Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_013203 | Atopobium parvulum DSM 20469, complete sequence | 0 crisprs | cas3,WYL,DEDDh,csa3,DinG | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NC_013203
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
634906 : 692720
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_013203|634906:692720|DBSCAN-SWA CTTAGCTTTGTTTTAACATTTCGAGCATTTGTTGCTCACTTATAATTTTGATGCCAGTTCGGTCGGCATACTTCCTAGCTGTTTTAATTTTTGTGGTTTCGTCTCCAGAGCAATCAATCAAATAATTAGTTTTGAGAGTTACTCTTTCGCTCAAGGTTGCCCCATTTGTAATTAGCATTTTTAGAAAATCGCTTTTAGGCATACAGCACGGAACACCTGTCAAGCAAAAGACGGTTCCAGAAAGCTTTGTGCTTTCAGTGTTTTTATCGGTGTATTTCTCAATACATTTTACGTTTTCCGTTGTTGCTATAGAAATTTCTCTCATCTTTTCGTAGATGCCATAAGTCATATAACAGTCCGCGAGAGCCCTGTGAGCTTTGCCATGTTGTTTAACGTTAAGTCTTTTGGCAATATTTATCAGTTTGTATGGTGGCTCTAAGATTTGTCTAGCCAATTTGTATGTGTCATACCAAACATAATCGCATAAAAAGTCGCGTCTAAAGAAATTCTCCTCGAGAACAATCGCGTCATATCTAAGAGAGTTATGACCGATTAGAGGAAATCCTTTAACGAACGTATCAAATTGCGGGATAACTTTATCGAGCGTTGGCGCATTCTTTACCATGTGATTAGTTATATGGTTGATTGCAGTTGCGCCAGATGGTATCTCTCTTGGAGGATGAATGAGCGAACTAAATTCTTCTGTAATTTTTCCGTCTACTACTTTAAGAGCGGCAATTTCAATGATTTCGCAGTAATGGACGTCTAGCCCTGTTGTTTCAAGATCTACTACTACATATGATTCAGGATATTTTGAGACATCAAAATCTGCCCAGCGCGTTCTTTTTAAAGGAACATTACTTGGTTTAGTTTTAACTTTTGGTGCTTGAGGGGATACAGGCAATGGGATATTTTGTGCACCAGCAGGAGGTGTTGGGTAAAAACCATTTGTCGAATTTTGTTTTTTATTGCGCCGCTTTTTGAAAAGTAGGAACACAACTACGAGAAACACTAGATACCAGAAAGCCATACATTCTCCTAAATGGTTTACCGCTAACTCTCGTAATGACTAGTTTTACTTGAATAAATCGAAGATACTAAATGTAAGTTTGTTATAAGCCTTGTTGTAGAGAGCTTTTTTAGGGTCTTTGAAAATACCTGTACCTTTCTTCTCATATCCAGGAATAATGGCTTTTTTGATACTTCGTTTTAGCTTTCCTGTTGTACGAGCTGATATAGAGCGCTTAAGACTTGGCTTTCGCATTCCGAACTTCATGTTCTTTACCCTTTCACAATTCCTTCAAGCTTTTATAAATCGGACTCAATTTTTGTCCGGTGTTACCACTAGAGTAGAACGCATGTTCTTTGAGAATTAAACATTTCTTTAGATTTCAAATCCGAATGGAACTAAATACCAAATAACTTCACCAATAATCGAAATTGGCTGCGTGTCAATCTCATTAAAGTCAAATATTTGTGGTCTAAATGTAGGATCTATGCTGTCTGGGATTAGCTCATAGCCATTCGATAGAGGCTTTACTCGTTTAATAGTTGCATCAAAGCCATTCACACACACTGCATATGCCTTCATAGGCTTAATTTCTTCTTTACATGGGTTAATAAGTGCATAACAACCATTAGGAAGAACACGGTTCATGGACTCACCGACAACTTTTAAAAGAAAAGCTTGCGGATATCTCTCATGAATGTCTGCTGGGATGTCATAAGTCTCATCAACGCTAATCATTTCAATAGGGGTGCCCGCAGCTATTGAGCCTAAGAGTGGAACAGGTGCCATATCAGAAACTTCTGATATCTCTGGACTACTAGACATTCCAAGAAGGTATGCCAGGCTCACATTCAAGATTTCGGACATTTCAATCATCTTATCCATGCGGATGTTAACTTGGTTAGTCTCATATCTTTGAACTGTCTGCTGAGTGGTTCCCATTTTCTCAGCTAATTCAGCTTGCGTAATATTTCTAAGCTTACGTGCTTCAGCAATTTGGTATTTCATTACCGCTCACCTTCAGTTACACGCATTATATTGTCTTCATAATAATTACACACTTTTTGTGTTGTATCAAACACATTTTGTGTGTATTATCAACATCGTTAACACACAGAATATGTGTATTTGAAAGGAGGTGCTTACTATGAGAATGAACATGAAAGCTGAAAGAGCAAGGTGTGGACTGTCTGCAAGTGAAGCTGCTAAAAGAATTGGCGTTTCAACGAACACACTTTTACGCTGGGAGTCTGGCAAGAATACCCCTCTTTCAGAAAATCTTATGAAGCTGGCAAGGCTTTATAACTGCACTCCTGATTACTTACTTGGCATAGGTAATTACCGTACACGAATCACATGTTAAGTAACTAAGCACTTTCACGCACTATGTACCTTGTAAACAAGATAGACGCAAAACGTCCTAGGGAAACTTACAAAAGCTTACTCAAACTTTAAGTTTTACGAGTACCTGGAGAAATAAAGCTTAGCCGTGAATAGTAGCGGTAAAAACGTTGCATGGTCATCGCGTTAACCATGTAGAGTCTTGTGACTCGCTACGTCAAGGGACTTCAGACGTACAGAGCGGGCGTAGACGCTTTGATTCTATGTAAAGTCCTGCAGAAGTTTTGCTCTTTCGTTATTAAAACAAAGAGCTCTATTTTCTATGGAGATCTGAGAAAAAATGCCAATTCCTCAAAATACTGGCTCAGCGTGGTCATACTACTGGGAGCCTAAAGCCACGCATAAGCTCGAACCAGAAAAGGCTAAACCGCCTCACACAACAATATCGCGCATTAAGAAAGCATCACTTATAAAGAGTTGTTTTAACGATGCTTATTACGCCAGGGAAGACAGTGGAAATCTTTGGTTTCTTGGTAGTTTTGAAACGGATCAAGAAGCAAATGAAGCCTTAAAAAGGTGGGCAAAATGTCATTAGAAAAAGTAGCTGCTTTTTGTATAGAACTTAAGTTATCAATTAGAAAACATCCAATCCGTATGCTTTCGTGTTTGGTATCTGTTCTATCACTTATGTTTTCAGTTTATTGTATTTTTGCCTGCTCAAAGATGACAAGCGTCGTTGGCTTGTGCATCGCAGTGTTTGCCCTTTGTTTCGCAGGTCTTATTTATTAACAAGATAAAAGTGCCCTCCTCACGGGGCAACGTGGGAGAGCGTGTCCAAAAAACTTTAAGGAGTTGAAATGGACGATACAAGTATACAGGTTTTTAGTTCGCAACAATTTGGTGAGCTAAGAGCCCTCAAAGATCTTGACGGTGAACCATGGTTTATTGCTCAAGATGTGTGTAGAGCTCTTGGGACTGATGTTAAAGATGTTCGGTCAGTTCTTGAATGTGATGAAGTTTCAAACCTCGATACTATCGAGGTTTATAAAAAGCCTGGACGATCTCCGCTCATTGTGTCTGAAGCTGGTTTATATAATCTTGTGCTCAGAAGTCGTAAGCCAGAAGCAAAGCCTTTTCGGCGCTGGGTCACGCATGAAGTACTTCCGTCAATTCGGCGCTCTGGCGGCTACATCGCCACAGATGGATCAGAAAGCAATGAAGACCTTCTCGCTCGTGCGGTTCTAGTCGCAAATGAAGCAATCCAGCGCAAGGATGCACAACTTAAAGAGCAGCAACGTCAGCTCTATGAGAAGGATACAACCATCATCGAGCAAGGCGCCAAGATTGACGAGCTCGCTCCAAAAGCTGGTATGTATGACACAGTTATTAACGTCAAAGGCACGATGACGATTACAGATGCTGCTCGCTATCTTTCGCAGTATGACCCTCAAATAACCCGCAAACGCCTCTTTGCCCTTCTTCGCGCTGATGGTTTGATTTGCCGTGTTGGCAAAGCTCCAACAAAGAAGGGAATTGAGACGGGAAGATTCGTACAGATCATGAGCACCCGTCGAGATGGTAAGTCTAATGAGCCTTATGCCAGGATGACGCAAAAAGGCTTTGACTGGTGCGTTACCGCTTACTGTACAGCTCCGCTCATTAATTAGCTCTTATGGAGAGCTTGCGAAACACCGAGCTTATAACCGTTGAACAGGCTTCTCAACTATTAGGCATACCAGTTTCCACGATGCGCAAGATGTGCGCAAGAGGGGAGGTGTATGCCAAGAAAGCCGGTAAACGGTGGCTCATTAATAAACGGATTCTCTTAAGCCTCTACGGCTTGCATTCTAAGGAATAACAAATGGACAAAAGAATATTTTTTGTGGCTTTACTGCCTTTGCTTGTGTATTTCACAGCGGACTGCTTGGGCATTTTTGAGCCACATAACGTGGCATATTTAATGGCTTTTAGATATGCCATAGCTGCGTATGGACTTGTTGGAGCTTTAGTCGCATGGCTCAAAGACAAAGAGAAAGAGGTGTGTGATGCTAACTAAACAGGAACGCCGAGAGATTGCAGAGAGAGCTAAAGAGTATAAGAAAGAAGAAGAACAGCTTAGCTGGGACCAATTTTCATACGTTCTTCTAGGCATTCAGAGCTGGAGAAGTGACGATGAGCTTTTAGACCGCATTGTTGAGCTTTGTGAGGCAGTTAATGTTGACGAGCTGGCATTTAGGCCATCAGCGGACGAAATGTACCTGCAGGCTTTGAACGTCAAGCATGAGCGTATTGCTGCATATGTCGAAGCTGATTCGTACGTAAACATAAAACACATTATTAGCTGTATCGAAGACTTTGACGCAGCGATTTCTCACTACAAGCGACTGGTCGAAAGGAGTAACAATGCTAACTAAAGAAGAACGCGAGAAAATCGCTGAAAGGTTTAAGAACCACGATGAAAAATACATTGTTGATTTTTATAGATGCTTATTTGGCACAAACCCTCCAAATGGCGTACCACTTGAGAAAAGTCGTAGAAATACCATAAGCCGTCTAATCGACCTTTGCGACACGTCAAACATGATTGAACTACCGCTCGATAAAGACGGTGAGGTTACCCATATCGGCGATATCGTATATGACGAAAACA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67 | uncultured_Caudovirales_phage(12.5%) | integrase,holin,protease,portal,capsid | attL 632003:632022|attR 665309:665328 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
810855 : 820397
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013203|810855:820397|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013203|810855:820397|812101_812821_+|WP_012808819.1|DBSCAN-SWA MSESVNLMQLQNIDLKLLKLTSNLASLPQAQKIKNAQLAKKKIASQLKQVLGVKKDVEIDISDLNEQRAHYVLKTEEVSAAVETATNHRAIRDFDQQLSSLAKNIEKCDFKLAEKAKELEKCKKAYQAAQDLQVKLMRECESLSESLEIDSTALRAEIIELSKSREELAVQISVETLERYETARKRFKGLAVEHLVGNVPSVCRVKLQPSSFYDLQHSTEIAECPYCHRMLITSTTFEE >NC_013203|810855:820397|812835_814062_+|WP_012808820.1|DBSCAN-SWA MLDKTTQPSVCLVICGGIAAYKACEVLRGLQKANCDVRVVMTEDAAQFVGKTTFEALTHHEVVQSLYNNTETPVAHVDLADWADCMVVVPATANIMAKMAHGIADNAASATLLAAHTPVLVAPAMNTHMWINPATQANVALLRQRGIQMVMPESGHLACGYTGDGKLAPVQQIVDSALKVLSGKDTVSAKQDLAGKKLLITAGPTHEKIDPVRFIANCSTGKLGYTIARVAASRGADVTLISGPTYLEAPEGVIIQRVVSAEDMYKACMSVFDDVDAAILTAAVADYTPAHPADHKLKKSLEYLESIDLKETTDILASLSKAKKGQVVVGFAAETNNVLEHAQAKLERKGCSMIVANDVSRPDSTFGSDTDRVAFVTPQGIEQLETLPLSDVASELLDRVAKMLEERA >NC_013203|810855:820397|810855_812004_+|WP_012808818.1|DBSCAN-SWA MNYVYLDYAASAPMRTEALYAEKTYEASPIAGVNPNSLHSLGRQAARELDSARSVIANAVGGKFRSPDVIFCSGGTEGNNLSVLGMAEGIRNKDHKRNVVVFSAIEHDSVLDLAPVLREKGFEVRIVQPNRQGKIEGSVLEGLLDQSVALVSVMYANNETGVIQPVAELARITHRAGALFHTDAVQAFGRICLEVTDVDALTIAAHKIGGPLGIAAVLMRSKVPFQAQSYGGGQESGRRHGTQDVRGALAFAAATRWCQDNLTQTQEIVSMRANKVYETLCSSPKIKPTTAAYAGTDHMPGTVSIMVPSMDSETLILKLDQAGYEVSAGSACSSGSLNASHVLTAMGISRNEALGSLRITFDERVSESDLNAFCTTLLRIVG >NC_013203|810855:820397|814914_816807_+|WP_012808822.1|DBSCAN-SWA MGILVGCEQISMEWPGKKVLTNQTIGVNEDDRIGVVGKNGDGKSTLLNLIAHRIEPDSGNVIWRSGIQVGYMGQTDSLSDTQTVCNAVVGDTPGYEWASDARIRKIIDELIGDLDWNGLVGELSGGQRRRCDLARLLVGTWDLMLIDEPTNHLDLHAIQWLANHLKNRWPEGSGALIMVTHDRWFLDEVCDHMWEVHDGVIDPFDGGYSAYIQTRVERDRQAVVAEERRQNTLRKELNWLAHGAKARTSKPKFRIDAAMELLAEDPPLRNTLELKRMAVSRLGKQVIEMHDVSFAYKNAGANAVDDSNARTDISKAQTDVIKHVEWLIGPGDRYGILGENGAGKSTLLELMTQQLQPTSGLVKVGKSVKFGWLSQQIDTFATKETWTVLELLSQYKTSYLVNGKMQSPTQLLESLGFDRREFTNRLQDLSGGQRRRLALLCVLLEEPNVLVLDEPGNDLDTDMLAVLEDLLDSWSGTLLVVSHDRFLIERVTDDQYALIDGHIRHVPGGVDEYLKLVDAAKQTARKAGELSGTHESSGSNELQLDGASRQKDAVLSNAERRELKKRVDSIERRMGKAQELPEQIREQMNSADATDAQRLMELQQQLNDAEAALTELEDEWLTLSEKLGEA >NC_013203|810855:820397|814123_814915_+|WP_049754800.1|DBSCAN-SWA MGKDALSIGATTFAFFTRNPRGGNAKALDEVDIAKLRTLLEAHHFGPLVAHAPYTMNLCSAKEETRDFARRALAEDLERMEYLPGNYYNFHPGSHVGQGSGVAIEQISEALNSCLFEGQHTCVLLETMAGKGTEVGKTFEEIASILDKVEYPELMGVCLDTCHVHDGGYEIVENLDEVLDTFDQIVGLEKLKALHLNDSKNPLGAHKDRHEQIGKGFIGLDTFRSVVTNSRINTLPMILETPHSELSGWREEIALLRSFLGDN >NC_013203|810855:820397|816807_818553_+|WP_012808823.1|DBSCAN-SWA MGELLSKFVWPKYGRKSFVALLCKVVEVIGDLLTPLIIARMIDLGIHGANMYDIIRYGILLVIIAVVGFCFTIVCQKIASIVSQRTGTDLRNELFKKIQELSSADIYTLGTDTLVTRLINDVNQVQVTVALGIRQLVRWPILAAGSIIATLMLDAQLGMVFLLATVLVAAIFFFVARKSTALFTELQKRLDAVSLYMRQMLSGIRVIRAFRHEAEEKAQFSEAVLAQTDAATNAANYSALLNPATFLVMYLGIAVTLWLAAPQITSGTLSQGTVVALVSYMTSALLAIGYVANLVIIITRGTASAARVMEVLNTKPTLTDEENKRINLTESDFSANAVVFKDASLVYDGGGEPALSDINLSLQAGQTLGIIGGTGSGKSSFAALIPRLFDTETGSVSVFGHDVKTYTFEQLRSLIGYVPQHTSLVSGTIRTNLCWKNPNATDEELWKALEVAQAADFVREKPDQLDSIVERGGKNFSGGQRQRLTIARALVGSPRIVILDDAASALDFATDAHLRAALRKLSATTTSIIISQRVAAVMQADKILVLDHGKQVGLGTHKELLATCPLYKEICLSQLRPEEVE >NC_013203|810855:820397|818552_820397_+|WP_012808824.1|DBSCAN-SWA MADMYSGGSTSAITSSAPEHGKGGSADVISMSAAEVTRRLAAWISPHGGFLVLAATSSIATVLLQLWVPIIVGSAIDQLIKLVQSGEAALLPTLAQLSLVVLLASATQWLASWSTNKLTYLVTRDLRDAAHSKVANLPLSYIDTHSQGDLLSRVVNDVDQLGDGLQQGLTQFLTGVVTIIGTLCFMFYMSVPMGLVVALATPLSIIAAALVTKYASSSFGKQQGYQGQLSGYAEEMVSNQKLITAFAHKDAVIEQFEAINEKLRVVGERAQFASSLSNPSTRLVNNFIYALVAGLGCICVLTGIPSPLTIGQVQSFLSYANQYMKPFNAISAVVTQVQTAYASARRVFDLLDAKEIKPDPADAEVIQDPQGSIEFDDVAFSYDVKHPLLNHISFKAEPGQKIALVGPTGCGKTTLINLLLRFYSIDSGAIYVDGHNTQKLTRASLREQFGMVLQDTWLFKGTIKENIRYAKPDATDEEVIAAAQKAQAHQFIQQLPQGYDTMVGESGGSLSQGQQQLLCIARVMLANPPILLLDEATSSIDTRTEQLVQKAFDTIMNGRTSLVVAHRLSTIQGADCILVLKDGSILERGTHDELLAKGGFYAKLYESQFEGTNA |
7 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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