Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009441 | Flavobacterium johnsoniae UW101, complete sequence | 8 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,RT,PD-DExK,WYL | 0 | 3 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009441_1 | 644499-644594 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009441_1
|
1 spacers
spacers of NC_009441_1
>1.1|644522|49|NC_009441|CRISPRCasFinder ACCTGAAATTGGAAACTTATCAAAAGTAACTCATTTATACTTATATCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009441_1
The CRISPR arrays of NC_009441_1 >merge|NC_009441|1|644499-644594|CRISPRCasFinder AATGAACTTACCGGTTCTATACCACCTGAAATTGGAAACTTATCAAAAGTAACTCATTTATACTTATATCATAATCAATTAAGTGGTTCAATACCA >NC_009441|1|1|644499-644594|CRISPRCasFinder AATGAACTTACCGGTTCTATACC ACCTGAAATTGGAAACTTATCAAAAGTAACTCATTTATACTTATATCAT AATCAATTAAGTGGTTCAATACCA
>NC_009441.1|WP_012022691.1|638166_643740_+|hypothetical-protein MIQPKISKLKKTVAIYLAMMILLETLQPMQMYALTGGPSQPEFESFTPIGTSDMVDLASGDFNYNIPIMDVGGYPINLAYNSGVTMDQEASWVGLGWDLNVGQITRQMRGLPDDFNGDEMTYENNMKPNVTVGSDFNVFFGAFGVNEVKANVGMSIKYNNYEGFGATASGGLSAQIANNIRVGMNLESSASEGVSASPSVAYQDIDDTKKTRDNTPTGNFGISYNSRKGVENVTYSASMNLKKIKDKAGNEKTRTINGFAGSGSTSFIDASFTPTKRVGMVSSNFIFNLNIEGEFWGIEPGMKFTGYRTSQGIKNSEKYKTERAYGFENTYNASTADVLDFNREKDRTFNKNTTSLPLTNNTYDLYNIQGQGISGMFRPYKSQVGYVFDKETNDDSVGANLGLELGAGGLTHWGIDATVTLGKSNTSLWSASNPALGRFKENKTNNRPDYEKVFFKNIGGNHVDKELDLFNTKLGGYDAVKLGLSGGKFSRSTDVKYAKNTGAIAYTGAVKRESSRLSRNQSIQKLTKVEAKRFGSKLQPSEYSRDHHTTEIRITKEGGERYIYGRAAYNTLKKEVTFDVSDKDRPAEKLDYRNGLIHYDSGDNSANNKKGGDQYFNRVTTPPYAHSYLLTSVLSADYQDLKNDGPTDDDLGNYTKFEYDNKTAEHLYKWRIPFKENEANYDEGLRSSKKDDKGNYQYGEKELLYIKKIVTKTHVAVFHLSERNDAYGVKGENGGIGYDSKMYKLDKISLYSKPEYLAQGDNATPIKEANFEYNYSLCKGIDNSINNEGKLTLSKVYFTYKNSNMGKYTPYVFNYGFNPDYDMKAYDVWGNYKKVKEGVNEGTLAQLSNAEFPFVDQSNRTQADEYASAWLLKSIRLPSGGQMELNYEADDYSSVQNKDAMQMFKVVGSGSKEGLTANNISNGIERKTLGKYIYVQLDHKVDNSKEFYDQYLKNVGDASNPLYFRFLLNMVNPNPLPGVDSTDKYDYVTGYLNIEGIKNKTVDCGFLEVNDKQYVAIPIDYVGKGDGFNKDSHEVNPISKAGWNFGRQNLNRLVYSMYNEEDTTDLKSIVMEMIGWLPTILDIFKSPNAKLEQTEIASRFITNKSWIRLIQPTGKKVGGGTRVKNIAINDQWDVMTANTNKELYQQSYGQKYVYETENGKSSGVATYEPLGCKENPFVKPFYDQNKRDLPLGPDNTNYVEEPFGESFFPAPKVTYSRVTVANLSREKHNESNVVTNSVKKHATGSVVTEFYTTKDFPTLTDRTTLSLNYDKSSALASLLNLKVKDHITLSQGFSVHTNDMDGKMKNQRVYGEGQKDFISGVDYKYNTITDAQNRNEGRLNNTVQTIDSKGNIASKLVGVDYDVINDFRENKSTTQIAGIHYNTAGIPIFLAIIVVPVPLPSYSQYESQLRSAVTTKVIHTTAILSETIAYDLGSKVSTKNLAYDAETGEVLLTETVNEYNDKYFSFNFPAYWSYAGMSQAAKNIGLEWDITKTGNNQYQLKDEGIKTFLESDYLVDGDELWLNGLAPDGKTKTLMKAWAVHVTKDNFKLIDEKGILIKSDVINTAKMKVIRSGYRNLQTASMASVTSMTNPLYNYDGNNKITTIKTNIGNNPFMSSDSSNRIVNASAVQYNDVWPSQCECNLPKMVFENGNLVFEYEKENNTAEEDDIAKRSFNPYLYNILGNWRANKSYAYLTGRNYTVDPTPRKTGFFNDFYPFYVYDTTKNVWGKTASNYDRWTFASEVTQYNPAGQEIENKDALKRYSSALFGYNNRFPVAVASNTKYTELASDGFEDYDLSNCGTESHFDFQAQLKTNDVSVSDRQAHTGRKSLKISPSKKAIIKKQVVSCNEIPSTVTAKK >NC_009441.1|WP_012022690.1|637567_638170_+|hypothetical-protein MKDLNKLFCIFCVLFFISCKKETKNDSKNSEIRDRYFNLEKIGWKSRAYTQKADDIAFTAIEVPIQYYLLKDLGTENLIPVDSLYEKNKRERIIEFTFQQDEEKDLLEKKFTGIDYTDAVKYMSFGLEKDFYVVTSKKDTIACSGVNYERTYKIAPYQKVLLFFSGIDPNEKIQLVYSDYLFRKGTLKFQFKDTYTQIAL >NC_009441.1|WP_012022689.1|637077_637584_+|OmpH-family-outer-membrane-protein MIKHKSSLLLIINSLLVFSLIFYVILTSFTSKTKIVYVDTTELFNGFSMTKELKSKGEKEFISKKIALDNLYSQIQSKSINASQKEVLMKQFIQEKEELEQFNQIYAATESSKIWSRINSYSEDFSKENNYDLIIGTENKTTVLYADEKITVTKELLTYINKRYEGLK >NC_009441.1|WP_012022688.1|635684_636449_-|enoyl-CoA-hydratase/isomerase-family-protein MSSEIIKGSLQTSFQNTIATVQFGHPASNSFPRELLDRLTSEINELSRNEKVSVIILKSEGAKAFCSGASFDELLQVENEEQGTEFFSGFAHLINAMRNCNKLIIGRVQGKAVGGGVGIISACDYVFATQESDIKLSELAIGIGPFVIEPAVSRKIGKTAMVEMTLTAHAWKSAEWAFQKGLYSVLSNAENLDAEVENFAQKLSSYNPESLKEMKKIIWEGTEQWESLLFERAAITGKLVLSDFSRNALLQFKK >NC_009441.1|WP_012022687.1|635417_635594_-|hypothetical-protein MTIISLFQNVDVAEKIKHAPDSSYQIGVVIGSFIPFLVLGGIALWMYNRAKKRDKNGY >NC_009441.1|WP_012022686.1|634932_635385_-|6-carboxytetrahydropterin-synthase MSNIRITKQFSFETGHALYGYDGKCKNVHGHSYKLSVTVIGSPITDRSNVKFGMVIDFSDLKKIVKEEIVDQFDHATVFNQTTPHIELANELKNRGHHVILVDYQPTSENMVVDFAERIKNRLPVGISLFSLKLQETESSFAEWYASDNL >NC_009441.1|WP_012022685.1|634116_634860_-|UDP-2,3-diacylglucosamine-diphosphatase MKKVYFASDQHFGAPTPELSLPREKKFVAWLDEVKEDAEAIFLLGDLFDFWFEYKTVVPKGFVRILGKLAEIRDSGIPIYFFVGNHDLWMNDYFETELNIPVYHDNKEFTFNGKTFLIGHGDGKGPGDKGYKRMKKVFTNPFSKWLFRWLHPDVGVSLAQYLSVKNKLISGDEDIKFLGEEKEWLILYAKRKLETKHYNYFIFGHRHLPMIRPVGENSEYVNLGDWIGYFTYGVFDGETFELKEYKK >NC_009441.1|WP_012022684.1|632904_634116_+|hypothetical-protein MKNTCIIIAFMVLSVFLTNCTNKSDEYIDPRGTNYAGSESCIQCHKAESESAFHSSHFKATSPALKENVLGHFSKGKNTFVYDKNTKLVMEERNDTLYQVLYKNNKEVEAYPFEVLFGVKHAQTSAYWKNHYTYELPVSYYKSLNSWATSPGYSATVPNFERKIEKECYGCHSSNIASRYITTSSDSITFTNMEVEDFMNPKTLIYGIDCERCHGPAKKHVQTHLKFPDLKLAQDIVSFKKLTRQQKIDACAICHSGNDKLKIKSRFEFRPGDNLLDYFRGVPGSNDNKVYDVHGNQLGLLSQSKCFKKNETMTCMNCHNPHENTSKSMVSYSKICMSCHQDPKHTPETLKTVSKTAMAENCIECHMPKQDSNAIRFQQSNTAAMSSYSLRTHKIGIYPANKK >NC_009441.1|WP_012022683.1|632464_632821_+|hypothetical-protein MREIEQIYHNNFGIAFYWKQNSQTILDKVQLVFKETGFYFTISELNQFCDLIEDSLLENTCCEACEMKYSCHKFLLKTPCNSIDLAVSMTELKSIKDLVEGSLFKIELDEYVYGVGLN >NC_009441.1|WP_044047442.1|631470_632385_+|alpha/beta-fold-hydrolase MKSFFVSFFLMFCFFANAQNLYIKTYGNEKNKPVIFIHGGPSGNATLFEGTTAQKLADQGFYVIAYDRRGEGRSADPDAKFTYEEAFQDLNFIYKIYNLKKAVLLSHSFGGLVATLYANKYPQNVSALVLAGALFSQQETYDHILNTLKKKYNNDSEQLKRIHVVENLDKNSAEYRKKCFELAGENGFFKMPNPTAESKKLYTDYETGEFYKTNIRNKNAPLLFYQNEKQNNIDSRPFLKKIKAAGVPIYGIYGKQDGIFSLAQIKSIKDLAGEKHFAFLDNCSHYLFVDLQKEFLDNIKKWLK >NC_009441.1|WP_012022693.1|651286_654070_+|PKD-domain-containing-protein MVNDFKIKKYWITALCTVLFSLAGFSQGLSDATIGFNLSKETEVLKKQGLKDEDLTKEIARLRKIKMASFIIIKNKEAAAIQENKMKPLAKSILTKNIKTASKISSLAKTEMECSYDYYRAGRIQYAGGPTYDQNSVKINTPANITFYKYYNGTNGNLSYEWKLYNPDGIVIDTKNTSNFSITLPAVGAYKIVLTLTDAIGCSEFEATLYVRDSNNCVISPEERNGTIYTPRNSDQLVENRESIVTLSPSGFSTNNLIYKWDLFDVNGSNIFTSSEPEFKFTPPAKGQFLINLKITDPNGCSTTYTRNVETVDICTYTQYDDYFDIMAPEESAGGRVSFAKVGQRVTLEPVFFSGGNKEFTYSWKLFDPKGQQIGTGSHRVFPFTPTEPGYYTLTADLTNLETGCILTAKKTVASQIENGCVLTNPKSSEVYELYLKFVKKLIERLVLGETDEQINSSIAMPEFMALKPYIKNGVGDKIYNFVSIQEGYGDQRVNGINFSFSPEREYDIHIYSIDGVYYNSEYSTPEDLEYNISSAIFTNISQYIAADDFFVSCQVINGGKKAKTGKVVLEPYECTRESEVRNIIFCPGEGSNCTPEIVGTIKSNFPFIYPKTEYSFYFETIIPNLTYSWSITSETGEVLSTSDTDITTPYRYTFLNEGIYFVKLTAKNELGCTTNFTKKIIVDNKRCANDSNNFTFETEENGVTYIWTTTDINGNIVDTVTNTSGNYSFTTNTAGTYEVKLTANAEKKCETIFAKTIFVENCTPVVVVSCTQNNPLTPKIHQLFINLINKAATTPNGVDVNTYAKTEIAALAPYTFGPNAKIFNFSNDSSSVSFSFTENYTGIDVYIPKSSQGTITGIDLSKYESSSSKTIVETNYTNGSSNLTNGYVTNIDFCPSIDCTPITGVINIVKRGTASTNKKTNSSSKI >NC_009441.1|WP_012022694.1|654137_658010_+|leucine-rich-repeat-domain-containing-protein MTNNLKIKKYWITTFCLVFFSLFSFAQELSDETIGFNVVDYTAFLKNRGVTDKDMKSELSKLRKTRLSDYLEMKKSENDFLQMNINENKVKQSRSSINSKTAVLDIPQIEKDALLAFYNSTNGSNWLLKKGWDFSTPVTTWDGFSQTGWYGITITDGHVTKITDILNATGTLPDLSALQYLKELYIFNSSFTGNLTGLQNLNNLEKLRIGWSTSSQSSFQDLNPLSKLTNLTELCLHSCNFTNNSIPSDFTKLVNLKKLEIRFGNVNQNWEVLGNLTNLIHLNLGNNNFASQNTTLVVPPNFANLTKLEILDLSNNKIKDISVINNMKELKYLNAQWNEISTIPSGFSELTKLNYIRLGQNKIKGNFPSYLQNLQLNTFEISSNEFEGKIPALNFDLANSTVNYYIAGQGVAFLNKTLGIYDNKFRFIDFANEFEIYKTKIASNYFTYQYQKRINVVETITKGIGQSVTLKMFPEGDSRYLNDDTFKWFKNGVEIIGATERTYTLTNLTAANAATYICRSYHTSNPDMSALTLEREPITLKVVNCTPLTGNITSTTDKFHTGGESNFAFQTTATGLSYEWSVTTAEGLPVNEIPSNTLEIYTYTFTNPGDYIVKVKATDSTGCTTEFTKEITVTERYCDNEPVDFSFETTATNLTYTWTTTDSTGKVVNRVTDTTGLYTFTPQVSGEYVIELVASSATSCKTLFTKNITIDQCTPYISCTRDNPLSPEIHRLFINMITKLTSAPAGTNVNVYAHKEIAAVAPYTTEKTAKIYNFVNNGTAISFSFTENGTDDVYIPKASTGSVTAIDLSKYVDSVTSTIVATSYSNGTTNNSDGRVKNIDFCPKELSCVSHVALVVDESGSLDQSEINKIKKQLKLFVAQQAFTNDDIGSNIHISITGMSDSDDVNKRRKDFIIPTKVTASNVYLFNNWIEKLGKRYGDTIGISQASDFWKSGLDGALSYSMKPNFVIMITDGAQTDDVTGLKETLAKFDNNNKTVTDPKLPHLYVVGIENGVYIDRNSLTGKALPRNEDPNYNSAIGSQNNLTAKTTPFLTKSLQFLLDLSPTEFPVADINQFTVGTYFGHSNFDLLASDETYFSDKLIVGEVVCGTPAVKDSCDDCFSFKPEPGKEYVLSAWVKEESNEQVKTYVNPLIKIKFYNNKEALDIPAHKIDSLSIKGSGDIIDGWQRVVKKFKIPNNTITLGIELENLSPSIPVYFDDIRIHPLQGSVKSFVYDPETFKLMSELDENNYSTFYEYDNEGGLVRVKKETAKGIKTIQETRSGNVIETTNTTP >NC_009441.1|WP_012022695.1|658014_658725_+|hypothetical-protein MYKKIIYVWVLFNCCLAHTQTVNEVIQKISKQYSLAKPLQYKSTYSLYKDFDSKKIEETYKGIYYKNDLNEIYTKIGDTEILNSKEVYLKISNSEKAVEISNPVPNYNGDFDIKPLLQLCKIEKFVDYKTYWEITLTAKPYSSLSYSKIVVQVTKNYFLQKQVFYYSTAVNFSNDYRKPDPHYPRLEIVNTNFNRNAVNASVFNTKTYFTTSAKKQIVPAEKLKKYEIIDQRVISK >NC_009441.1|WP_081432683.1|668709_669735_+|hypothetical-protein MLVPNRHESSKDYRYGFNGKEKDDEFNGDVNSYDYGARMYNPRVGRFLSLDPLSHDFPFYSPFQFAGNSPIFAIDLDGLEMQISNTVFTLKEGKGTPELNYSTDIKIHYKVLNLTGRKIEGIQQITDFARDRSRLVYSDRAGMGNFSITFDGKGNRLKQPISYKLNGKIKSFETTFSVIKSTKEINDSDYVVILVNQRLSNKKYPEHAHANLAGNIMTVDIGNPDYKSILTNGTFNFNLMTTVARKIGATINHETGHNLGLDDEYKMKEDGQAIVNPGYENNQMSGGSGKELNSRQIASILNDIFTNFRIDLYNKKKSGKEQTDSTKSQVNEEQKKLNLGN >NC_009441.1|WP_012022697.1|669700_670273_+|cytochrome-c MKNKKNLIWGISALLIINCILLLKNCNQKQLIEVKDKKIDKTIDKKVLFTGEFNDVGSPINFWDFYGDNGESILSLIFYKNDKNEFDYEIKQKNSLGKIVYSAEMRNGKVLKEFDYEILQNINIDNGRFMYENYCVNCHNYKKEGVSKPLLKLKNIEVSKFIKKYKNVSHENVPKLNDNELKSVILFINK >NC_009441.1|WP_012022698.1|670446_671493_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MKKTTPIVPLFKQFIKETESGKRLKKNGEKIKSGSIQNYYYVLNNLIQFSSETKFELRICDASKLDKRELASEKSYWKKFYLKFTEFLYKKGCHDNYVGANIKIIRVFFNYLKNDKDIITGDFQRLFYVRKEEIEIFVLSPEQLKFLIHDKDFEQTLIPSHKRIKDIFVFGCSTGLRYSDIFLLTNKNFEQMEGDWYLKLKSQKTKTFSFIKLSAYAITIFQRYKATSDRIPIFGTISLFNFNKSLKQIGEQAGFTMPIEVSREQQGKTQKLTKKTDTSRNRFCDKMSSHMMRRTAITTLLILGMPEHLVRKISGHSNASSSFNRYVHYAQAYMDKEIEKVHSKLESY >NC_009441.1|WP_159436621.1|672197_673193_-|DUF1990-family-protein MPNRHESSKDYRYGFQGQEKDDEIRGGEGNSINYTFRMHDPRIGRFFAVDPLFREYAYNSPYSFSENRVMDGVEREGLEVENINAYLKAKKYGVDALEIKKMDDGMGNVSSQLYSLRTLGITPSEFANLRDTFLNAPQTFTNNFMATYKPVQKANSNILSPGDEIGINLQPATPFPIFVRVMNVVKKDNSFEMTFATLEGHTDAGYITFSGVFNKRTGQMDINIFNETRENLAMAYPLDLGRGAQILQWKIVMKNIAKAIQQDPKNNNTVIEITKHIEEYEYDESGTGGKGKLVESITEQIDIPKKPSIPAKTTKIKNTKSDYDIQDGDGF >NC_009441.1|WP_012022700.1|673472_674261_+|hypothetical-protein MKTKVLSGFLLFFLSLFLVSFSDPYAIKRISDANFRYEFFTTDKKVKVKDNKIYFWFKGGTIHNAQSGIAGALLDDKFVKMYHNNQLAEQGQFDEGLKVGLWKTWHSNGIIESTQKWKKGIKCGEYFRYNSNGDLVETGKYSQDLKTGKWVDLEKKDTLVYKKGILLSKPQKISKSQEYKLKEEQEKLDKSRKEAKELEIIQDSNTLNSYKEATKQREKAEKEKLEREKKAEKDKKAAEKASQPKKDSKVKSFFKNLFSKKK >NC_009441.1|WP_012022701.1|674265_675480_+|hypothetical-protein MIKAHSLLYAIYICLIVSIICGALLYFSNLYNQLNLYYNLQEELYIQNQSVVNFALGNKIKPQEIQKDENSGIEGNYKTKPYGLLTLLLAESSVGNDTVKSAHFVGSYTTDKTAVFLTNISKPLSYSGTVTLNGDSELPSTFIQTAYINNSPNKLNNNGKIAVSEIRLPEINPNFEKIFEETEGVKTALKDIEKAKDSIYYNSFFNETKDIYVTSSLSNIIFKGNFILRSKDSIRVRKNAVLEDVILIAPKITFETGFKGNLQAFATKGIDVEEKVTLNYPSVICVYNKNEEESQIRIKKETTISGAVVYFGNSSDDDFSKKTVEIAEEGLVFGDIYCTGKLSLRSNVYGSVYTNRFFLKTDATSHDNVISNVEINPHKRPEYFISIPLFSNQKTAYGILKKVL >NC_009441.1|WP_012022702.1|675454_675799_+|hypothetical-protein MVFLKKYCSVKANSILESVIALTIISICLYFAILIFAAVFTPRTSAKFYNTQNKVNELFFLSQLKNDSLQYESNDENLLIEEEVVTDHLKKISVEYKDSTKFKFQKSFYVEGNP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009441_2 | 644859-645169 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009441_2
|
4 spacers
spacers of NC_009441_2
>2.1|644882|49|NC_009441|CRISPRCasFinder TAGCAGCATTAACCGATTAAGAAACATTGGCTTACTTTATCTCGATCAC >2.2|644954|49|NC_009441|CRISPRCasFinder AGCAAATATTGGTAACCTTCCTGAAGCAATACATCTTAATTTAAGTAAT >2.3|645026|49|NC_009441|CRISPRCasFinder TCCTGAACTAGGTGGATTATCTAAAGTGCAAATGCTAGATTTGTCTTTT >2.4|645098|49|NC_009441|CRISPRCasFinder TTTAGAAATAGGCAATTTAACATCCATTCGTAATTTATTCTTAAACAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009441_2
The CRISPR arrays of NC_009441_2 >merge|NC_009441|2|644859-645169|CRISPRCasFinder AATCAATTAAGCGGTCCAATACCTAGCAGCATTAACCGATTAAGAAACATTGGCTTACTTTATCTCGATCACAATCAATTTACAGGTACAATTCCAGCAAATATTGGTAACCTTCCTGAAGCAATACATCTTAATTTAAGTAATAATCAATTAACAGGTACAATTCCTCCTGAACTAGGTGGATTATCTAAAGTGCAAATGCTAGATTTGTCTTTTAATCAATTAACTGGTTCCATACCTTTAGAAATAGGCAATTTAACATCCATTCGTAATTTATTCTTAAACAACAATGAATTTAGCGGCACTATACC >NC_009441|2|2|644859-645169|CRISPRCasFinder AATCAATTAAGCGGTCCAATACC TAGCAGCATTAACCGATTAAGAAACATTGGCTTACTTTATCTCGATCAC AATCAATTTACAGGTACAATTCC AGCAAATATTGGTAACCTTCCTGAAGCAATACATCTTAATTTAAGTAAT AATCAATTAACAGGTACAATTCC TCCTGAACTAGGTGGATTATCTAAAGTGCAAATGCTAGATTTGTCTTTT AATCAATTAACTGGTTCCATACC TTTAGAAATAGGCAATTTAACATCCATTCGTAATTTATTCTTAAACAAC AATGAATTTAGCGGCACTATACC
>NC_009441.1|WP_012022691.1|638166_643740_+|hypothetical-protein MIQPKISKLKKTVAIYLAMMILLETLQPMQMYALTGGPSQPEFESFTPIGTSDMVDLASGDFNYNIPIMDVGGYPINLAYNSGVTMDQEASWVGLGWDLNVGQITRQMRGLPDDFNGDEMTYENNMKPNVTVGSDFNVFFGAFGVNEVKANVGMSIKYNNYEGFGATASGGLSAQIANNIRVGMNLESSASEGVSASPSVAYQDIDDTKKTRDNTPTGNFGISYNSRKGVENVTYSASMNLKKIKDKAGNEKTRTINGFAGSGSTSFIDASFTPTKRVGMVSSNFIFNLNIEGEFWGIEPGMKFTGYRTSQGIKNSEKYKTERAYGFENTYNASTADVLDFNREKDRTFNKNTTSLPLTNNTYDLYNIQGQGISGMFRPYKSQVGYVFDKETNDDSVGANLGLELGAGGLTHWGIDATVTLGKSNTSLWSASNPALGRFKENKTNNRPDYEKVFFKNIGGNHVDKELDLFNTKLGGYDAVKLGLSGGKFSRSTDVKYAKNTGAIAYTGAVKRESSRLSRNQSIQKLTKVEAKRFGSKLQPSEYSRDHHTTEIRITKEGGERYIYGRAAYNTLKKEVTFDVSDKDRPAEKLDYRNGLIHYDSGDNSANNKKGGDQYFNRVTTPPYAHSYLLTSVLSADYQDLKNDGPTDDDLGNYTKFEYDNKTAEHLYKWRIPFKENEANYDEGLRSSKKDDKGNYQYGEKELLYIKKIVTKTHVAVFHLSERNDAYGVKGENGGIGYDSKMYKLDKISLYSKPEYLAQGDNATPIKEANFEYNYSLCKGIDNSINNEGKLTLSKVYFTYKNSNMGKYTPYVFNYGFNPDYDMKAYDVWGNYKKVKEGVNEGTLAQLSNAEFPFVDQSNRTQADEYASAWLLKSIRLPSGGQMELNYEADDYSSVQNKDAMQMFKVVGSGSKEGLTANNISNGIERKTLGKYIYVQLDHKVDNSKEFYDQYLKNVGDASNPLYFRFLLNMVNPNPLPGVDSTDKYDYVTGYLNIEGIKNKTVDCGFLEVNDKQYVAIPIDYVGKGDGFNKDSHEVNPISKAGWNFGRQNLNRLVYSMYNEEDTTDLKSIVMEMIGWLPTILDIFKSPNAKLEQTEIASRFITNKSWIRLIQPTGKKVGGGTRVKNIAINDQWDVMTANTNKELYQQSYGQKYVYETENGKSSGVATYEPLGCKENPFVKPFYDQNKRDLPLGPDNTNYVEEPFGESFFPAPKVTYSRVTVANLSREKHNESNVVTNSVKKHATGSVVTEFYTTKDFPTLTDRTTLSLNYDKSSALASLLNLKVKDHITLSQGFSVHTNDMDGKMKNQRVYGEGQKDFISGVDYKYNTITDAQNRNEGRLNNTVQTIDSKGNIASKLVGVDYDVINDFRENKSTTQIAGIHYNTAGIPIFLAIIVVPVPLPSYSQYESQLRSAVTTKVIHTTAILSETIAYDLGSKVSTKNLAYDAETGEVLLTETVNEYNDKYFSFNFPAYWSYAGMSQAAKNIGLEWDITKTGNNQYQLKDEGIKTFLESDYLVDGDELWLNGLAPDGKTKTLMKAWAVHVTKDNFKLIDEKGILIKSDVINTAKMKVIRSGYRNLQTASMASVTSMTNPLYNYDGNNKITTIKTNIGNNPFMSSDSSNRIVNASAVQYNDVWPSQCECNLPKMVFENGNLVFEYEKENNTAEEDDIAKRSFNPYLYNILGNWRANKSYAYLTGRNYTVDPTPRKTGFFNDFYPFYVYDTTKNVWGKTASNYDRWTFASEVTQYNPAGQEIENKDALKRYSSALFGYNNRFPVAVASNTKYTELASDGFEDYDLSNCGTESHFDFQAQLKTNDVSVSDRQAHTGRKSLKISPSKKAIIKKQVVSCNEIPSTVTAKK >NC_009441.1|WP_012022690.1|637567_638170_+|hypothetical-protein MKDLNKLFCIFCVLFFISCKKETKNDSKNSEIRDRYFNLEKIGWKSRAYTQKADDIAFTAIEVPIQYYLLKDLGTENLIPVDSLYEKNKRERIIEFTFQQDEEKDLLEKKFTGIDYTDAVKYMSFGLEKDFYVVTSKKDTIACSGVNYERTYKIAPYQKVLLFFSGIDPNEKIQLVYSDYLFRKGTLKFQFKDTYTQIAL >NC_009441.1|WP_012022689.1|637077_637584_+|OmpH-family-outer-membrane-protein MIKHKSSLLLIINSLLVFSLIFYVILTSFTSKTKIVYVDTTELFNGFSMTKELKSKGEKEFISKKIALDNLYSQIQSKSINASQKEVLMKQFIQEKEELEQFNQIYAATESSKIWSRINSYSEDFSKENNYDLIIGTENKTTVLYADEKITVTKELLTYINKRYEGLK >NC_009441.1|WP_012022688.1|635684_636449_-|enoyl-CoA-hydratase/isomerase-family-protein MSSEIIKGSLQTSFQNTIATVQFGHPASNSFPRELLDRLTSEINELSRNEKVSVIILKSEGAKAFCSGASFDELLQVENEEQGTEFFSGFAHLINAMRNCNKLIIGRVQGKAVGGGVGIISACDYVFATQESDIKLSELAIGIGPFVIEPAVSRKIGKTAMVEMTLTAHAWKSAEWAFQKGLYSVLSNAENLDAEVENFAQKLSSYNPESLKEMKKIIWEGTEQWESLLFERAAITGKLVLSDFSRNALLQFKK >NC_009441.1|WP_012022687.1|635417_635594_-|hypothetical-protein MTIISLFQNVDVAEKIKHAPDSSYQIGVVIGSFIPFLVLGGIALWMYNRAKKRDKNGY >NC_009441.1|WP_012022686.1|634932_635385_-|6-carboxytetrahydropterin-synthase MSNIRITKQFSFETGHALYGYDGKCKNVHGHSYKLSVTVIGSPITDRSNVKFGMVIDFSDLKKIVKEEIVDQFDHATVFNQTTPHIELANELKNRGHHVILVDYQPTSENMVVDFAERIKNRLPVGISLFSLKLQETESSFAEWYASDNL >NC_009441.1|WP_012022685.1|634116_634860_-|UDP-2,3-diacylglucosamine-diphosphatase MKKVYFASDQHFGAPTPELSLPREKKFVAWLDEVKEDAEAIFLLGDLFDFWFEYKTVVPKGFVRILGKLAEIRDSGIPIYFFVGNHDLWMNDYFETELNIPVYHDNKEFTFNGKTFLIGHGDGKGPGDKGYKRMKKVFTNPFSKWLFRWLHPDVGVSLAQYLSVKNKLISGDEDIKFLGEEKEWLILYAKRKLETKHYNYFIFGHRHLPMIRPVGENSEYVNLGDWIGYFTYGVFDGETFELKEYKK >NC_009441.1|WP_012022684.1|632904_634116_+|hypothetical-protein MKNTCIIIAFMVLSVFLTNCTNKSDEYIDPRGTNYAGSESCIQCHKAESESAFHSSHFKATSPALKENVLGHFSKGKNTFVYDKNTKLVMEERNDTLYQVLYKNNKEVEAYPFEVLFGVKHAQTSAYWKNHYTYELPVSYYKSLNSWATSPGYSATVPNFERKIEKECYGCHSSNIASRYITTSSDSITFTNMEVEDFMNPKTLIYGIDCERCHGPAKKHVQTHLKFPDLKLAQDIVSFKKLTRQQKIDACAICHSGNDKLKIKSRFEFRPGDNLLDYFRGVPGSNDNKVYDVHGNQLGLLSQSKCFKKNETMTCMNCHNPHENTSKSMVSYSKICMSCHQDPKHTPETLKTVSKTAMAENCIECHMPKQDSNAIRFQQSNTAAMSSYSLRTHKIGIYPANKK >NC_009441.1|WP_012022683.1|632464_632821_+|hypothetical-protein MREIEQIYHNNFGIAFYWKQNSQTILDKVQLVFKETGFYFTISELNQFCDLIEDSLLENTCCEACEMKYSCHKFLLKTPCNSIDLAVSMTELKSIKDLVEGSLFKIELDEYVYGVGLN >NC_009441.1|WP_044047442.1|631470_632385_+|alpha/beta-fold-hydrolase MKSFFVSFFLMFCFFANAQNLYIKTYGNEKNKPVIFIHGGPSGNATLFEGTTAQKLADQGFYVIAYDRRGEGRSADPDAKFTYEEAFQDLNFIYKIYNLKKAVLLSHSFGGLVATLYANKYPQNVSALVLAGALFSQQETYDHILNTLKKKYNNDSEQLKRIHVVENLDKNSAEYRKKCFELAGENGFFKMPNPTAESKKLYTDYETGEFYKTNIRNKNAPLLFYQNEKQNNIDSRPFLKKIKAAGVPIYGIYGKQDGIFSLAQIKSIKDLAGEKHFAFLDNCSHYLFVDLQKEFLDNIKKWLK >NC_009441.1|WP_012022693.1|651286_654070_+|PKD-domain-containing-protein MVNDFKIKKYWITALCTVLFSLAGFSQGLSDATIGFNLSKETEVLKKQGLKDEDLTKEIARLRKIKMASFIIIKNKEAAAIQENKMKPLAKSILTKNIKTASKISSLAKTEMECSYDYYRAGRIQYAGGPTYDQNSVKINTPANITFYKYYNGTNGNLSYEWKLYNPDGIVIDTKNTSNFSITLPAVGAYKIVLTLTDAIGCSEFEATLYVRDSNNCVISPEERNGTIYTPRNSDQLVENRESIVTLSPSGFSTNNLIYKWDLFDVNGSNIFTSSEPEFKFTPPAKGQFLINLKITDPNGCSTTYTRNVETVDICTYTQYDDYFDIMAPEESAGGRVSFAKVGQRVTLEPVFFSGGNKEFTYSWKLFDPKGQQIGTGSHRVFPFTPTEPGYYTLTADLTNLETGCILTAKKTVASQIENGCVLTNPKSSEVYELYLKFVKKLIERLVLGETDEQINSSIAMPEFMALKPYIKNGVGDKIYNFVSIQEGYGDQRVNGINFSFSPEREYDIHIYSIDGVYYNSEYSTPEDLEYNISSAIFTNISQYIAADDFFVSCQVINGGKKAKTGKVVLEPYECTRESEVRNIIFCPGEGSNCTPEIVGTIKSNFPFIYPKTEYSFYFETIIPNLTYSWSITSETGEVLSTSDTDITTPYRYTFLNEGIYFVKLTAKNELGCTTNFTKKIIVDNKRCANDSNNFTFETEENGVTYIWTTTDINGNIVDTVTNTSGNYSFTTNTAGTYEVKLTANAEKKCETIFAKTIFVENCTPVVVVSCTQNNPLTPKIHQLFINLINKAATTPNGVDVNTYAKTEIAALAPYTFGPNAKIFNFSNDSSSVSFSFTENYTGIDVYIPKSSQGTITGIDLSKYESSSSKTIVETNYTNGSSNLTNGYVTNIDFCPSIDCTPITGVINIVKRGTASTNKKTNSSSKI >NC_009441.1|WP_012022694.1|654137_658010_+|leucine-rich-repeat-domain-containing-protein MTNNLKIKKYWITTFCLVFFSLFSFAQELSDETIGFNVVDYTAFLKNRGVTDKDMKSELSKLRKTRLSDYLEMKKSENDFLQMNINENKVKQSRSSINSKTAVLDIPQIEKDALLAFYNSTNGSNWLLKKGWDFSTPVTTWDGFSQTGWYGITITDGHVTKITDILNATGTLPDLSALQYLKELYIFNSSFTGNLTGLQNLNNLEKLRIGWSTSSQSSFQDLNPLSKLTNLTELCLHSCNFTNNSIPSDFTKLVNLKKLEIRFGNVNQNWEVLGNLTNLIHLNLGNNNFASQNTTLVVPPNFANLTKLEILDLSNNKIKDISVINNMKELKYLNAQWNEISTIPSGFSELTKLNYIRLGQNKIKGNFPSYLQNLQLNTFEISSNEFEGKIPALNFDLANSTVNYYIAGQGVAFLNKTLGIYDNKFRFIDFANEFEIYKTKIASNYFTYQYQKRINVVETITKGIGQSVTLKMFPEGDSRYLNDDTFKWFKNGVEIIGATERTYTLTNLTAANAATYICRSYHTSNPDMSALTLEREPITLKVVNCTPLTGNITSTTDKFHTGGESNFAFQTTATGLSYEWSVTTAEGLPVNEIPSNTLEIYTYTFTNPGDYIVKVKATDSTGCTTEFTKEITVTERYCDNEPVDFSFETTATNLTYTWTTTDSTGKVVNRVTDTTGLYTFTPQVSGEYVIELVASSATSCKTLFTKNITIDQCTPYISCTRDNPLSPEIHRLFINMITKLTSAPAGTNVNVYAHKEIAAVAPYTTEKTAKIYNFVNNGTAISFSFTENGTDDVYIPKASTGSVTAIDLSKYVDSVTSTIVATSYSNGTTNNSDGRVKNIDFCPKELSCVSHVALVVDESGSLDQSEINKIKKQLKLFVAQQAFTNDDIGSNIHISITGMSDSDDVNKRRKDFIIPTKVTASNVYLFNNWIEKLGKRYGDTIGISQASDFWKSGLDGALSYSMKPNFVIMITDGAQTDDVTGLKETLAKFDNNNKTVTDPKLPHLYVVGIENGVYIDRNSLTGKALPRNEDPNYNSAIGSQNNLTAKTTPFLTKSLQFLLDLSPTEFPVADINQFTVGTYFGHSNFDLLASDETYFSDKLIVGEVVCGTPAVKDSCDDCFSFKPEPGKEYVLSAWVKEESNEQVKTYVNPLIKIKFYNNKEALDIPAHKIDSLSIKGSGDIIDGWQRVVKKFKIPNNTITLGIELENLSPSIPVYFDDIRIHPLQGSVKSFVYDPETFKLMSELDENNYSTFYEYDNEGGLVRVKKETAKGIKTIQETRSGNVIETTNTTP >NC_009441.1|WP_012022695.1|658014_658725_+|hypothetical-protein MYKKIIYVWVLFNCCLAHTQTVNEVIQKISKQYSLAKPLQYKSTYSLYKDFDSKKIEETYKGIYYKNDLNEIYTKIGDTEILNSKEVYLKISNSEKAVEISNPVPNYNGDFDIKPLLQLCKIEKFVDYKTYWEITLTAKPYSSLSYSKIVVQVTKNYFLQKQVFYYSTAVNFSNDYRKPDPHYPRLEIVNTNFNRNAVNASVFNTKTYFTTSAKKQIVPAEKLKKYEIIDQRVISK >NC_009441.1|WP_081432683.1|668709_669735_+|hypothetical-protein MLVPNRHESSKDYRYGFNGKEKDDEFNGDVNSYDYGARMYNPRVGRFLSLDPLSHDFPFYSPFQFAGNSPIFAIDLDGLEMQISNTVFTLKEGKGTPELNYSTDIKIHYKVLNLTGRKIEGIQQITDFARDRSRLVYSDRAGMGNFSITFDGKGNRLKQPISYKLNGKIKSFETTFSVIKSTKEINDSDYVVILVNQRLSNKKYPEHAHANLAGNIMTVDIGNPDYKSILTNGTFNFNLMTTVARKIGATINHETGHNLGLDDEYKMKEDGQAIVNPGYENNQMSGGSGKELNSRQIASILNDIFTNFRIDLYNKKKSGKEQTDSTKSQVNEEQKKLNLGN >NC_009441.1|WP_012022697.1|669700_670273_+|cytochrome-c MKNKKNLIWGISALLIINCILLLKNCNQKQLIEVKDKKIDKTIDKKVLFTGEFNDVGSPINFWDFYGDNGESILSLIFYKNDKNEFDYEIKQKNSLGKIVYSAEMRNGKVLKEFDYEILQNINIDNGRFMYENYCVNCHNYKKEGVSKPLLKLKNIEVSKFIKKYKNVSHENVPKLNDNELKSVILFINK >NC_009441.1|WP_012022698.1|670446_671493_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MKKTTPIVPLFKQFIKETESGKRLKKNGEKIKSGSIQNYYYVLNNLIQFSSETKFELRICDASKLDKRELASEKSYWKKFYLKFTEFLYKKGCHDNYVGANIKIIRVFFNYLKNDKDIITGDFQRLFYVRKEEIEIFVLSPEQLKFLIHDKDFEQTLIPSHKRIKDIFVFGCSTGLRYSDIFLLTNKNFEQMEGDWYLKLKSQKTKTFSFIKLSAYAITIFQRYKATSDRIPIFGTISLFNFNKSLKQIGEQAGFTMPIEVSREQQGKTQKLTKKTDTSRNRFCDKMSSHMMRRTAITTLLILGMPEHLVRKISGHSNASSSFNRYVHYAQAYMDKEIEKVHSKLESY >NC_009441.1|WP_159436621.1|672197_673193_-|DUF1990-family-protein MPNRHESSKDYRYGFQGQEKDDEIRGGEGNSINYTFRMHDPRIGRFFAVDPLFREYAYNSPYSFSENRVMDGVEREGLEVENINAYLKAKKYGVDALEIKKMDDGMGNVSSQLYSLRTLGITPSEFANLRDTFLNAPQTFTNNFMATYKPVQKANSNILSPGDEIGINLQPATPFPIFVRVMNVVKKDNSFEMTFATLEGHTDAGYITFSGVFNKRTGQMDINIFNETRENLAMAYPLDLGRGAQILQWKIVMKNIAKAIQQDPKNNNTVIEITKHIEEYEYDESGTGGKGKLVESITEQIDIPKKPSIPAKTTKIKNTKSDYDIQDGDGF >NC_009441.1|WP_012022700.1|673472_674261_+|hypothetical-protein MKTKVLSGFLLFFLSLFLVSFSDPYAIKRISDANFRYEFFTTDKKVKVKDNKIYFWFKGGTIHNAQSGIAGALLDDKFVKMYHNNQLAEQGQFDEGLKVGLWKTWHSNGIIESTQKWKKGIKCGEYFRYNSNGDLVETGKYSQDLKTGKWVDLEKKDTLVYKKGILLSKPQKISKSQEYKLKEEQEKLDKSRKEAKELEIIQDSNTLNSYKEATKQREKAEKEKLEREKKAEKDKKAAEKASQPKKDSKVKSFFKNLFSKKK >NC_009441.1|WP_012022701.1|674265_675480_+|hypothetical-protein MIKAHSLLYAIYICLIVSIICGALLYFSNLYNQLNLYYNLQEELYIQNQSVVNFALGNKIKPQEIQKDENSGIEGNYKTKPYGLLTLLLAESSVGNDTVKSAHFVGSYTTDKTAVFLTNISKPLSYSGTVTLNGDSELPSTFIQTAYINNSPNKLNNNGKIAVSEIRLPEINPNFEKIFEETEGVKTALKDIEKAKDSIYYNSFFNETKDIYVTSSLSNIIFKGNFILRSKDSIRVRKNAVLEDVILIAPKITFETGFKGNLQAFATKGIDVEEKVTLNYPSVICVYNKNEEESQIRIKKETTISGAVVYFGNSSDDDFSKKTVEIAEEGLVFGDIYCTGKLSLRSNVYGSVYTNRFFLKTDATSHDNVISNVEINPHKRPEYFISIPLFSNQKTAYGILKKVL >NC_009441.1|WP_012022702.1|675454_675799_+|hypothetical-protein MVFLKKYCSVKANSILESVIALTIISICLYFAILIFAAVFTPRTSAKFYNTQNKVNELFFLSQLKNDSLQYESNDENLLIEEEVVTDHLKKISVEYKDSTKFKFQKSFYVEGNP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009441_3 | 1118828-1118972 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009441_3
|
2 spacers
spacers of NC_009441_3
>3.1|1118868|31|NC_009441|PILER-CR ATTGTCTGCTTCTAGTTTTGCTTTCGCAGCG >3.2|1118939|12|NC_009441|PILER-CR CTTACTTGTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009441_3
The CRISPR arrays of NC_009441_3 >merge|NC_009441|3|1118828-1118972|PILER-CR GCTTCAGCATCAGCTTTAGCTTTATTGTCTGCTTCTAGTTTTGCTTTCGCAGCGGCCTCAGCATCTGCTTTAGCTTTTTCTGCGGCTGCAAGTCTTACTTGTTTTGCTTCAGCATCAGCTTTTGCTTTTGCTTCAGCTGCAAGTT >NC_009441|3|1|1118828-1118972|PILER-CR GCTTCAGCATCAGCTTTAGCTTTATTGTCTGCTTCTAGTT TTGCTTTCGCAGCGGCCTCAGCATCTGCTTT AGCTTTTTCTGCGGCTGCAAGTCTTACTTGTTTTGCTTCA GCATCAGCTTTT GCTTTTGCTTCAGCTGCAAGTT
>NC_009441.1|WP_012023065.1|1095622_1115116_-|T9SS-C-terminal-target-domain-containing-protein 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>NC_009441.1|WP_121362941.1|1094604_1095603_-|type-IX-secretion-system-membrane-protein-PorP/SprF MLSKKIITMKKFILSLVLMAVTTSYSQELNLPVFTQYLADNPFVLSPAYAGIGDNLRIRANGLTQWVGIKDAPQNQSLYADFRILDRSGVGISMYNDKNGYTKQTGAKVSFAHHLILDYYGEQYLSFGLSYNFNTFRIDIDEFNNTIEHPILDPSVTDNRYTTNNNFDISALYRNKNFYISFNANNVLKKNTNKYRGVEPDLLSNYQVYTGMIFKDAENRRIEYEPSIYYQYFASDKRSTTDFNFKYRRYNRYEDYYWIGVSYRFLNDQFPKPLSVGPMAGFMKSKFYFGYSYQVMFNDLGAYNTGTHVVTIGFDFLQSISNCPCTQSPVHD >NC_009441.1|WP_012023063.1|1093200_1094388_-|phosphoglycerate-kinase MKTLNDFDFKNKKAIIRVDFNVPLDENFNVTDTTRIEAAKPTIDAILAQGGSVILMSHLGRPKGAEEKYSLKHILKTASEILGVQVKFAENCIGEPAQTAAKNLQPGEVLLLENLRFHAEEEAGDVAFAKELASLGDIYVNDAFGTAHRAHASTTIIAQFFPNDKCFGTLLAKEIDSLNKVLKNSEKPVTAVLGGSKVSSKITVIENILDKVDHMIIGGGMTFTFIKAQGGKIGESICEDDKLDLALEILRLAKEKNVQVHIPVDVVAADDFSNTANTQIVDVTAIPDGWQGLDAGPKSLENFKKVILESKTILWNGPLGVFEMETFSKGTIALGDFIAEATKNGAFSLVGGGDSVAAVKQFGFEDKMSYVSTGGGAMLEMLEGRILPGIAAILD >NC_009441.1|WP_012023062.1|1091257_1093090_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein 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MNKTHFLFLILPFLLISCLKSDKQSQPVSGKTNTISIIIDDQLWYGEVGDTIRNKFASPVLGLTQEEPLFTINQYPAKLLEGFVTDSRSIIVVKKTANEKFEITHSKALPHNTFRIYGKSIDDIICSIELNSAQIIKMIRDAEIEKIQEDNSKSLLNPAVIKNKFHIDIQIPTGYEYVLHKKNFIWLKKDIISGNTSLLIYQIPLHNFKTKGNVVGNIIKMRDSVGRYIKGREPNTPMITGEAYAPYFSATHLDDKEAFETKGTWELKNDFMAGPFINYAIVDPLYNRILVIEGFCYSPSNQERDLMLDLEAIIKSVKIDKR >NC_009441.1|WP_012023060.1|1089518_1090160_-|DUF1579-domain-containing-protein MKKLTTALVLFAMCFVSCKKEIKTETITEKDSDTVKTEQAEAEPVLDSAAQMKAWQAYATPGNPHKMMADEVGTWNCDMTFWSEPNGKSEKAASIAVVRMILGGRYQEADYKGTMMGQPFEGKSTLAYNNASQEYTTTFIDNMGTGMMVAMGKYDEKTKSMELKGEMVNPLNGKKTPYREVYTIVDPTTRKMEMFDTKNGTEYKSMEIIMKKK >NC_009441.1|WP_012023059.1|1088479_1089283_+|OmpA-family-protein MKLSRVLFLFIIYNLAAQQKPIETVYFDFDKYNLTESQSKVVNNFIKSIDTAKVESIQIYGYCDDRGTDDYNFRLSHDRVNTIQNLLVSSGFKESKIVILEGKGRVVVRPDTVENLYETRLRNRRVDLIVVKRNSFGKDIYSSFKDKLKVGDKIYLESILFDMGSARLTHNSKRELDKIALTLLKQKNIQFEIRGHVCCTPEIYSDGIDKDTKERRLSWNRAKNVFNYLSSKKVSKNRMRYQGCGNKFPLRMGDNYDRRVEFLITKI >NC_009441.1|WP_012023058.1|1086838_1088476_+|S41-family-peptidase MNRYFKKKFIIPAVAAGFLFIGTSFKEDFFEIAKQIEIFTTLFKAVNTNYVDETNPGDLMDKAIKSMLGSLDPYTVYFNEQDVVNFKINNTGEYTGIGAMIARKKDRLIVREPYKNYPADKAGLKAGDEIIQIGDVLIADFKDDASQLLKGTKNTKISIKYLRQGKTYTTELVLDEVDIKSVPFYGKIDEKTGYIVLAHFSRKASAEVKDALEKLKADGATQIVLDLRGNPGGLLNEAIDICNLFVPKNEVIVTTKSRIEKHNNTYKTTKEPIDTQIPLAILVNGRSASASEIVSGALQDLDRAVVLGSRSFGKGLVQRSVDLTYGTQLKVTISRYYTPSGRCIQALDYAHKDKNGVAQKTDAKNFNAFKTRKGRTVYDGGGVLPDIELEEAKMSPITSALLKNDGIFDYATSYYYKNPNLGEKIPVVTDADYSAFKQYLKANKISFDTETEVALKNTLAAAKNEKIDETIAPEYQQLLAALEKSENTLLDKNQKEIRGLIQEELIKRYQYQEGLYQLYIKNNSEIKRAVNVLNNQTEYKTILKM >NC_009441.1|WP_012023057.1|1085993_1086842_+|DUF4349-domain-containing-protein MRNIFFLSVFFLIFSGCSKSNEPQNESMMISAVKLPAKANVNANVNAESDSYDRNPDLSAPKIEQKIIKEATLRFETDDLENTFNQIQKAVTAGKATIINDSEGKDYGTVFRNLTVKVPSQNFDRFINDISKGVSYFEIKNISAQDVTEQFIDLTSRLNTKKKLEERYLQILQKAVKVSEILEIEKQISVIREEIEAKEGQLKYLQSRVSESTVTIEFYKTTAEKEGVKISYGSKIWTAVKSGFFSLSDFLISLISVWPFIIIFCVLAYFIRKRFKRKKQQS >NC_009441.1|WP_012023056.1|1085517_1085916_+|ribonuclease-P-protein-component MNFTYPKNERLKSKTTIGLLFSEGKSVSKYPLRLVYRQAEEAYQGNTKVGVSVSKKYFKKAVDRNYFKRVLRETYRLNKHLLLDNLDKPYSFMLFYQSKDRLSYEEINTKTIQLFEKFVLQINKPADSEKEN >NC_009441.1|WP_012023067.1|1120007_1121459_-|gliding-motility-protein-SprC MIQKTTLSFFKVFILFSIIIFTKSNSYAQAAIVPQPLDGLQKLCAGPSFNEFFATFGYVNFPAGTTFEVELSDVSGSFLTTTTATTKLEVIDINTTQQTIKFALPTNLAGSEIYGIRIKSSTGVVSARFRNSIDNASEFPAYYKSYESSFSINKRSSSAIICTGGSVTLSVDNDTPADVNSSPLNYPNLKYRWYKDDVLITGQSSASLVVNTPGSYYAEVDYGKCTEPNISSNRVTVSSVSGGSAVTIDSSLGNPFCSSGEGTVLTATNGNTYVWTKNGVELGRTRSINAKESGVYTVEVDFGGCKATGSINLSSNGFEASIDVAETTSINEGETLNVTVTTDAANPDFQWFLNGNAISGANANSYLVAVPGNYKVTISQVSGCVSSKEFNFKVTGPSKPSSVIQNIIKLGGLNPYWNIPDEYKNANTNVIILSSNGEKVLDVVNYQGDWPQTAIDFKNVNPVYYYVIKSDTGEKKGSITVIK >NC_009441.1|WP_012023068.1|1121455_1121869_-|hypothetical-protein MALSTKKYLYIFFLVSPISLSLYAQSLTTEKPTVSVGFDCKSAAVIEANQNNDSAVLNNSKIDNSNQFIVGLSTPKDNLTMATETNDQFTKCNENTLLSSTSILAKDIIENYKYDFSETFIDILFFERIDLARKRTI >NC_009441.1|WP_012023069.1|1121967_1123260_-|hypothetical-protein MKKITQMICVLLTVASMNAQQEKGIMGYTNWLNNWTEFKPNKVEYGEANQILAGNISVNTKLLKRNIYVLQGNVYVTNNAVLTIEPGTLIIGDFETKGTLVVTKGAQLVADGLETDPIVFTSNRSQKKAGDWGGIVVLGDAPINKFGNVGSYNMDLDPTLTTYGGDNVASNSGILRFVRIEFAGKKVKGVDTFNGLTLAGVGNKTILENIMVSYAGGDSFGFLGGDVNATKFVSYKSINDDYKFSQGVQCRFYNSLAVRSSYFSSTKDGSRCMEVKSYEKKSETDFTKKQTLVVATNITMLNDSENINADIQAGLVKEAVYVAENASLEMKRSVISGFNPAVLLDSKTEINDANLKKIKFEEMYFNLCKGNIFTEYNSNNEDLESWYGNSVFFNVYSQSDNKETFIDMFNPKKPDYRLQLGKITASSGNR >NC_009441.1|WP_012023070.1|1123447_1123900_-|hypothetical-protein MKGKIILFSAFLIMTTAAVSAQAKNAPRSIISTTALIRKYHDQKELSGMQKGELLELYIERIKVLVKTLPYIALVTKPGVTMADLGIPDDNEHKKVLDAQAVGTSTFLDTTVEFQRKMMPYSDKGNLIAAILFYENTLKSLHEFNELNEM >NC_009441.1|WP_012023071.1|1124336_1125485_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta' MQFSQILGQDYIKSHLIKSASSGRIPHAQLFIGPEGSGTLSTAIAYAQYILCNNTGNENENGNDSCNLKFQNLSHPDLHFIYPTVTTEDVKTKPKSLDFIQDWRTFIQEMPYGGLFDWYKILGVQNKQGEIRVEDAQEVLKSLSLKSYEGGYKIMIIWMADKMNIAASNKLLKLLEEPSDKTIFILISENEEDIIQTIRSRCQVIHFNGLPEKVIAEALVSRENIDSNFAKKIAHQAQGNFNKAMHLLKEDDSEYPFEQWFVNWVRAAFRAKGNAAAIQDLISWSEEIAGLGRESQKKFIQFCIEMFRQALLLNYQTPSLVYIEPKVDKFKLENFAPFVNGNNIHEIFKELSDAMYHIERNGNAKIILTDLSIKLTRLIHKK >NC_009441.1|WP_012023072.1|1125492_1125876_+|hypothetical-protein MNNVASILSLAFLALTFLQSGYEKIFYWKDNVAWLKEHFAKTPLKNQVPLALLHLLILELISGILSVVGAIQLLTNSGREYGFYAGIFSCICLLMMLFGQRLAKDYDGARTIVIYFIPAVMVVNWLN >NC_009441.1|WP_012023073.1|1125912_1126422_+|acyl-CoA-thioesterase MNPKHPSESLTILTDLVLPSETNPLNNLFGGELLARMDRAASIAARRHSRRIVVTASVNHVAFNRAISLGSVVTVEAKVSRSFKSSMEVFIDVWVEDRESGNRTKANEAIYTFVAVDDTGRPVEVPPIVPETEIEIQRFDAALRRKQLSLLLAGKIKPSDATELKALFL >NC_009441.1|WP_012023074.1|1126569_1127577_+|recombinase-RecA MSSDKEAKLKALQLTLDKLDKTYGKGTVMKMGDRAIVEVETISSGSLGVDLALGVNGYPKGRIIEIYGPESSGKTTLTLHAIAEAQKAGGIAAFIDAEHAFDRNYAEKLNVDIENLIISQPDNGEQALEIAENLIRSGAIDIVVIDSVAALTPKSEIEGEMGDSKMGLHARLMSQALRKLTGTISKTNCTVFFINQLREKIGVMFGNPETTTGGNALKFYASVRLDIRRSAQIKDGENVIGNRTKVKIVKNKVAPPFKTAEFDIMYGEGVSKTGEILDLAVEFDIVKKAGSWFSYGDTKLGQGRDAVKALIKDNPELADELEEKIKAHMKELANA >NC_009441.1|WP_012023075.1|1128125_1128881_-|1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate-acyltransferase MKILKIAFWIIWRVWFYVLMAVPILIMLPLLLISIISERGYPYFFKMARIWAKFILYGMGFYYKVKREQKLIKGKSYMIVANHTSMTDIMLMLAIIKNPFVFVGKKELVKIPLFGFFYKRTCILVDRNSSKSKNEVFKRAQSRLNQGLSICIFPEGGVPDDESILLDEFKDGAFRLAIDHQIPIVPIVFPDNKDRFPYRFLSGSLGKMRSKILPFVETSGLASDNRKELRDTVREMIYKGLLEFKKKDLKE >NC_009441.1|WP_012023076.1|1129033_1130008_+|tryptophan--tRNA-ligase MAKILTGVQSTGTPHLGNLLGAIIPAIELSNNPANESFLFIADLHSITQIKDGKTLRENTFSVAAAWLAFGLDIDRVTFYRQSDVVQTTELTWYLSCFFPFQRLTLAHSFKDKADRLDDVNAGLFTYPMLMAADILLYDAEFVPVGKDQLQHIEITRDVASRFNHQMGETFVLPEAKIQEDSKLIPGTNGGKMSKSANNYINIFLDDKALRKQIMSIETDSTPLEAPKNPDTCNAFAIYSLMADEAQIAEMRANYLGGNYGYGHAKQAIFELITEKFKTERERYNYYINNLDEVDALLKKGAAKASAVADGVLQRVREKLGFGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009441_5 | 1341622-1341770 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009441_5
|
2 spacers
spacers of NC_009441_5
>5.1|1341645|40|NC_009441|CRISPRCasFinder TTGATTATATGTAAGATTTGTAACATATAACAGTTTGTTG >5.2|1341708|40|NC_009441|CRISPRCasFinder GTTGTTATACTCTGCATTTAAAGAAGTTAATTTTGTATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009441_5
The CRISPR arrays of NC_009441_5 >merge|NC_009441|5|1341622-1341770|CRISPRCasFinder TTAGATAAATCTAAAGTTGTTAATTGATTATATGTAAGATTTGTAACATATAACAGTTTGTTGTTAGATAAGTCTAAAGTTGTTAAGTTGTTATACTCTGCATTTAAAGAAGTTAATTTTGTATTTTGACTTAGATCTAGTGTCGTTAA >NC_009441|5|4|1341622-1341770|CRISPRCasFinder TTAGATAAATCTAAAGTTGTTAA TTGATTATATGTAAGATTTGTAACATATAACAGTTTGTTG TTAGATAAGTCTAAAGTTGTTAA GTTGTTATACTCTGCATTTAAAGAAGTTAATTTTGTATTT TGACTTAGATCTAGTGTCGTTAA
>NC_009441.1|WP_012023269.1|1339243_1340101_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKLYPIESGNFKLDGGAMFGVVPKTIWNKTNPADSNNLIDIAARCLLIEDGNRLILIDTGMGDKQSEKFFGYYSLWGSHSIDKSLAEYGFNRDDITDVFMTHLHFDHCGGSVQWNSDKTFYEPAFKNAKFWTNENHWQWAVKPNAREKASFLTENIIPMQESGQLNFIERPESDFGFSKELGFGIFYADGHTEKQMIPHIQYQDKTIVFCADLLATAGHIPLPYVMGYDTRPLLTLDEKAKFLNSAADNNYYLFLEHDAHNQIITVEHTEKGVRLKDVFTCEDIL >NC_009441.1|WP_012023268.1|1338232_1339159_+|hypothetical-protein MKKNYTNEWLRAFLAIFFILGIGATFFLFSNELKESAEKAKIITKKSELTGPSNETIAQKSILDSLNILKLEYDVALLEKTSLSEQLELERKNVQNLMEIIKVSKNPSIVQIQIYRKQLLDLKTALAAKIVEIKNLKSQNKSLLTEIESQNVVMYKQKTENDTLLLHQKKLELAIKDAAKLSLSNFKVAAFREKKSGKELETEKARNAQKLKVSFSVNGNSIAKTGKRVFYIQVLDQKNTVLGENKLIEFENDKALVYSFIVAVDFQGKPLNAYGVLNSDGNEFKKGTYFVNFFDKQEIMGSASVTLE >NC_009441.1|WP_012023267.1|1337527_1337857_-|iron-sulfur-cluster-assembly-accessory-protein MIKVSDTAKKKIIDLMTDDGFDAASDYVRVGVKSGGCSGLSYDLKFDKTKGEDDKIFVDNDIQIAVEKKSFLYLAGTILEFSGGLNGKGFVFNNPNASRTCGCGESFSL >NC_009441.1|WP_012023266.1|1335999_1337448_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MSKYTEDDLKIELETKEYEYGFYTNIESETFPIGLNEEIVRAISLKKEEPEWMTEWRIEAFRAWKEMIEPEWANVQYEKPDFQAISYYSAPKQVDPNKTLDDVDPELLEMYKKLGISVDEQKKMNNVAMDIVVDSVSVATTFKKTLAEKGIIFCPISEAIKEHPELVKKYLGTVVPQKDNFYAALNSAVFSDGSFCYIPKGVKCPMELSTYFRINQAGTGQFERTLVIADEGSYVSYLEGCTAPSRDENQLHAAVVELIALDDAEIKYSTVQNWFPGNKEGKGGVYNFVTKRGLCETNAKISWTQVETGSAVTWKYPSCVLKGDNSVGEFYSIAVTNNFQQADTGTKMIHLGKNTKSTIISKGISAGKSQNSYRGLVQISPRAENARNFSQCDSLLMGNNCGAHTFPYIESKNPTAKIEHEATTSKIGEDQVFYCNQRGIPTEKAIALIVNGFSKDVLNKLPMEFAVEAQKLLEISLEGSVG >NC_009441.1|WP_012023265.1|1335503_1335992_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MENKKVIILGSSRKNGNTTKIVDVLSKEHNIDVVNLSDYNISYYDYESKNIDDDFLPLIRGIIEKYDTLIFATPVYWYNMSGILKVFFDRFSDLIRIEKETGRKLRGKKIGVISNSHDNIIEDSFYIPFKKTSDYLGMEYLGHAHFNANVLNQTTKIELTFI >NC_009441.1|WP_008466070.1|1334745_1335492_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MLSIKNLHAAIGDKEILKGINIEVKAGEVHAIMGPNGSGKSTLSAVIAGNENYEVTDGEVILDGEDLADLAPEERAHKGVFLSFQYPVEIPGVSVTNFMKTAINETRKANGQEEMPANEMLKVIREKSELLEIDRKFLSRSLNEGFSGGEKKRNEIFQMAMLEPKLAILDETDSGLDIDALRIVANGVNKLKSDKNAIIVITHYQRLLDYIVPDFVHVLYNGRIVKSGGKELAYELEEKGYDWIKAEN >NC_009441.1|WP_012023264.1|1334326_1334695_-|four-helix-bundle-protein MSKFKSFEEINSWQKSRIFNKKIYLITENSNFKKDFDFVRQIRRASLSISSNIAEGFERNTDKEFIYFLYVAKASAGEVRSQLYLAFDLEYIIKEEFEMLLESITEISKLLSGFIKYLSPKS >NC_009441.1|WP_012023263.1|1332892_1334209_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MDLKEKLVSSFMAFEERVDVHSDLHDIRTNALKNFENKGFPTKKEEAWKYTSLNAILKNDFTVFPKQENAIEFNQVKKYFLHEIDTYKLVFIDGVFSSHLSSTTHDGIDVCLMSSALTKPKYKMVIDTYFNQIASKDDSLTSLNTAFAIEGAFINIPKKKVADKPIEIMYFSTGNEAALMVQPRNLVIVGENSHVQIIERHQSLNENPVLTNSVTEIFAQKRAIVDYYKIQNDNNEANLIDNTYVSQQQESHASVHTFSFGGNLTRNNLNFYHYGERLTSTLNGISILNDKQHVDHYTLVNHAQPNCESFQDYKGIFSDRSTGVFNGKVLVEKEAQKTNAFQKSNNILLSDKATINAKPQLEIFADDVKCSHGCTVGQLDETAMFYMQSRGIPKKEAKALLMYAFSNAVIESIKIPELKQRITKIIATKLGVNLGFDL >NC_009441.1|WP_012023262.1|1331496_1332846_+|serine-hydrolase MKKFLKVLLLVVVLAFLYFGFTTYPKLDLISGFSAKSVASGHFIDNRPLDLIQKTDNDINLVDLAKNSIDDAGKYAISSVYGLKERKAIYREGLGATLINDDFDVSKPYLLPKRTKLENNLPFPYGDNEPKDTSFSNVDYSKLKKAVDNAFDKTGGRIKRTRAVVVLYKDKLIAEKYDTGFNKDSKILGWSMTKSITSSAFGVLAKQGKIDIYKPAPVVEWKNDERKNITLNDLLHMNSGLEWEENYSTICDATKMLFQAEDMGKVQLDKPAQFKPNTHWNYSSGTTNLLSLILRRQFKTQQEYLDFWYSAVIDKIGMNSMIVEQDMSGTFVGSSYGWATPRDWSKFGLLYLHKGNWNGEQILDESWVKYTATPTNTSDGKYGAQFWLNAGGKFPDVPRDMFYCSGYQGQMVAIIPSKDMVIVRMGVREEEPGFDFNGFLKEVIASIGK >NC_009441.1|WP_012023261.1|1330062_1331277_-|cysteine-desulfurase MLDIQKIRADFPILSQTVNGKPLVYFDNGATSQKPQVVIDAEVKYYQEINANIHRGVHTLSQLATDAYEVARGKVKDHINAKHAHEVLFTSGTTHGINLVANGFASILKPGDEVVVSSLEHHSNIVPWQMLCEKTGAVLKVIPINDNGELIIEEFDKLLSDKTKIVTVNHISNALGVINPIKYIIDKAHAVGAAVLIDGAQAVPHLKPDVQELDCDFYAFSGHKMCGPTGTGILYGKEAWLNKLPPYQGGGEMIKEVTFEKTTYADLPHKFEAGTPNIAGGIVLGTAIDYLNEIGFDKIHEYENELLEHATKRLNEIEGIRIYGNTKNKASVVSFNIDGIHPYDVGSIIDKLGIAVRTGHHCAQPIMNFFCIPGTIRASFSFYNTKEEIDQMVDAVKKAQTMLS >NC_009441.1|WP_012023271.1|1344532_1349572_-|T9SS-type-A-sorting-domain-containing-protein MRKTLLLILIFSFIQIKAQCWKTAAAGYSHTVAVRNDGTLWTWGNNDEGQLGNSTPAAINIPTKMGTANNWKTAAAGWGHTVALKTDGTLWAWGYGRLGQLGNGNYNTNFNLPQQIGTENDWQTIAAGHGHTVALKNDGTLWAWGNNFSGQLGNGTSFDRNTPTKIGSDSNWLAISAGGLYTIALKKDGTLWAWGKNTYGTLGDGTTTNNRVPKQIGTDTDWKTIAAGSDHTIAIKNDGSLWIWGKNTYGALGDNTTIDKIVPTKIGTDTDWKSAEGGVDYTVAIKTDGTLWAWGYNADGVFGNGSKINSLIPVQIGTEKNWQMVSGGSVHTVAVKTDESLWSWGNNSYGQLGDGTSIEKNIPTLLNCAGSLIVTVSQTNVRCAGSNEGSASITSVSGGTTPYTYLWSNGKTTASITELAAGDYSCTITDASSLSITKNITITQPPALFSTVTVINTNCNNNNGSIEIIANGGTLPYQYEIWSNAIYQDSNVFTGLPSGNYQVIVKDSKGCLVSSYVVIEKESTPIPTVSAQTLSASATVADLKATGSNLKWFTTLTGGNALASSVSLQTGKYYVSQTINGCESVRAAVDITILPASYGEIPTNGLVAYYTFNGNANDTSGNGFNGNAVSTNLASDRFGNSNSAYSFNGAGSYIDAPIANIPQGNAARTISGWFKTNTPNPGENGDVCIFNYGALSRLQRFGLTVYSKGYLETSTGPNAIGDDFYVNNFNYLSNDWYFFTLTYNGTKVSLYVNGVFVSEKNAALNTTNNLFRIGKRISGDTTNEYFKGQIDDIGIWNRVLTPEEIAAMYTPGEQPAYTLIPDPSFEQKLINLGIDSGVVDGKVRTSDIASVESLDVSSSSISDLTGIQDFISLTNLNCGQNNLKALNVSNNTALTVLDCNNNQIAYLDVSNNLALTDLACYSNKLTSLDVKKNTALTKLDSGSNQYTSLDVSHNTALTFLGCNTSQLTTIDVSNNTALKLLDCRENKITSLDVSKITTLTELYCQSNELKDLDISKNKVLEFLNCSKNQLTTLDISTNTALVGLFPNYNQLINLNLKNGNNDKLIYLNFKNNPNLTCIQVDDVAFANANWTDKKDAGAAFNVKCDNYTLIPDVNFENRLIALGYDSGSADGKVLTANISNITSLNVSSKSISDLSGIQDFKSLTTLNCAKNNLTSLNLSNNKNLKTLYCEQNQLTALDLSNNVSLITVECSYNKLQNVNISKNLVLKNLYCINNQLTNIDVTNNTALEQFYCFGNQLTSLNVSKNLNLLGLECGLNKLTTLDVSNNTLMYYLECYSNQLTSLNVTKNIALFHLNFFNNQLTSIDLSNNPLLKELYCLNNQLTSLDLSKNNALTNLDCKNNKLTALNLKNGNNTLLATIDLNFTQNPDLTCIQVDNAAYSNTNWPAAKDAAASFSENCGSISIPDSNFEQKLVDLGIDTDGLNGKITIADASAVTILNLSNSNIKDLTGIEYFTSLTYLDVSNNQLTTLDVSKNILLETLNASSNQLTILDLSKNTKLRIVYVVNNPLVSLNLRNGNNTNFILPPNTGKKSVSGLYTSFLGLKTLGCIQVDDESYSNANWSNIKESTTTYSNTCKTLGVPESALKNVVIHPNPTKGELHIQNVNLEKANVYNVLGQLVKSFTLNSNNTDNTINLSGLPKGVYYVYLINQDAASAKKVIVE >NC_009441.1|WP_012023272.1|1349848_1351483_+|S8-family-serine-peptidase MSHIKPLKLSAFALLVLAGCSATVQAQVSTQKEFIKAPAAIVKKAPVSENELKRWSHLDLLKDSIPGMSVDKAYAELLQGKKGQKVIVGIVDSGVDIEHEDLKGMIWTNPKEIPGNGIDDDKNGFIDDVNGWNFLGDAVHENLELTRIVKKGDDGSAQYKAALAQYTEKYEEALQDKQQVDFLLDVHNTIKKELNKTTYKLEDLSTITSADPKVLQSKKVMTQIFTNAGSTFDPESELKEYGEQVYDQLNYNLNKEFDGRKIVGDNPEDIKNTRYGNNIVFGPDKEKALHGTHVAGIIAQIRGNNLGGDGVTNNVEILTVRAVPDGDEYDKDIALAIRYAVDNGAKVINGSFGKSFSPHKQWVYDAIKYAAKKDVLIVHAAGNDGYNIDETKNINYPNDSEDNVKEFADNVITIGAINKQYGENVVAGFSNFGKINVDVFAPGEEIYATVPNNKYKFLQGTSMASPNAAGVAALIRSYYPKLKASQVKHILMDSGVALPAQIVLGKGENPGEKPAAVSSAESSKTAKMVNAYNALLMAEKMSKK >NC_009441.1|WP_044047539.1|1351547_1353428_+|M1-family-metallopeptidase MRKIILLSFLSLGINSTFAQSAPYWQQHADYKMEVSMDVKNYQYKGKQELVYTNNSPDTLKKVFYHLFPNAFQPGSEMDARLHFIKDPDGRMVNKVKGADGKEVKQSRIETLKPNEIGFLKISDFKQDGVTAQTRVSGTILEVTLAKPILPNSKTTFTLDFDGQVPVQIRRSGRNNSEGVELSMSQWYPKLAEFDFEGWHADPYIAREFHGVWGNFDVKITIDKDYTIGGSGYLQDKNSIGHGYEDEGVTVTYPKKTKTLTWHFIAPNVHDFTWAADKEYTHDIVKGPNDVDLHFFYKNNPKTTANWKQLEPLMVKVMDYYNHRVGQYPYKQYSFIQGGDGGMEYAMCTLMLGNGTLEGILGTATHELGHSWFQHILASNESKHPWMDEGFTTYIEDSALNELKGDKKEVNPFTGNYKAYYSLVNSGKEQPQTTHGDRYDENRPYSISSYVKGSIFLSQLEYVIGRENVDAALKRYFNDFKFKHPTPNDIKRSAERVSGAELDWYLTDWAQTTNTIDYGIKDVADNAGKTTVTLERIGRMPMPIDLKVDYTDGTSETFYIPLRMMNFIKPNPNPSEKRTVLDDWAWAQQNYSFTIDKNKASIKKITIDPSGLMADVKQTNNVFEVK >NC_009441.1|WP_012023274.1|1353616_1354171_+|hypothetical-protein MSGEEKYNFKIQHKINYELFDKKHEAAAAYEIEIKKFENYNFRLELNRHNFKINDHNPEAKFEKIAHAYNDALFPVLFEVRNGKFLLANFDGISERIAQKDQELRYKHQGPGLEYIRNNFFEKTGKDGYAMAEYIYSFELIRILLFCVEKPENDNNYHFNWKIPLLDNDVFWEGQKSFDPQTIP >NC_009441.1|WP_012023275.1|1354412_1355258_+|hypothetical-protein MDQVNGDYKFRIVRNIHYRLNQKRDEIVYTYEIQFKTIGEKEFTVEISNFSYTDYAKNQATPVVRNMIEQYDAVFFPVLLDIKEDTCFIKNKGDIIKRLESKNNQLRVNPKYLIDEDTAKIKNITRHHVIDDIKGAFLRNAIDDYILENSCSKGIMELLLFSLNEIRDYESYDLLFNLSPFNEKIKWECKKISEDDIHSVIYIGQIKDRNELFEQFEKYAKLEGYWLNKIEGEKLIYSELKHEVHFDLEKSLFDFFEMNVKIKHDFYDYKETIYISAINKK >NC_009441.1|WP_012023276.1|1355263_1359307_+|DUF4280-domain-containing-protein MNSSIPYLVKKEDTLESIAKELGITDPYDLRHYHNMNAEINDGIGQEPVQGKTLLTPSPEKIKEINAKRAKLDEAEEAEIQKEEQVKEEQHKQQKEEKEQEEKQEKETVQNAHNDKYFVVHGSLCSCDKAENPKQTAKLLVTSHNKVILNAEAGKFFATEIDKTFDPAAATFGKCTLKPSSGGNQPCALAPAPKWTKVYDKTSIFGNKVLTEISTLQCTVGGKIEVAKHGQTNTVMKEHAEKTNPAALALINPAVKMPNLKTAYPSVSSIALKSLKNDPDFKAVSSTQTKNVEKIVIRPNQECTFEAKVSKGNVDFVSWVIYEGFDGDKDKRLYTEEQIGTRFTYTFLTVGKYRIEGYGKPKQDDPEAETAYKSYPDCCLDIEVILNKLQGTELLPIDGGNFTKMIGGKMRLRQNFPASFKANFLMPPTDEELENLKIYVTDASGSVLKSTRIENTISFTPVNTKAKYTITAQYKLSAEEVQKQSFSAETITNSVSQITHNAEVIRPGTPMNFAVKESTFSLYIPDEQEAVAKEVQAVKWNLNGRLIGNGKSITIPGHELMNFGKYVVEAYVTLANAYGQNAKHEEDDWHFEVKENDVISFSYTGVPKVGKTTFLEADHLVFPDLTANETVIWDTAIPHKTTDKKTISIKPLKAGKEIVKCRINRQQGKTLSIDVKQAKVLGMMFTDSNGIEIEKSGWHQTVNIWVQQEHLIGEDLTIEIWDNDAFKDDYCKAITVKSYDGNLIPFTLDSYVKNKAGDWAMLYVKISAPKLKLANTEGVFKSKNRLDVQDKREIYSAQIGSQDAKQRHYHVDYNQVSYFYGKSRGIKAGEKLKITIYEKGNKLFEVTDVAVDTSGAVKAKLQWDRISEKLPSRAVYAVVQDGEDKILYNGNKTANGGVAITKKSALLGLAEYKSAVLVKKSESNANNKTGTCVCKDYDLAWGNKFTCEERKKVVQICSNLWGEENKKQMANHLMNCIALETADSFKPYEGYSSGGATGLVQWTSDAINGMNKDNKYNKGTKLTKERLSKMTVLEQLEYVELYFKMWIDSKKVIRNALDMYMCIWCPAAVGKEDSFICYSEEKDKKRRELDPKATQPYDANKSIDGEYYNEKGNNVLSGKKNKEISRGELYPRLKVKEVLGFKNKTKLFDCRNIGGKDKDNLYGEGVLAKMKRIADEHHEYAQETNNLRTDNTVEGLEKMDCSEFVSRYLFELGITTKPIYMTTANMVSESSFRKIIGNNNIDLVKGSKEESFKPQRGDIFAWGYAKNGSWQGHTGIVYEYDETKDTVTILESIGSSGSRDDSFNNANGGWQKTGCTRTAVYQRKGKALVNHSNWFGYYRPTNYSKEL >NC_009441.1|WP_012023277.1|1359322_1360249_+|hypothetical-protein MKKNVLFLFLLFIFQIAGCKQNEIKKNNEIKESIENKPTTSINFLSFLDEICWEGHKGVFKNCDELFTDKGHMFFIIIPKGGAENWYNKQMNNFSVKDVWKKEDKILEQINKCLVSNLEKDFNIWVFYVDVKFLKRNPDMDSPYSPVNPRKVQVCFYKEKLKRWDVIDVIDINNEKDESNFNNWRENYINSIVKKSNESSNNSSEDKIKISQKWQGKFSRNFTEKFNDGSNSSWVYYFIIESNKVVFKSDSELPIESEYKGLERNNQLELFEGDNKQPSYIIKEDGGKFYIQSDSFENRKGWLLLDKN >NC_009441.1|WP_012023278.1|1360647_1360914_+|hypothetical-protein MLGIAAIAYVDECLERGYPLRAGINHTLGLDYNEEDNPTTDHYVVIVGRKCDKGTLTYLYWDVGTKRGESADYRFQLIDGYKCSWKRE >NC_009441.1|WP_044047540.1|1360898_1361810_+|hypothetical-protein MEKGIMTIIYLQLHKLQEILKMEKLFKLLLLISTFSSCQEIKNDFTEIKNHSFYEVKKINSVNSIYEPCDASNKKYLLKDSILLYTSAQDGDFKYRILNISKNKDTYQLKIKNTDPTQNISTLSIKKIDSKYFSINDKIYIDSTFIKTIPHIKQSCEECGNCDDAKPQIRLDNQRLNGYWKINCINGNASMTITNKTAFLEVMFNQIYVELVELKRYNSENGIAYKLKEIPEDRGSFGAKLNWNEYLNNKPIAYVKVIDKNTLYFYWYGFFNKKKQKREFVECEFQQEKSKDQQEIILKKCDE >NC_009441.1|WP_012023280.1|1362046_1363246_-|DUF418-domain-containing-protein MTNSYHPVEQSKRTVIVDILRGWAILGVAIGNYLDFLYIGIEKDIKYDTFSEVLQTINRYFFAAKSWTLLTLLFGYGFAILINNVASKGKNPVAFFTWRMALLFILAFINSSFWLGDILKDYAFLGLVLLLFYRCSAKTLAVISTVIVLTVPFLMAYINGLKIEHTAISSNPEYLKLYHSGNWIDFFRFNLLASLYEQIIVPGYAITAHYVMLGCMLFGFMLQKLNFFNRLIELKKLLQYVCIISFLCAVVIGIGFNIAIIYKAGFLKFFHPLYWLVLSTMIFISTGICLLYINGKLKTIFSYFSAGGKMTLTNYISQNILAALIFSGIGLGIADTMPYWFYFSVAVFIFVVQLFISKWWLSKYNYGPIEWLWRSASYREWFPLRKIQPEVTPADIKTI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009441_4 | 1341181-1341330 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009441_4
|
2 spacers
spacers of NC_009441_4
>4.1|1341204|40|NC_009441|CRISPRCasFinder TAGATTAGAATAACAATAAAAAGTATTCAATTCAGTATTT >4.2|1341267|40|NC_009441|CRISPRCasFinder AGAATTGCCGTAAACACTTAAGGATGAGAGCAATATGTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009441_4
The CRISPR arrays of NC_009441_4 >merge|NC_009441|4|1341181-1341330|CRISPRCasFinder CTAGAAATATCAATGCTTGTTAATAGATTAGAATAACAATAAAAAGTATTCAATTCAGTATTTTTTGAAACATCAAGAGTTGTCAAAGAATTGCCGTAAACACTTAAGGATGAGAGCAATATGTTTTTTGATACATTTAAAGCTGTCAAT >NC_009441|4|3|1341181-1341330|CRISPRCasFinder CTAGAAATATCAATGCTTGTTAA TAGATTAGAATAACAATAAAAAGTATTCAATTCAGTATTT TTTGAAACATCAAGAGTTGTCAA AGAATTGCCGTAAACACTTAAGGATGAGAGCAATATGTTT TTTGATACATTTAAAGCTGTCAAT
>NC_009441.1|WP_012023269.1|1339243_1340101_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKLYPIESGNFKLDGGAMFGVVPKTIWNKTNPADSNNLIDIAARCLLIEDGNRLILIDTGMGDKQSEKFFGYYSLWGSHSIDKSLAEYGFNRDDITDVFMTHLHFDHCGGSVQWNSDKTFYEPAFKNAKFWTNENHWQWAVKPNAREKASFLTENIIPMQESGQLNFIERPESDFGFSKELGFGIFYADGHTEKQMIPHIQYQDKTIVFCADLLATAGHIPLPYVMGYDTRPLLTLDEKAKFLNSAADNNYYLFLEHDAHNQIITVEHTEKGVRLKDVFTCEDIL >NC_009441.1|WP_012023268.1|1338232_1339159_+|hypothetical-protein MKKNYTNEWLRAFLAIFFILGIGATFFLFSNELKESAEKAKIITKKSELTGPSNETIAQKSILDSLNILKLEYDVALLEKTSLSEQLELERKNVQNLMEIIKVSKNPSIVQIQIYRKQLLDLKTALAAKIVEIKNLKSQNKSLLTEIESQNVVMYKQKTENDTLLLHQKKLELAIKDAAKLSLSNFKVAAFREKKSGKELETEKARNAQKLKVSFSVNGNSIAKTGKRVFYIQVLDQKNTVLGENKLIEFENDKALVYSFIVAVDFQGKPLNAYGVLNSDGNEFKKGTYFVNFFDKQEIMGSASVTLE >NC_009441.1|WP_012023267.1|1337527_1337857_-|iron-sulfur-cluster-assembly-accessory-protein MIKVSDTAKKKIIDLMTDDGFDAASDYVRVGVKSGGCSGLSYDLKFDKTKGEDDKIFVDNDIQIAVEKKSFLYLAGTILEFSGGLNGKGFVFNNPNASRTCGCGESFSL >NC_009441.1|WP_012023266.1|1335999_1337448_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MSKYTEDDLKIELETKEYEYGFYTNIESETFPIGLNEEIVRAISLKKEEPEWMTEWRIEAFRAWKEMIEPEWANVQYEKPDFQAISYYSAPKQVDPNKTLDDVDPELLEMYKKLGISVDEQKKMNNVAMDIVVDSVSVATTFKKTLAEKGIIFCPISEAIKEHPELVKKYLGTVVPQKDNFYAALNSAVFSDGSFCYIPKGVKCPMELSTYFRINQAGTGQFERTLVIADEGSYVSYLEGCTAPSRDENQLHAAVVELIALDDAEIKYSTVQNWFPGNKEGKGGVYNFVTKRGLCETNAKISWTQVETGSAVTWKYPSCVLKGDNSVGEFYSIAVTNNFQQADTGTKMIHLGKNTKSTIISKGISAGKSQNSYRGLVQISPRAENARNFSQCDSLLMGNNCGAHTFPYIESKNPTAKIEHEATTSKIGEDQVFYCNQRGIPTEKAIALIVNGFSKDVLNKLPMEFAVEAQKLLEISLEGSVG >NC_009441.1|WP_012023265.1|1335503_1335992_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MENKKVIILGSSRKNGNTTKIVDVLSKEHNIDVVNLSDYNISYYDYESKNIDDDFLPLIRGIIEKYDTLIFATPVYWYNMSGILKVFFDRFSDLIRIEKETGRKLRGKKIGVISNSHDNIIEDSFYIPFKKTSDYLGMEYLGHAHFNANVLNQTTKIELTFI >NC_009441.1|WP_008466070.1|1334745_1335492_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MLSIKNLHAAIGDKEILKGINIEVKAGEVHAIMGPNGSGKSTLSAVIAGNENYEVTDGEVILDGEDLADLAPEERAHKGVFLSFQYPVEIPGVSVTNFMKTAINETRKANGQEEMPANEMLKVIREKSELLEIDRKFLSRSLNEGFSGGEKKRNEIFQMAMLEPKLAILDETDSGLDIDALRIVANGVNKLKSDKNAIIVITHYQRLLDYIVPDFVHVLYNGRIVKSGGKELAYELEEKGYDWIKAEN >NC_009441.1|WP_012023264.1|1334326_1334695_-|four-helix-bundle-protein MSKFKSFEEINSWQKSRIFNKKIYLITENSNFKKDFDFVRQIRRASLSISSNIAEGFERNTDKEFIYFLYVAKASAGEVRSQLYLAFDLEYIIKEEFEMLLESITEISKLLSGFIKYLSPKS >NC_009441.1|WP_012023263.1|1332892_1334209_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MDLKEKLVSSFMAFEERVDVHSDLHDIRTNALKNFENKGFPTKKEEAWKYTSLNAILKNDFTVFPKQENAIEFNQVKKYFLHEIDTYKLVFIDGVFSSHLSSTTHDGIDVCLMSSALTKPKYKMVIDTYFNQIASKDDSLTSLNTAFAIEGAFINIPKKKVADKPIEIMYFSTGNEAALMVQPRNLVIVGENSHVQIIERHQSLNENPVLTNSVTEIFAQKRAIVDYYKIQNDNNEANLIDNTYVSQQQESHASVHTFSFGGNLTRNNLNFYHYGERLTSTLNGISILNDKQHVDHYTLVNHAQPNCESFQDYKGIFSDRSTGVFNGKVLVEKEAQKTNAFQKSNNILLSDKATINAKPQLEIFADDVKCSHGCTVGQLDETAMFYMQSRGIPKKEAKALLMYAFSNAVIESIKIPELKQRITKIIATKLGVNLGFDL >NC_009441.1|WP_012023262.1|1331496_1332846_+|serine-hydrolase MKKFLKVLLLVVVLAFLYFGFTTYPKLDLISGFSAKSVASGHFIDNRPLDLIQKTDNDINLVDLAKNSIDDAGKYAISSVYGLKERKAIYREGLGATLINDDFDVSKPYLLPKRTKLENNLPFPYGDNEPKDTSFSNVDYSKLKKAVDNAFDKTGGRIKRTRAVVVLYKDKLIAEKYDTGFNKDSKILGWSMTKSITSSAFGVLAKQGKIDIYKPAPVVEWKNDERKNITLNDLLHMNSGLEWEENYSTICDATKMLFQAEDMGKVQLDKPAQFKPNTHWNYSSGTTNLLSLILRRQFKTQQEYLDFWYSAVIDKIGMNSMIVEQDMSGTFVGSSYGWATPRDWSKFGLLYLHKGNWNGEQILDESWVKYTATPTNTSDGKYGAQFWLNAGGKFPDVPRDMFYCSGYQGQMVAIIPSKDMVIVRMGVREEEPGFDFNGFLKEVIASIGK >NC_009441.1|WP_012023261.1|1330062_1331277_-|cysteine-desulfurase MLDIQKIRADFPILSQTVNGKPLVYFDNGATSQKPQVVIDAEVKYYQEINANIHRGVHTLSQLATDAYEVARGKVKDHINAKHAHEVLFTSGTTHGINLVANGFASILKPGDEVVVSSLEHHSNIVPWQMLCEKTGAVLKVIPINDNGELIIEEFDKLLSDKTKIVTVNHISNALGVINPIKYIIDKAHAVGAAVLIDGAQAVPHLKPDVQELDCDFYAFSGHKMCGPTGTGILYGKEAWLNKLPPYQGGGEMIKEVTFEKTTYADLPHKFEAGTPNIAGGIVLGTAIDYLNEIGFDKIHEYENELLEHATKRLNEIEGIRIYGNTKNKASVVSFNIDGIHPYDVGSIIDKLGIAVRTGHHCAQPIMNFFCIPGTIRASFSFYNTKEEIDQMVDAVKKAQTMLS >NC_009441.1|WP_012023271.1|1344532_1349572_-|T9SS-type-A-sorting-domain-containing-protein MRKTLLLILIFSFIQIKAQCWKTAAAGYSHTVAVRNDGTLWTWGNNDEGQLGNSTPAAINIPTKMGTANNWKTAAAGWGHTVALKTDGTLWAWGYGRLGQLGNGNYNTNFNLPQQIGTENDWQTIAAGHGHTVALKNDGTLWAWGNNFSGQLGNGTSFDRNTPTKIGSDSNWLAISAGGLYTIALKKDGTLWAWGKNTYGTLGDGTTTNNRVPKQIGTDTDWKTIAAGSDHTIAIKNDGSLWIWGKNTYGALGDNTTIDKIVPTKIGTDTDWKSAEGGVDYTVAIKTDGTLWAWGYNADGVFGNGSKINSLIPVQIGTEKNWQMVSGGSVHTVAVKTDESLWSWGNNSYGQLGDGTSIEKNIPTLLNCAGSLIVTVSQTNVRCAGSNEGSASITSVSGGTTPYTYLWSNGKTTASITELAAGDYSCTITDASSLSITKNITITQPPALFSTVTVINTNCNNNNGSIEIIANGGTLPYQYEIWSNAIYQDSNVFTGLPSGNYQVIVKDSKGCLVSSYVVIEKESTPIPTVSAQTLSASATVADLKATGSNLKWFTTLTGGNALASSVSLQTGKYYVSQTINGCESVRAAVDITILPASYGEIPTNGLVAYYTFNGNANDTSGNGFNGNAVSTNLASDRFGNSNSAYSFNGAGSYIDAPIANIPQGNAARTISGWFKTNTPNPGENGDVCIFNYGALSRLQRFGLTVYSKGYLETSTGPNAIGDDFYVNNFNYLSNDWYFFTLTYNGTKVSLYVNGVFVSEKNAALNTTNNLFRIGKRISGDTTNEYFKGQIDDIGIWNRVLTPEEIAAMYTPGEQPAYTLIPDPSFEQKLINLGIDSGVVDGKVRTSDIASVESLDVSSSSISDLTGIQDFISLTNLNCGQNNLKALNVSNNTALTVLDCNNNQIAYLDVSNNLALTDLACYSNKLTSLDVKKNTALTKLDSGSNQYTSLDVSHNTALTFLGCNTSQLTTIDVSNNTALKLLDCRENKITSLDVSKITTLTELYCQSNELKDLDISKNKVLEFLNCSKNQLTTLDISTNTALVGLFPNYNQLINLNLKNGNNDKLIYLNFKNNPNLTCIQVDDVAFANANWTDKKDAGAAFNVKCDNYTLIPDVNFENRLIALGYDSGSADGKVLTANISNITSLNVSSKSISDLSGIQDFKSLTTLNCAKNNLTSLNLSNNKNLKTLYCEQNQLTALDLSNNVSLITVECSYNKLQNVNISKNLVLKNLYCINNQLTNIDVTNNTALEQFYCFGNQLTSLNVSKNLNLLGLECGLNKLTTLDVSNNTLMYYLECYSNQLTSLNVTKNIALFHLNFFNNQLTSIDLSNNPLLKELYCLNNQLTSLDLSKNNALTNLDCKNNKLTALNLKNGNNTLLATIDLNFTQNPDLTCIQVDNAAYSNTNWPAAKDAAASFSENCGSISIPDSNFEQKLVDLGIDTDGLNGKITIADASAVTILNLSNSNIKDLTGIEYFTSLTYLDVSNNQLTTLDVSKNILLETLNASSNQLTILDLSKNTKLRIVYVVNNPLVSLNLRNGNNTNFILPPNTGKKSVSGLYTSFLGLKTLGCIQVDDESYSNANWSNIKESTTTYSNTCKTLGVPESALKNVVIHPNPTKGELHIQNVNLEKANVYNVLGQLVKSFTLNSNNTDNTINLSGLPKGVYYVYLINQDAASAKKVIVE >NC_009441.1|WP_012023272.1|1349848_1351483_+|S8-family-serine-peptidase MSHIKPLKLSAFALLVLAGCSATVQAQVSTQKEFIKAPAAIVKKAPVSENELKRWSHLDLLKDSIPGMSVDKAYAELLQGKKGQKVIVGIVDSGVDIEHEDLKGMIWTNPKEIPGNGIDDDKNGFIDDVNGWNFLGDAVHENLELTRIVKKGDDGSAQYKAALAQYTEKYEEALQDKQQVDFLLDVHNTIKKELNKTTYKLEDLSTITSADPKVLQSKKVMTQIFTNAGSTFDPESELKEYGEQVYDQLNYNLNKEFDGRKIVGDNPEDIKNTRYGNNIVFGPDKEKALHGTHVAGIIAQIRGNNLGGDGVTNNVEILTVRAVPDGDEYDKDIALAIRYAVDNGAKVINGSFGKSFSPHKQWVYDAIKYAAKKDVLIVHAAGNDGYNIDETKNINYPNDSEDNVKEFADNVITIGAINKQYGENVVAGFSNFGKINVDVFAPGEEIYATVPNNKYKFLQGTSMASPNAAGVAALIRSYYPKLKASQVKHILMDSGVALPAQIVLGKGENPGEKPAAVSSAESSKTAKMVNAYNALLMAEKMSKK >NC_009441.1|WP_044047539.1|1351547_1353428_+|M1-family-metallopeptidase MRKIILLSFLSLGINSTFAQSAPYWQQHADYKMEVSMDVKNYQYKGKQELVYTNNSPDTLKKVFYHLFPNAFQPGSEMDARLHFIKDPDGRMVNKVKGADGKEVKQSRIETLKPNEIGFLKISDFKQDGVTAQTRVSGTILEVTLAKPILPNSKTTFTLDFDGQVPVQIRRSGRNNSEGVELSMSQWYPKLAEFDFEGWHADPYIAREFHGVWGNFDVKITIDKDYTIGGSGYLQDKNSIGHGYEDEGVTVTYPKKTKTLTWHFIAPNVHDFTWAADKEYTHDIVKGPNDVDLHFFYKNNPKTTANWKQLEPLMVKVMDYYNHRVGQYPYKQYSFIQGGDGGMEYAMCTLMLGNGTLEGILGTATHELGHSWFQHILASNESKHPWMDEGFTTYIEDSALNELKGDKKEVNPFTGNYKAYYSLVNSGKEQPQTTHGDRYDENRPYSISSYVKGSIFLSQLEYVIGRENVDAALKRYFNDFKFKHPTPNDIKRSAERVSGAELDWYLTDWAQTTNTIDYGIKDVADNAGKTTVTLERIGRMPMPIDLKVDYTDGTSETFYIPLRMMNFIKPNPNPSEKRTVLDDWAWAQQNYSFTIDKNKASIKKITIDPSGLMADVKQTNNVFEVK >NC_009441.1|WP_012023274.1|1353616_1354171_+|hypothetical-protein MSGEEKYNFKIQHKINYELFDKKHEAAAAYEIEIKKFENYNFRLELNRHNFKINDHNPEAKFEKIAHAYNDALFPVLFEVRNGKFLLANFDGISERIAQKDQELRYKHQGPGLEYIRNNFFEKTGKDGYAMAEYIYSFELIRILLFCVEKPENDNNYHFNWKIPLLDNDVFWEGQKSFDPQTIP >NC_009441.1|WP_012023275.1|1354412_1355258_+|hypothetical-protein MDQVNGDYKFRIVRNIHYRLNQKRDEIVYTYEIQFKTIGEKEFTVEISNFSYTDYAKNQATPVVRNMIEQYDAVFFPVLLDIKEDTCFIKNKGDIIKRLESKNNQLRVNPKYLIDEDTAKIKNITRHHVIDDIKGAFLRNAIDDYILENSCSKGIMELLLFSLNEIRDYESYDLLFNLSPFNEKIKWECKKISEDDIHSVIYIGQIKDRNELFEQFEKYAKLEGYWLNKIEGEKLIYSELKHEVHFDLEKSLFDFFEMNVKIKHDFYDYKETIYISAINKK >NC_009441.1|WP_012023276.1|1355263_1359307_+|DUF4280-domain-containing-protein MNSSIPYLVKKEDTLESIAKELGITDPYDLRHYHNMNAEINDGIGQEPVQGKTLLTPSPEKIKEINAKRAKLDEAEEAEIQKEEQVKEEQHKQQKEEKEQEEKQEKETVQNAHNDKYFVVHGSLCSCDKAENPKQTAKLLVTSHNKVILNAEAGKFFATEIDKTFDPAAATFGKCTLKPSSGGNQPCALAPAPKWTKVYDKTSIFGNKVLTEISTLQCTVGGKIEVAKHGQTNTVMKEHAEKTNPAALALINPAVKMPNLKTAYPSVSSIALKSLKNDPDFKAVSSTQTKNVEKIVIRPNQECTFEAKVSKGNVDFVSWVIYEGFDGDKDKRLYTEEQIGTRFTYTFLTVGKYRIEGYGKPKQDDPEAETAYKSYPDCCLDIEVILNKLQGTELLPIDGGNFTKMIGGKMRLRQNFPASFKANFLMPPTDEELENLKIYVTDASGSVLKSTRIENTISFTPVNTKAKYTITAQYKLSAEEVQKQSFSAETITNSVSQITHNAEVIRPGTPMNFAVKESTFSLYIPDEQEAVAKEVQAVKWNLNGRLIGNGKSITIPGHELMNFGKYVVEAYVTLANAYGQNAKHEEDDWHFEVKENDVISFSYTGVPKVGKTTFLEADHLVFPDLTANETVIWDTAIPHKTTDKKTISIKPLKAGKEIVKCRINRQQGKTLSIDVKQAKVLGMMFTDSNGIEIEKSGWHQTVNIWVQQEHLIGEDLTIEIWDNDAFKDDYCKAITVKSYDGNLIPFTLDSYVKNKAGDWAMLYVKISAPKLKLANTEGVFKSKNRLDVQDKREIYSAQIGSQDAKQRHYHVDYNQVSYFYGKSRGIKAGEKLKITIYEKGNKLFEVTDVAVDTSGAVKAKLQWDRISEKLPSRAVYAVVQDGEDKILYNGNKTANGGVAITKKSALLGLAEYKSAVLVKKSESNANNKTGTCVCKDYDLAWGNKFTCEERKKVVQICSNLWGEENKKQMANHLMNCIALETADSFKPYEGYSSGGATGLVQWTSDAINGMNKDNKYNKGTKLTKERLSKMTVLEQLEYVELYFKMWIDSKKVIRNALDMYMCIWCPAAVGKEDSFICYSEEKDKKRRELDPKATQPYDANKSIDGEYYNEKGNNVLSGKKNKEISRGELYPRLKVKEVLGFKNKTKLFDCRNIGGKDKDNLYGEGVLAKMKRIADEHHEYAQETNNLRTDNTVEGLEKMDCSEFVSRYLFELGITTKPIYMTTANMVSESSFRKIIGNNNIDLVKGSKEESFKPQRGDIFAWGYAKNGSWQGHTGIVYEYDETKDTVTILESIGSSGSRDDSFNNANGGWQKTGCTRTAVYQRKGKALVNHSNWFGYYRPTNYSKEL >NC_009441.1|WP_012023277.1|1359322_1360249_+|hypothetical-protein MKKNVLFLFLLFIFQIAGCKQNEIKKNNEIKESIENKPTTSINFLSFLDEICWEGHKGVFKNCDELFTDKGHMFFIIIPKGGAENWYNKQMNNFSVKDVWKKEDKILEQINKCLVSNLEKDFNIWVFYVDVKFLKRNPDMDSPYSPVNPRKVQVCFYKEKLKRWDVIDVIDINNEKDESNFNNWRENYINSIVKKSNESSNNSSEDKIKISQKWQGKFSRNFTEKFNDGSNSSWVYYFIIESNKVVFKSDSELPIESEYKGLERNNQLELFEGDNKQPSYIIKEDGGKFYIQSDSFENRKGWLLLDKN >NC_009441.1|WP_012023278.1|1360647_1360914_+|hypothetical-protein MLGIAAIAYVDECLERGYPLRAGINHTLGLDYNEEDNPTTDHYVVIVGRKCDKGTLTYLYWDVGTKRGESADYRFQLIDGYKCSWKRE >NC_009441.1|WP_044047540.1|1360898_1361810_+|hypothetical-protein MEKGIMTIIYLQLHKLQEILKMEKLFKLLLLISTFSSCQEIKNDFTEIKNHSFYEVKKINSVNSIYEPCDASNKKYLLKDSILLYTSAQDGDFKYRILNISKNKDTYQLKIKNTDPTQNISTLSIKKIDSKYFSINDKIYIDSTFIKTIPHIKQSCEECGNCDDAKPQIRLDNQRLNGYWKINCINGNASMTITNKTAFLEVMFNQIYVELVELKRYNSENGIAYKLKEIPEDRGSFGAKLNWNEYLNNKPIAYVKVIDKNTLYFYWYGFFNKKKQKREFVECEFQQEKSKDQQEIILKKCDE >NC_009441.1|WP_012023280.1|1362046_1363246_-|DUF418-domain-containing-protein MTNSYHPVEQSKRTVIVDILRGWAILGVAIGNYLDFLYIGIEKDIKYDTFSEVLQTINRYFFAAKSWTLLTLLFGYGFAILINNVASKGKNPVAFFTWRMALLFILAFINSSFWLGDILKDYAFLGLVLLLFYRCSAKTLAVISTVIVLTVPFLMAYINGLKIEHTAISSNPEYLKLYHSGNWIDFFRFNLLASLYEQIIVPGYAITAHYVMLGCMLFGFMLQKLNFFNRLIELKKLLQYVCIISFLCAVVIGIGFNIAIIYKAGFLKFFHPLYWLVLSTMIFISTGICLLYINGKLKTIFSYFSAGGKMTLTNYISQNILAALIFSGIGLGIADTMPYWFYFSVAVFIFVVQLFISKWWLSKYNYGPIEWLWRSASYREWFPLRKIQPEVTPADIKTI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009441_6 | 3182380-3182461 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009441_6
|
1 spacers
spacers of NC_009441_6
>6.1|3182403|36|NC_009441|CRISPRCasFinder AATTTGTAATTTATTCATTTTCAGCGCATTGAGTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009441_6
The CRISPR arrays of NC_009441_6 >merge|NC_009441|6|3182380-3182461|CRISPRCasFinder TTAAAACCATATAAATCTATATGAATTTGTAATTTATTCATTTTCAGCGCATTGAGTTTTTAAATCCATATAAATCTATATG >NC_009441|6|5|3182380-3182461|CRISPRCasFinder TTAAAACCATATAAATCTATATG AATTTGTAATTTATTCATTTTCAGCGCATTGAGTTT TTAAATCCATATAAATCTATATG
>NC_009441.1|WP_123875775.1|3181783_3182308_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MQTIVLKLERDNDLKFALLIATGSYIGLRISDLLQLRWNQVLNEEHFIITERKTKKIRKVTINPELQIILKRLFVQLEAKETDLMFANRSGDKPFSTQYVNSKLKDIFTKYNVKGQYSSHFMRKTLGRRVWEVNKYSDQALLLLSQLFNHTSVSTTKIYLGIREQEISNLYLSI >NC_009441.1|WP_012024732.1|3180724_3181369_+|hypothetical-protein MKYENLKKFIISTKSSKSTIYRFYKKNEDLFLETKMSTGKRLFPVDHARYFDSEIMFDENKILRQENQSMRNLIDCLTDKESLQHTFWQMDWSFFFTVAYKTERNKNSCFKQMHSLYDYLNEKYHDSTDLRMFFTTEPFTNRKGFHNHFVLHVEDKKLHESIISDVQEHFSYDRVDVSIYDRYKAGLFYISKKGLNGEDWDFINNSANTSTDES >NC_009441.1|WP_123875774.1|3179850_3180222_+|hypothetical-protein MISCVKKENEQWKGEGKIDHIGEFKTKSMYTIKVENNDDIISFNVSDNSKHSVVTSTEGISNIHNWYLYWDDANKALWVYSSDIGSSVWLEQNSIFSETTITYKNQDKLPVKMPKEIEKDILE >NC_009441.1|WP_012024729.1|3171115_3174574_+|RHS-repeat-protein MFKINYNLKGLISIFLFMLMSTLTYGQTENDPSKFVPNIIPPSPTAYGLGTYGNTPVGLFTGSQNINIPIYTYKTANLEVPVSMFYSSNGVKVDEISSNIGQSWNLSFGGVITRIVRDKPDEERGEYPIPISMTEEMGRYSPQALEFYQYIGENDVDTEADLFSFNFGKYSGKFVFDNDGGIVLMPAQDFQINCTVSSDGFDFVITTPDGVKYFFNDKEITSQRVVGSGHSIPITTISSWYLSKIVHPKGDVIQFFYNSEVSNYITSKSQTFRMLSPRIQYDQGGSLENFSPSLSSVCDHTITLNGKSIKSIKSTNPEYGEISFTYLSSASADVTSGNRKIEKIIVKDKTAKEIENVGFTYTTTTNKRVFLDKIQFKDINQNYQFEYEDRNNLPQRLSYSQDHWGYFNGKSNLNLVPKGITLYEFSNVNYNGADKEPDSDYAVKGLLKKITYPTKGYTIFDYEANTYYGTKLVYPPKTYKSLNVVTTEQTYSAVKTTSFINPTPQDISLVGGVSFNCLDANLNVGKNQAYISVYDNTTNKYIPLKRSDNESVVSNGNMYTIRPNTEPEAKNLFFTAELNHEYKLTLEADFTCTSSTLNFNYYPTPPVELASNIKTGGIRVAQTLDYSLNKPEPVVKKFLYAKKDDLSKSSGNKGQDPYYIDRFRVDRIMESPVAGIYGVVTSKTLVNLSSSSLVSLFDTGNSNVFYQYVTISYGNNFLNGGEEHEFIVHRDAPDGFVFGNYEVRNAPLSNLGWDNGLLKKIDYFNKELKTIKETINIYEERYEFRKEVRSFSSRKNYEKIASASVNYVCTQADLSKRTKYISCVAVHKHVYSDNLVDNLIKGKSYYTCIAPGNDNKTTFIEHPCYGVQLPKTISNLENIDNLSIVSYKNIGFWYYLKSSQDITYDVSGSNPICNTAIYNYNGINHVQLSSQTKTNSKKETITTKYFNAKDAEMSGKPFAAELAEKNILSPLNTQTFTGNNKLSEQLITYNNLLLPNAVYSAKFPNANSNITGIGNLEKKIVFNQYDDRGNILQYTLDGGVPTAIIWGYNKTQPIAKIENASYSDVQNYVSNLQTKSDTGTEIDLLSNLNSLRNALSNAMVTTYTYLPMIGISTVTDPKGNTTTYSYDEFNRLKTIKDAQGHVVSENRYHFKN >NC_009441.1|WP_044047738.1|3169450_3171112_+|T9SS-type-A-sorting-domain-containing-protein MKKNYLLFFILLSFLTYSQDILWEKSYGGIHADYLFDAQPTADYGFILAGSSLSNKTGNKDEDNHGDLDYWIWKMNEKGELDWQKSIGGNGFDLLQSIKGTRDGGFILAGTSSSGNSFQKKDNCKGLTDFWVIKLDASGEEQWQRTIGGDGQDELLCAFQTKDGGYILGGSSSSSPSSVTNIKAEGKMDAFPQTDLYSKSEKSRGNMDYWIVKLDKEGVIEWQKTYGGKYADVLRSMEQTADNGYILAGYSNSPVSGDKADANKGVGDYWIIKIDDSGAVQWQSSYGGDGDDQPYVIHQTADGGYILGGNSNSTNPLTTLGGIVSNGTDFWILRLDHEGGVVWSKTYDFGKVDILTSLVENNDNTYLIGGYAKSEAKQSLLGDAAKKAGTGKDKEGINDYIALKIDEKGEELWKKTVGSAGEDILRKLIETRDGGYLMAGTSNSGSSKDKKSTIGGNDFWVVKLKDKAKVEKVKASIEAIPNPAVTYTNVIIGYDFTEGTASVIDILGRILQQFSINSRTVPVDLSHYAEGIYIIKIKTDVKTESVKVIKTVR >NC_009441.1|WP_012024727.1|3167403_3167973_-|hypothetical-protein MKTDTKGNQRQDDKNFQNTASGKQGQLKTASPAAHPFTENAEPDYGDDLSTEEIGSGSDQQKPSDAEQQKLKVRNSDVQDSDKDSNPYDSENLDNETGSESKDITEKDIEENLINNDPSEGFETDIDALQSDETQNSGFETIEPDHDNPVNKEFEIGELGNQELKEDERVRDETANGSVHNYRPSQRKF >NC_009441.1|WP_159436648.1|3166977_3167133_-|hypothetical-protein MKALFSKVVILSILMAALHISCEALCEDENDASNRKENYIIKNDSLAVSKN >NC_009441.1|WP_012024726.1|3166460_3166685_-|hypothetical-protein MIPQENYDTYRQDDSLYHMGEESIQSETMEHTDPGVNQHYKDERSADHQPTELDHDDADRRTLDESEADEDDED >NC_009441.1|WP_012024725.1|3165263_3166364_+|catalase-family-protein MIEYIPYSDSIEVIQPDELEISRKIVDSMARVNRLMYEKYRHAIRDAHAKSHAVLKGELKVYDNLPEHLAQGLFAKARTYPVIVRLSTAQGSIVPDKMSAFRGMAIKVIGVEGEKLLPELSDAVTQDFLMVNYPVIPTGTIKEYLKMQEGLEKQADSGELFQEIAQKAAVGVQNVLAAVGLADDTNQLSAPGPHILGDTYFSMAALRFGDYVAKINVKPLSDNVKELAGKKIDKDIIDEDEHAFLTKIVADFFQSATAEYEIGAQLCTDLELMPVEDGSVQWPEDQSPYQPVGKITFHPQQTFSPERRVYADDTLSFNPFHCLADHRPLGNIMRVRQLAYETSSRYRHHMNAKARIEPVSIDQLPD >NC_009441.1|WP_012024724.1|3164274_3165234_+|hypothetical-protein MKKYIILLLAAQLTWAQQPTKRIEFEAPESYPEGVAFDKAANVFYVSSARLGTVGKVTKEGRYSELYADKTLKSTYGLKVHPDGKRLFVCAGDANYSKFSTPDTKKKMARLLILDLKTGKKLNDIDLAGLIAGEHFPNDLAFDQAGNAYITDSYAYAVYKVDAKGTASVFSTNELLKTAGVGPNGIVYHPEGFLLAANNGKGALIKLPISNPNSGTKVKIEQFFPSADGMLLNDNSTLTLVQNGGVNKIFKIKSTDNWTNAEVSESTSVEDRFAFPSTAAISGSETWIMNANFSELTEGNNVPSKKFSLQQAVFNPVKK >NC_009441.1|WP_012024734.1|3182733_3183297_+|hypothetical-protein MQNLESLFQSFETGIRSVKATKPKEYLNKIGLDYAELRIGFNSGQFHHNKSQEAKDEFEALGMLKKSDAGVRKEDLTAYTVFGRYGLIFPLLSKENQIVNYFALRFDLESPKEEYLNSEGIYPSYPNLLTKRLYIVPTVIDCASFLQSKALENRDAVIAMHSGTLLPQHLEAIKSLHELEEIIIIKR >NC_009441.1|WP_012024735.1|3183301_3184981_+|hypothetical-protein MQDIRTQIQNIRPELPVNMIQLPDGHSMNDMWLNYGTGGIVELLQNTETEKAVPTLEIHSDYKIGYRGKTGTFYAIGSLPMDLGNLRVSLQIVEKDSQKKHRVKIDLFDFTSVENQCRELSEKQGFDGNLLEADLKQFTDLLEEYRENLFNAEMNPVTDQFSEKELTPQAHEKAIEFLSKPRLLESVDKLLGQSGIVGEEENRILLFVLASSYKMPYLMHGLVQGSSGEGKSHLINAIADCMPQEDVMNMTRITSKSLYHYKDKELMNKLIIIQDFDGLDEEAQFAFREMQSAKFLTSSTVVKDMLGNTRGKMKKVHAHFASLTATTKAEVYYDNMSRSVVLGVDESLEQTLRIIKSQNLKNAGISNIENEQQAKQLLRNCMRVLKSYTVVNPFADKIELPIEAKMLRRLNDQFQSFVSQITILNQYQRKKDDKGRLIATIEDIQKAVKIFFSSIIIKVDELDKSTRQFFEKLKGFVKSQPNGTTYRFTTREIRQELNISKTSAFKYMQTLQELEYIQAVEGSANKGFKYVVSYWDNMEKLKAKIKTEMAMQLDQIKNS >NC_009441.1|WP_012024736.1|3185091_3186009_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MKKTIQTPAFQNLLNEFDSYVRVKNYKQGKGSMYQKAVSEFLIWLEDSGITNIKSVTGKESVNYFEYLIKRPKLRGKGTLAGKTIKFHLFALGLFVSNLLENRHIENAYYIPSYSEENGKARNALSVEEIRNIYQHCESDLQRALLSVAYGCGLRRSEITALNVRDVMLSKGMLIVRDGKGSKRREVPMSDIVVEYLGKYITEERYEKLISENKVQDAFFIHDSGKRMNGEYLNNTLKKMIEQTNDYKLIQKEITLHCLRHSIANHLMEKNAGIDFIRGFLGHSGINTTYIYAVRNKKRKPVTAF >NC_009441.1|WP_081432672.1|3186020_3186887_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MTKPTIENFLLQSYSKQTVDSYMFAINHFLKRNPKAKRYKYRNIVQYMEEISQEQPNGKYRVVILSAIKKYYDYLIMSGYRTDHPCRKLNIKVNSNQAVQVQDLFSSEELELLLARENRYENLDTRNSVLLNLLIYQGLTSDEIIKLNVQDIDLDEGTIYIKASSNLNRRKLSLLAKQILLFSKYLNEARPKMLRTSTDKLIIGKLGKPITVNSIHAMIEPLKPLFPDKKLNPRTIRMSVICNWLNEKKLPLEHVQELAGHKWPGTTEKYIKADSQQQRELINKYFPI >NC_009441.1|WP_012024738.1|3186929_3187301_-|hypothetical-protein MNKPLTILVRIFLVGFTLLCLGAYMLSKHYDNEWDKDHPKTKSMEELKAWAQTAIVQDYCESYRFAKSFSNETKREKELYFVESRQSIYVPQVVRNVIEDNDLPDSYVEELRSYVDAEIDKCK >NC_009441.1|WP_012024739.1|3187413_3187677_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKDSTQTNNMEELNAIALRLKELRKAKGYSNYEHIAYALEMSRSAYWRLETGANFELKTLIKICRVLEISLEEFFKGIDLPNSKIKS >NC_009441.1|WP_044047745.1|3188050_3188233_+|hypothetical-protein MNDLVIVLAFFLIMRTMSMAFPKRAEKATKCETKLINALCISKAFEAITAYFKQKKNHLK >NC_009441.1|WP_012024740.1|3188353_3189046_+|DUF4329-domain-containing-protein MNWDSFKWRNYDYAIGRFMSIDPLAEKYSFQSPYNFSENRVIDSRELEGLEAYRLFRTEKEAANNWGQQYAGKSIRENKEFGSTIGKSTDAKGNVRYSYAPPALGDNDGVTISDAPQGTTPTADIHAHGAYDSEYFNNDFSRGDKKGNDNTGLNGYLTTPSGTLQKYNPKTKEITIVNETQASDPKDPDKKNNISPNEKKAEKSTTDSKQKTNTNIWPVIKPLIPTIPAK >NC_009441.1|WP_012024741.1|3189063_3189411_+|YbbC/YhhH-family-protein MKKHNVLLVVFLLIFFNSCSQEKTKSQKVVKSVVDKPNLVFKDLVPDNETAIKIAEAILVPIYGKKIYKQRPFVATLKSPNVWAVEGTLHTTKGGVAYIEIQKKDCKILKVYHEK >NC_009441.1|WP_012024742.1|3189623_3190283_+|IS1-family-transposase MKIKCNFCNGKCIKNGLQSNGNQRYKCCACKKRQQIEYSYNAYKKDINQEIVLFTREGLGIRSTARILKISATTLLKRIVSIARNITKPIISNGKTYEVDELCTYIRHKKNYIWLVYALEKNSKNVVSFNVGKRTNKTLNRVLETLKLSDAKKIFTDRLKNYRYPIDEKMHFVKRFGTNHIERKNLTLRTHLKRLNRRTICFSKSLVIFTAVLKIYFWI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009441_7 | 5194431-5194658 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009441_7
|
3 spacers
spacers of NC_009441_7
>7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder CGGGATAATATAAAATCCTTTTTTTTTATA >7.2|5194523|26|NC_009441|CRISPRCasFinder AAAGGTAATAAAAGCTCTTTTTTTAG >7.3|5194580|48|NC_009441|CRISPRCasFinder ACTGATTCGAAATAGAATTGGAAAGGCTTACTGTATGGAAATTTGTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009441_7
The CRISPR arrays of NC_009441_7 >merge|NC_009441|7|5194431-5194658|CRISPRCasFinder AATTTTACTTAACAGTGTAAAATGATTTAAACGGGATAATATAAAATCCTTTTTTTTTATAACTTTCGCTTAACACTGTTAGAAAATTTAATAAAGGTAATAAAAGCTCTTTTTTTAGACTTTTACTTAACATCGTTAGATAATTTAATACTGATTCGAAATAGAATTGGAAAGGCTTACTGTATGGAAATTTGTGCACTTTTACTTAACAACGTTAGATAATTTAAT >NC_009441|7|6|5194431-5194658|CRISPRCasFinder AATTTTACTTAACAGTGTAAAATGATTTAAA CGGGATAATATAAAATCCTTTTTTTTTATA ACTTTCGCTTAACACTGTTAGAAAATTTAAT AAAGGTAATAAAAGCTCTTTTTTTAG ACTTTTACTTAACATCGTTAGATAATTTAAT ACTGATTCGAAATAGAATTGGAAAGGCTTACTGTATGGAAATTTGTGC ACTTTTACTTAACAACGTTAGATAATTTAAT
>NC_009441.1|WP_012026272.1|5193826_5194420_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MASKDRILRQKEETRNNILGAAYDIVKDEGWNGLSMRKIADRIEYTAPIIYEYFSNKEAILEELTGKGFIKLAKELQTAKGKFEKPEDQLEAMWMTYWDFAFTNTEMYQLMFGVQMTCCAQRCSAQEAPYKLFTGVIAEIMKDSNPSEDIIKQKYFTFFSVIHGLIAINIINKSDILETINAQILKDAITGIIKSIQ >NC_009441.1|WP_012026271.1|5192183_5192618_-|cupin-domain-containing-protein MKRLTILKTTIAVLFFQQTFSQETKKETTAPQYTIENCVNHFEIDKATKTKAGYQYWFGDKNFTQENTLKMSIVEPGKSTHAPHHHPEEEFFYILEGTAEFYLDGKTKTAGPNTSFYCPSNMEHGIKNAGNTDLKYLVIKKDLR >NC_009441.1|WP_012026270.1|5191756_5192203_+|hypothetical-protein MKKKADNQKTDEIDKTELLNKVRLSINEKCQDWVLFQNGTYIIFDHAETIPDIENEAIKLMKEFGPVYVQTPSEDFDVTDLKKTEGWIVSGHCYGMYTYVNPKEKNWKTPDMAEIGLHGRNKRELDGRNPVIVYVNRKKIDNVTSNPF >NC_009441.1|WP_012026269.1|5188519_5191624_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MKKFVQGLVAFSLKNSLIIFFFTAILLAAGIVSYIHTPIEAFPDVTNTRARIITQWPGRSAEEVEKFITLPISKQMNTIPKKAEVRSISLFGLSVVTVLFDDGVEDFYAQQYASNRLNGLDLPEGADVEIDPPSGATGEIFRYVIKSDLPIKEIKAIQDWVIERELVSVPGVADVVSFGGEEKMFEIKINPTELENYNLSALDVYEAVSKSNINVGGDVIKRGDQAYVVRGVGLINKVEDIGNILIETKGGAPVLVKHVAEVSISAKPRLGQVGLDGNDDVVEGIVVMLRGENPGEVIGRLKERLNELNERVLPDNVKIVPFIDRTELVNTTVKTVTKNLIEGVLLVSLIVFVFLYNWRTSLIVATVIPLSFLFAIVMLRIQGLPANLISMGALDFGLLLEGTLVIVENVFVSLEKKAHKVGMERFNNMSKMGLIKKSVGSVATYIFFALIILIVALMPIFSFTKVEGKMFSPLAFTLGYALLGSLILSLTYVPAMCKVMLTKNIVEKENMISRFFRTNLFNLFKWSTKHRKLTIYSFLALLAVCCVRFAFYGSEFIPKLNEGAIYVRATLPNSINLDESVRLTKEMKTKIRKFEEVKFVLSQTGRPNDGTDPTGFFNIEFHIELKHKDEWKHDISKEELIAEIKKVLDVYPGIAFGFSQPIQDNVEEYVAGVKSPLAIKIFGSDLFQMEEMAAKVANSIKDVKGIEDINVYKNIGLPELRIQLEDEKMARYAVTTADAQAVIRMTIGGQAATKFYDDEKIFDITLRFEKEYRDSKEKIEGILIPTMNGKKVPLKEIATVEYKTGPTFIYREGNSRYIAVGFSIEGRDLGSTIEEAQKKVAAEVKLPKENVMKWAGEFESKERASKQLAMIVPVVLILILCLLYFNFGNFKDTMIAVSAMPYAFIGGFISLWVTGTVFGISAGIGFIILFGVSAIDSIVLIGMIKENMRAGMHLRDAISEGIHSRIRPIVMIALMGSLGLLPAALSTGMGSEVQKPLAIMIVGGLITCMILSLTVLPQVFYLVYRKKDISNTES >NC_009441.1|WP_012026268.1|5187399_5188485_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKKLIIPILGLMLVYGCGKKEEVKKAQDEKFCIDKDLKEKITIEPVQKRAVSESINLTGNITYNGDHVVQFNSLVEGIITKTTFSLGDYVKKGQVLAEIKSTELNSMQSESKSLQSQITVAQRNLQATKSMFEDGISSQKDLLQAQSELDVLKSSLENVRANLAMFSASSERAVFQIKAPTEGFIVDKNISPGMQITNESDPLFTISDLKEIWVLVNVYTSNLKNISENMQVDVTTPAYPGEIFKGKINMMSKVFDADEHVLKARIVMDNRNMKLKPGMTADITIDKSKGGEELAAIPAKAAIFDNNRDYILIYKNDCTIETREINPVLKNNSWLYFDKGVNEGEKVITKNQLLIYERLKN >NC_009441.1|WP_012026267.1|5186132_5187371_+|TolC-family-protein MAQITAITDTIVLSRNQAEALFLDKNISLISEKLNIDIADAQVIQAKLWPNPTLTVGEINLWSNATAQQLPPLWGNYGKTQQVNAELEQLIQTAGKRKKLIAMEKVNAEIAKEYFKTFLRSLKIEFRDNLTDLQYNQAQEAVYQKQLSSMQTLLKAYANQVKQGNIGKGEYVRLKASELQYLKEINDLQKENNALQKELKVLMNLPAASFIKLTDEGFVPVNKNIEGINLANLMESAIENRPDMKVLKLGNEYNDNKYKYERAMRTPDVTLGISYDRGASLMNDFVGVGFSLDLPFFNRNQGNVKAAKIAINQGKLLTEEKTLSVQSEVLQAYQDFITTKKLYESADASFEGDLDKLLESYRKNFLQRNTSMLEYLDFVDAYLDNKSILLNSKKDLNKNFEELRYITGQEIN >NC_009441.1|WP_012026266.1|5184632_5185988_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKIRDRFTLISSLTFSVVFVIASLITYFSFYSYSEKIVYNELQKTCLLTGIFYLEKDELPENQHLIIGQQFRENSLEIITRVYDEKNQIVYGDKTLDNNINQLKLDYVRKNRKLSFKSKHHFYFGSYYHDNQGDFVVFVKKNDTDFKTMTDRLLIIMILVLVSGLISIYIVSRVLSNLAYAPIKNIINQVNEIQATSLDRQIVSPNSKDDIQELIESYNNLLKRLSDTFIIQKNFINYVSHEFKTPLTAISGNLEVFAQKDRSSAEYKEMSEKVLENVYQIEDTMNTLMMLSGLRENMELNEIFRVDELVWDINDQLSASYHLKGQIQIALEVLNDKLLSIKGNSNEIKIALFNIIENAVKYSAGNPIKISLSEHNQQLKIVIEDQGKGISEEDLQFIKQTFYRGKNVSDIKGSGIGLPLANVIFKQNNIEFTIASKKDAGTTVTLVFPKL >NC_009441.1|WP_012026265.1|5183958_5184630_+|response-regulator-transcription-factor MNVLLIEDDKRISEFIIKGLEENNFTVHLAETGEMARDLVQENTWDIILMDIMLPGIDGIQLVKLMRFKKIHTPILILSALSNTDDKVTALDSGADDYLVKPFHFKELISRVNALTRRTKFNYNEPETLYTCGTLTINPDEHKVTENDKLIDLSPREYKLLLYLLENRNKVMSRTQILTAVWGINYDNNTNVVDVYISYLRNKIEHNHKFIHTIKGIGYMLKE >NC_009441.1|WP_012026264.1|5182818_5183367_-|type-1-glutamine-amidotransferase MKKNIAILATNGFEESELASPKAYLEEQGWNADIVSLKSGTIKSWKDGNWSKEYNVDVVLDQANEADYDALVLPGGVINPDLLRREETAVNFVRSFFESKKPVAAICHGPQILVDADVLEGRKVTSFFSVKNDLKNAGAQWEDSEVVVDNGLVTSRNPNDLPAFNKKMVEEIKEGIHERQRV >NC_009441.1|WP_012026263.1|5182063_5182297_-|hypothetical-protein MKTNTLSKEAETRLIDFFNHIIDPEDMAKILRQVNCILALAVMRQHDTLQIGLSNFEDNYYWLNELAEILNPYLSEE >NC_009441.1|WP_012026273.1|5194668_5195886_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MNPENARIPKNFIRENVQPIKTTMKMKNVIITSFILALVLSSCGDKNQAPTAPPPPVLPVLAITSANTTTDAEYPASIQGTVDVEIRPQVSGNLDRIFVDEGAYVSKGQTLFKINERPFREQLNNALASLHAAEAALINANLEVDKLTPLVQNKVVSDYQLKTAKASQKIAAANIEQAKAMVGSAKINLGYTNVTAPVSGYIGRLPKKQGSLVSASDVEALTTLSDVHEVFAYFSLGETDFINFKEQYKGSSLGDKIKKLPPVTLILADNNAYPQTGKIDMVDGQFDKTTGAITIRATFPNANGTLRSGNTGRIRLGLQHDDAILVPQSATVEMQDKVFVFTVGKDNKVTKMPITVVGKSGTNYLIKEGVKTGDQIVLSGIDKLQDGQAIQPEKSTKVAEVTNKK >NC_009441.1|WP_012026274.1|5195898_5199063_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MFKIFIQRPVLATVISILLVILGVLGLTKLPLQQFPDIAPPSVLVTAVYPGANAETVLRSVAPSIEESINGVENMTYMSSTASNDGTLAITVFFKLGTDADQAAVNVQNRVAQATSQLPAEVVQQGIVTAKQQNSFIMAIGMYTDDEAKYDQTFVANYAQINIIPELKRIPGVGSASIFGGVKDYSMRVWLNPTQMSTYKVTPSEVMGAIQDKSLEAAPGKFGERSKEVFEYVIKYKGKLTKPEDYENIAIRSNADGSVLRLKDVARVELGAYSYNSLTRLNGKKGIVIGVIQLAGSNSNDIQIAINKMMEKASKDFPKGIKHNIFYSTKVSLDQSIEQVEHTLLEAFILVFIVVFIFLQDFRSTLIPAIAVPVAILGTFFFMQLFGFSINLLTLFALILAIGIVVDDAIVVVEAVHAKMEHKRLSPKIATHEAMHEITGAIISITLVMAAVFLPVGFMEGSTGVFYRQFAFTMAIAIVISAVNALTLSPALAALFLKDNHGAHDHNEPYQKKGFKEKFFTAFNSSFESLTNRYTGGLKFLIRRKWLSLGGLALITLATVVMVKTTPQGFIPTEDQGFIAIAVNTPSGTSLDGTQKVMTEAENTLKALDASRFVTAISGFNLLTNSTSPSSAVVFVLLKPNEERGEVKNIDEIMNQVRGKLGAISGGSFFVFSFPTVPGFSNVEALDLVLQDKTGGKLDKFSGISQNFIGELMKRPEIAVAFTSFKADYPQLQLEVNDEKANQLGVNVKDILQTMQAYFGSAQASDFNRFGKYYRVVVQADIEDRADPTAIDRVFVKNKTGEMVPINTLVKLTRIYGSETASRYNLFNSISINAIPKPGFSSGDAIKAIEEVAAQQLPAGYGFEFSGQTREEISSGGQSATIFLLCLIFIYFLLAAQYESYILPLAVILSIPAGIFGVFVAIGLTGIENNIYVQVALVMLIGLLAKNAILIVEFAAQRRRSGQGLAAASIMAAKLRLRPIIMTSLAFVVGLVPMMSAKGPSAQGNHSISIGAAGGMLSGVILGLFIIPVLFIIFQHLQEKVSGKPIAVIHNEEK >NC_009441.1|WP_012026275.1|5199398_5200817_+|TolC-family-protein MKNHITKIVTFAILITTLISCKVSKDIETPKDAFPENFRNASVSSDTTSIADVEWKNFFTEKDIIKLIDSAVARNNDLQIAEKNIEIAQYRFTQSKWGNVPQVNLFVNASTSNPSDNSFTGLNLNQAIGAKHIDDYSAGASLSWEADIWGKIRNQKKGAYAGYLQSEEVKKALQTNIVANVSRGYYNLLMLDAQLDIARQNLRLNDSTTNIIKLKYDAGQVTTLAIQQSEAQKLNSAQLIPLLEQNIAIQENALSVLTGSFPNSKERSTQLSAIEVKHNTAIGVPSALVSRRPDVKSAELALKAANANVGITKADLYPALRITAQGGVNSFETSNWFNIPASLFGTVAGGLTQPLLNNKRVRTQYNIAVAEREKAVLSFRQSVLVAVSEVSDALVKVEKLQQQETFLKEKVKTLQQAIKNANLLFKNGMAEYLEVLTAQANLLQSELELADIKRQQLTANTDLYRALGGGWK >NC_009441.1|WP_012026276.1|5201096_5201558_+|hypothetical-protein MKKIACIALLALLFTNCKQSNNEESKPIEKPADTIAVVKTEKIEKKTEPKEDCKDIEVEMGDGRECILQDSDLDKVYQNIIKNKEVEESNYFLSTIPNENKSVEVNQNGLISIDYQITKDKVAISMNYEGGVTEVTLEKINNTVKRSIYHYAD >NC_009441.1|WP_012026277.1|5201904_5202510_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MTFNKETYLNNLKLYFESYAPISEKSWNLIESLTHFQTIKKGEILLENGEICKNLYFIAKGILRTFITDEQGNFYNKNLFLENKLACSKVSSILQTPSNFTIEALEDCILINLNYQKYIQLISENDDLKTFYIAYLEQNWIIEKEQREVALVMQNATERYVNLLEKHPTIADRVPLLHIASHLGITPTQLSRIRKSLEKDL >NC_009441.1|WP_012026278.1|5202583_5203315_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNSINLIKDNIDNLTTLWKTVASPLLSYHKNDPFEVSHIKNSGWPNRLWFREDITEENFPQIQEIMEKKPGLVIPYWDIFGSSSKYFFEKNGFHIRIQLVAMVLKLGEKLPLQNNLTFKRVLNEEDAKTWSDIYPLSFSYVISKETLVHNYENVKFYLVHFEGKAIGTLTLFQTEKTMGIHGVGVIPEMRKRGFAEEIMKFAINEAIDADCEYAQLQASALGKGIYTRLGFEDLFTITNYQLT >NC_009441.1|WP_012026279.1|5203522_5203903_+|DoxX-family-protein MKKAKIIFWITTTIIFLFEGVMPALTSQTELAKEGIRHLGYPEYFGNALVIFKILGVLVLVIPSVPKNVKEWAYAGFGFDFIFASISHFAVDGINFQSFFPLIFLVILAISYIYYHKIERYKNIAL >NC_009441.1|WP_012026280.1|5203914_5204124_+|hypothetical-protein MIEVFKTNVQEVEESIMIIGKLLEHFPNSAINFDLEDCDKILRVNGASISNPKIIELLNSYGFHCEALL >NC_009441.1|WP_012026281.1|5204201_5204576_+|VOC-family-protein MNIPAEHQTIMPYLILQGASKFIDFTKKVFGASETNTKSVREDGTIIHAEITLNASTIMITDVIPDWSKQTSHLFVYVPNADETYKKAIENGASSLMGLSNKEYGRTCGVTDPFGNVWWITSVQ >NC_009441.1|WP_012026282.1|5204595_5205105_+|DinB-family-protein MNTNVQKDIVETYKKLNDTLSKFSESELNLIPYQGSWTAGQVVQHIILACSGFPELFAGNTEKTTRKPDEKIKDIDGLFLNFNIKMDAPVFLQPEKKEYSKNALNMKLLKIESELLDSASKYDLTLTCLDFQVPGFDKFTMYEWIDFALVHTQRHTHQLNNIFQYITKL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009441_8 | 5739460-5739576 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009441_8
|
1 spacers
spacers of NC_009441_8
>8.1|5739488|61|NC_009441|CRISPRCasFinder TAGTACGCAGTTATTTTGCGTAGTGAAATTTTTGTTTTCATTTTTTAGAAATACTATTTGT |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009441_8
The CRISPR arrays of NC_009441_8 >merge|NC_009441|8|5739460-5739576|CRISPRCasFinder TTTTATTTCTGAACAAAGATTTCAAAACTAGTACGCAGTTATTTTGCGTAGTGAAATTTTTGTTTTCATTTTTTAGAAATACTATTTGTTTTATTTCTTGAACAAAGATTTCAAAAC >NC_009441|8|7|5739460-5739576|CRISPRCasFinder TTTTATTTCTGAACAAAGATTTCAAAAC TAGTACGCAGTTATTTTGCGTAGTGAAATTTTTGTTTTCATTTTTTAGAAATACTATTTGT TTTATTTCTTGAACAAAGATTTCAAAAC
>NC_009441.1|WP_012026712.1|5736733_5738974_-|hypothetical-protein MKTKELLKISLRQNAIFIPSEMITNDIKNLSGTTSVFLANVSKLGFTFSESLLHALNNVSPTYKIEVLEVLREVLGTDKNWTPLVKEWNVPTNESVIDHIITYFGNVFKTKNGTTLQCGHIIPDNTFPLERYNGCPFCGTPFEFGKLENIGQGSKMKVLELWTEKDLNDFYISLLQSKTALDATQVDSLKMAMQYLPLPKTEVAMKETLMLVIDLLIENGKEDEASQFLKTPTDILRYLWYKNTGMLQIIEPKTIIKRTSKNAQHFHNVLDTSVQARIASQKDLKLKYSRKECLMVANWLNNMNMEVEAMCETMHPKRGMWVRFIRALRLAEYSKRKGFEKLNFLMDVFYNQVYDVWQSKVDSSRLKFDADKTFGLLKQRPGLFARSLFSNMLWFGAEETVAHFEEIIDKVPARLVFTLNMYAQNYFDKNMQRSVKPLGGTNKRIEANALLKLYEDFQLEAMKNQIEELCLLAMKKRFAKIANTNKTIYIDPQLFNIPVSIGDRSDTVQDLPVALMGTRFPVEGNEVRLFMQWGKDLPAQHLDMDLSCQIAYEDRLDMCSFSRLTTTGCQHSGDIRSIPNKIGTAEYININIDELAKAKAKFVTFTCNAYSNGSITPNLVVGWMNSKYPMKISEKTGVAYDPSCVDHQVRVTQNIAKGLVFGVLDVAKREIVWLEMTFGGQVVGGLDFKGVQALLAKLNSKLNIGSLLQLKAEAQGLTITENEIADEVYTAQWAMNPAVVTQLLVD >NC_009441.1|WP_012026711.1|5735769_5736330_-|hypothetical-protein MRNLEFEIHPFDQAFYIESLLKKTHSVLNDAKSLNKFWMKRNYHCKNDDMILDLFENIILNAGGVSRFFWPSSKKVHYKIRGKKLREVYEINDSNVLKNRDMRNHIEHFDEKLDDFLKEFSTWKVTRKYVGPLTFVDDNRTFFRAYFYDKDIFKIFNVEYEMEPIIAEIRRIHEILLQQQKNGSRF >NC_009441.1|WP_012026710.1|5734274_5735696_-|RtcB-family-protein MKTQINGTDILELGFPEGKIIGIALKINSKRNGFTRDEMIANFKNVLETPENYIDDKIFSKLAVALIEKSNEKPEDFIALNQNPNAYSAYGLDHIEDGARKQMEVAMKLPVTVAGALMPDAHQGYGLPIGGVLATKNAIIPYGVGVDIGCRMALSVYDIPEDFYFENEAKFKKELITNSIFGAGHGFHGQYKSDHAVLENETFNMNPFVKNLKDKAWSQLGSSGGGNHFVEFGIMEFAKDDAVLNIPKGKYVALLTHSGSRGMGATIAGHYTKIAKDECKLPEVAKNLAYLDMNSQLGQEYWLAMNLAGDYASACHEIIHNKMERALGATILAKVENHHNFAWKEIWNGEEVIVHRKGATPAGKGVMGIIPGSMTAPGFLVRGKGEENAINSASHGAGRQMSRTQAIKNITQTEMKSILRDHGVTLIGAGLDEAPMAYKDINQVMEAQKELVDVVAKFTPKLVRMADDGSKED >NC_009441.1|WP_012026709.1|5733828_5734050_-|hypothetical-protein MIESKEVATKISELMLNIGKELNESVFLVQEQCSESEFFIYRRQVGIIMGNILLDVLNPLYEKHADLKPRELK >NC_009441.1|WP_012026708.1|5733415_5733736_-|hypothetical-protein MNKYERLKTELETVGNGKMKAFGDSMRPILKSGSLLTFQKSENYQIGDIVFCKVKGRYIDAHKIIKTDVNKGFLIANNHGFENGWTKIIYGKVVEAEFKNEIIYKK >NC_009441.1|WP_012026707.1|5733072_5733411_-|hypothetical-protein MMLVDDKRIIALINALESNGWKNAGFSDQVIEWYFAEIIEFVSVWSPLGKKLYMVLLINELDYPKKNIVEIGFSLVPCNVSNTFFENIYLKDILQTDLKKFCESINSKALHD >NC_009441.1|WP_012026706.1|5732182_5732980_-|TatD-family-hydrolase MNYIDIGINLTNKQFQNDIDDVVQDAIDADVSQMILTGTSVRNSEASLEIAKQYPGVLYATAGIHPHDAKSFDAQSISKLRKLLELKQVVSVGECGLDFDRDFSPRNKQEECYKVQLELAIEVQKPLFLHERSAFNSFMNITKDYLPKLPKAVVHCFTGTLQEAKTYLDNGFYLGFTGAISDVKRFSHLKEVIQYVPLDRMMIETDAPFMLPKNVPNSLLKKYHERRCEPAFLPYVAGTIAQFKGITLAKVAEETTRNSKCFFGI >NC_009441.1|WP_012026705.1|5729058_5731977_-|hypothetical-protein MSNRGSEWRKWNFHVHTKGTNKNDQFTSGSMDDFFCTFFKKAYEDKIEAIGITDYFSIDRYLDAINYVKEIHTKEDEDWEEKLFSEDEINFIRKIFIFPNVELRISPTTKKGKFINLHFIFDPKIVENLNNEFFNKISNVENYLMNYQGIKDYAKHINPLLNDDQLYKFGIDNYNIEFGSIKSLLESNKLIRDNSLIAVSSKSNDGVSGLKDYYEEFEKEGGSLLGTVKSIYKLTNIVFSNAPSDKEYFLGKKTSEQEVISHTGSLKPCIIGCDSHSEDTLFSRFTWVKSDLTFEGLRQICYEPEQRVKIQNDKPDFKEDKVIINKVQFISENKVFTNKEIYLNPNLNVIIGGKSSGKSIFLYSMAKTLLVDDTILKNENLEEKYNLRSIDSDFNFRITTNSGISQEMFRSLDENSVIPDIKYIPQNYLVKLAEPDINKKGKSLNKLVRDLIKEDQDSKDKYDQFIRNVKQNDKERDDLLSKYFELLEEIAKTESELKTKSNKEVLEKNIKSNTESVEKLNKESGLSDQEILKYKEIQTKLEFNTIQKNNFNDDFNNINAGLSDLKKLSNDILEKKKEFVEKIKTESVKQYYVDKLSFIDKIYLDITKIFEEIEIQTDEAGKRSFKNENLLKKNLISINGEKATLTKELEPYQQNEKLKKQIEVLNQSIIDDKKLLADIDLLNKAILDKKSLSENCRQDIFKLFRENFEEYNKIINELKHRTLELEGDGLKIDGIAQFNFPKFVKNLYEVSDGRKASYNNYTILKETHKATSPTNFEEIINEIEKIFIDIINGDYFILAKFGKMQAVKELLDDYFFDYWKITYKEDKLGEMSTGKASFVILMLIIGLSKSKAPILIDQPEDNLDNRSITLDLVSYLKNKKLERQIIIVTHNANIVVNSDAENVIVANQKGQNEIDSSSNFKFDLINGSIENTFEKILEETDILRSMGIREHIADIVEGGKEAFKKREEKYGF >NC_009441.1|WP_012026704.1|5728590_5728989_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSTVNRPKHIGRNISRIRELRGMKQGALADAIGTSQQTISSIETSETVDFDKLVQIAKALGVTVEAIENFTEESVFNFFNNFYDNSANHGQVNGPFNSCTFNALDKVVELYERLVQAEKDKVEYLEKLMKLK >NC_009441.1|WP_165768437.1|5728287_5728434_-|hypothetical-protein MNYKISFKERAKLGMEILSKQSPVTLEKARAQVERLSQASKSKVKKHL >NC_009441.1|WP_012026713.1|5740309_5740957_+|hypothetical-protein MNLEKIYSELLSNIGFSANEIQKNWIDLEKAYSKKSRHYHNLTHLKEMTASFETYRDKLQNPNEVLFSIFYHDYVYSASKKDNELKSAEYAVSIFTDDKPDRFQKPVGFAEFDRQLVFDAICATQQHQQNVIEDINWLIDFDLKILAKDWEDYKIYFEQIRKEYRIYPDFLYKPGRAKALTHFLENEFIFQTEEFRGLYEEKARANIEKEILLLT >NC_009441.1|WP_012026714.1|5741189_5742191_-|type-IX-secretion-system-membrane-protein-PorP/SprF MKLKLFTIIIACCLFTKARAQDPIFTQYFLIPETLNPGFTGFMETTYAGIIHREQWPELDLRIDTDYAFVNTWSDSMNSGLGISFLNQRENVTNYNFSQLNANYAYKVRLNDYWEFRPGIEAGFGLKSFAFQNLLLEDQINIRTGVINTSSMDPMLLNRKATFFDVSAGMVFNTDKAWIGLSMKHLNRPNIAFSSEGNVPLNTFFSLSAGYEFLIIDYIDVLLLPYETKFFLTSNYMQQGRYNRLDLGASILFEKIFFGATAVTNPAKNGANGDLMTSVNLLTGLQYEHLRLGFSYDFNTTKIGKTGGIYELSLTYQFDLRRKCFGCPNYSGN >NC_009441.1|WP_012026715.1|5742207_5746599_-|PKD-domain-containing-protein MGKLYLLPLSFIFLITTSVFALHADDNSNLFFNSYNLTVPPSVDFNFTNNNSCSGTPVTFNAIVSGAAPFVYSWDFGDGTTSTVNNPNHTFTALGCGFQNFTVRLTVTDANGEINTVVKTVSVAQKPDLKFVDLNAAGSAKPFERCGDNNSNPKYTINVGNSSASVSCITSYNVNWGDGTSETNVTFPRTHEYQKLGAFNMTITALGTNSCSNSITYVVKNSNNPIGALIAPGNTTNLCTPVPPMDFAIGSWGLNPSDTNYQVNYGDGTFQNYTQQQLESSPYYNSANPGASQNFPIPHTFTRFNCPSGNTVTLTITTSCGSTYLTAGPIIILDVPTVSFNVNSIICANTYAYFSNTTMAGYTNGCSTYNVYTWDFGDGTPVSREVNPAHVYTRPGTYTITLRAQTPCGIGNTATRQICVEPILEPNFTFGNACAASNLQITNTTDTSLSCGVESYYWEVINYVEGFCGKESVPGAGRGQWNFANGTYSYSKEPVFNFVMPGTYYVRLTTRNSCGIDRSIVKTIQVKKPPVITLEKISDFCNSATIKPVGKVEETCAPASEITYLWSFPGGTPSSSTLLDPGSINYTVSGNYQATFSVTNSCGTTTKTQNFSVNTVLSPVITPKSVQICSGASFQVTPFTNGTDNVPAGTTYVWSAPVVSPPVAVSGAFAQSSPRTNISQTLTNNTNAPATVTYTVSPISTVCPGPDFTITVTVDPLIKVTETIKTGTCFGSNDGSITIAVAGGIPFATGNPYNFSWTGPNGFASSDQNISNLKPGYYNLRVIDNGRCPFNQSYYVSEPGKFQVVGESKNDITCFGLNDGRINVSVSGGTLPYTYVWTKNGAPYTANTGNPANLGPGDYNVTITEVNSCDVLNRSFTIIEPPLLKVSYVSQVDILCYGYSTGEINVTTTGGRATEISPGIFNYRYNWTGPNGYRSTVQNPRNLAAGTYNLTVTDNSGCVSNLQVVLLQNDEIKLDYTKTEIACYNYADASITINNITGGVPFATGEPYIIKWSNLGSGRVQNNLSAGTYVITITDALGCPKVFTIVIDNAPVFTIKPDVRQISCFGQKDAHIRLNLVGGKAPVRLVWDDDATAGIERNNIGPGKYSVTITDAKNCEIKETFTIVEPLLLEIKGEVSNTLDCTRSDTGAVNLIVTGGTQPYTYSWSNGARTEDLVNLVPGKYTVVVTDANGCKQSDTWTIMRFDQLTPSIEVITDHNCETKYVKQTFVGHVKGGIPPYTLNWSDGIVSGANNEIMNTENNGLVIFSVTDSFGCKAEVAYNVNTPVLGTANFSTGSYGKDMYDLYSIYDPITFTNLATGDFTLISWDFGDGNFSNEENPKHIYTKVGTYTIKQTVTYPFGCQYSYSATIKVEKGYSLIMPNAFTPNNDGYNDTFAPVFLGLSDITLDVFDTWGGVIYTEKGTNIRGWNGKVKDIDAENGNYYYKIILKTFYNHTIVEKGAFTLIK >NC_009441.1|WP_012026716.1|5746911_5747949_+|WYL-domain-containing-protein MSQNKNALIRYKTIDKCLQNKYRQWSLEDLIEECSEALFEYEGRQNPISKRTIQMDIQLMRSEKLGYNAPIVVYDKKYYKYEDEDFSITDIPLTETDMNVLTETVSMLKQFKDFSLFNDVSDILQRLEDKIYAEKSHTKPVIYLDKNDKLKGLHYLDEIYQAIIKKMVLIITYKSFKSAEESKFHFHPFILKEFNNRWFLIGKKKASQPITNLALDRIISIDYDFNHPYLEEDFDADNFYKDVIGVTVNSGLNARRIELWVDASNAPYVLTKPLHTSQRLIKQNKDGSVIIHIYVIPNYEMERLLLGFGSCLEILKPEGLRNRMKKILQDAISRYDSEKPTEINA >NC_009441.1|WP_012026717.1|5748170_5748629_+|MarR-family-transcriptional-regulator MKDKTIDYILRATWQAVSRMYNEEAAKYDATMATGFALLSMDKEEGTPSTALGPRMGMEATSLTRTLKSMEEKGLIVRKKNPSDGRGVLIYLTDFGKEKRDLSKNTVLKFNETVRKHVSEEKLNHFIEVSEIINELIHDKNIFNQIENTEKE >NC_009441.1|WP_012026718.1|5748663_5751054_+|3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase/enoyl-CoA-hydratase-family-protein MKRTIKKVAVIGSGIMGSGIACHFANIGVEVLLLDIVPRELTEAEAKKGLTLESKAVRNRVVNEHLANSLKSKPSPIYSQKFANRITTGNTTDDMAKIANVDWIIEVVVERLDIKKLVFEQIEKFRKPGTLVTSNTSGIPIHFMSEGRSEDFQQHFCGTHFFNPARYLKLFEIIPGPKTSTEVLDFLNEYGSKFLGKTSVVAKDTPAFIGNRIGIYGIQSLFHLVKEMGLTIEEVDKLTGPVIGRPKSATFRTVDVVGLDTLVHVANGIYENCPNDEQHELFKLPDFINKMMENNWLGSKTGQGFYKKVDKDILSLDLNTLEYRAAKKANFATLELTKTIDKPINRFKVLVKGTDKAGEFYRKSFAGMFAYVSNRVPEISDELYKIDDAMKAGFGWENGPFEIWDAIGVAKGIEIMKAEGLEPAAWVTEMLASGSDSFYTVKEGATYFYNIPTKSQVKVPGQDSFIILNNIRESKKVWSNSGAIIQDLGDGILNLEFQSKMNTIGGDVLTAINKAIDLSEKEYQGLVIGNQAANFSVGANIGMIFMMAVEQEYDELNMAIKLFQDTMMRVRYSSIPVVVAPHGMTFGGGCEMSLHADKVVAAAETYMGLVEFGVGVIPGGGGSKEMTLRASDLFRKNDVELNVLQEYFLTIAMAKVSTSGYEAFDTGLLQHGKDVIVVNKDRQIAEAKKHALLLAEAGYTQPIRRNDIKVLGKQALGMFLVGTDQMQAGKYISEHDKKIANKLAYVMAGGDLSEATLVSEQYLLDIEREAFLSLCTERKTLERIQYMLTKGKPLRN >NC_009441.1|WP_012026719.1|5751103_5751457_+|four-helix-bundle-protein MHQFEKLKIWQKAMDITENVYKVCSELPSDEKFNLISQIKRCAVSIPSNIAEGSGRNSNNEFAHFLGIANGSTYELITQLMISKRLKLIAEEKISTIINELVEVSNMNFALQRSLKK >NC_009441.1|WP_012026720.1|5751515_5752697_+|acetyl-CoA-C-acyltransferase MKTAYIVKAYRTAVGKAPKGVFRFKRPDELAAETIQFMMDELPNFDKKRIDDVMVGNAMPEAEQGLNVGRLISLMGLKVEDVPGVTVNRYCASGLETIGMATAKIQSGMADCIIAGGAESMSYIPMGGYKPTPDYKVAAAGHEDYYWGMGLTAEAVANQYKISREDQDEFAYNSHMKALKAQAEGKFDKQIVPITVEQTFINENGKKETKSYVVNKDEGPRAGTSKEALAGLKPVFAADGSVTAGNSSQMSDGAAFVLIMSEEMVKELNLEPIARLVNFASSGVEPRIMGIGPVKAIPKALKQAGLTLNDIELIELNEAFASQALAVTRELNINPEIVNVNGGAIALGHPLGCTGAKLSVQLFDEMKRRGNKYGIVSMCVGTGQGSAGIYEVL >NC_009441.1|WP_012026721.1|5752843_5754649_+|acyl-CoA-dehydrogenase-family-protein MADTIQKNVTRGGQFLVKETKCEDIFTPEDFSEEQLMMRDSVKEFVDKELWAHKDRFEKKDYAYTESSMRKAGELGLLGVAVPEEYGGLGMGFVSTMLVCDYISGATGSFSTAFGAHTGIGTMPITLYGTEEQKKKYVPKLASGEWFGAYCLTEPGAGSDANSGKTKAVLSDDGKYYSITGQKMWISNAGFCSVFIVFARIGDDKNITGFIVENDPSNGISMNEEEHKLGIRASSTRQVFFNETKVPVENMLSERGNGFKIAMNALNVGRIKLAAACLDAQRRVTSGAVKYANERIQFNTSISSFGAIRSKLAEMATNAYAGESASYRAAKDIEDRIAAREAEGTSHQEAELKGVEEYAIECSILKVAVSEDVQNCSDEGIQVFGGMGFSEDTPMESAWRDARIARIYEGTNEINRMLSVGMLIKKAMKGHVDLLGPAMKVQEELMGIPSFDTPDFSELFSEEKVIVANLKKVFLMVAGSAVQKYGPELDSHQQLLMAAADILIEIYMAESTILRTEKLAKKEGEDKVQEQIAMAKLYLYKAVDIVNLRGKEGIASFSEGDEQRMMLMGLKRFTKYTNLPNVVALREKIAEKLVAENSYCF >NC_009441.1|WP_012026722.1|5754876_5755971_+|glycoside-hydrolase-family-18-protein MKQINLIALLFCCILSTTTFAQKNKKFDIIAYYTGDSQLIDQYEVSKLNQIIFSFCHLKDGKLSVDSAKDSLTIKHLVSLKAKNPQLKIIVSLGGWGGCEPCSDAFSTAEGRLKFAKSVKEVSDYFKVDGLDLDWEYPSIEGLPGHLYQAADKPNFTELVKILRSTLGKKYELSFAAGGFQKCLDESIDWKAVAPFVNRINIMSYDLVNGYSKVTGHHTPLYSTNPKEESTDRAVEFLLKQGVPAEKLVIGGAFYTRQWKNVENINNGLYQAGEHFQGVDFKNYATTYTEANGWKYFWDDKAKAPYWYNAQTKTFATSDDLKSIKAKTEYVKEKKLGGIMFWELTLDSFRNGMVDEIYKVKTAK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009441_7 | 7.2|5194523|26|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194523-5194548 | 26 | MG543995 | Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome | 115381-115406 | 4 | 0.846 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | MH319732 | Marine virus AG-345-E02 Ga0172268_12 genomic sequence | 42205-42234 | 6 | 0.8 |
NC_009441_3 | 3.1|1118868|31|NC_009441|PILER-CR | 1118868-1118898 | 31 | MK552327 | Pseudomonas phage Psa21, complete genome | 1625-1655 | 7 | 0.774 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | NC_011774 | Bacillus cereus G9842 plasmid pG9842_140, complete sequence | 110456-110485 | 7 | 0.767 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | NZ_CP013615 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence | 82142-82171 | 7 | 0.767 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | NC_015221 | Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202, complete sequence | 58145-58174 | 7 | 0.767 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | MH319749 | Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_11 genomic sequence | 102156-102185 | 7 | 0.767 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | MN855778 | Myoviridae sp. isolate 416, complete genome | 10862-10891 | 7 | 0.767 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | NZ_CP019641 | Planococcus sp. Y42 plasmid unnamed1, complete sequence | 96388-96417 | 8 | 0.733 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | NZ_KX274135 | Staphylococcus arlettae strain SA-01 plasmid pSA-01, complete sequence | 10980-11009 | 8 | 0.733 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 459878-459907 | 8 | 0.733 |
NC_009441_7 | 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder | 5194462-5194491 | 30 | NC_014819 | Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX02, complete sequence | 33999-34028 | 9 | 0.7 |
1. spacer 7.2|5194523|26|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to MG543995 (Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
aaaggtaataaaagctctttttttag CRISPR spacer aataataataaaagctcttttttttg Protospacer ** ..******************* *
2. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to MH319732 (Marine virus AG-345-E02 Ga0172268_12 genomic sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgggataat----ataaaatcctttttttttata CRISPR spacer ----attatctcaataaaatcctttttctttata Protospacer ** ** **************.******
3. spacer 3.1|1118868|31|NC_009441|PILER-CR matches to MK552327 (Pseudomonas phage Psa21, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
attgtctgcttctagttttgctttcgcagcg CRISPR spacer attgttttcttctagttttgctttaaccaca Protospacer *****.* **************** .* .*.
4. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to NC_011774 (Bacillus cereus G9842 plasmid pG9842_140, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgggataatataaaatcctttttttttata CRISPR spacer atacaaaatataaaatgctttttttgtata Protospacer . * ********** ******** ****
5. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013615 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgggata-----atataaaatcctttttttttata CRISPR spacer -----tatttgtatataaactactttttttttata Protospacer ** ******* * *************
6. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to NC_015221 (Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgggataatataaaatcctttttttttata- CRISPR spacer tgcgataatataaaat-ctttttttcggtgc Protospacer .* ************* ********. .*.
7. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to MH319749 (Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_11 genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgggataat----ataaaatcctttttttttata CRISPR spacer ----gttatcttaataaaatccttttttattata Protospacer .* ** *************** *****
8. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to MN855778 (Myoviridae sp. isolate 416, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgggataatataaaatcctttttttttata CRISPR spacer agcgataaaataaaatccgtttttttcttg Protospacer * ***** ********* *******. *.
9. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019641 (Planococcus sp. Y42 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cgggataatataaaatcctttttttttata CRISPR spacer tctgataataaaaaatccttttttatcttg Protospacer . ******* ************* *. *.
10. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to NZ_KX274135 (Staphylococcus arlettae strain SA-01 plasmid pSA-01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cgggataatataaaatcctttttttttata CRISPR spacer agggatgctataaaatccttttttgaaaac Protospacer *****. **************** *
11. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cgggataatataaaatcctttttttttata CRISPR spacer catttcaatattaaatcctttttctttatg Protospacer *. .***** ***********.*****.
12. spacer 7.1|5194462|30|NC_009441|CRISPRCasFinder matches to NC_014819 (Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX02, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cgggataatataaaatcctttttttttata CRISPR spacer aaaatgaatataaaatgatttttttttatt Protospacer ... ********** ***********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
345025 : 356253
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009441|345025:356253|DBSCAN-SWA TCTAATTAACTTCAATTGACCAATCAAATTTAGGTTTTATAAAACCCGGTTCTCGTCCCATCCAAGATCCCACAGGTCTTTCTCCTTCTTGGATAACAAAGGAAATGATATCTTTTTCAATAAAAAGTGCAGATTTTGAATCCTCTATGATATATAGAGAAAGATAATAGGTCCCTACATTCAAAAATCCTTCTGGCAGTAGACATTTGATTTTGTTTGTTCCTTTATTCAATTTCAAATTCTTGTTTACATGGGAGAATGTAAAAAGTGGTTCTCCAAAATCATTATTCAAAACAAATGTTAAATGCAATTTTCTTGAATCATCCTTTAATGTAAATAAAGTATTTATTTCAATTTCTTGATATTCATCTAGAGGGGCTTCTGATGACTTCCCAACCGCATTTAAACTAATTTCATGGATAGTAAATTCATTTTTATCATAGTTCGAATCAAAAACTTTCGCATTCATTGATTCTGAATCTTGACTTAAATAAAAATTAACCGCATTTTCTACACTTCCAGCCATAGCAACCTTACCATTAATTAAAACTAGCCCTCTGGTACATAGACTTTTTACTGCAGCCATATTATGACTAACAAAAAGTACAGTTCTTCCTTCTCCTCGAGAAATATCTTGCATTTTCCCTATTGCTTTTTTTTGAAATTCTGCATCTCCAACAGCTAAAACTTCATCAACCACCAAAATTTCAGGTTCTAAAAATGCTGCAACAGCAAAGGCTAATCGAACGGTCATTCCAGAACTGTATCTCTTTACTGGAGTATCTATATAACGTTCGCAACCCGAAAATTCAATTATCTCATCTAATTTTGACGCAATCTCTTTTTTGGTCATACCCAAAATAGCCCCATTAAGATAAATATTTTCTCTTCCTGTCATTTCTCCATTGAACCCTGTTCCTACTTCTAAAAGAGATGCAATACGTCCTCGTGATTTAATAGTTCCTGTTGTTGGGGCTGTTACTTTTGAAAGTATTTTTAAAAGTGTAGATTTTCCAGCGCCATTTTTCCCAATAATTCCTAAAACCTCACCTCGTTCTACTTCAAAATCAATATTCTGTAAGGCCCAAACATAGTCTGACGTTCCTTTAGTAGATCGGTCATTAGTCTCACCAATCTTTAGATAAGGGTTTTCTTTACCACGTATTTGATGCCACCATTTATTCAAATCATGTTTTAAAGTTCCGGTTCCTACTTGTCCTAAACGATATTGTTTAGAGATATTTTCGGCTTTTAGAATAATGTCTTTCAATTTAGGAATAGTTAAAATAGTTATTTATTATACTATATTTTTTAGTTTATTATCTGTAAAATTAAAATATAAAAGTTTTTTAATATATTAATTAGTCTTACATGCTATGTTGTATACAGTTATACATTCTACTGCTGCTTTTTCCCAACTAAACTTTTTTGCCTGCTCAATTCCTTTTTTTGAAAAGTATTCTCTAACAGATTTATTTTTAATCAGGGTATTTATTTTTTCAACTAAATCATCTGAGTTATTCAATTCAAAATATACTCCTGCATCACCTGCAACTTCAGGAAATGAGCTATGATTTCCTAAAACTACAGGACAACCACAAATCATTGATTCCAAAACTGGAATCCCAAATCCTTCATATTGTGAAGGAAAAACAAAACATTCTGCATGTTTATAGAAATAGCCCAGCTCATCATCTACAAAAGATTTAAAAAGAATTTTATTTTTCAATCCTAATCTAGAAATATATTCATTTTCTGCATTAGTAAAATTTCCTCCTCCAGCGCATACTAAAAAAAGGTTCTCCTCATTTTTCAATAAATTAGAAATAGAATTAATAAAAAAAAGAAAGTTTTTGTAAATTGATCTATTTCCAACAAATAAAATATACTTATCTGGCAGTATATTTTCAATATTATTTTTTATTTTAATAGATGCTCCATGATAAATTACGTCAATTTTAGATTCATTTATGTGAGGGTACAATTTTAAAATATCTTTCTTAGTATTTTCTGATACTGCTATTATTCTAGTTGCCTTCTCCATCAACAAAAGTTTGTTTTTGAGTAGAACTTCTGAATTAGTAAAGTACTCAGGGAAAAGTTCATGAATCATATCATAAACTGTTAGTACAAAAGGTTTAGACCCTATATATTTTAGAAAATTAACATCATAGTATGTTGGTATAAATAAATCGTATTTTGCGCTAATTAACCTCTTTTCAAAGTTTAAATTTGCAATATACTGTATTTTAAGCCTTTGATATAATTTAATCTTTTTAAAATATTTGATTATGATTCCATATATATTTTGCTTAAACGAATTTAATACACTATTATTAAAATAAATATTAGTTGAATTGTTTAGAGGTGTAATTATTGTGACATTTTTATCTTTTGCTAATAAAGTAAATACTTCTGTATAATATCTTGAAATCCCCCCATATCTCTGTAGATTATAAATTTGTGGATCTAAAATAATTCTCATTATATCTTGATTAGTTAAGTGCCGTCAATTAAATCTAAATACTATGATTTATTTTAAACTGTATCAATGAAACTTTTTTCTGTTCTATTAAAAATTAAAAGACCTATAAAAAAAACAATTACTGTAAAAAAAACGGTATAGACCAATCCTAAGGTAGATATATTACCAATATTTAAAAGCATATATCTAGTTGTCTCGATTGTATAAGCTAAAGGATTATATTCAACCAGCCATCCAAATTTTGGCAGTTTATCTTTAACAAGTTCCATTGGATACATTACTGCAGAAAGATACATTAGCAGTTGTATGCCAAAACTAATAAGATAGCTAAAATCACGATATTTAGTTACCATTGAAGAAATAAGCATCCCAAGTCCTAAACCTAAAACTCCCATAATGCAAATTAATAAAGGAAAAAAAAACACAGAAATATTTAAACTTAAATCAAAACCATTAAAATAATAGAATAAATAAAAGAAAATAAAGATTATGAATTGAATTCCAAATTTGATCAAATTAGAGATTACTACTGAAAGCGGAGTAATAATCCTAGGAAAATACACCTTCCCAAATATAGAAGCATTAGCTTTAAAAGTATCTGAAGTCCCTGTCAAGCAGGCCGTAAAATAATTCCAAATAGTAATGCCAGCTAAATTAAAAAGAAATGGAGGAACTGAACCAGTAGATATACCTGCAACATTATTAAATATAATAGTAAATGTCACTGAAGTAAAAAGAGGCTGAATTAAATACCATAATGGTCCTAAAATAGTTTGTTTATATACAGTTATAATATCACGCTTTACAAATAAAAATAATAGATCACGATATTGCCATGTTTCTTTTAAATTTACAGAAAGGAATTTGTTTTTTGGCGCTATTTCGAAAAGCCAATCATTTGATTCTTTTGTATTATTCATTTTAATTAATTATATCTGAATTCAAAAATTCAAACTCAACTTTTTAAATTAACAGGATTTTTACTCTTTTTAATATATCATAAAATAGAAAAAAGGTGTCAACAACACCTTCTTAATTCTATTAACAAAAATAATCATTCTTAAATTTATTTATCTAAAACTTCAAAAGCAGAGTTCATACTTTTAAATTCAGGAACAATTTTTTTCATTTTTGCAACAATATCTTCATTTTCATAAAAATCTGCAATACCTATTAATTCATCAATATCGTTATGCAAATCTTCATACTCATCTTGGATTTCCTGAGCAATCATAATTTTATTATGATAAGTTGGCAGTGTTTTAGAAGTATCATTTAATAATTCTTCATATAATTTTTCACCTGGACGTAATCCAACTATTTTAATTTTAATCTCTTTATCCGGAATAAAACCTGCAAGTTTGATCATTTTTTTTGCCAGATCTATTATTTTTACAGGTTTACCCATATCAAAAATATAGATTTCTCCACCATTACCCATTGCCCCTGCTTCGAGTACTAATTGACACGCTTCTGGAATAGTCATAAAATATCTGATAATATCTTGGTGGGTAATAGTAACAGGACCTCCTTCAGCAATTTGTTTCGTAAACAAAGGAACAACAGATCCATTAGAACCTAACACATTTCCAAAGCGGGTAGTAATGAATTTAGTTACTCCTGGAATATTTTCTTTTTGATTTTTTAATGATAATGACTGTACATACTTTTCTGCTATACGCTTACTAGCTCCCATAACATTGCTAGGATTTACAGCTTTATCAGTAGATACCATTACAAATTTTTTGACATGATATTTACAAGATAAATCGGCTAGATTTTTTGTCCCTCGTATGTTAGTTAAAATAGCTTGTGATGGATTTTCTTCCATCAAAGGAACATGCTTATATGCCGCAGCGTGATAAACAACATGCGGATTGTAATTTTTAAATACTTTTTCTAATGCTTTTTTACTTTTTATGTCTGCAATTACGGCAACAATCTTAGCAGTAGGATTCATACTAAGAGTTTCTAAACACAAATTATGTAATGGAGTTTCAGCATGATCTAAAATAATAACTATTTTTGGATTAAACCCAAGAACCTGTCTAACTATCTCACTTCCTATCGAACCAGCTGCTCCAGTAATAAGAACTGTTTTATCCTTCAATTGTTTAGAAATTGATTTACTATCTAACACAATAGGTTTTCTTTCTAGTAAATCCTCAATTTGTATATTTTTTACTTTTTGAGAGATTTCTTTTTGATTTTCCCAATCTGAAATTAAAGGAACGGTATAAACTCTATAATTGAATTCAAGACATTGATCAACTATAATTAATTGTTCGTCTTTTGTTAAACTTTTATCAGCAATAATGACCCCTTCAGCAGCAACTGAACGCATTAAAGCAGGCAATTTTTTACGCAAAATCAAAATGGGTAAATCCAGCATACGCTTAGATGCATTTTGATTATTCTTATCTACAAAACCAACAATCTTAAATCGAGATGGAGTTTCAAATTTTAGTGCATTTGCTACAGAAATGGCGTTAGCATCTGTTCCATAAATTACCGTTCTTATGAGCTTTGAATTTGTTTTTTCTGAGAAATACATTTCAAAAGTCTGTTTTACAATTACTCTGTACAAAAACAGGCCACAAAATGACAACACAAGATTAATAAATAATGCTGTATTTAAAAATGCCTTGTGTCCTGTATATAATTCAAATACTAAATTAAAGAATAAGAAAAACACCAAAACAGACATCTGCGAAAACAAAAGTTTAATGGCATCAATGTAAGACGAATGTCTAATAATTCCTGAATAAGTCCTAAATAACCAGAAGAAAAAGATATTTATAAAAAGTAATCCACCAACAAAGGCAAACTGATGAGAAGTAATTATATAGCCTAATGCTGTTCCTTCGAATAGCATATAAGTAAAAGTAAATGAAAAAATCAGAACCATCACATCTATTACTACAATGATCCATCTAGGCAAATAACTAAGATTATTAATATTTGCCCTTAAATTCCTTGGTGATAAAGAATTATATAATATCGACGCTATTTTGGTTTGATTATCTGTATCCAATTTTGGTTTGATTTGATAATTTACTATGTCTTACAAAAGTAATAATTAAAGGTGTTAAAAATTACTTACCACTAAAATTATATTTTTGAACAGATAAATAAAACTCTATTTAGTAGTAAGAAACACTTATTCTGTAAAACTTTATTTTATTTGTCCCAATTAGAATCTTTTATTTCTTTGTAAACTTTCTGAATGCCTTCTTCTAAACTTGTTTTTGCTTTCCATCCAAGGCTGCTTAATTTTGAAACATCCATTAATTTACGAGGAGTTCCATCAGGTTTAGAAATATCATTTAGAATTTCTCCTTCAAATCCAACTATTTTTTTTATCAAAACAGCCAAGTCTAAAATTGAAATATCTTCCCCTACGCCTACATTTACTAATCCTTGGTCATCATAATTTTCCATTAAATATAGACAAGCATCGGCAAGGTCGTCTACATGTAAAAATTCTCTTTTAGGACTTCCACTACCCCATATAGTGACAGAAGTGTCATTATTGCGTTTTGCTGTAATAAACTTTCTCAACATTGCTGGAAGAACATGCGAATTTGTTAGATCATAATTATCATTAGGACCATACAAATTTGTTGGCATAACCGAAATGAAATTACATCCAAATTGACTTCTATATGCATCACACATTTTAATTCCAGCAATTTTAGCAATTGCATATGGTTCATTAGTTGGTTCTAACTCTCCTGTAAGCATATATTCTTCTTTTAATGGCTGTGGCGCCATTTTTGGATAAATACATGAAGAACCTAGAAACATTAATTTTTTAGTATTATTTAAATAGGCATGATGAATTACATTACTCTGGATCATTAAATTTGCATAAATAAAATCTCCTTTATAAATATTATTTGCAAGAATTCCACCGACTTTTGCAGCCGCTAAAAAAACATAATCCGGTTTTTCTTTCAGAAAGAAATCAGCAACATCTTGTTGTTGTGTCAAATCTAATTCTGAAGAAGTTTTTAAAACAAAATTTGTATATCCTTTTATTTTTAACTGGCGCAGAATAGCAGACCCTACCATACCACGATGTCCTGCTATATATATTTTATCACTTTTATTCATTAATTAATTTTATAATAATTATTCGAATTGATTTTTAATAAAATAACCTGCATCCTTCAGAACTTTTTCTTTTTGAAAATGTTCAACATCTGCAGCCATCATTTCTTTTACTAATGAGGGCAAATCGTATTTAGGTTCCCACCCTAGTTTTGTCTTCGCTTTAGTTGGATCACCAATTAATAAATCGACTTCCGTTGGACGGAAATAGGCTGTATCTACGACAACAACTTCTTTTCCTGCTTCAATTTGGTATGCAGGATTCGAACATGAACGTATATATCCTTTTTCATCTATGCCCTCACCTTTGAATTCAATCTCTATACCAACTTCATTAAATGACATTTTAACAAAATCTCTAACGGTTGTTGTAACTCCTGTCGCAATAACATAATCTTCAGGTTGATCTTGCTGCAAGATCAGCCACATTGCTTCTACATAATCTTTAGCATGTCCCCAATCACGTCTAGCATCTAAATTTCCTAAATATAAACAATCTTGAAGACCTAGAGCCATTTTAGAAACTGCTCTAGTGATCTTACGGGTTACAAACGTTTCTCCACGTAGTGGACTTTCATGATTAAATAGAATTCCGTTACAAGCAAAAATGCCATAAGCCTCACGGTAATTCACTGTTATCCAATATGCATAAAGCTTAGCTACCGCATAAGGTGATCTTGGATAAAATGGGGTATTTTCAGATTGAGGAACAGCCTGAACCAAACCATATAATTCTGAGGTTGAAGCCTGATAAATCTTCGTTTTTTTAGTAAGATTTAATATTCTTAGAGCCTCTAATAATCTTAATGTTCCTATACCATCTGCATTTGCTGTATATTCAGGTGTATCAAAGCTCACTTTTACGTGACTCATTGCTCCTAAATTGTAAATTTCATCAGGTTGAACTTCCTGAATAATCCGAATAAGATTCGTAGAATCACTTAAATCACCATAATGTAATTTAAAACGAATATTTTTTTCATGTGGATCTTGATACAAATGATCTATTCTATCTGTATTAAACAACGAACTTCGACGTTTAATTCCATGAACTTCATATCCTTTTTTTAATAGCAAATCTGCTAAATAAGCACCGTCTTGTCCTGTAATCCCTGTAATAAGTGCTATTTTCATTTTATTTTTTTATTTAAAATTTCAAATTAAATTTTTATTTGCTTCTTCTTTTGTTTAGAAAACCTAATAAATAAGTTCCATATCCTGATTTAAGTAATGGCTGAGCTAATTTTTCAAGTTGATTATCATCAATAAATCCTTGTCTCCAGGCAATTTCTTCAATACAACCTACTTTAAGTCCTTGTCTTTCTTCTAAAACCTGTACAAATTGTCCTGCTTGCATTAAACTATTAAAAGTTCCTGTATCAAGCCATGCAGTACCTCTGCTTAATATACCTACTTTTAATTTTCCTTTTTCAAGATAAGCCTTATTAACATCTGTAATCTCATATTCACCACGCGGACTAGGTTTAATACTTTTTGCAATTTCTACTACAGAGTTATCATAAAAATATAAACCTGGAACTGCATAATTAGATTTTGGTTCTATAGGTTTCTCTTCTATAGAAATAGCATTTTTATTTTCATCAAATTCTACTACACCGTATCGTTCTGGGTCTGCAACATGATAAGCGAAAATAACTCCACCTTCTGGATCAGCATTATCTTTTAAAAGTTGCTGCATATTTGTTCCAAAGAAAATATTATCTCCAAGTACTAAAGCAACCTTATCTTTACCTATAAACTTTTCTCCAATTACAAAAGCCTGCGCAAGTCCATTTGGTATAACTTGTTCCGCATAACTAAATTTACATCCTAAACTTGATCCATCGCCCAATAATTTTTTAAAATTTGGTAAATCATGGGGAGTTGATATTATAAGAATTTCATTGATTCCCGACATCATTAATGTTGATAAAGGGTAATAAATCATGGGTTTATCATAAACAGGCATCATTTGCTTACTCATTGCCAATGTCAAAGGATGTAAACGTGTACCCGAACCTCCAGCTAAAATAATCCCTTTCATAAATATTCAATTCAGATCTATACGATCCTAAATTATATAAACATATTTTTTAAACTTTTCTTATAACAAGGTATTTCTAAATTATAAGTTTCTTTTATTTTTTTCTTATCTAATAATGAAAATCTTGGACGCTTTGCTGGAGTATGATATAATGAAGATGCAATACCTTCAACCTTACAACTATATCCTCCAAATTCTTTTATAGAGAGAGCAAATTCGTACCAACTAATTTCACCTTCATTCGAATAATTATAAACCCCTGGAAACCAACCGCAAAACCTTACAATATTAATCAATACCTGTGCTAAATCTGCGGCATATGTTGGTGACCCAATCTGATCATTTACAACATTAATTTCATCTCTTTCCAGCATTAGTCGCTGCATGGTTTTTACAAAATTTTTTCCAAATTTACTATAAACCCAAGAAGTTCTAATGATAATTGAATTTGGGTTTTCTTTTAAACAAGCTAATTCACCTTTTAATTTACTTTCTCCATATACATTTATCGGATTAGTCTCAGCTTCTTCATTTAGAGCAGAAGATGAAGACCCATCAAATACATAATCTGTTGAAACATGTATTAATTTTACATTATTTTCGTATGTATACTTTGCAATTAATTCTACTGCCAAATAATTTATTATAAATGCCAATTCTTTTTCTGTTTCTGCTTTATCTACATCTGTATAGGCTCCACAATTAAAAATAACATTAGGCTTAATTTCATTTAACTGGATCTTAAGCAACTCTAAATTATCTAATGTGATTTTTATTCTATCTGCAAAAATCCATTCAAATTCTGGATAAGATGTTGATAAAACAAAGAGTTCAGATCCTATTTGTCCATTTGCTCCTGTTACAAGAATCTTTTTCATTAGAATAAACTATTACAATTATCAAGAAAAGGTAGTTTTTGATCTTTTTCAGAAACAATTGCATCTTTTAAATCCATTCCCCAATCAATATTTAAAGATGAGTCATCAAATCTAATTCCTCCTTCTGAAGCTTTATTATAAAACTGATCACATTTATACATTACCGAAGCAGTCTCGCTGATAACTGAAAATCCATGAGCAAACCCTTGTGGCACTAATAACTGTTTTTTATTTTCAGATGACAACAAAACACTAAATACTTTTCCATAAGTTGCTGAATCTTTTCTTAAATCTACAGCAACGTCAATAATTTCACCTTCTAGAACTCGTACTAACTTGGTTTGTGCAAACGGAGGATTTTGATAATGCAAACCTCTTAAAGTTCCTCTTTTTGAGAATGATTGATTGTCTTGAACGAAATCAATATGAATATCTAGATCTTCAAATTTAGTTTTACTGTAAGATTCAAAAAAATATCCTCTTTCATCTCCAAATATTGTTGGTTCTACAATTAATAAATCTTTTATAAACGTTTTTTCAATTTTCATTTTAAATATAGTACTCTATTCTTTGTCTCAATTAAAAAATTCTTCAATTACTTTTCTAATTCTATCCTTATCTTCAATTGTTAAATTTGAACCTGATGGTAAACACAATCCGTTATCAAATAGACCTTCCGCAATTTTACCTCCATAGTAGGGGTATTTACAAAAAATAGGCTGTAAATGCATTGGTTTCCAAAGAGGACGACTTTCAATATTTGCGTTTTCCAATGCCGTTCTTAAACCTTCCTTATTTATATTATTACTTGGCTTTATAAGAATTGTGTTCAACCAAAAATTCGAAAAATGAGTTTCATCTAATACTTCTGAAAGTTCTACATTTTCTATTTCTTTAAAAATCTCTTTGTAAAAAAAATGATTTTTTCTCCGCGCTTCAACATTCTTATCCAAGATTTTTATTTGTCCTAAACCAATACCTGCACAAATATTACTCATTCTATAATTATATCCAATTTCACTATGTTGATAATGAACAGCTATATCCTTTGATTGATTTGAATAAAAAATGGCTTTATCTTTTATTTTTTTAGAATCTGTAATCAGTGCACCTCCACTTGAAGTTGTAATAATTTTATTGCCATTAAAAGAAAGAATTCCAAAGCTTCCAAAGCTTCCACATTTTTTACCTTTATATGTACTCCCTAAAGCTTCTGCACTATCTTCAATAATTGGTATTTCATATCTATCTGCTATAGCATGAACCTCATCAACCTTATATGGTATTCCATATAAATGAACAGCAATAATTGCTTTAGGCTTTTTTCCTTTTGCTATTCTGTCTTTTATCGCTATTTCAAGATTCTCAGGGCAAATATTCCATGTATCAGATTCACTGTCAACAAAAACAGGCACTGCACCTTGATACAAAATAGGATTAGCAGATGCCGAAAATGTCATGCTCTGACAAATTACTTCATCGCCAGCTTTGACATTTAATAAAATCAATGCCAAATGAATAGCTGATGTTCCAGAATTTAATGCAGTTACAAACGATTTTTTATTAAAATAATTTTCAAGTTTAATTTCAAAATCATCAACATTTGGCCCTCCGGAAGTTATCCAATTTGTTTCTAATGCTTTCTGAACATATTTTTGTTCAAAACCACTTTGTGCTGAGAGTGATAAATAAATTCTTGAATTATCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009441|345025:356253|353698_354544_-|WP_012022438.1|DBSCAN-SWA MKKILVTGANGQIGSELFVLSTSYPEFEWIFADRIKITLDNLELLKIQLNEIKPNVIFNCGAYTDVDKAETEKELAFIINYLAVELIAKYTYENNVKLIHVSTDYVFDGSSSSALNEEAETNPINVYGESKLKGELACLKENPNSIIIRTSWVYSKFGKNFVKTMQRLMLERDEINVVNDQIGSPTYAADLAQVLINIVRFCGWFPGVYNYSNEGEISWYEFALSIKEFGGYSCKVEGIASSLYHTPAKRPRFSLLDKKKIKETYNLEIPCYKKSLKNMFI >NC_009441|345025:356253|348575_350543_-|WP_044047400.1|DBSCAN-SWA MDTDNQTKIASILYNSLSPRNLRANINNLSYLPRWIIVVIDVMVLIFSFTFTYMLFEGTALGYIITSHQFAFVGGLLFINIFFFWLFRTYSGIIRHSSYIDAIKLLFSQMSVLVFFLFFNLVFELYTGHKAFLNTALFINLVLSFCGLFLYRVIVKQTFEMYFSEKTNSKLIRTVIYGTDANAISVANALKFETPSRFKIVGFVDKNNQNASKRMLDLPILILRKKLPALMRSVAAEGVIIADKSLTKDEQLIIVDQCLEFNYRVYTVPLISDWENQKEISQKVKNIQIEDLLERKPIVLDSKSISKQLKDKTVLITGAAGSIGSEIVRQVLGFNPKIVIILDHAETPLHNLCLETLSMNPTAKIVAVIADIKSKKALEKVFKNYNPHVVYHAAAYKHVPLMEENPSQAILTNIRGTKNLADLSCKYHVKKFVMVSTDKAVNPSNVMGASKRIAEKYVQSLSLKNQKENIPGVTKFITTRFGNVLGSNGSVVPLFTKQIAEGGPVTITHQDIIRYFMTIPEACQLVLEAGAMGNGGEIYIFDMGKPVKIIDLAKKMIKLAGFIPDKEIKIKIVGLRPGEKLYEELLNDTSKTLPTYHNKIMIAQEIQDEYEDLHNDIDELIGIADFYENEDIVAKMKKIVPEFKSMNSAFEVLDK >NC_009441|345025:356253|354543_355092_-|WP_012022439.1|DBSCAN-SWA MKIEKTFIKDLLIVEPTIFGDERGYFFESYSKTKFEDLDIHIDFVQDNQSFSKRGTLRGLHYQNPPFAQTKLVRVLEGEIIDVAVDLRKDSATYGKVFSVLLSSENKKQLLVPQGFAHGFSVISETASVMYKCDQFYNKASEGGIRFDDSSLNIDWGMDLKDAIVSEKDQKLPFLDNCNSLF >NC_009441|345025:356253|346381_347509_-|WP_012022432.1|DBSCAN-SWA MRIILDPQIYNLQRYGGISRYYTEVFTLLAKDKNVTIITPLNNSTNIYFNNSVLNSFKQNIYGIIIKYFKKIKLYQRLKIQYIANLNFEKRLISAKYDLFIPTYYDVNFLKYIGSKPFVLTVYDMIHELFPEYFTNSEVLLKNKLLLMEKATRIIAVSENTKKDILKLYPHINESKIDVIYHGASIKIKNNIENILPDKYILFVGNRSIYKNFLFFINSISNLLKNEENLFLVCAGGGNFTNAENEYISRLGLKNKILFKSFVDDELGYFYKHAECFVFPSQYEGFGIPVLESMICGCPVVLGNHSSFPEVAGDAGVYFELNNSDDLVEKINTLIKNKSVREYFSKKGIEQAKKFSWEKAAVECITVYNIACKTN >NC_009441|345025:356253|355119_356253_-|WP_012022440.1|DBSCAN-SWA MDNSRIYLSLSAQSGFEQKYVQKALETNWITSGGPNVDDFEIKLENYFNKKSFVTALNSGTSAIHLALILLNVKAGDEVICQSMTFSASANPILYQGAVPVFVDSESDTWNICPENLEIAIKDRIAKGKKPKAIIAVHLYGIPYKVDEVHAIADRYEIPIIEDSAEALGSTYKGKKCGSFGSFGILSFNGNKIITTSSGGALITDSKKIKDKAIFYSNQSKDIAVHYQHSEIGYNYRMSNICAGIGLGQIKILDKNVEARRKNHFFYKEIFKEIENVELSEVLDETHFSNFWLNTILIKPSNNINKEGLRTALENANIESRPLWKPMHLQPIFCKYPYYGGKIAEGLFDNGLCLPSGSNLTIEDKDRIRKVIEEFFN >NC_009441|345025:356253|350689_351625_-|WP_012022435.1|DBSCAN-SWA MNKSDKIYIAGHRGMVGSAILRQLKIKGYTNFVLKTSSELDLTQQQDVADFFLKEKPDYVFLAAAKVGGILANNIYKGDFIYANLMIQSNVIHHAYLNNTKKLMFLGSSCIYPKMAPQPLKEEYMLTGELEPTNEPYAIAKIAGIKMCDAYRSQFGCNFISVMPTNLYGPNDNYDLTNSHVLPAMLRKFITAKRNNDTSVTIWGSGSPKREFLHVDDLADACLYLMENYDDQGLVNVGVGEDISILDLAVLIKKIVGFEGEILNDISKPDGTPRKLMDVSKLSSLGWKAKTSLEEGIQKVYKEIKDSNWDK >NC_009441|345025:356253|352790_353666_-|WP_012022437.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLHPLTLAMSKQMMPVYDKPMIYYPLSTLMMSGINEILIISTPHDLPNFKKLLGDGSSLGCKFSYAEQVIPNGLAQAFVIGEKFIGKDKVALVLGDNIFFGTNMQQLLKDNADPEGGVIFAYHVADPERYGVVEFDENKNAISIEEKPIEPKSNYAVPGLYFYDNSVVEIAKSIKPSPRGEYEITDVNKAYLEKGKLKVGILSRGTAWLDTGTFNSLMQAGQFVQVLEERQGLKVGCIEEIAWRQGFIDDNQLEKLAQPLLKSGYGTYLLGFLNKRRSK >NC_009441|345025:356253|347562_348429_-|WP_012022433.1|DBSCAN-SWA MNNTKESNDWLFEIAPKNKFLSVNLKETWQYRDLLFLFVKRDIITVYKQTILGPLWYLIQPLFTSVTFTIIFNNVAGISTGSVPPFLFNLAGITIWNYFTACLTGTSDTFKANASIFGKVYFPRIITPLSVVISNLIKFGIQFIIFIFFYLFYYFNGFDLSLNISVFFFPLLICIMGVLGLGLGMLISSMVTKYRDFSYLISFGIQLLMYLSAVMYPMELVKDKLPKFGWLVEYNPLAYTIETTRYMLLNIGNISTLGLVYTVFFTVIVFFIGLLIFNRTEKSFIDTV >NC_009441|345025:356253|351643_352756_-|WP_012022436.1|DBSCAN-SWA MKIALITGITGQDGAYLADLLLKKGYEVHGIKRRSSLFNTDRIDHLYQDPHEKNIRFKLHYGDLSDSTNLIRIIQEVQPDEIYNLGAMSHVKVSFDTPEYTANADGIGTLRLLEALRILNLTKKTKIYQASTSELYGLVQAVPQSENTPFYPRSPYAVAKLYAYWITVNYREAYGIFACNGILFNHESPLRGETFVTRKITRAVSKMALGLQDCLYLGNLDARRDWGHAKDYVEAMWLILQQDQPEDYVIATGVTTTVRDFVKMSFNEVGIEIEFKGEGIDEKGYIRSCSNPAYQIEAGKEVVVVDTAYFRPTEVDLLIGDPTKAKTKLGWEPKYDLPSLVKEMMAADVEHFQKEKVLKDAGYFIKNQFE >NC_009441|345025:356253|345025_346294_-|WP_012022431.1|DBSCAN-SWA MKDIILKAENISKQYRLGQVGTGTLKHDLNKWWHQIRGKENPYLKIGETNDRSTKGTSDYVWALQNIDFEVERGEVLGIIGKNGAGKSTLLKILSKVTAPTTGTIKSRGRIASLLEVGTGFNGEMTGRENIYLNGAILGMTKKEIASKLDEIIEFSGCERYIDTPVKRYSSGMTVRLAFAVAAFLEPEILVVDEVLAVGDAEFQKKAIGKMQDISRGEGRTVLFVSHNMAAVKSLCTRGLVLINGKVAMAGSVENAVNFYLSQDSESMNAKVFDSNYDKNEFTIHEISLNAVGKSSEAPLDEYQEIEINTLFTLKDDSRKLHLTFVLNNDFGEPLFTFSHVNKNLKLNKGTNKIKCLLPEGFLNVGTYYLSLYIIEDSKSALFIEKDIISFVIQEGERPVGSWMGREPGFIKPKFDWSIEVN |
10 | Sphingomonas_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
819450 : 829608
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009441|819450:829608|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009441|819450:829608|823756_824488_-|WP_012022836.1|DBSCAN-SWA MKRTLVFGDIHGGLKALIQLLEKIDYSKNDRFIFLGDYVDGWSESKQLIDFLIELSQKQECIFIKGNHDAWCQEWLENDVVNDIWFLHGGKSTIESYKGIDSSHKEKHLEFFNEMKDYFVDENNNLFIHAGFSSMHGPEKEHYKTNYSWDRTLWEMALTMDERIQKDSLLYPKRLLLFNEIYIGHTPTLHYNVEIPMQGCNVWNIDTGAGFYGKLSCIDIESKEFWQSDVLQTLYPNEKGRNK >NC_009441|819450:829608|825653_826181_-|WP_012022839.1|DBSCAN-SWA MKYNIDTIAPESKFLFFWGHQPSKDGTITKNCFSQWWLSSFKVNEVTYKTAEHWMMAKKAELFNDQEILEKIIQCNSPAEAKKLGRKVKNYDDKIWLENRFEIVKEGNYHKFSQNSDLKTFLLNTNDRVIVEASPVDPIWGIGMAGDHKDALNPEKWKGLNLLGFALMEVRDELR >NC_009441|819450:829608|820081_820447_+|WP_012022832.1|DBSCAN-SWA MSGIKSYKELFIWQKGIKLVVLVYKLTKNFPKEEIYALTSQLKRASVSIPSNIAEGFGRQTDKSFNHFLNISRGSLNEIETQLIIAKELEFISDESLFNEIMFLIEEESKMISAFAKNLKD >NC_009441|819450:829608|826189_827272_-|WP_012022840.1|DBSCAN-SWA MKTAQIVIGLGFGDEGKGITTDFLAKQNPESIVIRFSGGQQAAHTVMIGDKKHVHSSFASGALRGLPSYYSEHCTIHPLFLYNEREELKEKNANLDLYIHPLAKVTTPFDVWHNRGNTRNIDHGTCGKGIGSTMKRNEGPYKLFAIDLIAPREMLLEKLNQIAYYYGFLNESGIDEEIQAYLEAVDKLKWNIVDYTFLLKYDNLIFEGSQGILLDMDHGVFPNVTYANTTSKNAVEICNKLKIEDVEVYYATRSYTTRHGHGWMPNEREIKLKNNEEETCVFNEYQKHLRFGDLDYDLLNYALKLDAAYSPMAKRNLVVTCMDQLEKDYEFENLTTDFDTIYGSFSPDSKDFKQITSLFQ >NC_009441|819450:829608|824484_825033_-|WP_012022837.1|DBSCAN-SWA MNENIAKSISKFLSLVLRHSPEKIGLKLDENGWADVNELIEKCTKKGNRLDAELLDYVVENNDKKRFAYNEDKTKIRASQGHSISVELNLAETEPLEYLYHGTVGKFMESIQKEGLKKMSRQHVHLSKDKETAVKVGSRRGVPQILTVRSGAMYRDGFKFYLSENNVWLTDEVPPKYIEFKS >NC_009441|819450:829608|819450_820023_+|WP_012022831.1|DBSCAN-SWA MNKGKLIVFSAPSGSGKTTIVKHLLGQEDLNLEFSISAASRAPRGEEVHGKDYYFISLEEFKKHIKAEDFLEWEEVYRDNFYGTLKSEIERIWALGKNVIFDIDVVGGLRIKHKFPEETLAVFVKPPSVDELKRRLKQRSTESEDKINMRIAKASVELATAPQFDAIIKNYDLSVALEEAHQLVKDFVSK >NC_009441|819450:829608|828789_829608_-|WP_012022843.1|DBSCAN-SWA MNKNYRVEIANKTLEIIKNGFYEYKGKKIDIKNELEESIKNTFTIAPNDWDTILKTPIENKFETEIVTKNCSTIEAIVEEENGKICVLNFASAKNPGGGFLGGASAQEESLARSSSLYETQIKDKTMYDFNRNQSSFLYSDYMIYSPNILFWNDDNGDYFEKPFVVDVITAPAPNKGAMLQHNRKEEITATEDVFRKRMDKVLAIALQQKSDTLILGAWGCGVFRNEPKDVAHLFKEIIAEKYSGAFKKIVFAVFDNSDKKTNFKKFEEVLN >NC_009441|819450:829608|820473_821055_+|WP_012022833.1|DBSCAN-SWA MKIGLYFGTYNPIHVGHLIIANHMAEFADLDQIWMVVTPHNPLKKKSTLLDDQQRLQMVYLATEDYTKIKPSDIEFKLPQPSYTVITLEHLKEKYPNHEFSLIMGEDNLKTLHKWRNYEVILENHDIYVYPRISDEPENVELKSHPKIHVIDAPIVEISSTFIRNSIKEGKNIQPLLPPKVWEYIDHNNFYKK >NC_009441|819450:829608|822816_823755_-|WP_012022835.1|DBSCAN-SWA MKNRIESGLFGVAIGDALGVPVEFKSREKLKQNPVVDMMGFMSWNQPPGTFSDDSSLAFCTAESLCKGYDIEDMALTFVKWMQEGYWGAHHKVFDIGGTTKHSLARVVKGESARNSGNFFEEDNGNGSLMRILPLVFYLQKENDIEVIYKKVKEVSSITHAHFRSVFSCFIYVVYCLEILKDKDKFEAYKEMQNVLSEFLKDKKYNPVEIQLFEKILKNDIWTYPENEIRASGYVLHSLEASFWCFLNSDSYGETVLKAVNLGEDTDTTGAIAGGLAGIYYGIENMPQKWIDNLVRSNDIKDLAKRLSNKYK >NC_009441|819450:829608|828311_828647_-|WP_012022842.1|DBSCAN-SWA MSDDLKPRFIESLRRNNDQIREDRAKTIGEDSELIYRRRVEDIELKIKRLEREQEGLIDISPLDKNSLTFADFQPEAFVQKDMELSLTIRNLNIQFEVTKKRFEYLFGKTF >NC_009441|819450:829608|825045_825516_-|WP_012022838.1|DBSCAN-SWA MKDIQYTKGDATSPQTLGNKIIVHVCNDIGGWGKGFVMAISKRWKKPENQYREWFKSKDNFELGQVQFVQVEEDLWVANLIGQHKINKDENGGAPIRYNAIEEGLKAVSDFAKTNNASIHMPRIGCGLAGGKWEMIEPIILKTLSDNNVEVIVYDF >NC_009441|819450:829608|821338_822808_-|WP_012022834.1|DBSCAN-SWA MNPLLLTDGYKVDHRRQYPDGTSLVYSNWTPRKSRIEEVDEVIFFGLQYFIKKYIIHDFEEYFFKKSKEEVVSKYARRINNYLGENQVGTKHIEDLHDLGYIPMVFKALPEGASVPLRVPMFTMYNTIPEFFWLTNYFETLLSAVIWLPCNSATIAKEYRKVLDKYAAETSSVPEFVDWQAHDFSMRGMGGIEASVTSAAGHLLSFTGSDTIPAIDFLEEYYKANSDQELVAGSVAATEHSVMCMGTTEGEYETFKRLITEVYPKGIVSIVSDTWDLWKVLTDYLPRLKEEIVSREGKVVIRPDSGDPVDIICGNPNGKTEQEKKGVIKLLWDVFGGTTNAKGFKELVPQIGAIYGDSITVARATQICERLKEKGFASTNVVLGIGSFTYQYNTRDTFGFAMKATYGEVNGEGRAIFKDPITDDGTKKSAKGLMKIDLIDGKYHLSDNVSWEEEKQGELKEVFRDGKLLIDQSLSEIRTRVKSEVSIEA >NC_009441|819450:829608|827433_828309_-|WP_012022841.1|DBSCAN-SWA MGGTRYDFGAREDRAKKVGYASKSASEIFTQNALRKAHESMNPNGVIFREARDSEVHPNTVPIILGLDVTGSMGHIPHELIKEGLPKLMGGIIQGGVPDPALLFLGIGDHECDRYPLQVGQFESGDEELDMWLTRTYIEGGGGGNAGESYLLAWYFAAFHTKTDAFEKRGQKGLLFTVGDEPGLKTLPASAIKEIMGQGQQTYTHLELLAEAQKRYDVYHISVLHSGQAINADVEWKELLGQNCLSIEDHREIPNVIKKIICDKHKSSGSGLGTIPVSDTNDKGLDNIQML |
13 | Bacillus_virus(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3131193 : 3186887
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009441|3131193:3186887|DBSCAN-SWA 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42 | unidentified_phage(11.11%) | transposase,integrase | attL 3162366:3162380|attR 3189456:3189470 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
4286592 : 4336082
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009441|4286592:4336082|DBSCAN-SWA TTCATAACTCTTTTTTCTTTAAAGATACCAGTTGTATTGCTTCTGATGCTTTATTTTTCTTCTCATCTACCACTTTTGCATAGATTTGAGTAGTTTTTACGTTGGTATGTCCCAGCATTTTACTTACCGTATAAATGTCTGTACCGCTGGATAACTGCAGTGTTGCAAATGTATGTCGGAAGCAGTGGAAGGTAATATTTTTTTTAATGCCTGCCGATAGAACCCATTTTTTCAGAGGGCGAGAAATCCACGACGGGTCTGGAAGATCTTCAAAAACAAGCTGCCCGGGAAGCCTCGGCTCTCCACATAGCTGGAGAGCCTGCTGGGAAATAGGCATATATTCCACACCCTTTGTCTTTTTCTGCGTAAAATGCAGTTTAGCCATCCCATCTTCTACAGCTATTTCTTTCCAGCGCAGCTTCTGAATGTCAGAATGCCTCAGACCTGTGAGGGCCGAGAAAAGCGCGGCTCTTTTGAGAACGTCTTTTTCACAATCAGTTGATGCCAGTGCATTTAATTCTTCAATAGTCAGATATTCACGTCTTGACTCCTCCTCTGGAATGCCTTTTATTTTTGAAGATAAATCAACTGTTAGATATCCGTCGATAAATGCCTGCTTTACAGCCGCTTTAAATATCGCAAAATAAGTTCCCGCAGTGTTACGGGAAATGGTTCCCTTTTTGCCTCCTCCCTGTGGCGCGCCCAGCAGAAACAGTTTAAAATCTTCAGCCATTCTGCTGTCAATCTGAGAAAAATTCAAGCTGCCATTTGAAAAGCTTTTTAAAAATTCTGCCAACCGCTCCCAATTGATGCGAATGGATTTTGAACTTCGGTTGTGCCTTTTAGCAGCAACAGCAGCAACATATTTAATAAAATCCTCTTTTCCTTTTTCTTTCTGTTCAGCCAACAGTTTATCAGCATCAGTATATAGATCAATATTATCGTATTCTTTCTGCCTTATTTTACGTACTCCGTCAGCATACAACATTATTGCACAGTCGCTTTCGCTTCTGCAGATTATAATTCCGTTATCGCTGCGTTTGGGTTTGTAGGACTTTGATCCCGCTGCATCTGTCCGGGCAGTCCTTTTCTTATCCCACTCCACTGTTGTTACGGTTCTGTTCAAATATTCACGGATTCTCTGGGGAGTTTTCCTTCCAGAAACCTCAACAGGATAGCTTTCTATGTAAACATACCATTCTTTTCGGTCATCTGCTTTTCGAAGACGCACGGTCACTTTGGTTTTTGCTAATTGTTTCATATAAAATCATTTCCGTTATACAAATTATCAATTTCGCTTTTTGGAGCATATACATGCTTTCCAATTTGTCTGGTCGGGATTGAATATTTTCTGATATGGCTGTAGACAGAACCTTCAGATATCTGAAATCTATGAGCTATTTCGCCGATAGAATAGCAGTCCTCTTTTTCAAGGCTGTATAATTTTTTCTTCAGTCTGCTTTCAGCCTGCGGCAGAGTACGTGCATGGCCGAACATCTCTTCCATAACTCTGCGGTCTATTCTTATAAGGCGGGATCCCAGATTAATTGAAGGAATTTTTCCCTGGTCTATAAGCCGATAAAGGGACTTATTGTTAATGCCAAAAAGCATGCCAGCTTCTGGAACAGAGATAAATGCCCTATTCTCGGGTATTTTATCCGTTAGCGCTTTAAGCTCCTCATCAATTTTAAGCCGTTTCATCTTCAGTTTGTATGCTTTTTTACTGCATACATGCGAGCAGTAAACAGAAGTGACGGTTTTAGGATTAAATTCCTCTCCGCAGTTAAGACATTGTTTGTTCGTTCTTTTCATCGTCTTTGTCGCCTCATTAAGGTATCATAAGGGTACATAAGTCCCACTTTGTCTCCTTCTAAGAGACAGGTACAAATATGGTACAAATATATGATAAAAAACGATTAAAAAAGAACAGAAACAATAAAGAACAAAAAAGAAAAAGCGCTGTAAACATTAAGTTTACAGCGCTTTAGCACTTATTGTTAACTGATGTTAATCAGTTATTATTTGACTTATTTAAAAACTTTGGTAAATGAATTATGCAAACCACAATCTTCGAACTAACTTACAAGAATGGAAAAATCGATTATACAGATCCACTTATGAGCAATTTGGATTTCAATTAAAATATATTATAAGCAATTTTGACACTAATCTTCAAATTCACGCATTGATAAATGACTCAATAAAAGAGTATGTTTTTTCACAGGAAGAATTTAATAGCAGAACTAGTTCATATCGATCTCCTGAACTAATTTTCGAAAATGAAACTCATCAGTCTGCATACTGTTATCAGTTTTTAAAATACTTTATTGAAAAAAGTGGAAATTACAATTTACATAATAATACATTTTTTAGAGGTCGTGATTTTGAAGAGACAAAAACTAAAATAATAGAAGAATATATTTCTCCTATTCTTTACTATTTACACGATAAACTTGAAAAGTTAAATTCAACTATCTACCTTCTAGAAAAATATAAAAAAAGAACAGAATGGTTTACGCAAAATAGCATTTTATCAGCTTACAAAACCGCAACAAAAAATTATGAACAAATACTTGAAGATGATTTAAGATTATTTCTATTTGATCAAGGTATTGATTATCCCTTTTCTACTCCGACATCTGCTTCGGGTCGCGCCGATGTAATTGGTGAAATTGAAACAGACGATCCTTTAATTATTGAAATTAAAATATTTGATAGAACCAAAAAATATGGTAAGGACCGAATTAAAGATGGTTTCTCTCAAATTATAAAATACACTAACGACTATAATAAAGATGTTGGTTTTTTGATAATATATAATATGGAGGACGTTGAAATTAATTTTAAGTTCTCTGAACCAACTAAAGTTTTTCCACCATCATTTCAATTCAATAATAAAACTTATTATTTTATTGTAATAAACTGTGGATTTACGAACTCTGCTAGTAAATCTGGCACAACTCAAGAAATTGAAATAACCGAATCTGAATTGACTAAAAAATAACTACCACAAACAATTTTACGACGGATTTGGGCAAGAGACTTACCGGAAAAATGGTTTTGTATTTGGATAATTTGGCAAATCCGAGGAATGGGGCTTGATGGCAGTGGCGCAGTTCAAAGATGGAAATAGGTAGCGTCCCCACCGTAGCCCCGATAGCAGTGGAAATCCTTTTTTGCCGAGGTTCGGCACAAAAGATTGAAACGGATAGCGGGAAAAAGCTCCAAAAAAAAATAATATTAAAACTAAAAATAATATAAGTCCTAGAATTCTGGTAAGCATTCCCAATACCGGGTTAACGGAGTACATGCAGAATTCTGCCCACTACTACATCAAAGAGAAAAACCTATAATATTCCTGACAGCAAAAGAAAGATTCGCTCAATGATCGAAATGCTATTTGGCGCTTTAGATCAGCAAAAATAAAATGACTCACTCCTACCGCCCTGATTACCTGATCGCTGTTTTATAATTGCAGATCCTTATTCTGTAAAAATATCGTAGCTATCCTCTTTACATTTGATAAAGGACAACCCGCAAAGTACAGAGAAGGGAAAAATACCGGCAGGCACACCGCATGGATGGAGATTTTTTGCAAAGACCTGAAAGGCCCGGCCTTGCTTTTGGTAAAGGACACGGACTACCTTTGCTCCTGAAATAAAAACAAAGCATACGGGGTATTTGATTACTAGAAAAGGGAAGCAATCGCGATACTGTGGATAAAAAGAATCAGGAAGTAAAAGCAGACAGCTTAAGGATGAATTACAAAAAGAATTATCAACTTAACTAATTGCAAAAAATTAAAAACACTTAATTTTCTCACCGGAAATCAAGTAAATATACTTGTTCCTTTATACAACATAATTGATATTTTTGAAAAATTATGCAGATAAGGATATGGTTTTCCGTAAAATAAATACAAATCATTTCGACACCTTTGTTCTAGGATTTATGTTACAGTTATAATTTTTCACATTGATAAAAACATTTTATAATTATGAGGCGATATAATATTGTTGATCATCAAATGATTTATAAAAACATAACTCTCATACACATTAATCCCACTAACAATGCATTGAACTTTAAAGAAGTTTTCGATTCACCTTCGGACTTAGAATGGACAAGTGCATTGAAAGAGATTATCTGCTGACCGGCTATAAGGGTCAGTGTAGAAAGACAAAAAAGAAATAAAAAACAATGAGCGAATTATTCAGAAAATATCATCTAGGCCATTTTATAGGGGAATACAGAAATAATCTTTTCGAGCGAATAGACAAATTGGAAATAACTGATAGCACTAATATTTCCGAACTTGCTGAAAGGCTAAAATCTGAATTCACCATTTTTCCAATTATTATAGGTGAGCCAAAACCCTCACAGCCAATAGAAACAACAAAAAAAATGTACAATCCTTGGGGACAATTGTATAACCAGAATGTTCTGGAGATTACGGTTACGATTCCATTTGAGGGAAACCATAAGTTATTTTACTGCATGCCTTCGCGATCCACGATAGTTTATCTTGAGGATAATGTTGTTATTGGCAATACTAATATCAAGGCAACAATCACGCTGACTCAGTTTGACGAGAAGGCTTACTTTTCAGAAGTAAACGAAATTATCAGCACTGTAAGCACAAACTTACCCGCAATACACGATGAAATTAAACCTTGGAATGACAGACTTGAAAATTTAATTCAGCAGGCCTTAGAAAGCAGAAAAGGAATTGTGTCAAAGAAGTTTGATTTTATGGAAAAAATTGGATTGAAAGTAAATCCAAATTCTACCGAATATTTAGTGCCGCCAACTATTACCAAAAAAGCAATTCCAACTCCAGTAACAGAAACAAGTAAAACAGTAGCAAAAGAAAAAGTTCCAATACTTCAAGAAGAAGTTTACATAGATATTAGAGAAGTTTTGTATAATGTCGGAAAAGCAATTGAACGAAAACCTTCATTATACAAGGATAAGTATGAAGAAGATTTGCGAGATATTTT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55 | Brevibacillus_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 4283576:4283590|attR 4340951:4340965 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
4364592 : 4396142
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009441|4364592:4396142|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009441|4364592:4396142|4366574_4368245_-|WP_012025653.1|DBSCAN-SWA MEKIRLQMQEARPDVPLSIAELPEGHSLNDMWVNYGAEGISNLLKSAKTEKAGEGLQIVNGYKISYKGLSGTFFVLGNLPMDLGNLRISLQIVEYNTNRKHRLKIDLFDFAGVQSQCTDLSEKQGFDYDSLEKDLVTLTDLLEQHRESLFEAEINPIAERFAEKELTPQAQENAVAFLTKPKLLENIDSLLEQNGIVGEEENRIVLFILASSYKMPYLMHGLVQGSSGEGKSHLINGIAGCMPQEDVMNMTRITSKSLYHYRDKELINKLIVIQDFDGLDEEAQYAFREMQSAKFLTSSTVVKDIFGNNRGRIKQVQAHFASLTTTTRAEVYYDNMSRSVILGVDESQQQTLRIIKKQNLKTAGHSNGEKEEQAKQLLRNVMRVLKSYEVVNPFADKLSLPLEARMLRRLNSQFQNFVCQITILHQYQRKTDTKGRLITDKADIKSAVDLFFSSIIIKVDELDKSTRQFFEKLKDFIKKQKEGTSKKFTAREIRQGLNISKTSAFRYMQLLQELEYIQPVEGSFNRGFKFMISYWDDMEKLKTRIRKELHRQLEEF >NC_009441|4364592:4396142|4365479_4366397_-|WP_012025652.1|integrase|DBSCAN-SWA 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MVINCPKCKEKKVIKNGTTKNNKQQYYCKMCFYRFIQNYTNQAYKLDINQKNVQLTKEGLGIRSTARILEISATTLLKRIVSIGRKINQPIISKCKTYEVDEMCTYIGSKQNFIWLVYALDKNSKTVVSFNVAKRTNKTLSRVLDTLKLSEAKKIFTGRLKNYRYLLDEKMHSVKRFGTNHIERKNLTLRTHLKRLNRRTICSSKSLLIFTAVLKIYFWI >NC_009441|4364592:4396142|4387908_4388442_-|WP_123875769.1|DBSCAN-SWA MKTIIIEKNKKYFKRIAIILLMIFVLCGLVIFLRYPSEHTYFLLPTKNAVIIFSIVGIITCALIIFLLIKSIFRKDIFLRIDQQGIFNGFFLYSKKLIKWEEISKIETIKYNYNNYIAIFLKETPNNEKGISSLFFKMNEKSMGTPYIITSGDLDCSFDELERLILESYNQSKQIKN >NC_009441|4364592:4396142|4387195_4387783_-|WP_012025675.1|DBSCAN-SWA MKRSGSETGTSTGEEHINKKMKEIIIALDKKKLILLLFAGVVFTFFSFWIILKPSDFVNFITRSENIIFIAGILGLIVFGFGSVLLFFKLFDNKPGLIINERGIIDNSNSNSIGLIKWSDITKISQKKVVSTKFLLIEISNPEDYIQKANQIKKLSLKQNLKTYGTPITITSVGLQCSFEDLEQMILESYDQNRQ >NC_009441|4364592:4396142|4369534_4369864_-|WP_012025656.1|DBSCAN-SWA METDKIKKLEDIRVLSGKLLNALKPADDKRGMYNAEIRVYDYCELGSVVRNLMKLCIIALDQDSAEVPPTIENQYIDVGLILGIALQLFPVDEFEFLNEITDLFSEETE >NC_009441|4364592:4396142|4377530_4378226_-|WP_012025667.1|DBSCAN-SWA MSEYAVTVDGELLDSNLFEEKSWDQLKKDYKIGDLKMICCGANAVPKTSIKYNRFFAHQSIECTTAPETIWHKTSKKIIVEEFSKLGFRAIEEQIGNGWIADVYVELDGRKIAIELQQSPQTLKVYFERQKKYSEFQIEAYWLLFPPRYLTIIKAIKHYRLKNEFNNKCPNAGFFPSLNNLPVFYIDDIEYKIKGVGLFNHTIEDFVISIVNNKLSYLSTWYIEGKKTLLK >NC_009441|4364592:4396142|4375834_4376224_+|WP_044047904.1|DBSCAN-SWA MKREKSNRTRIVGLRFTPLEYAELEKRFRASTCRKLSDHIRSHLFNKPIVATYRNQSLDELMEETALLTSELRAIGNNINQIARKINTLKTVPEFKGHLYLFEIQRERLFDKMEEVSVHTHKIAEKWLQ >NC_009441|4364592:4396142|4373637_4374570_-|WP_044048383.1|DBSCAN-SWA MKNQILILLIFLKTLAAQGQSKMENKFITWDDFVKGFGKEMVSAEDVFKNMSDSGLKDNCLTKMDFTFISDDKENLIRLSEFLSSHYPYVLHEVKKYGSLWEVNGETNEIPMTAENLMYWSLDMYKRGYEFDSTLDAYGGLFDPRSPNFPDLANSKAEYYFDKGIDCYNNGDLSGSIFNWSLAIAIDSKDSNAYYSRAIVKNELYTWKSALKDYDKAIEIAPKFGSALINRCGLKDENGDYQGAIADYEKVLQFDDSSLENKQQAYFNLGNTKLNLNDKRAACENWNRALELGADYAKDKIDEYCKGKKK >NC_009441|4364592:4396142|4394522_4395089_-|WP_012025683.1|DBSCAN-SWA MKNTLETLFQSFETGIRSSKAIKPKDYLKKIGLDYAELRIGFNSGQFHHRETQEFKDDFEALGVLKKSDAGVRQEDFTAYTAFGRYGLIFPLVDKENTIVNYFALRFNLETPKQEYLNSEGIYPAYPSPLTKRLYLAPTVIDCASLMQSKALENRDSVMAMHNGELLPQHLEAVKSLCELEEIIILKN >NC_009441|4364592:4396142|4391809_4392727_-|WP_012025681.1|integrase|DBSCAN-SWA MKTAIKNTAFQNLLRDFDSYVKVKNYKQGKGSMYQTAVSEFLIWLEKSGINSIRKVTGRESVSYYEHLISRPKHRGNGTLAEKTIKFHLFALGLFVLNLLENNQIEKAYYIPSYSGESGNSRNALSVEEIRMLYQHCENDLQRALISTAYGCGLRRSEIEALNTRDIQLSRGMVIVRDGKGSKRREVPMSDMVAGHIKKYIAEERYEKLKATNRTEDAFFIYDSGKRMNGEYLNSMLKKIVGQTSSYELIQKDITLHCLRHSIASHLMEKNAGIDFIRGFLGHSQINTTYIYAVKNKRKKPVTTF >NC_009441|4364592:4396142|4364592_4365468_-|WP_012025651.1|integrase|DBSCAN-SWA MENKKPDLENYLRGIVAEKTAQSYLYTINHFLKTNPKAKRYQYKDIVKYMDKISQKQSNVQYRIRILSAIKKYYDYLVMYGYRNDHPCRKLNIKIKGNQTIQVQDLFNRTELQLLMERENRYKHLDMRNNVLISLLIYQGLASDEIARLAVKDIDLDNGTVYIKGSANLNKRTLELVPKQMILFHNYINETRPALLRGSSDKFILTKLGQPIVVNSIHAMIEPLRGLFPDRKLNPQTIRMSVICNWLNEKNISLERVQELAGHKWPGTTEKYIKVNSSHQRELINRYFPSI >NC_009441|4364592:4396142|4389528_4389750_-|WP_044047910.1|DBSCAN-SWA MSEEFLIQLGNNINARAKAKFKTNLEFASACEIDEASIRRILKGKQNFSIKIFLKICTALDIKMSELLSEQNL >NC_009441|4364592:4396142|4389855_4390227_+|WP_012025678.1|DBSCAN-SWA MNNPLKIIVRGAVLVFALLCFGGYMYSLRIHNEYRQEHPKTQSLDELKAWAQTAIIQKYCEDYASVKAINNETNHQRELSRLDNNRYLYVPQMVRNVIEDNDLPDSYADELFHYVDKEIDKCQ >NC_009441|4364592:4396142|4390252_4390864_+|WP_012025679.1|DBSCAN-SWA MRKIVLFALLSILFANCQSDDSEQGNADNSKSSIAFTLNNKTEYVTATDVSGSAIDVTWAKSESTNTAENEYSIYGSFIIKSPASNDNRDSGDMYFQIVTSDAKLTAGKTYDISFSYLNSGVRDIPLAYDQAVCYTSTDLFEGTRTAGKIKITSFDGTTLKAEFSVDNLTNKNPYSDFGFCNGSRITEKSFSISKGTLTAVAE >NC_009441|4364592:4396142|4390930_4391797_-|WP_012025680.1|integrase|DBSCAN-SWA MTKITIEEFLQQDYSPQTVKSYMFAINHFLKLNRKAKRYKYKNIVEYMEEISQQQPNAKYRVVILSAIKKYYDYLVMSGYRADHPCKKLNIKVNSNQAVQVQDLFSSEELQLLLNRENRYENLDTRNSVLLSLLIYQGLTSDEIIRLNVKDIDLDSGTVYIKSSANLNNRRLQLLAKQILLFSKYISEVRPRMLRSSTDKLIITKLGKPIAVNSIHAMIEPLKPLFPDKSLNPKTIRMSVICNWLNEKELPLEQVQELAGHKWPGTTEKYFKADSQQQRELINRYFPL >NC_009441|4364592:4396142|4369876_4370734_-|WP_044047902.1|DBSCAN-SWA MKAIQNTASDLIYRVISQNIDPIGIYCFAEKKSSYTFNEPFQKPAQKEKHVHLYLLVITEEFEDNIGNDLTDKIKSRSRGQITVTILMHSLRNIVKLYGDQQYFFWNIFKNAQRIHIDAYRSPIIWAKNPEKRYVKSTSAYAGDRRNVSESIWDLIYNNDQYFSYEVRMCSLHQIVEQTCLSLIRVFLGYTPNHFSLGYLFELCEYFTSMTSEYFPRNSSDEKNMFKILKKNPNTLRFSRTNSFGYDYYGMMEGRCRDFMKEAEAMIQKELERLEGIHQQEVLSA >NC_009441|4364592:4396142|4381472_4381928_-|WP_044047906.1|DBSCAN-SWA MNEKAMHKTNKNNIISLKGYPSDHAFKAYEEGYYFEAVAVLHGFIEGQMKSLFHLHAITICKTSISDTWDVNDKISYIMLAHVLFVSNLINRNQYDILISFNSVRNELMHRFYLDKYDKDSKGLSKAKLSSCFKPAYNLLYEIMEKADNLM >NC_009441|4364592:4396142|4376211_4377456_+|WP_012025666.1|DBSCAN-SWA MVAVIKTSSSIRGILNYNENKVEIGKAECISAVNYPLKLEKLNFTSKLNRFLKLAELNTNAKRNTVHISLNFDPSENHSKEKLAEIADTYMEKLGFGRQPYLVYQHHDAGHPHCHIVTNNIQRDGKRIDLHLLGIRKSEPARKEIEEMFGLVKAEGRKQKEQFSLNPIDVGRVQYGKAESRKAINSVLNQVLFDYKYSSLPELNAVLNLYYVHADRGSEESRVFKNNGLLYKILDQNSKPIGVPIKASEFYSRPTLKFLEEKFKVNETKKEYCKNHVRNALRQAFYDERMTSVERLSERLKDEAIHTILRKSSEGNLYGITFIDFKAQTVVNESSLSKEFSAKGIQESCAMNILALERKYQKSNSTDSEIFQNLESQEFVKENLVAILLRGEKINDYVSKKFKQKKKRSLYKGI >NC_009441|4364592:4396142|4383608_4384388_-|WP_012025672.1|DBSCAN-SWA MLYIRSNLKLEFMELILLILFFLLMLIFGSYKSKIKGIIGEKKVSSILYFLDKSDYKVINNVIIKTGNISAQIDHIVISSFGVFVIETKNYKGWIVGYENSKYWTQVIYKYKKKFYNPILQNAGHIRALKNYLKGYKDLEYRSIVVFCTKARIKVDSDSDVVNANSLIKTIKKYSSVNLSKTDKENIFQIISTSNLVKSIDQREHINSVKQRINFLDKKTIQEIKCPKCGNKMIQRQGKFGIFLGCKSYPKCNYTQQEF >NC_009441|4364592:4396142|4372087_4372399_-|WP_012025660.1|DBSCAN-SWA MTLSQAIIKCMDYIDTDESMYSIYAKKVNGRFRPDSEALVLKLTIDEMEMKSIEVAEKKCPGFDYFLEIFVLKDFYEDLLKLEEFKSDTKKVERIIYYAEFDA >NC_009441|4364592:4396142|4370907_4371324_+|WP_012025658.1|DBSCAN-SWA MSTLTKPNHMGRKISRIRELKDMKQEALAQAMGTNQQTVSILENSEEIDDEKLKEVAKALGVSVEAIKNFSDEGVINYFNTFSDNSINQGPIGNQNICHFNPLDKLVEVYEENKKLYERLLKSEQDKIEYLEKLLKAK >NC_009441|4364592:4396142|4373149_4373641_-|WP_012025662.1|DBSCAN-SWA MNFLKTIFGSKKPVIQSISVIKYPDRIFFETYYKIVNSYSTRSKEITISEINISDFEIGKTILKHLDLSRTIKNFTKQERVENYEAYKKITGLKSIKAQMKDSVYVSISRQNNQITFYPTINGGTSGQRKGYHFLDEEKIVIEDSEDFQSIGEALKLAFEKCS >NC_009441|4364592:4396142|4382340_4383132_-|WP_012025671.1|DBSCAN-SWA MDQSIKLPHIKFKPTIKQKIDFHPSELNKITVPEESKMRAKKYQKSNELNDGSVILMFEDNIVFGFDFLYNNEKYMVQEINPATIFYSNAVMCHRLLVSKRNQLISGSPKVKGSALENTNPSDFANFFQVSVNMIINLQATVESFANRLIPTDFEFLDANGNEFQPSISHKINTALPLLKGKKVKRKESNYLRQLIEIRNELIHLKPAGDVNSAYKIVYRKLINFKYFEVLQAVKTFVNFYEEGLIEECSCKKEFFYDISVVE >NC_009441|4364592:4396142|4368249_4368813_-|WP_012025654.1|DBSCAN-SWA MESLESLFRSFETGIRSAKAVKPKAYLKSIGLEYSDLRIGFNSGQFHHRKTLKSKERFEELGVITKSDAGVRDNSLTAYTVFGRYGLIFPLLDRDSAIVNYFALRFDLDSPREEYLNRKGIYPAYPHPLTRKLYLAPTVIDCASLMQSRILDQREAVIALHDGELLDEHIEIIKSLNGLESIVIFKR >NC_009441|4364592:4396142|4372448_4373105_-|WP_012025661.1|DBSCAN-SWA MKKFKIILFLMLTIISCQLKNKNESEGKSKKIASEFIKGNKMDETEFWKIIDYSIANSKNDKLEQEKTIVEKLSAYNPEQIIEFEIILRQLIIQADDFKIMGAQKIIEGYVSDDSYLYFRCWLIGKGEEIYKETIRNPDVLSDSISREDEFDFEELLYVSTKAYKIKTGKIEEDATFPRDVAYLKGLDYDFGAPPTKGVDWKEEDLPVTYPKLWRFFN >NC_009441|4364592:4396142|4369175_4369505_-|WP_012025655.1|DBSCAN-SWA METDKIKTLDEFKDFASYHFKLLKPIQDKEGESIREIKFYGYSDMTCLGVNLIRMCLNIIYSDELDNREIYIGSVLELALQLIPRAEIEVLDEIYKMVNEKRETEESTQ >NC_009441|4364592:4396142|4388449_4389292_-|WP_081432677.1|DBSCAN-SWA MGLNVTAMDWRQYDPAIGRFNVIDPLTELAPMHNPYRFGFNNPVYWSDPSGLFENDNQGLAICPTCPNTPAFKPLIDDPNNIYDYDPQTQTASKATELNEVVVQGKSKKSSAVDHANSINDRIGDGADILALTNNKGGSFRLTNNGSYNPRNFSFKYYKSNWIGGSAANIKTFNVSKLIKRGSIATTVILGTIEVGQGVAGDYQNYQNTGYTNGENTAVATAKVGAGIAVGWAAGAATGAAVGSLIPIPIVGTVAGAIVGGVAGYYASETAGNLVEKAYE >NC_009441|4364592:4396142|4374571_4375312_-|WP_012025664.1|DBSCAN-SWA 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MTSDNFKIVSVSSSFIKIEVIDPSLFENQFNIGSYIKIPYKNIENKYVVGVIENYNIKDNNISKGDGIEETISNGPSFVLEVKLTGTMTKFNDSDLFERGGHGIPLPPNNGIELLNEKELNNIYSGKLVENDKFCFSKLVQNVEIDVPVSGNKFFNKHFAIVGSTGSGKSHTVAKILQEALIAKKGSYEGLNNSHIVIFDIHGEYKTAFPQANYIDIQNLVLPYWLLNSEELEELFIETEANDHNQRSAFQEAITSNKKLKSTLDPKLKAKLNYDSPSFFDLNEILIYFKNRNNEQKQKSNTIEWFDLKGEKFIFNEETNHNLFSGILKPVDGATTGTQNARFINFINRLEIKLNDKRLDFLLGDASKKITFIDTIKQFIGYPCKVQNEEGVINKEKSNITIIDLGGIPFEVLSITVSLISRMLFEFGYHSTKLASHEDDCEVPLLLVYEEAHKYVPKSDLVKFRASKNAIERIAKEGRKYGVTLSIVSQRPSEISDTIFSQCNNFVTMRLTNPEDQNYVKKLLPDTLGNLTDSLSTLQSGEALIIGEAIALPSLVKINRCEPEPKSSDIKYFEIWKDPWIDAEIQKVIGLWQK >NC_009441|4364592:4396142|4384961_4385525_+|WP_012025673.1|DBSCAN-SWA MAHKLKLRLFIFFTLLSCSDIISQETKNNSENVKTKMDVFNSKTGIITKYIDTKLSSLKTSYGNAESKIRKVVSGSISAYFYQISKQGKYGESTASIEYTDLIEVIKALKILQPEMEKDIALNPDYLENKFVTADGFEVGYYVSSGKANWYIKLEKHGSDNTLFLNNGNLIEISFTEARSKIDELKK >NC_009441|4364592:4396142|4384605_4384920_+|WP_044047909.1|DBSCAN-SWA MGQFRISGVWKNSDNVITHYAFHTVSENSTSRAVKKTKMEAILLLETSGNSATTWVWNYNQSKWNVGEKVQVINGNSGKYLRSNPDNKLTDNLEHLIDYDWITA >NC_009441|4364592:4396142|4380198_4381395_-|WP_012025669.1|DBSCAN-SWA MDGGYYAIKGFEFQIDKTILEILNTNNENKKISIEQIQDINSSDYVMQIKYKETQDYTPNKIREPIVQLIDEFKKNDQINYNLFCFFKDKSEQKKKITLVELEEILQVTLKSNSSKKLKALKLKIDSYNLADKKNFIKKFNLIFAPNFQIQFEEVISKIRNLGFCKSDDEAIFYYSSITDYFRKLVVNKTDPTNRSCTQKDIINYIKDGRNLVFTSSFIDYKGEVEYLKFLKTNFIKPVKNQENFIFIGNVVQSSELTIGQLIVNLIDKYYDKATYDIKPLTFIVNDKEIFEVKKEMSRSNLFFNDGYESILFNSELFFQKPIINRKTSGGKATESLAKSSFKLRIISKNTFDKNYNNEINPRRVYYFMEDLNNKLEEKSFIKIDQIDTKQVQKLFNT |
36 | Brevibacillus_phage(20.0%) | transposase,integrase | attL 4365850:4365864|attR 4403614:4403628 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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