Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NC_012468 | Streptococcus pneumoniae 70585, complete sequence | 3 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,RT | 0 | 1 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012468_1 | 137959-138054 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012468_1
|
1 spacers
spacers of NC_012468_1
>1.1|137983|48|NC_012468|CRISPRCasFinder TTTTTCTACACATATATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012468_1
The CRISPR arrays of NC_012468_1 >merge|NC_012468|1|137959-138054|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAATTTTTCTACACATATATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGAAATGTGTAAAATTTTTATATATAA >NC_012468|1|1|137959-138054|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAA TTTTTCTACACATATATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA AATGTGTAAAATTTTTATATATAA
>NC_012468.1|WP_000273863.1|137614_137941_-|PadR-family-transcriptional-regulator MYFPTSSALIEFLILAVLEQGDSYGYEISQTIKLIANIKESTLYPILKKLEGNSFLTTYSREFQGRMRKYYSLTNGGIEQLLTLKDEWALYTDTINGIIEGSIRHDKN >NC_012468.1|WP_000198692.1|137034_137628_-|DUF1700-domain-containing-protein MTRTEYLTQLELYLKKLPEADRIEAMDYFRELFDDAGVEGEEELIASLGTPKEAAHEVLSNLLDKKINEAPAQKNNRQILHIALLALLAAPIGIPLGIAILVTLFAILVAALTVILAFFAVSILGIIGGFLFLVESFTVLAQAKSAFILIFGSGLLAIGASSLVLLGISYVARFFGLLIVRLVQFVLKKRKRGNQHA >NC_012468.1|WP_001233693.1|136130_137042_-|DUF4097-domain-containing-protein MRKWTKGFLIFGVVTTVIGFILLFVGIQSDGIKSLLSMSKEPVYDSRTEKLTFGKEVENLEITLHQHTLTITDSFDDQIHISYHPSLSAHHDLITNQNDRTLSLTDKKLSETPFLSSGIGGILHIASSYSSRFEEVILRLPKGRTLKGINISANRGQTTIINASLENANLNTNSYILRIEGSRIKNSKLTTPNIVNIFDTVLTDSQLESTDNHFHAENIQVHGKVELTAKDYLRIILDQKESQRINWDISSNYGSIFQFTREKPESRGTELSNPYKTEKTDVKDQLIARSDDNIDLISTPSRR >NC_012468.1|WP_000808430.1|135003_136068_-|membrane-protein MKQEWFESNDFVKTTSKNKPEEQAKEVADKAEETIADLDTPIGKNTQVEEEVSQAEVELESQQEEKIETPEVGEARTEIEEKKASNSTEEEPDLSKETEKVTIAEESQEALPQQKATTKEPLLISKSLESPYIPDQAPKSRDKWKEQVLDFWSWLVEAIKSPTSKLETSITHSYTAFLLLILFSASSFFFSIYHIKHAYYGHIASINSRFPEQLAPLTLFSIISTLVATTLFFFSFLLGSFVVRRFIHQEKDWTLDKVLQQYSQLLAIPIFLTAIASFFAFFDSLRFTALLCVISIGIILLASLHIITRPSQASETDSFYQLFLSVLVNGVIILLFFVAEVALIGDYLRILAFL >NC_012468.1|WP_001140338.1|133965_134826_+|DUF4299-domain-containing-protein MAKTFFIPNKQSILGEQEILNAKSILALLDGLESHSYDVVYLRQPLNRLEYIECAIVGQSQFLFKVSYADGQKAYRVDLPDLLTKTDWLIIKSFLDALLAYTGTDIEGLDGFDFEAYFQASIQAYLADPVARFTICQGIFNPIFFSRENLKSFLEADGLAQFEARVRAVQETDAYFARVSFYQDGEGKVHGVYHLAQGVKTVLPREPFVPAAYIEQLVDKEVQWEIDLVQITGDGSKPEDYESIARLDYAKFLEVLPPSFYHQLDANQIEIQPILGQDFKTLAQEK >NC_012468.1|WP_001030014.1|132857_133844_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MAKDIRVLLYYLYTPIENAEQFAADHLAFCKSIGLKGRILVADEGINGTVSGDYETTQKYMDYVHSLPGMEDLWFKIDEENEQAFKKMFVRYKKEIVHLGLEDNDFDNDINPLETTGAYLSPKEFKEALLDKDTVVLDTRNDYEYDLGHFRGAIRPDIRNFRELPQWVRDNKEKFMDKRVVVYCTGGVRCEKFSGWMVREGYKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGELWDGKMYVFDERIAVDVNHVNPTIVGKDWFDGTPCERYVNCGNPFCNRRILTSEENEDKYLRGCSHECRVHPRNRYVSKNELTQAEVIERLAAIGESLDQAATV >NC_012468.1|WP_000800407.1|131110_132586_+|DUF3502-domain-containing-protein MKNWKKYAFASASVVALAAGLAACGNLTGNSKKAADSGDKPVIKMYQIGDKPDNLDELLANANKIIEEKVGAKLDIQYLGWGDYGKKMSVITSSGENYDIAFADNYIVNAQKGAYADLTELYKKEGKDLYKALDPAYIKGNTVNGKIYAVPVAANVASSQNFAFNGTLLAKYGIDISGVTSYETLEPVLKQIKEKAPDVVPFAIGKVFIPSDNFDYPVANGLPFVIDLEGDTTKVVNRYEVPRFKEHLKTLHKFYEAGYIPKDVATSDTSFDLQQDTWFVREETVGPADYGNSLLSRVANKDIQIKPITNFIKKNQTTQVANFVISNNSKNKEKSMEILNLLNTNPELLNGLVYGPEGKNWEKIEGKENRVRVLDGYKGNTHMGGWNTGNNWILYINENVTDQQIENSKKELAEAKESPALGFIFNTDNVKSEISAIANTMQQFDTAINTGTVDPDKAIPELMEKLKSEGAYEKVLNEMQKQYDEFLKNKK >NC_012468.1|WP_001075102.1|129977_130901_+|carbohydrate-ABC-transporter-permease MAKKKIKKEKIDNVGIHSFSKKADIFFSIISGLIALSCILPFVFVIIISVTDEKSLLQYGYSFFPSQFGLDGFEFLAQFKDKILQALFISVFVTVVGTLTNVFITTTYAYAISRTTFKYRRFFTIFVLLSMLFNAGLVPGYIMVTRVLQLGDTVWALIVPMLLSPFNIILMRSFFKKTIPEAILESARIDGASEARIFFQICLPLSLPGIATITLLTALGFWNDWFNALLYIKSDNLYPLQYLLMQIQQNMDYIAKAVGLTGQLGVALPKETGRMAMVVVATLPIAILYPFFQRYFVKGLTIGGVKE >NC_012468.1|WP_000714582.1|129034_129964_+|sugar-ABC-transporter-permease MKKFSKTLRDNWIFLLMVLPGALWLILFFYIPVFGNVVAFKDYHMTSNGFIDSIINSKWVGLDNFRFLFSSRDAFIITRNTVLYNLGFIFLGLVVSVGIAIILSELRSKRMVKIFQTSMLFPYFLSWVIISFFTDAFLNIDKGVFNHLLESLGLKEVNFYADLGIWPYLLLFLGIWKGFGYSSVMYYATIMGIDPTYYEAATVDGASKWQRIRNVTIPQLTPLVTVLTILAVGNIFRADFGLFYQIPHNAGQLYNVTNVLDVYVFNGLTQTADIGMAAAAGLYQSVVGLILVILSNLLARRVDPNSALF >NC_012468.1|WP_000148248.1|128494_128716_+|hypothetical-protein MTGVSNPTTDSAPLVLAEAKKAFADDSLIEQGLRDILQTVKDAIASLESIKESQSATKIDNLKEVIAKLKANA >NC_012468.1|WP_000744901.1|138079_139246_-|CynX/NimT-family-MFS-transporter MKKQSLFFVPGIILIGVSLRTPFTVLPIILGNISQGLEVEVSSLGVLTSLPLLMFTLFSPFSTRLAQKIGLEHLFTYNLFFLTIGSLIRLINLPLLYLGTLMVGASVAVINVLLPSLIQANQPKKIGFLTTLYVTSMGIATALASYLAVPITQASSWKGLILLLTLLCLATFLVWLPNHRYNHRLAPQTKQKSQIKVMCNKQVWAIIIFSGFQSLIFYTVMTWLPTMSIHAGLSSHEAGLLTSILSLISIPFSMTIPSLTTSLSTRNRQLMLTLVSLAGVVGISMLFFPINNFIYWLAIHLLIGTATSALFPYLMVNFSLKTSAPEKTAQLSGLSQTGGYILAAFGPTLFGYSFDLFHSWVPAVAALLLIDILMTVALFTVDRADKIL >NC_012468.1|WP_015898723.1|139303_139531_+|hypothetical-protein MSSKVSGFQDKNGKVLKIMIKWWKEKFRRVVVTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTNQDNTWNQKE >NC_012468.1|WP_000096181.1|139600_139828_+|hypothetical-protein MSSKVSGFQDKNGKVLKIMIEWWKEKFRRVVVTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTNQDNTWNQKE >NC_012468.1|WP_000096181.1|139897_140125_+|hypothetical-protein MSSKVSGFQDKNGKVLKIMIEWWKEKFRRVVVTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTNQDNTWNQKE >NC_012468.1|WP_001291462.1|140291_141122_+|glycosyltransferase MSEKQKISVLMSVYIKENPTFLKDAIESVQNQTLKPSELVLVEDGPLTPELYQVLDQVETESEIPVKRYPLEQNQGLGLALRQGVLQCQYNIIARMDTDDIAVPDRFEKQLQLMEKDKLDLLGGHIAEFIDNPDEIVSYRRVPTQHADIVAYQRMRSAFNHMTVMFKKDMVLKAGNYEDGLYMEDDLLWLNMIAAGAKTGNLDQILCQVRVGAGMFERRGGLRYLKLYRQARQRMLKRGQISYMEYAKSVAIQMIVALCPGFVRQFIFMKLLRKSK >NC_012468.1|WP_001035708.1|141207_143058_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MNKKLTDYVIDLVEILNKQQKQVFWGIFDIFSMVVSIIVSYILFYGLINPAPVDYIIYTSLTFLFYQLMIGFWGLNASISRYSKITDFMKIFFGATASSILSYSICYAFLPLFSIRFIILFILLSTFLILLPRITWQLIYSRRKKGSGDGEHRRTFLIGAGDGGALFMDSYQHPTSELELVGILDKDAKKKGQRLGGIPVLGSYDNLSELAKRHQIERVIVAIPSLDPLEYERILQMCNKLGVKCYKMPKVETVVQGLHQAGTGFQKIDITDLLGRQEIRLDESRLGAELTGKTILVTGAGGSIGSEICRQVSRFNPERIVLLGHGENSIYLVYHELIREIQGIDYVPVIADIQDYDRLLQVFEQYKPAIVYHAAAHKHVPMMERNPKEAFKNNIRGTYNVAKAVDEAKVSKMVMISTDKAVNPPNVMGATKRVAELIVTGFNQRSQSTYCAVRFGNVLGSRGSVIPVFERQIAEGGPVTVTDFRMTRYFMTIPEASRLVIHAGAYAKDGEVFILDMGKPVKIYDLAKKMVLLSGHTESEIPIVEVGIRPGEKLYEELLVSTELVDNQVMDKIFVGKVNVMPLESINQKIGEFRTLSGDELKQAIIAFANQTTHIE >NC_012468.1|WP_000200891.1|143361_143994_-|HAD-hydrolase-like-protein MTSITAIFFDLDGTLVDSSIGIHNAFTYTFKELGVPSPDAKTIRGFMGPPLESSFATCLSKDQISEAMQIYRSYYKAKGIYEAQLFPQIIDLLEELSSSYPLYITTTKNTSTAQDMAKNLEIHHFFDGIYGSSPEAPHKADVIHQALQTHQLAPEQAIIIRDIKFDMLGARETGIQKLPVTWGFGEQADLLNYQPDYIAHKPLEVLAYFQ >NC_012468.1|WP_000500038.1|144015_144888_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFYSIKELVEQADLDFQGNVAELMITTEFELTGREREEVFLLMERNLEVMKASVQLGLNENKSRSGLTGGDAAKLDHYIENGKTLSDYTILSAARNAIAVNEHNAKMGLVCATPTAGSAGCLPSVLTAAIEKLDLSHEQQLDFLFAAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMSAAALTLAAGGTPYQASQAIAFVIKNMLGLICDPVAGLVEVPCVKRNAMGASFAFIAADMALAGIESKIPVDEVIDAMYQVGASMPTAFRETAEGGLATTPTGRRLQKEIFGE >NC_012468.1|WP_000838915.1|144896_145568_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKSLRFQSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAVRIGKIVSSIFDDTPTEVEFQLFNSFAKTYRGHGTDLALVAGILGMDTDDPEIPNSLEIAHKRGIKIVWTIQKESNAPHPNTTKITVKNAHKTISVTGISIGGGNIQVTELNGFAVSLNMNTPTIIIVHQDIPGMIALVTEALSRYGINIAQMNVTREKAGEKAIMIIEVDSRNCDEAIEEIRKIPHLHNVNFFK >NC_012468.1|WP_000836442.1|145809_146397_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKSITKKIKATLAGVAALFAVFAPSFVSAQESSTYTVKEGDTLSEIAETHNTTVEKLAENNHIDNIHLIYVDQELVIDGPVAPVATPAPATYAAPAAQDETVSAPVAETPVVSETVVSTVSGSEAEAKEWIAQKESGGSYTATNGRYIGRYQLTDSYLNGDYSAENQERVADAYVAGRYGSWTAAKNFWLNNGWY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012468_2 | 1461339-1461475 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012468_2
|
2 spacers
spacers of NC_012468_2
>2.1|1461368|25|NC_012468|CRISPRCasFinder AACAGCTGGAGTTGGTTGTACTGGC >2.2|1461422|25|NC_012468|CRISPRCasFinder TTGCGCTGGCACAGGTTTAACCGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012468_2
The CRISPR arrays of NC_012468_2 >merge|NC_012468|2|1461339-1461475|CRISPRCasFinder TGTTCTGGAACCGGTACTTCTGGTGTTGGAACAGCTGGAGTTGGTTGTACTGGCACTTCTGGTGTCGGTACATTTGGTGTTGGTTGCGCTGGCACAGGTTTAACCGGTACTTCTGGTGTCGGCACATTTGGTGTTGG >NC_012468|2|2|1461339-1461475|CRISPRCasFinder TGTTCTGGAACCGGTACTTCTGGTGTTGG AACAGCTGGAGTTGGTTGTACTGGC ACTTCTGGTGTCGGTACATTTGGTGTTGG TTGCGCTGGCACAGGTTTAACCGGT ACTTCTGGTGTCGGCACATTTGGTGTTGG
>NC_012468.1|WP_000039614.1|1460366_1460915_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MSKKVLFIVGSLRQGSFNHQMALEAEKALAGKAEVSYLDYSALPLFSQDLEVPTHPAVAAAREAVLVADAIWIFSPVYNFSIPGTVKNLLDWLSRALDLSDTRGASALQDKFVTVSSVANAGHDQLFAIYKDLLPFIRTQGVGDFTAARVNDSAWADGKLVLEETVLNSLEKQAQDLVEAIQ >NC_012468.1|WP_000747253.1|1459557_1460046_-|DUF5590-domain-containing-protein MKKRQNKAKNNLLWQYGLGMTILFVVISASFLYMVSLSMKPYQTAKSEGEKLAQQYAGLEQADQVDLYNGLESYYSVLGRNKQQEALAVLIGKDDHKIYVYQLNQGVSQEKAETVSKEKGAGEIDKIIFGRYQDKPIWEVKSGSDFYLVDFETGALVNKEGL >NC_012468.1|WP_000777779.1|1458373_1459561_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MKLSNRVLEMEESVTLAAGARAKALKAEGRDILSLTLGEPDFTTPKNIQDAAIASIRDGRASFYTVTSGLPELKAAVNSYFERFYGYSVASNQVTVAAGAKYSLYTFFMAVVNPGDEVIIPTPYWVSYGDQVKMAEGVPVFVSAKEDNHFKVTVEQLEAARTDKTKVLVLNSPSNPTGMIYTREELLAIGNWAVENDILILADDIYGRLVYNGHEFTPISSLSEAIRKQTVVINGVSKTYAMTGWRIGYAVGEADIIAAMSKIAGQTTSNPSAVAQYAAVEALSGEQDTVESMRQAFEERLNTIYPLLAEVPGFEVVKPQGAFYLFPNVKKAMEMKGYTDVTDFTTVILEEAEVALVTGAGFGAPENVRLSYATDLDTLKEAVERLKAFMGSEND >NC_012468.1|WP_000565218.1|1458015_1458381_-|VOC-family-protein MIDHFEIKVKDLQISEGFYRSFLAPLDYKLAFKTSSLISFLSPNSPHPGGDFWLTQGTQDPVHFAFLAENKEEVQACYEAGLEAGGRDNGAPGYRSEHPIYYAAFMIDLDGNNIEVVCHKE >NC_012468.1|WP_162489602.1|1456653_1458000_-|asparagine--tRNA-ligase MMTKRVTIIDVKDYVGQEVTIGAWVANKSGKGKIAFLQLRDGTAFFQGVAFKPNFVEKFGEEVGLEKFDVIKRLSQETSVYVTGIVKEDERSKFGYELDITDIEVIGESQDYPITPKEHGTDFLMDNRHLWLRSRKQVAVLQIRNAIIYATYEFFDKNGFMKFDSPILSGNAAEDSTELFETDYFGTPAYLSQSGQLYLEAGAMALGRVFDFGPVFRAEKSKTRRHLTEFWMMDAEYSYLTHDESLDLQEAYVKALLQGVLDRAPQALETLERDTELLKRYIAEPFKRITYDQAIDLLQEHENDEDADYEHLEHGDDFGSPHETWISNHFGVPTFVMNYPVAIKAFYMKPVPGNPERVLCADLLAPEGYGEIIGGSMREEDYDALVAKMDELGMDRTEYEFYLDLRKYGTVPHGGFGIGIERMVTFAAGTKHIREAIPFPRMLHRIKP >NC_012468.1|WP_001151785.1|1456210_1456501_-|30S-ribosomal-protein-S6 MAKYEILYIIRPNIEEEAKNALVARFDSILTDNGATVVESKTWEKRRLAYEIQDFREGLYHIVNVEANDDAALKEFDRLSKINADILRHMIVKIDA >NC_012468.1|WP_000609607.1|1455728_1456199_-|single-stranded-DNA-binding-protein-SsbA MINNVVLVGRMTRDAELRYTPSNVAVATFTLAVNRTFKSQNGEREADFINVVMWRQQAENLANWAKKGSLIGVTGRIQTRSYDNQQGQRVYVTEVVAENFQMLESRSVREGHTGGAYSAPTANYSAPTNSVPDFSRNENPFGATNPLDISDDDLPF >NC_012468.1|WP_000068664.1|1455457_1455697_-|30S-ribosomal-protein-S18 MAQQRRGGFKRRKKVDYIAANKIEYVDYKDTELLSRFVSERGKILPRRVTGTSAKNQRKVTTAIKRARVMALMPFVNED >NC_012468.1|WP_000339024.1|1453762_1455163_-|bifunctional-Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase/peptidylprolyl-isomerase MDAKLRYKAKKIKIVFFDIDDTLRNSKTGFIPTTIPTVFKQLREKGILTGIASGRGIFGVVPEIRDLKPDFFVTLNGAYIEDKKGQVIYQHQIEKSDVEEYISWAKQEGIEYGLVGSHDAKLSTRTDMMSEAINPIYPDLDVDPDFHEKEDIYQMWTFEDKGDDLHLPDSLSDKLRMVRWHQHSSDIVPISGSKATGVEKVVEHLGLKPEKVMVFGDGLNDLELFDYAGISVAMGISHDKIKEKADYITKTLEEDGIFDALEVFGMVEKELHFPQVDIETVEGPLATIKTNHGDLRIKLFPEHAPKTVANFVSLSKDGYYDGVIFHRIIKDFMIQGGDPTGTGMGGESIYGESFEDEFSEELYNIRGALSMANAGPNTNGSQFFIVQNQHLPYSKKEITRGGWPEPIAEIYANQGGTPHLDRRHTVFGQLADEASYAVLDAIAAVETGAMDKPVEDVVIETIEIED >NC_012468.1|WP_000689596.1|1453401_1453761_-|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MKIGDKLKGRITGIQPYGAFVELETGDTGLIHISEIRTGFIENIHETLKVDEEVQVQVVDLDEFTGKASLSIRTLEEEKYQFPRRRRFSSDRFNYGFAPFRRMLPIWTGEALHHLKKKK >NC_012468.1|WP_001245197.1|1467324_1468809_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MRNLLSTKVQRQLRLMETLIQNRNWMKLHELAEKLGCTERILKSDLNELRIAFPSINIQSSVNGIMIDLEVNTSVEDIYQYFLANSQSFQLLEYMFFNEGLPIYRTIENLYFSSANLYRLGRNITKVLSSQFQIELSFTPSEIRGNEIDIRYFFAQYFSERYYFLDWPFPDLPEEDLTEFADFFYKITNYPMRFSIYRMYKLMIAISIHRVKNGHFIDLPNHFYKEYYPLLKSIPNFQETLAYFSKHFGLEMTPDTIAQIFISFLQNDIFLDPQEFFNSLEDNSQARYSYQLLSQILERLSKQYKITFTNHDELIWHLHNTAFFERQEIFSTPILFEQKALTIKKFEVYFPDFMGSARQELAQYRQAIGQHDHPEQLEHLMYTILTHAENLSTQLLENRPPIKVLIISNFDHAISLTFVDMLSYYCNNRFTFDIWDELKTSPEILNQTDYDIIVSNFYIPGITKKFICRNHLSIMNLVNHLNTLSNEIHLSNTL >NC_012468.1|WP_000697776.1|1468859_1469588_-|peroxide-stress-protein-YaaA MKILIPTAKEMNTDLPSIEAIPLKPESQTVLDALALYSASQLESFYKVSAEKAAEEFQNIQALKRQTAQHYPALKLFDGLMYRNIKRDKLTEAEQDYLENHVFITSALYGVVPALSPMAPHRLDFLMKLKVVGKTLKSHWKAVYDEALKKEEVIFSLLSSEFETVFSKEIRAKMVTFKFMEDRGGQLKIHSTISKKARGAFLTALIENQVQTVGEARRLNFAGFVYREDLSQPQGLVFVKEV >NC_012468.1|WP_000508266.1|1469666_1469831_-|YczI-family-protein MGFYLMVASMLLGLLALKIGFSQFKEKKDKFLSILTSLAGIALVLAAVWLGWPK >NC_012468.1|WP_000822859.1|1469997_1471593_-|hypothetical-protein MKRIVFELIFIATTWYIFLPPLNLTSWEFLFFLCGHLLVVAILFGFGKGINLVKTVHVRHGKAEAALNLEGFKINRLGKILLASIGGILLLAALVSLVTSSMFQAKNYANVVTVTEKDFTEFPKSDTSKVPILDRSTAEKIGDRYLGSLTDKVSQYVAADTYTQLTIDGKPYRVTPLEYADPIKWFNNQAKGIGEYIKVDMVTGNADLVDLKTPIKYSDSEYFNRDVKRHLRLKYPTKIFKTPSFEVDDEGNPFYVATVYQKQFGLAVPRPASVIILDATNGETKEYSLSDVPEWVDRIYPAEETIEQINYNGKYKDGFLNAMISKKNVTQTTNGYNYLSIGNDIYLYTGMTSANADESNLGFILENMRTGEITKYSLASATEESARESAEGAVQEKSYKATFPILINLNDKPLYIMGLKDNAGLIKEYALVDAVEYQNVIVATTVEEMLSKYANKNDLEIDNATTESIKGVVADLKSAVIKGDTVYFFKVDGKIYKVKASVSDDLPYLENGKTFEGQVGKDNYLKTFKVQ >NC_012468.1|WP_000412213.1|1471604_1472015_-|peptide-deformylase MEKKIVKDILFLSQVSHPASQEDLYLARDLQDTLLANRDTCVGLAANMIGMQKRVIIFNLGLVPVVMFNPVLLSFEGSYEAEEGCLSLVGVRSTKRYETIRLAYRDSKWQEQTITLTGFPAQICQHELDHLEGRII >NC_012468.1|WP_001277395.1|1472130_1472922_-|glutathione-dependent-disulfide-bond-oxidoreductase MSAYQLPTVWQDEASDQGAFTGLNRPTAGARFEQNLPKGEQAFQLYSLGTPNGVKVTILLEELLEAGFKEAAYDLYKIAIMDGDQFGSDFVKLNPNSKIPALLDQSGTENVRVFESAHILLYLAEKFGAFLPSNPVEKVEVLNWLFWQAGAAPFLGGGFGHFFNYAPEKLEYPINRFTMEVKRQLDLLDKELAQKPYIAGNDYTIADIAIWSWYGQLVQGNLYQGSAKFLDASSYQNLVKWAEKIANRPAVKRGLEVTYTEIK >NC_012468.1|WP_000032444.1|1472934_1475631_-|cation-translocating-P-type-ATPase MSKEQKRQAFYTQSPEEVLQAMDATEQGLSSSEAEKRLAEFGHNELEEGEKRSILVKFIEQFKDLMIIILVAAAILSVVTSGGEDIADAIIILAVVIINAAFGVYQEGKAEEAIEALKSMSSPVARVLRDGHMAEIDSKELVPGDIVALEAGDVVPADLRLLEANSLKIEEAALTGESVPVEKDLSVELATDAGIGDRVNMAFQNSNVTYGRGMGVVVNTGMYTEVGHIAGMLQDADETDTPLKQNLNNLSKVLTYAILVIALVTFVVGVFIQGKNPLGELLTSVALAVAAIPEGLPAIVTIVLSLGTQVLAKRHSIVRKLPAVETLGSTEIIASDKTGTLTMNKMTVEKVFYDAVLHDSADDIELGLEMPLLRSVVLANDTKIDVEGNLIGDPTETAFIQYALDKGYDVKGFLEKYPRVAELPFDSDRKLMSTVHPLPDGRFLVAVKGAPDQLLKRCLLRDKAGDIAPIDEKVTNLIHTNNSEMAHQALRVLAGAYKIIDSIPENLTSEELENDLIFTGLIGMIDPERPEAAEAVRVAKEAGIRPIMITGDHQDTAEAIAKRLGIIDANDTEGHVLTGAELNELSDEEFEKVVGQYSVYARVSPEHKVRIVKAWQKQGKVVAMTGDGVNDAPALKTADIGIGMGITGTEVSKGASDMILADDNFATIIVAVEEGRKVFSNIQKTIQYLLSANTAEVLTIFLSTLFGWDVLQPVHLLWINLVTDTFPAIALGVEPAEPGVMNHKPRGRKASFFSGGVLSSIIYQGVLQAALVMSVYGLAIAYPVHVGDNHAIHADALTMAFATLGLIQLFHAYNVKSVYQSILTVGPFKSKTFNWSILVSFILLMATIVVEPLEGIFHVTKLDLSQWGIVMAGSFSMIIIVEIVKFIQRKLGFDKNAI >NC_012468.1|WP_000813914.1|1475934_1477119_+|CDF-family-manganese-efflux-transporter-MntE MKQSISNLKLAERGAIISISTYLILSAAKLAAGHLLHSSSLVADGFNNVSDIIGNVALLIGIRMARQPADRDHRFGHWKIEDLASLITSIIMFYVGFDVLRDTIQKILSREETVIDPLGATLGIISAAIMFVVYFYNTRLSKKSNSKALKAAAKDNLSDAVTSLGTAIAILASSFNYPIVDKLVAIIITFFILKTAYDIFIESSFSLSDGFDDRLLEDYQKAIMEIPKISKVKSQRGRTYGSNIYLDITLEMNPDLSVFESHEIADQVESMLEERFGVFDTDVHIEPAPIPEDEILDNVYKKLLMREQLIDQGNQLEELLTDDFVYIRQDGEQMDKEAYKTKKELNSAIKDIQITSISQKTKLICYELDGIIHTSIWRRHETWQNIFHQETKKE >NC_012468.1|WP_001279143.1|1477261_1479133_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MSDFIVEKLSKSVGDKTVFRDISFIIHDLDRIGLIGVNGTGKTTLLDVLSGVSGFDGDVSPFSAKNDYQIGYLTQDPDFDDRKTVLDTVLSSELKEIQLIREYELIMLDYSEDKQARLERVMAEMDSLQAWEIESQVKTVLSKLGIQDLSTPVGELSGGLRRRVQLAQVLLGNHDLLLLDEPTNHLDIAIIEWLTLFLKNSKKTVLFITHDRYFLDALSTRIFELDRAGLTEYQGNYQDYVRLKAEQDERDSALLHKKEQLYKQELAWMRRQPQARATKQQARINRFHDLKKEVSGSSAETDLTMNFETSRIGKKVIEFQAVSFAYENKPILQDFNLLVQAKDRIGIVGDNGVGKSTLLNLIAGSLEPTKGQVVIGETVRIAYFSQQIEGLDESKRVINYLQEVAEEVKTSGGSTTSIAELLEQFLFPRSTHGTLIEKLSGGEKKRLYLLKLLLEKPNVLLLDEPTNDLDIATLTVLENFLQGFAGPVLTVSHDRYFLDKVATKILAFEDGKIRPFFGHYTDYLDEKAFETDMANQVQKAEKEKVVKVREDKKRMTYQEKQEWASIEGDIETLEKRIAAIEEEMQANGSDFGKLATLQKELDEKNEALLEKYERYEYLSEFDS >NC_012468.1|WP_001138810.1|1479129_1480314_-|CCA-tRNA-nucleotidyltransferase MPSEFQKALPVLEKIKEAGFEAYFVGGSVRDALLHSPIHDVDIATSSYPEETKQIFPRTADIGIEHGTVLVLDGDEEYEVTTFRTEDVYVDYRRPSAVSFVRSLEEDLKRRDFTVNAFALDETGEIVDLFHGLEDLEKQVLRAVGVASERFNEDALRIMRGFRFQASLGFALEPETFKAMKTLTPLLEKISVERTFVEFDKLLLAPFWRRGLASMIESQAYDYLPDMASSQDKLNRLFDLETDFTFESSEQAWAALLWALEIENAQSFLKSWKTSRQFAKQVQDLLIILALRENGELSKRDCYRFDIDLLLQAENLRQAQGKEVNPQATTEKYQSLTIHDKKEIQINGDILIKEYGYQPGPDLGEILTEIEFAIVDGELENNREAIHAYLREKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012468_3 | 1804729-1804815 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012468_3
|
1 spacers
spacers of NC_012468_3
>3.1|1804758|29|NC_012468|CRISPRCasFinder GAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012468_3
The CRISPR arrays of NC_012468_3 >merge|NC_012468|3|1804729-1804815|CRISPRCasFinder CTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCCGAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTGACTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCC >NC_012468|3|3|1804729-1804815|CRISPRCasFinder CTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCC GAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTGA CTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCC
>NC_012468.1|WP_000760673.1|1801166_1801877_+|trehalose-operon-repressor MKKYQQLFKQIQETIQNETYAVGDFLPSEHDLMEQYQVSRDTVRKALSLLQEEGLIKKIRGQGSQVVKEETVNFPVSNLTSYQELVKELGLRSKTNVVSLDKIIIDKKSSLITGFPEFRMVWKVVRQRVVDDLVSVLDTDYLDMELIPNLTRQIAEQSIYSYIENGLKLLIDYAQKEITIDHSSDRDKILMDIGKDPYVVSIKSKVYLQDGRQFQFTESRHKLEKFRFVDFAKRKK >NC_012468.1|WP_000514329.1|1799014_1800982_-|PTS-system-trehalose-specific-EIIBC-component MGKFEQEAKDLLQAIGGKENVTAVTHCATRMRFVLGDDKKANVKAIESIPAVKGTFTNAGQFQVIIGNDVPIFYNDFTAVSGIEGVSKEAAKSAAKSNQNVVQRVMTTLAEIFTPIIPALIVGGLILGFRNVLEGVHWSMLDGKTITESSQFWAGVNHFLWLPGEAIFQFLPVGITWSVSRKMGTSQILGIVLGICLVSPQLLNAYAVASTPAADIAANWVWNFGYFTVNRIGYQAQVIPALLAGLSLSYLEIFWRKHIPEVISMIFVPFLSLIPALILAHTVLGPIGWTIGQGLSSVVLAGLTGPVKWLFGAIFGALYAPFVITGLHHMTNAIDTQLIADAGGTALWPMIALSNIAQGSAVFAYYFMHRHDEREAQVSLPATISAYLGVTEPALFGVNVKYIYPFVAGMTGSALAGMLSVTFNVTAASIGIGGLPGILSIQPQYMLPFAGTMLVAIVVPMLLTFFFRKAGLFTKTEGDTNLQAEFVAQEEAEFVNHEPVELTSVEIISPLTGQVKELSQATDPIFASGVMGQGLVIEPSQGELTSPVNGTVTVLFPTKHAIGIVSDEGVELLIHIGMDTVGLDGKGFESLVVQGDHVTVGQQLIRFDMDVIKAAGLVTETPVIITNQDAYTATIPGTYPTTIQAGASLMVATRI >NC_012468.1|WP_000171226.1|1797211_1798837_-|alpha,alpha-phosphotrehalase MTLDKGKVVYQIYPKSYKDTTENGIGDFRGIIEKIPYLAKLGVDMVWLNPFYPSPQRDNGYDISDYMAVDPLFGDMADFEEMVCVGKEHKIDFMLDMVLNHCSTEHEWFQKALAGDKYYQDFFFIQDQSTDWQSKFGGSAWAPFGDTGKYYLHLFDETQADLNWRNPNVRKELFKVVNFWRDKGVKGFRFDVINLIGKDEVSVDCPENEGKPAYTDKPIVHNYLRMMNQATFGSDDSFMTVGEMSSTTMENCVLYSSPDRQELSMTFNFHHLKVDYKDGQKWTLAPFDFEELKSLYHSWGKEMSDKDGWSALFWNNHDQPRALNRFVDIQNFRKEGATMLAASIHLSRGTPYIYMGEEIGMIDPDYDSMADYVDVESLNAYQMLLEEGKSQQEAFQIIQAKSRDNSRIPMQWDASENAGFSTGTPWLKAGKSYKYINVENEIQGPIFTFYQDLIRLRKEMPIISEGSYKPAFEDSKQVYAFERQFEDQKLLVLNNFYAKEVEIDLPAVYQNGQILISNYEDAEVSEKILLKPYQTLAIYVN >NC_012468.1|WP_000364990.1|1796707_1796956_-|YneF-family-protein MDLLLAIVLIVLAFLGGALGGMYLVRKQIEKEFADNPRLNAEAVRTLLSANGQKPSEAKVQQVYHQIIRQQKAALANNKKKK >NC_012468.1|WP_000370376.1|1795706_1796501_-|glutamate-racemase MDNRPIGFLDSGVGGLTVVRELMRQLPHEEIVYIGDSARAPYGPRPAEQIREYTWQLVNFLLTKDVKMIVIACNTATAVVWEEIKAQLDIPVLGVILPGASAAIKSSQGGKIGVIGTPMTVQSDIYRQKIHDLDPDLQVESLACPKFAPLVESGALSTSVTKKVVYETLRPLVGKVDSLILGCTHYPLLRPIIQNVMGPKVQLIDSGAECVRDISVLLNYFEINRGRDAGPLHHRFYTTASSQSFAQIGEEWLEKEIHVEHVEL >NC_012468.1|WP_000182417.1|1794738_1795710_-|nucleoside-triphosphate-diphosphatase MTNKIYEYKDDQDWYVGSYSIFGGVNSLSDYQTDFPLFEFSKIFGDEEYGFPLSVTVLRYGSTYRLFSFVVDMLNQEMGRNLEVIQRHGALLLVENGQLLYVELPKEGVNVHDFFETSKVRETLLIATRNEGKTKEFRAIFDKLGYDVENLNDYPDLPEVAETGMTFEENARLKAETISQLTGKMVLADDSGLKVDVLGGLPGVWSARFAGVGATDRENNAKLLHELAMVFELKDRSAQFHTTLVVASPNKESLVVEADWSGYINFEPKGENGFGYDPLFLVGETGESSAELTLEEKNSQSHRALAVKKLLEVFPSWQSKPSL >NC_012468.1|WP_001118963.1|1794241_1794763_-|metallophosphoesterase MAKQTIIVMSDSHGDSLIVEEVRDRYVGKVDAVFHNGDSELRPDSPLWEGIRVVKGNMDFYAGYPERLVTELGSTKIIQTHGHLFDINFNFQKLDYWAQEEEAAICLYGHLHVPSAWMEGKILFLNPGSISQPRGTIRECLYARVEIDDSYFKVDFLTRDHEVYPGLSKEFSR >NC_012468.1|WP_000560728.1|1793783_1794245_-|CBS-domain-containing-protein MIAKEFETFLLGQEETFLTPAKNLAVLIDTHNADHATLLLSQMTYTRVPVVTDEKQFVGTIGLRDIMAYQMEHDLSQEIMADTDIVHMTKTDVAVVSPDFTITEVLHKLVDESFLPVVDTEGIFQGIITRKSILKAVNALLHDFSKEYEIRCQ >NC_012468.1|WP_001132186.1|1793052_1793793_-|site-specific-tyrosine-recombinase-XerD MPMRDRISAFLEEKQGLSVNSKQSYKYDLEQFLDMVGERISETSLKIYQAQLANLKISAQKRKISACNQFLYFLYQKGEVDSFYRLELAKQAEKKTEKPEILYLDSFWQESDHPEGRLLALLILEMGLLPSEILAIKVADINLDFQVLRISKASQQRIVTIPTALLSELEPLMGQTYLFERGEKPYSRQWAFRQLESFVKEKGFPSLSAQVLREQFILRQIENKVDLYEIAKKLGLKTVLTLEKYR >NC_012468.1|WP_000351907.1|1792324_1793053_-|segregation/condensation-protein-A MDIKLKDFEGPLDLLLHLVSKYQMDIYDVPITEVIEQYLAYVSTLQAMRLEVTGEYMVMASQLMLIKSRKLLPKVAEVTDLGDDLEQDLLSQIEEYRKFKLLGEHLEAKHQERAQYYSKAPTELIYEDAELVHDKTTIDLFLAFSNILAKKKEEFAQNHTTILRDEYKIEDMMIIVKESLIGRDQLRLQDLFKEAQNVQEVITLFLATLELIKTQELILVQEESFGDIYLMEKKEESQVPQS >NC_012468.1|WP_001291293.1|1804856_1805783_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSEKLVEIKDLEISFGEGSKKFVAVKNANFFINKGETFSLVGESGSGKTTIGRAIIGLNDTSNGDIIFDGQKINGKKSREQAAELIRRIQMIFQDPAASLNERATVDYIISEGLYNHRLFKDEEERKEKVQNIIREVGLLAEHLTRYPHEFSGGQRQRIGIARALVMQPDFVIADEPISALDVSVRAQVLNLLKKFQKELGLTYLFIAHDLSVVRFISDRIAVIYKGVIVEVAETEELFNNPIHPYTQALLSAVPIPDPILERKKVLKVYDPSQHDYETDKPSMVEIRPGHYVWANQAELARYQKGLN >NC_012468.1|WP_000159558.1|1805793_1806861_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTKEKNVILTARDIVVEFDVRDKVLTAIRGVSLELVEGEVLALVGESGSGKSVLTKTFTGMLEENGRIAQGSIDYRGQDLTALSSHKDWEQIRGAKIATIFQDPMTSLDPIKTIGSQITEVIVKHQGKTAKEAKELAIDYMNKVGIPDADRRFNEYPFQYSGGMRQRIVIAIALACRPDVLICDEPTTALDVTIQAQIIDLLKSLQNEYHFTTIFITHDLGVVASIANKVAVMYAGEIVEYGTVEEVFYDPCHPYTWSLLSSLPQLADDKGDLYSIPGTPPSLYTDLKGDAFALRSDYAMQIDFEQKAPQFSVSETHWAKTWLLHEDAPKVEKPAVIANLHDKIREKMGFAHLAD >NC_012468.1|WP_000103700.1|1806869_1807796_-|ABC-transporter-permease MSTIDKEKFQFVKRDDFASETIDAPAYSYWKSVFKQFMKKKSTVVMLGILVAIILISFIYPMFSKFDFNDVSKVNDFSVRYIKPNAEHWFGTDSNGKSLFDGVWFGARNSILISVIATVINLVIGVFVGGIWGISKSVDRVMMEVYNVISNIPPLLIVIVLTYSIGAGFWNLIFAMSVTTWIGIAFMIRVQILRYRDLEYNLASRTLGTPTLKIVAKNIMPQLVSVIVTTMTQMLPSFISYEAFLSFFGLGLPITVPSLGRLISDYSQNVTTNAYLFWIPLTTLVLVSLSLFVVGQNLADASDPRTHR >NC_012468.1|WP_000759905.1|1807795_1809292_-|ABC-transporter-permease MKKYIFMRVLRSLVSIFLVTTLTYTIIYTLVPRKLIFKQDPNYNKIATTADKRDNYENTVFERMGYIEYYDTKELQEKASSMDSSVTVEANATNKAIYEKYINQLGHGWTLGEFTESGQFYATREIPIFERVFHFYANLIDIDHTNKIQDPENPDLKRYLRFENDPAIGWSLVGSGTKHKYLLYFNSQFPFVHQNFVNLNLGDSYPTYANTPVLQVITQGQGQTKTAQVQFPTGKKTSSVNIYSRTYKSPSQADSREVASYGKDDPYTATESNYQYPSMIVSSAITGLIGLVLAYALAVPLGSAMARFKNTWIDSLSTGTLTFLLALPTIALVYIVRLIGSSIALPDSFPILGAGDWRSYVLPAVILGLLGAPVTAIWIRRYMIDLQSQDFVRFARAKGLSEKEISNKHIFKNAMVPLVSGIPGAIIGVIGGATLTETVFAFPGMGKMLIDSVKASNNSMVVGLVFIFTCISIFSRLLGDIWMTIIDPRIKLTEKGGK >NC_012468.1|WP_000742233.1|1809358_1811338_-|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKNRVFATAGLVLLAAGVLAACSSSKSSDSSAPKAYGYVYTADPETLDYLISSKNSTTVVTSNGIDGLFTNDNYGNLAPAVAEDWEVSKDGLTYTYKIRKGVKWFTSDGEEYAEVTAKDFVNGLKHAADKKSEAMYLAENSVKGLADYLSGTSTDFSTVGVKAVDDYTLQYTLNQPEPFWNSKLTYSIFWPLNEEFETSKGSDFAKPTDPTSLLYNGPFLLKGLTAKSSVEFVKNEQYWDKENVHLDTINLAYYDGSDQESLERNFTSGAYSYARLYPTSSNYSKVAEEYKDNIYYTQSGSGIAGLGVNIDRQSYNYTSKTTDSEKVATKKALLNKDFRQALNFALDRSAYSAQINGKDGAALAVRNLFVKPDFVSAGEKTFGDLVAAQLPAYGDEWKGVNLADGQDGLFNADKAKAEFAKAKKALEADGVQFPIHLDVPVDQASKNYISRIQSFKQSVETVLGVENVVVDIQQMTSDEFLNITYYAANASSEDWDVSGGVSWGPDYQDPSTYLDILKTTSSETTKTYLGFDNPNSPSVVQVGLKEYDKLVDEAAKETSDLNVRYEKYAAAQAWLTDSSLFIPAMASSGAAPVLSRIVPFTGASAQTGSKGSDVYFKYLKLQDKVVTKEEYEKAREKWLKEKAESNEKAQKELASHVK >NC_012468.1|WP_000835622.1|1812023_1813217_-|O-antigen-ligase-family-protein MKSIGFIEKLKGLSSKELILLGIILSIFLPFYLFVVVLCLYIISLIFTGDMKSILQKMGEHPMLLLFLSYSTVISILAQNWMGLVASVGMFLFTIFFLHYQSILSHKFFRLILQFVLFGSVLSAAFASLEHFQIVKKFNYAFLSPNMQVWHQNRAEVTFFNPNYYGIICCFCIMIAFYLFTTTKLNWLKVFCVIAGFVNLFGLNFTQNRTAFPAIIAGAIIYLFTTIKNWKAFWLSIGVFAIGLSFLFSSDLGVRMGTLDSSMEERISIWDAGMALFKQNPFWGEGPLTYMHSYPRIHAPYHEHAHSLYIDTILSYGIVGTILLVLSSVAPVRLMMDMSQESGKRPIIGLYLSFLTVVAVHGIFDLALFWIQSGFIFLLVMCSIPLEHRMLVSDMTD >NC_012468.1|WP_001122329.1|1813354_1814797_-|sucrose-phosphorylase MPIQNKTMLITYSDSLGNNLKDLYDNLEEHFGDAIGGVHLLPFFPSTGDRGFAPVDYDEVDSAFGDWEDVKRLGEKYYLMFDFMINHISRQSKYYKDYQEKHEASEFKDLFLNWDKFWPENRPTQSDVDLIYKRKDRAPKQEIVFEDGSVEHLWNTFGEEQIDLDVTKEVTMEFIRKTIQHLASNGCDLIRLDAFAYAVKKLDTNDFFVEPDIWDLLDKVRDIAAEYGTEILPEIHEHYSIQFKIADHDYYVYDFTLPMVTLYTLYSSRTERLAKWLKMSPMKQFTTLDTHDGIGVVDVKDILTDEEIDYASNELYKVGANVKRKYSSAEYNNLDIYQINSTYYSALGDDDVKYFLARLIQAFAPGIPQVYYVGLLAGKNDLKLLEETKEGRNINRHYYSNEEIAKEVQRPVVKALLNLFSFRNRSEAFDLEGTTEIETPTAHSIVIKRQNKDKSVTAVAEIDLQNQTYRVIENGVEVSF >NC_012468.1|WP_000692994.1|1814799_1815009_-|hypothetical-protein MKIKEQTRKLAAGCSKHCFEVVDETDEVSNHTYGKATLTWFEEIFEEYNMNLIYEARSYETWLQLEKGE >NC_012468.1|WP_000806567.1|1815015_1815849_-|carbohydrate-ABC-transporter-permease MKQDERKALIGKYILLILGSVLILVPLLATLFSSFKSTKDIVDNFFGFPTNFTWDNFSRLLADGIGGYYWNSVVITVLSLLAVMIFIPMAAYSIARNMSKRKAFTIMYTLLILGIFVPFQVIMIPITVMMSKLGLANTFGLILLYLTYAIPQTLFLYVGYIKISIPESLDEAAEIDGANQFTTYFRIIFPMMKPMHATTMIINALWFWNDFMLPLLVLNRDSKMWTLPLFQYNYAGQYFNDYGPSFASYVVGIISITIVYLFFQRHIIAGISNGAVK >NC_012468.1|WP_000757159.1|1815862_1816729_-|sugar-ABC-transporter-permease MKKVLQKYWAWAFVVIPLLLQAIFFYVPMFQGAFYSFTNWTGLTYNYKFVGLNNFKLLFMDPKFMNAIGFTAIITIAMVVGEIALGIFIARVLNSKIKGQTFFRAWFFFPAVLSGLTVALIFKQVFNYGLPAIGNALHIEFLQTSLLGTKWGAIFAAVFVLLWQGVAMPIIIFLAGLQSIPTEITEAARIDGATSKQVFWNIELPYLLPSVSIVFILALKGGLTAFDQVFAMTGGGPNNATTSLGLLVYNYAFKNNQFGYANAIAVILFFLIVVISIIQLRVSKKFEI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012468_3 | 3.1|1804758|29|NC_012468|CRISPRCasFinder | 1804758-1804786 | 29 | KY065475 | Streptococcus phage IPP35, complete genome | 21733-21761 | 2 | 0.931 |
1. spacer 3.1|1804758|29|NC_012468|CRISPRCasFinder matches to KY065475 (Streptococcus phage IPP35, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.931
gaaatttgtcctttctcgagcttagctga CRISPR spacer gaaatttgtcctttctcgagcttagcttt Protospacer ***************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4381 : 80151
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012468|4381:80151|DBSCAN-SWA AATGACCAAATTACTTGTAGGCTTGGGAAATCCAGGGGATAAATATTTTGAAACAAAACACAATGTTGGTTTTATGTTGATTGATCAACTAGCGAAGAAACAGAATGTCACTTTTACACACGATAAGATATTTCAAGCTGACCTAGCATCCTTTTTCCTAAATGGAGAAAAAATTTATCTGGTTAAACCAACGACCTTTATGAATGAAAGTGGAAAAGCAGTTCATGCTTTATTAACTTACTATGGTTTGGATATTGACGATTTACTTATCATTTACGATGATCTTGACATGGAAGTTGGGAAAATTCGTTTAAGAGCAAAAGGCTCAGCAGGTGGTCATAATGGTATCAAGTCTATTATTCAACATATAGGAACTCAGGTCTTTAACCGTGTTAAGATTGGAATTGGAAGACCTAAAAATGGTATGTCAGTTGTTCATCATGTTTTGAGTAAGTTTGACAGGGATGATTATATCGGTATTTTACAGTCTGTTGACAAAGTTGACGATTCTGTAAACTACTATTTACAAGAGAAAAATTTTGAGAAAACAATGCAGAGGTATAACGGATAAATGGTGACCTTATTAGATTTATTCTCAGAAAATGATCAGATTAAAAAATGGCATCAAAATTTAACAGATAAGAAAAGACAACTAATACTTGGTTTATCAACATCTACTAAGGCTCTTGCAATTGCAAGCAGTTTAGAAAAAGAAGATAGGATTGTGTTATTGACGTCAACTTATGGAGAAGCAGAAGGACTTGTTAGTGATCTTATTTCTATCTTGGGTGAGGAACTCGTCTATCCATTTTTGGTAGATGATGCTCCTATGGTGGAGTTTTTGATGTCTTCACAGGAAAAAATTATTTCACGGGTTGAAGCCTTGCGTTTTTTGACTGATTCATCTAAGAAAGGGATTTTAGTTTGTAATATCGCAGCAAGTCGATTGATTTTACCGTCTCCCAATGCATTCAAAGATAGTATTGTAAAAATCTCAGTTGGTGAAGAATATGATCAACACGCGTTTATCCATCAGTTAAAGGAAAATGGCTATCGAAAAGTTACTCAAGTACAAACTCAGGGCGAATTTAGTCTTCGAGGAGATATTTTAGATATTTTTGAAATATCCCAGTTAGAACCTTGTCGAATTGAGTTTTTTGGTGATGAAATTGATGGTATCAGGTCATTTGAAGTAGAAACACAATTATCGAAAGAAAATAAGACAGAACTCACTATCTTTCCAGCTAGTGATATGCTTTTGAGAGAAAAGGATTATCAACGAGGACAGTCAGCTTTAGAAAAACAAATTTCAAAAACTTTATCACCTATTTTGAAATCATACCTAGAAGAAATTCTTTCAAGTTTTCACCAAAAACAAAGTCATGCAGACTCTCGGAAGTTTTTATCTTTGTGCTATGATAAGACATGGACTGTCTTTGATTATATTGAAAAAGATACTCCAATATTCTTTGATGATTATCAAAAATTGATGAATCAGTATGAAGTCTTTGAAAGAGAATTAGCGCAGTACTTTACAGAAGAATTACAGAATAGTAAAGCATTTTCTGATATGCAGTATTTTTCTGATATTGAACAAATCTATAAAAAACAAAGTCCAGTGACCTTTTTCTCTAATCTTCAAAAGGGTTTAGGAAATCTCAAATTTGACAAAATTTATCAATTCAATCAATATCCTATGCAGGAATTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTAAAAGAAGAAATTGAACGATATAAAAAAATGGATTACACCATTATTCTGCAGTCTAGCAATTCAATGGGAAGTAAAACATTGGAGGATATGTTAGAGGAATATCAGATTAAATTGGATTCTAGAGATAAGACAAACATCTGTAAAGAATCTGTAAACTTAATAGAGGGTAATCTCAGACATGGTTTTCATTTTGTAGATGAAAAGATTTTATTGATAACTGAACATGAGATTTTTCAAAAGAAATTAAAGCGTCGTTTTCGAAGACAACATGTTTCAAATGCAGAGAGATTAAAAGATTACAATGAACTTGAAAAAGGGGACTATGTTGTCCATCATATCCATGGGATTGGTCAATATCTAGGAATTGAAACCATTGAAATCAAGGGAATTCATCGCGATTATGTCAGTGTCCAATACCAAAATGGTGATCAAATTTCTATCCCCGTGGAACAGATTCATCTACTGTCCAAATATATTTCAAGTGATGGTAAAGCTCCAAAACTCAATAAATTAAATGACGGTCATTTTAAAAAGGCCAAGCAAAAGGTTAAGAACCAGGTAGAGGATATAGCTGATGATTTAATCAAACTCTACTCTGAACGTAGTCAGTTGAAGGGTTTTGCTTTCTCAGCTGATGATGATGATCAAGATGCCTTTGATGATGCTTTCCCTTATGTTGAAACGGATGATCAACTTCGTAGTATTGAGGAAATCAAGAGGGATATGCAGGCTTCTCAGCCAATGGATCGACTTTTAGTTGGGGATGTTGGTTTTGGAAAGACTGAAGTTGCTATGCGTGCAGCCTTTAAAGCAGTCAATGATCACAAACAGGTTGTCATTCTAGTTCCGACGACGGTTTTAGCGCAACAGCACTATACGAATTTTAAGGAACGATTCCAAAATTTTGCAGTTAATATTGATGTGTTGAGTCGCTTTAGAAGTAAAAAAGAGCAGACTGCAACACTTGAAAAATTGAAAAACGGTCAAGTCGATATTTTGATTGGAACACATCGTGTTTTGTCAAAAGATGTTGTGTTTGCTGATTTGGGCTTGATGATTATTGATGAGGAACAGCGATTTGGTGTCAAGCATAAGGAAACTTTGAAAGAACTGAAGAAACAAGTGGATGTCCTAACCTTGACCGCTACGCCAATCCCTCGTACCCTCCATATGTCTATGCTGGGAATCAGAGATTTATCTGTTATTGAAACTCCGCCGACTAATCGCTATCCTGTTCAGACCTATGTTTTGGAAAAGAATGATAGTGTCATTCGTGATGCTGTCTTGCGTGAAATGGAGCGTGGAGGTCAAGTTTATTATCTTTACAACAAAGTTGACACAATTGTTCAGAAGGTTTCAGAATTACAGGAGTTGATTCCGGAGGCTTCGATTGGATATGTTCATGGTCGAATGAGTGAAGTCCAGTTGGAAAATACTCTATTAGACTTTATTGAGGGACAATACGATATCTTGGTGACGACTACTATTATTGAGACAGGGGTGGACATTCCAAATGCTAATACTTTATTTATTGAAAATGCGGACCATATGGGCTTGTCAACCTTATATCAGTTAAGAGGAAGAGTCGGTCGTAGTAATCGTATTGCTTATGCTTATCTCATGTATCGTCCAGAAAAATCAATCAGTGAAGTCTCTGAAAAGAGATTAGAAGCGATTAAAGGATTTACAGAATTGGGCTCTGGCTTTAAGATTGCAATGCGAGATCTTTCGATTCGTGGAGCAGGAAATCTTTTAGGAAAATCCCAGTCTGGTTTCATTGATTCTGTTGGTTTTGAATTGTATTCGCAGTTATTAGAGGAAGCTATTGCTAAACGAAACGGTAATGCTAACGCTAACACAAGAACCAAAGGGAATGCTGAGTTGATTTTGCAAATTGATGCCTATCTTCCTGATACTTATATTTCTGATCAACGACATAAGATTGAAATTTACAAGAAAATTCGTCAAATTGACAACCGTGTCAATTATGAAGAGTTACAAGAGGAGTTGATAGACCGTTTTGGAGAATACCCAGATGTAGTAGCCTATCTGTTAGAGATTGGTTTGGTCAAATCATACTTGGACAAGGTCTTTGTTCAACGTGTGGAAAGAAAAGATAATAAAATTACAATTCAATTTGAAAAAGTCACTCAACGACTGTTTTTAGCTCAAGATTATTTTAAAGCTTTATCCGTAACGAACTTAAAAGCAGGCATCGCTGAGAATAAGGGATTAATGGAGCTTGTATTTGATGTCCAAAATAAGAAAGATTATGAAATTTTAGAAGGTTTGCTGATTTTTGGAGAAAGTTTATTAGAGATAAAAGAGTCTAAGGAAGAAAATTCCATTTGATATTTTTCTTCTATAAAATAGATAAAAATGGTACAATAATAAATTGAGGTAATAAGGATGAGATTAGATAAATATTTAAAAGTATCGCGAATTATCAAGCGTCGTACAGTCGCAAAGGAAGTAGCAGATAAAGGTAGAATCAAGGTTAATGGAATCTTGGCCAAAAGTTCAACGGACTTGAAAGTTAATGACCAAGTTGAAATTCGCTTTGGCAATAAGTTGCTGCTTGTAAAAGTACTAGAGATGAAAGATAGTACAAAAAAAGAAGATGCAGCAGGAATGTATGAAATTATCAGTGAAACACGGGTAGAAGAAAATGTCTAAAAATATTGTACAATTGAATAATTCTTTTATTCAAAATGAATACCAACGTCGTCGCTACCTGATGAAAGAACGACAAAAACGGAATCGTTTTATGGGAGGGGTATTGATTTTGATTATGCTATTATTTATCTTGCCAACTTTTAATTTAGCGCAGAGTTATCAGCAATTACTCCAAAGACGTCAGCAATTAGCAGACTTGCAAACTCAGTATCAAACTTTGAGTGATGAAAAGGATAAGGAGACAGCATTTGCTACCAAGTTGAAAGATGAAGATTATGCTGCTAAATATACACGAGCGAAGTACTATTATTCTAAGTCGAGGGAAAAAGTTTATACGATTCCTGACTTGCTTCAAAGGTGATAAAATGGAAAATTTATTAGACGTAATAGAGCAATTTTTGAGTTTGTCAGATGAAAAGCTGGAAGAATTGGCTGATAAAAATCAATTATTGCGTTTACAAGAAGAAAAGGAAAGGAAGAATGCGTAAATTCTTAATTATTTTGTTGCTACCAAGTTTTTTGACCATTTCAAAAGTCGTTAGCACAGAAAAAGAAGTCGTCTATACTTCGAAAGAAATTTATTACCTTTCACAAT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84 | Streptococcus_phage(85.25%) | capsid,bacteriocin,tail,tRNA,protease,holin,terminase,integrase,transposase | attL 22564:22623|attR 67612:67683 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
83217 : 94674
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_012468|83217:94674|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_012468|83217:94674|93109_94132_+|WP_000182575.1|DBSCAN-SWA MTNKNAYAQSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGALGGFGGMFDLSKTGVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYVATGKNEPAKLEQVVAGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVVEGDVLLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGEEVLPELEGKKLKEVLLEPTRIYVKAVLPLIKEELVNGIAHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDESKVPVLPIFKALEKYGQIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVERVKELLDEAVYEIGRIVKKENESVIIK >NC_012468|83217:94674|85383_86733_+|WP_000801625.1|DBSCAN-SWA MKPEFLESAEFYNRRYHNFSSSVIVPMALLLVFLLGFATVAEKEMSLSTRATVEPSRILANIQSTSNNRILVNHLEENKLVKKGDLLVQYQEGAEGVQAESYASQLDMLKDQKKQLEYLQKSLQEGENHFPEEDKFGYQATFRDYISQAGSLRASTSQQNETIASQNAAASQTQSEIGNLISQTEAKIRDYQTAKSAIETGASLAGQNLAYSLYQSYKSQGEENPQTKVQAVAQVEAQISQLESSLATYRVQYAGSGTQQAYASGLSSQLESLKSQHLAKVGQELTLLAQKILEAESGKKVQGNLLDKGKITASEDGVLHLNPETSDSSMVAEGALLAQLYPSLEREGKAKLTAYLSSKDVARIKVGDSVRYTTTHDAGNQLFLDSTITSIDATATKTEKGNFFKIEAETNLTSEQAEKLRYGVEGRLQMITGKKSYLRYYLDQFLNKE >NC_012468|83217:94674|94128_94674_+|WP_000717506.1|DBSCAN-SWA MKKIAVFASGNGSNFQVIAEEFPVEFVFSDHRDAYVLERAKQLGVLSYAFELKEFESKTDYEAALVELLEEHQIDLVCLAGYMKIVGPTLLSAYEGRIVNIHPAYLPEFPGAHGIEDAWNAGVGQSGVTIHWVDSGVDTGQVIKQVRVPRLADDTIDRFEARIHEAEYRLYPEVVKALFTD >NC_012468|83217:94674|83217_85371_+|WP_000668300.1|DBSCAN-SWA MKFGKRHYRPQVDQMDCGVASLAMVFGYYGSYYFLAHLRELAKTTMDGTTALGLVKVAEEIGFETRAIKADMTLFDLPDLTFPFVAHVLKEGKLLHYYVVTGQDKDSIHIADPDPGVKLTKLPRERFEEEWTGVTLFMAPSPDYKPYKEQKNGLLSFIPILVKQRGLIANIVLATLLVTGINIVGSYYLQSIIDTYVPDQMRSTLGIISIGLVIVYILQQILSYAQEYLLLVLGQRLSIDVILSYIKHVFHLPMSFFATRRTGEIVSRFTDANSIIDALASTILSIFLDVSTVVIISLVLFSQNTNLFFMTLLALPIYTVIIFAFMKPFEKMNRDTMEANAVLSSSIIEDINGIETIKSLTSESQRYQKIDKEFVDYLKKSFTYSRAESQQKALKKVAHLLLNVGILWMGAVLVMDGKMSLGQLITYNTLLVYFTNPLENIINLQTKLQTAQVANNRLNEVYLVASEFEEKKTVEDLSLMKGEMTFKQVHYKYGYGRDVLSDINLTVPQGSKVAFVGISGSGKTTLAKMMVNFYDPSQGEISLDGVNLNQIDKKALRQYINYLPQQPYVFNGTILENLLLGAKEGTTQEDILRAVELAEIREDIERMPLNYQTELTSDGAGISGGQRQRIALARALLTDAPVLILDEATSSLDILTEKRIVDNLMALDKTLIFIAHRLTIAERTEKVVVLDQGKIVEEGKHADLLAQGGFYAHLVNS >NC_012468|83217:94674|91630_93073_+|WP_000220633.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPDAAKLTYFGLHSLQHRGQEGAGILSNDQGQLKRHRDMGLLSEVFRNPANLDKLTGAGAIGHVRYATAGEASVDNIQPFLFRFHDMQFGLAHNGNLTNAASLKKELEQRGAIFSATSDSEILAHLIRRSHNPSLMGKIKEALSLVKGGFAYILLFEDKLIAALDPNGFRPLSIGKMANGAVVVSSETCAFEVIGAEWIRDLKPGEIVIIDDEGIQYDSYTDDTQLAICSMEYIYFARPDSNIHGVNVHTARKRMGAQLAREFKHEADIVVGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLIKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVQLLKEAGATEVHVAIGSPALAYPCFYGIDIQTRQELIAANHTVEETRQIIGADSLTYLSIDSLIESIGIETDAPNGGLCVAYFDGDYPTPLYDYEEDYRRSLEEKTSFYK >NC_012468|83217:94674|87812_91538_+|WP_000361193.1|DBSCAN-SWA MDKRIFVEKKADFQVKSESLVRELQHNLGLSSLKSIRIVQVYDVFDLAEDLFAPAEKHIFSEQVTDHVLDEVSVQADLANYAFFAIESLPGQFDQRAASSQEALLLLGSSSDVTVNTAQLYLVNKDIDATELKAVKNYLLNLVDSRFKDITTGIAKQEFSESDKTIPKLTFFESYTAEDFARYKAEQGMAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKHIDFSASKFQKQLQSTYDKYIAMREELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITAPISETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKGNVVREKPEAGDVIILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRNGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLNKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMAVVVRPEDVDTFVAECNKENIDAVVVATVTEKPNLVMHWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDVKLPEERQTSAETLESDTLTVLSDLNHASQKGLQTIFDCSVGRSTVNHPLGGRYQLTPTEASVQKLPVQHGVTHTASVIAQGFNPYVAEWSPYHGAAYAVIEATARLVAAGANWSKARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVAALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAVGENIYYIPGQALSAEIDFDLIKKNFAQFEASQADHKVTSASAVKYGGVVESLALATFGNYIGAEVTLPELKTALTAQLGGFVFTSPEEIAGVEKIGQTKADFTLTVNGVKLDGHKLDSAFQGTLEEVYPTEFTQAKELEEVPAVASDVVIKAKEKVEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEKEGAEVNLVPFVTLNEEAIVKSVETMVDNIDKTNILFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRVAIDSFIARGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEDANSTSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVQVGDIHAIPVSHGEGKFVVTAEEFAELRDNGQIFSQYVDFNGKPSMDSKYNPNGSVHAIEGITSKNGQIIGKMGHSERYEDGLFQNIPGNKDQHLFASAVKHFTGK >NC_012468|83217:94674|86903_87611_+|WP_000043304.1|DBSCAN-SWA MSKQLIYSGKAKDIYTTEDENLIISTYKDQATAFNGVKKEQIAGKGVLNNQISSFIFEKLNAAGVATHFVEKLSDTEQLNKKVKIIPLEVVLRNYTAGSFSKRFGVDEGIALETPIVEFYYKNDDLDDPFINDEHVKFLQIAGDQQIAYLKEETRRINELLKVWFAEIGLKLIDFKLEFGFDKDGKIILADEFSPDNCRLWDADGNHMDKDVFRRGLGELTDVYEIVWEKLQELK |
7 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
147194 : 180682
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_012468|147194:180682|DBSCAN-SWA 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30 | Planktothrix_phage(33.33%) | tRNA,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
354852 : 402513
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_012468|354852:402513|DBSCAN-SWA 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37 | Streptococcus_phage(30.0%) | protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
479482 : 542608
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_012468|479482:542608|DBSCAN-SWA 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58 | Planktothrix_phage(11.11%) | tRNA,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
895553 : 905195
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_012468|895553:905195|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGAAATTAACTAGTTTAGCACTTGTAGGCGCTTTTTTAGGTTTGTCATGGTATGGGAATGTTCAGGCTCAAGAAAGTTCAGGAAATAAAATCCACTTTATCAATGTTCAAGAAGGTGGCAGTGATGCGATTATTCTTGAAAGCAATGGACATTTTGCCATGGTGGATACAGGAGAAGATTATGATTTCCCAGATGGAAGTGATTCTCGCTATCCATGGAGAGAAGGAATTGAAACGTCTTATAAGCATGTTCTGACAGACCGTGTCTTTCGTCATTTGAAGGAATTGGGTGTCCAAAAACTTGATTTTATTTTGGTGACCCATACCCACAGTGATCATATTGGAAATGTTGATGAATTACTGTCTACCTATCCAGTTGACCGAGTCTATCTTAAGAAATATAGTGATAGTCGTATTACTAATTCTGAACGTCTATGGGATAATCTGTATGGCTATGATAAGGTTTTACAGACTGCTGCAGAAAAAGGTGTTTCAGTTATTCAAAATATCACACAAGGGGATGCTCATTTTCAGTTTGGGGATATGGATATTGAGCTCTATAATTATGAAAATGAAACTGATTCATCGGGTGAATTAAAGAAAATTTGGGATGACAATTCCAATTCCTTGATTAGCGTGGTGAAAGTCAATGGCAAGAAAATTTACCTTGGGGGCGATTTAGATAATGTTCATGGAGCAGAAGACAAGTATGGTCCTCTCATTGGAAAAGTTGATTTGATGAAGTTTAATCATCACCATGATACCAATAAATCAAATACCAAGGATTTCATTAAAAATTTGAGTCCGAGTTTGATTGTTCAAACTTCGGATAGTCTACCTTGGAAAAATGGTGTTGATAGTGAGTATGTTAATTGGCTCAAAGAACGAGGAATTGAGAGAATCAACGCAGCCAGCAAAGACTATGATGCGACAGTTTTTGATATTCGAAAAGACGGTTTTGTCAATATTTCAACATCCTACAAGCCTATTCCAAGTTTTCAAGCTGGTTGGCATAAGAGTTCATATGGAAACTGGTGGTATCAAGCGCCTGATTCTACAGGAGAATATGCTGTCGGTTGGAATGAAATTAAGGGTGAATGGTATTACTTTAACCAAACGGGTATCTTATTACAGAATCAATGGAAAAAATGGAACAATCATTGGTTCTATTTGACAGACTCTGGTGTTGCTGCTAAAAATTGGAAGAAAATCGCTGGAATCTGGTATTATTTTAACAAAGAAAACCAGATGGAAATTGGTTGGATTCAAGATAAAGAGCAGTGGTATTATTTGGATGTTGATGGCTCTATGAAGACAGGTTGGCTTCAATATAAGGGGCAATGGTATTACTTTGCTCCATCAGGGGAAATGAAAACGGGCTGGGTAAAAGATAAAGAAGCCTGGTACTATATGGATTCTACTGGTATCATGAAGACAGGTGAGATAGAAGTTGCTGGACATCATTACTATCTAGAAGAATCAGGAGCTATGAAGCAAGGCTGGCTTAAAAAGGCAAATGATTGGTATTTCTACAAGACAGATGGTTCACGAGCTATAGGTTGGATTAAAGAGAAGGATAAATGGTACTTCTTGAAAGAAAATGGTCAATTACTTGTGAATGGTAAGACACCAGAAGGCTATACTGTGGATTCAAGTGGTGCCTGGTTAGTGGATGTTCCGATCGAGAAATCTGCTACAATTAAAACTACAAGTCATTCAGAAATAAAAGAATCCAAAGAAGTAGTGAAAAAGGATCTTGAAAATAAAGAAACGAGTCAACATGAAAGTGTTACAAATTCTTCAACTAGTCAAGATTTGACATCCTCAACTTCACAAAGCTCTGAAACGAGTGTAAACAAATCGGAATCAGAACAGTAGTAGAAAAGAAGGTTTTAGGGCCTTCTTTTTCCTATCAACTCTTTTCTATTTCCTGTTATTCATGTTATAATGGATAAATATGAATAATCGGAGTGAGACTATGAAATACAAACGGATTGTCTTTAAGGTGGGTACTTCTTCTCTGACAAATGAGGATGGAAGTTTATCACGTAGTAAGGTAAAGGATATTACCCAGCAGTTGGCTATGCTGCACGAGGCTGGTCATGAGTTGATTTTGGTGTCTTCAGGTGCCATTGCGGCTGGTTTTGGAGCCTTAGGATTTAAAAAGCGTCCGACTAAAATTGCTGATAAACAGGCTTCAGCAGCGGTAGGGCAGGGACTTTTGTTGGAAGAATATACGACCAATCTTCTCTTGCGTCAAATCGTTTCTGCACAAATCTTGCTGACCCAAGATGACTTTGTGGATAAGCGTCGTTATAAAAATGCCCATCAGGCTTTGTCGGTTTTGCTCAACCGTGGGGCAATTCCTATCATCAATGAGAATGATAGTGTCGTTATTGATGAGCTCAAGGTTGGGGACAATGACACTCTAAGTGCTCAAGTAGCGGCGATGGTCCAAGCAGACCTTTTAGTTTTCTTGACAGATGTGGACGGTCTCTATACTGGAAATCCTAATTCAGATCCAAGAGCCAAACGCTTGGAGAGAATCGAGACCATCAATCGTGAGATTATTGATATGGCTGGTGGAGCAGGTTCGTCAAACGGAACTGGGGGTATGTTAACCAAAATCAAGGCTGCAACTATCGCGACGGAATCAGGAGTTCCTGTTTATATCTGCTCATCCTTGAAATCAGATTCCATGATTGAGGCGGCAGAGGAGACCGAGGATGGTTCTTACTTTGTTGCTCAAGAGAAGGGGCTTCGTACCCAGAAACAATGGCTTGCCTTCTATGCTCAGAGTCAAGGTTCTATTTGGGTTGATAAAGGGGCTGCGGAAGCTCTCTCTCAACATGGAAAGAGTCTTCTCTTATCTGGTATCGTTGAAGCAGAAGGAGCCTTTTCTTACGGTGATATCGTGACAGTATTTGACAAGGAAAGTGGAAAATCACTTGGAAAAGGACGCGTGCAATTTGGAGCATCTGCTTTGGAGGATATGTTGCGTTCTCAAAAAGCCAAGGGTGTCTTGATTTACCGTGACGACTGGATTTCCATTACTCCTGAAATCCAACTACTTTTTACAGAATTTTAGAGGTAAACTATGGTGAGTAGACAAGAACAATTTGAACAGGTACAGGCTGTTAAAAAATCGATTAACACAGCTAGTGAAGAAGTGAAAAACCAAGCCTTGCTAGCCATGGCTGATCACTTAGTGGCTGCTACTGAGGAAATTTTAGCGGCTAATGCCCTCGATATGGCAGCGGCTAAGGGGAAAATCTCAGATGTGATGTTGGATCGTCTTTATTTGGATGCAGATCGTATAGAAGCGATGGCAAGAGGAATTCGTGAAGTGGTTGCCTTACCAGATCCAATCGGTGAAGTTTTAGAAACAAGTCAGCTTGAAAATGGTTTGGTTATCACAAAAAAACGTGTAGCTATGGGTGTCATCGGTATTATCTATGAAAGCCGTCCAAATGTGACGTCTGATGCGGCTGCTTTGACTCTTAAGAGTGGAAATGCGGTTGTTCTTCGTAGTGGTAAGGATGCCTATCAAACAACCCATGCCATTGTCACAGCCTTGAAGAAGGGCTTGGAGACGACTACTATTCATCCAAATGTGATTCAACTGGTGGAGGATACTAGCCGTGAAAGTAGTTATGCTATGATGAAGGCCAAGGGCTATCTAGACCTTCTCATTCCTCGTGGAGGAGCTGGCTTGATCAATGCAGTGGTTGAGAATGCGATTGTACCTGTTATCGAGACAGGGACTGGGATTGTCCATGTCTATGTGGATAAGGATGCAGACGAAGACAAGGCGCTGTCTATCATCAACAATGCTAAAACCAGTCGTCCTTCTGTTTGTAATGCCATGGAGATTCTGCTGGTTCATGAAAACAAGGCAGCAAGCATCCTTCCTCGCTTGGATCAAATGCTGGTTGCAGAGCGTAAGGAAGCTGGACTGGAACCAATTCAATTCCGCTTGGATAGCAAAGCAAGCCAGTTTGTTTCAGGTCAAGCAGCTGAGACCCAAGACTTTGACACCGAGTTTTTAGACTATGTCCTTGCTGTTAAGGTTGTGAGCAGTTTAGAAGAAGCGGTTGCGCACATTGAATCCCACAGCACCCATCATTCGGATGCTATTGTGACGGAAAATGCTGAAGCTGCAGCATACTTTACAGATCAAGTGGACTCTGCAGCGGTGTATGTTAATGCCTCAACTCGTTTCACAGATGGAGGACAATTTGGTCTTGGTTGTGAAATGGGGATTTCTACTCAGAAATTGCACGCGCGTGGTCCAATGGGCTTGAAAGAGTTGACCAGCTACAAGTATGTGGTTGCTGGTGATGGGCAGATAAGGGAGTAAGAGATGAAGATTGGATTTATCGGTTTGGGGAATATGGGTGCTAGCTTGGCAAAATCTGTCTTGCAGACTAGGACGTCAGATGAGATTCTCCTTGCCAATCGTAGTCAAGCTAAGGTAGATGCTTTCATTGCAGACTTTGGTGGTCAGGCTTCCAGCAATGAAGAAATGTTTGCAGAAGCAGATGTGATTTTTCTAGGAGTTAAGCCTGCTCAGTTTTCTGAACTGCTTTCTCAATACCAGACCATCCTTGAAAAAAGAGAAAGTCTTCTTTTGATTTCGATGGCAGCTGGATTGACCTTAGAAAAACTAGCAAGTCTTATCCCAAGTCAACACCGAATTATTCGTATGATGCCTAATACCCCTGCTTCTATCGGGCAAGGAGTGATTAGTTATGCCTTGTCTCCTAATTGCAGGGCTGAGGACAGTGAGCTCTTTTGTCAGCTTTTATCCAAGGCTGGTCTCTTGGTTGAATTAGGAGAAAGCTTAATCAATGCAGCGACAGGTCTTGCAGGCTGTGGACCAGCCTTTGTCTATCTCTTTATTGAAGCCTTGGCAGATGCAGGTGTTCAGACGGGATTATCACGAGAAACAGCCTTGAAAATGGCAGCCCAAACTGTGGTAGGAGCTGGGCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_012468|895553:905195|903920_904439_+|WP_001261449.1|DBSCAN-SWA MRTYENKEELKAEIEKTFEKYILEFDNIPENLKDKRADEVDRTPAENLAYQVGWTNLVLKWEEDERKGLQVKTPSDKFKWNQLGELYQWFTDTYAHLSLQELKAKLNENIHSISAMIDSLSEEELFEPHMRKWADEATKTATWEVYKFIHVNTVAPFGTFRTKIRKWKKIVL >NC_012468|895553:905195|900939_901578_+|WP_000033362.1|DBSCAN-SWA MSKGFLVSLEGPEGAGKTSVLEALLPILEEKGVEVLTTREPGGVLIGEKIREVILDPSHTQMDAKTELLLYIASRRQHLVEKVLPALEAGKLVIMDRFIDSSVAYQGFGRGLDIEAIDWLNQFATDGLKPDLTLYFDIEVEEGLARIAANSDREVNRLDLEGLDLHKKVRQGYLSLLDKEGNRIVKIDASLPLEQVVETTKAVLFDGMGLAK >NC_012468|895553:905195|901574_902465_+|WP_000806706.1|DBSCAN-SWA MKQDQLKAWQPAQFDRFVRILEQDQLNHAYLFSGFFGSLEIAQFLAKSLFCTDKVGVLPCEKCRSCKLIEQEEFPDVTLIKPVNQVIKTERIRELVGQFSQAGIESQQQVFIIEQADKMHPNAANSLLKVIEEPQSEVYIFFLTSDEEKMLPTIRSRTQIFHFKKQEEKLILLLEQMGLVKKKATLLAKFSQSRAEAEKLANQASFWTLVDESERLLTWLVAKKKESYLQVAKLANLADDKEKQDQVLRILEVLCGQDLLQVRVRVILQDLLEARKMWQANVSFQNAMEYLVLKEI >NC_012468|895553:905195|902504_902822_+|WP_000358228.1|DBSCAN-SWA MDKKELFDALDDFSQQLLVTLADVEAIKKNLKSLVEENTALRLENSKLRERLGEVEADAPVKAKHVRESVRRIYRDGFHVCNDFYGQRREQDEECMFCDELLYRE >NC_012468|895553:905195|904547_905195_+|WP_000345254.1|DBSCAN-SWA MDFEYFYNREAERFNFLKVPEILVDREEFRGLSAEAIILYSILLKQTGMSFKNNWIDKEGRVFIYFTVEEIMKRRNISKPTAIKTLDELDVKKGIGLIERVRLGLGKPNIIYVKDFMSIFQVKENDLQKSKNLTSEVKDFNLRSKENELQEVKNLDSNYIENNKSKYSKREYSFGENGLGTFQNVFLAAEDISDLQIIMNSQLENYIRLPAKLES >NC_012468|895553:905195|897516_898647_+|WP_001844793.1|DBSCAN-SWA MNNRSETMKYKRIVFKVGTSSLTNEDGSLSRSKVKDITQQLAMLHEAGHELILVSSGAIAAGFGALGFKKRPTKIADKQASAAVGQGLLLEEYTTNLLLRQIVSAQILLTQDDFVDKRRYKNAHQALSVLLNRGAIPIINENDSVVIDELKVGDNDTLSAQVAAMVQADLLVFLTDVDGLYTGNPNSDPRAKRLERIETINREIIDMAGGAGSSNGTGGMLTKIKAATIATESGVPVYICSSLKSDSMIEAAEETEDGSYFVAQEKGLRTQKQWLAFYAQSQGSIWVDKGAAEALSQHGKSLLLSGIVEAEGAFSYGDIVTVFDKESGKSLGKGRVQFGASALEDMLRSQKAKGVLIYRDDWISITPEIQLLFTEF >NC_012468|895553:905195|902824_903694_+|WP_001166869.1|DBSCAN-SWA MQIQKSFKGQSPYGKLYLVATPIGNLDDMTFRAIQTLKEVDWIAAEDTRNTGLLLKHFDISTKQISFHEHNAKEKIPDLIGFLKAGQSIAQVSDAGLPSISDPGHDLVKAAIEEEIAVVTVPGASAGISALIASGLAPQPHIFYGFLPRKSGQQKQFFDSKKDYPETQIFYESPHRVADTLENMLEVYGDRSVVLVRELTKIYEEYQRGTISELLESIAETSLKGECLLIVEGASQDVEEKDEEDLFLEIQARIQQGMKKNQAIKEVAKIYQWNKSQLYAAYHDWEEKQ >NC_012468|895553:905195|895553_897437_+|WP_000728252.1|holin|DBSCAN-SWA MKKKLTSLALVGAFLGLSWYGNVQAQESSGNKIHFINVQEGGSDAIILESNGHFAMVDTGEDYDFPDGSDSRYPWREGIETSYKHVLTDRVFRHLKELGVQKLDFILVTHTHSDHIGNVDELLSTYPVDRVYLKKYSDSRITNSERLWDNLYGYDKVLQTAAEKGVSVIQNITQGDAHFQFGDMDIELYNYENETDSSGELKKIWDDNSNSLISVVKVNGKKIYLGGDLDNVHGAEDKYGPLIGKVDLMKFNHHHDTNKSNTKDFIKNLSPSLIVQTSDSLPWKNGVDSEYVNWLKERGIERINAASKDYDATVFDIRKDGFVNISTSYKPIPSFQAGWHKSSYGNWWYQAPDSTGEYAVGWNEIKGEWYYFNQTGILLQNQWKKWNNHWFYLTDSGVAAKNWKKIAGIWYYFNKENQMEIGWIQDKEQWYYLDVDGSMKTGWLQYKGQWYYFAPSGEMKTGWVKDKEAWYYMDSTGIMKTGEIEVAGHHYYLEESGAMKQGWLKKANDWYFYKTDGSRAIGWIKEKDKWYFLKENGQLLVNGKTPEGYTVDSSGAWLVDVPIEKSATIKTTSHSEIKESKEVVKKDLENKETSQHESVTNSSTSQDLTSSTSQSSETSVNKSESEQ >NC_012468|895553:905195|899922_900720_+|WP_000689709.1|DBSCAN-SWA MKIGFIGLGNMGASLAKSVLQTRTSDEILLANRSQAKVDAFIADFGGQASSNEEMFAEADVIFLGVKPAQFSELLSQYQTILEKRESLLLISMAAGLTLEKLASLIPSQHRIIRMMPNTPASIGQGVISYALSPNCRAEDSELFCQLLSKAGLLVELGESLINAATGLAGCGPAFVYLFIEALADAGVQTGLSRETALKMAAQTVVGAGQLVLESQQHPGVLKDQVCSPGGSTIAGVASLEAHAFRGTVMEAVHQAYKRTQELGK >NC_012468|895553:905195|898656_899919_+|WP_000254680.1|DBSCAN-SWA MVSRQEQFEQVQAVKKSINTASEEVKNQALLAMADHLVAATEEILAANALDMAAAKGKISDVMLDRLYLDADRIEAMARGIREVVALPDPIGEVLETSQLENGLVITKKRVAMGVIGIIYESRPNVTSDAAALTLKSGNAVVLRSGKDAYQTTHAIVTALKKGLETTTIHPNVIQLVEDTSRESSYAMMKAKGYLDLLIPRGGAGLINAVVENAIVPVIETGTGIVHVYVDKDADEDKALSIINNAKTSRPSVCNAMEILLVHENKAASILPRLDQMLVAERKEAGLEPIQFRLDSKASQFVSGQAAETQDFDTEFLDYVLAVKVVSSLEEAVAHIESHSTHHSDAIVTENAEAAAYFTDQVDSAAVYVNASTRFTDGGQFGLGCEMGISTQKLHARGPMGLKELTSYKYVVAGDGQIRE |
10 | Streptococcus_phage(88.89%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1205459 : 1270453
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_012468|1205459:1270453|DBSCAN-SWA 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58 | Indivirus(17.65%) | transposase,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1371385 : 1414005
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_012468|1371385:1414005|DBSCAN-SWA 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44 | Streptococcus_phage(23.08%) | tRNA,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1485791 : 1492542
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_012468|1485791:1492542|DBSCAN-SWA 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GTCGTCAAATTCCAACTCAACGTCATCATAAGAAAGCAAGGTTTGGTATTGTTTCACCAAGGCATTTCTTGGCTCTTTCAAGATGCGAACCAAGTCATCAACGGTCAATTGCTCAAGAGCCGCAAAAACAGGCAAGCGTCCAATCAACTCAGGGATAATACCAAATTTTTGAATGTCTTCAGCGATGATTTCTTGCATGTATGAGCTGTTTTCGTCAATCGCCTTATTGTTTTGACCAAATCCGATAACTTTTTCACCCAGACGTTGTTTGACAATTTCTTCAATACCATCAAAAGCACCACCCACGATGAAGAGGATATTTTTTGTATCCACTTGAATCATCTCTTGTTGTGGATGTTTGCGTCCACCTTGAGGCGGCACGCTAGCAACAGTTCCCTCAATAATCTTGAGAAGGGCTTGTTGCACCCCTTCACCAGAAACATCACGTGTGATAGACACATTCTCACTCTTCTTGGCAATCTTGTCAATTTCATCCACATAGATAATGCCACGCTCTGCACGTTCGATGTTAAAGTCAGCAACCTGCAAGAGTTTGAGGAGGATATTTTCCACGTCCTCACCCACATAACCAGCCTCCGTCAGAGCTGTCGCATCCGCAATAGCAAAAGGTACATTCAAGCTCTTAGCCAAGGTCTGGGCAAGGAAAGTTTTCCCTGAACCAGTTGGGCCAATCATCAAAATGTTTGACTTCTGCAAATCTACATCTTCTGACTCTTCGCGTGTATCGTGGAAATTGATGCGTTTGTAGTGGTTATAAACCGCCACTGCCAAGGCACGCTTGGCACGATCTTGACCAATTACATAGTGGTTCAAGATATGGAGGAGTTCAATTGGTTTTGGCACCTCAGACAAGTCTGCCAAGACTTCCTCAACCAATTCTTCTCGAATGATTTCCTGAGCTAACTCCACGCATTCATTACAAATAAAAGCATTGTTGCCAGCAATTATTTTTTGTACTTCTTCTTGGTTTTTGCCACAAAATGAGCAATAAACCATCATATCATTTTTTCTATTTGTAGACATGATTTCCTTCCATTCTATACTGTCATTCTATCTAAAATAAGGTCATGTAAAAAGCATGAATACTATTGACCAGATTGGTAAAGGCATTTAACCAAAGGAGGATAGAAAGCCCGTAACGCTTTTTACGAAAAGCCTGTGCTCCTGCCAGAAAGCAGATGAAACACAGAAAAGCCGTGAATAGACCAAATAAACTCCGTTCCATTAGACTTCCTTTCTCTTGCGGTATTGGATGGTAAAATCATAAGGATTTTTCTCATCTTTGGCGTAAAATTTGCTTGAAACTGTCTCAAAAAGAGATAAGTCAAACTCCTCAGGAAAATAGGTATCTCCCTCCACCCGAGCATGAATGTGAGTCACAATCACTTCATCCAAATAGGGTTCAAAAGCCTGAAAAATCTGCTTCCCACCGAGAATGTAGAGATTCTTGTCTTGACCCTGATACCAGTCCAAGACAGACTGGATATCGTGAAAAGTAGCAACCCCATCTATCTTTTCTTCTGGGTTACGAGTCAAAATCAAGGTCTCCCGTTTTGGAAGCAAGCGACGCCCCATCCCATCAAAGGTCACACGCCCCATCAAGATAGCATGATTCAGAGTTGTTTCTTTAAAGTGCTGCAATTCTGCTGGCAAATGCCAAGGCAGACGATTTTCCTTACCAATCACACCCTCTTCATCCTGGGCCCAAATAGCTACGATTTTCTTAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_012468|1485791:1492542|1488672_1489563_-|WP_000163033.1|DBSCAN-SWA MTKKQLHLVIVTGMSGAGKTVAIQSFEDLGYFTIDNMPPALLPKFLQLVEIKEDNPKLALVVDMRSRSFFSEIQAVLDELENQDGLDFKILFLDAADKELVARYKETRRSHPLAADGRILDGIKLERELLAPLKNMSQNVVDTTELTPRELRKTLAEQFSDQEQAQSFRIEVMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPYYLPELRNQTGVDEPVYDYVMNHPESEDFYQHLLALIEPILPSYQKEGKSVLTIAMGCTGGQHRSVAFAKRLAQDLSKNWSVNEGHRDKDRRKETVNRS >NC_012468|1485791:1492542|1492035_1492542_-|WP_000162481.1|DBSCAN-SWA MTKKIVAIWAQDEEGVIGKENRLPWHLPAELQHFKETTLNHAILMGRVTFDGMGRRLLPKRETLILTRNPEEKIDGVATFHDIQSVLDWYQGQDKNLYILGGKQIFQAFEPYLDEVIVTHIHARVEGDTYFPEEFDLSLFETVSSKFYAKDEKNPYDFTIQYRKRKEV >NC_012468|1485791:1492542|1490005_1490593_-|WP_000422599.1|DBSCAN-SWA MELNTHNAEILLSAANKSHYPQDELPEIALAGRSNVGKSSFINTMLNRKNLARTSGKPGKTQLLNFFNIDDKMRFVDVPGYGYARVSKKEREKWGCMIEEYLTTRENLRAVVSLVDLRHDPSADDVQMYEFLKYYEIPVIIVATKADKIPRGKWNKHESAIKKKLNFDPSDDFILFSSVSKAGMDEAWDAILEKL >NC_012468|1485791:1492542|1491865_1492036_-|WP_000442275.1|DBSCAN-SWA MERSLFGLFTAFLCFICFLAGAQAFRKKRYGLSILLWLNAFTNLVNSIHAFYMTLF >NC_012468|1485791:1492542|1487698_1488676_-|WP_001231086.1|DBSCAN-SWA MRKPKITVIGGGTGIPVILKSLREKDVEIAAIVTVADDGGSSGELRKNMQQLTPPGDLRNVLVAMSDMPKFYEKVFQYRFSEDAGAFAGHPLGNLIIAGLSEMQGSTYNAMQLLSKFFHTTGKIYPSSDHPLTLHAVFQDGTEVAGESHIVDHRGIIDNVYVTNALNDDTPLASRRVVQTILESDMIVLGPGSLFTSILPNIVIKEIGRALLETKAEIAYVCNIMTQRGETEHFTDSDHVEVLHRHLGRPFIDTVLVNIEKVPQEYMNSNRFDEYLVQVEHDFVGLCKQVSRVISSNFLRLENGGAFHDGDLIVDELMRIIQVKK >NC_012468|1485791:1492542|1485791_1486757_+|WP_000081011.1|DBSCAN-SWA MSQLYDITIVGGGPVGLFAAFYAHLRQAKVQIIDSLPQLGGQPAILYPEKEILDVPGFPNLTGEELTNRLIEQLNGFDTPIHLNETVLEIDKQEEFAITTSKGSHLTKTVIIAMGGGAFKPRPLELEGVEGYENIHYHVSNIQQYAGKKVTILGGGDSAVDWALAFEKIAPTTLVHRRDNFRALEHSVQALQESSVTIKTPFAPSQLLGNGKTLDKLEITKVKSDETETIDLDHLFVNYGFKSSVGNLKNWGLDLNRHKIIVNSKQESSQAGIYAIGDCCYYDGKIDLIATGLGEAPTAVNNAINYIDPEQKVQPKHSTSL >NC_012468|1485791:1492542|1490601_1491834_-|WP_000106346.1|protease|DBSCAN-SWA MSTNRKNDMMVYCSFCGKNQEEVQKIIAGNNAFICNECVELAQEIIREELVEEVLADLSEVPKPIELLHILNHYVIGQDRAKRALAVAVYNHYKRINFHDTREESEDVDLQKSNILMIGPTGSGKTFLAQTLAKSLNVPFAIADATALTEAGYVGEDVENILLKLLQVADFNIERAERGIIYVDEIDKIAKKSENVSITRDVSGEGVQQALLKIIEGTVASVPPQGGRKHPQQEMIQVDTKNILFIVGGAFDGIEEIVKQRLGEKVIGFGQNNKAIDENSSYMQEIIAEDIQKFGIIPELIGRLPVFAALEQLTVDDLVRILKEPRNALVKQYQTLLSYDDVELEFDDEALQEIANKAIERKTGARGLRSIIEETMLDVMFEVPSQENVKLVRITKETVDGTDKPILETA >NC_012468|1485791:1492542|1486790_1487702_-|WP_000011310.1|DBSCAN-SWA MSFTVAVKEEILGQHHLSWHELSAIIKMSGSIGLSTSGLTLSVVTENAKLARHLYESFLHLYEIKSEIRHHQRSNLRKNRVYTVFTDEKVQDLLSDLHLADSFFGLETGIDEAILSDEEAGRAYLCGAFLANGSIRDPESGKYQLEISSVYLDHAQGIASLLQQFLLDAKVLERKKGAVTYLQRAEDIMDFLIVIGAMQARDDFERVKILRETRNDLNRANNAETANIARTVSASMKTINNISKIKDIMGLENLPVDLQEVAQLRIQHPDYSIQQLADSLSTPLTKSGVNHRLRKINKIADEL >NC_012468|1485791:1492542|1489614_1489995_-|WP_001140412.1|DBSCAN-SWA MAKTIHTDKAPKAIGPYVQGKIVGNLLFASGQVPLSPETGEIVGENIQEQTEQVLKNIGAILAEAGTDFDHVVKTTCFLSDMNDFVPFNEVYQTAFKEEFPARSAVEVARLPRDVKVEIEVIAEIG |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1785721 : 1793053
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_012468|1785721:1793053|DBSCAN-SWA CATGACCAAAACAATTCTTGTTACAGGTGGGACTAGCTACATTGGCTCCCATACCGTTAAAGCTCTTTTAAATGCTGGCTATCAGGTGCATGTCCTCGATAATCTCTCCACAGGAAATCGAGCGACTGTGGATAGTCGTGCTAGCTTTAAAGAACTGGATGTTTATGATGCTAGCGCCTTAAAGGCTTACTTAGAAGAAAATCAGATTGATGCTGTCCTCCATTGTGCAGGTGAAATTGTTGTGAGCGAAAGTATTGAAAATCCAAGTAAATACTTCACTGCCAACGTTGCTGGTATGAACCAAGTTCTCAAAGTCTTATCTGAAGTTGGCATTCAAAAAATCATGTTCTCTTCGACTGCTTCTCTCTATGGAAATAACTGTATTGACAAGCCGGTGACTGAAGATACCCTGCTCGACCCTGTCAACCCTTATGCAGAGACAAAACTGATGGGCGAACGAATGATTTACTGGATGGCCAATCGCTACGACTGGAAATATGTTATTTTCCGTTACTTTAATGCTGCTGGGGCTGAAATGGATGCTTCAAACGGTCTGCGTGTGAAAAATCCAACTCACATCATTCCAAATATCAACAAGACCGCATTGGGACAAAATGATAGCTTAAAAATATTTGGAGATGACTACGATACACGTGACGGTTCATGTATTCGAGATTACATTTATGTCTTGGACCTTGCATAGGCTCATGTTAAAGGAATGAACTACCTATTTCAAGAAGACAGTTCTTCTCAAATCTTTAACTTAGGAACTAAAAAAGGCTATACTATCAAAGAAATCTTTAAAACTGCTGAAGAATTACTAAATTAAAAAATCCCACACGAGATTGTTGCTCGACGTGCTAGTGACCCAGCCAGTGTCCTAGCAGATGCTTCAAAAGCTAAACAATATCTTGATTGGACGGCTAGCTACTCCCTCGAAGATATTATTTTATCAGATTAAGGTAAAAACATTTTAGAATAGGATAACAAAGGAGAAAGTCTTGTTGCTCTCTCCTTGTTGTATTTATTAAATTGTCAGAAATTTTATTGACAGATTAGAAAAATAATGTTACATTTATATCCGCAGATATCTTTCGATACCAAATCTACATGAAAGGACGGGGTATGAAACTTTCTCATTATTTAATTGGCTTACTTCTACTCCTAGTCTTTCTCTCTATTAGCATTGGGACCAGTGATTTTTCATGGGGAAAGCTATTTGATTTCGACCAGCAGACCTGGCTCCTCTTTCAAGAGTCCCGTCTCCCAAGAACTATCAGTATTCTCCTGACTGCCTCTAGTATGAGTATGGCAGGCCTTCTCATGCAGACTATTACCCAAAATCAGTTTGCTGCACCGAGTACAGTTGGAACGACTGAAGCCGCCAAACTGGGAATGGTGCTGAGCCTTTTTGTCTTTCCATCGGCTAGTCTGACCCACAAGATGCTCTTCGCTTTTGTTTCATCCATCGTATTCACCCTCTTCTTCCTAGCCTTTATGACCATTTTTACTGTAAAGGAAAGGTGGATGTTGCCTCTGATTGGGATCATCTATAGCGGGATTATCGGCTCAGTCACAGAAGTTATCGCCTATCGTTTCAATCTGGTTCAGAGTATGACTGCCTGGACCCAGGGCTCCTTCTCCATGATTCAGACCCATCAGTATGAGTGGCTCTTCTTAGGCCTCATCATCCTGATAACCGTTTGGAAATTATCCCAAACCTTCACCATCATGAATCTAGGGAAAGAAACCAGCGAGAGTTTGGGGATTTCCTACTCCCTACTTGAAAAACTGGCCCTCTTTCTGGTGGCGCTAACGACAAGCGTCACCATGATTACCGTGGGTGGCCTACCATTTCTCGGAGTTATCGTTCCCAATCTTGTTCGCAAGCGCTATGGAGATAATCTAAGTCAAACCAAACTCATGGTCGCACTGGTTGGTGCCAATCTAGTTCTGGCTTGCGATATCCTATCCCGAGTTCTGATTAGGCCCTATGAGTTGTCTGTCAGTCTCTTGCTAGGAATCATCGGTAGTCTCGTCTTTATCCTACTTCTCTGGAGAGGGGGACGAAAAGATGCAGACTAAAAGCAAACATACCAAGCTCTTCTGGATTCTCATTATTCTTGCCATCGGAGCTTGTCTTCTCTACTTTTGGCCCATCACTCACTTGTCAGCCTTTGCTTGGAAGTTGCGTTCCCAAAAGATCATCGTTTATCTCTTGGTAGCCATCGCGACTGGGATTTCGACCATTAGTTTTCAAACCCTGACGGAAAATCGCTTCCTGACGCCTAGTATTTTGGGAATTGAATCCTTCTACGTCCTACTACAAACCCTACTACTGGTTTTTGAAAGCAAGTTTCTTCAACTTGGCAAATCCCCTATCTTAGAATTCCTAGTCTTACTTCTTGTCCAGTCCCTCTTCTTTCTCGCCTTACAAGGTTACTTGAAGACACTGATGAAGCAAGACCTGGTCTTCGTCCTGCTGATCTGTCTAGCGCTCAGAAGTCTCTTTCGAAATATCAGCACCTTCCTTCAAGTCCTAATGGATCCAAACGAATACGATAAACTGCAAAATAGTCTTTTTGCCTCCTTTCAACATCTCAACACTTCCATCCTAGCCATCGGTTCTCTGATCATCCTCGCTTTGACAATCTTTTTCTTTCGAAAAGCAGTCGTTCTAGATGTCTTGCACCTGCAAAGAGAAACGGCTCAGATATTGGGACTCGATGTTGAAAAAGAACAGAAAGAGCTCCTCTGGGGAATCGTGCTTTTGACCTCAACGGCCACTGCCTTGGTAGGACCTATGGCCTTCTTCGGCTTTATACTGGCCAACCTCACCTACCTGATTGTCAAAGACTATCAGCACAAGTTACTCTTTATAGTGGCCATTCTGGTTGGATTTATTAGCTTAACCTTGGGGCAAGCCTTGATTGAACGAGTCTTTGCACTGGAAATTCGTATCAGTATGATCATTGAGAGTGTGGGTGGCTTCTTATTCTTTATCTTACTATATAGGAGGTCTCGTCAGTGAAACTGGAAAACATTGACAAATCCATTCAAAAACAGGATATTTTGCAAGGCATTTCGCTTGAAGTCAGTCCTCAAAAACTGACAGCCTTTATTGGTCCAAATGGTGCTGGAAAATCGACTCTCCTCTCCATCATGAGCAGGCTAACCAAGAAAGATCAGGGAGTTCTCAGTATCAAAGGACGTGAAATCGAGAGCTGGAATTCGCAAGAACTGGCCCAAGAACTAACCATCCTAAAACAGAAAATCAATTACCAAGCCAAATTGACTGTTGAAGAACTGGTCAGTTTTGGACGTTTTCCCTACAGCCGAGGTCGACTTAGATCAGAAGACTGGGAAAAAATCCGAGAAACTCTGAACTATTTAGAACTGACCAACTTAAAAGACCGCTACATCAATAGCCTGTCAGGGGGGCAACTCCAGCGCGTCTTTATCGCTATGGTACTGGCCCAGGATACGGACTTTATCTTGCTGGACGAACCACTCAACAATCTCGATATCAAGCAAAGCGTCAGCATGATGCAGATTCTTCGACGACTGGTGGAGGAACTCGGCAAGACCATTATCATCGTCCTCCACGATATCAACATGGCCAGTCAGTATGCAGATGAAATTGTCGCCTTCAAGGACGGCCAGGTCTTTAGCAAGGGAAGAACCGATCAAATCATGCAGGCTGACCTGCTCAGTCAACTTTATGAGATTCCCATCACGCTAGCTGATATCAATGACAAAAAGATCTGTATCTATAGCTAGTAACATAAAAGCTCAAGTTAGAGAACCTTCAGTCTCTTAGTCAATAAGATTAAGAGACTCCCTAAATCGTTATCACATTTTAAAAAGGAGAAATTATGAAAACATCCCTTAAACTTTATTTCACTGCCCTAGTGGCCAGCTTCTTGCTCCTACTTGGTGCATGTAGTACAAACTCAAGCACTAGTCAGACAGAGACCAGTAGCTCTGCTCCAACAGAGGTAACCATTAAAAGTTCACTGGACGAGGTCAAACTTTCCAAAGTTCCTGAAAAGATTGTGACCTTTGACCTCGGCGCTGCGGATACTATTCGCGCTTTAGGATTTGAAAAAAATATCGTCGGAATGCCTACAAAAACTGTTCCGACTTATCTAAAAGACCTAGTGGGAACTGTCAAAAATGTTGGTTCTATGAAAGAACCTGATTTAGAAGCTATCGCCGCCCTTGAGCCTGATTTGATTATCGCTTCACCACGTACACAAAAATTCGTAGACAAATTCAAAGAAATCGCCCCAACCGTTCTCTTCCAAGCAAGCAAGGACGACTACTGGACTTCTACCAAGGCTAATATCGAATCCTTAGCAAGTGCCTTCGGCGAAACTGGTACACAGAAAGCCAAGGAAGAATTGGCCAAGCTAGACAAGAGTATCCAAGAAGTCGCTACTAAAAATGAAAGCTCTGACAAAAAAGCCCTTGCGATCCTCCTTAATGAAGGAAAAATGGCAGCCTTTGGTGCCAAATCTCGTTTCTCTTTCTTGTACCAAACCTTGAAATTCAAACCAACTGATACAAAATTTGAAGACTCACGCCACGGACAAGAAGTCAGCTTTGAAAGTGTCAAAGAAATCAACCCTGACATCCTCTTTGTCATCAACCGTACCCTTGCCATCGGTGGGGACAACTCTAGCAACGACGGTGTCCTAGAAAATGCCCTTATCGCTGAAACACCTGCTGCTAAAAATGGTAAGATTATCCAACTAACACCAGACCTCTGGTATCTAAGCGGAGGCGGACTTGAATCAACAAAACTCATGATTGAAGACATACAAAAAGCTTTGAAATAAGCCACTTCAAACTCAATTTAATACTCAATGAAAATCAAAGAGCAAACTAGGAAACTAGCCGCAGGTTGCTCAAAACACTGTTTTGAGGTTGCAGATGAAAGCTGATGCGGTTTGAAGAGATTTTCGAAGAGTATAAAATTTTGACATTCTAAAACGCAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_012468|1785721:1793053|1792324_1793053_-|WP_000351907.1|DBSCAN-SWA MDIKLKDFEGPLDLLLHLVSKYQMDIYDVPITEVIEQYLAYVSTLQAMRLEVTGEYMVMASQLMLIKSRKLLPKVAEVTDLGDDLEQDLLSQIEEYRKFKLLGEHLEAKHQERAQYYSKAPTELIYEDAELVHDKTTIDLFLAFSNILAKKKEEFAQNHTTILRDEYKIEDMMIIVKESLIGRDQLRLQDLFKEAQNVQEVITLFLATLELIKTQELILVQEESFGDIYLMEKKEESQVPQS >NC_012468|1785721:1793053|1786845_1787805_+|WP_000777235.1|DBSCAN-SWA MKLSHYLIGLLLLLVFLSISIGTSDFSWGKLFDFDQQTWLLFQESRLPRTISILLTASSMSMAGLLMQTITQNQFAAPSTVGTTEAAKLGMVLSLFVFPSASLTHKMLFAFVSSIVFTLFFLAFMTIFTVKERWMLPLIGIIYSGIIGSVTEVIAYRFNLVQSMTAWTQGSFSMIQTHQYEWLFLGLIILITVWKLSQTFTIMNLGKETSESLGISYSLLEKLALFLVALTTSVTMITVGGLPFLGVIVPNLVRKRYGDNLSQTKLMVALVGANLVLACDILSRVLIRPYELSVSLLLGIIGSLVFILLLWRGGRKDAD >NC_012468|1785721:1793053|1785721_1786423_+|WP_000167854.1|DBSCAN-SWA MTKTILVTGGTSYIGSHTVKALLNAGYQVHVLDNLSTGNRATVDSRASFKELDVYDASALKAYLEENQIDAVLHCAGEIVVSESIENPSKYFTANVAGMNQVLKVLSEVGIQKIMFSSTASLYGNNCIDKPVTEDTLLDPVNPYAETKLMGERMIYWMANRYDWKYVIFRYFNAAGAEMDASNGLRVKNPTHIIPNINKTALGQNDSLKIFGDDYDTRDGSCIRDYIYVLDLA >NC_012468|1785721:1793053|1788747_1789500_+|WP_000764303.1|DBSCAN-SWA MKLENIDKSIQKQDILQGISLEVSPQKLTAFIGPNGAGKSTLLSIMSRLTKKDQGVLSIKGREIESWNSQELAQELTILKQKINYQAKLTVEELVSFGRFPYSRGRLRSEDWEKIRETLNYLELTNLKDRYINSLSGGQLQRVFIAMVLAQDTDFILLDEPLNNLDIKQSVSMMQILRRLVEELGKTIIIVLHDINMASQYADEIVAFKDGQVFSKGRTDQIMQADLLSQLYEIPITLADINDKKICIYS >NC_012468|1785721:1793053|1787794_1788751_+|WP_001193674.1|DBSCAN-SWA MQTKSKHTKLFWILIILAIGACLLYFWPITHLSAFAWKLRSQKIIVYLLVAIATGISTISFQTLTENRFLTPSILGIESFYVLLQTLLLVFESKFLQLGKSPILEFLVLLLVQSLFFLALQGYLKTLMKQDLVFVLLICLALRSLFRNISTFLQVLMDPNEYDKLQNSLFASFQHLNTSILAIGSLIILALTIFFFRKAVVLDVLHLQRETAQILGLDVEKEQKELLWGIVLLTSTATALVGPMAFFGFILANLTYLIVKDYQHKLLFIVAILVGFISLTLGQALIERVFALEIRISMIIESVGGFLFFILLYRRSRQ >NC_012468|1785721:1793053|1791736_1792306_-|WP_000105310.1|DBSCAN-SWA MSTLAKIEALLFVAGEDGIRVRQLAELLSLPPTGIQQSLGKLAQKYEKDPDSSLALIETSGAYRLVTKPQFAEILKEYSKAPINQSLSRAALETLSIIAYKQPITRIEIDAIRGVNSSGALAKLQAFDLIKEDGKKEVLGRPNLYVTTDYFLDYMGINHLEELPVIDELEIQAQESQLFGERIEEDENQ >NC_012468|1785721:1793053|1790785_1791028_-|WP_000821636.1|DBSCAN-SWA MKRILIAPVRFYQRFISPVFPPSCRFDLTCSNYMIQAIEKHGFKGVLMGLARILRCHPWSKTGKDPVPDHFSLKRNQEGE >NC_012468|1785721:1793053|1789595_1790561_+|WP_000858259.1|DBSCAN-SWA MKTSLKLYFTALVASFLLLLGACSTNSSTSQTETSSSAPTEVTIKSSLDEVKLSKVPEKIVTFDLGAADTIRALGFEKNIVGMPTKTVPTYLKDLVGTVKNVGSMKEPDLEAIAALEPDLIIASPRTQKFVDKFKEIAPTVLFQASKDDYWTSTKANIESLASAFGETGTQKAKEELAKLDKSIQEVATKNESSDKKALAILLNEGKMAAFGAKSRFSFLYQTLKFKPTDTKFEDSRHGQEVSFESVKEINPDILFVINRTLAIGGDNSSNDGVLENALIAETPAAKNGKIIQLTPDLWYLSGGGLESTKLMIEDIQKALK >NC_012468|1785721:1793053|1791027_1791750_-|WP_001222228.1|DBSCAN-SWA MRINKYIAHAGVASRRKAEELIKQGLVTVNGQVVRELATTIKSGDKVEVEGQPIYNEEKVYYLLNKPRGVISSVTDDKGRKTVVDLLPNVKERIYPVGRLDWDTSGVLILTNDGDFTDEMIHPRNEIDKVYVARVKGVANKDNLRPLTRGLEIDGKKTKPAVYEILKVDPVKNRSVVQLTIHEGRNHQVKKMFEAVGLQVDKLSRTRFGHLDLTGLRPGESRRLNKKEISQLHTMAVTKK |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2162534 : 2171288
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_012468|2162534:2171288|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_012468|2162534:2171288|2163358_2164186_-|WP_000835715.1|DBSCAN-SWA MKSIIDVKNLSFRYKENQNYYDVKDITFHVKRGEWLSIVGHNGSGKSTTVRLIDGLLEAESGEIVIDGQRLTEENVWNIRRQIGMVFQNPDNQFVGATVEDDVAFGLENQGLSRQEMKKRVEEALALVGMLDFKKREPARLSGGQKQRVAIAGVVALRPAILILDEATSMLDPEGRRELIGTVKGIRKDYDMTVISITHDLEEVAMSDRVLVMKKGEIESTSSPRELFSRNDLDQIGLDDPFANQLKKSLSQNGYDLPENYLTESELEDKLWELL >NC_012468|2162534:2171288|2166881_2168132_-|WP_000424275.1|DBSCAN-SWA MELVHGISTHFIQSKKFKTNKITVRFTAPLSLDTIAGHMLSASMLETANQMYPTSQDLRRHLASLYGTDMSTNCFRRGQSHIIELTFTYVRDEFLSRKNVLTSQILELVKETLFSPVVVDNGFDPALFEIEKKQLLASLAADMDDSFYFAHKELDKLFFHDERLQLEYSDLRNRILDETPQSSYSCFQEFLANDRIDFFFLGDFNEVEIQNVLESFGFKGRKGDVKVQYCQPYSNILQEGMVRKNVGQSILELGYHYRSKYGDEQHLPMIVMNGLLGGFAHSKLFTNVRENAGLAYTISSELDLFSGFLRMYAGINRENRNQARKMMNNQLLDLKKGYFTEFELNQTKEMIRWSLLLSQDNQSSLIERAYQNALFGKSSADFKSWIAKLEQIDKDAICRVANNVKLQAIYFMEGIE >NC_012468|2162534:2171288|2164182_2164728_-|WP_000712131.1|DBSCAN-SWA MKKEQIPNLLTIGRILFIPIFIFILTIGNSIESHIVAAIIFAVASITDYLDGYLARKWNVVSNFGKFADPMADKLLVMSAFIMLIELGMAPAWIVAVIICRELAVTGLRLLLVETGGTILAAAIPGKIKTFSQMFAIIFLLLHWTLLGQVLLYVALFFTIYSGYDYFKGSAYVFKGTFGSK >NC_012468|2162534:2171288|2162534_2163374_-|WP_000510412.1|DBSCAN-SWA MGIALENVNFTYQEGTPLASAALSDVSLTIEDGSYTALIGHTGSGKSTILQLLNGLLVPSQGSVRVFDTLITSTSKNKDIRQIRKQVGLVFQFAENQIFEETVLKDVAFGPQNFGVSEEDAVKTAREKLALVGIDESLFDRSPFELSGGQMRRVAIAGILAMEPAILVLDEPTAGLDPLGRKELMTLFKKLHQSGMTIVLVTHLMDDVAEYANQVYVMEKGRLVKGGKPSDVFQDVVFMEEVQLGVPKITAFCKRLADRGVSFKRLPIKIEEFKESLNG >NC_012468|2162534:2171288|2168290_2168659_+|WP_000455903.1|DBSCAN-SWA MEYKLFEEFITLQALLKELGITHSGGAIKSFLSEHSVYFNRELESRRGKKLRIGDKVDIPDMNIDILLTQPTSEEQDEYQADKVEKERIAKLVKKMNKGVKKDKSKPASSPKSQQAPRFPGR >NC_012468|2162534:2171288|2164738_2165560_-|WP_001227958.1|DBSCAN-SWA MRKKTIGEVLRLARINQGLSLDELQKKTEIQLDMLEAMEADDFDQLPSPFYTRSFLKKYAWAVELDDQIVLDAYDSGSMITYEEVDVDEDELTGRRRSSKKKKKKTSFLPLFYFILFALSILIFVTYYVWNYIQTQPEEPSLSNYSVVQSTSSTSSVPHSSSSSSSSIESAISVSGEGNHVEIAYKTSKETVKLQLAVSDVTSWVSVSESELEGGVTLSPKKKSAEATVATKSPVTITLGVVKGVDLTVDNQTVDLSKLTAQTGQITVTFTKN >NC_012468|2162534:2171288|2165601_2166885_-|WP_000170208.1|DBSCAN-SWA MTKVVFEEKYYPAVKEMVYRTRLANGLTVALLPKKEFKEVYGSVTVQFGSVDTFVTEVDGDVKQYPGGIAHFLEHKLFEREDSSDLMSAFTNLGADSNAFTSFTKTNYLFSATDYFLENLDLLDELVTSAHFTEASILTEQDIIQQEREMYQDDPDSCLFFSTLANLYPGTPLATDIVGSEESISQINLTNLQENFTKFYKPVNMSLFLVGNFDVERVQDYFESKELKDSDFQEVAREKLFLQPVKLTDSMRMEVSSPKLAIGVRGKREVSEADCYRHHILLKLLFAMMFGWTSDRFQKCYESGKIDASLSLEVEITSRFHFVMLTMDTKEPVALSHQFRKAIRNFTKDLDITEEHLDIIKREMFGEFFSSMNSLEFIATQYDAFENGETIFDLPKILQEITLEDVLDAGHHLIDDGDIVDFTIFPS >NC_012468|2162534:2171288|2168661_2169759_+|WP_000266669.1|DBSCAN-SWA MWLQHLSLKTFRNYKETKIDFNPKLNVFLGRNAQGKTNMLEAIYFLALTRSHRTRTDKNLIHFDEEQLHLSGLVQKKTGSIPLEIELTQKGRVTKVNHLKQARLSDYVGHMNVVLFAPEDLQLIKGAPSIRRKFIDMELGQIKPIYLSDLTNYNHILKQRNTYLKSDQKIDETFLSVLDDQLVDYGCRVMNHRLDFIKKLESFGRKKHFELSNQIEELSISYQSSVNITDKQNLSESFKIALEKSRSRDLFKKNTGVGPHRDDISFYINGMDASFGSQGQHRSLVLSIKLAEIELMESITTESPILLLDDVMSELDNTRQLKLLETISQSIQTFITTTSLDHLQNLPENLSIFTIQDGKASVNGN >NC_012468|2162534:2171288|2169809_2171288_-|WP_000073428.1|DBSCAN-SWA MSNWDTKFLKKGFTFDDVLLIPAESHVLPNDADLTTKLADNLTLNIPIITAAMDTVTESQMAIAIARAGGLGVIHKNMSIAQQADEVRKVKRSENGVIIDPFFLTPEHTIAEADELMGRYRISGVPVVETLENRKLVGILTNRDLRFISDYNQPISNHMTSENLVTAPVGTDLATAESILQEHRIEKLPLVDEEGSLSGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEFGRLLVAGAVGVTSDTFERAEALFEAGADAIVIDTAHGHSAGVLRKIAEIRAHFPDRTLIAGNIATAEGARALYEAGVDVVKVGIGPGSICTTRVIAGVGVPQVTAIYDAAAVAREYGKTIIADGGIKYSGDIVKALAAGGNAVMLGSMFAGTDEAPGETEIFQGRKFKTYRGMGSIAAMKKGSSDRYFQGSVNEANKLVPEGIEGRVAYKGAAADIVFQMIGGIRSGMGYCGAANLKELHDNAQFIEMSGAGLKESHPHDVQITNEAPNYSM |
9 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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