Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_013921 | Thermoanaerobacter italicus Ab9, complete sequence | 5 crisprs | RT,cmr1gr7,csx1,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7,cas10,cmr3gr5,csa3,DEDDh,cas3,Cas14b_CAS-V-F,cas4,cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b1 | 2 | 10 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_013921_1 | 759928-763624 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_013921_1
|
55 spacers
spacers of NC_013921_1
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cmr3gr5,cas10,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013921_1
The CRISPR arrays of NC_013921_1 >merge|NC_013921|1|759928-763624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_013921.1|WP_012994798.1|758523_759594_+|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr3 MLFEVSPLDNVYFGKGHPFSAGFEGIGSGIFPPAPSVFYGAFATYYLSLNGINPQNLEFVQKNLKIKGIYYKNGEAWYTLVPMDLVKNKEDKEENKLEFLRVGKPLVETDLGDGQINLLYSPNKVENVKGLIDDLAMSNYLKGIKENIFFKPFNDFVTKENKIGIKIDYDKRSSKKGYLYKTDYIKMAKDIKNSLEFVVDVECKDFSFPDTGLVKLGGEGKAAKVSRVNDIPKFLEEKFTEEVKEIITKTGKFKLILVTPSIFQNGWKPDFSKLNIKVKLIAAAIGKPISIGGWDMKNKRPKVMSKAVPAGSVYYYEILEGPIDSLIEKIYECGISDARANEGFGRCLMGEYDWLN >NC_013921.1|WP_012994797.1|755799_758520_+|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MSKKEELFENKLKAYFHDSPDKPFILLTGENHEKRAKEISKKIDIPYHKTIASDVLASFMERYYIPKDASKNKNLQVVFEEQPEFVHPLAANRYNNFVIEKEVFKKAVDEAVDELSKLDFKDSYKKFVYLWRYLKELLKKHTPSEYRKYWDLAPADTRFPNHTIFEHLKLASAVNAYFYNELNLNNMTLFIFTIGPVQEYIVQARKTQDLYWGSYILSYLTWVAIEKVIEAYGPDSIIFPELKEQPLCDFWIAKLFNNSATTTKDLKTPTLPNRFFAILPTKNVEEIRLLNLKKTVKDEYIKIGEYVFSHLVKSNDEQKKLLLRQLSNFPDVYWVALPLENGDVNRPDWEIQLDKIKDYFNSDEVEEIKDLLRYIKDKGEYGPNIGNIYGLLYSFMEKMMGTRKGIRNFNQYEEIGRKCSICGEHNVIIYRCTREEDEKIEKGKESYKIKLLREQNAIIKKSDDKSITYKYLAQGEGLCSRCLTKRAAEIYFKDMFGKNNIEESFPSTAEIALLDIINNSDNDLKTNIKRYKEVFKKWCGDNFDYELLYEENLNENYFKTYDFNSKRLGKLKELLKSIDKRIKDIRLNKKKYYAVIKLDGDNMGKWLAGELAPYMLEMYHSKLQGFLPEDFKEKIKDKKRLMTPAVHSLISEALKNYSLKYVKEIVEETRAGKVIYSGGDDVFAIVNLNYLLDVMVKLRAAFSGHLIVNNEIIPDFTIDAGFVERKEEIDVMMGNKATASMGVVIAHYKEDLKNVIASVDEVEEEYAKKVEGKDAFAIKLILHSGENYIARAKWNYDDARNKEGTIGLLKDINSFFKEDKLSISFVGKLKAALERLDVDSLPQGIFISELKRNIKRSLNENLSKDEKEKVERDLYILLYSLYKEVKYDNFISLLTILAFLNRGGEK >NC_013921.1|WP_012994796.1|754848_755652_+|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MINSNKLKIPFDTSYYLKNAMEKVENFNLLFNKYIEFNKKSEVEKKRIPEAKKEFFDSCIQFTRKQKYIIDKYKLQGYEVATYEFRPYDKIVVGLGQESVREVSMTLHWIYGIPYIPGQAIKGVISNWIKFRDEENSNDDNFKKIFGTEGEKGKVIFMDSYLANDDFYLKQDIMNPHYFEYYSQSKNPSAPSDWQNPKPIFFLIVENAIFHISLIFLEKETKDLKIANKTMEEWMIEAFRYGGIGAKTSLGYGTGELTLIRENERNA >NC_013921.1|WP_012994795.1|754451_754859_+|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MTDKDSIKTTVNERAKFAYECVKKVATYEKEEFKNNYKSYAKKLMAIIKTNGLGATLAFMKAKGSSAYQELYNNIDSWLKSENCPVSSLYSNSTADMVEKIISLESDAYRAITKEVMEFINWIRRFAEGMIPDDK >NC_013921.1|WP_012994794.1|753486_754455_+|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MFKKAKPFFIYTETPTHVGSGSELGYVDLPIQREKHSGFPKIESSGLKGALRSAFKGDESLRENVEHIFGPEDGDLYAGAIGFLDARILLFPIKSARGIFGWITCPYVLSRFKEEISLCDRNELKELEGIETIEPNSIVEGSNLKLQNKGNNNVVILEEYSFKVKSNNKLQQFSEWLADTLFPKSQNGQNDFYSVFREKMKKDIIVISDDDFRDFTEMSTEVITRTRINPGKGTVENGALFNEEYVPENTLFYSLALASMLFIDEAEKEKIKKEEKSKPDEDFILDYFLNGIRKHEIIQIGGNATIGKGIVRIGALDRSDIK >NC_013921.1|WP_012994793.1|751981_753457_+|TIGR02710-family-CRISPR-associated-protein MESEGILSNSEIEKKIKEKVEIWETKPAKEAEDYYYQEIFPLVVKKFHLETDVSFKEKYENLILSLGFSFEPLVLTISFIKPKQVLFLYTKDSRENLDKVIQWAGLLPSQYVAEEIEKDNPVDIYRVLKKIYVEKWNKPDKTAIDFTGGTKAMSAGMAMAGAYLKIDLIYVASEYNNKMRKPWPGTEKLKVVEDPYEVFGDLEKDKAIALFNKGDFASAYKIFSELEERVAYRDYTFYKMLSQIYSCWDNLSFNEAIEGFEKLFKILKSWKPIDKDIIGYKYEEILYKQHELIKPLKEIDLKDKNKEWEYVTNKHVYIPLLFSIYTNALRRSYEGKYDVAILLLYRILELIAQVRLASYGFSVSLPDYSKLPVGGNELLEKMNENIKPFRKRSKNFKNYSELPQSSISLFDAYVLLKAIEDKLVKDIELGLIYRKVKLRNKSIFAHGFGILMEKDFNDFHETVKKILIRFCEIERIEFEKVCKDYKFVLLE >NC_013921.1|WP_012994792.1|751498_751900_+|DUF86-domain-containing-protein MRERVEKFFNDFAKAFENLKKATEVAKDDLDIDGTIKRFELCYELAWKLMKEYLADLGIIVKSPREAFKQAFINDLIENGEVWLKMIEDRNLLVHIYTHEQSRDIFQRIKDEHVAELGEFYKSIQQKIENDEF >NC_013921.1|WP_012994791.1|750183_751515_+|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MRSFLVRSVRKKGIEVYKARLKCEVITPVFMAGADGRTPELRPSEFKGMMRFWWRAVKAEDDIAKLKKEENGIFGGTGEGEGKSKVTVKVFCDKIFWEKALRVKEAGIKYLLYSTILPNRERGYIKEGSTFYIEISTFEEKYLNHALASLWFAIYFGGFGTRNRRGGGNIIVTEVDEHVSIDFIPKGKNSDEVAEWLVKNFEIAKKIINGSDKTYFASKYSNLSISRLIISNIGFTSWKDALNDIGTIFKNFRVRTEGQVFESAVFGLPVRHRSGGTVIGVKIEKKSKEKFQRRTSPIIIKLIKVEGKYYWSVIRLAGQFLPEGAVLKFNDKTQKPEYALIEEFWAQLKERGEEKILSIPDSMKEIVDKIKENIDPEKIYLYGSRARGDFNKKSDIDIAVESDKSVEAMDMIGPFDIVNLKKVNKEFREKIYREGVLLYERKG >NC_013921.1|WP_012994790.1|748517_749840_+|TIGR02679-family-protein MNKEELRYFKEKKGYKRIFEGIREKYRSLGRLGGVVKLDNLTEDEKEVLTNHFKKDYRTKKSASIDVAKFEESLKNTRFEEYTLKDILEYYFGEKLTSKKEDMEILAKEREEFFKELFSKYQECKCIDWLKSLYEGTAVGVRAVNQRYLNDKDGLKKDIMYVCDAINNLPVYKGEKKRLPVFSSQIARNPHYFDSNTEAGSMFINALCTLMGLNEVKGSEEISELYYNVGILIDEISNYVTLSGLLAYEGDTENQVFKAAYESNQVLQVPLLNLSKIERIVSPSKKVYVVENPSVFTSLIDATSKVFPVVCTYGQPKLSSLLLLDMLYKEGTEIYYSGDFDPEGLMIADRLYKRYKDKFHFLRYDVEDYLKSLSNEVINDVRLSKLNKIESPLLFDVANEMKIIKKAGYQELIIDDIINDIRLIEEGKGGGKIKVISMPS >NC_013921.1|WP_012994789.1|744358_748525_+|TIGR02680-family-protein MSEKLAERWMINRIGLLNFWYYDDEIFEFADGRLLLRGANGSGKSVTMQSFIPLVLDGNKSPERLDPFGSKARKLEDYLLGEEEVSGLDERTGYLFMEFKKEKKDSYITIGMGLKAKRHQNMDFWGFVILDGRRIGIDFFLYKMEVGDDGKRVKVPLTKKELKNRIGEGGEVVESQKEYMEMVNKYIFGFSSIEEYDELIKLLIQLRSPKLSKDFRPTVIYEIMKASLPSLTDDDLRPLSETIENMDQIKMHLDVLYRNMAAVKKLKNEYDNYNKYILYEKAGDLVKAYSDLYASKKEYDNLTKDIENYRSTIANLGNDIISLESEREALKKKEEQLSSGDAKRTQKELLEEEDRYKQYLEDKSKKEEELRNKQDKYYGLERKIKNTEEQKYKLDKELQDKLEDISSIAQDIDFMEHEFSVSELKKVYGKEFDFTYWKNELKKHKDKIKRAINALREEIEANKRYDAALKEQERLKKEREDRAKKLNEAERLFDEQKREYVERVYSWSQGNAELKLLSSQLEGLSRVILAYGEDKGFDDILAFVRKPYEEILNGIQQEILRLENQREVKENQLHEKEKLLEEWKNKKDPEPERDEQVINNRKRLKEAGIPYIPLYMAIDFKEDVDEETRGNIEAAIEDMGLLDALIVPKEYFEKALQLDSNMADKYVMPGSFNMMLNVSQYFRVVDNEEGVSPEDISDALSNIFVSEESGTTYIDSNGTYGIGVIKGKARDGVKSKYIGSESRKRYREELIKSIQEEIQAIKAEISAIDEEINVKKLRIQRLDYEYSAFPGKEDIEEAYRYLKTAKADYEYTSHKLDEQLFTVKNCFEDLQKKKAVVRELTSGINIHPDIDTYSSAYEYAEGYASGLNEVEILYNKYVLHISNEEMLLQQKQDLEYDIDNLKYEIDVLENKIQSSVKKIEMLKETLKELGLEEIEKELEICLKRLEEIPKEITNKSAEKAKLEERLQRSLKDLLNIEEEIHLKENIYNIVEEGLKRELALGFVKQDVEMEDMLKLSKSILSEYKGFFDKAGFDREKFTERLQNVYFETRNELLEYGLSIGNIFDEACEGDNERIKEAKNKQRRLNITANINGKIVSLYTLYSNIEEDIMANESLLRETDKILFEEIIMHNVGIKIRAKIFKAEEWVKKMNKLMSERDTSSGLKFSIEWRSIPASNEEELDTKELVDILKSDADMLKKEVFDKVVNHFRSKVERARRAMEEKNNTETFHKIMKEILDYRDWFEFKLYFKKEGESRKELTDNAFNKLSGGEKAMAMYIPLFSAVYSRYEGASPTAPRIISLDEAFAGVDDTNIRDMFKLIEDLRFNYIMNSQVLWGDYDTVPKLSIYELVRPKNAKAVLVMKYLWDGKVKHLILPEKDEVAALEVGAINE >NC_013921.1|WP_012994799.1|763709_764930_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSAKTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKRKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSVKKLESLGLKVTVESAAS >NC_013921.1|WP_012994800.1|765798_766794_+|aldo/keto-reductase MVKRKLGKSGLEVSGIGLGCMRMSFGQNPLPDREEMIALIRKAVELGVTFFDTAEVYGPYTNEELVGEALEPFKGEVVIATKFGFDLYPDGRPGWRGLNSRPEHIKKAVEGSLRRLKVDAIDLYYQHRVDPNVPIEDVAGAVKDLIQEGKVRYFGLSEASAETIRRAHAVCPVAAVQSEYSLWWRKPEEEVLPTCEELGIGFVPYSPLGKGFLTGTIDEKTQFDSTDIRSSIPRFQPEAIRANLALVDFIKEVARRKQATPAQIALAWLLAQKPWIVPIPGTTKLERLKENIGAVSITFTEEELREINEALSKIPIQGGRYPEEVERMTYR >NC_013921.1|WP_044018591.1|767925_768795_+|aldo/keto-reductase MNMQKVVLNNGVEMPILGYGVYQITDLEQCEQCVYEAIKAGYRLIDTAAAYMNEKAVGKAIKRAIEESIVKREDLFITTKLWIQDAGYESAKKAFEKSLKKLQLDYIDLYLIHQPFGDVHCAWRAMEELYKEGLVRAIGVSNFYPDRLMDLIVHHEVVPAVNQIEIHPFCQQTESIEFMKKYNVQPEAWGPFAEGRNNIFQNEVLASIAKKYNKTVAQVILRWLIQRGIVTIPKTVHRERMIENISIFNFELSQEDVEKIATLDTKKSLFLSHNDPETVKWLSTIKFEI >NC_013921.1|WP_012994803.1|768835_769528_+|hypothetical-protein MKRRLFWVLVLVFVMSFTLVACSGNNSARNHSQQEQQPTTSEGQADIENENPTLEIEAADPQTKTIDSRPVESESAVSQSESNDKSTSAGRESNSEIIDNEEDLDAVDSDRIKLTFNNEEVIVKMYDHPTSRDFLTLLPLTLTFRDYAGAEKISELPKRLSTKDAPSGSDPSVGDFAYYSPWGNLAIFYRDSGYASGLIILGKIESGMEKLARINGDFTVTIELLEQRKK >NC_013921.1|WP_012994804.1|769880_770375_+|flavodoxin MAKQILIVYFTWSGNTRKIANLIHKEIGGTTFEIQPKVPYPSSYNEVVAQAKKEIQTEYKPPLKTKIDHIESYDIIFVGSPNWWSTIAPPIATFLSEYDLSGKTIAPFCTHGGGGKGQMISDIIKLCPKSTILEEFVIYGSGAGDAQANVSQWLHKIGITQLKR >NC_013921.1|WP_012994805.1|770435_770876_+|cupin-domain-containing-protein MDKTEPRNLSGRTIFPLGQKVESEHFTGTVWVETLVSNDGIFNCPIYNVTFEPGARNNWHKHPGGQILLVTGGRGYYQEEGRPVQIIKEGDVVKIQPGVKHWHGAAQDSWLSHIAITANPKKGEVEWMEPVSDEYYLQLKIEGKDA >NC_013921.1|WP_012994806.1|771015_771408_+|MerR-family-transcriptional-regulator MTIAEVSKKFGLSPDTLRYYERIGLIPRVNRNESGIRDYTEEDCKWIEFIKCMRSAGVQVETLVEYVTLLQQGDKTIEARKQILIEQREKLLSRIEEMKRALERLNFKIEEYETKLIPAENNLKRLTHNS >NC_013921.1|WP_012994807.1|771770_772259_+|small-multi-drug-export-protein MESFVKEILNFLPRELAVLFIAALPVIELRGAIPIGISLGLSPFYTTIISLIGSMIPVPFILFTIKPIFVRLKKTRLFKKLVDKLTDRSLKYNGEKIQKYGVWGLVLVVAIPLPGTGVWSGSLAAALLNMQFKQALLAIFMGNIIAAILVMILSYGVGSLFF >NC_013921.1|WP_012269497.1|772677_774684_+|sodium-translocating-pyrophosphatase MEKLIWLAPISGVVALLFAFMRTMMIIKSPVGNEKMREISDAIHEGAMAFLLREYKTLAIFVAVMFFVIGTFINWQTAVSYITGSIASVLAGFIGMSVATRANVRTANAAREGMNKALSIAFSGGTVMGMSVVGLGLLGLGILYFLFGDPSDVKSFDVINGFALGASSIALFARAGGGIYTKAADVGADLVGKVEAGIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDVAGMGADLFESFVGSIISGIAIGAVAISPVTNQPYGIKGVIFPMLVAAAGIISSIVGTLFVRTGEGANPQKALSKGSFASAIFVILITFFFSRYFLQEINAFYAAVSGIVVGVLIGILTEYYTSSNYNPVREIAKASQTGPATNIITGLAVGMKSTALPVLFIALAIIISYKFAGLYGIALAAIGMLSTTGMTVAVDAYGPIADNAGGIAEMAELDPSVRKITDKLDAVGNTTAAMGKGFAIGSAALTALALFSAYTTAAGLKEGIDLLRADVIVGLLIGAMLPFLFSAMTMEAVGKAASQMIEEVRRQFREIPGIMEGKAKPDYARCVDISTRAALREMIIPGLIAVIAPLAIGFIFGREALGGLLAGALVTGVMLAIQMANSGGAWDNAKKYIEEGNYGGKGTPTHAAAVVGDTVGDPFKDTSGPSLNILIKLMTIVALVFAPLFMK >NC_013921.1|WP_012994808.1|774827_775268_+|SoxR-reducing-system-RseC-family-protein MKEKAIVVSKKGNKAEVAVIRTSACDKCRACSGGVKGQPLKVWAENETKAEVGQIVEIEMESKALLSATFILYVIPLAGFILGVILGLKLADILNIMWKELFSFLIGLLFIILVFAGIYVNNRFFEKSRMFTARIVNVLDDQYQKR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_013921_2 | 1389800-1391699 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_013921_2
|
28 spacers
spacers of NC_013921_2
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cmr1gr7,cmr6gr7,cas10,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr3gr5,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013921_2
The CRISPR arrays of NC_013921_2 >merge|NC_013921|2|1389800-1391699|CRISPRCasFinder,PILER-CR,CRT 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>NC_013921.1|WP_012995403.1|1388493_1389714_+|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELENIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEITKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKRKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESVAS >NC_013921.1|WP_012995402.1|1387007_1388024_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MNKKEVTVHLETITPLWTGDAWQENSKVRPSSLMGSLRFWFSVYWKAVKNGNNEKLNNNNVVVDNLGELENPKEVRTLKQIFLKRLLREGDNKSFDNILDESLEDLGLSVPSRLFGCTGWKSRVDIEISSFIKQELNFKEIDFNFPFKENGINTEHWIKSVLFQRKDSKIVLHKDVKLLLKTTEYWWDNYLSGFFNFYKDKIIFVGGKLSFGFGLVNIRVEGEQNDKEANIKGIKYNDIMRIHKIEKIKYDNRKKVLGYNFKYFLRREEEMRYRKRNFGEQGAASSIYVSNLIENDDYHVYLINFNNPFDNKKVPDKIFNKYQKLLFNHLKSRGDRNG >NC_013921.1|WP_012995401.1|1385764_1387015_-|hypothetical-protein 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MKYGDLIQYEPIETVIKLKDADKIDEAKRLVKSYVVSEGMADSIINICIPQLQFDETLDNKGIFIVGNYGTGKSHLMSVISAVAENKEMLDYVSHEELKKEMGKIAGKFKVLRFDIGAVNTPLRNIITKEIEKDLARYGIEFYFPPIDEVTNNKDAFMEMMSKFEDKFPDKGYLIVVDELLDFLKARKEQELIRDLTFLREIGEITKSTRLRFMTGVQETLFDNPAFNAVAQTVLKMKDRFEQLIIKREDISYVVSQRLLKKNDRQKAWIRSHLEKFSPLYKSISSRIEEFVELYPIHPMFIEVFEKMFIVEKREVLKTISHLMRELLDKDVPEDEPGIISYDSYWKFLRDNPSLRAEPDIKRVVDKSIVVEDLIEHSFTRPQYKHAALRIVHALSVHRFTTGDIHTSVGITVENIKDDLCLYIKMPEIEEDFLITTIETIIKEIMKTLSWQYISYNPDNQQYYLDMVREGINYDAKIQEKAELLSEDIFNRHYFELLIKVLDWNAPEKVPNMRIWEYSLTWNEKNVKRYGYLFMGYPDERSTAQPPRDFYVYFLPPFVEANYNKKYILNGKEDEVFFEFINADEEIIEKIKKYAAAMELSELSSSDQKKIYEDKAKGFQRDITKWIRDNVSKCFNVSYKGETQSMIYWLKGKTANYDTIKSYIDEAASSCLSLYFSEKYSEYPTFYTKITEANLSEVFKSAMNYLAGKKTETGKKVLQSFDLILGDDIVPGNSKYANYFLNELYKLPPGKVLNREDIIENVNGEDIDKRFKLEVQWVVLLLSALVYSGDIILRIKNKVYDATTIEALANMNVGELIEFDSFERPRDIPVRELKTLFTLLGLPSGLVTASLSKPEEAIRQMVAKSEELAKKVVTVNQFVVSNKTIWGKPIFDEFEVRDYKNLLNSFSDFLDSLKAFNTPGKLRNFKYTEEELKEKFNILETVKKIEKIIDFKNEVEELVKYLASAEQQLPEEIELKQNINEMKNEVERFIKEIDTKESEDIKRLTRELEELKIEYIKLYMEYHKKHRLDYNGDERKKKIMASDPFNNLKKLKDVGIFPVNKFDEIEKVLASLKTCYNFGKENIKTEVLCPNCGYSIKSDEVPVFGKLDEIEDKIENLYKEWTKILLDNIEDPMIQERIEILNKDQQKAIRDFLNKKELPDKVDNLFVSSVKDLIAGLEKVEIEINEFISAITYDGPVTVDEFKKRFLENVDFLIKGKDKDKVRIIIK >NC_013921.1|WP_012995395.1|1372680_1375242_-|DNA-methylase MKLTKEMLDKVRNIEGFPIGKDEDIIELSDPPHYTACPNPFISEFIEKYGKPYEEEKDDYNCEPYTADVSEGKNDPIYNAHSYHTKVPHKAIMRYILHYTKPGDIVFDGFCGTGMTGVAAQMCGNPDPEFKLKVEKEFGKEGKKVDWGARRAILGDLSPAATFIAYNYNTPVDVEEFKKEAERILKEVEKECEWMYKTIHTVEGVPQRDVEGNVIKGKINYTVWSDVFICPNCSNEIVFWDAAVDKEDGKVLDEFKCPHCGAKLTKTSLERAWRTVYDKAIGETIKQAKQVPVLINYTVGKQRYEKEPDKFDLELIQKIEEMDIPYWYPTDRMPEGEESRRNDKIGITHVHHFYTKRNLYVLSALYGRIKHENLFYYIFKFMFTAIVPMSTKMSRYGKRTGNVSGTLYIPSLIKELNILEYLKRKLWGAKGLLKPLQKFRNYSRNNCYIYTNSTTLVLIKSNSIDYIFTDPPFGDNLMYSELNFLWEAWLKVFTNNKTEAIINKVQRKGLHEYQELMEKAFSEMYRILKPGRWMTVEFHNSKNAVWNAIQEAILKAGFVIANVRTLDKKQGSFKQVTTTTAVKQDLIISAYKPKEGFIKRFLKEAGTEEGVWDFIRQHLEKLPVVIETNGKLDIIPERQEYLLYDSMIAFHIQKGATIPMSAAEFYEGLKKRFIERDGMYFLPDQAAIYDTKRLKLELNEQLAFIIQDEKTAIQWLKYKLLNKPMTYQEIQPMFLEELKQLRYEKLPELLDLLQENFLQDEAGRWYVPDANKQADLEKLREKRLLKEFEEYKNVPGRLKVFRTEAIRAGFKNCWKNKDYETIVKIGEKLPENVLQEDQTLLMYYDNAVTRLGG >NC_013921.1|WP_012995404.1|1391896_1392265_-|large-conductance-mechanosensitive-channel-protein-MscL MLKGFKEFIMRGNVLDLAVAVIIGAAFNKVVNSLVADVLTPLIGAIFGAPDFSALKLGPIAIGNFLNAVVNFIIVSAAIYFFIVAPMNAIRLRKAKEKEQTPPEPSEEVKLLREILEVLKEK >NC_013921.1|WP_012995405.1|1393242_1393707_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MWQDLYKAAFYYLLKLGVPQADAEDIAQEALLSTYLNLDGIQEGKLKAYVLTAARNKYTDYLRKTKKDMTVSIIDVFPQSTFSEFQQIENKEVIKKAVNRLTFNEQKLFYLKFILEMSNEEISSYLKTNSNTVKTMVWRLRKKLKEYLKEEEKS >NC_013921.1|WP_012995406.1|1393707_1394676_+|sigma-factor-regulator-N-terminal-domain-containing-protein MGSDLNKPISNIPFDEKAFLRKARFKSILRIIIISLIIAIGVFVLTIIIPEMMLQNQENRIDSFYPGIVKFTEPNTFAISGESYNVRLFGRQKEYYLLRLIGNKPYPAGIVTVDFDIWGGEQVKGDKSFCVIESNSNELSSLYTEISTVIPEGTKEYLAPYAVPKLKFYNPAVKYDKVIREFDVLKNIPNDNLVEMALSFDRPLTHSEIKTIIPEDLKLMWGAVLVYEEKDYKQRSYLAERLVGNPYVNSPNGKKEFLKELERLSNVQSYFSTNLKRTVNFLKENGIKYYGVVVVGPPESLQKLSSNSIITGAVLGIVTEPY >NC_013921.1|WP_012995407.1|1394719_1395988_-|copper-amine-oxidase MLKKLSLILLVFVAFSILIPISAQAANITIAINGQNVVFEQKPVIKNGTTLVPMRAFFETLGAKVNWEEKTKTVTAFRGETTVQFIIGHKIAKVNGKSYELVVAPQIINGYTYVPLRFVGEVLGYEVIYENGHIIIASNLKAAVSLITAPKNAIDEAKTFSSSHITSKKDLYLLIKNALENNEDEITFTLSNSFYNSVRSSGTVNDILNSISDIVDLVLAHHPEIGYANKWTISANSFNNVISKVSIKFEYIYPKDKLEKMKDEVYIKAKEIISQIIKPDMSDIDKVKAIHDYIVKNTKYDYENLINNTIPPESYTAYGVLIKGVGVCQGYAAAFNLLAQLAGIDSLGVAGTGFNYSGSMPHAWNMIRIDGKISYVDVTWDDPVPDQGDNVRYDYFNVTEEQLAKDHSWDKEKFLEKYFDYK >NC_013921.1|WP_012994256.1|1396797_1398210_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTGKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMGVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEIPKPDGGKRLLGIPTVLDRLIQQAIAQILNKVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVRSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKVNEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS >NC_013921.1|WP_012995408.1|1398269_1399466_-|site-specific-integrase MPGSIEKRGENSYRLIVSAGYGPDGKRKRYTKTIKVYGKSESAKLKEAEKELAKFVAEIEGNLFVEPSKLTFKAFIEKWLKEYAENNLAPKTLHRYKEMLEKRIIPALGHLKLDKIKPIHVLEFLNMLKEDGARLDGKEGGLSPQTIKHHYRLIHAIFEDAVKWQLIPSNPASNIEPPKVPKKEAGYYNEEEVRKLIKALENEKLKYKVAVMVTLAAGLRIGELMGLKWEHIDFENNIIKIEQANQYLPGEGTFTKNPKTETSKRLIAMPKEIMDLLREYKKEQNIERLKKGSMWIDTGYVFTQWNGQPMYPYTFTKWFPKFLEKHGLRRITFHQLRHTSATLLINAGENVRTVSARLGHSNTSTTMNIYAHALKSADRNAADKIANYLFDKNRVGAE >NC_013921.1|WP_004401152.1|1399640_1400342_+|hypothetical-protein MKKIIFLMIISLLIGLGIGHVFPIFSAPKEVKADTENVVYSKITNNNDNRENTTKKLKSVEDIEKILMSQNGYTYTTKENATKIFGDKLIQLPEKLHYDFETTGNYFADTNLQEGKTSIGQYWINVDKKKVITIREFMPSKDIKEAFQRDLKISLENKDNPFYAYPLKLSENAYALILGPNDKMEDGSSFEPNWIKFTISAYWIKGDIGVTVGGINIEKDEFAKILEEVNNQI >NC_013921.1|WP_012994256.1|1400424_1401837_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTGKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMGVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEIPKPDGGKRLLGIPTVLDRLIQQAIAQILNKVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVRSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKVNEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS >NC_013921.1|WP_004401150.1|1402301_1402856_-|hypothetical-protein MSNMFCVNKSGQKVPVYDAYYTTQIGVLYPREAFGWDANWGGEGVFCRIVFLNSQGKLQVGFLKNAIDYNGLPAPVGVYPYDRVYIDGNWYVTFKFRRTENVYTADGNYWGQVAAGMRVACLDDGFMNSLSGDTHPEWKAINYVERSTDKAWIKVSGAGKNYGFVDTGLSKGSMPDTISMYGSW >NC_013921.1|WP_004401147.1|1402934_1403645_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MAKIILDPGHGGKDPGASGNGVIEKEVTLDLAFRTKDKLLKNYEGVEIILTRSSDTYISLEDRAKIANDANADYFHSIHINAAENLAAKGYEDYIHSSLTDDSKTAKIRDVIHEEIINYLKNYGIVDRGKKKADFAVLRLTKMSAVLTENLFLTNPEESELLKNDSFLDGLADAHAKGIAKALNLPQKANTPTTVAQSNVLWLVQLGAFKNKENAERLAAELKSKGYSVFIKKETR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_013921_3 | 1417978-1418079 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_013921_3
|
1 spacers
spacers of NC_013921_3
>3.1|1418002|54|NC_013921|CRISPRCasFinder ACTATCATAGTCTGTAATTCCTACTGCCTCTAATATTTCAGTTCTATCTACTCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013921_3
The CRISPR arrays of NC_013921_3 >merge|NC_013921|3|1417978-1418079|CRISPRCasFinder TATCTCTCCTACTATCTTCTTTGTACTATCATAGTCTGTAATTCCTACTGCCTCTAATATTTCAGTTCTATCTACTCCTATTTCTCCTACTATCTTCTTTGT >NC_013921|3|3|1417978-1418079|CRISPRCasFinder TATCTCTCCTACTATCTTCTTTGT ACTATCATAGTCTGTAATTCCTACTGCCTCTAATATTTCAGTTCTATCTACTCC TATTTCTCCTACTATCTTCTTTGT
>NC_013921.1|WP_004401100.1|1417255_1417612_-|DUF2190-family-protein MARQVSKGRSVKLTVPAGFGPVEANKFYEILGFFGMAVDNAQESEQVVLLTEQAEYETSQTDAAINYNVGDKLYFDPANKVFTTAADDGAGNAFRLVGRVTQGKDTNGVIWFILGPQV >NC_013921.1|WP_004401101.1|1416190_1417240_-|hypothetical-protein MQYKVYSLETLREERRKQTIEKKIPYIRPDGKEDFVTKKIVNGEMEVLDFDRPVGEMITTASGLTAVVQKTVIDLELGREQVPLLYKPIYRVREDKNFTRHVDIRPFINARVVFLEHMELEEVKMGDMYVGPASTVPIVTYTAGFEWTEDVVMYGENWAMSELSRAMGEAYNALLNHIHLYPIISYNYPAKNKTAASTEGATYIEKLRSTIRQGLIDAASDKNKETGAVRRPTILLAHPSRQWDIEDALQRMQVGGTIYNPITQISSLIFYDGYSVQVGDKVYEYPGVDPNKAYLIDPQKYFVELIKHDLIIDAAGADLKRLIEGAIVGRARRGVVAAPENAVQEITLP >NC_013921.1|WP_004401104.1|1415926_1416175_-|hypothetical-protein MRCIDCKWYPWVLESDPTMLPAHRCHPSLPFKRWTPYSVKQDWECPFFEPIEGLKVTATEEKEAKKTTKKTSSKKKKGGGDK >NC_013921.1|WP_004401106.1|1415561_1415930_-|hypothetical-protein MTATPSLILMLREMIDEVIPEGGTDKETHFSDDFLTQVLTESSSLEEAAAKLWELKAAKAFSERGGIEETRAGDESIKYVSLAEYRDHCYQMADHYKRMTKGYGTKLFSIDLPEIGLKEVDS >NC_013921.1|WP_004401108.1|1415196_1415562_-|phage-head-closure-protein MVIETLRKSHLQLIEEVPTEVMILRTTKDEDGAGGFIETGETKIGPIKVRITPITRAIRNTYSEAGETTKEQWQIFAPYDADIRQKDRLEYEDKELEIIRVTKRWYRGEVYAIQCEAEEVS >NC_013921.1|WP_004401109.1|1414861_1415197_-|hypothetical-protein MPGANKIKRNAEEWINRKIAANLALASNWAAKLEGYMKSKAPWKDRTGNARAGLFARAERDGNDIVIRLAHTMDYGVYLELAHGRKYAILEPTARIHARDIVEGYRKLWEE >NC_013921.1|WP_004401110.1|1414457_1414862_-|hypothetical-protein MLMLRRAIIKHLRENITEIGGRVYQAYLAAEKAKRPYITVRLAESIASEVISFGGTMQIELFVYDDLGKSYLNLDYISDKIIAVLNGAYITDQEDGKTYYIEWNPTTNDIIEEDRKLIGRLLRFKTAILHERRI >NC_013921.1|WP_004401111.1|1413855_1414455_-|hypothetical-protein MATQVKKGYLRGVRGLILIPLNPDGSDMTTPERHPIRTPQEIELEMEILEGESFELRGGDRPLLRGEEPDTTVGVNLTVTDARFDIAAVHYIAGGTLKTTTDATGNEVITGWEAPTIEEQTELRPFVLEVYVANYDETGGIDGFIKYEFPYCIGRAPSISHSDRDWGTPEFEIRARQNPAKAGGPWKVEFVDTLPPELQ >NC_013921.1|WP_004401117.1|1413448_1413841_-|hypothetical-protein MGRVITIEEIKQRAQGEIIQIPDWDNKGTINVRVRMVDVTGKLLTAGILPNNLKLEVAKAFDGDVKIDDKIDVNISKMIPLLDAIVSEALIEPSYEEIQKILPLTLNQKLTIFNYVMGETKQLEPFREKH >NC_013921.1|WP_004401119.1|1413237_1413462_-|hypothetical-protein MKNIEAFADMAITAKTFGVRPSSFLEGISGLTAYMFDSAAALLLHYLQEGKKPITEVEDARNLLGMPPIQKGRR >NC_013921.1|WP_004405531.1|1419165_1419405_-|hypothetical-protein MRKIPGDTLPKGMKIPAQELENEVKQEVEFITLKDANYVADIREAIENLPYDVEIEELVVKEARNEFPIVQMLLTIHSK >NC_013921.1|WP_004405532.1|1419411_1419570_-|hypothetical-protein MMPRLPEEFIPYLAEAGLKLREDAPEEIKKKFEEWLKELKKREEETIKVKGE >NC_013921.1|WP_004405533.1|1419571_1419787_-|hypothetical-protein MKLKKETLKTLKLADDEEIITKVLSRYATLNSSEFMAEAFAEALGSPNPRLVAKTFIELLKEMLIKRGLLK >NC_013921.1|WP_004405534.1|1419752_1420982_-|hypothetical-protein MGKYISLEDWYKSAKRREFAEYIKRARQRLDKGEIATANEVRKIYERAAEEVAKDIAKATPGTLRFAHLEYLHKVIEEAAKEINDELLKTIDKGVRITVKASTDSAQQTFIELAKGVWTAAEVKQAFAAINERAVMALLARTGPDGLKLSDRVWRTSQTARNALKVIVEDGVVRGLDSRKLAKLTQKYLQPGVWTPLKQETRKRLGVPADVSMEAMRLAVTELHHAFHEGTRMAWSAVPGVEGYYWRLSNSHGITDICDDYASYNGNGFWPKDELPEKPHPWCRCYIIPAVEEPERFVERLKEWVYSPELQPDIEEWYNDVKEFISRPAPASIIVNRIKYSNKEEAKKYLVNELGFKDVAFGNIKDDAAVMITKAIEKTYNEFPFLKGFVKEIKTKDFNEAKERDIKNS >NC_013921.1|WP_004405535.1|1420984_1422460_-|phage-portal-protein MIKRQGLFQRQIAKIIGEISVLRTTISNIFIHGSLNEQYSLDSSRVDYSLARALYYNTDDRYKLGAAFARPVINTTTGFMGVPHFSHENPDANTELETAFDKWSSRLIRINRNTLRDGDVFARIVRRKSRFDKHETFDIDLIPPEWVIPIPDPLNGGYMEIIIKMPVENKDENGEPRYLYTVIEKITPTSREITIDGDAPFDIKKRLEGTYENPWGFIPIVHFKNESEDYQLFGSSDLEPIEPFMKAYHDVMLFSVQGTKLFSRPKVKMKLQDVKKFIEDNFSREEIEKGKIKFDNKEIFLMQQGDDIEFITADQGLEGVTTLLKFLFFNIVDASETPEFAFGTAVQSSKASVSEQMVPLVRKVRRKRAMFEEPYIELASMYLAMWAKVNRIKLDTYNVGIDWDEITPRDEQGIAQTIKTLVDGLATAVETRLISLESASEFLREFVPSMLPWLDADAQEDEQRRVAKSMAFLARVEDGFGFEELENEEGA >NC_013921.1|WP_004405536.1|1422452_1423835_-|AAA-family-ATPase MKMNKTQAKKVLDRARNDPVFFVRCVLKGDPWEKQEEILKAVRDHKRVAVRACHGVGKTKVAAWVALWFLYTHHNSKVITTAPTWHQVENLLWREIHAAHAASRIPLGGKVLQTQIELGEQWFALGLSTDKPERFQGFHAEHILLIVDEASGVEQYTFDAAEGFLTSIGAKLLLIGNPTQLSGEFYNAFRSPLYHKIHISAFDSPNLKAGKIVRPYLVTPEWVEDKRLKWGEDSPLWYSRVLGEFPEQGNDTLIPLAWIEAAQQRWHMTEAGEPVEIGADVARYGTDTTVIMLRRGDKAEIVYQLRGQDTMEVTGKVIDAFKKTGANVIKIDVVGIGAGVVDRLKEQGYPVQGLNVGESATDKGRFVNKRAEWYWALRERFQEGTIAIPPDDELASQLASLKYKFDSRGRIQIESKEELRRRGLPSPDKADALMLAFSSTGMKPVDEKIKDIFRRASFYD >NC_013921.1|WP_004405537.1|1423821_1424340_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MPAGYSTRCKVCNSLHRVEIEKWAKEDGLSPRAISAKLKEEFGEQISHKSIWQHLCEHFDVKAEARKQYKKSQQQMETSVKKALSDLQMLDFIAQDSYELHQAVRAWLDELIRQKGKIPKTLVDLYGVTASEVRQQLKQKSELLGDDPMSRLADGVATWAELVQAVMTDEDE >NC_013921.1|WP_004405539.1|1424415_1424811_-|hypothetical-protein MVTNEELEQAIWEYDKLVHGSINPDKVREYKEFIKPKLDEITNIKVIYPKNLFGVTNKPTEIIILTEDDKLMRGVIKKQCNIAYSFDIEKIDPEEIEMNYKEDNNDVGKNLGLDFSGNIKIIRDFIVKSQR >NC_013921.1|WP_004405540.1|1424975_1425509_-|hypothetical-protein MFRKILMIIKDFVKSSKRRELVEVYLVPLIFAFVLLFFYNKLDVNTNERYEFIKTFTDNILTIASLLAAFGVASITIILTSSSGNIEVAKKKTIKDRKDADNIPITYYKLVLIRNYYNIVVQFCLLFVSIIAKFIICNQILILILLIELWLLLHSIFLQVFVITTVYFLMWENKGRS >NC_013921.1|WP_004405543.1|1425508_1426486_-|hypothetical-protein MSKIQRKTEVYSIGVRDKNTLKDIEKDINFSEILKMFFSYKSVYKIKDNKVFWFESCKIDDDIIEVIINYSKYNKNVKIINVETLKITKTKSKKEGDLEKQHILVKLLEHKNKAIMVFEKISDGIYVKSIEEKLNHFIKQNTSGLDGEVASTLDVEDVEDVENIEFYIKNVPNEDFLYELARMKRISVLRVFVDKTKSKIDEDIEFSERNISRDEYEIIYKPNRNLSFSVQNVEKYIREFLAGKSNKSKKIKKIVIEGKNAEGKLRLDTDGIKLSKYMETELDTDGNIKSEDIFLKYRKFVNEDYKDYLTNIILDIDEDEQIGDD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_013921_4 | 2330986-2331286 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_013921_4
|
4 spacers
spacers of NC_013921_4
>4.1|2331016|38|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT GAGGTAGGTATCAAGGCGGGTGTATCTGCCGCTGATAA >4.2|2331084|37|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCAATCCGAAATTAGAGGTAGGAGAAATGCAGGAGT >4.3|2331151|40|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAGTATGCCATTTGTACCAGCCCTAACACTGCCTATAAT >4.4|2331221|36|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGACCCGGTAGTGGCAAGCTATACTCAGCAGCAGGG |
cas4,cas1,cas2,cas3,cas5,cas7,cas8b1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013921_4
The CRISPR arrays of NC_013921_4 >merge|NC_013921|4|2330986-2331286|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACTATTTTCAGGATAGGTAGGCTAAAAACGAGGTAGGTATCAAGGCGGGTGTATCTGCCGCTGATAAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACCCCAATCCGAAATTAGAGGTAGGAGAAATGCAGGAGTGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACCAAGTATGCCATTTGTACCAGCCCTAACACTGCCTATAATGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACAGACCCGGTAGTGGCAAGCTATACTCAGCAGCAGGGGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC >NC_013921|4|4|2330986-2331286|CRISPRCasFinder CACTATTTTCAGGATAGGTAGGCTAAAAAC GAGGTAGGTATCAAGGCGGGTGTATCTGCCGCTGATAA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CCCAATCCGAAATTAGAGGTAGGAGAAATGCAGGAGT GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CAAGTATGCCATTTGTACCAGCCCTAACACTGCCTATAAT GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC AGACCCGGTAGTGGCAAGCTATACTCAGCAGCAGGG GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC >NC_013921|4|3|2330986-2331286|CRT CACTATTTTCAGGATAGGTAGGCTAAAAAC GAGGTAGGTATCAAGGCGGGTGTATCTGCCGCTGATAA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CCCAATCCGAAATTAGAGGTAGGAGAAATGCAGGAGT GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CAAGTATGCCATTTGTACCAGCCCTAACACTGCCTATAAT GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC AGACCCGGTAGTGGCAAGCTATACTCAGCAGCAGGG GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC >NC_013921|4|3|2331054-2331286|PILER-CR GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CCCAATCCGAAATTAGAGGTAGGAGAAATGCAGGAGT GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CAAGTATGCCATTTGTACCAGCCCTAACACTGCCTATAAT GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC AGACCCGGTAGTGGCAAGCTATACTCAGCAGCAGGG GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC
>NC_013921.1|WP_011025138.1|2329079_2330123_+|IS30-family-transposase MVHNNDTTKKRSFKHLSSYERGEIYALLKEGRSIRYIAKKLNRSPSTISREIKRGTTTQLRSDLSSYTSYFPETGQAIYEKNRSNCGAKFKVAKAEDFLKYAENKILNEKWSPDAVVGYCKKDPSWNNKTIVCTKTLYNYIDRGLLKVKNIDLPLKLRLKPRKKQNRKNKRIMGKSIDFRPKEVESREVFGHWEIDTLIGKKSNDKVLLTLIERKTRHEIIFLLDAKDNKSVKDALSKLKDMFGDNLSKVFKTITSDNGTEFSDLESALLEYGVEVYYTHPYSSWERATNERHNGLIRRFIPKGKSIKDLSIDTIKRVENWLNNLPRKLLNYKTPKEYFYEELAKIC >NC_013921.1|WP_012996177.1|2328341_2328932_-|hypothetical-protein MLKRKIFFAIIIIGVTIAVVVVYYKYHNHVDTTLQITPSVRIYFSSDGTHYLYPKGERPNEARHRFVEYNLIVENRGNNTITKILGKVELDPQFEELIKNRAEMNIPLTLKPGHRVKLGYIYFVEGKPEKIEKLARLNKIVLTWEQGGTKYFKNISLISSSVRNTNVNITYKSNPKLSYKQALSFSCFLLKIFYKA >NC_013921.1|WP_012996176.1|2327784_2328282_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRIEKDNILIGEVKKSSKAAESAKMQLLFYLYKLKQSGISAKGQLFFPEERKREIVELTPELEDKIIEAINEIKEIALHELPPAFLKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_013921.1|WP_012996175.1|2326795_2327788_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTCEIMIFGEVTLNKRFLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILKQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKNLEDAIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYRTFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTVALGEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRTLSHNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_013921.1|WP_012996174.1|2326515_2326779_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANYKKLKLELGRIIDKEEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_013921.1|WP_012996173.1|2325413_2326193_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILIDAGLSGRTIERALLNIGVNPKSLSAILITHEHKDHIKGAGVLSRRYNIPIYANKATWGAMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGEIKIVPFKKPHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDVVLLESNHDIQMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFTTVTNMLKKSGVKFEVRLALRNIESDLVEI >NC_013921.1|WP_012996172.1|2323961_2325377_+|amino-acid-permease MTHSKEFFRRKTLEMILADAESEQYKLKKSLTAVDLVALGLGAIIGTGIFVLAGVAAAEKSGPSIVLSFILAGLACAFAAISYAELASMFPIAGSTYNYAYIAMGEFIAWIIGWDLILEYVLALPAIALGWSSYFTNLLSSLGVNIPGWATHSSLQGSGGLINIPAIGILIIIAILNYIGAKETATINNIGVAFKVFVVLFFIFVGISHVRPVNWQPFMPYGWKGVFKGAAIVFFAYMGFDAVSTAAEETKNPAKDMPIGILGSLGISTLLYIAVSAILTGVVSYGELKDTAPVAKALGLIGLNWAQGLVSLGAIIAITTVLLVMFYGATRIIFAISRDGLLPPTFSKVHPKFRTPAFSIYLIMIVTTLAAGFLPIDIIAELVNMGTMFALIITSAAVIVLRYKQPELPRNFKAPGVPLTPILAIFFILLLMLSLSWQTWVRFIVWFVIGLFIYFGYGRYHSILAKLKEYQ >NC_013921.1|WP_012995237.1|2322387_2323806_-|transposase MKIKAKQLSLSDIYDDVQSFFEEDKPKFIKLFDSFIDLSELIPPSFYAHYYSHFGRHRDFSLESMLTALIIQKILSIPTVQLLVHVLKLSKELRELCGFKRVPHPSQFSRFKSIFLKDLENFFNNLVNLTEPICQAINPSISNILIADTTGFEPYVRENNPKFFDSLYRNIKKFSKSNPDFDAHSYACSKMPKFAHSNPDAKFSYINGHYCYSIKATILTNGLGIIQHISFYDDDSLNVNTAKSAAESKDLYDSKTLIPSLKEFFNLHPNFSYRYFLGDAGFDSFDNYKYLFSKLGIIPIIPINPRNSKNLPQPTFNSDGIPTCPRDPSLKMSYDGIVREKGRATRIKWLCPMSKKVRLNGKTTYILQCDNPCTSSKCGRIFYTTLDIDFRKNTFVPRNSKKWSKLYEKRPIIEKSISLLKSSIAVDSFKLINTRSIKADVFLGAITQHIGLIITAKLGTFEHPLSLKKLLA >NC_013921.1|WP_012996171.1|2321307_2321748_-|ACT-domain-containing-protein MGEDSKLYIIREEILSDSLKKTLKVKELLESGKVRTINEAVKQVGISRSAFYKYRDYVFPFSKFSKGKIITLSMLLDHMPGVLSSILDVVAKARGNVVTINQSMPSMGVANVTISVDTQYMEMSLENFLEKLSSQNGVRKIEILGE >NC_013921.1|WP_012996170.1|2320038_2321295_-|homoserine-dehydrogenase MKIGLMGLGTVGTGVVHLINQNGKNIEKKLGEKIEIKKILVKDPNKKRASFAEGKITFDANDILEDEEIDVVVEVMGKEHPALEYIIKALKKGKHVVTANKEVIAVHGKELIKLATENKVNLLYEASVGGGIPIIRPLKQCLAANKIYEIKGILNGTTNYILTEMKEKGLDFEEALKEAQQKGYAEADPTDDVEGFDAARKLAILCTLAFNKFILPEKIYTKGIKSISKSDIKYAEELGYHVKLIAYAKIDENERLEAWVHPVMIKKDNPLSSVNGVFNAILVDGNAVGEVMFYGQGAGMMPTASAVVADIMDVKNHIVIQNGCEDADLLPVVDTASKYYIRLIAIDKPGVMSKITGILGDKGISLLSVVQKGVLKDTAEIVLITHIANTGKVFEALDEIQNMKEVESIESVIRVEEE >NC_013921.1|WP_012996178.1|2331609_2332830_+|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELENIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKHALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEITKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKRKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESVAS >NC_013921.1|WP_012996179.1|2334385_2336743_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYVYEKNVEIIDKDTFLKTVTIISLCHDFGKATSYFQKYLFTENEIERNKLKTMEETHHSLLSAVVAFYLIKNEINTQDRKGILLPFIAFLIVKNHHGDLKDIFNEVILDEKELKILKKQLNSIDDEKLQILNKNLKNAGLNKDLTKSLINEYIDNINSELRKVKRELRKLKEEQDISIYLLLNFLFSLLIDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEDQFVKAYKASFCGEENDKINLLREEAYKEALEREINIGQRIMSINLPTGLGKTLTTIAFSMKLWDILYKHTGVKYRIIYSLPFLSIIDQNSSVIEELLKYNGIYPSTEIILKHHHLSDVKYTKSNSEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLSNSIIILDEVQSIPFKYWLLIKELLKAIAEELNSYIIFVTATQPLIFKEKEIYPLVDKNKYFAQMERVEIIPKLDCDITLEELSEMFDLSDGRSYLFILNTIKSAQQFYSILKTKVPNDEIIYISTHITPLERMERIEKIKKGKIKFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWNGKGKVYIVSLIDEKGQRYSRYIYDRILLDITREILSKYDIVKEQELLKIIEKYYHEVSERMSSSEAKKLLDAIYALKYDSDDGDMCISKFKLIEDDYYKVDAFIELNEEAKELWQKYVGLKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATAENMPPDIWGFKYVNYDSLNEYYDKETGFIAKGVISIW >NC_013921.1|WP_012996180.1|2336726_2337440_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDIFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPSTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSSSNCNIAIRILNPVKKIRIGLNLINTKGNFWIPYKMKNHEARTQVRAEFVKDAAYRIYFAHKDNALFEDIVDKIKNHKNVYTLSLGLSEMLADYKFVGIYDSHEVKNVEVDILSVLPFEFIVEDKIYFEKGKKYFKEKIPMDMNEDRVVLSYQDVLYEANGQSIKCHVMKCWEVNGEHVIFF >NC_013921.1|WP_012996181.1|2337452_2338367_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MGNIVKNRAEILFLYDVNFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFILETREEEGGKLRTKEERMKDFGTNKDIIEKCIDVRLFGATTAVKDKVMTLTGPVQFKYGKSLHKIDLMYIKGTTVMPSGEGRGQGTFTEKYILPYSLIAFYGVVNENAAITQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKMGHEPRLLVEVIYQESNYQIGELEKRIKFVHDMEDEKIRDIQDGKLDITELVTVLKENKDKIKLIKYVYDDRVIFTCNGEVCTLEKALEGLNIQKLQY >NC_013921.1|WP_012996182.1|2338350_2340129_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQEGRYSKIATIDFTIKEDDIEYEKVRLEEYDDSKINRYLFTDTSGNAPGYTPAAKITEVTKTFNGKIKSWFKVLDDRTIKIDQKNKTFLQNIRNILEEKSDEIIAEVEKIRKDIPKREGLSLILKFNVDGDSKYIGDLDIFKSILLQLHNKKYQKIHSKDKVCSICGQKKKMIFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWRNYPVCKECMLALEEGKRYLENELTFKFYGLEYQLIPNFIIGNEFVKKEVREIFENASKLISLKKETKKRFIGDEDEILDYLAKAEDTMTVNFLFLKKANSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKDKVDETFNENFTFKNIRSFMSKSDSNKKDNDLDTYFLDITDRIFTGRPVDLGFLYGLIMKKVREEFVNDRNYKNAIKDGLMTVAFLEKLKLIKMEVVPMEERIFDSFFAKYGPSFETPLKKGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFDKGKRLLAKEVSNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFVCGINLADELTNIIYKKEEEEKTNGKHC >NC_013921.1|WP_012996184.1|2343963_2345235_+|copper-amine-oxidase METCKKKLVLSFIFIFLIVTIFNLQVVNAQEKQEITVLLDGYPVTFDVPPVLKNGTTLVPFRAIAEALNISVNWEVSTQTVTATDNKTKVKLQIGNKTAIKDNMPLTLRVSPQMINQRTLIPLRFFSEAFDCDVDWDKNTYTVKITSPPKEMFVTGFYALGDSQTSSWTNLFGKSYPEYTSGNTGYFSSIAFGWYSLDNNGNLLTKSRTGWQRPDGWEKVLEVISQYKLKSEMVIHVTDGDKTISNLLSSPEAIEKAISSIVEEAKIYNSVNLDFEGLGLNEDKEQLLQTQQKFTEFVKLLKNRLDVSKSITLTLHAPNSVYKGYDYKTLGEIADKIIIMAYDYGTKPEPEELVIQAIEQATEKVPKEKLLLGISIPNETPESFAVKIGLAKRFGLGGIAIWRLGLVQDEMWDVLKNSITPRR >NC_013921.1|WP_012996185.1|2345275_2345689_-|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRKELKDATRKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLQGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_013921.1|WP_012996186.1|2345685_2346915_-|cysteine-desulfurase MKNIDIEKIKKDFPILNVKPHGKKLIYLDNAATTQKPISVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSALSTQAYEEARERVKKFINAKSVESIIFTRNTTESINFIAYTWGMKYINEGDEIILTIAEHHSNMLPWQMVAEAKKARLKYVYLDEDFRFSMKDFKEKMSDKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLSDVPPFLRGGEMIDEVFEDRATFSPPPLKFEAGTPNVKGAYVLVSAIDYIEKIGLSNIYHHESELLEYGLQKMKELDFVKLYGPKDAEERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGIAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFDDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_013921.1|WP_012996187.1|2346911_2347961_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MWKRVNIEKIKVPSYKEYTLAVVKDSSQDTVKIKKIKDLHHLPIETLISANKTFGIDDKFVNMVKTLYNTGFYIKTFQNTSVEKPIVVDYITDEQNDTLIDYNIVEIEANSSATVVFDYNSGAHGFHNGITEVIAKEGATVNIVKIQRLGNEFNDFDNNLVIVGKDATVNWSNVVIGAKMSTFDVTVYLDEIGATFISKSIFLGVDSQKYDMAYKVYHQAPKSTSSVDLKGALKGSAEATFIGNIDIKKGAKKAKAEENETVLLLDKTVKSVAIPALYCGEDDVVAKHSASAGQIDEDKLYYVMSRGFSFEEARLLMVQAILNPVIDLIPYDPVKEIIIRGHIGRKIIK >NC_013921.1|WP_012996188.1|2347971_2349375_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKPDIKEIDFSIYDVKDNVKYEYQTGKGLSKEVVLEISEQKNEPSWMRDFRLKALEIYQKMPMPTWGVDLSQLDIDSIIAYIRPKAKMQRSWEEVPEEIRRTFERLGIPEAERKVLAGVGAQYDSEVVYHNIKENLTRQGVIFEDMDTAVKKYPDIIKEYFMTKNVTPSDHKFVALHAAIWSGGTFVYVPEGVKVEVPLQAYFRMNAPGSGQFEHTLIIADKGSEVRFIEGCSAPQYSVSNLHAGCVELFVKEGARIIYSTIENWSKNTYNLNTKRAIVEKDGIIEWVSGSFGSHKTMLYPTSVLKGKGAKAEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPYTSSKVVAKSISKDGGISTYRGFLKIGSTAEGAKASVQCEGLMLDDISRSDTIPVIEIENDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMSRGLSEDDARAMIVRGFVEPIAKALPLEYAVEMNRLIKLELEGAIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_013921_5 | 2332916-2334204 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_013921_5
|
19 spacers
spacers of NC_013921_5
>5.1|2332946|37|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT CGCTTGCACTAGGATATATTTTCGGCGAGGCAGCGGT >5.2|2333013|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGATGCAATAAGAGTAGCAGATAAAATGCTGAA >5.3|2333078|36|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTGTTCATGCTGCGCTAAGATGTTTACAGCTTGT >5.4|2333144|36|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTGGCAGATAAACTTCAGAACATGGGTGTAAATG >5.5|2333210|37|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTATATGTCCATAATAACTCCGACTTATCCCAACTGC >5.6|2333277|38|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAATGTAATTTGTTCAATGCTCTGATAAGTACGTTAA >5.7|2333345|38|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATAATGTAGCTTCTGATTATATTATAATGCTACTTTA >5.8|2333413|36|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATGGGCTCTTCATGGCTAATCACTCTTTTCGTCCA >5.9|2333479|36|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAGGACGGGCAAAGGACAGCTGAACGTTGGGAACC >5.10|2333545|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTATAGGTGTAGCGCTTTGGAGATGGCAGGAATC >5.11|2333610|37|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCAGTGGTTCATATATAATTATACCACATTTGCGCA >5.12|2333677|37|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTTAGCATAATTAAAGAGGCGATTACGCCTCCCAT >5.13|2333744|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTCAACGAAATTCTTACCTACTCCATTTATCCA >5.14|2333809|36|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGTCCAGTCTGTTTTAGGTGTTTGCCATGCCATA >5.15|2333875|36|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATAAATATCGCATGTTTTAGACTCTCTGGTATTTG >5.16|2333941|36|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATACCTGAACCATCATAAACTAATTCCTTATCAGAA >5.17|2334007|36|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATATCTCTTCAGCTTCAGCAACAGGATCGAAAGCA >5.18|2334073|37|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCATTTGATTGGTCTGTTTTTGATGGTCTTAAGTCTA >5.19|2334140|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTTCCTATTCTGTTTTAATACTATAGAACTAAT |
cas4,cas1,cas2,cas3,cas5,cas7,cas8b1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013921_5
The CRISPR arrays of NC_013921_5 >merge|NC_013921|5|2332916-2334204|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACTATTTTCAGGATAGGTAGGCTAAAAACCGCTTGCACTAGGATATATTTTCGGCGAGGCAGCGGTGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACGAAGATGCAATAAGAGTAGCAGATAAAATGCTGAAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACTTTTGTTCATGCTGCGCTAAGATGTTTACAGCTTGTGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACAAGTGGCAGATAAACTTCAGAACATGGGTGTAAATGGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACCTATATGTCCATAATAACTCCGACTTATCCCAACTGCGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACCCAATGTAATTTGTTCAATGCTCTGATAAGTACGTTAAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACCATAATGTAGCTTCTGATTATATTATAATGCTACTTTAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACTATGGGCTCTTCATGGCTAATCACTCTTTTCGTCCAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACCAAGGACGGGCAAAGGACAGCTGAACGTTGGGAACCGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACCCTATAGGTGTAGCGCTTTGGAGATGGCAGGAATCGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACTTCAGTGGTTCATATATAATTATACCACATTTGCGCAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACTTGTTAGCATAATTAAAGAGGCGATTACGCCTCCCATGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACTATTCAACGAAATTCTTACCTACTCCATTTATCCAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACGTTGTCCAGTCTGTTTTAGGTGTTTGCCATGCCATAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACCATAAATATCGCATGTTTTAGACTCTCTGGTATTTGGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACATACCTGAACCATCATAAACTAATTCCTTATCAGAAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACAATATCTCTTCAGCTTCAGCAACAGGATCGAAAGCAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACCCATTTGATTGGTCTGTTTTTGATGGTCTTAAGTCTAGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAACTCTTTCCTATTCTGTTTTAATACTATAGAACTAATGTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC >NC_013921|5|5|2332916-2334204|CRISPRCasFinder CACTATTTTCAGGATAGGTAGGCTAAAAAC CGCTTGCACTAGGATATATTTTCGGCGAGGCAGCGGT GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC GAAGATGCAATAAGAGTAGCAGATAAAATGCTGAA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC TTTTGTTCATGCTGCGCTAAGATGTTTACAGCTTGT GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC AAGTGGCAGATAAACTTCAGAACATGGGTGTAAATG GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CTATATGTCCATAATAACTCCGACTTATCCCAACTGC GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CCAATGTAATTTGTTCAATGCTCTGATAAGTACGTTAA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CATAATGTAGCTTCTGATTATATTATAATGCTACTTTA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC TATGGGCTCTTCATGGCTAATCACTCTTTTCGTCCA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CAAGGACGGGCAAAGGACAGCTGAACGTTGGGAACC GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC CCTATAGGTGTAGCGCTTTGGAGATGGCAGGAATC GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC TTCAGTGGTTCATATATAATTATACCACATTTGCGCA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC TTGTTAGCATAATTAAAGAGGCGATTACGCCTCCCAT GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC TATTCAACGAAATTCTTACCTACTCCATTTATCCA GTTTCAATTCCTCATAGGTAGGCTAAAAAC 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>NC_013921.1|WP_012996178.1|2331609_2332830_+|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELENIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKHALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEITKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKRKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESVAS >NC_013921.1|WP_011025138.1|2329079_2330123_+|IS30-family-transposase MVHNNDTTKKRSFKHLSSYERGEIYALLKEGRSIRYIAKKLNRSPSTISREIKRGTTTQLRSDLSSYTSYFPETGQAIYEKNRSNCGAKFKVAKAEDFLKYAENKILNEKWSPDAVVGYCKKDPSWNNKTIVCTKTLYNYIDRGLLKVKNIDLPLKLRLKPRKKQNRKNKRIMGKSIDFRPKEVESREVFGHWEIDTLIGKKSNDKVLLTLIERKTRHEIIFLLDAKDNKSVKDALSKLKDMFGDNLSKVFKTITSDNGTEFSDLESALLEYGVEVYYTHPYSSWERATNERHNGLIRRFIPKGKSIKDLSIDTIKRVENWLNNLPRKLLNYKTPKEYFYEELAKIC >NC_013921.1|WP_012996177.1|2328341_2328932_-|hypothetical-protein MLKRKIFFAIIIIGVTIAVVVVYYKYHNHVDTTLQITPSVRIYFSSDGTHYLYPKGERPNEARHRFVEYNLIVENRGNNTITKILGKVELDPQFEELIKNRAEMNIPLTLKPGHRVKLGYIYFVEGKPEKIEKLARLNKIVLTWEQGGTKYFKNISLISSSVRNTNVNITYKSNPKLSYKQALSFSCFLLKIFYKA >NC_013921.1|WP_012996176.1|2327784_2328282_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRIEKDNILIGEVKKSSKAAESAKMQLLFYLYKLKQSGISAKGQLFFPEERKREIVELTPELEDKIIEAINEIKEIALHELPPAFLKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_013921.1|WP_012996175.1|2326795_2327788_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTCEIMIFGEVTLNKRFLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILKQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKNLEDAIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYRTFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTVALGEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRTLSHNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_013921.1|WP_012996174.1|2326515_2326779_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANYKKLKLELGRIIDKEEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_013921.1|WP_012996173.1|2325413_2326193_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILIDAGLSGRTIERALLNIGVNPKSLSAILITHEHKDHIKGAGVLSRRYNIPIYANKATWGAMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGEIKIVPFKKPHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDVVLLESNHDIQMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFTTVTNMLKKSGVKFEVRLALRNIESDLVEI >NC_013921.1|WP_012996172.1|2323961_2325377_+|amino-acid-permease MTHSKEFFRRKTLEMILADAESEQYKLKKSLTAVDLVALGLGAIIGTGIFVLAGVAAAEKSGPSIVLSFILAGLACAFAAISYAELASMFPIAGSTYNYAYIAMGEFIAWIIGWDLILEYVLALPAIALGWSSYFTNLLSSLGVNIPGWATHSSLQGSGGLINIPAIGILIIIAILNYIGAKETATINNIGVAFKVFVVLFFIFVGISHVRPVNWQPFMPYGWKGVFKGAAIVFFAYMGFDAVSTAAEETKNPAKDMPIGILGSLGISTLLYIAVSAILTGVVSYGELKDTAPVAKALGLIGLNWAQGLVSLGAIIAITTVLLVMFYGATRIIFAISRDGLLPPTFSKVHPKFRTPAFSIYLIMIVTTLAAGFLPIDIIAELVNMGTMFALIITSAAVIVLRYKQPELPRNFKAPGVPLTPILAIFFILLLMLSLSWQTWVRFIVWFVIGLFIYFGYGRYHSILAKLKEYQ >NC_013921.1|WP_012995237.1|2322387_2323806_-|transposase MKIKAKQLSLSDIYDDVQSFFEEDKPKFIKLFDSFIDLSELIPPSFYAHYYSHFGRHRDFSLESMLTALIIQKILSIPTVQLLVHVLKLSKELRELCGFKRVPHPSQFSRFKSIFLKDLENFFNNLVNLTEPICQAINPSISNILIADTTGFEPYVRENNPKFFDSLYRNIKKFSKSNPDFDAHSYACSKMPKFAHSNPDAKFSYINGHYCYSIKATILTNGLGIIQHISFYDDDSLNVNTAKSAAESKDLYDSKTLIPSLKEFFNLHPNFSYRYFLGDAGFDSFDNYKYLFSKLGIIPIIPINPRNSKNLPQPTFNSDGIPTCPRDPSLKMSYDGIVREKGRATRIKWLCPMSKKVRLNGKTTYILQCDNPCTSSKCGRIFYTTLDIDFRKNTFVPRNSKKWSKLYEKRPIIEKSISLLKSSIAVDSFKLINTRSIKADVFLGAITQHIGLIITAKLGTFEHPLSLKKLLA >NC_013921.1|WP_012996171.1|2321307_2321748_-|ACT-domain-containing-protein MGEDSKLYIIREEILSDSLKKTLKVKELLESGKVRTINEAVKQVGISRSAFYKYRDYVFPFSKFSKGKIITLSMLLDHMPGVLSSILDVVAKARGNVVTINQSMPSMGVANVTISVDTQYMEMSLENFLEKLSSQNGVRKIEILGE >NC_013921.1|WP_012996179.1|2334385_2336743_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYVYEKNVEIIDKDTFLKTVTIISLCHDFGKATSYFQKYLFTENEIERNKLKTMEETHHSLLSAVVAFYLIKNEINTQDRKGILLPFIAFLIVKNHHGDLKDIFNEVILDEKELKILKKQLNSIDDEKLQILNKNLKNAGLNKDLTKSLINEYIDNINSELRKVKRELRKLKEEQDISIYLLLNFLFSLLIDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEDQFVKAYKASFCGEENDKINLLREEAYKEALEREINIGQRIMSINLPTGLGKTLTTIAFSMKLWDILYKHTGVKYRIIYSLPFLSIIDQNSSVIEELLKYNGIYPSTEIILKHHHLSDVKYTKSNSEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLSNSIIILDEVQSIPFKYWLLIKELLKAIAEELNSYIIFVTATQPLIFKEKEIYPLVDKNKYFAQMERVEIIPKLDCDITLEELSEMFDLSDGRSYLFILNTIKSAQQFYSILKTKVPNDEIIYISTHITPLERMERIEKIKKGKIKFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWNGKGKVYIVSLIDEKGQRYSRYIYDRILLDITREILSKYDIVKEQELLKIIEKYYHEVSERMSSSEAKKLLDAIYALKYDSDDGDMCISKFKLIEDDYYKVDAFIELNEEAKELWQKYVGLKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATAENMPPDIWGFKYVNYDSLNEYYDKETGFIAKGVISIW >NC_013921.1|WP_012996180.1|2336726_2337440_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDIFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPSTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSSSNCNIAIRILNPVKKIRIGLNLINTKGNFWIPYKMKNHEARTQVRAEFVKDAAYRIYFAHKDNALFEDIVDKIKNHKNVYTLSLGLSEMLADYKFVGIYDSHEVKNVEVDILSVLPFEFIVEDKIYFEKGKKYFKEKIPMDMNEDRVVLSYQDVLYEANGQSIKCHVMKCWEVNGEHVIFF >NC_013921.1|WP_012996181.1|2337452_2338367_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MGNIVKNRAEILFLYDVNFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFILETREEEGGKLRTKEERMKDFGTNKDIIEKCIDVRLFGATTAVKDKVMTLTGPVQFKYGKSLHKIDLMYIKGTTVMPSGEGRGQGTFTEKYILPYSLIAFYGVVNENAAITQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKMGHEPRLLVEVIYQESNYQIGELEKRIKFVHDMEDEKIRDIQDGKLDITELVTVLKENKDKIKLIKYVYDDRVIFTCNGEVCTLEKALEGLNIQKLQY >NC_013921.1|WP_012996182.1|2338350_2340129_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQEGRYSKIATIDFTIKEDDIEYEKVRLEEYDDSKINRYLFTDTSGNAPGYTPAAKITEVTKTFNGKIKSWFKVLDDRTIKIDQKNKTFLQNIRNILEEKSDEIIAEVEKIRKDIPKREGLSLILKFNVDGDSKYIGDLDIFKSILLQLHNKKYQKIHSKDKVCSICGQKKKMIFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWRNYPVCKECMLALEEGKRYLENELTFKFYGLEYQLIPNFIIGNEFVKKEVREIFENASKLISLKKETKKRFIGDEDEILDYLAKAEDTMTVNFLFLKKANSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKDKVDETFNENFTFKNIRSFMSKSDSNKKDNDLDTYFLDITDRIFTGRPVDLGFLYGLIMKKVREEFVNDRNYKNAIKDGLMTVAFLEKLKLIKMEVVPMEERIFDSFFAKYGPSFETPLKKGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFDKGKRLLAKEVSNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFVCGINLADELTNIIYKKEEEEKTNGKHC >NC_013921.1|WP_012996184.1|2343963_2345235_+|copper-amine-oxidase METCKKKLVLSFIFIFLIVTIFNLQVVNAQEKQEITVLLDGYPVTFDVPPVLKNGTTLVPFRAIAEALNISVNWEVSTQTVTATDNKTKVKLQIGNKTAIKDNMPLTLRVSPQMINQRTLIPLRFFSEAFDCDVDWDKNTYTVKITSPPKEMFVTGFYALGDSQTSSWTNLFGKSYPEYTSGNTGYFSSIAFGWYSLDNNGNLLTKSRTGWQRPDGWEKVLEVISQYKLKSEMVIHVTDGDKTISNLLSSPEAIEKAISSIVEEAKIYNSVNLDFEGLGLNEDKEQLLQTQQKFTEFVKLLKNRLDVSKSITLTLHAPNSVYKGYDYKTLGEIADKIIIMAYDYGTKPEPEELVIQAIEQATEKVPKEKLLLGISIPNETPESFAVKIGLAKRFGLGGIAIWRLGLVQDEMWDVLKNSITPRR >NC_013921.1|WP_012996185.1|2345275_2345689_-|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRKELKDATRKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLQGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_013921.1|WP_012996186.1|2345685_2346915_-|cysteine-desulfurase MKNIDIEKIKKDFPILNVKPHGKKLIYLDNAATTQKPISVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSALSTQAYEEARERVKKFINAKSVESIIFTRNTTESINFIAYTWGMKYINEGDEIILTIAEHHSNMLPWQMVAEAKKARLKYVYLDEDFRFSMKDFKEKMSDKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLSDVPPFLRGGEMIDEVFEDRATFSPPPLKFEAGTPNVKGAYVLVSAIDYIEKIGLSNIYHHESELLEYGLQKMKELDFVKLYGPKDAEERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGIAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFDDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_013921.1|WP_012996187.1|2346911_2347961_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MWKRVNIEKIKVPSYKEYTLAVVKDSSQDTVKIKKIKDLHHLPIETLISANKTFGIDDKFVNMVKTLYNTGFYIKTFQNTSVEKPIVVDYITDEQNDTLIDYNIVEIEANSSATVVFDYNSGAHGFHNGITEVIAKEGATVNIVKIQRLGNEFNDFDNNLVIVGKDATVNWSNVVIGAKMSTFDVTVYLDEIGATFISKSIFLGVDSQKYDMAYKVYHQAPKSTSSVDLKGALKGSAEATFIGNIDIKKGAKKAKAEENETVLLLDKTVKSVAIPALYCGEDDVVAKHSASAGQIDEDKLYYVMSRGFSFEEARLLMVQAILNPVIDLIPYDPVKEIIIRGHIGRKIIK >NC_013921.1|WP_012996188.1|2347971_2349375_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKPDIKEIDFSIYDVKDNVKYEYQTGKGLSKEVVLEISEQKNEPSWMRDFRLKALEIYQKMPMPTWGVDLSQLDIDSIIAYIRPKAKMQRSWEEVPEEIRRTFERLGIPEAERKVLAGVGAQYDSEVVYHNIKENLTRQGVIFEDMDTAVKKYPDIIKEYFMTKNVTPSDHKFVALHAAIWSGGTFVYVPEGVKVEVPLQAYFRMNAPGSGQFEHTLIIADKGSEVRFIEGCSAPQYSVSNLHAGCVELFVKEGARIIYSTIENWSKNTYNLNTKRAIVEKDGIIEWVSGSFGSHKTMLYPTSVLKGKGAKAEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPYTSSKVVAKSISKDGGISTYRGFLKIGSTAEGAKASVQCEGLMLDDISRSDTIPVIEIENDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMSRGLSEDDARAMIVRGFVEPIAKALPLEYAVEMNRLIKLELEGAIG >NC_013921.1|WP_012996189.1|2349394_2350141_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MRETLLEIKDLNVEVEGKYILKGLNLTIKKGEIHAIMGPNGGGKSTLCNSIMGNPKYRVTGGQILFEGQDITNLKVNERAKKGIFLSFQYPEEIPGITVDNFIRTSVNVMTGQNVPMLQFAKAMKNTLELLDMNSEYRNRYLNVGFSGGEKKKTEILQMAFLKPKLVMLDEIDSGLDIDALKVVAEAVKKLKTEEMSILIVTHYNRILDYLEPDVISVLMEGKIVKSGDRNLAKILEEKGYDFVRNGV |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_013921_2 | 2.16|1390835|36|NC_013921|CRISPRCasFinder | 1390835-1390870 | 36 | NC_013921.1 | 440685-440720 | 0 | 1.0 |
NC_013921_2 | 2.16|1390835|36|NC_013921|CRISPRCasFinder | 1390835-1390870 | 36 | NC_013921.1 | 653860-653895 | 0 | 1.0 |
NC_013921_2 | 2.16|1390835|36|NC_013921|CRISPRCasFinder | 1390835-1390870 | 36 | NC_013921.1 | 1170186-1170221 | 0 | 1.0 |
NC_013921_2 | 2.23|1391300|39|NC_013921|CRISPRCasFinder | 1391300-1391338 | 39 | NC_013921.1 | 2141970-2142008 | 0 | 1.0 |
1. spacer 2.16|1390835|36|NC_013921|CRISPRCasFinder matches to position: 440685-440720, mismatch: 0, identity: 1.0
gatttctcatgatagcttcaaaatttgtccaaaata CRISPR spacer gatttctcatgatagcttcaaaatttgtccaaaata Protospacer ************************************
2. spacer 2.16|1390835|36|NC_013921|CRISPRCasFinder matches to position: 653860-653895, mismatch: 0, identity: 1.0
gatttctcatgatagcttcaaaatttgtccaaaata CRISPR spacer gatttctcatgatagcttcaaaatttgtccaaaata Protospacer ************************************
3. spacer 2.16|1390835|36|NC_013921|CRISPRCasFinder matches to position: 1170186-1170221, mismatch: 0, identity: 1.0
gatttctcatgatagcttcaaaatttgtccaaaata CRISPR spacer gatttctcatgatagcttcaaaatttgtccaaaata Protospacer ************************************
4. spacer 2.23|1391300|39|NC_013921|CRISPRCasFinder matches to position: 2141970-2142008, mismatch: 0, identity: 1.0
tgatattgatggcacaaacttttacataaagctcaaaat CRISPR spacer tgatattgatggcacaaacttttacataaagctcaaaat Protospacer ***************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_013921_5 | 5.19|2334140|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2334140-2334174 | 35 | NC_004979 | Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum plasmid pNB2, complete sequence | 238-272 | 3 | 0.914 |
NC_013921_1 | 1.16|760961|35|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 760961-760995 | 35 | NC_004979 | Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum plasmid pNB2, complete sequence | 991-1025 | 5 | 0.857 |
NC_013921_5 | 5.19|2334140|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2334140-2334174 | 35 | NC_007110 | Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF, complete sequence | 56664-56698 | 7 | 0.8 |
NC_013921_5 | 5.19|2334140|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2334140-2334174 | 35 | NC_007111 | Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta, complete sequence | 33098-33132 | 7 | 0.8 |
NC_013921_5 | 5.19|2334140|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2334140-2334174 | 35 | NC_019229 | Rickettsia felis plasmid pRF, complete sequence | 56688-56722 | 7 | 0.8 |
NC_013921_1 | 1.17|761026|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 761026-761062 | 37 | MN552143 | Lactococcus phage P1046, complete genome | 2835-2871 | 8 | 0.784 |
NC_013921_1 | 1.17|761026|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 761026-761062 | 37 | NC_010576 | Lactococcus phage 1706, complete genome | 4029-4065 | 8 | 0.784 |
NC_013921_1 | 1.22|761358|35|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 761358-761392 | 35 | NC_002132 | Flavobacterium sp. KP1 plasmid pFL1 DNA, complete sequence | 181-215 | 8 | 0.771 |
NC_013921_1 | 1.43|762755|38|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 762755-762792 | 38 | NZ_CP023400 | Pseudoalteromonas spongiae strain SAO4-4 plasmid pl, complete sequence | 8076-8113 | 8 | 0.789 |
NC_013921_1 | 1.17|761026|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 761026-761062 | 37 | MK779875 | Lactococcus phage CHPC971, complete genome | 3800-3836 | 9 | 0.757 |
NC_013921_2 | 2.21|1391167|36|NC_013921|CRISPRCasFinder | 1391167-1391202 | 36 | NZ_CP048879 | Oceanospirillales bacterium S2-4-1H plasmid pA, complete sequence | 76878-76913 | 10 | 0.722 |
NC_013921_2 | 2.28|1391636|34|NC_013921|CRISPRCasFinder | 1391636-1391669 | 34 | NC_009036 | Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal02, complete sequence | 30456-30489 | 10 | 0.706 |
NC_013921_2 | 2.28|1391636|34|NC_013921|CRISPRCasFinder | 1391636-1391669 | 34 | NC_017578 | Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11703, complete sequence | 66813-66846 | 10 | 0.706 |
NC_013921_2 | 2.49|1391167|37|NC_013921|PILER-CR,CRT | 1391167-1391203 | 37 | NZ_CP048879 | Oceanospirillales bacterium S2-4-1H plasmid pA, complete sequence | 76878-76914 | 10 | 0.73 |
NC_013921_1 | 1.40|762555|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 762555-762591 | 37 | LN846931 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 megaplasmid, complete genome | 93117-93153 | 11 | 0.703 |
NC_013921_1 | 1.46|762956|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 762956-762992 | 37 | NC_011961 | Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed, complete sequence | 207974-208010 | 11 | 0.703 |
1. spacer 5.19|2334140|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_004979 (Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum plasmid pNB2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tctttcctattctgttttaatactatagaactaat CRISPR spacer ttcttcttattctgttttaatactatagaactaat Protospacer *..***.****************************
2. spacer 1.16|760961|35|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004979 (Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum plasmid pNB2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.857
aaaataggcgtttggttagttctttgggtattctt CRISPR spacer agaataggcggttggttagttctttaggtattttg Protospacer *.******** **************.******.*
3. spacer 5.19|2334140|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007110 (Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRF, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tctttcctattctgttttaatacta-tagaactaat CRISPR spacer actttccttttctattttaatactattaagattaa- Protospacer ******* ****.*********** **..*.***
4. spacer 5.19|2334140|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007111 (Rickettsia felis URRWXCal2 plasmid pRFdelta, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tctttcctattctgttttaatacta-tagaactaat CRISPR spacer actttccttttctattttaatactattaagattaa- Protospacer ******* ****.*********** **..*.***
5. spacer 5.19|2334140|35|NC_013921|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019229 (Rickettsia felis plasmid pRF, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
tctttcctattctgttttaatacta-tagaactaat CRISPR spacer actttccttttctattttaatactattaagattaa- Protospacer ******* ****.*********** **..*.***
6. spacer 1.17|761026|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN552143 (Lactococcus phage P1046, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
actctagact----tagaagaaggatcatagtaaacatttt CRISPR spacer ----tagccttctatagcagaaggatcatagtaaaaatttg Protospacer *** ** *** ***************** ****
7. spacer 1.17|761026|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010576 (Lactococcus phage 1706, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
actctagact----tagaagaaggatcatagtaaacatttt CRISPR spacer ----tagccttctatagcagaaggatcatagtaaaaatttg Protospacer *** ** *** ***************** ****
8. spacer 1.22|761358|35|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_002132 (Flavobacterium sp. KP1 plasmid pFL1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
atttcacaatttgataatttacttacttctgtgaa CRISPR spacer ttatcataatttgataatttactttcttttttata Protospacer * ***.***************** ***.* *. *
9. spacer 1.43|762755|38|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023400 (Pseudoalteromonas spongiae strain SAO4-4 plasmid pl, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.789
ttgactactgcttctttttgttcagctatctctttttc CRISPR spacer ctagccccagcttctgtttgttcagctatttctttttc Protospacer .*..*. * ****** *************.********
10. spacer 1.17|761026|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK779875 (Lactococcus phage CHPC971, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
actctagact----tagaagaaggatcatagtaaacatttt CRISPR spacer ----taaccttctatagcagaaggatcatagtaaaaatttg Protospacer **. ** *** ***************** ****
11. spacer 2.21|1391167|36|NC_013921|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048879 (Oceanospirillales bacterium S2-4-1H plasmid pA, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cagcgcctaaagcattttttgactacacgggtgctc CRISPR spacer ttgtacataaagctttttttgactacatgggtgact Protospacer . *..* ****** *************.***** ..
12. spacer 2.28|1391636|34|NC_013921|CRISPRCasFinder matches to NC_009036 (Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aagcaggataatcagcaagattaacagttgcact CRISPR spacer ctttaccataatcagccagattaacatttgcggt Protospacer .* ********* ********* ****. *
13. spacer 2.28|1391636|34|NC_013921|CRISPRCasFinder matches to NC_017578 (Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11703, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aagcaggataatcagcaagattaacagttgcact CRISPR spacer ctttaccataatcagccagattaacatttgcggt Protospacer .* ********* ********* ****. *
14. spacer 2.49|1391167|37|NC_013921|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP048879 (Oceanospirillales bacterium S2-4-1H plasmid pA, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
cagcgcctaaagcattttttgactacacgggtgctcg CRISPR spacer ttgtacataaagctttttttgactacatgggtgactg Protospacer . *..* ****** *************.***** ..*
15. spacer 1.40|762555|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN846931 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 megaplasmid, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
gggtttaataatgcttcctcaattttttctggggtga CRISPR spacer gttaaaaataatgctttctcatttttttctggagcat Protospacer * **********.**** **********.*..
16. spacer 1.46|762956|37|NC_013921|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011961 (Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
cgctcggcgagctcctggagcatctcccactcggtag CRISPR spacer tgctcggcgagctcctggaggacctccttgaggccac Protospacer .******************* *.****. * .*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
22591 : 31497
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_013921|22591:31497|DBSCAN-SWA TGTGATATTAAAAGGTGCACAAGTTGTAATAGAAGTTTTAAAAGAAGTAGGTATTGATACCATATTTGGCATACCTGGAGGAGCAGTTATCCCTATCTATGATGCACTGTATGATTCTGATTTAAGACACATATTAGCAACACACGAACAGATGGCGGCCCATATGGCAGATGGCTATGCAAGAGTTACTGGAAGAGTAGGGGTTTGTTTTGCTACCTCTGGTCCTGGTTCTACCAATCTTGTTACGGGTATAGCCAATGCTTATATGGATTCTGTACCTGTTGTAGCGATAACAGGACAGGTGCCTACAAATCTTATAGGGAAGGATGCTTTTCAAGAAGTAGATATAACAGGTATTACAATGCCTATAACTAAACACAACTTTATTGTAAAGTCTCCTGATAAATTAACAGATACTATAAGACAGGCATTTGCAATTGCTAAGAGTGGAAGACCAGGTCCTGTATTAGTAGATATTCCAAAAGATATACAAAACGCCGATATAGAATATGTAAAGGGAATGGGAGATAGTATTGATATAAAAAACGATATCAATGGAGTAGTTTCGCAAAAAGAATTAGACAAAGCTATAGAGCTTATTTTGCAAAGTAAAAAACCTGTAATCTTTGCAGGAGGAGGAGTGATTTGGGGAGAAGCATCAGACGAACTCGTAGAATTTGCCGAGAAGACCAACATACCTGTTGCTACTTCTTTGATGGGATTGGGAGCTTTTCCAGAAGACCATCCTTTGTCATTAGGTCTTATTGGTATGCATGGAAGCAGATTTGCAAATTTGGCTGTGTATAAATCAGACCTTGTGATAGCGATAGGGACGAGATTTAGCGACAGAGTCGCTGGCAAAGCAGGAGGACTTGCACCAAATGCTAAAATAATCCATATTGATATTGACCCTGCAGAATTAGGGAAAAATGTAGAAGTAGAGGTAGCAATTATAGGTAAAGTAAAAGAAGTTTTAAGACTCTTAATGAATAAACTTTCATTCATTGAAAGAAAGGAATGGTTAGAGGAAATTTCTTTCTTGAGAGAAAAGCACGGATTAAAGTATAAAAACGATGAAGTTTTAAGGCCTCAGTGGATAGTAGAAAAAATTCAACAGCTTTCAAACGATGACCTTATAATAGCCACTGAAGTGGGGCAAAATCAAATGTGGGCTGCGCAGTATTATAAATTTAAACGGCCCAGGACTTTTGTTACCTCAGGAGGACTCGGGACAATGGGCTTTGGGCTTCCTGCTGCAATAGGTGCACAGGTGGGAAAGCCAGACAAAAGGGTTGTGAACATTGCAGGTGATGGAAGTTTAAGAATGAATATACATGCTTTGGAGACAGCTGCAGTATACAATATTCCGGTTATAACGGTATTACTCAACAACCGGACTTTAGGTATGGTAAGACAATGGCAAAATCTTTTGTACAATAAAAGATTTTCGCAGACAGATTTAAATGCAAATTTAAACTTTGCAAATCTTGCCAATGATTTTGGAGTAGAAGGAATAAGAGTTACAACAAAAGAAGAATTTGAAAAAGCTTTTAAAAAAGCCTATAGCCAAAAAAGACCTTTTATGATAGAATGTATTATAGACAAAGACGAAATGGTGCTTCCATTTATCCCCGCAGGTGGAACTGTTGAAAATACAATTGGATAAAACCTTCAGGGATCGGTGAAATTCCGTACCGGCGGTATAGCCCGCGAGCCTTTTGGCAGACTCGGTGAAATTCCGAGGCCGACAGTTAAAGTCTGGATGGGAGAAGGAGAAATATTCCCCAGGGAATATGTTCTCTGGGGATTTTTTAACCCTGAAGGTTTAGCCTTCAGGATTTTTTAGTATAGGAGGGATTGAATTGGAAGAATATATGAAAAGAGCTTTAACACTGGCTGAAAAAGGATGGGGATACACAAATCCTAATCCGCTTGTAGGTGCTGTAATAGTAAAAAATGGCAAAATAATAGGTGAAGGTTATCATGAATATTTTGGAGGGCCACATGCTGAAGTAAATGCATTAAAAAATGCAGTTGAAGATGTTAAAGGTTCTACTATGTTTGTAACACTTGAACCTTGCAGCCATTATGGCAAAACGCCTCCTTGTGTTGAAGAAATAATTAAATCTGGCATTAAGAAAGTGTATATAGCGATGGAAGACCCAAATCCTAAAGTTAGCGGGAACGGTATAAAAAGGTTAAAAGAGGCGGGAATAGAAGTACATGTGGGGATGATGGAGAAAGAAGCGAGGAAACTCAACGAAATATTTTTTAAATATATTACGACAAAATTTCCATTTGTGATATTAAAATCTGCTATGAGTATTGATGGTAAGATTGCTTGTTATAATGGAAATTCTAAATGGATTACAAATGAGAAATCAAGAAAATTTGCTCATAAAATAAGAGGACGTGTATCCGCCATTATGGTTGGGGTAAATACAGTAATTAAGGATAACCCAATGCTTACAACAAGGTTGGAGGGGTATAAAAATCCTGTAAGGATTATTGTGGATAGTAGAGGTAGAATTCCACTTAACTCAAATGTAATAAGAGACAAAACGGCAAAAACGATAATTGCTACAACAGAACTTATGCCAAACAATAAGAGAAAGAAGCTTGAAGATATGGATATTGAAGTTATTATATTAAAGAATGACAATGGAAAAGTACCTTTAAAAGAGCTAATGATAAAACTTGGAGAGAGGGGAATTGATAGTGTATTGATTGAAGGCGGTGGGACATTAAATTGGTCTGCATTTAAAGAGGGAATTGTTGATAAAGTTATGTTTTTTATATCACCTAGAATAATAGGAGGAAAGAATGCTTTAACACCTGTAGAAGGTATAGGTTTTTCAAGCATAGAAAATTCAATAGAATTAAAAGATGTGGAGATTGATAGAATAGATGATGATATACTAATAACAGCATATGTAAGAAAGTAGGTTATGGCGTATGTTTACTGGAATTATAGAAGAAACAGGAACTGTTAAGAATATTACACATGGTACTTTTACAAAAATTGTTATAAAATGTAGCAAAGTCCTTGAGGAAACAAAAATAGGTGATAGCATAGCAGTTAACGGTGTATGTTTAACTGTTACTAATATATCAGACGAAAGTTTTGCGGCTGATGTTATGCCTGAAACTATGCGAGCAAGCAATTTAAAAGATCTGAAAATTGGAAGCATTGTCAATCTTGAAAGAGCACTTCAAGTTGGAAGGAGAATGGGTGGTCACATCGTAACTGGCCATATAGATTGCGTTGGAAAAATCATAGAGAAAAGGCAGGAAAAAAATGCTTTTATATTTAAGATAGCTATCAATGAGAAATTTACAAAATACATTGCCCGTAAGGGAAGTATTGCGGTTGATGGTATAAGTTTAACGGTTGTTGAGGATGGATATGATTATTTTACTGTTTCAGTTATTCCACATACAATGCTTAAGACCACATTGGGTTATAAAGGGGTAGGAGATAGTGTAAATATCGAAGTTGATATACTTTCTAAGTATGTAGAAAAACTAATAGGGAAAAAGGATATAAAAGATTTATTAAAAGAAAATGGATTTATATAGATGTTGATGACTTTTCTAAGTTAAGGAGGAAAGATCAATGTTTGATAGGATAGAAGATGCAATAGAAGATATAAAGCAAGGGAAAATGATTATTGTGGTAGATGATGAAAATAGGGAAAATGAAGGCGACTTAGTTATGGCAGCAGAAAAAGTTACAGGAGAAAACATTAATTTTATGATAAAATATGGACGGGGTCTTGTATGTGTTCCGATGACAGAAAAGAGACTTAATGAGCTTGGCATTTACCAGATGGTTGAGAATAACACTGACCATAAAGAAACTGCTTTTACTATATCTGTAGATTATAAAGAATGTACCACTGGTATTTCTGCATTTGAAAGAGCACTGACAGTGAAGAAATTAGTAGATGATAATTCAAAGCCAGATGATTTTACAAAGCCAGGACATATCTTTCCTTTAAGAGCCAAAGATGGTGGTGTATTAGTAAGGGCAGGGCATACAGAAGCGGCTGTAGACCTTGCAGTTCTTGCAGGACTCAAACCCGCTGGAGTAATATGCGAAATCATAAAAGACGATGGAAATATGGCAAGGTTGCCTGACCTTTTAGAGTTTGCAAAAAAATTTGGATTGAGAATTATATCTATTGAAGATTTGATAAAGTACAGAATGAAAAATGAAATACTTGTGAGAAGGGTGGCACAGGCGAAACTTCCAACGAAGTATGGAAATTTTGAAATTGTTGGATATGAAGAAATATTAACAGGAAAACAGCATGTAGCTCTGATTAAAGGAAACGTAAATAAAGAACCTGTACTTGTAAGGATACATTCTGAATGTCTTACAGGGGATATATTAGGGTCGCTAAGATGTGACTGTGGTGACCAGCTTCATGCGGCAATGGAAAGAATAGGACAGGAAGGAGGAGTACTAGTTTATCTGAGGCAGGAAGGAAGGGGCATAGGACTTTTAAACAAGATTAAAGCGTATCATCTGCAAGATCAAGGGCTTGATACTGTTGAAGCGAATATTAAGCTTGGTTTTCCACCCGATTTAAGAGAGTACAATATAGCTGCACAGATTTTGAAAGATATAGGAGTTAAAAAGATAAGGATTATGACAAATAATCCGCAAAAAATTACGGAATTATCAGACTATGGCCTTGATGTTGTAGAAAGGGTTTCTATAGAAATTTGTCCAAATCATTATAATGAAAAATACCTCAAGACAAAAAAGGAAAAAATGGGACATCTAATTTTGGAAGTGTAAAATGCTATAAAAAATGAATTGAATGTAATTATTGAGTATATTAAGTATGTAATGAAAGAATATTAATAAGGAGAGTGTATAGTTTATGAAAATATATGAAGGAAAACTTATAGCACAAGGAAAGAAATTTGGAATTGTAGTAAGCAGATTCAATGAATTCATAACGAACAAACTTCTCGAAGGGGCACTTGAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_013921|22591:31497|27482_27947_+|WP_012994204.1|DBSCAN-SWA MKIYEGKLIAQGKKFGIVVSRFNEFITNKLLEGALDALKRHGALNENIEIAWVPGAFEIPLIAKKMAESKRYDAVIALGAVIRGETPHFDYVANEVSKGIAKISLDTEVPVIFGVLTTDTIEQAIVRAGTKGGNKGFEAAVTAIEMANLMEEIK >NC_013921|22591:31497|25545_26169_+|WP_012994202.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEETGTVKNITHGTFTKIVIKCSKVLEETKIGDSIAVNGVCLTVTNISDESFAADVMPETMRASNLKDLKIGSIVNLERALQVGRRMGGHIVTGHIDCVGKIIEKRQEKNAFIFKIAINEKFTKYIARKGSIAVDGISLTVVEDGYDYFTVSVIPHTMLKTTLGYKGVGDSVNIEVDILSKYVEKLIGKKDIKDLLKENGFI >NC_013921|22591:31497|30225_31497_+|WP_012994208.1|tRNA|DBSCAN-SWA MIDVKRIRSNPEAIKRAIELKKDKADIDKFLKLDERRRQMLVELEALKNRRNVESDNIAKLKREGKDVSDLIAEMKELSSKIKEMEQEVKEVEEQLEGILWTIPNIPHESVPTGDSDEDNVEVRRWGETRKFDFEPKPHWEIGEELDILDFEAAARVTGSRFTFYKGLGARLERALINFMLDLHVEKHGYTEVFPPFMVHRRSMLGTGQLPKFEEDAFKVYGTDYFLIPTAEVPVTNMYRDTIIDGDKLPIYHCAYSACFRQEAGSAGRDTRGLIRQHQFNKVELVKFTEPDKSYEELEKMTKDAEEVLQLLGLPYRVVAICTGDLGFTASKKYDIEVWMPSYGRYVEVSSCSNCEDFQARRANIKYRPKDGGKAQYVHTLNGSGVAVGRTFAAILENYQQEDGSVVIPEVLRPYMKVDVIKK >NC_013921|22591:31497|29422_29953_+|WP_012994207.1|DBSCAN-SWA MDKNVQKEILSWIFTIALAFLIALFIRTYVFELVDVPTGSMLDTIQLNDKFIVNKFIYKFEPVKRGDIVVFRFPDNPKVNFVKRVIGIGGDVIEIKNGVLIRNGEVVKEPYIKEPMKGNFGPYVVPPGHYFMLGDNRNESMDSRFWQHKYVSKDQILGKIVFRIWPPNRVGSMSGK >NC_013921|22591:31497|22591_24256_+|WP_012994200.1|DBSCAN-SWA MILKGAQVVIEVLKEVGIDTIFGIPGGAVIPIYDALYDSDLRHILATHEQMAAHMADGYARVTGRVGVCFATSGPGSTNLVTGIANAYMDSVPVVAITGQVPTNLIGKDAFQEVDITGITMPITKHNFIVKSPDKLTDTIRQAFAIAKSGRPGPVLVDIPKDIQNADIEYVKGMGDSIDIKNDINGVVSQKELDKAIELILQSKKPVIFAGGGVIWGEASDELVEFAEKTNIPVATSLMGLGAFPEDHPLSLGLIGMHGSRFANLAVYKSDLVIAIGTRFSDRVAGKAGGLAPNAKIIHIDIDPAELGKNVEVEVAIIGKVKEVLRLLMNKLSFIERKEWLEEISFLREKHGLKYKNDEVLRPQWIVEKIQQLSNDDLIIATEVGQNQMWAAQYYKFKRPRTFVTSGGLGTMGFGLPAAIGAQVGKPDKRVVNIAGDGSLRMNIHALETAAVYNIPVITVLLNNRTLGMVRQWQNLLYNKRFSQTDLNANLNFANLANDFGVEGIRVTTKEEFEKAFKKAYSQKRPFMIECIIDKDEMVLPFIPAGGTVENTIG >NC_013921|22591:31497|29114_29285_-|WP_012994206.1|DBSCAN-SWA MREIEYLLDLAEIKDTEYKNLLTLLSLIDLLVEKGIITQHELAQKSKEIAKIKTAL >NC_013921|22591:31497|24452_25535_+|WP_012994201.1|DBSCAN-SWA MEEYMKRALTLAEKGWGYTNPNPLVGAVIVKNGKIIGEGYHEYFGGPHAEVNALKNAVEDVKGSTMFVTLEPCSHYGKTPPCVEEIIKSGIKKVYIAMEDPNPKVSGNGIKRLKEAGIEVHVGMMEKEARKLNEIFFKYITTKFPFVILKSAMSIDGKIACYNGNSKWITNEKSRKFAHKIRGRVSAIMVGVNTVIKDNPMLTTRLEGYKNPVRIIVDSRGRIPLNSNVIRDKTAKTIIATTELMPNNKRKKLEDMDIEVIILKNDNGKVPLKELMIKLGERGIDSVLIEGGGTLNWSAFKEGIVDKVMFFISPRIIGGKNALTPVEGIGFSSIENSIELKDVEIDRIDDDILITAYVRK >NC_013921|22591:31497|27965_29030_-|WP_012994205.1|DBSCAN-SWA MNNYLKYSNIIKKIILIVSVFIIFYLVIFKIIPFLMPFVVALIFAVIIDPGVNFLEKKLKVPRGLASFILLLILIGVIGSLIAITVTQLIYELSSLAEISTNYANTINDAILNLVDRIRTYYISLPPNITSLIESNMHSILNYISLFAKNLATWLLNFATKLPNFFFMTLITLVATFFISKDKNLILDFIKRQIPSHWAQHAKNIQIDLLKTFFGYLRAVAAIMLITFLEVSIGLVIIGFDYPFLLGLFVTIVDALPVLGSGSVMIPWALYNIIIIKNYMVGIYLLILYILVVVVRQMIEPKIVGQSIGLHPLVTLLSMFIGVKLFGALGLIIGPVFVVVFKALQRAEIIPPWK >NC_013921|22591:31497|26206_27397_+|WP_012994203.1|DBSCAN-SWA MFDRIEDAIEDIKQGKMIIVVDDENRENEGDLVMAAEKVTGENINFMIKYGRGLVCVPMTEKRLNELGIYQMVENNTDHKETAFTISVDYKECTTGISAFERALTVKKLVDDNSKPDDFTKPGHIFPLRAKDGGVLVRAGHTEAAVDLAVLAGLKPAGVICEIIKDDGNMARLPDLLEFAKKFGLRIISIEDLIKYRMKNEILVRRVAQAKLPTKYGNFEIVGYEEILTGKQHVALIKGNVNKEPVLVRIHSECLTGDILGSLRCDCGDQLHAAMERIGQEGGVLVYLRQEGRGIGLLNKIKAYHLQDQGLDTVEANIKLGFPPDLREYNIAAQILKDIGVKKIRIMTNNPQKITELSDYGLDVVERVSIEICPNHYNEKYLKTKKEKMGHLILEV |
9 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
523288 : 534832
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013921|523288:534832|DBSCAN-SWA TATGAAAATAGAAGGTAAAAAAGTTCTTGTGACAGGAGCAGGGGGATTTATTGGTTCACATCTTGTTGAAAGGCTAATTGAGAGAGGGGCGGAAGTAAGGGCTTTTGTGAGATATAATTCAAAAAACAACTGGGGCTGGTTGGAGACATCACCATATAAAGATGAGATAGAAATTTATACAGGAGATATAAGAGATTATGATAGTGTAAAAGATTCCATGAAAGGAATAGAGATTGTTTTTCACTTAGCTGCTCTTATAGGAATACCGTATTCATATATTTCACCACTTGCATATATAAAGACAAATGTAGAAGGAACATATAATGTATTGCAATCTGCAAGAGAACTAGGTGTAGAAAGAGTAATACATACCTCCACAAGTGAAGTTTATGGAACGGCGAAATATGTACCTATTGATGAATCACATCCCTTACAGCCACAATCTCCATATTCGGCTACTAAGATAAGTGCTGATAATATAGCATTGAGTTTTTATAATGCATTCAATTTACCGGTAACAATAGTGCGACCGTTTAACACGTATGGTCCACGTCAATCTGCAAGAGCAGTAATTCCTACAATTATTACTCAGATTATGAGTGGTAAAAAACAAATTAAACTTGGGAATTTACGACCTACAAGAGACATGAATTATGTGATAGATACAGTGAATGGATTTATAAAGATAGCAGAATGTGATGAACTGTTAGGAGAAATAACGAATATAGGTTCAGGAAAAGAAATATCAATAGGAGATTTAGCCAGACTTATTTCTCAATTAATGGGAGTAAAAATAGAAATAGAACAAGAAGAGCAACGATTTAGACCAGAAAAGAGTGAAGTTGAGAGGCTGCTTTGTGATAATACAAAAATGAAAAAATTTACTGATTGGGAGCCTCAATACACTTTAGAAGAAGGGCTTATTCAAACTATAAACTGGATGAAAACACATTTAAATATGTATAAGCCGGAGGTATACAATGTCTGAACTGTATCTTGATTCTCCTAATTTAAGTGAGTTAGAGAAAGAATATATTTTAAAAGCACTTGACAGTAATTTCGTATCGACTGTAGGCCCTTTTGTGCGCGAGTTTGAAGAGAAATTTGCAAGATATTTGGGAGTGACTTCTTGCGTTGCAGTACAAAGTGGTACAGCAGCGATTCATGTTGCCTTATATGAGGTGGGGATAAAAGAAGGAGATGAAGTTATTGTACCTGCTATCACCTTTGTTGCTACTGTTAATCCAATAGTTTACTGTGGGGCAACTCCAGTGTTTGTTGATATTGACAAAGATACGTGGAATATAGATCCGAAAGAGATTGAAAAAGCAATAACTTCAAAGACAAAAGCTATTATACCAGTTCACTTATATGGTAATCCATGTGATATGGATGAAATAATGAAGATAGCTGAAAAATATGGAGTTTACGTGATTGAAGATGCGACAGAAAGCCTTGGTGCTGAATATAAAGGGCGTATGACGGGAACAATTGGCCATATTGGATGTTTCAGTTTTAATGGAAATAAAATTATCACAACAGGCGGAGGCGGAATGATATCAACAAATAACGAAAAGTGGGCCTCTCATATAAAATTTTTAGTTAACCAAGCGAGAGATGCATCACAAGGATATTTTCATCCTGAAATAGGTTTTAATTATCGGATGACAAATTTGGAAGCGGCTCTTGGGCTTGCTCAACTAGAACGTTTACCAGAATTTCTCAAAAAGAAACGTATATATTTTGAAGCGTATAAGAAAATTTTTGAAGGCATTGACGAGATAGTACTTCAAAAAGAGTATGAAGGAGCTATAAGTTCTGCATGGCTTCCGTCTATAAAAATTAATTGCAAAAAAGTAGATATGACTATACCGGAAATTCAGAACAAATTAAAAGAAAGAGGTATTCCAACAAGAAGGGTATTTAATCCAATAATTGATTTTCCACCATATGTTAAGTATAAAAAGGGAAATTATCATAATTCATATGAGATATTTGAAAATGGATTAAGTTTACCAGCTTCTACCTTAAATACTCTTGAGAATGTAGAATACGCGGCAAAAACATTATTGGATATTTTAGGCATTAAGAAAGAGGTAGTTTTATGAAAAAGATTGCGGTTGTCACAGGTACAAGAGCAGAGTATGGATTATTGTATTGGACAATGAAAGAAATTGAGAATGATCCGGAATTAGAATTACAGCTTATTGTAACAGGAATGCATTTATCGCCAGAATTTGGACTAACGGTGCAGGAGATTGAAAAAGATGGATTTAAAATAGATGAAAAAATAGAAATTTTGCTTTCCTCTGATACAGGACAAGGAGTAGCTAAAGCTATAGGATTAGGAGTTATAGGATTTACTCAAGCTTTTGTAAGACTAAATCCTGATATACTCATGATTTTAGGTGACAGATTTGAAATATTTGCAGCTGCGACCGCAGCAATGGCAATGAACATACCTATAGCTCATATTGGTGGTGGTGAATCAACAGAAGGAGCAATTGATGAGCAAATAAGACATGCGATAACTAGAATGGCACACATTCATTTTACCAGTTGTGACTATTATGCAAAAAGAATAAAAAAAATGGGAGAAGAAGAATGGCGTATATTTAATGTTGGAGCGCCAGGATTAGAAAATATTAAACGATTAAAGTTGCTTAACAGAGAAGAAGTAGAAAAATTGCTTAATGTGGATTTAAGCGAAACTACTTTATTAGTTACATATCATCCAGTAACTTTGGAAATGCAAACTTTAAAAGAGCAAATGGATAATCTTTTAGGCGCGTTGATGCAAACAGGGTATCAAATTATATTTACCTATCCTAATTCTGATAGTGGAGGCAGATATATAATTAAAAGAATAAACGAATTTATTAAAAACTATAACAAAGCCAAAGCTTTTGTAAATCTAGGCCAGCAGAAATATTTAAGTTTGCTCCAATATGTCAATGCAATGGTTGGAAACTCTTCAAGTGGCATTATTGAAGCCCCATCTTTTAAATTACCTGTTGTAAACATAGGTGACAGGCAAAAAGGTAGATTGCGAGCTGAAAATATTATAGATGTAGGTTATTCCAAAGAAGAAATATTAAATGGAATTAATAAAGCATTACAGGATGAAGAGTTTAGAGCAAAACTTGAAGATATAAAAAATCCTTATGGGGATGGGGATACGAGTAAAAAGATTATTAAAATATTAAAAGAGATTAATACAAAACAAGAAAATTTTCTAAAAAAGAAGCTTACTTATTAGAGTTAATTTTAAATTAATTTTATAAAGAGAGATGGTAATCAGATGATTAAAATAGGGAGTAAAACAATTTCTGACAATTCACCCGTATTTATAATAGCTGAAGCTGGTGTGAATCACAATGGAGATATAGAAATAGCGAAAAAAATGGTTGATGCGGCGTGTGAAGCTGGAGCAGATGCAATAAAATTTCAAATATTTAAAATAGATAGTTTAGTGATTAAAAATGCGGATAAGGCTGAATATCAAAAGTTAAATACAGGAATAGATGAAACACAGTATGATATGTTAAAAAAATTAGAACTTTCATACGAAGAACATTTCAAAATTATGGAATACTGTAAAGAGCGAAATATAGTATATCTTTCAACACCGTTTGATTATGAAAGTGTTGATGTATTAGAAGACCTAAACATACCTGCATATAAAATAAGTTCAGGAGACATAACAAACCTTCCATTTTTAAAATATGTAGCAAGCAAGGGTAAACCAATTATTGTTTCTACAGGCATGTCAAATCTAGGTGAGGTAGAAGATGCAATAGAAGCAATAAAAAGCACAGGTAACGAAAAGATAATTTTATTACACTGTACATCCAATTACCCTGCGGAGTACAATGAAGTAAACTTAAAAGCGATGATTACTTTAAGGAATGCTTTTCAAATCCCAGTAGGCTATTCTGATCATACATTGGGAATTGAAGTCCCAATCGCTGCAGTATCACTAGGAGCAAGAATTATTGAAAAACATTTTACTCTTGATAGAACTATGCCAGGGCCTGACCATAAAGCATCATTGGAACCTGCTGAATTAAAACAAATGATTATTAGTATACGAAATATAGAAAAGGCATTAGGTGATGGAATAAAAAAATGTACTAAAAGTGAGGAAAACGTAAAAAAAATAGCAAGAAAGTCAATTGTTGCAGCAAGTTATATACCAAAAGGAAGTATTATTGATGAAAATATGTTAACTATAAAAAGACCCGGGACAGGTATACCACCGAAATTTATAGATTATTTAATAGGGAAAAAAGCAAAAATTGATATCTTAAAGGATACAGTTCTTGACCTATCGATGTTTGAATAAACTTTCTGTTTTGTGAGGGGGAACTTTTTTGAAAAAAATAATATTAATTGGTGCAGGAGGACATGCAAAAGCAGTAATAGATATACTTAAAAAAAATAATCAAGGAATAGAAATTGTAGGGTTAATAACAAAAGATGCTGACGATATAGGCAAGAAAATATTAGGAGTATCAGTAATTGGTACAGATAAACAGCTGAGTGAGTTGTTTAAGAGAGGTATAGAATATGCGCTTATAGCTGTGGGAAGTGCTGGAGATAATTTTTTAAGGAAAAAGTTATATGAAAAAGTCGCCAATATCGGTTATACATTTGTAAATGCATTTCATCCCTCTTCGATTATTTCGGATCATGTAAAATTTGGTGCTGGAAATGTCGTTATGCCAGGGGTATTAGTTGGACCGGATACAATAATAGGAAATAATGTGATTTTAAATACAGGTTCCATAATAGAACATGATTGTGTAATAGAAGATCATGTTCACATAGCTCCAGGTGTCAAAATTGCAGGAGGAGTAAAAATTGGAGAAGCAAGTCACATTGGAATTGGTAGTGTTATTATTCAGGGGATAAAGATAGGAAAAAATGCTTTGATTGGAGCAGGAACTATTGTTTTAAAAGATGTGCCAGATAATGCAGTAGTGGTAGGTGTGCCGGGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013921|523288:534832|529393_530095_+|WP_012994614.1|DBSCAN-SWA MYKGETILALIPARGGSKGVPRKNIKLLLDKPLIAYTIETALQVDFIDKVIVSTEDLEIAQISREYGAEVPFLRPYELATDEAKSIDVILHAMDWMEKKHGAFNLILLLQPTSPFRSSEDIKTALDIFFKKNAKAVVSVCEAEHSPLWMNTLNDDLNMKDFIRKDILNKNRQELGKYYRINGAIYIAEWDYLKQNKTFFGDKTYAYIMPKERSIDIDTEMDFKFAEFLINRYG >NC_013921|523288:534832|531258_532182_+|WP_012994616.1|DBSCAN-SWA MKELYIEFLNVENEESVIEKFHDTLVDTNRSYDFFVDWDKVRKHVEEHKIEFNILNSLIGSNQFDNDLRKILLNYPRVLPVIPILLAIRDLNFKVIRNFTDKNLDIMTYDFNTRTLTSEEIDNIIEFFDKTGLKRFFLEMGTKSVQDYVIGVEVGMDTHARKNRSGDAMELLLKPIIEDIVTKEKGFERVLFQKNFEYLETNYGIEVNSSIKNRKADFILIKDNKKVINIEVNFYSGTGSKPQEIVDSYIERQNELKNNGFEFIWITDGEGWRGQKNQIHKGFEKIDYLLNLHFVRIGLLEEILCRI >NC_013921|523288:534832|525391_526546_+|WP_012994610.1|DBSCAN-SWA MKKIAVVTGTRAEYGLLYWTMKEIENDPELELQLIVTGMHLSPEFGLTVQEIEKDGFKIDEKIEILLSSDTGQGVAKAIGLGVIGFTQAFVRLNPDILMILGDRFEIFAAATAAMAMNIPIAHIGGGESTEGAIDEQIRHAITRMAHIHFTSCDYYAKRIKKMGEEEWRIFNVGAPGLENIKRLKLLNREEVEKLLNVDLSETTLLVTYHPVTLEMQTLKEQMDNLLGALMQTGYQIIFTYPNSDSGGRYIIKRINEFIKNYNKAKAFVNLGQQKYLSLLQYVNAMVGNSSSGIIEAPSFKLPVVNIGDRQKGRLRAENIIDVGYSKEEILNGINKALQDEEFRAKLEDIKNPYGDGDTSKKIIKILKEINTKQENFLKKKLTY >NC_013921|523288:534832|524267_525395_+|WP_012994609.1|DBSCAN-SWA MSELYLDSPNLSELEKEYILKALDSNFVSTVGPFVREFEEKFARYLGVTSCVAVQSGTAAIHVALYEVGIKEGDEVIVPAITFVATVNPIVYCGATPVFVDIDKDTWNIDPKEIEKAITSKTKAIIPVHLYGNPCDMDEIMKIAEKYGVYVIEDATESLGAEYKGRMTGTIGHIGCFSFNGNKIITTGGGGMISTNNEKWASHIKFLVNQARDASQGYFHPEIGFNYRMTNLEAALGLAQLERLPEFLKKKRIYFEAYKKIFEGIDEIVLQKEYEGAISSAWLPSIKINCKKVDMTIPEIQNKLKERGIPTRRVFNPIIDFPPYVKYKKGNYHNSYEIFENGLSLPASTLNTLENVEYAAKTLLDILGIKKEVVL >NC_013921|523288:534832|532169_532949_+|WP_012994617.1|DBSCAN-SWA MQDIDFKKEITTVWSFPERGKWKTHKGDYRGNFAPQIPRNVILRYSQEGDFVLDPMVGSGTTLIETKILNRRGIGFDINPDSVELTKRNLDFDGDYKYEQIVRVGDVRNLKEISDSSIDLIITHPPYLNIIKYSNGRIEGDLSNISDVKKFCDELEKGVIELYRVLKEDRYCAILIGDTRKSGHYIPLSYYVMRLFLKNGFVLKEDIIKVQHNCKSTPYWEKQVEKYNFYMIMHEHLFIFRKPKKDENLNKIKYSTGLY >NC_013921|523288:534832|530285_531248_+|WP_012994615.1|DBSCAN-SWA MQALNLIETSDKILSILNNAKPFLKWAGGKTQLLDELCKRLPSSLIQSGEIERYVEPFVGGGAFFFFLKRNFKVKESFLIDINKELIIGYKVIQNNVNELIDELSSMEEKYLKLSEEQRKDFYYNIRDEYNRQKGNFDYVNYNLDWVKRAAYLIFLNKTCFNGLYRLNKKGEFNVPFGKYKNPTICDVDNLIEVSKALENTEVICADFEESKKYIHKNTLVYLDPPYRPLNNTSNFTSYNEDGFDDDDQRRLAQFFKEMDKRDAYLILSNSDPKNEDVDDNFFDELYAGFIIERVKAKRYINSNGDKRGDISELIIRNYE >NC_013921|523288:534832|523288_524275_+|WP_012994608.1|DBSCAN-SWA MKIEGKKVLVTGAGGFIGSHLVERLIERGAEVRAFVRYNSKNNWGWLETSPYKDEIEIYTGDIRDYDSVKDSMKGIEIVFHLAALIGIPYSYISPLAYIKTNVEGTYNVLQSARELGVERVIHTSTSEVYGTAKYVPIDESHPLQPQSPYSATKISADNIALSFYNAFNLPVTIVRPFNTYGPRQSARAVIPTIITQIMSGKKQIKLGNLRPTRDMNYVIDTVNGFIKIAECDELLGEITNIGSGKEISIGDLARLISQLMGVKIEIEQEEQRFRPEKSEVERLLCDNTKMKKFTDWEPQYTLEEGLIQTINWMKTHLNMYKPEVYNV >NC_013921|523288:534832|528332_529391_+|WP_012994613.1|DBSCAN-SWA MEKIKSVLIKEESLIKEAIKQLNENTLQILLVIDDNYRLIGTVTDGDIRRAILNNISFDEPVGKIMNRVPKFVYIGEEENAKELMIKHRIKTIPVLDREKRVVDLILMENLLETRYEYPEKSNYVFIMAGGKGTRLDPFTKILPKPLIPIGDIPIIEVIIKNFKKFGFNNFLISVNYKAEIIKLYFSENPDGYNINFIHEKDFLGTAGSLRLAEEKLKDTFIVSNCDVIIDIDFDELLKYHKKNNNHATIVGVVKNMQIPYGVIDVNNGELVNMIEKPEYNFVINSGVYVLEPELINLIPQGKPINMPDLLLKSKEVGYKVGVYPVSSKWFDVGQWEEYRNTLEYFKKVDGI >NC_013921|523288:534832|532990_534832_-|WP_012994618.1|DBSCAN-SWA MCGITGWVNFDMDLSLQNEVIEKMTNTLKERGPDGSGIWLSKHCALGHRRLIVIDPQGGSQPMIKKYGEKNFVIIHNGELYNMDELKNELISLGYIFKTRSDTEIILTSYIEWGPECVKKFNGIFAFAIWDEVQNRLFIARDHLGIKPLFYTIKNGSLIFGSEIKAILAHPHVKPEIDSQGLAEIFVMGPSRTPGCGVFKDIKELKAGHYLIFTKNGVNINKYWSLQSIPHEDSLEKTAEKIRYLLKDSSVRQLVSDVPLCSLLSGGLDSTAVSAFANEELKQKGQKLITYSVDYVGNDKYFTPNKFQPNSDADWVKFVAKKLDTNHNYVFIDNEELVYALKPALYARDLPGMADIDSSLYLFLKEVKKGATVALSGEGADEVFGGYPWFRNKEAIEANTFPWIRMINERMKLLLPEVVKYIRPIEYLNDRYNEALNEVPKLTGEDPKNTRMREMFYLNLTRFMPMLLDRMDRMSMAVGFEARVPYLDYRLVEYVWNIPWEMKNLNGREKGILRYALKGYIPNEVIERKKSPYPKTHNPVFKNIVKKWLKQIVDDSTSPLLQLVDKKAIITLIETDAKAYDPAWFSQLMGSAQLFAYLVQINMWLKDYKISIV >NC_013921|523288:534832|527660_528320_+|WP_012994612.1|DBSCAN-SWA MKKIILIGAGGHAKAVIDILKKNNQGIEIVGLITKDADDIGKKILGVSVIGTDKQLSELFKRGIEYALIAVGSAGDNFLRKKLYEKVANIGYTFVNAFHPSSIISDHVKFGAGNVVMPGVLVGPDTIIGNNVILNTGSIIEHDCVIEDHVHIAPGVKIAGGVKIGEASHIGIGSVIIQGIKIGKNALIGAGTIVLKDVPDNAVVVGVPGKIKKFRETND >NC_013921|523288:534832|526588_527632_+|WP_012994611.1|DBSCAN-SWA MIKIGSKTISDNSPVFIIAEAGVNHNGDIEIAKKMVDAACEAGADAIKFQIFKIDSLVIKNADKAEYQKLNTGIDETQYDMLKKLELSYEEHFKIMEYCKERNIVYLSTPFDYESVDVLEDLNIPAYKISSGDITNLPFLKYVASKGKPIIVSTGMSNLGEVEDAIEAIKSTGNEKIILLHCTSNYPAEYNEVNLKAMITLRNAFQIPVGYSDHTLGIEVPIAAVSLGARIIEKHFTLDRTMPGPDHKASLEPAELKQMIISIRNIEKALGDGIKKCTKSEENVKKIARKSIVAASYIPKGSIIDENMLTIKRPGTGIPPKFIDYLIGKKAKIDILKDTVLDLSMFE |
11 | Synechococcus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
614168 : 622941
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_013921|614168:622941|DBSCAN-SWA AATGGAAAAGGTGAGTAAAATGAGAAACAAAAATTCTTTAGAGAATCTAGCGAATAGGATATGGAGGCTAGAAAACTATAGTACTAATGTAAAAACAGAAATATTAGCTGGGATTACCACATTTATAACAATGGCTTATATTATGTTTGTAAACCCCATTATACTAAAAGAAGCAGGGATGGATGCAGGAGCGGTATTTGTAGCAACTTGTCTTTCAGCAGCTATTGGCACTTTTATGATGGCTTTGTATGCCAATTACCCTTTTGCACAAGCTCCAGGAATGGGACTTAACGCTTTCTTTACTTATACAGTCGTTTTGACAATGGGTTATACTTGGCAAGAGGCTTTAGCTGCAGTTTTTTTCTCAGGAATTATATTTATTTTGATTACTTTGACTGGAATACGTGAAATGATTGTCGATGCTATTCCTTTGTCTTTAAAATATGCAGTAAGTGCGGGTATAGGATTATTTATAGCTTTTATTGGACTTAAAAATTCTGGAATAATTGTACCAAATCAAGCAACATACATTGGATTTGGTGATTTAACTAATCCTGGGACACTTCTTGCTATTGCGGGACTTTTTATAACCGGGATATTGATGTCAAGAAACGTAAAAGGTTCAATACTTCTTGGCATATTGATAACTACAGTATTGGGACTTTTTACTGGAATAGTGAAATTACCCTCTGATTTTAGCATAATTAAAATGCCACCAAGTCTTGCACCTACATTTCTCAAACTCGATATAAAAGGGCTTTTGGGAGTTGGTGAGAATATCGGCTTTATTTCTTTAGTTACAAGTGTGCTATATGTAGTGTTGTCTTTTGCTTTTGTAGATTTATTTGATACCATAGGGACCTTTATAGGAACAGGATCAAAAGCAGGAATGTTAGATGAAAATGGTAAAATGCCTAATATGAAAAAAGGACTAATGGCGGATGCTATTGCTACCACTATAGGGTCACTTTTGGGAACTTCTACTGTGACTACTTACGTTGAGAGTGCTGCAGGTATTGCAGAAGGTGGTAGAACGGGACTTACTGCTTTTGTGACAGGCATTTTGTTCTTGGTAGCACTATTTTTCTCACCAATAGCTTTGCTTGTTCCTACAGAGGCAACTGCTCCTGCTCTTATTATTGTTGGCGTTTTGATGATGGGCTCTATTAAAAAGATAAGTTTTGAAGATTTTACAGAGGCTATGCCAGCTTTTCTTACTATAATTGCTATGCCTTTCACTTTTAGCATTGCTAATGGTATTGCTGCAGGTCTTGTTGCATACCCTATCGTAAAAATTGCTTCAGGAAAGGCAAAAGAAATTCACCCAATAGTTTATGTTCTTGCAATTTTATTCATATTGAGATTTATAACTTTGTCAGAGTAAAAATAAGACCCCAATTAGTAACTTACTAATTGGGGTCTTAAAAGAAAAGGAGGTATAAAAATGCCAAAGGTGGCTATAGTTGTTGGAAGTAAATCTGATTTGCCTGTAGTTGAAAGATGCACAAAAATTCTTGAAGAATTTGAAATTTCCTATGATGTTAAAGTGTTGTCTGCCCATAGGACTCCCTTTGAGACACAAGAGTTTGCTGTAAATGCGGATAAATATTATGATATAATCATTGCAGGTGCAGGAAAGGCTGCTCATCTGCCTGGAGTTATTGCTTCTTATACACTCTTGCCCGTTATTGGTCTTCCCATAAAGTCTTCTACTTTAGATGGTCTTGACTCCCTTTTATCAATAGTTCAAATGCCTAAAGGTATTCCTGTTGCAACTGTGGCTATAGATGGAGCAGAAAATGCAGCACTTTTAGCTTGTCATATTCTCTCTTTGAAGTATACTTATTTGAAGGAAGCCTTAGCTGATTATAGGGAAAAAATGGCTGAAGAAGTGTTAAATAATTAAGAGATTGGAGGAGATAAATATGGAAAAAAGAGAATTACTTTATGAAGGAAAAGCCAAAAAAGTTTATAAGACAGAGGAAGAAAACTTTTATATCATCGAATATAAAGATGATGCAACTGCTTTTAATGGCTTAAAGAAGGGCACAATTGCCGAAAAAGGAGTAGTAAATAATAAAGTTTCTGCAATTTTATTTGCATTATTAGAAAAAAATAATGTACCCAACCATTATGTGAAAAGACTTAGTGATAGGGAAATGTTGGTTAAAAAGGTTGAAATTTTTCCTTTGGAAGTTATCGTGAGAAATTATGCAGCAGGAAGTATTTGTAAAAGATTAGGTCTTGAAGAAGGACTAAAGTTTAAAACGCCTGTATTAGAATTCTCCTATAAAAATGACGAATTGAAAGACCCAATGATTAATGAATATCACATACAAGCTCTCGAATTAGCCACCAAAGAAGAGATTGAAATTATGACAGAAATGACGTTTAAAGTCAACGAAATTTTATCAGAATATTTTTTATCTAAAGACATTATTTTGGTAGATTTTAAATTAGAATTTGGCAAAAGTAATGAAGGAATATTATTAGCTGATGAAATTTCTCCTGATACTTGCAGATTTTGGGACAAAAACACTATGGAAAAACTTGATAAAGATAGATTTAGAAAAGATTTGGGTAAAGTAGAAGAAGCATATTTAGAAATTTTAAAAAGACTTGGAGGTATGTAAAAGTGCTAATTGCAAAAGTCTATATAACTTTAAAAAAGGGAATACTTGACCCTCAAGGAAAAGCAGTGAAGGGAGCTTTGCACTCATTAGGGTACGAAGAAGTAAAAGAGGTGCGGGTTGGGAAATATATAGAATTAACTTTTGAGGATGGCGATTTATCCCTCCTAAAGGATAAAGTAGATGAGATGTGCAAAAGGATACTGACAAACCCAATTATTGAAGATTACACCTTTGAAATTGTGGAGGGATAAAGATGAAATTTGCTGTTATAGTTTTTCCAGGGTCCAATTGCGATGTGGACTGCTATTATGCTGTTAAAGATGGGCTTGGTGAAGAAGTAGAATATGTGTGGCATCAAGAAAAAAATTTGAGTAAGTATGATGTTATAATGTTACCAGGAGGATTTTCTTATGGTGATTATTTGAGGGCAGGAGCTATTGCGAGGTTTTCGCCTGTCATGGAAGCTGTCAGAGAAGAAGCAGAAAAAGGAAAATTTATTATAGGCATATGCAACGGATTTCAGATACTTACAGAAGCAGGGCTTTTGCCGGGAGCTTTGAGAAAAAATGAAGGGCTGAAATTTATTTGCAAGACTGTCAGTATAACAGTTGAAAATGACAAGACTCCTTTTACTACAAGGCTTAAAAAAGGGCAGGAGATTTTACTTCCAATTGCTCATGGAGAAGGTAATTATTATGTAGATGACAAAACTTTACGAGAATTAAAAGAGAACAATCAAATTGTTTTTAGGTACAAAGAAAATATCAACGGCTCTGTTGAGAGAATAGCCGGAGTTATAAATAAAAAAGGAAATGTTTTAGGAATGATGCCTCATCCAGAGAGAGCTTATGCCCCCTTGCTGGGTAATACTGACGGGCTTTATATATTAGGATCAATAGTGGATAATTTTGTAAAAGGCGGGGTTTAAGGATGGATAAAATATGGAGAGAATTAGGACTTACTGATGAGGAGTATGAAAAAATTATTTCGATATTAGGAAGAGAGCCTAATATAACTGAATTAGGTATGTATAGTGTTATGTGGTCTGAACATTGTGCCTATAAAAACTCTAAACCTCTTTTAAAATATTTACCTACAAAAGGCGAAAGAGTAATACAAGGACCGGGAGAAAATGCAGGAATATTGGATATTGGAGATAATTTGGCAGTTGTCATGAAGATAGAAAGCCATAATCACCCTTCTGCGATTGAACCCTATCAAGGAGCAGCCACAGGTGTCGGGGGAATAATAAGAGATATATTTACAATGGGAGCAAGGCCAATTGCTCTTTTGGATTCTTTGAGATTTGGAATTCCTGAGGATAAAAGGACTAAATATCTCATCGAAAACGTGGTAGCCGGTATAGGGGATTATGGAAATTGCATAGGAATTCCTACAGTAGGTGGAGATACCTATTTTGAAGAAAGTTACAAAGGAAATCCTTTAGTAAATGCGATGTGTGTAGGAATTGTAGAAAAAGACAAAATAAAAAAAGGGATAGCAAAAGGCATAGGTAACCCTGTTATGATAGTAGGTGCTACTACGGGGAGAGACGGTATCGGAGGTGCAAGCTTTGCTTCTCAGGAGTTAAGCGAGGAATCGGAAGAAAAAAGACCTTCTGTTCAGGTTGGCGACCCTTTTATGGAAAAACTGCTTCTAGAGGCATGTCTAGAACTTTTTGAAACAGATGCCGTAGTTGCTATACAAGATATGGGAGCGGCAGGTCTTACCTCTTCTTCTTGCGAGATGGCTTCCCGCGGTGGAGTTGGAATGGAAATTGACCTTGATAAAGTGCCTTTGAGAGAAGAGGGAATGACCCCTTATGAAATAATGCTTTCTGAATCTCAAGAGAGAATGTTGGTTGTAGTAGAGAAAGGCAAGGAAGAAGATGTACAAAAGGTATTTAAAAAATGGGGACTGAATGCCGCCACAATAGGGAAAATCACTGATGATGGAATGATAAGAGTGATTAAAGAGGGAAAAATAGTTGCGGAAGTTCCAGCCAAGTCTTTAACAGAAGGTGCTCCACAATATGTGAGAGAAGAAGAAGTGCCTAAATGGCAAGAAGATGTCAATAAGTTGGATATAAATGAGGTAAAACCTCCAGAGGATATGAATAAAGCTCTAAAAGATGTAATTTCTTCTTTAAATATTGCAAGTAAAGAATGGATATACAGTCAATATGATTATATGGTGAGGACAGACACAGTAATAACTCCAGGTATGGATGCAGCTGTTGTGAGGATAAAAGGTACAAAGAAAGCTGTTGCATTGACAACGGACTGCAATGGTAGATATTGTTATTTAGATCCCTATATAGGTTCTCAAGTTGCTGTAGCAGAGGCAGCTCGAAATCTTTGTATGGTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_013921|614168:622941|616802_617051_+|WP_011025203.1|DBSCAN-SWA MLIAKVYITLKKGILDPQGKAVKGALHSLGYEEVKEVRVGKYIELTFEDGDLSLLKDKVDEMCKRILTNPIIEDYTFEIVEG >NC_013921|614168:622941|617053_617728_+|WP_012994692.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDCYYAVKDGLGEEVEYVWHQEKNLSKYDVIMLPGGFSYGDYLRAGAIARFSPVMEAVREEAEKGKFIIGICNGFQILTEAGLLPGALRKNEGLKFICKTVSITVENDKTPFTTRLKKGQEILLPIAHGEGNYYVDDKTLRELKENNQIVFRYKENINGSVERIAGVINKKGNVLGMMPHPERAYAPLLGNTDGLYILGSIVDNFVKGGV >NC_013921|614168:622941|619910_621308_+|WP_012994694.1|DBSCAN-SWA MGNGEKLKEECGVFGAFSLSTSVTSYIYYGLQALQHRGQESSGIAIYDGEKINCIKGLGLVSEVFNKENLKTLEGKMGIGHVRYSTTGSNDIINAQPLVANFKNEYMALAHNGNLINAKELRGQLEDDGRIFQTTTDSEIILHLIAKNFQKGLIEALKETIKQIKGSYALVILAANKLIGIRDVNSIRPLCIGKKDDTYFLSSESCAFDVIGAELIRDVEAGEIVIIDGKGIESVKLEGEEKKKPCVFEYIYFARPDSVIDRKSVYFTRLEMGKRLAEEAPVDADLVVPVPDSGVAAARGYSLKTGIPMGEGLIKNKYVGRTFIAPDQRDRETGVRIKLNVLKELIQGKRIVLIDDSIVRGTTMKRLVSLLKNGGAKEVHVRISSPPVKYSCYFGIDTPTKKELIAARMSVDKICKVIGADSLQFLSIEGLIKSVGLKFICTGCFDGDYPMYVPKEGNKYLFEKT >NC_013921|614168:622941|621325_622336_+|WP_012994695.1|DBSCAN-SWA MNYKDAGVNIDEGNKLVEMIKPIAKQTLNEYVLEGIGGFAGLIEIKNYKNPVLISSTDGVGTKLKIAFMMDKHDTVGIDLVAMCVNDIIVTGAKPLFFLDYFATGKLKSETAVEVIKGIAEGCKIAGCALIGGETAELPGFYKEGEYDLAGFCVGIAEKEELIDTKLIKEGDAIIGLASSGIHSNGYSLVRKIFFEKNNFSVKDFIPELGINLGEALLTPTKIYVKSIEALKGLKIKGMAHITGGGFIDNIPRILRKSIAAKINKGSWEIPAIFNLIQRLGDIEEREMYRTFNMGIGMVVIVEPSDVDKALEKLNGIGEKAYIIGEIVESEGGVIL >NC_013921|614168:622941|617730_619932_+|WP_012994693.1|DBSCAN-SWA MDKIWRELGLTDEEYEKIISILGREPNITELGMYSVMWSEHCAYKNSKPLLKYLPTKGERVIQGPGENAGILDIGDNLAVVMKIESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIFTMGARPIALLDSLRFGIPEDKRTKYLIENVVAGIGDYGNCIGIPTVGGDTYFEESYKGNPLVNAMCVGIVEKDKIKKGIAKGIGNPVMIVGATTGRDGIGGASFASQELSEESEEKRPSVQVGDPFMEKLLLEACLELFETDAVVAIQDMGAAGLTSSSCEMASRGGVGMEIDLDKVPLREEGMTPYEIMLSESQERMLVVVEKGKEEDVQKVFKKWGLNAATIGKITDDGMIRVIKEGKIVAEVPAKSLTEGAPQYVREEEVPKWQEDVNKLDINEVKPPEDMNKALKDVISSLNIASKEWIYSQYDYMVRTDTVITPGMDAAVVRIKGTKKAVALTTDCNGRYCYLDPYIGSQVAVAEAARNLCMVGAKPIGVTDCLNFGNPEKKEIYWQLKNSIFGIAKACETLQIPVVSGNVSLYNENEGEAIYPTPVIGMAGLIEDVSKICTMDFKKESDVIIILGKNKGELGGSEYLKVCFGMVKGQPPRIDLEEEKRLQELVLKLIDEGLIKSSHDISEGGFAAALVESAIAGKKGAKISLQTSLREDVELFSESQSRALITASPEKVDEVLKIAYEYQVPAQKVGVVEGKDIVIDVNGKRIIDLPLEALEESWRGRIKWEMERN >NC_013921|614168:622941|616092_616800_+|WP_012994691.1|DBSCAN-SWA MEKRELLYEGKAKKVYKTEEENFYIIEYKDDATAFNGLKKGTIAEKGVVNNKVSAILFALLEKNNVPNHYVKRLSDREMLVKKVEIFPLEVIVRNYAAGSICKRLGLEEGLKFKTPVLEFSYKNDELKDPMINEYHIQALELATKEEIEIMTEMTFKVNEILSEYFLSKDIILVDFKLEFGKSNEGILLADEISPDTCRFWDKNTMEKLDKDRFRKDLGKVEEAYLEILKRLGGM >NC_013921|614168:622941|622332_622941_+|WP_012994696.1|DBSCAN-SWA MNLVVMASGNGTDLQSIIDAIEEGYINARIIAVISDKKGAYALERAKKHGIATYCLPKKELKENFQEELLKLLEKLSPDGIILAGFLTILSGEIVERFENKIINIHPSLIPAFCGKGFYGMKVHQAVYEYGVKYTGCTVHFVDQGADTGPIILQEVVKIDEEDTPETIAKKVLEVEHKVLPYAVKLFTEGKLKVEGRKVRIL >NC_013921|614168:622941|614168_615551_+|WP_012994689.1|DBSCAN-SWA MEKVSKMRNKNSLENLANRIWRLENYSTNVKTEILAGITTFITMAYIMFVNPIILKEAGMDAGAVFVATCLSAAIGTFMMALYANYPFAQAPGMGLNAFFTYTVVLTMGYTWQEALAAVFFSGIIFILITLTGIREMIVDAIPLSLKYAVSAGIGLFIAFIGLKNSGIIVPNQATYIGFGDLTNPGTLLAIAGLFITGILMSRNVKGSILLGILITTVLGLFTGIVKLPSDFSIIKMPPSLAPTFLKLDIKGLLGVGENIGFISLVTSVLYVVLSFAFVDLFDTIGTFIGTGSKAGMLDENGKMPNMKKGLMADAIATTIGSLLGTSTVTTYVESAAGIAEGGRTGLTAFVTGILFLVALFFSPIALLVPTEATAPALIIVGVLMMGSIKKISFEDFTEAMPAFLTIIAMPFTFSIANGIAAGLVAYPIVKIASGKAKEIHPIVYVLAILFILRFITLSE >NC_013921|614168:622941|615611_616073_+|WP_012994690.1|DBSCAN-SWA MPKVAIVVGSKSDLPVVERCTKILEEFEISYDVKVLSAHRTPFETQEFAVNADKYYDIIIAGAGKAAHLPGVIASYTLLPVIGLPIKSSTLDGLDSLLSIVQMPKGIPVATVAIDGAENAALLACHILSLKYTYLKEALADYREKMAEEVLNN |
9 | Moraxella_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1356990 : 1423835
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_013921|1356990:1423835|DBSCAN-SWA 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63 | Geobacillus_phage(20.0%) | tail,portal,tRNA,integrase,head,transposase | attL 1396371:1396430|attR 1402205:1404102 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1427113 : 1433864
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_013921|1427113:1433864|DBSCAN-SWA ATCACCCCTTGCTTTGCTGTTTTCCCGCCAGCCATATCCCCGCTTCCCATTCCCTGTAAAGCTCTATCCAGTCCTCCAATTTCATGATTACAAGCCAGTTTTCTTTATTTTTTCTCCAAAATACAGCTGGCTTTTCGTCATCCTTTGCATCACGAGCCGCCTGCCTCATTGCATCGTAAATATTAAGTCTTTCTCTTCTTTTTACTTCAACGTGAATGTATGGAAGACCAACAATATCCATTCCTTCAATACCACTATATTGCTGTCCACGCCTTGTATCGTATCCATATTCTCTAAGTAATTTTGCAAGCTCTAATTCGCCTTTCTTGCCTTTTTGTTTGCTATTCACAATTATCTCCTCCCTCTATAAAAATTCTTTTAGTCTTCTACTCCTGTTAGGATGTCTTAGTCTTTTCAAAGCCTTTGTCTCAATTTGTCTTACACGTTCTCTTGATATCCCTCCTAATTCTTTTCCTACCTCTTCAAGAGTCCTTATTTTCCCATCATCAAGTCCAAATCTTAATCTCAAAACTTTTTCTTCTCTTGGTGCTAAAGTACTAAGTACTTCATCAACTTGCTCTTTTAGCAACATAGATTCTAGTTCTTCTACAGGGTCTACAGCTTCTTTATCAGCAATAATATCTCCTAATTTACCATTTTCATCTTCTCCTACTGGTTCTTCTAAAGACACTATTCCCTGCACAATTTCAAGCAATACTTTTGCCTTTTTTTCAGATATATTCATTTCTTCTGCTATTTCTTCTATACTTGGTTCACGACCTAATTTTTGTAAAAATTGTTTTTGAATTTTTAACAGTTTATTAACTGACTCTACCATGTGTACAGGTATTCTTATGGTCCTTGCTTGGTCCGCAATAGCCCTTGTGATAGTTTGTTTTATCCACCAAGTAGCATAAGTGCTAAATTTATAGCCTTTTCTGTAATCGAATCTTTCAACTGCTTTTAAAAGACCTAAATTGCCTTCTTGTATCAAATCAGGAAATGATATTCCTTTTCCAACATATCCTTTAGCAATACTTACAACAAGCCTTAAATTAGATTCTATAAACCTTTTTTTAGCTTCCTCGTCTCCCTCTTCTATTCTCTTAAGCAACTCGTTCTCTTCTTCTGGAGTGAGTAGAGGAATGTGTGATATTTCTCTTAAATACATCCCAATGTAATCCATATAAACCACCTTTCTTTTTATACATTTTCATCAAGATATTTTATATGTTTTTTTATTGAGTCATAGCATCTAAACACTCCTGTGTATGCTGCAAATGTCTTCTCTAAAGTTTGTATTTTTCTTCCTTTGGGTACTTGCTCGTATGCCGCCTTAGCCTTTTCAAGGGCTATTTTTACTTGTTCACTATTCCAATCCAATCCCTTTTTCATCCTTATTCTCCTTTCTTACTTGCCTTATACTTTTTACTCATCACCTTATTCATTTACTAATTCCTCTATAATCTTCGTCTTTTCATTAGCTGCTTTGACACGTTTTGAAGTCCCTTTAATCTCAACAGGATAGCACATCTCTATTAACCTATCATAAGTCCGGGCAACTCCATCCCAACCGGTTAACTTTTCTTTTAATTGTGTCAATGTGAGATTTGTTGTAACTATCATTGGTTTACCATCCCGGTATCGACTATCAATTATTTCATACAGTTTTTCCCTAGCCCAGTCATTGTTATTTTCAGCTCCAAGGTCATCCAGAACAAGCAGCGATGCATTTCTAAGAATATTTATTATCTCTACTTCTTCCTCTTCACTGTAATTCTTATAAGTCTGTTTAATTCTGTTTAAAAGACCTATAGTAGATATTGCTATAACCGGTACCAAGTTTTCTATGAGCTTATTAGCTATACAAAAAGCCAGAAAAGATTTGCCAGTACCCGGAGGCCCCCAGAACAGAAAGCCTATATTTTTAGCCTTCATCTCTGGCCACCGTTTGCAATAATTAACTGCCATCTTGTACAGCTTTTGATTGTTCTCGTTTATTTGAAAATTTTCAAAAGTACACTGCTCAAATCTTTTGTCCATAAGCGAATATTGTCTGAGCCTCTCAAGCCTTATTTTCCTCTGCTGATTTTGAAATTCCCTTTCCTGTCTTTCATACTCTTCTTTCCTACATTTGCACATAACTGGTACCGTATACTTTTGCCCCAATATCTCTATCTCCATCGATGTTTTACTGCCACAATTAGGACATACATCAGAAGCTAATTCCGATTCCTTCATACTGCTCATCATTTCCCCAATTATCAAATTGAGACTTTGCACCCTTACTACCCCCTTTATTTTTCTTTTTCTCATACATCATAAGCTGCTCTAAAGACTCTATATCTTTTTCTCTCCATGCCAGAAGTATCTTTTCCACATACCGTATGCTAGTGGCATGGTTAAGGCGTGCTCTCCTAAATGCCTCCTCAATAAGCTCATAAGGGTAATTATTTGATATATACTCTAATGATTCTGCTATAGTGGCATTGATAGTACCCATCCCACTCTGTTCAAACAAATTTACTACTTTTACCAACGTGTCATTTGTCATTTTGGTATCAATTTGGGTATCAATATTTGATACCTTTTCCGTTTGGCAACTTGCCTTTTTAACATCTACATCATCTACTACTTCATTATGTTTATATTTTAGTTTTAGTTTATATTTTAGTTTATTTATGGCATCAGTTTGGGTATCAGGTTTGGTATCAAGTTTGGTATCAGGTTTGGTATCAGCATTGGTATCAATTTGGGTATCAATATTTGATACCTTAACTTGGGTGTCAATTTTGGTATCAGGTTTGGTATCAATATTTGATACTTTATTGGTTAAATCTATAATTCTATAAGTTGTGCTTTCTCCTTTTTTATTCGCTGGCTTAAAATCTATTAGATTTTTTTGTTTTAGTTCATTTCTTGCCCTTTTTAATGTATTTTCGCTAACGCCCATAATCCCACATAGGGATTGATTGGTCCGCTGGAAATACTCCGACCATCCGCATCTGTTGTTTATCATGAGCAGTACATGATAAAGCAACTGTGCTGATGGAGTCAGAGTATTTGCCTGCAACCAATCGTAAAAGGCGTTTAACTGTTTTATATAATTCATAAAATCACACCCTATTTAGGTCAATCTTTCTCTTTTTTGTTACTCAATTTCTTTTTTCCGTTAAATTCAATATACATTTTTATGCCTCCTTTAACCGGAGCGGCAGAATTAACTGTCGCTTTCCGGTTTTATTTCTTGCTGAGTACCATCTTGCACCTCTACATAGTGTACATCTTCCTCATCTTCTATAATTTCACCAGTTACTTCTATCGGAGGTATTTCCGTCATATCTTCTGCTATCTCTTTTTTTACTGTTTCATCAGCCGATAAAGCTGCAGCAAATTCTGCACTCTTTGGTGCATACTTTAATAGCTGCTTTAAAACAGTCTTTTTAGCCATAGCATCAAAATCTGTATTCCAAGGACTATTTCTACCCTGTTTTGCTGCCTGAGAATACTTATCTCTGTGTTGTTCTATTTGCTCTCGACTCATAACCACAAACCCATAACCGCCATTTTTAAGGTGATAAACTGCATAGTAGTAAATTGGCTCGCCTTCTGGTTTAGGTGCTGGTACATGCACAAGCCTTTCATTAAGGCCATATTCGTATTCAAATTTGTCATTTTTATATACAGGCATAGCATAAATGCTTTTGTATTCACCTGTTCTATAGGCTAATGCCAACATTCCTTGATAACCTAGTTGGAATTGCACCTCCTTGCCGTAAGGTATTAAATACGCCTGACCTAATGGAGTATTTGGTTCAAGCCCCAGTTGAGCTGATTGCATCATTGCAGCTAAGAAAGATTCAGAAGTACATGTTTGAAGTTTTGGATTAGTCCTTACCGCTGTCATTACTATGCGAGAGAAACGGTCCACGGATATCTGTTTTGGTAATGCTTTTTTTATAGCTGGTTCCATTTCCCTAATCAGGTCAAAAATTGTTTTTCCTTTTTTCGCTACGGGTGTTTTTACCTTTTCTGCTAATTTGTTTTTTAAATCATTTTGATTTACAGTCATTTTACTTTACCTCCCGAACATCAAATTTTCTATAAGTACTTACTTGCAAATATTTCTCGTAAATTTCTGGTTGTTCTATTTTTAATTTTTTACTGTCTATTGAAGTTCTTGAATAAGTCTTCCAACTCACTATATACTTGGGCGTTCTACCTACCTCATTCTCTTTGAGCATAGCTTTAATTTTGTTTTCAATTTCCAACTGTTTTGTCTCAAGTTTCTTTATTTGTGCTTTGATATTCTCTCTTGCCACAATAAGTTCCTCAACCTCTTCAGGTAATTCTATTTCAGTTCCTTCTGCTGCTTCCGGATACAACAATTTCAAAATATTTTCCGAGCTCTTACTTCCATCTAGCGGTGGTGGAGTCCTTTCTTCAACCATTTTCCAAAAGTCAGACTCTATTTTTATCAAGTATTGAATTATTTCTTCATCTCTCTTAATATATTTGTAAATAAACTTATTGCCGCCAATTAATGCTGCAATCCACCATCCTTCATAACCCGTTACGGCCATATAATGTTGGCATTGGATTATATATTGGTCCGGAACTTTATCGCCTTCCCATTCGCTTTTCCCGTATTCACTTACAGTCTTACATTCTAATCCCACTTTCTCTCCTACAAGTTCTCTATCAATATTTGCAATCATGAATTCGTACTTGGGATGCCTGAGCATAAAGTTTCTTCTTCGGACCTTTTTCCCTGTCCTTAATGTGAATTCTTTTGCAACTATATCTTCCAGTATCCTACCCCAATACATTTTTTCATTATCTTCAGGTTCTGGTATTTCTCCTATTTTTTCTAAATATACTTCAATAGGACTTTTCCATGGATTAAGTCCAGCTACAGCAGCAGCATCACTACCGCCTATGCCTTTCTTTCTCCATTGAAGCCACTCGTTTCGGTCCATATTCTTTGTTTTAACTAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_013921|1427113:1433864|1430332_1431184_-|WP_004405559.1|DBSCAN-SWA MTVNQNDLKNKLAEKVKTPVAKKGKTIFDLIREMEPAIKKALPKQISVDRFSRIVMTAVRTNPKLQTCTSESFLAAMMQSAQLGLEPNTPLGQAYLIPYGKEVQFQLGYQGMLALAYRTGEYKSIYAMPVYKNDKFEYEYGLNERLVHVPAPKPEGEPIYYYAVYHLKNGGYGFVVMSREQIEQHRDKYSQAAKQGRNSPWNTDFDAMAKKTVLKQLLKYAPKSAEFAAALSADETVKKEIAEDMTEIPPIEVTGEIIEDEEDVHYVEVQDGTQQEIKPESDS >NC_013921|1427113:1433864|1433094_1433325_-|WP_004401467.1|DBSCAN-SWA MKNKLKEIRKSLNMTGVELAKKVGVSHSLIYMIEGGYRNPSMKLAKKIAKTLGKSLDEIFFDDICHETLLKSNETA >NC_013921|1427113:1433864|1432374_1432620_-|WP_004401478.1|DBSCAN-SWA MDNLQGQASVERITMSAKEAAAYLGISYWLILEMAKRHEIPYIACGSRKLFRKEALDKWMEEQEKKALERPSQYGVLRKIY >NC_013921|1427113:1433864|1429327_1430224_-|WP_004405557.1|DBSCAN-SWA MNYIKQLNAFYDWLQANTLTPSAQLLYHVLLMINNRCGWSEYFQRTNQSLCGIMGVSENTLKRARNELKQKNLIDFKPANKKGESTTYRIIDLTNKVSNIDTKPDTKIDTQVKVSNIDTQIDTNADTKPDTKLDTKPDTQTDAINKLKYKLKLKYKHNEVVDDVDVKKASCQTEKVSNIDTQIDTKMTNDTLVKVVNLFEQSGMGTINATIAESLEYISNNYPYELIEEAFRRARLNHATSIRYVEKILLAWREKDIESLEQLMMYEKKKNKGGSKGAKSQFDNWGNDEQYEGIGISF >NC_013921|1427113:1433864|1432907_1433108_-|WP_169303710.1|DBSCAN-SWA MKLHEEVRGMEKSMKGENNKINILSDLYTKLVVETDEDNPETIAVITDTDVIPADGYRVRLTPKYD >NC_013921|1427113:1433864|1433474_1433864_+|WP_004401466.1|DBSCAN-SWA MNFAKRLATLRKEAGLTQKELADKLGVSRGTIGMYEIGQRDPDTETLQKLSDIFGVSVDYLLGKTDIRNPSDEITEAVEDDPELLEFWNELKQREDLKLLFKQTRKLSPKDIKQVIRIIKAIEEEESNE >NC_013921|1427113:1433864|1428552_1429353_-|WP_004405553.1|DBSCAN-SWA MKESELASDVCPNCGSKTSMEIEILGQKYTVPVMCKCRKEEYERQEREFQNQQRKIRLERLRQYSLMDKRFEQCTFENFQINENNQKLYKMAVNYCKRWPEMKAKNIGFLFWGPPGTGKSFLAFCIANKLIENLVPVIAISTIGLLNRIKQTYKNYSEEEEVEIINILRNASLLVLDDLGAENNNDWAREKLYEIIDSRYRDGKPMIVTTNLTLTQLKEKLTGWDGVARTYDRLIEMCYPVEIKGTSKRVKAANEKTKIIEELVNE >NC_013921|1427113:1433864|1427476_1428298_-|WP_004405548.1|DBSCAN-SWA MDYIGMYLREISHIPLLTPEEENELLKRIEEGDEEAKKRFIESNLRLVVSIAKGYVGKGISFPDLIQEGNLGLLKAVERFDYRKGYKFSTYATWWIKQTITRAIADQARTIRIPVHMVESVNKLLKIQKQFLQKLGREPSIEEIAEEMNISEKKAKVLLEIVQGIVSLEEPVGEDENGKLGDIIADKEAVDPVEELESMLLKEQVDEVLSTLAPREEKVLRLRFGLDDGKIRTLEEVGKELGGISRERVRQIETKALKRLRHPNRSRRLKEFL >NC_013921|1427113:1433864|1427113_1427461_-|WP_004405546.1|DBSCAN-SWA MNSKQKGKKGELELAKLLREYGYDTRRGQQYSGIEGMDIVGLPYIHVEVKRRERLNIYDAMRQAARDAKDDEKPAVFWRKNKENWLVIMKLEDWIELYREWEAGIWLAGKQQSKG >NC_013921|1427113:1433864|1432686_1432911_+|WP_004401476.1|DBSCAN-SWA MGKNQHVTPHPSGGWQVKGEGNQKATKVTDTKQEAIDIARQIAKNQGSELIIHGKDGKIQSKDSHGNDPFPPKG >NC_013921|1427113:1433864|1428315_1428507_-|WP_004405550.1|DBSCAN-SWA MKKGLDWNSEQVKIALEKAKAAYEQVPKGRKIQTLEKTFAAYTGVFRCYDSIKKHIKYLDENV >NC_013921|1427113:1433864|1431185_1432124_-|WP_012995411.1|DBSCAN-SWA MQASVLVKTKNMDRNEWLQWRKKGIGGSDAAAVAGLNPWKSPIEVYLEKIGEIPEPEDNEKMYWGRILEDIVAKEFTLRTGKKVRRRNFMLRHPKYEFMIANIDRELVGEKVGLECKTVSEYGKSEWEGDKVPDQYIIQCQHYMAVTGYEGWWIAALIGGNKFIYKYIKRDEEIIQYLIKIESDFWKMVEERTPPPLDGSKSSENILKLLYPEAAEGTEIELPEEVEELIVARENIKAQIKKLETKQLEIENKIKAMLKENEVGRTPKYIVSWKTYSRTSIDSKKLKIEQPEIYEKYLQVSTYRKFDVREVK >NC_013921|1427113:1433864|1432163_1432361_-|WP_004401479.1|DBSCAN-SWA MNISWGHEPLSEREEEYILKLTWKEKFEIERLIYIEKEEVTKNIDFLKRKGVLKRNYKNVLEHLS |
13 | Bacillus_virus(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1479922 : 1488186
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_013921|1479922:1488186|DBSCAN-SWA TTTAACCGAATCTTCCAGTGATATAGTCTTCCGTCCTCTTATCTTTGGGTTTATAAAAAACTCTATCCGTCGGTCCGCATTCAATCAATTCACCATTTAAGAAAAAGGCAGTATAATCTGAAACTCTTCCTGCTTGTTGCATATTATGAGTTACTATTATTATTGTATATTTATTTTTCAACTCATTAATTAATTCCTCAATTTTCATCGTAGAAATAGGGTCTAACGCTGAAGTAGGCTCGTCCATCAAAATTACCTCTGGTTCTACTGCCAATGTCCTAGCAATACAAAGCCTTTGCTGCTGACCACCAGACAAACTGAGAGCTGACTTGTAGAGTCTATCTTTTACTTCATCCCATAAAGCCGCAGCTTTCAAACTTTTTTCAACAATTTCATTAAGCTTTTTTTTGTCTTTTATGCCATGAATTCTTGGACCATAGGCTACATTGTCGTAAACAGTCATGGGAAAAGGATTAGGTTTTTGAAAAACCATTCCTACTCTCTTTCTAAGTTCAATAACATCCACTTCTTTGTATACATCTTGTCCATCAAGTAAAACAGTCCCATTTATTTTAACTCCTTCAATAAGATCGTTCATCCTATTTAAAGTACGAATAAAGGTGGATTTCCCACAACCAGAAGGACCGATAAGTGCCAAAACGCTATTTCTCTCTACATCTAAATTTATTTTTTTGAGGGCTTGAACATCTCCATAAAACAAGTCTAAATCTTTAACCTGGATTTTTTTCATTTACCAGCATTCCCCTTCCTTATAAAAATATTATACCATTTTATTTTTCGCCTGTCATTCTCTTGTATAATACATTTCCTAACCATCTAGCAAGGATGTTAAAAATCAACACCATTAGCAATAAAACCGCTGCGGCACCGTCTGCAATCTCTCTTGCATCAGGCGCTAACCCCTCACTATTTATCTTCCAAATATAAACAGCCAAAGTTTCTGCAGGTCTAAAGATATTTAAAGGCGAGGTAGGACTCGAGGGATTTAAGTTTGAAAAATTCAAGGCAGGGCTACTCATACCTGCAGTATATAATAGAGCAGCAGCTTCTCCGAAAATTCTCCCAGCTGTCAAAATTATTCCTGTTATAATTCCAGGCATTGCAGCAGGTACCACAACTTTTACAATTGTTTGCCATTTAGTAGCACCTAAAGCATAACTTGCTTCTCTTAAACTATTGGGCACACTTCTAATAGAATCTTCACTTACTCTTGTCATTACAGGAAGATTTAACACCGTAAGGGCAAGCGCTCCTGCTATGAGAGAATACCCCCATCCGGTCATAGTTACAAACACTAAAAGTCCAAAAAGTCCTATTACAATAGAAGGCATTGAAGATAGTGTCTCTATTGATAACCTTATAATTTCCGTTAATAAGCCTGGCTTTGCATACTCTGCCATATAAATTCCTGCACCTAAACCTATAGGAACAGAAATTATCAAAGTTATTATTAATAATTCTAACGAATTAAAAAGCTGTGGCCCTATGCCTCCTCCTGCTTCCATAAATTTTGGAGGGGAAGTTAAAAAATCTACATTAAGTCTAGTTCTGCCTTGATACAATATATAACTTACAAAAAAAAACAAAAACAATATTAAAAACACAGCAACAGCGTAAAAATATATAGTCGCTATTTTGTCATGCAATTTAGATCTCATTTATACATGCCCCTCCTGCCTACCAATTTAATTACAATGATGAAAGTAAAAGATATCATAAGAAGGAGTAATGCTAAAGACCAAAGAGCATCATTCCATACGGTACCCATTACTGTATTTCCCATGTCCATTGTAATGATAGAAGTTATAGTACTTATAGGCTCTAAAAAAGATTTGGGAATAACTGGACGATTTCCTATAACCATCTGCACCGCCAAAGCTTCTCCAAAAGCCCTTGCCAATCCTAATACAATAGCAGTCAAAATTCCCGGCTTCGCTGCAGGAAGAATTACATGTCTTATTGTTTGCCATCGTGTCGCACCGAGAGCATAACTCGCTTCTCTTATCTCCACAGGTAACGACTTTATAGCATCAGTGCTAACACTAGTAATTGTTGGCAGCGTCATGACAGTAAGAACTAATATACCTGCCAGCAAGCTAAATCCTAATCCTCCAAAATGTTTACTTATAAAAGGAACTAACACTGTAAGACCAACCCAACCGTACACTACAGAAGGAATGCCTACAAATATTTCAATAGCTGGTTGTAAAATCTTTTGCCCTAATTTTTTAGCAATTTCTACCATAAAAATTGCAGAGGAAACTCCAAGAGGTGCACTTATCAGAATAGCAAAAACAGAAACGAGAACGGAACCTAATATAAATTGTAATGAACCTACTGCGGGAACATCTCTATCAGGCTTCCAGGTAGTAGAAAATAAAAATTCTTTTATAGAGATGCCATCTTTTATAAAAGTAGAAAGACCTTTAGATGCTACAAATAAAAATAGAGAAACAGTGATAATTATTAATAGTAAAGCAGAAATGAAAACGATAGCCTTTCCAAATAAATCAACCACTTTCCGCTTTCTTTCATAATTTTTATCAACTGTCATGTGCTTTCCCCCATTTAAGAAAATATAATGACAACAATAGCACTCCTTTTATAGTAGCAACTCTTAAAAAAAACTTCATTAAATTTACGTTAAATATATGTTAAATCTATGTTAATTCCATATTTATATAAAGAGGAACTGGTATTCTTGCCAGCTCCCCTCTTTTATTATTTTTTATTTTGTTTTCATTTCAGTAACAGGTATAAATCCCAACTTAGTAAGAGGACCTTTTTGCACTTCATCAGACATCATGAAATCTAAGAAAACTTTGACTGCACCAGTAGGCTCTCCTTTTGTGTACATATGCTCGTATGACCAAATAGGATATTTACCATCTATTATGTTCTGGGCAGTTGGCTCTACACCATTATACTTTAACACTTTTACAGTATCATCAATATATGCCAAACTGATATAGCTAATTGCACCTTTTGTATCTGCTACAGCTCTTTTAACTGCTCCATTAGAATCTTCTGTCAAAGCAAGGCCTTCTGCTTCTTCCTGACCTTTTAACACGATCTTCTTAAAAGTTGCTCTTGTGCCCGAACTTGCAGGTCTTAAAATAACTGTTATCTTTTCATCTTGCCCGCCAACTTCTCTCCAATTTGTTATTTTTCCGGTAAAAATGTCTACCAGTTGCTGCTGAGTTAAATTATCAACTGTAACATCTTTATTCACAACTACAGCAAAACCTACAACTGCAACTTTATGATCTACTAAAGATTTTGCAGCCTCGGCATCTAATTTTTCCTCAGCAGAAATATCAGAATTTCCGATATCAATTGCGCCTTGAACTACCTGCGTCAACCCTGTACCACTGCCGCCACCTTGTACTGTTATTGCTACATTAGGATATTTTTCCATAAACATTTTGGCAGCTTGTTCAGCTAATGGCTGTAACGCTGTAGAGCCAGCAATTGTTATGTTACCTGAAAGATTGTCAGTGGTTGTAGTAGAATCATCGCTTTGAGGTTGTTTTGAACCACAGGCAGCAAAAGTAAAAAAGCTCGCAATTAACAGTACTGCAATAGCAACTTTCGGAAATCGACTATTTAACATTAAAGCACCTCCAAAATTATTTAAATTTTTGTACAAGTACATTGTAGCAATTCATTGTAAATTCAATATTAAAATATTGTTAAGTCTTTGTTAAATCAGCTTTGTTGAATTTCATGATAAACTTTGTACCTTTTCCTATTTCACTTTCTACAGAGATTTCCCCTTTCATAGATTCAACAATATGTTTAACTATAGCAAGGCCTAGTCCCGTACCACCTAATTTCCTTGAGCGACTTTTATCCACTCGATAAAATCTCTCAAAAAGCCTTGGAATATTTTCTTTCGAAATTCCTATACCGTTGTCTTTAACTTCAATAATTATTTTATCCCCCTCTTCTCTGGTAGAAACTTTTACAAACCCTCCTTCTGGAGTGTATTTTATACCGTTATCTATTAAATTGATCATCATCTGATGAAATCTATCTTTATTAGTATTTATCACCAAGCCAGGACAATTTAAATCTTTTATCAACGTAATATTTTTATTTCTCGCCATCTTGTCCATTATATATAATATATCCTCTATCTCATTATCTAATTCTGTTTCTTCTGTCGGATAACCTTCTTTAACATTTTCTATTTCAGAAAGAGTGAGTATATCGTTTATAAGTCTTGTAAGTCTTTCAGACTCAAAATCAATTATATCTAAAAATTTATCTCTTGCTTCAGGGTTTTCAATAGCACCATTTCTTAAAGTTTCAATAAAACCCCTAATAGACGTTAAAGGCGTTCTAAGCTCATGGGATACATTTGCCACAAATTCATTTCTTATTTTTTCTAATCTTCTCATTTCTGTAATATCATCTATTATTAACACAAAGCCCAAATTTTGATGGGAAATTGGATGAAGAATTGGACTGGTATACACTTTGAGGTGTTTATTAAAAACATTTAGCTCTAAACTTTTAGAAGGGGAATTTTTATTTTTCTTAACATCTTCAAAAAGGTCATATAACTTGCTGTTTCTTACAATCTCCAGGATGTGTTTACCGATTAAATCTTTTCCTTTTATATTTAGAATTTTCCTCGCAGCGTCATTTATGAGCAATATTCTTTCATTATTATCAAATGCAATAACCCCATTTACTATGCTTTTTAAAATAGCTTCTAATTTTGCATTTCTATCATTTAATTCTTCTATAGTCACTTTTAATTTATAGGACATAGAGTCAATTGCATGAGAAAGCTCTTTTATTTCATCAATAGAATCGCTTTCAAGTCCATGACTGTATATCCCATTTGCAATATCTTTCGTAATCTCAGTTATCTCTTTTATAGGCTCTACTATATTTTTTATAAATCTATAACTTAAAAAAAATGTTACTAAAATTCCCAAAAAAATAGCAAAAATAAATCTGGTCATTGGAGCATAGCCTAAAAAAAATAGAGCAACTATTAAAATCCCAAGTAGGTCTATTAAAAGCAATTTACAATAGGATTTCTTTAGCATTAGACTTCACCTTTATCCTTCAACTTATATCCAATTCCTCTGACAGTCTCAATATACACAGGAGATTTATCATCGTCTTCTATCTTTTTTCTTAAATGCCTGATATGGACATCAACGGTTCGAGTCTCTCCAGCATATTCATACCCCCACACTTTATCCAAGAGATAGTCTCTAGTTAATACTTTACCCATATTTTGAGACAAAAGTTTCAAAAGCTCAAACTCTTTTAAAGTCAAGTCTAATACTTTTCCTTTTTTATAAACCAAATGCTTTCCAGTATCAATAACTATATCACCAAATCTTATTATTTCTTCTTTTTCTTCCTCTGGCTGCTGGGTTCGCCGAAGAACAGCTTTAATTCGAGCCAACAATTCTCTTACGCTGAAGGGTTTTGTAATATAATCGTCTGCTCCCAACTCCAATCCCAATACTTTGTCAAATTCTTCGCTTTTTGCCGTTAACATTATTATAGGAATATTTTTGGTTTCATCATTCTTTTTTAAAATTTTACATATTTCCAATCCATCAACATCTGGTAACATCAAATCTAGGATAACCAAATCAGGTTTTTCTTCAAGTGCTTTGTCCAATCCTTCTTTTCCATTTTCCGAAGTAATGACTTTGTACCCTGCTGCTTCCAAGTTATACCTTAAAAGTTCCAATATATGAACTTCATCTTCTATAACCAACACCCTATGGGCCATTTTGACACCTCCAGGTAATATGGCTTGTACACCTTTGAAGCAAAAAGTTATGCATTTTCTTTTTTTGTCTCACTCTCTTTAAGAAGTTTCTTAAGTTCGTCCATAAAAGTATTTATATCTTTAAACTGCCTATAAACAGAGGCAAACCTAACATAAGCTACTTCATCTACATTTTTTAACTTTTCCATTACCATTTCTCCGATTTCAGTGGAGGTTATTTCTCTTTCCATTGAATTTATTATTCTCTTGTCAATTTCATCTGTAATTTCTTCTAAAACTTTTATAGGCACTGGCCTTTTTTCACAAGCTTTTATCATGCCTTTCAATATTTTATCTCTGTCATAGACCTCTCGGCGATTGTCCTTTTTTATTACAAGTATAGGCAATTGTTCTACTTTCTCATAAGTAGTAAATCTCTTTCCACATTTTAAACATTCCCTTCTTCTCCTTATAGAAGTGTTATCATCTGTAGGTCGAGAGTCAATAACTTTTGAGTCCGGATACCCACAATAAGGGCATTTCATCTTATTACCTCCAACAATTCTTAATTATTTAATAAAATTATAATAAACTTGTTTTCATTAGTCAAACTTGAGCTTCTTTGTCTTTGAAATCTACCAATATCACATCTGTTCCAATCTTTTTTACAGATTCCCATGGTAAATAAATTTCTATATCTTTATTAAAGAACCTAAAAAAACTTGTTTCTTTTGGTATAACTATCCCCTCCACTTTCCCTTCTTCAAGATTTATTTCAATGTCAATTATATTCCCCAATTTTTCTCCTGTATTTATATCTATAACATCTTTATCTCTTAATTCTGAAGCTTTAATCATCTTAATTTCCCCCTTTGGTCCTTTTCCTTTTCATAAAATTATATGAAAAAATCTAGCTTATCATTCCTGATAAGCTAGATGTATTTCCTCATGTGATTTAAAGCTGCTTTTTCCAATCTTGAAACTTGTGCTTGAGATATTCCTATTTCTTTTGCTACCTCCATCTGAGTTTTACCCTCAAAAAATCGGAGTGTCAATATCAATTTCTCTCTTTCATTAAGTTTTTGTATCGCCTCCTTTAAAGCAATTTTTTCAAGCCAAACTTCGTCAATATTCTTATCATCGCTGACCTGGTCCATTACATAAATCGCATCTCCACCATCATGATATATAGGTTCAAACAAAGAAACCGGTTCTTGAATAGCATCAAGAGCCATTACTACTTCTTCACGTGGAAGATCCAGCTCTTTAGCTATTTCGCCTACTGTCGGCTCTTTGGAATTTTCCGATACTAATTTGTCCCTTACCTGTAATGCTTTATAGGCTATATCTCTTAAAGAACGGCTCACCCTTATAGGAGTGTTATCTCTTAAATATCTTCTTATTTCTCCAATTATCATTGGAACAGCATAAGTAGAAAATTTTACATTTTGATCTAAGTCAAAATTGTCAATAGCTTTTATAAGCCCTATACATCCTACTTGAAACAAATCATCTACGTACTCCCCGCGATTATTAAATCTTTGAATAACACTTAGTACCAATCGCAAATTGCCATTTATAAATTCTTCTCTCGCCTTTTTGTCTCCATTTTTCATCCGTATTAATAGCTCTTTCTGCTTGGAAGGTTTTAAAACAGGTAATTTAGAAGTATTGACCCCACAAATTTCAACTTTGTTATTCATAAATCCTGCCCCCACATGTTTAGCTTATTAACAGTATTGCCGGCAGGATAGAAAAATATACAGAAAAGCTCAGATTAGTCTATTCATTTCTTTTTTTAATCTTTTTAAAATCTTTTTTTCTAACCGTGAAATATAAGACTGTGAAATTCCCAACATATCTGCCACTTCTTTTTGAGTCTTTTCTACTCCACCATCTAATCCAAATCTAAGTCCTATTATCTTTTTTTCTCTATCTGGTAATTTCTTTAATGCAGAAGTCAATAATTCCCTTTCTACCTCATCTTCGATATATTTATAAACTGTTTCATTATCAGTACCTAAAATATCTGAAAGCAAAAGTTCATTTCCGTCCCAATCTACATTTAAAGGCTCCTCAAAAGAAACCTCTAATTTGGTCTTGCTATTTCTTCTTAAATACATTAATATCTCATTCTCAATACAGCGAGAAGCATAAGTTGCCAATTTTATCTTTTTCTTGGGATTGAAAGTATTAATGGCTTTTATAAGTCCAATCGTGCCAATAGATATTAAATCTTCGATTCCTACTCCTGTGTTTTCAAATTTTTTGGCTATATATACTACCAACCTTAAATTTCTTTCAATAAGTACCGTTTTTGCTTCATTATCTCCTTTTTCCATTTTTGAAACTAAATACGTTTCTTCTTCCACAGAAAGAGGAGGAGGCAATGCTTCACTTCCTCCAATATAAAATACGCCCTCAGACAAACCTAAAAAATCAAGGAATTTTTTCCACAGCAATAGCATTTCTATTTTTACTTTTGTTTTTAGTCGCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_013921|1479922:1488186|1482670_1483555_-|WP_012995460.1|DBSCAN-SWA MLNSRFPKVAIAVLLIASFFTFAACGSKQPQSDDSTTTTDNLSGNITIAGSTALQPLAEQAAKMFMEKYPNVAITVQGGGSGTGLTQVVQGAIDIGNSDISAEEKLDAEAAKSLVDHKVAVVGFAVVVNKDVTVDNLTQQQLVDIFTGKITNWREVGGQDEKITVILRPASSGTRATFKKIVLKGQEEAEGLALTEDSNGAVKRAVADTKGAISYISLAYIDDTVKVLKYNGVEPTAQNIIDGKYPIWSYEHMYTKGEPTGAVKVFLDFMMSDEVQKGPLTKLGFIPVTEMKTK >NC_013921|1479922:1488186|1479922_1480672_-|WP_012995457.1|DBSCAN-SWA MKKIQVKDLDLFYGDVQALKKINLDVERNSVLALIGPSGCGKSTFIRTLNRMNDLIEGVKINGTVLLDGQDVYKEVDVIELRKRVGMVFQKPNPFPMTVYDNVAYGPRIHGIKDKKKLNEIVEKSLKAAALWDEVKDRLYKSALSLSGGQQQRLCIARTLAVEPEVILMDEPTSALDPISTMKIEELINELKNKYTIIIVTHNMQQAGRVSDYTAFFLNGELIECGPTDRVFYKPKDKRTEDYITGRFG >NC_013921|1479922:1488186|1485756_1486233_-|WP_009052539.1|DBSCAN-SWA MKCPYCGYPDSKVIDSRPTDDNTSIRRRRECLKCGKRFTTYEKVEQLPILVIKKDNRREVYDRDKILKGMIKACEKRPVPIKVLEEITDEIDKRIINSMEREITSTEIGEMVMEKLKNVDEVAYVRFASVYRQFKDINTFMDELKKLLKESETKKENA >NC_013921|1479922:1488186|1480712_1481600_-|WP_012995458.1|DBSCAN-SWA MRSKLHDKIATIYFYAVAVFLILFLFFFVSYILYQGRTRLNVDFLTSPPKFMEAGGGIGPQLFNSLELLIITLIISVPIGLGAGIYMAEYAKPGLLTEIIRLSIETLSSMPSIVIGLFGLLVFVTMTGWGYSLIAGALALTVLNLPVMTRVSEDSIRSVPNSLREASYALGATKWQTIVKVVVPAAMPGIITGIILTAGRIFGEAAALLYTAGMSSPALNFSNLNPSSPTSPLNIFRPAETLAVYIWKINSEGLAPDAREIADGAAAVLLLMVLIFNILARWLGNVLYKRMTGEK >NC_013921|1479922:1488186|1483634_1485005_-|WP_012995461.1|DBSCAN-SWA MLKKSYCKLLLIDLLGILIVALFFLGYAPMTRFIFAIFLGILVTFFLSYRFIKNIVEPIKEITEITKDIANGIYSHGLESDSIDEIKELSHAIDSMSYKLKVTIEELNDRNAKLEAILKSIVNGVIAFDNNERILLINDAARKILNIKGKDLIGKHILEIVRNSKLYDLFEDVKKNKNSPSKSLELNVFNKHLKVYTSPILHPISHQNLGFVLIIDDITEMRRLEKIRNEFVANVSHELRTPLTSIRGFIETLRNGAIENPEARDKFLDIIDFESERLTRLINDILTLSEIENVKEGYPTEETELDNEIEDILYIMDKMARNKNITLIKDLNCPGLVINTNKDRFHQMMINLIDNGIKYTPEGGFVKVSTREEGDKIIIEVKDNGIGISKENIPRLFERFYRVDKSRSRKLGGTGLGLAIVKHIVESMKGEISVESEIGKGTKFIMKFNKADLTKT >NC_013921|1479922:1488186|1485004_1485709_-|WP_012995462.1|DBSCAN-SWA MAHRVLVIEDEVHILELLRYNLEAAGYKVITSENGKEGLDKALEEKPDLVILDLMLPDVDGLEICKILKKNDETKNIPIIMLTAKSEEFDKVLGLELGADDYITKPFSVRELLARIKAVLRRTQQPEEEKEEIIRFGDIVIDTGKHLVYKKGKVLDLTLKEFELLKLLSQNMGKVLTRDYLLDKVWGYEYAGETRTVDVHIRHLRKKIEDDDKSPVYIETVRGIGYKLKDKGEV >NC_013921|1479922:1488186|1486620_1487391_-|WP_012995464.1|DBSCAN-SWA MNNKVEICGVNTSKLPVLKPSKQKELLIRMKNGDKKAREEFINGNLRLVLSVIQRFNNRGEYVDDLFQVGCIGLIKAIDNFDLDQNVKFSTYAVPMIIGEIRRYLRDNTPIRVSRSLRDIAYKALQVRDKLVSENSKEPTVGEIAKELDLPREEVVMALDAIQEPVSLFEPIYHDGGDAIYVMDQVSDDKNIDEVWLEKIALKEAIQKLNEREKLILTLRFFEGKTQMEVAKEIGISQAQVSRLEKAALNHMRKYI >NC_013921|1479922:1488186|1481596_1482496_-|WP_012995459.1|DBSCAN-SWA MTVDKNYERKRKVVDLFGKAIVFISALLLIIITVSLFLFVASKGLSTFIKDGISIKEFLFSTTWKPDRDVPAVGSLQFILGSVLVSVFAILISAPLGVSSAIFMVEIAKKLGQKILQPAIEIFVGIPSVVYGWVGLTVLVPFISKHFGGLGFSLLAGILVLTVMTLPTITSVSTDAIKSLPVEIREASYALGATRWQTIRHVILPAAKPGILTAIVLGLARAFGEALAVQMVIGNRPVIPKSFLEPISTITSIITMDMGNTVMGTVWNDALWSLALLLLMISFTFIIVIKLVGRRGMYK >NC_013921|1479922:1488186|1486294_1486546_-|WP_012995463.1|DBSCAN-SWA MIKASELRDKDVIDINTGEKLGNIIDIEINLEEGKVEGIVIPKETSFFRFFNKDIEIYLPWESVKKIGTDVILVDFKDKEAQV >NC_013921|1479922:1488186|1487460_1488186_-|WP_012995465.1|DBSCAN-SWA MRLKTKVKIEMLLLWKKFLDFLGLSEGVFYIGGSEALPPPLSVEEETYLVSKMEKGDNEAKTVLIERNLRLVVYIAKKFENTGVGIEDLISIGTIGLIKAINTFNPKKKIKLATYASRCIENEILMYLRRNSKTKLEVSFEEPLNVDWDGNELLLSDILGTDNETVYKYIEDEVERELLTSALKKLPDREKKIIGLRFGLDGGVEKTQKEVADMLGISQSYISRLEKKILKRLKKEMNRLI |
10 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1880831 : 1943350
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_013921|1880831:1943350|DBSCAN-SWA TATGAAAATCAAAGCTAAACAACTTTCTCTCTCCGATATTTACGATGATGTTCAATCCTTCTTTGAAGAAGATAAACCCAAGTTTATTAAACTCTTTGATTCCTTTATTGATTTATCTGAACTTATTCCACCTTCTTTTTACGCCCATTATTATTCTCACTTCGGGCGTCATAGGGATTTTTCTCTTGAATCTATGCTCACTGCTTTGATTATCCAAAAAATTCTCTCTATCCCTACTGTTCAACTCCTTGTCCATGTTCTTAAGCTATCTAAAGAATTAAGAGAGCTTTGTGGCTTTAAAAGAGTCCCTCATCCTTCTCAATTCTCTAGATTTAAATCCATTTTCCTCAAAGATTTGGAGAATTTCTTCAATAATCTTGTTAATTTAACTGAGCCTATTTGTCAGGCTATTAATCCTTCCATTTCTAATATCCTCATCGCTGATACTACTGGCTTTGAACCTTATGTCAGAGAAAATAATCCTAAGTTCTTTGATTCCCTTTATAGAAATATTAAAAAGTTCTCTAAATCTAATCCTGATTTTGATGCCCACTCTTATGCTTGTTCTAAAATGCCTAAGTTCGCTCACTCTAATCCTGATGCTAAATTCTCTTATATTAATGGCCATTATTGTTACTCTATCAAAGCTACCATCCTCACTAATGGCTTAGGCATTATTCAGCATATTAGTTTCTATGACGATGATTCTTTAAATGTCAATACTGCTAAATCTGCTGCCGAGTCTAAAGATTTGTACGATTCTAAAACTTTAATCCCTTCTCTTAAGGAATTCTTTAATTTACATCCTAATTTCTCTTATAGATACTTCTTAGGTGACGCTGGGTTTGATTCTTTTGATAATTATAAATACTTGTTCTCAAAGCTTGGCATAATCCCTATTATCCCTATTAACCCTCGAAATTCTAAAAACTTACCTCAGCCTACTTTTAACTCTGATGGTATCCCTACCTGCCCCCGTGACCCTTCTCTTAAAATGTCCTATGATGGCATCGTTCGGGAAAAAGGTAGAGCTACCAGAATTAAATGGCTTTGCCCTATGTCCAAAAAAGTTAGACTAAATGGTAAAACTACTTATATCCTTCAATGTGATAACCCCTGTACCTCTTCTAAATGTGGCAGAATATTCTATACTACCCTTGATATTGATTTTAGAAAAAATACTTTTGTCCCTCGTAACTCTAAAAAGTGGTCCAAACTTTATGAAAAACGCCCTATTATTGAAAAATCTATTTCTCTTTTAAAAAGTTCTATCGCTGTTGATAGCTTTAAACTCATAAATACCAGGTCAATCAAAGCTGATGTTTTTCTTGGGGCTATCACTCAACATATTGGTTTAATTATTACTGCAAAGCTTGGTACTTTTGAACATCCTTTATCTTTGAAAAAACTTTTGGCTTGATAACTTGTTCTTATGATTTGATTTGTTTGTCATCTTTTTACATTAAAAAGGTGTGTTAAGTATTGTCTTTTTTGAATTTGTATCTTTCTTCCATTTCTCTTTTTCCGTCTTGAGTGTGCCTTTAAAATGTAATTTCTTTATTTTGTTCCTTGTAATGTAACTTTTTTACTCTAATATTTATCTCATTTTGCAATCACCTAACTATCGATAAAAGAAATGACTTTCTCTTTCAATCCTTCCATATCTGTAGCCACACTCCTAATCTAAAAAAATTTACAAAAAATTTCATTTCACATGTAGACATTCATATGATCCTTACGCAGTTTTTCAAAATTATCCTTATCCATCGATATGGCCCTTTTCATAGTTATTGAAACGGTATTTCAGCTCTATAAAAAAGCTTTCATTAAGATTTTGTATGGACATACTACAGTCTATTGTCTGACAAACAGCATTTAAAAATGATAAGAATTCACTTTCAGTCAAAGCACTCCTATAATCAGTTTTAAGATTATGACCTTCTTTGTTAACCGATATTATAATGATTAGAATGCCATGCTCTAAATTGATAGACAAGTCCAAAACGGTTTCTTTGACATATTGTAGTAAATACTTGACTAATGAAGACACAATATAAAATATCAGTATATAGTTTCCTCTAGGCCTAGCAGAACTATCATCGCTTACTTTGATATTTATCCAATCATTCAGTTTCCTGTTATGCAACCAGTTCTTTAAATCTGCTTCAAGTTTTTTCGGTTCAAAATCGACAATGCTTGTCGGTAATGTTTTCAGGTATTCGAGGTACAAATCCTCAATTACTTGAATTGCATCCAATATATCGGAATTACCGACCAGTCCGCTTTTTTGTTTTAAAATAGCAAATACAAATTTGCTTATCTCCCTTATACTCTCTAAATCCATTTTATTTTGCTTAAGCTTTTCATTTGTTAATTTCAGGATATTCTGATATAATATATTTCTTTTTTCAAGCGCTTCCTTAAGCATCTCCTTTTCCCGCTCAAGATTGTAATATTCTATTGCCTGTCTTATTATAACTTTAAATTCTTCCTCCAATTTCCACGGTTTTGTAATAAATTTGAAAATATCGACTTGGTTTATTGCAGCCAATATCTGAGGCAGCTGGGTATAACCCGACAATACAATTTTAACCGTCTTTGGGTACTTTTCCTTGATAATTTTTAAAAGCTGCAGACCATCCATTCCGGGCATTCTCATATCCGTAACTATGACACTTATTTCATTTTCTTCCATTATTGCAAGGGCTTCCTCTGCACTCATAGCAAAAAAGGATGTATAATCCTCGTCAATAAGTCCCCTCTTTAGTGAATTGAGTATCTCTTTGTCATCATCCACAAACAAAACTGAATTGCCCTTCATATATAGCTCCCTCCAACACTGTATTTTTAAGAAAAATTGCAGTTTCCCGGCAGCATTAAATACCTTAATGAATTTCGTCAACTACTTTATCGCAGTCTTCCTTGCAGAGGCCAAGAAAATCAAATGCACCTGCGTCTAAATCAATTTCTAAATTTTCCCCTAAATATCTTCCTGCATAATAGTCCGCAATATGTACCACAGACACTATTTCCCTGTATATCACCCTACTGTCTGATGGAGAATGGTGGAATAGTGCCGATTCTATAACAGGATATGTAAAGTCAAGATGGTCTAATATATACCCTCCGATTTCTTGGTGTAAAGTCTGCATATTTGCTTTCACTTCATCATTATCATCTGTAAATATAGACAAAACAGCATATCTTCCAATATCATGAACCAATCCTGCAATTAAATATATATCGCTTAAATCCTTCTTTAACAGGCGCCTATAAATTAAATCCGTTATCCTGTTAGTAAGCGTTGCATGCTTAATCAAAAGCTCTTTGTTTACGCTCGGGTTAATTTTGTTGATATATCCAAACATTACGGCGGCTAAAATAATATTCTTTATATTAAACTCACCTAAGCGACCGGTGGCTTCCTCTATTGAGCCAACCTGTGCTTCCCAAAAAGAAGAATTCACAATATCTAATGTATCCCTTTCCAGCCTTTTGTCTTCAGCTACTTTTTTTAGTGCTTTTTGAGTATCTCTTACTTGTTCTAGCGCAAAACTTAAACCCTCATAAAGACCTTTTTCTCTTAAAGTATCAATGATTGAGCTTATACCTTTCAGCGTTTCCTCACTATTGAGTATCTCTCTTGCCCCTATTACCTGTTCGATTGTCCGAATAAAATTCTCATTGTCCCAAGGCTTATACATGTACAATTTTGCTAAATTATTCTGTAAAGCGTCATTAAACAGTTTTTCCTCCGCGTAGCCGCTCAAAATGAGCCTTATAGTAGAAGGATGCTTTTGTTTCACTCTTTTCAACAGTTCATACCCATCCATTGTAGGCATCTTCATATCGACCACTATTACGTCAACTTTTGTATTATCCAATATTTTAAGCGCTTCATCTCCGCTATCTGCTGTATAAACACAATAATCACTATCAAGGTATAATCTTCTAATTGCTTTTAATATTTGCTTCTCATCATCTACAAACAATAACGTCTTACTCATTCTATACCCCACCCAAAAATAAATCTACAACGTCCCTCAATTAGGATAGTTACTTTGCTGGATGATTTGTGTCCATCTGCATTTGTCAATCCTGCCTATTGCTTTTCTCGCCTCTTCCAGATCCTGTCTCGCTTCTTCATACCGTTCCAAAACGCAAAAAAGTGAATACCTTCTGTAAAAACCTTTGGCCGCCTCATAGTCAGACTCTAACTGTAAAGCAAGTTGTATGGATTCTTCATACATTTGTAAAGCTTCAGCATAGTCTCCCATATTCGCCAATATGATGCCTTTAAGGCGCAACGCTTTTAGTTTCTTCATATCGTTCCTGGATTCCATCGCTGCAGATATAGACTTATTACAATATTCCAAAGCAGTATCCAGATTATTGCTTTGCAGTTCGTATATACTGCGGTATCTATAGTAATCGCTAATATAGGATATTTCTTCAGCATCTGTAAATATCTTATATGCGTTTTCCAGCATACCTGGAACCTTTTCGTAGTTTCCAAGTTTTAAATTCAGTCTTGCGATACCTAAATAGTTGATTGCTGCTTCAACCGGCAGCCCTTGGCTTTCCGCTATCTCCAGAGATTTGTTATAATACTCGAAGGCCTTAGCAAAATCTCCAATTTCATACATCAAATCTCCCATATTCAACTGAGCAAGACACAATTTATACATTGATGATATTTGATATGCTTTTTCCATAGACTCCATAAATAGTTGCTCAGCCCTTCTAAATAATCCTTTATCTAAGTATAGTATCCCTAAATTAATACTGCTGGATATATAATTTGCAAGGTTTGATATCTTTTTTGAAAGCTCAATAGACTTGTTAAAATATTCCTGAGCTTTTGATATCATTCCCATTGTATAAAAAATAATCCCCAGATTGATGGATTCATTGACCATTATTCTAAAATTATTTATTTTCTCAGCGTAATTATAGGCTTTATTCAGATAAAAAAGAGCATTTTCCATGTCTCCTCTGGT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53 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase,integrase | attL 1912491:1912507|attR 1939037:1939053 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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