Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_012985 | Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. NC_012985
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_012985_1 | 210644-210774 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012985_1
|
1 spacers
spacers of NC_012985_1
>1.1|210689|41|NC_012985|CRISPRCasFinder ATAGTCATGGAAAAAGAAACGTCGGTAAAAATCGATAAAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012985_1
The CRISPR arrays of NC_012985_1 >merge|NC_012985|1|210644-210774|CRISPRCasFinder CAAACAAAGTATACGAGATTTTACCTGCTCAGGAGGCTACGTCTAATAGTCATGGAAAAAGAAACGTCGGTAAAAATCGATAAAACCAAACAAAGTATACGATATTTTACCTGCTCAGGAGGCTACGTCTA >NC_012985|1|1|210644-210774|CRISPRCasFinder CAAACAAAGTATACGAGATTTTACCTGCTCAGGAGGCTACGTCTA ATAGTCATGGAAAAAGAAACGTCGGTAAAAATCGATAAAAC CAAACAAAGTATACGATATTTTACCTGCTCAGGAGGCTACGTCTA
>NC_012985.3|WP_012778536.1|209438_210539_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MTECNVFEDEVERIRSSLYNSIASVTDMDSLNAIRVATLGRKGSISSLLKDLKNLDSQQVSARGAILNQLKVDISGKISARKDFIRNQLIFEQISSQSVDVSLPVFSSPCHRGRIHPVTQVIDEVTCIFMDMGFALEEGSDIETDYYNFAALNFPDDHPARQMHDTFFVPGIAGGKHKLLRTHTSPVQIRVMESQDLPIKVIVPGKTYRRDSDSTHSPMFHQIEGLVVSDSATIANLRWVLESFCKSFFEVSSLQMRFRPSFFPFTEPSFEVDVRCSFSDGIIKFDEGTEWMEILGCGMVDPRVLRGVGIDPDIYQGFAWGMGLDRIAMLKYGMPDVREFFGADVRWIEHYGFSPLDIPPLFSRLA >NC_012985.3|WP_012778535.1|207008_209426_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MKFTLSWLKDHLDTDVSLEKICDTLTSIGLEVEKVDNREALSPFTIVKVLSVERNPDLDCAILRIDTGKHQEIQVVCGAPNVRVGLLGVWAPPGSCIPENNMIVNVRKIRGIESTGMMCSEKELMLSDDSASIMELPIDAPVGGRLSDYLELSDPIIDVSLTPNRSDCIGVRGIALDLVAAGLGKLKEINISCPLSSESIPLEIKFDLDDSSLCKGFAMCCVKGVRNNVAPNWMRQRLKAVGLRSISALVDITNYVSLDRGYPSHVFDASRISDVLTVRRACSGEKILALDNQEYDLSPDNVVIASDGRIQSIAGIIGGKHAGCDDNTTDVLVEVALWDPINIARSGKNLGIITDSRYRFERGVDLQGMIPVLKHIVSLILSLCGGTASDICIARNITYKPRKIVFMNSEVKRLSGIDVPIEDSLRILERLGFSVIGEYDKFEVSVPSWRQDVEEKADLVEEILRIYGVDQIKSEPLPLTQVEDKRNLSLQQSRTRYVKRVLASRAMMEVVNWSFISKEQSVLFGGGQRELEILNPISADMSNMRTSLLPGLLKATGRNVDRAIADFAIFEVSHVYENDTPEGQKYMAAGIRKGSSGIEGSGRLWSDKSEERCRFVDLFDAKADALSVIEPFVSLDSLRFESGAPSWYHPGRSGIIKTSAEIVLGYFGEFHPNILDFFGLSNPICGFEVYLDSIPISQKKRTKTKKVVHLSSLHPVKRDLAFIVDQHIPAGTLVNIIKNVDRLIDDVTVFDVFQGKSLGEGKKSVAIQVLIQPLKDTFRDDDIRILMDRIVENVVKKTNAVLRSS >NC_012985.3|WP_012778533.1|205403_206459_-|porin MGLKKFFLGTVAVATIISYSESFAYVRGKTSMVSNNRARNRSAGKVGNVLPHITKVGGSLEKSLQARYHKLNGNNEFNSLAYDIPVKGNLEVNANAGDVTGVAKLKLAVDDVLSMQFAESDVRALAFTVPSSKLSVEELSLSMKGARLGYYKSWSDEVNPVYSPTTLYNDARGLDKMMSLSYRHSFGLLKAGLSTDLLQKDGLKQVLGIGYMASYAIGKIRSTVTGGYDAGTNNVAIRANISSPVSRAGTLDCGAVWASGDNSYYDKSKYSVFAGYKFDVAKSITISGGGQYFGDINKTGKDGWSAGISAKYMISSGLEAQASVAFNDNFVKKGVAIDKGVDLSVGLKKSF >NC_012985.3|WP_012778532.1|204152_204836_-|RlmE-family-RNA-methyltransferase MVKPPGSSSRRGLTQKVKNRSCQGSSRDWLNRHINDPYVQRAQLEGWRARSAYKLLQINEKHQILQSNRRIVDLGSSPGSWSQVAARITGSNANNTRVVAIDILDMEPILGVKFFKFDFLDLDSWEFIRQAIGGNPDLVLSDMAYPTIGHRKIDHLRTMSLCEAATFFALEMLNIGGDFLVKTFQGGTTNDILCLLKKHFQKVIHVKPVASRAESVEMFLLAKGFRK >NC_012985.3|WP_012778531.1|202549_202918_+|response-regulator MNQKILLAEDDDDMRRFLIKALGKAGYEVVSCNNGASAYDKVREEPFSLLLTDIVMPEMDGIELARRATELDPDLKVMFITGFAAVALNPDSNAPKNAKVLSKPFHLRDLVNEVNRLLTIKN >NC_012985.3|WP_012778530.1|201483_202017_-|peroxiredoxin MIRFQIPQVVFHMRVATVLPDGSKAFQWKDVNTQDLFAGKRVFLFALPGAFTPTCSDHQLPGFEKIYDDLRCEGIEEVYCLSVNDAFVMNAWGKKLEIKNVKLLPDGSGEFTRKMGMLVYKDNVGFGLRSWRYGALIKDMVVESWFVEEGFSDNCATDPYEISSPENVLKVIRESKK >NC_012985.3|WP_012778529.1|200603_200963_-|hypothetical-protein MPAIIQTVKSIIIELFHCIYPSICPIYSRIINLRFCLCGHCWSKIHFITATEHILKNNKDNIDKDPLKSMQKDLPLTQIRSVTLYCDMSCVLVRLLKYHDRTDLAIMMAQWMFRVLEKI >NC_012985.3|WP_012778528.1|200228_200408_-|hypothetical-protein MRNAFNVPQYVSKHVAGLKILLIDDVYTTGATAKCAAIALKKAGAMTVSILTFSRSLKD >NC_012985.3|WP_012778527.1|199328_200195_+|lytic-murein-transglycosylase MSFKKYLLISLLMMVYPMLAQAVTQPKKATTQFICSDTADRFGEWKSAARARAVREGMSPKTAKHLFADLEYLDTTIARDRKMVTSPPVSFKDYLDGLSSSEIIAQGIALKKANSRLLINLKKEYGVPPGILMALWGLETHFGETMGKTPLLSTLATLAYDCRRAKFFTEQFFYALDLVKKGVISSHALGATFGEIGQFQFLPVNVVKYAIDADEDGKIDLVKSNIDAIASAAKFLAKLGWTKCAGYQPGEKNFAILKHWNASLNYNKTIAYIAAHIDGVPIGKGYDT >NC_012985.3|WP_012778526.1|198264_199272_+|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MTFKVAVVGATGNVGREMLNIICERGFPISEVVALASERSAGTKVPFGKETIDVQDVKSYDFSDTDICLMSAGHAVSSQMSPKIAANGCIVIDNSSAWRYDSDVPLIVPEVNPQTISLASRKNIIANPNCSTIQLVVALKPLHDLAMIKRVVVTTYQSVSGAGKKGIDELLAQTKAFLAKKTIENRVFTKNIAFNVIPHIDVFMDGGSTKEEWKVLVETQKILDPNIKVSCTAARVPVFIGHAESVNIEFEKDISIKDAVAAINKSKGCIVVDKPDKNEYITPVESIRRDLVFVSRIRKDPTLKSGLNLWIVANNLRKGAALNAVQIAELVAQEA >NC_012985.3|WP_012778538.1|211173_211377_-|50S-ribosomal-protein-L35 MPKMKTNSSSKKRFSITATGKVRAQAAGKRHGMIKRSNKFIRNARGTMVLASADAKKVIRNYLPNGI >NC_012985.3|WP_076778740.1|211524_212091_-|translation-initiation-factor-IF-3 MAIRKVCRSSKLDVGSKDNYRVNDEVLLHNPGVIKLVTADGQNANEISASEALQMAQEANLDLVEIDSSVTPSVCKILDLRKLRYTIQKNAVEARKKQKSTGIKEVKMRPVIDLHDLQVKLKAIDGFLRDGCKVKISVKFRGREIMHQDLGRELLSNIKERFGEISRIDCEPKFEGRQMIMILSSKCV >NC_012985.3|WP_012778540.1|212343_214164_+|elongation-factor-4 MQKKPTPLSRIRNFSIVAHIDHGKSTLADRFIQHCRGLTEREMSSQVLDNMDIERERGITIKAQTVRLNYTSTDAKDYQLNLIDTPGHVDFTYEVSRSLSACEGSLLVVDATQGVEAQTLANVYQAIDNNHEIITVLNKADLPSADPDRVKKQIEETIGISTEDALLVSAKTGEGIPLLLERIVQQLPSPTSPEGANAPLKALLIDSWYNSYLGVMVLVRIINGQLTKGQSIRLMGTNAKYQVERIGILTPKMIDIEALYPGEIGVMIASIKEVSHTRVGDTITDDSSPTTSALPGFKPIQPVVFCGLFPVDATQFENLRTAINKLRLNDASFSFELENSTALGFGFRCGFLGLLHLEIIQERLEREFSLNLIGTSPSVVYELYMHDGSMQKLSNPIDMPEVTKIAELREPWIQVTIITPNEYLGSILKLCQERRGIQIDMSHLDNRAMIVYELPLNEVIFDFYDRLKSVSKGYASFDYNVIDYRDSDLVKLTILVNNETIDALSILVHRSVSEKRGRGICEKLKNLIPQQMFQIAIQAAIGGRIIARETVKARRKDVTAKCYGGDITRKRKLLEKQKEGKKRMRRFGRVDIPQSAFISILKTDNE >NC_012985.3|WP_012778541.1|214733_215555_+|methyltransferase-domain-containing-protein MNILFDMQLINRNRLRSFRQKDFSVYFLLDRVAKEIAFRLNMINQTFENALELHGITGIVGYTCMETKKIHRMIRAEISTEFSTLKREVISCPLEEIPSISQSVDLILSPLNLHIINDTLEMFSKINHMLKPGGMFLAAIPGIGTLHELRKALLKAETELTGGASPRVIPFMDIKSAGTLMEKSGFISPIIDQDTYTVYYKSMLHLMHDLRGMGMSNPLIRRSKTPPYKSLFKRASTIYTEENSDLTGNVTASFSIIYVMGWKSTTFKTGTDE >NC_012985.3|WP_012778542.1|215812_217288_-|NTP/NDP-exchange-transporter MAHNQKILSVLLKIWQVFCAVKMSEAKKFIPMTLMMFLVLFNFSTLRPIKDSLVVPHMGAEIISFVKLWCVFPSAILFTILYMKLSNILETEKLFYVVVSFFVSFFAIFAFLLYPYRDFLHPSPESIRALASSWPYLKWFIYLAGKWSFALFYVFAELWGAVMINLMFWQFANRITKTEEATRFYATFGLVGNVGLIFAGGIVKTFSKLTNELMIYYSMLTLILSSILLMAVYRWMNLYVLTDPQQYSPKRGSVKKKLKLSVLESLRMALNSKYLGYLVLLVICYGTAINLVEGPWKEKVRQLYPTQNSYAQFMGQFIQWTGIVTIVFMILGSNILKSFRWFTSAIITPLMILITGGGFFVFVIFEDALLPFTEDVIKLVPLALAVFLGSLQNVLSKATKYTMFDSTKEMAFIPLDDEFRTKGKAVVDVIGGRMAKSGGAVIQSFIFMLFPMATFSSIVPYLAVFFLCLMFIWIYVVNQLSKEYTQLISKE >NC_012985.3|WP_012778543.1|217925_218111_-|hypothetical-protein MGNSVNSTILKAEGSIVNIKWRDANVWLLFGVVMVYFSISFSSRIVDYVDQKHDLYHDYRR >NC_012985.3|WP_012778544.1|218228_218654_-|(deoxy)nucleoside-triphosphate-pyrophosphohydrolase MIDVNLKKILLVVACAVFEPGGKVLLSCRPKDKSHGEFWEFPGGKIEDGETPEEALTRELFEELAIVVKPFSLVPLTFISHPYEKFHLLMPFFVCHCFEGIPQSCEGQQLQWVALDDLQNYSMLPADLSLISFLRKHALHM >NC_012985.3|WP_031935129.1|218786_220010_-|bifunctional-glutamate-N-acetyltransferase/amino-acid-acetyltransferase-ArgJ MLQSHVSPVLLPIKGVRLSAAALGIKYVGRDDVFLMVFDNPASVAGVFTRSSCPSAPVDFCKGNLSHGIARALIVNSGIANAFTGKRGRDTVRFIAKAVSELIPCKEEEVYVASTGIIGEFLDVALFDGVLSKMLCDATDDAWLDSAKAMMTTDRYAKVAVRTVDIDGIRVTINGLAKGAGMIAPDMATTLAFVVTDINISPAVLQNILSEGAEYSFNSITVDGDTSTSDTLLLFATGTVLGNFAPITDVSDKRLSLFRPALFDLLKDLALQVVCDGEGASKLLEVTVKGAADCASAKKVALSIANSPLVKTAFASESFGWWGRIVMAVGKSGVLVDRDRLSVWFGDVRIANNGEPEINFSQESVRSIVKKKCVPITVDLQIGNGIHTVWTCDFSKEYIHFNSNVQS >NC_012985.3|WP_012778546.1|220344_223017_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MLSHLAKLASKLLIPSNERRLRPYYAKVIAINELEKEISHLSDDSLANKTSEFKERINNGETLDDLLVPAFAVVREVARRTLGMRPFDVQLLGGMILHKGCVAEMKTGEGKTLAAVLPVYLNALSGKGVHVVTVNDYLARRDSNTMSAIYKFLGLSTGVVFHDLSDDKRRAAYACDITYITNNELGFDYLRDNMQYRRVDMVQRGHNFAIVDEVDSIFIDEARTPLIISGPVEDHSDLYRTIDSIIIQLHPSDYEIDEKQRTVHFSEKGTERIEELLHGENLLKSGGLYSFENVAIVHLINNALKSHTLFLRNRDYIVNRDEVVIIDEFTGRMMPGRRYSDGQHQALEAKERVKIQPENQTLSSITFQNYFLKYRKLSGMTGTASTEAEELANIYNLDVIEVPTNVPVIRIDEHDEIYRTSEEKYAAIIAEIIDSHKKGQPVLVGTPSIEKSEYLASQLRKHKFTKFQILNALYHEKEAYIISQAGIPGAVTIATNMAGRGTDIQLGGNVAMRIEHELANISDEEIRNKRIKMIQEEVQSLKEKAIVAGGLYVISTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSKFYLSLQDDLMRIFGSPRMESFLRKIGLKEGEAIIHPWINKAIERAQQKVEARNFETRKNLLKYDDVLNEQRKIIFEQRLEIIDTENILEIIADMRHDTLHNIVEKCIPNNSYPEKWDIKKLETEIYEIFGIHFPVLEWRNDNGIDHTEMSKRIFAKADKIAEDQENSFGTEKMQALGRHILLHTLDSFWREHMARLEHSRSIIGFRGYAQRDPLQEYKSEAFGFFNTLLTHLRKDVVSQIARIEPNNINNQELNNSLPYIAENDHGPVIQKENELDTPNVCKTSKIKRNHPCPCGSGKKYKHCHGSYL >NC_012985.3|WP_012778547.1|223174_224176_+|UDP-glucose-4-epimerase-GalE MENKNVLVVGGAGYIGAHTCRVLYERGFLPIVLDNLSSGHAEFVLWGPLEQVDICDYTNLRAVFAKYQPASVMHFAGLTNISESVKNPSLFYEINIKGSFNLIATAIESNVRRFIFSSTCATYGIPHNTIITENDPQESITPYGYTKYVVERELLQHNKVNGLRSVVLRYFNAAGATLDSIIGEWHNPETHVIPLAIKTAMGYQNSFKVFGQDYATRDGTCLRDYIHVLDLANAHIMALEYLINQGDSIAINLGTGTGITVKEIISTIQSMYECAFPITYESRRIGDPPSLVADNKKAKKILGWNPKYKLRDIIESAWNWHLKYPRSLSNEHE |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
35 : 11550
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012985|35:11550|DBSCAN-SWA GATGGGAGCATTAAAGAATCATTTTCATGACGAGATTAACGAGAACTTTTACTTTCATAGTCATCCGAACGCAGATCCAGATATAAGTATTGAGATGCAGATTAGCGAGAATCAGCGGTATTTGGATGAAGAGATATCGCAGTGCAATGCGGTAGTTGATGTTTTTAAAAGGTCTGATTCCACCATTTTAGACAAGCTAGATGCGATGGATGACCTAAAAACTTACATTTCTCTTCTGCAAGCTACGGCTAAAAATCTCAAGTCATTGCTTAAGGAATATTGGGAAGAGTCTTTGGACGGAGAGGACGACGAAGAGATTTATGAGCATCCTGATCAAGAGCATAGAGAAGATTATTATGCCAATCAGATTTAAGAGATCCCCAGTGATGGGTTCAGGGGGTGGATGTTTATATCTCCGTCCATCCCCAACAAATAAAAGTGTAAGAGCGGGAGCGAGTGAGGATGAGCGTACATTTTATTGAAGAGGCGGTTAAAGCCAAGGACATACCACAGTTGTTAACTTTTCTTTCTTTGATCACTCAAGGGTTGCAGGAGGCTTTAATCACCCAAGATGTTAAAGCCGTTGAAGCGGTGGATCCAGACCTCAAGAAGAGAGTCACGGTTTTAGCTATATCCTACATGAAGAGATGTGGTGATAAGGGGAAATCGCAGTTTTTATCCGAGATTTTGGTCCCTGCTTTAGGAACGCATAAAACTTTTGTCGATTGCACAGATGAGGATTTTAGATTGGTGGAAGCGAAGTTATTGGAGCAAAGCGATGCATGATTGCTTTTTCACCATTGGGGTTCTGATTTTTATTGTCGTTATGGTTTATTTATCACTTCCCGAGAGATCCTGACGATACCACCCCCGCTTAAACGAGAGTTGAATAAATTTAAGAGAGTGAAGATTAATGGCACACCATGCATTTTTATCGGCTTCAAGCAGTCATCGTTGGCTAAAATGTCCTATAGCCCCGACGCTTGAGAGCAAAATACCTCAAACAACAAGTATATACGCCTCTGAAGGCACTTTTGCCCATAATCTTTTAGCGCATTGCCTCGAACAAGGCGTTGATGCAGAGACAGTTTCTCATCAAAAGCTGACTTTTGAGAACGATACCCGCATTGTTGATACGGAAATGGCGTCTAGTGTCTCGATGGTTTTAGCGTATGTCCGCACTTTTTCTGGACCATTTTTATCGGAAACCGAAGTTCCCCTTGAGCCTTTTACAACGGAACCCGGGGCAACTGGCACTGCGGATATTCTTATTTTTAATAGCACTCAGTGGATCATTGTTGATTTTAAATATGGGGCTGGCGTTCCTGTTAAAGCCGAGAACAACACCCAATTGATGTTGTATGCCTGTGGTGCATTGCATCAGTACGGTGATATCTTTGGCAGACCTGAGGCTCTGACGCTTACTATTATTCAGCCCCGAGTAAGGACGGGATCGCCCATAAATGAATGGGTTATATCTGCCGATGACTTGTTAGAAAAAGCTAAAGAATTCAAAGAGAGAGGCACGTTAGCTTTAAGTCTTAAAAGCAAGCGAGCTGTTTCATTAGAACACTACGGTGTTAATGATGATTCTTGTCGATTTTGCCGAGCTAAAGTTCGTTGTCCTGCATTGAGTAGACATGTGTTGTTAGAAGCGACAAAAGACCCATCAACCAACACAACTGTTGAATTATCGAAAGCCTATTCCTCGATTTCGTTGATCAAGAGTTATGTGAAGGCGTGTGAAGATGAGATGTTTAAACGGTTGAATGCTGGGGATGAAATACAAGGGTATCAACTAGTCGAAGGACGCAAAGGAAATCGAAGTTTTAAGGATATTAACCGAGCGCAAGAGCTGTTGACATCAGTTTTAGGGGAAGAAGCGTTTAAGCGAATTCTCAAAACTCCTAAAGAATTGGAGCAATTGTATAAGGAGCAAAAGGTTTCTGATGAATTTTGGGAAGAGTTGCAAGAGTTGATCACGAGAGGCGACGGCAAGCCTGTCATCGCCCCCCGAGATATACCAACAAACAAACAAACCCAAAAATCGCAATTAAGCGAGTTCGAGGTACTAGGCTAGAAAGGATCAAAGTTATGATAAATATAACACCTTTTGAAGAATTCAATATAACGAGCGATATACCAGAAATAACGAAAGAAGTCAATAGACTACGTAATGTTTAACGATATCGAAGTTTCACGGCTCAAATTTGAGCCGTCAGATTTGGAAAGTATAGAAAGGATCAAACGATGAGCACTATAACCCCTTTTGAATTTGAAAGCAACAAGATCCGTACTATTGTGGATAAAGACCAGAATATATGGTTTGTGGCTAAAGATGTCGCTACGGCTTTAGGGTATGAAAATTCAAATGAAGCAATAAACGCTCATTGCAAGGGGGTAGCAAAACGCTACCCCCTTAAGACTGAAGGCGGAATACAAAAAGTCCGTATCATATCAGAACCTGATGTTTACAGGTTACTGGTTAAAAGCACGTTACCATCAGCACAGAAGTTTGAGCGTTGGGTATTTGAGGAGGTGTTACCTACTCTTCGCAAAACAGGCAGTTATTCGGTTGAAGCACCGAAGCTTAGAGCCACTTCAGCGAGTACAGTTTTAAGAGTTCACAAACATCTTGAAGAACTAGCCAAGCAAGCAGGATTAAAAGACAATCAACTTTTGTTGAAGGTTAACCGAGGCGTTACGAAGATAACAGGTGTTGATCAGTTAGAGGCTATGGATATCAAACACCTACCCTCTTCCGATAACGACGAATATTTAACAATTACCCAAATAGGGGAAAGGCTTAACCCACCTCAGAGAGCGAGATTTTTAAACAAACTTCTTCTTAAGCGAGGACTGCAAGTTAGCAAGGTCTCAGGTGGCTATAGACCGACACCTAAAGGTGAAGAGCGTGGAGGCAAGATGTGTGATGTGCCCATGCAGCATGTTGAAGGCTCAACCCAGCAATTAAAATGGAATTCGAATTTACTCGTTTCGTTTCTTCAAAACGAATTAATTAACACACCACGCCTATAATAGAAAGGAATTTAATAATGCAAAAACTAACTGTAAAAGGACGTCTATCATACCCTGCTCTTGATACGAAGGTGCGTATGAAGCTCCCTGATGGCTCAAGTGTTGAGCACTACGGCTGTGATATCGTCTTTCCGAAAGCGGATACGAAGCAGATTAACGCTGTTGAGGCGTGTTTAAAGACCGCTGTTACCGAGATATTTCCGAATGTCTCTCCGGATGCGTTTTTGTCGGCGGTTCGAAGCAAATCGGAATCCCGTGGGGTTTTGAGGGACGGCGATGCGAAGATCGCTTCTTCTCACAAGCCTGAGAATTACACACAAACATACACAGACAGCGTGTATATCTCGGCGAAGAACAAATATGTTCAACCGTTACTCGTGGATCGTCAAGCGCAACCTGTGAGCGATCCGAGGGAGGTTTTTTATCCGGGGTGTTGGGTCATTGCGAAGCTTAACATCGGGGCGTATGAGCTTGATCCGTACAAAACCAAGGGTTTCAGTTGCACGCTAACGGGCGTTCAGTTCTTCAAGCATGATGAGCGTTGGGGTGCTTCCCCGAAATCGGACACTTCGGAGTTTAAGGATTACGGCGAAGAGCAAGACTCCGATACCTCGGTCTCAAACTTTGCCTCAGCGGAGGTGGACTCCGACGCTCTGCCGTGGAACTGATCAATGTCAAAGCTGTTTATCGACATTGAAACCCGCAGTCCTCAACCCTTGCCTAAGGTAGGGGTTTGGGCTTATGCGGAGCAGGCGGTTATCACTTTATGTGCGTATGCATGGGACGATGAACCTGTGAAGTTGTGGGATAGGACTGAACAATCTGCTATGCCATCGGATCTTCTGCAGTACTTAAGAGATGAAACGGTGATGTGTGTTGCACACAATAGTCTGTTTGAACGGATACTGTTTAAGAAGACATTAGGTATTGATATTCCATCTAAACGTTGGATTTGTACGAGTGTTTTAGCCCGCACGAATGGTTTACCCTCTTCGTTGAAAAACGCTTGTTTAGCACTAAATTTTTCTGAACATTTAACCAAAATGGAAGAAGGAAAAGCTCTTATCGCTCGTTTTTGCAAGGGATCGATTGATTCCCCTCCGTATGACTGTACTCGTGCTAATCACGTTCAAGCATGGCAGTTATTTGGGGAGTACTGCAAACGAGACGTTGAAGCCACTAGAGAGTTATTTAAGCGACTTATTCCTTTATCTGATGGGGAAAGGGATTTATGGCTTTTAGATCAAACGATTAATGATCGGGGCTACAGGATAGACTTAGATTTAGTTTTGAAGCTTCAAGAGCTCATAGCCCAAGAGCGTAAGAAGTTAGATGAAGATATCGTTAAATTGACAGATGGTATTATACGCTCTTCTCGTCAAACGTATGCTTTAAGGATGTACCTATTTCTTATAACGGGAATAGATTTGGTTGATATGTCGGAGGGTACTTTAAAGTCTATTCTGTCTCATTCTAACATCACTCAATTGGCTAAAGACCTGATTTTGAACCGCTTAGCATCATCGGGATCAGCAATTTTAAAACTCAACACTTTATCTGAGGCTGTTAGTTCTGATGGGCGTCTTCGAGGGACTTTACAGTTTTATGGTGCGAGCAGAACGGGTCGATGGTCTGGATGTGTGTTTCAACCTCAGAATCTTCCTCGTCAAGAGCGATCGGAGGAAATATTGACACAGACTATTCAAGCTTTAAATCGAGGGGAAACTATTGCAGATCCGTTAGGTTTGGCTAGTGATTGTGTCCGTTCTTGCATCATAGCCTCAAATGGCAAAAAGCTTGTTGTTGCGGATTTAGCAGGGATTGAAGCCCGGGTTTTGGCATGGATTGCTGGTGAAGACTGGAAAATCAAAGCTTTTGCAAATGGTGAAGACATCTATGTTACAACTTATGCTAAAGCGTTTAACACCCCCATTGACAAAGTGAGTAAAGAACAAAGAGCTATTGGGAAAGTTATGGAATTAGCCTTAGGGTATCAAGGTGGGGCTAAGGTGTTTAAGACAATGGCATCTCATTGTGGATTAGATCTACAACAGTTTAGTCAGAATGTCAAAAGCACCTCAACTTTTGAAGATTGGGAACAAGCGGAATCTCATCATCTTTGGATGCAAGATCAATATCCCGAATTTGCGGTGAAGGATAAATTGATAGGCACGGCTTGTGAACTTGTTAAAAAGGCTTGGCGGGCTAAACATCAAGGTGTTCTTCAACTATGGAAGGACTTAACCGAGGGTTTTGCATGTGTAGTGCAAGAAGGAGGTTCAATATCTGCTCGAAGGGTTGCGAATGTTCCCCGTCTTGTGATGAGGAGGCACAAACGAGACGTTCACATTGTTTTACCTTCATCAAGAAGGCTTGTTTACAGTGATGTAAAGGGCGATTGTTCTTATCTCAATACTGCCACTTCACAGCTCATGAGAGAGAGAACGTATGGTGGCAAGCTAACAGAGAATATTGTTCAAGCCATCAGTAGGGATATCCTTTGCGAGGGCATGAAAAACGCTACTAAAAATGGCTATGACATAGTTTTAACGGTTCATGATGAGATTGTTAGTGAAACTCCTGATACTCCTTACTTTAGCGTTGGGACCTTATGTTCTTTGATGACAAAAAATCCCAGTTGGGCAAAAGGTTTGCCCCTCAAAGCAGAAGGTTATGAAGCGAAAAGGTATCGCAAATGAGTTTTTATTCTTTCCATTATCAGACAGAAAAAGACGTGGAAAAGCGTTTAGTGACAGGGGCAAAGAAACTTGATTGTTGGGTTCGTAAAGCATCGTTTGTAGGACGTAGAGGTTGTCCAGATAGATTAATCATCACCCCTAATGGGGGTTTATGGTGGATTGAAGTCAAAAAGCCAACAGGAAGATTATCACACCAGCAGATGAGTGAAATAGAAGAACTACGACGGCGAGGACAGCGGGTTAAAGTTCTGGTCTCTATGGAGGAAGTAGATAACTTTTTGGAAGAATTAGCATGCACCTTGTATTGAAACCCCATCAAATTGTAATGGTTAATTGGCTCTTAAGTCATGACAGATGTGCTTTGTGGGCTTCGATGGGTTCGGGAAAGACGGTAAGTGTCTTATTCGCCTTATCCACTATTAAAATACTTGATCCTCGTCCTGTCCTTATTATTGCACCCTTACGAGTTGCCCAATATGTTTGGAAGGATGAGGTGGAACGCTGGTCAGCATTTAGTGATATGACTGTTTCATCTCTTATTGGATCGGAACGACAAAGAATAAAGGCTCTCAATACTCCTGCTCACCTTTACATTATTAATTTTGAGAATATCCCTTGGTTAGTCAAAATGAAGCTTGATCATTGGGATTTTGCAACGATTGTTGTTGATGAAAGCACAAAGTTGAAATCTTTTAGAACCCATCAAGGAACAAAGCAAACGAGAGCTTTAGGGAAAGTAGCTTTTAGCAAGGTTAAACGTTTTATTGAACTCACAGGGACCCCTTCGCCTAATGGCTTAATCGACTTATGGGGTCAAATCTGGTTTTTGGATAAAGGGAAACGTTTAGGTTTAAGCTTCAAAAGTTTTGTTGAGAGATGGTTTCATACGCAACAAGTGGGATCTTCTATTGGAGCGGTCAAACACATCCCGAAAATCAATGCTCAAAAAGAATAGAAGAGAAACTATCCGATTGTTGTTTATCATTAGATATCGCTGATTATCAAAATATTGATAAACCTATTCTCATCACTAAAAAAGTCCCATTACCCCAACCGGTGATGAAGCAATATCACAAGTTTCAACGAGAGTTGTATTGCGATCTTCAAGGAGAGAATATTGAAGCGTTTAATTCCGCTTCTAAAACTGTCAAGTGTCTCCAATTAGCCAATGGTGCGGTGTACTACGACGAAGAAAAACATTGGAAAGAAGTCCATGATGAAAAGATCAAAGCGTTAGAAGTCATCATTGAAAAAGCCAATGCCGCCCCTATTATCGTTGCTTATCATTTTAATAGTGATCTTGCTCGATTGCAAAAAGCATTTCCCCAAGGCCGAACGTTGGATAAAGACCCTTGCACTATTCAAGAGTGGAATGAGGGGAAAATTCCTTTGTTGTTCGCACATCCAGCGTCTTGTGGCCATGGCTTAAATCTCCAATATGGCGGGAACATTTTAGTCTTTTTCTCCTTGTGGTGGGATTTAGAAGAACACCAACAGATGATTGAACGCATTGGGGTCACGCGTCAACGACAAGCGGGATTCAAAAGAGCGGTTTTTGTCTATTATTTAATTGCCCAGAACACCATAGATGAGTTGGTTTTGCAACGATTGCGAACTAAATCCACTATCCAAGACTTGTTGTTAAACGCTTTAAAAAAGGAGACTATCCATGTATAATTTTGACAGAGTTTTTAGATCTAGTAAATTTGAAAACGAGCATAATATTACTCCTGCCCAATGGAAAAAGCTTTTAACGCTTGAAGCAAAGTTTCTTCCAAATAAGCGCGCCCTAGAATCATGGCTCGACAAAGCAAAAAAGGTCACATCGCTGTCGAAGGGAGAAGCGATGATTGAAGTTGAGTATCTGGTTAAAATCGCTCTCCATCATCAGAAGTGGTATTATCGGTTGGACGACCCTCTATTTACTGATGGGTTATATGATCGCGTATCAGAGCGACTCGACGCATTACAAGAGCAATTCCCTGAGCTTTTTGATGAGGATCATCCATGGAACACCGTGGGGTATTAACATGGCTCATATCTTTGTTTTGATTGGGGCATCAGGAGTTGGGAAAACCACCATCGCTAAACAGGTGGTTCTGAACTCTGAATATCTGGTGATGCCTGTCGGGGTCACGACCCGACGACCCCGCGTCGATGAAAAGCAATACATCGATTATCGCTTTATCTCTCAATCCCAGTTTAAAGGATGGAAACATACCGGACTTTTTATAGAAACAACGAAGGTACGAGATGAATACTACGGATATCTCAAAGAAGATATTAATAATCCGATGGAACATGGATATGACATTCTCCTCATTCTCACTCATCAAGGACTAGCACCTCTCAAGAAACTCTATGAGGATCAAGTAACTTCAATCTTCATTGCCCCTCCTTCGGAAGCGGAATTAATTCAACGGCGTATAAAGAGACGGGAAGATATCCCTTTCAACCTAGATCCTGATCTTTTTGGAAAGAACCATTCTTATTCCTTCACAATAGTCAATAATCATCTACCAACCGCTTGTCGGCAAGTTGGTCTCATAAGAGAATTCGTGAAGCGGGGAAAAAAGGCTAACTATGACTGAGAAAGCAAACAAGCGTTATTCGCTTATAAGACGCGTTGATATCCGAGATATCGCGGTGATAGCTTCTGAAACAAACACTCGGATTGAGATTGAGCTTGAGGGGGCTATTTATAGGTTTGAGCCTATGATCCGAGGGGACAATCCATGTCTCATAGTTGACAATGACAACCCTTTAGATTTATGACCCCGAGCTTGCGACTTCCTCCTTTTGTCACAAAAGAACGTACCCGTCATGGCAAAATAATCTATTATTTTAGGAAGGGGCATGGACGTCGTATCCGTCTCCCCTATCCTCATGAATCTACTTTCATTCCTGCGTATATGTCCGCTTTGACGGGGAGTACCCCAAAGCGAGAATATATTAATTCTCCTCGGAAGAAACCGACTACTCTTAAGTGGCTGATTTCCGAATATAGGAAAAGTGCTCATTGGGGGAGTTTAGCAGTTAATTCCAGAATATCTTTTGAAAGTTATTTTGATCAGATCATACGAAAATCAGGAGATTTTGATTATCGCAAAATCACAACTAAACATATTCGTTCGGGGGTTGAATCGAGAAAGCATACTCCTTCTTCAGCTATACAGTTTTTAACGTCGATGCGTGTTTTGTTTAAATGGGCGGTTCGACAAGAATATGTAGCAATCAACCCATGCCTGAGTGTTGAAAGACCTAAACGAAAAACAGAGGGGATTAGACCTTGGACAAAGGAAGACATGCAACAGTTCAAAAGTTTTTGGAGCGAAGGCTCACAGCCACGGTTAGCATTTGAGTTTTTGTTGTATTCGGGTTTAAGATGTTCCGATTCTTGTAGAGCTGGAGTTCAACATCTCCAAAACAATATCTTTTCCATTAAAACGCAGAAAACAGGGACAATCATCACAGTGGAATTGCCGGATGGTTTTATGAAACTTCTTGCGATGACTCCTATAGGGAAAGAAACTTTTTTCATTAATAACGATAAACAAAAGATGAATGCTACTCAATTTAGTATTTGGTTTAAAGCAAAAGCTACAAAAGCCGGAGTTAATAAATCCGCTCATGGGGTACGGAAGTTTTCTGCGACCATATCAGCTGATGCGGGGGCAACAGCTCATGAGCTGATGGCTACTTATGGGTGGAAGACTGTTGACCAAGCGGAAACATATACGAAAGGAGCGGATAGAATCCGTTTAGGGATCAAGAACTCACGTCGAATTTCATCGGTTGTGGATTCGGATGATCCCTAACCTCAAATTGCAGGTGCGGGAGAATTTAAAAAAATAGTGTAAAATCAATATGTTAATTATAGATTTGAGGGCTAAGAAACTATTTCCTTAATATTTGCAACGTGATTTTATTTTATTATCAATGAGATCACCCGAAAAAAAATAATAGGTAAAAATTATTTTATTTTCTTAAATTCCTCGCGAAAACTTACCGCCTCTAGCTATCGACCACAGTAATTGTAAACTGACTAAACCAATTAGTTATAACATTACGTGCAAGACTTTTGGCTATAGGCATGACATTCTCGTCAGAATTAATTTCATAATATTTAGATGGATCACTTGCACATTGTCTTAAAGTATATCGCGTATCTTGATCCGGAGAAAATCCTACAGAAAATATGGTAATTGCACCTCTTCCAGTTCTATGATGCTTATGCATGTAATAGCAGTCTTGCAAAATTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012985|35:11550|5768_6080_+|WP_012778348.1|DBSCAN-SWA MSFYSFHYQTEKDVEKRLVTGAKKLDCWVRKASFVGRRGCPDRLIITPNGGLWWIEVKKPTGRLSHQQMSEIEELRRRGQRVKVLVSMEEVDNFLEELACTLY >NC_012985|35:11550|2284_3073_+|WP_012778345.1|DBSCAN-SWA MSTITPFEFESNKIRTIVDKDQNIWFVAKDVATALGYENSNEAINAHCKGVAKRYPLKTEGGIQKVRIISEPDVYRLLVKSTLPSAQKFERWVFEEVLPTLRKTGSYSVEAPKLRATSASTVLRVHKHLEELAKQAGLKDNQLLLKVNRGVTKITGVDQLEAMDIKHLPSSDNDEYLTITQIGERLNPPQRARFLNKLLLKRGLQVSKVSGGYRPTPKGEERGGKMCDVPMQHVEGSTQQLKWNSNLLVSFLQNELINTPRL >NC_012985|35:11550|35_407_+|WP_012778342.1|DBSCAN-SWA MGALKNHFHDEINENFYFHSHPNADPDISIEMQISENQRYLDEEISQCNAVVDVFKRSDSTILDKLDAMDDLKTYISLLQATAKNLKSLLKEYWEESLDGEDDEEIYEHPDQEHREDYYANQI >NC_012985|35:11550|496_820_+|WP_012778343.1|DBSCAN-SWA MSVHFIEEAVKAKDIPQLLTFLSLITQGLQEALITQDVKAVEAVDPDLKKRVTVLAISYMKRCGDKGKSQFLSEILVPALGTHKTFVDCTDEDFRLVEAKLLEQSDA >NC_012985|35:11550|8543_9590_+|WP_012778354.1|integrase|DBSCAN-SWA MTPSLRLPPFVTKERTRHGKIIYYFRKGHGRRIRLPYPHESTFIPAYMSALTGSTPKREYINSPRKKPTTLKWLISEYRKSAHWGSLAVNSRISFESYFDQIIRKSGDFDYRKITTKHIRSGVESRKHTPSSAIQFLTSMRVLFKWAVRQEYVAINPCLSVERPKRKTEGIRPWTKEDMQQFKSFWSEGSQPRLAFEFLLYSGLRCSDSCRAGVQHLQNNIFSIKTQKTGTIITVELPDGFMKLLAMTPIGKETFFINNDKQKMNATQFSIWFKAKATKAGVNKSAHGVRKFSATISADAGATAHELMATYGWKTVDQAETYTKGADRIRLGIKNSRRISSVVDSDDP >NC_012985|35:11550|7441_7801_+|WP_012778351.1|DBSCAN-SWA MYNFDRVFRSSKFENEHNITPAQWKKLLTLEAKFLPNKRALESWLDKAKKVTSLSKGEAMIEVEYLVKIALHHQKWYYRLDDPLFTDGLYDRVSERLDALQEQFPELFDEDHPWNTVGY >NC_012985|35:11550|7802_8363_+|WP_012778352.1|DBSCAN-SWA MAHIFVLIGASGVGKTTIAKQVVLNSEYLVMPVGVTTRRPRVDEKQYIDYRFISQSQFKGWKHTGLFIETTKVRDEYYGYLKEDINNPMEHGYDILLILTHQGLAPLKKLYEDQVTSIFIAPPSEAELIQRRIKRREDIPFNLDPDLFGKNHSYSFTIVNNHLPTACRQVGLIREFVKRGKKANYD >NC_012985|35:11550|8355_8547_+|WP_012778353.1|DBSCAN-SWA MTEKANKRYSLIRRVDIRDIAVIASETNTRIEIELEGAIYRFEPMIRGDNPCLIVDNDNPLDL >NC_012985|35:11550|947_2114_+|WP_012778344.1|DBSCAN-SWA MAHHAFLSASSSHRWLKCPIAPTLESKIPQTTSIYASEGTFAHNLLAHCLEQGVDAETVSHQKLTFENDTRIVDTEMASSVSMVLAYVRTFSGPFLSETEVPLEPFTTEPGATGTADILIFNSTQWIIVDFKYGAGVPVKAENNTQLMLYACGALHQYGDIFGRPEALTLTIIQPRVRTGSPINEWVISADDLLEKAKEFKERGTLALSLKSKRAVSLEHYGVNDDSCRFCRAKVRCPALSRHVLLEATKDPSTNTTVELSKAYSSISLIKSYVKACEDEMFKRLNAGDEIQGYQLVEGRKGNRSFKDINRAQELLTSVLGEEAFKRILKTPKELEQLYKEQKVSDEFWEELQELITRGDGKPVIAPRDIPTNKQTQKSQLSEFEVLG >NC_012985|35:11550|11172_11550_+|WP_012778356.1|DBSCAN-SWA MRDESLHLNFGIDVINQIKIENPHLWTKEFQQKSRTMLHEATLLEIAYAHETMPKGFVGLNAPSCEQYMQFIANRRCHQIGLEPLFKYTENPFPWMSEVIDLKKEKNFFETRVTEYQQGAELKWD >NC_012985|35:11550|9786_11013_-|WP_012778355.1|DBSCAN-SWA MFQNKNFLLGVLRLKKCTRGVFLVITAILLSSFVAIVDVVVDQVTVMQKTALLQEVLDHVIYRTSPKNLYDLREAGRDNFIRHQIEKALNTYNSRDLSNIGSIESIVKDAVILTKNVNSLPLQFTVDIALSTTVQLRGSLLQMFSQSKGKVDISRRKKVMYKQNIGLMIMPFAWDGYWLASRGKVADSQVHRPKYLEYSHYYQQYLNRNTLVKNFLSQIPYKNFCMAPYHYKSIFYWAFENFQYHQDNNMLIFYSHRDFYRITWDHFPYSFIKNVFDMTSNQFGDGQVLTNTNHCFPHGASHSKYMLMFAIGNQLSRSSVGKETIDRILQDCYYMHKHHRTGRGAITIFSVGFSPDQDTRYTLRQCASDPSKYYEINSDENVMPIAKSLARNVITNWFSQFTITVVDS >NC_012985|35:11550|3090_3741_+|WP_012778346.1|DBSCAN-SWA MQKLTVKGRLSYPALDTKVRMKLPDGSSVEHYGCDIVFPKADTKQINAVEACLKTAVTEIFPNVSPDAFLSAVRSKSESRGVLRDGDAKIASSHKPENYTQTYTDSVYISAKNKYVQPLLVDRQAQPVSDPREVFYPGCWVIAKLNIGAYELDPYKTKGFSCTLTGVQFFKHDERWGASPKSDTSEFKDYGEEQDSDTSVSNFASAEVDSDALPWN >NC_012985|35:11550|3744_5772_+|WP_012778347.1|DBSCAN-SWA MSKLFIDIETRSPQPLPKVGVWAYAEQAVITLCAYAWDDEPVKLWDRTEQSAMPSDLLQYLRDETVMCVAHNSLFERILFKKTLGIDIPSKRWICTSVLARTNGLPSSLKNACLALNFSEHLTKMEEGKALIARFCKGSIDSPPYDCTRANHVQAWQLFGEYCKRDVEATRELFKRLIPLSDGERDLWLLDQTINDRGYRIDLDLVLKLQELIAQERKKLDEDIVKLTDGIIRSSRQTYALRMYLFLITGIDLVDMSEGTLKSILSHSNITQLAKDLILNRLASSGSAILKLNTLSEAVSSDGRLRGTLQFYGASRTGRWSGCVFQPQNLPRQERSEEILTQTIQALNRGETIADPLGLASDCVRSCIIASNGKKLVVADLAGIEARVLAWIAGEDWKIKAFANGEDIYVTTYAKAFNTPIDKVSKEQRAIGKVMELALGYQGGAKVFKTMASHCGLDLQQFSQNVKSTSTFEDWEQAESHHLWMQDQYPEFAVKDKLIGTACELVKKAWRAKHQGVLQLWKDLTEGFACVVQEGGSISARRVANVPRLVMRRHKRDVHIVLPSSRRLVYSDVKGDCSYLNTATSQLMRERTYGGKLTENIVQAISRDILCEGMKNATKNGYDIVLTVHDEIVSETPDTPYFSVGTLCSLMTKNPSWAKGLPLKAEGYEAKRYRK |
13 | Liberibacter_phage(81.82%) | integrase | attL 7333:7346|attR 16594:16607 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1189296 : 1202363
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_012985|1189296:1202363|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_012985|1189296:1202363|1193148_1193445_+|WP_015824994.1|DBSCAN-SWA MRTDYLSEAKLEKRLVKGSKKLDCLVFKTQFINQRGCPDRLIITPNGAHFWVEMKTSRGRLSNAQKRVIATLLLYHQKVQVLSSTEEVDGFLRMLECY >NC_012985|1189296:1202363|1191124_1193152_+|WP_015824993.1|DBSCAN-SWA MATLFIDFETRSPIDLTKCGICKYAEDVCVILFAFGFDDHPVELWDCVHDPVMPQVLKEALENTDVTIVAHNSYFERTVLKACFNLDIPIHRWICTLVLARSNGLPSALKAVGEALKLSSQKMEEGKELIARFCKGETHECLYDRNKPNHREAWRLFGEYCKGDVTVTREIFKRLEPLSSKEQELWYLDQTINDRGYCVDVALAHTLNQIVDVERTKLDQELESLTYGLVSSSRCLEKLKTWLFLETGLHLEDLTETTCQRVLSSNKKLTPQAIQVFNNRMRASRSAVLKLNTLVEAMNSDGRLRGTLQFLGASRTGRWSGCVFPPQNLPRPSRSHEELDQIITHLPTSITSDPDPLQIISDCVRSCVIASEGKKLVVADLAGIEARVLAWMAGEQWKLKAFETGEDLYVTTYARSFNVAPAQVTKDQRAIGKVMELALGYQGGAKAFQKMASTTGLNLNTFAHLVKTNSAPEEWEDAENFCRWMQENHPEHAIEDLFIGTACERVKKAWRQKHSRVSELWNELHQAFEQTIENGKAIIARKRRDVPLVYMKKDKNNLILMLPSGRSLVYRDVGNNRSYLNTTTRQLTREYTYGGKLTENIVQAVSRDILAEGMMNATKAGYDIVLTVHDEIVCETPDTDEFNASMLYHLMTSNPSWAKGLPLKAEGYESKRYRK >NC_012985|1189296:1202363|1197002_1197362_-|WP_041862259.1|DBSCAN-SWA MDVYIQGQCFIRGTDTSIFDEIKRQLKPYILGLLQGRTMVRSANLREKASIGDIITGDKIDYWAYPSENGSGYISASATQAHTMAVSAEDARKRWRIMGITRSYYYTGYWLQEVINFDD >NC_012985|1189296:1202363|1190023_1190521_+|WP_015453019.1|DBSCAN-SWA MDENACRFCRAKPRCGALAVKALSTFSEHMQILSNRQLSQVMNVLPLIETWMKGVKEEALNVLSSGEDLPNYELKEGRKGSRTYNNDNQVEQLLMRELGDEAYNRTLLSPTETEQLVKRKKVSETTWEQLQKFITRKDGKQVIVPCDLPVNHLKANISEFSVLKD >NC_012985|1189296:1202363|1195910_1196264_+|WP_015824998.1|DBSCAN-SWA MNSMERRSVMDTNHKGSNLPPEEIKNIQDHRITLLEKNYERLSDKVEASHTKLMEAILDNREDIANVRIEVANVRIEVANVRTEMLGLIWKIPATAIGISICLRFLANVMDKGIHLF >NC_012985|1189296:1202363|1196737_1197010_-|WP_015453034.1|DBSCAN-SWA MTKRQEDHYITREEFIEFCTNSNSKQDCLISQFKLFEKHYREQQKGVNEILDILKSVKWLFSALKNIAIAVTSLTAIIYGLLNIKGWFKQ >NC_012985|1189296:1202363|1189296_1189998_-|WP_015453018.1|DBSCAN-SWA MVATDVDHYVYNGFGILCGIGTHPVYAFDVDVLDEQVVDRFNNEFQSCCGKPISRVGQAPKTLMLFRMQETNLKKQKSEEKIQGHLEFLAYGQQFVAYNIHPKTQRAYTWSIAPHALKVEELPLLTPDEVEYFFEFFDTITTPRDKEKSYRKLSKIWKSHNNRRYTNIEIRAFLSCFGEEFYNGSHDEWIPVVMAIHYETRGSAEGKEIVREWCKLGRTYDEKSFNAKWDSFD >NC_012985|1189296:1202363|1194810_1195170_+|WP_015824996.1|DBSCAN-SWA MYNFDRVFRSSKFENEHNITPAQWKKLLTLEAKFLPNKRALESWLDKAKKVTSLSKGEAMIEVEYLVKIALHHQKWYYRLDNPLFTDGLYDRVSERLDALQEQFPELFDEDHPWNTVGY >NC_012985|1189296:1202363|1195171_1195729_+|WP_015824997.1|DBSCAN-SWA MAHIFVLIGASGVGETTIAKQVVLNSEYLVMPVGVTTRRPRVDEKQYIDYRFISQSQFKGWKHTGLFIETTKVRDEYYGYLKEDINNPMEHGYDILLILTHQGLAPLKKLYEDQVTSIFIAPPSEAELIQRRIKRREDTPFNLDPDLFGKNHSYSFTIVNNHLPTACRQVGFIREFVKQHRIIKI >NC_012985|1189296:1202363|1199768_1202363_-|WP_015825000.1|DBSCAN-SWA MKPECIQVLNKAAGRELSKKELRRLEDGIVRAYVSLDGKGLSKAERYRLAGLKAEEDFQKELIRSVNDAIDEAYKRHQLRSDLDRVQAGVYGKSQALFNKLFFKAGSAEVPLEMKIKAAETKVLSKFNEYAEVGSKNLGFTLDKQFGLDVFDEMKGKKTQNEQASRLVKQYFETQRELHSQAHEAGLDYKFFENRIPQPMSVDKLRATKKDDFVRSMLDWLDLSRYKDIDGTPLSRSEIASFVGEVFAERVRSTSFKDPSIPSSEVGVKREFERVFHFKDSQAHMDYMEHFGVSTNVNTILTSELASLSKDIVIARELGPNADSFVKQMIVQTIANDQEASAGNKVLKDWLGRNKLEVRQEAMLQMWEVMRYGETVENTGWANWMAGLRSAAGASMLGQHPIGALLEDGFISRQMLSRVGIDKEAIQRINKMPLKERMELLSDVGLYAEGVVAHGRNMMEGSDAFQIGHKLHSKMHKWSGAEYLDKKRISSHALIVYNQIGRMTDTYASLKDLKADPRLDPSIKAFFKQLDDTDFTVIKRAKAMSSPDGYLYARTPSTIKNLKDADLRDLARMSDKIAYHRKKLKNSKTLSPEQRQELQQQLADLERKEINILKDKVSNKMHALVLDNVQTSVRGAMHTSLFDRQRLGLLTYKRGTRAGEALRMFQQFTTTPTGMFLNILDLSNSAKMPKGASMALNHVWIQYSATMALAGIGVASIKALLRGEDPSLPEVIYDGTLANGALLPYMDRLTKLVSKGDRAAIGGLLGPVPSMVTNLTSSAVELATKDNENSKVNATKAIRKTLPFMNMWYLKNSFDHLILNQILEELNPGYLDRQQSKKKKKGIELFQNMDEGLPHRLPFPFGED >NC_012985|1189296:1202363|1193435_1194818_+|WP_040055333.1|DBSCAN-SWA MLLNLAPHQTKIVDWILDHKRCAIWASMGSGKTVSVLTALSYIHLWGEKSVLVIAPLRVAQSVWTSEVQRWSNFSHMNISVITGTVKQRTKVLKTPAVLYVINFENLGWLVQELKGTWPFATIVVDESTKLKSFRLRQGSKTARALAKPAWESERFIELTGTPSPNGLIDLWGQIWFLDKGKRLGRVFQSFVARWFNTTQIGSHIGAVRYTAKETAQKEIEAQLSDCCLSLDIADYQNIDKPILITKKVPLPQPVMKQYHKFQRELYCDLQGENIEAFNSASKTVKCLQLANGAVYYDEEKHWKEVHDEKIKALEVIIEKANAAPIIVAYHFNSDLARLQKAFPQGRTLDKDPCTIQEWNEGKIPLLFAHPASCGHGLNLQYGGNILVFFSLWWDLEEHQQMIERIGVTRQRQAGFKRAVFVYYLIAQNTIDELVLQRLRTKSTIQDLLLNALKKETIHV >NC_012985|1189296:1202363|1190525_1191122_+|WP_015453020.1|DBSCAN-SWA MAKVLIKGRLSYPQLHEPRAYGDKGDEVYSADILFSKTDNEQCDKLEQAIREAGEEKFGGSNMSALIERMKRTGRYPLKDGDQKISTSLKPEAYEVYAGQYYITPKNKKVRPRLVDRHVQEVTENIQEVFYSGCHVNAIISVYAYTFQGTKGVTFTLTGVQFVKDDTRWGGQLRASSSDFESYEEETASIDELEEMPF >NC_012985|1189296:1202363|1196267_1196741_-|WP_015453070.1|DBSCAN-SWA MIQSFLAGGLFRFLLRFIPSGFERIVDVVSEYLTKKQSIEYDKLKLEMAKNDSSTQLDLAEIKAGIEELKIDKPIRLARIEAQKVKSGVKWVDGFTALIRPLTTFFWIIVYPLLVWWSVKEGMFNSDPLTLLSPFTQEIIACILGFWYTDKIVQKKK |
13 | Liberibacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1210475 : 1227157
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_012985|1210475:1227157|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_012985|1210475:1227157|1221333_1221936_+|WP_015453089.1|DBSCAN-SWA MEIDLQKQFKNYLHEDVKFYLDKWCEALYSPESYSNTYREQKLRDKIIELRRKFAKENGLKTVTEVCPKPKDITYSLSHFIEGLIESERSKITEKFKPLAVAKVVSDELLHDKLNKILKKSVRNYSRDSGHLNRDVIFHSRYALIRYLEDFYKEIKHTFGNPADALSPHISELADEIHTTCFTLQFVVNPSEAELLEKVA >NC_012985|1210475:1227157|1226690_1226897_-|WP_015825014.1|DBSCAN-SWA MNTVKLGVKHFDTRKRGRTTEIRADGWMKEDNTARLSVVVSVAGETTDEEKLREYKEFVISAFAKAIS >NC_012985|1210475:1227157|1216884_1218420_-|WP_015825010.1|terminase|DBSCAN-SWA 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MPVMQWKEQAKQAIHNGFKLIPLRLGDKRPQRLGKWEEQLLSSEKIDKLPACGFGFVCGVGEQPLYAFDIDSKDEKTANTFKDTFEILHGTPIVRIGQKPKILIPFRMNKEGIKKKKTTESTQGHLDILGCGQYFVAYNIHPKTKKEYTWTTPPHRFKVEDTPLLSEEDVEYLFKFFQEITVPLVKDKKSIIPSKTWTNNNNRQYTNREITAFLSCFGEEFYNGSHDEWIPVVMAVHHETRGSSKGKEIARRWSKQGSTYDEENFNYKWDTFDFEEIGDTAKKRSTFTSLFYHHGKLIPKGLLASRFSDAYNKAMFSIYKKGHFLYTADTKAWYKKDKNNVYIWSLTLDKITASIMNFLVSMKEDVFDLSEEPEDNNKNSKSPRFWFNTDYRRQNVEENSKAKSTAQSLEAGSIFSITSDLLDSSSRFLGEQDGILDLETGQKVKPTKELYITKSTGTPFVEGEPSQEFLDLVSGYFESEEVMDYFTRCVGMALLGGNKAQRFIHIRGVGGSGKSTLMNLIKYAFGNQYVINAEASDIMQNRPPEAGKANPSLIRLMGSRIVIISETNENDEINAAKIKQMTGGDCMTARLNYGNTYSESPASFTPFIVPNKHLFVRNPDDAWWRRYIVIPFDKPIANRDASFAQKLETKYTLEAKKWFLKGVKAYISKGLDVDIPEVCLKAKEEERQGTDTYQAWIDDCCDIGENLWEESHSLAKSYSEYREQELNYDRKRISTRTVTLNLKQKGFIGGIKREKIEKEWKSKRIIKGLKLKPAFESVDDNSNIIDFKR >NC_012985|1210475:1227157|1223554_1223866_-|WP_015825011.1|DBSCAN-SWA MEKTAVRQKVQKDSVEIRFTKLETALPYLATKADLADVRTELKQDIANVRTELKADIADVRTELACTKSELKDAINSQTKWFMGIIVSVLVSTIGILLKLSSH >NC_012985|1210475:1227157|1212731_1213763_-|WP_015825008.1|DBSCAN-SWA MATKEQLATANIYEFKKHVELALQETKSKLRPTVTEQATEGEASALVEVFKPTEAHEIVGDMPDTIYNATDQDRRWVGHSQFGWAERIDPFATLDSGINPLLPYASLATAAMHRKQDEAILKGMLGVNKKGKIGAETEFFSKENILSAVEGDDFFKTFIGQLITAKSIFRKRYIDVDSEQVYVLIPSDVWASLFALERATSKDYINTAALQAGKIEAFAGVWFINMEKVPGNDLFPAGTKFPGLIDGKVEYPNGKPTVKSSAKFEDTKIKYVLPIYCKSAVVFTQRKAIDVQHSKDPGKWHAPQITLTSSFGATRIEPDKILGIEISKDSLKGVPVLKGTKAA >NC_012985|1210475:1227157|1222525_1222732_+|WP_015453053.1|DBSCAN-SWA MTIKKVLIASTLLSLCGCGLADEPKKLNPDQLCDAVCRLTLEEQKELQTKVNQRYEEHLTKGAKLSSD >NC_012985|1210475:1227157|1214490_1214820_-|WP_015453082.1|DBSCAN-SWA MVNFRKLADMIKSKVLSRGYTVDSDALARQLEEDERRIRHYKHVYSTPEGRFVLTDLMVEGGLLSSVSNDSAHQLALLEGKRSLAVHIASNCGLSFERIVQMYSDNPRY >NC_012985|1210475:1227157|1226893_1227157_-|WP_015825015.1|DBSCAN-SWA MTNTPWNGPKFDVLTRRIADQDSVLILRLGLGTVSEDILRHIELEAKDSANELLKPLRKIIDELVKGERNKWRQSDNPDDDVCEVCQ >NC_012985|1210475:1227157|1210475_1212212_-|WP_015825006.1|DBSCAN-SWA MVNTTWTKHSFSAGELSPRLLQSRKDLSLHAQGVAKSRNLIPLRYGPLVSMPLMQEYRDCRLDPRSNRVFSFSIPDGGYALLVFGDKKLQIVVVRSSTKWSPALFGKTYKTPYTFKDNKSLEYAVFGSTAVFVHKDHPPHHLLYIQDGDKISFTFDEIKFLPPPWLGDGMISGVKSNAKLSISQADTSTARITSDMKIFKPLDKGRSIRLGCHPPEWAKNTNYSIGAYIVADDKVYRSLTTGRSGDRFGYSKGATYVKDNNITWITVLNLSSKTSRESASGAVAPYYVWGDIKDVSKDGRSISVAPQSQTLFQAGVSVVSWFMSAWGEQEGYPSHVTFHNNRLLFSGSKGDELSVYLSSFGAFYDFSLDGEYGCYDPTKALTTAVTDFSASTIHWMHPFGEGVLVGCDTSLWLLSISLSKGLSIDFRRVSGSGVYACPPVSVGDCLVFVCGVGRRIKYISGSTEQGFRFNEITQLADHLFNQRILQLVYQEEPHSIVWVVLEPKDNSFPRLLGCRFSAEGEGDFAWHTHMISDKHYVLSAASFPNDNRGGTSLWMLVALSAGEERSFTVRLNLLDDFK >NC_012985|1210475:1227157|1214812_1216483_-|WP_015453083.1|head,tail|DBSCAN-SWA MNQRSAKDIQDRFNYLKNQRGELNYWMEELTGFLYPYKNNAQLRMWDTTGSEACIKLSSLLSSLITPPGQKWHGLAESFSAYQAFLYKEDARSKKVREWCDQVTDTLFGFRERSRSGFVGCLQSFYTSVVEFGTGCFYMEADVDEKGLEEGIRYISVPLSNVYMSVNHQNVVDSVYREFTFTVDQIVSKWGDKVLSSKMKSALARNENERFTIIHAVYPKSLTDKKKDKGNKGFHSKFVSVDENRFFEEKQIATFPYIVGRYRVRADEIYGRSPAMEALPTIRRLNETVNELAQFGRLSLHPPTIAVSEAKQRNFDLKPGYMNIGALSREGRSLFQPVQFGNPLPYHEELNRLKESIRSLFLLDLFQVLDDKASRSAAESMEKTREKGAFVGPLIGGLQSEFIGAMISRELDILDSQGNLPECEGADNPPVSLLKVEYTSPLFKYQQAESVASALQGVNTVVELGVKTGDPSCMDHMDTDRVSRFSLWATNTPAVLIRDTAEVEDIRQQREVQRRVMEEQHLQQQLQQTSQDIGAKAAGRAMEKKLTHDMMENSYG >NC_012985|1210475:1227157|1220546_1221164_-|WP_015453088.1|DBSCAN-SWA MFLNPFLETSLKSLQEYTLIITPEIRQYWKDVGTRIKDIRKANNKTQKEMAIGANQLESAVNLFENGMCSTSIRYALYLRNEYEISFDWIYDGEVIDRRYEDVTNKKRLDPYAIGARLKSIRKDKGMSQIEFGKLLGMPNSTLSNYEQGRTIPEIKPARKIKQVTKKHLDWIYFGDEVIVPKSIKRAKGNQSSKKSKKDKKSSNP >NC_012985|1210475:1227157|1222968_1223301_+|WP_015453055.1|DBSCAN-SWA MYDNAVVRDCATVIDDARVSGNASVSRFAQVKSNAEVSDNTYVRDNAKVGGYAKVSGNASVGGNAIVRDTAEVGGDAFVIGFTVISGNARVRGNAVVGGDTVVEGDTVLE >NC_012985|1210475:1227157|1221997_1222390_+|WP_015453052.1|DBSCAN-SWA MGQLKQYYLEEIEANYEFLSAVNPRMGIEPESNYEVEVIEKLERALKTSKKLIHFRDRTIRTHILEDLIEEVNRIIVLAKAHKRRLELKIFEDNEVWRLLDEAREDCEGCENCSEHPDQEHKEDYYASQI >NC_012985|1210475:1227157|1226283_1226673_-|WP_015825013.1|DBSCAN-SWA MGRKVLTPEERMLCRREYKRRYYLKNRDKILERRRRRYLKNKDKIRESYHQYYLKNKDKYREYKRRYYLKNRDKMREKARQSYRKLYSKDSWIAPEEPMGMTKAEIEALEREIARLKAKPIEELIYKRG >NC_012985|1210475:1227157|1218954_1219443_-|WP_015453087.1|transposase|DBSCAN-SWA MYAHKYTKERIDNILASFSGGLSLSQSCKKHGVTVVSFHGWVKQDREDLEKRYEQAKQSHMEHLSENLASVVEAPLTEEERDHPQAIKLRELRMKRLQWELEKRYRNVYGNHVSVEQKHTIDLKPLMDRVQHSIQSKGLKPVKALDKQTEKPLELPKLTKHD >NC_012985|1210475:1227157|1222724_1222937_+|WP_015453054.1|DBSCAN-SWA MIKAKEPLEQTIKGLFQQSSTDRYGRIEPMTKKYKITKEEHRVFSECHRIRALRGFNDVKKGALGGFYRR >NC_012985|1210475:1227157|1213775_1214480_-|WP_015825009.1|DBSCAN-SWA MSDETDQLTPLPSTPPVVECERSQRSNPPPSKEEAVQSDPQGRNPSSSSSSTEEAGEPKPPIEDYTLSCPDYVSEAEVTAHIEAFKEAGVDARVAQKVVDKLVDHGRKIGEQFGASLEEERKLLQTKLGSDYETREKDIARYFRKEKIPDNDVQSLISAWGFEKTFNFFDRYAQQNKESSTGDTFVRSEGSQEADRDFDKVFNTPDFGSRVLSGDKEATKTLRQWAEKQATLNQ >NC_012985|1210475:1227157|1212204_1212732_-|WP_015825007.1|DBSCAN-SWA MTELEICNWALLKLGQRPLENWNERSLKADYCRLLLPPIHKGLLRSFSWSFATQSMDLLPLYFTYNGELKYYIPLKCLKVLNTSEETQLRGRCIVARGDTPRPLSLKYIGEVPLSDCDPLYQEAFALKLAGELCPPLIMDDQMRSYLKGESERVLAVAMDMDGVEIPEDRGYHNG |
20 | Liberibacter_phage(100.0%) | head,transposase,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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