGGAGAACTTTCTTTTCTCTATTTACAACAGATATTAACTGCTTCTTCCGATTGTTCAACCGATGAGTTCTAGAATGAAACACTTAATCTCTGAAATATAGATAGTTATATTATACCTTGATAAAATGATGCTCTCAAGTATTTTGACTTCACAACCTTATCCCAAAAATCATTTCCCAATTACATAACGTAAACGACTGGCTTGTTCTTTGCTTAAGACTTGATAAGAGAACAATGTATTATAACCAGTTCCTGATTGCGAAATTAATATAGAGCCATCCGGACGAATTTTTTCTACAAAAGCAACATGACCATAGGTAGGGTCAGCACCATCTTGTCCCGCTTTATAGCTAACTGCACTATGAAGTTGAGGAGTGGATGTAACTTGATAGCCTGATTGATTTTGCCAGTCTTTGCCATTTCCCATGTAAAGACCATAATTTATTCCAAATTCTTTCGCTCGATTATAGACCCACCATGTACATTGCTTATAGGCGTAAGTTTGAGTTGAATAATTTTCAATATCCATCGGTCTATCAATAGTCCAACCCGCTGGAGTGCCTGGTAAACTGTCAGAAGGCATTGTCTTCCACGCAGTAGCTCCATATTTCCAGCCTACTTTTAGCAGACTATTTTGCTCAAAAAAGTTCGTTGTATAATTGTGTGCTCCGGACTTAGTATTTGGGTTGTAAGCAACGTAAAGATTAACCGTTCCTGCTGAATAAAAAACCGGTTTGGCCCCATTATCCCAACGCCAACCTGCTTTTACTAGGCTTTGAGCCTCATAATTACTCAAGGTATAATAGTGGTCTCCCCCTTTAACGTTTGGATTATAAAGGCGATAAACTGGCGCACCTGAATTTGCTGCTTGCCAACCAATTCCCTCATCAAGCCAACCGACATTTTTTAGAGAATTTCCCTCATAAAAATTCGTTGTATAAAAATGTTCCCCACTGTTGGGATTATAAAGCCGATAGACTGGGCTTTTAGAGCTTGCCTTTACTTGGTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_008527|1607738:1619255|1610065_1610596_-|WP_011676632.1|DBSCAN-SWA MKWSLNELTKKKQIAFNENLDLREELVKLSAEILDCLPIEVSGEIAYDDELFYLDYQIKTTLTLPSSRSLKPVKYPIDILVNEIFATEETLKGNQELLDNDLIIVLDKDIISLDESVTDNILLEIPLQILAENEEAEELPSGKFWSVLSEEDYAKQQEDKKEEKKSPFDSLNGLFD >NC_008527|1607738:1619255|1607738_1609211_-|WP_021037558.1|DBSCAN-SWA MKKLFTFNKKKETVEESSAKRSIMLRWAFANTVFCFITFTLFATLTYQLTISSFIKEEQRLLTGSMDSVEEVLEQADAPLNSTNLNTYIEATSKIQNGESEGMSLGSIIGTRKAFYIYDLNHKLLYSTNRHDFGFQKQGNNEMKEIQGENPGYLVQRKIVSKGTGQVVGYLQAFYDTTTYHRISNLLLVVLLILEIVALIVAQMIGYFMANYFMKPLEKLYQGMQEMASDPTNDFKPIEIESGDEIEELAHVYNDMMLKMKAYLEQQNRFVSDVSHELRTPLAVLDGHINLLNRWGKNDPEVLDESLQASLDEVDRMKKMLEEMLALARLENVDLSSEELDCDVGKVSNHALKNFQLLHEDFEIVLDNQLIYPVHARISENHFEQGLRILLDNAVKYSPDDRKEIVITVSEDEQFVITSVSDKGIGIAEEDINHLFERFFRADKARNREIGGTGLGLPILARLAENYQGEIEVSSELGIGSTFTLKFPKM >NC_008527|1607738:1619255|1609216_1609909_-|WP_011676631.1|DBSCAN-SWA MASKKILIIEDEKNLARFVSLELEHEGYATEIKDNGRSGLEEATSKDYDLILLDLMLPELDGFEVARRLRKEKDTPIIMMTARDSTMDRVAGLDIGADDYITKPFAIEELLARVRAFFRREEHGHAVERAENTSFRDLVIDKTNRTVHRGKKVIDLTRREYDLLLTLMQNVGDVVTREHLVSQVWGYEEGTETNVVDVYIRYLRNKIDVEGQDSYIQTVRGLGYVMRERK >NC_008527|1607738:1619255|1611896_1612808_-|WP_011676635.1|DBSCAN-SWA MRHKKIYLLLAMIGATSAWTVANENQVKASSKSPVYRLYNPNSGEHFYTTNFYEGNSLKNVGWLDEGIGWQAANSGAPVYRLYNPNVKGGDHYYTLSNYEAQSLVKAGWRWDNGAKPVFYSAGTVNLYVAYNPNTKSGAHNYTTNFFEQNSLLKVGWKYGATAWKTMPSDSLPGTPAGWTIDRPMDIENYSTQTYAYKQCTWWVYNRAKEFGINYGLYMGNGKDWQNQSGYQVTSTPQLHSAVSYKAGQDGADPTYGHVAFVEKIRPDGSILISQSGTGYNTLFSYQVLSKEQASRLRYVIGK >NC_008527|1607738:1619255|1617962_1619255_-|WP_011676641.1|DBSCAN-SWA MHDNDIILKVDEKPAASQWFGLSFQHLFAMFGSTVLVPILVGINPAIALLSSGLGTLAHMSVTKFKVPAYMGSSFAYIGAMTLLMKNGGMPAIAQGAMTGGLVYLIVALIVKFAGKGWIDKVLPPIVVGPIVMVIGLSLAPTSINDAMYTDVANLKGYSLAYIIIALITVLSIVVYSIYGKGFLSVVPILLGIVTGYVAAMIIGKITGMNIVSFTGISQAKWLTLPPMEIPFASYKWAFYPSAILTMAPIAFVTMTEHFGHIMVLNSLTKKDYFKEPGLEKTLTGDGLAQIIAGFIGAPPVTSYGENIGVMAITKIHSIYVIAGAAVLAIVVSFVGKITALLQSIPAPVIGGASIALFGVIAASGLKILVENKVDFDIKRNLLISSVVLVIGIGGMIINITQNLQISSVAIATILGIVLNLVLPKDASEI >NC_008527|1607738:1619255|1613848_1614253_-|WP_011676637.1|DBSCAN-SWA MKKIYFLCTGNSCRSQIAEGYGHVFLKDWEVRSAGIERHGLNPHAVTVMAEDGIDISAQKSELIDMTYFNDCDLIITLCGDALDKCPMIPKSVSHEHWDLQDPARAVGTEADILTEFRKTRDLIKERVQNLSNI >NC_008527|1607738:1619255|1615620_1616694_-|WP_011676639.1|DBSCAN-SWA MSKRLLILEDGTIFEGEALGANLDVTGELVFNTGMTGYQESITDQSYNGQILTFTYPIVGNYGVNRDDYESIHPTCKAVVVHEAARRPSNWRMQMSFDEFLKSKNIPGITGVDTRAITKIVREHGTMKASLVQARDEVDHQMSQLQATVLPTNQVETSSTATAYPSPNTGRKVVVVDFGLKHSILRELSKRECNLTVVPYNTSAKEILEMEPDGVMLTNGPGDPTDVPEAIEMIKEVQGKIPIFGICLGHQLFSLANGATTYKMKFGHRGFNHAVREVATGRIDFTSQNHGYAVSSENLPEDLMITHVEINDNSVEGVRHKHFPAFSVQFHPDAAPGPHDASYLFDDFMDLMDNFKK >NC_008527|1607738:1619255|1612900_1613737_-|WP_011834858.1|DBSCAN-SWA MKIIKIVFSLVILLMLTCLGGLYYAFKIEPYRLVVNQHQLENRSSKEKIKIVQLSDLHIKKDFDAKHLDKVIQKTNEQNPDFIVFSGDLYDNYAHYNENEQVISKLQKMKAKYGKIAIWGNRDYGGGASREYANIMSESGFTLLRNENLLVPMNNGEKILFTGLDDTLLGNPSLPSSYQMEESTYDVLLTHEPDEVSQYQNKGYELILSGHSHGGQVNIPFIPQVQKKAASVMKHSNNYTGGLYQLNTNETLYVNTGIGTTHLSARFGVVPEIAVFNF >NC_008527|1607738:1619255|1614689_1615460_+|WP_011676638.1|DBSCAN-SWA MKFNTIQVLIASTLALGTVAVAQEVSAAEQTTSIYRLYNKNTGEHFYTQSRTEQLNAIIAGWNNEGIGWVAPSYSNSPVYRVYNPHAKGGDHYYTRSKYEAQSLVNKGWKWDRNGKPVFYSGGKASVYVAYNPNAQSGSHNYTPNSFEQQSLLNNGWKFGSTAWNAVTKFNWTLAQYRALTVGDSDGKGDVNYNAIIAAHDIPSDVTIYENGSYSSKNVLYSNSDFNSGVYQYVSLTFVKQANGDYLLSNKSYLSL >NC_008527|1607738:1619255|1611297_1611660_-|WP_011676634.1|DBSCAN-SWA MRLWHEALIEKLPRAQLLGQHRECCALRGKGWAKKHSMVNYVFNYSPYKLFQYHLEVMNEMKIRGYHPDESWFDPLYRGQKCEAYLELKKITQTLPIYPEHNESYLESCRENLKEKGIII >NC_008527|1607738:1619255|1610728_1610974_-|WP_011676633.1|DBSCAN-SWA MKQNIHPNYQPVVFMDTTTGYKFLTGSTKGSKETVEWEDGNTYPLIRVEISSDSHPFYTGRQKFQAADGRIARFEKKYGKQ >NC_008527|1607738:1619255|1616781_1617714_-|WP_011676640.1|DBSCAN-SWA MSVKNGLVQLENLTSMENLSVDEVMGLIKRASAFKAGKADFALDEQTFASNLFFENSTRTHHSFHIAERKLGLDVLEFDAQASSISKGETLYDTVLTLDALGVDICVIRSGVEHYYEELVNSDNIHCAIVNGGDGSGQHPSQCLLDLMTIYEEFGKFEGLKIAISGDLTHSRVAKSNMMMLQKLGARLYFTGPAAWYSEEFDDYGHYANLDRILPELDVHMLLRVQHERHDSGESFSKEGYHTHFGLTQERAKMLKPTAIIMHPAPVNRDVEIADSLVESPQSRIVQQMSNGVYTRMAILEAILAGKKAK |
12 | Bacillus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1628464 : 1696599
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_008527|1628464:1696599|DBSCAN-SWA 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73 | Lactococcus_phage(88.64%) | bacteriocin,head,terminase,portal,holin,transposase,plate,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_13 |
1822884 : 1884973
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_008527|1822884:1884973|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_phage(16.67%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1947569 : 2015853
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_008527|1947569:2015853|DBSCAN-SWA 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80 | Lactococcus_phage(83.02%) | head,terminase,portal,tRNA,transposase,protease,capsid,tail,integrase | attL 1976301:1976323|attR 2015873:2015895 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
2116657 : 2184157
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NC_008527|2116657:2184157|DBSCAN-SWA 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70 | Lactococcus_phage(61.54%) | transposase,terminase,tRNA,integrase | attL 2109820:2109837|attR 2142384:2142401 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
2243337 : 2309598
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NC_008527|2243337:2309598|DBSCAN-SWA 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50 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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