Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011898 | Ruminiclostridium cellulolyticum H10, complete sequence | 3 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,csa3,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas1,cas2,Cas14u_CAS-V,RT,cas9 | 1 | 12 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011898_1 | 1800644-1801010 | TypeI |
NA:I-C
Consensus repeat of NC_011898_1
|
5 spacers
spacers of NC_011898_1
>1.1|1800676|34|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder TCAGGAATAAATACAATGTGATACTGTCCAACCC >1.2|1800742|35|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder AAATGAACTCTGGTATGTCAAGGATCTGGAGCAGG >1.3|1800809|36|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTACTCCCGCAATGGTTTGAGGTTGATTTGTCGAA >1.4|1800877|34|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder GTCAATGTGGAGAGCATTTGCAAGTTCGGATATA >1.5|1800943|35|NC_011898|CRISPRCasFinder TCCTAAAGCTTCAAGCTTGGCTATTGATAGTGTGG >1.6|1800676|45|NC_011898|CRT TCAGGAATAAATACAATGTGATACTGTCCAACCCGTCGCTCCTCA >1.7|1800742|46|NC_011898|CRT AAATGAACTCTGGTATGTCAAGGATCTGGAGCAGGGTCGCTCCTCA >1.8|1800809|47|NC_011898|CRT CTTACTCCCGCAATGGTTTGAGGTTGATTTGTCGAAGTCGCTCCTCT >1.9|1800877|45|NC_011898|CRT GTCAATGTGGAGAGCATTTGCAAGTTCGGATATAGTCGCTCCTCT >1.10|1800943|46|NC_011898|CRT TCCTAAAGCTTCAAGCTTGGCTATTGATAGTGTGGGTCGCTCCTCT |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011898_1
The CRISPR arrays of NC_011898_1 >merge|NC_011898|1|1800644-1801010|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATTCAGGAATAAATACAATGTGATACTGTCCAACCCGTCGCTCCTCACGTAGGAGCGTGGATTGAAATAAATGAACTCTGGTATGTCAAGGATCTGGAGCAGGGTCGCTCCTCACGTAGGAGCGTGGATTGAAATCTTACTCCCGCAATGGTTTGAGGTTGATTTGTCGAAGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATGTCAATGTGGAGAGCATTTGCAAGTTCGGATATAGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATTCCTAAAGCTTCAAGCTTGGCTATTGATAGTGTGGGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGTGACCTTTCC >NC_011898|1|1|1800644-1800942|PILER-CR GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TCAGGAATAAATACAATGTGATACTGTCCAACCC GTCGCTCCTCACGTAGGAGCGTGGATTGAAAT AAATGAACTCTGGTATGTCAAGGATCTGGAGCAGG GTCGCTCCTCACGTAGGAGCGTGGATTGAAAT CTTACTCCCGCAATGGTTTGAGGTTGATTTGTCGAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT GTCAATGTGGAGAGCATTTGCAAGTTCGGATATA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT >NC_011898|1|1|1800644-1801010|CRISPRCasFinder GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TCAGGAATAAATACAATGTGATACTGTCCAACCC GTCGCTCCTCACGTAGGAGCGTGGATTGAAAT AAATGAACTCTGGTATGTCAAGGATCTGGAGCAGG GTCGCTCCTCACGTAGGAGCGTGGATTGAAAT CTTACTCCCGCAATGGTTTGAGGTTGATTTGTCGAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT GTCAATGTGGAGAGCATTTGCAAGTTCGGATATA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TCCTAAAGCTTCAAGCTTGGCTATTGATAGTGTGG GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGTGACCTTTCC >NC_011898|1|1|1800655-1801009|CRT CGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TCAGGAATAAATACAATGTGATACTGTCCAACCCGTCGCTCCTCA CGTAGGAGCGTGGATTGAAAT AAATGAACTCTGGTATGTCAAGGATCTGGAGCAGGGTCGCTCCTCA CGTAGGAGCGTGGATTGAAAT CTTACTCCCGCAATGGTTTGAGGTTGATTTGTCGAAGTCGCTCCTCT CGTAGGAGCGTGGATTGAAAT GTCAATGTGGAGAGCATTTGCAAGTTCGGATATAGTCGCTCCTCT CGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TCCTAAAGCTTCAAGCTTGGCTATTGATAGTGTGGGTCGCTCCTCT CGTAGGAGCGTGTGACCTTTC
>NC_011898.1|WP_015924977.1|1800181_1800472_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLITYDVNTESDGGKKRLRRVAKQCINYGQRVQNSVFECVMDAAKCREVKNKLEKIIDKEKDSLRFYYLGNNYQNKVEHIGTKDSFDVEGTLII >NC_011898.1|WP_015924976.1|1799140_1800172_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLLNTVYITSPDSYLSLDGENLVVFKGNTEAVRLPLHNLESIIAFGYTGASPALMGACAKRNISLSFMTQNGKFLARVVGEVRGNVTLRKVQFRLSDNMEESTKIARNFIFGKIYNGRWVIERATRDYSERLDVNKLKRVSEGLAKALNLVLNCENLDELRGFEGEAATQYFSVLDDLILQQKDKFFFHGRNKRPPLDNVNAMLSFVYTLLAHDTAATLETVGLDPYVGFMHRDRPGRISLALDLMEEMRSVYADRFVISLINKRVINDSGFTQKEDGAVIMDDDTRRTILQAWQSRKQEKITHPFLQEKLEWGLVPYAQAMLLARFIRGDLDEYPPFLWK >NC_011898.1|WP_015924975.1|1798475_1799144_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MTEYNEEDFLLLSGIQHFAFCRRQWALIHIEQQWQENLRTVEGNILHEKAHDDGFSEKRGDVIISRGMAVFSRTLGVSGVCDIVELHKCADGVNIFGRDGLYRPVPIEYKRGKPKENDADILQLCGQAMCLEEMLLCEIKEAYMFYGETKHRLKITLDNDLRERVRDVIQEMHELFKRKYTPKVKPSKSCKACSLADICMPRLCKNPSVSKYIRDSLKEAEQ >NC_011898.1|WP_015924974.1|1797594_1798479_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MSEIIKNRYEFTVLFEVKNGNPNGDPDAGNMPRIDPETGYGIVTDVCLKRKIRNYIETVKADSTGYKIYIKDGVPLERSDREAFTYFGISDEKEAQSKKEEVDIKIKDFMCKNFFDIRTFGAVMTTFVKAKLNCGQVRGPVQLGFARSIDQIVQQEISITRVVATTEKDAAKKETEMGRKYIIPYALYRVDGYISANLAQKTTGFNEDDLSMLWDAVINMFEHEHSAARGNMSVRELIVFKHDSEFGNCPAYKLFDAVSVCRKDKSNPPRCFDDYSVDIDEKAIPSGVEVIRKI >NC_011898.1|WP_081436741.1|1797073_1797592_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MLTGVHYPAALFNSIMIRIRAERDINYYKAAIIKAFLLRNSNKFREVLTVSLNEQSNNSAYVLGRLFAVLEKAQQDASDGQLKSTIKDKYFTSACATPASVFPILLRLSQHHISKAEFGKASDIRISKILEKLDIEQNSIPAHLSLDEQGVFVLGYYHQKNALYRKNNEKEN >NC_011898.1|WP_012634672.1|1795898_1796945_-|IS481-like-element-ISCce1-family-transposase MTAQDRIVKNKMSLIELAEYLQNVSEACKIHGVSRQHFYDIKKAYEENGLEGLKDKTRRKPCMKNRVAPETEEAVLRIAYEKPAYGQLRASNELRKQGVLVSAGGVRSIWQRYNIETFDKRLKKLEEKAAKEGILYTEDQLAALEKAQQEKNISIDEIDTQHPGYLLAQDTFYVGYIKGVGRIYQQTAIDTYSAVGFAKLYTAKVPVTAADILNDRVLPFFENHMIPIMRVLTDRGTEYCGAPEKHLYELFLQMNDIEHTMTKAKSPQTNGICERFNQTILNEFYKPAFRRTMYKSVEQMQEDLDFYMLEYNEERTHQGKRCKGKTPMQTFLDSLPLAREKLLNDPAS >NC_011898.1|WP_049756823.1|1794510_1795902_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MIIQSLVRYYEILAEDENSDIPRRGYSRTGVSYALNISKDGELLGVIPLKIPSESGKKMVPQRVTVPEQEKRAVGIKSNFLCENSSYSLGIDNNGKPDRTKKCFEAFKELHNIILEEVECAEAKAFLNYVNKWDMDNASNHIALKDCLEDITAGANIVFRLDGAGYIHQNKEIQKAWEVYKSNSESSKRMQCLDCGENANVARLHPNIKGVRGAQSVGAAIVSFNAKAYESYGREDEQGLNAPVSEYATFAYTTVLNSMIADNAHKQYLGDTTVVFWAESPQKFYQDIASLFIDPGELEVGENLKYARDMGAVKEVKAIFAKISTGAAIGDFLGAFDKNIKFYILGLAPNAARLSVRFFIVDSFGDFVRKVSQHYEDLRIEKQFESDKDIFSLWRLLNETVSPKSNDKAASPVLNGTWVDTPLGNIKFCLFGTSNMEVPFYVKPAPGLISFLPSSPGGLDPTN >NC_011898.1|WP_015924973.1|1793849_1794506_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MGFGIKLEVWGEYALFTRPEMKVERVSYDVITPSAARGIIEAIYWKRAIKWVIDKIHVCNKIQFTNIRRNEVSIKIAKSNAKALMDGTKTNDYINTNEQRQQRASLVLKDVRYVIEAHFELTDKAGGDDTVEKHYNIALRRMRQGQCYHTPCFGCREFPAKFRLVEDDSIKTHYSGEQDLGFMLYDMNFSDSDNIHPIFFRAKMADGVIDLKNIAKVG >NC_011898.1|WP_015924972.1|1791650_1793837_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFAAHIREDGTKQSVKEHLLNTAVKARDFAHPFNGDDYAYTAALLHDIGKYSNEFQNRILKGGKKCDHSTAGAKEIVKINKSGRLIAYCIAGHHSGLPNYGSVSDVGIEGTLNARLNKVAIPRYDRFFDEIETINLPVMPNIKLTKNTNIGFILSFYIRFIYSCLVDADFLDTEVFMSNNSVDRTANYDFYLFRKKLNKKLSSFKTDTMINRYRKKILDACIEKAKLKRNLFNLTVPTGGGKTLSSLAFAVNHLIKNSMDRIIYVIPYTSIIEQTAREFKNIFGEENVLEHHSNFDFDDDENSIKNKMRLSSENWDMPFLVTTNVQFFESLFSHKSSRCRKLHNIANSIIIFDEVQILPIDYLKPCIEAIKQLVLNFNSTVVMCSATQPPFDKLFGELEPIEICDNHAELYNAFKRTNVKTHGVINSSNLAKEMNNIEQVLCIVNTRKHALKIFSMLEEQGSYHLSTLMCPVHRKEVINTIKERLREGLTCRVCSTRLIEAGVDVDFPLVYRAMSGLDSIVQSAGRCNREGKLMAEEKLVYGEVHVFYPEDEFVQHQPEAFKRPTMVTESIMRNFDDITSPRAICTYFEELFEITGDGLDFKKILERLESDVTNFNFSFQDISRDFKLIEDTAIPVIIPYDDKACTLIEKLKYSDYKSGILRSLQGYTVTIYKNEYDNLFGMGALDFITNGEINNKDIAILKRDSFNHLYDKNTGLKVTEETGIAIYI >NC_011898.1|WP_015924971.1|1790441_1791425_-|hypothetical-protein MKLFKKVLSGITLLAVVSTLLAVTPVSVNALTEGDIDNSQLITIGEKLKSSVADDSVTWFKFTTSSTKEPWYRIGCIYKDESNYGPHMYLYNEEGEELFEKGINDGVDNFNHIKLDPNTTYYVRINFAENTDYTVYVDEIKDDISDNEENAVSLFSGIKANGKFECVNDADTYTFSAGSSKTTISASLKYKDNRANIKVFDEDGQSLLSEFIYDATPKTYTINTVKGQKYSVIYSAVEPSFDIVKYAGTYTLTVKSGSSDIKYLAMDSVFNKATQDVYLFNGKVRLTKGIDYTVSVGRISAGKTTVTIKGKGTYTGTITKTCYVAGN >NC_011898.1|WP_095206808.1|1801076_1802221_-|IS3-like-element-ISCce4-family-transposase MKRYDSNFKEQAVRLVTEQGKSVSSVANDIGIHENTLYKWIDQYKTHKENAFPGSGNLRPEDEELRKLKKRVADLEMENELPKKSNGNLRERPEIIYPIIHEYRFKFPVEKMCRLLNISRSGYYAWVKRPESLRKKRNTELLEKIRRIHKVSRETYGSPRVTNALKNEGIKCGKNRIAKLMKENNIAAKTRKKFKATTNSNHNYPVADNILNQDFTAYKPNQIWVADITYIPTDEGWLYLAAIIDLYNRKVVGWAMDSTMTKQLCIDALKQAIGRQRHPKGVIHHSDRGVQYASKEYQKVLNSNGFTASMSRKGNCYDNACMESFFGTLKTELIYLTRFKTRAEARLAIFEYIEVFYNRIRLHSKLGYKSPVEFEKQNKAA >NC_011898.1|WP_015924980.1|1802970_1804626_+|peptidoglycan-glycosyltransferase MTKRIKTILFIFMAIFSLLVTRLFYLQVIMGPGYSNEASSQRINNIQIENSRGDFLDKNGIKLTGRTPKVTVVLKPSLLRGQNEVVDNICQILGLDSEKTKEAIQRKNTPILMEVDSETKTVLSQLNNEGISFVNTLSRYNTDTKAKHLLGYLNKVDQVGSFGLEKVYEKTLNYGKGDSIGVITDAGNNLLGGLGYRIIEEDSNKKKLDIRLTINYHIQSIIEKVLDEKGMTGAIVVENVATGDIVGMCSKPDFDPNDIENYLLNNKKPLFNRAVAQYNIGSVFKLIDLAAIFEKDQDYNMVFNCPGYIQIGDTEFKCSSYNTGGHGTVDINNALAKSCNAYFINMSLDLGAEPIISMCDKFGLGKATGLSKQGIEEAKGVIPTITDLKNPGDIANVSIGQGQTMATPVQIADMIAIIANGGVKNNVNVIDCIVNEEGNKVRDLKEIEQKRVLSKSTSDKIKNLMEGVVNTGTGKKASIDEYGGAGGKTGSAETGQYVDGQKIVQAWFAGYFPAKSPKYSVAVFIEDGRSGGESAAPIFAEIGKEIMKKGL >NC_011898.1|WP_015924981.1|1804705_1805413_-|hypothetical-protein MHSVKFKHPDQAYIFPKLLEAVNRVCNDYQKDAVCSSGYRSPECQKVTAKLVLAQNKGSYQLRDGSVYIGMGNNRKCLAAAYGKSNHCFCIAMDITGWFEALTNRQLKKYGLYKPMSYEPWHVQLIEHTEISTEQKIAIRDSCLKGGNCTMNVKEFQTITGLVNDGIPGPKTQCKAKEVLQLCQEILGNDFKCAEDIIKRTQNNPDYWLPKLKEIKYFDSFIMNIVKVLGCKDNR >NC_011898.1|WP_015924982.1|1805405_1805702_-|hypothetical-protein MQLNILITCVAAVCGIIFGYITMQARIKGESKQSGIEAGQLKADIDYIKRSSDTTLLEIRCLNNTVSNHADRLARVEESTKQAHLRINEIREDLVKDA >NC_011898.1|WP_041706653.1|1805992_1806211_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEKEGTGVIAEKSYGFLEMVKKAQQGDKEAMDKILELFTPDIDYLSRYIMLPREDAIQTLKTELMSIIYFKL >NC_011898.1|WP_015924984.1|1806159_1806510_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MYTNDDISVENCRKLLRRAAWRIQYKARVQQAKECQIIFENQAYNCGFEAEIMSKLYVKELLDTIPWEKCRFILEKTIIYEMTEKEVAIELHMTQQGVNKWKKKGLELLRKNLMDF >NC_011898.1|WP_157668447.1|1806868_1813864_+|HYR-domain-containing-protein MKEEKSPFKAKSKSISMLHRWVCYILLGVLSFSLAVVLSDGETYSAESSGAALYAVSPLNQQMMLSQPSPAVTGGRGFMMPLTVIAKDAEGKPLAGIPVTFEVSESKKVIAQMRGSESRFITTTTDINGMASCVNTYTGYVGEGYQLYSLLAGSIENLQVKANVPGWNTVTFTVQVGTYGANLVDITPPLMTVSAKDDTGAAYIAGKWTNHTVTVYYEAKDTMSSIKSCTPEQVFSVDGANMTSTGTAVDSANNSSTLTFGPICVDKSAPSTTAILPKPIALGWHQKNITINFDGMDSYSGVEYIYYRIGNGEEIKLPGPSASVVVESEGIEDIYYYSVDKAGNKESIKTISTKLDKSAPILECKINPESNEDGWNDTNVTVNLKTSDLYSGVRELHYKIGETGIENIIQGTQASFTVNSEGITDVIYWAVDNVGNISPQKCTQVKIDKTNPAVYPPKDITVEATAVKTPLDIGVATVEDMSEFELTNDAPADGFPVGTTTVTWKARDKVGNMTSAVQTITVKDTIAPVLTVQGDIVVEAAGVGTKVSLPPAKATDVFPVAISNDAPEEFPVGETTVTWTAEDANKNITKATEKVIVIDSTKPVLTVPENMTVEAIGRRTPVNIGQALATDIFKVDITNNAPADYPVGKATVTWKATDANGNVTTKDQIIIVQDTKAPDLVIPKDITIEASDRNMVLDIGQATATDIFNVTVISNAPEYYTVGTKPVVWQATDENGNITTKVQNITVTDTTKPVIKPLADIKVEATGILTPVQIQLPEVYDIFPVVISSNCPETKLFTIGTTTIKWKVIDENGNESIVEQHITVEDTTKPLLTVPKDIKVEATGIRTPVNIGQAVASDIFSVNIKNNAPDDYSIGTTKVIWTATDANGNITIGYQNVTVEDTTKPVLSVPGDKKVEATAIRTHVDPGIATAKDIFPVTIKNNAPTDYPIGSTPITWTATDENNNEDTKIQSITIVDTTKPLLIIPADITIEATQVRTPLDIGKAEAKDIFPVKVENNAPVDYPVGITKVVWKATDANGNVSEALQNIIVKDTTKPVLTVPNDITLEATAKLTPVDIGKADAKDIFPVEIKNNAPEAYRLGTTVVTWTATDANGNTITKTQNITITDKTCPNLEVPEDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTSPELEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPLGTTEVTWTATDANGNVITKVQKVTVQDTTNPELEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVTVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPELEIPQDITIEATAVNTPVEIGVATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPELEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKFESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATVVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFGVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTKPVMSVPQDIISEATAVNTPVEIGEATATDIFEVTVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNATTKVQKVTVQDTTKPVMSVPQDIISEATAIRTPVEIGKATAIDIFHVDITNDGLLDYPLDITKVTWTATDENGNITTGYQNITIRDTTKPKLTVPANITVEATAVRTPVSIGRATAIDIFPIMLLNDAPKDYPIGKTTVTWMARDINGNESQAEQYITIKDTTPPVLKIPADITVAATGSRTKVLIGTATATDIFGANVSNDAPADFPVGKTAVTWTATDANGNITKAVQYINVVQKYVVKSFNATTSATTNSIDPRIMFENTGKTEFKLSDLKIRYYFTSDSDKDQSYWCDYAEIKGASGQRNITSSVKGSSVLFTGTQCDHYIEITFSGSTETLKPGESVLVQGRFSKADWSNYTQTNDYSFNPTAKDYTETSKITVYSSGNLIGGIEP >NC_011898.1|WP_015924986.1|1813944_1817976_+|hypothetical-protein MSPVITAQKQKENTTGVKSNNIQGYAGSRKPVARKADVVEIIHRLKKDPDSLKRDDVVVLQSTIGNKALGKMLTDLKTKKEQKKDEQGKNKVGAVKSLNGTVAKVEKTKVPDIKVEEKPQKAAPEVSKKTEKQQTNNDNATVDKSIVQSQKKNKNNPVLAQSPQKTYIEKESQEVVSQKKKDKVKETSAPAKSESTTSNKITSGFGGTVKSQNEAPTKKAPAKAPVIKINSEDPGKILNSLGSVPPTEIVNAFSQASSVSETAFEKQKIKTQAKIPVIPTPTGLPSKKGPAKVVNKVKELAHSAISSFKSEKSGGKACEGMPENIKIREGDDVDADDIMQEAKEYTKNAPEIGMTGEADPNQMEGFMNEASQNAGNAKQAELNQTKQDFGENAIAPQEDPTTIKADKAIGGVLPFGVDINKQAPISPEVASRVNPQLNSQLKSFMQGKENEFQKGKTQFDSGISNAKVNADAQIENHKVEARRSQLKEQENTKSEVGGLREQWKNEISTATEEYEKDAGAETEKKKKEVGKIKDEKEGEVKKTLKDAEKDADKECKTAKKDADEEKKKQEEKPKSLAGKIWGGIKKVGKAIVDGISKAVSFIFDKLRQAVKTIFEKAKQLAVGIIEAGRRLIVSAIKGLGTVLKGLVKTLLAKFPGIANKICNLIDKAVNKAVAAVNKAAALLKKGVTAALNFMAKAVDGLFAGLQKLYKTVMAGIKKFLTMDFKKIFGAILEAAEIAAEIALAFATGGGSVLIQIVKWLATTLPQLLRTAGSVMNFVNTIKSIKLKDVLKLLSAAGIAGFLTKGLFGELTGLPKESKDEKDGKEPASGRAEKGLVKVLHALSSVFNVFKGVYNKIAGGVGKILGIINIAVKPWFATFSAIYAGAVKAMDVVGNPVETLSEGAGKLKEAVGSFFGNVKGKLQEIAGSIKSKVAILGQPAQLMKLIANKAVDMVLNFIISHPPSALIKAVFKGIEAIAGKSIVELVRQYIPFADKLFDKIAGSGPVQSLMKPLQGPINNVNGMIDEVTDGATGMVNNAEKSATSTLGSGAKLVTAMGIGKAGGSKANSKGDAKGESKGGGPKGGGDFLGILLSGIHTKLYAIGLRNIAKLGKNLASKVAGGAKAIIGKMLTPKVKFKLGNENHELWVEKGKNKNVVMMASTPDLFENKIKEGKVPDNGEIRDKETIVKKNPSEGTVKDLGKAVQKAKGVSKVAPMTWNEFEAANAGKYDKAEMSKAWEKYKGEYYPNDGKHYLERPYLRQDTINGITRGRGANGTFFDANTLLPIEGTPDIGHVYGREFWRERDKAEDKGWTQSQFNDYMNNSEFYQFEDPKSNRSHQFEDKSK >NC_011898.1|WP_015924987.1|1817993_1818365_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MQKLDEVGRDAIFYKIIDKEFGEAKQLLESTKNVNFQDENGYSYLHCAAQVKSIEIATLLINKGAIIDIQDKYGKTPLMVAISDYNGDDKMIKLLLEYGANKEMENNYGISAIKVAAMKGIDL >NC_011898.1|WP_157668490.1|1819046_1819541_+|HNH-endonuclease MKEGKVPDNGEIRDKETIVKKNPNEGTVKDLGKAVQKAKGKTPAERAEKKGYKGIGTTKNGGPDFASTEYLYPVKEGQRNIVTIKMTGDRGRDFTQAFDEAKIPSRERKSIKENYTWHHADDFDPKSGTCSMQLVQKEAHEATYTHKGSCAQYDEYHNEKIYNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011898_2 | 1802270-1802838 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NC_011898_2
|
8 spacers
spacers of NC_011898_2
>2.1|1802302|36|NC_011898|CRT AAAATCTCAACATCCTTACTATCGTGGTATATCCAG >2.2|1802370|34|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCACGATCTTGGTAAAGCGGGCTACCACAACAA >2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGATTATTTTGCCCATAAAAAAAGCAATAACCC >2.4|1802501|37|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCGAGAAAATATACCGTTACAAATCGTCAGTAAGAA >2.5|1802570|36|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCAAATGCTACACAGGTAGTTTTGAACCGTTCGCC >2.6|1802638|36|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGATGATGAGAGGATTGTATATACCGAGGTTAAAAA >2.7|1802706|35|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGAAAGTGAATCATGGCCAATGATTTTAGTAATGG >2.8|1802773|34|NC_011898|CRT,CRISPRCasFinder CTTCAAAATTCCACGATGTTTTTATTTCTACCGG |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011898_2
The CRISPR arrays of NC_011898_2 >merge|NC_011898|2|1802270-1802838|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCAAATCGGGGTAAGGTCAGTGGATTGAAATAAAATCTCAACATCCTTACTATCGTGGTATATCCAGGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATTCCACGATCTTGGTAAAGCGGGCTACCACAACAAGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATCGATTATTTTGCCCATAAAAAAAGCAATAACCCGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATTGCGAGAAAATATACCGTTACAAATCGTCAGTAAGAAGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATTGCAAATGCTACACAGGTAGTTTTGAACCGTTCGCCGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATTGATGATGAGAGGATTGTATATACCGAGGTTAAAAAGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATAGAAAGTGAATCATGGCCAATGATTTTAGTAATGGGTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAATCTTCAAAATTCCACGATGTTTTTATTTCTACCGGGTCGCTCCTCACGTAGGAGCGACATGTTTATG >NC_011898|2|2|1802270-1802838|CRT ATCAAATCGGGGTAAGGTCAGTGGATTGAAAT AAAATCTCAACATCCTTACTATCGTGGTATATCCAG GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TCCACGATCTTGGTAAAGCGGGCTACCACAACAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT CGATTATTTTGCCCATAAAAAAAGCAATAACCC GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TGCGAGAAAATATACCGTTACAAATCGTCAGTAAGAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TGCAAATGCTACACAGGTAGTTTTGAACCGTTCGCC GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TGATGATGAGAGGATTGTATATACCGAGGTTAAAAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT AGAAAGTGAATCATGGCCAATGATTTTAGTAATGG GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT CTTCAAAATTCCACGATGTTTTTATTTCTACCGG GTCGCTCCTCACGTAGGAGCGACATGTTTATG >NC_011898|2|2|1802338-1802772|PILER-CR GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TCCACGATCTTGGTAAAGCGGGCTACCACAACAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT CGATTATTTTGCCCATAAAAAAAGCAATAACCC GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TGCGAGAAAATATACCGTTACAAATCGTCAGTAAGAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TGCAAATGCTACACAGGTAGTTTTGAACCGTTCGCC GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TGATGATGAGAGGATTGTATATACCGAGGTTAAAAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT AGAAAGTGAATCATGGCCAATGATTTTAGTAATGG GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT >NC_011898|2|2|1802338-1802838|CRISPRCasFinder GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TCCACGATCTTGGTAAAGCGGGCTACCACAACAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT CGATTATTTTGCCCATAAAAAAAGCAATAACCC GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TGCGAGAAAATATACCGTTACAAATCGTCAGTAAGAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TGCAAATGCTACACAGGTAGTTTTGAACCGTTCGCC GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT TGATGATGAGAGGATTGTATATACCGAGGTTAAAAA GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT AGAAAGTGAATCATGGCCAATGATTTTAGTAATGG GTCGCTCCTCTCGTAGGAGCGTGGATTGAAAT CTTCAAAATTCCACGATGTTTTTATTTCTACCGG GTCGCTCCTCACGTAGGAGCGACATGTTTATG
>NC_011898.1|WP_095206808.1|1801076_1802221_-|IS3-like-element-ISCce4-family-transposase MKRYDSNFKEQAVRLVTEQGKSVSSVANDIGIHENTLYKWIDQYKTHKENAFPGSGNLRPEDEELRKLKKRVADLEMENELPKKSNGNLRERPEIIYPIIHEYRFKFPVEKMCRLLNISRSGYYAWVKRPESLRKKRNTELLEKIRRIHKVSRETYGSPRVTNALKNEGIKCGKNRIAKLMKENNIAAKTRKKFKATTNSNHNYPVADNILNQDFTAYKPNQIWVADITYIPTDEGWLYLAAIIDLYNRKVVGWAMDSTMTKQLCIDALKQAIGRQRHPKGVIHHSDRGVQYASKEYQKVLNSNGFTASMSRKGNCYDNACMESFFGTLKTELIYLTRFKTRAEARLAIFEYIEVFYNRIRLHSKLGYKSPVEFEKQNKAA >NC_011898.1|WP_015924977.1|1800181_1800472_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLITYDVNTESDGGKKRLRRVAKQCINYGQRVQNSVFECVMDAAKCREVKNKLEKIIDKEKDSLRFYYLGNNYQNKVEHIGTKDSFDVEGTLII >NC_011898.1|WP_015924976.1|1799140_1800172_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLLNTVYITSPDSYLSLDGENLVVFKGNTEAVRLPLHNLESIIAFGYTGASPALMGACAKRNISLSFMTQNGKFLARVVGEVRGNVTLRKVQFRLSDNMEESTKIARNFIFGKIYNGRWVIERATRDYSERLDVNKLKRVSEGLAKALNLVLNCENLDELRGFEGEAATQYFSVLDDLILQQKDKFFFHGRNKRPPLDNVNAMLSFVYTLLAHDTAATLETVGLDPYVGFMHRDRPGRISLALDLMEEMRSVYADRFVISLINKRVINDSGFTQKEDGAVIMDDDTRRTILQAWQSRKQEKITHPFLQEKLEWGLVPYAQAMLLARFIRGDLDEYPPFLWK >NC_011898.1|WP_015924975.1|1798475_1799144_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MTEYNEEDFLLLSGIQHFAFCRRQWALIHIEQQWQENLRTVEGNILHEKAHDDGFSEKRGDVIISRGMAVFSRTLGVSGVCDIVELHKCADGVNIFGRDGLYRPVPIEYKRGKPKENDADILQLCGQAMCLEEMLLCEIKEAYMFYGETKHRLKITLDNDLRERVRDVIQEMHELFKRKYTPKVKPSKSCKACSLADICMPRLCKNPSVSKYIRDSLKEAEQ >NC_011898.1|WP_015924974.1|1797594_1798479_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MSEIIKNRYEFTVLFEVKNGNPNGDPDAGNMPRIDPETGYGIVTDVCLKRKIRNYIETVKADSTGYKIYIKDGVPLERSDREAFTYFGISDEKEAQSKKEEVDIKIKDFMCKNFFDIRTFGAVMTTFVKAKLNCGQVRGPVQLGFARSIDQIVQQEISITRVVATTEKDAAKKETEMGRKYIIPYALYRVDGYISANLAQKTTGFNEDDLSMLWDAVINMFEHEHSAARGNMSVRELIVFKHDSEFGNCPAYKLFDAVSVCRKDKSNPPRCFDDYSVDIDEKAIPSGVEVIRKI >NC_011898.1|WP_081436741.1|1797073_1797592_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MLTGVHYPAALFNSIMIRIRAERDINYYKAAIIKAFLLRNSNKFREVLTVSLNEQSNNSAYVLGRLFAVLEKAQQDASDGQLKSTIKDKYFTSACATPASVFPILLRLSQHHISKAEFGKASDIRISKILEKLDIEQNSIPAHLSLDEQGVFVLGYYHQKNALYRKNNEKEN >NC_011898.1|WP_012634672.1|1795898_1796945_-|IS481-like-element-ISCce1-family-transposase MTAQDRIVKNKMSLIELAEYLQNVSEACKIHGVSRQHFYDIKKAYEENGLEGLKDKTRRKPCMKNRVAPETEEAVLRIAYEKPAYGQLRASNELRKQGVLVSAGGVRSIWQRYNIETFDKRLKKLEEKAAKEGILYTEDQLAALEKAQQEKNISIDEIDTQHPGYLLAQDTFYVGYIKGVGRIYQQTAIDTYSAVGFAKLYTAKVPVTAADILNDRVLPFFENHMIPIMRVLTDRGTEYCGAPEKHLYELFLQMNDIEHTMTKAKSPQTNGICERFNQTILNEFYKPAFRRTMYKSVEQMQEDLDFYMLEYNEERTHQGKRCKGKTPMQTFLDSLPLAREKLLNDPAS >NC_011898.1|WP_049756823.1|1794510_1795902_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MIIQSLVRYYEILAEDENSDIPRRGYSRTGVSYALNISKDGELLGVIPLKIPSESGKKMVPQRVTVPEQEKRAVGIKSNFLCENSSYSLGIDNNGKPDRTKKCFEAFKELHNIILEEVECAEAKAFLNYVNKWDMDNASNHIALKDCLEDITAGANIVFRLDGAGYIHQNKEIQKAWEVYKSNSESSKRMQCLDCGENANVARLHPNIKGVRGAQSVGAAIVSFNAKAYESYGREDEQGLNAPVSEYATFAYTTVLNSMIADNAHKQYLGDTTVVFWAESPQKFYQDIASLFIDPGELEVGENLKYARDMGAVKEVKAIFAKISTGAAIGDFLGAFDKNIKFYILGLAPNAARLSVRFFIVDSFGDFVRKVSQHYEDLRIEKQFESDKDIFSLWRLLNETVSPKSNDKAASPVLNGTWVDTPLGNIKFCLFGTSNMEVPFYVKPAPGLISFLPSSPGGLDPTN >NC_011898.1|WP_015924973.1|1793849_1794506_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MGFGIKLEVWGEYALFTRPEMKVERVSYDVITPSAARGIIEAIYWKRAIKWVIDKIHVCNKIQFTNIRRNEVSIKIAKSNAKALMDGTKTNDYINTNEQRQQRASLVLKDVRYVIEAHFELTDKAGGDDTVEKHYNIALRRMRQGQCYHTPCFGCREFPAKFRLVEDDSIKTHYSGEQDLGFMLYDMNFSDSDNIHPIFFRAKMADGVIDLKNIAKVG >NC_011898.1|WP_015924972.1|1791650_1793837_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFAAHIREDGTKQSVKEHLLNTAVKARDFAHPFNGDDYAYTAALLHDIGKYSNEFQNRILKGGKKCDHSTAGAKEIVKINKSGRLIAYCIAGHHSGLPNYGSVSDVGIEGTLNARLNKVAIPRYDRFFDEIETINLPVMPNIKLTKNTNIGFILSFYIRFIYSCLVDADFLDTEVFMSNNSVDRTANYDFYLFRKKLNKKLSSFKTDTMINRYRKKILDACIEKAKLKRNLFNLTVPTGGGKTLSSLAFAVNHLIKNSMDRIIYVIPYTSIIEQTAREFKNIFGEENVLEHHSNFDFDDDENSIKNKMRLSSENWDMPFLVTTNVQFFESLFSHKSSRCRKLHNIANSIIIFDEVQILPIDYLKPCIEAIKQLVLNFNSTVVMCSATQPPFDKLFGELEPIEICDNHAELYNAFKRTNVKTHGVINSSNLAKEMNNIEQVLCIVNTRKHALKIFSMLEEQGSYHLSTLMCPVHRKEVINTIKERLREGLTCRVCSTRLIEAGVDVDFPLVYRAMSGLDSIVQSAGRCNREGKLMAEEKLVYGEVHVFYPEDEFVQHQPEAFKRPTMVTESIMRNFDDITSPRAICTYFEELFEITGDGLDFKKILERLESDVTNFNFSFQDISRDFKLIEDTAIPVIIPYDDKACTLIEKLKYSDYKSGILRSLQGYTVTIYKNEYDNLFGMGALDFITNGEINNKDIAILKRDSFNHLYDKNTGLKVTEETGIAIYI >NC_011898.1|WP_015924980.1|1802970_1804626_+|peptidoglycan-glycosyltransferase MTKRIKTILFIFMAIFSLLVTRLFYLQVIMGPGYSNEASSQRINNIQIENSRGDFLDKNGIKLTGRTPKVTVVLKPSLLRGQNEVVDNICQILGLDSEKTKEAIQRKNTPILMEVDSETKTVLSQLNNEGISFVNTLSRYNTDTKAKHLLGYLNKVDQVGSFGLEKVYEKTLNYGKGDSIGVITDAGNNLLGGLGYRIIEEDSNKKKLDIRLTINYHIQSIIEKVLDEKGMTGAIVVENVATGDIVGMCSKPDFDPNDIENYLLNNKKPLFNRAVAQYNIGSVFKLIDLAAIFEKDQDYNMVFNCPGYIQIGDTEFKCSSYNTGGHGTVDINNALAKSCNAYFINMSLDLGAEPIISMCDKFGLGKATGLSKQGIEEAKGVIPTITDLKNPGDIANVSIGQGQTMATPVQIADMIAIIANGGVKNNVNVIDCIVNEEGNKVRDLKEIEQKRVLSKSTSDKIKNLMEGVVNTGTGKKASIDEYGGAGGKTGSAETGQYVDGQKIVQAWFAGYFPAKSPKYSVAVFIEDGRSGGESAAPIFAEIGKEIMKKGL >NC_011898.1|WP_015924981.1|1804705_1805413_-|hypothetical-protein MHSVKFKHPDQAYIFPKLLEAVNRVCNDYQKDAVCSSGYRSPECQKVTAKLVLAQNKGSYQLRDGSVYIGMGNNRKCLAAAYGKSNHCFCIAMDITGWFEALTNRQLKKYGLYKPMSYEPWHVQLIEHTEISTEQKIAIRDSCLKGGNCTMNVKEFQTITGLVNDGIPGPKTQCKAKEVLQLCQEILGNDFKCAEDIIKRTQNNPDYWLPKLKEIKYFDSFIMNIVKVLGCKDNR >NC_011898.1|WP_015924982.1|1805405_1805702_-|hypothetical-protein MQLNILITCVAAVCGIIFGYITMQARIKGESKQSGIEAGQLKADIDYIKRSSDTTLLEIRCLNNTVSNHADRLARVEESTKQAHLRINEIREDLVKDA >NC_011898.1|WP_041706653.1|1805992_1806211_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEKEGTGVIAEKSYGFLEMVKKAQQGDKEAMDKILELFTPDIDYLSRYIMLPREDAIQTLKTELMSIIYFKL >NC_011898.1|WP_015924984.1|1806159_1806510_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MYTNDDISVENCRKLLRRAAWRIQYKARVQQAKECQIIFENQAYNCGFEAEIMSKLYVKELLDTIPWEKCRFILEKTIIYEMTEKEVAIELHMTQQGVNKWKKKGLELLRKNLMDF >NC_011898.1|WP_157668447.1|1806868_1813864_+|HYR-domain-containing-protein MKEEKSPFKAKSKSISMLHRWVCYILLGVLSFSLAVVLSDGETYSAESSGAALYAVSPLNQQMMLSQPSPAVTGGRGFMMPLTVIAKDAEGKPLAGIPVTFEVSESKKVIAQMRGSESRFITTTTDINGMASCVNTYTGYVGEGYQLYSLLAGSIENLQVKANVPGWNTVTFTVQVGTYGANLVDITPPLMTVSAKDDTGAAYIAGKWTNHTVTVYYEAKDTMSSIKSCTPEQVFSVDGANMTSTGTAVDSANNSSTLTFGPICVDKSAPSTTAILPKPIALGWHQKNITINFDGMDSYSGVEYIYYRIGNGEEIKLPGPSASVVVESEGIEDIYYYSVDKAGNKESIKTISTKLDKSAPILECKINPESNEDGWNDTNVTVNLKTSDLYSGVRELHYKIGETGIENIIQGTQASFTVNSEGITDVIYWAVDNVGNISPQKCTQVKIDKTNPAVYPPKDITVEATAVKTPLDIGVATVEDMSEFELTNDAPADGFPVGTTTVTWKARDKVGNMTSAVQTITVKDTIAPVLTVQGDIVVEAAGVGTKVSLPPAKATDVFPVAISNDAPEEFPVGETTVTWTAEDANKNITKATEKVIVIDSTKPVLTVPENMTVEAIGRRTPVNIGQALATDIFKVDITNNAPADYPVGKATVTWKATDANGNVTTKDQIIIVQDTKAPDLVIPKDITIEASDRNMVLDIGQATATDIFNVTVISNAPEYYTVGTKPVVWQATDENGNITTKVQNITVTDTTKPVIKPLADIKVEATGILTPVQIQLPEVYDIFPVVISSNCPETKLFTIGTTTIKWKVIDENGNESIVEQHITVEDTTKPLLTVPKDIKVEATGIRTPVNIGQAVASDIFSVNIKNNAPDDYSIGTTKVIWTATDANGNITIGYQNVTVEDTTKPVLSVPGDKKVEATAIRTHVDPGIATAKDIFPVTIKNNAPTDYPIGSTPITWTATDENNNEDTKIQSITIVDTTKPLLIIPADITIEATQVRTPLDIGKAEAKDIFPVKVENNAPVDYPVGITKVVWKATDANGNVSEALQNIIVKDTTKPVLTVPNDITLEATAKLTPVDIGKADAKDIFPVEIKNNAPEAYRLGTTVVTWTATDANGNTITKTQNITITDKTCPNLEVPEDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTSPELEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPLGTTEVTWTATDANGNVITKVQKVTVQDTTNPELEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVTVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPELEIPQDITIEATAVNTPVEIGVATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPELEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKFESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATVVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFGVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTNPGLEIPQDITIEATAVNTPVEIGEATATDIFEVNVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNVTTKVQKVTVQDTTKPVMSVPQDIISEATAVNTPVEIGEATATDIFEVTVSNNKLESYPVGTTEVTWTATDANGNATTKVQKVTVQDTTKPVMSVPQDIISEATAIRTPVEIGKATAIDIFHVDITNDGLLDYPLDITKVTWTATDENGNITTGYQNITIRDTTKPKLTVPANITVEATAVRTPVSIGRATAIDIFPIMLLNDAPKDYPIGKTTVTWMARDINGNESQAEQYITIKDTTPPVLKIPADITVAATGSRTKVLIGTATATDIFGANVSNDAPADFPVGKTAVTWTATDANGNITKAVQYINVVQKYVVKSFNATTSATTNSIDPRIMFENTGKTEFKLSDLKIRYYFTSDSDKDQSYWCDYAEIKGASGQRNITSSVKGSSVLFTGTQCDHYIEITFSGSTETLKPGESVLVQGRFSKADWSNYTQTNDYSFNPTAKDYTETSKITVYSSGNLIGGIEP >NC_011898.1|WP_015924986.1|1813944_1817976_+|hypothetical-protein MSPVITAQKQKENTTGVKSNNIQGYAGSRKPVARKADVVEIIHRLKKDPDSLKRDDVVVLQSTIGNKALGKMLTDLKTKKEQKKDEQGKNKVGAVKSLNGTVAKVEKTKVPDIKVEEKPQKAAPEVSKKTEKQQTNNDNATVDKSIVQSQKKNKNNPVLAQSPQKTYIEKESQEVVSQKKKDKVKETSAPAKSESTTSNKITSGFGGTVKSQNEAPTKKAPAKAPVIKINSEDPGKILNSLGSVPPTEIVNAFSQASSVSETAFEKQKIKTQAKIPVIPTPTGLPSKKGPAKVVNKVKELAHSAISSFKSEKSGGKACEGMPENIKIREGDDVDADDIMQEAKEYTKNAPEIGMTGEADPNQMEGFMNEASQNAGNAKQAELNQTKQDFGENAIAPQEDPTTIKADKAIGGVLPFGVDINKQAPISPEVASRVNPQLNSQLKSFMQGKENEFQKGKTQFDSGISNAKVNADAQIENHKVEARRSQLKEQENTKSEVGGLREQWKNEISTATEEYEKDAGAETEKKKKEVGKIKDEKEGEVKKTLKDAEKDADKECKTAKKDADEEKKKQEEKPKSLAGKIWGGIKKVGKAIVDGISKAVSFIFDKLRQAVKTIFEKAKQLAVGIIEAGRRLIVSAIKGLGTVLKGLVKTLLAKFPGIANKICNLIDKAVNKAVAAVNKAAALLKKGVTAALNFMAKAVDGLFAGLQKLYKTVMAGIKKFLTMDFKKIFGAILEAAEIAAEIALAFATGGGSVLIQIVKWLATTLPQLLRTAGSVMNFVNTIKSIKLKDVLKLLSAAGIAGFLTKGLFGELTGLPKESKDEKDGKEPASGRAEKGLVKVLHALSSVFNVFKGVYNKIAGGVGKILGIINIAVKPWFATFSAIYAGAVKAMDVVGNPVETLSEGAGKLKEAVGSFFGNVKGKLQEIAGSIKSKVAILGQPAQLMKLIANKAVDMVLNFIISHPPSALIKAVFKGIEAIAGKSIVELVRQYIPFADKLFDKIAGSGPVQSLMKPLQGPINNVNGMIDEVTDGATGMVNNAEKSATSTLGSGAKLVTAMGIGKAGGSKANSKGDAKGESKGGGPKGGGDFLGILLSGIHTKLYAIGLRNIAKLGKNLASKVAGGAKAIIGKMLTPKVKFKLGNENHELWVEKGKNKNVVMMASTPDLFENKIKEGKVPDNGEIRDKETIVKKNPSEGTVKDLGKAVQKAKGVSKVAPMTWNEFEAANAGKYDKAEMSKAWEKYKGEYYPNDGKHYLERPYLRQDTINGITRGRGANGTFFDANTLLPIEGTPDIGHVYGREFWRERDKAEDKGWTQSQFNDYMNNSEFYQFEDPKSNRSHQFEDKSK >NC_011898.1|WP_015924987.1|1817993_1818365_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MQKLDEVGRDAIFYKIIDKEFGEAKQLLESTKNVNFQDENGYSYLHCAAQVKSIEIATLLINKGAIIDIQDKYGKTPLMVAISDYNGDDKMIKLLLEYGANKEMENNYGISAIKVAAMKGIDL >NC_011898.1|WP_157668490.1|1819046_1819541_+|HNH-endonuclease MKEGKVPDNGEIRDKETIVKKNPNEGTVKDLGKAVQKAKGKTPAERAEKKGYKGIGTTKNGGPDFASTEYLYPVKEGQRNIVTIKMTGDRGRDFTQAFDEAKIPSRERKSIKENYTWHHADDFDPKSGTCSMQLVQKEAHEATYTHKGSCAQYDEYHNEKIYNK >NC_011898.1|WP_015924989.1|1819563_1820028_+|SMI1/KNR4-family-protein MDSIYNNEFINTKEKLSEWDLQEIEKKFSFKIPSDIYKHYLLYNGGYPEKCIFVDADGRRYEVEHFIPIKNSNNKRSLDKVLSLHYDDKLLPSWLIPLADEAGGDLYCYSLRENEIGAIYYWSHEFEYGENPEEHIKYLASNIKQFINTMIEDE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011898_3 | 3652357-3652923 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NC_011898_3
|
8 spacers
spacers of NC_011898_3
>3.1|3652393|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAAAATAAGCAAGCGATGATATGAATGC >3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG >3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG >3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG >3.5|3652660|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATTATCTATATTATAAATTATCATATAT >3.6|3652726|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATTATCTATATTATAAATTATCATATAT >3.7|3652792|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAACACGTTGCTAACAGTGATTAGTTTA >3.8|3652858|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATTATTATAAGCCGTTAAATGGCAGAAA |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011898_3
The CRISPR arrays of NC_011898_3 >merge|NC_011898|3|3652357-3652923|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTATAGCTCCGATTCAAGCTCCGATATGCTATAATTAAAAAATAAGCAAGCGATGATATGAATGCGTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAATTATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAGGTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAATTATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAGGTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAATTATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAGGTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAATCTATTATCTATATTATAAATTATCATATATGTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAATCTATTATCTATATTATAAATTATCATATATGTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAATGGTAACACGTTGCTAACAGTGATTAGTTTAGTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAATCAATTATTATAAGCCGTTAAATGGCAGAAAGTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT >NC_011898|3|3|3652357-3652923|PILER-CR GTTATAGCTCCGATTCAAGCTCCGATATGCTATAAT TAAAAAATAAGCAAGCGATGATATGAATGC GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT CTATTATCTATATTATAAATTATCATATAT GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT CTATTATCTATATTATAAATTATCATATAT GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT GGTAACACGTTGCTAACAGTGATTAGTTTA GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT CAATTATTATAAGCCGTTAAATGGCAGAAA GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT >NC_011898|3|3|3652357-3652923|CRISPRCasFinder GTTATAGCTCCGATTCAAGCTCCGATATGCTATAAT TAAAAAATAAGCAAGCGATGATATGAATGC GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT CTATTATCTATATTATAAATTATCATATAT GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT CTATTATCTATATTATAAATTATCATATAT GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT GGTAACACGTTGCTAACAGTGATTAGTTTA GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT CAATTATTATAAGCCGTTAAATGGCAGAAA GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT >NC_011898|3|3|3652357-3652923|CRT GTTATAGCTCCGATTCAAGCTCCGATATGCTATAAT TAAAAAATAAGCAAGCGATGATATGAATGC GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT TATATTTGTAAGCATCATATTCACCAATAAG GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT CTATTATCTATATTATAAATTATCATATAT GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT CTATTATCTATATTATAAATTATCATATAT GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT GGTAACACGTTGCTAACAGTGATTAGTTTA GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT CAATTATTATAAGCCGTTAAATGGCAGAAA GTTATAGCTCCAATTCAGGCTCCGATATGCTATAAT
>NC_011898.1|WP_020816302.1|3651743_3651878_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MKGKIKLLVLTVLSLVGVFAATASAGACWLWSYYQKECPKSLLK >NC_011898.1|WP_015926466.1|3650436_3651729_+|GHKL-domain-containing-protein MLIIGQLLINTVFAMITAYLTYIFIKNNFNIQIQLKSLVVFVIFNGMLSGIVSTLWMSVLPIPGNLQFLKTIILIIINIIMLRYFLHIEWAKAVLAFCLMTLFIGISNFTVPLVFYICGINATPDIINNNIPLFVLMNIVIYAVTLLLIKLSPYAKIIGNIKNLTPIGFLLVITILIMASFLGVHFVVHFDPVSFILVLLSSIAYFFFSVWYISIYHKYEMQREERNQQEFYNESLANTLHDLRRIKHDQMNHISVLYSMQKMKRFDETTSYLKEMLDTSSSVGNTAIYNIKNAGLFGLISAKINFAKSNGVKINLKIIGIVDSIPYIKISELCEVIGIYLDNALEEVLINGKLKFDMQIISTDSNLTIRVDNQCDKFPNIKKSSKGKDRGDGLNIANKIISSYKNILSSTFFDESSMIFSQVLTIAKEA >NC_011898.1|WP_015926465.1|3649729_3650437_+|response-regulator-transcription-factor MINIAVLDDELKFIYDYENKIPEILKKNSIEGSLIIATNSTSKFIDTVKSNKVNVCILDIDLKSDITGMNIANQLRQEDYPCEIIFMTGHYEYIKEAFNVQAFNFIQKPGWDELERNILKLSNEDLKRISKKTVGIKCGFDVIFINFDTILCIEHVGTKTTIHTTTGRYDTYEGLEDLINRINDKRFIRCHRSVFININYLQKIDIKNREIMLTDGSQYKIGPKYYPVFQTWRDL >NC_011898.1|WP_015926464.1|3649026_3649350_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MGLEVINELRKLKGLTSEQLSNQSGVPIGTLNKILSGVTKDPKLETLKALAKVLDCSLNDFDDSNNNNTCNSKTYSEAFKIFQMLNSDFQRYALNQIKSLLDLQNKL >NC_011898.1|WP_015926463.1|3648647_3648863_-|hypothetical-protein MFYNLLAEMARHRPRITKLNIAECLEISEKTARNYLNGTSKIPWSDALKIKNTYFSELEMEYLFETDENNN >NC_011898.1|WP_015926461.1|3647792_3647930_-|hypothetical-protein MIKRIEFVDPNLPSDIEKILPSILAQALINKLQNENITDNKNKSA >NC_011898.1|WP_041707052.1|3646231_3647737_-|recombinase-family-protein MRVAAYCRVSTEKDEQLLSLKAQKEFFEEYADKMGFELVALYADEGISGTKLKNRKQFNKMMQDAERGLFERVYVKDVSRLARNVVDFLQSIRKLKSLNIDCQFITANMSANDGELTLTILAAVAQEESSNLSKRVKFGKKKNAEMGKVPNLVFGYDKTVGDYFNLKINVREAEIVKRIFDMYINKGFGTNKISQILNKECIKTKRNCNWSQNAICRILSNELYTGKVINCKERVEDFLTGKRVKVEESGQSIVDKPEIAIISRSEFEQAQSLLGQRVDTFKIKKERHSNKYALSTLIKCGCCDRSFRRIYRKRENSEYIKWGCSTRNSDGATQCSNTTLVDEVELLDEIKEYLNTVVSSKEKLLEKTINEFKKKYKLGHGETNESDLTSELERLKKLKLKQTKMYEADIISIEELKERTADINEAIRKAEAELSILQGNTSTFDRLEAIVKKYCGSINDVLNTDTIDNSMLKKVIDKIVVNTDGGIKVYLKLFKDLELVN >NC_011898.1|WP_015926459.1|3644414_3644903_-|cation:proton-antiporter-regulatory-subunit MIVREIDLPGIGRKFEIEIGGGDKIVVIVHDDGRRELYHFCNGEDDSVSVISLEDTEARLLASIIGGMAYSPKSMDNVEVVIGGLVIEWYRVEEGSACIGKTIEEMNIRQATGVTILAVVEKNREKNINPRPDYQFKPNSTLIVTGERKNLNTFKNYIRDGR >NC_011898.1|WP_041706802.1|3643212_3644412_-|cation:proton-antiporter MGNLIFEIGLAVALIAIVGLISKKLRFSVIPFYILIGMAVGPHAPHFGIFDLRFIESSTFIEFMGRLGMLFLLFSLGMEFSVSRFVKSGKSILTGGLCYIAINFFTGLMIGWIGGLPINETLVICGIMTSSSTAIVAKVLMDLKRTANRETEIIMGMIMFDDLFIAIHISILSGLLLSGSKSVWGIIFTAATALFFILFMLFVGKRLIKYLDKLLNIQSTELFLLIVMALLFLFAGFSESLHVAESIGALLVGLVFAESVHAKRIEQNILPFKDFFGAVFFFSFGLTIDPMSLGGAVWLAVVAALLTVVGNIVSGLIAGHIAGITGSARANIGLTLASRGEFSIIMANIGKAGGLMPVIQSFAVLYVLILAIAGPVMSKQSVQIYNGYQKIFGRKKREK >NC_011898.1|WP_015926456.1|3642270_3642663_+|Zn-finger-containing-protein MNWFRKFMIGRYGPDHLSAGLLFLSLLISLIGMFVPIKWFGYLSYIPLLLCFYRLFSKNIYGRRAENNKFLKLWNPIAAWFLKKKTRIGDSKTHRYYKCPKCQQEVRVPKGKGKIQITCPKCKAEFIRKS >NC_011898.1|WP_041707054.1|3652989_3653307_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRILVFFDLPVKKKMDRDNYTKFRRNLIKDGFCMIQYSVYCRVCSCPEMAEKHVNKVKTFLPAKGSVRVLTVTDRQYSSMIILLGKKTSNEWIDKKMIEGQGMLI >NC_011898.1|WP_015926468.1|3653329_3654226_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRNIIVSNPTKLKLKQNNLWVEQSDGFSIPIDDINTIVLDSADVTITSALLSKLAEEDIALYSCDGKHTPNGVLLPFSCHSRQYKIVKTQINLSAPFKKRCWQRVVQQKIENQAFCLNILELKGRDELINLSKSVLSGDSTNVEAHAAKYYFSVLFTNFKRGMQDNTNYALNYGYSILRGAVARTIASYGFIPSIGIHHRSELNNFNLADDFIEPFRPIVDMWVKQNINEDTLLTPKHKLNLISLLGYECVFEGKIISIRSAIEKVISSFSSSCAKNDYSLLKLPEIIPLEVHANE >NC_011898.1|WP_015926469.1|3654188_3657254_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKYTLGLDVGIASVGWAVIDKDNNKIIDLGVRCFDKAEESKTGESLATARRIARGMRRRISRRSQRLRLVKKLFVQYEIIKDSSEFNRIFDTSRDGWKDPWELRYNALSRILKPYELVQVLTHITKRRGFKSNRKEDLSTTKEGVVITSIKNNSEMLRTKNYRTIGEMIFMETPENSNKRNKVDEYIHTIAREDLLNEIKYIFSIQRKLGSPFVTEKLEHDFLNIWEFQRPFASGDSILSKVGKCTLLKEELRAPTSCYTSEYFGLLQSINNLVLVEDNNTLTLNNDQRAKIIEYAHFKNEIKYSEIRKLLDIEPEILFKAHNLTHKNPSGNNESKKFYEMKSYHKLKSTLPTDIWGKLHSNKESLDNLFYCLTVYKNDNEIKDYLQANNLDYLIEYIAKLPTFNKFKHLSLVAMKRIIPFMEKGYKYSDACNMAELDFTGSSKLEKCNKLTVEPIIENVTNPVVIRALTQARKVINAIIQKYGLPYMVNIELAREAGMTRQDRDNLKKEHENNRKAREKISDLIRQNGRVASGLDILKWRLWEDQGGRCAYSGKPIPVCDLLNDSLTQIDHIYPYSRSMDDSYMNKVLVLTDENQNKRSYTPYEVWGSTEKWEDFEARIYSMHLPQSKEKRLLNRNFITKDLDSFISRNLNDTRYISRFLKNYIESYLQFSNDSPKSCVVCVNGQCTAQLRSRWGLNKNREESDLHHALDAAVIACADRKIIKEITNYYNERENHNYKVKYPLPWHSFRQDLMETLAGVFISRAPRRKITGPAHDETIRSPKHFNKGLTSVKIPLTTVTLEKLETMVKNTKGGISDKAVYNVLKNRLIEHNNKPLKAFAEKIYKPLKNGTNGAIIRSIRVETPSYTGVFRNEGKGISDNSLMVRVDVFKKKDKYYLVPIYVAHMIKKELPSKAIVPLKPESQWELIDSTHEFLFSLYQNDYLVIKTKKGITEGYYRSCHRGTGSLSLMPHFANNKNVKIDIGVRTAISIEKYNVDILGNKSIVKGEPRRGMEKYNSFKSN >NC_011898.1|WP_015926471.1|3658713_3659283_-|hypothetical-protein MLRFKKVTSLVLVLCILFAFSVQSFAASNEDSSVTTITQNKVADSTQIDEEKVKDVLEQLVKDKSITMDYSEQVTAIVEKYADSSSSNSNAGTIHTNYYNQSTGAVIVYSSMPSPLHGQLMFNKAGWNIIKEVLNLGGGSATVGFAIAAIAGITVTAPVAAIIGGALVIENALVNLQFSLGSEFATITF >NC_011898.1|WP_015926473.1|3660782_3661916_-|hypothetical-protein MMLYLCSHNNVNLFDWLNESSLVAQPFMLKKISSTQLDLSAFAKKEAIGINYYKYLAIDLSAVVNDTETFKLAIQSIHIMNPKIKFLYIDIGNKTNVLQEVLKTFGDIPVITENPEEDMSRFKTQVTAGLQYTQQILDTEKESRGNTVIASNTTTGKNEASKKCEAKKEYIFKNQKVMVAVINAYPRAGSTTLSINMAAYLNSIGATVSCVELNGELGHLDKIINSTPGFTAVTENRFEREGVVYLKGEIPEEVNFVINDMSRVIQDESSEGALEFAKNCNVAILCGTSKPYELQEIKKKIELLQKYGCYKINLCLAFTPEHEKAHLADLFGDKHISVYFTEYTPDMFAEDVNSDVFQRIFQEYIKEKTNDNMVKLF >NC_011898.1|WP_015926474.1|3661890_3662073_-|hypothetical-protein MKNSTNKVLELLFYAALSIIFIVLYFINKPYDKKPVHVDSPAKTTIESQVSPYDALPMQP >NC_011898.1|WP_015926475.1|3662084_3663017_-|M23-family-metallopeptidase MAINPALIKAAVQIVSTEKGRKGLLIAIFVPIGILMLIICVIFYILTAPFQFLTDTYSLSADEQTAIQNAQTDYGFYLIPENKVLDRGGLFTYPTEGTTGTRGFSPTPVHHPVLGISRPHWGQDFNTQWHSNVYAIADGQVYNMGISDEAGMFLVLYHDVNGKQFFTRYLHLSAIHVHQNSRIRQGDAVASEGGEPGKDMYPGTSTGHHLHFEVRVGSTYSSAVPVDPKLYIDPVPIEISCSSGKGSIKVNIAGGKDRGYEVSIDGGITWIGTFEKTYTFSSLNSGSYSIVARDWSYQDNISKVSIVSLN >NC_011898.1|WP_015926476.1|3663029_3664862_-|DUF87-domain-containing-protein MSRKNTEEIPINGALLNSITPIGMEFKQNTINVGESMGRVYGIVKYPQSADYGWLSKLTNIPSTVASITFTPVDDSVFLESLSNTIKQKRGECESAKDALTASRAKRAADDAEKMMIQVDQHGEKIGAMSLLVAPLTRDEKLLKKVCQKVESAIAVAKCKGRVLSSLQKESFKQLSPFYASNEQIERITQRILPLSSFIGGFPFASSGLNDGQGYYLAKDASGGLVVVDPWMRGGDRTNSCMTIMGVGGVGKSTAIKHIIMAEYMRGTKIIIIDPESEYKELTRNLQGDWLNCGGGIKGRLNPLQIRQVPKDDEDEDGERLYEDEGNGMGALALHMKSLEIFFKLYKPSFNDKHMALIKICLIEMYEKFGITWDTDVTNLKNEDYPIFTDLNEIIEEKKSKETEPNIKALYVDISLLLHDLIFGSDQFLWNGHTSIDTKTRCVCLDTHDLQDTSDNIKSTQYFTILQWAWEQMTRDREERVLLISDEAYLMIDHRVPQSLIFLRNAVKRARKYEAAIAIISHSVVDFLDPSVKMYGQALLDIPCIKILMGTDGKNLQETKELYKLTEAEEELLAAKRRKIALLIIGSKRLQIEFDLPEYKMKYFGKAGGK >NC_011898.1|WP_015926477.1|3664864_3665608_-|hypothetical-protein MDLITIIFPILAVIGGVIALYVINKGNVKTKNNSPVRINKGTKASRNKTTEEITAQEFVNVRDITDKYLYTRDGFVFSYIRIYPISPDLLSRREKRTLTRQLTAELSAETERFGFLALSRPVDISPLVKEYSELLSDTNDPVQKEILKSEMQAMSNYALSGEVVERQFYIKIWDKYSEGVENELQKRCFTLLGYFTSSNINGEILIEEDIIRLSNLITNPAYVHIENTDVRASMPIIESLVAAAKEE >NC_011898.1|WP_015926479.1|3665761_3666004_-|AbrB/MazE/SpoVT-family-DNA-binding-domain-containing-protein MKSTGIVRRVDELGRVVIPKETRQVLSISERDSLEIFTDEDMILLKKYSPGCIFCNNVKNLTVYKNKHICEECSHDLKSK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011898_2 | 2.7|1802706|35|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1802706-1802740 | 35 | NC_011898.1 | 3684049-3684083 | 0 | 1.0 |
1. spacer 2.7|1802706|35|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to position: 3684049-3684083, mismatch: 0, identity: 1.0
agaaagtgaatcatggccaatgattttagtaatgg CRISPR spacer agaaagtgaatcatggccaatgattttagtaatgg Protospacer ***********************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_KY270853 | Raoultella ornithinolytica strain YNKP001 plasmid pYNKP001-dfrA, complete sequence | 140214-140244 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_KX839207 | Klebsiella pneumoniae strain KP1814 plasmid pKP1814-1, complete sequence | 278292-278322 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_CP021328 | Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence | 423587-423617 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_CP019048 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain RJA166 plasmid pRJA166a, complete sequence | 139381-139411 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NC_018107 | Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence | 91610-91640 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_CP022441 | Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence | 285597-285627 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | KU318421 | Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence | 189559-189589 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NC_023911 | Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence | 126353-126383 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_CP025964 | Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence | 58542-58572 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_CP024641 | Klebsiella michiganensis strain F107 plasmid unnamed1, complete sequence | 174322-174352 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | CP027603 | UNVERIFIED_ORG: Klebsiella pneumoniae strain AR_0080 plasmid unnamed, complete sequence | 141767-141797 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_CP026014 | Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence | 7753-7783 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_CP026019 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence | 143164-143194 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_MF344561 | Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence | 238908-238938 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_MF344566 | Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence | 191287-191317 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_MF344565 | Klebsiella pneumoniae strain 19051 plasmid p19051-IMP, complete sequence | 241671-241701 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_MF344562 | Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence | 211041-211071 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_MF344567 | Klebsiella pneumoniae strain A708 plasmid pA708-IMP, complete sequence | 135252-135282 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_MF344563 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence | 202776-202806 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_MF344564 | Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence | 272974-273004 | 5 | 0.839 |
NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | NZ_CP026369 | Klebsiella quasipneumoniae strain A708 plasmid pA708-1, complete sequence | 224457-224487 | 5 | 0.839 |
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NC_011898_3 | 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652459-3652489 | 31 | MN661402 | Klebsiella quasipneumoniae strain KP18-31 plasmid pKP18-31-IMP,KPC, complete sequence | 315429-315459 | 5 | 0.839 |
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NC_011898_3 | 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652593-3652623 | 31 | NZ_CP024501 | Klebsiella pneumoniae strain KSB1_4E plasmid unnamed2, complete sequence | 50132-50162 | 8 | 0.742 |
NC_011898_3 | 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652593-3652623 | 31 | NZ_CP032356 | Klebsiella variicola strain 15WZ-82 plasmid p15WZ-82_Vir, complete sequence | 59985-60015 | 8 | 0.742 |
NC_011898_3 | 3.8|3652858|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652858-3652887 | 30 | AP018319 | Nostoc sp. HK-01 plasmid plasmid1 DNA, complete genome | 449118-449147 | 8 | 0.733 |
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NC_011898_2 | 2.8|1802773|34|NC_011898|CRT,CRISPRCasFinder | 1802773-1802806 | 34 | NZ_CP036540 | Bacteroides fragilis strain DCMOUH0017B plasmid pBFO17_1, complete sequence | 78314-78347 | 9 | 0.735 |
NC_011898_3 | 3.7|3652792|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652792-3652821 | 30 | MN693601 | Marine virus AFVG_25M543, complete genome | 4771-4800 | 9 | 0.7 |
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NC_011898_2 | 2.2|1802370|34|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1802370-1802403 | 34 | NZ_CP030772 | Streptomyces sp. YIM 121038 plasmid pSSP121038, complete sequence | 75241-75274 | 10 | 0.706 |
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NC_011898_3 | 3.8|3652858|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3652858-3652887 | 30 | MK448360 | Streptococcus satellite phage Javan205, complete genome | 6913-6942 | 10 | 0.667 |
1. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY270853 (Raoultella ornithinolytica strain YNKP001 plasmid pYNKP001-dfrA, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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18. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344567 (Klebsiella pneumoniae strain A708 plasmid pA708-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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20. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344564 (Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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21. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026369 (Klebsiella quasipneumoniae strain A708 plasmid pA708-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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22. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028952 (Klebsiella aerogenes strain AR_0161 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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23. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN661402 (Klebsiella quasipneumoniae strain KP18-31 plasmid pKP18-31-IMP,KPC, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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24. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY270853 (Raoultella ornithinolytica strain YNKP001 plasmid pYNKP001-dfrA, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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25. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX839207 (Klebsiella pneumoniae strain KP1814 plasmid pKP1814-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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26. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021328 (Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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27. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019048 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain RJA166 plasmid pRJA166a, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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28. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018107 (Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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29. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022441 (Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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30. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU318421 (Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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31. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023911 (Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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32. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025964 (Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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33. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024641 (Klebsiella michiganensis strain F107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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34. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP027603 (UNVERIFIED_ORG: Klebsiella pneumoniae strain AR_0080 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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35. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026014 (Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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36. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026019 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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37. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344561 (Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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38. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344566 (Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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39. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344565 (Klebsiella pneumoniae strain 19051 plasmid p19051-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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40. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344562 (Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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41. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344567 (Klebsiella pneumoniae strain A708 plasmid pA708-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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42. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344563 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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43. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344564 (Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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44. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026369 (Klebsiella quasipneumoniae strain A708 plasmid pA708-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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45. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028952 (Klebsiella aerogenes strain AR_0161 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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46. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN661402 (Klebsiella quasipneumoniae strain KP18-31 plasmid pKP18-31-IMP,KPC, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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47. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY270853 (Raoultella ornithinolytica strain YNKP001 plasmid pYNKP001-dfrA, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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48. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX839207 (Klebsiella pneumoniae strain KP1814 plasmid pKP1814-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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49. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021328 (Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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50. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019048 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain RJA166 plasmid pRJA166a, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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51. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018107 (Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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52. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022441 (Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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53. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU318421 (Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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54. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023911 (Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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55. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025964 (Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
56. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024641 (Klebsiella michiganensis strain F107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
57. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP027603 (UNVERIFIED_ORG: Klebsiella pneumoniae strain AR_0080 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
58. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026014 (Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
59. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026019 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
60. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344561 (Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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61. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344566 (Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
62. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344565 (Klebsiella pneumoniae strain 19051 plasmid p19051-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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63. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344562 (Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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64. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344567 (Klebsiella pneumoniae strain A708 plasmid pA708-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
65. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344563 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
66. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344564 (Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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67. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026369 (Klebsiella quasipneumoniae strain A708 plasmid pA708-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
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68. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028952 (Klebsiella aerogenes strain AR_0161 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
69. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN661402 (Klebsiella quasipneumoniae strain KP18-31 plasmid pKP18-31-IMP,KPC, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.839
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag-- CRISPR spacer tatatttgttagcatcatatt--ccagtaacct Protospacer ********* *********** ***.***
70. spacer 3.1|3652393|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011996 (Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
taaaaaataagcaagcgatgatatgaatgc CRISPR spacer taaaaaatcagcaagcgatgatacgttaga Protospacer ******** **************.* *
71. spacer 3.5|3652660|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT895374 (Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctattatctatattataaattatcatatat CRISPR spacer ttattatatatattttaaattatcattaaa Protospacer .****** ****** *********** *
72. spacer 3.6|3652726|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT895374 (Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
ctattatctatattataaattatcatatat CRISPR spacer ttattatatatattttaaattatcattaaa Protospacer .****** ****** *********** *
73. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018843 (Staphylococcus epidermidis strain 14.1.R1 plasmid pHOB1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tgtttttgtaagcatcatcttctccaattga Protospacer *.* ************** *** ***** ..
74. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP051648 (Staphylococcus caprae strain SY333 plasmid pSY333-45, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tgtttttgtaagcatcatcttctccaattga Protospacer *.* ************** *** ***** ..
75. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018843 (Staphylococcus epidermidis strain 14.1.R1 plasmid pHOB1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tgtttttgtaagcatcatcttctccaattga Protospacer *.* ************** *** ***** ..
76. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP051648 (Staphylococcus caprae strain SY333 plasmid pSY333-45, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tgtttttgtaagcatcatcttctccaattga Protospacer *.* ************** *** ***** ..
77. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018843 (Staphylococcus epidermidis strain 14.1.R1 plasmid pHOB1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tgtttttgtaagcatcatcttctccaattga Protospacer *.* ************** *** ***** ..
78. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP051648 (Staphylococcus caprae strain SY333 plasmid pSY333-45, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tgtttttgtaagcatcatcttctccaattga Protospacer *.* ************** *** ***** ..
79. spacer 3.5|3652660|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctattatctatattataaattatcatatat CRISPR spacer tgaatatttatattctaaattatcatatga Protospacer . * ***.****** *************.
80. spacer 3.5|3652660|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH121069 (Pseudomonas phage vB_PaeM_PA5oct, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctattatctatattataaattatcatatat CRISPR spacer taaataaaaatattataaattatgatatat Protospacer . * ** ************** ******
81. spacer 3.5|3652660|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042572 (Enterobacter hormaechei strain E5 plasmid pE5_001, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctattatctatattataaattatcatatat CRISPR spacer ttatgcgctaaattataaattatcatatca Protospacer .*** *** *****************
82. spacer 3.6|3652726|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctattatctatattataaattatcatatat CRISPR spacer tgaatatttatattctaaattatcatatga Protospacer . * ***.****** *************.
83. spacer 3.6|3652726|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH121069 (Pseudomonas phage vB_PaeM_PA5oct, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctattatctatattataaattatcatatat CRISPR spacer taaataaaaatattataaattatgatatat Protospacer . * ** ************** ******
84. spacer 3.6|3652726|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042572 (Enterobacter hormaechei strain E5 plasmid pE5_001, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctattatctatattataaattatcatatat CRISPR spacer ttatgcgctaaattataaattatcatatca Protospacer .*** *** *****************
85. spacer 3.7|3652792|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024012 (Acinetobacter sp. LoGeW2-3 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggtaacacgttgctaacagtgattagttta CRISPR spacer gataacacgtggcaaacagtgattacagaa Protospacer *.******** ** *********** *
86. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_011777 (Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
87. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042928 (Bacillus cereus strain G1-1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
88. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_014172 (Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
89. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009595 (Bacillus cereus strain 3a plasmid pBFC_3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
90. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053290 (Bacillus cereus strain WPySW2 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
91. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009606 (Bacillus cereus strain S2-8 plasmid pBFR_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
92. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_005707 (Bacillus cereus ATCC 10987 plasmid pBc10987, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
93. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053994 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_780 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
94. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040341 (Bacillus cereus strain DLOU-Tangshan plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
95. spacer 2.3|1802436|33|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053992 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_781 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgattattttgcccataaaaaaagcaataaccc CRISPR spacer cgatttttttgcccataaagaaagagacaaaga Protospacer ***** *************.**** .*.**
96. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN543575 (Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_fusion, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
97. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN543576 (Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_vir, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
98. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048109 (Klebsiella michiganensis strain BD177 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
99. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031818 (Klebsiella pneumoniae strain INF235-sc-2280127 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgttcgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
100. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024517 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_10J plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
101. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024497 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_7E plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
102. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024501 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_4E plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
103. spacer 3.2|3652459|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032356 (Klebsiella variicola strain 15WZ-82 plasmid p15WZ-82_Vir, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
104. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN543575 (Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_fusion, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
105. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN543576 (Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_vir, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
106. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048109 (Klebsiella michiganensis strain BD177 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
107. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031818 (Klebsiella pneumoniae strain INF235-sc-2280127 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgttcgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
108. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024517 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_10J plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
109. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024497 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_7E plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
110. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024501 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_4E plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
111. spacer 3.3|3652526|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032356 (Klebsiella variicola strain 15WZ-82 plasmid p15WZ-82_Vir, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
112. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN543575 (Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_fusion, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
113. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN543576 (Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_vir, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
114. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048109 (Klebsiella michiganensis strain BD177 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
115. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031818 (Klebsiella pneumoniae strain INF235-sc-2280127 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgttcgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
116. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024517 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_10J plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
117. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024497 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_7E plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
118. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024501 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_4E plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
119. spacer 3.4|3652593|31|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032356 (Klebsiella variicola strain 15WZ-82 plasmid p15WZ-82_Vir, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tatatttgtaagcatcatattcaccaataag CRISPR spacer tatatttgtttgcatcatattcaactagctt Protospacer ********* ************ * *
120. spacer 3.8|3652858|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP018319 (Nostoc sp. HK-01 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caattattataagccgttaaatggcagaaa CRISPR spacer tacttattataagcagttaaattgcactgt Protospacer .* *********** ******* *** .
121. spacer 2.8|1802773|34|NC_011898|CRT,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP036547 (Bacteroides fragilis strain DCMSKEJBY0001B plasmid pBFS01_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
cttcaaaattccacgatgtttttatttctaccgg CRISPR spacer gtttaaaattccactatgtttttatgttttcact Protospacer **.********** ********** *.* *
122. spacer 2.8|1802773|34|NC_011898|CRT,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP036540 (Bacteroides fragilis strain DCMOUH0017B plasmid pBFO17_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
cttcaaaattccacgatgtttttatttctaccgg CRISPR spacer gtttaaaattccactatgtttttatgttttcact Protospacer **.********** ********** *.* *
123. spacer 3.7|3652792|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693601 (Marine virus AFVG_25M543, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ggtaacacgttgctaacagtgattagttta CRISPR spacer acgaacacgttgataacaatgattaggcat Protospacer . ********* *****.******* .
124. spacer 2.2|1802370|34|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023976 (Streptomyces alboflavus strain MDJK44 plasmid pMDJK44.1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tccacgatcttggtaaagcgggctaccacaacaa CRISPR spacer ggctgtttcttggtaaagcgggctacggcaagac Protospacer * ******************* .*** *
125. spacer 2.2|1802370|34|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030772 (Streptomyces sp. YIM 121038 plasmid pSSP121038, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tccacgatcttggtaaagcgggctaccacaacaa CRISPR spacer ggctgtttcttggtaaagcgggctacggcaagac Protospacer * ******************* .*** *
126. spacer 2.7|1802706|35|NC_011898|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MT767754 (Microcystis phage vB_MweS-yong1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
agaaagt-----gaatcatggccaatgattttagtaatgg CRISPR spacer -----gttcctgcaatgatggccaatgatttaagtaataa Protospacer ** *** ************** ******..
127. spacer 3.8|3652858|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448356 (Streptococcus satellite phage Javan200, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
caattattataagccgttaaatggcagaaa CRISPR spacer taattattataagctgttaaatactcatct Protospacer .*************.*******. . .
128. spacer 3.8|3652858|30|NC_011898|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448360 (Streptococcus satellite phage Javan205, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
caattattataagccgttaaatggcagaaa CRISPR spacer taattattataagctgttaaatactcatct Protospacer .*************.*******. . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
17238 : 81753
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011898|17238:81753|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_virus(15.38%) | integrase,coat,protease,transposase | attL 50739:50755|attR 85622:85638 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
448697 : 515121
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_011898|448697:515121|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(18.18%) | coat,tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
914278 : 946011
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_011898|914278:946011|DBSCAN-SWA 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>NC_011898|914278:946011|941887_942139_+|WP_015924361.1|DBSCAN-SWA MEETLKLILDKLNSMDSDIKDIKNNVRNLEKHVFIIENKQSEDSKALYDGYSQTLENTVEIKKDIKDIKETLNVHEVKLLKVK >NC_011898|914278:946011|926526_928368_+|WP_015924347.1|DBSCAN-SWA MFDIQEELKKLPDKSGVYIMKDANGVVIYVGKAVVLKNRVRQYFQQSANHPPKVQAMVSKVSEFEYIVVDSEVEALMLECTLIKKYKPKYNILLKDDKHYPYIKVTLNEEYPRILKTRRVEKDGARYFGPYSSGFAVNDTIDTLKKLFSLKTCNKNLPRDIGKTRPCLNYHMKQCLAPCQGGVNRDEYREMMKKICRFLGGQYDEIINDLRIQMETAAEQLDFEKAAQLRNKITSIKQLSESQKVLFTDLEDRDIIGYSADSTDLCIQVFFVRNGRVIGREHFIFEGEANEDKGYSLSTFIKQFYTKVQYVPSEIVLQSEVDDSETIAKWLTEKRGFKVALRVPQRGDLVKLVHMVSENAEITLKLHRERQSREGTVHSEGMAQLVKLLGLEEAPARIESYDISNTGSSEIVASMVVFENGRPARQEYRKFKMKSIEQQNDYGSMQETLFRRLNRAKREKEEGTENAKFSKLPDLILVDGGSNHVNAARQVVEELGYNFKIAGMAKDDRHRTKSLVYMGNEYELATNMPLLRFITEIQDETHRVAVEYNRKLREKRYVRSELDEIEGIGQTRKKALIKHFKSVAAIRKADIAQLQEVNGISEKIAKNIYEYFN >NC_011898|914278:946011|938466_939324_+|WP_015924358.1|DBSCAN-SWA 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>NC_011898|914278:946011|932761_934444_+|WP_015924352.1|protease|DBSCAN-SWA MLTTTLFIIQFFFSVVIGIYFLSLLKNQQGNKSTIEKESRKELEKLRRMRDIHLTEPLSEKTRPASLSDIVGQEQGLKALRAALCGMNPQHVIIYGPPGVGKTAAARVILEEAKKNSMSPFRKEAKFIEMDATTLRFDERGIADPLIGSVHDPIYQGAGSYGVAGIPQPKQGAVTKAHGGILFIDEIGELHPIQMNKLLKVLEDRKVFLESAYYSAEDSNIPSHIHDIFQKGLPADFRLVGATTRVPDEIPAAIRSRCVEIHFRSLRADEICKICENAAAKGGFILNQGCSELVARYAQNGRDAVNIIQIAGGVSMVENRSTIDIKDIEWVIEFGHYSPRIEKKVSPINQIGCINGLAVFGESTGMVIDVEVTAISVARGTGNIRITGIVEEEEMDNRGHKLKRTSSAKASVENVLTVLRKYMDVDFKNYEIHLNFPGGIPIDGPSAGIAIATAVYSAVKNIPVSGELAMTGEISIKGKVKPVGGVVAKVDAAKAAGIKKVFIPKDNYQEIFEDMDIDVIPVENINEVMKAVFDIDLVEKKDETVPNGSAPITVLTAQGT >NC_011898|914278:946011|943380_944427_+|WP_012634672.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MNKPSIFRTRYIPFETVDISSDELLYRDEELLITRWKAIKPRKDISGGISYTFLKEGIKISRFYDADKRFAYWYCDIIDVEYDKGNDRFTLIDLLLDVKLMPDGTMQVLDADELAEALERGLITQEKVCSSLKKMDNILQQIYNGNFPPAICLEESYWKV >NC_011898|914278:946011|926098_926356_+|WP_015924346.1|DBSCAN-SWA MISTKVTINCPAGLDSKAAALLVQKVSKYSSSIWLEKGERRANAKSLLGLLSLGVERNAAITIITDGEDEKKAADEISEYFTVGF |
32 | Moraxella_phage(20.0%) | transposase,integrase,protease,tRNA,holin | attL 917615:917631|attR 950934:950950 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1795898 : 1827622
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_011898|1795898:1827622|DBSCAN-SWA 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26 | Escherichia_phage(20.0%) | tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1832244 : 1904154
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_011898|1832244:1904154|DBSCAN-SWA 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42 | Bacillus_phage(25.0%) | tRNA,plate,transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2144885 : 2214464
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_011898|2144885:2214464|DBSCAN-SWA 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67 | Escherichia_phage(17.39%) | transposase,integrase,head,protease,tRNA | attL 2185983:2186042|attR 2201443:2202739 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2365965 : 2373047
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_011898|2365965:2373047|DBSCAN-SWA TCTACAGTTGGTTTAGAAGGTTTGCCATTTCTATTGCTGTTACGGCAGCATCATATCCCTTATTACCTGCTTTAGTACCCGCACGTTCTATAGCCTGTTCAATTGTATCAGTAGTAAGGACTCCGAAAATAACCGGTACACCTGTATCAAGTGATATTCTGGCTACCCCTTTTGACACTTCACCCGCCACATAGTCAAAGTGCGGTGTAGAGCCTCTGATAACTGCACCTACACAAATTACCGCTGCATATTTACCGGAATTTGCCATTTTTTGTGCAGCTATGGGTATCTCAAAGGCACCTGGAACCCATGAAACAGTGATATCTGATTCGTCAGCTCCATGTCTTACCAATCCATCTATTGCCCCGGACAAAAGCTTACTGCTTATAAACTCATTAAATCGTCCTACAACAATACCAAACTTTAAACCACTTGCAATAAGATTACCTTCATTTGTTTTAATCGACATTTTTATTTTCCTCCTGATGTGCTGTTGTATTTTTCTCGCTTGTTTTATTGTTCAGACCATCAAACAAGTGGCCCATTTTTTCCTTTTTTGTTCTCAGATAAAATTCATTTTTTTCATTTTCTTTTATTTGAATAGATTCTCGTCCGACTACCTCCAGACCATACCCATTTAGCCCAACCAGTTTTTTGGGGTTGTTAGTCAGCAGCTTTATTTTCTTTATTCCTAAATCGTACAAGATTTGAGCACCTATGCCGTATTCTCTCAAATCTGCCGGAAAGCCCAGCTTTATATTTGCTTCGACAGTATCCATACCTTGGTCTTGAAGCTCATATGCACGTATTTTATTTATCAGACCGATGCCCCTTCCCTCCTGACGCATATAAAGCAAAACCCCTTTTCCTTCATTGTTGATTCTGCTCAATGCGGCTTCAAGCTGTTCTCCGCAGTCACACCTTTGTGAATGAAAAGCATCACCTGTGAGACATTCGGAATGTACTCTGACCAGAACAGGGTCTGTTGAGCCTGCTACATCTCCCTTGACAAGTGCTACATGGTGCTCCCCATTGGTAGTATTCTCATAACCAATTATTTTAAATTCTCCATAAGCAGTGGGCATTTTTGCTTCCGCAGCTCTTTTAATCAACTTTTCATTTTTTCTGCGATATTCAATAAGACCTGCTACCGTTATTATCTTTAAGCCATGCTTTTGGGAAAACTCCATTAATTGTGGAACCCTTGCCATCCTTCCGTCATCATTCATTATTTCACATATTACACCAGCGGGATACAGACCAGCCATACGGGCCAGATCAACTGCGGCTTCAGTGTGTCCTGTACGCTTAAGAACTCCTCCGTCCCTTGCAGTAAGAGGAAATACATGCCCCGGCCTTTTAAAATCGCCCGGATGTGCTTTTTTATTAGTAAGCTCAACTATTGTATGTGCTCTTTCGAAAGCTGAAATACCTGTTGTAGAATCTCTGTGATCCACAGTTACCGTAAACGCCGTACCATGACGGTCCTCATTGTGACTTACCATGGGGAAAAGTTCCAACTCTCCCGCTCTAGCTGATGTCAGAGGAACGCATATCATGCCCTTACCATAGGTAGCCATAAAATTTATGCTTTCGGGAGTAGCCTTTTCGGCAGCCATAAGAAGGTCTCCCTCGTTCTCCCTGTCCTCATCATCTACTACTATAATAATTTTACCTTGGCGGATATCCTCTATTGCTTCTTCTATTGAACTAAAATTCATGAAACTCACTTCCTTTTTTATTTTATATTACATAAATCCGTGTTCCTTGAGAAATTCAGCTGACAAATCCTTTTTAGAAGGTTTTGTCTCCAAGGTTTCGCCTTTTAACATCTTTTCCACATACTTCCCTATAATGTCACATTCTATATTTACTCTGTCGCCGATACTTTTAGTGCCAAGTATGGTGAATCCTCGTGTCAGCGGTATAAGGGAAACCGTAAAGGTATTTGAAGCCAGCTCAGCTATGGTAAGGCTTGTACCGTCCAGAGCGACCGAACCTTTTTGAACGATATATTTCATAATATGTTCAGGTGCAGTAATTGTAATCAGAACTGCATTATCCTCTTTCCTCAACCCGGTAATAGTCCCCGTTCCGTCAATATGTCCGCTGACTATATGGCCTCCCAGTCTGTCGGCAAGTCTTAATGCCCTCTCCAGATTTACCTTTCCGCCAGGCTTTAGCTTCTCAAGACCTGTTTTTCTCATGGTTTCTGGCATTACATCCGCTGTAAACCAGCTCGCCCCTAATTCAGTGACCGTAAGGCATATACCGTTTACAGCGATACTGTCTCCTTTAACAGTGCCTTCTATTACAGTTGTACATTCTATGGAAAGCTTTATTGAGCTGCTGCCGTATACAATGTTTTTCACACTTCCCATTTCCTCAACAATTCCTGTGAACACGCCCGTCACCTCCCAAATCGCTATTTGTCTGCAACATATCCCTCAATAAGTACATCTCTGTCAAACCTTTCAACTCTGATATCCGACAGAGCTATGGCATCCTTCATTTTTTCTATTCCTTTCCCCCCTACAGGCGTTACAGCCGAACTACCGCCTATTATTTTGGGTGAAATAAAGGTCATTACCTTATTTACTATACCTGCCTCAAGTGCCGAAAAGTTAAGGGTACCGCCTCCCTCCAAAAGAACACTGTCAATTTCCAGCTTGTACAATTCCTCCATAAGCTCCCTGAGATTTACTTTTCCATTTTTTGGGGCCGTTTTTATAATCCTTACCCCACGAGATAAAAGCTGAGTTTCCTTGTCTTTATGGATTTTTTCTGTAGTAGCAAGTATAAGTCCTGCCTCTGAATCGCTCTGGATAACCCTGCTTTCTATGGGAATCCTTCCGCTGCTGTCTACTACAATTCTGACAGGATCAATCCCTTTTCCTGAAATTGGTCTTGCAGTCAATGAAGGATTATCGTTTATTACTGTATTTACACCAACCATAATCGACGATACTCTGTTACGGATAGCATGTACATACTCCCTTGAGTATTCACCGCTTATCCATTTGGAGTCACCTGTAACCGATGCAATTTTACCGTCTAACGTCATTGCCGTTTTCATAATTACAAATGGAAGTCGTTTTGTTATATAGTGTATAAATATCTCATTGAGTTTTTTTGCTTCTTCCTCAAGCACTCCCACTATTACATTAATATTGGCATCCTTTAGCATTTGTATGCCTTTTCCTGAGACCTTGGGGTTTGGGTCTACCATGGCAACAACTACTTCCTTTATACCGGAGTCTATAATCGCTTTTACACACGGAGGCGTCCTTCCGTAATGGGAGCACGGCTCAAGATTTACATAAAGAGTAGCCCCTGAAATATCCGTGGGGGCATTACTAAAAGCACAAACCTCGGCATGGGCACACCCCAAGGCTTCATGGAAACCTTCAGAAATTATTTTGCCGTTTTTTGCTATAACAGCTCCCACCAATGGATTGGGGTTTGTTCTGCCCCACCCTTCTTTTGCAATTTCCAATGTCCTTTTCATATAAAACTCATGTATATTCATTTTTTCTCCTTACTTTTACTACCTTAAAATGTAAAAATCCCCGGAAACATACTGCACCGGGGACAAAATAGCAAAATTAAATACACTATCTTTCATCCAGACTGTACTGTCGGCTCCGGAGTTTGACCGGATCTGCTTTCGCTTGCGGGCTTATAGCTGTGCTATCTACCGCCGGTAAGGATTTTCACCTGTCCCTGAAGTGTCATTATTTTTATCATTAATATATAGTTTATCAAAGTAAACTATAACAGTATTGTATATATTAGTCAAGGTATAATGTTATTGATTTCTTCGTTGCCATAGCCGGAACAGACAGTGTTGAAAACATAAGAACGCAAATACCAGTCTACATAAAATAAGCAAAATGTGATTAGTTACATAATTTCCCTCTTTACAAGAACATCTGTTCGGATTTATAATAATTATACGAACAAACGTTCTGATTGGAGTGACCTTATGGATAGGGTAATTTTACATTGTGACCTGAATAATTTTTACGCTTCTGTTGAATGTCTGTATAATCCACAGTTTAGGGATTATCCTTTGGCAGTATGCGGAAGTCAGGATTTGCGTCATGGAATTGTTTTGGCTAAAAATTATATTGCAAAAAAGTTTGGTATAAAAACAGGCGAGGCTATCTGGCAGGCAAAACAAAAGTGTCCAAACCTCGTTGTTGTTAATCCAAATTATGCTTTATACCTGAGGTTTTCAAAGGATGCTAGGGAAATTTATTCCAGGTATTCCAACCTTGTTGAAAGTTTTGGCATAGACGAGTGCTGGATTGACGTTTCTGAAAGCACCAAGCTGTTCGGAGACGGGGAAAAAATTGCAAATGAAATACGTGCACTTATTAAAACAGAACTTGGTGTTACTGCTTCAGTTGGAGTGAGCTTTAATAAGATATTTGCAAAGCTTGGGTCTGATCTACAAAAGTCTAATGCTACTACTGTTATTAACCAAAATAATTTTAAGGAAATGGTTTGGAATTTAAACGTTGGGGAGTTACTTTATGTGGGCAGATCAACCCGGAAGAAACTAAACCAGATTGGAATAATGACTATCGGAGATCTTGCAGGACTTCCTCCCTCTTTCATTAGAAGATATCTCGGAAAATGGGGAGAAATTCTCTGGAATTTTGCTAATGGCATGGACTATTCCGAAGTAACTGCAACAGATTATCACGAAACTATAAAGGGAATCGGTAACAGTATGACGACCGCAAGGGATCTTGTAAACACAGAGGATGTCAAGCTTACCTTTACTGTACTGGCTGAAAGTGTGGCAGAGAGACTTAGAAAACATAATTTAAAGGGTTCTACAATACAGATTTATATTCGTGATAATGAGCTTGCCTCAATTGAACGTCAAGCAAAGCTCCCGGTTTCCAGCTATATATCCGGTGAAATCACACGTAAAGCTATGAACATTTTTAATACAAATTGGAGTTGGTATAAGCCTATACGCTCTCTTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_011898|2365965:2373047|2371201_2371435_+|WP_015925459.1|DBSCAN-SWA MKKVFVELNATFSPNGELTPVSFIWEDGVKYIIDKVYDHRKAASLKVGGQGIRYRCKVMGKEVFIFFEEGRWFVEGK >NC_011898|2365965:2373047|2368389_2369493_-|WP_015925457.1|DBSCAN-SWA MNIHEFYMKRTLEIAKEGWGRTNPNPLVGAVIAKNGKIISEGFHEALGCAHAEVCAFSNAPTDISGATLYVNLEPCSHYGRTPPCVKAIIDSGIKEVVVAMVDPNPKVSGKGIQMLKDANINVIVGVLEEEAKKLNEIFIHYITKRLPFVIMKTAMTLDGKIASVTGDSKWISGEYSREYVHAIRNRVSSIMVGVNTVINDNPSLTARPISGKGIDPVRIVVDSSGRIPIESRVIQSDSEAGLILATTEKIHKDKETQLLSRGVRIIKTAPKNGKVNLRELMEELYKLEIDSVLLEGGGTLNFSALEAGIVNKVMTFISPKIIGGSSAVTPVGGKGIEKMKDAIALSDIRVERFDRDVLIEGYVADK >NC_011898|2365965:2373047|2367712_2368369_-|WP_015925456.1|DBSCAN-SWA MFTGIVEEMGSVKNIVYGSSSIKLSIECTTVIEGTVKGDSIAVNGICLTVTELGASWFTADVMPETMRKTGLEKLKPGGKVNLERALRLADRLGGHIVSGHIDGTGTITGLRKEDNAVLITITAPEHIMKYIVQKGSVALDGTSLTIAELASNTFTVSLIPLTRGFTILGTKSIGDRVNIECDIIGKYVEKMLKGETLETKPSKKDLSAEFLKEHGFM >NC_011898|2365965:2373047|2366422_2367685_-|WP_015925455.1|DBSCAN-SWA MNFSSIEEAIEDIRQGKIIIVVDDEDRENEGDLLMAAEKATPESINFMATYGKGMICVPLTSARAGELELFPMVSHNEDRHGTAFTVTVDHRDSTTGISAFERAHTIVELTNKKAHPGDFKRPGHVFPLTARDGGVLKRTGHTEAAVDLARMAGLYPAGVICEIMNDDGRMARVPQLMEFSQKHGLKIITVAGLIEYRRKNEKLIKRAAEAKMPTAYGEFKIIGYENTTNGEHHVALVKGDVAGSTDPVLVRVHSECLTGDAFHSQRCDCGEQLEAALSRINNEGKGVLLYMRQEGRGIGLINKIRAYELQDQGMDTVEANIKLGFPADLREYGIGAQILYDLGIKKIKLLTNNPKKLVGLNGYGLEVVGRESIQIKENEKNEFYLRTKKEKMGHLFDGLNNKTSEKNTTAHQEENKNVD >NC_011898|2365965:2373047|2365965_2366433_-|WP_015925454.1|DBSCAN-SWA MSIKTNEGNLIASGLKFGIVVGRFNEFISSKLLSGAIDGLVRHGADESDITVSWVPGAFEIPIAAQKMANSGKYAAVICVGAVIRGSTPHFDYVAGEVSKGVARISLDTGVPVIFGVLTTDTIEQAIERAGTKAGNKGYDAAVTAIEMANLLNQL >NC_011898|2365965:2373047|2371903_2373047_+|WP_095206808.1|transposase|DBSCAN-SWA MKRYDSNFKEQAVRLVTEQGKSVSSVANDIGIHENTLYKWIDQYKTHKENAFPGSGNLRPEDEELRKLKKRVADLEMENELPKKSNGNLRERPEIIYPIIHEYRFKFPVEKMCRLLNISRSGYYAWVKRPESLRKKRNTELLEKIRRIHKVSRETYGSPRVTNALKNEGIKCGKNRIAKLMKENNIAAKTRKKFKATTNSNHNYPVADNILNQDFTAYKPNQIWVADITYIPTDEGWLYLAAIIDLYNRKVVGWAMDSTMTKQLCIDALKQAIGRQRHPKGVIHHSDRGVQYASKEYQKVLNSNGFTASMSRKGNCYDNACMESFFGTLKTELIYLTRFKTRAEARLAIFEYIEVFYNRIRLHSKLGYKSPVEFEKQNKAA >NC_011898|2365965:2373047|2369949_2371191_+|WP_015925458.1|DBSCAN-SWA MDRVILHCDLNNFYASVECLYNPQFRDYPLAVCGSQDLRHGIVLAKNYIAKKFGIKTGEAIWQAKQKCPNLVVVNPNYALYLRFSKDAREIYSRYSNLVESFGIDECWIDVSESTKLFGDGEKIANEIRALIKTELGVTASVGVSFNKIFAKLGSDLQKSNATTVINQNNFKEMVWNLNVGELLYVGRSTRKKLNQIGIMTIGDLAGLPPSFIRRYLGKWGEILWNFANGMDYSEVTATDYHETIKGIGNSMTTARDLVNTEDVKLTFTVLAESVAERLRKHNLKGSTIQIYIRDNELASIERQAKLPVSSYISGEITRKAMNIFNTNWSWYKPIRSLGIRATDLVTADSHTQLSFFDNYNKRPQLENLEFSIDAIRKRFGHYSVQRAILLKDSALNANPIEDNIIHPVSFFR |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3154644 : 3233734
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_011898|3154644:3233734|DBSCAN-SWA 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56 | Leptospira_phage(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3239372 : 3281705
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_011898|3239372:3281705|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_011898|3239372:3281705|3278372_3279098_-|WP_015926104.1|DBSCAN-SWA MKKLTHLSLVGKLEPYGAGFSEPIPINIKDILKGKTTFDLSVSEFEKYLVGISFDIIASTSDYAEHKTVGYLNGKFYNIEQALEDNTLTDVADNAFDDIDQYTFDIYELVTELQNELSYEPGEMPSLCFNIFSIDNIYIEPEYRNNKFGSCAIILLSDYLKTQFNRQAGYFVLEPIPRYNPEKEHEIVDCQPVFIEKKLNRFFNNLGFKSKGDYLYFNLNYDMQKIYINKIKSLNKKKPKK >NC_011898|3239372:3281705|3259023_3260613_+|WP_015926038.1|transposase|DBSCAN-SWA MQKIDITGLSPNQIEYVSSLEKTVENQQVRIEQLTELLIKSQKALYGQSSEKRRYVFDEDSGQLSLFNEAEVEAGNKAEEPTVQTIVAAHTRKPKRTKEELAETVPVVEVVCDLDKDKRTCNICNTDLRYLGKEYVRDELEIIPAQVRILRYIRLNYVCKECEKETCEANIVKAPVPKPVMKRSLASASTVAYVMYQKYANGMPLYRQEKDWANQGVKLSRATLANWIIRPSHEWLEPMYDAIKKNLVTEPLIHADETVLQVLKEPGRRATTESRMWVYTSGQSLTPAVLFEYQPTRSGQHARRFLEGFSGYLQTDGYSGYNAVPNVIHCGCWAHLQRKFEEAIPNGADNKSSKAAIGYDYCNRLFAMEKKWIELSSENRHQERRKNAKPLLDEFWQWVSHLNPLQNSNLGKAVTYALNQKETLINFMLDGCIEISNNRAENAIRPYVTGRKNWLFADTTRGAKASAIVYSMIESAKANQLNPYMYLVYLLSKLPDLKELTQKSLTPYLPWSPELPCWCHKDSNKAPQD 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29 | Escherichia_phage(30.0%) | integrase,transposase | attL 3249223:3249241|attR 3292958:3292976 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3357742 : 3448198
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_011898|3357742:3448198|DBSCAN-SWA 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85 | Erysipelothrix_phage(66.67%) | portal,tail,transposase,capsid,terminase,head,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3501367 : 3550131
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_011898|3501367:3550131|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_011898|3501367:3550131|3506176_3507321_-|WP_095206808.1|transposase|DBSCAN-SWA MKRYDSNFKEQAVRLVTEQGKSVSSVANDIGIHENTLYKWIDQYKTHKENAFPGSGNLRPEDEELRKLKKRVADLEMENELPKKSNGNLRERPEIIYPIIHEYRFKFPVEKMCRLLNISRSGYYAWVKRPESLRKKRNTELLEKIRRIHKVSRETYGSPRVTNALKNEGIKCGKNRIAKLMKENNIAAKTRKKFKATTNSNHNYPVADNILNQDFTAYKPNQIWVADITYIPTDEGWLYLAAIIDLYNRKVVGWAMDSTMTKQLCIDALKQAIGRQRHPKGVIHHSDRGVQYASKEYQKVLNSNGFTASMSRKGNCYDNACMESFFGTLKTELIYLTRFKTRAEARLAIFEYIEVFYNRIRLHSKLGYKSPVEFEKQNKAA >NC_011898|3501367:3550131|3527948_3528818_-|WP_015926328.1|DBSCAN-SWA MYKIRLFFFLILIIFMFSGCSLGESIQTIKQENTNLQAQVTSLKQENQSLKSQLNEIKNGAKNLYNNIQNYYKDKSYDKAKEEINNLLQKHPDSEEAKKAKQLLSTINIEIKNDAEKAQLIKKQKKDADKKRLAESTKKMRKQYDEVQEVTWYFDKSSPQYANVNSFYVYIGTKKDSLPGLRLKIQYTADDWIFINKYIFKVDNKTFEIDTGDFGVTRDNNGDGIWELYDVELSNENYDLIKAIISSKKTIIRHQGDEHYSDRVITSTEKQGLKNVLDAYEALGGKFDF >NC_011898|3501367:3550131|3510190_3510802_-|WP_015926317.1|head,protease|DBSCAN-SWA 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51 | Clostridium_phage(23.08%) | portal,tail,transposase,terminase,integrase,head,protease,tRNA,holin | attL 3532418:3532434|attR 3556573:3556589 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3582719 : 3617500
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_011898|3582719:3617500|DBSCAN-SWA 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45 | Clostridium_phage(37.5%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
3831150 : 3862231
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_011898|3831150:3862231|DBSCAN-SWA 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>NC_011898|3831150:3862231|3855931_3857098_-|WP_015926652.1|DBSCAN-SWA MEIARGVIKSAQKIVVYGPEGIGKSTFAAMFPGALFIDTEGSTKHMDVARLPKPYSWQMLLDDVNYVYVHPEVCNTLVIDTADWAEKLCSEDLCAKSQKAGIEDFGYGKGYVYLAEDFGKLLNTLEEIVNMGVNVVFTAHAQMRKFEQPDEMGAYDRWEMKLQKKTAPLLKEWADAVLFVNYQTYVVNVDGQGTAKGKNKPQGGRRVMYTSHHPCWDAKNRYNLPPDVDFDYSVIAQFIPVKGSAAPVEYKTKVQPVESPYPSTATTQPVQQQSVPSPAVSQNKPVNEPTQQQLQTDLAQQTPPVKQATEIKTDEDLSGIPKALASLMKEKQVTLKEIQGAVSYKGYFPADTPFQAYPDEFVSGVLIAAWPQVFNVIELLRSGEEAPF >NC_011898|3831150:3862231|3853809_3855420_-|WP_015926650.1|DBSCAN-SWA MELRPYQQEAKQAVLNEWGKGILKTLLVLVTGGGKTIVFSKITEECVRNGERVLILAHRGELLDQAADKLKKATNLGCATEKAEESCIGSWFRVVVGSVQSLMREKRLNQFPKDYFNTIIIDEAHHCLSDGYQRVLSHFNEAKVLGVTATPDRGDMRNLGQFFESLAYEYTLPRAIKEGFLCPIKAQTIPLKLDLSGVSVQAGDFKNGDLGNALEPYLESIADEMLKCCTDHKTVVFLPLIKTSQKFKDILNKKGFRAAEVNGNSQDREQVLADFDSGKYNVICNSMLLTEGWDCPSVDCIVVLRPTKIRSLYVQMVGRGTRLHSGKDHLLLLDFLWHTERHELCHPAALICESEEVAKKMTENIEAAGCPVDIEAAEKQAADDVVAQREEALAKKLAEMKNRKRKLVDPLQFEMSIQAEDLASYVPAFGWEMGPPSDKQIKTLEKLGIFPDEIESAGKATKLLERLDKRRNEGLTTPKQIRFLEGRGFQHVGTWQFEGAKSLIDRIAANGWRVPNEINPSEYKPTQIEQPLGWEI >NC_011898|3831150:3862231|3837998_3838316_-|WP_015926633.1|DBSCAN-SWA MKLPFPDWVLVTPVKVYQETQGENGISEELIFDGKCCYDDKTKQALDAERRLVTLAGKIILKGDIYPDDLISGYVMLGESKKTIYRTTRPRNPDGSVFSTELELI >NC_011898|3831150:3862231|3840880_3841099_-|WP_015926398.1|DBSCAN-SWA MGEDFYFAYDYDGTKGTASRLYRRIDDQFQRFIPQKRLWESAPEQCCIYIGEDTFYDEITEEQAKEIIKTWN >NC_011898|3831150:3862231|3859715_3859898_-|WP_015926657.1|DBSCAN-SWA MKKLKQARESKNLTQSELASRTGISQQHISMIENGERIGSVETLRELAKALDTSVDQLLS >NC_011898|3831150:3862231|3858453_3858741_-|WP_015926420.1|DBSCAN-SWA MKAACSKCGQPWNVSVHKKLNKPYVCPRCSKVKKMVLTAVGFIICCVAVPKLNRIVNVQRGYSAGGGEVLIPLLYLVVVGFIKTVLDYKKENAHQ |
39 | Clostridium_phage(40.0%) | capsid,integrase,terminase | attL 3837197:3837211|attR 3865049:3865063 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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