Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010723 | Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43, complete genome | 7 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,WYL,DinG | 1 | 3 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_010723_1 | 376278-376375 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010723_1
|
1 spacers
spacers of NC_010723_1
>1.1|376301|52|NC_010723|CRISPRCasFinder GGCGACAATTGTTGACATGATAAGACTAATGTAAGCCTTTTATTTTTAAATT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010723_1
The CRISPR arrays of NC_010723_1 >merge|NC_010723|1|376278-376375|CRISPRCasFinder CAATTGTTAATATTATAACAATTGGCGACAATTGTTGACATGATAAGACTAATGTAAGCCTTTTATTTTTAAATTCAATTGTTAATATTATAACAATT >NC_010723|1|1|376278-376375|CRISPRCasFinder CAATTGTTAATATTATAACAATT GGCGACAATTGTTGACATGATAAGACTAATGTAAGCCTTTTATTTTTAAATT CAATTGTTAATATTATAACAATT
>NC_010723.1|WP_003370953.1|375523_376156_+|redox-sensing-transcriptional-repressor-Rex MDKNKNISMAVIKRLPKYHRYLNELMKNDVDRISSKELGEKIGFTASQIRQDLNCFGDFGQQGYGYNVKELYTQINSILGLDKEYNAVLIGAGNIGQAIANYSRFDKLGIMITAIFDANPKLIGIKIRDIEIRDIDELGSFLKSDSVDIGVICVPKKSAQKVSDELVNGGIRGIWNFAPIDLVVPEDVKVENVHLSESVSTLIYQLHQQR >NC_010723.1|WP_012450485.1|372829_375091_+|cadmium-translocating-P-type-ATPase MENEIKLSLKGLDCANCANKIERKVNDMEDVYEADMNFSLGKLTVKLHENKDRDKVFNLIKDIVNKLEPDVIVINEKDNISYNLNTNETNHNNKCNKTCCNHDSCSSHNHEKHHVHSHDNQDNFIETEECEPNSKIKLFDKKKFFYENQIFIIGLILYIIAVLFKENSYLNISIFVLSYILIGGDVLKTAFNNILIGEIFDENFLMTIATIGALAIGEYPEAVGVMMFYKIGELFQGYAVNKSRKSITSLMNIRPEYANVITEYGEKRVSPEEVNIDELIVIKPGERIPLDGIVVEGKGSVDTSALTGESLPREINIDDELLSGSINLSSVIKLKVTKIFSESTVSKILNLVENSSSKKAKTEKFITKFSRLYTPIVVFLAIAVAIIPPIIISGEVFSDWIYRALIFLVISCPCALVISVPLGLFAGIGGASKKGILIKGGNYIEVLKNVDTIVFDKTGTLTKGVFKVTEINSIDMKKEDFLRIVALGESFSTHPIAQSIVKEFNGILEKRYVENYQELSGHGIKAIIEGKNVILGNYKLLEDNNINIEKVEKPGTVVYVVINNKYSGNIVIADEIKEDSIEAINKLKNIGIKKTVMLTGDNKIVANSIGKSIGVDEVKSELLPNDKVLEIEKLISSSTSKGKVMFVGDGINDAPVLARADIGIAMGGIGSDAAIEAADVVLMKDNPTALVDAIKIAKKTNAILWQNIIFALGVKVFVLVLGALGIANMWEAVFADVGVTLIAILNSMRSLKN >NC_010723.1|WP_012449787.1|372446_372812_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNNETNFVESCKCNIIHEDTVIKVKDSLPQEETLYDLAELFKVFGDSTRIKIICALFESELCVCDMAALLGMTQSAISHQLRTLKSARLVKFRRQGKVIYYSLDDEHIKHIFDEGFKHITE >NC_010723.1|WP_012449470.1|371740_372322_+|zinc-dependent-phospholipase-C-family-protein MINTHKLIAENILNNTNSKSIYLINDYRFIWGNIKPDCVLKYKMIKHYFIESIDMIIKKIEKLCSLSLQDVYYKMSVNKFSEELGVICHFICDYFCAPHYYRWEFKNTSQVKNHVMYEKDLAKIAKEFNSNGIITSNIDANNIKEFIYDLQNQYEGSMDFKNDLTYAYYACDSIVNMVLNKVFLNECSLSKVV >NC_010723.1|WP_012451618.1|370399_371467_+|NTP-transferase-domain-containing-protein MIYGLILAGGKGSRLYPLSRNSQPKQFLKIINEKSFLVNTVERIKPLIDRENIYVVTNKDYEDKIKEEVQDIKKENIFIEPANKETATCIGLSAVKLLKQDADAVMVVLPSDHYIQGEKEYLDTLSQAVEMANRRRCIVTLGIEPTRPETGYGYIEMGDRSTGNISTYKIARFTEKPNLEVAKDFLLKGTYLWNSGMFVFRADVILREIEKYIPKMHKSLMEIYKYIGEENEEDVVKEQYEIIDGISIDFGVMQKTRKAFVIKCDFNWDDIGSFNALSRFLGKYRSNSISKNVYMEDCESCSVFGEKNLIIGFGIKDLVIVDAGDVILVMDKNKDQEIKHLLNKLSDEDKYNEFL >NC_010723.1|WP_012451188.1|368970_370185_+|zinc-chelation-protein-SecC MVKKECSNKDTNNEFIENKETDESAELYDNMMDDLFQKYENKMNKMFVKGVYSFEVSEQLKSLSKEAVYNIAKNLGMSKISTLNKDALIEKVLNEYTEIIANQFIYFEEERFNILKSYLNNDGVKIFDDIDEYELSRTAYFMQQGIIFPSTKDEKAVFLMPKIVQDIITNKDTTEYIDILKRNKEVLDLYRGLNKAYGIVNNKDVTSLLQRYDIENSDEFSINEIIKEAQYYYREYREEKGFFINNNIENWSDLLKDIEKDNKDLEYYNINKNELLDMIGSEWIYKSKFGKSFLKEFTNIFEIKKDMVYQIMDDLSFDIQDNGMDDTINSLLELINANNLELRNHVKGVVTKFLSNIRLWKYRGATINEISGNITEVKPKITIGRNDPCVCGSGKKYKKCCGKN >NC_010723.1|WP_012450139.1|367959_368802_+|patatin-family-protein MTGLVLEGGAFRGLFTAGVLDALIDINLEIKYIVGVSAGITNGYSFVSKQRGRNLEVMERFIDHKRYVGYNNLLKCRSIMDMDFVFDEIPNEHCPFDYETFDKFDGKVLAGSVNVNTGEVEYFDKEYLDKKNTILRATCSIPLLFKFININNQLYADGGLVDAIPIKKSISDGNNKNIIVLTRNEGYRKHESKGNKFAYKLYKKKYPKLACVLRDRHIEYNSQIDYCKELESKNEAIVIRPTIEMNVGRFEKNKDKLKEIYNNGYKETMKIKDRLIKFID >NC_010723.1|WP_012449804.1|364418_365822_+|FAD-binding-protein MTYKNVEVKDYEYILSIAENDKERVFFGDEINEDYSHDELGGIKKMPDIVVHAISTEEVSKIMKYAYKNSIPVTPRGSGTGLVGAAVPIKGGIVIDLCRMNKILEIDEENLTLTLEPGVLLMEIGKYVEEFDLFYPPDPGEKSATIGGNISTNAGGMRAVKYGVTRDYVRGLEVVMPNGEVVQLGGKVVKNSSGYSLKDLLIGSEGTLGIVTKAILKLLPLPKKSLSLLIPFPTLEKAIDTVPKIIKSKTIPTAIEFMQREAILAAEEFLGKSFPDKSSDAYLLLTFDGNSTEEIEKAYENVANICLEAGAIDVFISDTEERQESIWSARGCFLEAIKALTTEMDEVDVVVPRNKIGEFVKFTHELESKFNIRIKSFGHAGDGNLHIYILKDQLEENVWHEKLELVMKDMYDKSKELKGQVSGEHGIGFAKKPYLKESLSNDVLSVMEGIKLAFDPKNILNPGKIFK >NC_010723.1|WP_012451489.1|363223_364414_+|electron-transfer-flavoprotein-subunit-alpha MAKLVVNQEKITNKKELIKICPFGALEINDGKVEINGACKMCKLCVKKGPKGAIEYIEEEVKSIDKDLWKGISVYVDHVNGKIHPVTYELIGKARELAAKINHPVYCVFIGHKVSEEAKELLHYGVNKVFVYDDEELKDFRIEPYAAAFEDFIKNVKPSSILVGATTIGRSLAPRMAARFRTGLTADCTILDIKEDTDLVQIRPAFGGNIMAQIVTPNSRPQLATVRYKVMTAPERTDDVNGEIIKCDIKKDKLKSGINVLEIKEKNTEVGISDAEVIVAAGRGIKSEKDLAMIKEFAELLGAEFACTRPLIESGWVDAKRQIGLSGRTVRPRLIITCGISGAVQFSAGMNNSEHIFAINNDDKAPIFKVAHYGVVGNIYEIIPQLIEKIKMSKEA >NC_010723.1|WP_012449992.1|362332_363121_+|electron-transfer-flavoprotein-subunit-beta/FixA-family-protein MNILVCIKQVPGTSKVEVDPVTGVLKRDGIDSKMNPYDLYALETALRIKENEGGNVKVLSMGPNQALSVIREAYSMGADEGALLSDRKFGGADVLATSYTISQGVRKMGDFELIICGKQTTDGDTAQVGPEMAEYLDIPHVANVERIIEIKEKSIIVEMDMPETLEVVEISYPCLITVDKGIFEPRLPSYRKKIATKDKEISIMSLNDFEDRNEKKYGLNGSPTQVERIFPPEVNDDREMWIGDSSELAEKIEHKLKEFKFI >NC_010723.1|WP_003372943.1|376504_377287_+|short-chain-enoyl-CoA-hydratase MELKNVILEKEGHLAIVTINRPKALNALNSETLTDLDTVLENLENDSNIYAVILTGSGEKSFVAGADISEMKDLNEKQGREFGELGNKVFLRLENLDKPVIAAISGFALGGGCELSMACDIRIASEKAKFGQPEAGLGITPGFGGTQRLARIVGLGKAKEMIYTCDIIKAEEAYRIGLVNKVVSLESLMDEAKAMANKIIANAPIAVKLCKDAINRGMQVDIDKAVLIEAEDFGKCFSSEDQTEGMTAFLERREKNFQNK >NC_010723.1|WP_003371045.1|377367_378507_+|acyl-CoA-dehydrogenase MNFQLTREQELVQQMVREFAENEVKPIAAEVDETERFPMENVEKMGKIGMMGIPFAKEFGGAGGDVLSYIMTVEELSKVCATTGVIVSAHTSLCASVINEHGTPDQKAKYLPELCQGKKIGAFGLTEPGAGTDAAGQQTTAVLDGDHYVLNGSKIFITNGGVAETFIIFAMTDKSQGTKGISAFIVEKSFPGFSIGKLEDKMGIRGSSTTELVMEDCIVPKENLIGKEGKGFGIAMKTLDGGRIGIAAQALGIAEGAFEEAVNYMKERKQFRRPLSAQQGLQWYIAEMDVKIEAARHLVYKAACKKQNGQPYSVDAARAKLFAAEVAMDVTTKAVQIFGGYGYTKDYPVERMMRDAKITEIYEGTSEVQKMVIAGSILR >NC_010723.1|WP_012451925.1|378524_379307_+|electron-transfer-flavoprotein-subunit-beta/FixA-family-protein MNIVVCVKQVPDTTAVKIDPKTGTLIRDGVPSIMNPEDKHALEGALQLKETLGAKVTVISMGLPMAKATLREALCMGADEAILLTDRALGGADTLATSKALAGVIAKLDYDLVFAGRQAIDGDTAQVGPEIAEHLNIPQVTYVQGVEAKGEGTLLVNRALEDGYEKIEIKTPCLLTAIEELNEARYMNVANIFSTNDNEIKVMSADDIDVDKAELGLKGSPTKVKKSMTKEVKGAGEVVNKPAKEAVTYVLGKLQEKHYI >NC_010723.1|WP_003373302.1|379329_380337_+|electron-transfer-flavoprotein-subunit-alpha/FixB-family-protein MNIADYRGVWVFAEQREGELQKVSLELLGEGRKIADKLGVELTALLLGNNIENLSKTLAEHGADKVLVADDKNLEHYTTDAYTKVICDLANERKPGILFIGATFIGRDLGPRVAARLSTGLTADCTSLDVEVEDGALLATRPAFGGNLMATIACPEHRPQMATVRPGVFGKVNTDGSNCTVEKVEVKLADSDVRTKVVEIIKAHKDVVDISEAKILVAGGRGMGSKENFTLLQELAEVLDGTVAGSRAAVDNGWLERDYQVGQTGKTVRPSIYIACGISGAIQHVAGMQESDMIIAINKDETAPIMQVADYAIVGDVKKVLPELIAQAKAVKSAE >NC_010723.1|WP_003369662.1|380440_381289_+|3-hydroxybutyryl-CoA-dehydrogenase MKKVFVLGAGTMGAGIVQAFAQHGYEVIVRDIKDEFVERGIAGINKGLTKQVAKGRMTEEVKEEILSRISGTTDMKLAADCDLVVEAAIENMKIKREIFAELDEICKPETILASNTSSLSITEVASATKRADKVIGMHFFNPAPVMKLVEIIRGMATSQETFDAIKELTVAIEKNPVEVAEAPGFVVNRILIPMINEGIGILAEGIASVEDIDTAMKYGANHPMGPLALGDLIGLDVCLAIMDVLYNETGDTKYRAHSLLRKYVRAGWLGRKSGKGFYDYSR >NC_010723.1|WP_012450991.1|381448_381883_+|hypothetical-protein MLKETAIKYWDDKYDLNCAECLIYASNEEYDLNLSKDALKTMAAFGGGMAIGDVCGVISGAIAVIGIMFTDISGHKSPIVKKMTTEFINKFKNKLGSNNCIELRKEYRKSKKEGTCIVMVETAADILESIVNRDNNFKLDSNKY >NC_010723.1|WP_012451791.1|381972_382899_+|DNA-3-methyladenine-glycosylase-2-family-protein MDYKSIETSENGVIIRGVKNFNLKHIFECGQIFRFEEIEDDNFIVIAFGKLIELVQKKDDVFIYNTTEKEFKEIWLNYFDLDRDYSIIKEELSKDELLKQSIEFGSGVRVLNQDPFEMLISFIISARNSIPSIRKTVNKISEQWGNKIEYKGKVYYAFPTIEQIKDAKLDEIKETGASFRSKYLIDTIENVHNSIGNKSNLSENEKELLNKYDLKYIKGLSDDECHAALQEFKGVGAKVADCIMLFSMGKTSAFPVDVWVKRAMMHFYNAEEGSLNKIRVFARNKFGKLSGFAQQYLFYYARENNIKV >NC_010723.1|WP_012449595.1|383060_384545_+|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MFKFENQLIKLKHDVLSNIVRLAKEDNINKENLDKIPYEMLPGNEPQYRESVVHEREVLLERLKLASGFIPNGKGTDELVNIEDEKQILYVIKNACDMCPTKKFEVTDACRNCIAHKCQSVCNFGAITYVDGKAYIDPDKCKECGMCKKACPYDAIAEDMRPCKRSCPTGALDINSDKRAMIKQEKCVNCGACMAACPFGALEDRSLLVKIVKELTNNSNIYAVVAPAITGQLGPKTGYGQVKNAIKKLGFTDMVEAACGADAVTVHESNEFVERMENGDPYMTNSCCPGFLSYIEKMMPDQVDRISGTVSPMVAAGRFIKANDKDAKVVFIGPCTAKKSEILRDSIKDAVDYVLTFEELLALFEGFNIDPANFYDIVVDEASIFGRGFGVGGGLTAAIENYIKDKGIDCEFKPVKVSGGAEIKKTMMMAKMGRLPGNFIEGMMCEGGCINGSGKILSPMKAKSSFNKVNQQATMKNVLENSKIDDYKDIDLER >NC_010723.1|WP_012450317.1|384743_385439_+|response-regulator-transcription-factor MKILLVDDEESILNLIKMNLIFENYEVITAECGIDAINLFKSESPDLIVLDLMLPDKDGFEVIHEFQSINSEVPIIILSARDQLNNKLLGLQLGADDYITKPFDSRELILRIRAISRRINKAKAIGKNEIKNKTNDIIEKGFIKIIVPERRVFIDDKEVIFTHIEFEIILLMVQNPFKVFTREELLDKIWGYSFVGNTRAVDIHIKRIRQKLIGNEDVIKTIYGVGYRLEV >NC_010723.1|WP_012450450.1|385442_386858_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MNWGIKGKIVIMNIFILIIAILSIYVVTIYTLYSRVINNSIDMLRKESYTSQSFIMKYLETEDDFHVENVLNEMSPFIATYLSNNCKFRVQIYNNSSLIGDSDNYPNISKDDDVVTALKGNKSYIIRRIEESSYILFSSPIYYSDGTIGCIRYVYDLNNENTIITNTILSMVLFAIVAIIFSSMMSNSFSNRIVRPIVSLKNIARKVSFGDFSKKISINSKDEIEDLSNSFNIMSNNIEIMIENLKDEKETQKRFLDNVTHEFKTPLAAILGYSDLLLRVKEKKDIEQCVKYIVQSSNRLLKLVEQLLDLSRLNKNELEVKNENVDIKSIIETAAMMLNPRMNKFGIKLNMNLISKSVYADKEKTEQVILNLLDNAIKYSECTEIDIYMENNEDYEIIYIIDNGQGIPKEDLKNVFENFYTAHKALQKKYGGSGLGLAICKEFMEKQSGKIEISSLNGTTVKLSFKHAISN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010723_2 | 1666820-1667108 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of NC_010723_2
|
4 spacers
spacers of NC_010723_2
>2.1|1666850|34|NC_010723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATCACATACGTTAAATATATTTTTAACTACCT >2.2|1666914|35|NC_010723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTAGTTCTAAATGTTTCGCTTGTTTTGTAGAA >2.3|1666979|35|NC_010723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTAATGAGATTCCAAGAGTTAACGATACATCTAA >2.4|1667044|35|NC_010723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTATTTGTATGCCTTTATTTGGGATTGTAGATT |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010723_2
The CRISPR arrays of NC_010723_2 >merge|NC_010723|2|1666820-1667108|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAATTCATCACATACGTTAAATATATTTTTAACTACCTGATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAATACTTTAGTTCTAAATGTTTCGCTTGTTTTGTAGAAGATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAATGCTAATGAGATTCCAAGAGTTAACGATACATCTAAGATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAATACTTATTTGTATGCCTTTATTTGGGATTGTAGATTGATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT >NC_010723|2|1|1666820-1667108|PILER-CR GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT TCATCACATACGTTAAATATATTTTTAACTACCT GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT ACTTTAGTTCTAAATGTTTCGCTTGTTTTGTAGAA GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT GCTAATGAGATTCCAAGAGTTAACGATACATCTAA GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT ACTTATTTGTATGCCTTTATTTGGGATTGTAGATT GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT >NC_010723|2|2|1666820-1667108|CRISPRCasFinder GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT TCATCACATACGTTAAATATATTTTTAACTACCT GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT ACTTTAGTTCTAAATGTTTCGCTTGTTTTGTAGAA GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT GCTAATGAGATTCCAAGAGTTAACGATACATCTAA GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT ACTTATTTGTATGCCTTTATTTGGGATTGTAGATT GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT >NC_010723|2|1|1666820-1667108|CRT GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT TCATCACATACGTTAAATATATTTTTAACTACCT GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT ACTTTAGTTCTAAATGTTTCGCTTGTTTTGTAGAA GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT GCTAATGAGATTCCAAGAGTTAACGATACATCTAA GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT ACTTATTTGTATGCCTTTATTTGGGATTGTAGATT GATTAACCTTAACATGGGATGTATTTAAAT
>NC_010723.1|WP_012451163.1|1665132_1665897_+|cell-wall-binding-protein MKKIKKVLVGILGIALSFSFMPKEANASWIKDNNGWWYSQQNYVIGWKQVNNIWYYFDNNGYMKTGWIHDNGRWYYTDLNGAMQTGIVEVNGKVYYLDKNGAMATGKVEINKQTYTFAMSGESIGNKIPQATKAFLSNGVEINPTKVNNTYVTSGKLVEIKLEGNPTTGYNWDYNINTNEVIKEESKDYKSDAAGLNIEGAGGIYTWKFLGIKEGTTKVVFKYSRPWENEVLETKTYIFTVDKDLNIIVEECNI >NC_010723.1|WP_012451653.1|1663041_1664253_+|MFS-transporter MKNISFKLNTIRSFSMNLLFNSFGNSVVGTIYVLFLSQVKGFSDKDVSLMVGLIPIITIPSYILWGIIIDKTKKVVLTNKMVIIANIVTLILLIYVDNIYAFFIINLIRTVLLQPGGMVNDEYLLNLVKDNTGSYGSIRTFGTVGYGLGGLVCLLLMDYIEISGLLIIAIMSLASTLLFISKMPEINIDKSLKKGYHKTKFKIEQLDLLKNMKYMRLMIIYVLMNGTLASASSYAIPMIMIKLDAPQNIIGVMPFIMIVFELILLLQNKRLNFPEKRNKYLLIGLILLTIRWITMGVTESYVIIILISIIHGAVAGILLPIQNDMVEKFVPQNQQSTAIMLQTLLSSTIVPSILNIILGFLLEPWGIKSFGIVYLICNVITLFMYIINLLFNRYEEKRVVFDK >NC_010723.1|WP_012451525.1|1662295_1662937_+|ROK-family-protein MKYYIGIDIGGTNLRAAILDEECNLVDKLKISNEVEEGPEYNLDKLILEIKERWSDKEIISVGVGCPGPLDIRSGTILVTPNLRTWEYFKLKEYLENKFDLPVFVNNDANVAGYSEAMVGAGKGAEKGNMELQKMLSEWVINVSKAIANIIVTVDPEVIVLGGSVIINNPSYLNKIKEETQKRVFDGIKINIKLAEIGDDTGLIGAGLLGKLK >NC_010723.1|WP_012449553.1|1661349_1662285_+|mannose-6-phosphate-isomerase MYPIKFKNIYYEKIWGGRDLAQFRDNLPLGDIGESWDVACHSNSMSIVENGELKGKRFDELIKEYGKDLLGESFENKDFPLLVKLINSREKLSVQVHPNDEYANRVENSLGKTEAWYVVDAKPGACLIVGTKDCNKAVFEKAIKEGKTEDYLNKIQVKKGDCFLINSGLVHAICEGVIIAEIQQNSDITYRIYDYGRPREIHVDKSLDVIDFGLKAMNFSENKLDSYDGYKKGVLCSIEYFTMEKYVVNGEVEESSDINKFFIFTCVDGNGFIKSLHGHDIEVLKGDSILIPAKLGKYVIEGNLTLLKSYI >NC_010723.1|WP_012449875.1|1659570_1661172_+|alpha-glucosidase MHKKWWKESVFYEIYMPSFKDGNNDGIGDFKGITSKLEYLSDLGIRGIWLTPFYPSPKVDNGYDISDYYNIDKDYGTLEDFNEFLSKAHSLGIKVIVDIVLNHTSSEHPWFKESRKSKDNEKRDFYIWKKEKPNNWESFFGGEAWEYDELTKEYYYHAFAKEQVDLNWSNPKVYEAMKDVLKYWIDLGVDGFRFDVINFLTIKNDLAQDNPYDEKGEQIHKYDKDQEGIIEIIKTLVKDIREIKEDVFLVGEVGSEDLNELKGYSGKDLLDVVFNFNLGSINEFSAEKIYKEIKNMNDNYDSYQIPTIFFNSHDMGRSISRFNPDGNKNGIEKAMAALLLTSYGVPFMYFGEEIGMKDLVCLDINKMNDIQGVTKYNIEISNGKTQEEALISANKSSRDKSRSPMQWNNSKFYGFSNTMPWINIEDKNDNELVEKQIKEEGSLINLYKDLIKIRYKNDTLLYGKYANLSFDDGVLIMERELNNETIRNVINFGDNEYIENNTEEIIYSNIKVQEKRTLGKFDFIIQRYKTTTN >NC_010723.1|WP_012451714.1|1658638_1659556_+|DUF1861-family-protein MKDMKTCEILLAEYLKSESKIYGVEKINFINVGENDVYNISAPFVDNDKTIIAGRVEARDSEHSTVYFFEKNHEVWSPIDSYPTFSLQDPFFTKINNELIVGGVEIFPHPEIEGTLKWRTIFYKGKDVASLQRFFVGPDGMKDLRLVQLLDKRIGILTRPQGEKGGRGRIGFSIINTLEELNIKVIEDSPLLDGLFVDEEWGGANEARPLNETTLGILGHVACFDKDGNRHYYPMTFELNINTLEVKNQKLIAVRKDFKPGQAKRPDLEDVVFSGGLEIKEDKATLYAGISDAEAQFIIIDNPFK >NC_010723.1|WP_012450319.1|1657563_1658625_+|LacI-family-transcriptional-regulator MGKVTMKDIAAKLNISINAVSLALNGKPGVSEETKKLVLDVAEKIGYLDRSPKFIQSFASKNICALIKQSHFEDSTFYSKILMSIVEEARKKGYDVITCIVNEDEQNIPSCIESKKVCGIIIISAIDDDYLIKLKEFELPVVLVDHASLLENTDSILTNNKLGSFKITKLLLDKGYTKIGFFGDLEYSLSIKERFFGYQEAIKKFIKFYNKDGITDFINNYSILSDLESYIINQDSEGIQKKISQMDNIPEAFVCSNDNAAIMLITSLKELGYEIPKDISVVGFDDIILSSLVMPKVTTVRVQKELMGKNAVNRLLWRIDHKDAPNEDIVMGVDIVERDSVGRKNIMENEQKN >NC_010723.1|WP_012449880.1|1656406_1657495_+|glycosidase MNNKLNVVRSAKNPLIKPSDVKPSREDFKVDGVFNCGVCKYKDEYILLCRVAESVKVENEDEVKIPVVANENGKDVIKIISFNKKIDTEFDYSDSRSLWKLEKKGTRKIAYLTSLSHIRIARSKDGENFEIDDNAFIKPIASEEEWGIEDPRITQIDNKYYINYTSVTRNGAATSLVSTEDFKSYERHGIIFAPENKDVTIFPEKVNGKYLTFNRPVPCAIGAPDMWLAESPDLIHWGKQKHFYGGSDEESWDSGRVGGGAVPFLTEKGWLKIYHAADKEDRYCLGAFLLDKDDPMKILAKTNDPILEPEAVYEKDGFFGNVVFTCGCLFEDGIVKIYYGAADDKICRADIKIEDIFALMDK >NC_010723.1|WP_003373473.1|1655565_1656393_+|carbohydrate-ABC-transporter-permease MKTKTKLKGIFVIVATMIILGISLFPYYYMIIQSFTPWDQIDKVMMPDSFTLKSYSYLFGGSGGATAGMWIKSLINSFIVSVPTAIISVVIGLLVGYSVSKMNKFKGEKFIMNTLLFQMFFPVIILLVPRYIISKPLTNTYLGMILPLSVSVWGIFMYINYFKSLPNEVFEAARIDGASELKILCSIGFPVAKSVTTIVFLSTFMTRWSELMWDMLISPKIDMQTLNVLISTQFKPMGNLPGPMYGASVILTIPIIIMFLCFSKHFKEGINFMLK >NC_010723.1|WP_012422640.1|1654642_1655539_+|sugar-ABC-transporter-permease MKKKIDALKNSDGFLGWIFNVPYLAYSVVFFLIPLIWAFWLSTTDWNLMSNNKNFIGMDNFISLVNDPRVRAAFMNSFKYLVPIVLLTFAAAMIIALLVHKLPEKLKGITSVLFFIPYLTSGVAISVVVRYFFSYNSALNMFLREKGITIDWFRDPKWAFVIIIGIIVWKMSGYYALFILSALESISDDIHDACKIDGVKGIKKFIKVTLPMIIPTLTTVVVLTAGLAFGIFTEPYLLTGGGPNLATTTWQLEIYNTSFTNFQSGYGAAIAIASAVHIFITIKIITFTMGKVNKKYGM >NC_010723.1|WP_012449879.1|1667279_1667687_+|SMI1/KNR4-family-protein MSKLTKYIEDLRKKYGDAIVTKESHYDDMMLLKVPEPLREFYREYESLEMPFGIIDSIEISIRSSEAEPFKSEGWFSFGADRYFSFWLCAYKEDNYGNSIISWDHDIDDEIEAMDNNIIDFLNDMKEEYEEYRKE >NC_010723.1|WP_012450589.1|1667965_1668928_+|WYL-domain-containing-protein MPKNDNMLAILWMLNSGTKITAKQISERLEINIRSVYRYMDALCVSGVPIISESGHNGGYSLLNNFIRTPLFFDLEEKKSLLHAAIFAMEAGYPFMEALNSATSKLKMFSNQEQEKVLNRHLVGFEVVSRICDRAVKLILREIEQAVANECSIEIEYCTGYEGHPKHRVVDPYGMLYWNNKWYAIAFCHLRNEIRSFRVDRIVNIISTKNSFKRPEAFSAREFFTKNLLSNVESKVGLCTLVIEGKSEALNDLCAHWFLGYHLIERTECRANFLMDEDSIHTYVPHILLQYGKSIKVLEPNSFKDAMAAILRELMAHYLN >NC_010723.1|WP_012450888.1|1669028_1669655_+|glutamine-amidotransferase MKNTVYLYVFDTMADWEIGYLSTEINSGRYYKKGLMPLKIVTVGITKTPITTMGGLKILPEIELKECSVKDTAALILPGGNTWTEAIHAPIIRMAEKYLEKGIVVGAICGATIGLAMGGVLNKRAHTSNDLGYLKMVCPSYDGEKYYKQECVVTDGSLITASGIAPLEFAFHILKILDVFLPQTLDSWYNLYKTQESKYFFELMNSIQ >NC_010723.1|WP_144311747.1|1669741_1670446_+|hypothetical-protein MHVEVQSYSSDEAVFGERMFRYFYRIWDKFRYKYKDKSEIVAAAIYTYKGERGKDKKYVYKLPELEKEILTYNFKTIDVEKLSLENISEDNPLKLVFKMAKRLLETKQKDEDIYEAKINLAEELVNYDKVKNNEQIKALVDFLEYLFLIQNSEIEKKYDDYKKKKGGALKMTVDEIRRKHYTQKGKEEGREEGEKIKALEIAKNLLDILDNKTIAIKTGLTEEEIDALRKKEVN >NC_010723.1|WP_012449473.1|1671138_1671591_+|ASCH-domain-containing-protein MTEMQMWNEYIKINTNAKEYQSWSFGGNTPKMPNLLAELVLKGIKTATASAYPCYISENAPLPPVGGYNLILNTKGEAICIIETTKVYTIPFNQVKEEHAYKEGEFDRTLISWRKCHSKFFSMELKEIGQEFTEDMLVVCEEFKVVYPKI >NC_010723.1|WP_012450188.1|1671937_1673173_-|ATP-grasp-domain-containing-protein MLNKRILFIEPSFYGVNLVKAAKELYCEVVVIVSSDQNPIIYGYEGLYDDLLVCDIKSIDSIYKTIMKSKYYKNFDALIPGYDYVTAATAKVSELLDIKGTSYQATLTARNKDMARDIFLKNNVPSAKYAVITNYTDALKASNLIGYPVVLKPTNAAGSQNVSYIKDEDSLLKAFNKISKFKTSYLGFSVRQEYLIEEYLIGPEFSVELFLNEGSIEFAEITEKHTSDLPYFVERLHIFPSSICQEVRDNIIDVAKKAVFFIGIQNGPTHVEIKYTNEGPKIIEVNGRPGGDNITSDLIINSYGINIYKETIKMYLSEPLDMEKKNDIASAIGYILSEKKGKVKTITGLENLPNDKNVTRYQIDVKENYEVNISRSSEERLGYIIITAETSKEAKNKIEKLLKEIKITYFE >NC_010723.1|WP_012451202.1|1673162_1674383_-|MFS-transporter MISILTNKNFRNFFVSDIISGFGVGLIMIAENWYVFTQTNSTKYVGFLLAFTVIASFIVSPIAGICADIFNRKNVISITYVVRISFLLVIALVFLMHGFDIRLMYLLSIINGIGWTFYMSTSRSFIQELLPKNLLIKGNSLLEICLQSGMLFSGAIFGIFFEYFGFVNILFINIIVFLISNFIVSRIQYNSIISTIDNEKFFKSFIAGLSYLRKRKVIFVFGIITIIPLAVTMIYNVVLPAYVNEISKNSSIVFGISDMFYGIGGLVSGFGVALIIKKMRNNQIIFLFFIIAISDLLSLYLNTNVFVLYFCSLLLGVSNSTLKIVMNTVLMENVDKQFMGRATAVWTAISLLIQAVGTSTMGIIIDNFGAKYGFLCMALLMFIGVISFVFIYSMINLIKKENSNVK >NC_010723.1|WP_012451875.1|1674508_1675543_-|hypothetical-protein MYETTGHYNKYSKDMYPSFYAYDEDYVMRSVTCPNHYAIFLQQERSYKELPLRITEMSTLIRKDRSSELSGLYRTNTFTLNDAHIFCSQDNIELEFLKIIDFIKCVNDKFGISSHVRYRLSFSDFSNDKYIKNESLWKKSENILESILNKSDLDFFISKDKACFYGPKLDVLIENYNGKEYILTTVQLDFILPGKFNVYFINNNFEKEQPVVIHRALPFSIERTIAFLTEYYQGIFPFWLAPEQVVIIPTTLDNIKYSQQIEYHLKEIDIRIECDLRDTRFNKKIKQATLNRTPYIVIVGDKESKNNMVTIRNRNNEQQFLTLEDFIQKLDTKNRNCCLSTGLL >NC_010723.1|WP_012450395.1|1676667_1677942_+|peptidase-S41 MKFNKKGKVIATIVLVIAVVIGIFAFKIFHRVTNSPMIKSEDRNEKFITDIEFLKKELPKKHKNLFFSKSKEEFNDEIDSLINNVSRYSDEEINGELAKIIVSINDSHTNVDIMGSLAYPLSFFQFGDDIYLVDGDSEYKEYWGKKLVSINGYSIENLKEKLEPFISKDNEAISKNQFSVLLKCVEVLKLSGIVKEDNATFTFEGLSNADVMIKPVTMEEYMNIRTLSSDEEFKNRFPISKQNSNDNYWFKYIEEENTVYVKYNSCMEMKEYSFSDFTKDVFNVIDTKNATKLVVDLRDNGGGNSRIFEVFLDEIKKRENTNKVGNLYAIIGRRTFSSAVLNAMSLRNETNATLIGEPTGGKPNHFGEVKTIHLSNINIDVNYSSNYFKTSDEDTDSIYPNVEINLNAESFFNGQDDFLDYVIR >NC_010723.1|WP_012451898.1|1677992_1679249_+|hypothetical-protein MLINKILEKFNKSSVTKIDNLIGEDILFKVKNGLGKLTMKFAKDINNDIKAIFYLGNTPLIMCNSEYCPTCSTMIALAKGRDEADDEVVKILSELNNIESLEDSFSKISPILSLLEDGYYVLKEVEFFPTDGEGNFFWNLKMKAKNYMASSYYYAPNYGTIIIEPKFLLPSQGTNSYNKDRVEYYRGKIRNGEKLFGLAIEMRGALGLLIDGHHKATACYLEGKPIRCITIINTFSYKNFNSKEEGISYTDNNIKYSDIKDGDSIKEFYEKKSKNRKSNISYKEVYLKEKYIKSIDIGIPKEEFPDYDTYALSTLASDTSEEKIRDLLNYIGENPLEELEEVFCNLRVNDKKRARELCFSILLLECFQNLWDECVMFLSRYNDEEVQEVFVNLLVEYGFEYGHNKMKHIIDEYFKRLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_010723_3 | 1670802-1671031 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of NC_010723_3
|
3 spacers
spacers of NC_010723_3
>3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR ATAGTATGTCCATATTGATTTAATATATCCC >3.2|1670911|27|NC_010723|PILER-CR GAATTTAGGTTGGCAAATGAATAAGGT >3.3|1670835|35|NC_010723|CRISPRCasFinder TAATAGTATGTCCATATTGATTTAATATATCCCTC >3.4|1670901|35|NC_010723|CRISPRCasFinder TAGTAAGAATTTAGGTTGGCAAATGAATAAGGTAA >3.5|1670967|34|NC_010723|CRISPRCasFinder GAGCAATTCCTAAATGTTTAGGTCTTAGTATACT |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010723_3
The CRISPR arrays of NC_010723_3 >merge|NC_010723|3|1670802-1671031|PILER-CR,CRISPRCasFinder TGGTTTAACCTTAACATGAGATGTATTTAAATATAATAGTATGTCCATATTGATTTAATATATCCCTCGTTTAACCTTAACATGAGATGTATTTAAATATAGTAAGAATTTAGGTTGGCAAATGAATAAGGTAAGTTTAACCTTAACATGAGATGTATTTAAATAGAGCAATTCCTAAATGTTTAGGTCTTAGTATACTGTTTAACTTTAACATGATATGTAGTTAGAAG >NC_010723|3|2|1670802-1670972|PILER-CR TGGTTTAACCTTAACATGAGATGTATTTAAATATAATAG TATGTCCATATTGATTTAATATATCCCTCGT TTAACCTTAACATGAGATGTATTTAAATATAGTAAGAAT TTAGGTTGGCAAATGAATAAGGTAAGT TTAACCTTAACATGAGATGTATTTAAATAGAGCAA >NC_010723|3|3|1670804-1671031|CRISPRCasFinder GTTTAACCTTAACATGAGATGTATTTAAATA TAATAGTATGTCCATATTGATTTAATATATCCCTC GTTTAACCTTAACATGAGATGTATTTAAATA TAGTAAGAATTTAGGTTGGCAAATGAATAAGGTAA GTTTAACCTTAACATGAGATGTATTTAAATA GAGCAATTCCTAAATGTTTAGGTCTTAGTATACT GTTTAACTTTAACATGATATGTAGTTAGAAG
>NC_010723.1|WP_144311747.1|1669741_1670446_+|hypothetical-protein MHVEVQSYSSDEAVFGERMFRYFYRIWDKFRYKYKDKSEIVAAAIYTYKGERGKDKKYVYKLPELEKEILTYNFKTIDVEKLSLENISEDNPLKLVFKMAKRLLETKQKDEDIYEAKINLAEELVNYDKVKNNEQIKALVDFLEYLFLIQNSEIEKKYDDYKKKKGGALKMTVDEIRRKHYTQKGKEEGREEGEKIKALEIAKNLLDILDNKTIAIKTGLTEEEIDALRKKEVN >NC_010723.1|WP_012450888.1|1669028_1669655_+|glutamine-amidotransferase MKNTVYLYVFDTMADWEIGYLSTEINSGRYYKKGLMPLKIVTVGITKTPITTMGGLKILPEIELKECSVKDTAALILPGGNTWTEAIHAPIIRMAEKYLEKGIVVGAICGATIGLAMGGVLNKRAHTSNDLGYLKMVCPSYDGEKYYKQECVVTDGSLITASGIAPLEFAFHILKILDVFLPQTLDSWYNLYKTQESKYFFELMNSIQ >NC_010723.1|WP_012450589.1|1667965_1668928_+|WYL-domain-containing-protein MPKNDNMLAILWMLNSGTKITAKQISERLEINIRSVYRYMDALCVSGVPIISESGHNGGYSLLNNFIRTPLFFDLEEKKSLLHAAIFAMEAGYPFMEALNSATSKLKMFSNQEQEKVLNRHLVGFEVVSRICDRAVKLILREIEQAVANECSIEIEYCTGYEGHPKHRVVDPYGMLYWNNKWYAIAFCHLRNEIRSFRVDRIVNIISTKNSFKRPEAFSAREFFTKNLLSNVESKVGLCTLVIEGKSEALNDLCAHWFLGYHLIERTECRANFLMDEDSIHTYVPHILLQYGKSIKVLEPNSFKDAMAAILRELMAHYLN >NC_010723.1|WP_012449879.1|1667279_1667687_+|SMI1/KNR4-family-protein MSKLTKYIEDLRKKYGDAIVTKESHYDDMMLLKVPEPLREFYREYESLEMPFGIIDSIEISIRSSEAEPFKSEGWFSFGADRYFSFWLCAYKEDNYGNSIISWDHDIDDEIEAMDNNIIDFLNDMKEEYEEYRKE >NC_010723.1|WP_012451163.1|1665132_1665897_+|cell-wall-binding-protein MKKIKKVLVGILGIALSFSFMPKEANASWIKDNNGWWYSQQNYVIGWKQVNNIWYYFDNNGYMKTGWIHDNGRWYYTDLNGAMQTGIVEVNGKVYYLDKNGAMATGKVEINKQTYTFAMSGESIGNKIPQATKAFLSNGVEINPTKVNNTYVTSGKLVEIKLEGNPTTGYNWDYNINTNEVIKEESKDYKSDAAGLNIEGAGGIYTWKFLGIKEGTTKVVFKYSRPWENEVLETKTYIFTVDKDLNIIVEECNI >NC_010723.1|WP_012451653.1|1663041_1664253_+|MFS-transporter MKNISFKLNTIRSFSMNLLFNSFGNSVVGTIYVLFLSQVKGFSDKDVSLMVGLIPIITIPSYILWGIIIDKTKKVVLTNKMVIIANIVTLILLIYVDNIYAFFIINLIRTVLLQPGGMVNDEYLLNLVKDNTGSYGSIRTFGTVGYGLGGLVCLLLMDYIEISGLLIIAIMSLASTLLFISKMPEINIDKSLKKGYHKTKFKIEQLDLLKNMKYMRLMIIYVLMNGTLASASSYAIPMIMIKLDAPQNIIGVMPFIMIVFELILLLQNKRLNFPEKRNKYLLIGLILLTIRWITMGVTESYVIIILISIIHGAVAGILLPIQNDMVEKFVPQNQQSTAIMLQTLLSSTIVPSILNIILGFLLEPWGIKSFGIVYLICNVITLFMYIINLLFNRYEEKRVVFDK >NC_010723.1|WP_012451525.1|1662295_1662937_+|ROK-family-protein MKYYIGIDIGGTNLRAAILDEECNLVDKLKISNEVEEGPEYNLDKLILEIKERWSDKEIISVGVGCPGPLDIRSGTILVTPNLRTWEYFKLKEYLENKFDLPVFVNNDANVAGYSEAMVGAGKGAEKGNMELQKMLSEWVINVSKAIANIIVTVDPEVIVLGGSVIINNPSYLNKIKEETQKRVFDGIKINIKLAEIGDDTGLIGAGLLGKLK >NC_010723.1|WP_012449553.1|1661349_1662285_+|mannose-6-phosphate-isomerase MYPIKFKNIYYEKIWGGRDLAQFRDNLPLGDIGESWDVACHSNSMSIVENGELKGKRFDELIKEYGKDLLGESFENKDFPLLVKLINSREKLSVQVHPNDEYANRVENSLGKTEAWYVVDAKPGACLIVGTKDCNKAVFEKAIKEGKTEDYLNKIQVKKGDCFLINSGLVHAICEGVIIAEIQQNSDITYRIYDYGRPREIHVDKSLDVIDFGLKAMNFSENKLDSYDGYKKGVLCSIEYFTMEKYVVNGEVEESSDINKFFIFTCVDGNGFIKSLHGHDIEVLKGDSILIPAKLGKYVIEGNLTLLKSYI >NC_010723.1|WP_012449875.1|1659570_1661172_+|alpha-glucosidase MHKKWWKESVFYEIYMPSFKDGNNDGIGDFKGITSKLEYLSDLGIRGIWLTPFYPSPKVDNGYDISDYYNIDKDYGTLEDFNEFLSKAHSLGIKVIVDIVLNHTSSEHPWFKESRKSKDNEKRDFYIWKKEKPNNWESFFGGEAWEYDELTKEYYYHAFAKEQVDLNWSNPKVYEAMKDVLKYWIDLGVDGFRFDVINFLTIKNDLAQDNPYDEKGEQIHKYDKDQEGIIEIIKTLVKDIREIKEDVFLVGEVGSEDLNELKGYSGKDLLDVVFNFNLGSINEFSAEKIYKEIKNMNDNYDSYQIPTIFFNSHDMGRSISRFNPDGNKNGIEKAMAALLLTSYGVPFMYFGEEIGMKDLVCLDINKMNDIQGVTKYNIEISNGKTQEEALISANKSSRDKSRSPMQWNNSKFYGFSNTMPWINIEDKNDNELVEKQIKEEGSLINLYKDLIKIRYKNDTLLYGKYANLSFDDGVLIMERELNNETIRNVINFGDNEYIENNTEEIIYSNIKVQEKRTLGKFDFIIQRYKTTTN >NC_010723.1|WP_012451714.1|1658638_1659556_+|DUF1861-family-protein MKDMKTCEILLAEYLKSESKIYGVEKINFINVGENDVYNISAPFVDNDKTIIAGRVEARDSEHSTVYFFEKNHEVWSPIDSYPTFSLQDPFFTKINNELIVGGVEIFPHPEIEGTLKWRTIFYKGKDVASLQRFFVGPDGMKDLRLVQLLDKRIGILTRPQGEKGGRGRIGFSIINTLEELNIKVIEDSPLLDGLFVDEEWGGANEARPLNETTLGILGHVACFDKDGNRHYYPMTFELNINTLEVKNQKLIAVRKDFKPGQAKRPDLEDVVFSGGLEIKEDKATLYAGISDAEAQFIIIDNPFK >NC_010723.1|WP_012449473.1|1671138_1671591_+|ASCH-domain-containing-protein MTEMQMWNEYIKINTNAKEYQSWSFGGNTPKMPNLLAELVLKGIKTATASAYPCYISENAPLPPVGGYNLILNTKGEAICIIETTKVYTIPFNQVKEEHAYKEGEFDRTLISWRKCHSKFFSMELKEIGQEFTEDMLVVCEEFKVVYPKI >NC_010723.1|WP_012450188.1|1671937_1673173_-|ATP-grasp-domain-containing-protein MLNKRILFIEPSFYGVNLVKAAKELYCEVVVIVSSDQNPIIYGYEGLYDDLLVCDIKSIDSIYKTIMKSKYYKNFDALIPGYDYVTAATAKVSELLDIKGTSYQATLTARNKDMARDIFLKNNVPSAKYAVITNYTDALKASNLIGYPVVLKPTNAAGSQNVSYIKDEDSLLKAFNKISKFKTSYLGFSVRQEYLIEEYLIGPEFSVELFLNEGSIEFAEITEKHTSDLPYFVERLHIFPSSICQEVRDNIIDVAKKAVFFIGIQNGPTHVEIKYTNEGPKIIEVNGRPGGDNITSDLIINSYGINIYKETIKMYLSEPLDMEKKNDIASAIGYILSEKKGKVKTITGLENLPNDKNVTRYQIDVKENYEVNISRSSEERLGYIIITAETSKEAKNKIEKLLKEIKITYFE >NC_010723.1|WP_012451202.1|1673162_1674383_-|MFS-transporter MISILTNKNFRNFFVSDIISGFGVGLIMIAENWYVFTQTNSTKYVGFLLAFTVIASFIVSPIAGICADIFNRKNVISITYVVRISFLLVIALVFLMHGFDIRLMYLLSIINGIGWTFYMSTSRSFIQELLPKNLLIKGNSLLEICLQSGMLFSGAIFGIFFEYFGFVNILFINIIVFLISNFIVSRIQYNSIISTIDNEKFFKSFIAGLSYLRKRKVIFVFGIITIIPLAVTMIYNVVLPAYVNEISKNSSIVFGISDMFYGIGGLVSGFGVALIIKKMRNNQIIFLFFIIAISDLLSLYLNTNVFVLYFCSLLLGVSNSTLKIVMNTVLMENVDKQFMGRATAVWTAISLLIQAVGTSTMGIIIDNFGAKYGFLCMALLMFIGVISFVFIYSMINLIKKENSNVK >NC_010723.1|WP_012451875.1|1674508_1675543_-|hypothetical-protein MYETTGHYNKYSKDMYPSFYAYDEDYVMRSVTCPNHYAIFLQQERSYKELPLRITEMSTLIRKDRSSELSGLYRTNTFTLNDAHIFCSQDNIELEFLKIIDFIKCVNDKFGISSHVRYRLSFSDFSNDKYIKNESLWKKSENILESILNKSDLDFFISKDKACFYGPKLDVLIENYNGKEYILTTVQLDFILPGKFNVYFINNNFEKEQPVVIHRALPFSIERTIAFLTEYYQGIFPFWLAPEQVVIIPTTLDNIKYSQQIEYHLKEIDIRIECDLRDTRFNKKIKQATLNRTPYIVIVGDKESKNNMVTIRNRNNEQQFLTLEDFIQKLDTKNRNCCLSTGLL >NC_010723.1|WP_012450395.1|1676667_1677942_+|peptidase-S41 MKFNKKGKVIATIVLVIAVVIGIFAFKIFHRVTNSPMIKSEDRNEKFITDIEFLKKELPKKHKNLFFSKSKEEFNDEIDSLINNVSRYSDEEINGELAKIIVSINDSHTNVDIMGSLAYPLSFFQFGDDIYLVDGDSEYKEYWGKKLVSINGYSIENLKEKLEPFISKDNEAISKNQFSVLLKCVEVLKLSGIVKEDNATFTFEGLSNADVMIKPVTMEEYMNIRTLSSDEEFKNRFPISKQNSNDNYWFKYIEEENTVYVKYNSCMEMKEYSFSDFTKDVFNVIDTKNATKLVVDLRDNGGGNSRIFEVFLDEIKKRENTNKVGNLYAIIGRRTFSSAVLNAMSLRNETNATLIGEPTGGKPNHFGEVKTIHLSNINIDVNYSSNYFKTSDEDTDSIYPNVEINLNAESFFNGQDDFLDYVIR >NC_010723.1|WP_012451898.1|1677992_1679249_+|hypothetical-protein MLINKILEKFNKSSVTKIDNLIGEDILFKVKNGLGKLTMKFAKDINNDIKAIFYLGNTPLIMCNSEYCPTCSTMIALAKGRDEADDEVVKILSELNNIESLEDSFSKISPILSLLEDGYYVLKEVEFFPTDGEGNFFWNLKMKAKNYMASSYYYAPNYGTIIIEPKFLLPSQGTNSYNKDRVEYYRGKIRNGEKLFGLAIEMRGALGLLIDGHHKATACYLEGKPIRCITIINTFSYKNFNSKEEGISYTDNNIKYSDIKDGDSIKEFYEKKSKNRKSNISYKEVYLKEKYIKSIDIGIPKEEFPDYDTYALSTLASDTSEEKIRDLLNYIGENPLEELEEVFCNLRVNDKKRARELCFSILLLECFQNLWDECVMFLSRYNDEEVQEVFVNLLVEYGFEYGHNKMKHIIDEYFKRLI >NC_010723.1|WP_012451291.1|1679348_1680536_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MVSREEIIKNLTLQIKINSHIIGVATGAGVTAKYAQRGGADLVLTLNSGRFRQMGRSSLAGILPFANSNDMVMGFALREVVPLIKDIPVIFGLNATDPKIKLDEYIDDIKNKGFSGINNYPTVGIIDGIFGEALEDAGCSYNLEVEAIKLAHKKNLFTVAFVFCKEQAMDMLEAGADVICVHLGLTEGGMLGAKKILSLEAAKEKAKSIFDLCDKIRPNVIKMIYGGPVKTPVDVQYMYNNCNTMGYIGGSAFERIPTEKYITNITREFKYSGNLEKDDFLNKMLDGITKHYDYVEFVKEYVSKNYMNNISFLELAMVANISRTHLSSLFKKEVGCSFPQYLVKFRMSKAADIIKKENIQLSEVAALVGYDDYAHFSKMFKKYIGKSPKIYREST >NC_010723.1|WP_012451241.1|1680680_1681889_+|UPF0261-family-protein MKTIAIAGTFDSKGVEYLYVKKLIKSIGLKTFTIHTGVFEPKFKPDVSNQEVARAVGEDIYEISAKKDRALATEILSRGMEKLVPKLYEQGKFDGIISFGGTGGTSLITPAMRALPIGVPKVMVSTVASGNTEQYVGSSDIVMVPSIVDVAGLNSISTKIFANAVFAIAGMVNFENKEIIEKKPLVAATMFGVTTPCVNYARKYLEERGYEVLVFHATGVGGKSMEHLIKGGFIKGVLDLTTTEWCDELVGGVLGAGKNRLEAAGKNNIPQVVSVGALDMVNFGPVDTVPKKFEGRNFYKHNPTVTLMRTTVEENKIIGEKIAEKLNMATGKTALFLPLKGVSMLDEKGQKFYGEEEDKMLFDTLKNRINKDVVEIEELNLAINDKAFGEAAAKKLIDLMSK >NC_010723.1|WP_012450684.1|1681993_1682815_+|phosphoenolpyruvate-hydrolase-family-protein MKRAEIIKKFKEEIAKGNSLLGVGAGTGITAKSSEAGGADMLIIYNSGKYRMAGRGSLAGLLSYGDANQIVVEMGAEVLPVVKHTPVLAGVCGTDPFRLMEVYLKQLKEQGFSGVQNFPTVGLIDGVFRQNLEETGMGYDLEVEMIRKAHELDMLTTPYVFDPDQAKAMAEAGADILVAHMGLTTKGTIGAKTALTLDDCVEKIEAIIKAGRDVNPDIMVICHGGPIAEPDDAAYVIEKTEGIDGFFGASSIERFAAERGIKAQAEAFKLIKK >NC_010723.1|WP_012450100.1|1683275_1683704_+|large-conductance-mechanosensitive-channel-protein-MscL MKKFLNEFKQFALKGSVIDLAVGVLIGGAFQGIVKSLTTDIISPIIGIFANKDFSDLTLNIFGVTVKYGSFITAVINFLIMALLIFLLVKGMNKLSDFGKRNKAEEITEPSTKKCPFCYTEIDIKATRCPNCTSKLEVIQEV |
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NC_010723_4 | 1753789-1754545 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of NC_010723_4
|
11 spacers
spacers of NC_010723_4
>4.1|1753819|36|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT GTGGCAACTCTTCCTCAATATTTGTTTTTGCTTCGA >4.2|1753885|36|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT TGTTGATTGATTTAGCGGACGAGTTGGGGGACGATA >4.3|1753951|37|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAGCGTGTGCTGGAATACTTAATGTAGCTGGAACAG >4.4|1754018|36|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATAGAAGCTTTTAAAAATTCTACTAGTAAAGCTGT >4.5|1754084|35|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGGTTTTAAATTATTTTCAAGTGCTTTACGATT >4.6|1754149|36|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAAACACTTGGAGTTTTTACAGATACTATAATAAT >4.7|1754215|37|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAGTTACTTCTTGTAAATTTAAGCAACATAAATAC >4.8|1754282|36|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACAAGTCTATAAAGTAATAATTCTTTTGGTTTTCCT >4.9|1754348|36|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCATATTGATTAATTCATTCCTGCTATACCCTGTTT >4.10|1754414|35|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTATAAAAGTTTCAAATTTAGACTCTATACCTCT >4.11|1754479|37|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCCTAAGTATAGTAGTATAGTCCCCTCTCTAAACAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010723_4
The CRISPR arrays of NC_010723_4 >merge|NC_010723|4|1753789-1754545|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATTAACATTAACATGATATGTATTTAAATGTGGCAACTCTTCCTCAATATTTGTTTTTGCTTCGAGATTAACATTAACATGATATGTATTTAAATTGTTGATTGATTTAGCGGACGAGTTGGGGGACGATAGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATGCAGCGTGTGCTGGAATACTTAATGTAGCTGGAACAGGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATTATAGAAGCTTTTAAAAATTCTACTAGTAAAGCTGTGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATGAAGGTTTTAAATTATTTTCAAGTGCTTTACGATTGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATTCAAACACTTGGAGTTTTTACAGATACTATAATAATGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATTAAAGTTACTTCTTGTAAATTTAAGCAACATAAATACGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATACAAGTCTATAAAGTAATAATTCTTTTGGTTTTCCTGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATTCATATTGATTAATTCATTCCTGCTATACCCTGTTTGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATTCTATAAAAGTTTCAAATTTAGACTCTATACCTCTGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATATCCTAAGTATAGTAGTATAGTCCCCTCTCTAAACAGGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT >NC_010723|4|4|1753789-1754545|CRISPRCasFinder GATTAACATTAACATGATATGTATTTAAAT GTGGCAACTCTTCCTCAATATTTGTTTTTGCTTCGA GATTAACATTAACATGATATGTATTTAAAT TGTTGATTGATTTAGCGGACGAGTTGGGGGACGATA GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT GCAGCGTGTGCTGGAATACTTAATGTAGCTGGAACAG GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TATAGAAGCTTTTAAAAATTCTACTAGTAAAGCTGT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT GAAGGTTTTAAATTATTTTCAAGTGCTTTACGATT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TCAAACACTTGGAGTTTTTACAGATACTATAATAAT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TAAAGTTACTTCTTGTAAATTTAAGCAACATAAATAC GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT ACAAGTCTATAAAGTAATAATTCTTTTGGTTTTCCT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TCATATTGATTAATTCATTCCTGCTATACCCTGTTT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TCTATAAAAGTTTCAAATTTAGACTCTATACCTCT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT ATCCTAAGTATAGTAGTATAGTCCCCTCTCTAAACAG GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT >NC_010723|4|2|1753789-1754545|CRT GATTAACATTAACATGATATGTATTTAAAT GTGGCAACTCTTCCTCAATATTTGTTTTTGCTTCGA GATTAACATTAACATGATATGTATTTAAAT TGTTGATTGATTTAGCGGACGAGTTGGGGGACGATA GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT GCAGCGTGTGCTGGAATACTTAATGTAGCTGGAACAG GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TATAGAAGCTTTTAAAAATTCTACTAGTAAAGCTGT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT GAAGGTTTTAAATTATTTTCAAGTGCTTTACGATT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TCAAACACTTGGAGTTTTTACAGATACTATAATAAT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TAAAGTTACTTCTTGTAAATTTAAGCAACATAAATAC GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT ACAAGTCTATAAAGTAATAATTCTTTTGGTTTTCCT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TCATATTGATTAATTCATTCCTGCTATACCCTGTTT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TCTATAAAAGTTTCAAATTTAGACTCTATACCTCT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT ATCCTAAGTATAGTAGTATAGTCCCCTCTCTAAACAG GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT >NC_010723|4|3|1753921-1754545|PILER-CR GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT GCAGCGTGTGCTGGAATACTTAATGTAGCTGGAACAG GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TATAGAAGCTTTTAAAAATTCTACTAGTAAAGCTGT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT GAAGGTTTTAAATTATTTTCAAGTGCTTTACGATT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TCAAACACTTGGAGTTTTTACAGATACTATAATAAT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TAAAGTTACTTCTTGTAAATTTAAGCAACATAAATAC GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT ACAAGTCTATAAAGTAATAATTCTTTTGGTTTTCCT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TCATATTGATTAATTCATTCCTGCTATACCCTGTTT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TCTATAAAAGTTTCAAATTTAGACTCTATACCTCT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT ATCCTAAGTATAGTAGTATAGTCCCCTCTCTAAACAG GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
>NC_010723.1|WP_012451518.1|1752926_1753565_+|hypothetical-protein MSLFLGKIHFWLFNKILWFEGLENEIIYVAKSEGLDILNLQKEIEDKYGGKLPNKPLDEIIDTSNIHGWLQEKIYSSEGRIAAWTTIIIDNRREAKEKLEEIYTNQGIMAAKEVNEKGFILDSAEDIFNKVNDYILDGMPCDRVNEIINSNENCVKWTRRICVHKEIWDKESGDVEYFYFLRSLWIKAFVNEINTEFDYLEDSKGVKSIRRK >NC_010723.1|WP_003371960.1|1752200_1752575_-|PH-domain-containing-protein MIDFNNGALFKLKKTSNDDISKQIEPLLISGEIIISTYKTIRDYVVFTSKRVIAINVQGITGAKKDYTSLPYSKIQAYSIETAGTFDLDSELEMYFSGLGKVKFDFKGSSDIIKIGQIISEFVL >NC_010723.1|WP_012450151.1|1751261_1751912_+|hypothetical-protein MNDAYVFKDDNRYGEYCDTVNIGDINVNFKPTEFIEKFIKSSYNIKKVNLNYTVLIGTYNLEDGKKIDYYYKPYITLEKDSEKNYENSVQKISMADMKKASEEAQIRRYDFIADYTYTRSKSNKRRSVVECEENPLLVKIIDNVIYNYERKFMRELNIISFESFFNKIVQEGEIEVKNIYNTYVKIHNTSYYKEKFKKIPSFKISKIGMEYFYSKY >NC_010723.1|WP_012449910.1|1750179_1751052_-|DMT-family-transporter MNTYKGISYAILSSVAFGLMPIFASIAYENGSNPTTVIIFRFLLSSISLFIYLLYKKVKIKIERKPMLILLGIGIIAYTVTTQTLFISYNYLGAGLATTLHFIYPAIVCIIGFVFLKEKISKRKLISLLLSGIGVYSLVAFESKSLSAIGIFLALFSGVAYAINLIILGLDCIKSIDNKISTLYMCVGATLGMITYGLFTKSIVLTFNTKMVASYIGISLISTIVSIILLLKAIELIGTSSTSILGTFEPIISIIFGVLILGENLSFELVIGAALILTATIVLAKDTKSE >NC_010723.1|WP_012450126.1|1748810_1750061_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MITLYYKDERVKLSLFILSVFIIQGIIFGVIYFNSILAINKDVITQNSSIIGELYLKDKELALEIIPIITGKKLNNVEIGEKILSDYSYNTALKYNNNPVIGNVTQSTVLLFEILILVTFLILIIGSFIIMNPLYNEIKYLTHRAESIVENKIIHNDKQYSYRGSLDKFILKFNLMEDRIKNSIGLLQEEKINLKNIINDISHQLKTPLTALSMYNDIISDHREMNNEDLDNFINLSKDQLERMEWLVKTLLKYARLESNVVEYNKEMFSIKNTIEESINPLKVKAKNKNQSLILKCEKDIEYYHDRKWVSEAISNIVKNAIEHTENNGKIEINLYETPITITISIKDNGEGIEKEELKKIFNRFYKGETSINPTSIGIGLCLSKSIIKAHDGDITVESYLGKGSIFYITFLKTVL >NC_010723.1|WP_012449424.1|1748112_1748811_+|response-regulator-transcription-factor MGNILLVEDDRAVALAVIYSLKKEHFNVEHAINLRSAKNMITDDIDIILLDLMLPDGDGYELCTEIRQSGNDVPIIFMTACDEESNVVLGLDLGADDYVTKPVKMRELISRINAVLRRKGKNKVFEERKIIESEGILLDKGAHLVKKDGNEISLTLNEFKLLQFLMENSPNVLTRNTILEKLWDIEGNYIDANALSVYIKRLREKVEYDSRTPTLIETVRGVGYKWTPKVVK >NC_010723.1|WP_012451611.1|1745480_1748084_+|ABC-transporter-permease MKAYSYLANKQFKVNKKRNFSIVLGIILSIILFTTVGYIQSFAREIDIINAKEERGNYEAIFKNISKEDVYTLKNNVLIRTVGIYKKETEDKVKIGSLDKTIEVYALDSESIHNLFKPLIKIIKGRYPVSENEIILNQSVNLELNKYIDDKITIGDKSYVIVGFCDNEKYSNPYVINGITYLEKELFDGDINVAIISKDIKNKLVEIKNIANRIGISMEEVNEERGIIFNKRLFDSYGISVDENTNYIDEYKMGSISLYGIILILSTILTYSSINVSVKERIQQFSSLRCIGATPSKIRILLMKESFLLIVFSLIPGIILGQIVCFIISGVIFNKIIGINTYGILYKVYWNVILTVILLSILNIIISTMIPIIKMGHISPIQGAKTGGEIKSSIKRGNYKIIKKLFGYNAELAYKNIRIGNKNFIITTSALSILLIIFITFTGYYNIIINNYRSERNKNKDVSMTVYRSIPNEFNSLNSLDMLNKHKSDVKHLEVTDEINAHINYSIKALFKDVNLNKWIKTVDSKSNYGESIIYNNGKKYVYSNSVSLLIYDNESINEILPYIEDDINNKNNIKLEDFKENGVIVAYRSILKNGFNPKKEEIFDLNIGENFIMYIDSSNINESVYGKDTNYIDNMKEYINMKFLGSIDGDDLFEGNRHGFSNHLTIIASEDFYDNNKEILSSNNYNVNMEINLKKDLDRELSKDTIGSYANKIGEFYLDNESTFQDSRKSFLALSSIIYTVLFLTIFIGGVTILNNKNISILLRKKELGILLAIGINKKRLKKVLLFEGIIQWFISSSIGILSSYIILRVIYSVLYYSGEADNFRMPIISVLIVISILFIIILLGSYFPVRKLNQMETTELIRNEE >NC_010723.1|WP_012450895.1|1744800_1745478_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNVIRLNGVYKSYGNGENEVKALKNINLDIKKGEFVSIIGASGSGKSTLLHILGGIDRPTEGEIFIEDVNLKNLSENEISLLRLRKVGFVFQFYNLIPVLTVEENIEMPVLLDDGAIDKDYKNELIKLLGLENKLNNLPSELSGGQQQRVAIGRALANRPSIILADEPTGNLDSKTAMDIMELLKYSRKKYNQTLILITHDERIAKMADRVIGIKDGEIAINEVI >NC_010723.1|WP_012451649.1|1742932_1744618_+|ABC-transporter-permease-subunit MKLFNLTYNEVVKQFKKTSIKIIIPIILLSAIVLPLGISKINVDSNIKNAMESNLFLLEDVNNSIESLNKDKNQKAQIEKAYLQAEKEYRQLFVDYKIGFDDWKQKEAEEFRYIAYNLVAIELVLNGYRQDVVLESLQGVNPDEVIKYYEMTLENKKEVEIKFIAEKEKLKDIIINNDYMGHTALEIERKEKYIEGNKKIIYEYEKLKAKNPNDEEGKEKLEELKKENNLAIKEIYALEQDLQVLRFRYDKKVDYDKNNWKNNSIKSIEKNLEEFRRTMQTEKEFSSMANQQRIEITYDEYVKNYETQNDKCIEEIKELWYGLENEIPPLNSIRDARSVIDGTYEFYVIFAVIIAIIIGGGIVANEFSKGTIRLLLIRPVSRWKVLLSKLLSVLIISFGIVILGTTILVISSGYVYGFETLKTPLLETINGTITKIDYIQYMIPKLMISVSSLIFITSLVFMISTVARNTALAVAISMVLYLGAAPLTQVLINMKQVWLLKTLIPYINGSFFKIMPFFTEQLSKEYGIQMQYTIGAKQLLLASILMIIVTFVTFTKKDIKN >NC_010723.1|WP_012450914.1|1741985_1742918_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKAVLELKNVSKVMGNTALVEDISFTVNKGEIFGFLGPNGAGKTTTIKMITGLYSISKGEIYIDGKNVKKQFEKALKGVGGIIENPEMYGYLSGKDNLKIYARMHGGITKHRIDEVVNLVKLGNRINDKVSKYSLGMRQRLGVAQALLHRPKLLILDEPTNGLDPMGIKELRETLRELCDKEGLSVMVSSHLLSEMELMCDRFGIIDSGKIIDIKTIDDIKNNESLNIKTYLLEVNDKKKTIRIINSRYPNVVLNEDKEGIKISCEKDELAKINKELVINDISVFGTRVITKTLEDEFMEVTSGSKDQIR >NC_010723.1|WP_012450284.1|1754628_1755528_-|LysR-family-transcriptional-regulator MDIRQLRYFLTIAEEGHITAAAKKLNISQPPLSKQLKLLEEELGVTLFNRTSRNLELTDAGILLQNKSSQLLELYKSTINEMKNFNNGIEGTLGIGTVCSSGINVLPQKIKEFCKQYPKIDYEIYEGNSFKIMELLNNGVIDVGFVREPFNLSLYNSFIIKDNLENNLNDYFVTIAKSKFYNSIESNTILINELKDKPLIINRRYDDVIKNACNKAGFEPHIICKNDDIITSLSWAEAGIGISILPLTASNILPNVNLKIKKIIEPSIESYLRLIWPKNKPLSNISCNFIEMFDKNIFN >NC_010723.1|WP_012450496.1|1755701_1756940_+|MFS-transporter MNKKFIRLFAAGHLVTDIYQGALPAMLPFLISEKNLSYAAAAFLIFAANASSSIIQPLFGIYADKISLPWALGTGVLLGGIGIGVSGVTSSYNMIFSLVALSGVGIALYHPEGARLTNKFSGENKTTGVSQFAAGGNIGFAVGPIITTVILSILGLKGTILLCIPAIIMGLILLYEARYFSKNENELVNERECIRNKGEVKADQWGAFGRLTLTLLCRSTVFFGLNTFLALYFVHVLNQSEVHGSIALSTLIVVGAVGTLFSGKLADKSGNKKVIILGYSCLVPLLICFLSIKNPIIVTIILIPLGFFLYMPYSPMIALGQKYLPNHVGLASGVTMGLGVTMGGVVSPILGWVSDNYGIHTALCTLIAMPIFAVILARKLPVCNEELENDKMQENVQSNTKKLSNKSLNLQK >NC_010723.1|WP_012451066.1|1757164_1758373_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNKKQLKLKSIGIEHLEQYNQLLRYVFQVTEHELNQIGWQDKEIIRAKSPTLKQADVLGWFDGDNVISQVAVYPMKVRIFNCTYDMGGLTGVGTYPEYSNQGLMHKLLYQALYNMKERKQFISYLYPYSIPYYRRKGWEIISDKITYEIQDYQLPKNRQVAGDVRRVPIESDQVKKAYNRFAYLTHGALLRDDLAWNEYWLWDTDDIMAAVYYNENDEPDGYVIYWIADDVFHIKDMIFVNEDARIGLWNFVSAHFSMISKVVGNTFTDEPLAFLLEDADIKETISPYFMARIVDFEHFIEEYPFKPDTIEREWRFTLSDPLLAWNQGTFTLKISNDGKGKVVHSTEKTTDRIDIQTMTTMLLGYKRPDYLHRIGRIVCSSMTVDMLEDAIEQQSPYFSDYF >NC_010723.1|WP_012451897.1|1758699_1759890_+|hypothetical-protein MQEKEVLNSLRCNTQSIEEEIQINVLLNKTKRNRIKINNLDEFKDALKKEGYEINEFDEEKFKEDLVKIFQVDSSVIEVLHTYINNPEITYKVYDASDLIDYIKKMILFENEYNRLCEKISSIKKMDIDRVEYEREFSLQDNVEDIIRAIEEIKDDISGIISKEGKTRLENLEREINKEYLYAKDIELLKKMVIIENENVKEEYNIESKIKTISIEIPKKINYEHIVAKKGSVEYHDYLSSNIPRMQRLIKNMHKYMKVDEKEKSTFKINQSKALQDSINIAVATYDNKEFKAISGSNDIKNYCKITPIENATFKSSKVNKLGNLGIGYNRVNDSEKKIFEEIHRQIEKNALKDEGNLILYTKLEPCPSCYYVISQFCKKYPNIKVQVKYSKKYGE >NC_010723.1|WP_012451674.1|1760103_1760568_+|hypothetical-protein MRGKHAIGNRPFGNIHLDYIRYKESDKDIRQMYERVKNDYLKNENLDIDLEKAYLNERFISYKGDIGKYYLNVFIISLTAFLGGIFTQYFNRSFMTLAILIAFIIIVVKFFSNIHTKIMFNKEKYEHKYYIICIEALKEIEHEQNSIIELENIN >NC_010723.1|WP_012450056.1|1760730_1761690_+|hypothetical-protein MKNKRYLISLIFVIVMIVMAEFTGEKEIIFPEVLSLAVGAWISDKQPWKINKIGLVALMTLSSTFGTCIVRYFSFPLIIKFMIALIFIGLILKLTQTTLVPTISAAILPILLNTETWIYPISVCIMSVIIVLVQYGMEKYGLRECENKQVEETEISKNQRKLETIRLSKIFLVTTILAALAFTSKNMFIIAPPLIVGFIELSNVQSKARNNNKKIFMLFVFASIIGMVSRVFISEYLSLPLWVAGSIATIGIFICFEKLKVTFAPVAAIALLPMLLDIEKVKYFPIQVTLGSIVLIFLAMTIFKEETMEVSSMSTSINS >NC_010723.1|WP_012449966.1|1761790_1762285_-|hypothetical-protein MVNLSMKERILLQDEKSHEELCVEKYNKYSNKACDVELKNLFSTLAQKEQQHLDSINQMLSGTVPNVNQGQQANQNQNANQNQTSMQNMNNTANSQLTQNDISNDKMLCQDSLSTEKYVSSTYNTAIFEFKDKNMRQVLNHIQKEEQEHGEQIYNYMSQHGMYN >NC_010723.1|WP_012451345.1|1762422_1763157_+|hypothetical-protein MKENLKDKIDNFLNENKINITGGTIKTEEELSLVLNNIAMSDLKKGKFQKSLYFVSKALEFDSKNYYALFIKGLIYRYSKNFNKAIKTFEEYYDLSKDSLSLIHMGFCYAELNDSDNALEFFRKGEQEFTEDEKNKYSSLMYTVYECMGNIYMNRENILEFKENDKFSLNYKLAIKYYKMSLRINKNNHLLLNKLAACYHHFDDEKKALYCYEEAAKVAPEIQEYKGAIEEMKEQGIIADVIEF >NC_010723.1|WP_012449946.1|1763327_1764986_+|hydroxylamine-reductase MEQNPMFCYQCEQTAGGKGCTKLGVCGKTPEVANLQDLLIYQCKGISVYAMELIEKGENIDKDIVKFVENSLFTTLTNVNFDAEVHVEMLKESQKIKEELRKKIVNNKEYPEQASYNLSETKDEMLKDSKKAGIMFDQTIDADVRSLRQTIIYGLKGISAYGHQARFLGYYDDQVDNFYFRGLECTTNDNLSVEELIRMTMRTGDMSVAVMKKLDEANTETYKNPIPHKVNVHIKKGPFIIVSGHDLRDLEMLLKQTEGKGINIYTHGEMIPSHGYPGLKKYKHLVGNYGGAWQDQQKEFDGIPGCILMTTNCLMRPRETYKDRIFTTSVVGWDGLKYIKADKDGYKDFTEIIEKALELGGFKESEEPHEILVGFGHHATLSNAETIVNAVKDGEVRHFFLIGGCDGARPGRNYYTEFAKKVPMDCIILTLACGKYRFNKLEFGEVAGLPRLLDVGQCNDAYSAVRIATALADAFDTDVNGLPLSIILSWYEQKAVADLLALLSLGIKGIFVGPTLPAFFSPNVLQYLVDTFNLKLISEPDDDLKTCLQQGV >NC_010723.1|WP_012450238.1|1765279_1765933_+|HAD-family-hydrolase MRAFIFDMDGVIIDSEPIHRQVHGEIMNTLGINISKGELALYAGATNEYIFTKLKERYGIKKSVSELMDYKSKLIINKVKEESLEPINGIRELLNALRKNNIKIAIGSSSPRSLIEAVIDKFNLHSAFDCIVSGEEVERSKPYPDVYIEVSKNLGINPEKCIVVEDSHNGVQAAKSAGMKCIGFNNVNSGNQDLSKADVRVDTIRKIDIYNLCKYFE |
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>5.1|2225817|42|NC_010723|PILER-CR TCAAGTGGTTCACCTACTCAAGCACAAATTGATGCATCTAAA >5.2|2225880|32|NC_010723|PILER-CR TTGCTGATCTAAAACTTGCTACTGCTGCTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010723_5
The CRISPR arrays of NC_010723_5 >merge|NC_010723|5|2225796-2225918|PILER-CR GTAACTGCTGCTACTACTGCTTCAAGTGGTTCACCTACTCAAGCACAAATTGATGCATCTAAAGCTGCTATTGCTGATCTAAAACTTGCTACTGCTGCTTTAGTAACTGCTGCTACTACTGCT >NC_010723|5|4|2225796-2225918|PILER-CR GTAACTGCTGCTACTACTGCT TCAAGTGGTTCACCTACTCAAGCACAAATTGATGCATCTAAA GCTGCTATTGCTGATCTAAAA CTTGCTACTGCTGCTTTAGTAACTGCTGCTAC TACTGCT
>NC_010723.1|WP_012451911.1|2220652_2221930_+|hypothetical-protein MIQNSTDLIKHINIEETISLTPEIYALKSPLIIGNTFEILGNGSTLVGPILICTDIIISDITFSNTDNIIRLTSDCSVVFKNCTFLGNNKNSAIILENHSKSTLSLKNCIFHNFFSAISVNEDNTLDLLQDCLFEFCNVAINNVVKNSIINIHSINNNLMFNSKESIFLNFSESFNIEDYHNFCFELSSRNSFARILGKSSTTVFDTSCFYIDNLKNLSVILKSCPHCSTIFLKEGQYNLTSSLLDDELTIDVPINLIGINSPKLYKSENDFIKYAIIINTSNVRIKNIVIDGGDKYSLRDGIHFEENGATNIKIQNVTISRILRRGVSIWGKKTSNCIIDNCKFSYIKEQCAIYASGTTYIYNSNFKNLRTAINCINKNVILFENNLFENIYCCLLNEIIPFNNIKQKNNTFNFVENLVMLSKY >NC_010723.1|WP_012451478.1|2219413_2220466_-|hypothetical-protein MAKVNYINQASFYDQNTDCLKITEAPIIIKAETKVFSYKYVFSEADCNCSENCYPGKGDDVGFTLIFGNYGEETYTPTSTTDPTVIDTLDLSNIYNASLKVMDLCIGKNFKVFDITGVTPGSGQGTEVIHGETEFIGGSVYTLEIRECYENPETGEKCTAAFCLPCHSVFCITMLFQVEFTPCSKLKNGGFCNGTTPSLENWIAIPATGGGTVQAVASYTSSTNVNVTPKDGDCGFALLKTGANEVKSILKQTFEVKAGDVLSFYAFFDLMDIPGWPDEAQVIVIKNSSGNVIDTIVTKNAHYVSTDWEYYSYNVEECGTITFEASVKNVREPILPDGYLAIDAVTITHP >NC_010723.1|WP_012450795.1|2218387_2219050_-|RNA-polymerase-sigma-factor-SigI MLECVLEDLNIGQDLDVNQLIEKHMPFIIKSISDVTGKYVSCENDEELSIALLAFCEAVERYEKDKGYFLPFAKLVISSRIKNYLKSQNKHSCSSLDELVEKGIEIQDEYLEEEDNGLLVDDINILKSEIMLYGFTFEDLVEEAPKQRATRENAINLAKQISEVEELTNFMEIKKRLPIKKIVLRFSVTEKVVKRSKKFIISVVIIFKKDLKTLKNWIRK >NC_010723.1|WP_040968314.1|2217259_2218378_-|anti-sigma-factor-domain-containing-protein MSKGIIMEIKKEYAIVMNDTGSIECIKIKDGMKLGQKIFYFEEDLVNINQNRSVNKISLFKTFGTFAALFLLIFTFFQPLAFNKAYAVVSLDINPSIQIQVNNKKKIVAVEGINEDGKNIDFSSVNGLEIDKGIDGIKAILVEKDYLNQMGEVLVAFALLDNEEDEKYENQIKDAIQTTFKTENVTYVKGSKEAVEEAKTKGISLGRYEVSLSADETVKSKIDNIPVKEITSLIKDKENCIYWKADDVQNSEKPETNNNLLDDKYSDKPENTLENNTLPKKDKVEEPIKEITPEVQKPVDNNKESEIKKDPEEVPETKPEIVLPPIEEIKPEGNTPSNEESEDKNNEITDNKNNGSENNMTDTGDIEQNLKK >NC_010723.1|WP_012450009.1|2214898_2216170_-|NAD(P)-binding-protein MYKNNDMKKNNEESISPVFAIEESSRCLLCHDAPCSQACPIGTNPAKFIRSLRFRNLKGAVETIRENNILGGVCARVCPTKKYCEGACSRTNIDKPIEIAKLQQYLTDYEKVLGLEILNKVEIDKEKVAIIGSGPSGLAAATKLAQLGYNVTVFEKREKLGGWLTYGIPEERLPQTVVNNEIEYIKNIGVEFKTNVNIGKDVTIDSLSKEGYKAFLIACGMQKSKEVKIDGSELDGVINGTDFLAEAKSTGKYKLGNKVIVIGGGDVAIDCAMTAKNLGSEDVKIVYRRTIEKMPAERKSIQEVIDLNIPIFTGIKPSEIIGENGKVLRFKGTGMFDDSNLDIPTENVIFAIGQEQEEVSSIANLDLNNKGIIETKEYATNIDGVFACGDIVEGDKTVVYALKLGKEAAEKVDQYLNEKEGAR >NC_010723.1|WP_012451722.1|2213660_2214899_-|NAD-dependent-dihydropyrimidine-dehydrogenase-subunit-PreA MSIIKDLSIEFCGVKCENPFFLSSSPVGNCYEMCAKAFEAGWGGVMFKTIGFFMPNEVSPRFDSLRKEATSFVGFKNMEQISDHPLQQNLDDLRRLKENYPTKIVVASIMGENEKEWEDLAKLVTEAGADMIECNFSCPQMTSHEMGSDVGQNPELVKKYCEATRRGTNLPILAKMTPNIGDMSVPAIASMEGGATGLATINTIKSITGIDINSMTAKPVVNAKSSVSGYSGKAVKPIALRFIYELAKNEKLKGVPISGIGGIETWEDALEFILLGSSNLQVTTSVMQYGYRVVEDMISGLSHFMDENGFEKLEDMVGIAIKNIIPAEDLDREYIVYPEVNEEKCLGCGRCYISCYDGAHQAIKWNSEERKPEVNKDRCVGCHLCALVCPVTAIGKGEIKFKNNGKEREIIL >NC_010723.1|WP_012451090.1|2212960_2213422_-|DUF1097-domain-containing-protein MSSLFSLSLTTAILCGAWMIGADAAGLIAWAGFAGCTTFFAAGGKKQGFKSAICTNISGVFWAMLSIKVSAMLGFPQAGVIMTIVTTFFLCIQSKISLLAFIPGAFVGSFSTFAANGDWMSLIPSLLVGAVLGFLCEWTGNLLYEKCGKKEEN >NC_010723.1|WP_012449484.1|2211339_2212662_-|amino-acid-permease MENNNLKKEISLFMATMLVCGNMIGSGVFMLPATLAQVSGPLATIIAWIITTIGSILIAISFANLGSKYPATGGAYQYTKEAFGEFTGFLSAWLYWNGSWIGNAAIIVALSSYSASIIPALQNPLASIIYTSSLLWIFTILNIVGVKEAGKIQTFVTVFKIAFFGVFIIAAFLNFDKINLMPLMPDGKGLSTIPLAATSTLWAFVGLESSTVTAGEIRDPEKNVRKSTIYGLIIASIIYILISVGSMGAMSNANLSNSSAPLTDILTNVFGNSIGKGLTIAVVICILGTTIGWLLSTARVSYAAGIDGVFPKFFGKLHPKYGTPINSLIAGSVLVNILLIMNYQKSMVSAFTFITILATLSFLPVYLLTVSAEMMLTFRDEKKFNFKIFMKKSTIPLLAFAYSIWTIYGSGAETVMWGFILMLIGIPFYIYNHYNSKQTS >NC_010723.1|WP_012451487.1|2210523_2211072_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKNLEKIEVRDFKSFFNLLEKSFPNIERRSREGQKEIFDDDLYKVYGVKDNVGNVVGFIATWEFDKFNFIEHFAVDASLRGNGMGTRLLKEYIQNSNKPIYLEVEYPNDDICIRRIDFYKRLGFNLNEFDYLQLPLQIGNELLPLKIMTYPSKVSNDKFIYFRKNVYEKVYKQNSCSNSKF >NC_010723.1|WP_012450578.1|2208987_2210070_-|alpha/beta-fold-hydrolase MCKNIKKTIAIFTMMVLMTLCFELPYQQVFAFDKASLESIYVSEENYEEKMKDVVEPYIDNIKETGFVKGQEGIDIYYEMYKLNDSKGNIVISHGFSESLEKYNEIIYYFLNQGYSVFGLEHRGHGRSGSLGIKDKSQINVKDFEHYVLDLKELMDEVVVPNSDGEKVFLFAHSMGGGIGSKFLEEYPEYFDAAVLTSPMLEINTGKVPSSIAKLIANTSVALSFGDKYIAGQGKYDDTYDLKGSDTSSDARCRYYHSIVSGNDELQRGGASYNWLQTSIYATKEITKKDNAAKVEIPVMLMQADKDDFVKPGGQNNFTKYAQDCDKVFYEGSKHGLFRENDKILHDYLNNLFVFYEANL >NC_010723.1|WP_012450358.1|2226330_2226939_-|hypothetical-protein MALITFSTPVNDNRNEIYYKSTCARNEKDKQEKRTEQEFYKESDYELMNKLKEKELELKERELDIKEEKIKIKEKEISINQREIDIKENTEKLNGLLIMLNKKENGLKEKEAKIHEMEIKVKESKEILDNLSMSFNKKEDELKEKESNLKQTEVKLSQKEQYLNKVEMNLKQIENKNNYNSNYKQGRNNRRDYYGNNYYDSF >NC_010723.1|WP_012449593.1|2227210_2228260_-|hypothetical-protein MAKVNYINQASFHDPGVDCLKITEAPIIIKAETKVFSYKYVFSEADCNCSENCYPGKGDDVGFTLIFGNYGEETYTPTSTTDPTVIDTLDLSNIYNASLKVMDLCIGKNFKVFDITGVTPGSGQGREVIPGETEFIGGSVYTLEIRECYENPETGEKCTAAFCLPCHSVFCITMLFQVEFTPCSKLKNGGFCNGTTPSLENWIAIPATGGGTVQAVASYISSTNVNVTPKDGDCGFALLKTGDAEVKSILKQTFEVKAGDILSFYAFFDLMDIPGWPDEAQVIVIKNSSGNVIDTIVTKNAHYVSTDWEYYYYNVEECGTITFEASVKNGVDNISDGYLAIDAVSITHS >NC_010723.1|WP_012449590.1|2228474_2231627_-|ATP-dependent-helicase MKLLDLEFKLLRGLSKISLTRGKNIITDNKLVRLNGKKIEDSYNIYGKIKDDKLKEYNPHLRFNLKNGKVTLAKCECHEEKYDEDLGRMVICEHLVAIILTFFDKIKKQSNKDNIENVKKETVKYILDEKSNKELLDIDVVLNEVKDKNGDYFEANFFIGSKIKYLVNIKEFISNYIKKENFYIAKGFIYSYKKYYFNEDDEELIEFLEEYLSICRLELNTGNIKIFPQNIRRFLSFIQKKKIKFKYNYQNYLCDIKTTDLPISFTFKKIKEDYVLSTKKVFPIPLNKKMNAFLYDRKIYISSIKHLQSYIKFYEDLKEYGKIIFSKDTCIKDINKVIEVLNEISNDINIEQDIIDDLDKLISFKFKLTNIKNHRIIKVKIIRGNLELEYTNDNINSNYIIKRSRKVRNIESEMNKLRFFYNDGDFIFQGNDDEYYEFLKNGINNIKKMGEVNNFKEEKAFTLFDGSFLHYNLKSNNEEHTSFMFSLSDFSSSDLNKLYIGWKEKKSYIKLNDDSFVNLEDEDMTNFFKIVENLNLDIMSENNSYIVENNKLYYLNEKLNSKKYNVNGVEIFKEALNKLENLDDEKIFIPSNLNATLREYQVKGYRWLKNLSKLGFGGILADEMGLGKTIQIISFLLSEPNKKAFVITPTSLIYNWDEEFKKFAPSLKVGIIHGDLKARNKVLDDIEKYDLIITTYGTLRNDYLKYENIKFNYLIIDEAQNISNPKAKVTEVVKGIKANIRFALTGTPIENNLIDLWSLFDFIMPGYLFSKDEFSKKFTNNDEKSKQELRIMINPYILRRLKKDVIKELPNKIEDRFFVEMTKNQKKMYKIYVKDIQDKLKQIDSRNNRITIFAYLTRLRQLCLDPSIIVEDYDGGSGKINVAKELIKKSIKNNHKILLFSQFTSVLHKVCDELKGEQISYLYLDGSTPSKERIRLAHEFNNNEDIKIFLISLKAGGTGLNLTSADMVIHFDPWWNPAIEDQATDRAHRIGQKNVVRVIKLITKESIEEKILLLQEDKKALIEDVITGELKEDGLINKLSRDELLELLKI >NC_010723.1|WP_012451406.1|2231833_2232352_-|molecular-chaperone-DnaJ MDPYKVLGLNEGASKDDIKERYQEIIGSYNESDQNEYNQSILKDVNIAYDVLVNGNLYKEVRSLIEKNNFLEAEAKLNVADDKTSAEWNYLQGFIAVQKGWFETALAYLKTSTEIEPNNIEYLDSLNKLQAKVMEFASNYARKNANNKNTNNNNNNMNACGGGGGGGNGGMC >NC_010723.1|WP_012450666.1|2232542_2234981_-|DNA-helicase-RecQ MKSKELELLEKYYGYKSFRKGQENIISNIIDGNDVLAIMPTGGGKSICYQVPALIFEGLTIVISPLISLMKDQVDALKDMGINGEFINSSISSAEENRVIDNIRNGQCKILYVAPERLESLNFLNVISECSVSQIAIDEAHCISQWGHDFRTSYTKVSGFIKLLKTRPIITAFTATASEEVREDIIKLLNLNKPKIFITGFDRENLLINVIKSGDKKSYLHNYINNNKESSGVIYAATRKEVDKIHEELSHNGFSITKYHAGLSENDRKQNQEDFIYDRSNIMVATNAFGMGIDKPNIRFVVHYNMPKNIEGYYQEIGRAGRDGEKSECILLFSPQDVQIQKYLIEQSIENIDRKNNQYKKLNEMTDFVYSNECYRKYILDYFGEVYDHNCNNCSNCLNEGELVDKTIDAQKVLSCIYRMKNKFGSGMLVDVLRGSKNKKVIQFNFNELSTYGIMKDYSNDELKNFINTLISHRYISVVNGTYPVLGLNQRSMSVLKSEEKVVFKEFKIEKKAREDNELYSILKEIRKEISVENGVPPYVIFGDATLKEMTVKYPVNKEQMLNISGVGEIKYKKYGEIFENEIKKFIKENNIEISNEINEKEEVKMESIHLDINTNEELFNKLDEIRHEFAKKENTIPKMIISKNSLKEISGRYPINIDELKDISGIGPKKISLYGEKLILAVNDYIAQNNIEIKWVNRKKRKVIIDGEDREDNEIAIDMLKDGKKLNEICDEIEVSISTILGYVTDYIKEFGESNFDLNLEDFYNEEEEDIIGDVCEKIGYEKISAIKKQLPPYIKYETIRAVILKKYFLR >NC_010723.1|WP_012450102.1|2235379_2236177_-|glycoside-hydrolase MKGIDISNHNGEIKFASVKSSGVELVYIKATEGTTYQDPMLNQYYNGANSEGLRTGFYHFLVGTSAPESQAQNFYDNIKGKTNDLKPCLDIEKNGFDVMDFALRFIKKFESLSGLPLCIYSYPYFINNNLDSRLAKYPLWVANYGVQTPIPNNVWGDSYVGHQYSETGNVNGINGNVDLDTFYDGILVNKIDKAYVVTQYLPNGYNGDGSFQGVDLNYVLSYMPGVRCYALGDSKGVWIETQMLTMEKCLELKQTLGSWFYDIRQ >NC_010723.1|WP_012451062.1|2236233_2236500_-|hypothetical-protein MEKCLNEWNVHRYVRKQDREVLKTALKENVDRTFTPITVCSQIADGTNYMFICASIDNISKLKVELVKIYVYVSKDGKVQLNNIEKCN >NC_010723.1|WP_012450492.1|2236542_2236794_-|holin MDFMTYISQNALILIPALYIVGMVIRGTESIPNKFIPFILLIIGIVGAMFLLGFNINGAIQGILVTGVTVYTNQLFKQYNKNE >NC_010723.1|WP_012451473.1|2237502_2238555_-|serine-protease MKKAFLRRILGGVVAVATITSLSPLGVSAAGKNNTNNNCATTQCWSKVYGTWFCLGSNGQIQIGNQTTNNNPGCNLQFGWVTCPTQPNKPGDNNGSDNTIVPEVPGDNNGSNDTTVPEVPGDNNGSDDTTVPEVPGDNNGSNDTIVPEVPGDNNGSGNTTVPETPGDNNESENTSKPDNNGNNGTVKPEQPGDTEENLPPTSGDSVNVNGLSKLPEKYSISVQSSAENKILQLMNEKRVQAGLKPLTMDNTLLQVARYKSNHMIQYNYFDHTNPDGTKWVNWLQTIGYKYNTTGENIAYNTYDPVELFNQWWNSQGHRENMMNPSYTKVGVGVVYDKDNNKYMGTQTFSN >NC_010723.1|WP_040968315.1|2238939_2242455_-|pyruvate:ferredoxin-(flavodoxin)-oxidoreductase MRRTKTMDGNTAAAHISYGFTEVAAIYPITPSSPMAEHVDEWASQGRKNIFGEPVKMVEMQSEAGAAGAMHGSLQAGALTTTYTASQGLLLMIPNMYKIAGEKLPCVMHVSARALATSSLSIFGDHQDVMAARQTGFAMLAETSVQEVMDLSGVAHLAAIKGKIPFVNFFDGFRTSHEIQKIEVIEQDELAKLVDYNAIDEFRKNSLNPNHPVTRGTAQNPDIYFQTREAVNKAYDDVPSIVEEYMSEITKLTGREYHCFDYYGAKDADRIIISMGSVNDVVEETVDYLNNNKQKVGLVKVRLYRPFSVERLLKVIPKSVKKIAVLDRTKEPGAIGEPLYLDVVRCLYGKKDAPIIVGGRFGLGSKDPTPSHIAAVFDNLISDEPKNQFTIGITDDLTNTSLKLHEDINATPEGTTSCKFWGLGSDGTVGANKSAIKIIGDHTDMYAQGYFDYDSKKSGGITVSHLRFGKELIKSRYLIDKADFIACHNQSYVYKYNVLKGLKKNARFLLNTIWDKDELDEKLPASMKKFIAENDIEFYTINAIKIAQEIGLGGRINMIMQAAFFKITNIIPVEDAVKYLKEAVVNSYGKKGEKVVRMNNDAIEAGVEGVVKIEIPAGWKNSIDEKNEFSKDLPAFIREIVNPMNRLEGDSLPVSTFVKHNLEDGTFMAGTTAYEKRGIAVNVPEWLQDKCIQCNQCSYVCPHATIRPFLLNEEEKSKAPSSIKLIEPKALKSDEKLYYSIGVTPLDCTGCGNCVEVCPAPGKALIMKPQASQHDQIEVWDYTVEKVTNKNPMNKNTVKGSQFEIPLLEYSGACAGCGETPYAKLITQLFGDRMMIANATGCSSIWASGAPATAYTKNQQGHGPAWANSLFEDNAEFGYGMHLGVKAIRERIAHNIEVALNSDLSENTKEVLKDWLDHKDCGEGTRDRSNKVIEVLEKENNELAKVILKDKEFLVNRSQWIFGGDGWSYDIGYGGLDHVIASGENVNIFIFDTEIYSNTGGQASKSTPTAAIAKFAASGKRTKKKDLGMIAMTYGYVYVAQIAMGADKNQTLKAICEAENYDGPSLIIAYAPCISHGIKIGMSNSQEEEKKAVECGYWSLYRYNPTLKGVKNPFSLDSKEPKGNFREFLMGEVRYSSLAKVFPELSEELFKKTEEDAIERYNNYKKLASQE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010723_6 | 2731332-2731426 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010723_6
|
1 spacers
spacers of NC_010723_6
>6.1|2731362|35|NC_010723|CRISPRCasFinder GTTATTAAACGCAGGAAACAACGACCCTCCTAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010723_6
The CRISPR arrays of NC_010723_6 >merge|NC_010723|6|2731332-2731426|CRISPRCasFinder AAAAGTTATTTACATATGTTTAGTTCTTATGTTATTAAACGCAGGAAACAACGACCCTCCTAAGAAAAAGTTATTTACATATGTTTAGTTCTTAT >NC_010723|6|5|2731332-2731426|CRISPRCasFinder AAAAGTTATTTACATATGTTTAGTTCTTAT GTTATTAAACGCAGGAAACAACGACCCTCCTAAGA AAAAGTTATTTACATATGTTTAGTTCTTAT
>NC_010723.1|WP_012449497.1|2730578_2731124_-|hypothetical-protein MNNKIKQMVYAALLTALAIIIPIQFGFLKVVIPPFTATLASHVPMMLAMLISPAVSIVVGIGSALGFLISGMPMVVVFRAATHILVGYVGAKIMIKSRNYMKATIITAPIHGIAEMVVVIPFIGFDLFQLLIVTAVGTIIHHFIDGAIAYSLAKAMSKARKTDIYHVFGEFCEDKDVQAQI >NC_010723.1|WP_012450476.1|2727779_2730065_-|AAA-family-ATPase MKSELLYEEEILEEKRSLILEELNEKRINREKVNEKIRYLSKESKGSYNEEKETTEKIYGVLQKDIDGYEEALETPYFGRVDFTEKFGFEENIYIGKKGITNNMRGEEVVVDWRAPIADLYYSGTGGEAYYKAPAGLIEGKLLLKRKFLFDDGKIKDIFDDSLNELMINGEEGTELVDEFLKINLEESRGKKLKEVVSTIQKEQNEIIRWPKNFPIIVQGSAGSGKTTIALHRLAYLIYRYKDSMKGDDILVLAPNKLFLDYISETLPNLGAEEVQQNTFEELVKSKFKLRGKIYSKDDKLRAIMEEDDDNKRNLIIKSAGFKGSIEFKNMIDKYIALVDSSTREIEDITIDGYVIFEKKEIVKLYLKDLKSYAINKRKDEIKRYLSLKIKEKIDVLLYSIDFRWESKIKNIKNTCEDLIERRKLLVEEYDKRDEIKNHILKNYKKQFNEYFKSWKGIGVSDIYYRFFTDDLFDFIGPENISSELLDFMKEDFLINYENKIIDEDDLAPLLYIRNLLEGIDEKEKFKHIVVDEAQDYSPFQIHLINSFSKGNSLTLVGDLAQGIYYYKGLKCWEDITKDLFQDKATYVQLTQSYRSTVEIIDFAKHTLKAQNLGLKDAKAVLRHGEEPKIIKFDESEKNIYKIIDKIIEKIRELGKISIAIITKDSKQAQKVEKILKNNSAYKFQRIKGKEACFLEDNVIIPSYLTKGLEFDCTIIYNPSKENYQNNILDQRLLYVMLTRALHYEYILKLDSLTHLIEENN >NC_010723.1|WP_003371054.1|2727428_2727680_-|DUF1292-domain-containing-protein MEEKEIMSFKDEAGNKVDFEAIARIYLDKTEYLLLSPVDESSDDANIFAFRVDRNKDDKEELNIVEDEKEFEAIKKEYKKLLY >NC_010723.1|WP_012451502.1|2727016_2727415_-|hypothetical-protein MKSSEIIEYLEKNGLSEVEEINITDEYILIKFFYDFDKEEIDAAENYANEDCDFDDDSDEWYNDFYMPYLNDIAMDNIESIIEEAMEDLDIEGKYRQIESETRNLGYVKFISVFANSDSEVDLDEVLIDYND >NC_010723.1|WP_012449558.1|2725988_2726204_+|hypothetical-protein MKIKDLLKLKRKIIVRKKLLNFLLVWFNPRNTLMIVLSKNLDKHIAKYQKILSLQHRHEKYRLDMVRLAIA >NC_010723.1|WP_012449728.1|2725367_2725556_-|DUF896-domain-containing-protein MNIENMKIEEVIEQINLLYKKSKEASLTEEEKELQQKLRKRYIDNVKKNFRAQLEGVELKNK >NC_010723.1|WP_012451064.1|2724436_2725351_-|HPr-kinase/phosphorylase MAVSVKRLINDFDLEVLVEGNEDVKIEVNDVNRPGLQLAGFYNYFAPERIQIIGKAEWSFLQDMQIEVRKKRVKKYLSFNITCLIISRGLDPHEEFIKEARKNNIWVLRSKSVTTKLISKITLYLADKLAPETRLHGVLVDVSGIGILITGESGIGKSETALELIKRGHRLITDDAVDIRESDGTLIGSSPKITIGMLEVRGIGIIDVTQLYGLSSVLEEKEIKLIMHFEHWKDDNDYDRLGIDNQYMDILGIPVKKLTVPVRPGRNIAVIIEAAAVNYRYSLMSKISPVDIIENRMSAVSDEA >NC_010723.1|WP_012451787.1|2722868_2724260_-|aminopeptidase MKSEKNNKNVWNKYEEKGVKEIFDFCDGYKNFMSICKTERECVKEVIKMAEDNGYKNIDDIIKNGGALKAGDKVYANNKGKTIALFIIGNESMEKGLKILGAHIDSPRLDAKQNPLYEDNEMVLLDTHYYGGIKKYQWVTLPLALHGVVVKKDGSIIDICIGEDESDPVVGVSDLLVHLSGDQLLKKGNKVVEGEDLNVLVGSMPLKGEEKDAVKANILKILKEKYDFEEEDFLSAEIEIVPAGKARDYGLDRSMVMAYGHDDRVCSYTSLMAMFDINECDKTCCCLLVDKEEVGSIGATGMQSKFFENIVAEVLDKVEGFSDIKLRRCLSNSKMLSSDVSAAFDPNYPSVMEKKNSAFFGRGMVFNKYTGARGKSGCNDANAEYMAELRRIMEKHDVSIQTAELGKVDAGGGGTIAYILAQYNMEVIDCGVALLNMHAPWELASKADIYETMRGYRAFLIEA >NC_010723.1|WP_012449949.1|2722388_2722640_-|holin MIDKSRFKNYGLWVSIAALIPLILKSFGVEVIQGDYEQIVQAILSILVMLGIVSNPTTDAKWFSDDKALEEPKNVEIDSKDSK >NC_010723.1|WP_012449927.1|2721396_2722230_+|PHP-domain-containing-protein MYKMDFHIHTSSSDGLLSPTEVVKRAKENSVSYLAITDHDTLSGLDAGIKCGKELGVTIIPGIELSTQYNNESIHLLGFFKDNNFNNSKLINELDKIKNHRIIRAKEIIKKLKSEFNIIISFDDVLANGKDTIARPHIARAIIDAGYDYDNEYIFQNFIGKDCKAYVPTLKLSTEDGISLLKSYNALVFLAHPKLISNSKIDDFLKMDLDGIEAIYFQNTKVEEEKFINIAIENNLLISCGSDFHGNLKDDKKHGDIGSMTMPSIYLENLLSALNIK >NC_010723.1|WP_012451634.1|2731609_2734021_-|homocysteine-methyltransferase MGLREFIKDNILVFDGAMGTMLQKEGLKLGENPEIFNIEESEKVKNVHKKYIENGAMVVTTNTFGANELKLDNTKYTVEEIIDAAISIAKGARENKGIYIALDIGPIGELLEPMGTLSFERAYDIFKRQMIQGEKSGADLILIETMTDLYEAKAALLAAKENTKLPVFCTMSFDESGRTFTGCTPESMALTLGGMGADAIGINCSLGPKELLPIVKRIKKATNLPIMTQPNAGLPKLSFGEAIYDIMPEEFKYWVNEFIKEGVSIIGGCCGTNPEFIKELRLLADSNKRLRRENIEFSAVCTPSKVVKIEGVKIIGERINPTGKKLFKEALKNNDIDYILKQAIEQVEAGADILDVNVGLPEINEKEMMKKVVKEIQGIIDTPLQIDSSNIEAVEAGLRTYNGKPIVNSVNGEDEVLEKVLPLVKKYGASVVGLTLDKKGIPATADERFKIAEKIVKKAKEYGIEKHDVFIDCLVLTASAQQAEVKETLKALRKVKEELGVKTLLGVSNISFGLPCRELINETFLAMAIANGLDLPIMNPNSTGMMDVINSYNVLTNIDKGCERYISIYGNREIQSGVRYNSKGENKSDKNEETQSNNSDLRYIVIKGLKDEAEEATKNILESMNELDVVNEILIPSLDEVGLKYEKGEIFLPQLIQCAETVKKSFEVIKKNIVINKSENISKGKIVLATVKGDIHDIGKNIVKVILENYGYEIIDLGKDVPIETVVDAVLKNDIRLVGLSALMTTTLKSMKETIKALKDNGYSGKTFVGGAVLTSEYAKEICADYYAKDAKESVEIAKKILG >NC_010723.1|WP_012451856.1|2734010_2734697_-|methionine-synthase MCNTKQLKIPKDEVLRYLGYKKQKLSESMNELIEETIDECRNLIIPKQVYCKYKKHDENDGVYIYKTNLILKGEDIKNHLLYANEVFIIAATVGNKIEQKIRLYEKINLTKALILDACATVAIEEFLDELEEKIRLDARKEDLAITFRYSPGYGDLPLDIQKDIVNVLNADKTIGLTVSSHSLLFPRKSVTAIIGLIPIEKEEKQRGCEVCKNYNNCNFRKEGINCGA >NC_010723.1|WP_012450205.1|2734698_2735154_-|S-ribosylhomocysteine-lyase MEKVESFELDHRKVKAPYIRKCCLLDGKCGDKVTKFDIRFLQPNKEEFGTAAMHGLEHLLAHELRAKLEGIIDLSPMGCRTGFYLSIWGDREASEIKEALEYSLEKVLEAKEIPAANDIQCGNYRDLSLFGAKEYAKEALERGFSLNIYGE >NC_010723.1|WP_012450429.1|2735195_2736074_-|methylenetetrahydrofolate-reductase-[NAD(P)H] MNIKNLFKDKKVVFSFEIFPPKTTSSIQTIYDTLDDLKGLNPDYMSVTYGAGGSVKNNNTIELSSLIKNKYGIEPVSHLTCINLTKKDVEYYLREFEKNNIENILALRGDVPIGSKITGELNHANELIKYISDNGNFNIAAACYPEGHIEHKGLYREIESMKRKEEAGVSYFISQLFFDNNLYYNFQDEVRAANINLPIEAGIMPVTNKRQIERILSLSGASLPDKFKRIMERYEHNPEALRDAGIAYAVEQIVDLISTGVDGIHLYIMNNPYVAKRISQSIQSILLTVNQI >NC_010723.1|WP_003369464.1|2736343_2737294_-|undecaprenyl/decaprenyl-phosphate-alpha-N-acetylglucosaminyl-1-phosphate-transferase MQYILAMIVTLLLSLLIMPIVMKLAIKLKFTDKPTKRKQHKKETPLCGGIVLYICFFISFFLFVKDDIKQQIVVFIAATAILLIGLIDDYYKTRFKEFAILPRLIIQLLSAVLVFKAGIAFMGFTNPFTGEFIELSKTIQFLLTITWIFGVTTVINWSDGMDGLAGGISLISAITFLLAAIILKQQVSAETSIILIGSILGFLYYNKFPAKVFMGDSGANFLGFILSVIALDGAFKQATVLSLFIPILALAVPIFDNLFVIFKRFSEGKPVYQADRSQIHFRLEEKGFTPKQVVNYIMIISSVFSAISVILLLIKI >NC_010723.1|WP_012450114.1|2737651_2739400_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKKILSAMLSLTLVFSLNTTSVWAASKDDSTKITIIHTNDTHSRVLSADGGFGFAKIATIVNETKKENPNTLLVDAGDTLHGKPIVNVSKGENAIKILDAAGYDFMVPGNHDFNYGNERLMELSKLAKNFKMLDANVKKNGKDMLPPYEIVEKGNVKIGIFGLSTPETAYKTNPANVKDVTFEDPIKVSEEMVKELKDKTDVIVALAHVGLDDSSVVTSKQIAEKVKGIDVIIDGHSHTTLNDGLMVNNTLIAQTGEYDQNLGVVELEVKDKKVTEKKAKLLNSKDYKELKEDEKVTDLLNDIQAENDKVFSEVVASNDVLLDGVRGNVRTKETNLGNLTADATREVTKADIAFVNGGTLRTSIEPGDITKGKLAELFPFGSVAQTVKLSGSDIVNALEVSVGAYPTEQGGFLQVSGMTFSFDPTKEKGNRTFDVKVGENPIDLNKEYTVAINDFLSQGGDGYTMLKTTVVGEFATYDDIFAKYLNDNGMKNDISLGRVQVKENGKQVVTNQNNVVTAPVVQTVQTPQEPVKTETVYTVIAGDNLTKIARRNNTTWQTLAQYNNLQNPDLIYVGDQIKIPA >NC_010723.1|WP_003374514.1|2739746_2740388_-|V-type-ATP-synthase-subunit-D MAKLNVNPTRMELSKLKKRLTTSTRSHKLLKDKQDELMRQFINLVKYNNKLRKEVEDNLQGSLKDFVMARAVMSSEFLEEAIVYPKEHISVEVGEKNVMSVSVPVMNFKRQLEGDEGSIYPYGFANTSSELDDTLSKLYEILPQLLELAEVEKSCQLMANEIESTRRRVNALEYMTIPQLQETIKYIRMRLDENERSATTRLMKVKSMIEQRG >NC_010723.1|WP_003370262.1|2740391_2741771_-|V-type-ATP-synthase-subunit-B MLKEYRTVTEVVGPLMVVEGVEGVKYDELVEIELHTGEKRRGKVLEVNGSKAMVQIFEGSSGINLKGTKAKFLGRPLELGVSEDMLGRVFDGMGRPNDNGPDIIPEKRVDINGEAINPMARDFPSEFIQTGVSAIDGLNTLVRGQKLPVFSAAGLPHAELAAQIARQAKVLNSDSKFAIVFAAIGITFEEAQFFQDEFKRTGAIDRSVLFMNLASDPAIERIATPRMALTCAEYLAYEKGMQVLVIMTDITNYAEALREISAARKEVPGRRGYPGYLYTDLSTLYERAGRLRGKEGSITQIPILTMPEDDKTHPIPDLTGYITEGQIILSRELYKKGIMPPIDVLPSLSRLKDKGIGKGKTREDHADTMNQLFAAYSQGKQAKELSAILGESALSDTDKKLAKFAEAFEDEYVSQGFNTNRTIEETLNLGWKLLKMLPRTELKRIRDEYLEKYMPREEE >NC_010723.1|WP_003372165.1|2741763_2743542_-|V-type-ATP-synthase-alpha-chain MKTGKIIKVSGPLVVAEGMDEANIYDVCKVGEKGLIGEIIEMRGDKASIQVYEETSGIGPGDPVVTTGEPLSVELGPGLIESMFDGIQRPLDAFMEAAKSSFLTRGVSVPSLNREKKWDFKPTAKVGDEVKSGDVIGTVQETPVVEQRIMIPIGIEGKIKEINAGSFTVTETIAIVETEKGDREVQLMQKWPVRKGRPYSAKINPVEPMLTGQRVIDTFFPVAKGGAAAIPGPFGAGKTVTQHQIAKWGDAEIVVYVGCGERGNEMTDVVNEFPELIDPKTGESLMKRTVLIANTSNMPVAAREASIYTGITIAEYFRDMGYAVSIMADSTSRWAEALREMSGRLEEMPGDEGYPAYLGSRLADYYERAGKVECLGNDGRIGSITAIGAVSPPGGDISEPVSQSTLRIVKVFWGLDAQLAYQRHFPTINWLTSYSLYADTIDKWMNGNVAENWGALRLEAMTILQDEAQLQEIVRLVGIDALSEKDRLKLDVAKSIREDYLQQNGFHEIDTYTSLKKQYKMLSLILGYRKEAERALEAGVYLNDILAMEDLKDRIARSKYIHEDDLEKMDQIVVDLKNAIDNLINKGGVANA >NC_010723.1|WP_003373988.1|2743559_2743871_-|V-type-ATP-synthase-subunit-F MFKKIGVVGDKDSVLAFKALGIDVFPVVGNEEAKKTVDKLAKNDYAVVFVTEHVAQGIEETIERYNKEVLPAVILIPSNQGTLNIGMQRISDNVEKAVGVNIL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010723_7 | 3197282-3197365 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010723_7
|
1 spacers
spacers of NC_010723_7
>7.1|3197306|36|NC_010723|CRISPRCasFinder AATAGGTAGTACCAAGCTCCGTTAACATTTTGCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010723_7
The CRISPR arrays of NC_010723_7 >merge|NC_010723|7|3197282-3197365|CRISPRCasFinder CCAGTTTGCATAGCACCATTTCCTAATAGGTAGTACCAAGCTCCGTTAACATTTTGCCATCCAGTTTGCATAGCACCATTTCCT >NC_010723|7|6|3197282-3197365|CRISPRCasFinder CCAGTTTGCATAGCACCATTTCCT AATAGGTAGTACCAAGCTCCGTTAACATTTTGCCAT CCAGTTTGCATAGCACCATTTCCT
>NC_010723.1|WP_012450041.1|3194619_3196926_-|surface-protein-PspA MREFMRHIHFKPIAMILTILFIQVAFILYLPCKDSYIAYADEVLHKDDTEKSYELSENLIGKSTELMSDENVLSNTENNQVDIILKDFNESHIVKESDNTENTESKHDKVQGESNNTTDGDNIIDKDDNASEKPDEGNTDETEQGGSSGNESSGGSDEDVPPEIDNKKQAIVPSINSFAEDMGKNREKLTVSATNINAQGEYTFIILASDKLNVCKHSATNSTLNKWFIPLIELSKGEQKLSYSTDGKNFFELSLDSNNKIPYYMRANITGAPNYTEKERDSILYFKYAEDGGDTAIKIRIHYIPSINANDNNNSGNVSGDILKSVSIYGTERIGSTLRAKIKYNNNTDKPKVSYQWLRCKDKDGEYKEISGADKEEYKLKSNDKGYYLKVKVTVSGEVSENKESNRSEVIKEKLKDNSSSSNSGSSSSNDYNSGIVVDTDKTNDEQMYLNTSYSSKVDKEIFDLTKEYEYEKLILEGSNYVWNFNASDLKNVSQMDDSFDSEIQTKAQRDSEVVINFKHHGVLPGKATVQVNVGDELNGNNRYLYYYNEETNSLELISSNISVKKGKATFTITHCSKYILSANPNSNSNISSSDYNTTIDKSTQNNYVNNVVNSDKTSNESNFNNVDSSSLKWRESMDGKWYLCSNSFIMTGWQKVDNNWYYFNEFGVMQKDWVNSNGKWYYLDNNGCMATGWIKSNNNWYYINSNGEISTGWKEFNKVWYYFNTNGEMQTGWQYIDYRWYYLYPDGSMAYNVEIDGRVLNQNGAAR >NC_010723.1|WP_012449881.1|3192558_3194232_-|choline-binding-protein-A MNKRLKRIIAIALTISAFSTIQPTKYINLFTTEAYAASSHISNLILNKTDTSNELKLYRDDEYDVSTEFRTSRNQYYAKTSLRSVNISCDTDSKYETYIFADSNKRSTAFEPDEEVELGKGTTTLYVRTYKEGRFDKNNVKNDVVDEYEIHIERTSSGSSNNSSLYLSSISLDYGKISFSKTKTSYDVDVNSSVDELEIKAKPSDEDYTVRIDGTKVKDSNGYEETVDLKKGKNVIEIAVTDEDDNEKIYTLNVYRGGRDSSSSDSSKEDNKQDPVYLDDLKLNNGDIKLDFNKKVTSYDVKVASTMDSVTIEAEPDDDEYEVTVNGKSVNSKNQRTVDLTLNKKNEIKVKVTNEDDEYRTYTLNITRGTVSSSNDNNNNNNSGTVTPGGTVTPGGGNNNNNSSNNNASAAKNKWVKTSNGNWQYYDENGLVLKNKWFKDTSKNKWYYLDANGDMKTNWLQNNGKWYYLNYDGSMMTGWTKINGFWYYLNTDGTMLVGWYKIGDNWYYSNADGAMRTGWLQEGKTKYYLNENGTMQKGQKTINGVNYNFDASGKLVE >NC_010723.1|WP_012451855.1|3190063_3192298_-|hypothetical-protein MKINLKRIISQILIFAVMITGIQLDNIKAASAVELNLGFVVEAGGANLDINKSSSNAYYTDEIDMSVSTINIKSSDTSYYKLEGVTSSSSGVKIASSTTNGVTSYKIAVTKYNDFNATIKVKDLGTQEVKSYNVTFKFKEENADTFKFNKIMIVASGSGGSMTLDLDYNSDGDDYYISGLGDDVDTAKVSIVDENGKAITSGVKITMDGKTGTFKLLGGENEILISRTVNGRTKTFKLVIAKKGSAKLKSLTGITLSPRFDPETTDYTATVPTATDKVILKPTAADNSSTIRINGVLVTSGANSQPISLKEGKNDITIRVTTKDGEVGVYNLEVTRTEAPRSSYLKSLKINSASLSPSFNKQTFDYTATVENKVTAVTVTPTAEYATSTIKVNGKTVVSGGTTGYISLDEGSNEIEIKVTDAKGDTSTYDIVITRRYGKDNVKLSNLKSTEGTLSPKFDPETYLYTVKVDRAIGRTKLVFTAQNDKAVVKINGKEYASAQESDYIDLKIGANLINIEVVAEDKKTTTLYRVSVIRDKIQAINEWVLSGDDWTFYDALGYQVKNKWVKYDNQWYFVNINGYMEKNGWLNESGEWYYLNGDGTMKTGWFKDNGYWYYLQGDGKMKNSGWGYYDKEWYMFGPNGMLETGWKQHKGNWYFLLDNGTMRRGWQYYDLNWYYLNDDGTMKKGWLYDGKNYYYLNNSGVMKTGWQRINGKDYYFDSAGKMKTGFIFLDGKWYNLGQDGSLS >NC_010723.1|WP_012450883.1|3187665_3189480_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIKRMNKLTALLVAATAVASIVPTGVSAADYKRIESKDGTIYNAVAFKDGKFFVDGNVKDGDTDAAYYLNDGKYSELDNIDTGVDVDGIYSDKYLSVDGGDYYIDLETGKVIDEDLVENNLDDLAVSLRKQIKDKVDDRYTTEHDTLKSVKDFTLLEGAKFANAWYGVKYDGNNVYTDIKGNYIDADYNLGKIKVEVTTGSSTKSVTLNNTEDTEKSITDGQKVSAKIADANVIGQDDKNIYRTATIEISAGTDTVAKINNVDVTAKDGKVEFKVIQKISKAQASDDIDGAKYAKTVANYAITNEKGVDATAELADMSFNIVDGKLVAYKTTESNGKTNVTVKTVKFSTERGYTYTEIENADDQDATAFDIDVDGNMWALDGGFVYKFDNADEWTKVYKVDGSMDQMSVYNKDNMVVWNENDEVYSVIGSKDESGETEDSQGWVQAEDGSWTFVKEDGTKATGWLNDNGTWFYLNSNGAMMTGWQNVNGTWYYLNPVSDGTRGAMKTGWINDNGTWYYTNASGAMQTGWQNVNGTWYFMQGSGAMQTGWLNDNGTWYYLQASGAMKTGWLNDNGTWYFLNASGKMLSNTVVDGYKLGANGAWIR >NC_010723.1|WP_012450441.1|3185064_3187569_-|LuxR-family-transcriptional-regulator MIINPESLKNINSEYILNRKRIVKKVDSCLSCSNIVYFFAPIGSGKTIAMNYYVQKIKIDVLWFEMERKDNNNINLFNSLFKILNKFNDNKKRIVVLDSFDLISDSQRLEEFITLINKFSQNFKYIFLSRKKIPACFSLFIAKSMIQVVNSKDLCFNKDEINEFYSKNGIMLSQNKINKLIETTRGWPAILSIFLMCLKLQLTSNFESLFVHNEYVNDFIYKNIWKKFNPEIQRFLIILSLCDEIEINQYKEIIGEEDLEDFLEEVMNLHNNNVYVLNPIMRNFLIDRQSELADEEKVDVYKKVGIWYEKSNLNLEAAKYYGKANDYKNEIRNLEKFCSKKIEFKKIEIVEDYIRNLPQDILKNNSTLCATMAFICIIYYKLDEAIKWYENLLNIRDELNEKVKSISKNEDGKIYTTKEFLKYSRILLETEKNIDFIYFHMPHFNNKDMVKKFLEMKIKKPKYNNKFIENISLTFNFPSIINGIIDISSICVNYNEKFKEKKNLISDIYGDYGISLFNLACAEIDYEKENINKCLIKLTSEIIDYKRKAHIDMLFVAYIIFSKSMIVNGYINEAKIHLTTLKEFIKEKEADYLMKNFEAVYARINLLNGKLKEANDWILLYPTETEPRFNLLDMYKYFTKARIYIANGDYIKANTFLQIIYKLNYEYNNTYRIAECCILQSIALFNSKDEQLAFAKMEEALILMQNFDYTRIFADEGEACYKVLNNYIKSKDKDKRLDEKYIKKILLRTREFGAIYPKYLKIFDEFPEIYLTKSEIKILYLINKGMSNIEISEYLNIKKDTVKFHTKNIYSKLNVKNRIQAIKVAKEFGIIKEI >NC_010723.1|WP_012450702.1|3184418_3184736_-|hypothetical-protein MDLDYSGWRNLDGKWYFFKDGSMKKGWVQDGYAWYYLNDDGEMQKGWIKDGESEYFTSPRGIMQTGWIDDCGILYYANKNGVIQKGKTTIEGKEYNFSRDGKLNS >NC_010723.1|WP_012450307.1|3182126_3183839_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MDFYKNLKVRTKLMGSFCFMAIIVILLGIIVNNSIVKLNNAEKQMYKVNLQAMDKILSIKSNLETINGDILIIMHDKDVNMIEKSKKEIQNKVEENNKHIEEYESLNISDKEKQAWNEFKSDLDKYRTERNILVQNIYEEKYEEAELKYLDISPIRDNMLKSLNTLVKTNHNIAEASNKNNKDTFTKARRNIRLIVIASIFVAIALGLTSSISISKLLDKMKNFSERLASYDFSEPLILGTNNEFGQTADSLNKMQENVRELVKNIMDDSQDISSASEELSATVEELSANAMHINEAVNEIANGMYETSATSQEVTAAVEEVDLSINQLSSKAIQGSNNASEFKEKALVVQNNSKIAIENTEKLYIEKEKRMMKAIEDGRVVDNIRGMADTIANIASQTNLLALNAAIEAARAGEAGKGFAVVADEVRTLAEQSSLAVIGIQDTIVEVNKAFKISINTGTDILKFINDDIQKQFNAYGEAGHQYYNDSDFVSKMSEEISSMSQNVASTIGGVSKAIQNMDTIAQNSNERVDLIKESVNENTRAINEIALAAQGQAELAQKLTEMVQKFKI >NC_010723.1|WP_012450059.1|3180187_3181792_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIKRIKKIMALVLVATSVVAIAPREMFKGNVTAYAATTKEGEWTEANEAQVQAGLKKYLKDNVCNSADEIKLTFMKYVKVDLSKETIEKIVTPIVTKEVTAQITEKVTAGAIAEAKKKQPELAALPDEKIAQMLKPQIDAKVKELVSQILPGKIQETTAQLQSATQQIPVYQYVGVKSDGTVVGMGVIAGGPIAGMLLPQKAIYVDTTKLGTVGNAVLPELIGKLEEAIKNLGGNISGIIGNISGTITGALDDVADSVDKISNSITDLFDDLDDSTDDFFDKINKDEGWDKHDGYVYYYDEDGIKYRGVHEIKGKNYYFNRVDGAMETGWQIVYGKRCYFSPKKGYQLYSQWIKDGDKIYCLDEKGEVRKSQWAQDGANSCYLKADGTVAKGWYSVNRDERYYFNETTGYIETSKWIYDDQEWYYLKDSGVAATDWECINGKWYCFKSTGKMYSGWFRNEGNWYYSDSTGAMQTGWVYHKNKWFYLDDSGKMKKNEWISVNGKWYYFNLNGEMITSSRYIDGIKYHFNSDGSLQ >NC_010723.1|WP_012451415.1|3179026_3179902_-|surface-protein-PspC MNKKLKRIIAITLIIGAVSSVLPANYKVFNNEKVYASTKDDYLLKKLSVFEAKSGDEVDLLDNEWKKTNFNKKSKENYCVKVDSNIDSIRIDTSTDAEDYAIYKDDGKKNYKGKDILLYDGITKIYIKTYDSKSDADDDKNVKKEYKLTVKKSLDSNEGISSSDDNDIKNQNNSLSKFDNKVLNNAKRNQWVIVNGLWKYNNYLGDSLKDEWYHDTFNDKWYFLDSYGNMVTGWLNKGEQWYYFDSNGEMVTGWRSINGQWYYFNLLGKMMIERVLDNGKWYYFLPSGEMI >NC_010723.1|WP_012451156.1|3177519_3178866_-|hypothetical-protein MNKRLKHIIAATLVVSAFTTITPAKYINLGAINAYASSSSISKDEFDDLVVCKGSSSKELQLYSSSSCKDSDEIDFKFGTKTYYVKISGSTNSVTIDAEVDSDYEAHVFKGNKDEPYDLGEEIKVGSGTTTLYVRIYEDGEFDEDDVEEDVVRTYKICVKNGSSSDDEDDSDSDKVYLKDLTLSDGVINFSKQKTSYDINVNESVNSIKIKAVPKNEDDYTVEIDGDKVDDGDKYKKEVDLKKGKNTIKINIEDDDDNKRTYILNITRGGTSTSGNQSINNNTNNKQDQNTVKPSTPADINKKFDQWVNANGKWQYNDSNGNIIKSKWHSDKSSGKWYYLDENGYMKTGWLKDGELWYYLDDNGAMKTGWLLLGSDWYYLNSNGSMHTGWLQSGSNWYFINRNTGVMKSNGWIVDNGKYYYFSSSGMMLSNVTINGYILGQDGAWIGR >NC_010723.1|WP_012451553.1|3199512_3200994_+|DUF2334-domain-containing-protein MNKFFTYILLSLSLISLTGCNDINNSKSQIPENTNNTIENKIMDEDLTSDNLSKNNNLTLIDYSNFKDLGINKDNVTLKINGHDLDFNLPIYLDKNRYYFSLNEIIHNLNGTFTKDEDCLYLNIHDEIYSINLLDNTIHCPNKEFKLKKDLLNSENIYYICFFDLSNMLDLYTRWDKDNKIINCKINSNQYINDTSSKVNNDNYKNNSLNNELEDKNNSTSASSKNTQIGLIRFEDVCVTSQGYDKNYFENLRIIGEYMNEQNIPYHIAWIPRYKNPNFKIDNDPLTKNNFEIAEMVYTLDYLKNNNGIIGLHGYTHQFGNYESAAGFEFGKFEPSTDVFKEKIEKAIETASYLDIPIDFFEVPHYEITPEQNKIAEKYFKILYYPFNDYGVDKADLKMPQLSPYNNSSLYISTPLDYIAEGKENICLDRIKNSDISNMGSVFFHPSLENAFISLNEDSDGYPSFNYADNSILKRLVTILKEKGFKITKVTEL >NC_010723.1|WP_012450989.1|3201102_3203142_-|M13-family-metallopeptidase MAKFKKSRLIACALVFSLFMSQATYVKAAEVTNTVNLGNKVVADDVRLQDDFYSVTNKEWLNTAKIDAGEVSNSAFNEAEKALTEQKKEIMKELLANEKNYSKDSDEKKMINLYKNVLNSEARNKQGIEPIKGMLDKIKNIKTLDDIRELNKYDIGNPLINIGCSVDLKDATRYAAYVGSTSLSLGNSDEYVKPTENTARVKGLSENYYKKILTLVGYTEEEAKMKVDNFYKLEYMIAPSIIGKEESTKNPNAIDDEYNVYTLDKLNDVSPNLKIKDLMKDLKIDKANKIILTEPNWLKAMNDIYTEENVPLIKDYIEIRNIAGAAGCLGDDFEKAAQEFSNAYLGSSGETPKDEEAINIVNSALAMPFGKIYVEKYFSKKTKNDVKDMTDEIIKTYEKRIENLDWMSDSTKKSAKEKLNKISVQIGYPEKWEDYSSLKIRSYEEGGSLFENLMNLSKFAEDKQLSVLNERVDKSQFACPPQMVNAFYNPTANSITVPAGILQQQFYDVNASKEHNLGAIGAVIGHEISHAFDNTGAKFDGDGNLNSWWSTEDSKKFEEKTNKVRSFYNNVKLDSGKNVNGDLTVGENIADLGGIACALDILNNMPKADYKVFFESNANVWREISTKEYGELKLQNDVHSPNKVRTNIVLSQFDEFYKTYGIKENDKMYVNPQDRLKIW >NC_010723.1|WP_012450432.1|3203593_3204088_-|hypothetical-protein MYNVEHFDNDLYFLCSMIEYVGRETHNKRIDIINKIGFHNLKHEYICACVNHCLPVERVCAEWIENYKIEQGTFDNLATVDGIETPDFWSIGDVYMNLILNTLDYEYKAKDSETNSDHDSLIKHLMEVYNSSLAKVIDDYNNIVFTRSPMYLWDCYIKNEILDF >NC_010723.1|WP_012449860.1|3204080_3204596_-|DUF3990-domain-containing-protein MTKFHSTNNSINNTVNNLESIGVYHGSDCIVEKPQIFTKGYYKDFGFGFYVTKIKKQAERWTLKKEPKVVNIYEIDKNYKENLNVKIFSEMTEEWLDFITACRSGKSHDYDIVEGPMADDTIFQFVNMFISKRITREAFWALCKFKYPTHQILFATEKSLNYLKYKGCYYV >NC_010723.1|WP_012450830.1|3204921_3205656_-|phage-protein MERKIVKLRVDMYNDTKFKIIDTMEHRDLIHYIWTRLLTLAGKVNLEGKLYLSRSIPYTIETLALEFNRSVKKVELALKVFMDLEMIELGENNVYKVRNFAKHQNIKPKKKEDSNDKKDSNVNIESINVRDNINKKDNIEIQNKDILDKINLNKASATENFLNNKSDVKNKIELKDKSDLDAEFVFSKANDNKKRSKPKIKNKKVSKKNDNEIISSWDDEADDIKICEFTDEPPKGKLIATFKV >NC_010723.1|WP_003373918.1|3205897_3206746_-|glycosyltransferase MKISVICPLYNAENYIYNLNNNILTQELDSEQELEILYVLTRSIDKSEDILKKLNCNYCVVEPKKFSHSLTREIMANKVSGDIIVFISQDVKMKNKLWLKNLVTPIISGECEASFSRQICENNSIEKYTREKNYPEESRVVSKKDIEKYGLLTFFYSDASSAVNAKIYRELNAYDGKDMPTNEDMYFAHKLIHAGYRIKYCADSEVYHSHDFTFKQLYNRYYDTGVFFKENSYLMKYKGNESGFTLAKYVFKRALKERNIKVIFSLLPNFGVRYIAMKIGQK >NC_010723.1|WP_012450659.1|3206865_3207699_+|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010723_4 | 4.6|1754149|36|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1754149-1754184 | 36 | NC_010723.1 | 969909-969944 | 0 | 1.0 |
1. spacer 4.6|1754149|36|NC_010723|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 969909-969944, mismatch: 0, identity: 1.0
tcaaacacttggagtttttacagatactataataat CRISPR spacer tcaaacacttggagtttttacagatactataataat Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010723_3 | 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR | 1670841-1670871 | 31 | KY653126 | Staphylococcus phage IME1354_01, complete genome | 7172-7202 | 6 | 0.806 |
NC_010723_3 | 3.2|1670911|27|NC_010723|PILER-CR | 1670911-1670937 | 27 | LC576631 | Staphylococcus phage vB_SauH_DELF3 DNA, complete sequence | 121434-121460 | 7 | 0.741 |
NC_010723_3 | 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR | 1670841-1670871 | 31 | MK936476 | Staphylococcus phage SA46-CL1, complete genome | 4739-4769 | 8 | 0.742 |
NC_010723_3 | 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR | 1670841-1670871 | 31 | MK764384 | Staphylococcus phage SA46-CTH2, complete genome | 4738-4768 | 8 | 0.742 |
NC_010723_3 | 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR | 1670841-1670871 | 31 | MK903033 | Staphylococcus phage SA44-CTH7, complete genome | 4739-4769 | 8 | 0.742 |
NC_010723_3 | 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR | 1670841-1670871 | 31 | KU878088 | Bacillus phage AR9, complete genome | 33657-33687 | 8 | 0.742 |
NC_010723_3 | 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR | 1670841-1670871 | 31 | NC_031008 | Staphylococcus phage SLPW, complete genome | 4489-4519 | 8 | 0.742 |
NC_010723_3 | 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR | 1670841-1670871 | 31 | KF926093 | Lactococcus phage phiL47, complete genome | 1301-1331 | 8 | 0.742 |
NC_010723_3 | 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR | 1670841-1670871 | 31 | NC_049857 | Lactococcus phage P1048, complete genome | 1300-1330 | 8 | 0.742 |
NC_010723_2 | 2.1|1666850|34|NC_010723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1666850-1666883 | 34 | NZ_CP047113 | Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.1, complete sequence | 5294-5327 | 9 | 0.735 |
NC_010723_2 | 2.1|1666850|34|NC_010723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1666850-1666883 | 34 | NZ_CP053900 | Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-2, complete sequence | 24237-24270 | 9 | 0.735 |
1. spacer 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR matches to KY653126 (Staphylococcus phage IME1354_01, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
atagtatgtccatattgatttaatatatccc CRISPR spacer attggttgtccatagtgattgaatatatctc Protospacer ** * ******** ***** ********.*
2. spacer 3.2|1670911|27|NC_010723|PILER-CR matches to LC576631 (Staphylococcus phage vB_SauH_DELF3 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
gaatttaggttggcaaatgaataaggt CRISPR spacer tgtgttaggatggcaaatgaataagta Protospacer . ***** ***************
3. spacer 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR matches to MK936476 (Staphylococcus phage SA46-CL1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
atagtatgtccatattgatttaatatatccc CRISPR spacer ttaatatctccatattgatttaataattgga Protospacer **.*** ***************** *
4. spacer 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR matches to MK764384 (Staphylococcus phage SA46-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
atagtatgtccatattgatttaatatatccc CRISPR spacer ttaatatctccatattgatttaataattgga Protospacer **.*** ***************** *
5. spacer 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR matches to MK903033 (Staphylococcus phage SA44-CTH7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
atagtatgtccatattgatttaatatatccc CRISPR spacer ttaatatctccatattgatttaataattgga Protospacer **.*** ***************** *
6. spacer 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
atagtatgtccatattgatttaatatatccc CRISPR spacer catctatgtccatgttgatttaataaatttc Protospacer *********.*********** **..*
7. spacer 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR matches to NC_031008 (Staphylococcus phage SLPW, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
atagtatgtccatattgatttaatatatccc CRISPR spacer ttaatatctccatattgatttaataattgga Protospacer **.*** ***************** *
8. spacer 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR matches to KF926093 (Lactococcus phage phiL47, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
atagtatgtccatattgatttaatatatccc CRISPR spacer gtgatatttccatattgatttaatttaacta Protospacer .*..*** **************** ** *.
9. spacer 3.1|1670841|31|NC_010723|PILER-CR matches to NC_049857 (Lactococcus phage P1048, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
atagtatgtccatattgatttaatatatccc CRISPR spacer gtgatatttccatattgatttaatttaacta Protospacer .*..*** **************** ** *.
10. spacer 2.1|1666850|34|NC_010723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP047113 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tcatcacatacgttaaatatatttttaactacct CRISPR spacer actttgcatacggtaaaaatatttttaactatga Protospacer * *..****** **** *************.
11. spacer 2.1|1666850|34|NC_010723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053900 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tcatcacatacgttaaatatatttttaactacct CRISPR spacer actttgcatacggtaaaaatatttttaactatga Protospacer * *..****** **** *************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
447565 : 500724
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010723|447565:500724|DBSCAN-SWA GATGGATAAAAAATTAATTTTAGCGATAGAATCAAGTTGTGATGAAACTTCAGCAGCAGTTGTTGTTAATGGAAGAGAAGTTTTATCTAATGTTATATCTACACAAATAGATACTCATAAAAAATTTGGTGGTGTAGTACCAGAAGTTGCATCTAGGATGCATATTGAAATTATAGATTATGTAGTAAAAAAAGCTTTGGATGAAGCAAATGTTTCTTTAAATGATATTGATGCTATAGGTGTTACTTATGGACCAGGTTTAATAGGCGCACTTTTAGTTGGACTTCAGTATGCTAAGGGGTTGGCTTTTGCAGCTAAAAAACCATTAATTGGAGTAAATCATATAGAAGGTCATATGTGTGCTAATTTCATACAATATAAGGATTTAAAACCACCATTTATATCTTTAGTTGTATCAGGAGGGCATACTTTTATAGTGTCTGTTAATGATTTTTGTGATTTTGAAGTAATTGGAAAGACTAGAGATGATGCAGTTGGAGAAGCATATGACAAGGTAGCAAGATCTTTAGGACTTGGATATCCAGGAGGTCCTAAAATTGACAAATTAGCAAAAGAAGGAGATCCTAATGCTATTTCTTTCCCAAGAGCTAAGTTTCATGAAGATACACTTGATTTTTCGTTTAGTGGGGTAAAATCTGCTGTATTAAATTATTTGAATAAAGCAAAGATGAAAGGAATTGAAGTTAATAATGCTGATGTAGCTGCTTCATTCCAAAAAGCTGTTATAGATGTTTTAAAAGATAATGTATTTTTAACTTGTAAGAAAAAGAATGTTAATAAAATAGCTATAGCAGGTGGGGTTGCATCTAATTCTTGTTTAAGGGAAACTCTAAAAAAAGAAGGTGCATTAAGAAATATTGAAATTTTATTTCCAGAGCCAGTATTATGCACCGATAATGCAGCTATGATTGGAAGTGCAGCATATTTTAATTATGAAAAAAACTATGTGTCTTCTTTTGATATAAATGCAAAGCCTAATTTAAAGTTGGGAGAACGTTAAATATGAATTTGTTGCCTCATTCGAATGGATTTCAAAGAATTAAATCACCTAAATTTAATTTGTTAGATTTTTTAAGAAGAGCATTAATTATTATAATTGTTTTTCTTATAGCTGGATTTTTAGTGCAATCTATGAGCAATTTCATTGCTAATGAAAAATTAAAGGCAAGTTTAAAGTATGTTAGAGTAGAGACTAAAAAATTAGAATATAAAATTAAGGGTACAGGATCATATACTGTAGTTTTTGATGGAGGAATTGGAAGCAATATATATCAATGGGATGAAGTTTGTAAAAAATTAGAACGTGATTCTGATGTAAAAACATTTGTATATAATAGAAAAGGGTATGGGTTTAGTGATTCTGGTGAGCGAAGAACACCAGAGGAACAAGCAGAAGATTTGAAAAATTTATTGAAAAAATCTGGTGCTAGTGAACCATATGTATTTGTTAGTGAGGAATATGGAAGTTTAATTTCTATGAATTTTGCGGAAAAATATCCAGAGTTAGTAGCTGGACTTATTTTAATAAATCCTTTATCGTATGATTTAGTAAATAATAAAGAATACTTAGACTCTATAAAATGGGAATATTATAAATCTAAATTAAGATTTTTAGGAAGTTATTTTTATATTACAGAATTAAGTGATAAATTAGGATTAGTAAAAAGTGATATTGATGTAGAAGATTTACCAAATGGAGCAAAGGAAGAAATTAATATACATAAAAATAAAAAAAATTATACTAAAGCAATATATGATGAGATAGGAAACTTATATAAAAAGGATATTAAAATAAATATCGATAATATAATAAAAAGTAAACCAACATATATTATAAGTAATAAAATTACATCTGATATGGACGATATTCCAGAAAATTCATTATTAACAGTATATAAGTCATCAATATTAAGCAGTCCATATGCATTACATGATCAAGATAGTATTGTAGATGGCGTTAATAACATAATAAAAAAGGCAAAAAAAATAGAAAAAGTTAATTCTTAAAATTAATATTAAAATTAGTAAATAATAAATGAAAATTATGGGATATTAATATATAGTGCATATATATTAATATCCCATATTCTTATATTGACATTTTTCTGACACAAAATAACTTTATACTAAGAGTGTAAGATAAATATAAAAAATTTAGGAGGAATTTATTATGGATAATAAAGATAATTTTATAGATGTAGATGAAAATGAAATTAAATATACAGATGAGAGTTTTATAGATAATAATGTACAGAAAAAAAAGAAAAAAAGGAAAAAAATAATTACTAGTATAGCAACTTCACTAGCAATAGCATTAGTTGGTGGAATTTTCGGTAGTGGAATAACTTACTTATTAGTTAAAGATAATATATCAGCAGCACAATATAAAAATTATGCACCATCAATATTTACGCAGGAAACATCGTCAGGAACACTTTCAACAACGGAAGCATTCAATAAGGTAGCACCAGCCGTTGTAATTGTATCTACCAAAGGATTATCAAATTCAGGATTTTTCCCACAAGAGGTTGAGGGAATTGGATCAGGATTTATTATAAATGAAGATGGTTATATATTAACTAATTATCATGTTATACAAGGTGCAAATGAAGTGAAGGTTACCTTAAGTGATGGAAAAGAAGTTAATGCAACAGTAGTAAATTATGATGAAGCAAAAGACGTTGCTATGATTAAAGTTGAAGATGGGACTAAAGTTCCAGCAGTTGCTGAATTAGGAGACTCAGAGGCTTTAGTTCCTGGAGATCAAGTTATAGCAATTGGAACACCTCTTTCAAAGGAATTTGCACAAACACTTACACAAGGTGTTATAAGTGCTGTTAATAGAAATGTAGCAAGTCAAAGTGGAACTAGTGTTAATCTTATACAAACAGATGCAGCTATAAATCCAGGTAATAGTGGAGGACCATTAGTTAATTCTAAAGGTCAAGTTATAGGAATAAATTCTATGAAGATAGGTACTCAATTAAGTGGAACTAGTGTTGAAGGTATGGGATTTGCAATTCCAATAAATGAAGTAAAAGAAAAGATAGATTCATTATCTAAGCCTATTTTAAATTTAGGAATACAAGTAAGAGAGATAGATAACAATCTTGCTAAAAGATATGATTTACCAGAAGGCATTTATGTTGCTGGTGTTGAAGAGTTTTCACCAGCAGAAAAATCAGGAGTAAAGGTTGGAGATGTAATAACTAAGTTTGATGGAAAAAATATTACAACATTTAATGAACTAAAAGAATTAAAATCAGGAAAAGAAGTAGGAGATAAAGTTAAAATTCAAGTTGTAAGAGATGGAAAAAATATTGATTTAGAAATTACATTAGAAGAAAAATCTAAATAGTTTATTTCAAATGCTCTGTTTAATTATTAAATTAAACAGAGCATTTTTATATATTTTTTTAGGGTTCTATAATAGGAAAAAATAAATATTGCATAAAATATTCACAAAATAGAATCTAGACTCATATTTTATTATCATAAATAAACTTTTGGAGGGAAAAATAATGAGCGGAAGAATAAGTGTATGTTCTATTTGTCCTAGAGAAAATGAACAAATTGATGCGGTAATTAAATTATCAAAAGATAGAAGAAGTTGCATTTATGGAACAGTAATAGATGAAAATGGCGCTGCTGTACCTGATGCAGTAGTTAAATTATTACAAATTACTGGATGTGGAGAAAAAACTCCAGTTCCATTAACTCACACTTTTACTGATAAATACGGTCAATTTTTACTTGGACCTTTATGTCCATGTAAAAAATATATGTTAAAAGTATACAAAGATAATATTACAATTAGATATGCTCCACTAGATGTTGACTGCTATGAAGGATCTTGTATAGGCGTAAATGCTACAAGAAATAATTCTGAAGAAGATTCAGATGGCTGCTGTGGAAATAATCGTGGCGGTTGTTGCAGATAGAAGAAAATTTCTAATTGAAATTAATAAACTAATCTATAATTAATTATTATCATTAATTATACTAGGAAAATAGATTAATATAGTTGAGTTTTGTTTATAAAAAGTCTTCTTTTATAATAAAGGAGGCTTTTTATGTTATACTTAGTATTGATTTCATATAAAAAATTATTATTAAATTGACTTACTATTATATATAAAATTTAGTCAATTGTATTATTACTGTAGAAAAAAATAGATGTGAATACTTAAAGTTTTACTAGTAATAATTTATATAGTAATCAGTAATATGAATCTTGCTATTTTATTTAGATGTGGAGGAGAAATATGAATAATATAGTATTAAGTATTATAGCATTTTTCTTTTTAATTGGTGCTGTTGACTATCTTGAAGGAGGTAAACTTAAGCTATCTACTTATTTTGAAGAAGGCATAAAAACCATGGGATCATTAGCAATATCAATGATTGGTATATTATCGCTTACACCATTTTTAACACATGTTTTAACTAAGTTTTTAATACCAATAGCACAAAAGTTATCTTTAGATGCATCTATATTTCCCGCAAGTTTAATAGCGATCGATATGGGTGGATTTAATTTATCTAGTGAATTAGCTTTGTCTAATTCTATGGGGAATTTTTCAGGAATATTAATGTCATCAATTTTAGGGTGCACAATTAGTTTTACCTTACCATTAGCTGTAGGGTTGCTTAAAGAGGAATTGATGGAAACAGTTTTCAAGGGGATTTTATGTGGAATTATAACTATGCCTATAGGATTGTTTGTTGGTGGAATAATGTTAAAGGTTCAAGTGTATGCTTTGATTTACAATTTGCTTCCTGTAATAGTACTTGCAATAATTTTAGCTTTAGGTATAATTTTTAGACCTAAAAAATTAATAGTAATTTTTAAGTATTTAGGAAAAATGATAATGTTTATAAGTATAATAGGGTTAATTATACAAGGGGTATATTCTATTTCAGGAATAAAACTTTTAAATGATATTATGCCTATTGAAGAAGTAATTACAATAGTTGGA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51 | Clostridium_phage(23.08%) | protease,coat,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
915696 : 937865
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010723|915696:937865|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010723|915696:937865|920386_920896_+|WP_012451074.1|DBSCAN-SWA MELQEINIEGIIEMAVKTAIKEYDKEQKDLDKKKVFHNTKLLMKHYNDLKSHIIYSISDINDITNTDKIELEKEEYDELYILSIKQSKVKTLIMISHIDSSLEVLKKEQRKKGVVEKYLALEKLFIDEKTYEEVAEELNCGVITIRRWVKEMLEELGIYLFGIEGIKVC >NC_010723|915696:937865|919766_920132_-|WP_012449566.1|DBSCAN-SWA MSYIGNFLKNKRIEKKLTLKDLSDLSGVGPSTISDIETGKALNPRMITLQKLASSLDISVNDFFEERKIDIIDENLIKNVDIEKQKQIDTVAAHLEDKHLTPKKVKLLKDYIDALFDDENW >NC_010723|915696:937865|915696_916821_+|WP_003370603.1|DBSCAN-SWA MAEGGKESMEQKVKNKAEKGKEDKSAKMAMVKGLIDKGKKNGSLTYKEIMDEIDHIDLSPEQIEKIYEVLEMMGIEVIGGATDAPEVEEEIDLTVLEGIAIDDPVRMYLKEIGKVPLLSSEQEIDYAKRIEEGDPVAKKKLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDYRKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQELGRDPFPEEISKVMELPVDKVREIQKIAQEPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDEAPAPAEAAAFTMLKEQLINVLDTLTPREEKVLRLRFGLDDGRARTLEEVGKEFNVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLKDYLD >NC_010723|915696:937865|935698_935863_+|WP_012450478.1|DBSCAN-SWA 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26 | Clostridium_phage(75.0%) | tail,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1085533 : 1099287
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010723|1085533:1099287|DBSCAN-SWA AATGCTAAGAATTAGTAATGTTAAAAAGAAATTTGGGAATACGGAAGTATTAAAAGGAATTAATCTTAATATTGATCCAGGAGAAATACTAGTTATTGTTGGTCCATCTGGTGGTGGAAAAACAACACTTCTTAGATGCGTTAATGCTTTAGAACAATGTGATAACGGGAAGATTGAGATTAATGGACGAGCAATTTGTGAAGGAGGAAAATATGTTGATAAGAAAACTATGTCTGAGATAAGAAAAGATATAGGATTGGTATTTCAAAACTTTAATTTATTTCCACATATGACTGTCTTGGAAAATCTAATAGAAGCACCTAGAAAAGTGCTTGGATTAAGTAAAGAAGATGCTATAAAGAAAGCAGAAAAGATTTTAGGTTTTTTAGGATTAGAAGAAAAGGCAAAAAATTATCCGTTTGAATTATCTGGAGGACAAAAACAAAGGGTTGCTATAGGAAGAGCTTTAGCATTAGAACCAAAAGTTATGTGTTTTGATGAACCAACTTCAGCACTAGATCCGGGACTTACAGAAGAGGTAGCAAATTTAATAAAAAGTTTAAGTCAAAATGGAATGGCAATGATGATAATAACGCATGATATGGAATTTGCAAAAAGAGTCTCAGATAGGATTGTTTCAATGGATAAAGGTAAACTTATAGATGGTTTAATATTTGAATAATAAAATAAATGCACTTGAAATATTGTAACGTATATGATATTATTAAGTAGTAATATAATTCAAGATTTAATCATACGTACTATACATCACCTCTTTTTCAGAGATTGGTCTAGTATTAAGGTTATAATCTATGAAGAGGAGGATTTTATAATGGAAGATAAGAAAATACTTTGTAAAGATTGCGGTAACGAATTTGTGTTCACAGTTGGGGAACAAGAATTCTACAAAGAAAAAGGATTTGACAACGAACCAGTAAGATGTCCTGATTGTAGAAGAGCAAGAAAACAACAAAGAAACAACAGATAGTAGAAATTAACAGCTACTAAAAAATGATTTTAATTCATTTTTTAGTAGCTTTTTTGATGTTTATTTAAATAAAATAAAGGATAAAATTAAAATGGAGGATAAAATTGAATATAATTATTGCAAAATTCAAATCGATAAAAAGATATATAATTACTTTTTTTCTATGGGTTGTTGTTGCAGGAATTACAGGTTTGATAGGTGGTTTTATAGGAAGCCTGTTTCATCTTAGTGTTGAATATGCAACAAGCTTTAGAATAGAAAATGATTGGATAATATTTATGCTACCACTTGGTGGGGCTCTTATAATATGTTTATATAAAATATTGAAATTAGGAAGTAATATAGGCACAAATTTGGTTATAGACTCTATTCGTACAGATGGAAAAGTACCTTTTTCTATGTCACCTCTTATATTTATAAGCACCGTAATAACTCATCTTTTTGGAGGATCAGCTGGTAGAGAAGGAGCGGCTTTACAACTTGGTGGTAGTATTGGTTCACAAGTGGGAAAAATTCTACATCTTGATGAAAAGGATATGCACTTAATTACTTTGTGTGGAATGAGTGGTGTTTTTTCTGCATTATTTGGAACTCCTTTAACAGCAACATTTTTTGCTATGGAAGTTATAAGTGTTGGAATCATTTATTATTCTAGTTTTATTCCGTGCATAGTTTCATCAATTGTTGCTTATAAAGTATCATTACTATTTGGCCTGGAACCAGTCCGTTTTAATATAAATGTTATTCCGAATATTTCAACAGAAAATATAATAAAAGTTGCAATTTTAGGGGCTTTATGTGCATTGGTGAGTATTATATTTTGTGAGACTCTACACAAAACTAATAAATTTTTAAGCAATTTAATAAAAAATGACTATCTTAGAATAATTTGTGGTGGCTTAGCTATAGTTGCACTTACGTTTATTGTGGGGTCTAGAGATTATAATGGAGCAGGAATGAACATTATAGCTAATGCAATTAATGGACAAGCAAAACCAGAAGCATTTATTTTAAAAATTATTTTTACAGCTATTACTATAAGCGTTGGGTACAAAGGAGGAGAAATCGTTCCTACATTTTTTATTGGTGCGACATTTGGATGTGTAGTAGGAGGATTAATTGGTTTGGATCCAAGGTTAGGAGCTGCAATTGGACTAGTTGCTTTGTTCTGTGGTGTAGTTAATACACTAATTACTTCAGTAATATTAAGTATAGAACTTTTTGGTTCTGGTGCCCTTATTTTATTTGCAGTTGCTTGTGGTGTTAGTTATATGTTATCGGGGTATTTTAGTCTTTATAGTAGTCAAAAAATAGTTTATTCAAAACTTAAAGCTGAATTTATAAATAGAGATGCTGAGTAATATTAATTTACTTGGCACTTTTTTATATTTAAAGTTGTAGTTTTTTTATTACGAGCTGTGATATACTATTAAAAATTGTATGGTAACAAAGGAGACGATATTTGTGGATAGAGTTAAATTAAATGAAAATTTTGAACTTTCGAGAATTGTTCAAGGTATGTGGAGAGCAAATAAGTGGAATAAAAGTCCTAAAGAAGTATTGAAATTTATGCAAGAATGTATTGAACTTGGAATTACTTCTTTTGACACGGCAGATATATATATGACTGAAGAGTTACAAGGTAATGCTATGAATTTAAAAAAGTCATTAAGATATAACATTGAAATAATAACTAAGTGTGGAATAAAGTTGCCAGGAAGGTTAGTTGATTGTAAAGTTCATCATTATGATTCTAGTAAAGATCATATAAAATTTTCAATTGAAAGTTCGTTAAAAAGATTACAAACGGATTATGTTGATTTATTATTAATTCACAGACCGGATTATTTAATGAATCCAGAAGAAATGGCAGAAGCTTTTAATGAATTACATAATGAAGGTAAAGTATTAAACTTTGGAGTATCTAATTTCACTCCATCTCAAGTTGATATGCTTAAAACGTATTTAGATTTTCCGATTGTTACAAATCAAGTTGAAATATCACCAGTGCGTTTAGAACCTTTTATAGATGGTACTTTAGATAATTGTTTAAAGAACAAAATGACGCCTATGGCATGGTCTCCTTTAGCTGGTGGAAAAATATTTAATGTGGAAGATGAGAGAGGGAGGAGACTTATGACTACTTTGAATAAAATAAAAGAAAAGAATAATATATTTTCTATAGATGAAGTTATTTATGCTTGGCTTTTATATCATCCTTCAAATATAATTCCTATTATTGGGTCAGGTAAAATTGAAAGGGTTAAATTAGCAGTAGATTCGTTAAAAGTGAAATTAACTAGAGAAGATTGGTATGAAATATGGCAAAGTTCTACTGGAAAAGAAATCGATTAGCAAATATTCGTGTTATAAAAAGTTAAAATATACGTAAAAAAGAGGTTGATTAATTGAAAATCAACCTCTTTTTTTAATAATATTCTTAAAAATAAAAAATGTGTGTTAATTTTATACAATAAAAGTTGACAGTGATAATTTAAAATGGTAATCTTTAATTAATGACACGAAAGTTAAAGTTAACTAGTTTGATAATATTCGTAATTATAACAATTAATAAAATTATAAATCTCAAATTAATATTTTGGAGGAATTTTTAATGTTAAATATTAAGAGTATATTCGTTGAAAAGAAAAGCGGATTTGATGTAGAAGCACAGGGCTTACTAAGAGATTTTAAAGAAAATTTAGGAGTAGCTAATTTAGAGAATGTAAGGCTTATAAATAAATATATTATTTCGGATATAAGTGATGAGTACTATAATAAAGCACTACATACTATTTTTTCAGAATTAACAGTTGATAATATTTATGAATCAGAATTGCCTATAAATGAAGATGAAATAGCCTTTGCAGTAGAATTTTTACCAGGACAATATGATCAGAGAGCAGATTCAGCTTCAGAATGTATATCATTATTGACTGAAGAAGATAAAGCTTATATAAAATCAGCTAAGATAATTGTGTTAAAGGGAAATATTAATAAGGAAGAAATTGATAAAATAAAATTATATTATATAAACCCAGTCGATTCAAGAGAAGTGGATATAAATAGTAAAGACATTACATCAACTTCAAACATACCTAAAGATGTTCTTATATTAAATGGATTCATAGAAAAAAGTTTAGAAGAATTACAAGAATTTCATTCAGATTATGGTCTTGCTATGAGTATTGAAGATCTTGTTATGATAAAAGACTATTTTAAAAAAGAAAATAGAGATCCATCAATCACTGAAATCAGAGTTATAGACACTTATTGGTCAGATCACTGTAGACATACTACATTTTCTACAATATTAGAAAATATAGAGTTTGAAGATAATAAATATACAAAACCAATTAAAAAAAGCTATGAAAATTACATGAAATCTAGAGAATATGTATATGGAGAAAAAGAAAAAGAAAAAACTCTTATGGACATTGCAGTTATAGCAATGAAAGAACTTAGAAAAAGAGGAAAGCTTGATGATTTAGATATATCAGAAGAAATAAATGCATGCTCTATTAATGTAAAAATTGAAACTAATAATGGATTAGAAGATTATCTAGTTATGTTTAAAAATGAAACTCATAACCATCCTACTGAGATTGAACCTTTTGGTGGAGCCGCAACTTGTTTAGGTGGAGCAATAAGAGATCCATTATCAGGTAGAACATACGTGTATCAAGCTATGAGAGTTACAGGAGCTGGTGATCCAACAGTTTCAATTGAAGAAACTTTAAAAGGAAAACTTCCTCAAAGAACTATAACTTTAGGAGCAGCACATGGATATAGCTCTTATGGTAATCAAATAGGTCTTGCAACTGGACAAGTTCAAGAAATTTATCATCCTAATTATGTAGCAAAAAGAATGGAAGTTGGAGCAGTTATTGCAGCGGCACCAAAAGAAAATGTTGTTCGCGAAGAACCAAAATTAGGCGATGTAATTATCTTACTTGGAGGAAGAACAGGTAGAGATGGAGTTGGTGGAGCAACAGGATCATCAAAAGAACAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010723|1085533:1099287|1096028_1097030_+|WP_012450386.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYRSVKLIKEYAAKTMSEYVLNGLGSFAGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGRLEAEVASDLVKGISDGCIQSDCALIGGETAEMPGFYDEGEYDMAGFAVGIVDKEKIINGSRIKDGDKLIGISSSGIHSNGYSLVRKIFTDLNEDFKGEEVWKTLITPTKIYVKPILNLLENFDIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGRELTAVINKDSYPLPAIFERIIEKGVDKDHMYNTFNMGIGFVLAVNEKDVEPIIKALIAMGEKAYEIGYITSGGEGVCLK >NC_010723|1085533:1099287|1086624_1087881_+|WP_012451322.1|DBSCAN-SWA MNIIIAKFKSIKRYIITFFLWVVVAGITGLIGGFIGSLFHLSVEYATSFRIENDWIIFMLPLGGALIICLYKILKLGSNIGTNLVIDSIRTDGKVPFSMSPLIFISTVITHLFGGSAGREGAALQLGGSIGSQVGKILHLDEKDMHLITLCGMSGVFSALFGTPLTATFFAMEVISVGIIYYSSFIPCIVSSIVAYKVSLLFGLEPVRFNINVIPNISTENIIKVAILGALCALVSIIFCETLHKTNKFLSNLIKNDYLRIICGGLAIVALTFIVGSRDYNGAGMNIIANAINGQAKPEAFILKIIFTAITISVGYKGGEIVPTFFIGATFGCVVGGLIGLDPRLGAAIGLVALFCGVVNTLITSVILSIELFGSGALILFAVACGVSYMLSGYFSLYSSQKIVYSKLKAEFINRDAE >NC_010723|1085533:1099287|1094591_1096019_+|WP_003373905.1|DBSCAN-SWA MTNSEFELIMDPSLDKFKDECGVFGVYTNKPLDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIEMHKGLGLITDAFKHEDLEKLRGHIAIGHVRYSTAGGKGIENAQPILTTSKIGSIAMAHNGNLVNDDVIRELLEDAGQIFHTSSDSEVIACLIARSAKKGLTRAVVDAISAIRGSFALTIMSTDKLIGARDPHGIRPLSLGKIDEGYILTSESCALDAIGAELVRDIEPGEIIIIDDEGIHSYKYSENTVCQTCAFEYIYFARPDSKIDGLEVHTSRVRAGEQLYKEHPIDADLVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPYDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKVNIEGKRVILIDDSIVRGTTSKHLIESLKRAGVKEINFLIASPGVKYPCHFGIDTPYRSELIAANNSVEEIRDIIGADYLGYLSEDGVKESCRGKKGFCMGCFNGIYPVATPIETPNQFER >NC_010723|1085533:1099287|1087984_1088875_+|WP_003369960.1|DBSCAN-SWA MDRVKLNENFELSRIVQGMWRANKWNKSPKEVLKFMQECIELGITSFDTADIYMTEELQGNAMNLKKSLRYNIEIITKCGIKLPGRLVDCKVHHYDSSKDHIKFSIESSLKRLQTDYVDLLLIHRPDYLMNPEEMAEAFNELHNEGKVLNFGVSNFTPSQVDMLKTYLDFPIVTNQVEISPVRLEPFIDGTLDNCLKNKMTPMAWSPLAGGKIFNVEDERGRRLMTTLNKIKEKNNIFSIDEVIYAWLLYHPSNIIPIIGSGKIERVKLAVDSLKVKLTREDWYEIWQSSTGKEID >NC_010723|1085533:1099287|1089134_1092881_+|WP_012451813.1|DBSCAN-SWA MLNIKSIFVEKKSGFDVEAQGLLRDFKENLGVANLENVRLINKYIISDISDEYYNKALHTIFSELTVDNIYESELPINEDEIAFAVEFLPGQYDQRADSASECISLLTEEDKAYIKSAKIIVLKGNINKEEIDKIKLYYINPVDSREVDINSKDITSTSNIPKDVLILNGFIEKSLEELQEFHSDYGLAMSIEDLVMIKDYFKKENRDPSITEIRVIDTYWSDHCRHTTFSTILENIEFEDNKYTKPIKKSYENYMKSREYVYGEKEKEKTLMDIAVIAMKELRKRGKLDDLDISEEINACSINVKIETNNGLEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAGDPTVSIEETLKGKLPQRTITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVQEIYHPNYVAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPKLGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTIDSLNECGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNSKVAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVTKKYEGLDGTELAVSESQERMAVIVTKENADEFIRLSNEENLEATLVAHVTDTDKLRLYWRGKKIVDLDRSFLDTNGASQKVSVKVNGPTQYPYEVYDVNVKDTWINNLKDLNIASQKGLVERFDSTIGAGTVIMPFGGKYANTPAEGMAAKIPVLGGESKDATIMTFGFNPYLGTWSQYHMAYYSVIESITKLSAMGGDYRKARLTFQEYFEKLGKDETRWGKPFAALLGAYEAQMQLGIAAIGGKDSMSGSFGELDVPPTLVSFAVGIEKASKIISPEFKGVNSKLVLLKTEKLEDGTIDMNKFKKNLEVLYKLIEEEKVISASAVKFGGVAECLTKMSLGNRIGTEFNNLTKDELFGFNYGSLLLEVKNEIDINEEFKDCLYKEVGKTISSQKIISKEYDLKLDIENLEEIYEKKLNSVFKIKTEDVSQKIETVLYEKKEISSPAIKLAKPRVVIPVFPGNNCEYDCRRAFEKEGAKVSEVVFRNITKEALVESIERLKSEIDKSQIIMIPGGFSAGDEPDGSGKFIATVLRNEKIKESVMELLKNRDGLALGVCNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMPTLTYNNINRHMSSIVRTKVVSNKSPWFNEVNVGDIHSIAISHGEGRFVAPESLIKELINNGQVATQYVDLQGDVALNMPYNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGENLYRNIPGNFDQKIFRSGVNYFK >NC_010723|1085533:1099287|1093289_1093769_+|WP_003371243.1|DBSCAN-SWA MKVAIFFGSKSDTEIMKGAANALKEFNVDYKAYILSAHRVPEKLEETIKMVESKGCEVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGVPINAALDGLDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLALQMIALKDDELRERLIEFRENMKKNFIDENGEGVEL >NC_010723|1085533:1099287|1085533_1086214_+|WP_012450048.1|DBSCAN-SWA MLRISNVKKKFGNTEVLKGINLNIDPGEILVIVGPSGGGKTTLLRCVNALEQCDNGKIEINGRAICEGGKYVDKKTMSEIRKDIGLVFQNFNLFPHMTVLENLIEAPRKVLGLSKEDAIKKAEKILGFLGLEEKAKNYPFELSGGQKQRVAIGRALALEPKVMCFDEPTSALDPGLTEEVANLIKSLSQNGMAMMIITHDMEFAKRVSDRIVSMDKGKLIDGLIFE >NC_010723|1085533:1099287|1097781_1099287_+|WP_012450774.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFNKDGVLDFAEFLVSKDIEIVSTGGTYKYLKENGIDVIEINEVTNFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNKEHMKVLEEREIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLTFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVTVISNINDYEVVKNEIENAGQVSLKTKKKLAGKVFNLMSAYDGAIANFMLADEEEYPEYLSVSYKKMQNLRYGENSHQSAAVYSSTMVDGAMNTFETLNGKELSYNNFKDVDIAWKCANEFDEPACCALKHNTPCGVATGENSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIIGFNRKVDKKTAQEMVKIFLEVIAAPDYDEDALEVLKTKKNLRVLKFHNTPKAEKCMVTVDGAILVQDEDNKLIDEIKVVTEKKPSDEEMEDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALRRGKGATILASDAFFPFRDVVDKAAEGGIKAIIQPGGSMRDQESIDACNEHGIAMVFTGFRHFKH >NC_010723|1085533:1099287|1086364_1086520_+|WP_003369129.1|DBSCAN-SWA MEDKKILCKDCGNEFVFTVGEQEFYKEKGFDNEPVRCPDCRRARKQQRNNR >NC_010723|1085533:1099287|1093768_1094476_+|WP_003369697.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKQIYATDKADEVVIYYKDDATAFNGEKKGQITDKGVMNNKITSILFEQLEKQGIKTHFIKKLNDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGTKLKTTVFEFSYKDDELGDPLINSYHAVAIGAATFEEIDTILEMTAKINNILKEAFAKENINLIDFKIEFGKCADGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVEDAYIEILKRISK >NC_010723|1085533:1099287|1097017_1097632_+|WP_012451414.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTDLQSIIDAVENKEIECSIEMVIGSKEGIYALERAKNHNIPTYVVSKKEYKDKSSDKILHLIKGKVDLIVLAGYLAILDGEILKEFNNKIINIHPSLIPAFCGSGMYGLKVHEAVIKSGVKFSGCTVHYVNSEVDGGAILLQDIVPVYFEDDVKSIQKRILEKEHILLPKAIKLISEGKVEIVNGKTKVIEI |
11 | Cyanophage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1840695 : 1868604
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_010723|1840695:1868604|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_010723|1840695:1868604|1848506_1849877_-|WP_012451298.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNFDIEKLEKIKVRDGQEFFFIQTFGCQMNEEDSEKLSGMLKSQGYEETENRDEASIVIFNTCCVRENAENKVFGNLGRLKNQKEKNPNLIIALCGCMMQQKGMADEILSRFPYVDIIFGTHNAYKFPEYLHRVQVEGVQVKEIFDKETEIVEGVPIDRKSNVKAFVTIMYGCNNFCTYCVVPYVRGRERSRRPEDIENEIKELVSNGYKEITLLGQNVNSYGKGLEEEITFAQLLRRINEIDGLERLRFMTSHPKDLTLDVVYAIRDCDKLCEQIHLPVQSGSNEILQKMNRHYNKEQYLELAKKIREEIPDVTFSTDIIVGFPGETEEDFEETINLVKEVRYDAAFTFIYSRRNHTPADKMEDQIPDDVKHDRFNRLVAAVNEGIVVGNKAAEGKIYEVLVEGTSKNNENKLTGRTRNAKLVNFDGCKEMIGKLVKVKIIEAKSFSLVGEVVEQ >NC_010723|1840695:1868604|1847704_1848184_+|WP_012450588.1|tRNA|DBSCAN-SWA MAKESKTNAMRILDSSKIEYTTYNYQNKDGKIDGVAVANKINKNENEVFKTLITQGHSKEFYVYVVPVAQELDMKKAAKAASEKSIEMIHIKDINKITGYIRGGCSPIGMKKTFKTFFHNTALNCETIVFSGGKIGSQIEMNPRQLENILDCIFVDIIK >NC_010723|1840695:1868604|1867557_1868604_-|WP_012450276.1|capsid|DBSCAN-SWA 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34 | Bacteriophage(28.57%) | bacteriocin,tail,capsid,plate,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1882422 : 1888962
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_010723|1882422:1888962|DBSCAN-SWA 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TTATTTTTATTGGTGATACAAAGATACCAATATTCAATGGTTTCATATTTTTAATCGCTTCATCAAGTTCTTTCTCTGTGTAAATACCATTTTCATTAAGATATTCCCACATTCTCTTAACTCTAAGTTTTATATCATCCATTAACCTCATTCCCCTCAGTATTTTTAAATTACTTTTTAAGCTTTTCTGTTACAATTATTAGGTCATTTGTAAGTCCTGCGAGTTTTCTTAAGTTGTCCAATATCTTATCTAAATCTTCTTTTTCACTTTCATCAATTACTCCATCTTCAACTATGTCAAGCAAAGTGTTTCTAAGCTGATTTCCTTCTCCTATGAGATTAAAAATATTAATTGATAATTTATAAATATTATTAATATTTGTTTTATCTACAGGGCTAATTGTAAGTTTTCCTATAGGACATTCATTACAACAGTAATAATTCATCAATTCAGGTGCGTTGTATGCATCTGCCATTCTTACAACTACATCTACTGGAACTTGTTTACATAATCCTAATTCATAGTTTATAAGTGAATCTTTACTTACTCCCAAAGCTTCACTCGCACCATCCCTATTTTTAAATTTTTCATTAAACTCAGATGCTATTGTTCTAGCTTTACGATAAATATTTTCATTTTCCTTCATATATCTACTACCCTCTTTTCTTGTATCAATTTTCCATATTTATGTTAAAAAGTATGGACGAGTTTCTATTCTTTTTGTCCAAGCTTTAGAATATAATTATTTTATATTCAAGTTTCTTGAATCAAGCTTTTAAAAAAATAGTTACGTCTACTTTATAAAATTTAGCTAATATTTTTGCTTTTGGAATAGTAAGTTCAACTTTTCCATTCTCTAGCATTGAATATCCGCTTTTTCCCTTATATCCTAGCACTTTTGCTATTTCTTCTTGAGTTCTTCCATTTTTTATACGTAATTGTTTTAACAAATCGTTCATATGCGTTATCGCCTCCAATTCAAGTTGCTTGAACTTTATAATATAATGATAATCCAAGAAGGTTGAACTGTCAATATATTTCCAAGAAAAAGTACAAATATTTTGAACTCGCTTTAAAATATTTATATAATGGAGTACAATTATATTGAACTATTTTTATATAAGGAGATTTAAAGATGTTTACTTTAGCAGATAGAATAAAAGATTTACGGAAATCAAAGAAACTAACACAAACTGATTTAGGAAGAATCTTAGGTGTTGGTAAAACAACTATTTCAATGTACGAAAATGGTAATAGTACTCCTAATGATGAAATTAAATTTAAAATAGCAGCTTTTTTTGATGTAACTTTAGATTACCTGTTAGGAAAAAGTGACATAAAAAAATATGATGATGTTTTATCAATAGATAAGCAAGATAATACTCAAAATACACCTATAGAGGATAAACTAATTGAAAAACTAAAAAACCTTGATGATGAAAGTAAAAAAGAACTTGAAAAATATATGGATTTGCTTAAACTTAAAGAATCAATGGGTGAATCTAAAAATGAAACTCCATCTTCTTTAAAACAAGCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_010723|1882422:1888962|1885288_1886437_-|WP_012450314.1|DBSCAN-SWA MSSYLKGIANRVNGVEKQGFTEELDINSLVPSKNNFYGIREIEELAASIKENGLMHNLVVRDIGNGKYEIISGERRYTALKKLGYEKVPCQIREINDLDAELMLIHANLEQRELTPTEKMEGIKRLENIYKKKRKNGEKLDGKTRDLIGKDFGLSGVQVGRYKKIGKDLIPELKEKLNKEDITLTQAHTLSSLTKEEQKIIHDEIKNLNTKEHKLEVDILVQGIKQPIEREEDKKLLEELNNKKIKQNSLGDRFLKKSKKKQDDVELKEQYIRIIREQIAKILEYDSHPTIIISNDKITSIFYDVDRIDILEKEIRAFFKGSVLDLYTKNISESTKVPRTNETAFKMALYKLNEGTYLYFKNYDNQMKQLTKRGFVEVDDNI >NC_010723|1882422:1888962|1882422_1882635_-|WP_012449837.1|DBSCAN-SWA MEELMKKFDECLDTWIDLHQYVYTEEYRNAFIEFAKKKESVGQKLEPLIATMALHHETDGRHPYFKFNRM >NC_010723|1882422:1888962|1882753_1883020_-|WP_012451283.1|DBSCAN-SWA MSKCNCIESVKKGIEEKFQKREDIEKVNKVSLENAALMFTEAGCQRQLYSLIVIEYDYKNKKGEIKHKKEKANMYYAYCPFCGKKYEK >NC_010723|1882422:1888962|1886421_1887177_-|WP_012450952.1|DBSCAN-SWA MKIISFLNIKGGVAKTTSCVNVAAQLGKEGKNVLIIDIDPQSNATKYLNMYDSHVKGTYEVLRGEDISIQPTKYDGLWLLPGNINLIMSEGEILTDTKRVKETRLKTWLSVKDQKAFDYILIDCPPSLGMLSTNALVASDYVIVPLKIDKFGLDGFEYLMSSIEGVGEQFNHNLNLLGILITMDKSTRIHKEIKQELKEELGDLIFNQTIRDNVDIVKSTFESTPVVYLNSRANASRDYKKFVEELQCRLI >NC_010723|1882422:1888962|1883619_1883805_-|WP_040968299.1|DBSCAN-SWA MLHGDYFTIYKEFRILINMLFYIVMSISVFNIFTISNKLETKERIKIIVSFGLCFLLVILY >NC_010723|1882422:1888962|1884234_1885176_-|WP_012449973.1|DBSCAN-SWA MNEIKAYYAIIPANVRYDKDLTANAKLLYGEITALCNEKGYCWATNNYFADLYGVNKNTISTWINNLVKKGYLISEFKYKPGTNEIDKRYLKINTSPIITHDITYTEKTEYPINANRDTPITKNHDTYSEKNGDPINENNYTLSRKSRKRIIQVNNTINNTISKDIVSCTTTVQQVIDAWNELKLQKVIGIKSGTNRLRLLNARIKEYGIENVLKAISNIQSSSFLKGQNNKSWVITFDWLIKPNNFIKVLEENYKDQEAKVKKHIVEKQFTGSSNLKFDNFEARDYYSNDEAMNNLEKKLLGWDSNESRDIN >NC_010723|1882422:1888962|1887389_1887563_-|WP_012451023.1|DBSCAN-SWA MDDIKLRVKRMWEYLNENGIYTEKELDEAIKNMKPLNIGIFVSPIKITSDINVGLNE >NC_010723|1882422:1888962|1888557_1888962_+|WP_012451504.1|DBSCAN-SWA MFTLADRIKDLRKSKKLTQTDLGRILGVGKTTISMYENGNSTPNDEIKFKIAAFFDVTLDYLLGKSDIKKYDDVLSIDKQDNTQNTPIEDKLIEKLKNLDDESKKELEKYMDLLKLKESMGESKNETPSSLKQA >NC_010723|1882422:1888962|1887591_1888068_-|WP_012451770.1|DBSCAN-SWA MKENENIYRKARTIASEFNEKFKNRDGASEALGVSKDSLINYELGLCKQVPVDVVVRMADAYNAPELMNYYCCNECPIGKLTISPVDKTNINNIYKLSINIFNLIGEGNQLRNTLLDIVEDGVIDESEKEDLDKILDNLRKLAGLTNDLIIVTEKLKK >NC_010723|1882422:1888962|1888189_1888381_-|WP_012451011.1|DBSCAN-SWA MNDLLKQLRIKNGRTQEEIAKVLGYKGKSGYSMLENGKVELTIPKAKILAKFYKVDVTIFLKA >NC_010723|1882422:1888962|1883217_1883544_+|WP_012450636.1|DBSCAN-SWA MKFLKIFIPFILFLTLSTSIAYAMPPISNTYKQGVYKMSACSERSVIVKSTNKNTINHLTILDSQCNVKFSQKFDHIKLSTCKIPIQNNDFIVIVGDGELSLIFQSNS |
11 | Clostridium_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2236542 : 2301359
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_010723|2236542:2301359|DBSCAN-SWA 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70 | Clostridium_phage(48.57%) | portal,terminase,tail,capsid,protease,holin,integrase,head | attL 2228775:2228792|attR 2307562:2307579 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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