Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_010730 | Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1, complete genome | 5 crisprs | c2c9_V-U4,Cas14b_CAS-V-F,csa3,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,cas14j,DEDDh,cas14k | 2 | 6 | 5 | 0 |
1. NC_010730
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_010730_1 | 26281-27614 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010730_1
|
20 spacers
spacers of NC_010730_1
>1.1|26310|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA >1.2|26375|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA >1.3|26440|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA >1.4|26505|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT TGATATTGATAAATTTGTATCTAATCTTAAGCAAGA >1.5|26570|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC >1.6|26635|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAATTGAATATGAAAATTAAAAATTGCATAAAAA >1.7|26700|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC >1.8|26765|38|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGGAGTAGTTCTTGTCGTTATAATCTTTTTACAGAGA >1.9|26832|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCAAAGAGCACAAAAAGTTTTTGCAGTTTTTGCAG >1.10|26897|37|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGGCTATGATTTCTAAAGCAGAGACTAAAAGAGCAA >1.11|26963|37|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTTGGAACTGCACCAGTTCATACTACTATTCCTAC >1.12|27029|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGACCCGACTAAAGTCCAAGCATCGGATATAATCGG >1.13|27094|35|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATGGCTTTTTATGATTGTTTTATGATTGCATTA >1.14|27158|37|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATAAAATTTATAATGTAAAAAATTGAATAAGAAAA >1.15|27224|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCTTTCAAAAGATAAAAGAGATTTTGTAGATTTA >1.16|27289|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG >1.17|27354|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG >1.18|27419|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG >1.19|27484|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATAAAATTTATATGGTAAAATAATTTAAAATAAAA >1.20|27549|37|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAATTTTTTATGGTTTTTATTATGATTACATTTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010730_1
The CRISPR arrays of NC_010730_1 >merge|NC_010730|1|26281-27614|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAAATAACCCACACGGTTCAGATGTAACAGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACAGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACAGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACTGATATTGATAAATTTGTATCTAATCTTAAGCAAGACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACGGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGCCTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACTAAAATTGAATATGAAAATTAAAAATTGCATAAAAACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACGGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGCCTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACTTGGAGTAGTTCTTGTCGTTATAATCTTTTTACAGAGACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACCCCAAAGAGCACAAAAAGTTTTTGCAGTTTTTGCAGCTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACTCGGCTATGATTTCTAAAGCAGAGACTAAAAGAGCAACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACTTGTTGGAACTGCACCAGTTCATACTACTATTCCTACCTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACTGACCCGACTAAAGTCCAAGCATCGGATATAATCGGCTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACTTATGGCTTTTTATGATTGTTTTATGATTGCATTACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACATATAAAATTTATAATGTAAAAAATTGAATAAGAAAACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACTTGCTTTCAAAAGATAAAAGAGATTTTGTAGATTTACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACCTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATGCTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACCTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATGCTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACCTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATGCTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACAATAAAATTTATATGGTAAAATAATTTAAAATAAAACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAACTTAATTTTTTATGGTTTTTATTATGATTACATTTTTACTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC >NC_010730|1|1|26281-27614|CRISPRCasFinder TTAAATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TGATATTGATAAATTTGTATCTAATCTTAAGCAAGA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TAAAATTGAATATGAAAATTAAAAATTGCATAAAAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTGGAGTAGTTCTTGTCGTTATAATCTTTTTACAGAGA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CCCAAAGAGCACAAAAAGTTTTTGCAGTTTTTGCAG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TCGGCTATGATTTCTAAAGCAGAGACTAAAAGAGCAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTGTTGGAACTGCACCAGTTCATACTACTATTCCTAC CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TGACCCGACTAAAGTCCAAGCATCGGATATAATCGG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTATGGCTTTTTATGATTGTTTTATGATTGCATTA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC ATATAAAATTTATAATGTAAAAAATTGAATAAGAAAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTGCTTTCAAAAGATAAAAGAGATTTTGTAGATTTA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC AATAAAATTTATATGGTAAAATAATTTAAAATAAAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTAATTTTTTATGGTTTTTATTATGATTACATTTTTA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC >NC_010730|1|1|26281-27614|CRT TTAAATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TGATATTGATAAATTTGTATCTAATCTTAAGCAAGA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TAAAATTGAATATGAAAATTAAAAATTGCATAAAAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTGGAGTAGTTCTTGTCGTTATAATCTTTTTACAGAGA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CCCAAAGAGCACAAAAAGTTTTTGCAGTTTTTGCAG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TCGGCTATGATTTCTAAAGCAGAGACTAAAAGAGCAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTGTTGGAACTGCACCAGTTCATACTACTATTCCTAC CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TGACCCGACTAAAGTCCAAGCATCGGATATAATCGG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTATGGCTTTTTATGATTGTTTTATGATTGCATTA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC ATATAAAATTTATAATGTAAAAAATTGAATAAGAAAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTGCTTTCAAAAGATAAAAGAGATTTTGTAGATTTA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC AATAAAATTTATATGGTAAAATAATTTAAAATAAAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTAATTTTTTATGGTTTTTATTATGATTACATTTTTA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC >NC_010730|1|1|26541-27614|PILER-CR CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TAAAATTGAATATGAAAATTAAAAATTGCATAAAAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTGGAGTAGTTCTTGTCGTTATAATCTTTTTACAGAGA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CCCAAAGAGCACAAAAAGTTTTTGCAGTTTTTGCAG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TCGGCTATGATTTCTAAAGCAGAGACTAAAAGAGCAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTGTTGGAACTGCACCAGTTCATACTACTATTCCTAC CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TGACCCGACTAAAGTCCAAGCATCGGATATAATCGG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTATGGCTTTTTATGATTGTTTTATGATTGCATTA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC ATATAAAATTTATAATGTAAAAAATTGAATAAGAAAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTGCTTTCAAAAGATAAAAGAGATTTTGTAGATTTA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC AATAAAATTTATATGGTAAAATAATTTAAAATAAAA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC TTAATTTTTTATGGTTTTTATTATGATTACATTTTTA CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
>NC_010730.1|WP_012458768.1|24576_25995_-|aldolase MANILSNLDQVKEVLNGVVEISDSGIKILDEKKLRETVIDDLIYTAVFSKDYNLKEEVKYIIREIANEFGAVASSIHDLYMAMGRGETRNFTTPAVNIRGMTYDVARRMFKVGIKNNIGAMIFEIAKSEIEYTYQRPSEYAACVLAAAIKEGYKGPVFIQGDHFQFSAKKYFENPERELNAIKELTKEAIDAGFYNIDIDPSTLVDYSKKTLKEQQYHNYLNTAKMTDYIREIEPEGINVSIGAEIGHIGGKNSTVEEFEAFMEGYLETLNKKPGISKISVQTGTEHGGIPLPDGTVAKVKLDFNVLRDIGEVARKKYGLSGTVQHGASTLPEELFDKFPENNCSEIHLATGFQNIMFDLAPEKFKEEIYKFIEENFKDEWKEGMTREQFLYKSRKRGFGPFKYQWWTLENKEEILDAIEKKFEFLFEKLKVFDTKQYTDKYIKLVKKSYVKGSTKDVQQKAQEIKLEAGAD >NC_010730.1|WP_012458767.1|24051_24576_-|hypothetical-protein MSLDKQIQAIKEIYREYKRAGEKTRPVIVGKFALSVYTQGMYPANMISLLHPDVIFLEKVLSNLGYKKFGDLWLKDDITIEVSKDFHLITGMLNQIEVDGEEILNVLSLEDLILDMMKFCVEGDDLVCELVRMIVKSYYSALDFHYVYQNIKDRRFIPKLKEYKKEAEELKWQK >NC_010730.1|WP_012458766.1|23092_24064_-|class-1-fructose-bisphosphatase MAKIGMDLNSFILEQERLYPNATGSLSRALVAIESATKVIASHVRMAGLADILGMAGKKNIQGEEVQKLDELSNNLLIQYLSQSGEFFALASEELDEPIFPEEGKDAKYVIAFDPLDGSSNIDVNISIGTIFSIHRRVNSDVSDFLQEGYKQVAAGYVIYGSSTMLVLSTGNGVNGFTLDPAVGMYLLSHPNMKIPEKGKIYSINESNDKKWIDAGLKEYIESLKDEGYTSRYIGSMVADVHRTLIKGGIFAYPADVKNKNGKLRLLYEASPMAFLTVQAGGIATTGKEDILNIKPTDIHQRVPVFLGGKYEMEKLKSMLKNG >NC_010730.1|WP_012458765.1|21861_23100_-|DNA-methylase-N-4 MDNWIKLYVADSRSMEEVEDESISLIITSPPYWHIKDYGVENQIGYGQTLHDYLKDLYRVWLECFRVLKPGRRLCINVGDQFARSVIYGRYKVIPIHSEIISQCEKIGFDYMGSIIWQKKTTMNTTGGAVVMGSYPYPPNGLIEIDYEYILIFKKPGGKEKIAKDIKEKSKLTKEEWKEYFSGHWKFGGEKQINHEAMFPEELPKRLIKMFSFVGETVLDPFVGSGTTLKVANLLQRNAIGYEINEKFLDIIKQKISFKDILFTKIDVIKRETKTEVKPIDYTPSIQDAKPEIDPKKLNFKKDSTYKVIDILSEDTIKLNTGLNVKLLGVKILDKEKSLEYLKSHVLKKEVLLKFDKNPILNENMVYAYVYLKNKIFINAYMIKSGMAKTDTEIDFSLKEKFLKLEKELINE >NC_010730.1|WP_012458764.1|21206_21869_-|MjaI-family-restriction-endonuclease MSKEWILNIATNRWGLNKKNSVGPVSEWIRECSPKKIEEWEICYKDKLKKFLERKKIYIKPDEYLEDLGKKLYTKISEVLKKEIEEVSEEDCIVYIKNLVINRTFEGYQTEINTIYSILEKELGVKLIPAPDNWDRLYNVDFYIQVKDKYIGIQIKPISYNQTPEIHKWKDWLEKSHKKFKEKFGGDVFIVFSVKNEAGKKEIWNKEVIEDIKKEIERLS >NC_010730.1|WP_012458763.1|20222_21203_-|ribonuclease-Z MSSRIKHYLINEKYEDPGIVIEIPELQDFILFDVGNIYKLDRDLIKKINKIFITHTHMDHFIGFDFLLRSKLGRPQTVEMFGIDPLSYNVFCKLQGYTWNLVDLEPQIIFKVKCLKDNLYQYYEFDIKKKFANDFIKEEEADSDIIYENSHYRVRYAVLDHKIKVMGYAFEYKDRLFLKKEKIQELPLKGKEIGFFKQWLENPENQGKTFKILDKEYPYEYLKEEYSYAQKGIKISYITDVVYSQENKEKIVNLVKDSDYLYCESVFLERDKEQASKVYHLTTTQTAEIANLANVKNLIVFHFSRRYGKNKDIVLEEIRKYFPNVS >NC_010730.1|WP_012458762.1|19255_20233_-|tetraacyldisaccharide-4'-kinase MFRNLLYPLSAIYWTLASLRRFLYEKNIIKKKRLPKPVISVGNLSVGGTGKTPIAISISKYLQNQGFKVAVLSRGYKRKSKEEIIKCDNTLNAKSCGDEPFLMVKKGMDVFVGKDRYKSGMYALKIKDYDFFILDDGFQHFQLFRDFNILVVDAGKPFWKDKILPVGNLREPKSFYKYADVFLITRYKGQADVIDKLKEFGKPFFITQERFDGLIDLDNNKIDFSFLKGKKVSVISGLGNNLQFFNLVKSLSKQYDFIVEEFINLPDHFDYKNFKFDLNKTYITTEKDLVKINQKNVYAVSYEILIPEEFYKFMMERIHARAKSD >NC_010730.1|WP_012458761.1|18669_19278_-|chromosome-segregation-and-condensation-protein-ScpA MQEQNPIDIILKLVLKGEIDPWNIDITVLAEKYLEEVKKMYIPDFQTVSKVLIVAALLLKMKAESLKIEDEEENEDKTSRKRLFGIKRFYTIEELAMILKEYTQPPVDYSPSKRSPSQKRERNSAKKIKKFDYQLHKASLEEAIKFIEDYLKEVLQVIKFSEFNYPDKTQAFIALLFLNYDNKINLYQEEHFGEIYIEPIMV >NC_010730.1|WP_012458760.1|17707_18661_-|magnesium/cobalt-transporter-CorA MIRVFYREGLIIKSIQLKELEKIEDKSNILWVDIFNPTEEEIKWSVETFKIEFPSFQEREDIEISSRYWEEEDSITINTYFLIREEENAFNDTVSFIIKDNYIITVRYRELKTFREFVRRLLTNPSIYKTGFHVFSSILEIKIASDSDVLENVSKEISKLGKIVSSGNLDVTETVFESISYYEDLNMTIRESLIDKQRVLSSLLKSYKVPEDVREELRILIKDVNSLIDYTKFNFERLSYLQNTFLGLLNIEQNKVIKIFTVIATIFIPPTLIASIYGMNFENMPELHWQYGYFYALILMFLSASVPIFLFKRKGWL >NC_010730.1|WP_012458759.1|17177_17711_-|hypothetical-protein MIKKKMLFLFVETVAFVFLIILGLSVINFIYKNDIIQDKADFFKAVWVVIVVTLYSSSVIFTLKLKDKDPALEQKELEERLKAKQLYEERDFIINRRITLAYGITLLFLFFAVLTSELLSFFFDEGLLSPVQLAFHTAAFVGYVITFKYVWEKQDYIEYKSREFVRKQIKEDDNLVE >NC_010730.1|WP_012458769.1|28268_29567_-|amidohydrolase MFDLVIKNAWVLTMDENFTEYKNGYIAIKDGKIAEVGENKENLKSREVIDANGNIVLPGFINTHTHAAMTLLRGYGSDNPLKVWLEQYIWPVEGKFVSYEFVKDGTDIACYEMLRNGITCFVDMYFYENAVADAVKSAHMRAVLTTGILDFPTPGAKTPDEGIQKTIDFIREYKNDEFIYPAIGPHAPYTCSPSTLQKSMQVAVDYDVVYHIHVAETLHEVEDIKNRYGDTPVKHLNNIGVLNDRVLAAHMVHPTDEEIELLAEKNVKIAHCPESNLKLASGIAPVPKMLEKGVIVSFGTDGTASNDDLDIIGELSTAAKLHKGYNLNPTVLPAKQVLAMATRDAAKAVRLDKKIGSIEVGKYADLVIIDINQPHLQPLFDPYIQIVYSSRGSDVDTVLINGKVVVKNKEVLTVEKERVLSIAKKWKEKILS >NC_010730.1|WP_012458770.1|29566_31114_-|ATP-binding-protein MKKLPIGIQTFEKIINENCYYVDKTPFIKKLEQGGYYFLSRPRRFGKSLFLDTVKEAFSGNKELFEGLYIYDKWDWNKKHPVIKIDFTEGNVKTQEDLKIKLTEMFISLQREFDVEITFQTFSGKLSELIYALYKKYNQQVVVLVDEYDKPILDAIENIGYAKENREILKDLYSALKKSDPYIKLAFLTGVSRFSKVSIFSGLNQLNDITLDPNFATICGYTQTDLETVFADRIVDFDKEEVRKWYNGYSWLGEKVYNPFDILLLFDKKIFRPYWFESGTPTFLIKLFKQYNYYLPELENLEVGEELLSNLDIDDLYVENVLFQAGYLTIKDVKRRLYREVYTLSYPNYEVKVSLNNFFLLHFVPDRSLKDKTENELEKALRDNQIDKLKDILYRFFASIPYDWYRKNDLENYEGFYASIVYALFSGAGFEIIAEDTTNKGKIDLTVIYNNKVYIIEFKVVEDKPEKTALKQIEEKRYYEKYLGKFEEVYLIGIEFSKKDRNIVDFDYKKIQEAD >NC_010730.1|WP_012458771.1|31118_33377_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MEEKILKAHGLNVEEYKRIVELIGREPNEIELGIFGALWSEHCSYKSSKPFLKVFPTKADWVIQGPGENAGVVEIDDKYAVAFKIESHNHPSYIEPFHGAATGVGGIIRDILSMGARPIALMDSLRFGDIRKDGTRKGIKDAKPIVKRVVEGIGFYGNCIGVPTVGGEAVFDEVYAGNPLVNAFCLGVLEKDKMFRARATKVGQKMVMVGSSTGRDGIHGATMASAEFSEESESKRPNVQIGDPFFGKRLIECTLEVMEKGLIEGCQDFGAAGFAGSTSEFGAKSGMGVKVYLENVPLREEGMTPYEILLSESQERMLYAVNDENVEEVIKIAKKHGLEAAVIGETTDTKRMEVFYKGEKVADLPISAIVDDAPVYNRPRKEPEYLKQVKSFSQNNLPEVDLAEAIKKVLSSPTVAKKSWVYSQYDHEVGTNTVFKPGHDSAVLRLKWVVRPEVKTEKGIAISSDGNGRIVYLDPYEGGKRVVAEAVRNVYITGAKPLAITDCLNWGNPENPEIMWQFEQATKGMADACKELNTPVISGNVSLYNETVLSDERINIYPTPIVVAVGVLDKVEEAIPSFYQSVGDLIAIVGETEKGPNIAGSEYLKEIFNTVAGDIGQISFKTEKKLMEFIHKNKDKIKSAHDVSDGGLITALLEPAFREGQKLGLELNIETKYRPDFELFDELRSIVVISLKEDDLKILEKEAKKLGLGFKIVGKVLERDKILLKVNDKIILEEPLSNLKNLYENGLSKLMG >NC_010730.1|WP_012458772.1|33525_33996_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase-subunit-E MFDIDKEFENLKNKKNGFIPLLHSIQNHYGYIPIEFVEILAKRLNLSKAEIWGVITFYSDFKTKKPGKNIIKVCRSESCIANGGLEIQKYLKSKLNINFKETTEDGKFTLEEVFCFGNCGCGPSVMINNKLYGRVSLKKLEELLKNLSGDKNEQDI >NC_010730.1|WP_012458773.1|33979_35551_+|formate-dehydrogenase-beta-subunit MNKIFKVYVPKDFSSVSVGSDEVAEEIVNQAKKRNLDIEVIRNGSRGAYWLEPLVEVETEKGRVGYRNISIDDVESLFESKFYFGSQNHEKYVGLVEDLDFFKNQTRITFERVGLVDPLSIKDYQSNGGFLGLKKAISMKSEEIIEEIKKSGLRGRGGAGFPTGIKWETVFKTGSDKKYVVCNADEGDSGTFSDRMIMESDPFLLIEGMVIAGLAVGADEGYIYLRSEYPLAKEVLTKAIDLAYKNRYLGKNILGSGKDFDLEVYVGAGSYVCGEETALLESLEGKRGVVRPKPPYPAINGLWNKPTLINNVNTLATVPWIIREGGDKYFNYGVGKSRGTIAIQLSGNVKHPGLVEVPFGISIKDIVYGFGGGTKTGKKVKAALIGGPFGIYIPESMFDISIDYESLSKIGGTIGHGSIVVFDEEADLKYLARFAMEFCFIESCGKCAPCRIGSIRGLEILDKLLNQGRDERLISMFVDLSEVMINTSLCGLGGMAPKPILSLFKHFPEEFGLFKEDLEKFSF >NC_010730.1|WP_012458774.1|35560_38563_+|formate-dehydrogenase-subunit-alpha MICRIFDDFGTPPSNSEKLITVEIDGKEVSVPEKTSVLRAAKMAGIDIPKLCSTDTLKPVGSCRLCIVEIEGKKGYPTACTTPVEEGMKVKTNSEKIQKLRRGILELYISDHALRCGICPANGSCELQRALSLVGVREFKYKKGLNHCDLPVDNSNPYFVFDPSKCIMCYRCVEACNEIQGTYALAVEGRGFNSKIKPGIDGLFINSECVSCGACVINCPTGALVEKKVVEHGRGNRFVKTVCPYCGVGCSFYAEVSGNNVIRMIPDKKGKANQGHACIKGRFAWYYIYSKGRITKPMIRKGINEPWRECTWEEVINFVANKFKSIQEKYGRYSIGAVTSSRCTNEETYLLQKLVRTAFRNNNVDNCARVCHAPTGYGLKTAFGTSAGTNEFNSVLKSDVIMIIGANITEGHPVFGSLVKRRVRDGAKLIVIDPRKIEISDSPHVKADIHLQLRPGSNVPLLNAMAHVIISENLEDEEFIKSRCDLETYERWKEFILKEENSPEYVEKITGVLASQIKEAARLYAKAEKGSIYYGLGITEHTQGTTAVYALANLAMITGNVGREGTGVNPLRGQNNVQGSNDMGSFPHDLSGYRHVSDQATRKLFEEAWNVDIDPEPGLRIQDMLQLAIDGKFKGIYLHGFDLVQSLTDTNYVIEALKSMELVVVHDLFLNETAKYAHVFIPGCSFLEKEGTFTNAERRVQLLKKVIKPMCDKQEWEVFCEIARVMGYDISYQNSQEIMEEISKLTLTYNGITYEKLEKFGGIQWPCNENAPYGTPTLHKDGFLIGKGKFFITGYIPSKEKISSNYPLILTTGRNLFQYNVGTNTRRTFNINFYKEDILEINPMDAKAKNIKDGDYVRLKGENGSIVIKAKITERVSPGVVFSTFHFPETKTNVLTKNNFDWATLCPEYKFTAVDVEPIEKPISESEPELKESGENIIIDMANRIGLFFEFYEKEDSIKAIVDHFKKFWHPLLREKLKQFKDDKALLQIVKEAIEILDSN >NC_010730.1|WP_012458775.1|39140_40022_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MFYGSVVALITPFKDGTLDRQGLKRLIEFHIENGTDAIVVAGTTGESPTLTYEEHELLIELAVGYSNKRIPIIAGTGANSTHEAITLTKFAEKVGADASLQVVPYYNKPTQEGIYQHFKAIAEETNIPLILYNIPSRTGVDMLPETFARLYGDFPNVIGIKEATGNVARVSETISLTNEDVLILSGDDALTLPMMAVGAKGVISVANNIIPKEISQMCKLALEGKFEEAKKIHNQYWDLFKVLFIETNPIPIKTAAYLMGLIESLELRLPLYTMSKSNEEKLKEVLRKHSLIK >NC_010730.1|WP_012458776.1|40094_40490_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE MERIIVKNLEELDKLTKEIAKNLKGNEIILLEGDLGAGKTTFTKYLLKNLGVDEHITSPTFTVMNQYESPNFDIYHIDMYRVNDIDISDLIGNGLIVIEWPKIEIRCDDCKVIKIKIEPLEDDSRIFEINQ >NC_010730.1|WP_049751876.1|41089_41617_+|tetratricopeptide-repeat-protein MEQKITLIDACIAFLNAGDYEKAIEVGKLAVEKYPDNLVAYLCLGEAYYRTLKLDAAYEIFKKAESLTNKKENLMQIYSRIGQILENMNNLDDALTYYNKSLSLAKELGDTDIQAIALKGIASIYHQKGELDKALGHCQEYLSLEKNEKGKPIVYNNIGSIYYEKGNYQKAIENY >NC_010730.1|WP_049751877.1|41701_41947_+|tetratricopeptide-repeat-protein MKDYKNAEKYLSEGLEGVKRAGDEYFEAKGYSYFGDLYRDKGDKETARDYYTRAYNLFKSIGAEKNAKDVLNEAKKLDKSI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_010730_2 | 578053-578190 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010730_2
|
3 spacers
spacers of NC_010730_2
>2.1|578074|18|NC_010730|CRT TTCGCCTGCTGGTGCAGC >2.2|578113|18|NC_010730|CRT AGCAGCTTGTTGAGCTGG >2.3|578152|18|NC_010730|CRT AGCTGGTGCTGGTGCAGC >2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder GAGCAGCTTGTTGAGCTGGTTGTTGTTCAGCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010730_2
The CRISPR arrays of NC_010730_2 >merge|NC_010730|2|578053-578190|CRT,CRISPRCasFinder CTTTTGTTCAGCTGGTTTTTGTTCGCCTGCTGGTGCAGCTGGTTGTTCAGCTGGTGCTGGAGCAGCTTGTTGAGCTGGTTGTTGTTCAGCTGGAGCTGGAGCTGGTGCTGGTGCAGCTTGTTGTTCAGCTGGTGCTGG >NC_010730|2|2|578053-578190|CRT CTTTTGTTCAGCTGGTTTTTG TTCGCCTGCTGGTGCAGC TGGTTGTTCAGCTGGTGCTGG AGCAGCTTGTTGAGCTGG TTGTTGTTCAGCTGGAGCTGG AGCTGGTGCTGGTGCAGC TTGTTGTTCAGCTGGTGCTGG >NC_010730|2|2|578070-578186|CRISPRCasFinder TTTGTTCGCCTGCTGGTGCAGCTGGTTGTTCAGCTGGTGCTG GAGCAGCTTGTTGAGCTGGTTGTTGTTCAGCTG GAGCTGGAGCTGGTGCTGGTGCAGCTTGTTGTTCAGCTGGTG
>NC_010730.1|WP_012459281.1|576218_577760_-|DUF1957-domain-containing-protein MKGYWMPVLHSHLPFVKHPEYEYFLEEHWLFEAITETYIPLLMRFKKLEEEGVDFRITTSITPPLAYMLSDRLLIEKYKKYLDKMLSLTEKEIKRTRASETFNKLANFYNKLFTYIKDFFYGFLNQNVLNGYRYFEEKGYIEIITCNATHGFLPLLQPEIQSVERQIELAIKTHEKFFGKKPKGIWLAECAYYDGLDSILAKHGIEYFFLDSHGLLFGKPTPRYGVFAPIYTPSKVAAFGRDPESSKQVWSAKEGYPGDPNYRDFYRDIGFDLEFDYIKDYISPDGIRVYTGIKYYRVTGDVDLAHKQPYDPDKAKEMTKVHAGHFHISREKQMEHLGKFMDRLPLIVSPYDAELFGHWWFEGPEFLYNLFKEIDKHKQFKAITPSEYLNIYPENQVIRPSPSSWGDKGYYEVWINPKNHWVYRYLHQMERDLESLKSKYNNQRVLKQLEVQLLLAQSSDWTFLITTETAQQYATNRLKEHISHFYTLKEQLEMGKIDKEYLEFLEYKYSIFG >NC_010730.1|WP_012459280.1|575308_575992_-|dUTPase MKEKVNECLKLQDELNKKIDINWKNIRTKEDFFRAIWLECAESVESLPWKWWKKIEPDIENLEIELADIFHFVLSLVLMERNPNLSYFYKGLNKDFSDLKDIEGDYINHYLAQKYKEEENTKIYIYLIERIAEKALRQDLKGVLFFFGMVVSEVFNFDKLYLLYIGKNILNHIRQEKGYKSGNYQKVIGGLEDNKYLLNVIKEVGSKDELEEKLRNVFNNLEVKSNE >NC_010730.1|WP_012459279.1|574464_575316_-|hypothetical-protein MNDSGYFFIGQLFWLIFLFMFIFPVIQAQMLQWSRERILKAIEEKYGSKVITLIHRQETRSLFGFFMMRMITIEDSEAVLRAIRMTPKDKPIDFIIHTPGGIALAATQIARALVAHPAKVRVIVPHYAMSGGTLIALAADEIVMDPFAVLGPVDPQLGTEPAASLVRIEQLKDPKDIDDQTLVKIDMSKKALKQMKDTVKEILIKKGHSEEKAEFIANELSQGKWTHDYPLTYDYLKYLGLNVSTQMPEEVYALMDLYPQPTGIPAVQYLPEPPVKRPEAIKK >NC_010730.1|WP_012459278.1|573823_574468_-|DUF502-domain-containing-protein MKVNLKNTFITGLFVLIPIIVTFWVVKTVLSAVNNLILPYIEELGVPVPHIPGLGILVTLSIIFLLGLLAQNYFGKRLLEYWDKFISKIPVVSSIYNATKQTMETLFSKKENFSKVALVRYPHKDTLAIGFVANELKICNEHYYIVFIPAAINPTSGFAIMVKKEDLILTDLTVEEATRTILSGGLVIKKQIKLLENQKTEEAKVVENGEKNAV >NC_010730.1|WP_012459277.1|572358_573834_-|menaquinone-biosynthesis-decarboxylase MPYEDLREFISDLEKNGELVRVKSKVSPILEITELADRMSKLPKGGKALLFENVEGYENIPVLINAFGSEKRMKMALGVESFESIGWKLYKILKPEIPNTFLDKIKKLPELKRLNDALPVVVKDGKCKEVIKKGQDVNIFDFPVLKCWPKDGGRFITLPIVISKDPENGIRNVGMYRIQLIDRDKVTVHWQIHKGGSHHFWKAKKLGVKIPVAIVVGADPVLTYCASAPLPEDVDEFLFAGIIRDKGVKLVKCETVDLEVPADAEIVIEGYIDPSEPLVDEGPFGDHTGFYTPVDKYPLMHIICITHRKNPIYHTTVVGKPPMEDGWLGKATERIFLPLVQFNLPEIVDYNLPISGCFHNFAFVSIKKRYPGHAFKVINALWGLGQLMFEKHIIVFDEWVNIHDIDEVLWIWGNNVDPSRDVIIQKGVIDVLDHSTNLPGFGGKMGIDATTKWKEEGYTRDWPEVAKMDEEVKKKVLPVWYEILQKMKGER >NC_010730.1|WP_012459276.1|570909_572184_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MKVLVVGNGGREHALVWKIKQSSLVKEVYCASGNAGIGKIAKRVNISPTDIYNLVRFAKENKIDLTVVGPEQPLSEGIVDRFNEEGLKIFGHQKSAAILEASKVFAKNLMKKYGIPTAKFESFEKEEDAIKFIKEVGAPIVIKADGLAAGKGVVVAKTEEEAIQAVKDMFAGKFGPASKRVVIEEFLEGEEASYICFVKDDKLVPMPTSQDHKRAYDNDEGPNTGGMGAYSPCSLITPKMEKEIQEKIVYPTLRAMINEGRSMCGFLYAGLMIGPKGINVLEFNVRMGDPETQPIMRRLQSDLVEHILEILEGNIENVKPKWNPDYAIGVVMASKGYPDAYEKGKVITGIEEAEKDQDVVVFHAGTEEVDGKIITNGGRVLTVTATGEDIIKAREKVYSAIEKIHFEGAFYRKDIGFREVNRKK >NC_010730.1|WP_012459275.1|569653_570913_+|diaminopimelate-decarboxylase MHQVYNYFGYIEKKLYCEEVSILNLASKVGTPFFVYSKKAILDKINQYKEAFKDYDTLICYALKANSNLSLLKIFEENGVGADIVSGGELYKAKKAGFSSNKIVYAGVGKTDFEISYAISENILSFNVESFMELDVINEIAGKQEKKANVSIRVNPNVDPKTHPYISTGLKKSKFGIDIDQALDAYKKAAKLENLNVVGVHCHIGSQIMDISVFREAAEKVVDLVFKLKKEGIELKFIDMGGGLGVKYHPDDNPPTPKDLADAIIPVVKQTGLKLIIEPGRSLIAEAGALITKVIFLKDKQEKHFVIVDSGMNDLVRPAMYNAYHHVLNVQEKDEEMIADIVGPICETGDFLALDRKIGKVERGDLLAIMTAGAYGSSMSSNYNVRPRALEVLVDGSNFKVIKEREDYKHISKYEEEVL >NC_010730.1|WP_012459274.1|568961_569570_-|septum-site-determining-protein-MinC MGVEIKGLTVPALLIKLDPSKSLQENIDELKQKLSSAFFKGSYAVVDYNGLELNEESKVEIEKVLKDFNASVLGFQNTKNNKESLKGVTQKKSLKIINKTLRSGQKVEYDGDVLILGDVNPDAYVVSSGSVIVMGNLRGVVHAGANGDETAVVMALKLRPQQIRISNYIARSPDEPDVKAEESNSPEIAYIENNAIVIDKIK >NC_010730.1|WP_012459273.1|568164_568947_-|septum-site-determining-protein-MinD MARVIVVTSGKGGVGKTTITANISTALAMMGKKVLAIDADIGLRNLDMILGLENRIVYDIVDVVEGRVPPEKAFVKDKRGLPLYLLPAAQTKDKDAVKPGQMVDIVEKVKDSFDYIFIDSPAGIEGGFKTAAAPAEEAIVVVNPEVSSVRDADRIIGLLESMEKGNARLVINRIRLHQVKKGEMLSVEDIEEILQIPKIGIVPDEEKLVDFTNRGEPIVLHKELPAAKAIMNIARRLEGEEVPFTELEEKKGFLAKLFGR >NC_010730.1|WP_012459272.1|567903_568149_-|cell-division-topological-specificity-factor-MinE MSIFSFFKRQSSANKAKERLMMVLSYERKGLPPNFADILKNDLITVFSKYPQFDSHNIEVEIKSENDRDELWISIPFANGK >NC_010730.1|WP_012459283.1|580386_581022_+|nucleotide-exchange-factor-GrpE MFVKQKSGGKKLEEKNNQENIENQEQNQEEVREEKPLTEQEKDELIKKLQEEVETLKQKLQKTEEAAKRLSALYQSIQKDFEDYKIRAIKEREQIKEESIEKFAKAFLDVVDNFEKALESFKVSNDINAIMQGIRMTHYQIMNLLQSYGIEKIEAAGEFNPMEHEALETLKTKEYRNNQIVKVLQAGYKYKGKVIRPAKVVVAISEEEEIT >NC_010730.1|WP_012459284.1|581021_581912_+|J-domain-containing-protein MNFYKLLGLKIDATEEEIKKAFRKQAKKFHPDLNKDSEEIFKLINQAYKTLIDPEKRSSYNNILGKSNLLNVFEEKLLEFLGFTDKPKNGSNIHITLKVSLKDAILGSEKVITYKRYKTCENCEGSGLSQSSKIVKCKKCDGIGKIQTKIGKIVCFNCFGKGYEILNPCEKCKGQGYYKGLESIKINIPKGIDDGERLRIRNLGHDGISGGKSGDLIIRFKLVENVFKKIGNDLYLKLKLQKPLEEYEILRIKTITDEILELKIPKEEQLPLTLKIPKEGYIDKSGNRGNLYIYIF >NC_010730.1|WP_007545826.1|582192_582519_-|(2Fe-2S)-ferredoxin-domain-containing-protein MSEFRHVFVCMQRKPPGMPSCGDKGSDQIFMKFQEALMTKGLFNKMAVTATGCLGPCMFGPNVVVYPDAIWYGNVTPADVEEIVQKHIIEGQPVERLIVSKGKPPGMF >NC_010730.1|WP_012459285.1|582620_583691_-|DNA-protecting-protein-DprA MNEILSSLEISFIKGIGNITFKNLILKFKTSENILNTDFNQLKENFGENIANLIVNRDKSLRERALKEYEKALKYNVRIIPFSSENYPKLLKEIPDPPMVLYVKGNLNNLDNSLSVVGTRKYSNYGLYVVNSIVKELAKNGVTIVSGLASGIDTLAHRITLKENGYTIAVLGNGIDIVYPYENKKLYEEISEKGCIISEFPFGTKPSQYTFPNRNRIIAGLTYGTFVIEAQEKSGSLITANYANDYGRLVFTVPANINLSSATGNNLLIKDGAIPITSFEDFKDHLPFLNFKKENFEKVLDLTEEEKFILQIIGSDKVYIDKIIESVDGKFDVFTVLNEMVIKGILSEEFGFYYHS >NC_010730.1|WP_012459286.1|583749_584400_+|PilZ-domain-containing-protein MSDGIIDRFINKLQKDKKIEAYIFYDESPIKVVLPVLDIDFERKQIEFEINPKIEAMINQEKEIYVRFSNEVLLLRPLFWNKETLVTTFPFLAIEPKVKREHVRVKCSQKNPILLEIDDDINVCVLLRDISEKGFSFKLPKTVYLELNKPFSGKLNINGKSLPIVFKVLYKIERPDNTYRYGAKILNATAKVEDEVAKYIFERQREIAKILNTFAD >NC_010730.1|WP_041674686.1|584396_585050_-|radical-SAM-protein MKKDLNKETFKVVEIFRSVEGEGRWVGLPVVFIRLEGCNLRCSWCDTPYSYTGENFKLLSISDILEEIKKYNLKRVCITGGEPFFTENLDILVGNLIENNYQVFIETNGTLWNQNFENLDKSKIYITCSPKPPFYFINKNLLPYISEFKFVVDETLDVKHIIRPDLTEYIKNDVIVLQPESNKPEMVNKALKLQDELLKFGIESRIIPQCHKVLGLP >NC_010730.1|WP_012459288.1|585030_587817_-|translation-initiation-factor-IF-2 MKLKDLALELGIDPKKLKEELNEELGLGLKKITDKLPDEVVDLIKDRYKKSQEVKEVQVEEKGIKAFDLYHSLGITLSELEEKLKEVGFSKEITNWTIIDEETVEKVKKAIEDEKKRREEELRKLEEERKRREEEEKAKKEEELKAKEKIKEIPEEKKEEEIKPEPKKEEIPEVIEGVVAEEERKPFRKEKREFEKKEERKPYEKKPFEKKPYEKREGYEKREKYEKKGKFEKREETRPPKEGFAEKEKYKEERKPFEKKERFEKREEKQPTPIAIVPESIKEEKRVEKKETKEERETRLAKEQKEEMEALRKLMEGQPKKRKPKKEEKKKEVEEQSKEEEIKIVQIPEVITVRELADLLDIPVNQILMDLLKRKILATVNQTIDPKIAIEIAEEHGFLAELKEEGVEEEKEAEEEILSEEETAEEEGNLVPRPPVVVVMGHVDHGKTTLLDTIRKTDVAAKEHGGITQHIGAYKIKLPNGKEITFLDTPGHEAFTTLRARGSKVADIAILVVAADDGVKPQTVEAINHAKSAKVPIVVAVNKIDKPGADPMRVRQELTQYGLIPEEWGGDTIFVDVSAKTGKNVEELLEMVLLVAEMLELKANPNRQAVGTVIESKLDPKKGPVATVLVENGTLKVGDYFVAGYTWGKVKALLNERGERLKEAGPGTPVEVLGFEEVPQAGDKFIVKASEREAKQLAEIRKLRREEELLAKKTRIHLENLSEVKEINIIIKADTQGSLEALRKSIEELSNKFSEVSINIIHGAVGGITESDVMLAAASNAIIIGFNVRPDAGARKAAEEENVDIRVYNIIYQALEDLEKAMKGMLAPTYREVLLGTAEVRATFKAKSIGTIAGCYITDGIIKRNAKARLVRNGVVIYDGEISSLKRFKEDVKEVQKGFECGLTLKNFNDIKVGDIIEAYEIVEERPQ >NC_010730.1|WP_012459289.1|587829_588126_-|50S-ribosomal-protein-L7ae MDLEAEKKVISLLQLAYRSGKLKFGYENLYKLKGKHFLILAKDLSENTKKDILKLNKFEIYFFKNKQELGKIFGKNNVGVVAVLENNLGREIKRFLKG >NC_010730.1|WP_012459290.1|588125_589241_-|transcription-termination-factor-NusA MSVKLKNVIETISREKNIPEDVIEKALRDGILTAVKKEFKLREKDAVKIIFDKEKDELKVLIKKKVTPFVEDETKEIALEEAKNYDPNADYGKYVYVPLNLEDIGRIALSVAKEVIAKKVSKVERDILYREFKDYEGKIITGTVRRFEGDDIIVDLGRIEAILPKEEQIPKEKYKIGDRIRALVLKVSKENTYPIIEKGKLKRVIKVFEPPMVILSRTHPNFLKKLLEIEVPEIAEGEIEVKAVAREPGERAKVAVYSKDKNIDPVGVVVGLKGSRILNVSSELSGEKIDVIEWDEDPAKFIIRALAPARAKKYRLLPREKRIEIAVPREELSLAIGKNGINAKLAHKLTGWHIDILSEEDFERIQKLPSK >NC_010730.1|WP_012459291.1|589255_589699_-|ribosome-maturation-factor-RimP MKVEEKVKELLLPILEERDFKLVDIEFIPSKRPILRIYIYNPEGTSIDDCEWVSKRIGALLDVEDLIDKAYILEVSSPGLDRKFKNIEEYDIFKGRDVVVKTKEPINEKKVFKGTLLGLEDEKVKIKENEETVEIPFENVSQTKLDF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_010730_3 | 693082-694222 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_010730_3
|
17 spacers
spacers of NC_010730_3
>3.1|693110|37|NC_010730|PILER-CR,CRT AGTGTAAGAAAGGTATTGTTTTTAAATGTTGGAATGT >3.2|693175|37|NC_010730|PILER-CR,CRT ACTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA >3.3|693240|38|NC_010730|PILER-CR,CRT AGTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT >3.4|693306|37|NC_010730|PILER-CR,CRT AATACTTGATAGCGTAGGATTGATTAGAGAGTTGTTA >3.5|693371|38|NC_010730|PILER-CR,CRT ATTTAAAAAATTTGATGTATATTATTATTAACAATATA >3.6|693437|37|NC_010730|PILER-CR,CRT ATCTTTTTAATAGGTGGTTTTCTTCTTGGCTCTATCT >3.7|693502|37|NC_010730|PILER-CR,CRT ATAGCAAAAGCTAAGATAGTATTCATTGTTAAAGCCG >3.8|693567|38|NC_010730|PILER-CR,CRT ACTTTTAACTCATATATAGAATTATTTTTAAATATTTC >3.9|693633|37|NC_010730|PILER-CR,CRT AGTTTTTAAATTAACAAACTCTTCAGTTGAAAGCATG >3.10|693698|38|NC_010730|PILER-CR,CRT ATTGAAACATACAACAGAGAAGAACATAAATTTGAGCA >3.11|693764|37|NC_010730|PILER-CR,CRT ACTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA >3.12|693829|38|NC_010730|PILER-CR,CRT AGTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT >3.13|693895|37|NC_010730|PILER-CR,CRT GTAATTTTAATCTTTCTTATGTATTAATTTTTAGTTT >3.14|693960|38|NC_010730|PILER-CR,CRT GGTTTAAAGTTGTTGGCTGGAATATTGAAATTAGCACT >3.15|694026|37|NC_010730|PILER-CR,CRT GTACTTTTTACTCATCACACTTCACTCATCTATTCAC >3.16|694091|37|NC_010730|PILER-CR,CRT GTTGGTCTTCCTTTTGAAGTAGGTTGACCCATTAAAA >3.17|693111|36|NC_010730|CRISPRCasFinder GTGTAAGAAAGGTATTGTTTTTAAATGTTGGAATGT >3.18|693176|36|NC_010730|CRISPRCasFinder CTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA >3.19|693241|37|NC_010730|CRISPRCasFinder GTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT >3.20|693307|36|NC_010730|CRISPRCasFinder ATACTTGATAGCGTAGGATTGATTAGAGAGTTGTTA >3.21|693372|37|NC_010730|CRISPRCasFinder TTTAAAAAATTTGATGTATATTATTATTAACAATATA >3.22|693438|36|NC_010730|CRISPRCasFinder TCTTTTTAATAGGTGGTTTTCTTCTTGGCTCTATCT >3.23|693503|36|NC_010730|CRISPRCasFinder TAGCAAAAGCTAAGATAGTATTCATTGTTAAAGCCG >3.24|693568|37|NC_010730|CRISPRCasFinder CTTTTAACTCATATATAGAATTATTTTTAAATATTTC >3.25|693634|36|NC_010730|CRISPRCasFinder GTTTTTAAATTAACAAACTCTTCAGTTGAAAGCATG >3.26|693699|37|NC_010730|CRISPRCasFinder TTGAAACATACAACAGAGAAGAACATAAATTTGAGCA >3.27|693765|36|NC_010730|CRISPRCasFinder CTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA >3.28|693830|37|NC_010730|CRISPRCasFinder GTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT >3.29|693896|36|NC_010730|CRISPRCasFinder TAATTTTAATCTTTCTTATGTATTAATTTTTAGTTT >3.30|693961|37|NC_010730|CRISPRCasFinder GTTTAAAGTTGTTGGCTGGAATATTGAAATTAGCACT >3.31|694027|36|NC_010730|CRISPRCasFinder TACTTTTTACTCATCACACTTCACTCATCTATTCAC >3.32|694092|36|NC_010730|CRISPRCasFinder TTGGTCTTCCTTTTGAAGTAGGTTGACCCATTAAAA >3.33|694157|37|NC_010730|CRISPRCasFinder GCAGTATTATGAGATCGGTGTTATGTTTATCTATTTA >3.34|694156|38|NC_010730|CRT GGCAGTATTATGAGATCGGTGTTATGTTTATCTATTTA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010730_3
The CRISPR arrays of NC_010730_3 >merge|NC_010730|3|693082-694222|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAAGTGTAAGAAAGGTATTGTTTTTAAATGTTGGAATGTGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAACTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAAGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAAGTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGTGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAAATACTTGATAGCGTAGGATTGATTAGAGAGTTGTTAGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAATTTAAAAAATTTGATGTATATTATTATTAACAATATAGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAATCTTTTTAATAGGTGGTTTTCTTCTTGGCTCTATCTGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAATAGCAAAAGCTAAGATAGTATTCATTGTTAAAGCCGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAACTTTTAACTCATATATAGAATTATTTTTAAATATTTCGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAAGTTTTTAAATTAACAAACTCTTCAGTTGAAAGCATGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAATTGAAACATACAACAGAGAAGAACATAAATTTGAGCAGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAACTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAAGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAAGTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGTGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAGTAATTTTAATCTTTCTTATGTATTAATTTTTAGTTTGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAGGTTTAAAGTTGTTGGCTGGAATATTGAAATTAGCACTGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAGTACTTTTTACTCATCACACTTCACTCATCTATTCACGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAGTTGGTCTTCCTTTTGAAGTAGGTTGACCCATTAAAAGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAGGCAGTATTATGAGATCGGTGTTATGTTTATCTATTTAGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATGTAA >NC_010730|3|2|693082-694155|PILER-CR GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AGTGTAAGAAAGGTATTGTTTTTAAATGTTGGAATGT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ACTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AGTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AATACTTGATAGCGTAGGATTGATTAGAGAGTTGTTA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ATTTAAAAAATTTGATGTATATTATTATTAACAATATA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ATCTTTTTAATAGGTGGTTTTCTTCTTGGCTCTATCT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ATAGCAAAAGCTAAGATAGTATTCATTGTTAAAGCCG GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ACTTTTAACTCATATATAGAATTATTTTTAAATATTTC GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AGTTTTTAAATTAACAAACTCTTCAGTTGAAAGCATG GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ATTGAAACATACAACAGAGAAGAACATAAATTTGAGCA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ACTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AGTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA GTAATTTTAATCTTTCTTATGTATTAATTTTTAGTTT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA GGTTTAAAGTTGTTGGCTGGAATATTGAAATTAGCACT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA GTACTTTTTACTCATCACACTTCACTCATCTATTCAC GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA GTTGGTCTTCCTTTTGAAGTAGGTTGACCCATTAAAA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA >NC_010730|3|3|693082-694222|CRISPRCasFinder GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA GTGTAAGAAAGGTATTGTTTTTAAATGTTGGAATGT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA CTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA GTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA ATACTTGATAGCGTAGGATTGATTAGAGAGTTGTTA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA TTTAAAAAATTTGATGTATATTATTATTAACAATATA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA TCTTTTTAATAGGTGGTTTTCTTCTTGGCTCTATCT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA TAGCAAAAGCTAAGATAGTATTCATTGTTAAAGCCG GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA CTTTTAACTCATATATAGAATTATTTTTAAATATTTC GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA GTTTTTAAATTAACAAACTCTTCAGTTGAAAGCATG GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA TTGAAACATACAACAGAGAAGAACATAAATTTGAGCA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA CTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAA GTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG TAATTTTAATCTTTCTTATGTATTAATTTTTAGTTT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG GTTTAAAGTTGTTGGCTGGAATATTGAAATTAGCACT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG TACTTTTTACTCATCACACTTCACTCATCTATTCAC GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG TTGGTCTTCCTTTTGAAGTAGGTTGACCCATTAAAA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG GCAGTATTATGAGATCGGTGTTATGTTTATCTATTTA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATGTAA >NC_010730|3|3|693082-694221|CRT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AGTGTAAGAAAGGTATTGTTTTTAAATGTTGGAATGT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ACTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AGTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AATACTTGATAGCGTAGGATTGATTAGAGAGTTGTTA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ATTTAAAAAATTTGATGTATATTATTATTAACAATATA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ATCTTTTTAATAGGTGGTTTTCTTCTTGGCTCTATCT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ATAGCAAAAGCTAAGATAGTATTCATTGTTAAAGCCG GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ACTTTTAACTCATATATAGAATTATTTTTAAATATTTC GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AGTTTTTAAATTAACAAACTCTTCAGTTGAAAGCATG GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ATTGAAACATACAACAGAGAAGAACATAAATTTGAGCA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA ACTCAAGTAAAGTCTTCATAGCTAAAACCTCCTATAA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA AGTCTTTTTCATCTTTTCTTCTAACTTTAGCAACCTGT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA GTAATTTTAATCTTTCTTATGTATTAATTTTTAGTTT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA GGTTTAAAGTTGTTGGCTGGAATATTGAAATTAGCACT GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA GTACTTTTTACTCATCACACTTCACTCATCTATTCAC GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA GTTGGTCTTCCTTTTGAAGTAGGTTGACCCATTAAAA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAA GGCAGTATTATGAGATCGGTGTTATGTTTATCTATTTA GTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATGTA
>NC_010730.1|WP_012459387.1|692016_692283_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIICYDITDDGRLNKARKVLRKYLNWVQYSVFEGNISYGNLEKCLAEVSEVIDKREDSLYVYMTDFEKSIRKKIIGKDKNPSDNFI >NC_010730.1|WP_012459386.1|691034_692015_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSRRYYINNSGRLKRKENTIFFEISEKERKIIPINDIDSIYIFGEVDLNTKVLNYLAQNDIPVHIFNYYGYYSGSFLPKKKNVSGILLVSQVSHYTDYSKRLYLAKSFIEGGVYHILRNLKTNQAEEEVEKINEFLKQLPDANTIEEVMAVEGNIRNIYYQAFNKIIKNQDFKIDKREYNPPTNPINALISFGNSVLYSVILSEIYKTHLEPTISYLHEPSERRFSLSLDISEIFKPLIVDTVIFNLLNYETINLSHFNQDLNFSYLNDEGRKIFLKYLEDKLETTIKHKTLQRNVSYRTLIRLECYKLIKHLLDEEDYKPLKAWW >NC_010730.1|WP_012459385.1|690512_691022_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDLETLKEIRITGLKVNYYYICKRKLWLFSKNLNFEKNNDKIILGQILHENYYKSEKERDILIQELISIDIVDDDYIREVKSSDKMEKADTMQVVYYLYVLKQLGIEKVGLINYPKQKKKKEVYLTKQLEQELLESLKDIEKIINQPNPPKLEKLPYCKKCSYFEFCFA >NC_010730.1|WP_012459384.1|688322_690512_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNQYIAKLSGNNQQTLQEHTEKLLENFEILKKYIQLDKETEKAVYLACLFHDIGKASKEFQAKIAKQKPQPKQEIPHNLLSAVIFYFLRKHFKDNIDLFRKIQYAVAYHHDRYDTDINKSKPILEDFAVRVENDLKDWILEKLKIYEITQLNIDKSKLIDGLRSALEFKKQILRNENFLKDKKTILLKGLLHRLDHAASADVEVEKGLIEDYQSIFIKGLSKKGINKLKDFQKKALDYKDKSVILTASTGMGKTEFALNWVAGDKAFYTLPVRVSVNSMYERISNIFGKDNVGILHANTTDFYLNQFKNLEDNGIEVLINQVQSVRQLSMPITVSTADQIFLATLKYSGFEKIYATLTYSKVIVDEPQGYSPDTLAVILKGLEEIYNLGGKFCLMTATMHPFIKEYLKDKAEILEPVFNPEKKHKIKLVDKTVDEMVDFAIKEYQKGKKVLILTNTVRKAQEVYKALENLKQPIQFHLLHSLYIQKTKREKEMQIQNTTEPVIWISTQIVEASLDIDYDLLITELSTADSLIQRMGRVYRKTGRTITPDNQPNIIICTKEPSGKGKVYDKEIVDYTLKELEKYDEKILTEEIKQEIVSTVFDLKRIENTNFYKKFDKNIKLLDYGFMADSKKEAQDIFRDIMNLSVIPKVIFDKNQEKINTLLEKINQKDKIERIKAMQELNDFTVSAQFYRIKNIIPYKEILISDIPYDDKLGFNLLDKDYKEIGEIL >NC_010730.1|WP_012459383.1|687628_688321_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MSILRVRLYQEFACYRKPITYGFWETYPLPPLSTVKGFFHNVVEAKEYMPARYGIQGKFKSVVLDMQSMYKFGRKDSENKGIIIEGFNKPLLKSPIYVSNLYAVELTIYIESKLEYLEKFRENLLNLEYPSLGRKEDLVRVDSADIVELIERDLFEDSYPLENGIYFSKEKAKELEVNGINYRMNFYYESKNGIRFFKKKDVVYVDNKNLEIGSILYDKEEDKVVDLIGD >NC_010730.1|WP_012459382.1|686689_687604_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKGLTLTVIFEASSLNYGESIGNISELKKLTRDGEVYTYMSRQALRYEVFRKLRELFNVDADKEVPLSDEKGTIQFKPTANIKDYVEVDLFGYMKTDKGKGSLTRSAVVRFSPAISLSPMAFDVEFGANHDFAKRAKTDPNPFQFEVHSSLYTYTVAIDLDRVGVDPNDGIELDGTEKARRVNMVLDALKILDREIKGRTENLSPLFVIGGLYPVKNPFFLGRIKVNYDRNQRKYSLNTKEIESVLSLKLNGNSVKDYTSCGLVEGFWANEDYIIQNLNGKTISDFFEELKSKVNQHYNVRRET >NC_010730.1|WP_012459381.1|685073_686693_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MELFNRKDSHVSPLTSHVSRIYLGDWLYNAGIVGFLRINNHLWDVKDKKLISKDENLLKIGDNYIEIDRKIFDGFTDRFFDYAFNLYGRYDRKLKRFRELLENLNDGTFKDVYKDFKEEVNGFTLLKNKLGDIKAKNSQELKHLIEKAIRILEQDKEEFVESDVQIFLRSFNGQKSFLNKTITKDRKKKFYEDFEEPLKTDNNQKDKKFTCVICGERPAKKDTNYDTGFSPIFGLNKDAVNFAWNFNTKLPSCDICEIVYFCYFAGLTELNGKYYFVNLDDSVESLMLANNLFKEEIEKSPENPFVDFFTEYLLRIKKSQAKYTLSNINFLETELKETLPKVFSFNIDYKTAEFIEENHENLKLLSKSFFILPDKNKTRVYILTEFLNLILKKDLNYGLLYKIFKSATQDKAYVSNYNLQRLIIMYLLYKQKVGGKEMGLEEKSLWAMYMQGKNLLERLKDGDAENKIQSIAYKLLNALKIGDVNQFMDVMMRVHMAYDLEVPSLLIKALQDKDNFYLLGYSFLNGLLGKENKLQEENQ >NC_010730.1|WP_012459380.1|684702_685062_+|four-helix-bundle-protein MKTHKDLDVWKNGIELVEKVYIVTSSFPKEEIYCLTSQIRKSAISIPSNIAEGSARNSTKEFIQFLYFALGSTAELETQLIISRELGYLKDLSIFEDLEKIKAQLINLIRTLKNKMNSK >NC_010730.1|WP_012459379.1|683843_684602_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRVKIPITTEKVPIIFRQRVLAFIKEALAQADKDYKESMYSVRMPKAYTFNLVFDRTNPKEEEISLDEKFKIKDKVFYQDRPVFLYISSNDYQFLINLFNGMKKIKIFDFNKFDNIYWQVGKPVILREKIIFNDEIIFKTNAPFIIETKDDRPVVFSDENFQTELNNVMERIFRKLDNRGLKQPLEFYPIKMKKEVIKHTLRGFREKTGKPIMYITGNSGIFRLKGHPEDLQTIYQIGLGNRTGQGFGMVST >NC_010730.1|WP_012459378.1|683317_683800_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MMNNKLIPIFLYIALIISTAIYKITNLPYFVYFVVLSPILFIDFKSVFSYSIKYDLSIIFILPFLFIHEPLQALNNLFVAFSEELFFRVYLLSYFSNLLTSILFTIPHIIIYQDLHSILTFFPSLFYGFVYQKTKSFSLAIVLHFLSNEFYVVFLSEIFK >NC_010730.1|WP_012459388.1|694584_695877_+|30S-ribosomal-protein-S12-methylthiotransferase-RimO MKNLKINFISLGCPKNLVDTEVLIGKLNQENISFTANPEEADVILINTCGFIEPAKEESIETILEAVKLKQNSNKKIIVTGCLVERYKQELEKEIPEVDYFIDLKNQSQIPVLFDIKPKENTKRIISTPKHTAYLKISEGCDHTCSFCAIPNIRGKHRSKPIEALVEEAKYLANLGVKELNIVSQDTSYYGYDLYGKPMLFELLQHLEKIDGIKWIRLYYLYPSTVDEDFFKFIKGSEKILHYIEMPIQHSEDKILKDMMRGYRKKKLYQILEWKEKYTPDMTIRSSVIVGYPTETEEDFENMKNFIQEAQFDWLGVFVYSHEEGTPAYQKHKDKIPKKEKIRRLNEISALQENITEQKNKSLIGKELDIIIDGFSEEWETLPIGRSYRSAFEIDGAVYVETTEPVNVGDIIKVRIKDTIDKYDVVGEAE >NC_010730.1|WP_012459389.1|695873_696893_+|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase MRKLKDIKPLELKDDVLYVINQLKLPHELVWEKLETLADYEKAIKDMIVRGAPLIGIVGAYGFYTGIKEGIDYIQVYERLKQTRPTAVNLFWALDRMKSIYEKYGNDLNLLLKEAKRIEVEDYHANRSIGGYGEVLIPKKANILTHCNTGALATAGWGTALGIIRSAFENDKDITVYVDETRPYLQGSRLTAWELLREGIPHYIITDSSAGFLMKKGMIDVIVVGADRITLNGDVANKIGTYSLSILAKHHNIPFYVAAPSSSLDFNLESGDEIPIEERNEDEVKNCHCCKVAPQQSHALNYSFDITPADNITAIITEKGIIEKPNKEKILKFFGRKLS >NC_010730.1|WP_012459390.1|696889_697882_+|YvcK-family-protein MKVVAIGGGTGLSTLLRGLKYFVPDIIQDLTAIVTVSDNGGSTGILRKELNIPAPGDVRNCITALAEDEDILTKVMQYRFEEGEGLKGHSFGNLFLTVLTKITGDFLEAIEITSKILKIKGHIIPSTDSMVNLVAEFTDGNIIKGEVEITQYGRKLIAKIKRIWLEPEDVRAPQKAVDSILDADMIILGPGSLFTSIIPNLLIKDIRDAILNSKAFKLYICNVMTQYGETDGFTASDHVKVLNKIVAGDEEASFLNAVLLNTTIPPDEVLKRYLKENSEPVVADVGNLSRMGLTVYAKDLLDEGNYARHSPKKLDAAILEIINNLKVHAV >NC_010730.1|WP_012459391.1|697871_699449_+|L-aspartate-oxidase MQFNRYLTCFNTKELSEERVDTIIVGTGLAGISTAYYLLQLGIKPLLITKKKPGISNSFLAQGGIAAAISPEDSTELHYEDTLKAGKGLCIERNVRLLVEEGLERVIDLINIGVNFDRDEKGFIKLTREGAHSRNRVLHSKDKTGYEIGKTLLSYVKDKVNLADGHYLEEILTDEDRYVGIILSDGNNQKVIRSKSIVLATGGYSAIYLRNTSAYNVAGDTISVAYRAGCELMDLEFVQFHPTAIYLEGKPGWLISEAVRGEGAILVDENGERFIDELKPRDEVAKAIFKKYQEGHKVFLDIKPLLEKGIDFKERFPNVYSMLKEFGLENETRISVSPSAHYTIGGIKADLNGKTDIKGLFAVGETSSTGVHGANRLASNSLLECIVSGYKTAYTVYLHNIYANILNVDIKNETQTKEQLNKEERAEVLKNIKTIMWEKAGLIRSKESLESAILDLENLYNSIDKFCNVRYLKDLIILGKGICEAALKREESRGVHYRIDFPEENEEFRKHSILEKNFKINHRRF >NC_010730.1|WP_012459392.1|699451_699958_+|translation-initiation-factor-IF-3 MQELRINNQIRVKEVRLIDDEGKNLGVVPIEEALRLAREKNLDLVEVSPNANPPVCKIMDYGKYKFEQKKKEKEAKKKQHVQDVKEMKFKLNIEKHDYETKIKHIRDFIQDGDKVRVWIWFRGRENVHPELGDKLAQRIIEDVSDIAVVEKPPVKEGKNMMFTLIPKK >NC_010730.1|WP_012459394.1|701641_702406_-|glycosyltransferase-family-2-protein MGLSVLILTKNEEKNIERAIESVKPIADEIIVLDSGSTDNTVEIAKTLGAKVFFREFDDFPSQRNYGVSLCSNDWIFVLDADEEVSLELRKSILNAIKEESYTCFEVPRRTYYLGKYLDYVWYPEYVIRLFKKEYFKYEGKLHEKVVCEGKVGRLKGDLYHYSYKSLYHQFKKTIDYAQKMAEILYQEGKRFKFYNLMLNPIIIFIKFYFLKRGFLEGKRGLIISFSALMYVFLKYAFLYELQLKEKYKDKLWL >NC_010730.1|WP_012459395.1|702405_703026_-|RdgB/HAM1-family-non-canonical-purine-NTP-pyrophosphatase MKILLATTNEGKVRELRQLLKDLDIEILSLKDMDKKLEVEEDKETFLENAIKKATSYAKFYKLPVIAEDSGLEVDALNGLPGIYSARFFDIEFGKEVLKEIPENLSKDEKNNLKLLRLLENQTNRKARYKTALVFYNFDYGIWTEGVCEGQIAYKPEGNQGFGYDPIFIPEGYNKTMAQLTPEEKNKISHRGKAVSKLVEILKKVL >NC_010730.1|WP_012459397.1|703329_703794_-|crossover-junction-endodeoxyribonuclease-RuvC MERILSIDPSSSKTGYVIAKLEKDEALSLDYGLIELKKEKQPLKKLYQALEEKILKYTIEKIILETPFYSINAQTLIKLGEVRGVILLLAQNYNIKVEEFSPAEVKISITGYGRSGKEEVLEMVNKIFNLNIKDYDIADAFAILHCYMLNKVGV >NC_010730.1|WP_012459398.1|703793_704549_-|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MAGHSRWHNIKNKKAKADAIKGRMFTKVIKEITIAARLGGGDPEANPRLRIAIEKAKEVNMPMENVERAIKRGTGELEGVNYEEVQYEGYGPGGVAIVVEATTDNRNRTTAEIRHIFSKYGGNLGSSGCVSFSFEDKGIINVPKDKYSEDEIFEKAIEAGAEDVIMDDPEYYEIRTAPSELYKVRENLEKMGVEIAKAELTKIPTTTVQITDEETATKLMKLLDALEDNDDVQKVYANFDIPESILEKLEG >NC_010730.1|WP_012459399.1|704853_705474_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MTLKDVYNKLFEKYGYQNWWPVHEGQNSIVEITFGAVLTQNTSWKNVEKAIENLIKHNMLNFEKVYCSDIEFLKELIRPAGFYNQKAKTLKSVSKLFLEKPHKDITREDLLSIKGVGKETADSILLYALNKPYFVIDAYTKRFLKRLSLVSDKIDYDSLQSFITQNIEMDLEIYKEFHALIVKHCKELCTKKPKCEVCFFKCERLS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_010730_4 | 855939-856163 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010730_4
|
3 spacers
spacers of NC_010730_4
>4.1|855968|38|NC_010730|CRT CAAATCATTATAGACTTCAATCTTAGCTGGCTCTTTAT >4.2|856035|34|NC_010730|CRT TATCTTCAAAAAGTATCCTATTCTGTCCATTATG >4.3|856098|37|NC_010730|CRT AAATCGTCCATCTTAAACTCGCCCAAAAATCCTGCCA >4.4|855967|44|NC_010730|CRISPRCasFinder ACAAATCATTATAGACTTCAATCTTAGCTGGCTCTTTATGTTAT >4.5|856034|40|NC_010730|CRISPRCasFinder ATATCTTCAAAAAGTATCCTATTCTGTCCATTATGGTTTG >4.6|856097|43|NC_010730|CRISPRCasFinder CAAATCGTCCATCTTAAACTCGCCCAAAAATCCTGCCAGTTAT >4.7|856033|41|NC_010730|PILER-CR TATATCTTCAAAAAGTATCCTATTCTGTCCATTATGGTTTG >4.8|856101|39|NC_010730|PILER-CR ACAAATCGTCCATCTTAAACTCGCCCAAAAATCCTGCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010730_4
The CRISPR arrays of NC_010730_4 >merge|NC_010730|4|855939-856163|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTATTAGCTTACCTATGAGGGATTGAAACAAATCATTATAGACTTCAATCTTAGCTGGCTCTTTATGTTATTAGCCTACCTATGAGGAATTGATATATCTTCAAAAAGTATCCTATTCTGTCCATTATGGTTTGTAGCCTACCTATGAGGAATTAAACAAATCGTCCATCTTAAACTCGCCCAAAAATCCTGCCAGTTATTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAA >NC_010730|4|4|855939-856163|CRT ATTATTAGCTTACCTATGAGGGATTGAAA CAAATCATTATAGACTTCAATCTTAGCTGGCTCTTTAT GTTATTAGCCTACCTATGAGGAATTGATA TATCTTCAAAAAGTATCCTATTCTGTCCATTATG GTTTGTAGCCTACCTATGAGGAATTAAAC AAATCGTCCATCTTAAACTCGCCCAAAAATCCTGCCA GTTATTAGCCTACCTATGAGGAATTGAAA >NC_010730|4|4|855944-856162|CRISPRCasFinder TAGCTTACCTATGAGGGATTGAA ACAAATCATTATAGACTTCAATCTTAGCTGGCTCTTTATGTTAT TAGCCTACCTATGAGGAATTGAT ATATCTTCAAAAAGTATCCTATTCTGTCCATTATGGTTTG TAGCCTACCTATGAGGAATTAAA CAAATCGTCCATCTTAAACTCGCCCAAAAATCCTGCCAGTTAT TAGCCTACCTATGAGGAATTGAA >NC_010730|4|3|856006-856161|PILER-CR GTTATTAGCCTACCTATGAGGAATTGA TATATCTTCAAAAAGTATCCTATTCTGTCCATTATGGTTTG TAGCCTACCTATGAGGAATTAAACAAA TCGTCCATCTTAAACTCGCCCAAAAATCCTGCCAGTTAT TAGCCTACCTATGAGGAATTGA
>NC_010730.1|WP_012459524.1|854847_855540_-|YggS-family-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MSIKENVLKIEERIQKACDKVGRKREEVILLAASKTQPVEKIIEAYESGIRYFGENKVQEGIEKIEKLKEYADIHWHLIGGLQTNKVKYAVKYYELIHSVDRQALVDEIEKRGEKLNKVIDGLIEVNFGEESKFGVKKDNLKELFEYILTKKYIKIHGLMAIPPYFENPEDVRPYFIKLRTLRDNLEKEYNVKLSHLSMGMSHDFEVAIEEGATIVRIGTAIFGERNYAK >NC_010730.1|WP_012459523.1|854681_854858_-|hypothetical-protein MLNKELLDILACPVCKGDLILIQKDKEEFLKCENCKLLYPIKEDIPIILEDEAIKEEN >NC_010730.1|WP_012459522.1|853905_854685_-|phosphatidate-cytidylyltransferase MSELIKRVISAVVLASITIGGIIYLPAQALKIVITLLTVVVSYEAFNLIGKKYPELKHPIVFIMAFLSSLSLLFIDTYLSILIIFLFSFYVASKKWDLNYLAITIFGLSYSVFFVSSLGLLVDYNKYLLFLLFAVVWTGDTLAYFVGKNFGKHKLSPRISPKKTVEGAVGSFLGSLLGGYLVIKYLGFDIKFMIPVIISAVILQIGDLFESFIKRQVNEKDSSNLIPGHGGVLDRIDSLIFASVVFLIWIKVIHAFNLG >NC_010730.1|WP_012459521.1|853134_853842_-|hypothetical-protein MNKKAFIISAVFTLLPMINAFSDECKECTYIKTIIQDKKEIEPDILAVSVDISVKGSKESELINILGEVDKSIRDLGFEYKGGKFSVYKNCWWENNKTKCEGFKGSSFYVFELKNPTDQNKIYEKLSYFSGKYKDKLDYSVSQPEWTASKEKTEQIEYQLKLSVIDKALSFTQQVSKKLNKSCNIKSLDYESDQVYPMPIYRTMLMKTAESVSAPEPKNNINFIDIKVKTEIICK >NC_010730.1|WP_012459520.1|852846_853122_-|cupin-domain-containing-protein MIDINEAKKKLIDLGYSDLYVWQDSPGTYYDWHTHSEDEVRYILEGSMVIGTKDKVYHLKAGDILEVPAGTKHWAKTEEGVKYLCGSKRHI >NC_010730.1|WP_012459519.1|850522_852514_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MSKKIFNLKSNFKPTGDQPKAIKQLYENLISGVNQQVLLGATGTGKTFTIANLIEKYGRPTLILSHNKTLAAQLYREIKELFPDNAVEYFVSYYDYYQPEAYIPQKDLYIEKDSAINDAIDRLRHSATRSLIERPDTIVVASVSCIYGLGTPEFYEKLRLQLYVGMEIDRQTLLRKLVELQYQRDDFSLKRGTFKVKGDTVEILPAYTEDIIVRVEFFGDEIESISEIDIFNRDVKRKLDRTVIFPASHYVIPRPDMLEAIKQIQKDLEIEVEEFRRAGKEIEANRLWQRTNYDIEMMLELGTCKGIENYSRYFDGRKPGEPPYTLIDYFPEDFLLIVDESHVTIPQIKAMYNGDFSRKENLVKYGWRMKSAYDNRPLKFEEFVQKIQKAIYVSATPADWEIKRSKGVIVEQIIRPTGLLDPVIEVKKTEGQIDDLINEIWKVKERDERVIVITLTKKMAEHLADYLTEREIKAIYLHSEIDTIERVKIIKEFREGKYDVIVGVNLLREGLDMPEVSLVAVLDADKQGFLRSKTALIQTIGRAARNVNGKAILYADKLTPAMIETIEETNRRRKIQEEYNKKHGIIPKTISKEVKDLISLEELGILEIYNQLPDDINSEEDLMKKIEQLEKQMWDYAKNWEFEKAAEIRDQLEKLKKLATVIG >NC_010730.1|WP_012459518.1|849590_850508_+|Ppx/GppA-family-phosphatase MKPKIIALLDIGTYSTRMLIVAVHSDGRFDEILSVGRITALGRKLKETGYLQKEAMEETLAVLKEYVQIASQYKPEKILAVATQACREAKNADEFISKVKELGIDVRVITGEEEARLAFIATAKALNIEGKFTVIDQGGGSTEFSYGEKSNLIVSISFPFGIVNFTEKYIKSDPPKPEEIMQIKDFLKQQLPIAYEKMKDTEILVGLGGTITTVVALEYNIYPYDSKKVHGSKLTYEAVTKWLNKLASMTVNQRKAIPMIEDKRAEAIVPGIVIFQTAMEVFQKDEITVSEWGVRHGLLLELIQN >NC_010730.1|WP_012459517.1|849348_849591_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MNSMKLKLIYPEEKIKEPLLSKVCKNFNIDINIRKANVQEKMGWLELEFIGNDEEIEKAINFLVENGVEVQPIEGQVFIE >NC_010730.1|WP_007546504.1|849070_849349_+|MoaD/ThiS-family-protein MAITVRIPTALRRITQGQGEVQISASTIGELIENLEKEFPGIKERLVDENGEIRKFVNFFVNDEDIRFLQGKDTQLKDGDVVAIIPAIAGGK >NC_010730.1|WP_012459516.1|848784_849057_+|hypothetical-protein MAYTLPRSLYNILEEALGSKENELVTRDLFEERFKVINERFNSIDEKFKVVDEKFKRLELKLNILIILVLLALTLFNPAFLSIIEKLLKL >NC_010730.1|WP_012459525.1|856415_856715_+|hypothetical-protein MLGDILLKYWKIILGVGIVFAVGGLFLQQTLPVIGKIVEFIGFSFVAIVAYVLGYKNASDEAEKQIKAEIEKLAKQDIRYKFAADRAIKNIKAPLTGKK >NC_010730.1|WP_012459526.1|856733_858182_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatB MESAVLIDKEFDVVIGLETHVQMNTQTKMFCGCKVEFGAEPNTNVCPVCLAHPGTLPVINKRAIEFAIKAALALNCKVHNLSIMARKNYFYPDLPKGYQISQYDKPLATDGYIEIKTENGFKKIRIHRLHIEEDAGKTIHEGSFSYVDLNRAGTPLMEIVTEPDISSAEEARKYLEKLRNIMRYLGVSDADMEKGQLRCDVNISLKPKGSEKLGTKVELKNINSFRFIVKAIEYEIERQSKLLKKGEKIVQETRLFDPNTGKTYTMRTKEEAHDYRYFPDPDLLPVVIKDEEIQQIKNSLPELPDQKYHRYIEKLGLPEYDAEVLTSDKALANYFEKVIEIFPQNPKLVANWILNELLGKLNEKGLEIENSPISPNSLAELLSLITDGTISGKIAKDVFEIAFETQKSPKQIVEEKGLKQISNEDEIRKIVKDILAKFPAEVEKYKSGNEKILGFLVGQIMKETKGKANPQLVNKIIKEELQ >NC_010730.1|WP_012459527.1|858178_859495_+|adenylosuccinate-lyase MIKRYTLPEMGNIWSEKNKFQKWLDVEIAVCKAWNKLGKIPDEALKEIIEKTHIDDETVERINELDKVYNHDVLAFVSAVAEQVGENGRYIHLGLTSSDVIDTALALIMRESLDLLIKDVEKLLEVLKENAFKYKNTVMMGRTHGVHAEPMTFGLKFALWYEEFKRNKKRLENAREVISVGTISGAVGTYSNIPPELEELTLKELNLKPEPVANQVIQRDRHAEYMTALAITASSLEKIAVEIRHLQRTEVLEAQEPFKKGQRGSSAMPHKKNPITCERITGLARVIRSNSLPAMEDITLWHERDISHSSVERVILPDSSIALDYILNLTINVLKDLVVYPENMKKNMDKSKGLYFSSKVLVALVEKGLSRDQAYDIVQRNAMKAWDTENLMFKEALLQDPEVMSYLSKEELDKIFDVNEFLKNIDYIYNRVFGREYS >NC_010730.1|WP_012459528.1|859924_861238_+|tRNA-(N6-isopentenyl-adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase-MiaB MKFYIKTFGCQMNVNDSEKMAGILQTLGYTPTENWEEADVILVNTCSVREKPDQKVLSALGEFKKVKKHNPNAVIGVCGCLAQRAGYEIYQKAPFIDIVFGTTNIHHLPNLLEEAKSGNKAIEILEEIDENENLLDQFPTVRENKYTAFVTVIRGCDKKCTYCIVPTTRGRERSRRIGDILREVQYLVEDGVKEIHLIGQNVTAYGKDFGDVKFWELLKAVAEVDGVERIRFTTGHPRDLDEDTIKVMADLPQICEALHLPIQAGSDRILQAMDRGYTQKEYLQKIELLKKYIPNIALSTDIIVGFPGETYEDYLETVKVIKEVEYDQVFAFKYSPRPGTPAADLPMTESPEELSKRLNDLINLQKDITFKKNLEYQDKIVEILVEEINQENKLVGRTRTNKLVYAEGSPEYLGKLVNVKIEKVNRFSLEGSIIGGD >NC_010730.1|WP_012459529.1|861240_861723_+|bifunctional-nuclease-family-protein MVEMEVQGITLDPITNMPVLLLKGKENDEILTIWIGVFEANSIAMYLESMTYPRPLTYDLFTNILNSLSTSVENIIIHTLKDNTYYASIILRDKEGRTVEIDARPSDAINIALRSRCPILVSEEVLAEANNGKKEKIDEEDLKEWIESLKPEDFEKNIEF >NC_010730.1|WP_156769246.1|861800_863576_+|DUF255-domain-containing-protein MMRVFLFIISIFIFSCTSGKEIKWYDFEEGLKKAKQENKLILLDISAKWCHYCNLMETTTYSNPEIIKIINQYYIPIKVDADLRKDINKKYNQGGLPTTAILTSDGQILYGNLYLPPEDMKKILLYFINLSKEDLENLKRQKNLALLPKIKIQEKEIDEPTIKLVKSRTLSLIDKEYGGYYDEVKFPIDNIVYFLILRYLENKEDKNLLIKTLNGYEKLIDDQEGGIFRYATQKDWTSPHYEKLLRDQALISVAFFNAYSLLQDKKLLEDANMILNFAKNKLYDKNKGYFYASQGADIVDDEGKILVSGEVYFSKNKQDREFIENVYRRKLSLDKTFYFSENALMVKALLYSYIFNNDNQDLKNAENLMRKIIKDGLKDKGIIHTYSVEKYFLDTQVNTLESLFLLYQITGDSYYLKNFKDLLFIILKNYYSKEIGLYTDYEDTGLNLNRISYVDSLVSLNFKLAKIIYSYQLLDNNKELENIKNNILKRLINFDTVEAGLSIYLYTKPPLFTVSVAKNREIDKVLFSFFPYWNISMSFSSEDKLLSKIGYPYEGIDVVYVCSLKLCFEKIEKSKLSNDSIKNVFEKYFKI >NC_010730.1|WP_012459531.1|863565_864498_-|ketoacyl-ACP-synthase-III MSSEIKGIGMYVPERVLTNHDLEKILDTSDEWITTRTGIKERRIADEWVKASDLAFHASKEAIENAGLTPKDIDIVIVATSTPDNVFPSTACILADKLGCKNPMAFDFSAACSGFIYGITIADSFIKSGKAENILVVGSEVFSKIIDWTDRTTAVLFGDGAGAVVISKSNSSSDILSTVMKSDGSYGHLLHCQVGEKLRMQGRETFKQAVKSMETACLKALQKAGINKEDIKLVIPHQANIRIIQALAEKLELPLEKVYSNIHEYGNTSAASIPIAIYEAYKEGRFNKGDYILLTAFGGGLTWGAAVIRF >NC_010730.1|WP_012459532.1|864490_865549_-|phosphate-acyltransferase-PlsX MFIALDAMGGDYAPLCNIKGAIEFAKEYKIGVYLVGKKEVLEEEIKKNNLSIENLPIQIIDAPEVIEMHESPSIALRKKRNSSMHIAGKLVREGKAQAFVSAGNTGAAMSIGKFIIGAAEGIERPGIAVAFPNKKGTRTVLIDVGANVDSRPRHLLYFAVMGHTYVKEILQTSDNPKVGILSIGEEEGKGNELVKDTYPLLKMTKLNFIGNAEGRDIFTGDFDVIVCDGFVGNVVLKTSESLGMIILEMIKEEVEKSFVSKIGAALMLPALKRFKKKADFTEYGGAPLLGTKGTCIITHGRADEKAIKNALRFASEFVNHDFNKKLLENINTLIPQELIKGKEEEVYGENNV >NC_010730.1|WP_012459533.1|865549_865726_-|50S-ribosomal-protein-L32 MAVPKRKKSKAKTAMRRAQWKLKMPGLSICPECGQPKAPHRVCSNCGYYKNKEVIEVV >NC_010730.1|WP_012459534.1|865775_866303_-|DUF177-domain-containing-protein MKIYLNLKEELKKEPFKELEFDIPMNELDLPEEYIVKDGQSVSVKLHLLKDKDGYVITAIFNTSILMHCDRCLTEFSQKFNISESILFTKKHLKHQELSEAELYSEYLEDEEKFDVYDFIREEIIVNTPMKLLCNEDCKGLCPYCGADKNVEQCDCEEKMRRKLSPFAKLESLKS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_010730_5 | 1561790-1562087 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010730_5
|
4 spacers
spacers of NC_010730_5
>5.1|1561821|35|NC_010730|PILER-CR CATCAAAAGCTACAATGACATATTCACCAATATCT >5.2|1561887|36|NC_010730|PILER-CR GCTTGATACATCGCCCGCATAAACTACGTTTGTGCC >5.3|1561954|37|NC_010730|PILER-CR TCTTTATTTTCTCAACAATTTCTTCATAATCTTCTCT >5.4|1561821|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT CATCAAAAGCTACAATGACATATTCACCAATATCTG >5.5|1561887|37|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT GCTTGATACATCGCCCGCATAAACTACGTTTGTGCCT >5.6|1561954|38|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT TCTTTATTTTCTCAACAATTTCTTCATAATCTTCTCTG >5.7|1562022|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT TCCAAATCACTTTTTTTCTCTTTTCATCTCCTTCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010730_5
The CRISPR arrays of NC_010730_5 >merge|NC_010730|5|1561790-1562087|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAGCATCAAAAGCTACAATGACATATTCACCAATATCTGGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAGGCTTGATACATCGCCCGCATAAACTACGTTTGTGCCTGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAGTCTTTATTTTCTCAACAATTTCTTCATAATCTTCTCTGGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAGTCCAAATCACTTTTTTTCTCTTTTCATCTCCTTCTTCGTTATATCTGAACCGTGCAGGTTATAAAG >NC_010730|5|4|1561790-1562021|PILER-CR GGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG CATCAAAAGCTACAATGACATATTCACCAATATCT GGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG GCTTGATACATCGCCCGCATAAACTACGTTTGTGCC TGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG TCTTTATTTTCTCAACAATTTCTTCATAATCTTCTCT GGGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG >NC_010730|5|5|1561791-1562087|CRISPRCasFinder GGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG CATCAAAAGCTACAATGACATATTCACCAATATCTG GGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG GCTTGATACATCGCCCGCATAAACTACGTTTGTGCCT GGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG TCTTTATTTTCTCAACAATTTCTTCATAATCTTCTCTG GGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG TCCAAATCACTTTTTTTCTCTTTTCATCTCCTTCTT CGTTATATCTGAACCGTGCAGGTTATAAAG >NC_010730|5|5|1561791-1562087|CRT GGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG CATCAAAAGCTACAATGACATATTCACCAATATCTG GGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG GCTTGATACATCGCCCGCATAAACTACGTTTGTGCCT GGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG TCTTTATTTTCTCAACAATTTCTTCATAATCTTCTCTG GGTTACATCTGAACCGTGTGGGTTATAAAG TCCAAATCACTTTTTTTCTCTTTTCATCTCCTTCTT CGTTATATCTGAACCGTGCAGGTTATAAAG
>NC_010730.1|WP_012460176.1|1559060_1560344_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-F MKSYPNIPNFHTYSSVNLLLRRCKEPRTVDIEEYITTGGYSALKKALNRFTPEDIIVLVEESTLRGRGGAGFPTGRKWRFAISNPKPRYLVCNADESEPGTFKDRIIIERDPHLLIEGMIISAYAIGAERGFIYIRGEYPAGAKILENAIKEARERGFLGKNILGTDFSFDISVYRGAGAYICGEETALIESLEGKRGHPRLKPPYPVSEGLFGKPTVVNNVETLANIPIIITYESYYMNIGPAGYYGPKLFPISGKVNKPGVYELTMDITLRELIDIAGGMKDGKKFKAVFAGALGVYSERDLDIPMDYSPKGFGGTGTTIVLAEDDCIIDSLIVIAEFFHHESCGKCTPCRIGTYELLNILKKFQEGIATEKDLQYLEHLGRNIPVGSICGLGYSAPNALMDALRKFKDEFIAHINKQCPAGACF >NC_010730.1|WP_012460175.1|1558603_1559086_+|NADH-dehydrogenase MEYTYLTPEIINKIEEYKKEFLTKEQVIIQALHLIYSKSRDISLDHMLELSNYLEVPLNQIERIVSFYDMFRVKRNARHHIRVCKNLPCHIMGCKKLIELFEKLTCEERNQESKNGRFYIETVECIGACSVAPAFMIDDDLYDGTKITEEKLNEILSKYT >NC_010730.1|WP_156769262.1|1557591_1558569_+|glycosyl-transferase MKNNDLKKILVIRFSSLGDVILSSVVLDPLYEKDYNVDFLTFKPFSDVFEKDYRIKNLIAVDKSRLKSISDIYSFTKSLDKYDYVLDLHSNLRSYLIGFFLKLRYNPKILRYKKQSLKRRLKILDPNFNVLKVYLEPLKKLGIENLNYRPKVIITNQEVEKVKTFLPQKFISLGTGARYKSKVYPYYKELSEILLENGFNVVLVGSKEDLEMDKSIYPKEVLDLRGKITLRETITVISQGLATISNDSAIAHMSRAVGIKVLMIYGSTHPYFGFAPLKDEGDYIFKNLPCQPCSLHGQNSCKYKTFECLTSISPQEVYNKLKNLI >NC_010730.1|WP_012460173.1|1557292_1557610_+|tetratricopeptide-repeat-protein MDRIEQLKKALEKDPNNPLGLYGLALELYKQGLYEDAIVYFKKYLSLYEDQGAAYRTLAQCYINIGDIEQAIETYERGIEKARKYNHPTMVEEFKQEIERLKTMI >NC_010730.1|WP_012460172.1|1556984_1557305_+|helix-hairpin-helix-domain-containing-protein MKINQELLSFQSLIIGLLILFLFTLKSININPKPKFTENDLKIDINTADIITLQRIPYIGEKTAELIIKDRKIRGGYTDINQLKWVKNFDKIKPYIKISEEAKWTE >NC_010730.1|WP_012460171.1|1555851_1556988_+|DNA-double-strand-break-repair-nuclease-NurA MRVELLEKILKKKDKIREYLQQNIEKINEEEIKSKWTAYNPNPKPIHHLAADGSFYQKSYLGFSLIVFAGYAENTNLNSENISSFTIGDIFPTVIKKTEHVKTLATLFMFLCEAKALLYLAKKEKPDFIIFDGTITSRFIIPFPLSNWFTDNEVESQINTIVNELFKENLEKIKETDLYFLRDDIIKSIFTKLESPRKDYIEAIVSKFAYYEYLFTLYNIFKLEHKPLIIGLAKTSTGTDMLNHSLPDIKLFLNYINELGYSESVEQNLEKLKTSLGELQLIDDKIFSFLYELNIESFYAKYTLKNAINLIEVYQNPDFGTIRKEDILDYLADMDYLGYNYPFKLKKVDNEVRITSSDFEFIEKQLGLEFSITGREAL >NC_010730.1|WP_012460170.1|1554681_1555533_+|tRNA-pseudouridine(55)-synthase-TruB MDGILLVNKPKFITSNDLVIKIKKHLNEKMGHTGTLDYAASGLMVLTVGQGTKITQYLQKLDKQYIAEGKLGEITDTYDSQGKIIQTKPVEIDEEKLKEIIFSFVGEYYQTPPPYSSKRIGGTRAYKLAKKGVEVQLKPVLIKIYGIEILEINLPYFKIKVDCSSGTYIRSLIKDIGDKADCGAYMTDLVRTKIGQFDLKDALSFEEILKKNPNEIKLISLKDALYFLPEIKLNQDYEKRFKHGQKIKVDCIESKDIKVLNENHELIGIGEIKDCILKPKIVL >NC_010730.1|WP_012460169.1|1553465_1554707_+|bifunctional-folylpolyglutamate-synthase/dihydrofolate-synthase MQNLYDLFQKKAFNIEPGLERIRSALKELNNPEKNFKSILVAGTNGKGSTSAYLESLLRHYGYKTGLFTSPHLIRENERWQIDRKEIDDKKLQNYINELKPIIEKYNLTYFEACTLLAFKYFSDKKVDIAVVEVGLGGRWDSTNVLEPETSVITNVSFDHMHMLGNTLLDIAYEKTGITRQDKPAVIGRNQPEIIHWLKERKIKEYYIKDIDYFVKEIDFNKYNYKFKEHIFENLEISMLGKRQIENSSLALTTFLLFLDKNNQPVVENIIRKALYNTKWKGRMEIISKNPFIIIDGAHNEEGLIKTFQEIKEIFPNKKIFTIFSFMKDKDTEKMINIIKQNSDFYIATVMPFSRAMTAEDFKNLGIENVKENHLEAVKELKNSVDKDTIILITGSLYLIGEILKDGWNTFSK >NC_010730.1|WP_012460168.1|1552699_1553482_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MFPDLISIGGITIHTYGVLTAIGLIVGFYVGLYHAKKEGINEKDYENAFIFIVLGGIIGARIAYIIEHSEDFTSFLDFFAIWNGGIDWFGGFLGGLAAAILYLKYKNISILKLGDVAGVSIPIGHFFGRLGCTSAGCCYGKPVPPDSPLRDIAIIFPNDPHCLAPKGIPLYPTQPAEAIGNLLIFAILFFTYRKKTFDGQILSLYLILYGFLRFLLEFWRGVTPPLPYIGLTWNQIITLSMVLSGIALFFYMKKRYAKPV >NC_010730.1|WP_012460167.1|1552156_1552690_+|peptide-deformylase MDYKIRTWPDPILKEPTKEVDFFDERLQEYINKMWEFMYKEEGVGLAANQIGIPYQILVIDTSLREKRSEEEAEPPVKMVLINPKIVEKEGEVQSTEGCLSFPGVQITIPRAKRVKVVGKNEKGEDVEIESSEFLAIVLQHEIDHLNGIPFINYLSPLKRKLVLDKYLKSLKELEKA >NC_010730.1|WP_012460177.1|1562187_1562733_+|hypothetical-protein MELIIGLIALIALILMIRKVGVIEPNRNVASNMQPPQDIPQHTSTTQNISQNTPPQNNSDILNDIAKAGLIGTAAGLGMVGSGMLFGRNYYNYYYPREPDTALAEHLHDLILNDDCNKCDNDVIYNIFSSCDDTGSDNSDSSCSSSWDDNYDNNNYDDNGYSWNSWDSGDDSSWLKYPGEK >NC_010730.1|WP_012460178.1|1562956_1563166_+|hypothetical-protein MDLTPLFTIIGLFILILVALIVKGITSSDSTVSSDSFYSYDDSRNFYHLTDYSSDWYQTIIQTLQKAHL >NC_010730.1|WP_012460179.1|1563392_1565288_-|DUF3488-domain-containing-protein MKLSVENIVKINAYVGSLFIFLLIFKEVSLAYSFIFIALYALSAYKDFKKPLNINRTFINITGILFVILLVLRINPDNIVQPSVETLLVLLGLKLLEEKAFRDYMQIYLLIILLFAGYTILSTSMIFLLYLLILIFFINASVILLTYYQQNKEIELDISVIKRILIKTAIIPLLSIPFMIFLFFTLPRSNYPFLNFLQGQGKASTGFSQDVKLGDVSNIQEDDSVVMRVSGENIGEIYLRGLTWNYFDGKQWMSKDLFSAVKARRLFGKKYEYTVYLEPHSDIYLFTVEYPYAISQISGYFITPRMDKTYVVDKPIFNKIKYSGISFINDRYYEELKSMDEYLQLPKLNESIIKLAKDLNGNDKEETAKNIEKFLKSYTYSLQNLSVSQDPIYDFLFVKKQGNCEYFASSMVILLRLNGIPARLVGGYKTATYNQTANYYIVKQKDVHVWAEAYINKHWIRFDPTPAARNAIIEREKKLNKFKLWLDTINYYYTTFIVNYDFSKQVELFNKVKKSFSNIRDSKKIEFNFNKNYLIFTIILLLAGYLIFLSIKYLKQPYEKRLLNILNKRLKKYGYERKGNEGLEEFISRVENAELKQKLLTFARELESYVYKDKKLSKADYERLKKMIEKL >NC_010730.1|WP_012460180.1|1565271_1566153_-|DUF58-domain-containing-protein MIKITKAGWLYILITIVLGIAAVNTGNNLLFLIVSTLLSFMGISGYFGKRNISKIDIWVEFPEEVFAKKEFYLTVKAINKKAFMPMFLIKVSINNKSVLIPYAEKYGEGKLKISVVQRGIFIIKEAKACSVFPFNFFERCFTVKVDAKKVVFPEPKECNLFQISDYKFKAKQKSEGQVIEKQGYEGDFLGLRDYNFGTPVKYIDWKASTKSENLKEKVLSSIQSTPTIIEFEKINIDLESKISCITYLAVNHKKFENIFVKVENTTYNLQDKSDRHKLLTKLALYGMKDEAIG >NC_010730.1|WP_012460181.1|1566149_1567067_-|MoxR-family-ATPase MRFEFKNIIDFLSSYLHGKEKAIELTLICLFSKGHLLIEDLPGLGKTTLAIGIAKTLGLDYGRVQATSDLLPSDIIGVSIYNKNANEFEFKPGPIFNNIILVDEINRATPKTQSALLEAMGEKQVTVDGKTYKLPQPFFVIATQNPVEQYGTFPLPESQLDRFLMKISIGYPSREAEKEIIKGGSKREELYKIQPFITKEEIIKIQEEIKNVYVSDKIADYILDIVWATRESKYLESGLSTRGTLAIVNTAKTNAYMEGRDFIIPEDIKKLYKYVIPHRVIFKPEYESQKEEIIKTIVESIPTPI >NC_010730.1|WP_012460182.1|1567076_1567919_-|pantoate--beta-alanine-ligase MEVITNPGQMQTLMLSLKKQGKKIGFVPTMGYLHEGHLSLIRCSKKENDITVVSIFVNPIQFGANEDFGRYPRDFERDKSLCEKENVDYIFYPSYEEMYPDGFQTYVEVAELSKGLCGDFRPGHFKGVATVVAKLFNIVCPDNVYFGKKDFQQLKVIQRMVKDLNFPVNVVGCPVVREPDGLAMSSRNKYLSDEERESALNISKALFEAKRMFEDGITDPNLIKERVRQIISQAKHLKEIQYVEIVDSNTLKPVDKVKKSDVLAVAVYIGNTRLIDNIEF >NC_010730.1|WP_012460183.1|1567918_1568356_-|hypothetical-protein MKKFIFGFGFLLTLISPSFSSSQNDYAWMDKYYLVARFTPYDPSLLQKMDLELSPKQIELIKAEYDKYFPIMLGKARILKDKEAELTDAVYKSNDPQKIKNLIIEIAKLKTELTVLDINLFKAIQSILNKSQNEKFIKYLTSGSM >NC_010730.1|WP_012460184.1|1568361_1569027_-|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MIPIKDDVPTRSFPLITLLLIGVNVGVFLHEMSLSDEELEIFVRTYGLLPLDLIHFNLLNFITHMFIHGDIAHIFGNMLFLWIFGNNVEDALGKFRFLILYFLSGFAAAILQSAVAILMGDINIPMVGASGAISGIIAAYGKLYPFARVYAFIPPFIFFIFALPAWFFIGYWFVIQVLSAMFIPTSLGGVAWYAHIGGFLAGWYLIDNLYPRAKKFVIYTR >NC_010730.1|WP_012460185.1|1569013_1570237_-|MFS-transporter MIDKDFLPEEKKITLGLAFIFALRMLGLFLALPVLSIYAKNMPGSDAFLAGLAIGAYGLTQAIFQIPYGLWSDKIGRKPIIITSTIIFILGSFLSAYAASIENIHLLIIGRFLQGIGAVSSVVIALLADMTREEIRTRAMATIGASIGMAFAFGMVLGPLIASHFGLAGVFTFTGILGLISLPYIIFGIKEPPIVKHHDDAEFTSSYLGIVLKDKNLLKMDFGMFVLHMTLTAVFTAVPIIFAHQYTIDVKDLWKIYLLMFFVGLTIMVPSTIIAEKKNKIKEVKMLGILVLIVSFIMFLMFKNNFYLTVLAIVVYFTGFMMLEPIMPSLMSKYAKPHVKGTASGVFNTAQFVGAFVGGAVGGYLLKLDESANFNFIFLIILTVIWLGLVSTMEMPKKKEVLNNDTN >NC_010730.1|WP_012460186.1|1570233_1571232_-|NAD(P)-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase MNLGVIGAGSWGTALAQILSVNFENVFIWDIDKEVLDSVKNSNINVKYHPDIKLNTNIKPIYDLQELINISDILIVVIPTQYIRQTLSKVKIENKPVISASKGIEIESLKLVSDIMEESLGIDRKYIFALSGPSFAKEVIKGLPTAVVLAGNTEIGNKLLSYLNTKTFRVYLSDDLVGAEVGGAIKNVIAIAAGISDGLGFGSNARASLITRGLYEISKIVKIYGGNPQTVYGLSGLGDLVLTATGELSRNRTFGMLIGQGYSVEEALKKVGQVVEGYTTVKAVYDIKNKYNIELPISYQVYRVLYENLNPKDAAMELMNRGYKFEFMEENK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_010730_2 | 2.3|578152|18|NC_010730|CRT | 578152-578169 | 18 | NC_010730.1 | 578179-578196 | 0 | 1.0 |
| NC_010730_2 | 2.2|578113|18|NC_010730|CRT | 578113-578130 | 18 | NC_010730.1 | 312113-312130 | 1 | 0.944 |
| NC_010730_2 | 2.2|578113|18|NC_010730|CRT | 578113-578130 | 18 | NC_010730.1 | 141156-141173 | 2 | 0.889 |
| NC_010730_2 | 2.3|578152|18|NC_010730|CRT | 578152-578169 | 18 | NC_010730.1 | 141456-141473 | 2 | 0.889 |
1. spacer 2.3|578152|18|NC_010730|CRT matches to position: 578179-578196, mismatch: 0, identity: 1.0
agctggtgctggtgcagc CRISPR spacer agctggtgctggtgcagc Protospacer ******************
2. spacer 2.2|578113|18|NC_010730|CRT matches to position: 312113-312130, mismatch: 1, identity: 0.944
agcagcttgttgagctgg CRISPR spacer agctgcttgttgagctgg Protospacer *** **************
3. spacer 2.2|578113|18|NC_010730|CRT matches to position: 141156-141173, mismatch: 2, identity: 0.889
agcagcttgttgagctgg CRISPR spacer agcagcttttttagctgg Protospacer ******** ** ******
4. spacer 2.3|578152|18|NC_010730|CRT matches to position: 141456-141473, mismatch: 2, identity: 0.889
agctggtgctggtgcagc CRISPR spacer agctggtgctggagctgc Protospacer ************ ** **
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_010730_2 | 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder | 578112-578144 | 33 | MN693860 | Marine virus AFVG_250M392, complete genome | 18681-18713 | 6 | 0.818 |
| NC_010730_2 | 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder | 578112-578144 | 33 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 128570-128602 | 7 | 0.788 |
| NC_010730_2 | 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder | 578112-578144 | 33 | NZ_CP021117 | Rhodobacteraceae bacterium strain G7 plasmid unnamed3, complete sequence | 102332-102364 | 7 | 0.788 |
| NC_010730_2 | 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder | 578112-578144 | 33 | MF417908 | Uncultured Caudovirales phage clone 10S_1, partial genome | 24288-24320 | 8 | 0.758 |
| NC_010730_2 | 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder | 578112-578144 | 33 | MT939492 | Xanthomonas phage Xoo-sp14, complete genome | 17460-17492 | 8 | 0.758 |
| NC_010730_1 | 1.19|27484|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 27484-27519 | 36 | NZ_KY984046 | Acinetobacter baumannii pAb242_12 plasmid, complete sequence | 214-249 | 9 | 0.75 |
| NC_010730_4 | 4.2|856035|34|NC_010730|CRT | 856035-856068 | 34 | NZ_CP053905 | Hymenobacter sp. BRD67 plasmid unnamed1, complete sequence | 42006-42039 | 9 | 0.735 |
| NC_010730_5 | 5.3|1561954|37|NC_010730|PILER-CR | 1561954-1561990 | 37 | NZ_CP039706 | Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence | 314952-314988 | 9 | 0.757 |
| NC_010730_5 | 5.3|1561954|37|NC_010730|PILER-CR | 1561954-1561990 | 37 | NZ_CP033246 | Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence | 17956-17992 | 9 | 0.757 |
| NC_010730_5 | 5.3|1561954|37|NC_010730|PILER-CR | 1561954-1561990 | 37 | NZ_CP033248 | Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence | 17997-18033 | 9 | 0.757 |
| NC_010730_5 | 5.3|1561954|37|NC_010730|PILER-CR | 1561954-1561990 | 37 | NZ_CP039703 | Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence | 361028-361064 | 9 | 0.757 |
| NC_010730_3 | 3.21|693372|37|NC_010730|CRISPRCasFinder | 693372-693408 | 37 | NZ_CP040082 | Acinetobacter baumannii strain SP304 plasmid unnamed2, complete sequence | 1351-1387 | 10 | 0.73 |
| NC_010730_3 | 3.24|693568|37|NC_010730|CRISPRCasFinder | 693568-693604 | 37 | MK250029 | Prevotella phage Lak-C1, complete genome | 410622-410658 | 10 | 0.73 |
| NC_010730_3 | 3.24|693568|37|NC_010730|CRISPRCasFinder | 693568-693604 | 37 | MK250016 | Prevotella phage Lak-A1, complete genome | 445724-445760 | 10 | 0.73 |
| NC_010730_3 | 3.24|693568|37|NC_010730|CRISPRCasFinder | 693568-693604 | 37 | MK250019 | Prevotella phage Lak-A2, complete genome | 364027-364063 | 10 | 0.73 |
1. spacer 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder matches to MN693860 (Marine virus AFVG_250M392, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
gagcagcttgttgagctggttgttgttcagctg CRISPR spacer atgcttcttgttgagctgcttgttgttctgctg Protospacer . ** ************ ********* ****
2. spacer 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gagcagcttgttgagctggttgttg-ttcagctg CRISPR spacer gcccagcttgttgatttggttgttgtttttgct- Protospacer * *********** .********* **. ***
3. spacer 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021117 (Rhodobacteraceae bacterium strain G7 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gagcagcttgttgagctggttgttg--ttcagctg CRISPR spacer cagcagcttgtagaggtggttgttggatgtagc-- Protospacer ********** *** ********* * .***
4. spacer 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder matches to MF417908 (Uncultured Caudovirales phage clone 10S_1, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gagcagcttgttgagctggttgttgttcagctg CRISPR spacer gttcttcttgttgaactggttgttcttcagcaa Protospacer * * ********.********* ****** .
5. spacer 2.4|578112|33|NC_010730|CRISPRCasFinder matches to MT939492 (Xanthomonas phage Xoo-sp14, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gagcagcttgttgagctggttgttgttcagctg CRISPR spacer ctggatcatgttgcgctggttgttgtacagctc Protospacer * * * ***** ************ *****
6. spacer 1.19|27484|36|NC_010730|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KY984046 (Acinetobacter baumannii pAb242_12 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aataaaatttatatggtaaaataatttaaaataaaa CRISPR spacer taaattttttataagttaaaataatttaaaatatta Protospacer * * ****** * ***************** *
7. spacer 4.2|856035|34|NC_010730|CRT matches to NZ_CP053905 (Hymenobacter sp. BRD67 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tatcttcaaaaagtatcctattctgtccattatg CRISPR spacer attggtcacaatgtatcctattctgtccataaaa Protospacer * *** ** ****************** * .
8. spacer 5.3|1561954|37|NC_010730|PILER-CR matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tctttattttctcaacaatttcttcataatcttctct CRISPR spacer ttaaaatctgttcaacaatttcttcatagttttctct Protospacer *. **.* .*****************.*.******
9. spacer 5.3|1561954|37|NC_010730|PILER-CR matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tctttattttctcaacaatttcttcataatcttctct CRISPR spacer ttaaaatctgttcaacaatttcttcatagttttctct Protospacer *. **.* .*****************.*.******
10. spacer 5.3|1561954|37|NC_010730|PILER-CR matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tctttattttctcaacaatttcttcataatcttctct CRISPR spacer ttaaaatctgttcaacaatttcttcatagttttctct Protospacer *. **.* .*****************.*.******
11. spacer 5.3|1561954|37|NC_010730|PILER-CR matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tctttattttctcaacaatttcttcataatcttctct CRISPR spacer ttaaaatctgttcaacaatttcttcatagttttctct Protospacer *. **.* .*****************.*.******
12. spacer 3.21|693372|37|NC_010730|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040082 (Acinetobacter baumannii strain SP304 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tttaaaaaatttgatgtatattattattaacaatata- CRISPR spacer gctaaaaaatttgatttatatgattatt-gttctgtac Protospacer .************* ***** ****** .. *.**
13. spacer 3.24|693568|37|NC_010730|CRISPRCasFinder matches to MK250029 (Prevotella phage Lak-C1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
cttttaactcatatatagaattatttttaaatatttc CRISPR spacer aatattactcatatataaaattatttttatattatat Protospacer * * ***********.*********** ** * .
14. spacer 3.24|693568|37|NC_010730|CRISPRCasFinder matches to MK250016 (Prevotella phage Lak-A1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
cttttaactcatatatagaattatttttaaatatttc CRISPR spacer aatattactcatatataaaattatttttatattatat Protospacer * * ***********.*********** ** * .
15. spacer 3.24|693568|37|NC_010730|CRISPRCasFinder matches to MK250019 (Prevotella phage Lak-A2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
cttttaactcatatatagaattatttttaaatatttc CRISPR spacer aatattactcatatataaaattatttttatattatat Protospacer * * ***********.*********** ** * .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
953350 : 961345
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010730|953350:961345|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010730|953350:961345|960409_961345_+|WP_012459622.1|DBSCAN-SWA MEYGLPETLKTGQNELEIIDFRIFERKEDGSIYQWILGVNVAKVREVLRMPKLTKVPNMPPEIEGMAEIRGELIPVVSLAKWMKIPEEEEFKKYLLFMEFLREKVGVIIHAAKRIRRIQWSDIKKAPDILNTRLNGRITGVVDTEEGLLLILDFEGILNDMNLLTVFNVGPDQERKAKKKLRILVAEDSAVARKIIKDILESAGHEVIMTESGKQAWEKLNEIFEKAKAEGKSVRDYIDLVLTDIEMPEMDGLTLTNLIKHTAGFLNLPVIVNTTLSDEANKQKAFSVGADDYLVKFDASHLIELVDKVSE >NC_010730|953350:961345|956203_956716_+|WP_012459619.1|DBSCAN-SWA MRPKIEPKPIEKPVPSDKFLVSKTDTKGIITYANPIFIEISGYTEDELIGANHNIVRHPDMPRTVFKLLWDTIQKGDEIFAYVKNMAKDGSYYWVFGHVTPTFDSSGKIIGYQSDRRPVRNREFLNGVIIPLYQELKKEEQNGLDAGMRKLEETLNKAGMSYEEFIFKNY >NC_010730|953350:961345|959961_960219_+|WP_007547964.1|DBSCAN-SWA MENQEINKNVEDIKRMVDTIKKIAKQSNLLALNAAIEAARVGEMGKGFSVVASEFRKLADDTNKIATEIAILISNLEEELKNVSR >NC_010730|953350:961345|953350_954931_-|WP_012459617.1|DBSCAN-SWA MLNKKLKLYKRFKDITLELSKLGIYNIYDYFKALFGIETDPSLGPQRIRETLEKLGPSFIKLGQVLSIRPDIVPQSVILELIKLQDNVKPVDFEIIKNIIEKELNQKIEEVFTYVDPNPIGSASIAQVYKGILKTGEIVAIKVKRPNLEELISLDAEVFYKVISFLERHSKTVKDLNLKSVIYQYKFTTLREADFEIEASNIQTFRKNFENFNEKFYIPKYYPQYSTKNILVLEFIEGKKINQIQLTTSEKQDIARLITDAYYKMVFYDGFYHADPHPGNLLIKEDKTLVLLDFGMVGTLSEEKKRLLYEHIFAVVNKNKTLAMNFYEGMGMISPKSDIEKLESLVEVFIDRYYNKTLQNINLKDMVLEIIELVRECNLYLPTTLAYLGKASIGLDGLIRYLDPNFNPTERLTKFLTKSTKDYIKEKFEEAMDIANFYYNLSFKLDRIIKTLNIERLTFRVIFKDIEELQEFYKNQINKIVLAIIFFAFLVSSALFHLSNQPFMANLMLYISIFMFVILLYKIVRQ >NC_010730|953350:961345|954932_955907_-|WP_012459618.1|DBSCAN-SWA MLLNFFSIEDFKDSFPFTALGARVCYNSGDLNSLLNDPRVVEKQKRAEFLSKLGNYKHFSVFAHSFVYKKVGEENALRIGATYFKTHYNPKYPDVIGVSLRHYLEELLKINESEYFKAFEKLAEYDTPVDPIEIRTEGDLTVSLIGLKKEYDGYAVFFIDGVSRAMTHQLVRHTALNFSQRSQRYVREDENYTVLPPSILESQEEIEVDVSGMNQTMAEIYEVLKNLKEEIPEPKFLELKSKIRAYELAKLHDELSQYIYDLLVYGYKIKREDARFFLPTGRRTTIVVSGTLSWIKDFIEKRNTPHAQWEIRNVAKLMKEILDS >NC_010730|953350:961345|956843_958295_+|WP_012459620.1|DBSCAN-SWA MTTHKVSSLTKIQYANMLSIGIFTFALVIEVYKHGFDFIRILNIINFLTAWYIFVNIKKVQGFVSRISNVVSKAERGDLESRLVKEKEGGELLKLAYDVNYLLDQVDAFLREVQSPLEYASKRKYWRKVITDGFTGTFKSVAEKLNVPLKAIENNDRFIEKTKMIEELSHLGGGIQGNLKVISEDLNKLVSKLSLIKEESKKTVDIAVEGNKEIEKIVNDLSQVIKNIEESNRVIQNLAKKTEDISVVVSLIKDIADQTNLLALNAAIEVARAGEMGRGFAVVADEVRKLAERTQKATEEVTQAIAVLQEESKNTLAKSEKMVEITQASAKSITGMTDILKAFQDTALNNEKLTEIMATQAFLSSKKLDHIIFKNNVYSSVTQEKMTFKFTDHYNCAFGKWYYGDGVKEFDGITSFKEIEKYHANFHNALYNIVEIIENNKDILKHKELIFKSFETAEKESQELFKEMDKVAEEKARRLGIQF >NC_010730|953350:961345|958432_959920_+|WP_012459621.1|DBSCAN-SWA MGLFGGSNKERERQLEAQLAECQKQLQELSKLEKGSDEYEEKYLEFKQALDNLSEEAVFFATAEFREGKAGNEIVYVNRKGKEIIDKMSQDIRSNFGIEINSNNIIGKSIHIFHKDPERIKQLLKALKPGEVKRNADIKVGNTIIQSDRSVIADKNGNVKYYMTSMKDVTAERLIEQKIIPLNAKNTALAVYNSVKTLINQIILDIYIQNQLQSLLNETHGIVKEVESLKETTAATQKKIKDSENVLNLILEISEQTNLLSLNAAIEAARAGEMGRGFAVVADEVRKLAERTGKSTEDVRKIISAVISEVSQTANLVDKAVARILKNSENFETSSNDLKRYATEIENSSKKTFNELLDSWNVFRELKETTKNENLKLYIYLIEKIIDHAKFMLNIAEAVERKEIINVVSHHECDLGKWYYSVGSKEITICGAEGERLFRDIEAPHKNLHDIGRQVMEAMKRGNMDELIQLLSKMLEDSQNIINDLVRLGESCIRT |
7 | uncultured_Caudovirales_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1129460 : 1140071
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010730|1129460:1140071|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010730|1129460:1140071|1129460_1132280_+|WP_012459771.1|tRNA|DBSCAN-SWA MEFKDTLNLPQTEFPMKGNLPNKEPEILSFWEKINLYQKLREDRKGKDKYILHDGPPYANGHIHIGHALNKILKDILVKYQSMKGKDAPFVPGWDCHGLPIEQQVEKELKEKKIKKEDLSKSEFRKLCREYALKFVNIQKEEFKRLGIIGNWEKPYLTMRPSYQAQEVLELGRVFNKGVAYRGKKPVYWCIYDKTAEAEAEIEYYDKKDPSIYVKFKMKDSDDTYLVIWTTTPWTLPANLGVMVHPEFDYVYFKTGKGTLIVAKELLENFKEKTGLNGEVIKQVKGKDLEFKEYYHPFIDRVSKVYLSEFVELGTGTGLVHMAPGHGQEDYIIGQRYGVDAFAPVDDEGRFIQEAPDWLKGIRVFDANDLIIEKLQEVDALIYKEVISHSYPHCWRCKNPVIFRATPQWFISMEAKVNENQTLREAALKEIERVKWIPYYGQNRIKSMVENRPDWCISRQRSWGVPITVFYCENCGEIVKDMEVFEHVANLIKNDEFGADIWFEKLVKELLPEGYKCKKCGGQEFKKEEDILDVWFDSGVSHAAVLKYGEWEELRWPADMYLEGSDQHRGWFQSSLLESVASYNRAPYDTVLTHGFTLDEKGRKMSKSAGNVVAPEKVIKEYGADILRLWVVTEDYTEDIKIGFNLIKRIAEDYRKIRNTFRYFLGNLYDFNPNQDYVPYENLLEIDRWMLSKLQNIIQIADKSYEEGKFHKIYHTIKNFVIVDLSAIYLDILKDRLYVYAPKSLERKSAQTVLWELLLSLNKILAPIISFTAEEVWQYVRKIDSNIKESIHLEIMPVVNEKFIDKNLEETYEKLLEVRDDILKAIEEARKQDLVRHPYEARVILKLPKEYKEIVEKRLDWIKFFFTVSQVELSDNPEGDVVINGESVKDSVIAVSKAKGEKCPRCWIYDESVGRNGQPVCDRCKIQLEIMNIKLEELA >NC_010730|1129460:1140071|1132556_1133603_+|WP_012459772.1|DBSCAN-SWA MQNPKNDLFLRACRRQKVERTPIWLMRQAGRYMKEYRQLREIAGSFKNYYKNVDLAVKASILPYTLLGVDAIIIFSDILTPLESIGMKFDFKEGEGPVFENPIKGKEDIQSLKEFNAEDVYFVGEIIKGVNQTINREIPVIGFAGAPFTIAAYMIEGRGSKDFKKTKSFMYNNQEDFKILLDKIADMTIKYLSFQIESGADAVQIFDSWAGHLSPKDYKEFVLPSVKKVIENLKHYNKPIIHFTKGVCGFMDFILDSNADVYSIDWMIDIKKAKDLIYPKASVQGNLDPMVLYADKDIIKKEAEYIIKSWGEDTGHIFNLGHGLMPDMDASKVKFLVDTVKEISVRRR >NC_010730|1129460:1140071|1134697_1135156_+|WP_012459775.1|DBSCAN-SWA MSEKVVATNKKAFHDYAILEKYEAGIVLTGSEVKSLREGACNLKDSFVMIEDGEAWLYNCYIAPYKPAAKFGHDPTRKRKLLLHKKEILKLMGKVKEKGLTIVPLRVYFKNGKAKVEIALAKGKVKYEKREAMKEKDMKREIEKSFKGKIKL >NC_010730|1129460:1140071|1132276_1132576_+|WP_007547480.1|DBSCAN-SWA MKKPDIVKYIKEKHPEMDLKSIKDVVDEIFEVMAEALAKGEKIEIRKIGSFRVLKRKKPLKGRKRVSYSKTVHFKPGKVLKRALKSVSLEGEKNAKSKK >NC_010730|1129460:1140071|1133603_1134398_+|WP_012459773.1|DBSCAN-SWA MRPFLKWAGNKYKIVEDIKRLLPVGNRLIEPFVGSGAVFLNADYKSYLLADINEDLINLYRTLGDYGKDFISFTKTFFTPENNTKERYMELRDVFNTTNDKVLKSALFVYLNRHCYNGLIRYNQKGEFNTPFGRYQKPYFPEEEMQLFYNKLKKTDVELRVSSYEETLKDVFYGDVIYCDPPYIPISKTSNFTQYYQEKFTILDQLKLIQILKDLAKKGIPSVLSNHYNNLIIDHFEDFETLDVRRIISCKSREKVKEILAVIK >NC_010730|1129460:1140071|1135170_1136772_+|WP_012459776.1|DBSCAN-SWA MKKYIFITGGVLSSLGKGVTSAAIGSILESMGYKITLMKLDPYLNIDPGTMNPYQHGEVFVTEDGAETDLDLGHYERFTNAVMTKNNNTTSGRLYFNLLEKERRGAFLGATVQVIPHFTNEIKKSIEKVAENHDITLVEIGGTVGDIESQPFLEAIRQMGIENKKEDVIYIHLTYVPYIKVAGELKTKPSQHSVKELRAIGIQPDILIGRAETPLPKEIKKKLSLFTNVDEDSVFSAPDLNIIYEIPLYFKKEGLDRAIAKHLNLEYKEPDLSKWKKIVTVLSKLEETVDIGIIGKYVDLKDAYKSIHEALIHAQIPNKVKVNIHWINSEKINQENYQEVLKGLDGILVPGGFGDRGIEGKILTAKYARENNIPYFGICLGMQIAVIEFARSVAGLEGANSTEFNPFTPHPVIDIMPDQKHVDKKGGTMRLGAYKCHIKKGTKAYEIYKQEEIYERHRHRYEFNPKYVPILEEKGLVVSGIYKAKNLPEIIELPTHKWFIACQFHPEFKSKPFAPHPLFVSFVEAAYKNKQGA >NC_010730|1129460:1140071|1137965_1140071_+|WP_012459778.1|DBSCAN-SWA MEITQAAIVDFLKNQKKPVYLKQILKAFNLDKKEDKKLVRRLLRKLQKNKIVLYKNGGYILKREIQEKENLIKGKVEAHESGFGFLIREDGEPDLFIPPIEMKYLFDGDIVLAEEKIYRGKKEAKIVKVLERRVKTAVGKLKQEGNRYFVYLLDFVIPHKIYVDKKEAKKYELDNYVVVEILRYPEPKVEAKGRIIKDLGKVKNTQTVAEIVARKYDLPLTHSPEALKEAEKLPSVVKITKNRKDLTKQICFTIDPESARDHDDAVAIEKEGDKYRLYVHIADVSHYVKEGSVIDKEAFQRGNTYYLPERALHMLPERLASQLCSLKPREKRYAFTCEMLIDKKGNVVEYDIYESVIESKAKLTYDQALGIILGQPELEKAFPYLVKPLKHMKELAEILMKAKEKRGSIDFDMPESQILFDQYGNPYDVVPYERHLANRIIEEFMIIANETVAKHMEKNGYPFIYRVHEKPKLEKVMAFVDLIAGLGYKVEYPKKDVDSKFIQKIIEMAVGTPEESLVRFLALRTMKQARYSPENIGHFGLASECYTHFTSPIRRYADVWVHRLLKKAIKKKFTKKDMEELPKKLDIIAKQCSERERVADDAERDALDILKLRILKDKVGEKFEGIITGVMAVGLFIEIERYIIEGLVPIDSLPGKFKYDEKNHQLIGDKMKFRLGDKVLVEIVKVDEDTKRIDLKLVEKL >NC_010730|1129460:1140071|1136801_1137965_+|WP_012459777.1|DBSCAN-SWA MNFEEADKYLFPNYARLPYSFVKGEGCYLHDENGKKYLDMLSGIAVNQLGYNHPKLTESICRQAKEIIHISNLFYIKPQYEVAKILVENSCGDKVFFCNSGAEANEALIKLIRRYFYDKKENRYEIITFEGSFHGRTLATITATAQPKYQEGFQPLPEGFKYAKFNDIDSVKQLINDKTAAVLIELVQGEGGVNPADKKFIKELYSICRENGILFTVDEVQTGIGRTGKLFAYQHYDIEPDIISLAKGLGGGVPIGAVIAKDEIAKSFVPGTHASTFGGNYLATAAAKVVLEEILSDGFLDKVIKNGEYLKEGLKTFGYPVKGLGLMIGMDLPEEISAKEIMKKALENGLIIGTAGKNTLRFVPPLIIRKDDIDLAVNILEKVLGEK |
8 | Orpheovirus(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1288631 : 1300004
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010730|1288631:1300004|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010730|1288631:1300004|1296094_1296415_+|WP_012459922.1|DBSCAN-SWA MIEFQYFEGCPNADETLKNLISLKDEGFISEEIKIVNVESPEKAKELNFQGSPTILYNGYDIYTMEKPEGFTYNCRVYFINSFPTGVLPREFIKERIKILKEKNYA >NC_010730|1288631:1300004|1290302_1291082_+|WP_012459917.1|DBSCAN-SWA MKKIVFLTNDDGYQSKGLQAIRNRLIEENFRVITVAPDRNMSGTSHSLTFTRPLKIEKIEEDFYYIVDGTPADCVHLGLNVILQNQKPDLLISGINTGPNIGNDVFYSGTVGAAREGTLFCIPSVAFSVGSSKNPNFEDVSKVAVKIVKALLIKNLPKGTFLNVNIPTIPAEKIKGFLLTKQGRGAYKEEIVKYLSPSKEEYYWIGGEEALLEECSPGTDYTAVKDGYVSITPIRLDLTDHKAIDILDKENFISEIVRL >NC_010730|1288631:1300004|1296407_1297595_+|WP_012459923.1|DBSCAN-SWA MLEGKRLLVGVCGSIASYKACEIVRHFQKKGMEVKVCMTPEAEDFVGKLTFQALTNSEVYSSWKDGKTGLEHIYVARWADVFLIAPATANTIAKLASGMADNFLTSTALAYDKPLVIAPAMNTKMLENPITQKNINILKEKGDIFVNPCEGLLACGEEGSGKLADLEDIELAVKYALYPKFLKGKKVLITAGATREFFDPIRYISNASSGQMGYALAKEVYGFGSQVTLISAPTCLKLPSQIKKIDVVTAIDMFEAIKDIYQDFDIIIMNAAVADFRPKAYSENKLKKTKENPVVELQPNPDILKFLGENKKENQILIGFAAESENIFENAIDKLKRKNLDVIIANPVKVFSKDIYEGYIIFKDGGKIEIKAESKERASYLILDSIFNKLGSELE >NC_010730|1288631:1300004|1293567_1295391_+|WP_012459920.1|DBSCAN-SWA MSANSDKVSLSNVIRAIGTVFGDIGTSPLYTFAVIVLVTKPKPDEILGIASLIIWTLILIPTVQYAWFAMNLSLRGEGSIIVLGEIAQSITKNPKIRLIHRALTIVGIGFLLGDGIITPAITILSSTEGLRLIHGLEGLSQEIILGIAIFITTMLFLIQRYGTGKIGIAFGPIMTLYFITIASIGIYYISHNPIVLKAFNPLEAINFISNHPFVAFLALSEIILAATGGEAMYADMGHIGKNAIRTAWVFVFFAVVMSYLGQASILLGNIKEDNPFFHGANLLLGNDLYILFLILITIAGIIASQALISGVFSLIFQSINARLVPLLLVRHTSTEISTQIFIPIVNLFLFIGVLIMFFIFRESEKMASAYGLAVNIDMVITSLFLIYIYFNLKKYGYFLGSILLLLIDLTFLSSNTLKIPHGAYWPILFAIPPIFIISLYTIGQSRIGKVGKFMPKENFIENFNKIYPKKCHIKGSAVFLVRSIERIPPYIVETMIKHGIVYEENIFLSLKKLDRPFGIRSYFAEDLCPGIKYAVIEYGYQEIVNVEKELRNLDINERVVFYGVDNVYSDNIIWKIFGLIKRIFSNFAEFYKLPAQKVHGVVVRVEI >NC_010730|1288631:1300004|1288631_1289117_+|WP_012459915.1|DBSCAN-SWA MKYEITKIFRFEAGHRVWKQNLAEGKTAVLSGYACIDNKCRNLHGHSYILEVTVGSDTLNEQDVVVDFYHIKNALKDLVDNVFDHSFIIDINDPLYPIFKEHFKDLKITEVDFCPTAEAMAKYFYDYLVQKLKEANLEEDIKVVQITLWETATGKATYKGE >NC_010730|1288631:1300004|1291081_1292560_+|WP_012459918.1|DBSCAN-SWA MGLISFQEFERLAKEFNVIPIYKEILLDIDTPLSVYLKISSPDRFNFILESVERGEQIGRYSFIGSSENFYIRTKKDTVEIYNKGQIEYKKTTDPIREIKNLVKEFKPYKDESLPPFYGGFVGYIGYDVIHFYEPIPDVKIDTLKIPDLFMFLSDEVIAFDNLTNKIKIIVCAIINKNEDLKIQYDKAVSKLNAIEERLNKTIEEKRLTLKEKEVNLENWNSNFKKEDFEKVVLKAKDYIKEGDIIQVVLSQRFSKKIKTDPLNIYRAIRVINPSPYLFYLDFKDLKIIGSSPEILVTVKDKKILTKPIAGTRPRGKTIEEDLKLKEDLLSDEKERAEHLMLVDLARNDVGKVAVKGSVKVDRFMYIENYSHVMHIVSDVSGILREDLHPLDVLKSVFPVGTVSGAPKVRAMQIIEELEPEKRGVYAGAVGYISFDGNLDTAIAIRTAVVVNDTVYIQAGAGIVADSVPEKEWLETVNKAKAMMKAVEVVED >NC_010730|1288631:1300004|1292827_1293496_-|WP_012459919.1|DBSCAN-SWA MKKLTFILLFLISSFLFSNAEVITTLKTDDKVVALTFDACETKTPSYLDHKIIDFLVSQKIPFTLFVSGKFIERNFQDLKNLYNTGLVSIQNHSYNHNNHMNLLNEEEIKEDVLKNENLIIGITGIKPKYFRFPAGNYNERALRLVESLGYKVIHWTFPSGDPDKKITKEMLIDHVIRNTKPGSILIFHANGRGYKTGEALPEIVRILKQKGYRFVRLEDYL >NC_010730|1288631:1300004|1289889_1290186_+|WP_007547163.1|DBSCAN-SWA MKRADIVNKIARNEKITLDKKEIATIVNETFDLISDYLTNDIHEGKKVMISGFGTFVIKKRKSKIGRNPKTGEEKLIPDRLGITFKPGKLLKKKVNSK >NC_010730|1288631:1300004|1289223_1289748_+|WP_012459916.1|DBSCAN-SWA MAIIKPYKGIYPKIDQTVFIAENAVIIGDVEIGKDSSIWYNVVIRGDVNYIRIGERTNIQDGTIIHVDHKRYPTIIGNNVTVGHKVMLHACTIEDYCLIGMSATVMDGVIVGKYSIVAAGALVTPGKVIEPYSLWAGVPAKFVRKLTEEEIAWLEKSAENYVKYKNSYLEEGLG >NC_010730|1288631:1300004|1295403_1296093_+|WP_012459921.1|DBSCAN-SWA MRTLAIRHVKIEHLGLIENYLKEKNFEIDYVDTSEGQLLKRELDKYQFIVVLGGYMGAYEESKYPFLSYEFKIMEQALKKEIPLLGICLGCQMLAKVLGSKIYKGENGKEIGFYDIKKVSDNKIFEGFPEVFKAFQWHGDTFDLPKDAQLVFSNDIYTNQGFICKNAVGLQFHIEVSQNMIKQWIQEYKDEILEEKLNPDEIIKDAEIYIPNLKTYLYDFLDKFLNDRR >NC_010730|1288631:1300004|1297982_1300004_-|WP_012459924.1|DBSCAN-SWA MNKLTKIDGLDGFRGILVLSVIVFHAFLVFSPENLSKFNGGFLAVESFFVLSGFLITKSLIIKNKKLNNFFEVYLDFLKSRLLRLFPAFILLSIIEISFIHLFFPEKLKNLLNELLFGSLNVYNWWLIKREVPYFERFQETLFNLHFWSLSIEWQYYLIWSVIFLILLRFSKIVAIIFTIMLALLSVLDMYIFYKMYENIDRIYFETDTRFSSFMIGSLLALAENKIEKRNWIFLTTGIISLFLLLASFFLLNNYESYMYPFGFLVVSIISALFILSVLKSEYFDKLLSFYPLSYVGVRSYSLYLWHFPIFSFLSLFYAKNIQEAVILGFILSFLISNISYLLIEEPFRRLNFLSLYDLKVVLNLSISSVLLGLVFGYLSFSTDANLAKERNVEKAAFLSISNDKVVSEEVKVSGIDKKSQKDNTKENEENPLEEIKNIEVGNLNGEVILIGDSVLLGASKYVQDFLKNAYIDAKVGRQFKEIYSLLESGKLDKYNKIVIALGNNGYVSKKDLENVIERLKDKEIYLITLKVPRPWQNQVNNTFKEIASEYKNVKIIDWYSYSREKEELFTTDKVHLNNKGAKYFASLIAKNLGIEYKNYKPQQKTDDEQKYDKVEAKINKKESLDNKESDISEKLSNKDKETKGKNVENIILKEQNNPNDEIENLILSAPGE |
11 | Campylobacter_virus(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1399538 : 1454944
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_010730|1399538:1454944|DBSCAN-SWA 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47 | Enterobacteria_phage(12.5%) | transposase,integrase | attL 1396824:1396840|attR 1458644:1458660 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1568361 : 1639761
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_010730|1568361:1639761|DBSCAN-SWA 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MAIQTPYVAVDGIIKVFDENENFKGIVLIERKYPPHGLALPGGFVDVGESVENALIREMQEETNLNVQIVRLFNVYSDPKRDPRFHTVSVVFVCKAYGTPAGKDDAKEAKIYKLEEIPFDRLVFDHEKILRDFINLL |
58 | Bacillus_virus(11.76%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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