Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009697 | Clostridium botulinum A str. ATCC 19397, complete sequence | 9 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,WYL,cas3,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,cas6,casR | 0 | 11 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009697_1 | 1826270-1826487 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_009697_1
|
3 spacers
spacers of NC_009697_1
>1.1|1826293|43|NC_009697|CRISPRCasFinder CCTATTAATAATATGGAAAAACTAAAGGATATAAATTTATCTA >1.2|1826359|40|NC_009697|CRISPRCasFinder TATTTAAAGGATTTAAACTTACATCATTTAGATCTAAGAG >1.3|1826422|43|NC_009697|CRISPRCasFinder GTCTTAAAAGATAAAACATCCTTGCAACATTTGTATTTAGCTA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009697_1
The CRISPR arrays of NC_009697_1 >merge|NC_009697|1|1826270-1826487|CRISPRCasFinder ATAATAATATAGAAGATATATCTCCTATTAATAATATGGAAAAACTAAAGGATATAAATTTATCTAAAAATAAAGTAAAAGACATATCTTATTTAAAGGATTTAAACTTACATCATTTAGATCTAAGAGATAATAAAATAGAAAATATAGAAGTCTTAAAAGATAAAACATCCTTGCAACATTTGTATTTAGCTAATAATAGTATTAAGGATTTCTTA >NC_009697|1|1|1826270-1826487|CRISPRCasFinder ATAATAATATAGAAGATATATCT CCTATTAATAATATGGAAAAACTAAAGGATATAAATTTATCTA AAAATAAAGTAAAAGACATATCT TATTTAAAGGATTTAAACTTACATCATTTAGATCTAAGAG ATAATAAAATAGAAAATATAGAA GTCTTAAAAGATAAAACATCCTTGCAACATTTGTATTTAGCTA ATAATAGTATTAAGGATTTCTTA
>NC_009697.1|WP_011986369.1|1820776_1825234_+|DUF5050-domain-containing-protein MIRGVFAIFSKKFVAKFLLYSSIVIIPMFNHNYVQAASSKQYETKYNVSLDKVWKIRFSREVDKATLNPENIKILDNQGKEMPIDLSLDVDKHYVKIALKSGTYNGVHYSGKYEKDKKYSLIVKEGLMSEPSKNKKSKNLAYETMMDFNTIGDNEYPGLPIEDGLIVIGDKAYSVGYLSKHSSIANEITSNGNYYIAYISKEYGEKIKQVLGNNTTKGNQERANKILYYAPNGNQYEYEWNEAFGEYKIVLPKAYVDVTPGVINGVVNLAVKQVKAVPGAKYFKLAHSNTIKPIGESISYSMTYPTEKLTILSADETPLATALVDVYLPKTGYVSLSSVNETLGNTAGNISNNGSAAMDLDFYVYYVNSADKNSLYRKTLTGRMDTQISLDKAQYINVIGDWIYYSNYNDNGKIYKMKKDGTKKQILCDDTATYITVSGGVVYYANQSDKGRLYKINTDGTIDGGASNRDPAGKVHGMPVMDDYGNYNKATDQANFINVVGDWIYYSNFSDGHKIYTVNKDGNIRRKVNDEWADGIQIVGAWAYYCSGSGAISKVRVDGTGSVIPLRGTTRKVDKGYHLNIVDGWLYYSNAEDGGKLYRIKEDGSGEKKKLADLATDYINIVGDTMYLISGGKTYTLPLNTDGTIKPTLVTKDNNGNTVVDVKDLNITVAYEDANKTIGELEAKYLPQKVAVFMKDDTVQQLPVDWDIKNRKYNGQGIYTYTGTVLGHGKQIKCTLTIPSEMLNATSIIEVYNNGPKNGSIMIKERSFGPSKQDQELKEKLKLAKRVEIGDVIKVYDNPNSEKPLGNIKVDANNANGPLVKSLDLDMYGRSFWITITRKNKAESKPTEVRQLGAAVLSGDVLDEDGEALGVDGRDFTVKGWNNPSIRDDGFISDTTEIAAQGTKSIYVIPGTGKLNMENQGVIPAGITSANYWNGGNARALLTNYDLLTNDSLKNKLKEGNYSIYVVVGYDGKAEEDVNGFGSPLVIGKTASIPKAMKATEEKIPKAPSVTKQYAKSGDTVKISGVTNEDEIYLAPEGASYIAKDITNKPYKSHDNLFFEDQSKSKEEREKEYEKSGKPSIEDGYQCKLVNGKIPQGVRSGKYKVYMVNAIGSSSPASGEIIVDNEDPVVRLDSAKQEDVIKTVTQNGTTTQETTGQKFKVNFAAFDNSFDNSIKEGITVSMARLDSPKSAIKAQEIKDKGNKTFEVIINDPHANLNDYAIYAEDKAGNIGQVNLKVQDPPANINNISLAIRTSNEGVDLVKSRLVGRTKYMTKDLTRASDNYEVTVDGVKYVLQEEALRNLGTSPSIDAFMNALMQAKQWDIANNKPMEDKPKLSSKVSIYKVNDVIYIEGNDNTPIQIEDKTKIDSDTAIVSNMIGLNPNENNTGENSKNQQYVINVTGTAQKNGKLKVCLAGKCFDINMVAGDSRTNIAAKIKEAINNNTILDSYQYPGTNVESNGSEVRLTRKSPGAVVPTFTVEYFNYDN >NC_009697.1|WP_011986368.1|1819177_1820623_+|DEAD/DEAH-box-helicase MNKLTFENYKLSDEILKSLGKLGYKNPSEVQKQVIPLILKDKDIIVKSETGSGKTAAFSIPICEKLELEEKDPQVLVLTPTRELALQIKEEISSIALYKRLRCTAIFGKQPMSLQKRELKQRVHLVVGTPGRTLDHIERENLNLKKIKYFVLDEADEMLNMGFIDQVEAVIKRLPKNRVTMLFSATIPEKVENLCKKYMNNPENININPENITTGTINQCYYEVEDKDKFYLLQKIIYKEVVDNSIIFCNTREKVDEVLKHMKKKGLNAIGLHGGMEQKDRLETMKKFKEGEFQFLVCTDVAARGIHIENISHVINYEMPYEKESYVHRIGRTGRAGKEGVAITFIEPNKVRFLKDIEDYIEKEIPKRKEPSSEEVAKGKKIFEENIKNRIKTKVPKDNKKQKDITKIYISAGRKKKIRPGDIVGAITSIEGINVDNIGIIDIQDNHSYVDILERKGDIVLKASEDMKIKGKKVRIQRAVK >NC_009697.1|WP_011986367.1|1818162_1818999_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MIKLGEIQKLEIIREAPMGVYLNSKEDKSENDILLPGKQVPKDAKIGDEVEVFVYRDSEDRMIATINRPKITIGEIATLKVIEKTKMGAFLDWGLERDLFLPFKEQTYGIQEGMECLVYLYIDKSDRLCASMNVYRVLSTESPYKEDDEVKGFIYDIKREIGAFVAVDNEYHGLIPKNELYGKFRYGDIVEARVTKVKEDGKLDLSIRKKAYKQMDEDVDTILEKLNSNGGKLYLNDNSDPRAIKELLNMSKNAFKRAVGRLLKEGKIEFIEKGIKLK >NC_009697.1|WP_011986366.1|1816574_1817840_+|DEAD/DEAH-box-helicase MNNSFDTLNLNPKLVQGLKKLNINIPTEIQAEAIPLAMENKDIIGQSETGTGKTLAYLLPIFEKITTEKREMQAIILAPTHELAMQINNEIKNISSNSNMDVKSMAIIGEANIKRQIEKLKEKPHIIVGSPGRILELIKKKKITAHTVKTIVIDEGDKLLDKNNLKVVKEVIKTTLRERQLMLFSATITESTLNIAKDLMKDSVIVKVKEKNTVNENIKHLYITGEHRERIEILRKLIAATNPKRAIVFINRNEEIELTTLKLQYHKIKAYGIYGAAEKEQRKKALEDFRSGKVQILVSSDLSARGLDVKDVTHIFNLDLPENPKEYLHRVGRTGRASKEGIAISIITEKEKALIRKYEKEFNINIEEKKIYKGTLISSKGERSSQPKSKNKSTSAHKDNNKKKRSSSINKSKNNHKKKKY >NC_009697.1|WP_003403172.1|1815312_1816206_-|chemotaxis-protein-CheV METNILLESGTGEVEIIEFLVNNKHYAINVIKVKEVIEVDNVTKVPQSDPAIEGLILCREKIFPLIDLSYILGQKNTSKKKFKTIICEFNRVSVAFKIDEIVAVHRIGWDKILKPDDIAANPLVIGNILLKDKIILLLDFEKIVTDINPSTGISEERIVNVDYKDRSHIKVFLADDSSLIRKLLKDTLTKAGFKKLTIFDDGKQVLDKLLELVEKKGEDFTEDVQILITDIEMPQMDGHTLTRKVKEHPILKRLPVIIFSSLITKDLKHKGTSVGADEQLSKPDIGELVNIIDNYIE >NC_009697.1|WP_011986365.1|1814318_1815173_+|4Fe-4S-binding-protein MKMISKNEIAKLKGEGFLAQKQEGYFSVRILSRAGNFTSKQIIKLAEIADNYGKGYLGVTTRLATEIPWIRYEDIEAVKKEIVSSGMSHGGTGKRVRPLVSCKGTVCVHGLYDTQKLCGELHDKYFGYELPSKFKITLVGCPNNCAKASINDIGIMGQAYVEFDEEKCKVCGICTKSCRQKAVTVENKKIVYKKDLCVNCGKCATVCPFEAMTIKEQGLQVYLGGRFGREYRMGNRLKGLYKEEEIPALVQKIFDVYSEMGNPGERLAKMIERVGFDKVEEAIL >NC_009697.1|WP_012047671.1|1813289_1813748_+|YbaK/EbsC-family-protein MSLEGVKKQFTDENLNLKILEFDESTATVELAAKALGVEPGQIAKTLAFHVKGENMLIVAKGDARIDNKKFKAYFNGKGKMMAPEVVLEVTGHAIGGVCPFGLENPINIYLDQSLKEFEKVYPAAGNANTAVEVTLDELEGITKGLWIDVCK >NC_009697.1|WP_011986363.1|1811370_1812951_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVTNLSLRYGDKKLFEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKILSGEIEANTGDVSIQPGVRMSILKQDHFKYDEFPVLETVIMGNERLYEIMKEKDAIYAKTPFTDEDGIKASELEGEFADLNGWEAEAEASSLLQGLGIGTELHEKNMKDLSGSEKVKVLLAQALFGNPGVLILDEPTNHLDIKSVNWLEEFLINFEGTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADVDFGKIKLYVGNYDFWYESSQLALQMAKDQNKKKEEKIKELQEFIARFSANASKSKQATSRKKLLDKIDLDNIQPSSRKYPYIAFKPERKVGNDILRVEGLTKTIDGTKILDNISFIIGKDDKIAFVGDELSITTLFKIISGELEPDSGEYKWGITITNAYFPKDNSEYFNDVDLNLVDWLRQYSEEKSESYLRGFLGRMLFSGEEALKEVKVLSGGEKVRCMLSKMMLNNANVIILDQPTNHLDLESITALNNGLMDYKSNILFTSHDHQFIQTIANRIIEVSEAKFVDKKVTYDEYLESK >NC_009697.1|WP_011986325.1|1809086_1811090_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKFKTMKGKMLTYFLSLFLIICIAISFMAYFMSKRMIERKASSLMSEVSRQAVQNIEARLNGTLDSIETVANMPTIKDPKLGWDKKKTILDEEIKLHGHVKMGIVGKDGQSIQTDGTTVNIKDRNYFKETMEGKRTISEPIVSKVDGKVVIIYTVPIKNGNTIMGALTAVREGNDISNISNSIKVGESGGAYLIDSTGTVIAHKNKESVIKRENSIKDAQSNEELKPIAAIEKSMIEGKEGIGQYKYKGAEKYISYSPMKSTGWSLAIYAPKNEILKEVSEITRNIIIVSILGIGIALVCIWFISTQISNNLISMRDSLNIVATGDLTTNVDSKIEKEKDEIGHMARALSKTVLSIGNMINSLKGSSFNIDDKANNLAAISEEFTATTENVSTAIQEVATGATNQAQALTEIVSMLNDFSDKINSTVNNIEEIDGMSKEIDEKANVSNKDMKELLNSIENLTKVFENFETKIWTMESNVQKINEITNLINDIAEKTNLLALNAAIEAARAGESGKGFAVVAEEIRKLAEMSRKSSEDIYTIVNGVLEDTKDMVKSSNEVNEKLNGQRSTADEAMNSFMEISKSVTNMIPKIRNINNSANIIEKNKNEILNKSETIASISQEISASAEEISASSEEMSASSEEVANTAQSLNDMTQDMLDEMNKFKTE >NC_009697.1|WP_011986324.1|1808501_1808711_+|cold-shock-domain-containing-protein MSMHTGTVKWFDNERGYGFIAGNNGKDVYVHSMQIKEKTLNKDLHEGEEVLFDIVEKEKGPIAINVQKL >NC_009697.1|WP_011986371.1|1830117_1831047_+|glucosaminidase-domain-containing-protein MKKATGLILKLMILVLLAFTIFIMFNSLILNKKNERFLPENAMNIYIKAADEVSENKLQVNWKYIAALDGVKNKEDFSKANIEDSKVLGEKFLEISKSTKFKNTNYRLLTLDEVISKMSFTEEEKKNVHKYLDKLNNIYPITPDEYKRQFIDELIPISKELYDEYGILPSVTIGQAILESDWGRSELSKKGNNLFGIKATPSWQGKVLNMETSENYNDKIKDNFRYYSSKEDSIKDYANFLVKNKRYRENKVFRATEYKTQAKAIEKAGYSTKKDKDGNLLYSSLLGKIIREYNLQLIDSKTQEEISKK >NC_009697.1|WP_003403076.1|1831172_1831688_-|ferritin MLSEKLLEALNNQINFEFYSSYIYLAMASYAESEDLAGFANFFRVQAQEEIFHAMKFYDYVNQMGGRVILEKIDQPKAEYKNILECFEDGFNHEKIVTSRIYNLTDIATEEKEHATISLLKWFIDEQVEEENNFNTIIRKLRRAESNPAVLYMLDDELSARVFTPPTNTGA >NC_009697.1|WP_011986373.1|1832092_1832947_+|response-regulator MKDTKVVIVDDSPFSISIIKDILEENGLTVVGEAGNLEEVINVVKDKKPDIVTMDMTLPGTDGIECIKAINKINKNVKVIVISSMMDEEIVKKANKNKVCGYIQKPIDPEELIATIEKVVMKEELFLQLENDYFQIFKESFKDALNKFTKTTAEFSEDTKCTISETSRGMVVVIGIIGNFSGRMILDLSQETANSMVNFMLKREPKDMNEVLNVIGEFSNIVAGNACSMLNRKSKVFGLRIAPPSIFYGKSLNISQSLIKSLSVESNTEFGQIYMNVGFKRGES >NC_009697.1|WP_004450459.1|1832946_1833408_+|chemotaxis-protein-CheX MDAKYINPFIDSFYNVLPQLGFSNVTREDVAIKNNVESLGILINLGIVGDIRGNIVYNIQGENGKKIASKMMMGLPVEELNEMAQSALSELSNMLTANASINFSNIGVNVNISTPTLMYGQDIKIKLNTDKILNIKIVADDIPIDVNIAFEKI >NC_009697.1|WP_011986374.1|1833590_1834949_-|YjiH-family-protein METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMGIIICITFICTAITKIFKPKAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPEWMWSKNTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLEFVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHMFVPFYLTVCLSGIIAAILIPRIPPLSRKPDTYLNGGESKNSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNGDPLNFIRQGLQNVLDMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIACLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLVAHILF >NC_009697.1|WP_003403080.1|1835686_1835890_+|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MPSNKNSNNLVVPEAQQGLNQLKMEVANEVGIANYDSMDKGNLTSRQNGYVGGNMVKKMVEAYERNL >NC_009697.1|WP_003363259.1|1835950_1836151_+|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MANRNSNNLVVPEAKHGLNQLKMEVANEVGIANYDAVDKGNLTSRQNGYVGGNMVRKMVEAYERNL >NC_009697.1|WP_011986375.1|1836354_1836684_-|HesB-like-protein MILVNMSDLAYKEFKNFIKENNVNSNIFRIFLAGNGUGGPVFNIVLDEQTSEDLLSPIGELSFLVHKDLFSEFGGFIIKCAEENGKGGFTIDPIIQSENISCSTCSSCS >NC_009697.1|WP_003358892.1|1837601_1838582_+|tyrosine-recombinase-XerC MKYNIQQLYDANFPQRLNDFLNYLRTIKGKSENTIESYKLDLIMFFRFLKLYKGMVPGETEFNDIEIKDISDEDIKNISLTDLFAFVSFVENYRNNGSYAKARKVATLKSFFRFLQGKVKIIKENPALELESPKISKRNPVYLTLDESKRLLSSIDGKFKERDLCIVTMFLNCGLRLSELCGINISNIKNDILTVVGKGNKERTVYLNKACIKTLNDYLNVRKEMGEKIVDKDALFLSKNYTRINKRSVEMLVKKYVKKAGLDGEKYSPHKLRHTAATLMYKHGGVDIRSLQMILGHENISTTQIYTHVDSDRLREAVKSNPLSDE >NC_009697.1|WP_011986376.1|1838904_1839378_-|hypothetical-protein MNRETCIFNYTKKCTDCGECEICDLDQNKKCDNCGECLQREGIDTQAIKIDEIKEDKNFVDKEDLKKVLKEDEKELESLKEFEEDLENEILQETQLLKDYDENFKEQGLYAIENVEGVQIEYIEDVDGLSELMEDESRLKKVAYEEFPGLIKIRENK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_009697_2 | 2230709-2231068 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009697_2
|
5 spacers
spacers of NC_009697_2
>2.1|2230739|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT TTATATGGTATTTAAGGTTATAGATAAATTAACTGG >2.2|2230805|35|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT CTTAAATATATAGGTATAGATCAAGACGCTAAAGA >2.3|2230870|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT TCTTAACCTTTAATTACATTATATATTATAAGTTCA >2.4|2230936|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT ATTTCATCAAATCCGCATCAATAAATGAGATAAACT >2.5|2231002|37|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT TAAATTATACCTTAATGCTTATCAATATAGTCTTGTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009697_2
The CRISPR arrays of NC_009697_2 >merge|NC_009697|2|2230709-2231068|CRISPRCasFinder,CRT GTTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACTTATATGGTATTTAAGGTTATAGATAAATTAACTGGATTTAAATACACCTCATGTTAATGTTCAACCTTAAATATATAGGTATAGATCAAGACGCTAAAGAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTCTTAACCTTTAATTACATTATATATTATAAGTTCAATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACATTTCATCAAATCCGCATCAATAAATGAGATAAACTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTAAATTATACCTTAATGCTTATCAATATAGTCTTGTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >NC_009697|2|2|2230709-2231068|CRISPRCasFinder GTTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC TTATATGGTATTTAAGGTTATAGATAAATTAACTGG ATTTAAATACACCTCATGTTAATGTTCAAC CTTAAATATATAGGTATAGATCAAGACGCTAAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TCTTAACCTTTAATTACATTATATATTATAAGTTCA ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC ATTTCATCAAATCCGCATCAATAAATGAGATAAACT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TAAATTATACCTTAATGCTTATCAATATAGTCTTGTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >NC_009697|2|1|2230709-2231068|CRT GTTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC TTATATGGTATTTAAGGTTATAGATAAATTAACTGG ATTTAAATACACCTCATGTTAATGTTCAAC CTTAAATATATAGGTATAGATCAAGACGCTAAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TCTTAACCTTTAATTACATTATATATTATAAGTTCA ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC ATTTCATCAAATCCGCATCAATAAATGAGATAAACT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TAAATTATACCTTAATGCTTATCAATATAGTCTTGTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
>NC_009697.1|WP_011986659.1|2230087_2230576_+|lipoprotein MISKKIIAFIAMTIMMISLLIGCSNNTMDKVYNDNSKIASVYDTFGLDKSDEIIESGIYKGKLKLSGSGTIWTYESSSDFDLKVPYILSVKSGKAKIVLMSPDNTVVNLVENTDKATMKGTTSLTLPIKKGNNRIKLVGYKKADIDIELHIEKGTFEKISFN >NC_009697.1|WP_011986658.1|2228666_2229260_-|glycerol-3-phosphate-acyltransferase MIIIITSVISFLLGSIPTGYFITKKACGIDIRTKGSGNIGSTNVKRIVGTKISIITQIIDVLKGIIPVVLGISLSKIVKLPVSTDTYLSIIAIAAILGHDYTPFLKFKGGKGVNTTLGVFIFIAPIPTLTGLAVYFILGLFIRIVSIRSISIGITIPIMCIITKLPIQIIISTTIACILMIIRHKDNLVRLIRGEEK >NC_009697.1|WP_011986657.1|2227592_2228327_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLVIMYMVLMGSFPRFTGWATIFSAIAVGGYFLKNKKDLKGLTRKNKNFIFAGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMADKAKQEQEIKQEEQKKVEEKKLAEEQKRVQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKIKAENEQAQAAFAQSTGKGDSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEGLTPCSVCNP >NC_009697.1|WP_011986656.1|2226850_2227255_-|membrane-protein MNILMLTCSIAIPVLMILIGILFKCNSYKKIDRTLDLIIPIATFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFISVEYILKRNFNKKISEQY >NC_009697.1|WP_011986655.1|2225899_2226616_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYNKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVKIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDVLKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_009697.1|WP_011986654.1|2225438_2225876_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPVNFGNEEHDPVDMVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >NC_009697.1|WP_003361919.1|2225125_2225410_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKK >NC_009697.1|WP_003358211.1|2223748_2225113_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MLGLLQFLRDVLKQPALLMGIMALVGLVALKKPGHKVLTGTLKPILGYLMLGAGADFIVANLEPLGGMIQTGFNITGVVPNNEAIVAVAQKVLGVETMSILVVGLLINLVIARFTKYKYVFLTGHHSFFMACLLSAVLGTSGMKGTELILFGGFLLGAWSAISPAIGQKYTLKVTDGDEIAMGHFGSLAYYVSAWVGSKVGKPEESTENIEIPEKWGFLRDTTISTAITMMVFYIVAAVAAGPEYVSKLSDGMSPILFAIMSSLKFAVGVTIVYNGVRMILGDLIPAFQGIATKIIPDAIPAVDCAVFFPYAPTAVIIGFVSSFIGGIIGMVLLGVAGGVLIIPGLVPHFFCGSTAGIFGNATGGKKGAVIGSFVNGLLITFAPALLLPVLSTLGFKNTTFGDFDFGVLGIIIGKTSNLAGKTGIIIIAMLMLVALIVPNFIKTKSKALNNIEE >NC_009697.1|WP_011986653.1|2221443_2223537_-|transcription-antiterminator MLNKRCSNILQMIVNNEKPITIKEISKKVNKSPRTVRYDLDKIDDYLTEIEFPKLERKSNLGISLDLKDEEIKKLFKIIGKINNYDYVLSQKERVFYIIYELLNKSEFVTINMLSDRMMVSRSTIINDLIEVKKWLSENKITLESSKGQGIKILGRERDLRRAAVKLFFQSMDSINFFNVTTLKLFNDIDIDFIRNTIKIAEEQMETSFSDDAFNNLVIHIAIAIKRIELSKDIIMDSEELKNLRKTAEYAIASGIAKMLEDRFKISIPEDEIGYITIHILGSNTSTLENIVKDDWIYLHLIVFKLIENVENITGINFSKDNKLFDSLAQHIRPAIYRLKHDIKVKNPLIEEIKEKYSYIFESIEEGVKFIEEDIGDSVNQEEIGYLTLHFMASIERSKNKKHRKPNVLIVCATGIGTSKFISNKLKSIFDINIIDTISSHTMEKILKYNKNIDLIVTTIPLKVKGIKCIEVNTFLTEKNISELGLYFAKFIRNNSEECNGSCKYEERDKVQEILNIVKENCTIHDYYKLRNKLALYLNIKDPTLTEDHKPSLKELLKPDFIKLNEEAENWEDAVRKSGEILMNNGCVKESYIDAMVNTVKNMGPYIVIAPGIAMPHAAPEDGVLKTGISMLTLKDPISFGNSEHDPVSVIISICSIDKVNHMKALKELMSIMDQEDFISKVKNIKASSEIDSILYS >NC_009697.1|WP_011986652.1|2220764_2221118_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MIIWGWGKVTKKIIGAVFQRTCNYCNTDEVWNLCVVRTWFTLFFIPIIPYKKQYCIACPKCWSYIELTQEEFEKIKIDITSSSNNINEKVVTDNIKYAGKTETQINYLKQMEEYANK >NC_009697.1|WP_012047734.1|2231358_2231853_-|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPIKHIMSYPTEIRKRVGSLPQYKDVIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIILAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFAVNIYDTIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRSPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSGGMVHFISII >NC_009697.1|WP_011986661.1|2231895_2232510_-|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMANKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILGKAGADIHIEAPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGMGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAMGNPCKVIREITEEDRKYYYKNYEFDVDDYKE >NC_009697.1|WP_079995891.1|2232824_2233187_+|aminopeptidase-P-family-N-terminal-domain-containing-protein MDEVHLFINKNKLSDEIKLSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVILVHPDRMNYALYNNIGKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVRCILLMENSFMIVTV >NC_009697.1|WP_021134338.1|2233270_2233444_+|M24-family-metallopeptidase MNIHETPTGFRWQYRPKETHRFEEGIVITDEPGIYIAGSHGIRIENELIVCKGENNG >NC_009697.1|WP_011986662.1|2233517_2234924_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYSKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NC_009697.1|WP_011986663.1|2235026_2235767_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLRELYKKAPEAKVFESSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLRKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDLNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_009697.1|WP_011986664.1|2235773_2236664_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIEYIEEHIRESLTVNQITKEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRKLSLSTIDLLEGEKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPSQYIKKMKFYYKSENNLILSKFMNDPYIIKKEAFKVAGYGIKTNVADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDITYLLGVIVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVESKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRPDTVMDIYVPIKKLER >NC_009697.1|WP_011986665.1|2236964_2237486_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLVLILSLNLIGCGVNSEKKSKENVKNSSKIETYDLIKHKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFSLQTTKEPYEITVNYKTNKNLGEENYNKFWKDKKVEELLEKNAVILLSLIPNAEIIKFNVENIGEESYKYDRKNLGQKYGNLKDLFKDNDSLNKFLNN >NC_009697.1|WP_011986666.1|2239449_2241447_-|FAD-dependent-oxidoreductase 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MRYSITDLAEILGYTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEKRETMYQLEALKRAQYYMNLADAIEEHLVSIRRIEELLNKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQKIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHAKEIKSTSCIHTIVMADEDFTQQPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009697_3 | 2237705-2238000 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009697_3
|
4 spacers
spacers of NC_009697_3
>3.1|2237735|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT TGAACTTATGAAAGAACTAGAGTGTGGAGAACCCTT >3.2|2237801|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT ATTAGGTTTGCCACCACATTCCGTTACTGCAGTAGT >3.3|2237867|38|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT TTAAGTATGATAATATAAAACCTTGGTAAATATATTAA >3.4|2237935|35|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT GAAAAAGGTAAATTAGCAAGTGCAAAAGATTTAGA >3.5|2237737|36|NC_009697|PILER-CR TGAACTTATGAAAGAACTAGAGTGTGGAGAACCCTT >3.6|2237803|36|NC_009697|PILER-CR ATTAGGTTTGCCACCACATTCCGTTACTGCAGTAGT >3.7|2237869|38|NC_009697|PILER-CR TTAAGTATGATAATATAAAACCTTGGTAAATATATTAA |
cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009697_3
The CRISPR arrays of NC_009697_3 >merge|NC_009697|3|2237705-2238000|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTTAAGTACATCTCATGTTAATGTTCAACTGAACTTATGAAAGAACTAGAGTGTGGAGAACCCTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACATTAGGTTTGCCACCACATTCCGTTACTGCAGTAGTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTTAAGTATGATAATATAAAACCTTGGTAAATATATTAAATTTAAATACATTTCATGTTAATGTTCAACGAAAAAGGTAAATTAGCAAGTGCAAAAGATTTAGAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACC >NC_009697|3|3|2237705-2238000|CRISPRCasFinder GCTTAAGTACATCTCATGTTAATGTTCAAC TGAACTTATGAAAGAACTAGAGTGTGGAGAACCCTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC ATTAGGTTTGCCACCACATTCCGTTACTGCAGTAGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TTAAGTATGATAATATAAAACCTTGGTAAATATATTAA ATTTAAATACATTTCATGTTAATGTTCAAC GAAAAAGGTAAATTAGCAAGTGCAAAAGATTTAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACC >NC_009697|3|2|2237705-2237999|CRT GCTTAAGTACATCTCATGTTAATGTTCAAC TGAACTTATGAAAGAACTAGAGTGTGGAGAACCCTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC ATTAGGTTTGCCACCACATTCCGTTACTGCAGTAGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TTAAGTATGATAATATAAAACCTTGGTAAATATATTAA ATTTAAATACATTTCATGTTAATGTTCAAC GAAAAAGGTAAATTAGCAAGTGCAAAAGATTTAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >NC_009697|3|1|2237707-2237934|PILER-CR TTAAGTACATCTCATGTTAATGTTCAACTG AACTTATGAAAGAACTAGAGTGTGGAGAACCCTTAT TTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAT TAGGTTTGCCACCACATTCCGTTACTGCAGTAGTAT TTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTT AAGTATGATAATATAAAACCTTGGTAAATATATTAAAT TTAAATACATTTCATGTTAATGTTCAAC
>NC_009697.1|WP_011986665.1|2236964_2237486_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLVLILSLNLIGCGVNSEKKSKENVKNSSKIETYDLIKHKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFSLQTTKEPYEITVNYKTNKNLGEENYNKFWKDKKVEELLEKNAVILLSLIPNAEIIKFNVENIGEESYKYDRKNLGQKYGNLKDLFKDNDSLNKFLNN >NC_009697.1|WP_011986664.1|2235773_2236664_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIEYIEEHIRESLTVNQITKEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRKLSLSTIDLLEGEKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPSQYIKKMKFYYKSENNLILSKFMNDPYIIKKEAFKVAGYGIKTNVADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDITYLLGVIVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVESKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRPDTVMDIYVPIKKLER >NC_009697.1|WP_011986663.1|2235026_2235767_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLRELYKKAPEAKVFESSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLRKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDLNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_009697.1|WP_011986662.1|2233517_2234924_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYSKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NC_009697.1|WP_021134338.1|2233270_2233444_+|M24-family-metallopeptidase MNIHETPTGFRWQYRPKETHRFEEGIVITDEPGIYIAGSHGIRIENELIVCKGENNG >NC_009697.1|WP_079995891.1|2232824_2233187_+|aminopeptidase-P-family-N-terminal-domain-containing-protein MDEVHLFINKNKLSDEIKLSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVILVHPDRMNYALYNNIGKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVRCILLMENSFMIVTV >NC_009697.1|WP_011986661.1|2231895_2232510_-|sugar-O-acetyltransferase 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>NC_009697.1|WP_011986666.1|2239449_2241447_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERVHAYGSKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGVEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGGSLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLIVGGGVAGMEAARVAAIRGHKVTLIEKNGYLGGNIVPGGVPDFKDDDRALVKWYECILKDLGVEIKLNVDASKENIKEFGADEVLLATGSSPRTLTIEGADKVYSAEDVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETALWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLVDLIKFNKIDVKTSSYISKKTDEGFVLNTNGEESIINADSAVVAIGYLSEKDLYSEVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >NC_009697.1|WP_011986667.1|2241543_2242341_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGYTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEKRETMYQLEALKRAQYYMNLADAIEEHLVSIRRIEELLNKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQKIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHAKEIKSTSCIHTIVMADEDFTQQPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NC_009697.1|WP_011986668.1|2242388_2242682_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLEEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLIYMTPILNLLLLIKGIVNYFNKAEG >NC_009697.1|WP_011986669.1|2242873_2243212_-|hypothetical-protein MDINSITNSLFIGMKIHKPKKETEIIKITDDGFWYGIGEKNKKKVTYDEIEEAVKEIKEKGMLTRQWYKEKFPKISKNNPCNFTTIGGVLVKFKLAEYTMGKYLYKNEIIYK >NC_009697.1|WP_011986670.1|2243223_2244117_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIGNIGYLYYKEYFKDEYIHECKIQSKKYDEKNNPLIKINQKILDNSNIDILKNNKFKFIKEIQDKLYKKRIYFKTTYPGLIVGTGYSHILKEKEEFKLSLEFDYTTGLPVINGSSIKGMLRSVFYNKKDDEKLIEEKEKYIRDILKELIKKENPKFNGEFDFEELTNNIFEGKCKAKDKNGIHMSISERDIFLGATIDIEATIEEMKRTKQEKNNLLGEDYVTPHGEGKDKLKNPNPIKFLKVMPNVVWCFGFDLKDFNKDIPADIKKKLFKQILLDLGIGAKTNVGYGRLEFISY >NC_009697.1|WP_011986671.1|2244128_2244563_-|hypothetical-protein MNKREIEKQIPIAIDLIDEFMKKKKFLKKDDKEDDKKLKGIAKEYKGYISNFGASIIQSGLLSTVAFFEANDSKSKSDKQVLMDLILKVVDIYNEKQLEWKNNSPFLHYILENNNKQTEEEVINAAIAVKLAMRVFKFTENSES >NC_009697.1|WP_011986672.1|2244590_2245430_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MDNFKIYTIRCLTNMHVGSGDASYTLIDNQVQRDVITGFPTINSSSLKGSLRSFLDPKKEKSKAIKYIFGDKEDGMGNYKIFPGMLLSMPVRSNVKPFFRATCPRIIKDFLGFIENFQPQTSDIKNIKTLEEDLKNIEKVADKNKNTIFILKNFNRDIDVKFDNNQRIEGIKITSEQEISLKGEERIKEIFGESLILIDDNSFNDIVDRLPVIARNKLDNGESENLWYEEVVPRETRFYFGTILGKEHQSEFGKIEGKQPVQIGSNATIGYGYCDIKSI >NC_009697.1|WP_011986673.1|2245441_2246641_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009697_4 | 2238280-2238376 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009697_4
|
1 spacers
spacers of NC_009697_4
>4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder ATGTTGTAAATGTTGTGGTATAACAGAATGTAAATA |
cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009697_4
The CRISPR arrays of NC_009697_4 >merge|NC_009697|4|2238280-2238376|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACATGTTGTAAATGTTGTGGTATAACAGAATGTAAATAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACC >NC_009697|4|4|2238280-2238376|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC ATGTTGTAAATGTTGTGGTATAACAGAATGTAAATA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACC
>NC_009697.1|WP_011986665.1|2236964_2237486_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLVLILSLNLIGCGVNSEKKSKENVKNSSKIETYDLIKHKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFSLQTTKEPYEITVNYKTNKNLGEENYNKFWKDKKVEELLEKNAVILLSLIPNAEIIKFNVENIGEESYKYDRKNLGQKYGNLKDLFKDNDSLNKFLNN >NC_009697.1|WP_011986664.1|2235773_2236664_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIEYIEEHIRESLTVNQITKEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRKLSLSTIDLLEGEKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPSQYIKKMKFYYKSENNLILSKFMNDPYIIKKEAFKVAGYGIKTNVADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDITYLLGVIVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVESKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRPDTVMDIYVPIKKLER >NC_009697.1|WP_011986663.1|2235026_2235767_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLRELYKKAPEAKVFESSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLRKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDLNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_009697.1|WP_011986662.1|2233517_2234924_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYSKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NC_009697.1|WP_021134338.1|2233270_2233444_+|M24-family-metallopeptidase MNIHETPTGFRWQYRPKETHRFEEGIVITDEPGIYIAGSHGIRIENELIVCKGENNG >NC_009697.1|WP_079995891.1|2232824_2233187_+|aminopeptidase-P-family-N-terminal-domain-containing-protein MDEVHLFINKNKLSDEIKLSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVILVHPDRMNYALYNNIGKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVRCILLMENSFMIVTV >NC_009697.1|WP_011986661.1|2231895_2232510_-|sugar-O-acetyltransferase 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>NC_009697.1|WP_011986666.1|2239449_2241447_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERVHAYGSKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGVEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGGSLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLIVGGGVAGMEAARVAAIRGHKVTLIEKNGYLGGNIVPGGVPDFKDDDRALVKWYECILKDLGVEIKLNVDASKENIKEFGADEVLLATGSSPRTLTIEGADKVYSAEDVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETALWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLVDLIKFNKIDVKTSSYISKKTDEGFVLNTNGEESIINADSAVVAIGYLSEKDLYSEVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >NC_009697.1|WP_011986667.1|2241543_2242341_-|MerR-family-transcriptional-regulator 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>NC_009697.1|WP_011986671.1|2244128_2244563_-|hypothetical-protein MNKREIEKQIPIAIDLIDEFMKKKKFLKKDDKEDDKKLKGIAKEYKGYISNFGASIIQSGLLSTVAFFEANDSKSKSDKQVLMDLILKVVDIYNEKQLEWKNNSPFLHYILENNNKQTEEEVINAAIAVKLAMRVFKFTENSES >NC_009697.1|WP_011986672.1|2244590_2245430_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MDNFKIYTIRCLTNMHVGSGDASYTLIDNQVQRDVITGFPTINSSSLKGSLRSFLDPKKEKSKAIKYIFGDKEDGMGNYKIFPGMLLSMPVRSNVKPFFRATCPRIIKDFLGFIENFQPQTSDIKNIKTLEEDLKNIEKVADKNKNTIFILKNFNRDIDVKFDNNQRIEGIKITSEQEISLKGEERIKEIFGESLILIDDNSFNDIVDRLPVIARNKLDNGESENLWYEEVVPRETRFYFGTILGKEHQSEFGKIEGKQPVQIGSNATIGYGYCDIKSI >NC_009697.1|WP_011986673.1|2245441_2246641_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009697_5 | 2238493-2238790 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009697_5
|
4 spacers
spacers of NC_009697_5
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cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009697_5
The CRISPR arrays of NC_009697_5 >merge|NC_009697|5|2238493-2238790|CRT,CRISPRCasFinder TGCTTAAATACATATCATGTTAAGGTTCAACTGGTAAGCAAAGCATATCTTCAGAGTTGTTTATCTATATTTAAATACATTCTATATTACTGTTCAACAAATGTAGATAGGCAATTTTTTAAAGAAAATAGAAAATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACACGAATAGGGGGTGATAAATATTGTTATTTGGACAAATATTTAAATACATCCTATGTTACTGTTCAACGATAAAACCAATCTATTAACCTGTATAACTGCCTTATTTAAATACATCCTATGTTACTGTTCAACC >NC_009697|5|3|2238493-2238789|CRT TGCTTAAATACATATCATGTTAAGGTTCAAC TGGTAAGCAAAGCATATCTTCAGAGTTGTTTATCTA TATTTAAATACATTCTATATTACTGTTCAAC AAATGTAGATAGGCAATTTTTTAAAGAAAATAGAA AATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC ACGAATAGGGGGTGATAAATATTGTTATTTGGACAAA TATTTAAATACATCCTATGTTACTGTTCAAC GATAAAACCAATCTATTAACCTGTATAACTGCCT TATTTAAATACATCCTATGTTACTGTTCAAC >NC_009697|5|5|2238494-2238790|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATATCATGTTAAGGTTCAAC TGGTAAGCAAAGCATATCTTCAGAGTTGTTTATCTAT ATTTAAATACATTCTATATTACTGTTCAAC AAATGTAGATAGGCAATTTTTTAAAGAAAATAGAAA ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC ACGAATAGGGGGTGATAAATATTGTTATTTGGACAAAT ATTTAAATACATCCTATGTTACTGTTCAAC GATAAAACCAATCTATTAACCTGTATAACTGCCTT ATTTAAATACATCCTATGTTACTGTTCAACC
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NC_009697_6 | 2239064-2239159 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009697_6
|
1 spacers
spacers of NC_009697_6
>6.1|2239094|36|NC_009697|CRISPRCasFinder AGGTGGAGTATTAGAAGATATGCATCTATATAAAGA |
cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009697_6
The CRISPR arrays of NC_009697_6 >merge|NC_009697|6|2239064-2239159|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAGGTGGAGTATTAGAAGATATGCATCTATATAAAGAATTTAAATACATCCTATGTTATTGTTCAAT >NC_009697|6|6|2239064-2239159|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AGGTGGAGTATTAGAAGATATGCATCTATATAAAGA ATTTAAATACATCCTATGTTATTGTTCAAT
>NC_009697.1|WP_011986665.1|2236964_2237486_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLVLILSLNLIGCGVNSEKKSKENVKNSSKIETYDLIKHKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFSLQTTKEPYEITVNYKTNKNLGEENYNKFWKDKKVEELLEKNAVILLSLIPNAEIIKFNVENIGEESYKYDRKNLGQKYGNLKDLFKDNDSLNKFLNN >NC_009697.1|WP_011986664.1|2235773_2236664_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIEYIEEHIRESLTVNQITKEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRKLSLSTIDLLEGEKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPSQYIKKMKFYYKSENNLILSKFMNDPYIIKKEAFKVAGYGIKTNVADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDITYLLGVIVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVESKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRPDTVMDIYVPIKKLER >NC_009697.1|WP_011986663.1|2235026_2235767_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLRELYKKAPEAKVFESSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLRKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDLNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_009697.1|WP_011986662.1|2233517_2234924_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYSKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NC_009697.1|WP_021134338.1|2233270_2233444_+|M24-family-metallopeptidase MNIHETPTGFRWQYRPKETHRFEEGIVITDEPGIYIAGSHGIRIENELIVCKGENNG >NC_009697.1|WP_079995891.1|2232824_2233187_+|aminopeptidase-P-family-N-terminal-domain-containing-protein MDEVHLFINKNKLSDEIKLSLKKNAALFIHPYNKIYKEVKKFTNSDVILVHPDRMNYALYNNIGKEVITEISSSNKLDAFPAEQGRFICPSFEPISSFGEHVTIVRCILLMENSFMIVTV >NC_009697.1|WP_011986661.1|2231895_2232510_-|sugar-O-acetyltransferase 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|
2 spacers
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009697_7
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MAKLKIGLKQHTPLIHFQSEQPGAILRATEVKSKLDKFLKKYAFPGGFEEYKQYLIGYKTDKKDKIEDFGDKQAFDYKLRIYTENPNKIQKINIKGGMQALYFAGRSNNGNVKGILTNEDIILEFFTFHKGLMEIIKNNIEGFFCINNFGTRQNKGFGSFYLKKPINEVDKLIDRICTHDKTNIYLNIKYNKGDYFQIFEDISVIYPLMKSGLNFPKWPKSYHKSFLFKYMLNKDIGNEKRFIKENFFSPWKRIENDNKEKRYVRAMLGICDGIEFRDSERTGKVKYNSNIERFQSPILFKIINNELFIIPKKIPKEMFYNKFKFSNEFKSGRESKVNKEIIYTPKEDEFNLENFLSGFADYFNNHIKVSNVNNVFENKIRKAKLRRIDIKQVVK >NC_009697.1|WP_011986674.1|2246657_2248370_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MTKNKKSYIGLTIGPIVETIGNAKQTGELWASSYLFSYIMKNIIKTLIVKDREVNKDREQNEKLENRFILPCIDDILNKLSKNEMEQKSIQKIENNTDKAEQEVGLFHDRFIFQSENGEFDLVKESINEVIDGIVTGIENHDVCKDKSREEIKSDIEDFLKIYYLEIDIDLNQEEKENKLSSENNIIFKVNRALDALELREKILGNNGVENNYILQTLNNKQLKEQDFKKHFLSKDAYGENGKDGDYPSLFKIALDETYNNEFPNEDEKIKEELKQMGERKRLKANEYVAIVQADGDSMGRVIEKFKIHNDRENIYVDYKDFSSKLLEYDKNSHEKIKKYGGFTIYAGGDDLLFIAPVITKNKNNIFQLIDALSGLFDNEFKHEEEKPTTSFGIAIVHHKFPLYYALDEARDLLFNKAKNYKFNGEEKNAIAFKVIKSSGQSFETVVGKKSESYKQFKELFKNVSNSLNGKDRKIKNYLKAIHFKIKRDKVILNKIGKNEELLENYFKNNFDEKFHENGDIKKYINYLIKFIYLIYGETKTDEDKNKCIEQIYTYLRFIKFMDEDINLDN >NC_009697.1|WP_011986673.1|2245441_2246641_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 MSKYLVKLKPVDSFFFGGEKVFDFYDGKKPLKNNIVKSREFPQQTSILGMIRKEILVLNSCIREKWDYSKDQQKENNKLIGERSFNITDKNEDFGIINSISPVFIIEETKVSDKFLIKIPKDHNVNDSLNKYNPFKFNNDKGNCLKVKTNLVKEVYLPIDFEAKKGLSEDFIDIKTGDIVSKNKVFIRDCSIGIKLDENHKTKDNSLFRLEKYKFKYDNRYERADKCFAFILDVEEEKGKITFENYKNIITLGGEGSHFFISFEKVNFDIKEKIDFINKEKNSFTIKERVRVATNKEEIKETKLIYKIILLSDTYISKDIYEKNCNYSISTKIDFRNLCSDNYCKNIDEYHYKRLKKSDSKYSLLEKGSVLFASKENYDRLIKNINNSKFQKIGYNIFI >NC_009697.1|WP_011986672.1|2244590_2245430_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MDNFKIYTIRCLTNMHVGSGDASYTLIDNQVQRDVITGFPTINSSSLKGSLRSFLDPKKEKSKAIKYIFGDKEDGMGNYKIFPGMLLSMPVRSNVKPFFRATCPRIIKDFLGFIENFQPQTSDIKNIKTLEEDLKNIEKVADKNKNTIFILKNFNRDIDVKFDNNQRIEGIKITSEQEISLKGEERIKEIFGESLILIDDNSFNDIVDRLPVIARNKLDNGESENLWYEEVVPRETRFYFGTILGKEHQSEFGKIEGKQPVQIGSNATIGYGYCDIKSI >NC_009697.1|WP_011986671.1|2244128_2244563_-|hypothetical-protein MNKREIEKQIPIAIDLIDEFMKKKKFLKKDDKEDDKKLKGIAKEYKGYISNFGASIIQSGLLSTVAFFEANDSKSKSDKQVLMDLILKVVDIYNEKQLEWKNNSPFLHYILENNNKQTEEEVINAAIAVKLAMRVFKFTENSES >NC_009697.1|WP_011986670.1|2243223_2244117_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIGNIGYLYYKEYFKDEYIHECKIQSKKYDEKNNPLIKINQKILDNSNIDILKNNKFKFIKEIQDKLYKKRIYFKTTYPGLIVGTGYSHILKEKEEFKLSLEFDYTTGLPVINGSSIKGMLRSVFYNKKDDEKLIEEKEKYIRDILKELIKKENPKFNGEFDFEELTNNIFEGKCKAKDKNGIHMSISERDIFLGATIDIEATIEEMKRTKQEKNNLLGEDYVTPHGEGKDKLKNPNPIKFLKVMPNVVWCFGFDLKDFNKDIPADIKKKLFKQILLDLGIGAKTNVGYGRLEFISY >NC_009697.1|WP_011986669.1|2242873_2243212_-|hypothetical-protein MDINSITNSLFIGMKIHKPKKETEIIKITDDGFWYGIGEKNKKKVTYDEIEEAVKEIKEKGMLTRQWYKEKFPKISKNNPCNFTTIGGVLVKFKLAEYTMGKYLYKNEIIYK >NC_009697.1|WP_003385097.1|2253207_2253375_+|hypothetical-protein MDMLELTIKSFVVIYIVKLILKHNLFISKLVIKIKFLGIHIELNGKEKKHPSDQE >NC_009697.1|WP_011986679.1|2254147_2255803_-|AAA-family-ATPase MKKRFNVTGTCIPEKHYMVDISKKLDSILKLIDNEEYFIINRPRQYGKTTTLYMLEKRLNKMEEYLPIKISFEAIDTEGYSEAKKFLSSIMMQIINYFRFSTKKEIYKFVKRHENKVNTMNEFNRFITDLIEFTEKKVVLIIDEVDKSSNNQLFLDFLGMLRSKYLLRSEGKDYTFHSVILAGVHDVKQASKIYDFDMIAYSCEEISRRFLTKDLKIRSDEEHKYNSPWNIASDFDVDMSFSRSEIKTMLDDYVENKKVALDKEYFAEKLYFYTSGYPFLVSKLCKIIDEKIMDENKLEWKKEYLEIAVKELLKDSNTNFDSLIKNIENNEGLSRLVDNLLIKGVRINFNIHNPDINLGCLYGIFKDDKGNLKINNRIYEQLIYDYRISKIQTSSNFYNYNSKENFIDTNGDLNIRKVLLKFQEFMQHEYSKKRKGFLEEDGRLVFLAFLSPIINGIGFAFKEVKAGEEKRFEIVITYNKKMYILELKIWRGEEYHKKGLIQLAEYLEQYKLDKGYLLIFDLRKSTNLIGEVEENYIGIENHSKKIIQVYC >NC_009697.1|WP_012047738.1|2256579_2257428_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MEYFHVDVFSNEILYGNGLTVVFCNEELEDNLMLKLTQEFKQFETIFVRRMDNSIFNARIFTVDEELDFAGHPILGAAATIHSNIFRNEEDIAITFQLNQKTIIVNSKKIEEYYEVQMNQGKAEFLCEVSKEKRNKYVHALNLSEENLSEEFPMEVVSTGLPYLLVPLASGIENAKIISSKFEEMLKEVGAKFAYIFDVNYIEGRTWDNQGNVEDVATGSAAGPLGAYLYKHNIFNVGHEIIINQGRFVGRPSKIKVSMSISEKEILVSGEVAILAKGTILL >NC_009697.1|WP_011986681.1|2257718_2258639_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNFSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGVIETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGRVFGDIRTAAELLSLDIADIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDVISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >NC_009697.1|WP_011986682.1|2258962_2260456_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MNIKIDKNSLITITQQLVHYFSDRIMSEFIKAGQKLPSIRNLAKELGISPMTIIKAYNNLEQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLSLIQNDIKLLSQYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMETPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSNRKAELLDIARYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKSIKSMDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESSILSRLIAAKSNHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIENLNKQLVKRRDKVISLLKSHAPSGMKWAIPEGGINIWVTLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >NC_009697.1|WP_011986683.1|2261380_2261836_+|staygreen-family-protein MSKLNPEKLSVEFRDGVTGTEPILGRRYTLTHSDITAELFLTIGLTYAYDKIDVMRDEVLGEWIEKEKNYLFHVYLHVDGNNPIVTGVRNHIFRRELPLALEAIRYGDRKFFISHPKLDNSPVIVHFISSYPSFDRIEKWGTFSDYSLKKR >NC_009697.1|WP_011986684.1|2261915_2262383_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSLGEKLLYLRKKAGLSQEDVAEKLSVSRQTVSKWETDQTVPELNKAKLLSELYNVSYDYLISENYISGDVTGIEMIVDEIDWTGAWSKKYSILASYPGIKGINTYSEKISELYDSFKNDFGFNDTDTVLVLKDILYQKYKMEKKKKVDNSKEKI >NC_009697.1|WP_012047739.1|2262550_2263582_-|alpha/beta-hydrolase MKKVIKVVSVILVILVIAGFFIIKNLTETKDGKLNMYVAANLQLYKILNPKSLNNKSIEETRGALNKQSTRWSNKPIPFSNIKNLDIKMNNEKIPVRIYTPEKGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTIDGVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNGKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPSITCQVLIYPSTNIFKLNSKSWSHFSNSFNVSTEDMEKYISIYAPKKEDRKSPYASPLLSKDLRKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKAEVTRYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK >NC_009697.1|WP_011986686.1|2263847_2265200_-|amidohydrolase MNQILIKNGYIITMDCSKRIFEKGDILVEDSKIIAIGNVESELIKSNVEIIDANGKIIMPGLVNTHVHLSQQLARGLADDVDLLTWLRKRIWPYESNMDLEDSYISSLACCTELIRSGVTTFCEAGGQEVDGMGKAVEEAGLRGILCRSTMDCGDGLPLKWQETTEESLQKQVELLERWNGKGDGRIKYWFGLRTIFNTTDKLITKTKELADKYKVGIHMHVAEIEEEVRYAEATRGETTVQHLAKLGVLDKNFLAVHTVWLTEQEIDLFKLHNVKVSHNPGAAMKVVLGFAHIPEMLEKGINVSIGTDGAPSNNRMDMFDEMHLTSLIHKGRRLNPKVVPADEVLEMATMNGAKCALWEDEIGSLEVGKKADLIIINPKSIGSLPMHDPIGNIVYSMHSSDVESSMCNGKWLMKNKVLLTIDEEDIIREAQEKATALVKKAGIVLPKRF >NC_009697.1|WP_011986687.1|2265408_2266752_-|purine-permease MKNTKDTNLIVGIDEKISLRYAFFLGLQHVFAMDLYIVPIILAGILSLDAQNTAYFIQMSFIAAGIATLIQTGLCMRLPIMQGPSYIPIGALAAIGSKLGLQAMVGSLIPGSLFLMILGYPLRFLSKIISKFIPHIVGGTVIVIVGISLMPVAMTNIFTAPGNLKINCILALISSALLVGCMMIGRKSNKFGKAVRLTSVMISLIGGTIAASLLGVVDFTPVTKAAWFSFPKLLPFGKPVFDLKAILTMLFIYAVILVETSGTWFAVSAVTGSELTDEGLNRGAVGEGIGCFVGALFGGTPMTGYSTNAGIIAVTGVGSRMAIIAGGIILVALGMLPKLMNVIACIPSAVVSGVFAVVCVIIAMNGFKSIQHEEFDERNMLLIGLPILLALGTTVLPKDILNSLPSLANYIFSSGITVGALAAVILNILLPKAPVEVSKSQEYEEAV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009697_8 | 2253708-2253937 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009697_8
|
3 spacers
spacers of NC_009697_8
>8.1|2253738|36|NC_009697|CRISPRCasFinder AATAGAGTATTCAGATGAATATAAATTCTTGGAAGA >8.2|2253804|37|NC_009697|CRISPRCasFinder TAGAGGTGATTTTATATGAAAAAGGAAAACATAACAA >8.3|2253871|36|NC_009697|CRISPRCasFinder CGACCCTATAACAGTTTCAGAAGTAGAACAAAATAT >8.4|2253738|37|NC_009697|CRT AATAGAGTATTCAGATGAATATAAATTCTTGGAAGAA >8.5|2253804|38|NC_009697|CRT TAGAGGTGATTTTATATGAAAAAGGAAAACATAACAAG >8.6|2253871|37|NC_009697|CRT CGACCCTATAACAGTTTCAGAAGTAGAACAAAATATG >8.7|2253806|36|NC_009697|PILER-CR AGAGGTGATTTTATATGAAAAAGGAAAACATAACAA >8.8|2253873|35|NC_009697|PILER-CR GACCCTATAACAGTTTCAGAAGTAGAACAAAATAT |
cas6,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009697_8
The CRISPR arrays of NC_009697_8 >merge|NC_009697|8|2253708-2253937|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTCAATACATTTAATGTTAATGTTCAATAATAGAGTATTCAGATGAATATAAATTCTTGGAAGAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTAGAGGTGATTTTATATGAAAAAGGAAAACATAACAAGTTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATCGACCCTATAACAGTTTCAGAAGTAGAACAAAATATGTTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATC >NC_009697|8|8|2253708-2253936|CRISPRCasFinder TTTTCAATACATTTAATGTTAATGTTCAAT AATAGAGTATTCAGATGAATATAAATTCTTGGAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TAGAGGTGATTTTATATGAAAAAGGAAAACATAACAA GTTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT CGACCCTATAACAGTTTCAGAAGTAGAACAAAATAT GTTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT >NC_009697|8|4|2253709-2253936|CRT TTTCAATACATTTAATGTTAATGTTCAAT AATAGAGTATTCAGATGAATATAAATTCTTGGAAGAA TTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TAGAGGTGATTTTATATGAAAAAGGAAAACATAACAAG TTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT CGACCCTATAACAGTTTCAGAAGTAGAACAAAATATG TTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT >NC_009697|8|2|2253775-2253937|PILER-CR TTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTA GAGGTGATTTTATATGAAAAAGGAAAACATAACAAG TTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATCG ACCCTATAACAGTTTCAGAAGTAGAACAAAATATG TTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATC
>NC_009697.1|WP_003385097.1|2253207_2253375_+|hypothetical-protein MDMLELTIKSFVVIYIVKLILKHNLFISKLVIKIKFLGIHIELNGKEKKHPSDQE >NC_009697.1|WP_011986678.1|2251719_2252409_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MEFCELIATVMLKKDIYFEDCGYIIGKNINKSMLLDKDLKEIHPKKQYKNYVFNSFYPIERDKFYKKDRLYIFNIRGLSKEFIDKIETCLCNLESNDFNVISTSKKEIKQRYIKELYTQTPLIITVDDKPWLQNDGDLDLFKQRLEDNLEKKYKSFFNEDIDVKGKFIKSIEFKNRKPMHYNYKNGIKLLANKVSIQIKDNEEAQKVAFLARAIGLGEKNPSIGAGFCK >NC_009697.1|WP_011986677.1|2251325_2251700_-|hypothetical-protein MGKTLRFEIVSGVNKGYFHTNSQSESLDLVGGIWQKIAKEEFEKSNIYVSAVIKPSKTVYNQEWGCPENGEETVVLTGVANEEFVDDIEKWKDTVIKLAKELKNQMKQSTLTCEFIETELHYFK >NC_009697.1|WP_011986676.1|2249570_2251274_-|hypothetical-protein MTKEIISSHIFVFPFRWDVVKDEACFDTCIDSRLNTEKFIKYLKDNNQWEEDINISNIVENKEVENDLDYNTYAYFYDNVRKAIYGNPNSIKKNKNISVDLKNSKYYAGKLFNKKISNTIVRCLNYKNIDANSIYEIHVEKKDDKGTIVFDEHYKLKIKSIKLKVYDTGVATLSYFLNNYEWKNKEDILRINDYGRRIYPQHIPLDTVRSNFLAKKLSLKLKKRIIEEEFDYEIKEKPTKISKTIINILGEKFVSTEKELRYKSLSKEEIIFVKPVIDDRMFVICYYNNGFHSRVLTKYDKDEYLKNDFWYQFLFVDNDGATCKDEEMTKELLLKSTYTRWKSYGTLFGISRYSFVILCDESGFSKDVLYNHINIIYYEMILLALVQRASILRFSDETSRIASFERKNIYEQIKKLQEYYIRFVNTIYFREVTAQEQGIELYDKIVELMRIDTEVKRLDEEIDEIQRYINLETNDRTNRLLNVITFVGIGISVISLISSLFSNSKQIGDLTWLVTWQYVPFVMVLLVISVIKNYVNDNKVIKIIMWVITLLAIYIVLDYKFIKLFIK >NC_009697.1|WP_011986675.1|2248370_2249558_-|hypothetical-protein MAKLKIGLKQHTPLIHFQSEQPGAILRATEVKSKLDKFLKKYAFPGGFEEYKQYLIGYKTDKKDKIEDFGDKQAFDYKLRIYTENPNKIQKINIKGGMQALYFAGRSNNGNVKGILTNEDIILEFFTFHKGLMEIIKNNIEGFFCINNFGTRQNKGFGSFYLKKPINEVDKLIDRICTHDKTNIYLNIKYNKGDYFQIFEDISVIYPLMKSGLNFPKWPKSYHKSFLFKYMLNKDIGNEKRFIKENFFSPWKRIENDNKEKRYVRAMLGICDGIEFRDSERTGKVKYNSNIERFQSPILFKIINNELFIIPKKIPKEMFYNKFKFSNEFKSGRESKVNKEIIYTPKEDEFNLENFLSGFADYFNNHIKVSNVNNVFENKIRKAKLRRIDIKQVVK >NC_009697.1|WP_011986674.1|2246657_2248370_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MTKNKKSYIGLTIGPIVETIGNAKQTGELWASSYLFSYIMKNIIKTLIVKDREVNKDREQNEKLENRFILPCIDDILNKLSKNEMEQKSIQKIENNTDKAEQEVGLFHDRFIFQSENGEFDLVKESINEVIDGIVTGIENHDVCKDKSREEIKSDIEDFLKIYYLEIDIDLNQEEKENKLSSENNIIFKVNRALDALELREKILGNNGVENNYILQTLNNKQLKEQDFKKHFLSKDAYGENGKDGDYPSLFKIALDETYNNEFPNEDEKIKEELKQMGERKRLKANEYVAIVQADGDSMGRVIEKFKIHNDRENIYVDYKDFSSKLLEYDKNSHEKIKKYGGFTIYAGGDDLLFIAPVITKNKNNIFQLIDALSGLFDNEFKHEEEKPTTSFGIAIVHHKFPLYYALDEARDLLFNKAKNYKFNGEEKNAIAFKVIKSSGQSFETVVGKKSESYKQFKELFKNVSNSLNGKDRKIKNYLKAIHFKIKRDKVILNKIGKNEELLENYFKNNFDEKFHENGDIKKYINYLIKFIYLIYGETKTDEDKNKCIEQIYTYLRFIKFMDEDINLDN >NC_009697.1|WP_011986673.1|2245441_2246641_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 MSKYLVKLKPVDSFFFGGEKVFDFYDGKKPLKNNIVKSREFPQQTSILGMIRKEILVLNSCIREKWDYSKDQQKENNKLIGERSFNITDKNEDFGIINSISPVFIIEETKVSDKFLIKIPKDHNVNDSLNKYNPFKFNNDKGNCLKVKTNLVKEVYLPIDFEAKKGLSEDFIDIKTGDIVSKNKVFIRDCSIGIKLDENHKTKDNSLFRLEKYKFKYDNRYERADKCFAFILDVEEEKGKITFENYKNIITLGGEGSHFFISFEKVNFDIKEKIDFINKEKNSFTIKERVRVATNKEEIKETKLIYKIILLSDTYISKDIYEKNCNYSISTKIDFRNLCSDNYCKNIDEYHYKRLKKSDSKYSLLEKGSVLFASKENYDRLIKNINNSKFQKIGYNIFI >NC_009697.1|WP_011986672.1|2244590_2245430_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MDNFKIYTIRCLTNMHVGSGDASYTLIDNQVQRDVITGFPTINSSSLKGSLRSFLDPKKEKSKAIKYIFGDKEDGMGNYKIFPGMLLSMPVRSNVKPFFRATCPRIIKDFLGFIENFQPQTSDIKNIKTLEEDLKNIEKVADKNKNTIFILKNFNRDIDVKFDNNQRIEGIKITSEQEISLKGEERIKEIFGESLILIDDNSFNDIVDRLPVIARNKLDNGESENLWYEEVVPRETRFYFGTILGKEHQSEFGKIEGKQPVQIGSNATIGYGYCDIKSI >NC_009697.1|WP_011986671.1|2244128_2244563_-|hypothetical-protein MNKREIEKQIPIAIDLIDEFMKKKKFLKKDDKEDDKKLKGIAKEYKGYISNFGASIIQSGLLSTVAFFEANDSKSKSDKQVLMDLILKVVDIYNEKQLEWKNNSPFLHYILENNNKQTEEEVINAAIAVKLAMRVFKFTENSES >NC_009697.1|WP_011986670.1|2243223_2244117_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIGNIGYLYYKEYFKDEYIHECKIQSKKYDEKNNPLIKINQKILDNSNIDILKNNKFKFIKEIQDKLYKKRIYFKTTYPGLIVGTGYSHILKEKEEFKLSLEFDYTTGLPVINGSSIKGMLRSVFYNKKDDEKLIEEKEKYIRDILKELIKKENPKFNGEFDFEELTNNIFEGKCKAKDKNGIHMSISERDIFLGATIDIEATIEEMKRTKQEKNNLLGEDYVTPHGEGKDKLKNPNPIKFLKVMPNVVWCFGFDLKDFNKDIPADIKKKLFKQILLDLGIGAKTNVGYGRLEFISY >NC_009697.1|WP_011986679.1|2254147_2255803_-|AAA-family-ATPase MKKRFNVTGTCIPEKHYMVDISKKLDSILKLIDNEEYFIINRPRQYGKTTTLYMLEKRLNKMEEYLPIKISFEAIDTEGYSEAKKFLSSIMMQIINYFRFSTKKEIYKFVKRHENKVNTMNEFNRFITDLIEFTEKKVVLIIDEVDKSSNNQLFLDFLGMLRSKYLLRSEGKDYTFHSVILAGVHDVKQASKIYDFDMIAYSCEEISRRFLTKDLKIRSDEEHKYNSPWNIASDFDVDMSFSRSEIKTMLDDYVENKKVALDKEYFAEKLYFYTSGYPFLVSKLCKIIDEKIMDENKLEWKKEYLEIAVKELLKDSNTNFDSLIKNIENNEGLSRLVDNLLIKGVRINFNIHNPDINLGCLYGIFKDDKGNLKINNRIYEQLIYDYRISKIQTSSNFYNYNSKENFIDTNGDLNIRKVLLKFQEFMQHEYSKKRKGFLEEDGRLVFLAFLSPIINGIGFAFKEVKAGEEKRFEIVITYNKKMYILELKIWRGEEYHKKGLIQLAEYLEQYKLDKGYLLIFDLRKSTNLIGEVEENYIGIENHSKKIIQVYC >NC_009697.1|WP_012047738.1|2256579_2257428_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MEYFHVDVFSNEILYGNGLTVVFCNEELEDNLMLKLTQEFKQFETIFVRRMDNSIFNARIFTVDEELDFAGHPILGAAATIHSNIFRNEEDIAITFQLNQKTIIVNSKKIEEYYEVQMNQGKAEFLCEVSKEKRNKYVHALNLSEENLSEEFPMEVVSTGLPYLLVPLASGIENAKIISSKFEEMLKEVGAKFAYIFDVNYIEGRTWDNQGNVEDVATGSAAGPLGAYLYKHNIFNVGHEIIINQGRFVGRPSKIKVSMSISEKEILVSGEVAILAKGTILL >NC_009697.1|WP_011986681.1|2257718_2258639_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNFSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGVIETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGRVFGDIRTAAELLSLDIADIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDVISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >NC_009697.1|WP_011986682.1|2258962_2260456_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MNIKIDKNSLITITQQLVHYFSDRIMSEFIKAGQKLPSIRNLAKELGISPMTIIKAYNNLEQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLSLIQNDIKLLSQYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMETPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSNRKAELLDIARYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKSIKSMDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESSILSRLIAAKSNHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIENLNKQLVKRRDKVISLLKSHAPSGMKWAIPEGGINIWVTLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >NC_009697.1|WP_011986683.1|2261380_2261836_+|staygreen-family-protein MSKLNPEKLSVEFRDGVTGTEPILGRRYTLTHSDITAELFLTIGLTYAYDKIDVMRDEVLGEWIEKEKNYLFHVYLHVDGNNPIVTGVRNHIFRRELPLALEAIRYGDRKFFISHPKLDNSPVIVHFISSYPSFDRIEKWGTFSDYSLKKR >NC_009697.1|WP_011986684.1|2261915_2262383_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSLGEKLLYLRKKAGLSQEDVAEKLSVSRQTVSKWETDQTVPELNKAKLLSELYNVSYDYLISENYISGDVTGIEMIVDEIDWTGAWSKKYSILASYPGIKGINTYSEKISELYDSFKNDFGFNDTDTVLVLKDILYQKYKMEKKKKVDNSKEKI >NC_009697.1|WP_012047739.1|2262550_2263582_-|alpha/beta-hydrolase MKKVIKVVSVILVILVIAGFFIIKNLTETKDGKLNMYVAANLQLYKILNPKSLNNKSIEETRGALNKQSTRWSNKPIPFSNIKNLDIKMNNEKIPVRIYTPEKGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTIDGVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNGKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPSITCQVLIYPSTNIFKLNSKSWSHFSNSFNVSTEDMEKYISIYAPKKEDRKSPYASPLLSKDLRKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKAEVTRYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK >NC_009697.1|WP_011986686.1|2263847_2265200_-|amidohydrolase MNQILIKNGYIITMDCSKRIFEKGDILVEDSKIIAIGNVESELIKSNVEIIDANGKIIMPGLVNTHVHLSQQLARGLADDVDLLTWLRKRIWPYESNMDLEDSYISSLACCTELIRSGVTTFCEAGGQEVDGMGKAVEEAGLRGILCRSTMDCGDGLPLKWQETTEESLQKQVELLERWNGKGDGRIKYWFGLRTIFNTTDKLITKTKELADKYKVGIHMHVAEIEEEVRYAEATRGETTVQHLAKLGVLDKNFLAVHTVWLTEQEIDLFKLHNVKVSHNPGAAMKVVLGFAHIPEMLEKGINVSIGTDGAPSNNRMDMFDEMHLTSLIHKGRRLNPKVVPADEVLEMATMNGAKCALWEDEIGSLEVGKKADLIIINPKSIGSLPMHDPIGNIVYSMHSSDVESSMCNGKWLMKNKVLLTIDEEDIIREAQEKATALVKKAGIVLPKRF >NC_009697.1|WP_011986687.1|2265408_2266752_-|purine-permease MKNTKDTNLIVGIDEKISLRYAFFLGLQHVFAMDLYIVPIILAGILSLDAQNTAYFIQMSFIAAGIATLIQTGLCMRLPIMQGPSYIPIGALAAIGSKLGLQAMVGSLIPGSLFLMILGYPLRFLSKIISKFIPHIVGGTVIVIVGISLMPVAMTNIFTAPGNLKINCILALISSALLVGCMMIGRKSNKFGKAVRLTSVMISLIGGTIAASLLGVVDFTPVTKAAWFSFPKLLPFGKPVFDLKAILTMLFIYAVILVETSGTWFAVSAVTGSELTDEGLNRGAVGEGIGCFVGALFGGTPMTGYSTNAGIIAVTGVGSRMAIIAGGIILVALGMLPKLMNVIACIPSAVVSGVFAVVCVIIAMNGFKSIQHEEFDERNMLLIGLPILLALGTTVLPKDILNSLPSLANYIFSSGITVGALAAVILNILLPKAPVEVSKSQEYEEAV >NC_009697.1|WP_012047740.1|2267187_2268087_+|hypothetical-protein MSNKRNLQSIRSFYLCILIFNIVYSSIFHLNNKGFNIKLFGDLTMRSVVLFTLNSILFLCVAIAVEKKINIDEEIKTQVSMRIKPLYLVNMFFITYILVCIFLLKNLDVILSSFVMEIIYIGILILTKKIIALELTDRQLQWQKACGYIDESCEKSSFLWKFKIWYSPHINVPFKNRWKGLSRLLYDLALVYGIFISKGNLFSLPLLILLFPDVLSWLEGLLGLQTSLTGMCTGITEHHNKNSHVIYHKVYVTDYKNKREITFYVDGPLFIHENSHMTVVHGTFSKRVLYVEGLNLDIR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009697_9 | 2256155-2256315 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009697_9
|
2 spacers
spacers of NC_009697_9
>9.1|2256185|36|NC_009697|CRISPRCasFinder ACGTAGGAAAGAAAATGGAATCTATAGGTAAGGATA >9.2|2256251|35|NC_009697|CRISPRCasFinder TTTAATATTTTTTCTATATCCATAGGCTTAAAATC |
cas6,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,cmr4gr7,cmr5gr11 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009697_9
The CRISPR arrays of NC_009697_9 >merge|NC_009697|9|2256155-2256315|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACACGTAGGAAAGAAAATGGAATCTATAGGTAAGGATAATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACTTTAATATTTTTTCTATATCCATAGGCTTAAAATCATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC >NC_009697|9|9|2256155-2256315|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC ACGTAGGAAAGAAAATGGAATCTATAGGTAAGGATA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC TTTAATATTTTTTCTATATCCATAGGCTTAAAATC ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC
>NC_009697.1|WP_011986679.1|2254147_2255803_-|AAA-family-ATPase MKKRFNVTGTCIPEKHYMVDISKKLDSILKLIDNEEYFIINRPRQYGKTTTLYMLEKRLNKMEEYLPIKISFEAIDTEGYSEAKKFLSSIMMQIINYFRFSTKKEIYKFVKRHENKVNTMNEFNRFITDLIEFTEKKVVLIIDEVDKSSNNQLFLDFLGMLRSKYLLRSEGKDYTFHSVILAGVHDVKQASKIYDFDMIAYSCEEISRRFLTKDLKIRSDEEHKYNSPWNIASDFDVDMSFSRSEIKTMLDDYVENKKVALDKEYFAEKLYFYTSGYPFLVSKLCKIIDEKIMDENKLEWKKEYLEIAVKELLKDSNTNFDSLIKNIENNEGLSRLVDNLLIKGVRINFNIHNPDINLGCLYGIFKDDKGNLKINNRIYEQLIYDYRISKIQTSSNFYNYNSKENFIDTNGDLNIRKVLLKFQEFMQHEYSKKRKGFLEEDGRLVFLAFLSPIINGIGFAFKEVKAGEEKRFEIVITYNKKMYILELKIWRGEEYHKKGLIQLAEYLEQYKLDKGYLLIFDLRKSTNLIGEVEENYIGIENHSKKIIQVYC >NC_009697.1|WP_003385097.1|2253207_2253375_+|hypothetical-protein MDMLELTIKSFVVIYIVKLILKHNLFISKLVIKIKFLGIHIELNGKEKKHPSDQE >NC_009697.1|WP_011986678.1|2251719_2252409_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MEFCELIATVMLKKDIYFEDCGYIIGKNINKSMLLDKDLKEIHPKKQYKNYVFNSFYPIERDKFYKKDRLYIFNIRGLSKEFIDKIETCLCNLESNDFNVISTSKKEIKQRYIKELYTQTPLIITVDDKPWLQNDGDLDLFKQRLEDNLEKKYKSFFNEDIDVKGKFIKSIEFKNRKPMHYNYKNGIKLLANKVSIQIKDNEEAQKVAFLARAIGLGEKNPSIGAGFCK >NC_009697.1|WP_011986677.1|2251325_2251700_-|hypothetical-protein MGKTLRFEIVSGVNKGYFHTNSQSESLDLVGGIWQKIAKEEFEKSNIYVSAVIKPSKTVYNQEWGCPENGEETVVLTGVANEEFVDDIEKWKDTVIKLAKELKNQMKQSTLTCEFIETELHYFK >NC_009697.1|WP_011986676.1|2249570_2251274_-|hypothetical-protein MTKEIISSHIFVFPFRWDVVKDEACFDTCIDSRLNTEKFIKYLKDNNQWEEDINISNIVENKEVENDLDYNTYAYFYDNVRKAIYGNPNSIKKNKNISVDLKNSKYYAGKLFNKKISNTIVRCLNYKNIDANSIYEIHVEKKDDKGTIVFDEHYKLKIKSIKLKVYDTGVATLSYFLNNYEWKNKEDILRINDYGRRIYPQHIPLDTVRSNFLAKKLSLKLKKRIIEEEFDYEIKEKPTKISKTIINILGEKFVSTEKELRYKSLSKEEIIFVKPVIDDRMFVICYYNNGFHSRVLTKYDKDEYLKNDFWYQFLFVDNDGATCKDEEMTKELLLKSTYTRWKSYGTLFGISRYSFVILCDESGFSKDVLYNHINIIYYEMILLALVQRASILRFSDETSRIASFERKNIYEQIKKLQEYYIRFVNTIYFREVTAQEQGIELYDKIVELMRIDTEVKRLDEEIDEIQRYINLETNDRTNRLLNVITFVGIGISVISLISSLFSNSKQIGDLTWLVTWQYVPFVMVLLVISVIKNYVNDNKVIKIIMWVITLLAIYIVLDYKFIKLFIK >NC_009697.1|WP_011986675.1|2248370_2249558_-|hypothetical-protein MAKLKIGLKQHTPLIHFQSEQPGAILRATEVKSKLDKFLKKYAFPGGFEEYKQYLIGYKTDKKDKIEDFGDKQAFDYKLRIYTENPNKIQKINIKGGMQALYFAGRSNNGNVKGILTNEDIILEFFTFHKGLMEIIKNNIEGFFCINNFGTRQNKGFGSFYLKKPINEVDKLIDRICTHDKTNIYLNIKYNKGDYFQIFEDISVIYPLMKSGLNFPKWPKSYHKSFLFKYMLNKDIGNEKRFIKENFFSPWKRIENDNKEKRYVRAMLGICDGIEFRDSERTGKVKYNSNIERFQSPILFKIINNELFIIPKKIPKEMFYNKFKFSNEFKSGRESKVNKEIIYTPKEDEFNLENFLSGFADYFNNHIKVSNVNNVFENKIRKAKLRRIDIKQVVK >NC_009697.1|WP_011986674.1|2246657_2248370_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MTKNKKSYIGLTIGPIVETIGNAKQTGELWASSYLFSYIMKNIIKTLIVKDREVNKDREQNEKLENRFILPCIDDILNKLSKNEMEQKSIQKIENNTDKAEQEVGLFHDRFIFQSENGEFDLVKESINEVIDGIVTGIENHDVCKDKSREEIKSDIEDFLKIYYLEIDIDLNQEEKENKLSSENNIIFKVNRALDALELREKILGNNGVENNYILQTLNNKQLKEQDFKKHFLSKDAYGENGKDGDYPSLFKIALDETYNNEFPNEDEKIKEELKQMGERKRLKANEYVAIVQADGDSMGRVIEKFKIHNDRENIYVDYKDFSSKLLEYDKNSHEKIKKYGGFTIYAGGDDLLFIAPVITKNKNNIFQLIDALSGLFDNEFKHEEEKPTTSFGIAIVHHKFPLYYALDEARDLLFNKAKNYKFNGEEKNAIAFKVIKSSGQSFETVVGKKSESYKQFKELFKNVSNSLNGKDRKIKNYLKAIHFKIKRDKVILNKIGKNEELLENYFKNNFDEKFHENGDIKKYINYLIKFIYLIYGETKTDEDKNKCIEQIYTYLRFIKFMDEDINLDN >NC_009697.1|WP_011986673.1|2245441_2246641_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 MSKYLVKLKPVDSFFFGGEKVFDFYDGKKPLKNNIVKSREFPQQTSILGMIRKEILVLNSCIREKWDYSKDQQKENNKLIGERSFNITDKNEDFGIINSISPVFIIEETKVSDKFLIKIPKDHNVNDSLNKYNPFKFNNDKGNCLKVKTNLVKEVYLPIDFEAKKGLSEDFIDIKTGDIVSKNKVFIRDCSIGIKLDENHKTKDNSLFRLEKYKFKYDNRYERADKCFAFILDVEEEKGKITFENYKNIITLGGEGSHFFISFEKVNFDIKEKIDFINKEKNSFTIKERVRVATNKEEIKETKLIYKIILLSDTYISKDIYEKNCNYSISTKIDFRNLCSDNYCKNIDEYHYKRLKKSDSKYSLLEKGSVLFASKENYDRLIKNINNSKFQKIGYNIFI >NC_009697.1|WP_011986672.1|2244590_2245430_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MDNFKIYTIRCLTNMHVGSGDASYTLIDNQVQRDVITGFPTINSSSLKGSLRSFLDPKKEKSKAIKYIFGDKEDGMGNYKIFPGMLLSMPVRSNVKPFFRATCPRIIKDFLGFIENFQPQTSDIKNIKTLEEDLKNIEKVADKNKNTIFILKNFNRDIDVKFDNNQRIEGIKITSEQEISLKGEERIKEIFGESLILIDDNSFNDIVDRLPVIARNKLDNGESENLWYEEVVPRETRFYFGTILGKEHQSEFGKIEGKQPVQIGSNATIGYGYCDIKSI >NC_009697.1|WP_011986671.1|2244128_2244563_-|hypothetical-protein MNKREIEKQIPIAIDLIDEFMKKKKFLKKDDKEDDKKLKGIAKEYKGYISNFGASIIQSGLLSTVAFFEANDSKSKSDKQVLMDLILKVVDIYNEKQLEWKNNSPFLHYILENNNKQTEEEVINAAIAVKLAMRVFKFTENSES >NC_009697.1|WP_012047738.1|2256579_2257428_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MEYFHVDVFSNEILYGNGLTVVFCNEELEDNLMLKLTQEFKQFETIFVRRMDNSIFNARIFTVDEELDFAGHPILGAAATIHSNIFRNEEDIAITFQLNQKTIIVNSKKIEEYYEVQMNQGKAEFLCEVSKEKRNKYVHALNLSEENLSEEFPMEVVSTGLPYLLVPLASGIENAKIISSKFEEMLKEVGAKFAYIFDVNYIEGRTWDNQGNVEDVATGSAAGPLGAYLYKHNIFNVGHEIIINQGRFVGRPSKIKVSMSISEKEILVSGEVAILAKGTILL >NC_009697.1|WP_011986681.1|2257718_2258639_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNFSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGVIETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGRVFGDIRTAAELLSLDIADIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDVISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >NC_009697.1|WP_011986682.1|2258962_2260456_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MNIKIDKNSLITITQQLVHYFSDRIMSEFIKAGQKLPSIRNLAKELGISPMTIIKAYNNLEQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLSLIQNDIKLLSQYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMETPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSNRKAELLDIARYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKSIKSMDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESSILSRLIAAKSNHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIENLNKQLVKRRDKVISLLKSHAPSGMKWAIPEGGINIWVTLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >NC_009697.1|WP_011986683.1|2261380_2261836_+|staygreen-family-protein MSKLNPEKLSVEFRDGVTGTEPILGRRYTLTHSDITAELFLTIGLTYAYDKIDVMRDEVLGEWIEKEKNYLFHVYLHVDGNNPIVTGVRNHIFRRELPLALEAIRYGDRKFFISHPKLDNSPVIVHFISSYPSFDRIEKWGTFSDYSLKKR >NC_009697.1|WP_011986684.1|2261915_2262383_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSLGEKLLYLRKKAGLSQEDVAEKLSVSRQTVSKWETDQTVPELNKAKLLSELYNVSYDYLISENYISGDVTGIEMIVDEIDWTGAWSKKYSILASYPGIKGINTYSEKISELYDSFKNDFGFNDTDTVLVLKDILYQKYKMEKKKKVDNSKEKI >NC_009697.1|WP_012047739.1|2262550_2263582_-|alpha/beta-hydrolase MKKVIKVVSVILVILVIAGFFIIKNLTETKDGKLNMYVAANLQLYKILNPKSLNNKSIEETRGALNKQSTRWSNKPIPFSNIKNLDIKMNNEKIPVRIYTPEKGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTIDGVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNGKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPSITCQVLIYPSTNIFKLNSKSWSHFSNSFNVSTEDMEKYISIYAPKKEDRKSPYASPLLSKDLRKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKAEVTRYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK >NC_009697.1|WP_011986686.1|2263847_2265200_-|amidohydrolase MNQILIKNGYIITMDCSKRIFEKGDILVEDSKIIAIGNVESELIKSNVEIIDANGKIIMPGLVNTHVHLSQQLARGLADDVDLLTWLRKRIWPYESNMDLEDSYISSLACCTELIRSGVTTFCEAGGQEVDGMGKAVEEAGLRGILCRSTMDCGDGLPLKWQETTEESLQKQVELLERWNGKGDGRIKYWFGLRTIFNTTDKLITKTKELADKYKVGIHMHVAEIEEEVRYAEATRGETTVQHLAKLGVLDKNFLAVHTVWLTEQEIDLFKLHNVKVSHNPGAAMKVVLGFAHIPEMLEKGINVSIGTDGAPSNNRMDMFDEMHLTSLIHKGRRLNPKVVPADEVLEMATMNGAKCALWEDEIGSLEVGKKADLIIINPKSIGSLPMHDPIGNIVYSMHSSDVESSMCNGKWLMKNKVLLTIDEEDIIREAQEKATALVKKAGIVLPKRF >NC_009697.1|WP_011986687.1|2265408_2266752_-|purine-permease MKNTKDTNLIVGIDEKISLRYAFFLGLQHVFAMDLYIVPIILAGILSLDAQNTAYFIQMSFIAAGIATLIQTGLCMRLPIMQGPSYIPIGALAAIGSKLGLQAMVGSLIPGSLFLMILGYPLRFLSKIISKFIPHIVGGTVIVIVGISLMPVAMTNIFTAPGNLKINCILALISSALLVGCMMIGRKSNKFGKAVRLTSVMISLIGGTIAASLLGVVDFTPVTKAAWFSFPKLLPFGKPVFDLKAILTMLFIYAVILVETSGTWFAVSAVTGSELTDEGLNRGAVGEGIGCFVGALFGGTPMTGYSTNAGIIAVTGVGSRMAIIAGGIILVALGMLPKLMNVIACIPSAVVSGVFAVVCVIIAMNGFKSIQHEEFDERNMLLIGLPILLALGTTVLPKDILNSLPSLANYIFSSGITVGALAAVILNILLPKAPVEVSKSQEYEEAV >NC_009697.1|WP_012047740.1|2267187_2268087_+|hypothetical-protein MSNKRNLQSIRSFYLCILIFNIVYSSIFHLNNKGFNIKLFGDLTMRSVVLFTLNSILFLCVAIAVEKKINIDEEIKTQVSMRIKPLYLVNMFFITYILVCIFLLKNLDVILSSFVMEIIYIGILILTKKIIALELTDRQLQWQKACGYIDESCEKSSFLWKFKIWYSPHINVPFKNRWKGLSRLLYDLALVYGIFISKGNLFSLPLLILLFPDVLSWLEGLLGLQTSLTGMCTGITEHHNKNSHVIYHKVYVTDYKNKREITFYVDGPLFIHENSHMTVVHGTFSKRVLYVEGLNLDIR >NC_009697.1|WP_011986689.1|2268427_2269747_+|APC-family-permease MLEKKYGLWTTVSMVIGIVIGSGVFFKADNILMASGGNVKTALLAWLVGAISMIFGALVFAECANRFERSNGIVDYAEGMLSEKFAYLIGWFNGIIYYPAIAAVLAWAAGNYTAILFNKDGNFVWIMAAIYMIGIYILNYISPILSGKFQIASTAIKLVPLMLIAILGTFQGLNNGILIENFSKVSTIGDSGSGFAAAVLGAAFAYEGWIIATTINGEIKDAKNTLPKALVFGSLVIVIIYILYFLGIVGMIPTETILKQGDNTVNVAARTVFGNFGASILTTFIIVSCLGTLNGLILGGSRSFYSLAIRGQGIKPEAFSKLDSKTNIPTNSTIANFILICIYLVVWYMNFKGLFPNKMFVDISELPIALIYGIYIIIYIAYMMKMKDLSFIKRFVIPSLALMGALIVVYGGLSKPSVIIDLGISVFVFLSGLLFYNKK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_009697_2 | 2.4|2230936|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT | 2230936-2230971 | 36 | NC_012654 | Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence | 174503-174538 | 0 | 1.0 |
NC_009697_2 | 2.4|2230936|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT | 2230936-2230971 | 36 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 62802-62837 | 0 | 1.0 |
NC_009697_2 | 2.4|2230936|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT | 2230936-2230971 | 36 | NZ_CP031095 | Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence | 207645-207680 | 0 | 1.0 |
NC_009697_4 | 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder | 2238310-2238345 | 36 | NZ_CP014152 | Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence | 149447-149482 | 0 | 1.0 |
NC_009697_4 | 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder | 2238310-2238345 | 36 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 128281-128316 | 0 | 1.0 |
NC_009697_4 | 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder | 2238310-2238345 | 36 | NZ_CP013710 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence | 129903-129938 | 0 | 1.0 |
NC_009697_4 | 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder | 2238310-2238345 | 36 | NC_010379 | Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence | 80344-80379 | 0 | 1.0 |
NC_009697_4 | 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder | 2238310-2238345 | 36 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 37712-37747 | 0 | 1.0 |
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NC_009697_4 | 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder | 2238310-2238345 | 36 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 47769-47804 | 2 | 0.944 |
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NC_009697_2 | 2.2|2230805|35|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT | 2230805-2230839 | 35 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 163878-163912 | 3 | 0.914 |
NC_009697_8 | 8.4|2253738|37|NC_009697|CRT | 2253738-2253774 | 37 | GU949551 | Clostridium phage phiCD6356, complete genome | 4906-4942 | 3 | 0.919 |
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NC_009697_8 | 8.3|2253871|36|NC_009697|CRISPRCasFinder | 2253871-2253906 | 36 | NZ_CP013844 | Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence | 17535-17570 | 5 | 0.861 |
NC_009697_8 | 8.6|2253871|37|NC_009697|CRT | 2253871-2253907 | 37 | NZ_CP013844 | Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence | 17535-17571 | 6 | 0.838 |
NC_009697_8 | 8.8|2253873|35|NC_009697|PILER-CR | 2253873-2253907 | 35 | MN693403 | Marine virus AFVG_25M412, complete genome | 14464-14498 | 6 | 0.829 |
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NC_009697_9 | 9.2|2256251|35|NC_009697|CRISPRCasFinder | 2256251-2256285 | 35 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 1277029-1277063 | 8 | 0.771 |
NC_009697_8 | 8.3|2253871|36|NC_009697|CRISPRCasFinder | 2253871-2253906 | 36 | MN693403 | Marine virus AFVG_25M412, complete genome | 14464-14499 | 10 | 0.722 |
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NC_009697_8 | 8.6|2253871|37|NC_009697|CRT | 2253871-2253907 | 37 | MN693403 | Marine virus AFVG_25M412, complete genome | 14463-14499 | 11 | 0.703 |
1. spacer 2.4|2230936|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 2.4|2230936|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atttcatcaaatccgcatcaataaatgagataaact CRISPR spacer atttcatcaaatccgcatcaataaatgagataaact Protospacer ************************************
3. spacer 2.4|2230936|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atttcatcaaatccgcatcaataaatgagataaact CRISPR spacer atttcatcaaatccgcatcaataaatgagataaact Protospacer ************************************
4. spacer 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014152 (Clostridium botulinum strain BrDura plasmid pRSJ20_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata CRISPR spacer atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata Protospacer ************************************
5. spacer 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata CRISPR spacer atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata Protospacer ************************************
6. spacer 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013710 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata CRISPR spacer atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata Protospacer ************************************
7. spacer 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata CRISPR spacer atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata Protospacer ************************************
8. spacer 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata CRISPR spacer atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata Protospacer ************************************
9. spacer 2.4|2230936|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
atttcatcaaatccgcatcaataaatgagataaact CRISPR spacer atttcatcaaatccgcatcaataaatgagattaact Protospacer ******************************* ****
10. spacer 4.1|2238310|36|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
atgttgtaaatgttgtggtataacagaatgtaaata CRISPR spacer atgttgtaagtgttgtagtataacagaatgtaaata Protospacer *********.******.*******************
11. spacer 8.1|2253738|36|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
aatagagtattcagatgaatataaattcttggaaga CRISPR spacer aatagagtattcagatgaatataagttcttagaaga Protospacer ************************.*****.*****
12. spacer 2.2|2230805|35|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
cttaaatatataggtatagatcaagacgctaaaga CRISPR spacer ttgaaatatataggcatagatcaagacgctaaaga Protospacer .* ***********.********************
13. spacer 2.2|2230805|35|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
cttaaatatataggtatagatcaagacgctaaaga CRISPR spacer ttgaaatatataggcatagatcaagacgctaaaga Protospacer .* ***********.********************
14. spacer 8.4|2253738|37|NC_009697|CRT matches to GU949551 (Clostridium phage phiCD6356, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
aatagagtattcagatgaatataaattcttggaagaa CRISPR spacer aatagagtattcagatgaatataagttcttagaagat Protospacer ************************.*****.*****
15. spacer 8.8|2253873|35|NC_009697|PILER-CR matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
gaccctataacagtttcagaagtagaacaaaatat CRISPR spacer aaatctataacagtttcagaagtagaaaaaaatat Protospacer .* .*********************** *******
16. spacer 8.3|2253871|36|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.861
cgaccctataacagtttcagaagtagaacaaaatat CRISPR spacer taaatctataacagtttcagaagtagaaaaaaatat Protospacer ..* .*********************** *******
17. spacer 8.6|2253871|37|NC_009697|CRT matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
cgaccctataacagtttcagaagtagaacaaaatatg CRISPR spacer taaatctataacagtttcagaagtagaaaaaaatata Protospacer ..* .*********************** *******.
18. spacer 8.8|2253873|35|NC_009697|PILER-CR matches to MN693403 (Marine virus AFVG_25M412, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
gacccta-taacagtttcagaagtagaacaaaatat CRISPR spacer -acagtactaacagcttcagaagtagcacaaaattt Protospacer ** ** ******.*********** ******* *
19. spacer 9.2|2256251|35|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to MN694042 (Marine virus AFVG_250M538, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tttaatattttttctatatccataggcttaaaatc CRISPR spacer tttaatatttcttctttatccatagtgtttataac Protospacer **********.**** ********* ** * * *
20. spacer 2.3|2230870|36|NC_009697|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT795651 (Vibrio phage vB_VnaS-AQKL99, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tcttaacctttaattacattatatattataagttca CRISPR spacer gcttaacctttaaatacattatacattaccaaccca Protospacer ************ *********.****. *...**
21. spacer 9.2|2256251|35|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttaatattttttctatatccataggcttaaaatc-- CRISPR spacer agtaatattttttctatattcataggc--agcttccg Protospacer *****************.******* *. **
22. spacer 8.3|2253871|36|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to MN693403 (Marine virus AFVG_25M412, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cgaccctataacagtttcagaagtagaacaaaatat CRISPR spacer cacagtactaacagcttcagaagtagcacaaaattt Protospacer *. . ******.*********** ******* *
23. spacer 1.2|1826359|40|NC_009697|CRISPRCasFinder matches to NC_018689 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.725
tatttaaaggatttaaactta---catcatttagatctaagag CRISPR spacer tatttaaaggatttaaacttagttcattacataggttatc--- Protospacer ********************* ***.*. ***.*.
24. spacer 8.6|2253871|37|NC_009697|CRT matches to MN693403 (Marine virus AFVG_25M412, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
cgaccctataacagtttcagaagtagaacaaaatatg CRISPR spacer cacagtactaacagcttcagaagtagcacaaaatttt Protospacer *. . ******.*********** ******* *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
539300 : 548714
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009697|539300:548714|DBSCAN-SWA CATGATTATAAAAAAGAAATTGCTTTTAAAAGGCTTACATTGTGCCAATTGTGCAACAAAAATAGAACGAGCCGTGCAAAAGCTAAATATAATAGAGGAAGCTAACTATAATTTTAATAATTCAACTTTAATTATTAACTTAGAAGAAACTCATAAAGATAGCATTATAAAAACAATACAAGAAATAGTAGATAGAATAGAACCCGGGGTAAAGGTAGTAGATAAAGAAAATTTAAAAAGAACGGTAGTGCATGCCCCTGTTAAAAATAGTAGTAATTTAAAGATGCAGAATAATAAAGAGGAAAATTTAAAATTAGATAAAAAAGAAAATAGTTATGAGCATAATCATGATCATAGTCATGGACACAGTCATGATGGAGAAGATAGTGACGAGTTAGAAAAGAAGACTCTTATAAGAATTATTTCAGGAGTGGTTTTATTAATTTTAGCTACCGTATTGAAATCTAAAGAAACTTTGTCTATAGGTCTATATTTAACTTCATATGTATTAATTGGAGGTAAGGTAATATTAAGTTCTATAAGAAATATATCTAAAGGACAAGTATTTGATGAAAACTTTTTAATGGCTGTTGCAACTGTAGCGGCTATAGGAGTAAAACAGTATCCAGAAGCAGTAGCGGTTATGCTATTTTATGAAGTAGGGGAGTTCTTACAAGATAAAGCTGTTAATAAATCTAGAAAATCTATAACAGCACTTATGAATATAAGACCTGACTATGCCAATTTAGTTAGAGGTGAAGATATAGAAGTAGTTTCTCCAGAAGATATTAATATAGATGATATTATAATGGTAAAACCAGGAGAAAAAATTCCTCTAGATGGTATAGTTGTAGAAGGACAATCTTTTGTAGATACATCAGCTATAACAGGTGAATCTTTAATAAGTGAAGTTTCAAAAGATAGTAATGTATTAAGTGGATATATAAACAAAAATGGTGTTATAAAAATAAAAGTTACAAAAACCTTTGGAGAATCTACAGTGTCCAAAATATTGGAATTAACAGAAAACGCATCAGCTACTAAGGCAAATACAGAAAAATTTATAACAAAGTTCGCCAGATATTATACTCCTGTAGTTGTTTTTGCTGCTTTAGCTTTAGCAGTAATTCCTACACTAATACTAAAAGATCCAGATATATCTAAATGGATTTATAGAGCAGCTGTATTTTTAGTAGTATCTTGTCCATGTGCTTTAGTAATATCAATACCTTTAAGCTTCTTTGCTGGTATTGGAGGGGCATCTAAAAAAGGTGTTTTAATAAAAGCAGGAACAGCATTAGAAGCTCTAAATGATGCAGATACAATAGTATTTGATAAAACAGGAACTTTAACTAAAGGTGTGTTTAAAGTATCAAAAATTGATTCAGAAGAAGGAGTAAATACAGAAGAATTAATAGAATATGCTGCTTATGTAGAAAGTTATTCTAATCACCCTATCGCAAAATCTATACTAAAGTATTATGAAAAAACCATAGATAATAAAAGAATAGAAGGTTATGAAGAAATAGTTGCAAGAGGTGTAACTGCTTATATTGATGGCAAAAAAGTTTATGCTGGTAACAATAAATTAATGGAAGAATTAAATATTAACTATAAAAAAGCTCAAGAGGATGGAGTAATCCTTTATATAGCATTAGAAGATAAGTATATAGGTTATATAGTTATAAACGACGAAATAAAGAAAGATTCAAAAGAAACAATAAAATCATTAAAAGATATAGGTATAAAAAAAGCAGCTATGCTTACAGGAGATAGAAAATCTACAGCTAATAATATAGGGACTTTTCTAGGAATGGATGAAATATACTCAGAACTTTTACCACAGGAAAAGGTAGAAAAGATGCAATCCTTAAAGTCCAAAACATCTAAAGATGGGAAAATTGTTTTTGTAGGGGATGGAGTAAATGATGCTCCAGTATTAGCTATGTCAGATATAGGGGTATCCATGGGAGGCTTAGGATCTGATGCAGCCATAGAAGCATCTGATTTAGTTTTAATGTCTGATGAACCATCAAAATTAGTAGATGCCATAAAAATAGCTAGAAAAACTCATAAAATAGTATGGCAAAATATAATTATAGTTTTAATAATCAAGTTTGCAGTATTAGCTCTAGCTGTAATGGGAAAAAGTACTATGTGGATGGCTGTTTTTGCCGATGTAGGTGTGGCTTTAATAGCAGTAATAAATGCATTAAGAATACTAAAATAAGAATTTACTAAAATAATAACTTTCTAAAGAAGGATAGGAACGAATAATTTTAAAGAAAAATATTTAATTATATTTATATAGTTTTAGTTAAGTAGTTTTAGGTTCAGATGGAGTTTGCTTAGAATAATTATTTTTCTCCATCTGAACATTATTATTTATCAGAGAGTAATAAATATAGAAGATTAATTTTTATGAAAGTATAAAAAATTATCAAATTGTATAAACAAAGTATACTTATGAGAAATTATAAGATGAGTATTAGGTACTTCTATATATTCTTCAATAAATGTTATGTAAAAATAAAAGATTTAATAATTTAATAAAAAAATTAAAAACAAAAGAAAATATTTCTAAAAAATATTGACTTAAAATTTAGGCTGTAATATAATTATATATGTTCAAAGAAAATAAATAATTGAGGCTTCTTGGTCAAGCGGTTAAGACGCCACCCTCTCACGGTGGAATCAGGGGTTCGACTCCCCTAGGAGCTACCAGATTTGAAGAAATGCTGTAAACAGTGATGTTTACAGCATTTCTTATTTAGAAGTGAAAATGGAAAATTAATATTTTCCCACACTAGAAAAATACAAATATAAACTTCCTTTCTAATCAAATTTCCATTGGCATCCCCCAATAATTTAAATAGTTTGTTAAAGGCTAAAGAAAAAGCTTTACCAAAAGGATTTAATGAAGCTAGATTTTTACAAAATTGCATGACAGTATTAAAAGATATTAAAAATATAGAAAAATGTAATGAAGTGAGTGTAGTAAGAACAATGCTTAAAGGAGTATTTCTAGGTTTAGACTTCTTTAATAAGGAATGTTATGCAATACCAGTTTATTTAAATCTTTTTTAGAAGAATATAATGGATGTGAAGCTAGGATGATGGCAGTATTAAATGTATCCATGAAAATATAAAGAGTTAAAAAAGTATGAAAGGTGAATTAGAGTTTATTAGATGTGGTAAATATGATTATTGCAAGATTACTAAAGAATTAAAAGAAATTATACACTATAAAAAATTATAAGAGGGGTAATAAAGTGGCAGGTACAACCTCATATATAGATAAAGAAACAAAAGTAAATATTTAAGAGGATGATGATTTTTTTGTTAAAATTCACAAGTTATTTGATGAATATGCTTTAAGTATTATTGGAAGAAGAGAAGTTCCTCAAAAAGTATATGATGTTCTACCAAGTAATTTATCTGATTGTCCAATCTATAGTGAACTAGAAGAACAGTTAATAAATAAAGAGTTGCTTTTATAAGAAGCATAAAGTCAAATTGAATGTTTAAAAGATATAATAGATTTTTTAAAAAGATAACACTACCGTAGTAGAAATTAATATGGCAAGATAAGTGAAAGCCTGGATAAGTTTATATAGAAGTATACAAGAGCATTGGTTATAGCAAGAGAAGCTTTTTTCAAAAAGACAGGCATGACTGAACATTATTTTCTTAGAGAATGAATTGATAATTGGTGCAAGAGGTAGCTTCATAACATCACCAAAAAAGTTGATCCAAAAATGGGGATGGGGTTATAAAAAGACCAGAAGATTTTTAAAAAGAAGCGTTATGTAATACTATATTTGGATTAAAAGATTTAAAATAGGTAATACTACATTTACATTAAAAGACTTAAAACAAGTGGTATAGGAACTAGTACAAGCGGAAGAAGTTATAGAGAAATTAAAATAAATTACAGGATTTATATCCCTGATGATAAGGAGGAAATATGACACCGATAGAAATAATGGAAAAGATAGGGGCATGTCAACGGGGGCTGACGAAAGGGAATATAGAATTAAAAGCTTTAGGAGTGAAGAAGGCTAGAGCAGAACATGACTATAGGATAGCTCTAAGAAAAGAGATTTTAAGATTAAGACAGTTAGAGAATCAGCCAGCAACAATAATAAATGACTTAGCTAAAGGAAAAGAAGATATTGCAAAATTAAGACTTGAAAGGGATATAGCAGAAACTAATTACAGTGTATATATAGAAAGTATGAGGAATTTAAGATTAGAGATTGAGGCGTATAGAAGTTTTCTCACATGGGAACGTGTAGAACTTAAAAATACGTAATGTTAAAATTATGATGAACTAAAGAGAGGTAAAGAAGACCTCTTCTTTTCTGATGTAAATTATTATTGATTGCTTAACTCTGATTTTATTTAATTTATCTGCTATTGTTTCATGTGCACCAATAAGATGAGGAAGATTTTGTAATTCTAGTGAGTTTAAATTTGACATAAAATCACCTCTTTAATAATTAGTTCAATAATATTATTGGAAAGAGAATTAAAAATTATACAGTGATGTTTAATACTTAAATATAAAGTTGAGTGAGCTCATGGCAAAATTCAAATATTGAACTAAGATAAAAGATAAGCTTGTATTAGCTGAAGAAAGGGCAAGAAATGAAGTAAGTAATGGACAAATAACAAAGAATCTAGGGATAGATAAGGGTATATTTTATAAATATAAAAAGCAAGTATATAGGATTTTTTATATCTTAGAAAGGGGGAAGGAGATAATGATGATAGATTTTGGAATTAAAGATTCATTTTTAAAAAGAACATTAGAATATAAGTATAAGGAAGTAACCAAGGAATTAGTATAAGATCATAGGACTAAATTGTATACATATATAATAACTTTGATCATTATTAAATATGTATAATAAATAATAAATATATCAGTAACATAATGTTGTTTGTGAACATATTATATTAAGTAATATAGATTAGAAATATTTTGGAGGGTAACT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009697|539300:548714|544299_545109_+|WP_011948236.1|DBSCAN-SWA MKISNIKEITLFEHHFWLQILGDHSRFILNSLSPKEKSFIEEANRFKNLFDNLLKKSKQSLSEEELFALNNHAYNAAMKIREFKLDIIDRQITDKIVISLPPTFINHMVNEVDEYIFILTKLMKGNVSNIGPIHLHLLWLPDGAGHASNIASSLDITEKELIKKSNQYSKKFNNLYLRTIEYNGYTRTGICDFPALDSLNNNADETMSCFKEFLNELKKGVIEKKILGTIVPLVPDHMFREECYYLTKLSMVSNIKKPECDPTKSRVES >NC_009697|539300:548714|543632_543782_-|WP_011948235.1|DBSCAN-SWA MSNLNSLELQNLPHLIGAHETIADKLNKIRVKQSIIIYIRKEEVFFTSL >NC_009697|539300:548714|542176_542386_+|WP_011986136.1|DBSCAN-SWA MLKAKEKALPKGFNEARFLQNCMTVLKDIKNIEKCNEVSVVRTMLKGVFLGLDFFNKECYAIPVYLNLF >NC_009697|539300:548714|539300_541529_+|WP_011948233.1|DBSCAN-SWA MIIKKKLLLKGLHCANCATKIERAVQKLNIIEEANYNFNNSTLIINLEETHKDSIIKTIQEIVDRIEPGVKVVDKENLKRTVVHAPVKNSSNLKMQNNKEENLKLDKKENSYEHNHDHSHGHSHDGEDSDELEKKTLIRIISGVVLLILATVLKSKETLSIGLYLTSYVLIGGKVILSSIRNISKGQVFDENFLMAVATVAAIGVKQYPEAVAVMLFYEVGEFLQDKAVNKSRKSITALMNIRPDYANLVRGEDIEVVSPEDINIDDIIMVKPGEKIPLDGIVVEGQSFVDTSAITGESLISEVSKDSNVLSGYINKNGVIKIKVTKTFGESTVSKILELTENASATKANTEKFITKFARYYTPVVVFAALALAVIPTLILKDPDISKWIYRAAVFLVVSCPCALVISIPLSFFAGIGGASKKGVLIKAGTALEALNDADTIVFDKTGTLTKGVFKVSKIDSEEGVNTEELIEYAAYVESYSNHPIAKSILKYYEKTIDNKRIEGYEEIVARGVTAYIDGKKVYAGNNKLMEELNINYKKAQEDGVILYIALEDKYIGYIVINDEIKKDSKETIKSLKDIGIKKAAMLTGDRKSTANNIGTFLGMDEIYSELLPQEKVEKMQSLKSKTSKDGKIVFVGDGVNDAPVLAMSDIGVSMGGLGSDAAIEASDLVLMSDEPSKLVDAIKIARKTHKIVWQNIIIVLIIKFAVLALAVMGKSTMWMAVFADVGVALIAVINALRILK >NC_009697|539300:548714|547709_548714_+|WP_011948238.1|DBSCAN-SWA MENKEKKSKNKKFSFKIFLYFIIFELFFTAATAPFIIFHGPFKNVKKTMVGAAMTTLKHQYIAKTFLSDAKIKEILGEDSIQTIKQDKNSVLKFENKHDSTIERYDISYGKKFKGYMLVVHDPSRVKVGYSSKLPVQGELTSQIARNKRAVAAINAGGFTDKSANSKWTGTGGNVEGVIISKGEVKYNSNKQGEFTGDVAAITKKGALVVGKHSIQELKDLNVQEAITFGPALVVKGQGTITSGDGGWGMAPRTAIGQREDGAILMLVIDGRQASSLGATLKDVQDIMLQYDAYTATNLDGGSSTTMYHEGEVINNPANSLGERSVPSILYVEP >NC_009697|539300:548714|546065_547442_+|WP_011948237.1|DBSCAN-SWA MKLTYVLDTNVILYSPGAIFSFADNDVVIPEVVLEELDSFKKNNYDLGANARHAARIIDKLRKDGSLIDGIVLPGGGTLRVEMNHYDVKLPPSWDKNKPDNRIIQVCKGLKEKGEEVVLITKDTFERIKADTINIDVEDFYEKVVPEYESQYKGRCDAFASHSTLESFYKNKYMDVESLFFYSEEKNDYYKADININEFILIKSMENPKQTALGRYNGEKVVPLFYKDVKPLGISPRNIGQKFMLEAFLTDSKNAPLVIVKGPAGTAKTLFSLATGLHKVMEEGEDGYRKILICRPNVTMDEDIGFLPGTEEEKIMPFMRPIFDNLEILVDSDEKERYKNEKELYDKIKELFDRRIITTEAVAYLRGRSIVKNWVIIDEAQNLTPKQVKAVITRVGQGTKLILVGDPDQIDQPFLDSRSNGLCYASEKMKGSKLCYQVTLKDHECERSPLAYEGAKRL >NC_009697|539300:548714|543266_543614_+|WP_003356906.1|DBSCAN-SWA MTPIEIMEKIGACQRGLTKGNIELKALGVKKARAEHDYRIALRKEILRLRQLENQPATIINDLAKGKEDIAKLRLERDIAETNYSVYIESMRNLRLEIEAYRSFLTWERVELKNT |
7 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
874207 : 885926
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009697|874207:885926|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009697|874207:885926|874207_876088_-|WP_011948507.1|DBSCAN-SWA MNSSIKKIYNDIQEKVINYSDTIDLADGNYVVRRGDGWILSRQNQILGGSVISNGSTGIVGDLRVNDNAIPYYYPTPSFNEEYIKNNIQTVFTNFTEANQIPIGFEFSKTAPSNKNLYMYLQYTYIRYEIIKVLQHEIIERAVLYVPSLGYVKSIEFNPGEKINKDFYFLTNDKCILNEQFLYKKILETTKNIPTNNIFNSKVSSTQRVLPYSNGLYVINKGDGYIRTNDKDLIGTLLIEAGSSGSIIQPRLRNTTRPLFTTSNDTKFSQQYTEERLKDAFNVQLFNTSTSLFKFVEEAPSDKNICIKAYNTYEKYELIDYQNGSIVNKAEYYLPSLGYCEVTNAPSPESEVVKMQVAEDGFIQNGPEEEIVVGVIDPSENIQEINTAISDNYTYNIPGIVNNNPFYILFTVNTTGIYKINAQNNLPSLKIYEAIGSGNRNFQSGNLCDDDIKAINYITGFDSPNAKSYLVVLLNKDKNYYIRVPQTSSNIENQIQFKREEGDLRNLMNSSVNIIDNLNSTGAHYYTRQSPDVHDYISYEFTIPGNFNNKDTSNIRLYTSYNQGIGTLFRVTETIDGYNLINIQQNLHLLNNTNSIRLLNGAIYILKVEVTELNNYNIRLHIDITN >NC_009697|874207:885926|877712_878249_+|WP_011948509.1|DBSCAN-SWA MNKLFLQIKMLKNDNREFQEIFKHFEKTINIFTRKYNIYDNYNDILYHLWYTLKKVDLSNFNTQNDLERYISRTLKRYCLDICNKRKIDKKIIYNSEIVDKKLSLIANSYSSYLEFEFNDLISILPDDQKKIIYMKFVEDIKEIDIAKKLNISRQSVYKNKIMALERLEPILKKLINM >NC_009697|874207:885926|876604_877486_-|WP_011948508.1|DBSCAN-SWA MEHYSVIQNSLNDKIVTISCKADTNLFFYQVAGNVSLFQQTRNYLERWRLIYDSNKAAYKIKSMDIHNTNLVLTWNAPTHNISTQQDSNADNQYWLLLKDIGNNSFIIASYKNPNLVLYADTVARNLKLSTLNNSNYIKFIIEDYIISDLNNFTCKISPILDLNKVVQQVDVTNLNVNLYTWDYGRNQKWTIRYNEEKAAYQFFNTILSNGVLTWIFSNGNTVRVSSSNDQNNDAQYWLINPVSDTDETYTITNLRDTTKALDLYGGQTANGTAIQVFNYHGDDNQKWNIRNP >NC_009697|874207:885926|878410_881992_+|WP_011948510.1|DBSCAN-SWA MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGGGYYAPNMITFGSAPKSNKKLNSLISSTIPFPYAGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRAYEYHFNNSNDSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFK >NC_009697|874207:885926|876101_876542_-|WP_003356711.1|DBSCAN-SWA MSVERTFLPNGNYNIKSIFSGSLYLNPVSKSLTFSNESSANNQKWNVEYMAENRCFKISNVAEPNKYLSYDNFGFISLDSLSNRCYWFPIKIAVNTYIMLSLNKVNELDYAWDIYDTNENILSQPLLLLPNFDIYNSNQMFKLEKI >NC_009697|874207:885926|882035_885926_+|WP_011948511.1|DBSCAN-SWA MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGIITSKTKSLDKGYNKALNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL |
6 | Clostridium_botulinum_D_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1654792 : 1661858
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009697|1654792:1661858|DBSCAN-SWA ACTATGTCATATTTGAATATATATCATTAATTTTTTTACATTTATCCTTTATAATTTCTCTAATATGATTGGGTTCAAGTACTTCCACACATTCTCCGTAACTTAATATCATGGAATATATCCAGTCATCTTCTAATAAATATGTATCTACAATTACACTACCATCTTCTTGAAACTTTATTTCATCTTTATCAAAACAATCGTCTATTCTATATCTAACTCTTTCAGAAAACTTTAATACAACTCTTGTAGGTACTTGTTCACTCTCACTAATATTTATATATTCTTTATAGGAAATTCTATTTTCATTAATTTTTTCATGTGGAACAGTTAAATTTTCCATTCTTGATAATTTGAAAAGTCGGTAATCATTTTTTAATTTGCAAAAGGAAAATAAATACCATGAGAAACCTTTAAAAACAAGAGTTAATGGCTCTATCTCCCTCCAATTATATTCACCTTTTGAGTTTCTATAATCAAAGGCTATACAGTTTTTGTTATCTACAGCATCATATATAATTTTGTATTTTAAGTTTTCTTCTTCACATTTTTTAAAGCCCCAAGGTAATGTATCTATACACATTTGCTCAAAATGCAAATCAAATACTTCTTTTTTTTCTTTAGGAACAATATTTTTTACCTTTTCAATGGCCATTTCAACATTTTTATTATCTAAAAATTTATTCATATTTTTTAGAGCTTCTATAATTGAAATCATATCTTCTAATGTTAAAAGTTGATGATTGATTTTATAGTTATCTATAATATAAAATCCTCCATTATTTCCAATTTGAGAAACTATAGGAATTCCAGCAAGATTAATTGCTTCAATATCTCTATAAATTGTTCTTACAGAAACCTCAAATTTTTCAGCTAATTCTGATGCAGATATTTTTTCTCTATTTAAAAGCATTACAACAATTGCCAATAATCTATTAATTTTCATGAATCTATAAACCCCCCATAATTTGAAATGACTATTTTATTATATCAAATTAATAACTTGTAAGATTGGTTAGAGAGAAATTGTTGAGGGAATTGCATAAGAAAGTTTTAAAAGAATAAATTCTAATATGGTAATTTTTGGGTTATCCATGGGTATGAACTTGACTTAACAAATGTACTATAGTAAACTTATATCGTAAAAAAGAATAAAGACAGTTCGTAACCATCCTGTCTATAAATAAAACTAGGACGTAGCTACCGCCTTAGGTAGTTTTTTTGTTGATGGGCATTTAATGCCCTTTTTTATTTGCAAAAAATTTACAAATAGGATTTTTGTTTTAGGTGAAATTTTTAATTTATATAAAGTTTAGAAATTGTTATTTAAGGACGCAGAGGTCTTATCCAATGAATTTTTTAACTTAAATATAACAGTAACAGTATAAGGCTGTTTTTTATAAAGATTGTCCAAATATAACTTAAAAACCTTACAAGGTAGGAAACTTTAAATAGTTGTAAAATATCCTAATAAATAATAATTTATCATAACCATTATAACTGTTTAATGTTTTCAAGTCTAAGTGAGTGTAATAGATTGAAAAATCTATAGCACAAGGAGGAATGAAAATGAAAAAAATAGGACTAACAACTACAGTGCCAGTGGAAGTTATTGTTGCAGCAGGATATACACCAGTAGATTTAAATAATATGTTTATAACTTCAGAGAATTATTTAAAATATATAGACATAGCTGAAAGAGACGGTTTCCCTAAAAGCTTATGTGCTTGGATAAAGGGAATTTATGGAGCATGTCTAGAAAATAATATTAAAGAAATAGTTGGAGTTATGGAGGGGGATTGTTCTAACACTAAAGCCCTCATCGAGGTTTTTAAACTAAGAGGAATAAAAATTTATCCATTTTCATTTCCACATAGCCATAGTTTAAAGGATGTAGAAATTGAAATAAGAAAGTTCATGGATATCTTCAATGTTAACGAGGATAAGGTAGAACAGGTTAGAAAAAGATTAAATAGAGTTAGGAAGCTAGCAAAAAAAATAGATGAAATGACTTATATAGATAATAAGGTTAATGGTTTTGAAAACCACCTATATCAGGTGAGCTTAAGTGACTTTAATGGAAACATAGATGAATTTGAAGAACACCTTAAAAAAGTCATTGAGGGTATGGAGAAAAGAGAGCCAATAAATAAAAAATTAAGATTAGGCTATATAGGAGTTCCTCCAATGACTGGAGATATATATGAGTTTAGTGAAAAATTAAATGCTCATTTTGTATATAACGAAGTTCAAAGAGAATTTGCTTTTCCTAGGGGGATAGAAGCTGCAAATATATTTGAACAGTATTATAATTACACCTATCCTTATGATAATGAGTTTAGAATTAAGGAATTGAAAAAGCAAATAGAAAAGAGAAAAATAGATGCTATAATTCACTACACTCAGGCTTTTTGCCATAGAGCTGTTGAAGATATAGTATTAAAAGAAGAATTAAATATTCCTATGTTAAATATTGAAGGTGATAAGTTAAATACATTAGATGCAAGAACTAAACTAAGATTAGAAGCCTTTCTGGATATGTTGCTGGACTTAAAGCAGAAGTAATAGGTGATCTAGTAAGAATTTTTATCTTAATATATTGTTGGATTTAAAGCAAAAGTAATAGACGGTATATAAAAGAAGTTCATGTTTTCTTTATATTTAGCGAAGGAGGGGAATTAATGAGATTGTTAGGAATAGACCTTGGAAGTAGAGAAGTTAAGATTGTTTTAATGGAAAACAATATTATAGTTCAAAAGAAAAAAGTAAGTACCATGAAATTTTATAGAGATTACTGTAGCTTTCATGGCAAGATTGTAGTAGATTTAGAAAAACTTAATATAGAAGGAATAGATAAAGCGATATCAACGGGTTATGGAAAAAATAATACGGATTTAGAATTTTTTACACCTATAAATGAGATAAAAGCCCATGTTTATGGTGGGATCTATCAAAGTAATTTAAAGGATTTTATACTTTTAGATGTAGGTGGTCAGGACGTTAAGGTGGTAAAGGTAGAAAAGGGTGTTGCAACAGATTTGGAGCTTAATGAAAAATGTGCTGCTTCCTGTGGAAGATACTTGGAGAATATGGCAAATGTACTTGAAATATCCCTAGATGAAATGAGCCAGTACTCGGAAAATCCCGTGGATTTAAATTCCACCTGTGCAGTATTTTCTGAATCAGAATTAATTGGAAAAATAGCCGAAGGGGTACACATAGAAAGGTTATGTGCTGGGGTTAATTACTCTTTGTATAAAAGGCTACAACCTCTTTTAAGTAAGTTTAGGGGGAAGAAATTAGTTATAACCGGTGGTGTTGCAAATAACCATTCAATAAAAAAATATTTAAATAATGATTATGAAGAAATAGTATCCGTAAAAGATCCTCAGTTTAATGGGGCTATTGGATGTTGTTATTACGGAAGCAAATTTTTAAAATAAACTTAGGAGGAAAAAACATGTATACTTTAAAAGTAGAACATAATTTTGATAGTGCTCATTTTCTTGCAGGTTATGAAGGTAAATGTGGAAATATTCATGGACACAGATGGAAGGTTGAAATTCAGGTTCAGGCAGAATCATTAGTACAAGGTGGTCAACTTGACGGGATGATAATAGACTTTGGAGACTTAAAAAAAGATGTTAAATCTATGGTAGATTATTATGATCATGCACTTATAATAGAGAAGGGAACTATGAGGGGGCAATCATTAAGCTCATTAAAGGAGGATGGATTTCGTATAATAGAAGTTAATTTTAGACCAACAGCGGAAAATTTTGCAGCTTTTTTCTATAAAATTATGAAGGATAGAGGATATAATGTAAAAAGTACTACAGTTTATGAAACACCTAATAATAGTGCTACCTATGAAGAAAGTGGGGTAATTTAAAATGGATTTTAAGGTGGTTGAAAGGTTTGTAAGCATAAATGGAGAAGGAAGGCGTTGTGGACAACTGGCTATATTCATAAGATTCGCGGGTTGTAATTTAAACTGTAGCTATTGTGATACACTTTGGGCAAATGAAAAGGATGTACCCTATGAAGTATTAAGTTCCAAAGATATATATGAATATATTAAGTCCAAAGAGGTTAAAAATGTAACTTTAACAGGAGGAGAACCTCTTCTACAAAAGGGAATAATGGAGTTATTAAAACTTTTGTCTAAGGATAAAGAGCTTTATGTGGAAATTGAGACAAATGGCAGCATATTATTAGATGAATTTTTGAATATAGAAAATTCACCAAGTTTTACTATGGATTATAAACTTCCTTTAAGTAATATGGAAAATAAAATGGCATTAGATAACTTTAAATATTTAACTAAGAAGGATACAGTAAAATTTGTATCAGGTAGTATAGAGGATTTAGAAAAAGCTAGAGAAATAATAAATAAGTATAACTTAGTAGATAAAACTAATGTATATATAAGTCCTGTTTTTGGAAAAATTAATTTAGATACTATTGTAGAATTTATGAAAAATAATAGAATGAATGGAGTTAATTTACAACTGCAGCTTCACAAGATTATATGGGAGCCTAGTAAGAGAGGAGTATAGCATATGGCAATTGATGTTAAAGCAATTGAAGAACACATAAGGGGAATTTTGATAGCTTTAGGAGACAACCCAGAAAGAGAAGGTCTAAAGAACACACCAAAACGTGTAGCTAAAATGTATGAAGAAGTATTCAAAGGTATGTGTTATAGCAATGATGAAATTGCAGAAATGTTTAATGTAACCTTTGAAGATGATTTATGTATAAATGATAATGAAAATGACATGGTTTTTATGAAGGAAATAGAAATATTTAGTCATTGTGAACATCATTTAGCACTTATGTACAATATGAAAGTAGCCATAGCATATATACCTAAGAAAAAAATTATTGGTTTAAGCAAAATAGCACGAATAGCAGATATGGTAGGACGTAGACTACAGCTTCAAGAGAGGATTGGAAGTGATATAGCAGAAATACTTCAGAAGATAACTGACTCAGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009697|1654792:1661858|1656360_1657356_+|WP_011949099.1|DBSCAN-SWA MKKIGLTTTVPVEVIVAAGYTPVDLNNMFITSENYLKYIDIAERDGFPKSLCAWIKGIYGACLENNIKEIVGVMEGDCSNTKALIEVFKLRGIKIYPFSFPHSHSLKDVEIEIRKFMDIFNVNEDKVEQVRKRLNRVRKLAKKIDEMTYIDNKVNGFENHLYQVSLSDFNGNIDEFEEHLKKVIEGMEKREPINKKLRLGYIGVPPMTGDIYEFSEKLNAHFVYNEVQREFAFPRGIEAANIFEQYYNYTYPYDNEFRIKELKKQIEKRKIDAIIHYTQAFCHRAVEDIVLKEELNIPMLNIEGDKLNTLDARTKLRLEAFLDMLLDLKQK >NC_009697|1654792:1661858|1658251_1658683_+|WP_011949100.1|DBSCAN-SWA MYTLKVEHNFDSAHFLAGYEGKCGNIHGHRWKVEIQVQAESLVQGGQLDGMIIDFGDLKKDVKSMVDYYDHALIIEKGTMRGQSLSSLKEDGFRIIEVNFRPTAENFAAFFYKIMKDRGYNVKSTTVYETPNNSATYEESGVI >NC_009697|1654792:1661858|1658684_1659350_+|WP_011949101.1|DBSCAN-SWA MDFKVVERFVSINGEGRRCGQLAIFIRFAGCNLNCSYCDTLWANEKDVPYEVLSSKDIYEYIKSKEVKNVTLTGGEPLLQKGIMELLKLLSKDKELYVEIETNGSILLDEFLNIENSPSFTMDYKLPLSNMENKMALDNFKYLTKKDTVKFVSGSIEDLEKAREIINKYNLVDKTNVYISPVFGKINLDTIVEFMKNNRMNGVNLQLQLHKIIWEPSKRGV >NC_009697|1654792:1661858|1657472_1658234_+|WP_003358645.1|DBSCAN-SWA MRLLGIDLGSREVKIVLMENNIIVQKKKVSTMKFYRDYCSFHGKIVVDLEKLNIEGIDKAISTGYGKNNTDLEFFTPINEIKAHVYGGIYQSNLKDFILLDVGGQDVKVVKVEKGVATDLELNEKCAASCGRYLENMANVLEISLDEMSQYSENPVDLNSTCAVFSESELIGKIAEGVHIERLCAGVNYSLYKRLQPLLSKFRGKKLVITGGVANNHSIKKYLNNDYEEIVSVKDPQFNGAIGCCYYGSKFLK >NC_009697|1654792:1661858|1660901_1661858_+|WP_011986260.1|DBSCAN-SWA MINIFSKKDSEKDNKNDTIEQEVIVEEKHEVETIDTMKFLKEMTIQIEGIIQQHNKVNGEHEVLEKLAKQIENHMVTVSNLTERTNESTDKLFSQGESLLEITKDTVNKSLEGKKSIEGMVKVIENLDIETKDTYENINALGEKLKEIGEIAQLISGIASKTNLLALNAAIEAARAGEQGKGFAVVADEVRKLAEMTGESSSNITNLISGIDSQTENVLNSVEKSTLVVTEGVKSSKGALEKIEEVLDSFNRVEDDTDSLIKTINTQKEDISKIFNGINGVDKILTETNEQIIKHIDEAHKVDEKLEKSVYHIAQYVK >NC_009697|1654792:1661858|1659353_1659944_+|WP_004451708.1|DBSCAN-SWA MAIDVKAIEEHIRGILIALGDNPEREGLKNTPKRVAKMYEEVFKGMCYSNDEIAEMFNVTFEDDLCINDNENDMVFMKEIEIFSHCEHHLALMYNMKVAIAYIPKKKIIGLSKIARIADMVGRRLQLQERIGSDIAEILQKITDSEDVAVIIEGEHGCMTTRGIKKPGTKTITTTLRGKFNTDPIVSNKLMMLYTK >NC_009697|1654792:1661858|1660127_1660787_+|WP_011949102.1|DBSCAN-SWA MNKEKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKKYKEVIAVSFDYNQKHKLELDCAKDICKKYNIEHHILDLNLLNQLAPNSLTRQDITVDKSAPKEGVPNSFVDGRNLLFLSFVAVFAKQKGINTIITGVSQSDFSGYPDCRDVFIKSLNVTLNLAMDYEFEIITPLMWINKAETWKMAYDLGVLDIVKEETLTCYNGIKADGCGECPACKLRKKGYWEFEKEYLK >NC_009697|1654792:1661858|1654792_1655737_-|WP_011949098.1|DBSCAN-SWA MKINRLLAIVVMLLNREKISASELAEKFEVSVRTIYRDIEAINLAGIPIVSQIGNNGGFYIIDNYKINHQLLTLEDMISIIEALKNMNKFLDNKNVEMAIEKVKNIVPKEKKEVFDLHFEQMCIDTLPWGFKKCEEENLKYKIIYDAVDNKNCIAFDYRNSKGEYNWREIEPLTLVFKGFSWYLFSFCKLKNDYRLFKLSRMENLTVPHEKINENRISYKEYINISESEQVPTRVVLKFSERVRYRIDDCFDKDEIKFQEDGSVIVDTYLLEDDWIYSMILSYGECVEVLEPNHIREIIKDKCKKINDIYSNMT |
8 | uncultured_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2557333 : 2615948
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009697|2557333:2615948|DBSCAN-SWA 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>NC_009697|2557333:2615948|2613308_2615948_-|WP_011986885.1|tRNA|DBSCAN-SWA MERMGLNEIREEYLKFFESKAHLRLPSFSLVPKNDKSLLLINAGMAPLKPYFTGLQVPPNKRVTTCQKCVRTGDIENVGKTSRHGTFFEMMGNFSFGDYFKEEVIPWAWEFTTEVLKLPKNKLYVTIYEDDDEALDIWVNKTDMDPKRIFRLGKEDNFWEHGLGPCGPCSEIHFDRGAGEVKTSEEFVKASDEDKIVEFWNLVFTQFDKDEEGNYNKLANPNIDTGMGLERMATIMQNVDTIFEVDTIKAVLDKVCKLSGANYKEDRVKDISIRIITDHIRSITFMISDGILPSNEGRGYVLRRLLRRAARHGKTLGINNTFLHNLTDIVIENCYKNYPELEEKREYIKKIIKLEEERFDETIDAGMQILNDYIKEVKNNNYKILSGDKAFKLYDTYGFPVELTEEILEEEGISIDKEGFNKEMKEQRERARSAREETNYMGAEDTILNKIDLNINTDFEGYDKLEVKSKVAVIIKDEEFKNEMEKGNEGVIVTYNTPFYAEMGGQIGDTGIIYNDNFKAEVIDCKKNISGKILHFVKILDGKVALEDQVILKVNEERRNNIRKNHTATHILHAALIKVVGDHVQQSGSYVDDERLRFDFSHFEAVSEDELKEVEKIVNKEIMKANAVNTKVMNIEEAKQQGAIALFDNKYKDDVRVVSVGDFSKELCGGTHVSNSGQIGIFKIVSEAGVAAGIRRIEAVTAFKAMEYVDHKNNILKEAAQILKCNEKELLNKLNHQVLEMKEKEKEIEALKLKLASGAEDEILDNIKEIKGVKVASAAVKDIDGNALRDLGDKIRDNMQSGVVVLGSNYKGKVLFVAMATKDTVAKGVHCGKIIKEVATIAGGGGGGRPDMAQAGGKDPNKLEDAIKTVETVVESLVK |
74 | Clostridium_phage(39.47%) | tail,capsid,protease,portal,head,terminase,tRNA,integrase | attL 2560421:2560437|attR 2583740:2583756 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2989682 : 2999151
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009697|2989682:2999151|DBSCAN-SWA TCTAGTGTTTAAAATGTCTTATTCCTGTAAATACCATAGAAATCCCTTTTTCATTACATACCTTTATAGATTCTTCATCTCTTATAGAACCGCCTGGTTGAATTATAGCTTTTATTCCCCATTTTGCAGCTTCTTCTGCTACATCTCCAAATGGGAAAAAAGCATCTGAAGCTAAAACTACGCCATCTCCAGCTCTATCTAACGCTTCCTTTGCTGCCCATATTCTATTTACTTGGCCTCCCCCAATACCTTTTGCCATACCATCTTTAACTACTACAATAGCGTTGGATTTCACATATTTAACTACTTTCATACCAAATATAAGATCTTTCATTTCTTGCTCTGTTGGAGATTTTTCTGTAACTACTTTTGTATCTTCTAATAATTTATTATCACTCTTTTGTACTAATATTCCTCCATCTACCTTTGCCATATCTTTTCCTTCTGTAGATTTTTCTTCACATTTTATAACCCTTAAATTTTTCTTGTTTTTTAAGACTTCTAAAGCATCTTCATCAAAATCTGGTGCTACAACTATTTCTAAAAATATTTTTGCAAGATTTTCTGCTGTTTCCTTATCTACTTTTCTATTAAAAGCAACTATGCCACCAAATATAGATATAGGATCACATTCATAGGCCTTAGTATAAGCTTCCTGTACAGTATCCCCTATAGCCACACCACAAGGTGTATTATGTTTTAATGCACAACAAGCCACCTCTTCAAATTCACAAACGGTTTTCCACGCTATATCCATATCCTTTATATTATTGTAGGATAATTCTTTTCCATTTAACTTTTCAAAATTTTTCATAGGATATTTTCCAACAGTAGATGTGTAATAAGCTGCTGTTTGATGAGGATTTTCTCCATATCTTAAATCCATGTTCTTTTTATAGGATAGAGTTAAATATTCTGGATATTCCTCTTCTAATAAGAAATTACTTATAGCTGCATCATAGGCTGACATTAGATTGAAAACTTTTCCTGCTAATTTTTTTCTAGTTTGTATATTAACCTGATTATTTTCTTTTATCTCATTTATGACATTTTCATAATCCTTAGTATCTGTTAGTACTACTACATCTTTAAAATTTTTAGCTGCTGCTCTTATCATAGTAGGTCCACCAATGTCTATAAACTCTACTTTTTCATCAAAACTTAAATTTTCTTCTACTTTATTAAAGAAAGGATATAAATTCACTACTACCATATCTATAGGGTTTATGCCCTTTTCTTCTATTACCTTCATATGCTCTTCATTATCTCTTATAGCTAATATGCCTCCATGAATTAAAGGATTTAATGTTTTTACTCTTCCATCTAACATTTCTGGGAAACCTGTTACCTCTTCTATATCTATTACTTTTACTCCATTTTCTTTTAAATGTTTATAAGTTCCACCTGTAGATATTATTTCTACATCTCTACTTTCTAAAAACTTTGCCAAATCTAAAATTCCTGTTTTATCAAATACACTTATTAATGCTCTTTTTATCACTTAAACTCCCCCAGTTTCAATATTTTTTATTATCTTATTTATCTGTCATAAGTAACTGCCACCAATATACCTTCTTTCAAAGAAAACATATAAGTGGCACTATTTCAATTTACAAACTACAATTTTTTATATTTCAATAAATTTAATCTACTCTAAACACATTTTTCTATTAGTTTCATTTATATTAATAGTAATTTTTTCATTATTATAAATTTAGTATGTTTTAATAAAAACTTTTCTTCCTTGTAATTTTACTTTTTCTTCACTTATAAGTTTTATAGCTTCTGGTAATGCCTCATGTTCTTTTTCTAGAACTCTTTTTTGCAATATTTCTGCTGTATCTTCTGCAAAAACTGGTACAGATTTTTGTATTATTATAGGTCCACTGTCCGTACTCTCATCTACAAAATGAACAGTGCACCCAGATACTTTTACTCCGTATTCTAATGCTTTTTGGTGCACTTTTATACCATACATTCCATCTCCGCAAAAGCTTGGTATTAATGAAGGATGTATGTTTATTATCTTATTTTCAAATTTATTTACCAAATCCCCATTTAATATAGAAAGCCATCCTGCTAAAACTATTAAATCTACGTTTCCATATAAACACTCACATATTTTATTAGACAGATTGCTTTTATATATTTTTCTATCTAGAGTTAAAGTTTTAATTCCCTTTTTTTCTGCTCTTTCTATACCATAAATATTAGATCTATCCCCTATAACCATTTCTATCTTGCAATTTTTTATATATCCCTCTTCTATTTTATCTATTATAGATTGAAGATTGCTTCCTCCCCCTGAAACAAGTACTGCAATTTTAAACATCTTATTCTCCTTTAATTTAAAGAAAATTTTTCATATATACTCTATAAATAATTAATTCCCCAATCAATTATTTTAAAGATCTAACCTATGAACTAATTTTTATTATAAATTTATTTAATGCCTTTTTTTAAATTAGTTCAACAGACTTATCTCCTTTTTTAACATATCCTATTTTATAACCCTTTTCTCCCATTTCTATCAGGTCTTTTATTATATTTTCCCCATCTTTTTCATTTACACATAATACAAAACCAATCCCCATATTAAAAGTATTGTACATATGATCTTCTTCTATCCCTAAACTTATTAGATGGCTAAATATATTTGGTAATGGATAAGATTTTTTATTTATAACTGCTGTAAAATCCTCTTTAAACATTCTAGGAATATTTTCATAAAAACCTCCTCCAGTTACATGAGCCATACCTTTTATATTATATTTTTCTAAAAGTTTCATTACAGGTTTTACATATATTTTTGTAGGAGTTAAAAGAGTATTTCCTATTTTATTTCCTTCAAAATCTTTATGCAAATCTTCTACTAATTTTCTAATAAGAGAATATCCGTTGCTATGAGGTCCTGAAGATGCTATACCTATTAATATATCCCCATCTTCTATTTTACTTCCATCTATTATTTCATCTTTTTCTGCTATACCTACAGCAAAACCAGCTATATCATATTCCCCATCTCTATAAAAGCCTGGCATTTCTGCTGTTTCTCCACCTATTAGAGCACATTCACTTTGGATACAACCATTGCTAACCCCTTCTACAAGCTGAGCTGCAACTTCTGCTTCCAATTTCCCACAAGCTATATAATCTAAGAAAAATAACGGCTTAGCACCATGACATAATATATCATTTATGCACATAGCTACGCAGTCTATTCCCACTGTATTATATTTTTTCATTCTAAAGGCTATATCTAATTTAGTTCCAACTCCGTCAGTTCCTGATACTAATACGGGATTTTTATATTTAGGAAGTTCAAACATTCCTGCAAAACTTCCTAAATTATTTAATACTCCCTTTGTAAATGTCTTTGAAGCATGTTTTTTTATAAGATCTACTGATTTATAACCTTCCTCTATATTAACCCCAGCTTCTTTATAAGATACCATGAATAACATTCCCTTCTTTACATTATTAGTTATTCTCAAAATTTAAAAAACTTAAATTCCCTATTCCAAACTATCTTTAGGCATTTCTATAGGTGCAGATATAGGATATACGCCATTAAAACATCCCAAGCAAAAACCTTTATCTTTATTAAGTGTTTCTACTAAGCCTTCCATACTTATATAAGCTAGACTATCTGCTCCTATTTTTTCTCTTATTTCTTCTACTTCTGAGTGAGCACCTATTAAATCTTTTCTATAAGGAGTATCTATTCCAAAATAGCAAGGATATTTAACCACTGGAGATGATACTCTAAAATGAACTTCCTTAGCTCCAGCTTTTCTTAATATTTGTACTAATCTTTTACTAGTAGTTCCTCTTACTATGGAATCATCTATTATTACTACTCTTTTTCCTTCTACATTTATTTTAAGTGGATTTAGTTTTACAGATACAGCTTTTTCTCTTAATTCTTGAGAAGGTGCTATAAAAGTTCTTCCCACATATTTATTTTTTATAAATCCTATACCATAAGGTATTCCTGAAGCTTCAGCATATCCTACCGCAGCTGGTATACCTGAGTCTGGGACTCCTATAACTATATCTGCCTCTACTGGGTATTCTTCATAAAGTTTTCTTCCCGCTCTAATCCTTGATTCATAAACATTTATACCATCCATAGTACTATCTGGTCTTGCAAAATATATATATTCAAAAGCACAGGTATGACATCTTGTTTTTTCTGTAAACTTAATTGAATTTATTCCACTTTCGTCTATAATAACTATTTCTCCAGGCTCTATATCCCTTATAAACTCTCCACCTACGCAATCAAAAGCACAACTTTCCGAGCTTAATAAATAATCATCCCCAATTTTTCCTAGGCACATAGGCCTTATACCATGAGGATCACGTGCTCCTATTAACTTATCTTCTGTAAGTATAACGATAGCATAGGAACCTTTAATTGCTTGTATTGCATCTACTACTGCTTTATCTATACCTTTTTTAGCGCTTCTTGCTATTAAGTTTAATAATACCTCTGTGTCTATAGAAGTTTGAAAAATACATCCGCCATCTTCTAAAAGTTCTCTTATAACTGCTGCATTAACTAAATTACCATTATGAGCTATAGCAATAGAACCTAACTTATAAGTACCTACTATAGGTTGTGCATTATCTGATTTACTCGCTCCTGTAGTTGAATATCTAACATGTCCTATAGCAGAATTTCCTATTAATCCTTCTATAGTTTCTTTGCTAAAAACATCCGATACAAGACCCATACCCTTATGATATTTAAATTTTTCTCCATCAGATACTACTATTCCTGCACTTTCTTGTCCCCTATGTTGAAGAGCATATAATCCGTAATAAGTTATTTCTGCTGACTTTGATTCATTATCTTTAGAAAATACTCCAAATACCCCACATTCTTCTTTAAACTTATCTCCTTCTAAATCAAAGGGCATATTTTCATTTAAATCATCTAACATATAGCACATACTCATTTTTACTCCCCACTTATTTTCTATTTTAAAAATTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009697|2989682:2999151|2992140_2993136_-|WP_012099415.1|DBSCAN-SWA MVSYKEAGVNIEEGYKSVDLIKKHASKTFTKGVLNNLGSFAGMFELPKYKNPVLVSGTDGVGTKLDIAFRMKKYNTVGIDCVAMCINDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAAQLVEGVSNGCIQSECALIGGETAEMPGFYRDGEYDIAGFAVGIAEKDEIIDGSKIEDGDILIGIASSGPHSNGYSLIRKLVEDLHKDFEGNKIGNTLLTPTKIYVKPVMKLLEKYNIKGMAHVTGGGFYENIPRMFKEDFTAVINKKSYPLPNIFSHLISLGIEEDHMYNTFNMGIGFVLCVNEKDGENIIKDLIEMGEKGYKIGYVKKGDKSVELI >NC_009697|2989682:2999151|2994736_2995441_-|WP_012047943.1|DBSCAN-SWA MEKKDMLYEGKAKKIFRTDDKDTVVVYYKDDATAFNGEKKGTIEDKGVMNNSITAMLFELLEKKGVKTHFIEKINEREQLCKKVEIVPLEVIVRNIAAGSMAKRLGLSEGRKLDTTVFEISYKNDDLNDPLINDYHAVAIGLTTFEELKEMYSIAEKVNNTLKEFFDEQGINLVDFKIEIGRFNGELLLADEISPDTCRLWDKSTGEKLDKDRFRRDMGNVKEAYMEILKRVNK >NC_009697|2989682:2999151|2991395_2992013_-|WP_012047940.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIDKIEEGYIKNCKIEMVIGDRSNIYGIERAEKKGIKTLTLDRKIYKSNLSNKICECLYGNVDLIVLAGWLSILNGDLVNKFENKIINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHQKALEYGVKVSGCTVHFVDESTDSGPIIIQKSVPVFAEDTAEILQKRVLEKEHEALPEAIKLISEEKVKLQGRKVFIKTY >NC_009697|2989682:2999151|2996595_2999151_-|WP_012099417.1|DBSCAN-SWA MYEFILNERNVSVSEDINLLEYLRDNEDLTSVKNGCAEGACGACMILVNGKALRACICTTAKVNGKDVKTVEGLTEFEKDVFTWAFSKAGAVQCGYCIPGMIISAKALLDKNLNPNKKEIKTAIRGNVCRCTGYVKIIKAIEMAAGAFRNGKLPFAKEYKGKIGENIPRIDAKDKILGIGKYVDDMKIEGMVYGSALRSKYPRALVKSIDISVALKHPEVEAILTAEDVPGNRLIGHIVKDWPAMIAVGEGTRYVGDAVALVAAKSKKALKEILNLIKVEYEELEPISNPNIAIAEDAPKIHPKGNILTVEKVNRGDVDEAIANSKYVVTNHYSTPFTEHAFLEPESALAMPDGDGVIIYTGSQGIYDEQREISELLGLPKEKVRTISKYVGGGFGGKEDMSVQHHAALLAWTIKKPVKITLSRKESIKIHPKRHAMEMTITTACDEKGNLTAFKADIISDTGAYASLGGPVLQRACTHAAGPYKCPNVKIKGTAVYTNNPPGGAFRGFGVTQSVFGSECNLNLLAEKVGISPWEIRFKNAVEPGDALPNGQIADKGTAIKETILAVKDVYKKSKCAGIACCMKNSGVGVGIPDIGRCNLIVIDGKVHIRTSAACIGQGLGTILTQIICETIGLLPEQIILDLPDTKFAPDSGTTTASRQTVFTGEATRMASLKLKEKLLTTSLEECEGEEFYGEYQSITDPINSDKKNPVSHVAYGYATQVVILDDDGKVERVVAAHDVGKAINLTNVEGQIEGGIVMGLGYAFTEDYPLNKSIPTAKFGTLGLFRATDIPEIETTIIEKNTNDLAYGAKGIGEITTIPTAPAAQGAYYKFDGNFRKKLPLEDTAYRRKK >NC_009697|2989682:2999151|2993196_2994645_-|WP_012047942.1|DBSCAN-SWA MSMCYMLDDLNENMPFDLEGDKFKEECGVFGVFSKDNESKSAEITYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKFKYHKGMGLVSDVFSKETIEGLIGNSAIGHVRYSTTGASKSDNAQPIVGTYKLGSIAIAHNGNLVNAAVIRELLEDGGCIFQTSIDTEVLLNLIARSAKKGIDKAVVDAIQAIKGSYAIVILTEDKLIGARDPHGIRPMCLGKIGDDYLLSSESCAFDCVGGEFIRDIEPGEIVIIDESGINSIKFTEKTRCHTCAFEYIYFARPDSTMDGINVYESRIRAGRKLYEEYPVEADIVIGVPDSGIPAAVGYAEASGIPYGIGFIKNKYVGRTFIAPSQELREKAVSVKLNPLKINVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKRLVQILRKAGAKEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRKDLIGAHSEVEEIREKIGADSLAYISMEGLVETLNKDKGFCLGCFNGVYPISAPIEMPKDSLE >NC_009697|2989682:2999151|2989682_2991182_-|WP_003385254.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKTGILDLAKFLESRDVEIISTGGTYKHLKENGVKVIDIEEVTGFPEMLDGRVKTLNPLIHGGILAIRDNEEHMKVIEEKGINPIDMVVVNLYPFFNKVEENLSFDEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYENVINEIKENNQVNIQTRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEEEYPEYLTLSYKKNMDLRYGENPHQTAAYYTSTVGKYPMKNFEKLNGKELSYNNIKDMDIAWKTVCEFEEVACCALKHNTPCGVAIGDTVQEAYTKAYECDPISIFGGIVAFNRKVDKETAENLAKIFLEIVVAPDFDEDALEVLKNKKNLRVIKCEEKSTEGKDMAKVDGGILVQKSDNKLLEDTKVVTEKSPTEQEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGMAKGIGGGQVNRIWAAKEALDRAGDGVVLASDAFFPFGDVAEEAAKWGIKAIIQPGGSIRDEESIKVCNEKGISMVFTGIRHFKH >NC_009697|2989682:2999151|2995440_2995920_-|WP_003357851.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMKGAAKALKEFSIEYKAYILSAHRVPEKLMETIEDLEKEGYECIIAGAGLAAHLPGVIASHTVLPVIGVPIEAAVGGMDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILSLKYEKLKEKLIEYRKDMKEKFINDNKEGVEL |
7 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3077304 : 3154805
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009697|3077304:3154805|DBSCAN-SWA 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93 | Clostridium_phage(48.84%) | tail,capsid,protease,portal,head,tRNA,terminase,holin,integrase | attL 3100981:3101007|attR 3140246:3140272 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3187108 : 3209008
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009697|3187108:3209008|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_009697|3187108:3209008|3198473_3198641_-|WP_003393374.1|DBSCAN-SWA MTNDYEAFCFDEACVYILNEISKEDAREPKFIDGDRINKANNEDVIQWLNANNRK >NC_009697|3187108:3209008|3192646_3193627_-|WP_012048049.1|DBSCAN-SWA MSLPKYIINFEELTEDLKNHLLSLIDDNIRTNYPEINTNNIQDLLQQLKNLLPSVQYEGLKKKIDAFIYRKIEGIQKVKGILLDIPAIQNDYKEQFKFDKDVYITGLHFNQTGWKKEDKYSLEINKIKIIDNVTTKEIGEHKYFNTFYKVNANTPISFVFHNLSGNSRQIIVDLEYIDGEDSSITVEPPPGIEDIDNEWDIAVVMNWEENTDADIDLHGKIDDKKVWYGNKSYDGFYLNFDYTSHKTNKNPEIISVKGYKNKKLLISIKNFNGVELKEPVTLEIYQYRPYGNKLLKKFNVNLDTNRDLKDIFIMDLNTLKITNLNK >NC_009697|3187108:3209008|3191385_3192624_-|WP_012048048.1|DBSCAN-SWA 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MGLPSYVVNFDELSDLIKDYLQNGVKVDIGNINFSTKDMENLLSEIKDKIQGVDYNDLINALNALGVKLDNLSGNLGISGTQKIYGKMLEIPAVKGQHIIEFKGNGQITGITYSQSSWRFEDSWDLQVGNDKLFESVRTKEYGEHKFLNVFYPINGTVKFIYNNISGTSKVLWVDFNILENSNLPTPTIPTTSEKNYRFLAIGESEYTLQGANNLMGCTYDADNISNLFKEHKESAKFTKNIVAKNKTKSEALNLIKNTFQDAQDNDISYLFWSGHGTVYEDKFALVAKDNIITVYELQTILDDIKGTKVIFIDTCHSGLAIDKNFAYTLAVVEEKLRSIDKTLNKQGYKVLTASAGSETSGDLSAGYNGNPNPSGAFTWALTQSIKTKKSDKDKNRIVTLEELYQSVLHFYDEFNIKNPYLKITQTAQVYPRNDTSSIFEYKEGA >NC_009697|3187108:3209008|3199107_3199995_-|WP_012048056.1|DBSCAN-SWA MTSGKTLVNVVKVNFIDEVTNTKHTIETSNEIDIEPINSKGKRDILRIKNKIYGINETDDIVIGYKLKMKDNLFNIETMALIDGGTIQDNKYCGTEVGIAVERHPFTMEIFTEEKDYSRTTGYVKFVYKHCKGKPAKYKIQDGKFLVSSYEAESIPFRNEKPVEIEFLNKLQENNNGEKPGESTPIEDIGVEGGEVENKNPDVGVSITNRVVWSFSNKINQDDVNLENFIIKRKSDNSRVNGNVTIDDTKKIVTFVPDSLAIDTVYIAEAKEINKLDGSGKTTALSTEFKTIKIR >NC_009697|3187108:3209008|3205578_3205989_+|WP_012048067.1|DBSCAN-SWA 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>NC_009697|3187108:3209008|3202112_3202634_-|WP_012048061.1|DBSCAN-SWA MLDKKLYIKTEERLYRHFRSKKELNKLKNRAKHLSNRIEIIMDKIKNNDVTLEEESRSRTYDEIVQTSSNGTGYAEKELIRQIERLEIELGEKIKKKGKVEYKIREIEEEISVMEDNISSLNEENKKFIELKYGENKSVDWIAVEMFGRARSTAYRKKNELVEHVAQLNNLIV >NC_009697|3187108:3209008|3200776_3201142_-|WP_012048059.1|DBSCAN-SWA MNNINRAKISKNIYEHLEKKDLLREIKILRIGKNAFEEKLDEVYVCTIRGYYYRNNSNIITTSMEGLEFNNLYNDKLLIIYNDISSKIQKDDYFILDGTKYEIVDTGNIQNLVFDMILNRV >NC_009697|3187108:3209008|3198675_3199092_-|WP_012048055.1|DBSCAN-SWA MDLKVTNIEDLKKAAQDEVIQLPQFSQGIPFNARVKRVSLLNLVRKGVVPNKLLSAAEELFYGKQSSKENVDLAQMTDVMYIMAENALVEPSIEDLKSVGLELTDEQIVALFNYTQEGVSELDSFREESENTECNINK >NC_009697|3187108:3209008|3189475_3191371_-|WP_012048047.1|DBSCAN-SWA 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MLFNSMHFLLFFPIVTFIYFFIPHKFRYIWLLITSYYFYMSWNPKYALLIGISTIITYLSGILIEKSNKITDKQKSKFFKKLWVFLSLFINLSILFLFKYCNFFTYTLTKIFSLINITIKVPSFDFILPVGISFYTFQALSYTIDVYRGNIKFEKNLGKYALFVSFFPQLVAGPIEKSKDLLNQFNEKHIFDYNRVKNGLVLMLWGFFQKVFISDRLAILVDTVFNNPSNYKGLEIIVASVFFAIQIYCDFSSYSNIARGAAEVMGFDLSLNFKQPYFSKSIQEFWRRWHITLGAWFKDYLYIPLGGNKCSKWRRYFNNMVVFLISGLWHGAAINFIIWGGLHGFYIIIGDMLKPLKEKIINNLKIKTNVFSFKLFQTLFTFILVDFSWIFFRANSFSEAKLLIKNMFYFNPWIFTSGSIYKLGLDQKDFKMSILGILIVFIIDNIARNKDVRVELSNQNIVFRWAIYLSAICFILILGIYGAGYDANQFIYFQF >NC_009697|3187108:3209008|3203904_3204810_-|WP_012099499.1|DBSCAN-SWA MDKKESGDMLAEVKWIKITTNMFDDEKIKLIDAMPERDTVHYIWMRLLVQAGKTNSNGYIFLNDNVPYTEEMLSTIFNRPLNSLRFALKVLRDFGMIQIQEDKLIKIANWSKHQNIEGMEKVRQQTRERVAKHRAKKKELLEETKRQSCKNNDNKKNIMLHETLSNGRDIDIEDIDIEIKEDRKSDIRKNLDKINEAYFNTFYRQISATYLNQVLKVMAKEDYTDLLIYALDITKKREQEQGKIKGFKYTMSIFESWINKGYKLPQDVKRNEISKKWREGEVYETSRTSFGEDLKKQGIGL >NC_009697|3187108:3209008|3194983_3195325_-|WP_012048051.1|DBSCAN-SWA MAHMGYKNFREPVVYILNQELRKRNFKNQINTNEDSKYAGELPEYPCRIIRDSNNKAYKFIYASGTDMQWQEELIRNAEGKVYRIKTTYPNNTNKTIQLIKDNHGKLETIDYV >NC_009697|3187108:3209008|3204903_3205116_-|WP_003384849.1|DBSCAN-SWA MAVIKTKEYRRIRNLSISKLSYKSKIARSYITELEEGKYENPGLKVICNLCKILKITPNELIDQELWRWW |
26 | Clostridium_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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