Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009253 | Desulfotomaculum reducens MI-1, complete genome | 5 crisprs | cas3,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas4,cas1,cas2,csa3,c2c10_CAS-V-U3,cas8c,cas7,RT,WYL,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csx1,DinG,DEDDh | 1 | 13 | 9 | 1 |
1. NC_009253
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_009253_1 | 586379-587743 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NC_009253_1
|
20 spacers
spacers of NC_009253_1
>1.1|586409|37|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTATTTTTAGGAAGCAGGGATCAAAGCACAAAAGA >1.2|586476|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCTATCCTTGGCAGTATCGTTTTCTGGAGGTACTGT >1.3|586544|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTTTCAAGGCTTGGTTGCAATTTTCCGGTTTC >1.4|586609|39|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAATTACGAAAACGTATTAGTTACCGAGGAAAATATTG >1.5|586678|36|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATCAAGATGCTTTAAAACTAGGCGTTAAATTTG >1.6|586744|37|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCAC >1.7|586811|37|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACCATGCCGGGGCTAGGTTTACAAAGATTAGCATAC >1.8|586878|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACCAATAAATGTATATTATATAATTTGAATATAG >1.9|586946|36|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTGAGTCTGCTGCACTCAATTTTCGGAGGGTATA >1.10|587012|37|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder CTACATAATATATAAATTATGTAGCGAGTTATCAGCC >1.11|587079|36|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCA >1.12|587145|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAGATAAAAATAATAGTATCATTTAATCAGGG >1.13|587210|37|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCCCGTCCGGTAGAAGAACCAGCAGGCAAACATCC >1.14|587277|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACTTTTATGCAGTCGATGTTTTCTTCGGTGACACGG >1.15|587345|40|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAATATTAGGGATTGCAATATACAAGTTTGGTCTTCTCC >1.16|587415|37|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTGCCTACCCTGTTATGTAGAGTAAGCACTAAAAA >1.17|587482|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATTTTTTGGTTGGTGTTTGTCATTGTTATGCAC >1.18|587547|36|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAATATTGCATACGAATTTCTTCATGGTATCATCC >1.19|587613|36|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATATCCAAAAAGCTTTAGAAAAACGGCTAGAGA >1.20|587679|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGCAAGTACGCTTTAAATTCCGGTGAGAAGATC >1.21|587012|27|NC_009253|CRT CTACATAATATATAAATTATGTAGCGA >1.22|587069|46|NC_009253|CRT GAATTGAAACGTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCA |
cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009253_1
The CRISPR arrays of NC_009253_1 >merge|NC_009253|1|586379-587743|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCGTATTTTTAGGAAGCAGGGATCAAAGCACAAAAGAGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCCCTATCCTTGGCAGTATCGTTTTCTGGAGGTACTGTGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTGTTTCAAGGCTTGGTTGCAATTTTCCGGTTTCGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACAATTACGAAAACGTATTAGTTACCGAGGAAAATATTGGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAATATCAAGATGCTTTAAAACTAGGCGTTAAATTTGGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCACGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCACCATGCCGGGGCTAGGTTTACAAAGATTAGCATACGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTTACCAATAAATGTATATTATATAATTTGAATATAGGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTTGAGTCTGCTGCACTCAATTTTCGGAGGGTATAGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTACATAATATATAAATTATGTAGCGAGTTATCAGCCGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCAGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCAAAAGATAAAAATAATAGTATCATTTAATCAGGGGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGCCCGTCCGGTAGAAGAACCAGCAGGCAAACATCCGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATACTTTTATGCAGTCGATGTTTTCTTCGGTGACACGGGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAATATTAGGGATTGCAATATACAAGTTTGGTCTTCTCCGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGTGCCTACCCTGTTATGTAGAGTAAGCACTAAAAAGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTATTTTTTGGTTGGTGTTTGTCATTGTTATGCACGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTAATATTGCATACGAATTTCTTCATGGTATCATCCGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGAAATATCCAAAAAGCTTTAGAAAAACGGCTAGAGAGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGGCAAGTACGCTTTAAATTCCGGTGAGAAGATCGTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_009253|1|1|586379-587743|PILER-CR GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGTATTTTTAGGAAGCAGGGATCAAAGCACAAAAGA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCCCTATCCTTGGCAGTATCGTTTTCTGGAGGTACTGT GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTGTTTCAAGGCTTGGTTGCAATTTTCCGGTTTC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAATTACGAAAACGTATTAGTTACCGAGGAAAATATTG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATATCAAGATGCTTTAAAACTAGGCGTTAAATTTG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCAC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CACCATGCCGGGGCTAGGTTTACAAAGATTAGCATAC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTTACCAATAAATGTATATTATATAATTTGAATATAG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTTGAGTCTGCTGCACTCAATTTTCGGAGGGTATA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTACATAATATATAAATTATGTAGCGAGTTATCAGCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAAAGATAAAAATAATAGTATCATTTAATCAGGG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCCCGTCCGGTAGAAGAACCAGCAGGCAAACATCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATACTTTTATGCAGTCGATGTTTTCTTCGGTGACACGG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAATATTAGGGATTGCAATATACAAGTTTGGTCTTCTCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGTGCCTACCCTGTTATGTAGAGTAAGCACTAAAAA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTATTTTTTGGTTGGTGTTTGTCATTGTTATGCAC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTAATATTGCATACGAATTTCTTCATGGTATCATCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAAATATCCAAAAAGCTTTAGAAAAACGGCTAGAGA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGGCAAGTACGCTTTAAATTCCGGTGAGAAGATC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_009253|1|1|586379-587743|CRISPRCasFinder GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGTATTTTTAGGAAGCAGGGATCAAAGCACAAAAGA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCCCTATCCTTGGCAGTATCGTTTTCTGGAGGTACTGT GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTGTTTCAAGGCTTGGTTGCAATTTTCCGGTTTC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAATTACGAAAACGTATTAGTTACCGAGGAAAATATTG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATATCAAGATGCTTTAAAACTAGGCGTTAAATTTG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCAC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CACCATGCCGGGGCTAGGTTTACAAAGATTAGCATAC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTTACCAATAAATGTATATTATATAATTTGAATATAG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTTGAGTCTGCTGCACTCAATTTTCGGAGGGTATA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTACATAATATATAAATTATGTAGCGAGTTATCAGCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAAAGATAAAAATAATAGTATCATTTAATCAGGG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCCCGTCCGGTAGAAGAACCAGCAGGCAAACATCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATACTTTTATGCAGTCGATGTTTTCTTCGGTGACACGG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAATATTAGGGATTGCAATATACAAGTTTGGTCTTCTCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGTGCCTACCCTGTTATGTAGAGTAAGCACTAAAAA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTATTTTTTGGTTGGTGTTTGTCATTGTTATGCAC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTAATATTGCATACGAATTTCTTCATGGTATCATCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAAATATCCAAAAAGCTTTAGAAAAACGGCTAGAGA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGGCAAGTACGCTTTAAATTCCGGTGAGAAGATC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_009253|1|1|586379-587743|CRT GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGTATTTTTAGGAAGCAGGGATCAAAGCACAAAAGA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCCCTATCCTTGGCAGTATCGTTTTCTGGAGGTACTGT GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTGTTTCAAGGCTTGGTTGCAATTTTCCGGTTTC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAATTACGAAAACGTATTAGTTACCGAGGAAAATATTG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATATCAAGATGCTTTAAAACTAGGCGTTAAATTTG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCAC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CACCATGCCGGGGCTAGGTTTACAAAGATTAGCATAC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTTACCAATAAATGTATATTATATAATTTGAATATAG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTTGAGTCTGCTGCACTCAATTTTCGGAGGGTATA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTACATAATATATAAATTATGTAGCGA GTTATCAGCCGTTATCAGCCTACCTATAAG GAATTGAAACGTTTTTTGTTCCAATTGTGCCCCAAAACTTGGGGCA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAAAGATAAAAATAATAGTATCATTTAATCAGGG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCCCGTCCGGTAGAAGAACCAGCAGGCAAACATCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATACTTTTATGCAGTCGATGTTTTCTTCGGTGACACGG GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAATATTAGGGATTGCAATATACAAGTTTGGTCTTCTCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGTGCCTACCCTGTTATGTAGAGTAAGCACTAAAAA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTATTTTTTGGTTGGTGTTTGTCATTGTTATGCAC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTAATATTGCATACGAATTTCTTCATGGTATCATCC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAAATATCCAAAAAGCTTTAGAAAAACGGCTAGAGA GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGGCAAGTACGCTTTAAATTCCGGTGAGAAGATC GTTATCAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
>NC_009253.1|WP_011876920.1|583829_586181_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEQLKSHPHLFLHQHIEQVNQATKAIRDWHTTDTITNDIKLLLGHLAKYHDLGKGTPAFQEYIENPEGYQGDPQEKAHSTLSLLLTLAIARQQSWEELHTLVIAAAVAGHHSRLPTIPEKKIGGVCCPQWDIDGFAGGEKASLLKRQLASIDFPALEQETKVEFGSYGLAQALQSDPAKSLREMKRFLITRIYGIFASLSLEEALRLRMKAQLLYSVLLEADKALLAVSSPEVYLNREVRHWQSRWVEDKIGKPPETSINQLRQRARQGVIAALEAKNTNLYSLTAPTGCGKTMLAATWALKLRERVTEGQAPPKIIIVLPFLSVIDQTAREYARLLSHSGQETDGRWLIQSHSLADRHYARGLEDEDGRFFIDTWRSEIIITTYDQFLMSLLDPRAKYQMRFHNLCDAMIIMDEVQALPCKLWQTLEKVFQALASEGNSRLLLMSATLPPFMKEALPLLPDYQGYFTLFNRYTLQLRLQESQTLDNFCEEMSDRLIGWLECSNRILITLNTRHSARRVRDFLSQSWPAEYGDVPLFFISADVTPKDRLEIVKQIKQGKPCVVVSTQCIEAGVDIDMDRVIRDFGPLDSIIQIAGRCNREGLRAQGVVEVVDLINEQDKRYSEMIYDTTHLQITRKILADKQEIQEKEIITLSTQYFKDLTEQKDTGYNHLIRFAKWQEDTPVKELLRGKERLQIDFLVLEQDAELRDEMQIVGRIKDRWERREAWRKLSGRIALVSVSIFAQPGFHPEQIADEFMGSWWVVREGYYNSKQGLLIEGETMIL >NC_009253.1|WP_011876919.1|583104_583833_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 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MIEAMRTLALDYLVQELAGYPVPQDPEQWYQEFRKNSPGRMFPYLVEDSGRIEKVYLLEEKATGVVELTVQDMIHEPGGSRVGCTQDKLPFIKPPGSQSPQMGPVIKRSYQSGKSGPSAKILNTTMKSFAEIASDNKPWSSYFKQIVEILSAPRLKLVDHSTVDWQQEGYANLLDCVVQRIGPEKNTVFLAVKDRNGRLPGEVSEYIDYLLGEKLAGERYVTSEARAQEDGECPLCNATKVTVFPNALKGAGINFKNTDRIGVFPGVNPAQAWKGYALCGACADLLYVYKHHVIKKGGPNKDRQFFGSKIAGDSALVIPVFFPGLAAEVRQELLSDVTDYINNMNSNVTQDEESLLDILKDEKSILSLIFLWADVGQNLENVTGMIHSVLPSRLRELSLLNEASRNWHHPLFPNVPLAIETADFRPDLSLRALKVLFYRPGGKKAKDINASKQLFQVKKQLAACVYHRTPVLLERFWQETITTARWHWLEASQKKDGYTGLLYEGTGKNGSYLTPAGWIKHVNWWLYYFKQVGVMEMEKQFYKPAMAELQPYFGSQSGIDTPEKAYAFLLGVLYGRLLMIQGGKGVNVGANALTWLKRLTLKGKDLPELYTKIRSKILAYEAEKSQAVRELITEISTLGIALGDNIKLSEVQTNYYLLLGQAMTTVILSKKTEKENEA >NC_009253.1|WP_011876916.1|579303_580062_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 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MFTQFFGLKFNPFSKEVPADKLFISQDLLELESRLKYLQSTRGIGLVAGEPGAGKSTALRKFVNELNPALYKHCYFSLATVTVLEFYQGLALELGEQPKHKKVAIFRQIQGAINSMYYERRITPVIILDEIHLASNKLLEDLRLIFNFKMDSQNPFILVLAGQPLIRSKLSLNINNPLRQRLVVKHIMQGLKPEEIRDYCTSRLKQAGLIEEIFTDSAIDAIYATTKGLPRLINNLVTNCLLYAYYKKLRQIDEEVVYQAQNELNI >NC_009253.1|WP_041274407.1|573772_574354_+|hypothetical-protein MQLIFDSKTTPKQYYQCGYEYSFPKPYTCLHPDCKIPVPPRPHGYYIRNVITLGFNGRILIRRYYCKYCGHTFSYLPSFCLPYFQYSLVTIFLALLWHYLNLIPLLKVLTSRLQWQRQHLQFYRRRFKANLKFIKAVLRQMMPQVILPKEDDIKKEARKVLIIVKTGFGQIQAFSTRFFTQSNNTFMASRKLA >NC_009253.1|WP_011876910.1|569452_571669_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSDDFDLKGYRENKLKITQAELASWLGVTQDYISKIENGNISVGLDFLLKFCNAVGDTPDGVLNFKLNNPGPLEIGDVYKEIKLKKKMLDLHVQPRIEKFNYDENNYGTALTKIDELYDIINIYGSKPLVAFLGPSDAGKSRLINILTGLDVLLAQWTPTTAATVYLKHIEDKPKWMGSDDVWVFKAESEEKGWDFRRYYDPDYCNQYKVFSGGLEILTKYCNRHTENLYKQVDSAVVYLESEILKACDIVDLPGFGTDNHRDTAQAQRAREKADVVVFLCQSNGFLNHENDLIFLKNVIQCLPPVNLSTNLPVLSNLMIVASQAHIVGESQVENLFRRGYTALDNQLNEGVIRSVFKISKPEFLSQLKNRFFSYSIESTNLRKDFVAELKRLLEEVLPVLRNKLLNNAIQEFINNTGELFADETKKFQLALNERETTKKIYEKKLQGKPRLYAQIQDGREKIIDLIEYLKKEDCQKLKTWEEKNITVKTIEKIIEDKKYTKKQAQQYLASNITDLYFVELQNIVSRSSEVFARESKKLFADIEKTSNEFNKLPMGQVDIPFDFKGAMAGGLAGATVLGGLSVMAASMGNLGGYILVAKGVSVLSAMGVSVGGTAAAASAVAALGGPITIGLALAATAYVLIQAFFGESWKTRLAKQVKEALTKEKVLENYSNEVVKFWDETKTAFLSLVDTIINKYEEHLLDLKVIIETYNEVELRDKVRKSWEMKHFFEEIPWDQS >NC_009253.1|WP_011876909.1|568330_569428_-|HNH-endonuclease MFESTAKNILSGISDTTKKVVNEAVDFIEEATRENKLTGAVREVGTSVIDVTNNTLHKVVEVADGSMDVVKGVVQGDDFTRDDGFCKIKDAVTETTEKIGSGIMLTFEAGGKTIKGLVESGSAALNGGDVQVGLDKAIDGATQITKTLAVGGLALGALDVLDLPTDDIDGFQEEAELPGGDASDIGIEQMADSKDVPHITHIVSDWSNPINTPHLFSVQDAEAADFAQEPISIDNLIAMPADPDGLTVELDYEPGEGLLPEVSVDEIEGVENGMASDEAFDQLIDIGCVEDTTHIEDPPRSDAAVRSFLNKYGYEQTPEGYEVHHIIPLSEGGADSPDNMVLVTEEMHDDITAAQRDYYGWGRDN >NC_009253.1|WP_156779711.1|587836_588331_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MVPVTGTLIWYYYICQREVWLIGHQITPDQSDSNISLGRYIHENSYDRERKELVIGHSKMDVFRVSNGELVVGEVKKSSKYSQSARMQLAFYLMELQDRGIKARGELRFPQEKKLEEVVLDENILEELGRASQAITQILSLQRPPEPKKINFCKNCAYAEFCWA >NC_009253.1|WP_011876922.1|588349_589342_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELHRKDNTLCFEKEKEKRYIPIEDTGEIMAFGEININKRLLEFLSQKEILLHYFNHYGYYMGTFYPREHLNSGFMILKQAEHYMDQTLRLKIAIEYIRGGGKNIRQVLKYYQGRGRYVGDKLEAIEKLLLDIDQQQDIPSLMAVEGNIRSWYYKGFDDIICDTNFVFEERSRRPPKNFLNTLISFGNSIMYSICLSEIYKTHLDPRIGYLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPILIDRTIFSLLARKMITAKDFDRDANGVLLKEKGKKCFIHALEEKLKTTINHRDLGRPVSYRRLIRLELYKLEKHLMGEKTYTPFIARW >NC_009253.1|WP_011876923.1|589366_589630_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVILVYDVNQKRVAKVLKRCRQYLTWVQNSVLEGEISDVNLKKLKMELQKIINKEEDSVIFYTMRTTNYSSRELIGLQKNEEGNII >NC_009253.1|WP_011876924.1|590920_591463_+|NYN-domain-containing-protein MKRVMVFIDGNNFEKAVTNLYSGSQQRIDYSKLANYLAGKRNGNLQRLYYYTAASNNDKQKAASTKNFVDTLNKQVPNCIAKIGYLQVVGKDASGQDIYTEKGTDVNIAVDLVSLAFFNAYDEAILLSADTDYEPAVNMVRQFGKTVVLGIVDRQKAGYLKGLCDDHISLQIADLDQVKR >NC_009253.1|WP_156779570.1|591633_591831_+|hypothetical-protein MPPIFFCNHGDGAGAVKGGVQCSVREWSRPATDQDLYDVATAINSLQNNALVGVFRADDSELINE >NC_009253.1|WP_011876925.1|591880_592099_+|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELIFVNVAGDKVTLRVTDPRDDLQEAEVRTVMDTVVAKNVFTSSGGSLTGVAGARLVTRDVSELNIL >NC_009253.1|WP_011876926.1|592245_592446_+|DUF882-domain-containing-protein MGGVADSYHIKGMAADIRVPGLVVAELGRLAEQAGFEGIGTYPTQVFVHVDIRYNSARWEAQPVKR >NC_009253.1|WP_011876927.1|592708_592948_+|thioredoxin-family-protein MEIKVLGTGCQKCKEVEKLVREVLAEINVPANVEKVEDIAQIVQYGVMLTPGLVINGKVKVSGRVPNKADIKKLIEEEK >NC_009253.1|WP_011876928.1|592971_593232_+|hypothetical-protein MGANLDAKTLALIGVGASVGANCFPCLEQKVTEALKAGASVEEIAQAVQLGEEAKMQPNQGIKALAEMLLQNAQSLLDRGSAGGCG >NC_009253.1|WP_011876929.1|593434_594391_+|permease MFDWLDYLMQLLVTNVFGLSMQSRTGASVHFFFYDTIKIIILLGVMIFAISYIRSYFPPERTKRILTRFSGITGNIMASLLGSVTPFCSCSSVPLFIGFVEAGIPLGVTFSFLITSPIVNEAAFAILIGSFGVKIAAIYIVAGTILGVLGGLVIGKMKMEDQIEEYVKQIKMGETEIQELTTQDRIAFAKGQVVDIVKRVWLYILIGVGIGAFIHGYAPAELLAKYAGPQNPFAVIVAVILGVPLYSNALGTIPIAEALINKGVGFGTAMAFMMATTALSLPEMIILRKVIKPRLIASFVVVTSIGIIIIGYLFNFLV |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_009253_2 | 1079904-1083390 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NC_009253_2
|
52 spacers
spacers of NC_009253_2
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cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009253_2
The CRISPR arrays of NC_009253_2 >merge|NC_009253|2|1079904-1083390|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACGCATTAATTACCCCCCTTTGTCCAAACTGTGATACGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAATAATAGCCCTGGTTACCTAGAAGCAATAAGGCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACACCGCCTCATTGTCAGTGGTTATTATGCAATGTAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACGTTAATGGCATGGTTCTATGCTGGCCTACAGGGGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAGAAGATAATTTGTTCAATATGCTTGCTGATAAAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTATCTATAGAATTTTTAATATGTTCTTTTAACTGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATTTAGTAAACCATTTTCAAGAATATATAAAGCAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACACTTTGGATTGCTTTGAATTGCTAGGTTTTTTGAAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTCCATTGTTCTATTTCTGTATCCTGGAAAATTTGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTCCATTGTTCTATTTCTGTATCCTGGAAAATTTGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAGTAAACACTAAGACAAACAAAGTATATTATATGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACACATACAATCACACCACAGACAAATTTAAAACGCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTGCGGCAAGAAGTGCCTTTTCAACTGCATTATCAAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACGGAAAGAGGGCATTAATGAGCCGGTCGAAGTCCCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACGTTAATGAACCTGAACTCGAAAATTGGGACGGTAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAAAAATTACCGGACAGACAACAGATTAAATACGGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTGAAGTTGATGCGTTATCAAGTTGCTGCTTTGATAAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTAGCTCCGTTCATGTCGTACCATTTATTGTTGTGGTATGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTAGCTACAATTTTAAGCATCATCTTCCTGTGTTCAATGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTCATTGATGCCGTCACCTCTGACATAATGCAACGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTGAGAAAAAAGGTTACCTTAAAAAAATGATACCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTGTACTTCGGCAGGGCATACATTACCCCTTCCTCTGGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATTTTTGTAGCGACAATAATAATCAATTATCAGAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATACCGGCCCTGGGTGTCAGGAGAAGCGGGAAGAGATGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAATGGTACTGCTACTATTTGGTAGGTAGCACTCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAATAATTGCTATGCCTGAGTAAATTCCATGTACGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTTCGTAACCAGACCGGGCATATCCGGTCTGGTTAAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTGCTTGTGACATTGTTCTTATCCTCCGTAGTTCGTCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATTTTGTTCTTTTGTTGTAATCTCCTGTACTTTTGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTTTTTCCAAACGCTTTAATTCTACTTCCGCCTCCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATTGCACTTTGATATGGTTCTGTAGAATCTTTCATGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATCTAAAAGTGATTGTTACTATATTTTATCTGCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAAATTTTACTATATCACCTTTAAATTCTCCTGTGCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTGAAGAAGATGGATTATGTGTGATTAGACAAGATAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACCATGTGAAATACATTATGGACTTACATATGAAGATGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACCGAAAGAGCATTGGAAATACATTGAATTAGGGTAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACACGTAACTAAAGTTTTTACCATACCATTATTTCACGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTGATTCGCTCAATACATGACATAACTGCACATGACGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAATTAGATCCGGAGGAAATACCGCAAAGTGCGCACCCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAGCTTTCATTAAATCTTTAATACTAGGCTCTATGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATATTCGGTTTGATCTAGTTCTGTTGCTATGTCGTCGCCCCACACGCAGGGGCGTGGATTGAAACCTCGAAAAAGTCTTAATTCTACGGTGTTGCGATTGGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATCGACTTCAAGCTCAACGCCTAAAAATATATTTGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATTGTCATAGCATAATTCATTGCAGTGACTACATGGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTTATCTGTGAATACTGTCAAGAAATTACTTTAGTGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTTCTTCCAACAGGATATTATTCCATTGCTTATCTTTAGGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATTATGTACTATAGTAATTTGCCCTCTTTGGCTCCCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACACTATAACAGATAACAGTCATAACCTACATAACAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACCCTAGACTGCAATACTATACATACCACTTGACAGGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACTGATTACTATTATCAACGAGTAAAAAATTTACGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACGGTGATGGTGCTATCTTCGTTTGTGACTATGTGATGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACATATTCGCCCGCGATACCGGCCCCTTTCACTGTAGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC 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GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TCCATTGTTCTATTTCTGTATCCTGGAAAATTT GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC AGTAAACACTAAGACAAACAAAGTATATTATAT GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC ACATACAATCACACCACAGACAAATTTAAAACGC GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TGCGGCAAGAAGTGCCTTTTCAACTGCATTATCAA GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC GGAAAGAGGGCATTAATGAGCCGGTCGAAGTCCC GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC GTTAATGAACCTGAACTCGAAAATTGGGACGGTA GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC AAAAATTACCGGACAGACAACAGATTAAATACG GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TGAAGTTGATGCGTTATCAAGTTGCTGCTTTGATAA GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TAGCTCCGTTCATGTCGTACCATTTATTGTTGTGGTAT GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TAGCTACAATTTTAAGCATCATCTTCCTGTGTTCAAT GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TCATTGATGCCGTCACCTCTGACATAATGCAAC GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TGAGAAAAAAGGTTACCTTAAAAAAATGATACC GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TGTACTTCGGCAGGGCATACATTACCCCTTCCTCTG GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC ATTTTTGTAGCGACAATAATAATCAATTATCAGA GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC 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GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC AATTAGATCCGGAGGAAATACCGCAAAGTGCGCACCC GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC AGCTTTCATTAAATCTTTAATACTAGGCTCTAT GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC ATATTCGGTTTGATCTAGTTCTGTTGCTATGTC GTCGCCCCACACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC CTCGAAAAAGTCTTAATTCTACGGTGTTGCGATTG GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC ATCGACTTCAAGCTCAACGCCTAAAAATATATTT GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC ATTGTCATAGCATAATTCATTGCAGTGACTACATG GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TTATCTGTGAATACTGTCAAGAAATTACTTTAGT GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TTCTTCCAACAGGATATTATTCCATTGCTTATCTTTAG GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC ATTATGTACTATAGTAATTTGCCCTCTTTGGCTCCC GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC ACTATAACAGATAACAGTCATAACCTACATAACA GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC CCTAGACTGCAATACTATACATACCACTTGACAG GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC TGATTACTATTATCAACGAGTAAAAAATTTAC GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC GGTGATGGTGCTATCTTCGTTTGTGACTATGTGAT GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC ATATTCGCCCGCGATACCGGCCCCTTTCACTGTA GTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC
>NC_009253.1|WP_041274487.1|1079443_1079734_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMMLITYDVNTTTDAGKKRLRRVAKQCINYGQRVQNSVFECLLDPAQFAELKNTLEEIIDKEKDSLRYYYLGSNWKKRIKHVGAKEIFDPEGTMII >NC_009253.1|WP_011877371.1|1078391_1079423_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKMLNVLYITNPEAYLAKDGENLVVRVQDEEIFRTPIHYLEGIVTFGYMGASPALLGMCVEKGVTVSFLTAHGKHQATVHGTPKGNVLLRRKQYRLADSESESAKLASMFIIGKIANCRTVLRRFMSDYGDKVQIEEVDRVSKIMARNVLRLGKELLLDEVRGIEGESAQMYFSVFDQLIICHKDHFFMKGRNRRPPLDNMNALLSFLYSLLLHETRSALETVGLDPYVGFLHRDRPGRTGLALDLMEEFRPYLVDRLALSLINRRQVTGDGFLKKESGGVIMKENVRKIVIEAWQKRKREEITHPFLEKKIYVGLLPYAQALLLARHLRGDLDRYPPFVWK >NC_009253.1|WP_011877370.1|1077715_1078375_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEKLYEEDDLLALSGIQHFAFCERQWGLIHVESQWVENVKTVEGKNMHKRVDDPYFTETRGDVKIVRSVPLMSKTLGLYGVADVIEIQQHDDNFGIVNYSIVEYKRGKPKADDRDQVQLCAQALCLEEMLAITINYGYLFYGETKHRYRVEFNNCLRTRVQELAQRMHLLFEKGQTPPAVYNKKCKNCSLFDICVPELSKVNKRTQKYLSRVFDDMRIE >NC_009253.1|WP_011877369.1|1076847_1077714_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MFEPIKNRYEFVLFFDVENGNPNGDPDAGNMPRIDAETGLGLVTDVCLKRKIRNYVDIVKNGIEGFDIYVREGSILNNQHMKAYSALDIKPESKKLPKNEEDARRVKAFMCKHFYDIRTFGAVMTTEVNCGQVRGPVQINFARSIDPIVQQEVTITRMAVTSVKDAEKKDREMGRKHIVPYALYRAEGYVSAHLAEKSGFTKEDLELLWQSLTNMFDHDRSAARGKMATRKLIIFEHETALGNASAHSLFDMVEVSRKDLIRPPRAYSDYKVTVNMAALPAGIKLMEK >NC_009253.1|WP_011877368.1|1075040_1076864_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MIINALYQYYGTLLNDQDSGVSRPGFSKAKVGYCLVLSREGQLLDIIDLRVERNKKLVSREMDVPEQVKRASGVAANFLCDNCTYILGLGQKNKQEKRDRIKKCFEAFVQRQEEILQGVEDEGAVALLKFLRGWDIASAVEHPAIIRQLDGLVEGSNLVFKLEGNEGYIHERKTIREAWNRHRNAQVSDIRMQCLVTGEKTGIARLHPSIKGVTGAQPSGASLISFNLNSFTSYRKTQSFNAPVGEEAVFGYTTALNYLLGSEKHRIRIGDTTTVFWAEKSTNGLEEDLLGLLFFPVAEENGKSDKKDDHSLRQATRDPQTVKLLHDIFRRVKEGKAVSQELTGINLNTNFYILGLAPNASRLAVRFWHVDTYGKLIAKIAQHYRDMAMVKNFEKNPYFIPLGMILKETAPLKDSKRIAPLLGGVLMRAILSGTPYPMSLYSSMISRIRADQEVNYVRAAVIKACLVRHERFYNKGNEVELTVALNEQNSNKGYLLGRLFSLLEKAQEDANPGINSSIRDRYFGSASATPGSVFPILLRLAQHHITKAEYGRHTDKRIEDVISSIDGFPAYLTLEEQGQFVLGYYQQRQALYTKTEKKGELNNVRTN >NC_009253.1|WP_011877367.1|1074378_1075044_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MGYGIRLLVWGEFACFTRPEMKVERVSYDVMTPSAARGILESIHWKPSIVWKIDKIHVLNEIRFDNVRRNEVGSKIPTGNVRKAMKGEPTLLCQYASEDRQQRATLLLRNVAYVIVAHFEMTSKAGPQDSPEKHYAIFSRRARQGQCFQQPYFGCREFPAKFRLIEEDEPTPHSLHKGDKDLGWMLLDIDHEDGMNPRFFRATMKDGLIEVPPMERGLTVL >NC_009253.1|WP_011877366.1|1072165_1074361_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNYYAHSDKEKDKNQWHLLRDHLQGTGVTASTFAKSFGGETIAHVAGLLHDLGKYSPEFQKRLEGHSIKVDHSTAGAIEGGKRYGLIGKILAYIIAGHHSGLPDWGSVADETSLEARLKKKLYDYMSFSKEINLPVEKDITMPAIRPIVGAGFSVQFLTRLLYACLVDADFLDTERALNPEKAAARVKKYSLKKLSNNLEQYLNNLCTKASDTAINRKRYKILANCREKAECEPGLFTLTVPTGGGKTLSSLSFALRHAIRYEKERIFYVIPFTSIIEQNAMVFKRVIGEENVLEHHSNFAYPQEDQWEMENDLADKLAQQKLATENWDMPVIATTNVQFFESLFAAKSSRCRKIHNLANSVIIIDEAQMIPTGFLKPCLNAVVELVANYHATIVLCTATQPAINKFLPKEIVPVEIIDNPEELYKAFKRVQVHNIGTVSDVELVEKLVSQDQVLCIVNSKKHARILYEGIRGDGTFHLSTRMCPVHRTKVLEMVKERLKEGQVCRVISTQLIEAGVDIDFPVVYRSMAGIDSIAQSAGRCNREGLREMGQVYVFWPEKHGMPRGWLNRTASLGSMVFKRYEDPLGLEGVKAYFTSLYDVDAAELDKKCIMEDIREQERQLRFPFRTIAEKFKLMNDNTSTIVIPWDKYCQKTLAEAESNLFSGSYARKLQRYGVAVYEKEFRELLEFGALEVVGGRFYVLKEDMFDAYYSQETGLKPFTESMFLNDTLII >NC_009253.1|WP_011877365.1|1070286_1071813_+|cysteine-desulfurase MESAMPANSKLINQKIKFGKLLGLKGAVSSEVLYAAKGNAEYLHNLMISKNKPEFMHYLLKNPVQTNINPTEQEIVNFVEELERKLFHQEQKQSYERRYGIFFELDPKKDSRAEPCKSWAPIKTPDFREVYLDHNATTPVRPEVASVLLNYYSGKYGFGNPSSNTVQGSYAAALVSEARQRIANCLAASPREIIFTGSGSEANNLAIKGIAFKDLDKKGHLITSKVEHPSVLRVMEYLETIGFSVTYLATDKYGQVLPNSVKQAIRKDTLLVSLMAANNEIGTINPLREIGQICRERNILFMVDGIQAFGKIPLNPKEMGISLLSFSGHKIYAPKGIGGLYVEKGISLIPQVHGGGQESGIHSGTENVGSILALGKAAELAHGEMEKERVRFLELRSFFLDGLKEIEPCFILYGSLENRIPNNLSIGFPAVDSGALLRSLNRIGISVSAGSACSSKKFKNSYVLEAIGADTEKYATIRFGFGLQTKEEDVAYLLKYLKQILNLIKETK >NC_009253.1|WP_011877364.1|1067916_1070064_+|hedgehog/intein-hint-domain-containing-protein MGWENCVANIRTTLDRNAKEVNEVNWSAIDQDALDNDTFRNGSPFSLICPSRHCTDFADISPQAHRICRCEDMNGNPIPNCEPKDYLYPYPSQVCLNIDNPSDYSGKRSRACTRQGDSYYQLTCHCCCSCFAYGTKIGTPNGHKKIEKFAVGDLVLAAGIETSAGGIKLNWSPLKVSFSSGTGPDSHQPAMVYIRHGDTGSIIVTPDHLFLMPNGKLKRADRLVPGKDQLVSYEGRPVPVHEVSIGEYEGGVHHIATQKNFTGDLDGHLLLSEGVVSGDFNLQIHATELKEKYFIVDHDSYPQIGTKEYIEQNNELVQGSYLNFQVAGLNESNTAPQPLKYFVHGQKVSYIPETAAKYLSSLQEIDVNDNAEKRSFSEMNMGNAAVNYVLKLFRGFYSNIIFHHDIARLEPNAYAFNQYGKDIVVLSGGLSRIKNLQMEGLAVILSHMVTRLQKSDPLDYNGYTSVAMADYYSPSVLQTVLFDKLYADVLKEGVKQIEDNIFSNIDKKHAAFEEDPYTPTWETRLDSLDAGYAMDFPPEEIGGPVFQGLKLQGAEAFSAVLTQDSFIAGDIDSAVSRQVFEMLKKNKVLDEQGVLSSKFSIDTDLDFLFKEKPKNLKRYLTEGVRYMLMHEHAKIRLTFNLPMSAARVSAVSNYELEPETSIFHAEVDEKDASVLWLAAPLQRDKEYTLTVSNYFTSQDGSTLDPKYNSIKVKLS >NC_009253.1|WP_156779604.1|1059964_1067887_+|hypothetical-protein MNLNTLKLKGMESFQEQNPQFNILDFNFHNEEQLANLKWDGTDKKTLLRNLQAYQRLLRIYPDVNAAQTLQEQGFDSAFKITALSRNQFVKELGPLLGEQGDAKAEKIHSRAENKKNQVMHTWAAAQNITSPHFKAMRVNSINSGVNAFFERMPSYQDIFGSLDYCQCEHCKSIFGPAAYFVDLMRITEKYVNKPNEKTIPPGMKLSDRRPDLTKIKLICENTNGTMPYLRIVNERLEDLVGRTLKERDNLYQTLANQYYPFNLPFQLPLERIRQYLQRLKTELWQIYDAFASSDKNKAAEYLKLSTEEWQLLTSENTNEDKLKEYYGIADLSRLTDAATFCNQTGLTFKQLRDLLYQNLSEEEVEQGIAKQFFINQGLPNYLRIEAAGEKQVIKNLNNTALDRLHRFLRLVRKTGWTYAELDWSLHCVKKGIPALDDSALAGLAGIKELASQLNVSTADACALLFDLKSYGVGIDPANSAAPFDLVFNGAGVKTYRPKYPWNPMYTQDVMQWQVAADDDANRNLAVRMAAAVALSQDHVKLLAQKLFGTEQPVNMTVENLSLLYRHAKLAALLTLPVPQYLKFIALLIDDVCRFTAGSIMETVQTASLLRRSGMNVFDLDYIVNGMNSPFVDTSYREQDVEPWLKTLPALVKSAALPAGEQQSEQEKKIIEQLAIFFGARTEQIQALLSLTGHTALVPIFLDATKKEEAKGIIKDVARHLVLVRKLNLKVQEIESIRQHPASYGIKNPTSLSPYDIIKLIRFKELAASYDDPQDHLTAYMNAANEAEASQEMAALTGQEEGQITILWALFKDANRMDILYKIYRVWELIQQTGTNLSFLQSLNNLAGKGVTGSWDTYVSAADSLITAVKARYTNEVWNKLYEQLEGEEQENKRQALIGLAIHQLSQNEETQWIKNTRNLYEYLLIDVEMSGCAQISYIKEGLNAVQIYLSRCRKQLEPGVEDFSVPEIWWEWMMNYRVWEANRKIFLYPENYIEPAHRNSKTRLFKELENTLKQGDIDNKTVEEAYKKYLDGFAELAKLVYVDAYYCNVSDEKREDAPTLFLFARTQTQPYTYYYIVRESDGTWSEWHKINITINSEYITPVYVFNRLFVFWVELKKNEDNQEAGKKITQHKASIKYTFYNFSGDWIQPQTLVEDMVISVQGGPQLPGYNGLFSASLFDIDQLWWKKVYALKLEKGRYWMLGAGANKFEKVMLLYGPLLNTSDFGGWTPPDFSKSPVKDSFAFGLYQTAKNFKVVKDYGYEGCLPVCKPVVINDDLEKGFIANPDEFLFIRKDSADSITCFRPKIDSTSGCLNLLDSENIICDNFSEQQIMDTLGKVCLASGTTCLSTAMRNKKYEIFTVKNHPAAFVFKGEKESFLLCDPDKNLLSISRGIYNSDTLFKADSFVSSAVDIQKEGSETLFNQLVQYGYLSQQGIISTDTLLRDLVKDLNDIFYDQAQKDDKVAAVKNILMHRPLIKPNSFVSADVKIEQSGSTALFNQLMKYGYLDKNGRLDADIDFYTLSQDVASMLQGQPDQDKKVRFVVDTLYRSAFPTSVGFFVGKEPAYSVCDFKFKATRMTTAAVHKLSTALFTGSIDKLLSLESQQIPVESELPFQRFHFSEPKVEVPEVLDGTQVDFFGTYGLYYWELFFHAPLYIYKLLQTNQKFQDAEKWIKYIFNPTLPQNPVREDTFQTSRLGIRDSRAIYKILCDQGIITAEGMVSPSFTRKTPLNTYLKTILNQEQIESVKNILLNYKISNQVAHFWQFQPFRNHTLESLLDQLKNPGEIAAYNNTPFDPHAIARLRIGAYEKMVVMQYIDNLLEWGDSLFARYSWEFITAATLLYICAYNLLGERPENMGPAKTPTPVTFQDIFQKYQYDIPQFLIDLEHVTGQHPPDTAGTPFNEFDAYFCVPENTEFIGYWDRVEDRLYKIRHCLNIDGVKQALPLFQPPIDPAQLARFATAESDILSIISHGKTDVPHYRFNHMLEKAKGMAATLSQLGSSLLSVLEKKDTEALTLLRSTHEKNILNLTTLTKEKQLEEINETIESLRQSWSSAQNRLQHYQSLYDENLNALENTSLNLMQSSVGLQVVSSCIRGLSVAGYLTPNIYGFSNGGMDFGQAINAGAQVIDVTAGIMSQTAGVIATGAQYVRRREEWKIQCDIARYEVQQIEKQISANQARLAYMERELEIHQKNIQQADEYELFIKNKFTNQDLYQWMIGRIASVYFQTYRMALDTALAAQAAYQNELCRDDQFIAFDYWDSLHKGLLTGESLLLSLSQMEKAYLQNNVRQLEIEKTISLLHLDPQSFMAFKWGINGAEIGKLTFELSEKLFDFDFPGHYRRKIKSILVTIPAIMRPYQNINATLVQNSNKIVLKPDIKAIEHVMEPATYPDYPDGSLRENWLPNQQIAITRGVDDSGLFVLDFRDEQYLPFEGTGAVSRWTLHLPPESNRIDFNTISDIILQIKYTAQDGGENLANQVKALLYADNPPYPYSLAKCVDLKQSYLAEWQKFINSWPSGGLQQISFPINDEMILPNLKDVQISTATVLLQTPAGIEVSDRDSTSQFVYLKTGDKDRQPVPINNNIGSIVLSKTLPIKENWLLELDTARLPAVLLDKGVINPHVLLDMVVLIGYESNVFNKPKKN >NC_009253.1|WP_011876914.1|1083631_1084432_-|AAA-family-ATPase MFTQFFGLKFNPFSKEVPADKLFISQDLLELESRLKYLQSTRGIGLVAGEPGAGKSTALRKFVNELNPALYKHCYFSLATVTVLEFYQGLALELGEQPKHKKVAIFRQIQGAINSMYYERRITPVIILDEIHLASNKLLEDLRLIFNFKMDSQNPFILVLAGQPLIRSKLSLNINNPLRQRLVVKHIMQGLKPEEIRDYCTSRLKQAGLIEEIFTDSAIDAIYATTKGLPRLINNLVTNCLLYAYYKKLRQIDEEVVYQAQNELNI >NC_009253.1|WP_011877373.1|1084431_1085811_-|IS481-family-transposase MLTAKDRESIALKKFSLISPVLNGQVKNQKDYFETICVKPIDMPYYGFRMYSPKTLMCWLSDYRRGGLDSLKPGYRSDKGKSRKVSLEIADEIRKKRSQMPRITSALLYEELVKDKVILPEKLSRATFYRFLVANPELAAGKDPENPGEKELKRFSHQRINELWQTDIMFGPYISIGKSKKQAYLIAFIDDASRLITHAQFFFFQNFVALRVALKEAVLKRGIPKMIYTDNGKVYRSDQLNMLCAGLGCSLIHTEPFTPTSKGKIERFFHTVRQRFLSRLDPTKLKSLDQLNLYFWQWLEEDYQCKTHSALNMSPLDFFMAQVHNINFLANPQLLEEHFLLRVTRKVNHDATLSVESILYETEQSLANSRLEVRYDPDWLANSNQPILLYRDGMKVGEARQVNFFDNARAKRKGRGRQSQSSQELLESVETSEQKATPSISYAQIDDQLKQSSREVGDR >NC_009253.1|WP_041274407.1|1085974_1086556_-|hypothetical-protein MQLIFDSKTTPKQYYQCGYEYSFPKPYTCLHPDCKIPVPPRPHGYYIRNVITLGFNGRILIRRYYCKYCGHTFSYLPSFCLPYFQYSLVTIFLALLWHYLNLIPLLKVLTSRLQWQRQHLQFYRRRFKANLKFIKAVLRQMMPQVILPKEDDIKKEARKVLIIVKTGFGQIQAFSTRFFTQSNNTFMASRKLA >NC_009253.1|WP_011877377.1|1088819_1089191_+|hypothetical-protein MTSNFQFSSRPSEPIRKAELSIRLSEFEIPPMRDVLLVGKKAPIGPEAVRHMVDALSPDQYEIIRMDHPLFEAAVIKKSMLKLMPQEKLLPILLEEGERVSSDSSLLKAQINIEIQVTRGVEL >NC_009253.1|WP_011877378.1|1089190_1090042_+|CBS-domain-containing-protein MNCVEQIMIRELITISPFDSVGRVVNVMEKHKIGGLPVLENKRLVGIITSRDVRKAHPNRLVADAMSREVVTVMPQFSLWQAKELMENHCIERLVVLKEDYPVGLITKSGLITELGKYTDALTGLPRAEFLYDKALEFLRKGQEIAIIFLDLDDFGFIDKQFGHVVGDEILRQMAQVLKGTTQDKLDYLCRYAGDEFAIVTIRPWEDAQRLAQGIVEAISLEKWPQLINVKGSAGVVGSQIMCCHSINREADVISDLFNMASLASTKAKKEEGSIVIAGQVKL >NC_009253.1|WP_011877379.1|1090233_1090737_+|YqeG-family-HAD-IIIA-type-phosphatase MLAKLYPKLFVPSLFDINLSDLKRAGIKAILFDIDNTLIPWDRKDLDPKIEKWFRSLGQEGFKLCFVSNNDERRVIALTSLLQVPGVHKAAKPRRKGLRRALRILGTDIHETALVGDQVFTDVLAGNRLGLYTILVAPLAGKEFIGTRINRKLEKLVLRRIKKRYLK >NC_009253.1|WP_011877380.1|1090783_1091659_+|shikimate-dehydrogenase MGHCRINGKTQVCGLFGFPVEHSFSPAMHNAAFQQLDLNWTYVPFRVHPDNLKQAVTGIFSLNMAGVNVTVPHKQRVMPFLDELEPAARIIGAVNTIVNNNGKLVGYNTDGKGFVRALTEEARFNPLGKSAILIGAGGAARAVAVQLALSGLRTIYITNRNQEKAEELARDILESTDTSASMIPWGNNLLGKRMVEVDLVVQATPLGMSPEVDQVPEFPFQMLTPQHLVCDLIYNPEQTCFLRRAKSRGSKTMNGLAMLLYQGVLAFELWTGFTAPVDVMRNVLHKQVAKG >NC_009253.1|WP_011877381.1|1091669_1092833_+|chorismate-synthase MLRFLTAGESHGPALTAIVEGMVAGLPVTHEYINTQLARRQGGYGRGGRMKIEKDEVQFLSGIRGGYTTGSPITLQIANRDWQNWCHIMASGPDALLDERVVTRPRPGHADLPGAIKYDHSDIRNILERSSARETAARVAVGSMARCLLEELDIKLVGFVCSIGSIKASVAENLSIEDLVARTQSSQLFCPDEQAEEAMVKEIDQAKETGDSLGGVFEVRVYGVPVGLGSHVQWDRKLDSRLAGAMMGIQAIKGVEIGLGFGAAAVPGSQVHDEIYYAAQRGFYRGSNRAGGIEGGITNGEPLILRAAMKPIPTLYKPLRSVDIKNKEPYLASVERSDVCAVPAACVVGEAVVAWELAVALMEKFGGDSLGEIKARLNQWQQWVRQV >NC_009253.1|WP_011877382.1|1092834_1093368_+|shikimate-kinase MKNIVLVGFMGSGKSSIGHRLARKLGYQFVDTDYAIEEVTGLTVEQIFAKHGIKRFRGEEVLLVSKLADKEGVVIATGGGLVLNSQNVEKLQQNGIFICLQASPETICKRVKNKRTRPLLARGNLKEKVIKLLQERKDAYDMADLTISTDHLEPDDIVKIIYKFLLERGVIHGNHSG >NC_009253.1|WP_011877383.1|1093348_1094428_+|3-dehydroquinate-synthase MGTIQVDLGNRSYPIYIASAILDKIGTYLSEQPLGKKVLLVTDQQVAPLYAPRVIESLKNAGFKVAVAEIPAGEPSKTLEQASRLYDLAFDHALDRQSSVIALGGGVVGDLAGFVAATYMRGVPFIQIPTTLLAQVDSSVGGKVAVNHSRGKNMIGAFYQPQMVMIDVATLQTLPERELKAGLAEVIKYGVIWDGSFFTWLEKNYSRILNLDTTALEQVAETCCKIKASVVEQDEREQGCRAILNYGHTVGHAIESLSGYGTYLHGEAVAMGMISAARLALNEGILSQQDFERIYRLISAVGLPTELPRGLGPQDIIDSMYHDKKTVLGKLVFVLPRSLGQVDIFKDVKEADILAVLSQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009253_3 | 1086730-1086828 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NC_009253_3
|
1 spacers
spacers of NC_009253_3
>3.1|1086763|33|NC_009253|CRISPRCasFinder AGCTTTGGACACTCCTATACCAACACCTTCTGG |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009253_3
The CRISPR arrays of NC_009253_3 >merge|NC_009253|3|1086730-1086828|CRISPRCasFinder CGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAACAGCTTTGGACACTCCTATACCAACACCTTCTGGCGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC >NC_009253|3|3|1086730-1086828|CRISPRCasFinder CGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC AGCTTTGGACACTCCTATACCAACACCTTCTGG CGTCGCCCCTCACGCAGGGGCGTGGATTGAAAC
>NC_009253.1|WP_041274407.1|1085974_1086556_-|hypothetical-protein MQLIFDSKTTPKQYYQCGYEYSFPKPYTCLHPDCKIPVPPRPHGYYIRNVITLGFNGRILIRRYYCKYCGHTFSYLPSFCLPYFQYSLVTIFLALLWHYLNLIPLLKVLTSRLQWQRQHLQFYRRRFKANLKFIKAVLRQMMPQVILPKEDDIKKEARKVLIIVKTGFGQIQAFSTRFFTQSNNTFMASRKLA >NC_009253.1|WP_011877373.1|1084431_1085811_-|IS481-family-transposase MLTAKDRESIALKKFSLISPVLNGQVKNQKDYFETICVKPIDMPYYGFRMYSPKTLMCWLSDYRRGGLDSLKPGYRSDKGKSRKVSLEIADEIRKKRSQMPRITSALLYEELVKDKVILPEKLSRATFYRFLVANPELAAGKDPENPGEKELKRFSHQRINELWQTDIMFGPYISIGKSKKQAYLIAFIDDASRLITHAQFFFFQNFVALRVALKEAVLKRGIPKMIYTDNGKVYRSDQLNMLCAGLGCSLIHTEPFTPTSKGKIERFFHTVRQRFLSRLDPTKLKSLDQLNLYFWQWLEEDYQCKTHSALNMSPLDFFMAQVHNINFLANPQLLEEHFLLRVTRKVNHDATLSVESILYETEQSLANSRLEVRYDPDWLANSNQPILLYRDGMKVGEARQVNFFDNARAKRKGRGRQSQSSQELLESVETSEQKATPSISYAQIDDQLKQSSREVGDR >NC_009253.1|WP_011876914.1|1083631_1084432_-|AAA-family-ATPase MFTQFFGLKFNPFSKEVPADKLFISQDLLELESRLKYLQSTRGIGLVAGEPGAGKSTALRKFVNELNPALYKHCYFSLATVTVLEFYQGLALELGEQPKHKKVAIFRQIQGAINSMYYERRITPVIILDEIHLASNKLLEDLRLIFNFKMDSQNPFILVLAGQPLIRSKLSLNINNPLRQRLVVKHIMQGLKPEEIRDYCTSRLKQAGLIEEIFTDSAIDAIYATTKGLPRLINNLVTNCLLYAYYKKLRQIDEEVVYQAQNELNI >NC_009253.1|WP_041274487.1|1079443_1079734_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMMLITYDVNTTTDAGKKRLRRVAKQCINYGQRVQNSVFECLLDPAQFAELKNTLEEIIDKEKDSLRYYYLGSNWKKRIKHVGAKEIFDPEGTMII >NC_009253.1|WP_011877371.1|1078391_1079423_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKMLNVLYITNPEAYLAKDGENLVVRVQDEEIFRTPIHYLEGIVTFGYMGASPALLGMCVEKGVTVSFLTAHGKHQATVHGTPKGNVLLRRKQYRLADSESESAKLASMFIIGKIANCRTVLRRFMSDYGDKVQIEEVDRVSKIMARNVLRLGKELLLDEVRGIEGESAQMYFSVFDQLIICHKDHFFMKGRNRRPPLDNMNALLSFLYSLLLHETRSALETVGLDPYVGFLHRDRPGRTGLALDLMEEFRPYLVDRLALSLINRRQVTGDGFLKKESGGVIMKENVRKIVIEAWQKRKREEITHPFLEKKIYVGLLPYAQALLLARHLRGDLDRYPPFVWK >NC_009253.1|WP_011877370.1|1077715_1078375_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEKLYEEDDLLALSGIQHFAFCERQWGLIHVESQWVENVKTVEGKNMHKRVDDPYFTETRGDVKIVRSVPLMSKTLGLYGVADVIEIQQHDDNFGIVNYSIVEYKRGKPKADDRDQVQLCAQALCLEEMLAITINYGYLFYGETKHRYRVEFNNCLRTRVQELAQRMHLLFEKGQTPPAVYNKKCKNCSLFDICVPELSKVNKRTQKYLSRVFDDMRIE >NC_009253.1|WP_011877369.1|1076847_1077714_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MFEPIKNRYEFVLFFDVENGNPNGDPDAGNMPRIDAETGLGLVTDVCLKRKIRNYVDIVKNGIEGFDIYVREGSILNNQHMKAYSALDIKPESKKLPKNEEDARRVKAFMCKHFYDIRTFGAVMTTEVNCGQVRGPVQINFARSIDPIVQQEVTITRMAVTSVKDAEKKDREMGRKHIVPYALYRAEGYVSAHLAEKSGFTKEDLELLWQSLTNMFDHDRSAARGKMATRKLIIFEHETALGNASAHSLFDMVEVSRKDLIRPPRAYSDYKVTVNMAALPAGIKLMEK >NC_009253.1|WP_011877368.1|1075040_1076864_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MIINALYQYYGTLLNDQDSGVSRPGFSKAKVGYCLVLSREGQLLDIIDLRVERNKKLVSREMDVPEQVKRASGVAANFLCDNCTYILGLGQKNKQEKRDRIKKCFEAFVQRQEEILQGVEDEGAVALLKFLRGWDIASAVEHPAIIRQLDGLVEGSNLVFKLEGNEGYIHERKTIREAWNRHRNAQVSDIRMQCLVTGEKTGIARLHPSIKGVTGAQPSGASLISFNLNSFTSYRKTQSFNAPVGEEAVFGYTTALNYLLGSEKHRIRIGDTTTVFWAEKSTNGLEEDLLGLLFFPVAEENGKSDKKDDHSLRQATRDPQTVKLLHDIFRRVKEGKAVSQELTGINLNTNFYILGLAPNASRLAVRFWHVDTYGKLIAKIAQHYRDMAMVKNFEKNPYFIPLGMILKETAPLKDSKRIAPLLGGVLMRAILSGTPYPMSLYSSMISRIRADQEVNYVRAAVIKACLVRHERFYNKGNEVELTVALNEQNSNKGYLLGRLFSLLEKAQEDANPGINSSIRDRYFGSASATPGSVFPILLRLAQHHITKAEYGRHTDKRIEDVISSIDGFPAYLTLEEQGQFVLGYYQQRQALYTKTEKKGELNNVRTN >NC_009253.1|WP_011877367.1|1074378_1075044_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MGYGIRLLVWGEFACFTRPEMKVERVSYDVMTPSAARGILESIHWKPSIVWKIDKIHVLNEIRFDNVRRNEVGSKIPTGNVRKAMKGEPTLLCQYASEDRQQRATLLLRNVAYVIVAHFEMTSKAGPQDSPEKHYAIFSRRARQGQCFQQPYFGCREFPAKFRLIEEDEPTPHSLHKGDKDLGWMLLDIDHEDGMNPRFFRATMKDGLIEVPPMERGLTVL >NC_009253.1|WP_011877366.1|1072165_1074361_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNYYAHSDKEKDKNQWHLLRDHLQGTGVTASTFAKSFGGETIAHVAGLLHDLGKYSPEFQKRLEGHSIKVDHSTAGAIEGGKRYGLIGKILAYIIAGHHSGLPDWGSVADETSLEARLKKKLYDYMSFSKEINLPVEKDITMPAIRPIVGAGFSVQFLTRLLYACLVDADFLDTERALNPEKAAARVKKYSLKKLSNNLEQYLNNLCTKASDTAINRKRYKILANCREKAECEPGLFTLTVPTGGGKTLSSLSFALRHAIRYEKERIFYVIPFTSIIEQNAMVFKRVIGEENVLEHHSNFAYPQEDQWEMENDLADKLAQQKLATENWDMPVIATTNVQFFESLFAAKSSRCRKIHNLANSVIIIDEAQMIPTGFLKPCLNAVVELVANYHATIVLCTATQPAINKFLPKEIVPVEIIDNPEELYKAFKRVQVHNIGTVSDVELVEKLVSQDQVLCIVNSKKHARILYEGIRGDGTFHLSTRMCPVHRTKVLEMVKERLKEGQVCRVISTQLIEAGVDIDFPVVYRSMAGIDSIAQSAGRCNREGLREMGQVYVFWPEKHGMPRGWLNRTASLGSMVFKRYEDPLGLEGVKAYFTSLYDVDAAELDKKCIMEDIREQERQLRFPFRTIAEKFKLMNDNTSTIVIPWDKYCQKTLAEAESNLFSGSYARKLQRYGVAVYEKEFRELLEFGALEVVGGRFYVLKEDMFDAYYSQETGLKPFTESMFLNDTLII >NC_009253.1|WP_011877377.1|1088819_1089191_+|hypothetical-protein MTSNFQFSSRPSEPIRKAELSIRLSEFEIPPMRDVLLVGKKAPIGPEAVRHMVDALSPDQYEIIRMDHPLFEAAVIKKSMLKLMPQEKLLPILLEEGERVSSDSSLLKAQINIEIQVTRGVEL >NC_009253.1|WP_011877378.1|1089190_1090042_+|CBS-domain-containing-protein MNCVEQIMIRELITISPFDSVGRVVNVMEKHKIGGLPVLENKRLVGIITSRDVRKAHPNRLVADAMSREVVTVMPQFSLWQAKELMENHCIERLVVLKEDYPVGLITKSGLITELGKYTDALTGLPRAEFLYDKALEFLRKGQEIAIIFLDLDDFGFIDKQFGHVVGDEILRQMAQVLKGTTQDKLDYLCRYAGDEFAIVTIRPWEDAQRLAQGIVEAISLEKWPQLINVKGSAGVVGSQIMCCHSINREADVISDLFNMASLASTKAKKEEGSIVIAGQVKL >NC_009253.1|WP_011877379.1|1090233_1090737_+|YqeG-family-HAD-IIIA-type-phosphatase MLAKLYPKLFVPSLFDINLSDLKRAGIKAILFDIDNTLIPWDRKDLDPKIEKWFRSLGQEGFKLCFVSNNDERRVIALTSLLQVPGVHKAAKPRRKGLRRALRILGTDIHETALVGDQVFTDVLAGNRLGLYTILVAPLAGKEFIGTRINRKLEKLVLRRIKKRYLK >NC_009253.1|WP_011877380.1|1090783_1091659_+|shikimate-dehydrogenase MGHCRINGKTQVCGLFGFPVEHSFSPAMHNAAFQQLDLNWTYVPFRVHPDNLKQAVTGIFSLNMAGVNVTVPHKQRVMPFLDELEPAARIIGAVNTIVNNNGKLVGYNTDGKGFVRALTEEARFNPLGKSAILIGAGGAARAVAVQLALSGLRTIYITNRNQEKAEELARDILESTDTSASMIPWGNNLLGKRMVEVDLVVQATPLGMSPEVDQVPEFPFQMLTPQHLVCDLIYNPEQTCFLRRAKSRGSKTMNGLAMLLYQGVLAFELWTGFTAPVDVMRNVLHKQVAKG >NC_009253.1|WP_011877381.1|1091669_1092833_+|chorismate-synthase MLRFLTAGESHGPALTAIVEGMVAGLPVTHEYINTQLARRQGGYGRGGRMKIEKDEVQFLSGIRGGYTTGSPITLQIANRDWQNWCHIMASGPDALLDERVVTRPRPGHADLPGAIKYDHSDIRNILERSSARETAARVAVGSMARCLLEELDIKLVGFVCSIGSIKASVAENLSIEDLVARTQSSQLFCPDEQAEEAMVKEIDQAKETGDSLGGVFEVRVYGVPVGLGSHVQWDRKLDSRLAGAMMGIQAIKGVEIGLGFGAAAVPGSQVHDEIYYAAQRGFYRGSNRAGGIEGGITNGEPLILRAAMKPIPTLYKPLRSVDIKNKEPYLASVERSDVCAVPAACVVGEAVVAWELAVALMEKFGGDSLGEIKARLNQWQQWVRQV >NC_009253.1|WP_011877382.1|1092834_1093368_+|shikimate-kinase MKNIVLVGFMGSGKSSIGHRLARKLGYQFVDTDYAIEEVTGLTVEQIFAKHGIKRFRGEEVLLVSKLADKEGVVIATGGGLVLNSQNVEKLQQNGIFICLQASPETICKRVKNKRTRPLLARGNLKEKVIKLLQERKDAYDMADLTISTDHLEPDDIVKIIYKFLLERGVIHGNHSG >NC_009253.1|WP_011877383.1|1093348_1094428_+|3-dehydroquinate-synthase MGTIQVDLGNRSYPIYIASAILDKIGTYLSEQPLGKKVLLVTDQQVAPLYAPRVIESLKNAGFKVAVAEIPAGEPSKTLEQASRLYDLAFDHALDRQSSVIALGGGVVGDLAGFVAATYMRGVPFIQIPTTLLAQVDSSVGGKVAVNHSRGKNMIGAFYQPQMVMIDVATLQTLPERELKAGLAEVIKYGVIWDGSFFTWLEKNYSRILNLDTTALEQVAETCCKIKASVVEQDEREQGCRAILNYGHTVGHAIESLSGYGTYLHGEAVAMGMISAARLALNEGILSQQDFERIYRLISAVGLPTELPRGLGPQDIIDSMYHDKKTVLGKLVFVLPRSLGQVDIFKDVKEADILAVLSQ >NC_009253.1|WP_011877384.1|1094472_1096137_+|type-II/IV-secretion-system-protein MLTVAPKSLIGNILLEKGAISQQQLREALNNHRQTDQPLGQVLVDLGYVTKKQVSQYLDYQEQMEEEVIHIQEIDKALLKLFSEQILRRYKIFPLFKKGNKLTVAMAEPANVIAIDDLKVISNLDIVPVEVQEQIIELAIDLYYDITKREVNDKEQRLVITDEEEVPIIQLVYQIIDRAIDQGASDIHIEPQEKRVRIRYRIDGMLILGMELAPTLDKAIISRIKIMSQLNIAEKRVPQDGRIQYGKQSRNFDLRVSTMPTVYGEKAVIRILNPESIKKYQLAQLGFSAYNLKSFQKCLRATSGMVLITGPTGCGKTTTLYAILNELNLEDRNFSTIEDPVEYRLEGINQTQVNTKTGMTFAVGLRALLRQDPDIIMVGEIRDRETAEIAVTAAGTGHLVFSTLHTNDALGALDRLIHMGLEIFQVASSVLVVVAQRLVRKLCPYCKEGYLVETKSPEYAFLQSTPWQDHIFYKAKGCVHCNFIGYRGRMAIQEVLQVNGNIRKLLVERAPSGELKKAALQGGMTTLKTDGIEKALQGLTSIPEVMRVAYSDEE >NC_009253.1|WP_011877385.1|1096302_1097508_+|type-II-secretion-system-F-family-protein MAVFFKYQAKKYSGEEVRGRIKADHKNTALQMLRKQRLFVTKIWQVPEPGYLSVKIKSGVQVKELALFCRQFATLSSSGVPIVQSLYLLKEQTGNKALKGALEAIAEDLQGGKSLGQALSSHHKIFSAFFINMVEAGEMSGSLDHVLDRLADYFERAYELREKFKTAITYPAFIMSMAICTIGCVFIFVLPTFAQIIIELQAPISLPTAIVIQISEWLKGNWVSLLFFPLLSGLLYKKYTQTPQGKRRLDYLTLQTPVYGKIVKQMNIVRICRTLAILLESGITLMTGLELIKNQTRNTLFKEALEQAIESLKKGIGLSVPLQESSYFPPMVSHMIRVGEETGGLDTVLRKITDFYEKEVHRTITRLSTLLEPVLICLIGGIISFIMISILMPIFSIMDAM >NC_009253.1|WP_011877386.1|1097545_1098034_+|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MKWVKNNRGFTMIEILVVITMIGILSTIVVPKITSQMDKPKKSRAMIEIKTIKDALDIYFAENSSYPTTQKEIAEVMRDNGVLGEKFGKYSALDPWKNPYYIKITTNEYTIWSEGPKTGTELDDIVTTNEDTEVYVDKNNNLDPSTATTDSTKNGTISTEGS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009253_4 | 1764821-1766001 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_009253_4
|
15 spacers
spacers of NC_009253_4
>4.1|1764858|39|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAAGTCTAATACCAGTAGCGAGTATCCATTCTTCCTC >4.2|1764934|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATATACATAAGTAAATTGGCTGTGGTTAGTTCTTC >4.3|1765009|40|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAATATGGATTCAATCTTTAGAAGGTGGCACTATATCC >4.4|1765086|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCTGCACTGTTATAAGATTCACTGATTGTAGCTGATT >4.5|1765161|39|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATGCTTCTTTATATTCTTAATAACTGTAAATGGTCTA >4.6|1765237|39|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATTATTATATTTGCTTGTTTCTTCCGTTAACCACTTT >4.7|1765313|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAATAAAAAAGGTCAGATGACTTCTGTTACATTAAC >4.8|1765388|37|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAAGTGTCAGTATGCATATTCAAGCAATTCAAAAA >4.9|1765462|42|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTTAAAATTATTCATTTTTACCTCCTATTCTGTGACTGGT >4.10|1765541|45|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTATCCACCTTCGGCAGGTGAAACAAAAAAGTGGGCAAGGCCCA >4.11|1765623|40|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATAGCAGAAGTTGGAGTATTACAGCCGATACTGGTAAA >4.12|1765700|39|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAGGAATGATGGCAGTAACACTGCTTTCTATGCCTGC >4.13|1765776|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCTTACCCCTTTAGCAGATATACAGTCATCTTCTTCA >4.14|1765851|37|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTACACTATTCTACCTATGTAATTAATTTCCTTTAC >4.15|1765925|40|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATTCAACACACCATCCTTTTACCTATCTCGGCAATAT |
WYL,cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csx1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009253_4
The CRISPR arrays of NC_009253_4 >merge|NC_009253|4|1764821-1766001|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACAACAAGTCTAATACCAGTAGCGAGTATCCATTCTTCCTCGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACAAAATATACATAAGTAAATTGGCTGTGGTTAGTTCTTCGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACTGAAATATGGATTCAATCTTTAGAAGGTGGCACTATATCCGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACAGCTGCACTGTTATAAGATTCACTGATTGTAGCTGATTGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACGTATGCTTCTTTATATTCTTAATAACTGTAAATGGTCTAGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACGCATTATTATATTTGCTTGTTTCTTCCGTTAACCACTTTGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACACAAATAAAAAAGGTCAGATGACTTCTGTTACATTAACGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACTGAAAGTGTCAGTATGCATATTCAAGCAATTCAAAAAGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACATTTTAAAATTATTCATTTTTACCTCCTATTCTGTGACTGGTGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACGGTATCCACCTTCGGCAGGTGAAACAAAAAAGTGGGCAAGGCCCAGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACGTATAGCAGAAGTTGGAGTATTACAGCCGATACTGGTAAAGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACTTGAGGAATGATGGCAGTAACACTGCTTTCTATGCCTGCGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACTCCTTACCCCTTTAGCAGATATACAGTCATCTTCTTCAGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACATTACACTATTCTACCTATGTAATTAATTTCCTTTACGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACTATATTCAACACACCATCCTTTTACCTATCTCGGCAATATGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC >NC_009253|4|3|1764821-1766001|PILER-CR GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AACAAGTCTAATACCAGTAGCGAGTATCCATTCTTCCTC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AAAATATACATAAGTAAATTGGCTGTGGTTAGTTCTTC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TGAAATATGGATTCAATCTTTAGAAGGTGGCACTATATCC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AGCTGCACTGTTATAAGATTCACTGATTGTAGCTGATT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GTATGCTTCTTTATATTCTTAATAACTGTAAATGGTCTA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GCATTATTATATTTGCTTGTTTCTTCCGTTAACCACTTT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC ACAAATAAAAAAGGTCAGATGACTTCTGTTACATTAAC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TGAAAGTGTCAGTATGCATATTCAAGCAATTCAAAAA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC ATTTTAAAATTATTCATTTTTACCTCCTATTCTGTGACTGGT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GGTATCCACCTTCGGCAGGTGAAACAAAAAAGTGGGCAAGGCCCA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GTATAGCAGAAGTTGGAGTATTACAGCCGATACTGGTAAA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TTGAGGAATGATGGCAGTAACACTGCTTTCTATGCCTGC 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ATTTTAAAATTATTCATTTTTACCTCCTATTCTGTGACTGGT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GGTATCCACCTTCGGCAGGTGAAACAAAAAAGTGGGCAAGGCCCA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GTATAGCAGAAGTTGGAGTATTACAGCCGATACTGGTAAA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TTGAGGAATGATGGCAGTAACACTGCTTTCTATGCCTGC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TCCTTACCCCTTTAGCAGATATACAGTCATCTTCTTCA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC ATTACACTATTCTACCTATGTAATTAATTTCCTTTAC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TATATTCAACACACCATCCTTTTACCTATCTCGGCAATAT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC >NC_009253|4|3|1764821-1766001|CRT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AACAAGTCTAATACCAGTAGCGAGTATCCATTCTTCCTC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AAAATATACATAAGTAAATTGGCTGTGGTTAGTTCTTC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TGAAATATGGATTCAATCTTTAGAAGGTGGCACTATATCC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AGCTGCACTGTTATAAGATTCACTGATTGTAGCTGATT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GTATGCTTCTTTATATTCTTAATAACTGTAAATGGTCTA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GCATTATTATATTTGCTTGTTTCTTCCGTTAACCACTTT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC ACAAATAAAAAAGGTCAGATGACTTCTGTTACATTAAC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TGAAAGTGTCAGTATGCATATTCAAGCAATTCAAAAA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC ATTTTAAAATTATTCATTTTTACCTCCTATTCTGTGACTGGT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GGTATCCACCTTCGGCAGGTGAAACAAAAAAGTGGGCAAGGCCCA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC GTATAGCAGAAGTTGGAGTATTACAGCCGATACTGGTAAA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TTGAGGAATGATGGCAGTAACACTGCTTTCTATGCCTGC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TCCTTACCCCTTTAGCAGATATACAGTCATCTTCTTCA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC ATTACACTATTCTACCTATGTAATTAATTTCCTTTAC GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TATATTCAACACACCATCCTTTTACCTATCTCGGCAATAT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC
>NC_009253.1|WP_011877966.1|1763558_1764020_-|WYL-domain-containing-protein MPLPHTLSVIKGKLLSLMLIRECEDWRNEIIKMTQRIIVHGQGQAGQQVIESVNQLVEQAIANHRAVCIDYRGQNYKISPLGIVYHWQRMDRYIIAINSKNSTIYNYRLDRVDRLELLKDTFVPPEDFVLASYLENCWGIYPAASKIIGDNAS >NC_009253.1|WP_011877965.1|1763234_1763456_-|hypothetical-protein MNNKMLMRVSAILNTLEAHPQGLSAVELSKYTTYPADQVLRDLNEILNNTDLGHYFAIFPDEQPDDPEEYLVD >NC_009253.1|WP_011877964.1|1760323_1762744_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MRVSYQWLKDYVDIQITPQELADRLTLSGLAVDTVDELGTEIENVVTGRIVKIEKHPNADKLVVCQVDVGQEELLQIVTGATNVREGHVIPVALEGAKLAEGLQIKRSKLRGVESRGMLCSGQELGMETRLLSPDMANGILILPEDVPVGLDAKEILGLNDAVLELDLTPNRGDALSMIGVARDVAALLNTELKIPVPQFQENNEKIDKLAKIDIEDIDLCRRYVGRVIKGIKIGPSPIWLQNRLRAAGIRPISNVVDVTNYVMLEMGQPLHAFDYDKIANHHIIVRRAQEDEKIISLDGVERTLNPEMLAITDEAGPVAVAGVMGGLESEVTDATINILVESAYFHPINVRRTSKALGLRSESSMRFEKGIDINGCLRAADRALQLMQQLAGGMVVSGTIDKFPNPITEKTILLRPKRVNWVLGVDIPKQEIMRIMESLQFRVQEQEGDILVTVPTFRPDISGEWDLVEEVVRLYGFNQIPETLPFGATSQGVRTAEQQMNWDMRRIMTSCGFYEVVTYGFVHPRIFDLMNLPKDSIFRNCVKLQNPLSEEQSIMRTVLVPSLLEVLQKNSNRRAQSGAIFEIARVFYPQEGQPLPEEVPVLAAVAYGNTQKTWNQPARPMDYYFMKGVVEQLMEGLGAASTAFSRHQDPSFHPGRCAKIEVAGRMLGVVGELHPNVVENYELPSRAVAVKLDLKVLAEVNRPVKQYQGLPKFPTMERDLAVLVKLEVPAAEMLSIIQRAAGELLKETDIFDVYQGSQVPEGYKSVAFSMKFQAKDRTLTDEEINEKMQRITKSLFAQTGAELRK >NC_009253.1|WP_011877963.1|1759271_1760294_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MEQKLRTLAQEALAALESAKTPEALNDIRVKYLGKKGEVTQLLRGMGALSAEERPRVGQVANEVRASIEQALEERNARVKEAQKEQMLAAETIDVTLPGNQFGLGRMHPLTQVMQEIESIFMGLGFKIAEGPEVELDYYNFEALNLPKDHPARDMQDTFFINPEVLLRTHTSPVQVRTMEKMVPQVPIKIICPGRVYRRDDDATHSPMFHQVEGLVVDKHITFADLKGVLATFARQMFGLDTKTRLRPSYFPFTEPSAEVDISCFNCKGNGCRVCKGSGWLEILGSGMVHPRVLEMSGYNPEEVTGFAFGMGVERIAMLKYGIDDLRLLFDNDLRFLSQF >NC_009253.1|WP_011877962.1|1757994_1758798_+|RNA-methyltransferase MITSSQNLRVKLVKKLAQRNFRQKERKLAVEGIRFVEEALSSTWQTEILLYTDQACQAQRGKILLDLARDKGVEVLAVSDAIMKELSDTETPQGMLAVLRQPDYTLEDIIRPDQKPLVVIVDGVQDPGNLGTIIRSADAAGASGVILLKGTVDIYNPKTLRATMGSLFHLPVIQVSDVNEALEYLASIGVTLLVGEPAGGIPVFKANLQTPVGIIVANEGAGPREEIFRYNHQKITIPMPGCAESLNVAIATSIILYEAIRQRHKIQ >NC_009253.1|WP_011877961.1|1757341_1757995_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein MKQFAVIGLGRFGSSVARTLSKMDYEVLGLDVNEERVNDIIEDVTHAVQLDALDDHSLQAVGIRNFDVVVVGIGQEVQSSILVTLMLKEMGVKRVVAKAQNDLHGKVLERVGADKVVFPERDMGIKLAHALVSQNIMEQISLSPEYSLVEMAAPPNFVNKTLEKSGARQQYGVSILAIRRGEDMIISPGASQEILEGDILVVIGKNEKLQKFDTVEV >NC_009253.1|WP_011877960.1|1755991_1757326_+|TrkH-family-potassium-uptake-protein MKNNKGFLSQPSRALAVGFAGLILLGGILLSLPVASASGQPTDFLTALFTSTSAVCVTGLVVVDTGTYWSTFGQVVIISLIQVGGLGFMTMAVLFWLILGRKVTFRERLLIQQSLNVIDLSGIIKLAKQVIVLTLTIQIFIATLLAVRFVPELGLQKGIAFSLFHAVSGFNNAGFDLFGDFRSLTQYTADPIVNFAIGLDIILGGIGFTVMTDAIRYRKRKKISLHSKLALYITAILLLFGMVVFLLLEFNNTLASLSFGGKLWASWFQSVTPRTAGFNTIDLTAMRPVTLFFIILLMFIGASPGSTGGGVKTTTFGIVVLALISLARGKEDAEVFYRRISKEQVYKGLGIILLAMGWIIFATLLLGAVEKADFLKILFEVVSALATVGLSAGLTPTLSDFGQVVIMFTMFLGRLGPLTVAYALATKQQRKQQFRYPEERIIIG >NC_009253.1|WP_011877959.1|1755439_1755796_+|50S-ribosomal-protein-L20 MPRAKSSVVSRNRHRKILKLAKGYRGSRSKLFRVANQAVMKGLFYAYRDRRQKKRDFRKLWIARINAATRMNGLSYSRFINGLKKAGVEVNRKMLADLAVNDAKAFGQLVELAKSKLA >NC_009253.1|WP_011877958.1|1755208_1755403_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKIKTHRGAAKRFKKTATGKIRGWHAFHSHILGKKTAKRKRNLRKSTIIHESDAVRISRLLPY >NC_009253.1|WP_041274543.1|1754661_1755192_+|translation-initiation-factor-IF-3 MYISKQEQRINEEIRAREVRVVDAENNQLGIMSTKEALRLAEEKQLDLVEVAAQAKPPVCRIMDYGKFKYEQSKREKEAKKRQRIIQVKEVKLRPRIEDHDYSTKSKNAERFLKDGDKVKVTIMFRGREIVHTELGRALLERLAQDLKDICIVERHPKLEGKNMIMILAPKNEKQD >NC_009253.1|WP_011876481.1|1766726_1767962_+|IS110-family-transposase MSQMLVGIDVSLQSHHVQFMDGDGGALASFSIHNNRQGADTLIQKIVDTSDRIKSQSLRIGMEATSNLGWHLAHYLQEQLQTTCPQKDTQIYVLNARKVARFKKGYDTLPKNDRIDAWVIADHLRFGRLPHAMKDIIQYEALQRLTRTRFHLMQNITRDKTYFLNQVFLKFSGLRQDNPFSNLFGSTCLAVIQELEPEQIVAMSMEELVDFLKDKGKNRFDNPEEIALYLQKIARSSYRLNKAMADPVNISLATMLNVIKHMESEVKKLDKEIAKIMKGLPQTLTSVKGIGDVFTAGIMAETGDIQRFKDHNALAKYAGLTWNQHQSGEFEAEDTSRTRTGNKYLRYYLIQAADSVRKHVPEYKDFYQKKYDEVPKHKHKRALVLTARKLVRLVFSLLNTRQLYTSPERRG >NC_009253.1|WP_011877968.1|1768843_1770478_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas4/Cas1 MAEHNISNEQHYFPISSVAEILYCPRNFYYRVVEGAEDSNHHLLEGKLQEERRDERQRLVREGYRQDRSIHVSSEKLNLYGIVDIVEQGKEIYPVEYKKGFRKESLNDDVQVCAQAMALEEKLGQDINRGYIYYAGSKARREVIFDEDLRLMVENAVGLARNIALSGEIPPPLADNRCEGCALVNRCLPFEVKGIKENKAKAVRPQPGINLGRVLYVDEQGASLYKKGERVLVTKDQIKFKDIPLCNLDQVVLVGNVNLSSQLIKLFLGRGTEVHFISTKGKYYGCLQAALSKNSVLRIAQHRAYQKQEERLLYASEFVRGKLSNMRTNLLRYNRSLNNHSIDEAVSRIKNIIKRLEKAKDLNELMGLEGAGSRDYFSVFGLLIKDRVPFDFNKRSRRPPEDPANALLSFSYSLLLKDVITAVQVVGFDPFIGFLHRSDFGRPALALDIIEEFRPVVADSVVLTALNKGVIAEGDFEYRMGGCFLSETGRKKMYRLYEERRKEMITHPVFGYRISYLRTIELQARFLAKVLTKEIDGYKPFLVR >NC_009253.1|WP_011877969.1|1770482_1770761_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKQYIISYDITNDKRRNKIRKLLCDYAVPVQYSVFEARLSEEDYIMLRHKLSRLLRKDEDSIIFYLQCSRCRDGIIRLGNCSDPFGDGIYIV >NC_009253.1|WP_011877970.1|1771039_1773382_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MIYETIQLAGLLHDIGVFFQRGNISNLNSLQYSEISARLIKSFSKQLSKICDSELLKNLILNQYEDTDFSQEAIPKNKINLTYLISRADRYSSSELEQDTVEIYNYKKRPMDAVFCHLEIGKKVPQRMQYSLAEYRPENGFPREIISHTEGEINKILTDFSLEFKNIVSNIKSFECFYNQLYSLLLKYTWCIPYNTREKIADISLFDHLKTTSAIATCLYQYHNFCNDYSIPSIIDDQTFKFRLLVGDLSGIQSYIFSGANVGAGGVAKRLRARSFILSMLSELISYQIIKSFNLTVANILMASGGKFYILLPNTKESVSRLEKLQQKLDKYLLQEFKGEIALNLAHQELNGNDFCQFGSAVSRLSKKLAVKKKMPFANVMYSQEEWKEGQFIFHAEDTKGLGICKGCEKEFAIQQVEDKVYGPACLRDLKIGQKLPRIKSFALTDGEADIKISGSYGIRLYDNVPSNTDLDIVILNDNKIDPNVSMTNRYMANYVPNNQGITKSFDEICQNSSGVKKLAYFKADVDNLGGLFAFGFKGGLESGQNKDYDSISRVTTFSRMLDLFFSGRVNQLVSNEFTNCYIVFSGGDDLLVVGPWDEIIEFSLKIYQEFRKFVAYNDNITISAGIGLAKSKTPVVKAVQVAEDLLEEAKEKVLRGNKTGRNQVSIFDRTLSWHDFSAAVQEGKRLAKWITEGKLNRSDIWKLKRYDQMFQDFWQNHRVEGLKYQALLAYDIGRKRKENKDCQEVTRWQECLFSITNPSLINLGVITDYALCATRGGNI >NC_009253.1|WP_083755152.1|1773354_1773891_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MCNQGREYLMSDWKKQLQGYKDKQGNRNQPHQGKRDKNDMGYQRYTTPGLPDGYLSKGYFDDQGCLLEILLTETASKIAKSFGSNMNNSQLRRFYGHAKTAEKSYAFSGDERKFINDIKALDSFVAEAKGKDKVPQIFYDFINVNVAKANSLKDIKQGFLPHFQAVVAYFTYHYPKSK >NC_009253.1|WP_011877972.1|1773912_1774560_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MKLLKTSIIKGKIECITGMRIGGSAEAIEIGGIDNPVIKHPVNNEPYIPGSSLKGKMRSQMEKIEGKVNEKPCGCADKGCMVCRVFGPHNRPKHDLGPTRILVRDAMLSDESRQEMIRIIQEGKSYIEIKTENIIVRTTGVANHPRTQERVPAGAKFDFEIVVQVFDIDLEKDVIDFVKKALKSVENSYLGSSGSRGYGQVHFTKLTLDGEEFKL >NC_009253.1|WP_011877973.1|1774575_1775505_+|hypothetical-protein MKLYKLKIEPKSSQITPWHSDTIFGSLCWVLAQSRGQEKLRDFLHEYTGNCYPMVVSNGFPGDYLPKPMGGNTFNTNDNRIKQEAIRLAQKAKEAKKTNLLSLEEFNTIINNGQVEIKPKEKLYLENGVMHNQLSRLTGTTSDGSLYELTETFWSSSHISIYLGISSGWEKEVFTLFEILSLKGFGKRISVGKGYFKIMDCTEFKDLTIPESPNSIVTLSNYVPRSHDPYLGQYKTFVKYGKLGQNYAVSGNPFKKPLLMIMPGAVFWTENPQFAYGRMVKGISPSYPEVVQCGCALAIPSYIEKVEME >NC_009253.1|WP_011877974.1|1775509_1776769_+|hypothetical-protein MDILISAVGVRDPYAKDGSKGAVLTLVDKLKPDICFLFGTDPGVNEEVENTHQRALQIKQIVKESVKIISIPMVLPDPTDHREILLCFEQHLNEIITKYHTTKPHYHVNVSSGTSQMHAALMLLFNGRRLKAKIYQVKEPRFVNCEAERVAEVDASFIEEENYIFRAKKFFLNFNFSAAQDELIELALFTTREKRQKRAELFSDICRAYKYWDRYEHEQARDILEKLIVDIQRFKINELADITIRQINILKSICANKPRETVATIKDLLHNANRKKIIGEYGDCLNRYKRLIDGLAACKCGLTGSKRVNDQPVWVQDILIHKKKNDNLYYSDYLTIYREKNNKEMIPQSLNDKMLSLNRRRNTSYVAHGMDSVSKQDAEESINILWKMATSLFSGEKWKEYEFSADVILNISELLFNDL >NC_009253.1|WP_011877975.1|1776785_1777583_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MLTALQVELEAVADGALPVGNALYIHGLFFRLLQEVNINISDYLHNVQSIKPYTLSTLQGVKQNKGWCSVCQGKKYRFRATFMQEEVFLNFYEVVYSYYVNKKTVKIGNIDFLVSKIDLERTNKFEDLIGNEVNLQKFEIDFLSPTNFRVNGIQHIFPDSHTVFKSYKNRWNTFCPNHLIFPEHDLSLIYDGCYSVRYNLHTEIIEMGKYKMVGFKGTCRYEINPKLSGELRDRASGLLKFARYCGTGYKTTMGLGQTKVSFMIK >NC_009253.1|WP_011877976.1|1777778_1778051_+|cell-division-protein-ZapA MSNQANRVEVEIFGEYYTLKGHESPEYMLKVAHLVNKKMMEISERNPILSSNKVAVLTVVNLIDELLKLQEQYNNLLQMMDPEKGDSSNS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009253_5 | 1768139-1768717 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_009253_5
|
7 spacers
spacers of NC_009253_5
>5.1|1768176|40|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAACCGAGTCTTCGAGAATTAACCTACCAACACAGTTT >5.2|1768253|43|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAATTTCTTTTATGTTCCTTCCATCTGCCTAATATATCAATA >5.3|1768333|40|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGATTTATTATCTTCAGATTCACTATCTGCTCCAGCAT >5.4|1768410|40|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCCTAGTGTTTCATTTAAGCATTCAATTTCTTTTGCAA >5.5|1768487|40|NC_009253|CRISPRCasFinder,CRT TTTTCTTCTGCTGTTTTTAATGTCTGTCCTGAAAGTTGTT >5.6|1768564|40|NC_009253|CRISPRCasFinder,CRT AAAAACCGAGTCTTCGAGAATTAACCTACCAACACAGTTT >5.7|1768641|40|NC_009253|CRISPRCasFinder,CRT CTTGATTTATTATCTTCAGATTCACTATCTGCTCCAGCAT |
WYL,cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csx1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009253_5
The CRISPR arrays of NC_009253_5 >merge|NC_009253|5|1768139-1768717|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACAAAAACCGAGTCTTCGAGAATTAACCTACCAACACAGTTTGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACTAAATTTCTTTTATGTTCCTTCCATCTGCCTAATATATCAATAGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACCTTGATTTATTATCTTCAGATTCACTATCTGCTCCAGCATGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACTATCCTAGTGTTTCATTTAAGCATTCAATTTCTTTTGCAAGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACTTTTCTTCTGCTGTTTTTAATGTCTGTCCTGAAAGTTGTTGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAACAAAAACCGAGTCTTCGAGAATTAACCTACCAACACAGTTTGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAACCCTTGATTTATTATCTTCAGATTCACTATCTGCTCCAGCATGTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATATTTGG >NC_009253|5|4|1768139-1768486|PILER-CR GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AAAAACCGAGTCTTCGAGAATTAACCTACCAACACAGTTT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TAAATTTCTTTTATGTTCCTTCCATCTGCCTAATATATCAATA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC CTTGATTTATTATCTTCAGATTCACTATCTGCTCCAGCAT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TATCCTAGTGTTTCATTTAAGCATTCAATTTCTTTTGCAA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC >NC_009253|5|5|1768139-1768717|CRISPRCasFinder GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AAAAACCGAGTCTTCGAGAATTAACCTACCAACACAGTTT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TAAATTTCTTTTATGTTCCTTCCATCTGCCTAATATATCAATA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC CTTGATTTATTATCTTCAGATTCACTATCTGCTCCAGCAT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TATCCTAGTGTTTCATTTAAGCATTCAATTTCTTTTGCAA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TTTTCTTCTGCTGTTTTTAATGTCTGTCCTGAAAGTTGTT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AAAAACCGAGTCTTCGAGAATTAACCTACCAACACAGTTT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAACC CTTGATTTATTATCTTCAGATTCACTATCTGCTCCAGCAT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATATTTGG >NC_009253|5|4|1768139-1768717|CRT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AAAAACCGAGTCTTCGAGAATTAACCTACCAACACAGTTT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TAAATTTCTTTTATGTTCCTTCCATCTGCCTAATATATCAATA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC CTTGATTTATTATCTTCAGATTCACTATCTGCTCCAGCAT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TATCCTAGTGTTTCATTTAAGCATTCAATTTCTTTTGCAA GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC TTTTCTTCTGCTGTTTTTAATGTCTGTCCTGAAAGTTGTT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAAAC AAAAACCGAGTCTTCGAGAATTAACCTACCAACACAGTTT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATTGAACC CTTGATTTATTATCTTCAGATTCACTATCTGCTCCAGCAT GTCAAAACACAAAATAATTCCCTTTGGGAATATTTGG
>NC_009253.1|WP_011876481.1|1766726_1767962_+|IS110-family-transposase MSQMLVGIDVSLQSHHVQFMDGDGGALASFSIHNNRQGADTLIQKIVDTSDRIKSQSLRIGMEATSNLGWHLAHYLQEQLQTTCPQKDTQIYVLNARKVARFKKGYDTLPKNDRIDAWVIADHLRFGRLPHAMKDIIQYEALQRLTRTRFHLMQNITRDKTYFLNQVFLKFSGLRQDNPFSNLFGSTCLAVIQELEPEQIVAMSMEELVDFLKDKGKNRFDNPEEIALYLQKIARSSYRLNKAMADPVNISLATMLNVIKHMESEVKKLDKEIAKIMKGLPQTLTSVKGIGDVFTAGIMAETGDIQRFKDHNALAKYAGLTWNQHQSGEFEAEDTSRTRTGNKYLRYYLIQAADSVRKHVPEYKDFYQKKYDEVPKHKHKRALVLTARKLVRLVFSLLNTRQLYTSPERRG >NC_009253.1|WP_011877966.1|1763558_1764020_-|WYL-domain-containing-protein MPLPHTLSVIKGKLLSLMLIRECEDWRNEIIKMTQRIIVHGQGQAGQQVIESVNQLVEQAIANHRAVCIDYRGQNYKISPLGIVYHWQRMDRYIIAINSKNSTIYNYRLDRVDRLELLKDTFVPPEDFVLASYLENCWGIYPAASKIIGDNAS >NC_009253.1|WP_011877965.1|1763234_1763456_-|hypothetical-protein MNNKMLMRVSAILNTLEAHPQGLSAVELSKYTTYPADQVLRDLNEILNNTDLGHYFAIFPDEQPDDPEEYLVD >NC_009253.1|WP_011877964.1|1760323_1762744_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MRVSYQWLKDYVDIQITPQELADRLTLSGLAVDTVDELGTEIENVVTGRIVKIEKHPNADKLVVCQVDVGQEELLQIVTGATNVREGHVIPVALEGAKLAEGLQIKRSKLRGVESRGMLCSGQELGMETRLLSPDMANGILILPEDVPVGLDAKEILGLNDAVLELDLTPNRGDALSMIGVARDVAALLNTELKIPVPQFQENNEKIDKLAKIDIEDIDLCRRYVGRVIKGIKIGPSPIWLQNRLRAAGIRPISNVVDVTNYVMLEMGQPLHAFDYDKIANHHIIVRRAQEDEKIISLDGVERTLNPEMLAITDEAGPVAVAGVMGGLESEVTDATINILVESAYFHPINVRRTSKALGLRSESSMRFEKGIDINGCLRAADRALQLMQQLAGGMVVSGTIDKFPNPITEKTILLRPKRVNWVLGVDIPKQEIMRIMESLQFRVQEQEGDILVTVPTFRPDISGEWDLVEEVVRLYGFNQIPETLPFGATSQGVRTAEQQMNWDMRRIMTSCGFYEVVTYGFVHPRIFDLMNLPKDSIFRNCVKLQNPLSEEQSIMRTVLVPSLLEVLQKNSNRRAQSGAIFEIARVFYPQEGQPLPEEVPVLAAVAYGNTQKTWNQPARPMDYYFMKGVVEQLMEGLGAASTAFSRHQDPSFHPGRCAKIEVAGRMLGVVGELHPNVVENYELPSRAVAVKLDLKVLAEVNRPVKQYQGLPKFPTMERDLAVLVKLEVPAAEMLSIIQRAAGELLKETDIFDVYQGSQVPEGYKSVAFSMKFQAKDRTLTDEEINEKMQRITKSLFAQTGAELRK >NC_009253.1|WP_011877963.1|1759271_1760294_+|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MEQKLRTLAQEALAALESAKTPEALNDIRVKYLGKKGEVTQLLRGMGALSAEERPRVGQVANEVRASIEQALEERNARVKEAQKEQMLAAETIDVTLPGNQFGLGRMHPLTQVMQEIESIFMGLGFKIAEGPEVELDYYNFEALNLPKDHPARDMQDTFFINPEVLLRTHTSPVQVRTMEKMVPQVPIKIICPGRVYRRDDDATHSPMFHQVEGLVVDKHITFADLKGVLATFARQMFGLDTKTRLRPSYFPFTEPSAEVDISCFNCKGNGCRVCKGSGWLEILGSGMVHPRVLEMSGYNPEEVTGFAFGMGVERIAMLKYGIDDLRLLFDNDLRFLSQF >NC_009253.1|WP_011877962.1|1757994_1758798_+|RNA-methyltransferase MITSSQNLRVKLVKKLAQRNFRQKERKLAVEGIRFVEEALSSTWQTEILLYTDQACQAQRGKILLDLARDKGVEVLAVSDAIMKELSDTETPQGMLAVLRQPDYTLEDIIRPDQKPLVVIVDGVQDPGNLGTIIRSADAAGASGVILLKGTVDIYNPKTLRATMGSLFHLPVIQVSDVNEALEYLASIGVTLLVGEPAGGIPVFKANLQTPVGIIVANEGAGPREEIFRYNHQKITIPMPGCAESLNVAIATSIILYEAIRQRHKIQ >NC_009253.1|WP_011877961.1|1757341_1757995_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein MKQFAVIGLGRFGSSVARTLSKMDYEVLGLDVNEERVNDIIEDVTHAVQLDALDDHSLQAVGIRNFDVVVVGIGQEVQSSILVTLMLKEMGVKRVVAKAQNDLHGKVLERVGADKVVFPERDMGIKLAHALVSQNIMEQISLSPEYSLVEMAAPPNFVNKTLEKSGARQQYGVSILAIRRGEDMIISPGASQEILEGDILVVIGKNEKLQKFDTVEV >NC_009253.1|WP_011877960.1|1755991_1757326_+|TrkH-family-potassium-uptake-protein MKNNKGFLSQPSRALAVGFAGLILLGGILLSLPVASASGQPTDFLTALFTSTSAVCVTGLVVVDTGTYWSTFGQVVIISLIQVGGLGFMTMAVLFWLILGRKVTFRERLLIQQSLNVIDLSGIIKLAKQVIVLTLTIQIFIATLLAVRFVPELGLQKGIAFSLFHAVSGFNNAGFDLFGDFRSLTQYTADPIVNFAIGLDIILGGIGFTVMTDAIRYRKRKKISLHSKLALYITAILLLFGMVVFLLLEFNNTLASLSFGGKLWASWFQSVTPRTAGFNTIDLTAMRPVTLFFIILLMFIGASPGSTGGGVKTTTFGIVVLALISLARGKEDAEVFYRRISKEQVYKGLGIILLAMGWIIFATLLLGAVEKADFLKILFEVVSALATVGLSAGLTPTLSDFGQVVIMFTMFLGRLGPLTVAYALATKQQRKQQFRYPEERIIIG >NC_009253.1|WP_011877959.1|1755439_1755796_+|50S-ribosomal-protein-L20 MPRAKSSVVSRNRHRKILKLAKGYRGSRSKLFRVANQAVMKGLFYAYRDRRQKKRDFRKLWIARINAATRMNGLSYSRFINGLKKAGVEVNRKMLADLAVNDAKAFGQLVELAKSKLA >NC_009253.1|WP_011877958.1|1755208_1755403_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKIKTHRGAAKRFKKTATGKIRGWHAFHSHILGKKTAKRKRNLRKSTIIHESDAVRISRLLPY >NC_009253.1|WP_011877968.1|1768843_1770478_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas4/Cas1 MAEHNISNEQHYFPISSVAEILYCPRNFYYRVVEGAEDSNHHLLEGKLQEERRDERQRLVREGYRQDRSIHVSSEKLNLYGIVDIVEQGKEIYPVEYKKGFRKESLNDDVQVCAQAMALEEKLGQDINRGYIYYAGSKARREVIFDEDLRLMVENAVGLARNIALSGEIPPPLADNRCEGCALVNRCLPFEVKGIKENKAKAVRPQPGINLGRVLYVDEQGASLYKKGERVLVTKDQIKFKDIPLCNLDQVVLVGNVNLSSQLIKLFLGRGTEVHFISTKGKYYGCLQAALSKNSVLRIAQHRAYQKQEERLLYASEFVRGKLSNMRTNLLRYNRSLNNHSIDEAVSRIKNIIKRLEKAKDLNELMGLEGAGSRDYFSVFGLLIKDRVPFDFNKRSRRPPEDPANALLSFSYSLLLKDVITAVQVVGFDPFIGFLHRSDFGRPALALDIIEEFRPVVADSVVLTALNKGVIAEGDFEYRMGGCFLSETGRKKMYRLYEERRKEMITHPVFGYRISYLRTIELQARFLAKVLTKEIDGYKPFLVR >NC_009253.1|WP_011877969.1|1770482_1770761_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKQYIISYDITNDKRRNKIRKLLCDYAVPVQYSVFEARLSEEDYIMLRHKLSRLLRKDEDSIIFYLQCSRCRDGIIRLGNCSDPFGDGIYIV >NC_009253.1|WP_011877970.1|1771039_1773382_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MIYETIQLAGLLHDIGVFFQRGNISNLNSLQYSEISARLIKSFSKQLSKICDSELLKNLILNQYEDTDFSQEAIPKNKINLTYLISRADRYSSSELEQDTVEIYNYKKRPMDAVFCHLEIGKKVPQRMQYSLAEYRPENGFPREIISHTEGEINKILTDFSLEFKNIVSNIKSFECFYNQLYSLLLKYTWCIPYNTREKIADISLFDHLKTTSAIATCLYQYHNFCNDYSIPSIIDDQTFKFRLLVGDLSGIQSYIFSGANVGAGGVAKRLRARSFILSMLSELISYQIIKSFNLTVANILMASGGKFYILLPNTKESVSRLEKLQQKLDKYLLQEFKGEIALNLAHQELNGNDFCQFGSAVSRLSKKLAVKKKMPFANVMYSQEEWKEGQFIFHAEDTKGLGICKGCEKEFAIQQVEDKVYGPACLRDLKIGQKLPRIKSFALTDGEADIKISGSYGIRLYDNVPSNTDLDIVILNDNKIDPNVSMTNRYMANYVPNNQGITKSFDEICQNSSGVKKLAYFKADVDNLGGLFAFGFKGGLESGQNKDYDSISRVTTFSRMLDLFFSGRVNQLVSNEFTNCYIVFSGGDDLLVVGPWDEIIEFSLKIYQEFRKFVAYNDNITISAGIGLAKSKTPVVKAVQVAEDLLEEAKEKVLRGNKTGRNQVSIFDRTLSWHDFSAAVQEGKRLAKWITEGKLNRSDIWKLKRYDQMFQDFWQNHRVEGLKYQALLAYDIGRKRKENKDCQEVTRWQECLFSITNPSLINLGVITDYALCATRGGNI >NC_009253.1|WP_083755152.1|1773354_1773891_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MCNQGREYLMSDWKKQLQGYKDKQGNRNQPHQGKRDKNDMGYQRYTTPGLPDGYLSKGYFDDQGCLLEILLTETASKIAKSFGSNMNNSQLRRFYGHAKTAEKSYAFSGDERKFINDIKALDSFVAEAKGKDKVPQIFYDFINVNVAKANSLKDIKQGFLPHFQAVVAYFTYHYPKSK >NC_009253.1|WP_011877972.1|1773912_1774560_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MKLLKTSIIKGKIECITGMRIGGSAEAIEIGGIDNPVIKHPVNNEPYIPGSSLKGKMRSQMEKIEGKVNEKPCGCADKGCMVCRVFGPHNRPKHDLGPTRILVRDAMLSDESRQEMIRIIQEGKSYIEIKTENIIVRTTGVANHPRTQERVPAGAKFDFEIVVQVFDIDLEKDVIDFVKKALKSVENSYLGSSGSRGYGQVHFTKLTLDGEEFKL >NC_009253.1|WP_011877973.1|1774575_1775505_+|hypothetical-protein MKLYKLKIEPKSSQITPWHSDTIFGSLCWVLAQSRGQEKLRDFLHEYTGNCYPMVVSNGFPGDYLPKPMGGNTFNTNDNRIKQEAIRLAQKAKEAKKTNLLSLEEFNTIINNGQVEIKPKEKLYLENGVMHNQLSRLTGTTSDGSLYELTETFWSSSHISIYLGISSGWEKEVFTLFEILSLKGFGKRISVGKGYFKIMDCTEFKDLTIPESPNSIVTLSNYVPRSHDPYLGQYKTFVKYGKLGQNYAVSGNPFKKPLLMIMPGAVFWTENPQFAYGRMVKGISPSYPEVVQCGCALAIPSYIEKVEME >NC_009253.1|WP_011877974.1|1775509_1776769_+|hypothetical-protein MDILISAVGVRDPYAKDGSKGAVLTLVDKLKPDICFLFGTDPGVNEEVENTHQRALQIKQIVKESVKIISIPMVLPDPTDHREILLCFEQHLNEIITKYHTTKPHYHVNVSSGTSQMHAALMLLFNGRRLKAKIYQVKEPRFVNCEAERVAEVDASFIEEENYIFRAKKFFLNFNFSAAQDELIELALFTTREKRQKRAELFSDICRAYKYWDRYEHEQARDILEKLIVDIQRFKINELADITIRQINILKSICANKPRETVATIKDLLHNANRKKIIGEYGDCLNRYKRLIDGLAACKCGLTGSKRVNDQPVWVQDILIHKKKNDNLYYSDYLTIYREKNNKEMIPQSLNDKMLSLNRRRNTSYVAHGMDSVSKQDAEESINILWKMATSLFSGEKWKEYEFSADVILNISELLFNDL >NC_009253.1|WP_011877975.1|1776785_1777583_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MLTALQVELEAVADGALPVGNALYIHGLFFRLLQEVNINISDYLHNVQSIKPYTLSTLQGVKQNKGWCSVCQGKKYRFRATFMQEEVFLNFYEVVYSYYVNKKTVKIGNIDFLVSKIDLERTNKFEDLIGNEVNLQKFEIDFLSPTNFRVNGIQHIFPDSHTVFKSYKNRWNTFCPNHLIFPEHDLSLIYDGCYSVRYNLHTEIIEMGKYKMVGFKGTCRYEINPKLSGELRDRASGLLKFARYCGTGYKTTMGLGQTKVSFMIK >NC_009253.1|WP_011877976.1|1777778_1778051_+|cell-division-protein-ZapA MSNQANRVEVEIFGEYYTLKGHESPEYMLKVAHLVNKKMMEISERNPILSSNKVAVLTVVNLIDELLKLQEQYNNLLQMMDPEKGDSSNS >NC_009253.1|WP_011877977.1|1778178_1779888_+|DNA-polymerase/3'-5'-exonuclease-PolX MQNIEVAWIFTELADLLELNGEDIYKIRAYRRAAEVIAKVEEPLQELHRRKLLSKLPGVGKAIEGKIEEILETGKLAKHQKLLQEIPLGVLEIKQLPGIGPNRARTLYKELGISNLAELEQAVQQRQVRTLKGFSAKVEWDILNGIEMIRNRRGRTRLSVSRELAEELIKFFKLLPGTVEIEVAGSTRRWKETVGDLDLVAAAEEPAPLLRALATHPRVKDILEEQENRIRVYTWWGIAVDLQVVSPSEFVATLHRSTGSKAHYAKLQKIAEEQQLRLSHHGLRNQQDHFLPIRQEAEIYQALGMAYVPPELREDNGEVETALAGKLPPLIELADIKGDLHIHTTWSDSALEIDDIINRCREKGYSYAAITDHSRSLKIANGLDLDRLEQQHQIIRERDQELADFALLTGVEMDILPNGELDYPDEILEKMDVVIGSVHMGFKQSKKDMTRRITKAMENEHVDIIAHMSGRILGKREPYDIDMEALIETAAKTGTILEINSSPDRLDINEVYARKARDMGVKISINTDAHDLRRLDEMVYGVAVARRAWLEPQDVINTLNIEDLREVLR |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 196360-196397 | 0 | 1.0 |
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 572765-572802 | 0 | 1.0 |
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 671686-671723 | 0 | 1.0 |
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 839709-839746 | 0 | 1.0 |
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 2851086-2851123 | 0 | 1.0 |
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 3410144-3410181 | 0 | 1.0 |
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 3520097-3520134 | 0 | 1.0 |
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 326577-326614 | 0 | 1.0 |
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 1106496-1106533 | 0 | 1.0 |
| NC_009253_2 | 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082924-1082961 | 38 | NC_009253.1 | 1518654-1518691 | 0 | 1.0 |
1. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 196360-196397, mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 572765-572802, mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 671686-671723, mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 839709-839746, mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 2851086-2851123, mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 3410144-3410181, mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 3520097-3520134, mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 326577-326614, mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1106496-1106533, mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1518654-1518691, mismatch: 0, identity: 1.0
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009253_1 | 1.21|587012|27|NC_009253|CRT | 587012-587038 | 27 | NZ_CP040345 | Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence | 451896-451922 | 6 | 0.778 |
| NC_009253_2 | 2.29|1081794|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1081794-1081827 | 34 | MN693075 | Marine virus AFVG_25M503, complete genome | 25515-25548 | 6 | 0.824 |
| NC_009253_2 | 2.41|1082593|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082593-1082625 | 33 | MF403008 | Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome | 37469-37501 | 6 | 0.818 |
| NC_009253_2 | 2.50|1083194|32|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1083194-1083225 | 32 | KP282673 | Acidianus bottle-shaped virus 2 strain ABV2, complete genome | 4792-4823 | 6 | 0.812 |
| NC_009253_1 | 1.12|587145|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 587145-587179 | 35 | NZ_CP022118 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Macclesfield str. S-1643 plasmid unnamed1, complete sequence | 57921-57955 | 7 | 0.8 |
| NC_009253_2 | 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080266-1080298 | 33 | NC_019507 | Campylobacter phage CP21, complete genome | 4275-4307 | 7 | 0.788 |
| NC_009253_2 | 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080266-1080298 | 33 | MT932329 | Campylobacter phage F379, complete genome | 66001-66033 | 7 | 0.788 |
| NC_009253_2 | 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080266-1080298 | 33 | HE815464 | Campylobacter phage CP21 complete sequence | 4275-4307 | 7 | 0.788 |
| NC_009253_2 | 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080266-1080298 | 33 | MK408758 | Campylobacter phage CP20, complete genome | 93607-93639 | 7 | 0.788 |
| NC_009253_2 | 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080266-1080298 | 33 | FN667789 | Campylobacter phage CPt10, complete genome | 93441-93473 | 7 | 0.788 |
| NC_009253_2 | 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080266-1080298 | 33 | NZ_CP040048 | Acinetobacter baumannii strain VB1190 plasmid unnamed1, complete sequence | 474593-474625 | 7 | 0.788 |
| NC_009253_2 | 2.41|1082593|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082593-1082625 | 33 | MK295204 | Shigella phage vB_SdyM_006, complete genome | 135988-136020 | 7 | 0.788 |
| NC_009253_2 | 2.41|1082593|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1082593-1082625 | 33 | MG696114 | Proteus phage phiP4-3, complete genome | 29701-29733 | 7 | 0.788 |
| NC_009253_2 | 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080266-1080298 | 33 | MN692960 | Marine virus AFVG_117M7, complete genome | 7849-7881 | 8 | 0.758 |
| NC_009253_2 | 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080266-1080298 | 33 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 180370-180402 | 8 | 0.758 |
| NC_009253_2 | 2.7|1080331|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080331-1080364 | 34 | MN693120 | Marine virus AFVG_25M98, complete genome | 58008-58041 | 8 | 0.765 |
| NC_009253_2 | 2.50|1083194|32|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1083194-1083225 | 32 | NC_010470 | Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1, complete sequence | 37411-37442 | 8 | 0.75 |
| NC_009253_2 | 2.50|1083194|32|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1083194-1083225 | 32 | JQ340088 | Halocynthia phage JM-2012, complete genome | 33899-33930 | 8 | 0.75 |
| NC_009253_3 | 3.1|1086763|33|NC_009253|CRISPRCasFinder | 1086763-1086795 | 33 | NZ_CP017077 | Novosphingobium resinovorum strain SA1 plasmid pSA2, complete sequence | 386255-386287 | 8 | 0.758 |
| NC_009253_2 | 2.32|1081993|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1081993-1082025 | 33 | MT422786 | Bacillus phage Novomoskovsk, complete genome | 7938-7970 | 9 | 0.727 |
| NC_009253_2 | 2.49|1083128|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1083128-1083161 | 34 | KT997846 | Uncultured Mediterranean phage uvDeep1-CGR2-KM23-C896, complete genome | 29092-29125 | 9 | 0.735 |
| NC_009253_2 | 2.7|1080331|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080331-1080364 | 34 | NZ_LR134433 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 24 | 172613-172646 | 10 | 0.706 |
| NC_009253_2 | 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080069-1080102 | 34 | NZ_CP046724 | Pantoea agglomerans strain ASB05 plasmid pASB05p2, complete sequence | 199805-199838 | 11 | 0.676 |
| NC_009253_2 | 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080069-1080102 | 34 | NZ_CP034471 | Pantoea agglomerans strain CFSAN047153 plasmid pCFSAN047153_2, complete sequence | 131682-131715 | 11 | 0.676 |
| NC_009253_2 | 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080069-1080102 | 34 | NZ_CP034150 | Pantoea agglomerans strain L15 plasmid pPagL15_2, complete sequence | 174704-174737 | 11 | 0.676 |
| NC_009253_2 | 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080069-1080102 | 34 | NZ_CP031651 | Pantoea agglomerans strain TH81 plasmid unnamed2, complete sequence | 99400-99433 | 11 | 0.676 |
| NC_009253_2 | 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080069-1080102 | 34 | NZ_CP034476 | Pantoea agglomerans strain CFSAN047154 plasmid pCFSAN047154_2, complete sequence | 64123-64156 | 11 | 0.676 |
| NC_009253_2 | 2.13|1080725|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080725-1080759 | 35 | NZ_CP017691 | Geobacillus thermodenitrificans strain ID-1 plasmid pLDW-2, complete sequence | 218-252 | 11 | 0.686 |
| NC_009253_2 | 2.13|1080725|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1080725-1080759 | 35 | NZ_CP017691 | Geobacillus thermodenitrificans strain ID-1 plasmid pLDW-2, complete sequence | 70312-70346 | 11 | 0.686 |
| NC_009253_2 | 2.48|1083062|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1083062-1083095 | 34 | NZ_CP022517 | Pantoea vagans strain FBS135 plasmid pPant1, complete sequence | 141864-141897 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.21|587012|27|NC_009253|CRT matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ctacataatatataaattatgtagcga CRISPR spacer atacgtaatatataaattatgttataa Protospacer ***.***************** ...*
2. spacer 2.29|1081794|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693075 (Marine virus AFVG_25M503, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
attttgttcttttgttgtaatctcctgtactttt CRISPR spacer attttgttcttttgttttaatctcattttgcttt Protospacer **************** ******* * * .***
3. spacer 2.41|1082593|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF403008 (Agrobacterium phage Atu_ph07, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
atattcggtttgatctagttctgttgctatgtc CRISPR spacer atcttcggtttgatctagttctctttttgtttc Protospacer ** ******************* ** .*.* **
4. spacer 2.50|1083194|32|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KP282673 (Acidianus bottle-shaped virus 2 strain ABV2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tgattactattatcaacgagtaaaaaatttac CRISPR spacer tcattattattatcaacgagtaaaaattaaaa Protospacer * ****.******************* * *
5. spacer 1.12|587145|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022118 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Macclesfield str. S-1643 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
caaaagataaaaataatag---tatcatttaatcaggg CRISPR spacer ctaaagataaaaataatagttttattttttagtca--- Protospacer * ***************** ***. ****.***
6. spacer 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019507 (Campylobacter phage CP21, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tatctatagaatttttaatatgttcttttaact-- CRISPR spacer tatctatagaattttta--attttttcataattat Protospacer ***************** ** **.*. ***.*
7. spacer 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT932329 (Campylobacter phage F379, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tatctatagaatttttaatatgttcttttaact-- CRISPR spacer tatctatagaattttta--attttttcataattat Protospacer ***************** ** **.*. ***.*
8. spacer 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HE815464 (Campylobacter phage CP21 complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tatctatagaatttttaatatgttcttttaact-- CRISPR spacer tatctatagaattttta--attttttcataattat Protospacer ***************** ** **.*. ***.*
9. spacer 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK408758 (Campylobacter phage CP20, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tatctatagaatttttaatatgttcttttaact-- CRISPR spacer tatctatagaattttta--attttttcataattat Protospacer ***************** ** **.*. ***.*
10. spacer 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN667789 (Campylobacter phage CPt10, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tatctatagaatttttaatatgttcttttaact-- CRISPR spacer tatctatagaattttta--attttttcataattat Protospacer ***************** ** **.*. ***.*
11. spacer 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040048 (Acinetobacter baumannii strain VB1190 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tatctatagaatttttaatatgttcttttaact CRISPR spacer tttcacaagaatttataatatcttcttttaatt Protospacer * ** ******* ****** *********.*
12. spacer 2.41|1082593|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK295204 (Shigella phage vB_SdyM_006, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
atattcggtttgatctagttctgttgctatgtc CRISPR spacer tttttctgtttgatctagttttgttgcattttc Protospacer * *** *************.****** * **
13. spacer 2.41|1082593|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG696114 (Proteus phage phiP4-3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
atattcggtttgatctagttctgttgctatgtc CRISPR spacer tttttctgtttgatctagttttgttgcattttc Protospacer * *** *************.****** * **
14. spacer 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN692960 (Marine virus AFVG_117M7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tatctatagaatttttaatatgttcttttaact CRISPR spacer ttgtaacagaatttttaatatgttgttctaaca Protospacer * . *.***************** **.****
15. spacer 2.6|1080266|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tatctatagaatttttaatatgttcttttaact CRISPR spacer tggctttagaatttttaatatattcttctgaaa Protospacer *. ** ***************.*****.*.*
16. spacer 2.7|1080331|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693120 (Marine virus AFVG_25M98, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atttagtaaaccattttcaagaatatataaagca CRISPR spacer atttggtaaaccatcttcaagaattcttagaacc Protospacer ****.*********.********* . **.*.*
17. spacer 2.50|1083194|32|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010470 (Leuconostoc citreum KM20 plasmid pLCK1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgattactattatcaacgagtaaaaaatttac CRISPR spacer ggaccttttttataaacaagtaaaaaatttac Protospacer **.. .* **** ***.**************
18. spacer 2.50|1083194|32|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JQ340088 (Halocynthia phage JM-2012, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgattactattatcaacgagtaaaaaatttac CRISPR spacer cgagtactattatcaatgagtaaattaattga Protospacer .** ************.******* * **.
19. spacer 3.1|1086763|33|NC_009253|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017077 (Novosphingobium resinovorum strain SA1 plasmid pSA2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
agctttggacactcctataccaacaccttctgg CRISPR spacer agctttggacattcctgtaccaacagcgttcca Protospacer ***********.****.******** * *.. .
20. spacer 2.32|1081993|33|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT422786 (Bacillus phage Novomoskovsk, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atctaaaagtgattgttactatattttatctgc CRISPR spacer agctaaaagtgattgtcattatattttgcgctt Protospacer * **************.*.********.. . .
21. spacer 2.49|1083128|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT997846 (Uncultured Mediterranean phage uvDeep1-CGR2-KM23-C896, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
---cctagactgcaatactatacataccacttgacag CRISPR spacer atgttta---tacaatactatacattccacatgacat Protospacer ..** *.************* **** *****
22. spacer 2.7|1080331|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134433 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 24) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
atttagtaaaccattttcaagaatatataaagca CRISPR spacer ttcccaaaaatcattttcaagaatatgtaaaccg Protospacer *.. . ***.***************.**** *.
23. spacer 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046724 (Pantoea agglomerans strain ASB05 plasmid pASB05p2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
accgcctcattgtcagtggttattatgcaatgta CRISPR spacer gccgccgcattgtcagtcgttattaacctgctcg Protospacer .***** ********** ******* * .. ..
24. spacer 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034471 (Pantoea agglomerans strain CFSAN047153 plasmid pCFSAN047153_2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
accgcctcattgtcagtggttattatgcaatgta CRISPR spacer gccgccgcattgtcagtcgttattaacctgctcg Protospacer .***** ********** ******* * .. ..
25. spacer 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034150 (Pantoea agglomerans strain L15 plasmid pPagL15_2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
accgcctcattgtcagtggttattatgcaatgta CRISPR spacer gccgccgcattgtcagtcgttattaacctgctcg Protospacer .***** ********** ******* * .. ..
26. spacer 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031651 (Pantoea agglomerans strain TH81 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
accgcctcattgtcagtggttattatgcaatgta CRISPR spacer gccgccgcattgtcagtcgttattaacctgctcg Protospacer .***** ********** ******* * .. ..
27. spacer 2.3|1080069|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034476 (Pantoea agglomerans strain CFSAN047154 plasmid pCFSAN047154_2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
accgcctcattgtcagtggttattatgcaatgta CRISPR spacer gccgccgcattgtcagtcgttattaacctgctcg Protospacer .***** ********** ******* * .. ..
28. spacer 2.13|1080725|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017691 (Geobacillus thermodenitrificans strain ID-1 plasmid pLDW-2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tgcggcaagaagtgccttttcaactgcattatcaa CRISPR spacer aaactcaaaaaatgccttttcaactgcattttttg Protospacer . ***.**.****************** *. .
29. spacer 2.13|1080725|35|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017691 (Geobacillus thermodenitrificans strain ID-1 plasmid pLDW-2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tgcggcaagaagtgccttttcaactgcattatcaa CRISPR spacer aaactcaaaaaatgccttttcaactgcattttttg Protospacer . ***.**.****************** *. .
30. spacer 2.48|1083062|34|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022517 (Pantoea vagans strain FBS135 plasmid pPant1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
actataacagataacagtcataacctacataaca CRISPR spacer gcctaaacagatcacagtcattacctacaccgtc Protospacer .*. ******* ******** *******. ..
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
256397 : 321588
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009253|256397:321588|DBSCAN-SWA 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51 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
350739 : 357142
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009253|350739:357142|DBSCAN-SWA CTTGGCTGTTAATTTGCAAAAAGGTCAAAAGGTTGACTTAACAAAAGGGAGATCTAACCTTTCAAAGGTGGTTGTTGGCCTGGGATGGGATACTAACAAATTTGATGGCCCAGACTTTGATTTAGATGCGTCTGCTTTCCTGCTTGGCGAGAACGGCAAATGCGCTAGTGCCGATGACTTTGTTTTTTATAATAACTTAAAACATGTTAGCGGTTCTGTTATGCATATGGGAGATAACCTTACTGGTGATGGTGATGGTGACGATGAACAGATTACCATTGATTTAAGCAAAGTACCTGCCCATATTCATAAAATTGCTATTACCGTTACCATTCATATGGCCAAAGAACGTAACCAGAATTTCGGTCTGGTTTCCAATGCCTTTGTTCGTGTGGTAGACGATAGCAACGGTTCTGAGCTGCTACGCTATGATTTAAGTGAAGATTACAGCATCGAAACCGCCCTGGTATTTGCAGAACTCTACCGTCACGGTTCCGAATGGAAATTTGCTGCAGTTGGTCAAGGCTTCAACGAAGGCTTGCAAGGATTGGTTAATCTATATGGTTTAGCCTAAGGAGGGAATTAATTCGTTGATTAACTTACAAAAGGGGCAAAAGATTGATCTCACCAAAACCAACCCTAACCTTTCGAAGATTATGGTTGGTTTGGGTTGGGATCCAGTTAAAAGCGGTGGTGGTGGTTTCCTGGGTGGTTTATTTGGTGGAGGAAGCCCCAACATTGACTGCGATGCGTCAGTTTATCTTTTGAATGCCAATGGAAAGCTAGCCAAGGATAAAAACCTTGTTTATTTTGGTAATAAGACAAGCCCTTGTGCAAGTGTTCGTCATGCCGGCGATAATGTTACCGGGCAAGGTGATGGTGATGATGAACAAATCTTTATTGATCTGACTCAGGTACCTGCCGATGTTCACCGCTTGGTATTTGTAGTTAACATTTATGATTGCGTGGCACGTAAACAGCATTTCGGCATGATTCAAAATGCTTTTATCCGTGTTGTAAACAGTGCCAATGGCCAAGAGTTGTGCAAGTTTAATTTATCGGAAGGTTACGAGGGAAAGACTAGCCTGATCACCGGCGAGGTTTATCGCCATAATGGTGAATGGAAGTTTGCTGCCATTGGTGAAGCTACCACAGACCCCGGTCTAAAATCCTTAACCCAAAGGTACTTGTAGAAAAAAATAATTCTGAGGGGGTATATGTTTTGATATCTCTGGCAAAGGGTCAAAAGATTGATTTAACTAAAAGCAACCCTGGATTAAGCAAAATTCTTGTTGGTCTCGGTTGGGACACCAATAAGTATGATGGTGGTCATGAATTTGATTTAGATGTTGTTGCTTTCCTGGTGAATGCCGAAGGCAAAGCCACCGGGGACAGTGCCTTTATTTTTTACAATAATAAGCAAGATGCCAGTGGTTCCGTTATTCTCTCCGGTGATAACCGCACCGGCGAGGGTGATGGCGACGATGAATATATAAAGATTAACCTGTCTGGTGTGCCCGCAGAAGTTGATAAAATTGCTGTTTGCATCAATATCCATGATGCGGCAACTCGCAGCCAAAACTTTGGACAAGTTTCCAATGCCTACGTTCGCGTGGTAAATGATGAAACAAATGAAGAACTTATGCGCTACGACCTGGGCGAAGATTACTCCATCGAAACGGGTCTTGTGGCCTGCGAAATCTATCGTCATAATGGCGAATGGAAATTCAATGCAGTGGGAAGTGGTTTCCAAGGGGGACTGGCATCCCTGGCCGCAACCTATGGCTTAAACGCTGGCTAAATAATTGACGAACTTTACGCAAAGGGGTGCTGTCTAGGCACCCCTTTCTTAGAAAGTACGTGTCAAATTGATTAAGGGGTGGATGGTATTGGGTTTATCCGGTTTCAACTTTAGTATAAGAGAGAATAGACAAGACAATACAGGAACTTAAGGACTATTTAAGGAGGCTTTTATTAATTGGAAGCTGTAACAACGTTTTTGACCGGGCTGGTTGCCAACTATGGCCATTTTTTCTCCTGGCAGGATATTCACAGGGTTATGACTGACCCTGTGAGTTGGGGCATTGTTTTTTGGTTAGTTATCCTGGAAGGGCTGCTATCCTGTGATAATGCCTTGGTATTGGCAGTGGTAGTGAACAAACTACCGAAACATCAACAGAAAAAAGCATTGCTCTATGGTATTTGGGGAGCGTATTTCTTCCGTTTTATTGCAATTGGCCTAGGAACATATTTAGTAAAGATAAAATGGGTGCAAATTCTAGGTGCGGGATATCTGCTATGGATGGCAGGTAAATTCTTCCTCTCTAAGGGTGAGGAAGCAGATGAAGGTGATGGAGAAGCGAAGGTAAGCGGCTTCTGGTTAAAAATGGTTGGACCCTTTTGGGCCACTGTAATAACGGTTGAATTAATGGATATCACCTTTAGCGTCGATAGTATCCTGGCAGCCTTTGCTATGAGCAACGAAGTTTGGGTTTTGTTCATGGGAGGGATATTAGGTATTTTGATGATGCGGGGTGTAGCGACTATTTTCATCAAATTGCTTGAGAAATATCCCGAGCTGGAGGCGTCGGCATATGTTTTGATCGCTTTAATTGGCGGTAAACTGATGGGACAAGCCTTTGGCTACCATATACCCCATGGCATTTTCTTCTCTATAATGGCGGCTGTATTACTGGGCACCATTGTGCTTCATCACTTGCGAGAAGGTGGTAATAAAGCAGCATGATTCACTTTGCTTATTTCAAAGAGGAACAAAGGAAAAAGATGTTCTTTATTCCTCCGGTCGAATTACGAGAGGATCATGATAAGGACACTTTGGCCCATGCCTTAGGGGCTACCCTGTATATGCCGGGTACTGCCAACAGGGCCATTGATAAAGTGATTAACAATGAAATCCCCGGTCTTACCTCTACGGTTCTTTGTCTTGAGGATGCGGTAGACGATCGGGAAGTTGAAGATGCTGAGGAAAACCTTGCTTTGCAGCTGGGGACTCTGCTTGCAATGGCAGAAAAGGGGAGTTCGCTCCCCTTTATCTTTGTTAGGGTTCGCAATGTGGAGCAATTTAAAAGGCTGACCCAAGTCCTTGGGGAAAGCATCCATGTGTTAACCGGTTTTGTATTTCCAAAATTTGACATGATGGCCGGTCAGGAATATTTTGCACATCTTACTACAATTAATAAAACTACGAAGAAAACTATATATGGCATGCCCATATTAGAGGGGCCATCCGTGATTCATCTGGAATCAAGGGTAAGAGAGATGCTAAAAATTAAGGAACTGCTTGATCAATACAAGGAGTTAGTATTAAATGTACGCATGGGAGCAACGGATCTTTCTGGTTTGTATGGTCTTCGCAGGAGCCCGGAACTTACCATCTACGATGTCTCTGTAATTCGAGACTTTATTGCAGATATGGTCAACATATTTGGTAGACCTCAGGATGGTTACGTGATCTCGGGTCCGGTATGGGAATATTTCAATAACACGGCAAGGATGTTAAAGCCCCAGTTAAGAAAAACCCCTTTTCAAGAACAGTATGGCAGAGCAGGAGAAAGCTTCCGCTTAGAGCTTCTTGGCAGATACATTGATGGATTAATGCGTGAAGTTATGCTTGATAAAGCAAACGGCTTAGTGGGGAAAACCATCATTCACCCATCCCACATTTTGCCCGTTCAGGCTATGTATGTGGTAACACACGAAGAATATTGTGATGCCAAAGATATCTTGGCCAATGGTGGAAACGGTGGGGTAACCAAGAGTGTGTACGGTAATAAGATGAATGAAGCCAAACCTCATATTAACTGGGCAAAGAAAATCATGATTTTAGCAAAGATATACGGGGTGTTAAATGAGAGGTATGACTATACAAGCATTATCTACGAAGGAGAAAAACTACAAAATATTGGATAACCTGATGGTAGGGATAAGGATGGAAGAAAATCCTTATTCCTTAACCATCGATAGCATATTCTCAATGGCAGCCAGGAACAACCCCAAGAGAAGTTTTTTATTTGTTAGTAAGTTAATCGGCAAACATATTCCGGTTCTACCCAATGTACCCCTGATAACAGGCTTTCTCTTAGCATCCCGGTTGGCTGAATTATGGGGACTTTCTGTAGGCAAGGAAACCATTAGGCATGCGGTAGCTAGTTTATCCGCTGGGGTTAATAATGAATTTCATCCACCATCCTATTCATTCCCAGGGAAGGCGTTATTTATTGGTTTTGCAGAAACAGCAACAGCCCTGGGCCACGCAGTCTTTAGTTCCTGTACAGGAAATATCAATTTCCTACATACAACGAGAGAAAACCTAGAAGGTAACCACGATACTATCTATTTTACAGAAGACCACTGCCATGCTCCGGACCAGCGGTGTCTTATCTGTCAAGGGTCCATAATGAAAGATAATGATTTGCTGGTATTGGTTGACGATGAAATCACCACAGGTAATACCTGTTTGAATATCATAGAGACCTTACAACAGAAATATCCGCAAAAGAGATATGTCATACTAACCATCTTGGATTGGCGTTCGGATGAGGCGATGGCAAAATATCGCCAGGTTGAGGGTGTATTAGGGGTTAAAATAGACGTCCTTTCTCTGTTAAAAGGACGGTTCTGGTACCAGGGGGAGGCTCCGGTTATTCCGCAATCACCCATTGCCCCGGAGGAAGGAATGCCTTGTGTAAGAAGCTTGTACAAGGAAATGGGTTTTCAAGTAGCTACTGTCTTGCCAGATGGCTCAAAGGTTTCCTATCTTGGTTATACTGGGCGCTTTGGCGTGGGTGTCAAGGAAACTAAACAGGCCCTGCTTAGAGCAAAGGAAATTGGCTATGAGCTTTTACAAGTTAGGAAAGGCAAGAAAACCCTTTGCCTGGGAACCGGAGAGTTTATGTATATCCCCTGTCTCATTGCCAAATACATGGGGGAAGGAATTATGGTACAGTCCACCACCCGAAGTCCGGTGCATCCTTACCTGGGCACGGACTATGCGGTAAAATATGCCATAAACTTTGAAGATCCCCATAACCCCGATGTTAAAAATTATATATACAATATTCCTCCTAATTATTATGATGAGGTATTTGTTTTTTGGGAGCGAAAAGTTGTGCCGGAACAAGTGAAGCCCTTTGTCCAAGCACTTCATAAACTAGGAATTGAAAACATTGTATTTGTTTACTTCACTGATGGTGCGGGAGGTGTTTCTAATCGAACAAATTGCTGATTTTGACAGATACGGCACACTGAATGCTTACCCCAAAGTACCTGACCCGAGACCCCTTGGAAGTTACTCCTCCCAAGATGTTATTTTTCTCTTAAAAGATATCGGCCCTTATATTCAGGAACAAGGCAACGAGGCAAGAGAAAAGGCAATTCAAAGTGGCAAGCACTATTCAGAAATGCTTCCCATTGAATATGAGCCCACCCAAGAATATATTGATTTGTTCCATAAGTCCCTCAAAGAAACCGGTTACAGACTGGCCCTGGCCACCGCCATTGTTGCGGAAACTATTTTAAAAAAGAGGGGCAAGAATCTGGTTTTGGTGTCCTTGGCCAGAGCCGGTACCCCCATAGGTGTCCTTATAAAAAGATACATACAGCAATTCCACGGTGTCAAAGCACCCCATTACAGCATTTCCATTATCAGGGACAAAGGAATTGACAAGAACGCCCTGATCTATATCCTGCAGCAACACCCTGGTTGTGAGGTTCAGTTTCTGGACGGGTGGACTGGCAAAGGTGCCATTACAATGGAACTAATCAAATCAGTCAGTGAATTTGAAAAGGAATTCAAGATGCCCCCGGATACAATCAGTAAGGATATGGCTGTGCTGGCGGACCCGGGCTATTGCGCAAATATTTTTGGCACAAGGGATGATTTTTTGATTCCCAGTGCCTGCCTAAACTCCACCGTATCTGGCTTAATGTCCAGAACGGTTTGTAGAGAGGACCTACTGGGACCTTTGGATTATCATGGTGTAAAATTTTACCGTCAGCTTCAGATAAAAGACCTTTCCAATTATTTTGTTGATGTAGTATCTGATTATTTTGCGAAGGCCCAGACAAAGGCCAAAACTATACTCCAACACAATCCCCAATTTGGCATAGATGAATCGCCGGCCTGGCTTGGCCAAAAAGATACCACTAGGGTCCAGTTGGAGTATGGCATCAAAAGCATCAACTATGTAAAACCAGGAGTGGGGGAAACAACCAGAGTATTACTGCGAAGGATTCCCTGGAAAATCCTTGTTAGAGACATGAACAGTCCGGATATAAAGCATGTGTTACTCCTGGCAAAGGACCGTGGAGTGACGGTGGAGGAACACCCTAATCTTAGCTATTCCTGTTATGGACTGATCAAGAATCTGGAGGATAGAAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009253|350739:357142|351960_352539_+|WP_011876724.1|DBSCAN-SWA MISLAKGQKIDLTKSNPGLSKILVGLGWDTNKYDGGHEFDLDVVAFLVNAEGKATGDSAFIFYNNKQDASGSVILSGDNRTGEGDGDDEYIKINLSGVPAEVDKIAVCINIHDAATRSQNFGQVSNAYVRVVNDETNEELMRYDLGEDYSIETGLVACEIYRHNGEWKFNAVGSGFQGGLASLAATYGLNAG >NC_009253|350739:357142|351328_351931_+|WP_011876723.1|DBSCAN-SWA MINLQKGQKIDLTKTNPNLSKIMVGLGWDPVKSGGGGFLGGLFGGGSPNIDCDASVYLLNANGKLAKDKNLVYFGNKTSPCASVRHAGDNVTGQGDGDDEQIFIDLTQVPADVHRLVFVVNIYDCVARKQHFGMIQNAFIRVVNSANGQELCKFNLSEGYEGKTSLITGEVYRHNGEWKFAAIGEATTDPGLKSLTQRYL >NC_009253|350739:357142|355945_357142_+|WP_049755920.1|protease|DBSCAN-SWA MVREVFLIEQIADFDRYGTLNAYPKVPDPRPLGSYSSQDVIFLLKDIGPYIQEQGNEAREKAIQSGKHYSEMLPIEYEPTQEYIDLFHKSLKETGYRLALATAIVAETILKKRGKNLVLVSLARAGTPIGVLIKRYIQQFHGVKAPHYSISIIRDKGIDKNALIYILQQHPGCEVQFLDGWTGKGAITMELIKSVSEFEKEFKMPPDTISKDMAVLADPGYCANIFGTRDDFLIPSACLNSTVSGLMSRTVCREDLLGPLDYHGVKFYRQLQIKDLSNYFVDVVSDYFAKAQTKAKTILQHNPQFGIDESPAWLGQKDTTRVQLEYGIKSINYVKPGVGETTRVLLRRIPWKILVRDMNSPDIKHVLLLAKDRGVTVEEHPNLSYSCYGLIKNLEDRK >NC_009253|350739:357142|352797_353484_+|WP_083755202.1|DBSCAN-SWA MTDPVSWGIVFWLVILEGLLSCDNALVLAVVVNKLPKHQQKKALLYGIWGAYFFRFIAIGLGTYLVKIKWVQILGAGYLLWMAGKFFLSKGEEADEGDGEAKVSGFWLKMVGPFWATVITVELMDITFSVDSILAAFAMSNEVWVLFMGGILGILMMRGVATIFIKLLEKYPELEASAYVLIALIGGKLMGQAFGYHIPHGIFFSIMAAVLLGTIVLHHLREGGNKAA >NC_009253|350739:357142|354660_355983_+|WP_156779705.1|DBSCAN-SWA MDNLMVGIRMEENPYSLTIDSIFSMAARNNPKRSFLFVSKLIGKHIPVLPNVPLITGFLLASRLAELWGLSVGKETIRHAVASLSAGVNNEFHPPSYSFPGKALFIGFAETATALGHAVFSSCTGNINFLHTTRENLEGNHDTIYFTEDHCHAPDQRCLICQGSIMKDNDLLVLVDDEITTGNTCLNIIETLQQKYPQKRYVILTILDWRSDEAMAKYRQVEGVLGVKIDVLSLLKGRFWYQGEAPVIPQSPIAPEEGMPCVRSLYKEMGFQVATVLPDGSKVSYLGYTGRFGVGVKETKQALLRAKEIGYELLQVRKGKKTLCLGTGEFMYIPCLIAKYMGEGIMVQSTTRSPVHPYLGTDYAVKYAINFEDPHNPDVKNYIYNIPPNYYDEVFVFWERKVVPEQVKPFVQALHKLGIENIVFVYFTDGAGGVSNRTNC >NC_009253|350739:357142|350739_351312_+|WP_011876722.1|DBSCAN-SWA MAVNLQKGQKVDLTKGRSNLSKVVVGLGWDTNKFDGPDFDLDASAFLLGENGKCASADDFVFYNNLKHVSGSVMHMGDNLTGDGDGDDEQITIDLSKVPAHIHKIAITVTIHMAKERNQNFGLVSNAFVRVVDDSNGSELLRYDLSEDYSIETALVFAELYRHGSEWKFAAVGQGFNEGLQGLVNLYGLA >NC_009253|350739:357142|353480_354668_+|WP_041274380.1|DBSCAN-SWA MIHFAYFKEEQRKKMFFIPPVELREDHDKDTLAHALGATLYMPGTANRAIDKVINNEIPGLTSTVLCLEDAVDDREVEDAEENLALQLGTLLAMAEKGSSLPFIFVRVRNVEQFKRLTQVLGESIHVLTGFVFPKFDMMAGQEYFAHLTTINKTTKKTIYGMPILEGPSVIHLESRVREMLKIKELLDQYKELVLNVRMGATDLSGLYGLRRSPELTIYDVSVIRDFIADMVNIFGRPQDGYVISGPVWEYFNNTARMLKPQLRKTPFQEQYGRAGESFRLELLGRYIDGLMREVMLDKANGLVGKTIIHPSHILPVQAMYVVTHEEYCDAKDILANGGNGGVTKSVYGNKMNEAKPHINWAKKIMILAKIYGVLNERYDYTSIIYEGEKLQNIG |
7 | Caulobacter_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
809587 : 818774
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009253|809587:818774|DBSCAN-SWA GATGTCTGCTGAATCTATGAATGGACTTCATCGTACTTTATACTGTGGTGAATTGCATAAGCAACATGAAGGCCAGGAAGTTACACTGATGGGGTGGGTGCAAAGACGTCGAGACCATGGGGGCCTAATCTTTGTAGATCTGAGGGATCGTTCCGGCATTGTTCAGGTTGTTTTTAGCCCGGAAGTAGATCAAGAAGCCTTTAAAAAGGCTGAAGGGGTTCGAAATGAGTATGTCCTGGCAGTGGTCGGAAGGGTAAACGGTCGTCCGGAGGGAACCATTAATCCTAATATGGCCACTGGAGAAGTGGAAGTTTACGCACATACCTTACGGTTACTAAACCGTGCCAAAACGCCCCCTTTCTATATTGAAGATAACATCGAAGTGGATGAGAACCTGCGTCTGCGTTATCGTTATCTTGATTTGCGCCGGCCAGAAATGCATAAGGCTATGATGCTACGCCATCGGGCCTCTAAGAGTATCAGGGATTTCCTGGATCAACATGGCTTTTTGGAAATTGAAACACCCATGTTAACCAAGAGTACCCCCGAAGGGGCCAGGGACTATTTAGTGCCCAGTAGGGTAAACCCCGGTAAATTTTATGCCTTACCCCAATCTCCCCAGCTTTTTAAACAAATTTTAATGTTAGCTGGTATGGAGCGTTATTTCCAAATTGTACGCTGTTTCCGGGACGAAGACCTGCGGGCGGACCGTCAACCGGAATTTACCCAAATCGACTTGGAAATGTCCTTTGTGGAAGCAGAAGATGTTATGGGCCTCATGGAACAAATGATTGCCGAAGTATGCAGTGATACCATCGGTGTCAAAATAAGCACACCTATCCCGCGTCTTTCCTATCAGGAGGCTATGGATCGTTTCGGTTCGGACAAACCTGACACTCGCTTTGGGCTAGAGTTAAAGGATATAACACCCATTGCTGCCCAGTGTGGTTTTAAAGTATTTAACAGTACAGTAGCTGGTGGAGGGCAGATTAAGGGAATCAATGCAAAGGGCTGTGCCAGTTTCTCACGGAAAGAAATTGACGATTTAACAGCCTTCGTAGCTGTTTATAAAGCTAAGGGTTTAGCTTACTTTATTATTAATGAAGATGGGTCGGTAAAATCGGCCATTGCTAAGTTCTTTACTGAAGAAGAGATTGCTGCCATCAAGGATAAAATGGAAGCACAACCTGGAGATTTACTGTTATTCGTGGCAGATAAACCTGCGGTTGTAGCTGCCTCTTTGGGGGCGTTACGGGTCCACCTGGCGGAACGCTTGGAGCTGATTCCCCAGGGAATGTGGAATTTCCTTTGGGTAACTGATTTCCCATTACTGGAGTACGATTCCGAAGCAGGACGTTTCTTTGCTATGCACCACCCATTTACATCACCGGCGGAGGAAGATCTGCCACTGCTGGAGAGCAATCCTGGTAAGGTTCGTGCCCGTGCCTATGATATGGTATTGAACGGTGTAGAAATTGGTGGAGGTAGTATTCGTATCCACCGTAGGGATATACAGGAGCTAATGTTTAAAGCCCTGGGTATGAGTCAAGAGGAAGCAAAGGAGAAATTTGGCTTTATGTTAGAGGCCTTTGAATACGGTGCTCCTCCCCATGGTGGGCTGGCCTTTGGTTTAGACCGTCTAGTCATGTTATTGGCCGGTAAAGACAGTATCCGTGATGTAATTGCCTTTCCCAAAACTGCCAGCGCAACCTGTTTGATGACCCAAGCACCGGATGTGGTGGATCCTGCCCAACTGGCAGAACTTCATATTCGTAGCACGGCTCCGGTTAAAAAGAGTAATTAATTGTTAACGGTTGAAGTTGAAAGTGTGGGTAATTCTAAGAGGAACCCACACTTTTTTATTTTTAATTATGGATATTCTTGGAAGTTGAGAGGTCTTGCGAAATAATTAAAGGTGTGTTAACATAATCTTAAATAAGTTCCTTCTTGAACAAGCATAATTTACCCTGCTTTGTGCGTGGGTTATCTGGGGTTTTGAGCCAACATTTTGCAAAACGGGAGTCCGGTTTCACGCAAGGAAATGTAGACCTTACATTGTATAAGGAAACAGGAAACTGCGGAAGGGCACCCACCTGTTGGAGAACAGGTTCAAAAAACCTTAGGTAACAAACACGGCATGGTGGGGTTTCCTATTGATGCTAAAGCAAACACCTCTTCCGAGGTGTTTTTTTATTTTAGAATTAAGGACTTCCCCACATGTAGAGGCTATCAGGACCAGGTGTCCTTTTGAGTATGGCACACCCTAAAGGGAATAACCTAAGGGTTACAAGTGAACAAGCCAAGTTTTTTAATCTCCTCCCTTTTTAAGGATCTTTTAAGGTTAAGGCCTTAGAATTAATGTATAAAATGAAGAGGAGGAGAACAAAATGTCTTTGCATTGGGAAAAGTTTAAAAAACCCTATGGATTTCTTCTGGCCCAAATAGGTTTCATTATTTTATTATTTGTCATTGCTATCCATTTCTCCAGCAACCAACTACATATGCTGTCTCTTGGGAATGGAACTGCAATGGCTCAGCAGCAATCAGATGGGTTTATTCGACCTGCTAATATTTCTGATGTTGTAAAGCAAACTGCACCAGCAGTGGTAAAAATTGAAACTATTATACAAACCAACATAAATACAAACCCCTATATAAACGACCCCTTTTTCAGGCAATTTTTCGGGAATCGGAGCCTGCCCAGTACACAGGTTCAAAAAGGAATGGGGTCTGGATTTATTGTTTCTGAAGATGGTTATATTATAACCAATAACCATGTTATTGAAGGAGCTACACAAATTCAAGTTACACTGACCACCAATAAGAGTTATCAGGCTAAGGTGGTTGGGTCAGATAGAGAATTGGATTTAGCAGTTTTAAAAATTAATCCAGATAATCAGTTAAAAACTCTTAAACTGGGAAACTCTGATCAAGCAGAAGTGGGAGACTGGGTAATTGCCATTGGCAACCCCTATGGTTTAGATCACACGGTAACAGTGGGGGTTATTAGTGCCAAGGGAAGGCCTGTAAGCATAGAAGATAAGAACTTCCGTAACCTTTTACAAACCGATGCCTCTATTAACCCAGGAAATTCCGGGGGTCCTTTAATTAATTTGCAAGGTGAAGTTGTGGGAGTTAATACGGCTGTAAATGCCCAGGCCCAAGGAATTGGTTTTGCTATACCATCAACAACAGTTGCATCTGTGTATAACCAATTGATTACAAAAGGAACAGTATCACACCCTTATTTAGGAGTAAATATTCAACCTACGCAAGATCAAAGGGGTGTGCTGGTTTCTGGCATTGTTCCGGACAGTCCTGCCAACGAAGCAGGTTTGCAAGTGGGGGATGTTATAGTAAAGTTTAAGGATATAAATTTGACGAACCCACAGGAACTTCTTGATGCGGTGGCTGAGTCCAGGGTGGGGGAAAAAGTTTCCCTTGTAATTGTGAGATCTGGACAAATGAAAGAAATTCAGGTAATAATGGGAGATAAAAGTAACCAAAAATTTTAAAGTATAAATGGAGTCACTATGATTTAAGTGAGGGGAGTTTATGGGTGCCAGGGTCTTGGTTATTGATGACGACCCTAAAATAACGGCCATGTTACAGAGGGCCTTAACCTATGAAGGATACAGGGTAGAGGTAGCTAACGATGGTTATAAGGGAATGAATATGGCAAAGGAAAACCCTCCAGAGCTATTGATACTGGATATTATGTTACCTGGTTTGGACGGTTGGGAGATTTGCCAGCGATTTAGAAAAGATAATTTCACCCCTATTTTAATCCTCAGTGCCAGGGATGAAGTGGAAAGTAAGGTAAAAGGTCTTAATTTAGGAGCAGATGATTATTTAGGTAAACCCTTTGCATTGGAAGAACTGCTGGCTCGTGTTCAGGCTTTGCTAAGGCGAAGGATAACTGCCAATAAAGTTATTCAATTTTCGGACCTGAAAATGGATCTAGAAGCCAGGGAAGTACGTAGAGCAGGAAATTTACTTACCCTTACATCCCGGGAGTTTGATTTGCTAGCTCATTTTATGCATCATCCGAATCAAGTATTAACTAGGGAGCAAATTATAGATCGAGTTTGGGGCTTGGACTTCACCGGAGGCTCCAATGTTCTGGAAGTCTATATTAATATGCTGCGACAGAAGATCGAAGACTATGGGTCAAGGATTATACATACGGTACGGGGAGTTGGCTATGTTCTGAAGGAGCAGGGATAATGACAATTAGACTTAAACTTACATTATGGTACAGCATTGTAGTAAGCTTAACTTTAATCGTTTTCTCCTTTATTATCTATACTTTTCTTTCCTATAGCTTGGCACAGGAAATTGACAGAGATTTGGCAGGTCGAGCCGTTGGTGTTATACGTTCTATTCGGGTTGTGGAAACTAGCTTTCTAACACCTCAAAAAATTGTGCTACCGGACGTGGATGTGTTTGGCTACCCCAATACCTATTTGCAGGTCGTGGATATGGACGGGCGTTTGGTGGCAAAATCCAGTAATTTGTTTAACCGGAATGTTCCCCTCAATGAAGATACCCTTCAACAGGCGAAGAACGGTGAGAGTTTTTATGAATGGGTTGAGGTAGGAAAACAAAGGATGCGTATATATAATTACCCTTTACTGGCCCAAAATCGGGTAGTGGGGTTGCTTCAGGTGGGACAACCCTACTCAGGGGCACAGATAGCTTTGAACCGACTTCGCTGGCTCTTATGGTTTTTTAGTGGATTGATGATCTTGGCTGCTGCTACCATAGGGTGGTGGCTGGCCAAGGTAGCTCTTAAACCTGTAGAAAACATTACAGAGACTGCAGCATCCATTCGCCATAGTTTGAATTTACAACAAAGGATTGCCTATGAAGGACCCAAAGATGAACTGGGGCGACTGGTGGCAACCTTAAACAGTATGCTTGATAGCCTCGAAACGGCCTATCAAGAGCTGGCTGATTCCCATGTAGCCCAAAGAAGATTCGTAGCTGACGTCTCCCATGAATTAAAAACACCTCTTACAACCATTCGGGGAAATATAGATTTAATACGTAGAATGGGTGAAGAACATCCGGATATCCGGCAGGAAGCGATGGAGGATATAGCCTCGGAGGCAGAACGTATGAGCCGGTTAGTTCTGGACATGTTGGTGCTGGCCCGGGCAGATGCGGGTCTTACCCTACCGCTTGAGCCTGTTTTTCTTAGTAAAGTCATACAACAGGTTGGGAGGCAGGCCAAGCTATTAGCCAAAGATATTGAGTTTAAAATCACTGTGGAAGAAAGCTGTGAGCAAGTTCAAATCCTGGCGGATACTGACTATGTTAAGCAACTTGTACTTATACTATTGGATAATGCTTTTAAATACACTGCAAGTCCGGGTGTAGTTGAGCTGCTTGTGCATTGTACCCATGAACATGTTAAAATTCATGTGAAAGATAACGGAGTGGGAATTGAACAGGCTGAACTGGAGCATATTTTTGAACGTTTTTACCGGTCGGATAAATCTAGACCGGTGGGAGGAAGTGGTTTAGGATTGTCCATCGCCAAGTGGATTGCCGAACAACACCAAGCCACCATAACCGTTAACAGTATTTTGCATAAAGGAAGCACTTTTATAATAACGTTTCCGATCTTTCAGTCTACTCTAAATTAAGTATTAGGAGGTTTCCGTGAATCTGCATAGATTTTCTAGAACAGAGATGTTGATAGGGGAAGAAGGTTTAGCCAAACTGGCTGCTGCCAAGGTGATTGTCTTTGGGGTAGGTGGGGTTGGTTCTTATACGGTGGAAGCTCTGGCCCGGGCGGGGGTTGGCGAATTAACTTTAGTAGATTTTGATACCGTCGATATTACCAATATTAATCGACAGCTACATGCTATGGACAACACCATTGGGCAATATAAGGTTGATTTAATGGCTGAAAGGGTACAATTGATTAATCCCCAGGCGAAAGTACTTCCACTAAAAATGTTCTACACTCCGGAAAATGGCGATGATTTACTCACAAAGGGTTATACTTATGTGATAGATGCCATTGATAATGTAACGGGTAAAATTGATATTATACAAAGATGTTATAAAAATAATATATCGGTGATATCCTGTATGGGTGCAGGAAATAAACTGGATCCTGCAGCCTTTCGGGTGGCAGATATCTCAGAAACCTCCGTGGATCCCCTAGCTAGGGTTATTCGACGGGAGTTAAGGAAACATGATATTCATAAAGGGGTGAAAGTGGTCTTTTCACTGGAATCGCCCCTCGTACCCAGAACAAAGCTAACCAAGGCAAAAAATGATACTGAAGTTGGAGCAAGGCAAAAATCCCTGGCACCGGGCAGCATATCCTTTGTGCCGGCGGCAGCGGGACTTATTATGGCCGGAGCGGTTGTCAGAGAGATAATACAAGTTTAATAATGGCTAACTGTATTTGACAAGGAGTCATGAAGAAAATATAATTGTTTTCGTCCCTTTAGGAACATCCTAAAGGTCTAAAAAAGGATAGGGAGATGTGTTTATGGCCGAAAACATAGTGGGTTTGACAGATGACAACTTCAAAAACACAATCCAAGCGGAACAATTACCGGTATTAGTTGACTTTTGGGCTAACTGGTGTGGACCTTGCAAAATGATTGCTCCGGAAGTTGAAGGTTTGGCTGCAGAATTTGAAGGTCAGGTACTAGTGTGCAAGTTGAACGTAGACGAAAGCAGAGAAACTCCAAATAGCTTGGGTGTCATGAGCATCCCAACTCTAATCCTTTTTAAGAATGGTCAAGAAGTAGAACGAACAATCGGCTTTCGAAAGAAAGAGGAACTGAGGGGTCTAATCAAAAAATATCTCTAATTAGTTTGTAGGGTATATACTGCTTAGTTTTCCAGAAAGTCTTTTAATTAAAAATAAACTTATTTGAATAGTACCACCCAAAAGGTGGTATTTTTTTATATTAGATTTTCTAAGTTTTAAACTTGAGTGTTTTGGTCGGAATTAATATTGACAACCCAAAAAACAAATGGTATTATATCCCCAGAAAACCGAGTGGTTTACTTGGGATTGTAAGGGGGGGATGTTACTTGCGGCTGTCCACAAAGGGTCATTATGGACTTAAGGCAATGTTTGACTTGGCCATGCATTATGGGTCCGAGCCAATCCCCTTAAAGGTAGTGGCCGAGCGGCAAAATATATCCGAACATTACCTGGAGCAACTAATTGCAGTTTTGCGAAAGGTGGGTCTTGTAAAAAGTATTCGGGGAGCGCAAGGTGGCTATATATTGGCCAAGCCTCCTTCAGATATAAAGGTGGGGGATGTTGTGAGGGCCTTGGAAGGTCCCATTGCTCCACTGGATTGTGTAAGTGAATTGGAACCAACTGTCTGCGAAAAGGTTGATTATTGTATTTCAAGGGATATATGGGCTAGGGTGAGGGACAGCATAGCGGAGGTATTGGATTCCATAACCTTGGAGGATATGTGCCTGGAGGCGCAAAAGGCGCAAAGTAATCAGATTGAGTCAAAACATATATAAGGTATTATAAGGAGGAGCAAACCATGCGAAAAGTTTATTTCGACCACTCAGCAACAACTCCTGTTGATCCTGCTGTTGTAGAAGAGATGATGAAATACTTAACCGAACATTTCGGTAATCCCTCCAGCATCCATGCCTTCGGACGTGAAGCCAGGAAGGCCGTAGAAAAAGCACGTCAACAGGTGGCAACAGCCATTGGAGCATCCAGTGTGGGCGAAATCAGCTTCACTAGCTGTGGCACAGAATCTGATAATATGGCCATTCGTGGTGTAGCCTATGCAAATCGTCAAAAGGGTAACCATATTATTACCACTGCTGCAGAACATAGTGCTGTCTTAGCCTGCTGTAAACAATTGGAGAGAGAAGGCTTTTCTGTAACTGTTTTACCTTTGGATGAATACGGCAGAGTAACTGCACAGCAGGTTGCTGATGCTATTACTGATAAAACGATTTTAATTTCTGTTATGCATGCTAATAATGAAATTGGTACCATTATGCCCATTAGGGAAATCAGTGAAGTTGCTAGGGCCAAAAGGATTCTTTTCCATACAGACGCGGTACAAAGTGTTGGCAAAATTCCTGTAAATGTAGATGAACTGGGAGTGGATTTGCTGACCTTGTCTGGACATAAAATATATGGTCCTAAGGGTATTGGGGCCATGTACATTCGTAAAGGTACTTTCTGGCAACCCATTACCTTTGGTGGTGGACAGGAACGCCGGCGGCGTCCAGGGACTGAAAATGTGGCAGGTATTGTTGGCCTGGGCAAAGCCATCGAAATGGCAACAGAAAATATGTATGCTGATGCTGAAAGACTGTCCAAATATAGAGATCGCATTATCACAGAGGTTCTTGAAAAAATCCCTAATACCATCTTGACTGGTCACCCTCAGGAACGCCTGCCAAACCATGTAAGCTTCTGCTTCCGGTTTATTGAAGGCGAATCCATGCTTCTTATGTTGGATATGAAGGGTATTGCCATTTCCAGTGGTTCTGCCTGTACTTCCGGTTCGCTGGAACCTTCCCACGTGTTGACAGCTATTGGCCTATCTAAGGAAGTGGCCCACGGATCCCTGCGCTTGACCATGGGTAAAATCAATACTGAGGAGGATGTAGAATACTTCCTGGAGGTACTGCCCCCCATTATTGAGAGATTAAGAGAAATGTCCCCACTCAGTGAAGGATGCAATCCCTGTGCTTGCAGTTCTTGTACTGTTCATGACGATGATCACCACCATGATCATGGGGAATTTGAAGACGAGTTTTAATAATTATTGTATTGGGAGCAAGGAGGTCTACTTATGTACACTGAAAAAGTAATGGATCATTTTACCAATCCCCGTAATGTAGGAGAAATTGAGAATGCTGATGGTATCGGTCAGGTTGGAAACCCCAGTTGTGGGGATATAATGAAAATAACACTTAAGGTAGAAGATAATATAATTAAGGATATTAAATTTAAAACCTTTGGTTGTGGGGCAGCCGTTGCTACCAGTAGCATGGTAACAGAAATGGCCATGGGTAAAACCATTGATGAAGCCCTTACCATTACTAACAAAGCTGTAGCAGAGGCCCTCGAAGGACTCCCTCCGGCTAAGATGCACTGTTCCAATTTGGCTGCAGATGCTTTAAAGGTGGCCATTGAAGACTACTTGAAAAAACAAAATGTGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009253|809587:818774|818402_818774_+|WP_011877139.1|DBSCAN-SWA MYTEKVMDHFTNPRNVGEIENADGIGQVGNPSCGDIMKITLKVEDNIIKDIKFKTFGCGAAVATSSMVTEMAMGKTIDEALTITNKAVAEALEGLPPAKMHCSNLAADALKVAIEDYLKKQNV >NC_009253|809587:818774|816651_817101_+|WP_011877137.1|DBSCAN-SWA MRLSTKGHYGLKAMFDLAMHYGSEPIPLKVVAERQNISEHYLEQLIAVLRKVGLVKSIRGAQGGYILAKPPSDIKVGDVVRALEGPIAPLDCVSELEPTVCEKVDYCISRDIWARVRDSIAEVLDSITLEDMCLEAQKAQSNQIESKHI >NC_009253|809587:818774|815283_815994_+|WP_041274777.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLIGEEGLAKLAAAKVIVFGVGGVGSYTVEALARAGVGELTLVDFDTVDITNINRQLHAMDNTIGQYKVDLMAERVQLINPQAKVLPLKMFYTPENGDDLLTKGYTYVIDAIDNVTGKIDIIQRCYKNNISVISCMGAGNKLDPAAFRVADISETSVDPLARVIRRELRKHDIHKGVKVVFSLESPLVPRTKLTKAKNDTEVGARQKSLAPGSISFVPAAAGLIMAGAVVREIIQV >NC_009253|809587:818774|811973_813101_+|WP_011877132.1|protease|DBSCAN-SWA MSLHWEKFKKPYGFLLAQIGFIILLFVIAIHFSSNQLHMLSLGNGTAMAQQQSDGFIRPANISDVVKQTAPAVVKIETIIQTNINTNPYINDPFFRQFFGNRSLPSTQVQKGMGSGFIVSEDGYIITNNHVIEGATQIQVTLTTNKSYQAKVVGSDRELDLAVLKINPDNQLKTLKLGNSDQAEVGDWVIAIGNPYGLDHTVTVGVISAKGRPVSIEDKNFRNLLQTDASINPGNSGGPLINLQGEVVGVNTAVNAQAQGIGFAIPSTTVASVYNQLITKGTVSHPYLGVNIQPTQDQRGVLVSGIVPDSPANEAGLQVGDVIVKFKDINLTNPQELLDAVAESRVGEKVSLVIVRSGQMKEIQVIMGDKSNQKF >NC_009253|809587:818774|816097_816424_+|WP_011877136.1|DBSCAN-SWA MAENIVGLTDDNFKNTIQAEQLPVLVDFWANWCGPCKMIAPEVEGLAAEFEGQVLVCKLNVDESRETPNSLGVMSIPTLILFKNGQEVERTIGFRKKEELRGLIKKYL >NC_009253|809587:818774|809587_811390_+|WP_011877131.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSAESMNGLHRTLYCGELHKQHEGQEVTLMGWVQRRRDHGGLIFVDLRDRSGIVQVVFSPEVDQEAFKKAEGVRNEYVLAVVGRVNGRPEGTINPNMATGEVEVYAHTLRLLNRAKTPPFYIEDNIEVDENLRLRYRYLDLRRPEMHKAMMLRHRASKSIRDFLDQHGFLEIETPMLTKSTPEGARDYLVPSRVNPGKFYALPQSPQLFKQILMLAGMERYFQIVRCFRDEDLRADRQPEFTQIDLEMSFVEAEDVMGLMEQMIAEVCSDTIGVKISTPIPRLSYQEAMDRFGSDKPDTRFGLELKDITPIAAQCGFKVFNSTVAGGGQIKGINAKGCASFSRKEIDDLTAFVAVYKAKGLAYFIINEDGSVKSAIAKFFTEEEIAAIKDKMEAQPGDLLLFVADKPAVVAASLGALRVHLAERLELIPQGMWNFLWVTDFPLLEYDSEAGRFFAMHHPFTSPAEEDLPLLESNPGKVRARAYDMVLNGVEIGGGSIRIHRRDIQELMFKALGMSQEEAKEKFGFMLEAFEYGAPPHGGLAFGLDRLVMLLAGKDSIRDVIAFPKTASATCLMTQAPDVVDPAQLAELHIRSTAPVKKSN >NC_009253|809587:818774|813141_813813_+|WP_011877133.1|DBSCAN-SWA MGARVLVIDDDPKITAMLQRALTYEGYRVEVANDGYKGMNMAKENPPELLILDIMLPGLDGWEICQRFRKDNFTPILILSARDEVESKVKGLNLGADDYLGKPFALEELLARVQALLRRRITANKVIQFSDLKMDLEAREVRRAGNLLTLTSREFDLLAHFMHHPNQVLTREQIIDRVWGLDFTGGSNVLEVYINMLRQKIEDYGSRIIHTVRGVGYVLKEQG >NC_009253|809587:818774|817124_818369_+|WP_011877138.1|DBSCAN-SWA MRKVYFDHSATTPVDPAVVEEMMKYLTEHFGNPSSIHAFGREARKAVEKARQQVATAIGASSVGEISFTSCGTESDNMAIRGVAYANRQKGNHIITTAAEHSAVLACCKQLEREGFSVTVLPLDEYGRVTAQQVADAITDKTILISVMHANNEIGTIMPIREISEVARAKRILFHTDAVQSVGKIPVNVDELGVDLLTLSGHKIYGPKGIGAMYIRKGTFWQPITFGGGQERRRRPGTENVAGIVGLGKAIEMATENMYADAERLSKYRDRIITEVLEKIPNTILTGHPQERLPNHVSFCFRFIEGESMLLMLDMKGIAISSGSACTSGSLEPSHVLTAIGLSKEVAHGSLRLTMGKINTEEDVEYFLEVLPPIIERLREMSPLSEGCNPCACSSCTVHDDDHHHDHGEFEDEF >NC_009253|809587:818774|813812_815237_+|WP_011877134.1|DBSCAN-SWA MTIRLKLTLWYSIVVSLTLIVFSFIIYTFLSYSLAQEIDRDLAGRAVGVIRSIRVVETSFLTPQKIVLPDVDVFGYPNTYLQVVDMDGRLVAKSSNLFNRNVPLNEDTLQQAKNGESFYEWVEVGKQRMRIYNYPLLAQNRVVGLLQVGQPYSGAQIALNRLRWLLWFFSGLMILAAATIGWWLAKVALKPVENITETAASIRHSLNLQQRIAYEGPKDELGRLVATLNSMLDSLETAYQELADSHVAQRRFVADVSHELKTPLTTIRGNIDLIRRMGEEHPDIRQEAMEDIASEAERMSRLVLDMLVLARADAGLTLPLEPVFLSKVIQQVGRQAKLLAKDIEFKITVEESCEQVQILADTDYVKQLVLILLDNAFKYTASPGVVELLVHCTHEHVKIHVKDNGVGIEQAELEHIFERFYRSDKSRPVGGSGLGLSIAKWIAEQHQATITVNSILHKGSTFIITFPIFQSTLN |
9 | Bacillus_phage(25.0%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
906144 : 934254
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009253|906144:934254|DBSCAN-SWA AATGAATTATAAACAAAAACAAAGAATTGAGCAACTCACTGAATCAACTTTAATTATTGGAGCCGATATTGCCAAATCTAAACACGTGGCACGTGCCCAGGATTTTAGGGGTATCGAGTTGGGGAAACGCTTGGTCTTTGACAACACTAGGGCGGGCTTAACCAAGCTGATGCATTGGATTAGAACCTTGATGGTAGAGCACGGTAAGGATCATGCTCTGGTAGGTATCGAACCCACAGGACACTACTGGTTACCAATGGCTGAGTTTTTGCGCAAAGAAGGTGTACCAGTTGTAGTTGTAAATCCGTTGCATGTTAAGAGAAGCAAGGAATTAGATGATAACTCGCCCACAAAGAACGACATCAAAGATGCAAGGGTAATTGCCCAATTAGTAAAAGATGGCCGTTACTCAGAACCCAACTTACCCACAGGTGTCTATGCGGAACTGCGGGTGGGAATGGTTCAAAGGGACCGTCTTAATCAAGACCTTAACCGAGTAAAAGGTAGAATCCACAACTGGCTTGACCGGTACTTCCCCGAGTACACAAGTGTTTTCAAAGATTGGGAAGGCAAAGCATCCTTGATGATATTAAATACTTGTCCACTCCCCCGGGAAGTCATCAAAACAGGCACAGAGGCAATTGTAACCCTGTGGAAAACTGAGATTAAACGGGCAGTTGGTATAAAAAGAGCTAACAAACTAATGCAGGTTGCTAGAGAATCCATCGGACTATCCACAGGGATAGAGTTTGCCCGTCATGAAATAAGGATGCTACTTGAACAATATGACATCCTGTGCAAACAGATGGAAATCCTGATGGAAGCAGTTCAAGAGTTACTGCAACAAATACCTGGAAGCACAGAAATGATGACCATTCCAGGAGTCGGTTTGGTTACAGTAGCCGGATTTCTTGCAGAAGTAGGCGACTTAAAAGGATATGAACATGGGCAACAAATCATAAAGTTGGCGGGCCTAAACCTAAAAGAGAACAGTTCTGGTAAACACAAGGGACAATCACGAATCAGTAAACGGGGGCGCCCCCGGCTGCGGGCCTTGTTATTTAAGACTGTGTTAGTCATGGTTGCAAAAAACCGAGAGTTTAAGGCCATCCACCAATATTTAATAACAAGGCATGGAAATCCCTTAAAGAAAAAGCAATCCATAGTTGCCCTCTGTGGAAAATTGATTCGTATTTTGTTCACCATAGGCAGTAAACAAACTCCATATGACGCGGAGCAAGTATTAGGCGTTGTACGCCAAGAGCAATTACAGGAAGCTGCTTAAAAGGCTATTAAATATTAACACTTATTCACAATGAATTGGATAGACAAACGAAGCACGGAGAAGCCGGGAACTAATATTTCCATACGGGCATGACCCAGCAAAGGAGCATACCTGGCCTCCACCCCTTGAGAGGTAGAACGAAGGAATGTAAGGGCCATATATTGGACCCCGTGAGACGTGGGAGGGTAAACCACAAGGGTACATGTGGAGATCCATTGTGCAACCATAATCTGTAAAATTAGGCGTAGCCTTTGATTGGCTACACCCCCACCAACCATATAATGTAATTTATTTAAAATTATTCCTTTGAACCTTGTTTGTATGTGCTTGAAATTGTAAGAATGAGTGAGTAAATGAAAGAAAAATTTATTTTATTGAGGGAGGGGATAGCTATGTTATCCATGTTATTAAGCCTATTCACAAAGAAATGGGCAGGGGAAGTAAATGTGACCGAATACCCTAAGGTTGAAAAACGCACCGAAGTAGCCGATTACCATGCGGTAAGAGTATGTGATGATTGCTGTACTTATTACCCATGTAGTAAACCAGGAGATATGGGTTGTCCACTATGGGGGAGAATGCTTTGGGACCGACCGAATTACTCTAATTTAGGGTAAGAAATAATCCGTCCCCCCTGCGAGAGATAGAGAACGTTTTGCAACTGCAAACGTTCTCTATTATTTTTGGGGAGAAATAAGAAATCCATGCCATGAATGGGTATACCAAAGGAATACTAGAATACATTAGTATACACAACAATAAATGGGTATAAAAAGTATACCTTAAAGGGTATACAAAAAGTAGTCTGGTATATAACGGTATACCCCACGGATTGGGAGAGGAGAATTTAAATGAGTGAAGTCGTGAACTTTTCATCTAAAATGGATGCCGATGTAAGAGAAAAACTGAATAACCTTGCTGAACAGAGTGGATTAACGTTGAAGGATTTCATGGGACGGTTAGTGGTCAGTTATGAAACTGCCCAGGAACGTGAAAGCATGGGTCAGGTTAAGGAACTGGAAAATCTGCGCCATCACTTGGCCCGGGTGGAAGAGGTTTATATTTCTATGGTAAAAGCTGCCCGGGATCGCCAGGAGGTCGATGCTGCTCGAATAAGTAATGCCGAAGCAGATGCCCAGGCTGCCAAAGCCGAAGCGCATGAACGGGAAAAGATGGCTGCGGAAGCTATTGATTCTGCTAACGAAAGGGTTCAGCAAGCGGAAGCCCAGGCAGCTCTTATTAGAGAACAAACTGACAAAGAATTAAATGAAATGAGAGAGGCTTTATCAAGGGAAAAAGAAGCCCGGGAACAATCAGCAAGATTGGCAGGTCTCGCTGAACAGGCGGCATCTGCAGCCCAAGAGAAGGCAGAGGCCCTAGAGGAACAGGCTAAGAAAGCTGAACAATATAGACAAGAACGGGATGAGTTGGTACAGGATAAAAAAGCATGGAAGGACAAGGTGGAGCAGCTTCAGGCTCAACTGGAACAAACTCGGGTGGAAGCGCAGAAAGAACTTAATGCTCAGGCTGATCGAGTAAAGGAAAAGATTGAACGTTTGAATGAGCAGCATAATGAAGCCATGACACGCGCTTTGGAAAAAGCCGAGGTTGAGAAAGAAAAGGCTGTATTACTAGCACAAAGGGAGTTCATGAAGGAGATAGCAGGGCTAAGAGAATCATTGGCTCAATGCCGGGAAGAAAAAGCACAATTTGAAGCACAAGTAACCGTCATGCAGAGTAAAAGGGAGCAAGACAATAATTTAATTTAATAATATATGGGGCTGGGCTGATACCGTCAATCTAAACTTTGAAAGGAGGTTAGGGGGGGCGGTTACGCCCTCGAGGTTATGAAGATGATACCTTACTGTAAGAGCGAATATACCTTAGAGTATTGTAAAGAAAAGGCTAAAGAGCTGCGTGCTACCTGTAAATATAAAGCTGTACACGTTCGCAAAACAGTACATGAAGCTGGCCAGTGGTATGCAAGGATTTATGTTAATCATCATCAATATCCTGCTTAAGCGATTTAATCTAAGTAAAAAAAGAATATGTAAGGAGATGCCTACCGGGTGTATTTTGCCCGGTAGGGCGCACCCGGACATATTTATAGACGAAAAAATCAAGGAAAATATTGATAAAATATTGGAAATGTTCGAGACAGGAAATATGCCTGCGGCCATTGCCCGGACAGTTATTCGAGCACAAGAAGGTTTTGAGTTACCCTCGGACAAGTGGAGCCTGGGAAATCAAATAATCATGATGGCCCATAATACTGAGGATGCCCGGGGATTTAAGCAATGGCAAGAAGTAGGCAGATTCGTAAAAAAGGGGGCTAAAGCCTTCTATATACTTGGGCCTATGTGCAAAAGAATTAAAAACAAGGAAGACGATAGGGAGAAGATCATCATAACGTGTTTTAAAAGTATTCCTGTTTTTCGGTATGAAGACACCGAAGGGGCAGAAGTTGAGTATCCGGATTATTTACCAAAAGAGCCCCCACCATTATGGGATGTTGCTGAGAAAATGGGTATTCAAGTAAACTACCGTCCTTTTACCGGTGAGGCATTTGGCAGTATTACAACCGACGGCCGTAAGATGACCTTAAGAACCCACGATGTAAAAACTTATTTTCATGAGTTGGGTCATGGAGCCCACGGAACATTTAAGAAACTGAAGGGCGGCCAGCACGAGGACCAGGAGATTGTTGCTGAAACGGTTGCCTGTGTGTTGTGTGAGTTATATGGTTACCATGGTTATATTTATCATGGCTTTCGTTATATCAAGCACTATGCAGGAGCAAAGGACGGAAAAGAATCTGCCAGAGCAATTATGGCTGTCTTATCCGATGTAAAGCAATGTCTGGACATTATCCTTTCATTGGCAGAGCCCCTAGAAGAGTTGACAGCAGCATAAAAAATACCGAGGTCGTTTGAACGGTTTAATATTATGTTTCCAGATGAAAGTTAGAAAGGCCAGGGATTTACGCCCTGGCCTATTTAGTACCTTTTTGAAAGGGGGTGGTTTGAAATATATCATCATGTAAGGGAGGTGAGGCAATTACCCTAAGGAAAACAAAAAACGGGTTCAGCATTAACTGACCCGAAAACAAAATCCGTAAGTAAATGTTACCATTAGAAAAAGAAAAAATCAACTCTTTTTATCCTGCTGCACCAGGGAAACTAATAATTCCCCTGGGGTGCAGACCAGGGGTAAAAGAGGGATAGAAATGTTAAAAATTAAGGGAATGAATATTCCTAGAATAAAGTGCGTTGGTTGTGGAGCAGAAATTCCAGAAGGTATGGCTTGCGGCTATTGCCTCGGTCTATTGGATGAACCTAAGGATTATAACTATCACAGTTTCGAGGTTGTGGGGAATAGGAGGAAAAATGCTCGGTCCAATATTTGGGGGTTTGGGGTAGAGATCGAAACCCTTTCTACATCACCAAAACAATTAGTTTTATTGAAGAAGGGGTTTACGCCCTGTTATGACTCCTCCGTGACCCTTGAATGGAAATCTCCTATTTTTCAAAGTCTTGTGGGTTTTAAGGGTATTTGTAAAATGATTGAGAAAATGGATGTCGAGCATGGTGGTAGCCATGTTCATATATCCGTCAAAAGAAAAGACTTGTTCGAGGATTATTATAAGGAGATATTCTATCCCTTGGCGGAGTATTTGGATGGTTCTGCTTACTATCGGATATGGGGACGCCAGGAT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23 | Pandoravirus(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1255343 : 1305344
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009253|1255343:1305344|DBSCAN-SWA 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60 | Vibrio_phage(19.51%) | portal,tail,integrase,protease,plate,capsid,head,terminase | attL 1258534:1258582|attR 1308184:1308232 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1941191 : 2003428
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009253|1941191:2003428|DBSCAN-SWA 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53 | Ostreococcus_lucimarinus_virus(14.29%) | protease,integrase,transposase | attL 1952240:1952255|attR 1998081:1998096 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2119503 : 2175708
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009253|2119503:2175708|DBSCAN-SWA TTTAACCTGAACTTACGGCAACCCATGCCTGTATGCAAAGGAATTCTTGTAATTTTTCCTTAGCATTCTTCAATGCCTTTTGCAGCCAGGGATTAGGGGCTAACTTTATATGGCGGTAACGGTTGTTGCCTACAATGTTCCCAGGTACATTCAGTATTTTACGGCGGATAGTGGGCACTTCAGCACGGCTGTCTTTGCCATCCAATAAGGCCAAGCGAAACCAGTTGAGAAGGTTATACGATAATACTTTGAGCCACATAAAGGCTTTGTTTCGATCCATCTCTGCTTGGCTCATTTTTTCAAAGCCTAAGCCAACCTTGAGTTCATCAATTTTGTTTTCGATATTGCAACGCTTATTGTATTCGTGCCATACCTCCTCTGGGTTGTGCTCGTCACTAGAAGTAATTATCACCTGGTAGTCGAATGTCTTCAGGTCAAAGTTAAGTTGATCGCCGCATGCCTTAGGTTCTTGAGTTTCACGGATAAATACAAACCTGCGGGCTTTGGACCATTTAGGTAATGGAATGGTGATTTCTGCTGCAGCATAATGGTTGCTCAAAGACTGCCACTGGTTCTGGTCATCAAGGTATTTAATGACCTTTCTCATATTACTGGTGAGTTTAGCCTTACAAATATACTCGATGCCCTGTTCTTCCAGGTAGGCAAAGTTATCCTCATCAAAGAAACCTTTATCTATGCGGATACCTTTTACGAGGATATTCTGGGCAGCTAAGATCTCTAATGTCTCTTTAAGGAATTCCATAAATTGGCCATTGCTGGCGACGTTCCCACTATATAACCCGGCATTGACTAGTTCGCAAGTTCCAGAGATAAATGCTACCTTTACCTTGTAGGAAGGCCTCCCGTGGTACCGAGGATTGTAACCGACTTTTGATCCTTCCTGTTTCCCAAAAACAGTGAGGACACTGTCATCAATATCTAGCCAGACTTCACGGGGCTGATCGGATTTGGCCTTTAAGGACAGCATTTCCTGATTCACCAGAGGCAATTGGTTTAATGCCTCCTGCTCACAGATAAGAGATAGAAAGTTCCGCAAAGTGCTTTCGTCAGGCACTTGTGTTACTTCTTTAATTTTCTGGTATCCAGGGTCAGTTTGCAGAGCATTCATATGAGAAAACCGTAATAATCCCAAGGAAAGGGCATCAATGATTGTATCTAACAACCCTGTATCAGAGTATTTACAGTTATGATGTCGCTTAAGGGAAACCCCTTTAAGCATACCCTTGAAATCAATGGCTTGCTTAAACGCCTCTAGTATGCCAAAATTTCCATAAGCAGTTACAGAAGTATTGTCAAAGCTAATCGGAAGATCACTTTTGCTAGTCAGGCGTTGAAGAGAATGTAATTTCTTCTGATATTTACGTTCCAAATCACGTCGTTGTTGACGGGTCAAAGTTTCAAGTTGATTTGTGGTAATAAATTGTGATACCATCATTTCAGAGGGTCACCATCCTTTTGGAATGTTTTGTTTGGACGCTAAACAATTCCGTAGAAGGGGCGGTGTACCCTCTTTTTCTGTCAAATTTTTTACAACAAAAAATGGTTATTAGACCTTGATGTTATTGGGTTTTTAAACTTTACTTTCCGTATCTAAGTTTATAGTATACCTTATTTATTTTTTCAAATCATGATAAACAGGAGTAAAAACAAAATGAAAACGGAAAAATAAAATAAAATCATCTGGAGGTGATTGTTTTATGATGCGTAATAACACGTGGAGATATCCTAATCTTGGCTTCTGGGTAGTTCATGTTGCATCTTTGGCTGCAATGGGATATTTAGCATACAAAGCCAAGGATTGCAGTTGTGACATTGATTATTCAGAAAACCAATCCTTCTCCAACAAAATGCCCCAGAATCAGGAACCTCAGGTTGACCAGTTTTAAAGTATAACTTGATATTTTTTTTTAGAAAAACATAGTTTGTATAATCCTCTAATGTTTTAAATCCCGAGGCAACCTTCGTATCTCTAGTACATTTAGGGAGGTCAATACTTCCTATATACTAAAAATAACCCGACTTAAGTCGGGTTATTTTTAGTATAATATAGGTTAAAATACGCAAGAGGTGATCATAATGCATATTCTTTGGTTATTAATGGGAGTCTTGGGCGCTTTATGGATATTTTGGGATACACGTAAACAGGGTTATTCCTTTGAATCTTCTTTTCGGTGGGCACTAGGTACTTTTTTTGTACCCGCAGCAGTCATCCCTTTTTACCTCTTCCAATCCAACATAAGAGAAAAGAGGCATAAAAGCTATAATAAGGGACCTGTGGATATTACCGCAAATATTCTTTTGAAATGTCCCCATTGCGGAATTTTCTACGAAGGAAATCCAGAAAGGTGTCCCAACTGTAAAGCCCTTGTTAAAGATGAATAAGGAGCTTAGTCTCCCCTATCCCTGTGTTAATTTAGGATCTTCGCCAGCGTTAAATGGTATTCTTACAACCTTACCATTTTCTCCGAGACGGCCAAGGTTCTTTCCGTTGACATTCACTTCTACTACACCGGCATTTCCCACATGAAGAAAGATCTTCTCCTGAGCTTTAAAGTCTTTCATTTCCCCTGCTCCTACCAAACCACTAAAGACGGTATTACCATCCGCTTCAACTTGCATCCAACTTTGTTTTTCAGTAACTTTCAAAACAACCCTTACCCCATCCATTTCCTGTGGGGTGCGGGGTTTTGTGGGTACATTAATTTGACTAGGTGTCTTTTCTGCTGAACTATTTAAATTATCCTGTGCTGTCTTAGGTAAATCCGGCTTGTTATCTTTTGTTTGACCACTGTTATTATAAAAGGTGTTAAAGGCTAGCAATGATACAATGGCCAGTCCTGCTGCAACATATCTCCACATTTTGTTCCCTGAAATAACAGGTTCTGGGTCAGCTTGTTTTTTTTCTTCAACAGGAGGTTGATTATCCTGTGTGATTTGGCCATATTCTTCCATGATTTCTTCTGTATTAATCTCAAGATATTTTGCATAGGTTCTTAAGAAGGCCTTTGCATACACAGGCCCAGGCAAAATATCAAATTCTTCATTTTCTAAGGCTTCAAGATATTTCGCTCTAATCTTGGTTGCCTCTTCTAAGTATTCAAACGAGTAACCCTTTTCTTTTCTTGCGCTCCTTAAAGCTTCCCCTACTGCCACCATCGTCACCTCCGATTTTCGCTGGTATACCATACTCGGGTAAAGATGTTACCCAATTCGCAATTATACCTGTGGCTTCATTTAAATCATCACAATCAACAGATAAATCATATTCATCGTTGGGTGAATCAGGATATTTATATAGAGGATCGTAATACTTTGTTAAAAGGTAAGGAATAACCTCCTCAAACTTTCTTTCATCGATCTTTTGATTTAATTCTTCTACAGTTTTGTTTCCAAGAGACTTCTTTAATAGGGCTGTACTTAACTTCAGCATTTCAATATTATTATCAGGGCCCTTTGTATATTCATCTATAATCCTTTGCACCCGCTTCTCTATTGAAGCATACATTAAAACTCGATAACCCTGTGACATGGCGTTGAAAACTGAAGTTGGTACGATTAGTTTACCCACTCTGCGACTTTCACACTCTACAGCTACCATTCCTTTATCTTCTGCTCTTATAAGGGTTTGTACAATACTTGACTCAAAATCCTTTTGGGAAGGTGATTCTGGCAAACCAATCTTACCATAGGCTGATCCTCTATGACAGGCAATAGATTCTAAATCTAAAACAGGTATGCCAAACCTATTTAAGTTATTTAAAACAATGGTTTTCCCTACTCCGGTTAAACCATGTAAAACAATGCATTTATGCGGTATCAAGTCCTGATCTAAATAAGCATGTATATGCTTACGATAAGCTTTATAACCACCCTGTATCCGATAAAGGTTTATGCCTAGGGTATTTAAGATCGAGGCTGCATATTTGCTACGCATTCCTCCACGCCAACAGTAAAGAAAAACCGTTTTATCCTTAGCCAATTTTGAAATATCATCATATAGTGCCGGAAGTTTTGGGCTTGCAATTTCTAAACCCAATCTTTTGGCGGCTTCCGTCCCAACCTGTTTGTATACTATGCCAACCTTTGCCCTTTCTTCATTTGTAAATAAAGGAATGTTTATTGCACCAGGAATCGAACCTTCTGCAAATTCTCCCTCTGACCGTAAATCAATAAAACAAGCATCATTTTGTTGTAAAGCTTGATTAATGAAAATATCTTTTAGCATATTGTCTTACTTCCTTGTCGCATCTATTCTAGTTTTTCTTTTTTTATCCTGCAAAAAGAATTAGATAAAAAACCCTATGACTTTAGGATTTCCTATCTAATTCGCCAAAATTCTATCGCCACTCTACATTTAGGCATATTTAGGTAATGTTAATCAAAGTCAGTATAGCATGCACATCAATAATGGTCAACTTATGCAAGTTGACCATTATATAAAGTTACTCTTGTTTATTTTCTTTAAAAGTTTGTATGTATTGTTCCATGGTCATTAAAATGGTCCTTGGTTTACTACCCTCATAACCCCCTACAATGCCTTTTTTCTCCATTATGTCAATTAACCTCGCTGCCCTCGCATACCCAATATGGAGTCGACGCTGTAACATGGAGATTGATGCATGACCAGTTTCTATTAAAATGCGAACAGCCTCAGGTAAAAGATCATCTTCAACCTCTGCCTCTTGTTTTGCCTTTGGGTCTTCTTTAACCACCGTATCATCATAGATAGGTTCAGATTGCTTTTTCAAAAAAGAGACGACATCCTCCACTTCCCTATCAGACAAAAAGGCTCCCTGTACCCTTATTGGTTTTGAAGCACCCACCGGAAAGTACAACATATCACCCTTACCCAATAGCTTCTCTGCCCCTGCCATATCAAGAATGGTTCTTGAATCCACCTGGGATGACACTGCAAAGGAAATTCTGGAAGGAATGTTTGCTTTTATCAAACCGGTAATGACATCCACTGACGGACGTTG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55 | Bacillus_virus(37.5%) | protease,coat,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2587202 : 2595822
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009253|2587202:2595822|DBSCAN-SWA 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TATCCCGTAAAATTCCACCCACACCGGTGGCCGCACCTTGATAGGGCTCAATGGCTGAAGGGTGGTTATGACTTTCTATTTTAAAGACAACAGCTTGTCCATCGCCAATGTCAACAATACCAGCATTTTCGCCGGGTCCCTGCAGAATGGCCGGTCCCTCGGTGGGGAGCGTTTTCAAGGCTGGCCGGGAAGTTTTGTAACTGCAGTGTTCCGACCACATAACGGCAAATATACCAACTTCTACATAGTTAGGGTGGCGACCCAGAATCTCTACGATCCTTTCATACTCAGAGTCAGTCAGGCCCATCTCCCGCCAAACCTTTTCCTCCACTATCATTAGCCACACCTCCTCTGCCAGGTTTCCAGCAAGGATTTAAAAATCAGTTGTCCATCAATATTACCCAGTATTTCTTCGGCACAGCGTTCCGGGTGGGGCATCATGCCCAGCACATTGCCCTGCTCATTGCAAATACCAGCAATGTTGTTTACAGAACCATTGGGATTGACTCCCTGTGTAATTTCGCCATTGTAATCACAATAACGGAACACAACCTGATTATTTTCTTCTAAACGACGGACCGTGTCTGAATCCGCAAAATAATTTCCCTCACCATGGGCAATGGGAACCTTAATAACACTACCCCGGCTGGCCAATGAAGTAAAGGGAGAAATATCATTCTCCACCCTTAAATAGGTGTCATGACAAAGGAAAGATAAATTTTTATTTCGATGTAGGGCTCCGGGTAAAAGACCTGCTTCGGTCAAAACCTGAAATCCATTGCAAATTCCCAGCACCAGTCCACCCCTGCGGGCAAATTCAATAACCGGTGACATCACAGGGGAAAACCTTGCCACAGCGCCGCATCGCAAATAATCTCCATAGGAGAATCCCCCAGGCAGCACGATGCAGTCATAACCATCCACGCTGCCAGACTTGTGCCAAATGTAATCCACCGGCTGCCCGGTAACAGTTTTAATGGCATGCAGGCAATCGGCGTCACAATTGGAGCCAGGAAAAACCACCACTCCAAATTTCACGCTTTACACCTCCACCAGTTCAAATGTATAGTCTTCAATTACCGGATTAACCAGCAATTTATCACACATATCACGTACCTGTTTTTCTGCTTCAGCCCTGTCAGTGATTTCTATATCAACCACCATATAACGTCCAATACGTACTTCAGGAACATTGGAATAGCCCAGGGCACAAAGGGATTTACGCACTACATTTCCCTGGGGGTCCAATACACTTTTCCTAAGGGTAACGTAAATCTTTGCTTGAAACACGCTAAGCCCTCCTTATTTTCAGGCCACAGCCCATTTAAATTTTAAGAAAAACTATTGCTTTTTACTAAAAAACCTTTATTATATTATAGGGGAATTTTGTTATACTTCTAAATACGGTTGAATTAAAGCTCTTATGGAACTAATGTTTTAATTAATTAAATTTATTAGGCTTCTCCGGTTAAGCGGCGCAGTACTTCCTGGTAAGCTCCTTCCACGTTGCCCAAGTCCCGGCGGAAGCGATCTTTATCCAATTTTTCTCCGGTGGTTTTATCCCAGAAACGGCAGGTGTCCGGAGATATTTCATCACCCAGCAAAACTTGACCTTTATGAAGTCCGAATTCTAATTTGTAGTCAATGAGGTCAATGTTAACAGGGGCTAAGTATTCTCGCATAATGTCATTTACTTTCAGGGCAGTTTCTTTGATAAAAGCCATTTGCTCCGGGGTTGCCAGGTCCAAGGCTGCAATATGTGAGGCGTTAATTAAAGGGTCGCCCAAGTTGTCATCCTTATAATAATATTCAAGAACTGTTTTCGGCAGAATGGTTCCTTCCGGAAGTCCCACTCTTTTTGCCAGGGTGCCGGCCACAATATTACGGACCACAACTTCTACTTTGATAATATCCAGGGCCTTAACAATCATTTCACGGTCGTTTACCAGCTCAACAAAATGAGTAGTAATGCCTTTGCTCTCCATAAGTTTAAAAAAAACTGCTGAAACTTTGTTGTTAACGACACCTTTGTTATCAATGGTACCTTTCTTTTGCCCATTAAAGGCAGTGGCATCATCTTTATACTCAACCCAGTAAAAATCAGGATTATCGGTACGATAAACCTTTTTTGCTTTACCTTCATAAATCATTTCTAACTTTTCCATTATATCCTCCCCTTTTACATTTAACAGCTTGTTGATAACTTTTCGGTAGCATGCAAAATTCTACTTGTGACAGCTCCTTGCAGTAATTTCAACAAACCCTTTATCTATTTTTTAAAAAGGTAGCGTATTACCCCCGTTGCCGGGGATAATACGTTATTAATTTTTAAAGTCCAAACCGGGCATAAATATCGTCAATATGAGACAGGTGATAGCTATAATCAAAGAGTCCGGTTAACTCTTCTGAAGTGATATGAGACATAATGTCGGCGTCCGCTTTCAATAAATCAATAAACTTGGTACCAGTACGCCAGGCTTCCATAGCATTGCGTTGTACCATTTCGTAGGCCTGTTCCCTGGTTAAGCCTTTATCCACCAAGGCCAACAGCACCCGTTGGGAGAATACCAAACCCAGGGTTTTTTCCAGGTTTCGTTTCATATTTTCTGGGTACACCAACAGTTTTTCCATAATACCGGTAAAACGATAAAGCATAAAATCTAAAGCAGTGGTACTGTCAGGGATAATGACCCGTTCAGCGGAAGAATGGGAAATGTCTCTCTCGTGCCAGAGTGTTACATTATCCAAGGCTGCCATGGCATTGGCTTTCACCACCCGGGACAGGCCAGATACATTTTCTGCTGTGATGGGATTCCGCTTGTGGGGCATGGCTGAGGAACCCTTTTGGCCTTTATTGAAGTACTCCTCCGCTTCTAAAATATCTGTACGCTGCAAATTGCGAATCTCTGTGGCAAACTTGTCTAGGGAGGCGGCGATGACTGCCATTGTGCAGAGATAATCTGCATGGCGGTCCCGTTGTAGAATTTGGGTGGAAACCCGAGCTGGCTTCAGCCCCAGCCTATTACAAACATGGGCCTCAATCTTGGGATCAATATTGGCATAGGTTCCCACTGCACCGGAAATTGCTCCTACACTTACTGTCTTAATGGCGTCCTGTAGACGCTCCATGTTACGTTCGGTTTCAGCTACCCAAAGTAGCATCTTCAGACCAAAGGTCATGGGCTCCGCATGAATACCGTGAGTTCTGCCAATCATGATGGTATGTCTGTGTTCCTTGGCCTTTTCCAGCAGTACTTGGCGCAGGCGTTCTAGTTTTTTAAGGATTAGTTCCCCGGCTTCTTTCATGCGCACACACTGGGCCGTATCCACTACATCAGAGGATGTAAGACCCATGTGTATATATTTAGAATCTTCCCCTACGTTCTCAGCCACGCAGGTTAAGAAGGCAATCACATCGTGTCTGGTAACTTCTTCAATTTCCAGAATACGTTCCACAGAAAAGCTAGCCCGTGCCTTAATGTTCTCCAGAGCCTCCGCAGGAATTTGTCCCAATTCAACCATAGCTTCGCAGGCAGCTATTTCTACGTCCAGCCATTTTTGGAATTTGTTTGTGTCAGACCAGATGTGCTTCATTTCGGGCAAGGTATAACGTTCAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009253|2587202:2595822|2588903_2590328_-|WP_011878673.1|DBSCAN-SWA MFNEIGTILWSDKPVEECGVFGIFAPGLDVARLTYYGLHALQHRGQESAGIAVADGSQIELQKGMGLVPEVFSGHSLDKFSGFAAIGHVRYSTTGASSPLNAQPLVFRYAKGMLGLAHNGNLTNVADLRAQLASTGSVFQSTTDSEVLVNLIARYNANSVEEALMKCMIDVKGAYALLIITEDTLYAARDPYGLRPLCLGRLGEGYVVASESCALTTVGATFVRDVEPGEIIRIDRGGLTTTHGLTAQCPAHCIFEYIYFARPDSTMDGFNVNKVRREMGRQLAREYLVDADIVIPVPDSGTAAARGYAEESGIPFEEGLMKNRYIGRTFIQPTQEMRELGVRMKLNPIREVLQGKRVVMVDDSIVRGTTSQKLVAMLREAGAKEVHMVISSPPVLRACYYGIDTSNEQELIAAQKSPEEICQSIEADGLHYLSLEGLLDIFAPKEKNFCTACFNGIYPVEVPKQTQGGKFSLE >NC_009253|2587202:2595822|2592537_2593239_-|WP_011878675.1|DBSCAN-SWA MKFGVVVFPGSNCDADCLHAIKTVTGQPVDYIWHKSGSVDGYDCIVLPGGFSYGDYLRCGAVARFSPVMSPVIEFARRGGLVLGICNGFQVLTEAGLLPGALHRNKNLSFLCHDTYLRVENDISPFTSLASRGSVIKVPIAHGEGNYFADSDTVRRLEENNQVVFRYCDYNGEITQGVNPNGSVNNIAGICNEQGNVLGMMPHPERCAEEILGNIDGQLIFKSLLETWQRRCG >NC_009253|2587202:2595822|2594529_2595822_-|WP_011878678.1|DBSCAN-SWA MIERYTLPEMKHIWSDTNKFQKWLDVEIAACEAMVELGQIPAEALENIKARASFSVERILEIEEVTRHDVIAFLTCVAENVGEDSKYIHMGLTSSDVVDTAQCVRMKEAGELILKKLERLRQVLLEKAKEHRHTIMIGRTHGIHAEPMTFGLKMLLWVAETERNMERLQDAIKTVSVGAISGAVGTYANIDPKIEAHVCNRLGLKPARVSTQILQRDRHADYLCTMAVIAASLDKFATEIRNLQRTDILEAEEYFNKGQKGSSAMPHKRNPITAENVSGLSRVVKANAMAALDNVTLWHERDISHSSAERVIIPDSTTALDFMLYRFTGIMEKLLVYPENMKRNLEKTLGLVFSQRVLLALVDKGLTREQAYEMVQRNAMEAWRTGTKFIDLLKADADIMSHITSEELTGLFDYSYHLSHIDDIYARFGL >NC_009253|2587202:2595822|2593655_2594366_-|WP_011878677.1|DBSCAN-SWA MEKLEMIYEGKAKKVYRTDNPDFYWVEYKDDATAFNGQKKGTIDNKGVVNNKVSAVFFKLMESKGITTHFVELVNDREMIVKALDIIKVEVVVRNIVAGTLAKRVGLPEGTILPKTVLEYYYKDDNLGDPLINASHIAALDLATPEQMAFIKETALKVNDIMREYLAPVNIDLIDYKLEFGLHKGQVLLGDEISPDTCRFWDKTTGEKLDKDRFRRDLGNVEGAYQEVLRRLTGEA >NC_009253|2587202:2595822|2587202_2587814_-|WP_011878671.1|DBSCAN-SWA MNKLRIGVLASGRGSNLQSILDRCQEGTVAAEVVVVISDKPAAYALERARQAGITAFGLEIRSFPGKREYEQAVVKLLQDAGVELVCLAGYMRLVGESLLRAFPNRIMNIHPALLPSFTGLHGQRDALQYGVKISGCTVHFVDEGMDTGPIILQAAVPVLDDDTEESLSARILNQEHRIYPEAVKLFAEGRLQVVGRKVYIKK >NC_009253|2587202:2595822|2593242_2593491_-|WP_011878676.1|DBSCAN-SWA MFQAKIYVTLRKSVLDPQGNVVRKSLCALGYSNVPEVRIGRYMVVDIEITDRAEAEKQVRDMCDKLLVNPVIEDYTFELVEV >NC_009253|2587202:2595822|2590312_2592538_-|WP_011878674.1|DBSCAN-SWA MIVEEKVWREMGLTDSEYERIVEILGRHPNYVEVGIFAVMWSEHCSYKTSRPALKTLPTEGPAILQGPGENAGIVDIGDGQAVVFKIESHNHPSAIEPYQGAATGVGGILRDIFTMGARPIAVLDSLRFGELDNPRVRYLFDGVVSGISGYGNCIGVPTVGGEVYFSDSYEENCLVNVMCVGLIDQKDIKKGLAAGVGNPVMVVGAKTGRDGIHGATFASEELSEAAAERRPAVQVGDPFMEKLLLEACLEVIKTGYVVGIQDMGAAGLTSSSCEMASRAGTGLEMDLALVPRREEGMTPYELMLSESQERMLLVVEKGTEDKVKDIFAKWDLDCVVVGQVTDDGLLRLKEGDQVVAEMPAKALTDEAPLYHRPTEVPAYLEDIHNFPLEQLNMPDDYNEVLLKLLATPNIASKEYVYRQYDHMVGLNTVVLPGSDAAVLRVKGTKKGIAMTTDCNGRFCYLDPKTGAAIAVAEAARNLVCSGAKPLAITNCLNFGNPEKPEVMWTFWRCIEGMGEACRVLETPVTGGNVSLYNETKGSAVYPTPTIGMVGLVEDLDKVCTQDFKTEGDAIFLIGENLPELGGSEYLKVHHGLEKGKAPVLDLALEKKIQQFVLNEIKNGLIKSAHDCSEGGLAVALAECCIAGGLGADITMVRRFRGDALLFGESQSRIVISLDRSKGVELVKKLVDAGVPYSQLGTVGGNSLVINVVNPGCTGCGGNLINLSVSKLAETWRGAIECLMK >NC_009253|2587202:2595822|2587838_2588891_-|WP_011878672.1|DBSCAN-SWA MTEQKSQPLTYAGAGVNIEAGNQAVSLMKQAVRSTFRPEVLTDIGGFGGLFALNAGKYKEPVLVSGTDGVGTKLRVAQLTDNHHTIGIDAVAMCVNDILVQGAEPLFFLDYLAVGKLVPERVAEIVKGVAEGCRQAGCALIGGETAEMPGFYAVEEYDIAGFAVGVVERTQLIDGRGIEAGDAVIGLPSSGLHSNGYSLARKALLEVAGYGMTDTVKELGRSVGEELLEPTRIYVKAVQPLLEKFTVKGMAHITGGGLTENIPRMLPEGVKVVLNRSAWPVLPVCQLIQQIGQVAEEEMLRTFNMGIGMVLIVPAAESAAVLQDLASRHEQAYLIGQVESGPSQVEYIQG |
8 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2787452 : 2858817
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_009253|2787452:2858817|DBSCAN-SWA 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MNTYEETKVTDRISLIEGDITKLKVDAIVNAANTSLLGGGGVDGAIHLAAGPALLEECRKLNGCPTGEAKITAGYNLPARWVIHTPGPIWRGGQNNEESLLTNCYRNSLNLAVKNEIKTIAFPLISAGIYRFPLERAVNIAVKEVKQFLDTDASISKIYIVLFKKSPSSIMKLLKD >NC_009253|2787452:2858817|2847199_2847883_+|WP_156779670.1|DBSCAN-SWA MPRETFRFIITNIRLVSMRCLEMVETTFDILKFSERLKELMENSNYNTYSLAEAVFLTPGTISKYVNAKMEPKRNTIELLAKHFQVNPAWLMGYDVDKWLDGQAPKAKTIPFIKSANYADNEIDGYEVVSSSEEIDLSFLVQDNSMINARIFEGDIAYISKQSTVENGEIAAVVIDGAITLKRLYMMDNSIVLHSENPTIPDKVLSKKDKKDITILGKVTSVKFKVR >NC_009253|2787452:2858817|2833126_2833441_-|WP_011878916.1|DBSCAN-SWA MARKTEIKKDLKNQLERNGVYGSHYLDLINDYMSLWEIKNRLIKDIKTRGVSVEWNNGGGQKGFKKNDSIAELNKTNAQMLKILNELGLKANSSGSGDDDDEEM >NC_009253|2787452:2858817|2836303_2836507_-|WP_041274645.1|DBSCAN-SWA MATLCETCAKAVPQLCQWINKGDRTGLEYKSKNSPYGDKKTYEVVIVISCPRYKPGPLPSIGMTEWR >NC_009253|2787452:2858817|2806451_2807264_-|WP_011878885.1|DBSCAN-SWA MLTDYHIHVERGPYTVDWLRQFYEQAQQVGIKDWGISEHAYRFIETKHIFWNNWVEPRQTEKMDDYQNMIFRARAEGIKVKFGIEIDFFPGKEKEIKEFIDRYPFDYVIGSVHWIDQWGIDLSEMKEEWERRRVEDVWLAYFDRIESLIESNLFDIAAHLDLAKIFSYIPTNQEFLQEQYNRIARVLAKRGTCIEISTAGLRKPVGEIYPHPLLLETCFGQGVPIVINSDAHCPEDVGADYERALDLARKIGYKKIQTFTNRKAESHLLG >NC_009253|2787452:2858817|2844554_2844953_-|WP_041274647.1|DBSCAN-SWA MEITELLARARSIEINISPRDGQINISMPWDINSVPDPAKEILREIKKNRSQLMGYFALNSNPVDIKLLINALKLQGVRIAPDNNTGFKMFITKDAPGRCNGTAIKLINLLNYHRHMVIDYLAVQGEKQQPG >NC_009253|2787452:2858817|2815720_2816035_-|WP_011878899.1|DBSCAN-SWA MGESDVQSIREDLREVKKALSELTAAMADLRVQVAGNYVTKVDFLKCQECAEKRIVKLHDRIEQHELQDKADRWKLAGLVATVTGIVLSVIQWIASLYRSGGQS >NC_009253|2787452:2858817|2807994_2808378_-|WP_011878887.1|DBSCAN-SWA MDKEQLIKDIVFVGVHWGSGREKDRERVNKKMTLLLETFPSCQHCNDETCDNKFWVIEEIKKGFLIKKYETNIFSVCSLKCLLNRGLSKDAYYSVIVRVANGDVLSTGFRGLNAMALNEFANKIKSQ |
89 | Bacillus_phage(18.75%) | portal,tail,integrase,transposase,protease,plate,capsid,terminase | attL 2807658:2807674|attR 2860361:2860377 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Click the colored protein region to show detailed information
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009253.1|WP_011878895.1|2814301_2814562_-|hypothetical-protein |
2814301_2814562_-
Protein sequences of NC_009253.1|WP_011878895.1|2814301_2814562_-|hypothetical-protein>NC_009253.1|WP_011878895.1|2814301_2814562_-|hypothetical-protein MKITIYGDVTKAEIDSIVAEEKERFAARGKEIATIEISVVGQEELEIKTWAKSDIRRVRRITGYLSTVDRFNDAKQEELGDRVVHS |
86 aa aa | NA | NA | NA | 2787452-2858817 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.46|1082924|38|NC_009253|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009253 position: 2851123-2851086, mismatch: 0 ttcttccaacaggatattattccattgcttatctttag CRISPR spacer ttcttccaacaggatattattccattgcttatctttag Protospacer ************************************** |