Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012730 | Rickettsia peacockii str. Rustic, complete sequence | 0 crisprs | cas3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
NC_012732 | Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
650798 : 712678
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012730|650798:712678|DBSCAN-SWA AATGAACTTAAATCAAAAAATAATAAAGCCAAAAATAGGGTTACTAGAACTAGCTAAGAGTCTTGGTAGCATATCATCAGCATGTAAAGCGATGGGCTATAGTAGAGATAGTTATTACAGATTTAAAGCACTGTATGAAACTGGTGGCGAAGAGGCATTATATGAAATTAGTCGAAGAAAGCCAATAATAGCGAATAGAGTTGATCCAGCGATAGAGAAAGCAGTAATGGATATGGCAATAGAATATCCAGCATATGGTCAGCTAAGAGTATCAAATGAGCTTAAGAAGAGCGGTATACTTGTATCGCCTGGAGGAGTGCGATCAATTTGGTTACGTAATGATTTAAACAATATCAGTAAAAGGCTTAAAGCATTAGAAGCAAAGATGGCTCAGGATGGTATTGTTCTTACTGAATCTCAATTACAAGTGCTAGAGGAGCGTCGTAATGAAAGAGAAGCTCATGGAGAAACTGAGACGCAGCATCCAGGTTATCTAGGATGTCAGGATACGTATTATGTAGGTAATTTCAAAGGTATAGGTAAGGTTTATTCTCAGGTATTTATTGATAGCTATACTAGGGTAGCTGATGCTAAACTATATACTGATAAAACAGCTTTAACTGCTGCTGATATGCTTAATGACCGCGTGTTACCATGGTACGAGACCCAAGGGATACCAATACTTCGTATTCTTACAGATCGTGGGTCAGAATATAAGGGGAATATAGAGCATCATGCTTTTGAGTTGTTTCTAAGTATCGAAGGTATAGAGCATACTACAACTAAGGCATATTCTCCCCAAACAAATGGTATGTGTGAGCGTTTTAATAAAACCATGAAACAAGAATTCTTTGATACAGCTATGCGGAAAAAGATTTATACAGATCTTGATGATTTACAATTAGATCTTGATATTTGGTTAGAGCATTTCAATAATGAGCGACCACATTCAGGAAAATATTGTTATGGAAAAACTCCTATGCAAACTTTTAAGGATAGTAAAAAATTAGCTGTTGAAAAGAATAATGAAATCTTGTATCTTGAATACGTCTCTGACAGTCAAAATGTAACTGACCATCAGGTGCAAAATTTATAGTGTCTGTAAGATCAAATCTTGACTTCTACAATTAATTTCATCCTGCGACTTGATCGCAGGATCTAGTCTTTTTTAAATTTTTTTCTCGATACTCTGGTCAAGCCACGGTATGACAGCGAAAAGTACTGGATTTCCGCTTTTAGCTAGAAATGACATACTATAGGCCAAATTGCGGTATGACATAATAACATACAACAACTATAAATTCTTATTCTTTTTCTGCATTTTTTCTAGTAGACGGTGAGAGATAATGCTTAGCTCTTTTAGAGCTTTATCCTCTACATAGCTTGGGGCGTTCATTAGTAAATCTTCAGCCTGCTGGTTTAAAGGAAACGCAATTATTTCCCTTATATTTGTTGCTTCCGCAAGCAGCATAACGATTCGGTCAATACCGGGGGCTATTCCACCATGTGGTGGAGCTCCAAACTTAAATGCTCTAATCATCCCTCCAAATCTCTTATCAACTTCCTCTTCACTATAACCTGCTATGGAAAATGCTTTATACATAATTTCCGGCTTATGGTTTCTAATAGCACCGCTGGACAGTTCAATACCGTTACAAACAATATCATATTGGTATGCGGTAAGTTCTAATAACTCTTCAGTGGTTTTAGCTTGTTCTAAAGCATCTATTCCGCCCTGCGGCATAGAAAACGGATTATGGCTAAAATCAATTTTTCCTGTTTCTTCATTTAACTCATAGAATGGAAAATCGGTAATCCAGCAGAATTTAAAACAATCTTTTTCAAGTAAATCAAGCTCTTCACCAAGTCTTATTCTAACCTTACCGGCAAGTTTAGCAGCTTTCTCTTTCTTATCGCTAGCGAAAAATACAGCATCACCGTTACTAACACTAGCTGTAGCTTTTAGACTCTCTAATTGCTGCGGGCTTAAGAATTTTACTACCGGTCCCTTTGCTTCACCGGTTTCACTAAACTGAATATAGCCAAGTCCACCTGCTCCTTCTGATATCGCAAACTCTATCATTTTATCGAAGAAACTATGAGGCAATGCAGCTGCCTTAGGTGCAGGAATTGCACGAACTATGCTACCTTTTTTAATATTCTCTCTAAAGATTGTAAAATCGGAATCTCTAAATATCTCAGTTACATCGGCAATTATAATAGGGTTACGCAAATCAGGCTTATCAGAGCCGTATTTTAGCATAGATTCATTATATGGAATACACACGAAAGGAGTCTCTGATACTTTCTTATCCGTGAATTTAGTGAATAAATCATACATCACAGGCTCAATAGTACTAAATACGTCTTCCTGTGTAACAAACGACATTTCTACATCTAGCTGATAAAACTCGCCGGGTGATCTATCGGCTCTTGCATCTTCATCCCGAAAACAAGGAGCAATTTGGAAATAACGATCAAAGCCTGATACCATCAATAACTGCTTGAATTGCTGAGGTGCTTGCGGTAATGCATAGAACTTACCCGGATGCATTCTACTAGGTACTAAAAAATCCCTAGCCCCCTCAGGTGAGCTTGCTGTTAAAATCGGAGTTTGAAATTCGGTAAAACCGCTTGCCGTCATCAAATGACGAATATGAGAAATAATTTGTGAACGGAGTATTATATTATTATGTAATTTCTCACGTCTAAGATCTAAAAAGCGATGTTTAAGCCTAGACTCTTCGGGAGCGTCTTTTTCAGTATTAATAACAAAAGGTAGAGTGTCCGCAGCTGACTCAACACTAAATTCCACAGCTAGCACTTCAACATGACCTGTCGGAAGCGTATTATTAATCGTGTCCTCTGACCTTGCTACAACTGTACCCCTTACCGTAATTACCGACTCATAACGCAAACGACTTGCATCCTCCATAAGCTGAGGGTTTTGATCGGTAAACACGATTTGAGTTATACCGTAATGATCACGTAAATCTATAAAAACTAGATTCCCGTGATCTCTTCTTCTATGTACCCAACCGGATAGCTTAACTTCTGTTTCTACATCGGATATTTGTAATTCGTTACAATTATGAGTTCTGTATTTATGCATTTTTATTTTTTTATTATACGATTTCCCCATTATATACATAAAATCACAAATTTTCGCAAATAAAAACTAAAAATTTATCTTGCCAAAGTTTTATCTTGATATTGCAGCAGCTTTTGGCTTTGATGGGCGTTGCTGATAATTTTGTTGTTGAGGTTTTACTTGATTTAACTCACCTTTAATCCATTCATATATTGCTTTCTTAGGATTTTTAATTATCTCTGCAACATTTTCGACTAGATTTATTATTCCTTTAACTAACGATAATACATCTTTTGCTATTTCACCTATAGAATTATTACCTGCTTGTAGTTTTTCTTGGTCTTGCTTAGACAAATTACTACGTATCCTATTCATTCTTGATTTAAGCTCATCTTGTTCTAGCTCTTCTTGTGTAAAATGTGACTTAAGTTTTCTATCAACAATTTTTTGTTCTTCCGGAGTTAAATTTTTATATTGATCAACAAGCTTATTAACTTTTGCTTGTTCTTCCGGTAGTTTTGAAATATTTTCAGCAATATTTGGCATTTGTTTCTCTTCTCTTATAAAGTTAAAACATATTAATTTACATTATATATATATTTTTATACAAGCAAAACTTTAATAGAAATTAACCTTTGAACGCAGCCTTAATACCTAGAAAGTCTAAAAAATTTCGTAATTCTTGACGTGCAAGCACGTGTGAGCTATTAAATGCTCTATCATATTTTGCAGTTTTTAGATCAAGTAATGTTAGACCTTGTAAAAATAACTCCCTATATATTACACGTTCACTAAATCCTTCTGCGAGTTTAAAGTTAATTCTTTTAGCAAGTTTAGCTAATACATTTCCTACGCGTCTTTTATTTAATGCATCAAGATTACTTAAACGATTACGAAGTATTACCCAATCTATACTAATTCTATCACGACTAGCACGTTCCATTTTCTGTTCCCAAATCATTTGACTATATATTGATGGGCTAATAATTTCATCCTTGCTATCGACTTTTGCTATTACGTCTAAATCTAGAAAGCTATCATTAATCGGTGTAATAATTGTATCGGCGTAAGAATGAACAACCCTTGATAAAGGAGTATGACTGCCTGGGGTATCAATCACTATATAATCGACATCCTGATTATTTTTGAGTATCGGCTCAAAACTCTTTGCTGGCTCTTCTACTTTGCTTTCCGATATATGAAAATGTTTCGGTACTAATACAGGTTTATCAGGATTGTGTTTATTATATAAATCTCGATTTTTTAAATAATTCGTTAACGAACTTTGACGTGAATCGGTATCTATACTTACTACCGAATAATTTTGATAAAGCAGAGCGATTATTAGATGCATAGAACAGGTAGTTTTACCTGCTCCGCCTTTCTCATTACCTATAACAAATATATAAGGTTTATTTATTGTGTTCATAATTATATTCAGAATAAACGCATAGTAAATAGACGAAGTTTAATGTCATTCTTAGCTTAGTATTACACATGTGGATAGTTTTTTCCGTCATTGCAAGAAAATGACGTAAGTAATTGACGAAGCAATCTCAGGATATTTGACGAGATTGCCACGCAGCCTAAGGCTGCTCGCAATGACGACTCGGTATCCATGCAGGCAATGCAACGCAAGAATAGCATTTAAGTATATTCTTTGATAAATTGCTCTAGTAATCTCACGCCGTATCCTACTGCCCCCTTAGGACCGAGTGCTGAAGCTTTATTACTATTTGCAACGCCTGCTATATCTAAATGAGCCCAATCTACTCCATCTTTAATGAAACGTTTAATGAAATGTGCAGCTATGCAGCTTCCGGCAGCTCTTGGTACGTTCCCGATATTTGCCATATCGGCTATGTCGGAGTTAATCATTGCATCGTACTCATCATGCAGCGGCATTCTC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51 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(28.57%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
911337 : 963394
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_012730|911337:963394|DBSCAN-SWA 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52 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
12491 : 19252
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012732|12491:19252|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012732|12491:19252|14356_14548_-|WP_085065840.1|transposase|DBSCAN-SWA MSRKVNCWDNAVAESFFHTIKTELVYQHKFKTREEAKHAIFEYIEVFYNRIRMHSAKTIIYHQ >NC_012732|12491:19252|12491_14279_+|WP_085065845.1|DBSCAN-SWA MSNPYLNLIYTVWHYGAPWRFAIIGYYLALIVAQIFLSLSPYAFGRVVDELQHFKPGQLTQIIFWLLAGVGLMLLFWLFHGPARVVERNVALKIQQAFRLNIYKQLMHLPLKWHQDHHSGNIITRINRSSAAIYRFADNQFSYIHTIVKFVTAMGFLLWISPPLGFISFFSSLFVMIVVILFDNKLVPLFNAENEVENHIGSVFFDYISNITTILTLRLGKLTHNNLFEHMMSIWPFFRKRVVLNEIKWFSMMILFTIVQTIILVSYVVHTLNKTETIMLGIVVMIFRYQCDINDVFQALSTHYGEIVRMNTDIKSIQPILDDIKKLTLLPKSSATVKQWHVIEVKNLTFHHASEAVRYVQIFNRIEFKIRRGEKIALIGLNGGGKSTLMNLLSGLYTPSHVDLKIDEVHFNSLEPLQTITTLIPQDPEIFENTIAFNITMDLPTELDKIHHVVKLSGFSNVLDTLPNGLKTDIREKGLNLSVGQKQRLALARGLFAARFSSLILMDEPTSSVDLPTEQEILLQIINDFPESAMIISLHRLHLLPNFDSVIMLNNGKVIASGSVSMLLNKSGPVRDLWQAYKQDYSKTKKDLKIL >NC_012732|12491:19252|14580_15282_-|WP_146603381.1|transposase|DBSCAN-SWA MKEIEKRTRQSNTGTRSIKKGCCVLCERIPIRYAWIKENEGNFSIAVMCKFMKVSRSGYYEWFNNPGCNRVQEDNELTNRIEIIFKEGRGNYGTRPIKKELSRQDIIASRRRIARLMKEASLICKTKSKFKATTDSNHNKQTAPNLLNRKFTVSAANCYWVGDITYVPTSEGWLYLATVIDLFSRKIIGWSMNNNMKADLVNNALLMAIWQRKPPKGLIWLLIRGSQYFLIVI >NC_012732|12491:19252|15188_15476_-|WP_085065842.1|transposase|DBSCAN-SWA MTDIKPKIYPAEFKESAIRLAIESQQPLAQTARELGITKSSLYNWVNKYSKPKEVMRNDEHQYDELKRLKKELDKVTQERDLLKKAAAYFAKESR >NC_012732|12491:19252|16421_16886_+|WP_012737738.1|DBSCAN-SWA MAFNLPRIRNKSELQNNSNKRSYIDDVFNNFFNEMASFSYPSSYNERMLSPRTDIMENDSAYNLEMELPGITQDNIDLKIDSNILTIEGKKEQSTEKKDHNYHMQERYYGSFYRSISLPSNIDEEHIEAQFKDGILSIKIPKKEQSKAKKITIT >NC_012732|12491:19252|18157_19252_-|WP_012736634.1|transposase|DBSCAN-SWA MNLNQKIIKPKIGLLELAKSLGSISSACKAMGYSRDSYYRFKALYETGGEEALYEISRRKPIIANRVDPAIEKAVMDMAIEYPAYGQLRVSNELKKSGILVSPGGVRSIWLRNDLNNISKRLKALEAKMAQDGIVLTESQLQVLEERRNEREAHGETETQHPGYLGCQDTYYVGNFKGIGKVYSQVFIDSYTRVADAKLYTDKTALTAADMLNDRVLPWYETQGIPILRILTDRGSEYKGNIEHHAFELFLSIEGIEHTTTKTYSPQTNGMCERFNKTMKQEFFYTAMRKKIYTDLDDLQLDLDIWLEHFNNERPHSGKYCYGKTPMQTFKDSRKLAVEKNNEILYLEYVSDSQNLTDNQVQNL >NC_012732|12491:19252|15812_16340_+|WP_012737737.1|DBSCAN-SWA MLYNNIKLYLITCITVILFVNPAIAAEDKKTSNNNHYTIYLRHPLDFINRPFSAFDYYWNSIFDDRLSIYDSSAIKSKFITQDKQYILVLEVPGYDKSHIKLKVNNHKLFIEGNIDDTKANSATDHLNKKFNYVMSLYDDIDQKSISSKLKNGILTITLPRIELKNQNAQEIPVE >NC_012732|12491:19252|17188_18103_+|WP_012737739.1|transposase|DBSCAN-SWA MAVSKFLDPKNDIAFKKIFGSEKNKDILIHFINDIMGFKDAEQIQDVTFLSPVQDPDIAYKKQSLVDVLCKAQNGTQIIVEMQVSPSKGFEKRAQYYAAKAYSRQLSQGQKQDGLYANLKEVIFIAISDYIIFPDKADYISHHVILDKITFEHDLKDFSFSFIELPKFNIDKIEDLKTITEKWCYFFKYAANTSEADLQKIIGSDLVVGRAYEALNQFNWNEAELLAYEQEIKRIMDNKAVEDFMIESAEARGEARGMQIGKAEGKYNKSIEVAKNMLAADSDPDFISQVTGLSTIEINKLKNE |
8 | Wolbachia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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