Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012037 | Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE02, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NC_012034 | Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725, complete genome | 9 crisprs | cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,csx1,cas10,csm3gr7,csx19,csa3,Cas14b_CAS-V-F,cas14k,DEDDh,cas14j,Cas9_archaeal,c2c9_V-U4,TnpB_regular.1,cas7b,cas8b1,csm5gr7,csm4gr5,csm2gr11,csx20,WYL | 0 | 30 | 5 | 0 |
NC_012036 | Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012034_1 | 151654-160464 |
I-A
Consensus repeat of NC_012034_1
|
134 spacers
spacers of NC_012034_1
>1.1|151683|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGAAAGAGGGAAAGTAAATGGCTTTGATAGATT >1.2|151748|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCATTAAGCCACTGCAAGGTAGAATTTGACCAATT >1.3|151813|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTATTTGGACTTTAAAATTGTCATTTGCAATATCA >1.4|151878|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATGATACAAATGGTAATGAGATTAGATTGTATCT >1.5|151943|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATATCCATATTTGCGAGGTGTAGATGGTGTCGA >1.6|152007|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACTTAAAAAACTTAATGTAGCATTCATTGGTGGA >1.7|152072|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATTTTCCTTGTTCGTGTATTAAAATCATATTCA >1.8|152138|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGAAAGCAAACCACAGATTGTGAATGCTGACCAAT >1.9|152204|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAATTTCTATATCGCTAAATATAACAAGCATATA >1.10|152269|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGCTTCTAACGCAACTGTTTATGACGTTCATAGGTG >1.11|152335|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGTTAATCATTTTAAGCGCTTGGAGCCTTTTTGAT >1.12|152401|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAGAACTTTTATATTAACTCTATCAACTAACCCAG >1.13|152467|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAACCAACTAAGTATGCTAAATCAAAAGGCAGCGA >1.14|152533|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAATCTTGTTGGAATATTTTCAAACAGAGCAACT >1.15|152597|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGATGATGTAGCACCATATGTCGCACTTGGCTTTAG >1.16|152663|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAAAACAAGAAAGATTTTAATATCAAGCCACTGGAC >1.17|152729|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAACAATTTTATAGCCAAGTGGTGGAATTCCACCA >1.18|152794|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATGATTATTATAACAAAATGTTCTGTTCCTTAAA >1.19|152859|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTGTATCCCAAGTTTAACGCACATCTCATTCACCTT >1.20|152925|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATAATATATTTGACTTTGCTCATCACTTTACAG >1.21|152990|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCACCAAACAAGCTCAAAATAGGTATTGCCTGCCTTA >1.22|153056|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGATTTCTTTATTGAGTTCCTTTTCTATTTCTGC >1.23|153121|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAAAATGGTAGAAAACAACAGAAAGTATAAATTGT >1.24|153187|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTGCAAAGATAAAAAATGCTGGTTGTGTGGAGGT >1.25|153252|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTTCTTTTTTTTTCTAACAGACCAGCCCTACTCGG >1.26|153318|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGTCAATGAAAATTGGTGCTGAGAAGTTGTAATATT >1.27|153385|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTCTGATGGAAATCAGGATATTAGCCTCTGGTA >1.28|153450|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTCTGTTTCAAGGCGTCTTATAAGCTTATCTTCTG >1.29|153515|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTCTGTGCAGCATTGTAAGCCTGCATTACAATT >1.30|153581|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTAAACCACCAGCTAATAATGTTGCTGTTGCCACAT >1.31|153647|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGCATGTGCATGAGCCGATTCAGAAGGGTTAATCCCT >1.32|153714|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAATTTCATGTATCATCAAATAATGTCTCAAATAA >1.33|153779|39|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGAAGCACAAGGGATTATAAAATACGAAATTGATAAT >1.34|153847|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCGCATTGATGAGATTAACAGAACAATGATAGCAG >1.35|153913|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGAATACTCTAAATCTTCAACTGTATTATAAAACC >1.36|153979|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCGCATTGATGAGATTAACAGAACAATGATAGCAG >1.37|154045|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGAATACTCTAAATCTTCAACTGTATTATAAAACC >1.38|154111|33|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATTATATGCTTGTTATATTTAGCGATATAGA >1.39|154173|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTGAACTATAAACTGTTTTGTCGCTGGTGAAAGTG >1.40|154239|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAATCAGTAGGGCCCATTATTTTTTCGCCAAAA >1.41|154303|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTATTTTTTTATTTTTAGAAGGGGGAGTAGTGATG >1.42|154369|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGCTAAAACTGTAGTTTTTTTGCTTGTAGGTGACT >1.43|154435|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGTAGGATATTTCCCTTTGTATGCTGCAGGTTATA >1.44|154501|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAATTCAAGCAGTTTTTTAGAATTCTGTTCAAGCG >1.45|154566|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATAGAAAGCGCTATCATATCGATTGCGTGCAAA >1.46|154631|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAGTCTTTGTCAAAAACTTTTATAAACATCTTCAT >1.47|154696|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGGCAACTGAAGCAAAAGCAAGATATGATGAGTAT >1.48|154761|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTACTGTTTGATAATGTGCAAATATTCTGTATATG >1.49|154827|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGAAAACAAATTTGTACTTCCAATCATTCTGCGGA >1.50|154892|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACAGATATTGTTGAACTTCTGGGAATTCTTTTGCT >1.51|154957|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGGTAAATTCGGAATTGTACCCATATCATAATCC >1.52|155022|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATATCCCTAAAACCATGTCAGAACTCTTCATTG >1.53|155087|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGAATCTTTATCTGCTCTAGTAGGAAGCTTTGCT >1.54|155152|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGAATCTTTATCTGCTCTAGTAGGAAGCTTTGCT >1.55|155217|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTTATCCGGGCAACTGGGATACTCAAACGATTGAA >1.56|155283|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGAAAGTTTTGATTGATAAAGAAGGTACTTTATGG >1.57|155348|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTCAATAATATTCGTTCCTGTCGTATCATAGTAA >1.58|155414|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATACCTTCTATTGAAATTAACATATTGTGACCT >1.59|155479|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTGGGTGGCATAATGATACTATAGTTACTGTTGAAG >1.60|155546|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCAAAGTGTAACGTTAGTTTAAAAATATGTGAAT >1.61|155612|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAGGTAAGACAGTTCAAGCTAGAAGACATTCAGGTA >1.62|155678|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTTCTTGCAATCTTCATATGTTGAGCTTTGGTAA >1.63|155745|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTTCTTGCAATCTTCATATGTTGAGCTTTGGTAA >1.64|155812|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGGACCAGTTGCCGAGCTGGAACGACATAGCAGA >1.65|155877|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGTTTTCTTGAATTCATTGCTTCACCACCTTTCTT >1.66|155943|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACAAAGGAGATTCAGCAACAGATTGAAGTAGTAA >1.67|156008|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGAAAGGCCGAAACAAACGTCAACGAATTGACCCTG >1.68|156074|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACTTTTGCTAAAACACCGTCAATGGTCAGGTAGCC >1.69|156139|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTTTTCCCCAGAACAACAAACCGACATTCTTTTCT >1.70|156204|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATGGGAAGAGGTAGGTACAGAGAAAATAATTAA >1.71|156269|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGTTGGGTATTTACTTGGCTTGCCTTTAACGATA >1.72|156335|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGCTTATTCGTCGTCAACCTGATGTGCCTTCTAA >1.73|156400|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCTTTTTAGAAATATTAAAAATATGGATTGACTT >1.74|156465|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAACCCATGGCTGAACCAATCGCTTACCAATAGCAG >1.75|156531|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGACGCCCAAACATAATAAAGTGCTTCAGGTATTTC >1.76|156597|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTCTGCCGAGTTCATGTTGTATCACCATCTGCTG >1.77|156662|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTGTTCAGTTGCTACTATTCTTACTACATTACCT >1.78|156728|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAGTTTGCAAGTTTAATTTTAATGTCATCAGGT >1.79|156793|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATATGGAATGGTCAGAGGGTATCAAGAGTATATTA >1.80|156858|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTATACTAAAATTTTGCACAGAAATAGGGCAAA >1.81|156923|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATACAGCGCAATAATAACTATATCCTCTGCTTTT >1.82|156989|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTCTGATGGAAATCAGGATATTAGCCTCTGGCAG >1.83|157055|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAACTTGTATTTTAGATAATAAGTGTCTGTTGCAT >1.84|157121|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGATATAAAAAAATTTAAAGACAAAGCATACTTC >1.85|157186|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTCAACCTACTTTCTTTTGTGAGTATATCTCTATT >1.86|157252|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGAGCCTGCGGGGGAGGTCTGGAGGGGGAAAGCCT >1.87|157317|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTGAGTAGGTCCCATTATCTTTTCCCCAAAATC >1.88|157381|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCAAAAGTAATTCCTCATATTAATGTGTTTCACTT >1.89|157446|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAAATCATGAACAGGATAAAAATAATTAATATAGCT >1.90|157512|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCAATTAATTTATCTTGGTCACCTAATTTATC >1.91|157577|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCATTTACATTGAACTTTTTCAACCAGTCATTGGTG >1.92|157643|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAAAGTAGTTTTGTATGTGCTTCCTGCAGATGCA >1.93|157708|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATCTTATACGATTATAATTGAAAAAAAGTATAATA >1.94|157773|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACTCTAAATATTCAGCTAATGACATTTCTGTATCA >1.95|157839|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATGCAGCAAAGCAAGCTGACCTTGACGCCCACAT >1.96|157904|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTCATGGAATCATATAAAAAAACAATATGTTGCAA >1.97|157970|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATCAAGAAAAAGCCAGCTTCTTTAATACAGCAG >1.98|158035|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCGACCCAGATGGATATGGGCATCTGAATATGGCA >1.99|158100|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTGTCTTTGTCTTGAATCAAAAGTTTTTTGATA >1.100|158165|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAAAACGCGAGCGGGTAATGTATTTGATACAGATT >1.101|158231|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAGACCCAGTTAGTTACTTTAAAAAATTTGGCAAG >1.102|158297|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGATTAGTTTCTATGTTCTGTTTGTTCAGCTTTCA >1.103|158362|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACACTGAAAAAGAAATCAATACATAAAGATATAAAT >1.104|158428|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGATGGTGTAACGTCAGTGACAAATTTGCAAGCG >1.105|158493|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTGAAGGCGGTTCAAAAAGTATAACACAATTCA >1.106|158558|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGAACGCAGAGGTGAAGGTGATGACTGGTATTATG >1.107|158624|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGATTCAACTTCTACTAACACAAAATGCTCATAAAA >1.108|158690|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTACCGCCCGCTGACACTGGAGACTGGGGTGATAA >1.109|158755|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTAAACCACCCGAACTAATTTGCTCTGAATAGCTAA >1.110|158821|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATACTGCTAAATAATAAAACCTTACGTACAACAG >1.111|158886|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGACGACAAAGGAAATATCAAAGTTGGTACAACT >1.112|158951|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATATTTTTGTTTGTTCTAGTTCATAACTATACCCATC >1.113|159018|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGAAAAGGAAGAAGGTGATAAAGGAGAAAAAACA >1.114|159083|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGTTGTTGTTACACAAGAATTAGGCAGACAATAC >1.115|159149|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGAGTTTGTTGTTGACGACGACGGCACAGGGGAAA >1.116|159214|39|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGTAAGTATTAAAAGGGTAAGTCGTCATCGTTGCTTG >1.117|159282|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGATGGTATGGTCGATTTGGAAAAGATTAAAGAC >1.118|159347|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTTTGTTGCTTGTAAAGGCGTTGTAGAAATTCTG >1.119|159413|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGGTTTTTTTACTATAAACTCTTGAAAAATTTTTA >1.120|159478|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTAGTTGTTCGTTGGTGGTTTTATTTACACACACA >1.121|159545|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGTTGCCTGATGGGTCATACAAACTAATTGTGACT >1.122|159610|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTCTTTGCTACCCCATTGATAGTGCGGGCATTTCTC >1.123|159677|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTTCATTACTTCATCAAGAGAAGAATGCATTGAA >1.124|159743|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTCTTTCAAGCTCCGCCTGTACGTCCGTTACCCA >1.125|159808|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAGTTTTAAAAGCTGAGATTTAACAGAATCATTCA >1.126|159874|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAATGGTATATACAATATAAATCCGAATGCTTGCAT >1.127|159940|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAGTAGGGATGTTATGTTTGGATAAGGGGTGTAGA >1.128|160006|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATAGTACCGTCTGATGCACCAGATTTGCCACATGTT >1.129|160072|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAATAATCTGTATTATTTCATTCCAGTCAACAAACG >1.130|160139|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACATTGTCAAAAGTGGGTAAGCCACCCTTGGTAAG >1.131|160205|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTAGATTTTTAATTGTTACCCAATCTCCTGCTGA >1.132|160269|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCTTTCATTACAAGAAGGGAATTTGGTCTATGAATA >1.133|160335|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTAAAGGTTGCGGTCTTTGATTGCGTGAAGCTCATC >1.134|160401|35|NC_012034|CRT CTTCAACTGCATTTTCAATATAACCTTTTATCACA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,csx1,cas10,csm3gr7,csx19 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012034_1
The CRISPR arrays of NC_012034_1 >merge|NC_012034|1|151654-160464|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_012034.1|WP_015906765.1|151152_151416_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIVTYDVNEKRVNKVRKILKKYFTWVQNSVFEGEITLGKLEKCKRELLSVIEKNEDSVYFYEMEYKLVCNKKVLGQEKNYDSIII >NC_012034.1|WP_015906764.1|149983_150964_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MQKTLYITSNGRLRRKNNTLYFETETEKRSIDIENIEQIHIFGEVDLNTKTLNYISQYGIVLHFYNYYGFYLGSFLPRKKNISGDVVVRQALHYLDREKRIFLAYCFVESAVYHMMRNLRERKKTEAFLNAIEDEWENGRFNISSISELMGLEGRVRNIYYSSFNQFLPEDFYMEKREKRPPTNPINALISLGNSLIYSTVLTEIYHTQLDPSISFLHEPSEKRFSLSLDISEIFKPLIVDSVIFKLLNNHQLTLEHFDEDLNYCYLNQDGKKIFINELKNKLETTVRHRQLNRNVSYKGFIRLECYKLIKHFIGDQVYSPLKAWW >NC_012034.1|WP_015906763.1|149462_149978_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MSEEIQELQDLKFQGIKINYFYVCKRKLWLFSKNITFENQSDKVLLGRILHEYSYPKEKTKEVLIDNLIMIDILSDGAVREVKYSSRMKEADIMQVMYYLYYLKQKGIEKQGIINYPKERRKEILQLTPEYEQKVKQALSEIEKITSQATPPPATKQKICKSCAYLEFCWG >NC_012034.1|WP_041726941.1|147099_149433_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSMKAYEDIDLYAKRFKTEKGYEYQTIYEHTMTLLQNMEKLFKEYREEIEEGFQKLQIDLEMFKYLLKLAIIYHDLGKANSNFQRKIRDKTKSNEVPQVKCLSVEVPHNFISIAFVALEDEIDKGNISPEDFENLLFAIAFSHDRGFDFNYQYFEKYICEDVSKYLTNKTLLPLFKELPSFPTKDEIEKSSNYVYRTIDWLKEVMLKSYTDLYNKNTIMRILLKGFLHRLDHSSSAGISTEEGKITDFSHKVESYLKEKGNFVGFKEFQLKALDFSNQNVILFAPTGSGKTEFGLNWAGRSKLIYTLPIRVSINAMYERLAKIFGSNKVGILHSDSMIYLLEKYSQSAEDVQELESLFDNVNLARNLSFPIIVTTGDQIFTSALKWPGFEKIYSLFLYSKIIIDEPQSYSPESLAIIIKTLEEIVNLNGRFCLMSATVNPLVLKYLGDISEYLQAYSDEELKKCWSHVVSVKPLSILDCVDEIVNCGKQQNVLVICNTVRRSQEVYKAIKESIGNSDDVPVELLHSRFLEGQRRQKEHFILSNQRKNSIVISTQLVEASLDIDYDVLFTELASADSLLQRMGRVYRKRPYEGQKPNVIILTKEPSGIGRVYQKEIVTRTEEFLKRFDGRKITEYDKKELNEYAYDVEVLSNTNFMKSFKKAYELLKLGFKADRKIEAQKIFRDVVTVEGIPRKVFEVNEETIRECLKRIGSKSLSPIEKLQLISDVRKYTVTVPVYFFAKGGASEYSKKLGIFILNCDYDDELGLLPPKESEKDDIW >NC_012034.1|WP_015906761.1|146369_147119_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MSQKLLKIKLYQPFANFRKPFSYGIVDSYPLPPPSTVKGWLHNILGAKNGEYYKMAVSICGKFNSIVYDIQRIIKFDRLRKEDSSAPILKDVSARVLNGIIYVTNLVDVELCIHVNAEQEVLKGISLDIFNSYWGLGRKEDLLRVDEVKFFEPQVVEYREYVKHKLPDIGMYLKTSTAEKLRVDGIRFRLNNRYIKTKDGLRIFTDKKDVVYFENLQHLNPIMSVSDKLLVDDENILIDLIGDDEYESL >NC_012034.1|WP_015906760.1|145437_146367_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MSKNAGITITVVFEAMSLNYGESVGNISELKKLTRENKVYTYMSRQALRYEKHKFMLENSEYREAPVTGDEQVVQFTKEATITQYPEIDLFGYMKTSGQGQGAQTRTTVVKITPAVSLEEYKNDIEFATNLNLAKRANTNPNPYQLEQHKSLYTYTISVDLDRLGRDFDEKGNVIEEVPIEERLKRLNTLFDAIKFLSREIKGRRENLSPLFVIGGLYPVKNSFFLNRIKIIKDDVGYAIDARLLNSTCELTLPNGKKVYDYTLLGLIEGFFVNEEQLKKLLPDSSGTIDYFFETLKEKAQKYYKEGTV >NC_012034.1|WP_015906759.1|143800_145441_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MKERVYLGDWAYNAGIIGFIEIMLDGEDIDSQNIITIGLNYIEFERESLRGFSDKFFKKAYQRYPRTDEIINEGKDLLEQLNNRSDIDEQQRERIRKFKDRVNGFAKLSRLAKEYGCSLNKKFNKNEAVDFVNTIIKILEDRKQEFMENDVKVYLNSVSSVYGEASFLNRQITENLKEKFYNDFEKPIIEKANEEDKKYPCIFCGERKAKKGAMFNTGIVNFLGANKDNKNFFWNFKPQLPICEICELMYFCIFAALTEFRVGQTKRFYFVDKSTSVLELYQANKLFMEIMSKEENLLKDKGILNFINDYLLLKLREESKFALTNVLFVEIDLSSVAPKVYGFNISKQKAEFVTSNYEFFENVVGTKITVKDNTLYPFHELLQRFLNNTLSFQFVSFLESQFISSKKVNSKIKTNLSPYRLQMFNIITYKFLKSIKRGEMLMDEKSLWRMYFFGQELKKTFLKSGAENKITSLAYRLISALRIGDINTFMNLVIRTYMNYNMEVPALFVSCINDKDNFCALGYSFVNGLLGSERDERLENEEDEEK >NC_012034.1|WP_015906758.1|142982_143768_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRAKFIFEVHNGFNETKELPVYYRTLFMAFLKKALSSYNEEYFKRLYWWEDKKNKWQKPFVYAVNLPNMNFSDDKVLFRGDIVLNLSTSDYEFFVNIYNSLISSKLYPHKLANNCGIKLKRAYLIKEPEQFSSTMTFKTFSPVLIEKKEGDEKIPVLPYDEGFEEVLNEVIDFEIRNLRILRGQNRGLHKRISFRPINIKKIVVKHKISEFVENTGKEIMYLTGFGGIFELSGHPDDLKEIYQNGLGFRRGQGFGFIEVVR >NC_012034.1|WP_015906757.1|142060_142768_+|CRISPR-associated-protein-Cas6 MRAKFIFEVSEKQGQVHELPIYYRTIFMSFLKRALSLYNQEYFNRLYWWEDKKNKWQKPFVFAVNLPNMNFQDDTVSFKGDILLNLSTSDYEFFVNMYNSLLNNRLYPYPLTDSCKIALKRTYLVREPEKFDSKMTFKTFATILIEKKEGKKKVPVLPFDEGFEEIFNDVVDFEIRNIRILRGQNKGLQKRFYLNYKGCKRLIQFLELSLFLYSLIWIMELLFEINQIFSVLFSY >NC_012034.1|WP_015906756.1|141261_141849_+|hypothetical-protein MEKKTFENPFLMAFVVYLVISLVVIFIFIAKINRLEVFKTNYNAKIPNIFFAEYSYKLSDAKDILKHLVEDQNIDFSYLRGRAEEYFLNNTLTMSIAKEPDIFEEKDISRIMNERYGLVVKVRDFVRKINERIIVPKDRNLALQIKPDIEKIIFLLDALNEDLQSFRDSNTKKVYKEYEKELLEYFKKVEKKILQ >NC_012034.1|WP_013429593.1|162207_163410_+|IS21-like-element-ISCbe3-family-transposase MQNLTAHLNMIRAMKMKPNFSELARIYGMDRRTVKKYYEGYEGKPKNRNKPSKLDKYYDEIKSKLAIKGVTVKGVYEYLKSKDETIGTYSNFNKYVKKKGLKPEKKIKGHPRFETDPGEQAQVDWKENIKLVSRNGEEFIINVLDFKLGYSRYCCFEINRTKTQEELIETLIRIFKDIGGVPREILFDNTAAVVDITGEKIKVNSRFKSFAKDFGFEVKLCKPRHSYTKGKVEAANKFIDWILPYQGEFETEEDLVRIIKEINAKVNMQPNQTTQVPPALLFQKEKEYLQPLPDKRLIDSYLNSYKSVKVQKDSLIYYKGSKYSVPPEYIGKTVQVKEVENKIYIYYNTNLLRIHVIDEKNINYHDEDYKQLMLMRVGQREELNKICEENLKKFDNLLKT >NC_012034.1|WP_015906766.1|163430_164195_+|AAA-family-ATPase MSNYVKLLNNLEELGLHNIKNNLDKYLDLVASGEKSMTDALYELSNLEIKAKEERAILGCVRVANFPFIKGIEDFDFSFQPSINKQQIMDLMSLRFLEGNENILFVGTPGVGKTHLATAIGIECAKRRYSTYFIHFQELIAQLKKVLLENRLEYRLKHFSKYKVLIIDEIGYLPIDNDGANLFFQLISSRYEKSSTIITTNVVFSEWGEIFGGATIANAILDRLLHHSYVIFIKGPSYRLQSKTAYFSNTNQQS >NC_012034.1|WP_041726944.1|167187_167967_+|AAA-family-ATPase MLGKLKDLKLSGIIKSFDLRVEEAIKNNFSYQEFFEILINDEVSNRRINSNQKRISKARFPWHKTLEEYNFSYQPSINKRFIYNLATCEFVRKKENVAFIGPPGTGKTHLAIAIGLKAVALGYRVLFTTANEMLEELYISRADNSYQQKLKNYVNVDLLIIDELGLRKFNQSSVDDFYEIISKRYERGSIIITTNKVFEEWPTIFYDPVLATAILDRFVHHCHFVVIKGESYRMKQREGAIKALTDDSKNESNQLNNDN >NC_012034.1|WP_015906768.1|168760_170152_+|hypothetical-protein MGENILVVTVGTSPLPEYIATKYFLRYLPNKCSAEKYNYVFFICSEETIRQKSTASYAEKLEEVLGRDNVKVFYILLSDVSDPETIYNDLNEYFSSRQEFSKEKVNKVHLHYSGGTKAMAVYIYDFFKTKYGEKFESSYLDARDKRMIVSNPHSKNKIKTLASDDLRNVDEVSIDIDTLLRIHLYEKKEENESWGNKFCSNNFIIIMRQIEDIIKTPEKIKIFIAWLDDQFRRLFKSSGKFIEKTEEFCNVVKNNENIVNQFNEQLSKYEFIKSLLLSFPEEKRIINEDGKLWIPPEDLSSKKFKEKIFETVKFLDGKWLEYYVYNELKNKLLERGLKEGSHFGLSLKAKKKEGSNNSKGFELDIFVIRGYQLIGISITTSLKTGECKFKGFEVIHRVNQIGGEESKAILITAIDRNGKDSNPESLKEDLAYETGSHEEKIVVFGIDDWADIGDKIVEEVFDE >NC_012034.1|WP_015906769.1|170148_171723_+|hypothetical-protein MNNCVAVLIDTVSIQEYIFSSNKLKDNIGASFIVDNIYKDQLKRALEIVFKASNININTWRENPDIIQITQNKVEFEVGYIGGGNALILFKEGERYNRVEKAKEFVRTFTKMLLEEVPGVKTAFGIAADFNLDKFEDSMKKLHKELQMNKNKFFSLVTLQKHGFTLDCPRTDESAEFDKKDEEESFISAVAKAKIEVSKKARERMKECYLKNYENEYLFTDEIDKLGQQKNSKNYIAIVHIDGNKIGEKFKKCESLQEIRKLSIDVENASQSSFKRIIEEVVDKIKKKIISKENGFYLSSEDEKTVLPLIPVLIAGDEVTFVCEGRLGIWLAEKYIKELMNYKIQNSVFSACAGVSIVKSKYPFYRAYLIAEGLLSRAKRKSRENGNSSYLDFFVSSGGCSGEIDDILEKHFSTINGNLHFGPYKVDSDCDTNCYNDDSLKYLKENIKGLLKFPRNKLMRLREALFEEKEIRKLILEEFSVKDLNLPKLPFKKDYITDLWENKKTPYFDAIEAIDFYPEGLLNE >NC_012034.1|WP_041727292.1|171724_173989_+|hypothetical-protein MKIFLKTLSYTLVGCGESKGMVDNDIVYDSLGLPYIPSRRIKGLFKESATEVCEMLGISIELVDSLFGRDGFNPAKIYIDNLYVTNYKEIKREIEKLKEEEYYKHFLYPEKIISCYTVERYQTAIDAENGTAKENSLRTSRVLKPNIEFEGAIFELKPLSEKEKALLYLASINLRRIGTLRNRGFGQVRCWIEGIDFKNVVEAIEKLKCEEESFSEVNKSIKEFKCTGTEDRTLAKLVYTIKTLSPIVIASPRGEQNTVYTKTYIPALTVKGLIVNQFIRLMDLGENAHQNDYFYKMFLKGEIIFTPAYPAKENRIFEPIPLCLQPEKGSEPDVLYNLFDPTNESRNTKPMKKFWYFTEDKVDNGNCVYELYEPETIFYFHNSRDRQKGHSVGEGIFYYEAIDSEQEFKGEIVGPRNYLLQLKELIGSFEGFIGRSKTAQYGLVKFDFGEIKDIETQEDIDDEYIIYALSPIIVYNCYGFTEPSERVLKSYLAKILECKEEDIEIMSSAAKVERLENFVGVWKMKSSSEIAYAAGSCFRIKLRCQIRDFKDKINEILINGIGEKTQNGYGRVKIYFDLAKKYQKRDSKEEHKEKVIINKSVNLIEDIVKSDLFMWAKIKGFEKAREFDKKKEISSHLIGRLENLLSDSKNLDTWKKGLSKFSDKQAGKKLKKVRLWDELFDENSKVDITVKLYNSLAEERDFNKYFHKSIFGNLKWNIEQDTDFLWEFFKAYWLSFLRYLRLFKKREEEVNVQN >NC_012034.1|WP_015906771.1|173975_175400_+|hypothetical-protein MCKIKGRLILKGILKNESPFVIGKGKGDLIDIEILKGEKGMPYIPATSFIGVLKHHICNEKFDIEDEYTWNYFWGDNVKENDNDSNTGIQSHFMVSDIKLEEEQTGILAIRDGIAIDSRYGVAKEKAKYDYEVVNKNLTWGFCAELILREGVNENLFFKILNTVLNELKQGRVRIGAFTTKGFGKFRLVDCNVYLFVFPKDGEKYLKFLADEENALKELEEFDLSEYGTLQVKDSDDRDFELKAKFTLKSSILINSYGTNTEETGNKEQEDVDKIHIKYNGEPVLPGTSLKGAIKARCVKIINTLIDNKNYILPDKIESLLNDLFGFVDNEGKTKRKQKSRLIVEESIIEGAEESEQTRIKIDRFTGGVIEGALVKSKPVWHKNEEVEMCIKIEKAKEWEIGLILLVLKDLWSEDLPIGGEKSIGRGLLSGKLAQIKYGNKEYIIKQNGRKLEIQGNKAELENFVEQLLKEMGV >NC_012034.1|WP_015906772.1|175407_176019_+|TIGR03984-family-CRISPR-associated-protein MIMLKKMYEVKKISSCVNLIGEIEKEKIIEIISSYFFNASIVFWLDYEVLFGTFESGKLRFYKELSRDFGKYLLKARIFDENKELYLWRNNNLVLKGRLRKDYVGEHKVDEHKVEYIDVIDAQQVMFGKNFYDLKNGFVEVSEPRGIKYIVPKEFLLGEKLTQSDMRLILYTRNYIGYNEIGQAGFIDYRFVKIEARGGEQNG >NC_012034.1|WP_079504048.1|176050_177859_+|TIGR03986-family-CRISPR-associated-RAMP-protein MAAKAPYNFVPLNICVVKAQEVPSFSKFYKDRYSGYIELEIETITPLFIGTKEKCSQFFSPAGKPRIPGSTLRGMTRTLVEIVSYGKYGFCDKSRRLYYRAVAGSSSLDKSYRELFVDRNDYFKYKFSAGIMRKEGNTYRIYPSKFCEKTQIYRIEFNNLPDELKDKKPYYFEVVYYKPVSVKVHKHSKVNLKYAKITSISLSQDSEHPQRGYLIISGNVEKKKHMHWIINEPEEHNYIVIPEKKIEEYRNDEKRDPSFDILKILNECGEVPVFFITDQANNVIAFGHTGFFRLSYDYTIGEHIPKNLQSDDVIDFAEAIFGKAGQTNSFASRVFFEDAELIETPENLENIFLTETSPKILSAPKPTAFQHYLEQPEGVQTSKDKLHHWNTKEAKIRGYKLYWHRNTPDEPYHEHSWSEGKIIKDSEQHTVIKPIGRGVKFKSRIRFENLSKEELGCLLFVLDLPDGYYHKIGMGKPLGLGTIKIKPTLFLIDKKIRYSSLFHEDEWELGIERKETLQDYKSDFEKYIMRNIPDEEKDNANSLWETKRLKELKILLCWEHNNCVGWLEKTRYMTIGDRAKKIENEFRKRTVLPKPSEVIQGD >NC_012034.1|WP_015906774.1|178387_180409_+|hypothetical-protein MGILLEVAGVLISIYILLKLIGLRVIPNDKVGIVEKWWSFKGSLDEQIIALHGEAGFQPEVLRGGIHFRTPLMYKVHIVPLVTIPQGQIGYVFARDGKPLEPTQTLGRVVPECNNFQDVRAFLENGGQRGPQRAILREGTYAFNLAQFIVITEDKIYYLPMGNKEEKEMIEKMVQTLKSRNAFRPIVITEDKVGIVTVHDGPSLPSGDIVAPTVGDDPSDPETYHNNFQDPEKFLKAGGFRGRQLQVLVEGTYFINRLFATVELIDKTVIEVGYVGVVVSYVGPKGQDTSGEDYKHGELVEKGYRGVWKDPLMPGKYAFNTYAGKIVKVPTTNIILKWISNQTGTHRYDENLKEVSLITKDAFEPSLPLAVVLHIDYRKAPLVVQRFGDLKMLVEQTLDPMVSAYFKNIGQKKTLIELIQQRDEIQKIASAEMKERFAHYNLELEEVLIGTPMSSPNDNKIDAILEQLRDRQIALEQIETYSRQQKAAEKERELREAEARAAQQKLLTESEINIQIQTNQGKAEYQRSLQEAQKIKALAEAEAEKEARIGIGRAIAIEEQVKAYGGPQYQVLQDVMGKFTQALEKTGIDIVPETVVSMGEKSSSVSFNAFEMLLTLLLTKELGVEFKAKETEDENIKRIKQEILNSILLAKENEKEEKTEQVSQGLQQQNAVS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012034_2 | 164244-165518 |
I-A
Consensus repeat of NC_012034_2
|
19 spacers
spacers of NC_012034_2
>2.1|164273|38|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT GTCATCTTTCATTTCAAACATTGAACGTTTTTTGTGAC >2.2|164340|38|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT GTCATCTTTCATTTCAAACATTGAACGTTTTTTGTGAC >2.3|164407|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT GTCCCAATCTTTTGTTATATTGTAAGTTGGTATAG >2.4|164471|37|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTAAAATCATTATGATATGCTAAGGCATAGTAGATG >2.5|164537|38|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GACATCTTTGTTAAAACTGTGGTAGACAGCGTTCGCAA >2.6|164604|37|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAGGATTATGCGAGAAAAGTTGCTAAAGCAAGTTTG >2.7|164670|37|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAACATACTATACAATCAATAAGAATTTTTATCAT >2.8|164736|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTAAAGGGCTTGAAAACTTAACTGTTGCTCAGCAG >2.9|164801|37|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACATATCTTGCATACGCTTTTTTAGATTCACATCTT >2.10|164867|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGAAGCTGTACAAAGAGAAATGAAAAGAAGAGCTC >2.11|164932|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTCACAAGACATGTATCAAAATATTTACAACCTTG >2.12|164997|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTCAAAAATGGATTATAGCAAAAATCAGCTTCAA >2.13|165062|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGCAAGAAGAATAAGGCAGGCAATACCTGTTTTGAG >2.14|165127|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGGATTAAGATAGGCGTTCAAGCAAACACAACAGG >2.15|165192|37|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGAAAGAGCTGAAAGCAGATTTAATGAGCAAGAAAG >2.16|165258|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGCTCTGGTTTAAATTGAGAAATAAATCCATTGCCT >2.17|165323|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTGAAATATTTAATAATGTGTTAGGATAAGGAACA >2.18|165388|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTTTTATCAAGAATTTTTTCTTTTGTTATGCTG >2.19|165452|38|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT TTGAATCTAACGCAGCAACGCCTCCGCTTTTTTGTATA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,csx1,cas10,csm3gr7,csx19 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012034_2
The CRISPR arrays of NC_012034_2 >merge|NC_012034|2|164244-165518|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGACATTTACACTATGAGGGATGTAAACGTCATCTTTCATTTCAAACATTGAACGTTTTTTGTGACGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTCATCTTTCATTTCAAACATTGAACGTTTTTTGTGACGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGTCCCAATCTTTTGTTATATTGTAAGTTGGTATAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTTTAAAATCATTATGATATGCTAAGGCATAGTAGATGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGACATCTTTGTTAAAACTGTGGTAGACAGCGTTCGCAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTGAGGATTATGCGAGAAAAGTTGCTAAAGCAAGTTTGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAAAAACATACTATACAATCAATAAGAATTTTTATCATGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACCTTAAAGGGCTTGAAAACTTAACTGTTGCTCAGCAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAACATATCTTGCATACGCTTTTTTAGATTCACATCTTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTTGAAGCTGTACAAAGAGAAATGAAAAGAAGAGCTCGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACCTTCACAAGACATGTATCAAAATATTTACAACCTTGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACAATTCAAAAATGGATTATAGCAAAAATCAGCTTCAAGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGGCAAGAAGAATAAGGCAGGCAATACCTGTTTTGAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACCGGGATTAAGATAGGCGTTCAAGCAAACACAACAGGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACATGAAAGAGCTGAAAGCAGATTTAATGAGCAAGAAAGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGGCTCTGGTTTAAATTGAGAAATAAATCCATTGCCTGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACGGTGAAATATTTAATAATGTGTTAGGATAAGGAACAGTTTTATCTAAACTATGAGGGATGTAAACAGTTTTTATCAAGAATTTTTTCTTTTGTTATGCTGGTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAACTTGAATCTAACGCAGCAACGCCTCCGCTTTTTTGTATAGTTTTATCTGAACTATGAGCATTCCTGTA >NC_012034|2|2|164244-165518|CRISPRCasFinder TTGACATTTACACTATGAGGGATGTAAAC GTCATCTTTCATTTCAAACATTGAACGTTTTTTGTGAC GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC GTCATCTTTCATTTCAAACATTGAACGTTTTTTGTGAC GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC GTCCCAATCTTTTGTTATATTGTAAGTTGGTATAG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC TTTAAAATCATTATGATATGCTAAGGCATAGTAGATG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC GACATCTTTGTTAAAACTGTGGTAGACAGCGTTCGCAA GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC TGAGGATTATGCGAGAAAAGTTGCTAAAGCAAGTTTG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC AAAAACATACTATACAATCAATAAGAATTTTTATCAT GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC CTTAAAGGGCTTGAAAACTTAACTGTTGCTCAGCAG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC AACATATCTTGCATACGCTTTTTTAGATTCACATCTT GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC TTGAAGCTGTACAAAGAGAAATGAAAAGAAGAGCTC GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC CTTCACAAGACATGTATCAAAATATTTACAACCTTG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC AATTCAAAAATGGATTATAGCAAAAATCAGCTTCAA GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC GGCAAGAAGAATAAGGCAGGCAATACCTGTTTTGAG GTTTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC CGGGATTAAGATAGGCGTTCAAGCAAACACAACAGG 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>NC_012034.1|WP_015906766.1|163430_164195_+|AAA-family-ATPase MSNYVKLLNNLEELGLHNIKNNLDKYLDLVASGEKSMTDALYELSNLEIKAKEERAILGCVRVANFPFIKGIEDFDFSFQPSINKQQIMDLMSLRFLEGNENILFVGTPGVGKTHLATAIGIECAKRRYSTYFIHFQELIAQLKKVLLENRLEYRLKHFSKYKVLIIDEIGYLPIDNDGANLFFQLISSRYEKSSTIITTNVVFSEWGEIFGGATIANAILDRLLHHSYVIFIKGPSYRLQSKTAYFSNTNQQS >NC_012034.1|WP_013429593.1|162207_163410_+|IS21-like-element-ISCbe3-family-transposase MQNLTAHLNMIRAMKMKPNFSELARIYGMDRRTVKKYYEGYEGKPKNRNKPSKLDKYYDEIKSKLAIKGVTVKGVYEYLKSKDETIGTYSNFNKYVKKKGLKPEKKIKGHPRFETDPGEQAQVDWKENIKLVSRNGEEFIINVLDFKLGYSRYCCFEINRTKTQEELIETLIRIFKDIGGVPREILFDNTAAVVDITGEKIKVNSRFKSFAKDFGFEVKLCKPRHSYTKGKVEAANKFIDWILPYQGEFETEEDLVRIIKEINAKVNMQPNQTTQVPPALLFQKEKEYLQPLPDKRLIDSYLNSYKSVKVQKDSLIYYKGSKYSVPPEYIGKTVQVKEVENKIYIYYNTNLLRIHVIDEKNINYHDEDYKQLMLMRVGQREELNKICEENLKKFDNLLKT >NC_012034.1|WP_015906765.1|151152_151416_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIVTYDVNEKRVNKVRKILKKYFTWVQNSVFEGEITLGKLEKCKRELLSVIEKNEDSVYFYEMEYKLVCNKKVLGQEKNYDSIII >NC_012034.1|WP_015906764.1|149983_150964_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MQKTLYITSNGRLRRKNNTLYFETETEKRSIDIENIEQIHIFGEVDLNTKTLNYISQYGIVLHFYNYYGFYLGSFLPRKKNISGDVVVRQALHYLDREKRIFLAYCFVESAVYHMMRNLRERKKTEAFLNAIEDEWENGRFNISSISELMGLEGRVRNIYYSSFNQFLPEDFYMEKREKRPPTNPINALISLGNSLIYSTVLTEIYHTQLDPSISFLHEPSEKRFSLSLDISEIFKPLIVDSVIFKLLNNHQLTLEHFDEDLNYCYLNQDGKKIFINELKNKLETTVRHRQLNRNVSYKGFIRLECYKLIKHFIGDQVYSPLKAWW >NC_012034.1|WP_015906763.1|149462_149978_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MSEEIQELQDLKFQGIKINYFYVCKRKLWLFSKNITFENQSDKVLLGRILHEYSYPKEKTKEVLIDNLIMIDILSDGAVREVKYSSRMKEADIMQVMYYLYYLKQKGIEKQGIINYPKERRKEILQLTPEYEQKVKQALSEIEKITSQATPPPATKQKICKSCAYLEFCWG >NC_012034.1|WP_041726941.1|147099_149433_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSMKAYEDIDLYAKRFKTEKGYEYQTIYEHTMTLLQNMEKLFKEYREEIEEGFQKLQIDLEMFKYLLKLAIIYHDLGKANSNFQRKIRDKTKSNEVPQVKCLSVEVPHNFISIAFVALEDEIDKGNISPEDFENLLFAIAFSHDRGFDFNYQYFEKYICEDVSKYLTNKTLLPLFKELPSFPTKDEIEKSSNYVYRTIDWLKEVMLKSYTDLYNKNTIMRILLKGFLHRLDHSSSAGISTEEGKITDFSHKVESYLKEKGNFVGFKEFQLKALDFSNQNVILFAPTGSGKTEFGLNWAGRSKLIYTLPIRVSINAMYERLAKIFGSNKVGILHSDSMIYLLEKYSQSAEDVQELESLFDNVNLARNLSFPIIVTTGDQIFTSALKWPGFEKIYSLFLYSKIIIDEPQSYSPESLAIIIKTLEEIVNLNGRFCLMSATVNPLVLKYLGDISEYLQAYSDEELKKCWSHVVSVKPLSILDCVDEIVNCGKQQNVLVICNTVRRSQEVYKAIKESIGNSDDVPVELLHSRFLEGQRRQKEHFILSNQRKNSIVISTQLVEASLDIDYDVLFTELASADSLLQRMGRVYRKRPYEGQKPNVIILTKEPSGIGRVYQKEIVTRTEEFLKRFDGRKITEYDKKELNEYAYDVEVLSNTNFMKSFKKAYELLKLGFKADRKIEAQKIFRDVVTVEGIPRKVFEVNEETIRECLKRIGSKSLSPIEKLQLISDVRKYTVTVPVYFFAKGGASEYSKKLGIFILNCDYDDELGLLPPKESEKDDIW >NC_012034.1|WP_015906761.1|146369_147119_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 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MLGKLKDLKLSGIIKSFDLRVEEAIKNNFSYQEFFEILINDEVSNRRINSNQKRISKARFPWHKTLEEYNFSYQPSINKRFIYNLATCEFVRKKENVAFIGPPGTGKTHLAIAIGLKAVALGYRVLFTTANEMLEELYISRADNSYQQKLKNYVNVDLLIIDELGLRKFNQSSVDDFYEIISKRYERGSIIITTNKVFEEWPTIFYDPVLATAILDRFVHHCHFVVIKGESYRMKQREGAIKALTDDSKNESNQLNNDN >NC_012034.1|WP_015906768.1|168760_170152_+|hypothetical-protein MGENILVVTVGTSPLPEYIATKYFLRYLPNKCSAEKYNYVFFICSEETIRQKSTASYAEKLEEVLGRDNVKVFYILLSDVSDPETIYNDLNEYFSSRQEFSKEKVNKVHLHYSGGTKAMAVYIYDFFKTKYGEKFESSYLDARDKRMIVSNPHSKNKIKTLASDDLRNVDEVSIDIDTLLRIHLYEKKEENESWGNKFCSNNFIIIMRQIEDIIKTPEKIKIFIAWLDDQFRRLFKSSGKFIEKTEEFCNVVKNNENIVNQFNEQLSKYEFIKSLLLSFPEEKRIINEDGKLWIPPEDLSSKKFKEKIFETVKFLDGKWLEYYVYNELKNKLLERGLKEGSHFGLSLKAKKKEGSNNSKGFELDIFVIRGYQLIGISITTSLKTGECKFKGFEVIHRVNQIGGEESKAILITAIDRNGKDSNPESLKEDLAYETGSHEEKIVVFGIDDWADIGDKIVEEVFDE >NC_012034.1|WP_015906769.1|170148_171723_+|hypothetical-protein 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MKIFLKTLSYTLVGCGESKGMVDNDIVYDSLGLPYIPSRRIKGLFKESATEVCEMLGISIELVDSLFGRDGFNPAKIYIDNLYVTNYKEIKREIEKLKEEEYYKHFLYPEKIISCYTVERYQTAIDAENGTAKENSLRTSRVLKPNIEFEGAIFELKPLSEKEKALLYLASINLRRIGTLRNRGFGQVRCWIEGIDFKNVVEAIEKLKCEEESFSEVNKSIKEFKCTGTEDRTLAKLVYTIKTLSPIVIASPRGEQNTVYTKTYIPALTVKGLIVNQFIRLMDLGENAHQNDYFYKMFLKGEIIFTPAYPAKENRIFEPIPLCLQPEKGSEPDVLYNLFDPTNESRNTKPMKKFWYFTEDKVDNGNCVYELYEPETIFYFHNSRDRQKGHSVGEGIFYYEAIDSEQEFKGEIVGPRNYLLQLKELIGSFEGFIGRSKTAQYGLVKFDFGEIKDIETQEDIDDEYIIYALSPIIVYNCYGFTEPSERVLKSYLAKILECKEEDIEIMSSAAKVERLENFVGVWKMKSSSEIAYAAGSCFRIKLRCQIRDFKDKINEILINGIGEKTQNGYGRVKIYFDLAKKYQKRDSKEEHKEKVIINKSVNLIEDIVKSDLFMWAKIKGFEKAREFDKKKEISSHLIGRLENLLSDSKNLDTWKKGLSKFSDKQAGKKLKKVRLWDELFDENSKVDITVKLYNSLAEERDFNKYFHKSIFGNLKWNIEQDTDFLWEFFKAYWLSFLRYLRLFKKREEEVNVQN >NC_012034.1|WP_015906771.1|173975_175400_+|hypothetical-protein MCKIKGRLILKGILKNESPFVIGKGKGDLIDIEILKGEKGMPYIPATSFIGVLKHHICNEKFDIEDEYTWNYFWGDNVKENDNDSNTGIQSHFMVSDIKLEEEQTGILAIRDGIAIDSRYGVAKEKAKYDYEVVNKNLTWGFCAELILREGVNENLFFKILNTVLNELKQGRVRIGAFTTKGFGKFRLVDCNVYLFVFPKDGEKYLKFLADEENALKELEEFDLSEYGTLQVKDSDDRDFELKAKFTLKSSILINSYGTNTEETGNKEQEDVDKIHIKYNGEPVLPGTSLKGAIKARCVKIINTLIDNKNYILPDKIESLLNDLFGFVDNEGKTKRKQKSRLIVEESIIEGAEESEQTRIKIDRFTGGVIEGALVKSKPVWHKNEEVEMCIKIEKAKEWEIGLILLVLKDLWSEDLPIGGEKSIGRGLLSGKLAQIKYGNKEYIIKQNGRKLEIQGNKAELENFVEQLLKEMGV >NC_012034.1|WP_015906772.1|175407_176019_+|TIGR03984-family-CRISPR-associated-protein MIMLKKMYEVKKISSCVNLIGEIEKEKIIEIISSYFFNASIVFWLDYEVLFGTFESGKLRFYKELSRDFGKYLLKARIFDENKELYLWRNNNLVLKGRLRKDYVGEHKVDEHKVEYIDVIDAQQVMFGKNFYDLKNGFVEVSEPRGIKYIVPKEFLLGEKLTQSDMRLILYTRNYIGYNEIGQAGFIDYRFVKIEARGGEQNG >NC_012034.1|WP_079504048.1|176050_177859_+|TIGR03986-family-CRISPR-associated-RAMP-protein MAAKAPYNFVPLNICVVKAQEVPSFSKFYKDRYSGYIELEIETITPLFIGTKEKCSQFFSPAGKPRIPGSTLRGMTRTLVEIVSYGKYGFCDKSRRLYYRAVAGSSSLDKSYRELFVDRNDYFKYKFSAGIMRKEGNTYRIYPSKFCEKTQIYRIEFNNLPDELKDKKPYYFEVVYYKPVSVKVHKHSKVNLKYAKITSISLSQDSEHPQRGYLIISGNVEKKKHMHWIINEPEEHNYIVIPEKKIEEYRNDEKRDPSFDILKILNECGEVPVFFITDQANNVIAFGHTGFFRLSYDYTIGEHIPKNLQSDDVIDFAEAIFGKAGQTNSFASRVFFEDAELIETPENLENIFLTETSPKILSAPKPTAFQHYLEQPEGVQTSKDKLHHWNTKEAKIRGYKLYWHRNTPDEPYHEHSWSEGKIIKDSEQHTVIKPIGRGVKFKSRIRFENLSKEELGCLLFVLDLPDGYYHKIGMGKPLGLGTIKIKPTLFLIDKKIRYSSLFHEDEWELGIERKETLQDYKSDFEKYIMRNIPDEEKDNANSLWETKRLKELKILLCWEHNNCVGWLEKTRYMTIGDRAKKIENEFRKRTVLPKPSEVIQGD >NC_012034.1|WP_015906774.1|178387_180409_+|hypothetical-protein 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MSALKKLVEILNNKAKEWDGKNDFRVPKLWDSFGYDGFEKKENNDGTISVNPYKFVAQAIEKAILPCMKNNTDYLQPLSEILSKDNRPSEKSYSSWIEKSSVYGMQIRTFSAWDHDGSKELELENSFGLKDTGTFVKTIALLPYIKRMGFDAIYTLPITKNSTKYKKGEMGSPYAVKNFFELDPVLFDPMADELSIDEQFKALIEACHILDIRFIIDIIPRTSARDSDFILEHPDWFYWIKVEDLKDYGPPKLTLIKEFTKANEENIELIYKDPAVQKHIKKFVPSPDRFDPQKWQSIKERCEKDKNLDFFELIEKEIGITTAPAFSDCLNDPQPPWTDVTYLRLYLDHPVQSAKYVDESQPPYILFDVIRGNIFKGKKPNKKLWEKIANIIVYYQKNFGIDGARIDMGHALPKELEDMIISNARKVDTEFCFIAEELSMNAHRKAKESGYDMIIGDLWAREPRYYQGTLKKVLDILLQLEVPVFAACEIPDSPRAASRLGKREFSRFATVLNFFLPNSVPFVTCGQEVYEVQPMNLGLDPQPEGKFMLSKSDPLYGKLAFFDKYALHWTNEGADEMIALIEGVAKIRKEYLDFMSKENFFKIPHNSKFVLAFGYKLFSEHGKQYLIVVANADILRKRKVSLNLMKAGLFDVGKGRQIECIYSLKGNKNHMYDFPHITVDMETLDIKILKVK >NC_012034.1|WP_015906776.1|183495_184248_+|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012034_3 | 2788959-2789130 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NC_012034_3
|
2 spacers
spacers of NC_012034_3
>3.1|2789002|28|NC_012034|PILER-CR CGTAAAAAATAAGGAGTATGTAAGGGGT >3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR TTGATATTTTTCATAGTTAACAC >3.3|2788993|37|NC_012034|CRISPRCasFinder ACGTAAAAAATAAGGAGTATGTAAGGGGTTTTTTGCA >3.4|2789060|36|NC_012034|CRISPRCasFinder TAATTTTGATATTTTTCATAGTTAACACTTATCAGA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012034_3
The CRISPR arrays of NC_012034_3 >merge|NC_012034|3|2788959-2789130|PILER-CR,CRISPRCasFinder CACGGTTTTTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACGTAAAAAATAAGGAGTATGTAAGGGGTTTTTTGCAGTTTTTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTAATTTTGATATTTTTCATAGTTAACACTTATCAGAGTTTTTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAATT >NC_012034|3|3|2788959-2789130|PILER-CR CACGGTTTTTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACGTAAAAA ATAAGGAGTATGTAAGGGGTTTTTTGCA GTTTTTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTAATTTTGATATT TTTCATAGTTAACACTTATCAGA GTTTTTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAATT >NC_012034|3|3|2788963-2789125|CRISPRCasFinder GTTTTTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ACGTAAAAAATAAGGAGTATGTAAGGGGTTTTTTGCA GTTTTTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TAATTTTGATATTTTTCATAGTTAACACTTATCAGA GTTTTTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
>NC_012034.1|WP_015908961.1|2787618_2788542_-|hypothetical-protein MHLLMHDVMRIAKEFHSPVCLRFSNSNYQRVSTCEKCLPKVHFKRKNNGNIRDYDCQNMIYYYCGRFSLKHLGELFMLLQRISHRIPNNPRIFSIGCGPCTDLFAFEKYIKHNKLNEKIKYHGIEKNVLWKEIHNFIIKHGKRHKLSKIEVSYLDAIREFQEVVRIMKEEQPNVILFQYVLSDIAKYYPVDLVKRFSEKFVEKAFEILPKSTMIIFNDTNVTQEYAKRNPDEIKGRIFLEHLSERFWTNRNISVIKYYFPYKDDPSLKFGAAHSDFRVDFSNIPEDLINYFEMWDEYRSAQLVLIKN >NC_012034.1|WP_015908960.1|2786498_2787581_-|DUF1848-domain-containing-protein MIISASRRTDIPAFFGDWFINRIKEGFAMYRNPMRPSQVFAVSLLPEDVDAIVFWTKNPKNFLEKLKYLENYIYYFQFTITPYGKDIEPNIPPKDEVVQTFIELSNLIGKKRVIWRYDPIIITDKMPLSYHKEKFEELCEKLAPYTQKCIISYVDFYSKAVDELNKINAKDFSADELYNVFGAIGSIGKRYNLSVETCAEDVSIEQLGLKKAHCVDGDLIRELRKEKGFYEVKEYKKDNNQRKACGCAQSIDLGIFNTCKHFCTYCYANFSRSSIVKNVEKYDEKSPLLCSYLDLEKDEIRIKEKDGSRKIEKDNILQKKFNELKTLEQRSFCTMEEVFSKEGSNDWLEKKVLEYLEKLR >NC_012034.1|WP_015908959.1|2783723_2785109_-|ATP-binding-protein MFVGRKYELETLNRLYNEDKFHFVVVYGRRRVGKTTLLTEFCKNKPSIFFVAEEYNDKINLESFSDKVLSYFNLEGLVGRFESWEKAFIFLAQQAKDKRLIVVIDEFPYIANTNKSIPSLLQNLIDHHLKNTKLFLIICGSSVSFIEKEVLSYKSPLYGRRTAQLIVEPFRFFESREFFLNYSFEDQVIAYGVLGGIPQYLSIFDSTKDIYENIKTKILDKSSYLYEEPKLLLRQEVREPALYNSIIEAIATGSSKLSEISAKVGTDIDKCAKYISVLIDLKILEKVTPLKLESKSRKSIYKIKDNFFRFWYRFVFTNKTLIEQGLIDEVIENKIKPFMNEFIGEVYEEICMDYLKILNKAKKLPFIFENIGKWWGNNPYKKREEEIDIVAFDNNNILFGECKWRNQKVDMSVLNNLIEKSMIFNNRKKFYVLFSKSGFADEVISFAKQNPYVLLINKFDY >NC_012034.1|WP_015908958.1|2780424_2782869_+|PBP1A-family-penicillin-binding-protein MQSKNKKVKKQTPFRLFLKSFVRTILVLLIASMAVLIGAGFGMVTGYIKAIPANALDIITSSSDTQTTIVYDQSGNEIARLHGNENRIRVPYNKIPKNLINAFVAIEDERFWQHNGIDIKRIFGAIFKNIKTGSLSEGASTITQQLVRNKLLTFEKSFKRKIQEQYLAIQLEKKWTKEQILEEYLNTINLGSGAYGVGAAAYTYFGKDVSQLTLAECALIAGITQNPSYYNPYVFPDHAKKKQEIVLKKMLELGYITEQEYLEAINQPLVYVKKDISAESAYKHAYFVDSVIDEAIEILSEKKRISKDEAENLIYGGGLKIYTTMDENIQSTMEDVFSDLSIMPKIKHYDASGIPQPQAAAVLIDFKTGAVKGIMGGRGNLKGVRLLNRATMSVRQPGSAIKPIADYSLALENGYTAATVIDDVPFSVGRYTPRNWYKSNVVSGKRGYKGLMTLREALQWSANVPAVKVAYNLGIQNVYRNLKGFGFTTLAPQDMNSLSIAIGGFTYGVKPIELTAAFAAVANSGVYIKPYFITKIEDKNGITIFERTPYKRRVMDEKNAYILTNMLQSVVTARITVGVKFSYPVAGKTGTTDDSKDRWFVGYTPNYALGVWVGEDKPVALNYITGTNPSLKIFKAIMDRVVRQKGVSSEFLRPAGIVERYVCKESGKLATSLCKQDPRGSQVIKEIFVEGTEPTEYCDKHVKLKVCTQSNKLATQYCPTTIEKVFIKRDNPIWPGSSVVPPDDYMYQAPTSYCDIHKAPQEEIVPQKGTTSQQEQSSSQSQQPSSAEQGSQQSVEENLPLESDTTQSSTYSSQ >NC_012034.1|WP_015908957.1|2779186_2780242_-|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-radical-SAM-maturase-HydE MKVKDILEKACYENILTKDEIKLLLMAEGDDKELLFKTADSVRKEHVGDEVFLRGLIEFSSYCKNDCFYCGLRRSNSQAQRYRMQEDEIVEVAKRAYQMGYRTVVLQSGEDMYYTKDMLCSIIKKIKSSVDVAITLSIGERSYDEYKAFKDAGADRFLMRFETSNKKLYRKYHPGMSFENRIECLKWIKNLGYELGTGFLIGLPGQTIDDLAQDILLVKELDADMIGIGPFIPHPQTPLKDAEEGSVDLTLKSIAILRLLIPDANIPATTALGTLDPLGRQKGLMCGANIVMPNVNDLEYKLKYELYPGKICINEDATKCRGCIESIIVSLGRKVGQGKGQSRHYKRAAAS >NC_012034.1|WP_015908956.1|2778435_2779092_-|hypothetical-protein MRIKKGAAKRLWIAVLIVVVCVLGGLAGYYIAGYLNQKPAVQQPHQADENSNQPRQEQSQLEQENPSQQQSQEVLSEVYKAVARFVGGVDAHTIQLSLINTNFDFKEFEVDENLTQGLNLSEGEIVEVEFEKPKDGGNPRIVSIKKPDKVTLKGKFVGLADNNFAEFVFDQKHIVLQISNVSDKLAYLNENTDVEVTFKTNPQSPKSNPVVEDIKALE >NC_012034.1|WP_015908955.1|2776966_2778391_+|MFS-transporter MHTQEDRKINKNILIATTLSSFLVPFMSSAVNIAAPDIAKSFKLNAEELNLVISIFLIFSAAFILPMGKLSDTFDRTKIFKTGLLLFTLSTLMCALSNTVEILFVFRALQGFFSAFTFVTSMPILIEEHLPQIRGRLLGINTAVVYLGTSLGPFLGGLLVKLWGYRSIFLFGFAIGLVGSFVSLFLLQKEVKNTRQAKLLDSLKSLDKMGTILSMTGLFLLMYGASTFELGNTSKILFFAGLILMVIFVVAEAKLQNPILDVKLFVKIPQFGFSNLAALINYSCTFSASYLMSLYLQLVKALPSQLAGSILIVQPLSQVITSLISGRASEKIEPRKLATSGMVLTTAGLFIFSTFAAKTNLVIVILNLFIMGIGFGLFSSPNTNVVMSCVPKSLYGTASSTISVMRVIGQAFSMAIVSFVSIMFLKGVKLSHENYLLILKSMKTSFLVFALLSILGIVASYKRGNIYSEVKQSK >NC_012034.1|WP_015908954.1|2776081_2776732_-|hypothetical-protein MKVAWSATHQEFLLTDGYYFSGLYKELCKRKIEIEEVDDFDRLFEYDVIVFNYPENPFSNEEKEKIREALQQKGKKIIFTAHFKNKDGVSEICNSITREYGINILPEGIKDEIHHLEDDLFIITTDEVKLYRKGVKEVVFPYSAPLEVGNGAEVVLEARKTSLTDSGKKSPVLIAQKRFESGGKLIVCGSCIFWDNFSLFRLDNLQFVINIFEGAE >NC_012034.1|WP_013291477.1|2775664_2776060_+|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MSDKYQQRRFDIYGYEKIDTEVLEAIPYEYPEKNTVVEYITEEFSSVCPWTGLPDTAKLTIRYIPHQKLVELKSLKYYLTSYRNVGILQEHAVNRILDDLVKLLEPKFMEVIGEFHERGGISTKVVARYEK >NC_012034.1|WP_015908953.1|2774586_2775501_-|AraC-family-transcriptional-regulator MPEKEPLYIEEIFDYVSQRPQKFALNFWEDPRYFKLHRHNFVEFMYVVKGEGTEHINSISYNLKPGTFSIVMPYQIHRIDYSEQTPLSIYVVAISFEELLAPSSIFYRIGELLLSYDENVLPYYYFEGKEKEVMDRLFKEAWIYYNQQDVWAEIILKAKILEIVAYFDRCRNLACDKSFQRPASNSVTNRAQKESIPVPFDYWQLVYYVHKNYNQNIDLKTLSKEFHLSPSYISQLFKKLVGSNFHNFLNEVRLQHACSLLLSTDKPVTDIALEVGFDSYSTFARVFHKHKGMSAQEFRKRGGV >NC_012034.1|WP_015908962.1|2789180_2791535_+|hypothetical-protein MKIKLNKKSIISLAVVVTFIIVTLLSPVFYNCSQKSSVKQDITSQQPTDSNTQTEKSTTITDKLFNWMNIFKAYADNTNSDSDGNIDNEIVNDAPYLVPVWQPGEINPVIYQKNGKLYRLNDVSPETLARYCRILYELEVKDVKEKYVVEGNDRVGWGLLYKRIGQPFYKASCDSGEDYYPQVSFMERMVASWYNYYYNWFSAITPIKLNRNTLNTTYMYDNQYISKNRREFYMNCDLVLELEPDLNGAKDRFPDYLQLSEIGSHSGSNVKAELINWEYFDMIRAYTYLSVRFLKDFDTKVYNKLASIIKKYKMSLGKDAFVSVKMSSKPLKYGKYYSGQRFTISLKFMYIKPTLDIKPVKTKVPKIGKNQLAYVIQLDPYTISFEKVYNITELYSEQDLRPLLTELGKIYKAIGSGKISAKGYFEFLKKAKLTSGKSNEYFKNASKLGDTYLNLGKSKQPLYVVTTSTSTFRAACLNYKRKYIVDIFYDILSKMDYLDDFKSAWNLGAKYASAVYNTPDQKTLDPVNLFDFETSQDLYPVFVAGKVPIGKVGFTGYNLEDRVGKPIGKDCFYAPEYYTLIEAMNKKIANKSILSKYYNIEYFAIPISVEANSTKDYKNLVPAAMPHLYNVMVISSRYPELDNNGKPFKYRNQVSGRTCYTFPIVFRFFPEFVNKDKTTYPYFAVESIIFEGVKFNNKPTIPLSDGKIAKDWAEIPLRWWWSNLAVKSDIEQGKDLETIGIHFGPSYNYTKNDIEIAKKYAITQDVILKKAKYFGSILGSAFEK >NC_012034.1|WP_049760267.1|2792692_2793154_+|DUF975-family-protein MLFGAVAFYVEIAKGGKPPFSTFFIGFSDKLIYKVVLLYLLTQLINPIGLIAFIIPGIIFILALFPANYILYENSDVSIIEIIKECFRITKKAKLKLLMFYLSFIEWYILGMLTLGILFIYVTPYISVTSYYLYKKLSGKEYVNSEISSQYMI >NC_012034.1|WP_013404366.1|2795379_2795643_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVILVYDVNEKRVAKALKKCRQYLTWVQNSVFEGNISEGTLRRLILELERILDLSEDSVIIYKFQNTWYSERQIIGIEKNPVDFMT >NC_012034.1|WP_015908965.1|2795648_2796641_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKDLYVFNSGFLRRKDNTIMFETDEGKKYFPVEEIESVFIFGEVDINKRFLEFMTEKNICVHFFNRYEYYVGTYYPREHYNSGIVILKQVEFYNDYNKRMTIARSIVEGAVLNMLVVLRYYNSRGNMLKDEIETIERMRHNINSCDDVNTLMALEGNIREIYYRCFNKILDNENFTFVRRSKNPPLDRINALISFGNSLLYATTLGEIYQTQLDPRIGYLHSTNQRKFSLNLDISEIFKPIIVDRVIFSLVNKKVLSEKHFEKELNGIILNDQGKKLFVSEYNQKLYSTIMHPKLNTQVSYKRLIRMEAYKLQKLFLENIEYKPFVARW >NC_012034.1|WP_041727458.1|2796687_2797185_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDIYMTGVYIWYYNICKRQVWLMAHNILPDENDDNIVLGRFLHEYYYKKDQKEIKFGNAVFDILYQDKDEIVIGETKKSSRFKEASRYQLLFYIKLLKEAGISAKGVLFYPEERKKEEVVLTAEEEEKLEKMIAEIETIIDKESPPPSAYCRYCPKCAYREYCFA >NC_012034.1|WP_015908967.1|2797213_2799637_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEYYSHKNPDKLLYDHLLEVYHYAMEANVELKSWEKEALQIICLCHDFGKFTTFFQSHLSGVSSKHSQHGFLSAIFGVFCWMQKKGLCLQKMNSPASLDEVISLLIYACILHHHGDAKDISKNLPEKFAGDFKADINLVQKIDDAYVQIEDLRCNAEDIKPLLEKIGLGNKFEKFLAQQRGFIEDILRYLKKIEYGIRFIGLIPQAFKDGTELYFVQQKLYSLLIWADKMSAANYKVLSPCYASLDRLIVARDKVIKPTQDKNLHRIRQSVFEAVLSNIEKNKEKDIFSITTPTGTGKTLAGVFAAVKLKEILKKSGRIIYALPFTSIIDQNYDVVKNLFETIEDFGKNRDRYLLKHHHLTDVEFRGKEGALKEITDEITVFEKVASECFIENWTSGFVVTTFVQLLETLISNRNRMLKKFHAFYDSVLLLDEIQAIDVELLPLVEEVLRKLTQLFRCKIILMTATKPLIFEDACELAGFCDYSIFNRTKLMYHHSDLKVAEFVDFFSEDIYEDEKSFLIVANTINQSHQIYNGIKNNLKNKEVIYLSASLVPKDRKDIIKKIEKMLESGAKPIVVSTQVIEAGVDIDFDCVIRDIAPIDSIIQCAGRCNRHNEKSQGNVLVVNMKDESGITFAKRVYGNTAIEISRGLLLKHPEVEEKDYGMLIDNYFRMIKENKSFKKSEEFLKAIRLLKFDSILEKEELTISRFSLIQQRGGYVSVIIRNNQEIEDTYEKYINSFSIKDYYKRREIYLELKNILFEYTISVPVKYAQIFDEEKGILSLPPTSCERYYSPETGFVYDPNDNVIFA >NC_012034.1|WP_015908968.1|2799728_2800481_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKFLVFDLKGKFAHFRKFYTNSSSLSYLVPPRTVIEGMVAAILGFERDSYYDMFSAENLLVAVQKLEKTYKIVQTVNYIKAQTISELKNPNTHTQVPLEILAGYNGFVGFRVFVMPKDEKIYSFLRARLESGKSEFPIYFGSAPFAAKIEFLGEFEACRWEDSRAGILTVLDTGLIKSLNLSLEFSSSLALMKDRMPCDFDKDRFATKVKTYIHDENLNPIWVDLNSSAQDKVYYIKEFSGDRKECICVM >NC_012034.1|WP_015908969.1|2800501_2801407_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MEKKIIDKNSEILFTYDAKLCNPNGDPDEENRPRMDWEKEINLVSDVRVKRYIRDYLEDIGQKIYVRKIEGKSEKPEKVLDATAKEKNTEVDKLDVLDTFIDIRLFGATIPIKGRTETYIGPVQFNWGYSLNKVELLEASITSHFASDEKKQQGAIGKDYRVKYSFIAFSGIVSARRAKETKLTEDDLKFLDRAMKEAIPLLATRSKIGQYPRLYMRVEYVDDKTLLGDLRDYIKLIEVVEKPRKIEDVQLDITDLAEFLHKNKDIISKIYYFKHPELCLVCGGNVVDFKDTFGTFELEEV >NC_012034.1|WP_015908970.1|2801427_2803488_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MIEEIVEIGDILIGDASGNDAYLSVLTEDIEVPTGDEKRYVAKIDFSTNEKKINIDCAEEIDDETAKKYVYVGSAEGANSSQWFASTTSFAYFLTETIPNLVECKIPVVSDICKKILDMYFVKVKEYLSRSSELIDEEKRYLQQKIEKKYVYFLDTDNIVVNDNKRLTEKQLSQIYKELINNTKSTDKIFKQLRDVFTKECTNGLKKLTEIKPQQIGLYVLCVDGKPLTSYPEYIDAVIAYKRQVKKGSKKAKNKQEGNICYICLDTDNLSFEGFKKTRFKYFTTDKNIFASYLDQKNYAKNITVCEKCLLKLVAGDIFLRNKLKTQLGTFDVYVLPTFVYTSAKLTKNYLEELSQNITNSMNTAWNYNSLEKLRDDIYNFLSYFDQNHYFLLNLIFYREAQASTKIIRFIADINPSIFDKIYNAASKVFSQYTDLIGNDPSFRISLESIYYSVPIRLKNISESKEAQRLLNIYDAIFSGKRIARDVLIENFIKAVGVVVYGKEGYNLSKFIENDIASMVIRMVFVIRFLEILDCLEVKRGMDIAQLNLSDDLKSYIQQMNYDEPRTALFLLGVLIGEIGAKQYLTTKDRQDDSAGHKPILNKINYNGIDKPKLIRLCNDVHNKLRQEKLLPYTEMIFAEMKRLLDKHIDSWKLDKYETLFYILSGYAYKTQKVILNALNSQDTSN >NC_012034.1|WP_079504043.1|2808712_2809165_-|IS200/IS605-family-transposase MINIQFRYIIKLVMIMKFDSNKHSVFLLYYHLILVTKYRRDVIDEKISKRLKEIFEYIQPNYNITIVEWNHDKDHIHVLFKAAFTTPLSKFINAYKSASSRLIKKEFPEIKQKLWQEYFWSRSYCLLTSGGAPVEVIRRYIESQGEKRKC |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012034_4 | 2803920-2807402 | TypeI-B,TypeV |
NA
Consensus repeat of NC_012034_4
|
52 spacers
spacers of NC_012034_4
>4.1|2803950|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATCTCCAAAACCTTTATATACTTAAAATCATAAA >4.2|2804017|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTACCATATGATAAGACTTTCCGCTTCCAGGTTT >4.3|2804084|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATGATTTGTGTTTTTATTTCGAACTATGAGGAA >4.4|2804150|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAAAGCAATTAGTTTGTAACTAAGGTCATCTTTGA >4.5|2804217|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCTTCAATCTCAAGTTTGTCTTGTTCATAATTG >4.6|2804282|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCTTGGTTGCTTCAAGCTCTAAAACTTTGAGCTC >4.7|2804348|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGCATTATTTATGACAGAAATTTAGATAACGAAGG >4.8|2804415|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATATCTCGTATCTTCTCACTTGCCTTGTCTGTTG >4.9|2804481|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCTTGCCTTAGTAACAATTGCCTTCTTTTGGTTCGT >4.10|2804549|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTATTATCGTTCACAAGGTAGATAGATTTGCTCG >4.11|2804616|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTACACATCTTTACCTTTTTTCAGATTATATACT >4.12|2804682|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTCTCGATTATTTTTGAAAATAACTTTTCCTGTAT >4.13|2804749|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGAACCTAGCATTCTTACAACTAAAAAACATAAAT >4.14|2804815|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTTTCGACTTTGTTTGCATCGGTAAAGGATACAA >4.15|2804881|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTTTTAGGTTTTGTTGATTGTTTTGAAATTTTA >4.16|2804947|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTAATAGATGTAGAAGGTGAACCTTTCAAATATGA >4.17|2805015|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTGTCTCATTCATTCTATCACTTCCTTATCCAACCA >4.18|2805083|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTCTTTCTCTTCTCTTTCTCTCTCTTGCATCATCAC >4.19|2805150|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACGATAAGAAAAATGACGTAAGCAAATATTGTGCTG >4.20|2805217|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTTCCTCCTTTCTAAATTTTAATCCCTAAATGG >4.21|2805283|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAACTTTGAAGAAGCTCCACAGACCACGCAGAACG >4.22|2805349|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTAATGAGTTCGTTTTGCTTACGGATGGTTTCCA >4.23|2805414|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGTTTGGCTATCAGCTGTGTTAGTTTGGTATGGT >4.24|2805480|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTATTGCTGATGCATTTAGTTCTTTAGGAAGT >4.25|2805546|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTTGAGTGAAATCTTTAGTGAAAGTGATTTGA >4.26|2805612|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATCTGCAACATGTTGTGCGCAGTTTCAATGAAAT >4.27|2805678|39|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATATAACTTTGATATTTGTTATTTTTAGACTTTTTG >4.28|2805747|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTTCCAAATCCACCGTCCCATCCTGTGGCACA >4.29|2805812|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTATCATAGCTACATTTGTGTAAACACCTAAAG >4.30|2805878|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTATCATAGCTACATTTGTGTAAACACCTAAAG >4.31|2805944|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCACTATCTTATCGTAGTAAGTCACAATAGCCGT >4.32|2806009|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTAACCACTGATTCTAAACGTACTACTTAAAACT >4.33|2806075|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCATAAAACCTCCTATGATTCTTAATAATAGTCTTA >4.34|2806143|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTCATTTTTCCATATCTCTGTCCAATATTCCC >4.35|2806209|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATATAAAGATTTACTTTTGCTGTTATAAAATCATT >4.36|2806276|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATCTCTTATCATAGACTTACAATCATCATAATT >4.37|2806341|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAACTCTATTACTCTTTGTTCCAATTCTTCAGCCC >4.38|2806407|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGCTCAGGTTTGTATAATACATCACCTGATTCAG >4.39|2806473|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATATACAAGCTTATTCTTGCCGTTATAAAATTATTC >4.40|2806541|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGAGAGTAACGCTATTAGAATGGTAATAAAGTGG >4.41|2806606|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTACAACAGCAAAAAATCCTCTTTATATGGCAAAT >4.42|2806672|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGCTATCACAAGCCTTATCACCAGCGCCAATATAAA >4.43|2806739|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGAATTTGACACAAGCAGTAACAGGAAGTGTAAATT >4.44|2806807|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTATTAAAGTTCTTCAAACAAAAGAAGAAATTG >4.45|2806873|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCCTTTAAATTGTAACCTCTCAATCCTTCTACAA >4.46|2806939|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAAAAATGGAGATACAATAAATGGAATACTTAATAT >4.47|2807006|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTATAGTGGTAGTATACCTAATACTTTTCGTGT >4.48|2807071|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGAATATGTCTGCTTGGTGTATCGCAGGATTTA >4.49|2807136|38|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTTCCAGCATTGTAAACTCCACTAGCTGGTGAATA >4.50|2807204|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAAAGCGAGGCTGTGAGGTTTTTAATGCAGAAT >4.51|2807270|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACATTTTCTCTACCAAACTTCTCTGTTATTCTTT >4.52|2807336|37|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT CTGGTAACCTGACTGTTGAATACTTGTCAAAAAGATT |
cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012034_4
The CRISPR arrays of NC_012034_4 >merge|NC_012034|4|2803920-2807402|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_012034.1|WP_015908970.1|2801427_2803488_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MIEEIVEIGDILIGDASGNDAYLSVLTEDIEVPTGDEKRYVAKIDFSTNEKKINIDCAEEIDDETAKKYVYVGSAEGANSSQWFASTTSFAYFLTETIPNLVECKIPVVSDICKKILDMYFVKVKEYLSRSSELIDEEKRYLQQKIEKKYVYFLDTDNIVVNDNKRLTEKQLSQIYKELINNTKSTDKIFKQLRDVFTKECTNGLKKLTEIKPQQIGLYVLCVDGKPLTSYPEYIDAVIAYKRQVKKGSKKAKNKQEGNICYICLDTDNLSFEGFKKTRFKYFTTDKNIFASYLDQKNYAKNITVCEKCLLKLVAGDIFLRNKLKTQLGTFDVYVLPTFVYTSAKLTKNYLEELSQNITNSMNTAWNYNSLEKLRDDIYNFLSYFDQNHYFLLNLIFYREAQASTKIIRFIADINPSIFDKIYNAASKVFSQYTDLIGNDPSFRISLESIYYSVPIRLKNISESKEAQRLLNIYDAIFSGKRIARDVLIENFIKAVGVVVYGKEGYNLSKFIENDIASMVIRMVFVIRFLEILDCLEVKRGMDIAQLNLSDDLKSYIQQMNYDEPRTALFLLGVLIGEIGAKQYLTTKDRQDDSAGHKPILNKINYNGIDKPKLIRLCNDVHNKLRQEKLLPYTEMIFAEMKRLLDKHIDSWKLDKYETLFYILSGYAYKTQKVILNALNSQDTSN >NC_012034.1|WP_015908969.1|2800501_2801407_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MEKKIIDKNSEILFTYDAKLCNPNGDPDEENRPRMDWEKEINLVSDVRVKRYIRDYLEDIGQKIYVRKIEGKSEKPEKVLDATAKEKNTEVDKLDVLDTFIDIRLFGATIPIKGRTETYIGPVQFNWGYSLNKVELLEASITSHFASDEKKQQGAIGKDYRVKYSFIAFSGIVSARRAKETKLTEDDLKFLDRAMKEAIPLLATRSKIGQYPRLYMRVEYVDDKTLLGDLRDYIKLIEVVEKPRKIEDVQLDITDLAEFLHKNKDIISKIYYFKHPELCLVCGGNVVDFKDTFGTFELEEV >NC_012034.1|WP_015908968.1|2799728_2800481_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKFLVFDLKGKFAHFRKFYTNSSSLSYLVPPRTVIEGMVAAILGFERDSYYDMFSAENLLVAVQKLEKTYKIVQTVNYIKAQTISELKNPNTHTQVPLEILAGYNGFVGFRVFVMPKDEKIYSFLRARLESGKSEFPIYFGSAPFAAKIEFLGEFEACRWEDSRAGILTVLDTGLIKSLNLSLEFSSSLALMKDRMPCDFDKDRFATKVKTYIHDENLNPIWVDLNSSAQDKVYYIKEFSGDRKECICVM >NC_012034.1|WP_015908967.1|2797213_2799637_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEYYSHKNPDKLLYDHLLEVYHYAMEANVELKSWEKEALQIICLCHDFGKFTTFFQSHLSGVSSKHSQHGFLSAIFGVFCWMQKKGLCLQKMNSPASLDEVISLLIYACILHHHGDAKDISKNLPEKFAGDFKADINLVQKIDDAYVQIEDLRCNAEDIKPLLEKIGLGNKFEKFLAQQRGFIEDILRYLKKIEYGIRFIGLIPQAFKDGTELYFVQQKLYSLLIWADKMSAANYKVLSPCYASLDRLIVARDKVIKPTQDKNLHRIRQSVFEAVLSNIEKNKEKDIFSITTPTGTGKTLAGVFAAVKLKEILKKSGRIIYALPFTSIIDQNYDVVKNLFETIEDFGKNRDRYLLKHHHLTDVEFRGKEGALKEITDEITVFEKVASECFIENWTSGFVVTTFVQLLETLISNRNRMLKKFHAFYDSVLLLDEIQAIDVELLPLVEEVLRKLTQLFRCKIILMTATKPLIFEDACELAGFCDYSIFNRTKLMYHHSDLKVAEFVDFFSEDIYEDEKSFLIVANTINQSHQIYNGIKNNLKNKEVIYLSASLVPKDRKDIIKKIEKMLESGAKPIVVSTQVIEAGVDIDFDCVIRDIAPIDSIIQCAGRCNRHNEKSQGNVLVVNMKDESGITFAKRVYGNTAIEISRGLLLKHPEVEEKDYGMLIDNYFRMIKENKSFKKSEEFLKAIRLLKFDSILEKEELTISRFSLIQQRGGYVSVIIRNNQEIEDTYEKYINSFSIKDYYKRREIYLELKNILFEYTISVPVKYAQIFDEEKGILSLPPTSCERYYSPETGFVYDPNDNVIFA >NC_012034.1|WP_041727458.1|2796687_2797185_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDIYMTGVYIWYYNICKRQVWLMAHNILPDENDDNIVLGRFLHEYYYKKDQKEIKFGNAVFDILYQDKDEIVIGETKKSSRFKEASRYQLLFYIKLLKEAGISAKGVLFYPEERKKEEVVLTAEEEEKLEKMIAEIETIIDKESPPPSAYCRYCPKCAYREYCFA >NC_012034.1|WP_015908965.1|2795648_2796641_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKDLYVFNSGFLRRKDNTIMFETDEGKKYFPVEEIESVFIFGEVDINKRFLEFMTEKNICVHFFNRYEYYVGTYYPREHYNSGIVILKQVEFYNDYNKRMTIARSIVEGAVLNMLVVLRYYNSRGNMLKDEIETIERMRHNINSCDDVNTLMALEGNIREIYYRCFNKILDNENFTFVRRSKNPPLDRINALISFGNSLLYATTLGEIYQTQLDPRIGYLHSTNQRKFSLNLDISEIFKPIIVDRVIFSLVNKKVLSEKHFEKELNGIILNDQGKKLFVSEYNQKLYSTIMHPKLNTQVSYKRLIRMEAYKLQKLFLENIEYKPFVARW >NC_012034.1|WP_013404366.1|2795379_2795643_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVILVYDVNEKRVAKALKKCRQYLTWVQNSVFEGNISEGTLRRLILELERILDLSEDSVIIYKFQNTWYSERQIIGIEKNPVDFMT >NC_012034.1|WP_049760267.1|2792692_2793154_+|DUF975-family-protein MLFGAVAFYVEIAKGGKPPFSTFFIGFSDKLIYKVVLLYLLTQLINPIGLIAFIIPGIIFILALFPANYILYENSDVSIIEIIKECFRITKKAKLKLLMFYLSFIEWYILGMLTLGILFIYVTPYISVTSYYLYKKLSGKEYVNSEISSQYMI >NC_012034.1|WP_015908962.1|2789180_2791535_+|hypothetical-protein MKIKLNKKSIISLAVVVTFIIVTLLSPVFYNCSQKSSVKQDITSQQPTDSNTQTEKSTTITDKLFNWMNIFKAYADNTNSDSDGNIDNEIVNDAPYLVPVWQPGEINPVIYQKNGKLYRLNDVSPETLARYCRILYELEVKDVKEKYVVEGNDRVGWGLLYKRIGQPFYKASCDSGEDYYPQVSFMERMVASWYNYYYNWFSAITPIKLNRNTLNTTYMYDNQYISKNRREFYMNCDLVLELEPDLNGAKDRFPDYLQLSEIGSHSGSNVKAELINWEYFDMIRAYTYLSVRFLKDFDTKVYNKLASIIKKYKMSLGKDAFVSVKMSSKPLKYGKYYSGQRFTISLKFMYIKPTLDIKPVKTKVPKIGKNQLAYVIQLDPYTISFEKVYNITELYSEQDLRPLLTELGKIYKAIGSGKISAKGYFEFLKKAKLTSGKSNEYFKNASKLGDTYLNLGKSKQPLYVVTTSTSTFRAACLNYKRKYIVDIFYDILSKMDYLDDFKSAWNLGAKYASAVYNTPDQKTLDPVNLFDFETSQDLYPVFVAGKVPIGKVGFTGYNLEDRVGKPIGKDCFYAPEYYTLIEAMNKKIANKSILSKYYNIEYFAIPISVEANSTKDYKNLVPAAMPHLYNVMVISSRYPELDNNGKPFKYRNQVSGRTCYTFPIVFRFFPEFVNKDKTTYPYFAVESIIFEGVKFNNKPTIPLSDGKIAKDWAEIPLRWWWSNLAVKSDIEQGKDLETIGIHFGPSYNYTKNDIEIAKKYAITQDVILKKAKYFGSILGSAFEK >NC_012034.1|WP_015908961.1|2787618_2788542_-|hypothetical-protein MHLLMHDVMRIAKEFHSPVCLRFSNSNYQRVSTCEKCLPKVHFKRKNNGNIRDYDCQNMIYYYCGRFSLKHLGELFMLLQRISHRIPNNPRIFSIGCGPCTDLFAFEKYIKHNKLNEKIKYHGIEKNVLWKEIHNFIIKHGKRHKLSKIEVSYLDAIREFQEVVRIMKEEQPNVILFQYVLSDIAKYYPVDLVKRFSEKFVEKAFEILPKSTMIIFNDTNVTQEYAKRNPDEIKGRIFLEHLSERFWTNRNISVIKYYFPYKDDPSLKFGAAHSDFRVDFSNIPEDLINYFEMWDEYRSAQLVLIKN >NC_012034.1|WP_079504043.1|2808712_2809165_-|IS200/IS605-family-transposase MINIQFRYIIKLVMIMKFDSNKHSVFLLYYHLILVTKYRRDVIDEKISKRLKEIFEYIQPNYNITIVEWNHDKDHIHVLFKAAFTTPLSKFINAYKSASSRLIKKEFPEIKQKLWQEYFWSRSYCLLTSGGAPVEVIRRYIESQGEKRKC >NC_012034.1|WP_015908975.1|2810289_2811972_-|hypothetical-protein MRKLLSFAVILSLLLSFAFPVAQAGTITQKVQAAINKIDYITAGEFVTSLLIGAKVKPDKPLDYWGKAVSMGLIPGEVKQDKPLTRAQASYIVWKLINAVPELRKKNIPVKTEILTPWDLTLRGRGYLYDYMTNLDFVLYWSDLLIIDYYYADGRVKTKYVWDVLKGYVMRDDYAKFLQDFAKKCPDKLKIAPKTEYLKYDEKYKGYYYQLPFEPKGRYFVTYPGITRTKDSGDREWNSAYDPRANKYLEEYIKNHPRKYALDHTRFAQMADDYTKIPQAYREPMLKLADLGIITPEMSPLYVSKIRFNPAKMLTRAEAVAMISRVFDESKREVYDEFKWQLRSYVDMKTGIVYLWNSYKRTYEPITNDYKQVIDIVYSWDSDKQTFVPIIIDNRYRKLRSSDTPEFGEPVLTFRMDEMKLLAFIKDSINYASKYSIGNSFVRYSFAGLEFFIPGVYGSILPWEDKPFYRFPWYHGANFNYLLVPLAYKKEAIADAKYYTNPKTKLPADGIVKWYGDICIWYVNLNGEDNVGYWCTTNPTYKGYFEKAKVLYAKPDPNIK >NC_012034.1|WP_015908976.1|2812245_2812800_-|hypothetical-protein MNLKMPIVFDNDCVCSFSWINRLDIIDKLFAGNIVIPRVVLDEIKELQKYRFYRFVFLNIDQRIKKRQYEIKEIPELSPYKDEFSRLTERKSADSIGKGEAAAIVIAKMLNGTLASNNLKDVLPHIQQDQPPLITTETILYLAYQRKLISFQEGQQILDEMKLRKRKLSTYSFFELIEKYKETE >NC_012034.1|WP_015908977.1|2812771_2813539_-|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MNNLAEIKATEARKTLGLASHEAVDIFKVLHEIEGVSLAFMEMSEKMSGLFVRKGRAALIVVNSKKTLGHQRFTAAHEYYHYKYSKGAVSRVCPIRKFVEDNPEEREANIFAINFLLPEEGVKYMFFKRTEGKTPDISDIIFLEQYFGVSHQFMLIRLKELNLITEKQEKDFSKDVIKKAREYGYSTQLYKDTSDKDIQVYSPYAELAKKLLDAGRISYGKYEELLIEGGYAHLIFEPEEDTEGEINELEDAYSL >NC_012034.1|WP_015908978.1|2813531_2813888_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKEEVYKKIGKRLQELRKQRGFTQEQVAKYLGITQEQLSHYENGKREVSVDILLQLARLYGCDYNYLLGEEQNTDEQITMNFRADEISDEDLEVIAFANQFVANLDMMYKKLEEIKNE >NC_012034.1|WP_015908979.1|2814318_2815281_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MNSNLPSKEHDSTFKLLFENPKDILFLVRDVIGYSWAKDIQEDSIELADKEFVDENFQQRRADIIAKARLKEREVYFYIIIENQSTVAEDMPERLLRYIILLWAKKIREGVKKLPAIIPIVTYNGLKEKWDVTKDIIEAFEIFKDNIFRYELVDLSKIDAEGLFDKEEDSLVPVVFYLEQARNDTKELVIRLNKIKSVLEKMGKYNRERFAILVKNIVEPRLNERQRIEIEKITRTLLQGGEKMGEFVSNIARVLDESLERKFNEGIQQGIQQGIQQGEYRTKVEIAKKLILKGTSDEDIAEVTELAIEEIRKLRKELAN >NC_012034.1|WP_041727251.1|2818112_2818436_-|hypothetical-protein MIKSNCEGSLNCVCKKAESKAQTGHRSAAKTQIYSGVADSSQIQEGLSSRALSVGTGNRVEKVIVNDYIEMRQKKHVSYKTAGSKAQTRFVPVSKTLENPGIKLCLV >NC_012034.1|WP_015908982.1|2818521_2819517_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKLSRSYDVGFKKLFSDKINVCWFITEIIPEPRLKNYTQSDIEIVATESINAQWKARRSDMVYRLPYSSSWIYLLVEFQSRPNKQMHCRIYEYVFLIQRKYQIDKRLPVVVPVVLYNGVEKWQPVTQFADNVEYAEDFPEYVQRLNYIFIDVRDIPEDKLLNGNNVLAAALYVDQVATNPDSVVERLLELGKNIRIPDEQREELAEWLYHAVLKSYKIPREEINELFAKSKILGVEEMFQSTAMKIKKGLAEEKKKIRLESKIEGKIEGKIEGKIEGKIEGKIEGKIEGRMEAQLEIARNLILEGAEDSFIAKVTGLDIEKVKELRNQQQK >NC_012034.1|WP_015908983.1|2820206_2820512_-|STAS-like-domain-containing-protein MIKLNEFGSIVCSRKNGEIVREKILEEIKNGNTVVINFEGVEMINHSFADEAFGKLLYDLPVDVFKNQIKFIKANDDVKGIIKMAVAERYRLIEEEKKIAI >NC_012034.1|WP_049760268.1|2820609_2821230_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012034_5 | 2828426-2831032 | TypeV,TypeIII-A |
NA
Consensus repeat of NC_012034_5
|
39 spacers
spacers of NC_012034_5
>5.1|2828455|38|NC_012034|PILER-CR TAGGCTTTCTAAAATTTCTTCAACGTCTTTTTTGCTTG >5.2|2828522|36|NC_012034|PILER-CR TAAAAAGCTGAGGAAAGTGATTTTCTATCAGGACGA >5.3|2828587|37|NC_012034|PILER-CR TTTGCTAAAAATGTCGCAAAAACCGTTATACCAGCTG >5.4|2828653|36|NC_012034|PILER-CR TTGCCTTATTGATGAATTATCTATGATAGATTTAAA >5.5|2828718|37|NC_012034|PILER-CR TAGGGAATTGTAAAGAAGGAAAATACCAGCTGTGATG >5.6|2828784|36|NC_012034|PILER-CR TCAATATTTTCATAGCTTTCATACACATAATTTTCA >5.7|2828849|37|NC_012034|PILER-CR TATAATTTTCATTTGTACATAAATGGTGTTGAAGCAA >5.8|2828915|36|NC_012034|PILER-CR TAATCCTTTTAACCTCATGGGTCGTGTAGGGAGTAG >5.9|2828980|36|NC_012034|PILER-CR TTCTTAAGACCACTTTTTGTTTTAACAAGTTTAACA >5.10|2829045|36|NC_012034|PILER-CR TTTAACCTCTTGTCTCCATCAGGAACTGGAGCAAGA >5.11|2829110|37|NC_012034|PILER-CR TCGGGGATGTTTTTACCTGCCCAATTTTCGATGACTA >5.12|2829176|37|NC_012034|PILER-CR TATTTCACAGATGATGCAGTTAGGCGTTCTTACAATA >5.13|2829242|38|NC_012034|PILER-CR TGCTGGCTGGGTTCTGTTAGTTTTTTTCAGTGTCGCCC >5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR 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csx1,cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012034_5
The CRISPR arrays of NC_012034_5 >merge|NC_012034|5|2828426-2831032|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_012034.1|WP_015908985.1|2825157_2826549_-|ATP-binding-protein MKKFINRSKELDFLEKQYREQNSSLVVIYGRRRIGKTALIKKFIQHKPAIYFLASEEAENQNIEYFKKAVGNFLKNPLIERLSGVGWDDIFDVIVNSKIDKKVVIVFDEFQNLCKTNPAFASVVQRIWDEKLKNHSFMLILSGSLVGMMQEHALSYSSPLYGRRTGQIKLKQFSFKDAKEFFSEVSDDQFIWIYSIVGGVPKYLEMFKFEGDIYKAIEENILSRQSFLYEEPVFLLEKEVHEVGSYFSIIKSIALGNHKLSQIAQSLSVAQTKLTKYLNTLMDLDIVRREVPITEEYPEKSKRGLYFINDNFIDFWFKFVYPYREQLELDNTKYVVENIKSKIVTNHISFVYEEICRQILMDLIKTKEIDIQLDRVGKWWDSKSEIDIVGIGKNTGHVVFGECKYSQSVVDIDVFFNLKKKAENVKVFPDQKELYILFSRMGFSERLLEFAKETKNLILIKFP >NC_012034.1|WP_015908984.1|2822433_2823759_-|TIGR02221-family-CRISPR-associated-protein MNVHKASNILISVIGKGRLKKDQTVGYEQTEYVFNPDKEKNNRYTASKTAFFGIALYEYLTNVECIQIDKFIIIGTDKSAWSELYQILPHYIQNSEDIAEMCLKVYEEEKEGISEQTLIEWQSTLTKYVPGLKFYKIEPVELGKGVDILLEELEKDVDNNVIFDMTHAFRNIPIVFSYGIMLLKYLRKINKIRIFYGAHEMREYFSGLVDGQSPVIEISFIDKLVKMIEAMATFENSGYFVPILNQLGFGNREKTYFKLEMNRQPRREIEEIIKGLEDKLNTAEHVYEREIVEIMYEEFSEMNRQEKLFQRMYKRSQFFYERKQYLKALILLYEAMIVLCADVYNKNNMNYEGREEARKILKEIECKNVNFYPENNKLIKDPNEVEIIKELEYVRNAAVHGSSSKGNQNYLEDIESFKVLFNSALNVFEKMLQRRNQIKKG >NC_012034.1|WP_156046815.1|2822017_2822173_+|hypothetical-protein MRFLEIRKSFYHYVISVPLIDNIPVNFENLILYVPHSQLNDFYNLITGFRT >NC_012034.1|WP_049760268.1|2820609_2821230_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MLKAYKYRIYPEKSQEEFFEKTFGCCRFVWNKMLEEKLEALRQGRKVPRITPARYKKEYPFVREVDSLALANVQLEQEKSFRDHFKNPKHFRMPNQKIHQWCFRKMVEMITYKAQLLGIEVELVPEEYTSQVCPVCGSKNRPIGRNYECRSCGFRYHRDGVGAINIWQRYLGRESQVVAGLAPVRGVRFKPHLCGHGVSNAPWKAA >NC_012034.1|WP_015908983.1|2820206_2820512_-|STAS-like-domain-containing-protein MIKLNEFGSIVCSRKNGEIVREKILEEIKNGNTVVINFEGVEMINHSFADEAFGKLLYDLPVDVFKNQIKFIKANDDVKGIIKMAVAERYRLIEEEKKIAI >NC_012034.1|WP_015908982.1|2818521_2819517_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKLSRSYDVGFKKLFSDKINVCWFITEIIPEPRLKNYTQSDIEIVATESINAQWKARRSDMVYRLPYSSSWIYLLVEFQSRPNKQMHCRIYEYVFLIQRKYQIDKRLPVVVPVVLYNGVEKWQPVTQFADNVEYAEDFPEYVQRLNYIFIDVRDIPEDKLLNGNNVLAAALYVDQVATNPDSVVERLLELGKNIRIPDEQREELAEWLYHAVLKSYKIPREEINELFAKSKILGVEEMFQSTAMKIKKGLAEEKKKIRLESKIEGKIEGKIEGKIEGKIEGKIEGKIEGRMEAQLEIARNLILEGAEDSFIAKVTGLDIEKVKELRNQQQK >NC_012034.1|WP_041727251.1|2818112_2818436_-|hypothetical-protein MIKSNCEGSLNCVCKKAESKAQTGHRSAAKTQIYSGVADSSQIQEGLSSRALSVGTGNRVEKVIVNDYIEMRQKKHVSYKTAGSKAQTRFVPVSKTLENPGIKLCLV >NC_012034.1|WP_015908979.1|2814318_2815281_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MNSNLPSKEHDSTFKLLFENPKDILFLVRDVIGYSWAKDIQEDSIELADKEFVDENFQQRRADIIAKARLKEREVYFYIIIENQSTVAEDMPERLLRYIILLWAKKIREGVKKLPAIIPIVTYNGLKEKWDVTKDIIEAFEIFKDNIFRYELVDLSKIDAEGLFDKEEDSLVPVVFYLEQARNDTKELVIRLNKIKSVLEKMGKYNRERFAILVKNIVEPRLNERQRIEIEKITRTLLQGGEKMGEFVSNIARVLDESLERKFNEGIQQGIQQGIQQGEYRTKVEIAKKLILKGTSDEDIAEVTELAIEEIRKLRKELAN >NC_012034.1|WP_015908978.1|2813531_2813888_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKEEVYKKIGKRLQELRKQRGFTQEQVAKYLGITQEQLSHYENGKREVSVDILLQLARLYGCDYNYLLGEEQNTDEQITMNFRADEISDEDLEVIAFANQFVANLDMMYKKLEEIKNE >NC_012034.1|WP_015908977.1|2812771_2813539_-|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MNNLAEIKATEARKTLGLASHEAVDIFKVLHEIEGVSLAFMEMSEKMSGLFVRKGRAALIVVNSKKTLGHQRFTAAHEYYHYKYSKGAVSRVCPIRKFVEDNPEEREANIFAINFLLPEEGVKYMFFKRTEGKTPDISDIIFLEQYFGVSHQFMLIRLKELNLITEKQEKDFSKDVIKKAREYGYSTQLYKDTSDKDIQVYSPYAELAKKLLDAGRISYGKYEELLIEGGYAHLIFEPEEDTEGEINELEDAYSL >NC_012034.1|WP_157678178.1|2831044_2831182_+|hypothetical-protein MEVEEKRRPSVGDLNCYQQGGNMVVQVHGLYAFTLEIREIKEFLL >NC_012034.1|WP_015908987.1|2831264_2833040_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MTSEVHESFKALARNDVAEQKRLCRELYKSEYYIPCFLFSSKLIDMGEESEKIIYIASLAKMGYTDLAFHIFESEREKIERYLLICNEEDLNIASDLLFLVEEFEKVPKEISRRIDKVSGNLQSCFIWNEIRKLKENLGTFKLCLSGKNDIVKIVEDTDDAFVKTRAGYCLYNLGIVECRKHLTEKYLRHEEKVKLGLDASDDIYYFENLEDISKKVWYFNYQDEHMHFFTYPEYNIHFLRFENEILVIDCGSQPREFCIVDIEGFLAQKGYSTNMIKAVLISHAHYDHYSFVQYLPHQIPVYATKETIDLIFIMNRECLRGKKINFIQYAEEFEIGKFKVSAFPNGHILGSAGFDIYFGNRRLIYTGDFSLHSQMILEGMSLQEILKKGKVTYLVCEHTYGIKDFAIKYEDAARCLAHAVDFLVKLKLKVFIPAFSIGRAQEVLAIINAYCRTRPKVIVDGLAKEISLYYLEKREKNFFYNVSLGNSNNVENNIKKAEVVVASSGMLQPNSIAVKYVQLLNGSAFGFIKSGYIEEQQYIHEMIKVIKNFEVHYFDIPLSAHSNYFEILRTLRILEPEKIILVHGQGLKGL >NC_012034.1|WP_015908988.1|2833064_2834723_-|hypothetical-protein MEKVIKDFGELDINLFEPFYRPDDKIFEGAIIGTNKINYVSNRLFMWMFSREDVEEFELIFGLLRQPKYGYVRSEFKRKLIFQCNKLLREGICPIEPMLYASKTVNRIISNDVEDHEDISDVICEVAKYDRNVAVKTLEHIISRWSWYPQIKIALLAIGKISDSELIQMAYSRFSDIKHLNYIKFELLKMLVYSKNTNFINQMIFLLTTLERDNTTDRAIANFFKEKFDVYMGKEGVIELKNYFEINYNFLKNFAKSIIQAVIKDYIAEESAESQNNHAENIKNGSEKNFTYFKQLCIAYSKQKKNEDFKKEILNYLFDSNYSAFSSMVYCLRYTKDKDLAPYLEDAVLKRKDAKLGDYKNAILTLGFLGADSLNFVKELAQKEKDLKYAEYAFFIVQGSETYCTLMADELLLCKDLSALSSIHRVLKEVITVSPKLREIIKEKLKNILLTDNKNIRRIALLNIQPYWKNIVDKDILKFLYEQMGYPDKPVKLTSEEQAIVLQITKDVLNNFSKSDIYKYLDYIRKRSDFDTNIKQAATRILLNDFEPAPPQ >NC_012034.1|WP_015908989.1|2834740_2836429_-|Hsp70-family-protein MHIGIDLGTTNTVVSYAKRKARGGVEPHVMKITQLNEYNSSVQEEILPSVLFLDFDKNIVVGKKAKQMKQYHPKRTISNSKRYMGTSAMFEIDDMKFTPVDVAAHILKMCKRTIELNSGEKPVQQVTITVPASFNTDQIRDTRNAAIKAGFDPEKIRIIPEPTAAFIDFINDQFELVEEDRKIDISTPKRVLVFDLGGGTCDIVVMDVVQSENCLKVEEKAVGRYSELGGIDFDKAAALYLLSKFFDENRIKEGDIESEEQTQMANKLMVFCEKAKEFFSNQVMLNPEIEKTNPSFKINIPEFWRGKSWLFSITLKEYNDATRDLYYSSGTKLKTIEEFEKCKNIIDPIFETLERYEIDKNSIDYVFATGGMSFYYRIIQRLKELFPKSQVIRAPNPIEAVARGASIFSFYEVEIKRQTEKPSVLDIAVRKEASAEMEIVTRTVLAEAIMIDVEEGLPREIITKNQPVPYKGVIKNSFRVSSPSGIKIDIYAGEDPYDCKMRIQKSFIGSFRSPVTPGTPIDIEYEIDENKYLKLRVIVNDSMNPPIDLDVDSDVKTAKQKI >NC_012034.1|WP_015908990.1|2836443_2837673_-|hypothetical-protein MNEYVGREKNMIVQGRETKNGNYEKPNYRLFLRNELKNVLEFEKFQFELEVLTIAGASKCLKENSKFISLSKFIKEKLGKYQFDFKKIQLIEDYIYSENFAFRLIVNDGLENVKKDRFIIEAFVRSFIVRYFANEMNEKTEDVFSNIKRSLYEICGERDPQFFGELNRRLIMIDPRSKTAFKQYMEMASSYKNEIEYIYNKLLKEAEKRGLFVYKRNAIENKNLESVEEKNIKQSLENTNNLENRELEKFKEKIKNYELMLNMYQEQIEELKAINSELQREKEALLQDRQQLPEKILIKLFNDLNSPQFGNLLDRIYIYANGFEQADVGTAHEIFTNFLAVLSLYNIIGHLDKEEYNSEINVKKEEIGSIYRSDKPVQSAKQTFVAKVLYPRWTLNQKTIAHKFVKIIS >NC_012034.1|WP_015908991.1|2839248_2839998_-|serine/threonine-protein-phosphatase MFKVFYFTNKGNSRDTNEDALLVFEKIISSTNMEKCESIDIDGKNIFLAVADGIGGHTKGELASKMVLEILKSYKDDIIEKKLSVEDAIKIARDELENYARTNPNSFGMGCTVAGVLIVGSKVQVFNVGDCRVYRLLGQRAIRLTKDHTVVEDLISSGYITVDEAKTHSKKHALTSAIIADNYRTEVQIYRNETEIIDEDRFIICSDGFWDKFEKEIPEIFSSDEFCMEFQKRFHLGNFNDNISFILLS >NC_012034.1|WP_015908992.1|2840022_2840508_-|FHA-domain-containing-protein MERYKICPNCNWQNPPDEIICVKCMADIINVPVTENNAVREAKKAEGIERKESFKKESFDDRTMVEVSKIILRGKDFVLEVFSGDVVGRHEKGKEYLGEYKTVSRRHAKFFKQAGIWYVEDLNSTNGVYINGMKIKGKDVIKKGDRISLSLSLELTVDELQ >NC_012034.1|WP_015908993.1|2840494_2841079_-|radical-SAM-protein MEELLVNIIHYPVYTLGPGKRVGIWLQGCSIRCKGCMSSHTWEFDKNRAIKIEQVTNILKSFGCKRLTISGGEPFDQHVPLQILLSSIRDFFDDILVYTGYTYEYLLNKHKNILKLIDAIVDSPFIKGLESELIWKGSENQRFFLFNKSLSNDYSLWIKKKKERVLQIINQKDKIVIIGIPYQKDAEVFINGEI >NC_012034.1|WP_015908994.1|2841059_2842886_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MANEIIPEKIKGIPKFAKELLRFCSITSQFILFGNIYDLFPFPQGEKYIPMNITQFIAHLLTTYDNYKIVIEYVPLEGFRLLKGDEGIFANLTRRKIGDKVVSLLDVYETIEKFITGDEKTAVVINFSSRLPEISCSKDLPDFLYHTFKLSININQKGNPPSFNPIIFLVEKENDLPPWYTVENPRIRTIPIPKPDFEIRRWIAQALLPRMDEWTSLPDSKKEELIKDFVNLTSGMFAREMLSIVVLSKRENLSAREIGEATRRYKVGVSENPWAKVDKDRLNNAEEFLKRRVMGQEKAIKQAATILRRAFFNLSGSQFSRYSNRPKGVLFFAGPTGVGKTELAKAITELIFGSEHHYIRFDMSEFSHEHSDQRLIGAPPGYVGYDVGGELTNAVKQNPFSVILFDEIEKAHPKILDIFLQILDDGRLTSGRGETVYFSESLIIFTSNLGVFEVTSDGKKIQRISPEMSYDEIEKILTEAIKEYFTFKIARPEILNRIGENIIVFDFIRNENVKRILDKMLNNVKIKLEEDKGVKLEISDNVQQKIYEEIVKDLSMGGRGIGNKLELLFINPLSELLFKLFPQAESTVVINELLKKDDRWELNGRVIS >NC_012034.1|WP_015908995.1|2842889_2844434_-|hypothetical-protein MSSFTYCWTFVGNKNLTETLRENKEFFKNQIDNSIGHVKDMLKNIDSYFLGEDLIENLEKCKKDFLEKYTMEILLSENHTQWVDAQIAKLQDIVRKTKEYIILVKTELTDNLDIQTLKAFIDVLPDGALETKKKIQKIIELFENLEKEFKNPNANVKVIKQYLNNFPKDLCNIKYYKKMQQYAEILNTIEKCTFDNPSDIEILKKYLKEVPSEYHGIIRKIKQKLLEQKTFEVKKQIEVEQIFKEENLKVTKKEEMLEKIEAIFGKLKNINLKLAEEKKQLIQEAKETDDILRVELIFEDLKFSYIKARTIYIQTEVLKNDLKMYETFAEEVGMKSEFNDLMQMDILHKEAVDDFIKMLLDRKRQIMEQEIRKVSVDKFIRKIRELGYSVVEEGLMERLSKGEIVEIRTPFGEDYILRIKYENDGIKIMFVRYVEDEGSLSEYEKHKDISIAKKWCSDYDKIKQLLSQEGIVIEDKQRIEPEMRFYYLKKEKMEYAKRHQNIKSNDIQHRQRSV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012034_6 | 2847036-2847194 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_012034_6
|
2 spacers
spacers of NC_012034_6
>6.1|2847064|38|NC_012034|CRISPRCasFinder AAATATTGATGGCAAAGAAAGGAAAAAAATTGTTGTGG >6.2|2847130|37|NC_012034|CRISPRCasFinder TAGCTGATGTAGTCAAACGGTTTTTTAGAGGATTTGT |
cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012034_6
The CRISPR arrays of NC_012034_6 >merge|NC_012034|6|2847036-2847194|CRISPRCasFinder TTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAATAAATATTGATGGCAAAGAAAGGAAAAAAATTGTTGTGGTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAATTAGCTGATGTAGTCAAACGGTTTTTTAGAGGATTTGTTTGTACCCTACCCTTTGGGAATTGAGGG >NC_012034|6|6|2847036-2847194|CRISPRCasFinder TTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAT AAATATTGATGGCAAAGAAAGGAAAAAAATTGTTGTGG TTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAT TAGCTGATGTAGTCAAACGGTTTTTTAGAGGATTTGT TTGTACCCTACCCTTTGGGAATTGAGGG
>NC_012034.1|WP_015908996.1|2844465_2846541_-|serine/threonine-protein-kinase MDEKTVIESWWDKENIQDATVREADILNEREKSTMTTFRNYNIVEELPAKGGECDAYIIENNGKKMFLKLYRKGITPKIEVLERLKKISFELKEHVVTIFEVGKDEQTGRYFEIMEYIQYGSLKDNLEKVKDRVDIVVKEIAEAIEALHKKGIVHRDLKPSNILIRDLKSLDLVLIDFGISSAMSEEMSKVITTLKGTYSYMAPEEISGYFGKEIDWWHLGIVIYEVLKGKNPFSNLSEAVIINTLATQGVQIPEDIPERYKILLKGLLTRNNRKRWGYEQVKQWLNNVKNIPVFYEEYDERTKKYDIKEWNRLGFSSDSEWVKVGIEINLSPQEAKTFWEAGFSAKDMKEWVLAGFRKGNIALEWYNYGFSPKESAIFDNLGLSPKNAYEWQRKCITAFDILELLEKGIDKNKIFDFVEKGIFHYIMNGLSEIDAQKWKKYGFDINEAKNWAEKGFSAEEAEEWKKNNVSVIEAVRWKTIKVKPILALKFINLGFSIDEVEEMVFKGAKDSKILERIADEIVEWCKAEFSVSEAVDWIIKGYKLHQAVRRKKLLRDIKKTLKGIYKVAVFYLMGLIATRLILYFTTEKYFYGVIAKKYFDNSRNYYMFVLIVISLLSYYLYKKYFHFTKIKIAGLSILYVCVIMFYFSYISSYEYFINGTANKILINSVYFYFVLSVISVLSKILRRYDN >NC_012034.1|WP_015908995.1|2842889_2844434_-|hypothetical-protein MSSFTYCWTFVGNKNLTETLRENKEFFKNQIDNSIGHVKDMLKNIDSYFLGEDLIENLEKCKKDFLEKYTMEILLSENHTQWVDAQIAKLQDIVRKTKEYIILVKTELTDNLDIQTLKAFIDVLPDGALETKKKIQKIIELFENLEKEFKNPNANVKVIKQYLNNFPKDLCNIKYYKKMQQYAEILNTIEKCTFDNPSDIEILKKYLKEVPSEYHGIIRKIKQKLLEQKTFEVKKQIEVEQIFKEENLKVTKKEEMLEKIEAIFGKLKNINLKLAEEKKQLIQEAKETDDILRVELIFEDLKFSYIKARTIYIQTEVLKNDLKMYETFAEEVGMKSEFNDLMQMDILHKEAVDDFIKMLLDRKRQIMEQEIRKVSVDKFIRKIRELGYSVVEEGLMERLSKGEIVEIRTPFGEDYILRIKYENDGIKIMFVRYVEDEGSLSEYEKHKDISIAKKWCSDYDKIKQLLSQEGIVIEDKQRIEPEMRFYYLKKEKMEYAKRHQNIKSNDIQHRQRSV >NC_012034.1|WP_015908994.1|2841059_2842886_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MANEIIPEKIKGIPKFAKELLRFCSITSQFILFGNIYDLFPFPQGEKYIPMNITQFIAHLLTTYDNYKIVIEYVPLEGFRLLKGDEGIFANLTRRKIGDKVVSLLDVYETIEKFITGDEKTAVVINFSSRLPEISCSKDLPDFLYHTFKLSININQKGNPPSFNPIIFLVEKENDLPPWYTVENPRIRTIPIPKPDFEIRRWIAQALLPRMDEWTSLPDSKKEELIKDFVNLTSGMFAREMLSIVVLSKRENLSAREIGEATRRYKVGVSENPWAKVDKDRLNNAEEFLKRRVMGQEKAIKQAATILRRAFFNLSGSQFSRYSNRPKGVLFFAGPTGVGKTELAKAITELIFGSEHHYIRFDMSEFSHEHSDQRLIGAPPGYVGYDVGGELTNAVKQNPFSVILFDEIEKAHPKILDIFLQILDDGRLTSGRGETVYFSESLIIFTSNLGVFEVTSDGKKIQRISPEMSYDEIEKILTEAIKEYFTFKIARPEILNRIGENIIVFDFIRNENVKRILDKMLNNVKIKLEEDKGVKLEISDNVQQKIYEEIVKDLSMGGRGIGNKLELLFINPLSELLFKLFPQAESTVVINELLKKDDRWELNGRVIS >NC_012034.1|WP_015908993.1|2840494_2841079_-|radical-SAM-protein MEELLVNIIHYPVYTLGPGKRVGIWLQGCSIRCKGCMSSHTWEFDKNRAIKIEQVTNILKSFGCKRLTISGGEPFDQHVPLQILLSSIRDFFDDILVYTGYTYEYLLNKHKNILKLIDAIVDSPFIKGLESELIWKGSENQRFFLFNKSLSNDYSLWIKKKKERVLQIINQKDKIVIIGIPYQKDAEVFINGEI >NC_012034.1|WP_015908992.1|2840022_2840508_-|FHA-domain-containing-protein 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>NC_012034.1|WP_015908989.1|2834740_2836429_-|Hsp70-family-protein MHIGIDLGTTNTVVSYAKRKARGGVEPHVMKITQLNEYNSSVQEEILPSVLFLDFDKNIVVGKKAKQMKQYHPKRTISNSKRYMGTSAMFEIDDMKFTPVDVAAHILKMCKRTIELNSGEKPVQQVTITVPASFNTDQIRDTRNAAIKAGFDPEKIRIIPEPTAAFIDFINDQFELVEEDRKIDISTPKRVLVFDLGGGTCDIVVMDVVQSENCLKVEEKAVGRYSELGGIDFDKAAALYLLSKFFDENRIKEGDIESEEQTQMANKLMVFCEKAKEFFSNQVMLNPEIEKTNPSFKINIPEFWRGKSWLFSITLKEYNDATRDLYYSSGTKLKTIEEFEKCKNIIDPIFETLERYEIDKNSIDYVFATGGMSFYYRIIQRLKELFPKSQVIRAPNPIEAVARGASIFSFYEVEIKRQTEKPSVLDIAVRKEASAEMEIVTRTVLAEAIMIDVEEGLPREIITKNQPVPYKGVIKNSFRVSSPSGIKIDIYAGEDPYDCKMRIQKSFIGSFRSPVTPGTPIDIEYEIDENKYLKLRVIVNDSMNPPIDLDVDSDVKTAKQKI >NC_012034.1|WP_015908988.1|2833064_2834723_-|hypothetical-protein MEKVIKDFGELDINLFEPFYRPDDKIFEGAIIGTNKINYVSNRLFMWMFSREDVEEFELIFGLLRQPKYGYVRSEFKRKLIFQCNKLLREGICPIEPMLYASKTVNRIISNDVEDHEDISDVICEVAKYDRNVAVKTLEHIISRWSWYPQIKIALLAIGKISDSELIQMAYSRFSDIKHLNYIKFELLKMLVYSKNTNFINQMIFLLTTLERDNTTDRAIANFFKEKFDVYMGKEGVIELKNYFEINYNFLKNFAKSIIQAVIKDYIAEESAESQNNHAENIKNGSEKNFTYFKQLCIAYSKQKKNEDFKKEILNYLFDSNYSAFSSMVYCLRYTKDKDLAPYLEDAVLKRKDAKLGDYKNAILTLGFLGADSLNFVKELAQKEKDLKYAEYAFFIVQGSETYCTLMADELLLCKDLSALSSIHRVLKEVITVSPKLREIIKEKLKNILLTDNKNIRRIALLNIQPYWKNIVDKDILKFLYEQMGYPDKPVKLTSEEQAIVLQITKDVLNNFSKSDIYKYLDYIRKRSDFDTNIKQAATRILLNDFEPAPPQ >NC_012034.1|WP_015908987.1|2831264_2833040_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MTSEVHESFKALARNDVAEQKRLCRELYKSEYYIPCFLFSSKLIDMGEESEKIIYIASLAKMGYTDLAFHIFESEREKIERYLLICNEEDLNIASDLLFLVEEFEKVPKEISRRIDKVSGNLQSCFIWNEIRKLKENLGTFKLCLSGKNDIVKIVEDTDDAFVKTRAGYCLYNLGIVECRKHLTEKYLRHEEKVKLGLDASDDIYYFENLEDISKKVWYFNYQDEHMHFFTYPEYNIHFLRFENEILVIDCGSQPREFCIVDIEGFLAQKGYSTNMIKAVLISHAHYDHYSFVQYLPHQIPVYATKETIDLIFIMNRECLRGKKINFIQYAEEFEIGKFKVSAFPNGHILGSAGFDIYFGNRRLIYTGDFSLHSQMILEGMSLQEILKKGKVTYLVCEHTYGIKDFAIKYEDAARCLAHAVDFLVKLKLKVFIPAFSIGRAQEVLAIINAYCRTRPKVIVDGLAKEISLYYLEKREKNFFYNVSLGNSNNVENNIKKAEVVVASSGMLQPNSIAVKYVQLLNGSAFGFIKSGYIEEQQYIHEMIKVIKNFEVHYFDIPLSAHSNYFEILRTLRILEPEKIILVHGQGLKGL >NC_012034.1|WP_015908998.1|2847560_2848184_-|hypothetical-protein MMGCDEKVAKYFTFHFWAREDGIFLPSSYYSKVYEALKSLFSTELFTISPIRTKNKKEVEDGIWVFEDFRIYLATPFLELVTQNVLKVYENLNYLFDGIYLKRISCRTQQPKTSGILLSGVFVQKDGVCLEYDRQPEIFSEMLRRQLLSIYYQRFGTYPEDQRFFFVIKDGLKKQYVVPSRIEYFGRYEVFASTELLDMFCQMFCVR >NC_012034.1|WP_015908999.1|2848180_2849353_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MAADSFESKTYEIEVLTPTIIGGQDKIQSFEFVREGEYLYFLNFDKLFEQNLFKDSFIEELSRELSSGARDFNIKDILKKYSIDFKKAVKYTLRLEGVTSPYREVVAFVKSAGRFYIPGSSLKGAMRSSMTKALSKNLLQFYESALSNAYQKVLNRNRVDPKFVSRDADEKIFGTPYESPFKYLRVSDSSFVGQESAGIFEIKVLNICSNQPKWFSRNGNIDDPKQATAIVAEGLKPGVKLYGSIKVEKDLIEGNAAVKGLKEKLLASGLSSSPYEFVAQILNSVAKDYIQKEMTFYSKYNQKQIVSEYQRLLNILNSLDKNKFLLQIGFSTGYLSKTVGIFFNKSHFEKLSRVDTQSKIYPDIFPKSRRLLFKDGQVWTVPGWIKVTIR >NC_012034.1|WP_099716427.1|2849339_2850314_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MRFKAPVHIGEKEKIYNITRTFAHSDTLMSGIINAYSLLYGKDETEKLISEFVNGTPPFEVSSTMPYVNFQYFVPIPLGMDMEEYKNKGVINAEHQKELKKIKFVKERDLFEGFPFKYKPAGSFLIPQNEFEKDKERVSLGRIKERARVSIDRQTSSSNIYYFSHFEFEKESGLWFYLKINIEKLENKIKAAIRLLGDEGLGGDRTCGLGSFEVDFKDDVPQFKNDKSRYYMSLSLVNPKDEDEIKSVVFYEILTRSGYVYSKAGLGIKKKTVSVFGEGAVFSSKIYGRVVDVTPDKFTEHRVYCFGLAFLLPLPEGVMLFGSR >NC_012034.1|WP_015909001.1|2850372_2851173_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MDVILKGKYIIKCKIEAQTGLHIGEGNNSLEIGGIDNAVVKDAKGRPYIPGSSLKGKMRALMEFAEGKVRDNLLVVSVKREGRPEICLHMCDDLNCPVCGLFGRNHGSHDLKSGGKIDLTDAVIPTRLIVRDAKLIETSITEEMKENLDLEWTEVKFENNIDRITSKANPRQSERVPAGAQFSAEFVINRFEVDSKDDQKYYLEKFIKAMKLLEDDYLGGQGSRGNGKVRFVDIEIFYKDSSDYEKDSSELQPIATAKSLDELKLS >NC_012034.1|WP_015909002.1|2851200_2851614_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MPAQQNVNPIVSLKNDILSKIQTAIDPSKDKDGTVLAEVSEKTGQLLKDCGVTVTQLRKVFTEVKRLSPDDENYKYKLNLLKAKLAYTAGRFPKIKDFQEIVNKAIPVALQSPDALSRFKDFFEGAVAYHKYFGGRE >NC_012034.1|WP_015909003.1|2851642_2854156_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MIFYNAYQTEDKILDYNIFLGAILHDIGKFYMRTENSEAKITISREYDVFFKEAGKHAPRHEDWGAYYVQQILPERFKKEILKDVTNLILYHHKPSSYGQYLISVADKISASVDRKDIEEDDTSADKSKYLISILSQICLDQNEKSSRKTYYKNLTKRYEIKYPTDSFYSNARNDYQNLWEDFSKKALILKDKFEKSLNEIHFDLEEYASAIYNLIRIYTYNIPSAFYYSKPDISLWAHSKSTAAIAFCLDRQLKKEFSQENERVRVLESINTKILSGRGSSIKKGEFPYFCLVKGDISGIQDFVFDTKMDGALKALKAKSFYISFLLDTVARFILKKENMPICNLIFNGGGHFYLLMPAYFAEKVEDYQKEIDKLLFKAHRGSISILLETDIVDLYDFSGNFGNCFDRVSSKIYRKKISKFRNVIENQKLKFFEPYEDYEQKCPHCHRALRPREDDPDFCPFCESFVEFGEKLMKSDFIKESWGEQIEYSDFKNIEDIFEAFGRKIEFSNYSEKVINPVTNTIVIDRNRLEKLLEKNNNLENRKKSDDKFEIDFYEALDISTHAPFKDEINLKTIDEISNSSKGIKTWGIVRGDVDNLGRIFKEGLGDDNSISRVMTLSEEFSLFFGYYFNKLVSQQNGNIVVIYAGGDDFCILGQWDVLPHTAHKIYTEFRSFSCHNPDITLSMGFEIAPDKKYPIYRVAIVCGDHLDKAKEYQREDGRKKDCFAFGGNFVGWEDYEDVEKLKEVIADLIGSKNVSKALINGIYAVCNLKKMTQTQEELFKSWRFVYFMARLKERYKKYSKELEDILPKIIDKKSNSLYKHSYLAARWAELELRR >NC_012034.1|WP_079503988.1|2854914_2855367_-|IS200/IS605-family-transposase 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012034_7 | 2856808-2857631 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_012034_7
|
12 spacers
spacers of NC_012034_7
>7.1|2856838|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATGAAGGATTGTAGGATTTTTGCAATATATAAAC >7.2|2856904|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAATAGTTGCTCGCATAGGAAACTCTATACATT >7.3|2856969|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTTTATCTATTTCTTCTTGCGTTTTATTTGTTT >7.4|2857035|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATATTTAGCGCTTTGTCTTTAAATTGAGAATATAA >7.5|2857102|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCCCTCACAACGATGAAACAATCAAAAGAATCTATT >7.6|2857169|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACAAATTAATGTAGCTAAATTTGTCGCCTTGTA >7.7|2857235|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCAGTGGGATGGAAAGAGATGAAATAATGTCAAAA >7.8|2857301|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATAATCAAAGATTCTTTTACCCCACCTACACATC >7.9|2857368|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATATCGAGAATAATCTTTCTTCCTTCAGTAGTTT >7.10|2857434|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAATGAGGGATTGAAAGTTGGTGAGCTTGTGAAA >7.11|2857500|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCTTGTATTCGCTACAGGCAAAGTGATTTTACCA >7.12|2857566|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATAATTTAATCTTCTGCGTGTTTGTCTGCGCAAA |
cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,cas6,csx1,csx20 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012034_7
The CRISPR arrays of NC_012034_7 >merge|NC_012034|7|2856808-2857631|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCGATGAAGGATTGTAGGATTTTTGCAATATATAAACGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTATAATAGTTGCTCGCATAGGAAACTCTATACATTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAAGTTTATCTATTTCTTCTTGCGTTTTATTTGTTTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAATATTTAGCGCTTTGTCTTTAAATTGAGAATATAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGTCCCTCACAACGATGAAACAATCAAAAGAATCTATTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTAAACAAATTAATGTAGCTAAATTTGTCGCCTTGTAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCCAGTGGGATGGAAAGAGATGAAATAATGTCAAAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAAATAATCAAAGATTCTTTTACCCCACCTACACATCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATCAATATCGAGAATAATCTTTCTTCCTTCAGTAGTTTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGATAATGAGGGATTGAAAGTTGGTGAGCTTGTGAAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTCCTTGTATTCGCTACAGGCAAAGTGATTTTACCAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCATAATTTAATCTTCTGCGTGTTTGTCTGCGCAAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC >NC_012034|7|6|2856808-2857631|PILER-CR GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CGATGAAGGATTGTAGGATTTTTGCAATATATAAAC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TATAATAGTTGCTCGCATAGGAAACTCTATACATT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAAGTTTATCTATTTCTTCTTGCGTTTTATTTGTTT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAATATTTAGCGCTTTGTCTTTAAATTGAGAATATAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GTCCCTCACAACGATGAAACAATCAAAAGAATCTATT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TAAACAAATTAATGTAGCTAAATTTGTCGCCTTGTA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCCAGTGGGATGGAAAGAGATGAAATAATGTCAAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAAATAATCAAAGATTCTTTTACCCCACCTACACATC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT CAATATCGAGAATAATCTTTCTTCCTTCAGTAGTTT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GATAATGAGGGATTGAAAGTTGGTGAGCTTGTGAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTCCTTGTATTCGCTACAGGCAAAGTGATTTTACCA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCATAATTTAATCTTCTGCGTGTTTGTCTGCGCAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC >NC_012034|7|7|2856808-2857631|CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CGATGAAGGATTGTAGGATTTTTGCAATATATAAAC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TATAATAGTTGCTCGCATAGGAAACTCTATACATT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAAGTTTATCTATTTCTTCTTGCGTTTTATTTGTTT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAATATTTAGCGCTTTGTCTTTAAATTGAGAATATAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GTCCCTCACAACGATGAAACAATCAAAAGAATCTATT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TAAACAAATTAATGTAGCTAAATTTGTCGCCTTGTA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCCAGTGGGATGGAAAGAGATGAAATAATGTCAAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAAATAATCAAAGATTCTTTTACCCCACCTACACATC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT CAATATCGAGAATAATCTTTCTTCCTTCAGTAGTTT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GATAATGAGGGATTGAAAGTTGGTGAGCTTGTGAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTCCTTGTATTCGCTACAGGCAAAGTGATTTTACCA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCATAATTTAATCTTCTGCGTGTTTGTCTGCGCAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC >NC_012034|7|5|2856808-2857631|CRT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CGATGAAGGATTGTAGGATTTTTGCAATATATAAAC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TATAATAGTTGCTCGCATAGGAAACTCTATACATT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAAGTTTATCTATTTCTTCTTGCGTTTTATTTGTTT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAATATTTAGCGCTTTGTCTTTAAATTGAGAATATAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GTCCCTCACAACGATGAAACAATCAAAAGAATCTATT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TAAACAAATTAATGTAGCTAAATTTGTCGCCTTGTA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCCAGTGGGATGGAAAGAGATGAAATAATGTCAAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAAATAATCAAAGATTCTTTTACCCCACCTACACATC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT CAATATCGAGAATAATCTTTCTTCCTTCAGTAGTTT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GATAATGAGGGATTGAAAGTTGGTGAGCTTGTGAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTCCTTGTATTCGCTACAGGCAAAGTGATTTTACCA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCATAATTTAATCTTCTGCGTGTTTGTCTGCGCAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
>NC_012034.1|WP_015909006.1|2855866_2856148_-|hypothetical-protein MAERMPQITQLFGFPTYDDIEEENLKQLYETCRMIKANYKIIVSILEDSSITKEKLRCLQSYSMSFEILKTVYKREFSVWTNSKEKMGSLDDL >NC_012034.1|WP_015909005.1|2855485_2855836_-|hypothetical-protein MILDPHLAKYLSQASVVEEIEITDQIEGVFLQANECNLPLINYPFRLIGRDKTTGEILFSVNFEKSFTGFNFIGAHVKNGHINFGLVDEIYSYNDFKEKALDFAKIIIENNLFELK >NC_012034.1|WP_079503988.1|2854914_2855367_-|IS200/IS605-family-transposase MINIQFRYIIKLVMIMKFDSNKHSVFLLYYHLILVTKYRRDVIDEKISKRLKEIFEYIQPNYNITIVEWNHDKDHIHVLFKATPTTPLSKFINAYKSASSRLIKKEFPEIKQKLWQEYFWSRSYCLLTSGGAPVELIRRYIESQGEKRKC >NC_012034.1|WP_015909003.1|2851642_2854156_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 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>NC_012034.1|WP_015908999.1|2848180_2849353_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MAADSFESKTYEIEVLTPTIIGGQDKIQSFEFVREGEYLYFLNFDKLFEQNLFKDSFIEELSRELSSGARDFNIKDILKKYSIDFKKAVKYTLRLEGVTSPYREVVAFVKSAGRFYIPGSSLKGAMRSSMTKALSKNLLQFYESALSNAYQKVLNRNRVDPKFVSRDADEKIFGTPYESPFKYLRVSDSSFVGQESAGIFEIKVLNICSNQPKWFSRNGNIDDPKQATAIVAEGLKPGVKLYGSIKVEKDLIEGNAAVKGLKEKLLASGLSSSPYEFVAQILNSVAKDYIQKEMTFYSKYNQKQIVSEYQRLLNILNSLDKNKFLLQIGFSTGYLSKTVGIFFNKSHFEKLSRVDTQSKIYPDIFPKSRRLLFKDGQVWTVPGWIKVTIR >NC_012034.1|WP_015908998.1|2847560_2848184_-|hypothetical-protein MMGCDEKVAKYFTFHFWAREDGIFLPSSYYSKVYEALKSLFSTELFTISPIRTKNKKEVEDGIWVFEDFRIYLATPFLELVTQNVLKVYENLNYLFDGIYLKRISCRTQQPKTSGILLSGVFVQKDGVCLEYDRQPEIFSEMLRRQLLSIYYQRFGTYPEDQRFFFVIKDGLKKQYVVPSRIEYFGRYEVFASTELLDMFCQMFCVR >NC_012034.1|WP_015908997.1|2846917_2847430_-|hypothetical-protein MSLSSLLGESIMLNRLAEGLKVFKIVVQGFVIKLFWQGSTNLHSTSVLSRKATDPALQIFHHRPNCFRISTGYNTNSLLPQFPKGRVQTNPLKNRLTTSANFNPQRAGYNHNNFFPFFAINIYFNPQRAGYKLIERFNFIISTLCTTVNVFILEHTLKTNSKPAILSFKA >NC_012034.1|WP_013404392.1|2857719_2857956_+|hypothetical-protein MVYEVTYNNSRLVFEGKEINYFKILEALDKLRDLRDYIELFYTEYSGLPLTSLPYDVLLDIFTNYLDFIGVQIKVIGR >NC_012034.1|WP_015909007.1|2858348_2859191_-|hypothetical-protein MSYFYIDEDGVVKLHESYYEQTLIDYVGESLRTFASLRELLKDEIGNFKRPKEYLQAKKCPGWVGLCPNNKEEKDSSCNPDQCWNTKIKTIKDKIDKKDHFKYDNILIKVLSPSICSECGSSEMKIEWGKRVNVKVAGYTLNFENVAYMVCKKCGIFYMSTVDKKAIEVIKEKIRDYNPYEEAIEQAGIDNEAGLDADCSVSEFEIPPVKTIILDKDKIGLEMLIEDLKKGCISLTMALFPISSPVSSVDVTTFNICHYADPEDMYPEGLEDEGEDIIEE >NC_012034.1|WP_157678180.1|2859204_2859366_+|hypothetical-protein MILYILKKPLIIPKINLNIKYKIPSEMSISGRRIGARIIKIMTANTIPYFATS >NC_012034.1|WP_015909008.1|2859730_2860276_+|hypothetical-protein MQQKSLLEKLSSIRFRQYVLQEEGLNSWWDFRMPIEDDYTTLFELIKSIKSARLVFKALMACKRYFRIIPSKKGLCLVYRFSILSTAKNPELPVDINQPTEIIEYNGIKWFVEEFGSLIVIGEVNINKVKRIVEKLEENWKKRYPKIREKEIKKYIDIIKNENIEEMRRIWDAFVDVVNGD >NC_012034.1|WP_015909009.1|2860373_2861183_-|hypothetical-protein MSFWDLLIFFIIASSLQPALKQRMLESARQKLIAKIEKKRGSRVILLVHRQETMSFLGFPIYKYIDINDSEEVIRAINMTDPSIPLDIILHTPGGLVLAATQIARAIKRHKGKVTVHVPHYAMSGCTLIALAADEIVMSEDAILGPVDPQIGEFPAVSILEVVKQKAVNEIDDKTLILADIAKKAIRQTKEIVLELLSDNYSEDVAQKIANELVEGKYTHDFPITYEKARELGLKVNCCIDKEIKQLMCLYPQPVAKKSSVDYLWIPRK >NC_012034.1|WP_041727261.1|2861209_2861938_-|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MIPLKDTIPSREKPFMTWFIIIVNVLIFLFQVSIPPEAAQEFVYRYGFIPEKFSRALSDGLITGIIYSIWPIICSMFMHGSWMHLISNMWSLWLFGDNVEDRVGHFRFLIFYLLSGFSAAYTHWFFNAHSLVAVVGASGAIAGVMGAYFLMFPLSNIVTLIPIGFIPLFVNIPAVFYLGLWFLSQVSSGILELFGPVFGSGIAWWAHIGGFVFGALTVNFFKKRYRRYNNFFDDEIFYYRYY >NC_012034.1|WP_015909011.1|2862488_2863925_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein 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MIKLNEYGNIICSRENGEVVREKILKEIKNGNIVVINFEGVEMINHSFADEAFGKLLYDLSEDVLRNQIKFVNANDDIKGMIKMALMERHKLILLEMQN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012034_8 | 2866258-2868585 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_012034_8
|
35 spacers
spacers of NC_012034_8
>8.1|2866288|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATAAAAAACGTGCGATTTCCTTTTTGCCTGTTTC >8.2|2866354|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTCTTAATATACATTTTACTGCAAAATAACTT >8.3|2866419|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAATTTAAACCTCCCCACTTTATGGCGTATGTCGT >8.4|2866485|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACTAAACCAAGAGAAACCTTTATTTTATAATCAA >8.5|2866551|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTAATGAGCAAATCATAGCTAACCTTATGATTTA >8.6|2866617|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCTTCTTTCTTTTGTTTTTCATAGTTTTCCTGA >8.7|2866682|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCTTCTTTCTTTTGTTTTTCATAGTTTTCCTGA >8.8|2866747|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCTTCTTTCTTTTGTTTTTCATAGTTTTCCTGA >8.9|2866812|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAAATTTACAGCTATGCTCAAGAAATGATGAGC >8.10|2866877|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCATTAACATGGAGATATGCTTCCTTCTGTGCAAG >8.11|2866942|33|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGATAAACAGTTTTATTCACAAATGGGGTATG >8.12|2867005|34|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTTTGACACGTGTAAGGTTTTCATGGGTGCCG >8.13|2867069|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTATTTTTTTCTTATTACAAACGGAATAAGCGTT >8.14|2867135|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCAGCTCCTTCTTGAGCATCATACATCACCAAAA >8.15|2867201|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTTCCTGAAAGCCCAGTTAGCTTGCTCAAGATTTG >8.16|2867268|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTAAATTGTCCACGCAAAACATCTATTTCCTCGC >8.17|2867334|33|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTATATAAAAATATTTTCTGCACATTTTT >8.18|2867397|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGACCACTACCCAGCGAGAGTTTTTTGGAACAGCCA >8.19|2867464|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGCTCTACATAGGCAGTGATAACAAGCAATATTT >8.20|2867531|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGTATCGGGGCTGCGGCGCAAGGCTGCAGCGTTC >8.21|2867597|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTGTATGTCATGCTGTCTTCCCTTCTTCCTTAGA >8.22|2867663|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGCATGATTGGCAGTGGATAGCAGAGCTTGACGA >8.23|2867728|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGCTTTTGCCAAATCACGATAAGTAAGTTGTCTTG >8.24|2867795|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACTCTCAGCCTCTTTACACAAGTTATATAGCCTT >8.25|2867861|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATATAAATACCCCCCTATCTTATTTCTTATCTTG >8.26|2867927|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTATTTTTTTCTTATTACAAACGGAATAAGCGTT >8.27|2867993|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAGAGTTTAAGACTTGCAAATTCGAGGAGTGGTA >8.28|2868059|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAGAGTTTAAGACTTGCAAATTCGAGGAGTGGTA >8.29|2868125|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAGGGAAGAGTGATGGTTTATCAAATCAAAATTGA >8.30|2868192|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAACGCATCGTCGCTATTCAGTTTGTCCTCTCTT >8.31|2868258|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGCTTCTTTTTCAACTTTTATGTTGCTTTTACTTA >8.32|2868325|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGACTTTTTAAAACTGTTAATTATTTTTTACCTATT >8.33|2868391|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTGATAGCAAGGAATATACGATTTAAAAGAGGTG >8.34|2868457|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTGTTCTGGGTCATATAATCCATATTTTGCAGC >8.35|2868522|34|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCTTTCGTTTTCTCGCTCACAGTATTCAATTG |
csx20,csx1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012034_8
The CRISPR arrays of NC_012034_8 >merge|NC_012034|8|2866258-2868585|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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CTCTTCCTGAAAGCCCAGTTAGCTTGCTCAAGATTTG ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CTCTAAATTGTCCACGCAAAACATCTATTTCCTCGC ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAATTTATATAAAAATATTTTCTGCACATTTTT ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCGACCACTACCCAGCGAGAGTTTTTTGGAACAGCCA ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TAAAGCTCTACATAGGCAGTGATAACAAGCAATATTT ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ACAGTATCGGGGCTGCGGCGCAAGGCTGCAGCGTTC ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTTGTATGTCATGCTGTCTTCCCTTCTTCCTTAGA ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CCGCATGATTGGCAGTGGATAGCAGAGCTTGACGA ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ACAGCTTTTGCCAAATCACGATAAGTAAGTTGTCTTG ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAACTCTCAGCCTCTTTACACAAGTTATATAGCCTT ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCATATAAATACCCCCCTATCTTATTTCTTATCTTG ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAGTATTTTTTTCTTATTACAAACGGAATAAGCGTT ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAGAGAGTTTAAGACTTGCAAATTCGAGGAGTGGTA ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAGAGAGTTTAAGACTTGCAAATTCGAGGAGTGGTA ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TGGAGGGAAGAGTGATGGTTTATCAAATCAAAATTGA 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>NC_012034.1|WP_015909013.1|2864443_2864695_-|hypothetical-protein MEKKVEMMFKKFLEEQKRMIGSDVDISQIEMGSVTKLCPFCLSESLYNYQYDAYYCERCNIWLEPKCEDDSCEFCKNRPLRPL >NC_012034.1|WP_041727263.1|2863970_2864369_-|hypothetical-protein MRKLFLIFNHVLTEEQEKEAKEVLKITQIISLPQHLQDLWSNIPPDKELSSDLFSPITSYLLVNRGEEENYCLIQGDFGATVYLVSWCFKHGFIPIYATTKRVAQEIVKPDGSVELIKVFKHERFRRYILCS >NC_012034.1|WP_015909011.1|2862488_2863925_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MKIIYQIGRLDNPKTAKRKFFITNKSQNGDEMIPKESELSSFVLKDFLEQQGHKVKTVVIYPVSILLNEKIKEYIEDDDLKEKLKSICENPLEYLKSPFDIINKLPLESLRDDTLVIHSLGTYLNNVELDGSYDDIVLEILFDMIERYIDDKKEENIDEIYLDISSGHNIYISAMIEASRHFAVLTKLMHWIHEERQPRIYLTFSDPITGRTAENYELHIQPQSYTAFFSSPISKKEACDHNFSFLRNIYQEPQDDKNGNNKVLQKKQIREKRKALKEKIEMFTILFSAIKNNVPLYLYYHPYHSIDEIKNELKNLINHAKDQLSKDFKSSPRLNKKAYLDAILSLCFYMGIVEVLEEYNITMFCQQTGFDLEKLGQTFAQIYTIFGIPMNWTMLGNEISNDTEKIQEHGEIEQWTRLRKIVDPGKPIYDEPDKRNFFAHSGLEGNITEVRYNGEKVYVRYIQVLPQSTIDCWLKERV >NC_012034.1|WP_041727261.1|2861209_2861938_-|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MIPLKDTIPSREKPFMTWFIIIVNVLIFLFQVSIPPEAAQEFVYRYGFIPEKFSRALSDGLITGIIYSIWPIICSMFMHGSWMHLISNMWSLWLFGDNVEDRVGHFRFLIFYLLSGFSAAYTHWFFNAHSLVAVVGASGAIAGVMGAYFLMFPLSNIVTLIPIGFIPLFVNIPAVFYLGLWFLSQVSSGILELFGPVFGSGIAWWAHIGGFVFGALTVNFFKKRYRRYNNFFDDEIFYYRYY >NC_012034.1|WP_015909009.1|2860373_2861183_-|hypothetical-protein MSFWDLLIFFIIASSLQPALKQRMLESARQKLIAKIEKKRGSRVILLVHRQETMSFLGFPIYKYIDINDSEEVIRAINMTDPSIPLDIILHTPGGLVLAATQIARAIKRHKGKVTVHVPHYAMSGCTLIALAADEIVMSEDAILGPVDPQIGEFPAVSILEVVKQKAVNEIDDKTLILADIAKKAIRQTKEIVLELLSDNYSEDVAQKIANELVEGKYTHDFPITYEKARELGLKVNCCIDKEIKQLMCLYPQPVAKKSSVDYLWIPRK >NC_012034.1|WP_015909008.1|2859730_2860276_+|hypothetical-protein MQQKSLLEKLSSIRFRQYVLQEEGLNSWWDFRMPIEDDYTTLFELIKSIKSARLVFKALMACKRYFRIIPSKKGLCLVYRFSILSTAKNPELPVDINQPTEIIEYNGIKWFVEEFGSLIVIGEVNINKVKRIVEKLEENWKKRYPKIREKEIKKYIDIIKNENIEEMRRIWDAFVDVVNGD >NC_012034.1|WP_157678180.1|2859204_2859366_+|hypothetical-protein MILYILKKPLIIPKINLNIKYKIPSEMSISGRRIGARIIKIMTANTIPYFATS >NC_012034.1|WP_015909007.1|2858348_2859191_-|hypothetical-protein MSYFYIDEDGVVKLHESYYEQTLIDYVGESLRTFASLRELLKDEIGNFKRPKEYLQAKKCPGWVGLCPNNKEEKDSSCNPDQCWNTKIKTIKDKIDKKDHFKYDNILIKVLSPSICSECGSSEMKIEWGKRVNVKVAGYTLNFENVAYMVCKKCGIFYMSTVDKKAIEVIKEKIRDYNPYEEAIEQAGIDNEAGLDADCSVSEFEIPPVKTIILDKDKIGLEMLIEDLKKGCISLTMALFPISSPVSSVDVTTFNICHYADPEDMYPEGLEDEGEDIIEE >NC_012034.1|WP_013404392.1|2857719_2857956_+|hypothetical-protein MVYEVTYNNSRLVFEGKEINYFKILEALDKLRDLRDYIELFYTEYSGLPLTSLPYDVLLDIFTNYLDFIGVQIKVIGR >NC_012034.1|WP_015909006.1|2855866_2856148_-|hypothetical-protein MAERMPQITQLFGFPTYDDIEEENLKQLYETCRMIKANYKIIVSILEDSSITKEKLRCLQSYSMSFEILKTVYKREFSVWTNSKEKMGSLDDL >NC_012034.1|WP_015909014.1|2868846_2869146_+|STAS-like-domain-containing-protein MIKLNEYGNIICSRENGEVVREKILKEIKNGNIVVINFEGVEMINHSFADEAFGKLLYDLSEDVLRNQIKFVNANDDIKGMIKMALMERHKLILLEMQN >NC_012034.1|WP_099716426.1|2869338_2871690_+|hypothetical-protein MKVKFSRKMIIALIIVVAFILVTIFGAVFYDRIPKRDIKQNINMGTTDNNLKSEKSTITTDKLFNWMNIFKAYADNTNSDSDGNIDNEIVNDAPYLVPVWQPGEINPVIYQKNGKLYRLNDVSPETLAKYCRILYELEVKDVKEKYVVEGNDRVGWGLLYKRIGQPFYKASWDSGEDYYPQVSFMERMVASWYNYYYNWFSAITPIKLNRNTLNTTYMYDNQYISKNRREFYMNCDLVLELEPDLNGAKDRFPDYLQLSEIGSHSGSNVKAELINWEYFDMIRAYTYLSVRFLKDFDTKVYNKLASIIKKYKMSLGKDAFVSVKMSSKPLKYGKYYSGQRFTISLKFMYIKPTLDIKPVKTKVPKIGKNQLAYVIQLDPYTISFEKVYNITELYSEQDLRPLLTELGKIYKAIGSGKISAKGYFEFLKKAKLTSGKSNEYFKNASKLGDTYLNLGKSKQPLYVVTTSTSTFRAACLNYKRKYIVDIFYDILSKMDYLDDFKSAWNLGAKYASAVYNTPDQKTLDPVNLFDFETSQDLYPVFVAGKVPIGKVGFTGYNLEDRVGKPIGKDCFYAPEYYTLIEAMNKKIANKSILSKYYNIEYFAIPISVEANSTKDYKNLVPAAMPHLYNVMVISSRYPELDNNGKPFKYRSQKNGVIGETLPIIFRFFPEFVNKDKTTYPYFAVESIIFEGVKFNNKPTIPLSDGKIAKDWAEIPLRWWWSNLAVKSDIEQGKDLETIGIHFGPSYNYTKNDIEIAKKYAITQDVILKKAKYFGSILGSAFEK >NC_012034.1|WP_015909016.1|2871787_2872573_+|hypothetical-protein MSQILGINFREKIKVIVRFVVLVIMMITIFSLFKPYAVKAEENNNRVSFIYEPLINIEDKLYKIKHGLYSLNIMGLVDLLERKGYTSDLIQPVISNESNSNNFIYLIAEKFFTKGIPFLNILQPSGNFFIQSKLNETKVYSGLDLTREQINTGLKDVAVKLKDATAIKFPFLELAKNDVKLPDGIVPDATVSIERILKEIIEGRGNIENNFVYKLNLNSYVFDWPWFKVIDSDGRLVNATTARDHEKMLYYAQEAFNPNSR >NC_012034.1|WP_015909018.1|2873291_2875178_+|hypothetical-protein MSLRMPYLISDGMVLQRNKQINIWGWAEPCKMVTVNFLGKSYTAVADHLGKWKVTLPPMDAGGPYFMEIKCQHHAVTIKDILIGDVWVCSGQSNMVLPMERVIDLYPEELDDCNIPLIRQFTVPEKYNFKGPQEELEGGTWDVLSKETLLKFSAVGYFFAKALYKKYNIPIGLIKSCVGGTPIEAWMSSDIVYKFLENPDELEKLKDDSYIEAVSKEEEAKIKAWFDYLNANDTGLNSNPPFFDENCSTSDWKAITIPATWKEMGLDSTIGVVWFKKEINIPSCMVGNPARLYLGTIVDSDFTYVNGKLVGSTSYRYPPRKYNIPAGLLKEGKNTIVVRVISNDGNGEFVKGKEYKLFTEDCKIDLKGQWLCKVGVRSPEPLPQQTFWQYKPTGLFNGMIAPLLNYSIKGIIWYQGESNTDRPEDYCNKLCNLVDDWRKKWGDSSLPFLYVQLANFMEPKPQPCESNWARLREEQRRALLHLDNVGMAVAIDLGEWNDLHPSNKKDVGERLALLAQKVAYGEKDLVASGPLYKSMKIEGNKIILEFSEVGSGLIAKGDSILKHFAIAEKDKRFIWANAIIEGNKVIVWNDSIKNPVYVRYAWADNPEGANLYNKEGLPASPFTTEDEI >NC_012034.1|WP_015909019.1|2875205_2876003_+|polysaccharide-deacetylase-family-protein MKVSYLFPNGRSKALTVSYDDGQVYDRKLVSIFNEYGIKGTFFLNSETLGKDIFIQPDEVVTLYKGHEVGIHAKTHPFLDSIPLEGIIEEIIEDRKFLEGMVGYPVKGMSYPYGVYNEDVIKILPSLGIEYSRTVNSTYNFNMPENFIVWNPTCHHKQNLLEITKRFLEIENKNQLQLLYVWGHSFEFERENNWDLIEEFCKMISKASSVWFATNIEIVRYVKALKMLEFSVERDVVYNPSAISVWLLVNGNVVEVSGGQIVTLK >NC_012034.1|WP_015909020.1|2876036_2877263_+|beta-1,4-xylanase MDRYNHRKSQMLLKITTADGKPLKNAEITVRQIKHKFLFGCAEFSVVPFVNGEFSGDFKEKAEMAFEKFVDLFNFATLPFYWGRFEPVRGKPDTQRLKNAAKFLKNAGFVLKGHPLCWHTVTADWLLELTNNQILEAQLMRIKREVSDFAGLIDMWDVINEVVIMPNFNKYDNGITRICKQFGRMGLVKMVFDAAREANPKAILLINDYIVSDAYEILIEALLDKGVKIDAIGIQSHMHQGFWGVEKTQEVLERFSRFGLPLHFTEVTLISGKLMPPYIKDLNDYKPESWPSTVECEERQAMEATLFYKMLFAHPLVEAITWWNFIDTFAWLGAPAGFITKDGRVKPIYNALYNLIKKEWWTGTQNLVTDQDGFVKVSGFMGEYEVSFKDKKSKFTLDRTHEVAQIIL >NC_012034.1|WP_015909021.1|2877418_2877973_+|biotin-transporter-BioY MENAKTTYTTKMLVLSALFTAIVAVCAQISIPIGPVPFTLQVLAIFLASLILPPKYAFLSLLVYDLLGAVGVPVFAGFSGGLSKFVGPTGGYLIAFPIAAFVTSYINTKKPLKNEIANSILALILGLAIIYIIGFLYLSWAAHMTLKKAFAAGVLPFIIPDIIKLAIAYLIARAIKSRKALNIA >NC_012034.1|WP_015909022.1|2877902_2880128_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MQQNIQGMVSDIIYKNMENNYTVFEIICDDEVFTAVGIVPDIAIGEKVSVYGEFYVHPVYGQQLKVSYLEKLLPQTKDEIYLYLSSGVIKGIGQKTAKKIVDTFGDDTARILQQEPEKLLSIRGMTPEKVERIRNMFAFQKFLKDIMSIFSQYGLSQNHAMRLFKLYGFSALSLLQENPYFLLDVFPELDFKKVDRLALDMGVMPDDKRRISAKILNLLTLAANNEGHTCLPENRLKQLCIRTLDLPVEKIEEAIEALAQERRIVKDEVDSQEMVFLYGYYECERYIADKILSMLKEYDDIADIDEKISQFEEKNGIAFSPNQKKAIKMALTQGVSIITGGPGTGKTTIIKCIIQIFEGEGKKVFLCAPTGRAAKRMQAACERESKTIHRLLEITVLDTHVIFQKGPNNPLKCDVIVVDEMSMVDSFLMNYLLAATKPTTRIVLVGDKDQLPSVGAGNVLKDFIKSQIVPCTTLTEVYRQSENSFIVLNAHRINRGEFPHLQKESDFYFIQKNSQEEILKTVIELVTKKLPNYLSCDPMTDIQVLCPSKKGIVGMYNLNRVLQQYLNPPHPSKKEYAYKENLFRVGDKVMQVKNNYSLEYEIVQGEEKGRASTGIFNGDIGVVKDIDRAQGALEILFDDEKLVYYDFSLLDDLELAYAMTVHKSQGSEFRCIVMPVVETYPILMTRNLLYTAVTRAKELVVLVGKKSALEYMIANQKEAMRYSALCDFLLRGQSNMQLQAL >NC_012034.1|WP_015909023.1|2880177_2880690_-|hypothetical-protein MNSIPKDIIYFVPHYTENGDSVLILFLSGEKKIVPMSIRSFSKKLYSLYAIDCQAIKKLIAQRIGQKNLLPIVLPDATFIPVKTRKAVVKTDPIFGYVNMSQIFRIDDKDDHFEMLLRCGAVLSCLGSAKYFKKRITLASVITDYLQGIWSQGALKIKEECELENVFGLE >NC_012034.1|WP_013404408.1|2880774_2880924_-|YvrJ-family-protein MQDIIANIANIGFPIVLCIYLLTRFESKIDKLSDSIDKLSEKILQMKNN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012034_9 | 2872661-2873020 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_012034_9
|
5 spacers
spacers of NC_012034_9
>9.1|2872692|35|NC_012034|CRISPRCasFinder ATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTC >9.2|2872758|35|NC_012034|CRISPRCasFinder ATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTC >9.3|2872824|34|NC_012034|CRISPRCasFinder TTTGCAACCTCTCTTGTCAAAAATACCTGACCGA >9.4|2872889|35|NC_012034|CRISPRCasFinder TCCCTCTGAACAAAAACATCAATATAAAAACCATC >9.5|2872955|35|NC_012034|CRISPRCasFinder AGCAGTTGCTAAAAATAGCAAATAAGCGCAATGAA >9.6|2872692|36|NC_012034|CRT ATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTCA >9.7|2872758|36|NC_012034|CRT ATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTCA >9.8|2872824|35|NC_012034|CRT TTTGCAACCTCTCTTGTCAAAAATACCTGACCGAG >9.9|2872889|36|NC_012034|CRT TCCCTCTGAACAAAAACATCAATATAAAAACCATCG >9.10|2872955|36|NC_012034|CRT AGCAGTTGCTAAAAATAGCAAATAAGCGCAATGAAA |
csx20,csx1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012034_9
The CRISPR arrays of NC_012034_9 >merge|NC_012034|9|2872661-2873020|CRISPRCasFinder,CRT AGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTCAATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTCAATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTTGCAACCTCTCTTGTCAAAAATACCTGACCGAGATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCCCTCTGAACAAAAACATCAATATAAAAACCATCGATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAGCAGTTGCTAAAAATAGCAAATAAGCGCAATGAAAATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGAA >NC_012034|9|9|2872661-2873020|CRISPRCasFinder AGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTC AATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTC AATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTGCAACCTCTCTTGTCAAAAATACCTGACCGA GATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCCCTCTGAACAAAAACATCAATATAAAAACCATC GATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AGCAGTTGCTAAAAATAGCAAATAAGCGCAATGAA AATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGAA >NC_012034|9|7|2872662-2873020|CRT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTCA ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ATTTCTTTACCGTCTTCAGAAGTGTAAACTACCTCA ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTGCAACCTCTCTTGTCAAAAATACCTGACCGAG ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCCCTCTGAACAAAAACATCAATATAAAAACCATCG ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AGCAGTTGCTAAAAATAGCAAATAAGCGCAATGAAA ATTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGAA
>NC_012034.1|WP_015909016.1|2871787_2872573_+|hypothetical-protein MSQILGINFREKIKVIVRFVVLVIMMITIFSLFKPYAVKAEENNNRVSFIYEPLINIEDKLYKIKHGLYSLNIMGLVDLLERKGYTSDLIQPVISNESNSNNFIYLIAEKFFTKGIPFLNILQPSGNFFIQSKLNETKVYSGLDLTREQINTGLKDVAVKLKDATAIKFPFLELAKNDVKLPDGIVPDATVSIERILKEIIEGRGNIENNFVYKLNLNSYVFDWPWFKVIDSDGRLVNATTARDHEKMLYYAQEAFNPNSR >NC_012034.1|WP_099716426.1|2869338_2871690_+|hypothetical-protein MKVKFSRKMIIALIIVVAFILVTIFGAVFYDRIPKRDIKQNINMGTTDNNLKSEKSTITTDKLFNWMNIFKAYADNTNSDSDGNIDNEIVNDAPYLVPVWQPGEINPVIYQKNGKLYRLNDVSPETLAKYCRILYELEVKDVKEKYVVEGNDRVGWGLLYKRIGQPFYKASWDSGEDYYPQVSFMERMVASWYNYYYNWFSAITPIKLNRNTLNTTYMYDNQYISKNRREFYMNCDLVLELEPDLNGAKDRFPDYLQLSEIGSHSGSNVKAELINWEYFDMIRAYTYLSVRFLKDFDTKVYNKLASIIKKYKMSLGKDAFVSVKMSSKPLKYGKYYSGQRFTISLKFMYIKPTLDIKPVKTKVPKIGKNQLAYVIQLDPYTISFEKVYNITELYSEQDLRPLLTELGKIYKAIGSGKISAKGYFEFLKKAKLTSGKSNEYFKNASKLGDTYLNLGKSKQPLYVVTTSTSTFRAACLNYKRKYIVDIFYDILSKMDYLDDFKSAWNLGAKYASAVYNTPDQKTLDPVNLFDFETSQDLYPVFVAGKVPIGKVGFTGYNLEDRVGKPIGKDCFYAPEYYTLIEAMNKKIANKSILSKYYNIEYFAIPISVEANSTKDYKNLVPAAMPHLYNVMVISSRYPELDNNGKPFKYRSQKNGVIGETLPIIFRFFPEFVNKDKTTYPYFAVESIIFEGVKFNNKPTIPLSDGKIAKDWAEIPLRWWWSNLAVKSDIEQGKDLETIGIHFGPSYNYTKNDIEIAKKYAITQDVILKKAKYFGSILGSAFEK >NC_012034.1|WP_015909014.1|2868846_2869146_+|STAS-like-domain-containing-protein MIKLNEYGNIICSRENGEVVREKILKEIKNGNIVVINFEGVEMINHSFADEAFGKLLYDLSEDVLRNQIKFVNANDDIKGMIKMALMERHKLILLEMQN >NC_012034.1|WP_015909013.1|2864443_2864695_-|hypothetical-protein MEKKVEMMFKKFLEEQKRMIGSDVDISQIEMGSVTKLCPFCLSESLYNYQYDAYYCERCNIWLEPKCEDDSCEFCKNRPLRPL >NC_012034.1|WP_041727263.1|2863970_2864369_-|hypothetical-protein MRKLFLIFNHVLTEEQEKEAKEVLKITQIISLPQHLQDLWSNIPPDKELSSDLFSPITSYLLVNRGEEENYCLIQGDFGATVYLVSWCFKHGFIPIYATTKRVAQEIVKPDGSVELIKVFKHERFRRYILCS >NC_012034.1|WP_015909011.1|2862488_2863925_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MKIIYQIGRLDNPKTAKRKFFITNKSQNGDEMIPKESELSSFVLKDFLEQQGHKVKTVVIYPVSILLNEKIKEYIEDDDLKEKLKSICENPLEYLKSPFDIINKLPLESLRDDTLVIHSLGTYLNNVELDGSYDDIVLEILFDMIERYIDDKKEENIDEIYLDISSGHNIYISAMIEASRHFAVLTKLMHWIHEERQPRIYLTFSDPITGRTAENYELHIQPQSYTAFFSSPISKKEACDHNFSFLRNIYQEPQDDKNGNNKVLQKKQIREKRKALKEKIEMFTILFSAIKNNVPLYLYYHPYHSIDEIKNELKNLINHAKDQLSKDFKSSPRLNKKAYLDAILSLCFYMGIVEVLEEYNITMFCQQTGFDLEKLGQTFAQIYTIFGIPMNWTMLGNEISNDTEKIQEHGEIEQWTRLRKIVDPGKPIYDEPDKRNFFAHSGLEGNITEVRYNGEKVYVRYIQVLPQSTIDCWLKERV >NC_012034.1|WP_041727261.1|2861209_2861938_-|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MIPLKDTIPSREKPFMTWFIIIVNVLIFLFQVSIPPEAAQEFVYRYGFIPEKFSRALSDGLITGIIYSIWPIICSMFMHGSWMHLISNMWSLWLFGDNVEDRVGHFRFLIFYLLSGFSAAYTHWFFNAHSLVAVVGASGAIAGVMGAYFLMFPLSNIVTLIPIGFIPLFVNIPAVFYLGLWFLSQVSSGILELFGPVFGSGIAWWAHIGGFVFGALTVNFFKKRYRRYNNFFDDEIFYYRYY >NC_012034.1|WP_015909009.1|2860373_2861183_-|hypothetical-protein MSFWDLLIFFIIASSLQPALKQRMLESARQKLIAKIEKKRGSRVILLVHRQETMSFLGFPIYKYIDINDSEEVIRAINMTDPSIPLDIILHTPGGLVLAATQIARAIKRHKGKVTVHVPHYAMSGCTLIALAADEIVMSEDAILGPVDPQIGEFPAVSILEVVKQKAVNEIDDKTLILADIAKKAIRQTKEIVLELLSDNYSEDVAQKIANELVEGKYTHDFPITYEKARELGLKVNCCIDKEIKQLMCLYPQPVAKKSSVDYLWIPRK >NC_012034.1|WP_015909008.1|2859730_2860276_+|hypothetical-protein MQQKSLLEKLSSIRFRQYVLQEEGLNSWWDFRMPIEDDYTTLFELIKSIKSARLVFKALMACKRYFRIIPSKKGLCLVYRFSILSTAKNPELPVDINQPTEIIEYNGIKWFVEEFGSLIVIGEVNINKVKRIVEKLEENWKKRYPKIREKEIKKYIDIIKNENIEEMRRIWDAFVDVVNGD >NC_012034.1|WP_157678180.1|2859204_2859366_+|hypothetical-protein MILYILKKPLIIPKINLNIKYKIPSEMSISGRRIGARIIKIMTANTIPYFATS >NC_012034.1|WP_015909018.1|2873291_2875178_+|hypothetical-protein MSLRMPYLISDGMVLQRNKQINIWGWAEPCKMVTVNFLGKSYTAVADHLGKWKVTLPPMDAGGPYFMEIKCQHHAVTIKDILIGDVWVCSGQSNMVLPMERVIDLYPEELDDCNIPLIRQFTVPEKYNFKGPQEELEGGTWDVLSKETLLKFSAVGYFFAKALYKKYNIPIGLIKSCVGGTPIEAWMSSDIVYKFLENPDELEKLKDDSYIEAVSKEEEAKIKAWFDYLNANDTGLNSNPPFFDENCSTSDWKAITIPATWKEMGLDSTIGVVWFKKEINIPSCMVGNPARLYLGTIVDSDFTYVNGKLVGSTSYRYPPRKYNIPAGLLKEGKNTIVVRVISNDGNGEFVKGKEYKLFTEDCKIDLKGQWLCKVGVRSPEPLPQQTFWQYKPTGLFNGMIAPLLNYSIKGIIWYQGESNTDRPEDYCNKLCNLVDDWRKKWGDSSLPFLYVQLANFMEPKPQPCESNWARLREEQRRALLHLDNVGMAVAIDLGEWNDLHPSNKKDVGERLALLAQKVAYGEKDLVASGPLYKSMKIEGNKIILEFSEVGSGLIAKGDSILKHFAIAEKDKRFIWANAIIEGNKVIVWNDSIKNPVYVRYAWADNPEGANLYNKEGLPASPFTTEDEI >NC_012034.1|WP_015909019.1|2875205_2876003_+|polysaccharide-deacetylase-family-protein MKVSYLFPNGRSKALTVSYDDGQVYDRKLVSIFNEYGIKGTFFLNSETLGKDIFIQPDEVVTLYKGHEVGIHAKTHPFLDSIPLEGIIEEIIEDRKFLEGMVGYPVKGMSYPYGVYNEDVIKILPSLGIEYSRTVNSTYNFNMPENFIVWNPTCHHKQNLLEITKRFLEIENKNQLQLLYVWGHSFEFERENNWDLIEEFCKMISKASSVWFATNIEIVRYVKALKMLEFSVERDVVYNPSAISVWLLVNGNVVEVSGGQIVTLK >NC_012034.1|WP_015909020.1|2876036_2877263_+|beta-1,4-xylanase MDRYNHRKSQMLLKITTADGKPLKNAEITVRQIKHKFLFGCAEFSVVPFVNGEFSGDFKEKAEMAFEKFVDLFNFATLPFYWGRFEPVRGKPDTQRLKNAAKFLKNAGFVLKGHPLCWHTVTADWLLELTNNQILEAQLMRIKREVSDFAGLIDMWDVINEVVIMPNFNKYDNGITRICKQFGRMGLVKMVFDAAREANPKAILLINDYIVSDAYEILIEALLDKGVKIDAIGIQSHMHQGFWGVEKTQEVLERFSRFGLPLHFTEVTLISGKLMPPYIKDLNDYKPESWPSTVECEERQAMEATLFYKMLFAHPLVEAITWWNFIDTFAWLGAPAGFITKDGRVKPIYNALYNLIKKEWWTGTQNLVTDQDGFVKVSGFMGEYEVSFKDKKSKFTLDRTHEVAQIIL >NC_012034.1|WP_015909021.1|2877418_2877973_+|biotin-transporter-BioY MENAKTTYTTKMLVLSALFTAIVAVCAQISIPIGPVPFTLQVLAIFLASLILPPKYAFLSLLVYDLLGAVGVPVFAGFSGGLSKFVGPTGGYLIAFPIAAFVTSYINTKKPLKNEIANSILALILGLAIIYIIGFLYLSWAAHMTLKKAFAAGVLPFIIPDIIKLAIAYLIARAIKSRKALNIA >NC_012034.1|WP_015909022.1|2877902_2880128_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MQQNIQGMVSDIIYKNMENNYTVFEIICDDEVFTAVGIVPDIAIGEKVSVYGEFYVHPVYGQQLKVSYLEKLLPQTKDEIYLYLSSGVIKGIGQKTAKKIVDTFGDDTARILQQEPEKLLSIRGMTPEKVERIRNMFAFQKFLKDIMSIFSQYGLSQNHAMRLFKLYGFSALSLLQENPYFLLDVFPELDFKKVDRLALDMGVMPDDKRRISAKILNLLTLAANNEGHTCLPENRLKQLCIRTLDLPVEKIEEAIEALAQERRIVKDEVDSQEMVFLYGYYECERYIADKILSMLKEYDDIADIDEKISQFEEKNGIAFSPNQKKAIKMALTQGVSIITGGPGTGKTTIIKCIIQIFEGEGKKVFLCAPTGRAAKRMQAACERESKTIHRLLEITVLDTHVIFQKGPNNPLKCDVIVVDEMSMVDSFLMNYLLAATKPTTRIVLVGDKDQLPSVGAGNVLKDFIKSQIVPCTTLTEVYRQSENSFIVLNAHRINRGEFPHLQKESDFYFIQKNSQEEILKTVIELVTKKLPNYLSCDPMTDIQVLCPSKKGIVGMYNLNRVLQQYLNPPHPSKKEYAYKENLFRVGDKVMQVKNNYSLEYEIVQGEEKGRASTGIFNGDIGVVKDIDRAQGALEILFDDEKLVYYDFSLLDDLELAYAMTVHKSQGSEFRCIVMPVVETYPILMTRNLLYTAVTRAKELVVLVGKKSALEYMIANQKEAMRYSALCDFLLRGQSNMQLQAL >NC_012034.1|WP_015909023.1|2880177_2880690_-|hypothetical-protein MNSIPKDIIYFVPHYTENGDSVLILFLSGEKKIVPMSIRSFSKKLYSLYAIDCQAIKKLIAQRIGQKNLLPIVLPDATFIPVKTRKAVVKTDPIFGYVNMSQIFRIDDKDDHFEMLLRCGAVLSCLGSAKYFKKRITLASVITDYLQGIWSQGALKIKEECELENVFGLE >NC_012034.1|WP_013404408.1|2880774_2880924_-|YvrJ-family-protein MQDIIANIANIGFPIVLCIYLLTRFESKIDKLSDSIDKLSEKILQMKNN >NC_012034.1|WP_013431413.1|2881034_2881247_-|DUF2922-domain-containing-protein MLTLVLTFKLQNGKNFRLSIPDPKPSLTAAEVDSVMNLIVQKNIFVTSSPIVEKVSARIVDREVNTLIGQ >NC_012034.1|WP_013404410.1|2881303_2881516_-|DUF1659-domain-containing-protein MAAKPLVGSLQLKLENGTTSTGKIRLKTLSFDIKPEAQDMDVYQVGQAIASLQSKPLYTIIRSNNFELLY >NC_012034.1|WP_015909024.1|2881724_2882183_+|stage-V-sporulation-protein-AC MNIKDKKASEYQVLVKVNEPKTNSFKNCILAFLVGGAICDVGQAFLNLYSNFFPKDEAQVLTSITMIFLGSFLTGLGVYDKIGAFAGAGSIVPITGFANSIVSPAIEYKKEGFVFGVGSKMFLIAGPVLVYGISTSILVGLLYYLVKVFPGI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_012034_3 | 3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR | 2789073-2789095 | 23 | MT774397 | CrAssphage cr56_1, complete genome | 88207-88229 | 1 | 0.957 |
NC_012034_3 | 3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR | 2789073-2789095 | 23 | MT774403 | CrAssphage cr113_1, complete genome | 91496-91518 | 1 | 0.957 |
NC_012034_3 | 3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR | 2789073-2789095 | 23 | MN855593 | Siphoviridae sp. isolate 195, complete genome | 3197-3219 | 2 | 0.913 |
NC_012034_3 | 3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR | 2789073-2789095 | 23 | NC_019737 | Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.07, complete sequence | 21813-21835 | 3 | 0.87 |
NC_012034_1 | 1.84|157121|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 157121-157156 | 36 | NZ_LR214939 | Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2 | 467690-467725 | 7 | 0.806 |
NC_012034_1 | 1.106|158558|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 158558-158594 | 37 | MN693462 | Marine virus AFVG_25M534, complete genome | 831-867 | 7 | 0.811 |
NC_012034_3 | 3.1|2789002|28|NC_012034|PILER-CR | 2789002-2789029 | 28 | NZ_CP033461 | Brevibacillus laterosporus strain 1821L plasmid p1821L01, complete sequence | 25612-25639 | 7 | 0.75 |
NC_012034_3 | 3.4|2789060|36|NC_012034|CRISPRCasFinder | 2789060-2789095 | 36 | MT774397 | CrAssphage cr56_1, complete genome | 88202-88237 | 7 | 0.806 |
NC_012034_4 | 4.15|2804881|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2804881-2804916 | 36 | NC_017235 | Borreliella afzelii PKo plasmid lp28-7, complete sequence | 5947-5982 | 7 | 0.806 |
NC_012034_5 | 5.1|2828455|38|NC_012034|PILER-CR | 2828455-2828492 | 38 | MN013189 | Microcystis phage Mic1, complete genome | 87325-87362 | 7 | 0.816 |
NC_012034_5 | 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR | 2829309-2829342 | 34 | MN693735 | Marine virus AFVG_250M590, complete genome | 32144-32177 | 7 | 0.794 |
NC_012034_5 | 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2829310-2829342 | 33 | MN693735 | Marine virus AFVG_250M590, complete genome | 32144-32176 | 7 | 0.788 |
NC_012034_8 | 8.22|2867663|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2867663-2867697 | 35 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 598046-598080 | 7 | 0.8 |
NC_012034_3 | 3.4|2789060|36|NC_012034|CRISPRCasFinder | 2789060-2789095 | 36 | MT774399 | CrAssphage cr109_1, complete genome | 14383-14418 | 8 | 0.778 |
NC_012034_3 | 3.4|2789060|36|NC_012034|CRISPRCasFinder | 2789060-2789095 | 36 | MT774403 | CrAssphage cr113_1, complete genome | 91491-91526 | 8 | 0.778 |
NC_012034_5 | 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR | 2829309-2829342 | 34 | NZ_AP014824 | Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence | 28607-28640 | 8 | 0.765 |
NC_012034_5 | 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR | 2829309-2829342 | 34 | NZ_AP019836 | Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p1, complete sequence | 2425-2458 | 8 | 0.765 |
NC_012034_5 | 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR | 2829309-2829342 | 34 | NZ_AP019837 | Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p2, complete sequence | 7729-7762 | 8 | 0.765 |
NC_012034_5 | 5.44|2828785|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2828785-2828819 | 35 | CP024686 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-2-313K, complete sequence | 6485-6519 | 8 | 0.771 |
NC_012034_5 | 5.47|2828981|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2828981-2829015 | 35 | NZ_CP014325 | Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence | 8988-9022 | 8 | 0.771 |
NC_012034_5 | 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2829310-2829342 | 33 | NZ_AP014824 | Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence | 28608-28640 | 8 | 0.758 |
NC_012034_5 | 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2829310-2829342 | 33 | NZ_AP019836 | Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p1, complete sequence | 2426-2458 | 8 | 0.758 |
NC_012034_5 | 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2829310-2829342 | 33 | NZ_AP019837 | Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p2, complete sequence | 7729-7761 | 8 | 0.758 |
NC_012034_5 | 5.55|2829506|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2829506-2829541 | 36 | NZ_AP019839 | Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p4, complete sequence | 2350-2385 | 8 | 0.778 |
NC_012034_5 | 5.68|2830367|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2830367-2830402 | 36 | NZ_AP019839 | Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p4, complete sequence | 2350-2385 | 8 | 0.778 |
NC_012034_1 | 1.66|155943|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 155943-155978 | 36 | NZ_CP054046 | Yersinia massiliensis strain 2011N-4075 plasmid unnamed1, complete sequence | 75744-75779 | 9 | 0.75 |
NC_012034_1 | 1.84|157121|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 157121-157156 | 36 | MN694383 | Marine virus AFVG_250M176, complete genome | 9874-9909 | 9 | 0.75 |
NC_012034_4 | 4.15|2804881|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2804881-2804916 | 36 | MN693020 | Marine virus AFVG_117M64, complete genome | 4623-4658 | 9 | 0.75 |
NC_012034_5 | 5.6|2828784|36|NC_012034|PILER-CR | 2828784-2828819 | 36 | CP024686 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-2-313K, complete sequence | 6485-6520 | 9 | 0.75 |
NC_012034_5 | 5.17|2829505|37|NC_012034|PILER-CR | 2829505-2829541 | 37 | NZ_AP019839 | Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p4, complete sequence | 2350-2386 | 9 | 0.757 |
NC_012034_5 | 5.30|2830366|37|NC_012034|PILER-CR | 2830366-2830402 | 37 | NZ_AP019839 | Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p4, complete sequence | 2350-2386 | 9 | 0.757 |
NC_012034_5 | 5.39|2828456|37|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2828456-2828492 | 37 | MN013189 | Microcystis phage Mic1, complete genome | 87326-87362 | 9 | 0.757 |
NC_012034_5 | 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2829310-2829342 | 33 | MN694482 | Marine virus AFVG_250M11, complete genome | 99-131 | 9 | 0.727 |
NC_012034_5 | 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2829310-2829342 | 33 | MN694482 | Marine virus AFVG_250M11, complete genome | 39110-39142 | 9 | 0.727 |
NC_012034_1 | 1.103|158362|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 158362-158398 | 37 | NZ_CP051683 | Mucilaginibacter sp. F39-2 plasmid unnamed1, complete sequence | 6168-6204 | 10 | 0.73 |
NC_012034_4 | 4.18|2805083|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2805083-2805119 | 37 | NC_008014 | Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3, complete sequence | 159726-159762 | 10 | 0.73 |
NC_012034_4 | 4.18|2805083|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2805083-2805119 | 37 | NC_020130 | Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3, complete sequence | 159748-159784 | 10 | 0.73 |
NC_012034_5 | 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR | 2829309-2829342 | 34 | MN694482 | Marine virus AFVG_250M11, complete genome | 99-132 | 10 | 0.706 |
NC_012034_5 | 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR | 2829309-2829342 | 34 | MN694482 | Marine virus AFVG_250M11, complete genome | 39110-39143 | 10 | 0.706 |
NC_012034_5 | 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR | 2829309-2829342 | 34 | NZ_CP018869 | Sporosarcina sp. P37 plasmid pSporoP37, complete sequence | 8778-8811 | 10 | 0.706 |
NC_012034_5 | 5.47|2828981|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2828981-2829015 | 35 | NZ_CP009065 | Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-4, complete sequence | 23266-23300 | 10 | 0.714 |
NC_012034_5 | 5.47|2828981|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT | 2828981-2829015 | 35 | NC_017234 | Borreliella afzelii PKo plasmid lp28-4, complete sequence | 162-196 | 10 | 0.714 |
NC_012034_7 | 7.3|2856969|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2856969-2857004 | 36 | MK448708 | Streptococcus phage Javan23, complete genome | 669-704 | 10 | 0.722 |
NC_012034_7 | 7.3|2856969|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2856969-2857004 | 36 | MK448897 | Streptococcus phage Javan28, complete genome | 669-704 | 10 | 0.722 |
NC_012034_8 | 8.6|2866617|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2866617-2866651 | 35 | NZ_CP026535 | Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p2_DKU_NT_04, complete sequence | 16190-16224 | 10 | 0.714 |
NC_012034_8 | 8.7|2866682|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2866682-2866716 | 35 | NZ_CP026535 | Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p2_DKU_NT_04, complete sequence | 16190-16224 | 10 | 0.714 |
NC_012034_8 | 8.8|2866747|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2866747-2866781 | 35 | NZ_CP026535 | Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p2_DKU_NT_04, complete sequence | 16190-16224 | 10 | 0.714 |
NC_012034_8 | 8.10|2866877|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2866877-2866911 | 35 | NZ_CP019747 | Lactobacillus brevis strain TMW 1.2111 plasmid pl12111-4, complete sequence | 40915-40949 | 10 | 0.714 |
NC_012034_8 | 8.10|2866877|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2866877-2866911 | 35 | NZ_CP019738 | Lactobacillus brevis strain TMW 1.2108 plasmid pl12108-4, complete sequence | 29246-29280 | 10 | 0.714 |
NC_012034_8 | 8.11|2866942|33|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2866942-2866974 | 33 | MN694331 | Marine virus AFVG_250M889, complete genome | 29537-29569 | 10 | 0.697 |
NC_012034_4 | 4.15|2804881|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2804881-2804916 | 36 | HQ634195 | Vibrio phage eugene 12A10 genomic sequence | 20281-20316 | 11 | 0.694 |
NC_012034_8 | 8.9|2866812|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2866812-2866846 | 35 | NZ_CP026317 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence | 158152-158186 | 11 | 0.686 |
NC_012034_9 | 9.1|2872692|35|NC_012034|CRISPRCasFinder | 2872692-2872726 | 35 | MN694358 | Marine virus AFVG_250M310, complete genome | 12117-12151 | 11 | 0.686 |
NC_012034_9 | 9.2|2872758|35|NC_012034|CRISPRCasFinder | 2872758-2872792 | 35 | MN694358 | Marine virus AFVG_250M310, complete genome | 12117-12151 | 11 | 0.686 |
1. spacer 3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR matches to MT774399 (CrAssphage cr109_1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.957
ttgatatttttcatagttaacac CRISPR spacer ttgatatttttcatagttaaaac Protospacer ******************** **
2. spacer 3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR matches to MT774397 (CrAssphage cr56_1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.957
ttgatatttttcatagttaacac CRISPR spacer ttgatatttttcatagttaaaac Protospacer ******************** **
3. spacer 3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR matches to MT774403 (CrAssphage cr113_1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.957
ttgatatttttcatagttaacac CRISPR spacer ttgatatttttcatagttaaaac Protospacer ******************** **
4. spacer 3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR matches to MN855593 (Siphoviridae sp. isolate 195, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.913
ttgatatttttcatagttaacac CRISPR spacer tagatatgtttcatagttaacac Protospacer * ***** ***************
5. spacer 3.2|2789073|23|NC_012034|PILER-CR matches to NC_019737 (Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.07, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
ttgatatttttcatagttaacac CRISPR spacer ttgatatttttcatagttacttc Protospacer ******************* . *
6. spacer 1.84|157121|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214939 (Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aaagatataaaaaaatttaaagacaaagcatacttc CRISPR spacer aaagatatgaaaaaatttaaagaaaaatttgactac Protospacer ********.************** *** . *** *
7. spacer 1.106|158558|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693462 (Marine virus AFVG_25M534, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
attgaacgcagaggtgaaggtgatgactg-gtattatg CRISPR spacer gctgaacgcagaaatgaaggtgatgactgtagattat- Protospacer ..**********..*************** . *****
8. spacer 3.1|2789002|28|NC_012034|PILER-CR matches to NZ_CP033461 (Brevibacillus laterosporus strain 1821L plasmid p1821L01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
cgtaaaaaataaggagtatgtaaggggt CRISPR spacer attaaaaaataaggaggatgtaacatga Protospacer ************** ****** . *
9. spacer 3.4|2789060|36|NC_012034|CRISPRCasFinder matches to MT774397 (CrAssphage cr56_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
taatt--ttgatatttttcatagttaacacttatcaga CRISPR spacer --attgattgatatttttcatagttaaaacatatatgc Protospacer *** ******************** ** *** *
10. spacer 4.15|2804881|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017235 (Borreliella afzelii PKo plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ttctttttaggttttgttgattgttttgaaatttta CRISPR spacer ctagtaataggttttgttgattgcttttaaatttta Protospacer .* * ****************.*** ********
11. spacer 5.1|2828455|38|NC_012034|PILER-CR matches to MN013189 (Microcystis phage Mic1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.816
taggctt-tctaaaatttcttcaacgtcttttttgcttg CRISPR spacer -atgcttacctaaaatttcttcaatttcttttttgcatt Protospacer * **** .***************. ********** *
12. spacer 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR matches to MN693735 (Marine virus AFVG_250M590, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tgcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa CRISPR spacer tgttaaagggcaaggactttttttattttataaa Protospacer **. ***.. **** ************** ****
13. spacer 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693735 (Marine virus AFVG_250M590, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa CRISPR spacer gttaaagggcaaggactttttttattttataaa Protospacer *. ***.. **** ************** ****
14. spacer 8.22|2867663|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
ccgcatgattggcagtggatagcagagcttgacga-- CRISPR spacer ccgcatgattgccattggatagcaga--ttggtcaac Protospacer *********** ** *********** ***.. *
15. spacer 3.4|2789060|36|NC_012034|CRISPRCasFinder matches to MT774399 (CrAssphage cr109_1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taatt--ttgatatttttcatagttaacacttatcaga CRISPR spacer --actgattgatatttttcatagttaaaacatatatgc Protospacer *.* ******************** ** *** *
16. spacer 3.4|2789060|36|NC_012034|CRISPRCasFinder matches to MT774403 (CrAssphage cr113_1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taatt--ttgatatttttcatagttaacacttatcaga CRISPR spacer --actgattgatatttttcatagttaaaacatatatgc Protospacer *.* ******************** ** *** *
17. spacer 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR matches to NZ_AP014824 (Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa CRISPR spacer tataaaaaatcaagtatttcttttattttctctt Protospacer *..*************.**.*********.*
18. spacer 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR matches to NZ_AP019836 (Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa----- CRISPR spacer ttcaaaaaatcaagtccttttttca-----taaaaattt Protospacer * ************* *******.* ****
19. spacer 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR matches to NZ_AP019837 (Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tgcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa----- CRISPR spacer ttcaaaaaatcaagtccttttttca-----taaaaattt Protospacer * ************* *******.* ****
20. spacer 5.44|2828785|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP024686 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-2-313K, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
caatattttcatagctttcatacacataattttca CRISPR spacer gaatatttttatagctttcatacaaatcttgtgct Protospacer ********.************** ** * * *
21. spacer 5.47|2828981|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014325 (Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcttaagaccactttttgttttaacaagtttaaca CRISPR spacer ttctaaccacattttttattttaacaagtttaact Protospacer *..*** **.*****.****************
22. spacer 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014824 (Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa CRISPR spacer ataaaaaatcaagtatttcttttattttctctt Protospacer ..*************.**.*********.*
23. spacer 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019836 (Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa----- CRISPR spacer tcaaaaaatcaagtccttttttca-----taaaaattt Protospacer ************* *******.* ****
24. spacer 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019837 (Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa----- CRISPR spacer tcaaaaaatcaagtccttttttca-----taaaaattt Protospacer ************* *******.* ****
25. spacer 5.55|2829506|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019839 (Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
aagaaatagagagaaaaagaaaagaagaacaacaaa CRISPR spacer gggggatagagagaaaaaaaaaagaagaaaaagtaa Protospacer ..*..*************.********** ** **
26. spacer 5.68|2830367|36|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019839 (Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
aagaaatagagagaaaaagaaaagaagaacaacaaa CRISPR spacer gggggatagagagaaaaaaaaaagaagaaaaagtaa Protospacer ..*..*************.********** ** **
27. spacer 1.66|155943|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP054046 (Yersinia massiliensis strain 2011N-4075 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaacaaaggagattcagcaacagattgaagtagtaa CRISPR spacer atgaaaatgacattcagcaacagattgaagacgttg Protospacer * . *** ** ******************* ** .
28. spacer 1.84|157121|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694383 (Marine virus AFVG_250M176, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaagatataaaaaaatttaaagacaaagcatacttc CRISPR spacer gagaatattaaaaaatttaaagacaaagaatgggta Protospacer .*..**** ******************* **. *
29. spacer 4.15|2804881|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693020 (Marine virus AFVG_117M64, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ttctttttaggttttgttgattgttttgaaatttta CRISPR spacer ttctttttaggtttgtttgattgtttaaaatctact Protospacer ************** ********** .** .* .
30. spacer 5.6|2828784|36|NC_012034|PILER-CR matches to CP024686 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-2-313K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tcaatattttcatagctttcatacacataattttca CRISPR spacer ggaatatttttatagctttcatacaaatcttgtgct Protospacer ********.************** ** * * *
31. spacer 5.17|2829505|37|NC_012034|PILER-CR matches to NZ_AP019839 (Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
taagaaatagagagaaaaagaaaagaagaacaacaaa CRISPR spacer agggggatagagagaaaaaaaaaagaagaaaaagtaa Protospacer ..*..*************.********** ** **
32. spacer 5.30|2830366|37|NC_012034|PILER-CR matches to NZ_AP019839 (Leptotrichia wadei strain JMUB3934 plasmid pJMUB3934p4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
taagaaatagagagaaaaagaaaagaagaacaacaaa CRISPR spacer agggggatagagagaaaaaaaaaagaagaaaaagtaa Protospacer ..*..*************.********** ** **
33. spacer 5.39|2828456|37|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN013189 (Microcystis phage Mic1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
aggctttctaaaatttcttcaacgtcttttttgcttg CRISPR spacer tgcttacctaaaatttcttcaatttcttttttgcatt Protospacer * .* .***************. ********** *
34. spacer 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694482 (Marine virus AFVG_250M11, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa CRISPR spacer gatctaaagcaagtactttttttatattttttt Protospacer * *** **************** ****
35. spacer 5.52|2829310|33|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694482 (Marine virus AFVG_250M11, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa CRISPR spacer gatctaaagcaagtactttttttatattttttt Protospacer * *** **************** ****
36. spacer 1.103|158362|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP051683 (Mucilaginibacter sp. F39-2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
----cacactgaaaaagaaatcaatacataaagatataaat CRISPR spacer tctttatatcg----agatatcaatacataatgatataaat Protospacer .*.*..* *** ************ *********
37. spacer 4.18|2805083|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008014 (Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
actctttctcttctctttctctctcttgcatcatcac----- CRISPR spacer tttctttctcttctctttctttcttttg-----tcgctcttg Protospacer .******************.***.*** **.*
38. spacer 4.18|2805083|37|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020130 (Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
actctttctcttctctttctctctcttgcatcatcac----- CRISPR spacer tttctttctcttctctttctttcttttg-----tcgctcttg Protospacer .******************.***.*** **.*
39. spacer 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR matches to MN694482 (Marine virus AFVG_250M11, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa CRISPR spacer cgatctaaagcaagtactttttttatattttttt Protospacer .* *** **************** ****
40. spacer 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR matches to MN694482 (Marine virus AFVG_250M11, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa CRISPR spacer cgatctaaagcaagtactttttttatattttttt Protospacer .* *** **************** ****
41. spacer 5.14|2829309|34|NC_012034|PILER-CR matches to NZ_CP018869 (Sporosarcina sp. P37 plasmid pSporoP37, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgcaaaaaatcaagtactttttttattttttaaa CRISPR spacer tgcaaaacatcaaatacttttttttgttcgcttc Protospacer ******* *****.********** **. .
42. spacer 5.47|2828981|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009065 (Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcttaagaccactttttgttttaacaagtttaaca CRISPR spacer tgtattaaccactttttgttttaaagagtttattt Protospacer * * .***************** .****** .
43. spacer 5.47|2828981|35|NC_012034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017234 (Borreliella afzelii PKo plasmid lp28-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcttaagaccactttttgttttaacaagtttaaca CRISPR spacer tgtattaaccactttttgttttaaagagtttattt Protospacer * * .***************** .****** .
44. spacer 7.3|2856969|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448708 (Streptococcus phage Javan23, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aaagtttatctatttcttcttgcgttttatttgttt CRISPR spacer gtcttttttttatttcttcttgcgttttattgtaat Protospacer . *** *.********************* *
45. spacer 7.3|2856969|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448897 (Streptococcus phage Javan28, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aaagtttatctatttcttcttgcgttttatttgttt CRISPR spacer gtcttttttttatttcttcttgcgttttattgtaat Protospacer . *** *.********************* *
46. spacer 8.6|2866617|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026535 (Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p2_DKU_NT_04, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
attcttctttcttttgtttttcatagttttcctga CRISPR spacer attcatcgttcttttgtttttcataagtcattcta Protospacer **** ** *****************. *. ... *
47. spacer 8.7|2866682|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026535 (Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p2_DKU_NT_04, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
attcttctttcttttgtttttcatagttttcctga CRISPR spacer attcatcgttcttttgtttttcataagtcattcta Protospacer **** ** *****************. *. ... *
48. spacer 8.8|2866747|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026535 (Bacillus velezensis strain DKU_NT_04 plasmid p2_DKU_NT_04, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
attcttctttcttttgtttttcatagttttcctga CRISPR spacer attcatcgttcttttgtttttcataagtcattcta Protospacer **** ** *****************. *. ... *
49. spacer 8.10|2866877|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019747 (Lactobacillus brevis strain TMW 1.2111 plasmid pl12111-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ccattaacatggagatatgcttccttctgtgcaag CRISPR spacer ttttttccatggagagatgctcccttctgtgcgta Protospacer .. ** ******** *****.**********. .
50. spacer 8.10|2866877|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019738 (Lactobacillus brevis strain TMW 1.2108 plasmid pl12108-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ccattaacatggagatatgcttccttctgtgcaag CRISPR spacer ttttttccatggagagatgctcccttctgtgcgta Protospacer .. ** ******** *****.**********. .
51. spacer 8.11|2866942|33|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694331 (Marine virus AFVG_250M889, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
tagataaacagttttattcacaaatggggtatg CRISPR spacer tagataaacagttttatacgcaaacgattcgcc Protospacer ***************** *.****.*. ...
52. spacer 4.15|2804881|36|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ634195 (Vibrio phage eugene 12A10 genomic sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
ttctttttaggttttgttgattgttttgaaatttta CRISPR spacer gatgaagaaggtattgtggattgttttgaaattttg Protospacer . **** **** *****************.
53. spacer 8.9|2866812|35|NC_012034|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026317 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
acaaaatttacagctatgctcaagaaatgatgagc CRISPR spacer gtttgcgttatagctatgctcaagaaaggatgaat Protospacer .. . ***.**************** *****..
54. spacer 9.1|2872692|35|NC_012034|CRISPRCasFinder matches to MN694358 (Marine virus AFVG_250M310, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
atttctttaccgtcttcagaagtgtaaactacctc CRISPR spacer tatactttaccttcttcagaagtgttaacagaaaa Protospacer * ******* ************* *** .
55. spacer 9.2|2872758|35|NC_012034|CRISPRCasFinder matches to MN694358 (Marine virus AFVG_250M310, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
atttctttaccgtcttcagaagtgtaaactacctc CRISPR spacer tatactttaccttcttcagaagtgttaacagaaaa Protospacer * ******* ************* *** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
70961 : 79224
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012034|70961:79224|DBSCAN-SWA GATGGACAAAAACATAGCTGTAAAGATTGAAAATGTTTCAATGATGTTTAATATGGCATCTGAAAAGATTTATAGTATTAAAGAGTACTTTATAAAACTTGTGTCAGGTAAGCTATACTTTAGAGAATTTTGGGCCTTGAAGGATATAAGTTTTAAAATCAAAAAAGGTGAAATTTTTGGTATAATAGGCTTAAACGGGGCAGGCAAAAGTACCCTGCTCAAAATAATTGCAGGAGTTTTAAAGCCGACAATGGGTAGAGTCTATGTAAACGGTACTATGGCACCATTGATTGAACTTGGAGCAGGTTTTGACTTTGAACTTACTGCAAGAGAGAATATATTCTTAAACGGCGCTATTTTGGGCTATTCAAGAAAGTTCATGAAAGAAAAATTTGACGAGATAGTAGAGTTTGCAGAACTGAGAGATTTTTTAGATGTTCCTCTAAAAAACTTTTCGTCTGGTATGCAGGCAAGACTTGGTTTTGCTATTGCTACAATTGTTGACCCTGACATTTTAATTGTTGATGAGATTCTGGCAGTAGGAGACTTTCATTTTCAGGAAAAATGCGAAAGAAGAATTAATAGTATGCTTGAAAAAGGGACAACTATTGTGATGGTGTCCCATTCAATAGATCAAATTGAGAGAATGTGCCAAAGAGTTTTGTGGCTTGAAAAAGGCAGAATGAAAATGATAGGCGATGCAAAAGAGGTTTGTGAGGCTTACAGGAACTCTTGATGGTTTAACAAATAAAAAATATAAAAAGAAAGGACTGTTATTTCATGAAAGGAATAGTTTTGGCAGGAGGAACAGGTTCACGTTTATATCCGTTAACTAAGGTTACAAACAAGCATTTGTTGCCTGTTGGAAAATATCCAATGATTTATTATCCAATTTTTAAATTAAAACAAGCAGGTATCAAAGAGATAATGATAATAACTGGTAAAGAACACATGGGAGCTGTTGTCAATTTATTAGGAAGTGGTCGTGAGTTTGGATTAGAATTTACTTATAGGATTCAAGATGAAGCTGGTGGAATTGCTCAAGCTCTGGGACTGTGTAGCTTTTTTGCTGGGAATGATAAGTGTGTTGTGATACTGGGCGACAATGTTTTTGAGGATGATATAACTGAGTATGTAAGGAATTTCGAAAAGCAGGAGCGGGGCGCTAGGATTCTTCTTAAGGAAGTTCCGGACCCGCATAGATTTGGAGTTGCTGAACTGAAAGATGGGAAAATAGTCTCGATTGAAGAAAAGCCTAAGAATCCGAAAAGTAATTTTATTGTCACAGGAATCTATATGTATGATAGCCAAGTTTTTGATATTATCAAGACACTTAAGCCTTCACAGAGGGGTGAATTGGAAATTACGGATGTAAATAACGAGTACATAAGAAGAGGAGAGTTGTATTTTGACTTTTTAAAGGGCTGGTGGACTGATGCAGGGACTTTTGAGTCACTAAAAAGAGCAAATGAGCTTGCTGAAAATATGGTGTTAGATTTTAATGGAATATAAATTAAAGGAGAGGTAGGGAATAATGGAGCTTATTGAAGGTGTTAAGGTAAAAAGACTCGAGAAATTTGCTGATGATAGAGGTTTTTTCATGGAGATTTTGAGAGACGAAGATGGCTTTTTAGAAAAATTTGGACAGGCTTCAATGTCTTTGACTTATCCAGGGGTAATAAAAGCTTTTCACTATCATAAGTTGCAAGACGATGTTTGGTTTTTCCCAAAAGGCAATGCACAGGTTGTTCTTTACGATTTGCGGCCAGATTCGCCTACATACAAAAAAACAAATGTATTCTACATGGGAGAACACAACCCTATAGTACTTTTAATACCCAGAATGGTTGCTCATGGCTATAGGGTATTGGGGAATGAGCCGGCAATAATTGTGTATTTTACAACAGAGCATTATAATAGAGAAAATCCAGATGAATACAGAATTCCTTGGGATGACAAGGAAATTAATTTTGATTGGACAACAAAATTTAGATAAGGTGGGAACACGAAGATGGAGACAATTCTTGTAGCAGGTGGGGCAGGTTTTATAGGAAGCAATTTTGTTAAGTACATGATTAGCAAAGAAGAATACAAAATAATCAATTATGATGCATTAACCTATGCAGGAAATCTTGAGAATTTGAAAGAGGTAGAAAACCACCCTTATTATACATTTATTAAAGGAGATATTGTTGATAGATCTAAAGTTGAAGAGGTTTTTAAAAATTATCAAATTGACTATGTAATAAACTTTGCCGCAGAGTCGCATGTGGACAGAAGTATAAAGGACCCTGATATATTCGTTAAAACAAATGTTTTGGGAACACAAGTTTTATTAGATGTGTCGAGGAAATTCGGGATAAAAAAGTTTATTCAAATTTCAACAGATGAAGTATATGGTTCCTTAGGGCCTGAAGGATATTTTACAGAAGAAAGTCCGCTTGCACCAAACAGTCCTTATTCTGCCAGCAAAGCAGGGGCTGATATGCTTGTGAGAGCATATTTTAAGACATATGGTCTGCCTGTGAACATAACAAGGTGTTCAAACAATTTTGGTCCACATCAACACCCAGAAAAGTTTATACCGACCGTAATTTTGAATGCGCTGCAAAACAAGCCGATACCAATTTATGGTGACGGGCAAAATATAAGAGACTGGCTATATGTAGAAGACCACTGCAGAGCAATTGAGCTTGTGCTCAAAAAAGGTAGAATAGGTGAAGTATACAATATTGGCGGGAATAATGAGTGGAGGAATATAGATATAGCCAAATTGATTTTAAAACTACTCGGGAAACCAGAGAATCTAATACAATTTGTGGCTGACAGGCCAGGACATGATAGGAGATATGCAATTGACTCGAGTAAGATTCAAAAGGAATTGGGGTGGAAGGTTGAATATAAGTTTGATGAAGCTATTAGAAAGACTATAGAATGGTATAAAAATGAATTTTTCAAAGGAGAATGAGAATATGAGAAGTATAAACCAATTAAATATTGGTCTAACAGAGACAAAGTACGGCAAATTCTATTATTTAAAGAGTGATGCAATAATAGGCAAATCTTTAGAAATATACGGAGAATGGGCGGTACCAGAAATAGAGTTGTTAACAAGTTTTATAGAAGAAGGGGATATAGTAATTGATGTAGGCGCATACATAGGAACTCATACTATTCCATTTGCTCAAAAGTTGAATGGAAAAGGTTTTGTAATTGCATTCGAACCCCAAGAGATTATATTCAATATACTAGCAAAGAATATAAGGACAAATAACGCAGATAATGTGCAAATATTTAACAAAGCTGTTTTAGATAAAAATACAATAACCTACATAGAAACTTTTAACTACAATGAAACTAATAATTTTGGCAGTGCTAAAATAATAACTGATGATATTGAAACTCAAGGAATTATCAAAAAAATTGAAGCAATCACTATTGATAGTTTAGAATTGAATAATTGTAAATTAATAAAAATTGACGTAGAAGGACAAGAAGAATTTGTATTGAGAGGCTCAGAAAAGACAATAAAAAGTTTTATGCCAATTATTTATTTTGAAAGTAATGAGCTTGAGAAAACATGGAATAGTATTTGCTTAGTAAAGAAATGGGGATACGATACTTTCTTGTTTAGATTTCCAGCATTTAATCCATTTAACATTAAAGGTACACAAGATAATATTTTTGGTTATGCATGTGAAACAGGTATTTTGGGGATTCATAAATCAAAACTGAGTACTTATGGAAATGATACTTTGAAATGGCGAAAATTAAATTATCTATTTGAAATTACCACGCTTGACGATTTAGCTTTTTTATTAATAGAAACTTCTCGTGGACATGATCCCATTATACCTGATATTAAATATAATGAAATCAGAAACATAAAGTTTCTTCAAAATTATATAATTGAGGTGGTAAAAGAAATTGAAAAAAAAGATAAACTATTACAAACAATTAAAGAAGATTTAAAAATAAAAGAACAACACTTACAAAGTATTTATTGTTCGGAAGGTTGGAAACTGTTAACCAAGTGTTATAAAATAAGAGATAAGATATTCCCACCGAATAGTAAGAGAAGAGAATTAGCAAAGTTTATTTTATTTATTATGAAAAAACTGAATTTAAAATTTGTTCAGGAAATAATAAGATTTGCAAGGATGTATGGTATTAAAGCTCTTTATAATCGAAGTCGAATTGCTTTGCACTCTATGAAAAGTTATTCGAGTAACCAAGAAAATTATTTTGTTCCTGAACAATTTGAAAGAGATTATCTTTTAAGTGAAATCAGTGTTGATATAATTGTACCTATTTATAATGCTTATGAGGATTTAAAGAGGTGTGTAGAAAGTATTCTTAAGCACACTGATTTGAAAAAACATAGATTGGTATTAATTAATGATTGTTCGACTGATGAGAGAATATATTCTTTCTTAAAAAATCTTGAGAACGAAAGAACCGAAGAAAATTTACTTGTTATTCATAATAAGGAGAATTTGGGTTTTGTAAAAACAGTTAATAAAGGAATTAGTTTGAGTAATAAAGATGTTATTATTCTTAACTCTGATACAATTGTAACTGCGAGATGGGTAGAAAAGCTTATCAGAGCAGCGTATTCAAGGTCTAATGTTGCAACAGTTACACCTTTTTCAAATAATGCCACAATTTGTTCATTACCAATAATGTTAAAAGATAATTCGCTTCCTTTGGATTGGGATATTGATTATTTTGCTAAAGTTGTAGATAGGATTTCACTTTTAAAATATCCTGAAATTCCAACAGCAGTTGGATTTTGTATGTATATTAAAAGAGAAGTTATTGAAAAAATAGGAATGTTTAACGAAGAGAAATTTGGCAAAGGTTATGGAGAAGAAAATGATTTTTGTATGCGAGCGCTAAACGAAGGGTATGTAAATATTTTATGTGATAATTTATTTATTTATCACAAAGGAAGTCAAAGCTTTACGGAAGAAGTTAAAAGGAAAAGAGAAATGGAGAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012034|70961:79224|71740_72472_+|WP_012660726.1|DBSCAN-SWA MKGIVLAGGTGSRLYPLTKVTNKHLLPVGKYPMIYYPIFKLKQAGIKEIMIITGKEHMGAVVNLLGSGREFGLEFTYRIQDEAGGIAQALGLCSFFAGNDKCVVILGDNVFEDDITEYVRNFEKQERGARILLKEVPDPHRFGVAELKDGKIVSIEEKPKNPKSNFIVTGIYMYDSQVFDIIKTLKPSQRGELEITDVNNEYIRRGELYFDFLKGWWTDAGTFESLKRANELAENMVLDFNGI >NC_012034|70961:79224|70961_71696_+|WP_012660725.1|DBSCAN-SWA MDKNIAVKIENVSMMFNMASEKIYSIKEYFIKLVSGKLYFREFWALKDISFKIKKGEIFGIIGLNGAGKSTLLKIIAGVLKPTMGRVYVNGTMAPLIELGAGFDFELTARENIFLNGAILGYSRKFMKEKFDEIVEFAELRDFLDVPLKNFSSGMQARLGFAIATIVDPDILIVDEILAVGDFHFQEKCERRINSMLEKGTTIVMVSHSIDQIERMCQRVLWLEKGRMKMIGDAKEVCEAYRNS >NC_012034|70961:79224|78378_79224_+|WP_012660732.1|DBSCAN-SWA MILITGSKGQLGSEFIKQFENKYNVKGIDIEQVDITDLDSTVSYISATKPNIIIHCAAYTNVDGCESDKDTAFKVNAIGTRNVAMAAEKVGAKLVYISTDYVFDGEKEKPYNEFDRPNPISIYGLSKLAGEEFVKTFCSRYFIVRIAWLYGENGNNFVKTIVKLAKEKGEIDVVNDQRGNPTFTKDVVQAVEVIMNSEKYGTYHVTNEGITSWYDFAYKIVSTFGIDCKVNPTTSDKFIRPAKRPKNSALDKMMLRLEFGYKMRHWEEAFEEFAMLMKGRI >NC_012034|70961:79224|73905_76104_+|WP_079503990.1|DBSCAN-SWA MNFSKENENMRSINQLNIGLTETKYGKFYYLKSDAIIGKSLEIYGEWAVPEIELLTSFIEEGDIVIDVGAYIGTHTIPFAQKLNGKGFVIAFEPQEIIFNILAKNIRTNNADNVQIFNKAVLDKNTITYIETFNYNETNNFGSAKIITDDIETQGIIKKIEAITIDSLELNNCKLIKIDVEGQEEFVLRGSEKTIKSFMPIIYFESNELEKTWNSICLVKKWGYDTFLFRFPAFNPFNIKGTQDNIFGYACETGILGIHKSKLSTYGNDTLKWRKLNYLFEITTLDDLAFLLIETSRGHDPIIPDIKYNEIRNIKFLQNYIIEVVKEIEKKDKLLQTIKEDLKIKEQHLQSIYCSEGWKLLTKCYKIRDKIFPPNSKRRELAKFILFIMKKLNLKFVQEIIRFARMYGIKALYNRSRIALHSMKSYSSNQENYFVPEQFERDYLLSEISVDIIVPIYNAYEDLKRCVESILKHTDLKKHRLVLINDCSTDERIYSFLKNLENERTEENLLVIHNKENLGFVKTVNKGISLSNKDVIILNSDTIVTARWVEKLIRAAYSRSNVATVTPFSNNATICSLPIMLKDNSLPLDWDIDYFAKVVDRISLLKYPEIPTAVGFCMYIKREVIEKIGMFNEEKFGKGYGEENDFCMRALNEGYVNILCDNLFIYHKGSQSFTEEVKRKREMESLKVINQLHPFYSEMVKAFIEKNPLKYYHSTLEEIMSLYNLLKSEEKK >NC_012034|70961:79224|72971_73928_+|WP_012660728.1|DBSCAN-SWA METILVAGGAGFIGSNFVKYMISKEEYKIINYDALTYAGNLENLKEVENHPYYTFIKGDIVDRSKVEEVFKNYQIDYVINFAAESHVDRSIKDPDIFVKTNVLGTQVLLDVSRKFGIKKFIQISTDEVYGSLGPEGYFTEESPLAPNSPYSASKAGADMLVRAYFKTYGLPVNITRCSNNFGPHQHPEKFIPTVILNALQNKPIPIYGDGQNIRDWLYVEDHCRAIELVLKKGRIGEVYNIGGNNEWRNIDIAKLILKLLGKPENLIQFVADRPGHDRRYAIDSSKIQKELGWKVEYKFDEAIRKTIEWYKNEFFKGE >NC_012034|70961:79224|76103_77345_+|WP_012660730.1|DBSCAN-SWA MSTIVYLVHSIPKYEKSGTPIAAWRVAKGVKEKYNQNVAFIIPSPDGEEGKEKVDDILVYKVKRIDWHENFFHDFDIDRETYIRKIKNILKEVNCNILHIYNLVFSSYQVMKLRKEGIRIVRTITHTEDICFNVDPFVKVGDKIEICSGPDPIAKCACHYKQMYGGNNLMEFIIKKISKHFTSVELLYSNFCDIITFTNEEFAKYFTNYVNIPRDVIRIIPHGVENKLEKYILPNMPKNEGFRFLYLGGDNFRKGFVILDNALNSLNGELFNKIKEITIVGKTTKEFRERFNNDKYMFKGVLPEEELYNEISNADLVILPTFFETYNISLREAIKLGKPVITTKTFGSNIVVDGYNGFRFDIGDSLQLKNIIELILSNPQILVDMSKNCLNTHITDIEEEIKLFMKVYNELKD >NC_012034|70961:79224|72494_72956_+|WP_012660727.1|coat|DBSCAN-SWA MELIEGVKVKRLEKFADDRGFFMEILRDEDGFLEKFGQASMSLTYPGVIKAFHYHKLQDDVWFFPKGNAQVVLYDLRPDSPTYKKTNVFYMGEHNPIVLLIPRMVAHGYRVLGNEPAIIVYFTTEHYNRENPDEYRIPWDDKEINFDWTTKFR >NC_012034|70961:79224|77374_78382_+|WP_012660731.1|DBSCAN-SWA MRNLTVIIPTYNQKDLLERAINSLISKCNDEINIYVLVNNTESNYIVRNKNYANLHVEYLNTNCGFCKAVNYGLRLIKKSRFIFLLNDDTEVINQIDIDNIIHELIEKGNIFSISLKMLKGNYPNLLDDAGDMYTILGWQFKRGNGLPKELYDRPCEIISACGGAAIYNKKILDEIGYFDEDFFAYLEDVDLGLRALMRGYKNLYYPYISVLHVGSATTGGKYNDITIRLTARNSIYVIYKNLPLPLLIINFPFILLGYLIKFIFFAKKGKGKIYISGVLEGLKNLPKFKEKRRENMRKKKISNIKLEWILIKATFEYFHQYIKRAFYTLRGAKK |
8 | Staphylococcus_phage(16.67%) | coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1530781 : 1542927
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_012034|1530781:1542927|DBSCAN-SWA 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CTTGTTTTTGAAAAAATTATTAACGAATTGTTAATAAATAATAAAAATTATTTTAAATCCAGTGTGAATGTAAACTTAGAACCAACTCCTTCCTCGCTTTCAACCCAGATGTTCTGTTTATGAAGCTTTATAATCTCTTTTACAATTGAAAGCCCTAACCCAACTCCATTTTCAAGGCTTCTTGACTCATCAACCTTATAAAATCTTTCCCAGATAAGCTTTTGTAGCCTTTCAGGAATACCCACGCCTGTATCCTGTATTGTTATATAAGCTTTGCCATTTACTACTTCAGAATATATATATATCTTCCCGCCAACCTTGTTATACTTTATAGCATTGTCAAGAAGATTGTGAACAACCCTGCTTATCAAATCCTTATCTGCCTTGACAACAAGTTCTTCGTCCACTTGCAGAGTTACATCTATTTCTTTTTCTTCTATTCGTTTCTCAAACTTAATTAGCTCCTCTACAATTACAGAATAAATCTTAAATTCACTCAAATTAAGATTTATTTTCCCCCACTCAAGTCTCGACAATTCTAAAAGTTGATTAATCAAATTGTTAAGCTTTATAACCTCTTCTTTTACAAGGGTCAGATAAAAATCTTTTTTGTCGTCTGGAATAGTCTTATCCAATATACCCTCTACAAATCCTCTTATAGAGGTAAGAGGAGACCTGAGCTCATGTGACACATTAGAAATAAAACTTTTTCGCATCATCTCCAAGTTTTCCAATTTTTCGGTCATATAATTAAAAGATGAGATAAGTTCGCTAATCTCGTCATCACTATTGTTTGGAATAGGAATTTTTTGTGAAAAATCACCTTCAGCTATCTTTCTTGAAGCCTGTGCAAGCTTTTTAATGGGAGTTATAATCCTTTGAGTCAGTGCATATGTTATTATCAAAACAACTAAAACTTCAAACAATGTAATCAGCCAAATTATTTTATTATACATCTTTAATGTCTGTCTTATTTCATCGGTTGAGGTGATAAGAAGCAGTCCTGAGACAACATGGTTATTTATCACAACCGGATACCCTATCACAAGATATTCTCTTTTTATCATATCCCCTATAAGAAGCTTTTTTACAGCAATTTCTCCTTCAAAGACCTTGTCTCTTATTTTCTGCAAATTCAAATCATCTATATAAATCTGTTCATCTGAGTTTAATATTACATTTGCATTTTTATTTATCAGCAGGATTGAAGCATTCAAATAATCCCTCAAAAATCTAATCTCGAACCTAAGTCTATCCTGTTCCAAAAACCCTGTTATATACCAAAGAGCAAGTCCAGTTGCTATCTTTTCAGCTTCACGAACAAGCTGAGTCTGTTTTTGAGAGACAAAATAGTTTTCTGTAAGGTTATTGAGCACTGTCCCAAAAATTAAAAATCCAACTGCAATTATGATTGTATATGTCATCACAAATTTAAAATATATAGATTTCAATTCTTTTCACTTCCTCAACAAAGCCTAAATTTCAAACTTATAACCTACACCCCATACAGTCTTTATCTTCCAAGGATATTTGTCCTTTTCAATCTTTTCTCTTATTCTCTTGATGTGTACATCAACTGTACGAGTGTCTCCAACAAAGTTGTAACCCCATATATGGTCAAGAAGTTGCTCTCTTGTGAACACCTTGTTGGGATGTGATGCTAAGAAATACAAAAGCTCTATCTCTTTCGGCGGCATATCTATTACTTTATCTTCAAGTTTTACCTCATATGTAGTGAGATTTACTGTTAGATTTGGATATACAACAACCTTTTCATCATTGACTTCACCCTGTGTTCTTCGCAGTACTGCTTTTATTCGTGCAATTAGTTCTTTTGGATCAAACGGTTTTACAATGTAGTCATCTGCTCCCAACTCTAATCCAAGTACCTTATCAAATGTCTCGCCCTTTGCAGTAAGCATTATAATTGGAATGTTACTAATTTTTCTGAGTTCTCTACAGACTTCATATCCATCTTTTTTGGGCAGCATAATGTCCAGTATTACCAGGTCGGGCATTTCATTTTTGAACATAGCAATTCCATCCATACCATTGTGAGCAACTACTACTTCAAATCCTTCTTTTTCTAAGTAAAGTTTTATTACCTCACATATCTTTACATCATCATCAATGATAAGGATTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_012034|1530781:1542927|1536770_1537019_-|WP_013430231.1|DBSCAN-SWA MLKAEIFVYLKKSISDPPGIAVLNSLKSLGFNNVEKVRMGKYIVVYLNENDIEKAKELVKLMCEKLLCNPVMEEYKFNISEE >NC_012034|1530781:1542927|1536068_1536767_-|WP_015907910.1|DBSCAN-SWA MKFGVVVFPGSNCDSDCFHVIKDVINEDVEYIWHDSDEKLKGFDCIILPGGFSYGDYLRAGAIARFSKVMPRIEEFAHNGGLVIGICNGFQILTESHLLPGALIRNKSLKFICSDQYVKVVNNNTPFTNLYKEGEVINLPIAHGEGNYVVDEETLKQMIQNQQIVLQYCDKYGNVNDETNPNGSILNIAGICNKEKNVFGLMPHPERSSERILGCEDGKRVFLSIVNYLKSR >NC_012034|1530781:1542927|1540827_1542231_-|WP_015907914.1|DBSCAN-SWA MKSIYFKFVMTYTIIIAVGFLIFGTVLNNLTENYFVSQKQTQLVREAEKIATGLALWYITGFLEQDRLRFEIRFLRDYLNASILLINKNANVILNSDEQIYIDDLNLQKIRDKVFEGEIAVKKLLIGDMIKREYLVIGYPVVINNHVVSGLLLITSTDEIRQTLKMYNKIIWLITLFEVLVVLIITYALTQRIITPIKKLAQASRKIAEGDFSQKIPIPNNSDDEISELISSFNYMTEKLENLEMMRKSFISNVSHELRSPLTSIRGFVEGILDKTIPDDKKDFYLTLVKEEVIKLNNLINQLLELSRLEWGKINLNLSEFKIYSVIVEELIKFEKRIEEKEIDVTLQVDEELVVKADKDLISRVVHNLLDNAIKYNKVGGKIYIYSEVVNGKAYITIQDTGVGIPERLQKLIWERFYKVDESRSLENGVGLGLSIVKEIIKLHKQNIWVESEEGVGSKFTFTLDLK >NC_012034|1530781:1542927|1532463_1533888_-|WP_015907908.1|DBSCAN-SWA MCFKELEESFKDHCGIFGIYCPDGKLDVAKITYFGLYALQHRGQESSGIAVNDSGNIIYHKDSGLVNEVFNEVVLNHLKGYSAIGHVRYSTTGKSDRENAQPLVIKYRKGHMALAHNGNLVNAHIIREKLEQEGAIFQTTIDSEVIASLISRNRIKSENIEEAILKTMNEIKGAYSLLILTPNKLIAVRDPYGLRPLVMGKINNSICFASETCALDTIGAEYIRDVEPGEIISVSRNGIKSIKYENGTKHLCVFEFIYFARADSYLEGISVYEIRKRLGKQLCKESYVDCDIVIGVPDSGTTAAIGFAEEAGIPFSEGFIKNRYIGRTFIKPEQTQREIAVKIKLNVLKNNVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRKIIKMLRDAGASEVHLRISSPPVIFPCYYGIDTPDRKELIAANYSTEEIARILGANSLEYLSLNGLNEVFNGEIHQFCTACFSGEYVTEIPENFNKYILEEGV >NC_012034|1530781:1542927|1530781_1531438_-|WP_015907906.1|DBSCAN-SWA MKKLAVFVSGSGSNLQTIIDQIKIGEIPATISCVISNKKDAYALERARKNGIQAIYISKRDFPSSLEYEKYLVKLLKYQKIDYVILAGFLYIFSEYFVEEFKNRIVNIHPSLLPAFGGKGMYGINVHKSVLEYGMKVTGATVHFVDAVPDGGPIILQKAIYVREDDTPETLQKRVLEEVEWKIYPLAIKLLCEDKIEVVGRKVIIKDKEILKKVGIEI >NC_012034|1530781:1542927|1537056_1537776_-|WP_015907911.1|DBSCAN-SWA MSYIITKLLYEGKAKKVYETENPDVVVIEYKDDATAFDGTKRGIINNKGVVNNLVSNHFFKILEANNIPTHFIEQIDERKTAVKRVQIIPVEVIVRNIAAGSLSKRLGLEEGTILKRPILEFCYKNDDLHDPQVNQYHILALELATEEEIRKIEEYSFKVNDVLRNYLKQVNIDLIDFKLEFGRYRGDVILADEISPDTCRFWDTTTKEKLDKDRFRRDLGNVEEAYMEILRRLGLDKK >NC_012034|1530781:1542927|1533869_1536062_-|WP_015907909.1|DBSCAN-SWA MNKHLYEEVGLTYDEYKMIVEILGREPNELELNLFGVMWSEHCGYKNSKAFLKNLPTKGEHILQGPGENAGIVDIGDGYAVCFKVESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFTMGARPIALLDSLKFGSLSDSRTKYLFEGVVAGIAGYGNCVGIPTVGGETTFDPVYKNNILVNVMCVGIMKKDKIFKGIAQGVGNSVFYVGHTTGRDGMGGATFASTDLTAESEEKRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELFQTDAVVGIQDMGAAGLTSSTCETAARAGTGIEIDVALVPKREEGMNPIEVMLSESQERMLVIVKKEKEEEVYKIFEKWGLHAVKIGKVTDDGMLRVLENGKVIAEVPAKALAHAPAYVREVKEPAIIKEAENFDIYSIPQPNDLNEAICKMISNPNLASKEYIYRQYDHMVRTDTVIRPGHDASLLRIKGTKKGIAVTIDSNGRYCYLNPYEGVQLVLAESYRNIVAVGAKPLAITDGLNFGNPHYPEIYYQFVKTIEGMKVACEHFETPVTGGNVSFYNQSEEGAIYPTPVIGMIGIIDDIEKAVDISFKNEGDLIAVVGKTSDDIGASEYLSFYHRIVSGRVPKLDLKLHKRVCDKVLECIKEGLFNSVHDISDGGFAIALIESAIKGSKGAELQIKTKLREDFYLFSETPGRFVVTFKEENLRKIHDILDDIEFTVVGRVTDEYIINGKINDKDIHLDLKEIERIYQEAIPCALKS >NC_012034|1530781:1542927|1542255_1542927_-|WP_015907915.1|DBSCAN-SWA MKILIIDDDVKICEVIKLYLEKEGFEVVVAHNGMDGIAMFKNEMPDLVILDIMLPKKDGYEVCRELRKISNIPIIMLTAKGETFDKVLGLELGADDYIVKPFDPKELIARIKAVLRRTQGEVNDEKVVVYPNLTVNLTTYEVKLEDKVIDMPPKEIELLYFLASHPNKVFTREQLLDHIWGYNFVGDTRTVDVHIKRIREKIEKDKYPWKIKTVWGVGYKFEI >NC_012034|1530781:1542927|1537899_1539288_-|WP_015907912.1|DBSCAN-SWA MLENIFKLKERRTDVKTEVLAGFTTFITMAYIIFVNPSILSTTGLDKHAVFFATCIGAAVGTLIMALYANLPFALAPGMGLNAFFTYTVCLQMKYTPQQALAAVFISGIIFVIITAVGLRQAIVRSIPQSLKHAMTAGIGLFIAFIGFINSGIVVIDSGSKLPKFGDFTSAFKSFTNDHNINSAIISSRGAIVALIGLLIIGILIAKRVKGAIIIGIIIATVISFPLKIVDLSKFKFSLEAFEVSAFNFDFAGLFAAHGQGGGIGAVLLSLFAVILTFTLIDMFDSIGTFVGLADKAGMLDEKGDIPNMDRALMSDAIATIVGAIFGTSTVTTYIESAAGIEEGGRTGLTSLVTGILFILALVIAPFIGLVPSQATAPALIAVGVMMISSIKKIDFNDFEEALPAFLTIVIMPFTYSIANGISAGIIFYVLVKLLRGKAKEVHPITYILAILFILRFMIIAH >NC_012034|1530781:1542927|1531434_1532460_-|WP_015907907.1|DBSCAN-SWA MTTYKDAGVNIEEGYKAVNLIKSLARETFDSNVITDIGSFGSMYLLNIGNSEYILVSGTDGVGTKLKIAFYLDKHDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLNSSKVANIVKGIAEGCKMAGCSLVGGETAEMPGFYKEDEYDLAGFVVGIVERQKAVCGKDVNTGDVLIGLASSGVHSNGYSLVRKVFGIDDNPKVLEKIYEELGLSLGEELLKPTRIYVKPVLKVLERVNVKGIAHITGGGFFENIPRAFPKGYFAIIEKGSWEVPAIFRLIQEYGKVEEREMFSTFNMGIGMVLIVSEEDVDLTMKILEQEKVNAWVIGTIQKGEDGVVLK >NC_012034|1530781:1542927|1539506_1540736_-|WP_015907913.1|DBSCAN-SWA MTDKFDFETPNYQPSYSPINFEIPKTIRKKKSVKEYIVAGLLGGLIGAILMSIFFMAYFGVNFNNFKNDINSTLNSFNLNNSTATEPITKTVVLNSGNSSFVTDVAQKVGPAVVGIKNKGTAYNWWTDEEQEITIGEGSGVIISKDGYVVTNNHVVSGAKSVSVILSGEKEVPATIVGTDALSDIALLKIDPKYVKAVAPLGDSSKVKVGEFVVAIGNPLGQEFAGTVTFGVVSAVNRKLDMGNGVQIPLIQTDAAINPGNSGGALVNSSGEVIGINTAKISQTGVEGMGFAIPINYVKPIINDLMKYKKVLRPTIGISVMEYYDRSGNIMGMYISKVYPGTGAAKAGLKEGDIILQIDGKKVTTFSDIQSILSNHKIGDVITIRVLRDGQTKDFKVTLGTPVNTTTND |
11 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
2086560 : 2138091
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_012034|2086560:2138091|DBSCAN-SWA 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48 | uncultured_virus(25.0%) | coat,transposase,integrase | attL 2095479:2095525|attR 2138274:2138320 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2574181 : 2621302
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_012034|2574181:2621302|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(10.53%) | transposase,integrase | attL 2570865:2570885|attR 2610158:2610178 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2753762 : 2819517
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_012034|2753762:2819517|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_phage(40.0%) | protease,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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