Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014029 | Yersinia pestis Z176003, complete sequence | 6 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,cas3f,cas1,csa3 | 3 | 9 | 14 | 1 |
NC_014017 | Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
NC_014022 | Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NC_014027 | Yersinia pestis Z176003 plasmid pPCP1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014029_1 | 1716154-1716275 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014029_1
|
1 spacers
spacers of NC_014029_1
>1.1|1716187|56|NC_014029|CRISPRCasFinder TAGTGGAGGGGGAGGATTGAGTTTTTTCCAAAAAAACATATTGCAGTATTAAATCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014029_1
The CRISPR arrays of NC_014029_1 >merge|NC_014029|1|1716154-1716275|CRISPRCasFinder CTTAATGCCAATATTAATCGACATAATCAATTGTAGTGGAGGGGGAGGATTGAGTTTTTTCCAAAAAAACATATTGCAGTATTAAATCTCTTAATGCCAATATTAATCGATATAATCAATTG >NC_014029|1|1|1716154-1716275|CRISPRCasFinder CTTAATGCCAATATTAATCGACATAATCAATTG TAGTGGAGGGGGAGGATTGAGTTTTTTCCAAAAAAACATATTGCAGTATTAAATCT CTTAATGCCAATATTAATCGATATAATCAATTG
>NC_014029.1|WP_002213038.1|1715154_1715901_-|SDR-family-oxidoreductase MKKTILITGALSGIGNTATKLFSEMGYNVVFSGRRPEEGRVILDDLKRINKDVLYVNADMNSESDIKHLIEMTLERFGSLDVAVNCAGTVGETAEIQAVTQDNFHLVFNTNVLGTLLAMKYQIPVMVERGKGSIINISSIAGLVGLPSTGIYVASKHAIEGLTKTAALEVATTGVRINSISPGPVEGKMFDRFLGHDENNKKAFIEMMPNKRFTTQEEVAHTIVFLAEDNVTAITGQTITIDGGYTAQ >NC_014029.1|WP_002213039.1|1712583_1715001_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTTTLDIINSAKDLDPAEYRAFFLQSKAPLFYDLRFLIAAEQSPLLNVSKIFYLLARDEGRLIALVPLYLQEFRSADPLGLLISSAKLSIESEERGLFSHIIHCTDTTIPTLSHDPSLYARIFDAITAIAQAELARYFCFLNVQDGVLLREAQRNGLNINYMVDKFSIELDAFPDFDSFAQALPKYRRYEMVRQLRIFNRSDAKVRILAPPFDNEIEKLARLYYLTTQRLGTPYYWPESQLAVFCRLCGDLVRLIVVEQNGQIVSGFICFEEDGALHFWSAGMDDESSDFSPYTLGVSAVYRYAFEKGINLIECGRLNSHIKTRLGFKPKRLYSIVSQDLGIPAATQTSLSQLKLASQLDGEVRLASHPAFDEWYLTSVWNGRGPTRRPAGIVRAATEADVIRTIVFAKERGMEVSVRGSGHNYVGCFLRVDTLMLDISGLKGLDIDSRHKRAIVESGVSSGQLCHALAAKGLAFPTGHVKEVGISGFLLGGGLGINCSQWGGMSVFNVQALDIVTADGHLRHVSETQEPDLFWAARGAGPCSFFVVTRFYLSCYSLPRVITNSLYTLPFTYLHDLLARLEDASPPTNLQVMVSVSPPTSGDTPAVLLNILAFTDSPQEAQALCESFETRLELPLTALAINQPSNFETIYEQFSSMVVSKRFYADNILTDNTQELVSILSRYLSDAPSRGALTTIFWRGVTTYPQAAFSAHGKFFVSTYAQWDDAKDDSVNKYWLKRMYDELQEIARSRYINEYDLETRAGETSKCFAAENWERLQRLRLEYDPDGVFVDVQQLEEHGDQPGANN >NC_014029.1|WP_002213046.1|1708608_1708938_-|sulfurtransferase-TusE MLEFEGRIIDTDAQGYLKNSTDWSEALAPVLAEQEGITLTEPHWEVVRFVRAFYQEFNTSPAIRMLVKAMAQKYGEEKGNSRYLYRLFPKGPAKQATKIAGLPKPVKCI >NC_014029.1|WP_002213049.1|1708278_1708557_+|acylphosphatase MSKIYIVAYVYGVVQGVGFRYSTQRQAQQLGVTGYAKNCDDGSVEVVASGNPQAVERLMEWIRQGGPRGARVDRLLTEPYPPTPFETFSIRY >NC_014029.1|WP_002213052.1|1706994_1708185_-|23S-rRNA-(cytosine(1962)-C(5))-methyltransferase-RlmI MTVRLILAKGREKSLLRRHPWIFSGAVQRLEGDALSGETIDILDSQGKWLARAAYSPESQILARVWTFQQDEVIDCAFFIRRLQQAQNWRDWLAQRDGLNGYRLIAGESDGLPGITIDRFQNFLVLQLLSAGAEYQRETLVSALQHCYPECSIYDRSDVSVRKKEGLPLTQGLICGEMPPALLPISENGMQLFVDIQQGHKTGFYLDQRDSRLAARNYANGRRVLNCFSYTGAFAVAALMGNCQQVISVDTSQSVLDIAKQNIELNQLDLSKTEFVRDDVFQLLRSYRAQGEKFDLIIMDPPKFVENKSQLASACRGYKDINMLAIQLLRPGGILLSFSCSGLMPVDLFQKILADAALDAGHDIQFIEQFRQAADHPVIAAYPEGLYLKGFACRVM >NC_014029.1|WP_002213054.1|1706616_1706934_-|heat-shock-protein-HspQ MIASKFGIGQQVRHSLHGYLGVVIDIDPEYSLAPPEPDEVANNKTLRSSPWYHVVIEDDDGQPVHTYLAEAQLTYEDVDAHPEQPSLDELAASIRHQLQAPHLRN >NC_014029.1|WP_002213056.1|1706091_1706508_+|CoA-binding-protein MHDKDIADILKKVKTIALVGASDIPSRPSYRVMAYLLQQGYQVTPVNPKLAGELLLGQLVYAELADIPHAIDMVDVFRNSDAAYCIAQDAIAIGAKVLWLQIGVINEQAAILATDAGLQVVMDRCPKIELPRLGLEKG >NC_014029.1|WP_002213058.1|1705095_1705776_-|DUF2057-family-protein MKLGLVAGMLAVCFSFSSVAMTLKLTPEIDLLVVDGKNMSGSLLKGADSLELNSGMHQILFKVIKPLPTDPLVLYSSPPLIVVFNAHNTRSVAIKLPVINTLRDGHQFSKNPLYQLIGDNGHPLSVRHDVLRQDHLNNSTTLETVMAAYNVGKYNASVPAFAAIPPSPVSAVPGTTIPVAGVNTPHKTASLQGENVTEQMLQYWFLQANPETQKRFLIWAKKQPIH >NC_014029.1|WP_002213060.1|1704452_1704917_-|methylglyoxal-synthase MELTTRTIAARKHIALVSHDHCKKSLLAWVMENRDLLAQHELYATGTTGNLVQKATGIDVHCLLSGPMGGDQEVGALISEKKIDILIFFWDPLNAVPHDPDVKALLRLATVWNIPVATNRSTADFLIGSTLFSSEVTIAIPDYDRYMQQRLDLK >NC_014029.1|WP_002221095.1|1702337_1704392_+|DNA-helicase-IV MELKATSFGKHLSQHPYNRVRLLNAGIEVCGDKHQYLIPFNQLVSIQCKRGIVWGELEFELPQQKVVRLHGTEWQETQHFYHYLLGVWQQWSEEMSQVCAEVLHKQVESIKRIEQQDKWFKRSELGQIQVMIREAFSALPMPVERLAAFESCRADYECCLRWLQQGRHSVERCNQQWTARMLEEYQDFFQNVETSPLNASQSRAVVNGEDSVLVLAGAGSGKTSVLVARAGWLLRRNEALPEQILLLAFGRQAADEMNSRIKQRLGVDSIQAKTFHALALHIIQQGSRKTPVISKLESDSQARRALLIQHWQQQCSEKKAQAKGWREWLTDELEWDVADGDFWQDKRLAARLASRLERWVGLMRMYGGSQAEMIEQANDEVRDLFQKRIRLMAPLLKAWKTALKDEGAVDFSGLIHQAVNLLEKGRFVSPWKHVLVDEFQDISPQRAMLLAALRKQNKQTCLFAVGDDWQAIYRFSGAELSLTTAFSEHFGEGAECALDTTYRFNDRIGDIANRFIQQNPYQLKKPLNSLSKGNKKSVMILPDEQLEALLDKLSGFVKDGERILILARYHHLRPEVLQKAATRWPKLTIDFMTIHASKGQQADYVIIVGLHEGNDGFPAAARESVLEDVLLPPPEDFPDAEERRLLYVAITRAKHQVWLLQDTARPSIFVSQLSELGALVQRKP >NC_014029.1|WP_002213036.1|1716631_1716850_+|hypothetical-protein MYLLQQIELCPDQILHAWKISQNPQVSEVFEIEVVSSEEDAEEAVLFWKAYFSSLGETVIDGRHVGDTFSRF >NC_014029.1|WP_002213034.1|1717113_1717638_+|beta-hydroxyacyl-ACP-dehydratase MKNTELNFLKTNFLFNQDITNELNTSFGQDIIKKMIPHREPFLMVDNVELINIECRLIKAIRRVDEKDPVFGGHFPNDPIYPGVLQQESMFQTALILMYFLLNETAIPPAEENIIHAVGTRVYDVFHLSAVRPGELMTIRCCITEYDTFLATAIVQITVNDQIVTVGKGEFHVF >NC_014029.1|WP_002213032.1|1717627_1718911_+|beta-ketoacyl-[acyl-carrier-protein]-synthase-family-protein MSSDRIVITGVAINTPIGDTLDLVGNNLLSGKSAIGYWRNFDTSNIYSKIGGQIPEYDIEGKLHAFSNRIPDIVLSRAEKVFKQTTKGVQLSVLMAMEAWLDAGLFEHIIDPFDCGIICGGHNLSDKYLLDQQKIFSDEPEFIDAFSGLNSLDTDHSSSVAQVLNTKGFAYLVGGTCATGNIAIQTAINAIKVDKKQVVAVVCPMASFHPMMLHSLTILEAICYSQYQDTPTKASRPYDINRSGFLPSEGGAVLIFEQAEHAKNRGAKIYAELLGASVNSDANHLGDPSHEGQVRVIQDVLKKCNISPEQVDYVSAHATSTKLGDIVELKSIKRVFGSHAEKLIINAPKSLLGHTMWASGVVEAAIAIWQMRQGEFHQSHNIETLDPAVELNVCASGNVKKEVNIFLNNSFGMGGINSASLFSRYHG >NC_014029.1|WP_002213030.1|1718912_1719650_+|SDR-family-oxidoreductase MNLFISGGASGIGRSVVIAALSKGWNVGFSYHNNKEGAQQLLDIAVAEFPRQLCRAYQLDVIDSGAVEYVGDRLLVDFSNIDAVVCNAGIDLPGNLVSMTDEDWALVLNTNLTGTFYLIRYFLPLFLANKYGRIVTLSSLAKDGSSGQAAYAASKAGLVGLTKTTAKEYGHFGITANVVVPGLINTEIIGDDIKGIKNFFAQYAPVGRLGSPSEVAEAILFLVAKESSYVNGAVFNVTGGIDWVY >NC_014029.1|WP_002213028.1|1719665_1720904_+|hydroxymethylglutaryl-CoA-synthase-family-protein MNSIGIEKISIYPSSLALKLSELAQARGGDNKYIQESLMVIKRSLVPQWEDAVTLAVNSAKDMLNDQDRSDIGLFIIATESGLDQEKAISTWAHRYLGLPATCRVFELKSACHAGAAALKMAESWISSGLNRGKKVLLINVDISNNMICHGKMEYSLGAGAIALLISDNPVFAVIETGKSGIHTHEVTDVIRPLPWKEVAFDVEASLFSYMDGLENAFEEYCHQTPEARESTYFNYNLYHVPFPGISKEAHKVLLELQGLFGKEALATSFKQKVMPSLYYAQKIGATYCGSIFLSLFSLMVKAPEIKSGDRIGVYSYGSGSCAEYFSMQVGDQAVEIAQQQGAALDILLTQRKILDVAAYEQLENARSAQMQGKDYRLDGDNLQDWYTHHYSGSGLLILERIDNHLRRYRYA >NC_014029.1|WP_002213026.1|1720896_1721616_+|enoyl-CoA-hydratase/isomerase-family-protein MHEYVTVPIKFSPDSLADFENRFISALNDERYKVIVLIGGPTYFSMGMDLTYISTHYDADFVSQFCHILKMVRNSHKPVLAKVEGNVIAGGLALLSVVDFILSSDSASFSLPEVTFGITPTIAMSCLLERIRPHHLKYFVWSSSVISAKQALKWGLIDQINTLENLDQDIQVISNKLSRIPKSAIRESKLLLAEQYSFEESLDLGSHLLVERLNDAQTIEKIRHYLEDIKLFNDEYADD >NC_014029.1|WP_002213025.1|1721617_1722370_+|enoyl-CoA-hydratase/isomerase-family-protein MKKIYLRKSDEGIAFMHINDPVNKNAIDDEFCLQLHGIVDTIKQDKTIKVLILVGLPDIFCTGGTEAFLQSLITHYKTNIEHEYANHLKHFLNIPIPVIAAMEGSATGGGLVLGLYADILVAAEESRYGMSFMNMGFTPGMGSTAMSKEAFGYYTGFEMMVTGNYIRGSELKGKCCFNYILPRAMVMEKAIELATSIAEKPRHSLELLKKYMSIDRRKMLEETSTIEAFMHHIAFNQSNIEQQIQDNYTG >NC_014029.1|WP_002213024.1|1722372_1723161_+|SDR-family-oxidoreductase MLNNLSEMTVLVTGGTKGIGRATVESFVKAGAKVYGTYFWGDNLDELENHFSQYLNRPVFLQADISDEEITTQLIEKIAQENKKIDILILNAAFAPQFKDTYKFRGLLDSIEHNSWPLITYIDCIKQHFGQYPGYVVAITSEGHRSCHITGYDYVAASKAVLETLTKYIGARENIIINCISPGVVDTEAFELVFGKKAQAFIRKFDPDFIVSPEAVGNVSVALCSGLMDAVRGQVITVDNGRMFTDNFTKWIDMIETNFIEK >NC_014029.1|WP_002228570.1|1723247_1723688_+|lipocalin-like-domain-containing-protein MSNPNRNLFLGRWKLESCIGNSGGIHIYPIGREPFGMLIYTEQYMMVFISSVERTQFSTEDIRAIPSEQIVADFPKFETYCGHYIVNHDEKIVTHFIDNSKIPNQIGTQFRRYFSFEHEKLVLKSIDSLLLNDESWLFELVWNKQE >NC_014029.1|WP_002213017.1|1723725_1723974_+|acyl-carrier-protein MDRDHIASIVKKHIVNSIDGAKEHEIDLQKSMADYGASSLDIVSVVSGVMRELKIKIPRTELKNIKSINGLIDLFVTSSSES |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014029_2 | 1846213-1846420 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NC_014029_2
|
3 spacers
spacers of NC_014029_2
>2.1|1846241|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAG >2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAA >2.3|1846361|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT GTCAACGCTTCACTCCCTGCGCGGGGTATAAC |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014029_2
The CRISPR arrays of NC_014029_2 >merge|NC_014029|2|1846213-1846420|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAGGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAAGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAGTCAACGCTTCACTCCCTGCGCGGGGTATAACGTTCACTGCCGCACAGGCAGCCCAATAA >NC_014029|2|1|1846213-1846360|PILER-CR GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAG GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA >NC_014029|2|2|1846213-1846420|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAG GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA GTCAACGCTTCACTCCCTGCGCGGGGTATAAC GTTCACTGCCGCACAGGCAGCCCAATAA >NC_014029|2|1|1846213-1846420|CRT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATGTTCGACGATTTATTTTATTTGTATTTCAG GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA ATTTATTAAAGATGCTGACAAAAAGAACTTAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA GTCAACGCTTCACTCCCTGCGCGGGGTATAAC GTTCACTGCCGCACAGGCAGCCCAATAA
>NC_014029.1|WP_002211902.1|1844326_1845718_+|APC-family-permease MAHDATVAVGTNQTGTNNRVQLRKTLTLVQVVMMGLAYLQPMTIFDTFGIVSGLTDGHVATSYAIALIAVLFTAVSYGKLVKRFPSAGSAYTYAQKSISPNVGFMVGWSSLLDYLFMPMINILLAKIYLEAIFPGVPSWIFVGALVSLMTLFNLRGINIVANLNSVIVVVQVAIMVVFMGLLIHGVYQGEGAGTLVSARPFYSENAHLVPMITGATILCFSFLGFDGISSLSEETPNAGKVIPKAIFLTALIGGIIFIAVSYCLQLYFPDISRFTDPEASQPEIMLFVAGKFFQSVILCFSCVTVLASGMAAHAGVSRLLYVMGRDGVFPEKVFGYVHPKWRTPAINVLLVGGVALSAISFDLVTATALINFGALVAFTFVNLSVIAQFYVRERRNSTFKDHFNYLILPMIGAGTVGVLWVNLESSSMTLGLVWGAIGLSYMVWKTRAFRRALPQFTEEPAQL >NC_014029.1|WP_002216312.1|1842775_1843867_+|oxidoreductase MSANAIRVQVGPANYFSFPGAIDKLSEFYPQAALDKALWIYGERALAAAQDYLPKAFHGPQAVRAKFSTHCSQSTVADLVSAAGGDRQVVIGIGGGAVLDTAKVVARQLGVPLVAIPTIAATCAAWTPLSVWYNEAGQALNFEIFNDANHLVLVEPRIMLHAPVEYLLAGIGDTLAKWYEAVVLSPQPETLSLTVRLGLQAALEIRNVLLKQSEAALQAVAQGELTQDFLDVVDAIIAGGGMVGGLGERYTRVAAAHAVHNGLTLLPQTEHFLHGTKVAYGILVQTALLGQDEVLRSLIVAFNQLGLPTHLAALDVDINDREAIDRVIGRILKPGESIHYLPIALNSEKVWAAIEQVEIAAQH >NC_014029.1|WP_002216311.1|1841596_1842490_-|sugar-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSSIPPSRLEMRNISISFSGFHALQEVDFTLEGGSTHALIGANGAGKSTLMAILSGAHNHYRGEIFIDGQPIDIHSPRQARQHGIHVVQQEVDVALIPTLSVAENIMLDELADRGHLFNWPQLYRQAEALLEQLELKLNVRQRLESCTLAEKQQVLLARALSHQCRFLILDEPTAPLDQEESARLFRVVRRLQSEGIGIVFISHRIHELREVCDQLTVLRDGRRVSHDTMEGMSGEQIVEKMLGHTLEDISPLGERQSAAKHGCRKHYCRKHCYRSAAYMISISCAISPSHYIRAKF >NC_014029.1|WP_002216310.1|1840949_1841639_-|sugar-ABC-transporter-ATP-binding-protein MRDISLTLHQGEILGIAGLAGAGKTELCKALFGDTPSTLERGELSGKAWRPRSPDRSVAQGLALVPEERRKEGIFIDEGIPMNLSVAADDSFSRWSLFSRRQELSWAKELIERLGIRTSSPQQKLAHLSGGNQQKVAIGKWLRGDAQVLIFDEPTKGVDIKAKQDLFSLIDQLAQQGKGIIYASGEFSELVGLCDRICVLWDGRIVAELNAAEVDEETLLLFSTGGTPQ >NC_014029.1|WP_002211900.1|1839957_1840953_-|ABC-transporter-permease MSKELPLPDVQPWRHQLFDFLYKWGMLLTVVALIALFGLASDNFLDPNNIINILRSIAIVTVIAIGVSISLSIGGFDLSVGSTASLANAVVVSLFVWYGFGTTGAIILTLLICTLVGLFNAFLIVVLKIPDMLATLASLFVIQGVAMTYSRGGSITQSMLLPSGDMAEGVIPEIFSALGQVPVIVLIMLAVTVVVQLYLSLTKHGRRMYAIGGNPQAARLAGIRTVRYRVLAYVLSAQLAALGGILLASRIGSSQVNAGSGYLMDAVAAAYIGFSLAGSGKPNAFGTLIGAIILGVLQNGLVMLSVPYYAMDIIKGLVLAMALALTYIQKR >NC_014029.1|WP_190947800.1|1839579_1839693_-|gluconate-5-dehydrogenase MDVFTASLRSACSLRRGHFVNNLTYLFNFFLYSCSRS >NC_014029.1|WP_157131899.1|1839278_1839569_-|hypothetical-protein MQQKNNLENFALSICLAEGFPDGEINSEAFSAVGAYVELGAYPVEAYEEVSELAKKFLEKKYISKNGESKLTVMKCIDLSQSSELSAIKDKYTRHI >NC_014029.1|WP_002211898.1|1838296_1839124_+|SDR-family-oxidoreductase MKKVAIIGLGWLGMPLAQSLSRRGIDVVGSKTTPDGVDAARMSGINCYPLVLTPELICEPDDLAQLMAVDALVITLPASRTTAGGDHYFQAVQQVVDSALAFGVPRIIFTSSTSVYGETRGRIKESSPLQPVTVAGKTLMALEQWLHQLPHTSVDILRLAGLVGTDRHPGRFLAGKTGVKGGSQGVNLVHQEDVIAAIELLLNRPKGGHLYNLCAPIHPRKRDFYPACARALQLTPPEFAVEEQEGANREIDGSKICSELGFEYLYPDPSRMPLN >NC_014029.1|WP_002231208.1|1837873_1837921_-|his-operon-leader-peptide MNRVQFNHHHHHHPD >NC_014029.1|WP_002211896.1|1836691_1837591_-|ATP-phosphoribosyltransferase MLDKTRLRIAMQKSGRLSDESQELLSRCGIKINLQQQRLIAFAENMPIDILRVRDDDIPGLVMDGVVDLGIIGENVLEEELLNRRAQGDDPRYFTLRRLDFGGCRLSLAAPLDAEYTGPQCLQDTRIATSYPHILKQYLDKQGVRFKSCLLNGSVEVAPRAGLADAICDLVSTGATLEANGLREVEVIYRSKACLIQRDGEMSVDKQQLIDRLMTRIQGVIQARESKYIMMHAPSERLDEIITLLPGAERPTILPLAGDKSRVAMHMVSSETLFWETMEKLKALGASSILVLPIEKMME >NC_014029.1|WP_002211904.1|1846454_1847885_-|exodeoxyribonuclease-I MSDKNKQPTFYVHDYETFGQRPALDRPAQFAGVRTDLDFNLVEEPLVIYCKPADDYLPQPEAVMITGITPQHALANGVNEAEFSRQIHQAFSVPGTCILGYNNIRFDDEVSRNIFYRNFYDPYAYSWQGGNSRWDLLDVMRACYALRPEGIVWPENDDGLPSFKLEHLTKANGVEHLQAHDAMSDVYATIAMAKLVKQAQPRLFDYLYQHRSKHKINALIDIAEMTPLVHVSGMFGAARGNTSWVAPLAWHPENKNAVIMCDLAGDMSPLLELDSDTLRERLYTRRDKLQAQESAIPIKLVHINKCPVLAPAKTLLPENADRLGIDRQRCLQNLQLLRQNPQVREKVVALFAQAEPFAVTDDVDTQLYNGFFSDADRATIKIIQQTESQNLPALDLTFQDPRLEALLFRFRARNYPNTLNDSEQQRWLQHRREALSPERVQDYVLQLEQFYNQYEDDKEKLALLKALFEYAKGLVS >NC_014029.1|WP_002211905.1|1848177_1849287_+|SDR-family-oxidoreductase MKKLLLTGATGFLGGAVLEKLLLASSDFNYLLLVRANTPEQGLMRIRENLEKFYLPNELINKININHVLLGDLAEPDSFINDVRIDDVTHVINCAAIASFGNNPLIWKVNVEGTLAFGKRMAQVAGLQRFVHVGTAMACTPEADTVVDERVLSTENDAHLVEYTKSKSAIECLLAEHCPTLPLVFARPSIVVGHTRLGCQPSSSIFWVFRMALMLRKFMCSLDDHIDVIPVDYCADALLYILEYPNLPDDIYHISAGEKGSVSFSEIDQAMSVAAKQKPVGVNYSQVEYTALVQMRNQLKGIFGPCNERLMLKAMRLYGSFAMLNVRFSNERLLSLGMPRTPRFTDYIARCVESSHGMTIQQQMAVDFK >NC_014029.1|WP_002217522.1|1849720_1850038_+|DUF496-family-protein MDNASKPTFQDVLEFVRMFRRKNKLQREIVDNEKKIRDNQKRVLLLDNLSEYIKPGMSIEEVQAIIANMRGDYEDRVDDYIIKNADLSKERRELSKKLKAMGEVK >NC_014029.1|WP_002209743.1|1850408_1851617_+|IS256-family-transposase MDEKKLKALAAELAKGLKTEADLNAFSRMLTKLTVETALNAELTEHLGHEKNTPKSGSNTRNGYSSKTLLCDDGEIELNTPRDRENTFEPQLIKKNQTRITQMDSQILSLYAKGMTTREIVATFKEMYDADVSPTLISKVTDAVKEQVAEWQNRQLDALYPIVYMDCIVVKVRQNGSVINKAVFLALGINTEGQKELLGMWLAENEGAKFWLSVLTELKNRGLQDILIACVDGLKGFPDAINSVYPQTHIQLCIIHMVRNSLKYVSWKDYKAVTSGLKMVYQAPTEEAALMALDKFAEAWDDKYPQISKSWRTHWENLNTFFGYPPDIRKAIYTTNAIESVNSVIRAAIKKRKVFPTDDSVRKVVYLAIKDASKKWSMPIQNWRLAMSRFIIEFGDRLSDHL >NC_014029.1|WP_002216388.1|1851579_1854732_-|inverse-autotransporter-beta-barrel-domain-containing-protein MSLYRISSLHQAKQLNKNKQLNKTRISKSVVWANIVIQAIFPLSIAFTPAVMAAETVGASDEKPRSASQAEQSTANAATRLASILTNDDSAKQASSIARGTAANAGNEALQKWFNQFGSAKVQLNLDEKLSLKGSQLDVLLPLTDSPDLLTFTQLGGRYIDDRVTLNVGLGQRHFFAQQMLGYNLFIDHDASYSHTRIGVGAEYGRDFINLAANGYFGVSGWKNSPDLDKYDEKVANGFDLRSEAYLPTLPQLGGKLIYEQYFGDEVGLFGVDNRQKNPLAVTLGVNYTPIPLFTVGVDHKMGRAGMNDTRFNLGFNYAFGTPLTHQLDSDAVAIKRSLMGSRYNLVDRNNQIVMKYRKQNRVTLELPARVSGAARQTMPLVANATAQQGIDRLEWEASALTLAGGKITGSGNNWQITLPSYLSGGEGNNTYRISAIAYDTLGNASPVAYSDLVVDSHGVNTNASGLTAAPEILPANASASSVIEFNIKDNANQPITGIADELAFSLELVELPEELAKAKARSVPLKTVSHTLTKITESAPGIYQATLTSGSKPQLINITAQINGVPLADVQTKVTLIADESTATLQTSSLQIITNGSLADDTDANQIRAVVVDAYGNKLSGVQVNFTVGNNAKITETTLSDKQGGVTAAITSTKAGTYTVTAELNGVTQQIDVNFIPDAGTATLDDSDEYKLQWVTNGQVADGESTNSVQLTVVDKFGNTVPGVDVAFTTDIGAIISEVTPTDANGVATAKIISSQAKSHTVKATLNRKEQTVEVNFIADTATAEITANNFTVEVDGQVAGSGTNQVQALVVDKKGNPVANMTVNFTATNGVVVETTSAKTDENGKVTTNLSMTNVGGTISTVTATMINSANVTSTQDKPVIFYPDFTKATLNTPANTYSGFNINSGFPTTGFKNTHFQLSPHGITGANSDYDWVSSHPNVSVSNTGAITLQDNPGGKVTITATWKHDSSKVFTYDFTLNYWVGLYSSTNLSWAQANASCINAGMRLPTNREVSAGQDVRGVGSLLSLSIILCNCHRIKGDRSGGHRTR >NC_014029.1|WP_002211911.1|1855756_1857061_+|MFS-transporter MSNFNHYPDPTLNSAIKKAWYRLMPLMFIMYFVAFIDRINVGFAKDAMSADIGLSQSAFALGAGIFFAAYALFGIPANLMMNKLGAKVWLSSTTVVWGLLSAGTGLVSNEYQFVILRFLLGVAEAGFYPGILLLASIYFPNKIRASVIGIFVLGVPAALTLGSPISGALLDMQGFLGQPGWFWMFLLEGLPAVGLGIFAFFYLDDSPATARYLNPEEKQALLTQLSIEQSDTESSSVKAVLLSPKVWHLALIYGTIQVGVYGLIFFLPSQVATLLGSTLGFKESLVAAIPWAFSALGVYYIPRYADRKTHRRNPIATLNLVVAAIGLIISAYASPVLAIAALCLCAIGFLAVQPIFWTFPAQILSGKALAAGIGFCTTMGAFFSFLAPIIRVEAESQFNSPPAGLITLALFSLLSATLIFSLKFWPAKATAEVI >NC_014029.1|WP_002211912.1|1857069_1857492_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MSAPLPYIKPGERVIIYDGVCALCTGWVNFLIRHDRRHTVRLSAVQSKKGHALLEWAGLPTDKINTLVLIENQQVYLRSEAIFRVIANLPWPWRILGVLRIFPRPLRDRCYDGIALNRYRLFGRYDAVRKLKADHERRFL >NC_014029.1|WP_002216393.1|1857919_1858660_+|SDR-family-oxidoreductase MNLKGKKALVTAAGQGIGFNTATLFARKGAEVIASDINIAALSNIPGITAVSLDVTDTLAINDVAQAIGPIDVLFNCAGVVHSGDILTCSEQEWQFALDLNVTAMFHMIRAFLPGMIACQQGSIINMSSVASSIKGVPNRFAYSTSKAAVIGLTRSVAADYVTQGIRCNAICPGTVESPSLRQRIAVQAHAEGRSEADVFQAFAARQPIGRIGKAEEIAQLALYLASDASAYTTGTIHIIDGGWSN >NC_014029.1|WP_002211916.1|1858707_1859550_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKLLRYGPVGEERPALLDELGEIRDLSAHIEDISGKFLLPATLYKLRQLDSASLPLVRGEQRLGACVGHVGKFICVGLNYADHAAETGAEIPQEPVIFNKWTSAIIGPNDDIEIPRNSVKTDWEVELGVVIGTGGRYIGEANAMSYVAGYCVVNDISEREFQLEHGGTWDKGKGCDTFGPIGPWLVTRDEIPDPHQLGLWLDVDGRRYQNGSTRTMIFKIPQIISYLSRFMSLQSGDVISTGTPPGVGLGQKPPVYLHAGQIMRLGIEGLGEQCQKTIQA >NC_014029.1|WP_002211917.1|1859581_1860859_+|L-fuconate-dehydratase MTIITALRTEDVRFPTSLELDGSDAMNPDPDYSAAYVILDTDNPALSGHGLTFTIGRGNEICCVAIHALEHLIVGRDLASMTANMGKFWREFTSDSQLRWIGPEKGAIHLATGAVINAVWDLWSKAEGKPLWRLVADMSPEELVRCIDFRYITDCITPEEALTLLQQRAHNKALRLEKLQDEGYPCYTTSAGWLGYPDDKLRRLCQDAVDAGFDYLKLKVGRDLEDDIRRVRITREVLGPDRKLMIDANQIWETNEAIPWVNQLAFANPWFIEEPTNPDDIEGHRRIRQGVAPVKVATGEMCQNRIMFKQFIMREAIDVVQIDACRLGGVNEVLAVMLMAAKYDLPVCPHAGGVGLCEYVQHLAMIDYLCIAGTDKGRVIEYVDHLHEHFVHPCVIKNAAYMPPEQPGFSIEMHQSSIEKYRFRV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014029_3 | 2721665-2722112 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of NC_014029_3
|
7 spacers
spacers of NC_014029_3
>3.1|2721693|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT TCAGGGGACTGGCGAACAATGTCTTTCATGAT >3.2|2721753|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGTT >3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGAT >3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGCCATTCCGTGAACCTGAGCGCGTTCGCGA >3.5|2721933|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATTCTCGAGCGATAGCAATAGCCATTCCAC >3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGGTCAAACAAATTTAGGCGACGATTTAACA >3.7|2722053|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAGAATTTGGGATTAAAGTTACCCATCAG |
cas1,cas3f,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014029_3
The CRISPR arrays of NC_014029_3 >merge|NC_014029|3|2721665-2722112|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGATTATTGCCTGTGCGGCAGTGAACTCAGGGGACTGGCGAACAATGTCTTTCATGATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGAAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGTTTTTCTAAGCTGCCTGTGCAGCAGTGAACATTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTCGCCATTCCGTGAACCTGAGCGCGTTCGCGATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACATATTCTCGAGCGATAGCAATAGCCATTCCACTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTCGGTCAAACAAATTTAGGCGACGATTTAACATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAAAAAGAATTTGGGATTAAAGTTACCCATCAGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NC_014029|3|3|2721665-2722112|CRISPRCasFinder TTTGATTATTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCAGGGGACTGGCGAACAATGTCTTTCATGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGTT TTTCTAAGCTGCCTGTGCAGCAGTGAAC ATTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCGCCATTCCGTGAACCTGAGCGCGTTCGCGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATATTCTCGAGCGATAGCAATAGCCATTCCAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCGGTCAAACAAATTTAGGCGACGATTTAACA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AAAAAGAATTTGGGATTAAAGTTACCCATCAG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NC_014029|3|2|2721665-2722112|CRT TTTGATTATTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCAGGGGACTGGCGAACAATGTCTTTCATGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGTT TTTCTAAGCTGCCTGTGCAGCAGTGAAC ATTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCGCCATTCCGTGAACCTGAGCGCGTTCGCGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATATTCTCGAGCGATAGCAATAGCCATTCCAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCGGTCAAACAAATTTAGGCGACGATTTAACA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AAAAAGAATTTGGGATTAAAGTTACCCATCAG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NC_014029|3|2|2721725-2722112|PILER-CR TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAAAGGTAAGATGGGCAAGCTTCTAGTAGTT TTTCTAAGCTGCCTGTGCAGCAGTGAAC ATTATCTGAATGGCATTTTCTTTGGCGCAGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCGCCATTCCGTGAACCTGAGCGCGTTCGCGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATATTCTCGAGCGATAGCAATAGCCATTCCAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TCGGTCAAACAAATTTAGGCGACGATTTAACA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AAAAAGAATTTGGGATTAAAGTTACCCATCAG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
>NC_014029.1|WP_002210191.1|2720324_2721305_-|type-I-F-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MENAIHSSDLKTILHSKRSNIYYLEYCRVLVNGGRVEYVTDEGKQSLYWNIPIANTTVIMLGTGTSVTQAAMREFARAGVLVGFCGGGGTPLFAANDVEVNVSWLTAQSEYRPTEYLHDWVSFWFDDEKRLAAAVAFQRIRIAQIQQHWLSSHIQRESLFPVNHDQLLFILTRFEQNLANCLTSNDLMVQEAVLTKALYKLAANTVNYGDFTRAKRGGGIDLANRFLDHGNYLAYGLAATATWVIGLPHGLSVLHGKTRRGGLVFDVADLIKDALVLPQAFIAAMQGEEEQEFRQRCISGFQRTEALDVMIDGIKETAALCSQVPR >NC_014029.1|WP_002221142.1|2717040_2720328_-|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MNILLISQCHKRALNETRRILDQFAERKGDRTWQTAITQEGLNTLRKLLRRTARRNSAVACHWIKSNNQSELLWIVGNLRRFNAEGTVPTNTTQRDILRSQDENNWHSVETIALLAGIAGLFHDFGKANVLFQQGLQGQGKTYQPYRHEWVSLRLFQAFVEQKNDIQWLTALSQINPADETTLMSNLVKDGLDDYTNPLAALPPLAKTIAWLILSHHRLPVYPSKDYHRPPKVEEIDDWLHQQLMPVWNSTNMDSGDWREKDKLDVWRFPHGTPLQSAEWCKKAQKFAKRALRQPSLVNDGHLNQRFTSHMARLVLMLADHHYSSLPATPGWQDKNYQVFANTHNKMRDANAHSKTIEMKQRLDEHNIGVGQNALLLGRSLPHIRKTLPAITRHKGFKQRSVQEKYRWQDKAFDLAVTLRERSLQQGFFGVNMASTGCGKTFANARIMYGLSDEKQGCRFSVALGLRTLTLQTGTALQQKLTLQKDDLAVLIGSQSVLQLYQLNNDKLEPRGTGSQSADKFFSEHQYVSYDGSLDDGRLSTWLSNNDRLKRLLCAPVLVCTIDHLIPATESLRGGKQIAPMLRLLTSDLVLDEPDDFDRNDLPALCRLVNWAGMLGSRVLLSSATLPPALVQALFNAYRAGRADYQQASGQPDTPVNICCAWFDEHGVAQQDIQQSKDFIQHHGDFITRRVGKLSTAEVLRRAELIPVSSASVKNGSVLDAMAAVMRDSMLRLHQAHHQTHPSEKTVSVGVVRMANIDPLVAIAQRLYAMAAPENYRIHYCVYHSQHPLAVRSAIERRLDVTLTRYQPNALWQVAEIEHALQHHPEQHHLFVVLATSVVEVGRDHDYDWALAEPSSMRSFIQLAGRVQRHRQVAPQMANMHILQKNFKALTQKDPAIPVYCKPGFETTRCRLNTHDLDKLLLPSQYKVINAISRIQERTKLEPRDNFVDLEHLSLRLILQGSAEPLKYYAALWWRKQATWSGEQQRCTPFRQSSPDEQHNLWIDDEADKPVFKRLDSDQIEWKVSDGFQDVELTLAAGNSAWIDTDCLRIYQWLAESLNKELNEVSRQFGEVRLPKKDGERWHYHPLLGVFGALD >NC_014029.1|WP_002222491.1|2715286_2716633_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy1 MSDEGLAAFIVSYIKSREQPKLEAFDKEAEKRLAGLTQAEDIALAQQEIAQQRQELIARYEVRNWLTDAANRAGQIKLATHAPKYTHSDSKSSGILNIELQSKKKDYFSSVDLAEQASDVIGNAAVFDLVKLLQSECEGGSLIKCLEQGDNSVLKLFSNDDELVEEWTTKFKSILNNEKFTSHKLAKQFYFPVGPDQYHLLSPLFSSSLAQAMHQRIIEARFSDQSKEAKAAHKAGRWHPTVRVLYLDTAVQHIGGTKPQNISYLNSVRGGKVWLLPCGAPSWKNIQKPPIKYRSIFHDRSEFTVLARNNLWQMQLYLLGVKPLSNTMDIRAARLACCDEIIDILFNYVAEIQNLDGTNGWSDAEDCKLKRSEQLWLDPTRAMDDPVFKLEREKEDWKQEVSQDFGYWLNRWLQHDELVFGYVEQREWSSLFKQRLREFEQGSLETSS >NC_014029.1|WP_002211868.1|2714339_2715290_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MSSLIVLHQVRVENANAIAGLTYGFPAITHFLGYSHALSRKLQSSHGLTLRGCAVICHYQQVHAYLSGWDYVFSLTRNPLTKEAKTAAFNEEGRMHMTVSLVIECDGTIANGDDGANALEKHLASLCLTQRLAGGTITNIRRVKVINYPETEVATRRLLCRLLPGFALLDRSELLAEHLNRLRQTNPQAEMLDAWLDFSALKIQAIPPQSDTPVESGAPAPWGYVGKPAAGYLVPIVTGYRAISPLYAPGEVDKTRDPHTPFRFVESLYGIGEWRGLHRITDLRQLLWGYHQEGDNYLCRCALPASVDTYLLNDEE >NC_014029.1|WP_002211867.1|2713317_2714322_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MAKATIKTASVLAFERKLSNSDAMMYAGNWGQTDNWQPIIIKEKAVRGTISNRLKNALASDPAKLDAEIQKANLQRVDVAALPFDTDTLKMSFTLRVLGNLATPSVCNDQEYQAELASVINGYISEQSFSVLAARYAENLANGRFLWRNRVGAEDIKVCITSQTKSYQFDSNEFSLRQFSQPSKELTALAQEIEQGLAGNGFAFFTVDAFVRLGNGQEVFPSQELVLDSNSKKSKVLYQIDGIAALHSQKVGNALRTIDDWYPDATELALGPIAVEPYGSVTSRGKAYRQPKQKMDFYTLLDNWVTKGTVPAVEQQHYVMATLIRGGVFGEKGE >NC_014029.1|WP_002211866.1|2712752_2713307_-|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MDHYLDIRVLPDPEFSAQTLLEALFAKLHRALVATIPGRVGVSFPTAGKTLGSQLRLHGSRGDLLELQSAGWLKGLQDYCECSEILPVPADVKHRTIRRVQVKSSAQRLRRRSVSKGWLTEEQARLRIPDSHDKRCDLPFLRLKSRSSEQYFLLFIEQGTLQASATTGEFSAYGLSVNATIPWF >NC_014029.1|WP_002211865.1|2711655_2712675_+|aldo/keto-reductase MDYIKLGHCGLQVSRLCLGTMNMGSKQWKPWVFDKAESTPLIKHALDCGINFIDLADFYSAGVGEEVVGRIVKNLMSRDELVLTTKVGYPIGHGPNNQGHSRKHIMASIDASLKRLGTDYIDIYMLHYFDINTPVEETWSAMNDIIHSGKARYTGVSTMFTWQLSKILWCCERNGFAKPINMQLQLNCAYREEEREMIPQCRDQGLGISAFSPLARGLLSCDFSSVRNKTDFFTQEMYADVTSLNIAQSVERVAKNRGITPAQVAQAWVLNHPGTDCMLVGADTIEQINSAVTALRISLNAEEHFELERNYTPCDVINDYTAGQRIAREARPPSGIFAP >NC_014029.1|WP_002211864.1|2711141_2711645_+|formaldehyde-activating-enzyme MQMYIGEGFAGNGVNAAHINIMIGPRDGVVGQAFAASLASPSQGHYPFIVVIKPNVAAKPMTLYVNKAEIRSELHGRATWGASQAAVAKAVAEALLANLFPPEAEDDWCIITANWVNIDCDDIDEVYRNNYRACTTALHAAMAKTPKRDQLTHALTQLSNPFFTPKA >NC_014029.1|WP_002211863.1|2709736_2711095_+|MFS-transporter MQTLPSEKIRMDDVPLNRFHIRIAGLTFGAHFIDGYILGLIGFALIQLKPIMALTPLWEGLLGSAALIGLFLGSLILGWISDYIGRQKIFSFSFVIITLASALQFFASTPEQLFILRVIVGIGIGGDYSVGHTLLAEFSPRKHRGVLLGAFSVIWTFGYVSASFVGHYLSMVSPEAWRWLLSSAALPALLILLVRIGTPESPRWLMGKGREDDAMAIVHKYFGPNVTLIDEEPATSTRRFLSLFGRKYWRRTAFNSLFFVCLVIPYFAIYTFLPSILNVMALSQNFATDLLLNGLLVVGALVGIVLTAFCSRRSFLISSFIFLATCLLLLSILPSNQTFWLIALFAAFTLVMSAVSNLVGVFPAESFPTEVRSMGVGFATSMSRLGSAIGTSLLPLAIVNYGMPVTTTLLAFVLIIGAIVSIAWAPETKGLTLVDASQSATTPRPPSSIIPN >NC_014029.1|WP_002216551.1|2709403_2709613_-|hypothetical-protein MVIGDLLTETDRLFQKRTAAMDDLFSSPGPVRLILFVMAMCQPKYKAASAFYAYPSEKKVRDPPLNSYK >NC_014029.1|WP_002210192.1|2722449_2723694_+|mechanosensitive-ion-channel-family-protein MQQRISQWLERLGMEFSDVMSLTMVIGLILLISVMIHLVLHRVVLAALQRRGQQSQRIWQQAITKHKLFQRVALLLQGIIINLQAVLWLQNGSQTQAVIVTAAQVWIMAFALLALFSLLDTLLALLRQSSVAHQLPLRGICQGLKLVAAIFIGIMIVSLLMGRSPLLLLSGLGAMTAVLMLVFKDPILGLVAGIQLSANDMLKIGDWLEMPKYGADGAVTDIGLTTVKVRNWDNTVTTIPTYALISDSFKNWRSMSESGGRRIKRSINIDTTSVHFLSEQEQQRLTLNPLLQHYLSEKSQELNQYNQQIALDLSSPLNGRRLTNIGTLRAYLVAYLRAHLGIHQSMTLMVRQLAPTPEGLPLEVYAFTNTTIWAEYEGIQADIFDHIFAVVSEFDLRIHQTPSGNDMRSMLAKV >NC_014029.1|WP_002210193.1|2724288_2725563_-|hypothetical-protein MKLLNTLVCIIGLTSFSSSAKLVNAEHLDALYQKVTVANKTELGLIHIYSEFPDYRWVKDPIEGVSAIDDVARAAIFYQRQYQATGSAADLEKVKSLVEFILYQRADNGYFYNFIYPDHSINKEYKTSVAEPNWWTWRALWALTQVYPTLVKTDNALAQRTRETIFATIDVIYKDFNFKQTRGEKEGVAVPEWLPHTAGDQASVLLMALSDAQALEAKPEIEKMMRSLAAGIMLMQVKDTSSPVNGAFLSWQNLWHGYGNSQAYALLVAGNRLGDRDMIKAAFNELDHFHPWLISNGLLNEFTVRQQGEKVTLIEQKKFSQIAYIIRPMVFANIKAWEISRDAVYLERAVDLSLWFFKNNPAQAQMYYPVTGIAFDGIDSATTVNKNSGAESTIEALLTLQLIESIPDAKRMLESALEKRNIKQ >NC_014029.1|WP_002210194.1|2725601_2726717_-|hypothetical-protein MKHKKYLPLFLMAGICSVAQADNSPDVVSANNMDNRTFFAGDKIRIVKDGGETIEAVVELSDDNIGIVRIPKDEKAYFHGNWLAEYKIEHFRNEGRSTNSRPVHEIVFADGRVNFGDTGWNTGFLLKQVRFTSDSRNESNHKVDFRMVEMEIRPAWSKSIDKHWFMFEGIYLGKTGYEKNRTTGGDNNIGGDGYGFRPYYRYQVSDRLSVNTDVKMLVEDKDARGADNGRFQFYEALVNVNYRVADNVHVGIEVFRKEGQDFNHNGTKTANVLEQELRPWVAWNMGKNNFLFKMEPQLRRIGGQDGYRETSKAQKYIFNYSYPIADRVYLVAEYFYRVEHDKKFWDRGVRDNKSYSDTTTHFGKLGINYIF >NC_014029.1|WP_002213840.1|2726839_2727778_-|DUF1861-family-protein MMRHAPPASVAQLFADYQKRTAHNTFSTGRLEFTGVGDKDVYNITAPFTSAGQVVIAGRVEARDSEHSTIVFFSEQQGQWAPVENAPTFQLQDPFFTRIEDELILGGVEINPHPDNPRQLIWHTVFFRGRDIHSLTRFASGPPGMKDIRLCHIQQGRIGVFTRPQGKIGGRGTIGYVEINNLEALTPETITSAELFEQQFNSEEWGGVNETHLLCDGTIGLLSHIACFDQHGRRHYYPGVFIFNPDTKNYTPIKIIAARDNFLPGATKRPDLVDVIFPGGLIVLPNNGWRLYVGASDAEAHWIDIEDPFSGF >NC_014029.1|WP_002210196.1|2727804_2728860_-|glycoside-hydrolase-family-130-protein MMRYSGNPLITPQDITPSHPGFKVECAFNAGITKLGDETIMLIRIAESVIPESEGITVVPLLMEISGHWQVTTRVFKHDDPAYDFSDPRLISDIADPSTVYLTSLSHLRVARSHDGVTFVVDDQPFIFPANGDEAFGCEDARITQIDGAYYINYSAVSAKGICTALAVTQDFTDVKRLGLIFCPDNRDACLFPEKINGKYMTLHRPAPKHFGKPEIWLASSLDLLHWGDHRHLLGTSQDPWDALKLGGGAQMLKTEKGWLQIYHGVDATQRYSLGALLLDLEQPTKILAKSPVPLLQPQAPYELHGFFGNVVFTCGALIENDSLRVYYGAADECMCLAEMPLAQLWQHLSV >NC_014029.1|WP_002210197.1|2729006_2729831_-|carbohydrate-ABC-transporter-permease MKKNINSLIIHLVMFSLALSWLYPYIWMVLSSFKQSADIYTTGLFGSAYSLDNYRFLFENSGRVEKPFLKTLFNSLFISTVVTVAVTLSSMFIGFALAKMQFKGQSLFRNLLFLQMVFPASMFIIPQFVLVRELGLLNTYSAMIVPFLMSSWGIFMISQSFQGTPNDYIHAAKIDNASLWQIMIYLMMPLNKAIIAIVALFTFVGTWDNFLWPLIVIQDESKMPLSVLLATFSKSYGVYVGPVIAGAVIQTIPIVVLFILFRKYFMQGMSLSLK >NC_014029.1|WP_002210198.1|2729831_2730707_-|sugar-ABC-transporter-permease MTFLKLKDKQVGSVLAASYLGYTSIFWFYPFIWLAVLSLTEWRFVGIPTFNGLNNFILVMQDPLFWKSMLNVMRFLMYYLPIVFISSFLFAFGLQKLKHGRTFVALSFLLANVSSGVAYSIVFSKIFSQNGPLNTFLYDWFGFTLPWLTSPDFAMLSIALVVTWKFVGYYGLILFSGLNSIPKEIYSAAELDNTRTIKRLFHITLPMINPQLIMVLVLAITVSFAIFTEPYLITGGGPLNSTTTPMIVMYETAFMKMQPSWAATMSIFIALISFGIILGVRKLLERKVEIV >NC_014029.1|WP_002210199.1|2730815_2732102_-|carbohydrate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MLEKMKNTLISLAIASSCVVFTGCDNDTASAKNEKQDITLWIAPNNVQEAFWSEVVGEWNKQPDKKKVVFSTIPAAGSSEEAIMNAIASDRAPDISENIFTGFGSQLADLGQVVDLSTLDGYENLISTRQMTDIMDNWRYNGKNYILPIYMNPVLFWWRGDLLKEQGFSEVPKTYDEVYALSEKYTIPDKRYAIQATSGRNWWDRWFDFIALYYAQSDGKPYIANQQASYDNQAGRDVLDFMHTLFSKKWTLYDFGQDDPLVTGKVLGAVRGPWDISRYQQQYPEILKHIKMGPMLVKEQQDKPHTFADGKGLVLFSHSKVKPEAWEFIQWVFSQPKFDKRWMELTGMPPARADLLTNPFFAEYYQEHPYAAAYAEYVNVAIPPVSSGETVEIQRSMTQMIEKTAFNTATPDEALQQSIKEVNAILKP >NC_014029.1|WP_002210200.1|2732373_2733414_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MTTGKKRETLKTIAETLNVTHTTVSNVFNRPEKVSPELREKILAYAESINYHGPAGAGRFLRTGKCGTLGVIFNDNLSYVFSDRHDIALMRGIAEECEKNGINIALMPLKTNNALKKRMMGALVDGYILNATYNNDEVVQAALTSGLPVITTDIKLQNFTCVSIDDGAAMQAICHHLLAAGHKKFGIVSFPVKRLPGELTSLAEFSTDYDNGVAFGRISACITALSDAGIDLHTSYVAEQPHSETGGEKAAKALLAKEPGISAIICLSDRFAFGVYQFCQDHNIPVPGQIAITGFDDIDIQDPPVGLTTIRQPTVLKGREAARALISGQLDNDISLDFELVVRDSA >NC_014029.1|WP_002210201.1|2733430_2734819_+|phosphomannomutase/phosphoglucomutase MEKLTCFKAYDIRGKLGSELNEEIAYRIGRAYCQWLKPAKVVVGGDARATSVELKNALAKGLMDGGADVIDIGMVGTEEVYFATRFYGVDGGIQVTASHNPIDYNGMKLVKKDAQPISGDNGLYEIQRLAQDNHFAPPGVRGQLETQLVREHYVEHLLSYIDLNALLPMKIVVNAGNGAAGPTLDALEAALAKRKVPISFIKINHQPDSSFPNGIPNPMLPENQWSTRQAVCEHQADLGIAWDGDFDRCFFFDHLGNFIEGYYIVGLLAEKFLLTNNMGKATHNTDKIIHDPRLTWNTIDIVQTLNGTAIESKTGHAFIKDAMRHHDAVYGGEMSAHHYFREFGYCDSGMIPWLLVIELLSKKTTSLFSLIESRKAKFPVSGELNFTVSDPKTKIQQIKQFYADSAIHVTGIDGLSMEFEHWRFNLRSSNTEPLVRLNIETRGDVTLLEQKTAQLTQLLYPK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014029_4 | 2951925-2952194 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NC_014029_4
|
4 spacers
spacers of NC_014029_4
>4.1|2951953|33|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAA >4.2|2952014|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAA >4.3|2952074|33|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCT >4.4|2952135|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT AGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014029_4
The CRISPR arrays of NC_014029_4 >merge|NC_014029|4|2951925-2952194|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAACTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAAGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAGACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAAGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAACCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCTGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAAGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGAGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTATAGA >NC_014029|4|3|2951925-2952134|PILER-CR GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA GACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA >NC_014029|4|4|2951925-2952194|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA GACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA AGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTATAGA >NC_014029|4|3|2951925-2952194|CRT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CTGATACAATCATCCTATTTGTCCTATCCAGAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA GACAAGAACCGAATCTTTCGCCGTGCCGTAAA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA CCGAAATCATCAGATGTAATTAAGATTTTTGCT GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAA AGACTGATGCAAGATGGCGGTATGCGTACAGA GTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTATAGA
>NC_014029.1|WP_002214718.1|2951015_2951564_-|DUF1440-domain-containing-protein MSEKRVNLQVIAWATIIGGFVSSLVKSGTEVNMPPRVVGEISPPAANIDAWLGWLGINSHSMDYVYQGVTISGTVVLYHWLFSFVFAFVYVLLSAYWPKVRLWYSAAYGLSITVAIHGVLIPALGFRHPAYLAGETGWLWNLNGYELWSEIIGHLCWSASLEICLVAVLAFFSKPIKGIWAN >NC_014029.1|WP_002210294.1|2944630_2950609_-|alpha-2-macroglobulin-family-protein MDLLRFLLISPFALIKGLYRLSAYLLRLVGRLLRPVVGNLNWRAPQWMTKTANGLHCAFNRSEQWVAKHPKGISAAIVLLMAAASAAFYGYHWYLNRPQPIEPAPMVYQETSIRVSAPRTVNYQAQKPEAQPLSLNFMHSAAPITAMGQVVDQGISLTPAIEGEWKWATERTLVFTPKKAWPMGANYQITIDTEKLLAPQIKLNQTELNFTTPAFAYQLEKAEYYQDPQEAQKRSTIFHVQFNAPVDVASFEKQILLGLVEGKSKSEKKLNFSVVYDEKKLNAWIHSQPLMPMDKGGSVHLSINKGVNASVAATPTTQAQNKWVSVPNLYSLAVNSINATLVESDNNNGERALIIAISDAVKDKEIKNAVKAWLLPQHNFQAKESAKTSTDFYPWDMDDIDDNLLQQSTPLALTLNEAEQEYQPIFSFKFDAPSYRTLLIEVNNSLTSVGGYKMPEKIYQIVRVPDYPKTLRFMSQGSLLSMQGDKQISVAARNMTGMKLDIKRVIPSQLQHIVSFKSSEYSSAHFNRLSDEYFTEHFQYQTALNNDNPGEINYQGVDLSRYLANNPSARRGVFLLTLSAWDPEKRDNQQHSEEDYDEDQEWVGDSRFVVITDLGIITKQSQDRSRDVFVQSIHSGLPAADAKVSVVAKNGVVLLSQITDSKGHVHFPALDAFKNERQPVMFLVEKEGDVSFLPTRATYDRNLDFSRFDIDGEETPSDPRTLSSYLFSDRGVYRPGDRFNIGLITRTANWATALDGVPLRAEIRDPRDTLMSTLPITLDSSGFNELSYTTGENSPTGEWNVYLYLVGKNNETSMLLGHTTVNVKEFEPDRLKVQLQLTPERQQGWVKPQELQANINVQNLFGTPAQERRVTSRLILRPMYPSFAPFPDYLFYENRHNSDGFETELEEQTTDLQGMATIPLDLKSYADATYQLQLLSEAFEAGGGRSVAATARVLVSPYDSLVGVKADGDLSYINRDAVRKLNIIAVDPSLNKIALPDLSLSLIEQKYISVLTKQDSGVYKYQSRLKEQLVSEQPLQISPTGTDFTLVTQQPGDFILVVKDSQGQVLNRISYTVAGNANLTRSLDRNTELKLKLNQAEYLQGEEIEIAINAPYAGSGLITIEKDKVYSWQWFHSDTTSSVQRIRIPPAMEGNGYINVQFVRDVNSDEIFMSPLSYGVMPFKISTKARQAAIELASPSVIKPGEVLPIKVTTDSPQRVVVFAVDEGILQVARYRLKDPLDYFFRKRELSVQSAQILDLILPEFSKLMALTSAPGGDAGEGLDLHLNPFKRKQDKPVAYWSGITEVNGETTFNYPIPDYFNGKIRVMAISATPDRIGKVQTSTTVRDNFILTPNVPAMVAPGDEFDVTVGVSNNLQGLKGKAVDITVRLTPPPQLEVVGEAQHSLSLAEKRETLVSFRLRARSALGDAPLVFDASYGSQSSRRTVSTSVRPAMPFRTQSVMGRMEGNKHTVTNLRQMFDNYAQRQATASHSPLVLTQGLARYLADYPYYSSEQIVSRSIPLIMQSKHPEMDSALNQNEVRDQLKNMLRILSSRQNSTGAIGLWHASPTPDPFVTPYVVQFLLEAKSAGYSLPNDILEGANNALRLLAARPYDDLYSLRLRAFAVYLLTLQGEITTNTLASVQSTLQQLYPDSWQTDLSAIYLASSYRLLKMDDEANKLLQPTWKQLGKAYSKAWWTQNYFDPLVQDATRLYLITRHFPEKVSSIPPQALENMVLALRDEHYTTYSSAMSILALESYTSQVAAQQDTPETLQIIEISKSKGIDPNVISTLNGLFVQGDFTGEAKAIQFNNYASAPAWYVVNQSGYDLQPPKDAISNGLEISRSYTDEQGKPVTQVTLGQKVNVHLKIRANAKQGQNNLAIVDLLPGGFEVVQQTAPEPEFYDNQDDQDEETGSGWQSPLMVSGSSWYPDYSDIREDRVIIYGSASTDVKEFIYQIKSTNTGRFVVPPAYGEAMYDRNVQALSVGKGHILVVPPEAK >NC_014029.1|WP_002214717.1|2943695_2944574_-|transglycosylase-domain-containing-protein MRIPTLMATKRLLQNILMALFLLALLVIGFRLWPHPPLSQGLPLSTAYYDRHGTLLRLSLANDDRYRLWTPLEEISPLVIQGIQLHEDRGFYYHPGVNPISLLRGFWQSYVQGGRQQGGSTLTMQLARMHWHLNTRSPTGKLRQIARAIQLELSYSKHDILEAYLNYAPYGRNIESIAAASLIYFDKKPQQLTLPEALTLAVLPQSPSYRIDPTTGVLGSALTQARNRLFVRWQQTYPTDSSQMALFQLPLSLRQPEKMPYIAPHFIEQIRRQNQQLANTRDCKQYCVIACF >NC_014029.1|WP_002209743.1|2942453_2943662_-|IS256-family-transposase MDEKKLKALAAELAKGLKTEADLNAFSRMLTKLTVETALNAELTEHLGHEKNTPKSGSNTRNGYSSKTLLCDDGEIELNTPRDRENTFEPQLIKKNQTRITQMDSQILSLYAKGMTTREIVATFKEMYDADVSPTLISKVTDAVKEQVAEWQNRQLDALYPIVYMDCIVVKVRQNGSVINKAVFLALGINTEGQKELLGMWLAENEGAKFWLSVLTELKNRGLQDILIACVDGLKGFPDAINSVYPQTHIQLCIIHMVRNSLKYVSWKDYKAVTSGLKMVYQAPTEEAALMALDKFAEAWDDKYPQISKSWRTHWENLNTFFGYPPDIRKAIYTTNAIESVNSVIRAAIKKRKVFPTDDSVRKVVYLAIKDASKKWSMPIQNWRLAMSRFIIEFGDRLSDHL >NC_014029.1|WP_002210293.1|2942177_2942432_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGTSLMMEISIKSILKELAVSAEVDHVDLGSAKGTPSDIFIGTKDIAEQLVAQAVGGKIVALDNMIDKKARACP >NC_014029.1|WP_002210291.1|2941565_2942009_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MLKTLLTSDVIQVVSQAKDWRDAIAISCQPLIDNGAVEARYVEAIYRSHEAIGPYYVVGPGIAMPHARPEDGVNRLSLALTVITEGVTFNAEGNDPVKLLIVLAATDSNSHIEAISQLAQLFDTASDVQALLNAKTPQDILSVIARY >NC_014029.1|WP_002216059.1|2940164_2941199_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MEKIRKRRNTGRVTLQEVADYAGVGSMTVSRALRTPEQVSDKLREKIEQAVEKLGYIPNRAAGALASGHSDTVAVLIPSLTDKASSRFMQALQQILNKNEFQLLLGCHEYNQRKEAEILMTLLQSHPAAVVIFGSQLADKTYQILERTNIPIVNVVGSYFKGAKITLEAAFFESAYELTRHLLERGYQHIGYLGAHRDNQLQRQQLNGWHKSMLEHYKNADQTVTTPDAASLQFGRYALTEILLRQPELDAVICSHEDIALGVLFECQRRLLKIPSGIAVACLDGSESCDQTHPTLTSMRIDYKKMGKEAGKMLIDMLNEDDAGVKSVPLSQSFNYKFEPRQST >NC_014029.1|WP_002265141.1|2937760_2939899_+|phosphate-acetyltransferase MLIPTGTSVGLTSVSLGVIRSMEQKGVSLSVFKPIAQPRAGNDAPDQTTTIIRANSSITAAEPLNMNYVETLLSSNQQDVLMEEIVARYHENTKDAEVVLVEGLVPTRKHQFANALNYEIAKTLNAEIVFVIALGNDSPDQLKERIELARSSFGGSKNKNITGVIINKLNAPVDEQGRTRPDLSEIFDDSTKASVANIDPSQLFANSPIPVLGCVPWSFELIATRAIDMAKHLNARIINEGDIKTRRVKSVTFCARSIPHMLEHFRPGSLLVTSADRPDVLVSACLAAMNGVEIGAILLTGGYAIDDRINNLCERAFQTGLPVFMVDTNTWQTSLSLQSFNLEVPADDHERVEKLQNYVASHISSEWIDSLTAASERPRRLSPPAFRYELTELARKAGKRIVLPEGDEPRTIKAASICAERGIATCVLLGNPEEIQRVATSQGVELGKGVEIIDPVAVREQYVPRLVELRKSKGMTEVVAREQLEDNVVLGTLMLEKGEVDGLVSGAVHTTANTIRPPLQLIKTAPGSSLVSSVFFMLLPDQVLVYGDCAINPDPTAEQLSEIAIQSADSAAAFGIEPRVAMISYSTGNSGAGSDVEKVREATRLAQEKRPDLIIDGPLQYDAAIMADVAKSKAPNSPVAGRATVFIFPDLNTGNTTYKAVQRSADLISIGPMLQGMRKPVNDLSRGALVDDIVYTVALTAIQSAQADSAAS >NC_014029.1|WP_002210288.1|2936375_2937578_+|acetate-kinase MSSKLVLVLNCGSSSLKFAIIDATNGEEHISGLAECFHLPEARIKWKVDGGKQEAALGAGAAHSEALNFIVNTILAQKPALSAQLTAIGHRIVHGGEKFTSSVIVTEDVIQGIKDSIPFAPLHNPAHLIGIAEALKSFPNLADKNVAVFDTAFHQTMPEESYLYALPYSLYKDHGIRRYGAHGTSHFYVSQEAAKILNKPLEELNVITCHLGNGGSVTAVRNGKCVDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDLDPAIIFHLHDAMGMSVDQINTLLTKESGLLGLTEVTSDCRYVEDNYATKADAKRAMDVFCHRLAKYIGSYTALMDGRLDAVVFTGGIGENAAMVRELTLDKLGLLGFEIDHERNMAARFGKSGTITKDSSRLALVIPTNEELVIAQDAARLTA >NC_014029.1|WP_002210287.1|2935498_2935954_-|DUF412-domain-containing-protein MTIKPSDSVSWFQVLQRGQHYMKTWPADKRLAPVFPENRVTVVTRFGIRFMPPLAIFTLTWQIALGGQLGPAIATALFACGLPLQGLWWLGKRAITPLPPTLLQWFHEVRHKLFEAGQAVAPIEPIPTYQSLADLLKRAFKQLDKTFLDDL >NC_014029.1|WP_002210296.1|2952197_2953052_-|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MTTASNLSELQQQIRDRYDNLSKRLQQVSRYVLDNTNSVAFDTVAVIAERADVPPSTLIRFANAFDFSGFNEMKQLFRMNLVEETASYTDRARLFRAMESEAVPETPLGILQEFARSNAQALQQLAARTEPEMLQRAVELLAQADTIYVVGLRRSFSVAAYLTYALSHLECRPVQLHGLGGMLREQVNSIKARDIVVSISFSPYAEETVMVSEIAASAGARQIVITDSQISPLATFSDLCFVVKEAQVDAFRSQSATLCLVQSLVVALAYQQEAQAGAALAHRQ >NC_014029.1|WP_002210297.1|2953357_2954884_+|CoA-acylating-methylmalonate-semialdehyde-dehydrogenase METVANFINGKCVFSCGNSVTSGSPRAQAIFNSATGEPIRQVMMSTAQETEQAITAAQQAFASWSRQAPLKRARVMFRFKSLLEQHLDALAQLISEEHGKVYSDAVGELTRGLEVVEFACGIPHLQKGEHSANVGTGVDNHSLMQPLGVCVGITPFNFPAMVPMWMFPIALATGNTFVLKPSEKDPSLAVRLAQLLTEAGLPDGVFNVVQGDKTAVDVLLTDPRVQAVSFVGSTPIAEYIYQTASAHGKRCQALGGAKNHCILMPDADMDMAASAIMGAAYGAAGERCMALSVVLAVGDETADNLCARLEQQISTLRVGPGLAQEPENDMGPLISAPHRAKVLGYIDSGVAQKATLRIDGRGLKVAGHEQGYFVGPTLFDHVTPAMTIYQEEIFGPVLSVVRIADYRSAVDLINRHEYGNGTAIFTRDGGTARRFCEEVQVGMVGVNVPIPVPVAFHSFGGWKRSIFGPLNVHGNDGVRFYTRMKTITARWPEAQHDQGAAFSMPTLG >NC_014029.1|WP_002359655.1|2954918_2956844_+|3D-(3,5/4)-trihydroxycyclohexane-1,2-dione-acylhydrolase-(decyclizing) MKTVRMTMAQALVRFLNQQYVAIDGQEVAFVHGVMTIFGHGNVLGIGQALEENPGHLQVHQGCNEQGMAHMAIGFAKQYRRQRIYAVSSSIGPGAANMVTAAATATANRIPLLLLPGDIYASRQPDPVLQQIEQYHDLSISTNDCFRPVSRYWDRINRPEQLMSAMLSAMRVLTDPADTGAVTLCLPQDVQGEAWDYPASFFERRVHRIERRPPDTRRLSDALSLIARKRRPLVVCGGGVRYSGAHEAFRAFVENAQLPFTETQAGKGALPSDHPLNLGGIGVTGGLAANRLAPQADLVIGIGTRLTDFTTGSKALFSHPEVAFLLLNVAEFDALKLDATALIADARVGLEALTEGLAGYRTAWQGDIIEAKAAWCDECQRLWSRTWRPDEVPEVAGHLDDSLQEYAEVLNTTLTQTRVLGLINQHIEDDAIVVGAAGSLPGDLQRLWQVKTADTYHLEYGYSCMGYEIAAAIGAKIAMPHQPVYAMVGDGSYMMLHSELHTAVQEGLKITVLLFDNAGFGCINNLQMGHGMGSFCTESRHRNHESGQLNGPLICVDFAQNAESYGCRAWRVHDEPSLLAALAASRDHPGPVLLDIKVLPKSMTHDYASWWRTGDAQIARSPAVQQAAERTQMKVKRARQY >NC_014029.1|WP_002210300.1|2958248_2959178_+|substrate-binding-domain-containing-protein MKKLILAALIVFTSGVAFAENEQIVFSTPNLAMPFEVHMQRTAVKTAKALGVKLQVLDGQGSSPKQVADLENAITRGAQGFIVSPNDINAISSAVEEIQQAKLPVVTLDRSVESEKKVPHFGANNYKGGEAIANYVKSMFPNGAEIVLLTGQPGSSSNIERTKGIRDSLKTGGDKYRIVVDQTGNWMRSEGMRIIESVLPSLPKPPQVILSANDDMALGAIEALQSHGMKPGEIMVTGFDAVPEALARVREGWMAVTADQRPGYAVTTAMNQLVANIRDQKAITGADFLPTMITKENLDQAERVSEAGK >NC_014029.1|WP_002223323.1|2959226_2960774_+|sugar-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSQPLLKITDMAKSFSGVWALSNVQLTLEQGEIHALLGENGAGKSTLLKALSGAQPQTHGEIWFNGEMLALDDSPVERQNKGIITIYQEVNLLPNMTVAENMFLGREPRRRQVFVDEKAVNQEAQAILDYLQLNVSPTTAVARLSIAQQQMVEIARALTLNAKLIVMDEPSAALSDSEVESLHRVVRELKGRGVSIIYVTHRLHEVFQLCDRFTVFQDGRYTGSDEVAGTNVEKIIRLMVGRDVVFNRRPASETHHQDQPIRLSVQGLCREKPPLDPHGVALKDISFHVHAGEVLGIAGLVGAGRTEVARCLFGAGAFTSGNFEIDGVPYQPRDPMFALEQGIALVPEDRKKEGAVQGLSIRDNLTLSSLAGLLQWRFFVNTRKEDQLIETYRLALQIKMVNSEQAVRKLSGGNQQKVILARCMALNPRILIVDEPTRGIDVGTKSEVHQVLFDMAKQGVAVIVISSDLPEVLAVSDRIITLSEGRVTGEIHGDDASEERLMTMMTINHNALNAA >NC_014029.1|WP_002210302.1|2960785_2961814_+|ABC-transporter-permease MLQPLSKPQASVKSAMRFDPITFFERFGVLIFMFLLLIFFQLQNSNFLSERNIFNILTEVSIYGIMAVGMTFVILTAGIDLSVGSILAVSAMTAAYVIKGDNFTTIDPNAWGGMSWLIGLSICLAMGTLIGFLQGLGVTRLRLPPFIVTLGGMTIWRGLTLVINDGAPIAGFDAGYRWWGRGDLLGISIPIWIFAIVAIAGYLALHKTRWGRFVYAIGGNPEAARLAGVNVKRVLVSVYVVIGCLAGLAGFILSARLGSAEAVAGISFELRVIASVVIGGTSLMGGYGRIGGTIIGSIIMGILINGLVLMNVSAYYQQIITGLIIVLAVAFDTYAKNRRGAL >NC_014029.1|WP_002210303.1|2961837_2962971_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MKEVRIGLIGTGYIGKAHAIAYAQAPTVFELRGKLVREMVAEVSPALAAQRAQAFGFNRFTCDWRELVADPAIDVVDICSPNYLHKEMALAAIHHGKHVYAEKPLALNARDASEMAAAATRAGVKTLVGFNYIKNPSAKLAKEIIERGEIGEVIHFYGTHNEDYMADPNTPIHWHCLHATAGLGALGDLAAHIVSMAQYLVGEITQVCGDLKTVVVTRPASVGSSARVAVENEDQAHAMVRFVNGAQGVIEASRVACGRKMGLSYMITGTQGAISFTQERMAELKLYLHNDPVNRQGFRTLLVGPAHPEYAAFCMAAGHGIGFNDQKTVEVRDLIDGIAMDTPLWPDFAEGWKVSRILDAIALSHQDSRWVNVTDIV >NC_014029.1|WP_002210304.1|2963002_2964973_+|5-dehydro-2-deoxygluconokinase MSVEKQFSVSAEKTCNTENKCNTEKKFDVICMGRIAVDLYGQQIGARLEDVASFAKYLGGSSGNVAYGSARQGLRSSMLARVGDEHMGRFLREELHQVGCDTSHLTTDKKRLTALVLLSIKDRDTFPLIFYRDNCADMAITAQDFSEQYIASARSLAITGTHLSHPNTREAVLTALRYARRNGVRTVLDIDYRPVLWGLTSLGDGETRFIESHQVTAELLAVFNLFDVIVGTEEEFHIAGGSTNTLDALRGVREVSDAALVCKRGALGCSVYTEAIPQTLDEGLTVSGVRVKVLNVLGAGDAFMSGLLRGYLNDEGWPQACRYANACGALVVSRHGCAPAMPSKIELDNYLARADAVVRPDLDVHLNHLHRVTTRRRQWPELCVMAFDHRSQLEEMALQCGADLCHISTLKTLILQASREAVHTAGLQGKAGLLCDGTFGQDALNAITGAGWWIGRPIELPGSRPLAMEHGNIGSQLIGWPQEHIVKCLVFFHPEDAYSLRLEQEQKIIEVYRACCQSGHELLLEVILPAGMPRSDELYLRAISRFYNLGVYPDWWKLPPLASEGWAALNKLIERRDPHCRGVVILGLDASLEALRTGFNAAAGYPIVKGFAVGRTLFGDASLAWLKRDIDDTQLIARIRDNYLQLITLWRERGQK >NC_014029.1|WP_002214721.1|2964987_2966046_+|myo-inosose-2-dehydratase MTMVDQRTAVEPKTAVDQTTEVVRKAEVNQKIGIVRKIDIVRKTETVRKTEADRHTTAVQLGINPLTWTNDDLPSLGAETSLETCLSEGKEAGFAGFELGNKFSREAGVLGPILEHHQLKLVSGWYSGRLLERSVEEEIVAVRSHLALLRELGAKVMVFAEVSGCIHGEQQTPVHLRPRFPPARWAEYGAKLTAFARYTQALGVQIAYHHHMGTVIESAQDIDNLMIHTGEEVGLLLDTGHLTFAGADPLAVAQRWIARINHVHCKDVRTSVLADVKNRKTSFLDAVLSGVFTVPGDGGVDYPPIMALLKQHGYQGWLVVEAEQDPNVAHPMTYARMGYHNLSRLAHNAGLI >NC_014029.1|WP_002210306.1|2966055_2966871_+|5-deoxy-glucuronate-isomerase MSRLLSRRQAPDERGLTQRITPAQAGWGYVGFEVYELNEGQPLTLTAVPDERCLVLIAGRASISTPSAQFPNIGDRMSPFERHKPWAVYVTPGEAVQVQAITPLELAVCSAPGKGTYPTRLISPEDIGAEARGKGHNQRYVHNILPEDHPADSLLVVEVYTNEGASSSYPSHKHDTDNPPHETYLEETYYHRLNPEQGFCMQRVYTDDRSLDECMAVYNREVVMVPRGYHPVATMAGYDSYYLNVMAGPVRKWIFSWENDHVWINHNYPIT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014029_5 | 4129760-4130160 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014029_5
|
3 spacers
spacers of NC_014029_5
>5.1|4129822|51|NC_014029|PILER-CR GTCAACGCCACTCATTCCACAAAATCCCGCTTCGGCGGGTTTTTGCTTTGG >5.2|4129935|51|NC_014029|PILER-CR GTCAACGCCACTCATTCCACAAAATCCCGCTTCGGCGGGTTTTTGCTTTGC >5.3|4130048|51|NC_014029|PILER-CR GTCAACGCCACTCATGCCACAAAATCCCGCTTCGGCGGGTTTTTGCTTTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014029_5
The CRISPR arrays of NC_014029_5 >merge|NC_014029|5|4129760-4130160|PILER-CR AGGATAGGGCGTGAGAGGAATGACTGTCCACGACACTTTTCATAAAAGAAAGCGGCTTACCGGTCAACGCCACTCATTCCACAAAATCCCGCTTCGGCGGGTTTTTGCTTTGGAGGATAGGGCGTGAGGGGAATGACTGTCCACGACACTTTTCATAAAAGAAAGCGGCTTACCGGTCAACGCCACTCATTCCACAAAATCCCGCTTCGGCGGGTTTTTGCTTTGCAGGATAGGGCGCGAGGGGAATGACTGTCCACGACACTTTTTATAAAAGAAAGCGGCTTACCGGTCAACGCCACTCATGCCACAAAATCCCGCTTCGGCGGGTTTTTGCTTTGCAGGATAGGGCGCGAGGGGAATGACTGTCCACGACACTTTTTATAAAAGAAAGCGGCTTACCG >NC_014029|5|4|4129760-4130160|PILER-CR AGGATAGGGCGTGAGAGGAATGACTGTCCACGACACTTTTCATAAAAGAAAGCGGCTTACCG GTCAACGCCACTCATTCCACAAAATCCCGCTTCGGCGGGTTTTTGCTTTGG AGGATAGGGCGTGAGGGGAATGACTGTCCACGACACTTTTCATAAAAGAAAGCGGCTTACCG GTCAACGCCACTCATTCCACAAAATCCCGCTTCGGCGGGTTTTTGCTTTGC AGGATAGGGCGCGAGGGGAATGACTGTCCACGACACTTTTTATAAAAGAAAGCGGCTTACCG GTCAACGCCACTCATGCCACAAAATCCCGCTTCGGCGGGTTTTTGCTTTGC AGGATAGGGCGCGAGGGGAATGACTGTCCACGACACTTTTTATAAAAGAAAGCGGCTTACCG
>NC_014029.1|WP_002210149.1|4128423_4129323_+|16S-rRNA-(cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase MNQHDRAVISASTLYVVPTPIGNLGDITHRALEVLKGVDLIAAEDTRHTGLLLQHFAINARLFALHDHNEQQKADQLLAKLQEGQSIALVSDAGTPLINDPGYHLVRRCREAGIRVVPLPGACAAITALSAAGLASDRFCYEGFLPAKTKGRKDTLQALIEEPRTLIFYESTHRLLESLQDMVTVLGPQRYVVLARELTKTWESIHGAPVGELLAWVKEEETRRRGEMVLIVEGHKVQSDDALPADALRTLALLQKELPLKKAAALAAEIHGVKKNALYKYALEQQQGDVETEEDDIQQ >NC_014029.1|WP_002228200.1|4126387_4128361_-|penicillin-binding-protein-activator MLSSTFVRSKAGLVPVILAALILAACTGDAPQTPPPVNIQDEASANSDYYLQQLQQSSDDNKADWQLLAIRALLREAKVPQAAEQLSTLPANLSDTQRQEQQLLAAELLIAQKNTPAAADILAKLEATQLSANQKVRYYQAQIAANQDKATLPLIRAFIAQEPLLTDKAHQDNIDGTWQSLSQLTPQELNTMVINADENVLQGWLDLLRVYQDNKQDPELLKAGIKDWQTRYPQNPAAKNLPTALTQISNFSQASTAKIALLLPLSGPAQVFADAIQQGFTAAQNGSAVTASVPVTPNVTESSPTDTAAVVSDDTPATLPAPVPPPVVTNAQVKIYDTNTQPLAALLAQAQQDGATLVVGPLLKPEVEQLSATPSTLNILALNQPEASNNSPNICYFALSPEDEARDAAHHLWEQQKRMPLLLVPRGALGERIAKAFADEWQKQGGQTVLQQNFGSTTELKQSINSGAGIRLTGTPVSVSNVAAAPASVTIAGLTIPAPPIDAPVVSTSSSGNIDAVYIIATPSELTLIKPMIDMATSSRSKPALFASSRSYQAGAGPDYRLEMEGIQFSDIPLMAGSNPALLQQASAKYANDYSLVRLYAMGIDAWALANHFSEMRQIPGFQVKGVTGDLTASSDCVITRKLPWLQYRQGMVVPLA >NC_014029.1|WP_002210147.1|4125950_4126304_-|YraN-family-protein MSQRDTGAHYENLARRHLERAGLVFQAANVAFRGGEIDLIMRDGDAWVFVEVRFRRNDLFGGAAASITPRKQQRLHLAAAVWLAQRGASFATTSCRFDVVAITGNQLEWLPNAFNTD >NC_014029.1|WP_002210146.1|4125089_4125680_-|DnaA-initiator-associating-protein-DiaA MLERIKGCFTESIQTQIAAAEALPDAISCAAMALVQSLLNGNKILCCGNGTSAANAQHFAASMINRFETERPSLPAIALNADNVVLTAITNDRLHDEVYAKQVRALGQAGDVLLAISTRGNSRDIVKAVEAAVTRDMTIVALTGYDGGELAGLLGQLDVEIRIPSHRGARVQELHMLTVNCLCDLIDNTLFPHQND >NC_014029.1|WP_002210145.1|4124503_4125079_-|divisome-associated-lipoprotein-YraP MKVGYIFAMLFSTLLLQGCVGAVVVGSAAVATKTATDPRTIGTQVDDGTLEARVVNALSKDKEIKSQTRFVVTAYQGKVLLTGQTPSAELSNRAKQIASGVDGVTEVYNEMRLGKPVDLSTASMDTWITTKVRSQLLTSDSVKSSNVKVTTENGEVFLLGLVTQQEAQSAAQIASKVSGVKHVTTAFTIVK >NC_014029.1|WP_002210144.1|4123571_4124297_+|monofunctional-biosynthetic-peptidoglycan-transglycosylase MISVRRGFSQLWYWGKRGVIGIIALWMAGILIFAFLPVPFSMVMIERQLGAWLTGDFAYVAHSDWVPMDEISPYMALAVMAAEDQKFPDHWGFDVGAIESALSHNQRNQKRIRGASTLSQQTAKNVFLWDGRSWVRKGLEVGLTAGIELIWTKRRILTVYLNIAEFGNGIFGVEAAARHFFNKPASKLSASEAALLAAVLPNPLRFKVNAPSGYVISRQQWILRQMHQLGGKTFLQENTLD >NC_014029.1|WP_002210143.1|4122921_4123575_+|isoprenoid-biosynthesis-glyoxalase-ElbB MKTVGVVLSGCGVLDGAEIHESVLTMLALDRAGAEVLFFAPDKPQLHVINHITGEIVAEERNVLVESARIARGLITPLSAADPEVLDALIVPGGFGAAKNLCDFAIKGGECSVEPDLYKLIQLMHKSGKPIGLMCISPVMLPKLLGKPIRLTIGNDPDTIDAIEIMGGEHVICPADDVVIDLENKVVTTPAYMLAGSISEAAKGIDKLVTKVLDLTE >NC_014029.1|WP_002210142.1|4120343_4122680_+|aerobic-respiration-two-component-sensor-histidine-kinase-ArcB MKQIRVLAQYYVDLMVKLGLVRFSLLLASALVLLAMVVQMAVTFVLRGSVETLDLVRSIFFGLLITPWAVYFLSVVVEQLEESRQRLSRLVDKLEVMRHRDLELNKQLTENITQLNQEIVEREKAEKAHLQVVDKLKEEMGHREQAQIELGQQSALLRSFLDASPDLVYYRNEDNEFSGCNRAMELLTGKSEKQLVGLTPKDVYAPDIAEKVMETDEKVFRHNVSLTYEQWLVYPDGRKACFELRKVPFYDRVGKRHGLMGFGRDITERKRYQDALENASRDKTTFISTISHELRTPLNGIVGLSRILLDTELDAEQLKYLKTIHVSAITLGNIFNDIIEMDKLERRKVQLDNQPVDFTGFMADLENLSGLLVQPKGLKFIMEPQLPLPEKVIADGTRLRQILWNLIGNAVKFTQQGKIVVRVRREGNDRLIFEVEDSGMGIPEDEQDKIFAMYYQVKDRNGGRPATGTGIGLAVSKRLAQSMGGDITVKSTQGVGSCFTLTIKAPAVQEASNAPSGDDMPLPALHVLLVEDIELNVIVARSVLEKLGNSVDVAMNGHDALAMFNPEDFDLVLLDIQLPDMSGLDIARQIRAEYGKQSLPPLVALTANVLKDKKEYLDAGMDDVLSKPLSVPALTAMIKQFWDSKPSSAVQKQEHKVMQTHESLLDTTMLEQYIDLVGPQLIHQSLEMFEQMMPGYLAVLDSNMTARDQKGITEEAHKIKGAAGSVGLRHIQQLAQQIQTPTLPAWWDNVQDWVDELKLEWRNDVQVLREWAAEVEKK >NC_014029.1|WP_002210140.1|4119156_4120080_+|TIGR01212-family-radical-SAM-protein MQLQQLVNMFGADLQRRYGEKIHKLTLHGGFSCPNRDGTLGRGGCTFCQVASFADEQMQQQSITQQLAIQAKKANRANRYLAYFQAYTSTYAEVNALAAMYQQALCEADIVGLCVGTRPDCVPDAVLDLLSSYQQQGYEVWLELGLQTANDKTLKRINRGHDFACYQQTARRARARGLKVCCHLIVGLPGEDRAQGRETLEKVVTTGVDGIKLHPLHIVEGSTMAKAWRAGRLTALALEDYVLTAGEMIRHTPAEVVYHRISASARRPTLLAPLWCENRWTGMNELNNYLLQHGVQGTAIGDAYCYR >NC_014029.1|WP_002229651.1|4113867_4118334_-|glutamate-synthase-large-subunit MLYDQSQERDNCGFGLIAHIEGEPSHKVVRTAIHALARMQHRGAILADGKTGDGCGLLLQKPDHFFRMVAEERGWRLAKNYAVGMMFLSQDEELAKASRRIVEEELQNETLSIVGWREVPTNPDVLGEIALSSLPRIEQIFVNAPAGWRSRDMERRLFVARRRIEKRISDKDFYACSFSNLVTIYKGLCMPADLPRFYLDLADLRLESAICLFHQRFSTNTVPRWPLAQPFRYLAHNGEINTIAGNRQWAKARAYKFKTPLIPDLQDAAPFVNETGSDSSSLDNMLELFLSGGMDLIRAMRLLVPPAWQNNPDMDTDLRAFFDFNSMHMEPWDGPAGIVMSDGRYAACNLDRNGLRPARYVITKDKLITCASEVGIWDYQPDEVVEKGRVGPGELMVIDTRSGKILHSAETDNDLKSRHPYKEWMEKNVKRLVPFEDLPEEQVGSRQLDDSQLETYQKQFGYSNEELDQIIRVLGENGQEATGSMGDDTPFAVLSSGPRIIYDYFRQQFAQVTNPPIDPLREAHVMSLATSIGREMNVFCEAEGQAHRLSFKSPILLYSDFQQLTTLEGEHYRADRLDLTFNPAENDLEQAVLSLCDEAERKVRDGAVMLVLSDRAIAPNRLPVPAPMAVGAIQTRLVDKSLRCDANIIVETASARDPHHFAVLLGFGATAIYPYLAYESLAKLVDSQAIDKKYRDVMLNYRNGINKGLYKIMSKMGISTVASYRCAKLFEAVGLHRDLSDLCFQGVVSRIGGASFSDFQQDLQNLSKRAWLKRKPLDQGGLLKFVHNGEYHAYNPDVVSTLQKAVHSGEYSDYQAYAKLVNERPIATLRDLLAIKPQGTPIPVDQVEPAESLFKRFDTAAMSIGALSPEAHESLAIAMNSLGGFSNSGEGGEDPARYGTNKVSRIKQVASGRFGVTPAYLVNADVIQIKVAQGAKPGEGGQLPGDKVTPYIAKLRYSVPGVTLISPPPHHDIYSIEDLAQLIFDLKQVNPKAMISVKLVSEPGVGTIATGVAKAYADLITIAGYDGGTGASPLSSVKYAGCPWELGLVETQQALVANGLRHKIRLQVDGGLKTGVDIVKAAILGAESFGFGTGPMVALGCKYLRICHLNNCATGVATQDEKLRRDHYHGLPERVVNYFHFIARETRETREIMAELGVSQLVDLIGRTDMLLELDGISAKQNKLDLSPMLKTATPHPGKALYCTESNPPFDKGLLNKELLSQAEPYIEAKQSKTFYFDIRNTDRSVGAALSGAIATKHGDQGLATDPIKAYFSGTAGQSFGVWNAGGVELMLTGDANDYVGKGMAGGRIAVRPPVGSNFRSHEASIIGNTCLYGATGGKLFAAGRAGERFAVRNSGAITVVEGIGDNGCEYMTGGIVCVLGRTGINFGAGMTGGFAYVLDEDGEFRKRVNPELVEVLDVEQLAIHEEHLRGLITEHVQLTGSSRGEEILANWPEWVTKFALVKPKSSDVKALLGHRSRSAAELRVQAQ >NC_014029.1|WP_002210150.1|4130259_4130964_-|pirin-family-protein MITCRTAEQCGQADFGWLQARYTFSFGHYFDPTLLGYASLRVLNQEVLAPGAAFQPRTYPQVDILNLILQGEAEYRDSLGNHVHAKTGDALLFSPQQGVSYSEHNLSANKSLTRIQLWLNACPERESAPTQHQRLSTRPVQLLASPAGEQGSLQLRQQMWIHHLALAAGEQQKMPLHGHRAYLQSIHGTVDATGPQTGTSQRLTCGDGAFVEEEQHLVIKAITPLRALLIDLPV >NC_014029.1|WP_002210151.1|4131225_4132119_+|LysR-family-transcriptional-regulator MARDRALTLEALRVMDAIDRRGSFAAAADELGRVPSALSYTMQKLEEELDVVLFDRSGHRTKFTNVGRMLLERGRVLLEAADKLTTDAEALARGWETHITIVSEALSPAWKLFPLIDKLALKANTQVSILTEVLAGAWERLEQGRADIVIAPDMHFRASSEINSRKLYKVTSVYVASPDHPIHQEPEPLSELTRVKYRGIAVADTARERPVITVQLLDKQQRLTVSTIEDKRRALLAGLGVATMPYEMVEKDIAAGRLRVIGPEYSREADIIMAWRRDSMGEAKSWCLREIPKLLGK >NC_014029.1|WP_001297096.1|4133199_4133979_-|AAA-family-ATPase MMELQHQRLMALAGQLQLESLISAAPALSQQAVDQEWSYMDFLEHLLHEEKLARHQRKQAMYTRMAAFPAVKTFEEYDFTFATGAPQKQLQSLRSLSFIERNENIVLLGPSGVGKTHLAIAMGYEAVRAGIKVRFTTAADLLLQLSTAQRQGRYKTTLQRGVMAPRLLIIDEIGYLPFSQEEAKLFFQVIAKRYEKSAMILTSNLPFGQWDQTFAGDAALTSAMLDRILHHSHVVQIKGESYRLRQKRKAGVIAEANPE >NC_014029.1|WP_000255944.1|4133978_4135001_-|IS21-like-element-IS100-family-transposase MVTFETVMEIKILHKQGMSSRAIARELGISRNTVKRYLQAKSEPPKYTPRPAVASLLDEYRDYIRQRIADAHPYKIPATVIAREIRDQGYRGGMTILRAFIRSLSVPQEQEPAVRFETEPGRQMQVDWGTMRNGRSPLHVFVAVLGYSRMLYIEFTDNMRYDTLETCHRNAFRFFGGVPREVLYDNMKTVVLQRDAYQTGQHRFHPSLWQFGKEMGFSPRLCRPFRAQTKGKVERMVQYTRNSFYIPLMTRLRPMGITVDVETANRHGLRWLHDVANQRKHETIQARPCDRWLEEQQSMLALPPEKKEYDVHLDENLVNFDKHPLHHPLSIYDSFCRGVA >NC_014029.1|WP_002210152.1|4135057_4135759_+|esterase MWITIAPFVTLPTIFFYHGYTSSKEVYSYFAYAFAQAGFRTISPDADMHGARFNGNETQRLSHFWEILKSNIDELPDLKRHYQQAGLIEGERIGVAGASMGGMTALGAFARYPWIRVAADFMGSGYFTSLAHSLFPPRDAGREISQQAFERRLAPLADYELTHQLEKITERPLLVWHGEADDVVPAAESARLVQALRTRGGDNNLTYLTEAGIGHKITPTALRAGSDFFTQYL >NC_014029.1|WP_002210153.1|4136125_4136518_+|30S-ribosomal-protein-S6 MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYSATITNAAGTIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLLNVEAPQEAIDELETNFRFNDAVIRSMVMRVKHAVTEASPMVKAKDERRERHDFASEANDDSEAGDSEE >NC_014029.1|WP_002210154.1|4136523_4136844_+|primosomal-replication-protein-N MVTTNRLVLSGTVCKTPVRKVSPSGIPHCQFVLEHRSTQQEAGFSRQTWCRMPIVVSGQQSQALTHSITVGSQLTVEGFISCHQGRNGLNKLVLHAEQIEFIDSGD >NC_014029.1|WP_002210155.1|4136848_4137076_+|30S-ribosomal-protein-S18 MARYFRRRKFCRFTAEGVVEIDYKDIATLKNYITESGKIVPSRITGTRAKYQRQLARCIKRARYLSLLPYTDRHQ >NC_014029.1|WP_002210156.1|4137115_4137568_+|50S-ribosomal-protein-L9 MQVILLDKVANLGSLGDQVNVKAGYARNFLVPQGKAVPATKKNVEFFEARRAELEAKLADVLAAAEARATKINELVSVTISSKAGDEGKLFGSIGTRDIADAVTAAGVEVAKSEVRLPNGVLRTAGEHEVHFQVHSDVFAKLNVVVVPEA >NC_014029.1|WP_002213775.1|4137763_4138222_+|IS200/IS605-like-element-IS1541B-family-transposase MRDEKSLAHTRWNCKYHIVFAPKYRRQVFYREKRRAIGSILRKLCEWKNVNILEAECCVDHIHMLLEIPPKMSVSGFMGYLKGKSSLMLYEQFGDLKFKYRNREFWCRGYYVDTVGKNTARIQEYIKHQLEEDKMGEQLSIPYPGSPFTGRK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014029_6 | 4463641-4463752 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_014029_6
|
1 spacers
spacers of NC_014029_6
>6.1|4463667|60|NC_014029|CRISPRCasFinder CCAGACCATCATCCTTAGGCTTTTAATACGTTTTTGATTTTGAATGGGTTGTTGACGTCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014029_6
The CRISPR arrays of NC_014029_6 >merge|NC_014029|6|4463641-4463752|CRISPRCasFinder AAAGCACATTTGAGCAGCGAGTGAAGCCAGACCATCATCCTTAGGCTTTTAATACGTTTTTGATTTTGAATGGGTTGTTGACGTCCAAAGCACATTTGAGCAGCCGAGTGAA >NC_014029|6|5|4463641-4463752|CRISPRCasFinder AAAGCACATTTGAGCAGCGAGTGAAG CCAGACCATCATCCTTAGGCTTTTAATACGTTTTTGATTTTGAATGGGTTGTTGACGTCC AAAGCACATTTGAGCAGCCGAGTGAA
>NC_014029.1|WP_002209491.1|4460583_4463220_+|phosphoenolpyruvate-carboxylase MNEQYSAMRSNVSMLGTLLGDTIKEALGEHILDRVETIRKLSKSSRAGNEASRQELLTTLQNLSNDELLPVARAFSQFLNLTNTAEQYHSISPHGEAASNPEALAQLFTRLKDKKLSDQDMRSAVDDLSIELVLTAHPTEITRRTLIHKLVEVNTCLSQLDHNDLADYERNKIMRRLRQLVAQSWHTDEIRKLRPSPVDEAKWGFAVVENSLWEGVPAFLREFNEQLENSLDYRLPVEAVPIRFTSWMGGDRDGNPNVTAEITRHVLLLSRWKATDLFLRDIQVLVSELSMSECTPELRELAGGEEVLEPYRQLMKNVRTQLTNTQAYLEARLKGERVLPPHDLLVSNDQLWEPLYACYQSLKACGMEIIANGQLLDTLRRVRCFGVPLVRIDVRQESTRHTDAIAELTRYLGLGDYESWSESDKQAFLVRELNSKRPLVPLKWEPSAETQEVLETCRVIAEAPQGSIAAYVISMAKVPSDVLAVHLLLKEAGCPFTLPVAPLFETLDDLNNADDVMTQLLGIDWYRGLIQGKQMVMIGYSDSAKDAGVMAASWAQYRAQDALIKTCEKAGITLTLFHGRGGSIGRGGAPAHAALLSQPPGSLKGGLRVTEQGEMIRFKFGLPEVTISSLALYAGAILEANLLPPPEPKKEWIEVMDLLSDASCDMYRSYVRENPEFVRYFRAATPELELGKLPLGSRPAKRRPDGGVESLRAIPWIFAWTQNRLMLPAWLGAGAGLQRAIDAGKQDVLATMCRDWPFFSTRIGMLEMVFAKADLWLAEYYDQRLVDKSLWPLGQQLRDQLAADIKVVLAIANDDHLMADLPWIAESIALRNVYTDPLNVLQAELLHRSRQQEHPDACVEQALMVTIAGVAAGMRNTG >NC_014029.1|WP_002223919.1|4459046_4460210_+|acetylornithine-deacetylase MKLPPFIELYRALIATPSISAADSALDQSNEALINLLAGWFADLGFRVEIQPVPDTRHKFNLLASIGENENGEGHGGLLLAGHTDTVPYDEGRWTRDPFTLTEHDHKLYGLGTADMKGFFAFILDAVRDIDASKLTKPLYILATADEETTMAGARYFAANTQLRPDFAIIGEPTSLQPVRAHKGHISNAIRITGQSGHSSDPARGVNAIDLMHESITQLMALRTTLQERYHNPAFTIPYPTMNFGHINGGDAANRICACCELHMDIRPLPGLTLSDLNELMTEALEPVSQRWPGRLSIDELHPPIPGYECPTDHHMVGVIEKLLGERTAVVNYCTEAPFIQQVCPTLVLGPGSINQAHQPDEFIDMAFIEPTRELIGQLVDHFCQQK >NC_014029.1|WP_002209489.1|4457791_4458796_-|N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate-reductase MLNTLIVGASGYAGAELTAYLNRHPHMNITGLAVSAQSADAGKLLSDLHPQLKGILDLPLQPLVDVAQAAKGIDVVFLATAHEVSHDLAPQFLAAGCVVFDLSGAFRVRDAAFYSQYYGFEHQHPDWLDKAVYGLAEWQSEDIKQAQLIAVPGCYPTASQLALKPLVDGQLLNDAQWPVINAVSGVSGAGRKASMGNSFCEVSLQPYGLFTHRHQPEIVTHLGTPVIFTPHLGNFARGILATITCRLKAGVTAQNIADAYHHAYQNKPLVRLYQQGVPALKAVVGLPFCDIGFSVQGEHLIIVATEDNLLKGAAAQAVQCMNIRFGFPETQSLL >NC_014029.1|WP_002215335.1|4456849_4457626_-|acetylglutamate-kinase MMNPLVIKLGGVLLDSEEALERLFTALVTYREKHERPLVIMHGGGCLVDELMKRLALPVVKKNGLRVTPADQIDIITGALAGTANKTLLAWAVKHQINAVGLCLADGNTVTVTLLDAELGHVGKAQPGSAALVQTLLAAGYMPIISSIGITVEGQLMNVNADQAATALAATLGADLILLSDVSGILDGKGQRIAEMTAQKAEQLIAQGIITDGMVVKVNAALDAARSLGRPVDIASWRHSEQLPALFNGVPIGTRISV >NC_014029.1|WP_002209487.1|4455309_4456683_-|argininosuccinate-lyase MALWGGRFSQAADQRFKQFNDSLRFDYRLAEQDIIGSVAWSKALVTVGVLNADEQQQLEQALSVLLEEVQANPHAILASDAEDIHSWVETKLIDKVGDLGKKLHTGRSRNDQVATDLKLWCKFQITELQTAVQQLQQALVMTAEANQDAVMPGYTHLQRAQPVTFAHWCLAYVEMLSRDESRLQDTLKRLDVSPLGCGALAGTAYAIDREQLAGWLGFASATRNSLDSVSDRDHVLELLSDASIGMVHLSRFAEDLIFFNSGEAAFVDLSDRVTSGSSLMPQKKNPDALELIRGKCGRVQGALTGMTMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDALDTWLDCLHMAALVLDGIQVKRPRCKEAAEQGYANATELADYLVAKGVPFREAHHIVGEAVVEAIRQGKALEALALSDLQQFSSVIGDDVYPILALQSCLDKRVAKGGVSPQQVASAIAEAKARLF >NC_014029.1|WP_002209485.1|4452218_4454711_-|TonB-dependent-hemoglobin/transferrin/lactoferrin-family-receptor MDNIIRDKKTIISVNKITTCILFALVTQGYSGQLAANTAETPTNNNDMALDKLNVEGKGNAHDSDWIYDEPRSVSEITREQLDNRPARHAADILEQTPGVYSSVSQQDPGLSINIRGIQDYGRVNMNIDGMRQNFMKSGHGQRNGSMYIDPEILSNVVIERGIFNGIGGAGAIGGIATFNTINASDFLAPEKELGGHIRAMTGDNGTRFIGSGALALGNPNGDILLAVSERNLKDYWPGNKGVLAGLRLYSPTRNVGDDLKNTKTLFTGYKMRSQLAKVGWNFEAGQRLEFSYLQTQIASPNASMLSEVLALSPSGKEITKIGWRNTSFTNVENRNIALDYRLNPEHISWLDATAKIYYVDTNDETDNANSLFKEYFWTQTRLKTRGLQLQNTNTFTPSDAHQIRLKYGLEWFSDKSEGYSTRKLIERTTPPGKRAITSTFAQLNYEYDDWLRLEGGLRYDQFRLKGNTWLHTRSFLQPYTFENPCDRRIHEQSEKPGSRCSSRRPATMRWDVDRCEQQLSPTLAMGVKPGLEWLEFFGSYGKSWRPPAMTEVLATGTAHGYSWVLPNPFVAAERARTWEAGFNIQQSNLFIEDDHFAAKVAYFDTRIANYINLELGKAKPKFGGDSFTDVAYVNNLLKTRFRGLEYQLSYDAGTFYTNINYTRMIGVNNVCSPYAWLGGLQSVKYKYVGKVEQIYAVENEVANNYVTCMNANVLFGSSAYLPGDRGSLTLGSRIFDRRLDFGTVIRYNKGYQDRSAQDENGNPLTAYVADWPKYIVYDLYASYKVTNNLILRSSIENITNRAYLVNYGDTLSFAPSRGRTIQGGFEYKF >NC_014029.1|WP_002209484.1|4451379_4451997_-|heme-acquisition-protein-HasA MSTTIQYNSNYADYSISSYLREWANNFGDIDQAPAETKDRGSFSGSSTLFSGTQYAIGSSHSNPEGMIAEGDLKYSFMPQHTFHGQIDTLQFGKDLATNAGGPSAGKHLEKIDITFNELDLSGEFDSGKSMTENHQGDMHKSVRGLMKGNPDPMLEVMKAKGINVDTAFKDLSIASQYPDSGYMSDAPMVDTVGVVDCHDMLLAA >NC_014029.1|WP_002209483.1|4449405_4451214_-|type-I-secretion-system-permease/ATPase MESCKTPGASSVPPTILSVLAGNKKILWGIGLFTAVINLLMLAPAIYMLQVYDRVLASANTMTLLMLTVLVLGVFVFIGLLEWVRSAVVIRLGTQIDMQLNQPVFNAAFAANLKGHNTPAAQALNDLTVLRQFATGNALFAFFDAPWFPLYLLVIFLLHPWLGMLAAAGAGILVVLAWLNQWICKKPLHDASIITSHATQQANANLRNADVIEAMGMLKALRERWLMQHANFLYQQNLASDKSSRVTAVAKSSRQALQSMMLGLGALLVIYNEITAGVMIAGSILIGRVLGPIDQLIAVWKQWSHARLAYQRLSQLLAQHPSSPTGMVLPAPQGKLNVTQLMACKPGTHIPVLHSINFELQPGDVLGILGPSGSGKSTLAKLLVASQPTFSGTVRLDSADLSRWDKTQLGEFIGYLPQNIQLFRGTVAENIARFGAIDTAKVVAAAQLADVHDLILHLPQGYDTPLGDDGEGLSGGQRQRIALARAMYGIPRLIVLDEPNASLDKEGEQALLASIIQLKQQGCTIVMITHKPELLSGSDYLLFLKNGQMDLFDRTQAVLQNIQGKDKPAVQPEAKILNSRSGWSNGVSYGIGPARTTSSPKP >NC_014029.1|WP_002209482.1|4448001_4449330_-|HlyD-family-type-I-secretion-periplasmic-adaptor-subunit MLPESVCYSVANANRQPPLQINSGRYLNIGGGLVVIGFIGFLLWAGLAPLDKGVAVTGLLVVAENRKVIQPLQGGRIQQLHVTEGDEIVSGQLLVTLDDTAIRNQRDNLQHQYLSALAQEARLTAEQNDLDVITFPQALLEHATQPAVERNIILQQQLLHHRRQAHLSEIARLSTQLTRHQARLDGLQAMRSNHQRQSNLFQQQLDSVQLLAKDGHIAKNKLLEMESQSTSLQARVEQSTSDIAEAHKLIDETEQHVLQRREQYQSENSEQLAKAQQNTQELVQRLNIAEYELSHTRIFAPVSGSVIALAQHTVGGVVSSGQALMEIVPSGQPLFVEAQLPVELIDKVAVGLPVDLNFSAFNQSNTPRLQGSVWRIGADRIQPPPTSPPYYPLTVAIDLDPTELAIRPGMAVDVFIRTGERSLLSYLFKPFTDRLHLALAEE >NC_014029.1|WP_002209481.1|4447133_4447937_-|energy-transducer-TonB MNRLQQSSDKLIFWLVGALLACGIHIYALWWLSTASIPAIPTSYPAAIMMELSAEPEFMQNLPQNSVVGITQNIIEPAVEQRVNQPDDIVDLPTLPEQPEGQREITRKEPIKVKRPAENRATSRKPVNKETQESDSKQSSPAAAASAMLSGTSQQVAAAVNSDSSHRQQAQVSWKSRLQGHLMGFKRYPSSARKQQQQGTAMIRFVVDKNGYVSSVQLSHSSGTSALDREALAIIKRAQPLPKPPAELLSQGQITLSLPVDFNLKRK >NC_014029.1|WP_100067904.1|4463962_4465317_+|IS3-like-element-IS1661-family-transposase MKHPFSTRLAAVQHYLSGKATLRETARQFSVGKSPLTRWIRAFRRQGEAGLEHHLSRTYTPEFRLCVVRYMMANRCSAADASAHFNIPNETIIQNWMKRYREGGKEALNPSKTGPTMPKDKYEHDSKPFSEMTHAELEKELEYLRAENAYPKKAESPERRKGTQGAAEKTRIVQALTAEHRLSCLLCAAKLARSTYYYHASKPDGVIDDYADAVKAIGALSRRHAQRYGYRRMTVALRKEGFTLNHKTVRKLMNQHGLLSLIRRKKYRSYRADGGRASDNLLARNFTSEISGLKWCTDVTEFRVGAQKLYLSVIQDLFNNEIISWHMSERAALILTCKTLEKALKVKGRKEGLMLHSDQGWHYRTPMWRSMLVEAGIRQSMSRKGNCLDNAVMENFFSHLKAEMYHRKKYDSATVLKRDIVEYIHYYNTERISLKTGGMSPAEYRTQVEKQ >NC_014029.1|WP_002215753.1|4465789_4467019_+|MFS-transporter MQTSFSPATRLGRRALLFPLCLVLFEFAAYIANDMIQPGMLAVVAEFNASVEWVPTSMTAYLAGGMFLQWLLGPLSDRRGRRPVMLAGVAFFVVTCLAILLVNSIEQFIAMRFLQGIGLCFIGAVGYATIQESFEEAVCIKITALMANVALIAPLLGPLAGAALIHVAPWQTMFVLFAVLGAISFAGLWRAMPETASLKGEKLSVANMWRDYKQVLANRRFLCGSLALGFASLPLLAWIAQSPVILISGEQLSTFEYGILQVPIFGALIIGNLTLARLSGKTSIPQLIRYGAGPMIVGLMIAAGSTLYSSHAYLWMTAGLSLYAFGIGLANAGLVRLTLFASDISKGTVSAAMGMISMMIFTLGIELAKVAYLWGDSRGFNLFNLMSGLLWLGLVMVFIRRQPEAVATE >NC_014029.1|WP_002209605.1|4467167_4467371_-|hypothetical-protein MFLDTFSFLRVEPRQMGNGRVGRRANQPVLVNQPFCHLAGQARDRNSLFDNRPALFLTGNFNEYIDA >NC_014029.1|WP_002215752.1|4467491_4467650_+|hypothetical-protein MDIGLSLQERNNKYFYAMAKIEADKLINLSRRVSFNNIKDVFLRVKFENDIK >NC_014029.1|WP_002215751.1|4467728_4468310_+|DUF4225-domain-containing-protein MECYHLSKQDSMLSLKQAKVYISAKIEEHDKVIGYVIDGIAVIVGGLQMVAGSGILLGSIASGNIVGIIVGAHLILNGASSLSEGVQRLRGNKNTTGFMQDAYMGTAEFFGFERKTGMLAYYAADLTTSFYGVIKLSLKPDAWRLYKYIPSDYYRKINSMSKLALTIQGVKATNKIRVIGSTYLDDNSEYERK >NC_014029.1|WP_002215750.1|4468323_4468656_-|hypothetical-protein MTELEMEKKLLNNGFTAKNITHMRKIISRDDQQKETYSSLLIDLKKRFFAGCLICAILFTPLIFMMFNDYTSDEIFSYLVALIFGLYMTYYITPLNLAWKSYRYLSNKEE >NC_014029.1|WP_002223796.1|4469415_4471368_-|selenocysteine-specific-translation-elongation-factor MIIVTAGHVDHGKTTLLQAITGVNADRLPEEKQRGMTIDLGYAYWPLPDGRIMGFIDVPGHEKFLANMLAGGGGIDHALLVVACDDGVMAQTREHLAILRLSGRPALTVALTKADRVDDERIAQVHQQILQELVAQGWSAEQISLFVTAAVTERGIGELREHLAQCHQQRDPKGRLQRRFRLAIDRVFSVKGAGLVVTGTALAGQVAVGDTLWLTGGDCPVRVRGIHAQNQPAQQAQAGQRIALNISGDISKQQINRGDWLLAQPPLPPVDRVLVTVDADTPLQHWQPLHLYHGARHITGRFSLLGHQQLIDDQQPLIDHQQIINNQSTSGGHSSQILAELLLDSPLWLVENDRVILRDIGAKKTLGGARVIHLAVPSRGKRQPAYLAWLTALAQATSDREVLDLHLAQGPVSVRTFSWARQLTDNEMAALLAATDTVVAGDIALSHPHAQQAQQTLLHVLALYHQQHGDQLGLGRARLRRMALPTLDEGVVFRLIDNLLAEGALHNTRGWLHLPEHGLAFTEQEQIGWQQAAPYFVDDPWWVRDLAAELQAAEGEMRSLLRKAAQLGYITAVVTDRYYLSQRIEQLADLVRELDSRQGSVSAADFRDRLGIGRKLAIQILEFFDRSGFTRRRGNGHILRDSGLFSATGS >NC_014029.1|WP_002209608.1|4471364_4472753_-|L-seryl-tRNA(Sec)-selenium-transferase MSAEPHPLYRQLPAIDRLLNEPEMAPLLAEYGPVLLADTLRQLQAEAREYIGQFHTLADWCADWPAALRQRLNQRQPALKPVFNLTGTVLHTNLGRAPLAESAIAAVTDAMRSAVTLEYSLEGAGRGHRDRAVADLLCALTGAEDACIVNNNAAAVFLLLTVMAAGKQVVVSRGELVEIGGAFRIPDVMRQAGCELVEVGTTNRTHLKDYRQAINENTGLLMKVHTSNYSIEGFTAAVSEQQLAALGQECSIPTATDLGSGSLVDMTRYGLPAEPMPQQLIAAGVDLVTFSGDKLLGGPQAGIILGKKQWIERLQQHPLKRALRADKMTLAALDATLRLYQQPDRLVEQLPSLRLLTRPASEIAACAQRLLAPLIACYGTDFTLDIESCWSQIGSGSLPVDRLPSWALTFTPKDGRGSTLEALTARWRTLTKPVIGRVADGRLWLDLRCLEDEAALLRELAS >NC_014029.1|WP_002209609.1|4472936_4473866_-|formate-dehydrogenase-accessory-protein-FdhE MSIRIVPKDQLGKQREKGTTAGNIPPLLFANLKSLYTRRTERLQQLALDNPLADYLDFAAKITEAQQKALHDHPLVLDMQAELVQSAASGKPPLDGSVFPRTEHWRKLLSALIAELRHDAPDHILAVLDNLDKASVHELELYADALLNRDFSQVGSEKAPFIWAALSLYWAQMASQIPGKARAEYGEHRQFCPVCGSIPVSSVVHIGTHNGLRYLHCNLCESEWHVVRIKCSNCEQTRDLNYWSLDSELAAVKAESCGDCGTYLKILYQEKDPQVEAVADDLASLILDAKMEGEGFARSSINPFLFPGE >NC_014029.1|WP_002209610.1|4473865_4474540_-|formate-dehydrogenase-cytochrome-b556-subunit MKKEKPIQRYSAPERINHWIVAFCFILAAISGLGFFFPSFNWLMNIFGTPQMARILHPFAGVVMFAAFLIMFFRYWKHNLINKDDLEWAKNIHKIAMNEEVGDTGRYNFGQKCVFWAAIISLVLLLVSGVVIWRPYFASSFPIPLIRLALLVHSLAAVGLIIVIMVHVYAALWVKGTITAMVEGWVPAAWAKKHHPRWYREVRSKDDARANAKGQPQEKQKEKP |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014029_3 | 3.7|2722053|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2722053-2722084 | 32 | NC_014029.1 | 2238742-2238773 | 0 | 1.0 |
NC_014029_4 | 4.4|2952135|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT | 2952135-2952166 | 32 | NC_014029.1 | 2233176-2233207 | 0 | 1.0 |
NC_014029_5 | 5.1|4129822|51|NC_014029|PILER-CR | 4129822-4129872 | 51 | NC_014029.1 | 4129709-4129759 | 1 | 0.98 |
1. spacer 3.7|2722053|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 2238742-2238773, mismatch: 0, identity: 1.0
aaaaagaatttgggattaaagttacccatcag CRISPR spacer aaaaagaatttgggattaaagttacccatcag Protospacer ********************************
2. spacer 4.4|2952135|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 2233176-2233207, mismatch: 0, identity: 1.0
agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga CRISPR spacer agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga Protospacer ********************************
3. spacer 5.1|4129822|51|NC_014029|PILER-CR matches to position: 4129709-4129759, mismatch: 1, identity: 0.98
gtcaacgccactcattccacaaaatcccgcttcggcgggtttttgctttgg CRISPR spacer gtcaactccactcattccacaaaatcccgcttcggcgggtttttgctttgg Protospacer ****** ********************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014029_4 | 4.4|2952135|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT | 2952135-2952166 | 32 | MT374852 | Yersinia phage vB_YpM_3, complete genome | 12-43 | 0 | 1.0 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK820641 | Gordonia phage EnalisNailo, complete genome | 34088-34119 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK878898 | Gordonia phage Zameen, complete genome | 34513-34544 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK919483 | Gordonia phage Suscepit, complete genome | 34514-34545 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK284520 | Gordonia phage Lilas, complete genome | 35799-35830 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK016492 | Gordonia phage Bialota, complete genome | 35265-35296 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK820642 | Gordonia phage Polly, complete genome | 33956-33987 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | NC_041883 | Gordonia phage Attis, complete genome | 31646-31677 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK814755 | Gordonia phage Antonio, complete genome | 34513-34544 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK875796 | Gordonia phage Tayonia, complete genome | 34513-34544 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK801734 | Gordonia phage LordFarquaad, complete genome | 31627-31658 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | MK433274 | Gordonia phage Bradissa, complete genome | 34554-34585 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | KU963257 | Gordonia phage Kita, complete genome | 34522-34553 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | NC_031251 | Gordonia phage SoilAssassin, complete genome | 31645-31676 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | NC_031097 | Gordonia phage Zirinka, complete genome | 35253-35284 | 6 | 0.812 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | NZ_CP005086 | Sphingobium sp. TKS plasmid pTK2, complete sequence | 138555-138586 | 6 | 0.812 |
NC_014029_2 | 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1846301-1846332 | 32 | MH616963 | CrAssphage sp. isolate ctbg_1, complete genome | 86942-86973 | 7 | 0.781 |
NC_014029_3 | 3.1|2721693|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT | 2721693-2721724 | 32 | CP049262 | Cronobacter sakazakii strain CS-09 plasmid pCsaCS09b, complete sequence | 69636-69667 | 7 | 0.781 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | JF974294 | Aeromonas phage pIS4-A genomic sequence | 21965-21996 | 7 | 0.781 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NC_021534 | Vibrio phage pYD38-A genomic sequence | 3299-3330 | 7 | 0.781 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | NZ_AP014579 | Burkholderia sp. RPE67 plasmid p1, complete sequence | 440819-440850 | 7 | 0.781 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | NC_016626 | Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p, complete sequence | 282870-282901 | 7 | 0.781 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | KJ433975 | Mycobacterium phage 40BC, complete genome | 23231-23262 | 7 | 0.781 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | KJ433973 | Mycobacterium phage 39HC, complete genome | 23231-23262 | 7 | 0.781 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | NC_024145 | Mycobacterium phage Hosp, complete genome | 21427-21458 | 7 | 0.781 |
NC_014029_2 | 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1846301-1846332 | 32 | NZ_CP010358 | Acinetobacter johnsonii XBB1 plasmid pXBB1-8, complete sequence | 46720-46751 | 8 | 0.75 |
NC_014029_2 | 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1846301-1846332 | 32 | NC_019694 | Oscillatoria acuminata PCC 6304 plasmid pOSCIL6304.02, complete sequence | 20911-20942 | 8 | 0.75 |
NC_014029_3 | 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721993-2722024 | 32 | NZ_CP024873 | Leptospira mayottensis 200901116 plasmid p1_L200901116, complete sequence | 14979-15010 | 8 | 0.75 |
NC_014029_3 | 3.7|2722053|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2722053-2722084 | 32 | NZ_CP047125 | Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed4 | 1912-1943 | 8 | 0.75 |
NC_014029_2 | 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1846301-1846332 | 32 | MT774386 | CrAssphage cr110_1, complete genome | 42858-42889 | 9 | 0.719 |
NC_014029_2 | 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1846301-1846332 | 32 | NZ_CP028934 | Campylobacter jejuni strain FORC_083 plasmid pFORC_083_2, complete sequence | 25849-25880 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.2|2721753|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721753-2721784 | 32 | NZ_CP031943 | Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p2, complete sequence | 4006-4037 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | MF679145 | Escherichia coli plasmid pBJ114-96, complete sequence | 37586-37617 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_KP453775 | Klebsiella pneumoniae strain ST11 plasmid pKP12226, complete sequence | 60831-60862 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP021340 | Escherichia coli strain 95NR1 plasmid p95NR1A, complete sequence | 67671-67702 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP021336 | Escherichia coli strain 95JB1 plasmid p95JB1A, complete sequence | 67672-67703 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP040920 | Escherichia coli strain FC853_EC plasmid p853EC1, complete sequence | 33435-33466 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP024832 | Escherichia coli strain CREC-532 plasmid pCREC-532_2, complete sequence | 33830-33861 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP024817 | Escherichia coli strain CREC-629 plasmid pCREC-629_2, complete sequence | 62769-62800 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP029117 | Escherichia coli strain AR435 plasmid unnamed4 | 15616-15647 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP029117 | Escherichia coli strain AR435 plasmid unnamed4 | 112580-112611 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP023961 | Escherichia coli strain FDAARGOS_448 plasmid unnamed2, complete sequence | 16858-16889 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | AP023222 | Escherichia coli M505 plasmid pM505-b DNA, complete genome | 93734-93765 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | AP023233 | Escherichia coli YJ4 plasmid pYJ4-b DNA, complete genome | 47570-47601 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP019075 | Escherichia coli strain CRE1493 plasmid p1493-4, complete sequence | 16520-16551 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP015837 | Escherichia coli strain MS6198 plasmid pMS6198C, complete sequence | 3287-3318 | 9 | 0.719 |
NC_014029_3 | 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721813-2721844 | 32 | NZ_CP011063 | Escherichia coli str. Sanji plasmid pSJ_98, complete sequence | 37637-37668 | 9 | 0.719 |
NC_014029_4 | 4.3|2952074|33|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2952074-2952106 | 33 | NZ_CP040366 | Bacillus flexus isolate 1-2-1 plasmid punnamed3, complete sequence | 923-955 | 9 | 0.727 |
NC_014029_3 | 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721873-2721904 | 32 | NZ_JX627581 | Methylobacterium oryzae CBMB20 plasmid pMOC2, complete sequence | 30496-30527 | 10 | 0.688 |
NC_014029_3 | 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721993-2722024 | 32 | NC_007974 | Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid, complete sequence | 815356-815387 | 11 | 0.656 |
NC_014029_3 | 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721993-2722024 | 32 | NC_007974 | Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid, complete sequence | 820287-820318 | 11 | 0.656 |
NC_014029_3 | 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721993-2722024 | 32 | NZ_CP046333 | Cupriavidus metallidurans strain FDAARGOS_675 plasmid unnamed3 | 2180994-2181025 | 11 | 0.656 |
NC_014029_3 | 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2721993-2722024 | 32 | NZ_CP046333 | Cupriavidus metallidurans strain FDAARGOS_675 plasmid unnamed3 | 2185925-2185956 | 11 | 0.656 |
1. spacer 4.4|2952135|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT374852 (Yersinia phage vB_YpM_3, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga CRISPR spacer agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga Protospacer ********************************
2. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK820641 (Gordonia phage EnalisNailo, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
3. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK878898 (Gordonia phage Zameen, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
4. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK919483 (Gordonia phage Suscepit, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
5. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK284520 (Gordonia phage Lilas, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
6. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK016492 (Gordonia phage Bialota, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
7. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK820642 (Gordonia phage Polly, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
8. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041883 (Gordonia phage Attis, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
9. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK814755 (Gordonia phage Antonio, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
10. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK875796 (Gordonia phage Tayonia, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
11. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK801734 (Gordonia phage LordFarquaad, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
12. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK433274 (Gordonia phage Bradissa, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
13. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU963257 (Gordonia phage Kita, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
14. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_031251 (Gordonia phage SoilAssassin, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
15. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_031097 (Gordonia phage Zirinka, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer gtcgtc-cgccgtgatcctgagcgcgctcgcga Protospacer ***.* . ****** **********.******
16. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP005086 (Sphingobium sp. TKS plasmid pTK2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga-- CRISPR spacer tcgcctttccctgaacctga--gcgatcgtgacc Protospacer ***** **** ********* *** ***.**
17. spacer 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH616963 (CrAssphage sp. isolate ctbg_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer aattataaaagatgctgataaaaagattatta Protospacer * **** ***********.******* . * *
18. spacer 3.1|2721693|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP049262 (Cronobacter sakazakii strain CS-09 plasmid pCsaCS09b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tcaggggactggcgaacaatgtctttcatgat CRISPR spacer acgtcgcgctggcgaacaatctctttcatgat Protospacer *. * .************ ***********
19. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JF974294 (Aeromonas phage pIS4-A genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attacctgaatggcatttgctttatgcctgat Protospacer ****.************* ****. * ***
20. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021534 (Vibrio phage pYD38-A genomic sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attacctgaatggcatttgctttatgcctgat Protospacer ****.************* ****. * ***
21. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP014579 (Burkholderia sp. RPE67 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
----tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer cacctcgc----tcgggaacctgggcgcgttcgcga Protospacer **** .** *******.************
22. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_016626 (Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
----tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer cacctcgc----tcgggaacctgggcgcgttcgcga Protospacer **** .** *******.************
23. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ433975 (Mycobacterium phage 40BC, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer cccgccg-cccgtgtacccgagcgcgttcgcgc Protospacer .****. .***** ***.*************
24. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ433973 (Mycobacterium phage 39HC, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer cccgccg-cccgtgtacccgagcgcgttcgcgc Protospacer .****. .***** ***.*************
25. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_024145 (Mycobacterium phage Hosp, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
-tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer cccgccg-cccgtgtacccgagcgcgttcgcgc Protospacer .****. .***** ***.*************
26. spacer 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010358 (Acinetobacter johnsonii XBB1 plasmid pXBB1-8, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer atttattaatgatgctgacgaaaatatggcac Protospacer ********* *********.**** * .*
27. spacer 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019694 (Oscillatoria acuminata PCC 6304 plasmid pOSCIL6304.02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer atttattaaagaagctgccaaaagagcatcaa Protospacer ************ **** *****... *.**
28. spacer 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP024873 (Leptospira mayottensis 200901116 plasmid p1_L200901116, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tcggtcaaacaaatttaggcgacgatttaaca CRISPR spacer ttactcaaacaagttgaggcgacgattctaaa Protospacer *.. ********.** ***********. * *
29. spacer 3.7|2722053|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047125 (Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed4) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aaaaagaatttgggattaaagttacccatcag CRISPR spacer taaaagcttttgggattaaagttattcaaaat Protospacer ***** ****************..** *
30. spacer 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774386 (CrAssphage cr110_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer tgctattgaagatgctgataaaaagaaacttg Protospacer .****.**********.******** .* .
31. spacer 2.2|1846301|32|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028934 (Campylobacter jejuni strain FORC_083 plasmid pFORC_083_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atttattaaagatgctgacaaaaagaacttaa CRISPR spacer gcacattacagacgctgacaaaaagaaagtta Protospacer .. .**** ***.************** * *
32. spacer 3.2|2721753|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031943 (Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gaaaaggtaagatgggcaagcttctagtagtt CRISPR spacer ttatgagaaagatgggcaagcttttagtggta Protospacer * ..* ***************.****.**
33. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF679145 (Escherichia coli plasmid pBJ114-96, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
34. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KP453775 (Klebsiella pneumoniae strain ST11 plasmid pKP12226, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
35. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP021340 (Escherichia coli strain 95NR1 plasmid p95NR1A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
36. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP021336 (Escherichia coli strain 95JB1 plasmid p95JB1A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
37. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040920 (Escherichia coli strain FC853_EC plasmid p853EC1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
38. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP024832 (Escherichia coli strain CREC-532 plasmid pCREC-532_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
39. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP024817 (Escherichia coli strain CREC-629 plasmid pCREC-629_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
40. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029117 (Escherichia coli strain AR435 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
41. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029117 (Escherichia coli strain AR435 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat----- CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaac-----tgttta Protospacer ********* ***** *******..* *
42. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023961 (Escherichia coli strain FDAARGOS_448 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
43. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP023222 (Escherichia coli M505 plasmid pM505-b DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
44. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP023233 (Escherichia coli YJ4 plasmid pYJ4-b DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
45. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019075 (Escherichia coli strain CRE1493 plasmid p1493-4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
46. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015837 (Escherichia coli strain MS6198 plasmid pMS6198C, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
47. spacer 3.3|2721813|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011063 (Escherichia coli str. Sanji plasmid pSJ_98, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attatctgaatggcattttctttggcgcagat CRISPR spacer attatctgattggcagtttctttaactgtttt Protospacer ********* ***** *******..* *
48. spacer 4.3|2952074|33|NC_014029|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040366 (Bacillus flexus isolate 1-2-1 plasmid punnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ccgaaatcatcagatgtaattaagatttttgct CRISPR spacer aatggattatcagatgtaattaagtttttttcc Protospacer ..**.**************** ***** *.
49. spacer 3.4|2721873|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_JX627581 (Methylobacterium oryzae CBMB20 plasmid pMOC2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tcgccattccgtgaacctgagcgcgttcgcga CRISPR spacer ctaacgagccgtgaacctcagcgcattcgcgt Protospacer ... *. ********** *****.******
50. spacer 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007974 (Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tcggtcaaacaaatttaggcgacgatttaaca CRISPR spacer gtggtcaaacaaatttaggcaaggagccgctg Protospacer .******************.* ** ... ..
51. spacer 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007974 (Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tcggtcaaacaaatttaggcgacgatttaaca CRISPR spacer gtggtcaaacaaatttaggcaaggagccgctg Protospacer .******************.* ** ... ..
52. spacer 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP046333 (Cupriavidus metallidurans strain FDAARGOS_675 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tcggtcaaacaaatttaggcgacgatttaaca CRISPR spacer gtggtcaaacaaatttaggcaaggagccgctg Protospacer .******************.* ** ... ..
53. spacer 3.6|2721993|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP046333 (Cupriavidus metallidurans strain FDAARGOS_675 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tcggtcaaacaaatttaggcgacgatttaaca CRISPR spacer gtggtcaaacaaatttaggcaaggagccgctg Protospacer .******************.* ** ... ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
393692 : 465073
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014029|393692:465073|DBSCAN-SWA CATGAGTCAGGACTATCTCGCCCGTATCGCCGCACTGGAAGATGCGCTTCGCCAGAAAGACAATCAGCTCAGTCTCGTTGCGGAGACTGAGTCGTTCCTGCGCTCAGCGCTGGCTCGCGCAGAAGAGAAAATAGAGAACGAAGAGCGCGAAATAGAGCATCTGCGGGCACAGATAGAAAAACTGCGCCGGATGCTGTTCGGCACACGCTCTGAAAAGCTGCGCCGCCAGGTTGAAGAGGCCGAAGCTCTGCTGAAGCAGCAGGAGCAGCAAAGCGATCGTTATAATGGCCGGGACGATGATCCGCAGGTCCCGCGCCAGCTGCGCCAGTCACGCCATCGTCGTCCTCTGCCTGAACATCTTCCCCGTGAAACACAGCGACTGGAGCCTGCGGAAACCTGCTGCCCGGGTTGCGGCAGCGATATGGCATACCTCAGCGAAGTCAGCGCGGAGCAACTGGAACTGGTCTCCAGCGCCCTGAAAGTGATCCGTATCGTCAGGGTGAAAAAAGCCTGTACCCGATGTGACTGCATCGTTGAAGCGCCAGCGCCCTCACGTCCCATCGATCGCGGTATCGCCGGACCAGGGCTGCTGGCCCGGGTGTTAACAGCGAAATACTGTGAGCACCTGCCGCTGTATCGTCAGACTGAAATCTTTGCCCGCCAGGGAGTGGAACTGAGTCGTGCGCTGCTCTCCAACTGGGTGGATGCGTGTTGTCGCTTAATGGCACCGCTGAATGAAGCACTGTACAGCTACGTGATGGACTGTCACAAACTGCACACTGACGATACGCCGGTGCCGGTACTGGCACCGGGCAGAAAGAAAACGAAAACGGGGCGCATCTGGACCTATGTCCGTGACGACCGAAACAGCGGTTCGTCAGATCCGCCAGCAGCGTGGTTCGCCTTCTCGCCAGACCGACAGGGGAAGCATCCCCAACAACATCTTCGCCACTATCATGGTGTGCTGCAGGCGGACGCCTTCGCAGGTTATGATCGGTTGTTCAGTCCCGAACGTGAAGGAGGGCCGCTGACAGAAGCCGCATGCTGGGCCCACGCCCGCAGAAAAATCCACGATGTGTACATCAGCACCCGGACGTCAACAGCAGAGGAAGCTCTGAAACGTATCAGCGAGCTGTATGTCATCGAGGAAGAAATACGCGGGCTCCCGGCAGAAGAGCGGCTGGCGGCGAGGCAATCCCGAAGTAAACCGTTGCTGGCATCTCTGCATGACTGGTTGGTGGAGAAAAGCGCAACGCTGTCGAAAAAATCGCGGTTAGGCGAAGCGTTCACGTATGCCCTGAACCAGTGGGAAGCGTTGTGTTACTACAGTGATGACGGCCTTGCAGAGCCTGATAATAACGCTGCTGAACGCGCGTTACGAGCGGTCTGTCTTGGCAAGAAAAACTACATCTTCTTCGGCAGCGATCATGGTGGTGAACGTGGTGCTCTGCTGTATGGACTGATCGGGACATGCCGGCTCAATGGTATAGATCCAGAAGCCTACCTTCGCTATATCTTGAGCGTACTGCCGGAGTGGCCTTCGAATAAAGTAGCTGAACTCCTGCCATGGAATGTAGATCTCACCAATAAATAACCGTCAACACGGCACTCACTTAACGCTTACAAGCATGATGACCAGGTTCACTGACTTCCTAGGGACGGTTTTCATGCAGCTGGAGCTGGGTGACAAGTACCGTGGTCAGTTTTTCACGCCGTGGGACATCAGCAGGATGATGGCGCAGATTTCATTGGGAGATGTCGACGCCATTTTCAAGGAGAAACCCTTCATTAGACTTGGCGAACCGGCATGCGGTGCCGGCTGTATGGTCCTGGCCTACGCCGATGTGCTTAACCAGGCTGGCTATCTGTCACACCGCCACATGTGGGTATCTGCTACGGACGTCGATCCGCTGGCGGCTGGCATGGCCTATATACAATTGTCGCTCTGTGGCATAGCAGGGGAAGTGGTGATTGGCAATTCGCTTCATAACGAGCGGCGCCGAATACTCTATACGCCCGGTCACTATTTGGGAAACTGGCCATCACGCTTGCGGGGGGATCAGGTTGCCTGATGAGTGAGAGGTTGAATTAACTAATGCCGGCTTATCGCCGGCTTTTTTACCGTTAATGTACTGATACTTCTGTTACTCGAAAGCTGTCGGGCTTGTGCTCAATGCTGTTGTATGGCGCTGATATGTTCCAGGATTGGCCAGGTTCAACATGATTGGCCATATCCACCGTCTGGCCAATGATTTGTCCATTCTGAAGCAGAGTGAACTTAATCATGACCATTTTAATTTCGTGGTCAGTCTTGTTGGTGCCGGTTCCTGTGATGTTTTTCAGTCCTATGGCTCAATTCTTCAGGCTGCCCTGTCTGGCGGTAGGGGCTTCCGTCGGTTTAATGTGCCTCGGCTCAGCACAAACAGTGTCCGTCTGATGTGGCCAATCTTCCTGAAAGAGCCCTGACAGGCCTGGATTGATAACGGGAACCGCCTGGTTACAGTAAATCTTTTCTTCAGGAAAAGATTTACTGTGGTGCGTATCGTTCTGATCTGCGCAGCATAGCGCCGGTCTGGATTTTATGGAGTGCTGCTGATGTCTTATTCTGATATGCCTGAACAGACTACCGTCATCGGCTGGTCTGGTCACTTATGAAAGAGCTGATTTCCCTCAGTTGCCTTTTATAATTAAGAGGGTGTAGTCTTTAAAATCGCATTTTTTCAATCATGGTATGAGTAGCGATTCGCTACAGTCAGGTATTTACAACCTATCTTGAGGATTTTCTAATGTCAGCGAAAGTAGTTGTAATAACAGGTGCGCTTTCCGGGATTGGCGAAGAGTGTTGCCGTCAGTTTGCGAATAACGGTTATAACGTAATATTTTCCGGCAGAAAAACCAAGCGTGGCGCAGAGCTACAAGAAGAGTTGAGGAGTATTAACTCTCAAAGCCACTTTGTGCTCGCTGATGTTGTGCTCGAAGAACAAGTCGCCGCTTTGATAGAAAAGGCCTGTCAAATGTACGGTAAAATTGACACGTTAATTAACAGTGCAGGAACAGAGGGCCTGCCCGCACCACATGATCAGACTACCGTTGAAGACTTTCACCGGGTATTTGATACTAACGTCCTGGGGACACAGCTTGTGATGAAGCATGCTTTGCCTGTTATGAGCAAGCAGGGAACCGGTAGCTTAATCAATATATCTTCGCAAGCCGGATTGGTTGGGATCCCAGGAGGAAGCGTATATGCTGCCAGTAAACATGCAGTCAATGGGCTTACGCGCTCCGTAGCACTTGAGGTCGCAGCTAAAGGCATCAGGGTTAATGCAATTGCACCAGGCCCCGTAGATACTGATATGTTTGACCGCTTTGTTGGCCGGAATGAAGAAGCGAAAGCCGAATTTCTCAGTAGAATGCCTACCGGGCGTATAGCCACAACTGGGGAGATTGCTGCCACGGCTTTATTCCTCGCCTCTGATGCAGCTCGGTCCATCATAGGACAAATCATTACGGTTGATGGTGGGTACTCGGTTGGTTAGAACGAAGTCTGATGCTGTAAAGTCCGCCATATGGGGTAGACTTTACAGCAGCAAGCGGTTTGGAACCCATGTTCACTCGTTGTCAATATCTCACTCATAGTTTAGATTCAGGCAGGATAAATCGATGTCGGGCTGATCTGCCTTCCAGTTGTCTGCAAGGTTTTCCACAGGGGCGGTGGAGCAGGAGGCTGATACTCACTAAGGTGACTGAGCAACAAATCCCTTTGGAGGGGCTTTCTATGGAAAAGGAAGTACGGCCTTTCACAGGAGAAGATCAAGTCCTTGAGCCAACGATTGAATCCTATGTGGACAAACCATTAATTTATGCTGGCGGCGGTATTATTCTTGTGAAGGATTTGAACCACCGCTTTGTGGCATCTAACACGGTATTTAGTCGTTTCTCAGGCGTGCACCCATATAAGCTCCAGGGTCTTAATGACTTTGATATGCCCTGGGCTGAAAGAAGGGATATTTATACCAATCATGAGAATGCTATTCTGTCTGGCGAAAATTATAATGTCCTTGAACCGTTGCCTGGGGTGATTAAGGCCTTTTTGCACACATCCAAAGAAATTATTTATGATAAAAATGGGCATCCTGCTGGAACGCTTGCTACAGCTATTATTATGAACGGTGTTTTTGATTTTTCTAACATTGCTGGAATATCAAAATTTATGAAAGTAGCCCCTTACCAAGGGGTGAACCTTACCGCGAATGAGGCTAAGGTTCTTTTTTTTATACTTAAAGGCATGAAAAGGAAAAGAATTGCAGATGTGATGAATATGTCACTTACGAACTATGATTATTATTTGAGGAACATTAAATTTAAATTTCATACTAACTCAATAGTAAATCTAATAGAGATTTGCATTGAGCGAGGTTATCATGAAAACTTTCCTTTTCAAATGGTTATGTGACATGTTAAATTTTATGACCTATGAGAAATCATAGGTTTTCAATTTTAGGTCTTTGATTCTCTCGTCTGTTAACTTTACCCTACGCATATTGAAGAACTGAGGTCAGTGATTTTTCTGCATCGAAGTAATCGCAATACCAGGGAAATATAAGAAGGCGAAAAAGCCGTATGTCGGGCAAGTGTATTAATTATATATCTGCAATGTTATTAGGCGCTGAATATTAATGGTGCGTACACCATGGTATTCAGCGTTTTTTTTAAGGCTACAGCAAGAGTAATGCAACGTAAGGCTACCCACCCATAGAAATCTTTTCTTTTTGAGAAAAGGTTTTCTTGTGGTGGATATCGTCTTGATCTGAGCAGGATAGTGTCGGTTATGTGATTACGGAGTGCTGCTGATGTCTTATTCTGATACACCTGAACAGGCCGCCATCATCGGCTGGTCTGGCCATCGCCTTGTGGTCAGGGCGTTCGCCGGTACTGGCAAAACATCCACTCTGGTGCGATTTGCGCAGGCGAACCCGGACTGCAGGATGCTTTACCTTGCC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58 | Vibrio_phage(14.29%) | tRNA,plate,protease,transposase,integrase | attL 401416:401430|attR 470830:470844 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
558228 : 604700
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014029|558228:604700|DBSCAN-SWA AATGAGTGACTACAAGAATACCCTGAACTTGCCTGAAACAGGGTTCCCGATGCGCGGCGATCTGGCTAAGCGTGAACCTGACATGCTGAAACGTTGGTATGAGCAGGATTTATACGGGATTATTCGTGCGGCCAAGAAAGGTAAAAAGACCTTTATTTTGCACGATGGCCCCCCTTATGCGAACGGCAACATTCATATTGGTCACTCTGTTAACAAAATTCTCAAAGATATTATTGTTAAATCAAAAGGAATGGCTGGATATGATTCACCGTATATCCCCGGTTGGGATTGTCATGGTTTGCCTATCGAGCTAAAAGTTGAACAATTAATTGGTAAGCCGGGTGAGAAAGTCAGCGCTGCAGAGTTCCGGACTGCTTGCCGTAAATATGCCGCTGAGCAGGTTGAAGGCCAGAAGAAAGATTTTATTCGTCTGGGCGTGTTGGGTGATTGGGACCATCCTTACCTAACGATGGATTTCAAAACTGAAGCCAATATTATCCGCGCATTAAGCAAAATCATTGATAACGGTCATCTGCATAAAGGTGCCAAACCTGTGCATTGGTGTACCGATTGCGGTTCGTCGCTGGCTGAAGCAGAAGTTGAATATTACGATAAGACGTCACAATCTATTGATGTGCGTTTTAACGCGGTTGATACGGCAACTGTTGCGGCCAAATTTGGTGTATCTGCTGTTAACGGCCCAATCTCACTGGTTATCTGGACTACCACGCCATGGACTCTGCCTGCTAACCGGGCTATTTCACTGAATGCCGAATATCTTTACCAGTTGGTTCAGGTTGAGGGCGAGTGCCTGATTCTGGCAGCCGATCTGGTTGAGAGCGTCATGAAGCGCGCGGGCATTACTCAGTGGGCCGTGTTGGGAAGTTGCACAGGCTCCGATCTGGAACTGTTGCGCTTTACCCATCCCTTTATGGGCTTTGATGTTCCAGCCATTTTAGGTGACCACGTTACATTGGATGCCGGTACCGGTGCGGTTCACACCGCGCCAGGTCACGGCCCGGATGACTTTGTTATCGGCCAAAAATATGGCTTAGAAGTGGCGAACCCTGTCGGTCCAAACGGTTGCTATCTGGCGGGTACGTATCCAACGCTGGACGGCCTGTTTGTGTTTAAAGCCAACGATGTGGTTGTCGAGTTGCTGCGTGAGAAAGGCGCACTGCTGCACGTTGAAAAACTGCTCCACAGCTACCCATGCTGCTGGCGTCACAAAACTCCTATTATCTTCCGTGCAACGCCGCAGTGGTTTATCAGCATGGATCAGAAGGGGTTGCGTAAGCAGTCACTTCAAGAGATCAAAGGCGTGCAATGGATCCCGGATTGGGGTCAGGCGCGTATCGAAACCATGGTAGCAAACCGCCCAGACTGGTGTATCTCTCGTCAGCGTACTTGGGGTGTGCCGATGTCTCTGTTCGTTCACAAAGAGACCGAACAACTTCATCCGCGCAGTATTGAACTGATGGAAGAAGTGGCCAAACGTGTTGAGCAAGATGGCATTCAAGCGTGGTGGGATCTGGATCCGGCAGAGATTTTAGGTGCCGATGCCGCAGATTATGTCAAAGTGCCAGATACGCTGGACGTATGGTTTGACTCTGGTTCCACCCATTCTTCGGTCGTTGACGTCCGCCCTGAATTTGGGGGTCATAGCCCGGATATGTATCTGGAAGGTTCTGACCAGCACCGCGGCTGGTTTATGTCTTCATTGATGATTGCTACGGCGATGAAAGGTAAAGCGCCTTACCGTCAGGTTCTGACCCACGGTTTTACTGTGGATGGTCAGGGTCGCAAAATGTCCAAATCCATTGGTAACACCATCAGCCCACAAGATGTCATGAACAAGCTGGGGGGTGACATTCTGCGCCTATGGGTGGCATCAACCGACTATACCGGTGAGATTGCTGTTTCTGATGAAATTCTGAAACGCTCTGCGGACTCCTATCGTCGTATCCGTAATACCGCACGCTTCCTATTAGCTAACCTAAACGGCTTTGATCCCGCACAGCATCAAGTGAAACCGGAAGAGATGGTTGTAGTCGATCGCTGGGCGGTTGGCCGTGCGCAAGCGGCTCAGGCAGAAATTATGGAAGCGTATGAGAATTACGATTTCCATTTGGTAGTGCAACGGCTGATGCAGTTTTGCTCGGTTGAGATGGGATCCTTCTATCTGGATATCATTAAAGACCGTCAGTACACCGCGAAAGGTGACGGCATTGCACGCCGTAGCTGCCAGACAGCACTGTTCCATATTGCCGAGGCGTTGGTGCGCTGGATGGCCCCAATCATGTCCTTCACTGCGGATGAAATCTGGAATCATCTGCCGGGCGAGCGTCAACAATATGTCTTCACTGAAGAATGGTATGACGGTCTGTTTGGTTTGGCGGGCAACGAAAGTATGAATGATACTTTCTGGGCTGAATTGTTGAAAGTGCGCGGCGAAGTGAACAAAGTGTTGGAGCAGGCCCGTAGCGATAAACGTATTGGTGGCTCATTAGAGGCCGCAGTGACGTTATACGCAGAGCCTGAACTGGCTGCTCGTTTGAACAGTTTGCAAGATGAATTGCGCTTTGTTCTACTGACTTCTGCCGCTAAAGTGGCCGCTTATGCTGATGCGGGCAATGATGCTCAGCAAAGTGAATTAATTGCCGGGTTGAAAATTACCTTTAATAAGGCTGACGGCGAGAAGTGCCCACGTTGCTGGCATTACACGCAAGATGTCGGTTTGGTAGCAGAGCACGCTGAACTGTGTGGGCGCTGTGTCACTAACGTTGCTGGTGATGGTGAGGAGCGTAAGTTCGCCTGATGAATAAACCTATTTGCTCGACCGGATTGCGCTGGTTATGGCTGGCAGTTGTCGTTGTCATCTTGGATATCAGCAGCAAACAGTGGGTCATGGCCCACTTTGCTCTGTATGAATCGGTGCCACTGATTCCTTTTTTCAACCTAACCTATGCGCAGAATTTTGGCGCAGCATTTAGCTTCTTGGCGGATAAAAGTGGTTGGCAGCGTTGGTTCTTTGCCGGTATTGCGATAGGCATCTCCGTCGTACTGATGGTGATGATGTATCGCTCAACAGCAAAGCAACGCCTGATAAATTGTGCTTATGCATTAATTATCGGTGGTGCACTCGGGAATTTATATGACCGTTTAGTGCATGGCGCAGTCAACGATTTTCTCGATTTTTACATCAATAACTGGCATTTCCCGACGTTCAATTTGGCCGATGTGGCGATATGCATTGGCGCTGCGTTGGTTATTTTTGAAGGCTTCTTAAGTCCGGTAGAAAAAAACGCGGTGAATAACGATGAGTGATATGTCCGAATTTGTGCAAGATACCGAATCGGTACAAAATACTGGAACGGTAAAAACGACTACAGCGGTGCAAAATAATGGCGCTGTTTTAGTGCATTTCACTCTGAAGCTTGAAGATGGTTCAACGGCCGAGTCAACACGCACTCACGGTAAACCGGCGCTCTTTCGTTTAGGTGATAACAGCCTTTCTGATGCACTGGAACAGCAATTGTTGGGGCTGACCGTGGGCGATAAGCACGCTTTTACGTTACGCCCTGAAGATGCTTTTGGTGTAGAAAATCCAGACCTTATTCAGTATTTCACTCCACGTGATTTTGCTGAGACTGGTGTGCCAGATGCCGGCACCATCATGTTATTCAGCTCTCGCGATGGCAGCGAAATGCCGGGTGTCGTACGGGAAGTCGCAGAAGAGTCTATTACTGTTGATTTTAATCACCCGTTGGCTGGGCACTCTGTCAGTTTTGAACTTGAAATACTGGAGATTGACCCCCAACAGGAGGTTGTCTATGCAGATATTGCTGGCTAATCCACGTGGCTTTTGTGCTGGCGTTGACCGGGCTATCAGTATTGTTGAACGTGCGATAGAAATGTATGGCGCGCCAATTTATGTACGCCATGAGGTGGTACATAACCGCTATGTGGTTGAGAGCCTGTGCGAGCGCGGTGCTATCTTCATCGAGGAAATTTCAGAGGTGCCAGATGGCTCCATTCTGATTTTCTCGGCCCATGGTGTGTCACAGGCCGTTCGGGCAGAGGCCCGTTCACGTAATTTGACGATGCTGTTTGATGCAACCTGTCCATTGGTTACCAAAGTCCATATGGAAGTCGCCCGTGCGAGCCGTAAGGGTAAAGAAGCTATTTTGATCGGCCATGCCGGTCATCCAGAAGTGGAAGGGACCATGGGGCAATACAGCAACCCTAACGGGGGGATGTATTTGGTTGAATCGCCTGATGACGTTTGGCAGTTGAATGTCAAAGATGAGAATAATCTATGTTTTATGACGCAGACCACCTTATCGGTTGATGATACCTCTGCTGTTATCGATGCGTTGAACACGCGCTTCCCAAAGATAGTCGGCCCACGCAAAGATGATATTTGCTATGCCACAACCAATCGGCAAGAGGCAGTACGTAATCTGGCAAATGATGCCGATATCGTATTGGTCGTGGGGTCGAAAAACTCCTCTAACTCTAACCGATTGGCCGAACTGGTACAGCGAATGGGTAAGCCCGCTTATCTGATTGACTCTGCGGCAGATATTCAGGAATTTTGGTTACAGGGCGCCAAGTGTATCGGTGTTACCGCTGGTGCATCTGCCCCTGATATTTTGGTGCAGCAAGTGATTGCACGCTTAAAAGATCTTGGTGCTGGTGAATCGATTGAACTCAGCGGTCGCGAAGAAAATATTGTTTTTGAAGTACCGAAAGAACTGCGTGTTGAGGTTAAACAGATCGACTGATTCAGGTGTTTCTTTGTCGATCAGATAGGTGTTTACTCAATATGTATTTACTGACGAAAGCAGCCCTTTGCGGCTGCTTGAGGTTATTGATAATGCTATTTTTAGCCTCGTGAATGAAGGGTTGACCGCACCTAGGGGCACTTCGGTGGCTTACGCCACTACGACCCCAACGGCACGTTTCCCCTTCAATTGACTTTGTCAGCAGTCTGAAGC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40 | Bodo_saltans_virus(20.0%) | tRNA,plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
625523 : 682145
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014029|625523:682145|DBSCAN-SWA 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53 | Escherichia_phage(50.0%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1281544 : 1336687
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014029|1281544:1336687|DBSCAN-SWA 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56 | Escherichia_phage(33.33%) | protease,integrase,transposase | attL 1281476:1281535|attR 1327257:1329213 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1359407 : 1395629
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014029|1359407:1395629|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014029|1359407:1395629|1363350_1363947_-|WP_002218278.1|DBSCAN-SWA MPKVGMQPIRRQQLIEATMAAVNEVGMHEASIAQIAKRAGVSNGIISHYFRDKNGLLEATMRYLIRHLGEAVKQHLAALSVNDPRARLRAIAEGNFDDSQINSAAMKTWLAFWASSMHSPQLYRLQQVNNRRLYSNLCAEFKRCLPREQAQLAAKGMAGLIDGLWLRSALSGEHFNRQEALLIIHNYIEQQLNIKYKC >NC_014029|1359407:1395629|1372603_1374418_+|WP_002220171.1|DBSCAN-SWA MKESKGKSNLFSVIPYGFFVGLVIILIAVIITMAIKDLNRGRNIEFQTLLEKSAVLIRSFESSSRTGMGMSWRQRQTLMEEMAYQPGVIYIAVTDLSGKILAHSNPARVGTQLYSPQEMADLNVQLAEQWRIAAFLDEDNKSQDAFEVYRFFKPLRRNNTHQSHMNMVRRSNVAATQDNNDKYENQSVIFTAFDTEALDAMQAKDIRNTIIFLSILSMLALAGILALFWARRYQLSRRQLQDSKAISTEIINNLPIGLITTNEEQLISVVNHTAEKIFGISKDILTGQNIHQALPPEWNLLVKKSQRHQPVIEHEIDYKLKEGLIIPLSISVANIVNHNGSFLGNIFIFRDMREVRQLQEEIRRKEKLVAIGNLAAGVAHEIRNPLSSIKGFAKYFEGHSPQGSEEQELAKVMIKEVDRLNRAVTELLGLVRPSDLRIQLVNINEIIAHSLHLIRQDADSKKITIQFISNENLPRVEIDPDRFTQALLNLYLNAIQAMGRAGTLEIALALVEESKLRISVIDTGKGIRAEDLENIFNPYFTTKASGTGLGLAIVQKVIEEHQGRITVTSHPQSGTRFDMTIPLVQRGQYRPDGQEQKASNNDNT 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MPSVKGFKHVGFLTRKKGQSFEDFVKHWEEVHTAITLKLPGLRGYVLNPIDREKYPDSPVDGFSELWFDSIEDAIAAFDSPIGKAAYEDVPNFVESAAITYITEIRKL |
30 | Catovirus(12.5%) | holin,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1436217 : 1481576
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_014029|1436217:1481576|DBSCAN-SWA 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39 | Pseudomonas_phage(25.0%) | tail,plate,transposase,protease,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1655123 : 1729361
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_014029|1655123:1729361|DBSCAN-SWA 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60 | Streptococcus_phage(20.0%) | plate,tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1759220 : 1803738
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_014029|1759220:1803738|DBSCAN-SWA 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36 | Tupanvirus(14.29%) | lysis,tRNA,plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2161438 : 2261095
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_014029|2161438:2261095|DBSCAN-SWA 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MELEDLISVMTPEIYQRLVQAVELGKWPDGVALTSEQKENSLQMVMLWQARHNRDAQHMSIGTDGQIVMKTKQELKQQFSQSTLVKLKPE |
104 | Escherichia_phage(15.09%) | lysis,holin,tail,tRNA,transposase,integrase | attL 2208790:2208820|attR 2250514:2250544 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2532347 : 2571432
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_014029|2532347:2571432|DBSCAN-SWA 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31 | Escherichia_phage(14.29%) | protease,coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2643328 : 2699140
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_014029|2643328:2699140|DBSCAN-SWA 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53 | uncultured_virus(30.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3280127 : 3349877
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_014029|3280127:3349877|DBSCAN-SWA 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59 | Escherichia_phage(25.0%) | tRNA,plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
3887061 : 3958033
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_014029|3887061:3958033|DBSCAN-SWA ATTACTTACGGCCCGTAAACGGGCTACCGGGATACGGGATCGAGAGTTGCTCACCCATTTTATCCTCTTCCAATTGGTGCTTTATGTATTCTTGTATCCTGGCCGTGTTTTTCCCTACCGTATCAACGTAATACCCTCGACACCAAAACTCCCTGTTACGGTATTTGAACTTCAAATCGCCAAACTGCTCATAAAGCATCAGACTGCTCTTTCCCTTCAGGTACCCCATAAATCCCGAGACACTCATCTTGGGCGGGATCTCCAGAAGCATATGGATGTGATCCACACAGCATTCTGCTTCCAGGATATTCACGTTTTTCCATTCGCACAGTTTTCTTAAAATACTGCCAATCGCTCTGCGTTTTTCCCTGTAGAACACCTGCCTTCGGTACTTCGGCGCAAAAACTATATGATATTTACAGTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCATCCCTCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTGTAACGAACGGTGCAATAGTGATCCACACCCAACGCCTGAAATCAGATCCAGGGGGTAATCTGCTCTCCTGATTCAGGAGAGTTTATGGTCACTTTTGAGACAGTTATGGAAATTAAAATCCTGCACAAGCAGGGAATGAGTAGCCGGGCGATTGCCAGAGAACTGGGGATCTCCCGCAATACCGTTAAACGTTATTTGCAGGCAAAATCTGAGCCGCCAAAATATACGCCGCGACCTGCTGTTGCTTCACTCCTGGATGAATACCGGGATTATATTCGTCAACGCATCGCCGATGCTCATCCTTACAAAATCCCGGCAACGGTAATCGCTCGCGAGATCAGAGACCAGGGATATCGTGGCGGAATGACCATTCTCAGGGCATTCATTCGTTCTCTCTCGGTTCCTCAGGAGCAGGAGCCTGCCGTTCGGTTCGAAACTGAACCCGGACGACAGATGCAGGTTGACTGGGGCACTATGCGTAATGGTCGCTCACCGCTTCACGTGTTCGTTGCTGTTCTCGGATACAGCCGAATGCTGTACATCGAATTCACTGACAATATGCGTTATGACACGCTGGAGACCTGCCATCGTAATGCGTTCCGCTTCTTTGGTGGTGTGCCGCGCGAAGTGTTGTATGACAATATGAAAACTGTGGTTCTGCAACGTGACGCATATCAGACCGGTCAGCACCGGTTCCATCCTTCGCTGTGGCAGTTCGGCAAGGAGATGGGCTTCTCTCCCCGACTGTGTCGCCCCTTCAGGGCACAGACTAAAGGTAAGGTGGAACGGATGGTGCAGTACACCCGTAACAGTTTTTACATCCCACTAATGACTCGCCTGCGCCCGATGGGGATCACTGTCGATGTTGAAACAGCCAACCGCCACGGTCTGCGCTGGCTGCACGATGTCGCTAACCAACGAAAGCATGAAACAATCCAGGCCCGTCCCTGCGATCGCTGGCTCGAAGAGCAGCAGTCCATGCTGGCACTGCCTCCGGAGAAAAAAGAGTATGACGTGCATCTTGATGAAAATCTGGTGAACTTCGACAAACACCCCCTGCATCATCCACTCTCCATCTACGACTCATTCTGCAGAGGAGTGGCGTGATGATGGAACTGCAACATCAACGACTGATGGCGCTCGCCGGGCAGTTGCAACTGGAAAGCCTTATAAGCGCAGCGCCTGCGCTGTCACAACAGGCAGTAGACCAGGAATGGAGTTATATGGACTTCCTGGAGCATCTGCTTCATGAAGAAAAACTGGCACGTCATCAACGTAAACAGGCGATGTATACCCGAATGGCAGCCTTCCCGGCGGTGAAAACGTTCGAAGAGTATGACTTCACATTCGCCACCGGAGCACCGCAGAAGCAACTCCAGTCGTTACGCTCACTCAGCTTCATAGAACGTAATGAAAATATCGTATTACTGGGGCCATCAGGTGTGGGGAAAACCCATCTGGCAATAGCGATGGGCTATGAAGCAGTCCGTGCAGGTATCAAAGTTCGCTTCACAACAGCAGCAGATCTGTTACTTCAGTTATCTACGGCACAACGTCAGGGCCGTTATAAAACGACGCTTCAGCGTGGAGTAATGGCCCCCCGCCTGCTCATCATTGATGAAATAGGCTATCTGCCGTTCAGTCAGGAAGAAGCAAAGCTGTTCTTCCAGGTCATCGCTAAACGTTACGAAAAGAGCGCAATGATCCTGACATCCAATCTGCCGTTCGGGCAGTGGGATCAAACGTTCGCCGGTGATGCAGCACTGACCTCAGCGATGCTGGACCGTATCTTACACCACTCACATGTCGTTCAAATCAAAGGAGAAAGCTATCGACTCAGACAGAAACGAAAGGCCGGGGTTATAGCAGAAGCTAATCCTGAGTAAAACGGTGGATCAATATTGGGCCGTTGGTGGAGATATAAGTGGATCACTTTTCATCCGTCGTTGACATCTGGGGAGACAGTCGGATGCTCTTGAGCTACCGCTGTAGTGAATTCAGCCACTCCCAAGCGGGCCCCCTGACCCAAGGTTGCTAACTCTGAGCGGTTTTGCATCAGAGCATCCTCTGATGTAATTTCAGTAAATTCCACAGCAAGCCTTTGTGCAACATCACGAATGTGCTCAGCTGTAGCCTGATATAATTCATTTACAGAATCAGTGGGACAAAAAGCGGTCCAGTCTTGTTCAACATCAGATTCGAAACCTTCTGTATCAACGATAACCTTGTAACGCCGGGCAAAGCGTGTACGTCCGTCGAAATTGGCTATCTGTCCAACTGCCCATGACGGGGTCCCAACTAATCTGTGCTGTACCCAAAATGCAATTCCTTGGTGCAAAGAAGAATGATTCAGACGAGTTGAGTCGATGACAATCACTTTGGCATGACGTCCTGCACTGAGGCACAGGGTCTCTTCACTTATTCGCCCATCAATCTCAGTAAAGGGTCGTAACTTGCCATTAACACGCACCTCGAATTCAGGATCGTGGATGAAGCGGGCGGATAATACAGTGAGTATTTCATCGGCATCTGGCAGTTTGCGTGTTACCTGTACCTGCAATCGTGTACCGGATCCTATGTGTTTCTCCTCAGTCTCACTACGACACACGAAAGGACTAGAACCAGCTCCGGTGCCAACAACGAAGGTTGCCAAAATGCCATCGCGCCAGGTTTTCACTTCGTATTCGTCAGCAAAACAAAGCAAGCCATGGCGACCAATGCCATTGCGACCGTAAGCCTTTCGCGGGCGGGCAGTTCGTCCGGTAGGGAACTCTACATTGAAACCTTGATACTTCTCGCGGGTATAGCGCAAAGTCATCCAGCGCTTTTTAAATTGCTCCGGGGTCATACCATGACCATCGTCTGTCACAGTCAATATTCCACCTATATCGGTAGGTAAAACCAAGTCTACTCGTGACGCTCCGGCATCCCAGGCGTTAGCAACTAACTCTGTTAAAGCGACCTGTGGAACATGTGCTACCTGCCCAAGTTCCCGTAGCAGGTAATCGTCCTCAAAAAGCGAGTTCTGTAGTGGTTGCTCAGACATGGGCGGCCTCACATAAACGATTCGGTGACCAAATTAATTCTACTAATCCCGCAATCAGTTTCCGGCGTACCTGTTGCTCCGCTTTATCGAATACCTCAGCGAATTTGAAAGGCAGCTCATATTTGGTAGAAAACTGCTGAAACTGTGGCTGATGTTCGTAAACACTGGAGTCCAAACTTGCGGCAAAGAAGTTCTGTTTGGCATAGTGCACCCGCTTCAGGGGAAACGGTTTGTCCTGCAGGCTCCGGTTAACATCTGCTGGTAAGAGTAAAATTGACGCAACATGATTGCGCCAATCTTGAAATTCCTGCTCAGTACTGAACTGATCTTTCACGATTTCGTAATCATCAGCCCAGATATGTTCGATGTCAAATGGGTTCTTGAGAGTACGGTCCACCAATCGATCAAATGTCTCAGTACGCCCTGCGCCGATCTCAGTTGCTTCTGTCAGTCGTGCTAGCAAATGGTAGATATAACGGCGGCTGAATTGATTGAGCCCTAAACCATCAATACCCGTTCGTCCTTTTACTGCGTAGCCGGAGAACGTAACATCATCATCTGCCAACTTATTCTGGAGGATAGCTACCAACTCCGATAGCGGTTTACGCCTGATCTCCCGGCACAATAACCACATAGCGTAAGACACACTTGAGTATCCAACCCGGACATAATTCACTACTCGACGCATCAACCAGATGTCCAAATAAGTAGCTGTGACCGCCAGTTTGCGATCCACTGTCTCGTCGTCGTCAGTTTCTATCAACGATGCTAGGAGCACCGTATTCTGCCAAGTAAAATCATTGTGAGCGTTGTAGTAGACCGCTCGTAGCTTCGGTGTGTAATGCTTGCTGGTATGTAGGATACGTCGGTACGCTTTGGCAAAAAATGGAAAGCTTACAGCCATCATGTTCTGATTTTCCTGAGCTTTACCCAAACCCAGGCGAGAGTTGTTTTCTCGCACCCAGCGGTGAAAGACTGAACCGATCAACTCCCAATCTTTATCGACCGAGCCCGCCTTACGTTCACGGATACTTTCTGCGTACTGTGCCCGTAACCACGCCTTAATACAGTTGGCATCACGCTCCGGTTCGTGCCCCCCTCCCCAAGAGATCAATTCCAAAACTTGTTGTTTCCAGACCTGATTAGCCTGTAATCGCGCATCCTGTTCTTCAATTGGAGCCAACAGATAGGCCTTCAACATATCGACTGGACTCAGTGGCTTACCCCGATCATTCATCGTTTCAAAAATAGCGTAGGCATAGCTATCGTTATCCGTGGCAATCTCGATCAAACCTACCCTCGTCAACAACCAGTAGATGAAATGTGGCAGCGCGTCTCCTAGTTCTGCCATCAGGTCATTTACTTCAATATCGCTATAACGAGCATACATGGTTTGGATGGATTCATCCTTACCGTCCGGATTGAACGCTTCCCCTTTAAATAGTGCATTAATAACAGGTAACCGCTC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60 | Bacillus_virus(18.75%) | plate,tRNA,integrase,transposase | attL 3878379:3878395|attR 3906491:3906507 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
4048926 : 4111361
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_014029|4048926:4111361|DBSCAN-SWA 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56 | uncultured_Mediterranean_phage(18.18%) | holin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014029.1|WP_002214494.1|2204125_2204482_-|hypothetical-protein |
2204125_2204482_-
Protein sequences of NC_014029.1|WP_002214494.1|2204125_2204482_-|hypothetical-protein>NC_014029.1|WP_002214494.1|2204125_2204482_-|hypothetical-protein MKYSTLAAVIFGISATLSSATNPVQAAEASLINLVCQLKDGNDLLAILDGPNQQLIIDKSVFQFIKVNPEGQGEALIFQKANSEEQVIASLNISALPIRLAVVDEVQASQYTCTHTQA |
118 aa aa | NA |
HTH_GNTR
HTH_GNTR HTH domain information
|
NA | 2161438-2261095 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.7|2722053|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_014029 position: 2238773-2238742, mismatch: 0 aaaaagaatttgggattaaagttacccatcag CRISPR spacer aaaaagaatttgggattaaagttacccatcag Protospacer ******************************** 2. spacer 4.4|2952135|32|NC_014029|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014029 position: 2233207-2233176, mismatch: 0 agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga CRISPR spacer agactgatgcaagatggcggtatgcgtacaga Protospacer ******************************** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 6365
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014017|0:6365|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014017|0:6365|2731_2974_-|WP_002224342.1|DBSCAN-SWA MAHVTSVTLGEHLTGFVGEMIQSGRYGNISEVLRDALRLMEAREQRVQHVRDMVLAGTNVPVSHRLMDEIFSAAVKDTSV >NC_014017|0:6365|3840_4077_-|WP_154020274.1|DBSCAN-SWA MGPWSQLLTLALDIQVGPWSQLPTLALDIQVGPWSQLPTLTLDIQVGPWSQLPTLALDIQVGPWSQLLTLALNILVEM >NC_014017|0:6365|1054_1447_-|WP_002213403.1|DBSCAN-SWA MYSFEQAITQLFQQLSLSIPDTIEPVIGVKVGEFACHITEHPVGQILMFTLPSLDNNDEKETLLSHNIFSQDILKPILSWDEVGGHPVLWNRQPLNSLDNNSLYTQLEMLVQGAERLQTSSLISPPRSFS >NC_014017|0:6365|4236_5202_-|WP_002213354.1|DBSCAN-SWA MMKRSPVLRNAPSINFDDAKPAISNAEPSVSAPAVSQLASRVSGMKGNTIVLPVCGRNVAFTLKVIAAPDVESKTIVFSGNERNQALLSETSLDDLIPSFLTSGQQIPAFAREHNGNIEVADGSRRRKAAILTGSDYKVLVGNLNDEQMLWLSQIANEYRPTSAYERGLRYAQRLISEFEGNISKLAEAEHLSRKIIQRCIKTAGLPLKTIQLFANPNELSARSGEALSKAYENNVDTLKRVTHKIMKQKQEGRQFTTEELIVLLMPERKQPENIHKKSFGKNIEAKYSKDNVSFYLKSVPESLVKQIEELLNTYAKEHSL >NC_014017|0:6365|3518_3692_+|WP_002213357.1|DBSCAN-SWA MKSPYPTWRDGYRYQKADIMLNDVGSRPGQIDMFDETPPHANSKHLMQVVDASIALG >NC_014017|0:6365|5198_6365_-|WP_002220902.1|DBSCAN-SWA MDLKSTLDRCIERGQFMTQEIAKSQFGNDSPAARTITRRWRITEAAELVGVTPQTIRNYEDSGKLPPPDTAMIGRVEQRTGYSIQQINDMRDVFKTRLSKPKGENPVVLAIAAHKGGAYKTSTSVHIAQWMALQGLRVLLIDATDPQATASLYHGYVPDLHIHEEDTLLPYYLGQRDDAAYAIKPTCWPNLEVIPSCLAVHRIESEIYGLHDQGKLPVAPHLLLRAAIESVWDSYDVVVLDSAPNLGIGTINVVCAADVIVVPTPAELYDYVSTLQFFTMLRDLMSNIDLNGFEPDVRVLITKFSNAIGSQSQWMDDQIRNAWGGMVLKEVVRVTDEVGKGQVRMRTVFEQAANQRSTPAAWRNAVSIWEPVCAEIFNRLVKPRWENA >NC_014017|0:6365|2439_2739_-|WP_002213360.1|DBSCAN-SWA MYKLSELADEDIYNIASYTIRHFGVTQAKLYHENLAKVFELLAKNPELGAECNWICSDIRRFQYKKHGIYYITLSNDILISRVLHQSIDIDVQDFPEHE >NC_014017|0:6365|1640_2300_+|WP_002229754.1|DBSCAN-SWA MKISSFISTSLPLPTSVSGSSSVGEMSGRSVSQQTSDQYANNLAGRTESPQGSSLASRIIERLSSVAHSVIGFIQRMFSEGSHKPVVTPAPTPAQMPSPTSFSDSIKQLAAETLPKYMQQLNSLDAEMLQKNHDQFATGSGPLRGSITQCQGLMQFCGGELQAEASAILNTPVCGIPFSQWGTIGGAASAYVASGVDLTQAANEIKGLAQQMQKLLSLM |
8 | Yersinia_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
10651 : 66067
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014017|10651:66067|DBSCAN-SWA 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59 | Enterobacteria_phage(40.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
86 : 64182
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014022|86:64182|DBSCAN-SWA 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65 | Salmonella_phage(91.94%) | tail,terminase,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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