Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_011527 | Coxiella burnetii CbuG_Q212, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,cas3-cas2,cas8f,cas3,cas1,cas5f,cas7f,cas6f | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. NC_011527
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
67039 : 130080
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011527|67039:130080|DBSCAN-SWA GTTAATATAGCCAGTCTTGGCATCTATACTTTATCCTTATTTGCGAACTCACTTTCTTTTTTAGAGAAAGCAAACGGGTCGCTTCAAATCGATCCGTTTGAGCGACATGTCGGTATAACATCGTTGTGCCAATATCACTATGTCCAGCATTTTCTTGGGCGACTTTAAGCGGTGCACCTGAGTCCAATGGCAATCGTGATTGACAATAATGGTGATTACTTTGATAATCACTTCATACATTTTAGTGCCAAAGAATTGTATTACACAAAATTGAAGATCCAAACTAATGAAGAAGCGTTAGCTATACTTGAAGTGCAACCTTATGTTAAAAATTTCGTCGAAAATGACATGGACAACTTATGTGAAAAGGTTACATGGCATGAAGTTAATGTAATTGCATGAGATAAACGAGCTAATGGAGCCTTTGATGAAAACAGTACCACTAGCACTATTTGACTCTATTGAAAATATCACTGCTGGAAATGATTATTCGTATCTTAAAGGTATCTATGATTTAGATGATATTAAAATCGCAACAAAATTTCTAAAATCCTACAAAGGTAGCCAAGGAACTTTTAATTCATATCGCCGTGAAATCGAGCGCCTTATCCATTGGTGTGCCTTAATCACTAATAAATCATTAAAAGCGTTAAAACGTGATGATATAGAAAATTTTATTTATTTTTGTAAAAAACCACCCAAAACCTGGATAGGGGAAACAAAGCCGCCCCGCTTTATTATTAAAGATGGTGTGCGGATTCCGAATCCAAAATGGCGGCCATTTATCGTTAAACTTTCCAAAATAGAGCGTCGAAAAGGAATGGACTTAGACAAAAATAATTTTGAGCTTTCACACGGATCCCTACGCGAATCATTTGCAATATTAAGCAGTTTTTTTAATTATTTGCTGCAAGAAGAATATGTCGATGTAAATCCAGTCGCCCTTATCAGACAAAAAAGTCAATTTATCCGAAAAACGCAAGGACAACCTAAGATAAGACGTTTATCAGAACTACAGTGGCAATATGTGATTAAATCAGCAAAAAGCTTGGCTGAACAAGACCCTGATATTTACGAGCGAACCTTATTTATTATGTCGGCTTTGTATTCTATGTATCTTCGAATTTCAGAACTTGCCGCAACTGAACGTTGGGAGCCGCGCATGAATCACTTTCATCGTGATGGTGATGGAAGTTGGTGGTTTATAACTGTTGGTAAAGGTAATAAAGAAAGACAAATCGCTGTAAGCAATGCGATGCTTAAAGCATTAAAGCGCTGGCGAAAGCATTTAGGCTTGACCTCCCTACCTTCACCCGCTGATCAGTCGCCTTTGTTGCCCAAAAATAAAGGCCGGGGTCCAATCAAAAGCACAAATTACATTAGAAATATCGTACAATATTGCTTCGATCGTGCCATTGATCAACTTGATCAAGACGGGTTTTCTGAAGAGGCAGAAGCCTTGAATGAAGCAACGGTTCATTGGTTGCGACATACGGGTATCTCTGATGATGTAAAAATCAGACCCCGTGAACACGTTCGTGATGATGCTGGGCATAGCTCTAGTGCCATTACTGATCGGTATATCGATATTGAACTACGAGAACGGCATCAATCTGCTCGAAAAAAAACTATTTCCGATGAAGATTAAATCCAATTTATACAAACGAGTGACGCTTTACCAGTAACTTATAATGGGACGCAAATTTCTATGATACGTTAGCGCCTCGTCATTACGTCCCCAGCAATACCCCAAAATTACATGTTGATTTACATTTCTGACATGACGTCCAAATTCGCTCTCTGTCATACCAGCCATATCCACGATCTTAACTCGCCCGTTCAATTGTCCTTTATAATTTTGTACGTCTTCTATATAAAAAGCCCGCTCAAGTATGTCAGGCCTACGTAACCCTTGACTTGTCCAATTATCGCCATGTACACGACCATGAGTACCCGATAGAATCACTATATCGCGTTTTGTGATGCTGGGTCTTCTTCTGAAAAACTCTATAGGCTCCCGTATTTCATATCCAAATATTTCTCTGTCAGCCCCAAAAACATGTTGATACCCGAGCGAGCTTTTCTGACTAACTTTGTGCCAATAATTGAGTCCAGCGGGGCGCATCGATTCGGGGGCCACGGTAACCCTACTCAAACTTTGAAAGTGTGGTGGTCCTCCCCTAAGAGGGTCCCCCCTAGATAGACTTCTATAATTAATTCCCTGCACTGGACTTTGTGACCTGATTTTACCGCCGCCCTTGGCTAGCCCGGAGATTAATTTTTTGCCCGCTCTAGCTGCAGTGGCCAGGCCGCTGACGGCTCCCGGTCCGCCCAATCCCAGGGAGATCCATCCCAGGGTTGCCGACGCTTGCGGATTGGCATCTTCAAGCGCGCCGCTAGCGATGCTTGCCACATCCGCCGCGACGCCGAGGGTTCCCACCACCAAAGAGATTGCCGAAGCACTCTCAATGGCTGCGCTAATTGCACCGGCAGCCGCAATGGATGTGCCGGCGGTAAAGACAGCCAAAACTAGGCCGACGACACCCAAGCCAATACCGAGCTCCGCCTGCCAACTTAAATGGCCATTTGGATCCACGCGATTGATCGGATCGCCGTCGCAATACGCATAAGGGTTAATTCCCCCCGCACCAAACGGGCTCCAGCTGTCTGGGCAGTTAAAGCGCATCAGTATCGGATTGTAGGCGCGGTAGCCATTGCCCAAATGATAGGTACCACTAACCGGGTCCAGCCGCTCCCCATTAAATCCCAGGACGGATGGCGTTTCTGTCTGTGGGGTTCGATAACCATAAGGTGTATAGATACAATCCTGCGGTGCATGGTTACCTTCTGAGACTGATAGCACACTGCCTTGCTGATTAGTGGTCGTTAGCCAGCTGGTGTTCGATGATCCCTGCTTCGTGCATTGTCCCACACAGCACCCATCCGACTTCACATAGCGGGTCTGGCTGCTGCCATCGCGACGGGCCTCGCCTACCAGATCATCCGCACGATAGTAAAGGTCATAAATCGGTTCATCCTGAACCACTTGGCTGACCAGCGTATTGAGCGCGTCATACGCATATTGACCGCCTTTTGCGCCCTCACCATTCACTTGCTGTAGCCGGCCCAACGCGTCGTAACGCAACGTGCGACCGGCTTCATCCCGAATCATCCGCCCTGCTTTGTCATATTCGAGCGTGATTTCTTTCGGATAATTGCTGTGATCGTTGTTTACCTTGAGCAGTTGAGTGGGGTCAATCGCGCTATAGATATAGGTGGCGGTGTTGCGCCCGCCGCTGAAGTCGGTTTGTGTTTTTGTCATATTACCCAGTGCATCGTAGCTGAAGGTCTGGCGATGGATGGCTTTGCCGTAAGGGTCTTGGGGTCGTGCTTCTCCATTGCAAGTATATTCGATGAGCCGGTTGCGGCTGTCATAAGCGAACACTTCTTTGCGTAAGGTTGTGCGGCCGCGCTGAGTAATTCGCTCTTTGAGCAAGTGATTTCTTTGGTAAGTTTGTTCAATGACAAGCACAGATTGGCCACTTGCACTGATTTCGCGCTTGATTTCTCGATTCAGATCATCGATCATCGTAGGTCAGCGTAGTGCTCAGTACTGCGCCCGTTTTTTTATCCGTGGCCTGCTGTTTCGTGAAGCGACGGAACGCATCATAGCCGAGTGACACCTTGATATCGTTATCTTCGATGCCAATGCGACGGCCATGTTCGTCGTAATCGTAGCGTTGCGTCACACCGAACACGTCCGTATAGGACTGTGGAGCGCCGGCCAGTGAATAGGTGTAGGCGGTAGACTTCTGGGCGGCGCCATCGGGCATGGACGTTTCGTTCTTAAGCAAACCGGACGGATAATAGGTCATCTGACGGATCATCCCCGCGGCTTGCGTTGCCGAGGTCATGGCGCCGGTCAGCGCATCATAGTCCCATGTTTGGAGAATTTCCGGCGCGCTGATTTTTTTCACTGCATTGCCCAGTTCTTTTAGATACTCGTACGAAACCGTCTCACCAGTCGGCGCAGTTACCGCCGCGGGAACAGATGATGCGTTTTCATAAGAAAATGCAGAGGTGCGCCCGCCACTGGCTGTCTCAGTGAGTCGCTCCAAACTGTCAAAGGTTTGGTTCCCCATTGAAAAATTGTTGACCGAAATCCCGGTTATCAGGGACGCCGTCGAGTGGGGAGCGTAAGACTTTTGGATAATGGTGTTTTCAGGGAGCGTGGTTTGGGTCACACGTCCAAAATAATCGTATTCGTACAGCGTTATCTGGCCCAATTCGTCATATTCATATTGAGTCACGTTGCCAAGCTCATCCGTGGAAGAGAGAAGCCGGCCACTGTAACGGGATTGCTCACGACTTATTGATGTTTTTATACCGTCACCGCCTGTAAAGTCGATTTTTTGTAAAAGATGCTCCGCTTGCGAACTAAATGCGAAGGTGGTTTGGTTTTGATATTTCTTTCCCTCCTTACTGGTAAGCACTTCCGCACGACGTTTCATTCTTCCGTGCTCAGACTGGGTAGGATCATTAATATAATATAATCAGTATTTATTGTTAAAAGTAAAACATCGTCACTGCAAAGTGTTTCTTGTTCTGCAAGACTGCATAAGATAAGGAAGAACCAGCAATACAAGGATATTGAGCATAAGCGTATGTTGTCTGTTGTACGGGTGCATAAAATTCAGAATTAGCGGGCGTGACAATTTGAGTTTTAACGAAGCGCACAAAGCCATTGGGTTCTGGCGGACAAAGTACAATACCTTTATCCGTCTCTCCCTTGCTATCGTAATAAATGTATTCTGTTTTTGTTCCGTCGGGTTCAATCTTTGTTAGCAGGTTGCCCTCTGGGTCGAAGGTGGTTGTAGTGATTTCACTGCGGCATTGATTTTTCGAGTTTTCGCGCCAAGTTTTTTTCTCTTCCTTGGGGAGTTGAAATTGTTTCGGCTGTTTATCAAATGAAAGCCCTGGTTTGGCGTAATAATCAGTTT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52 | Streptococcus_phage(22.22%) | integrase,transposase,protease | attL 60810:60826|attR 99058:99074 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
331526 : 387637
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_011527|331526:387637|DBSCAN-SWA 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54 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_3 |
1657820 : 1666719
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_011527|1657820:1666719|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_011527|1657820:1666719|1664842_1665403_-|WP_005771454.1|DBSCAN-SWA MTIAYVGVGANLDNPLKQVQIAVSNLSTLPQTACLGYSSFYRSKPLGPTDQPDYINAVAAVETTLSPQMLLKALQRLEEKQGRCRGGKRWGPRIIDLDILLYGDLALQSDELCLPHPGLFVREFVLYPLAEVAEDLILPGGESILELKAKCPDRGIERIIKNPSSLLPFPFRGKGLEKEGDTKALA >NC_011527|1657820:1666719|1663880_1664093_+|WP_005771448.1|DBSCAN-SWA MAVSPREKIMLQSTGKTKAGKPTGTFYTTYKNKRNTTDKLNIKKFDPRAWNSETSKCGMHVLFKEKKIPK >NC_011527|1657820:1666719|1657820_1658600_-|WP_012570393.1|DBSCAN-SWA MRIITLNLNGIRAAARRGFFDWLKRQKADIVCLQETKACLEITNGDQFHPKGYHCYYHDAEKSGYSGVGIYCREKPDRVTTRLGWEHADKEGRYIQADFGSLSVASLYMPSGTTGEHRQKIKFDFMDRYMKRLKNIVHSKRSFIICGDWNIVHKDIDIKNFKSNQKHSGCLPEERAWLDEVFTKVGLVDAFRVVNQKPDQYTWWSSRGRAWEKNVGWRIDYQVITSDLKNSVKSERIYKDKRFSDHAPLIIDYEREISD >NC_011527|1657820:1666719|1664366_1664846_-|WP_005771452.1|DBSCAN-SWA MKPIAIYPGTFDPLTNGHVDIIERALPLFNKIIVACAPTSRKDPHLKLEERVNLIADVLTDERVEVLPLTGLLVDFAKTHQANFILRGLRAVSDFDYEFQLAHMNYQLSPEIETIFLPAREGYSYVSGTMVREIVTLGGDVSPFVPPLVARHLQKRREK >NC_011527|1657820:1666719|1658627_1659275_+|WP_010957485.1|DBSCAN-SWA MCNNDFMNQATEIAKLLLNIKAVTLNLHEPYRYTSGILSPIYCDNRLIISYPEKRKMIIEAFLQLIEKNHLSFDIVAGTATAGIPHAAWIADRLDLPMIYVRAKAKTHGKQNQIEGRIRKGQRALIVEDLISTGKSALAAGLALREKGVTVTDCIAIFSYQLPQAQQNFSDANINCHALSHFDTLIEMAVDEGYIDEIEKQKALAWNKDPEHWQP >NC_011527|1657820:1666719|1663630_1663870_+|WP_005771445.1|DBSCAN-SWA MAKVCQVTGKRPQSGNNVSHANKKTNRRFLPNLKKRRFWLPDEKRFITLTVSTHGMRIIDKLGINAVLKKIREREKESK >NC_011527|1657820:1666719|1662129_1662615_-|WP_010957483.1|DBSCAN-SWA MCLTGGRSAMTHSVQLKILDKRLGSEFPLPAYATTGSAGLDLRACLDEPLKIEPDETCLISTGLAIYLGHSNVAATILPRSGLGHKHGIVLGNLVGLIDSDYQGPLMVSCWNRGKEPYTINPGDRIAQLVVLPILKAQFAVVEEFELTERGAGGFGSSGQN >NC_011527|1657820:1666719|1664106_1664352_-|WP_005771450.1|DBSCAN-SWA MALKITEECINCDVCEPECPNDAISMGELIYEINSNRCTECVGHFDEPQCRQVCPVDCIPLDFHESKEDLMKKYQRLQDEK >NC_011527|1657820:1666719|1660736_1662152_-|WP_005771434.1|DBSCAN-SWA MAAQGKINQWNVPEIVPATLFRAYDIRGPVTSEALTPGLAYAVGLSIGSEAREQGQKAIVVGRDGRLSGPKLTAALIQGLCETGLAVLNVGLVPTPLVYFATNRLETNSGVMVTASHNPGHHNGFKIVLNGKTLRSEEIATIRTRILERRFVKGHGAVVDVDIIEDYESYITKHIQLDRPLKVVVDCGNGIAGKVAPALYRKLGCEVVELFCEVDGHFPNHHPDPTIPANLTDLIHKVKETQADLGLAFDGDADRLGIVTDKGEIIWPDRQMMLFSMDVLSRLPGSDIVFDVKCSRSLAEIIKKYGGNPVMWRTGHSILKAKLFEIGAPLAGEMSGHIFFKDEWFGFDDGIYVGARLLRIISQTNQRTSEIFAELPDSVNTPELKLPMTEEKKQPFMQALLKKADFGNAKLITIDGLRVEFEDGWGLIRPSNTSPYLILRFEADTEEKLKRIQEIFRTQLRMIDNALELPF >NC_011527|1657820:1666719|1665402_1666719_-|WP_012570396.1|DBSCAN-SWA MFKPSQWRKISYLLRFERKKDRPRVIKRKNHSISRSDISPNALRVLYRLSKSGYEAYLVGGGVRDMLLSYHPKDFDIATNARPHEIRKLFKNSRLIGRRFRLVHVYFPNEIIEVSTFRANAEELLKEEPLSEMQKTGATMLSEDNTYGTIEEDAWRRDFTVNALYYNITDFSVIDFTGGMRDLHQRLIRMIGDPTQRYHEDPVRLLRAIRLAAKLDFKIHPDTEEPLKKLHNLLRHVPSARLFTEVLKIFFEGHAVRSYQLLKQTHYMRTLFPESATILEKTRQPLYENLIKLALKATDERFHNQQSLNPGFLFAIFLWPPVQELMQQHFKKHKRLFPALYHGINTALQRQVTILPLPRRLTAMMRSVWMLQYHLERRRHTRVYRIAQQRFFRAAFDFLELRERAGEPLTEIVYWWRAFRDGTSKQREQLINELARKT |
10 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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