Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NC_009257 | Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418, complete sequence | 0 crisprs | csa3,DEDDh,cas4,cas2,cas9 | 0 | 0 | 4 | 0 |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
275502 : 337745
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009257|275502:337745|DBSCAN-SWA 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60 | Erysipelothrix_phage(40.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1211995 : 1221159
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009257|1211995:1221159|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009257|1211995:1221159|1219033_1220077_-|WP_003026527.1|DBSCAN-SWA MAGLKYEDAGVNIEAGNQAVERMKQHVKKTFTQDVLTGLGSFGSLYSLKNIINNYDDPVLVQSIDGVGTKTKVAVMCGKFENLGYDLFSAATNDIVVMGAKPITFLDYVAHDKLDPAIMEELVKGMSKACAECVVSLVGGETAEMPGVYQAGEIDMVGVITGIVDRKRIINGENIKEGDIVFGLSSSGLHTNGYSFARKLFFDVAGNKHTDTYPELEGKTIGDVLLEPHINYTNIIHDFLDNGVDIKGMAHITGGGFIENIPRVLPQGLGAQIDKDSFATPAIFKLMQRIGDISEFEMYRSFNMGIGMTIIASQDQFDKMQELAKKHTNTKLYQIGKITNSGKVEII >NC_009257|1211995:1221159|1214433_1215531_-|WP_003026520.1|DBSCAN-SWA MKIGIIGAGQLARMLSLAGTPLGLEFHCLGKNGDCAEEVVKTVTDIELTKVNDVVAWAKQFDVITFENENISHELIKAINHEVSVYPSAKAIAISQDRLLEKSFMQDHGIATAKFVNIDSLAKLQSAVDDHGLPAILKTRRFGYDGKGQFVIRSQEDITKAWDVLKYAPDGLIYEAFVDFDYEVSQICTADLKGNIAFYPLARNTHKQGIIVESEAPFENVVLAEKAQQIAKILVKEFAYVGTLAIEFFVKGDELIVNEIAPRVHNSGHWSIDGAVTSQFENHVRAIAGLILGDTTSRKTVMLNCIGGMPATKDLAALDRVKIHSYNKEPRKGRKVGHLNLNLNDETDEYQLLQVKKLIALSEEI >NC_009257|1211995:1221159|1215534_1216026_-|WP_003026522.1|DBSCAN-SWA MSVQVGVIMGSKSDWSTMKECCDILDNLGIGYECEVVSAHRTPDKMFDYAETAKERGLKVIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVLGVPVKSSTLNGQDSLLSIVQMPAGIPVATFAIGMAGAKNAALFAVSILQHTDINIAKALAEFRAEQTRFVLENPDPREH >NC_009257|1211995:1221159|1216721_1219034_-|WP_003026526.1|DBSCAN-SWA MLDKQIIANNIKNVLKSTNLDIKNKYIGKVRDMYFTDDKSILISTDRQSAFDRSLGFIPFKGQILAQSSVWWFKETAHIVKNHFIDSPDPNVVIARKAKVLPIEFVVRGYITGSTSTSLWTHYKNGSRDYCGNILPEGLKKNQKLPQNILTPTTKEQDHDRPISAEDIVKEGWLTQQQWDFASQKALELFEFGQKKALEHGLILADTKYEFGIDEQTGEIILIDEIHTPDSSRFWLKDSYATRFENGEEPENIDKEFFRLWFAKNCDPYNDEVLPQAPQELVVELSQKYIALFEMITGQKFEVPRDLENINQRIVKNVTDYLNMEKPVNILLVGSGSREHAIAEAVKRSSIANKLFCISTAINPAIDKITQGYQIADICNCDEVLEYAKSQSIDIAIIGPEAPLEAGLADALKTAAIGVVGPTKKLAQLETSKGFTRDLIRDYDIGANPFFRKFNSMDGVEETLKKYQNQFVIKADGLCGGKGVLVWGDHLHSLDEAIRHCQSLVDAGKEFVIEEKLVGQEFSLISFTDGKNFIHMPAVQDHKRAHEGDKGPNTGGMGTYSDANHSLPFLSAADIERAKQINEKVVRALADKFGEPYQGILYGGFMATKDDTKVIEYNARFGDPEAMNLLTLLETDFVEIAQAITQGKLDTVKAKFKNQASVCKYLVPLGYPNQSVKNFEIDISQCPDNVELFLGAVDYKDGKLIGTGSRAIAVLGLGDTIAEAEQKAENAVKNIYGKLFHRPDIGTKELINKRIKHMNLLRGDKYQELK >NC_009257|1211995:1221159|1216142_1216718_-|WP_003026524.1|DBSCAN-SWA MSKLNLVILGSTRGTNMQAIIDAIANKQLNAQVSLVISNKSDAYILQRAADYNIPTKYIAAKGLTREQYDELVVAEIQKYNPDLILLIGFMRILSSVFIKAFEGKILNIHPSLLPKHRGLMDLAVHQSVIDAGDSISGCTIHQVSEEVDGGDIVLQLKCDVVKEDTADSLKEKVQALESKAWIEVIKNWDK >NC_009257|1211995:1221159|1220310_1221159_-|WP_003020886.1|DBSCAN-SWA MILIDGKSLSKDLKERLATQVQEYKHHTAITPKLVAIIVGNDPASKTYVASKEKACAQVGIDSQVITLPEHTTESELLELIDQLNNDSSVHAILVQLPLPAHINKNNVIYSIKPEKDVDGFHPTNVGRLQLRDKKCLESCTPKGIMTMLREYGIKTEGAYAVVVGASNVVGKPVSQLLLNAKATVTTCHRFTTDLKSHTTKADILIVAVGKPNFITADMVKEGAVVIDVGINHVDGKIVGDVDFAAVKDKVAAITPVPGGVGPMTITELLYNTFQCAQELNR >NC_009257|1211995:1221159|1214083_1214437_+|WP_003026519.1|DBSCAN-SWA MQTIEIGNKAELQACKFLHTQALEILAHNFKALPYGEIDIIALDKDTLVFIEVKYRSKTKFAQAEEMLTYSKQQKLVNSASIYLQHNPQYQDYQCRFDLIAINESNINWIKNAFGVI >NC_009257|1211995:1221159|1211995_1214017_+|WP_003026518.1|DBSCAN-SWA MNSIIEDSKLPKLAEFKVDEVKPAIDKLFSLAQSNLENALQTQNPNWQTLLKLEEDDEKISQAFSTISHMNAVCNSKELRESYEYAIAKLTDYYTKLGQNKDLYNLYKQIQKDNLTNEQAQAVRKAIIGFEQSGVNLDEAKRKRLQQISQELAQLSTKFENNVLDATMDWLYTTDDEKELKGLSQHTIESAKAKANQKNIAEKYALGIDIPTYLAVMQQADNRKLREKFYKAYCTKASKEADNKNFVNDENIEKILKLRIEKSQILGFDNYAENSLFTKMAETPEQVLELLNKLLEKSLPQAKKELNELRRFAEDAGLVDALQPWDSAYYSEKLKKAKFDFTEEELREYFPLEKVQDGLFKILKQIYNLDVKENTQYTKYVPEQQTFDFFKNDQYVGSIICDFFARDNKRGGAWMDDSRTAFTTSSGSKQNPVAYVNCNFLPPSKDGANLTHNDVVTLFHEFGHALHHILSQVTIPSISGTNGVEWDAIELPSQFMENFCWCQEGLAVISGSRDGKVLSSKQIDKLVGTRHFHSALMMVRQLEFGIFDMNIHYKKLTSATEVQKELDSIREKINLIKTPSYNKFQNGFSHIFAGGYAAGYYSYKWAEILSSDVFSRFEQEGILSHKVGNELLENIISKGSSRDAMDNFVAFMGRKPNEDALLRHSGINYKIYI |
8 | Klosneuvirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1608990 : 1640671
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009257|1608990:1640671|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009257|1608990:1640671|1618906_1619329_-|WP_003020029.1|DBSCAN-SWA MTKQRTLSIIKPDAVEKNVIGEIYSRFEKAGLRIIAAKMKHLSKAEAERFYAVHKDRPFFSALVEFMISGPVMIQVLEGENAIAKNRELMGATNPKEAKAGTIRADFADSIDANAVHGSDAEDTAAQEIRYFFSDTEIFG >NC_009257|1608990:1640671|1616378_1616789_-|WP_003020035.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKSILVNDEEQMYQLAKEYSQQLKPGQIIYLYGDLGAGKTTFVKGILNALGYTGNVKSPTYTLVESYEFDKFDIYHFDLYRLADPEELEWIGARDYFNQKDICFIEWPEKGKGFLPLNTTKVHIKYLAQGRQVDFY >NC_009257|1608990:1640671|1639790_1640671_-|WP_011886459.1|transposase|DBSCAN-SWA MPSYSQYFRDIVINKYEEGMTEFELSKFFNIDKRTVVSWIEFYKRTGDYSSKQGVGCGRVASFTDKTLIEQYLIDHPDASALDIKEALAPDIPRSTFYDCLNRLGFSFKKKTPKYKQRKEHERLEYIEKLKEIAQNLLFYIDEMGCDNKLSILRGWSLIGEPSYGEVLAYQTQRRSIVAGYNYADKKIIAPLEYSGYTNTEIFNQWFEEHLCPSLKPKTTIVMDNASFHKSSKLIEIANKFDVQILYLPPYSPDLNPIEKVWANFKKIFRKVNNSFEKFCDAISYVFNKILSD >NC_009257|1608990:1640671|1622213_1622864_+|WP_187145844.1|DBSCAN-SWA 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29 | Powai_lake_megavirus(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1817931 : 1826703
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009257|1817931:1826703|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009257|1817931:1826703|1826088_1826703_+|WP_003022621.1|DBSCAN-SWA MSEYSLFVMLCVIAAISSYFNLRFLKLPKAIGLTVVSALISLMLVVLIKLEPKLFYPAYHMLNSIDFKILVLKVLLGYLLFAAAMHLNFLEIKNFLASIFVLSSLGVVVSTFIIGTLCWLAAPIVIKHDVSYIYCLIVGAIFSPTDPVTVFAVFKTSKSVPMRVKSILSGEAMFNDVFSIVIFLILLSLVISGKSDIVNPRVFC >NC_009257|1817931:1826703|1824630_1825698_-|WP_003022623.1|DBSCAN-SWA MKNIDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIIVKNGAIISEGWHETVGEAHAEVHALTKAVDKAKGATAYVTLEPCCHCGRTPPCTDTIIKAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVERLKNAGITVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQTTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNDGDSKKISSHQAFVNTHELRNICDAILIGKQTLIDDNPSLDVRININKIKHPTRFILANHLTTINHNWRVLDQRHAKTIFVCSKISARVATKLNQLGIEYWLLPQSQHQVCLDTLLEKMGKIGITSLLVEGGNKTLNSFINQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQISVREDIIINSCFKENSNV >NC_009257|1817931:1826703|1821854_1822373_-|WP_003014032.1|DBSCAN-SWA MSLEILKYPHPVLKEVAKEVTKDEINDDLRATIAEMHELMLEANGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEQNGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATVVKIKALNEFGEEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENAKS >NC_009257|1817931:1826703|1822828_1824040_-|WP_003017616.1|DBSCAN-SWA MFEQIKNNVENAIEALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGQKATEENIAFMLEHTSGIICLAMDSKKARELNLTPMVAADQNNSTFTTPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKADAKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAAELEAFAKKHDLPLLTIAELYQYRLATEIFVTKMASSTIPFKKIGELEMSVYKDNFSGDEVVVLSKPYSGNNPLVRMHSSCITGDIFGSLRCDCQDQLHKGIEMISEEGGFFIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMNENMDTLEANLALGLPADARKYDLAIQVLKYNNVNRCRLISNNPEKLAALRNVDIETQPVYCEAFVNSHNRNYLITKKIKAKHTIKGI >NC_009257|1817931:1826703|1824032_1824638_-|WP_003022624.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITTKDSLKTFCIKFDNSLQCSIGDSVAINGTCLTVTKLDKQNLTANFDAVPETLKKTNLDTLKENQLVNIELAMRYGDHIGGHMVQGHIDEPGQIKSIQNVGGAWLIEISASREFLKYLVKKGFVTIDGMSITVINVLKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYSNGSMVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV >NC_009257|1817931:1826703|1817931_1819716_+|WP_003027483.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPSAEPDRVAQEIEKIIGIDATGATTCSAKIGIGVEDVLETIVAKVPAPEGDVNAKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRVKNGTIKKGEKFKVMSTGVAYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNLSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICIEKRGVQVDLNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPANMVCLDVLINGDKVDALASIVHKDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGGTIVARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK >NC_009257|1817931:1826703|1820828_1821773_-|WP_003027490.1|DBSCAN-SWA MEFSMRNIFKKTLLILLLSVIIASCGMLSNDQFVYLGHGENSPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKDDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDVRLAKDDYGNYAIEELRKAGVTTVNKPIKTKKVFATPVKQIVLDRKQQYHLVRKEYEIDSNLVAMVVNDKEGKKRIKVAYTVDFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDAVHEAQFMQRDVMKSQTNVKKKVDDYLKDVVDSDKKDTGYTHQEVASSVAALDNDLITKADEQREDKETTLASGSSTIQTATKTASTTQVDSNDTPKTTLASDNK >NC_009257|1817931:1826703|1819729_1820809_+|WP_003027486.1|tRNA|DBSCAN-SWA MENKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFAAEYWDNVFEHFLIKYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLSYVHLLGGDYIATGHYAQTRLAADGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGNIEKSKVREIAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPLLFKQSLQAIELSWVAGMAPADKFRCAAKVRYRQKDQSCEVEVNQDGSVNVTFDQPQRAITPGQSVVFYIDDVCLGGGVII >NC_009257|1817931:1826703|1822375_1822819_-|WP_003017614.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVPGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSIQAAITMAKMKKDILEQGV |
9 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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