Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010003 | Petrotoga mobilis SJ95, complete genome | 5 crisprs | DEDDh,cas3,cas14j,csa3,RT,cas14k,Cas9_archaeal,cas3HD,cas6,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8b1 | 1 | 2 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010003_1 | 816672-816801 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NC_010003_1
|
1 spacers
spacers of NC_010003_1
>1.1|816713|48|NC_010003|CRISPRCasFinder GCTACTCCCTCATAAGGTTAAATTAATTTTTATCCATTTACATAGCTT |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010003_1
The CRISPR arrays of NC_010003_1 >merge|NC_010003|1|816672-816801|CRISPRCasFinder CCCACCCATGTGGAAGAGGGACCTGCGGTCCTTTAAACCCTGCTACTCCCTCATAAGGTTAAATTAATTTTTATCCATTTACATAGCTTCCCACCCATGTGGAAGAGGGACCTGCGATCCTTTAAACCCT >NC_010003|1|1|816672-816801|CRISPRCasFinder CCCACCCATGTGGAAGAGGGACCTGCGGTCCTTTAAACCCT GCTACTCCCTCATAAGGTTAAATTAATTTTTATCCATTTACATAGCTT CCCACCCATGTGGAAGAGGGACCTGCGATCCTTTAAACCCT
>NC_010003.1|WP_012208591.1|816222_816612_-|30S-ribosomal-protein-S11 MAKGGAKQRTKKKKAAPEKAAIHIHSTFNNTIVTLTDTEGRPIIWSSGGNVGFKGAKKGTPFSAQMASDKVAKEALNLGVKRVDVYVKGPGSGRESAIRALQAAGLNVESIKDVTPIPHNGCRPKKKRF >NC_010003.1|WP_012208590.1|815567_816203_-|30S-ribosomal-protein-S4 MARYIGPLEKLSRREGINLYLKGKRSYTEKSALRKRNYVPGQHGRQKQKLTQYAMQLRSKQALKRMYGLMERQFRNTFEEAERSRSGETGEVLMQLLERRLDSVVYQMGFAPNRRTARQIVTHGHILVNGKKVNIPSYRVKVGDVIEVKEKSRNIQQVREGLELVQEGYRNIPNWLNVEIENFRGTFQRLPKIDEMDVPVPLTNIIELYSK >NC_010003.1|WP_012208589.1|814410_815472_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MEILIKPEKFRIVQKEEQDEYNYSKYELFPLEKGYAITLGNALRRVLLSSIPSLAITGLRIPGKLHEYDTVEGIKEDIIEITLNLKKVQLKVDDIEKINEIDYPILLSLRKKYKAGQVIKSGDIKTPAELEVANPDFVIAHVNKDMEVDFELYAQAGKGFIPAQELTFQSDIEYIFIDGVFSPVLKVNYLTENIRVGRRTDYDKLILEIWTKKNITPTEALKEATKILMEHFDFISRLWEREGQVGAIEQTEVSVEKEEEEEEEEENIFGLPKDLMETQLDSLDLTKRAKNCLKREKIDTIGELLKRKPADLLKIKNFGRKSLDEIKNELKEKFDIDYEKLYQEERGNTFDEA >NC_010003.1|WP_012208588.1|814034_814421_-|50S-ribosomal-protein-L17 MRHRVKTKKLNRYASHRKALLNNLARSVFESESIITTTAKAKAVRPLVERIITKAKEANSTDLPERRVALNRDINKHFNDRKLVYKIVHEIAPRYENRNGGYTRILKIGYRKGDASELSILQLLPKEE >NC_010003.1|WP_041534049.1|812740_813667_+|TIGR01212-family-radical-SAM-protein MVILLDLYNRLSEYFKNRYGERVQRLPINAGFTCPNKTGERGKGGCIYCDLTGSGFAAFKPKVSIEEQVKEMINRYEKKANKFLAYFQANTNTYAPVDELKEKYESALIDDRIVGLDVSTRPDCVPDEVITLLKTFKDRVDVYVELGVESTNPNTLKYMNRGHSLAEVIDSVNRLKKAELEVILHYIIDFPCDTLEDVKEMAKVSSALKVDGVKLHSLYIVENTKLADLYKSGEFVPLTLDDFVERAITFLEYLDPKIVIHRLVADPPKIGTLHGNWGISKIKILNLIENTMRERGSYQGKYFNYLNN >NC_010003.1|WP_041534048.1|812255_812747_+|hypothetical-protein MRNSTNFTKESKISIIIAIILISITTIGISKPIDDYIEFSPTGYEEISRIVTRNGTIINTTVPDTGEHLEMNFKKNGGLYEVHIVHFENPFALLNFWYTFVSDYSDGLAAAFSAIPFIYGEYNDEYMKMQISAWYRGVNNLFFVIYGPKRSVINDLKLQLNRW >NC_010003.1|WP_012208585.1|811018_812347_+|amidohydrolase MSKKLLKNAYVLISADDDVEKFDILIDGDEIEDLLAPGDSTEMDLGDVDEYDLTGKLIVPGFINTHSHSVMSYFRGIADDLSLNDWLFKEMLPREDFLESEMAYYGALVSMLEMISNGITTFVDMYMFTDEIAKASYDLGIRAYISRGLSFDTDEGWNRRIKENIETYEKYNGLDNRIYIGFGPHAPYTVPMDKLKEVAKIAKKYNTHIQIHLLESANERKQYNLLDVENTGLFDLPTIAAHCVHVDEKDIEVLSRNEVNVAYNPISNMKLGNGIAPIVDMLDKNINITFGTDGCASNNSLNFFNEMKFGGILQKYKYGPDRFSVEQILRMSWENGGFALETNIGRLEPEFKADLVILDMDSFEFLPNDLSRLKSHIVYSANPKNVFATMVAGNFLYYDGKFLTLKEEKEQIYEKFHKFYQRIEDKYNNSDYSDIHNDDRDI >NC_010003.1|WP_012208584.1|809663_810812_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MLKTYKFRIYPSNEQIEKLNQHFGHTRFVYNLFLEFSSNAYKNTKTSTNYYMWAKVLTVLKKTEKYQWLNDVNSQSLQQSIKDLETGYKRFFKKQAKHPKFKKKSSRQSFRVPQHIQLYENEGNDKYGTLFVPKFKEGIKVRVHRKIDPNAKIKNCTFIKTTTGKYFVSITFEVEGSFPDRDIDYENSIGMDMGLKDSVVLSDGTKYPAPKVLSKYERKLKHAYKKFSSKEQGSKNWDKAKLEVARIHEKIKNTREDFLHKLTKEISENQADVFVVETLNIRGMLKNHHLAKSISDSGWYQFKTFLKYKAERLGKKVIEIGMFEPSSKVCSVCGYKNEGLKLSDREWVCPECGTKHDRDVNAAVNIRQFGLKQAFSTQPYGT >NC_010003.1|WP_012208583.1|808153_809209_-|hypothetical-protein MKKFYYVGLISILLFVLTGCLPKTNERVLFKPINPSLLGEKPIISYTIKEEITTTQSETFTQRLNDDFMNNNILVKYFELKDLVSGLESIPENSNLWIVVNWYDYYEALQEGLIDYNKFIKPDGYNIYRSFDGIHYTKIGDAGYGYFLDSSTENAPNKEVWYAVSSYTENGESTLVELGSVVPLETFNIELISPTDEEKNVSRQPTFAWEPTKELTSPESEVEYHYTMWIYDLVQSENYILPGILEGEDVILYDFMMQGAEEVSVTFLGSKGSSEYDDLSWFLYLPDGIYYYEDDKLEPAKTYDWGIEYTYAVAYDIDSVSVSVAVDNGYNVNPKGDIMPEKQNEFTTASN >NC_010003.1|WP_081429221.1|806094_808227_-|S8-family-serine-peptidase MGIMLILKVILCQKSKMNSLLRATEKRKENVMKMRNFVFFSLLILSIFIFNSCVNLNYLEDEDESNTFMEPSDISPINSYIPDLIKLAEREYDEDVLVVGYENLSDLENFTDKLDQEIEVKSLIPEIRVALLSLEGQNVENVLKDLDSEKKIEGIRYIEPNYTDREIQVIKNDPNVIIEETGSNALNQVEEGYPDYREFQYALDKDKIDAEAAWATATGAGVIVGLLDTGTDGTHPDLVNQLKEGYDPYWNKKIDPSENSDTDGHGTHTAGIIAAKDDGQGVVGLAPDAKIMPIRIFNPNYVGDYAVAAGIVWAVENGADILSNSWGGGGYSNILKDAFDYALTHNVVVVASSGNFTTDQHWFYPSGFPGVIAVAASDDKDNIAYFSSRGDYVSVSAPGVDIISTIPVESLDEYEGIDGNPYIRWSGTSMSAPYVSALAALIKEKCPDANVYQIRKMIEVGAEDIEQDGYDTAAGYGRISSDSLDLDPTNYTAGALRVEAISERSCDYLPGVNITLENQETGKRYYGKTNDEGYELFAYIEPGNYEIIIGGPEYLYGSAPNYRMEEELSYSGIVEVEQVEYESIELLPEATVTTYIQKFETTQFRANLKADLPFEGTLTISLLDYYETPIKTFELPSNEEISIDLLQHIIESGHYYLAYEYVGAIAEEEFGISGEIQINSESIPVAIPINQEGRGFIDEYGGSGIPWTIF >NC_010003.1|WP_012208592.1|816840_817206_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARILGVEVPDNKALFVGLTYIYGIGRKTALDILNNLEIDPNKRAKELTDDEISRLSHHINENYKVEGELRQEINKNIKRLIDIGSYRGKRHKAGLPVRGQKTHSNARTRKGPRLTKIKKR >NC_010003.1|WP_012208593.1|817236_817353_-|50S-ribosomal-protein-L36 MKVRASVKKRCEHCKIVKRGGKVWVVCSKNPKHKQRQG >NC_010003.1|WP_041534284.1|817402_817633_-|translation-initiation-factor-IF-1 MAKKDVVVMQGYIIEALPNANFKVKLDNGHEILAHISGRMRKNFIKILPGDRVTVEVSVYDLNKGRIVKREKVNKD >NC_010003.1|WP_012208595.1|818096_818849_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MIIIKTDQEIEMMRRAGKKLARLLDALLPEIVKEGVNGESIEKYVLEYMEKEDAIPTFKGYNGYKYAINFSVNEEVVHGFPLRNKVLKNGDIVSVDCGLTYKGYIADSARTYIIGQVSEREKELVESTKESLYMGIKKAVVGNTIGDIGHEIQTYIESKGFSVIREYVGHGVGRKLHEDPQIPNYGRQGRGPKIRKNMTLAIEPMVSMGSYEVDILEDGWTAVTRDRSKAAHFEHTIAVTENGPEILTQL >NC_010003.1|WP_012208596.1|818845_819493_-|adenylate-kinase MRLLFFGPPGAGKGTQAKKVAQEFQIVHISTGDILRDAVSKGTELGKMAKAIMDRGELVSDEIMNSLVKERLEELDSFILDGYPRTLDQAKFLDQATKELQKEIDAAVLIDVSEEEIVKRISNRRVCPNCGKVYNLITLQPKEDEKCDVCGTKLIQRDDDKEEVVRERYKVYKKNTEPVIEYYRKNNKIITIDGAQNVEDVTKELFNILRSFNKQ >NC_010003.1|WP_012208597.1|819500_820781_-|preprotein-translocase-subunit-SecY MFKAFRNVFRIPELRDRVIFTFLALIGFRIGIYIPIPGINVEAWQAALSGASQGAVGGFIGFFDVFAGGALSNLSIFVLSVTPYITASIIFQLLSSIIPSLKEMLREGESGRKKFAHYTRMLTLVLAFGQGLLMSIAANNYRSPNLSPVLFVTLATVSIAAGTMFLLWIGELITEKGIGNGVSVLIFAGIVSRYPTYAAEALIGLTPLEWILLAAVAIFIVIAVVAVQTSERRINIQYAKRVVGTKIYGGSSTYLPIKVNGGGVIPIIFASAIMTLPSMIAGVTNTTVDDRLFAIGSPLYLVLYGLLVFFFTYFYSSVVMDPNDVANNIQNYGGFIPGLRPGKPTVNYITSVMTRVTFIGAIFLVVIALVPYFIRGASGMQQIWIGGTSTLIAVGVALDIVQQMEQHMIVRQYEGFMKKGRLRGRR >NC_010003.1|WP_012208598.1|820782_821238_-|50S-ribosomal-protein-L15 MPLKIEDLKPTPGSRKPKKRLGRGIGSGLGKTAGKGHKGEKARGRGKIGRTFEGGQTNIIRRTPKFGFSNAPFKKVYSVVNVETLEKYFSENEEVTPDILLEKKLIKKLNDGVKILGKGEISKPLVVKANIFSQTAREKIEAVGGKIEVIE >NC_010003.1|WP_012208599.1|821270_821456_-|50S-ribosomal-protein-L30 MSSLKIKLVKGRAGKDKRQLATLDALDLTRKDKVVIKPDNPQIRGMIRTVHHLVEWEEIDS >NC_010003.1|WP_012208600.1|821459_821993_-|30S-ribosomal-protein-S5 MPNDQKVKATDAANELEERVIEIRRVSKVTKGGKTISFRAVSVVGNRNGKVGLGIGNAREVPQAIRKSIENAKNNMIEVPVKNGTIPYEIIGEQDASTVLLFPAGPGTGVIASSAVRAVVELAGIDNILSKSISSTNVLNLAKATYNGLKKLRSPQEIAKLRDLTVKQVFFGAHKGV >NC_010003.1|WP_012208601.1|822009_822378_-|50S-ribosomal-protein-L18 MIKQLDKKALRQKRHLRVRKNVRGTSEKPRLTVFKSQKHIYAQIIDDTKGVTLASASTTQKQLKEKLEKTWDENAAKEVGKLIAEKAKEKGITEIVFDRSGYKYHGKVKALAEAARETGLKF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_010003_2 | 1292520-1292616 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010003_2
|
1 spacers
spacers of NC_010003_2
>2.1|1292544|49|NC_010003|CRISPRCasFinder ATTATTTCAAAGGAATTATGAACAAGGCGTTTTGCATAAGGCTGCAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010003_2
The CRISPR arrays of NC_010003_2 >merge|NC_010003|2|1292520-1292616|CRISPRCasFinder TGCTGCGCAAATGAGAATTTGGAAATTATTTCAAAGGAATTATGAACAAGGCGTTTTGCATAAGGCTGCAAAATGCTGCGCAAATGAGAATTTGGAA >NC_010003|2|2|1292520-1292616|CRISPRCasFinder TGCTGCGCAAATGAGAATTTGGAA ATTATTTCAAAGGAATTATGAACAAGGCGTTTTGCATAAGGCTGCAAAA TGCTGCGCAAATGAGAATTTGGAA
>NC_010003.1|WP_012209025.1|1291102_1292284_-|tryptophan-synthase-subunit-beta MKKAYFGQYGGRYVPETLIPALEELEEAHEKYSKDPDFINEYQGLLKDYCGRPTPLYFAERFTEYLNGPKIYLKREDLNHTGAHKINNALGQVLLAKRMNKKRIIAETGAGQHGVATATAAARFGLECIVYMGAEDIRRQALNVYKMRMLGAKVVPVYSGSQTLKEAINEAIRDWVTNVENTHYVIGSVVGPHPYPKIVRDFQRVIGDESKNQILEKEGRLPDYIVACVGGGSNAMGIFYPFIEDKDVELIGVEAAGKGLETGQHAASLTAGKIGVLHGSKSYVLQDDDGQIQLAYSISAGLDYPGVGPEHSYLHDEKRAQYVSITDEEALKGFELLTKLEGIIPAFESSHAIAYAMKIAPSLDKDKIMVINLSGRGDKDVDSYIKLGREALE >NC_010003.1|WP_012209024.1|1290329_1291106_-|tryptophan-synthase-subunit-alpha MSKISEVFKNSKALITYVTAGDPNLEVTKEIILELNKDGVDIIEVGIPFSDPLADGPIIQKASQKALKNGVTLKKIFETLNEIKEEVTCPLVLMGYYNSILNYGIDNFITEAVNTGISGVIIPDLPFDEEEEFYAKIKENGIDPILLVAPNTSEERLKEISKVCSGFLYCVSIMGVTGDSQAPMEHLKEYSQRVRKYVNIPLAIGFGIDSPTKAKNIIEYFDGIIVGSALIKIIDENSDDKGKLLKEIKRFTKSLKVW >NC_010003.1|WP_012209023.1|1290027_1290297_+|acylphosphatase MVCKRWILYGRVQGVGLRHFLRVHGVRLQLEGYVRNLPDGSVEVVAQGEKEKVLKLKTIILQGNGFSRLEDVQEEDFPIGNYGSFHIEY >NC_010003.1|WP_012209022.1|1289343_1290015_+|zinc-metallopeptidase MYYTTMLLLIPPLILAIWAQARVSSTFNKYSRVKASIGEPGYMFARRLLDSVGLYDVKVERVRGTLSDHYDPTNKVLRLSDSTYNSSSIAALGVVAHEAGHAIQHAKGYKPLILRNLAVPLAGFGSNMAWIIFFIGLIFSTPFLLNAGIFLFLFVVLFSVITLPVEFNASSRALKLLPVMGMSKEEVSGAKKVLSAAALTYVAAALMSIAQLLRMLVLARSRN >NC_010003.1|WP_012209021.1|1287876_1288896_-|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MVIVMEENATEEEVRNVIKKVEEVGFKAHPDKGENHTIVGVVGEGDREYILSNIETFPGVERVVEITQPFKLASRTFKSKDSIYDIGGIKIGGENFLTIAGPCAVESKEQVLETALFLKEKGVKFLRGGAYKPRTSPYSFQGLKEEGLKILKEVSEETGLKIVTEVMDTREVELVSRYADVLQIGTRNMQNFVLLKEVGKLNKPVLLKRGLSATYKEFLMSAEYIISEGNNQVILCERGIRTFTDETRNTLDISAIPVIKRYSHLPIIIDPSHASGDWRYVAPLSKAAVAAGADGLIIEVHPDPKNALSDGKQSLNFEQFSELMDQIKALLEIDSKILA >NC_010003.1|WP_012209020.1|1286998_1287841_-|prephenate-dehydrogenase/arogenate-dehydrogenase-family-protein MLFNTAIIVGTGLVGTSLALAFKETKEVKNIIGYDIDSNSLKEALKLGAIDEPAKISEISKADLIIFATPVESIKSILHDTISLVKENTVVTDVGSTKYEIMQLFDTFKNKRVNFIGGHPLAGSEKSGPLNAKANLFKGKKYVLIKSANCDQIYFNKFERLITKIGAIPIIIDAKTHDEILSTTSHLPQIIAYYLVKTLMNLKEDNENYLKLVGTGFKDTTRLSKSDPQMWIDIFKQNKENILRAIENFEKELTAFKKDLIEDKYNEIKDDLIKISKFEL >NC_010003.1|WP_012209019.1|1285520_1286819_-|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MKIEVTPTENINAEITLPGDKSISHRALIIGSLAEGETKIHNFLSSEDTLSTLNILNSIGASIKQISEDEVIVEGKGKDNFIEPSNVLNAKNSGTTMRLMMGVLSAQNFYSVITGDDSLRERPMKRVIDPLSKMGGRFFARKNGEFAPITILGTKDISPLVYKTPVASAQVKSAILLAALYAKGETQVIEPAKSRDHTERMLKYFGADIAQKDTTVVIRGLTKNLEGREFFVPGDLSSASFFIVAALITKNSTLLIKNVGINPTRTGILSVLKMMGADIKIINEKTLNNEPVGDLLVKSSSLKGVEIKGEMIPLIIDEIPILAIAATQAKGKTTIKDAKELRYKETDRIRAITRELKKLGIDILEKEDGFDIIGNQKIRGNCTCESYNDHRIAMSLAIAGLIADNPIEIDNFECVNISFPEFTEIFEKIRSI >NC_010003.1|WP_155811073.1|1284735_1285524_-|shikimate-dehydrogenase MMKKFGLLEYPHKESLSKRVFNEYFKKANIDAVYEDIVIAPDNFDDEINKYIDSYHGLNVTVPFKEKVIKYVEPVEEAKEINAVNCIFNNKGYNTDWKGFYNSLKSSMLQEPVLLVGAGGASKSIIYALYKMGIKKLFLVNRTVERAEKLRKIFLSKIDIKIESFDHLQSIILSSKTFINATSIGMFGESFNLEVSDLSNLSLIYDIVYNNTPLQKIAKESNIKCIDGRTFWYHQAIENLKIWQIYTPEIFDETFKTFARGE >NC_010003.1|WP_012209017.1|1283627_1284734_-|chorismate-synthase MQVKIAGDSHGPQMIGLIEEIPAGLKIDIEKINTDLRRRQLGYGRGNRMKLEKDEVIIVSGLWEGITTGAPLVLIINNKAKNPIKEERHIPRPGHGDYSCWYKYRLDDLNIYTERNSARWTSVLTAIGSVAKQFLENFGITTMSFVKSIGKVSVEEERFEEIQKDFTYYIQKRNESEVQCPFEDISEKMMEEIKENALKKATTLGGSVKTFATNVKPGLGSYADVLNRVDSKIGKYFMSIPSVKGVFIGKEDVSIPGSEFQDPFTVEDGVIRRTKNYAGGIEAGITNGENIVVTTYFKPISTLASPLPSVDLKTKESKEGPYIRSDSVIIPAATVITECTLAIILMEEIIDGFGNDNIELIKDRYFKK >NC_010003.1|WP_012209016.1|1282128_1283616_-|bifunctional-shikimate-kinase-AroK/3-dehydroquinate-synthase-AroB MKIFLVGMMGSGKTTLAKKISKVLSIPHIDTDDEIEKNENLKIKDIFEKYGEEYFRKLESTILEKLAENTNSFVVSTGGGIILSAKNRAILKKENAIYLKVTPEKLKDRVSLENRPLLANNKENIIKIYKDRKELYEQFKTVDITNLTEWESVAKILYQYDIKNHFEIDSSFQKVSINAGSLKSPPPDSIVFTSEKVNELYGEYLPQKKLVLPNGEKTKDISLVIRAYEYLLENNVSRDNLLLGIGGGTITDFTGFVGSTYKRGMNFSFYPTTLLSQIDAAIGGKNGIDFKKYKNVVGTINLPIEVVIDPLSILSLDDETFIEGLIEGYKMALISGNDFYEYFKENLQEILNRNLDKLSFFIKRSVEEKLRIVEQDFKDTGLRSCLNLGHTLGHAFEATTGIAHGLSVGWGLIKEIEFFYKKKYLEEKDYLEIKDTLEALVPEKVRNIQIDEKDIYYYLSNDKKIGANQKIKMPILKSPGNIIIEEITIKEGEIF >NC_010003.1|WP_012209026.1|1292756_1293380_-|phosphoribosylanthranilate-isomerase MIRIKVCGITNIEDAINISKAGVDALGFILAESPRKVELSKVLEISKELPPFVSRVAVVVNPVKEEIEKIERSKVFDYVQFHGSEDVNIIKNCKLKTIKAIKIENKSSLEEISKYNDFVDYFLFDTKIGEKIGGTGHTFNWEILKEANIKKPFILAGGLSPENIVEAIKTIRPNAVDLNSKVELYPGKKDIRLIKETIDRINSIKIK >NC_010003.1|WP_012209027.1|1293376_1294138_-|indole-3-glycerol-phosphate-synthase-TrpC MYLEKIVETKREEVAKLKEKKISLKDSFQKGKLTLIAEIKKASPSKGIISTNFDPQRQLELYIKGGADAISILTDEKYFQGSTNILKELRPKTNLPILRKDFIIDPIQIYQSLFLGANVILLIASILTKKEISNFLKISKDIGLEAIVEVHNHQELTKVLDTETEILGINNRDLSDFSLSLRNTEKLLEELEKLGKRRDFYVISESGIKEKSDIDYLRSLEVDGVLIGEALMKENDPVLKIGELFPEKRSNLQ >NC_010003.1|WP_012209028.1|1294151_1295186_-|anthranilate-phosphoribosyltransferase MFNYYLQKVVKGENLSLDEMEQAMEMIMEGKVTHSQLSGFLVALHMKGETVEEITASAKVMKEKATPISIESGELMDTCGTGGDAKGTFNISTAVAFILAAAGVVVAKHGNRSVSSKSGSADVLESLGINISLPPSSVERCLKEINIAFLFAQDFHKATKHAAVPRKELGIRTIFNVLGPLTNPANIKYQLMGIYDPKLVYPIAEVLNNLGVKRAMVVHGSEGIDEFSLSGKNKVAFLNEGKIEKLEISPEDLGLEKYSIQEIQGGSAEENKRIILNIFNGEMGPKRDVVVLNTAAGLYVANKVNSLEEGINFAQEIIDSGKAMKKLEEMVEFTNFLSLQAKTS >NC_010003.1|WP_081429257.1|1295178_1295778_-|aminodeoxychorismate/anthranilate-synthase-component-II MVEMILLIDNYDSFTYNIYQTACEFDDVLVYRNDKITVKDIEMLKPSHIIISPGPGVPKDAGISIETIKHFKGVIPILGICLGHQCIAEAFNGKVVRAKEIFHGKTSKIYIKEKKDIFQGIDSPFEATRYHSLIVSNEMFPKELKITASTQDGEVMALRHISYQIYGVQFHPESILTTVGPRLIENFINIKVERGVSYV >NC_010003.1|WP_012209030.1|1295770_1297249_-|anthranilate-synthase-component-I-family-protein MYTKRSVINQTILPVIEKISLENPDPTVVYKKIALNNQYSFILENLSINEKKYSLIGITPLKVAKLNYTTKKKTRLHFFEKGKAFLDENTDYISFLKEQLESIQYESILNIPDLFASFVGYFGYEIISIWEDIYHNEMDKDLKHGDLPLSILVFPRISLILDQNEKLGYLVNVVNSGSEEDIESRISLAKHENHQILKDLEKTSTQGEEERNNDQVKLKIKHHTSKEEFVEKVEKTKNYINAGEAFQIVISQRFSCKITQHPFEIYENLRKINPSPYMFYLNFPEATIIGSSPEMLVKVEGQRVITRPLAGTRKRGETPQADEAIEKELLRDEKERAEHIMLVDLARNDLGRVCKEGSVKVTKFFGIEKYSHVMHIYSQVEGLKKNYLNSLDVLKSLFPAGTVSGAPKIRAIEIIDELEDEPREIYAGVVGYIDTKGNLDTSIAIRTMVCKENEVRIQAGAGIVSYSIAENEYYETVNKAMAMFKSLEKGDC >NC_010003.1|WP_012209031.1|1298549_1299569_+|DUF4065-domain-containing-protein MYELKKPKERLFCEQCGKLVGYKTIKKKENYNVKNYPIEVERTVAICEECGAELLEPYYENENLKAAYRKYAELNNLVLPEEIKEIRSKYNVSQTLFALILGLGEATIQRYEMGSLPTKVNSDLIKRVSEPIEFYKILKSNKDNIPDIEYKRILGNIQRILKEFENKLEVQELEKILYIKHPEIDIEKMKGLIAGLFYYSNKYHHKDFLYKTVFFKLLWLVEKESKKSLGRQIANLKFIHYNYGPIPKGAKNEEGVLLDYLIKTNLIRMNIDFSKKFLQETYKIGLVDQTPLRNLTDEERKIVEKIVKKYGGLSASELVEVSHNDVAYKSSNYDEEIVI >NC_010003.1|WP_012209032.1|1300000_1300837_+|DegV-family-protein MKFKIVVDSCCDLTKEIKERFDISTVPLFIDIDDQHFIDDENLDREKLLEAMRNSTEVPKTASPGPKPFLNLYEKYENTFVVTLSKELSSSYQNAVLAKNILLEEAKDKFVKVFNSFSASVGETMIAYKIGELIEAKLGREEIINKAEKYIEEMKTLFVLDSLDNLIKAGRMGRLKGEFASLLNIKPILAGTREGTITLLDKARGSKNAIKKLIDKIGEVGNNLKDKVLGIAHCNALERAEYIKKEAAKRYNFRDIIIVETAGISTVYANEGGVILAF >NC_010003.1|WP_012209033.1|1300984_1301935_-|ROK-family-protein MLVVGIDLGGTEIKAGLVDEKKGIIKKISRPTEVEMGNAQVIANITKTVKDLTENTEFSAIGIGSPGSIDRKNGIVRFSPNFPNWRNFELVRLIKENINVDVFLENDANAFALGEWYFGKAKGLHDFIALTIGTGIGSGVVCNNTFLTGKDGLAPELGHVVVVPNGPQCGCGNRGCVEATSSAKYIALEAKNLIDRYPDSLVLKLAGKKEKIESKHVFQAYEKNDPLARVVCNFAIDALARAIGGYVHAFNPEKIIIGGGLSRAGDALFVPLREMTKKYVMSSFADTYTIEQSSLVEDAGILGAASAAFYAEENPL >NC_010003.1|WP_012209034.1|1302207_1302891_+|2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate-cytidylyltransferase MVYAIIVAAGEGKRAGFEIPKQFVKLNNKTILRMSAEKFQNSASIDKFLVVSHRNYVDLTEKEVKIFSKFENVVIGGSNRQESVYNALMYLGKKENKPDFVCIHDAVRPFVDTNKIDESIYKAKEIGGAVLAEMAENTISQVNNGRIVKTLERSQIYLHHTPQTFDFNKLLKAYQKAEKILSSFTDDASIFIHAGYETAIVEDYKNNIKLTKKEDFELAKCIFELNS >NC_010003.1|WP_155811113.1|1302887_1303994_-|amidohydrolase MIPPYELRHKIHENPELSLEEYQTTELLEKTIKEAATFYNVDINVYKPLKTGLIVEYNGGSGEEYLLFRADIDALNIKEKTKVDFKSKNEYMHACGHDVHTAILYGFFLNVIKNKVNKNIVFLFQPAEESKGGAQRVIESGILDKYNIKAAFALHVNDEFPVGTIASTRGTLFASALEFFVDFEGVSSHLAFPHQSKNALNALRIFLDVLDKLPKNPMEPFVIGVGKVNAGSAINILPGNSHVEGSIRGVNSENNLKYFEDMRNVLSGIKIMTGVDYLLGKGSFYPEVTNDSLLYDKFIPKLSKTFTFIDCGLKMTGEDFGFISKKYPSLMCWLGSSKGEHHGLHNPEFLPPDEVIDVGIQVFETFLD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010003_3 | 1333698-1333764 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NC_010003_3
|
1 spacers
spacers of NC_010003_3
>3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder ATGAGCCAATTGAGCCA |
cas14j,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010003_3
The CRISPR arrays of NC_010003_3 >merge|NC_010003|3|1333698-1333764|CRISPRCasFinder CAATTGAGCCAAAAAAGAGCCAATAATGAGCCAATTGAGCCAAAAAAGAGCCAATAATGAGCCAATT >NC_010003|3|3|1333698-1333764|CRISPRCasFinder CAATTGAGCCAAAAAAGAGCCAATA ATGAGCCAATTGAGCCA AAAAAGAGCCAATAATGAGCCAATT
>NC_010003.1|WP_012209059.1|1330174_1332406_+|hypothetical-protein MSNFNFPKGSEWRKWDLQIHVPGSKHADQYSTKKGNDVWEKFIEYIKNSDISVFGITDYYSVAGYETFRDKIKNIEELKNKQFFPCVELRLDINVNIDSEQLQCHLIFDSNYDINKIKDFLAHLPLKNKMPNGAVAYCTEDDITACGGYDKISITKEKLEESLKGSFGNDRPFLIAGVASGMGSNRAIANSNIKKELSDIFDDFCDLFFGCEENREYYLNESRYENKSLKAKAKPVVSISDCHTLEDCKNRLGKKYPVPNNEGKDLERYGFSWIKADPNFEGLRQIIFEPFDRVAFGFEKPELKRPYYLIDKVRFLDNTGQDNFSSDAIEINQNLVTIIGGKSTGKSLLLYYIAKTIDRKEVETRFADLSEASQYDFDKSADFNFEVVWSDGARMYLKNTEGSNGSDERKILYIPQNYLNRLSEENTGSRDTINKFVKDVLLQDETVRENYENNLTRIKGLTKLIPTNVADLYQIKQEIKEVEENIKKFGEENGIKTYIVQLKKEAEDIKSKSGLSNQEITDYEALLEKEKETTTSITVLSDDKKSLVSFKQNLMQQLESLEKLYNEQSSYLGNDEIKKEFTKEFAKIRQLKTDLLTATDVVIKFVNSSIVAYQKELEKIKNDLIPFMAKVKLQDELKKKNKAISDEQNKLNKIDLEKKKLESKADAEQVIVANQEGQEKGRDNKKFKFEYISGALENSFELPEAKQKAILFRKGIRQHVCEVLEGGQIAFEKREKKYGFRIS >NC_010003.1|WP_012209058.1|1327838_1329587_+|proline--tRNA-ligase MRFSKLYAPTLKETPSDSDIKSYELLIRGGFIRKISSGVYSYLPLGWKVIRKIEQIVREEMEKIGSQEIMLPIIHPAELWKMTGRWEDYGPELMKLKDRHDREFTLGPTHEEIVTFLMKNELRSYKQFPVNLFQIATKFRDEIRPRFGVLRAREFIMKDAYTFHTDYNSLHESYQHFYNAYENIIKRIGLKYVVVEADTGAIGGSFSHEFHVLAQNGEGEIFYCEKCGYAASDEKARSGEDFSVDENEAFKEMEKVDTQHAKTIEEVAKFLNVSEKKLIKSILLRSSKGWVMALIRGDYEINLAKVRSVLQDQSLELADPQDVLKEFGVNVGFIGPINIPENVKIIADLSVKSIKNGVIGAMEEKAHYINANAERDFRINLFADIRYVKEGEKCPTQGCNSTLKRTRGIEVGQIFELGDKYSSKMNAVFTDENGEQKPYIMGCYGWGVSRTLGAIVEQLNDENGIIWPKSVAPFEVAIIPVAMNDEAIVSTSQEIYDYFLKEGIDVIIDDREVSAGFKFKDIDLIGVPIKIIIGKRLKEGKIELKQRDKEEGTLIEFKNVKELYDKVKEKLENYDPTQNLTI >NC_010003.1|WP_041534088.1|1327450_1327657_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MKFIVTIDRDEDGMFVVECPSIPGCVSQGKTEQEAIENIKDAIKQCLEVRAERGMPLTVSMREVEVSV >NC_010003.1|WP_012209056.1|1327226_1327451_-|addiction-module-toxin,-HicA-family MEKLPLLSGREVVKVFERLGWEVARQRGSHIILVKGKHIATLSVPDHREVARGTLRSLIARAGITVEEFLSAMK >NC_010003.1|WP_012209055.1|1324816_1326754_-|methionine--tRNA-ligase MDKFYVTTPIYYVNSEPHIGSAYTTIVADIVARFKRMMGYDVFFLTGTDEHGQKVLQAAKEKNIPPQEYVDSLSSKFKNLWDEMGISYDHFVRTTDAYHVKTVQMFVDKMMENGDVYKGKYAGWYCIHDESFWDESEIVTQDGVKLCPECNRELKWVEEENYFFKLSKYTEPLLKHYENNPDFVEPSFRRNEMLQILNDGLKDLSITRTTFDWGIPLKSDPKHVVYVWVDALINYVSAIGYSDDQQKFNRYWPADLHLIGKEINRFHSLIWPAMLMSVGLPLPKKVFAHGWLTVNGQKISKSLGNAVDPRILMDAYGRDVIRYYLLRDIAFGRDGDFSEENLITRYNADLVNDLSNLVHRTLTMVEKYFNGVIPKPERKDKVDEELLELLESKKNAYLNLMERYQFTQALENLWEVIRFSNKYIDLTEPWILGNDPNEKDRLSTVLYNLLDVIRIISILIYPIMPDTSETMLKKIGYGLEILNRENLEKGLLHSGVKVVKGDPIFQRIDVKSWKRIIKTVNINKEDEVMPENENVQNIVEIEDFKKIDLRVAKVVKAENIEKSNKLLRLHLDLGQMGERQVIAGIKSFYSPEDLVDKKIIIIANLKPAKLMGELSEGMLLAAKDGNGNLSVLTVDKDVEPGSKIS >NC_010003.1|WP_012209054.1|1322345_1324787_-|DNA-gyrase-subunit-A MDDKIFIKDFTEELKTSYLLYSLSVIVSRAIPDVRDGLKPVQRRILYSMSELGLKHNSSFKKNARIVGEVMGKYHPHGDAAIYDALVRMGQPFTMRYPLVEAQGNFGSIDGDPPAAMRYTEARMPELGEYMLKDIEKETVDFRENFDGSLSEPVVLPTMVPNLLMNGASGIAVGMTTNIPPHNLNELVAALKLLIEKPESEVADLLKHIKGPDFPTGGQVVDGEGLKELYETGRGKITIRGKYRIEDEGKGTSIVFDEIPYNVSKADIIEQIVRYVVKAKEQKKDVGIKDVRDESDKEGIRLVIELRKNANVKKLINDLFKHTNLQSYFYVQMNVIDNEKPSLMNLKGLLQSFLDHRVNVITRRTKYELEKARKRAHIVEGLIKAVQGIDTVVEIIRNSENPQEALKNLQETIGVSEEQAKAIADMRLISLSKLESTNLSEELKNLYKDIENAMDILQKKERLLGVIKEELDEVANKFGDKRRTEILYNKGDLAEEVEMIQDEDVVIVLTKWGYLKAIPSSEYKVQGRGGKGVKGLKISDEDDVKEVIYTNKLSKLMLFSSAGKAYQINAYEIETTLKNTKGKHIANFISLDEGEEIKSIVAISLDGDYDKDILIFTKQGKVKRTSLREFSSARASGIRAINLVDKDVVVDVVLLDGSDRDLLIVTKLGMSLMFNSSQVRTMGRTAMGVNSIKLREGDEVINVVKVDEGKKLLLITERGYGKRVSFHSYKPQNRGGIGVKTVRDISRIGPIVATMSVEDGRDILIFTKKGKAIRVNVNNINVLGRITQGVIIVRLDEDDSVVGAIEVQANDEE >NC_010003.1|WP_012209053.1|1321683_1322301_-|repressor-LexA MEELTKRQSQVLDFIKSYMEKNGFAPSIRDIMKHFNFKSPRAAHKHLIILEKKGYIERKNVSRGIKMMPKSGEIFATETLAPVSGKIAAGDAIEAIQTISDYIPIPTNFFPKNYEYFSLRVEGNSMIEAQIKSGDFVLIRKQDYAMDGDIVVALIDGNDATLKRYKRLNEDEVLLIPENKSMKEIKVKADHLKIQGKMVGLIRVL >NC_010003.1|WP_012209052.1|1321232_1321667_-|ribose-5-phosphate-isomerase-B MKIAIASDHAGYEMKEQLKNYLLEKKFNIIDLGTNSNASVDYPDYAKKLGEKVTKGEADFGIGICGTGIGMSIAVNKVKGVRGALCLYPSMAEYARKHNDANVLVLAGRLMGIDLAIWTVVKFLSTDFEGGRHKRRVDKIDEIK >NC_010003.1|WP_012209051.1|1320229_1321219_-|hypothetical-protein MKSISFSKGIEKDININISQGYYKEFSKRYASKYGTLMIIDSNLKNHLNPGTDKNIFYVKGGNETKYFDKYLELCKVIVEGSYSNLVVIGGGSLIDMVGYVFHTLDFPTGTLTVMPTTLSSMIYLPVSGEFYLDMNYTRNFLKVRGYPDLVYIDPYFCKFLDKKDMKNHFFLGYILGLLFDNNFASLSLKYSKNFIRLDLEDYLYSAVKFVLSLYSNDLPFPGTKLMKYIADTSVKSDFVQSESLSFAFLLYLSFKFGYIHEESFQEIFEKIRSFEDLKSSKIQNIKAKVNNVPIREILLKEDGFVDLLLNFGELKDLLLEFKSLLRGV >NC_010003.1|WP_012209050.1|1319461_1320226_-|hypothetical-protein MAKNNSPWFSVILILVFILPLITFALTTYTIYLKNQMKNLELKIEELDNNQLNTLNEVESASQSAVLEDLVLPQIEIGNTMARASYTIQELDYQVLLNNSVTMLKPYNEGAVKVFYDQREVFEEALYALNNDIPYFVFQNRDKYYLYRSDYSLEGEAEEQYLFSIQIYLYTTPAPAMFPTMALRQGGIPAFVFNGKFQQSNEDYWAILVGLFDDYNEAQTYLKNMDEELVFELTGLSIADRFTKGIYFTGVETE >NC_010003.1|WP_012209061.1|1333891_1334725_-|hypothetical-protein MKDTNRTGDIHKDEPAEYHELNFPKIISVKPIDIPVINVSNQNPDFVFELEDNSLLHLEFQTTWKKADLLRFAQYDIALYQKERRRINTVVMYSGKYESAESELDMGSNKYKVQQIFMIKYDGIKRYEEIKEKIEKEEELTDKDLMDLVFLPLMRNEKSEEEVTKDVFELAIKIPDEDKKEAVIGSLLGFSDNYVRDEYINELKEVIRMTKIGTSLFEEGVEEGEKELTIKILNKRFGRRLTEEIKDRIREADKKTIDYIGDNLLEITIEELKGILK >NC_010003.1|WP_041534089.1|1334877_1335105_-|UPF0175-family-protein MKTISVNLPDFIDLNEKEIKLLIASKLYEEGKLSLGEAAQLAELSKRAFIEILGGFDISLFNYNTEELRNDVKRA >NC_010003.1|WP_041534090.1|1335152_1335338_-|hypothetical-protein MMEIKYTPIEIVHSPFKETKGTPIQPNAAKDGLRKMFTNCNNQKTTVDLVKESFLSYNICI >NC_010003.1|WP_012209063.1|1335514_1336525_-|hypothetical-protein MSNPIKDSIFKELFEDRTVFYDFLKAFLPKETTKQIKETDLKREQTELIGKDFSIKRSDILYKIEKRNGQDVYIYLLLEHQSKVDQLMAFRMLAYKVRIWEQYVNSHKKESEQKGFKLPVIIGMVFYDGKAKWTSPMDVKEKITEIKNMEEYLIKANYELINLSNIKEETIINMKKALGVILLTDKPNVRVKNAEELLKIINKDILLKLSEEEQEKFNKHRNAFIELFGKRTDYEEIKERFEELKEMEVPKMFNTLEEIAKRDREKAKLEGKAEGKVEGKLEERRELIIEILNQRFGEDFDKSLEEKIRNANEETINQIKKNILSITLEDLKEILK >NC_010003.1|WP_012209066.1|1338517_1339513_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MNELVHNPHDRFFKLIFSDKEIARDFLQNYLPQEAVEIVDLDYLIPENNSHVDENLRESLSDMLYKTKIKGQDGYIYILMEHKSYIEGKVIFQLLRYITSIWEEKYDPKTKKVPIIIPMVIYHGREIWNVETNLLNMVQGIEDLPNELKTYLPTYRYEICDFSIKRKKRIIGLTAMKVAIEAMRAGTAMTKEEFKERLRRVFAYIKQLPKEQVHEWFEECMIYLLNVREDVTIEEILKVQKEIMPGRGEIVMTIAEKLRNEGMEKGKIEGERKGKLEGEREFAIRILSKRFGNQLTEEIKDRIREADEKTIDYIGDNLLEITIEELKDLVK >NC_010003.1|WP_041534092.1|1340012_1340600_-|hypothetical-protein METLEEISKREREEARLEGEKEGRIIGRIEGEMVGIQIGKLRERKEFVIRILSKRFSNRLNEELKDEIRKAGEKTISNIENNLLEITIKELEKIKITNVFDTLEKMIKMGKEKARLEGKIEGFKKGRIEGEEEGIEKAKLEERKECEIRLLSKRFGRRLTKELKAKIREADEKTIDYIGDNLLEITIEELKDLVK >NC_010003.1|WP_155811074.1|1341104_1341275_+|hypothetical-protein MSNNVESLKNQDDPVKTLIQKYPRIIVLKAVFNLLDNEENIDLESLENEVIKLLKN >NC_010003.1|WP_012209068.1|1341308_1342316_-|alkaline-phosphatase MLPEGEVVPTIAEVLAEQGYKTGVVATSRITHATPAAYYGHTNDRDAEQVLAEQLVNSNLTVALGGGWRYFDPTQRSDGKDLISVAKENGFDYITTKQELMAYSGDKVLGLFSSSHMNSVTERTPAEPLLPEMTAKALEILSKDDAPFFVMIEGSQIDWEAHDNDVFGIWKETVEFDEAVKVALDFAKENPDTLVIVTADHETGGLGLSSGGYTMDLEMVRDYQKTTDWVVANSQDMEELKSNVKEYYGFDLSEEEVAYLESAKNKVDALGEITSARASIGWTTHDHTGALVPVFAFGPGAEEFVGIMDNTDLPRKIASLVGVELSYPLVNVPNN >NC_010003.1|WP_012209069.1|1342460_1343597_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MLKTYKFRLYLTNEQVEKFSQHFGHTRFIYNLFLEFSSNAYKNTKTSMVNYNTWCKILTVLKRSEKYHWLNDANSQSLQQSIKDLETSYKRFFKKQAKHPKFKKKSSRQSFRVPQHIQLYENEGNDKYGILFVPKFKEGIKVRVHRKIDPNAKIKNCTFVKTPTDKYFVSITFEVEGSYPERDIDYENSIGMDMGLKDFVVLSDGTKYPALKVLSKYERRLKHAYKIFSSKEQGSKNWDKAKLEVARIHEKIKNTREDFLHKLTKEISENQADLFVVETLNIRGMLKNHHLAKSISDSGWYQFKTFLKYKAERLGKKVIEIGMFEPSSKVCSVCGYKNEGLKLSDREWVCPECGTKHDRDVNAAVNIRQCGIKQLVAV >NC_010003.1|WP_012209070.1|1343878_1345297_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MKDAKGHGKSIQLRLEGFLHEDKGEPENNVEAPSITSTSERGRNDDKGCSEGMLEKILSKDNMNKAYKKVKANKGAPGIDGMKVEELFGYLRQHGEELRQELLEGRYTPKSVRRKEIPKPDGGKRLLGIPTSIDRVIQQSIAQVLTPIYEKKFVDNSYGFRPLRDAKQAIRKSKEYLNKGHTWVVDIDLERYFDTVNHDKLMRIISKDVKDGRVISLIRKYLKSGVMVNGVVIETEEGTPQGGPLSPLLSNIMLHELDVELTKRGHKFCRYADDCNIYVKSEKSAYRVMESITKYIEKKLKLKVNSKKSKVVRPWDLKYLGFSFYVKEEKYEIRVHGKSIKEFKKKLKGETKRSSGRSMAYRLSRIKQIITGWTNYYGIANMKSVAGSLDGWLRRRIRMCIWKEWKKIKTKHENLVKLGLNTYKAWEYANTRKGYWRISNSPILSMTLTNKRLKEMGLTSILETYNLKHQFC |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010003_4 | 2069951-2070245 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_010003_4
|
4 spacers
spacers of NC_010003_4
>4.1|2069982|34|NC_010003|PILER-CR ATGAAAGGGGGGAGGAACGTAAAATTTACTTATA >4.2|2070047|34|NC_010003|PILER-CR GCTTTGCTCTGTTCGCATAAACCAGCTCACAAAG >4.3|2069981|35|NC_010003|CRISPRCasFinder,CRT CATGAAAGGGGGGAGGAACGTAAAATTTACTTATA >4.4|2070046|35|NC_010003|CRISPRCasFinder,CRT TGCTTTGCTCTGTTCGCATAAACCAGCTCACAAAG >4.5|2070111|37|NC_010003|CRISPRCasFinder,CRT TTTGTTTTTCATAAGCTTTCTGCCCAGCGTAACCCGC >4.6|2070178|38|NC_010003|CRISPRCasFinder,CRT GAGATATTGACAATGAGAATACAAATGTATATACAATA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010003_4
The CRISPR arrays of NC_010003_4 >merge|NC_010003|4|2069951-2070245|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAACCATGAAAGGGGGGAGGAACGTAAAATTTACTTATACTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAACTGCTTTGCTCTGTTCGCATAAACCAGCTCACAAAGCTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAACTTTGTTTTTCATAAGCTTTCTGCCCAGCGTAACCCGCCTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAACGAGATATTGACAATGAGAATACAAATGTATATACAATACTTTTTATCCTACCTATAAGGAATGGAGTT >NC_010003|4|1|2069951-2070111|PILER-CR CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAACC ATGAAAGGGGGGAGGAACGTAAAATTTACTTATA CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAACT GCTTTGCTCTGTTCGCATAAACCAGCTCACAAAG CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAACT >NC_010003|4|4|2069951-2070245|CRISPRCasFinder CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAAC CATGAAAGGGGGGAGGAACGTAAAATTTACTTATA CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAAC TGCTTTGCTCTGTTCGCATAAACCAGCTCACAAAG CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAAC TTTGTTTTTCATAAGCTTTCTGCCCAGCGTAACCCGC CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAAC GAGATATTGACAATGAGAATACAAATGTATATACAATA CTTTTTATCCTACCTATAAGGAATGGAGTT >NC_010003|4|1|2069951-2070245|CRT CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAAC CATGAAAGGGGGGAGGAACGTAAAATTTACTTATA CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAAC TGCTTTGCTCTGTTCGCATAAACCAGCTCACAAAG CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAAC TTTGTTTTTCATAAGCTTTCTGCCCAGCGTAACCCGC CTTTTTATCCTACCTATGAGGAATGGAAAC GAGATATTGACAATGAGAATACAAATGTATATACAATA CTTTTTATCCTACCTATAAGGAATGGAGTT
>NC_010003.1|WP_012209658.1|2066973_2069496_+|adenosylcobalamin-dependent-ribonucleoside-diphosphate-reductase MRVLNKWIQKEPSKNAITILKDRYFLKDGEGNYLESTWDEVAKRIARHVAAAEVNYTNDIEEIKNAEEHFYQLIKSRIFLPNSPTIFNAGKTMDRQLFKKDIEETTLEDYKTIFDSRTKHNMLSACFVIPMDDSMSAIFDAVKNAALIMKYGGGVGYDFSVLRPKGSSIAGTGGKSSGPISFMHVFNTAASTIEQGGARRAAQMAVLRYDHPDVFDFINSKKDNKGNNVLNYFNISVNIDNPKEFKKMLEEDGDLTLEHPASSIRKTIKANDLMNKMVENAWKTGDPGMLFLGRHNQYYAMSEHTPVTATNPCGEEPLPPFGSCNLGSIDVAKLVEDMDLGNPNSPDISEFQEIVYWAVRFLDDVIESNIYPLKEIEEISKKQRFIGLGMMGLADALYKKELPYNSEQARKFMAKLTAELAYFSHVASTELAKERGNFPDFQRSKYPNGFIPFPMLDDEIDEDIKVWNEKIRQHFQGEATKYKRNVQTNTIAPTGSISNLADTSSGIEPNFLLSYVRYMTNKEGDRVPLSYINPILMEKIGTNMTEELKAEIIEKGSIQNIDSIPNEIKKIFVTSMDIPPKDHLLAQHVIQSYLDASCSKTINMPKSSTIEDVKAIYLQALELNLKGLTIYRDGSLETQVLTSSSQEEKETSETQGKSVTFFVLDEKHKLRARPRKETLRSVTRKFKHDTGTVYVTVSFDDAGEAVEIFLSDGTETAEVIGRLSSIALRAGVSTDEIVEQLKKVKGTYCKGLAQEISKALNDFNQLWGSKIEDYEVIRTGTPKTREEVEKFVYANDLKYDKGYYIDSEGNAYCPSCLSKNTLVNESGCVTCTTCGWSKCS >NC_010003.1|WP_012209657.1|2064311_2066879_+|alpha-glucan-family-phosphorylase MDFISKITVVPKIPEKILGLKELSENMWWTWNYKTQALFETIDKELWESTQRNPVTFLKRVEQKKLNTAAEDSKFNELYQEVMKEFSNYMNENSNTWFSKTHRSFKDGEIAYFCMEYGLHESFPMYSGGLGILAGDHLKSASDLGIPLIAIGLLYQKGYFIQRLNSEGWQESIFLDYDFSDFPIIPAKESNGDEIYVDIDLLGKKVFAKVWQVKVGRVNLYLLDTNLMQNDPEDREITSTLYGGDIEMRIKQEILIGIGGVKAVRKLGYNPSVWHMNEGHAAFLGLERIRELVQEHGLTFQEAIEAVRAGNVFTTHTPVPAGNDVFSISLIDKYFGDFWPKLGASRQDFLNLGLEKRQNAEELFSMTILALKLSGRSNAVSRLHGEVSRKLWNHVWPGIEWLEVPINYVTNGVHIDTWLNPKLQESLKEYLGADWMSKIDDPELWEKIDNIPDHELWETHQQLKKELIEYIRKSIKAQRSRHGETVEQLEEVNQIGDEKALTIGFARRFATYKRADLIFSDEERLKKILNDPDKPVQLIFAGKAHPADKPGQELIKKIYEYSRKPEFQNKVIILENYDMDMARHLVSGVDIWLNNPRRPREASGTSGQKAGMNGAINFSVLDGWWVEGYNGKNGWAIGDNRDYEDLKLQDKIDSVSIYNQLEKQIVPMYYEKGETDVSKEWVSKMKESIKSVTSFFNTARMLKEYTQKLYMPALEQHTRFSNDDFKLAKEFAGWVKLLKENWDSIKIHVKLDQDLTGVKNAEEEIGVQAEIYLPGIGPDSILPEVVFARLKDGKIANIRRYDMKLIKEVQKDTYLYSVKFKIEDRGEYGINVRVTPNNPLMPHKNYLMGLVKYPQ >NC_010003.1|WP_012209656.1|2063449_2064184_+|hypothetical-protein MEEKEKNQSNDSLKNLLIIIGTMAVIYFATFILWNLYVENLESHYYYPYVKIKETGYERVKKMPFSPKGYNITIEKSNITNTYTVKTKFGSFNIQTFDDRFFFFENSDMVVVSYPSYDFRGLEYSVILKNGSIFKFVIVPNEEIVEDIFTFVENLLRIRVLEIPELANYEYIKESENSYTIVSNDQEFTLSKNLISTVGESQDYIYFISKKYGLFNKIYYLEKSTNNFGELIMISESQEFWSNN >NC_010003.1|WP_012209655.1|2061125_2062853_+|NAD+-synthase MKIRISLAQMNSTVGDYPGNVEKIKDFISKADEKGADIILFPELSLNGYPPEDLILKTQFLKDSLKSIEEIQDFSKSKDVVIVLGAVDWDVESYNSAFVIYKGEIYGSYKKMFLPNYSVFDEKRYFTAGRAPFLMEMERIKIGITICEDLWVPNGPAVSLAQNGANLILNLSSSPFYKGRNKVRFEMLKTRASELSSWIAYCNIIGGQDELVFDGGSVVINPYGEIELSAPSFEEGLYFIDIDPLEPTRANLREGKRKHYNQSAYYESVNTIKIEKKIREKTPIKAVKVDSFDIYEQLYLAVKTGIKDYVLKNGFQKVVLGLSGGIDSSLTAAIAADAIGPENVVGLLMPSQYSSKGSIDDSIELSKNLGINYKIIPINDIYEKYIENLKESFKNTDEDKTEENIQARIRGNLVMAFSNKFGYLALACGNKSEAATGYATLYGDMAGGFSPIKDLYKTDLYKVARKYNELHGKEIIIKSILEKAPSAELRPNQKDEDILPPYALLDEILFKYIDREMSYDELLQEGYDEGLLKNVINMVNKNEYKRRQSAPGIKLTERSFGKDRRMPITNKYIPW >NC_010003.1|WP_012209654.1|2060141_2061044_+|phospholipase-D/transphosphatidylase MKTKLTLTALFLSFFTSIFSYELFFSGGELVHFINQKLTTSTSVKVVSFSLDDTISENLSAINHQIFLEKDGGYSGDLNLTIKYDKNTDGYLHQKYMIFDNNSVLFGTGNFTTSGLLTDLNIFIYTEDEKIVKVFLDEYENFQRGKFGYSKEVINKRLNTTEFGKVKIITGPSKEVLNSVLNEIKRSKISLKVFSYSFTDPYFVHVLEQASSNNVKVEILSDDWNKIYTSPLKYMQGINIKYRNDIHAKCITIDGETVIIGSYNLTYRAREKNDEMVVIIKNKGLADIINRKFDLLWQEW >NC_010003.1|WP_012209653.1|2058359_2059778_-|glycosyltransferase MKVLFLNPQGNFDKNDSHLTEHPDFGGQLIYVKEVSKELANLNVSVDIVTRQIIDRDWPEFSKELDYFDINKNPTIVRIPFDGEKFLNKEQLWPYLKEYVDNILSFYKGKNIDFITTHYADGGYSGVLLRSKLGLNFSFTGHSLGAQKMDKLNVSSKNFEDLDKEYHFSQRIMAERLSMQYASKIIVSTSMERYEQYSHPLYADVSEVANDSKYKVIPPGVNTEIFNDDLTDLDQDTVAQIENKLNKQQKPFIVLSSRLDAKKNHIAVVKAYANSRDLQDKANLGIFLRGIPDPFTDIQKLSEKERSILTPILEEIEKADIKDKVYFFDLKSQLALATAYKLFSKLKSVFVLPSFYEPFGLAPIEAGACGLAVVATKNGGPSEIFSDGSGVLINPEDIQDIVEGLIKALNNYDYFSKKVKKRVLENYTWKSTARGYLEVIEEGVKLPKKTLEKVPPLDANEIILDYLKNKKI >NC_010003.1|WP_012209652.1|2056702_2058298_-|AAA-family-ATPase MLLSLSIKNFGLFKSANVDFNDNFCAITGESGTGKSMFLNALNLFLIGNVPQNLKTSEGSVSAYFTVNDFIKEMLREYVPFDGDDLILAVNFTPKKTLFRVNDTIVPKNVVQDISKYLLEIHSQDSNIALRDENYQNSLIFKILREKFPEYFFDYDKGYEEYLNLKRKLENLPTNKTEIFRNIDILNYQIQEIEEANLQPHEDDELSARFKTLNNLEEIRERLVESLNILKDREEQSIDEEIGYIIYNLSKLKDFGFIEEHSLASSIQEQIAELYTLLENRLSQLDSDPEELERVSERLNKIIDLKRKYGPSLDDVLKNLNKFRIQKNELEEIKNDFHELEPRLYKLKDELLELSDKIIEEVTPFLNDLKSNIENNLKDLNMENSKIDWKIERLKEPKKEAAHRITFLLKTNPKSDFMPLSEIASGGELSRIILAVEVVLGKNHAIDTMVFDEIDSGVGPRMADVVGNKLNELSKDKQIIVITHMPQVANFATEHFKIVKSSNEETSSAIIKLSENERLEEIKEMYGNIVY >NC_010003.1|WP_012209651.1|2056065_2056686_-|hypothetical-protein MYSREDLIKKIVDEKGLQAIPNLIELLDDEDYEVRELARDALSVMAPEGKEYLLQEFKRRFNLNFQDDTVLLYLAELLSDLKCHEIVENLKMMFNKFSDERAFPLIIENLLKITKDESYLDILKTYIDSDEWEIEEISVMAITELPNRKTLDILLEKYYKTSNNSLKVLILDSITKILSKNFDLVPYLQERDPEISEKLQWHLKRS >NC_010003.1|WP_012209650.1|2053908_2055324_-|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-radical-SAM-maturase-HydG MFWIRDKENQKPFIKEDEIFNILEGTKSPSKLKVRDIIQKSLSKERLNPDEVATLLNVEDDETLEEIFEGARTLKRNVYGNRIVFFAPLYIGNKCINNCEYCGFRSSNTEIYRNSLSFEQLEKEVKALEDKGHKRLILVYGEHPDYDADFIAKTVETVYKTKNRNGEIRRVNINAAPQTIDDYKKIKEVGIGTFQIFQETYHFDTYKKVHPKGPKSSYIWRLYGLDRAVAAGIDDVGIGALFGLYDYKFEVMGLLYHTIHLEERFGFGPHTISFPRIEPALNTPLSEQPPYLVNNNEFQKIVAILRLAVPYTGLILTAREPSHIRNEVLKLGVSQIDAGSNIGIGAYSTEDQQAYKKSQFTLGDQRSLDTVINELAIEGYLPSFCTACYRMGRTGEHFMEFAIPGFVKRFCTPNAILTLLEYAQDYAPENTRISIEKRIEEELKVMNEGPLKEKLLERMDLVKAGKRDLYF >NC_010003.1|WP_012209649.1|2052747_2053890_-|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-radical-SAM-maturase-HydE MKLQNEEILKILQSNTPHSTSQWDDYSNFSEKVQNIVNYFISNETIEKEHIIQILSLKKEDKDRDDLFNVANLIRKTYTGDYINIKGVIEFSNYCKKNCYYCGLRAKNPSVQRYRMSPKEIIEVANQAAILGLDTIILQSGEDDRYTDDDLIYIIREIRKNTSLPVSLSIGERSFSSYRKFRKAGAVRVLLKHETINKNIFKNIHPEKSYDNRIELLRYMNSLGYVTGSGNIIGLPGQTLEDIADDILFMRNENIRMIGMGPFIPTENTPLKNHPRGSGELTLNAYCATRFCVPRAQMPTTTALGTISPDLQYQGFFAGCNVIMVNITPEVYRKNYNIYDNKIKVEFYETYEKIKQLGFSPSKITQKRMEDGNNASNIRL >NC_010003.1|WP_155811099.1|2070355_2070535_+|hypothetical-protein MLYSTLFNKYQKMSVPIRTVDICSNKNLPCLSLMLQKNPYLGLGHLEFTVFIRKYLLPK >NC_010003.1|WP_012209659.1|2071314_2073357_+|heavy-metal-translocating-P-type-ATPase MKHRNRQTKHNMNAEHTNHTDGGGHASHHAHMVADFRKRFWVSLIVTIPVLLLSPLIQSFFGYSIDFAGSMFFLFGLSSFVYFYGGWPFLEGLFQELKKKQPGMMTLIALAISVAYFYSSAVVFGVEGKVFFWELVTLIDIMLLGHWIEMKSIMGASQALEELAKLMPSEAHRLKESGDIEEVKIEDLQSQDKVLIKPGEKIPVDGIVLEGESDVDESAITGESKPVSKKKDDKVIGGAVNGEGSLTVQVTKTGKDSYLSQVIELVRIASESKSRAQGLADKAAFWLTIIAITAGAATLITWLVLGKEFVFALERMVTVMVITCPHALGLAIPLVIAVITSISAKNGLLIRNRTSFEGARNIDVVVFDKTGTLTKGEFGVSDIVTFGGWKEDELLRDVAAIETNSEHTIAKGIVKKAKEKKLDLPKVENFSSLPGKGAKARIQGKQIFVGNKGIFEIAEVSSTDDAQKQANEFASQGKTLVFVASENKIQGIIALSDIIRDESKEAIKRLKKQDISVSMITGDNQATAKFVADQLGLDSFFAEVLPDKKSEKIKKLQSEGRKVAMVGDGVNDAPALAQADVGIAIGAGTDVAVETADVVLIENDPRNVLDIIRLSAINHRKTVQNLAWATGYNVFAIPLAAGVLYSYGIILAPAMGAIIMSLSTVIVAINSRLIKFQKEY >NC_010003.1|WP_081429301.1|2073387_2073546_+|hypothetical-protein MGKPNCTQTCPEVFQLEEGKSKVIVDTVYKEAEVKCREVEARCSVQAIFVTE >NC_010003.1|WP_155811123.1|2073592_2073724_+|hypothetical-protein MAQDFLQNYLPSEVKKVLDLNYLTNTFSLNTKVTIMPVCFCNF >NC_010003.1|WP_081429302.1|2073669_2073819_+|hypothetical-protein MLFEHKSYNNASVFLQLLKYPLKIWEEKYITKTNKLSIIIPNQCQVFKL >NC_010003.1|WP_041534156.1|2073843_2074098_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MAYDVNEKRVAKVLKKARQYLNWVQNSLLEGEITKAKYEILKQQIRKITKKDEDSITWYIFESRKIFIKETYGVEKGEPDDFII >NC_010003.1|WP_012209661.1|2074112_2075114_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKPIYIFQSGTLSRKGNTLAFKNESDEKTKYFPIENISEIKIFGEININKRLLEFLSANNLPLHFFNHYGFYVGSFYPYEHNTNGITIVKQVEHYISSEKRLVLAKKFVEGAMQNILKIVQYYERKNDLTIKRYSQKMEEFIQNIPQIGSINELMAQEGNYREIYYNFIDNNIISNEDFKMVVREKRPPTNYLNTLISFGNSLMYSTVLTQIYQTPLDPRIGYLHSTNFRKFSLNLDIAEIFKPIVVDRTIFNLVNKKIINENHFKKVQGGIHLNEEGQKNFIKNYEEHLSTTLKHKKLKRNITYRTLIKHEAYKILKHLIEEKEYVPFTMRW >NC_010003.1|WP_012209662.1|2075115_2075628_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDDNIITGYSVLAYSICPREAWFVLRRFTPEQDNPYIELGRFLHKNSYEGKGEKEIKLPGAVIDLIWNDNKCTIVGEIKKSSKSFKGAKIQLLYYLKLLEDMGIQAKGEILLPKEKKRIPIVFDEEAKKEIQDTLLKLNELIESPIPSPPKWIGVCSKCGFAELCWAGEE >NC_010003.1|WP_041534157.1|2075620_2077822_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEMMKLFGFLNGQESHPDKLLKDHLEGVFEKSKEISNFHGYNDLVDPLKPICLTHDVAKSHVKFQQYLKTKKGKYPHSEPSSYLTFMLTKDVFQAEIVRRHHSYQLNFEDIMSFWRNLNYQDVIKALEEFLDLNKIEYLTEKEWKRLIFQSWHSQYLLNKTVKAEELWFNTRIENSIFITSDRLDALNVDRINFDKISYQQDRFDKFLESLPKNHLSDWKNKIRESTLSNVDTISEPGIYTITLPTGAGKTLTGLQASMKLANKLSLKTIIYVLPFISIVDQNSEVAKKIYDKVQEDHHLVSASKEKEDLDNLERFILSFRYFKEPLIVTTLAKFWEVLYSPNANDSMSFHRLKDAVVILDEPQSIPPEYWQGFGETMSFLSKKMGTYFILMTATQPKIAEGKELAPKSSFPKNRHCYNIVNEKIKLSDIKQFTADRTDNSSLLILNTRKEALKAFILLREHLKSNLFFLSTWVIPKERLERIKQIKQLENKNLPRNLISTQVVEAGVDLDFDYVFKDLSPFDSIVQAAGRCNRRMLNKLGTVMVAEIVDDDSENERSYASYVYDSISLNKTKEIFSNKNKFSENEVQELLDKYYTALSVSKYQKGPWYEIKEGNWSNYKPLIKEHLYEDVVFVDSDGTVSNKLYEIESLEHSLENYERKKQLWKEIQNYSINVPHKELEEWENYCNEVFLEDDKKLEYKGNGIWLITQLGIGEIYSEEVGFIPYELKEDFHG >NC_010003.1|WP_012209664.1|2077766_2078495_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MALVFDITGEYAMFRKFYTTTSSASYPFPPPTAVGGLIAAIIGVENKSENKAHLASYWEALYGNRISISIRSPIKWFTTSINLWNYKDPKKGIHNIIKHQFVKRPKYRIYVEGPIEEKLKPFLEQGNFVFTPYLGTAYSFANIDYIGSFNPVKINDGEVNIKSIIPADIKPKINLKKTKGIFKDIVPLQMDEERGLTKSLSVFYPVNSDTGIIVDNPEEIGGVLVGNDEIVWLPEWSRKPSG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010003_5 | 2082391-2085301 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_010003_5
|
43 spacers
spacers of NC_010003_5
>5.1|2082421|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGGAAAAGAAAGAAAGACATCAAGAACGTTTGACC >5.2|2082488|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCATCCACATAGTAGATTATTTGTTATGGATTATG >5.3|2082554|38|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTTCATGATAAAATCATCTCCTTTTTTAGTAAAA >5.4|2082622|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATAGTTACTATGGTGGACGTACTGAATTGATTGA >5.5|2082689|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCATATTTGTCTCCGAATGAATCAAAAAACACT >5.6|2082754|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGGCGAAAAGGAAATCATGAAACGTATTGGTGAATT >5.7|2082821|38|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCAAGAAAAGGCGATAAAACTTCTAAAATATTCTAT >5.8|2082889|38|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAATGAGGATATAGAATATTGTAGGCGTGATGTTGA >5.9|2082957|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAATTGTATCCCTTCGGTACGATAAAAGAATAA >5.10|2083022|39|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGAAGATGATAAAAGGATTTGGCATGGTGATAAAAGC >5.11|2083091|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTATAGAAAGTACACTGTACTTTCTAAGTCG >5.12|2083156|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTAACAATTAACAACGAGCCAGCTCGAATGAAAAT >5.13|2083222|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGCATTCTTGACACCTTGGAAGTTTTCAGTTATTT >5.14|2083289|38|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAATTGGATACTTTCAAATATCTACGTGGAGGGGTG >5.15|2083357|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCGTGCCGCTGACGTTGTATAACTTGAAAAAAGAAT >5.16|2083424|38|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGGTTAAGAATGAGAGCACTTTAGAAGAGAGACCTGT >5.17|2083492|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTCTCAATAGGTTCTTTTGGTTGAGTCTGTCCTG >5.18|2083558|40|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCCTGAAAAACCGTGTCGGTTTTTCCGTGTCGGTTTTT >5.19|2083628|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAGGAACCTAAAAAAGAGGAGGCAAATAATAAAA >5.20|2083694|40|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAATATAACTTCCATCACCATTTTCAATTATCTTTGCCA >5.21|2083764|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCCGTCTCGCACGTCCGGCACTGTGATGCTGTATC >5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTGTATACAGAAACAGAAGCAGACATAAAAACA >5.23|2083895|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGACACCAATTAGATCCATAACAGTTACCTCCTTAAG >5.24|2083962|39|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGGCGTTTGTTTCGGCTCCGTGTTTGCGGCTCCGTGC >5.25|2084031|39|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCATGAATGAAACGCTTCTTTTGTCTTTCTTTGCTTCT >5.26|2084100|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTAACTTCCTTCTTTCAACTTCTTTTTGTAACTT >5.27|2084165|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATACAGTATTCCCACAAGTAATAAGTAATAACAA >5.28|2084232|38|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATAATTTCACAATAATAATTTCTCAACAAATCATC >5.29|2084300|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGCTAAATTAGCAATTATAACTCCTTTTTCTTTT >5.30|2084366|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTATTCAACATATCAACATTATTTTCTTTCTCA >5.31|2084432|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCGATTTCTTCTATGTACATTTTTTCCGACAACTCG >5.32|2084499|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAGATTTTTGTGTTGATATTTGTGTAGATATTTA >5.33|2084565|38|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATATCATCCTGTCTTCCTTCGTCTGTGATTTTCTCC >5.34|2084633|38|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTATTTCTTTAACTATTTCTGGTTCTAATTGTTCA >5.35|2084701|41|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGAAATATCTCTTAGTTTTTTTTTTGAACCATATAGTAG >5.36|2084772|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTAAAAAAAAGAGATGATTTCTCACCTCTTTTTTC >5.37|2084839|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTTCATTTAAACTAACAATCTTTGTATCTTCTTTTT >5.38|2084906|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATGAAAAGTAAAGTGAATACTGCTAAAACGCCCC >5.39|2084972|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTAAATCTGTGAATACTTTTACTTTTCCTTGAAG >5.40|2085037|37|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCCCCTGAGCTGAAGCTAACATACCCTCGGTGTACC >5.41|2085104|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCCTTCACATATTGGTCTACTTCACCATGTATCC >5.42|2085170|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCACTCTCCTCTAAAGCTCCTCTTTGAGCAGCTAAT >5.43|2085236|36|NC_010003|CRISPRCasFinder,CRT GTATATACAGCATAACGCATTGCATCCATTGCATGG |
cas6,cas8b1,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010003_5
The CRISPR arrays of NC_010003_5 >merge|NC_010003|5|2082391-2085301|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_010003.1|WP_012209668.1|2081382_2082129_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLNVQFSLNSLILPLNYNHIIQAFILDLIDNAEYRNFIHNEGFSYNKRKYKLFSFSRLSGKFSLNQKDKTIEFSDNVSLKISSHDKNLIQYCADSLLFKDDFELLGQKIHVEKLEYDDLEIKSDKIKVKTLSPITIYSTIVQNSSKKTIYFSPSEDQFSKLIKENLIKKYLAYYDSYLSKKISNDEFVIKEADQKGSKMIITKYKNFIIKGWHGVFEIQGNPSLLKIGYDSGFGAKNSQGFGLVEVI >NC_010003.1|WP_012209667.1|2079882_2081361_-|hypothetical-protein MGFIEAVYTIGKEFSSKTDEITDYLAIPVRTDGSKEIRIYLKVSNYSTLKLQSEKENTIIPLKIEGVSKIDEADFFADSKDEQYKKLRYLYKEPPGSNTDWRYSPVLRISKPKSTREKNREVLLNGSKSYISKIEKMIQDFEDLGFFEKGSVQKIINDLSNNDFVDRFLECYSDPKASYLIVFGIEDDGQFLYPGEVKLFQQYFLKKLNEELNKKNVSKKGGVCDYCGKESDILLNFDMIFPFATFDKVNFLPAINKNFSNKVYKYCKDCFKTFSNAKTYIDYNFVDQSIINNIQIWIIPEFFTTDTNILDDAFNDLKNYFWSDQYTKEKDLLDYITDPDYDVDKPYTAVFHFLFLEQNQAQLVIHQMIEDVPLTRIQKLHQIWEETVQLLAKKKDTQLSAALKHIYRTLRHLVLKEDSEEKVMRTLTMEIIGKILSGERVETKTIKQNFVARIPKLMNDKVQNDYFHLTLNDFLLLIEFLNNYNKSWRYSL >NC_010003.1|WP_012209666.1|2079400_2079886_-|hypothetical-protein 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MIVERVIEEAQPYLEGIKIKDAVIGISLIGMELSNNHVGVSYVLREDLKSGCSIFPYAQDIIGKDSLEIAEWALTGQDDLQRSIGVAVLTAASRSLPLVDVDTSIHPFSIEITPEDNVCLIGYIPQVANMFNGMVKNVFIFDRGISKKGGIFGKVLPEEEQKGILPKCEIVFLSGTTVINHSLEYLLSLCKNAREIVLIGASTPMFPNAFVGTRVSILAGSWWDEREKDKIFRIISLAGGISHISKFAIKKNVRV >NC_010003.1|WP_012209670.1|2087208_2087724_+|cob(I)yrinic-acid-a,c-diamide-adenosyltransferase MERSFVHVYTGNGKGKTTAALGLSVRAALAGKKVFFAQFIKGMEYSELKVSQYIKNIDIQQFGRECFIYKKPTEEDIEAAKRGMDICEKILKGVEYDLVVLDELNIALYYKLIPLDRVVKAIKERTPSIEVVITGRYAPEEIIEMADLVTEMKEIKHYYNQGVQARKGIEF >NC_010003.1|WP_146026671.1|2087945_2088440_+|hypothetical-protein MNDSNLVHEDHLHPEVILWVNFSEESKKEFLDKIKKQDEDLAQDISEHLSQFKIEEEVVPVNLPLDVDTEEEFDKFMYFLGELAEIVDLKAYSVITEVSLADEESEKEDFEDLYNFPAIFSEEKEGSCYLTVFDWDLKEMEEYSGKFEKNEKDIEGLRFPFFQS >NC_010003.1|WP_012209672.1|2088520_2089270_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKAINLTKKFKDFTAVDGINLNVSAGEIYGFLGPNGAGKTTTIKMLTGTLKPTSGQIFIMDKDYNNYELEIKREIGVVPDEPKMYENLKGSEYIEFVMNVYKLNSNEIHSRFNEICDAFGIDYLNDYIGDYSHGMKQKLMVASVLMRKPKVIFLDEPTVGLDARAARILKELLQKYKSEGSAIFFTTHILEIAEKMCDRIGIIDHGRILAEGNLEELRSLSKLGNRSLEDIFLELTGGSEVKEIIDEL >NC_010003.1|WP_012209673.1|2089291_2090887_+|hypothetical-protein MNELKLLLKYSYKNKSRPTKNKKGIERGSGMLSSVMSYLIVPIIFLAVIIPTMLAAAGSFNLNIPLNQIGLDSNYTLLELMFAPSFLFVSAIFVLQFSPLIVTTLFDNDMMDILLTMPIKRSTLFFSSTIDSLIMSGIGSGAFLSIVVSYMILKGSNIILSILGIIGFFLFLISISIVIGLIMSFFVGKTSAKRIAQLTYFIGLIFMVLIPQFLPRMMTSDPQNLVEGMGNSLKVFMNPLWPHAQFINAINGSIFSLVFIYAVSILFFYLVYRYSNNLDFSTSRKKSKVKKIEKFKTKRLPLFEKDRKLLFRNSQLIFMMIYPVVLPFIFFFTGMQDLSYITIFFVLIAADYSAMISAYMLTEEIKIWPVPKLFPFKTRTMVNSKIMISTGLYTIEFIALIIVFSIVLKFKLFDLILIIPTVILLYYSSLLGTRIFLSDPKRDVSQMNKVFKGKEVLVIELITMGYAAAIFGLLFFYDLMLAQGPLWIFKNISMQLTSLIILGTVAVLLLVIIRSIGKEQRKINQYIEAME >NC_010003.1|WP_012209674.1|2091311_2091968_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MVENKRLKVTILYDNTVYDKDLQANWGFSALIEVGKAPKILFDTGGSGDILLNNMKKLGVDPSTIDEVFISHNHYDHVGGLSGFLSKNPDVTVYVPPSFRGVKNAKEVITIKGPIEIHEGIYSTGELEGIEQSLCVKTEKGIVIIVGCSHPKMENILKTASTFGEVYGIIGGLHGTPAESLKGLKLICATHCTQHKEDIKKLFPEAYIEGGAGKVVEI >NC_010003.1|WP_012209675.1|2092020_2093415_+|YfcC-family-protein MEKSVKISRNMFITSALVIFSIMMISGVLTILLPAGEYQREFIDGRTVIVEDSYQTIEKPNYPFWRWFTAPIEVLWSSDAPLIITIIVFILVVSGSIYILNKNHVIEYIINKIVKRYSKQKNVLLGLMILVFMLLGALMGIFEEIVPLIPIVIMFSVSLGWDDLTGLGMSLLAAGFGFSAAIANPFSLGVAQRIAEIPLFSGIGLRIIIFITTYLLLFFFLRNYAKKHQKEVVDQQIETIDYDVNTSKASKILITIISILFILILISGFTGFMSGLMLPVVGVLFMVGGFLSGLVVEKSISKVFKDFLIGMSNLLPGVILILMAMSVKLIITNGKILDTILYNASIVISESGTVAATFLIYLLFFIMNLFIGSASAKAFLTMPIVVPLADLVGITRQTAVQAFVFGDGFSNLLYPTNAVLLISLGIAGVSYLKWFKFIWKIQLAVFILSLLYLYIAVKIGYGPI >NC_010003.1|WP_012209676.1|2093429_2094524_+|DUF2817-domain-containing-protein MYDYSYDYDECRKNFYTFENELKKYYSTVSNDSYSIEEDSYIDSFLCQNEGNRKLFLITTGEHGIEGFAGNVFMQIFVKEFLHRIKNQEISLFLIHSLNPWGMRHKRRVNENNVDLNRNFLYQNEDLNNESYEKMQRYFTKKGSVGVLDSSLILGFFELLPYLLKLGTKGVKEALTKGQYDDNKSVYYGGKKEEKSTKYIKGIYERVFNSYEFILHLDIHTGAGSKDKLLIVNSAFDKEDCNIREKQFNYSPITQAKKETFYSINGDMIDYIYKKYHSTSNFYSTCLEYGTYGEGLIGQLKSIKSLVLENQAWWYGTKNSQVRSKVDKLFREMFFPERNEWRNSFEEDTKKALNGILKYFEFLK >NC_010003.1|WP_012209677.1|2094598_2095522_+|L-lactate-dehydrogenase MKISIIGTGRVGSSTAFALINAAVADEIVLYDLNKEMAEGEALDLLHATTFHKRMIIRAGEYSDIEGSDIVLITAGAAQKPGETRLDLTIKNAKIIKGISENIKKYAPNTLIINITNPVDVMSYVVWKVTGFESNRVIGTGTILDTARLRALIGKNCGVSPMSVHAYIIGEHGDSELAAWSSAMIGGVPIKGFCRNCPYKDNCNKDLSKIFDDVKNSAYTIISKKGATNYGIASATTALVESIIKNEGRVYTPSVLLDDVYIGYPAVINKDGVERTIDITLNDEETEKFESSKSIIKEYLESIKNLL >NC_010003.1|WP_012209678.1|2095536_2096220_+|DUF3298-and-DUF4163-domain-containing-protein MKKFLSIFLLLILFSITLYSIEYITLSSDLSENLGGRVSIPFFYGTKDAPSAFLLNSYLVKDVEDFLSEYLDQLYGLRNSIDESEEPYVQVVIESEIGFVSDSFVSFYTDYFSYVYHQAHPMTTRKTYNYDLTLSKFLNLYDFLALYSEDTGESFRIIKESIIEEINADPKIYFNVDETLDTIGYDRDYYITNEDFVVIYQLYEIAPYSSGIREFKIPLKELGIEIQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010003_3 | 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder | 1333723-1333739 | 17 | NC_010003.1 | 1333754-1333770 | 0 | 1.0 |
NC_010003_3 | 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder | 1333723-1333739 | 17 | NC_010003.1 | 1338232-1338248 | 0 | 1.0 |
NC_010003_3 | 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder | 1333723-1333739 | 17 | NC_010003.1 | 1338263-1338279 | 0 | 1.0 |
NC_010003_3 | 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder | 1333723-1333739 | 17 | NC_010003.1 | 1339789-1339805 | 0 | 1.0 |
NC_010003_3 | 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder | 1333723-1333739 | 17 | NC_010003.1 | 1338294-1338310 | 1 | 0.941 |
1. spacer 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder matches to position: 1333754-1333770, mismatch: 0, identity: 1.0
atgagccaattgagcca CRISPR spacer atgagccaattgagcca Protospacer *****************
2. spacer 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder matches to position: 1338232-1338248, mismatch: 0, identity: 1.0
atgagccaattgagcca CRISPR spacer atgagccaattgagcca Protospacer *****************
3. spacer 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder matches to position: 1338263-1338279, mismatch: 0, identity: 1.0
atgagccaattgagcca CRISPR spacer atgagccaattgagcca Protospacer *****************
4. spacer 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder matches to position: 1339789-1339805, mismatch: 0, identity: 1.0
atgagccaattgagcca CRISPR spacer atgagccaattgagcca Protospacer *****************
5. spacer 3.1|1333723|17|NC_010003|CRISPRCasFinder matches to position: 1338294-1338310, mismatch: 1, identity: 0.941
atgagccaattgagcca CRISPR spacer atgagtcaattgagcca Protospacer *****.***********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | MN270271 | Streptococcus phage phi-SsuNJ2_rum, complete genome | 24290-24324 | 8 | 0.771 |
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | KT336321 | Streptococcus phage phiSC070807, complete genome | 22219-22253 | 8 | 0.771 |
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | MN270273 | Streptococcus phage phi-SsuSC05017_rum, complete genome | 22163-22197 | 8 | 0.771 |
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | KT336320 | Streptococcus phage phiNJ3, complete genome | 24215-24249 | 8 | 0.771 |
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | MN270272 | Streptococcus phage phi-SsuNJ5_rum, complete genome | 24214-24248 | 8 | 0.771 |
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | NZ_CP011350 | Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC1, complete sequence | 545862-545896 | 8 | 0.771 |
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | NZ_CP013056 | Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-1, complete sequence | 184925-184959 | 8 | 0.771 |
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | NC_017203 | Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT281, complete sequence | 18188-18222 | 8 | 0.771 |
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | NC_020384 | Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-285, complete sequence | 22410-22444 | 8 | 0.771 |
NC_010003_5 | 5.30|2084366|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2084366-2084401 | 36 | NZ_CP050647 | Escherichia coli strain PapM-36-2 plasmid pIncFIB, complete sequence | 13271-13306 | 8 | 0.778 |
NC_010003_5 | 5.30|2084366|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2084366-2084401 | 36 | NZ_CP010126 | Escherichia coli strain C8 plasmid A, complete genome | 46178-46213 | 8 | 0.778 |
NC_010003_5 | 5.30|2084366|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2084366-2084401 | 36 | NZ_CP031323 | Escherichia coli strain ST2350 isolate Es_ST2350_SE1_NDM_03_2018 plasmid pEsST2350_SE_2, complete sequence | 7995-8030 | 9 | 0.75 |
NC_010003_5 | 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2083830-2083864 | 35 | NZ_CP009368 | Bacillus cereus strain FM1 plasmid unnamed, complete sequence | 216749-216783 | 11 | 0.686 |
1. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN270271 (Streptococcus phage phi-SsuNJ2_rum, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer aaaaatttccagagacagaagcagagataaaaaca Protospacer * .* * ****.*********** *********
2. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT336321 (Streptococcus phage phiSC070807, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer aaaaatttccagagacagaagcagagataaaaaca Protospacer * .* * ****.*********** *********
3. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN270273 (Streptococcus phage phi-SsuSC05017_rum, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer aaaaatttccagagacagaagcagagataaaaaca Protospacer * .* * ****.*********** *********
4. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT336320 (Streptococcus phage phiNJ3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer aaaaatttccagagacagaagcagagataaaaaca Protospacer * .* * ****.*********** *********
5. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN270272 (Streptococcus phage phi-SsuNJ5_rum, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer aaaaatttccagagacagaagcagagataaaaaca Protospacer * .* * ****.*********** *********
6. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011350 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
---acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer gtaattcgt---cagacacagaaacagacataaaaacg Protospacer *.*.** **** ******.*************.
7. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013056 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
---acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer gtaattcgt---cagacacagaaacagacataaaaacg Protospacer *.*.** **** ******.*************.
8. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017203 (Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT281, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
---acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer gtaattcgt---cagacacagaaacagacataaaaacg Protospacer *.*.** **** ******.*************.
9. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020384 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-285, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
---acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer gtaattcgt---cagacacagaaacagacataaaaacg Protospacer *.*.** **** ******.*************.
10. spacer 5.30|2084366|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050647 (Escherichia coli strain PapM-36-2 plasmid pIncFIB, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
actttattcaacatatcaacattattttctttctca CRISPR spacer acatccttcaaaatatcaccattattttctttggaa Protospacer ** *. ***** ****** ************* *
11. spacer 5.30|2084366|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010126 (Escherichia coli strain C8 plasmid A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
actttattcaacatatcaacattattttctttctca CRISPR spacer acatccttcaaaatatcaccattattttctttggaa Protospacer ** *. ***** ****** ************* *
12. spacer 5.30|2084366|36|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031323 (Escherichia coli strain ST2350 isolate Es_ST2350_SE1_NDM_03_2018 plasmid pEsST2350_SE_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
actttattcaacatatcaacattattttctttctca CRISPR spacer acacccttcaaaatatcaccattattttctttggaa Protospacer ** .. ***** ****** ************* *
13. spacer 5.22|2083830|35|NC_010003|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009368 (Bacillus cereus strain FM1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
acttgtatacagaaacagaagcagacataaaaaca CRISPR spacer gtagttcaacagacacagaaacagacataaaaaat Protospacer .. * ***** ******.************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
459167 : 469196
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010003|459167:469196|DBSCAN-SWA AATGAAGCTTTTTACAAAGTACATGACGCGAAACGACTGCTATACGGCAGGTCGGAAAATCACGCCTAAAGGAATCATGGTACATTCGACGGCTGTGCCGGGCGTAATGGCGGCTGAGTGGTTTTCCCGTTGGAACAAATCTTACAAGGCCGGCGATATAAATAGGCAGGTATGTGTTCACGCTTTTGTAGACGATAAAGAGGTTTGGCAATACCTGCCTTGGGATCATCGCAGGTGGCATGCGGGAGGAGCAGCCAACAATACCCATATTGGCTTTGAAATCTGTGAGCCTGCTGGGTTTTCGTATAAATCCGGGTCGGTAATGGTGGGTTATGATGCAGCAAAGCAGGAAGATTATTTCCGTAAAGCGTGGCAGAATGCTGTTGAACTCTGCGTTATGCTCTGCAAGAAGTACGGTCTTAATGAGAATGACATCATCTGCCACTCCGAGGGATATAAGCTCGGTATTGCCAGCAACCATGCTGATGTGATGCACTGGTTCCCCAAGCATGGGGAGAATATGGACACTTTCCGTAAAGCAGTAAAAAAAGCGCTGGAGAACAGTACAGATATCAATACTGATATTGGAATTGGAGATATGGTGGAGTTTAAGGTCAGTGTAAAGAATTACTACCCCGGCAGTGTGGAAGTTCCAACGTGGGTCAAAAATGACTATTACCACAGGGTCACACAGACTTTATACAAAGGCAAGCCGGTCATAAAAGGCGGCAAAGAATGTGTTTTGCTTGGCAAAAAGGTTAAGAAATCCGGCGGTCAAGAGATTGCAGGCATAAACACTTGGGTAGCAAAAGAAAACCTTGTAATTGTAAACAGCATTCCTGATAACAAGTGCAATAGAACCTATACAGTGCAAAAAGGCGATACCTTATGGAGAATAGCGGAAAAAGAACTCGGTAGAGGAACAAGATATCCGGAGATTAAGAAACTCAATGGTCTGACTTCAGATACTATTTACCCCGGACAAGTTCTCAAATTGCCGGAATAATCGGGTAGGAGGTAGATAATTAATTTATCTACCGTCCTCCCACACCACCGTACGTACCGTTCGGTATACGGCGGTTCAACAGAATTCATGCTTTAGGTTATACGTTTCCAGGATCGAAGTTAACCCCATTTTCTTAAGGTGTTTATTAGTTAGTGTTCTTGAAAGTATGGGGCTGTTGGAGATTCTCCAATAGCCTTTCCTTGTATTTGCATATTCCCATGCTTTGTAGATGTTTAACCCTAATTTGACTAAGTTTTTATACCTTGTTTTGATTTTCTTCCATTCCTTCCAGATACACATCCTAATTCTCCTTCTAAGCCATCCATCAAGACTTCCCGCTATCGATTTCATGTTTGCTATTCCATAGTAGTTTGTCCATCCTGTTATTATTTGTTTTATCCTTGACAGCCTGTATGCCATGCTTCTTCCACTGCTTCTCTTCGTTTCTCCTTTTAACTTCTTTTTGAATTCTTTAATGGATTTTCCATGGACTCTAATTTCGTACTTCTCTTCTTTCACGTAGAAGGAGAACCCTAAGTATTTGAGGTCCCAAGGTCTGACTACTTTGCTTTTCTTGCTATTCACTTTTAGCTTTAATTTCTTCTCTATGTATTTTGTTATACTTTCCATCACCCTATATGCGGATTTCTCGCTTTTCACGTATATGTTGCAATCGTCTGCATACCTGCAAAACTTGTGTCCCCTTTTCGTTAGTTCTACGTCAAGTTCGTGGAGCATTATGTTGCTTAGTAATGGGGATAGCGGTCCCCCTTGTGGAGTCCCTTCTTCAGTTTCTATTACTACCCCATTTACCATTACCCCACTCTTGAGGTATTTCCTTATCAGGGATATCACTCTGCCATCTTTTACGTCTTTTGATATTATCCTCATCAGTTTGTCATGGTTGACTGTGTCAAAGTAGCGTTCTAAGTCTATGTCCACTACCCATGTATGCCCTTTGTTTAGGTATTCTTTGCTTTTTCGTATGGCTTGTTTTGCATCCCGTAATGGCCTGAATCCATAACTGTTATCTACAAATTTCTTTTCGTAAATAGGTGTCAACACCTGGGCTATGGATTGCTGGATTACTCTGTCAATTGATGTTGGTATGCCTAGTAGTCTTTTCCCTCCATCCGGTTTCGGTATTTCTTTCCTCCTTACCGACTTCGGGGTGTACCTTCCTTCAAGGAGCTCTTGCCTTAATTCTTCTCCGTGTTGTCTGAGATATCCAAAGAGTTCTTCTACTTTCATCCCGTCTATCCCAGGGGCTCCTTTGTTGGCCTTTACCTTCTTGTATGCTTTATTCATATTATCCTTGGATAATATCTTTTCAAGCATCCCTTCACTGCATCCCTTATCATCGTTTCTTCCTCTTTCAGACGTAGAAGTTATACTAGGCGCTTCTACATTATTTTCAGGCTCTCCCTTATCTTCATGTAGGAAACCTTCTAATCGAAGTTGTATGCTTTTTCCGTGTCCCTTCGCATCTTTCAAGATTCGAAACCTCCTGTTGTTCAGTCCTTCCTCATCTTCCAATGAGTACTATGACTTCTGCTGACTTCTCAAGATTCAGCCATACATTGCTGCATGGGTTGCCTTAACAGCGTATTCTTGAGATCTCCCCAGGTAAGTGCAATAACTTTCATCCCATCTATCCGCCAGATTTACTCCGTGAAGTTCTGGGTAGCTATTGGACTTCGTTTTGTAAAGCAAACTCGTCCACTTCACTTAGCCTTGTATCTGGTTCTTATTCATCGGACCGGGACTTTGCCTTGGGCTTCCTTCAGATTCCACCTCACGATGGACACCCTTGCCTTCGACTAGTGGTTCCCGCTATCTGGTCCACAGCGGACTTTCACCGCTTAGCTATTGCGCATGCTGGGCGCACACGATAAAGGACAGCCAATCGCGGCTGTCCTAAGTCTTTATAGGAGGTGCTTGAATGATAGAGGCGGCTAATCATTTACCATATAACCCGCAGGAAACGAACTATACAAAGATAACACAGGAGGAAATTCAAAGAGAGGTTGATTACTGGCGGGCGTACAAAATTCTACAGAGGATGCTTAAGGCGGGACTGATTTCAGAAGAAGAATTCAACAAAATCGACAAGTTGAACCGCAAAACTTTCTCGCCGATGTATGCACAGCTTATGGCCTAATTGGCTTGCTATTAGCGGCACACAGAGGTAACATGTCACATACCCAAAGGAGGTGAAAACAGTGAGAAAGGTAACAAGGATTGATGGAAACAATGCTCTCCAAGCTTTCAAGCCAAAGGTGAGGGTAGCGGCTTATTGCAGGGTTTCAACAGACAGTGATGAACAAATGGCAAGCCTGGAAGCACAAAAAGACCATTATGAATCCTATATAAGAGCAAATCCTGATTGGGAGTTTGCAGGGATCTACTATGATGAAGGCATATCAGGCACAAAAAAGGAAAACCGAACTGGACTTTTGAGACTGCTTGCAGATTGTGAAAACAAGAAAATTGACTTTATTATAACCAAGTCAGTCAGCAGATTTGCCAGAAACACAACCGACTGCATTGAAATGGTGAGAAAACTTACCGATCTCGGTGTTTTCATCTATTTCGAGAAAGAGAATATAAACACACAGCGCATGGAAGGCGAATTGGTGCTGACAATTTTGGGCAGTCTTGCAGAAAACGAGTCATTATCCATTGCAGAAAATAGTAAGTGGTCTATCAGACGTAGGTTCCAAAACGGATCATACAAAATTTCGTATCCTCCCTATGGTTACGATTATGTGGATGGAAAGCTATTTATCAATAAAGAACAGGCTGAAATCATAAAGCGGATTTTTTCCGAGGCTTTGGCTGGTAAAGGCACACAGAAAATTGCAGATGGGTTAAATTTGGATAAAATCCCAACAAAGAGAGGTTCACACTGGACAGCGACCACTATCCGCGGTATCCTTAGCAATGAAAAATATACCGGGGATGTCCTTCTGCAAAAAACATATACAGATGAGAATTTTAAGCGGCATTATAATCGTGGTGAAAAGGATCAATACATGATAAAGGATCATCATGAAGCCATTATATCCCATGAGGAATTTGAAGCCGCCCAAGAGATATTAAAGCAAAGAGGAAAAGAAAAAGGTGTAATTAAGGGAAGCAGCAAATATCAAAACCGCTACCTGTTCTCAGGGAAAATCAAATGCGCAGAATGTGGCAGCAATTTTAAACGTCGAATTCATGGCAGCGGTAACCGTAAATATATTGCCTGGTGCTGCACAAAGCATATAAAGGACGCATCAAGCTGTTCCATGAAGTTTGTCAGAGAGGATGCAATTCATCAGGCCTTTGCTGTAATGATCAATAAGCTTATTTTCGGTCATAAATTCATTATAAGACCATTGCTACAAAGCTTAAAGAAAGCAAATTACTCAGATAATATAGCGAAGATTCAAGAACTGGAAACAAAAATCAAAGAAAATACAGAGCGGGTTCAGGTAATTATGGGACTTATAGCTAAGGGATACCTGGAACCCGCTCTTTTTAATACACAGAAAAATGAGCTGCTTAAAGAAGCGGCTTTATTAAAAGAACAAAAAGAAACCTTAAAACGCGAAATTGATGGAGGCATAACTACTCTTGTTGAGGCAGAAAAGATTCTTAAATTTGCAACGAAAGCTGAAAAGCAGATTAATGCATTTGAAAGTGAAATATTTGAGAATTTTATTGAAGAAATCATTGTGTTTTCTCAGGAGGAAATTGGTTTCAAAATGAAATGCGGGTTGAACTTAAGGGATAGGCTGGTGAAATAATGAGCCATATACCTTTTGGATATACCATTCAAAACGGCAGGGCTGTAGTTAATGAAGAGGAAGCAGTTAAAATTAAGAAGCTATTTAGGTTTATCTTTCAGGGCTTTCTTTAAGCGAAGCGGCACAAAAAGCAGGTATTAAGCGTTACCACACATCTGTTGCAAGAATGCTTTCAGATAAACGGTATGTTGAGGACAAATTCT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ATGAGGGTAATGAATACAAAAAGTATATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010003|459167:469196|464379_465948_+|WP_012208276.1|DBSCAN-SWA MTTRNVTVIPARKRIGNSAKAEELPKLRVAAYCRVSTDSEEQATSYEAQIEHYTNYIKSNPEWELAGIFADEGITGTNTKKREEFNRMIEECMQGKIDMIITKSISRFARNTLDCLKYIRQLKEKNIPVYFEKENINTLDSKGEILLTIMASLAQQESQSLSQNVKLGIQYRYQQGKIHINHNRFLGYTKDKDGNLVIVPEEAEIVKRIYREYLEGSSMLQIARGLEADGILTGAGNPRWHTSTINKILRNEKYIGDALLQKTYTVDFLSKKRVANNGIVPQYYVENSHEPIIPREIFMQVQEQLVKRRCVHISKNGKKRNYSNNHPLSQMVFCGKCHEIFRRVHWNNRGKKSIVWRCVSRLENTGLFCTASTILEDTLKEKIVDAINVAVSGKNSFLAILKKNIETVLSEDLDESTADIDKRLEELQTELIQKANSKEAYDNIVNEIYRLRDLRQETLSRNALRQDKRDRIAEMTDFLNMQTGGITEFDDKLVRKLIEKATVYNDRLVVEFKSGLEIEVNL >NC_010003|459167:469196|462114_462333_+|WP_012208274.1|DBSCAN-SWA MIEAANHLPYNPQETNYTKITQEEIQREVDYWRAYKILQRMLKAGLISEEEFNKIDKLNRKTFSPMYAQLMA >NC_010003|459167:469196|466835_469196_+|WP_012208277.1|DBSCAN-SWA MLKKEVILEGLDCANCAAKIEDEVNKLNGVKAYMNFMNKTLTLEIESEQEYKNILQQVKTIVHKHEPDVVVKEKSVNKSNKKVLILEGLGCANCAAKMEKEISGLEGVEFAAVDFVSKKLTLEISPKVNRSELNEKIEGIVKKIEPDVKVIFEENNSKTKINENNEEEEEGVNKKEIIRLVVGGAIFAVGIIFNFQNWLELTLFIISYIIVGGEVVLRAIKGIARGQVFSEHFLMSIATIGAFFVGEYPEGVAVMLFYLVGELFQDIAVGHSRKSISALMDIRPDYANLKVGDEIRKVSPEEVNIGDIIIVKPGEKVPLDGKVIEGNSMVDTAALTGESVPRELGPGDDVLSGFINKNGVLTIEVTKDYGDSTVSKILDLVQNASSKKAPTEKFITKFARFYTPIVVFGALALAIIPPLVIPGATFSTWIYRALVFLVISCPCALVISIPLGFFGGIGGASKRGILVKGSNYLDALNNVETVVFDKTGTLTKGVFEVVSINPQSDFTKEELIEYAAYAESHSSHPIALSILKAYNKDVDITKIEDYEEIAGHGIRAKVGGKEILVGNSKLMNKENIKYQEVETLGTVVHVAVDKKYAGNIVISDAVKEDSADAIKGLKALGVRNIVMLTGDSKAVGEKIATQLGIDEVYTELLPTDKVEKIEALDAKKSHKGKIVFVGDGINDAPVLARADIGVAMGGLGSDAAIEAADIVIMTDEPSKIVTAIKVAKRTRKIVMQNIVFALGVKAIFLALGAVGVATMWEAVFADVGVAIIAILNAMRVMNTKSI >NC_010003|459167:469196|466101_466248_+|WP_028306869.1|DBSCAN-SWA MTDFLNEQSYELEEYDEQLVRRLIEKVTVFDNKLTVEFKSGVEIDVLI >NC_010003|459167:469196|466447_466822_+|WP_005584884.1|DBSCAN-SWA MAKKIQPIERCDCDVIHEEIVNKVREKMPQEETLYDLAELFKVFGDSTRIKILWALDESEMCVCDIAFLLNMTQSAISHQLRVLKQAELVKSRREGKIVFYSLEDEHVKQIFDQGLIHISEESK >NC_010003|459167:469196|460247_461666_-|WP_012208273.1|DBSCAN-SWA MKDAKGHGKSIQLRLEGFLHEDKGEPENNVEAPSITSTSERGRNDDKGCSEGMLEKILSKDNMNKAYKKVKANKGAPGIDGMKVEELFGYLRQHGEELRQELLEGRYTPKSVRRKEIPKPDGGKRLLGIPTSIDRVIQQSIAQVLTPIYEKKFVDNSYGFRPLRDAKQAIRKSKEYLNKGHTWVVDIDLERYFDTVNHDKLMRIISKDVKDGRVISLIRKYLKSGVMVNGVVIETEEGTPQGGPLSPLLSNIMLHELDVELTKRGHKFCRYADDCNIYVKSEKSAYRVMESITKYIEKKLKLKVNSKKSKVVRPWDLKYLGFSFYVKEEKYEIRVHGKSIKEFKKKLKGETKRSSGRSMAYRLSRIKQIITGWTNYYGIANMKSIAGSLDGWLRRRIRMCIWKEWKKIKTRYKNLVKLGLNIYKAWEYANTRKGYWRISNSPILSRTLTNKHLKKMGLTSILETYNLKHEFC >NC_010003|459167:469196|462394_463963_+|WP_012208275.1|DBSCAN-SWA MRKVTRIDGNNALQAFKPKVRVAAYCRVSTDSDEQMASLEAQKDHYESYIRANPDWEFAGIYYDEGISGTKKENRTGLLRLLADCENKKIDFIITKSVSRFARNTTDCIEMVRKLTDLGVFIYFEKENINTQRMEGELVLTILGSLAENESLSIAENSKWSIRRRFQNGSYKISYPPYGYDYVDGKLFINKEQAEIIKRIFSEALAGKGTQKIADGLNLDKIPTKRGSHWTATTIRGILSNEKYTGDVLLQKTYTDENFKRHYNRGEKDQYMIKDHHEAIISHEEFEAAQEILKQRGKEKGVIKGSSKYQNRYLFSGKIKCAECGSNFKRRIHGSGNRKYIAWCCTKHIKDASSCSMKFVREDAIHQAFAVMINKLIFGHKFIIRPLLQSLKKANYSDNIAKIQELETKIKENTERVQVIMGLIAKGYLEPALFNTQKNELLKEAALLKEQKETLKREIDGGITTLVEAEKILKFATKAEKQINAFESEIFENFIEEIIVFSQEEIGFKMKCGLNLRDRLVK >NC_010003|459167:469196|459167_460172_+|WP_012208272.1|DBSCAN-SWA MKLFTKYMTRNDCYTAGRKITPKGIMVHSTAVPGVMAAEWFSRWNKSYKAGDINRQVCVHAFVDDKEVWQYLPWDHRRWHAGGAANNTHIGFEICEPAGFSYKSGSVMVGYDAAKQEDYFRKAWQNAVELCVMLCKKYGLNENDIICHSEGYKLGIASNHADVMHWFPKHGENMDTFRKAVKKALENSTDINTDIGIGDMVEFKVSVKNYYPGSVEVPTWVKNDYYHRVTQTLYKGKPVIKGGKECVLLGKKVKKSGGQEIAGINTWVAKENLVIVNSIPDNKCNRTYTVQKGDTLWRIAEKELGRGTRYPEIKKLNGLTSDTIYPGQVLKLPE >NC_010003|459167:469196|461741_461885_-|WP_155811037.1|DBSCAN-SWA MLYKTKSNSYPELHGVNLADRWDESYCTYLGRSQEYAVKATHAAMYG |
9 | unidentified_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
678814 : 739968
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010003|678814:739968|DBSCAN-SWA CATGAATGAATTAGTGCACAATCCTCATGATCTATTCTTCAAACGAATTTTCAGTGACATAAGGATAGCTCGAGATTTCTTATGGAACTATCTCCCTCAAGAAGCTGTAGAAATAGTAGACCTAGATTATTTAATTCCTGAAAACAACAGTCATGTTGATGAAAACCTAAGAGAAAGCCTCTCGGATATGTTGTACAAAACAAAGATAAAAGGACAAGATGGCTACATATACATTCTGATGGAACACAAAAGCTACATTGAAGGGAAAGTAATCTTTCAACTGTTGAGATATATTACGAGCATCTGGGAAGAAAAATACGATCCCAAAACAAAAAAGGTACCAATAATAATACCGATGGTAATATACCATGGAAGAGAAATCTGGAACGTAGAAACGAATTTATTAAATATGGTACAAGGGATAGAAGATTTACCAAATGAACTAAAAACATACTTACCTACATACCGATATGAAATATGTGATTTCTCGATCAAAAGGAAAAAAAGGATAATAGGATTAACAGCGATGAAAGTTGCAATAGAAGCAATGAGAGCAGGAACGGCAATGACCAAAGAAGAATTTAAAGAAAGATTAAGAAGGGTATTTGAATACATAAAACAACTACCAGAAGAAGAGGTACATGAATGGTTTGAAGAGTGTATGATCTACTTACTAAACGTAAGGGAAGATGTAACGATAGAGGAGATATTAAAAGTACAAAAAGAAATAATGCCTGGAAGGGGTGAGATAGTTATGACGATAGCTGAAAAGTTGAGAAACGAAGGTAAATTAGAAGGAGAAAGAGAAGGGAAACTTGAAGAAAGAAGGGAAGTAGCTATAAAGTTATTAAATAAACGATTTGGAAAAGAATTTACACAAGAGATGAAAGAAAAGATAAAAGAAGCTGAAGAAAGAAGAATAAACCAAATAATTGACAACATATTTGAAATAACCATAGAAGAGCTAAAAGAAATATTGAAGTAATGGTAGTAGGTGAAACACTATCTGATATTTTTGGATAGGTAACAGGGCAACACCCTTTCCCATTTCCTCATAGGTGAGTTGCGGAGGGAAAGGGTAAAAGGCTTTTTTCCCTCATGGGTGGGCGGACCCACTTTGCATAATCGGGTACACTTTTCGCTTATTAAACGCAACTGACTTAATTATTAATCAGATATTATTATTTGTGGCTCTATGTCGCTATGATAATATAAAAATATTTTATCGAAATTATTTTCTCCTTTAGTATATGAATTAAGTATTTCTTTAATATATTGGATATCAACATCTACAAAAAATACTAAGTTGGGTGGAAAAGATGAGATTTTTATTAATAAATATATTTTATCAACTTTCTCTCTGTAAAGGGGGATTTTTTCAATCTTTTTATTTATTGCGAGTCTTAATTTCTCTTCATAATTAAATCCTATACAATTGATGCTTGTTGGAATTACTAATGGTTTCTTATAATCCTCTTGTATTGGTTCAACTTCTAAATATTTGCATATTAAAGAACTTTTATTTGATTCACAGAATTCTTCAAACGAAGAATATTCCTTATTTCTTCTTGCCATTATATATTTTTTGAATTCTTCAATAAAAGCTTTAATAAATTTGTTTTTGTTTATTTTGTTTATATCAGAATCCAATTTATTAGAGAAAGAAAACCATATTACACTTTTAATATTTTCTTCCTCCATATATTTTCGTACAATCTTATAAATCTCAATTTTTGAATCTAGACTTTTCATCATTTCTTCCTTAATAGCTTCCGTTATCTCTATCCCAATTTTTTGATTATCAAACTTAATTATAAAATCAGGAGATTCACTACAGTCTAATTGATAATTTTCAGGAAAAAGATGTTCATGAAAACTTTTATAATAATCGCTGAAAAAATCTTCTAATAGCTTAAATTCTTCCTTTTTCTTATCGTTTATTTTTATCACTCCTACCTTTTGTAGCATTTTCGATACTTTTAAGTGTTTTAGAGAGCATTTCGACAATTGGTCCAACAGCTGGTGCACTTACTAAACGAAAACTATACCTCCCTCTCAGACAAATCCTGTATAATGAATTTGGTCAAAAACATTGTACAGGAAAAGGTGAGGCTAAGGTACAATACAATTATATAAGATTTTTGTATTTTAACAAACACAAAAGTCAAAGAGTGATAGCAAAAGAAATGGGGATACACAGAGCGACGGTTAAAAGAGCTATCAAGAACCCAGAACAGAAGTATCATATGAACGTTAATAGAGATAAACCAGTAAATAGTGATTTTAGAAAACATATCAAACATTTGCTAGAACATAATTCAAAGGGAACCTCTTAGTTGAAATGCAGGAAGAACGACAACTAACGAAATTCCAAAAAAAGCTGATCAAAGTAGACTTACTAATAATTGATGAACTAGGATACGTGCAGTTATCCGACCAAGTTACACAACTCATGTTCCAAATATTCTCTGAAAGGTATGAAAAAGGATCTATCTTGGTAAACAGCAACCTTGAATTTGCAGAATGGGCTAAAATATTTCACGATGAAAGGATGACAGCAGCGATTATCGACAGGTTAATCCACAACAGTAAGATAATACTATTCAATGGAGAAAGCTACCGTTACAGGAACCAAAGGCGAGAAATTCAGCAAAATTGATAAATATTCGATTTTTCTCTTTTCATATGAAAAGAGAAAGAAAAGAACTTCTTCTTTGCATATGGTACATAATTAGGTTAGCAGGATGATACAGTATTCAGGTTCTTTCCGCTGATTGTTGAATCCTATCCATTATTTTCTAGAAAAAGAACTTTTTGTCTCAACATCTCAAATTTGTTTCTTCCATACATTATCCTTTTAACAACTTTCAGTTTATTCACAGAACCTTCTGCTAGTCCATTGTTGTATTCATATATGATGGCATTTCTAACCGCTTGCATATCTCTTTTTAACCCATTTACAAATTTATCTATCTTTCTGATCTTTAGATTATTAGCTTTTTCTATCCATTCTTCAAGTTTTTCAACGTTCTTTGATTTCAACATCTGTTTGAATTCATTTACTAAGTTTATTATACTTTCAATAACGGGGTATCTTTGAATGATCTTTTCATACAATTCTTTTGAAAGAGCTTCTACTTCTTCAACGGGTTTGTACAGTAATTTTATTAAATCTTTTCTTTTTACCCTTATTTCTTTTGGATCTTCAATTTTTAAATTTCTTTTTGCCAAATATATTCCAATGTTCGAATAACTACCTGTATAACCTTCACCTCTTATTATTTCAAATATCTCTTTGTTTGATTTTCCGCTTCTTTTCAATACTTGCATTTCCTCTTTATATGGATCCAGCATACCTGGGAGCCTTTTTCCTTTGTTCATGTTTGTGGGAGAAAAATCATTATCTAAATATTTATCCACAGTATTTCTATGTATGTTCAGTAATTTTGATATTTTCCTTTTTGAGTAACCTTTGCTGTATAATTCCCTAACTTCTTTGACTAACTTAAGTTTTGCCTTTTCTTTTTCAGAATGAACCACGTTTTTGTTATCATCAACCATCTGTTCAAAGTCCTGATCTTTTGTTTCTCCAACAACTAAAGAGGTACTGAACTTTTGATAGATGTACTCTTTGCAAGAATCCGTTAGATTTTTTATTAAATGGAACCCATCCGATATCTGAATGGCATCTGGATGGGCTTTCTCTATCGCCTTTTTATATGATATCGAACCGTCTCTTGATACCATTTGGATATTCTCGTATCCCTTTAGCCATTTTTCTACCTTTTCTGGTTCCCTTGAGTTCAACATATCCACCACTTTGTGAGTTTCCAAATCGATCATGATACTTCCATATCTTTGCCCTCTTTTTATTGCAAAATCATCGATACTTACCTTTTTTACTTTCCTTTTGTCTATCATGTGGATTATTTTTTTTTAATAAGTTGCATATCGAACTTTTTCCTATATCCGCTATATCTTTACTTATCAACTTAGCTGCTTGTACAGAACTCATATTCATGCTTATATTCGTTATTTCCTTTTCCAGCCTTTTCGTTCTTTTGAATTTTGGTTCCACAAAGTCAAGAGGTTCAGCAAACGTCTTTTTCTTACACTCTTTGTTTTCACAGAACATCTTTCTTCTTATTACAACTATCGTTGTTTTTTTACCTTGTATCGGTAAATCTTGAAAGCTTCTTTCATACCTTGAATGTACTTTTTTGGATGGTTTCCCACAATATGGACAGATTACTTCTTTTTTAGCTGATTTCACCCAAATTGTTATTCTATCTCCTGTTACTTCATGTTTAACGTATTCTAAGTTCTCATCCAACAACTTAACTATTTCTTCCATTCCCCTCATCCTCTTTTAAGTGATTTTCATCAATTATATCACCAGAGGCTAATCAAGTCAACCGTTGATGGAAAGAACCAGTATTCGGTTAGCCATAGCCAAAAGGAAAATGTTAAGAATAATAAAAATTTTTGATAATGTATGATAATATATGATAATATATGAATGATAATAAAATTATCAAAAGCCAATTAACGATATGCCAATTAGTAAAAATCAAAAAATTGTAAAAAAATTAGCGTAACTGACATTCCCTATACTTTCAAAAAAATGCGTAATAAATTCGAAAGATAAAAAATGAAATAATTTCCTGATTGACGTTTTCTCCAAGTCAGTCCTGTGAATTTAGCCAAACTATCATGAGATTAAAAGGAAGTTAAGAGTAGAACTCAGTCAAAGCGGGGCAAGATGTAGCACCATATATATCGGAAAAGGGCTTATCCCTATTATTCACAGCCAATTCACTGAATTTCAGATAAATGTTGGAAAGCATCCAATTCTTTTCAGAGACGAGTGTATGAACTAAATGGAACCTATGGCGTGTAAGTCTTTGTAAAGCCAAAAACTGAGAACCACGCCAATTGGATTTAGCTTTTGCATTAAGCTGGTACACAAGAGGTTTAAAAGGGCAAAGTTTCTTATTGGT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57 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1072000 : 1080793
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010003|1072000:1080793|DBSCAN-SWA 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CCAATATTTCTTTTTTCTTCTTTTCTATTTCAGAAGCGCCTAAAGGTATTATTGATGAACCAGATACTACATACTTAGCTTCTCTTTTCCAAAAATTAACAACCCCTTGAAACTTCCATCTTTTGTTGAAGAGTTCCCTTTCGTTGTCAATACCGCAATGTTCAAAAACATATGGAACAACAGTTTGGCTGAAAACAACTGTTATTGAATAATTTGAACTTCTCACTCTTTGAGAAAGTTCAATGTAGAGGTCCCCTCTTTTACTGTATTTTGCATGAGTGACATCTCCGATAACCTCGATTTCTTGCCTGTAAAGAGGAGAACTGGTGAATATACTGTTCAAATATTCTATTAACTCTTGTATACTTTCAAATTTAAATTCTTCTTGCTGGGGAAATAACAACGGTCAGCTCTCCTTTCACTTGATCTTTGGATTCAAAAAATTTTATCCCTTCAGAAATCTTCCCTTTAAAAAATTCTTGATACAGCTTCGTCATTTCTCGGGCAACAAGTACATCCATCTCTCCAAAAATTTCCAAAATCTCTTGCAAGGTTTTTTTTATTCTATTTGGAGATTCAAAAAAAACTATTGGATATTCGAACTCTTTTATCTCTCTCAAAAGTCTTCTCAATTTTTTATCCCGAGGTAAAAAACCTAAGAACAAAAACTTCGAAGCAGGGAATCCACTCACAGCTAAAGCAGAAGTTAAGGCTGAAGGGCCTGGCACCACATCTATTGGAATACCTTTTTCCCAACATCTTTGTACTAAGTTAAAGCCAGGATCTGCTAAAACAGGCATACCCGCATCTGATACTAAGGCTGTTATATTATGACTTTCAATCAAAGATAGAACTGTGTCCATAATCTTTTCTGAGTTTGCCTCGTTGAAAGTGAATAACTCCTTTTTGCCCAGTTCAAAATGATTTATCAATTTCAAGGTAACCCTTTTATCCTCCGTGAGTATCAAGTCAGCTTCTTTCAAGGTTTTTAAAGCTCTTAAAGAAATATCTTCTAAATTACCTATGGGTGTGCCAACTAGAATTAATTTCCCCATTTTGATTTCTCACATCCTGATAAGTTTATTTAAATCGCATTCATGTTCCCCTGCAAAGTCAGAATTGTTGTATCCGTCTAAATAAGTTAAGTCTTCCAATTTCCAGAAAATGTCGCCTAAAAAATCCATCAAGAACTTAGTTAAATCAACCTTTTTTCCCTTTTCTTCTATTTCTAGAAGATACATTATCTCCGAAAATTCTTTTTTATACCTTATACAACTATCAGGGTTTAACAACTCATCTACCACTATTTCCGGGTCTTTATTTAAAAGATATCTTTTTTTCATTACCATCCTTTGACTTTTTAAATTATCAAAGTCGATTTCTTTTTCGTTTATAAACCCTTCTTCCTCTTCTCTTAATCCCTTTGTAATTTCCTTTTTAAGATTTGTAGTCCACACTTTTTTGCCCTTTTTAATCTCTAACCGCGTTCTCAATCCATTTTTATCGTACCATTGAAGTATAAGCCATTCATCAAAGGCCTGTGAGACTAATTTTTTAAATATATATTTATCGAGTATTCTATACTTTCTCTCATTTTCATATTTCAATGCAATCTCCTCTTTACTTAACTTGTATATATATAATTATACCATATCAACGCCATTTTCTTTGAAAAACGCTCAAAATCTTGGTAAATATCCTTGAAAAAGAATTTTTAGGTCATAAAAAAGAGAAATTTCATAAATATTTTACTTTTATGAAAATAAGAAACTTGACAAAACCAAAATAACTCATTATAATTGACACGAATTTTATCAATGACCAACGTTCGGAAGATGATAAATTATGGCTAAGGAGGTAAACGAATATGACAAAGGATGAGTTGTTCGAAAAAGTAAAAGAAATAATCGTAGATACATTGAGTGTCGACGAGGATGAAGTTACATTGGATGCCTCATTTACCGATGATTTAGACGCGGATTCTTTAGAGCTAGTAGATTTGACCATGGCTTTTGAGTCTGAATTCGGAGTAACGATAGAGGATGAAGAGTTAGAAAAAATCAAAACCGTTGAAAATGCGGTTAATTTATTATCTGAAAAATTGAACATCGACGATGAGGATTGAATTAATCACAAAAAGAGGGGAGCTTTCGCTCCCCCTTGTTTTTTAAAATATGGTAATTTTTTCTTAAAAAAGAGGTGAAAAAATAATGGCTGAAAAATATATTATAGTAACTGGCGGCGTGCTCAGTGGCATAGGAAAAGGAGTCGTTTCCGCTTCAATAGGAAGGCTATTAAAAGAATTGGGATTAAAAGTCAATTCTTTGAAAATAGATCCCTATCTAAACGTAGATGCAGGAACTATGAATCCCAATCAACATGGAGAAGTTTTTGTGACCGAAGATGGTTACGAAGCAGACCTTGATTTGGGACATTACGAGAGATTTTTAGGAATAGAGATGAAAAGTTTTAACAATATGACAGCTGGCCAAGTGTATAAATACGTTATCGAAAAAGAAAGGGAAGGAAAGTATTTAGGAGCCACCGTTCAGATGGTGCCTCACGTCACCGAAAGAATAAAAGAAAGAATCGAAGAGATAGACACAGAAGTCTTGCTCATTGAAATAGGGGGTACCGTTGGCGATATTGAAGGTGAAATATTTTTAGAGGCAGTAAGAGAGCTATCCTTTGAGAAAGGCCGAGAAAATTTTATGTTTATACATGTAACCTTTGTTCCCTATTTACATGTAACCAACGAGTTTAAAACCAAGCCAACTCAACAATCTATTCAACTTTTAAGAAGAATAGGAATCCAACCAGATATGCTTTTGGTAAGAACGGAAAAAGAGATAGATCTTTCCAGTCTTGAAAAAGTAGCTCTGTTTGGCGGCGTCCCTTTAGAGTACGTTGTCAACCTTCCTGATTTAGCTAATGTTTATGAAGTTCCTCAAATGCTATATGAAAAGAATATTCATGTGCTTATCTCAAGTAAATTGAATCTGGAAATATCAAAAGAAGTAGGAGAATTAAGTTGGAAATGTCCCAAAACATTTAAAAACCTAAAAATTGCTATGATTTGCAAGTATTTAGGTACCGATGATGCCTACAAGAGCATAATGGAAAGTGTTTTTTTAAGTGGCACTAAAAGGCCCGATCTAATCAACTCCGAAGAACTGGAAGAAATGAATGAAGAGGAAATTAGAATACTTTTAAGTAAATACGAAGGTATAATTATCCCAGGTGGATTTGGATCAAGAGGAATAGAAGGAAAAATAAAGGCTATAAAATATGCTCGTGAAAATAATGTTCCTCTTCTAGGGATCTGCCTAGGTATGCAACTAATGGTCATTGAATATGCCAGAAATGTTTTCGACTACAAAGAAGCAAATTCTACAGAATTCGATGAAAATACTCCTTATCCTGTTATAGATTTGATGGAAGAACAAAAAAAGATGTTGAATTTGGGTGGTACTATGAGACTAGGCGCCCAAAAAATTGAAATATTTCCAAACACGAAACTTCACAAGATTTATGGAGAAAAAAATTCTGTCCTTGAAAGGCACAGACACCGTTATGAAGTCAATTACAAAGAGTTCGAGAATATGTTTGAAAAAGGAAAAAATGTTCCTAATAAACTTTCTATTTCAGCTATGACAGATTTCGTTGAAGCCATTGAATTGAATTCTCATCCTTTTTATATTGGCATTCAATACCATCCGGAATTTAAAACAAAAGTTGGAGATCCGCATCCTATCTTCAAAGCATTTATTGAAGCGATTGAAAAAAACAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010003|1072000:1080793|1072000_1074454_-|WP_012208829.1|DBSCAN-SWA MSDLTPMIKQYLKIKEEYKDSILLFRLGDFYETFFEDAKKVSEILQIVLTKRNGNPMAGIPYHALNNYLKRLLDAGYKVAICEQMEDPQSSKGIVDRKVTRILTPGTIIDEGMLEESNRFAALITKNGNLYKIAIFDFSTGDFYLDSFDFKEDELLDFISSFGLVQILLSKELEQLSKKIKNLTNEIYVEILDEWYFSNNFKDHLKETYEVLSLDHLDYDDDELKVADAVLKYLEVTQFSKIKHMRLPKRFKTKNYMFLDSNTIENLGILPTNSNKGKTLYDILKLTKTSMGNRKLREFILTPLTDKENIEERLNKVEHLVEDPLLLEELKEYLASVKDLERISSRISLMKATPKDLIALKDSLEVVPYIIESLTSNPGLSDFFDGVDVLKEAKEFIENTIIEEPAIAPGNGKVIKEGVSGELDEYRNLFNNLDGVLKDIEKREKEKTKISSLKVGRNKIYGFYIEVSKAQSSKVPDNYVRKQTLVNTERYTIKELEEVEQRLALSEEKIKVIEKDIYDKVLTHLSQYVDKIEKLSNKIAELDVFRSFAEVSRVYNYKRPTFVQNSKEIKIINSRHPVVERFVDEFTPNDLFLSEDKFYIILTGPNMSGKSTFIRQIGLISVMAQIGCFVPAEKAEIPIYDGIFTRIGARDDIVSGKSTFLVEMLEVSTILNKATDNSLVLLDEVGRGTSTLDGISVAWAISEYLFQVKRCNTIFATHYTELTYMSHIYEEVAAKRIKVLETMDGVIFLHKIEDGTSDNSYGIEIARLAGFPIEIIERSKEILSQLSNRVDLESRLKRIKNINKKKYESQENQLKMF >NC_010003|1072000:1080793|1075626_1075899_-|WP_012208832.1|DBSCAN-SWA MEEIIKLSEEEIKSLSFKEQLKLLERINDYFQNEKQDELDVENALEIYKKALDILTYAREKLVGLKEEKAQIDEKYEKIKNQLSESADID >NC_010003|1072000:1080793|1075998_1077402_-|WP_012208833.1|DBSCAN-SWA MLFPQQEEFKFESIQELIEYLNSIFTSSPLYRQEIEVIGDVTHAKYSKRGDLYIELSQRVRSSNYSITVVFSQTVVPYVFEHCGIDNERELFNKRWKFQGVVNFWKREAKYVVSGSSIIPLGASEIEKKKKEILEKLEKSNLLRKVEHELIELDPIKKIAVITSPTAAGFGDFQKNINHSRFIPIVHLYPAPMQGAETVPGIKKALFAILKSGIDYDVVVIIRGGGSKSDLMYFDDFELGSLIAKFNRKIPVLTGIGHEQDSTIPDFVSWKNYSTPTEVSRDIVNQINYFTDNLETLEKNITYSFTNVYYQMENLLSFNTINNIKYYLSRELINLFRTLDEDHLNITRKVNQMIESSEKSISLNKLDYIQRFIEYSIKTYNQNIISTTNEIVSELKSKFEVSERLLFSTFQELTKSSPFAAFLNNGVLVKKGEEIIDSVEKLQTKDEVKLIFKDGEAESSIEKIQKW >NC_010003|1072000:1080793|1075240_1075555_-|WP_041534073.1|DBSCAN-SWA MIEMFISVGKGVFVPTERIHSIVPDSFVQFGKIKKIYHGIDVVTQFGDANELENLPPPLTASVSLIDASYGKAVKSIIYMDSGQIVLSTLEAKKIIEKIKKGRR >NC_010003|1072000:1080793|1078063_1078606_-|WP_012208835.1|DBSCAN-SWA MKYENERKYRILDKYIFKKLVSQAFDEWLILQWYDKNGLRTRLEIKKGKKVWTTNLKKEITKGLREEEEGFINEKEIDFDNLKSQRMVMKKRYLLNKDPEIVVDELLNPDSCIRYKKEFSEIMYLLEIEEKGKKVDLTKFLMDFLGDIFWKLEDLTYLDGYNNSDFAGEHECDLNKLIRM >NC_010003|1072000:1080793|1079209_1080793_+|WP_012208837.1|DBSCAN-SWA MAEKYIIVTGGVLSGIGKGVVSASIGRLLKELGLKVNSLKIDPYLNVDAGTMNPNQHGEVFVTEDGYEADLDLGHYERFLGIEMKSFNNMTAGQVYKYVIEKEREGKYLGATVQMVPHVTERIKERIEEIDTEVLLIEIGGTVGDIEGEIFLEAVRELSFEKGRENFMFIHVTFVPYLHVTNEFKTKPTQQSIQLLRRIGIQPDMLLVRTEKEIDLSSLEKVALFGGVPLEYVVNLPDLANVYEVPQMLYEKNIHVLISSKLNLEISKEVGELSWKCPKTFKNLKIAMICKYLGTDDAYKSIMESVFLSGTKRPDLINSEELEEMNEEEIRILLSKYEGIIIPGGFGSRGIEGKIKAIKYARENNVPLLGICLGMQLMVIEYARNVFDYKEANSTEFDENTPYPVIDLMEEQKKMLNLGGTMRLGAQKIEIFPNTKLHKIYGEKNSVLERHRHRYEVNYKEFENMFEKGKNVPNKLSISAMTDFVEAIELNSHPFYIGIQYHPEFKTKVGDPHPIFKAFIEAIEKNK >NC_010003|1072000:1080793|1074619_1075237_-|WP_012208830.1|DBSCAN-SWA MSIPMPVVIETEGRYERAYDIYSRLLKDRIVFLGTPINDDVANVIIAQLLFLESQDPDKDIFLYINSPGGSVTSGLGIYDTMQYVKPDISTICIGQAASMGAVLLAAGAKGKRYSLPYSRIMIHQPWGGAEGTAIDIQIHAREILRLKDDLNNILSKHTGQSLEKIEKDTERDFFMNAQEALNYGLIDKVITTKSEATAKENNEK >NC_010003|1072000:1080793|1077373_1078054_-|WP_012208834.1|DBSCAN-SWA MGKLILVGTPIGNLEDISLRALKTLKEADLILTEDKRVTLKLINHFELGKKELFTFNEANSEKIMDTVLSLIESHNITALVSDAGMPVLADPGFNLVQRCWEKGIPIDVVPGPSALTSALAVSGFPASKFLFLGFLPRDKKLRRLLREIKEFEYPIVFFESPNRIKKTLQEILEIFGEMDVLVAREMTKLYQEFFKGKISEGIKFFESKDQVKGELTVVISPARRI >NC_010003|1072000:1080793|1078866_1079124_+|WP_012208836.1|DBSCAN-SWA MTKDELFEKVKEIIVDTLSVDEDEVTLDASFTDDLDADSLELVDLTMAFESEFGVTIEDEELEKIKTVENAVNLLSEKLNIDDED |
9 | Indivirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1358392 : 1366083
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_010003|1358392:1366083|DBSCAN-SWA TTCAACAGAATTGATGTTTTAGGTTATATGTTTCCAGGATCGAAGTTAATCCAATTTCCTTAAGGTGCTTATTAGTTAGTGTTCTTGAAAGTATCGGGCTGTTGGAGATCCTCCAATGGCCTTTTCTTGTGTTTGCATATTCCCATGCTTTGTATGTGTTTAGTCCTAATTTGACTAAGTTTTTATACCTTGTTTTGATTTTCTTCCATTCCTTCCAGATACACATCCTAATTCTCCTTCTAAGCCATCCATCAAGACTTTCCGCTGCCGATTTCATGTTTGCTATTCCATAGTAGTTTATCCATCCTGTTATTATTTGTTTTATCTTTGACAGCCTGTATGTCATGCTCCTTCCACTGCTTCTTTTCGTTTCTTCTTTTAACTTCTTTTTAAATTCTTTGATGGATTTCTCATGCACTCTGATTTCGTATTGCTCTTCTTTCCCGTAGAAGGAGAACCCTAAGTATTTGAGGTCCAAAGGCTTGACTACTTTGCTTTTCTTCCTGTTCACTTTTAACTTTAATTTCTTCTCTATGTATTTTGTTATACTTTCCATCACCCTATATGCGGATTTCTCGCTTTTCACGTATATGTTGCAATCGTCTGCATACCTGCAAAACTTGTGTCCCCTTTTCGTTAGTTCTACGTCAAGTTCGTGGAGCATTATGTTGCTTAGTAATGGGGATAGCGGTCCCCCTTGCGGAGTCCCTTCTTCTGTTTCTATTACTACCCCATTTACCATTACCCCACTCTTGAGGTATTTCCTTATCAGGGATATCACTCTGCCATCTTTTACGTCTTTTGATATTATCCTCATCAGTTTGTCATGGTTGACTGTGTCAAAGTATCGTTCTAAATCTATGTCCACTACCCACGTGTGTCCTTCGTTTAGGTATTCTTTGCTTTTCCGTATGGCTTGTTTTGCATCTCGTAATGGCCTAAATCCATAGCTGTTATCTACAAATTTCTTTTCATAAATCGGTATCAGTTCCTGGGCTATGGATTGTTGGATTACTCTGTCTATTGCTGTTGGTATGCCTAGTAGTCTTTTCCCTCCATCCGGTTTCGGTATCTCTTTCCTCCTTACCGGGTTCGGGGTGTACCTTCCTTCAAGGAGCTCTTGCCTTAATTCTTCTCCATGTTGTTTGAGATATTCAAAGAGTTCTTCTACTTCCATCCCGTCTATTCCAGGGGCTCCTTTGTTGGCCTTTACCTTCTTATATGCTTTATTCATATTATCCTTGGATAATATCTTTTCAAGCATCCCTTCACTGTATCCTTTATCATCGTTTCTTCCTCTTTCAGACGTAGAAGTTACACTAGGCGCTTCTACATTATTTTCAGGCTCTCCCTTATCTTCATGTAGGAAACCTTCTAATCGAAGTTGTATGCTTTTTCCGTGTCTCTTCGCATCTTTCAAGATTCGAAACCTCCTGTTGTTCAGTCCTTCCCCATCTTTCAATGAGTACTATGACCTCTGCTGACTTCTCAAGATTCAGCCATACATTGCTGCATGGGTTGCCTTATCAGCATGTTCTTGAGATCTCCCCAGGTAAGTGCAATAACTTTCATCCCATCTATCCGCCAGATTTACTCTGTGAAGTTCTGGATAGCTGTTGGACTTCGTTTTGTAATGCAAACTCGTCCACTTCACTTAGCCTTGTATCTGGTTCTTGTTCATCGGACCGAGACTTTGCCTTGGGCTTCCTTCAGATTCCACCTCACGATGGACACCCTTGCCTTCGACTAGTGGTTCCCGCTACCTGGCCCACAACGGGCTTTCACCGCTTAGCTATTGCCCATGCTGGGCGCACCAAATAAAAGCTGTTGAAAAACAGCTTTTTTTAAAAGATTTTCAAAAATAAGATTTCGATTTTAAAAGGGTAAAAGGCGCTTAAAATATATAAAGAATTACTAAAAAATTTCTCTATTTTTCAATACCCTAAGAAACTAAAAAACCACTTTGCATCTATTATATGGTAAAATAGACTGTAAGGATAGGTATAATAACGACAAAAAACGACAAGTTGTAAAAATTAATAGAATTTTAATAATAAAATGATATAATGAGGTGTAGAGAATGGGAGAAAGAGAAGAAAATTTGCAAGAATTATCCCCAAAACAGCTAAAGGAGGAAATAATAAAAGCTCTTGAAAATCAACCCTTCCCAATCTTCAAACGCTCATTGAAAAACATAAACAATAGGAACCTTCTATTAAAAATATTGGAATCAGTCTTGGAAATAAATTATGATTACACAATAGGTGAAATGAAAACAGGAAATTTAAGAGGAATCAGGGCGTACAAATTCATACATGATAGCGTATCTTACCGGTTATCGTATTACGTAGTAAATGATGGGAAAATAATAATAACTTATATAGATATAATGAAAAGAGAAGATAGTTATGATAATTTAAAAAAATACTTTCAATCAAGAAAATCTGTATTAAAACAAATAAATGAAAAAGGGATATAAGGAGGGAAAACAATGCTTAAAATACATGAATTATTAAATATTTTCTCTGATTTAAAGCCAAAAAATAAAGAAGTTTTGTATAATTTCTTAGCAAATCCTAAAACATATGAAGACAAAGAAGAAATTGAAGAGTTTATACAGATATTGAAAGAAATGAAAGAAGACTTGTTATATTATGATGAAGAATTTGACGACATTGAAGAAAAAGAACAAAAATTATATTTCACACAAAAAGATTTAGCAACAATGACAGGACAATCAATAAGAAATATCCAAAGAATTATCACAGAAAACAATATAAGCCCAATTAATCCTGGAAGAAAACCATTATATTATGACCTAAAAGAATTTAATAACTATTATTTTATACAAAAAAAACTAACCCCCTCTTTGAAAAATCAAGAAATCAATACAATAAGAATATTTGGAGATAAAAGAGAAGTAAAAGAAGAAATAGCCATGCAACGAAATTTATACCAATTTTTAGAATCGATGCCACACAGGAATCAAAGCATAACCTTATCATTGCCTAACAAAGGATGTGAAAAAGATGAAAATGAGCAATATTCAAATGCGCTATGACATAATTAAAAAATTAAATTATGAATTAAAAGACGAAAGTCTAAACAACAAAAAACTAACACCAAATATAGACATTTCGGTTACACAAAATTTCCAACCAAAAGAAAAAGAATACTTTGGGACATTAGGATTAAAAATAAAATTTCATTTGAAAGAATCAAAAAAAATAGTATTAAAATTAGAACTTGAAACAGAAGCAGGATTTTATGGCAACCCCAAAATAAAGGAAAACGAATTCAAAGAACTAGTAATAAAATCTGGAATAATGAGCTTATTGCAGATATCAAGAGCAAAAATAATATCAATATCCGCAAATTTTGGGTTTGTTCCTCCAATATATCTTCCGATGTTGAACATTAACGAACTAGTAGAAAAAGAATTAGAAAAAGCTAAAATAACAAACCAATAAAAGCTGTTGAAAAACAGCTTTTTTTAAAAGATTTTCAAAAATAAGATTTCGATTTTAAAAGGGTTAAAGGCGCATAAGAATTATAAAGAATTACTAAAAAATTTCTCTATTTTTCAATACTCCATCGTCTATATTCACCTCAAAATTCTTCGACTCTATCATCTTCATTAAATCCCTGACACTTTTGTTCTCGTTCCTTCTTTGCCGTGAGGCTGTCTTTCCTTGAACCCCCTTCGGGGCGCTTGAGGCTGTCTTCCTTATTTGCCGTGAGGCCGTTTCTTTGATCCTATTTCTCAAAAAGCTCAAGATATTGATCTTTGTTTTTTCGTTCAAGTTATGATAATGAACTAAAAAACCACAATCTCTCTTTCCCAACTTCCAAACAATAGGCCTATCTTTATAAAACTTTTCATGAAGTTTTAGGTAATCTTTAAAGATATAATCCCTCAAATCTTTCTTCACAATACTCTCTAATTCAGAACGCTCCTTGAATATTGAGGATAACAGTTTATTTTCTTCTTCAACTGAAAACCCAAAAGGGATAAAACCATCTTCGCAATTCAAAAGATACCTTTGGATCCCATTATCTATTCTTACAAAAGCTAATTTTGCTAAAATCTGATCTTGGTTACTCATACTGTTGTAAACGGAAATAGGACTTTGAAAACTTTCTTCTGCTTTTCTTTCCACATAGTTATCGTATGGCTCTCTTCGATGATAGTTGGTTACACCTTCATCAAAAGGAATAATGGAAATTAAAGACCTGATTTTATTATTATAAGCCTCTTTAATAAAATTTTCTATTTTGGTAAGTTGAGCTTCATTCAAACCAAATTCATAAAGATACTGGTTTTTCAACAGTTCTTTCAATGGGGGCAAACCCTTTATACCTTTATCGGTAGAAAAAGGGAAAAAGGCCGTAGGAATCCCCACTGTTTTATAAATCTCCTCAAAATTTCTTTCTTTCAAACTGTACAACTCCATCACCAGTATATCTATCAAACCTTCAGAAAGAAGCATATACGTATCAAGAGCGTTTTTACTCTCTATGAAACCATAAAACTTAGAAACGCCATCGATACTCTCCTCGTTGAAATGCAGTTCGTTTGGATATATCTCGGTATTCTGCTTTTTAATTGCCACGTTCAATCTAGCAAGCGTTTCTAACGCCTGAGTCTCAGAAGAACCCTCAAACAAACCTTGTGGAACGGGAAGCTTTTTCAAATCCCCAACTTCCAAATCCACGCTTCCTGCAATAAAACTCTCCAAATAAGAAAACAAACTACTATTGAGTAAGCCCAAAAACCTAAAGATATCTTCATCTTTTGAAAAGAACAAACTACTACCCTTACAATCGAACAAGAATCCTGAGGGGAGATATCTAAAAGTTGCCCCTTTCGAGGTTGTCATCGTGTAAGTTATACCCTTTTTAAAATAATACTTTCTATTTGGAAGATAGTTCCCCATTTTTGACAATAGATTATAATTCTCTTCATCGAAGGCTATAACCCACCACAAATTACCATACCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_010003|1358392:1366083|1361954_1365332_-|WP_012209085.1|DBSCAN-SWA MNRSVKKMALELKSILQKEVINEEDSLKRPERGSRKDSLTAGEGRVLLDVFLSFIVLRVLQAKGNSLKRPEGGSRKDSLTANMEGDLQLFGKSGSDSNLLGSYLSGVQFLNRNFDCCYLVDDIKSRITSQTIEKVRDLFQSVKDEDWKKEEIISWSYEYFNEASLKSPKGGSSKDSLMAGKDLKGKNGVISQFYTPKWIVDYLVENTLGKYYGRNGLTAHKEDSLTAGDDKGVDLEDVKIIDPACGCGNFVIGVYDKLREMYQNKGYDDALIPKLIITKNLYGIDIDENAVEITNLLLRLKALEDGAYERIETNIVAVPKENSLKRPEGGSRKGSLTTNEEGQNEYLKKFEKIGSLMRTEDVLSLKESGINDEPLKKALDILSLKYDVVLTNPPYLDSSDYDFELKRYINEDYSEFKKNLYACFIKKSCELVKMDGFVGMITPQTFMFIGSYEKTRRFILDNFQIERLVHFGLGGVFDNALVDTAMFVLRKSKNSLTAHKENSLKRPEGGSRKDSLTASEEKSLGEYINLTSFNGKDSKKRALFSIWKDSLTASEEKKRENYLSKYVFKVDKRVFTKVPRFPFIYWVDSDVVRTFENEPLEKFADARQGIATGNNNRFLRYFWEVRREDIKDGKKWVPYAKGGPYNKWYGNLWWVIAFDEENYNLLSKMGNYLPNRKYYFKKGITYTMTTSKGATFRYLPSGFLFDCKGSSLFFSKDEDIFRFLGLLNSSLFSYLESFIAGSVDLEVGDLKKLPVPQGLFEGSSETQALETLARLNVAIKKQNTEIYPNELHFNEESIDGVSKFYGFIESKNALDTYMLLSEGLIDILVMELYSLKERNFEEIYKTVGIPTAFFPFSTDKGIKGLPPLKELLKNQYLYEFGLNEAQLTKIENFIKEAYNNKIRSLISIIPFDEGVTNYHRREPYDNYVERKAEESFQSPISVYNSMSNQDQILAKLAFVRIDNGIQRYLLNCEDGFIPFGFSVEEENKLLSSIFKERSELESIVKKDLRDYIFKDYLKLHEKFYKDRPIVWKLGKRDCGFLVHYHNLNEKTKINILSFLRNRIKETASRQIRKTASSAPKGVQGKTASRQRRNENKSVRDLMKMIESKNFEVNIDDGVLKNREIF >NC_010003|1358392:1366083|1360471_1360870_+|WP_012209082.1|DBSCAN-SWA MGEREENLQELSPKQLKEEIIKALENQPFPIFKRSLKNINNRNLLLKILESVLEINYDYTIGEMKTGNLRGIRAYKFIHDSVSYRLSYYVVNDGKIIITYIDIMKREDSYDNLKKYFQSRKSVLKQINEKGI >NC_010003|1358392:1366083|1358392_1359811_-|WP_012209081.1|DBSCAN-SWA MKDAKRHGKSIQLRLEGFLHEDKGEPENNVEAPSVTSTSERGRNDDKGYSEGMLEKILSKDNMNKAYKKVKANKGAPGIDGMEVEELFEYLKQHGEELRQELLEGRYTPNPVRRKEIPKPDGGKRLLGIPTAIDRVIQQSIAQELIPIYEKKFVDNSYGFRPLRDAKQAIRKSKEYLNEGHTWVVDIDLERYFDTVNHDKLMRIISKDVKDGRVISLIRKYLKSGVMVNGVVIETEEGTPQGGPLSPLLSNIMLHELDVELTKRGHKFCRYADDCNIYVKSEKSAYRVMESITKYIEKKLKLKVNRKKSKVVKPLDLKYLGFSFYGKEEQYEIRVHEKSIKEFKKKLKEETKRSSGRSMTYRLSKIKQIITGWINYYGIANMKSAAESLDGWLRRRIRMCIWKEWKKIKTRYKNLVKLGLNTYKAWEYANTRKGHWRISNSPILSRTLTNKHLKEIGLTSILETYNLKHQFC >NC_010003|1358392:1366083|1360882_1361452_+|WP_012209083.1|DBSCAN-SWA MLKIHELLNIFSDLKPKNKEVLYNFLANPKTYEDKEEIEEFIQILKEMKEDLLYYDEEFDDIEEKEQKLYFTQKDLATMTGQSIRNIQRIITENNISPINPGRKPLYYDLKEFNNYYFIQKKLTPSLKNQEINTIRIFGDKREVKEEIAMQRNLYQFLESMPHRNQSITLSLPNKGCEKDENEQYSNAL >NC_010003|1358392:1366083|1361420_1361861_+|WP_041534098.1|DBSCAN-SWA MKMSNIQMRYDIIKKLNYELKDESLNNKKLTPNIDISVTQNFQPKEKEYFGTLGLKIKFHLKESKKIVLKLELETEAGFYGNPKIKENEFKELVIKSGIMSLLQISRAKIISISANFGFVPPIYLPMLNINELVEKELEKAKITNQ >NC_010003|1358392:1366083|1365315_1366083_-|WP_155811077.1|DBSCAN-SWA MFTEERTALRHIRKTASRQIREVASMPNSSERDCFCKDPENCPSRGILDNKYMCSIFMNYLNGSRNYRDISPKIYLDASFDNFLALNEHLKKGLLKCRYFVEEKLWEKGVGLILHGGYGTGKSRLGFTVLKEAAVMGCSIGVLDILRDFENFEGADAAIERAFESDLIFIDDLGAKSYEWIGQKIRIVIDEVNRNQKSVIISTNLNPKELVNFLDDRTVSRLIEIVPKEGLIYLGEEDFRVKKREEKVAYFEQIR >NC_010003|1358392:1366083|1359886_1360045_-|WP_155811076.1|DBSCAN-SWA MKWTSLHYKTKSNSYPELHRVNLADRWDESYCTYLGRSQEHADKATHAAMYG |
7 | Marinitoga_camini_virus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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