Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NC_009036 | Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal02, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 1 | 0 |
NC_009052 | Shewanella baltica OS155, complete sequence | 2 crisprs | csa3,DEDDh,PD-DExK,cas3,WYL,DinG,RT,TnsE_C | 0 | 1 | 15 | 0 |
NC_009035 | Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal01, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_009037 | Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal03, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_009038 | Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal04, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3497 : 59455
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009036|3497:59455|DBSCAN-SWA CTCATAGGCTCTCGCCATCAGCAATCATTTCTTTCGCCACTCGGTAGCCTACAACATGAGACTGTAATGTACTCCAACCTTCCCAAACGGCTGTCCAGCTTGCGATACCTGTTCGTTTTGTATCGGTAAAACCACCCAGTTTTGCAATTGATTGATACGCCCATTTCAGGCTGGGTGCTCCATTACCTTTATCCCCTCTAGGCTTATTAAATCGCATTAACACCTTCCATTCATCTTCTTCGAGTACTGTGTCACAACTTTGACCCTCTACGGCTTTAGCTTCCTCAACCAGCCCTTTCTTACGTAAATAATAAGGGATGGTGATAGCTTCTCTGAGTTGGAGCAAACGGACTCCAATGAATCAGAGCGAGAACCGAACATGAGAATACCTTTTTTAAGTCATTGTTGAAAGCCACTGAAGTTTACAGAAATTAGTGATTCCACGCAAAGACGCGTAGAGCCAAAATCCCTTCTGCCGGACTTCCTGTCTGATTCGTGTCGGACCATGTTTTTTTCTGATGTGCTTATCAACCAGATGTATGACCAGACGCTCATCATCCAGATAGCCGCTCACGATTAACCGCTGCAATGCGCTATCAACACACTCACTGTTTTCCGTCATTCTGAGCAATGTTCTGCTCAACTCCCCCGATGAGTAATCGCGTTTTGCCAGTAATGACACTGCATGGTCATACAGTTCCTGTGCGTTCATTCCTGACTCCCGTTGTAATAAATGACACCGCTTTGGATAGAAAGTCCTGCAATTTTAGCGACCATCAAAGGCCAGAGTGATACTTTCCGCTTATGTGTTTCAAATAACGTCCTGAGGTAACGCTGTGTTCCCGGTAGCAACAGGCTTTCTTCCAGCCCCTCGCTGTAATCAATGGCTTTTTTCATATCCGAGGCGGCATAGCTGTAATATTTACTTTTCGATTGCAGGATATTTTCCTCAACCAAAAAACGCCGCAGCAGGGTGGCTGACAGTGCGTAGCCATATTTATATAACTCGCTGGATAATGTTCGCACAGATGAACCTGACATCGATTCAAAGGCGTTTACGAGTTGTTCTTTTGGTGTTGATGTTACGCAATCATCAATTAAATCAAATCTTTCCACTTCTATTGCAAAACGAATATAAACAATCAGCCCTTTATTTTTGGCTATATCCAGAAATGCCTGGATATTATCGCCATCATTCCCGCTGGCTTTTTTGTATAGTTGATACAAGGAGACTGTGTAGAAAAAAGCGAACGCTTTAATTGCATGTTCTTTGGCTTCCTCTTTCCGTCCATCCTCTAGCAGAGCACTAACAAATAATTCATTCCACTTACTGTTATTGGTGTAACGCTTATCCATACCAGATAATAACTCAATGGCTTCGTCAGCTCTCACTTCCTCTAACAGTAATCGGGCATAATCAAAATAATGGTCAGGGTGGCTGAACTCCCCTTTTTTATAGGTTGTTTTTATAAAGTTGATATCTTTGATAATTACGCTGATACCCAACGATTCTTGAATATGTTTCTTTTGATAGTACATATCCCGTACAGCACGTAAAATATCGGTACCTAACAACTGACGATAGTGTTGAAAAATTTCAAAGCTGAAATAAAACTCACGCTCGATGACCGTAAATATTTTTTTTGCAATGAAGACTGGTTCACTTTTTTTTTGTGCCGCCAGTGATTTCATCCACGCATCAAACAGCACCTGGTAGTAATCCATCCAGCTTCCACTTGAGGTATCAACGTTCCCCGTGAAGTCTTCAAACTCCAGCATGATTTTGACTGCTAGCCCTTCGACTTGCTCAGGCAATGTGTTAGCCAGTTTCTCAAGGGGCTTCGCTATACTGCGTGTTAGCTCATCAAACAGCGAATCTGCGTCGTAGTAATCATAAAAGCGTTTACTTTTTGCTCGTCTGGCATACTCTTTCTCGATGGCTTTGAGTCTGTCTGAGGTGGATGATAAATACCCGTTTATCAGTGCGTCTTTCGCTTGCTTGTTGTCTTGTATCAGGTCATGGAGTGCAGTGAGCAACGCTTCGTGACTCATTCCTGAAAGTTGTTCTGTCTGTTTTTTGGTTAATTTGACCATTGGATACCCCTTTAAATCATCCTGTGTTCCGTCATTCGCCGTTTTATCTTAATGGGTAATACTCGCTCACTTCTCCTCCGGCTTACCAGAACGCGCTGTAAGCGATTTTTAGTTCGTGGAACTACCTCCCCCTCGCTACGCGCCATAACGTATTAAGAGCCAACGTTATGGAAAGGAGGAGGCTTCCACGGTTACCGAAAGAATGAGCTTTTCAAGCTCACGCTATGCTTACCCTGCCATAAATAACAGGGTTTGGCATGAACGCTAATTGATCAAACACGAGCCAATATTTATGAGTCGGCCCATTGTGTTGAATGTAGCGAGATTTAACCGCCTTTTTAGCCGCAATGATGCTCAAACCATTAGATAAATCGTCTGAATAATAGGGTTTCTTGGGTAAACGCTGTTCGAAAAGGTTTAATTGATGGGCTGCATTCAAAAAACACCGCTCAAATGGCGGCTATTTTGTTGTTTTTTTATGATCATGTGGTAGTATTTCCCTAGGATTATTCCTGAACCCTGAACTCTCAAGCCTCCCGCCAAGTTGGAATGAGATTCGGGGTTTTTGTTTTTATGCCCGTAGCTTACGCGATTTTTAATACTCAATCCACGATCATTTTTTAGCTACTGGACCAAGCGCTTAACCAGCGTTATTAGGCCTGAGCTAACAAGCCATTTTCCTGATAGAACTGCTCAATGAATTTGGGATGTTCTGTGATCTGCTCTGCTACCATCAGCAAATCAGAAAGGTACATGGCATCACTATCTAAAACCCTCCAATTGCCATACATGACATAGAGAATAGCTACGCTCATTTCAACATCGTGAGGCAATACAGCGCCAGATAACACATGCTTTTTAAGATACGGGACGGCTTCATATTCAGAACTAACACTGGGGAGAGTTTGAAACATCTCAGCGACATCTGGCGGAACGCAAACCACTTGTTCTTGGTTAGATCTTTCTTGTGTTTTTTGCTTTTTTAAACGGGCTTGCTTAGCTTTATTTTTTGCCCTTTTTATTCTTTTGTCGGTATTACTCATAGATCTCTTTCCTGTGCCCTATCAAAGCAGTCAGAATGACTAATTTGCTATCTTGAATTTCACAAAGCACTCGATAGTCACCGACTCGATAACGCCAAAAAATACCCAAATCCCCCTTCAGGGGCTTTCCTGACGTTCTCGGGTCGTCCAATATCGCTATGCGCTGTTCCAAAAAATCCAGAATGCGTTTAGCGTTCTGCTTATCCATTTTTTTTAGTGATTTTAGCGCTCGTTCTGAGTAATCAATTGTCCAAGCCAAGAGACGCCCTCACATCTTCGCTACTGTAGGTTTTTTCAGCCCCTTTACGAATATCAGAGACAATCTGAGCCGCAAGATAGTAATCCTCCAGATCCTCTAAATGAGTCAAAATAGCTTCTCTGGCGTAAAAGGTTTTTGTTCTACCGGTTTGATCTGCCAAAGCAGCCAGACGGGTTTCAATATCATCAGGTAACCGTATTGCTAACATAATTAAATCCTCCATTGCTATACACGTATAGCATACGCCATTTATCGATTTAATCCACGATCATTTGATCAATTAGCGTGTACTTTGCCAAACCCTATCATTCATGGGAACGCGGGTTAAATGAGAATACTAATGGCTTGCTTCGCCGGCTGTTTCCAAAGGGAATGTGTTTTTCGTCACTGACAAAAAAATGCATAGAGCAAGCGCAATTTTTGATCAACATGAGGCCGAGAAAAGCGTTAAACTATCTCAGCCCGTACGAATTTTTAACTGGCAAGCGTGTGTCGCTTATTGCTGCGATCTAGCAGATACCCTAAAGTTTGTCCCAAAGACCTCTGTTGCTCGACTTTTATTCAACATAGTAAGGATATCTGTCGCAGGTATAGGTTTTAAAAAACCACGAAGCTCTAGCTGGTATAGCACAAATAGGATATCTTTTTGGACTGCTGAAATTCTCATCAAACATCACTCTTATTCATGTGTGATATGATTAAGATATCAAATTTAAGGGTAAAATAAAATGAAGTTGGCTACCTCCCTGGCATTATCAAGTCTGTTGTTTACGCCGATCACACTTGCCCAGGACTTATTTGCAGAAAGCACTAAATCAACGTTCAATGATGCGTTAGCGAGCCCATTTACAGGATATGTGGTGGGCGCGTTTACCGCAATTATCATCATTGCTTTAATTGTGTACGCGCTCAAAGACTAATCACTCATTAAGCTGGTGTTTACCCTTCAAATTACGCAAGCGCTGTAACCGATTGAATACCTGCAAAATAAGATTGACGCCCTTAGCCTCATTAAACGCTTTTAAATCATGATAACCCGGGTTCCTGTAATTATGCCTATCCGTGGTATTTATCACCCCCGTCGCCTGGCATGTAACGCACTTACCACTGACACAGTAACGCTTAGGCGTCTCACAATGACAGCCGTCGCAGCGATGAACAGATGTGTACATTCGCTGAAGTGCCAGCATTGCCTCAAGGCGTTCACCTTCAATTGAAGGAATATTTTCAGACATAGGAAATGTTATCTTAGAAATAAACGCGTAAAACCCAATCGACGAATGCCCTTCCCGTTGTAACAGGACGTGAAGCATATTCAAGTACGTTGCGGCCTTCAAAACGGCCTGTAACCAACGTGGCACCTTTTTCAACATGCCAATAATGATTATTATGCTTAGCTGTAAATATTCCGTTTTCTTCAATGGCAATAATATCTAGCGAGTTCAATGTAGGTCCTTTTTTAGGTTGACACCATGATGATGCGTACAACGATGTTCAATATCAAGCTCAATCAACCGCTGATTCATATGGTCTGGGTGTTGCCAGTATACCTCACCCTTCACCGGTGCGATTTGTAATGTTAAATGCTGAGCAATATCATCATT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MPKRKTTTLSLAIVCFTLLAALALIRDDLCKVEYRNGAMLLNVVLAYEVRG >NC_009036|3497:59455|34862_35081_+|WP_014620439.1|DBSCAN-SWA MSQTKKKTTVSINLEMSAETNQGVTLAAKAAKRSKHIEAALRLEDHVGVRLENGKYPTLRPFFKQQVFAVLL >NC_009036|3497:59455|6243_6633_-|WP_011839956.1|DBSCAN-SWA MSNTDKRIKRAKNKAKQARLKKQKTQERSNQEQVVCVPPDVAEMFQTLPSVSSEYEAVPYLKKHVLSGAVLPHDVEMSVAILYVMYGNWRVLDSDAMYLSDLLMVAEQITEHPKFIEQFYQENGLLAQA >NC_009036|3497:59455|28926_29205_+|WP_080514436.1|transposase|DBSCAN-SWA MVAGSAKLIDALYTLLTAAITLWNTVYIERAIESLKRKGVPINEQLVAHLSPLGWEHINLSGDYVWRHNVKLGSGKYRPLRTVNTELYKKQS >NC_009036|3497:59455|43987_44437_-|WP_011839991.1|DBSCAN-SWA MYRGTITLEGNIGQAPAITFLEGNERSRGEKRPILKLNVKYDRLVNGPNNEGLIDKGGVWIAVDYWKKDGPALAQLLQKGMRILVIGEPRAEPWENDQGVMEPGFCITAESISILPRRIASITLEEKAPYQPHAAQVPYQDDSSYEPRY >NC_009036|3497:59455|49463_49715_-|WP_011839998.1|DBSCAN-SWA MAIYSFTEVRSNFKSICDTVVNDCEPVVIHRRGNENVVLFSESEFNSWKETLYLLSNPANAKRLLESIKQVNDGHASEHELSE >NC_009036|3497:59455|22279_23179_-|WP_011839973.1|DBSCAN-SWA MSQVKRKYDHFFQIFSSHLKGFYFNQYKKCLINTVLDGLAPDIPSDHLAEWYFSDDLTDELAFCYPISESETIGEYFLRKRGWREGAMARLYFSAVLAAPTAIWEMIEVIKGSTAYVKQVNVDMAPIMVAIPKCSLVDLDKQPFFVGKVLSLEPMGLCGLTISLGSVPLPRNAVERVIERVDALTSKEALTPLQSQYQLQRQALMEKHVDKVQQGKEFDDGIDDDLIALYQLGDIYQAGLQAFRLDQAEQVNPYSGEEGECWSQGWQDGQQIATQNELGQPFKLSDVFPLKFANKLHIT >NC_009036|3497:59455|45767_46349_-|WP_011839994.1|DBSCAN-SWA MTVKLTYYQMVSSVVTNALIHLYLTVADTPGHVTIAKRNEILVKFIKPIHKDHRFKFIRNETRKILSIGRQKGASLELKLIEIGSLITKNTEEVTDAQKLFDLLELVRVKHDIESRFILDGEARKSKFIYLLRSHVEYGFAETGEQIAPVSVFYESPEFDKLEAILKGEALFNVEVAQVNPDCQQIHLILHPL >NC_009036|3497:59455|47441_48371_+|WP_014620444.1|integrase|DBSCAN-SWA MKSKLQKKLTQQAERLFMNNFNGIGKAKTKTSELLHGRRSIKEQARIVGKAASDLNLKNLKLLTPIMAQEYLTTCRDKGLCQKYLSTIKCSLQRALFKHENNTLTRVIAFDRKKIPLTDKNRAYTNEQIRLIMTSMNDKAKLSTLIAVNAGLRVEELLTIRRLDEATVSSSRSWSSKRFIGREEGVRYILTGKTGLRREILISKDIAELMENTRLTQPKTIIDRKHSFVINYDLLGGKRLSDAFSRASIKTLGWSNGAHGLRFTYAQNRMDNELINFTDSEAKLIISQELGHFREEITDRYLEPYSKRT >NC_009036|3497:59455|23744_24476_-|WP_011839974.1|DBSCAN-SWA MIKSKADKARIKQQKLRSAKQAALHVKTHKTAVGANAYKASLEGFKALKSRLPRYFDEVINNARKLIYSRKFEIDEGGISRQMSELTKRKLFEIIVTLMTSCDFMSGQIGKAKNNGMDTTSHDALMLAHAKRWGYAMPSSTWYRYIGMLKQAGVFVVEEVKIAGETEKTIRSVAAYKWLSTQFLQAIGAYTDTIRAQIKQAYQKAVNNGLSFTWRVFKRQLPVKQRFTADMFFSQSTNPPQTH >NC_009036|3497:59455|57900_59455_+|WP_086011359.1|transposase|DBSCAN-SWA MARYSPERKEAILKKLLPPHNLTVAEVAREEGIAVQTLYHWRDIARKEGRPVPGKTLTADDWSAEAKFAVLIETAPLSEAEISQYCREKGLYREQVQQWKLECLSGFQTSEVQTKTIKQQAKADKAEIKSLQRELRYKEKALAEAAALLVLRKKPQCALGGRQRGELTPLPERIALIALIQEAYTQGARLYKACAETGLSKRTYRRWYREGQVQADLRPTAARPEPANKLEEHERQQILSVCNQAEYASLPPSQIVPTLLDNGIYIASESSFYRVLNAHGQLNHRGRTQATVNRSKPLSYRADGPNQVWSWDITYLASTVKGQFYYLYLFEDIYSRKIVGYEVHEQENGEYAAALIQRSLLREQCFNTPLVLHSDNGAPMKSLTMKAKLEELGITASLSRPRVSNDNPFSESLFKTLKYRPQWPASGFSCLATAREWVEKFVSWYNDEHKHSQLNFVSPGQRHALQDGAILAKRKKVLEAAKERKPMRWSTEIRNCEAVGAVTLNPDKAPVEGVINAA >NC_009036|3497:59455|21338_21965_-|WP_011839971.1|DBSCAN-SWA MAQKKLALPPGVSVIRQGKAYVIFRDGHEAIGGVIVSETTQGNTQLQPYMNVDASDNKAVIAFVAQQMTDALLQHQAQKPLNEQLPIFTENVPDNVQVIENKSFPCSRCNSIIAKLIFVPEAATASAMLAMAQKFELDVFVSPYPVWLIGAPDSQNDDIAQHLTLQIAPVKGEVYWQHPDHMNQRLIELDIEHRCTHHHGTNPKQDLH >NC_009036|3497:59455|6625_6892_-|WP_011839957.1|DBSCAN-SWA MAWTIDYSERALKSLKKMDKQNAKRILDFLEQRIAILDDPRTSGKPLKGDLGIFWRYRVGDYRVLCEIQDSKLVILTALIGHRKEIYE |
59 | Enterobacteria_phage(18.75%) | integrase,transposase | attL 27380:27439|attR 57766:59353 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009052_1 | 1619072-1619178 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009052_1
|
1 spacers
spacers of NC_009052_1
>1.1|1619102|47|NC_009052|CRISPRCasFinder TAAATCGCTTGATTTTCTGTTGTTGTAAAAACCACAGCGCCGCGCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009052_1
The CRISPR arrays of NC_009052_1 >merge|NC_009052|1|1619072-1619178|CRISPRCasFinder ATCAATTGCTGGAGCATTGTGATGTTAGTTTAAATCGCTTGATTTTCTGTTGTTGTAAAAACCACAGCGCCGCGCCAATCAATTGCTGGAGCATTGTAATGTTAGTT >NC_009052|1|1|1619072-1619178|CRISPRCasFinder ATCAATTGCTGGAGCATTGTGATGTTAGTT TAAATCGCTTGATTTTCTGTTGTTGTAAAAACCACAGCGCCGCGCCA ATCAATTGCTGGAGCATTGTAATGTTAGTT
>NC_009052.1|WP_011846313.1|1616296_1619029_-|carbohydate-binding-domain-containing-protein MKGLIKKKGKIKWQRIKTALVSGIMAVLPAMPVLSILVMPSVQAANAVQEANHVALNQLADKLQLNYQLTASYLETCPAKETQCYRSAIELTLPTQLSNEELNHGDWQIYFSQLSPVYFVDAGDFNIEHINGDLHKIVPKASFKGFVANQFYRIEFYSQGSQITRSEFMPNFFVAMGDKAQLIKSTQTQRNKETGLPEQAYLAPFNADQQFLLAKNDATPFADGQYLAEQYQALAANANKATDISDKLIPTPLHSQSLDSAPLSLAKGYRLTADAVDFKGRQAAFDYLASLGFAAKDKGTPLLLQLDTQAPKVASTEAHDSEMKTSEAYQLTITAEQISIRAGTEAGLFYGLQSLAGLISLSDDQLVAIEIQDQPRYAFRGLHIDLARNFHSLDFIKRIIPQLAAYKINKLHLHLADDEGWRLAIPGLPELTDVGAKRCFDLTEQSCLLPQLGSGIADVKPVDGYLTVAQYQEILQLADAHHIEVIPSLDMPGHSRAAIKSMEARYHNYLAKGDKAKAEEFLLTEFADKTQYSSLQYYHDNTLNVCLASTYHFIDTVIDEVKKMHQAVGIPLVHYHIGADETAGAWVDSPACITMKKQKADELTGLHSLNGYFIERVANMLADKGIIAAGWNDGMGEVRPENMPAQVQSNAWSLISDNGHQIAHKQVNLGWKVVLSTPEVTYFDFPYASHPDERGNHWAARAIDSFKVFSFMPDNLPAHAERWRNSLNQPFIADDSHSQLKPGHRFYGLQGHLWSEMVQSDEQAEYMLFPRMIALAERAWHKASWELAYDYQGKIYSQQTQHFASQLNGQAEQVLKQDWQTFAAVYANKVQPKLAKAGVFYRIAPPGIRIENQLLVLNSLYPNAELEYQLDSGPWLTYRQAFKLNDVKHIRARVKDGTRYSRPSTWQSSL >NC_009052.1|WP_006080930.1|1615803_1616046_-|hypothetical-protein MTTASTSPFAVLNQTTATSFNEQKNLIKRVFKGKPVQCPSCKQTLKVILPEQAKAEQAAGIYCAKGCTDIELDMEAVAGL >NC_009052.1|WP_006085186.1|1615040_1615667_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKSVVLGEKRIVPTKIVCIGRNYVDHIHELGNDIPDDMVVFLKPNSAMSTVLLAEHQGEALHYETELCFMFQDGRFSSVAIGLDLTKRDLQSKLKAKGLPWERAKAFDGAALFSPFVAIDDAEAPLHFTLSINDNLVQEGHIDLMIYKPQTILSELQAFISLDEGDIVMTGTPKGVGVIPAKSVFNVTLSRGLQASAEPLLEWQWQVS >NC_009052.1|WP_011846311.1|1612804_1614832_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MLTLTIKQKIIFSFSAIGALLIAGSSFFYYSLSQVQTAYQNIETLAVPVQKQSNSLQLVLLKMSRLATLAHSQQDTAALTKSQQAFTALQKKYQSIENELTERVADQSKMQTSLHEAQARYQAYLQQSQAMFSAKLANEQAKQQYQQLFQRFNDAKTNASNAMIDLETLSIPDNPTLLEEIIGTGTRIDDMLYTLTNTMGELIHTQSLEVIQSHQQDVSILLGNLTTNFTFLKQQTDGLDTLGLLQTFEQQYAIINTLLAAPAELYKTQQAVVEAQLQAEQHYLDADKEFNANNLALDKLITLADRRFSSLQTIASNAIEQGQTLAIVLALVFIVMVSFISFFTSKAMLNPLALVNGALASIARGDLSKRIHKRHDDEFGTLIDNMNTLSDDLAKLLTNISQNAHSLDSSATQTNEQGQRIANAATAQISRVDETKALAEQMFTSSNLVTEQASESAKQISQASKYGNQVKQIADDNRNKIAELSARLSSSVEIMSRLSIQSDNIGNILTTISSIAEQTNLLALNAAIEAARAGEHGRGFAVVADEVRSLASRTQAATAEIQTMITALQKETSTAASAITTGQNQANECVGQSQTLQDAIAHIESTLHTLNDMSLEITHAAHEQLDYSQRIESSMSEAAQAADQNANEAMDMAKRSNEVTTLAHSLTSSVERFKL >NC_009052.1|WP_006080925.1|1611648_1612662_+|succinylglutamate-desuccinylase/aspartoacylase-family-protein MVKRREAFELAGKRVTAGTQLGIKLAAAKLYTDTQLDIHVEVFHGAKPGPTLLVCAAIHGDELNGIEICRRLLARVNPKNLTGTLIVVPIVNVFGFIQQSRYLPDRRDLNRCFPGSSKGALASRLANLFATQLLVHATHVIDLHTGAIHRDNLPQIRCDTSDETMLAMANAFGAPLIMHSKARSVSMRGYANQQGIPCILYEAGEALRFSELSIKSGLKGVLNVMRSLGMLKGRVSNKGSSVSAIRSYWVRSESDGLVNMKLKLGQRVTKGYIIAHIVSPHGGDSVAIRAPTDGIIIGISNIPVTNEGEGMFHIAQFEGDEIEMANEQLDEFLMEYA >NC_009052.1|WP_011846310.1|1610846_1611485_+|MarR-family-transcriptional-regulator MTAKMTLTHASPADTNASSADKNASSADKNASLADKDQAASNTKADGLESEDGLDSIVGQWQQQGVTDDLIPMAVLGRIARLTKYIEVVLLQCHAEFGLGQGEFDVLATLRRSGEPFTLSPSQLYLSMMLSSGAMTSRLDRLENKGLIERAHSKEDRRAVHVSLTAEGKALIDKALPQHIQCQSALLAGVSVEDRPMLLQILKSWLNQFEPQ >NC_009052.1|WP_011846309.1|1609411_1610617_-|MFS-transporter MRSPQSEKANLLLLGIAFILIGLNLRPILASVGPLLPSIQEDISLSFTLASMLTLLPVLAMGLGCFAGFSIAKRLGFNTVMTGSLLLLIVATAMRFWAMDASWLICSALLAGVGIALIQTIMPAMIKLNFGERVPLMMGLYVTAIMGGAALAASSAPFIGMNLGWRAGLGHWTWLGVVALALWLMVKHNAALPNQTAEQTVQLSFWRFRRSWLLAIFFALGTSCYVCVLAWLAPYAVELGYSQTQSGLVLGFLTSMEVIAGLVFPWLASKSTDRRAIIALLCLLQLIGFMGLALAPQVSLFLWAGLAGLGIGGIFPLGLIVTMDHQQNPMLAGKLTAFVQGVGYTIAAISPWIAGLIRDNFNSFNSAWLLLGGLSLMAWILSWQFNPQGYARQYQVTRCVS >NC_009052.1|WP_006080922.1|1608740_1609304_+|alkylphosphonate-utilization-protein MTENELLSRCGGKCELCGSEIELSIYDLPASDGRDNEIMICETCSGQIAAPDTMDMNHWRCLNDSMWSPVPAVQVMSYRMLKRLNGESWAQDLLDMLYLEDDVKAWGDAEVAAAGDDTTPTLDSNGAVINAGDTVVIIKDLNVKGTSFVAKRGTAVRNIALTNNPEHIEGRVNGTRIVILTCFVKKS >NC_009052.1|WP_011846308.1|1606385_1608605_+|TonB-dependent-receptor MGCLPKFGKWKANRNLSLMGLCLLPSMPLYANEVLGEPKVEPIEILQVHGQQYRRAITVAKPGEAIISMEQIEEMQATTFAEVIDDMAGAHIDGGTRSGGERINIWGFGETEDFNVYVDNAPVGFEQYRYGSFFLDPDLIKRVEVIKGAHDVRSGNGGFGGAMYVVTKSADDFLKYDQAIGARVKTSYASNNDAAGYTGTVYGRVNPHLSGLLHLTRRDAGDVTLANGDEFEYSGYEQDNYLGKIDYEQGDHQLALSVTHYLDEGRKPWANRRGPMPAISDYNIKKYGSYEQALYATTAYNTYEDNTWSANYRYSPSNPLIDTQVVISHSANARHWVRPDIAWEKMTVSVGNFGHESWLDYKRDYIDINNLSLIGDHEITTGLQYRSLDRTSLVFNKSYEKNPEKNFGWYTPYYQPEGRQDTYAVYVRDAIHLTNDLTVTPSLRYDFIYSIGRPNIAPDYNDISAGHDYSSTHHSGFSPRLGIDYQLTNYARLNFDYAYSLQAPVVDEIYAVQYARASITGTSRDIDVERLHAFKLGLMTQHQHLLANDDALTTQLTLFANLGRDDIAQRRGAKSDKTQLIQSGYTNLDGYHIYGADFEAQYRYQDVFSDLAVSWLQGQHNGSLRDSQDDDEYLANMAPLDIRLRLGMYITDDISVAWQGAWYDAQTNVPHGDIFNAESPSENYFLQNLYLAYEPQASLKGLSVRLMVKNLTNLQVVPFLSDGIPAAGRDVRLSLAYEF >NC_009052.1|WP_011846307.1|1605333_1606047_-|DUF2461-domain-containing-protein MATLTTKIPIATGATFSAASLQFLNQLAQNNSRDWFKAHQAEYEETVRTPALQFIEQMQPSILALSPRLTAVPKKVGGSLMRPQRDSRFSKDKTPYKTNVGIQFRHFQGKDVHAPGLYLHIAEDGCFIAAGIWHPESKALNAIRTCIDENPNGYKKALQTLQSHGFNMDGDSLTRPPKGFDKNHPMLAELKRKDFIAVKNITFEELCRPDAASFCAEQFAHCTQLMAYLCFALDLDF >NC_009052.1|WP_014620668.1|1620017_1621316_-|MFS-transporter MKHKLIILFVLCTFFVISLMTNSMGPIFPALIDSYAIGLTLAGLFPFAFFIAYGVTSIPAGILVDKYGERRVIILAFSLAFIGAVTFVCLPSFSIAMFSLFCIGTGMSLLQVAVNPLLRQAAGPEHFAFFSVLAQLAFGGAATLAPLVYQHFVALDQASAASANYVQQLLPENMSWLAMYWLFAVVALAMVLFASLVKMPKVDKLADESAGALETHLHLFKDKTVLKFFFAIAAYVALEQGLANSISVFLSQYHGLDTLSVGANVVSDFWFYMTLGCLLGLLLLKLIDSQILLLSFSLSSLVCFLVAIWGPSQLALICFPLVGFFISIMWSVIFSLALNSRAQDHGSFAGILCTGIIGGAFISPIIGVISELSGELRFGMLVLLIPMAYIGYVALTARPLIKNTTLFSTKAASKDDGSKQMATTNTRGNKLL >NC_009052.1|WP_011846316.1|1621855_1622830_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKPLCEKVIPDENSSWRYFRYEWDHMDLNWHYHPEYEICLTLNSYGMRYVGDHIARYGDYDLVIIGPDMPHGWQSEANLDISPDEVSKDDGLKGGTSTAVNLKEPALKGSASKSRVPEVVYVAQIPAAWLHQIVNDQRELASLHSLLTHAKRGVLFSEETARKAHSVFIAMEMANPFKRYILLLELLALLQQDSQQELLSSTLFTHGSKLDFTVKKLDKVIEHIYDNYTQALSAQDLAKLAHMSTNHFHRFFKKRTEKTLTEFINQLRIAKACKLLLSNQSPISTISDQCGFNNLSNFNRRFIQFKGVTPSRFRQRFSSKQRAI >NC_009052.1|WP_011846317.1|1622839_1624345_-|tryptophan-7-halogenase MKVKQAIRKIIILGGGTAGWMAAAALANNPVFAAIELCLVESDNIGTIGVGEGSTPHLKRFMDNLGISEKDWMELCHASYKTGIDFINWNGDGQQYFHPFYFQMDVKPAEVFFINANARRRGHGNAVKPDAFFSSGVLAKRNLSPRPNKALPCTNEYGYHFDATELANYLKDYACKRGVRQIIADVVEVSTTQHQQIETLILANGERLSADFFIDASGFSAKLIHKALGVPFQSFADELLNDSAVTVPVPALMDSTQTQQAKYHTRATALSAGWLWQIPLTHRLGNGYVYSSRHLSANAAAKELLHSINLPESTQVRFLKMRVGVSDKAWHNNVLAIGLAQSFIEPLEATSIMMTQFTLERFMSLFERYQLNKQAETLSRQTLNQAVMQLVLGIKDYIQAHYVTSQRSEAYWVAARKVAISQRLTQLLKAWYQGEDFDLLLYQYDQQLAYFRPSWYALLAGMDYRDPKLKRPFEPISAEITAQAISYCQTLVEQYFQPKHS >NC_009052.1|WP_011846318.1|1624412_1627049_-|TonB-dependent-receptor MSEGQLFKSSLLALCIANALFGMSSTAVAAEQQEATAENMEVIQVRGIRRSIEASLNTKRFADSTVDAITSEDIGKFPDKNIGDALQRISGVTVDRQYGEVSGVTIRGTAPEQSRILLNGQTVASTSWYDLGPATRTFNMELLSAEQVNAVEVHKTPTARLEEGALGGTVDLKTRKPLDLDAHTYQVAGELSQSSLYDETDPSGSFLGSWKNDDEKFGILGAYSVEKITSGRQVLESLSGYYEYFAADPAQNQESTVGAWGIGSQAFRAERERTSAQVTLQFAPTDNTEFTLDYFNFELDIPHVNHNFLTVGARGSGSTNVVNNAQGGTASATILPAYASIIYNPVVRHAVNMKSDVLNLTGKYVGDSFTVSGVIGQSTSDGGTQGGSSSWWIPATDQGGKIGDPAFPNGQGSVDGGFSYDATGPYQVVLTSLDANDASQFKHAQEANYETTVQDHKVTYAQTDFEYQLDHDFINKIAVGIKYNTSDFERNAFNRNPAEILGFVPNGNLANWSDGVLSGLHSQSGGNVLDSYAKLDEDKWWAFISEKYANGELVEVADLGNTFTVEEDMLALYAQADFSGEFYRGNFGVRYVNTDQTSTGFADGKPYNESVNYDNWLPSINVAFDLKEDLILRASASSVMARNNYSDLKPGLAIAKNFGTATGGNPNLKPYKANQADLGIEWYFTESSMLSAALFYKDIDNVVFVTESTQYIEGCGASESEWDKCRVIAPANGGSGSVTGLEIQLQHNFESGFGFLTNYTYVDSKSTRPDGTEQMIEGVSENSFNGSLFYEDDLFSARIAYNWRSEYLGVGNIQNVLNDSYQQVDASIIWHAMENLDVSLEGVNLTNEVVQSYDVKYGLTQNTIEFGSRYFVGASYKF >NC_009052.1|WP_011846319.1|1627393_1628521_+|polysaccharide-deacetylase-family-protein MKLKSIAAAVGLCLASLSVAHASDKTIYLTFDDGPIDATLGLLDALKDANIKATFFINAFHMYGEGDENEALAAVALQRLLDDGHILANHSYDHMLHNCTDGVQSGAVYCNQVGLWPVKSYQDAATDFTYFVTNTAKVVEIIPNAASYPNNKMTKLARLPYTNGWRVSSKLKGDGLCATSDTVPPWDPAFACTAETSTNSSQVAVQIQNMLAESDYKIFGWDFDWGPEDWGVAFPAESMADGVELVDKINQVINTCAGTTMNPLNSRTQNLDCSDGLHDGKVVILTHDFLFENAHRGQGATINLPKIKRFVEEAQRQGYRFDTLDNYAPAWQDQHDYQQPDFVSYQDKIYSLVQAHFSQSNWQPNQTPALWKNEK >NC_009052.1|WP_006080938.1|1628735_1629521_+|hypothetical-protein MSTFVKLTLAGTLVILAILAAGIYRFNMTNDDIYMVMEDGKVMQYDEAMAQEKTQAQTNEVEVVTPLEVKPVANASEVMLKLFSLNTANPFEITLPEGGKSVALTHFIKIKQTEFAMGDYQDGEVKGRVLLDYLRITPLNFDPALEPDTQSNAPIQDDPKMQTMPFVAPFIVTTQGSGAFWYLGLFSLDFEHNNLKHLGSVMLGDRIEVDSIEPVYPFEAPFKIAVTYRDRAPDQPMSESPEIVKTLEVTVSETGITNINQ >NC_009052.1|WP_006085199.1|1629675_1630098_+|DUF3224-domain-containing-protein MQVSKITGKFDVKLTPDSTYATGVGGVTLGRMGLDKTFYGELEGRSQGEMLSAMTSVKGSAGYVAIEQVVGKLCGKQGSFVLQHFGIMTDGQNRLILEVVPHSGAGELQGLTGTMAISIENGQHFYEFQFGFEASAEPAF >NC_009052.1|WP_011846320.1|1630416_1631739_+|IS4-family-transposase MQLSEALARTHITRLTEFTCLADVLEPELIQSCLDSQGVATLRRRKLPMDAMIWAVIGMALFRGESVRSLINKLDIVLPQEIDYVARSAVTQARKRLGSEVIREVFSRSANTWHARAEHPHWCGLNLYGVDGVVWRTPDSVQNQAAFARTANASGEAAYPQIRMVCLMELSSHLLVNSAFDSVAENEMNLASQLIPSIPNHSLTLFDRGFYSLGLLHAWQQAQPDSHWLLPLKKGTQYEVVRTLGKHDQWVKLTTTPLARKKWPQLPDTLEARLLTKTVKGKSVAILTSLTDPMRYPSEDIVDLYGHRWEIELGYREMKQHLLESRFTLRSQLPELVTQELWGVLLAYNLIRYKMLLMAKSLPSVHPNQLSFRDAASYIIFKLTQLPSQTPGNVPRDVLDIERNARQFKLDGKRERAYPRVLKMSKNKFPVRPKKNAVHS >NC_009052.1|WP_011846321.1|1631894_1632449_-|BON-domain-containing-protein MKTTTASVLATLLVGSISLNVAAAQDWKDGAKDAWIDGKAETTLLLNTNLNSFDIITDVKEGNVTLTGKVESSVDKALATELIKSLDGVKDVDNQLIVMNEKEGTSEVVATLTDSKVATVVKTRLLFSTDVSGTQINVDVANGIVTLKGEVASDAERQLALKIAENTDDVKKVVDEIKVVKKAS >NC_009052.1|WP_011846322.1|1632780_1633236_-|glutamyl-tRNA-reductase MKSNVVQHQTDIRADIMLIDEMITLNQEGLTFYNQAMTYVEDYNLKRIFSTKANIHQRMLRRFEQLRPLSSEPLHGLSHTIPVTYTQATKLLHQCHISQAMAALVVIEQQVLTQMKQAVRQAHQPQLANQLAEGAAWLQISCDGMSSLNPG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009052_2 | 5060793-5060868 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009052_2
|
1 spacers
spacers of NC_009052_2
>2.1|5060817|28|NC_009052|CRISPRCasFinder TAAACTTATGTACAAACTTTACTGTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009052_2
The CRISPR arrays of NC_009052_2 >merge|NC_009052|2|5060793-5060868|CRISPRCasFinder TGTACAAACTTTATTATTCCAAAATAAACTTATGTACAAACTTTACTGTTTATGTACAAACTTTATTATGCCAAAA >NC_009052|2|2|5060793-5060868|CRISPRCasFinder TGTACAAACTTTATTATTCCAAAA TAAACTTATGTACAAACTTTACTGTTTA TGTACAAACTTTATTATGCCAAAA
>NC_009052.1|WP_011848266.1|5059920_5060748_-|heteromeric-transposase-endonuclease-subunit-TnsA MGRFRKLETLEDYQRALKNNYGLGEADTYMPWLRVQDVNSAGNSGKIDGIKSNRVHHTLSEQESCFFYLVEFCDPVIDIREQFPLLPLDLSVRLAKTLDVDHPINPMTKEKCFNVMTTDFLLTLTDGTKTWYEAISVKPADDLKDKRTAEKLDIERVWWQLQGVVFHIFSMTEQSQIQSRNIQWFTSPYRQGSNFQNDIIEKAKSIVKLGTNLIEDLCNEFIRELNVEHDDALVLLKVLLATKQIRVDLTKPIAESGILQVVKVARQVGEQQNAS >NC_009052.1|WP_011848265.1|5058320_5059931_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MQVELNSVWLFEDVGEIQDGTYRVLSHYPDDSIIVIFKLTDDSNLQRPIAVSIAVFIKATEDGQVSPSDYLTPFYQLVSEETISEAHKNKRNTRFQQIKELITVPNFLLDISLNPRCKHVVDHAKKQNTYVQGLYRSLNLFWKYGQELNALLPAYKNSGGTGKSRIAGDVKRGSPIQVSTPGLIVPKGINTSEEDKVKFLKAMKCYGLRGKAVIYSRVYDQMLTEFYADELISADIEQRDVCVPSYRAFIYWVNRLIPKQEIIRKQTSLGYFDRNLRGLSGSSTDHTEVPGSCYELDATVLDVHVVSEIRRNHVLGRPTLYLIIDKESRMIVGIHVSMEFASWRAGRQALVNCASSKKEYCAQFGIKIEDKDWPCNHIPQRLLCDRGEFICQNAEDLAVPLIGHLSIAPPYRADRKGTIEQRFNMLNKRLNHELQGTTLGRPSTRGDRDPRADAIFTLKEVTTLLIDEVLSLNRQYLDSLGGQSRLFIESGNKPCPLNYWNFHLDKHLHALNKVNEAEVRSRLLPVETVSIARQLP >NC_009052.1|WP_011839977.1|5056746_5058249_-|IS21-like-element-ISSba11-family-transposase MPGHRITDQQIRLFMSKRKDHLQVTAASKAGISERSARRIESGQRQLGPSKPRNYRTRTDPLELVWDPVVLPLLQLSDTITPVGVFDYLCEEYSDVFAVTLRRTLERRIQKWRQINGQDKEVIFRQVKEFGQLGIMDFTWADFIVTIRGTTLKHRFFNYRLPASGWSYVQVVYGGESFVAVATGLQNAFEQSNGVPQEVRTDSLSAAYKNHSNETLFTERFSELSIHYGFKPSKNNTGIAHENGAIESANNHLKNQIRQALAIRGSSDFDSIDEYETFIDDVVQRRNRRIMALLIDEQRQLQPLPKFESVNYEIYPVKVSSTSTFQLKRVTYSVPSRLVGATLRVHLFDKKLDIYCHGVHTATLTRVHASANNRGHQINYRHLIGALMKKPRAFRGGQWRDQLLPNEDYRQIWKNVDALLSADEASLYMVRLLNIASKSDREEAVGRFVLEGINLGQRPNIVDCEERFLKDEEWEFNPKVQQHSLASYQQILDEVNEYVS >NC_009052.1|WP_011839978.1|5056010_5056757_-|ATP-binding-protein MSVETLPIILKELRLVSLLPHWQPLAEKAREQHWPVERYLAELCQLELSCREQKRLHRGLKEATLPIGKYLDTYDFSEVEGLSKKQVWHLADNAEWLKTGDNILLFGASGLGKTHIAAGLGYRLVEQGHRVKFMSASLLVQHLQKAKEELRLPEALVKLDRFAVLILDDLGYVQKSTEETSVLFELIAHRYERYSLIITSNQSFEDWDKLFSDTVMTVAAIDRLIHHAKILQCKGESYRRKEAQNKLN >NC_009052.1|WP_150100093.1|5055386_5055941_-|hypothetical-protein MTSKGIRLNDDMYYECDRPEFEDWKTIARSGARWSMEARIDQDNSSFIYVRLQKMEGFTRCTLMLQSSSLEGLHRADVLFFEDWKKLEKIRAKPDTKSVEQHQRRKAIVKHAQGEAKNAPPLSSKVERTRGMKERRREVIEEARLSSSSAKVERKNEETNYVEQWSEERNKKVVSLLKRKKDND >NC_009052.1|WP_011848263.1|5053950_5055387_-|ATP-binding-protein MYVENACYQKAILPEHVGNALIESLPKKLTDEELVDKLANYPKCLTEDTQNDPEIRAEYLTRIKRLRQPQLVYFDVFRAVEIAIKDGYSAKNPLSPTTMNYLHYSLEDRPIIEPNTGFFKPKGCGITIIGESGVGKTSMLEQVLSIYPDVIKHQSYSGMSLPLTQVVWLKVDCPDDSSVKGLCHRILDEIDRKLDIKDTKPQNTIALLIKQIEAKMKSNYLGILVIDEMQNLNTAKAGGAERLLGFLHNLMNNLGIPILFCANPPFDKLLSKTLKAARRAESGGYFDIGLLKNSEDEWGLFVDELWKLQWTNVQTPLTQDLSDRLFNLSVGNMDLAVRIFYASQRAVIGSLNERITTDVLDKGASIAIRASKSTTDELRLSLLKRKNESKKETPNNEASEEAKVITESKGKFVTIPGDLSRPHHPEFAERITELQYEDDLHALIEDPALIQRASEEEHPLDMLKSAGLFCEDPLKTFG >NC_009052.1|WP_011848262.1|5052506_5053940_-|TniQ-family-protein MLLPPLLPDELLLGRLIRYLAISGDEVGAFCEKAFGSNRISLHPLLTAGIEHLSHAVGESPEELLNQQTLAPLFLFYLPGHASNLKKYLLANEGAKALRESQLPSYGHGGSVCLKWCQLCAKQDIQSYGMTYWHRAHQIPGVIACYKHQVLLGNIALEERKHRFDAGLPPLRNEVTRTALDIEYRVAKFSQQLTLVLMKAPPVIELSSVYRWRLADLGFITSGGRVRRQLLMRQFITWVGSYHSGPDTPLPNDIKDYRYLSELLNPKTSHHPFRHLLFASWLFSHPNEIFKQKQSEPNVALVKPSLIKTKAQQLENKCLKLLEENRSMAEVSRLTGKSRCYLKRIALQHGIKLNLKPRQLTSELKSKIVHLALSGMHRELISERCGIGIGSIEQVISSVSGLVDWRKKCHFESVRRRYRLEIQRYMLENHDAIRRDIKSDCNSAFFWLYLYDRHWLDSALPSPAKPIGHGEYVLNSD >NC_009052.1|WP_086011359.1|5050418_5051974_-|IS3-like-element-ISSba13-family-transposase MARYSPERKEAILKKLLPPHNLTVAEVAREEGIAVQTLYHWRDIARKEGRPVPGKTLTADDWSAEAKFAVLIETAPLSEAEISQYCREKGLYREQVQQWKLECLSGFQTSEVQTKTIKQQAKADKAEIKSLQRELRYKEKALAEAAALLVLRKKPQCALGGRQRGELTPLPERIALIALIQEAYTQGARLYKACAETGLSKRTYRRWYREGQVQADLRPTAARPEPANKLEEHERQQILSVCNQAEYASLPPSQIVPTLLDNGIYIASESSFYRVLNAHGQLNHRGRTQATVNRSKPLSYRADGPNQVWSWDITYLASTVKGQFYYLYLFEDIYSRKIVGYEVHEQENGEYAAALIQRSLLREQCFNTPLVLHSDNGAPMKSLTMKAKLEELGITASLSRPRVSNDNPFSESLFKTLKYRPQWPASGFSCLATAREWVEKFVSWYNDEHKHSQLNFVSPGQRHALQDGAILAKRKKVLEAAKERKPMRWSTEIRNCEAVGAVTLNPDKAPVEGVINAA >NC_009052.1|WP_011848261.1|5049836_5050208_-|hypothetical-protein MPEIDSNEPRAVSVGIRAVLKILEKWSCDQQQVKALLKLPENYNDLDFEHENFSLEQVERVRCILNIHASLRTLFTNPENVYGFMSMVNHNSPFNGSTPLNFILNDKAYNFQLVIKHLESQLY >NC_009052.1|WP_011848260.1|5049082_5049301_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLMFRELPNVYLHRAPVDFRQSINGLAVIVEQQLSLSATDGSVFVFCNKARDKLKILYWDNTGFALWYKRLE >NC_009052.1|WP_011848267.1|5060873_5062058_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MKHHDVIIIGAGAAGLMCAATAGYRGRDVLVLDNAKQAGRKILISGGGRCNFTNLKVEPANFLCGNPHFVKSALARYPSQQFIELVERHGIEYHERDHGQLFCNDSAKEIVTMLLTECEWAGVTIKLRTDILAVKKTEAGRFELNTSNGELSCDSLVIATGGLSMPKLGATPYGYQLAEQFGLKVLTTHAGLVPFTWHSEDKIRFEPLSGIAVPSRITAKDGTAFSEALLFTHRGLSGPAILQISNYWKAGETIEIDLLPNMDLAQLLEQQLTAHPKQSLRNTLSQWLPKRLVEVLFDEALLNKALNQLVHAERAKLVDDLHRWTLLMNGTEGYRTAEVTLGGIDSNELSSKTMEASKVAGLYFIGEVMDVSGWLGGFNFQWAWASGVAAGQAV >NC_009052.1|WP_011848268.1|5062248_5063265_-|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase MKNSADITVLGAGSYGTALAISLASNGHKTLLWGHDPVHMQTLAQDKCNQAFLPGIAFPDCLQIEADLAKALAASNNVLVVVPSHVFGTVLEQAKPLLRSDARIVWATKGLEPETGRLLQDVARDVLGEQYPLAVLSGPTFAKELAMGLPTAISVAGTCPTFTNYLVELLHSPKRLRVYANDDFTGLQLGGAVKNVIAIGAGMSDGIGFGANARTALITRGLVELTRLGEALGANAATFMGMAGLGDLVLTCTDNQSRNRRFGLALGKGCDVMTAQAEIGQVVEGYRNTKEVFTLAKRLGVEMPITEQIYQVLYQGKSPVDAAKELLSREKKSETPAQ >NC_009052.1|WP_011848269.1|5063269_5063755_-|protein-export-chaperone-SecB MAEVANNEQQAPQFNIQRVYTKDVSFETPNSPAVFQKEWNPEVKLDLDTRSAKLADDVYEVVLSLTVTAQNGGDTAFLCEVQQAGIFSITGLTEPQLAHSLGAYCPNFLFPYARETVGSLVGRGTFPQLNLAPVNFDALFAQYVQQRQAAATAPAAEEANA >NC_009052.1|WP_006083779.1|5064050_5064485_-|rhodanese-like-domain-containing-protein MQEYIEFFKAHSMLSLAWVGLFVVLVASIIKSSMSKIKSISHQELTIMVNRQDAKVVDVRSNDEFRKGHIVDAINVTLADIKNNQISALEKFKASPIILVCNAGMTSSQAAQLLSQQGFENLYNLKGGMGEWQAANMPVSKSKR >NC_009052.1|WP_006084808.1|5064752_5066297_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MTTAKRPLALLILDGWGYRENTHNNAIFHANTPVLDRLNAQYPHSLISGSGLDVGLPDGQMGNSEVGHINLGSGRVVYQELTRISKAIADHEFEQNPALCDAVDSAIKAGGAVHIMGLLSAGGVHSHEEHIEAMCRMAVARGATKVYLHAFLDGRDTPPRSAKSSLSHFDDLFTTLGHGRIASIIGRYFAMDRDNRWDRVSQAYDLITQGKSKFQYDNAVTALEAAYERNENDEFVSSSAITDADGQVATLQDGDALIFMNFRADRARQITRSFINPDFDGFERAVVPKMHFVTLTEYAGDIKAPIAYPSENLVNTLGEVLQKQGRTQLRISETEKYAHVTFFFNGGKEEPFEGEDRILINSPKVATYDLQPEMSSAELTDKLVAAIESTKYDVIICNYPNGDMVGHTGNFDAAVKACEAVDACIGRVVDALAKVGGECIITADHGNAEQMTDETTGQAHTAHTSELVPFVFVGRNATIDEGGKLSDVAPTILTLIGEAIPAEMTGKPLIHIKE >NC_009052.1|WP_014620909.1|5066307_5067441_+|peptidoglycan-DD-metalloendopeptidase-family-protein MSTRLLVKASILAGFMMLSFSANASDLEKRQSELKSIQTQINQQQSALKNTSKQREKLLSLLRSDEEAIASAAKKVNSTKNSLAQIDTKLIELKQRQDELETLKVSQQQTLSKQLSSAYLAGNHDYTKMMLNQQSPATIERMLAYYQYLNKARMKSINELKQTLTELDEIKVSQTSKQKQLTKLVAEQQVQAKRLSQEQDQRQLTIKELQRTLNSKGAELEQLQIEEASLKRVVEQALRAMKDNPSMEGFGKQSGKLKWPTKGRVSANFGSQRSGQVVWKGTMLSAPEGQNIRAVSGGKVIYADWLRGFGLVMVIDHGKGYMSLYGHAQTLLKSPGDMVKSGEAIALVGRSGGQSEAGLYFEIRHKGQAVDPAKYCR >NC_009052.1|WP_011848272.1|5067473_5068679_+|S41-family-peptidase MKHMIRYISCVGLGLTLGLSISLSSQENAKSYRSDFDYPLLQDVLETVETYYVKTVSKEELVQAAIKGIFEHLDPYSSFLNHQELLDLKDSNRGEYFGFGFEVATQNDHINIIAPFAHSPAEQAGIRAGDIIVKLNDTLATETNLANILAEIKKHSLSNQSIKLVLKHSNDDATFEVSLKPSTITIESVTTQLLDGNIGYVRLSSFQENSTEDMVRSLSQWQNKPLAGLILDLRNNPGGLLDQAVKIADLFLAKGRIVSTSGRFFDANSDYYASPQTMLTNVPMLVLINKGSASASEVLAAALQENGRAKLLGETSFGKGTVQSLIPILEDGNAIKLTIAQYNTPRGENIHNIGIVPDIKIAAETGSGAGNLAIIDALSAHASLAQDHQVTSAIAWIQHHD >NC_009052.1|WP_011848273.1|5068691_5069447_+|divergent-polysaccharide-deacetylase-family-protein MRLLYSLALLALSISQSHAAQIALIIDDIGYRHTDQAVLALPSTVTLSVLPHTPLGEELANAGHKKGHEIMLHLPMQALNGKALGLGGLTNTMTEAQIRASVVDAINSVPFAKGANNHMGSLLTQLDDPMLWIMETLKQKHLYFIDSMTTRFTKAGETADQLGVPLLKRQLFLDNDTSAKALERQFNLMISQAHTQGNLVAIAHPYPETMRFLKANLQRLKTEGIDLVPASSLLPIGIAHKNGTNPAVTLR >NC_009052.1|WP_006083784.1|5069421_5069877_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MQLTRYTDFGVRTLMYLAVQPDRTTLFRIAEITQVFDLSPNHVSKIVHHLGKMGYLETIRGKMGGFRLGKPASEINLGQLVRVLENSLAPIDCSKPYCRFTPACKLKGVLAQAVEAYLNVLDQYTLLDIVSNRDELLALLPDMSISVLQLD >NC_009052.1|WP_006084804.1|5069899_5070154_-|YkgJ-family-cysteine-cluster-protein MNCRLGCGACCIAPSISSSIPGMPNGKAAGERCVQLSDANLCLIFGSPDRPAVCSDFDASEDVCGHSNEEALWLITQLEAQTSH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NC_009052_2 | 2.1|5060817|28|NC_009052|CRISPRCasFinder | 5060817-5060844 | 28 | NC_014841 | Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B04, complete sequence | 246254-246281 | 6 | 0.786 |
1. spacer 2.1|5060817|28|NC_009052|CRISPRCasFinder matches to NC_014841 (Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B04, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
taaacttatgtacaaactttactgttta CRISPR spacer gaaacatttgtacaaactttactgtgcc Protospacer **** * ***************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1214581 : 1287932
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009052|1214581:1287932|DBSCAN-SWA 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55 | Acinetobacter_phage(18.18%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1392750 : 1512619
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009052|1392750:1512619|DBSCAN-SWA 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111 | Pseudoalteromonas_phage(45.95%) | tail,plate,transposase,capsid,head,holin,tRNA,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1838852 : 1918454
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009052|1838852:1918454|DBSCAN-SWA 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57 | Ralstonia_phage(12.5%) | transposase,protease,integrase,tRNA | attL 1829003:1829062|attR 1913100:1914178 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2172429 : 2250402
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009052|2172429:2250402|DBSCAN-SWA 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60 | Bodo_saltans_virus(10.0%) | transposase,integrase,tRNA | attL 2173884:2173898|attR 2247819:2247833 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2326386 : 2374144
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009052|2326386:2374144|DBSCAN-SWA 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35 | Acinetobacter_phage(25.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2425878 : 2488044
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009052|2425878:2488044|DBSCAN-SWA 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47 | uncultured_Caudovirales_phage(27.27%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2503900 : 2512004
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009052|2503900:2512004|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009052|2503900:2512004|2505224_2505599_+|WP_011846839.1|DBSCAN-SWA MNNLLLVALGGSIGAVFRYLISIFMIQVFGSSFPFGTLLVNVLGSFLMGVIYALGQMSHISPEFKALIGIGLLGALTTFSTFSNETLLLLQEGDWLKATLNVVLNLSLCLFMVYLGQQLVFSRI >NC_009052|2503900:2512004|2507522_2507804_-|WP_006081641.1|DBSCAN-SWA MILHHIQTSPSRDSALKLCLRYACKEDAILLSSDGVNALLLRQWAMALSPFKLMVLKDDVVARGLSERLKNVTLIDYNEFVAQSLLHDKVITW >NC_009052|2503900:2512004|2508633_2509293_-|WP_011846841.1|DBSCAN-SWA MTQETLYSTSASTLEVNKLLKNTYMLLSMTLAFSALCAGLAMALNISPLLSIGLSIGGLVLLFVTLRKAESAAGIFWVFAFTGMEGASLGYMLNHYVGMANGPQLIMQALGLTSVIFVALSAYAVTTKKDFSFLRGFLFAGLIVVIAAAVINIFMGNSIAFMAINAGIALLMTGFILFDTSRIVNGGETNYIRATISLYLDFLNLFIALLHLMGIGNDD >NC_009052|2503900:2512004|2510732_2512004_+|WP_011846843.1|DBSCAN-SWA MKTSSNTFVNIKFFMFLFYLAMLSMLGFIATDMYLPAFKAIEGSLNSTPSQVAMSLTCFLAGLALGQLLYGPLVNKIGKRWALIFGLVLFAVASVFIANSDSILMLNTARFFQAIGACSAGVIWQAIVVEQYDADKAQGIFSNIMPLVALSPALAPILGAYILNELGWRAIFISLCVIAFLLILMTLYFVPGKRQHTHTEHAAVSYGQILKNTRYLGNVVIFGACSGAFFAYLTVWPIVMEMHGYLPTEIGLSFIPQTIMFIVGGYASKLLIKRIGGHQTLNILLSIFAACVISIIMFTLIFPASTIFPLLISFSILAAANGAIYPIVVNSALQQFSQNAAKAAGLQNFLQISIAFGASSLVAMWASLGEVAIGWGILCCAILVVVGYVLKSQQGWGDFAKHFTKPDPARVGIVADVKQNPAD >NC_009052|2503900:2512004|2503900_2505232_+|WP_011846838.1|DBSCAN-SWA MSSLSFNFAPDFRPLAARMRPRTIAEYIGQAHLLGEGQPLRKALEAGRAHSMMLWGPPGTGKTTLAELIAHYSNAHVERISAVTSGVKDIRAAIEQAKAVAESRGQRTLLFVDEVHRFNKSQQDAFLPFIEDGTVIFIGATTENPSFEINNALLSRARVYLIKRLSHDEIAHIVTQALSDTERGLGQRQFVMPTDVLTTLAQLCDGDARKALNLIELMGDMLADGGTFTTEMLIQVAGHQVAGFDKNGDQFYDLISAVHKSIRGSAPDAALYWFCRILEGGGDPLYVARRLLAIASEDVGNADPAAMTIALNAWDCFHRVGPAEGERAIAQAIVYLASAPKSNAVYTAFKAARELARDTGQVEVPHHLRNAPTQLMKDIGMGAGYRYAHDEANAYASGENYFPESLQTAQFYFPTERGFEKRIKDKLAQLALLDQASEHKRYE >NC_009052|2503900:2512004|2509714_2510617_-|WP_011846842.1|DBSCAN-SWA MLSEQALELIDIVARVGSFTAAANRLHKVPSAVSYAVKQIEEELGVILFERHHRSVTLTPAGEHFVKQARTLLTQMDEMKRGTQRVANGWQPTLSIALDNIVRADRISVLIADFYRHFHDIELIIRIEVFNGVWEALATGRSDIAIGATTAIPVGGVYQYKDMGDIEWAFLVSKNHPLANIDRPLSDDELRPFPSICLEDTSREIPKRMTWLLENQRRLVVPDWIRAINCFREGLGVGYMPVHLASVFIKAGALVEKQLENPKQTSPCCLAWNADKMSPALAWVLEYLGDTEKLHKEWLA >NC_009052|2503900:2512004|2507190_2507529_-|WP_006081642.1|DBSCAN-SWA MVNPLQFNGAEIARDHQGYLKDLNDWQPDMALLLAAEEQIVLTPAHWEVINFVRDFYLEYKTSPAIRVLVKAIGQALGPDKGNSKYLYTLFPIGPAKQATKIAGLPKPAKCI >NC_009052|2503900:2512004|2505617_2506904_+|WP_011846840.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDPKFLRNELEVTAERLATRGFILDIAHLTQLEEKRKSLQVATEELQASRNAISKSIGQAKARGEDVDAIMAQVGDLGSQLDAKKIELAAVLEEVNAIAMSMPNLPDESAPIGADETENVEVRRWGTPRTFDFPIKDHIDLGEGLNGLDFKNAVKITGSRFIVMKGQVARLNRAIGQFMLDLHTTEHGYTEAYVPLLVNEASLLGTGQLPKFGEDLFHTKPATEEGQGLSLIPTAEVPLTNLVRDSIVDEDELPIKLTAHTACFRSEAGSYGKDTRGLIRQHQFDKVEMVQIVKPEDSMAALEALTGHAETVLQRLGLPYRTVILCTGDMGFGSSKTYDIEVWLPAQNTYREISSCSNMKDFQARRMQARYRVKADNKPALLHTLNGSGLAVGRTLVAILENYQNADGSITIPEVLRPYMGGLTKIG >NC_009052|2503900:2512004|2507803_2508160_-|WP_006081640.1|DBSCAN-SWA MKKFCILFRCSPHGTVRGREGLDLALLSASFEQEVSLVFVDEGVLHLIKDQQPELIGAKDYISTFKALPLYDIESVFVCKQSLADYGLSHGLLSVPVTVVNDEAIAAHLKQVDEVLVF >NC_009052|2503900:2512004|2508174_2508564_-|WP_006081639.1|DBSCAN-SWA MSKFIIQVNGPAYGTSASVNALRFSQAALLAGHQIICVFFYQDGVYNSTDLSLPASDENDVISDWKQLAQSHQLPLVNCVSAAQRRGIVSKQDASENGLSHWNVGESFIMGGLGELVTGIESADRLISF |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2777364 : 2786016
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009052|2777364:2786016|DBSCAN-SWA CATGGAGATGTTATCCGGCGCCAGCATGATAGTGCGTTCTTTGATCGATGAAGGCGTAAAGCACATTTTTGGCTATCCTGGCGGTTCAGTTTTAGATATCTACGACGCCCTGCACGTTATCCCCGGTATTGAACACATACTCGTTCGCCACGAACAAGCCGCCGTACACATGGCCGATGGCTACGCCCGTGCCACGGGTAAAGTGGGCGTGGTATTAGTCACCTCAGGCCCAGGCGCGACCAACGCGATTACCGGTATTGCCACCGCTTACATGGATTCTATCCCCCTTGTGGTGTTATCGGGTCAAGTCCCGAGCAATCTTATCGGTAACGATGCCTTCCAAGAATGCGACATGATAGGTATCTCTCGCCCTGTAGTGAAACACAGCTTTTTAGTTAAAGATCCGACTGAAATTCCTGAAATTATTAAAAAGGCTTTTTACATTGCCTCTACTGGCCGTCCCGGTCCTGTGGTTGTCGATCTGCCAAAAGATTGTTTAAACCCCGCCCTGCTGCACGAATATTGCTACCCAGAAAGCGTCAAAATGCGCTCGTACAATCCAACGACATCAGGCCATAAAGGTCAGATCCGCCGTGGTCTTCAAGCCCTGTTAGCCGCAAAAAAACCGGTACTTTATGTCGGTGGCGGCGCAATTATCTCAGGTTGTGATAAGCAAATTCTGCAATTAGCTGAGAGATTAAACATTCCCGTCGTCAGCACGTTGATGGGGCTTGGCGCCTTTCCAAGCACCCACAAAAACAGTTTAGGCATGCTTGGGATGCACGGTCGCTACGAAGCCAACATGACAATGCATAACTGCGATTTGATCTTCGGTATTGGTGTACGCTTCGACGATAGAACCACCAATAATGTGGAAAAATACTGTCCGAACGCGACCATTTTGCACATAGATATCGATCCCTCTTCTATTTCGAAAACTATCCACGTGGATATTCCTATCGTGGGGTCAGCCGACAGTATTTTAGACAGCATGTTGGCACAGTTAGATGAATCGAACGAACACAACGACAACGATGCTATTGCTACTTGGTGGAATGACATTGAACAATGGCGCAGTCGCGATTGTCTGGCCTATGACAAAAACAGTGGCCGCATCAAACCACAGCAAGTGATTGAAACCTTGTATAAGCTGACCAATGGCGATGCCTATGTCGCATCAGATGTTGGCCAGCACCAAATGTTTGCCGCCTTGTACTATCCGTTCGATAAGCCGCGCCGCTGGATCAACTCAGGTGGCCTAGGGACAATGGGATTCGGCCTGCCCGCCGCGATGGGCGTAAAAATGGCCATGCCTGATGCTACTGTTGTGTGTGTCACGGGTGATGGTTCCATCCAGATGAACATTCAAGAGCTTTCGACCGCGCTGCAATATGATACGCCGGTTAAAATCATCAACTTAAACAATCGTTTCCTTGGCATGGTAAAACAATGGCAGGACATGATTTACTCTGGCCGTCACTCACATTCCTATATGGATTCAGTGCCAAATTTTGCCAAAATTGCCGAGGCCTATGGTCATGTTGGCATGACGATCAGCGATCCCGCCGAACTTGAGTCAAAAATGGCTGAAGCGCTGGCGATGAAAGACAGACTGGTCTTTATCGATATCATGGTGGATGAAACTGAGCACGTGTACCCCATGTTGATCCGCGGTGGTGCGATGAATGAAATGTGGCTGACCAAGACGGAGAAATGCTAATGCGTCGAATTATATCTGTATTATTAGAAAACCAATCCGGCGCCCTGTCTCGTGTGGTCGGTTTGTTTTCACAGCGCGGTTATAACATTGAAAGTTTAACAGTGGCGCCAACGGACGATATCACCCTGTCGCGGCTTAATATCACAGTTGTTGCCGATGAAATGGTGTTAGAGCAGATAGAGAAGCAGCTACATAAGTTAATCGATGTGTTAAAAGTATCGAATATTACTGAGTCTGCTTATATTGAACGTGAGCTTGCCCTTGTTAAGGTCCGTGCCCAAGGCGAATTTAGGGAAGAAGTGAAACGTATGGCGGATATTTTCCGCGGTCAGATTGTCGATGTCACCGCCAATTTATACACCATCCAAATGGTGGGCACGTCAGATAAACTCGATGCGTTTATTCATGCGCTGGGAGAAGTCACCAAACTGGTCGAAGTCTCACGCTCCGGCGTGGTGGGTTTGGCCCGCGGCGAAAAGGCCATGAAAGCCTAGTTTTCCCTCGGAAATCTCGCGGACATTTTCGCATAAGCACAAAAACATCAAGGGGAGCATAATGCTCCCCTTGTTTTTAAGCGGTTATCACAGCGTCAATTATGACTGGCTGTCTAACAAGCGCGATGAGGTGATCTCAATTTTGCGTGGTTTCAATGCTTCAGGAATTTCACGCACTAAATCAACATTGAGTAAGCCATTTTCTAAACTTGCACCAAGCACAGTAACATAGTCTGCCAGCTGGAAAGTACGCTCAAAACCGCGTTCAGCTATGCCTTGATACAGGTATTTACGCTCGGTTTGGCTTTCGGCTTTATTGCCTTTCACCAGTAATTTTTCACCTTCACTGCTGATCTCAAGTTCATCCATAGAGAATCCGGCTACGGCCATCGTTATGCGATAACGATTTTCGCCGAGTAATTCGATGTTATATGGAGGATAACCTGAGTTACCATTATTGGCGGCGGCATGTTCTGCCAATTGCGCTAAACGGTCAAAACCTATGGCACTGCGGTAAAGTGGTGTTAAATCATAAGTACGCATATTCATATCCTTGTCTTAAGCAATATGGAGAATTGGCGGACTGTTTTCAGGATGAAAACGTTTGTAGAGTCTGCCGAATTAAATCTTCTGTCCTTACGGCACAGAATTCACACTAGGACCCTCATCGAGCGATCCTGAAATAGATATAAGGACGGGAGAGAAAATTTCAAGCAAGAAAATTAAAAAAAATGTGCAGAACTTTAAAAGACCAATAAAAACAAACGCTAATTCAACTTTAAAACGGTGAAGCGAGACGTGATTGGTATCGCTGCATTAGATTCATTGCGCACGGCAAGCAGTATTCGCTAAATTGCAGCCAATAAAAAAGGAGCCTAGGGCTCCTTTTTCAGTCTTAGCATCGAATTAACGAGTGCGTGGACACAGTTCTTCAGCGCTGAAGAAGTAAGCAATTTCACGAGCAGCAGATTCAACAGCATCAGAGCCGTGAGCCGCGTTTTCGTCAATGCTTTCAGCGAAATCAGCACGGATAGTACCAGGAGCCGCTTGAGCTGGGTTAGTTGCACCTAAAATTTCACGGTGAGCTAAAACAGCGTTTTCGCCTTCTAATACTTGGACCATGATAGGACCAGAAGTCATGAATGCAACCAGAGCACCGAAGAAGCCGCGCTCGCTATGCTCAGCATAGAAACCTTCAGCTTGTTCTTTAGTCAGGTGTAACATTTTTGATGCAACGATCTTAAGACCAGCAGTTTCAAAACGATTGTAGATAGCACCGATGTGGTTTTTTGCAACAGCATCAGGTTTGATAATAGAAAATGTGCGTTCGATCGCCATAACTAGCTTCCTTTGTCAGCAAGTTTAAAAAAATTCGCGCGGATTATACGAAATTTAAAAGCTAAATCCTATCTTTATAGCAAATTAGTCTGAGATATTGCGCACATTCGCTTTATTCGTAATCAGCTTGATCACGCAAAAGACCCCGCTAGAAGGATAAATCCTTAGCAGGGTTAATTAACTCATTAAAAAATGGGATTATTTTCTATTTTTTGCCCAAATACCTGCCCAAGCAATCAAAGCGACTAAAATGACTGCGGGAGCAAGATCTAACAAGTGGTGGAATAAACCGACACCGCCATGCCCTGGATGAGCCCAAGCCATTGAAGGGACAAGCATACATAACAATACAAGCAAAAGTTTCATGTGAACATCCTTGCAGTTGCGATAACAAAGTTAAGCCATTTAAATGCCTTAACCAATATACAACAAGGTACGATATCCGCTAAAAATGAACTTGACTGTGATCAAACTCTCGCCAAATATTCTCTGCGCCGCTGCAAATGCGTGAGGTAAATCACCTTAGTTAAACGTCAAAAGGACAAGATGCCTCACATAAAAAGCCGTATCACCACTGTGTTCACTACTTTTCATCAATCCAACACTGCTGAATCGCTTCCAGTATTTTTTCATTACAGTGCTTGGGATCATCGGCAAAATCATCCAAGGCTAACACCCACTCATACAATTGGGTGAAATGCAGCTGAGTAGGATTCACCTCTGGGTGTGCTTCGAGTAATTCCAACGCAATATCTAACGAATCTATCCAGGTTAATGTCATCGTTTTCCCCTATTCGGTTCGCTTTAATGGGTAAGTTCTTGCTAAACGGCGTTACCCATAAGGAGGTGAATCAAGTGTTGATATTCCGTAGTCAATACTCGACAGCAAGGGCACTAACCCTGTGCTTGCGTCACCTTTTTCACTTTAATTGCATTTTTTTCAACAAAATCAATAATAGCACCCGCCACATCTTTCGTGGTGGCGCCTTCAATTCCTTCAAGCCCTGGTGAAGAGTTCACTTCCATGATGACAGGACCGTGGTTTGAGCGTAGCAAGTCAACGCCAGCGACATTGAGCCCCATGGTCTTAGCCGCACGAATGGCGACTGAGCGTTCCTCTGGGGTTAATTTGACTAAACTTGCCGTGCCACCACGGTGCAAGTTAGAGCGGAACTCACCGGGCATAGCTTGACGCTTCATGGCGGCAATCACTTTATCGCCGAGCACAAAGCAGCGAATGTCTGCGCCATTGGCTTCTTTAATATATTCCTGCACCATGATGTTGGCTTTAAGGCCCATAAAGGCTTCAATCACGCTCTCAGCCGCTTTACGGGTCTCGGCTAATACCACGCCGATACCTTGGGTGCCTTCGAGTAATTTAATCACCAGAGGCGCGCCACCCACCATATCAATCAAGTCGGGGATATCACTCGGTTTATTGGCAAAACCAGTAATGGGCAAGCCAATACCGCGGCGTGACATCAACTGCATAGAACGCAATTTGTCACGTGAGCGCGAGATCCCAACAGAATCATTTAAAGCATATACGCCCATCATCTCAAACTGACGCAAAACCGCAGAGCCATAAAAGGTAATCGACGCCCCTATACGGGGGATCACAGCATCAAATGCGGGTAACTCTCGCCCACCAATGTGGATACTCGATTGCCGCATATTGATATTCATATAACATTCAAGGGGATTGATTACGTGTACTTCATGACCACGTAATTGAGCCGCTTCAACGAGTCGCTTCGTTGAATATAACTCAGGCCCTTGCGATAAGATCGCTATTCTCATTCTGGTCTCCGGCAACCATTAATTTTGAGCGCATAATACGCCTGCGCAGGGATAAATCAAACAACAAGAGGCATAGACAAGATTAGTTGCACAAATGCTCAACGCCAAAAGCAAAAAAACCAGTCACGTGGACTGGTTTTAACAATTATCGCGGCAGCATTAATTGCCTTCGCTGACCATGTTAACCGTGTATTTAGGGATCTCAATCACCATGTCAGTGTCGACCACTTTCGCCTGACAAGATAGACGGCTTTCGGGCTCAAGTCCCCAAGCTTTGTCTAACATGTCATCTTCCAGCTCATCACTTGGCTCAAGATCATTAAAGCCTTCACGCACGATACAGTGACACGTCGTGCAAGCACAGGACTTTTCACATGCATGCTCGATATTGATGCCATTACGCAGCGCAACATCAAGAATGGTCTCACCAACATTCGCCTCAAGCACTGCACCATCTGGGCACAACTCGGCATGGGGAAGAAAGACTAATTGGGGCATTACATCACCTATATGTTGTCGATCGACTGGCCTTTGAATGCCACTCGAATAGAATTGTCCATACGTCTGGCAGCAAAATCTTGGGTTTGCTCATCCAGTTTTTCAATCGCGAGCTTAATCGCATCGGCATCATCGCCCGCGGCAACTTGCGCCACATTGACCATAGTGGCATCGATTTGTCCACGCTCATCGGCATTCAGCAAGTCGCCATCTTTCGCTAACGCGGCATGTAAAGACTCGAGTACCCTCGCCGCCTCCACTTGCTGCTCGGCCAGCATACGACGACCGATATCGTCTTTGGCATACTTCATCGAATCTTTCAGCATAGTGGCAATTTCAGTATCCGATAAACCAAAAGATGGCTTAACTTGAATGCTAGATTGCACGCCGGTGGATTTCTCCATCGCGGTCACGCTGAGTAAACCATCGGCATCCACTTGGAAAGTCACACGAATGTGCGCAGCGCCTGCAGCTAACGGCGGAATACCTTTTAGCGTAAAACGCGCCAGTGAGCGGCAATCGGCAACGAGCTCACGCTCGCCCTGCACCACATGAAATGCCATGGCCGTTTGACCATCTTTAAAGGTGGTAAATTCCTGTGCTCGCGCAACCGGAATCGTCGTATTACGCGACACCACTTTTTCCACTAAACCGCCCATGGTCTCTATGCCTAATGACAAAGGGATCACATCGAGGAGCAGCAAATCAGATTCAGGTTTATTACCCACTAAAATGTCGGCTTGAATAGCTGCACCAATGGCGACAACACGATCGGGATCGATAGACGTCAGTGGTGGTTTACCGAAGAAAGCTTCAACCTGTTCACGCACTAATGGCACGCGCGTTGAACCGCCAACCATCACAGTTTCAAGCACTTCATCCGTCGTCACGCCCGCATCACGCAGGGTACGGCGACAGCTAGCAATGGTCTTCTTAACCAACGCCGCAATCATGGCATCAAATTCAGCTTTAGAAACGATTTGCGTGAGTTCAGTCCCATCGGCAAGGATCACTTTTGCTTCAGTTTCTGCGGCATCCGTTAAGGCTTCTTTGACTCGACGCGATTCAATCAACAGTTGACGGCTTAATTGTGAGTCGATGTCGCTAAGCTGCCACACTTGCTGCATATGTGCTTGCAGTAAATGATCGAAATCATCGCCACCAAGCGCTGAATCACCACCAGTGGCTAACACTTCGAATACACCGCGATTCAAACGCAAAATAGAAATATCGAAGGTACCGCCGCCTAAGTCATAGATGGCAATCACGCCCTCTTGCTTAGAGTCTAAGCCGTAGGCAATCGCAGCAGCTGTCGGTTCATTCAACAGACGTAGCACTTTAACACCCAGCAAAGCTGCGGCATCTTTCGTGCCTTGGCGCTGGGCATCATCAAAATAAGCCGGTACGGTTATCACGACACCTTGCAGCTCGCCGCCTAAGGTTTTTTCAGCACGGGCAATCAGCGGACGTAAAATCTCCGCAGACACTTGCACGGGATTCACTTGGCCTTGGGGAGTCACGAATAAAGGTAAACCGTTTTCGCTTTCGGCAAACTCGTAGGGGAATGATTGCTCGCCGGCTTTGATATCAGCCAGGCTGCGGCCCATAAAACGCTTAACCGAAACGATCGTGTTTTGCGGATCCTGCGCCGAACTCAACGCCGCAAGGGCGCCGACTTCGACTGAATCTTGGGTATAACGCACGATAGAAGGTAATGAATGCTGTCCAAGTTCGTCCGGCAGGGTTGCCGTCTCTCCACTTCGAACAGCCGCCACCAAAGAATTGGTCGTACCTAAATCGATGCCAACGGCAAGTCTATGTTGGTGCGGCGCGGCACTTTGACCGGGCTCAGCTATCTGCAAAAGGGCCATATATATCCAACTTAGTAATGCCAACTCAAGCGTGCTTGAGTCAGCAAAGTAACATAAACACGGAAAATCAATCTAACAGAGCGTCTTCGACTCTGGTCAACTCGTCGTGTAATTTTGCCATAAATTTGAGTTTGCGAACTTGATCCGCCGCTAACAATGCATCTTCAGCCTGCTCACTGGTTAACAGTTGAGTCAATTGCTGAGTGAGTTGCGCGCGGTACTCTGCAAACGATTGATATAACGCGTCAATACTCGCTTGAGGATCGGCACTATCGCGTATGTCTTCCAACGCTTCACGCCATTCCATTTGCTGCATCAAGAAGCCAGTATCTTTCACTGTCGTGGTTTCATGGCTTAATTCAATGCCACGCAGCGACAACATATGCTCGGCACGGCGAATGGGATCTTTTAAGGTTTGAAAACCATCATTGACTTGCGCCGTGCGCTGCACCGACAGCAATTTTTGCTGCTCAGTATCATTGGCAAATTTATCGGGATGAACCGCCCGTTGCAGTTCGCGATAGCGTTCTGCAAGTAAGGCGGTATCAATATCGAAGGCAGGGGAAAATTTAAACAGCTCGAAATAATTCATGCGTCAACTTTAGCGGTTAAACAGTGAAACTCTCACCGCAACCACACTCACCTTTTGCGTTAGGATTGTTAAATTGGAAGCCTTCATTCAGCCCTTCTTTAACAAAATCCAGCTCGATCCCTTGAAGATAGATGAGGCTCTTAGCATCGATGATGATTTTCACATCTTCGATATCAAACACTTCATCGTCATCATTTAAAGAATCAACGAACTCAAGTACATAAGCCATACCAGAACAGCCTGATGTTCTTAAGCCGAGACGCAGGCCTACACCTTTGCCTCGGTTAACTAAGAAAGATCTGACACGATCGGCTGCCGCTGGGGTCATTGTAATCGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009052|2777364:2786016|2780483_2780915_-|WP_006081848.1|DBSCAN-SWA MAIERTFSIIKPDAVAKNHIGAIYNRFETAGLKIVASKMLHLTKEQAEGFYAEHSERGFFGALVAFMTSGPIMVQVLEGENAVLAHREILGATNPAQAAPGTIRADFAESIDENAAHGSDAVESAAREIAYFFSAEELCPRTR >NC_009052|2777364:2786016|2782874_2783213_-|WP_006081852.1|DBSCAN-SWA MPQLVFLPHAELCPDGAVLEANVGETILDVALRNGINIEHACEKSCACTTCHCIVREGFNDLEPSDELEDDMLDKAWGLEPESRLSCQAKVVDTDMVIEIPKYTVNMVSEGN >NC_009052|2777364:2786016|2783221_2785084_-|WP_011846945.1|DBSCAN-SWA MALLQIAEPGQSAAPHQHRLAVGIDLGTTNSLVAAVRSGETATLPDELGQHSLPSIVRYTQDSVEVGALAALSSAQDPQNTIVSVKRFMGRSLADIKAGEQSFPYEFAESENGLPLFVTPQGQVNPVQVSAEILRPLIARAEKTLGGELQGVVITVPAYFDDAQRQGTKDAAALLGVKVLRLLNEPTAAAIAYGLDSKQEGVIAIYDLGGGTFDISILRLNRGVFEVLATGGDSALGGDDFDHLLQAHMQQVWQLSDIDSQLSRQLLIESRRVKEALTDAAETEAKVILADGTELTQIVSKAEFDAMIAALVKKTIASCRRTLRDAGVTTDEVLETVMVGGSTRVPLVREQVEAFFGKPPLTSIDPDRVVAIGAAIQADILVGNKPESDLLLLDVIPLSLGIETMGGLVEKVVSRNTTIPVARAQEFTTFKDGQTAMAFHVVQGERELVADCRSLARFTLKGIPPLAAGAAHIRVTFQVDADGLLSVTAMEKSTGVQSSIQVKPSFGLSDTEIATMLKDSMKYAKDDIGRRMLAEQQVEAARVLESLHAALAKDGDLLNADERGQIDATMVNVAQVAAGDDADAIKLAIEKLDEQTQDFAARRMDNSIRVAFKGQSIDNI >NC_009052|2777364:2786016|2785692_2786016_-|WP_006081855.1|DBSCAN-SWA MAITMTPAAADRVRSFLVNRGKGVGLRLGLRTSGCSGMAYVLEFVDSLNDDDEVFDIEDVKIIIDAKSLIYLQGIELDFVKEGLNEGFQFNNPNAKGECGCGESFTV >NC_009052|2777364:2786016|2781113_2781281_-|WP_006081849.1|DBSCAN-SWA MKLLLVLLCMLVPSMAWAHPGHGGVGLFHHLLDLAPAVILVALIAWAGIWAKNRK >NC_009052|2777364:2786016|2785151_2785676_-|WP_011846946.1|DBSCAN-SWA MNYFELFKFSPAFDIDTALLAERYRELQRAVHPDKFANDTEQQKLLSVQRTAQVNDGFQTLKDPIRRAEHMLSLRGIELSHETTTVKDTGFLMQQMEWREALEDIRDSADPQASIDALYQSFAEYRAQLTQQLTQLLTSEQAEDALLAADQVRKLKFMAKLHDELTRVEDALLD >NC_009052|2777364:2786016|2777364_2779083_+|WP_011846944.1|DBSCAN-SWA MEMLSGASMIVRSLIDEGVKHIFGYPGGSVLDIYDALHVIPGIEHILVRHEQAAVHMADGYARATGKVGVVLVTSGPGATNAITGIATAYMDSIPLVVLSGQVPSNLIGNDAFQECDMIGISRPVVKHSFLVKDPTEIPEIIKKAFYIASTGRPGPVVVDLPKDCLNPALLHEYCYPESVKMRSYNPTTSGHKGQIRRGLQALLAAKKPVLYVGGGAIISGCDKQILQLAERLNIPVVSTLMGLGAFPSTHKNSLGMLGMHGRYEANMTMHNCDLIFGIGVRFDDRTTNNVEKYCPNATILHIDIDPSSISKTIHVDIPIVGSADSILDSMLAQLDESNEHNDNDAIATWWNDIEQWRSRDCLAYDKNSGRIKPQQVIETLYKLTNGDAYVASDVGQHQMFAALYYPFDKPRRWINSGGLGTMGFGLPAAMGVKMAMPDATVVCVTGDGSIQMNIQELSTALQYDTPVKIINLNNRFLGMVKQWQDMIYSGRHSHSYMDSVPNFAKIAEAYGHVGMTISDPAELESKMAEALAMKDRLVFIDIMVDETEHVYPMLIRGGAMNEMWLTKTEKC >NC_009052|2777364:2786016|2781809_2782715_-|WP_006081851.1|DBSCAN-SWA MRIAILSQGPELYSTKRLVEAAQLRGHEVHVINPLECYMNINMRQSSIHIGGRELPAFDAVIPRIGASITFYGSAVLRQFEMMGVYALNDSVGISRSRDKLRSMQLMSRRGIGLPITGFANKPSDIPDLIDMVGGAPLVIKLLEGTQGIGVVLAETRKAAESVIEAFMGLKANIMVQEYIKEANGADIRCFVLGDKVIAAMKRQAMPGEFRSNLHRGGTASLVKLTPEERSVAIRAAKTMGLNVAGVDLLRSNHGPVIMEVNSSPGLEGIEGATTKDVAGAIIDFVEKNAIKVKKVTQAQG >NC_009052|2777364:2786016|2779082_2779577_+|WP_006081846.1|DBSCAN-SWA MRRIISVLLENQSGALSRVVGLFSQRGYNIESLTVAPTDDITLSRLNITVVADEMVLEQIEKQLHKLIDVLKVSNITESAYIERELALVKVRAQGEFREEVKRMADIFRGQIVDVTANLYTIQMVGTSDKLDAFIHALGEVTKLVEVSRSGVVGLARGEKAMKA >NC_009052|2777364:2786016|2779676_2780120_-|WP_006081847.1|DBSCAN-SWA MRTYDLTPLYRSAIGFDRLAQLAEHAAANNGNSGYPPYNIELLGENRYRITMAVAGFSMDELEISSEGEKLLVKGNKAESQTERKYLYQGIAERGFERTFQLADYVTVLGASLENGLLNVDLVREIPEALKPRKIEITSSRLLDSQS >NC_009052|2777364:2786016|2781498_2781696_-|WP_006081850.1|DBSCAN-SWA MTLTWIDSLDIALELLEAHPEVNPTQLHFTQLYEWVLALDDFADDPKHCNEKILEAIQQCWIDEK |
11 | Yellowstone_lake_phycodnavirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3030465 : 3108333
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_009052|3030465:3108333|DBSCAN-SWA 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59 | Bacillus_thuringiensis_phage(12.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3646995 : 3658421
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_009052|3646995:3658421|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_009052|3646995:3658421|3652192_3654763_+|WP_011847433.1|DBSCAN-SWA MNVIDTDDLEKHTPMMRQYLTMKAEHHDMLLFYRMGDFYELFYDDAKRASELLGISLTARGKSGGDPIPMAGLPYHAVEGYLAKLVQIGQSVAICEQIGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTLTDEALLQERQDNLLAAVYQGKIGFGYATLDVSSGRFVIAELDTRESLEAELQRTNPVEILYSEDFGELGLLNGFKGKRRRPEWEFDYDTSIKLLLAQFGTKDLHGFGIADARLSLQAAGCLMQYVKDTQRTALPHINAITRFNQTDSIVLDAATRRNLELTQNLAGGRDNTLAAVLDNTATPMGSRILQRWIHQPLRDPKHIQARQQAVTELLDTAAHEGLHEQLKALGDIERIMARLALRTARPRDFARLRQALGLLPELQKSLSTLSAPHTTQLRQHLGEFPAEQALLERAIVDNPPMLIRDGGVIREGYNSELDEWRGLSEGASDYLVQLEAREKERTGINTLKVGYNRVHGYYIEVSRLQSSQVPLNYQRRQTLKNMERYITPELKEYEEKVLSSQGKALALEKQLWEQLFDLILPKLHELQAFARAAAELDVLSNFAERAETLGYTCPELSQDIGVQIEAGRHPVVERVSQTPFIANPVTLHNQRRMLIVTGPNMGGKSTYMRQVALITLMAHIGCFVPAGRALIGPIDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETANILHNATASSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWSAAEYLAQQVGAMTLFATHYFELTQLPELMAGVYNVHLDAIEHDDTIAFMHTVQEGAASKSYGLQVAALAGVPNKVIKAAKHKLQQLESRDHQAEGTRTPIQSLLALPEPVENPALTKLSSINPDNLTPKQALDLLYELKRLS >NC_009052|3646995:3658421|3654981_3655962_-|WP_011847434.1|DBSCAN-SWA MSRIKSTAAEALVDLSVDTVDFDLEKEEVASDLVQELGIEQQVQDDLQKNLDATQLYLGEIGFSPLLSAEEEVYFSRKALKGCAKSRNRMIESNLRLVVKIARRYNNRGLALLDLIEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERAIMNQTRTIRLPIHVVKELNVYLRTARELAQKLDHEPTAEEIAEKLQVSSADVSRMLKLNEKITSVDTPLWGDNDKALLDILADDDNVGPDYKVQDEDISNSVVKWLNELNTKQREVLARRFGLLGYEPSTLEDVGAEIGLTRERVRQIQVEALKRLRDLLGSQGLSVEALFRN >NC_009052|3646995:3658421|3650740_3651808_-|WP_011847432.1|DBSCAN-SWA MKVDPNKEKALAAVLIQIEKQFGKGSIMKLGEDRSMDVETISTGSLSLDVALGAGGLPMGRIVEIYGPESSGKTTLTLEVIAAAQREGKTCAFIDAEHALDPIYAKKLGVDIDNLLCSQPDTGEQALEICDALTRSGAVDVIVVDSVAALTPKAEIEGEIGDSHMGLAARMMSQAMRKLAGNLKQSNTLLIFINQIRMKIGVMFGNPETTTGGNALKFYASVRLDIRRTGAIKDGDEVVGNETRVKVVKNKVAAPFKQAEFQILYGQGINRTGELVDLGVAHKLIEKAGAWYSYKGDKIGQGRANAGKYLTENPAIATEIDKTLRELLLSNPSALAAKADASTEDNVDLETGEVF >NC_009052|3646995:3658421|3657671_3658421_-|WP_006086855.1|DBSCAN-SWA MIRILVSNDDGVNAPGIKALTEALTEIATVLTVGPDRNCSGASNSLTLTNPLRINRLDNGYISVHGTPTDCVHLAIRELYDGEPDMVVSGINAGANMGDDTLYSGTVAAAMEGRFLGFPAVAISLNGRKFEHYQSAAVYARRIVQGLLAQPLAKDQILNVNVPDLPLDQIKGIKVTRLGARHKAEGIVRTQDPAGREIFWLGPPGQEQDATEGTDFHAIANGYVSITPLTVDLTAYGQLTALQNWVDKI >NC_009052|3646995:3658421|3650252_3650666_-|WP_011847431.1|DBSCAN-SWA MLEKGFELNDIEPVLDACESSGFINDNRYAELLVRSHISRGHGAIRIRQAIAQKGLSKDCIEAAITNSDCDWFELAKDKATKKYGIPRVTEVKGSTARDLIAQEKAKRVRFLMGQGFSYDQITYALDSDPNDLDDDY >NC_009052|3646995:3658421|3657039_3657675_-|WP_006082610.1|DBSCAN-SWA MTRVALTSAVNLAKKLHDAGIRNQAVLKAISHTPREMFLDNALAHKAYENTALPIGQGQTISQPYIVARMTELLLHKMPQRVLEVGTGSGYQAAILAQLVPQLCTIERIKGLQIQARQRLKRLDLHNVSFKYGDGWLGWANRSPFDAIMVTAAASTIPEALLSQLAEGGVLVLPVGEDTQQLMRITRTADRFSSETIETVKFVPLINGELA >NC_009052|3646995:3658421|3656042_3656939_-|WP_011847435.1|DBSCAN-SWA MLNAGLVLNLCFIFLLAGCSFQASRPAPVENISHSYSKNNKGHIKSNSYKVKKGDTLYSISWGAGKDFSEIAKLNQLDNPYTIYPGQILYLTNAKSSSQSKSTTLDGWKTSSSGNNSSKNDKKQTDNQVSQTDAKSSNDLKKTLDQKAKPAYLVTSSQQNVNSIMVPPTSTLPTSVSQWEWPVRGKLIGTYSANEQGNKGIKIAGNRGDIIKAAADGRVVYAGSALRGYGNLVIIKHSDDYLSAYAHTDKILVKEKQHVLAGQTVAKMGSTGANRVMLHFEIRYHGQSVNPLTYLPKQ >NC_009052|3646995:3658421|3646995_3649620_-|WP_011847430.1|tRNA|DBSCAN-SWA MYQTTAELRSAFLEFFRSNGHQVVDSSSLVPGNDPTLLFTNAGMNQFKDVFLGMDKRNYTRATTAQRCVRAGGKHNDLDNVGYTARHHTFFEMLGNFSFGDYFKEEAIRFGWTFLTETLKLPKERLCVTIYQTDDEAFEIWNKKIGVAAENIIRIGDNKGAAYASDNFWQMGDTGPCGPCSEIFYDHGDHIWGGRPGSPEEDGDRFIEIWNIVFMQYNRQASGEMLPLPKPSVDTGMGIERIAAIMQGVHSNYEIDIFRTLIAKAAEIIGVSDLTEKSLRVIADHIRSCAFLIADGVMPSNEGRGYVLRRIIRRAVRHGNKLGATEAFFYKLVPSLIAVMGDAAKGLAETQAIVEKALKAEEEQFARTLERGLGILDTALNELKGTTLDGETVFKLYDTYGFPMDLTADVCRERNIIVDEAGFEVAMAEQRSRAQAAGNFGADYNAALKIDAETAFSGYTELAGQAKITAIYQNGESVTAIKAGDEAVVVLDVTPFYAESGGQVGDKGQLVASGVEFTVNDTQKYGQATGHQGVLATGNLSVGQVVEAKVDKKLRHRTQLNHSVTHLLHAALRQVLGTHVSQKGSLVDPERLRFDFSHFEGVKAAELKEVEELVNTQIRRNHELKTAEMGIDEAKEKGAMALFGEKYDSQVRVVTMGDFSIELCGGTHVGRTGDIGLFKITSEAGIAAGVRRIEAVTGAAAMAYVAQQQAELEEAAALLKGDANSVVAKLKAQLDKMKQLEKEMAQLKDKLAAAASADLVGDAVVVNGVNVLIKKLDGVEASSLRGLQDELKQKLKSAIIVLGTAQEGKVNLIAGVSNDLIGKVKAGELVAMVAAQVGGKGGGRPDMAQAGGSQPENLDAALAQVLPWITERLA |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3696297 : 3703893
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_009052|3696297:3703893|DBSCAN-SWA ACTATAACAACTGTTGTTCAAGTTCTTGCAGAACATTGACCATTTCAAGCAGACTTAAAGCAGCTTCGCCGCCTTTGTTACCCGCTTTGGTACCTGAACGTTCAATAGCTTGTTCAATGGTATCTGTGGTCAAAACACCGAAAGCAACAGGCAGATCAAATTCTAAAGCAACTTGAGCTAGACCTTTATTACATTCGCCTGCAACAAAATCAAAATGAGGAGTACCACCACGGATCACCGCACCTAATGCGATAATACCGTCGAATTTACCACTGGCAGCTACGCGACGCGCAGCTAGCGGCAACTCAACCGCACCTGGTACACGGACAACAGTGATATTGTCGTCGCTGACTTGGCCAAAACGTTTCAGCGTGTCAAGTGCACCTTCAAGCAAGCTCTCAACTAAAAAGCTGTTGAAACGCGAAATTACAATCGCAACTTTGGCATTTTTCGCTTCGATATTACCTTGAACTACGTTCATTATCTTACCTAATTTAGCTAAAGCACCCAGCTCGGGGCGAAAAGTGGCGACATGATATCACAGCCAATTGCCCAGAGCCCTATGCAAATTATCAGAAATTGTTAATTTTACTTCAGTGTAACTTTGGGTTTTAGTCCGCCACATACTCAGTCACTTCAAGGCCAAAGCCCGAAAGTGAATGGTAACGTTTAGGCGAGCTGAGCAGGCGCATCTTAGTCACGCCAAGGCTAGCGAGGATTTGCGAACCCACACCCACACGGCGCGACGTTCCCTGCCATTTTGCAGAAGCAGGCGCTTGGCCTTGATCTTCGGCTTCAAAGGCTTTCACCTTAGAGAGGATTTCACAGGGATGTTCTTGATTCCCTAGTAAAACCAATACGCCACCTTCTGCTGAAATACGCTCCATCGCCTTTTCGAGTGGCCAGCTGCGTTGCTGATCGCGCTCTGAATGGAGTAAATCGTTGAAGGTGTTTTGCAGATGCACGCGCACCAAACAATCACTCTTCACCTCACCTTTGACTAAGGCAAAATGCAGTTGATTGTCGATAGTGTCTCTGAAAGTCACCATATCGAACTCGCCGAAACGGGTCGGTAGTTTGCATTTAGCTTCACGCACAACCGTGGTTTCTTTAGTGTTGCGATACTCGATCAATGCCGCGATAGTGCCGATTTTGATACCGTGCAACTCGGAGAAAATCTCTAAATCTGGGCGGCGTGCCATAGTGCCGTCTTCGTTCAAAATCTCAACGATAACGCCCGATGGCTCAAGTCCCGCAAGACGGGCTAAATCACAACCAGCTTCAGTGTGGCCTGCGCGGGTTAATACGCCGCCGTCCTGTGCCATTAACGGGAAGATATGCCCAGGTTGCACTAAATCAGACGCTTTAGCCTCTTTAGCCACGGCCGCTTTTACCGTTACCGCGCGGTCGTGGGCCGAAATACCGGTAGTCACGCCTTCGGCTGCTTCAATAGAAACCGTAAAGTTAGTCGAGAACTGGGCGTTGTTATTCGTCACCATTAAGGGCAGATTTAACTGCTGACAACGGGCTTTGGTCATGGTCTGGCAAATGAGTCCACGGCCATATTTCGCCATAAAGTTAATCGCTTCTGGCGTTACCATTTCGGCCGCCATGATCAAATCACCTTCGTTTTCTCTGTCTTCGTCATCCATCAAAATAACCATTTTGCCTTGACGAATATCTTCGATGATCTCTTCTATACTGTGCAGCGCCATTGTAGGACCTTATGATTTTGCTGTTGTTATGAAATTCTATACCTTAGCAGTACGATTACCAGTGCACTAACGCACAAAGCCGGCACGGGCTAACATTTCCATGGTGACACCACCGCTCTTGCTGTCTTTGCCATCATAATTCATCAAGCGTTCAAGATAACGGGCGATTAAATCCACTTCGATATTCACCTTATCGCCCGCTTGCAGGTCGATTAACGTGGTTTCACCTGCGGTATGCGGCACTATGGTCAGGCGGAATCGACTACCGTCCACTTCGTTAACCGTCAAACTCACGCCATCAATGGTGATGGAACCTTTATGGGCAATGTAACGCCCAAGCTCTGCAGGTGCGGCTAACCAAAACTCGATAGCTTGACCACGCACTAGGCGTTGCTCAACCATAGCAATACCGTCTACATGGCCGCTGACCATGTGTCCGCCTAAGCGTGTGGTTGGGGTGACGGCTTTTTCAAGATTCACCTTAGTGCCCACTTTGTAGTTAGCAAAACCGGTTAGACTCACGGTTTCGGCAGAGACATCAGCCACATAACCGTCGGCTAATTGCTGCACAACCGTTAAGCACACACCGTTGGTGGCAATACTGTCGCCTAAACGCACATCGTTTAAATCCAGTTTGCCGCTCGCCACGGTAAGACGAATATCATCGCCTTTACGCTCCAGTTTGCGCAGGGTGCCAACGGCTTCAATAATCCCAGTAAACATGGTTAACTCACTTAATTAATTAAAGAAGTATCAAGCATAACGCTCAAGATTAAACGGGTATCTGGCCCTAATTTGCGCTCATCGACCAACATTAATGCAGGAATTTGCGCCATGGTTTGATAATCGGGTAGCTGCAATAGATTACGCCCTTGCCCACCGAGGATTTTCATCGCTTGGTACAGCACTAATTCATCGGCCAGCCCCTGCGCTAAAAAAGCGCCCGCTAAGGTTGCACCCGCTTCCACTAGCACGTGATTACAGCTTTGGCCTAAATAGCTTAATAGTTCAGGTAAGGATACGCGACCTGCAATCGCAGGTAACACGAGGCAACTCACATGGGAGGGCAATTGTGCTTGAAACTTTGCGGGATAAGCCACGGTCGAGACCAAGAGTATCGGCGATACGACAGCCAAACAGGCAGCCGATAACGGCAAACGGGCGCGACTGTCGAGTATGACTCTTAATGGCTGCAGTAATTGCGCTTCGGTTACGCTGTCTTTTATGCCGCCAAGTTCTTGATATCGCACATTGAGCGAGGGATCGTCCACCAGTATGGTTTCAATCCCTGTCACCAACGCGCAGGAACGTAAGCGTAAGCGCTGCACGTCGCGGCGAGATTCAGGCCCAGTAATCCATTTAGACACACCGTTAGACAGCGCGGTTTTACCATCGAGACTCGCAGCTAATTTGACTGTAACTCTGGGTAAACCTGATTCCATCCGCTTCATAAAGCCTAAATTCAAGGCATAAGCTTCATCGCGGTGTAACCCCACATCCACTTCAATACCGGCGTCGCGCAGCATTTGAATACCGCGACCAGCCACTTGCGGATTAGGATCTTCAACCGCTACCACCACACGTTTAACGCCAATATTGATCAGCGCCAAGGCGCAGGGCGGCGTGCGGCCATAATGGCTGCATGGCTCTAAGGTGACATAGGCCGTTGCGCCACGGGCGTGTTCGCCAGCCATGCGTAGCGCATGCACTTCGGCGTGGGGCTCACCCGCTTTTTGATGATAACCTTCGCCGACGATCTGATTATCTTTAACAATAACGCAGCCCACACTGGGATTGGGTCTGGTGGTATAAAAACCTTTGCGCGCCAATTGAATCGCGCGGCTCATCATTTGGGTATCGAGTACGGACCAACTTATGTTCAAGCTCATGTTCAACCCTGTTGTTAAAGGTTTCGGCTTTCACCAGTCTTGTAAATCTGTGTTTAAAACCTGTCTTGCAGAAGCTATTAATCAAAAGCCTCTTTTAAAGCTAGCGCAACCAGAAGACTGAACGACAGGCCACAAAAATCGAATAACTACTTTTGCAGTTTAGCGATGGCTTCACCAAATTCAGACACATCTTCAAAGGCGCGGTACACAGAAGCAAAACGTATGTAGGCGACTTTATCGAGACTCATCAATTGCTCCATCATCAAGTTACCGACCATTTCTGAGGGCACTTCCCGCTCGCCAGTGGCGCGTAGGGTAGATTTGATTTTGCTAAGCGCTTGCTCGATTTCATCCATAGACACGGGGCGTTTTTCAACCGCGCGCAGCATGCCACCTTGGAGTTTTTCTTCATCGAAGGGTTGGCGTGAACCATCACGTTTAATCACCCTAGGCATGACTAACTCGGCGCCTTCGAAGGTGGTAAATCTTTCATGGCATTCGGTACATTCTCGGCGACGGCGCACTTGATGGCCTTCCGCCACTAATCGAGAATCGATGACTTTAGTATCTGTCGCGCTGCAAAATGGACAATGCATTGAGCCTCCTGCCAGTGAATGCGAGTAAAGCGTTAATGGCTTTACCTGTTAAATCTCAGCTAAACGCAATGGATTTAAGCCTAAGATTTTACCAATAAAAATGGCCGCTTGATGCGGCCATGGGATTTTATCCTATTTATGGGCTGAGGTTAACTACCGGATGCTAAGTACCTGATGTAAGTAACTGATGTAAGTACCTCATGTAATTACCTAGTCAGCAAGCGATCACTCTCAGCCAATCATCTACGTAAGCACATACGTACTTAAACCTAGATGCGTCAGCAAATTAGCCGTAAACAGGGAAACGTGCACACAGTGCCAATACTTGGCCCTTAACACGCTCAATCACAGCAGGATTGCTTGCATCATCAAGGATGTCACAAATCCAGCCAGTCAGCTCTTTCGATTCCACTTCTTTAAAGCCGCGGCGCGTAATGGCTGGCGTACCGATACGCACACCTGAGGTCACAAAAGGTGAACGTGGGTCGTTTGGCACTGAGTTTTTGTTCACGGTAATGTTAGCGCTACCTAAAGCGGCATCGGCTTCTTTACCGGTCAAGTCACGACCAATCAGGTCAACTAGCATTAAGTGGTTGCTGGTTCCGCCAGAGACGATTTTGTAACCGCGCTCAAGGAACACTTCAACCATAGCTTTAGCGTTATTAACTACTTGCTGTTGGTACACTTTAAATTCTGGCTCTAGTGCTTCTTTGAACGCAACCGCTTTACCAGCGATAACGTGCATTAATGGGCCACCTTGACCGCCTGGGAATACCGCTGAATTCAACTTCTTATACAAGTCTTCATCATCAGCAGCAGACAGGATCACGCCACCACGAGGACCGGCTAAAGTTTTATGGGTCGTTGATGTCACAACGTGCGCGTGTGGAACTGGGTTTGGATAAACACCCGCAGCGATAAGACCGGCAACGTGCGCCATATCGACAAATAGGTAAGCACCTATTTTGTCTGCGATTTCACGCATTTTTGCCCAGTCAACGATACCAGAATAGGCAGAGAAACCGCCGATCATCATTTTAGGCTTATGTTCTACGGCCAGACGTTCCATTTCGTCGTAGTCAATTTTACCTGACTCGTCGATACCGTAAGGAATGATATTGTACAGTTTGCCAGAGAAGTTAACGGGTGAACCGTGGGTCAAGTGACCACCGTGGGCTAAGTTCATGCCCAGTACGGTATCGCCAGGTTTTAACAATGCCATGTAAACAGCGCTGTTTGCCTGTGAACCTGAATGAGGTTGTACGTTAGCGTAAGTTGCGCCAAACAATTCTTTAGCACGTTCAATCGCTAAGGTTTCAACTACGTCCACATACTCACAACCACCGTAGTAACGCTTGCCTGGATAGCCTTCAGCGTACTTATTGGTTAACTGTGAACCTTGCGCTTCCATCACGCGTGGACTGGTGTAGTTTTCAGAAGCAATCAGCTCAATATGCTCTTCTTGACGCAGAGTTTCATTCTGAATTGCCTTAAACAGTTCCGGATCATAATCTGCGATATTCATATCTTTTTTCAGCATTGCTTACTCCAGCTGCCAATTCTTATAGGTAGGGTTGCGCGGTATTCTACTCGGAACGCGACCACAATCCCAGTATTTGAAACATGAAATTCCTGTGGATAGTGCTTGAACTTGGCTCATTGTCGAGTTGAGTTCGGCGCGCAATCGAGTAGAATTAGCCGCATCATTAGTCACTTAAGATAGAGAAAAATGGCTCAGTTTGTTTACAGCATGCTGCGGGTGGGTAAAATTGTTCCGCCTAAGAAGCAGATCCTTAAAGATATTTCTTTAAGCTTTTTCCCCGGCGCCAAAATTGGCGTACTCGGCCTCAACGGTTCAGGTAAGTCGACACTACTGCGCATTATGGCGGGTATCGACACCGAAATTGAAGGTGAAGCGCGCCCAATGCCGGGATTGAAAATCGGTTACCTGCCGCAGGAACCTAAACTCGATCCGAATCAAACCGTGCGTGAAGCGATTGAAGAAGCGGTTGCAGAGGCAAAAAATGCCCTGACTCGCCTCGATGCCGTTTATGCTGCCTACGCCGAGCCGGATGCCGATTTCGACGCCCTTGCGAAAGAGCAAGGCGAACTCGAAGCGATTATCCAAGCCCAAGATGCCCATAACTTAGAGTACGTCCTTGAGCGCGCCGCTAACGCCCTGCGTCTGCCGGATTGGGATGAAAAAATTGAAGTGTTATCCGGTGGTGAACGTCGCCGCGTAGCGATTTGTCGTTTGCTGCTTGAAAAGCCAGAAATGCTGTTACTGGACGAACCAACCAACCACTTGGATGCTGAATCTGTGGCGTGGCTTGAGCACTTTTTGCAGGAATATGCCGGTACTGTGGTCGCGATTACCCATGACAGATACTTCCTCGACAATGCCGCTGGCTGGATTTTAGAACTCGACCGCGGTGAAGGTATTCCGTGGGAAGGTAACTATTCTTCATGGCTTGAGCAGAAAGACGCCCGTCTGAAACAAGAATCTGCCACCGAAAGTGCTCGCCAAAAAACCATTGCCAAGGAATTGGAATGGGTACGCCAAGGTCCGAAAGGCCGTCAGTCTAAGGGTAAAGCCCGTATGGCACGCTTTGAAGAACTGAACACTAACGATTACCAAAAACGTAACGAAACCAACGAGCTGTTTATTCCGCCCGGACCACGTTTAGGTGACAAGGTTATTGAAGTAAATAACCTGACCAAGTCTTACGGTGACCGCGTACTCATCGACAACCTGTCGTTCTCTGTGCCTAAGGGCGCGATCGTCGGTATTATCGGTGCCAACGGCGCGGGTAAATCGACCCTGTTCCGCATGTTATCCGGCGCTGAAACACCAGACAGCGGCACGATTGAGCTGGGTGATACTGTGCAATTAGCATCGGTTGAGCAGTTCCGCGATTCGATGAATGATAAGAACACCATTTGGGAAGAAATCTCCGGTGGTCAAGACATCATGCGTATCAACAACATGGAAATCCCGAGCCGCGCCTATGTGGGCCGCTTCAACTTCCGTGGTGGCGATCAGCAAAAAGTTATCGGCACCTTGTCTGGTGGTGAGCGTAACCGGGTGCATTTAGCCAAACTGCTGCAAGCGGGCGGTAACGTCTTATTACTCGATGAACCCACCAACGACTTAGACGTTGAAACCCTGCGTGCACTGGAAGAAGCGATTCTGGAATTCCCAGGTTGCGCTATGGTGATTTCGCATGACCGTTGGTTCCTCGACCGTATAGCGACCCACATTCTGGATTACCGTGACGAAGGCCAAGTGAACTTCTACGAAGGTAACTACACAGAATACTCGGCATGGTTGAAAAACACCTATGGCGCCGATGTGGTTGAGCCACACCGCTTGAAATACAAGCGCATGATTAAGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_009052|3696297:3703893|3696297_3696777_-|WP_006082639.1|DBSCAN-SWA MNVVQGNIEAKNAKVAIVISRFNSFLVESLLEGALDTLKRFGQVSDDNITVVRVPGAVELPLAARRVAASGKFDGIIALGAVIRGGTPHFDFVAGECNKGLAQVALEFDLPVAFGVLTTDTIEQAIERSGTKAGNKGGEAALSLLEMVNVLQELEQQLL >NC_009052|3696297:3703893|3696907_3698011_-|WP_006082640.1|DBSCAN-SWA MALHSIEEIIEDIRQGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEMVTPEAINFMAKYGRGLICQTMTKARCQQLNLPLMVTNNNAQFSTNFTVSIEAAEGVTTGISAHDRAVTVKAAVAKEAKASDLVQPGHIFPLMAQDGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGLEPSGVIVEILNEDGTMARRPDLEIFSELHGIKIGTIAALIEYRNTKETTVVREAKCKLPTRFGEFDMVTFRDTIDNQLHFALVKGEVKSDCLVRVHLQNTFNDLLHSERDQQRSWPLEKAMERISAEGGVLVLLGNQEHPCEILSKVKAFEAEDQGQAPASAKWQGTSRRVGVGSQILASLGVTKMRLLSSPKRYHSLSGFGLEVTEYVAD >NC_009052|3696297:3703893|3698745_3699900_-|WP_011847460.1|DBSCAN-SWA MSLNISWSVLDTQMMSRAIQLARKGFYTTRPNPSVGCVIVKDNQIVGEGYHQKAGEPHAEVHALRMAGEHARGATAYVTLEPCSHYGRTPPCALALINIGVKRVVVAVEDPNPQVAGRGIQMLRDAGIEVDVGLHRDEAYALNLGFMKRMESGLPRVTVKLAASLDGKTALSNGVSKWITGPESRRDVQRLRLRSCALVTGIETILVDDPSLNVRYQELGGIKDSVTEAQLLQPLRVILDSRARLPLSAACLAVVSPILLVSTVAYPAKFQAQLPSHVSCLVLPAIAGRVSLPELLSYLGQSCNHVLVEAGATLAGAFLAQGLADELVLYQAMKILGGQGRNLLQLPDYQTMAQIPALMLVDERKLGPDTRLILSVMLDTSLIN >NC_009052|3696297:3703893|3700782_3702036_-|WP_011847461.1|DBSCAN-SWA MLKKDMNIADYDPELFKAIQNETLRQEEHIELIASENYTSPRVMEAQGSQLTNKYAEGYPGKRYYGGCEYVDVVETLAIERAKELFGATYANVQPHSGSQANSAVYMALLKPGDTVLGMNLAHGGHLTHGSPVNFSGKLYNIIPYGIDESGKIDYDEMERLAVEHKPKMMIGGFSAYSGIVDWAKMREIADKIGAYLFVDMAHVAGLIAAGVYPNPVPHAHVVTSTTHKTLAGPRGGVILSAADDEDLYKKLNSAVFPGGQGGPLMHVIAGKAVAFKEALEPEFKVYQQQVVNNAKAMVEVFLERGYKIVSGGTSNHLMLVDLIGRDLTGKEADAALGSANITVNKNSVPNDPRSPFVTSGVRIGTPAITRRGFKEVESKELTGWICDILDDASNPAVIERVKGQVLALCARFPVYG >NC_009052|3696297:3703893|3702225_3703893_+|WP_011847462.1|DBSCAN-SWA MAQFVYSMLRVGKIVPPKKQILKDISLSFFPGAKIGVLGLNGSGKSTLLRIMAGIDTEIEGEARPMPGLKIGYLPQEPKLDPNQTVREAIEEAVAEAKNALTRLDAVYAAYAEPDADFDALAKEQGELEAIIQAQDAHNLEYVLERAANALRLPDWDEKIEVLSGGERRRVAICRLLLEKPEMLLLDEPTNHLDAESVAWLEHFLQEYAGTVVAITHDRYFLDNAAGWILELDRGEGIPWEGNYSSWLEQKDARLKQESATESARQKTIAKELEWVRQGPKGRQSKGKARMARFEELNTNDYQKRNETNELFIPPGPRLGDKVIEVNNLTKSYGDRVLIDNLSFSVPKGAIVGIIGANGAGKSTLFRMLSGAETPDSGTIELGDTVQLASVEQFRDSMNDKNTIWEEISGGQDIMRINNMEIPSRAYVGRFNFRGGDQQKVIGTLSGGERNRVHLAKLLQAGGNVLLLDEPTNDLDVETLRALEEAILEFPGCAMVISHDRWFLDRIATHILDYRDEGQVNFYEGNYTEYSAWLKNTYGADVVEPHRLKYKRMIK >NC_009052|3696297:3703893|3698077_3698734_-|WP_006082641.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEAVGTLRKLERKGDDIRLTVASGKLDLNDVRLGDSIATNGVCLTVVQQLADGYVADVSAETVSLTGFANYKVGTKVNLEKAVTPTTRLGGHMVSGHVDGIAMVEQRLVRGQAIEFWLAAPAELGRYIAHKGSITIDGVSLTVNEVDGSRFRLTIVPHTAGETTLIDLQAGDKVNIEVDLIARYLERLMNYDGKDSKSGGVTMEMLARAGFVR >NC_009052|3696297:3703893|3700046_3700496_-|WP_006082643.1|DBSCAN-SWA MHCPFCSATDTKVIDSRLVAEGHQVRRRRECTECHERFTTFEGAELVMPRVIKRDGSRQPFDEEKLQGGMLRAVEKRPVSMDEIEQALSKIKSTLRATGEREVPSEMVGNLMMEQLMSLDKVAYIRFASVYRAFEDVSEFGEAIAKLQK |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
4091390 : 4170278
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_009052|4091390:4170278|DBSCAN-SWA 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51 | Planktothrix_phage(27.27%) | transposase,protease,integrase,tRNA | attL 4099508:4099522|attR 4168397:4168411 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
4177890 : 4242597
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_009052|4177890:4242597|DBSCAN-SWA 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64 | Vibrio_phage(28.0%) | integrase,tail,transposase,protease,tRNA,terminase,portal | attL 4233577:4233590|attR 4237506:4237519 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
4276473 : 4340899
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_009052|4276473:4340899|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_virus(22.22%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
5026825 : 5060748
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NC_009052|5026825:5060748|DBSCAN-SWA 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26 | Shigella_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 5048210:5048226|attR 5060843:5060859 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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