Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009617 | Clostridium beijerinckii NCIMB 8052, complete sequence | 6 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,DinG,RT,WYL | 0 | 3 | 10 | 0 |
1. NC_009617
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009617_1 | 1015037-1015137 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009617_1
|
1 spacers
spacers of NC_009617_1
>1.1|1015061|53|NC_009617|CRISPRCasFinder TCAATTCACATATGAAAAAGTGTGAAGCACAATTAAGAACAATTCATATATGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009617_1
The CRISPR arrays of NC_009617_1 >merge|NC_009617|1|1015037-1015137|CRISPRCasFinder AAAAAGTGCGAAGCACAATTAAGATCAATTCACATATGAAAAAGTGTGAAGCACAATTAAGAACAATTCATATATGAAAAAAGTGCAAAGCACAATTAAGA >NC_009617|1|1|1015037-1015137|CRISPRCasFinder AAAAAGTGCGAAGCACAATTAAGA TCAATTCACATATGAAAAAGTGTGAAGCACAATTAAGAACAATTCATATATGA AAAAAGTGCAAAGCACAATTAAGA
>NC_009617.1|WP_011968177.1|1014158_1014818_+|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MRMRKKPWARPELEGCDFFVINPKEYKGKWKEFFGNDKPIYLELGCGKGTFMAVHASENPDINYIAIDIKDEVLGLAKRNIEKAYEEKNRKTDNVKLMAQEIGLISEILSEEDVVSRIYINFCNPWPKEKHKKRRLTHMRQLEQYKTFLKSEGEIYFKTDDDELFEESLEYFNEAGFRIKYITYDLHNSDVEGNVQTEHEKMFSEQGIKIKFLIAMKDN >NC_009617.1|WP_011968176.1|1012186_1013737_+|nitrite/sulfite-reductase MKELKEKLLIEIEEFRELGNKFLSGEVSIMDFKKVSGGMGVYSERNKKEFMIRLRIPSGISSFENMNWLCDIADKYNLDKFHLTTREAVQYHNLTIDQVCGIMKDGIDNDIYSRGGGGNFPRNVAMSPLSGVDKDEAFDVTPYALTVNKHFLNKITSYKFPRKFKVSFSSSDSDQGHCNVADLGFLATIKDNEKYFRVFMGGGIGRNPQVAVEYDELIKPSDVLYHVEAMTSLFIKEGNYEDRNKARIRYILERMGKEKFIETYKEHLKYVLDNNALDLFVESKEITKEGKEIELKHSRLYSQKQKGLYSVYFHPIGGQISVKTLREILDKLKVVKDLEIRLTMTEGLYFRNLNGDEAKEILDLTQNIGGETALQQSVSCIGVPICQVGILESQKMLNNIINYFAEKGYNKDILPRVHISGCGNSCAVHEVVGIGLTGKRKKVVDVVEDVFELHINGSFETGSARLGKVYGDLLASEIPEFLYELSLYIENKNMNFYEFVENNEEELLKIIEKYKK >NC_009617.1|WP_011968175.1|1010892_1012026_+|molecular-chaperone-DnaJ MANKDYYELLGLQKGASDDEIKRAFRKLAVKYHPDRNQGNAEAEEKFKEINEAYQVLSDPEKKAKYDQFGSAAFDGSGGFGGGGFGGFDGFDMGGFGDIFESFFGGGGSNSRRRNGPVRGNDIEYTITLTFEEAVFGVEKEISVTRNENCEHCHGSGAEPGTNAKTCPTCSGSGQVRVQRQTPLGSFVSTSTCDTCRGTGKIIEKPCSECRGKGSVRKTRKIKVNIPAGVDTGNVMPLRGQGEHGLRGGSPGDLYVRINVTPSKVFTRKGNDVYIDAHISMPKAALGTEITVATVDGNVKYTVPPGTQSGTMFRLKGKGIQRVNSNGKGDQYVKVIVDIPKTLNKEQKEALYDFMRASGEEFDEANVPKKKLFGKNK >NC_009617.1|WP_011968174.1|1008937_1010782_+|molecular-chaperone-DnaK MGKIIGIDLGTTNSCVAVMEGGEPTVIANSEGARTTPSVVSFQANGERLVGQVAKRQAITNPDKTVISIKRHMGTGYKVDIDGKQYSPQEISAMVLQKIKADAESYLGETVTQAVITVPAYFNDSQRQATKDAGKIAGLEVLRIINEPTAASLAYGLDKTDSAHKILVYDLGGGTFDVSILDLGDGVFEVLSTNGDTKLGGDDFDEKIMKYIADEFKASNGIDLMQDKMAVQRLKEASEKAKIELSASQQTNINLPFITADATGPKHIDLTLSRAKFNEITHDLVERSIEPMRKALADAKLSLNDIDKIILVGGSTRIPAVVEAVKNFTGKEPSKGVNPDECVAVGAAIQAGVLTGEVKDVVLLDVTPLTLGIETAGGIATPLIERNTTIPTKKSQVFSTAADNQTSVEINVVQGERQMAMDNKSLGQFTLSGIAPAPRGIPQIEVTFDIDANGIVKVSALDKGTGKEANITITASTNLSDDEVDKAVKEAEKFAEEDKKRKEKVEAVNNADQTIYQIEKTLNEVGDKATEDEKAAVRAKIEDLKKVKDGDDVEATKAAIEAVNQSFYPIATKMYQQAGGAEGAADPNAAAGGAQSAPHDDNVVDADFKVDEDK >NC_009617.1|WP_011968173.1|1008208_1008832_+|nucleotide-exchange-factor-GrpE MEENRDVKNEELEKEEIADEVAEKDNETQESNDAAETNEASKEASENIEAAEEDQEDLVKNQEEENKKLREELDATKDRLLRLTAEYDNYRKRTAKEKEGIYSDAYVDVLKEIVPILDNLERAVAADGSIEDLKKGIEMTIKGCKDSFAKLGVEEIDATGEFDPNLHNAVMHIEDEELGKNVVAEVFQKGYKKDDKIIRHTMVKVAN >NC_009617.1|WP_011968172.1|1007142_1008171_+|heat-inducible-transcriptional-repressor-HrcA MSIDDRKIRILQAIINDYIRTGDPVGSRTIAKNYNLGIGSATIRNEMADLEDMGYLEQPHASAGRIPSSKGYRLYVDQLMDNQMLTVEEDLRIKQYIIDSAMLEVDKIVKQTSALLSELTKLTCVIETPSVKRSFIKSIQLIKVDDHNLVSVFLTDTGVIKNHIMKLNNRVPEVETLTRINEVINNRLVNLSIQEINLEVINNLKKDLGAYEEIFNALLPILYETLNSADSTEVFMEGTTNIFNYPEYNDIDKAKEMLSLLNDKEALMELFNPQDNITVSIGDENYKPQARDCSIISAEYSFKDRPIGKIGLIGPRRINYSKVIMIMSEVIKELNNILSNPK >NC_009617.1|WP_011968171.1|1005776_1006904_+|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MRDISLYIHIPFCKQKCFYCDFPSYSGKEGLMNEYIEALSNEILQKGKEYRISSIFIGGGTPSYLNDLSLEKLLGTLNKLNLKDDLEFTVECNPGTLNEKNLNIMKEHNVNRISMGLQSTKNSLLKDIGRIHSYEEFEENYFLARKLGFNNINVDLMFGLPNQTIEDWECSLRKAAELELDHISAYSLIIEEGTRFYNLYEEDKLNLPEEDKERIMYLTTKDILNGYGYHQYEISNYSKKSKECFHNKVYWKCDEYLGMGVSASSFIDKKRSKNIDNIKEYIKRINNKESVIEEIHLNDIKDDMEEFLFMGLRMIEGIKVEKFKERFNKDIYEVYGEIIEKNIKKGLLINNSGNLYLTSHGIEISNYVMSDFILS >NC_009617.1|WP_011968170.1|1005120_1005561_+|hypothetical-protein MFLNELKKNEGIAFMQLVRILANSDNVFAKEEKNLYNDYLKELSINESEISESDLNSVCENLKGSSNRCKNIIYFELIGLALIDGEYNEEEVELLEKLGEALGITRSKRIAFANYFYNFVDVYGFSVVDAESKIALLKEQAEKLLV >NC_009617.1|WP_038458213.1|1003134_1004940_+|elongation-factor-4 MKSERQKHIRNFSIVAHIDHGKSTLADRLLETTGTLTKREMEEQVLDNMEIEKERGITIKSQAARLVYRRDDGEEYILNLIDTPGHVDFNYEVSRSLAACEGAILVVDATQGIQAQTLANCYLALDNDLEIAPVINKVDLPSARPDEVKKEIEDVIGIPAEEAPTISAKTGLNIGDVLECVVKTIPSPDGDEEAPLKALIFDSYYDSYKGVVCIVRVMDGRVKIGTKIKLMATNKVYDVTEVGVFTPGVLPISELSAGDVGYVTASIKNVRDARVGDTITEANRPTETALPGYKPAIPMVYSGIYPVDGAKYDELREALEKLQINDAALSFEPETSIALGFGFRCGFLGLLHMEIIQERVEREFNLDIITTAPSVIYKVIKTDGEILEITNPTNLPPLTEVDYMEEPVVKASIITPKDYVGAVMELCQDRRGIYIDMQYIEETRAVVNYDIPLNEIIYDFFDTLKSRTRGYASLDYEFKGYIRTKLVKLDILLNGDVVDALSMIVPEERAYHKGRGIAEKLKEIIPRQLFEIPIQAAVGSKIIARETVKAMRKDVLAKCYGGDISRKKKLLEKQKEGKKRMRQVGSVEVPQEAFMAVLKVD >NC_009617.1|WP_011968168.1|1002633_1002963_+|hypothetical-protein MKKIIKSNILRRISPMIFILFIIFIGIIKIDMINTKALSPLGNTNENYKLVSNEFGEDFSNFIKDNSFLKIYKESEKDVLVKIGSNDFRINNQSSFIKKIEDIIERIKP >NC_009617.1|WP_011968178.1|1015517_1016462_+|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MDGIWIEVSVITKSEALEPISGIFYGLNCPNVAIEDPEDLLSRDQGPLTWDFADINILEHKGNAAVVKAYFSQDDKVEEIVEYVKEKLSEIKEFGIDIGEGTVEAKKMHEEDWANNWKQYYKPVKITDKIVVKPIWEEYEKNDEELIIELDPGMAFGTGTHETTRMCIQALDKYVKPDTTVFDVGCGSGILAIAAAKLGAKHVVGVDLDPVAVDSSKENISFNNLNNIEVLEGNLLDVVDGKADIVVANIIAEIICVLTEDVKKALNEGGLFITSGIIHDRVDMVTEKFAECGFEVIEINKDGEWNCIVAKAIN >NC_009617.1|WP_011968179.1|1016668_1017436_+|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MHKFFTEPHNISETEGKILGDDVKHIYKVLRLSEGEEVVLNNCEGIEYLGEIETITKSEVIVKIIKRLDINNESKVKVHLFQGLPKGQKMDLIVQKGTELGVSEFIPVTTARVDVKLKGEFKKLDRLNRIALEACKQSKRSVIPQVKEVIDFNEAINELKKMDLIIVPYENAEDFGIKTLVRKLERDSVDLDTINNVGILIGPEGGFEESEIDDLKEQGAYIVTLGNRILRTETAGFTATALIQYELGDLGGKLS >NC_009617.1|WP_038457176.1|1017435_1018839_+|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MGENQMKLVRAGSDKTKLKKLSNKEPIKNTEGKSLVAFATLGCRVNHYETEAMAEKFIREGYEVTDFEGFADVYVINTCSVTNMSDKKSRQIISRARRRNENAIIAAVGCYSQVAPEEVSKIQGVDVVLGTRNKGDIVYYVNKAKDEQKPQLMVGEVLKNKQFEELNIEEYQDKTRAFLKIQDGCNRFCAYCLIPYTRGTTCSKDPQKVLDEIKNLSEHGFKEIILSGIHTASYGVDLDGNVTLITLLEEIEKLDGIERVRIGSIEPSFFTDEVIEKMKKMKKLCPQFHLSLQSGCDATLKRMNRRYTAKEYEDAVNRIRENLKDASITTDVIVGFPGETDEEFNETYEYLKRIKLTKTHIFKFSPRKGTKASDMPNQIDGNVKDKRSKALIELNAKNEGDFSKSLVGRELDVLVEQEVSNKPGVFEGYTRNYVKVEIPNGSRDMIGKIILCKIMASDAEYVVGKII >NC_009617.1|WP_011968181.1|1018988_1019333_+|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MEGCIFCKIISGDIPSKKIYEDDKVYAFYDINPEAPTHFLVIPKEHIESANTLDDSNIDIVSHIFKVIGKLVVDLGISDKGYRVVNNCGEDAGQTVKHIHFHVLGGRSLQWPPG >NC_009617.1|WP_008429643.1|1019475_1019652_+|30S-ribosomal-protein-S21 MSEIKVGENETLESALRRFKRKCARAGVLSEVRKREHYEKPSVKKKKKSEAARKRKFK >NC_009617.1|WP_011968182.1|1019682_1020135_+|GatB/YqeY-domain-containing-protein MSSIKDRLQDDWKIALKAKDKFTSSVISTAKAAVLLVEKTDNRKLEDDEVITILAKEIKQRREAMLEFEKGNRQDLIDQSKAEIEILLKYLPQQLSEEEIKQLVKESAEEVGANSIKDMGKVMSAVKPKVVGKADGKLVSQLVKEYLNNK >NC_009617.1|WP_011968183.1|1020423_1020702_+|sporulation-protein-YqfC MEEKFQRGKEKILSKLDFPSDISLDLPKIIVVGNREITIENHKGIIFFETNMVKINSRIGAIIIEGKEFEILFIAETSITISGIFKGISYER >NC_009617.1|WP_011968184.1|1020708_1021836_+|sporulation-protein-YqfD MFSSLKSGQVTIEINALVPEKILNAFWNSQIYTCNIVKVSLTTVRVTIYYRDYKDAEILIKKYKGKVKIVRTSGIIVLLMKMRRKISLVIGMGLFFAVIYILSNYIWAIDIETQRNLSPFEVRQQLSSIGIKPGLNKSQVNVYQIEKKMEDLNSQIMWIRVRIEGSTLKLVIKEKVNPPSTEKTLYNQVVAKMDGEVKRVYTNSGNPAVVPGDIVKKGDDLILPIQGREGFQMEVKPSGTVIANTFYDKFMEVQISGEKLERTGNKNSDIYLNFFGKKVYLKKAINQFEYYDKIEEKDGFFNKITYFEKKGINVNLDKESTVKEATEKLEGSLRKTLSNDAKIIDKKTAVEDIEGGKILINVKFTVEQDIAKNVS >NC_009617.1|WP_011968185.1|1021896_1023981_+|HD-family-phosphohydrolase MDIKQNNKWKNNRIQRIVLFILVFSIGYLLLVTAITPKQYSLKEGDIPRVDIKAPRDIVDEKATKEKEDQAAEKVGKQYTSKPEVKKEAEDNVRALFDKLVSLSNMASSTVADKQTELKKLTIFQLTDEQCKALIGISKDTLPGIEDKIVNIIDSAYEKNIQEKDEGALKEAKGAVSTQIDNLNLDKDVSSALKQIAQTQINPNVFFDEEKTQEKIQEVKKNVSKVIIKQNQIIVKEGEPVTQDQIDILSDLGMLNDENVTAYVYIYLALAIFWMIILFLQYGYVRINYGEIYKNNKKLILISTINLISLVLARTVGVISPFLIPFACAPMMLTLLLNYKISFVLSALNAIVIGALNGFDVQIIILGIVSSVLGAAFLKKMQQRNELLYSTLYTAVVTVILTLSTGILISSNFGDVLVKGGITFIGGLLSGIFALGILPFLEGTFNEVTTLKLLELSNPNTPLLKKLLMEAPGTYHHSMLVANLSEMAAEEVGANSVITRIGSYYHDIGKTERPYFFGENQMGIDNPHENIPPNLSAMIIKSHVKDGLELAKKYKLPKVIQDIILEHHGKTLVKYFYYTMKNSAENPEEIKEEDYRYEGPIPSSKEAGIVMLSDSVEAAVRSIKKPTKDAINQMVNCIIDDKLSSGQLNDCDLTLKDIEKIRVCFLTSLNSIYHQRIEYPKEKMKDFNGESNKG >NC_009617.1|WP_011968186.1|1024007_1024511_+|rRNA-maturation-RNase-YbeY MIYVDNRQNKVEASEKLIERLTEVIEFALKEEEVNMKCEISLLFVDNNEIKEINNETRGINRETDVLSFPMLEYEDKKVFKDMYKDYKFSQSDFDGDELVLGDIVLSLEKALEQSKEFNHSYEREASYLVVHSVLHLLGYDHMEDDDKIIMRSREEDILNKLNIIRG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_009617_2 | 1516095-1516173 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009617_2
|
1 spacers
spacers of NC_009617_2
>2.1|1516119|31|NC_009617|CRISPRCasFinder AGGAACTTGCTAAGCGCAACCAAGATCTTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009617_2
The CRISPR arrays of NC_009617_2 >merge|NC_009617|2|1516095-1516173|CRISPRCasFinder ATGAAAAGAGTGCGGAGCACAATTAGGAACTTGCTAAGCGCAACCAAGATCTTAGATGAAAAGAGTGCGAAGCACAATT >NC_009617|2|2|1516095-1516173|CRISPRCasFinder ATGAAAAGAGTGCGGAGCACAATT AGGAACTTGCTAAGCGCAACCAAGATCTTAG ATGAAAAGAGTGCGAAGCACAATT
>NC_009617.1|WP_011968616.1|1515293_1515935_-|undecaprenyl-diphosphate-synthase-family-protein MRIPKHIGIIPDGNRRWALSNSLGKDKGYDHGINPGLEVFKLCQKENIQEVTFYGFTIDNTKRPSDQKIAFTKACIDSVMLLTKEDCEILVLGNTESSCFPKELLPFTKRKKFGSGGIKANFLINYGWEWDLNLLKNADISKKHIQPHLQSKDISRIDLIIRWGGRRRLSGLLPVQSVYSDFYILDNYWPDFKKEDFYNALSWYNEQDVTLGG >NC_009617.1|WP_038457279.1|1514881_1515148_-|DUF1294-domain-containing-protein MLKVVFTYLLIINLLGFLIMFIDKQRAIHKEWRIPEKTLIGISIFGGSIGMLIGMSSFRHKTKHKKFTIGVPFILLMQIFIAILYLNY >NC_009617.1|WP_011968614.1|1514234_1514843_+|DUF2238-domain-containing-protein MKEKNFHLILLISIFAILVASGINPHDRFTWVLEVIPAVIGVMVLITTYNKFVFTNLTYILIWFHAVILIVGGHYTYAEMPLFNWLRDTFDLSRNYYDRLGHFAQGFVPAIIIREIFIRNKIVKNIAWTNFITISICLAISASYEIIEFIVALITGESATAFLGTQGDIWDTQWDMIFALLGSMVSVLTVGKYHENLLKTKQ >NC_009617.1|WP_011968613.1|1513234_1514149_+|homoserine-O-succinyltransferase MPIKIPIELPAFQVLSDENIFVMNNERANTQDIRPLKIAILNLMPKKIVTENQLLRYLSNTPLQVEVSLIQTKSYTSHNTPPEHLNKFYSYFDDIKQEKFDGLIITGAPVEQMAFEEVTYWKELTEIMEWSKTHVFSTFYICWGAQAGLYYHYDIPKYDLDEKMFGVFSHWVNDEKADLTRGLDDVFYAPHSRHTEVKREDIEKVSNLEILSESEEAGVFIVATKDRRNVFVTGHMEYDRNTLMDEYIRDKEKGDEIALPKNYFRNDDINQKPLYTWRGPASIVFGNWLNYCVYQNTPFDLNTL >NC_009617.1|WP_011968612.1|1511586_1512645_-|lactonase-family-protein MVLKENISVGFIGTYTKNESKGIYRINFDTISGNIENINLAYNIENPTYLTLDRERHILYSTCKINEKAGVSSFKYWKEDNKLHLINSNLSEEKPPCHVSLNNSHEILISSNYHENKMFVYKTLDGLILNSPMLGSHSGSSVNQLRQEKPHIHCSMFTDDDKYILSIDLGIDKMIVSSIKDGKLYQNENLSYTFPAGTGPRHITYANGKHYYYVLSELTSEIFVFDYKAKSNIVFENIQTLSSLSKDYKGTKSGSAIRIHKNNKFLYTSDRGNNSLSLFHINSDNGKLKYIDTISCNGDSPRDFQLDPSGKFLLCANENSDNISIFSINSITGELTFIKSENIPTPTCIEFI >NC_009617.1|WP_011968611.1|1509559_1511329_-|adenine-deaminase MNKDTLINHIKASNRSVKCDLVIKNVTIIDVFNKNRFVDTIGIKDGYIVGIGDYDGYEIVDGTNKYICPGLIDSHCHIESSLVTPTEYSKLALLNGITSVIADPHEISNVMGADGINFMLNSSQNIPFDIYFMLPSCVPGTSFESSGATLLSKDLKDFYKNDKVLGLAEVMDYPSVSECDDKIIDKICDSITNNKVIDGHGAGFTSMMTNTYRAANILTDHECNNAEEALDKIRRGMYILIREGTVAKNLKELLPAVNESNSNRFCFCTDDKHIDDIAANGSINSSIIYTINNSNLNPETAIQMATLNPSLLYKLNNKGAIAPGYIADFILLDDLERFKISQVYKEGKLVVNNNELVNFDTDLVKNANNNAFYNSINLPPLSEDSFKINIPNKDVKILNAIEIIPNKLESIHLRLNISDINSIKDSDYKFFTSSTEEDLLKIAVIERHKASGNLGLGILKGLEISAGAIGTTIAHDSHNLIIAGTNDKDMLFAAKELERMGGGIIVVKDKNILAHIKLEIGGLMTNRTYGEIEFDLKNLHSAIKIIAPQIDFNPFLTLSFLSLPVIPDLKITDKGLFDVINFKFIDIFE >NC_009617.1|WP_011968610.1|1508407_1509514_+|HD-GYP-domain-containing-protein MRLVPIENVKPNTVLGKSLYDINGRILLRAGVVLRENTIAKIKEINILSIYIVDKYSNEEIEDIIKPELRQKAIITIKEAFSNIGRLNNNSVRNKESDYTWQEQSYFYNIGKMAVDLIEDIVNRRDVMLALVDIRSMNNYMYSHSVNVAVISLTIGIALQLSKKKLEALCIGALIHDIGKSLVPREIFDKQGSLSEEEKEILKQHPRLGYKYLSTTYNINSLSKLIVLQHHERPDGNGYPDGLTKDNIIELSNIVSIANVYDNLSTDLPNKRAMFPSDVLEYLMSNAGTMFDYNIVNIFCRIVIPYPKGTIVELSTEEVAVVEETIPGFPLRPTVRVIESPRVSRISMKIDLIKEISIVITGVKYEID >NC_009617.1|WP_011968609.1|1507135_1507948_+|sugar-phosphatase MYKLLALDMDGTLLTTDKKVSKNTEAAIKAAEEKGVKIVLASGRPLDGLNRYLEELDLKKGEDYVLSFNGGLVQNTRGKIVSKVCLKGSDLKYIYEISKRLNVNVHAFSAKDGLIAPKTSQYTEYEAAMNGIDITIKDFNEVDDNEDIIKVMMIDPQEILDPAIKELPSEIYEKYSVFKSAPYFLEFTHKEVDKGLGLKKLGEYLGIKQEEIIACGDAGNDLSMVKYAGLGVAMGNATEEIKQAANFITDSNDEDGIVKVIKKFILSESK >NC_009617.1|WP_011968608.1|1506198_1506825_-|sporulation-membrane-protein-YtaF MLESLLLVSSLCIDSFVASIAYGTSKIRIPPICAVVINLVCTITLACSLLIGSIVKSILPSNLPAILGFVLLMLLGIYRLFEYIFKSYISKCSKSDSPLTFKIFDFQFVLQVYADEIKADFDNSKCLNIKESFYLGLALSLDSLAVGIGSSLCNINYTEVLVLCFIIGVSLVSLGVVIGRKFAQKVHLELSWLSGALLILLAILRVLK >NC_009617.1|WP_011968607.1|1505487_1506003_+|hypothetical-protein MLTATEERLLEYIEERARANVKGKTFYKMTDILEQAFWISEEKAYEVLKNIIARKNIGNSKDAIIDEYIDMLKKGYGSIQEQVDLFGGDKYTSVMYAAERRLKQYEGGTFFDLLREVYKVPDEEIMEVTEKYLKFLNSPIFSYRLEKETFHKFLQSDLEELDKQFNRFVNL >NC_009617.1|WP_011968617.1|1517020_1518226_+|glutamyl-tRNA-reductase MIGLIGIRKNTPLEIREKFIVKSKKYNEYFGELLKELNEVVILATCNRTEIYFNASLNEEELLKKIFDIFNWDYEYKKYVFITNNKDAYRHLFEVCSGFHSKILGEDQILGQVKDAYEEALEFKAVSLELHRLFQEAITCGKRFRKEAKLFEIPVSSSSIVVSEAIKRECTKFMVLGYGEVGQLVMKYLLSHKIQTVYLVVRNPKIKDEIQDERVKVITFEEKNKYINSIECIISCTSAPHPVVKTEDISESGSRLVIYDLSVPRDVEKEVALLSRTEVYNIDTISRIDDENKKLRKDKMEDNRHIMNKYLKEYDEWLKLRSISHVIKNLKTVGNDVYEKRVQTFSHKSKDKNDIALAHKLIKSTSDFYINRAIEVIKEETLKGCGEEWIGIIEKIFMTKE >NC_009617.1|WP_011968618.1|1518183_1518864_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MDRDNRENIYDEGIEYSYISLISKKLRVGIVGGGKAGTIKARHFVKNKCCVEVISKTFDGELIELSKEFSEILTLKNEDLSYEFLSDKHLIIIALDDENLKNIVKKYCEENYKIYIDSSDFISGMGVVPIQRSTENVVFALNTNYGNPKGAVLLSNKVENTIKEYDEFIRYIGLIRNKAKSFPELKIQITSFIGNDEFKKSFDKGEAEKALRSRFSKEIVDYLINF >NC_009617.1|WP_011968619.1|1518907_1519783_+|hydroxymethylbilane-synthase MNKLTIATRKSKLAQTQTEIIMKSLKDKFNIDSEKMLIVTEGDRKLDVSLAKIGGKGLFVKDIEIALLEKRADGAVHSMKDVPYELSHEFEIAAITEREDIRDVLISKDNIPFKELRKGAIIGTSSIRRACQLKLMRNDLDIVPIRGNVQTRLEKMKEQNLDGIILASAGLKRLNEEDIITEYFDPKVFIPAVAQGALGIECLKTSSAKKYFEKMEDSNAKLTVEAERSFMRMLNGDCHSLIGAYSEIQGNDLYMIGIYDIGGRIVKKDILGDKNDHIELGRKLANKILEI >NC_009617.1|WP_011968620.1|1519795_1521259_+|uroporphyrinogen-III-C-methyltransferase MSKVYIIGTGPGDEELLTLKAVKVLKRCTAVLYDRLVSNNVLNYLEPNCEIYYCGKEPGAHSKTQEEINELLVKLAKEGHTVGRIKGGDPYVFGRGGEEVLALVDENIEFEVIPGVTSPIAVLNYAGIPITHRKIAQSFHVITGKSAQDLNVNFKALAKEEGTLVFMMGLGNLDNIVEELINNGKEPIFPCAVVMRGTSAKQKKVVGTLENISQKVKDAKLQSPCIIVVGEVVNLNKDLNWYENKPLFGKNICITRSRRQSEKLKNKLVDLGAEVTSFNSIKIESSAENLNDYIEKIENYDHMVFTSVNSVEIFFDYLIEKDYDIRRIKAKISAIGAATANSLKQRGIICFAKAREFVGEGLVSILKPHLKDNQTLLLPCSAKSRKYIYEELTNCGASVDKVYIYDTVCGSVVNKRSFDEVDIVFFTSPSTVENMIDMLGIEEIKKKQVIAIGPKTNEPLEKYGIKAYVCKEHSEEGFLKEIENLLQ >NC_009617.1|WP_011968621.1|1521357_1522323_+|porphobilinogen-synthase MIKRGRRLRVNAAIRDMVRETSLDSKDFIYPIFVVEGDNIKNEISSLPDVYHYSVDRLYEVVEEVREANISGVLLFGIPNHKDECGSESYNDNGIVQQAIREIKKLDKELLVITDVCMCEYTSHGHCGIIHDEYVDNDETLEYLSKIAVSHAKAGADIIAPSDMMDGRIGSLRSALDENNFKNVSIMSYSAKYCSAFYGPFRDAANSAPQFGDRKTYQMDPGNRMEAIRETQMDVEEGADFIMVKPALSYLDIIRDCKENFNLPLVAYNVSGEYAMIKAAGKLGVIDEERVMMETLTSIKRAGADIIITYHALEAAKVLRR >NC_009617.1|WP_011968622.1|1522560_1523856_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MKNVDIFKESEEYMPGGVNSPVRAFKGVNLNPPIIKSGKGVIIKDEEDNEYIDFVLAWGPLILGHCDDDVVEAIKEVSSMALAFGAPTKLELDLAKFICTNLDNVEMIRMVNSGTEATMSAVKLARGYTKRKRIVKFAGCYHGHFDGFLIEAGSGVMTGGIPGSLGVPNESIENTLIGIYNDKEQITELFKKYGNEIAGVIIEPVAGNMGVIKSENDFMETLRDLCNQYGSLLIFDEVMSGFRVAFKGAQSLFNVKPDLVTYAKIMGGGLPCGAYGGRKEIMKNLSPLGGVYQAGTMSGNPIVMAAGIATLNKLKNNQNYYDHIENIGARLEEGIINISKKYDLPVVMNRVGGMMTLFFNDLKEVRTYDDVKKCDVNRFNRYFEHMLKSGFNLPPSQFEALFLSVQHKESHIDAFLKAFEEFALNENKMSL >NC_009617.1|WP_011968623.1|1523898_1524540_+|epoxyqueuosine-reductase-QueH MNKINYQKELDSLIENLVKNEEVPTLLLHSCCAPCSSYVLEYLSQYFKITIFFYNPNIYPMEEYTRRVAEQKGLISEMKVKNEIRFIEGKYDTESFYKLTKGLEEEKEGGVRCFNCYELRLNEAAIMAKEKGYDYFTTTLSISPHKNSAKLNEIGKSLSEEHDVKYLYSDFKKKEGYKRSIELSKQYKLYRQDYCGCVFSKNERMNDGNEKNK >NC_009617.1|WP_011968624.1|1524623_1525181_+|DUF3867-domain-containing-protein MSDKIIDFNELKNKVKDKDIDKFEEYIYSMYYKLAEGKMNMSDFSKNILAYMEENNISQDKLINIQKKFLERYGVDPSLIQGQFKIPGFDTGGSNLDYQTIKKTMGFQEKYKSRISNKTMSEYFIKNEKNDLKVLLENLDVILVSEKSIDLNDNELNEFLCSYKKVIEDKKINIVICENVKNYEY >NC_009617.1|WP_038457281.1|1525587_1526562_-|alpha/beta-hydrolase MKKFFKRFFLILFIVLFVFSLFFYKRIMLSYRIADKYISLKNHVWTIQEFNTQKSSSSMNYKDVIYKNTNGVPLKLDIYGPINQVYKSSPVLVYVHGGSWAYGDKNIPDALSPVLDTFREQGYTIISTSYELMKEKENFNKQISDVKDTIRWINKNQYSYNLNTSEIGIIGVSSGAHLSLMASYSGDDEFIDDNELSNYSSKVKYLIDFAGPTDLSLLNTQNLNYDLSKIFASISNKEDVIKKYNPITYVNKATPNTLIIHSNSDNMVPYESSKELYDKCVQEHSKAKLITLNSSAHDLSDISKDDVIDISEGLLKFVIFNSPL >NC_009617.1|WP_011968626.1|1526935_1527874_+|hypothetical-protein MSNPFGILVYLDEILVRNLSSLVLTGFIETITRTQAFDRTLSAGFHEGDRIENSNQGSVTRIERKGFKDKNELDANNNFEHHHIDKEIDARQCVREERQVKTTYTTFVLNGSLINYFNENKQLQHKNEKDIENNNIYPGDLIEIEGTITNKSIMSYIETLINLITIFGAEYLDDLTKECNVKINFSMCLKMLTYMKSILENNNTTDLIMKCGNGTIILNVNKDNFMNNKFNIFDNINCPCRVIGKVIKTCTEEQDSISLLRKTGQEQFYEKFFEQFTPLIECLEKNNIFVPECPDLRINDCAIQIMPLNIYM |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009617_3 | 1588990-1589129 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009617_3
|
2 spacers
spacers of NC_009617_3
>3.1|1589017|29|NC_009617|PILER-CR TTATATTGTTTGTAATCTGCTAATTATAA >3.2|1589073|34|NC_009617|PILER-CR TTTGGTGTGAATATTACATATTTAGATGATTTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009617_3
The CRISPR arrays of NC_009617_3 >merge|NC_009617|3|1588990-1589129|PILER-CR TATATAAACAATTTAAAATAAAATTATATTGTTTGTAATCTGCTAATTATAAAACCTATATAAACAATTTAAAATAAAGTTTGGTGTGAATATTACATATTTAGATGATTTGTAATCTATATCAACAATTTAAAATAAAA >NC_009617|3|1|1588990-1589129|PILER-CR TATATAAACAATTTAAAATAAAATTAT ATTGTTTGTAATCTGCTAATTATAAAACC TATATAAACAATTTAAAATAAAGTTTG GTGTGAATATTACATATTTAGATGATTTGTAATC TATATCAACAATTTAAAATAAAA
>NC_009617.1|WP_011968684.1|1587939_1588896_+|hypothetical-protein MYEFLGEDTTLDKLDEFQKNKVQWLQDNVQYSETTKRTYWEIININFHDYEKERKRDLYDFGKDEIISVINSIIYTSIKTNISLISIVSSYINWAIEHEYKKGENPCRDIDKTEIMKNRAEIVKRKYITLREFFKLLNNLKCSDIDKMLLVLARYGVKSQSVGTIKWNQVDRDNMILNLENNAKLPIDDRFLTYLDRAYKCEMYDYKTSTLNYVDYGYILKVSDKTDSDKLGRDTIYTRVNAIFRNNGMQKISLTDLYHSRQYDFLFDILRKNKDVTYNDVRNVLMMFFGESTPARAQYLKERFTLMSDYLPDLINNT >NC_009617.1|WP_011968683.1|1587497_1587851_+|hypothetical-protein MGKRSINELSDVAKKRKEHRWDDLTSLIVIYGIEWEEDMAFCKLEDYKSGEAFDEENATKILYGFNEDEIWNNLFKVSNTNDYDDLHSRFKNAKWCTHENLMIFELLDGAKFCAMRL >NC_009617.1|WP_158380889.1|1587311_1587473_+|hypothetical-protein MSLNLYSLIIKAANDNNINITLEDIGRINNTINNLISRKTNIQWIKNNIEVLL >NC_009617.1|WP_038457294.1|1587024_1587222_+|hypothetical-protein MDKIRSFRGITAEKLIEVLKQVPSDTKICIELLGDNFPIKQVEECTYFDWSNGEKKQEHKGILIK >NC_009617.1|WP_011968682.1|1586346_1587000_+|hypothetical-protein MNTSKDFIKFRQYVRSLSLSVNEQYMLEYLFEYTNVQYMYAYPKFSDLLLAFSTTSKNRISSTIKKLEKKKLLFVDRSFTNNRYHVVNAELFIHQGKHNDKNGTEAPLNGQVEFELTQEEKEVIDATNFTRNQAKSLLQLCNNKVDKLISMIKYVSNKANISNKFGYIKALLERGINIEDTKGNYPKKSISFVDNCSSRNYTEEWYQNIENRLLYGL >NC_009617.1|WP_011968681.1|1585993_1586194_-|ribbon-helix-helix-domain-containing-protein MEEKSKYRRVVNREPFSTTVNLNYNNLLSELSEKTRIAKSKLTDEALELLFEKYNIDYKNESTEKK >NC_009617.1|WP_077836901.1|1585276_1585690_+|SHOCT-domain-containing-protein MALRQACQNLDGFNINDFDETLKILYLKAGVSLFSWGENITVTVASCDNGNSEISILSTPKTGVMFGGTVDMGKNRKNINTIMSALSEELKNYVQVTKKSTSTESVADEIRKLAELKEQGILTEDEFSSKKKQLLGL >NC_009617.1|WP_011968679.1|1584495_1584795_+|hypothetical-protein MINSDYLIRKNGKYSGDIKCPICEEIIEWKENENAEVRVVLKDCAIEEHMTSGLNIGRNYIIPAKISKTGEVTFKVYVVAECPKCNHKIEFYERAKYTR >NC_009617.1|WP_011968678.1|1583738_1584464_+|hypothetical-protein MSGNPWSSDISEEKVCLSPDEFSINNSDDWTCALEKNYDKGSKFSTFRCDNKEKLLEITKDYWCFLKLILDERNKYEKCLGILEYRNGYPFVNNKEASNYNNYKVENYVFIRENRDVKSTMKLIFNCFRDNLQEEGIVLNILNKDNMELRAEHFKNKVEGQLENIPLRPIMIKEVETGIYELETYIPIDKYTEFQNIVGKEIDFEIYQYIKNIKIKVIERGTGGGTSDKWDSVSIKFKKVN >NC_009617.1|WP_139355891.1|1583464_1583641_+|YegP-family-protein MARFEIKKSSNDQYYFVLKANNGQVILQSETYTSKQNCNNCIKSIKENAPDAEVADLT >NC_009617.1|WP_011968685.1|1589376_1589790_+|hypothetical-protein MAWNRRVYITLNSDKEKDIIIEKFLSQSYSEADCIKEVLYRMATQGDNLKLININSTDKVQKITNSNKKVKNYTKPKGNNKVLKGADNDKELLKDDNILVNNMEQIETDNTKKVQINDNSDNEELNKNILEGLDRYF >NC_009617.1|WP_038457297.1|1589898_1590096_+|hypothetical-protein MENVPLVKFVRTQKLAGYLMLQGFKFLRDDIDRNNPNYKIYIFKNQDGIETAIDNYKKEFGRKGN >NC_009617.1|WP_011968686.1|1590098_1591946_+|hypothetical-protein MEELAVKKLSLQECLEDLQNEIRHGKNRDFFRVYSIETSGGKTYNTIKAIKDHYIFVRDNPFIKDKKRRFIFVTKFIEEGIEVAKEINKDEEEKIAMFYTPDKAIKNENCSSNFFECAKANTLILTHAMYSILCNPKKQEHKEYRKIFLKYKTLIIDEEINPVKDSLFTFSQGDTYWLTTLDSFTEQNLSKKLYQLMKPLLTLLKEDYKPENQLHRVECDYDRKEVDKLYEELMQGVQNIRNELFEDKYKCGETKCQKENLFKLLNGILLTYDSIDDNICLINPKRQIFSYNYKFDYLMLNNNIWLDASANFNKMYENGLFKVIDCPREIDHTNSKLIFHKIKTTTSSKNTDENFRRDISKYLIKEYSDQEILILSKDVECKQLAEKEEYLKNYPNFKYSNFEAMRGKNDWKDFKVCCYIHTYRWTSAYYIFLYEYFNDVILPDNDLITSNRKFVFKSKKSKSEWGFEKEELNEIMLSDMSSSMYQGLKRVQRNKQPKAIFDVFTDSINTIMTVKKQLYGIETKKNFIIADKGKQTDADKLKEYIKEHFEENEDKWIKVKSSDVMEQLEIGKSNWSKLWSKDELFKQYSKDKRLKQSQLKNDDGSNKKINWIIKY >NC_009617.1|WP_139355890.1|1592467_1595923_+|hypothetical-protein MTKLKLSDFKIETEKTGKIIETENGEKALEIVHIKNEKGTSVPKLIYTWSNYPKIRSALNSKLNAMKIELQKSIEEIDTNLTEEERKELIKSKKKEFNNNLRNAFENCKEKNHNSYKVIVRDTELIRIIRALNLKNNDTEENGYTYIKDLICVSVSVPMYKQIEKDGVIKVNHVRFKRILASSGNVRNKKVIFINEKLYDSAMTILLCGLPKDMEHEQVSKYNAYIGLVNSDTIPVSTPRMIVIDDFTTKIPETFDVVIKDKNKKFSVIPDQEKEFKLMPFDGAGIVDLEVAKIWSKELNDILRKETNRNKVNYIPSSFQFRAIIGVKGNLYTFDLKKYALSLDEDKRYIKDVWGKEHKILDDKDNLLIDAILTKSQFKFKKKYDSFDKWQTEFDKEVELKDLDNNDIKYKRTFNIAKWGNKKNKDKALLSYQPIQSLELTQEQIEILCKPTVEIIKNISTDVDEFLKYRGLLEETYDENGELVLKETDMDRVPKYYEALKKNKNLFYDSYIQKKVQKDINRFKENAMKGMVFVDGNFQTMSPDIIAFMEYATGQSVKGVVPKNNIYSNYWRNKEYISYEKNEAGEEVKKIEKVTAVDIIRFPHVSNEHIFATVMQNEIEEFQYIQDGIIMSIYDTSLERLGNGDEDGDRILTIPNVGAENKIIVDNAKEQQTNTIYFINEYEKDKKEKEEKLIAEGKMERPKPIKINQIDELIKCDANGMEASIGKVVNKISILWSLPKTKERDNYIKIMSVIGSLTIDYVKTGVLEPIPKEIEEFLENKKEVDGKEFKDSYKKPIFLKVKYKKLERDEKRINKNHKLFDDNITEELFSDTDCTMNRLYHHIESELNKINLDKPKGDFDFTTLIKDKANVRNETYPKVKEKLIELKKEHDDLTQENSIDIENYSYDSDKKVEQYDRFKYFYRYCKNELASINKETQKKDKLIDYLVYAFYCDKDFALKNEAKDLLWNVFGAELNTRINNKSYNDKEFDVIELEDKRKELLIEKKEKAKNNAKKIKIEGIDTLEDKDKKKIEFHKQNTFKNIDEMGLSKQANKVLKVLIMLDLLFNQYNKKLLIGQSSKKTITRATISKFTGINGIKIDEYLKELISKELIELTTKSDKITLECNINVSVSNTGNAVKLRDSESILKQLKK >NC_009617.1|WP_038457299.1|1596126_1596306_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKQDIIREDLKSYLKENGIKAKFIAEKIGISPAMISYFINHKKKLSSASLILISNIIYN >NC_009617.1|WP_011968688.1|1596635_1597271_+|hypothetical-protein MMETNKALTKRDYIIIKKYLLENEFNIDTFKREYPDIKVPNIRAGEFQNIIFVNGYLFPIEFYYNRNFFQISDTKTFKLDLEKKQFIKVTQFSEIYIDFINAIEKNAIEFSKIDEDKSLEDLEDLLDEKLHMTLLIDRKDKVSELVEGFSKALKSSELEEIHEDMKKTIKNLKPFLDKFYYYAVDMENSRLGQGYIIVDSKNNFIEFIRTI >NC_009617.1|WP_011968689.1|1597844_1598399_+|hypothetical-protein MELSELNLNEEQLTGVNEYLESQIQAKLQSEGDKIRTKYNNKIKEYETKIGEYDITIKDLQSKVPVEKSPEQIENDKRIKALEDKAKEVDKKEKMLDLQEKLSSKGLNKQLHKFLNVEGVEDFETYLGELVEAIGKQSTSTYQPKKHVDTANSNITKADFQKMNYQQRTELYSSNPDLYKLLSK >NC_009617.1|WP_011968690.1|1598409_1598715_+|hypothetical-protein MQRYNGQLFADAQFTNVNLDVEFGEDETEIDVMPLLLKNGFDYLWKVRVMSYGSVKYLINGIEYERNGCLYLDEVLVETFKILKLEGATNNKVTLNLEYCL >NC_009617.1|WP_011968691.1|1598785_1599625_+|hypothetical-protein MAQVTIVPDVYSTMVTEKVKGMIKISTLAKDLGDLSGNVGDTLQFPMFKALSDAELMKKGVAITPEELSQTSSGKKIVQYGKGVRVYDMDSLTALGNFVENGISQQARIMAHAQDNEMVKDIDANAILKVATAQPKAITDDELMAGFQMFGDEQDNVDFAGIVVNSLLAPSFYKMESFVKSTSTTATAQNGRVVNGCIGFYRGTIPVMLSDVNTFDSTLGECKSYIIKNDALGIMPKRDILVEPDRKPDFKATDVYADYIFACGLIMKDGVCILRKTIA >NC_009617.1|WP_139355892.1|1599763_1600015_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MRERIRMTRAIYNITQKDVADYLGLSKQYITQIETNKLTATDERMEQILNAVYSVGELKKQGRLKEVLEELKKANENNKTKTE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009617_4 | 4694168-4694264 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009617_4
|
1 spacers
spacers of NC_009617_4
>4.1|4694193|47|NC_009617|CRISPRCasFinder ATATTTTATCATAAGTATTTTAAAAAATCTATTATCAATCCATACTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009617_4
The CRISPR arrays of NC_009617_4 >merge|NC_009617|4|4694168-4694264|CRISPRCasFinder CCATACTTGTATGGTAGTTATATTTATATTTTATCATAAGTATTTTAAAAAATCTATTATCAATCCATACTGCCATACTTGTATGGTAGTTATGTTT >NC_009617|4|3|4694168-4694264|CRISPRCasFinder CCATACTTGTATGGTAGTTATATTT ATATTTTATCATAAGTATTTTAAAAAATCTATTATCAATCCATACTG CCATACTTGTATGGTAGTTATGTTT
>NC_009617.1|WP_012060242.1|4693465_4694137_-|GntR-family-transcriptional-regulator MALEVNKNTTSKTIYYKLRDEIINLYLEPGTSISEKELSEKYSVSRTPVREALVRLAQEGLVNIYPQKGTVVSLIDLSAVEEGRFLREHLERAVVKEACKEFSQENVLALEMNLKLQKMYIENNDYKKLFEADEEFHKIIFEGSNKKRVWNSINDGSTEFQRIRMLRLVTNSSWDNIYLQHKEIFNAIKNKSPEIAEDFMKEHLNMVTFDKNKIKEKYPNYFK >NC_009617.1|WP_012060241.1|4692213_4693275_-|mannonate-dehydratase MKMGFRWYGEGNDTVTLEQIKQIPGVGGIVWALHDMAAGEEWPMEKILEVKKSADKYGFNMDVVESVNVHEDIKLGLPTRDKYIENYKKTIEKLAKVGVKVICYNFMPVFDWLRTDLFKKAEDGSTALFYEKAKIKDIDPMELVNKIASNPDLTMPGWEPERLKNLSQLFEAYKNVTEEDLWNNLKYFLEQIISVAEINDIKMAVHPDDPPWPIFGLPRIVKNRDDLARLLRLVDNPYNCLTLCSGAIGSDPNNNVPAMIREFGNRIAFAHIRNVKIYENGDFIETSHRTCDGSLDICDIVKAYHEVGFTGYVRPDHGRHIWNEQCRPGYGLYDRALGIMYLWGIWDSLERNK >NC_009617.1|WP_171788826.1|4690486_4692085_-|mannitol-dehydrogenase-family-protein MVLSKESIKNSDLWEKAGIEIPKFDYDKMSASTKENPTWVHFGAGNIFRGFIAILQQELLNTGKAKSGIVAVEGYDYEIIDEIYSPYDNLSLLVIMKPDGSLDKKVVGSIGESLAGDYSREEDWNRLKEIFSNPSLQIASFTITEKGYSVKNLSQQDTTDGLEHPVSIIAKVASLAYVRYQNGQLPIAFVSMDNCSKNGEKLHNAMEIMIKNWVENGLVDKGFLEYINDTKKVSFPWSMIDKITPRPSQSVKNTLEAVGFDSTKIVTTSKNTYIAPFVNAEGPQYLVIEDNFPNGRMPLEEAGVFLTNRETVERVETMKVTTCLNPLHTSLAVFGCLLGFDLIADEMKDPALKKLVEKIGYEEGMPVVVNPGILNPEDFIKEVVEVRLPNPYIPDTPQRIASDTSQKVGIRFGETIKAYSKREDLDAKELKYIPLVIAGWCRYLMGLDDNGNVMELSPDPLLDELKKYVADIKLGSKESVESSLKSILINEEIFGVNLYTIGLGEKIEGYFNELISGAGAVRATLEKYLDCK >NC_009617.1|WP_171781305.1|4688661_4690083_-|glucuronate-isomerase MKNMKNFMDENFLLSNQTAIDLYHNYAKNLPIIDYHCHIDPKEIYENKKFSNITEAWLYGDHYKWRAMRSNGIDEKCITGDGSDYDKFLAWSQTIPMAIGNPLYHWTHLELQRFFGIYEPLDEDTAPEIWKRANELLNGEGFNVRDLIIKSNVETICTTDDPIDTLEYHIKIKEDASFNVNVLPTLRPDKGIEINLDGFVSWVKDLEKVSEVSINNYDEFLKALDSRIRFFHSVGCRIADHGIDGVVVYADSSKEEAEAIFAKALEGKSISIDEEKKYKTYTLRHVFKLYHELGWTMQLHIAALRSNNTKMLEKIGVNTGFDSINDESIAYPLSRLLDSVDRENSLPKTILYTLNPKDNYVLGTMIGNFQGDGIPGKMQFGAAWWFNDNKDGMIEQMKALGNLGLLGRFVGMLTDSRSFLSYTRHEYFRRIACNLIGEWVENGEVPKNDKLLKRIVQGICYSNAKEYFGFDEK >NC_009617.1|WP_012060238.1|4687117_4688623_-|MFS-transporter MSNNNRKITIARGVGYGLVDLMGGGAFTIIGAFLLFFYTTFAGLTPIEGASIIAIARIVDAVASLFIGSISDNFYKTKLGKLFGRRRFFLLIGAPLMADYVLLWVTGRSYAFYLVTYLLFEIIAAMVLIPWETLPAEMTKDFTDRTKLSASRMFISATGTFLATFVPGRLIAFFGDKSPQAYFINGLVFAIIYAICILISHKVTWERDLTPEMEQELLNGSTSKSFGEQLMTIVKVAGDYVSTFKIRAFRQHLAIYICSFTAKDLFNSVFIYFCVFNLGVSSTTAANVLSLSIIGIPVTILGGFLMIKVGPGNLYKMAYSIMIVCLLAFYGLYVGNLGSNIVLLFVIGTIYQVGRSLLEFTPWNVFPFIPDVDEMVTRQRREGLFAAVMTFTRKSSVAIATFVIGVVLQESGFVKGQATQSPQVVSTIATLLAVGCISLLVIALICAATFKLNKRTHGILVDEVERLKNNGSKEEVTPETKTIVENLTGYKYENVWKETVV >NC_009617.1|WP_012060237.1|4686410_4686833_-|HIT-family-protein MSNKNNCLYCDKDEKLDNLMIEICKLEVSTLYLFKEQSHKGRCIVAYDKHVKELFELDDKELELYMKDVTRAAAMIKKTFSPDKINYGAYSDTLPHLHFHLVPKYKDGYSWGGVFEMNPQKKYLSDEEYVKRINLIKENL >NC_009617.1|WP_012060236.1|4684965_4685523_-|methyltransferase-domain-containing-protein MWIKFLMEYFKSPRTVGAVAPSSKKLAEKMAHDIDFDHAKCIVEYGPGTGVFTDRLMKKIKDHTMLMLVEYNEEFCRELEEKYGEYNNVVIVNDSAENVDKYLKEYNIKEVDYVVSGLPFASLPKNMSNSILKKTKDILKKNGLFITFQYTLLKKGYIGSYFEDISLERVVLNIPPAYVLKCQNT >NC_009617.1|WP_012060235.1|4682924_4684388_-|sugar-ABC-transporter-substrate-binding-protein MEILNFRLRKLSCIVLIILVGSILSACSQVGKVIVDKEPKEDRQKDYIEEVPTQTVTNEKSVNLAPLYDQVRNLKGQEALDFFESLKSKGLSDRDILEFFINLPLSDANKEITDIYKNEKFETYMSTYPTGKPFGNYKWTNGDGTKIKGAFSELDLKLPFSNYVALKSGPVGDLNKKYRIGVAIHGFDQPWNVSLADAAQWEAERHPNVEVDVKDAQWDNDRMADIIDSFVLQKVDGILTWPMVESETTIAPVKRAIEAGIPVVSVDRMTGLEETTSRVTGNFPANGAQCGMYLIWKLAKEGSLNANVVLLRKPSGSTADANRTGHFLKVLSYFPDIHILKSYHDDDNTAEALANMQLALNEYPSIDVVFGTGDHEAIAAYDASKNANRLNSRKDDKKMMFLSIDDSKKAITSVKDGLFEVNTPYTPLISDIGMRTLLNIITKNGSMPHDIITPNIPMVTKDGDTIFGLKTQTPDQWYEYTFGAPIK >NC_009617.1|WP_012060234.1|4681144_4682842_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKKISSVPGRIPLTIKSKLIISFSLIVFLISAVGITSYMTMRSYLVQENIMIEKNVMANDIIILINSIPQDISKYILNPTAENKKIIDDKFININKNQEFIKDNVSGEKALKSFDAVSRMLESYSEENIKLFESKNATEMVEKNKLMNRFSKLIQNSMQEYMSVELDQQNKARADLAKKSNFTGVLIIVFIVSIGFFSIIFAIFFSIKLGKSLNKIVLLADDIANGNLQVEEYKVNSNDEVSLLASSFNEMTKNLRTMIKGIINNSKDLYESSTMIKDRAKESVKAVNQIAVSTQDAVDGSQYQFSEAKRTEEAVNRLIKMNSTIKEKSNNVLSLANKSLKIAEGGNEKVRSMLNQMNTIKEQVMNIQSVTGILKENSSQIETILDTISKITASTELLALNAAIEAARAGEYGKGFAVVSDEIRKLATSSATSTVEISKILTQIQNYINVLIKSMSIAVSEVMSGSEKVLEVEGAFKNIVESNNDVDGEIKNISDEILVMVNEINAIEKISKNICEISNKSLEGSTDISAIVEEQLATQEEFFASATTLANISSELANVVSKFRV >NC_009617.1|WP_012060233.1|4680079_4680979_-|ribokinase MKSLCVIGSLNMDLVTTVENFPAAGQTVMGKEFNTFPGGKGGNQAIALGRLGSDVLMVGKIGEDIYGKRYLEVLRSNNVKSHGVSIEKGISSGVAVIQVSNKGENNIIVVPGANAEVDINYIESKWSLIERADIFLFQLEIPLETAIATMKKLKKQGKTVILDPAPALDLPDEIFKYVDYLTPNETELETLIGRNINSEENLVEAAKTLFDKGVKVIVAKLGSDGAAIIKKDKCIRVPGFIIDPIDTTAAGDSFALAKEKELKECVIFGNAVGAISTTALGAQEAMPTFERVDKFIRDR >NC_009617.1|WP_012060243.1|4694483_4696163_+|MCP-four-helix-bundle-domain-containing-protein MLKNIKIINSIILMVILSTVVSLSIAIIGYNNMKTINLNSSSMYTIALTRIIKTEEIRQTFLNIRLNVNRISISEFNDDDVAAIDNDYSAINKMVEDYENLSLSTIETNNLSEFKKDSSAYYEQIKNLEKGNKLYGIDLEKFNQLGVEMQLFLDNLVTYSSNTANTLHNDNMSLYIRSTKIFFTTFFIGFILQILVSSSIILVIRKSIKEIMSDLDNVAQGDFSFEISTNLKNEFGRMKKSLKVTTSNISSMLEEVQNSANVVNIQATNLLGASDEMSSSAQEINAAVQEVANAATEQSSDLMNVKTSLDSFADSLDQITSSINDVNSNIHNISSMAEDSNSKLEFLFNSIKDVNESFDTVRNKVVQLDNHVEQVNNITTIINSIADQTDLLALNAAIESARAGEVGRGFSVVAEEIRKLAEQSKVSASNISDLITNINNEAQIAVKTTDLGKDSLNNQSVLIEDSIKSFALIFKAINTILPRVDNINKSIENINIEKDLIISKTLDISGVSEENAASSEEIAASVQQINSSFNDVATSAQTLSNLTTSMMNEVSKFKL >NC_009617.1|WP_012060244.1|4696244_4697420_+|extracellular-solute-binding-protein MKNFKFLNVTLVIVFMTTILTGCGSKNVSKAMQPITLNIIDVSGSMQLVGDSIDQFKAANPDLIGDVVVKKSTALEVPSLLKAQILSEDMQTNLIFTGIDGLSTCIDRDVIENIMTAYSSRFPDLESNYSSGAKATYDLVKGYGITYVYSPSGPFFTYNPDTVQNIPKTPDELLAFAKANPGKFTYARPAGSGPGRIFLQGLPYILGDKDPKDPKTWDKTWAYLKELNQYIDYYPAKTGTTFTELKDGKRSIIASQLGWDMNQRIIGGIPQTYQGFILNNTTLVADAQYMAIPKGLSDEQKNVVLKLMAWLMTPKMQAITYDSGYFYPGPSVKNVSLDMAPKESQDKIKPAIRQSYEDSINTLPNSTQLDTTKFMDALNMWDQLFGTKVKR >NC_009617.1|WP_012060245.1|4697499_4699362_-|APC-family-permease MLTKFLDVLLGEPLSNEQGCNEKYNIPFGLAIMASDAISSVAYAAQEILFVLIVLGVAAYQWLTWTSFMIIGLLIILTISYIQIIRAYPQGGGAYKVANENIGKKSGLAAGAGLIISYILTVAVSASAGADAIISAFSNLTEYKVMFVLIIIIVLTILNLRGISESSKIFAIPTYIFIFSMAFMILYGLFKYFILNIHPEPMYSIPANTTENVSIFLILRAFSSGCSALTGVEAVSNSVPNFQEPSQKSAKTVMILLAALIFFIFGGTSVLAIFYTAVPIANGPTVVSQIAFAIFGNGIMYYIIQFSTAVILLMACNTAYTGFPMLMYIVGKDGFAPRQFTIRGKRLSFSFGIVALSCIACILVIVFKADTHRLIPLYAIGVFISFTLGQFGMVNHWRKEKGKGWVKRAIINGIGSVVTLLTTIIILIEKFSEGAFIVAILIPIIIVIQLRIKKHYDKVACGLSISQLNLKKVNLRKKYTHIVIVPIASLNKATIGALQYAQSVSDNVIALNISPDKEAMEKLKSRWSELDTDILLVAKYSPYRAVVTPLLKNIELIANSTAKDEKITVIVPQFVTNERFGEVLHNHTSFFIRETLLKNDNIIVSTYPYHLLDEDVKQSK >NC_009617.1|WP_012060246.1|4699933_4700230_+|hypothetical-protein MAQNHICELCNRNVSSITKHHLIPLEKGGEKFKTLSLCSTCHRQIHALFTNRELATHYRSLESLKKDIKIVKFLKFIQNIPGDSYLDIKKSRHVRKSC >NC_009617.1|WP_012060247.1|4700367_4700811_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNNITYEFINYKSKEFKEVSELRFKILFKPYNLIHKYDYDELDYSSIHLVALDEGAVVAYSRMTNYNMNGKMTNIVVSQEYVGKGIGIEMLKTHKIKAKELGIICLYLNARLDTINFYKKAGFQCKGNIFLSEKSGLALQPMYFKIS >NC_009617.1|WP_012060248.1|4701099_4701255_-|hypothetical-protein MEKLRKGEHEKAMEKAKEMLDKGCGMGDIMEETKLSEENVMKAKRKWEDRS >NC_009617.1|WP_012060249.1|4701407_4702469_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase-family-protein MKTSTHRIAIPSILEVGKGNINNVGNLIKKAMFKNVLICFGEGLEELFGESIRNSLKEANIGISRIETISDINFEKISVKAFEISNDVEALIGVGGGKAIDAVKYMSFLRKLPFVSIPTSTSNDGFSSAGASLLVNGRRMSLPAKTPYGIIVDIDVIKSAPEKFIYSGIGDLVSNITALYDWKFEEENGRIIIDDFATMISKKAVNSFIRTEFKNIKDDLFLKELVDSLILNGISMEIAGNSSPASGSEHLISHALDKFLEMPQLHGIQVGIATYIMAKVQDHRFERISKILKETNFFEHAKTLKMKRKDYKNAIDIAPSIKPNRYTYIHVDENRILAKKIIDEDEILNYILI >NC_009617.1|WP_012060250.1|4702564_4702876_-|hypothetical-protein MDKVNSLIKNTPIHLTTNTIVLIIVAIIALYILIKAIAGIIRIAALIGVCWFILMSIQSTNLINIPIIREAYTTVEKIIPSKELWTEALDKADKINKVVNDLK >NC_009617.1|WP_012060251.1|4702959_4703151_-|PspC-domain-containing-protein MEKRLYLAATDKKLAGVCGGIAEYFGLDSTLVRIGWAILIVCAGSGLLLYIICALIIPKQPLL >NC_009617.1|WP_012060252.1|4703555_4705271_-|dihydroxy-acid-dehydratase MISQEVRKIAPEMDPLRRGMGWTTEDLSKPQIIVESTFGDSHPGSAHLLKFANKAVEGITQSGGKGARYFATDICDGMSQGHDGINYSLASRDTLTSLIEIHANATPFDGGVFISSCDKAVPSHLMSIGRLNIPSIIVTGGVMEAGPDLLTLEQIGAYSAMCQRGEISEEKLTFYKENACPSCGACSFMGTAATMQVMAEALGLMLPGSSLMPATCEDLEEVALKAGRQAVELAKMNLRPKDIVTIKSFENAILVHAAISGSTNSLLHLPAIAHEFGLYIDEETFDRIHKDAHYLLNIRPAGKWPAQYFYYAGGVPAIMEELKHLLHLDVMTVTGKTLGENLEELKTNGYYEKCNEYLEKVGLKKEDVIRPFNNAIGTNGSVSILKGNIAPEGAVVKHSAVPKEMHEAILKAKPFDSEEEAIDAVLRKIIRPGDAVIIRYEGPKGSGMPEMFYTTEAIASDEELAASIALITDGRFSGASKGPAIGHVSPEAAVGGPIALIEEDDLIEISIPNRVLQIVGIKGKKCSKEEVEKVFEERRKNWKPRKSKYESGILKIFSEHAVSPMKGGYMK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009617_5 | 5491433-5491638 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009617_5
|
3 spacers
spacers of NC_009617_5
>5.1|5491459|34|NC_009617|CRISPRCasFinder CTATATTAAAGCAGATGGCATCATGGCTACTGGC >5.2|5491519|34|NC_009617|CRISPRCasFinder TTTCTTAACTGGCTCAGGTGCCATGAAAACTGGC >5.3|5491579|34|NC_009617|CRISPRCasFinder TTACTTACAATCATCAGGTGCTATGAAGACTGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009617_5
The CRISPR arrays of NC_009617_5 >merge|NC_009617|5|5491433-5491638|CRISPRCasFinder TGGGTTAATGATTCCGGAACTTGGTACTATATTAAAGCAGATGGCATCATGGCTACTGGCTGGATCAAGGATGGATCAACTTGGTATTTCTTAACTGGCTCAGGTGCCATGAAAACTGGCTGGTTGAATGATAATGGAACTTGGTATTACTTACAATCATCAGGTGCTATGAAGACTGGTTGGTTAAATGATAATGGAACTTGGTA >NC_009617|5|4|5491433-5491638|CRISPRCasFinder TGGGTTAATGATTCCGGAACTTGGTA CTATATTAAAGCAGATGGCATCATGGCTACTGGC TGGATCAAGGATGGATCAACTTGGTA TTTCTTAACTGGCTCAGGTGCCATGAAAACTGGC TGGTTGAATGATAATGGAACTTGGTA TTACTTACAATCATCAGGTGCTATGAAGACTGGT TGGTTAAATGATAATGGAACTTGGTA
>NC_009617.1|WP_012060871.1|5487518_5489402_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MFKRANKITSLLVAAASVMSLVPAYAADVKKIDSDDGTVYNAVAYKDGKFFVDGEINDDEEAYYVSDGKFNKLEDIDSGDDADLFGEKYLDINDGDYTVDLDKGSITDDDTKGDTADDASADLRKKIKDDTDDRYDEDFADNIIDENKDDTEDLTKLNIIPGAKYKTPWYYTQYKAADKAVNDNVNGLKEITDQNKRVFNVYTDTKGGYIDADYNLGKVKVTTTADGASTKTETIENTNDKYDAAGKDDALTASVSQDKILTQDDDYIYRLATIKVNVTTDAGAKVRISEINGVELNPKNANDKPQIFKVENDGGTVSFKAIQKISKAQDSDDVDGAKYAKTVTTYALSDEDGKNLDAKDLFLNTDGTINEDTKFTVANGKLIAYNTEMNEYKKVVVRAYSLKTKGGYYYADEEDESKEDCEVSSQDDKTSAVQTDVDGNLWRLDGGYIYKFDNTDDWDKVYKVDGSFDELSVYDKDNIAAWSEDDDVYSLIGGKSSDDNNTNPPTTTAGWVQAADGTWTYNKEDGTKATGWLNLNGVWYYLNTDGVMATGWLNLNGVWYYLNPSGAMATSWLNLNGTWYYLNSSGAMATGWLNDNGTWYYLNSSGAMLYNTTVDGYVLGSNGAWIR >NC_009617.1|WP_012060870.1|5485394_5486990_-|peptide-chain-release-factor-3 MADYIKEIEKRRTFAIISHPDAGKTTLTEKFLLYGGAIRLAGSVKARKASKHAVSDWMEIEKQRGISVTSSVMQFNYNNHCINILDTPGHQDFSEDTYRTLMAADSAVMVVDAAKGIEDQTRKLFHVASLREMPIFTFINKMDREAKDPFQLLDDIENELGIKTYPMNWPIGSGKEFKGVYERDNNRIIAFNGGNHGQNEVEAIEGSPDDPKFREILGDALHDKLMEDIELLDIAGDELDLDVVRRGELTPVFFGSALTNFGVEPFLEHFLEMTTSPLARNSSGGTIDPFDDKFSAFVFKIQANMNKAHRDRIAFMRICSGKFNKGEDVYHMQGGKKIKLAQPQQFMAQDREIVEEAYAGDIIGVFDPGIFSIGDTLCAPSKKFKFEGIPTFAPEHFARVRPVDTMKRKQFIKGVSQIAQEGAIQVFKEIHIGMEEIIVGVVGVLQFEVLEYRLNSEYNVDVKMDRLDYRYVRWIENKDVNMDSLNLTSDTKKVKDFKDRNLLIFQNDWGISWALEHNKGLILSGVGKSED >NC_009617.1|WP_012060869.1|5484283_5485243_+|DNRLRE-domain-containing-protein MNSITIPAIKSLSITNKYSDKSLNEDKIIVGADGNYNYYSYLFWDISSIPTNATVHNAKLTLFKTDNFYYDTSKKFSISPLYEYFSTYTTYNNSPNYDHYTVINFYPLTDNISVTIDITTIVSSWVKNSLKNKGIILYGRNEDILTSFGSVKSSDNYLMPFIIVNYDPYSPNKCLKKECTNKYSKDCCKKKYNDEYFKDDCCEKYIKICKEELESILFKVCKEACGGNCNPFPSNTSITRTVRVTGTVAPTSVYYIVVDLQVTRASSGQVNHYYVSDEYDNSLNNTPLPIDKTYNIAVSPPIQSGDAEDVILYGSYKGF >NC_009617.1|WP_012060868.1|5483585_5483870_+|hypothetical-protein MASFDTPQNSTIQTIYATGTIPAHNDAGFIEIQAVASRNGGHETFYKTFQVAASATRATAEVWAGAGNYQIIITPKLFGTQSVSSTTVINSFKH >NC_009617.1|WP_012060867.1|5480710_5483221_-|glycosyltransferase MKDNLVNIVMQSKDELINDTENLKEDISCVVKDKMKLAFFVRLGLDSFLGDIIEGLSQEYEIKKIIVTEYKQIEDGMQWADICWFEWCDELIAYGSKLELAREKKVICRLHSYEAFTDYINNVTWNSIDKLIVVGAHIKDFIVQNFNIDEKIISVIPNGIDEKKWTYKERENGFNIAYVGYINYKKGPMLLLHTFKAIYDEDNRYKLYIAGVFQDNRDVLYYNQMVRELGLENNVIYEGWQNDLDKWLEDKNCILCTSVLESQNISVMQAMCKGIKPIIHNFVGARVIYPSQYVWNTITEAVEMISDKNYTSKVYRAFIKERYSLNDQLIKIKDLLISSSEKGSKENLNYINPDHLRKSSDQVDLMKTKFMVNSDDMTNTEALFDYLLSINDEESYMKYLSEWFIRSKYELTFKFNYYYGNMYRRFTSYSRFKYMQQNVYEEMDKIGERILDENYLTYFNNKKMSLKENKRKILFILNGLDIHQSVTQFFINYLESSENAKDRYSVLSLLNKNEFNNSKESIEYFNKLNVNLFVPISNCIEDKIKEFYTYISEENFDYVVYQSLYFAPIGILLYPLLKKACEIIGKIQFQQPEDYFDKKLDFCYTYIKKDNCCENIFELISPINTELVDKNLDIRTLFNIDKKKKVVISIGRSIKYKNNEFWNFVIKLINEIDDICLVVFGGNYSEFEQYVPNKLIQECNVIFAGFNLEASSYLKSCDFYLNSYPGGGYSLEEAYYAELPIITFYKEENNEAFDVINASYMAPAYLYNNAKTIFPKTGDFDKLLSYSKKLIQDNSFRNTVKMNRKIESNNLKFEYFVKEFEKYMDNIANNNGRNNK >NC_009617.1|WP_012060866.1|5479751_5480714_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MIKSKKIFLTGGAGFIGTKLCEKLSSNNELLIYDNLKRNSIKNTKLLNKDNIKLVKGDILNFNFLKHVIDEFKPNIVIHLAAIAGIDTVIKNPVSTMKVNMIGTYNILEALKNQKIEIFIDFSTSEIFGSYAYKVDEAHTTNLAPVGEARWTYSVSKLAGEHLAYSFYKEYGLPIVTIRPFNIYGDGQVGEGAIHQFVVRAIKNEQIQIHGEGNQIRSWCYIDDFITGVMLCLDNEKAIGQAFNIGNPRGTITIAMLAKLIKRIAKSKSEIVYVPKNYVDIELRSPSIEKAKEILKFVPKYDLDEGLERTIKWYRGVLND >NC_009617.1|WP_012060865.1|5478655_5479759_-|DegT/DnrJ/EryC1/StrS-family-aminotransferase MIKLASPDIGQEELDEIKKVFDSKYLVQGDKVEEFENQLKEYLNAKYCFAVSSGTAALHLALLAIGIKADDEVIVPDFTFPATANVVEIVGAITKFVDIKLDSLCIDTDKIENAITDKAKAIIPVHEFGQSADMDKIVTIAKKYNLKIIEDAACALGAEYKGKKVGTIGDIGCFSLHPRKAITTGEGGIVVTNNSKLAENIRILRNHGLNYKNGKISFVEAGLNYRMTNIQGAIGTVQMKKLELINERRIELANKYNNLLKNVKFITLPEEKSYEKHVWQTYHILLDKRIDRDKLIIELKDKGIETNFGAYAVHEEPYYKEKYGYENCQFYNSVYAHKHGIALPLHNNILSKEIIYIVSELEKILNE >NC_009617.1|WP_012060864.1|5477625_5478663_-|hypothetical-protein MNNNIIMYFKENGMINPKRSINLICKAIKFTKLDLSGLIVFTEAACGEFIYTPIIAAMAGAKKVYAITKDSKYASKDEVKKKTMLFAELCDVVDKIEIVFDKRNINQADIVTNLGFVRPIDKETIDMMKENAVIPYMCETWELRNEDIDIEYCKQKAINVMGTNENYPGLDTFKFSGPLAVKMLFDVGIEIYKSKIVIVSNDNFGQIIYTTLSKLSSDVVVIKNLLEENHDLLINTDALIVADYTSEKCFIGMNNSDITSKKLKSLSSFITVIQYSGIVDIDDLKENCINFYPDYKVGNYRMGKTLAYLGPKPIIDLHCAGLKVGEIMYKNSKKHIRNKLCQEFL >NC_009617.1|WP_012060863.1|5476716_5477607_-|UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine-N-acyltransferase MKLSELVNKIENISIYNDGEFDNLDYSNSKTRSRILTFINDEKYIHTLSESVTCIICDAKIAKILPNKYGICLSENPRLSFYLIHNCLCRDINLYNKEEFETIIGDNCIIRDRKGISRKNVIIGNDVTIEENVIIRENVKILDNSVIRSGVILGGEGFQFNKEGRIFFIEHCGGVEIGRNVEVQYNTCIDKAMFPWDNTVIGEETKIDNLVHVGHGAKIGKRCLIAANALIGGSSIIGNDCWIGVSVTISNGLIVGNNVSIKIGAVVTTNIADGSAVSGNFAIEHSKFIKFIKSIR >NC_009617.1|WP_012060862.1|5475067_5476384_-|nucleotide-sugar-dehydrogenase MLDKDNLIYKINNKTATIGIVGLGYVGLPLAVEFAKSGYKVLGFDIQEKKVNMINNGENYISDVMTEELKFAIKNRRLKASNEIKFLKDTDVILICVPTPLDKYQQPDISYVKESTESVGKYLHEGMLVILESTTYPGTTEELVLPTLEKMSGLKCEKDFYLAFSPERVDPGNSIYNTANTAKVVGGVGRDSTEIAAELYRKVLNSEIFEVSTPRVAEMEKILENTYRNINIGLINEMAVICNKMNINIWEVIEAAKTKPYGFQAFYPGPGLGGHCIPLDPYYLTWKAREYDYHTRLIETSGEINNFMPQYIVQRSATILNKFNKALNKANILILGIAYKSDIGDYRESPALKIIENFQKQGSEVKFYDPYISSYMYKGEEHYGIKLTQEVLRNADLVIITTAHKKYNYSFIQENSIFIFDTRNATKNVQNKDNIELL >NC_009617.1|WP_012060873.1|5492038_5493988_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIRGMGKVTSLLVAAATVASLVPFSGANAAEVKRISSDDGTIYNAIAYKDGKAYIDGEINDDEEAYYLSNGKFNKLDDVDSGDSAALFGEKYLDISDGDYTVDLDKGSVTDDDIKGDTEDDAAAALRKKIKDDTDDRYNETEANTIKDSNHGDLFDLIPGAKYNKVWYYTQYKAAQKSIDKNVNGLNGLDSAHQIFNVFTDDKGNYIDADYNLGKVKVTTTASSASGTTLTKTDTIENTNDAYDAADGIINGTSVSGSDKLSASVVQDRVLTQDKDYIYRLATVKITITTGAAATISEINGVKVDPNNSNDIFKVENNGQVVSFKAIQKISKTQASGDIDDAKYAKTVTTYALSDKDGKKLDAEDLFINTSGNVVTTTNYTVGSGKLIAYNSEINNNDKVTVRAYTLKSSSGFYYADEEDQSKEDCENSKNQGAAVQTDVDGNLWRLDGGYIYKFDNTDDWDKVYRVDGSFDEFSVYDKDNIVAWSEDDDVYSLIGGKQSNTDPDDTPVVKTGWVQASDGTWSYIKADGNKATGWVQDGSTWYYFKADGSMATGWVQDGSTWYYFQSWGGMQTGWLNNNGTWYYLQSWGGMKTGWLNDNGNWYYLQSWGGMQTGWFNDNGTWYYLYSNGVMAANTVVNGYNLSASGAWV >NC_009617.1|WP_012060874.1|5494261_5495134_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MKILNIAHRGYSGKFDENTMLAFKKAIEYNADGIEADVQLSKDGVPIILHDETLDRTTNGHGFVKDYTLDELKIFRTKSVPEIQLLKNDSLQEMAHLKLNMATERNYEEGKQAGSYKVGKYTMEEVEYFQNRGGEEIPTLRELLELVADSDLKVLNLELKNSVIEYKGLEKKVLSMIDEYNLRDKVIISSFNHTSLVKVRKLENNKKITLGALTETILVNVPKYLKAISVDCYHPHFSSILNEEYIKEIKDAGIKVNPYTVNSLVDMKKVIMVGVDSIITNEVELLNTLL >NC_009617.1|WP_012060875.1|5495425_5496493_-|InlB-B-repeat-containing-protein MKYEYLRKSIAVSLAISSLITVAPVKSLAAWIENYDGSWSYADIYGYANGGWKQINGIWYYFDSYGLMRTGWILDNGEWYYTDLSGVMQTGVIQIEGKIYIFSENGAMQKGTSIINGRIYNLDDSGACIGSDYPIPTKSFDYYGNNTLPYVPNQIIDEDSKMSKDIPTDPSKEVKKQYKVKFKDPEAEDDDDELLRTKTVDEDTMLTLYKPVKNGYTFIEWNTKSDGDGSSYEYDDRIKITKDITLYAQWRKNEDTGGETTIKVENIVVLGPISGTTEISSITTKGGSLQMSKKVYPTNSDNQKVKWLVVNEDGSATISDTGKLTAISNGKVIVKAIATDGSGVIGTKEIKISGQ >NC_009617.1|WP_012060876.1|5496584_5499902_-|Ig-like-domain-containing-protein MKWKFINKIISAITVSMTLFTLIPLRASAEWVNDYQGNFYYMQDNQKVTGWKRIDGQIYYFDGNGKMQTGWIKAGSSWYFLQNDGALKTGWINYNKKWYYADSSGVIQTGIVNISGKVYIFDDNGAIKTNNTVINGEFYTIGSDGEVVGTKMPTPEKEYDDSGNCIQVLKNTDNKVITSPTDSKFNEVIEDKTGSDDNPNEGRTFKVLLKDSDGSELKTKTVKYGKSFDLYKPTKDGRVFAGWNAKSNGSGKSYDADDSIKVEEDIILYAQWKEDTSVYVEDINIKGNSNVTVNKSVTMTAEVSPSNVTNADVTWSVSDETGKATIDSNGVLTGVSAGTVMVKATAKDGSDVSGTKEVTVTNTDVVVPVSKVTVSGQSGESTITAENGTLQMKATILPEDATNQAVTWEVQNNTGSASIDSSTGLLKAISNGTVTVKATASNNVVGSMTVTISGQSTKILVTRMDITTTKTDFAITEDGGTLQLNLNITPTTATNKSVKWSIKSGQDKATINSSTGLLKAVTNTNGTPVTVQAEALDGSGVVATKDVTISGQKIKVSKITIDGPDSVTGTGKVTMDKTVLPKDATNGAVVWSVENNTGSATIDTNTGELTPKSNGKVTVKATATDGTGISDTKEVTISGIDNNIPATKINIATKDGAALSITEDDGTLGLIASLLPSYSTTTSEAVNWEVISGSDGGSAKIEGGTVGSSINIKGVTNGTVTVKASVVNADGTTAIGSATVRIAGQITNVTDITISPDEAPEVVVGGTLQMSASVDPNNATYKIVNWSVSNGTGTATITSSGVLTGVSSGDVKVIATADNGKGISKYITVKVIPQVKVTKVTVNAPDGSGNEITDGGALQMTASFEPTGATSKSVTWSVTPGTGKATVDSNGLLSAVSNGTVTVNATATDGSKVVGSLPITISGKVGTITVTGTGNISTIVIPNGTLQMLATVGPTDAVNKAITWSVTPVTGKATIDSNGILTAVSNGTVTVNAAATDGSGIVGQSVVTINSASGITINQSSNTVAVGNTVKLTSVISPTSVTGKKVIWSISNIDGTNTDLATINSTGDLTADLTALKQGSVNIKATLDDGSGISVTKTIIINPNS >NC_009617.1|WP_012060877.1|5500217_5502320_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIRRINKILALILIGTSIIATIPNSVFSTPVKAETNDISKIILNPQTNNIALSGIDIGSMVPDGDTLIGMAENTTINPQLENGVKLMFSSKGAKSIDNEECGKLSYNLSGSLVDEISAQVYEVLKDPITNAVVSKAESATGGTIPEETLKNVIEPIVEKNLQAALPSAIKSRFQNIPIYQYTGKNNSGDVIAQAFVVKGLVGSIVNTVVGNGAYCINTYSANVRNASYSSLDIVPSLTFDPAVGTTAYSKVINLDNGSKVIGDGMSINVIDSINNKVYVINNPIYNMLKAKQGQSDKINRDLNIIDFNGVTNLSGSLSFPLDIDGTKFSILSLSLTKNGDITANKSYKYAVVVGDYEKNLLDNMIDGVNLGNVGDKIKVMIKSGTYNMIPDINTQIGGLIDKGKNEFDKTIDGISDGINDINDSLDDLTDALKDKNNDVDDAWDKVFDRYDNDKGWGKHDGYIYYYDKDGVSLKGIQKINGKIYYFNRIDGAMETGWQIVDGKKCYFDKKKGYELFNQWVQDDDWYYVGEDGAVKKMEWVNYNGKYYYLKADGKMVKDWFKVDEYWYYFNNDGSMSASIWKSSNGKWYYLKDNGQAAGDWLNLGSNWYYFKNTSGEMQTGWFRANGNWYYSNDDGSMKTGWIYSKNNWYYLDEGTGVMKKNEWVVIDGKNYYFNINGEMVTGSRYIDGTKYMFGSDGTLY >NC_009617.1|WP_012060878.1|5502592_5503900_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MNKEKKNVSLKVKLQVSYVIMSILVFISGIVNFKQLSDIKNGIANGDTLARDITTTVVVCIISIIAAIFAGFYMHKNIISRLNSLQKFAMKLASYDFSEGIEITKDDEIGATGRELNVAQENVKNLISTILNEACNMSGLSQELSANVEEVSAKLDEVDNSSKNINVTMTETSATAEEIAASIEEVNSSMESLANKAADGSTNAEKIQRRAEKVKEDSKIAIANTTQIREQKEKDIIKAIEDARVVEEVKVMAGAIADIAEQTNLLALNAAIEAARAGESGKGFAVVAEEIRKLAEESSQTVFTIQDTISKIQDAVKNLSDNSNDILNFMSSEVNKQLQDYAKIGEKYSNDGDFVSSMSEELVSMAQEVEATVEQINEALQSTAADVQKSSVNSEKIQSEIETSSSAISQVANAATQQAQIAMHLTELVQKFKLK >NC_009617.1|WP_012060879.1|5504169_5506404_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MSAKKINLNKITSYLLIFTVFFTLMQTVNLQKASATDETQVKGLQFHIGDVNGKTKNIDGNEKDGYLCEFLPIGENFTLVADSGYSIVGVQSSNSSFMNVKGIPNSSGGKDYVVNTITDYSDFTLTVTMKDSSGKQFIYPIKMKFESDSSLSFGTLRVTLDGKATYDLLFTQTDANGNYNIPDVNSDVKMAKVQLFDNNKTPMNFSANGGSSAAEATVNLTGGDNVISIAVTNQNISRQYKLIITKKGEAKLQSLVPSTGTLSPAFNSSTYDYTLQVPTAQTTIAFTPTAVDNSSTIKVNGVTVKSGSRSQNIKLDEGENDVEVIVTTKDGDTNTYNIKVTRTALFRSSQLIGLTLTSGTLTPAFNKGIYEYSGTVDNSVTSIGVTPTAEDVNATITVNGKKVPSGATSPYISLDEGGNTINVKVTDSKGNSNTYVLNITRRYPKDNVNLASLSVTDGTMSPKFDPETYLYSVKVARNIEKVRVMYTSQNDKAKIKINGKEYTNGQSDYIKLDIGANLVVVEVTAEDGKTTTTYKLSVIRGDIEGTNQWVLVGGNWTFYNAAGMQIKNQWVKYDNQWYFLDINGYMQTGWIQDSGNWYYLNKDGIMQTGWFYDKGYWYYLEANGAMRVNTWATYDGKWYYFNNFGEMQTAWAQYKGKWYLMDDHGVMQKGWVTYDRNKYYLNDDGSMRTGWLYNGKSWYYLDDSGIMITGWKNINGKNYYFDAGGVMKTGMLFLDGQWINLNNA >NC_009617.1|WP_012060880.1|5506726_5508148_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MSKMVRRIISTFFIIYSVSFLQTSSLNLLMTKVYAEQDNPSLKDIYLSDGGNLDFSEDKYSYVTDVGNDIDQVLIKAKPYDLLDTVKVDGEIVTRDDSYRKVVPLVKGKNKVEIEVLDNRSDATSTYNVYIYKGGKDAVYLKDININDSNIGFDKNTNFYNIELDEGTNMMELEATPEDGNYSMTANGKQLSNDSIKVKFNGIGKYTINLGVKDDDTQRIGNYTLNMYLGIPVTPNVQDTINSIIKPNQWVIVNGRWRYNDTAGKCLKNTWYYDNKYKSYFYFNARGNMQTGWMEDDDKWYYLEANGEMQAGWLYYKNEWYFLDNNGVMKTGWIKDNDKWYFLKDDGTMATGWITSNGTWYFMERNGSMRTGWIYYGKQWYYLEQSGAMNTGWVNENNQWYFLNADGSMKAGEWVYWKNNWYYLNYAGNMRCGWLYKDDKYYYFNEDGAMRTSPVEIDGYIYNFNNDGSVNFG >NC_009617.1|WP_012060881.1|5508580_5510362_-|cell-wall-binding-protein MIKRMTKATSLLVAAAAIISIVPAHAADYTKIDSQEGTIYDAVAYKDGKFYVDGEVNDKDEAAYYLADGKYNNLSDIDSGADTDIYGSKYLEVQDGDYFVDLDNGSVTDESIKENAEDDAASALRKNLKKDNDKRYASSEAETIQDLAGAEIAGNKFSAPWYKFEYTKDNATNGSVAKLNVYTDAQGNYIDADYNLGSIKVTTTASSTTSKTVTIANTDDSYDADGTSDATGKEKVSASVDTSAGKVIGQDANYIYRTAKVTVNAANGATITKINGMDVTVDGGHTFTVSNGTLGSSASTVGFNVIQKISKAQASGNVDGAKYAKSVTTYIVSDEDGKNEAFAYDNYTVANGKIVGYTANGTNVKTATGTLSSKNGYYYVDLGDEASEDVKENGTKSAVDTDVDGNLWRLDAGYIYKWDNDEDWTKVYKVDGSFDQMSVYNQDNIVAWSKEDDVYSVIGGKGTTTPTDPTPVVNKGWVKTDAGWTFYNTDGTQVKGQWVNDGGVWYYIKADGTMATGWIQDGSTWYYLQSSGAMKTGWLNDNGTWYYLQSSGAMSTGWLNDNGTWYFLNSSGAMLANTTVDGYKLGASGAWIK >NC_009617.1|WP_012060882.1|5511390_5513358_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MALLELRSINKYYRLKDNDKFHVLNNINLSFNAGELVSIIGESGSGKSTLMNLIGGLDSDFSGELLVNEKDIKKLRRKELDKYRKNEVGFIFQSFNLIGHLSVLDNVTIAMTLSNVRKKKRLKRAKEILRDLGLENHINKKPSQLSGGQKQRVAIARALINNPKIIIADEPTGSLDSKTTIQVLEIMKDISRKGKLVIMVTHSERVASASSRIIKISDGEIIDDNKVIELDNEVNIEKQDNIRKQKQNLSLISSAKLALVNMKEKLPRNILVSVGGSIGIMSIILMLSLGNGVKSYFNKTMNNYVNPLVIEVNMPSEEDENINLDVTTVQKPDVNATKPFEESDIDTLSKIENVSSVERGYSIISLGANSLVYNNKTNNLMNVSTISSNITTSNVETGTLPKAGEVLINKALSDNLGKDIIGQKVNLRILANQKILNRDFIVSGVYTTTSGDLTANMKSAFLNYADLEKLYSDNGYKLKPNVIYVNTTNSKYTSQIKQKVNELGYSQSSQEQMASMFNQMIDILTYVLSGIAAISLIVSAIMIIVVMYISVVERTKEIGIIKAIGARAKDIRRIFVSEAFLIGFFSGAIGLVGAYLIMRGINLMSNKLFGVSVVLIKREYAILGVIVSIVISTLAGLLPANKAARLDPVESLRRE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009617_6 | 5552525-5552671 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009617_6
|
2 spacers
spacers of NC_009617_6
>6.1|5552552|33|NC_009617|CRISPRCasFinder GAAAGTTCCGTTATCATTTAACCAACCAGTTTG >6.2|5552612|33|NC_009617|CRISPRCasFinder CCAAGTTGCTCCATCTTGAATCCAACCTGTAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009617_6
The CRISPR arrays of NC_009617_6 >merge|NC_009617|6|5552525-5552671|CRISPRCasFinder CATAGCACCTGATCCATTTAAGTAGTAGAAAGTTCCGTTATCATTTAACCAACCAGTTTGCATAGCACCTGATCCGTTTAAGTAGTACCAAGTTGCTCCATCTTGAATCCAACCTGTAGCCATTGTACCATCAGCTTTTAAGTAGTA >NC_009617|6|5|5552525-5552671|CRISPRCasFinder CATAGCACCTGATCCATTTAAGTAGTA GAAAGTTCCGTTATCATTTAACCAACCAGTTTG CATAGCACCTGATCCGTTTAAGTAGTA CCAAGTTGCTCCATCTTGAATCCAACCTGTAGC CATTGTACCATCAGCTTTTAAGTAGTA
>NC_009617.1|WP_012060912.1|5549357_5551190_+|O-antigen-ligase-family-protein MTNSRNNSNEKSFNFFLPIAFILSIVPLIVRMAAVKLDENLIKIWGTTVKTDLFSQRKALLLIIFSVILIITCVIFFKKIFSRKDKLVNYILIACGVFTLFTFLSAIFSKYKQVSFWGMFDRAEGFIIIACYIVLFLYSLYTFKTTNNYKYIITPLLILVFINAFLGLFQYIGQDLIKTSLGASIAGASSNSGIDLLNEKGTIYGTLASYNYMGSFVSIALPILFCYTIFEDEVMYKILSFIGTLLSFWLLFGSTARSGIIGVLGALIFGIIIFYKPLIKRWKGILIGVITLIILFVGANFASKGSLFKRIPSLASDAFSIFKDTSDLDYTNYTPVKDIKYIDSTTEVVLPNDTLKITYESGNPVFKDSNGEVVPYALNGKVLSTNIETFKNITFAFGKLDKKSVISDSLLLNINNQPTFLFKLNDNKIFHLIDMSTKNYIDLQTPETFGFKGKEKLGSSRGYIWSRSLPLIKNTMILGTGPDTFVFDFPQGDLIGKYYAYDTPNIVVDKAHNLYLQIAINYGVIALVGFIAMLLIYIIDSIKLYALKNNFEDRNQALGAITCLGIIGYLFAGIFNDSVVGVAPIFWIIFGVGIAINFMNRENIRKKSNK >NC_009617.1|WP_012060911.1|5548279_5549149_+|glycosyltransferase-family-2-protein MKLSIIIVNYNTYDLTKQTIESVIKEHHNFNYEVILVDNASSDGSINKLQDKFRNIVTTKKLHIIINKDNLGFAKANNIGIKFARGKYILLLNSDTVLKENCLEKCIAKMEKDKNIGALGCKVVLANGDLDHACKRGFPTPKASLYYFLKLHEKNPSKYGQYNALHLREDDIGEVDCLTGAFMLMPKLIFDKVGGLDEDFFMYGEDIDLCYKIKELGYKILYYPEAQIIHYKGGSSKKKRSKVIYDFHQAMWIFYKKHYYKKYNFAVTFLVFIGIGLKYLVQIIKNAFK >NC_009617.1|WP_012060910.1|5546785_5548204_+|undecaprenyl-phosphate-glucose-phosphotransferase MIKENQNLLNKFNAISDIIILFISITLAYLIRFYIFSPDTYYITLTTYIEFSVIIIPINLILFNFFNLYHSFRTRSFVKECSAIIKSNTILTAVLLSLLFVLKLVHISRLVIIIFYFVNIMLIMAKRLILRKILSRMRTKGLNLKHVVIVGAGEVANEYLDVLKNNKSFGYNYSGYVSDASNFQGRKLGNYSDLYNVLNEYKPDEVVCALDLSDAKYLENIVSDCEKSGTKISIIPFCYKYIPSQPYIDQLGSIPLINIRRIPLDNLGNAFIKRSLDILGSLFLILCTSPIMIITAVIIKFTSNGPIIFKQKRVGLNKNLFVMYKFRSMKINSQEETGWSTDNDPRKTKFGSFIRKFSIDELPQFFNVLKGDMSLVGPRPELPHFVENFKNEIPLYMVKHQVKPGITGLAQVNGYRGDTSIKKRIEFDIHYIENWNILMDMSILFKTAFKGFKNNEKIRINSTKSTNNEVNL >NC_009617.1|WP_038458054.1|5545476_5546358_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA MTKGIILAGGSGTRLYPLTMVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKDILIISTPNDLPNFEKLLGDGSRYGINLSYKVQPSPDGLAQAFILGEEFIGNDNCAMILGDNIFHGNGLKNHLKKAVENKGRATVFGYYVEDPERFGVVEFDVNGKAVSLEEKPENPKSNYAVTGLYFYDNKVCEYAKRLKPSQRGELEITDLNKIYLEQGNLDVITLGRGYGWLDTGTVDSLTEASEYVKVIETRQGLKIACLEEISYKNGWIDKKTLLESAEQYGKSPYGQHLKNVAEGKVIY >NC_009617.1|WP_012060908.1|5544890_5545442_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase MNLIKTKLEGVYIVEPQVFGDERGWFMETYSRIKTPEIACDFCQDNQSYSKGKGILRGIHFQNGENAQAKLVRCVKGAVLDVAVDLRKGSPTYKEWVAVELSAENKKQLFIPRGFGHGFLTLTDDVEFVYKTDNYYNYESDRSIKFDDPEIGVEWGIENPILSEKDKKAPLLKDSDCTFIYNK >NC_009617.1|WP_012060907.1|5543705_5544725_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase MKIVVTGGAGFIGGNFVHYMLNKYKDYKIICVDALTYAGNMETLVSVKDNSNFSFYKIDIADRDAVYDMFEKEHPDMIVNFAAESHVDRSIENPEIFLKTNIIGTAVLMDACRKYGIKRYHQVSTDEVYGDLPIDRPDLFFTEETPIHTSSPYSSSKASADLLVGAYHRTYELPVTISRCSNNYGPYHFPEKLIPLMIANALNNKELPVYGTGENVRDWLYVEDHCRAIDLIIHEGKVGEVYNIGGHNERTNLQVVKTVLHELGKPETLIKYVTDRKGHDMRYAIDPAKIHNELGWLPTTTFDEGIKKTIEWYLDNKTWWENIISGEYQNYYDKMYGSR >NC_009617.1|WP_012060906.1|5542750_5543719_-|glycosyltransferase-family-2-protein MEVDKPLVSILLAVYKPNENWFIEQLISLNEQTYNNLELFVYDDCPDFPTSEDFLKKCITNFNYTVIRGKTNEGSNKAFEELTKIGNGEFFAYCDQDDIWEKDKISIIMDGFKEDDVTLVCSDLSIIDENGTKTANSITEIRKRIIYKSGYDLTEGLLERNFVTGCAMIVRSNIAKKAIPFVDSLVHDNWIAIIASINGKIEFVNKPLVRYRQHNSNQTGILKGIYDKNTYCKFKIEDVLERYISLKNRLGYIGELQGHLNYCITSLRARRSYFLKPSLKELKIIIKYSKYYKASIVLEIFLPIMPEFVFKYIIRLTKKGIL >NC_009617.1|WP_012060905.1|5541896_5542736_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase MILVTGVNGQLGYDVVKELNRRNIECLGIDRAELDITDKNAVKDCIGKLKPDCVIHCAAYTAVDRAEDEEEVCAKVNVYGTDNIAKACKEIGAKMIYISTDYVFDGKGNTPFEVEDKIEPHSVYGKTKYEGELKVKEVLDKYFIVRISWVFGVNGNNFIKTMLRLGSEKESLNVVCDQIGSPTYTADLAPLLCDMAVSEKYGVYHATNEGFCSWAEFAGEIMKKAGLSCKVNPIPTSEYPAKAQRPFNSRLSKKSLVDNGFGLLPNWENALDRYLIELK >NC_009617.1|WP_012060904.1|5540504_5541881_-|ABC-transporter-permease MNKRKFIKLTILVSLIFITNILIFKFCNIDDKNITLSYKIVSNEEDSYQVFYGTDMLWSEEQSQINSYTNINRQETLKFSIPKDITNLRFDFGEHPANINVSEIKLSCWGKSINIDLNEILNENNENQIGEVQEINNSLNIQTIGNDPYVVYKMDSTLISGLIEYEDSINNAIKLGSCILIDILAAIVLRKSRSVLILIQELKNNKTLIWSLSKNDFKTKYAGSYLGIIWAFIQPIVTILVYWFVFEYGLKSGSPIKGVPFIVWFMSGLVPWFFFQEALLNATNCMLEYTYLVKKVVFKISILPIVKILSALFVHLVFIVFLFFVAAIYRFYPSLYTTQLIYYSFCTFCIVLGISYTTSAIVIFFKDLGQIINIFLQVGMWLTPIMWSYTMVPQQYQWILKLSPMYYIVEGYRDTFINHVWFYERYFQTIYFWVVTLGVFAIGAVVFKKLKPHFADVL >NC_009617.1|WP_012060903.1|5539229_5540492_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNDIAINVEHLSKIYKLYDKPIDRLKESLFFTRKVLYHEHYALNDINFEIKKGETLGIIGTNGSGKSTILKIITGVLNPTLGRVEVNGRISALLELGAGFNQEYTGIQNIYLNGTMMGFTKEEIDRKVNNIIEFADIGGFINQPVKTYSSGMFVRLAFAVAINIEPEILIVDEALSVGDVFFQNKCYRKFEEFKSEGKTILFVSHDLGSISKYCDRVILLNRGRKICEGNPKESIDMYKKVLVNQQDDSYDINHISQNKYIEKGQWKRSLTVNPDTLEYGNKFAEIIDFGIVDNTGIITNNITKGTIFMIKMKVLFNKKIQNPIFAFTIKDLKGTEITGTNTMIEKEDISVIEQGDIKEISFTQNMNIQGGQYLLSLGCTGYRDGDFTVYHRLYDVCNITVVSHKNSIGYYDMNSEVKIK >NC_009617.1|WP_012060914.1|5555078_5556296_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKNLKKIIAIILAVNTVSTIAPVANLGLLTTKVYAANKITNLTVEDSNGDNMSLYSESDCTDKHRVDSDDVQPGKTYYTRKTSADEINIDADGVDSDNIRVFEETSSDTEGKDVGEDVDLSSGTNIITVRVYNGDPGTVKYSDNSYVNEYKIRVKYSGSNDDDDEDSDNVYLSSITLMGGNIDFSKKVYTYDVQVPEDLSKITIRARPDCDSGKYDDYKVKINGVKVDKDDKFKDDVSLNKGKNVIDIKVEDDDDNERVYTLNITRGKDNSNNNSKSSEQAEVTKTSQWVQVDGKWQYKDSTGNSVKNTWVQNYFVQADGNMATGWLNNNGKWYYLGDDGARKTGWQLVNGNWYYLDSQGTMQVGWIKDISNGKYYYLNNDGSMAYNTTIGEYKLGSDGAWYNR >NC_009617.1|WP_012060915.1|5556426_5557671_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKNIKRVIAIVLAIGIISAATPNSKINLLTTRAYASTTNDESTLDSLSLDDSDGNNVKLYDDNDYKNRVKENDVHEDETYYAKTSSKTVSVDISGPDDNFVRVFRDSSDSTKGKEVGDDIQLTDKSVVTDLIIKVYGKDLDGETVRNNEHDDDEYDLLNTYEVKVRHVDEDDSDKTDFDDIYLERLSIAGSTINLSNSITKYTYNVDSNVNTVVIKATPENDNYDVTIDGEDADYDDNYKRTVNLEKGQNIIKVEIEHNNKDRVYTLIINRGNVSSSNTNNGSTNTDTNTGSKDVKANQWVQTNGIWQYNDAEGKVVKNSWIQNYYLNSDGNMVTGWLNLNGTWYYFGTDGAKKVGWQQSSGKWYYLDSEGRMQTGWVKDRNGKYYYLNSDGSMAYNTKIGVYRLGADGAWIK >NC_009617.1|WP_012060916.1|5557721_5559263_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MKKNMIKIVSIALALGIVSAAAPATNINVLTTKAYAATDNDDDYLDRLELNDEDGNNIKLYSDSDYDSKVNASDVEEGETYYAKTSSDTVSIDIDGPDEKYVRVFNGTSSSSKGKEMGEDVDLSDDSSTTTLTIKVYGKEPDDDMRYKDNDDYNVLSTYRIKVENPNYNQNNDNDNIYLERLSVNNNKVQLSKSELTYTYNVASDVKRVTIKATPEDDDYDVTIDNKNVQSADNYKKEVDLDEGTNEFEIELEDGDKDRVYTLIINRGNPSSNGTSSQDTAETEHQDSIYLDKLSIDGRLFSLSQSQVNYSSNVPSDVNKVTIKAEPEKDFYTVKVNGDEVFEDDDYKATVNLKDGENKIKVDVKNENSDEERVYTLTVIRGSVTSTQNNNGSSAANQWVQVNGIWKYNDASGNFVKNTWVGNYYLLDSGNMATGWLNYNGSWYYLGSDGARKTGWQLVDGAWYYLDSQGKIQTGWIKDSNGKYYYLNSNGAMAYNTTVGGYKLGYDGAWIQK >NC_009617.1|WP_012060917.1|5559493_5560759_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKNLKKIVAIALAIGTISAVAPATNINFLTTKAYASSDNDETELESLQLLTESGSKIKLYESSSYDSDDKVDADQVEAGEKYFAKTSADTISIDIDGPSSKYVRVFKGTSDSTKGKKISSDISLDKDSTTTLTVRVYDEEPDDDVRYEDDDYSSEYTIKVKCTADSSDSDDEDSSDSSDDYDDIYLDRLSVDGQSISLSKSKVEYTYNVSSDTDEVTIKATPEDEDYDVTIDGDSVDDDDKYKSDVDLKKGENKIKIELEDGDDERVYTLIINRGGTSSTTGSTTNTASGSPSSATDVVATVTNKWVQVGGNWQYKDATGNTVKNTWVQNYFVQADGNMATGWLNYSGKWYYLGSDGARKTGWQQAGGKWYYLDSEGAMQTGWVRDLGSGKYYYLNSDGSMAYNTMIGKYKLGSDGAWIN >NC_009617.1|WP_012060918.1|5560923_5562225_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MHKKIKYIIAATLVVAAVSGFAPSNNFLLGSVEAYASTYNDASNGELKSLDLTWGSGSKIKLLDSYSGDEVDLSSDTDYYVQLKGVSDFNVAAEVKGSGYVVKMFTSSSRSEKGEDVGQDVNIGSGYKDIYLRTYKSEEAYKEAYNDGDVSDCEKTYIIHARKESSTSEAEEDREYAYLDGIYLSDGSVDFSKNKTSYDVNVGEDVDKLTVRANPDDDDDYIEINGNSVYEDDNFEKTVNLDKGNNTITIYVEHEDEDTTYTLNVYRGKSANKTDSSNGQNFAIQTQEGSLNAWQRVDGKWRYVDGTGSVLKNKWWFDKDTGKNYYLGQDGFRTTGWFSDNNNWYYFNENGEMQTGWVNTNKNWYYLNKSGAMQMGWLEDSTGNWYYLDGSGAMETGWIEDSNGKWYYLDSTGKMIKDSAIGAYKLGTDGELE >NC_009617.1|WP_012060919.1|5562692_5564420_-|cadherin-like-beta-sandwich-domain-containing-protein MNKNIKRIIAITVAVNTISTISPTTLNTYFVGAKPVYASSYSPDDEQLKTLKIKSLDGETLDLRDGYNGDTVKLSDETEYYTKLTDDSDGIKITAEAEDDDYVVKIFTSDAENATAYDPGDEILLGKGDTTLYIRTYKSKSEFNKVKNNVSNCKEEYTLNVRKTKESSYEDDSQDSIYLDKIDLSKGNIDFLKGKTSYDIKVDENVDSMWIKAIPESNSDRVRVDGSLVDSSDNYKETVSLNKGKNEIKIKVTDSKDNQRTYTLNVTRGDDSDNEDDIYLDNITLSEGDIDFSKDDNSYNVDLDESVSKITIGAEPEDSDYSVTIDGDEVRSSDDYEKKVSLDKGENVIKVNVEDELNDKKRTYTLTINRGKETDDSKDNNTEDTSDKKSQWVQTNDGWKYYDENGKVLKSSWLYDKDQKVYCYLDKDGLRVTGWHKDNEKWYLLDSKGAMLTGWQKDNEKWYLLGSDGAMLTGWHKETVDDQNKNTDTSTNSGDNDTKKVDNWYYLNQDGSMRTGWLSDGGKWYFFNADGTMQKGWLIDYNSKYYLTEDGSMATGTRTINGKEYKFNNSGALIL >NC_009617.1|WP_012060920.1|5564653_5564911_+|hypothetical-protein MSKERTPYNPTPGDYDVEKLSGTRPESSNRQGGRDNIAPTRSLNPLSTDGPNKNITSSTSSKPHPVTGSVSMNHEDAFEYKNHNI >NC_009617.1|WP_012060921.1|5564931_5565153_+|hypothetical-protein MSKEKMSSNENEKYYSEEELTDSHPSDPNDSELKKIKSMYLPDSKADHAPSEKSIEDANGLEHPEPVKPKSLI >NC_009617.1|WP_012060922.1|5565251_5565503_+|hypothetical-protein MSQSKIPFSINPGDDYPMEEYSKESSPKSKASDSENVGKTTASGERNAKSLNNANISRTNLDTELIDLNADGDSDESKYSDLI >NC_009617.1|WP_158380906.1|5565548_5565692_+|hypothetical-protein MSKGKYPYVPTPEDVPAPDLSYIFSPESKNSSNKNDNKNTDSHKRNS |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009617_3 | 3.1|1589017|29|NC_009617|PILER-CR | 1589017-1589045 | 29 | MN856024 | Bacteriophage sp. isolate 154, complete genome | 5002-5030 | 5 | 0.828 |
| NC_009617_6 | 6.1|5552552|33|NC_009617|CRISPRCasFinder | 5552552-5552584 | 33 | MT446411 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH40, complete genome | 28967-28999 | 7 | 0.788 |
| NC_009617_6 | 6.1|5552552|33|NC_009617|CRISPRCasFinder | 5552552-5552584 | 33 | MT446412 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH41, complete genome | 156610-156642 | 7 | 0.788 |
| NC_009617_6 | 6.1|5552552|33|NC_009617|CRISPRCasFinder | 5552552-5552584 | 33 | MT446392 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH15, complete genome | 21954-21986 | 7 | 0.788 |
| NC_009617_5 | 5.3|5491579|34|NC_009617|CRISPRCasFinder | 5491579-5491612 | 34 | GU075905 | Prochlorococcus phage P-HM2, complete genome | 11901-11934 | 10 | 0.706 |
1. spacer 3.1|1589017|29|NC_009617|PILER-CR matches to MN856024 (Bacteriophage sp. isolate 154, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
ttatattgtttgtaatctgctaattataa- CRISPR spacer ttatattgtttgttatctgataa-cacaac Protospacer ************* ***** *** .*.**
2. spacer 6.1|5552552|33|NC_009617|CRISPRCasFinder matches to MT446411 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH40, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gaaagttccgttatcatttaaccaaccagtttg CRISPR spacer aaaagttccgttttcagttaaccaaccagaagc Protospacer .*********** *** ************
3. spacer 6.1|5552552|33|NC_009617|CRISPRCasFinder matches to MT446412 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH41, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gaaagttccgttatcatttaaccaaccagtttg CRISPR spacer aaaagttccgttttcagttaaccaaccagaagc Protospacer .*********** *** ************
4. spacer 6.1|5552552|33|NC_009617|CRISPRCasFinder matches to MT446392 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH15, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gaaagttccgttatcatttaaccaaccagtttg CRISPR spacer aaaagttccgttttcagttaaccaaccagaggc Protospacer .*********** *** ************
5. spacer 5.3|5491579|34|NC_009617|CRISPRCasFinder matches to GU075905 (Prochlorococcus phage P-HM2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttacttacaatcatcaggtgctatgaagactggt CRISPR spacer agaaacaaaatcatcaggtgctgttaagactgca Protospacer * .* **************.* *******
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
468366 : 531211
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009617|468366:531211|DBSCAN-SWA 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58 | Clostridium_phage(13.33%) | coat,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1078724 : 1097835
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009617|1078724:1097835|DBSCAN-SWA 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31 | Clostridium_phage(84.21%) | portal,integrase,head,protease,terminase,capsid | attL 1085194:1085209|attR 1098999:1099014 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1103557 : 1112936
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009617|1103557:1112936|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009617|1103557:1112936|1108884_1109058_+|WP_173709449.1|DBSCAN-SWA MQFNKNSGCVKVWVTLIVGGTYEYKDVPKLLNLQEQVKLVLVDMGAIEDITTESTAS >NC_009617|1103557:1112936|1108577_1108850_+|WP_011968270.1|DBSCAN-SWA MKTLAIYNKNTGEILFTQSGGTELEDNILTNLSCEVPDGKITKSVNIETKEAIFEDIPKTELELLKEKVNDLAQANAELTSIVAMGKSNA >NC_009617|1103557:1112936|1109953_1110742_+|WP_011968274.1|DBSCAN-SWA MFKGIDISNHNGNINFNQVKTAGVEVVYIKATEGTTFKDSYLDTNYSNAHYAGLKTGFYHFLVGTSEPESQANNFYNAIKDKTSDLIPMLDVETNFDGLMDYILRFIAKFKELSNMQIGIYTYTSFMDNLDNRIADYPLWEANYNNDPWRLNSNFFTNRVGHQYSETGSVSGINTECDMNEFNDGILNKTTGYVVTNYLPNGYQGDNSFNGVDADYVLQYFKGVRCYFRGNEKGVWIETQNLSMSKCLELKETLGSWFYDIK >NC_009617|1103557:1112936|1109487_1109883_+|WP_011968273.1|DBSCAN-SWA MIKQILGLVISILKNKTYMTAAREVWSIVDENFRITEKIEDTFKSKTEEFDKLLLAKFPELTKEDVIYFRQAVAGSVNVGKEAVLDNSVIMKELQESNTKLQAENASLKDQLSKFQSLAAATVNVDVQQTV >NC_009617|1103557:1112936|1109235_1109472_+|WP_011968272.1|DBSCAN-SWA MNEELVKDKIETHERRLNNHGDRIDKLEQDGRELKTELKNLCENLKNLTSMMKWFITAMGGALISFFFYAVQTGIFNK >NC_009617|1103557:1112936|1111207_1111630_-|WP_049767631.1|DBSCAN-SWA MRIDLKDEFKDLPANTIAENLIRLRKLNNLTQKELSLTIGISKSSISKYERGELFPTKEQSIKLASYFNINSKYFYDPYLESMDNFHQYLSTVLNKNIHINKDKLCKSLDISKRTLYRYCYQNNVPSRNIFDRMESYLNT >NC_009617|1103557:1112936|1104626_1106450_+|WP_011968267.1|DBSCAN-SWA MNVTQFHEKLNKLENNIYVIEEVVKVLNGVYESELQHDNVNLKTLNVYTGSKLTGNKIEAYFTSTPSLTPWKTIIKIYSNVSPIYISYETLGDQVEAEDVNKLQDAVVETQENLNSEINRATGAEKVLTDNLNTEISRAKSSENTLTINLNSEITRAKSAESILTTNLDFEINRAKTKESSIDAELSNRYTKDKVYTKDEVLQKISELINNAPNVLDTFKEIADALGNDPNFATTMTTMLAGKVDKVSGKGLSTNDYTDTEKANLADTNNKKHEHGNKSVIDGITATLIGYWNAAYTHISDSVKHITSDERSLWNTVSNKVDKITGKSLSTNDFDNNYKGKIDGISSNANKVEVSTTNGNIKIDGAEKTVYTHPSGTNPHGTTKTDVGLGNVTNDPQVKRSEMGAASGVATLDSSGVNSQAPKPHTHDDRYYTESEANSKFATKDEISNAGYGDMLKSIYDTNSDGIIDNADKLDGKHASDFAPSGYGLGGKGQRLNTSTDLNNIVANGWYDVQNPVNGPYSSGWFNFMVICSGDQSYLTQLGFGMTVNVGHVYIRTKSGSSWSTWIELYSNSVKPTPFDIGASPSTHNHDSVYLKKGLSWNDLEGV >NC_009617|1103557:1112936|1112168_1112936_+|WP_011968277.1|DBSCAN-SWA MSLLEISNISMNYHSIKGETQALNNVNFQVDDGKFISILGPSGCGKSTLLNIMSGLLEPSNGSVLYKGEDVKKNLDKIGYMFQKDHLFEWNTVWENVILGLKIKKQLNSESKERVSGLLDAYGLTRFKNHHPSELSGGMRQRVALIRTLALNPEILFLDEPFSALDYQSRLLVCDDVYKIIKTEKKTAIMVTHDIAEAISLSEKVIVLSKRPSSVKAEIPIHFSDEELTPFQKRRAPEFSDYFNMLWKELNDGNG >NC_009617|1103557:1112936|1103557_1104625_+|WP_011968266.1|plate|DBSCAN-SWA MSDSRAVIQARLLSNISDEYNKSEGEFMYDAEKPVAIELENAYTEIEGVLDKRFAETAAGKDLDKVVKDVGLTRKLTTQSIGKVTITGVVGSPINKGELVASDSVSFEFTETLVIPESGIIDVSVKCVKYGEVGNIPVGTIKYFPKTLSGLQKVINKEAISNGYNEETDEELRKRYYAKIQTPATSGNKYHYRNWALEVTGVGDARVVPLWAGNGTVKVVIINANKTGADKTLVDSVKKYIDPVDGMGEGQAPIGATVTVVSAIEKAINITANVSITNGFNLGIIQTTFKTLVLEHLQSISFNASYISIAKIGKILLSTEGVMDYSDLKINGAISNINLADEEIAVMGNVNLGVM >NC_009617|1103557:1112936|1106451_1107057_+|WP_011968268.1|DBSCAN-SWA MNYGTTKYGINEEDNIDEIKLISPDLMRYMPDYYITSKVMKELEHSNSLELGRLNYKIKDIKNQLWIDTATWGLTYWENEYGIETNLSLGYEQRREVLKAKKRGQGTTTKQMIKNVAETFSGGEVNIIQDNPNYAFVVQFVGVKGIPKNMQLFKDMLENIKPAHLGYTIKYTYTVWNVLKENKLTCNNAKLKTWDELKVYE |
10 | Clostridium_phage(75.0%) | plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1260535 : 1270726
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009617|1260535:1270726|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009617|1260535:1270726|1260535_1264279_+|WP_011968396.1|DBSCAN-SWA MLNIRSVFVEKKKGFNVEAQSLLNDFRDNLGVTGLEDVRLVNKYIISDIPEEYYNKALHTIFSEATVDVVYESELPMNEGEVAFGVEYLPGQYDQRADSASECLALLTAEDRVEIKSAKVVLLKGNLSKDDIEKIKKYYINPVDSREVDINSKDLSSLSNIPKDVQILDGFTSKTLDQLKEFHSGQGLAMSIDDLLMIQDYFKGEKRDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTILEDIQIEDNKYTAPIKASYESYIKSRSYVYGEKEKNKTLMDMAVIAMKELRKRGKLEDLDISEEINACSINVKIETDKGMEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAADPTVAIEDTLEGKLPQRKITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVEEVYHPNYAAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPALGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTVDSLNECGAEVQKGNAPTERKLQRLFRNSKAAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVPKKYEGLDGTELAVSESQERMAVVVTKEDADEFIRLSNDENLEANLVAHVTDADRLRLFWRGKNIVDLKRTFLDTNGATQKTNVTVKAPVDYPYTVADIDVKEEWINNLRKLNVSSKQGLSERFDATIGHGTVLMPFGGKYAKTPAEGMAAKIPVLDGESSDATLMTFGFNPELGTWSPYHMAYYAVIESMSKLAAMGGDYRKARLTFQEYFERLGIEASRWGKPFAALLGAYEAQMAFETAAIGGKDSMSGSFGDLDVPPTLVSFAVGVEKARNIISPEFKEAGSSLVLLQTEKLEDGTINVEKLKKNLDVLYNLIQSGKVISASAVKYGGVSETVTKMTLGNRIGAEIENLTKDELFGFNYGTIVLEVKNGVNVEEFKECLYKEVGKTISSAVIISKEYDLNLDIEALEKTYEEKLSSVFKIKTEDVEGKVETVLYDKKSTLSPAIKVAKPKVVIPVFPGNNCEYDCARAFEKEGAEVTQVVFRNITKEALNESIERLAKEISTAQILMIPGGFSAGDEPDGSGKFIANALRNEKISNSVMELLKNRDGLALGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMATLTYNNINRHMSSIISTKVVSNKSPWFSEVNVGDIHSVAISHGEGRFVAPESLIKELIANGQVATQYVDFDGNVSLNMPFNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGTDLYRNIPGDFDQKIFKAGVEYFK >NC_009617|1260535:1270726|1268592_1269204_+|WP_011968401.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTGLQSVIDAVESNYMNVKIEMVIGSRDNIYALERAKKHNIDTFVVNRREYGEESSNKILELTTGKVDLIVLAGFLAILDGEILKEFDNRIINIHPSLIPSFCGPGMYGLKVHEAVIKSGVRFSGCTVHFVNSEVDGGAILLQEVVPVYFEDDAETLQKRILEKEHEILPKAIKLISENKIRVIDGRVKIEE >NC_009617|1260535:1270726|1267603_1268605_+|WP_011968400.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYKSVKLIKEYAARTMSQYVLNGLGSFAGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAADLVKGISDGCVDSDCALIGGETAEMPGFYSDGEYDMAGFAVGIADKDKIINGSNIKDGDKLIGIASSGIHSNGYSLIRKVFPDLNEEFNGEEVWKTLITPTKIYVKPVLKLLESYEIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGGDFTAVINKDSYPLPAIFERIIEKGVDKEHMYNTFNMGIGFVLAVKDEDVEPIIKALVEMGEKAYEIGYVTSGGEGICLK >NC_009617|1260535:1270726|1266118_1267534_+|WP_011968399.1|DBSCAN-SWA MSNPNFELIMDPSNDKFKDECGVFGVYTNKPIDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIDIHKGLGLITEAFKQEDLQKLKGHIAIGHVRYSTAGGKGIENAQPILVSSKMGPIAMAHNGTLVNADVIKELLEDGGQIFHTTTDSEVIACLIARSAKKGFAKAVVDAMSAVRGSFALTIMSKDRLIGARDPHGIRPLSLGKIEEGYILTSESCALDAIGAEFVRDIEPGEIVIIDSEGIQSYRYSENTKCQTCAFEYIYFARPDSRIDGLEVHTTRVKAGEQLYKEHPLDADVVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPYDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKSNLEGKRVILIDDSVVRGTTSKHLVESLRRVGVKEVSFLLASPSVKYPCYFGIDTPYRSELVAANNTIEEIRDMIGADYLGYLSEEGVYKSCGDREEFCMGCFNGVYPVATPVEKEI >NC_009617|1260535:1270726|1269217_1270726_+|WP_011968402.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKEGVLDFAKFLVSKDVEIVSTGGTYKYLKENGLNVIEINEVTDFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNEEHMNTLKGRNIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLEFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISDKNDYKVVMEEIEANGETSYKTKKKLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLADEEEEYPEYLSVSYKKMQSLRYGENSHQTAAVYASTMLDGAMNTFETLNGKELSYNNFKDVDIAWKCANEFDEPACCALKHNTPCGVAIGKDSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIIGFNRKVDKKTAEEMVKIFLEVIAAPEYDEDALEVLKTKKNLRVLKFHNTPKADKYMVTVDGAMLVQEEDNKLVEEIKVVTEKKPTDEEMKDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALKRGKGATILASDAYFPFGDVAETAAKAGIKAIIQPGGSIRDQESIDVCNKYGISMVFTGYRHFKH >NC_009617|1260535:1270726|1264676_1265156_+|WP_011968397.1|DBSCAN-SWA MQVAIFFGSKSDTEVMRGAANALKEFGVGYKAFILSAHRVPEKLEETLEEIQAQGCQVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGVPVKAALEGVDALYSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSVNNDELKNKLKEFRLNMKKKFIEENAEGVEL >NC_009617|1260535:1270726|1265155_1265863_+|WP_011968398.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKKIYATDKADEVIVYYKDDATAFNGEKKGQIEDKGIMNNAITSVLFEILEKAGVKTHFIEKLNDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGFKLKTTVFELSYKDDSLGDPLINDYHAVGIGATTFEELKVIYDMTAKINDTLKAVFKEQNINLIDFKVEFGRCADGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILKRISK |
7 | Cyanophage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1564521 : 1616661
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009617|1564521:1616661|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_virus(22.22%) | portal,protease,tail,integrase | attL 1575756:1575773|attR 1618544:1618561 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1901501 : 1945453
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009617|1901501:1945453|DBSCAN-SWA 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55 | Clostridium_phage(50.0%) | plate,portal,tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2580447 : 2586971
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009617|2580447:2586971|DBSCAN-SWA TTCATTTTTTCCCTTTTCTACTGATCATTATAGATGTTATTACACTTATTACAAGAATTAGTAAAATAACTGAAATAGAAATCACTATAGATATATGATACTTAAATGATATTCCAAGCTTTATACCAGTAAATATAAGTATTAAGGCTACTCCGTATTTAACATATTCGAAGGTGCTGTGTAGTTTTTCTAAAATAAAATATAAATTTCTAAGACCTAATATTGCAAAAATATTTGATGTGTATACAATGAAAGCATTAGTCGTTATTGCAAATATTGCAGGTATTGAATCAATAGCAAATAGTAAATCTGATCCTTCAATTAAAAATAATATTGCAAATAACGGTGTTGCATGAAGAACATTGTTTATTCTTATAAAAAACTTTTCATCATGAAGCTCTTTAGTTACAGGTATCATTTTTTTTAGAAGTTTAATTAATTTACTGTTCTCAAATGATACATCATCTTCTTTGTTAATCATCATTTTTATACCACTTATAATAAGAAGTATACCAAATATATATATAATCCATTTAAATGCATTAATAATTGCAATTCCTAATAAAACAAATATAAATCTTAGAATAATCGCACCAAAAATTCCATAAGTTAAAATTCTTTTTTGATGTTTAGCAGTAATTCCAAAGCTTGAGAAAATTAATAAAAAGAGAAAAAGATTATCGACACTAAGACTTAATTCAATAATATATCCTCCGAGAAATTCTAAAGCTCTTTCAGAACCCATGTAATACCATATAGCTAAATTAAATATAGCAGCTATAAATGTAATTAATAAAAACTTAAATAAATGTTTTCTAGTAGACATTTTTGTAGCTCCTTTCAGATAAATTTGTATTTAAATTGTATATATTTTTTTAATATATTCGAAATTTTATGTAAAAACAATATTAATATAAGTTTTGTTTTTTTGCGTAAATTATAATAATTTTAAAAAGTAATTAAAAAACTCATTTAAAATAATATAACAATTATGTAAGAATAAATCAATAAAAGTTTATCATGTTAAGATTTTTATAATATTGACAAGTTTTTTATTTAATAGTAATATTGTTAATAACAATATTAAAAAGACAGTGATAATCTCATTTATAGGGGGAGTAACTGCCTGTTAATTATAACAGGATTCAAAGTCGTCATTACGGAGAGATCCCGGCTTTGAAAGCAAAAAATGCTTAGTGAGACTCTATAGTTAGAACGTGTTCTAGCTATAGAGTTTTTTTGTTACATAAATTTCTGAATTGAGAAAAAATTGTCAAAATATTTTAGTGATTAAGTAAAAGGAGGAAAACAAAATGAGTAGTTTTGGAAATCAAATTAAAACTTTACTCTTGATGAGTGTCCTGACGATATTAGTAGTATTAATAGGCAGAGGTATTGGAGGGCAATCAGGGATGCTGATGGCTTTGGTGCTTGCATTAGTTATGAATGGAGGAAGTTATTGGTTTAGTGATAAAATTGCACTATCTATAACTGGAGCTAAGCCATTAACAAGAAATGATAATATTGAAATTTATAATATGGTGGAAAGATTGACAGCAAATGCAGGAATACCAATGCCAAGGCTTTATATTACAGCTTCTACGCAGCCTAATGCGTTTGCAACAGGAAGAAATCCTAAGCATTCAGCTGTTGCTGTTACACAAGGATTATTGAATATACTAAATTATGAAGAATTAGAAGGTGTTATTGCTCATGAACTGGCACATATTAAGAATAGGGACGTGCTTATAAGTACTATTGCAGCTGTAATGGCAGGAGTAATCACAACAATGGCTAATTGGGCGCAATGGGCGTTAATGTTTGGCATGGGTAACAGTGATGAAGAAGAAGGCTCAGGATTCCTAGCAGCTTTACCATTAATTATTTTAGGACCTATTGCAGCTATGTTAGTACAGATGGCAGTATCGAGATCTAGAGAATATCTTGCTGACAGTACAGGAGCGAGGATTGCAGGACATAGCAGAGGACTCTCTAATGCATTACTTAAGTTAGATCAGGCTTCAAGAGTGGTTCCTATGGACGTAAATCCTGCAGTAAGCCATATGTTTATAGTCAATCCTCTAAGTGCGCAAAGATTAATGAATCTATTTAGCACTCATCCAACGATAGAAGATAGAGTACGTAGACTTCAAAATTCAAATTTATAGTCTTATTTAAAATTAGGAAACTAACTTGCTATTTTTTTGAATGAGCCTTAATAAAATATGAAAAGATCGTACTATACAAAGGAATAAAGTTTATTCAAGTGAAATAGCAGGAAGTCTAAAAATCATACCCAGATAAATTCGTTAAATTTCAAATTGTAGAATTCCATGAAGATGAGAAGTTCAAATATCTTGATGAAGTTGGCATAACAACAGCCATAAAATATAGAAGAGAAATTATTATAGAATTTACAAAATATAAAAATGGTCAGTTAGTTGCAGCAATGAAAATGAAGTATGAGAATAGAAAAGATCCAATATTTTTGTATTTGAGGAGGGGGGAATTAAAAGCAACTTGAAATTTAAATATAGCTTAAAGCAAGAAATTAAAGTGCTGTATTATTCTAGAGTGAATTATACAGCATTATTAATTATATATGAAAATTAATAATTAAAAGGTTGTATATCAGTGATATAGCTATTGGTGCAATTAATTAGAAGTGTTGTAATTTAATTTGGGTATTTAATTTTAATTTATTTTTATCAAATAACGTCCCCATTATAGACAATAAATTAAAAGATTCTATCTTGATTATTAAGTTGTGAGCAACGATTAAATTCCATTTCTAATACCGTGTTTACTGTATGTTTACCTAGATTATCTAAAGAATTATATTTTTTTAATAAACATTCTAATTCTTCTGATAGTTGTAAACGTGTTTTTATTTTGTTTTCATCCCATCCCATTAAAATAGATGGAGTTGTTTCTAATATTACTGCAAGTTTTTCGATTTTGTCAGAAGGTATATTAGAGATTACACCGCTTTCATATCTTTGAAGTGTTGGCTTACTAATAGATAATCTTTTAGAAACATCTTCTAATGTGAGATTCAATTCTAATCGTCTATTTTTGATATTTTCTTTCAAACCCATTTTATATCACCTCTTAGTTCTATATTAAAAGTAAGTAAATTATAGATTATCAATTAATATAATTTATTGATAATCTATAATAAAATCGAAGCGTCCTAATAAAACTTAATAACTTTTTATTTAGTTTGTTTACTGCAGTTAGGCAAATTAAAAAAATCATTCTAATTTGGAGACTATTAATATAATTTATTATAACATCTGTTTCCGGATATGCAACAATTATTTTCCATTATATAGAAAAAGTTACGTAGGAAGTATTGACAATAATAGCCATAATATATAAAATATTACTTAACGAGTAACGAAAGGAGAGCATTTATGATATTAGTTAATGAGTTAAAAGGAAAGATAAAAGCAAAAGGATATACTCAGGAAAAGCTGGCAAGGGAATTAGGAATGTCTCCAAAAACCTTAGGTAATAAACTTAATAAAGGAATATTTGGTTCTAATGAAATCGATAAGATGATAAAACTGTTAGATATAAGTAATCCAATAGAGATTTTTTTTAATAAATAAATTACTTGAAAAGTAAATTGTATTAACTTTATATATAGTGTTAGAAATCAAAAATTAATTATATATATTGCAAAAATAATTCTTCATCACAATTCTAAAAATATTGCAAGAATTTTATACGTAATTGTGAAATGTGCATTGGGAATTGCAACGTATATATTGTAATGTAAGAGCATTATGTTGAGCTGATAATTATTTTTATAGAAGGACAAGCTATGGAAGAATCATTAAAAGAAATTTTAATTGAATTAAGAAAATAGTAGTCTTAAATTAAAAAATAAATGCAAATTTATTTTAATACATCTTTAGCTAGAATGTATCAGGGATACAACTTTTGATAGAAATGTATAAAAAGAAAGTGAGGACTTACAAATGAATTTTAGGATTTTTAAATGTTATATAGATGTTTGTAAGTTAATTGAGTTAAACCCATCATGGAATGGTCTCAAAAGATTTAGGCAATTTTATTTATGGGAGCGTGAAAATAATGGCAGATATTAAATGGATTAAATTAGCTACTAATATGCATGATGATGAAAAGATGAAGTTAATAGATGCAATGCCTAACAGGGATACAATTCATTATGTTTGGATAAGAATACTTTTACTTGGTGGAAAACTTAATGCTAATGGAAAGGTTTTCTTATCAGAAGGGAAACCTCTCACTGCCAAAATGTTAGCTGTATTATTTTCTAGGCCTTTAGAGGATATTAAGATTACATTAAAAGTATTATCTAACTTTGGCATGATTGAAATAGCTTCTGATAAAGTAATTAGAATTGTGAACTGGGATAAGCATCAGAACATAGAGGGAATGGAAAGGGTTCGTGAACAAAACAGAAAAAGAGTTGAAAATCATAGAGAAAAGAAGAAAGAAGAGAAGAATGCAGCTAAAAGTAATAAGGAAGAAACTCAGGAAGATAAAGTCTTAGAAGAATTTATAGATTTAGAAGAAAATCAAGATCTGGATGAAAGTGTAGAATTAGAAAAAACTAATGAATTAGAACGAAAGAAAGATTACTCTAAGAATTCTACTATAGAAGAAAACAAAGCTCTAGGTAAAATTGATATATTAGAAAATTTGGAAACTAATGAAGATATCAGTAATAACATTTTAGAAACTGCTGATGATAATTGTATTGTCACTAAAAATAATAGTAACGTTACACGAAATAGAAGTAACGTTACAGTAACGCAGCAGAATAAGAAAAAGATAGATAATAAGAAGAAGAATAAGAAAGAGAAAAAAGAGATAGATAAAGATAAAAACATAGAGGGTAAAAAGAATAATGGTTTTGATATAAATAATAAAGGCTCAGCTTGTGATGATGAAGTTAGCCAGTCGAATCTATCTAAGAAACACAATAATACTAAAAGTGAATCCGGGGAAGAGGAGGACATAAATCTTAAAGCTTTAGAGCTTATGCATTATCATGAAAAAATAACAGGGAAGCCAGGAGGATGCGACTATGTTGCTCTTAGATCGGCTATTGATATCCATGGAGAAAAAATGGTTAAGATGGCCATGGATGTTGGGTTTGAGAAGAATTGTCCTGACATAAAGTATGCAATTGGGGTATTAAAAAACTGGAGGAGAGATGGGTATCCAGAAGATCATATGGAGGTAAAGAAAAATGGGGTTAGAAGCAATGGAAAGAGTGACAGAGCAGATAAAAATGAATTTGCTGGATTCAAGCCAAAGGAACCGCGAAAACTTACAGAAGCTGAGCGAAAGAGGATTGAAGAAAACCTCATATAAATGCGATAAATGCTGCGATACTGGATGGATACTTATCCCCCAGGAACATATGCAGCCTCTTGCTGTAGCCTGTGAATGCAGAAAAATAGAAAAACTAAAGAATGAGTGGAAGTATTCGGGAATCAATGTTGAACAAAGTAAACTTACTTTTTCTAGTTTTGAAGTTTGGAATAATGCGTCACAAAGGATGAAGGACACTGCAGCAGCATATTGTACTGATTTTGATGAAATAAAAGATAATAGGCGAAATAGTATTCTATTATGTGGACAGGTTGGCAGCGGTAAAACGCACTGCAGTATTGCTGTTGCATTAAATTTTTTAAAACAAAGAATCAAAGTGGTGTACATGCCTTATCGTGATGTAATCACAAAGGTAAAACAAAATATGATTGATGAAGAATATTATACTAGGACCATTTCAAAGTATCAATTATGTGAGGTTCTACTTATTGATGATCTCTTTAAGGGAAAAATCAATGAAACAGATACAAATATTATGTTTGAAATTATTAATTACAGGTATCTTAATTTTCTGCCTATCATAGTCAGCAGCGAATTCTCTATTGACAGATTACTGACATTTGATGAAGGGGTCGCTTCAAGAATATATGAAATGTCAAAAGATTATGTTGTAGAAATTGAGAAGGATATTAGTAATAATTATAGGCTTAAGTAAGAGCCCAAAAAGTGAGAGTCCAAATTTTATATTTGGTTACTCGAACTTTCTCTGTGAGATTTCATATTTGGCTGCTCGCACTTACTCCTATGAACGAATGTGAGTAGGAGTTTCATAGATTGTGCCTAAGCTAGGTTATGAAAATGTGATTTTAGAAAAGAAAATAGAGATATTAGAGGAAAAGACAAGAGTAATTCAATGCAAGAAATAATTTATATGAGGAGAATGTAAAGATGAAATCGTCAGGAATAGTAAGAAAGCTCGACCCACTTGGAAGGATTGTAATACCAAAAGAAATAAGAAAGGTACTAGAAATTTACGAGGGAGATTCCATGGAAATAATTAAGGTTGATAATGGGGTGGTTGTTAAAAAATATATTAAAGGATGCATTTTTTGTGGAAGTGATAAAGATGTTGTTGAATTTAATGGAGCAGTTGTTTGCGATGGATGCAGAAAGGCTTTAGGGCAGGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009617|2580447:2586971|2583862_2584060_+|WP_012058441.1|DBSCAN-SWA MILVNELKGKIKAKGYTQEKLARELGMSPKTLGNKLNKGIFGSNEIDKMIKLLDISNPIEIFFNK >NC_009617|2580447:2586971|2584547_2585819_+|WP_012058442.1|DBSCAN-SWA MADIKWIKLATNMHDDEKMKLIDAMPNRDTIHYVWIRILLLGGKLNANGKVFLSEGKPLTAKMLAVLFSRPLEDIKITLKVLSNFGMIEIASDKVIRIVNWDKHQNIEGMERVREQNRKRVENHREKKKEEKNAAKSNKEETQEDKVLEEFIDLEENQDLDESVELEKTNELERKKDYSKNSTIEENKALGKIDILENLETNEDISNNILETADDNCIVTKNNSNVTRNRSNVTVTQQNKKKIDNKKKNKKEKKEIDKDKNIEGKKNNGFDINNKGSACDDEVSQSNLSKKHNNTKSESGEEEDINLKALELMHYHEKITGKPGGCDYVALRSAIDIHGEKMVKMAMDVGFEKNCPDIKYAIGVLKNWRRDGYPEDHMEVKKNGVRSNGKSDRADKNEFAGFKPKEPRKLTEAERKRIEENLI >NC_009617|2580447:2586971|2586728_2586971_+|WP_012058444.1|DBSCAN-SWA MKSSGIVRKLDPLGRIVIPKEIRKVLEIYEGDSMEIIKVDNGVVVKKYIKGCIFCGSDKDVVEFNGAVVCDGCRKALGQD >NC_009617|2580447:2586971|2585868_2586495_+|WP_012058443.1|DBSCAN-SWA MQPLAVACECRKIEKLKNEWKYSGINVEQSKLTFSSFEVWNNASQRMKDTAAAYCTDFDEIKDNRRNSILLCGQVGSGKTHCSIAVALNFLKQRIKVVYMPYRDVITKVKQNMIDEEYYTRTISKYQLCEVLLIDDLFKGKINETDTNIMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLTFDEGVASRIYEMSKDYVVEIEKDISNNYRLK >NC_009617|2580447:2586971|2580447_2581272_-|WP_012058438.1|DBSCAN-SWA MSTRKHLFKFLLITFIAAIFNLAIWYYMGSERALEFLGGYIIELSLSVDNLFLFLLIFSSFGITAKHQKRILTYGIFGAIILRFIFVLLGIAIINAFKWIIYIFGILLIISGIKMMINKEDDVSFENSKLIKLLKKMIPVTKELHDEKFFIRINNVLHATPLFAILFLIEGSDLLFAIDSIPAIFAITTNAFIVYTSNIFAILGLRNLYFILEKLHSTFEYVKYGVALILIFTGIKLGISFKYHISIVISISVILLILVISVITSIMISRKGKK >NC_009617|2580447:2586971|2581759_2582614_+|WP_012058439.1|protease|DBSCAN-SWA MSSFGNQIKTLLLMSVLTILVVLIGRGIGGQSGMLMALVLALVMNGGSYWFSDKIALSITGAKPLTRNDNIEIYNMVERLTANAGIPMPRLYITASTQPNAFATGRNPKHSAVAVTQGLLNILNYEELEGVIAHELAHIKNRDVLISTIAAVMAGVITTMANWAQWALMFGMGNSDEEEGSGFLAALPLIILGPIAAMLVQMAVSRSREYLADSTGARIAGHSRGLSNALLKLDQASRVVPMDVNPAVSHMFIVNPLSAQRLMNLFSTHPTIEDRVRRLQNSNL >NC_009617|2580447:2586971|2583184_2583544_-|WP_012058440.1|DBSCAN-SWA MGLKENIKNRRLELNLTLEDVSKRLSISKPTLQRYESGVISNIPSDKIEKLAVILETTPSILMGWDENKIKTRLQLSEELECLLKKYNSLDNLGKHTVNTVLEMEFNRCSQLNNQDRIF |
7 | Escherichia_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2629163 : 2635884
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009617|2629163:2635884|DBSCAN-SWA ATTAAAAGCTTTTATCCTGATTATTAAGTTGTGAACAACGATTAAATTCCATTTCTAATACTGTGTTTACCGTATGTTTACCTAGATGATCTAAAGAATTATATTTTTTTAATAAACATTCTAATTCTTCTGATAGTTGTAAATGTGTTTTTATTTTGTTTTCATCCCATCCCATTAAAATAGATGGAGTTGTTTCTAATATTGCTGCAAGTTTTTCGATTTTGTCAGAAGGTATATTAGAGATTACGCCACTTTCATATCTTTGAAGTGTTGGCTTACTAATAGATAATCTTTTAGAAACATCTTCTAATGTGAGATTCAATTCTAATCGTCTATTTTTGATATTTTCTTTCAAACCCATTTTATGTTTCCTCCTTATAGCATATTAAAAGTAAGTAAATTATCCAATATTTATTAATTTAATTTATTGAATTGCAGTAAATTAATTAAAATTATTCTGATAAAGTATAATATCTGCCTATATAATTTACAGATTAAAAACAGTAAACTAAATAAATGATAGTGTACTTTGACATTAATTGTAATTAACTAATCTTAGATTTTAATAGATTATATTGATTATGTATATATTTTATCTGCTATTGTTAATAAATAAAATATATAATAATATTCATTTACCATTTAATTTGTTCAGTATAGTAAATAAATTAAATTATCATTTTTAATTTATTATAACATCTGTTTCTGGATATGCAACAATTATTTTCCATTATATAGAAAAAATTACGTGAGAGGTATTGACAATAATAGCCATAATATATAAAATATTACTTAACAAGTAACGAAAGGGGAGCATTTATGATATTAATTAATGAGTTAAAAGGAAAGATGAGAGCAAAGGGATATACTCAGGAAAAGCTGGCAAGGGAATTAGGAATGTCTCCAAAAACTTTAGGTAATAAACTTAATAAAGGCATATTTGGTTCTAATGAAATCGATAAGATGATAAAACTATTAGATATAAAGAATCCAATAGAGATATTTTTTTATGAATAAATTACTTAAAAAGTAAATTGTAATAACTTTATATATATTGTTTAGAAATCTAAAATTAATTATTCCAATTTAAAAGTATTATGTTACGCTAATAGTTATTGTTACGGGAGGACAAGCTATGGAGGAATTATTAAAAGAAATTTTAGTTGAATTAAGAAAAAATAGTGAAAAAGAGAATGCTGGAGATAAACTTACTTATACCCTTAAAGAGTGTTCTTATATATCAGGTATTGGTCTCAATACGTTACAAGAAGAGATTTCAAAGCAGAATTCAGATTTTCCATTCTTTAAAATAGGAAAGAAGGTGATGGTAGATAAAAAACTATTTCATCAATGGCTTGAAAATATTTCTATGGTTCACCAAGAATTAAGAAAATAGTAATCTTAAATTAAAAACATAAATGTAAAATTATTTTCATACACCTTGATTTAGAATGTATGGGGATTCAACTTTTAATAAAAATGTATAAAAAGAAAGTGAGGACTTACAAATGAATTTTAGGATTTTTAAATGTTATATACATGTTTGTAAGTTAATTGAGTTAAACCCATCATGGAATGGTCTCGAAAGGTTTAGGCAATTTTATTTATGGGAGCGTGGAAATAATGGCAGATATTAAATGGATTAAATTAGCTACTAATATGCATGATGATGAAAAAATGAAGTTAATAGATTCAATGCCTAAGAGGGATACAATTCATTACGTGTGGATAAGAATACTCTTACTTGGTGGAAAACTTAATGCTAATGGAAAGGTTTTCTTATCAGAAGGAAAACCTCTTACTGCCAAAATGTTAGCTGTATTATTTTCTAGGCCTTTAGAGGATATTAAGATTGCATTAAAAGTATTATCTAACTTTGGCATGATTGAAATAGCTTCTGATAAAGTAATTAGAATTGTGAACTGGGATAAGCATCAGAACATAGAGGGAATGGAAAGGGTCCGTGAACAAAATAGAAAAAGAGTTGAGAATCATAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAGAATAATTTAGCTAAAAGTAATAAGGAAGAAACTCAGGAAGATGAAGCCTTAGAAGAATTTATAGATTTAGAAGAAAATCAAGATTTGAATGAAAATGTAGAATTAAAAAAAACTAATAATTTAGAACGAAAGAAAGATTACGCTGAGAATTATACTATAGAAGAAAACAGAGATCTAGGTAAAAATGATATACTAGGAAATTTAGAAACTAGTGAAGAAGATTCTACAAATACTGATATTAATGATAAAACTAATACTGATACTAATGAAGCAGCTAGTGATATAAGTGCAGAAAGAGCTAATAGTAATGAAGATATCAGTAACAATATTATAGGAAGTGATGATAATAATTGTATTGTTACTAAAAATATCAGTAACGTTACACGAAATAAAAGTAACGTTACAGTAACGGTACAGAATAAGAAAGAGATAGAGAATAAGAAAAAGAAAAAAGAGATAGATAAAAACATAGAGAGTAAAAAGAATAATGGTTTTGATATAAATAATAAAAGTTCAACTTGTGATGAAGATGTAAGTCAGTCAAGTCTCTTTGAGCAACATAATAATACTAAAAGTGAATCTGTAGCAGAGGATGATATAAATCTTAAAGCAATTGAGCTTATGCAGTATCATGAAAAAATAACAGGAAAACCAGGTAGTTGTGAGTATGTTGCGCTTAGATCAGCTATTGATCTTTACGGAGAAAAGTGGGTTAAGAAGGCTATGGATGTTGGGTTTCAAAAAAATTGTCCAGACATAAATTATGCAATTGGAATATTAAAAAACTGGAAGAGAGATGGATGTTCAGAAGATAATGTGGAGGTGAAGAAAAATGGCTTTAGAGGCACTAGAAAGAGTAACACAGCAGATAAAAATGAATTTGCAGGATTCAAGCCAAAGGAACCACGAAAGCTTACAGAAGCTGAAAGAAAGAGGATTGAAGCAAACCTCATATAGGTGTGACAAATGCTGCGACACCGGATGGATACTTATTAAGCAGGAGCATATGCAACCTCTTGCTGTAGCTTGTGAATGCAGGAAAATAGAAAAGCTAAAAAGTGAATGGAAGTATTCAGGAATCAATGTTGAGCAAAGTAAACTTACTTTCTCTAGTTTTGAAATTTGGAATGAAGCGTCAAGCAAAATTAAGGATACTGCTGCAGCTTATTGTACTGAGTTTGATGAAATTAGAAACAATAGGCGCAATAGCATTTTATTATGCGGACAGGTTGGCAGCGGTAAAACGCACTGCAGCATTGCTGTTGCATTAAACTTTTTAAAACAAAGAATTAAAGTAGTGTACATGCCTTATCGTGATGTGATCACAAAGATAAAACAAAACATGATTGATGAAGAATATTATACTAGGACAATTTCAAAGTATCAATTATGCGAGGTCCTTTTGATTGATGACCTCTTTAAAGGAAAGGTCAATGAAACCGACGTGAATATTATGTTTGAAATCATTAATTATAGGTACCTTAATTTTCTGCCTATAATAGTCAGCAGCGAATTTTCTATTGATAGATTATTAGCATTTGATGAAGGGGTAGCTTCAAGAATATATGAAATGTCAAAAGATTATGTAGTAGAAATTGAGAAGGATATTAGGAATAATTATAGGCTTAAGTAAATTTACAATGCACACAGCACAATTCACAATAAACAATTACAGAGTGAAAATTCGCATTAAAATGAATTTTTTTGAGAATTAATCAAAATTAAGTTATGAAGGGAAGTTATTTAAATGAAAGCATCAGGGATAGTAAGAAATCTTGATAATTTAGGGAGAGTTGTAATACCAAAGGAAATAAGAAAGGTATTAGGAATTAATGAAGGGGATTCAATCGAAATAACTAAGGTTAATAATGATATAGTTTTGAGGAAATACAGTAAAGGATGCATCTTTTGTGGAAGTGATAAAGATATAAGTGAATTTAATAATGTGCTTGTTTGTAGTGGCTGCAGAAAGATTTTAGGACAGAATTAGAATGAACAGGCCGAAAGATTTACCTAACCGCCTGGAATGCGCATACTGCAAGAGGAATTATAAACATGGTGGAGAATGTCAGGGAAAAAGCACAAATAGAAATGAAGATGGCTGTCTTTATTTTAGCATGGATGAAAAAGGATGTATAAGAAATATAGATCAAAGTATACCTTTTAATCTATATAGTGATATTCCACCAGTTGGTATGTGGAGAGATGGATGGACAATATATAATCAAGATACAAAAATCAGAATAAATAAGATATATGCTTTAAGCTGGAATGAAAGAAAAGGTTTGTTGTATGTTAAATGTAACTTTGATTATTTTATTAATGAGTTTAGTGAGAATTATAAAAAAGAAACTAATAAACCAAATCTAAAGGTTATTAAATGAGTCACATGAAGAAATGAATATTTTGAATTATTGATTAAGGATTAAAAGGATAAAATTTTAAAAAAGGGGATAATCAAAATGGGAGGTTTACTAATTTTCAAGAATGAAAGATTTGGAGAAATAAGATGGGTAAAAATTAATAATAAAGATTATGCTGTTGGGATTGATATAGCAAAAGCTTTAGGATATAAAAAGCCTAATGATGCAATTTCAAGACACTGTAGAGGGTCCGTGAAACACGGAGTAGGGGTAGTAACGGGGAAAAGAAAAGATGGAACTGATGCTATCCAAAATGTAGAAATGAGTGTAATTCCTGAAGGAGATATATATCGCTTAGTCGCTAAATCTGAATTACCAGGTGCAGAGAAATTTGAAGCCTGGATTTTTGATGAGGTGTTACCTTGCATAAGGAAAACAGGGATGTATGCTACAGATGAATTATTAGATAATCCAGATTTACTTATTGCTGCAGCTACTAAGTTAAAAGAAGAGAGAAAAGCAAGGTTGGAAGCCGAAAATAAAGTAAAATTACTAGAACCTAAAGGGGAATTTTATGATGATGTTGCAGGCTCTAAAGATTCTATTGAAATGGGCCATGTTGCAAAGGTTCTTGGCATTAAAAGAATGGGAAGAAATAGACTATTTTCATTATTAAGAGAAAAGAAAGTCTTGGATAAAAATAATATTCCTTATCAGCAGTTTGTAGACATGAGGTATTTTCGAGTATTAGAGCAAAAATATACAGTACCAAATGGAGAGACTAAAATCAATATAAAAACAATGGTATTTCAAAAAGGAATAGAATTTATAAGGAAAAAGATTAATGAGCCATGAGTCAAGTTACTTAATGAAGAAAGTACAAAAAATAGAAGCTTATCATATAAAGACAAGCTTCTATAATGTTACTCAAAACTAAGCTACATCAAATTTAGTAACTTGTCGTTGAGTAACTTGAGCACCAGATTTCTTAACTAAATCACCAGAATTAGTTTTGAAAACATTCTTAGCAATTACAGTATCCATAAGTGCGTTAACCTCATCTTTTGTAAGAGTAGGTTTAACACCAGAAACACTTAAAGTACTTTTTTCACCAGCTACAGTTAAAAAAGTCATAGATAAAGAATATTCCATTTAATTTCCCCCCAATCTTAAGTAGAGAACTCGAATCTATGATTCGGTGTGAATCACTTACTCAGCGAACGAATGTGAGTCGAGTTTCCTACAATATTTTTTTTAGAATAAGATCCTAAGCATTTGCTAAGCTAGAAGATTCATTAATAAAATAATCTCTAGTATTAGCTTCCATAACACCTTTAATTGCATCTGCGACAGCATAGACATTCTCAGGTGTAGCATCTGTTTTTATACCTGAGAAAGTTTTCTTGGTATAAATTGGGTCCCCAGCTTTATCTAAAGCTTTTTGAACCTCGATACTAAGAGAAACTGAGTCGATAGTTTTAGTTACAGCCATAGTTTTAACCTCCTTCATTTTGTTTTCATAAATGATATATGGATAAATGCTTAACATTACATAAATAGATAAAATTTATTTGTTTTTTATGAACAAAAGAACTAAAACAGATTAAAGATATTGAAAGGATGAATATGAAAAGTGAATGTTTCATCGAAGGACAAATTAGTATATTTGATTTACCTGCTATAGAAGTTATAAAACCCAAGAAAATTATTATTAAAGAAGAAACTAAAGAAGTGGATAAGTTTTATGCAATCACTAGATTATATTCACAAAGTTGTAGCAGAATAGTTAAGACACTGAGTGGCGCAGTGTTAGTTGAATTAGACGATAAAACTTTGTATTTTAATGCAAGTGGCATAAATGAGTTTAGTCTACCTAAAGATGTGGGAATCATGCCTGGAGAAGAAATACTTATTGCGAATAGTGATAAGAAAATAAATGAAACACAAAAACAAAAGTTAGAGGCTCTTAAGCCTAAACAATATATCAAAAGAAAAGGTGATGCTAATTTAATAATACCTGGAGAAAAAACTATAGTGATAAATCCAAAAGGATGGATATTAGAATATAATCAAAAGCCAAGTTATCATTCAAATGAACTAATTAATACGGAATTTAATCTTGAAATTAATGAGGTGGATGATAAAAAGAATAAAATAGATCTTGAAACGAATGATATAGAATTTAAGATTGACGATGAGGTTAATATTGAATATCAAGGCATAAAGACCGTTGGGAAGGTTGTTAGGGTATATAATAATGGAGAAACCGTGAATGTGAAATGGGATGGAAAACAAACAGCTTTTTATTATAAGAATGTAAGTAAGATAAATAATCCTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_009617|2629163:2635884|2635167_2635884_+|WP_012058492.1|DBSCAN-SWA MKSECFIEGQISIFDLPAIEVIKPKKIIIKEETKEVDKFYAITRLYSQSCSRIVKTLSGAVLVELDDKTLYFNASGINEFSLPKDVGIMPGEEILIANSDKKINETQKQKLEALKPKQYIKRKGDANLIIPGEKTIVINPKGWILEYNQKPSYHSNELINTEFNLEINEVDDKKNKIDLETNDIEFKIDDEVNIEYQGIKTVGKVVRVYNNGETVNVKWDGKQTAFYYKNVSKINNPK >NC_009617|2629163:2635884|2633169_2633562_+|WP_012058490.1|DBSCAN-SWA MNRPKDLPNRLECAYCKRNYKHGGECQGKSTNRNEDGCLYFSMDEKGCIRNIDQSIPFNLYSDIPPVGMWRDGWTIYNQDTKIRINKIYALSWNERKGLLYVKCNFDYFINEFSENYKKETNKPNLKVIK >NC_009617|2629163:2635884|2629981_2630179_+|WP_012058486.1|DBSCAN-SWA MILINELKGKMRAKGYTQEKLARELGMSPKTLGNKLNKGIFGSNEIDKMIKLLDIKNPIEIFFYE >NC_009617|2629163:2635884|2630297_2630558_+|WP_012058487.1|DBSCAN-SWA MEELLKEILVELRKNSEKENAGDKLTYTLKECSYISGIGLNTLQEEISKQNSDFPFFKIGKKVMVDKKLFHQWLENISMVHQELRK >NC_009617|2629163:2635884|2634808_2635033_-|WP_012058448.1|DBSCAN-SWA MAVTKTIDSVSLSIEVQKALDKAGDPIYTKKTFSGIKTDATPENVYAVADAIKGVMEANTRDYFINESSSLANA >NC_009617|2629163:2635884|2633640_2634396_+|WP_012058491.1|DBSCAN-SWA MGGLLIFKNERFGEIRWVKINNKDYAVGIDIAKALGYKKPNDAISRHCRGSVKHGVGVVTGKRKDGTDAIQNVEMSVIPEGDIYRLVAKSELPGAEKFEAWIFDEVLPCIRKTGMYATDELLDNPDLLIAAATKLKEERKARLEAENKVKLLEPKGEFYDDVAGSKDSIEMGHVAKVLGIKRMGRNRLFSLLREKKVLDKNNIPYQQFVDMRYFRVLEQKYTVPNGETKINIKTMVFQKGIEFIRKKINEP >NC_009617|2629163:2635884|2629163_2629523_-|WP_012058485.1|DBSCAN-SWA MGLKENIKNRRLELNLTLEDVSKRLSISKPTLQRYESGVISNIPSDKIEKLAAILETTPSILMGWDENKIKTHLQLSEELECLLKKYNSLDHLGKHTVNTVLEMEFNRCSQLNNQDKSF >NC_009617|2629163:2635884|2630785_2632135_+|WP_012058488.1|DBSCAN-SWA MADIKWIKLATNMHDDEKMKLIDSMPKRDTIHYVWIRILLLGGKLNANGKVFLSEGKPLTAKMLAVLFSRPLEDIKIALKVLSNFGMIEIASDKVIRIVNWDKHQNIEGMERVREQNRKRVENHREKKKEENNLAKSNKEETQEDEALEEFIDLEENQDLNENVELKKTNNLERKKDYAENYTIEENRDLGKNDILGNLETSEEDSTNTDINDKTNTDTNEAASDISAERANSNEDISNNIIGSDDNNCIVTKNISNVTRNKSNVTVTVQNKKEIENKKKKKEIDKNIESKKNNGFDINNKSSTCDEDVSQSSLFEQHNNTKSESVAEDDINLKAIELMQYHEKITGKPGSCEYVALRSAIDLYGEKWVKKAMDVGFQKNCPDINYAIGILKNWKRDGCSEDNVEVKKNGFRGTRKSNTADKNEFAGFKPKEPRKLTEAERKRIEANLI >NC_009617|2629163:2635884|2632925_2633168_+|WP_009168788.1|DBSCAN-SWA MKASGIVRNLDNLGRVVIPKEIRKVLGINEGDSIEITKVNNDIVLRKYSKGCIFCGSDKDISEFNNVLVCSGCRKILGQN >NC_009617|2629163:2635884|2634474_2634693_-|WP_009168791.1|DBSCAN-SWA MEYSLSMTFLTVAGEKSTLSVSGVKPTLTKDEVNALMDTVIAKNVFKTNSGDLVKKSGAQVTQRQVTKFDVA >NC_009617|2629163:2635884|2632184_2632811_+|WP_012058489.1|DBSCAN-SWA MQPLAVACECRKIEKLKSEWKYSGINVEQSKLTFSSFEIWNEASSKIKDTAAAYCTEFDEIRNNRRNSILLCGQVGSGKTHCSIAVALNFLKQRIKVVYMPYRDVITKIKQNMIDEEYYTRTISKYQLCEVLLIDDLFKGKVNETDVNIMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLAFDEGVASRIYEMSKDYVVEIEKDIRNNYRLK |
11 | Clostridium_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
3935042 : 3997832
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_009617|3935042:3997832|DBSCAN-SWA ACTACATTAATCCTCCATTCATCAGTATATAATAGATATTGCTAATGTCTTCTCTTGTTAGCTGTTCGTTTGTTTTGGGTGCGTCTTTGTATTCATACACTAGCTCTTTTGTCTCATATAGATAATATAAGTCCGGTATTTTGCCTGCCGGTACGTCTGGCTTAGGTACGCTGTCCACAATTATTCCAGTACTTTTTTCTTCCTCTGTTAGCTGCTCTGGAAAATAATGTGTTAGGCCTACCCTAGCTTTCGTATCATCTACTTTTTCTAATCCTAAAAATATCATTTAAATCATCTCTCCTTTTCTTATTATAGTATTTTAAATCTTGGTTTGTAAATTGTTGTATTTCCCGAATTATCTCCGACAGCTATAACCCCAGTTTTACTAATGCCTACGGGCAGCAGTGTAGTAGATGATTGGAAATTTATTGAGCCTAGCTGTCTGAGTAACGAATCAAATCTGTGTACATACGCATCATTAAGGTTGTAGTTGTCCTTTGTGGTAATAACAACAGTATTAGAACTTTTATCAACATCCATGAAATATATATCACCATAAATACATCTTTTACCACCCTGAAATGATGCATTTACAACGTGTAGCTCTTGAAAGCTGCTTACCCCATCTGTAATATAATATATGTTATCTAAACCATCTATAACAAGTCCAACTACACTTGATGCAGTATAATAATTAAGTTTACTGCCACTAGGTGAATATTTATTGATGTAGTTTCCTACAGCTGCCCATACATTACCAGCTGAATCTATTGATAGACTTCTAGGATGTATAATACTAGAAGTATTTCCTGCATTGATTGTTAATACTAGTCCACCATTAGAACTAAGCTTATATATTTTTCCAAGTGCCCCTCCTGCATATACATTACCTGCACTATCTACATCAACTGCATAGATCCAGTTACTACTTTCAGGGTCATAATATACCCAAATTTGCGCACCATTAGAACAAGCTAGTTTTCTGACACTATAACCATCCTCTGCTGTATAAATATAACTTTCAGTAGGGTCAAAGGCTATATCAATAGCATCGCCATTTGTTGCAGTTTGCCATAATAGTGTACCATTTGGACTGAACTTTCTTACATAGCTATCACCACCTCGTCCTGCTGTATAATAATTACCAGCACTATCGAATATTACTCTATATATAAGATAATGCGACGTATCCTTAATAATAACAGGTGTATCATATTGTGTATTCCCCAAATCCGCATAACCACCTACTGGAATGGCTGTTCCAGTTATTCCGAGCACATTTGCGTCTTTAGTAAGCTTAGCTGCTGTTAGACCTATTGCTGTAGCTACATCAGTGGCATTTACGTAGGTATACTCATTAGTATCCCCTGCATAGTAGCCTGGTGCAGGGCATACTACTAGCTTTGCAGACGGATTATTTAAGCCTATTAGGCCATATATTACCTGTGCTGCTTTGCTTATCGGCTGAGTAGGGTATGCCGAACTATACATATCATCCCCTGTTTTATTTCTGTTAATCATTGTACCAGTAACCTTATTACCATTAACGTACACTGTAGAACCATTTAAAATCTGTGCTGCTGAAGCTGTAGTATCTGCTGTATCTACAATGGAAGATTTACCTGTAACACCATCTATAGTAATACCTGCTCTTATATTTCCTGGAACTAATAAAGATAAATCAAGCCCTCCAACTATACCAGCATCATTATTATTACTAAATGTTTTATCCTTACGTACATCAGACGCTAGTGCAGTGCCTTCCGCACTAGCTTTGATAAAAAAACAGTCACCAGTTGAGTTATACCAAACCGTATATGCTTTTCCTGCCATTAAGTTTGGTGATGTTGTTGTTCCTGGTTTATATAATTTTTTACCATTTATAGTTGTTGCAGCTCCGCCATTATTGATACTTGCTATAAAAGTTATTGGATATCCATTTACTAATGTTCCTCTAATTGTTAATGTTATTGCTGTAGCAGATCCGCCTGCTGTTTGATACACAATATCTGACAATGTTGCATTAACATTTGAATCCCCAAATTTAACAATTGATGCATCAGTATGTGGGTAATATATATTTCCTGTACTATCTTGTATTTCTATATTTTTTGTTGCCATTTGTTTTCCCCCTTAAATAGTCTTTAGAAATAATTTAACTTGTGTTCCACTTGCATAATCAGTACCAACTTTAATACTTGCTCCATCTGCTCCTGCCGGCCCTTGTGGTCCAGTTGCACCAGTTGGTCCAGCAGCACCTGTTGCGCCTGTGGCTCCTTTTAAACATATTGAATATACCCATTTTGCTGTGCTTGCGTCTCCTGAAGCTGTACATACATATACATTTCCTGTGCTTGTATTAAAATATTGATCATTTACTAAAGCTGAAGTTATACCACTTCCAGTAAAAACTGTTGCTGAGGTGCTAGTGCCTGTTATCGCAGTTCCACTATACCATTGAGATCCTCTAATTCCAGATGATCCCTGTGGACCTTGTATACCTTGGATTCCTTGTGGCCCCTGCATACCTGTTGCTCCACTAAGATCTGTTATATATGTGTATGCTGTTGAACCCTTAACATATAATTTTGCATTATCAGCATCATTAATATTTCCAGTGTCTATTAACACAAAGCTCCCTATTTTTAATCCATCTGTAGCAAATCCTGTATTCATAGCTGAAACTGAACTATACACTTTTGCAATTGTAAATGGATCTCCAGCTGGTCCTTGCACACCTTGTATACCTTGAACCCCTTGAGGGCCTTTCAATAATCCTCCATCTAACTTTTGTTGAAACGTTTGTCCATCAGCAAATGTAACTGCATCTGCGCTTGTTAATACATTTACTTCCTTTAATACTGCACCTGTACTTTCATCTAATAATTGAACTCTTACTTTATCTAAATTTGCCATTATATAATCGCCCTTTCTTATTGACTGTTTTAATCATTATTTATATAAATATTTAATTTTTAATATATATTGCAATTAAATTTCTACATTATAGACTTAATTGAGCACTAGGCCTAGTAGATATTCAAATGTAACTTTATTATTTCAATATATACACTATTTTTATCTTCCTATTGAACTATTTTAATTCCCATATTGGGACTTACTTTTACATTGTCTGCAAAGCCATCGGTTATTTTATCTGTTATTTTAAAATACAGCGTATCACTTGTTCTATCAGCTATAGCTGGCAGCGTCTCACTAATATACAATTGCATTTTCCCTGATAACTTAGTGCTGACTTCTTGAAATTTTGACTGTAATATTTGTATATCTCCTTTAGTTGCAACTACTACATTTGGATCTATCTTAAGATCTATGCTGCTTGCATTGCTTACTTCTAGTACAATTTTTATGACTAAATCTTTTGTGCTTCCTTCTGAAATTGCTGGTTTGTAGGTTTCTGATAACTTTGCGATGGCAATCATATCTCCAGCATCATCAAAAATACCAGCTTCTCTGATGAAAAAGCCTCCGTCAGCTGCTGGTATTACTGTTTCTACAACTATCCAGTTTTCATTTGATCCATCGACTGAAATTGCACTTATATTTCCTGACCAAACTTCTTTTACAATTGAGGTTTGATCTTCTGAAGGTTCATAATATGAGCCGTTTCCATCTCCAACTTTTAGGGTTTTAAAGTTTACTTTACTACCTGAAACTGCTGAAGCTGATAATTTTTTTCTCCCTAATTTTGTTAACATTGTATAAAAATTTTCTGCCAAATTAACTCATCTCCTTACTGGGATATATTGTTATACTCTCTGAACCTGTACATTGGCTGATACCACTTTCCATTTTTCCGTTGGATTCAATATTTTTAGCAATCCACGGATAGACTGTCATAGTCTCTCCCATAATTGATGCTAAGCCATAATACATTTGTGATTGATTTACGGATATCAGTTTATACTTAACGCCTAAATGCGCCGGTTTAGCTATTTCTATTGAATCGTACAAGCTATCTAAAGCATAAGGAAAGCCTGTATCACTTATTAAATTTACTTGAAAATAGTATTCTGGGTTATTCTGAATTATTTCAGCTTCTGAAACAAAACTCTTACATATCTGCTTTATTACTTCAACTGTTGTTGTGCCTTTAGAGTTAAGCTTTGCTAATACCCTTGCTCTTCTTTCTTCAATTGATTTAGCATTATTTGTAGTTATTCCAACTCGTTTTTCCCATAATTTCAATCCCCATTCAGTTGCAGTTTGAGGCAAAATTTGCAAGAATAAATCTGAAATATCCAAACCTAATTTATCGAAGCTATGTCCGTAAGCATTAAATATTTCCCGGAAAATATAGCCATTCTTCATTTCATCAATAACATAGCTTTCTAGCTTATATTTTGACTCATTTCCACTATTTTCACTTGAAGGACTTACAATATTAATATTTTTAAATGCTTCAAAATCAGCTGTATTACTCATAAGTTATCCCTCCCAAAGATGCCTTATCTTCATCCGCTGTAATTATATTTTTAGTATCATTGTTTATTTTTACTGAAGATATATCATTAACTCCGGCTGTCATTACTACCTTTGCCTCAACAGTATTTATTTTTACAACTCCGCCTACTGGAATTGTTTTAAAATAATTATCAAGAGACTCTTTTATATTGTCTTTAACATCCTTTATATCAAATCCATCTAATACAGTAAGACCAAGTATATTAACATCAATTTTTAATGGATTGACTGATACTACAGTTACTTTAGCCCCTATTGGTGCCTTTCCACTTCCTTCACCATCTGCTGGATCTATATATTGTTTAACTTTTTGTACTATAGTATCATCTAGCTCCATTCCATTATTTCCTGCAACTATTACCTTTACAGTTCCATTTCCATTCATTCCATTGCTTTTATCCCAAAGAGGTTTTACTTTCACATATTCAACACCAGATATCTGAAGAGCCCATTTTTCATAATCATATATATTTCCACTGCTGCTTTCTTCTCTCTCTTTAGATATGATTCTTTCC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62 | Clostridium_phage(62.5%) | plate,transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
4942366 : 5004140
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_009617|4942366:5004140|DBSCAN-SWA 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56 | Lactococcus_phage(18.18%) | transposase,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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