Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_011566 | Shewanella piezotolerans WP3, complete sequence | 5 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,cas5f,cas7f,cas6f,WYL,DinG,RT | 0 | 1 | 3 | 0 |
1. NC_011566
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_011566_1 | 283748-283866 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_011566_1
|
1 spacers
spacers of NC_011566_1
>1.1|283779|57|NC_011566|CRISPRCasFinder CCTAAGTCCATTTAGTCATGGAAAGTGCTGGTAGTTATACATGGCCAGCTCTTTATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011566_1
The CRISPR arrays of NC_011566_1 >merge|NC_011566|1|283748-283866|CRISPRCasFinder AGTAAGAGTGTTCCATTCATTTATTGGCATTCCTAAGTCCATTTAGTCATGGAAAGTGCTGGTAGTTATACATGGCCAGCTCTTTATAAGTAAGAGTGTTCCATCCATTTATTGGCATT >NC_011566|1|1|283748-283866|CRISPRCasFinder AGTAAGAGTGTTCCATTCATTTATTGGCATT CCTAAGTCCATTTAGTCATGGAAAGTGCTGGTAGTTATACATGGCCAGCTCTTTATA AGTAAGAGTGTTCCATCCATTTATTGGCATT
>NC_011566.1|WP_187148530.1|281711_283538_+|translational-GTPase-TypA MLENLRNIAIIAHVDHGKTTLVDKMLAQSGTLESRGEATERVMDSNDLEKERGITILAKNTAIKWNDYRINIVDTPGHADFGGEVERVLSMVDSVLLLVDAVDGPMPQTRFVTKKAFAQGLKPIVVINKIDRPGARPDWVIDQVFDLFDNLGATDEQLDFPIVYASALNGFATLDPDETSDNMTPLFETIVEKVSSPDADAEGDFQMQISQIDYNSYVGVIGIGRIKRGSVKTNQQVTVIGADGKTRNGKMGQVLGYMGLERHEVAEANAGDIVAITGLGQLQISDTICAPTTVEALPALSVDEPTLTMTFQVNTSPFAGKEGKYVTSRNILERLEQELVHNVALRVEETDSPDRFRVSGRGELHLSILIENMRREGYELAVSRPEVIEKEIDGEMCEPYETLTVDVEEEHQGAVIEKLGTRKGDMRDMQLDGKGRVRIDFVIPSRGLIGFQTEFMTATSGTGLIYHSFDHYGPVKGGDIGQRARGVLISNATGKALTFALFNLQERGRLFITHAAEVYEGQVVGLHARANDLTVNCLKGKQLTNMRASGTDEAQVLTPHIEMTLEQALEFIDDDELVEVTPENIRVRKRYLTENERKRHNRTAKDAK >NC_011566.1|WP_020910491.1|279558_280968_-|glutamate--ammonia-ligase MSAESVLQQLKELEVKFVDLRFTDTIGKEQHVSIPSHQVDEDFFEDGKMFDGSSISGWKGINESDMVLMPDAASFVLDPFTAETTANIRCDILNPGTMTGYNRDPRSIAKKAEDYLRSTGIADTVLIGPEPEFFLFDDVKYGADMSGCFYKVDAEEAAWNSGTSYEDGNKGHRPGVKGGYFPVAPVDSSQDIRSAMCLVLEEMGQVVEAHHHEVATAGQNEIATRFNTLTLKADEVQVLKYVIHNVAHAYNKTATFMPKPIVGDNGSGMHVHQSLAKDGVNIFAGDKYGGLSETALFYIGGIIKHARAINAFANPSTNSYKRLIPHFEAPVMLAYSAANRSASIRIPVVPSAKARRIELRFGDPMANPYLAFSAMLMAGLDGIQNKIHPGEAMDKDLYDLPAEEAAEIPTVATSLENALECLDADREFLTRGDVFSNDFIDSYIKLKSVDVERVNQTTHPVEFELYYSL >NC_011566.1|WP_143711225.1|277187_279314_-|DUF3300-domain-containing-protein MLLGIFNANAIEWPQEVTAKEGNIVVYQPQPESLDGNILQGRAAMSLELIDRDDPIFGAFWFSARIDTSADNATVRDVRVTRVRWPESTETDEQRFTEVVEKSIGTSSFTISMERLSASLANAKQEKQSLENIKNDAPNIIFRQQLTVLLSYDGSPQFREIENSPYERALNTPFAVARNKQTKKMYLSSGTFWYTADNPMGPWQVTEYPPEDLVKMLPKPDDTEAKNTETAPAVIAVKTPTELVATDGKPKWKSLTEGKLLYVSNTETAWIREVSSGDMYLLLSGRWFQAKKEAGPWAFVRADKLPASFNDIPPESDIGGLRVSVAGTTEADQAMLDAQIPQTAAIKRSEAKLTVEYDGEPKFDAIPGTKVAYAVNTTTQVLKINGQYYAVDNAVWFVASAAKGPWKVADNVPTDEIAKIPPSSPVYNTTYVEIYDSTPEVVYVGYTPGYMWSYPYYGVPVYGTGWYYPPYWGRYYYPRPPTWGLHVGYNPWTGWNVGVSWSNGFFSVGVGWSAGWGNHYYPGRCCGGYYGGGYRRPVVINTGDINIGNSVSIGNRTNISNKVARNNNISGNRVGKNNLYNRPENRVRNADASKINSNFKQATHNKNRANNVFADKNGNVARDLNGEWQSRDKGNWTPAPQTRDRVATGLNNRDISQPVTLPSRPNTELNRPNNMNRQINNRNFDRESLNRSRNARQHGMVREGRRGR >NC_011566.1|WP_020910489.1|275803_277021_-|dicarboxylate/amino-acid:cation-symporter MWQKLQPYRSSIILLSALLIGGAIGIVLPEFALSLKPIGQVFLNLLFMIIVPLVAISVTSSIARMTDLRKLGIILITLFMVSIAMAIIPAVSIVGLALAFDPAQGVVLDLHQQVEASSGNMDFVGLLTTNDFVGLLSKSNILALIIMSVIAGIAIGQSGKDGEKVSAMLDSLNTVIMKIISILMVAAPVGLAAYFASTMASQDTELLSTFARAIGLFFVAAFFYFTVGSTIYAWLGGGVGGVTQFWKNAVDPSVTALGTSSSLATLPVNIRAANKMGIKEEIADICLPLLVNLNKGGASMTTALKIVFIYSILGLDFSADVFALTVLISVLSAFIISGVPGGAFLGEIFIVTTLGLPIEVIPILVIIGAVTDAPATLINVIHDLNATQIIERINGKRYKSETIIE >NC_011566.1|WP_020910488.1|275193_275622_-|hypothetical-protein MENSMTRHKMDTTMDMPTITNGYWYYFEDAGVRVTAHGSGYSGQETVYVNDEVVSDKRNLGMKSSHEFCHLGNDYEVRFQVTNLLTATVACALYKNGEHVTTETKAYRNMDGKSALKLISLFFVAGLVFGGAAAWLAHQFIG >NC_011566.1|WP_020910487.1|274829_275144_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MEIDAITVKALRQSKGWTQQHLADACAISLRTVQRVEKEGSASSETLLGLCAVLEVEQRNLLQIPIPERHQMQQVSLRAQSIILVIAVVCGGCIGAAIMYLLIS >NC_011566.1|WP_020910486.1|273725_274745_+|oxidoreductase MKLIMSLLCLFSFSALSSAWNTQQIDANLSFRGSAAADGVFWVSGSKNSVFLSKDSGKTWLDVSVKNQPLTDFRDIEVFDANTAIVMGAGEGELSKLYITEDQGASWQLLLENKHEAGFFDSIAFWDRNNGLLLGDPVDGCFVILRTRDGGKTWQRIARGRLPEMLDREVAFAASGNTLMVGESGQAWFTTGGYSSSIYTSQDFGEYWQRTHIPLFDDTQTAGGYGISKNSVDDIFVVGGDYQQRDKHDANIVYLKNKVWHKTRKSTPGLRTAMVCYQATCIATGKLSTDISFDHGYSWQPLQIDGLKQGYYTLAIDNDTVVAAGHNGRVAVFIMPQKQ >NC_011566.1|WP_044555537.1|273181_273484_-|hypothetical-protein MKTSLITPLILATLLFSTSTLAAMAPVVKCNDCSATASLDTAKALASDNVYVVDFVNATAQKYISDDKGNTVVAKMSLGDITRLNQQFDYRKTHLRALNR >NC_011566.1|WP_020910484.1|271915_273031_+|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MKDFKNDFMLAPGCYLLNHSVGRPLKTAEQSFKQQFFTPWQDSAVEPWGDWLGIIERFTQALSMLFNAPASEFCPQVNLSSALTKLVMSVERLQQNDTVILMSELDFPSMGFALKKALPSSCELRFIPVKCDITDANVWDDYITADVDMVFVSHAYSNTGQLPPLKSIVEIAKSRGVLTLIDIAQSAGVVPLDLNALQADFMIGSSVKWLCGGPGAAYLWVNNQHITDCQPKDVGWFSHENPFEFDIHDFRYHQSALKFWGGTPSIAPFAIASHSIDYFSRIGSIALRQHNQQLLDIIAQELDGKVVSPHAQNQRSGTMILDFAGKQQQVLQRLKSANVSIDVRSFGMRVSPHIYNDEADIQGFIQLIKSI >NC_011566.1|WP_020910482.1|270738_271914_+|DUF1864-family-protein MTLNTRAFDHWIRTRFVEINTELEQLYAEQTDRANVEGVGEHLKMALEAEGREMIATLLAEGNTDEGFDHAFDLLGNVGLYMAACRRHEITEPSRERVSPLTEASALAMHIGASIGVTPRFATAHLTTHNSARNGLYKRFTNLPAEKLFVDYNTKGILAYKRAADALIKIEPLGITHPIAADLLKVAKQALVDVKESNQQLFKKLDTDDFFYCVRPYYKPYRVGSQVYRGANAGDFAGINVIDMLLGLCEANEPAYSQMLVDKFLYMMPEDQSILRDCMRRTSFMDELLALKHLNQQSWFTENVALFLEVCALHGDTAIQHHNELVNKYIAVPSKKLQQQHMEKVTASGPPLPVLLNALEKLRDRRSAADRSDINTRYDDIKSLKASLEAL >NC_011566.1|WP_020910494.1|283909_284191_-|hypothetical-protein MNNSISESKPLAFIWFSVALIISALSVYFAINDVLMLVPSFLGMAVIHVYIGRQRLTKYQISDAQYKKVIQTLGIFVVIASGSAAGFYQLSAA >NC_011566.1|WP_020910495.1|284251_284479_-|DUF350-domain-containing-protein MEITSLEQNIFFMLINLGYAVLSLFISVIALVVIDKFIFKDVDFIQEIKNGNIAVAIFQSVILLFIGVVVSSAMN >NC_011566.1|WP_020910496.1|284480_285590_-|hypothetical-protein MKFYIFIFIVVIGVLLIFDTPQSASPPTETGNIELRNTTQRIYQLMISGDYDLAEAVIMPAIFTLERSAAMNSATLAWLYEMKATIMAAKYHYHHAITAISAAAKHRDEPRYKQQKLDWQQQIDSMQKERLLKESYRNSRHAGLSKTLTKQVNIAYIYIDDNASSKWSGKQRLRNQSSIDSVTNWYQTQASRYSVDDINFKVRYFVVRSPKGISKQWLRNRESFNQILNSLVKRMHFKNIDGFINNIAASDKNAQVAIVFHSNYQGRSFAMSCPASPKPNRCKYEYVMLTEKMNNNHFSWVLPQIQAHEVLHLFGAKDLYNIRGAKNYAVTDVMNYYSKDLKYATIDPLSAWAIGWQQQQPTPPFKIEN >NC_011566.1|WP_020910497.1|285612_286506_-|rhombotarget-lipoprotein MNNLHLLKQQGLLLFIILSLTGCASQQVNTKSSVMEYLYPKSSDTFETPSTPHLTLPLRVGVAFVPESEDSGSSRHFWTGNLYSGSIAEAKKNQILEKVSENFRALDFVSSIEVIPTAYLTPGGSFANLSQIKTMYGIDVIALVSYDQVQFTDEGALSLSYWTIVGAYIVSGEKNDTSTLMDTVVYDISSKKMLFRAPGTSQITGSSTPVNLSEELRSDSVRGFEQAAENMTQNLNSQLTQFKEKLKQEPDQVKISHRDGYSGGSLSLWDCIVLLFLSQLAWQRKHINQSLRLSSRL >NC_011566.1|WP_020910498.1|286727_287924_-|DUF418-domain-containing-protein MEPLTTSETFQPPAPSARNANIDAIRGLAVLGILFMNIYFFGNSFSGYANHETVPIHDTVIMLFSNFFLEGRFISLFSMLFGVGLAIQYNKLSALDGAAYQTMKSRLKWLLLFGVIHGIFIWYGDILFTYALGGFLALCYLKQDNKKLLKKSIIFITLPLFIFAIISFISPEEAIIRGSAQFEEDLSIWSGTYSGQLMMQLIIFTGMLFITPLTTMWLTAGLMLLGVVLYRKKVFEKGLTQRQLLQLLLATILLSALDSACTLATNPSLNTMSDSIVMLSAIPMALIYIHLLVKLCQNRATILAPLQKVGRLAFSLYILQSVCGVLLFRHIEPTLMSTLDRPGYMLIAIGFSLFQVILASVYLKYFNQGPLEWVWRRLATRKLTATATQTTPIASADT >NC_011566.1|WP_044555538.1|288633_289848_-|4Fe-4S-binding-protein MSFIESLTLTLALTYSVSLLYWSGKKWGAAASGVLVSAAAISSLYWPLIAALAIAAIVIGLVNKFQPQVAQGNMRSNNLREGVQHLLALSMLLVGVQFAVNSALLKAGVTPWLMRPDVGDAFLPIAGGIELKAIATLGIWDQTHPAAAVMLFVVLLTGLLCKRAFCGWACPLGLAGEYLYKLRKRFIKHEYLPPAWLDWPLRMLKYLLLLGLLYIIISMPSQSIPHYLSGNYHKIADLKMALFFVTPGLVTLLCFALILSLAAWRRQGFCRYICPYGALLGLASFLSPFKIRRNTQHCLIESKGMSCDKCTRACPANIAVHTQLNVRSDECQACMRCVSACPKNEALHLSTRNGIKLSARGLTIGLMLLLFLIPLIAYLSGFWVSQTPTETRMYLIQHLNSIGH >NC_011566.1|WP_020910501.1|290029_290677_-|DUF2959-domain-containing-protein MKKILSVTIISASLLLTGCQSAYYGAMEKVGYHKRDIMVDRVEDAKESQEEAQEQFSSALEEMQALLNHDGGDLESAYNKAKDEYESAQEAADDVTKRIDKVEDVAEALFDEWQTEIGEISKASLRRSSESKLKETRRSYTQLVRSMRRAESKMPPVLTAMKDNMLYLKHNLNAQAIGAIKGEFTSLQTDISGLINEMNKSIDESTKFIAALEGK >NC_011566.1|WP_044555539.1|290729_290951_-|hypothetical-protein MSQQGSAGNVIAAIASFFFPGLGQLVQGRIFAAIVFCIIAVVGYAMWWLIFPAIIGGIAHLWSIIDAAKFRAD >NC_011566.1|WP_079891901.1|291072_292038_+|virulence-factor-BrkB-family-protein MKNKIAVNQFRSFMWSIWAFFLHLLRRFKEDQVNIKAGHLAYVTLLSLVPIVAVMFSMLSAFPVFAGIRGQLEGFVYDNFLPAAGDTVQIYINEFVANASKGTTVGIAALVVVALMLISAIDKSLNSIWRTKEKRQVAVSFSMYWMVLTLGPVLVGASLVATSYLVSLKLFNDSELSGVVPLIIERLPMMFSVAAFLLLYMVVPNKKVKFFHALLGAIVAAMLFELGKKGFAFYVTQFPSYEAIYGALAVIPILFVWVYVSWIIVLVGAEITAAMPEYLRERQIARAARLAEAAQLEELESATQRTEQAAKQVKPTSEGGA >NC_011566.1|WP_020910504.1|292042_292990_+|alpha/beta-fold-hydrolase MTSQPISRDWLAVGDGHELYVAQYGNVNGIPLLYLHGGPGAGCSTDELVLFDLSVYRVIFMDQRGAGLSRPRGELKHNNLGKLLTDIEQVRQWLGLSKWTLAGGSFGATLALLYAAKYPSRVIEQVLWGAFIPSEDSIRWLYGQQGAARLFPAEQLEFSVTATTDEQLSQFFSCYRAGLDNQCASVRQDFTRRWLSWEMALAYPGCKQDRKNVNLSQVLASIELYYVSNNYFAAFEQLCVSVVNIQAKTVILQGELDWVCPSGVLFSFLQDHRNQHIRLMEIKGGYHALADIKMTRAVVSAIREMAQTIVKGSIN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_011566_2 | 1020817-1021023 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_011566_2
|
3 spacers
spacers of NC_011566_2
>2.1|1020844|33|NC_011566|PILER-CR,CRISPRCasFinder GTAGCACTGCGCCCGCTGGCCAAACTTCTGCCG >2.2|1020904|33|NC_011566|PILER-CR,CRISPRCasFinder GCTATGGCCGAATATGAAAAATCGAGTTGTGGA >2.3|1020964|33|NC_011566|CRISPRCasFinder TGTCAGTGAAGTACAGTCAATTAATCATGCTTT |
cas6f,cas7f,cas5f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011566_2
The CRISPR arrays of NC_011566_2 >merge|NC_011566|2|1020817-1021023|PILER-CR,CRISPRCasFinder GTGAACTGCCGAATAGGCAGCTGAAAAGTAGCACTGCGCCCGCTGGCCAAACTTCTGCCGGTGAACTGCCGAATAGGCAGCTGAAAAGCTATGGCCGAATATGAAAAATCGAGTTGTGGAGTGAACTGCCGAACAGGCAGCTGAAAATGTCAGTGAAGTACAGTCAATTAATCATGCTTTGATATCTGCCGAATAGGCAGCAAAACC >NC_011566|2|1|1020817-1020963|PILER-CR GTGAACTGCCGAATAGGCAGCTGAAAA GTAGCACTGCGCCCGCTGGCCAAACTTCTGCCG GTGAACTGCCGAATAGGCAGCTGAAAA GCTATGGCCGAATATGAAAAATCGAGTTGTGGA GTGAACTGCCGAACAGGCAGCTGAAAA >NC_011566|2|2|1020817-1021023|CRISPRCasFinder GTGAACTGCCGAATAGGCAGCTGAAAA GTAGCACTGCGCCCGCTGGCCAAACTTCTGCCG GTGAACTGCCGAATAGGCAGCTGAAAA GCTATGGCCGAATATGAAAAATCGAGTTGTGGA GTGAACTGCCGAACAGGCAGCTGAAAA TGTCAGTGAAGTACAGTCAATTAATCATGCTTT GATATCTGCCGAATAGGCAGCAAAACC
>NC_011566.1|WP_020911195.1|1020086_1020686_+|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MQRYYFMVRFLPEQANLALLTGRCISVMHGFICKHEIQGLGVSFPAWSDVSIGNMIAFVHTDIAVLNELRLQGYFQDMQEYGAFNIGDVEAVPDSCTEVRFKRNQAIAKMFVGETRRRLKRLEKRALARGEVFNPSKSYEPRELDSFHCIAVGSTSTEQDFLLHVQKENVQKREGAEFSQLGLATNQLLRGTVPEFDMF >NC_011566.1|WP_020911194.1|1018972_1020085_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MELCNVLKYDRSLYPSKAVFFYKTAESNFVPLEAEINRIRGQKAGFTEAFTPQFKSKNLAPQDLAHCNPLILEECYVPPNVEHIYCRFSLRVQANSLKPAGCSEPTVFALLEEFAATFKACGGYKELATRYCKNVLLGTWLWRNQNTGNSQIEIKTSSGNCYQIANTRQLAWDSSWPADAQQVLEELSHEVHQALTDPAVFWHAKITAKIETAFCQEIYPSQSFGEKAAQGEASKQFAKVKCVDGRYAVSFNSVKIGAALQLIDDWWDVDGSKRLRIHEYGADKEIGVARRAPESKQSFYSLFVNAELYLAELKQQLAEGEYSISPNIYYLFAVLIKGGMFQKKAEAKSKSKAEPTTAKTTTSKATPVKA >NC_011566.1|WP_020911193.1|1016857_1018963_+|hypothetical-protein MVDKLKFQELLDIDDISERNIVLRRAFTAYTVPLDVTGNEAAALTILLNLTYPRKRVDDLLDMRLAKQTLNTDAHVDACIGEVQWLHTHNLKYPDIRVSKQRLIAASPLLHPHVLSSANCINTLGWSHDSAKVNLAKLFSCHFIWQERVCCLATLLADAPKGWKEAFQALGMLVKDFMNLCGRIKASLPNDDTPNHVDKYSIQVRLPYQDGYLAITPVVSHALQAEIQQAAMAKQGRYTNIEFTRPAGVSELSASLGGNVKALNYPPRIENAEHGLSDSWALKVQSGQTVLNQGALSQPRFKRALEGLLSKNFELALKQRRQQKVACMRQIRATLTEWLSPLLEWRLEVEENKVNTSELGCIHGSFEYQFLTTQKENFVELLSPMFSLLNTVLSNSNTLQKYAFHQHLMKPLKNSLKWLLDNLSKESNAVAIDSDEDNQQRYLYLKGIRVFDAQALSNPYCAGIPSLTAVWGMMHNYQRRLNERLGTQLRLTSFSWFIRQYSSLAGKKLPEYGMQGQKENQFRRAGIVDNKHSDLVFDLVVHIDGYEEDLDAIDNSIDAIKASFPATFAGGVMHPPEIGSVDEWCELYCSEASLYSKLRRLPASGKWIMPTRYQMDSLDGLLQLLKLNVALCPVMSGYLMLGSAESRNYSLEPLHCYAEPAIGVVECATAIDIRLQGMSNFFRRAFWMLDIKETSMLMKRI >NC_011566.1|WP_020911191.1|1015628_1016864_+|TniQ-family-protein MAFLFSPKSLAFSGESLESYLLRVVAENFFDSYQQLSLAIREELHELDFEAHGAFPIELKRLNVYHAKHNSHFRMRALSLLESLLDLPPHELQKLALLRSNRRFVGGMSAVHRNGIDIPLSFIRCADKDGIESVPICPQCLKEGPYIRQAWHIKPIEVCAKHGCELINHCPDCQQPINYIENESITHCACGFDFTTASSVKADSQAVLLSRSLFDGDALSNNPLLFMGTSVTHRFAALIWYQKCHARNTECMAHRAVGYFEDWPTSFYRELDAVTTGAEARLIDLFNRTSFRSIYGELILDSQCLLPEDKDPHFIYLALMEYISKLVESHPKSKKPNVADMLVTVAEIAVLLSTTHEQVYRLYQDGVLTAGMRSKIRTRISPHIGVFYLRQVIEYKTSFGNDKQGMYLSAW >NC_011566.1|WP_020911190.1|1013955_1015149_-|metallophosphoesterase MKTVNFLVISDLHAGLSQDSASDTKLILRDKHNVFGDRLINYIKGLDEHIDYLVCTGDIGNQGCNKSFQAGWEYVNKMAQELSIQDILCVPGNHDHQSRPPQDDKYGFSPKHELQFIQPSFPFSCFNKNTHFWAWNWELTSTDTFNVVSINSSAYHGYGSEYKHGRIALEITDQIKQKLISGKVDRKPFNVLLTHHHPKKMDFVDSKYDSQAMEGADYLLRALEAADLGPWLIIHGHKHYAQIGYANSQIQGSQLILSAGSLSAVLYEAIEHRTSNQFYLLSVEPDKSEYLGKVVGKFRTYEANKLHEWQPSKSNNLPANGGFGSTHTPDQVVNDLKKLINEDNPFLEGDELNQFKEKIEHFTPDEICRLNSRLESNMFSVTRCSDNHIVEVGLGNE >NC_011566.1|WP_020911189.1|1012163_1013963_-|hypothetical-protein MNNYIPSINESINAKTTSFRDLCSSFIVNEYYERLASSSNTILVGPRGSGKTTLMRMLEVRSLEHWEAEEAKLFRRKVSFSGVFIPTDRLWKRQYDNAKDKVKNHEDSLVLSSQFIYHILEQLVQSISFRTSRTLKLDHNFRHVELSKQDEVELVSCLAKQWHVKPHINSLKGLVISIALKKSEVSNYISDISFKKSTSEAPKVVSADISEVLNTSITIINTYLNENGEKWAFLFDELELAPDEIIQPLIDCMRGGHQDIILKLALSPYHKGINITNSPESSMKNQDLSYIDLTDISEKEGLKFATSLCTKMLIGKGIFSDIESCFISPDEIAIDQVFHSLCQKDADFYQYLNSKGFLGINYSDVEPTRRPQFRKVKFIAYLRDLRRNNSGQKQARRRPADYYAGFENICKSTEFNPRMIIGIMNMFIPIIKDRNRVTISEQISGLQSYFESFRSLLSTIAIDSSDGRINNIYDLVDKIAWFFNNEIYGDKFSSQPKGVIVLDRDTPRELGEAIGLALNAGALISTENSDSKGGDLTNESINSCRLSYLFSHHYGLLLTQQGPIDLSRIMKSKDINSGSIRVVRTSNYNDDRQFRLELK >NC_011566.1|WP_020911188.1|1011264_1012167_-|hypothetical-protein MKLLKSNDIGNIDLAIVGLGYETRATTRCRSMVNSNIIAIGYDQHTSALRYQDNLEYYNSIGATVIEGDNCNVYRELFKLIDVQWTGRPVNCLIDITVLSRTRLAEIILYLISNLEEGSHIKVSYSLAEYTEPSNSISPMRKVGPIIDSLSGALGDINLPSSIVIGLGYEIGKAIGISNYLDTENQFIFIPNGKDSNFETSVRTNNELLINITPENHTFTYDICNPYKTYLDLRETMLAIMDISRPVLVPLGPKIFSALSVVLSEEMNRTLPVWRVSSEYLEEPVDRKPTGFYIEFTLVT >NC_011566.1|WP_020911187.1|1010546_1010873_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSEKQINPLPLRLKQARTALGISQKQLGIQLGMEPGTASARMNHYEKGKHTPDYATLKAMADELGVPVAYFFCESEKNAQLLCLLEQMSDKEKDILIEKLSKSHVVDK >NC_011566.1|WP_044555663.1|1009801_1010326_-|hypothetical-protein MTQSTIRINKLLIKLLKSKSLTQFSAIELKKMYVEELPDTKNKDASQLVHRTLNKLCNANFIQKKIDGKKVLFIKTPMFDESRLHASTPRKQVSKEPIVNDNAPKLQKLKTTLNQYQIDLLGHIGEAEEFKRLFNEFPETKTSLYSRYMHARNQSSSMVGKIKAVEACINTLES >NC_011566.1|WP_020911185.1|1008408_1009797_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MKLRQWQHDCVKKALESYQTQNHFMCLATPGAGKTVMAAELAARLIAMGKVDFVLCFSPSSEVNESIRASFSRRLHKRFDGLMGAIGSVYTYQSMSSLTPEFWQLLHSHNVFVIMDEVHHLKGTELNNANAWGEEVLLNIQNQACYTLALSGTPWRSDSAPIVLSRFTEPDNTIHCDFVYGLKQAVADDVCRKPNIALIDNDKIRLDDELESETFSSITELLKGSGFSYKALISNHQVMHYMLNQGIKKLEQIRQETPFSGGLIVASSIKHAKQLYQIIVGDFKQTACIVTSKLKHPSHTIEAFRQSDTQWIVSVGMISEGTDIPRLQVCCHLSLIKTEMHYRQVLGRILRVTSCDAQQAWLFTLAEASLIEFAYRIDQDLPENAVIVEQTEQQELNLALPHKPISTEFDHDLSSNLHFSEISLATKAATPPLLIDIEEENSYNLALLGGYKEQIVRMFDAH >NC_011566.1|WP_044555664.1|1021168_1021375_+|DUF2384-domain-containing-protein MTTKDLSACDLLRKACDIYKGDRSLAESLFNSDVPALGNKKPNDLLGSPEGRQQVNELLNKMECGEFS >NC_011566.1|WP_044555665.1|1021988_1024298_+|type-I-secretion-system-permease/ATPase MDSGLHSLVAIARFHQLPAEPEQLSHEFGVPGTSFTDTEILLAAKALTLKAKQLTLSISELKNGVLPAIAKDKQGGYFVIARLSTDNLSESADKVDEQLEANQAKTKQDSILIHDLAQGAPQSISVDELQQRWSGELIALVRRQGFGQSLQQNFDISWFIPSLVKYRKLFSEVLIASFFLQLFALVIPLFFQVVMDKVLVHRGFTTLDVLAVGFFVVVVFEAILGGIRNYTFSHTTNRVDVELGSRLFQHLLNLPLSYFESRQVGQNVARVRELDTIRNFITGTALTLVIDLLFVFVFLAVMWYYSPTLTWIVMGSIPFYVLLSVFITPILRRRLDEKFKHGAANTAFLTESITGIGTVKSMAVEPQMRRKLEDHLSSYVHASFRSQNLGNVAGQIAGLINKLVTLGIIWVGAHLVIDGHISVGQLVAFNMLAGRVSGPILKLVQLWQDFQQAGISIERLGDILNTPKEPGFNPNRSRLPSLQGAISLEHVRFRYRPDGPVILNEINLQTRPGEVIGIVGRSGSGKSTITKLVQRLYIPESGRVLVDGVDLSMIDTAWLRKQIGVVLQENFLFNRTIRENIALTDPSISMERVVAAAKMAGAHEFIVELPEGYDNIVGEQGSNLSGGQRQRLAIARALIGNPRILIFDEATSALDYESERLVQDNMARICKGRTVFIIAHRLTTVRQCNRIIVMDKGRIVEQGNHDSLIAHNGYYAKLHSYQSHTPNLHPVEPNQPNYSQTKQARASSQNNRVNRSTPSAAQHQTGEKI >NC_011566.1|WP_020911199.1|1024294_1025704_+|HlyD-family-type-I-secretion-periplasmic-adaptor-subunit MSAWGILKDAWQNRDKLGDVNNSRDLAAFLPAALEIQEPPPNPLARKLGWSLLVLLVIAIVWACLGEVNIVASAEGKIIPSSKVKQIQPLEKAVVKNILVREGQYVHQGEPLIELDSTLTTADEKRLSGELHSARLSLAGSQALLVMLAQDVNDTNIALVSLDFPHVPNATQVELALHKRLLWQQWLQYRAQWQMLQSNLLQTQAEQAASDEVIGKLEQILPIITKRTSTMKGLHKQNYASENDYLALEQERIQYTHDLAAEHQRLKQLQASESEVRQQFNTLKAQTSVTELTKIPQIQQQIASLQEELAKAVDRNKKQVLYAPVSGQVQELSIGTVGGVVTEAQQLMLIVPDEVLLDVEVFLDNKDIGFVREKMLAEIKIHTFPFTKYGIIDGEVISVSNDATVDEQRGLIYGMRLKMKQSTIMVEGKEIKLMPGMAVTAEVQTGKRHIIEFFMAPLLRYRQESIRER >NC_011566.1|WP_143711167.1|1025811_1026432_+|hypothetical-protein MESYNVNRINEAIGSHPDKKIIEKIDKSKGVLLYLKGLMLNYGVYYGRNYNEALKIFDTLSMRDSLSSFQAGLILFLCENDISINDRNHDVYYYFDLAYKNGEPRAGYFKYLLEYYSEKISLNKYVQSLVEVNNLERSSLVDFELAYQAYLSDSEYRYLLEGTKLFSTCDFYNVITEPSIYDDAELNSRLYFIKEINSGYYNGCIN >NC_011566.1|WP_020911202.1|1026444_1030461_+|calcium-binding-protein MNNVLSWLYNGWGNYETGKGAGDLIDSRNELIEACKEGYSNPTAGNAQKIRDAADEYRRNAAKSGTGLLVSDPILGKALGQLIDNENLRDYYHGNERDNKRWSEIAQALGHEDWEKDGIREQCTLEGITQLVNEIGNIPPGSSRVIDPLMIDLDGDGLELTSSIYFDNDNDGILNRTSWVGSDDGVLVFDINSNGLIENGSEIFGDDFVKSNGEKAIDGFDALRDLDSNNDGQFDSNDSNFADVNIWRDLDQDGVADDGELFTLESLGIQSIGLEEVRTNTPLNDSVEVSRSTVNLINGSTLNIHDVNLASSTLHTAYDHTGIELDDSIRSMANIIGMGRVDSLQYSMKQNIELKNLVVQFSSLDSMDGQLGLIQAITEQWAKTHNSAALDRIVEWNVGRFVSSVSTDPETGRRVETTSVAFMPEVLSEELSYKINILSAFYGDDRFKNVNVMGDRLGGALQAIDAAIDSLQNNFYELLVSQTRLNKYLDLIDVDFGSENIFNYEALNEYVKRQVQTGEDKLTVLEDILFIIERDPVLLADSELYLQLNDLIDLLPIEETKELLDEHNVSVDDFGYIFKSYLGVEIVSVKDGYTDALVINRDAPVILLAGDSVTNVTINAPEVIVTAGSGDDHVTTGSGEDLIEAGNGNDTINSGSGNDTIYGGAGNDTINTGAGDDIAYGAAGEDVINSGAGNDTIYGGAGNDTINTGAGDDKAYGGAGDDMLTNTGAGDTALYGEEGHDTLTGYYRANNTLDGGEGNDTLTMNSISSSYRDSSNSLRGGRGDDSFTMGYGSDTYHYDLGDGHDVIRDKGYDSSQDETKHRRDTLVLGAGITREMVSFTHDSAGNIIITITDPDNAANNGSIMVMGAYTSSTYRIEGIEFSGDESGASNLDEAAILAAAEGMFGTDGDDALTGTSMSETLYGGEGNDVIHTGSGEDIAYGGADNDTLTNTGAGDTALYGEEGHDTLTGYYRANNTLDGGEGNDTLTMNSISSSYRDSSNSLRGGRGDDSFTMGYGSDTYHYDLGDGHDVIRDKGYDSSQDETKHRRDTLVLGAGITREMVSFTHDSAGNIIITITDPDNAANNGSIMVMGAYTSSTYRIEGIEFSGDESGASNLDEAAILAALEEMHGTEGSDVIQGTSTADIIYGENGGDTLYGRKGADKLFGGSGDDKLVGGGGKDLLIGGSGDDQLIGGGGGDTLNGGEGSDNLKGSAGNDTYLFSSDFGNDVINNYDSNSSSIDTAIFNDVSIEELWFSRDGNDLQINVIGTDNQVEISDWYSGVNYQLDKVQVGDSVLLNTQLEQLVSAMASFDVPVGTGSIVTEEAQDALRPILVESWNTL >NC_011566.1|WP_044555666.1|1031311_1031830_+|RHS-repeat-associated-core-domain-containing-protein MVDHQGNIISQRYFDPFGRTASASVAGSLGDLVDTNRNRRGFTDHEHLNEQQLIHMNGRVYDYSMGRFMSVDPFIQSPTSTQSVNPYSYIMNNPLAGTDPTGYASCYEKGFLCTKDNVDKGENVNWAKACIPGSCESRSNNSNGSTQEQSSKNKETQNSDIGGLGGDCSAGK >NC_011566.1|WP_143711168.1|1031840_1032395_+|hypothetical-protein MSTRKGKLNSVEHMYDDRPKSFTKEKVKDIRMAVDNAWGDNDLSRGFATEELAAQAFSDAINPISIDNSVEIGANIGYEALSDSYYLSNPVTSYLPDAIRYTEYALEPALGARTAYVHTHGSVSKGAESFSGHNYKGGDIGFSKLNKINAYMASPSRRLYKFNFSAFTRAQSSDSRDFVSEVGK >NC_011566.1|WP_020911205.1|1032397_1032838_+|hypothetical-protein MEVRQILVLIFSVILLFSIEVEANSVTLNANERCGQNYCIVSVAHLMTNADKYEKRKVALVGIVDVSNPQSVMVYLDEGSFKHKVYENAVAVSAPLIATMSKEKKGLIQGNYVYIYGKYYSNIGSDKGFINGTIDKVESITLYGEN >NC_011566.1|WP_048908453.1|1033467_1033743_+|TNT-domain-containing-protein MTLRPGTIIDRYGPETGTYVAPAGVPFTQRSLPPEHINLPLTQYRVVRPIPVYYGPATPHFGQFGGGIQYQLPNNVRSLRQGTKPYLELVK >NC_011566.1|WP_044555668.1|1033739_1033976_+|hypothetical-protein MKVKELKLRLQKEKFNPHCYNVDGGKPLDGYGLVFRSGLWVYFTFERGIESNQKMFLDESDACEYFYNAINEDPTVKP |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_011566_3 | 2879337-2879463 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_011566_3
|
1 spacers
spacers of NC_011566_3
>3.1|2879384|33|NC_011566|CRISPRCasFinder CTATTTCTTTACCAATGCGCTTTGAATTGAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011566_3
The CRISPR arrays of NC_011566_3 >merge|NC_011566|3|2879337-2879463|CRISPRCasFinder GGCTGAGGGGCTCTGAAATGGTCAAATACTTAATGCAATTGGTATAACTATTTCTTTACCAATGCGCTTTGAATTGAAAAGGCTAAGGGGCTCTGAAATGGTCAAATACTTAATGCAATTGGTATAA >NC_011566|3|3|2879337-2879463|CRISPRCasFinder GGCTGAGGGGCTCTGAAATGGTCAAATACTTAATGCAATTGGTATAA CTATTTCTTTACCAATGCGCTTTGAATTGAAAA GGCTAAGGGGCTCTGAAATGGTCAAATACTTAATGCAATTGGTATAA
>NC_011566.1|WP_020912828.1|2875930_2876302_+|DUF2069-domain-containing-protein MESSTLFKLCRIGYLLLVVMLSYWFIQQGVSGEYSMLFSLLWLIPLLLPLKGILTGKPYTYAWASFILCLYMLHALTLVYVTETNLAFAVIESLLIGVLLIGFPFYARTRGRELGLGLKKKKK >NC_011566.1|WP_020912827.1|2875567_2875918_+|arsenate-reductase-(glutaredoxin) MTNVSIIHNPRCSKSRQTLALLEEQGCEITIIEYLKTPLSATEISSIQSKLGVTPREMMRVKEDEYKQQNLADINVTDAQLIQAMVNTPKLIERPIVLANDKAAIGRPPENVLTIL >NC_011566.1|WP_020912826.1|2874046_2875504_+|M48-family-metallopeptidase MSKLTFSKSIIAGTLAFTLAASPVTYANNDLPDLGTAAVNTFSLEKETEYGDAYMRVIRSSAPMLNDPVLNQYLTELGNKLVAHATGVKTPFYFFLLRNDEINAFAFFGGHVGVHTGLFLNADTESELASVLGHEITHVTQRHLARSLEAQQKSSTATIAGMLGAILLTIASPQAGMAALATTQALSTQAKINYTRMHEKEADRIGMQILVDAGFDPNGAANFFGKLASRYRFTTKPPQMLLTHPLPESRISEARIRAQQYPLRHVPDNLNFQLAKARIQVRFSGYSEAAVLSMFEKQLKHHRYTFRSAAEYGKALAYFRMDKFEESEEIIDELLAKEPNNLFFIDTKTDLLTQKGDYKSAIALLLNQQKIKPTSSVVNTNLANVYIENDQTEKAIPLLEDLIFLNKQDQLAYFLLTEAYRKNGNKAMEHFVKAESLALSADYKTAIDQLNFAYKQSKENPLQLARIEARIRQFRQADRAMESLQ >NC_011566.1|WP_044555895.1|2873719_2873935_-|sulfurtransferase-TusA-family-protein MIIIDLTAFRCPLPLVKVKLALKQIDTGEKLRVLLSDPGSRQDVPRFLKKVGYHHQIIQSKESVLALEITK >NC_011566.1|WP_020912824.1|2872533_2873628_-|AI-2E-family-transporter MLTILSRWYKERFSDPQAVTLVLILAGLALAIYFAGGLLAPLLVALVLAFLLEWPVAQMARIGINRTTAASLVLILFIGLMLLISFGLIPSLWKQGVSLIGDLPSMIDKGLFTAQQFINQYPQFVNPTQLDTMVAELKKMLDTQHLLDIGKQLLGYSASLLVLMVYAILVPLLVFFFLKDKDELLRASKRFFPSNRDLARKVWNEMHQQIFNYIRGKIIEIVIIGVVSYAFFAVMDLRYAALLGVLTGLSVLIPYVGATLVTLPIALVAFFQWGISSEFGYLMIGYGIIQALDGNLLVPILFSDAVDLHPVFIIAAVLVFGGLWGVWGVFFAIPLASLVKAVINAWPVHGAAVEETAKAEPLAK >NC_011566.1|WP_044555894.1|2871589_2872489_+|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP MFDYAHLKALSIVVSQGGFDKAAKHLYISQSAVSQRIKQLEDKVGQALVVRASPVYATEMGKRLLRHYAQVQLLESELRTEMNVDDPSLPTIVRIAVNADSLATWFLPALTEVFKRHKWLLELVVDDEAYTHHLLKSGDAVGCVTTSQSPMAGCSSEYLGNMEYMCVATPEFITHHFAQLPQQPDSILTAPAVVFSTKDKLHDKFLNFYFGINEGSTREHKIPSSESFLEAITMGLGYGLVAHLQARPLLESGDLIEVFPGKRMQVPLYWQHWNIKAKQTTIVYRSLAATARHLLINPE >NC_011566.1|WP_044555893.1|2870855_2871467_-|amino-acid-transporter MQTAFIQGMAIGGSLIMAVGAQNAFVLKQGLKQSHSLPIAALCSFIDAIMITAGVAGLGHLILAFPLIKDIASFGGAIFLFIYGYGALKSSFTEQKMEGEQELAADSLKKAVITTLAISFLNPHLYLDTVVLLGSISVQFEGTAKQWFGAGAVLASFVWFFSLSIGARYLSPIFQKPKAWCYLDRFICLTMWSIALALLYPYL >NC_011566.1|WP_020912821.1|2870338_2870806_+|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MHTLTVGDKAPEFTLQNQNDEAISLSKALQSGPVLVYFYPKASTPGCTVQACGLRDSQPQLNDLSVTVFGISPDPVAKLKKFSDKQSLNFSLLSDEDHAIADAFGVWGEKKFMGKIYDGIHRLSFLVGQDGNIAHVFNKFKTKDHHEVVLAYLAE >NC_011566.1|WP_020912820.1|2869784_2870321_+|glycine-cleavage-system-transcriptional-repressor MSNHLVVTAMGADRPGIVSKFARLASECDCDIVDSRMALFGNEFTLIMMLSGSWPSITKMESTLPSLSVELELMTVMKRTAKHTPKNYISRLEVNFSGFDQRGTMKKITQFLADRSLDLGAVKSHAEEDDTGEPTQNISLTINVPEKVDLEKLEVSIHELAKELSLECTLEHMQGIDS >NC_011566.1|WP_020912819.1|2868664_2869546_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MINGSIVALITPMNSDGTVDNKSLENLVEYHIAQGTDGIVAVGTTGESATLPAKEHIQVVQQTVSFAAGRIPIIGGNGANATAEAIELTKGLSSVGVEAMLGVTPYYNKPSPKGLVAHYKAVAQSTDIPQILYNVPGRTSVDMLPETVAELASVSNIIGVKEATGDLSRVSKLRSLCGDDFLLYSGDDATAREFLTLGGNGIISVANNIVPKAFKAMCDAALAGNTEEAIAVEKSMQSLFSALFCEANPIPVKWAAHQMGLISKGEIRLPLTELSSEFHGLLLEAMKNARIEV >NC_011566.1|WP_020912832.1|2879533_2880244_-|DnaA-inactivator-Hda MKSNSPLQLSLPVHLPDDETFNSYYPAAGNDELIQSLQACAEGRAEGAVFIWGPEKSGRTHLMHAACAHANDLNRSSFYIPLGIHASISPALLEGLEKIDLVCIDDVNAIAGHPLWEEAIFDLYNRISEQKTCSLVLSASVSPSETGFALPDLISRMQWGLNYQLQPMADDEKLAALQRRAAMRGLQLSEDVGRFLLNRLARDLRTLFDVLDRLDKASMVHQRKLTIPFIKEMLRL >NC_011566.1|WP_044556420.1|2880315_2881422_-|DUF2066-domain-containing-protein MLKAVCRYLMMFPLLFCFSAISAEVYNLDESLVPVDSRAKNLRSQAIKQGLKEVILKNTGTQSALTHPDVVKQLANASAMMTQYGYQDLDGKLFIKVSFDHKRLISLLRQAGLPVWGKQRPLTLVWLVEEIEGERKILNDASTSVTRTSFDTQSSNRGVPLLFPLMDLDDSMQIGINDIRGQFTDNVANASLRYQANYFIMATISPQGEVFSYKMSLYPRELSAGSSQYNPSTSQSGESASVEQAVVDITAAASEYYVSQYAIADSGEKLTTKITFTDVSKMKQLVEIEKYLNQLSAIKTVAVASIEGMTVEFNLGLFGNEEDLHRLMKLDPRIESIGNTSSNNIEYASFGSENNANKPTQIYYWKGQ >NC_011566.1|WP_044555896.1|2881596_2882850_+|uracil-xanthine-permease MKNLTLPLQGAQMLFVAFGALVLMPLLTGLDTNVALFTAGIGTLIFQLITKRQIPIFLASSFAFIAPIMYGVQTWGIPSTMGGLMAAGCVYVVLATVVKVRGAGFIKRLLPPVVVGPVIIVIGLGLAPVAVNMAIGKTGDGSLVLVEQNTALIISLASLFTTIAVAIFAKGMLKLMPILAGISVGYGLSLAFGIVDFSPVANASWIAMPNFVAPEFNWHAILFMIPVAIAPAVEHIGDILAISNVTGKDFIKKPGLHRTLAGDGVATIASSAFGGPPNTTYSEVTGAVTLTKAFNPVIMTWTAITAILLAFVGKLGALMQTIPVPVMGGIMCLLFGSIAAVGLNSLIKNHVDMNEPRNLSIVGVTLVFGIGGMAFGIGSFSLTGISLCGIIAILMNLVLPDNAAAHEKIVSDDLDQI >NC_011566.1|WP_020912835.1|2882933_2883281_-|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin METVDKIKQQIAENPIIVYMKGSPKLPSCGFSSQVAQIMINCEEQFAFVDILQHPDIRAELPKYANWPTFPQLWIEGELIGGCDILTEMFQKGELKTLIKETAAKYKTEDEQASS >NC_011566.1|WP_020912836.1|2883505_2884090_+|superoxide-dismutase-[Fe] MAFELPALPYAKNALEPHISEETINYHYGKHHNTYVVKLNGLVEGTELAEKSLEEIIKTSTGGIFNNAAQIWNHTFYWNCLSPNGGGEATGPVADAIVAAFGSFDAFKAQFTDSAVNNFGSAWTWLVKKADGTVAIVNTSNAATPLTDESVTPVMTVDVWEHAYYIDYRNVRPDYMAHFWELINWDFVNANFAG >NC_011566.1|WP_020912837.1|2884221_2884761_-|proteinase-inhibitor MLSKIALAMVILTVSGCSQSNSSVGEVTDMTKKNNVKVSPAVVTPVKNDEETRAKLAQKGLFEGKLIVEHDTGSAMNVTLQYTNTQSYGVPLMFNSGMTADLWLFDSAGKKVWAWSNEMMFTQALRETVMPAGKTQNVKFRIAEGIAMKIGKGFYLQAIFSGRATESQTPAMTPVIYKF >NC_011566.1|WP_020912838.1|2884760_2886578_-|AsmA-family-protein MKLLKWFFVALLGLVAALVLYITLIFDPNDFKPQIVEVVKEKTGRDLAINSDLSWTFFPSLGIKLGGITLSNPDGFENAAMVSVNEVVAEVALMPLLTKEVEISQLNLDGLTLSLETQKDGRSSFDGLTGGGNSSEASKRPANEASSVSLSKLDIGGISITNTQISNLDRQSNTKQLLSLKSLTLGRFQLDQFAPLKYELSASLADLNVTSSGEGQIKVSQNLQLIVINDFAVTNQLKGKGVPNGELKADLTTSLEMALDKQTMSLVLASFNAADIDASGKLDIAYGNKVPNIMAELEVGDVDLDRFLPKESTKTDDIKKTDTAKAAAVEPDLTVMKSVNLDVNVKVKSVKVANMKTQDWVFKMTMNQGVANMSQLSAALYGGTIKASAKLDGRSKVAKYEFDKRLKGIDIRALLIDAAEVDMLDGTANFNVAGKGSSLLPDNLKKNLLANGKFEIADGAIHGVNIPQMIRDAKAKLGGDMSSSGTREQKTDFTSMTGSFKVAKGVVTNPDLNMASPLIRLTGSGTANVINEALNYKLTTSVVGSLEGQGGSERDALYGVEIPFAISGTMSEPKFALDTKALLDSKLKDETNKLKDSLFKKFGGF >NC_011566.1|WP_020912839.1|2886610_2887108_-|putative-4-hydroxy-4-methyl-2-oxoglutarate-aldolase MLDLLPDLFDSYPEHLSLLPPMFKSFGREDCFWGEVVTVKCFKDNSLVKEELSKNGKGKVLVVDGQGVTDCALLGDMIAKNAEVNGWQGVVIFGCVRDVSALKTMKIGIQAIGINPIKTVKKGLGELNVAVEIYGVIISPHSYVYADLNGIAISNQALDLSMLNL >NC_011566.1|WP_020912840.1|2887296_2887623_+|hypothetical-protein MKENLDLENAIAALDQYGYEKKTSSDLEQARNKPQMIKYIDSLDFNLRRLLILQESVNELVENEKRLLAQQENIQTYKTKIINLSRQFNISYDEVLQVMKQQEANATK >NC_011566.1|WP_020912841.1|2888308_2888956_-|protein-methionine-sulfoxide-reductase-heme-binding-subunit-MsrQ MKNKSFKLTSRSLFWLKCLMHTIGLLPIIYLVLLVLNDRAGGDPVQYIIHFTGIGALNALVATLLISPVAKKLKQGLLLQTRRLVGLYVFAYASLHILAFFSLDLLFAWSLFFQEVVKRPYILVGAAAYVLLSALAFTSFKKVMRKMGRRWQKLHNGVYLIAILVPVHFYWSVKSEIIEPILYFVFIGVLLGVRAKKSNWWKKNSIKYFTKQERV |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_011566_4 | 3247744-3247866 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_011566_4
|
1 spacers
spacers of NC_011566_4
>4.1|3247788|35|NC_011566|CRISPRCasFinder ATTAACCCCCTCATAGTGATGAGGAGGTGTCCACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011566_4
The CRISPR arrays of NC_011566_4 >merge|NC_011566|4|3247744-3247866|CRISPRCasFinder AAACTGAGGAAGAACAGTCTTTCTTGGTTGGTATATCTAGGCATATTAACCCCCTCATAGTGATGAGGAGGTGTCCACTAAACTGAGGAAGAGCAGTCTTTCTTGGTTGGTATATCTAGGCAT >NC_011566|4|4|3247744-3247866|CRISPRCasFinder AAACTGAGGAAGAACAGTCTTTCTTGGTTGGTATATCTAGGCAT ATTAACCCCCTCATAGTGATGAGGAGGTGTCCACT AAACTGAGGAAGAGCAGTCTTTCTTGGTTGGTATATCTAGGCAT
>NC_011566.1|WP_044555936.1|3245140_3247183_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MQTISDYRSNFNMLLAFIFSLIFVSACNSNDDTEIQSDFLLEKDFADNSRLRANPEQGVVALFLEPGSATTADDSNGESGTDLIPYQYSRTLNHTFCYEDGNSDSNHSMVLNNSDGEEVLSMSANDKCVSAIMPAGEFQLVLTHGEHVESTDLTFLVTQPNSGSLSAINSTHYSIVSRLLSHIGNILISSAHAETTDDNVTTLISTNACKNCDLSDADLDNATLTFADLSGADLTDAILTNVDLFESTLTGTNFSGADMSKGDFRGSEMTYADLSDANLTGAYFSSAQLSPADLHNATVTDTDFDNANLVGATWTDGGICDITSVGFCNSTAVAESDPCDSVKQDVTDDGNTVYKCLLPAVDKQVCTTEYGGVDGGTPITSCEAIDSSELVTSVNLVDIFSQVSSSFDATLDNDTPMAILAWGGEGGIGSSGGLWTSGGDGGKAGFASTVTTLSHFLDSYGQTSFNFFIGENGTLSNIYGDGGSSTLVMIAESSPSSLEDDVILIAGGGGGGDSSGWINDGTDGADGGVAASSVIGQGTIGVGQSFDSGADGGSTDEWGDGGSGADDGKDGIGGQGGQGFLGVNSEWVNGDPGVGSNGRGGNADDSFSGAGGGGGGGGYGGGGAGDDAAGAGGGSWSIIPATTCNSAPTKETAPSTPGSSGDDFGSKNGAVEVWIFPKGC >NC_011566.1|WP_020913163.1|3243981_3244626_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKYQLIPVTPFQQNCSLIWCEQSLKGAVVDPGGNLERILEEAAKNHVQIEQVLLTHGHIDHVGAAQTLAEQLNVPIVGPHLADSFWLESLPKQSQHFGFVHCDPFTPSRFLQEGDEVTVGEQVLSVLHCPGHTPGHVVFFAKEAAIAWVGDVLFRGSIGRTDFPQSNHQDLIDSITKKLWPLGKEVQFIPGHGPLSTFGEERAQNPFVADQLFD >NC_011566.1|WP_020913162.1|3242705_3243893_+|cystathionine-beta-lyase MKKETQIISLGRDKKWTQGVINPPVYRASTMVFDTMEDLRFAAKNKANGEMFYGRRGGPTHFAFQAAIAELEGGVGTALYPSGSAAISNSLLSFLKAGDHLLMVDSAYEPTRDLCNKLLAGYGIETTYYDPMVGEGIEELIRPNTKVLFLESPGSITMEIQDVPTLSRIAHEHDIVVMLDNTWASPINSRPFEMGVDISIQAATKYIVGHSDVMMGTATANEKHWEQLRENSYLLGQCTSPDDVYLASRGLRTLGIRLAQHEQNALKVANWLNSRPEVDHLRHPAFETCPGHEFFKRDFSASNGLFSFVLKQGNQKSVTAFVENMQHFKMGFSWGGFESLILGVFGIDKLRTATKWDSSKPLIRLHIGLENVDDLIADLDAAFDRFNAELKLTAK >NC_011566.1|WP_044555935.1|3240426_3242613_+|proteobacterial-dedicated-sortase-system-histidine-kinase MFNLPIGLRAKVAVLSLFLLCLPWLGYQYVWEMEKYLRLGQEKTLEGTTQALATALHERPRLFDSQASFLTQVEQGRDLYAYPLAGPIQLDGKLGDWQPYRHRALHYGEDYQIYKRDQATPLAIDFTHMVGKYAGYLYGFFEVTDPQVIYRGKNSLSIDRNDHIAIATLAPDGQFRRYIIATTKDGWISAFELPEDPALTTPVTPEVKIQGKWLKTAKGYNVELRIPLSMVGSKLGFAIYDVNNRNTRQLDAIVGTSAIDDVNKLGTVLVPSPEIESIIKGMAHNSSRIWVVDKHGRVLAKSGDIHSDNSVWSRSTIENEGKSSWDRFKQQYLYPLYYKILTTPPKDFVDSLQDSTVLQGSHISKALQGKQGSTWRLTPDSKAVVLAAASPIWIDDKVMGVVIAEETTHGIRTLRNKALEKLFNVILTIMSMGTLALFFFASNISSRIRKLRDEAEEAIDNQGRIKKSIQGSKVRDEIGDLSRSFASIVSRLGQYTHYLENMSSRLSHELRTPVAVVRSSLEHLSLQTLNPDSRKYVDRAQEGVNRLNMILSNMSEATRLEESLTHAEKSLFPLDKVVSGCMQGYQLTYPSQRFNTDIEPQTILVEGVPEYIAQLMDKLIANALEFSHADSAIEVSLVVQSKSALLTVANYGTPLPENMSEQIFESMVSVRAQKAQDKPHLGLGLYIARLISLFHKGKISAQNRVNDQGAVSGVEIVIQLPISKEKPV >NC_011566.1|WP_020913160.1|3239734_3240427_+|proteobacterial-dedicated-sortase-system-response-regulator MKRIAIVEDEAAIRENYKDVLQQQGYSVQAYANRLEAMRAFNSRLPDLAIIDIGLENEIDGGFTLCQSLRAMSSTLPIIFLTARDSDFDTVCGLRLGADDYLSKEVSFPHLIARLAALFRRSELKDASNDNSPLIEHGLLSIDINRMQVYWNKHHIELTVTEFWMVHALARRPGHVRQRQELMQEAKIFVDDSTITSHVKRIRKKFLAQDPQFDCIDTVYGMGYRWDAQS >NC_011566.1|WP_020913159.1|3238737_3239487_-|sortase-associated-OmpA-like-protein-PdsO MKKHLIASLVIASITLSSNASAAENVENTERSHNEELIGLSSGIVVGAVVGGPVGAIIGAFAGSLLGKSVGDDDEIKTQQVMLESKQSELAALNEENQSLIALSSQYEDAQQQLTSLKMAQEQKLTELALGLNVQFKTGSSTIEPHFQQQLDDVAYAMSLSPELTLDLTGYADRRGDGDYNQALSEQRVAEVTNYLVAQGVANERLNYQAYGASSPLTAEQNFENDFFDRRVTLKLQSHDSALAANPAQ >NC_011566.1|WP_079891946.1|3236528_3238730_-|marine-proteobacterial-sortase-target-protein MTGTTQPCGLLLVRPQVVYKEIKMVSQQDAGKGLIRHCYKAVLLLSTAFLPMYTSATAAVPTSATKSAESRVEMVNAIAQGSLITYDSAGKASVSLPIKTTVNMQVSGWVNRVSLRHEFSNNQFVWVNGEYLFPLPNEAAVDGLRMYIGERVIEGEIKPKAKANALFNEAKKQGKKASLLQQKRPNIFSAEVANLAPGETLIVELNYQELVHYDNGEFSLRFPMVVAPRYKPRGEKSALSNMAAEVNSYVASTLGDLQGSESERVNLVDIEVTLDAGMPIGEINSPYHQIEVSSNGDSQAQIQLTAAKANSDFVLNWRPIVGSAPKAAIFSQQGKTHVSDLESKATAAQPQYSLVMLLPPQDKMRLSALAPRELILVIDTSGSMSGEAIEQAKASIIYALAGLSAQDSFNILQFNSNVYALSDTPLNASAKNIGRAQAYVQRLQANGGTEMSLALDKALSQQDANRERLRQVLFITDGAVGNEPQLFTQIRNQLQQSRLFTIGIGDAPNAHFMQRAAELGRGTYTYIGKQSEVKSKMVAMLDKLEKPTVTDVEVHFADGSVPDYWPASIPDLYAHEPIMVAMKLPSFSDKELVVSGQLAGQYWQQSLVIENSAEAKGLDLIWARKQIAALELSKEPANRDRIEKQVTAISLNYHVMSAYTSLVAIDKTPVRPIGDKLVNGRVLPHTPKGWQRLPQTATSSYAMLIFGGMLILLSLLYWGSFSGVGRRAKKAAL >NC_011566.1|WP_044556453.1|3235821_3236448_-|class-GN-sortase MFTTLLFIVGLSFVIQGGYMQAKAYFAQFLIQQAWQKTLDDQQEHKPWSWADTHPVAKLKFINAEHGAGDVPDRKMISANSSVENPSLYVLAGASGRNLAFGPAHVMSSAVVNGNGNTVIAGHRDTHFSLLKRVKVGQMLTLQNSQGLEVLYKVINTQVVHETDTSVMTDGGEKQLTLVTCYPFNSPVAGGALRYIVTAVPIDKVEAI >NC_011566.1|WP_044555933.1|3234748_3235771_+|diguanylate-cyclase MSNELLREAAAKLKKAVPLMLKHQIPTTPTNYALWYAYVGQSSPELNRQLDEVVNQYSTCPPSQGERLYQAYLSDPIELDVIELRQNLDAMVTDLSQSLKDTNVDANQFQSKINSNVERLNKIENEGFSIDEVLSLVKNLVSDAADIKNSTLHFTEQLAHAQSEINQLKVQLKKSEHDMHYDALTGALNRRAFNKDIKGLVEQNPQGLCLIITDIDHFKLFNDTYGHQLGDQVLKAVARRLGESCHEGSKLYRFGGEEFALLVPKSQLGRARQLAESMRRSLEKLVLKDKRKDQRVDNVRASFGVAQYQDKDSDSTLIERADKQLYEAKRLGRNRVMPIT >NC_011566.1|WP_187148502.1|3232957_3234556_-|M28-family-peptidase MNKLILASVVSALAFPAFAHSEKSDISIDLDKYRSHVKTLASDEYGGRAPLSAGEGLTLEYIEAQFKKIGLKPGFGDKYLQPVPLAKVTADQNMSLTIGELTLKNGSEFTARTQRISDSVKLENSELVFVGYGINAPEYDWNDYQGIDVKDKTVIVLVNDPGFATQDPAVFKGNAMTYYGRWTYKYEEAARQGAKAVFIVHETAPAAYGWGVVQNSNTGSKFTLVDDNNNRDQLGVMGWIQHDNAKQVFAAAGLDYEKQKALAAKSSFKPVSLKTSATLELKNSIERAESYNVMALLPGSDRADEMVVMHAHWDHLGTRVDEKGVKHIYNGAVDNASGVAGVLELARMFSLRAKEKPFKRSILFTSFTAEETGLIGAQHFAKQPPIPTKQIVSFLNIDGMNVNDSVDYILRYGKGVSEMEYYLNNAAKHQQRYVKGDPLPQNGLMFRSDHFALAQEGVPGLLFMSLGDTDPDYIAHKYHKEADDYDPSWSLGGVKQDISLISDILATLANNEDWPKWLEESDFKSRRAQDGR >NC_011566.1|WP_020913165.1|3247960_3248383_-|nuclear-transport-factor-2-family-protein MTVEQEIRSTLEDYAKAYCAKDIDSLMHIFEDSDDISIIGTGADELCIGRDSVKELFLRNFAEATASEFEWQWSKINISNDYAVVAISLIIHLEYQGSKIEIPIRWSVALRKTDRWVWLHRHASSPASNQDDGQAYPQQA >NC_011566.1|WP_020913167.1|3249151_3250441_+|alpha/beta-fold-hydrolase MTPELSFAGMLAYKHRFTLPLDYQQPNGETIEVFARELVSPENQHKQLPFIVFFQGGPGFGAVRPAATGGWIKRALQEFRVLLLDQRGTGLSTPVSSASLSHLSAAQQSEYLSHFRADNIIRDAESIRQQLVADDKWSILGQSFGGFCVLKYLNDAPHGVAEAYITGGIPSLSRSADEVYQATYQRVIAKNNDFFTRFSDAQGLVKSLAQHISDNEVRLATGEQLTVEMLQLLGINIGMEQGPESVYYLLEHALISTPSGTIVNPLFLAHFCQLLDYNTNPIFALLHESIYCQNSASNWAAHRVRQQYPQFNYSADKPFLFTGEMIYPWMFEQFNNLKPLKSTASTLAEKDNWPMLYDQTKLASNQVPVAAAIYSEDMFVEMRYSLETAEKVGNLKYWLTSEYEHNGIRMDGEHILDRLIAINRGEKLR >NC_011566.1|WP_020913168.1|3250579_3250777_+|DUF4250-domain-containing-protein MDITHLEQLSSETLLGIVNEKLRLTCSSQAALFYELDIDKQLLESKLGDIGYHYDAISNQYKNPK >NC_011566.1|WP_187148566.1|3250942_3251338_+|GFA-family-protein MNKGSCLCNKVKYEIDGELKDVLNCHCSMCRKLHGAAFRTRAQINSTDWRTIEGKEFIKFYESSPGEHKGFCSECGSNLYTKFDAKPNVLGFPLGTLDTDPKVTPSRHIFVGSKAPWHEIADDLPQQREYE >NC_011566.1|WP_020913170.1|3251427_3254568_-|CusA/CzcA-family-heavy-metal-efflux-RND-transporter MDTIISFALKRRLLVLAITLLIALLGVYNTLKLPIDAVPDITNVQVQINTAIAGYSPLESEQRLTYVIENAMAGIPSLDYTRSISRYGLSQVTVIFEEGTDIYWARQQISERLQGVRSELPLEAEPALGPVSSGLGEVFTYSIRALEGAVKEDGTPYNAEDLRTIQDWIIRPQLVKVKGVTEINSLGGYEREYQVAPVPAKLLAFKVTVDDVITALERNNRNAGAGYIERSGEQWLVRSPGQLKDLESIRQVVVTKRDDAPVRIGDVADVFYGKQLRTGAASQNGKETVLGTAFMLLGENSRVVAKEVGEKLKLVNASLPEGIVAEAVYDRTTLVDKAIETVQKNLFEGAVLVIVVLFALLGNFRAALIAALVIPLSMLFAITGMTANRVSGNLMSLGAIDFGIIVDGAVIIVENALRRLGMAQKQYGRLLVLEERIKVVAEATKEVFRPAVFGVLIIMLVYLPIFALSGVEGKMFHPMAFTVVAALIGALLFSVTFVPAAIALFVKGKVNEKENWLMANARKAYEPVLFFSLKRPFIIIAGAIVLMAVTSVQLSRLGSEFLPKLDEGDIAMHAMRITGTGLEQSIEMQKKLELVISELDEVERVFSKVGTPEVATDPMPPSVADTILIIKPRSQWADPSKTKAEFIEELREHVEQVPGNNYEFTQPIEMRFNELIAGVRADVALRIYGDDLDTLKDAGDRAVGLFQGIDGATDVRVEQMSGLPTLSVEPNRDHLALLGLTIVDVQQALQTAVSGVPVGLIYEGDRRFKLVVRMDDDISQDLDKLANIPIALPAELNPDLSYVPLGEVAELHFKVGPNQINRQSGKRHVVVTANVDGRDLGSFIQDTKQVMADELALPSGYWSEYGGTFEQLESASNRLMILVPLTLLLIFGLLYSAFGSVRDSLIIFSGVPLALTGGVLALVLRDMPLSISAAIGFIALSGIAVLNGVVMLSFIKELKLQGLELIEAIKQGASQRLRPVMMTALVASLGFVPMALNVGTGAEVQRPLATVVIGGIISSTLLTLVILPVLYSLVYRYSRQQSSAMS >NC_011566.1|WP_020913171.1|3254580_3255870_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKLNFDTLPAQLAATLLSFSLLTAGTLAPIAVANASGGHGHEEEEEHQEEGPHGGRLLEQQDFAIEVTMAEAGIPPEMRIYAFYKGEPVNPTEVDLSLTLARLGGVIDNVSFTAEEQYLVSEHSVREPHSFDVEVHAGFKGVDYDWHYENHMGRVTINDRLLALSGVETESSSAQTLHFVDRLFGVVSAITDKQFSVSAPYTGVIEQLNVTVGDTVAKGQVIATVRNSSTLQRYTVKSPANGQVTEQMLSVGDSTFNKALLRVSDLSNVWIDMSAFPKNLARVALGQKVTIGDDEHGNSEETHSEGKAVSTISYIAPVMTGGHIARVRAVIANPDGHWRPGMHVQANIETRSKDVALAVRADALQTFNDKPAVFVKHGNTFEVRPLTLGESDGEFVEVLEGLEPNAEYVTKNSYLLKADIMKNAAKHVH >NC_011566.1|WP_079892000.1|3255869_3257153_-|TolC-family-protein MYCAKSIATEQGSSKQQALAPKTDAGIELAWALEQSLLNNIALKSFPYSLRASEALSLQAGITPNPELSVSVENILGTGDMQGVDNAEITLALSQLIELGDKRQRRIDYAQASQRQQLSDYESTRLQVLAQTTERYYQLLRLQALQTWIERRIELEQASLAAIKDRASAGAVIQADVSKMQLRLVRSNALKQRIDGDFNVAKKKLSAMWSSEVKFARANDELQPLNVLPTAASVLNAIETAPQYLQLLSVERLLIAKRRMEESKATSDITLGVGVKSYDGFDDGALMLNFSMPLQFSNPNEGNILAAKAEEDKAHEQQRFAREQLKLTLLELHQSMLNNAKQAQMLKAQVLPLAKKLQQHTQSAYQTGQVNVLQLADAQSELFSVERELIEAKTAVYMALLAIERITGQSMTVANTNMKPVVAMENR >NC_011566.1|WP_020913173.1|3257468_3257858_-|hypothetical-protein MFNSQISMQMFQSKLTLVLLLVVFVSQLFPTCVAADIHNVELGMSETHHFENTLPLELQQACCDSALNACSHMVDVSEQDEHSDDFHTACHPPVELGTVAKSTGVEDRALFAISYQNRSYAPPIPPPYC >NC_011566.1|WP_020913174.1|3258011_3259997_-|DNA-topoisomerase-III MILYIAEKPSLGRAIADVLPKPLKKGEGFIRAANGDCVSWCVGHLLEQAEPDAYSPEYKSWKFEHLPIVPDVWKMKPKYKMRGQISVLRGLVKEATQLVNAGDPDREGQLLVDEIIAHLGVKGNKLTQAKRLLISDLNPQAVKRALGQLRLNREFIPLSTSALARSRADWLYGMNMTRAYTIQGRKVGYQGVLSVGRVQTPILGLVVRRDEEIAHFVSKPFFEVIAHLTAEPQQTFTAKWQPSEACQPYMDEDGRVLSKGLAQNVVGRITGQPATVEKVNAQDKKQNAPLPYNLSSLQIDAAKRFGMSAKTVLDTCQSLYERHKLITYPRSDSRYLPQEQHGMAPSVINTVNKGAPELTQGIDAPNAKLKSKAWNDKKVDAHHAIIPTEKVANLSSLSPAEKQVYLLVARQYLMQFYSAYQYKETQVEIIIAGGLFKTKAKQEIAKGWKLLLKQSKASTSSDSNGQDEDELATIPPLTIGQKLFCDRGQLLEKQTQPPKHFTDATLLSAMTGISRFVTDVEIRKILKDTDGLGTEATRAGIIELLFKRSFLVRQGKTIVATDVGKGLINSLPLSATTPDMTALWENNLDSMSRKETQYQAFMQPLISKLDELITQAGSVLPTALQGVKSPTPFKKKSYARKGGKGQSTTKKNVGKPRMAKS >NC_011566.1|WP_044555938.1|3260199_3260472_+|hypothetical-protein MLTTMTNPGVRLDRLLLFHFLLITAWVILAAPLLSQNRTIEPLVLASLTITLSCISTLIGLKLEHGFSKVAYTLLFVSWMAVWAQQLFNL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_011566_5 | 4115699-4115794 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_011566_5
|
1 spacers
spacers of NC_011566_5
>5.1|4115725|44|NC_011566|CRISPRCasFinder CATATTGCCGGGACTTACGTACCGTTATTGCTACATACTCTATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011566_5
The CRISPR arrays of NC_011566_5 >merge|NC_011566|5|4115699-4115794|CRISPRCasFinder TTTTACATCCTGAGAAAGATGGTAGCCATATTGCCGGGACTTACGTACCGTTATTGCTACATACTCTATATTTTACATCCCGAGAAAGATGGTAGC >NC_011566|5|5|4115699-4115794|CRISPRCasFinder TTTTACATCCTGAGAAAGATGGTAGC CATATTGCCGGGACTTACGTACCGTTATTGCTACATACTCTATA TTTTACATCCCGAGAAAGATGGTAGC
>NC_011566.1|WP_044556502.1|4113506_4113845_+|hypothetical-protein MFIHNVNGIDWLVITAFEELKTIFVEEAGAIPFCFSTASELNLIDQAKRTYGYLPTLSGVITDTGTFQSQDNEEDLNPQLACLVEGRGRVFIYCGGFVAFVDDEQTFITRMD >NC_011566.1|WP_143711211.1|4109552_4111922_-|hypothetical-protein MMKIFDMKVATLATLIGLALAGCSGDDGTNGKDGAPGTPGTPGTPGIPVATDAKALTVAVDTIAVGATSDVTFTVTNEKDLPVVGLEKFGFILSGLEQGTDGDASNWKLLSSEACPASKYSKCGNLVDNQDGTYTYSFEKDVTTESAFAITDEKTLRLVMRTGGEAVGATELSYENMHYDFRGQGLEPLYSKNVVNNQNCVSCHDDFTIHGGKYTEVETCVACHADNKVSDISKVFPMLAHEVHIGVIPAPVGGCDNCHAENEQATDFANWKNVPTQETCITCHTDVNFKEGIGHWPYQDNAQCANCHTSDTLEMVHLSTYKGQNERRENLHLTVTEAKMVDAPEAKANIDANLDTDKTGYVQLTVDILDKNGNTRNEQLDLVKYMYYAEFYINWGGQDMGMDRGKVLRVHTNKENFPGYVDEPIVLNYENGKTTFEIGPFDLEDDFDGDLNDSYGMVTPRIWFCIDKDGETIQDCDGKTDWSNGAAGYNWQHFFNKEGMLEERPRRQIVTNALCGDCHGTTTSEDGFVQMTLNCRSCHSVVKNDSTYFGTTCASGSVDSDGDGSLDPMVMMKDLMPRAERDWTTASNAGEECVACHNANNMPTQVIRNSQTKQGDEDYIEQLTMSHPDQKVWIHAMHANNRANQSGEGWKRNVEYSADLANCAKCHVEDSFDAKYLVGRKPLALDLDYMDTYDGLDPANGKDTSGNKRYAVDAVADAFVSPTAAVCLSCHGKRAAEEGEDRRQVRKDVVSHMKQNGAQFGVEMGQYTGEESCAVCHDLNNLKESHNLK >NC_011566.1|WP_020913916.1|4108005_4109364_-|winged-helix-turn-helix-domain-containing-protein MKITEFLIIDLDARDLVDLRTTERHALSLAELEVLKCLVSHVGDVVSKEQLNTAGWPGRVVAPSSLTQCMSSLRKKLVAQTDIELKNIPRYGYSLCIVDEHDIATDETKAETVSTAVQPQTEEGHVAFKSKRLNINLASRIVWSTLVVLAGIIITLHFSGGLKKAVNYIALLAKPQIAAITTQNFEFNHTSSLVSKVFLDSQSTDTSQQATSADELIANWFNYEDVLAASSEKQLFTYDNGQYESIALCNDFGSTCSDRQPLNLVRTADAPVTPLDIQWLADTKLRMEQVTYNKILLDKFETENSGVVEDVYRADVYYYSDTKNVVRADVRLSMIFDSDNRGKLVAAACITDDMLREISIRYQFSGDFKLKQSLIDGKVVKTFLVDVDERSFTSPQQVSKESATIYREIRKNVLQNEQMVIRQVYQDDDSGVWMLPLWGETMVWAHREQVSL >NC_011566.1|WP_044556501.1|4106947_4107895_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MPDIKLFAGNATPSLAKKIADRLFCKLGDAEVGVFSDGEISVQINENVRGADVFIIQSTCAPTNDNLMELIVMVDALRRASAGRITAVIPYFGYARQDRRVRSARVPITAKVVADFLSSVGVDRVLTCDLHAEQIQGFFDVPVDNVFGSPVLLEDMLAKNLENPVVVSPDIGGVVRARAVAKLLDDSDLAIIDKRRPQANVAQVMHIIGDVQGRDCIIVDDMIDTGGTLCKAAEALKEHGANRVFAYATHPVFSGNAAKNIAESVIDEVIVTDTIPLSPEIAALEKVSQLTMSTVMAEAIRRVSNEESISAMFKH >NC_011566.1|WP_020913913.1|4106028_4106883_+|4-(cytidine-5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol-kinase MTAALSLGWPAPAKLNLFLHINGRREDGYHELQTLFQFIEHCDFLDFKVTENTNLKLHSNMSTVVADNDNLILRAAKSLQEYSQCQQGAEIWLDKRLPMGGGLGGGSSDAATTLVALNSLWGLNIPIDELAKIGLKLGADVPVFINGFSAFAEGVGEQLQPVYPPQPWYLVVVPDVHVSTAEIFQDPALPRNTPKHSLTSLMESPWKNDCQELVAKHSPQVAKALAWLLEYAPSRMTGTGACVFGQFEQEQQAKDALAKLPTSMNGFVAKGANKSPLMLRLAQC >NC_011566.1|WP_020913912.1|4105366_4106032_+|outer-membrane-lipoprotein-LolB MNNLSSFTKNTYAWVILSFIFISGCSTTIPDNLVPVSVEQAEQAQAWEMQGKLAVRTADDKFSTNLYWLHTQTSDELTLTTMLGTTVLSLSSTAGDTLLELDGKTYTDTNAQRLLARITGWTIPIDALPLWITGQLSEGDKVMSQDSLNRPIKLINLNQRPAWEVSFKSWQTQSGAELPRLLEINRDDIRLKIQVSKWQALLPEKQIVTNQPNSTANESSL >NC_011566.1|WP_020913911.1|4103845_4105096_-|glutamyl-tRNA-reductase MSLVAIGINHKTATVDLREKVAFAPDRIHDAMKSLATHTQSGEAVIISTCNRTELYCNNGEEADVVQWLEDYHQLSHADVEPCLYQFKDQEAVKHLMRVSAGLDSLILGEPQILGQVKQSFVKAKEAGTVATTMDRLFQNTFSVAKKIRTETEIGAAAVSVAFAAVSMAKHIFSSLSTTQVLLVGAGETIELVARHLKDNGVKTMVVANRTISRAEAMCDEFGATAITLEQIPDFLPKADIVISSTASPLPILGKGMVEKALKQRRHQPMLLVDIAVPRDIEAEVADLDDAFLYTVDDLQSIIEQNMASRREAAEQAELIADDQSYQFMEWIRSLESVDSIREYRTQSMAIKDELVERAVNKLAQGGNSEQVLLELANKLTNKLIHAPTQALTAASRQGDLNSLGQLRTMLGLDKD >NC_011566.1|WP_020913910.1|4102746_4103832_-|peptide-chain-release-factor-1 MKDSVIRKLEGLLERNEEVLALLSDAGIIADQERFRALSKEYSQLEDVVKAFKSFQQAEEDLESAKEMMEEDDAELKEMAQEEYKAAKETIETLESELQILLLPKDPNDDNNCFIEIRAGAGGDEAAIFAGDLFRMYSKYAESNRWQIEVMNTNEGEHGGFKEVIAKISGEGVYGKLKFESGGHRVQRVPETESQGRVHTSACTVIVLPEIPEAEAIEINKADLKVDTFRASGAGGQHVNKTDSAIRITHIPTGIVVECQDQRSQHKNRAQAMSVLSARIQAVEDEKRRSEEDSTRRNLVSSGDRSERIRTYNFPQGRVSEHRINLTLYRLGEFMEGDIDVVIEPLIQETQADMLAALGEG >NC_011566.1|WP_020913909.1|4101863_4102706_-|peptide-chain-release-factor-N(5)-glutamine-methyltransferase MQLTISGALKWASSQLETISDSAMLDAEVMLLHIINKPRSYLYTWPERDLDSAQVSEFKQMLAKRLRGNPIAHIVGEREFWSLPFRVNPTTLIPRPDTEILVETALNLPLAENARVLDLGTGTGAIALSLAHERNEWQVCAIDKVEEAVALAIENRVNLKLEHVDVFQSDWFDAVECYDFNLIVSNPPYIDEEDEHLSQGDVRFEPQSALTAPLKGFADLFHIANCARDYLAPGGYLLLEHGYQQAIELREKLIELGFENVATVRDFGSNDRCTIGRWPR >NC_011566.1|WP_020913904.1|4098273_4100349_-|thioredoxin-family-protein MSVTEIKLKTIKYFLLVLSLLSSSVLAQSTDWIENPNHPPVQVRFMLTGELDPVSNTLPAVLEVKLDDDWKTYWRSPGEGGIAPSIKWDTSGNLADVSWDWPAPEAFSLLGLQTFGYKHDVVFPMQVKVKDINQPFELKGLLTLSSCTNICVLTDYDINLDVDLKTITADPGAMFAYNKAKVSVPQRKTSADINLGWDNSKQQLQVILKEGEWQYPQVIIDGEPDVSFKLKHIETTEDEQGSKQLKAVFDGSSWLGEADVIGKSLNITLIEAENAIEYTAVVTAAEIVNHSSPLWTMMLIALLGGLILNVMPCVLPVLGMKLSAVVAAPDLNKTQIRQQFLASALGILVSFWLLAGFILTLKMTGQAIGWGVQFQNPWFIGFMALVTSVFAINMLGAFEINLPSSLQTKLATSGGNDNRGHFLQGMFATLLATPCSAPFLGTAVAFALGADVVSLFVIFTALAVGMALPWLLVAAAPQVANYFPKPGRWMSVVKVIFAGLLLLTSLWLISLLANFISAGILWGVAAILLLLFIVLMARLHGAAAVIASVSMAILISAITAFATSDNWARPLPTDLSWTPLQQSDIQAQVAKGQTVFVDVTADWCITCKANKVGVILQDPVYSRLKQADMELVIGDWTKPSAPITNYLQSHNRYGVPFNVVYGPNAPDGIELPVILTAKQVIDAINQASAQL >NC_011566.1|WP_020913920.1|4116655_4117747_-|redox-regulated-ATPase-YchF MGFKCGIVGLPNVGKSTLFNALTKAGIEASNFPFCTIEPNTGVVPVPDSRLDALAEIVNPERIMPTTMEFVDIAGLVAGASKGEGLGNKFLANIRETDAIGHVVRCFEDDNIVHVANKVSPASDIEVINTELALADLDSCERAITRQAKRAKGGDADAKFEVAVLEKMRPVLDEGKMLRSMELTKEELAAVGYLNFLTIKPTMYIANVSEDGFENNPHLDTVRAIAAEENAVVVAVCAAIESELAEMDAEDRNEFMADLGLEEPGLDRVIRAGYDLLTLQTYFTAGVKEVRAWTVRIGASAPQAAGVIHTDFERGFIRAQVMAYDDFITYKGEAGAKEAGKLRVEGKTYIVKDGDVMHFLFNV >NC_011566.1|WP_044556503.1|4117798_4118383_-|aminoacyl-tRNA-hydrolase MSNIKLIVGLANPGAQYERTRHNAGAWYVEELARVCGASLTLDSKYFGMTARATLHGKDVRLLIPTTFMNLSGKSVGALANFFRIAPEEILVAHDELDMSPGVAKFKLGGGHGGHNGLKDIIAKLANDKGFYRLRIGIGHPGDKNQVSNYVLSKASPTDQELMDAAIDEAVRSTEILFNEDMAKAMHRLHSFKA >NC_011566.1|WP_020913922.1|4118609_4119809_-|FAD-dependent-monooxygenase MEQLKNKNHSYDAVVVGGGMVGAATAIGLAQLGLTVAVVEAFAPKAYESSQPLDLRVSAISAASEELLSRLGALKFLKTMRQVAYKGLETWELDGCITQFHSDQIGASHLGHIVENRLIQLSLWERITQLDNISLYCPVKINQLQRSHGDDAIDVSLEDGHVFSTKLLIGADGANSYVRQWANIGITGWDYAQSAMLINIETGSDEQDVTWQQFTPQGPRSLLPLPGKNASLVWYDDANRIAQLSQLNNTALKKQIDQHFPERLERDFTVVNKASFKLTRRHAQRYYSDNIVILGDAAHTINPLAGQGVNLGFKDVDALITTIESQLHNESGWWNSEVLKQYQGCRYRDNQLMMSAMDMFYASFSNDILPLKLLRNSALKLANIDSPIKKYVLKYAMGF >NC_011566.1|WP_020913923.1|4120394_4120709_+|hypothetical-protein MKKSIYAALMIIIISPFTALAANDQQDMDRMSVVYRAPLEYAAYQYTTEVLSNFNLQLLADIYIQARMSSLQMAKEHSLISNKLSMEQQHDESLASTGVMSSAE >NC_011566.1|WP_044556051.1|4120804_4122232_+|tRNA-(N6-isopentenyl-adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase-MiaB MSKKLHIKTWGCQMNEYDSSKMADLLDEYEGYELTDEAEEADVLLLNTCSIREKAQEKVFHQLGRWKTLKDKKPGLIIGVGGCVASQEGKAIKERAQCVDLIFGPQTLHRLPEMLDQIKDGKKAVIDVSFPEIEKFDRLPEPRADGPSAYVSIMEGCSKYCSFCVVPYTRGEEVSRPLDDIILEIAQLADQGVREVNLLGQNVNAYRGATHDDEICTFAELLRYVAAIDGIDRLRFTTSHPIEFTQDIIDVYEDTPELVSFLHLPVQSGSDLILTQMKRGHMAIEYKSIIRRLRKARPDIQISSDFIIGFPGESKQDFADTMKLIEDVQFDHSFSFIYSARPGTPAADLPDDVTLEEKKERLAILQDRITQQAMRYSRHMVGTVQRILVEGPSVKNPMELRGRTENSRVVNFEGKPEHIGGFVDVEIVDVYTNSLRGVFVRAEDEMDLRRDLRPSDIVAKYKLDDALGVTQFTPS >NC_011566.1|WP_020913925.1|4122394_4123435_+|PhoH-family-protein MSNKLTTLNLYLEPAETRRLVSLCGPFDDNIKQLERRIGVEISYRNNHFQIVGAPQNCLTANNLLKELYIETQAVRGSTPDLEPDTVHLAIQEAVALDLEAPRDEKELYIKTKRGVIKPRNPNQSDYVRNIVSHDITFGIGPAGTGKTYLAVAAAVDALERQEVRRILLTRPAVEAGEKLGFLPGDLSQKVDPYLRPLYDALFEMMGFEKVERLIERNVIEVAPLAYMRGRTLNDAFIILDESQNTTVEQMKMFLTRIGFNSRAVITGDITQIDLPKHQKSGLRHSIEVLGEVSEISFNFFQAKDVVRHPVVARIVEAYEAFDLKAQTSKGNKDSQYQLQEVPNHD >NC_011566.1|WP_020913926.1|4123427_4123898_+|rRNA-maturation-RNase-YbeY MTNTATSVELDLQVAVEGVELPSVQEMELWVKTALRDSMDQAELTIRIVDVAESQMLNSTYRGKDKPTNVLSFPFEAPPGIELPLLGDLVVCAAVVKQEAIDQNKPLNAHWAHMVVHGCLHLLGYDHIEDIEAEEMESLETQLIESLGYNNPYQEQ >NC_011566.1|WP_020913927.1|4123925_4124801_+|CNNM-family-magnesium/cobalt-transport-protein-CorC MSDDIPPSTSAQKKGWLDKVSQLFQGEPQNREDLVDVIHDAEQREVISEDTREMIKGVLEVSDLRVRDIMIPRAQIVALQIDNTVEELLSTVIGSAHSRFPVVNEDKDHIEGILLAKDLLQYGFKNSEKPFELGQVIRPAVVVPESKRVDVLLKEFRSQRYHMAIVVDEYGGVSGLVTIEDILEEIVGDIEDEFDHDSAEETEIKQVAKQVFMVKALTPIDDFNEAFATQFSDEEFDTVGGLVSHAFGHLPERDEKVTIEGIEFKVVNADTRRLIQLRVKFPDKTVSESIA >NC_011566.1|WP_020913928.1|4124836_4126393_+|apolipoprotein-N-acyltransferase MLNNIRAAAHHTYLRLVLAFAAGAMTALAFAPYSYWPLYLIAMAFALYQSAGLSAKQGMQYWLSFGFGCFAIGISWVHVSMDTFGGMPLIASIALMALLALYLAIYPAITGYLLQKLAPTTSLSRNLMLFPALWTLTEWARGWVLTGFPWLWAGYSQTQGPLKPIASMTGTLSLSFVVALLAGAMALAAAKRWRSILVIVPVLAILTLIAPLTSTVESKDESLSVALVQGNIPQSMKWEPDALWPTMLKYMDLSRAEFSADLIVWPEAAIPAPEHMVKDFLYNANQAANLNNSAIITGIISQRGNHYYNSLIVLGNYGAKQQEQADYYGEEHNEFKKHHLLPIGEFVPFESLLRPIAPFFNLPMSSFNRGDFKQENLNAVGHQISPAICYEIAFPEQLRANMNDTTDLLLTVSNDAWFGTSNGPLQHMEIAQMRSVELGRPLVRATNNGVTAVVDEHGNITHQLPQFEAGVLTADIALVKGHTLFTYIGQWPILLLSTLLFGFAMFSSMKRSRFNKKG >NC_011566.1|WP_044556052.1|4126467_4128210_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKFVHKIVISASLILILSLGGLSSYQYFQVKQQINDQVSQSVAELADSMKNNIEAVMAEKSDLTRLAVSLFESDLSDEHFQKVLGQPVIKEHFILAGMGLESGHFVGNESSWQPQNYDPRTRMWYQEVKQKGKQLFTEPYADASSGEILVSAAAPLFSNGEFKGALFADISLRSLADISNQANLFGAGHAFIVGNNGNFIAYPDASKNGKPMSEVFGRQLDINQQTAHISINGKTHSVIFTPLSGLDWSLGIVLDEEVIYAAADRLRGDAIFYSLLALVLATLVMAGFIRHMMKPLDVLNEAMKDVASGEGDLTRRLSTDSDVEFASLAGSFNSFVIKLQKLIQQVKVIGGEVAQGTEMTAEGALAASRAMERQTQEVEQLATAMHEMAVTASEVASNAQTAAFAVQQADTAVSNGVVAVNQTTNLLALNAAIEAARAGESGRGFAVVADEVRSLAARTQESTSEIKDKIEKLQTGVAAVVNVMDESRGTTKETVEKASTANDTLEDIRQSIQEITDMNLQIASAAEEQSQVAEEMNKNTANIKDLTVEVAENANQADVAMVTQMKQVKEQETLLNQFIV |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_011566_2 | 2.1|1020844|33|NC_011566|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1020844-1020876 | 33 | NZ_CP025614 | Niveispirillum cyanobacteriorum strain TH16 plasmid unnamed2, complete sequence | 164232-164264 | 8 | 0.758 |
1. spacer 2.1|1020844|33|NC_011566|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025614 (Niveispirillum cyanobacteriorum strain TH16 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gtagcactgcgcccgctggccaaacttctgccg CRISPR spacer gaacagctgcgcccgctggccaaacatctggac Protospacer * * .******************* ****
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
1381221 : 1391827
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011566|1381221:1391827|DBSCAN-SWA AATGAAAATTTTAATTAGTAACGATGACGGTGTAAATGCAGTTGGCATTGCTGCATTGACCAACTCCTTAAGCTTGATTGCGGAAACTTTAACGGTGGGCCCAGACAGAAACTGCTCTGGTGCTAGTAACTCTCTGACCTTGACGAATCCATTGCGGCTGAATAAATTAGACAATGGTTATATATCTGTGAGTGGTACGCCTACCGATTGTGTCCACCTAGCGATAAGAGAGCTGTATCAAGATGAACCTGACATGGTGGTGTCAGGTATTAATGCTGGTGCTAATATGGGAGATGATACTCTCTATTCTGGAACCGTTGCAGCAGCAATGGAGGGGCGATTTTTAGGTTTTCCTGCAATAGCAGTTTCATTAGTGGGATCTGAACTAAAACACTATGATACGGCAGCACATTTTGCATTGAAGATAGTTCAGGGCCTAAAGAAGAGTCCGATTGCACAAGATAAAATCTTAAATGTAAATGTGCCTGATCTGCCTATCGAGGATATTAAAGGTATTAAAATCACGCGACTTGGTGCCAGACATCGCGCAGAAGGTATGGTCAGGACACAAGATCCTGCGGGTAAAGAGATCTTCTGGTTAGGCCCGCCAGGTGATAAGCAAGATGCGAGCGAAGGCACAGATTTTTATGCCGTAGAGCATGGCTATGTTTCTATTACACCATTAACGGTTGACTTAACCGCTTTTGAGCAGTTACCTGAAATGACGACTTGGCTTGAGTCGCTAGTTTAATCACAACAATTAGCACTGTTAATTTTTGCTATAGGTGCTGCAACTTAATGATTTATTTTAATTGGAACTGTTATTTATGGATCGGCTCGCGTCAACATCGGCTTTAAACCTAGCAAGAAGTTTATATGAAGCAGGTATTCGTGATGAGCCGGTCTTAAAAGCGGTAGCCAATACGCCCAGAGAGCGGTTTTTAGATGCGGCTTTAGGACATAAAGCTTATGAGAATACCGCCTTGCCTATTGGGCAAGGGCAGACAATATCGCAACCCTATATTGTTGCGAGAATGACTGAAATTCTACTGCAGTGTCAACCTCAAAAAGTGCTAGAAATTGGCACGGGTTCTGGTTACCAAGCGGCAATATTGGCGCAACTGGTTCCCCAACTTTGTACTGTAGAGCGTATAAAGAGCTTACAAATACAAGCTAGACAACGTTTAAAGAAGCTAGATTTACATAATATAGCTTTTAAATACGGTGATGGCTGGCAGGGCTGGCCGAGTAAAGGCCCATATGATGCAATTATGGTGACTGCAGCAGCGGCAAGCGTGCCGAATGCATTAACAGAGCAGTTGACGGATGGTGGAGTACTGGTTATTCCTGTAGGGGAAGCTTCACAACAACTACTTAAAGTCACTCGTAAGGGCAATCAGTACGTCTCAGAGGCTATAGAAATCGTTCGGTTTGTACCGTTAATCAATGGCGAGCTTGCCTGAACGATTTATATCTGTGTAATATTTTAGTTATCGTCGCAGACTAGCGATTTGGGATGGCCTGTTTATATGAAGTTTTTACCGCACTTCACTATCGTTTTTACTTTGTTATTAGCCGGTTGTAGTTTTCAGGCTGATCGTCCCGCGCCTGTAGAGTCACTCAATTACGCTAGTAAACCTTCACACGATAAAGGCTCTATCACTGCTAGCCGTTATAAAGTGAAACAGGGAGATACACTTTACTCCATCTCTTGGGGAGCAAATAAAGATTTTGCCCATGTCGCCAAGATAAATAATCTTGCAAAGCCTTACACCATCTACCCTGGACAGGTGTTGAGTCTAAACTCTAAAAAATCTGTTACAAATAGCAATACTGCCAAAAAACCGTCGAAATCAGCATCAAAACAGGCTGCGGTCGCACCTAAATCTTCTGAAAAACAACTGGTTACATCATCTACTACTTCTCAAGGGACCGCTAAAGTAGCGTCAAAAAAACAGCTTGATCATGTGGCAAAGCCTGCGTATTCTGTTACAGACAATCAACAAACTGTTAACCGAGTTATCCACAGGCAAGAGTCAACACTGCCGAAAAAGGTAAGTCGTTGGTCCTGGCCAGTGAAAGGTAAGATGATTGGTACTTTCTCAGCCAAAGAGCAGGGAAATAAAGGAATAAAGATCGCGGGTAATCGTGGTGATGCAATTAAAGCCGCTGCTAGTGGTAGAGTGGTTTATGCAGGAAGCGCACTACGAGGATACGGTAATTTAGTTATTATAAAACATAGCGACGATTACCTCAGTGCTTACGCACATGCTGATAAGATCTTAGTAAAAGAAAAGCAAGCTGTTAATGCTGGACAGACAGTTGCTAAAATGGGTAGTACGGGCACGAATCGGGTCATGTTACATTTTGAGATCCGTTATCATGGGAAGTCAGTAAACCCACTTAAATATTTGCCTAAGCAATAATTGATTAGGCTGCCAATTTGGCAAATCGGAGGATAGTGAAGTGCAGTAAATAAATTGAAAATTCGGGAGATATATTATGGGTAGAACTAATAACGCCGTTATGGCAGAAGAACCTACGAATGTTTCTGTAAAGGAATCCAAATCAGACCTCAGTAAAAAAGCAGTTAAAGAAGCAGAATTAGAACAACAAGTACAAGACGATTTACAAAAAAACCTCGATGCAACTCAACTGTATCTTGGCGAAATCGGATTTTCCCCCCTTCTCAGTGCAGAAGAAGAGGTGTTTTTTTCACGCAAGTCTCTTAAGGGCTGTGAAAAATCACGTAACCGCATGATTGAAAGTAACCTCAGACTCGTGGTAAAAATTGCTCGCCGATACAATAATCGTGGCTTAGCGCTGCTTGATCTTATCGAAGAGGGAAATTTAGGCCTAATACGCGCAGTCGAAAAATTTGATCCTGAACGCGGTTTTAGATTCTCAACCTATGCCACTTGGTGGATTAGACAAACAATTGAACGAGCAATAATGAATCAGACTCGTACGATTAGATTACCTATTCACGTTGTTAAAGAGCTCAATGTTTACTTGCGTACCGCACGAGAACTCGCACACAAACTTGATCATGAACCGACAGCGGAAGAGATTGCAGAGAAGCTTGACCTATCAAGTAGTGATGTTAGTCGTATGCTAAAGCTTAATGAACGCATTACCTCTGTGGATACCCCATTAGGCGGTGAAAGTGATAAAGCACTGCTTGACGTATTAGCCGATGATGACAACGTTGGCCCTGATTATAAAGTTCAGGACGAAGATATGTCGAAGTCGGTGGTGAAATGGTTAGATGAACTTAATACCAAGCAAAGAGAAGTGCTAGCGCGCCGATTCGGGTTATTAGGTTATGAGCCATCAACACTTGAAAACGTTGGCAAAGAGATTGGTTTGACACGTGAGCGTGTACGCCAAATCCAAGTAGAAGCGCTAAAGCGCTTGAAAGACCTGCTTGGGGCTCAAGGGCTTTCAGTTGAAGCTATCTTCAGAGTCTAATACCAATCTAGTAAGTGTTAAGAGATAGCCTAGCAAAAACGCTTGATAACAAGCTGGAAATTTTCGATAAGTAGTTATCTCTACAATTAAAATTTCTAACGACGTTATCGAGTGGTTTAACAAGCTAGGGTGAGCAGTTATTGACTACGATTGGTATAAAGTTACTGATAATAAATTTAAGGCGCCATTGGCGCCTTTTTTGTATCTCTTGATTACAAATTACCTGGCCATTTTCTTCAAGTTGTATAGGTAATCGAGAGCCTGTCTTGGGGTTAATTCATCAGGGTTTAGCTTTTCAAGTGCTTCTATCACTGGTGATGTCGGCTGAGTTGGGAAGCTGATTGTCTGCTGCACTGCCATCTCTCCATTTTTAGATTGCTCCAATGCGTGATCTCGGCTTTCTAAATGGTGAAGTTTTTGTTTCGCTGCACAGATAACACTGTTAGGAACACCTGCAAGTGCAGCAACTTGTAGTCCGTAACTACGGCTCGCTGGACCTTCCTGTACAGCATGCATAAACACGATACTATCACCATGTTCAACGGCATCTAAATGCACATTTTCGACATTTTTAATCTGCTCAGGCAGTTGGGTTAACTCGAAATAATGAGTGGCAAATAGGGTCATAGCGTTTAAATTATTTGCTAAGTACTCGGCTGCAGACCACGCGAGAGAAAGACCATCATAGGTAGATGTTCCACGACCAATTTCATCCATTAGCACTAGACTATTTGGCGTCGCATTGTGGAGTATATTTGCCGTTTCGGTCATCTCCACCATAAAGGTTGAGCGGCCAGATGCTAAATCATCTGATGCACCAATGCGCGTAAATATCCTATCAACAGGGCCAATAACCGCATGCTCTGCGGGAACATAACATCCTATATGTGCCATTAATGTAATGAGGGCAATCTGTCTCATATAGGTGGATTTACCCCCCATATTAGGTCCTGTCACGATCAACATCTTACGCTGTGAATTTAGCGTCACTGGGTTGGCGATAAAGGGGGATTGGCTTACTTGCTCGACGACGGGATGACGACCAGCTTCTACGTGTATACCTGATGCATCGGAAAGCTCTGGGCAGGCATAATTAAGTGTTTCAGCGCACTCAGCGAAATTGCATAATACATCTAACTCAGCTGCCGCAGTGGCAAACTCTTGGAGTTCATGCAACTTAGGTAAGATTAGATCGAATAACTCTTCCCATAACTGTTTTTCAAGTGCTAACGCTTTGCCCTGGCTAGAAAGCACTTTCTCTTCATGCTCTTTAAGCTCAGCAATAATATAACGTTCAGTGTTTTTTAGCGTTTGGCGACGCTGATAGCTCAGTGGCACCAAATCAGACTCGCGGCGGCTGACTTCAATATAGTAGCCGTGAACTCGGTTATAACCAACTTTGAGGGTAGATATACCTGTTTGCTCTTTTTCTCTGGCTTCAAGTTGAGTCAAGTAATCAGTAGCACCAGCGCTTAGTACGCGCCACTCATCCAACTCTGCATCGTAACCGTCTCGTATTACACCGCCAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011566|1381221:1391827|1384910_1387493_-|WP_020911530.1|DBSCAN-SWA MTAIEPQNLEKHTPMMRQYLTLKAQHPDMLLFYRMGDFYELFYEDAKLASELLGISLTARGKSGGDPIPMAGLPYHAVEGYLAKLVQLRVSVAICEQIGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTLTDEALLQERQDNLLAALYQGKSGYGYATLDIASGRFVITELANTEALEAELQRTNPAELLYSEDFSQMSLIAGMNGTRRRPEWEFDFDTCQRLLLNQFGTKDLNGFGIEGARLSLQAAGCLMQYVKDTQRTALPHINSIVRFNQTDSIVLDAATRRNLELTVNLQGGHTNTLASVLDSTVTAMGSRMLQRWLHQPLRDHQVIKARQSSIAELIATENYQLLAEDLKALGDVERITARIALRNARPRDFARLRQALGLLPQLQQTLKASSEPHLQYLSQVIGEFPEELALLSRAVVDNPPMLIRDGGVIRDGYDAELDEWRVLSAGATDYLTQLEAREKEQTGISTLKVGYNRVHGYYIEVSRRESDLVPLSYQRRQTLKNTERYIIAELKEHEEKVLSSQGKALALEKQLWEELFDLILPKLHELQEFATAAAELDVLCNFAECAETLNYACPELSDASGIHVEAGRHPVVEQVSQSPFIANPVTLNSQRKMLIVTGPNMGGKSTYMRQIALITLMAHIGCYVPAEHAVIGPVDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETANILHNATPNSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWSAAEYLANNLNAMTLFATHYFELTQLPEQIKNVENVHLDAVEHGDSIVFMHAVQEGPASRSYGLQVAALAGVPNSVICAAKQKLHHLESRDHALEQSKNGEMAVQQTISFPTQPTSPVIEALEKLNPDELTPRQALDYLYNLKKMAR >NC_011566|1381221:1391827|1383722_1384691_+|WP_020911529.1|DBSCAN-SWA MGRTNNAVMAEEPTNVSVKESKSDLSKKAVKEAELEQQVQDDLQKNLDATQLYLGEIGFSPLLSAEEEVFFSRKSLKGCEKSRNRMIESNLRLVVKIARRYNNRGLALLDLIEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERAIMNQTRTIRLPIHVVKELNVYLRTARELAHKLDHEPTAEEIAEKLDLSSSDVSRMLKLNERITSVDTPLGGESDKALLDVLADDDNVGPDYKVQDEDMSKSVVKWLDELNTKQREVLARRFGLLGYEPSTLENVGKEIGLTRERVRQIQVEALKRLKDLLGAQGLSVEAIFRV >NC_011566|1381221:1391827|1382047_1382683_+|WP_020911527.1|DBSCAN-SWA MDRLASTSALNLARSLYEAGIRDEPVLKAVANTPRERFLDAALGHKAYENTALPIGQGQTISQPYIVARMTEILLQCQPQKVLEIGTGSGYQAAILAQLVPQLCTVERIKSLQIQARQRLKKLDLHNIAFKYGDGWQGWPSKGPYDAIMVTAAAASVPNALTEQLTDGGVLVIPVGEASQQLLKVTRKGNQYVSEAIEIVRFVPLINGELA >NC_011566|1381221:1391827|1389202_1391827_+|WP_020911532.1|tRNA|DBSCAN-SWA MYQTTAALRSAFLEYFRTNGHQVVDSSSLVPGNDPTLLFTNAGMNQFKDVFLGEDKRNYTRATSSQRCVRAGGKHNDLDNVGYTARHHTFFEMLGNFSFGDYFKEDAINFAWNFLTKELKLPKERLCVTIYETDNEAYDIWSKKVGVAPENIIRIGDNKGAAYASDNFWQMGDTGPCGPCTEIFYDHGEHIWGGRPGTPEEDGDRFIEIWNIVFMQYNRQSDGAMNPLPKPSVDTGMGIERIAAIMQGVHSNYEIDIFQALIKKTAEILGVTDLENKSLRVISDHIRSCAFLIADGVMPSNEGRGYVLRRIIRRAVRHGNKLGATSSFFYKLVPTLIEVMGDAAKGLVATQAIVEKSLKAEEEQFARTLERGLGILDNALSGLKGDVLDGETAFKLYDTYGFPVDLTADVCRERDITVDEAGFKTAMAEQRSRAQAAGQFETDYNEGLKIDEQSGFVGYQELNNQATVTAIYKAGEPVDALNVGDEAVIVLNNTPFYGESGGQCGDKGVLLADGIEYQVADTQKYGQAIGHIGKLAEGSIVVGQSIATNVDKKLRHRTELNHSVTHLLHAALRQVLGTHVTQKGSLVDPERLRFDFSHFEGVKASELKEVEELVNTQIRRNHELKAEVMDIEQAKEKGAMALFGEKYDAEVRVVTMGDFSIELCGGTHVGRTGDIGLFKITSEGGIAAGIRRIEAVTGAAAMAYVAKQQASLEEAAALLKGDSASVITKLKAQLDKSKALEKELAQLKDKLAAATSADLAGEAVEVNGIKVLVKQLEGVDAGSLRGLQDELKQKLKSGIVVLGIAGDAKVNLIAGVTKDLTGKVKAGELVASIAVQVGGKGGGRPDMAQAGGSQPENLKGALDSVIPWITDKLA >NC_011566|1381221:1391827|1387813_1388881_+|WP_020911531.1|DBSCAN-SWA MKTDPNKEKALNAVLGQIEKQFGKGSIMKLGEDRSMDVETISTGSLSLDVALGAGGLPMGRIVEIYGPESSGKTTLTLEVIAAAQKQGKTCAFIDAEHALDPVYAQKLGVDIDNLLCSQPDTGEQALEICDALTRSGAVDVIIVDSVAALTPKAEIEGEIGDSHMGLAARMMSQAMRKLAGNLKQSNTLLIFINQIRMKIGVMFGNPETTTGGNALKFYASVRLDIRRTGAIKDRDEVIGNETRVKVVKNKIAAPFKQAEFQILYGQGINSTGELVDLGVVHKLIEKSGAWYAYKGSKIGQGRANAGKYLIENPEISDEIETALRSMLLSKGEKVAAGATDTAGDNVDMETGEVF >NC_011566|1381221:1391827|1381221_1381971_+|WP_020911526.1|DBSCAN-SWA MKILISNDDGVNAVGIAALTNSLSLIAETLTVGPDRNCSGASNSLTLTNPLRLNKLDNGYISVSGTPTDCVHLAIRELYQDEPDMVVSGINAGANMGDDTLYSGTVAAAMEGRFLGFPAIAVSLVGSELKHYDTAAHFALKIVQGLKKSPIAQDKILNVNVPDLPIEDIKGIKITRLGARHRAEGMVRTQDPAGKEIFWLGPPGDKQDASEGTDFYAVEHGYVSITPLTVDLTAFEQLPEMTTWLESLV >NC_011566|1381221:1391827|1382749_1383646_+|WP_044555716.1|DBSCAN-SWA MKFLPHFTIVFTLLLAGCSFQADRPAPVESLNYASKPSHDKGSITASRYKVKQGDTLYSISWGANKDFAHVAKINNLAKPYTIYPGQVLSLNSKKSVTNSNTAKKPSKSASKQAAVAPKSSEKQLVTSSTTSQGTAKVASKKQLDHVAKPAYSVTDNQQTVNRVIHRQESTLPKKVSRWSWPVKGKMIGTFSAKEQGNKGIKIAGNRGDAIKAAASGRVVYAGSALRGYGNLVIIKHSDDYLSAYAHADKILVKEKQAVNAGQTVAKMGSTGTNRVMLHFEIRYHGKSVNPLKYLPKQ |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1918155 : 1984993
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_011566|1918155:1984993|DBSCAN-SWA 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56 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | transposase,protease,tRNA,integrase | attL 1931519:1931540|attR 1983833:1983854 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
2709440 : 2719050
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_011566|2709440:2719050|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_011566|2709440:2719050|2709440_2710268_-|WP_020912679.1|DBSCAN-SWA MKTGKVGLFTIAFGVVIGGFLLVRLTLIPEQESENLRLGKAIKNSAIESKVPNFSEIKDIKAKKKAFFDFLRPSVKHQNAVIKAEREFLLGIKSQIESDKQLTDADEFRLQQIAEKYQYTSRRINSNTIDKLLVRVDVVPEQMVLIQAANETGWGSSRFAREGLNFFGQWCFRKGCGLVPQSRTTGLSHEVAVFKTVEDSVASYMRNLNSNAAYSVFRSIRADMRADNQVPTAEKLVYGLVNYSERQEAYIDELLEMLRQNQPYLVDKNEKTPAA >NC_011566|2709440:2719050|2711382_2712576_-|WP_020912681.1|DBSCAN-SWA MIFSQVELAPADPILGLTDAFKADPRDEKVNLGVGIYKDESGKTPILKAVKLAEEKLLATEMSKSYLGMEGVQAYNRAVQSLLFGADHTVVNNARALTAQAPGGTGSLRVAAEFLVRHTKSDTIWVSNPTWANHHNIFNSAGLKTKSYGYYKAETHGLDFDAMKADLEGAKEGDLVLLHGCCHNPTGIDLNEVQWQEIAELCLSKSLVPLFDFAYQGFGAGVEEDAEGLRIVASIVPELIVANSFSKNFGLYNERIGAITVVAGNDAEAVNAFSQIKSTIRASYSNPPAHGALIVSTILEDESLKLMWQQELQEMRERIAEMRALFVQSLKESGVSQDFSFISTQNGMFSFSGLNKEQVSRLKNEFGVYIVGSGRISVAGMTKTNMPNICKAIAAVL >NC_011566|2709440:2719050|2712832_2714119_-|WP_020912682.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDPKFLRNELEVTAERLATRGFILDVERLGKLEEKRKSLQVSTEELQASRNAISKSIGQAKAKGEDVAPIMAKVGTLGAELDAKKVELAALLDELNAIAMSVPNLPDESAPIGADESENVEIRRWGTPKEFNFEVKDHVELGETLGGLDFKNAVKLTGSRFIIMKGQIARMHRALAQFMLDLHTTEHGYTEAYVPLLVNEDSLLGTGQLPKFGEDLFHTKPATEEGQGLSLIPTAEVPLTNIARDSIIDEDDLPVMMTAHTPCFRSEAGSYGRDTRGLIRQHQFDKVELVQLVKPEDSMQALEELTGHAETVLQKLGLPYRTVVLCTGDMGFGAAKTFDIEVWLPAQDTFREISSCSNMQDFQSRRMQARFKAKSAKKPSLLHTLNGSGLAVGRTLVAVLENYQNEDGSITVPEVLRGYMGGLEKIG >NC_011566|2709440:2719050|2716560_2719050_-|WP_020912686.1|DBSCAN-SWA MSKANSVKTLSGVQRLLEGSLIICCMIATYILIALSSFNASDPGWSQSNFDGDIQNLTGAVGAWLADVLFYIFGYTAYIIPIIIALTGWLLFKRTHKLLEIDYFSVGLRLIGFLLIVFSLAALGSMNANGLYEFSAGGVAGDVIGQAMLPYFNQLGTTLLLLCFVGAGFTLLTGISWLTVIDMTGFATLWCLKALRELPARLTPEKEETEDTRGFLSVVERFREKRSKEQAEDEYQQDEEHLEVINEQVEPHTESRIEPQLTPSEPLKEPTIQAPWVSENIDELETIDFGSKESTGAVNASKRIKEDKAKIVDGIVILPGQEEQALSAPMDPLPSISLLDVPNRQSNPISQEELEQVGKLVEVKLADFNITAKVVGVFPGPVITRFELELAPGVKASKITNLSKDLARSLLAENVRVVEVIPGKAYVGLELPNKFRETVFMRDVLDCKEFRDNPSHLSMVLGADIGGKPVIVDLGKMPHLLVAGTTGSGKSVGVNVMITSLLYKSGPDDVRFIMIDPKMLELSVYEGIPHLLCEVVTDMKEAANSLRWCVGEMERRYKLMSALGVRNLKGYNAKIKLAKEAGEPIFDPLWKSSDSMEPEAPELDKLPSIVVVVDEFADMMMIVGKKVEELIARIAQKARAAGIHLILATQRPSVDVITGLIKANIPTRMAFQVSSRIDSRTILDQQGAETLLGMGDMLYLPPGTSVPSRVHGAFIDDHEVHKVVADWHARGKPQYIDDILQGSAEGEQVLLPGEASESDEDTDALYDEAVAFVTQTRRGSISSVQRKFKIGYNRAARIIEQMELQGVVSAQGHNGNREVLAPPPPKVFD >NC_011566|2709440:2719050|2715845_2716472_-|WP_020912685.1|DBSCAN-SWA MNKLIAIAIVSLPLLTHFSAQADASEQLKVKLAEIDNLKANFSQTVTDINDKVIQTGEGVFALAQPNQFYWHLTAPDESLIVADGTDVWIYNPFNEEVSVMDVNQAISASPIALLVHDDAKTWAQYQVTNTDQCFAISPIDKDAGVSEVEVCFNETTLTEMVLKDQQGNTSSFLLSEQTTLDKSEKNLFKFVVPEDVDIDDQRLKSPN >NC_011566|2709440:2719050|2710424_2711339_+|WP_020912680.1|DBSCAN-SWA MKNNALNQYQHVVAIGGGHGLGRVLSTLSFLGPKLTGIVATTDNGGSTGRLRAEKDCIAWGDLRNCLTQLSKKPSVGSLMFEYRFNGESELNGHNLGNLMLTALDELCVRPLEAINLVRQFLNIETRLIPMSEEPTHLVAMEACGRSVFGEINVDKMEDTPIALSLDPIVQATCEACEAIREADIIILGPGSFLTSIMPPLLLPKIAKALAESNAEVILIDNLTEEPSPIANCGLAQKLDWCHQVLGLKIVDKVLRHGDTPSQDGYISYYPLRSSHHRGLHDKRALATALAEMIPDKLTQLENT >NC_011566|2709440:2719050|2714137_2714512_-|WP_020912683.1|DBSCAN-SWA MNNVLFVALGGSIGAVLRYLISILMLQVFGSGFPFGTLMVNILGSFLMGVVYALGQVSEVSPEIKAFIGVGMLGALTTFSTFSNESLLLMQEGYLVKAILNVVVNVGVCIFVVYLGQQLVFSRY >NC_011566|2709440:2719050|2714504_2715836_-|WP_020912684.1|DBSCAN-SWA MSSFSFDFAPDFRPLAARMRPETLSQYIGQQHLLGEGQPLRQALEAGRAHSMMFWGPPGTGKTTLAELVASYANAHVERISAVTSGVKEIRSAIEHAKSVAQSRGQRTLLFVDEVHRFNKSQQDAFLPFIEDGTVIFIGATTENPSFEINNALLSRARVYLIKQLTIEEICQITQQALLDEERGLGKRKLILPPDVAIKLAKVCDGDARKALNLIELISDMLKDGEVFTEEMIVQVAGQQLAGFDKNGDQYYDLISAVHKSIRGSDPDAALYWYCRMLEGGCDPLYIGRRLLAIASEDIGNADPNAMTVAVNAWECFHRVGPAEGERAIAQAVLYLASAPKSNAVYTAFKAARQLARETANESVPEHLRNAPTKLMQDIGYGEGYRYAHDEPNAYADGEVYLPKSIAGSQFYFPTERGFEKRIKEKLANLSELDLKSKVKRYE |
8 | Pelagibacter_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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