Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_013061 | Pedobacter heparinus DSM 2366, complete sequence | 2 crisprs | DinG,DEDDh,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. NC_013061
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_013061_1 | 1049026-1049105 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_013061_1
|
1 spacers
spacers of NC_013061_1
>1.1|1049053|26|NC_013061|CRISPRCasFinder CCGAGACGCAGGAGAGCTCATGAGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013061_1
The CRISPR arrays of NC_013061_1 >merge|NC_013061|1|1049026-1049105|CRISPRCasFinder CCAAAATCAATAAAAGCTACCGAATAACCGAGACGCAGGAGAGCTCATGAGGACCAAAGTCAATAAAAGCTACCGAATAA >NC_013061|1|1|1049026-1049105|CRISPRCasFinder CCAAAATCAATAAAAGCTACCGAATAA CCGAGACGCAGGAGAGCTCATGAGGA CCAAAGTCAATAAAAGCTACCGAATAA
>NC_013061.1|WP_012781061.1|1048576_1048876_-|GIY-YIG-nuclease-family-protein MDRGGCIYIMSNLARTTFYIGVTSDLYARIQEHKTKKYPNSFTAKYKLHFCIYYEMQPSIEEAIAREKEVKKWSRSKKIKLITTLNPKWNDLWEEIQQW >NC_013061.1|WP_012781060.1|1048239_1048485_-|hypothetical-protein MSKMTKEERELYESDVKAKSDWNAGIRYAEKKAKKEGKLEGKLEGKLEEKLEIARNLKSKAIAFEIIAETTGLSIDEIEKL >NC_013061.1|WP_012781059.1|1045261_1048189_+|phospholipase-D/transphosphatidylase MDILKWIKYWRDSLADAESINVDVSKIDAKYKTEAYNFEQATLPDQLFKELWPKNELEALKEGQVLDKEILISPLSLVPRLNHAIPKANEEEISPFWIPALLSSENELKPRQDMYPLIPRKILDPVSYRDIVFSNVDQVDEALAKVELSTDTWKVYHQSLNKIFNYITGTDIQDFKAQEFFEVKYQWVFIPDEVVKGTSHHILELYRSLIKQSSFPRLLKTIIKEARPVLNQQYTKDEVFNRSAGHLGQMNNGFGLSPSQRKSLAHNLDLKHGEILAVNGPPGTGKTTLIQSVIADNFVKSAMTGQNPLITVASSTNNQAITNIIDSFSKGNSGTLLEQRWLPDITSFALYMVSGDPEKIKKSKERNWMYHSSKKGDSVLTEIENEVYLQTARASFLEKLSTFSGIDFTDITTSQKYLQKQIKKSSELIAEGLKVWKQFKSVYHLLVDYDAAAYEGKDFSGVNDQFFEREISDVSKLITKLVEARQKEPFYFWLLSFLKPVKTQRKLYYESIFADCSFDTSTWDFSSFSTLQPNLIGKSEKIKKAFSHYKAFFKWLNSTEGLKNEYFYIDDYTEDDRFLDKLDTKIRYQNFLFAVHYWESRWIEETSSALQDDSNWKNTEAGTMNRLHRFAMLTPCFVSTFHMLPKMMQYTRYPSRQIDYLYDFIDLLIVDEAGQVSPEVGAPSFSLAKKALVVGDNYQIEPVWNIDGRTDEGNLLRNQLITKGDNNRIEQLMASGYMSSNGSLMKLAQKSCSFAYSKKDRGLLLTEHRRCLNQIIAFCNELVYNNQLEPLSSLRYEKSDFLPPMGFLKIAGQSDKSGTSRFNRAEAQGIIKWLKANESKIVEFIYSKELKESKSPEKVKRKALHDLVGIVTPFSAQKRFLTEAMHLNGLQPSLFQYGTVHSLQGAEKDIVIFSPVYTSDVKSGYFFDMGPNMLNVAVSRAKRSFIVAGDKDIFRLGNKNVPSSLLTKYIKDEIK >NC_013061.1|WP_143715817.1|1043836_1044568_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MGLVYGDMTIDQDGRLVEVKGAFLIFVNPAVPHSIVRRINRISGYACIFTESFISSREMKDSPLFRVGDSPVIPLDSDEALFMQGIFHKMLTAYNGDYPHKGDLIKSCIALVIHEALRLQPSQQTTPLRNGTGRITHLFMDLLERQFPIERSNDPLRYRNPQAFAKVLAVHVNYLNRAVKEVTGKPTSTHIAARITAEAKALLKHTDWNVADIAYALGFEYPAYFNNYFKRVTGTTPNSFRKV >NC_013061.1|WP_012781055.1|1042939_1043773_-|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKILVTGATGKVGSRFVPRLIAKGYDVTILVRDAAKTLPGAKVVVGDLYDANTLPPAVAGMDAVIHLAALFRTFTDNEGIVKTNHTGTVALAQAAMAAGVKRFIFVSTSNVYGSGYGHPAREDDSVNINDPRPYSSSKIAAEQALLKLDLDVRVLRLGFVYGDKDPHIEEIIPILKNWGRHSGSRMHMVHHLDVAQGLFLLLQQDNLNGEIFNIVDDAPITLYELADSVGKAAEIYDGNEGPLADPFEGIMDISKLRKIGFRPLVPSFYVARDLDIL >NC_013061.1|WP_012781053.1|1041981_1042785_+|SUMF1/EgtB/PvdO-family-nonheme-iron-enzyme MKNLSLLVLLSCFLCLASLSAFIDTTHIDQHAISKKGMVLVKGGTFYMGLDSSQLKDLVAKLNVPASSFSQEFPANKTMVRSFYMDKHEVTNADFKKFIDANPDWAKRYISDSFHNGNYLKEWDLDSYKKGTEDQPVVYVCWYAAKAYAKWKGKRLPVEAEWEYAAKNGVGLQDMDGSVSEFCVDQWKKDAYAERAERVKELLLSGKRYNYQHRSLKAYSADSIVIRGGKVSGPAANHHHTWRQGYGNKDCSATVGFRCVAGNDSQI >NC_013061.1|WP_012781052.1|1040764_1041697_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MRREDATEDLLAEPVVVYSKGQDGRPYFIDPLEDLGFKRLFSAEQNKDITITFLNHVLKGKREVVSLEFLKNEYPGETQEEGGVIIDIVCKDQIGAFFLVEMQKSWNQNFKERSLFYASRLITEQAPHGNRKEWAYSLKDVYVIALLEKFTINAGNKGKWLHDIALVNTDTGKVFNERLRFTYIELLSFKKTENQLETDLEKWIYALKNLKHLKQAPAAFTEPQLLQFCQAARYINLTKEEKNMISAKTKARWDYYYAIDGAKIMGREEGETRGAHQKAAQIAIKLKNKGVPFTEIQELTELSITEIKNL >NC_013061.1|WP_012781050.1|1038038_1039991_+|KUP/HAK/KT-family-potassium-transporter MSSHKNFNTLSAGGLLVSLGIVYGDIGTSPLYTLKAIFNSVVGGGQEVTSDLVLGALSCIIWTLTLQTTIKYVVITLRADNKGEGGIFSLYSLVRKNAKWLVIPAVVGGCALLADGIITPSITVTSAIEGLQLKFPTVSVIPIVLAIITGLFVIQQFGTNLVGKLFGPIMFLWFGALGLVGILFVVQDFSIFKALNPYYAFNLLVNNPMAMLILGGVFLCTTGAEALYSDMGHCGRSNIRVSWIFVKIMLILNYLGQGVWILHHGNYDTGLNPFFEIVPPSYLLFMVALATVAAVIASQAMITGSFTLISEAVRLNLWPKVRINYPSNQKGQIYVPSINWILWAGCIAIVLIFKNSGAMEGAYGLAINLTFLSTTILIAAYMKRKKVPVYVIGIFLFIYVLLEMTFLVGNMAKFLHGGWVTVLIGSALFTVMWSWYVSRKIKNRFVKYVEIEDYYQIIKELSEDISVPKYSSQLVYLTSANFKTEIESKIIYSIIQKEPKRADVYWLVHVDVVDEPFTRDYKVEFLIPGKLIRIDFKLGFRVEQRVNLLYRKVIEELVKNGEVDITSQYTSLNKHKIAGDFRFVLLEKHLSKFSKLSLYERTIMDYYFILKRLSLSEERSFGLDSSYVDVEKVPLIFVTPDDIELNRLPV >NC_013061.1|WP_143715689.1|1037250_1037766_-|T9SS-type-A-sorting-domain-containing-protein MKIQRKIAHLLNISCLISMSVLCSVSVFGQRTDSSTTSIRAKKINKTPQIKASVPTYKPKYAVGYLQYNDLISGNKSLTNPKQEKILTVLKVYPNPVDDQINLILRIDRESNLSVKIMDLLGNEVVTLSNERIPAGEQTKSYTIPNRLNSGIYFLKIMSGAETVVKRISVL >NC_013061.1|WP_012781048.1|1036568_1037180_-|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKIIAIGRNYAEHAKELNNPIPDQPVIFLKPDTAVLKDNKPFYIPDFSSDIHYEIEVVLKIAKEGKHIAEKFAHKYYEELGLGIDFTARDIQSAHKAKGLPWELAKAFDHSAAISNFIPKTAIKDLSDLSFTLNINGEPRQNGNTRDILFSFEKIIAFVSRYITLKKGDLIFTGTPEGVGQVKPGDKLEGWLQGQQLLNFDIK >NC_013061.1|WP_012781062.1|1049330_1049753_+|hypothetical-protein MKYLITFALLTLCLSSKAQKDASFLIGSWKVIDAYVPESTNARQKQALNIVRANLLKTLFKFDNDGNGKFKFPMTNVPIDKTIIPSEDISWTYSAAKQYVEITERSKPKELIAQLHVKVENGNTYFIIGETSVKLKVVKY >NC_013061.1|WP_012781063.1|1049791_1050256_-|hypothetical-protein MYQILLPLHSLIRWLVLISLLFAIYRAYYGRFKKLDFSTFDNTIMHIAVKILQIQFCIGITLYFISPIVRYFLNNFKTAVHLREMRFFGMEHITMMTIAVFVITIGAEKVSKAKTSEQKYRIMALWFSIGLVLILSSIPWSFSPLTSRPGFRAF >NC_013061.1|WP_012781064.1|1050811_1051663_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MTEKNSRYIDPLTDYGFKRLFGNEPDKDIMIEFLNALFEGEKIVIDIRYSPTEHAGEDVKEKKVLFDLTCTGADGETFIIEMQRADQEFFRDRCVFYMSRLISAQLPRGTSNWDVPLKEVYLIGIMEFQFNNINSNYLHNIALMNRDTGKVFYKGMGYKFLELPNFDKKESDLVTELDKWFYLLKNLSHLDKIPDFLDKRVFQKIFKIAEMSKMTKEERELYDSDVKAKSDWNAGIRYAEKKAKEEGKLEEKLEIARNLKSKAIAFEIIAETTGLSIDEIEKL >NC_013061.1|WP_012781065.1|1051912_1052203_+|hypothetical-protein MIDAIDFKQSIMNRQLPEGLALHLQALWYDGTGDWKTAHDLIDQLTDKAAAHVHAYLHRKEGDLWNADYWYNRAGQPSTQVSLEEEWENLVVLYSQ >NC_013061.1|WP_012781066.1|1052211_1052778_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MEKGISDRIMVETDRIILREITINDAPAMFEMDADPEVHTYLGKSPIQTIDQAINQIKYIRQQYLDYGIGRWAIVDKSTDNFVGWGGLKFRTEEVNGHINFYEVGYRLLRRYWGQGFATASARASLTYAFNELQLDAVYAMANVENLASKNALLKSGLVITGQLSHEEIDCDWFEIKREDWRSSLQLF >NC_013061.1|WP_012781067.1|1052956_1056376_+|T9SS-C-terminal-target-domain-containing-protein MAFSEIFVVISNADAGVGTLREALTKAASNGIAEKDYIHFNLSGNTEADRTITLATALPYISSNLVIDGTTQPGNSFGVSNAKVVLQPQNSSSPYNAFVLIDIDGFEIYGFYVRDFMGPILNGPTQSIYSISAVLYVENARNIQIGAPGKGNVFVNNGLILSTLYVSLKTGVGVPPMGVENLKVYSNFFGFEPDGKTFRGTPRGYLGGIDLAYCKGIIEIGGKEDSKRNIFGNGTHYISGKNTTPDKYFPTEFLIENNYFGYSVNGDPVLLPNFNGSTINAVHFSLSGYIGYTAYAPYSFKILNNKIQGSHSIMIEDVLGQIILQGNVIKREALPNNPSYKPFFWLFTKDIVKIGGLLPGEANSIENGQLMLDAVKSLLVQRNSLYCVDIRLGEEVYNGPVNLLPHIEITNVSAGSVSGTATPNSKIELFWDDDCEKCHPLTYFATVTADENGLWKFEGAIERGVIASATYNGFTSQFTITYNNQYAQILHSSCGEANGSIIGQRYKNAGGYEWRNEAEEIVGSDADISGLLPGKYVLSVLNGSCTQRFTFTILDGTPKFNTSSVYKINPSCGISNGAITNLSINYNGINYSVKWYDQEGKIRGTDYNLRNVEAGTYHAEVTYNNCTVKSPYYTLSNQTGPNIDQSAPDIKGSLCNSPTGSIKNLAVTGSGTLIYKWKNAAGQLVGSSSELLDVPAGSYTLEVKDGSACPALVSAPIMVPEINGVTVNTANKVIGKAACNTSNGSITGIIVAGATSYQWIDAGNTPVANTLNLTGMPAGKYRLVASNATCNKTSEELTIELVQTTKDYATTKVSTSATCALNNGKIEAIFTKDQPAACFWKNNAGVVVGHSRILENQGPGTYDLYAIDDLGCEHLLQQYSIGNISGATINRNLEQITNDQCGLGRGRIKAPGLTGGQLPYFYQWKDKDGHVIGSNAVLDGLKAGDYQLTIGDALDCSRQIIPYSIENESSTLPVPVVNDVKICSSGNALIQVQQAQNGTYVLYNANGTLIAQNITGAFNVEIKESQHFSIVLRQGTCESLAASAKITIENDGIGVFANAFSPNGDGHNDEWLIPGMQSYPEATIAIYNRYGHKVFESTGYKTPFNGRWNGAELPVGTYYYIIDLKRGCGLQKGSLSIIR >NC_013061.1|WP_012781068.1|1056631_1057201_+|RNA-polymerase-sigma-70-factor MGAYSTYTDQELTALLKSGDSHALTEIHSRYYAVLYAHAYKRFPYREEVLDILQELFTYMWDHRMQLVFTTTLPGYLYAAVRNRVLNLHRSQKVRGEYAVSLQEFSEQGESITDNLIREKELLQMVEQEIAKLPTQMRIIFDLSRNEALSHNEIAKKLNLSPQTVRTQVRNALRILRVKLGANIFLIFL >NC_013061.1|WP_036675166.1|1057355_1058402_+|Fic-family-protein MMKINSLNITSEILNIIAGIDEFKGSWKVLGNLAPEQLISLRRVATIESIGSSTRIEGSKLSDKQVEVLLSNLQIQKFENRDEQEVAGYAAVMNTLFENYQEIPLTENYIRQFHRDLLKYSDKDSRHRGEYKKHNNQVEAFDASGKSVGVVFVTATPFDTPLRMQHLIAWTNDTLANKSLHPILVTAIFVVEFLAIHPFQDGNGRLSRALTTYLLLSAGYAYVPYSSLESIIEHSKEGYYLALRQTQGTLENDNPDWQPWIMFFLKALLKQKQRLETKLDKEYLLLGQLPQLSLDILELVKSRGQLTISDIVVITKANRNTIKKHLENLVLRNQIQKHGIGKGTFYTR >NC_013061.1|WP_012781070.1|1058538_1059702_+|FecR-family-protein MKEINKEELLDRYVAGTATEAEKALVESWYIKAPFSAKVPDADQLLIDQKVSRDELVKYMQPAGVFKLWPRIAIAAAAVAAIVFGVFLFKAPRNPKPAQGATNYTNDIAPGKNTATLTLANGKTILLSDVKTGVIVDANSLKYNDNTVIPTEGRDLSSLRSVEMTILSTPRGGTYQITLPDGTRAWLNADTKISFPSQFIGKERKILLINGEVYFEVAKNKEKPFIVETSRQVVEVLGTHFNISAYKEEGSTKTTLLEGSVAVTSTRARPKKPNERAIVYPGTVLKPNQESVLNENNELVLKQVDASEAIAWKNGEFIFNDEPLESIMRKLARWYDVEVIYQGVDKDRLFGGGVSRYDNISKILNKMEKTGGIHFKIEGKSVTVTGK >NC_013061.1|WP_012781071.1|1059996_1063542_+|SusC/RagA-family-TonB-linked-outer-membrane-protein MRLTTVILIASLMQVSATTLAQRITIKGNPISLKAIFTEIKKQTGFQVLYQSAQLNKAKPIKIALNNVPLEEAMPQILADQQLDFEIEDKTIIIKERSPSLLDKLSNVISNMVRNLTIKGRVVDQDGKPLPNASIRVKGKSAVTNTNSEGEFEIKGVDEDAVLLVSYVGYKTLEIALKDAVMPLEIKLNAATGELEEVKVVYNTGYQELNKERATGSFVQIDNKSIKRGVSTNILDRISYLTSSLRKGGNGEASVNGTDISIRGLSTVNANQKPLIVIDGFPYEEYIFGFGGQIILNNLNPNDVESATILRDAAAASIWGARSANGVIVITTKKGKFDQKANVSFFSNTTIGERPDLFKANIMSSNDMIDYEKKLFKIGVYNDYDDLYPSSNSFPSLSSGIELLLANRRGEISDSQTIINLEKLRNNDVRNDVNKYLLRSSVNQQYNLNVSGGSNKMNYYGSIGYDKELKSAIGNEYNRLTLRLDNNYRITNNIELNTYVSYTQSKTQNNGISYDQYIANGINQVSPYTMLADENGNLLSVPKRLRSSYIDTVKTRGLVDWHYNPIEEISNQDNTDKLSTIRFGGGLIYKIIQGLNLNLKGQYDHSLSNSEDYKSIRSYEVRDNINTYMFLNALGQPQYPIPLGGTLNFRSMRQTSYNLQGQLNFSKTFDAHAISAIGGFNVNESQRDLNSNKKWGYDPLTLGFANNMDYNTRYAMRASSGNTGTIPKDNGSLSGSLNRSLSYYSNVGYTLLNKYTLNASARIDAANLFGVKANLKAKPTWSFGTGWNISKEDFFDVGSISSLSLRATYGYNGNVDNNATSFPVIRYQLASLPYSIPQQYATSVSPPNPGLTWEKVKVINLGLDISMFGNRLIGSVDYYIKKAGDLISSQPVDPTVGVNSYTGNFGALKAEGIDLNLTALVLNYGIKVNSAISLSYNKEEITDYYLAPSLLIQPLNYLSNQVLAGKPRNYLYSYRWAGLNSQTGDPMGVVDGQIVPFTTVLGSTGVAPNTHPTDLIYHGRSTAPVFGNMLNTISYKGFSTSFNITYAFGYYFRRPSVNFSLIQYTWGGHGDYKNRWQKPGDELFTNVPSLPLMSDGRDEFYAYSEVLVEKADHIRLRDIRLSYDLNKGQVRKFPFTNISFYVLANDLNVLLWRANNHNIDPENLNKVPNPRSISVGLTLNY 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_013061_2 | 2374535-2374647 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_013061_2
|
1 spacers
spacers of NC_013061_2
>2.1|2374563|57|NC_013061|CRISPRCasFinder TGGTTATGAAGCTATCATGAGCTCAATCGTTTTTAGTTAATTTGTATCTCATGATGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013061_2
The CRISPR arrays of NC_013061_2 >merge|NC_013061|2|2374535-2374647|CRISPRCasFinder TTTCATAGAGTTATAAATTGATTTTTAATGGTTATGAAGCTATCATGAGCTCAATCGTTTTTAGTTAATTTGTATCTCATGATGGTTTCATAGAGTTATAAATTGATTTTTAA >NC_013061|2|2|2374535-2374647|CRISPRCasFinder TTTCATAGAGTTATAAATTGATTTTTAA TGGTTATGAAGCTATCATGAGCTCAATCGTTTTTAGTTAATTTGTATCTCATGATGG TTTCATAGAGTTATAAATTGATTTTTAA
>NC_013061.1|WP_015807874.1|2372786_2373758_-|electron-transfer-flavoprotein-subunit-alpha/FixB-family-protein MSVLVYVEQVDGKFKKSVFEAVSYAKAIADKQSSNLTAISIGNVGDSELKELGKYGASKVLNVSNEQLKNFVNQAYAAVIAEAAKKENADVIILSNSFSGKGLAPRIAVKLNAGLVDGAVELPQLDAGKFQVKKTAFSGKAFAITELSSAVKVIALNPNAFGVKDNASDISIEAFSPELKPSDLTAIVKEVVRATNKISLPDAELVVSAGRGLKGPENWGMIEELAALLGAATACSKPVSDADWRPHAEHVGQTGIAISPNLYIAIGISGAIQHLAGVSSSKVIVVINKDPEAPFFKVADYGIVGDAFEVVPKLIEALKAHKG >NC_013061.1|WP_015807873.1|2372124_2372736_-|bifunctional-nuclease-family-protein MKKVKLDIVGLSYSQTQSGAYALVLGEVNGRRRLPIIIGAFEAQAIAIEIEKMTPSRPLTHDLFKTFAQIYNIDIQEILIYNLVEGVFYAKLICTDGKTTHEIDARTSDAIALAVRFSAAIYTYEFILSSAGIVIEGNDFLFLENIDNISKEQGTEDLSSIPSSSYKSLTLEELNQKLQEAIAEEAYEKAARIRDEINKRGSK >NC_013061.1|WP_036674455.1|2370847_2372113_-|nucleoside-permease MNVKFRLTLMNFMQFFIWGSWLITIGVYWFQNKKWSGSEFGAIFSTMGISAIFMPALTGIISDRFINAEKLYGLMHICGAVVLFCLPMVDNPHTFFWVILLNMIFYMPTLSLSITVAYSALKSNGKDVVKDYPPIRIWGTIGFIAALWVVSISGSEATSNQFYIASAVSLLLGLYAFTLPKCPPLANKVDSKSFVDALGLRAFALFKQKKFAVFFLFSMFLGAALQLTNAYGDTFLHDFKNVPEFQDLLAVKYPAIIMSISQISETLFILAIPFFLRKFGIKYVMLFSMLAWVLRFGLFAYGDPAGGLWMIILSCIIYGMAFDFFNISGSLFVETQIDAKIRGSAQGLFMMMVNGFGALFGSFTSGFIIDKFFTHTDQSKDWHSIWITFASYTLLLAIVFPFVFKYKHNKAEEKAIEAMRH >NC_013061.1|WP_015807871.1|2369492_2370779_+|citrate-synthase MSDIAEIKIDGKVYEFPVITGTEGEKAIDISKLRDLTGHITLDFGYKNTGSTKSAITFLDGEQGILKYRGYPIEELAKKSTFLEVAYLLIYGDLPTQVQLDDFQKQISRHTLIHEDMKKFLDGYPSKSHPMAQLSSLVCSLSTFYPESLNANSSPETMDLTMIKLLAKFPTIVSFIYKKSLGHPLIYPKNKYDYISNFLNMIFGQRTEEVEIDPVVVNAMNTLLILHADHEQNCSTSTVRIVGSSDCNLYASVSAGIDALWGPLHGGANQAVIEMLELIKQDGGDTEKWINKAKDKNDPFRMMGFGHRVYKNFDPRAKIIKKACDDILEKLGINDPVLEIAKKLEEAALSDPYFVQRKLYPNVDFYSGIIYRALGFPTDMFTVLFALGRLPGWIAQWKEMHENKEPIGRPRQIYVGHTDRTFTAIKDR >NC_013061.1|WP_015807870.1|2368835_2369369_+|DUF3347-domain-containing-protein MRKYLAVMLITGIVSCTNTEKKVAGNSDTTSGVVDTIANHIELKDNKVQAIYNGYIALKDALVAAKFEDAQKTAAVLKTDLAAYKGCESTALTAEKIAVAKDIKNQRALFTSLSEDVIALFKHADLIKGSIFVQHCPMANNGVGGDWLASEKKIQNPYYGDEMMDCGRVVEEIRTGK >NC_013061.1|WP_143715855.1|2368225_2368735_+|hypothetical-protein MKKVTKFLASAVAAVALLVSTNVHAQSGDSKAWRLGVGLNVGVPTTTGYSLAIGGDLRLQKDFSSNVSGLLSAGYTSFSLKDSYGGGSFGMVPVKAGVKIFLAESLYASGELGAGFGTESGSKTAFLWAPGIGYGFDNGIDLGLRYEGAEFSGASLGQVALRIAYGFKL >NC_013061.1|WP_015807868.1|2367201_2368125_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MEASKLLIVLGATASGKTKLAVELADVLEAEIISADSRQIFTGMDLGTGKDLKEYNIQGKQIPYHLIDIKKPGEKYNVNEFKEDFYKVFEQLNSEGKKAILCGGTGMYIHSLLQKHDYTAVPVDQELRQQLLSLDKEELRKRLLAYPDVFTGHADHSSAKRLIRAIEIASYLSRYPLNIPERAVIKPLVIGLFSDVEKRRERIFKRLELRLETGMIEEVEQLLEAGVSKEMLVFYGLEYKFMVSYLDKEITYTELKEKLGTAICQFAKRQMTFFRKMEKDGVNIHWLNTEGNTDQLVSKIISLYKIS >NC_013061.1|WP_015807867.1|2366400_2367201_+|hypothetical-protein MGIKSVWQSKVVLALEETGLYVEHPEHEIYQLLLCNQKVVLHLVPLENNYDPAGLIALQAEYKAIGKILLHLWEDVWLTRQVQVLGRICSLLGINKRLHARKAKIRVLTQKQAADFMDQHHLQASARARYKFALCIDEKIVAVACFSALRSMKNISATHKSAELIRFASLTGFTITGGFSKLLKHFITLMQPDDVMSYADRDWSLGNAYAQSGFVLKETTAPAKIWLNKNELSRYFEHRLPADAASCLADYVQIFNTGNLKYILYL >NC_013061.1|WP_015807866.1|2366032_2366410_+|hypothetical-protein MKTDFIEIFQTIRAVLQPYATLGFSNRINSETTYDLWSDKNVVIDGEKRNELYFAAVMIHKGHVGFYYMPVYAEPEMKRIFDPSLLKLLKGKSCFHIKKLDDALLGHIENALAEGYRLYKEKAWV >NC_013061.1|WP_015807865.1|2364881_2365973_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKKTMYVILLIVVLLGLTTILVLRLPVFGSVPAGKRLERIKSLANYKEGALQNLSPTPMKPDGVSYWDMIRGMIKGNENSSPKKPLPHKVPDFSGSGQTKLIWFGHSSYFLQIDGVKILVDPVFSKKPSPFSFLGSSAYKGTDFIKAEDFPETDIILITHDHYDHLDYQSILKLKDKTSLFITSLGAGAHLERWGVPAAKIRELVWGEETLARGLKFRAAPARHFTGRTFTRNQTLWSAFVLEGTKHKLYLGGDSGYDTHFKEAGEKYGPFDLAILECGQYNTYWPLIHMFPEQTVQAAKDLNAKVLMPVHWAKFSLAMHAWNEPAIRVVKKAKAENFKLTTPLLGESVILDESYPSKEWWLD >NC_013061.1|WP_015807876.1|2374717_2375053_+|tetratricopeptide-repeat-protein MQSTRIAKLLEFLQSDPNDPFVLYALATEYNTSNDTEKALEYYLRLTTDHPDYVGTYYHLGKLYEQLQQTEKAIEIYQKGMLAARNKRDMHAFSELQGAYNSAAGLDYEDD >NC_013061.1|WP_036674008.1|2375064_2376264_+|chromate-efflux-transporter MGKRKLLFIRNVVLFTFTAFGGAQAHLALLLKYFVKSVPFVTEEELLELNALAQVLPGPASTQTLVGVAYKVGGLKLSIITFLIWILPSAAIMTFAAISFAKLDQQAKFTEILEFIQPIALGIVAYGAYNLAKRVLVSQLTVFLAISAAIVTLVLRNAYVFPMAILLGGMVSSAIGTPAEESTIRLNLFSNINPKKLTYFFGVLLFLALLGAIINRTSPFSLPIRLFENFYRNGIVIFGGGQVLVPLMFTEFVQMKQYLSASGFLSGFALQQALPGPTFSFTSYLGALSMRNFGFGPTGQVLGGLVGVLGINLPGLILVLFIVPFWEDLKKITRIKHSLTGINAVSVGFIIAAFVLLLMPVALNGLAIAIMVATFLILNYTKISPPFIVLAGILLGYFL >NC_013061.1|WP_015807878.1|2376268_2377837_-|replicative-DNA-helicase MSNDQPQGQDKANFSARKTRLSNTMSTMGRIPPQAIDLEEAILGALMLEKDALSTVIDILKPEMFYHEAHKKIFEAIQGLFQKSKPVDILTVTAELRTLGLLEMIGGAYYITNLTNRVASAANIEFHARIVSQKYIQRELIRISSEIIQNAYEDTTDIFDLLDHAEKNLFDIAQNNLRRDTQKMDEIVKQSLATLEELRSKSDGLTGVPSGFTDLDRITGGWQASDLVIIAARPAMGKTAFVLTCARNAAVQFKRPAVVFSLEMSSVQLVNRLISGEAEIEQEKIRKGNLAEWEWQQLHSKIGGLTEAPLLIDDTPALNIFEFRAKCRRLKAQYDIQLIIIDYLQLMHGKGEGQSGGGNREQEIGSISRALKSVAKELNVPVLALSQLSRAVESRPGVNGKRPMLSDLRESGSIEQDADMVLFLYRPEYYGITEDEQGRSQAGVGEVIIAKHRNGETGIVPLRFIGKYVKFADLEESFAAPTSFSMDSPSAGMAPSQDFDRPAGNVIIKPSRMDDMHDDAPF >NC_013061.1|WP_015807879.1|2378000_2378765_+|23S-rRNA-(guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase-RlmB MENSRRPARGKESNEFIFGIRAVIEAIKAGKEIESIYIQRGLTGGIIMELKALLKEVDAPVHNVPVEKLNRMTLKNHQGVIAVISAITFQKIEDIIPAIYEKGETPLVLILDGITDVRNMGAIARTAACAGVHAIVVPSKNSAQINADAIKTSAGALFTIPVCRHPNLHKTALFLQECGLQIVACTEKTNDLIYVPDYTAPTAIVMGAEDEGISNELMRMANHLAKIPMIGEISSLNVSVSAGIILYEAIRQRQ >NC_013061.1|WP_015807880.1|2378830_2379922_-|mannose-1-phosphate-guanylyltransferase MNKNNYALIMAGGVGSRFWPVSRTEYPKQFIDFFGVGKTLIQSTYDRFLKICPPENIFVVTNEIYTDIIKEQLPGLHENQILAEPIMRNTAPCISYGSMKIASLNPDATIVVAPSDHTITNQEAFIEAIGQSLKAASENDCLITLGIKPSRPDTGYGYIQYIENTLKTDNQIHKVKIFTEKPNLELAKSFIQSGDFLWNAGIFIWSARSINKAFSRHLPEMHEIFLQGGPVYNSENEKDFISDAYQQCTNISIDFGIMEKADNVYVLPADFGWSDLGTWASIYDIAEHDYVGNAVIPAEQVMMFNSSNCMVNVPKDKLVILQGLHDYIVVESNNTLLICPRSEEQTIKQVVADVKAKFGTKFI >NC_013061.1|WP_015807881.1|2379939_2380905_-|KpsF/GutQ-family-sugar-phosphate-isomerase MKSKKSIIEAGVSTLQLEAQAILGLINNINDDFVKVVNLIIESKGRVIVTGIGKSAIIAQKIVATFNSTGTPAIFMHAADAIHGDLGMIQKDDIVICISKSGNTPEIKVLAPLLKQSGNTMIGMIGQLNSELAMQADLVLNTYVEKEACPHNLAPTTSTTAQLAMGDALAICLLHARDFNEQDFARYHPGGSLGKKLYLKTGDLALKNQKPSICADASVKDVIIEISQNRLGAVVVVDGNDILGIITDGDIRRMLEKYSDLTNIKASDLMNPNPKRIEKDLLALNALEIIKENNITQLLVTDAGSYFGIVHLHDLLQEGII >NC_013061.1|WP_015807882.1|2380994_2383184_+|DNA-helicase-RecQ MDVKKSLFDNLQTFFGFDNFKGDQESIITNVLEKKNTFVIMPTGGGKSICYQLPALINEGTAIVISPLIALMKNQVDQLRAFGGSDSIAHFLNSSLNKTEITQVKSDLLNGQTKLLYVAPESLSKQDNIDFLKLIKISFVAVDEAHCISEWGHDFRPEYRKIRQVISGLGEGIPIIALTATATPKVQQDIIKNLGMSDATLFKSSFNRPNLFYEIRPKRDVLKEIIRYIKYNTGKSGIIYCLSRKKVEEVAESLNLNGIKALPYHAGLEPKVRAETQDKFLMEDVEVIVATIAFGMGIDKPDVRFVIHHDIPKSMEGYYQETGRAGRDGGEGVCIAFYAQKDVDKLAKFMKDKPVSEREIGTQILKEVIDYAESGVCRRKQILHYFGENFNETGCNCMCDNCKKPKKLFEAEESLLVLLKLIKKIGEKFDDAHIINVLMGLETAQTIAYEHSKLPEFGLGVVEGENHWKSLVRQAVLNNFLSKDIDNYGLLGLTNSGRDFIENPYNLKFILNEPIDSAADDDEDDVKHGTGTLDTQLLQLLKDLRKKIAKQKNVPPFVVFQDPSLEEMCTHYPIAMDELKQISGVGNGKALKFGAPFLELIKKYVEDNDIERPIDLIIKTQANKSQLKVSIIQNIDRKIGLEDIARAKGITYDDILKEIEAIVNSGTKLNLNYFVDEMIDEDRQDEVFDYFQSAENDSIDEALKELGETDYSREEIQLMRIKFMSELGN >NC_013061.1|WP_015807883.1|2383200_2384016_+|3-deoxy-8-phosphooctulonate-synthase MINFSLDKLKHTASGNFFLMAGPCAIEGEEIALRIAEKIVNITDKLEIPFIFKGSYRKANRSKGGSFTGIGDEKALKILEKVGKTFNVPTVTDIHESAEAAMAAAYVDVLQIPAFLCRQTDLLIAAALTGKVVNVKKGQFLSAGSMKFAVEKIVESGNNRVVLTDRGNTFGYQDLIVDYRGLPEMQGFGVPVVMDCTHSLQQPNQSSGVTGGKPELIETIAKAAIAVGADGLFIETHPDPANAKSDGANMLQLDLLEDLLVKLVRIRKAVI >NC_013061.1|WP_015807884.1|2384043_2385939_-|PD40-domain-containing-protein MKKVTLLFFLCFILQIARAQTSTVKKAQNSFDKAQEYLRNNDYDQAIPLLQEAIKADPAFQFAFIQLADINRRQKLYEQAKINYTSAIALGGIPDARAYYGFAESQIYTGDYANALNNIKLFIAQYKGNDPDFMNRAKKYLRDCEFAIVALKQPVKYDPINMGPEINSVHRDYFPSVTADGTRLIFSRNINGNEDFFVSEKKDKSWSTPLPLSDKINTQKYNEGAQSISPDGLYLFFTGCNRPDGLGRCDIYVSHKNGKDWGEPFNLGAPVNTSYWESQPAISPDGSTLYFVSNRPGGLGGYDIWKSMLKADGYWSQPENLGPEINTPYDEHTPFIHPDGKTLYFSSDGWPGMGNKDIFMSRMNEAGKWSSPENLGYPINTFNEETGLIVTPDGTYGLFSSNLKGGYGDMDIYQFKMPENKKPLPITYVKGIVTDKESKVFLEAKVQVVNLKTKKVDYSDYTSKETGDFLAVMPLGGNYAFNVSADGYLFYSENYQLDSAYISKPYVVQVALEKLSTGKNMVLKNIFFNTNEYTLLPASLTELNTLQQLLKNNASLCIEIQGHTDNVGNDQQNERLSLQRAKAVYDYLVQEKIEPQRLTFKGYGENKPIAANDTDAHRRQNRRTSFIITKI >NC_013061.1|WP_015807885.1|2385995_2386619_-|7-carboxy-7-deazaguanine-synthase-QueE MAHQIPEDGTLLPLMEEFYTIQGEGFNTGKAAYFIRLGGCDVGCHWCDVKESWDAELHPLTPADAIVAKAESYPGKAVVITGGEPLIYNLDYLTRRLREKGILTFIETSGAYPLSGDWDWICLSPKKFKAPRPDITPYANELKVIVFNKSDFEWAEKYAETVSANCKLYLQPEWSKSKEITPLIIDYVMANPKWEISLQTHKFLNIP |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
795728 : 804592
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_013061|795728:804592|DBSCAN-SWA TTTATTCATCGGAGCTTTTTGCTTTTAGTACCATAGTGACCTGTTCCATTTTTTTCCAATGTTGTGATCCCTTATAAAGTAGTTTACTAAAAGGGAGGCGGGGCTTGATGGCTTTCTGATAATCCTGTCCAAAAATGCGGTATTTTATTTCCGGATCCTCTGTTATGCATTCCAGTATAGCTTTAGAATAAGCTGTGGGACCTGTCATCCAGTGTACACTATTGGGATAAGCATTCTGCTGGATGTTCTGGATCACAATATCGAGTGTCCTTTTTAAAAAGGGGTGTCCCGGTTCGTAAATCAGTGCCCATTGTACAAAGATATTGGGGAACTTTTCTCTTGAAATAACGGCAACATCACCGGGTTTAATGATATTGTCCAGTTTGCCCAGCACATACGCGTCAATGTCCAGGTAAACTCCGCCTTTTTTATAAAGAATGGCATACCTGAAAAAATCGGCCTTGGCTGCGCCAATATTGAGTTTGTCGTATACGTCAAGTACATCCTGTCCGTACGCTGTTAAAATAAATGTCCTGATCCGTGTATCGTCATAAAACTCATAGATGTAGTCTTTATTTCTTAACTTTAACCATTTAATGGCAAGCCTGTTAATAAAGGGTAGTTTGGTATTTTTGAAGGTTTGATAAACAACTTTGGGTATAGACATTGTGAAAAATTAAAAACCAAATGTAATATGTTTTACTGCTTTATTACAATGTAATGATGCCGATTTTTGAGCTTCGACAAACCAAAGCCATATTTTGAGCGTATATTGTATAAAAACTACGAGGATGAAAACCTGGATTGATAAAACATTTGTGCTTGCAGGGCTGTTGGTGTTGTTAAACCTGGCAGCCTGTGGCCAGCAGCCTAAAAAAGAGGATATAAAAAAAGCAACCAATACTATGGAATGGAATAAATTAACTAAGGAAGAAGAAGATGTGATTGTACGTAAGGGTACAGAATACCCGGGCACAGGGAAGTTGTTGAACAATAAGGAGAAAGGGACTTATGTTTGTAAGCGCTGTAATGCGCCGCTGTACCGTTCGGAATCTAAATTTGAATCGCATTGCGGATGGCCCAGTTTTGACGATGAAATTAAAGGTGCTGTAGAAAGAATTCCTGATGCTGATGGAATGCGAACTGAAATTGTATGTGCAAATTGTAAGGCACATTTGGGCCATGTTTTTTTAGGAGAAGGCTTTACCGCTAAGAACACCCGCAACTGTGTAAACTCTATCTCTATGAATTTTGTGCCTGATAAGAAATAATATTCCTTTTAAGGAATATCGTTGTATGCCCGGTGATAACTTATCGGGCATTTTTTGTTTTTAAGGATTTAGTTTACTTATGTTTGTCGGTTCACCAACTATAGTAAATATGAAGTATTGTTTATTGTTATGTGGTATGCTAATTTCTTTTATGGGTTTTACCCAGGATTTTTCAGACGGATCAGGCGCAGTGCCGGTATCTGACATCTCAGCAGCCACCACATCCAATCGCTCTTCTAAATTAATCTCAAAAACAGTTTACGCAACCTATTACGCAAGGAAATTTGAGGGCCGCAAAACAACAAGCGGAGCAAGGTACCGCAGAAGCAAAATGACGGCTGCACACATGACTTTGCCTTTTGGGACTATAGTAACGGTTACCAATCCTGAAAACGGCGAATCGGTAGACGTTGAAGTAAATGATCGGGGCCCGCATTCTCGGAAATTCAAAATAGATCTTTCTGAAGCTGCGGCAAAAGAACTTGGTATTTACGGAAAAGGGGTGGCAAAAGTTGAAATCAGTTATTTGCCCGACGAAGACTAAGCTGTTTAACTTTAATGTTGTATTAGTCAGTTTCTTGAATTTATTAACACATTCTTTTAAGGATCCTCATTTCTGAAAAGAAATAAATACCAAATTTCAGGCGTAATTACTGTGTCAATTTCTCCTTTTAGTGTTGATAAAAATGCCCGCTTGTTAACAACTATTGTTCTCTTATCAGGGGTCGGTACTTTATATTTGTTTACATAAAGTTCTTTAATAAATCACACATAGATTTTTAGTTAAAGTTTTAATATTTAGTTGTTTAAGGTTGCCGGAGAATTTCGTGTCTTTTTAAACTTTATAAACTGGGTACGGATAGTCTGGCTACTGGATTTATGGAGGCTTTAAGAATCAAAATATACATTTACCCTATTAAATAGATGCTTATGCAAGAAGAAGAAGTATTATTAAAAGAAAACAAAGACAGGTTTGTTCTTTTGCCGATTAAATATCCTGAAATCTGGGAAATGTATAAGAAGAGTGAGGCCAGTTTCTGGACTGCCGAAGAAATTGATCTTTCAGATGATCAGAAACACTGGGATAACCTGAATGATGGGGAAAGACATTTTATTTCTCATATTCTGGCATTCTTTTCGGCCAGTGACGGTATCGTAAATGAGAACCTTGCCGTAAACTTTATGAGTGAGGTGCAATTGCCGGAAGCACGTTGCTTTTATGGCTTCCAGATCATGATGGAAAATATCCATTCTGAAACTTATGCCTTGCTTATTGACACATATATTAAAGATCCTGATGAAAAGGACAGGCTGTTCCATGCCATTGAAACCGTTCCATGTGTAAAGAAAAAAGCAGAGTGGGCCCTGCGCTGGATTGATAATGGCTCTTTTGCAGAACGTTTGGTAGCTTTTGCTGCGGTAGAAGGAATTTTCTTTAGCGGTAGTTTTTGTTCTATCTTCTGGTTAAAGAAACGTGGTTTAATGCCGGGATTAACTTTCAGTAATGAACTGATCTCGAGAGACGAAGGTTCGCACTGCGAATTTGCCTGTTTATTGTATGGCATGCTGAAAAATAAATTAAGCCAGGAGCAGGTACATGGTATTATCCGTGATGCGGTTGAGATAGAAAAAGAATTTGTTACCGATGCATTGCCGGTTGCACTGATTGGTATGAATGCAAAGTTAATGTCGCAGTACATTGAGTTTGTGGCCGATAGATGGTTGCAGGAATTGGGCTATAGCAAAATATATAATGCCACCAACCCGTTTGATTTTATGGAAATGATCTCTTTACAGGGCAAAACTAACTTCTTTGAAAAAAGGGTTGGTGATTACCAGAAAAGCGGAGTGTTGACTTCAACAGAAGATAAAGCAGCAGCTTTCTCTTTAGATGATGACTTTTAGTACTTATTGGGGTTAGACAATAAGAAAATAGATAATAATTAATTCGGTGCCGATGCTGGTTTTTTTCGCTCTGAAATCCAATATGCACCATAAATACCTGAAAATATGTTTGTAATAAAAAGAGATGGCCGCAAGGAAGCGGTAAGATTTGACAAAATAACAGCTCGTATAGAGAAGTTATGCTATGGTTTTAATGCCGAACTTGTAGATCCGATCGATGTTGCCAAGAAGGTGATTGAGGGTTTGTATGATGGGGTTACTACCTCGGAACTGGATAATCTTGCCGCAGAAACAGCAGCTTCTTTAACTACAAAGCACCCTGATTATGCTTTGCTGGCCTCCCGCATAGCGGTATCTAACCTGCATAAAAATACCACAAAGTCTTTCTCCAAAACAATGGAGATGTTATATAATTACGTAGATTCCAAGACAGAAAAACCGGCATCTTTAATTGCAGATGATGTATGGGAGGTGATTGAGAAAAATGCGGATATTTTAGACAGCACCATTATCTATGACCGGGATTTTGGTTTTGATTACTTTGGCTTCAAAACTTTAGAAAAATCCTATTTACTGAAAGTTGACGGACAGATCGTTGAGCGCCCTCAGCATTTATTTATGCGTGTTGCTGTTGGTATTCATAAAGGAGATATTGATAGTGCCATCGAAACGTATAACCTGATGAGTGAGCGTTGGTTTACCCACGCTACCCCAACCTTGTTTAATGCAGCTACACCTAAACCTCAAATGTCATCCTGCTTTTTGCTAACCATGCAGGACGATAGCATTGAAGGTATTTATGATACGTTAAAACAAACAGCTAAAATTTCTCAGAGTGCCGGTGGTATTGGCCTGAGCATCCACAACATCAGAGCTACAGGTTCTTATATTGGTGGCACCAACGGAACCAGCAATGGTATTGTGCCCATGCTGAAAGTATTTAATGATACTGCACGTTATGTAGATCAGGGTGGTGGTAAGCGTAAAGGCGCCTTTGCCATTTATTTAGAGCCTTGGCATGCTGATGTACTCAGCTTTTTAGACCTGCGTAAAAACCATGGTAAAGAAGAACTGCGTGCGCGCGACCTGTTCTATGCCCTTTGGGTATGCGATTTGTTTATGAGACGTGTAGAAGAGAATGGCGACTGGAGCTTGTTCTGTCCGCATGAAGCACCAGGCCTGGCCGATTGTTTTGGAGAAGAGTTTGATGCCTTATACGAACGTTATGAACAGGAAGGACGTGCCCGTAAAACCATTAAGGCACAAGAGTTATGGTTCGCCATCCTGGATTCACAAATTGAAACCGGTACACCATATTTGTTGTATAAAGATGCGGCTAATAGTAAATCTAACCAGCAAAACCTGGGCACCATTAAAAGCTCCAACCTTTGTACCGAAATTATAGAATACACCTCTAAAGATGAAGTTGCGGTTTGTAACCTGGCTTCACTGGCCTTGCCAAGATTCGTGATCAATGGTGAGTTTGACCATCAGAAATTATACGATGTAACGTATCAGGCTACTGTAAACCTGAACAAGATCATCGATTACAATTATTATCCGGTAGAAGAAGCCAGAAACTCCAACATGCGCCACAGACCAGTTGGTTTAGGTGTGCAGGGATTGGCCGATGCATTTATCTTAATGCGTTTGCCTTTTGAAAGTGAAGGGGCCCGCATCTTAAATAAAGAGATCTTTGAAACGATCTATTTTGCTGCCATGACTGCTTCTCATGATCTTGCCGTTAAAAATGGCCCTTATGAAACCTTTAAAGGTTCTCCTTTATCGCAGGGTAAGTTCCAGTTTGACCTTTGGAAGGTACAGCCTGACAGCGGCAGATGGGATTGGGAAACTTTACGTGAAAAGGTAGTAAAAGACGGGGTATACAACTCTTTACTGGTTGCACCAATGCCTACAGCTTCTACTTCGCAGATTTTAGGTAACAACGAGTGCTTTGAACCATATACTTCTAACATTTATACCAGAAGGGTATTGAGCGGAGAGTTTATTGTGGTAAACAAGCACCTGCTGAAAGACCTGGTAGCTTTAGGCTTATGGACCCCGGCCATGAAAGACAGGATCATTTTAGCCAACGGCTCTATTCAGGACATTGCCGAGATTCCTGACTACATTAAAGAGTTATACAAAACAGTTTGGGAGATCAAAATGCGCAGCATTATTGATATGGCGGCCGACAGGGGTGCATATATCTGCCAGTCGCAATCGCTAAACTTGTTTATCAATGCTCCAAATACATCAAAACTAACTTCAATGCATTTTTACGCATGGAAGAAAGGGCTGAAAACAGGCATGTATTACCTGCGTACGCAGGCGGCTTCGCAAGCAGTTAAGTTTACTGTAGAGAACCAGGCAGGCAAGAACATGGAACCGGTAATTCCGGAACATATTGAACAAAGTGCCGAAGAGATCGTTGAAGGTCCGGTTTGTTCAATGGAAGAAGGCTGTATCAGCTGTTCAGGTTAATCGTTCATATTGAATATATATATCGCGAAGGAGTAAGGATTCATTCTTACTCCTTTTTTATTACCTGTCCATGAAAAAGTATATCAGATACTTCCTGTATCTTTGTACCGATGGCAAAACACGAGATCATACCTTGCGAACGTTGCAATACTCCTATAGAATGCAAGGCAAACTCTTATACCAAATGCCAGTGCAGCGTGGTTCAGCTGAACCTGAATGAGGTACAATACATCAGTGAGCTTTATGATGGCTGTTTGTGTGCAAAATGCTTGTTCGAATTGCAACAGGAATACCGTGAAGGTATTGCTTCCTGATACGCTACAGCTTGCATTCTTGATAACAGGGCCTCATTTTTGTTTTTTTTGGCTAACTTTGCATCAAATTATTTGTTGATAAAGTATGGCTAAAGTAAAGGTTGGAATGGTACAGATGAGCTGTACCGGCAATAAACAGGAAAATTTAGATAAAGCGATTGTAAAAATCCGGGAAGCTGCAGCAAAAGGCGCACAGATTGTGTGCTTGCAGGAACTTTTTACTTCATTGTACTTTTGTGATGTTGAAGATTATGCAAACTTTGATTTAGCAGAAGCAATTCCAGGCCCTTCAACAGATAGCTTACAGGTTGTAGCAAAGGAATTGGGGGTAGTGATCATAGCGTCGTTATTTGAAAAACGTACGGCAGGGTTATACCACAATACCACAGCTGTGCTGGATGCCGACGGGGCTTACCTGGGTAAATATCGTAAAATGCACATCCCTGACGATCCCGCCTTTTATGAGAAATTCTACTTTACACCCGGAGATCTGGGCTATAAGGTTTTTCAGACAAAATTTGCTAAAATAGGGATCCTGATCTGCTGGGACCAGTGGTATCCTGAGGCATCGCGTATTACTGCGTTGATGGGTGCAGAGATCATGTTTTATCCAACTGCTATCGGATGGGCTACAGATCAGGATGAGGAAACCAATAAAGACCAGTACAATGCCTGGCAAACCATTCAGCGCTCACATGCAGTTGCAAACGGAGTACCTGTTGTTAGTGTAAACCGGGTGGGTTTTGAACAAAATGGCGCCATGAAATTCTGGGGGGGGAGCTTTGCCGCAAATGCCCAGGGCAAAATACTTTATTTAGGTTCACACGACCAGGAAGAAACTGAAGTAGTGGAGCTGGACCTGACGGAGTCTGATTTTTTCCGTAAGCACTGGCCTTTTTTAAGAGACAGAAGGATAGATTCATATCAGCCAATTACCAAGAGGTTCATTGATGAGGACTAGTGTATTTATTATATTGACCAGGATATTGCTGTTCAGGACATCTGGATAACAACAGGCGCTTTGGAAAAAACTTTAGAACTACTAAAAAATAAAAATTGAAGGATATAAATTTTTCAGCTTCCCCTAAAAAGCAGGGCTATTCATTTCCGGCCGAATGGGTAAAACATGAAGCAACGTGGTTAAGCTGGCCACATAAGGAAGCTTCATGGCCGGGTAAAATTGAAACGATTTATGCACCTTACTGCCAGTTTATAAAGATTGTTGCGACAGCTGAAAAAGTGCGCATTAATGTAAAAGATGAAGCCATGAAAGCAGAGGCTGCCCGTCATCTGCAGGAAGCCGGTGCAGATTTGACACAGATTGAATTCTATTTTAATGAAAGTAATGATGCATGGTGCAGGGATCATGGTCCGGCCTTTGTATTAAATGGCCGTGAAAAGGCGGTGGTAGACTGGCGCTATAATGCCTGGGGTAATAAATACCCTCCTTATGACCTGGATGATGTAATACCAACTAAAATTGCCCAACATTTTGACCTGCCCTTATATACACCAGATATTGTAATGGAGGGGGGCTCGGTAGAATTTAACGGTGCAGGTACCATCCTGACCACTACGGCATGCCTGCTGAATGAAAACAGGAACCCAGAGCTGAGCAGGGAACAGATTGAACAATACCTGCTGGAATTTTATGGTGCAGAGCAGGTATTATGGCTGGGCGATGGAATTGTAGGCGACGATACGGATGGCCATATAGACGACATTACCCGGTTTGTAAACGAAGATACTGTTTTAACGGTGGTAGAAAGTAACCCCCTTGATGAAAACTATCTTTTGCTCCAGGAAAACCTGGAAGCTTTAAAGGCCATGCGCTTACTGAACGGTAAGCCGTTGAACATTGTCCAGCTGCCAATGCCCTCACCTGTAATCCATGAGGATACCCGTTTACCTGCATCGTATGCCAACTTTTACATTGCCAATGCTGCAGTAATTGTTCCTACCTTCAGGGATGTAAATGATGAAAAAGCATTGAAAATTATTCAGGATGTATTTCCTGACCGGAAGGTCATAGGGATAGATTCAACAGATATCATCTGGGGGCTGGGCAGCTTTCACTGTTTAAGTCAGCAGGAACCAGCAATTTAACCATACGAACAGCTAAAATATAACCAAACATAAAAATACAGATGAAGTTATTAGAAGGAAAAACAGCACTTGTAACAGGTGCATCTAAAGGAATTGGCCGCAAAATAGCCGAGAAATTTGCAGAACAGGGTGCCAATGTGGCTTTTACCTATTTGTCGTCAGTTGAAAAAGGACAGGCTTTAGAGCAGGAACTGCAAAGCTTTGGTACTAAAGTTAAAGGCTACCGTTCTGATGCTTCAAAATTTGATGAAGCCGAAAAACTTATTACAGATATTGTTGCTGATTTTGGTGCCCTGGATATTGTGGTCAACAATGCAGGGATCACTAAAGATGGCTTATTGATGCGCATGAGCGAAGAGAACTGGGATGAGGTGATCAATGTGAACCTTAAATCGGTATTTAACGTGTCTAAGGCCGCGTCTAAGGTCATGATGAAGGCACGCAAAGGCTCTATCATCAATATGAGTTCTGTTGTTGGTGTACAGGGGAATGCCGGCCAGGCTAATTATGCAGCGTCAAAAGCCGGTATTATCGGATTTTCGAAGTCGCTGGCCAAAGAGCTAGGCTCGCGTAATATCCGTACCAATGTAATTGCCCCAGGTTTTATCCGCACAGAAATGACAGATGTACTGGATCCGAAAGTCGTGCAGGGCTGGGAAGAAGGTATTCCATTAAAAAGGGCTGGAGAGACAGAGGATGTAGCTAACGCCTGTGTGTTCCTTGCTTCGGATATGAGTGCATACATTACCGGGCAGGTATTGTCTGTTTGCGGCGGAATGTTGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_013061|795728:804592|797928_798903_+|WP_012780858.1|DBSCAN-SWA MQEEEVLLKENKDRFVLLPIKYPEIWEMYKKSEASFWTAEEIDLSDDQKHWDNLNDGERHFISHILAFFSASDGIVNENLAVNFMSEVQLPEARCFYGFQIMMENIHSETYALLIDTYIKDPDEKDRLFHAIETVPCVKKKAEWALRWIDNGSFAERLVAFAAVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGSHCEFACLLYGMLKNKLSQEQVHGIIRDAVEIEKEFVTDALPVALIGMNAKLMSQYIEFVADRWLQELGYSKIYNATNPFDFMEMISLQGKTNFFEKRVGDYQKSGVLTSTEDKAAAFSLDDDF >NC_013061|795728:804592|799008_801387_+|WP_012780859.1|DBSCAN-SWA MFVIKRDGRKEAVRFDKITARIEKLCYGFNAELVDPIDVAKKVIEGLYDGVTTSELDNLAAETAASLTTKHPDYALLASRIAVSNLHKNTTKSFSKTMEMLYNYVDSKTEKPASLIADDVWEVIEKNADILDSTIIYDRDFGFDYFGFKTLEKSYLLKVDGQIVERPQHLFMRVAVGIHKGDIDSAIETYNLMSERWFTHATPTLFNAATPKPQMSSCFLLTMQDDSIEGIYDTLKQTAKISQSAGGIGLSIHNIRATGSYIGGTNGTSNGIVPMLKVFNDTARYVDQGGGKRKGAFAIYLEPWHADVLSFLDLRKNHGKEELRARDLFYALWVCDLFMRRVEENGDWSLFCPHEAPGLADCFGEEFDALYERYEQEGRARKTIKAQELWFAILDSQIETGTPYLLYKDAANSKSNQQNLGTIKSSNLCTEIIEYTSKDEVAVCNLASLALPRFVINGEFDHQKLYDVTYQATVNLNKIIDYNYYPVEEARNSNMRHRPVGLGVQGLADAFILMRLPFESEGARILNKEIFETIYFAAMTASHDLAVKNGPYETFKGSPLSQGKFQFDLWKVQPDSGRWDWETLREKVVKDGVYNSLLVAPMPTASTSQILGNNECFEPYTSNIYTRRVLSGEFIVVNKHLLKDLVALGLWTPAMKDRIILANGSIQDIAEIPDYIKELYKTVWEIKMRSIIDMAADRGAYICQSQSLNLFINAPNTSKLTSMHFYAWKKGLKTGMYYLRTQAASQAVKFTVENQAGKNMEPVIPEHIEQSAEEIVEGPVCSMEEGCISCSG >NC_013061|795728:804592|796518_796998_+|WP_012780856.1|DBSCAN-SWA MKTWIDKTFVLAGLLVLLNLAACGQQPKKEDIKKATNTMEWNKLTKEEEDVIVRKGTEYPGTGKLLNNKEKGTYVCKRCNAPLYRSESKFESHCGWPSFDDEIKGAVERIPDADGMRTEIVCANCKAHLGHVFLGEGFTAKNTRNCVNSISMNFVPDKK >NC_013061|795728:804592|801497_801701_+|WP_012780860.1|DBSCAN-SWA MAKHEIIPCERCNTPIECKANSYTKCQCSVVQLNLNEVQYISELYDGCLCAKCLFELQQEYREGIAS >NC_013061|795728:804592|802766_803807_+|WP_183874120.1|DBSCAN-SWA MNFSASPKKQGYSFPAEWVKHEATWLSWPHKEASWPGKIETIYAPYCQFIKIVATAEKVRINVKDEAMKAEAARHLQEAGADLTQIEFYFNESNDAWCRDHGPAFVLNGREKAVVDWRYNAWGNKYPPYDLDDVIPTKIAQHFDLPLYTPDIVMEGGSVEFNGAGTILTTTACLLNENRNPELSREQIEQYLLEFYGAEQVLWLGDGIVGDDTDGHIDDITRFVNEDTVLTVVESNPLDENYLLLQENLEALKAMRLLNGKPLNIVQLPMPSPVIHEDTRLPASYANFYIANAAVIVPTFRDVNDEKALKIIQDVFPDRKVIGIDSTDIIWGLGSFHCLSQQEPAI >NC_013061|795728:804592|801786_802662_+|WP_012780861.1|DBSCAN-SWA MAKVKVGMVQMSCTGNKQENLDKAIVKIREAAAKGAQIVCLQELFTSLYFCDVEDYANFDLAEAIPGPSTDSLQVVAKELGVVIIASLFEKRTAGLYHNTTAVLDADGAYLGKYRKMHIPDDPAFYEKFYFTPGDLGYKVFQTKFAKIGILICWDQWYPEASRITALMGAEIMFYPTAIGWATDQDEETNKDQYNAWQTIQRSHAVANGVPVVSVNRVGFEQNGAMKFWGGSFAANAQGKILYLGSHDQEETEVVELDLTESDFFRKHWPFLRDRRIDSYQPITKRFIDED >NC_013061|795728:804592|797107_797542_+|WP_143715684.1|DBSCAN-SWA MKYCLLLCGMLISFMGFTQDFSDGSGAVPVSDISAATTSNRSSKLISKTVYATYYARKFEGRKTTSGARYRRSKMTAAHMTLPFGTIVTVTNPENGESVDVEVNDRGPHSRKFKIDLSEAAAKELGIYGKGVAKVEISYLPDED >NC_013061|795728:804592|803848_804592_+|WP_012780863.1|DBSCAN-SWA MKLLEGKTALVTGASKGIGRKIAEKFAEQGANVAFTYLSSVEKGQALEQELQSFGTKVKGYRSDASKFDEAEKLITDIVADFGALDIVVNNAGITKDGLLMRMSEENWDEVINVNLKSVFNVSKAASKVMMKARKGSIINMSSVVGVQGNAGQANYAASKAGIIGFSKSLAKELGSRNIRTNVIAPGFIRTEMTDVLDPKVVQGWEEGIPLKRAGETEDVANACVFLASDMSAYITGQVLSVCGGML >NC_013061|795728:804592|795728_796394_-|WP_012780855.1|DBSCAN-SWA MSIPKVVYQTFKNTKLPFINRLAIKWLKLRNKDYIYEFYDDTRIRTFILTAYGQDVLDVYDKLNIGAAKADFFRYAILYKKGGVYLDIDAYVLGKLDNIIKPGDVAVISREKFPNIFVQWALIYEPGHPFLKRTLDIVIQNIQQNAYPNSVHWMTGPTAYSKAILECITEDPEIKYRIFGQDYQKAIKPRLPFSKLLYKGSQHWKKMEQVTMVLKAKSSDE |
9 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1841787 : 1849375
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013061|1841787:1849375|DBSCAN-SWA CTTAAGTGATTTGCCAGTTAATGGGGCTTTGCCCCTGTTCAATAAGTTTAGCATTGGCCCTGGAAAAAGGTTTGCTATCTAAAAAACCGTTATAGGCCGAGAAGGGCGAGGGGTGTGCTGCGGCAATGATGGTATGTTTTTTCTGATCAATCAATACAGCTTTATTTTGTGCATATCTGCCCCATAAAAGGAAAACCAGGCCTGTCCTTTTTTCAGACAACTCACTGATGATCTTATCAGTAAAAATTTCCCAGCCCTTTCCCTGGTGTGAACCTGCTTCATGGGCCCTTACAGTTAAAGTTGCGTTTAAGAGTAAAACACCTTCATCAGCCCATTGGGTTAGGTTACCGTGATTGGGAATGCTGAAACCAGGAATATCGGCAGACAGTTCCTTATAAATATTTTTCAGGGAGGGGGGGACGGTAATCCCTTTCTGCACAGAAAAAGACAAACCATGGGCCTGGCCGGTCCCATGATAGGGATCTTGACCCAGAATAACTACTTTTACCTTATCAAAAGGGGTGTGGTTAAGGGCATTAAATATATCAGCACCCTTAGGGTATACCTTATATCCCTTTTGTTTTTCTTCCAGTAAAAAAGCTTTAAGCGATTTCATATAGGGTTTTTCGAACTCATCTTTAAGTACTTTTAACCAGCTTTCTTCTATTGCTACAGACATCTGTTTTTTGAGGTTTATACAAAACCAGCCTTTACTTTTTTTGTGCTGGCCATGAATTGAACTGTCGATTCTTTTTTTGTTGAAATTATAAATTAAATCTAATTTTTGGTATTTAAACACGATATTTGCAAAAAAAATATAATAGAATATGCCAAATGTAGTTCGTCTTATTTTAAGTTTTGCAGTGCTGGGAGGTTCGATAACCCTTATGGTCTTTGGTTTCTGGGGATGGGGGATTTTGGCCCTTTTTATAAGTATACTGATTATCGTTACCTATTTCTTTAACGAGAATATGTTATTGGCCCAATGGTTCTTAAGAAAGGACAACATGGCCAAAGCAGAGGTTTACCTGAAAAAGATCACCAATTATGAAAAACAGCTGATCAGGGTGCAACATGGTTATTATAACCTGTTGGTAGGTTTAATTGAATCAAGAAAGGCGCCTATGCAGTCAGAAAAATATTTTAAAAAATCACTTTCTTTAGGAATGCACATGGATCATAATATTGCCCTGGCCAAATTGAGCCTTGCAGGAATAGCCATGGCCAAACGGAACAAACGCGAAGCGCAAATGTATCTGACTGAAGCAAAGAAAGCAGATAAGAACAAATTGCTGGCCGATCAGATCAAACAAATGAAAGACCAACTGGGAATGCTGGATAAACAACAGCAGGTAAGATACAGATAAGCCAAAGCCACATGAAAATGTGGCTTTTTTATTTTTCGCTTAACCTGTCGAAATTTTCGTGTGCTTCTGCGTATGAAGTCCTGCTGATGATGTCATCTTCCAAGTAATCTTTGCTTTTGCTGAAGAACAATTGTTCCGACTGTATTCTGGTGATGAGCTGACGGATGAGTGTCAGGTCAAAGGCTTCTTTGCTCAGTTTTATACAGTATTCTTTTTCGGTAATTTCCAGACTTGAACTGTTCATAATCATTGTCATTTAAATATGTATAAAAATAAAAAAGGCCTGCCACAATTTTTGTAGCAGGCCTTTAAGCTTTTGTTACCTTTATGTTAAGCAAACCAGGCTGTAACCTCTTCTTTTGAAGGCATGGCCAGCTCCAATTTAAGTTTTTTACGCATACCCCCCAGATCGTTAAAAACCTTATTTGGATTTGCTGCTTTTAATTCCTCTATGGTGTTGATGCCCATTTTGCGGACTGCCTGTACCCATTCAGCAGGTACACCGGCATTTACAAAATCCTCATCAGTTGTTATTTTGACTTTCTTTTCCGGCCTCATCTGCGGAAAAAACAATACTTCCTGTATGGTCGATTGATCGGTCATCAGCATTACCAGACGATCTATACCAATACCCAGACCCGATGTAGGTGGCATGCCATATTCCAGGGCACGGATAAAATCATCGTCCATCGCCATCGCCTCATCATCACCTCTTGCAGCAAGTTTTAACTGGTCTTCAAAGCGTTCCCGCTGATCAATAGGGTCATTCAGCTCAGAGTAAGCATTGGCAATTTCTTTACCCATCACAAATAATTCAAAACGTTCTACCAGTCCTTCCTTGCTTCTGTGTTTTTTAGCCAGAGGTGTCATTTCCAACGGATAATCGGTAATGTAAGTCGGCTGGATCAGGTTCGCCTCTACTTTTTCGCTGAACAGTTCATCAATCAGCTTGCCCCTGCCCATAGAATTATCAATTTCTATGCCCAGGCTTTTGCAAACCGTTTTGATCTCTTCTTCTGTCATAACTGAAACATCTATACCTGTATATTTCTGGATAGACTCGTACATGGTCAGTTTTTCGTATGGGCCTTCAAAGTTGATCTCATAATCCCCAACTTTTACTACAGGTTTTCCATGGATCGCCAGAGCTACTTTCTCCAGGCATTCTTCTACCATGGCCATCATCCAGATGTAGTCTTTATAAGCTACATAAATCTCCATAGAGGTAAATTCAGGATTATGGGTACGGTCCATCCCTTCGTTTCTGAACATTTTACCAAACTCATAAACGCCGTCAAAACCTGCTACAATCAGTCTTTTCAGGTAAAGTTCATTGGCAATACGCAGGTACAATGGCATATCCAGCGTATTGTGGTGTGTAGCAAATGGACGGGCTGCAGCACCACCATGAATGGGTTGCAGAATAGGTGTTTCCACTTCCATCCAGCCCTGATTATCAAAATATCCACGCATGGTATTGATCACCTTGGAACGGTTGATAAAAATCTGTTTAAAGCCCGGATTTACCGTAAGGTCTACATAACGCTGCCTGTAACGCATTTCAGGATCAGTAAAACCATCATAAATATTTCCTTCCTCGTCACGTTTAACAATAGGCAATGGTTTTAAAGACTTGGAAAGCAAAGTAAGTGCTGTTACATGAACAGAGATCTCACCCGTTTGTGTGGTAAAAACATAACCTTTTATACCAATAAAATCACCAAGGTCCAGCAATTTCTTAAATACGGTATTGTATAAAGTTTTGTCTTCATCCGGACACAGGTCATCTCTTTTCAGATAAACCTGTATTCTTCCGGTTGAGTCCTGTAATTCCACAAAAGAAGCACTTCCCATAATTCTGCGGCTCATGATGCGGCCCGCCATGCTGATGTTCTTATAAGCAGTTTTATCCCGTTCGTAATTCGCTAAAATATCTGCTGCATGGGCATTGATCTCAAATGCTTCGGCAGGATAGGGATTGATACCCAGTTCACGTAATTGTGTTAGCGAATTACGGCGCAATACTTCTAATTCTGATAGTCCTGTACTCATATATTTTTGGTATCCGGCAGCTAAACCGGATAGCTTATTGATGTATTAATTTAATAATTAGGCAAAAATAGGGATTTACCTTAGTTCTTTTATGACTATAGGTATTAAAAATGCAATTAGTTTGTATGGTTTAATCTGTATCAACAGCCTCCGCATACATCTCATTGATGGTTTCTGCATATTTTGCTTCAATAACCCTCCGCTTAGCCTTTAAAGTTGGCGTAATTTCGCCTTCTTCAATGCTGAAAGGATTACGTTTTACCTTAAAATTTTTGATGCGCTCAAATTTGGCCAGTTCATTAGACAGCTTCTTCAGGTCCTGACCAATCCAGTCTGTAATTTCCTTTTCAGCGATAAATATTTCTGGTTTTTCAAAGAAAGATTCCGGCAGATTAAAGTTTTCCTGCAGGTTCTCCTTGTTTGGGATCACTATGGCAGTAAGGTATTCACGTTTATCGCCAATCAGAAAAATCTGGTCTATTTTAAGGCTTTTCAGATAAATGTTTTCTACTGGTGTAGGATAAACATTTTTACCGTAGGCATTTACGATCATATTTTTAAGACGATCGGTGATTTGCAGGTTACCCCGGTAAAAGCGGCCAATATCACCCGTATGGAACCAGTTGTCCTTATCTATCACCTCCGCAGTTTCGGCAGGTTTGTTAAAATAACCTTGCATCACACAATGGCCCCTTACAATGATTTCTCCCTCAGCACATTCAAAGTCTTCCATAAAGGTGTCATGGGTCTGTATACTGATCATTTGTCTGGTTTCTATATCCTGTATGCCCACCTCAATGCCAGGTATAATCCGGCCTACAGTCCCATAAACCTGTCTGTGGTATTCAGTAACAGCCATTACGGGCGAAGTTTCGGTCAGGCCAAAGCCTTCCAGTATTTTAATACCCAGGTTTCCAAAAAATTCACCCACATTCTTTGGTAAAGCAGCGCCACCCGAGATCATGAATTTTAACCTTCCCCCTGTTTTTTCTTTGATCTTGCTGAATACCAGTTTTTCGGCAAGGGTCTTTTTTGCACGCATCACCATTCCGGGTGTTTTACCTGCTTCTTTGATCTTTCGGTAATCCTGACCAACTTCCAGTGCCCAAAGAAATATTTTAGACTTTAATCCCCCGCCCGCAGTGCCACTCTTAAGGGCTTTGTCGTGGATTTTTTCCAACAGCCTGGGTACACAGCTCATTACAGTGGGCTTAATTTCAGCCATGTTTTTGGCCAGTAGTTCCAGGCTCTGTGCATAAGCGATCCTGCAACCCTGTGCACAGCAAACATGATAGGTTGCGGTCCGTTCAAAAACATGCGAAAGGGGCAGGAAAGAAAGGAATGTTTCCGTTTCGTCTATCACCGGGATTTGCTGTAAACATACTTTTACATTCTCTACAAAATTACTATGTGAAAGCATAACACCCTTAGGCGTACCGGTAGTACCCGAGGTATAAATGAGCGATGAAATATCAGCTGGTAGTATGGTGTTACGAATCCTGCCGATTTCCGTCAGCCGGGCAGGTTTTAGCTTTCCTGTTTCAGCCAGAACCTCATCAAAGGGAATGATCTGCACCTTCAGCTCTTCAGGGATGCTAACTTTCTGATATTCGGTAAAAGCAGGGACAATGTATTCCAGGTTGCGGCAGTTGGCCGCTATCTTTAATATTTTTTTATATAGAAAGGTGTTGCCGATCAGAATGGCCCGCATGCCCGAATCGTTCACAATATATGCTACTTCCTGCTCAGATAGGGTAGGATAAATAGATACATTGATGGCGCCAATTTGCTGTATGCCCTGGTCATAGTATACGTATTCGGGTGAGTTTTCTATCATCAGTCCCATCCTGTCACCTTTAACAATGCCTTTCTCCATAAAAAAAGCAGCTACGGCATCTGCACAATTAAGTGTATGCCCATAAGATACCTCTTCCCAAACCCCATTCCTTTTGTGGATCAGAAAGGTCTCTTCCGGGTTATGGATATTGGCGACAACATTACGCAATAAATTGGGTATGGTAGAATGCTCGTTAAATAGTTCCATGACATGTTGGTTATCTATAAAAATAGGCCGGTACAGATGTAACTGTACCGGCCTATGCAAATATAACAATTGTATTTAAACAGAAAAACTCTCGCCACAACCGCATGAGCGGCTTGCATTCGGGTTATTGAAATTAAAACCCTTCCCATTTAAACCATCAGAAAAATCGAGTTCAGTCCCTGCCAGGTAAAGGAAGGACTTCATGTCTAGTGCTATCCTGATTCCCTTATCTTCAAAAAACTGATCTCCTGCTTTCTCTTCATCGTCAAAGTCCAGGTTGTATGATAATCCTGAACATCCTCCCCCTTTAACAGATACCCGCAAAAAATAGGTCGTATCCATCTGCGACTCTTCCATTAACTGGTCGATTTTGCTTTTTGCTTTTTCAGTGATTGTGATCATTTTATATTAATATTTTGATTTCACAATGGTATAGCTCAAAAGATGTACCAGATTAAAATCGGTCAAATATTGATTAATGATGAGATTTGGCCAGTTCAAATGGCTCCATACCATTTTTAACACGGTAATCATTGATTGCCGATTTGATAGCATCTTCTGCCAAAACCGAGCAATGTATTTTTACCGGTGGTAAAGCCAGCTCTTCAACAATGTCCATATTGTCTATTGTTAAAGCCTCATCAATGCTTTTACCTTTTAACCATTCAGTCGCCAGAGAAGAAGAAGCGATCGCAGAACCACAGCCAAATGTTTTGAATTTAGCATCTGTAATTACATTGTTTTCATCCACTTCAATCTGTAAACGCATCACATCGCCACACTCAGGTGCACCAACAAGGCCCGTACCAACTGATTTACTATCTTTATTTAAAGTACCAACGTTTCTGGGGTTGGTATAATGTTCTATAACTTTTTCTGAATATGCCATCTTTACTTGTTTTTGATTTTAAAAATTAATGTTCTGCCCACTCAATTTTACTTAAATCCACACCATCTTTAAACATTTCCCAAAGCGGAGAAAGGTCCCTTAAGTGGTTTACTGCTTTTTTAGTATTTTCTATTGCATAATCCACTTCTTCTTCAGTCGTAAAACGGCCCAATCCATAACGGATAGAAGAGTGTGCCAGATCGTCAGACAAGCCCAGGCTCTTTAATACGTAAGAAGGCTCCAGGGAAGCAGATGTACAGGCTGAGCCTGATGATACAGCTAAATCTTTCATGGCCATCATTAAACCTTCACCTTCTACATATTTAAAAGAGATGTTGGCTACATGAGGTAAGCGGTGTTCCGTATTTCCGTTTACATAACTTTCTTCCAGCTCAGTAAGTGCATTTTCCAGTTTGTCCCTTAAGGCCGATAAACGTTTGGCTTCCTCATCCATTTCCAAACGGCACAGTTCACAGGCTTTACCCAAACCAACAATGCCAGGTACATTTAAGGTGCCGGAACGCATGCCGCGCTCATGGCCGCCACCGTCCATTTGTGCAGTTACTTTAACCCTTGGATTTTTACGGCGTACATACAATACCCCAACACCCTTAGGTCCGTACATTTTATGAGCAGAAAAAGCCATCAGGTCAATCCCGTCAGCATTTACATCTACAGGGATTTTGCCTACAGCCTGTGTAGCATCGGTCATAAACAACGCGCCAAATTTATGGGCAATGGCAGAAATTTCTTTAATTGGCTGGATTACACCGATCTCATTGTTTCCATACATAATGGTAACCAGGATTGTTTGCTCCGTCATTGCAGCTTCAAGCTCCTGAAGGTCAATTAATCCGTCCTCTTTCACTTTTAGATAGGTAACCTTCGCACCCAGTTTTTCCAGGTGTTTACAAGTATCCAACACAGCTTTATGTTCTGTAGTAGCTGTAATGATATGGTTACCCTTTTCCTGGTACATTTCAAATACGCCTTTAATGCCCAGATTGTCAGCCTCCGTAGCTCCTGAAGTGAAAATAATCTCTTTTTCAGTGCAACCAATCAGTTTGGCAACTTGTTCACGTGCGTAATCAACACCTTCTTCGGCAACCCATCCAAATGCATGGTTACGGCTTGCAGCATTGCCAAATTTATTGGTGAAATAGGGCAGCATTGCTTCCAATACCCTCGGATCAAGAGGAGTAGTTGCGTTATTATCTAAGTAAATAGGAAGTTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013061|1841787:1849375|1842613_1843153_+|WP_015807385.1|DBSCAN-SWA MPNVVRLILSFAVLGGSITLMVFGFWGWGILALFISILIIVTYFFNENMLLAQWFLRKDNMAKAEVYLKKITNYEKQLIRVQHGYYNLLVGLIESRKAPMQSEKYFKKSLSLGMHMDHNIALAKLSLAGIAMAKRNKREAQMYLTEAKKADKNKLLADQIKQMKDQLGMLDKQQQVRYR >NC_013061|1841787:1849375|1841787_1842465_-|WP_015807384.1|DBSCAN-SWA MSVAIEESWLKVLKDEFEKPYMKSLKAFLLEEKQKGYKVYPKGADIFNALNHTPFDKVKVVILGQDPYHGTGQAHGLSFSVQKGITVPPSLKNIYKELSADIPGFSIPNHGNLTQWADEGVLLLNATLTVRAHEAGSHQGKGWEIFTDKIISELSEKRTGLVFLLWGRYAQNKAVLIDQKKHTIIAAAHPSPFSAYNGFLDSKPFSRANAKLIEQGQSPINWQIT >NC_013061|1841787:1849375|1843483_1845205_-|WP_015807387.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSTGLSELEVLRRNSLTQLRELGINPYPAEAFEINAHAADILANYERDKTAYKNISMAGRIMSRRIMGSASFVELQDSTGRIQVYLKRDDLCPDEDKTLYNTVFKKLLDLGDFIGIKGYVFTTQTGEISVHVTALTLLSKSLKPLPIVKRDEEGNIYDGFTDPEMRYRQRYVDLTVNPGFKQIFINRSKVINTMRGYFDNQGWMEVETPILQPIHGGAAARPFATHHNTLDMPLYLRIANELYLKRLIVAGFDGVYEFGKMFRNEGMDRTHNPEFTSMEIYVAYKDYIWMMAMVEECLEKVALAIHGKPVVKVGDYEINFEGPYEKLTMYESIQKYTGIDVSVMTEEEIKTVCKSLGIEIDNSMGRGKLIDELFSEKVEANLIQPTYITDYPLEMTPLAKKHRSKEGLVERFELFVMGKEIANAYSELNDPIDQRERFEDQLKLAARGDDEAMAMDDDFIRALEYGMPPTSGLGIGIDRLVMLMTDQSTIQEVLFFPQMRPEKKVKITTDEDFVNAGVPAEWVQAVRKMGINTIEELKAANPNKVFNDLGGMRKKLKLELAMPSKEEVTAWFA >NC_013061|1841787:1849375|1847724_1848138_-|WP_015807390.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIEHYTNPRNVGTLNKDSKSVGTGLVGAPECGDVMRLQIEVDENNVITDAKFKTFGCGSAIASSSLATEWLKGKSIDEALTIDNMDIVEELALPPVKIHCSVLAEDAIKSAINDYRVKNGMEPFELAKSHH >NC_013061|1841787:1849375|1847324_1847651_-|WP_015807389.1|DBSCAN-SWA MITITEKAKSKIDQLMEESQMDTTYFLRVSVKGGGCSGLSYNLDFDDEEKAGDQFFEDKGIRIALDMKSFLYLAGTELDFSDGLNGKGFNFNNPNASRSCGCGESFSV >NC_013061|1841787:1849375|1845335_1847249_-|WP_015807388.1|DBSCAN-SWA MELFNEHSTIPNLLRNVVANIHNPEETFLIHKRNGVWEEVSYGHTLNCADAVAAFFMEKGIVKGDRMGLMIENSPEYVYYDQGIQQIGAINVSIYPTLSEQEVAYIVNDSGMRAILIGNTFLYKKILKIAANCRNLEYIVPAFTEYQKVSIPEELKVQIIPFDEVLAETGKLKPARLTEIGRIRNTILPADISSLIYTSGTTGTPKGVMLSHSNFVENVKVCLQQIPVIDETETFLSFLPLSHVFERTATYHVCCAQGCRIAYAQSLELLAKNMAEIKPTVMSCVPRLLEKIHDKALKSGTAGGGLKSKIFLWALEVGQDYRKIKEAGKTPGMVMRAKKTLAEKLVFSKIKEKTGGRLKFMISGGAALPKNVGEFFGNLGIKILEGFGLTETSPVMAVTEYHRQVYGTVGRIIPGIEVGIQDIETRQMISIQTHDTFMEDFECAEGEIIVRGHCVMQGYFNKPAETAEVIDKDNWFHTGDIGRFYRGNLQITDRLKNMIVNAYGKNVYPTPVENIYLKSLKIDQIFLIGDKREYLTAIVIPNKENLQENFNLPESFFEKPEIFIAEKEITDWIGQDLKKLSNELAKFERIKNFKVKRNPFSIEEGEITPTLKAKRRVIEAKYAETINEMYAEAVDTD >NC_013061|1841787:1849375|1848163_1849375_-|WP_015807391.1|DBSCAN-SWA MELPIYLDNNATTPLDPRVLEAMLPYFTNKFGNAASRNHAFGWVAEEGVDYAREQVAKLIGCTEKEIIFTSGATEADNLGIKGVFEMYQEKGNHIITATTEHKAVLDTCKHLEKLGAKVTYLKVKEDGLIDLQELEAAMTEQTILVTIMYGNNEIGVIQPIKEISAIAHKFGALFMTDATQAVGKIPVDVNADGIDLMAFSAHKMYGPKGVGVLYVRRKNPRVKVTAQMDGGGHERGMRSGTLNVPGIVGLGKACELCRLEMDEEAKRLSALRDKLENALTELEESYVNGNTEHRLPHVANISFKYVEGEGLMMAMKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLKSLGLSDDLAHSSIRYGLGRFTTEEEVDYAIENTKKAVNHLRDLSPLWEMFKDGVDLSKIEWAEH >NC_013061|1841787:1849375|1843181_1843397_-|WP_036674318.1|DBSCAN-SWA MNSSSLEITEKEYCIKLSKEAFDLTLIRQLITRIQSEQLFFSKSKDYLEDDIISRTSYAEAHENFDRLSEK |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
2050538 : 2069705
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_013061|2050538:2069705|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_013061|2050538:2069705|2060448_2061162_+|WP_015807576.1|DBSCAN-SWA MLENLPIYIPIIFGLTTVLALLFFFWAIQKSNLQSVRQNSTKILIGLILWLAIQVVLTLQNVYSANIDFFPPTILLTEILPALFTIIGLFSTQRGLRFIDSLPLINLTYLNIVRVPVELVLFWLFLNKAVPELMTFEGRNFDILAGISAPIIAYFGLTKGKISREVILLWNFICLLLLINIVINAFLSAPSPIQKFAFEQPNIAILHFPFSWLPTFIVPIVLFGHLTSIRQLWKHKN >NC_013061|2050538:2069705|2063078_2063456_+|WP_015807582.1|DBSCAN-SWA MKTYTLIFALSIISSIAFSQVKGKGRSGGGAAAASYAATGKAIVPSDTAKTIISKQTQGTTFGEKVNQGLHAAGSAVASGAAKTENPLYQGNAGSQNNPLHKSEAKVASPGNPIGGIIVKGGKNK >NC_013061|2050538:2069705|2066151_2066394_+|WP_015807588.1|DBSCAN-SWA MKRNAYLIILLVAATFTSCKKDKIEYANEFEKSYKVWTNFKAASGNSYAYTVSTSTWIGNIKFNFILGVEQFYNTCLILT >NC_013061|2050538:2069705|2050538_2051495_-|WP_015807561.1|transposase|DBSCAN-SWA 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25 | Bacillus_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 2059940:2059953|attR 2069773:2069786 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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