Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009012_1 | 716798-720026 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009012_1
|
48 spacers
spacers of NC_009012_1
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009012_1
The CRISPR arrays of NC_009012_1 >merge|NC_009012|1|716798-720026|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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TTTTTCAAACTTGCAGGGCTAGGCAGGAATCGAACCTGC GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
>NC_009012.1|WP_003517679.1|715766_716057_+|DUF503-domain-containing-protein MVVGVCRVILNINEAFSLKEKRQVVKSIVERVKSRFNASVAEVGFNDKWKNAIIGISCVSNEAGHTDSMMANIVNFIENDGRVELVDYSTENIYVD >NC_009012.1|WP_003517677.1|714452_715637_-|response-regulator MAKILVIDDESTILQNIKFLLEIDGNEVLTASSSTEGLRIFTENCNSIDVVITDMKMPKLSGMDILREIKKITPHMAVIILTGHGDLDNAILAMKEGAFEYLRKPVTAQDLSIAINNAINRKKLLMENERMTQELLAHRNYLQGLHDSAAKILLNMLPKNLPDIEGFNFAVDYKSCDGVGGDMYDVCDIGDYICFYVFDVSHHGILAAVISIIIKSFLQNIEYNYRQGINKRRFPEIVLDLNLELLSNTAQNVFASLFLGFIDKNSKKLYTVSAGHIPQYIMKENGLVPLESTGPILGVFEDSTYKCAVNQLEPGDKVLLFTDGIIESPSDSSDESSDGNQIFGYENMVKVLESCKNEPISTTIDKIMKAVKDFSGNRCTDDMTILGVEVLKEN >NC_009012.1|WP_011837876.1|712661_714425_-|PAS-domain-S-box-protein MRKNLHINENLPEDILESIVISSTEYAIIATDIHNRIIIWNKGAELIYGYSKEEMLGKQFPPDLHRKGLPNNEFLFVPNNETKSRLIDQTMYAKRKDGTFIPISITSTPRVNKNSKTLGLLILTRDITRYKLLDQFNSVLIEITHLINSSSSIDQMCSEVCNAISSFLGLPAVFICLFDRPGNFFYINAMTGLCKNCTGHTCGYHTCAKDVAENIKGCFKTYTQLTINHSPLSEHAIYEYMEAHLPGRGENFIIHIPLISDVSIMGILHIVVSEPQKTFLLKESQILSLVANEITTGIQRKRLIEEIKEYADNLEKMVKERTRELREKDAQLVQSEKLATLGEMATGIAHEINQPLGGISLITQGLILAKKRNKLTDEMLLEKLNAIIEQVDRIDKIIGHLRTFARQSDQTKTPVNIKMPLTDVFKLIGEQLKRQQISVDMDIEENLPYVLADHNRLEQVFLNLIINAKDALNEREKVQQRLVSENDADGQIVPPDKKITIKAFSDNKHVIIEITDNGIGISKSIINKIFEPFFTTKEVGKGTGIGLSISYGIVKEFNGTIEVESEEMKGSKFIIKFPIYKENSMQK >NC_009012.1|WP_003520265.1|710638_712405_-|NFACT-family-protein MPFDGIVTKNIVSELSDILTGARIEKIYQPEPDEIIINLRTKGQNLKLLLSANASYPRIHLTDVTKENPINPPVFCMLLRKHLSGGKITKIDFHDFERVVTIHIETIDELGDLTFKKLVVEIMGKHSNIILVNNENKIIDSIKHVDSDISRVREVMPARPYTLPPGQDKINPLELDIDLLFSKAKEQGDPRISKFFLNNIKGFSPLLCEEICHRADVDPRLPVSSLSEDTIQNLKKVLKEIISKIENSEFTPCIIWNGDDRQKAVDFHSLEIKQYNTVDFYPSISRVLDLFYTIKDTSERLAQKKADLAKILNNCIDRCNKKISIHMDTLREVAEREKFKLYGELITANIYCIPKNASKVSLLNYYSENGEYVEVPLDENLLPQENAQRYFKKYAKAKAAYIHATQQLEEARGELSYLESVLHSLENSNSFEDIDDIRQELAEQGYLPSKKKRPEKKNSKNFTPYTYKSTDGFYIYVGKNNVQNDFLTLKFASSNDIWLHTKNIPGSHVIIRKDRGEIPDSTLFQAAMLAAYHSKAKNSSHVEVDYTKVKNVKKPNGAKPGMVIYDNYKTIIVTPDENVVNNLRMENR >NC_009012.1|WP_011837875.1|709431_710625_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MISESVVNSLKKASWIRAMFEEGEKLRKIHGADNVYDFTLGNPDHEPPSSVKETLKKIVTEDKPGIHRYMNNAGYEDVRQKVADYLNRTSGLSSISSQHIIMTCGAAGALNVVLKTLLNPGEEVIILAPYFAEYIFYVGNHGGKVVIVPPEKDSFKPDLKILENSITEKTKAIIINSPNNPSGYIYSEETLKEIFEVLEKKEKEYNSSIYAISDEPYYKLVYDNVKLPFLFRLYKKSFIVNSFSKSLALAGERIGYIAVNPEIPELELILESLIFCNRTLGYVNAPALFQKAIADSLDADIDVESYKQRRDLIYDTLTRLGFSCIKPQGTFYIFPKSPIEDDIQFIKHAVKYNILLVPGTGFGLPGHFRLSYCVSMDIIKKSLPAFEALAKDFNLIK >NC_009012.1|WP_003517666.1|708843_709365_+|nitroreductase-family-protein MLYDLLKSRRSIRKFQNKEVEKEKIDIILKSALMAPSSRSRRPWEFIAVTDKEKLEKLSKIREHSSDFLAGAPLGIVVVANPKTCDVWIEDSSIAAIIIQLSAQSLGLGSCWIQVRERFGRNNKRAGDIVKEILQIPDEYEVECIIAVGYSAEEKKPYNVDELPYNKLHFESF >NC_009012.1|WP_011837874.1|706079_708290_-|glycoside-hydrolase-family-9-protein MKKLIITVIVSAVLLTALIPQLPVFAADYNYGEALQKAIMFYEFQMSGKLPDNIRNNWRGDSCLGDGSDVGLDLTGGWFDAGDHVKFNLPMAYTATMLAWAVYEYKDALQKSGQLGYLMDQIKWASDYFIRCHPEKYVYYYQVGNGDMDHRWWVPAECIDVQAPRPSYKVDLSNPGSTVTAGTAAALAATALVFKDTDPAYAALCIRHAKELFDFAETTMSDKGYTAALNFYTSHSGWYDELSWAGAWIYLADGDETYLEKAEKYVDKWPIESQTTYIAYSWGHCWDDVHYGAALLLAKITNKSLYKEAIERHLDYWTVGFNGQRVRYTPKGLAHLTDWGVLRHATTTAFLACVYSDWSECPREKANIYIDFAKKQADYALGSSGRSYVVGFGVNPPQHPHHRTAHSSWCDSQKVPEYHRHVLYGALVGGPDASDAYVDDIGNYVTNEVACDYNAGFVGLLAKMYEKYGGNPIPNFMAIEEKTNEEIYVEATANSNNGVELKTYLYNKSGWPARVCDKLSFRYFMDLTEYVSAGYNPNDITVSIIYSAAPTAKISKPILYDASKNIYYCEIDLSGTKIFPGSNSDHQKETQFRIQPPAGAPWDNTNDFSYQGIKKNGEVVKEMPVYEDGILIFGVEPNGTGPATPTPKPSVNPSPSPTPTSDILYGDINLDGKINSSDVTLLKRYIVKSIDVFPTADPERSLIASDVNGDGRVNSTDYSYLKRYVLKIIPTIPGNS >NC_009012.1|WP_004463235.1|705302_705941_+|thiamine-diphosphokinase MMYALIVCNGSIIDYSFYRKFFDEADFIVCADGGALHLQRLGIKPDVLLGDFDSIESEHLEYYMKQNVEILKFPAEKDMTDTELAVNTAIDRGYKNIVIIGGTGTRLDHTLSNIFLLKLMLDRGVKGRIINEYNEMFLINDSTEIEAEDGCYLTLLPLTSKVEGITTEGLYYPLRGEAIEMGSTRGVSNCFVEKKARISITSGILIAIKTRE >NC_009012.1|WP_003517659.1|704627_705290_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MLIKIAPSILSADFSKLGEEVLRIEKAGADLVHIDVMDGHFVPNITIGPPVVKSLKKVSKLPFDVHLMIENPDMYIESFADAGADIISVHAEACRHLHRTIQKIKQLGIKAAVALNPATPLCAVEWVMEDVDMILLMTVNPGFGGQKYINGVTRKIEELERIVESRGLNIDIEVDGGIDTETVQYVTKAGANVIVSGSTIFAAEDTAKIIQELRMNSYRK >NC_009012.1|WP_003517657.1|703584_704469_+|ribosome-small-subunit-dependent-GTPase-A MPSGIIIKGIGGFYYVKTENGIYECKARGVFRKDSKIPLPGDEVVISVIDEEKKKGYIEEICERKIQLIRPAVANINQIALVVSVKSPLPDFVLLDKLLITVMQKELNAIICINKIDLDEGYKDVIIDCYKGTGVETVCVSSVLNVGFEQLAKMLEGKTTVFAGQSGVGKSTILNKILDSYVMETGEISDKIERGRHTTRHAELLELKSGGFVVDTPGFSSFELSEIEPKELQNYYPEFRDYIGKCRFAGCSHISEPGCMVKSALENGMINKDRYGRYIIFYNMLKDKQRRKYS >NC_009012.1|WP_011838186.1|720605_721758_-|IS3-like-element-IS120-family-transposase MEKRKHFTPEQKAKIVIEVIKGERTLNEIAAEYGIHPNLLSRWKTEFISNAGRVFSKETDEVEKVKQSYEKEKDELLKQIGQLSYEVAWLKKNLASSKSREDRMKMIDRNEKKLSITRQAELLSLNRTSVYYKPAPVNEEEYLIKRIIDEIYASYPEYGYRRMTSILNKDYHIHINRKRTRRYMREMGIHGFCPGPNLSKRIHGKNLYPYLLRNLKIDHPNQVWSIDVTYCRMKRGFMYMVAIIDWYSRYIVGFELSNTLDKTFVIEAIQKAIKRYGKPEIMNSDQGSQFTSDDYINLLKNNGIKISMDGKGRALDNQRIERFFRSYKWEKLYLEECETVQQLRQITKEYVEHYNHRRPHQSLDYKTPAEYYFGGYDQLLAVV >NC_009012.1|WP_003512473.1|721918_723139_-|IS256-like-element-ISCth5-family-transposase MATNNRMALLEQLSKYVVEKDKDFLKEALTLLINALMDAEVTSIIGAEKYERNNNRNNYRNGYRLREWDTRVGTLQLSIPKLRHGSYFPSLLEPRKMSEKALLNVVQEAYVHGVSTRKVDELVEALGMKGIDKSEVSRISKQLDEFVEEFKNRRLEGEYPYLWLDATFPKVREGGRVCSMALVIAVGVNQQGEREILGFDVGMSEDGAFWEEFLRRLVARGLKGVRLVISDAHEGLKAAIKKILTGSAWQRCRVHFMRNVLSQVPKHYQGMVSSIIRTIFAQNDQESAREQLRHVVDELKNRFPKAMKILEEAEEEILAYMAFPREHWAQIHSTNPLERLNREIRRRTDVVCIFPNREAVIRLVGAMLMEQNDEWKVGRRYFSLESMSKITSINEFTLTPVALLHK >NC_009012.1|WP_003511744.1|723749_724820_+|IS30-like-element-ISCth3-family-transposase MAVQYKSTTTEHKFKHLSVYERGQIAALLKEGKSQRYIANKLGRSPSTISREIKRGTTMQMRTDLSTYKVYFPETGQAVYEKNRMNCGAKRKLAQVEDFLKFAEDKILREKWSPDAVVGLCRRDPKWQNSTIVCTKTLYNYIDLGLIKVRNIDLNLKLRLKSKIKRIRQNKRVVGKSIDQRPEEVQSRQTFGHWEIDTVTGKKSNDSVILTLTERKTRYELLFLLDAKDSNTVNEALSELKNCYGKDVSNVFRTITADNGSEFSRLSEMLQGLGIEAYFTHPYSSWERGTNERHNGLIRRFIPKGKAIKDFSEETIKRIQQWLNSLPRRILGYKTPEECFNEEIHNLVNKNISAIA >NC_009012.1|WP_011837877.1|726132_727285_+|IS3-like-element-IS120-family-transposase MEKRKHFTPEQKAKIVIEVIKGERTLSEIAAEYGIHPNLLSRWKTEFISNAGRVFSKETDEVEKVKQSYEKEKDELLKQIGQLSYEVAWLKKNLASSKSREDRMKMIDRNEKKLSITRQAELLSLNRTSVYYKPAPVNEEEYLIKRIIDEIYASYPEYGYRRMTSILNKDYHIHINRKRTRRYMREMGIHGFCPGPNLSKRIHGKNLYPYLLRNLKIDHPNQVWSIDVTYCRMKRGFMYMVAIIDWYSRYIVGFELSNTLDKTFVIEAIQKAIKRYGKPEIMNSDQGSQFTSDDYINLLKNNGIKISMDGKGRALDNQRIERFFRSYKWEKLYLEECETVQQLRQITKEYVEHYNHRRPHQSLDYKTPAEYYFGGYDQLLAVV >NC_009012.1|WP_003516481.1|727659_728325_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MMSIKWEQEWDRIYKEQGEVQSEILPTVKVEKDIFKRFGCKKVMDLGCGTGRHTIYLAQNGYQVFAVDISETGIEVTRAKAEKLNLTNIEFAQLDMRNLSVDDNLMDAIMCVWTSGHGTFEDARKNLKEMYRILRLGEILVIDYVSREDENYGKGTEIEKNTFINNVEGEENIPHHYFAKEEIEELYTDFSDVDINPVDYYFTDSYGTRHTIKAFVVIAVK >NC_009012.1|WP_003516485.1|729767_729968_-|hypothetical-protein MESIQRNKQLINKFNEIQEEILKIGWNGIIQKYHPDINCDDENSEKTFKMYKCIYENMRKRLIVNP >NC_009012.1|WP_003512473.1|730555_731776_+|IS256-like-element-ISCth5-family-transposase MATNNRMALLEQLSKYVVEKDKDFLKEALTLLINALMDAEVTSIIGAEKYERNNNRNNYRNGYRLREWDTRVGTLQLSIPKLRHGSYFPSLLEPRKMSEKALLNVVQEAYVHGVSTRKVDELVEALGMKGIDKSEVSRISKQLDEFVEEFKNRRLEGEYPYLWLDATFPKVREGGRVCSMALVIAVGVNQQGEREILGFDVGMSEDGAFWEEFLRRLVARGLKGVRLVISDAHEGLKAAIKKILTGSAWQRCRVHFMRNVLSQVPKHYQGMVSSIIRTIFAQNDQESAREQLRHVVDELKNRFPKAMKILEEAEEEILAYMAFPREHWAQIHSTNPLERLNREIRRRTDVVCIFPNREAVIRLVGAMLMEQNDEWKVGRRYFSLESMSKITSINEFTLTPVALLHK >NC_009012.1|WP_003516489.1|731946_733014_+|hypothetical-protein MKTTLILGAGFSKNSGLPIQSEIPALLTKYKENSNFERSVSLVLESFMRDVFGFEKDIYPQLDDLLTCIDISTNSEHHLGINYSPVHLKALKRLIIYRIFTILEDSFTYSKEVEKLIRFFIENRLEYTGFLVLNWDTVLEKYISAIAPKAIIDYCNGGRYLTEDLRFEEKRDGKRKVEILKVHGSCNWLYCDNCRILINDTVSRVPNIRKVGFKKSDFKLFDEMKKVTDKVFFEDVRCFICGDIVSAHIATQSYRKSFRTNSFPSIWDKAEDMLTNSEKWVFIGYSLPQADYEFKHLLKICEHKLGHKKDRRLSIDVVLFDSETTAMRYKSFFGNKINRIFNSGIGEYISYLEST >NC_009012.1|WP_003516491.1|733086_733710_+|YihA-family-ribosome-biogenesis-GTP-binding-protein MKLKLNLNLNNARFEITAVRPEQYPKNDLPEITFVGRSNVGKSSLINTMLNRKNLAKVAATPGRTRVINFYNIDDKLYFVDLPGYGFAKVPKTMKTGWKDIIETYLIERKQLKKVIMLVDIRHSPTSDDVLMHEWLKAMRKSYVVVATKLDKIPRTKIKERISDIRSILKLEDDVKIIPFSSETRQGRDELWDEILDESYFVESYFS >NC_009012.1|WP_003516493.1|733974_734175_+|sulfur-carrier-protein-ThiS MFITLNGKQTEVDNGTTLVGLIQSKGLEPESIVVEYNYEVLPREKWDSVVLKENDNLEVLRFVGGG |
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NC_009012_2 | 1712609-1719089 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009012_2
|
96 spacers
spacers of NC_009012_2
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>2.95|1718956|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATCTGTCAATTTATCACGGATTGCAGTATCGATTT >2.96|1719023|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT GTGAATTCCGATGCTGTTTCCCTTTCGGGTAAGTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009012_2
The CRISPR arrays of NC_009012_2 >merge|NC_009012|2|1712609-1719089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCTACATTGAAACTGGCAATGCTACAGAAGCAGCAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCTATCTTTGTCAAACAGCAACCACATGAAAGCGTCGGCAAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAATCTACTATAAGTCAGTATGAAACATGCAAAAGAGAACGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGGCGGTGTTGGTGCACATACAAAACTTCCAAGCACAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCACCTCATATGTTCAGGCATACATTTGTTTATATGGCAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCTTCTTAGCCTGCCACTGCTCCCATCTGAAACCTTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTAAAAATATCTTCGGTAATTGCATCCGTTTTAATTTCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACATTTTAAAAAACCCATATTATATCCTCCTTTAGTTTTCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTACTTTGCTTAAGTTTTTCATAATTATCAGATTTATCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTTGTAACCGAGAATGTCCCTCCAATGTTCTAACTTTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGTGATTGCAGACCCTGTTATTATTCAAGCCGCTGAAAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAAGCCGGATTTAGTGAGGCTTTTGGTGAGTCTAATGTCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACATAAACCTCAGACATATGTCACAGCAAAAGGCGTTTCCTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGCCCAAAAGGTAGCTGTAGCTGTTGCTGGCGCAATTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTTTTCCCCAGGTGACTAATTTCAGGAACTTTTGTTAATGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCTTGATAAAATAAACAATTTTTCTGTTGTAGATAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTGATGTGACTGTTGTGGTTCTCTACTGCTGCGCCTTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACATTCAAGTCTCTTTTTTTTGGTGTTGTGCTTGCGAGCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTTCTATGGTCGGAGTGACTGGATTTGAACCAGCGACCTCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAAGGCGAAATAGGTTATAGAAAAATAAGTAATATAACGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAACAGGAGCAGGAAGACAATGAAGCCATGCGCCAGGGCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCCATATCACCAAGTAAATTTGTTTCAACTCCGGCACCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAGAGAAGGGTTTGTAGAAGACGACTTTTTTACTGTCAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCCGACGCTGACTTTGCCGAGTGTGAAGAATGGCTGAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCTTCACGGGAAAGGTTCTTGCTGTAATATTCGGCCATAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAGGAACAGGACTTCATACAACGTCACCGTTGAAGTGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTAAGCCATCGGGCATGACGAACCATTATCGCATAAACGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACATCTCCAATCCACCTCCGGTATGCGGCTGCGTCTGCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTAAAGCTCTGGTCGGTAAATGTGCGGATTGGTCGCTCTGCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAACTCACCTTCTCCCCATTTACCGGACAAACTAACCGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGGTCTAGCTGTGTACCAGAAATACTGGCACAGCTTTTCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGGACTGGCTGCAACCTTGAACATAAACTTGAGTATGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGAGAGGCCTTTTGGCCGGAGGAAGTTGTGGAGGTGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCGCCATATCTACCACATAACCAGCGGTTGTTGCCAATGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACATAGCATTTCTTGAAAAAAACCGTAAAGAGTGGGGATGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTTTTTTTTGCAATTCCTTGTAACCCTGCTTTGCTACTCAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTACCTTTATTAGTCGATACAACACTTAAAGTCTATGACAAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCATACAGCGATGGTAGAAAGGTGAATATTGCTTCCTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTTGCCGCACTGCCCAAAACCAGCCCAATTTTTGAACCCAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTTCGACGTAGAAAATGCAATATCTATCGGGGAATGGTACTTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCCGAACATTTTATGCTCGTAGGGTACATCTTCGCAGAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCACGGCAGCACAACCAGCCGCACGTCTGCTTTGGCTTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCCGTTTCCCACATCTGATTGAGTTGTTTGTTGATAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTGCAATGATTTCGAATTCTTTGTAACATTGACTTTGGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAACCATAAAAAAGTAAACTGAACCATAAATGATACAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTGCCCCATTCTTTTCTTCGCTCTCCTTCGCCCATTAGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACACTTTTTGTCTTCACCTACCATGTCCATATTCGTCATAAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCTTTTATAAATTGAAAAGGAGGATAAGTATGTCAAACAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTACCATCTGAGGGCTATTTTGAAAGGTTCGTCAGTGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCGGTATGCACAAAGAAGTACATACCGCAATATCTCTCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGCTGCCATTTTGACAATGGTGTTCTGCTGATCTGCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCTCGCTCGAATAAAATTGGTACATCATATTTTTCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAATAAAAAATTTAGCATACTTTATATTGACCTTGAAGCGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTAGACATGGATTATGTGAACGTTGTGGCAGACCGGGAAAGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGACTAAGTCCTGCATCAGATGGCAATGTCGGTTCAGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAAGAAAACTGACAATGCAGAAGCACAAAGAGAAAAGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTTCACCTCCTTTTTTCATGAACTTTGGTCCTCCAAGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACATCATATATGATTCATGCAATGGATGTCAATATGGATGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGGTTTATAGGCTTTTAGTTCTCCGCTGTGTATCGCTCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCCGGCTTCACCTATCATCGCGAGAGTCGGAGCGTCTACGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCCTGAAAATCTTCATTCAATGCGGCTATGCCACTGCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAATAAATTTTCCTTTTCCATTTATTTACCTCCTTTTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCAAGCATTTCTTTCGGTAATGGTTCGCCGAAATCAATCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACATTTTCCTCCTTTATATGTATAAAAGACCTTTATAAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACGCCATATATACACCCCCTACAGGTAGCTTGGGGCAAACTCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACATCTAAACGAAGAACAATTGCAAAAGCTAAATGACTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCATTGAAACCGAATGGGTTGAAGAAGGCGGTTTCTTTAGAGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTACTATCTGTAAAATACTTGTAGCCTTGTCTTTTAATTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACCCAATCCATTCTTTCCGCATCTTGTACTGCTGATACCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTTTGTATAAAGTGAGGTAAATAGTAAATATATATGCGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACAAATCAAAGAATCGGCAAAAGGAAAGACATACGAAATTGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTGCCTGCAATGTTCTCGATGGCATTGTCGAAGATGAGGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCCTCCCCTTGCCATGTTATGGTTTCGCCCACTCTTTGTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCACCGTTAGGAAAGTTGATAGTGAACACGCTGTTAGTTTTTATCGTACCTATGAGGA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>NC_009012.1|WP_003518272.1|1710972_1712220_-|glycosyl-hydrolase-53-family-protein MLSKITKLTVIFILILSVTFLSMPKTYTQAAPTFAKGADVSWLPEMEANGYKFYNDDGIEQDCLQILKDHGIDSIRLRVWVNPPNGYCNKEETIKMALRAKKMGFRIMINFHYSDSWADPGKQTKPAAWAKYDFNGLMKAVYDYTYDVMSALKANGITPEWVQVGNETNNGMLWEDGKATNSMRNFAWLINCGYDAVKAVSPETKVIVHIANGYDNALYRWIFDGITANGARFDVIGMSLYPTASDWPQLTNQCLNNMKDMISRYGKEIMICEIGMDYWEAQACKDFITDIIQKTKSLPDNKGLGVFYWEPQCYNWQYYNKGAFDLSGKPTIALDAFLTSDTPDNLIYGDLNGDGRVNSTDYTLLKRYLLGAIQTFPYERGIKAADLNLDGRINSTDYTVLKRYLLNAIPSLPVK >NC_009012.1|WP_003518270.1|1710414_1710861_-|C-GCAxxG-C-C-family-protein MNGKSERAVELFKEGYNCSQAVLAAYCEDVGIDMKTALMIASPFGGGIGRLREVCGAASAMFMIAGLKYGYVDPKDMNAKKEHYELVQKLVERFKEENGSIICRELLGLNVVHDKPEPEKRTEGYYKKRPCAEIVRSAAEIVDELLKT >NC_009012.1|WP_003518268.1|1707537_1710066_-|xyloglucanase-Xgh74A 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MKKNTIKWRIFKYNIIAISVLLALTTIVFNITIQSYIKNDIKEQLSTIAQRVEDTALYRGPDFFPPQEPQRPRPLPGRQNGMFRENNDLFRFYFFLDRSLREPLSILNADFILLDNNMDIITPPEGDFFKPSGEIANEIISKIKKLDGSKVQEYVYFNVNNTDYISIVKPVSDKNSFGLGWLIIYSSLQKVNQLKLGINMILIVIVLLSALIFAIFSSLAAKKISAPFSSLNQHIRAIAERNFGVKIEMPVDAELQELVNSINIMSEKLESYDKAQKTFFQNASHEFRTPLMSIQSYAEGIKYDVVDKNTAADIIIDETKRMTHLVEDLLYLSRLDTIEENYRFADLDFKDFINACQERMYGIASKSGINLEVENINEPVVVYADEEKLFRAFANIIGNCIRYANNTVSIVPKIIDRSKIEIVIRDDGPGIDSNELPNIFERFYKGKKGNVGLGLAISKNIIERHNGKITARNSESGAVFTIVLPVKQS >NC_009012.1|WP_004463804.1|1728802_1729753_-|cation-transporter MIKLLIRWFIKDYQNVDNKKVREAYGVLSGVTGIICNVFLFIVKITVGLVMNSIAVISDAFNNLSDLGSSLVGILGVKLSNRPPDEEHPHGHGRYEYISSLVVSFIIFGVGLELLRNSFWKIIKPEEVTLSTISILLLVISVAVKLWMFSYNRYIGKIINSGINKATAQDSLNDAIATTAVLAGTLIGRFVSFPLDGIMGLIISALIMYTGFGIAKDSVDLLLGLCPNSELIESINSYFLVGEKIKGTHDLKVHDYGPGRISASIHAEVPEGADIVEIHSIIDEIEQRIKNELGIDIVVHMDPVEEKKEDCCNDDK |
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NC_009012_3 | 2729744-2741081 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_009012_3
|
168 spacers
spacers of NC_009012_3
>3.1|2729774|38|NC_009012|CRISPRCasFinder TTTATCAAAGCTTTTGAAAACAGTTGCCTGAAAATTTA >3.2|2729842|36|NC_009012|CRISPRCasFinder GTATTTGAACGGCACATCCTTCAAATCCGCACCATC >3.3|2729908|37|NC_009012|CRISPRCasFinder ATGAGTATCAATTAAGATTATTACTTGAATTAAAGTG >3.4|2729975|36|NC_009012|CRISPRCasFinder AGCGAGAATAACAGCCGAAACCCTTGGTTTCCAAAG >3.5|2730041|37|NC_009012|CRISPRCasFinder GAAGACGACTACGATATAGATTACATTTATTGCGAAG >3.6|2730108|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TTGCGCCTTCTCGCTTTTTGACAATGGACGATCTGCA >3.7|2730175|38|NC_009012|CRISPRCasFinder AATTGCAAATGCTATACGGTGGCTCAAAAACCAGGGAT >3.8|2730243|38|NC_009012|CRISPRCasFinder ATGGGACCCAATAAGGGGAAAATTCGATATATTATTTT >3.9|2730311|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TGACAAAGAAGAAAACGGCATAACGCAATTGAGTTT >3.10|2730377|37|NC_009012|CRISPRCasFinder AAGGATTGACTTATACAGAAACAACAACAGTTAGATT >3.11|2730444|40|NC_009012|CRISPRCasFinder ACTTAAAGGTACTGTATATTGCAAACAGAATTCCAATAGA >3.12|2730514|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TTACACCTATAGCTGATAGAAAGATTGAGTACATAG >3.13|2730580|36|NC_009012|CRISPRCasFinder CCATTGCCGTTTCTGTCTTCCCGGCTCCACAGGGCA >3.14|2730646|39|NC_009012|CRISPRCasFinder GAAAAAGATATCTTATTCAGATATCTCAAATTTAAGGAT >3.15|2730715|38|NC_009012|CRISPRCasFinder GATATATTCAGATACATCCGGAACTATTGTTCTTACTA >3.16|2730783|36|NC_009012|CRISPRCasFinder CGGAATGAACCAGTTCATAGCTTTGCAGGAAATGAT >3.17|2730849|38|NC_009012|CRISPRCasFinder AGTCGTAAGCGCAAGAGAATTGCATGAGAAGCTCGGTA >3.18|2730917|41|NC_009012|CRISPRCasFinder GCCCAATTCCCGGATGATGACAACAACATGATCCGGAACAT >3.19|2730988|37|NC_009012|CRISPRCasFinder GCATCAGATACTTCTGCAGATATAGCACCCAAGCCCT >3.20|2731055|39|NC_009012|CRISPRCasFinder TAGCGGCTTATCAATATTAGAATTGGGTTTACAATACGG >3.21|2731124|39|NC_009012|CRISPRCasFinder GCTGTACATTTTGATTTTAATATAACAGAATTTCTCAAA >3.22|2731193|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TTCCTAAGTTTATCGAGACTTTTATTATTTACATCAT >3.23|2731260|36|NC_009012|CRISPRCasFinder AGACAGATCCTGGCGTCTCCCAGGCAACACGGAAGA >3.24|2731326|39|NC_009012|CRISPRCasFinder GCATATCTGACCTTCAAGTTCAGATTTTCGCCTGAATCT >3.25|2731395|37|NC_009012|CRISPRCasFinder ATTCGTTTATCTTTATCAAATCACTCCCTCCCTTCAG >3.26|2731462|39|NC_009012|CRISPRCasFinder GCTGTACATTTTGATTTTAATATAACAGAATTTCTCAAA >3.27|2731531|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TGTAAACCTATTCGTCAACCAAAGTTAACAATTAAGT >3.28|2731598|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TCTTTCATTGTCGGATATTACGACAGCGAAAAAGAAG >3.29|2731665|37|NC_009012|CRISPRCasFinder CACGATATCGTAGCCTTGGAATCCCAATTTTGAACAA >3.30|2731732|38|NC_009012|CRISPRCasFinder GATGCATTTTTATTCGCTAAGAGATTCTCAGTGGATGT >3.31|2731800|37|NC_009012|CRISPRCasFinder AACAAATTTGCTTGGTGATATGGCAAGCGGTGCCGAG >3.32|2731867|40|NC_009012|CRISPRCasFinder GTGTCGCAAAGAAACTCGCCAATGGTAACTATATTTTTGT >3.33|2731937|39|NC_009012|CRISPRCasFinder TTTCTTTAAGCATTGCTCTTTCATTCAAAGGAATACAAC >3.34|2732006|38|NC_009012|CRISPRCasFinder AGGAACTTGAATGGGAGATATGAAGGTGAAAGGATTAT >3.35|2732074|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TTTAAGAATGTATTTTATATACTCATCCTCAGCCTG >3.36|2732140|35|NC_009012|CRISPRCasFinder AACAATGATGACGTACCTGCCATCCTTCAGCTTGG >3.37|2732205|37|NC_009012|CRISPRCasFinder ATAGCAATAGGTGGGCTTCAAAACACCTCGTCAGCAG >3.38|2732272|39|NC_009012|CRISPRCasFinder TGGAGAAGTAGAATTTGAAAGAGTAGTTACGGTTGAGTA >3.39|2732341|39|NC_009012|CRISPRCasFinder TAGAAAAGCTACTCGGTAAATCAAAATTTGCAGAATTGT >3.40|2732410|37|NC_009012|CRISPRCasFinder AGAATGAACAGGATTTTCTAACGATTACGCTTCCAAG >3.41|2732477|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TATACTGGTCCAGTGAATGGTCCAGTGAATTTGAAAC >3.42|2732544|39|NC_009012|CRISPRCasFinder CGGAGAATATGTAGAATTAGGGAGGGGTTAGATGGAAGA >3.43|2732613|37|NC_009012|CRISPRCasFinder GAAAGAAAAAGCGATACTTTTGATGCACTTGATGAAG >3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TAACTGATGGAATCTATTACAAAAGAAAAAAGTTCA >3.45|2732746|40|NC_009012|CRISPRCasFinder ATTTGCAACAAGGTGGAAATCACATCATATGGTTCGGCCT >3.46|2732816|40|NC_009012|CRISPRCasFinder CACGCTACTGCTTGACGTACTCCCACTCTCTCTGCTTGTG >3.47|2732886|37|NC_009012|CRISPRCasFinder GCAGAAAAAACAAACCAAGGCAATGCACTCACTATGT >3.48|2732953|35|NC_009012|CRISPRCasFinder GAAAAAAGAGAATTTGATGGAAACGTGTTTTATTT >3.49|2733018|39|NC_009012|CRISPRCasFinder TGGGCGGAGACCCACAGCTTGCTGGGAGCATCACGAATA >3.50|2733087|36|NC_009012|CRISPRCasFinder AAGATTTAGGCATTATTGATATATTCGGTAGCCTTG >3.51|2733153|40|NC_009012|CRISPRCasFinder GATTTAACAATACCAAACAATTTACCAAACTGTTCTTGAG >3.52|2733223|35|NC_009012|CRISPRCasFinder CTTCAAGAAGCCAGAGAGCGAGCCTTGGCAGAATT >3.53|2733288|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TCTTTGATTACATACGTTTTGTCTGGCGCGACATCA >3.54|2733354|35|NC_009012|CRISPRCasFinder GGAGGGTGGTGCTCCCCTCAGGGAGCCTTCCACCT >3.55|2733419|36|NC_009012|CRISPRCasFinder GCCGCAAGGGGCGAAAGTAAAACCTCTTACACCTGA >3.56|2733485|36|NC_009012|CRISPRCasFinder GTGATGGTGGATGTTTACCGAAAAAGAGATTGAGGA >3.57|2733551|38|NC_009012|CRISPRCasFinder ATTAAGGGCGGAATAAACGGAACAATTGAATTATTTAA >3.58|2733619|38|NC_009012|CRISPRCasFinder TTGGCACTTTAAAAAAATAAACAGTAACATTGAATTAT >3.59|2733687|39|NC_009012|CRISPRCasFinder GGCGATTACAAATACCGCCGGTATTGAAAGGAGGTATTG >3.60|2733756|38|NC_009012|CRISPRCasFinder ATATTCAACAGGATAAAAGAAGAAATAGAATATTATTA >3.61|2733824|38|NC_009012|CRISPRCasFinder TATTGTCGGGAAAGCAAATTGGACCGCAGGAACCGCGG >3.62|2733892|38|NC_009012|CRISPRCasFinder GCTGCAGAAATATATCAAATCACAAAAGAGCCAATCGA >3.63|2733960|36|NC_009012|CRISPRCasFinder AAAACTGAAATATGCAACAGCCAATGACAATACCTT >3.64|2734026|36|NC_009012|CRISPRCasFinder GCAACTTGCGTCCAGCAGATACCATAGAGTATATTT >3.65|2734092|38|NC_009012|CRISPRCasFinder TCCTTCTCCATCTTTGACAGTGTAATTTTCATTGTCAA >3.66|2734160|37|NC_009012|CRISPRCasFinder ATTACTCTTAAATATATATTAACATATTTTTATTACA >3.67|2734227|37|NC_009012|CRISPRCasFinder ATGGCTATTTTGAGTGGTTTGACCCCTCTTCTTGGCT >3.68|2734294|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TGAAAATCTAGGATATAGTATTGGTCAATGGTTCGG >3.69|2734360|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TATATGTTCCTTCTACGGCTAGGTACTATGAATTGG >3.70|2734426|39|NC_009012|CRISPRCasFinder GCGCATCGTTCTTGTATTCAGGCAGTGGTCTTGAATGAT >3.71|2734495|35|NC_009012|CRISPRCasFinder TGGTACCCGTGTTTTTGTTGTCTATAATAAGACTT >3.72|2734560|40|NC_009012|CRISPRCasFinder CAACAATATATTTGGCAGCCGATGAACCAGAATAATTCTC >3.73|2734630|39|NC_009012|CRISPRCasFinder GGAACATGCTATACCTGAATTAGACGCATTCAGATACAG >3.74|2734699|35|NC_009012|CRISPRCasFinder GGAATACTTTGCCATTATAGCTTTGTTCTGTGCCA >3.75|2734764|36|NC_009012|CRISPRCasFinder GAGTTCTGATATTGGATTTGGAACACTTGATATAGT >3.76|2734830|37|NC_009012|CRISPRCasFinder CCAAAAGTTCGGCAGCTCTGATTCTCTCTTTTGCGGA >3.77|2734897|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TTAGCGAAGCCTTTGGAGAATCGAATGTTGAATCTA >3.78|2734963|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TACTGCCAAAATCAGGGCTTGCATATTCTCCAAAGG >3.79|2735029|38|NC_009012|CRISPRCasFinder ATAAGAATGACAAACAAAACTAGTTCAGTTGTTGGCCT >3.80|2735097|38|NC_009012|CRISPRCasFinder TTGCCTGAATACAAGAACGATGCGCCGGAAGAACTAAA >3.81|2735165|36|NC_009012|CRISPRCasFinder CAGATGAAAGTAGCATAGCTTCAGTTTTTTGCTTTG >3.82|2735231|38|NC_009012|CRISPRCasFinder AAAAGAAATTGCAGATAGGGATGCACAGCTTGAGGAAC >3.83|2735299|39|NC_009012|CRISPRCasFinder CAACTCAAAAAATGCGTCTATTTCCTTTTTCCAACAATC >3.84|2735368|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TGACCTATAGAACTTGGTGATACATACAGTTCACCGT >3.85|2735435|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TGAACCTTTCACTTTATTTGGCTGTGTTACTTTTGT >3.86|2735501|39|NC_009012|CRISPRCasFinder CAGGTTCAGGTTCCTAATAAGAGGGGCATAACAGCCCCT >3.87|2735570|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TTGAGATTCTCGCTCCAACGTTCTTCAAACCGTTTG >3.88|2735636|36|NC_009012|CRISPRCasFinder AATATATTGCAGTCCATTGTCTTGTTGTTTATCTCT >3.89|2735702|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TAGAGAAGGATTATCATTATTTTCTTCTTTAGCAAC >3.90|2735768|39|NC_009012|CRISPRCasFinder CATACAGCCGTACAGGCGATTTGAGGTTCGTGCTCTTGC >3.91|2735837|40|NC_009012|CRISPRCasFinder GTGTAGACCATACTCGCGAAACTCTAGCGGGTCCATATTA >3.92|2735907|39|NC_009012|CRISPRCasFinder GCACCTTTTATCATATCCAAAATAATTTCCACTATCAAA >3.93|2735976|38|NC_009012|CRISPRCasFinder AAAAGCAAATTTCTCGTCTAAAGCTTCCTTTATATCAT >3.94|2736044|38|NC_009012|CRISPRCasFinder GTTTTCAATTGGTTGCGTAAGAAACCCCAAGCTATCCG >3.95|2736112|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TGAAAGCGAAGCCCTTCCTAAAGGCTATAAAACTAA >3.96|2736178|39|NC_009012|CRISPRCasFinder GCATATGCCAGTTTATACAATCTGAATGTTTCTCTGGTA >3.97|2736247|36|NC_009012|CRISPRCasFinder AATCTGCGAACAAGTTAGCGGAAATCATCTAACAAG >3.98|2736313|38|NC_009012|CRISPRCasFinder AGACAAGATTGATTTGCGAGAAGGTGGCTGCCGATGGC >3.99|2736381|39|NC_009012|CRISPRCasFinder TCTTCCTTCCGATGTTTACGATTATTGGGTAATTATCAG >3.100|2736450|41|NC_009012|CRISPRCasFinder CGATTGGGAAGATTTTGAAAGTCCGTATGAAGAGATGAAAT >3.101|2736521|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TTCGGACTCCAAAAATCAACATTTTCGATTGTTAAGT >3.102|2736588|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TGCATCTTCTGTTTGGAACAACTTAGGCTTTCCTGC >3.103|2736654|35|NC_009012|CRISPRCasFinder ACACCCTGCAATATATCCAATTACTTGGCGCATAG >3.104|2736719|40|NC_009012|CRISPRCasFinder GTGATATATTTCACACAGCGAAAGTTTGGAGTGAAAGATC >3.105|2736789|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TGCAACAAGCATTGATACGTCAAAGTCAAAACAAGG >3.106|2736855|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TAACGATTCCGGAGAGTTGCATGGACTATCAACAAA >3.107|2736921|37|NC_009012|CRISPRCasFinder AAGAAAATGAACGGTGGTTTGACAGAGATGAAATGTA >3.108|2736988|38|NC_009012|CRISPRCasFinder TATAGGTGGACTTGTCGGTTATGTAAGAGACGGTGGTA >3.109|2737056|36|NC_009012|CRISPRCasFinder GACTGATGAAGAAAAAGCCTTGGAGGTTGCAAGGAT >3.110|2737122|39|NC_009012|CRISPRCasFinder AGCATTTATACCGTCTGAGGGTTACTTTGAAGGGTTCCT >3.111|2737191|36|NC_009012|CRISPRCasFinder AACCATGACACACAAAGTGAAATTCACGCACAGCGA >3.112|2737257|33|NC_009012|CRISPRCasFinder ACGCCTGAAGAAGGAGCAGGCTGAAATCTACAA >3.113|2737320|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TTTGTAATGCCAATAAGATTTTTCTTGTACCGAATG >3.114|2737386|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TGATGAAGGACGCTGAAACAGGAATGTTCCAGGCTG >3.115|2737452|38|NC_009012|CRISPRCasFinder TTTGTCGCGAATGCTGATCGTGCAGAATAGGTTCCCGT >3.116|2737520|36|NC_009012|CRISPRCasFinder CCAGCATTCCGCCGACTATGGTGATCACTGGCAATA >3.117|2737586|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TGATTCTTCTGGGTGAAGACTACATCGTGATCGAACG >3.118|2737653|36|NC_009012|CRISPRCasFinder CATCTATCCATTGGGATATTACTTCATCAAGTGCAT >3.119|2737719|38|NC_009012|CRISPRCasFinder GGACGACAAGGTCCAACTCATAGAAGCGCGATTCGGTA >3.120|2737787|39|NC_009012|CRISPRCasFinder AAAAAGAATATGCTATGCTTCCTGAATCAACGAAGCAAT >3.121|2737856|37|NC_009012|CRISPRCasFinder AAAATTTCCCACAATAGCTTTTTGTTAGCCTTATCTT >3.122|2737923|38|NC_009012|CRISPRCasFinder CACACAAAAAACGGTTCCGTCATATTCATCTGTCTGTC >3.123|2737991|36|NC_009012|CRISPRCasFinder CCGACTTAAACAAATTACTGGAATAGCAGAATTATT >3.124|2738057|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TCGGTGCTGATGGATTACCGACTATTCGACGTGGACG >3.125|2738124|40|NC_009012|CRISPRCasFinder CAAACCATTCTGCTACGGTCAATTTACTATTTGTTATTTG >3.126|2738194|38|NC_009012|CRISPRCasFinder GTGGGTCTGGCTTATTATCAATTGGCAAGTTGTTTTCA >3.127|2738262|36|NC_009012|CRISPRCasFinder TTTACTTTTTCCTGTAGCTCCTTTGGAGACTTGGCG >3.128|2738328|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TTTTAGATAGTATATAGCTTTATTTGACAAAGGAACA >3.129|2738395|36|NC_009012|CRISPRCasFinder CAATGGCCCGGAGCAGTTCGCATGCTTAGTTGACAA >3.130|2738461|37|NC_009012|CRISPRCasFinder ATTACCTCCCCTGTTTTTTTACATCTGACTCACCTAT >3.131|2738528|37|NC_009012|CRISPRCasFinder GCTAGAGAAGTAAAACCAAAGAAGCTAGGTCAAAATG >3.132|2738595|37|NC_009012|CRISPRCasFinder GCTCTGATGGGTCTCCTCTATACCAAATTCTATTTCT >3.133|2738662|36|NC_009012|CRISPRCasFinder GAATGGCAAAGCAAACTTAAAGAACTTCAAAAAGAA >3.134|2738728|37|NC_009012|CRISPRCasFinder CTTAAAATTCAAAAGTACAAATCTCTACGCAATCCAG >3.135|2738795|37|NC_009012|CRISPRCasFinder GTGGATTCAATCGGTGAACAAATAGCATTGAAAAACA >3.136|2738862|38|NC_009012|CRISPRCasFinder TCGATAGGGTGGGTTCACACCTTCTACTACTTCTTGCC >3.137|2738930|36|NC_009012|CRISPRCasFinder GGTTTTGGGCAGCAGTACCTTCTACAGACTCAAGTA >3.138|2738996|36|NC_009012|CRISPRCasFinder ACGAAGCAGGTTTATACAGTTTGATATTGAAATCAA >3.139|2739062|39|NC_009012|CRISPRCasFinder TTCCTAACTGTATCACTGGACGATTACACAAAGGTTTCA >3.140|2739131|39|NC_009012|CRISPRCasFinder TTCGTTTTCAAGCTTGTCCATCTGCGTAATAATTTTGGA >3.141|2739200|40|NC_009012|CRISPRCasFinder GCTGTTCTATTTCTGTTCTTATAGCATCTGCGTGAGCCTT >3.142|2739270|37|NC_009012|CRISPRCasFinder TTTCGTACGACGGAAGAATTTCCAGCGAATTCAGAAA >3.143|2739337|38|NC_009012|CRISPRCasFinder GAAGCAGCAAGAAGGGCTGGTTATAGCGAGAAAACAGC >3.144|2739405|39|NC_009012|CRISPRCasFinder ACGTAAGATTCATAGCGGATTACCAGCTCAAATAGTAGA 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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009012_3
The CRISPR arrays of NC_009012_3 >merge|NC_009012|3|2729744-2741081|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_009012.1|WP_020457683.1|2728262_2729021_+|ATP-binding-protein MPVNKMLIETYMKKLKMPQVAKTYESLAREAADNNLDYEEYLLCVLEQEVHQRENNRIQRGIRQAGFPVIKTIESFDFLAIPSLNKPRVLKLMQGEYIRRRENVILIGNSGVGKTHIATALGYEACRQGMKVKFYTAAGLINELLAAQQEYRLNKLEKQWLAPHLVILDELGYVPFSKIGAELLFQFCSSRYERGSLIITTNLEFPRWTEVLGDEQMTAALLDRLTHNAHILNINGESYRFKQALSKQANND >NC_009012.1|WP_020457682.1|2726778_2728263_+|IS21-like-element-ISCth9-family-transposase MIKMAQLEDIRKMYFMEGLSIREINRRTGIHRDTISKYISLEEPKPPKYKLTKERTHPVLGPYIPMIKQIIEDDKTRHRKQRHTGTKIFETLKKEGFSGGYNTVMDYLRKEYRKQREAFLPLEFELGAYAEVDWTEAYFYLKGKETKAHLFVMKLRGSGGFYVRAYPFEKQEAFFDGHIKCFEFMNGVPYKIAYDNLKTAVKKILEGSNREEQEQFIALRTHYLYESSFCRPAKGSDKGGVENAGKEAVRRFFVPYPEVDSFEELNEYLHNECIKLLESNPKWEAERAALRPLPAVRFDGARYKEAKVNRYSMVQFETNRYSVPTIYVGEKVTVKATADEVKILNKGTMIASHPRIYGRYQEQIKLDHYLELLLQKSRALGNTKVYKPQMLAPVYEQYRRSLNARSPRGNREFVKILMLHRDYPTALVTEAIEIAMAYNVYSYDGVFNILGQLLVSGSPKTAPVSKDKLQGIPEVVVIPPDLSKYSALMSGGGQ >NC_009012.1|WP_080514922.1|2725601_2725889_+|hypothetical-protein MIIDKRVYLPIKGIYSKFILADINSTNVPYPVKNPMTEPLYIDAILIKIVVNVIRKLHENHKKKPYTVRPLPEVLSYSNCREPAKSQQIKLNISC >NC_009012.1|WP_037294722.1|2725444_2725708_-|hypothetical-protein MGFLTGYGTLVLLISASINFEYIPLIGKYTLLSIINPASIMFLYLLEQKIVVFFGFVYYIALTAFLINMCASLVNKIDVSIPLRENG >NC_009012.1|WP_003513467.1|2724754_2725435_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MHTIELRNISKVIKNNIVLSNINYKFESGKVYGLKGRNGSGKSMLLRTISGLIRPTSGSVIIDGKELHKEIESPGNIGIVVENAGLYPDFTGFYNLKYLAGIMGQISDDEIINAIKRVGLDLYDKKIVKKYSLGMKQKIVIAQAIMEKPDFLLLDEPTNALDESGVKLLREIVQEEATRGALVIIASHNQEDIELLCDKVIIMADGKISDEYVNSREMNLCSEETQ >NC_009012.1|WP_003513469.1|2724056_2724776_-|hypothetical-protein MFRRNAIISVVIIILTVILGQIAKANLLVDNKILKIKTVDELNKLVFQFDLSLDDYIYPNYYTPEKALEVNDRAEIIAVVSPTGRIEQYHWLLRQEVVINKVVRGDKSLEGMTAKLDVSNGLVYYNIDEKRDPFDPRGFNLYYTNTVNIMQPGNEYLAFFNRMPLQDYAEDDIIFNCISTEYSYFNLSLPENDLLITDATANYKLEDLKEYEYFTGSKRMLDLWYDVKEAAVKKYLDPQ >NC_009012.1|WP_003513471.1|2723352_2723907_-|phosphatidylethanolamine-binding-protein 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MMNDLLTSQYVAYELAGEKYALKISDVYEIIKMQSITPIHNSKPFLEGVINLRGKIIPVANLHKRFGLGNYTPTKKTRIVVVKSRDEMIGIVVDKVNQVIRFSDIQPPPEMVAGIDGSYFEGVGITDEGVISILKIDKVLHE >NC_009012.1|WP_003513463.1|2741247_2741511_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIMVYDAGERRNSKVLKVGRKYLHWVQNSVFEGELTEANYHKLKEEVRRKVDNEEDSVIFYKFRTMKYTEREVIGKNVDPNNFIL >NC_009012.1|WP_003513460.1|2741524_2742517_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSAFIFSDGELKRKDSTVLFESEDSKNYLPIEDISDIYIFGEVTVTKKFLELATQKEILLHFYNYNEYYVGTYYPREHYNSGFMILKQAEHYLDEEKRMAIAKKFIHGSVKNMLAVLKYYNNREKDLDRQITAISDLAEKIDEMDEINKLMAIEGNIREIYYGSFDIIVDDEYFEFGKRTKQPPKNRMNSLISFGNSILYTTVLSEIYKTHLDPRIGYLHSTNHRRFTLNLDVAEIFKPIIVDRVIFTLIGKKMLGEKHFEEKAGGIVLNDKGRKQFVAQMLEKLNATLMYKPLGREVSYRRLIRLELYKLEKHLMGEQEYKPYVASW >NC_009012.1|WP_003513458.1|2742530_2743037_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MYEADVRINGTLIWYYFICKREVWLISHGITADQEDENIEIGRFIHENAYSREKKEIDFDNFKVDVADSIDGKIIVQEVKKSSKFKKSARMQLLFYIYEIKKSGIDARGILLFPEERKREEVVLDEASQKELDSVIKDIFKIVNLEKPPIPEKCKYCRNCAYSELCWA >NC_009012.1|WP_003518145.1|2743055_2745308_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFAKPVDNYEGTYEYHVKRCAEILEFEIRSKYPAFKRILSSYGFDVEDFIEKMKTAVVFHDFGKLNPYFQEYMKRKIEKKKLSGIKHFRHEVLSCLFLMSNEKSKEAYFPYHILAVLGHHKMLSSDLKSFERERVWQDRWPEISEDAVKHAMEIASEFGIKVDGRSGPQGKSANNYLNALLKLALMLYEKDREKLKVVYSVSKGLLHNCDWIASSNLDYNRVCLIGVSANDIEKKLKEKLEKENKKYVRREFHSICANAVGDVVAIAPTGSGKTEAALMWALNSETTKIIFLMPTMVTSNSLYERLSTHYFPKESCGLSHSGAETYFYKKSKEDDTENDYDWSQILHQKAFIPAVMVSTVDQVLSTEFHTGLWNQKEYALVGSSVIFDEIHAYDGYTIGLITGVIKKIKKYGGRVMLMSATMPKFLRNHFLDLLDSKCLVVAEELMERASNEWAYLDTDLEGIREKVLKEVSEGKKVALIVNDVETAKKEYKYYSKKGFDVLCLHSEFTMKDRQEKEGRLTSKEGNPYRLVISTQVIEVSLDVSFDVMFSECAPIDSLVQRAGRCNRHGLINFGRFYVFNPSDTAVKYVYRKQKDILDKTVEVIRKNSGRLTEKQIMAMVEEVYEGFNLYDEDYKLGIDIVRDIEQRYNFFDVNIFQEDENLSTRKFDVVKVPVIPADEYMEIVEKLFESKDYKMISLYEIPVSISKFKKYIRRLEISNKYNLPIFKIKYSSEYGIDYEEDDSNTCYLY >NC_009012.1|WP_020457757.1|2745329_2746055_-|CRISPR-associated-protein-Cas5 MYGLIVTLYAKTASFRDPGAQLYHETMSLPPPSTITGIAGAALGLSFEDALAFMKENAVMVGCNGSSEGRGKDLWNYTKIKSGEITNAIIIRNFLADLKVEIFFACEKREVITRLADAFENPVYAITLGNSDEIAKICSIEIFEEISCEKKKILTNTWLPGDYSRKLKVDWEKVKKAKISLTLKPPIVKKLPCDFEFDANGVRKAVKYLDITFMGDNHILETEAEVLVFGNKFAAVMKHEG >NC_009012.1|WP_003513455.1|2746073_2746958_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKDAKAITVTYLTKASYSSLNGADKEADNIVSIKKIQMNDGKEYPYCSSQAVRRALREQLASMGWELSETTVAKQKKGAASTLCEPSKYIDDDLFGFMNADSSKTVKRTSPVRVSPLVALEPYGGGMDFGTNYMSVKAGGTPNIFETEIHSGYYVGTVLIELDRVGEKSPGDEYDLSLSQDEKKKRVNALVDAIQNLWTVGRQSRFLSDVSPKFVAAAVLKVKNPIFLECIKIGSSGSVDMSLVKNTVDDFHKQIIDYAIGERKGFFAQDSETALPLGQCFEKIHSWVEEYYKD >NC_009012.1|WP_003513454.1|2746963_2748640_-|hypothetical-protein MEYSIALRRHWWFDAGIAGLYSISKSRDDRLLEFDVEVKVDSENQALTFEGKDTDTLRAYFETCYEILAERYWNVSTIKQKENPELVVYDKEKDEIMLMPKRNPTPVVSLFIGARSWQGEGIPYGDITEPLKSRVDEFLEKTRAKLWGSKKLLLLSQPVCHQKLTILPEEKKKGKTEVCCVCGKHSLYMIEVGLPSFLLFASSNATKSFNSQGKNPAKLCWECEFISKFAIESASYKRTNDSIFVIQVTSPDIDKLIEMQKEFGSLSELRMLDDKYFYANIGLEEDSLIKKCSAPYELLWAFMEEKYSLLLKESSEGEETFDDVSADNFFFEFIEKLSKMPVQIYVLYATDSGQTFLTKNLVLYDELGYFYRLIHHMKKSGVNTRKLFSSLYEEKYDFREKILRNVLRKNSILRHIEQFAFRMVMRDQRISMGNILKFTIEYEQIIRGDEMNKEQIETAVNLGKQIVIQAVETARAENENEKQALKKIKGDLYQLRKSRTKTDFINQLNNLQFRYGIAVSKNILDGILEEVDFEDFRAYCVLGALNVYNAKNNKDKED >NC_009012.1|WP_003513453.1|2748651_2749374_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFKVGIEFDESLELPFNYNKILQGFIYRNIMDKDLARFIHDRGFSYEKRKYKMFTFSRLQGKFSIDSKKKKIIYQSPVELVVSSCYEDFFIDLSLSLLRRDVEIAGHKAYVSKMDIIMEEPKSIQKIRMLSPVTAYSTLDDKRTVYFSPYNHDFKRIIKENLIKKYKAFYKDDSKDNVDFDIELVSDKYAKVISSYDGFIIEGWMGDFVLKGDQEVIKLAYDAGIGGKNSQGFGCFKLI >NC_009012.1|WP_003513452.1|2749630_2750551_+|methylenetetrahydrofolate-reductase MLKQKILNRESGIITYGITPPKKNNTEEKIKEISQKHIERISGLDIDGLVIYDLQDEKERVSEERPFPFIETIDPQIYSENYLKDLKIPKIIYRCVGKYTPDEFRRLTRPVSGQDAFSVFVGAASRNQSVLLKLSDAYKIRQDVNPDLLLGGVAIPERHMKNTDEHLRIIDKINKGCKYFITQAVYNVEAAKDFLSDYYYYSKNNNLKMVPIIFTLTPCGSTKTLEFMKWLGISIPRWLENDLMNCEDILNKSVSLSKSIFNELMEFCLEKGIPIGCNIESVSVRKVEIEASIALAKDIKYIMKGI >NC_009012.1|WP_020457758.1|2750580_2751399_-|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MLELIKAIFLGIVEGITEWLPISSTGHMILVEEFINMNLSDEFMEMFRVVIQLGAIMAVVVLYWNKLFPFSFEDRIQIKKDTFSLWIKVLAATLPAALIGVPFDDKIDELFYNYITVAITLIVYGVLFIIMENRNKSKIPAISTFEELGYKAVLLIGAFQVLALIPGTSRSGATILGAIMIGCSREIAAEFSFYLAIPVMFGASLLKLVKFGFAFSQTELIILLTGMIVAFAVSIFAIKFLMGYIKRNDFKAFGYYRIILGLIVVLYFLAVR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009012_4 | 3785203-3791136 | TypeI-B |
?
Consensus repeat of NC_009012_4
|
80 spacers
spacers of NC_009012_4
>4.1|3785240|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT ATGTAGATGAATGATTACGATGTTGGAGAAATATTT >4.2|3785313|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT CTGTATCCGCATGTCCTACAGCAGATGTCACATCTG >4.3|3785386|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT ATCTTTTGTATATCAAAGGAAGCTACTTCTGTAATTA >4.4|3785460|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT AGTGCTGCAAACATCACAGCAGTATTCAATCAGGAA >4.5|3785533|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT TCGCATTTTCTACATCAAACAAAGTTGCTCCGTCGT >4.6|3785606|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT CCTCCAAGTTTCAGTCTCCATGAAGTACCATTCCCCT >4.7|3785680|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT GTGAAACTTGCCGGTTTTTATGGCGTATCTGTAGATT >4.8|3785754|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT TCAAAGTGCACAAATAAAAAGTGCTTGTGTCAATAC >4.9|3785827|38|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT CACAAGTTGCAAATGATGTATTGCCGCCGGTAATTTCC >4.10|3785902|35|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT GCCATCAGTGGCCGATAGATAAGGCACAATATCTA >4.11|3785974|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT GTTGCTATTCGAGCAGAAAGAAACCCAAAAGTTATC >4.12|3786047|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT 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>4.57|3789368|35|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGGAAGATGCGTTGTTTATGTCAGCAATTTCCGG >4.58|3789440|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAAATGGCAGGTGGTAAAACCACAGCTAATACATC >4.59|3789513|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTCATCAACATCCATCTCGTCTACATAGAACTCA >4.60|3789586|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAACATATTTTAAAGCAAAAAGCAGAAAATCACTGG >4.61|3789660|35|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGATTGTAAAGGAATATGTATCCCCAAGCCTTACA >4.62|3789732|38|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGATAGTGCAAACATAGATGAAGCCTCCGTAGGCCTT >4.63|3789807|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTATTTCAGCAACAATATATTTGGCAGCCGATGAAT >4.64|3789881|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCATTGTATATATCTTTGGAGTAACGTATAATACCC >4.65|3789955|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGATAATGTTCTTTTCAATAGTGCCAAGGTCTAATC >4.66|3790029|37|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACAGGAACGTGCGTTCTCTGGACGAGGTAACTATCGT >4.67|3790103|35|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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cas8b1,cas7,cas5,cas3,cas6,csm3gr7,csx10gr5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009012_4
The CRISPR arrays of NC_009012_4 >merge|NC_009012|4|3785203-3791136|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATGTAGATGAATGATTACGATGTTGGAGAAATATTTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTGTATCCGCATGTCCTACAGCAGATGTCACATCTGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATCTTTTGTATATCAAAGGAAGCTACTTCTGTAATTAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAGTGCTGCAAACATCACAGCAGTATTCAATCAGGAAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTCGCATTTTCTACATCAAACAAAGTTGCTCCGTCGTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCCTCCAAGTTTCAGTCTCCATGAAGTACCATTCCCCTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTGAAACTTGCCGGTTTTTATGGCGTATCTGTAGATTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTCAAAGTGCACAAATAAAAAGTGCTTGTGTCAATACGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCACAAGTTGCAAATGATGTATTGCCGCCGGTAATTTCCGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGCCATCAGTGGCCGATAGATAAGGCACAATATCTAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTTGCTATTCGAGCAGAAAGAAACCCAAAAGTTATCGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTGATATTATATTGAATCTGTTTAAATGAGATATTCAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCCACTGTCTTCTGTCAATTGTTATTATATCATATATTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATGTATGTTCAAATACATCATAAATATGGTAAGGAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTGATAATGTTCTTTTCAATAGTGCCAAGGTCTAATCCTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTCCCCGCCGTGTTAATCCGATTGTAAACCTATTCGTCAAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACTAATTTGATTTATAAAAATGACTTAATTACAAATGAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTATAGATATGTATGGAGTACCGAAAGGCGACCCATGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAATACGGTGTCAGTGACGTTTTGAACCTCAACCAAGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACTCTCCCATGTTCATTCCTCCTCTTTTCAAATTTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAGATAGACGTACATATGACAGGAGGTTGAAGTTATTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGAAGCTATGCCTTATGTGGGTGGACGCAGTTCTTCAGGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTATTTTGTAATAATCACTTTTAATTTCATAACCTACAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAAATAGTACATAGGTGGAGAGCAGCAAACCCGCGAAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTTGCAACGTTTCCGTTGCTGTTAACTACATAGCAAGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACGATGAGCTTAAAAACGATTACTAAAGAGAGGATGGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATTTTTGCTTCTCTAGCTTGTCTTTTCGTATGTATGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACTGCTTTAGCGTGATCCTTGTGACCGTGCGATACAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTGGACTTTGCTCAGGTCATTGGCCCGGAGAAACTGCGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTCATTCTTGCAAGCCTGAATCAGCCCTTTTAGATAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGGTTCTATGATTTCGATATACGACCCGCCTCTATATCCGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTTTTCTTAATTTCAAATACTCTTTTTGCCATTTTTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAATCCCAGCGAAGTCCTTTAGAGAACAGATTTTTGAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTAATTTTAAAGACTTATTCCGCAATGATATAAATATGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACTTTGCCTAAGAAGAATAAAAGTATTCGTAGAATATTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTAACATTATTCACACCTCCCATCAACGAACCTTTTTTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACTTAGCCGTTGCAGTGGGCTTACCTTCTAAAAATTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACTTTCCTTGATATGTTTACCTGTAAAGTAAAAATAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTTATATATAGAACATAAATTTTTCTATAATATTAAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCCCTTACAGTGGCGATATTTGTGGAATGAGGCTGTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATCTCTTGTAGAATTTTCTCTGCCTTTTCTAAGCTACGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACAGTTATCATAGGCTATCCTCCTTATAAATGTTAAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAATAATCCAAAAGCATTTCTACTGCTTTTGGAAATTTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATATTTACTCCGGCATCCCTCAGCCGGCGAAAAAGGTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATAATTCTTCTCGTTTTTGTTTTAATTCGTTTATTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTAATAAGCTGTCCAATCACCTCCTAGTTTTCCTGGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTAGAACTTGAAAGAGAATCCTTCAGGGAGAGTGGTACTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTATCTTCAAAGTAATAGCTGTTATATGTGTCAAGTTCGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTAATTCATCGCCATTTTTGCCTATAAGTCCATAAAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTTCTTCGAAGCTACTAAAGGTGGCCGTGCAGTAGTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATAGATAAGGCTATTGCAAGAGTAGCGAATGTGCTAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCAAATATTTCAGAAGCTATTGCGGATATATTTACTGTGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTGAATTCCTGCAATGTGGCAGGCTTTTCTCAACCTAGGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTCCCTGTGATTTCAGCCAATTTATCGCATTTTCAATTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACATACAGTTCGGTGTTTTCATCTAGTGCTACATTTATTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCCAGCAGGTTGAGCGTTAGGCAGGTTTCCCTGCCCGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTGGAAGATGCGTTGTTTATGTCAGCAATTTCCGGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCAAAATGGCAGGTGGTAAAACCACAGCTAATACATCGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTTTCATCAACATCCATCTCGTCTACATAGAACTCAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATAACATATTTTAAAGCAAAAAGCAGAAAATCACTGGGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTGATTGTAAAGGAATATGTATCCCCAAGCCTTACAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTGGATAGTGCAAACATAGATGAAGCCTCCGTAGGCCTTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTCTATTTCAGCAACAATATATTTGGCAGCCGATGAATGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATCATTGTATATATCTTTGGAGTAACGTATAATACCCGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTGATAATGTTCTTTTCAATAGTGCCAAGGTCTAATCGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACAGGAACGTGCGTTCTCTGGACGAGGTAACTATCGTGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTAGCACACAACAGCAAAAAAACAAAGAAAAAAAGAGTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGCACCAACTTGTCTTTTTTGATGAGGCT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>NC_009012|4|4|3785203-3790988|CRISPRCasFinder GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC ATGTAGATGAATGATTACGATGTTGGAGAAATATTT GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC CTGTATCCGCATGTCCTACAGCAGATGTCACATCTG GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC ATCTTTTGTATATCAAAGGAAGCTACTTCTGTAATTA GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC AGTGCTGCAAACATCACAGCAGTATTCAATCAGGAA GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC TCGCATTTTCTACATCAAACAAAGTTGCTCCGTCGT GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC CCTCCAAGTTTCAGTCTCCATGAAGTACCATTCCCCT GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC GTGAAACTTGCCGGTTTTTATGGCGTATCTGTAGATT GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC TCAAAGTGCACAAATAAAAAGTGCTTGTGTCAATAC GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC CACAAGTTGCAAATGATGTATTGCCGCCGGTAATTTCC GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC GCCATCAGTGGCCGATAGATAAGGCACAATATCTA GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC GTTGCTATTCGAGCAGAAAGAAACCCAAAAGTTATC GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC GTGATATTATATTGAATCTGTTTAAATGAGATATTCA GTTGAAGTGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAAC 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MAVQYKSTTTEHKFKHLSVYERGQIAALLKEGKSQRYIANKLGRSPSTISREIKRGTTMQMRTDLSTYKVYFPETGQAVYEKNRMNCGAKRKLAQVEDFLKFAEDKILREKWSPDAVVGLCRRDPKWQNSTIVCTKTLYNYIDLGLIKVRNIDLNLKLRLKSKIKRIRQNKRVVGKSIDQRPEEVQSRQTFGHWEIDTVTGKKSNDSVILTLTERKTRYELLFLLDAKDSNTVNEALSELKNCYGKDVSNVFRTITADNGSEFSRLSEMLQGLGIEVYFTHPYSSWERGTNERHNGLIRRFIPKGKAIKDFSEETIKRIQQWLNSLPRRILGYKTPEECFNEEIHNLVNKNISAIA >NC_009012.1|WP_003511809.1|3802517_3803192_+|hypothetical-protein MEEYTLKIELLTDAVFGSGNSVPGFVDADVLHDEYGFLYINGKTLKGKLGEMASVFVNILMEIDECREIAEILQKKKEELFGVAEKYSHSKLKFSDCEFSKNIKDYFKCYMKDSDIKPEEILEALTHIETQTSINYVSGVAKKNSLRNYRVINRGIVLYSSVYSPKKLDDEDKILLASACSMLRHLGSNETKGKGEVRVSLWLKEKEVTHEYIRLLEKKVKLNA >NC_009012.1|WP_003511811.1|3803184_3804786_+|CRISPR-associated-protein MHKCIQFDIQALEPLKLGKFERDSNNEYSYSYIPGSVVKGAVAWGLVEEKGFVPKEILNGSSIFYNAYPLLDGNPAIPMMQGYMGDKQEIRSNKDNVRVVHSFNRKIENSIPLNNYEFVVKDAENEKLLLGYNPGKIENLHINKKDALNDSSKLKMFRYEAIRKGECFRAYIRVPEEHYDDIVKILSKDYIYFGGSRGSGYGKCRVTGIKEVSAVCLYESDLDIKEDLYIYFLSDAILYYDGKVNTYIPENELKEMLGIEGKCEYVESYSGLGVAASYNTLYRTNTVCYTAVLKGSVIKYRVEGKINPDRIKKLASEGVGLRREDGYGQIAVLGKIQDDMVVSRYRKNDIVEKSDIELTDEDKRVVNMILCNIFKTRSKLQIEKMVIELLKDVNRPQESLQSQIGKLLNIFQNGFYQTEDDFRKYLNEYLEHIRKKKGKAVWHKLYDFTVANTLDKFRSERLSIQKMLEDFVQNKFNSVFREIENIVNKGITLGIYKYPVESQKAQVLHNLKMDFFISFFEYCLRMKEKEVIS >NC_009012.1|WP_003511813.1|3804782_3806114_+|hypothetical-protein MIYKNRLLKTIRYNVKATTISPLAIRDDEDNLKIDQLTGKVYIPGSSVAGAFRNYYENYIDKNSNENFNELFGGQKTGMSQIVFYDGYLVNDYVKEMISSRPGIKMDLKRMTVEVSDDAKKSGKKFKRRFLNEGLTFEFVFELNNYEDDAGKFEEKQRKFEELLKAFSIGDISLGSNKMIGYGRFRVDSISKSVFDFTNINDLLKYMLMETDSTEITQDILGREQETSKVRFKIKGKTVTPLLVKDETVRLSNESDGINIKDSRGNYIIPGSSIKGVIRSRAERLHRTFPCIGEEILTNIFGIESKKDDDGHISRLSCFDAVVKNPNKGIYNKIKIDYFTGGVMQGALMNDEVVMGDVEIECTFNTSGLNDYKREIGLLLLVLRDLCKEDLSIGSGYAVGRGYIKAETLELYDGEKLVLDFKSPNREVLKRFDSYISSLMNVG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009012_5 | 3813209-3816348 | Unclear |
?
Consensus repeat of NC_009012_5
|
42 spacers
spacers of NC_009012_5
>5.1|3813246|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTTTATCTCGTTATCTTCACCGTCTGTGTATC >5.2|3813319|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTCTCATATTCAATTTTTACCTTTTCCATTTTTTA >5.3|3813393|40|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTTGGGGTGCAAGAGGTCGCTGGTTCAAATCCAGTCAC >5.4|3813470|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGGCATGCTCATATGGTGTATCCCTCAACGCTATA >5.5|3813544|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATCTGTTGCGATTCTCCGCCACTGGGATTATCACC >5.6|3813618|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCACAAAATCAGCACTCAAGATGGGAAGTGACTTG >5.7|3813692|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCATACTACCCATAAAACCTTCTAATTGCTTTAGC >5.8|3813765|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCCTTACAATTGTTAAACATCCAAATATCGTCAT >5.9|3813839|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCACATTTCTATCCCTATACTGTTGCGGTTGGTAA >5.10|3813912|38|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGTATCATAATGCACGTGGCACTAACTGTAAGACTT >5.11|3813987|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGACAACATGAGAAGAAAAGGGGATGAAGCACAGA >5.12|3814060|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTCTCTTAAAGCACTACCAGTATCTTCTACTATT >5.13|3814133|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTATGTATTTTATTAATATAGTGTGCTTGTAATT >5.14|3814206|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGATTTGTCAAGTCTGCTAAAATAGCGGGCGGCAAAA >5.15|3814280|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTCTCCCCATTTACCACCGGGCAAATTAACTGTA >5.16|3814353|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTAATCCCAAATTATGCTCAAAAGAAAAAAACCAA >5.17|3814426|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATTGGAATCCAAAATAACCTTCAATTTTCCACCA >5.18|3814500|35|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGACGTTTTGGCGTCTATTGAAAATCTAGGATAT >5.19|3814572|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCACATGCATAATATGTGAAATAGCGACCGAACA >5.20|3814645|35|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACCTCCTTTTTATATTTCTGGATCATCATCATAA >5.21|3814717|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGTATTGCATTGTTATTCCTCGCTTTCTTTTTGTT >5.22|3814790|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACACTTCAAGAGAATAATGTCCAGTTCGTGTCGG >5.23|3814863|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGTGATGAAGTGAGGTATGAAGCTGGAAGCGGAGA >5.24|3814937|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATAGTAGATTAAGTTTTCTGCGTTAAAATAAT >5.25|3815010|38|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTCTTGAACTCAGGGTCTATATACCGCACCAAGCA >5.26|3815085|38|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCGGATAATCCGTCTTCTCGTTTAATTCTTAAGCCA >5.27|3815160|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATATACGAAGGTTTAAACAGGACAGCAGAGCAAAG >5.28|3815234|38|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACTACATTCTTTTAATTTTTAAAAAAGAAATATTAAA >5.29|3815309|39|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCTTCTGCGAGCAGAAGGAGTTCGTTTCTGTTGCAAC >5.30|3815385|39|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCAAAGAAAGCGCATGATAGGGTCTTTAGGTGGCTTCG >5.31|3815461|35|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATTACAGTAACAACTAAAGCAGGACATAAAAGT >5.32|3815533|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACATGATATTACCTCCTATTTTTATTTTTCTTCCAG >5.33|3815607|38|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCATCCCTACTTAAAGAGACTGGGGGCATATAACCCC >5.34|3815682|41|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAATCGTGGCCTCCAGGGAACGGGCGTAAAACAGTTCTT >5.35|3815760|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGAAGGGGCTTAAGCCCTTTTTATTCTGACCTGAA >5.36|3815834|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAAGCAGAGGATTACGTACGTCAGAAAACAGACTT >5.37|3815908|35|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTGTCAAGCCATTGATACATCCTTTAATGTCTA >5.38|3815980|38|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATAGCACAGGCCCAAGTAAAAGAAAGGAGTTCATCA >5.39|3816055|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTACAGCTATAGCTTGCTTGAATACAAACTCAACGA >5.40|3816128|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCCCTCCTTATGCTTCAACATTGATTGCTACGCCT >5.41|3816201|38|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACCTTACTATGATGTTATAACATACAAAGGTTGTAAA >5.42|3816276|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT CTCAAACTCAGTGATACTAAGTATTTTAAAAGAAAA |
csx1,csm3gr7,csx19,csx10gr5,cas6,cas1,cas2,cas4 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009012_5
The CRISPR arrays of NC_009012_5 >merge|NC_009012|5|3813209-3816348|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTTTTTTTATCTCGTTATCTTCACCGTCTGTGTATCGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATTTCTCATATTCAATTTTTACCTTTTCCATTTTTTAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATCTTGGGGTGCAAGAGGTCGCTGGTTCAAATCCAGTCACGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATGGGCATGCTCATATGGTGTATCCCTCAACGCTATAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTATCTGTTGCGATTCTCCGCCACTGGGATTATCACCGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATTCACAAAATCAGCACTCAAGATGGGAAGTGACTTGGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATCATACTACCCATAAAACCTTCTAATTGCTTTAGCGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTTTCCTTACAATTGTTAAACATCCAAATATCGTCATGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCGCACATTTCTATCCCTATACTGTTGCGGTTGGTAAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTATGTATCATAATGCACGTGGCACTAACTGTAAGACTTGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACGACAACATGAGAAGAAAAGGGGATGAAGCACAGAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTCTTCTCTTAAAGCACTACCAGTATCTTCTACTATTGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTGTATGTATTTTATTAATATAGTGTGCTTGTAATTGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGGATTTGTCAAGTCTGCTAAAATAGCGGGCGGCAAAAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCCTTCTCCCCATTTACCACCGGGCAAATTAACTGTAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTTAATCCCAAATTATGCTCAAAAGAAAAAAACCAAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAATATTGGAATCCAAAATAACCTTCAATTTTCCACCAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTGACGTTTTGGCGTCTATTGAAAATCTAGGATATGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTTCACATGCATAATATGTGAAATAGCGACCGAACAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAACCTCCTTTTTATATTTCTGGATCATCATCATAAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCAGTATTGCATTGTTATTCCTCGCTTTCTTTTTGTTGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATACACTTCAAGAGAATAATGTCCAGTTCGTGTCGGGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATGGTGATGAAGTGAGGTATGAAGCTGGAAGCGGAGAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTTTATAGTAGATTAAGTTTTCTGCGTTAAAATAATGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATTGTCTTGAACTCAGGGTCTATATACCGCACCAAGCAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTTCGGATAATCCGTCTTCTCGTTTAATTCTTAAGCCAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACACATATACGAAGGTTTAAACAGGACAGCAGAGCAAAGGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGACTACATTCTTTTAATTTTTAAAAAAGAAATATTAAAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAATCTTCTGCGAGCAGAAGGAGTTCGTTTCTGTTGCAACGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCCCAAAGAAAGCGCATGATAGGGTCTTTAGGTGGCTTCGGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATATTACAGTAACAACTAAAGCAGGACATAAAAGTGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTACATGATATTACCTCCTATTTTTATTTTTCTTCCAGGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAGCATCCCTACTTAAAGAGACTGGGGGCATATAACCCCGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTCAATCGTGGCCTCCAGGGAACGGGCGTAAAACAGTTCTTGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACATAGAAGGGGCTTAAGCCCTTTTTATTCTGACCTGAAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAGGAAGCAGAGGATTACGTACGTCAGAAAACAGACTTGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACTTTTGTCAAGCCATTGATACATCCTTTAATGTCTAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTATAGCACAGGCCCAAGTAAAAGAAAGGAGTTCATCAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTACAGCTATAGCTTGCTTGAATACAAACTCAACGAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACGTCCCTCCTTATGCTTCAACATTGATTGCTACGCCTGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACAACCTTACTATGATGTTATAACATACAAAGGTTGTAAAGTTGAAGAGGTATTTCCAGTAAAACAAGGATTGAAACCTCAAACTCAGTGATACTAAGTATTTTAAAAGAAAAGTTGAAGAGGTACTTCCAGTAAAACAAGGATAAAAAC 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NC_009012_3 | 3.143|2739337|38|NC_009012|CRISPRCasFinder | 2739337-2739374 | 38 | NZ_CP015439 | Anoxybacillus amylolyticus strain DSM 15939 plasmid pDSM15939_1, complete sequence | 202898-202935 | 10 | 0.737 |
NC_009012_3 | 3.171|2729908|38|NC_009012|CRT | 2729908-2729945 | 38 | NZ_CP015592 | Bacillus cereus strain AR156 plasmid pAR460, complete sequence | 102383-102420 | 10 | 0.737 |
NC_009012_3 | 3.359|2734161|37|NC_009012|PILER-CR | 2734161-2734197 | 37 | NZ_LR217736 | Candidatus Erwinia haradaeae strain ErCisplendens isolate 3004 plasmid pBioThi | 1630-1666 | 10 | 0.73 |
NC_009012_3 | 3.436|2739338|38|NC_009012|PILER-CR | 2739338-2739375 | 38 | NZ_CP015439 | Anoxybacillus amylolyticus strain DSM 15939 plasmid pDSM15939_1, complete sequence | 202898-202935 | 10 | 0.737 |
NC_009012_4 | 4.49|3788774|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3788774-3788809 | 36 | MN657047 | Psychrobacter sp. strain ANT_H19 plasmid pA19H1, complete sequence | 4232-4267 | 10 | 0.722 |
NC_009012_5 | 5.17|3814426|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3814426-3814462 | 37 | NC_015221 | Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202, complete sequence | 28542-28578 | 10 | 0.73 |
NC_009012_5 | 5.17|3814426|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3814426-3814462 | 37 | NC_015223 | Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21201, complete sequence | 53347-53383 | 11 | 0.703 |
NC_009012_5 | 5.37|3815908|35|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3815908-3815942 | 35 | NZ_CP045351 | Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence | 1150650-1150684 | 11 | 0.686 |
NC_009012_2 | 2.19|1713847|39|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1713847-1713885 | 39 | KR296695 | UNVERIFIED: Salmonella phage 41, complete genome | 88649-88687 | 12 | 0.692 |
1. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to MN871480 (UNVERIFIED: Pseudomonas phage PaSz-1_45_270k, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
2. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to MT133560 (Pseudomonas phage fnug, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
3. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to DI373487 (KR 1020130142837-A/1: Bacteriophage of Pseudomonas aeruginosa and uses thereof) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
4. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to MN871489 (UNVERIFIED: Pseudomonas phage PaZh_1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
5. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NC_042081 (Pseudomonas phage SL2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
6. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to KU521356 (Pseudomonas phage KTN4, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
7. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to MW057919 (Pseudomonas phage vB_PaeM_kmuB, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
8. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NC_042060 (Pseudomonas phage PA7, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
9. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to AP019418 (Pseudomonas phage PA02 DNA, nearly complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
10. spacer 3.44|2732680|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NC_004629 (Pseudomonas phage phiKZ, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
11. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to MN871480 (UNVERIFIED: Pseudomonas phage PaSz-1_45_270k, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
12. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to MT133560 (Pseudomonas phage fnug, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
13. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to DI373487 (KR 1020130142837-A/1: Bacteriophage of Pseudomonas aeruginosa and uses thereof) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
14. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to MN871489 (UNVERIFIED: Pseudomonas phage PaZh_1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
15. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to NC_042081 (Pseudomonas phage SL2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
16. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to KU521356 (Pseudomonas phage KTN4, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
17. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to MW057919 (Pseudomonas phage vB_PaeM_kmuB, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
18. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to NC_042060 (Pseudomonas phage PA7, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
19. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to AP019418 (Pseudomonas phage PA02 DNA, nearly complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
20. spacer 3.337|2732681|36|NC_009012|PILER-CR matches to NC_004629 (Pseudomonas phage phiKZ, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttca CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggtt-- Protospacer ***************** ******** * *.***
21. spacer 4.67|3790103|35|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017832 (Butyrivibrio hungatei strain MB2003 plasmid pNP144, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
tagcacacaacagcaaaaaaacaaagaaaaaaaga CRISPR spacer gaaaaaacaacagcataaacacaaagaaaaaaaga Protospacer *. * ********* *** ***************
22. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to MT133560 (Pseudomonas phage fnug, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
23. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to KU521356 (Pseudomonas phage KTN4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
24. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to MW057919 (Pseudomonas phage vB_PaeM_kmuB, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
25. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to NC_004629 (Pseudomonas phage phiKZ, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
26. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to MN871480 (UNVERIFIED: Pseudomonas phage PaSz-1_45_270k, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
27. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to DI373487 (KR 1020130142837-A/1: Bacteriophage of Pseudomonas aeruginosa and uses thereof) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
28. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to MN871489 (UNVERIFIED: Pseudomonas phage PaZh_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
29. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to NC_042081 (Pseudomonas phage SL2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
30. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to NC_042060 (Pseudomonas phage PA7, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
31. spacer 3.212|2732680|37|NC_009012|CRT matches to AP019418 (Pseudomonas phage PA02 DNA, nearly complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
taactgatggaatctattacaaaagaaaa--aagttcag CRISPR spacer gaactgatggaatctatttcaaaagaatatcaggttt-- Protospacer ***************** ******** * *.***.
32. spacer 4.67|3790103|35|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR135490 (Enterococcus faecium isolate E8414 plasmid 3) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tagc-acacaacagcaaaaaaacaaagaaaaaaaga CRISPR spacer -agcaattgaaaagcaaaaagacaaagaaaaaaagg Protospacer *** *. ** ********.**************.
33. spacer 4.67|3790103|35|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP044266 (Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tagc-acacaacagcaaaaaaacaaagaaaaaaaga CRISPR spacer -agcaattgaaaagcaaaaagacaaagaaaaaaagg Protospacer *** *. ** ********.**************.
34. spacer 1.31|718826|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
cagaaaacttgtgaactaccgccacttatagaagtg CRISPR spacer cttatatattgtgaactaccaccacttatagaagat Protospacer * * * ************.*************
35. spacer 3.95|2736112|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to MN693289 (Marine virus AFVG_25M43, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgaaagcgaagcccttcctaaaggctataaaactaa CRISPR spacer taaacttgaagagcttcctaaaggctataaaacaat Protospacer *.** .**** ******************** *
36. spacer 3.311|2739337|39|NC_009012|CRT matches to NZ_CP015439 (Anoxybacillus amylolyticus strain DSM 15939 plasmid pDSM15939_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.795
gaagcagcaagaagggctggttatagc----gagaaaacagca CRISPR spacer gaagcagcaaaaagggctggatatagcgctagaggcaac---- Protospacer **********.********* ****** ***. ***
37. spacer 3.388|2736113|36|NC_009012|PILER-CR matches to MN693289 (Marine virus AFVG_25M43, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgaaagcgaagcccttcctaaaggctataaaactaa CRISPR spacer taaacttgaagagcttcctaaaggctataaaacaat Protospacer *.** .**** ******************** *
38. spacer 1.9|717358|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014424 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C24-MedDCM-OCT-S46-C243, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***, 3 ordered pieces) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gctctaa--cagtaattcaattatttttgtattcatttg CRISPR spacer --tgtgatcccataatttaattttttttgtattcatttt Protospacer * *.* * .*****.**** ***************
39. spacer 2.52|1716069|35|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945712 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 1921-1801, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tctcgctcgaataaaattggtacatcatatttttc CRISPR spacer cgtaaattgaataaagtttgtacatcatattttta Protospacer . * . *.*******.** ***************
40. spacer 2.74|1717551|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX397372 (Erwinia phage vB_EamM_Phobos, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tcaccgttaggaaagttgatagtgaacacgctgtta CRISPR spacer gtaccgtcagaaaagttgatagtgaacaccgcggca Protospacer .*****.**.****************** .* .*
41. spacer 3.3|2729908|37|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015592 (Bacillus cereus strain AR156 plasmid pAR460, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
atgagtatcaattaagattattacttgaattaaagtg CRISPR spacer tttcttataaattaagattgttacttgaattataaag Protospacer * *** **********.************ *. *
42. spacer 3.62|2733892|38|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018748 (Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gctgcagaaatatatcaaatcacaaaaga---gccaatcga CRISPR spacer catgcagaaatatttcaaatcataaaagatgtggcaac--- Protospacer *********** ********.****** * ***.
43. spacer 3.62|2733892|38|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028868 (Borreliella garinii strain 20047 plasmid cp32-6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gctgcagaaatatatcaaatcacaaaaga---gccaatcga CRISPR spacer catgcagaaatatttcaaatcataaaagatgtggcaac--- Protospacer *********** ********.****** * ***.
44. spacer 3.75|2734764|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagt CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatgga Protospacer ..** .******** ********* *******.*
45. spacer 3.75|2734764|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagt CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatgga Protospacer ..** .******** ********* *******.*
46. spacer 3.75|2734764|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagt CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatgga Protospacer ..** .******** ********* *******.*
47. spacer 3.75|2734764|36|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagt CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatgga Protospacer ..** .******** ********* *******.*
48. spacer 3.148|2739672|37|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NC_010523 (Tetragenococcus halophilus plasmid pHDC DNA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ggtttggtgatattttagccagtattgaaagtttggg CRISPR spacer agaaagttgatattttaactagtattgaaagttcagg Protospacer .* * **********.*.*************..**
49. spacer 3.243|2734764|37|NC_009012|CRT matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagta CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatggaa Protospacer ..** .******** ********* *******.* *
50. spacer 3.243|2734764|37|NC_009012|CRT matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagta CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatggaa Protospacer ..** .******** ********* *******.* *
51. spacer 3.243|2734764|37|NC_009012|CRT matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagta CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatggaa Protospacer ..** .******** ********* *******.* *
52. spacer 3.243|2734764|37|NC_009012|CRT matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagta CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatggaa Protospacer ..** .******** ********* *******.* *
53. spacer 3.263|2736112|37|NC_009012|CRT matches to MN693289 (Marine virus AFVG_25M43, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tgaaagcgaagcccttcctaaaggctataaaactaaa CRISPR spacer taaacttgaagagcttcctaaaggctataaaacaatg Protospacer *.** .**** ******************** * .
54. spacer 3.355|2733893|38|NC_009012|PILER-CR matches to NZ_CP018748 (Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gctgcagaaatatatcaaatcacaaaaga---gccaatcga CRISPR spacer catgcagaaatatttcaaatcataaaagatgtggcaac--- Protospacer *********** ********.****** * ***.
55. spacer 3.355|2733893|38|NC_009012|PILER-CR matches to NZ_CP028868 (Borreliella garinii strain 20047 plasmid cp32-6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gctgcagaaatatatcaaatcacaaaaga---gccaatcga CRISPR spacer catgcagaaatatttcaaatcataaaagatgtggcaac--- Protospacer *********** ********.****** * ***.
56. spacer 3.368|2734765|36|NC_009012|PILER-CR matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagt CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatgga Protospacer ..** .******** ********* *******.*
57. spacer 3.368|2734765|36|NC_009012|PILER-CR matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagt CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatgga Protospacer ..** .******** ********* *******.*
58. spacer 3.368|2734765|36|NC_009012|PILER-CR matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagt CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatgga Protospacer ..** .******** ********* *******.*
59. spacer 3.368|2734765|36|NC_009012|PILER-CR matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gagttctgatattggatttggaacacttgatatagt CRISPR spacer tgattacgatattggttttggaacaattgatatgga Protospacer ..** .******** ********* *******.*
60. spacer 3.441|2739673|37|NC_009012|PILER-CR matches to NC_010523 (Tetragenococcus halophilus plasmid pHDC DNA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ggtttggtgatattttagccagtattgaaagtttggg CRISPR spacer agaaagttgatattttaactagtattgaaagttcagg Protospacer .* * **********.*.*************..**
61. spacer 4.45|3788480|35|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP282675 (Acidianus rod-shaped virus 2 strain ARV2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ataattcttctcgtttttgttttaattcgtttatt CRISPR spacer ctaatttttctcatttttgttttaatattactact Protospacer *****.*****.************* . .**.*
62. spacer 5.21|3814717|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009336 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
cagtattgcattgttattcctcgctttctttttgtt CRISPR spacer cctagtcccattgttattcctcgctttctacttgta Protospacer * .*. ********************* .****
63. spacer 1.31|718826|36|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026602 (Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cagaaaacttgtgaactaccgccacttatagaagtg CRISPR spacer acattaggttgtgaactaccaccacttatagaagat Protospacer . *. ************.*************
64. spacer 3.41|2732477|37|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038659 (Citrobacter freundii strain 680 plasmid p680_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tatactggtccagtgaatggtccagtgaatttgaaac CRISPR spacer cttctttttccagtgcatggtctagtgaatttgataa Protospacer . * .* ******* ******.*********** *
65. spacer 3.41|2732477|37|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to MN699848 (Citrobacter pasteurii strain 175G8 plasmid pCfr-OXA-198, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tatactggtccagtgaatggtccagtgaatttgaaac CRISPR spacer cttctttttccagtgcatggtctagtgaatttgataa Protospacer . * .* ******* ******.*********** *
66. spacer 3.66|2734160|37|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR217736 (Candidatus Erwinia haradaeae strain ErCisplendens isolate 3004 plasmid pBioThi) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
attactcttaaatatatattaacatatttttattaca CRISPR spacer acttattttaagtatatattaatatatttttatatgt Protospacer *.* *.****.**********.**********
67. spacer 3.143|2739337|38|NC_009012|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015439 (Anoxybacillus amylolyticus strain DSM 15939 plasmid pDSM15939_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
gaagcagcaagaagggctggttatagcgagaaaacagc CRISPR spacer gaagcagcaaaaagggctggatatagcgctagaggcaa Protospacer **********.********* ******* *.*. .
68. spacer 3.171|2729908|38|NC_009012|CRT matches to NZ_CP015592 (Bacillus cereus strain AR156 plasmid pAR460, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
atgagtatcaattaagattattacttgaattaaagtgg CRISPR spacer tttcttataaattaagattgttacttgaattataaaga Protospacer * *** **********.************ *. *.
69. spacer 3.359|2734161|37|NC_009012|PILER-CR matches to NZ_LR217736 (Candidatus Erwinia haradaeae strain ErCisplendens isolate 3004 plasmid pBioThi) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
attactcttaaatatatattaacatatttttattaca CRISPR spacer acttattttaagtatatattaatatatttttatatgt Protospacer *.* *.****.**********.**********
70. spacer 3.436|2739338|38|NC_009012|PILER-CR matches to NZ_CP015439 (Anoxybacillus amylolyticus strain DSM 15939 plasmid pDSM15939_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.737
gaagcagcaagaagggctggttatagcgagaaaacagc CRISPR spacer gaagcagcaaaaagggctggatatagcgctagaggcaa Protospacer **********.********* ******* *.*. .
71. spacer 4.49|3788774|36|NC_009012|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN657047 (Psychrobacter sp. strain ANT_H19 plasmid pA19H1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ttaattcatcgccatttttgcctataagtccataaa CRISPR spacer atagttcatcgccattttttcctataattgggtgtt Protospacer **.*************** ******* * .*.
72. spacer 5.17|3814426|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015221 (Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
aatattggaatccaaaataaccttcaattttccacca CRISPR spacer aatattgcaatccaaattaaccttcagtgaagctctg Protospacer ******* ******** *********.* * *..
73. spacer 5.17|3814426|37|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015223 (Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21201, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
aatattggaatccaaaataaccttcaattttccacca CRISPR spacer aatattgcaatccaaattaaccttcagtgaagctttg Protospacer ******* ******** *********.* * ...
74. spacer 5.37|3815908|35|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045351 (Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ttttgtcaagccattgatacatcctttaatgtcta CRISPR spacer tcgccataagcctttgatacattctttaatgtgac Protospacer *. . .***** *********.*********
75. spacer 2.19|1713847|39|NC_009012|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KR296695 (UNVERIFIED: Salmonella phage 41, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.692
ttctatggtcggagtgactggatttgaaccagcgacctc CRISPR spacer gaatttggtcggggtgactggattcgaaccagcatatag Protospacer * *******.***********.********. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
302271 : 380377
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009012|302271:380377|DBSCAN-SWA TTTAACCAAATACTAACTCTTTGATCCTCGAAAAATTAATATCACGGCCTATAAGCTTATTGATGTAATAACATAAGTTGTAGGCTAAAAGCTTGGTTTTTACCCTGGCTAAAAATCCCCAGTACGACTTTGCAAGCACCTTCTCTATATTGAGTTGCTGGGTAAGCTGAGAAGCCGAAGTCTCTATCCGGCGCCTTAATTTGAAGATTAATTGCCTTATAGCTTTCGGAAACTGTAACTTGCTGTTGCTCCTTTTAACAGGTAGGATCTCTATTTCCTTTTCCTCTTTTAGTTCAACAGCAAATTCTGTTCCAATATATCCCTTATCTCCAATTAAGGTTATCCGCCGGTAAGAATCAATCAGGTCCCATACACCAGCACGATCATCAACATTGGCAGGTGTAATTGCAAAATCAGTTATAAAACCATCCAGGGTTGCAAGCATATGCAGCTTATAGCCCAGATATATTTCTTTTTTGGAAGGACATTTTCCATAAGTTGCTCCGAAACCACGGAATGTTTTATGGAACTTGGCTCTTCCAAATTTGCACACCGGTATAGGAATACTATCTACTATCCGGTAAGGTTGCTGGGCATACCCTGTAAGGTTTGAGAGTTCTTTTCTGATTTCCTCAATTACTGCGTGCAGGTTTCTGCGGGTTCTATTGAACCTGGTCCTGTCACAGAATTTGGGAAACAGGTCTCTCATATTCTTCTTACAGAAACCCAACCAAGCTTTCTCAGAGTCGATAGTGAGTAACTCTCCAACAATACATATGGTAATTATTTCACTATCGCTCATAACCGAATTATTGATGTTACAGCGATTTGCAATGTGTGGTGGAGTTACCTTCTGGTAAATGTCGTCAATTATGATGTAGGCGACAGTTACAAAGTCTTTTAAGTTTTCAATTTCTTTGATATAATAATTTTTATCAAGCTCCATCATATATTGTGACCTCCTATCATTAGTTTGGTGTTTAATGATAGGTTACAATATTATGTTGGAGTTTTTCATTCGCAATTTTTACCTGTAAAAAAAGCTAGCACAACAAGTTAAATTATCTTGTTTTGTGGGGTGCATTGTTTAATGAACAGAGATAACAGGCCTACAGGAAGACAAAAACGCATAGGCTCAGGTACCGGTAACGTCAGCCGGCGCGGCAGTGGTTTGGGTTCGGGACCTGTAGGTAGACCGGGGGGATATTCTGACAGGTCCAAAGGAACCGGGACAAGTGGAAGAAGCGGCCCGGCAAGAAGCTTTGGCAGTTATGGAAGTTACGGAGGCTACGGAGGTTATTCGTCCGGCAGACGGAGAAGGTCTTCCGGTTGTTCAAAATACTTGACAATACTCATATTGATTCTGGCAATTGCATATTACATATACAGTAATTTTGGTGGAGGTTCGGGAAACTCAACTTCAACCAACAATTTCCTGAACGGAACGTCTTCGGTTTCCGGTTATGTTGACAAAGGCGAGTATCCGGTTGATACCACTGTGTCGGAGCTTGCCCGTGCGAAAAGGACCGTTTTAAAAGGCAATGGAGAAGATATAGCAACCGTAATGATATACATGTGCGGTACCGACCTTGAGTCAAAATGGGGTATGGCCACCGCTGATTTAAAAGAAATGCTCAATGCCGAGATTTCCGACAAAGTAAATATTATTGTGGAGACCGGCGGAACTTTAAAGTGGCAGAACAATACCGTAGACAGCAGCACAAACCAGCGCTTTAAAGTTACCAATGACGGGCTTAAGCTTTTGGAAGGCAATTTGGGCAAAAAATCGATGGTTGAGCCGGAGACCCTTTCGGATTTTATAAAATATTGCAAGACGAACTTTCCGGCTGACCGTTACATGCTTATCCTGTGGGATCACGGCGGAGGTTCCGTCAGCGGTTACGGTTATGATCAGCATTATCCAAGCAATACAATGAGGCTTGATGAAATTGCCGTTGCCCTTAAAAACGGCGGCTGTGTTTTTGACCTGATAGGCTTTGATGCCTGTCTTATGGCTACGCTTGAAACAGCCATTGTACTGGAACCTTATGCGGACTATATGATTGCTTCGGAAGAGGTTGAACCGGGAATCGGATGGTATTATACCGGTTGGATAACAGCTCTTTCCCGAAATACATCGATAAAAACCATTGACCTTGGGAAAAAGCTTATTGATGACTATGTAAAGGAAGTAAGGGCGAAAACGCCGAGCAGCCAGGCCACATTGTCGCTTGTTGACCTGGCGGAGCTCAAAGGTACCATACCGCAGGCCTTTACAAAGTTTGCAAAATCAATAGACACACTGGTTACCAGAAATGAATATAAGACTGTATCCAATGCCCGGGCAAATACGAAGGAATTTGCAAAATCATCGAAGATAAATCAGATTGATCTTATTAACTTTGCTGAAAACCTTGGTACCGATGAAGGGAAAAAACTTGCCGAGGCATTGCGCGGGTGTATTAAATACAACCGGACATCGAAAAACATAACAAATGCCAACGGTTTGTCAATATTCTTCCCCTATGGAAATCTTTCAAAGGTAAACTCAATGCTTGATACTTATGAACAGATAGGTATCGATAAAGAGTACAGCAAATGTATAAAAAGTTTTGCAAGCGTGTCGGCCGGAGGACAGATTGTGTCAAGCGGCAGCAATAATATGCTTGAAGTCCTGCTGGGGAGCTTTACGGAAGGTTCTTCAAATTCCGGCCAGTCCTTGACTACCGCCGCTTTGGAAATTTTGCTGGAGGAATTCTTAAATTCCGGAAATTACGGCAGGATTACGGGTGGAGAAAGTGATTCTCTGGATTGGCTGGATGTCAATCTTATGAAGTCTTCCGTAGATTATTACAGGAAAAACCGGTTTGACCCTTCGGCTCTCAAGATAACCGAAAAGAACGGGCAGAGGGTTCTGTCGATGTCGGAGGAACAGTGGAGTCTTGTCCAGCAGATGGAAATGAATGTTTTCATAGATGATGGAGAAGGATTTATTGACCTTGGTCTTGATAATGTATACGAATTCAATGAAGACGGAGACCTTGTGATGGAATTTGACGGAACATGGCTTGCTCTAAACGGCAATATTGTAAGCTACTACATGATAAGTGATGACCGCCATGGGGATACTTATTCGACAAAAGGAAGAATACCTGCATTGCTGAACGGTCAGCTTGTTGACATTATTGTGGTGTTTGACAATGAAAATCCTTACGGAAAAGTGCTTGGAGCCCAGATAAGGTATGACACAAAGGCCGAGACTGAAACTTTGGCAAAGGGACTTATAGATATAGTTGCAGGAGACAAAATTGATTTCCTTTGCGATTACTACACTTATGAAGGTGAGTACATAGATACCTATTTCCTTGGAGAGCAGTATACGGCAACCGGTGAGTGGAAAATAGAGAATTTGCATCTTGGGTACAGGGATTACCAGATGACCTACCGCATAACGGACATATACGGCAACAAGTACTGGACACCGTCTGTTACAAATTAGCGGTATTGGATGATGCGGAAATGTGGTGATTTTATGATAGAAATTAAAGGAAAATATAATACGGCAAAAGTTTTTACCAACAACGTTGAACCGGAGGCAATGGCTCAGATATTGGAACTTTGCAACCAGGAGTTTGTAAAGGACAGTGTAATCAGAATTATGCCTGATACCCATGCCGGTGCAGGTTGTACCATTGGAACCACCATGACCATTGACGACAAAATTGTGCCAAATCTGGTGGGTGTTGATATAGGCTGCGGAATGGAGACCATAAAGCTGAAAAATAAAAATATTGAATTGAGCAAGCTGGACAAAGTAATTCATGAATTTATCCCGTCGGGTTTTGACATTCGCAAAAAAGAGCATCCGTATGTCAGGAATATTAATTTGGATGAGCTATTGTGCAAAAAACACGTGGATATAAACCGGGCAAAGCTGAGTATTGGCACCTTGGGCGGTGGCAACCATTTTATTGAGGTGAACAAAGACAGTGAGGGAAACCTGTATCTTGTGGTGCATTCGGGAAGCAGACATCTGGGAAAGCAGGTTGCGGAGTATTATCAGGAGTTGGGTTACAAGGAGCTTGTAAAAAACACTGAAGTGATTAAAGAAATTATAGCAAAGCTGAAAGCGGAAGGCCGTGAAAAGGAAATCGAGAAGGAAATAAAAAAAATCAAGCCGCCGAATATAAGCAAGCAGCTTGCCTATGTCCAGGGCAAAAGTTATGAGGACTATCTTGCCGACATGAAATTGGTGCAGAAATTTGCGGTATTGAACCGCAAAGCAATTGTGGATGAGATTGTGAGGCGCATGAATTTTAAAATTGAAGAGCAGTTTACCACTATTCATAATTATATTGACTTAGACAGCATGATACTCAGGAAAGGTGCCATTTCAGCACGCAAAGGGGAAAGAGTGCTGATTCCGATTAACATGAGGGACGGAAGCCTTATCTGTATCGGCAAAGGCAACAAGGATTGGAACTATTCCGCGCCCCATGGGGCGGGAAGACTGATGAGCAGGGCTAAGGCAAAAGAAGTTATAACGCTTAAGGAATTCAAAGAATCAATGAAGGGAATTTATTCAACAACGGTCAACAAATCCACCATTGATGAATGTCCCATGGCTTACAAGCCTATGGAGGAAATCATTGAAAATATTCAGGACACCGTTGAAATTGTAGATATTATTAAGCCAATATACAACTTTAAAGCGGCTGAATAGGCAAAAATACCATTTTTCATGTACAAATATGAAAAAATTCTATATAATTATAACTGTATATGGAGAGATTGAGTGTGAATGATAGAAAAAATTTGATAAATCTTGCTGTTTTCCTTTTGGTTGCTTTGTTATCGACGCTTCTTATTATGGCCGCTATAAGTATGTTGGATTTGCGTGGGAACGGGTCGCCTGGAGGTGAAAATAATAAGAGGGCTTCCCAAAATGACGGAAGCGGCAAAAATCGCAATAAGCAGGACCGAAATAATAACAATAAAAA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58 | Bacillus_phage(23.08%) | protease,coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
720605 : 793682
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009012|720605:793682|DBSCAN-SWA 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57 | Enterobacteria_phage(16.67%) | coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1289869 : 1342918
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009012|1289869:1342918|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_phage(22.22%) | protease,transposase,integrase,coat | attL 1340314:1340331|attR 1347689:1347706 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1507661 : 1517084
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009012|1507661:1517084|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009012|1507661:1517084|1515027_1515549_-|WP_003517457.1|DBSCAN-SWA MGVTNVEKKPKVAVVMGSDSDFSVLQNCIKVLKQFDVEVSAIVCSAHRTPDKAAEFAKGAEENGFDVIIAGAGKAAHLPGVLAAFTPLPVIGVPIKSSTMDGLDSLLSIVQMPSGIPVATVAIDGAENAALLAVQILSTAYKDLRDKMKEYKKQLEKKVEEKNKALQEKIKEL >NC_009012|1507661:1517084|1515686_1517084_-|WP_003517459.1|DBSCAN-SWA MEKFFKLKENGTNVRTEFIAGLTTFVTMAYVIFVNPNTLEASGMDKGAVFVATILAAIIGTLIMGLVANVPYAQAPGMGLNAFFAYTVVLGQGFTWQQALALVFLCGLINILITVTRIRKMLIAAIPQSLQYAISGGIGLFITYIGIKQAHLLDFTVSSGTYTTLPNGNVVSGDIVPALADFTDPVTQLALIGLVITVVLMLLKVRGAILWGIMATTVIGLFMGITPIPELTASNFLPPSISPTFLKLDLAGLFTDPAKIPTVLATILAFSLSDTFDTIGTFLGTGRKTGIFDEEDEKALHSGKGFKSRLDKALFADSTATSIGALLGTSNTTTYVESAAGISVGGRTGLTSVFTALFFFLALFLSPIAGMVTSAATAPALIVVGILMMESLAKIKWDEFEEAVSAFFTVVVMPFTYSISNGVAAGFVFYVITKIVKGKAKEVHPILYVVVLLFILNFVFSALKL >NC_009012|1507661:1517084|1513510_1514977_-|WP_004463634.1|DBSCAN-SWA MFDVIRGKHFNYVHNLLKKDEFGFDKPKEECGVFGIYSKGNLDTARLTYYALYALQHRGQESAGIAVNNGGTLLFHKDMGLVPEIFNEKILNSLKGKIAIGHVRYSTTGASSRENSQPMVIKYKNGQMAMAHNGNLVNAAKIREKLEEEGIIFQSTIDSEVILNLISRFRLTSNNIEEAIVKVMKEIKGAYSLVILTPNKLIGIRDPHGIRPLCIGRIDDSYVLASETCALDAVDAEYVRDVNPGEIIVIEESGMTSIQTEVPEKTALCIFEYIYFARPDSYIDGVSVHRARIEAGRRLAREHPVEADLVFGVPDSGVSAALGYSMESGIPYDLGLIKNKYIGRTFIQPEQGQRESGVKIKLNALKEAVNGKRVVMIDDSIVRGTTSKRLVQILRDAGAKEVHMRISSPPYMYPCFFGVDTSSRSQLIAAECSVEEIRKMTGADSLGYLSLEGLLKTPVGAKCGFCTGCFTGKYPMEVPKDASKYSCG >NC_009012|1507661:1517084|1511772_1512402_-|WP_004463628.1|DBSCAN-SWA MLRIGVLVSGGGTNLQAIIDRIESGYIKDCSIVTVVSSKPNVYALERAKKHNIPAVCIARKDYPSVHEYGEALIQHFERCEVGLIVMAGFLSILGENFVKRFENRIINIHPSLIPAFCGKGYYGIIPHQKALEYGVKVTGATVHFVDVEADSGPIILQKAVYIRDDDTPETLQKRVMEEAEWEILPEAIKLFAEGRLEIDGRKVRIKDN >NC_009012|1507661:1517084|1507661_1508834_+|WP_004463623.1|DBSCAN-SWA MKRKYGEQKLNKELVSVSICVYNGEKYIESSIKSALAQTYQNIEIIVIDDGSTDRTGEIVKNYCPDVKYIYQENKGVSEARNTGLRHCSGNYIAWLDADDLYLPDKIKEQVDFLQQNKDIDCVYNDAFLIDAHDNLVKVLRSDYGNLAPNDFLAQLLFRQTIPCPPSTLYRRKCFENLRFIPGMRYAEDYWSSIQLAQRFKCGYLPKILYKYRRHDSNLTNNKEKQEEMEIKVVKSLGIDKIKDIVEKSSYPEHEKLLLLGKIFIKISEYEEACKALEKIQVPDYIQDRKTKFLKYFYLGNVNYLTKEYNKAKFCYEKSLRTDPGKAEAYNNLGAALYHLSETEEALENFNKALALKKEYLDPQNNLKNIKTGGDLKITIRELRENLMVY >NC_009012|1507661:1517084|1510164_1511709_-|WP_004463626.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVSDKTGIVEMARELQSMGVDIISTGGTAKTLSDAGIKVINISDVTGFPECLDGRVKTLHPKVHAGILAIRSNEEHMRQLKELNIETIDMVIINLYPFKQTILKENVDLSEAIENIDIGGPTMIRAAAKNYQDVVVIVDPSDYAAVLEELKTTKDVSLKTKFKLAYKVFEHTSHYDTLIAKYLREQIGEDEFPQTLSLTFEKVQDMRYGENPHQKAVFYKEVGANVGCITAAKQLHGKELSYNNINDANGAIEIIKEFDEPTVVAVKHANPCGVASASNIYDAYIKAYEADPVSIFGGIIAANREIDEKTAEEINKIFVEIVIAPSFTEGALKILTQKKNIRLLQLEDISAKIPKGTYDMKKVPGGLLVQNYNSELLNMDDLKVVTEKKPTQEELEDLIFAMKVVKHTKSNGIALAKGKQTIGVGPGQTNRVTACKIAIEYGGERTKGAVLASDAFFPFADCVEAAAAAGITAIIQPGGSIRDQESIDACNKYGIAMVFTGMRHFKH >NC_009012|1507661:1517084|1512395_1513418_-|WP_003517454.1|DBSCAN-SWA MTTYKDAGVDVEAGYEAVRLMRNDVKRTFRPEVLTDIGGFGGLFGLNKDKYSEPVLVSGTDGVGTKLKIAFLLDKHDTVGIDCVAMCVNDIVCSGAEPLFFLDYIALGKNRPEKVAQIVKGIADGCVEAGCALIGGETAEMPGFYPEDEYDLAGFAVGIVEKSKIIDGSKIKAGDKLIGLASSGIHSNGYSLVRKILAPTAKKLAEEIKMLGTTLGEELIKPTRLYVKTILDLKEKFEIKGIAHITGGGFIENIPRMLPQGLGVKVVRGSWPVLPIFTLLKDLGNLDEMDMYNTFNMGIGMTIAVDAEIANSVVEYLNKDKEQAYIIGEVVSDKEGLEIC >NC_009012|1507661:1517084|1508880_1510140_-|WP_003517447.1|DBSCAN-SWA MKVLVVGSGGREHALVWKIVQSPRVEKVYCAPGNGGISAIAECVPIKAMDIEGIVNFSKEKKIDMVVVAPDDPLAAGMVDALEEAGIRAFGPNKAAAVIESSKAFAKNLMKKYNIPTARYEIFENSADAINYLQDQKYPVVVKADGLALGKGVIIAQNFDEAKQAVQSIMEDKVFGEAGNKVVIEEFLVGQEVSMLAFTDGKTIKTMVSSQDHKRALDNDQGLNTGGMGTFSPSRIYTEEIDRYCMERIYKPTIEAMEKEGRKFKGVLYFGLIITKDGPKVLEYNARFGDPETQVVLPRLNTDIIDIFEAVIDERLDEVEISWNDSACVCVIMASGGYPKEYKTGYEISGIEDAERDANIVVFHAGTKRENGKYYTAGGRVLGVTAMENTLDEAIKKAYEGVGKIKFQDMHYRKDIGKK |
8 | Prochlorococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1938475 : 2016575
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009012|1938475:2016575|DBSCAN-SWA 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80 | Erysipelothrix_phage(56.0%) | portal,tail,head,holin,transposase,protease,capsid,terminase,integrase | attL 2000661:2000720|attR 2016575:2018022 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2025971 : 2062706
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009012|2025971:2062706|DBSCAN-SWA 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39 | Streptococcus_phage(18.52%) | portal,tail,head,holin,transposase,protease,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2224042 : 2239013
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009012|2224042:2239013|DBSCAN-SWA TTTATTCGTTAATCTTCCCAAGCATCTCCCTCTGTTTTCTTCTCAACAAATCCAGAGGATTGGATGGTAACTCTTCTTCCAGTTCATTAAGAGAGATTATCTCTGCATTCTTATTATTAGGTTGCCTATCCAATTCAAAAGCCTCTATCTCCCGATTTATCTCCTTTTCAACCTGCCTGTTTTGCCGTATGTTTTTCTTCCTTTGTGCATCGCTTTCTGTTGATAGTGAAAGTTCTTTATTTGTCTTGCTTTTTGCCCCTTCAACTATTGTTTCTATTTCTGTTATTAAATCTGCCTTGGCCTGCAATCCCTCATCAAGACTTTTAGCCTTTTGCATCTTTTCCCACTCCATCAGGTATTCAATTTCTTCAATGTACTTATCCTTAAATGCCGTCTGATATTCCAGCAGGTAGCATTTCTCAAACTCGGTGGCAGATTTCTTAATGTATATGTAATTCATGTTTCTTGGGTCATAGGATACAGGCACTTTCCAACTTCCACTGCTACGGGCTTTTACAAACCACTGCTCTTTCATGCTTGATTTAGAACTGTAGAACAGCCCTTTAAACCTTATCCCTTTTGCCGTAACCACCCCATTATCCGACGGCATCAGGTTAAGTTTCACTACTTCCTCATCTACGTGCCGAAGTTTGCCCATTCGGTTAGCGATACCCCAGTTCCAGATTTCCCTTGGAATAGGTTCCACTTCGTCTGCCACCATCATTTCATCTTTGTTGTAATTGTCAATACGATAATGGTTGTTGTGGAATAACGCACATTTTATAATAATGGCAGTAAATTGCATTAAATCAAGTTTCGCATCAAGCCTGTAATCTCTCCCGCCTCGCTGCATAAAATCTGTATTTACCGCTCCAGGAAGTAATGATTTTGTACGCTCATTGGTCAATTTAAAATATCTTTCTACTAACGGCTTCCAGTCAGCCCTGAAAGGCGGGGTATTCTTTACCGTAATTCCAAGATTCATAATCAAACTCTCTGCATTGTCTGACAGCATTTCCCCTCGGTCTGCCAAAATTGCCTGAGGGAGATGATGTACAGGCCATTCTTCTTCCTGAATATCTATACCATACTGACTACAAAAAGAAACTTTGTTTCCAGCAGTGTTTGCAAGAGCCATTGCTGCTCCAATCCATGACGGCCCTTCAAGTCCTACATAAAGCCCCACAATAAGTTTGGAAAAGCAGTCCTGGACAATATATAAAACAGGTCTGCCTATAATATGTGTTCTGTTGAAACGGGAAACCAAATATACATCAGCCACAGTTGCATCAATTTGGAATACTGAGCCAGGTCCTATAGCATCAGTACTAGAACTTCCCAACACAGGACGGTACTCCTGCTCATACTTCTTCGGGCTGAAACGGGAGGAAACCTCTCGCTTGATGTTGCGTTCCCTCTCAAAAAAGGGCAGTGTAAATATTTTTGTGTAAACTAATTTTCCTTCTATGTTAGTATTTAAATATATTTTAAGACTCGAAAGTCTGCTTTGTCAAATTTTATAGATTCAAAAGAATTTCTGATAAGAAATTCTTACAAAAGAAAAATTTGACAAAGATGATGCGTATAAAATATTACAGGGGGGTTCAGGAAACCAGAGTTTCCCTGAACCCCTTGATTATACTATATACGCCCTTCGAACATAATCTGTAGCTGTCCCAGTATCAAACCCCAGTTTTTGTAACGCATCGTCCATTTTGAAGTAATCTTCACTGTAGCTAAATATATGCTCTTTAAAAGTGACTGGTCGCCAGGAAATACTGTCCTTGATTTGTTTATCCTTCTATAACTGCTATTCAGGCTCTCAATAGTATTGGTCGTATACATGATTTTACGTAGTTCCTCCGAATACTTAAAAAATGGACAAATAACATCCCAATTGCTCTTCCAGCTCTTCATAGCTGCCGGGTATTTCTTCTCCCATTTCTCTGAAACCTCAAGCATCTGGTCGTACCCTGCCTTCTCATTCGGAGCCGTATATATCCGTTTCAAGTCCCTGGCAAATTCCTTTCGGTCTTTATCTGACACATACTTTAGCGTGTTTCTTATCTGGTGTACTATACACCTCTGATATTCAGTATTCGGAAAAGCCGCATTGATTGCATCCTTTATCCCTGAAAGTGCATCAGCACAGAGAATCAGGATGTCTTTAACTCCTCTGTTTTTAAGGTCATTTAAGACACTCAGCCAGAATTTTGAGCTCTCATTTTCTCCTACATAAATACCGATAACATCTTTCTGCCCTTCTATATCAATCGCCAGCACAATATATACGGCCTTCTTCCCAACAATGCCGTCATTTTTTACTGAAAAATGAATTGCGTCAATAAATACTATCGGATAAACCTCTCCCAGAGGCCTTTTCTGCCACTCTTCTATCTCAGGTAGTATTTTATCAGTGATCTTACTTACCATCTCGGCAGATACTTCAAATCCGTAGATTTCCTGTATCTGCTCGTTGATTTCTCTGGTAGACATCCCCCGCGCATACATTGCTATTATTTTATTTTCAATTTCTGAAATGTCCCTTTTATACCTGGGAACAATTTTCGGCTCGAATTCTGCATTCCGGTCCCGCGGGATATCTATTTCCACTTGCCCTACACTTGACTTTAATGTTTTTGATGTGTACCCGTTACGGTAATTTGATTTCGCTTCTTCAGTTGATTCGTACTTTTCATATCCGAGATGTTCATCCAGCTCTGCTTCCAACATATTTTGTATCGTATCTCCGAGCAGATCCTTCAATGCTTCCTGCAAATCCTTTGCTGAAGTAATGTTGTACTCAGAAATGAGATTTCTGATAAGCTCTTTCTTTTCTGGTGTTATTATCCTTTTTCTTGCCATAAAAAACTCCTCCTATACTTTATTATTCTATCATAGAAGGAGTCAATTAGTTTACATAAAATATTTTACAATCTCCAAAAAAGTAACGGAACTGTCCAAAAGTAGGGACTTCAGAGGAAGGTTTCAGAATGGGTATTTTCTTTCCGTCAACCGTCCTATGGCCATCGTTAAAATACTCCTTTAGCATCAGTTCATAAGTCATAGTCAAGGAATGCTTGGCAGAACTATAGTAAAACCTGTTTATTGCAATTCTGAATATGCGCTTTATTTCTTCGTCAACACTAATACCAGCGCCGATAATATTCGCATGCTTTCTTGGTCGCCCAAGTTTTACGCCTTTGGTATTCCTTTCTTTACCTCTACCGCCACACCTGTCATAGTCAGGCAGTAGGGCATTTACTATCTTGCCTCTTATCCAATACCGTTTCAGATATTTATAAATTACTTTCTCTGAAAGTCCGTATTTTTGTGCAACTGTTTTTACATGTTTAGCCCTTTCCCTTGGATAATAAATTTCAGGTTCTAAAATAACTATACTTGATATAGCCTCCCACGCTCTGTCCCTTATGGCTTTAGCCTTCTCTGACAGTAATACCTCATCAACAACTCTTGAAAACGGGTCTTTATCAAGCATTATTGCTTCCTCTGTATCCAAGGCTACTTTGTACTCGCTTATTGTCCTTGCATAAGGAAGTTTATTGGCATTTACATCAATGACATAAGTTAAATCACTTATCTCATCTAACCATAGAATCCGTTCTATTACGCTTACTCCCTGTTCCTTGGTTCCTATCCACTCAATTAGAACATTAACCGCCAGCACTCCGCATTCCCTCCTCCATATCCCTAACAATTTGAATACTGTTTGCGGGAGCATTTAAGTCTATTGGTGTTTCCATATCAATCTTAATCGCTTTTACGGCAACCAGATAACGGAACAAGAACAGGCCTGTCCCTGTATCCAGAGCATAATCATAATCAAAATCAGCAATTACACTCCGTATGGATTTTGTACTGTTAGCAAGCCTGAACTGAAGCGCTGAACCAAGTTCAACTATATCATCCTCATTAAACCTCATGTCAGGCAGCATATGTATTGATGAAAGCGCCCATTCTATGTTTTTGGCTTTATCACGGTTTATGTCTTTCTCCGTCACAATAGCCCAGTCCACACCTTTTATTTGCCAATACCTGCGCTCCATTTCCAACTTTTCAAGCGTTGTTTTTCTCTCAAGAATTTTTGATGATTTCACACTCCTTGCAGCATATGAGGTTTTCCCATTCTTCAACTTAACGGTAATTAGAAATGTTGTGGTAAGGACATATGGACAGCCAGTTTTTTTGTCAATAAACAGATTCTTGCTAATATCCTGCTTATCTTGGACAACTTCATCAAAATCCAGCAGCGGATAAAACTCCCGAATATCGATTATTTTGTTCCCTTCGTCAAATTCTAAAAGGTAAAAGTACCAGGTTTCAATATCCGCCATAAAATGATGAACCCTTCCCGTTTTGATTCCCTTGATACGGCTGCACCTCCCCCTTGAGGAGAAATCTGTAACAGTAAGCCAGGGTTTATATTCCTTTCCTTCTCCCTGCCCCCTACCCTCCTGTAACCATTTATTTAATTTATTTTCATCCCAATCCGTTTTCCGCTTAGCCATGCAGATACCTCCTGAGTTAGGAATTAAGTATAAAGGATTACGGAACAAAGGAGAATGATATCGTAATGTAATTCATACTCCACTTCCTTAAGTCCCTTATCCCTTGCCTCTAAAACCTTTTTTATAATAAAACTCTTATCCCTTTTCCCTTATTCGTCTATTCCCTGAAAAACAAAAATGCCACTGACTACAGTTGGACACCTTTATTAGGTGACTGTGTCAATGGCACTTAGTCCATTTCCCTTGAACCTATTTCCATTATATCATGGACCGACTTTATTTTAAACGTAAAATCTGACTTGAAATAATATGCAGTAGTCGGATAAAATTCTGTGTAACCAACATAAGGAGGTATTTTATGAGGCATAGTGTTTTTTTGACTATAAAACTGGTAATTCTCATGAGCATGTTTTTGTTACCATTTACCATTATTACAGAAAATATGTTTATCCGCTTTATTGCAGGCTCCCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009012|2224042:2239013|2224042_2225527_-|WP_080514916.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA MYLNTNIEGKLVYTKIFTLPFFERERNIKREVSSRFSPKKYEQEYRPVLGSSSTDAIGPGSVFQIDATVADVYLVSRFNRTHIIGRPVLYIVQDCFSKLIVGLYVGLEGPSWIGAAMALANTAGNKVSFCSQYGIDIQEEEWPVHHLPQAILADRGEMLSDNAESLIMNLGITVKNTPPFRADWKPLVERYFKLTNERTKSLLPGAVNTDFMQRGGRDYRLDAKLDLMQFTAIIIKCALFHNNHYRIDNYNKDEMMVADEVEPIPREIWNWGIANRMGKLRHVDEEVVKLNLMPSDNGVVTAKGIRFKGLFYSSKSSMKEQWFVKARSSGSWKVPVSYDPRNMNYIYIKKSATEFEKCYLLEYQTAFKDKYIEEIEYLMEWEKMQKAKSLDEGLQAKADLITEIETIVEGAKSKTNKELSLSTESDAQRKKNIRQNRQVEKEINREIEAFELDRQPNNKNAEIISLNELEEELPSNPLDLLRRKQREMLGKINE >NC_009012|2224042:2239013|2230053_2230848_-|WP_011838283.1|DBSCAN-SWA MSELITSNNLEQVIEKNNLIKDDILRLTNDFTVRFNKSGVTGQDKLSFSVLKENHLIQIPIDDEYWGGAIITKGNIKIPVINTAQPRVYQYFVAWHEIYHLFYDLSLRDETHNIAVDMDLNERKADYFAAKMIFGNVYDYYYSLDDEDFIDRVIKCMDVYKAPYKAVLIELFEEAVTKYNDLDLKEKILEHFDNKPENLVQKFIDLELDAELVKPSYVVSLGGLEKKIQSVMKENPDVSHHKDNYQFLLTLKNKIKKGVEGLAK 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14 | uncultured_virus(33.33%) | integrase,transposase | attL 2216974:2216988|attR 2241928:2241942 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2356640 : 2460095
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009012|2356640:2460095|DBSCAN-SWA 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75 | Enterobacteria_phage(26.67%) | tRNA,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2533914 : 2606886
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_009012|2533914:2606886|DBSCAN-SWA 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57 | unidentified_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2931282 : 2966457
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_009012|2931282:2966457|DBSCAN-SWA ACTATTTTGCAAACAACTCCTCTATTTTGGACACAGCTTCTTTTTGAATATTAGGTAACACATGGCTGTAAGTATCAAGGGTAACGGAAATTTGGCTGTGGCCAAGACGTTCGCTTACTATCTTTGGATTTATGCCTTGCTGTAAAAGCATAGTGGCGTGGGTGTGCCTCAGGTCGTGGAAACGTATTTTGGGGTAACCTAGCAGCTTGATCAGTTTTGTAAATTTCTGACCTAGGTAATGGGGGTCATACGGTCTTCCGTCGTCCCAAGCGCATACAAAGTCTTGGTCATTATAGGCAGAACCCATTAATAGCTTAGTTTTATTCTGCTTTCTTTTGTGTTCTTTTAAAGCTTGGACGGTGTAATCCATTAAAGCTATAGTACGCATTGATTTAGCTGTTTTTGGTTCTTTAAGCGTAAGTACGCCGTTTATGCGCTGTAGGGCATATTTGACCATTAAAAAGCCCCGTGGAAGGTCAATGTTCTCCCATTTTAAGCCGCATATCTCACCTGCCCTCATGCCGGTTTGCAGTGCTAACAATACTGGTATATAAATCGGTGTCTCGGCAATGTCATCTAAAAATTTTTTGGCTGTTTCGACGTCCCATACTCGCATTTCTACTTTATCAGGACGGGGTGGCGTAACGGCATCGGTGGGGTTTGATATTATAATCTGCCAGTTTACCGCATGTTTCAACGCCAGGTGCAGCATGCGGTGTATTTTTAAGACGGTGCTTTTACTTAAGTTTTTCTCCAGCAGGGATGAGTAAAAGCTTTGAATATGGGCTGGCTTTAGCTTCGGCATCATGATGCCGCCTATATGAGTTTTTATATGGGCGGCAAATTCGGTATAACGCCTATAAGTGCTCGGTGCTACATTGTTTTTGGGGTAAGTATCCAGCCAGTAATTGAGGTATTCGGCTACAGTCATGTTTGCTGGTTCAAAATATTCACCCTTCTCTATTTTTGCGATTATGTCGGCCAGGGCCTTTTCGGCTTCCTTTTTTGTTTTGTAGCCGCTAAACCACTTTTGTTTGCGTTTGCCGTTTTCGTCACGGCCGATGTCAACTACTATGCTGTAGGTGGAACCTCTTTTGCGTATATGGCCGCGCATAGGCTATCCCTCCTTTTAAGGCATATAACTTTAAAAGACCACCGCCTTGCCAAATTTTTACAACGAATGTTTTCTTATTGCTTCGACAATAGCGTCTGTATTCCAGCCTACTATTTCAATAGCTACGTCAGATACTGCTTTTGGTATTCTTTCTTGTCCCCATGGTTTTATTCCTATTATAGGTTTACCATAATCCACAGATATATCTATTTCTTTTTGAATCCAGAAACTGTAAGCTGCATACATTCCTGACAAAATAAGCACACAATTTACAGGACGAATTTGTCCTTTTAGCTCTTCAATTAATGTTTTCTGATCGACTGGGTCGTCTGGATCAATTACTGGGTCATGCTGTGGGACAGAGTAATTTCTCCATTTAAAATTTGGAGCTTTATTTAGTAGGTCTACTAAACGGTAATAATCATCATTGTATTTCCATGCATGGCTAATGAACAAATCATATATTTTTAGGTTGGGCATTGTTTACACACTCCCCTTCATTTGTGATATAATCATATTAGAATCATAAATTTTAGAATAAGGCAGGGCGGTGGTCCCATGCAGAATATAAGAAAGAGAAAGTTTCGGAAAAAGCCCATTATCATTGAAGCCTACCAGACTGACAAGGAAATCATTATAAACACGATGGAAGGTCCTCTTAAGGCTTCGCCGGGCGATTGGATAATTACCGGGGTAAACGGCGAACAATACCCATGCAAGCCGGATATTTTTAAAAAAACTTATGAACCAATTGAGGATGAGTGATTTGTGTTTCTCACGTTATGGAGAGGGTTTGTTTGCCTTTGACTCCAGTCAATGTGTTCGGTTGACATTATGCGTTCGCATTGTTCAACGAGCAACTTAAACGGATCATCTGTTTTGGAATATATGCCAGCTTTAGTAAAGTATAAAAATTTTTCTTGCTTTAGTGCTTCGCATGTATTCCTATATTTAATCCAGTTTTCTTGGAATTTGCAGATGCCGTGTACAGCTGCAATGATTGATATAACTGCGCTTAATATTGCTATAAGCAGTTTTAGATAAAGAGGTCCTTCCATGAGTGAAATCATAACAGTAATAGATGCAGACAGGACTATTTCTGCTATTCTTAGTCCTTTGTATATGTATTGATTTTTAGTGCTTTTTTCATCATACCACATTATCTGGTCATCTAGCCTTTGAGAAAGGTATTCTTCTTCTTTCATAAAGATATCCCACCTCTTTTCTTGTCGATTTATTTCATATGCAAGATTTTATACTCCACCAATTCCTCATTAACCCCTAGTGTGCTGGCGATATAACTTATCGGTTGGTAGCGCATTTCCTTAATGTCGTAATCATCGATAAGTAGCTCTGCTGCAAACTTGTTGGCCTCACATTCATACGGCCCAATAGGGAACAAGGTATATTCTCTGATAAAATATATTGGCTCTGATGAGTGCAGGATGGCATGTCCAAGTTCATGGGCCAATACGATACGCTGGCTGTATTCATCCAATGTACTGTTAACGACTATAAATTTATTTCGCAGCGTTTTTATGTAGTATCCTTTTGTATGATGTGAGTATTCCTTATGTACGACGTGTATGTTGAGGTATTTTGCAAGCCTTAAGGGGTCTCTAGTTTCATATTTCTGGACGAGGTGCTTTACACGGGCGTGAATATTCTTTTTCACTCCGGAAGCACCTCCTTATTGGTCGGTTTTTGCCTTTTTTCTGCCGTATTTCTTCTTGTTCATCTCCTTTGCCTTCCAGAAGAGCTCGGATATATCTCGAAAGAGCTTTTCTTTGTCTTCTTCTGCGACCTCATCGTTCATGAAGAAGATGCCGGCCTGCTTGATGAAGTCTTCATACTGCATTAGGTCACGTTTGGTCACTTTATGTTTTTGGGTGTATTCTTCAGGGATGTAGGGGTTGCGGATGTCAGTGCGACCTAGAAGATAATCGACTGATACCGAATAAAATTCAGCTAATTTCTGTATTGTGACAAAGTCAGGTTGGCTTTTGCCTGTTTCATATTTTGTATATGTGGTTCTATCTACGCCAATAGCATCGGCTACATCTTTTTGGCTTAAGTTTTTCTCTGTTCTTAACTGCCTGAGAATTTCATTAAAGGGCATGTTATTCACCTCCATATTTTATTATATGTGAATCTACTTCACATAACAATTATAGTGCAAAAATTTCACTTTGGCTATTGACAAAGTGAAGCAACTTCACTATAATTAATTTCGGGGGGTGAAGTTAATGCACAACAAAAACGTGGCAAGTGAAGTAAGAGAACTTATAAAAGAAAAACGTGCTGCCTTGAACCTTACACAAAAACAGCTAGCGGATTTGGTAGGAGTTGACAGAACAACAATTTCAAAAATTGAAAATGGAATAAGACCATCTGTAAATAGTGCCAAAAAAATAGCTCAAATTTTAGGCTTAGACTGGACAATTTTTTTTGATAGCGATGAAGAGCATCAAACCGAGACTGCGTAAAGGAAGGGGGTGAGGGGGATGGCAGACTTGCCACAGGTATTTAATTACAAAGGCAAACAAGTAAGGACATTTATCATCGATGGTGAACCGTGGTGGGTTGCTAAGGATGTGTGCGATATTTTAGAGCTTGGCGACACTCACAAAGCTATGGAAAGGTTAGATGAAGATGAGCGGAATACAATTCCGGTCACCGACTCACTTGGAAGATTACAAGAAACTTATGTAGTTAATGAGGCTGGTTTATATAATCTCATTTTAGGTAGCAGAAAGCAAGAAGCTAAAGAATTTAAACGATGGATTACCCATGAAGTCATACCTCAAATACGCAAGACAGGGATATATGCATTAGAACCAAAACAACTTTTAGCAGTAGCAATAATTGAAGCACAGAAAATCATAGAAGAGCAAGACAGGAAGATAAAAGAATTACAACCCAAAGCGGAATTCTTTGATGCGGTAGCAGGAAGCAAAGATGCAATTGACATGAACAGAGCCGCAAAACTGATATACGAAGAAACTAGACTAGGCAGAAACAAGCTGTTTAAGTTACTGCGGGACAAAGGCATTTTAATGAAAGACAACATACCGTATCAAGAATACATAGACAAAGGGTACTTTAGAACTATTGAGCAGAAATATACGAAGCCAGATGGAACAACACACATCTACATTAAGACTCTGGTTTATCAGAAGGGGCTGGATTTCATAAGAAAGATTGTTAAAGAGGATAACGTAATACATCTTAAAAGAGCAAAGGGGGTTTGACAATGCGATACGAGGACTTGCCTGATGTTTTAACTATACCGGAGATGGCAAAGTTTCTCCAGATAGGCATCACCAAAGCATACGAGATGAGCCACTGGAGGGGCTTCCCGGCCATACGAATAGGGCGGGCAATACGGGTACCCAAGAAAGCATTGCTGGAGTGGCTTGAACAACAGAGCAAACAGGAAGAGCCCAGACTAACTGCAATTAGGGTGAGGTGATAAAAGAAAAGCCGTTTTCAAACGGCACAAACAAAAACCACTACACCCTCATTATACCACAAGGTGTAATGAGGGGGCAATAAGGGGGAGCGAGAATGTTGTATAAAGTGACCTCACCCATGTTAGAACAGGAGATAGTTGTGGAAGCACAAAACTCAACGCAGGCTAAGAGAAAGGCTTGTAGGTTGTGGGGCGTTAGCCCCAGCGACGAATGGCATGGCATATCCACGATGCAGGCCAGAAAGTTAACAGAGAAAGAAAGACAAGAAGAGTTGAGAAAGTGGGGGATTGAGGATGCGAGTATTTAAGTGTGGCTGCTGTGGCTATAAAGCACCGGAATATATGTTTGCATACGGACGAGGGCGGGAGTACGGTGAGCATCCGGAACACCGCTACTGCCCTCAGTGTCATCAA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53 | Clostridium_phage(21.21%) | portal,tail,plate,transposase,capsid,terminase,integrase | attL 2931143:2931196|attR 2968318:2968371 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3204695 : 3273547
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_009012|3204695:3273547|DBSCAN-SWA CTCAGGCTATTGCTGATATATTTTTGTTTACCAGGTTATGTATCTCTTCATTAAAACATTCTTCAGGTGTTTTGTAACCTAATATCCTTCGTGGAAGGCTGTTTAACCATTGTTGTATCCGTTTTATCGTTTCTTCAGAAAAATCTTTTATAGCCTTTCCTTTAGGAATAAAACGCCTAATAAGTCCATTATGACGTTCATTAGTTCCTCTCTCCCATGAGGAATAAGGATGAGTGAAATAAGCTTCAATTCCTAGCCCTTGTAACATTTCGGATAGTCTACTAAATTCAGAACCATTGTCTGCCGTTATAGTGCGAAATACATTTGAAACATCCTTACCATAACAATTCTTAAGTTCTGAAAGTGCCTCGTTAACAGTATTACTGTCTTTTGCGTCCAAAAGAAACAATAACTCGTAGCGGGTTTTTCGTTCAGTTAAGGTTAAAATTACTGAATCGTTAGACTTTTTGCCTGTTACCGTATCAATTTCCCAATGCCCAAAGGTTTGACGTGATTGTACTTCTTCCGGCCTTTGATCAATGCTTTTCCCTACAACCCGTTTGTTTTGACGTATCCTTTTTATTTTAGATTTTAAACGTAGTTTAAGATTTAAATCTATATTTCGTACTTTTATGAGTCCCAGGTCTATATAATTATACAGTGTTTTGGTACATACAATAGTAGAATTTTGCCACTTGGGGTCTCTCCTACATAAACCAACAACTGCATCTGGAGACCATTTTTCGCGTAGTATCTTATCTTCTGCAAACTTAAGAAAATCTTCAACTTGAGCCAATTTACGCTTTGCTCCGCAATTCATACGATTTTTCTCATAAACTGCCTGCCCTGTTTCAGGAAAATATACTTTGTATGTCGATAAATCAGTTCTCATCTGCATTGTTGTCCCTCTTTTAATTTCACGGCTAATTGTACTTGGCGAGCGACCTAGTTTATTAGCAATATAACGTTGACTCTTTCCTTCTTTTAAAAGAGCTGCAATCTGCCCTCTTTCATAAACACTTAAGTGTTTAAACTTATGCTCAGTTGTGGTAGACTTATATTGTACAGCCATAGTTGAGAACCTCCTGTATGTTTGGATTGGACACCTAAATCATACATGATTTCTCGGGAAGTTGTAAAATAAAATGCCGTAATATATAGAAAACTCATGGTAATCCATTGTAAAATGTTTAATAACCAAAGAAAAACATTAGCAAAGGAGTACCATGAGTTATATATGAATAATAACACAGAAACAAGAAAAAACAAACACCTAAATGAAAGAGAAAGATACGCCATAGAGTTGTACCTAAAAGAAAAGTATACAGTAACGGAAATAGCAAAGAGGTTGGGCAGGCACAGAAGGACAATAGAAAGAGAAATAACCCGTGGGACAATATATTTACAAAATAGTGATTTAACATACAGAAAAGAGTATTGTGCAGATGTAGCCCAAAGGAGATATGTAGAGAACGGGAAGAATAAAGGTCCACGGTTAAAGATAGGAAATGACCATGAATTAGTGAGGTATATAGAATCAAAGATAATAAATGAAAAATATTCTCCTGATGCTGTTATTGGACAAATAAAAGCAAAGGGACTGAAGTTTAAAACGAGTATCTGCACGAAAACACTATATAACTACATTGATAGAGGGGATGTATTTTTAAGACTAACGAATAAATATTTGCCAGTGAAAAAGGATGGTAAAAAACGCATATATCAAAGGGTAAAGAAGATAGCACTGAAAAATCTTAAGGGAAGCAGCATAGAGGAAAGGCCGAAAGAAGTTAACGATAGGAAGGAATATGGACACTGGGAGATGGACTGTGTAGTAGGCAGAAAAAATAGCGCAGCAGTATTACTGGTATTAAGTGAACGAAAGACAAGAGAAGAAATAATTCTTAAACTACCAGACAAAACGCAGGAATCAGTAATCAAAGCAATAGATGAATTAGAAAGGAAGTATAGAAGGAAATTTAGGGAGAAGTTTAAAACGATAACAGTAGATAACGGGACAGAGTTTTTGGACTATAGAGGGATAGAGAAATCAAAAACAGAGCCAGGCAAGGACAGGACGAAAGTGTATTATGCTCATCCTTATAGTTCTTGGGAAAGAGGAACGAACGAAAATATTAATAAACTGATAAGAAGATTTATACCAAAAGGAACAGATATATCAAAAGTAAGTAAAGCAAAAATAAAAAGTATAGAGAGATGGATTAATGAATATCCAAGAAGAATGTTTGGTTATAGGTCAGCCATAGAAATGGCGGTATGATGTATAGAATTTATTCCAGTAAGCAATGGATTTACCAAATTTTGCACGGCATTTAATATTGCAATTTATATTTATGGACAGACATATAAAAAAATCTTGACTTAAGCTAAAAAATATGTTAAATTATTGATTGCTTCGCTGTACGTCTTTTTTTTTATGGCAAAATGAGATGTTAGTTAAAATGAGATATTAAATAATTTAAATATATTTGATTTTTAGGACAAACCTTGGAGGTGTGAAAGGTGAGAGTAAAAATTACATTGGCTTGTGGAGAGTGCAAACAGAGAAACTATAATACAATGAAAAACAAGAAAAACGACCCGGACAGACTCGAAATGAGAAAATATTGCAGGTTCTGCCAGAAGCATACTATGCATAAAGAAACAAAATAATAAAAAAGAGGGAATAATATCGGCAGCTGGGGGAAGACTTCTGATGTGCTGACAGAACAAAAAATTTTAAAAATGGAGATGTGTTCGTATGGCTGAGGAAGTGAAAGTCTCTAAGGTTGAAAAAAAGAAAGAAGGTTTTTTAAAGAGAGCCGCGGGGAAATTTTCAAAATACTTTAAGGACGTTAAAAACGAGCTTAAAAGGGTTATTTGGCCTACAAGGTCACAGCTTATAAACAATACCATCACGGTTTTGATTTTGTGCTTTATTGTCGGAGTGTTGATATGGCTGTTTGACCTGGGATTTGGCGCATTGTCCAGCCTTATTTACTAAGCTTATGCATAAAGCAGCGCGGGTTATTAAGTTATAAAGGAGGACTTGGAGCTTTATGCCGAATAATGAGGCATCCGAGGAAGCAAAATGGTATGTGGTTCATACCTATTCCGGATATGAAAACAAAGTGAAGGCAAACCTTGAGAAAATTGTTGAAAACAGGAACTTGCAGGATTATATACTTGACATAGTTGTGCCTATGGAGGAGCAGATTGAAATAAAAGACGGCAAGAAAAAAGCCTCCCTCAAGAAAGTATTCCCCGGATACGTTCTTGTTAAGATGATTATGAATGATGAATCCTGGTATGTGGTCAGAAATACCAGGGGGGTTACAGGGTTTGTCGGACCGGGCTCAAAAGCCGTGCCTTTAACCGATGAAGAGATAAGGGCTATGGGAGTTGAAGAATTTGCTCCTGTGCTGGACTATGAGGTCGGAGACAATGTAAGGGTGGTTTCCGGGCCTTTGGAAAACTTTATCGGAATAGTTGAAGAAATAAATCTGGAAAAGAAAAAGGTGCGTGTTTCCGTTTCGATGTTCGGAAGAGAGACACCTGTGGAACTTGAACTTCACCAGATTCAGAAAATATAGTGAAGATGTATTTTTTAAGATGCCTAATATGATTTTTAACTATAAATAAAATCTTTACTACAGATTAGCAAAAGCAAATAATAAATCTCTTTTTGTCAAGGCAGAGAGATTTATTATCATTAGAATTGGGAGGTGGAAAATATGGCAAAGAAAGTAGTCGGCTATATAAAACTTCAAATTCCTGCGGGGAAAGCAACTCCGGCTCCACCGGTTGGACCAGCTTTAGGACAACATGGCGTAAACATAATGGCGTTTTGTAAGGAATTCAATGAGAGGACGGCAAAGGACGCAGGTCTTGTAATACCTGTGGTTATTACCGTATATGCTGACAGATCCTTCTCATTCGTTACGAAAACTCCGCCGGCGTCAGTGCTTATTAAAAGAGCATGCAAGATAGAAAAAGGATCCGGTAGACCGAACAGGGAAAAAGTTGCCAAGATTTCGAAAGAGGAAGTAAGAAAAATAGCTGAAATGAAAATGCCCGACCTTAATGCAGCAAGCCTTGAGGCTGCCATGAGCATGATTGCAGGTACTGCAAGAAGCATGGGCGTTGTTGTTGAGGACTAAGTTGAAGGTTTAAAGCAAAGTTTTCATGTTGTTCTAAAGTAGAAGGTGGGAGGAAACGTAAGTTTCCGAGAAAAATTACCACGTAAGGAGAGTGAATTGGATGAAAAGAGGCAAGAAATATCAGGAAAGTGTAAAATTGGTTGATAAAACAAAGCTGTATGATCCTGTAGAGGCAATGGAACTTGTGCAAAAGACAGCCAAGGCAAAGTTTGATGAAACTGTGGAGGCACATATCAGACTCGGTGTTGACTCAAGACATGCCGATCAGCAGGTAAGAGGCGCCGTTGTTTTGCCGCACGGTACAGGTAAGAAAGTAAGAGTTCTTGTTTTTGCGAAAGGTGAAAAAGCCACAGAAGCAGAAAAAGCCGGTGCGGATTATGTTGGTGCAGAGGAATTGGTTTCAAAGATTCAGAATGAAAACTGGTTTGAGTTTGACGTTGTAGTTGCAACACCGGATATGATGGGTGTTGTAGGTAGACTCGGTAAAGTGCTTGGTCCGAAAGGATTAATGCCAAACCCAAAAGCCGGTACCGTAACAATGGATGTGGCCAAGGCAATTGCCGACATCAAAGCCGGTAAAATTGAGTACAGGCTGGATAAGACCAACATTATACACTGCCCTATAGGAAAAGTGTCCTTTGGTACCGAAAAGCTTGTTGACAATTTCCGCACATTGATGTCAGCAATAATCAAGGCTAAACCTGCAGCAGCAAAAGGCCAGTATCTTAAGAGTGTGGTTGTTACTTCCACAATGGGACCTGGCATAAAAGTAAATCCTTTAAGAGTAAGTGAATAAAAAATGTCTTTACAAATTTAGAATAATGTTATAATATATCCATT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55 | unidentified_phage(10.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3324050 : 3389049
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_009012|3324050:3389049|DBSCAN-SWA 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51 | Bacillus_phage(28.57%) | tRNA,capsid,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
3759641 : 3828682
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_009012|3759641:3828682|DBSCAN-SWA 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48 | unidentified_phage(42.86%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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