CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NC_009091	Prochlorococcus marinus str. MIT 9301, complete sequence	0 crisprs	cas3,csa3,DinG	0	0	1	0

1. NC_009091

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	427344 : 432676	7	uncultured_Mediterranean_phage(16.67%)	tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NC_009091|427344:432676|DBSCAN-SWA
CTTAATGAGAAGATGAAAGAGTTTTTGACTTAAGATTTTCTGATAAGTAAGTTAATCCAGTACCCACAAAAAATAAAAAAACAATCGATATAGAAAGCAATGACATTGTCAATGGGTCTGTTGAAGGGGTAATCACTGCAGATAAGATTGCGGAGGAGATTACAACTACCTTCCAATTCGAAATCATTTTTTCTGTTGTGATTATTCCAAGAGAACCAAGAATAAATTGTAATACTGGCAATTGAAAAGCTATTGCAGTGCTAGACATTAATAAAAGAACAAAATCAAAATATCTTTCTATAGACCAAGTTGGTTCAACAATATCAGCACCGAAACTAATGAAGAAATTTATTGCTGCAGGGACTAATATCCACCATGAAAAAATCAATCCTAAAAAAAATAGAAGACCTGAACCAAAAACTGCAGGCAAAATAAGGCTTTTTTCTTGTTTTGTTAAACCAGGGGAAATGAATAATATTATTTGATAAAAGATATAAGGCATAGAAACTATCAATCCACTGTAACCTGCAACTTTAATAGCGACAAATAAAAACTCTCCTGGAGCAAGTTGTAGTAAATGAATATCACCAGCTGGAATTTCTAAAAAAGATATTAATGGCTTTATAATTAGAAGACTAAAAAATATTGAAATCAGTATTGAATAAATTGAATTTAGTATCCTTTGACGAAGCTCCTCTAAATGATCACTAAAAGTCATCGAATCTGATAATTTTTTTTCACTTTGACCTGTATCTCTCATTAATATTTGAAAATTGTTTAAGAAAAAGGTTTAAAACTAGTATTGTCAAAGTACAATTTATTTTTCGATAAATTTAATTATTTGCTTAATTTAGGATTTGTTGGATCTGGTAATAAGAAAGGAGGGGCATCATTTAAAGATGATTCACCATAAGTTTCATATTCTCTATATCCACCCATTTTCCCATTCGTTTTCATTAAAGCGCTTACGAAGGCAAGTAGTAAGAAAACAGTAGGAGCTCCAATTATTAATGCAGCACCAAATAGATATCCAACAATAAATTCTGGAAAACTATGATTTCCTAAAAATTCATGAGTGCCTAAAAGAAAATCAAACATTTAGATTTAAAAATTTTTTTTATTATAAACTAAATTACTGTTTTAAGATTTTTTTTAATGTAATCTTCTCCTCTTGTAGGATTTCCCCAAATAATTTCTCCATTTTTAAAGGAAACGCAACCTGGTCCTCCGTTTTTGATTTTTTGTAAATCTTTAATCCTTACTAAATTAATTGGAACTTTAATGTTTCTTTTTGCCTTACTAAATAAAGCAGCTAAATCTGCAGCTATTTGAAGATCTTGTTCAGATGCTACTTGAGATGAAGACTTCAAAACTACATGACTGCCTGGTGATTCCTGTGCATGAAACCATAAATCGCCTTTTTTTGAGAATTTAAAGCTTATTAAATCATTTTGCCTCATATTTCGCCCTACCTGAAGCTTTAATCCTGTGGGAGTGTCAACTTGAATTGGTGAAGACTCTATCTCATATGTACTTTTCTGATCTTCTCTTTGCTTCTTGATATTGATATTAAACTCGTTACAAATTTCTTCCATAATTTCTTCTAGAAGTTTGATTCTCATAGAAAGTTTTTCATGATTTAAAGAATTTAAATTTTCTAGAAGCGTTGTGAATTCGTCTAATCTCTCTATATTTGTTTTGTAAATACTTAATCTTTCTTTTATTAATTCTCTAGATCTCTTTAGTTTTTTTGATTTTTTATATAGTTTTTGTCCCTTTATAATGTCTTGTTTTTTAATTTCATGTGAGGCAAATATATTATCAGCTTTTTCTTTATATTTCTCGTAGTTTTCTGATTTTGTCAGAAGATCAGATTGAATATTTAAATTCTTTTTCTCAGTATTGGACTGTTTAAAAATTATCCCTTCAATTTTCTTTTCCAATAATTCAAGTTTTTTTTGTTTCAGATGATAATCATAATAATTTTCTAAGCTTGTGCATAAATCTTTTTTATTTTCGAAATTAATTTCCTTATCAAAAAACCAAACGCAATAAAAATCTTTGTTGAATATAGAAAAATTAAAGTTATTGTTTTTAAACCTGTTTATCCAAATCTTCCAATTTTTAAATATCTCCTTTAAGTCTGAGTTGCTAATGAAATCAATATTTTTTCCCATTATTCCTGAATTAACAGTTGCGCTAACAAACTCTAATTGTTTTGTGAGGATAGGGCTTACTCCTTGATAGGTATTTATTAAACAGTATTTCAAAGACTCAGGTACTATTGAAATTGAGTCTTTCCATGATTGAAAAGACTCATCTTCTCTAGGTTGTTTTTTGAGATTGACTGGAGGGCCAGAATAAATTGATCCTGTTGAAATTGTTCTAAAACTAGATTGACTTGATTTAATTTGTTTACCAACGGCAATTATTTTATGTTTATTATCCAGATAAAAAATATTACTATGTTTTCCCATTAATTCAAAAATTAAATACTTATTAATTTCATCTCCAGGTTTTTTCGCAAAACTAAATTTAATAACTCTCTCGAAATCATCTTGATCAATCGAAATTAAAGCCATATACTTTAATCCGTATCTTATTTGTTTAGAAAGTGTGCTTTCTCTCCCAATCTTTTCTGGCTTATTTATCTTTAGTATTCTTGGGGAGTCTCCATTCCATGAAACTTCTAACCATGTTTGAGAATCAACTCCTCTAAAACATAATTGAATTGTATTAGGCTCTGGTTGTTGGGCAGTCTCAAACTTTGTAGGTAAGATGTTCTTTGTCAAATAATGCAAGACAGATCTAATAGATGTAATATCCATTATCTGTGGAACACCTTTCTGCATTATTCCTTTTTAATTCACAAGAAGTTTATTTTACTGTAAAAAATTTCATATGAAAAATCAAAAAAAACTTATTATCCTTACTGGACCCAGCGGGGTAGGTAAAGGAACAGTTGTTAAAGAAATATTATGTAAAGAAAAAAATTTTTGGCTTTCTATATCTGCAACTACTAGAGAACCTAGAGAGGGAGAGAAAGACGGAGAAAATTATTATTTCTTAAACCAAGAAAAGTTTAAAGAAATGATTGAACAAAACCTTTTCCTTGAATGGGCTCAATTTGCTGGAAACTACTATGGAACGCCTTTGTCTTCAGTTAATGAGAAAATAAAAAAGGGATTTACCGTACTTCTTGAAATTGAAGTAGAGGGTGCAAGGCAAATAAAAAATAAGTTTCCTAATTCACAGTCAATATTTTTGCTTCCTCCGGATAAAGAAGAGTTAGAGAGAAGAATAAGAAATAGAGGTACAGAAAAAGAAGAGGCAATTAAAAAAAGACTCTCAAGGGCTAATTATGAGATTTCAGCATCAAATGAATTTGATTTTGCATTAACAAATCACAATGTTGATGAAACAGCAAAAAAAATAATCAAGTTAATAAAAACTTGATTATTTTCTATTTATCAACTCATTGGATGGAATAATAAATCTGGGAAAAACCTATTAAATTCAATAATTATTCCAGCTGTAAGGCTTAGCCAAATTGCTGCTACGACTGGAGCAGATCTGACAAATTTTGTGTTTAGAATTTTGAACATTTGTTTTATGAAAGTTTTTTAAGGATGTTTAGCGAGGACCATTAAGTGTAATGTTGTTATCTTTCTCTCTTAAATCTCCATTTCTACCTTGTTTATTAGCAAGAAGAGGCCATTGGGCTCCTTTTACAAGACATTTTCTGGCTAAGTCCAGATCAATAATGATCTCAAGATCTGCTGGATTCTTAGTCTTTTTTGATTCAATGAGATACTCTCTTCCTGACCAACCTATAATTCCAGCAATGTAAATGAATAATACTCCCGGAATAAGTAAATCTCCTTCATGACCTCTATTTAGAAGGGCCCCCCATGGCTCAAGAGGAGGTCCAATTATTAAATGAGGAAGACCATCATCTCCGCATGATGCTTTTCCATATCTTTCAAATCTTGCTATGTCTTTTTGAGTAGTTGCAGAATTTGCTCTCTCAATGAATTTAGGATTTTCAGAGCATTTTGTGAGGGCTGAAGCGGTATATTCTGTGCTAGCTCTATCTGCGTTTAAGGCAGGACCATTTGCAGCTAGAGCAATTGGAGTAATTCCGAGGAACAGAAAAACTGAGGTTATGATTGAAAAAAAGAATTTCATAAGTTGCAATCTTTAATTCCTTATAGTGTATTAAGTAAGAAATTAATATTAAAATAGAACAAGTTGAATCAAAAATGCATAAAGTTTTAGCTATTGAAACAAGTTGTGATGAGACATCTGTCTCAATAGTTTCTAATATTGGCGATACTTTCAGAATACATTCAAATATAATTGCCTCTCAAATTGAAGATCATTCAAAATGGGGAGGAGTTGTGCCTGAACTTGCAGCTAGAAAGCATTTAGAATTATTACCTTTTGTTTTAGAGAAGGCTCTAGAACAAGCAAAAATTAAAATTGAGGAAGTCGATTATATTGCGTCAACTGTAGCTCCTGGATTAGTTGGTTGTTTACGAGTTGGATCTATAACCGCAAGATCACTTTGCATGTTACATTCAAAACCATTTTTGGGAATTCATCATTTGGAGGGTCATTTATCTTCAATTCTATTTTCAGAAAACTATCCAAAGAAATCTTTTCTTACATTACTTGTTAGCGGCGGGCATACTGAATTGATAAAGGTAGATGATAATAGGGGGATGCAAAGACTTGGGAAAAGTTTTGATGATGCTGCTGGAGAAGCCTTTGATAAAGTTGGCAGACTATTAGGTCTTGGTTATCCAGGAGGACCGGCAATTGAAAAGATTGCTAAAAATGGGGACCCAATGAAATTTAATCTACCAAAATGTAGAATCTCTGATAAAAAAGGTGGATTTCTTAAATATGATTTCTCTTTTAGTGGTTTAAAAACTGCCGTATTAAGATTAGTTGAGAGAATAAATTTGGCTGGGAAGACCGTTCCAATTCCAGATATTGCTGCAAGTTTTGAGAGAGTTGTGGCAGAGGTCTTGGTAGAGAGAACAATAAAATGCGCAGAAGATCATAGATTGGATAATGTAGTTGTGGTTGGGGGAGTGGCTGCTAACAATACATTAAGAAAAATGATGATTAGTGAAGCTAGTAAAAAATCTATTAAAGTTCATTTAGCTCCTCTTGATCTTTGTACAGATAATGCGGCAATGATTGGAGCGGCGGCTTTGTTCAGAATCAAATTTAAGGATCATTTAAGTAACCTTAAATTAGGTGTCGCAGGAAGACTATCAATTGAACAAGCAAATACCCTTTATGAAGAAAACCCTCCTTTCTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NC_009091|427344:432676|430244_430799_+|WP_011862489.1|DBSCAN-SWA
MKNQKKLIILTGPSGVGKGTVVKEILCKEKNFWLSISATTREPREGEKDGENYYFLNQEKFKEMIEQNLFLEWAQFAGNYYGTPLSSVNEKIKKGFTVLLEIEVEGARQIKNKFPNSQSIFLLPPDKEELERRIRNRGTEKEEAIKKRLSRANYEISASNEFDFALTNHNVDETAKKIIKLIKT
>NC_009091|427344:432676|428470_430171_-|WP_011862488.1|DBSCAN-SWA
MDITSIRSVLHYLTKNILPTKFETAQQPEPNTIQLCFRGVDSQTWLEVSWNGDSPRILKINKPEKIGRESTLSKQIRYGLKYMALISIDQDDFERVIKFSFAKKPGDEINKYLIFELMGKHSNIFYLDNKHKIIAVGKQIKSSQSSFRTISTGSIYSGPPVNLKKQPREDESFQSWKDSISIVPESLKYCLINTYQGVSPILTKQLEFVSATVNSGIMGKNIDFISNSDLKEIFKNWKIWINRFKNNNFNFSIFNKDFYCVWFFDKEINFENKKDLCTSLENYYDYHLKQKKLELLEKKIEGIIFKQSNTEKKNLNIQSDLLTKSENYEKYKEKADNIFASHEIKKQDIIKGQKLYKKSKKLKRSRELIKERLSIYKTNIERLDEFTTLLENLNSLNHEKLSMRIKLLEEIMEEICNEFNINIKKQREDQKSTYEIESSPIQVDTPTGLKLQVGRNMRQNDLISFKFSKKGDLWFHAQESPGSHVVLKSSSQVASEQDLQIAADLAALFSKAKRNIKVPINLVRIKDLQKIKNGGPGCVSFKNGEIIWGNPTRGEDYIKKNLKTVI
>NC_009091|427344:432676|430976_431531_-|WP_011817979.1|DBSCAN-SWA
MKFFFSIITSVFLFLGITPIALAANGPALNADRASTEYTASALTKCSENPKFIERANSATTQKDIARFERYGKASCGDDGLPHLIIGPPLEPWGALLNRGHEGDLLIPGVLFIYIAGIIGWSGREYLIESKKTKNPADLEIIIDLDLARKCLVKGAQWPLLANKQGRNGDLREKDNNITLNGPR
>NC_009091|427344:432676|427344_428103_-|WP_011862487.1|DBSCAN-SWA
MRDTGQSEKKLSDSMTFSDHLEELRQRILNSIYSILISIFFSLLIIKPLISFLEIPAGDIHLLQLAPGEFLFVAIKVAGYSGLIVSMPYIFYQIILFISPGLTKQEKSLILPAVFGSGLLFFLGLIFSWWILVPAAINFFISFGADIVEPTWSIERYFDFVLLLMSSTAIAFQLPVLQFILGSLGIITTEKMISNWKVVVISSAILSAVITPSTDPLTMSLLSISIVFLFFVGTGLTYLSENLKSKTLSSSH
>NC_009091|427344:432676|431605_432676_+|WP_011862491.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MHKVLAIETSCDETSVSIVSNIGDTFRIHSNIIASQIEDHSKWGGVVPELAARKHLELLPFVLEKALEQAKIKIEEVDYIASTVAPGLVGCLRVGSITARSLCMLHSKPFLGIHHLEGHLSSILFSENYPKKSFLTLLVSGGHTELIKVDDNRGMQRLGKSFDDAAGEAFDKVGRLLGLGYPGGPAIEKIAKNGDPMKFNLPKCRISDKKGGFLKYDFSFSGLKTAVLRLVERINLAGKTVPIPDIAASFERVVAEVLVERTIKCAEDHRLDNVVVVGGVAANNTLRKMMISEASKKSIKVHLAPLDLCTDNAAMIGAAALFRIKFKDHLSNLKLGVAGRLSIEQANTLYEENPPF
>NC_009091|427344:432676|430813_430948_-|WP_011862490.1|DBSCAN-SWA
MFKILNTKFVRSAPVVAAIWLSLTAGIIIEFNRFFPDLLFHPMS
>NC_009091|427344:432676|428180_428441_-|WP_011376025.1|DBSCAN-SWA
MFDFLLGTHEFLGNHSFPEFIVGYLFGAALIIGAPTVFLLLAFVSALMKTNGKMGGYREYETYGESSLNDAPPFLLPDPTNPKLSK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011862487.1|427344_428103_-	twin-arginine translocase subunit TatC	A0A1B1IVR7	uncultured_Mediterranean_phage	3.5e-11	28.4
WP_011376025.1|428180_428441_-	hypothetical protein	H6WG68	Cyanophage	2.2e-05	46.0
WP_011862488.1|428470_430171_-	DUF814 domain-containing protein	M1HE72	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	6.1e-08	35.6
WP_011862489.1|430244_430799_+	guanylate kinase	A0A0M5KCK5	Mollivirus	2.4e-09	31.0
WP_011862490.1|430813_430948_-	photosystem I reaction center subunit IX	NA	NA	NA	NA
WP_011817979.1|430976_431531_-	photosystem I PsaF protein (subunit III)	B7T4D2	uncultured_virus	1.7e-12	47.4
WP_011862491.1|431605_432676_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	1.4e-63	43.6