Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011134 | Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565, complete sequence | 5 crisprs | DEDDh,cas3,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas1,cas2,DinG,csm6,csn2,cas9 | 1 | 21 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011134_1 | 581380-582010 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NC_011134_1
|
9 spacers
spacers of NC_011134_1
>1.1|581412|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAATCAACTAGCCACTGGTTTCCTTTACGAAC >1.2|581479|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTGTCTAATATCGTTAATAAACTGATGTCCGTA >1.3|581546|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTGACATTTTTTTGATAAGCTACAGCGATT >1.4|581612|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACTGTTACCCTAATAATTTTTTTAGTTGTGGTTG >1.5|581679|33|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTTTGTGATCAGTCACTAGTAAGATCGTTAA >1.6|581744|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTCAGTCTCCGCTAAGGCAGGAGACAAGCCCAG >1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACGATTATCATTTAAATACTAAAAAAACTACAG >1.8|581877|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACATATAGCGGAACAATCGGACGCTATCATGGAG >1.9|581944|35|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT CCGACACTGCGAACTAATCATTTGTGACTCCTTTC |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011134_1
The CRISPR arrays of NC_011134_1 >merge|NC_011134|1|581380-582010|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAATAAAAAATCAACTAGCCACTGGTTTCCTTTACGAACGTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAATTCTTGTCTAATATCGTTAATAAACTGATGTCCGTAGTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAATTTTTTTGACATTTTTTTGATAAGCTACAGCGATTGTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAATGACTGTTACCCTAATAATTTTTTTAGTTGTGGTTGGTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAATATCTTTGTGATCAGTCACTAGTAAGATCGTTAAGTCTCGCCCTATACGGGCGAGTGGATTGAAATTAGTCAGTCTCCGCTAAGGCAGGAGACAAGCCCAGGTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAATTACGATTATCATTTAAATACTAAAAAAACTACAGGTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAATCACATATAGCGGAACAATCGGACGCTATCATGGAGGTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAATCCGACACTGCGAACTAATCATTTGTGACTCCTTTCGTCTCGCCCTTTGCGGGCGAGTGGATTGAAAT >NC_011134|1|1|581380-581943|PILER-CR GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT AAAAAATCAACTAGCCACTGGTTTCCTTTACGAAC GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TCTTGTCTAATATCGTTAATAAACTGATGTCCGTA GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TTTTTTGACATTTTTTTGATAAGCTACAGCGATT GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT GACTGTTACCCTAATAATTTTTTTAGTTGTGGTTG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT ATCTTTGTGATCAGTCACTAGTAAGATCGTTAA GTCTCGCCCTATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TAGTCAGTCTCCGCTAAGGCAGGAGACAAGCCCAG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TACGATTATCATTTAAATACTAAAAAAACTACAG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT CACATATAGCGGAACAATCGGACGCTATCATGGAG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT >NC_011134|1|1|581380-582010|CRISPRCasFinder GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT AAAAAATCAACTAGCCACTGGTTTCCTTTACGAAC GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TCTTGTCTAATATCGTTAATAAACTGATGTCCGTA GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TTTTTTGACATTTTTTTGATAAGCTACAGCGATT GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT GACTGTTACCCTAATAATTTTTTTAGTTGTGGTTG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT ATCTTTGTGATCAGTCACTAGTAAGATCGTTAA GTCTCGCCCTATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TAGTCAGTCTCCGCTAAGGCAGGAGACAAGCCCAG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TACGATTATCATTTAAATACTAAAAAAACTACAG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT CACATATAGCGGAACAATCGGACGCTATCATGGAG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT CCGACACTGCGAACTAATCATTTGTGACTCCTTTC GTCTCGCCCTTTGCGGGCGAGTGGATTGAAAT >NC_011134|1|1|581380-582010|CRT GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT AAAAAATCAACTAGCCACTGGTTTCCTTTACGAAC GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TCTTGTCTAATATCGTTAATAAACTGATGTCCGTA GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TTTTTTGACATTTTTTTGATAAGCTACAGCGATT GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT GACTGTTACCCTAATAATTTTTTTAGTTGTGGTTG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT ATCTTTGTGATCAGTCACTAGTAAGATCGTTAA GTCTCGCCCTATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TAGTCAGTCTCCGCTAAGGCAGGAGACAAGCCCAG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT TACGATTATCATTTAAATACTAAAAAAACTACAG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT CACATATAGCGGAACAATCGGACGCTATCATGGAG GTCTCGCCCCATACGGGCGAGTGGATTGAAAT CCGACACTGCGAACTAATCATTTGTGACTCCTTTC GTCTCGCCCTTTGCGGGCGAGTGGATTGAAAT
>NC_011134.1|WP_012515202.1|580937_581231_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLVTYDVNTETASGRKRLRQVAKLCVDYGQRVQHSVFECSVTPAEFVEIKHKLTTIIDTEVDSIRFYLLGKHWQNRVETLGRSDSYDPDIGVLLL >NC_011134.1|WP_012515201.1|579901_580927_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKLLNTLYLTQEDYYITKEGDNIVIKQDGKTVSRFPFRIIDGVVCFSYLGASPALIKLCTENQINLSFHTPQGRFCGRYVGATNGNVLLRREHYRLADRDESLEYAKRFILAKISNARKYLLHFRRDHRDQIDGKLFEEVNGELIWALEMVQATDNKDSLRGIEGQAANQYFRIFNDLVLTDKKAFTFGGRSKRPPLDRVNALLSFGYSLLTFECQSALEAVSLDSYVGFFHTDRPGRASLALDLVEEFRSYIIDRFVFSLINKGQLTKKHFDVKESGSILLTEKGRVTFIELWQKRKHMEVEHPFTKEKVKLMLLPYVQAQLLAKAIRGDIDSYPPFMI >NC_011134.1|WP_012515200.1|579233_579905_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MVYVEDDYLMLSGIQHFQFCKRQWALIHIDQQWADNEATVHGQILHTRADNPYIREKRKDFFLSRAMHISSARLGLYGVMDVVEFYKDDSGVTVKGKRGRWLPRVVEYKRGKPKKDRRDIVQLVAQTMCLEETLNCQIAEGSLYYHSVNKKVQIAITDELRREVQELANQMHRFYGAKELPKAEYFKNCQLCSLVEVCKPRISKKVRNVDRYIAAAMVSEEII >NC_011134.1|WP_012515199.1|578383_579232_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MLEHKIDFMVTVEVKEANANGDPLSGNMPRTNAKGYGLMSDVSIKRKIRNRLQDMGQSIFVQANERIEDEFRSLENRFSAQFDKNDKDDDIERRANELWLDVRSFGQVFTYLKKSIGVRGPVSISMAKSLEPVVISSLQITRSTNGMEPKGDSSRSSDTMGTKHFVDYGIYVIKGSINAHFAEKTGFSEEDADIIKQALVSLFENDASSARPEGSMRVREVFWFTHSNKLGNVSSARVFDLLVFDMETPDKDSYEAYGIHLDEENLAAYQAKGLTVEVLEGL >NC_011134.1|WP_012515198.1|576499_578383_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MDFFASLLRAYEHAEDIGLVDNQEQSGTILLPIYHTNRRSNGKDTIVVQLDKTGQFMKAEYLADGETIIFPVTAESVARSGKNPAPHPLVDKLTYFVSAHNQEQYETYHQQLEGWINACQDKQVMSYLSLIQQFILKEDFLDLICQSLFGKQISRNGLKVTYVLSEEKEKTVDLSACFLTFQIAQFIGFKTVSVTNFTALHKDYIAYLMSKQTANTICNISGQKEVLATKHRGLLGNAKLISVSNHAEAYKGRFRERDDVFRVGNQTSEKLHLMAKYFLEHEQTHVWLGSGQHMINWFSDDLANDSQLNITQALLLDPFDDEETFLSTPMISEENKSINRSFITGQRQFSDNASYYIAILNKTNDGRIALKYFRQLQASSLLKNLAVWQENYSWELQRKGNQFVQKLPSFKEIILAAYGVDRDRSLELDNDNFRSDQYQRLVTSLIDGKPLPDTIVKKLEANIKQRQKYRKHWHQVEHISLAILHKQNGEEFTPMLDRDNTNRSYLFGRLLGIYELIEKSRNNSKGRAKDELKRITNAERYWTAYANRPASLMRNLEDKIYPYSEYLKINEAGLWSKLEKEREEIIALLTSSLETTDFNKPLDYRFIFGYYAEKKYFYTPKDESEDA >NC_011134.1|WP_012515197.1|575780_576500_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MRVRGDIALFTNPATKGSSERSSYPVPTRQALQGIVDAVYHKPTITNVVTEVKVINQIQTELHGTRALLKDYGADLSYVSYLSDVEYLIKYHFVWNENRPDLVKDRLPNKHEAIMERSLRKGGRRDVFLGTRECLGLVEAISQEEYETAQIASEHANQEIDLGIMFHSFAYPTDRKEPLRSYFTRTVMTNGTIHFKEQAECEIVNTLSSYTFKPAGPIKPVEEEFEGYQLDTIRETGGQ >NC_011134.1|WP_012515196.1|573086_575540_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MILAHYQGKTDLEPAKEQSLEEHSFQVAELARTAATSIKQGDLLFLLGLFHDLGKAGYRFQEKLLKKPNSHVDHAYAGARYLYDEIGKILLGHVQQYPHSKSLVLYFRDIVAYVISAHHGMYDLRMTEPAEEASRFAYNKLLHRMFQERPGYHYQKDVFTFVEVLEQSLPRYGYDHLADLITRAFYNFQLAWDKLDMADSSEQDYYSGCFVRLYLSLLKNADVLDTINAYETVIEPLTEEKQEELRISYLEAVESLYASFGQSKLRLNAIRNKLAERVKGRGREDSTGIYRLNLPTGAGKTNLSLRYATHQMVYQQKKHFLYVTPFLSVLEQNALAMKQVIGEEGVLEHHSNVVREIDNTNQNNDDADEDRDSLRREYLIDSWDSPVVLTSMVQFFQTLFKTRSAHLRRFSSLIDSVVILDEVQSLPIEVTTLFNLTMTFLSRVMQTTIVLCTATQPAYDSESITHTLTYGGSKAEEADIVTVTDEEQLAFTRTELCKLSDSDEKTSLVELAHTILEQEMSTLVILNTKPAVERLYQHLRDQTERPLYQLSTNMCLKHRLDVIAEIKSRLPNNVPLICVSTQLIEAGVDIDFERVIRSYAGIDSIVQAAGRCNREGRCPIGQVLLVNLTDDEENLSYLKEIKHKKDATETILYQKTSLIDIAALNEAFFNCYYENNKKRLDYPLGDNESVYQYLSSNAPSNIKKGKLRQAFKTAGQKMDLIQDQSIGVFVYYDDGVGRERLEALEEQLLKSSYPSSEELKAIKAELKALQPYTITLRDNHELLKATRSYLSGQILILQEHYYNQTFGLTKEADSFIL >NC_011134.1|WP_111721761.1|572102_572621_+|hypothetical-protein MSVSDGVDIIYCMEKREDKYDISISERGKVITQHRVLNSKLARLYYILLVKKALTTIKYPLLNSIGNVDSEELLRAQLNSEGLENYYSINKNGIGKVNFQNIGKDRLYYLDNKNNAYDIFFVSSKVLSVFYTSIVRLKWYEKWIEQLSSIEDISSDLYPILLGFSHEGIEIL >NC_011134.1|WP_012515194.1|571655_572027_+|TNT-domain-containing-protein MARDNDDPNLDRFLNGEFKTTKLQSGKKIDRFGSNYGSFFGEVGDSRALRAMSPNSDFSNYNQYEVLEELPVREGKIAPWFDEPGGGRQYKLDSDFVNQLQPLLQDGTPLIDKLIELGYLRRI >NC_011134.1|WP_012515192.1|570967_571297_+|hypothetical-protein MKVQGKIIILENDRIEFDFDIRTVIETSHFFIILLSIPFDTESVNNIYGINKTNREMWQIENHQFWTKLLPYENISKGESGDIFATDFYGRRVVIDETTGLIKSHSIVK >NC_011134.1|WP_012515203.1|584154_584865_+|thiol-disulfide-oxidoreductase-associated-membrane-protein-CcdA2 MELTMLLMVSVFIAGLLSFFSPCIFPVLPVYLGILLDSDDSRSITIFGKKLYWYGIVKTLAFISGLSTIFIILGYGAGLLGNILYAAWFRYLLGAFVILLGIHQMEIVTIKKLQFQKSVAFQNKKDRNAVLNAFLLGITFSFGWTPCVGPVLSSVLALAASGGSRAWQGGFLMIIYTLGLGLPFLLLSFASGIVLKHFNKLKPHIPLLKKLGGLLIVVMGLLLMTGNLNSLSGLFE >NC_011134.1|WP_041785339.1|584878_585529_+|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKKTTFLTTGLACLALLTACSAKDKMAMNDNKKDHMTMTDDKSKMKKDQKDMMSDKKDMMSDDKHMSDADKASKNDGQMAPDFELKSIDGKTYRLSDFKGKKVYLKFWASWCSICLSTLGDTQSLATMKDKDFEVLTIVSPGHQGEKSEADFKKWFEGTDFKDLPVLLDPDGKLLEAYGVRSYPTEIFVGSDGILAKKHIGYAKKSEIEKTLKEIK >NC_011134.1|WP_012515205.1|585546_586659_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MEHKWKLLLLVFGALVFLGGVLMVFQRGYATSYHNNQVKLPAKGTSQLKKTANAKLPEKKKEIYLAGGCFWGVEEYFSNVDGVLDAVSGYANGRGDTTSYQLLHQTGHAETVQVVYDANRISLKELLLHYFRIIDPTSLNKQGNDRGSQYRTGVYYTDPSDLTVIDMVFQEKASDYKKKIVVEKAPLKSFTKAEEYHQDYLKKNPNGYCHINVNEASYPVIDKTKYPKPSKEEIKKKLSKDEYRVTQNNETEKAFSNRYWDSFEAGIYVDVVTGEPLFSSKDKFESGCGWPSFSRPISPDVLRYKTDKSFNMNRTEVRSRSGNSHLGHVFTDGPKDQGGLRYCINSLSIRFIPKAEMEAKGYGYLLTAVD >NC_011134.1|WP_041785342.1|586927_587668_+|response-regulator MYSLLIVEDEYLVRQGIRSLVDFDQFAIDRIAEAENGQVAWELFQENPYDIVLTDINMPKLNGIQLAELIKTRAPKTHLVFLTGYDDFNYALSALKLGADDYLLKPFSKSDVEEMLKKLKQKLEKLKKTEALQKLVDKPQQEGSEIKLAIQERLADSSLTLKSLSSQLGFSPNYLSVLIKKDLGLPFQDYLIQERLKKAKLLLLTTDLRVYEIAEQVGFEDINYFSQRFKQLVGTTPRQYKKGEGQ >NC_011134.1|WP_012515207.1|587664_589383_+|histidine-kinase MKRYPLLVQLVSYFFLIVISLITILGVIYYQTSSHNIRQLIERETRQSIRQSSQFIDAYIKPLKETTSALANHTSIQAFAKDANSNDQSQVLALMTTVLSTNSDLLSAVLVTKDGRMVTTNPKLTMTTSHDMMAELWYKSAIDRKAMPVLTPARQLSSHSKKDWVVSVTQEVVDQAGNNLGVLRLDIGYNTIKSSLDQLQLGRKGFAFIVNDKHEFVYHPKNTVYSSEREMAAMKPYLAVADGYTKPKDYFVYQRVIPDSQWTLIGVASLDQLYHVQRQIFWSFLGTGLLATIICGLGTVFVLRSWIGPIRRLQALILAIQKGNRQLRAEETGSPELADLARQFNAMLDQIDSLMVSVADKEKAIGQYRLQALASQINPHFLYNTLDTIIWMAEFNDSQRVVDVTKSLAKYFRLALNQGNEFISLADELDHARQYLFIQKQRYGEKLHYEIKGLEKYQDFMIPKLILQPLVENAIYHGIKEVDRPGMIRVTVLEADRHVILSVWDNGKGISLVDDSSQALLERGGVGLKNVDQRLKLQYGHLYRMAITSEQAVFTEIKLYLPKPLDGLNELP >NC_011134.1|WP_012515208.1|589422_590511_+|MmcQ/YjbR-family-DNA-binding-protein MSLESDYFKRKSPVFEALIPYGFTQEGDTYCYQESFMEGDFKALITIKSSGQLSARVIDTDLGEDYLPLRNARQQGVYIGQVRQAYLELLGRLSAACFRPTPFQTRQANQVATSISQQWNDPLDYPFEKYPNIATYRVSGKWYAMILPLLADKLGQVPKALQGQTVEVMTVKAAPNQLTNLLQQRGVYPAYHMSKKTWISLLLDGTLADDQLWELVTKSRQLANPNGLANPDGPDYWVIPANLSYYDIDAEFAANPDILWTQKASIKAGDYVFIYITAPTRSIRYACQVLRSDIPNQGYRKNAKIKTLMSLRLLHCYEDGLISLDLMKQYGVNAVRGPRRLSPQLVAFLKEKEYFKDVKQKE >NC_011134.1|WP_012515209.1|590525_591230_+|B3/4-domain-containing-protein MTQFIADQSFWELFPDAKLGVLLLRNYDNQEDSPQEVKQLLADSHDIAKQYLTEESFSDNEIIQVYRQAYQRFKTKKGARSSIEALLKRVANGQVLSSINPLVDIYNAASLRFGLPVGAEDSDCFVGDLRLTLTEGGDEFYLIGDSKNSPTLPNELCYKDDAGAVCRCLNWRDGERTMITDRTKNAFLVIEALDSKTQARLQDALKFIEDKAKCYLKAETALYTLDQASPSITF >NC_011134.1|WP_024273154.1|591488_591977_+|prolyl-tRNA-synthetase-associated-domain-containing-protein MELFDKVDDTLKALAIDYQLVEHEPALTTEQADQFIEGIEGVRTKTMFLTTRKKNHFYLVIMDDTKRLDMNRFKELVGEKQIKMASAECLLAKMQLPPGVVSPFGLLNNEDKDIQVYVDKAIAHEARMSFHPNTNDKTIFIQTDDLFRFLAAIGYAVNIVDL >NC_011134.1|WP_012515211.1|592487_592961_-|arginine-repressor MNKKETRHQLIRSLISETTIHTQQELQERLRKNGISITQATLSRDMKELNLVKVTTGNDTHYEALAISQTRWEHRLRFYMEDALVMLRVVQHQIILKTLPGLAQSFGSILDAMQISEIVATICGDDTCLIICEDNEQAKACFEILSHYTPPFFFSNK >NC_011134.1|WP_012515212.1|593101_593782_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MIRREDYQYLRKLDDFCHFSIEQFDKIVGQMEFRQAKKDHMLFFEGDKRDRLFLVTSGYFKIEQSDRTGTFTYTDFIRHGTIFPYGGLFTDDYYHFSVVAMTDVTYFYFPTDLFEDYSLHNQQQMKHLYSKMSSLLELHELKVRNLITSSASSRVIQSLAILLVEMGKDSDTLPFQLTTTDIAQMSGTTRETVSHVFRDLKKEGLIAVKGKYLTYLDKNYFLQYTT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011134_2 | 858453-858562 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_011134_2
|
1 spacers
spacers of NC_011134_2
>2.1|858480|56|NC_011134|CRISPRCasFinder TGCAATATAATTTGTCGTTTGAGTCAATAATAAGATGATAGATCATTACTATTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011134_2
The CRISPR arrays of NC_011134_2 >merge|NC_011134|2|858453-858562|CRISPRCasFinder CTGACTTGATGACAGCTTATACTAAAATGCAATATAATTTGTCGTTTGAGTCAATAATAAGATGATAGATCATTACTATTTATCTGAGTTGATGACAGCTTATACTAAAA >NC_011134|2|2|858453-858562|CRISPRCasFinder CTGACTTGATGACAGCTTATACTAAAA TGCAATATAATTTGTCGTTTGAGTCAATAATAAGATGATAGATCATTACTATTTAT CTGAGTTGATGACAGCTTATACTAAAA
>NC_011134.1|WP_012515453.1|854597_858314_+|pullulanase MMKRLRENQALFEERQLFGIRKLKLGVASVAIATAFSLGTVSGQITAAAESLTSVEPIDGAVMVKSEAADHDSKELPEATDISDISGISDVTKVSAAVNADTVKEVQPVAVPLVEDQAQEETTDQSQPSSSIVPVTTDSSLETPEATSSEAPIAAQTLRLHFKTLPAQDLSSLGLWVWDDVETPSDQLGGWPTGATNFSLAKTDDYGYYMDVKLSAEQAHKVSFLINNTKGDNITGDRTVELISPKVNEVWIDGQELSYYPPLAQGYIRINYYRSDGHYDNKSLWLWGSADASMTSQQGAWPDGIDFKQVGRYGAYIDVKLADFNELGFLLLDERQTGDAVKIQPNDYIFKDLKNHTQIFLKDEDPTIYTNPYFVNHVRLIGAKQVSPSSIEASFTTLADVDKESLLKELKISTDSKEAVAITDITLDEKTHKAVITGDFSQAVATYTVTFHHESFQARPNWQYKDSLYAYDGELGARVREAGAKVDLTIWSPSADKVSLVLYDKADQTKVIGNFALAKGDKGEWSITLSADSGLGISDYRGYFYHYEITRDGKSVLVLDPYAKSLAAWNSELAKTDPSYKVAKAAIVDPAAIGDKELAFADIKGFHKREDAIIYEAHVRDFTSDQAIANDLKAQFGTFAAFVEKLDYLKELGITHVQLLPVMSYYFVNELANKERMLTYSSSDNNYNWGYDPQSYFALTGMYSTDPTDPAKRIEEFKQLVNEIHKRGMGVILDVVYNHTANVDIFEDLEPNYYHFMNADGTARTSFGGGRLGTTHYMSRRVLVDSITYLVDEYKVDGFRFDMMGDHDAAAIEKAFLAAKALNPNIIMLGEGWVTYQGDEHMPEQPADQSWMSQTDTVASFSDDFRNQLKSGFPNEGSPAFITGGARDIMTIFHNIKAQPTNFLADDPGDVIQYIAAHDNLTLFDIIAQSIKKDPSVAANAAEIHRRLRLGNLLVLTSQGTPFLHAGQEYGRTKQFKDEAYKGKVADDKVPNKSHLLVNEDGTPFEYPYFIHDSYDSTDAINHFDWAKATDTERYPESTTSQVFTKGLIALRRSTDAFRLASKAEIDQKVKLITVPNEHGIKAQDLVIAYQTIASNGDVYAVFVNADSNDRTIRLTGKFQALLAGEVIVDAKQAGTEALASPEGVVLTKDGVKLSGLTATIIRLRASQSDKGTLGAMTDQAAHHQEKLVAAQTAGEVSQFSAKTLPKTGTSQLDALLALAGSGILAGLGGLVSKSKRR >NC_011134.1|WP_012678093.1|853034_853490_-|hypothetical-protein MVKHAKTNLHFELERSISRKVDSKLIAYQVSLSDGFYDKYTKLWDKTYSFDFVINHRAFYAQLTKRCVYDVLLQTLEKISRKAIAKQLAELEALVDVSESKEDFQIFFEKKYKLSFPDLKNCVYPKKKELSDFDQNLWIALHYNPRKERDT >NC_011134.1|WP_012515451.1|852747_853035_-|hypothetical-protein MTTWYDYMVRASEHAGSDGDLWFRYLYKIIKDGETKLTTDDVEQLLKNPNLTPFQKVTLQDALTEGTHTREHVLQANRKSQPKDILKLFREGNYG >NC_011134.1|WP_012515450.1|852206_852755_-|hypothetical-protein MDKKILFKALNTELAKENISLDIICVGGFVLEYYNLRGTQDVDAFYQESVNIRQMIKKVGDEFGVNEPDELWLNNSVANLNRIPPKTICETVFHYSNLIVLVPPLSYILGMKLESGRDRDRQDAGDIIKLANIRSPKKLINTLEEYGFQPDISMILEVFEIAYGMEWLANYMSEHPEEFRYY >NC_011134.1|WP_012515449.1|850834_852037_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MLTNQTGYRHRLSKQKLPISMVSCLLGMGVFISPTSISADSPPTITIKSAADKDISSNLPKVPLSNAKPEEKLEDTPQLPNEKGQGDDIREPEKLPELPNEKGQGDDIREPEKLPELPNEKGYGNDIRKPEKTPELPNEKGQGDDLKKEEDLKKQRKELTEQLRALDTVEKVLEFLRKPIPGFVTDEDWNFLVSFVEKGPENKTFEADKLKLLEIYSTSKGHRVWLGYLILEEPKPEPMPKPEPMPKPKPMPEPKPMPKPEPMPKPEPMPKPKPMPEPKPMPKPEPMPKPEPMPKPKPKPMPEPKPMPKPEPMPKPEPMPKPEPMPKPMPKPEPMPKPMPKPEPMPKPEAQKGDKPAVPKAMEHKLPSTGEATAPFFTAAALAVLASLGVAVVSRKRKKH >NC_011134.1|WP_012515448.1|849576_850755_+|IdeS/Mac-family-cysteine-endopeptidase MKKQSFTHSRKPKFGMRKLSIGLASCMLGMMFLTTSHVSGEVVEVWPYGQNPNGKTEILSQTEDSESLQRLRDIEDFQAEKKMQNVVYTKWLDGVDVKDHDFRKIVDGNIAYYATPLLNGRGFYDINKDFNRDSDKCAAAVAANMFHYWLDINRDNVDRFLRQNPEKHGIIELPDGQLKLSDFLNTYESDHGYRDKSKLFDFISNNFNGPVWTDKLLDNYINGYAYNYKYGRTIEDPTKNTSKINFFKEVFNEKILTNNHSIRNQNEFSVLLSEALYTGKAIGLSYGPAGLRHSLGHIISVWGADLDADGNVVAIYVTDSDDKKLTIGDERVGLKRYKISTDDENRLRLTAYEETHNTGGQIRGLWTLDTGKYAWADYFDKTEQTGTDQAEQ >NC_011134.1|WP_012515447.1|848452_849262_+|class-C-sortase MKKSVIFWSVILVAGCLIVLYPTLSNYWNAQHQSQLIADYISSTQALRHKDSQLMLEAANQYNQQLKANHDPDLTLTDSETEAYQQQLDLTNTGIMAYIDIPKVHERLPIYHGTDEEILQVAIGHLAGTSLPVGGKGTHAVISGHRGLPSAKLFTNIDKLRINDTFTITSLNRTMTYQVDKIATVLPDDVSLLRIEEGKDLVTLVTCTPYGVNTHRLLVRGHRIKTATPAAARGSQKPSRLILWLLLISALGLSLVLIGTWRWRRRSKA >NC_011134.1|WP_012515446.1|846935_848372_+|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MKTIKLILTSLLVTFLTMLSGKAFADTASYTITVEEATAGHTYEAYQIFKGDLFDSTLSNITWGGGVTPFEFDGSKDAAKIAEGLKEANAAAFAKEAGKHLTATIAGTGTHAITVNEAGYYLIKDKNDSQTGKHDAYTSFVLKVVKNTSFKPKSAIPTVLKKVKDRNDKTGLETDWQDSADYDKNDKVPFQLTATLPSNYDAFQEYYLEFVDTLSKGLSYNKDAKVYVINGDSRQDITGSFTINESGSSFKINNLKTVTDVTADSKIVVEYTATLNDQAAIGKKGNPNEVALKYSNDPNALGKGEESPKGETPKDKVIVFTYKTIINKVDQDQKALKGAGFTLYKLVKGDNGEEKYQIVQEIKAGDTTSFEFVGLDAGDYKLSETTTPGGYNTIADVMFSIVAQHETESDDPQLTSLTVDKATGFTTDTEAGTVSATIVNKKGSILPSTGSIGTTMLYVFGVMLMTISTLFIFRQKQQ >NC_011134.1|WP_041785432.1|844956_846921_+|Cna-B-type-domain-containing-protein MKQLTKIVSVVLLLVFTLSASLHKVRATNLSDNITSLTVASSSLRDGERTTVKVEFDAKSAKIKEGDIIEVTWPTSGNIYIQGFTKTIPLMINSINVGTLDVTLDKAVFRFNKNIETMQNVTGWGEFEITVRNVTQTTTETTGTTTVRVGNHTATINVTKPEAGTGTSSFYYKTGDMQPDDTDHVRWFLLINNNKEWVANTVMVEDDIQGGQTLDMTSFDITVSGYRNERFVGEKALEEFRQKFPNSVITATANHISVRLDQYDASQNTVNVAYKTKITDYDQKEFANNSKIWYQILYKNQVSGQESNHQVANVNANGGVDGSRYTSFTVKKIWNDKENQDGKRPKNIKVQLYANNKEVEGKAIELNDSNSWQASFGKLDKYDNQNQKITYSVKEVTVPTGYQSQVEGDSGAGFTITNTYTPEMISITGQKTWDDKENQDGKRPDQITVRLLANNVETGDVTTASVKTGWKYTFTNLPKYKDGKQITYTIQEDPVADYTTTIQGFDITNHHEVALTSLKVIKAWNDKDDYYHKRPKEITILLKADGKVIREHQMTPDQQGKWEYTFDKLPVYQAGKKISYSIEEKQVAGYQAPVYEVNEDLNQVTVTNTINQSYSLPDTGGQGVKWYLLIGGSIITVACLVLINLYKKHKHHNM >NC_011134.1|WP_041785430.1|844294_844888_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MLAKNIMYKININVQFLGVNDTMDKNKQTCKKIIKNYCRLLQYKDKDSITVSDISKASNISRTTFYHYFNSKKDLDREMIGVYLDDITSIIYQSPSLDTTITLKILNYLSDNQEVMQSLILYYPNIYKIFNHYIRDIISYSNLMNCGESQDYPEVTQKYVFELYIASIEVIIIKWISCGCKESPQQIIEVLKLLRSK >NC_011134.1|WP_012515454.1|858602_859142_+|RNA-polymerase-sigma-factor MIKGVLRGDKLLEFEDIYLEYKDDVYRFVNKLCCYQNSLSDDITQETFLKAYRNIAKFRGDSSIKTWLFTIAKNTFFSEIKKKKYENMSMESLEIVDAKGHDEPLDKIARRELLEITLTIIFNLPEKMQAVFLARIYSGDSYEKIAKDIGITVSSAKVLVFRARKHIKRQLREEYGYEV >NC_011134.1|WP_041785436.1|859131_859767_+|zf-HC2-domain-containing-protein MRYDCELIQDLLPLYVDDTLSDYSRAVVEAHLTSCKDCQTDLADLRQDYSKVEEELQEYQAEVCAFSRFIRKQRQQMIVATISICLVTGILSSILTAHRIRAPYDYVAIDVGEHTQLNKEGLLSTARTTAKDHVALVYKHKAQKVNGSFEISELQARKIQQQLKQAMLKEANATDISSRQLDQSQKRLSCNQDDQLVYIISTDGRIYYFGR >NC_011134.1|WP_111721763.1|859894_860590_+|polyphosphate-polymerase-domain-containing-protein MNEVLRQEKKYLITIEDYYRLSHEFSKLLRLDAHSSSEGYVIRSLYFDSLEDVDWQEKEDGIELRRKIRLRNYGSQSSFAKLEMKQKQGSNQKKRSLRLTRADAQLLIKGDKSILLTYPDRFAAECYSRMSMQLYQPKTVIEYQRKAFVAKENNIRITFDHHIIGSETNADIFSDHLPQNYLLDPYLVILEVKYNGFLLSYIKKLLESVNGSELSASKYCMGRAISKHYRF >NC_011134.1|WP_012515457.1|860603_861281_+|DUF4956-domain-containing-protein MKQLLRHVFEQRGTLSFQDVLLHIVAAALLSIVIYMSYAYTHTGTAYSKKFNVSLMTLTVLTATVMTVIGNNVALSLGMVGALSVVRFRTAIKDSRDTVYIFWTIVVGICCGVGDYTVAATGSSVIFLLLLLMGAVRNDNRLLLIVRCDKQMEIELERLVFNYFSGKAIQRVKNTTSDDIEMIFELSRKDYDSTYQQANPLTEAVYQLGRVDYFNIVSQSDDITG >NC_011134.1|WP_012515458.1|861286_862720_+|CotH-kinase-family-protein MKEKTIYVIVLVCLLLAAICGIGFPKTSAKRIHHHLQTVKKSSRSTGEFSSHLPIISIDTHHQQIPEQREYEGETKRQKTIKTTVSLRDQLDREHSLSESPRLSLTALIAYRGNSSRHFDKKSLKLRFINKSAKPKAVSLAGMSKESEWVLHGPFLDRTLVRNYLSYNIAGEIMTYAPNVRYCELVVDHQYCGLYLAVESIEQGRHRVNIEKSDRKSDKTPYILVWDRRHKAKQALDHYVSYTNQAGLSSLDIKYPSLHRLTPKQKQFIEKDISHIEKLLYSYDLKQYTDYLDQESFADYFIINEFFRNIDAGKFSTYLYKDLRDKLKLVVWDFNNAFDNQIEAPYDEADFTLSDAPWFCMLLKDPSFVKLVVTRYHQLRQNVLSTDYLIKYIDATVAFLGPAIQRNYHKWGYVFTVPSRSDATNYLVPASRNYSSYEASVKQLKDFIRRRGRWLDKHIETLYQYSAPSKNTNTLLE >NC_011134.1|WP_012515459.1|862726_864868_+|hypothetical-protein MKKYLIFVGLLLSVIGLSYYCCDIDGRLYLPVSNQSAIRTSFYAKDKRIYDQKGSPYLIKGVDVESSIAGYRQRDLSVDEKTYYRWFKQIAAMGANTIRVRVIMPAAFYHALSRYNDTASHSLYLLQGFRIDAYHDNSSISALDKAYLGTLLREARASVDVIHGRKRIWHSDLGLQHYDQDMSKWLIGYIVGDDWHSGTIAYTNHQNHAKPVGFKGRYYATTPQANRFEAILAEIMEEITSYESRKYGWQHLVSFSNTPQSDPFVYQDPFASQAAKYVQLTIENIKPSAKVKAGLFASYKLLDCHSAYRDYLLFDRLGLDDRLVGDIKRMPLYQGYVKLLTSYHRVPVVVTGYGYSTARGVDQMISTSSPLTEKDQGERLMADYTAFIASGCCGATIHSWQDDWTARSWNTSFATNRHQGFLWGDVQSKAQGYGLLTFEHAPRTHAIDGQKAAGEWSRALTYRKNGQQLLVDQDEKYLYIAIESTKKQPLQRQWLIPLDITPKTGSRVIEGFSARFDRFADFALVVDDHKGSRLLVQERYHATDANYLRQINGKDFYVFPPNKHTPRFTMVDMVMRNDGIFAAIDQVPIAKRGLKRYLTGQLKKGNGNRGSAHFDSQTDISFGEHLIELRIPWQLLNFSDPASNKIHDDYFEHYGVEELAIEAIAIGFAPLKESKVITMVEYPLLSWERPRVREVLKTSYQQVQAVWQEKRRK >NC_011134.1|WP_165626701.1|865008_866409_+|glycosyltransferase MIVQLLFLVLKYSQYLFLAFLIAYASFLLLSLIVGAIHLYERRQQVPLGGDVSLPPVSILVPAYNEELTIIETVESLLMLDYDCYEIIVIDDGSTDHTAKLLKEQFHLEAVTCSINQRIPTRPLKAVSQKQLKHVKLTLLEKANGGKGDSLNFGINAAQYDYFLCMDADSMLQEDSLKRIAKTVAKDPSVIAVGGMVKVSQGVALAAGRIVDYHLPRQLISCAQAIEYDCAFFGARVLLDQAAGNLIISGAFGLFKKELAIAVDGYDTGTLGEDMELVMKLHFFCQNNKIPYRIGYETDAICWSQAPSRLKDLCQQRRRWFLGLYQCLKKYLQFFVSGRFKVTVLISYVLYLLFELLSPFIEAFGVTIIVLSLLCHQLNTTFFVSLMLLYICYCVLIALTSFLNRVYSQNNSSITFFDMVWVIYAAIYQCLVLHTVLTLVKVSSFIGYQRKKNAWGQITRDKHKVA >NC_011134.1|WP_041785439.1|866619_869841_+|ATP-dependent-nuclease-subunit-B MKLLYTEISYSMTEILVKEARAYADKGYRVFYIAPNSLSFEKERSVLALLPEQGSFAITVTRFEQMARYFTLAKAANRQALDDNGLAMIFYRVLMQLQEDELKVFHRLRTDQAFIAQLVELYKELQAANLTAFDLTTLDRPEKQEDLITIMTKAEQLIAQGDYDQSSRLAQLAEAIKSKSLDDELRQTVLVIDGFTRFSAEEEQLLALLNEACEEIVIGAYISQKAYRLAFTKGNLYEASLAFIQQLAQQFQTKPIYTTSEKVFDVSFSRLTQLLEANHDYSQLDWQLSAKDKSKVVIWQALNQKEELEHVTKAIREKLYQGYRYKDMLVLLGDVASYQLQIGPIFEKFEIPYYIGKQEPMSAHPLVQFVESLERGRRYNWRREDIVNLLKSGLFGRFQEGELDQLEQYLVFADIQGFTKFSRPFTLNSSRQYPLPLLNQLRLAVVTPLQQLFKSQKQLGASLLDKLMTFFKTIQLADNFEALAGSRREADREKDEEVWKTFTGILETFYQVFGQEKMTLADCLALIKMGMQTAHYRTVPATLDVVSIKSYDLVEPHSKPFVFAIGLSRSHFPKQTKNTSLISDQERASINEQTASYQRLDVPSFENIKKNHQTALSLFNAATQELVLSLPTSLTNSSDDVSPYLKELIALGVPVIEKGKNRLSHSAADIGNYKALLSRLVAINRQGIADDMTSEDRNFWTVALRYLKRRLADEQLSLPAFEHHLTTKPVAPEVIETRFPSQQPLSLSSSALTVFYNNQYKYFLKYVLGLQEPESIHPDARIHGQYLHRIFELVTKDRSNAAFDQKLGAAIAAVNQQSAFQQVYQADAEGRYSLEVLKGIAYSTAPVLNLNQGMQVAKQEEAFELALGHQALIRGVIDRIDQLADGRLGIVDYKSSARVFDIGAFYNGLSPQLVTYLAALKNKGQGLFGAMYLHMQEPRLSLSDFKVLDDQLVAAAYKELTYKGIFLAQAKEYLANGSYHLNNTLYETDELETLLAYNEQLYLSAVKQIKTGHFLINPYTADGKSVQGDQLKAITRFEADLDLGYARRLVVLPAKERRQAFLTRMNEEIKHED >NC_011134.1|WP_012515462.1|869830_873475_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MRIDEGFLTPEAIARLQQEEALSDKRHKRTAQQIEAIYSSGQNILVSASAGSGKTFVMVERILDKILRGISVDRLFISTFTVKAATELIERIEKKLHTAIAETQDYQLKAYLNDQLQALSQADIGTMDAFAQKLVHQHGYVLGISPHFRIIQDKAEQDILKREVFRQVFEDYMSQTDNKAFIQLVQNFSGRRKDSSAFREIVDSIYAFSQSTANPSSWLAEVFLRGAKTYTSFADIPDQVVDALLACMQDTADQLRDLTDMEGYAQTTKAGKLTAKYTKHLKMIDNLYEWASHFDSLYGKERLGQLAQELTALLPSGADITVAGHKYPIFKSLQEQLVGFRHLETILAYQQESLPLLEVLQAFVISFSEAYLAAKMQENAFEFSDIAHFAIEILQQAPDIRQAYQGHYHEVMVDEYQDNNHMQERLLELLSNGHNRFMVGDIKQSIYRFRQADPQIFNQKFKDYQSNPEHGKLILLKENFRSQSEVLNVTNAVFSRLMDESLGEITYDDKHQLVAGSEAQKQLHPENRAQLLLYNTDQAQEGTEEASTNDGISAGEVTLVAKEIIRLYNEEKVAFEDITLLVSSRTRNDTIFQVFNQYGIPLVADGGQENYLKSVEVMVMLDTLRSINNPLNDYALVALMRSPMFSFDEDQLARISLQSSSQDQPQAFYDKLSNSLRGQGEHPGLIGQELMTKLVDFDRTLRDWRQFAKLHSLYELIWKIFNDRFYFDFVASQPKAEQAQANLYALAIRADQFEQSGYKGLSRFIGMIDKVLETQNDLADVEVERPKHAVNLMTIHKSKGLEFHYVFILNFDKRFAMADLQAPIILNRDEGIGIKYVANVKELLRDEKLASLKVTMETLPYQLNKQQLRLATLSEQMRLLYVAMTRAEKKVYLVGKASKEKIQAKTADNSSEGRLALASRERLLSFQDWLLAITATFSKEDLFIDVRFVDDSDLTAEAVGQLRSSGLLQADDLKDNRQTEDIARALDMLDKVSKLNASYQAAIELPTVRTPSQLKTLYEPLMDTDGVDIIDQPYHRPKSFELPDFSKKKAVEPSQVGSSLHELMQRIPMSDQITAGDIEQALQLVSADAEVKARLDIKKVTAFFATTELGKLLQEHHQRLYREAPFAILKKDSLSQEQYVVRGIIDGYLLFEDRIVLFDYKTDRYQQSAELKQRYQQQMDLYAEALSQSYGIARVEKYLVLMGGSQLEVVRLDE >NC_011134.1|WP_012515463.1|873740_874856_+|aminotransferase MKLPVFGVEEWLNQHEKRAVYDIAGSSIASLTLEELFDLTQEQPQAFYQQLHQKPLDYGWIEGSPDFKQAVAGLYQQQKARNILQTNGATGANFLVIYALLEAGDHVIAHYPSYQQLYDIPASLGVEVDYWQIREEQAWLPDLNELGAMIRPNTKMIMINNANNPTGAYMTKPYLEELINIAREHDIYLLSDEVYHSFTSDHLLAVADLYDKGITVNSMSKTFSIPGIRVGWVAASETICDQLRLYRDYTMICAGVFDDMVASLALKHADKLLQRNQAIIRTNLAILEDWITGEAKASYIRPREVSTAFVRLDIDEDIEAFALRLLEDYGTLVVPGNRFNQANHVRIGYCCQPQVLQAGLSRLSQCLKNIQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011134_3 | 879872-879943 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_011134_3
|
1 spacers
spacers of NC_011134_3
>3.1|879895|26|NC_011134|CRISPRCasFinder TAGGAGACGAGCCCGAAATAGGGTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011134_3
The CRISPR arrays of NC_011134_3 >merge|NC_011134|3|879872-879943|CRISPRCasFinder CCTTTTTAACGGCGAGCTAAAAATAGGAGACGAGCCCGAAATAGGGTGTCCTTTTTAACGGCGAGCTAAAAA >NC_011134|3|3|879872-879943|CRISPRCasFinder CCTTTTTAACGGCGAGCTAAAAA TAGGAGACGAGCCCGAAATAGGGTGT CCTTTTTAACGGCGAGCTAAAAA
>NC_011134.1|WP_012515467.1|878747_879857_+|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoD MAKEKEVTTFNVQVAEFIRHHKKEGTATDDEVTEKLVIPFTLDADQIDDLLERLTDGGISITDKEGNPSSKYVVEEPKPEELTDEELIGSNSAKVNDPVRMYLKEIGVVPLLTSDEEKVLAVAVAAGDMEAKQRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMQFLDLIQEGNMGLMKAVDKFDYSKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLVREQRNLLQELGQDPTPEQIAERMEMTPDKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDEVIENPVDYTTRVVLREQLDEVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGKMRTLEDVGKVFNVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKQLRDFIED >NC_011134.1|WP_012515466.1|876927_878739_+|DNA-primase MGFLWGGDGLAIDKEMISQIKHNVNIVDVIGEVVHLSRTGRHYLGLCPFHKEKTPSFNVIEDRQFFHCFGCGKSGDVFKFIEEYRQVPFLESVQIVADKAGMAVTIAPSQASLGQKQHPHQALIDLHEDAAKFYHAVLMTTKIGQRAKEYLYQRGLDDQLIEHFRIGLAPNEMDYLYQALSKKYTEAQLTASGLFHVSEQSNAVYDAFRHRIMFPLCDDKGNMIAFSGRIWAREDIEKQQAKYKNSRATVLFNKSYELYHLDKAKPIIAKTHEVFLMEGFMDVIAAYRAGYGNAIASMGTALTPEHVRHLKQLTQRVILTYDGDDAGQNAIAKSLELLTDFQVEIVKIPNRMDPDEFVQQHSPEALAKLLQHSRISSVEFLIDHLKPENMDNLQSQIAYVEHISQIIAQAPSITAQNSYINKVADLLPDFDYFQVEQSVNALRLQDRQSLQGQTSQSKASLVTLPINKSMTALAKTESHLLHRLLHHDYLLNEFRHRPDFYFDTPALQTLYEQLKATGQITSYDLSQLSEEVNQAYYRVLEENLPDEIASGEIEDILSRQMTLLKQRELHRQGKQIRESSSKGDHQMALEALERFIAEKRKME >NC_011134.1|WP_012515465.1|876306_876681_-|large-conductance-mechanosensitive-channel-protein-MscL MLKELKAFLFRGNIIDLAVAVIVGSAFSAIVTSFVNDIITPLILNPALKAANVENIAQLAWNGVKYGSFLSAIINFLIVGTSLFFVVKVAQKAMPKKGEEEPAKPKTPTQEELLLDIRDLLAKK >NC_011134.1|WP_000048058.1|875902_876079_+|30S-ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLDDALRRFKRSVTKAGTLQESRKREFYEKPSVKRKRKSEAARKRKKF >NC_011134.1|WP_012515464.1|874923_875736_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MNMKRLLVGALAMVSVLALAACGQTNKTSLQDRIQENGKLVVAVSPDYAPFEFKALVDGKDTIVGADIELAQAIADELGVKLELSAMNFDNVLSSLQTGKADIAISGLSYTKERAKVYDFSEAYYETENAILVKASDAKRYANKDSLAGKKVAVQKGSIEEGLVKEQLNKANCVSLTVMGEAINELKSGQVQAVDLEAPVAAGFLAQHKDLALAPFKLQTGDGDAKAVAMPKGSDDLRQTINKVIKQLNKDGKYKAFIQEAALLTGNAVE >NC_011134.1|WP_012515463.1|873740_874856_+|aminotransferase MKLPVFGVEEWLNQHEKRAVYDIAGSSIASLTLEELFDLTQEQPQAFYQQLHQKPLDYGWIEGSPDFKQAVAGLYQQQKARNILQTNGATGANFLVIYALLEAGDHVIAHYPSYQQLYDIPASLGVEVDYWQIREEQAWLPDLNELGAMIRPNTKMIMINNANNPTGAYMTKPYLEELINIAREHDIYLLSDEVYHSFTSDHLLAVADLYDKGITVNSMSKTFSIPGIRVGWVAASETICDQLRLYRDYTMICAGVFDDMVASLALKHADKLLQRNQAIIRTNLAILEDWITGEAKASYIRPREVSTAFVRLDIDEDIEAFALRLLEDYGTLVVPGNRFNQANHVRIGYCCQPQVLQAGLSRLSQCLKNIQ >NC_011134.1|WP_012515462.1|869830_873475_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MRIDEGFLTPEAIARLQQEEALSDKRHKRTAQQIEAIYSSGQNILVSASAGSGKTFVMVERILDKILRGISVDRLFISTFTVKAATELIERIEKKLHTAIAETQDYQLKAYLNDQLQALSQADIGTMDAFAQKLVHQHGYVLGISPHFRIIQDKAEQDILKREVFRQVFEDYMSQTDNKAFIQLVQNFSGRRKDSSAFREIVDSIYAFSQSTANPSSWLAEVFLRGAKTYTSFADIPDQVVDALLACMQDTADQLRDLTDMEGYAQTTKAGKLTAKYTKHLKMIDNLYEWASHFDSLYGKERLGQLAQELTALLPSGADITVAGHKYPIFKSLQEQLVGFRHLETILAYQQESLPLLEVLQAFVISFSEAYLAAKMQENAFEFSDIAHFAIEILQQAPDIRQAYQGHYHEVMVDEYQDNNHMQERLLELLSNGHNRFMVGDIKQSIYRFRQADPQIFNQKFKDYQSNPEHGKLILLKENFRSQSEVLNVTNAVFSRLMDESLGEITYDDKHQLVAGSEAQKQLHPENRAQLLLYNTDQAQEGTEEASTNDGISAGEVTLVAKEIIRLYNEEKVAFEDITLLVSSRTRNDTIFQVFNQYGIPLVADGGQENYLKSVEVMVMLDTLRSINNPLNDYALVALMRSPMFSFDEDQLARISLQSSSQDQPQAFYDKLSNSLRGQGEHPGLIGQELMTKLVDFDRTLRDWRQFAKLHSLYELIWKIFNDRFYFDFVASQPKAEQAQANLYALAIRADQFEQSGYKGLSRFIGMIDKVLETQNDLADVEVERPKHAVNLMTIHKSKGLEFHYVFILNFDKRFAMADLQAPIILNRDEGIGIKYVANVKELLRDEKLASLKVTMETLPYQLNKQQLRLATLSEQMRLLYVAMTRAEKKVYLVGKASKEKIQAKTADNSSEGRLALASRERLLSFQDWLLAITATFSKEDLFIDVRFVDDSDLTAEAVGQLRSSGLLQADDLKDNRQTEDIARALDMLDKVSKLNASYQAAIELPTVRTPSQLKTLYEPLMDTDGVDIIDQPYHRPKSFELPDFSKKKAVEPSQVGSSLHELMQRIPMSDQITAGDIEQALQLVSADAEVKARLDIKKVTAFFATTELGKLLQEHHQRLYREAPFAILKKDSLSQEQYVVRGIIDGYLLFEDRIVLFDYKTDRYQQSAELKQRYQQQMDLYAEALSQSYGIARVEKYLVLMGGSQLEVVRLDE >NC_011134.1|WP_041785439.1|866619_869841_+|ATP-dependent-nuclease-subunit-B 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>NC_011134.1|WP_165626701.1|865008_866409_+|glycosyltransferase MIVQLLFLVLKYSQYLFLAFLIAYASFLLLSLIVGAIHLYERRQQVPLGGDVSLPPVSILVPAYNEELTIIETVESLLMLDYDCYEIIVIDDGSTDHTAKLLKEQFHLEAVTCSINQRIPTRPLKAVSQKQLKHVKLTLLEKANGGKGDSLNFGINAAQYDYFLCMDADSMLQEDSLKRIAKTVAKDPSVIAVGGMVKVSQGVALAAGRIVDYHLPRQLISCAQAIEYDCAFFGARVLLDQAAGNLIISGAFGLFKKELAIAVDGYDTGTLGEDMELVMKLHFFCQNNKIPYRIGYETDAICWSQAPSRLKDLCQQRRRWFLGLYQCLKKYLQFFVSGRFKVTVLISYVLYLLFELLSPFIEAFGVTIIVLSLLCHQLNTTFFVSLMLLYICYCVLIALTSFLNRVYSQNNSSITFFDMVWVIYAAIYQCLVLHTVLTLVKVSSFIGYQRKKNAWGQITRDKHKVA >NC_011134.1|WP_012515459.1|862726_864868_+|hypothetical-protein 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MKRILLYVHFNKYHKVSDHVYYQLEQMRALFSKIVFISNSDIHQEDLEQLEQRHLMDQFIQRHNKGYDFAAWHDGMKALGCEHLVDFDSITIMNDTCFGPLWDMEPYYLKYEADEAVDFWGMTNNRATKVFKEHIQSYFISFKKSLVHSKEFRQFWENIVELTDVQDVIHNYETRITTVFVEAGFRYKTVFDTTKEDSSSMLHADFSYYNPTAILKHHVPFIKVKAIDANQHIAPYLLDFIDQKTSYPASLIVDHMSQVHLPDAKYLLAHKYLSNQPISIAPSKKIAVHLHVFYADLLSEFLEAFSHFHFDYDLLITTDSKAKKAEIKEILRESGASADILVTGNIGRDVLPMLTLKERLSQYDYIGHFHTKKSKEADFWAGQSWRTELIDMMVKPADQILTALAADAIGIVIADIPSFFRFNKIVDAWNEHLIAPEMNQLWQAMGLTKRIDFQTMDTFVMSYGTFVWFKYDALKPLFDLGLNEADIPAEPLPQNSILHAIERLLIYIAWDRHYDFRISRNEKLLTPFIDNKLLNLREGSVPHTYVDFDYMGGIKGALKYIVIGPAKAIRYIIKRLLKRRV >NC_011134.1|WP_012515476.1|888550_889240_+|glycosyltransferase-family-2-protein MKKDLLVMIPAYNEEESIEKVVENIKRHFPQYDYVIINDGSSDRTSEICHHNHYNIIDLPENLGLSGAIQTGFKYAFKKGYAKALQFDADGQHLPEYIEALSDSIKAGADCVIGSRFVSAEKNRSLRMMGNSLISFFIKLTTGKRITDPTSGMRMFNQELIRIFATNINYTPEPDTISYLIRQGYRVSEVQVQMNDRLAGQSYLTLSRSIKYMVHMFISIILIQNFRKR >NC_011134.1|WP_012515477.1|889244_889601_+|DUF2304-domain-containing-protein MFIGLQLILIIVALLTAMFILDSIRRSKILIEDSFFWLFFSLIVLLLSLFPNAAVYFSRQLGFESPANFVFLSIIFLLIINQFFITQKLSRTEIKLKKMIQYLALNEKEKQEEDENQQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011134_4 | 1366029-1367186 | TypeII |
II-A,II-B
Consensus repeat of NC_011134_4
|
17 spacers
spacers of NC_011134_4
>4.1|1366065|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT TGTTCAAACCATTCATTACACGTCTCATCT >4.2|1366131|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT ATCGGGCACACTTACTTGAATGTGAAACGA >4.3|1366197|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT CCGTAAACACGTCATAGGCTTGGTACTGAC >4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT TTGAGGGATTGTATGAGCAAATCCAATGAT >4.5|1366329|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT TATAAATTGCAGCAGTTAGCATTTTTAAAT >4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT TTACCATCATCTTTCCACTGTCTGATAGCT >4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT TTGAGGGATTGTATGAGCAAATCCAATGAT >4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTA >4.9|1366593|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTG >4.10|1366659|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACA >4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTA >4.12|1366791|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTG >4.13|1366857|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACA >4.14|1366923|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATGTAGAGTTAGCTTATTTCGACAATGA >4.15|1366989|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCATCAAGGTTTACAGAGATGTCATCAAGT >4.16|1367055|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGATAAGTAGCAGTATACAAGATGATTTA >4.17|1367121|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGAGATAGGCAACGCTGGGAAAGCTACCA |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011134_4
The CRISPR arrays of NC_011134_4 >merge|NC_011134|4|1366029-1367186|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATTAAAACCATTCAAAACAGCATAACTCTAAAACTGTTCAAACCATTCATTACACGTCTCATCTGTTTTGGAACCATTCAAAACAGCATAACTCTAAAACATCGGGCACACTTACTTGAATGTGAAACGAGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACCCGTAAACACGTCATAGGCTTGGTACTGACGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACTTGAGGGATTGTATGAGCAAATCCAATGATGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACTATAAATTGCAGCAGTTAGCATTTTTAAATGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACTTACCATCATCTTTCCACTGTCTGATAGCTGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACTTGAGGGATTGTATGAGCAAATCCAATGATGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACAATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTAGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACCTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTGGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACAGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACAATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTAGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACCTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTGGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACAGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACTAATGTAGAGTTAGCTTATTTCGACAATGAGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACTCATCAAGGTTTACAGAGATGTCATCAAGTGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACGAGATAAGTAGCAGTATACAAGATGATTTAGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAACACGAGATAGGCAACGCTGGGAAAGCTACCAGTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC >NC_011134|4|4|1366029-1367186|CRISPRCasFinder ATATTAAAACCATTCAAAACAGCATAACTCTAAAAC TGTTCAAACCATTCATTACACGTCTCATCT GTTTTGGAACCATTCAAAACAGCATAACTCTAAAAC ATCGGGCACACTTACTTGAATGTGAAACGA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC CCGTAAACACGTCATAGGCTTGGTACTGAC GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TTGAGGGATTGTATGAGCAAATCCAATGAT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TATAAATTGCAGCAGTTAGCATTTTTAAAT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TTACCATCATCTTTCCACTGTCTGATAGCT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TTGAGGGATTGTATGAGCAAATCCAATGAT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC AATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC CTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTG GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC ATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC AATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC CTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTG GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC ATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TAATGTAGAGTTAGCTTATTTCGACAATGA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TCATCAAGGTTTACAGAGATGTCATCAAGT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC GAGATAAGTAGCAGTATACAAGATGATTTA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC ACGAGATAGGCAACGCTGGGAAAGCTACCA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC >NC_011134|4|2|1366029-1367186|CRT ATATTAAAACCATTCAAAACAGCATAACTCTAAAAC TGTTCAAACCATTCATTACACGTCTCATCT GTTTTGGAACCATTCAAAACAGCATAACTCTAAAAC ATCGGGCACACTTACTTGAATGTGAAACGA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC CCGTAAACACGTCATAGGCTTGGTACTGAC GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TTGAGGGATTGTATGAGCAAATCCAATGAT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TATAAATTGCAGCAGTTAGCATTTTTAAAT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TTACCATCATCTTTCCACTGTCTGATAGCT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TTGAGGGATTGTATGAGCAAATCCAATGAT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC AATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC CTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTG GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC ATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC AATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC CTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTG GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC ATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TAATGTAGAGTTAGCTTATTTCGACAATGA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TCATCAAGGTTTACAGAGATGTCATCAAGT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC GAGATAAGTAGCAGTATACAAGATGATTTA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC ACGAGATAGGCAACGCTGGGAAAGCTACCA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC >NC_011134|4|2|1366491-1367186|PILER-CR GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC AATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC CTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTG GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC ATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC AATTTGCACTTTTAATTTGATAATATGTTA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC CTGGTGGCAGGTAAAGTGTGTTGTTTTTTG GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC ATTGCGTAAAGGGTAGCTGTAGCCTCTACA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TAATGTAGAGTTAGCTTATTTCGACAATGA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC TCATCAAGGTTTACAGAGATGTCATCAAGT GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC GAGATAAGTAGCAGTATACAAGATGATTTA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC ACGAGATAGGCAACGCTGGGAAAGCTACCA GTTTTGGAACCATTCAATACAGCATAACTCTAAAAC
>NC_011134.1|WP_012515927.1|1365456_1365666_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSSLSRKHEQIHHQRKLAKPSQSQLAELLETNKQTLSMTENGQRKAPIKKLIKLHNIFGVTANELLLKY >NC_011134.1|WP_012515926.1|1364629_1365100_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MAYSKEIIAYLVRSGVAKELARDISQDVLLKMLESDLALPPEKIRAWMYRVAVRKYIDQYRRDKAYLDILQRDFFHQERVIEFDQPNYEPLYTAVNELPEKYRWVLSLYYFQDLSVKEMASLLHWSVSSVKVNLMRGRRCLKEKLKKAGYTYDDFN >NC_011134.1|WP_012515925.1|1363557_1364646_-|anti-sigma-factor-C-terminal-domain-containing-protein MTISTDFEAIAKRHKRRLTLKYVVLSAGLALVALVLGYMGLNRLTSMNGQYLMAYYNNRIQIAYPNIDVNSFFYNANSQFTGELHSERTKDIAGISVPFEPYRAPYSLVLRRTDSSNEYLVSGDDGRSTYTRGTHYKMPRFFNTKAKVTESNHDKPTQDLDFIADMSGQAVEVAITFDKPYLLSDIVKLVPDQLKLNWIWIGTESSYDTSGLFPANLYGFKPDWKANMTYKEQKQLDEKINNILKKDNEADLSKLNAAYDKPVTPTVALQNSYDTFRHYLQEAVDNHWINSTYGDANGTHLSEQEDVALFLKNNRNVKTAKFAGIILTGKAEQFASLKTADWIYASNIGQSVTIQPYHQLTK >NC_011134.1|WP_012515924.1|1360121_1363268_+|hypothetical-protein MKLKKIIALACVGILTLHQLSPAIVYATTDASDGTAATVNTGDTAAPSAEAKPSQLMTDTQALFTDHSFSKLASNVTQEKIDALKQKATASTEPEKEQILGLLDKAASLLQQFTLQGLGNGVFAQLYFYADGSYTASLVTKKGQPHSYFSTNYATVTILNDKKETVYSKEYVGNVSQVAQTEELELKEGYYLIINKQEPNRFYTNHNDALKQNNTNPYTYVVRDGQLERIDDSNRTLRFLGLGNAEYATLRVDYNASTLTLKTKQTKPHVYFSGSYEKLEVLDTENQVIYTKDFIGTQVLEAKTETIPFKVGYKIRLTGSEHHTRVKFYDDYAVEAPLTLSKNQATLKLLDHSLELMRSKTGSELESEVLTLFTDESTSKLASGVTQEKIDALRKKATDSTEPEKEQILSLLDKAASLLQQFTLQGLGNGIFAQLYFYADGSYTASLVTKKGQPHSYIANNYATLTILNEKKETVYAKEYVGNVSQTAKTESLTLKEGYYLVITKQEPNRFYTNHNDALKQNNTNPYTYVVRNGQLERIDEKNRTLHFLGLGNAEYATLKVDYNASTLTLKTKKAKPHVYFSGTYEKLEVLDLKDKVVYTQDFIGNQVLTAKTETIPFKVGYKIRLTGSEHHTRVKAYDEENKAVSLSLPKNKAEIRITKGGLASVFALEAKATNTLVQAVEKRLTKEKIEDFKKKDNKHKAFIDWLLKDNEAMQLYLGAGYAHSAAQGGMSSYQFKNTYNLTNELEALELWFKIWDKYKASHQGIQLKMAIAVALEFTKPVGAWYNESQKIDPLERFATFAEAEQGNVLFEDFYSLTVEQIRNVVNAKITDEDMKWLRQYVETNKPAMINRNDITKGYSLISYVGTNPETGVSVHSSGFYGPNPTIKEVIKYGGVCGAMSKLSSVLAQAYGVPAFPIGQPGHCAYIYLNADHTYQLGYDVSGWTGCGNYNTTLPYVQIHNVYSLNIDAYNASEYERYKAEAATDEDTKLNHLDAALKAEPLNYKAWNDKLALIASDQTAYQSTLNDMKSALKDYPVIINNLEKDTKQ >NC_011134.1|WP_012515923.1|1357976_1359173_-|elongation-factor-Tu MAKEKYDRSKPHVNIGTIGHVDHGKTTLTAAITTVLARRLPSSVNQPKDYASIDAAPEERERGITINTAHVEYETATRHYAHIDAPGHADYVKNMITGAAQMDGAILVVASTDGPMPQTREHILLSRQVGVKHLIVFMNKVDLVDDEELLELVEMEIRDLLSEYDFPGDDLPVIQGSALKALEGDSKYEDIIMELMDTVDSYIPEPERDTDKPLLLPVEDVFSITGRGTVASGRIDRGTVRVNDEIEIVGIRDEIKKAVVTGVEMFRKQLDEGLAGDNVGVLLRGVQRDEIERGQVIAKPGSINPHTKFKGEVYILTKEEGGRHTPFFNNYRPQFYFRTTDVTGSIELPAGTEMVMPGDNVTIDVELIHPIAVEQGTTFSIREGGRTVGSGIVSEIEA >NC_011134.1|WP_012515922.1|1356952_1357711_-|triose-phosphate-isomerase MSRKPIIAGNWKMNKNPQEAKAFVEAVVSKLPSNDLVDVAVAAPAVDLVTTIEAAKDSVLKVAAQNCYFENSGAYTGETSPKVLADMGADYVVIGHSERRDYFHETDEDINKKAKAIFANGLTPIICCGESLETYEAGQAVAFVGAQVSAALEGLSAEQVASLVLAYEPIWAIGTGKSATQEDAQSMCKAVRDVVAADFGQEVADKVRVQYGGSVKPENIKEYMACPDVDGALVGGASLEADSFLALLDFVN >NC_011134.1|WP_012515921.1|1355404_1356640_+|aminoacyltransferase MALDIIDKETFGSFCSQVEYKSFIQSIEMAELLQKRGYQTQYLAISDQKDIKVAAILYSVAMAGGLRMEINSGPVVADTTYTTAFYKALQDYAKQQGALELVIKPYDTYQTFTGDGHPNDDEKPELIKALTKLNFTHDGLLTGYPNGEGDWHYVKELSGLTSANLIKSFSKKGKALLKKAKTFGIKLHKLSRDELTQFKAITAATSSRRDYTDKSLSYYQDFYDSFGDSCEFMVATLNFDDYLANLRHSQDRLKQGMAKLEADLAKNPRSEKKQNRLRELSSQFDTFQVRVAEAQELIIKYGKKDVPLAGSLFVYTPQEAVYLFSGSYPEFNRFYAPALLQEHVMLRAIEKGISCYNFLGIMGEFDGSDGVLRFKQNFNGYITRKMGTFRYYPKPFKYKAIKTIKALISRS >NC_011134.1|WP_012515920.1|1354190_1355405_+|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MYTYKIGISAKEHDQFVLSHPQVNLLQSAHWAQVKDNWEHELIGFYQDDKQVAAAACLIKRLPLGMTMIYIPRGPIMDYSDFELVNFVMTSLKAYGKSKRALLIKCDPSLFISQALIGEERKDNDFTLSTIDFLKTIGVEWAGRTKELEQTIQPRFQANIYAKDFKLQSLSKKARQSIRTAQNKGVEIIIGSTELLEDFSALMKKTEERKHISLRGISYYDKLMTTYANQAYITMARLNLPKQKTLIQQQLEEVLSNQQVFTQNSKPGKVAENQNTIKRLERELAFLDKEIQAGKSIVPLAATLTLIYGRTSENLYAGMDNDFRQYQAALLTWYHTAEEAFKRGCQWHNLGGVENQLDGGLFQFKARLNPAIEEFAGEFSIPVGPISKVAMIAYNLRKKLRSNP >NC_011134.1|WP_012515919.1|1353381_1354191_+|sugar-phosphatase MSIKLVAIDIDGTLLTDDRRVTNDVFDAIQEAKAQGVHIVIATGRPIAGVISLLEQLQLNQKGDHVITFNGGLIQDTATGEEVVKELMTYDDYLDIEYLSRRLGVHMHAITTEGIYTANRNIGKYTVREARLVDMPVFYRTPEEMADKEIIKMMMIDEPDLLDEAIKQIPQAFYDTYNIVKSTPFYLELTPKTVSKGTAISHLAKKLGIDMSQTMAIGDAENDRAMLEAVANPVVMENGAPELKKLAKYITKSNNDSGVAHAIRKWVLN >NC_011134.1|WP_012515917.1|1351868_1353170_+|HD-domain-containing-protein MNEKVFRDPVHNYIHVNHQLIYELINTKEFQRLRRIKQVPTTAFTFHGAEHSRFSHCLGVYEIARRVTEIFEEKYADLWHKEEGLLTMTAALLHDIGHGAYSHTFETLFDTDHEAVTQDIITSPETEINAILTRYSPDFPDKVASVINHTYPNKQVVQLISSQIDCDRMDYLLRDSYFSAANYGQFDLMRILRVIRPVKDGIVFDLSGMHAVEDYIVSRFQMYMQVYFHPASRAVELILQNLLKRAKALYPSQQDYFQKTAPGLIPFFEKSFTLADYLCLDDGVLNTYFQQWINSEDHILSDLSSRFINRKILKSVTFDQESQQDLERLRQLVESVGFDPNYYTGIHVNFDLPYDIYRPELENPRTQIEMIQKDGSRAELSQLSAIVKALTGTSYGDRRFYFPKEMLELDDLFTSDKEAFISYISNGHFHFTS >NC_011134.1|WP_037581793.1|1367461_1368139_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MMINFSLLDEPLKLEQMTILTVKDVRVFSSLIRNFYQYGESGDLKLFDHRLKGLKETELMIITDILEYDINSPTILKMVHADLEECFNEQPEVKSMLEKLAATITELIAFECLENELDLEYDKITILELIKALGVKVETQSDTIFEKCLEILQVFKYLTKKKLLVFVNSGSYFTREEFEQLKEYVELSNQTVLFLEPRPLYDFPQYILDEDYFLVTQNKLEGIEH >NC_011134.1|WP_021320962.1|1368128_1368473_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSYRYMRMILMFDMPVDTVEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSVYSKLLLNNTANNAMIRRLREQNPQKGNITLLTVTEKQFARMIYLHGEKNASIANTDKRLVFLGEAYSGDD >NC_011134.1|WP_012515930.1|1368469_1369339_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHFIFKDAYKTELIHLSEIDILLLETTDIVLSTMLIKRLVDNNSLVIFCDDKRLPTAMLMPYYARHDSSLQLSRQMAWSEELKADVWTQIIAQKMLNQSCYLGQCSYFEKSQAIMNLYHDLKSFDPSNREGHSARIYFNALFGNQFSREQDCDINAGLDYGYTLLLSIFAREVVICGCMTQFGLKHSNQFNQFNFASDLMEPFRPIIDRIVYDNRHKTFVQIKRQLLSIFSETYPYNGKEMYLSNIVSDYTKKVIKALNNEGEGVPEFRI >NC_011134.1|WP_012515931.1|1369338_1373385_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKKPYTIALDIGTNSVGWVVVTDDYRVPTKKMKVLGNTERKTIKKNLIGALLFDSGDTAEGTRLKRTARRRYTRRKNRLRYLKEIFTEEMAKVDDGFFQRLEDSFYVLEDKEGNKHPIFANLADEVAYHKKYPTIYHLRKELVDNPQKADLRLIYLAVAHIIKFRGHFLIEGTLSSKNNNLQKSFDHLVDTYNLLFEEQRLLTEGINAKELLSAALSKSKRLENLISLIPGQKKTGIFGNIIALSLGLTPNFKANFGLSKDVKLQLAKDTYADDLDSLLAQIGDQYADLFLAAKNLSDAILLSDILTESDEITRAPLSASMVKRYREHHKDLVTLKTLIKDQLPEKYQEIFLDKTKNGYAGYIEGQVSQEEFYKYLKPILARLDGSEPLLLKIDREDFLRKQRTFDNGSIPHQIHLEELHAILRRQEVFYPFLKDNRKKIESLLTFRIPYYVGPLARGHSRFAWVKRKFDGAIRPWNFEEIVDEEASAQIFIEKMTKNDLYLPNEKVLPKHSLLYETFTVYNELTKVKYATEGMTRPQFLSADQKQAIVDLLFKTNRKVTVKQLKENYFKKIECWDSVEITGVEDSFNASLGTYHDLLKIIQDKDFLDNPDNQKIIEDIILTLTLFEDKKMISKRLDQYAHLFDKVVLNKLERHHYTGWGRLSGKLINGIRDKQSGKTILDFLKADGFANRNFMQLIHDSELSFIDEIAKAQVIGKTEYSKDLVGNLAGSPAIKKGISQTIKIVDELVKIMGYLPQQIVIEMARENQTTAQGIKNARQRMRKLEETAKKLGSNILKEHPVDNSQLQNDKRYLYYLQNGKDMYTGDDLDIDYLSSYDIDHIIPQSFIKNNSIDNKVLTSQGANRGKLDNVPSEAIVRKMKGYWQSLLRAGAISKQKFDNLTKAERGGLTQVDKAGFIQRQLVETRQITKHVAQILDSRFNTEFDDHNKRIRKVHIITLKSKLVSDFRKEFGLYKIRDINHYHHAHDAYLNAVVAKAILGKYPQLAPEFVYGDYPKYNSFKERQKATQKMLFYSNILKFFKDQESLHVNSDGEEIWNANKHLPIIKNVLSIPQVNIVKKTEVQTGGFYKESILSKGNSDKLIPRKNNWDTRKYGGFDSPTVAYSVLVIAKMEKGKAKVLKPVKEMVGITIMERTAFEENPVVFLEARGYREIQEHLIIKLPKYSLFELENGRRRLLASASELQKGNELFLPVDYMTFLYLAAHYHELTGSSEDVLRKKYFVDRHLHYFDDIIQMINDFAERHILASSNLEKINHTYHNNSDLPVNERAENIINVFTFVALGAPAAFKFFDATIDRKRYTSTKEVLNATLIHQSVTGLYETRIDLSQLGEN >NC_011134.1|WP_024273206.1|1373898_1374222_-|hypothetical-protein MKTLDRQKQEILREIYRLGYDTLRFSIFSKERPGEWEVVIEYDDTSGVYLVYGTMDRSSYHGKTAYRKFNAAKEGFMTFLEDIVMINKYYVEEGMPVNYDSPLWSNN >NC_011134.1|WP_041785907.1|1374222_1374615_-|glycohydrolase-toxin-TNT-related-protein MTPAFLKTGDLLDRYGESGGPFTSPIINHKVISFNKRGLPYPEGYQNYHQYRILQDITIENVKFDYDNLAYKDKFILDKLMKDYKFSLDDIATPQKGMIDLVFGSGGGIQIKLGTSVSWYEKLGLIKEIK >NC_011134.1|WP_041785605.1|1374914_1375661_-|DUF1911-domain-containing-protein MKTRDKLNTLENYQKVIMFHQCVIESDLEKIEDLVKDERNGIQKSKIDNQQVIHNTKRWMARDLFKIFKATYSAGYPISEVKKAFLDYLDVKCQVLDGQVAYLNDLDIISIAILLDIDTETIAPFIDNIGQVGYDDFLIDFLIRWYRPEWKQHDDISFKRPYGHAQKIIQAPDKEQALGFLRNYIFSKWYAGSNDAPWYNSHKAKNPAFHVGYWSFESGAMAKILELDDSSLKDQQYYPYDLVHWKNV >NC_011134.1|WP_012515936.1|1376965_1377388_-|hypothetical-protein MARSQLEWEDVSQYEEVKGYGQRVWKHQGKYYFVAEEGGIAVQRVVYELPYDLFELLESGERSLGDVHSKLQDGNWPPTEEEKKKVKKEFLTKHPSSLINVPQNRELFTQEELEKLIPIAEELWIKGEGQLPDDYISPLK >NC_011134.1|WP_012515937.1|1377577_1377982_-|hypothetical-protein MKELKEELMKLLLKIGVTSLNESVLFEEKRPRVYFPEGQTVFLENNIYYVIGVEHGKVNSERTFGEKEDVLYFLLESYVDTIAGKYAWEKVSGDFEQYGKLLPEEQIRVFSMIAPKYGQRRKQELEAQQESDDV >NC_011134.1|WP_111721713.1|1377990_1379199_-|TNT-domain-containing-protein MAAADRVSQGWVDLALSLVTIAVGVAAIVMTAGAATPLVVGAFVVGSGAVAYGASNLYEAGHNIYLGSVGDGLTVATNPLRDTLFMGNDRLYHQIGGLFTTASAALIPIGQTKSIAKGLTEFTIGEVGGFIGGQASYHGTKLLGGSEQDAQRATLVGNILGGIAASSAARRFSLNEPIAARVTKPTYNHQQLLKNLESSKLARESSRFKNYVAREKFTTTLAGMSSEDSQRYIQWYKYAKAGLGPVDRAKFQDWKFTPDIDLYLSNKHIYDNLDYFNQLDGSVIYPGTPESALGRIDGSVHNQGFLNGEYVDDIIDPGTLIDRYGNNNTGRYFSPAGASFGERALPPYMEKMPKKTYITIKPIPNKKGPVAPWFDQPGMGTQYFTDMEGGYLEKYGYLVEID |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011134_5 | 1669119-1669283 | Orphan |
I-C
Consensus repeat of NC_011134_5
|
2 spacers
spacers of NC_011134_5
>5.1|1669152|33|NC_011134|CRISPRCasFinder CTTTAAAGGTGGTTGGAACTGTGGGTTTAAAAA >5.2|1669218|33|NC_011134|CRISPRCasFinder GACTGGGCGGAAATCCCAGAGATTACTTTTGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011134_5
The CRISPR arrays of NC_011134_5 >merge|NC_011134|5|1669119-1669283|CRISPRCasFinder AATGTCAATCCACGCTCCCATGAAGGGCGAGACCTTTAAAGGTGGTTGGAACTGTGGGTTTAAAAAAATGTCAATCCACGCTCCCATGAAGGGCGAGACGACTGGGCGGAAATCCCAGAGATTACTTTTGACGATTTCAATCCACGCTCCCATAAAGAGAGCGAC >NC_011134|5|5|1669119-1669283|CRISPRCasFinder AATGTCAATCCACGCTCCCATGAAGGGCGAGAC CTTTAAAGGTGGTTGGAACTGTGGGTTTAAAAA AATGTCAATCCACGCTCCCATGAAGGGCGAGAC GACTGGGCGGAAATCCCAGAGATTACTTTTGAC GATTTCAATCCACGCTCCCATAAAGAGAGCGAC
>NC_011134.1|WP_012516208.1|1667930_1668929_+|iron-ABC-transporter-permease MTATKRHVPLFLGLSAGLVCLMIISLSIGDSSMSPLEVIKVLFGKSTAAMTLIITNIRLPRILAACIGGGSLALSGLLLQSLTRNPLADSGILGINAGAGMAITLVISYSTSDSLISRQWLSLITIFGAMATIVLVYLLSLSHGRINPIRLIVTGVGVSSMLSSLMIAFVGNVNRYKVDYVIHWLSGQLTGDDWSKLSIVAPLLGITWLLAFSQAYKLNIMALNDEASMALGFKLHQYRTIVLALSAILAALSVILVGNITFIGLIAGHTSKRLVGADHRLSLPVSLLIGMILLLLADTIGRVYLVGSNIPTGILVSILGAAYFLYLMVKMN >NC_011134.1|WP_037584326.1|1666908_1667934_+|iron-ABC-transporter-permease MTAQHHTKPKLTKAAPPWLILTFISLTLVLAIYCSLRFGAVSLSHQELFHILLGKHGLGQKASIIWDIRLPRLILAALVGAALAVSGAIMQGITRNPIAEPGLLGINSGAGLALVIGYAFFPHLHYSIIILLSLLGSLLATLLILSLAYQTRKGYTQMRLILAGAMISMLLSAIGQGITTYCHLANAIIGWQAGGLIGVNWQMVSYVAPLIICGLVLSYLLAYHLTILSLSQEQAKALGQRTFLISLIFIGLVLLLSSAAVAVAGSISFVGLIIPHAITLVTAKDYRWILPLATLLGASFMLWVDFACRNINPPYETPLSALISFIGLPCFLWLVRKGGRF >NC_011134.1|WP_012516206.1|1665959_1666898_+|iron-hydroxamate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLLLILTVFVTAFTLVACSSQSKQQESTSKASLSHKPKIAGVTYYGDIPAKPKRVVSLAATYTGYLAKLDLHLVGVTSYDKKNPVLTKSITQAKQVAATDLEAITALEPDLIVVGSTEENIDQLAKIAPLISIEYRKRDYLQVFSDFGRIFNKEKETNQWLADWKQKTSDYEKEVKQATGSAATFTIMGLYEKEIYLFGKDWGRGGEIIHQAFHYDAPEKVTKEVFKQGYLSLSQEVLPDYIGDYVVVAAEDDQTGSALYESDLWQQIPAVTNNHVIKVNANVFYFTDPLSLEHQLEVLKKAILSNGANH >NC_011134.1|WP_012516205.1|1665155_1665935_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSTISAERISAGYDQSLIISDLSVTIPEGKVTTIIGANGCGKSTLLKTLARLLPLKAGQVLLDGQAIARLATKDVARTLAVLPQLQEATTATVYELVSYGRYPHQSYLGRLSQADKDKICWAMEVTSMAPYAHQTVDALSGGQRQRAWIAMALAQDTDIIFLDEPTTYLDMNHQLDILELLKELNQVSGKTIVMVLHDLNLSARYSDHLIAMKNGDIKYSGEVNQVMTPEMIQDIFQVKAQLVTDPLYHCPTLLTYQLI >NC_011134.1|WP_012516204.1|1663450_1664896_+|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--L--lysine-ligase MITIEHLLTILKKDHNFREVLDQDGYHFNYSGLQFDSLSYDSRQADEQTLFFAKGATFKADFLKQAIAKGLKIYVSEIDYQVGIPVILVNNIKHAMSLAAMAFYDYPQHKLKLLAFTGTKGKTTAAYFAYHMLKESHKPALLSTMNTTLDGKSFFKSQLTTPESLDLFAMMAQCVANGMTHLVMEVSSQAYLVGRVYGLIFDVGVFLNISPDHIGPIEHPSFEDYFYHKRLLMENSRAVVVNSGMEHFNILAEQVADKPHDFYGKGACNRLLQRQAFSFQAAGKLAGDYAIQLIGSFNQENAMAAGLACLRLGASLEDIRLGIAKTRVPGRMEVLTMTNQAKIVVDYAHNGDSLEKLLSVVEEHQKGQIYLILGAPGNKGESRRADFGQVINQHPNVRIILTADDPNFEDPQLISEEIASYIHREVDIIIDRKEAIKAGMERCQNEQDALIIAGKGADAYQIVKGQKTAYAGDLAIAKSYL >NC_011134.1|WP_012516203.1|1661733_1663365_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MSTEKKQLTQEQLMVQGAAWSTAGNFISRLLGVLYIIPWYIWMGQYAIQANALFNMGYNVYAYFLLISTTGLNVAIAKQVAKYNSMGQQEHSYQLIRSTLKVMLVLGLVFSVLMYLGSPLFARLSGGDETLVPIMHSLSLAVFVFPVMSVIRGIFQGYKEIKPYALSQIAEQLVRVIWMLLTTFFIMKMGSKDYIAAVTQSTFAAFIGMIASMAVLFYYFWTQGLLKAIFTKTEHAIPIDIKGLLIETLKESIPFIITGSAIQAFQLIDQWTFVNTMTLFTNYTRSQLWVLFGYFNANPAKITMVLIAVAASIGSVGIALLTENYVKKDMRAAARLIINNIEMLLMFLLPALTGAIILARPLYTVFYGSSEEQAVRLFVAVLCLTLLMALYTLFSPMLQALFENRKAIYYFAYGVFVKLVLQVPLIYLFHAYGPLLATTLGLLVPIYLMYRRLHQVTQFNRKLLHKRILLTVIETALMGLIVLLANWLLGYLFKPTGRLTSLLYLVIIGGLGMGVYAYMTLVTRQLDKLIGSRAARYRQKLGL >NC_011134.1|WP_012516202.1|1660954_1661584_-|uracil-phosphoribosyltransferase MGKCQVISHPLIQHKLSILRRQDTSTKDFRELVNEIAMLMGYEVSRDLPLEDVEIQTPVAKTVQKQLAGKKLAIVPILRAGIGMVDGFLSLVPAAKVGHIGMYRNEETLEPVEYLVKLPEDIDQRQIFIVDPMLATGGSAILAVDSLKKRGAANIKFVCLVAAPEGVKKLQEAHPDVDIYTAALDERLNDHGYIVPGLGDAGDRLFGTK >NC_011134.1|WP_012677455.1|1660132_1660723_-|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MIPVVIEQTSRGERSYDIYSRLLKDRIIMLTGPVEDNMANSVIAQLLFLDAQDNTKDIYLYVNTPGGSVSAGLAIVDTMNFIKADVQTIVMGMAASMGTVIASSGAKGKRFMLPNAEYMIHQPMGGTGGGTQQTDMAIAAEHLLKTRHRLEKILAQNAGKTIKQIHKDAERDYWMSAEETLAYGFIDEIMENNELA >NC_011134.1|WP_012516200.1|1659581_1660028_-|YlbF-family-regulator MLIINEELFAIEKAIEQLVQDIRTSSQYQAYALAKKAFEADLALQTELALFEELKQDYELRQDLLKSCPDARALRCQLLHQKRQLDLHPLVADLRLAQVDLQEVLATISTAIAEAVSEDILVDTGLPLATNRPRHELGPYQNIKEKST >NC_011134.1|WP_012516199.1|1659296_1659581_-|YlbG-family-protein MFQKQQRIGLVIYLYYNRDARKVMKYGDLYYHSRRSRYLVIYINKEDMEEKLKDISRLTFVKEVKVSAFDDIDCDFVGNLHREPLEPQALPEQG >NC_011134.1|WP_012516210.1|1669665_1670319_-|DUF1803-domain-containing-protein MIAIFNPDKLTRQPFFQDLVHYLNQHDDVTLRHIKQAFSHVKGIDKALEAYIQAGYICRKNRRYYLCLPLLDDLQQVTLEDLIFVDRASDLYEALLALVFETVLPNQTNQVLIKEKTTIDRDKLTLANYFYRLKRGEALSDEQLRLYALLGDVNQDYALKYMTSFLLKFARKEIVMQKRTDIFVNALELLGYIEKVEATKYCLKLAFDKEQLIFYAD >NC_011134.1|WP_012516211.1|1670385_1671321_-|manganese-dependent-inorganic-pyrophosphatase MSKLLVFGHQNPDTDAIASSYAFDYLAKKAFDLDTEVVALGDPNEETAFALDYFGVSAPRVVTSAKAEGASHVILTDHNEFPQSISDIREVEVYGIVDHHRVANFETANPLYMRVEPVGSASSIVYRLFKENRVDVPKDIAGLLLSGLISDTLLLKSPTTHASDHRVAVELAELAGVKLEEYGMAMLKAGTNLASKSEAELIDIDAKTFELNGNAVRVAQVNTVDIAEVLERKEAIEAAIKEVMASEGYSDFVLMITDIVNSNSEILALGANMDKVETAFDFKLEDNHAFLAGAVSRKKQVVPQLTESFGA >NC_011134.1|WP_012516212.1|1671805_1672597_-|pyruvate-formate-lyase-activating-protein MVEVDYGQVTGMVHSTESFGSVDGPGIRFIIFLQGCKMRCQYCHNPDTWAMETNQSQRRTVNDVLKEALQYRHFWGKKGGITVSGGEAMLQMDFITALFTEAKKLGIHTTLDTCGFAYRPTPEYHELLETLLAVTDLILLDLKEIDEEQHKLVTRQPNKNILQFARYLSDRQVPVWIRHVLVPGLTDIDDHLVRLDAFVKTLKNVDKFEVLPYHTMGEFKWRELGIPYQLEGVKPPTKERVENAKKLLHTESYTEYMNRIHQS >NC_011134.1|WP_012516213.1|1672673_1674008_-|HlyC/CorC-family-transporter 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---|---|---|---|---|---|---|---|
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1. spacer 4.1|1366065|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1865617-1865646, mismatch: 1, identity: 0.967
tgttcaaaccattcattacacgtctcatct CRISPR spacer tgttcaacccattcattacacgtctcatct Protospacer ******* **********************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_011134_1 | 1.2|581479|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581479-581513 | 35 | MK448845 | Streptococcus phage Javan118, complete genome | 3834-3868 | 0 | 1.0 |
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NC_011134_1 | 1.3|581546|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581546-581579 | 34 | MK448870 | Streptococcus phage Javan192, complete genome | 9540-9573 | 0 | 1.0 |
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NC_011134_1 | 1.4|581612|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581612-581646 | 35 | MK448870 | Streptococcus phage Javan192, complete genome | 25721-25755 | 0 | 1.0 |
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NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | MK448794 | Streptococcus phage Javan525, complete genome | 1647-1680 | 0 | 1.0 |
NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | MK448953 | Streptococcus phage Javan474, complete genome | 1648-1681 | 0 | 1.0 |
NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | NC_028700 | Streptococcus phage T12, complete genome | 1663-1696 | 0 | 1.0 |
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NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | MK448854 | Streptococcus phage Javan146, complete genome | 1575-1608 | 0 | 1.0 |
NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | MK448765 | Streptococcus phage Javan459, complete genome | 1647-1680 | 0 | 1.0 |
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NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | MK448683 | Streptococcus phage Javan149, complete genome | 1580-1613 | 0 | 1.0 |
NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | U40453 | Streptococcus pyogenes phage T12 repressor, excisionase (xis), integrase (int) and erythrogenic toxin A precursor (speA) genes, complete cds | 1347-1380 | 0 | 1.0 |
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NC_011134_1 | 1.8|581877|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581877-581911 | 35 | MK448680 | Streptococcus phage Javan139, complete genome | 10193-10227 | 2 | 0.943 |
NC_011134_1 | 1.8|581877|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581877-581911 | 35 | MK448688 | Streptococcus phage Javan161, complete genome | 14584-14618 | 2 | 0.943 |
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NC_011134_4 | 4.3|1366197|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT | 1366197-1366226 | 30 | MK448677 | Streptococcus phage Javan133, complete genome | 33774-33803 | 4 | 0.867 |
NC_011134_4 | 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366527-1366556 | 30 | NZ_MK275621 | Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p3, complete sequence | 42637-42666 | 6 | 0.8 |
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NC_011134_4 | 4.12|1366791|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366791-1366820 | 30 | NZ_AP019409 | Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence | 20005-20034 | 6 | 0.8 |
NC_011134_4 | 4.15|1366989|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366989-1367018 | 30 | NZ_CP032091 | Pseudoalteromonas donghaensis strain HJ51 plasmid unnamed1, complete sequence | 480216-480245 | 6 | 0.8 |
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NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 136114-136147 | 7 | 0.794 |
NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | NC_012654 | Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence | 93545-93578 | 7 | 0.794 |
NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 149484-149517 | 7 | 0.794 |
NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | NZ_CP031095 | Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence | 18581-18614 | 7 | 0.794 |
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NC_011134_4 | 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT | 1366263-1366292 | 30 | MK448753 | Streptococcus phage Javan407, complete genome | 6886-6915 | 7 | 0.767 |
NC_011134_4 | 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT | 1366461-1366490 | 30 | MK448746 | Streptococcus phage Javan383, complete genome | 7985-8014 | 7 | 0.767 |
NC_011134_4 | 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT | 1366461-1366490 | 30 | MK448753 | Streptococcus phage Javan407, complete genome | 6886-6915 | 7 | 0.767 |
NC_011134_4 | 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366527-1366556 | 30 | NZ_CP013043 | Clostridium perfringens strain JP55 plasmid pJFP55H, complete sequence | 17520-17549 | 7 | 0.767 |
NC_011134_4 | 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366527-1366556 | 30 | NZ_CP010582 | Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB51, complete sequence | 24616-24645 | 7 | 0.767 |
NC_011134_4 | 4.9|1366593|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366593-1366622 | 30 | NC_016851 | Aliivibrio fischeri strain KB1A-97 plasmid pKB1A97-67, complete sequence | 34169-34198 | 7 | 0.767 |
NC_011134_4 | 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366725-1366754 | 30 | NZ_CP013043 | Clostridium perfringens strain JP55 plasmid pJFP55H, complete sequence | 17520-17549 | 7 | 0.767 |
NC_011134_4 | 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366725-1366754 | 30 | NZ_CP010582 | Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB51, complete sequence | 24616-24645 | 7 | 0.767 |
NC_011134_4 | 4.12|1366791|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366791-1366820 | 30 | NC_016851 | Aliivibrio fischeri strain KB1A-97 plasmid pKB1A97-67, complete sequence | 34169-34198 | 7 | 0.767 |
NC_011134_4 | 4.5|1366329|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT | 1366329-1366358 | 30 | NZ_CP009119 | Borreliella valaisiana Tom4006 plasmid lp54, complete sequence | 47721-47750 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT | 1366395-1366424 | 30 | MN693615 | Marine virus AFVG_250M1187, complete genome | 2580-2609 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT | 1366395-1366424 | 30 | MN693624 | Marine virus AFVG_250M402, complete genome | 2576-2605 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT | 1366395-1366424 | 30 | MN693914 | Marine virus AFVG_250M396, complete genome | 2495-2524 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366527-1366556 | 30 | NC_003042 | Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13, complete sequence | 36445-36474 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366527-1366556 | 30 | NC_023917 | Clostridium perfringens plasmid pCP-OS1 DNA, complete sequence, strain: OS1 | 36660-36689 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366527-1366556 | 30 | NC_023918 | Clostridium perfringens plasmid pCP-TS1 DNA, complete sequence, strain: TS1 | 36642-36671 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366527-1366556 | 30 | NC_014533 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence | 765073-765102 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366725-1366754 | 30 | NC_003042 | Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13, complete sequence | 36445-36474 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366725-1366754 | 30 | NC_023917 | Clostridium perfringens plasmid pCP-OS1 DNA, complete sequence, strain: OS1 | 36660-36689 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366725-1366754 | 30 | NC_023918 | Clostridium perfringens plasmid pCP-TS1 DNA, complete sequence, strain: TS1 | 36642-36671 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366725-1366754 | 30 | NC_014533 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence | 765073-765102 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.16|1367055|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1367055-1367084 | 30 | FJ870915 | Sulfolobus spindle-shaped virus 6, complete genome | 15365-15394 | 8 | 0.733 |
NC_011134_4 | 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366527-1366556 | 30 | NC_008193 | Pasteurella phage F108, complete genome | 9388-9417 | 9 | 0.7 |
NC_011134_4 | 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366527-1366556 | 30 | DQ114220 | Bacteriophage F108, complete genome | 9388-9417 | 9 | 0.7 |
NC_011134_4 | 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366725-1366754 | 30 | NC_008193 | Pasteurella phage F108, complete genome | 9388-9417 | 9 | 0.7 |
NC_011134_4 | 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366725-1366754 | 30 | DQ114220 | Bacteriophage F108, complete genome | 9388-9417 | 9 | 0.7 |
NC_011134_4 | 4.14|1366923|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1366923-1366952 | 30 | NC_025146 | Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111 | 234946-234975 | 9 | 0.7 |
NC_011134_1 | 1.2|581479|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581479-581513 | 35 | NZ_CP014127 | Pantoea vagans strain FDAARGOS_160 plasmid unnamed2, complete sequence | 73059-73093 | 10 | 0.714 |
NC_011134_1 | 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 581811-581844 | 34 | NZ_CP010090 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB426, complete sequence | 382423-382456 | 10 | 0.706 |
1. spacer 1.2|581479|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448865 (Streptococcus phage Javan182, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcttgtctaatatcgttaataaactgatgtccgta CRISPR spacer tcttgtctaatatcgttaataaactgatgtccgta Protospacer ***********************************
2. spacer 1.2|581479|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcttgtctaatatcgttaataaactgatgtccgta CRISPR spacer tcttgtctaatatcgttaataaactgatgtccgta Protospacer ***********************************
3. spacer 1.2|581479|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcttgtctaatatcgttaataaactgatgtccgta CRISPR spacer tcttgtctaatatcgttaataaactgatgtccgta Protospacer ***********************************
4. spacer 1.3|581546|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448701 (Streptococcus phage Javan197, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttttgacatttttttgataagctacagcgatt CRISPR spacer ttttttgacatttttttgataagctacagcgatt Protospacer **********************************
5. spacer 1.3|581546|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448865 (Streptococcus phage Javan182, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttttgacatttttttgataagctacagcgatt CRISPR spacer ttttttgacatttttttgataagctacagcgatt Protospacer **********************************
6. spacer 1.3|581546|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448869 (Streptococcus phage Javan190, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttttgacatttttttgataagctacagcgatt CRISPR spacer ttttttgacatttttttgataagctacagcgatt Protospacer **********************************
7. spacer 1.3|581546|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448870 (Streptococcus phage Javan192, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttttttgacatttttttgataagctacagcgatt CRISPR spacer ttttttgacatttttttgataagctacagcgatt Protospacer **********************************
8. spacer 1.4|581612|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448701 (Streptococcus phage Javan197, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gactgttaccctaataatttttttagttgtggttg CRISPR spacer gactgttaccctaataatttttttagttgtggttg Protospacer ***********************************
9. spacer 1.4|581612|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448869 (Streptococcus phage Javan190, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gactgttaccctaataatttttttagttgtggttg CRISPR spacer gactgttaccctaataatttttttagttgtggttg Protospacer ***********************************
10. spacer 1.4|581612|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448870 (Streptococcus phage Javan192, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gactgttaccctaataatttttttagttgtggttg CRISPR spacer gactgttaccctaataatttttttagttgtggttg Protospacer ***********************************
11. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448946 (Streptococcus phage Javan456, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
12. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448794 (Streptococcus phage Javan525, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
13. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448953 (Streptococcus phage Javan474, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
14. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028700 (Streptococcus phage T12, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
15. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448944 (Streptococcus phage Javan452, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
16. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448945 (Streptococcus phage Javan454, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
17. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448854 (Streptococcus phage Javan146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
18. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448765 (Streptococcus phage Javan459, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
19. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
20. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448683 (Streptococcus phage Javan149, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
21. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to U40453 (Streptococcus pyogenes phage T12 repressor, excisionase (xis), integrase (int) and erythrogenic toxin A precursor (speA) genes, complete cds) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag Protospacer **********************************
22. spacer 4.3|1366197|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448865 (Streptococcus phage Javan182, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ccgtaaacacgtcataggcttggtactgac CRISPR spacer ccgtaaacacgtcataggcttggtactgac Protospacer ******************************
23. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448681 (Streptococcus phage Javan141, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat Protospacer ******************************
24. spacer 4.5|1366329|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tataaattgcagcagttagcatttttaaat CRISPR spacer tataaattgcagcagttagcatttttaaat Protospacer ******************************
25. spacer 4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448686 (Streptococcus phage Javan157, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaccatcatctttccactgtctgatagct CRISPR spacer ttaccatcatctttccactgtctgatagct Protospacer ******************************
26. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448681 (Streptococcus phage Javan141, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat Protospacer ******************************
27. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448895 (Streptococcus phage Javan274, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
28. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448769 (Streptococcus phage Javan471, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
29. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448684 (Streptococcus phage Javan151, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
30. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448680 (Streptococcus phage Javan139, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
31. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448698 (Streptococcus phage Javan187, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
32. spacer 4.10|1366659|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448694 (Streptococcus phage Javan179, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attgcgtaaagggtagctgtagcctctaca CRISPR spacer attgcgtaaagggtagctgtagcctctaca Protospacer ******************************
33. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448895 (Streptococcus phage Javan274, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
34. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448769 (Streptococcus phage Javan471, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
35. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448684 (Streptococcus phage Javan151, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
36. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448680 (Streptococcus phage Javan139, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
37. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448698 (Streptococcus phage Javan187, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer aatttgcacttttaatttgataatatgtta Protospacer ******************************
38. spacer 4.13|1366857|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448694 (Streptococcus phage Javan179, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
attgcgtaaagggtagctgtagcctctaca CRISPR spacer attgcgtaaagggtagctgtagcctctaca Protospacer ******************************
39. spacer 4.16|1367055|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagataagtagcagtatacaagatgattta CRISPR spacer gagataagtagcagtatacaagatgattta Protospacer ******************************
40. spacer 1.1|581412|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448701 (Streptococcus phage Javan197, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaaaaatcaactagccactggtttcctttacgaac CRISPR spacer aaaaaatcaactagccactggtttccgttacgaac Protospacer ************************** ********
41. spacer 1.1|581412|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448869 (Streptococcus phage Javan190, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaaaaatcaactagccactggtttcctttacgaac CRISPR spacer aaaaaatcaactagccactggtttccgttacgaac Protospacer ************************** ********
42. spacer 1.1|581412|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448870 (Streptococcus phage Javan192, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aaaaaatcaactagccactggtttcctttacgaac CRISPR spacer aaaaaatcaactagccactggtttccgttacgaac Protospacer ************************** ********
43. spacer 1.9|581944|35|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ccgacactgcgaactaatcatttgtgactcctttc CRISPR spacer tcgacactgcgaactaatcatttgtgactcctttc Protospacer .**********************************
44. spacer 1.9|581944|35|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448865 (Streptococcus phage Javan182, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ccgacactgcgaactaatcatttgtgactcctttc CRISPR spacer tcgacactgcgaactaatcatttgtgactcctttc Protospacer .**********************************
45. spacer 1.9|581944|35|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448864 (Streptococcus phage Javan180, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ccgacactgcgaactaatcatttgtgactcctttc CRISPR spacer tcgacactgcgaactaatcatttgtgactcctttc Protospacer .**********************************
46. spacer 4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ttaccatcatctttccactgtctgatagct CRISPR spacer ttgccatcatctttccactgtctgatagct Protospacer **.***************************
47. spacer 4.14|1366923|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448860 (Streptococcus phage Javan172, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
taatgtagagttagcttatttcgacaatga CRISPR spacer taatgtagaattagcttatttcgacaatga Protospacer *********.********************
48. spacer 1.1|581412|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448865 (Streptococcus phage Javan182, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
aaaaaatcaactagccactggtttcctttacgaac CRISPR spacer aaaaaatcaactagccactggtttccggtacgaac Protospacer ************************** *******
49. spacer 1.8|581877|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cacatatagcggaacaatcggacgctatcatggag CRISPR spacer cacatgtagcggaacaatcgggcgctatcatggag Protospacer *****.***************.*************
50. spacer 1.8|581877|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cacatatagcggaacaatcggacgctatcatggag CRISPR spacer cacatgtagcggaacaatcgggcgctatcatggag Protospacer *****.***************.*************
51. spacer 1.8|581877|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448680 (Streptococcus phage Javan139, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cacatatagcggaacaatcggacgctatcatggag CRISPR spacer cacatgtagcggaacaatcgggcgctatcatggag Protospacer *****.***************.*************
52. spacer 1.8|581877|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
cacatatagcggaacaatcggacgctatcatggag CRISPR spacer cacatgtagcggaacaatcgggcgctatcatggag Protospacer *****.***************.*************
53. spacer 4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448951 (Streptococcus phage Javan470, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ttaccatcatctttccactgtctgatagct CRISPR spacer ttaccatcatcttcccactgcctgatagct Protospacer *************.******.*********
54. spacer 4.14|1366923|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
taatgtagagttagcttatttcgacaatga CRISPR spacer taatgtagaattagcttatttcgataatga Protospacer *********.**************.*****
55. spacer 4.14|1366923|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448763 (Streptococcus phage Javan451, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
taatgtagagttagcttatttcgacaatga CRISPR spacer taatgtagaattagcttatttcgataatga Protospacer *********.**************.*****
56. spacer 4.14|1366923|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
taatgtagagttagcttatttcgacaatga CRISPR spacer taatgtagaattagcttatttcgataatga Protospacer *********.**************.*****
57. spacer 1.4|581612|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448865 (Streptococcus phage Javan182, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
gactgttaccctaataatttttttagttgtggttg CRISPR spacer aacggttaccctaataatttttttagtggtggttg Protospacer .** *********************** *******
58. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448944 (Streptococcus phage Javan452, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattgtatgagcaagttcaatgac Protospacer ********************.*.******.
59. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448849 (Streptococcus phage Javan128, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattgtatgagcaagttcaatgac Protospacer ********************.*.******.
60. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattgtatgagcaagttcaatgac Protospacer ********************.*.******.
61. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448767 (Streptococcus phage Javan467, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
62. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
63. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
64. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448942 (Streptococcus phage Javan448, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
65. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448775 (Streptococcus phage Javan489, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
66. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004586 (Streptococcus pyogenes phage 315.3, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
67. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
68. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448794 (Streptococcus phage Javan525, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
69. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448964 (Streptococcus phage Javan502, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
70. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448943 (Streptococcus phage Javan450, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
71. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448972 (Streptococcus phage Javan520, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
72. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448786 (Streptococcus phage Javan509, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
73. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448774 (Streptococcus phage Javan487, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
74. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
75. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448963 (Streptococcus phage Javan498, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
76. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
77. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448958 (Streptococcus phage Javan486, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
78. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448777 (Streptococcus phage Javan491, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
79. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448765 (Streptococcus phage Javan459, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
80. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448944 (Streptococcus phage Javan452, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattgtatgagcaagttcaatgac Protospacer ********************.*.******.
81. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448849 (Streptococcus phage Javan128, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattgtatgagcaagttcaatgac Protospacer ********************.*.******.
82. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattgtatgagcaagttcaatgac Protospacer ********************.*.******.
83. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448767 (Streptococcus phage Javan467, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
84. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
85. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
86. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448942 (Streptococcus phage Javan448, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
87. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448775 (Streptococcus phage Javan489, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
88. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004586 (Streptococcus pyogenes phage 315.3, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
89. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
90. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448794 (Streptococcus phage Javan525, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
91. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448964 (Streptococcus phage Javan502, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
92. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448943 (Streptococcus phage Javan450, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
93. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448972 (Streptococcus phage Javan520, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
94. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448786 (Streptococcus phage Javan509, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
95. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448774 (Streptococcus phage Javan487, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
96. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
97. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448963 (Streptococcus phage Javan498, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
98. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
99. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448958 (Streptococcus phage Javan486, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
100. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448777 (Streptococcus phage Javan491, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
101. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448765 (Streptococcus phage Javan459, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer tcgagggattatgtgagcaaatccaatgat Protospacer *.********.*.*****************
102. spacer 4.3|1366197|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448848 (Streptococcus phage Javan126, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
ccgtaaacacgtcataggcttggtactgac CRISPR spacer tagtaaacacgtcataggcttgatactcac Protospacer . ********************.**** **
103. spacer 4.3|1366197|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448857 (Streptococcus phage Javan164, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
ccgtaaacacgtcataggcttggtactgac CRISPR spacer tagtaaacacgtcataggcttgatactcac Protospacer . ********************.**** **
104. spacer 4.3|1366197|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448677 (Streptococcus phage Javan133, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
ccgtaaacacgtcataggcttggtactgac CRISPR spacer tagtaaacacgtcataggcttgatactcac Protospacer . ********************.**** **
105. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK275621 (Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tttctgcactttcaacttgataatatgttt Protospacer *.********.**.*************
106. spacer 4.9|1366593|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP019409 (Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctggtggcaggtaaagtgtgttgttttttg CRISPR spacer ttgtaggctggtaaagtttgttgtttttta Protospacer .** *** ******** ***********.
107. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK275621 (Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tttctgcactttcaacttgataatatgttt Protospacer *.********.**.*************
108. spacer 4.12|1366791|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP019409 (Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctggtggcaggtaaagtgtgttgttttttg CRISPR spacer ttgtaggctggtaaagtttgttgtttttta Protospacer .** *** ******** ***********.
109. spacer 4.15|1366989|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP032091 (Pseudoalteromonas donghaensis strain HJ51 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tcatcaaggtttacagagatgtcatcaagt CRISPR spacer tcatcaaggtttacatcgatgtcgtaattt Protospacer *************** ******.* * *
110. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag-- CRISPR spacer tttgattataatttaaattctaaaaaa--tacaatt Protospacer * .****** ******** ******** ****.
111. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag-- CRISPR spacer tttgattataatttaaattctaaaaaa--tacaatt Protospacer * .****** ******** ******** ****.
112. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag-- CRISPR spacer tttgattataatttaaattctaaaaaa--tacaatt Protospacer * .****** ******** ******** ****.
113. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag-- CRISPR spacer tttgattataatttaaattctaaaaaa--tacaatt Protospacer * .****** ******** ******** ****.
114. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag-- CRISPR spacer tttgattataatttaaattctaaaaaa--tacaatt Protospacer * .****** ******** ******** ****.
115. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448746 (Streptococcus phage Javan383, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattatatgagcacatcggaaaac Protospacer **********.******** *** .* .*.
116. spacer 4.4|1366263|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448753 (Streptococcus phage Javan407, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattatatgagcacatcggacaac Protospacer **********.******** *** .*..*.
117. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448746 (Streptococcus phage Javan383, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattatatgagcacatcggaaaac Protospacer **********.******** *** .* .*.
118. spacer 4.7|1366461|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448753 (Streptococcus phage Javan407, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttgagggattgtatgagcaaatccaatgat CRISPR spacer ttgagggattatatgagcacatcggacaac Protospacer **********.******** *** .*..*.
119. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013043 (Clostridium perfringens strain JP55 plasmid pJFP55H, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tttcagcactttcaacttgataatatgttt Protospacer *. *******.**.*************
120. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP010582 (Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB51, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tatttgcacctttaattttataatgtagca Protospacer ********.******** *****.*. .*
121. spacer 4.9|1366593|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_016851 (Aliivibrio fischeri strain KB1A-97 plasmid pKB1A97-67, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctggtggcaggtaaagtgtgttgttttttg CRISPR spacer gtgcaggcagtcaaagtgtgttgtttttaa Protospacer ** ***** .**************** .
122. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013043 (Clostridium perfringens strain JP55 plasmid pJFP55H, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tttcagcactttcaacttgataatatgttt Protospacer *. *******.**.*************
123. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP010582 (Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB51, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tatttgcacctttaattttataatgtagca Protospacer ********.******** *****.*. .*
124. spacer 4.12|1366791|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_016851 (Aliivibrio fischeri strain KB1A-97 plasmid pKB1A97-67, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctggtggcaggtaaagtgtgttgttttttg CRISPR spacer gtgcaggcagtcaaagtgtgttgtttttaa Protospacer ** ***** .**************** .
125. spacer 4.5|1366329|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009119 (Borreliella valaisiana Tom4006 plasmid lp54, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tataaattgcagcagttagcatttttaaat CRISPR spacer actttcttgcaccagttagcattattaaag Protospacer * ***** *********** *****
126. spacer 4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693615 (Marine virus AFVG_250M1187, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttaccatcatctttccactgtctgatagct CRISPR spacer gtcccatcatcttcccactctctgatccag Protospacer * **********.***** ******
127. spacer 4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693624 (Marine virus AFVG_250M402, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttaccatcatctttccactgtctgatagct CRISPR spacer gtcccatcatcttcccactctctgatccaa Protospacer * **********.***** ******
128. spacer 4.6|1366395|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693914 (Marine virus AFVG_250M396, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttaccatcatctttccactgtctgatagct CRISPR spacer gtcccatcatcttcccactctctgatccaa Protospacer * **********.***** ******
129. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003042 (Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tctcattactttcaatttgataatatgttt Protospacer *. .*****.****************
130. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_023917 (Clostridium perfringens plasmid pCP-OS1 DNA, complete sequence, strain: OS1) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tctcattactttcaatttgataatatgttt Protospacer *. .*****.****************
131. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_023918 (Clostridium perfringens plasmid pCP-TS1 DNA, complete sequence, strain: TS1) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tctcattactttcaatttgataatatgttt Protospacer *. .*****.****************
132. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014533 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tcgctgcacctttcatttgataatatgcaa Protospacer .*****.*** *************. *
133. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003042 (Clostridium perfringens str. 13 plasmid pCP13, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tctcattactttcaatttgataatatgttt Protospacer *. .*****.****************
134. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_023917 (Clostridium perfringens plasmid pCP-OS1 DNA, complete sequence, strain: OS1) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tctcattactttcaatttgataatatgttt Protospacer *. .*****.****************
135. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_023918 (Clostridium perfringens plasmid pCP-TS1 DNA, complete sequence, strain: TS1) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tctcattactttcaatttgataatatgttt Protospacer *. .*****.****************
136. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014533 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer tcgctgcacctttcatttgataatatgcaa Protospacer .*****.*** *************. *
137. spacer 4.16|1367055|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to FJ870915 (Sulfolobus spindle-shaped virus 6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gagataagtagcagtatacaagatgattta CRISPR spacer accagcagtagtagtatacaagatgatgaa Protospacer . * *****.*************** *
138. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_008193 (Pasteurella phage F108, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer ttaatgcacttttaatttcataatctgaat Protospacer ************** ***** **
139. spacer 4.8|1366527|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ114220 (Bacteriophage F108, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer ttaatgcacttttaatttcataatctgaat Protospacer ************** ***** **
140. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_008193 (Pasteurella phage F108, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer ttaatgcacttttaatttcataatctgaat Protospacer ************** ***** **
141. spacer 4.11|1366725|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ114220 (Bacteriophage F108, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aatttgcacttttaatttgataatatgtta CRISPR spacer ttaatgcacttttaatttcataatctgaat Protospacer ************** ***** **
142. spacer 4.14|1366923|30|NC_011134|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
taatgtagagttagcttatttcgacaatga CRISPR spacer atcggtaaagttagcttatttcaacaaact Protospacer ***.**************.****
143. spacer 1.2|581479|35|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014127 (Pantoea vagans strain FDAARGOS_160 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcttgtctaatatcgttaataaactgatgtccgta CRISPR spacer atctgtttaatatcgttaataacctgatggattga Protospacer ..***.*************** ****** . *
144. spacer 1.7|581811|34|NC_011134|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010090 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB426, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tacgattatcatttaaatactaaaaaaactacag CRISPR spacer catttcttccacttaaatactataaaaactacaa Protospacer .*. .* .**.********** **********.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
32081 : 42257
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011134|32081:42257|DBSCAN-SWA TATGAATAAACGTATTTTTGTTGAAAAGAAGGCTGATTTTCAGATTAAGGCACAGATCCTGTTAAAGGAATTGAAACATCAGCTGCAGTTAAAGACACTGGTTGATTTGCGTATTGTGCAGGTTTATGATGTGTTTCATTTGGATCAGGAGCTGCTTTTAACAGCTATAAAGCATGTTTTCTCTGAGCAGGTAACTGATCAGGTATTATCAGAAGAAGCCTTACAAGCAGATTTAAAAAGGTATACCTTTTTTGCGATTGAAGCTCTGCCTGGACAGTTTGATCAGCGTGCGGCAAGCTCTCAGGAAGCCTTATTGTTGTTAGGAGCCTCAACTGATGTGACTGTTTTGACCTCACAGCTTTATTTGGTCAATCAAGACATTGCTGCTGAAGAATTAGAAGCCTTAAAGCAGTACTTGTTAAATCCAGTGGATTCTAGGTTTAAGGACATATTAGCCGGTCTTGATGATCAGGATTTTTCAGTAGCAGATAAAGTGATTCCAACGCTTGATGTTTTTAATGATTATACAGCGGAAGATCTTGCTCGTTACAGGTCTGAGCAGGGACTAGCAATGGAAGTGGAGGATCTGCTGTTTATTCAGGATTATTTCAAGACAAAGGGGCGAGTGCCAACAGAGACTGAACTAAGGGTTTTGGATACGTATTGGTCTGATCATTGTCGTCACACAACCTTTGAAACAGAGCTAAAAACGCTTGATTTTTCAGCTTCTCATTTTGAAAAGCAGCTCCAAGCTACCTATGAGACCTACCTTGCTATGCGTGATGAGCTAGGTCGATCTGAAAGGCCTCAAACGCTTATGGATATGGCTACCATTTTTGGACGTTATGAAAGAGCTAATGGTCGTTTAGAGGATTTGGAGGTTTCAGATGAAATCAATGCTTGCTCAGTGGAAATTGAGGTAGATGTTGATGGTGTCAAGGAGCCTTGGCTGCTCATGTTTAAAAATGAAACACATAATCACCCAACGGAAATTGAACCCTTTGGGGGTGCTGCAACCTGTATTGGTGGAGCTATTCGTGATCCTCTGTCAGGCCGTTCCTATGTTTATCAAGCCATGCGGCTTTCTGGTGCAGGGGACATTACAAGCCCGCTGTCAGAGACTCGTAAGGGCAAATTACCACAGCAGGTTATTTCAAGGCGAGCAGCACATGGTTACTCGTCATATGGCAATCAAATTGGACTTGCGACGACCTATGTTCGTGAATATTTTCACCCAGGCTTTGTTGCAAAGCGTATGGAGCTTGGTGCTGTGGTTGGTGCTGCTCCCAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAAGGGCAGGTGATGTGGTTGTTTTGCTTGGTGGGAAAACAGGACGTGATGGTATAGGTGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAGACAGTTGAGTCCGTAGAAACAGCTGGTGCAGAGGTTCAAAAAGGAAATGCTATTGAAGAGCGTAAAATCCAACGTCTTTTTCGTCGTGGTGATGTGACACGCCTCATCAAGAAGTCAAATGATTTTGGTGCTGGCGGTGTCTGTGTGGCCATTGGTGAGCTTGCTGCTGGTCTTAACATTAACTTAGATAAGATTCCTTTAAAATATGCTGGGCTAAATGGAACAGAAATTGCCATTTCAGAATCCCAAGAGCGTATGGCTGTCGTGATTTGTCCAAAGGATTTAGAGGCCTTTATGAGCGCCTGCCATAAGGAAAATATCCATGCTGCTGTTGTGGCAGCTGTGACAGAAAAACCGAATCTTGTTATGACCTGGAATGGGCAGACGATTGTTGATATTGAACGCTCATTTTTAGAGACAAATGGTGTGCGCGTGTCTGTTGCTGCTAAGGTTGTTGACAGTGGTGCGCCAATACCAGAAGCTCGTCAAACTACTGCTGAGACACTTGAAGCAGATACCATTGCTGTCTTATCAGACCTGAACCATGCTAGTCAAAAGGGTTTGCAAACCCTGTTTGATAGCTCAGTGGGTCGCTCTACAGTAATACATCCGCTTGGTGGGCGCTATCAAATGACACCTGTTGAAGGCTCTGTTCAGAAATTACCAGTTCAACATGGAGTGACAAAGACAGTCTCTGTTATCGCTCAAGGCTATCACCCTTATATAGCCGAATGGTCACCTTATCATGGTGCTGCTTATGCTGTAATTGAGGCAACTGCTCGTCTGGTCGCAACGGGTAGCCATTGGCATAAGGCACGCTTTTCATATCAGGAATATTTCCAAAGAATGGATAAGCAGGCAGAGCGCTTTGGTCAACCGGTGGCAGCCTTGCTTGGAGCAATTGAAGCACAGGTGCAGCTTGGCTTGCCTTCTATTGGAGGTAAGGATTCAATGTCTGGTAGCTTTGAGGAATTGACAGTGCCGCCGACCTTGGTTGCCTTTGGTGTGACGACTGCTCATGTAGATCATATCCTTTCACCAGAATTTAAAGCTGCTGGCGAGTATATTTACTATATTCCAGGACAGGCTATTTCAGAAGTGATTGATTTTGAGATGATCAAATCCAACTTTAGAAGCTTTGCAGCCATTCAGGCAAGGCATAAGATTAGCTCGGCTTCGGCTGTTAAATACGGTGGTATTATTGAAACACTTGCTCTGGCAGCCTTTGGTAATCAGTTAGGGGCTTGTGTGACCTTGGCGGAGCTTGACAGGAGCTTAACAGCTCAGCTTGGCGGCTTTGTCTTTACATCAAAAGAGGAGATTGCAGGTGCTATCAGGCTTGGTCAGACCACTAGTGACTTTACATTGATTGTCAATGATGTCAAGCTATCTGGAGATCGTCTCTTAAAGGCTTTTGAGGGGAGCCTGGAGCAGGTTTACCCAACGGTATTTCAGCAGGCAGGTGACTTACAGCCTGTTCCTGTAGTGACAACAGCACTTGCTACTCAGTTTAAGGAAAAAATAGTTCAGCCAGTTGTCTATATTCCAGTTTTTCCAGGAACTAACTCAGAATATGATTCGGCTAAGGCCTTTGAAAGAGAGGGCGCAAGGGTGAACTTGGTGCCTTTTGTTACCTTGAATGAGGCAGCTATTGACGCTTCAGTTAACACGATGGTTGACCATATTCACCAAGCTCATATTATCTTCCTTGCAGGTGGTTTTTCAGCGGCAGATGAGCCAGATGGTTCAGCTAAATTTATTGTTAATATCCTGCTGAATGAGAAGGTTCGAGCGGCGATTGATGCCTTTATTGAAAAGGGTGGTCTGATTATCGGTATTTGCAATGGCTTTCAAGCTTTGGTCAAGTCAGGGCTGCTGCCGTATGGGCGCTTTGAGGCTGTGCATGAGGCTAGTCCAACCTTGTTTTATAATGACGCCAATCAGCATGTGGCTAAAATGGTAGAAACGCGTATTGCCAATACCAATTCTCCTTGGCTAGCAGGTGTCAAGGTGGGTGATATTCATGCTGTTGCAGTGTCGCATGGAGAGGGCAAGCTTGTGGTAACAGAAAGAGAATTAGCAGAGCTTTGTAAAAATGGTCAGATTTTCAGCCAGTATGTTGACCTTGATGGCAAACCAAGCATGGATAGCAGGTATAATCCAAATGGCTCTGTCAATGCTATTGAAGGTCTTACCAGCAAAAATGGTCAGATTATCGGTAAGATGGGACATTCAGAGCGCTTTGAAGAGGGACTTTTTCAAAATATTCCGGGCAATAAGGATCAATGGTTATTCCGAAGTGCGGTGCATTATTTTAGAGGAGACCATGTGGATATTGACTGAACTTGGATATAGCCTTGTAATAGCTAAGATAGCTGCTATTATTGCTCAGCCTAGCTGCTAGTTCTAGCTTAGTTAATGACACAATCATAATTAAAAGGGCATTAGCCCAGAGGTAAAGATGACATATGACGTAAAATCTCTTAATGAGGAGTGTGGTGTTTTTGGGATTTGGGGACACCCACATGCCGCTCAAGTGACTTATTTTGGGCTTCATAGCCTACAGCACCGCGGCCAAGAGGGAGCAGGTATTATTTCAAATGATAATGGGGAGCTTCATCAGCATCGTGATGTAGGTCTCTTGTCAGAGGTGTTTAAGGATTCATCTGATCTGGACAAGCTAAAGGGACATGCTGCCATTGGTCATGTGCGGTATGCGACTGCTGGGACGGCTTCCATTAATAATATTCAGCCCTTTTTATATCGTTTTACAGACGCTCAATTTGGCTTGTGCCACAATGGTAATTTGACCAATGCTATGTCATTGAAAAAAGCGTTAGAGAGTGAGGGAGCTATTTTTAATGCCTCTTCTGATACAGAAATTCTAATGCATTTGATTCGTCGTAGTCATCACCCAGAATTTTTAGGAAAGGTAAAAGAGGCACTCAACACTGTTAAAGGGGGCTTTGCTTACCTGCTGGTGACAGAGAACCAGCTGATAGCAGCGCTTGATCCAAACGGCTTTAGGCCGTTGTCTATAGGCCGTATGAAAAATGGGGCTTGGGTCGTCTCAAGTGAGACCTGTGCCTTTGAAGTGGTTGGTGCTGAGTGGGTTCGCGATGTGATGCCAGGTGAGGTCATTATCATTGATGATCAGGGGATCACTTATGACTGCTATACGACTACTACGCAGCTGGCTATCTGCTCTATGGAATATATTTACTTTGCGCGTCCTGATTCAACCATTGCTGGAGTCAATGTTCACACCGCTCGCAAGCGAATGGGAAAGAGACTGGCTCAGGAATTTCAGCATGAGGCTGATATTGTGGTTGGTGTGCCAAATTCCTCATTATCAGCAGCGATGGGCTTTGCAGAAGCATCAGGCCTGCCAAATGAAATGGGATTGGTCAAGAATCAATATACCCAACGAACCTTTATCCAACCAACTCAAGAGCTTCGTGAGCAGGGAGTTCGAATGAAGCTTTCAGCTGTTTCAGGTGTTGTAAAGGGTAAAAGGGTTGTGATGGTAGATGATTCTATTGTCAGAGGGACAACCTCACGACGCATTGTTAATTTGCTGCGTGAAGCAGGAGCTACAGAGGTTCATGTAGCAATTGGTAGCCCTGAGCTCAAATACCCTTGCTTTTATGGGATTGATATTCAGACAAGACGGGAGCTGATTTCAGCTAATCATACTGCTGCTGAGATATGTGATATTATCGGTGCTGATAGCCTGACTTATTTGTCACTTGATGGGCTTATCGAGGCTATTGGACTTGATACAAAAGCACCAAATGGTGGGCTTTGTGTGGCTTATTTTGACGGTCAGTATCCAACGCCGCTTTATGATTATGAGGAGGCTTATCTCAAGAGCTTAGAAGAAAAGGTAAGCTTTCACATTGATCAGGTGACGAAGTAGCGCTTTATGGCTAACATAGAATAAATGATCTAGGCAGCTAAAATAAGGAGGAGAAAATGTCTAAAAATGCTTATGCTCAATCAGGTGTCGATGTTGAAGCAGGCTATGAGCTTGTTGAGCGAATAAAAAAGCATTCCGAGCGTAGCAAACGATTGGGTGTTATGGGTGGTCTAGGAGGCTTTGGTGGTCTGTTTGACCTGTCAAAGACTGGTGTTAAGGAGCCTGTTTTGGTTTCAGGGACAGATGGCGTCGGAACAAAGCTAATGCTTGCAATCCAGTACGATAAGCATGACACGATTGGGCAGGATTGTGTGGCAATGTGTGTCAATGATATTATTGCAGCAGGTGCCGAACCCCTGTATTTTCTTGATTACCTTGCAGCAGGAAAAAATGAGCCTGCCAAATTAGAGCAGGTGATTGCAGGTATTGCTGAGGGCTGTGTTCAAGCAGGTGCTGCTCTTATCGGTGGAGAAACTGCTGAGATGCCTGGTATGTATGGTCAAGATGACTATGATCTTGCCGGTTTTGCGGTTGGTATTGCTGAGAAATCTCAGCTGATTGATGGTTCAAGAGTAGCTGAGGGAGATCATCTCCTAGGTTTGGCATCAAGTGGAGTTCATTCAAATGGTTATTCCTTGGTTCGTCGTATTTTTGCCGGTTATACTGGTGAGGAGCTGCTTCCAGAGCTTGATGGAAAAAAGCTTAAGGAGGTACTTCTTGAGCCAACTCGTATTTATGTCAAGGCTGTGTTACCACTCATTAAAAGCGGCTTAGTGGCAGGAATCGCTCATATTACGGGTGGCGGCTTTATTGAAAACCTACCTCGTATGTTTTCCAAAGAACTAGCCGCTGAAATTGAAGAAGCCAGCTTACCTGTGCTGCCCATTTTTAAAGTCCTTGAGACATATGGTAAGATCAATCATGAAGAAATGTTTGAGATTTTTAATATGGGTATTGGCATGGTGCTTGCTGTCAAGCCTGAGCACGTTGAGCAGGTGAAGGCCTGTCTTGATGAGCCTGTGTATGACATTGGTCGCGTTGTGACCAGAACAGTTGCTAGTGTGGTGATGAAGCCATGACAAGAATTGCCGTTTTTGCTTCTGGTAATGGCTCCAATTTTCAAACGATTGCAGAACAGTTTCCGGTTGCCTTTGTTTTTTCTGATCATTGCGATGCTCATGTTTTAAGTAGAGCCTGTGCTTTGGGTGTTCTGTCCTACAGCTTTGAACTAAAGGACTTTGAGAATAAGCAAGCCTATGAGCAGACTCTTGTGGCATTGCTGCAGCGGCATCAGATTGATCTCATCGTCCTTGCCGGCTATATGAAAATTGTGAGTACAACCTTACTTGATGCTTACGGAGGAAAAATCATCAACATTCACCCAGCTTATTTGCCAGAATTTCCAGGAGCACATGGTATTTTAGATGCTTGGCAAGCAGGTGTTAGTCAGTCAGGAGTGACTGTTCATTGGGTTGATAGTGGTATTGATACAGGAAAAATCATCAAACAGGTACGAGTACCACGTTTGAGTGATGATACTCTTGAAAGCTTTGAAGCCAGAATTCATGAAGCAGAATACCAATTGTATCCAGAGGTACTGGATAGTCTTGGAGTAGAGCGGCTTAACCGCTGATTGTGTAAGATTAATAACTATTTTCCCTATTGTGGCATTTCGTTTATCATAGCAGCTGCGCTAATGGTGGCTAACAAAGGCTAGAAGACTTGTTTGATGATGGCACTGCTATTGAGGAAAATAGACTTTTCTAAGGAGAACTTAAAATGACTAAACGCGCCTTAATTAGCGTATCAGATAAAAGAGGGATTGTGGACCTTGCTAGGGAGCTTAAGCATCTTGGCTGGGATATTATATCAACAGGAGGAACAAGGCTTGCTCTTGAAGAGGCTGGTGTAGTTACTGTTGCTATTGACGATGTGACAGGCTTTCCTGAAATGATGGACGGACGGGTAAAAACGCTGCACCCTCTCATTCATGGTGGCTTACTTGCTCGTCGTGACATTGAGCACCACTTACAGGCAGCAAAGCAAAACAGGATTGAATTAATAGACCTTGTTGTTGTTAACCTTTATCCCTTCAAAGAAACCATTTGCCGTCCAGATGTCACTTATGATGTCGCTGTTGATATGGTTGATATTGGTGGTCCTTCACTGCTGCGTTCAGCGGCTAAAAATCATGCTAGTGTTACGGTAGTGGTTGATCCGACAGATTATCCGCTCGTTTTAGGAGAGTTGGCTAGCACTGGCAGTACAAGTTACCAAACCCGTCAAAGCTTAGCAGCTAAAGCTTTTCGCCATACTGCAGCCTATGATGCAGTGATTGCAGATTATTTTACAAGACAAGCAGGTGAGACAAAGCCTGAAAAGCTCACGCTTACCTATGATTTGAAGCAAAGCATGCGTTACGGTGAAAATCCTCAACAGGCTGCAGATTTTTACCAAAGAGCGCTCCCAACAACCTATTCAATTGCTTCAGCCAAGCAGCTAAATGGAAAAGAGCTATCATTCAACAATATTCGTGATGCAGATGCTGCGATTCGTATTATTCGTGATTTTAAGGAGCGTCCAACCGTTGTAGCACTCAAGCATATGAATCCATGTGGTATTGGTCAGGCAGATGATATTGAGACAGCTTGGGATTTTGCTTATGCAGCTGATCCGGTGTCTATCTTTGGTGGTATTGTTGTCCTAAATCGTGAGGTGGATCTAGCGACAGCGGAGAAGCTTCATGCTATTTTTCTTGAATTGATCATTGCACCAGGCTATTCCAAAGAAGCGCTAGCTGTTCTCACCCATAAAAAGAAGCACTTGCGAATTCTTGAATTGCCATTTGCTGCTCAGGAGGCTAGTGAAATAGAAGCAGAATATACAGGAGTTCTTGGTGGTCTACTAGTGCAAAATCAAGATGTTGTCACAGAGTCTCCAGCGGATTGGATAGTGGTGACAAAGCGTCAGCCAAATGAACAGGAAATGGCTGCTCTAGCATTTGCTTGGAAAACCATCAAATATGTCAAGTCTAATGCGATTGTCATTGCTAATGATCATATGACTTTGGGCGTTGGTCCAGGGCAAACAAACCGAATAGCCTCTGTTCGTATTGCTATTGCGCAAGCAACGGGGCAGCTTGAGGGAGCAGTTCTTGCTAGCGATGCCTTCTTCCCATTTGCAGACAGCATTGAAGAAATTGCTGCCGCTGGTATCAAGGCTATTATCCAGCCTGGAGGCTCTATTCGTGATTCAGAATCTATTGCAGCTGCCAATCAGCATGGTATAACCATGATTTTCACAGGTGTGAGGCATTTTAGACATTAATAAAGTAAAAAGAGACTGGAGCCAAAAGAGTTGCACTTTAGAAATTCTTGGTTAATATACTTTATTACCTAGTTGGATTCATTAAAAAGCGAACAAGTCTAGTTTTCATAATCTCAGAAAACTAGACTTGTTTGCTTGTTTTATTTGGTGGTCATACTATTGTTTCAGCCTCTTTTTACTATGACTAATACAAGAATTTATGAAGGAACAAGGCTTTATTTTTTGTTGTGGTAACAGTGACCAGATCCGTTATCAATCAGTATTTGAGTATTTTGAGCTCTAGATGCATCACTTAGATAGGATATTGCAAAGGATACAGCTGCTGCATGTATTAGGAAAGCATTATCATAAAAGGCTTTTTCGTTAGCCTAAAGGTTTTAGACCTTCTTTGCCTTATCTATTGTTAACCATGTTCCACGTGAACCCATTTGCACGTAAATCCCCTTGCTAGGCTGATCAACCTTTAGAACCTTATAGGTTCCTGAAACGACAAAATAATCACCCACCTGCAAAATCTGATTTCCAGCAATACGTCCTTTATGGTCCGTTTCGTGGAGTGGAGCTGGGTCTATCCAGTTTAAGGAGGTTGGCTCTCCACCGGCTAATTCACTGCTTGCAATCATGTTCTGAGCGACCTGATCGACCCGAAAAACACCAGGAAAGGCTACAGTATCTCCAACCTTGATAGGAGTGGTCGCCACAGGCTTTGGTTTATCTATAGAGGCTTGACTATGTTGCTGAGGCTGAACCGGCAATTTGTGAATTGGAATGTAGCGACGATTTCCTGAATGACCGATATAGCTGAGCCATTCATAGCCATCAGCGACAAGGGTTTGATCATAGTGCACTAACTGTCCAGTATGATAGTAAGCTAAATCAGGACTTGCTAATGTAGCTTCAGCCTTTATAGGACTTTGGCTTGAAAAATAATAGGTACCACTTTTAGCTAGACGAGTTGATCCTGCTTGAGAAGCATGTAACATTTGTGTGTGGCTGGTAGAGTTGTGATCCAGATCCTTGAAGTGAATGTAACCACTTACCTGATGCTTATGAATCTGTCGTTTATGATACTTTTCAGGTCCCTGTCCGGCATTATAGTTGTATTCCTCAATAATAACAGTGTCACCATTGACCTCTGCTACCCAGGCGACGTGTCCATATAGGGCATGTGACTGGTTAAAGCCCTTATCCCACCAAGCAACAGCACCAACTCTAGGTGTATGATCAACATGATAGCCTTGGTGTTTAGCTATACGTCCCCAGCTTTCAGCATTACCATAGCCTCTAGGCAGGCTGAATCCATTTGAGGAATGCAGTCGGAATGCTACAAAAGAAGTGCACTGACGTAAGTACATGTTCCAAGGATCAGCTCCGAAGCCCTGTTTCCACTTACTTGGATAGTTATCCCCTAAAACAGCAGCGTGTACGATACCTGACTGACCTTGTGAAATCGTTGTTGTGGCAGAGGATATTGCACCATTACCACCTAAAAGGATTGCTCCTGAAGCTAACAATTGATAGACTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011134|32081:42257|41102_42257_-|WP_012514709.1|DBSCAN-SWA MKKVYQLLASGAILLGGNGAISSATTTISQGQSGIVHAAVLGDNYPSKWKQGFGADPWNMYLRQCTSFVAFRLHSSNGFSLPRGYGNAESWGRIAKHQGYHVDHTPRVGAVAWWDKGFNQSHALYGHVAWVAEVNGDTVIIEEYNYNAGQGPEKYHKRQIHKHQVSGYIHFKDLDHNSTSHTQMLHASQAGSTRLAKSGTYYFSSQSPIKAEATLASPDLAYYHTGQLVHYDQTLVADGYEWLSYIGHSGNRRYIPIHKLPVQPQQHSQASIDKPKPVATTPIKVGDTVAFPGVFRVDQVAQNMIASSELAGGEPTSLNWIDPAPLHETDHKGRIAGNQILQVGDYFVVSGTYKVLKVDQPSKGIYVQMGSRGTWLTIDKAKKV >NC_011134|32081:42257|32081_35822_+|WP_012514704.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFQIKAQILLKELKHQLQLKTLVDLRIVQVYDVFHLDQELLLTAIKHVFSEQVTDQVLSEEALQADLKRYTFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLLGASTDVTVLTSQLYLVNQDIAAEELEALKQYLLNPVDSRFKDILAGLDDQDFSVADKVIPTLDVFNDYTAEDLARYRSEQGLAMEVEDLLFIQDYFKTKGRVPTETELRVLDTYWSDHCRHTTFETELKTLDFSASHFEKQLQATYETYLAMRDELGRSERPQTLMDMATIFGRYERANGRLEDLEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRLSGAGDITSPLSETRKGKLPQQVISRRAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPRAGDVVVLLGGKTGRDGIGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRRGDVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELAAGLNINLDKIPLKYAGLNGTEIAISESQERMAVVICPKDLEAFMSACHKENIHAAVVAAVTEKPNLVMTWNGQTIVDIERSFLETNGVRVSVAAKVVDSGAPIPEARQTTAETLEADTIAVLSDLNHASQKGLQTLFDSSVGRSTVIHPLGGRYQMTPVEGSVQKLPVQHGVTKTVSVIAQGYHPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGSHWHKARFSYQEYFQRMDKQAERFGQPVAALLGAIEAQVQLGLPSIGGKDSMSGSFEELTVPPTLVAFGVTTAHVDHILSPEFKAAGEYIYYIPGQAISEVIDFEMIKSNFRSFAAIQARHKISSASAVKYGGIIETLALAAFGNQLGACVTLAELDRSLTAQLGGFVFTSKEEIAGAIRLGQTTSDFTLIVNDVKLSGDRLLKAFEGSLEQVYPTVFQQAGDLQPVPVVTTALATQFKEKIVQPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEREGARVNLVPFVTLNEAAIDASVNTMVDHIHQAHIIFLAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDAFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGRFEAVHEASPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVKVGDIHAVAVSHGEGKLVVTERELAELCKNGQIFSQYVDLDGKPSMDSRYNPNGSVNAIEGLTSKNGQIIGKMGHSERFEEGLFQNIPGNKDQWLFRSAVHYFRGDHVDID >NC_011134|32081:42257|39177_40725_+|WP_021320236.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKRGIVDLARELKHLGWDIISTGGTRLALEEAGVVTVAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPLIHGGLLARRDIEHHLQAAKQNRIELIDLVVVNLYPFKETICRPDVTYDVAVDMVDIGGPSLLRSAAKNHASVTVVVDPTDYPLVLGELASTGSTSYQTRQSLAAKAFRHTAAYDAVIADYFTRQAGETKPEKLTLTYDLKQSMRYGENPQQAADFYQRALPTTYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKERPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDFAYAADPVSIFGGIVVLNREVDLATAEKLHAIFLELIIAPGYSKEALAVLTHKKKHLRILELPFAAQEASEIEAEYTGVLGGLLVQNQDVVTESPADWIVVTKRQPNEQEMAALAFAWKTIKYVKSNAIVIANDHMTLGVGPGQTNRIASVRIAIAQATGQLEGAVLASDAFFPFADSIEEIAAAGIKAIIQPGGSIRDSESIAAANQHGITMIFTGVRHFRH >NC_011134|32081:42257|37454_38477_+|WP_012514706.1|DBSCAN-SWA MSKNAYAQSGVDVEAGYELVERIKKHSERSKRLGVMGGLGGFGGLFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIQYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYLAAGKNEPAKLEQVIAGIAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGQDDYDLAGFAVGIAEKSQLIDGSRVAEGDHLLGLASSGVHSNGYSLVRRIFAGYTGEELLPELDGKKLKEVLLEPTRIYVKAVLPLIKSGLVAGIAHITGGGFIENLPRMFSKELAAEIEEASLPVLPIFKVLETYGKINHEEMFEIFNMGIGMVLAVKPEHVEQVKACLDEPVYDIGRVVTRTVASVVMKP >NC_011134|32081:42257|35940_37398_+|WP_012514705.1|DBSCAN-SWA MTYDVKSLNEECGVFGIWGHPHAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIISNDNGELHQHRDVGLLSEVFKDSSDLDKLKGHAAIGHVRYATAGTASINNIQPFLYRFTDAQFGLCHNGNLTNAMSLKKALESEGAIFNASSDTEILMHLIRRSHHPEFLGKVKEALNTVKGGFAYLLVTENQLIAALDPNGFRPLSIGRMKNGAWVVSSETCAFEVVGAEWVRDVMPGEVIIIDDQGITYDCYTTTTQLAICSMEYIYFARPDSTIAGVNVHTARKRMGKRLAQEFQHEADIVVGVPNSSLSAAMGFAEASGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVNLLREAGATEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTAAEICDIIGADSLTYLSLDGLIEAIGLDTKAPNGGLCVAYFDGQYPTPLYDYEEAYLKSLEEKVSFHIDQVTK >NC_011134|32081:42257|38473_39031_+|WP_012514707.1|DBSCAN-SWA MTRIAVFASGNGSNFQTIAEQFPVAFVFSDHCDAHVLSRACALGVLSYSFELKDFENKQAYEQTLVALLQRHQIDLIVLAGYMKIVSTTLLDAYGGKIINIHPAYLPEFPGAHGILDAWQAGVSQSGVTVHWVDSGIDTGKIIKQVRVPRLSDDTLESFEARIHEAEYQLYPEVLDSLGVERLNR |
6 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
151370 : 217042
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_011134|151370:217042|DBSCAN-SWA 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55 | uncultured_virus(20.0%) | holin,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
504970 : 554827
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_011134|504970:554827|DBSCAN-SWA 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38 | Streptococcus_phage(41.67%) | tRNA,protease,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
903167 : 912462
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_011134|903167:912462|DBSCAN-SWA ACTACTGACTTTGGTCCTTAACGGGTTCTTCTTTGGGGTCAGAAGATGAACTAGACTCGGGTTTCTCGGCTTCTTTAGGATTTAATTCCAGATAAGAAGGTGCTTTGAAGAGCTTTTGAGTTGATTTGTTGCCATTTTTACTATAAATGCTGGTTGAATGCGATCCTAATTTCTCTGATATCTCTTTTAGCTGTTTTAGCTGTTTGGTATAAATAAGAGTTGTTGGATCAACAGGCTTCAAGCCATTATCAGTATCAAAGCGTAGTAGGTCTCCTGTTTGGATAGCATCACTAGCTGCCAGCTGCTGAGCAACGGCTGCTCGTATTTCTTTGACCTTAGCCATTGTCATCTCATCAGGGTTTGTAATTTCCAAGCCTGTTTGAGTGTTATAAAGGCGACCGCTATAGCTAGTGTAGTCTGGCGTGATATAAGTTCCAGAGGTTCTCTGCGCTACGATTTGACTATTTTGTGGCGATAAGAGGTCCTGTCCTAGTTGAACCATCTTGCTGGTATCAATGCCCAGGATATGCAGCAAGGTTGGTAAGGCATCAATTTCTCCACCAAAGGTTTCTTTGATCCCGCCATTGGTATAGCCTGGAATATGGATCATATATGGTACACGCTGGAGCATTGCATTGTCATATTCGGACCAGGTTTCGGGGTCTTTACCTAGTAATTCCGCCAGGCTGACATTTCTGGAATTAGAAATACCATAGTGGTCACCATATAGAACAAAGATAGAATTGTCATAAAGACCTGTCGCCTTGAGATAATCAAAGAATGATTTCAAGGCTGAATCTAGGTAGTTAGCTGTAGCAAAATAACCATTGATGGTTTCGTCATCGGTTTTGGCTAGTGGAAAGCCCTCTTCGCTGCTTTCGCCTCTAAGGCTGGTGTAAGGGTAGTGGTTGCTGACAGTAATAAACTTAGTGTAGAAGGGCTGTTGAAGCTGCTCAAGGTACTTGATAGAATCCCTAAACATGTATTTGTCATTTAAGCCATACTGGAAAGAGTTTTTATCAGTCTGTTTTGAAAAATAGCTTGAATCAAAAAAGTAATGATACCCCCACTGCTTATAAGCATTATTACGATTCCAGAAGGTTCCAACATTCCCATGAAAGACAGCACTAGTATAGCCGCCATTTTGTGCTAGGATTGATGGTGTGGCGAATTGAGTGTTTTCACCGCCATAATTTACCATAAAAGAACCACTGTTTAAGCCAAATAATGAATTTTCCATCATGGTCTCTGCATCAGACGTTTTTCCAGCCTTGACCTGATGGAAAAAGTTAGAGAAGGCTAGTGTGGCATTGGAGTGGTAGAGGGAATTAATAAAAGGTGTGACCTCATAGTCCTTGTCGTCATCCTTGAGCTTGTAATCAATAAGAAATTGTTGGAAGCTTTCCAAGTGGATCACAATGACATTTTTTCCCTTACCGATTCCAAAATATTGAGGATCAGGTGCGGCGTAGTGGTTCTTGACATATTGCTTAACATCGACTAATTCTTCAGCGGTTGCTCCGTTACGCTCTTTTTGTGCTTGATAGGTCTGGTTTCCGCTGTAAATGGTAAAAGCAGGCAATCCAAGCGCTCTAACGATATAGGTATTTGAAAATCCTCTAGTCAGAAGCTCCGGGCGGTCAATCTCTGCAAGAAACAGATTAACAGATAAGAGCAAGCAAGACAGTGCTGTAACAGCAAAGGAAGCCCGCTTGTTAAAAGGACGCGGGTCTTTTTTGATGGTCTTAGTTACTGATAAACTAATCAGAATGATGAAATCAAGGACGTAAACAATATCCCAAATGCGCAAAAGGTTTAAAGCAGAGTCTCCTAAACCAGCAGAAACCTTACTACTGGCTAGCATAGCACTAACCGTAATGAAATCTGAAAACTCTCGGTAATAAATAGAATTTGATATTAACAAGAGGTTAAGGATAATATAGACGATCCAAGAGCTGATATAAAAGGCCCTAGTATTCTTGATATAAAGGGTAAATCCCAATAGTAACAAAGCTAGAGGGATTGGGTTAATAATTGTTAGAAAGACCTGATAGGCATTTCCCAAATCTAGTGAAAAGTCAGCATGGTAAGCCCATAGGGTTTTTATCCAAAAGCAGAAGAGAAGCGTTAGCACAAAGCCTAATCTTGTATTGATAAAGCTTGTGATAAATGTTTTAAAATTCTTCACAGTAAGAACTTCCTTATCATTTTTTCCTAAAAGATATAATCTCCAAATAAAATCTCAGATTAAATTATACCAAAAATATGGAGCTAATGCTTGCAATAAGTTTAAATCTAGTATGATTTTTTAATAGTTTTTGTTATAATAGAAACTATGAATAAGGTCTGTATTAATCCCCTTGTTGAACGCAAGATAGCAGCAGGGATACAATTACTAGATGAAAAGGATTTTGATGGCACCATTTGGGACAATCAACTAGTGCAGCTTGTTAATTCATCTCATCATCTTATCGGCACAGCTTACCTTTCAAAGCAACATAAGGGAGTAGGCTGGTATCTAGGAAGGTCTGTTAAGAAATTGTCGGTTTCTTATTTTGTGACCTTATTTAAGACAGCTAAGAAGAAAAGAGAGCATTTTGCCGCGTCTGAATGGACAAATGCTTACCGTCTTTTTAACCAAGACGGTGATGATTTTGGAGGACTAACCATAGACCTCTATAAGGACTTTGCTTTATTTTCTTGGTATAATGTCTTTGTTTATCAAGAAAAGGAGCTTATTATTCAGGCTTTTCGAGAGGTTTTTCCTGAGGTCAGGGGAGCTTATGAAAAGATTCGCTTTAAGGGACCAGATAAGGAGACGGCTCATTTGTATGGCGCGTCTGCTCCTGATACCTTTACTATTTTAGAAAATGGTGTATCCTATCAGGTATTTTTAAATGATGGCTTGATGACTGGGATCTTTCTTGATCAGCATGAGGTTAGACGAGGTCTGGTGGAGGGCTTAGCACTTGGAAAGTCTGTTTTAAACCTGTTTTCATATACGGCAGCTTTTTCTGTAGCTGCGGCAATGGGCGGTGCAGTTGAGACAACCTCTGTTGATTTGGCAAAGCGCTCCATAGAGTTATCAAAGGCTCATTTTATTCAAAATCAGTTGGACCTATCCAGTCATCAGCTGGTCGTTATGGACGTTTTTGACTATTTTAAGTATGCTAAGCGAAAGCAGCTTTCTTTTGATCTTATTATCATTGATCCACCAAGCTTTGCTAGACACAAAAAGCAGACGTTTTCGGTGAGCAAGGACTACCATCAATTAATCGCTGAGGCTCTAGACCTATTGGCCCCCAAGGGAACAATGATCGCTTCAACAAATGCTGCCAATATGACTGTTAACCAGTTTAAAAAGCAAATTATCAAAGGATTGGGAGGCAGGCCATTAGCTCAGATGACACTTGAGCAGCTTCCAAGTGATTTTACTATCAATAAAGCAGATGAAAGAAGTAATTATTTAAAGGTATTTACTATAAGGGTACGAGAATGAAAATTGTAGCACCAGTCATGCCAAGAAATGTTGAAGAGGCTCAATCTATCGACGTTTCTAAATATCAAGATGTTAATTTAATCGAGTGGCGAGCAGACTTTCTTCCTAAGGAGGATATTGTTTCTGTAGCGCCAGCTATTTTTGAAAAATTTGCAGGTAGAGAGATTATTTTTACCCTTCGTACAAGTCGAGAAGGAGGGCATATTACACTTTCTGATCAGGAATACGTTGATTTGATCAAGGAGATCAATGCGATTTATAATCCTGACTATATTGACTTTGAATACTTTAGTCACAAGGCTGTCTTTCATGAAATGCTTGACTTTCCGAATCTTGTCTTGTCTTATCACAATTTTGATGAGACGCCTGAAAATCTGATGGAGGCTTTTTCGGAGATGACTAAGCTAGCTCCTCGCGTTGTCAAGATTGCTGTCATGCCGCAGAGCGAGCAGGACGTTTTGGATTTGATGAATTATACCAGAGGCTTTAAAACACTTAACCCAGAGCAGGAATTTGCAACCATGTCAATGGGAAAGCTAGGCAGACTATCACGCTTGGCAGGTGATGTTGTAGGGTCCTCGTGGACTTTTGTGTCCTTAGATCAAGCCAGTGCACCAGGGCAGGTTTCCTTGGCTGATATGAAAAGGATTCTTCATGTTTTGGAATCTGAGGATTGATAAGATACGGTAACAGACATTATTCTCTTGGATAGCTTAGAATAATGTCTTTTAGTTGTCTAGAGGAGGGCAGGTTTGCTTTTTATGTCTATGATTGATAAATGGAGGAATAATGAGGTATTTAACAGCAGGTGAGTCACATGGACAAGCTTTGACGGCCATTATAGAGGGAATTCCTGCAGGCTTAGCATTATCAGCTGAGCTTATTAACAAGGAACTGAAGCGTCGGCAGGGGGGATATGGTCGTGGCGCACGCATGCGCATTGAATCAGATCGTGTGCATATCTCTTCAGGTGTTCGTCATGGCAAAACAACAGGAGCACCAATTACTTTAACCATTCAAAACAAGGACCATCAAAAATGGCTAGACATTATGGCTGTTGAGGCTGTTGAAGAGCAAATCAAGTTCAAGCGTAAAATCACTCGTCCACGCCCTGGTCATGCTGACTTGGTTGGGGGGATCAAATATCGTTTTGATGATTTAAGAAATGCGCTTGAGCGCTCCTCTGCCAGAGAAACAGCGATGCGTGTGGCCGTTGGTGCAATTGCTAAGGCAGTCCTTACTGAGCTTGGGATCGAAACTGCTAATCACGTCCTGGTTTTTGGTGGTATTGAGGTAGCTGTGCCTGAGGCGATGCCTTTTACAGACATCAAAAAAGCAGCAGAGGCTTCTGATTTATCTATTGTCAATCCTAAGCAGGAGGCGACTATCAAGGCTCATATTGATCAAGTCAAAAAAGAGGGGGATACGCTTGGCGGTATTATTGAAACAATCATTTATGGCTTACCAGCAGGCTTAGGCTCATACGTTCAATGGGATCGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_011134|903167:912462|910639_911080_-|WP_012515499.1|DBSCAN-SWA MSSHYSRQQKPKKSASIPTKHIKTGFTALQKTIALVGSVLSIVVATITINRALQPSNEQPKSDSSPSSTSTIVKIIEKESSHSNKEETDKTETNSDSSGTQATHTTPSSADPATKDTEKQQNTETEAPAANQPTANEPAPNSTSNP >NC_011134|903167:912462|907454_908621_+|WP_012515496.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGQALTAIIEGIPAGLALSAELINKELKRRQGGYGRGARMRIESDRVHISSGVRHGKTTGAPITLTIQNKDHQKWLDIMAVEAVEEQIKFKRKITRPRPGHADLVGGIKYRFDDLRNALERSSARETAMRVAVGAIAKAVLTELGIETANHVLVFGGIEVAVPEAMPFTDIKKAAEASDLSIVNPKQEATIKAHIDQVKKEGDTLGGIIETIIYGLPAGLGSYVQWDRKLDAKIAQTVLSINAFKGVEFGMGFDMGYQKGSQVMDDIIWHETSGYSRRTNRLGGFEAGMTTGQPIVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDTETHEPYKATVERSDPTALPAAGVVMENVVATVITKEILEQFPSDNMTDLKQAFFAYRDYVHHF >NC_011134|903167:912462|906661_907342_+|WP_012515495.1|DBSCAN-SWA MKIVAPVMPRNVEEAQSIDVSKYQDVNLIEWRADFLPKEDIVSVAPAIFEKFAGREIIFTLRTSREGGHITLSDQEYVDLIKEINAIYNPDYIDFEYFSHKAVFHEMLDFPNLVLSYHNFDETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATMSMGKLGRLSRLAGDVVGSSWTFVSLDQASAPGQVSLADMKRILHVLESED >NC_011134|903167:912462|905501_906665_+|WP_012515494.1|DBSCAN-SWA MNKVCINPLVERKIAAGIQLLDEKDFDGTIWDNQLVQLVNSSHHLIGTAYLSKQHKGVGWYLGRSVKKLSVSYFVTLFKTAKKKREHFAASEWTNAYRLFNQDGDDFGGLTIDLYKDFALFSWYNVFVYQEKELIIQAFREVFPEVRGAYEKIRFKGPDKETAHLYGASAPDTFTILENGVSYQVFLNDGLMTGIFLDQHEVRRGLVEGLALGKSVLNLFSYTAAFSVAAAMGGAVETTSVDLAKRSIELSKAHFIQNQLDLSSHQLVVMDVFDYFKYAKRKQLSFDLIIIDPPSFARHKKQTFSVSKDYHQLIAEALDLLAPKGTMIASTNAANMTVNQFKKQIIKGLGGRPLAQMTLEQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIRVRE >NC_011134|903167:912462|908681_909023_+|WP_012515497.1|DBSCAN-SWA MSQDIYDYANKLERAVRALPEYRKALEAREEIKADEAASQLFDEFVAVQEKLQGLMQTGQLPTETEQADIQALSQKIEANDLLKGYFNAQQALSVYVNDIERIVFAPLKDLAK >NC_011134|903167:912462|903167_905354_-|WP_012515493.1|DBSCAN-SWA MKNFKTFITSFINTRLGFVLTLLFCFWIKTLWAYHADFSLDLGNAYQVFLTIINPIPLALLLLGFTLYIKNTRAFYISSWIVYIILNLLLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIVYVLDFIILISLSVTKTIKKDPRPFNKRASFAVTALSCLLLSVNLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTIYSGNQTYQAQKERNGATAEELVDVKQYVKNHYAAPDPQYFGIGKGKNVIVIHLESFQQFLIDYKLKDDDKDYEVTPFINSLYHSNATLAFSNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQNGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYHYFFDSSYFSKQTDKNSFQYGLNDKYMFRDSIKYLEQLQQPFYTKFITVSNHYPYTSLRGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDSALKSFFDYLKATGLYDNSIFVLYGDHYGISNSRNVSLAELLGKDPETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGGIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSKMVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYITPDYTSYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTMAKVKEIRAAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTDNGLKPVDPTTLIYTKQLKQLKEISEKLGSHSTSIYSKNGNKSTQKLFKAPSYLELNPKEAEKPESSSSSDPKEEPVKDQSQ >NC_011134|903167:912462|909216_910569_+|WP_012515498.1|DBSCAN-SWA MAIQYDYIVIGGGSAGIASANRAAMYGAKVLLAEGKAIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVAETIHTYAKDYGFTVLEDRFDFKTLKSNRQAYIDRIHASYEKGFEHNGVDRIYDYARFIDQHTVDIAGKTYTAPHILIATGGQPIFPDIEGAELGISSDGFFALDDIPKRTAVVGAGYIAVEIAGVLNALGSQTDLLVRYDRPLRTFDQDIIQVLVDEMKVPGPRLHTNADVTKVTKANDGSLQVHLSDGRRLEVDQVIWAIGRKPNVTGFGLEHTGVELDKRGYIATDAYENTSVEGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLAERLFHHKANEKLDYDKVATVVFSHPPIGSIGLTEEAAIQAYGQEAVRVYQSQFTSMYTAITSHRQPCLMKLVVAGEEETVVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGAEEFVTMR >NC_011134|903167:912462|911319_912462_+|WP_012515500.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTKPYEEALKTYQEVASKIYGNPSSLHQLGANASRILEASRRQIAALLDVEAKEIFFTSGGTESDNWAIKGIAFEKSHFGKHIIVSAIEHPAVRESAKWLESQGFELSYAPVTDKGVVDVKKLAALIRKDTILVSIMAVNNEIGSIQPIAAISELLADKPTITFHVDAVQAIGKLPVEAYLTARVDLASFSGHKFHAVRGVGFLYKKSGKRITPLLVGGGQEDELRSTTENVAAIASMAKALRIITERQDRSQARIAAMKKVIYQALQAYEDTILFSEIDDVAPHILTFGIKGVRGEVIVHAFEKHEIYISTTSACSSKAGKPAGTLVSMGIPAKLAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYEKTQKVR |
8 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1501203 : 1607708
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_011134|1501203:1607708|DBSCAN-SWA 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91 | Bacillus_phage(12.0%) | tRNA,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1949057 : 1958955
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_011134|1949057:1958955|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_011134|1949057:1958955|1951681_1952563_-|WP_012516456.1|DBSCAN-SWA MPANKSLKLKNCCFIILGSAIYAFAFVYFYMANRIAANGLAGLTQVANALFQINPSITGYLINLPLVLLGARLFGRRAMVYTVTGILSLYWFVWLFQQLPLFIDLDHDNLVVSLLAGILGGLGGGIVFRNGGTIGGSDIIAKLIEDRFGLQLNQALLGIDIFVMVVSLTYISIPQMMYALIASFMYSRIVHLVQNGGYSARGTFIISDYSQAISEFIMEELGRGVTYLHGEGAYSGREKRVIYVALGRSDVRELKAFIAQVDPNAFVSFFDVNEVNSPEFIATKSKYHKTKKR >NC_011134|1949057:1958955|1957381_1957531_+|WP_001265622.1|DBSCAN-SWA MRVNITLEHKESGERLYLTSKNKRNTPDRLQLKKYSPKLRKHVVFTEVK >NC_011134|1949057:1958955|1952578_1953526_-|WP_012516457.1|DBSCAN-SWA MIKKTTYRKRVKYLINRGAKKIGLLHAVKSISKEKYTEKISASLLYGILSSIAVNFFFQPGHVYSSGATGLAQVISAISHHLWGFEIPVALAFYVINIPLLVLAWYKIGHKFTIFTFITVSMSSFFIQIMPQVTLTTDPLINAIFGGLVMGLGIGTGFKSRISSGGTDIISLTLRKKTGKDVGNLSLMINGVIMAFAGLLFGWQYALYSMVTIFVSSRVTDAIFTKQKKMQATIVTSCPDKVIHMIHKKLHRGVTSINDAEGTYKHEHKAVLITILTREEYSEFKWLMLKTDPNAFVSVAENVRIIGRFVESDED >NC_011134|1949057:1958955|1953518_1955267_-|WP_012516458.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKRSMYAGHVREEHIGRTIVLKGWVSRRRDLGGLIFIDLRDREGVMQLVINPEDVSGDVMATAERLRSEYVIEVEGSVEARQQANDKLATGAVELKVSGLTILNTAKTTPFEIKDGVEVSDDMRLRYRYLDLRRPEMLESFKLRAKTTHVIRNYLDNLGFIDVETPMLTKSTPEGARDYLVPSRISQGHFYALPQSPQITKQLLMNAGFDRYYQIVKCFRDEDLRGDRQPEFTQVDLETSFLSEQEIQDIVEGMIAKVMKDTKGIEVKLPFPRMAYDDAMNHYGSDKPDTRFDMLLQDLTDLVKEVDFKVFSEAQAVKAIVVKGHADDYSRKDIDKLTEFAKQFGAKGLAWLKVVDGAFTGPIAKFLTGVESKLTESLQLEHNDLVLFVADTLEVANNTLGTLRTRIAKELDMIDMSQFHFLWVVDWPMFEWSEEEERYMSAHHPFTLPTQESAHELEGDLAKVRAVAYDIVLNGYELGGGSLRINQKDMQERMFKALGFTKEEASDQFGFLLEAMEYGFPPHGGLAIGLDRLVMLLAGKDNIREVIAFPKNNKASDPMTQAPSLVSEKQLEELQLQIEHHD >NC_011134|1949057:1958955|1957698_1958955_-|WP_041785325.1|transposase|DBSCAN-SWA MELFKNTTDLVGLKDKNIKILFALRYQTYIEIRARLDYQAPPCPHCQGKMIKYDFQRYSKIPLLDIQGMPTLLKLKKRRFQCKSCRRVSVAETPLVEKNCQISKEVWAKIVQLHTEKLTNTAIAQRLHISVSAVQRKLEQFTFTEDFSNLPEVLSWDEFSRNKGKLAFIAQDFETRQIVTILENNRQTTIKNHFYKYPRKVREQVKFVTVDMSGSYIPIIKQLFPCAQIVLDRFHIIQHLSRAMITTRIAIMKSFDKQSLPYRATKNHWRIFQKDSRKLSDKAFFSRTFRQTLTPREIVDKTLAFSDEIRYYYDLYQLLLFHFQEKRTTEFFGLIDDNISSVNAAFKTVFRTFTKYKLHITNALSYPYSNAKLEATNKLIKDIKRQAFGFRNFKNLKTKILIALNITKERTKLTLSRC >NC_011134|1949057:1958955|1957183_1957366_+|WP_012516460.1|DBSCAN-SWA MAVPARHTSKAKKNKRRTHYKLTAPSVKFDETTGDYSRSHRVSLKGYYKGRKIAKANAAE >NC_011134|1949057:1958955|1955494_1956775_-|WP_012516459.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKLQKPKGTQDILSVAAAKWQYVEGVARETFKQYHYGEIRTPMFEHYEVISRSVGDTTDIVTKEMYDFYDKGDRHITLRPEGTAPVVRSYVENKLFAPEVQKPVKLYYIGSMFRYERPQAGRLREFHQIGVECFGSANPATDVETIAMAYHLFERLGIKGVTLHLNSLGNAASRAAYRQALIDYLSPMRETLSKDSQRRLDENPLRVLDSKEKEDKIAVANVPSILDYLDEESQAHFDAVRSMLEALAIPYVIDTNMVRGLDYYNHTIFEFITEVDQSELTICAGGRYDGLVEYFGGPATPGFGFGLGLERLLLILDKQGVELPVEEGLDVYIAVLGADANVAALALTQAIRRQGFTVERDYLGRKIKAQFKSADTFKAKVVITLGESEIKAGQAVLKHNQTRQEMTVSFDQIQTDFASIFAECVQ >NC_011134|1949057:1958955|1949057_1950452_-|WP_012516454.1|DBSCAN-SWA MEALSIQHYALDTAEKNLLTIDSLMLNQGERVFIIGDNGAGKTSFLKTIIGESTDYSGFLQVHGDIAYVPQIKSASPQSGGERAMSYLKAAFQARPSLLILDEPSSYLDHANRDWLINQLKRYRGTLLVVSHDRYLINQLSQKIWLLEHQTIKIYHGNYDDYQRSRQLEEDKQLRAFLEYQRKTNQLKKSLTRKKVQANKMAVKKKSVSRSDWKTNSFAGSYDSQAKAMAKAAKAMENRLTRMKEVNRPRKKAWAKLKKDPNEGALPNTLLHLQEGTLTRDHQLLFDYPGIVIRSHSKLAIIGRNKAGKSSFLDQLAAQALSGFYAQNLRITYFKQDQADLELDQTAVELISRQSSQDRVTILNYLAMMGIDYDKANQKVAILSGGERVRLALVAALLTDHQLLILDEPTIYLDLVAIEALESCLIDYPAALLLVSHDLAFVNKVATEIYEVKDHHLTAYHFED >NC_011134|1949057:1958955|1950623_1951538_-|WP_012516455.1|DBSCAN-SWA MTNHDKRHRVRELLLIAVGVAIYTFGFVNFNMANELAEGGVAGITLILHAHFGINPAYSSLLFNLPLFMLGAKIFGRRSLALTIYGTVLMSVFIWLWQKVPMELGLENDMMLVAVVAGLFAGIGSGLVFRYGATTGGTDIIARIAEEKFGAKLGQTLLFVDALVLTASLTYVDLKHMLYTLVASFVFSQMISVVQNGGYTIRGMIIITKQSQAAAQAILTEINRGVTYLKGQGAYSGHDYNIMYVTLNPTEVREVKRILAELDPDAFISIIDVDEVISSDFKIRRKNFDKPIEKALQKKSNMLK |
9 | Streptococcus_phage(71.43%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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