Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_013512 | Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946, complete sequence | 2 crisprs | csa3,DEDDh,cas6,cas8b1,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,WYL | 0 | 11 | 3 | 0 |
1. NC_013512
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_013512_1 | 900441-907740 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_013512_1
|
111 spacers
spacers of NC_013512_1
>1.1|900471|34|NC_013512|CRT GATTTTGTATTTTAGAAAGCACCATAATCTAGCC >1.2|900535|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTTTAATCAATCTCAAAAGACACTTAAAAAATATA >1.3|900601|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTTTGGCACTTCTTGGCTCTCTTTTGGCTTTT >1.4|900665|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATTTAGAAAGTTCAATGTTTTTTACTGCAACTGC >1.5|900730|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAGAGCTTTATCTCTTTTTTCTTTAGTTGTAGG >1.6|900794|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGATATGCAACCGATGGCGCAAGTGCTTTTGATCT >1.7|900859|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGAAATGAAATTTGACCGCCCAACTTATGTGCCTGT >1.8|900925|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTATTCACAATGGGACTTAACAGTAAATAGCACA >1.9|900990|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCCCAAAAGCTAATTGATACTTAGACGCTTTCTT >1.10|901055|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCCTAAAAAAAGCATTTATGCTAAAGGGTGGCGCA >1.11|901121|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACGACAAACACAAAATTCATCTACTAGGCGGAAAG >1.12|901187|33|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTCTTCGAGCTTGACCCGTGAGCTTATCGTCTC >1.13|901250|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACGGAAGCAAAAGCGTTTCCACGCTTTTGTGTTT >1.14|901314|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTCGTAGCTTGCTCCGCTTGTCAATGGAATTTC >1.15|901378|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAAATGAGAACGGTTGAGAGTATAATAAATGATAA >1.16|901444|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CACAGAAGAGTATAAAAAGCCTATAAAATTATTATT >1.17|901510|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATCAGGGAACTCTTTTTCTTTTTTAGAAAAACATA >1.18|901576|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTAACAATAATTATGCATTGTACTGTGTGTGAAATT >1.19|901643|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACAGTAGGCGTTATTATAGGCTATTTAATCGTTTA >1.20|901709|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATAAAGACAAAAAGGGGATAAGATGGAAGAGATT >1.21|901774|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACCTAAACTAGGTGTTGAAAAAACCAACAGCTAA >1.22|901839|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAATAGTTTGAAATTTCTCCAAGCTAGTGTTCT >1.23|901903|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGACCCACCAAAGTTTTTTAATGATGGCACAAAGCA >1.24|901969|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCTATAAAACTCTTCAACACCTTTAGCGATTGACTG >1.25|902036|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGGTGGAGAGCTTGCAGATGTTAGGAGGCAATCA >1.26|902100|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGGTGGAGAGCTTGCAGATGTTAGGAGGCAATCA >1.27|902164|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGATTTGTGTCTCTTTTTCTGTCTCAAATTGTGAA >1.28|902230|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGGGTGCAAAAGCTCTTTTGACGTTGACGTGGTTTT >1.29|902296|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGCTTCTTTTGTCATCTCTACCCCTTTAAAATTT >1.30|902361|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGATAAGGTAACAGAAATCGTACGTCCTCACTTT >1.31|902425|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCATTTGTAAGAAGTAGGTAAGCACTTGGCGGTCG >1.32|902491|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCGATAGAATTATTATGATTAGTGAAGATGGAACTAT >1.33|902558|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTAAAGATTTTATAAGCCCGTTTTTATAGTTC >1.34|902622|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAACAATGGAGCACTATAAAGTTAAAATAAGTGTTT >1.35|902688|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGATTGAGAAAAACTAACTTCCAACCGTCCAAAG >1.36|902753|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATCCTGAGCCAAACGATAATTTAAAATCAATCTG >1.37|902818|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAAATAGTCTCCTTTTCTTTAAAATTGATAATGAAA >1.38|902885|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTAGATGCGTTACATGTAAACGAAACAGAGAATGG >1.39|902950|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGGATGAAGAAGTTAAAGAAGTCATGCTTGTTAGG >1.40|903016|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCAGATACCTTAATGGTTTCGTCCGAAATTTGCATC >1.41|903082|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATCAAGCACTGTTTCGCTTGATGATATAGATAT >1.42|903146|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTCATAAAGCTCTTTTGGTAAATCATCTCTCATTC >1.43|903212|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGAAGGGGATAATGTCGTCCGTGATGTCAATATC >1.44|903277|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATGGATAGATACAAAGCAAACAGTACAACACAT >1.45|903341|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGTACAGCACCGAAGGAAGCAGTGCGTTTGACCTG >1.46|903407|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTTTCATGCCTTGGTATGGTGACATTCTTACTAC >1.47|903472|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAAAAGCCAAAAAAGAGCCAAAAAGTGCCAAAAA >1.48|903537|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGGCAAAACACGGTCTTAACGCCTCGCCCCACCCTT >1.49|903603|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAAAGGAACTGACAATGCAAATGGTGCAAAAACTA >1.50|903669|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTTAATGGATGATGATAAGCTCTTATACTATTTT >1.51|903735|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATAGACGAAAAGTCTCTAAAACTAAGATGAGAAAT >1.52|903801|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAAAAGAAACCTAGCACAAGAACAGACCAGACCC >1.53|903866|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGTTCGAGTATTTAGAAAGTGTGGAAAAAATTATT >1.54|903932|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTTGATGGATGATGATAAGCTCTTATACTATTTT >1.55|903998|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCAGCTAATAGTATTCAGGTTATGTATATTATCGAA >1.56|904064|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAGTAGATGGAAGAATAGAAAATACATTAGAAG >1.57|904128|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAAAAGAAACCTAGTACAAGAACAGACCAGACCG >1.58|904193|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATATGGGAAGCAAAAGAAAATTATCTTCTAAAATT >1.59|904259|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCACAATAGGATAAAAAATGGATTTATACGTAAAA >1.60|904324|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATATCCTCTGTTTTCCAGTCGTAAATTGGGTAAA >1.61|904389|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATATCAGTAATAGGTACTACAATGGCATCAGTTGG >1.62|904455|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAGTTCAATATGACATAAGTCTTCAGCATACTTTG >1.63|904521|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTAGCCCTCATTTAAGGGCTTTATCTTTTCAAA >1.64|904585|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATTGCTGAAATATTAGTTAAAGCAAATGAAGAAGA >1.65|904651|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGGAAAACGCAGGTAGAAAAAAAAATAAAATGACA >1.66|904717|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTATTTAGAAGATACGATTAGAGATTTACATCAAG >1.67|904782|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCGACCCGACTCTTGTTACAATATCTGCGATAT >1.68|904846|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGTTGATAATGCAATATCAGCCTGCGAATAGGTAA >1.69|904912|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACATCAGGATTTGACATATACTTGATACCCTCTGT >1.70|904978|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTAATGGGTGTGCTGCAATCCATTTCACGGAGTTT >1.71|905044|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGGTAGCGTTCAACTACACACACACAAATAGCAATT >1.72|905111|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGGTAGCGTTCAACTACACACACACAAATAGCAATT >1.73|905178|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGAGCTTTTTTAATCTATGAAATTCAGGAGGACAT >1.74|905244|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAACACCAAAAATGGCACTTATACGTTTCCTAATG >1.75|905309|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGCTTTCAATGTCAAGCTTCATTTTAAGCTACTT >1.76|905374|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTATATCGCTTTTGGTCGTTTGCATCCCGATTGAA >1.77|905440|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATACGTCAAAGAGCCTTATCAAAACATCGAATCTCA >1.78|905506|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAACAACCCCCTAAAGTTTCTTAACTTTCTTCAAATC >1.79|905573|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGACATAAACGCCATCTTGCAATGCTTTTTTAATAGA >1.80|905640|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGGTACTTTCGCCTCTTCTTGAGGCGCTTGAGGCG >1.81|905706|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTAAAAACCATCTTCCCATTATTATTAAATTTTGG >1.82|905772|39|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGTAATTTACGCATAGTAACTAAGTAGTCAGGTATCTT >1.83|905841|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTCTATAATAACAATCGCTCCGCTAGTGGCTTTTG >1.84|905906|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTGGACAGAGCGTTTTGCAGTCGAAGGCATAAAGGT >1.85|905973|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTTCACTTTCAACATCAATGCTAAAAGAAGCGTTT >1.86|906039|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACTTTTCAGGTGTATCGATGTAAAGGATACGTA >1.87|906103|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCTTTAGAGATGGGCGCTACTTACATGTTAAAA >1.88|906167|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACGCTGGGGGCTTCTCTATGGAAGATTTTAACCGAA >1.89|906234|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGGCAAGAGTGGGATGTGATAATCTCTAACCCACC >1.90|906299|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCAAATATTCTTCTACATGTAAAGAAAAATGGATC >1.91|906365|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CACTATGATTCTTCAAAAGAGGTTTTTAGAATAGAG >1.92|906431|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTATTGATGACTTCCTTTACCATCCCCTTTTTA >1.93|906495|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATGATGCGAAAATAGTTCTGATGACAATAGACACA >1.94|906561|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATTAATTAAAGGTTCACACCCAAACAAATCAATA >1.95|906626|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTGGAAGCGTGACAGGTAATTGGAGAATAATTTC >1.96|906691|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGCTTTTAGCTTCTTTTTATGTAGGCAAATACA >1.97|906755|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTCAAAATCAAATCATCTTTATCAAAATAATTTTG >1.98|906821|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCCAACACGTCAGGGAATTATGCCCACGCCAACA >1.99|906886|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTCCGTACCCGAACCATTAGAATCTTTAATAGCGTT >1.100|906953|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GACGAAGACACGGTAAAGGTTTTGCGATTCGATGTT >1.101|907019|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTCTCAACCACCGTCACAGGGATTTTTTTACCGTTAA >1.102|907086|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTGGAATAATTGGCTTAATCCACCCATGACCTG >1.103|907150|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGTTTAAAAGCTTAGCCCCATTGCTGAGGCTTAAC >1.104|907216|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTGGAAGCGATAGGACTTAAAAATAAAATGCGCCT >1.105|907282|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGAACGGTAAGCCTAGAACGCTTATGATGTTGA >1.106|907346|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAAATGGCTATTTCCTTACATGTAAGGCTTCTG >1.107|907410|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACAATAGAGCGAGAGACATTTTTGTCATTCTCTT >1.108|907475|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTATTTTATTAACCTTTACATGTAGATGGTTCGCA >1.109|907541|38|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAAATTGATGATGGTGATGAAGTTATATGTGATCCACA >1.110|907609|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTGGAAATACTACGGAGGCGGTAAGAAAATAAAA >1.111|907675|36|NC_013512|CRT AGGTTTCTGCTTTTACTTATTAGGTTTTTTAGGATT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013512_1
The CRISPR arrays of NC_013512_1 >merge|NC_013512|1|900441-907740|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder 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CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC ATTAATGGGTGTGCTGCAATCCATTTCACGGAGTTT CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC CTGGTAGCGTTCAACTACACACACACAAATAGCAATT CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC CTGGTAGCGTTCAACTACACACACACAAATAGCAATT CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC TTGAGCTTTTTTAATCTATGAAATTCAGGAGGACAT CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC CAACACCAAAAATGGCACTTATACGTTTCCTAATG CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC ATGCTTTCAATGTCAAGCTTCATTTTAAGCTACTT CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC AGTATATCGCTTTTGGTCGTTTGCATCCCGATTGAA CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC ATACGTCAAAGAGCCTTATCAAAACATCGAATCTCA CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC CAACAACCCCCTAAAGTTTCTTAACTTTCTTCAAATC CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC TGACATAAACGCCATCTTGCAATGCTTTTTTAATAGA CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC AAGGTACTTTCGCCTCTTCTTGAGGCGCTTGAGGCG CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC GTTAAAAACCATCTTCCCATTATTATTAAATTTTGG CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC AAGTAATTTACGCATAGTAACTAAGTAGTCAGGTATCTT CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC GTCTATAATAACAATCGCTCCGCTAGTGGCTTTTG CTCGAACCGACACAAGATTTGTATTTAAAC 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>NC_013512.1|WP_012856699.1|900028_900340_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKETTNYNYVFLFYDIADEFSEVGKYRVAKVFKICKKYLKHHQKSIFRGNITPANQIKLQSELKKVIDKEIDFVTIIKMITSGSFNEETLGNPKKESEGIFI >NC_013512.1|WP_012856698.1|899027_900032_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAKNHTRYIFSMGELKRKDNSIAFSNEKGNFYLPIEETRELYCLNEVSFNTKFLDFIARAGITMHIFNYHGNYSGSFYPKEYLISGDLTIKQSLSFVNERLVIAKSIVSAIAQNIHEVLYHYYRHDKKELKPYLDWLKNDVESLLHVTTKIEQIMFVEGQIWSRFYDSFKYFLPEDFVMNKRVKRPPDNPMNALISFGNTLLYTKTIASIYHTHLNQAISFLHSPREGRFSLSLDLSEAFKPVIVFKTIFDLVGRKKLQVLKHFDKSLNYALLNEEGKKIFIDAFEERMNETFLHVKLKRKVSYKHCLKLDGYKLIKTIVEGREFTPFLLKEKM >NC_013512.1|WP_012856697.1|898529_899021_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MQINGTLISYYFICKTKLWLHANRLNLEDNSEDVRIGKVLHEISEEKAQKAEVKIDNVKIDKITKEYLVELKKSDSDPEAVKWQVLLYLYKLKGKGIERKGKVEYHEKNHNTKSEILELTEQNEHELLRVLEAITQLINAEVPPPPKFENKCKKCAYFDYCFI >NC_013512.1|WP_012856696.1|896311_898525_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEIVAKKSNERYQTLEEHTQWVVEEALNQIDPQILHKVSTCTGWSEQKIRDLIFFSAYFHDIGKATVEFQETINNGKKSYHPLYGASLLLHIKDFVYKDIGENNLLFSIVLSHHSLFPKQYDSANYNFTFLPQYSVLLKNYSSLYEKTFNEVCPYLFEFKEIKRELYQKYVDISEKRLADIQSCFKFRVLYSYVSGILNLADWLASARFTQTKPTTTFLTLPTKENFVTHLTFDELRPFQEELSSLDKSVLVEIPTGEGKTEGSLLWAIYNLYNQNTKIIYTLPTQTTSNKLYDRIQNFFDKEECGLIHSTAKIFLEKAYEKENGIVDDVFQSDFLISKSFNKPITVSTIDSLLKYFINIGRFNIATKNFLNSVIIIDEVHAYDFKLMGFLKRFLELCQEYDVRVCLMSASIPNQLKKLLGIDTYPLVTQKDLFAKKANEIIKKEMFLDDDLESMMQKFHEKKNVLIIRNTVKSAFQIYNELQTLGIKSDDMILYHSTFKKRDRATKEDLIFEKLNSKKPFILIATQIVEISLDIDFDVMFTDNAPIDALIQRFGRVNRKKSIERKGEIFIYQNKNIRPYTNESLLDLTFQTIQNGYYELGQYVEWLNIVYDKLFEDDTQLKNVKIRLFDPACLKYDATIKQLHGIEKSSDNYDLRDIEQPKNDYLLYDDYMNEEIKAKDYFEYSISLPLYYEGKNKENIHPIDDEKLYYKVLKLDYTLDEGITLDVDNQGMKELGA >NC_013512.1|WP_012856695.1|895598_896312_+|CRISPR-associated-protein-Cas5 MEAIRFEVEGLLNSFRVPFFRTYHKTFLAPPKTTIIGLLCNIALKSQKEFFEILNQELIDVSVIIDEINGKTKDLWSYKTLEKGNMGKSVIRRDKLFLSKYTIYLSIKNKTLFDEIYSALKNPKNTPALGLDDELIIIKNVTMIDDLPLNQSGRINSVFLNKAYHYKAFIKDLNQPLELPTPNLTPIKFNAFDKKGNRISKEVLLEYPQVEFINCEIQLDDVVSYIDTEKENKMVFY >NC_013512.1|WP_012856694.1|894676_895597_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MFLNIAYITKVNVASLNGGEGSGGNVTVMKKISNANGDEFAYVSGQALRRYMKETLMQLGEKISSVDEDGNPTVEENGKYPSLNAKIDDKQREKIFKSVCDLDLFGFMLPKGGRRWSPIKVSPMVSIFPYKGEYDYLTRKQKTEDESKKSGNIVQVEIDTLNFMRGNIMINLSHIGNEINEYTYEVKSILSDEEKKQRLNVFLDAIKSFNGGAKQARNLEDIAPKFVIVAKQKTGNPFLLNALSVDSDGSIDIETIQEALKDNKPESYTIGITKGIFTNEAEIRSSFDNVVSVAQALEEYKNNLGA >NC_013512.1|WP_012856693.1|892960_894664_+|hypothetical-protein MKEQNLFSSNNTGIIKIFTYKDFFYNNGIVNLYQFLQNKDFDITFSLHQNELTLEFDAQKEDQVYTQILNSFLKDNKIVYQTDNDRWYFDETKMDFIVDKKFDTKGGQKNDLRNGVYLYKKISELGLSREEVEKLYLDFCERTKLKPETESNGTLKVPNKNNEVIVAIALDTAIERFSQYFASTDILSIDSKIHSFEDGQDYFHDMLKQPQTYKIDKWNALMYWFGGRVQRFYNYSYFIYPNSSNLEALNTFKKFLQINDNRQEYRNDDGKVVTTSSNIDFFNILRKDEIVNKYFYISKSAEEFEVKFFMYLFSVIYHIESEYESLQDEDLAVLFDDDTLENSKILFELLQYMSFVIYTDDGTFKTSLSEYTKAYRLIQFFMKLKEESLFKYLGHVFQVFSLSQSKDEVNLNLQHWCQKILSFNNVRKEYFAASFSILKNNSQGFGKELYAFEQSYLKNILGGSEMGIHENAKKIGDGVGFFCAELGDKDLLFKLRSVKNYKQLVSYFKDLKFSSLKNADKARFSNEFNESLENLLVNVEQNWEIARDYIAIYAIDKFKTVSFAKTK >NC_013512.1|WP_012856692.1|891916_892639_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRYFELRCVAYLKKEMAFERSFEALSKYISFSMYQEGEGEVHQKEGFKYYVFSGFKPKDEDIQKKAYRGGETYPFTIRSLDETLIDTLSTSLRQNINNENLLVVEAHKKTISQFFITELYSATPVIVSVSNGKYWTMNESGDIVQLQRQLHENAEKKYQSFFGESLHVNQNFIQLIEIKNKVPQNILITKEGKSIRFFGNKFRIVPNEDEVSQKLAFVALACGVGEKNSYGAGFCVGGRV >NC_013512.1|WP_012856691.1|891323_891800_-|Cys-tRNA(Pro)-deacylase MSLKKTNAARFLDTLKLPYEMSSYEVDEEDLSAVHAAQSLGVAPECVFKTLVARDEAKRILVACIPAIEEIDLKALARVANAKRCELVAVKELLALTGYIRGGCSPLAMKKHYPTFIDASVLAHEKIYVSAGLRGVQLNLSPSVLIKATHAICEPLVK >NC_013512.1|WP_012856690.1|890205_891258_-|FIST-C-terminal-domain-containing-protein MFEEVAFFQSVEDLHVTLQSGSYLLLVAEKTVLPSDFFDKNRRCVGAAFPYILYGEHAYAEGIIAAKLSLHTNIHVVCMEHLEKSILPPQSHSVLTLIESNSTHTDLFLETLYSLLPEKAKLIGAAGKNLFMHDTQICTTAYCQSDKAIILSSHLPIGLGVKHGWKALISPFIATRCQGNIVEKINFQDAYPVYKNAIEKNTLLRFKEMDFAKIAQQHPLGIVRYHKDFIVREPLKTDGQSLTLAGSLDENSVLNILEGNKDELIEAGEEAAQIALNHFQGETPSSVLLISCYSRFLFLEDAFETEMKAIASLYPPHIPFWGMLSLGELANDNQEGIAFYNNTCVVGVLP >NC_013512.1|WP_012856700.1|908571_909594_+|bifunctional-3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase/GTP-cyclohydrolase-II MPIQRVKQAIEDIKHGKMVMMVDDEDRENEGDLVYAATFSTPEKVNFMASEAKGLICVSLKEEVAKRLALTPMVTNNDSQHETAFTVSVDARICSTGISAYERDVTIKILADSMSTPKELVRPGHIFPLIARKGGVLVRTGHTEGSVDLCRLAGVSEVAVICEVMKEDGHMARRDDLDLFCKKHGINIVYISDIVAYRMQSESLVREVASANVEFFGAHTRKIDMVDHEGNHHIVYAFGEIGKTSAVKFHHIIPDNELFANEKKYQGVLKAIEYLKKHHGLFIFIDSEYTSNPELREFGIGAQIVKKLGIENINLLSTTKRKDYVGLCGFGLNIHQEIVL >NC_013512.1|WP_012856701.1|909625_911317_+|cation:proton-antiporter MDLFLLSVLVLLAVTSIMVTISRHIGLGSILGLLIAGIIVGPHTGGFTVTSQVEALRHFTEFGVVLLLFIIGLEMQPSKLWSMRKEVFGLGSLQVIASGVVLGFYMHFFVEDLGVAMLIGFTLALSSTALVMQLLQEKGKMNTEHGKSAFAILLLQDLAVVPLLAILPLLSTQQQVQTPWWESLATVVVMFILLVAFGQYIIPNALDKVAKQRNKDAFLLLTMLSVVLSAYLMDHAGLSMALGAFLMGMFLSTSRYNFQIEATLEPFKGILMSLFFIAVGMSIDFNAILENPLVFSGHIIVILVLKALVVFGLVLAFGGNKSGAIKLAFLLNQSGEFGFVLFGSAKALNVIDDTLFVVGIGVISISMLVTPVLYSFGCSLANKLANLSQFSYFNTENAAMEQKVVVAGYGSTGKVISKMLKSSGIPFIVFDVNAQEVSLGRKNGMPVFFGDITDMRLLNTIKIDQASMLIVSIDHSISAIKIVKHIKESYPHIKILARALDIKVMDKLLLAGANWVIAETLESSIRTGEEALAQMGVPNDEVLALMELLRKNEYEAIREITKE >NC_013512.1|WP_012856702.1|911374_912253_+|3'-5'-exonuclease MKIILLDTETTGIYEKDRICQLAFLVLNEELEVEEIHNDLCQPPVMISYEAMAVHHITPERVAHEVSCIQTRAYQRLLELNTPYNLLVIHNASFDLTMLEKEGFVSQMNLVDTFRILRAYYPNEGSFSLQYKRYQWGLYHQEATFQKKHTVSIEAHDALGDVVVLKHLFEKLCEEHSLPQMMLLCQAPILLSHIPYGKHKGKKFVEVAQSARQDLHYMLGATGVDEDVKASILHALDATKTELELKIGFGKYATKTPQEVFELDPNYLRWMLEKMDNLNAELKEAIEKILNT >NC_013512.1|WP_012856703.1|912269_912728_-|hypothetical-protein MPNDEKKSSKPRTQRKASASRSTPKTRTSKTKKETLSPAYKRPSLILKVLALAVVMLFFGFGIKFAIDQTFYANPLLGKWRAQTTLGIIEIEFERDTFSSFGSKNPISYEISKGSVVVMDERIKVGSTYKIIDENTIASEAGGFKTIYKRVK >NC_013512.1|WP_012856704.1|912857_913466_+|hypothetical-protein MLSKITNLFKVKEDETLQYMDPEKLINPNKERVYDPLEDDEEAFFRELEENSRPSEASLRQTRQEAPQQQSPRESVLKKMAHCMKEREWHPKRNPKPFIALFVIVLIAVFISLALHETPNPLLGKWQPQKKSNIFIPTGDVEFRKEHVLANGVHTEVSYIIEESYVEVVDKQMQTRLRFELKDDKTIELNLLGVKTSYKKIH >NC_013512.1|WP_012856705.1|913481_913781_-|hypothetical-protein MKKIFPLEQENKNSDRVIDALKHEIRKYLKRERNKKLPEGSPFWIFECRFGQSAEETSLVYVQDLIAALDNAYAQKWQECYIEIIAQPAKNLKPTKEAN >NC_013512.1|WP_012856706.1|913948_915064_+|two-component-system-response-regulator MSAEILVPEKATIFIVDDTPENLTLVSTLLKPFYRVKVATSGEKALVYFAQHEAVPDLILLDIVMPGLSGFDVIVELKKNSKIRDIPVIFLTAMSRVEDEKKGLELGAVDYITKPISPSVVLARIKTHLQNKAVADFLRDKNEYLEAEIAKRTEEISAIQYVTIFALTSLAETRDSDTGNHIRRTQHYVKALAKALQTHPRFAPYLSDTMIETLFKSAPLHDIGKVGIPDAILLKPAKLTPEEFEIMKSHTTLGKKAIEHAEEQLGMSVAFLEVAKEIAYSHHEKWDGSGYPLGLKGDEIPICGRLMAVADVYDALITKRVYKEGFSHEKAVAIILEGRGTHFDPDVTDAFRALQETFHEIAMRFSDSQRL >NC_013512.1|WP_012856707.1|915079_921187_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKWLWIVLCVPFFLFGQEALVLSHQEKVWLNGQKEIYIGAMDDWAPINFVDYHGKASGIGSEIVAELNKLLKGKLKIVSGSWEEIYTQAKEGKIDAIMDITKKPEREAFFYFTKAYLNIPHVIVSRQDTPSFGSLESLYGKKVALEKNVGTIGYLRTNFPFIEIQTYDTTSMALHALAMKEVDAYIGNRAVMSYKIEQEFLNSLKIDALERSRKSVPLSLGVPRSNPMLFSILEKSMEAIPRETWVKILSKWSNEKPLSLDLTSEERAYLKMKKELRFVAGNEEWKPFSFLDKNGQMQGLEKDFLKLLESYLSVPIYVTHLPWEDALKQAKSHHFDGIISASPTPDRLEKLSFSHAYYISPLAVVTRHDNVRDINENFAQKRIAVMEGSAVVLHVKEHFPEAKIVYTKEGTQGLITMLLKREAEGAIDTMLSLEYLLKEKSLDAQVEIGYSFYSEALSSFQYALRKDEPLLLSIINKAIDAYSLDERKNIKERWESKNGNGMKTVSLKGEQKPLTTLSKEEIQWIKEHPIIKVSNEPDFPPFDFMKEGRAVGLGVDYMNFVAQKVGLHVSYVQSTWEDLLKQFEAGKMDVLQSVYLTKKRQEYAYFTTPFFTNYPAMAVRKGSSIKSLAELKGKKVALMRGYGTSEKLLRDIPEIKPIMCTNVYEALHLVSFGEADVAFDSVGTMSYAIMEQMLTNLSIHKIDVSDKELSSDVHFAVKKEKAILYSILQKALDAMTPEEHIALRSKWVFSNETNFQAEQKSHFQLSSQEKAWLKEHPILLFTGDPRYLPYEAFNKEGKYIGIVADLLQKMEKELGIHIEKVPSLTWQDALLKAKNKEVDMISAYENDKILSETHLSTKPYVSSPLVIVTRKDKHKYFLNSLLELENQKIAIIKDYSYIQGLKAAYPKLHYMEVENAKKGFEGVASGEYDAMVVSLRLATYALHTMGLHNLHVIGKTDMNMHLAFNVKKEWEPLVGILNKAIAAIPPEELQQILKRWGPEDIDTPFDMTLFLEVVSFALLALIALFYWNYLLKRQVASKTAELSSLLKSFDAHVIASKTDLKGVITYVSDAFCQISGYKREELMGKNHRISRHPDNDAKIYEEMWAVITHGGAWKGRIKNKTKEGGYYWVDSVIEQELDASGKVVGYAAIRHDVTAHVELEELSEKLESIVEKRTQDLAFLNKEQQAIFDSTSVGIVLLKERLIVQCNKRIDEMLGYKIGEQLNQSTDIWYREIPDYQSVYEQVWHGEVVRFEHRLMRKDGTLFWARLSGRAIDYLDKEKGVVVVVEDISTEKEALEAIQRAKSLAEEATQVKSAFLANMSHEIRTPMNAIIGMAHLALQTELSNQQRNYLVKIDSASKHLLGIINDILDFSKIEAGKMRFESIDFYLEDVMEHLADLSVMKAQEKGLELLFDIETNIPTALRGDPLRLGQILINLVNNAIKFTAQGEIRLFVKLLAQEAKQVHLLFEVHDTGIGIDEAQQAKLFEAFSQADLSTTREFGGSGLGLAICKHLVEMMQGKIWVKSTLGEGSTFSFSAQFELQEEQKKPQFNDEDVRNLRILIVDDNASAREILENILRSFHFNVHSVCDGHHALSLLKEAQKEPQPYNLVLIDWMMPQLNGIETIRKIREEIVSDQPLMFIMITAYSKEELQKELEELFVDGILIKPISPSTLLNTILNVLGKEVMRLSRKEDKQALYRESIHALRGAKVLLVEDNIINQEIAKEILEREGMDIVVANHGKEALEWIEKESFDGVLMDCQMPVMDGFEATRLMREGGHTLPILAMTANAMEGDKERCLACGMNDHISKPIDMAKLFITMAKWIVPSNPRPLKIIQKEERADRPLLNVEGLDIEKALLHVNNNHALLETLWRRFVETQAECAERIEEALRIGDTEKAMREAHTLKGLSGNIGARELFESSKNLEHSLKESSSDIPLFLCQTKQDLETVIAHLKEAFLDEATHKEVLDFEAILTQEALHEKLNDLGYLLKELDSEAIDVLANIRASLFHLGYKKEVEEMEKALASFDFEKAYALLKEIK >NC_013512.1|WP_012856708.1|921448_921799_-|hypothetical-protein MNFNNIILLAGRPGSGKTEMLIAYANLYPKTTLFISNESTQETLINRGLSKEITYHNNFENVDLSTYKILCIDYLELFDKELIQKVITNALEQKLRIIVATQMKKNGEINNIFGQI >NC_013512.1|WP_012856709.1|921855_923361_-|PcfJ-domain-containing-protein MQTSAIPWKIKCDFNTLPTLFHGETLPYQAITYLCSCSHQYTYLENKTLANHQPYRCPICANETFLNANYFLKPFSWYDPIEKLFPKEILYALEPTIIYGQGQYKLTSHVNLKIPYTINLLRNTIMYKEHQLLELSIDNQGKISQLLNVNFDFYGYDKDVYDFEDDLLKESIIDNCTLLTLYKRKIVAMIKNTKTTHNLEIPDECTSMNDIAFFIKYPYLKSYEFIYWKSIEFLPKHHSLTVLDALNFINIRKEKSIKKVLFQHYKQQIQHKKPFAFHYIYALLHHIKDPNIIIQILHLPLDISGDSSGSWELFFTFLTSHFDEKRIAHLLKQFAQEEDYWLVDTMELLSEVSYDENHKNIHYQANNPLRANYKEVHDYVVHMHSSLYRQTLTHQTFTYTPKELTPCIRTATYSVHVPYTGLELFEWGEKMHNCLAGYDRAILSKNKLIYGFFKEDELVFAIEIQERKIVQAKSKYNTELLSVEKDFLNSWFEQFFKVNNK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_013512_2 | 2192228-2192368 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_013512_2
|
1 spacers
spacers of NC_013512_2
>2.1|2192274|49|NC_013512|CRISPRCasFinder TACGCTAACGCTGTGTTTTGCTCGGCGCAAAGCCCACGCACTTTCGTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013512_2
The CRISPR arrays of NC_013512_2 >merge|NC_013512|2|2192228-2192368|CRISPRCasFinder TTTATTTTAAATTCCTATCACACTTTTCAAGCAAAGCTCTCAAAGTTACGCTAACGCTGTGTTTTGCTCGGCGCAAAGCCCACGCACTTTCGTGCTTTATTTTAAATTCCTATCACACTTTTCAAGCAAAGCTCTCAAAGT >NC_013512|2|2|2192228-2192368|CRISPRCasFinder TTTATTTTAAATTCCTATCACACTTTTCAAGCAAAGCTCTCAAAGT TACGCTAACGCTGTGTTTTGCTCGGCGCAAAGCCCACGCACTTTCGTGC TTTATTTTAAATTCCTATCACACTTTTCAAGCAAAGCTCTCAAAGT
>NC_013512.1|WP_012857943.1|2191205_2192216_-|rod-shape-determining-protein MFSFIRSSNASFAIDLGTNNTLVYQPHKGIILEEPTSIAFDSKRRSFFECGESSKRMVGKNPKNIEIMQPLSKGAISNLTVAKAYIKEVIARISRKNFLKPHIVVSVPSDLNVMERNAVIEAGREGGAKSVQLIKDPLAAALGSHHAVEKPQGVLVLDVGAGVSDISLLSLGGIVMSKSLRMAGNDIDEAIIEYFKASKRVLISPLDAERIKHELGNLFKEEEKVLNVSVKNLITRLPETFYVSSLDVHQAILPIADKIVRLTHSMLSELPPVFAQDIYDRGIVLTGGSSMLKGLDAYLSSKLEIAVNPVENPLHNIILGAGRVIEEERYGSLLGA >NC_013512.1|WP_012857942.1|2189915_2191205_+|hypothetical-protein MEESIENFENSALSLSEVEERVDHFFQNFPIEAHKIHETLYGFEDSEMVEIIALMNNCKLPKHYASYKDFLREKIIQHLELQPNDLVLFVEGGVYIKLFFQLPQNEGESSDRRACGIEPALLEQYKKQFFPNDEYKKAILDLLHFVMEENLSFRKLTPASFKRVFIPVLVNLVETVVILQTHFEELKTIRGFSFYLLRELFDDMMLLIAQDILFHFSNTDRKAIEFLSAFSVHETIDSKGNRHKPNPILDESNHAWNITTIRSTMLQHKKAKQALYDKRNALITMKKKLEALKLDQKEILQEMNAIQNHLKAIEEKIAQIHRTIDKLEESSAEEVTFSENGVETVVGRKALMAKLFKKEDTFLSEKNKTRKSAEESEMRLSNKNKEIDLWEKRYAEAKAFVESSEKNTHPLDKQYERIQRALAKTLASR >NC_013512.1|WP_012857941.1|2189366_2189768_-|arsenate-reductase-ArsC MKKVLILCTGNSCRSIIAEALVNAKLEGIEAYSAGVRASGKVNAYAKRVLEEEGIWKDSYYSKTVDEVLHVNFDLVVTVCDHANETCPMFPKAIPKIHVGFSDPDGKDYGAFILTCKAIEAELLPIIKEKIIF >NC_013512.1|WP_012857939.1|2188505_2189240_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MEYLLYFGVTLVISTLFSIGGTGSAVALIPVLSFLGVGFDLAKAVGLFANTASTIGASVMNALRKSIDVKHVLPFVLMSVVCSPLGAYVSTRIDVHWVKILFALFLLFSATMMFIQKKKGAFTYTKMWFMVCMGGIVGFLSGLLGIGGGAMIIPLLIYLGYDAKQTAITVSFMIPFSTLSAFITYVYLIEIDWILLGVVAIAAALGGVLGNYIMIFKLSVEQTRKFIALSLYLLGFKMLYTLMV >NC_013512.1|WP_012857938.1|2187531_2188491_-|permease MFEWWETLSAWLVFYLFGLEKGLQLGEAVHFFLYDTLKIYILLVMIIFAVSFLRTYFNTEKVRVYLQGKSEFSGNILASLFGIITPFCSCSAIPLFLGFMQARIPMGITFSFLISAPLNNEIAIAMLFGLFGWKITALYIGCGLLVAILGGFIIGKCKLEKYVLIPVTPMSGDLEDIEIKMSIKKRAKDAWAYTIDIFKKIYLYVLMGVGIGAFIHGYIPTEFIANYAGGDAWYAVPLAVLLGIPMYSNAAGVMPLIEVLTGKGMLLGTALSFMMAITALSLPEAMILKRILHVKLIALFFGVVGFGILVVGYLFNAIL >NC_013512.1|WP_012857937.1|2187294_2187522_-|TM0996/MTH895-family-glutaredoxin-like-protein MKIEILGTGCAKCASLYENTKKAVAQKGIFAQIEKVEDIVKIMEYGVTSTPALVVDGKVRSSGKLLSVEEILALV >NC_013512.1|WP_012857936.1|2185819_2187253_-|GGDEF-domain-containing-protein MRLKTKVVVIIAGLLLGVSILGSLFNYLKSVNETQAQLQNTSLPLSVDNIYTEIQQRMIEPLLVSSLMAHDTFMRDWIMEGEGDMNGIVRYLTEIQQKYDIFTTFLVSDVTKHYYHPRGFIDVVNEQNSADAWYFRFKNQPEVYEINLDYNANLSDALIMFINYKVMNYKNEMIGATGVGVKLLNIEAMLNSFKSKYKYDVYFIDPKGELMLYSQGLNKRGNIANIAGLSELKEAIFSGKQTQFEYKDTEGEYLLNTKYIDKLKLHLFVEINKKEYLATLQKTFYTNLLMSLLVTLLVIAIIVYTINIYQKQLVQLASEDALTKLYNRREFNEQFERFSKMHHKGQTSLALMLIDVDDFKEVNDTFGHLVGDEVLVRLAQLLKENVRSSDIVARWGGEEFAILLVGVCIETTEEIAQILCERIKHDAVLQGILGRALSVSIGVGMFNHLESQDGLVHKVDNALYAAKKAGKDQVVIA >NC_013512.1|WP_012857935.1|2184765_2185785_+|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MKIALLMSGGIDSSYCAYLLKEEGHEVVGIYLKLHDDDKKHGVNIANIEKVSQHLGIKTHIIDAKALFKEQIYDYFVRSYEQGLTPNPCAFCNPKMKFGFAFEKALEFGCEKIATGHYARVKEGHIQEAKDKSKDQSYFLFGLKREVIEKIIFPLGEMKKEEIKPIALEKLPWLGSLESYKDSQEICFVTDTYIDILQKHLNVDQKGLIKDTSGKVIGEHKGYMHYTIGKRKGLTINGAHDPHFVVGIDAKTNTVIAGKKEELLQKRVVAQNFSLAEDFKEGTYGVKVRYRSPQVKAHVKIEGDKIITELEEGVYGLASGQALVVYQNDLVLGGGWIEA >NC_013512.1|WP_012857933.1|2183418_2184333_+|sensor-domain-containing-diguanylate-cyclase MNDASIFLKAILNSMTEQIAVLDFEGNIVFVNQSWIDFSLNNDAKPIEWESVNYLKICEHAAQHGDTGASKALKGILKIIHKEEESFYLEYPCHSPTQKRWFMMRVTPLLSFEQSYVVIAHHNITERKIAENAILNLSKVDGLTKLPNYRAFSQFLSHEWRRAMRTHTPLTMAMIDIDYFKYINDTYGHLKGDEYLRKIAHMLQRTIHRPSDLCARYGGEEFVIILGDTPLEKALGMMQTCLEKTIALRLPNPKSPIMPILTLSIGVVSVYPKPDMNEKAFIQKADELLYLAKKQGRNQLAYEL >NC_013512.1|WP_012857932.1|2182464_2183334_+|DMT-family-transporter MRYLIFVTLIWAFSFSFIGEFLSGSIDNYFAVLIRVSIASLIFLPLTRFRGIPRTLALKIMLIGSIQIGIMYLFFYHSFLYISVPEVILFTIFTPMYVTLVYDGLKMQFKPLYLISTGVAVLGAYIIRYHAINSEFIIGFLLVQGANIAFAIGQSGYKKVMESYPTISQKEIFGYFHFGAFFVSLIAFLLFANLEKTSPSLLQWGILLWLGCVASGVGYFWWNKGACEVDAGVLAIMNNALVPVGLLMNLLLWGSKTNLTLLLLGSIVIAFSLWLHSFFMRYYARQKDF >NC_013512.1|WP_012857945.1|2193218_2193884_+|hypothetical-protein MIFGKIDYINLLPFHVFLKQSSLPSAFKRSSEHHKNVPAIINRKLRKRRVDAAFISSIESKRKTITPLHVGIVAQKNVKSVIVKKGERKTDPASATSNMLSRVLGVEGEVFIGDRALKLYLENPNSYVDLAQVWHEKYHLPFVFARFCINTKQTFYKNLATQFVRKPIKIPRYILQHYAKERGISEKDILEYLKLISYTIEKKEQKALFMFLKKAHTLTRK >NC_013512.1|WP_012857946.1|2193884_2195240_+|NADP-specific-glutamate-dehydrogenase MENFIEDALKATKHSTPEQDEFYQAVKEVLSSLEPLLVSDSKYTKHNILERLIIPDRQIIFRVPWIDDAGKIRTNIGYRVQFNNAIGPYKGGLRFHPSVNLSIIKFLGFEQIFKNSLTGLAIGGGKGGSDFDPKGKSEGEIMRFCQSFMVELSKHIGETIDVPAGDIGVGGREIGYMFGMYKRLTNRYEGILTGKGINWGGSLARTEATGFGSVYFAENILNKQGETLKGKTCTISGSGNVAIYTIQKLYELGALPVTCSDSKGMIYDKNGIHLNSLKSIKEVARNDLREYLKVHPHATYIPRSEYKEGTNAVWSIPCFAAFPSATQNELNLEDIQILHANGCHLVNEGANMPSTLNAIAYMQKNGILFGPAKAANAGGVATSQLEMSQNASMQKWSFAEVDNKLRHIMKSIFELSYATSKEFGDEGNLMLGANIAGFRKVADAMIDQGAV >NC_013512.1|WP_012857947.1|2195364_2195907_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNHHKNELNIALRIVHASEFEKFKGDLQSAFSVSAEKEFGHTLDEPIPSDEDIEESILAQGAIVYWIEANQEIVGGAVVIIDEATQHNSLSFFFISTKNQSRGVGLLAWKAIEEAHPNTKIWETVTPYFEKRNIHFYVNRCGFRIVEFYNKLTPDPHQDTTTFQDDDEDDEMFRFEKVMK >NC_013512.1|WP_012857948.1|2195893_2197234_-|MATE-family-efflux-transporter MNVTKDNIASIFFQYSIPSVMGMLAISSANIVDGFFIGNYVGDFGLAAINISLPIFSFLFGFALMLAIGSSVLAGKFIGEENVKNASLIFSKTIVTITLFSFLTSSVLFLNIKTLLHFFGADENLAKIAIEYLSIMLLFIPFLMIGVVLDYFVRVDNRPNLAFIALLFSALINVLLDWFMIVYLQKGIFGAALATGISQLILLFILLPHFFSKKATLQFVKPIGSYAHILKAFYNGASEFVNEISIGIMTLVFNYVMIKNFGMEGIAAFTVINYLLFIGVMISFGISDSLQPIISKNFGAKEHKRIGAFLKLAFIATSLVGVVMILLLLFVPDTLADIFLEESNDTTKQIVLSFATYLWIIFLFDGINLVISAYLTAIHKPLASMVIALSRSLIFPVFFIVMLPFVFDKNGIFMAIPMAEAVSFIIAMSLFRKFSPQNLGELNESS >NC_013512.1|WP_012857949.1|2197244_2197841_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MPKMVNKEEKIDFICDEAYKMFADIGIEAFSLNQFIVSINMSKGQFYHYFSTKEQLIYQVMSKKVFELNAHIIEVCKHKKSFMEKLNLLFAIYMSEEAYYTDFRKLMVDTMHLYINSHDSTIREFNTTMYQTVFAILDEIFDEEIQKDNFHKDAKSIAKSICATADGMFLQSLMVDNYDLKVELSNYFLEIEKLLKKK >NC_013512.1|WP_012857950.1|2198057_2201648_+|EAL-domain-containing-protein MMKAFKDLNIKTKLIIIFVFIKVIPVILISMIALFGINELYTFLNTNTLAIKKTAQEVVTSTATIAVEDSILALDKKSQNSLEILSTQIAQAVANFLYERDHDLLFLSQSKPNPEMYQTFLETKKRYIMDVDTQKYVYDEHEKKWVYQTQNELETYFNEAKLPDNKREFQRIDPKPFQSKAIPLYKEITFLDLKGNEQIKISSLSPNKVNVAQKSNTYLKAENYFKHLSSLKKNEIYVSEVIGKYIPSRIIGTFSPETAQKAGIAFEPENHAYAGKENPKGKRFEGIIRFVTPVYEGDKKIGYLSLALDHRHIMEFTDTVDPLAYSKTDIPDAGEGNYAFMWDYKGRNISHARDYFIVGFDEKSGEYATPWLSQDLTNAFNESNVSNIHTFLKSYPLFHEQSLEKKPNLEQIKKGELGLDCRYLNFAPQCQGWMQLTENSDLGSFIIFWSNVWKLTTAATIPYYTGQYGSTPRGFGFVTIGANVDEFHKAANATKENLEGIVQNKLGEIDTMMTQAEEETSKHVKSVMDELTYSTLLLIFFMILIAMWLSNHLRKRLDALLKGSNEFAKNNLTYHINVESNDEIGILANAFNQMAHSLKGYMDTVMTLNASLEKKVQERTSELLLLNQTIQEQLDIKKEQEEKLEIFAKIFSNTIEGIAITNLEGIVLQINDAFSAMTHYAPHEVLGQDIRLLRSYKHPDSLYKEIWDTVFSNTAWQGELWNKRKDGTLYPALLIIHPILNREGHISYIVFIQHDISVLKHNEEKLHQQAYYDPLTKLANRTLAYDRLQHAITNAKSRRRLVSVLFLDLDKFKNINDTLGHDIGDLLLIEVAKRIQALCSQSDTVCRLGGDEFLVILEDITHYETAISVAKGIIAALSQPFYLEGRTISTSTSIGITYYPNDGDTMKTLLKNADIAMYRSKTNGRGSYEIFTTALSDFIKESVKLEERLKKAVEKHEFFMHYQPIYDLQKKEIIGLEALMRWNYKGVTYFPDTFLSVMEETKMIAEASSNLFISVFHFIKKLNEALGRELFVSINISPVQFSVAPFQESLIHALEASTLRAQLVCLEVTESLFLENIEEVSQKLAALKTYGFCIALDDFGSGYSSLQYLKVLPLNKLKLDRIFVQDLPDSQSDIAITQSVLALGKNFNVNVIVEGVETEEQCKFLEQIGCRYIQGYLISKPMPEENVLEFLREKEH >NC_013512.1|WP_012857951.1|2201688_2202327_-|uracil-phosphoribosyltransferase MKNVHVIKHPLIEHKLSILRDEKTEPFQFRLLVDEISYLMLFEATRDLPLRFVRVQTPVAVANAQKLDAKIMICPILRAALGMLDSVFKLIPDASVGFLGFQRNEKTLEPEFYYAKLPADHKERTAIIIDPMFATGGTAIDAVNFLKQKGIQDIRFLALVSAPEGLKRFAEVHPDVPVYTACIDDGLNENGYIVPGLGDAGDRVFNTEGASS >NC_013512.1|WP_012857952.1|2202327_2203602_-|malate-dehydrogenase MSKGKVTKEESLAYHIGGKIEINVKSRCDTARDLSMAYTPGVAHPCLEIEKDNELAYQYTNKGNLVAVISDGTAVLGLGDIGAIAGKPVMEGKSVLFKKFANVDAFDIELDEHDADKIVEICKALSPTFGGINLEDIKAPKCFDIEQKLQACVNIPVMHDDQHGTAMITSAGLINALEISGKKIEEMKIVVSGAGAAGIACAKMYKLLGAKNIVMIDTKGVIHSGRTDLNKYKAEFALETSDRTLEDAMKGADMFLGLSAPGVVTQDMVKSMNPYPIIFALANPTPEILPEEVYAVRDDVMMGTGRSDYPNQVNNVLGFPFIFRGALDVKATKVTEGMKMAAAVALAKLAKEEVPEYVKAAYNGEDLKFGYNYIIPKPFDRRVLVWVSAAVAEAAINDGVARVADFDIGLYKRDLQEIIDAEQK >NC_013512.1|WP_012857953.1|2203604_2204996_-|glutamate--tRNA-ligase 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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_013512_1 | 1.81|905706|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 905706-905741 | 36 | KR131711 | Fusobacterium phage Funu2 supercont1.1, partial genome | 26991-27026 | 7 | 0.806 |
| NC_013512_1 | 1.5|900730|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 900730-900763 | 34 | NZ_CP033045 | Bacillus foraminis strain Bac44 plasmid unnamed, complete sequence | 504930-504963 | 8 | 0.765 |
| NC_013512_1 | 1.27|902164|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 902164-902199 | 36 | NC_003267 | Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120gamma, complete sequence | 20832-20867 | 8 | 0.778 |
| NC_013512_1 | 1.47|903472|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 903472-903506 | 35 | NZ_CP009655 | Francisella sp. CA97-1460 plasmid pFCD_1, complete sequence | 2028-2062 | 8 | 0.771 |
| NC_013512_1 | 1.12|901187|33|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 901187-901219 | 33 | NZ_CP007214 | Burkholderia plantarii strain ATCC 43733 plasmid bpln_1p, complete sequence | 170025-170057 | 9 | 0.727 |
| NC_013512_1 | 1.33|902558|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 902558-902591 | 34 | NZ_CP017574 | Bacillus thuringiensis strain SCG04-02 plasmid PSCG364, complete sequence | 144108-144141 | 9 | 0.735 |
| NC_013512_1 | 1.33|902558|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 902558-902591 | 34 | CP002509 | Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26, complete sequence | 81767-81800 | 9 | 0.735 |
| NC_013512_1 | 1.79|905573|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 905573-905609 | 37 | NZ_CP034685 | Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S2, complete sequence | 142596-142632 | 9 | 0.757 |
| NC_013512_1 | 1.5|900730|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 900730-900763 | 34 | NZ_CP018939 | Bacteroides fragilis strain Q1F2 plasmid Q1F2-p2, complete sequence | 8114-8147 | 10 | 0.706 |
| NC_013512_1 | 1.5|900730|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 900730-900763 | 34 | NZ_CP018939 | Bacteroides fragilis strain Q1F2 plasmid Q1F2-p2, complete sequence | 50314-50347 | 10 | 0.706 |
| NC_013512_1 | 1.5|900730|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 900730-900763 | 34 | MT074146 | Bacteroides phage SJC03, complete genome | 61625-61658 | 10 | 0.706 |
| NC_013512_1 | 1.63|904521|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 904521-904554 | 34 | MH023293 | Escherichia coli Phage vB_EcoS-Sa179lw, complete genome | 35333-35366 | 10 | 0.706 |
| NC_013512_1 | 1.74|905244|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 905244-905278 | 35 | NZ_CP022249 | Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 plasmid pAMT1, complete sequence | 21982-22016 | 10 | 0.714 |
| NC_013512_1 | 1.74|905244|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 905244-905278 | 35 | NZ_CP022249 | Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 plasmid pAMT1, complete sequence | 36555-36589 | 10 | 0.714 |
| NC_013512_1 | 1.85|905973|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 905973-906008 | 36 | NZ_CP031270 | Staphylococcus warneri strain 16A plasmid unnamed1, complete sequence | 89514-89549 | 10 | 0.722 |
| NC_013512_1 | 1.96|906691|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 906691-906724 | 34 | NZ_CP050813 | Yokenella regensburgei strain W13 plasmid pYRW13-131, complete sequence | 9538-9571 | 10 | 0.706 |
1. spacer 1.81|905706|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KR131711 (Fusobacterium phage Funu2 supercont1.1, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
gttaaaaaccatcttcccattattattaaattttgg CRISPR spacer attttttatcatcttgccattattattaaattttgg Protospacer .** *.****** ********************
2. spacer 1.5|900730|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033045 (Bacillus foraminis strain Bac44 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
taagagctttatctcttttttctttagttgtagg CRISPR spacer ttagagctttatatcttttttctttaccttttcc Protospacer * ********** ************* .* *
3. spacer 1.27|902164|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_003267 (Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418 plasmid pCC7120gamma, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
atgatttgtgtctctttttctgtctcaaattgtgaa CRISPR spacer ctgtattgtgtctctttttatgtctcaaaatgcaat Protospacer ** ************** ********* **..*
4. spacer 1.47|903472|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009655 (Francisella sp. CA97-1460 plasmid pFCD_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
aaaaaagccaaaaaagagccaaaaagtgccaaaaa CRISPR spacer caagaagccaaaatagagccaaaaagagaagaaat Protospacer **.********* ************ * .***
5. spacer 1.12|901187|33|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007214 (Burkholderia plantarii strain ATCC 43733 plasmid bpln_1p, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ctcttcgagcttgacccgtgagcttatcgtctc CRISPR spacer gtcttccagtttgacccgtgagcttgccgatca Protospacer ***** **.***************..** ..
6. spacer 1.33|902558|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017574 (Bacillus thuringiensis strain SCG04-02 plasmid PSCG364, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ctttaaagattttataagcccgtttttatagttc CRISPR spacer catagttcattttataagcccctttttaaagttt Protospacer * * . ************* ****** ****.
7. spacer 1.33|902558|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to CP002509 (Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ctttaaagattttataagcccgtttttatagttc CRISPR spacer catagttcattttataagcccctttttaaagttt Protospacer * * . ************* ****** ****.
8. spacer 1.79|905573|37|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034685 (Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tgacata-aacgccatcttgcaatgcttttttaataga CRISPR spacer -aatctactacgccatattgtaatgcttttttaatact Protospacer .*. ** ******* ***.***************
9. spacer 1.5|900730|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018939 (Bacteroides fragilis strain Q1F2 plasmid Q1F2-p2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
taagagctttatctcttttttctttagttgtagg CRISPR spacer gaatagctttatctctttcttctttaactaattt Protospacer ** **************.*******..*.
10. spacer 1.5|900730|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018939 (Bacteroides fragilis strain Q1F2 plasmid Q1F2-p2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
taagagctttatctcttttttctttagttgtagg CRISPR spacer gaatagctttatctctttcttctttaactaattt Protospacer ** **************.*******..*.
11. spacer 1.5|900730|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MT074146 (Bacteroides phage SJC03, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
taagagctttatctcttttttctttagttgtagg CRISPR spacer gaagagcttcttctcttttttctttgataaaatt Protospacer ********. **************..* . *
12. spacer 1.63|904521|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MH023293 (Escherichia coli Phage vB_EcoS-Sa179lw, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tttagccctcatttaagggctttatcttttcaaa CRISPR spacer acaagccctcatttgagggctttatttttaacgc Protospacer . ***********.**********.*** .
13. spacer 1.74|905244|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022249 (Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 plasmid pAMT1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caacaccaaaaatggcacttatacgtttcctaatg CRISPR spacer aataaccaaaaatggcactaatacatttctaacaa Protospacer * *************** ****.****. * .
14. spacer 1.74|905244|35|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022249 (Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 plasmid pAMT1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caacaccaaaaatggcacttatacgtttcctaatg CRISPR spacer aataaccaaaaatggcactaatacatttctaacaa Protospacer * *************** ****.****. * .
15. spacer 1.85|905973|36|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031270 (Staphylococcus warneri strain 16A plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
agttcactttcaacatcaatgctaaaagaagcgttt CRISPR spacer ttctttacttcaacaacaatgctaaaagtagcgtat Protospacer .*. .******* ************ ***** *
16. spacer 1.96|906691|34|NC_013512|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050813 (Yokenella regensburgei strain W13 plasmid pYRW13-131, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
atgcttttagcttctttttatgtaggcaaataca CRISPR spacer cttcttttagcttctttttaagtaagcttgggct Protospacer * ***************** ***.** . .*
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
759497 : 783783
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_013512|759497:783783|DBSCAN-SWA 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29 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase,integrase | attL 759548:759566|attR 782859:782877 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1244642 : 1285271
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013512|1244642:1285271|DBSCAN-SWA 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38 | Escherichia_phage(54.55%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1264181:1264197|attR 1291346:1291362 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1810059 : 1827730
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_013512|1810059:1827730|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_013512|1810059:1827730|1821006_1822032_-|WP_012857558.1|DBSCAN-SWA MAILITGGAGYIGSHTLIELANANYDFVVYDNLSNSSKESLKRVANIIDKEVTFIEGDVRNTQKLKEVFLTYSIDSVIHFAGLKAVGESVAKPLQYYDNNVVGTLNLLEMMKKFDCKKIVFSSSATVYGDPTTTPIVEHFPVGATTNPYGTSKYIIERILEDLYISDNSFQIVILRYFNPVGAHESGTIGEDPNGMPNNLMPFISQVAVGKREYLSVFGSDYDTHDGTGVRDYIHVVDLANAHVKAIDYLNKQLDNIKLLITNIGTGKGYSVLDVVKAFEKASGKEVPYRLCGRRIGDIAKCYANPAYAKEILGWEAKRTLEQMCEDSWRWQSNNPNGYGF >NC_013512|1810059:1827730|1816561_1817494_-|WP_012857554.1|DBSCAN-SWA MQKILITGSSGMVGKNIVEFEKSKNYILLTPSSKELNLLDKNSVEMYLKINKPDVVIHCAGRVGGIQANMAHPVDFLVQNTQMGLNIIMASYEARITKFINMSSSCMYPRYAKNPLGEELILKGELEPTNEGYAIAKVTSTRLCEYINKENKEFHYKTIIPCNLYGRYDKFDPKHSHMLPAVIKKIHEAKMNNEATLDIWGDGEARREFMYAEDLADFTYFALENFESIPQNINVGLGHDYTINEYYKVIAEVIGFEGEFVHDLSQPVGMKQKLIDDTKLKNFGWKYKISLKDGIKKTYEYYLKEVLNDK >NC_013512|1810059:1827730|1818621_1819953_-|WP_012857556.1|DBSCAN-SWA 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19 | Tupanvirus(13.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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