Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009513 | Lactobacillus reuteri DSM 20016, complete sequence | 0 crisprs | RT,cas14j,cas3,DEDDh,DinG,PrimPol,csa3 | 0 | 0 | 9 | 0 |
1. NC_009513
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
245555 : 307314
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009513|245555:307314|DBSCAN-SWA TATGGCTGAACAAAAACCAACTTATTACATTACAACACCAATTTACTATCCATCTGGTAAACTCCATATTGGTAATTCATACACAACAATTGCATGTGATGCAGAAGCACGTTTTAAGCGTTTGATGGGCTATGACGTATTCTACTTGACAGGAACCGATGAGCATGGCCTTAAGATTGAACAAAAGGCTGAAAAACTCGGCATGAAGCCACAAGAATACGTTGATCAAATGGCTGCCCAAATTAAAGAGCTATGGAAAAAACTTGAAATTACAAATGACAAGTTTATTCGGACAACCGATGACTACCATGAAAAAGCTGTCCAAAAGATTTTTCAACAATTGCTTGACCAAGGGGATATTTACAAGGGCAAGTATACTGGTTGGTACTCAGTTGATGATGAAGAATACTTCACAGAAAGTCAGTTAGCAGAAGTTTACCGTGATGAAGACGGTAATGTGATCGGTGGAAAAGCGCCATCAGGTCATGAAGTTCAATTAGTTGAGGAAGAATCATACTTCTTTAAGATGAGCAAGTATGCTAACTGGTTAATGAACTACTATAAGGAACATCCTGATTTTATCGAACCGCAATCACGGATGAATGAAATGATTAATAACTTCTTAAAGCCAGGACTAGAAGATCTTGCAGTTACGCGGACATCATTTAACTGGGGGGTTAAGGTTCCTAGTGATCCTAAGCACGTGGTATACGTATGGATTGATGCATTATCAAACTATATTACTGCGCTGGGATATGGTAGTGATGATGATAGTCTTTTCAAGAAGTACTGGCCTGCTGATGTTCACATGGTAGGAAAAGAAATTGTTCGTTTCCATACGATTTACTGGCCAATCATGCTTCATGCGCTTGGCTTACCATTGCCAAAACACATCATCGGTCATGGTTGGTTAACAATGCGTGACGGTAAGATGTCGAAATCAAAGGGAAATGTTATTTATCCTGAAACTCTTGTTGATCGCTACGGCCTTGATGCCACACGTTACTACTTATTGCGGGCAATGCCATTTGGTAATGATGGCGTCTTTAGTCCAGAAGACTTTGTTGATAAGGTAAACTATGACCTTGCTAACGATCTAGGAAACTTGCTCAATCGGACTGTTGCGATGATTAATAAGTATCAAAATGGTAAATTAGTTGGCACTAATGATGCAACGACTGATTTTGATGCTGATTTAGAACAAACTGCTAGTGATGTAATTGCTGAGTATAAAGAATTAATGGATAAAACACGGTTTGCTGAAGCATTGGCAACTGTTTGGAAGTTGGTTAGTCGTGCTAACAAGTACATTGATGAAACTGAACCATGGGTACTAGCAAAAGATGATAGTAAGAAGGATGTATTATCAGATGTGATGACCCATCTAGCAAAGAGTTTGTGGATTATTGCAGCCTTAATTCAACCAATTATGCCGCATGCACCAAAGCAAATTGTTGAACAACTTGGGATTGAAGGGACTGACTTATCATTAACTGATCTTCAATTTAATGATTTCCCAGCAGAAGCTCAGGTTGTCGCCAAAGGAACTCCGATCTTCCCACGTTTGGATGTGAAGGCCGAGGTTGAATTTATTAAGAGCAAGATGACAGCAAACGAAAAGAAGAAAGGAAGAAAGGCAATGGCTGAAGCAAAAGAAAAAGCCCAAGAAACAGCACAAGAAGAGAAAACAGATGGCAAAAAGCCAATTCGGATTGATGTCTTTGACAAAGTTGAATTGAAAGTAGCTCAAATCACTGCTGCCGATCATGTAGAAGGTGCTGATAAGCTTCTAAAATTCCACATGGATGATGGAACAGAAGAAGGCCGGCAAATCCTTTCTGGAATTGCCAAATGGTATCCAGACCCTTCTGTTTTAGTAGGTAAGAAAGTTTTGATTGTTGCTAACTTGAAACCACGGAAAATGCGGGGCGAATTAAGCCAAGGAATGCTTTTGTCTGCTGAAAAAGACGGTAATGTTCAAGTAGTAACTGTTCCTGACAATTTAGTACCTGGAATGGGCGTTGAATAAAGTGCATAATCATCAACACCAGCAATTGGTTTATGATTCCCATACCCACCTAAATGACGATGCGTTTTATGATGATGTGCCTGCCTTTATTAACCGTGCTGCTCATTATGGCGTGACGGAGATGAATATTATTGGCTCAAACCAACTATTAAATACCCGTGCCTTAAAGTTGGGACACCAGTATGATAACCTTCATCCAATTATTGGTTGGCATCCAGAAGATATTGCTAATTGGAATAGCGAAACCAAGAAAGAGTTATGCCAACAATTAGCAGATCCCTTAGTTGTAGGAATTGGAGAGATTGGCTTAGATTATTATAATGACGAGCATTCTCCTCACCAGCAACAACAAGAAATTTTTGCTGAACAGCTTGAGTGGGCGCGAGAACTGAAATTACCAGTTTCGATACACTGCCGAGATGCAATGGCTGACACGTATGAAATTTTGCGGAATGCCCACATCGATGAATTTGGCGGTGTTATGCATAGTTTTAATGGGACGCCAGAATGGGCAGAGAAATTTATGGATCTCGGGATGATGATTTCATTTAGTGGTGTCGTAAGTTTCAAAAATGCGACAGAAGTCCATGAAGCCGCGTTAGTTGTTCCCTTGGAAAAGATGATGGTTGAAACAGATGCACCTTACTTAACACCACTCCCATACCGGGGAAAGCAAAATGAACCCGGTTTTACTAAGTTTACGGTGGATGCAATTGCAGATTTAAAGCAGGTTGATGCTGGTAAGGTGGCATATAAAACATTTACGAACGCCCGCCGCTTATTTTTGGAAAATAAAGAAAGAGGCCTATGATTAGAATAAAAGAAGTTATAGTTGTTGAAGGTAAAGATGATACTAAGCAAATTTTAAAAGCGGTTGATGCCGATACCTACGAAACAAATGGGTCTGCAATTTCAACGGCTGACTTGGCGAAGTTGAAAAAGTTACAAGCAAGCCGGGGCCTAATTGTTTTTACTGATCCAGACTTTAACGGGGAGCGGATTAGAAAAATAATCAGTGAAGCCATCCCAGGAGTTAAGCATGCTTTTATTAAACGAAAAGATGGTGTACCAACTGAGGCTCATGGTAGCTTGGGAGTTGAGCATGCAACGCCAGCAGTTATAAAATCAGCTTTGGAGCACCTTTATACCCAAACAACGACACCTCAGCAAGTTTTTAAGCGAGAAGACTTGCAAAAATGGGGATTAACAGGTCAAGCAGATTCACGAAAACGGCGTGAAAAGCTAGGGCAATTACTCGGAATCGGTTATGGAAATGGGAAACAATTGATTCACCGTTTAAACATGTTTCAAGTTGACCGAGCAACATTTGAACAAGCAATTAAGCAAATAAATCAGGAGGAAGATCATGAGTAATTCACCAGAAATTGGTAGTCGAACACGTACCCGCGCGATAATGGAAAAGTACGGGATCCGAACAAAAAAGAGTTTCGGCCAGAATTTCCTTACTGATTTGAACGTCTTAAAAAATATCGTTGAGGCGGCGGATATTACAGCTAATGACAATGTAATTGAAATTGGCCCTGGAATTGGCGCTTTAACGGAGCAATTAGCACAAGCGGCGGGAGAAGTTTTAGCCTTAGAAATTGATCAAGATTTAATTCCGGTATTAAAAGAAGTATTATCACCATATGATGATGTAAAAGTGATTAATCAAGATGTCCTTCAAGCTAATTTACCAGAGTTAATCAAAAAGGAATTTAAGGATCCTAGTCGACCAATTAAGGTGGTTGCTAATCTCCCTTATTACATTACGAGTCCCATTCTAATGAATTTGCTGGCTAGTCCTGTTGAGTGGGCGACGATTTGTGTGATGATGCAAAAGGAAGTTGCTCAACGACTCACGGCTAAACCAGGAACTAAACAATATGGTGCGTTGACATTAGCGATTGAATACCAAATGCAAGCTAAAATTGCTTTTGATGTTTCACGAAAAGTGTTTGTGCCAGCACCTAATGTTGATTCAGCAATTGTGGTATTAACGCCACGGACAAATCCACTTCCAGTTCAGCCTTTTGATAAGCAAAAATTATTTGGCTTTATCCGGGGATGTTTTGCTCATCGTCGCAAGAGTCTTTGGAATAACTTGCAAAGTGTAATTGGTAAGGATCCAGCGGCAAAAGAGAAAATGACGGCCGTTTTAAACCAGCTGGATATTTCGCCGCAAATCCGTCCTGAGAAACTAACCCTCGAACAATTTATTGAACTTGCGAATGCTCTTCACCAGCAAAATCTCTTGTAAAAGATGGTTGACCGTTATAAAACATTATGGTACAATTTTGCTTTTTGTGTAAAAAAAGAGTATGCTAGTCTACAGTGAGGTGAAGGAGTCGTGCCTAATAGCATTGTAGAAATTAAGAAGAAGCTAGATGAACGGATTGGCGAGCATGTTTTAGTAAAAGCACAAGCTGGACGTAAACGTATTACCACCCATCACGGTATTTTGAGTAAGACCTATCCTGCAGTATTTGTTATTCATTTGAATGATGAACAAGGAACATTGGATCGGGTTTCCTATAGTTATACTGATTTGTTAACACGAAATATTTCAATTGCCTTCGATGAAGCAGAATAAACTGATAATTTAAAATTCATATTTATAAAATAATAGGAGTGGGTAAAAATACCTTTCAACAGGAAGGCAGTTTTTATTCACTCCTTTTGCTTTAGGAATAGTTAGGAAACAGTAGTTGCAAGGATTATAGTTCCGTTAGTATAATTTAACTAACTAAATTATTATAAATTAAGGAGGGTTGCCGGATGATAGTTACAGAAAAAGCACCAGCAAAATTGAATTTGAGTTTAGATACGCCGATGCGATATTTTGATGGTTCTCCTCAATGGGATATGGTAATGGTTTCGGCAGACCTGGCTGATTATGTAACTGTTGAGACACACCGGCGCCCTGCAACAATTAAAGTTTATACAAATAGTGGCTTTTTACCCAATGACC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59 | Pseudomonas_phage(15.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
722463 : 742730
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009513|722463:742730|DBSCAN-SWA TATGTTTGAAGATACCACTGGTATGGATTCAGTTCACTGTTCATTTTGTGGAAAGTCCCAAGATGAAGTGAAAAAAATTGTTGCTGGTCCTGGCGTCTATATTTGTAACGAATGTGTTGACCTTTGTAAACAAATTATTGATCAGGAATTAGCAGAAGATGAAGCTAAAAAAGCTTTCCGTGTGCCAACTCCAGGAGAGATTGTTAACGAACTGGATGACTATGTAATTGGTCAAGGTGATGCTAAAAAAACATTAGCAGTTGCTGTTTATAACCACTATAAGCGGGTTAATGCAATGATGAGTGGTGATAATAATGATACAGAACTTCAAAAGAGCAACATTGCCGTAATTGGTCCAACTGGTTCTGGGAAAACCTATCTTGCCCAGTCACTTGCCCGCATTCTCAATGTTCCATTTGCGATTGCAGATGCTACAACTTTAACTGAAGCTGGATACGTTGGTGAAGATGTTGAGAATATTATCCTTAAACTACTTCAGGCTGCTGACTTTGATGTAGAACGTGCTGAAAAAGGAATCATTTACATTGACGAAATTGATAAAATCGCAAAGAAGAGTGAAAATGTATCAATTACACGTGATGTTTCTGGAGAAGGGGTTCAACAAGCTCTTTTAAAGATTCTTGAAGGAACAATTGCTAATGTACCGCCTCAGGGAGGACGTAAGCATCCACAGCAAGAATTTATCCAAGTCGATACAAAGAATATCCTCTTTATTGTGGGGGGAGCCTTTGATGGGATCGAAACAATTGTTAAGGAACGACTTGGTGATAAGACAATTGGATTTGGAACAGACTCACGAGAAGCTGAAGAGGTTACGGATAAAAATATTTTGCAACATGTTATTCCAGAAGACCTTCTTAAGTTTGGCTTGATTCCAGAATTTATCGGACGATTACCTGTGATGACTGCTCTTGAAAAACTTGATGAAGATGACCTTGTTCGAATCCTTACTGAGCCGAAGAATGCATTAGTTAAGCAATATCAAGAGTTAATTCGCCTTGATGGAAGTCAGTTGACCTTTACTGATGGTGCATTACGAGCAATGGCACAACTAGCAATCAAGCGGAATACAGGTGCTCGTGGTCTCCGTTCGATTATTGAAGATGTAATGCGGGATGTAATGTTTGACTTGCCAAGTCGTAAAGATGTAGAAAAGGTAATTATTGATAAACGATGTGTAACGCAACATACAGAACCTCGTTACGTTTTAAAGGATGAAAAAGCTTCTTAATGAAATGAGGTAAGCAAATGGAAGTTCACAATGTAGATTTAACAATCAGTGCCGTAAGTGATGAACAATATCCTAAAACAAATATTCCAGAAATTGCTTTAGTTGGTCGTTCAAATGTTGGGAAGTCATCGTTGACAAATGTCTTAATCAACCGGCGCAATTTTGCTCATACGTCTAGTCAGCCAGGTAAAACCCAGACGTTAAATTTCTATGACGTTGAGGATAAGGTATATTTTGTCGATGTTCCAGGATATGGGTATGCCAAAGTCTCGAAAAAAGAGCGAGAACGATTTGGAAAAATGATCGAACAATACTTAACCCAACGTGAACAATTACGCGGAGTTATTCAATTAGTTGATGCACGGCATGAACCAACCCCTGATGATGTAAATATGTATAATTGGTTACAATATTATAATATTCCAACATTAATCGTAGGGACAAAGATTGATAAGGTAAAACGAAGTGCATGGAATCGCCAACTAAGCCTTATCAAAAAGACCCTTGATGTTGAGAGTTCAACACCGATTATTCTATTTTCAGCTACAGAGAAAAAGGGTAAAGATGATGTTTGGCAGTGGATTGAAGAGCGAATGGGGAAGAACTAAGTTGGATTTTAATGAATACCAAAATGCAGCAAAACGAACCTTATATGGGAATGAACAAGTTTTAACAAATTGTGCATTAGGATTAGCTGGTGAGTCAGGACAAGTCGTTGATTTAGTAAAAAACTATACTTTTCGTAGTCGAAAATTAGATCGTAAGGAACTAATCCACGAAATGGGTGATGTCTTATGGTATTTATCTCAGATTGCAGAATGGGCCGATATTCCATTTGAAGAGGTTGCCAAAGCAAATATTGAGGAATTAAATCAGCGCTATCCGACTGGTTTTAAAAAACAAGATTAAAAAAATAAGCGGGGGTATGAGTGATCACATCTCCGCTTTTGCATTATTTCTTTTCTTTATCTTTACTATCTTTTTCTTTTTTATCGTCATTTTTTTTAGTTGCTTTTGGTTTTTTAGGATCAATCGCAAATTGATCAAATAATTTATCAAGCTGTTCGCTTCTTCTAGTAACTAATCCCATTTTTTTAGCTCCTTTTTTATATTTGACAAAATGCTAGCATAAATTTTGCTAAATGTACAATTATTTCTAAACACTTTCTTTGCCTTAATGATGATTTTTCAGATATAATATATTGTTAGATAATTTTTCGGAGGGATTTTGCGATGGCCAGTGAACATTTAGAACATAAACTAGCATTGTTACCTGACAAGCCAGGTTGCTACCTGATGAAAAACATTAATGATCAGATAATTTATGTTGGTAAAGCTAAAAATTTGAAGAATCGGGTTCGCTCTTACTTTAAGAGTAGTCACACCGGTAAAGTAGCTAAAATGGTTTCGGAAGTTGCAGACTTTGAAACCATTGTAACTTCGACTAATAAAGAGTCGTTCTTACTCGAAATAACGCTGATTCAAAAACATCAACCTTATTTCAATATCAAATTAAAAAAGGGAACTGGTTATCCCTACATAAAAATAACAAATGAGCGAGATCCTCAAATTAAGATCGTTAGTAAAATAAAAAAAGATGGTGGATATTATTTTGGCCCTTATCCAAATGTCTATGCTGCGGAGGAAACGATGCATTTTATTCAAAAGGTTTACCCATTAAGACGATGTAATGGGTACCAAGGCCGTCCGTGTTTGTATTACCATATGGGACAATGTTTAGGAGCTTGTTTTAAAGAAGTTCCTAAGAGTGACTACGAAGAGCAAATTAAGAAAATTAAGTCATTTTTGAGTGGAAACACAGCGACAGTTAAGCGACAGTTAACCAAAAAGATGCAACGAGCAGCAGAAAATATGGAGTTTGAACGAGCGGCTGAAATTCGAGACCAGCTTCACTATATTGAAGTAACGGTTGAAAAACAAAAGATTATTTCAAATGATAAGACCCCTCGTGATTTGTTTAATTTCTATATGGATAAAGGGTGGCTTTCTATTCAAATTTTCTTTATCCGACAAGCACGGTTAATGAAACGAGAAAAACGTCTATTTCCAATCGTGGATACGGCAGTCGAAGAAATGACCAGCTTTATTCTTCAATTTTATAATCGTCGTAATAATATTTTGCCGCATGAAATTCTCCTTCCCAAGGGTCTCCCTAATAAAGAAATAAGTGAAATACTAGGGGTGCCGGTTCGGACACCTGTTCGGGGAGAAAAACGAGATCTCTTAGCAATGGCACATGAAAATGCTCAGTTGTCCTTAGATGAAAAATTTCGACTGCTTGAGATGGACCAAAGTAAGACTACCGGTGCGATGAAAGAGATTACGGATGCCCTTGGACTTCCAGAAGGTCACCGGATTGAAGCATTTGATCATTCTCATATTCAGGGGGCTGACCCCGTCAGTGCAATGGTTGTATTTATTAATGGAGAACCGGCTAAAAATTTTTACCGGAAGTATAAATTGAAAACGGTGATTAATCATGCTGACGAAGCTGCCAGTACCCGTGAAGTTATTCGGCGGAGGTATTCGCGTCTCTTAAAAGAGAATAAGCCAATGCCGGATATGATTTTTATGGATGGTGGCGAAATTCAGATGGATGCGGCTAAAGATGTTTTAGAGAATGAACTTGGTCTCGAGATTCCGGTAGTAGGGATGGTAAAGAATGATAAACACCAAACCGCTGACTTATTGTTCGGGGATGATGATCACCATATTAATTTGAATCCACGGAGCCAAGGCTTTTACTTAGTTCAACGCATTCAAGATGAGGTTCACCGGTTTGCGATTACTTTCCACCGGCGCGTTCATACTAAGCATTCGTTGAGCTCGCGTTTGGATGAAATTAAGGGAGTGGGACCCCGAACTCGAACAAAATTGCTTAAAAAATATGGATCAATTACCAAAATTGCTCAAGCCTCAGTTGATGAAATCCATTCACTAGGAATTAATCGACCTACCGCCCAGTTAATCAAGGTTTCATTGCAGAAAAATGCTGAGGTGGCGAAGGGTAGTAGTCATGATTGAGTTTTGACAGGCTTATAAATTTTAAATATACTAAATAATAGACTAAAGAACGGAGACAATCATTATGAATATGTTTGTTGATCAAATAAAAATTGAAGTACATGCAGGTAAGGGTGGCGATGGAATGGTAGCATTTCGTCGTGAAAAATATGTTCCTAACGGGGGCCCAGCTGGTGGCGATGGTGGCCGTGGCGGTAGTATCATTTTAAAAGTTGATGAAGGATTACGGACATTAATGGATTTCCGTTATCACCGAATTTTTAAAGCTAAAAACGGTGGCAATGGGATGAGTAAACAGATGACTGGGCCAAGTGCAGAAGATACAATTATTGCTGTTCCCCAAGGTACCACTGTTAGGGATCTTGATACTGGCAAGATTATTGGTGATCTCGTTGAAAAAGACCAAGAATTAGTAGTTGCCAAAGGTGGCCGTGGTGGTCGCGGCAACATTCACTTTGCTAGTGCTAAAAACCCTGCTCCTGAAATTGCTGAAAATGGTGAACCAGGAGAAGACCATTACTTAGAATTAGAATTAAAGATGCTTGCTGATGTCGGATTAATTGGGTTCCCTTCTGTTGGAAAGTCAACTTTATTATCAGTAGTAACCGGTGCTAAGCCTAAAATTGCTGCATATGAATTTACGACATTAACTCCTAATCTCGGAATGGTAATGCTACCAGATGGCCGTGATTTTGCGATGGCT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23 | Staphylococcus_phage(27.27%) | head,portal,capsid,protease,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
772673 : 781877
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009513|772673:781877|DBSCAN-SWA TATGGCAAGTAATAAGATTATTGGTATTGATTTAGGTACTACTAACTCTGCGGTTGCTGTTATGGAAGGTAATGAACCTAAGATTATCACCAACCCAGAAGGAAGTCGGACAACACCATCTGTTGTTTCATTTAAGAATGGTGAAACTCAAGTTGGGGAAGTAGCAAAGCGTCAAGCAATTACTAATCCTAACACTATTTCATCAATCAAGAGTCACATGGGTGAAGCAGGATACACTGTTGAAGTTGATGGTAAGAAATATACTCCACAAGAAATTTCAGCAATGATTTTGCAATACCTTAAGAAATATGCTGAAGACTACATTGGTGATACTGTTACTCAAGCAGTTATCACTGTTCCTGCATACTTCAACGATGCTCAACGTCAAGCTACTAAGGATGCCGGTAAAATTGCGGGCCTTGATGTAAAGCGGATTATTAACGAACCTACTGCTTCATCCCTAGCATACGGTCTTGACAAAAAGGACAAAGATGAAAAGATCCTTGTTTATGACCTTGGTGGTGGTACATTCGATGTTTCCATTCTTGAATTAGGTGACGGTGTCTTCCAAGTTCTCTCTACTAATGGTGATACTCATTTAGGTGGGGATGACTTTGACCAAAAGATTATGGATTGGTTAATCGATGGCTTTAAGGAAGAACACGGTGTTGATCTTTCTCAAGATAAGATGGCGCTTCAACGTTTGAAGGATGCTGCTGAAAAGGCTAAGAAGGACTTGTCTGGTGTTCAAGAAGCACAAATCAGCTTACCATTTATTTCAGCTGGTGAAAACGGCCCATTACACTTGGAAAAGACATTAAGTCGGGCACAATTTAACCAATTAACTAACGATTTGGTTGAGCGGACAAAGCAACCGGTATTGAATGCTTTGAAAGATGCTGATCTTACTTTTGATGACATTGATGAAGTTATCTTAAATGGTGGATCTACTCGTATTCCTGCCGTTCAAGAAATGGTTAAGGAATTAACTGGTAAGGAACCTAACCACTCAATTAATCCTGACGAAGCCGTTGCTCTTGGTGCAGCTATTCAAGGTGGGGTTCTTACTGGTGATGTTAAGGATGTCGTATTACTTGATGTTACTCCACTTTCACTTGGTATTGAAACCATGGGTGGTGTCTTCACTAAGTTGATTGACCGTAACACAACTATTCCTACTTCAAAGAGCCAAATCTTCTCAACTGCTGCTGATAACCAACCAGCTGTTGACATTCACGTTCTTCAAGGTGAACGTCCAATGGCAGCAGATAATAAGACTTTGGGTAACTTCCAACTAACTGATATTCCTGCTGCTCCTCGTGGTGTTCCTCAAATCAAAGTTACATTTGATATCGATAAGAACGGTATTGTTAATGTTTCTGCTGAAGATCAAGGAACTCATAAGAAGCAAAACATCACTATCAAGTCTAACTCAGGCTTAAGTGATGAAGAAATTGAACGGATGAAGAAGGATGCTGAAGAGCATGCTGAAGCCGACAAGAAGAAGAAGGAAGAAGTTGACTTGAAGAATGAAGTTGACCAAGAACTCTTCCAAGTTGATAAGACTTTGAAGGAAGTTAAGGGTAAAGTTCCTGAAGATGATATCAAGAAGGCTGAAAGTGCTCGTGACGAATTAAAGAAGGCTAAAGAAAGCGGCAACCTTGATGAAATGAAAGCTAAGAAGGATGCTTTGAACAAAGTTATTCAAGACCTTAGCGTAAAGCTTTACCAACAAGCTCAAGGTGCACAAGGTGGCGCTGCTAATGGTCAACCTGGTGATAGCCAACAAAATGGTAATGACAACGGTAATGATGACAATACTGTTGATGGTGATTTTAAGGACGTTACACCAGACGACAAGAAATAGCCTGCGGTAAACAGTCTTAAAATGTTAGTGTAAAAGCCAAAGGCCAGAAAAAAGGACTTTGGCTTTTACTTTCGTTTGCTGGCTGTGGTATAACTAAACAAGCAATAAAGTAATGAGGTATTTATTATATGGCAGAACAAGATTATTATGACATTTTAGGTGTCTCTAAGGATGCATCCGAAAAAGACATCAAGCGTGCATATCGTCGGCTTGCGGCAAAATACCACCCAGATGTTAACCACGAGCCTGGTGCAGAAGAAAAGTTTAAGAAGATTAATGAAGCATATGAGACATTGAGTGATAGTCAAAAACGTGCTCAATATGATCAATTTGGTTCAGCTGGCCCACAAGGTGCTGGCGGTCAAGGCTTTGGCGGCTTTGGTGGTGGTCAAGCTTATTCTAACTTTGGTGGCGGCTTTGACGACATCTTTAGTCAATTCTTTGGCGGCGGCGGTCGTACTCGTCGGGACCCAACAGCCCCGCGTCAAGGGCGTGATTTACAATATGCAATGACTCTTGATTTTATGGATGCGGTTTTTGGTAAAACAACTACTATCAAGTATGACCGTGATGCAGAATGTAAGACTTGTCATGGAACCGGAGCTAAGCCTGGCAAATCGCCAATAACTTGTCCACGGTGTCATGGTGCCGGAGTGATTACGAGCGTTCGTCAAACACCGCTAGGCAATATGCAAACTCAAACTACTTGTCCAGAATGTAATGGAACTGGAAAGATTATTAAGCCCGAAGATCGTTGTGATACTTGCCATGGTGCAGGACATGTTCACGAACGTCATGAGCTAGAAGTGAAGGTGCCTGCCGGAGTTGATGATGGTCAACAAATGCGGCTCCAACACCAAGGAGACGCTGGTGAGAACGGTGGCCCAGCCGGAGATTTGTATATTGTCTTCCGGGTAACACCAAGTCGAGAATTCCGTCGCGATGGTTCAACAATTTATGTTGATCGTGATATTTCGTTTGCTCAAGCAGCCTTGGGAGACGAAGTAAAAGTTAAAACGGTTCATGGTGATGTCAACCTTAAAATTCCTGCTGGAACACAATCAGAAACTAATTTCCGCTTGCGTGGCAAGGGTGTTCCACACCTTAACGGTAATGGTAACGGGGATGAACATGTTACTGTCCATGTTAAGACACCTAAGAGCCTTAACAAACGTCAACGTGAAGCAATGTTAGCTTTTGCGGCTGCTAGTGGTGAAGATGTTAAGGGTGTGAAGAAGACAGTTCTTGATAAGTTACGTGATGCCTTTGAGGATAAGTAAATAATTTTTATGAAGCAGGAAAAGCTTAATATTTTTCCTGCTTTTTGTATATCTAGTAGAAGGTTTCCCATTCTAAACGAGGATTTGGTATACTAGATAAAGAATATTCGTTGAAAGTGAGTCTTTTTAAATGAACCTAGAAGAAATGAAAGAGCGGCAAAAACACATTCGGAATTTCTCGATTGTTGCCCACATTGACCATGGAAAATCAACGCTTGCTGATCGTATTTTAGAAATGACTGATTCAATCAGCAAACGTGAAATGAAAAATCAGATTCTTGATGATATGCCTCTAGAACGAGAACGGGGCATTACAATCAAATTAAATGCTGTTGCCTTGACGTATCATGCTAAAGATGGTGAAGATTACATTTTCCATTTAATCGATACACCAGGCCACGTCGATTTTTCTTATGAAGTATCACGGTCTCTTGCTGCCTGTGAAGGTGCCGTCTTAGTAGTCGATGCAACGCAAGGAGTAGAAGCGCAGACGCTTGCTAATGTCTTTTTAGCGCTTGACAATGACCTTGAAATTTTACCTGTTATCAATAAGATAGATTTACCTTCTGCTGATCCTGAGGGTACTAAGAAGCAGATTGAAGATGAAATTGGTTTAGATCCTGATGAGGCAGTTGATATTAGTGCTAAGACTGGAATGGGCGTTGATGAAGTCCTGGAAAAAATCGTTAAGGATGTTCCAGCACCAACAGGAGATTTAACTGCGCCTTTGAAAGCTCTTATCTTTGATTCAAAGTATGATGATTATCGTGGAGTTGTCCTTAGTGTCCGGGTTGTTGAAGGAACTGTAAAAAAAGGTGACCGAATTAAATTAATGAACGGTGGTACCGAATATGAGGTAGCAGAAGTAGGAATTAACTCTCCTAAACCATTGGCCCGTGATGTGTTAATGGCTGGGGATGTAGGTTACATTACGGCGGCAATTAAAGACATTAAAGATACCCGGGTTGGTGACACGGTCACAAGTGCGGATAATCCTACAGATAAGCCGTTAGAAGGATATCGGCAAATGACGCCAATGGTATATGCTGGACTCTATCCAACCGATAATGCTAAATTTAATGATTTACGTGATGCGTTGGAAAAGCTTCAACTTAATGATGCAGCATTAACCTTCGAACCGGAATCATCGCAAGCATTGGGATTTGGGTTCCGTTGTGGTTTCTTAGGGTTACTTCACATGGATGTTATTCAAGAACGACTTGAACGTGAATTTAATCTTGATTTAATCACGACTGCACCATCAGTTACTTATCATGTTGAATTAGCAGATGGGACAACAAAGGAAGTGGAAAATCCGGCTGAAATGCCGGACGCTTCTTCCATTAAAGCGATTAAGGAACCGTATGTCCGCGCCTCAATCATGGTCCCCAATGATTATGTTGGCCCAGTAATGGAACTTTGCCAACGGAAACGGGGAGACTTTGATACGATGGAATATCTAAGCGATACCCGGGTAAACGTTATTTATCATATTCCGTTGTCAGAAATTATTTTTGACTTCTTTGATAAGTTAAAAAGTTCTACACGAGGATACGCTTCCTTAGATTATGAAATTGATGGCTACCGTCCAAGTAATTTGGTTAAGATTGACATCTTGCTTAATGGCGATAAGGTGGATGCATTAAGCTTTATTGCTCACCGTGACTTTGCGGCAGAACGTGGTCGAGAAATTACTGCTAAATTAAAGAAGATCATTCCACGGCAAAACTTTGAAATTCCAATTCAAGCAGCAATCGGTTCTAAGATTATTGCCCGGACTAATATTAAAGCCTACCGGAAAGATGTTACTGCCCGTATTCATACCGGGGATCCAGACCGGCGTGCCAAATTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009513|772673:781877|780794_781253_-|WP_003668160.1|DBSCAN-SWA MKFKNIIALSLLGICGGTVTTSLANNNYVYAASTNDDYPDITSKFDVNNMNQYDDSDLFTDVSIKKFYVQSISYDKHHNERIIFTNTPESTNYYFTVLQGRKHKKRIAVGDPITIKGQLNGRLEIEKTQANSWFAKKYFGKNAIMVLTDSYK >NC_009513|772673:781877|777935_779096_-|WP_003668165.1|integrase|DBSCAN-SWA MNGNVRKRGKKWYYRFDIADKDGKRRQYERVGGDSYKEAMHRLRVALELYENTGAVTNTDKISTHDYFEFWYDNYVKTNLSKNTQLNYRHVLDKYVQPTLGIYQLSKVTPELIQKTINKIADSTEYKPDHSRLHGHTVEIILMVIKEGFRQAVHPWHILTQSPAEYVRQPKYNHPKTTREDLKIITLQQFNQLLEQFPLGHPFHLPLLISFYTGMRRGEVAGLEWDNVSLPDAEINVTQQMKQYSKTDVRLGKLKTAASYRTIAIGDQLIHALKVQRRLQNENRLRYGKNYHESNFVCTKENGKPVTPNSIKYYASTVTKELGFPFNFHSLRHTHATMLLEAGASAKEVQVRLGHNKIATTLDTYVHLSNKKKHQTANLLDQIAKM >NC_009513|772673:781877|779958_780195_+|WP_003668162.1|DBSCAN-SWA MTPLNKNIIIVNDKKDIDNITELESFYSEFPTDSNIGIDELKTLMTGKALIDVSDGEYIHWLQLDKHALRFAKTILEK >NC_009513|772673:781877|781715_781877_-|WP_080502980.1|DBSCAN-SWA MGRNSICDYLKGKYEAKQDKLHSLVKALNVDEGWLMGYNINQEKIAILKCQLI >NC_009513|772673:781877|775949_777785_+|WP_003668167.1|DBSCAN-SWA MNLEEMKERQKHIRNFSIVAHIDHGKSTLADRILEMTDSISKREMKNQILDDMPLERERGITIKLNAVALTYHAKDGEDYIFHLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGAVLVVDATQGVEAQTLANVFLALDNDLEILPVINKIDLPSADPEGTKKQIEDEIGLDPDEAVDISAKTGMGVDEVLEKIVKDVPAPTGDLTAPLKALIFDSKYDDYRGVVLSVRVVEGTVKKGDRIKLMNGGTEYEVAEVGINSPKPLARDVLMAGDVGYITAAIKDIKDTRVGDTVTSADNPTDKPLEGYRQMTPMVYAGLYPTDNAKFNDLRDALEKLQLNDAALTFEPESSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNLDLITTAPSVTYHVELADGTTKEVENPAEMPDASSIKAIKEPYVRASIMVPNDYVGPVMELCQRKRGDFDTMEYLSDTRVNVIYHIPLSEIIFDFFDKLKSSTRGYASLDYEIDGYRPSNLVKIDILLNGDKVDALSFIAHRDFAAERGREITAKLKKIIPRQNFEIPIQAAIGSKIIARTNIKAYRKDVTARIHTGDPDRRAKLLDKQKRGKKRMKAVGKVDIPQAAFMAVLKTDEQLDEK >NC_009513|772673:781877|774667_775819_+|WP_003665811.1|DBSCAN-SWA MAEQDYYDILGVSKDASEKDIKRAYRRLAAKYHPDVNHEPGAEEKFKKINEAYETLSDSQKRAQYDQFGSAGPQGAGGQGFGGFGGGQAYSNFGGGFDDIFSQFFGGGGRTRRDPTAPRQGRDLQYAMTLDFMDAVFGKTTTIKYDRDAECKTCHGTGAKPGKSPITCPRCHGAGVITSVRQTPLGNMQTQTTCPECNGTGKIIKPEDRCDTCHGAGHVHERHELEVKVPAGVDDGQQMRLQHQGDAGENGGPAGDLYIVFRVTPSREFRRDGSTIYVDRDISFAQAALGDEVKVKTVHGDVNLKIPAGTQSETNFRLRGKGVPHLNGNGNGDEHVTVHVKTPKSLNKRQREAMLAFAAASGEDVKGVKKTVLDKLRDAFEDK >NC_009513|772673:781877|779219_779954_-|WP_003668163.1|DBSCAN-SWA MVNRKIRRSQSEYYDAFIEQLKFLNYAAKLYDSGERTAIKMATPQLRTLFYQQSYGDILINLIPEVNKDQFLSTCQFGEKPIIYGGSVTNAFVAGKYVYLPSCYEKNLEIGHYISFEHWWNGRILIASDTSFTRKELVRFIVNKDGGAHIDPELNEKYYNLKNDIYSLQATKMPNMPGIPFKELHLALLRQVVHETLMSFKKMNFIKDYDPGKNCFNMKNNIFPLHVTQMTINEGKSATPTIYY >NC_009513|772673:781877|772673_774539_+|WP_003668169.1|DBSCAN-SWA MASNKIIGIDLGTTNSAVAVMEGNEPKIITNPEGSRTTPSVVSFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTISSIKSHMGEAGYTVEVDGKKYTPQEISAMILQYLKKYAEDYIGDTVTQAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLDVKRIINEPTASSLAYGLDKKDKDEKILVYDLGGGTFDVSILELGDGVFQVLSTNGDTHLGGDDFDQKIMDWLIDGFKEEHGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVQEAQISLPFISAGENGPLHLEKTLSRAQFNQLTNDLVERTKQPVLNALKDADLTFDDIDEVILNGGSTRIPAVQEMVKELTGKEPNHSINPDEAVALGAAIQGGVLTGDVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIDRNTTIPTSKSQIFSTAADNQPAVDIHVLQGERPMAADNKTLGNFQLTDIPAAPRGVPQIKVTFDIDKNGIVNVSAEDQGTHKKQNITIKSNSGLSDEEIERMKKDAEEHAEADKKKKEEVDLKNEVDQELFQVDKTLKEVKGKVPEDDIKKAESARDELKKAKESGNLDEMKAKKDALNKVIQDLSVKLYQQAQGAQGGAANGQPGDSQQNGNDNGNDDNTVDGDFKDVTPDDKK >NC_009513|772673:781877|780246_780696_-|WP_003668161.1|DBSCAN-SWA MNKGFKIMLAVGLAGVSLATTTVVVNTNSSNITVVQASKRSRINKAVSIMQEEYGDSADVYYDKENDVIAIKPTDEEFEDEMIAVLDGDESEHDWNKLTKSIDDLSETIYDDCHIKTPIAIVNPENTDKVLYMSYDGESLYDVMHDDNN |
9 | Lactobacillus_phage(28.57%) | integrase | attL 766168:766182|attR 779931:779945 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
838235 : 846300
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009513|838235:846300|DBSCAN-SWA CATGGCAAACAAAGCAGAATTAGTAAGCAATGTTGCTACTGCAACTGGCTTAACCAAGAAGGATGCTACTGCAGCTGTAGATGCTGTTTTCAGTTCAATTCAAGCATCTTTAGCTAAGGGTGAAAAGGTTCAATTGATCGGCTTCGGTAACTTCGAAGTACGTCAACGTGCTGCACGTAAGGGCCGCAACCCACAAACTGGAGAAGAAATCAACATTCCTGCAAGCAAGGTACCAGCATTCAAGCCTGGTAAAGCTTTAAAGGACGCTGTTAAGTAATTAACAGTTAAATGTTAAAAAGAGACTAGGAAAGAATTTATCCTTCCCAGTCTTTTTTCTTTTTAAAGACTTGTTCAATGCTTAAAATCATCGATTGTGATATATTTAAAAGTGATAGTAAAAGGAGGGCATAATATGACCTACTCAGAACAAATGCTTGATCAATTAGAAGCAGGAAAGTTAAAAGAAGCCCAAAACTCATTTAAACTCGCACTAATTAATGATGATGATGATATGTTATTTAGCCTTGCAGAAGAATTATATGCATTAGGCTTTCTTCAACAGGCACGAACGATTTACTTAAAATTATTAGATCGTTATCCAGATGAAGACGAATTAAAGACTAATTTAGCGACGATTGCAATTGATGAAGGACATAATGACGAAGCTTTATCATACTTAGCCCAGATTAAACCAGACTCGCCAGCTTATGTTCAATCATTACTGGTTGCTGCGGATTTATATCAGACTGAAGAAGAATTTGAAGTGACGGAGGAAAAGTTAAAAGAAGCTTACGCCTTGGCTCCCGATGAACCAGCTGTTGAATTTGCGCTCGGTGAATTTTACTTTATGGTTGGCCAATATTCTGAAGCAATCCAATATTACTTTCAACTAATTAAAAATGGATATACTGACTTTGCGAAAGTTGATATTGCGGGACGTCTAGGGATTTGTTACGCTCAGAGCGGTCAGTTTAAGAAGGCTTTAGGGTACTTCAATCAGGTTAAACCGGAATACCAGACTAGTGATATTCGTTTCCAAAAGGGATTGACCCAACTTCAATTAGGAGATACTGAAAAGGCAATAAAGACTTTAGAGGATCTTATCAACGATGATAACCAATATGCATCCGCTTATCCTGAACTAGCAAAGGCGTATGAAAAGGAAAATAAGTATCAGCAAGCATTACGGGTTGTCCAAGAAGGGCTCAGTGTTGATCAATACAATGAATACCTTTATTCATTAGCAGCTGAAATTACCAGCCACCTTGGCGATCAAAAGTTAATGAAGAAATACTTGGTAAAGGCGCATGAACTTGCTCCAGAGAATATGACGATTACTTTGCAATATAGTAATTTCTTGCTTCACCAACACGATGATGAGGCAAATATTAAACTCCTGAGTCCATTGGTAAAAGAAGATGAAACAGATCCACAATTATATTGGAATCTAACGCGGTCATATCAACGAACTGATCAGCTTGAATTAGCCGGAAAATATTATGAAGCTGCTTTGCCGGCATACAGTGAAAATCCAACATTCTTAAAAGAATTAATTAATTACTACCGCGAAACTGGTGAAACTGATAAGTTAATGGATGAATTGGAACACTATCTTCGGTTAGTCCCAACAGACACTGAAATGCAAGATCTTTATGACCAATATGAAGATTACAAATAATTTTTAATTTAAATGAGACAGGAAACGTTAACGATTTTAACCGTTCTTTACGCTTCCTGTCTCTTTTTAGTAGTAACTTAATTTGTTATAATCAACTTTGATTATCAAAATGAGGACATGATTAAATGAAAATAAAACAATTACCAGCTATATTTGAACCAGCACGACCTGTCTTACAAAAAATAGAGGAGGCTGGCTACGAAGCATATTTTGTTGGCGGTTGTGTCCGTGACACTATCTTGCATGATGAGATTCATGATATAGATATAGCGACGAGTGCTTACCCTAGTGAAATAAAGGCGATTTTTAACCATACTGTTGATACCGGAATTGAACATGGTACAGTTATGATTCTCGACCATGGAACGGGATATGAAACAACTACTTTTAGAACCGAGTCAGGTTACCAAGACTACCGCCGTCCTGATAAAGTAACTTTTGTTCGTTCATTAAGTGAAGATCTCCAGCGTCGAGACTTCACAATCAACGCCCTCGCCTTACGTGAAGATGGGGAAGTTATTGATCTATTTGACGGACTAGAAGACCTGCAAAAACATCTTATTAAAGCGGTTGGCAACCCTAATGAACGTTTTCATGAAGATGCTTTACGGATGATGCGGGCCGTGCGTTTTGCAAGTAAGCTTGATTTTGTCATTGATACTGCAACGTTAAAAGGAATCAAAGAAAATGCACCATTATTAGAAAAAATTGCAGTTGAACGAATCCGGGTTGAGTTAGAAAAACTATTGTTGGGTCAAAATCCAGTAGCGGGCTTAAAAGATTTTATTGCGACTGGATTGTATCAATATTGTCCAGGGTTGGAAAATGCTCAAGCTGCTTTATCGGCTTTATTAATCCTTAACCAATGGCATTTGGAAAATGAGGCTCAATTATGGTCAGTTTTAGGCTTACAACTCCAGCTTGATCAAAAAGAAATTGGTAAATTCTTAAAGAAGTGGAAGACAGCAAATGATTTAATTGCACAGGTCAAAAAAGTAGTTCCAGCAGTCCAAGCAATTCGTCAACGTGCGCTTACACCAACACTAATGTTTAATACCGGTGAAACAGCCCTCCATGATGCTAACCAAGTAGCTAAGTTATATGGATGGGCAATTGATGATGAAGAATTGCAAAAAGCTTATCAAAAGTTACCAATTAAAAACGCTAAAGAATTAGCAATTGATGGTCGAGTATTAATTACCAAAGCGGGGGTAAAACCAGGACCATTGATGGGGAAGATTCTTCAGCAATTAACGCTGGCAGTGGTAAATGGTGAGATAGCTAACAATGCAACAGTCTTATTAGAAAAAGTAGAAGAGATAACGAAAGAGGGATAATATGCAAACAATGCGTGCAGAGGGTCTAACCAGCACATACGGTGAGAAGACCTTATTTGATGATATTTCGTTTATTATCAATGAAAATGATCGAATTGGACTGATTGGTGTTAATGGAAGTGGAAAAACCAGTCTTCTTAACGTAATTAGTGGGGAAGTAAATCCAGAAGGCGGCGGGCAGATCACTAAGCCTAATGATTACACGATCGGTTATTTAAAACAGCAGCCTGAACTTGATGAAAATAAAACAATCATGGAAGCTGTTTTTGAAGGTAAACAACCAGTCTTTGAAACAATTCGTCAATATGAGCTGGCTCTTGAACGTTTTACAAAGCATCCAGAAGATCCACAAGCAATCGACCGTTACACAAAAATGCAGGCACGGATGGACCAAGAAGATGCATGGGAGGCAGATAGTCGGGTGAAGACGATTCTGACCCAGTTAAAGATAAAAGATGTAAGTCAAAAGATTGCTCAACTTTCTGGAGGACAAAAGAAACGGGTTGGGTTAGCGCAAGTCTTAATTCAACAGCCAGACCTCTTATTGCTCGATGAACCGACTAACCACTTAGACCTTGATTCGGTAGTTTGGCTCCAGGATTTCCTTCGCAGTTATAAGGGTGCTGTCCTCGTTGTTACCCATGATCGGTACTTCCTTGATCAAATTACAAATCATATCTGGGAGCTATCTTTTGGTAAACTTTATCACTACGAGGGAAATTATCAGGACTTTGTAGCAAAAAAGGCGGAACGAGTAGAGTTAGCTAAAGATACTGAGAAAAAGAATCAACAGCTGTATAAAAAAGAATTAGCCTGGATGCGGACAGGTGCAAAAGCCCGTTCTACAAAACAAAAGGGACGGATCAATCGGTTCCACGAATTAGAAGGAAAAATCGGTAATCTTAAAACCGATGAAGATATTGCTATCAATCTTGGATCACAACGTCTAGGGAAAGATGTTATTCAATTTAAGGATGCTAACTTAAAATTTGATAATCACCAAATCCTCCATGACTTCAATTGGCTTGTTCAGGCAGGCGATCGAATTGGAATTACTGGTGAAAACGGAGCGGGTAAGACGAGTTTATTAAATGTGATTGCCCAACGTGTTCCCCTAGATAGTGGTGTCCTTAAGATTGGGGAAACCGTTAAGTTAGGGTATTATACCCAGCAAACAGAAGGAATTGACAATGATAAGCGGATGATTAGTTTCTTGTCTGAAATTGCTGATAATGTTACTGATAAAGATGGCAATAAGCTCAGCGTTACCCAATTATTAGAACGCTTCTTATTCCCTCGTTTTATGCATGGTACTTTGATCCGAAAACTTTCTGGGGGTGAAAAGCGGCGATTATACCTCTTAAAGATCTTAATGCAGCAGCCCAATGTCTTATTACTAGATGAGCCAACTAACGACCTTGATATTGGAACATTGACAGTTCTTGAAGATTACCTAGATAATTTTGCGGGAACTGTAATTACGGTTTCTCATGATCGCTATTTCTTAGATAAAGTGGCTGACAACTTGCTAGTCTTCAACGGGAATGGAGATATTGAGCGTTATACGGGACGCTTTACTGATTATCTAACTGCTAAAAAGGAAGAGGCAGATAAGGATAAAGGGCTTAAAAATGATCAAAAAGCCCTTGCCAAAAAGCAGGTAAATAAGCAAGAACCAGCTAAGAAAGAAAAAACAAAACTTACTTATGCTGAACAACTTGAGTGGGATCATATTGATGAAGAATTAGATGCCCTTGATCAACAGCATCAGCAATTAGAAAATGAAATGGCTGAAGCAGCAAGCGATTATACGAAAATTGCTAAGTTACAGAAGCAGCTAAATGAAATACAAGAAAAAATTGATGAAAAGACAGCTCGTTGGGAGTATTTAAGCACATACGTTGACGAGTAAAGGAAGGGACAAATAAGGATGGCAACAAATGTAAATGAAGAGCAATACTTAGACTTAATCCGTTATGTTTTGGCGAATGGACATCAAAAGGGTGATCGGACAGGAACAGGTACTAAATCTGTTTTCGGATATCAGATGCGATTTGACCTAAGCAAAGGTTTTCCTATTTTAACGACTAAGAAAGTCCCATTTGGCTTGATTAAGAGTGAATTACTATGGTTTTTACGCGGTGATACCAACATTCGCTTCTTACTTCAACACAAGAATCATATTTGGGATGAATGGGCATTTAAGAAGTGGGTGGAAAGTGATGAATATCAAGGTCCAGATATGACGGACTTTGGTCACCGCTGGCTTAAAGATCCAGAGTTTAAGCAGGTCTATCTTCAAGAAAAGAAGGCTTTCTGTCAGCGAATTCTTGAAGATGATGATTTTGCCCAAAAATATGGCGACTTAGGACTTGTTTATGGAAGTCAGTGGCGAAAATGGAAGACGAGTCAAGGCGACACAATTGATCAAATTGCTAATGTTATCCAGCAGATTAAAACTACTCCGGATTCACGACGGATGATTGTTTCGGCTTGGAATCCAGAAGATGTTCCTTCTATGGCTCTCCCTCCATGTCACACCATGTTCCAATTTTATGTTAATGATGGAAAGCTTAGTTGTCAGCTCTATCAACGGAGTGCCGACATCTTTTTAGGGGTTCCATTCAATATCGCTAGTTATGCCTTATTGACGCATATGATTGCTCACCAATGCGGTTTAGAACCTGGCGAGTTTGTTCATACATTAGGGGATGCTCACATTTATCTGAACCATCTTGATCAAGTTAAAGAACAGCTGACAAGAACACCTCATGAAGCTCCTAAATTGATTTTACCTGCTGAACCAAAACCAATCGATCAATATGAAATGACTGATATTAAGTTAGAAGGCTATACTCATGAGCCGGCAATCAAGGCTCCCGTAGCAGTTTAAAAGGAGTGGTTCAAAATGAGTGAGCTGAATTTAATCTGGGCCGAAGATTTAAATGGCTGGATTGGCAAAGATAATACAATTCCATGGCATGTTTCTGCTGATATGAAGCATTTTAAGACAAAGACTACTGGTCACCCAATTATAATGGGGCGAAGAACTTTTGCCTCACTTGGCAATAAACCGTTGCCTAAGCGGGAAAATATTGTGCTTACCAGTAGGAACATAGATGCTGAAGGAGTGGAAGTCGTTCATTCTTTAGCTGCCCTTAAAGAATATCTTAAAGCAAATCCAAACGAATATTTTGTAATCGGTGGGGCAACGATCTATCAGCAATTACTTCCAATGGCGACAAAGCTAACACGAACGGTGATAAATAAGCAAATTGTTGGAGATACAAAAATGCCAACGATCGATTATGACCGTTGGCACTTAGTAAATCACAATAATTATGAAAAAGATGACCAGCTAATTTGTCGTTTTGAAGAATGGGAACTAAACGTATAAAAGAATTGAAAAATACATTAATATCGTGCCGATGAGGACAAAAATATGCCAAATCAAATGGGTATATGCCGTTGGACGACTGTAAAAGAGGGCCCCAAGAGTAAAGGAAAGTCCTCCTAGTAAAAGCAAGCCGAAGCCAACTGGACCAAGTGCACGCCAGAGAGGCATGAAGGCGACTAGACATAGCCAGCCCATAAGAATGTAAATAATGGTTGAATATTTACTTTTATGTTTTAACCAAATACATTTATACACGATTCCGATAACGGATAGGCCCCAAATCACTCCGAAAATTGTCCAACCTAACCAGCCGCGAATGCTAACTAAGCAATAGGGGGTATAAGTTGCGGCAATAAGCACAAAGATCATTGAATGGTCGAGAATTTGAAAAACCCGTTTGGCTCGTGTAAAGATCAAGGCATGAAATAAGGTTGACGAAAGGTAAAAAAGAATTAAAGCACTTCCGTAAATAGTAAAGGTAACAATTCGCATGGGACTACCAGTATGAACAGCTCTAATAATTAACAAGATCAAGCCAGCGATCGATAGTCCTGCCCCGATCCCATGAGTAACCGCATTACCTATTTCTATTAACAAAGTACGCCGATCTCTTGTCTCTTTTTGTGTATCCATCAAAAAACCCCTTTCCAAAGACCAATGAATTTTTAAAATATTTTTGTTATACTAAATAAATAGTAATTGATCCTACAAAATTAGATAAAATTTAGTATAATAGTACTTGAAATAAAATATCTAGTTCTCAATACTAGATAATTATAGCACAAATTGTTCAGGAAGAGTGGTAAGTTTCATGGCAAAGATAAAAATTGTTTGTGACTCATCAGCAGGATTAACTGATGAAGAAATTAAAAAATATGACATTACAATTATACCATTAAGTGTAATGATCGATGGGACGGTATACGTTGAGCGTGAAACAATTACAAACGAACAGTTCCCTGAAATGATGAAGAATGCTAAGTCACTACCAAAGACTTCCCAACCACCAATTGGAAAGTTTGTCGATGCGTTTGATAAGCTAGGCGAAGATGGTAGCGAAGTATTATGCGTTACAATGATGGAATCAATTAGTGGGACCGTCCACGCGGCTGAACAAGCGGCTGGAATGACGAAGACAAAAGTTACAGTCTACGATTCTCAAACGACTGATCGGGCAATGGCTTTTCAAATCATTGAAGCGGCAAAGGTAATTGAAAATGGTGGCTCAGTTCAAGAGGCTATTGAACGAATGAAGTATATATTTGATCATTCAAAAGTTTATTTGGCAATTGATAACTTAGATAATTTAGTTGCTGGGGGCCGAATTAGTAAGTTTGCTGGTGCTTTGTCTAACTTACTAAATATCAAAGTGATGCTTCAAATTGCTGATGGACAAATCCATATTATTATGAAGGGACGAGGAAAGAAAGCTCTTCATAAGGAATGGGATCGAATCTTGAATGAAATGAAGAATGGGCCAAAAGTTATGGGTGCCGGAATCTCCCATGTTGAAGGGAATAGTGAGGTTAATCGTCTTCTAACAAAGATCAAGGCATTTGAGCCTAACTTAGACATCGTTGTTCGAGAGACAGTGCCAATTATTGCAACCCACACTGGAATGGGTGCTTGTTGTTTGCTATACTATACGGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009513|838235:846300|844634_845279_-|WP_003666062.1|DBSCAN-SWA MDTQKETRDRRTLLIEIGNAVTHGIGAGLSIAGLILLIIRAVHTGSPMRIVTFTIYGSALILFYLSSTLFHALIFTRAKRVFQILDHSMIFVLIAATYTPYCLVSIRGWLGWTIFGVIWGLSVIGIVYKCIWLKHKSKYSTIIYILMGWLCLVAFMPLWRALGPVGFGLLLLGGLSFTLGALFYSRPTAYTHLIWHIFVLIGTILMYFSILLYV >NC_009513|838235:846300|844157_844646_+|WP_003666061.1|DBSCAN-SWA MSELNLIWAEDLNGWIGKDNTIPWHVSADMKHFKTKTTGHPIIMGRRTFASLGNKPLPKRENIVLTSRNIDAEGVEVVHSLAALKEYLKANPNEYFVIGGATIYQQLLPMATKLTRTVINKQIVGDTKMPTIDYDRWHLVNHNNYEKDDQLICRFEEWELNV >NC_009513|838235:846300|843179_844142_+|WP_003668102.1|DBSCAN-SWA MATNVNEEQYLDLIRYVLANGHQKGDRTGTGTKSVFGYQMRFDLSKGFPILTTKKVPFGLIKSELLWFLRGDTNIRFLLQHKNHIWDEWAFKKWVESDEYQGPDMTDFGHRWLKDPEFKQVYLQEKKAFCQRILEDDDFAQKYGDLGLVYGSQWRKWKTSQGDTIDQIANVIQQIKTTPDSRRMIVSAWNPEDVPSMALPPCHTMFQFYVNDGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTHMIAHQCGLEPGEFVHTLGDAHIYLNHLDQVKEQLTRTPHEAPKLILPAEPKPIDQYEMTDIKLEGYTHEPAIKAPVAV >NC_009513|838235:846300|838646_839912_+|WP_011953444.1|DBSCAN-SWA MTYSEQMLDQLEAGKLKEAQNSFKLALINDDDDMLFSLAEELYALGFLQQARTIYLKLLDRYPDEDELKTNLATIAIDEGHNDEALSYLAQIKPDSPAYVQSLLVAADLYQTEEEFEVTEEKLKEAYALAPDEPAVEFALGEFYFMVGQYSEAIQYYFQLIKNGYTDFAKVDIAGRLGICYAQSGQFKKALGYFNQVKPEYQTSDIRFQKGLTQLQLGDTEKAIKTLEDLINDDNQYASAYPELAKAYEKENKYQQALRVVQEGLSVDQYNEYLYSLAAEITSHLGDQKLMKKYLVKAHELAPENMTITLQYSNFLLHQHDDEANIKLLSPLVKEDETDPQLYWNLTRSYQRTDQLELAGKYYEAALPAYSENPTFLKELINYYRETGETDKLMDELEHYLRLVPTDTEMQDLYDQYEDYK >NC_009513|838235:846300|841250_843161_+|WP_003668103.1|DBSCAN-SWA MQTMRAEGLTSTYGEKTLFDDISFIINENDRIGLIGVNGSGKTSLLNVISGEVNPEGGGQITKPNDYTIGYLKQQPELDENKTIMEAVFEGKQPVFETIRQYELALERFTKHPEDPQAIDRYTKMQARMDQEDAWEADSRVKTILTQLKIKDVSQKIAQLSGGQKKRVGLAQVLIQQPDLLLLDEPTNHLDLDSVVWLQDFLRSYKGAVLVVTHDRYFLDQITNHIWELSFGKLYHYEGNYQDFVAKKAERVELAKDTEKKNQQLYKKELAWMRTGAKARSTKQKGRINRFHELEGKIGNLKTDEDIAINLGSQRLGKDVIQFKDANLKFDNHQILHDFNWLVQAGDRIGITGENGAGKTSLLNVIAQRVPLDSGVLKIGETVKLGYYTQQTEGIDNDKRMISFLSEIADNVTDKDGNKLSVTQLLERFLFPRFMHGTLIRKLSGGEKRRLYLLKILMQQPNVLLLDEPTNDLDIGTLTVLEDYLDNFAGTVITVSHDRYFLDKVADNLLVFNGNGDIERYTGRFTDYLTAKKEEADKDKGLKNDQKALAKKQVNKQEPAKKEKTKLTYAEQLEWDHIDEELDALDQQHQQLENEMAEAASDYTKIAKLQKQLNEIQEKIDEKTARWEYLSTYVDE >NC_009513|838235:846300|838235_838511_+|WP_003666054.1|DBSCAN-SWA MANKAELVSNVATATGLTKKDATAAVDAVFSSIQASLAKGEKVQLIGFGNFEVRQRAARKGRNPQTGEEINIPASKVPAFKPGKALKDAVK >NC_009513|838235:846300|840037_841249_+|WP_003668104.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKIKQLPAIFEPARPVLQKIEEAGYEAYFVGGCVRDTILHDEIHDIDIATSAYPSEIKAIFNHTVDTGIEHGTVMILDHGTGYETTTFRTESGYQDYRRPDKVTFVRSLSEDLQRRDFTINALALREDGEVIDLFDGLEDLQKHLIKAVGNPNERFHEDALRMMRAVRFASKLDFVIDTATLKGIKENAPLLEKIAVERIRVELEKLLLGQNPVAGLKDFIATGLYQYCPGLENAQAALSALLILNQWHLENEAQLWSVLGLQLQLDQKEIGKFLKKWKTANDLIAQVKKVVPAVQAIRQRALTPTLMFNTGETALHDANQVAKLYGWAIDDEELQKAYQKLPIKNAKELAIDGRVLITKAGVKPGPLMGKILQQLTLAVVNGEIANNATVLLEKVEEITKEG >NC_009513|838235:846300|845457_846300_+|WP_003668100.1|DBSCAN-SWA MAKIKIVCDSSAGLTDEEIKKYDITIIPLSVMIDGTVYVERETITNEQFPEMMKNAKSLPKTSQPPIGKFVDAFDKLGEDGSEVLCVTMMESISGTVHAAEQAAGMTKTKVTVYDSQTTDRAMAFQIIEAAKVIENGGSVQEAIERMKYIFDHSKVYLAIDNLDNLVAGGRISKFAGALSNLLNIKVMLQIADGQIHIIMKGRGKKALHKEWDRILNEMKNGPKVMGAGISHVEGNSEVNRLLTKIKAFEPNLDIVVRETVPIIATHTGMGACCLLYYTE |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
860951 : 899634
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009513|860951:899634|DBSCAN-SWA ATTAGAAAAAAGGTGAAAGTTGTTCTTCTGTGACATGACTCAAGAATACTTCTAATGGTGTACGATAATTAAGAGATTTTCGTGGGATATTGTTGCGACGATGCATTAGCTGAGTGACTAGTTCGTCTGGTAAATCGCGAAAATCTAGCTTTTTACTAAGACCATCACGACGCAAGAGGCCGTTATTATTTTCGTTTAACCCTCGTTGATTGGGAGCACCGACTTCCGCAAAATAGGTGTGAAGATCATACTTATTGGCTATTTCTCGCCATCCAGCAAATTCTTTCCCGTTATCAAAAGTAATTGATTTAACAAAGTGACGTGGCAGTTTAGCGAGCCATTGATCAAGCTGGCAATTCACTGCTTCGTCTGTTTTATGATGAATATTAAGGACAATCATTACTTTGGATTGTCGCTCTACTAGCGTCATTACCGCTCCGCGGTGAGCTTTACCTTGAACTGTATCAGCTTCAAAGTGCCCAAATTCATGTTGGTAATGCGGAAAATCACGATATCGTTGATAGATACTGCGTCCTAATTGGCCAGCTTTACCACGATGTTCCACATAGCCATTGGGATGGCGTTTTCCTTTCATCGGTAGCTGTTTAACGGAAAAGCCATACTGATTGCGGGCAAACATGCGATAAAGGGTGCGCATACTGCAGCTAATTGGGTGTTCATGACGACCAATAATAGTATCAGGAGTCCAACCTGCCTTGATTTGCGCATGGATATAGTTAACTTCGATAGTTGGCAGTTGGGTCTGCTTCCGACCACAACGACGCTTATGTCGCTGATAAGTCTGAAGATATTGGTCGATGGTTTTACCGTCGTTGAGGAAACGATAAACACGATAGATGGTTTCTTGACTACGCTGAAGTAATTTAGCAGCCCGATAAGCTTTAGTACCTTGATACCAAAAATCAGCTATGAGAGTTAATTCACGTGTGGTAAGATGTTTATAGGTCATTTGTGATTGCCTTTCTTTTGATTAGGGATATTCAAAAGTCTATCACAAATGGCTTTTTATTTTTTCTAACTTAATTTTACAAACGACGAAATTAAAAACTGAGGAAAATCGCAAAATTTTTCTCAGTTTTTTTGAGCTTTAAATTTCAAAGCTTATTCTTAATTAGTTAAAATATAAGTACTGATTTTAAGAAATGGGGTTGATATTAATGAATATCACATTTACTGATCAAGCTATTGAACGTTTACAGCGTTATGAATTATCTTCTAAGAAGATGCTCCTAGATTTTGATGATGGGGTGGGCCCATTTTCTGCCGTTGGGAGTTGCAGTTTAGATGGTGATTATCGACTAATCCTTGTTAAAGAGGATTTAGATACCCCAGATTATAATGAAAAAATTACCTCTAATTTGGGGGATGTTTTTATTAAAGACCATACAGCAGTTCAATTTGATGATGAAATGGAAGTAAGGTTTAATCCGCGATACTTTACAATGCCACTTGTCAGTCCTAAACGCGTTTTAACGGATAATCTTGAAGTTCTGGATCTTAGTAAGACAGACTTAAATTCTCAAATTGATCGAGCGCATGATTGCTAACAATATAATAAGGGAGCGTGATAGAAGCCAGATACGACTTCATGATCATGCTCCCTTATTGCTTTTAAAGGATAATCCTGAAAATAAAAGTGATGATAATTGCAAAAATTCCAATAATCGTTGCATAGGAAAAATGTTTACGTTGAGCTGGTTTAATTAATGCTTGCCTCCCCCATGAAAATTGTGAATAAAGCCCATAAAAAAGCGGCAATAAGCAAAATATATAATTTCCAGTTAATTGGAAGATGATGGTAAAAATCGCCATAAAATACCATCATGCCGATAAACATCACAATAGCATAGGCATAGTTATCGCGGTGAAAGTTAAAATTAAAAAGATAAGCAAACGCGCAAAATAATAAAATACTAATAATATCGTTTAAAATCATACCCTCTACACACTTCCTTATGGTTTTTATTATAGTCATTAACAGGATAAAGATAAAATATTAAGAAGCAATCGCAAATAATATGATATGATGGTCTTGTTAGAATTAATGAAGGCGGTGCTTACAGTGAAGAAAAAAGCTATGCGACGAGAAATAAAATTATTAACTGAAGAAAATCAACAATTACGTCGATATACCTTACTAGCATCAATCGGAATTTTATTAAGTATGATGATTGGGTTAGTTCGAATGGTTCAAAAAAATTAGTTAGGAAATTTTTTAGAGGGAAGTATAGTGGAGTTAGGATACCGAAAAGCGACACTTGAAGATTTACCAAAAATTGTTGAAATTTATAACCAAATTATTCCGTCAAGGTTAGCGACTGCAGATCTTACTCCGATAACGGTTGAGAAACGGAAAGAGTGGTTTGAAGCGTTTGACGAAAATTATCCAATCTGGGTAATTGAATATCAAAAAGAGGTTCTCGGGTGGGTTGCCCTTGAGCACTTTTATGGTCGTCCAGCCTATGATCATACTAGTGAAATTGCCATTTACCTTGATCAACGGTTACGGAAACAAGGGGTTGGTACAAAAACCATGGAATTTATTATCGGTCAATTGCCTAAATTAACAGTTGATACAATCGTGGCTTATATCTTTGGTCATAATATTCCAAGCCTAAAGTTATTTAAATCGTTTGGTTTTACGCAATGGGGGCTTTTACCACAAGTAGCAGAGCTTGATGGGATTAAACGTGATTTAGTTATTTTAGGACGTCATTTTAAATGATTATTGTGTAAATATGACATAAGTAAAGCCACGTCCATAAGAAGTAACCAGAATAGGCCTCCAACGCCCGGTAAAGCCGAATGCTGGAGGCCTATGGTGCATATGAGAGCTTCGTATTGAAAACGAAGGTGCCCGTGATGCTTTGCTCGTTCCCTTATTTTGTATCTTTTTTTACTTCTTCTTTTGTTTTAACATCATTGATATGTAGCTCAAACTTAACTAAATTTAAACCAGTCATCTTATCGATTGCACGCTGCACCTCAGAACAAACAGCCTTAAAAATTTCTGGAGCACTTTTACCATATTCGATGGTAGCTTCCATTTTTAATGCGACTTGCTTTTCACCAACATCAGCATCGATTCCCTTTGTTGGATTGCTTCCGGAAGTTACTTTATCTGCTAATTCACTAAACATATTTCCGTCGAGGGAAAGGATCCCAGGGACTTTGCTAGCGGTAATTCCAGCAATTTTTTCAATTACCTGATCATCAAATGTTAATTGTTCATCAATTGTTTTATTATTTGTAGTGGTTGTCATATTAATTCCTCCTTGAATTAGTTGGCAAATTTATCTAACATTTTTATCGCGAGTTTATTTAATGAATAGCCTTTTGCATCAAGAACATAGCCAATTCCGCCTAAGATAGTGACAGCTAACAGAATGCCAATCATTGGGAAAAAGCCCCACATAATCCAACTAATGCTGATAAGCAGTCCTAAGATAACGCCAATTGTAGCAAGTTTCATAGTGTACCTCCTTTTTAGACAATGTTAACTGATTCTTTGTTTGAGTATGGACTTAACTTAATATGTAATTTATTAAGATCAATGTCGAAGTCTCGTTTAAGGTTTTCTTTAATTGTCTGGAGTAGTACTGTATGAATTAGTTTTGGATTGGTTCTATTGGACATCATTCCGTGAATGGTAACATCTGCATTATGATTGTTACGGTGCATTTTGAGTTTAATTACTGGGTTATAAAGGTCAAATTTAGCAATTGAAGTAGTTAAGCTATGTTCAACTGCATGTTGATCAATTTGAACTTTATTAGCACCATCCTTAGCGATTGTCATTTGTTTAGTCGTTGTTGGGCGAAAAACGGCAATTGCTATTACGGTTAAAGCAACGATAATTAAAAATACTGCGACTCCGGCTGAGAAACTTTGACCGATGGGGCTGTGAAGCCAATCGTTAACTGGAATCGTCCAAGTTTGGTCACGATAAAACCATAATGATACGACAACGATTCCAATAATTACCTGAAGCATCATCACAAATGAAACCCACCATTTTTTCCATGCGGCCATTAGTACCACTTCCTTTCTATAAATGTTTTTTTGCTATGAATTAATAATAACATAAGAGAAAGCGTTTTACGTTGATTACAAAAATGCTAAAGGTAATATTAAGAACCTATTAACAGAATAGTCATAATTAAAAATCGATCTTACAATCATGTTCCGATGTAAGATCGATTTTTAATTCTTTAATTATTTTGGCGCTCTTGTAGTTTGGCAATTTCAGAATAAGCAGGGGCAAGCATATCTTCAATTTGTTGGAAGAGTGGAGTATAACGTTGATATACTTTTACTGCGGTTGGATCTGGTTGGTAAGAACTGACCTTACCAATGAACTTTTGTGGTGTATCAAGACTATCGATCATTCCCAAACTTTGCATAGCCATAACTACTGATCCAAGGCAGCCTGATTCAAATGAGTCTGGAACATTAACAGGACAGTTTAAGATATCGGCAAGCATTTGACGCCATACTTTTGAACGGGCAAAGCCACCTGTTGCGGTAACGCTTGCTGGTTCGCCAACTAAAGCCCGTACTGCTTGGAAGACTGTTGCAATATTCATGCTAATTCCTTCCATGACTGCCCGTAGCATATCAGCCCGTGTATGAATATGAGAAAGGCCAAAGAAACTACCGCGCGCTTTGGCATTCCACAATGGCGCCCGTTCACCGCCCAGGAAGGGATGGAAGAGAAGTCCATGTGCCCCTGCTGGTACTCCTTCAATAACGTGATTTGCTAAAGTATAAGGATCCACCTGTTCGTTCTTAACAGCGCTACTATCGACAAGGTGTTTTACTGCCCATTCATAGACATCGCCACCGTTATTAAGCGGGCCACCAACGACCCACAATCCTTTATTAATAGCATAGCAGAAGAGGCGTCGTTCTGGATCAATAACAGGATGGTCAGTTACGACTCGTACAGCTGCAGAAGTGCCAATTGTAATTGCTACTGT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58 | Lactobacillus_phage(46.67%) | head,portal,capsid,terminase,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1030769 : 1062301
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009513|1030769:1062301|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009513|1030769:1062301|1039427_1040798_-|WP_003667763.1|DBSCAN-SWA MFSKVLVANRGEIAVRIIRSLRELGIKTVAIYSTADRESLHVQLADEAVCVGTARAQDSYLNAKNILEAALGTGAQAIHPGFGFLSENAEFATMCEECGITFIGPQASVIDLMGNKEHAREQMKKSGVPVIPGSDDYITNVNDAVEVANKIGYPILLKAAAGGGGKGIRRINDHNQMRQIFSEAQNEARLSFNDDRMYLEKIMENVKHIEVQVFRDNFGNAVFFPERDCSIQRNKQKLIEESPCVLVNEQERKTLGQITMRAINVINYHNTGTIEFLMDKDHHFYFMEMNTRIQVEHTVTEMVTGIDLVKAQVIVAANEPLPFTQQDIQVHGHAIECRINAENPKQNFMPVTGTINYLYLPVGNLGMRIDTAIYPGSKITPYYDSMIAKVIALGQDRQEAIEKIKRLLNEMVIMGVTTNQNFHLAILNNPKFLAGTASTTFLEDSFLPQWKKGLTA >NC_009513|1030769:1062301|1056289_1056748_-|WP_003664118.1|transposase|DBSCAN-SWA MANKLNSLAHTKWLCKYHIVFIPKYRRKAIFNQYRRDLRDYIRLLCKYKGVEIIEGHMMPDHVHLLVSIPPKLSVSQFMGYLKGKSALMMFDRHANLKYKYGNRHFWAEGYYVSTVGLNESTIKKYIRDQEKHDIAMDKLTSVEYSDPFKGK >NC_009513|1030769:1062301|1032871_1033330_+|WP_003667773.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>NC_009513|1030769:1062301|1047163_1048243_+|WP_003667748.1|DBSCAN-SWA MEADKYLKLIQEELQNLPDYVNEYYLGTNHAVTTTYQYLTEIRRFFDWLRSSGLVSVNSNKDLPIDTLANLRRSDVMLYIDYLQHTTNAQGRLNSPTSINRSINALRSLYKFLTVTADNNNGESYFDRNVMLKIDSLNDTKTLNYRAHTLASHMYRGQMKFDFITFIEEEYPNKCDKRALPSYKVNKERDIAIIALILGTGVRVSEAANVNLGDLNLKQSLLDVTRKGGQRDSVPIAPWAITYIKAYQAIRAQRYHALKKDTAFFLTVYHKQTRRMTANAIEKMVKKYSTAFGHPLTPHKLRHTLASEMYEVTKDQVLVAQQLGQKGTSATDLYTHVDQKQQRDALKEISETSYKKTNE >NC_009513|1030769:1062301|1053099_1054710_+|WP_003667418.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>NC_009513|1030769:1062301|1038582_1039431_-|WP_169471569.1|DBSCAN-SWA MKLYDQNNTLSERHIKADKNADERVPDQMWLRCPHCHQLLFAKQLTQYAVCPNCDYGLRIPARHRLSWLVDSFKEFDKDLQTKNPLHFPGYQEKISKLQRQTKLNDSVLTGEASINDQLFSLGIMDPTFIMGSLGTVTGEKITRLFEYATTHRQAVVLFTASGGARMQEGIMSLMQMAKVSQAINEHAAAGLLYIVVLTDPTTGGVTASFAMDGDIILAEPHALVGFAGRRVIEQTIHQQIPIDLQSAENILHHGFIDRIVKRQDEKKLLEWLLKTGSVANE >NC_009513|1030769:1062301|1043653_1044604_-|WP_003667755.1|DBSCAN-SWA MYYGILFSGQGAQRSGMGVELMADSLFSRIVSWASDVCELDLLKIMKNEHNELNKTVYVQPAIVTVSYGIYRMLKRDLPQLPIKGMIGLSLGEYAALIASNSLSFEEGIKLVADRARFMQQDADREISTLAAVLDPQLQEIKELITAQQENGQRVYIANYNSPRQIVVGGALTDLKATLKKMEEDKLAKRTILLKVNGAFHTPFFNGARQQMHNRLQTVDFHEPQIEVISNTTNSLFHCENLPGILEKQLAVPTHFGANVKELVKYAKIDTTLEIGPGKTLSRFAHQVDRHLNTQHIENLVDYENFIKEQKDGTDR >NC_009513|1030769:1062301|1045859_1046306_-|WP_003663667.1|DBSCAN-SWA MSKDNDYEKINKGLIKVYSGILWIEENELRKSTFNDLTIKEMHAIDAITMYNHQTISQVAEKLHLTPGTMTSMADRLIRKGYVERIRDKDDRRIVRLRLTKRGRVLYRAHRAFHNMMVERFLKGMNDEEMKVVKKALQNLEDFVDEHA 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30 | Lactococcus_phage(25.0%) | integrase,transposase | attL 1022983:1023000|attR 1066303:1066320 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1105269 : 1204263
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009513|1105269:1204263|DBSCAN-SWA AATGACCTATAAACATCTTACCACACGTGAATTAACTCTCATAGCTGATTTTTGGTATCAAGGTACTAAAGCTTATCGGGCTGCTAAATTACTTCAGCGTAGTCAAGAAACCATCTATCGTGTTTATCGTTTCCTCAACGACGGTAAAACCATCGACCAATATCTTCAGACTTATCAGCGACATAAGCGTCGTTGTGGCCGGAAGCAGACCCAACTGCCAACTATCGAAGTTAACTATATCCATGCGCAAATCAAGGCAGGTTGGACTCCTGATACTATTATTGGTCGTCATGAACACCCGATTAGCTGCAGTATGCGCACCCTTTATCGCATGTTTGCCCGCAATCAGTATGGCTTTTCCGTTAAACAGCTACCGATGAAAGGAAAACGCCATCCCAATGGCTATGTGGAACATCGTGGTAAAGCTGGCCAATTAGGACGCAGTATCTATCAACGATATCGTGATTTTCCGCATTACCAACATGAATTTGGGCACTTTGAAGCTGATACAGTTCAAGGTAAAGCTCACCGCGGAGCGATAATGACACTAGTAGAGCGACAATCCAAAGTAATGATTGTCCTTAATATTCATCATAAAACAGACGAAGCAGTGAATTGCCAGCTTGATCAATGGCTCGCTAAACTGCCACGTCACTTTGTTAAATCAATTACTTTTGATAACGGGAAAGAATTTGCTGGATGGCGAGAAATAGCCAATAAGTATGATCTTCACACCTATTTTGCGGAAGTCGGTGCTCCCAATCAACGAGGGTTAAACGAAAATAATAACGGCCTCTTGCGTCGTGATGGTCTTAGTAAAAAGCTAGATTTTCGCGACTTACCAGACGAACTAGTCACTCAGCTAATGCATCGTCGCAACAATATCCCACGAAAATCTCTTAATTATCGTACACCATTAGAAGTATTCTTGAGTCATGTCACAGAAGAACAACTTTCACCTTTTTTCTAATTTAAATTGACATTTCAGGTATGAAATATTTTATACCTTTAACTAATCTATAAAAATTTTCTAAACCAGCTATAGGTTCTCCATTAGCTGAATTATCAAGTGTCTTTTTGCCAAATAAAAAATATGTTGCATCCTTTAAGATCCAATAGTTTGGATTATTTTTCGCCAATCTATTAACCAGCTTTAACGCAGCATAATTGTTATCAATGATTAAAAGCTTTAATTGCTCTAATTGAATAGATGCTCCAACTTCATTAATAAAAAAATTGATACAGTTAATAATATCAGATTTAAATCCCAACAAATAATTAATTAAATCAAGTGATTGTGTAAAGTTAGGAATATATTTTTGATCACGAATAACTTCTAACACGTCACGCTTTGAAATAATGCTTTGGGAAGTCCTAGCCTTTCTCGCAAGAAGTAACAATGTATTTAAAATTCCTACAATATCAGAATTTGTTTGATGTTTGCTTAACCACTTACTAATAATACCACATACATAATTTTCTGAATTTAGAGCAGGTAGAATTTTTATCTTACACCTTCTTACTTTATAGATGTCTTTCTTATCTATCTTTAGCTTATTAATTATTTCGTTATCTGATAATTTACTAATGTTACTTCCAAAGTCATTAACATTAGTAAAAAAGTTTCTAGCTTTATTATCTAATTGCGAAAAATATAGTAAGTACTTATCCTTATTATCAGGTAAGTTAGTGATTACTTCTGAAATTTCTGATAATTTTTCTTTACCGATTTTAACTTGTACAGAAATATTCTGATTTATTATTTCATAATCATTGTCACTCTCGACTTCAATCCCTCTAAAATTATTTTCATCTATAAAGCAAAATATTGAATCTATCAATGTGTAATCCTGATAGGCAAATCCTCGCGATGCATATATACCTTCCACGATCTGGTAACGCCATAATATTTCTCCTTTCTAGAAAATAATATTTTCATTAGAAATTATGTCAACACCGATTTAAAATTGTCAGAAATCACCGGTTTAAATGCTGTTTTGTATGTTGTTCCGTGTAATCTTTCATGCGATATGATTTACCAGAAATTTTAAATATTTCTGAATGATGAACTAATCGATCTAGAATTGCATTGGCAATAGTAGGATTAGAAAAAGTTTGTCCCCATTTAGATAGCGGAATATTAGTAGTAACAATGATTGACTTTTTTTCATATCTCCTTGAAATTAGCTGAAAAAATAGGTTGGACCCTAAATTATCAATTGGTAAATAGCCAATTTCGTCGATTATTAAAAGCTTATAACGAAGATAGTTCTTGAGCATAGGCTCAAGACGATTCTCTTGATAAGCTAATTTCAACCTTTCAATTAGTTCATGACAATTAACAAAATAAGTACTCAAATGGTTTTTACATGCTTCAACTCCTAGTCCAGTAGCTAAATGAGTTTTACCCACCCCGGAACTGCCAATAAATAAAACATTACGTGCATTCTCAACAAATTCCATTGACATTAAATTGATTATTTTTTCTTTATCAACAGAAGGTTGAAAATTAAAATCAAAATCCTTAATTTCCTTTTGGTAAGGGAAGTGTGCTGTGTGAATTGACATACGAGCTGAGCGCTGCTTACGGTAATTTAATTCTTTATCAGTTAATTGTTTAAGAATTTCAGCTAGCGAGAGTTGTTTGTCTCCTTCGAGGTAATTTGGTAAATATTCTCTAATAGCATTTAGTTTCAGTGCTTCTAAGTTATTTTCTAGTTCTGTATAAGCTGTCATTGATTTATCCTCTTAAATTATCAAACATAGTAAGATTACGTTGAACCTGTTTCTCTAATTCTTCTTCGGCAAGATCGTGATATACACCGTTACTGAGTACTTCTTGTAGATCGTCATGGTGATAATTTATTTTCTGATCCGAAAGCAAATGCTTTCGAAGAAGGCGACCATCAAATGATACAAGAAGTAGAGAATCGGTTATATTGACTGTAACTTCTTTTCCGATATACTTAACTGGTACAGAATATTTATTACCCTTGTAAGTGATCATGGATTCATTGGAAACTTTGCGAGTTTGATCCCGATCAATTACTGACAGAAGCAAATTCTTGTCAAAAGGTGATAAATATTCTTTTTCTTTTGTCCATAAAGTGTTTAGCTTCTCCCCAGTTGCTTGACTCAATTCATTATTAAGCTGCACATTTAACTTGTGAATTAGCTGTGCTAAGTCATTTACATTATCAAATTCATAATCATAGACTCTTAATCGTTCAATGGTTCTAGCTAGTGATTCGACTTTACCTTTGGTTTGTGGTCTGAATGGTTTACATGATTTAGGTGTGAAACCAGCAGTGCGTGCAAACTCCAGTAACTTCTCATTCCATACAACCTTAGTAAAGGAACTTCTAGCATGATCAACAGCTGTTTTCATATTGTCGAAGACAATTTCTTTAGGAACTCCATTCATAAATTCAAAAGCTCCAACAAGACTCGAGAATAAGGTATCTTGTTTCCGATCAAAGACAAAATTAAGATACTTTTTCCTGGAATATCCAAGAACATAAAGAAAAATTGAGAACTTAATAGGAGTACCTTTTCGGGTATGTAGAACAAAATCCTCTTTCCAATCAACTTGTGCAGATTGACCTGGCGCAGTCTGAATTCTTACAACTGGAGTTGTTTGTTTTTTTACTTTAATTTGATGGCAATAATCACGCAATATACTTATACCGCCGGTATAACCCATCTCCTTAATGAAATAAAAAATTGAAGTAGCTGAACAAGAATTCTTAACCTTCTCATCAATAATATTTCGATAGGGATCTAATTTACTTTTACGTCGTTTTCTTTTGTTTTCATAACCATCGTCTTTCAAATAATAATATTTTCTAGCTGTCCTTGGATCACAGCCTAATTGACGACCTAATTCAGTAAAATTTGGTTTAATTTTATCCATTTGATATTTTCTCAACTCCTGTCGAATATCTTGTCTCATATAAATTCCTCCAGATTTAATATGAAACAAGTATAAAAAATGTTGGAAAACCGACAATTTTAAATCGGTGTTTTCCAACATTTTATAACCGGTGTGGACAAAATTATATTATATATTCTTGATATCAACATCTATCCTCATAAGTCGATAGTCTACCTCAAGTTTACTTTCATTATTTAAAGATAATCGGGGTTAATTAAATACACATCGCCTAATGATCTAGTTAATGCAACATAAAATTTATTAATACTTTTAAGATCAGTAACTTTTTTCTTCCCTTGAATAAATTCGACTGTGGACTTAGTTAAAATAATACAAACATTTTTATATGTTAGTCCTTTTGATTTTCCCCATGTTATTAATTTATCATCATTCAAAGCAGAAATTACTTTTTTTACTTTATTCTCTGCTACAATGTCCCATACTAAAATTTTATCGCATTGTTTCAATCTCTGTTCTACATCTTCTGCAGGAGTAATCTCTACTTTCCCGCTATTTAACGACTGTGACTCAATTGAAATTCCTAATTTATTCCTAATCCAACTGCAAACATCAGGGGTAACTCGATAACTAGTTTCTAAAGTTTTTACGTCTACGGTAACATATCTTTTCAAGAAACCAGCCTTCTTTCTAAGAAATTCTTCCTCACCGATTGAAACATAATCTTTCTTTGCATATGGTAGCCGTCGACGATTTGTAGTCACAACACATGATTGATATAAATCGCCAACTAAGACTAAATTAAAATTGCATTTTGTCATTTTAATTAACAAATTTAGTTCCGGCTTACAGATATCTTGAAATTCATCAATTACTATAAAGTCAAAATATTTATGCAGTCTCCTCATTCCTTTCTCAAAGCAACTTGTTTCCATAATGGCACTTATTCTCTGTTTAGAATATAATTGATCGGTTTTCTCATTTTGCCAGAAAGATTTTTGATTTTTTCTTGTATACATACTAGGCTCAGTTTTATAATCTATTCCTTTTAATGGAGCTAATCCCTTTTCTAGAATAATTGATTGTTCGAATGGCTTTATGAATTCCT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108 | Lactobacillus_phage(47.73%) | head,portal,tRNA,capsid,protease,plate,integrase,terminase,tail,transposase | attL 1196962:1196977|attR 1206972:1206987 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1330291 : 1395975
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009513|1330291:1395975|DBSCAN-SWA 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57 | Enterococcus_phage(26.67%) | integrase,protease,tRNA,transposase | attL 1391253:1391272|attR 1401160:1401179 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1643655 : 1662882
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_009513|1643655:1662882|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_009513|1643655:1662882|1645285_1646341_-|WP_003668962.1|DBSCAN-SWA MKKAIFEKAGQMKIVDVDRPTIEKPDDVIIKVVRTCVCGSDLWNFRGINPVEKDSENSGHEAIGIVEEVGEDITTVKPGDFVIAPFTHGCGHCAACRAGFDGSCQSHNDNFSSGVQAQYVRFQHGQWALVKVPGKPSDYSEGMLKSLLTLADVMATGYHAARVANVSDGDTVVVMGDGAVGLCAIIAAKMRGAKKIISTSRHADRQALAKEFGATDNVAERSDEAVQKIMELTNGAGADAVLECVGTEQSTDTAMKVGRPGTIVGRVGLPHTPKMDMTVLFYNNTIVGGGPASVTTYDKDVLLKAVLDGDINPGKVFTKSFDLDQIQEAYEAMDKREAIKSYIIMDGFERD >NC_009513|1643655:1662882|1651365_1651836_-|WP_011953551.1|transposase|DBSCAN-SWA MDRNQGPLLNYLHCYSRRNFQYHWLSNQEVVERLLDFSPDLRAAYEYYQDLIATISNRSQALLDQLIKRNNLPSAMRRVKRTLAKHRQEIIASFYILLTNGPIEGANNKIKIIKRTAYGYRNFFHFRIRLLISLKTSNLMIRELSKKRTRPKAKVA >NC_009513|1643655:1662882|1647808_1647991_+|WP_080502982.1|transposase|DBSCAN-SWA MNGPVEGTNNKIKVIKRTAYGFRNFFNFRIRILLALPNTYIAITWQNKQTAHAKVQAQAA >NC_009513|1643655:1662882|1661664_1662882_-|WP_003668983.1|integrase|DBSCAN-SWA 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19 | Streptococcus_phage(40.0%) | integrase,protease,transposase | attL 1646390:1646404|attR 1674046:1674060 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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