Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010117 | Coxiella burnetii RSA 331, complete genome | 0 crisprs | cas7f,cas3,DEDDh,cas8f | 0 | 0 | 2 | 0 |
NC_010115 | Coxiella burnetii RSA 331 plasmid QpH1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
332307 : 341193
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010117|332307:341193|DBSCAN-SWA AATGTTTAAACCTTCTCAGTGGCGGAAAATTAGCTATTTGCTCCGCTTTGAACGAAAGAAAGACCGGCCCCGAGTCATTAAACGTAAAAATCATTCTATCTCGCGCAGCGACATCAGTCCCAACGCGCTGAGGGTGTTGTATCGTCTTAGCAAATCCGGTTATGAGGCCTATCTGGTGGGAGGCGGTGTGCGAGACATGTTATTAAGCTATCACCCAAAAGACTTTGATATCGCTACCAATGCGCGCCCCCACGAAATACGAAAACTCTTCAAAAACAGCCGCCTTATTGGTCGACGATTTCGCTTAGTTCATGTTTACTTTCCCAATGAAATTATTGAGGTATCAACCTTCCGCGCGAATGCAGAAGAGTTATTAAAAGAAGAACCGCTGAGTGAAATGCAAAAAACAGGGGCGACTATGCTATCGGAAGATAACACCTATGGCACAATTGAAGAAGATGCTTGGCGGCGGGATTTTACCGTTAATGCGCTCTACTATAACATCACCGATTTTTCCGTTATCGATTTTACGGGCGGTATGAGGGATTTGCACCAGCGATTAATTCGTATGATTGGCGATCCTACCCAACGTTACCATGAGGACCCGGTACGATTGCTACGAGCCATCCGGCTAGCGGCGAAATTGGATTTCAAAATCCATCCGGACACCGAAGAACCTTTAAAAAAGTTGCATAATCTATTGCGTCATGTGCCTTCCGCTCGTCTTTTTACAGAAGTTTTAAAGATATTTTTTGAAGGACACGCGGTTCGCTCTTACCAATTGTTAAAGCAAACGCATTATATGCGAACTTTATTCCCGGAAGCCGCCACTATTTTAGAAAAAACACGACAGCCGCTTTACGAAAATTTAATTAAATTGGCTTTAAAAGCCACTGACGAACGTTTTCACAACCAACAAAGTTTAAATCCGGGATTTTTATTCGCTATTTTTTTATGGCCCCCCGTGCAAGAATTAATGCAACAGCATTTTAAAAAACATAAACGCCTATTCCCAGCGTTGTATCACGGGATAAACACCGCTTTACAGCGACAGGTGACAATATTACCCCTTCCTCGTCGATTAACTGCAATGATGCGTTCCGTTTGGATGTTGCAATACCATTTAGAACGCCGGCGCCACACTCGTGTTTACCGAATTGCGCAACAACGTTTTTTCCGAGCTGCTTTTGATTTTTTAGAATTACGAGAACGCGCTGGTGAACCGCTGACCGAAATTGTGTATTGGTGGCGGGCGTTTCGCGATGGAACTTCTAAGCAGCGTGAACAGTTGATTAATGAGCTCGCGAGAAAAACACAATGACAATAGCCTATGTTGGCGTAGGGGCAAACCTGGATAATCCGCTCAAGCAAGTGCAAATCGCGGTAAGTAATTTGTCCACGTTGCCGCAAACTGCTTGTCTTGGCTATTCCAGCTTTTATCGGAGCAAACCGTTGGGCCCGACTGATCAACCGGATTACATCAACGCCGTAGCAGCGGTTGAAACTACCTTGTCCCCCCAAATGCTTTTGAAAGCATTGCAACGACTTGAAGAAAAACAAGGCCGGTGTCGGGGCGGGAAACGATGGGGGCCGCGGATTATCGATCTCGATATTTTATTGTATGGAGATCTTGCGCTTCAGAGCGATGAGCTTTGTCTTCCCCATCCGGGACTTTTTGTGCGGGAATTTGTGCTTTATCCACTGGCTGAAGTCGCAGAAGACTTGATTTTACCCGGCGGCGAGTCTATTTTGGAACTGAAAGCAAAATGCCCTGATCGAGGCATTGAACGAATTATAAAAAACCCCTCTTCACTACTTCCTTTTCCCTTTAGGGGGAAAGGGTTGGAGAAAGAGGGTGATACAAAGGCGCTAGCATGAAACCAATCGCCATCTACCCAGGAACCTTTGATCCGTTGACCAACGGCCACGTAGATATTATCGAGCGCGCTTTACCCTTATTTAACAAAATAATCGTTGCGTGTGCTCCCACCAGCCGTAAAGATCCTCATTTAAAACTGGAGGAACGCGTTAATTTAATTGCTGACGTATTGACTGATGAGCGTGTTGAAGTTCTGCCCCTTACCGGACTTTTGGTGGATTTTGCCAAAACACACCAGGCTAACTTTATTTTACGCGGCCTTCGCGCCGTTTCTGATTTTGATTATGAATTCCAGCTAGCGCATATGAACTATCAATTATCACCCGAAATTGAAACTATTTTTTTACCGGCACGAGAAGGTTACAGTTATGTTTCTGGAACCATGGTAAGAGAAATCGTTACTCTCGGCGGCGACGTATCGCCGTTCGTTCCCCCTTTAGTTGCCCGTCATTTACAAAAAAGAAGAGAAAAATAAATAACATTAATTCTATGGCTTTAAAAATTACTGAAGAATGTATTAATTGCGATGTCTGCGAACCCGAATGCCCGAATGATGCGATTTCCATGGGCGAGTTGATTTATGAAATTAACTCTAACCGATGCACAGAGTGCGTTGGTCACTTCGACGAACCTCAATGCCGCCAGGTTTGTCCTGTCGATTGTATTCCTTTAGATTTTCATGAATCTAAAGAGGATTTAATGAAGAAGTATCAGCGATTACAAGATGAAAAATAACTAGACCCTAGTGTTATTTCGGGATTTTCTTTTCTTTGAAAAGTACATGCATTCCACATTTGCTCGTTTCAGAATTCCAAGCACGGGGGTCGAATTTTTTGATATTTAATTTATCGGTGGTATTTCGCTTATTTTTATAAGTCGTGTAAAAGGTACCGGTCGGTTTGCCCGCTTTGGTTTTTCCGGTAGATTGGAGCATTATTTTTTCGCGTGGACTGACAGCCATTGGTTAACCCTTATTTGCTTTCTTTTTCGCGTTCCCGAATTTTTTTGAGAACTGCATTGATACCGAGCTTGTCGATGATTCGCATGCCGTGCGTAGAAACGGTCAACGTTATAAAACGTTTTTCATCCGGCAGCCAGAAACGGCGTTTTTTCAAGTTAGGTAAAAAACGACGGTTGGTTTTTTTGTTTGCATGAGAGACGTTATTCCCACTTTGGGGCCGTTTCCCAGTCACTTGGCATACTTTCGCCATGACAATACTCTCCGATACTTTCAGCGATAAGGCTCGATTTTATACCAGAAATAGAAGCTACGCGCAAGCAATCGGGGACGTCAGCCGCCAGAGTCAAAGCAGCCCGCTTTCTGCAAAAGAAAACGAATTTCGATCACCGATAATAATATGATCGAGCAGCCGCACGTCGATCAAGGCGAGAGCTTCTTTGAGATGGGTTGTGGCGGCGCGGTCGGCTTGACTGGGGTCGGGGACGCCGGAGGGGTGGTTGTGGGCGACGATGAGGGCAGCGCTATTATGGTAGAGGGCGCGTTTAATGATTTCCCGCGGATGGACGGAGGCTTGATTAAAGCTTTTCGAACTGAATGATGCGATGACGGTTATCCAGAAAAAGACAGGCAAAAACTTCGCTTTCATGATGGCGCAACTGGGCGTAGAGAAGTTGCTGGGCGTCTTGAGTGCAGCCGAGTTGGCCTTTTCGCTCGAGTGACTGACGGAGGTAACGCCGTTGTAATTCGGCGGCCGCTTTGAGCTTACAATAGACCGCTTTTCCAAGACCGCGTAAGCCGGAAAGACGGTGAAAATCAGCATTCAGTAGACTAGCGAGCCCGCCGAGATGATTGAGCCATTCGCGTGCTAATTCAACGCGTTGCACCCGCGCACGCCTTTTTCGATGATCACAGCGATCAGCTCCGCATCCGAGAGGATATGCGCATCTTCTCGGAGCAATTTTTCCCGCGCTCGCTCGTTGGCCATTGTGTAATTGACATGAAGAAAGGATGGAGGGACTCCGATTAAAAAACAATACTGTAGTCAGCGGGGGACAGAGGACAGAAGACAGAAGACGGAAGACGGAAGACGGAAGACAGGGGACAGAGGACTGAAAACAGAGTTGTGTGGCTTGGCCAACATTAATTTATAAAATTTAGTTGTCGCATAGCGACACAACCACTGTCCTCTGTCCAGGCTACCCTTGCAGAAAGGGAGTAAATAGCTTGTTTGCTGAAGCATTAAGCGTTACATTTTGTGTCTTACAGGAGGAAGGAGCGCCATGACACATTCCGTTCAATTAAAAATTTTAGATAAACGCTTAGGAAGTGAATTTCCATTGCCTGCTTACGCCACCACGGGTTCAGCGGGTTTGGATCTGCGCGCCTGCTTGGATGAACCGCTTAAAATAGAACCGGACGAAACTTGCCTGATTAGCACAGGATTGGCGATTTATTTAGGCCATTCCAATGTAGCGGCGACTATATTGCCTCGTTCGGGACTAGGGCATAAACATGGGATTGTATTGGGCAATTTAGTGGGGCTCATTGATTCGGATTATCAAGGACCGCTGATGGTTTCTTGTTGGAATCGGGGTAAAGAACCCTATACCATCAACCCGGGCGATCGAATTGCTCAGTTAGTCGTTCTCCCTATCTTGAAGGCGCAATTTGCGGTTGTGGAAGAATTTGAACTTACCGAACGAGGAGCGGGCGGTTTTGGCAGCTCAGGGCAAAATTAATCAATGGAATGTCCCCGAGATAGTGCCGGCGACGCTTTTTAGAGCTTACGATATTCGCGGCCCGGTCACTTTTGAGGCATTGACACCCGGATTAGCTTATGCCGTTGGCCTTTCGATCGGCAGCGAAGCGCGCGAACAGGGGCAAAAAGCGATTGTCGTGGGTCGCGATGGGCGTTTATCAGGGCCTAAATTAACAGCTGCTTTGATTCAGGGATTGTGTGAGACCGGCCTGGCGGTGCTTAATGTTGGTTTGGTGCCAACGCCGCTGGTTTACTTTGCCACGAATCGTTTAGAAACCAATTCCGGCGTGATGGTCACAGCGAGTCATAATCCGGGGCACCACAATGGTTTTAAAATTGTTCTGAATGGAAAAACATTGAGGTCGGAAGAGATTGCAACCATCCGAACGCGTATTCTCGAAAGACGCTTTGTTAAAGGCCATGGCGCGGTGGTTGATGTGGACATCATTGAGGATTATGAATCTTATATCACCAAGCATATTCAATTAGACCGCCCGTTGAAAGTGGTCGTGGACTGTGGCAATGGGATTGCCGGCAAAGTGGCGCCGGCGTTATATCGCAAGCTAGGGTGTGAAGTAGTGGAGTTATTTTGTGAGGTGGACGGCCATTTTCCTAATCATCATCCTGACCCTACTATTCCCGCCAATTTAACGGATTTAATCCATAAAGTAAAAGAAACGCAAGCCGACCTTGGGTTGGCTTTTGATGGCGATGCAGATCGTTTAGGTATTGTGACGGATAAAGGAGAAATTATCTGGCCCGATCGTCAAATGATGTTATTTTCAATGGACGTATTATCTCGTTTACCGGGTTCTGATATTGTTTTTGACGTCAAATGTTCGCGTTCCTTAGCCGAAATAATAAAAAAATACGGCGGCAATCCCGTCATGTGGCGAACCGGGCATTCAATTTTAAAAGCTAAGCTTTTTGAAATCGGCGCACCGTTGGCCGGAGAAATGAGCGGACATATCTTTTTTAAAGATGAATGGTTTGGTTTTGATGATGGCATTTACGTGGGAGCGCGATTATTACGAATTATCTCGCAGACTAATCAACGGACGAGTGAAATTTTTGCGGAGTTGCCCGATAGCGTCAACACGCCCGAATTAAAATTGCCGATGACCGAAGAAAAAAAACAACCCTTTATGCAAGCGTTATTGAAAAAAGCTGATTTTGGAAACGCGAAACTTATTACAATTGATGGATTGCGCGTTGAATTTGAAGATGGTTGGGGGTTAATTCGACCTTCCAACACCTCGCCTTATTTAATTTTACGTTTCGAGGCTGATACAGAAGAAAAACTAAAGCGTATTCAGGAAATCTTTCGAACGCAGTTGCGGATGATTGATAATGCGTTGGAGTTGCCCTTTTAAAAAGTAAAGGATTGTTTAGAGTGTCTCTGTTCCTGTTTCCCCTCTTGCTCAAGAGTCTCTTCAGATTTACTCCTTTTGAAAATAGTCTTTATTGATAGGCGGTTGGGAGTGATATTGCTCATAACATTTTTTATGAAGCTTAGATTTTCTTCGCGATTTTCTCGTGCGGTCAACCAGTTTACTAAAGCGTTGAGTTTTTTTCTTTTATTTCATCTCCCAAGTAGGCTTCGGCGGTATGAAAAGGTTGTGAAAGAAGGGTATTGGCTATCTCCAAAGCTCGCCTTAATTTACTTTTATTTTCAAGAGAGAGGGATTGGTAATTTGAAATTAAATAATTTTTAAGTGAATTGCAATGTTTAATTGCCAAGGGCAATAGCGTAGTATTATCTTCTAGCAGACCCTTATTGAGGATAGCGTCGTAAAAATAGTTCCAATTACTTAAATTAAATATTTTTGGAATCCAAGTGAATATTTCTTCGAGCTTGTTAAGCGCTTCGAAGTGTTCGTTTTCGATAGCTTCTATACAGTATTCAATAGCTTTTCCATAATAAACGATGGCGTCCAGATTTGATTCTTGACCGATCCGCTTTTCATAAAGCATATAAGCAATACTGGAAAATACCAGGGAGAGTAGCAAAGGAGCGGTTTCGGTCCATTCAGACAGTAGTAAAAAAAGTCCCCACGCATCCTTAGAGTACTTTTCGTGCTCAAGGAAGCAGGCAAAGCGGTAGATGGCGTAGGGATTATTTGTGAATAATACCGCTTCGTAACATCGCTTAGCTTCTTTGATTTGATATTTATTTCCACATACCGCAAATAACCTCGCCAATGCTTCTACTGAGCCTGCTTGCACAGCCTCGAAAAGCGGCGTTAGATTCTGACGTTGATAAAGAAACAGATTGTGTTTGGCTAACGGCATACCTTGAATAGCGGCTTTTTGGAAGAGCGTTTTAGCATTTTCTAGTTCTTCCTTTTCGAGAGAGTGATTAGCAGCCAGCCATTGTGCACGAGGATGATTTTTTCGAGCGCTTGATTAAGGTATATTTGAGCCTGATCCTTTTCCCTCTCTTCTGAATAAATTTCGAAAAGCTCAACCGTGGCGTTAGGTTCTCCTGCTTTGGTCGCTTTTCTCAGAAAAAATTTAGCTCGACCGGTATTTTGTTTAACTCCTACGCCAAGAAAATAAGCCATCCCTAATAAATAACTTTTCGCGGGAATGTCATCCGGTAACTGAGTAATATAATTAAAATAATTTACGCAATCCTCGTGCGGTTTATCATTAAAAAACTCCCTTATTTTCCAGGCAATTAAAGCGGTTGATGAGATATCCTCTCGATTAGAGGCTTCGATAAAGGCGTTTGCTAGATCAATGAGATTGGTCTCTCGAGATTTTCGAAAACATTCAATAGCAAAATCTATATCCAGTGCTTCTTCTTTCGCTTCCATGTGTCGCTTGTACCTCAAGGTTGCCAGTGTTCGGGATCTTTATTCCACGCTAAGGCTTTTTGTTTTTCTATTTCATCAATGTAACCTTCATCAACTGCCATTTCGATTAAGGTATCGAAATGAGAAAGCGCATGACAGTTGATGTTGGCATCCGAAAAATTTTGCTGCGCTTGGGGTAATTGATAAGAAAAAATCGCAATGCAGTCGGTTACTGTCACTCCTTTTTCTCGTAAAGCTAAACCGGCCGCCAGGGCGCTTTTTCCAGTGCTAATTAAATCTTCCACAATTAGCGCCCGCTGACCTTTTCGAATCCGGCCTTCAATTTGATTTTGTTTACCGTGAGTCTTGGCTTTAGCGCGAACGTAAATCATGGGGAGATCGAGCCGATCCGCAATCCAGGCGGCGTGCGGGATGCCGGCAGTCGCAGTACCTGCTACGATATCAAACGATAAATGATTCTTTTCAATGAGTTGAAGAAAAGCTTCGATAATCATTTTTCGTTTTTCAGGATAGGAAATAATTAAACGATTGTCACAATAAATGGGGGACAGAATGCCCGAGGTATAGCGATAAGGCTCATGTAAATTTAAAGTGACTGCCTTGATATTAAGTAGTAACTTTGCTATTTCTGTGGCTTGATTCATAAAGTCATTGTTGCACAATTTAAATACTAAAAAAAGAAGATTTTTATGCGCATTATCACTTTAAACTTAAACGGCATCCGTGCGGCTGCTCGCCGAGGGTTTTTCGATTGGTTAAAACGACAGAAAGCGGACATTGTTTGTTTACAAGAAACAAAAGCTTGCCTTGAAATCACCAATGGGGATCAATTTCACCCTAAGGGATATCATTGTTATTACCACGATGCGGAAAAGAGCGGTTACAGTGGTGTTGGTATTTATTGTCGCGAAAAACCCGATCGAGTGACCACCCGATTAGGCTGGGAACATGCCGACAAAGAAGGGCGTTATATTCAGGCTGATTTTGGCTCGTTAAGCGTTGCCTCGTTGTATATGCCTTCGGGTACGACCGGCGAACATCGCCAAAAAATCAAATTTGATTTCATGGATCGTTATATGAAAAGATTAAAAAATATCGTTCATTCAAAACGATCTTTCATTATTTGCGGCGATTGGAATATCGTGCATAAAGAGATTGATATTAAAAATTTTAAAAGTAATCAAAAACATTCTGGTTGTTTGCCAGAGGAGCGCGCCTGGTTGGATGAGGTCTTTACGAAAGTAGGATTGGTTGATGCTTTCCGAGTGGTTAATCAAAAGCCGGATCAATACACGTGGTGGTCCAGCCGCGGCCGCGCTTGGGAGAAGAATGTCGGATGGCGCATTGATTATCAAGTGATAACGTCAGATTTAAAAAATAGCGTAAAATCAGAAAGAATCTACAAAGACAAACGATTTTCGGATCACGCGCCGTTGATTATCGATTATGAGAGAGAAATTTCCGACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010117|332307:341193|334180_334660_+|WP_005771452.1|DBSCAN-SWA MKPIAIYPGTFDPLTNGHVDIIERALPLFNKIIVACAPTSRKDPHLKLEERVNLIADVLTDERVEVLPLTGLLVDFAKTHQANFILRGLRAVSDFDYEFQLAHMNYQLSPEIETIFLPAREGYSYVSGTMVREIVTLGGDVSPFVPPLVARHLQKRREK >NC_010117|332307:341193|332307_333627_+|WP_005771456.1|DBSCAN-SWA MFKPSQWRKISYLLRFERKKDRPRVIKRKNHSISRSDISPNALRVLYRLSKSGYEAYLVGGGVRDMLLSYHPKDFDIATNARPHEIRKLFKNSRLIGRRFRLVHVYFPNEIIEVSTFRANAEELLKEEPLSEMQKTGATMLSEDNTYGTIEEDAWRRDFTVNALYYNITDFSVIDFTGGMRDLHQRLIRMIGDPTQRYHEDPVRLLRAIRLAAKLDFKIHPDTEEPLKKLHNLLRHVPSARLFTEVLKIFFEGHAVRSYQLLKQTHYMRTLFPEAATILEKTRQPLYENLIKLALKATDERFHNQQSLNPGFLFAIFLWPPVQELMQQHFKKHKRLFPALYHGINTALQRQVTILPLPRRLTAMMRSVWMLQYHLERRRHTRVYRIAQQRFFRAAFDFLELRERAGEPLTEIVYWWRAFRDGTSKQREQLINELARKTQ >NC_010117|332307:341193|336399_336885_+|WP_010957483.1|DBSCAN-SWA MCLTGGRSAMTHSVQLKILDKRLGSEFPLPAYATTGSAGLDLRACLDEPLKIEPDETCLISTGLAIYLGHSNVAATILPRSGLGHKHGIVLGNLVGLIDSDYQGPLMVSCWNRGKEPYTINPGDRIAQLVVLPILKAQFAVVEEFELTERGAGGFGSSGQN >NC_010117|332307:341193|334933_335146_-|WP_005771448.1|DBSCAN-SWA MAVSPREKIMLQSTGKTKAGKPTGTFYTTYKNKRNTTDKLNIKKFDPRAWNSETSKCGMHVLFKEKKIPK >NC_010117|332307:341193|333623_334184_+|WP_005771454.1|DBSCAN-SWA MTIAYVGVGANLDNPLKQVQIAVSNLSTLPQTACLGYSSFYRSKPLGPTDQPDYINAVAAVETTLSPQMLLKALQRLEEKQGRCRGGKRWGPRIIDLDILLYGDLALQSDELCLPHPGLFVREFVLYPLAEVAEDLILPGGESILELKAKCPDRGIERIIKNPSSLLPFPFRGKGLEKEGDTKALA >NC_010117|332307:341193|339738_340386_-|WP_010957485.1|DBSCAN-SWA MCNNDFMNQATEIAKLLLNIKAVTLNLHEPYRYTSGILSPIYCDNRLIISYPEKRKMIIEAFLQLIEKNHLSFDIVAGTATAGIPHAAWIADRLDLPMIYVRAKAKTHGKQNQIEGRIRKGQRALIVEDLISTGKSALAAGLALREKGVTVTDCIAIFSYQLPQAQQNFSDANINCHALSHFDTLIEMAVDEGYIDEIEKQKALAWNKDPEHWQP >NC_010117|332307:341193|336862_338278_+|WP_012220155.1|DBSCAN-SWA MAAQGKINQWNVPEIVPATLFRAYDIRGPVTFEALTPGLAYAVGLSIGSEAREQGQKAIVVGRDGRLSGPKLTAALIQGLCETGLAVLNVGLVPTPLVYFATNRLETNSGVMVTASHNPGHHNGFKIVLNGKTLRSEEIATIRTRILERRFVKGHGAVVDVDIIEDYESYITKHIQLDRPLKVVVDCGNGIAGKVAPALYRKLGCEVVELFCEVDGHFPNHHPDPTIPANLTDLIHKVKETQADLGLAFDGDADRLGIVTDKGEIIWPDRQMMLFSMDVLSRLPGSDIVFDVKCSRSLAEIIKKYGGNPVMWRTGHSILKAKLFEIGAPLAGEMSGHIFFKDEWFGFDDGIYVGARLLRIISQTNQRTSEIFAELPDSVNTPELKLPMTEEKKQPFMQALLKKADFGNAKLITIDGLRVEFEDGWGLIRPSNTSPYLILRFEADTEEKLKRIQEIFRTQLRMIDNALELPF >NC_010117|332307:341193|334674_334920_+|WP_005771450.1|DBSCAN-SWA MALKITEECINCDVCEPECPNDAISMGELIYEINSNRCTECVGHFDEPQCRQVCPVDCIPLDFHESKEDLMKKYQRLQDEK >NC_010117|332307:341193|340413_341193_+|WP_012220156.1|DBSCAN-SWA MRIITLNLNGIRAAARRGFFDWLKRQKADIVCLQETKACLEITNGDQFHPKGYHCYYHDAEKSGYSGVGIYCREKPDRVTTRLGWEHADKEGRYIQADFGSLSVASLYMPSGTTGEHRQKIKFDFMDRYMKRLKNIVHSKRSFIICGDWNIVHKEIDIKNFKSNQKHSGCLPEERAWLDEVFTKVGLVDAFRVVNQKPDQYTWWSSRGRAWEKNVGWRIDYQVITSDLKNSVKSERIYKDKRFSDHAPLIIDYEREISD >NC_010117|332307:341193|335156_335396_-|WP_005771445.1|DBSCAN-SWA MAKVCQVTGKRPQSGNNVSHANKKTNRRFLPNLKKRRFWLPDEKRFITLTVSTHGMRIIDKLGINAVLKKIREREKESK |
10 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1767915 : 1809227
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010117|1767915:1809227|DBSCAN-SWA 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38 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 25379
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010115|0:25379|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010115|0:25379|6977_8642_+|WP_155106168.1|DBSCAN-SWA MPPEAYTDENFFKKCEMEFNSLKKDTMVLVEEAKKQSAHRPRPYEDQFKTACSQLGASGRKLSSNSYIKKRFTEIKTLLDNTAVIHAYPHQATVFKCGVTYKSYSEEKIGNPLANLLVASLEEEIPDRCKRVAFDNSNPKKTRSASYLEMAEKCLEEAENDLNPHFREMFNDSYERFSNAAEIGDREDLVLEKQLYHISLSETDPVETNLYEKYKGEIPKEAFPLIPEEAEAVESEKRKKEEENFKQKLKELEKKSRENSDKTYEKLTETDLLERLIPRNDSRPTFTIPPLVGIHLTTYMQKCLFKIQKIDKRQTREARDEFIVRSTDRTHKARSAMDGEKRGDVVDPSIGYAAYDADPANIVNEIDRLKKNMMRIVPKRYLYSNRRRVKKAFFEYAGKKISGECDRKVTKIERSYERSKSNKRKTEECNQLIKKAIEQSNEDKKILNRFEKLLSDGLDGKKLYAPYDPFEGNTKLAELNPDSKKITWYSLEIDSAGTAQKDSSRERPSIENRLSNSLFSASKTAESDSDSDSEKEQTSYGVSNCLVDTLLSCF >NC_010115|0:25379|8763_9615_-|WP_012219989.1|DBSCAN-SWA MDDDEKKKLLEAYQNAVLIEPPKELPPIFVTPQTSDEPLQNLAITLSAFPIENRGGVQVFEVPKIADDCRSYVGRGYDAYEDTAAKGPQGPAWKPDSTWVKLESIEDFACRKGFEKVYVYEGHHYARQWGDGTILEKLGSTHWGATPVVRLIDPHALIVKKYYGEVKEIWIRPYLHGSVPIPYLRAQSSYRRGPFGNYHLFKSVYKKEIVIQKMTKDDWEPHYQWAKKEQQRQQQATAQFFKPQEEKQQESKKFINSFLVRLCEVLRIFISDENREPRKIDPS 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>NC_010115|0:25379|3451_4183_+|WP_010891172.1|DBSCAN-SWA MPYFFTLPKIDIKEKSASQTPEKVLREWLRGASNQEDASLFIGNSPIFGEHQDTSGSSLPKVEIPEFINSIKAVEAVFKKEGLKDEEILNYILHFGGINGYMTLGQVVFEEISMNKGKSSRMENRRYSYRVKNKGEVEYIEQFDFYKKNTCDRNEIGDFIGQVKIVSIISKDGDIQHACKKVEIAVPGEKLNSFRKHFGDQLNFVNRMKLRLVELYNSLVERFRAAINKADRTNNNCFPFCSR >NC_010115|0:25379|1863_2034_+|WP_011109639.1|integrase|DBSCAN-SWA MPLDSGAPLKVAQENAGHSDIGTTMLYRHVAQTDRFEATRLLSLKKKVSSQNKDKV >NC_010115|0:25379|18825_19179_+|WP_010891157.1|DBSCAN-SWA MNPKDLLYLKGFFDDFNKNKQRIKLVAEYRNNEYGIACDQFEIRKIPGSSLCADLNLLGNMSIESAFVIIYKTAYLKGVADSKKSQFLEQKQQCYGKDTPTRLLRLVNNNVEGGKDN >NC_010115|0:25379|17889_18636_+|WP_010891158.1|DBSCAN-SWA MEDNCIKIAQVSDLHLTSENCETSRGRYSNAMNVFSAISLSGQHDMIFITGDISDDYTENSYKQLLEMLKKLTCRVFVIPGNHDDVNLMNKIIPEKYLFSPETVTSFNTFDFLFVNTVVNGEIHGLLTDQDLSLLQNHLENSDNKKKCIIMHHNPIPLNRKIYDKYMLLNYQDFLRIICLYDNVKLVIFGHVHNDYTISYRQTLFSSAPATCYQIKKFESDIIIEEKYGYKNYFLFEEFIETNCIWIK >NC_010115|0:25379|21645_21786_+|WP_012219984.1|DBSCAN-SWA 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30 | Bifidobacterium_phage(33.33%) | integrase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
32675 : 36688
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010115|32675:36688|DBSCAN-SWA GATGAATGAATTACCTTATACCCAAGCGACAAATTTTATCAGTGCTGTACAGGGAGGTGTCGATCCTAGAACCGGCCTGTTTACGGTGAACATGGTTCTGGCCGAATTAACTGGAAATGACAACCTTGGACCTGATTTTCTTTTCACGTTGAATTATTCACATTTAAGCACTAGCAATATATGTGGATTTGGCATTGGGTGTTCTGTTGGAATTTCTATTTACGATAAAAATAATAAATTGCTTATATTAAGCAGCGGCGAGCGATACAAGACAGAAGATTGGAATGACAGTGTCTATGTTAGACAGAAAAAAATAAATAATTTTAAATTTGAAAAAATAAAGAACGGTTATATTATAAAATATAAGAATGGAAAAACGGAGTATCTTTATAAATATGGCGATAACCTGTTTCTGCCTCAGAAAATTTTTTCCCCGCTCGGATGGCCGCTTAAATTGACCTGGGAAAATAGAGGGCAGTACGTTAATTTAACAAAAATTGAAGATGCTAAGGATGTCCTATGTAAAATAGATTATCAGTTTTCAGATTGGGCTAGGATAACGTTTTGGCCAGGAAAAACAGAAAGCTATACGTTTCAATTGGATTTTGTTAATGAATATCTCTATTGGGTGACGAATAAATCGACCTCTCGGGAGCTGGTTTGGTCGTTTAATTATGACGATGTTGGTGCGGGTAATTTTACCCTGACGCAAGTAAAGTCACCAACTGGACTGACCGAAACGGTTAATTATCAAGCCGGCGTAATGCGATTTCCTGATGAGTCTGGTAAACCAGCATTACCGTCCGTTTATAATTATCGTCAATCCCCGGGTATGGGACAACCGGATATAGTCAAAGAATACGAATATACAGCATCGAATTATTTGGGGTATGGTGCATCCTTGGGTAAGGCGTGGAATGAAGATGAGGACAATATTTATAACGTAGTAATGGATGATTATACCTATAGTTCAACAGAAAAGCTTATTGTCGATAATAGAGAATTGGTTTCAATAAGTAGAATTTATAATAGTTATTACTTATTGATATCTGAGACCACTCGACAAAATTCGTGTGAGGTAATTTTAGAAACTGATTATTATGCCAAACCAGGGCTTTCATTTGATAAACAGCCGAAACAATTTCAACTCCCCAAGGAAGAGAAAAAAACTTGGCGCGAAAACTCGAAAAATCAATGCCGCAGTGAAATCACTACAACCACCTTCGACCCAGAGGGCAACCTGCTAACAAAGATTGAACCCGACGGAACAAAAACAGAATACATTTATTACGATAGCAAGGGAGAGACGGATAAAGGTATTGTACTTTGTCCGCCAGAACCCAATGGCTTTGTGCGCTTCGTTAAAACTCAAATTGTCACGCCCGCTGATTCTGAATTTTATGCACCCGTACAACAGACAACATACGCTTATGCTCAATATCCTTGTATTGCTGGTTCTTCCTTATCTTATGCAGTCTTGCAGACACAAGAAACACTTTGCAGTGACGATGTTTTACTTTTAACAATAAATACTGATTATATTATATTAATGATCCTACCCAGTCTGAGCACGGAAGAATGAAACGTCGTGCGGAAGTGCTTACCAGTAAGGAGGGAAAGAAATATCAAAACCAAACCACCTTCGCATTTAGTTCGCAAGCGGAGCATCTTTTACAAAAAATCGACTTTACAGGCGGTGACGGTATAAAAACATCAATAAGTCGTGAGCAATCCCGTTACAGTGGCCGGCTTCTCTCTTCCACGGATGAGCTTGGCAACGTGACTCAATATGAATATGACGAATTGGGCCGTCTTTTGACACAGACTGTCAATGCATCGTCAACGACTTACGCCAGCACGACACGTTACTCTTATAGTTTAGAGACAGATGCACGAGGCAAAGTAACGGCTATCAAAACGACGGTTACCGACCCAAAAGGCAATCAGCTGCGCACCTACTATGATGGTCTTGGCCGCAATCTTAAGCAGGAGCGGCTGGATAAGGATGCCGCTGTATCACAAAAGACGGGCACTTGGTATATAACGCACCAACAACAGTACGACGCGCTGGGGCGTGAGAGCAAAACAATTACTCAAGATGTCCTGCGCCTTGACAGCGAGGTAGGTCATGCCGGTTCCGTCCTCTCAACTTCTAAGGTGATGCACTATGACAGCTGGGGTCAGAACCATCTGACGGTCTTTAGCGACGGCTACCAGGAACGATCTGTTTACGATCCGATCACCCGACGCGCAACCCTACAACCCGAAAGTGGCAGCCAGAAACTGGGCCAACAGCTTACTGAATATAACCTTGCCGGTCTGCCCATCAAAGTTACGCAGTATGATAGTCAAGGCACAGAGCAAGGCAGCGCACATTATGAATATGACGGTTTAGGACAGCTGCGTAAAGAAACGGACGAATTGGGCCAGATAACGCTGTACGAATACGATCATTTTGGACGTGTGACCCAAACCACGCTCCCTGAAAACACCATTATCCAAAAGTCTTACGCTCCCCACTCGACGGCGTCCCTGATAACCGGGATTTCGGTCAACAATTTTTCAATGGGGAACCAAACCTTTGACAGTTTGGAGCGACTCACTGAGACAACCAGTGGCGGGCGCACCTCTGCATTTTCTTATGAAAACGCATCATCTGTTCCCGCGGCGGTAACTGCGCCGACTGGTGAGACGGTTTCGTACGAGTATCTAAAAGAACTGGGCAATGCAGTGAAAAAAATCAGCGCGCCGGAAATTCTCCAAACATGGGACTATGATGCGCTGACCGGCGCCATGACCTCGGCAACGCAAGCCGCGGGGATGATCCGTCAGATGACCTATTATCCGTCCGGTTTGCTTAAGAACGAAACGTCCATGCCCGATGGCGCCGCCCAGAAGTCTACCGCCTACACCTATTCACTGGCCGGCGCTCCACAGTCCTATACGGACGTGTTCGGTGTGACGCAACGCTACGATTACGACGAACATGGCCGTCGCATTGGCATCGAAGATAACGATATCAAGGTGTCACTCGACTATGATGCGTTCGGTCGCTTCACGAAACAGCAGGCCACGGATAAAAAAACGGGCGCAGTACTGAGCACTACGCTGACCTACGATGATCTGAATCGAGAAATCAAGCGCGAAATCAGTGCAAGTGGCCAATCTGTGCTTGTCATTGAACAAACTTACCAAAGAAATCACTTGCTCAAAGAGCGAATTACTCAGCGCGGCCGCACAACCTTACGCAAAGAAATGTTCGCTTATGACAGCCGCAACCGGCTCATCGAATATACTTGCAATGGAGAAGCACGACCCCAAGACCCTTACGGCAAAGCCATCCATCGCCAGACCTTCAGCTACGATGCACTGGGTAATATGACAAAAACACAAACCGACTTCAGCGGCGGGCGCAACACCGCCACCTATATCTATAGCGCGATTGACCCCACTCAACTGCTCAAGGTAAACAACGATCACAGCGATTATCCGAAAGAAATCACGCTCGAATATGACAAAGCAGGGCGGATGATTCGGGATGAAGCCGGTCGCACGTTGCGTTACGACGCGTTGGGCCGGCTACAGCAAGTGAATGGTGCGGGCGCAAAAGGCGGTCAATATGCGTATGACGTGCTCAATACGCTGGTCAGCCAAGTGGTTCAGGATGAACCGATTTATGACCTTTACTATCGTGCGGATGATCTGGTAGGCGAGGCCCGTCGCGATGGCAGCAGCCAGACCCGCTATGTGAAGTCGGATGGGTGCTGTGTGGGACAATGCACGAAGCAGGGATCATCGAACACCAGCCGGCTAACGACCACTAATCAGCAAGGCAGTGTGCTATCAGTCTCAGAAGGTAACCATGCACCGCAGGATTGTATCTATACACCTTATGGTTATCGAACCCCACAGACCGAAACGCCATCCGTCCTGGGATTTAATGGGAGCGGCTGGACCCGGTTAGTGGTACCTATCATTTGGGCAATGGCTACCGCGCCTACAATCCGATACTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010115|32675:36688|34252_36688_+|WP_052293383.1|DBSCAN-SWA MKRRAEVLTSKEGKKYQNQTTFAFSSQAEHLLQKIDFTGGDGIKTSISREQSRYSGRLLSSTDELGNVTQYEYDELGRLLTQTVNASSTTYASTTRYSYSLETDARGKVTAIKTTVTDPKGNQLRTYYDGLGRNLKQERLDKDAAVSQKTGTWYITHQQQYDALGRESKTITQDVLRLDSEVGHAGSVLSTSKVMHYDSWGQNHLTVFSDGYQERSVYDPITRRATLQPESGSQKLGQQLTEYNLAGLPIKVTQYDSQGTEQGSAHYEYDGLGQLRKETDELGQITLYEYDHFGRVTQTTLPENTIIQKSYAPHSTASLITGISVNNFSMGNQTFDSLERLTETTSGGRTSAFSYENASSVPAAVTAPTGETVSYEYLKELGNAVKKISAPEILQTWDYDALTGAMTSATQAAGMIRQMTYYPSGLLKNETSMPDGAAQKSTAYTYSLAGAPQSYTDVFGVTQRYDYDEHGRRIGIEDNDIKVSLDYDAFGRFTKQQATDKKTGAVLSTTLTYDDLNREIKREISASGQSVLVIEQTYQRNHLLKERITQRGRTTLRKEMFAYDSRNRLIEYTCNGEARPQDPYGKAIHRQTFSYDALGNMTKTQTDFSGGRNTATYIYSAIDPTQLLKVNNDHSDYPKEITLEYDKAGRMIRDEAGRTLRYDALGRLQQVNGAGAKGGQYAYDVLNTLVSQVVQDEPIYDLYYRADDLVGEARRDGSSQTRYVKSDGCCVGQCTKQGSSNTSRLTTTNQQGSVLSVSEGNHAPQDCIYTPYGYRTPQTETPSVLGFNGSGWTRLVVPIIWAMATAPTIRY >NC_010115|32675:36688|32675_34256_+|WP_043881098.1|DBSCAN-SWA MNELPYTQATNFISAVQGGVDPRTGLFTVNMVLAELTGNDNLGPDFLFTLNYSHLSTSNICGFGIGCSVGISIYDKNNKLLILSSGERYKTEDWNDSVYVRQKKINNFKFEKIKNGYIIKYKNGKTEYLYKYGDNLFLPQKIFSPLGWPLKLTWENRGQYVNLTKIEDAKDVLCKIDYQFSDWARITFWPGKTESYTFQLDFVNEYLYWVTNKSTSRELVWSFNYDDVGAGNFTLTQVKSPTGLTETVNYQAGVMRFPDESGKPALPSVYNYRQSPGMGQPDIVKEYEYTASNYLGYGASLGKAWNEDEDNIYNVVMDDYTYSSTEKLIVDNRELVSISRIYNSYYLLISETTRQNSCEVILETDYYAKPGLSFDKQPKQFQLPKEEKKTWRENSKNQCRSEITTTTFDPEGNLLTKIEPDGTKTEYIYYDSKGETDKGIVLCPPEPNGFVRFVKTQIVTPADSEFYAPVQQTTYAYAQYPCIAGSSLSYAVLQTQETLCSDDVLLLTINTDYIILMILPSLSTEE |
2 | Bacteriophage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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