Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009516 | Psychrobacter sp. PRwf-1 plasmid pRWF101, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_009524 | Psychrobacter sp. PRwf-1, complete sequence | 1 crisprs | cas14j,DEDDh,cas3,csa3,WYL,c2c9_V-U4 | 0 | 2 | 8 | 0 |
NC_009517 | Psychrobacter sp. PRwf-1 plasmid pRWF102, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009524_1 | 831244-831511 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009524_1
|
4 spacers
spacers of NC_009524_1
>1.1|831272|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT TGGGAATGTCTGTTACTGGCGGCGAGGACAAA >1.2|831332|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT TATTAGTAAGTGACTTAACTATATCAATACAA >1.3|831392|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT CTGTTTGCATAGCTCGCTTTCTTGTTCAGCAT >1.4|831452|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT TATCATTAGCATAGGGTTGTAAGTCTGCTAAT >1.5|831273|32|NC_009524|PILER-CR TGGGAATGTCTGTTACTGGCGGCGAGGACAAA >1.6|831333|32|NC_009524|PILER-CR TATTAGTAAGTGACTTAACTATATCAATACAA >1.7|831393|32|NC_009524|PILER-CR CTGTTTGCATAGCTCGCTTTCTTGTTCAGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009524_1
The CRISPR arrays of NC_009524_1 >merge|NC_009524|1|831244-831511|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAGTGGGAATGTCTGTTACTGGCGGCGAGGACAAATTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAGTATTAGTAAGTGACTTAACTATATCAATACAATTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAGCTGTTTGCATAGCTCGCTTTCTTGTTCAGCATTTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAGTATCATTAGCATAGGGTTGTAAGTCTGCTAATTTTCTAAGTCACCTATGCGTTATATCTA >NC_009524|1|1|831244-831511|CRISPRCasFinder CTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAG TGGGAATGTCTGTTACTGGCGGCGAGGACAAA TTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAG TATTAGTAAGTGACTTAACTATATCAATACAA TTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAG CTGTTTGCATAGCTCGCTTTCTTGTTCAGCAT TTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAG TATCATTAGCATAGGGTTGTAAGTCTGCTAAT TTTCTAAGTCACCTATGCGTTATATCTA >NC_009524|1|1|831244-831511|CRT CTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAG TGGGAATGTCTGTTACTGGCGGCGAGGACAAA TTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAG TATTAGTAAGTGACTTAACTATATCAATACAA TTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAG CTGTTTGCATAGCTCGCTTTCTTGTTCAGCAT TTTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAG TATCATTAGCATAGGGTTGTAAGTCTGCTAAT TTTCTAAGTCACCTATGCGTTATATCTA >NC_009524|1|1|831245-831451|PILER-CR TTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAGT GGGAATGTCTGTTACTGGCGGCGAGGACAAAT TTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAGT ATTAGTAAGTGACTTAACTATATCAATACAAT TTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAGC TGTTTGCATAGCTCGCTTTCTTGTTCAGCATT TTCTAAGTCACCTATGCGGTGATGAAG
>NC_009524.1|WP_011959966.1|830510_830801_+|hypothetical-protein MKIIDYDKLFAEFKPNGYVSEDAHTIANMLIYDLCIQPGYNLARFLEIKPCFDNHMAIRIWVQKRLDASLGYLVDDMYVQLQSEIYELLPPSGYGY >NC_009524.1|WP_041773283.1|829317_830508_+|site-specific-integrase MASIRSRNKRLIVDFYYMGKRCRETTNLIDTPANRKKLESIILNMEAEIRLGIFNYAKYFPKSDKAAEMVALNDRKECINTNVPSFKQFATLWFSEKEIEWRDTYKRKIQEIIDMYLLPEFGTKPIHLIKKTDVLAFRSSLGKVTYGKANKHLSAARINSIMVPLGMILKEAAKRYKFDNPYYDIKALKQPKTDIQPLTLEEVWTFINGVREDYRHYYLVRFFTGMRTSEIDGLTWDNVDFNRREIVIKQALVKGKIVPPKTQESYRAIQMSPWVYDALKEQKEISYRRSDYVFCSHTGEPLDYNNVNKRIWHPTLKVLRLKKRNAYQTRHTAATLWLAAGESPEWIASQMGHSTTKMLFNTYSRYVPNMTRQDGSAFEALVNRSQMAQLSTDKET >NC_009524.1|WP_011959964.1|829090_829306_+|hypothetical-protein MSHTYLTTQELSERIKYNPRTIRNELKDSVLIEGIHYIRPFGGRKILYVWEEIEKDMRTGITGSINAMALQ >NC_009524.1|WP_041773282.1|828716_828941_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIVSNLPVLLAERRMKVADLIRMTGISKSTMHKIYNEQTSRIDFETMDKICEALDVGVGELFTYIPNKASEEVK >NC_009524.1|WP_011959962.1|827079_828078_-|diaminopimelate-dehydrogenase MTQPIIRVAIAGYGNLGSGAQAAINQNPDMTLMGIFSRRDPASVTLIDNSVPVYAMDDIAQYKDEIDVLILCGGSKSDLPEQGPKLAALFNIVDSFDTHAKIPEYFESLDAPAKQAGKIALLSVGWDPGLFSINRLYGEAILPVGETYTFWGKGLSQGHSDAVRRVAGVKSGVQYTLPSESAMAKVRSGEQPILSTREKHTRECYVVLEAGADEDTVRTAIVNMPDYFADYDTTVHFIDQHTFEREHGKMPHGGFVMRSGSSGTQTDTNHQALEFSLKLESNPQFTASVLVAYARAAYKMNKAGETGAKTVFDVAPGLLSPKTPAQLRKELL >NC_009524.1|WP_011959961.1|825682_826687_-|glutamate/aspartate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MHYKVKTLTLATLLAFGLTGCNNNQSANTDAPATAEGTSTTEATPSTDAANADASATLNKIKDSGTIVVGFRDSSIPFSYIADDPNQPLGYAHDLEMKVVDAVKDKLNMPDLKIRYNLITSQTRIPLVQNGTIDFECGSTTNNEERQKQVAFSNGFFEIGTRLLTKKDSGINDFEDLKGRTLVTTAGTTSERYIRQYNDEKKLGAKIISAKDHGEAFLMLEKGRADAFMMDDVLLAGEKAKSAHPEEWQIVGTPQSFEIYGCMMRKDDPQFKAIVDEALKNVYASGEINDIYNKWFMNPIPPKNVNMNFEMSDNLKALIANPHDGAQPMAAPAQ >NC_009524.1|WP_011959960.1|824799_825546_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MNYSWNWGVLFESTGIGDGIYLYWILSGLGWLLLIGTIAWILALGIGTVLGIMRTLPSKTARTIGTMYVTFFRNIPLLVQLFFWFYVAPGWLTPVLQEWWYKGLSPNMSAMISASIGLGLFTAARITEQVRTGIQSLPEGQHNAAYALGFSTAQAYRQVLLPQAFRVILPPLSSELTNCYKNASIASLVGVMELISQTKTISEYTQNNIEIYTYATIIYLLFNLSLIGIMGLIEQKLRIPGLIAGGKK >NC_009524.1|WP_011959959.1|824128_824803_-|ABC-transporter-permease-subunit MSAFVTELTTAYPSLISGMIVTLKVLLLAIVGGMALGTVLAMMRLSGIKALELPAKLYVNFFRSVPLLLILLWFYFAVPMIYNGLTGSYITFDTAFTSCVVAFMVFEAAYFSEVVRAGIQSIGSAQVNAAKALGMTYAQTMRLIILPQAFRKMTPLILQQCIILFQDTTLVFAIGLSDFFRSAYVRGELMGYLTPYILGAGAVYFIISLIASIGVQRLQKSMRF >NC_009524.1|WP_041773523.1|823211_823943_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MVIEMSNVSKWYGDFQVLTDCTAHVHRGDVVVVCGPSGSGKSTLIKTVNALEPFQKGKIFVNGIAVGDSKTDLPKLRSRVGMVFQHFELFPHLSIIDNLTVAQIKVLGRSDSVAQQKAMAYLDRVGLSAQAKKYPAELSGGQQQRVAIARALAMDPVCMLFDEPTSALDPEMIQEVLDVMVELAKEGMTMMCVTHEMGFASQVANRIIFMDEGHIVENCSKDEFFEGARSDRAQLFLSKILGH >NC_009524.1|WP_011959957.1|822506_823154_+|glutathione-S-transferase MNNKLGVLYSFRRCPYAMRARLGLLFAGVSVDLREVVLKNKPPQMLAISPKGTVPVLQLADGTVIEESRDIMLWALNQNDPQCLLDNTVGAQAKALIDQNDTEFKYWLDRYKYADRYPDMSQEAYRQKGEQFLRTLEALLTQHPYLFGERIGVADIAIMPFVRQFAHVDRALFYRLPYVHVQRWLRHWLEHPLFLQAMTKYTPWSEGDDVVVFGS >NC_009524.1|WP_011959968.1|831814_832081_+|Serine-protease-inhibitor-like-protein MGMPIAFDSRANYSLFNDKLPLKVDSVIHKAVVEVDEKGTVAAAATGIGVQLVMATHKAEITADHPFMFMIKDNKTDAILFLGQVNKL >NC_009524.1|WP_011959969.1|832464_833724_-|ferredoxin-reductase-family-protein MAVKSWQVISSIVLITSITVLMQIPSETWITSATVSLIMGASALACMASSCILASRWHGVERIFGGLDRVYEAHKWIAIWALVFAVYHFLFKAKLDSWELAPILELSKYWTRMVRQLSLVALGLIILLALNRKIPYGNWRWLHKFSGPLFLIVILHWLSFESPITLTSPAGIWLALLCSVGVIAALYKMVFYPFIAKAGEYKLVAISHGKAAVHLEFEPVDKRFPFKAGQFAFISLKEAGLREPHPFTIANAPSDNGRIHFVIRALGDYTKKLNEQAKVGMLADIYAPHGNFKRISNAEREIWIGAGVGISPFISWQEDKTIGHFERATLIYCFDPARVFPSVERMQEMTEQSGVDFVANPSGSNAMAETIRQVASEVNPKQIQISFCGPKGLLGKVQELMKENGIPAKNIHYEFFDFR >NC_009524.1|WP_011959970.1|834046_834655_+|cytochrome-b/b6-domain-containing-protein MSQKDTMNWDDDSSAPLSNTPKARQVKVWDILVRVTHWTVAAGIIANLFFTEDGGEWHEYVGYTVLGLVVIRLLWGLVGTRYARFTSFFPTPTRIKHHVSDLSVRRVDEQHLGHNPLAALMMLSLWAVIIGLGLTGYLMESGLFGDKEVLEEIHELLANSLYLLVPLHIIAAIAMSYWQRQNLIKSMITGKKTVTDKPTTMK >NC_009524.1|WP_011959971.1|834674_835349_+|response-regulator MARILLIEDDSTIADGIVLGLKSHGMMVDWFSDAKQGEIALQDGMFDAVLLDLTLPKGDGMTVLKNWRAKHIDTPVLIITARDAIANRVAGLNAGADDYLVKPFALDEVVARLQALMRRSQGRCQPEVRYGEVAYQPQNQQVSYQGKMVELTIKEVAILEQMLTHPKQIHSRASLEDKLYGWQQDIESNAIEVHIHHLRKKLGNDFILTKRGIGYYLNPVHNHH >NC_009524.1|WP_011959972.1|835413_836877_+|histidine-kinase MKSIQQRLLTSLLIGLPLLWVLTSSFIAWKLWHEINEMNDTQITQVARYLIGVAPKEEDDKDHHRQRDDNKKHTPKIYALKSKQLSGDLGEAEDDYMGFAIWDKKGRLLMADENGQSFAFLPDQHGFLEEHDSAYQRLNPFSKRWRLFYVHDDHDYEGRVIAVGQNLKSRREMITDAMSVQVLPMLIGLFAFMGLVVWLIRRGFMPLTQISSALEQRQPQDDSPITADVPKEIQPLVSALNVLFVKVADTLAREQRFTADASHELRSPLAALKLQADLLQQQILQLSGVEDDNQLFYHAQNISNGIERATHLVDQLLILAKIEPQQQLPPEQLESPDWLMLTDIVLSDVNRLAREKHMQLKRTVNCDNPADILPILINPILFKLLIRNLLDNAIRYCPEGALIELQLDTNAIRVVDNGSGVEPEQLTRLSERFYRPAGQSQLGSGLGLSIANRIAELHGLTLEFANRSQPETGFIVTIRHKKAISSI >NC_009524.1|WP_011959973.1|836976_837567_+|hypothetical-protein MSLPLLKPLLLTVGATSLVFFGGVIALSVQSPSADDALSAANAMSQNTDITSISSDLSSFKAVANPLTQSPFANPSPLAALTATQATALAQQDAPNSVLQASPELVNYNGTVAYEVLLDSGATYIDASVGTVLNPVATNDYRAERFDDDDYEDKHHDDDKRKEDKHRKAHDKKYYKENDRLIAMSYQQHDEEEYDD >NC_009524.1|WP_020444569.1|837559_837874_+|hypothetical-protein MTNTKSHSTPAVKKTAKKADPFAALKSSIMMVSIAGTMAGWLVLLNQEQKTAPVSTAIISTAVAESDERAVTPTPIADINQLRQVNAVAPVEVIRVVARTRSSQ >NC_009524.1|WP_011959975.1|837929_839012_+|FAD:protein-FMN-transferase MHTNMSNQTTPQLATIKLFAMGCHIQISLNTTRLSAQPSQMRIDQQVAFLTNDIQQRLADWEHIFSRFDDSSELMRLNNRGDQWSEVSSELFEVLQRAIHFVSKTQGLVTPTLLHPLWDAGYKHSFETLPKMSVPSLPVTSVSTPTNVQDTTSANHANQQIEGIQLRQLADRQHQVYLPAGMALDLNGYVKGWCAMQLAENISRVHDWHIPCLVDMGGDIAIGVPKNPTDKPVSWGVAVAKPYFANSEHVHNDEDVAILKLSSGAVATSGQDYRRWLHDGRWQHHLIHPHDLRPVTSDVLTATVLAKDAMTAEVYAKYCVLLGVKAAVAWLNKHHIAALLIDRDNKVMVTSAMRPNLLAS >NC_009524.1|WP_011959976.1|839075_839759_+|hypothetical-protein MHTDHPTSSHTASNTNVLTQALWVGLTLSIAIGVGGYASLTWGETVSQLLTSTDKHFWYLSRASGVIAYTLFWLAVIFGLLLSTRLGKRFNAARVFVLHQYLSLIAVGFAAFHAGILLADNFLNLNLWQVLMPFGFQTERVGVALGQLGFWFLFICAFSFYIKQYIGQSAWRWLHFLTFMAYMFISIHVFMVGSDSRALPLLLFYAGSQTIVFLLITYRIIALKQAR >NC_009524.1|WP_011959977.1|839840_840542_+|VIT-family-protein MHHSIHDEAHLSNRNHWLRAAVLGANDGLISTASLLVGVAAASANSQTLLLTGMAALTAGALSMAAGEYISVSSQADTEKADLDKELHELTHNAERELFELTKIYEKRGLDHVLAHQVAIALTEHDALEAHARDEIGLTDLSQAKPIHASVASGLSFIAGAILPIIGILLLPAQTLVWSLATLTIVGLALLGIISARLGGAPVIPATSRVVIWGVLAMVATSLIGRLFGVAAL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009524_1 | 1.2|831332|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT | 831332-831363 | 32 | NC_014172 | Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171, complete sequence | 301804-301835 | 6 | 0.812 |
NC_009524_1 | 1.2|831332|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT | 831332-831363 | 32 | NZ_CP012100 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence | 233556-233587 | 6 | 0.812 |
NC_009524_1 | 1.2|831332|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT | 831332-831363 | 32 | NZ_CP029455 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence | 415256-415287 | 6 | 0.812 |
NC_009524_1 | 1.6|831333|32|NC_009524|PILER-CR | 831333-831364 | 32 | NC_014172 | Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171, complete sequence | 301804-301835 | 6 | 0.812 |
NC_009524_1 | 1.6|831333|32|NC_009524|PILER-CR | 831333-831364 | 32 | NZ_CP012100 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence | 233556-233587 | 6 | 0.812 |
NC_009524_1 | 1.6|831333|32|NC_009524|PILER-CR | 831333-831364 | 32 | NZ_CP029455 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence | 415256-415287 | 6 | 0.812 |
NC_009524_1 | 1.2|831332|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT | 831332-831363 | 32 | NZ_CP023312 | Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence | 219535-219566 | 7 | 0.781 |
NC_009524_1 | 1.6|831333|32|NC_009524|PILER-CR | 831333-831364 | 32 | NZ_CP023312 | Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence | 219535-219566 | 7 | 0.781 |
1. spacer 1.2|831332|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014172 (Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tattagtaagtgacttaactatatcaatacaa CRISPR spacer ttttatcgagtgatttagctatatcaatacaa Protospacer * *** ..*****.***.**************
2. spacer 1.2|831332|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012100 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tattagtaagtgacttaactatatcaatacaa CRISPR spacer ttttatcgagtgatttaactatatcaatgcaa Protospacer * *** ..*****.**************.***
3. spacer 1.2|831332|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029455 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tattagtaagtgacttaactatatcaatacaa CRISPR spacer ttttatcgagtgatttagctatatcaatacaa Protospacer * *** ..*****.***.**************
4. spacer 1.6|831333|32|NC_009524|PILER-CR matches to NC_014172 (Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tattagtaagtgacttaactatatcaatacaa CRISPR spacer ttttatcgagtgatttagctatatcaatacaa Protospacer * *** ..*****.***.**************
5. spacer 1.6|831333|32|NC_009524|PILER-CR matches to NZ_CP012100 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tattagtaagtgacttaactatatcaatacaa CRISPR spacer ttttatcgagtgatttaactatatcaatgcaa Protospacer * *** ..*****.**************.***
6. spacer 1.6|831333|32|NC_009524|PILER-CR matches to NZ_CP029455 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tattagtaagtgacttaactatatcaatacaa CRISPR spacer ttttatcgagtgatttagctatatcaatacaa Protospacer * *** ..*****.***.**************
7. spacer 1.2|831332|32|NC_009524|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023312 (Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tattagtaagtgacttaactatatcaatacaa CRISPR spacer tcaaagtaagcgacttaacgatatcaatttaa Protospacer * ******.******** ******** .**
8. spacer 1.6|831333|32|NC_009524|PILER-CR matches to NZ_CP023312 (Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tattagtaagtgacttaactatatcaatacaa CRISPR spacer tcaaagtaagcgacttaacgatatcaatttaa Protospacer * ******.******** ******** .**
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
214402 : 275700
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009524|214402:275700|DBSCAN-SWA 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58 | Phage_Gifsy-1(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
829317 : 874449
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009524|829317:874449|DBSCAN-SWA 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47 | uncultured_virus(22.22%) | integrase,transposase,protease | attL 830661:830680|attR 868347:868366 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1215177 : 1291193
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009524|1215177:1291193|DBSCAN-SWA 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45 | Acinetobacter_phage(23.08%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1300723 : 1382610
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009524|1300723:1382610|DBSCAN-SWA TATGAAAACCCTCAAGCTACGCATCAAAGACAAACATGCAAACCAGCTAAACAAACTAGCTGGGAGTGTTAACTATGCGTGGAACTATGTTAATGCGTTAAGCTTTGAGCATTTAAGACGCACAGGTAAGTACTTTTCGGCCTATGATTTAAGCCAATACACCAAAGGCAGTGGAGAGTATTTAGGCTTGCACTCGCAAACTTTGCAAGCCATCAACGAAACTCATGCCAAATCTCGTAAGCAGTTTAAAAAAGCCAAACTTAATTGGCGAACCAACCGACCCGATGCCAAACGCAAAAGCTTAGGTTGGATACCTTTTAAAAAGTCTGCCATAAAGTATCTACATACCAGACAAACAGGTAAAAAAGCACTTAAATCAACCATACAGCTATCGCTCTGTAAAGGTCAAAAGCTTATCATAGACGTATTTGATAGCTATAATCTAAGCCTATATCAAATCAATACGCTTGAGATAGTGCAAGACAGCCGTAATCGTTGGTATGCCTGTATTACCGTTAAAGACCATCCTAAGCAAGCAAGTGGTATGGTCAGCGTTGGTATTGATTTAGGCTTAAAGCAGTCTGCTACCACCTCAAATGGCGACAAGCTAACTATTAAGCAGACCCAAAAATGGGCTAAAAAGCTTGCCATTGCTCAACGTGCTAAGAATAAAAAGCGTGTCAAAGCAATCCATGCCAAAATTAAAAACTCAAGATTAGACTTAATTCACAAATTCACCACCAAGCTAGTTCAAAATAATGCTTTAATTGTGGTTGGTGATATTAAATCACGCTCATTCACTAATTCGATGACCAACCTAGCTAAATCGACATACGATGCAGGATGGTTTGAACTCAAAAGACAACTGGAATATAAATGCAAGTATGCAGGTTGTCAGCTTGAGGTAGTGAATGAGAGTTACACTACCCAAACCTGTTCGCACTGCCTTAAAATAAGTGATAGTAGTCCAAAAGGTAGAGCAGGTCTTGGAATAAGAGGATGGAGGTGTGCTGAGTGTGGCACATGGCATGATAGAGATATCAATGCTGCCAAGAACATCCTTGCGGTCGGGCTTGACCGTCTAGTTGTAGGAATCCCCTCGGTTTAGCGAGGGGAGGAAGTCAAACATCAAGCACTCATGGTGTATCAGATCATCATGTGTCTTAGGGGTACCATGCTGCTTTAAGTACTTTGGGGCGGCACAGATTATCCATTGGCTGTCTATAAGGCGTCTGGCAATCAAGGATGAGTCCTCAAGTTTGGCGGTTCTGATTGCCAAATCAAATCCTTCTTCTATGAGATCTACCAGTCGATTGGTGATATTAAGCTCCACTGAGATGTCAGGATACTTTTTGCAAAAATCAGCAATAGCATCGCTCAATAATAAATTGGCGGAGACCACAGGCATGGTAATACGTATTAGCCCCTTCATATCTTCACCGTAACGGGTCACCGCATTTTGCGCTTCTTGAAAAGCTGACTGAGCAATTTTTGCTTTGTGATACAGCGTCCGTCCGGCATCAGTCAAGCTCAGCTTTCTGGTGGTTCTGTACAAGAGCTGCGTATTTAAACTCTCCTCAAGTCGAGCAATACGTTTACTCACCACCGAGTTGGTTAAACCCAGTTTGTCAGCGGCTTTAGAAAATGAGCCGTCATCGACCACTTGGACGAATAACACCATATCATCAGCTTTGACCATATTTGTTCTCCAATGGGCGTAATAGAATGGTGATTATAGCAAAAAAGGAAAATAACCTTGTCCGTTTTGGCAATATATCACTCCCTAAGTAGCCAGTAGAATGCTATAGAGCATTTTACTCTCGTCAGCTGCGACATTCAGAGACACGATATGCACCGGTGTCATTGTGAGGGCAGTACTTTATATTCTTAATTATCAAGGGCATTGATGTTATGAGCGATATTCAATCAGCAGGCAGTACGGATCATATTTTCCCCTCAAAGCGGGTGACTTTGGGTACACTGACGCCCGATCAGGTGCTGCAACAGCTCACCCAACTGTTGGGTGCGGCTAATATACAAGCAGATCCCACAAAAAACGAATACTACCGAATGGGGTGGCGCTCTGGTGGCGGCAGTGCTTTGGCGGTATTGTTTCCGCAGACTTTGCTGCAGATTTGGCAAAGCTTAGAGGTCTGTGTGGCAGGCGACTGCATTATCATCATGCAAGCGGCCAAAACAGGTCTGACAGAAGGCTCAGCACCCAACGGCGAGGATTATGATCGACCGGTTATTGTTATTAATACACTGGCCTTAAATCAGCTGTATTTGGTCAATAATAACCAGCAGGTCATCAGCTTGCCAGGCGCCACATTGCATCAGTTACAAAAGCAGCTCAAGGCGGTCAATAGAGCGCCGCACTCAGTGATAGGATCATCGACTTTGGGCGCGACTATCGTGGGCGGCGTGTCCAATAATTCAGGTGGCGCTTTGGTAAAAAGAGGACCGGCTTACACTGAGCTGGCGTTATTTGCTCAAATCAATGAACAAGGTGAGCTGATATTGGTCAATCACTTAAATATCGATCTTGGGGCGTCGCCAGAGCAAATCCTAACCAATCTACAAACCGGTAACTTTGATAAAACCAAGCTGTCAGATAATGGCAAAATGGCTTCGGACAAAGAGTATGTGGCCCGTGTCAAAGATGTCGATGCAGATACGCCAAGCCGATTTAATGCAGACAAAAGAAGACTTTATGAGGCCAGTGGCTGCGCCGGCAAGCTGGCAGTTTTTGCAGTGCGCCTGGACACTTATCCAATAGCTGCCCAAGAAAAAACGTTTTATATCGGCAGCAATAGTATTGGTGAGCTTGCACAGTTAAGACGACAGATACTCTTAGGCTTTACCAATATTCCTGAAGTTGGCGAGTATATGCACCGTGATATCTTCGATGTCTCAACCAAATACGGCAAAGATACTTTTTTAAGTATTAAGCATTTAGGCACTGATACCTTGCCCAGATTGTTCTCCATCAAAGGCGCTATTGATGCGAAGCTGAACAAATGGTCTTGGATGCCAAAACATTTCACCGATAAAGTGATGCAGTTTATTGCCAATATTTTTCCCAACCATTTGCCCAAGCGAATGACGCAATATCGCAATAAGTACGAGCATCATCTTATCCTAAAAATGAGCGATGCAGGCATAATAGAGGCTCAGGTATTCTTGGAGAAGTTTTTTGCCGACTCGACAACCGGAGATTATTTTGAGTGCAGCGATGAGGAATCAGAAAGTGCGTTTTTACATCGTTTTGCCGCTGCTGGCGCCGCTTTAAGATATGAGGTGATACATCAAGAGGAGGTCGGCGATATATTGGCACTAGACATCGCCATTCCTCGTAATGAGTTAGCTTGGTTTGAAGCGCTACCAGAAGAGATTAATCAGCATTTGGAGAAGAAGCTGTATTACGGACATTTCTTTTGTTACGTGTTCCATCAAGACTATATCTTAAAAAAAGGCAGCGATGCTCAGCAGGTCAAGCACTTCATGCTTGAGCTTTTAAACACCAGAGGGGCCAAATATCCTGCTGAGCATAATGTGGGTCACTTATATGAAGCAGAGCCTGATTTGCAAAACTTCTATCAGCGCTTAGATCCCACCAATAGCTTTAACCCTGGCATTGGAAAAATGTCAAAAACCAAGCGCAATTGTTCTTGCTGTTTGTAAATAGCGGCTAAAAATGTCTGATCCATAGGCGGCGTTATTGGACAACAAATGCCAGTTGAATACAACGATACGCTAAATTATTCACTTGTTTTTTAGACATTTATAGAAATCGAACACTGAATGTATTACAGTAGGGGCATTAATGAAATACACTTAAAAGGAATTAGAATGATGAATCATTACAACGCCGCTGCCCATGCTTACCAATTTCCACTGACCATCAAGCAGTTATTAAACCGCTCAAAAGTCACTTCGCAAAATGAAGAGATTGTCTATGCGGATAAAAAACGCATGACCTATACGGAGCTGTTCTCACGTATCGGTAAGCTTGCCAATGTCCTAGACAGTCTTAATTTAGATAAAGGGGATGTGGTGGCGGTGATGGACTGGGACAGCCACCGCTTTTTGGAGTCTTACTTTGCCATTCCCATGTCGCAATATGTGCTGCAGACCGTCAACATCCGCTTGTCTCCAGACAAAGTGCTGTACACTATTAACCATGCCAAGCCCAGAGTGCTACTGCTAAACTCTGAGTTTGCGCCTATGGTAAAAGACTATCAGTTTGAGAACTCGTCGATTGAGCATATTATTTGGCTCGATGACAATGGGGTTAGTAGTGAGGGCGTGTTTGGTAATAACCAAGCACGGTTGTTAGGTGAATATGAAGCGCTGCTTGCCGAGGCCAGTGATGAGTTTGAGTTTCAAGATTTTGATGAAAACACCATTGCCACCACCTTTTATACCTCAGGCACCACGGGCAATCCTAAAGGGGTGTTCTTTAGTCACCGTCAAATTGTACTGCATGCGTTAGCAGAAGCGGCAACCTTGGGTATATTGCCACAAAAGCAAGGGTTAGTGCTTGGCGATGTGTATATGCCGATGACACCCATGTTCCATGTGCTGGCATGGGGCTTTCCTTATACCGCAACCATGCTGGGCATGAAGCAGGTGTATCCGGGTCGTTATATGCCTGATGTGATGCTAAACTTAATTGAAACCGAGAAGGTGAGTATCACCCACTGCGTGCCGACTATTTTGCAGATGTTACTGAAGCAAGCAGAAGCTGAAGGCAAGCGCTTTGATGGTCTAAAAATGATCATTGGCGGCTCACGCTTAACCGAAGGCTTGGCAAAAACAGCCCTGTCAGCCGGCATTGAGGTATATACCGGCTATGGCATGTCGGAGACGGCGCCACTGATTAGTTTGACTGAATTTAGATCAGATGATCCTGAGATGAGTCTAGAGGAAGAGGCGAAGCGACGTAGCCTAACCGGCAAGCCGGTCATAATGGTGGAGGCCAAAATTTGGGATGGTGA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>NC_009524|1300723:1382610|1373669_1373930_+|WP_011960376.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKRMTETQIVSILKEADAGIPAKDLCRKYGIASSTFYKWRSKYGGMEASDVKRLKELEEENRRLKQMYADLSLKAQMQEEIIKKL |
47 | Bacillus_phage(16.67%) | integrase,transposase | attL 1370975:1370990|attR 1389697:1389712 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1391636 : 1397746
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009524|1391636:1397746|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009524|1391636:1397746|1395811_1396342_+|WP_011960396.1|DBSCAN-SWA MTPLKILYICTHNRCRSALSEAITNQYQPQQGAQSKTDQKLLVAKSAGSAPVGQVHPLTLEYLTQAGYSVEGLTSNGWDDKEYMQGFEPDVLITVCDNAAGEQCPLWLGNIPNLVKLHWGLSDPSKDTQDATKTAQNFAKTIAIIEQRVAKLHQIASAELSAEARKQALLDLVHHV >NC_009524|1391636:1397746|1397308_1397746_+|WP_011960398.1|DBSCAN-SWA MLDLDINFGLMGYHLLKLFIAFLLSLPIALNREMKDSGAGLRTFPLVTIASCAFMLVGMDIYKGDAEARIMYAIITGMGFIGGGAIFKTEDGARGTATAASLWNTAAIGISVATGRYEIAIILSVVGFVILQFSEPFKVKDNRLP >NC_009524|1391636:1397746|1393639_1393909_-|WP_011960394.1|DBSCAN-SWA MVSSVTFFKALSDPTRLKLMLQLREQDMLCVCHLTEHLQQPQPTISRHLSHLKKAGLVTCERRGTWMWYAINPDLPQWCQDIIHRMPQI >NC_009524|1391636:1397746|1392551_1393514_-|WP_150097870.1|DBSCAN-SWA MTRFATDSALDLAVDTAITPEPDTSSTPAPHKPAILACIDGSSVTESVCDYAAWYARELKLPISLLHVIDVPKSYRHDLSGSIGMDSRNTLLQQLTLLDEQSARVANQHGEALLQDAKAHILINLPQANVYRYLRRSKLLAAIQHFIDDSKMIILGRRGRDHQGDHMTIGSQIESVVRAVDCPILICSDGFITPDSYMIPFDGSETAKKAVQKVCDNKIAKNLTGHIVMVDNKNSVHESALYKAQKQLSDAGFEVTAHLISSEKYGEGDVVSALTAFRNQHNISMFVIGAYGHAKWRRFFVGSTTTKLLTKTTAPVMLLR >NC_009524|1391636:1397746|1394234_1395539_+|WP_011960395.1|DBSCAN-SWA MVLAALIFVVTLVLVIWQPKGLGIGVSASLGALAALLMGVISLADIPVVWDIVWNATFAFIAIIIISLLLDQAGFFEWIALHVARLGGGNAKLLFVLIVLLGAVVSALFANDGAALILTPIVIAMLLKMRVSAATTLAFIMAAGFIADTASLPLVVSNLVNIVSADFFNLSFDRYAQVMLPVNMVSVLSSLAVLYFFYQKDIPATYEVANLPSPHSVIKDKATFVTGWVVLAALLVGFFVLEPRGVPISLIAAIGALVLILTALANKKLSVSSVLKGAPWQVVVFSLGMYLVVYGLKNEGLTGYLTQALNALGGQGLWAATIGTGFMSAGLSSIMNNMPTVLMQSLAIADVNTSTFSEPEQIHQAMVYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLASKEVVITWGYYFKVGVILTVPVLLATLMALALWLPMIS >NC_009524|1391636:1397746|1396507_1397257_+|WP_011960397.1|DBSCAN-SWA MSKIREFDDLPNIDPEQFHIPHINDFKRELSSHKPKFVLLYGSLREVSYSRLVVEECARILQAMGAEVKIFDPTGLPLPDSEEVTHPKVSELRELVQWSEGMVWCSPERHGAMTGIMKAQIDWIPLSLGAVRPTQGKTLAVMQVNGGSQSFNTVNQLRILGRWMRMITIPNQSSLPKAFLEFEDVENADGSISKRIKPSGYYLRIVDVMEELVRFTLLTRDHAPYLVDRYSERVESAEALMQRVNQNNL >NC_009524|1391636:1397746|1391636_1392359_+|WP_011960392.1|DBSCAN-SWA MSIDIQNVHKSFGNFVALENISLSVPTGKLTTLLGPSGCGKTTLLRIIAGLEYSDSGRILFDGVDVTDTPVQKRHIGFMFQHYALFRHKTIAENIAFGLKLLPKDQRPSSSDIKKRVEHLLELVQLPTLANAYPHQLSGGQRQRIALARALAVEPKLLLLDEPFGALDAKVRKELRTWLKTIHHELGVTSIMVTHDQEEARDVSDEIVVMNHGSVEQIGTPEALIAKPANAFVADFLDLV |
7 | uncultured_Caudovirales_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1611737 : 1667099
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009524|1611737:1667099|DBSCAN-SWA 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53 | Acinetobacter_phage(11.11%) | integrase,transposase | attL 1611672:1611731|attR 1652060:1653337 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1785231 : 1865738
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009524|1785231:1865738|DBSCAN-SWA 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57 | uncultured_virus(21.43%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2057781 : 2066406
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009524|2057781:2066406|DBSCAN-SWA 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TGCCTCGCTCGCATAAGATAATCTTATCGTTACCTGCTTCTAGACACTTATTAATGATATGGCGCATTTCGTGAGGGGCTAAGAACTGTGCCTTTTTGATATTAATAATTGCCCCTGTTTTGGCCATAGCTTGTACCAAATCAGTCTGACGACTCAAAAACGCTGGCAATTGAATAACATCTGCCACCTCTGCCACAGGCTCGGCTTGATACGGCTCATGTACATCTGTGATGATGGGCACATTGTATTTTTCTTTGATTTGACTCAGCCAGTCCACCCCTTTTTCTAAGCCGGGTCCACGGTAAGAGTTTAAGCTTGAGCGGTTGGCCTTATCGAAGCTGGCTTTGAATACATAACCGATACCCAAACGATTACAGATATCGATATAACCTTCTGCAATTTCAAAGGCCAGCTCCTTGGATTCTAATACGTTCATACCACCGAACAACACAAAAGGCTGATCATTGCCAATGGTCATGTCGTTTAACTGAAGATGCGATTGTGCTTGAGTTAATGCCGTCATAAGGGACTCTTTTTATTTTATGAAAGGGACGAATAAAGGGTTGTTACCAAGCTGCATGGTATCCCCATAGCGTAGGTTACCCATAGCGTAGCAAATACAAACCTTGAATACAAAAAGGGTGATAAAATTAAGTTTGACTTCCTCCCCTCGCTAAACCGAGGGGATTCCTTCTACAAGACGGTCAAGCCCGACCGCAAGGATGTTCTTAGCAGCATTGATATCTCTATCATGCCATGTGCCACACTCAGCACACCTCCATCCTCTTATTCCAAGACCTGCTCTACCTTTTGGACTACTATCACTTATTTTAAGACAGCACGAACAGGTTTGGGTAGTGTAACTCTCATTCACTATCTCAAGCTGACAACCTGCATACTTGCATTTATATTCCAGTTGTCTTTTGAGTTCAAACCATCCTGCATCGTATGTCGATTTAGCTAGGTTGGTCATCGAATTGGTGAATGATCGGGATTTAACATCACCAACCACAATTAAGGCATTATCCTTAACTAATTGGGTGGTGAATTTGTGTATGGCATCTAATCTTGAGTTTTTGATCTTGGCATGGATTGCTTTGACTCGCTGTTTGTTTTTCGCTCTTTGAGCTATTGCAAGCTTTTTAGCCCACTTTTGCGTTTGTTTGGTTGTCAGCTTGTCACCGTTTGAGGTGGTAGCAGACTGCTTTAAGCCTAAGTCAATACCAACGCTGCCTTTGCCACTTGCTTGTCTAGGAAAATCTTTGACGGTAATACAGGCATACCAACGGTTACGGCTGTCTTGCACTATCTCAAGCGTATTGATTTGATACAAAGACAAATTGTAGCTATCGAATACGTCTATGATAAGCTTTTGACCTTTACAGAGCGATAGCTGTATGGTTGATTTAAGTGCTTTCTTCCCCGTTTGTCTGCTACGTAGATACTTGATAGCAGACTTTTTAAAAGGTATCCAGCCTAAGCTTTTTCGTTTGGCATCGGGTCGGTTGGTTCGCCAATTAAGTTTGGCTTTTTTAAACTGCTTACGAGATTTGGCATGAGTTTCGTTGATGGCTTGCAAAGTTTGCGAGTGCAAGCCTAAATACTCTCCACTGCCTTTGGTGTATTGGCTTAAATCATAGGCAGAAAAGTACTTACCTGTGCGTCTTAAATGCTCAAAGCTTAACGCATTAACATAGTTCCACGCATAGTTAACACTCCCAGCTAGTTTGTTTAGCTGGTTTGCATGTTTGTCTTTGATGCGTAGCTTGAGTGTTTTCATAGGGTTAGTATGGCGAGGTTAATTTTAACTTGCAATACTTTAAGTACTGATCACGACAGTGTGTGTCGCCTTATATCCACCCCCTGAAGTGGGTGGTTTTACGGCGACCGGTGATAAAATACCTGCCAATAAAAAAGAGGTCGGGATAACCAAACCTCTTTTTTTATATAACGCTTAGAGCCTCACTGTCAGCTATAGACAGCTTGGCGCTGCCTTAGATATTTTGATGGTCAATGGCTGCTTTTACAAAGCTTGCAAACAAAGGATGACCTTCGCGTGGCGAGCTGGTAAATTCTGGGTGGAATTGCACCCCGATAAACCAAGGATGATCCGCAATCTCTACCGACTCGACCAAATGCTGCTTGGCAGAATAACCTGAGATGCTCATACCTGCCTGCTCTAACGGCTCAATATAACGATTATTCATCTCGTAGCGATGGCGATGACGCTCAGTAATTAACTTAGCACCATAGATTTGATGTAGTTTTGAACCCTCTACCAACTCAGCTTTTTGGCTACCCAAACGCATGGTACCCCCTAAGTCTGAATCATCAGTGCGAACTTGCAACTCACCTTTTTCATCCAACCACTCAGTGATTAAACCAATAATAGGCTCAGCCGCTTTACGATTAAACTCTGTAGAATCCGCCTCTAGACCAAGCACATTGGTGGCATATTCGATAACCGCCAACTGCATACCCAGACAGATACCCAAATAAGGCATTTTGTTCTCACGAGCAAATTTAATAGCGCGCATTTTACCCAATTTGCCACGCTCACCAAAGCCGCCTGGTACTAAGATAGAATCTGCTTGCTCCAAACGTGCTAACAGGCTGTCATCCGTCTCTAAGGCTTCGGCATCTACATAATCAATCTCAACTTGGGTTTTGTGAGTGATACCTGCATGCAATAAAGCTTCGTTAATTGACTTATAAGCATCTGGTAATTCAACATATTTACCAACGATGGCAACCGTCACTTTGCCTTGGGCATTTAGCAGACCATCTACTACCTTATCCCAATCTGACAAATCGGCTTCTGGCGCATCAATACCAAAGCGCTCACAAATGATGTCATCTAAATCTTGCTCATATAGGGTGCGAGGAATCTGATAAATGGTGTCGGCATCTTCACAAGTAATGACCGCGCGCTCTTCTACATTGGTAAATAGTGCAATCTTGCGACGGTTCTCTTCACCAATCGCATGTTCAGAGCGGCAAATCAACACATCAGGCTGCAAGCCAATTGAACGCAGCTCTTTTACTGAATGCTGAGTGGGCTTAGTCTTGGTTTCACCAGCACTTGAGATATAAGGCACTAACGTTAGGTGCATAAGCATAGCACGGTTGCGACCTAACTCCACTTGCATCTGACGTACCGCTTCCATGAAAGGTAGTGACTCAATATCACCCACAGTACCGCCAATCTCGATAATGGCAATATCATGGCCTTCACCACTGGCATGAATGCGGTGTTTAATCTCATCAGTAATATGCGGAATAACCTGTACAGTACCGCCTAGGTAGTCACCACGGCGTTCTTTATTTAATACGGTTTGGTAGATACGGCCACTGGTAAAGTTATTGGTTTTACTCATTTTTGAGTGGCGTAAAAAGCGCTCGTAATACCCTAGGTCTAAATCCGTTTCAGCACCATCCTCAGTAACGAATACCTCACCGTGCTGGAAGGGGCTCATGGTACCTGGATCGACGTTGATGTACGGATCCATTTTGGTCATGGTCACTTTTAAACCACGTGCTTCCAAAACGGCCGCTAAAGAGGCTGCGGTAATACCTTTACCTAGTGAGGACACAACCCCACCGGTCACAAATATAAATTTAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009524|2057781:2066406|2062442_2063303_-|WP_011960886.1|DBSCAN-SWA MTALTQAQSHLQLNDMTIGNDQPFVLFGGMNVLESKELAFEIAEGYIDICNRLGIGYVFKASFDKANRSSLNSYRGPGLEKGVDWLSQIKEKYNVPIITDVHEPYQAEPVAEVADVIQLPAFLSRQTDLVQAMAKTGAIINIKKAQFLAPHEMRHIINKCLEAGNDKIILCERGTAFGYNNLVVDMLGFDTMKQMDVPVFFDVTHSLQQPGARSDSAGGRREQITTLARAGMATGLAGLFLEAHPEPEVAKCDGPCALRMSQLEAFLSQLKQIDDLVKGFSVLDTH >NC_009524|2057781:2066406|2064774_2066406_-|WP_011960888.1|DBSCAN-SWA MTKFIFVTGGVVSSLGKGITAASLAAVLEARGLKVTMTKMDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTEDGAETDLDLGYYERFLRHSKMSKTNNFTSGRIYQTVLNKERRGDYLGGTVQVIPHITDEIKHRIHASGEGHDIAIIEIGGTVGDIESLPFMEAVRQMQVELGRNRAMLMHLTLVPYISSAGETKTKPTQHSVKELRSIGLQPDVLICRSEHAIGEENRRKIALFTNVEERAVITCEDADTIYQIPRTLYEQDLDDIICERFGIDAPEADLSDWDKVVDGLLNAQGKVTVAIVGKYVELPDAYKSINEALLHAGITHKTQVEIDYVDAEALETDDSLLARLEQADSILVPGGFGERGKLGKMRAIKFARENKMPYLGICLGMQLAVIEYATNVLGLEADSTEFNRKAAEPIIGLITEWLDEKGELQVRTDDSDLGGTMRLGSQKAELVEGSKLHQIYGAKLITERHRHRYEMNNRYIEPLEQAGMSISGYSAKQHLVESVEIADHPWFIGVQFHPEFTSSPREGHPLFASFVKAAIDHQNI >NC_009524|2057781:2066406|2063453_2064560_-|WP_011960887.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTLKLRIKDKHANQLNKLAGSVNYAWNYVNALSFEHLRRTGKYFSAYDLSQYTKGSGEYLGLHSQTLQAINETHAKSRKQFKKAKLNWRTNRPDAKRKSLGWIPFKKSAIKYLRSRQTGKKALKSTIQLSLCKGQKLIIDVFDSYNLSLYQINTLEIVQDSRNRWYACITVKDFPRQASGKGSVGIDLGLKQSATTSNGDKLTTKQTQKWAKKLAIAQRAKNKQRVKAIHAKIKNSRLDAIHKFTTQLVKDNALIVVGDVKSRSFTNSMTNLAKSTYDAGWFELKRQLEYKCKYAGCQLEIVNESYTTQTCSCCLKISDSSPKGRAGLGIRGWRCAECGTWHDRDINAAKNILAVGLDRLVEGIPSV >NC_009524|2057781:2066406|2061861_2062083_-|WP_011960884.1|DBSCAN-SWA MSLETTTIHIEGMTCGGCVKSVEGAVSQLSAVQSIDVDLAANQAVVSFDNDVTSIESVLEAIEDAGFDATVAR >NC_009524|2057781:2066406|2057781_2059098_-|WP_011960882.1|DBSCAN-SWA MYAENITNAVEIQDIRAREILDSRGNPTIEADVILADGSMGRAAAPSGASTGSREALELRDGDKSRYLGKGVTKAVANVNSQIRSALLESDATDQQGIDNILIELDGTANKDHLGANAMLAVSLATAKAAAISQNLPLHQYIANLRGQTSLTMPVPMMNILNGGEHADNTVDIQEFMIEPTGFSSFSEALRAGVEIFHSLKSVLKSQGLNTAVGDEGGFAPNLRTNEEAITVIMQAIEQAGYKAGKDIHLALDCAASEFYKNGQYILAGEGNKTFDSQGFSDYLVKLTEQYPIISIEDGLDESDWEGWAYLTSKLGKKVQLVGDDLFVTNPAILQEGIDKQIANAILIKFNQIGTLSETLDAIYLAKKNGYATVISHRSGETEDSTIADLAVGTAAGQIKTGSLCRSDRVAKYNQLLRIEQQVRASYRGGEEFIGLRG >NC_009524|2057781:2066406|2059337_2061590_-|WP_049751094.1|DBSCAN-SWA MNEPPRDDLAKTQFQIEGMSCQACATRIEKVLNKKPAIESASVSFAGETLNVAYHPNQASIDQITEWVGKTGFTARPMIDNQIPQPIEQAMDWRLLLIWLCMIPFLIGMAGMLVGQGMHWMPPLWLQFVLATLVQFGLAGPFYRSAWASIKGGLANMDVLVVIGTFTIWAYSTYIWFDSLGVNLADSSSFTLSWADILHSHTAHIPVYFEAGVMIIAFVKLGKYLEQRTKKHSLNSINMLLELTPTTVERRVGSKSPDTDTTFEQVSLAQVHKGDVLRAKQGARVATDGIVVSGEGWCDESHLTGESVPVSKKVGDKVLAGAMIDNGSLNYQVTATGSETQLSDMVKALSEAQGSKADLARLADKVAAVFVPVVVMIALVTFGLTWWLTGAMDKAVLHAVSVLVIACPCALGLATPAAIMAGMGVAARNGVWFKDAQSLEVAGSIDTVVFDKTGTLTKGKPHIVASMMVNNQINSDDVLQLAASVEAHASHPLATAVVNAAAERGITLLAASQVDVVAGMGIQANVEGFGLVKVGTAEFTGLKLPKQLPKAWVIASTIAVSVEDMPLGIFALADELKPESLEAVQTLKADGLEVVLLSGDKPTVVSHVAEQLGIMVAHGDLKPRDKSQWIENYQQLGHKVAMVGDGVNDAPAMATAYASFAMLDGTEVAKHSASARLMGHSIMQVHSGVDIAQTTVRNIKQNLFFAFIYNCLGIPLAAFGLLNPMIAAAAMALSSISVLMNALRLTRYKV >NC_009524|2057781:2066406|2062150_2062399_-|WP_011960885.1|DBSCAN-SWA MARQQVQFSIKNIDDDYGIDSLMTALKNIDGVVAAELLPDSQSGRVEFEDTKTSSHAIEAALSMVDYVTQPFPEGAPQNPDT |
7 | uncultured_virus(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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