Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_013943 | Denitrovibrio acetiphilus DSM 12809, complete sequence | 1 crisprs | csa3,DEDDh,WYL,Cas9_archaeal,cas3,DinG | 0 | 0 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_013943_1 | 2543836-2543974 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_013943_1
|
1 spacers
spacers of NC_013943_1
>1.1|2543878|55|NC_013943|CRISPRCasFinder GCAATGACGGGAAGAGTGTCATTGCGAGGAACAACGTGACAAAGCAATCTTATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_013943_1
The CRISPR arrays of NC_013943_1 >merge|NC_013943|1|2543836-2543974|CRISPRCasFinder CATGGAACGATAATTACAGTAAAAGATTGCTTCACTTCGTTCGCAATGACGGGAAGAGTGTCATTGCGAGGAACAACGTGACAAAGCAATCTTATAACATGGAACGATAATTACAGTAAAAGATTGCTTCACTCCGTTC >NC_013943|1|1|2543836-2543974|CRISPRCasFinder CATGGAACGATAATTACAGTAAAAGATTGCTTCACTTCGTTC GCAATGACGGGAAGAGTGTCATTGCGAGGAACAACGTGACAAAGCAATCTTATAA CATGGAACGATAATTACAGTAAAAGATTGCTTCACTCCGTTC
>NC_013943.1|WP_013011671.1|2543010_2543781_+|3-deoxy-8-phosphooctulonate-synthase MLYEKIKSGMFVMAGPCVIENESVIMQIAETVKTISEELKFTYIFKSSFDKANRTSISSYRGPGLDEGLRLLQKIKDTFQLPIVTDIHEPYQADAAAEVADILQIPAFLCRQTDLLVAAAKTGKIINIKKAQFLDGNDMLYPVQKVEQSGNKQIILTERGSMFGPGRLVVDFTQIVDMKKIGYPVVMDVTHSTQRPGGGATSGGKPEYAPYIAKAAKAVGVDGFFFEVHPEPKEALSDGSNMVRLSEFKELLASTL >NC_013943.1|WP_013011669.1|2540200_2541952_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKNILIYILLAVSLAACQTEIKGPEEAMIPSVPEDSFTFSPFAHPEFKQKLDKTFDIYTVVNTSHEFRFGPHDTEYGKYDVIALVENSRFDYYVRLFTGNYRKVFQKWLDRSNEYVYILRDILRREGVPEELVYLPFTESGFNPAIRSRAGACGMWQFMKGTGKAYGLDTDFWVDERNDFEKSTVAAARHLKDLYESLGDWYLAMAAYNAGLGKVLNAIKRYNTRDYFVMSQRKYRYLKLETKDYVPKYMALRYLARNYQEYGFDTPNGQPQLFDRVTLYRQANLYVLAKIIGSDIDTLRELNPELMTPMTPPVEEYSMRIPYGKKKILEEKLEHISDAELAQFHIEFARKGHSIASYAKKYGMTASALKDINGLRHNMILRDTYLFIPIKNAYDEELNRMFVQELKRYNPKVHIVRSGDNMYQIAHKYGMSLYELMAMNRDVNPKRIRPGQSIIVSDSYYNTRTNKKSVRTYASKTKSGSYAKITHKVSYGESLWSIANQYGTTISQIKSSNKLRSNVIQPGKDLIVYNYNSSAADDGKYTVRRGDSLWEIARKFNTSVNTIKRKNNLRGNNIHPGSVLVVD >NC_013943.1|WP_013011668.1|2539364_2540132_+|glycosyltransferase-family-2-protein MTFSVIIPVFNRTQTLKTAIESVLAQSFRDFEIIVVDDGSDKSVSSALRPYMPMIRYIRIEKNMGVSYARNIGIREAKGLYTAFLDSDDIWLPDKLSAQHEALTATKLKVCHTNEFWFRKDRFINQGAKHKRHGGMIFDKVLDFCRISPSSVVIHRDVFKTCGVFDSNMRTCEDYDLWLRICSKFEVCYLPEKHIIKRAVTNDQLSDSIKNIEYIRLVSLARFVKCKNIKPTLKVPAIKEISRKALITAGGINNF >NC_013943.1|WP_013011667.1|2538912_2539368_+|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MRHQIDEKDKQILNLLMDNARISYADIAKAVGMKSPSVIDRIKRLEQIGVIKGYSAEIDYKILGDDINAFIGVSMDNAKHIEEFESQLKEIDPDVIDCNHVTGDYTFLISVVTKNTQSLSKLIKKIRNIPGVDKTNTILVFSTLMNRKRQV >NC_013943.1|WP_013011666.1|2538247_2538907_+|endonuclease-III MKKSDIHEVYEILEDVYRNMDEPSVTKISKQTRRDPFRVLISCLISLRTKDEVTLAASNRLFAKADTPEKMLTIPADEIAKLIYPAGFYKTKSNTITNICRILLDEYDGKVPDEIDELLKLKGVGRKTANLVVVEGYGRDAICVDTHVHRIFNRLGYVATKTPDKTEMELRKHLPIKYWIRINEILVSYGREICTPVSPHCSYCRLSDICDKVSVDRRR >NC_013943.1|WP_013011665.1|2538000_2538261_+|hypothetical-protein MSTNQKTAKLLEELEAVASKLDIKLRYEVTKARGGLCTVDGEKLFILDRKSSKEYKLLILARAIKEFDLSDIYLSPKLREFLYEEI >NC_013943.1|WP_013011664.1|2536836_2537997_+|MFS-transporter MTEEYNNYKGTAFKLSSFFFLHYATLGVIFPFMGYFFKESGFSGTEIGLYMSIFPAAKFLVTNLWTLIFSKIRHKKIYIGTCILISSVSLIPLIYTTDRFIVAVIMVIFASTRTGVIPVMDSIAISMDSVIAYGRLRLFGSVGFIITSIISGIMVDNLGLSGFIWTFTGAGILAALPAIALDYSSETFTPTKRSERKLTPELIIFFTGVTVYLASYSFLYNFFNITVSEAGYSQSWAGYMWAIGVLSEIFFLYNQDKVLKLFNVKTLIALSMLLAGVRYVVTGYSDSLWMLALFSTMNGFAYGTFHLGVMRYIRLHVPQRLKLKAQGIYSGVGFGLGSITGSALSGLTYDISGLTSVWMLAFGLSTAGAVIIYFFTGRKKLSEYTV >NC_013943.1|WP_013011663.1|2535650_2536808_+|cysteine-desulfurase MPIYLDYSATTPMDPAVFEAMRPYFVEKYANPSSIHSLGRAIRDDLEKARETVAKSIGAEAHEIIFTASGSESDNMAIRGTAELFRDKGKHIITSSIEHKAVLESFKLLEKQGFEVTYLPVDTNGIVPLDAVKNAIRKDTTLISIMLVNNEIGTIQPVREISDIAKKQGIIVHTDAVQAMGKMKIDVGELGVDLLTISGHKLCGPKGIGALYIDENLKNDFKPLVVGGAQEYGLRAGTESVPNIIGLAESCAIIMKNLEKEKAHIKSLRDLFEHRLIEELGDVNINGDIEKRVCSISNIAFRYVEAEALMIYAEDICCSTGSACSSESVDASHVLYAIGVNPVDLHGAIRFSFGRFNTEEEVNRAVDILKESVEKLRAMSPLVNR >NC_013943.1|WP_013011662.1|2535235_2535667_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKITTKSRYAIRSIFALVLMGGDTKPVALTQIAEHEDISRKYLEQIFIKLKKSGIVEGSRGAQGGYVLARNPSDIRLKEVIYAMDGPVNISDCTQEESCDNFSSCGINWLWSGLKKTVDDYLDNITIQDLKRQAFGGKDANLS >NC_013943.1|WP_148214240.1|2534595_2535252_+|serine-O-acetyltransferase MLKTLREEIRTVFERDPAARSKAEVVFCYPGFHAILFYRTAHWFWVRKFYFIGRFISHLGRFFTGIEIHPGAIIGKRFFIDHGMGVVIGETAEIGNDVTLYHGVTLGGVSLEKVKRHPTVEDNVVIGSGAKVLGPFTVRKNAKIGSNSVVVKEVPENATVVGIPGKIVKGNGDKKSFDHNKLPDPVARAITDMATRMCYMEAEINDLRKKLKTYENND >NC_013943.1|WP_013011672.1|2544055_2544826_-|GTP-cyclohydrolase-I-FolE2 MKDIQSQSDTRNLDVDKVGIKDIRYPIVLSDKERGSQHTVALINMYVKLPHNFKGTHMSRFVEILSRHSSNIDLYTVGDILNEMQERLDSEEAYIELSFDYFMKKKAPVTGLEAVMDYKCRYFGAAGNEGRDQVMTVKVPVMTLCPCSKEISKYGAHNQRSFISISVRMKKMIWIEELIELAESCGSSPIYPLLKREDEKYVTEKSYENPAFVEDVVRNVAEKLMKEDRVTWFEVSSENLESIHNHSAYAVITRSK >NC_013943.1|WP_013011673.1|2544828_2545551_-|hypothetical-protein MYTLIISVAISTAAALGLYFLTYQIFWPLFIMVVGILGLNYFIGKKFMKKLTALFKSVEKDIQAGRVEKAVEKLKEGYPYAKWQFMVKEQIDSQIGILYYTSKSFDQAEPYLQNAFSKNWMAMSMLAASYYKKGDMAQVRRVMDKGIKGAPKEPFMYALYAWFLIEKSDKAKAVEVLSKGVAKNPVDDRLSSNLDAVKNGKKLKMQNYGNYWLQMHLGGKNPQGGQQYQQFLMNQRMKRK >NC_013943.1|WP_013011674.1|2546064_2546400_-|YraN-family-protein MRLLFGKKGEKKAACFLEKQGYAIVEMNYRCKFGEIDIIAEKNGVLIFVEVKTRSTDKFGLGYESVTLSKQQKLFKTAQHYMVENGEMPAQFDVISIDGDTLTHIPNAFSG >NC_013943.1|WP_013011675.1|2546396_2546951_-|ribonuclease-HII MLIVGIDEVGRGCLAGPVVAGAVLLPENFSDERLVDSKKISEKKRKIMDGVVRANAIAFGIGAVSNEDIDRYGIVPCTKKAMMLALEQISVSYDKVIVDAVKLEGVKVPLEHPFKAEDKFQCVAAASIIAKVYRDALMTKLHINHPDYGWYSNKGYGAKVHIEKIKEIGLTPLHRRSFCGNFIK >NC_013943.1|WP_013011676.1|2546954_2547605_-|hydrogenase-nickel-incorporation-protein-HypB MGKVDVETKILSKNDIKAAELREKFKNTCVLNFVSSPGSGKTSILEKILGSFKDKYKVAVIEGDQQTTNDADRIEATGVTAFQVNTGQGCHLEATDVEKGMAELGYDLDLLIIENVGNLVCPSQFDLGEDAKVIVLSTTEGADKPAKYPVMFHVGSAFIINKTDLLPYVDFDVEQCEEYAKGVNPELEVFKTSCKTGEGLNELTTYIERMIKAKKG >NC_013943.1|WP_013011677.1|2547607_2547952_-|hydrogenase-maturation-nickel-metallochaperone-HypA MHEASIAASLIEIVKETAANHQAKKVTKVFVQIGRLAGIEIDSLQFAYDAIKEDHNIIKDSEIIIEDVRITGKCQKCGVIDTYDEMFFKCSKCGSYEVELLTGEELKITEIEVD >NC_013943.1|WP_013011678.1|2547965_2548583_-|dephospho-CoA-kinase MYLGLTGNIASGKSTAAKFFEELGCYILDTDDISRIVMQPGQKAYGSIVELFGEDVLNDDKTLNRKAIRKIVFNDPVMLKKLEQIVHPAIGEYERKEIGRIKGRDDKAVIITQAAVTVEAGSQDRFDKLIVVYTDPETQLKRVMERDNITEEDAKKIINAQMPLDEKLKFAHYVIDNSGDLDNLRADVERVFELIKLTKYGMKNK >NC_013943.1|WP_041230382.1|2548593_2548821_-|hypothetical-protein MECLKCGTCCIAFDIKEIGKKAGERCRYLSDDKTCAIYEKRPWGCRGYRPDELCVLVSTLTDEQKVQVFRNIYEV >NC_013943.1|WP_013011680.1|2548868_2549633_-|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFCRFKDGKVEKKGVFIDGKIKEMEGSMFDDFVITDREFDADGVEFLPPVLPSKFPCIARNYVAHAKELGNDVPEIPMIFLKPSTAVNAHKGEVAIPAESEQVDYEGELAIVIGKKCRKVKREDAESVIFGYTCMNDYTARDLQKIDTKFTRAKSFDSFAPIGPFIETEFDWRKAHVKTIKNGKTVQDGTADLMIFDIPAIVEFMSGIMTLLPGDVIATGTPAGVGRVDAGDVVEVEIEGIGRLTNKIINGVD >NC_013943.1|WP_013011681.1|2549642_2550800_-|polynucleotide-adenylyltransferase MYNNLLKIPFFYELKKVMLEGGYDAYFVGGCVRDILLDREIQDIDFVCFSHDYKEFATAVKEAVPSVWVEFKDNIRLVRGNTEIDISKPRGETLEEDLQMRDFTINNLAMDTGGNIFGDRTDLDSKVIRHISESTFRDDPLRILRSFRFMAQLGFTASDATFEKMRQEKELLSQSASERIFNELDKLFKGDYACDSLRQMEETGVFSIITGGMSLDAYDEMAACAGRGLVFFASSLFCRLSVEEKNKLAGKLNFPNSMKKKAERISVFTKELAELLKNSDDTAIRKLIYKYPDELDDGIRLYIIRSGCDGVDQCRVEDDEFRVMSQLPYINFNLPERLNGAVLQELGVAPGPMMGEILKEVKPLMASGELNTLDKAAEYIKEKYL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
195266 : 215626
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_013943|195266:215626|DBSCAN-SWA AATGAGTTTAAAAGATAAATTACTTAAATCCCAAGAAGTAACCCGTCGTACCTTCCTTAAGGGTGCGAGTGCAGCCGGAGCTGCAGCGGCGCTTTACGGTTGCGGCGGAGGCGGCGGCGGTAAAACTTACATGGAAGAGGACGACACTCTTGAAGTGCCGGAAATAAAAGGGACAATCATACCCGGTGGTACTCCTCACAACTGTGGTGGACGTTGTCTCAGCAAATACTATGTTGAAGACGGTGTGGTAAAAAGAATTGTAACAGACGAAAGAGGCGATAAGACTCTTGAGAATGGTGACGATCCTGAATACCGCTCATGCGTCAGATGCCGTTCAAGAAAGCAGTGGTTCTACCGTAATGACCGTCTTATGTATCCTCTCAAGCAAACTGGTGAAAGAGGAGATATGGACGGATTCGTAAGAATCTCATGGGATCAGGCTTTCACAGAAATTGCCGCTAAAATGCAGGATGTTATCGGCAGATACGGCAGTAAAGGTATCCATTCCATTTACTCCTCCGGTGATGCTTCCGGCTGGGCAAGCAACTCTCTGCACAGACTTCTTGGTCTTACAGGCGGTTACACATATTACTACTCTAACTACAGCTTCCCTGCTCTTGAGCATGTTGCAAGATTTGTAGATGGTAGAAATAATGGTTCTCCATATGGAAACGGCAGACAGGATGCTAAAAATGCAGATTATCTTGTTCTGTGGAGTTTCAACCCTAACGAAGTAGTATTCGGTACTAACACAAACTGGTACCTTCAGCAGATTAAGGAGAGCGGTGTTCCTGTTATTGCTGTGGACACTCGTGTTTCTAAAACTGTTGCTACAGCAGCGGATGAATATATCAGCATTATGCCTGGTACAGACGCAGCACTTGTAATGGCTATGATGTATCACATTATGAAAGAGCATCCAGATAAAGTGGATTCTGCTTTTATTCAGAAATACTGCTACGGTTTCTTCGATACCGGTAACACTACACTTCATGCAGACAGTCCGTCAGCTAACTATGATGTGCCGGACGGCGGTTCACTTTCTGCTTTTATCATGGGTGATGAAAATGATCTTCTTACAGGTTCAGGTTCTATCCTTGCTGGCTTAAATAACAAATTGTCTATCTACCCTGACACAATAGGTTACAACGTAAACGATGACGATGACCTTTTCGGTAAGACAGTAGGCATCTGGGGACAGGAAGCTAAAACACCTGAGTGGGCAGAAGCGATCACTGGTGTTCCTGCTGCTAAAATCAAAGAACTTGCACTCCTTTACATGGACAATAAAGTCACAACATGGATAGGTGGTGGTTACCAGAGACACACAGAATCTGAGCAAGCTGTATGGATGAACAGAATATTCAGTGTTTTCTCTAAAAACTTTGGTGCGGCCGGTCAGAGTTCAGGACGTAATTCTAACAACGTCACAGCATCAACACCTGGAACAGGTATGGGCGCAGGCAATGGCGTAAACCTTGAAAGCGAACTTTATTACCCAAAAAGAGTAACATCGGATCTGAAATATGTACATACAGTGCAAAGAGCCAACATGCCTGTTTTTGTTATTCCTGATGCACTTGATAATGCGGGAACTGGAAAATCAAAATGGAATGACGGTCAGGTTAAAAAAATTCACGAAGGCTTTGGTAAAATTTTCTTCGTGCCTGGCGGTAACATTATGGTTAACCAGTCCGGTGATGTTAACTATAACTATGACATCTTCACTGACAGATCAAAGTGCGAGATGATTGTAAATTTTGACCACTTTATGACACCTTCAGCAGCAATTGCCGACTATATCCTTCCGTCAACAATGCAGGGTGAAAAACCAGGTGCTGTTAATGCGTGGGGTACAGGTGAAGTTTGTATCAGACTTAATAAAGTTAAAGATATTCCTGGCGAAGTTATGTCTGAATACGATATCTGTGCTGGTATTGCAAGTAAATTCGGGCTTGAGAGTGACTACTATGACGGCTACTCAACAGGGCAGGAAGGTATGGACGAAAGACTTGAAGCAGGATGGGATTCTGCCAATCTTTCTGCTAAGTATGGTATGACTTACGATGAATGGGTAGAGAAAGGTATTGCGTCACTTCACAGCACATACAACGAAAACCAATATTACATTCACTTCGAAGATTTCCGCAATGATCCTGTGAGCAATCCGCTTCAAACACCTACAGGTAAAATAGAAGCTTATTGTCAGGCAATGATGGAAGACTATGAAGCGAGAAATCACTTTAACATTGATGAAGTTACTGCCGATGCCGGTGGAGAAACAGTGCTTTACGGTACAGGAGAAATATATTCTCCACTTGCTAATACAGAAGGTAAAACTACAGCCAGAAGATTTGTTTACCCTATCCCTATGTATATACCTCTTATGGAAGGTGTACATGCTATTGACTATACAGATCCTGCTAATGAGTATGCTCACCCGGATCCACTTGGTACAAACGACAAAGGGTACACATATACTCTTCACACATGGCACCTGATGTATCGTTCACACTCAACGCTGAATAACGTTGCGTATCTGGATGAATGTCAGAAACAAGATATTAACGGTAACCCTGCGTTCCTCGACCCGAACAGAGATTGGTCTGAAGGAGCTTGGGACGATAATGTCTATGAGTCTATATGGCTTAACCCTGCAGATGCTAAAGACATCGGCGTTACTCAGGGGGACAGAGTCCTTATCAGTAACGACAGAGGGAAGATGTATGCATCAGTTGTTTTAACCAACAGAGTACGTCCGAAAATCATTCATATCGGACAAGGGTCATGGTCCAGCAAAAATTCTGATGGCATAGATGTTGGTGGTAATGCAAACACAGTAACCACAGCCCGCCCATCAAGGATTTGTAAAGGTATGACTTCAGCCAATGACTGCAAAGTCAAAATTGAAAAAGCGTAGGGAGGCTCATAATGGCTCAGATGGCATTTTACTTCGATCAAAATAGATGTATGGGATGTAACGCCTGTACAGTAGCTTGTAAAGACTGGAACGATGTTCAGCCCGGTCAGGCTAGATGGAGACGACTCAGCAATGAAGAATCAGGTTCGTTTCCTGATGTGAAAGTGTTCAATCTTGTGCTTTCATGCAACCACTGTGCTAACCCTGCTTGTACAGCAGCTTGTCCGGTTGGCGCTATATATAAAAGAGAAGAAGACGGTATAGTAATCGTAAACCGTGATCTCTGTCAGAATATCAAAGCCTGTGCCGTAGCGTGTCCTTATGGTGCGCCTCAGTTCGGTGATGATGACAGTGAACCGGTAGCCGAAGCTTCATGGGCGGTAGCTCACCCGATGCAGAAATGTACTTTCTGCTGGGACAGACAGGCAGAAGGTCTTGCACCATCCTGTGTAGCTGCATGCCCTCAGCGTGCGCTTGACTTTGGTACAGTAGCTGAAATAACAGCTAAATATCCGACAGCAGTGAAAACTGTAGTTGGTATGCCTCAGTCTGACCTTGATTCTAACGGCAACAAGCTCGAATCAGGCGACACTGTTCCGTCCATTTACTTTAAACCAAAGGGTTAATCCCTTTTAACTTTGGCGGGGTACATAACGTGTGCCCCGCCTTTTTTTTAATATTTTCAGGACTTGATACAACCGAAAAGAGAGATATCTGATTTTACCTTGGTAAATCTATCTTCGTTTGTATCAGTTTCTGAACTATATTTAGAAACCACCGCACTTGCGAAAATACGCAAGACAAGAATGACCAGAAAGCAGCAGAAGATGGGGGACGGTTCCTTTGTGTAATCCCTGACATATAGGAATCGTTCTGCTGCATTAAATACCCTCCGATTCTCTCAAAAAAATCACTTTTCTTAAATACTATTTACCATTTCTTTACTTTCACAGCGTTAGCTTTGACTGAAGCAAAGCGCTGTCCTAATTTTACAAACAGCCTCTGCTTTTATCACAAGGAGGGGAAATGAGTCATTCGTTAAGTAAAGCATTTTTCGCAGTATTAATCCTTGCTTTAACAGTATCAGTAGCCTATAGCTTCGAGGACGACAGCTACAGCACACCTGATAACTGGAAACAGCACGTGACTGCAGGTCGTATAGTCCAGAGCACCAGCGGTTCAGGACTGACCGATGATACTAGTCTTTACACAACGCTTACCACCCGTCTGCGTCTCAAGTCTAACGAATATGCTGAGGACAGCGATGTCTATCAGTACATTCGTATGCACACCGATGCAGCAGAAGTAGGTAACGGTACCGTAAAGCTTTCAATTTTCGGACGAATCACCAGCGATATCAATGGTGATTCTGATGAAGACTGGGGGGATAACGACTACTATGCCCAGCGGGATATTCTTGACGCTGACAGCAGCGAAGGAGATCTCGGCGGTCGTCTTTATCAGGGTTATCTCCAGGCAGACGGTGTTATTAAGAACACTAAGATCAGCATTGGACGTTTTTACCTTGATCACCTTACTACCTATCAGGTAGACGGTATTGACGCACAGGTAAATGTAACTGATAACTTTTCAGTTTATGCCTTTGGCGGTCTTCCGGTAAGCTACTTTTATGATCTTGAAGATTCCTATGTAGCAGGAGCAGGCTTCAGCTATAAGTATATGGATAACACTATCTTCAGAGGTGAGTACTCCTATGCCGAAGTAGACGACATTGATGACGATCATACTCAGCTTGAGTTTGTTCAGCTTATCCCTAACGGTTCAGTAATGCTCGGTTACGAGCTTCTTAATGATGCGGATACTTACAGCGCAGATCTTGATTACCAGATATCCTCCACCGGAACTATCGTTACTCTCGGTTTCGAGAGACTTAATGATGATATAGAAGGTAGCGACAGCAACTATCTGGTTAACCCTATCACTTATGCCCTGATGGATCAGAGCAAATACAGCAAATACAAAGCATCCGTGTATCAGCCTTTTATGAAATATTTCGTAGCAGGTCTGAGCTATGAGGCTAAGTCTGTAGACGGAGATGAGAACTTCGATAACCGTGACT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14 | Escherichia_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
262566 : 298779
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_013943|262566:298779|DBSCAN-SWA 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29 | Acidithiobacillus_phage(57.14%) | integrase,transposase | attL 261742:261757|attR 304840:304855 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
592149 : 645844
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_013943|592149:645844|DBSCAN-SWA 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MSVTVWYKRMSEKIQNKLAGFWSLLTVGDDFEKTDSSNSDCKRNEDKAFHLGFRNRKAARLAELRAHRESNQAK >NC_013943|592149:645844|621896_622148_+|WP_013009944.1|DBSCAN-SWA MDTIFADFSVSMSEFKKNPAEVLRNAGEKPVAVLNHNRPAFYMVTPKMFEAMLEEIADKELVNTIRTRLNNISDAVEVDIDEI |
54 | Vibrio_phage(22.22%) | integrase,protease,transposase | attL 622647:622670|attR 645888:645911 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
649007 : 710364
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_013943|649007:710364|DBSCAN-SWA 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57 | Acidithiobacillus_phage(13.33%) | integrase,transposase | attL 679130:679189|attR 719503:721216 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
719691 : 781278
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_013943|719691:781278|DBSCAN-SWA 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53 | Acidithiobacillus_phage(21.43%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1129372 : 1143837
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_013943|1129372:1143837|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_013943|1129372:1143837|1131910_1134775_+|WP_041229913.1|DBSCAN-SWA MELLINEDEVSKHYMLPEMLRGMGNTETANVLLKYAKNNTVKFKENYQWAWRMVEAILICEPTMVEELISFGLDGKINDNGKEDRLERVIQGICIKSQPVIKPSAMSFFMKLPSKVQYRLIPVFFKDKRREVLTPIMQFIYEKQANIDSKIYLNQLVKFNNSDEINEFLASIPMPSTHGKMLLHNSILFGILESIIWKEQNTIRSQCISVFEQNCTDEKILLNALRVLVFLQDDRCLTIAKQIPFKKDSFLSTFAGFIPLFFKHKVDFEEYRMRVLDVELDNEIRLQAFFVLSAAGIDIGQTLDELEKIDEGSANIWDFSALMFSIQNPSKRVIPIFEKSFEDSPENNPFLILINRFGELDGDDVTDFLLRMLRSRLSEANILACLSLQNRRDKRALPALLSLIRESNDVQIVQTALVAAIASGPDNINEFMDIWERFPESYLWRCVLIGRLRASSDADWLCEIAIDKNQHWQLRRTAVMAASRLPFELALEKIYLTIMGEESSFKIDNHPSLIMHNIIAPLVLKEGGALLRFYLRGEDAFVDFWGDLFKEMSQGASYPAPEGSEKSTATWLFHKLTEEGFPKNQSAQDSILNDLHIPIVQASILRGFRLCNRIDLIEKYIMEANSEWLLLRSICEWAKHNYTDADIDRLKKLVAKTSFQSSVCVKNVLSNISRPIVSKTSQSDIYKTFQTCNLEPRVTLHFQDIIDAIDSGRFKYDENYSIENMSKDKFIYLVNELNPSNDYKISHDINEPAIGFGESGPLIKEMKPISISANNENKVRKYLRTLIATFNKYEVDIPWHKSLLSGGAGHHDHIAYEYGLGFLRLLGKQGNMDMFYSELEKYHYDILPRMDKYLSDPLVKCLIDDRIVPYLRRYVNAGTDKMLLSVCSLASYLDSPAVDQVLSDLFYRWYNKFDRASKDTQHNNNRELWQSFNILKKHPRFKVICDYDVILQFN >NC_013943|1129372:1143837|1141831_1142386_+|WP_013010384.1|DBSCAN-SWA MTLTKHTFAKGIKILSVLLGSDKVNLDKRFNIEIWYASLLDLDDDQFQKACIYLVQNTKWHPSIAEIRETAQFIYEATQGNSYTAEGQWQVFKDAVTSHPGAAGLEKFFERGEQFFDDPVTNSVAQTIYKDFATSNISETGNWRARFISSYNNTKSFGNKTAQVQRLDNIISIVCNKKKELSHE >NC_013943|1129372:1143837|1129372_1130917_-|WP_013009975.1|transposase|DBSCAN-SWA MTRLTMSEIKEVIRLRYINQLSIRQISVSTGIPKSTVSDYVNRFRITGLKAEELSSVSEDELYSRLFPERSMPLNRTFPMPDLDYIAREKRRKGVTWLLLWQEYKSVHPDGYNYTQFKEYCKKHISRLSPTMRQIYNAGEIMFVDYSGLTMDIVDRYTGEVSEAQIFVSALGASGAVFVHATESQKKESFILSHSLAFEYYGAVSKTVVPDNLKSAVTKHTRDVLTVNSSYSDMAKYYGCAVIPARPAKPQDKAKVEQAVQGIQRWVLAKLRNRLFNTVQELNSAIAPLTEAYNNKVIRGIGKSRLELLNEIDRPEMLPLPKERYQYREYLIRHVGVDYHVDVSGSRYSVPYKLIKNKVDVWHSATTVEIHHKGYPVAIHPKSKRGSTLTEHMPPNHVMWQEKWNPTRILNWAGSIGFDTARLMKNILDSRSHPANAYRTCIAILSRAKSHDKSDFNMACKKAVEIRAYSVKSLESILSSKIYLEKDEKNTAPLSNHNNVRGRDYYKEEDKCQS >NC_013943|1129372:1143837|1136467_1137214_+|WP_013009614.1|DBSCAN-SWA MTLSNELKQTVKKLRLSGILATLPERMAYAKQQHLTYAEFLELVMQDEVDRRLHNQVDNQMKKAGINPFETLERYDFDAPVQVDREMIKGLFGLNFIEEKDNVMLCGPVGVGKTYLANALAHAAVRRGKKVLMVRAEKLFKRLQQSRADYSYEKALLGFITPDMLIIDDFGLKALNEQQSTDFYEIVVERYGRASTVITSNRDTDEWLELFHDPILANSALDRLVHNAYRVVIEGESYRKIKSRKKLI >NC_013943|1129372:1143837|1142378_1142588_+|WP_013010385.1|DBSCAN-SWA MNNHTQEELLTYEELARELKMSVKTLQNWKSLGVFHPKEYVKFGDSKQADIRFKKSAIYARIKDGKFIK >NC_013943|1129372:1143837|1141474_1141765_-|WP_013009985.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKTKRTRYSAEFKSKVALEALREELTLSELSAKYNVHPNQISKWKSEAIKGMSTIFSNKSSKSEEMSEAEIKDLHAKIGQLTVERDFLQRAFGKR >NC_013943|1129372:1143837|1140264_1141014_+|WP_013010082.1|DBSCAN-SWA MELTEMMTQLRLKGFIQAYELQRKMLEVDELSFDERLRILLEHESLYREDRQLSLLLKKAKLRYTGACIEDIRYRNGRNITKQMMLELGKNDWVRKHRNIIITGASGVGKTYIACALGNSACRNGIKSLYVRLPRLLQELKVARTDGSYVKVLTQLSKVNVLIVDDWGLDTLNDHERKDFLEVMEDRYSARSTIIATQIPVDKWHDIIGDHTIADAICDRLVHNAEHLQLTGESLRKEKEQSSVNMKNE >NC_013943|1129372:1143837|1141109_1141454_-|WP_083772352.1|transposase|DBSCAN-SWA MIENSGSKLSISKQCRLLSISRSSFYYQESGESALNLELMRIIDEQFMMTPDFGSRQMSKTLRRYGYNVGRKRIRRLMNKMGIAAVYQKPKTSNPHPACVFRCNWTLNPEMTGQ >NC_013943|1129372:1143837|1142604_1143837_+|WP_013010386.1|integrase|DBSCAN-SWA MAQVKTKTVRVRKDKDRLLLDFYYSDVRCREYLSVQANKEGRRYAERQAKLLEQAILDGNFEYAEWFPNSKKCRLFNSVRKSHKTFAEVAEEWKEHVERLHKAGELKRTTLRNYMNSLKSILDYFAIYEMQNITKSLVDDYKFELLDKPLSKKSINNKLTPLRRIFDYAYEMGYIEHNVMDRVKNFTLELPEIEPFNQLEVQAILNHLQKNNPKFHAMFTILFHTGMRIGEVLAMKWKNFDEMFCSYHVKEHFTEKRLDTPKTKASKRIVPLTDEAMKALRNHKQYTFMKSDFIFCNQYGDPWVSSDNIMKQVWEPMLKKLGIAYRIIYQCRHTHASLSILAGDNLAHIAERMGHKNVGTLITRYAKYVKSVQFQQPKIGSFLSNSGHDLQSGGHNLSEYCQNQESPITN >NC_013943|1129372:1143837|1134942_1136484_+|WP_013009613.1|transposase|DBSCAN-SWA MHDILDILRRRKHGDGFKTIAKARKMSRNTIRKYIELAVTLGFESDSEPPLEEIAYGVYRKVYGDGSRPVSECRKVLIPYKEKLEHWLSEERLTMTKIHSLLKRHGVSVSYDTLRRYLHEDLGFFKHNTVRMPETAPGEYAEVDFGRLGLLYDPETDRRRVVHALIVTLPYSRYQYVHLCHSMKFQEVITGLESAWEFFGGVPAKVIVDNMKTAIDKADRYDAQFNRYFYEYACYRGFIIDPARAVAPKDKPKVERNVSYVRDNFFKGETFRSLSHAQEAADAWCRTVSGMRIHGTTKKHPRIVFDMEEQANLLPLEQERYDVPFWGTCKVHPDHHIRIQSALYSVPTVYIGKEVSVRLDSKLVRIYHKEQQIKVHSRMKKGKRSTDTSDYPEEKRGYTMKSCEYHIYKAKEVGFYCGEFMERLLSGDFPWQNLRQAQKLIRDADKYGHGRMEQACQRAVSFDLINVYRVVNIIELSMQNNEVEKSSCKVLKPAKFTRNKNYFYEGGHDDTIK >NC_013943|1129372:1143837|1138693_1140262_+|WP_013010083.1|transposase|DBSCAN-SWA MRRRKKGRLTMKYLREVIRLYNLGGLSNRQIAKACNVSPTTAGGCINKYIDSGIPYETFAELPDEKLESIFYPKEPDQPVYSRPMPDMEYLCKELKRKGVTLQLLWEEYIRENPGGYSRSQFSYHYQQWSKKINPTMRFNHKAGEKVFVDFSGYKPEIVNPITGEVTSVDLFVATLGASSYTYAVCVPDQTKEFWIEAHVKMFDFFGGVPECIVPDNLKSGVTSPCFYDPDINPGYADMAAHYGIAVVPARPGKPKDKGKVENGVLNVQRRILAVLRNRTFNSIQELNSAVAEELVNLNDRPMQHMKSSRRQLFKELDQPALKPLPFERFEQYSWKKAKVNFNYHVQIGDAHYSVPWRLMGETVDIKYNSRIVQILHKNKCIASHPRSFKRGYYATSAAHMPPNHQFVASGWTPERMNKWASKTAGVYTAKAIDAIIDSRQFPEQAYKSCMGVIKLSKYYPPERLEKACRMVLESGTVRYNSIKSILEKGLDKIHYLEGEPRKNLVHENIRGNEYYRIKGDD >NC_013943|1129372:1143837|1137513_1137819_-|WP_148214148.1|DBSCAN-SWA MGKLIDQQGLLDRIEAHISLLINKEGLHSKSFKLVAYAVKEGEFRRGEAADIMGIQSRTVASQALSELLKRGLLVSKDKKAPVSLGITEEAKEFWLPGLFS |
12 | Acidithiobacillus_phage(75.0%) | integrase,transposase | attL 1117955:1117975|attR 1143861:1143881 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1490801 : 1562613
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_013943|1490801:1562613|DBSCAN-SWA 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63 | Leptospira_phage(14.29%) | holin,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2701552 : 2747052
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_013943|2701552:2747052|DBSCAN-SWA 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>NC_013943|2701552:2747052|2740837_2741593_+|WP_013011835.1|DBSCAN-SWA MVNGLDVFAEYFKGYTQSYVIIGGTACDYFLSKDDLEFRVTRDLDIVLLIEVLDKDFNDAIKKFITDGGYKNTSKASGNKQFYRFENPDDETFPYMIEIFSRKPDVIEIDEGPHCVPLDSIEEVNSLSAILLDDNYYRLIKENCVTENNVTFIKKEYIIPLKARAYIDNQRLKDESVFIKDKDISKHRNDIFRIAQTLTPEQRISLPDSVREDLRECLEMIQGVEFKMRSIGVREITKEALISNIVNIYSL >NC_013943|2701552:2747052|2745547_2746537_-|WP_013011838.1|transposase|DBSCAN-SWA MLIEEAHDCGACYAAVCDLVGISLRTLQRWKKSTNLTDRRKGSRKIIPRKLSEETRAEVITVCTSKRFCDYSPHEIVPLLLNEGLYIASVSSFYRVLRGNNLQHHRSNLKPRKKSVRPPEKQATASDTVWCWDITWLPSTVRGRFYFAYVIIDIYDKFIVGWAIHEDEREYHSRDLFERTLSGRKNIEFLSLHSDNGSPMKGATLLAFLNGLNVSISFSRPRTSNDNPFIESFFKTLKYNDKYPLKFASILHAREWMASFVEWYNNEHLHSSIGYVTPSQMRNGDAANIFKLRNLTMEAAKIKYPERWGRRKLKKWDASEKVILNKEKK |
35 | Ralstonia_phage(12.5%) | integrase,transposase | attL 2701428:2701445|attR 2721019:2721036 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2806108 : 2857754
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_013943|2806108:2857754|DBSCAN-SWA 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44 | Shigella_phage(13.33%) | integrase,transposase | attL 2811993:2812009|attR 2846320:2846336 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2887422 : 2898959
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_013943|2887422:2898959|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_013943|2887422:2898959|2892720_2893506_-|WP_013011973.1|DBSCAN-SWA MASVVTFANKKGGSGKTSSVVNSGGVLGERGYKVLLVDLDPQAHLSFWSGVNTYNNYLSVYDALLGSCSGRDCLHKAEHGLYDVLPAATNFSMGLLRQLLDGDKPEGKLAKVLMEFKNEYDYILIDTPPTVAVLTLNALVAATHVMIPILLNFLAIEGLAQLTQSIYRINAGFNPDVRMTGIIANQYDIRSNHSKRVLKEIYENFGDDMVAPRIRNDIKIAEAPEYREPINVFAPRSRGNMDFNLLADFIEEKTAITGGEV >NC_013943|2887422:2898959|2894208_2895147_-|WP_013011975.1|DBSCAN-SWA MKNKKMHVLIVDDNPQNLKVLGNILKDNTPYGLAFAMSGKEALEYLVKNVPDMVLLDVMMPDMDGFEVCKTLHARAETKGIPVIFITAKSEPEDIVKGFQMGGVDYVTKPFNEAELLMRINTHMELKRARDLLEEKNKELIEAYDKIEHLALTDTLTGIANRRNITNMLGKEAARCKRNKGKFSLIMCDIDFFKRVNDTYGHDAGDYVLKTISHVIQQALREQDIVARWGGEEFLIVLPETDAGNAVAVAEKLRTAIGNTEMSYEGISFSVTMTFGVSEYDVSLGIEKSIKKADDALYEGKQTGRNKVVRSD >NC_013943|2887422:2898959|2887422_2888931_-|WP_013011970.1|DBSCAN-SWA MSDNTLETESIYVSFGVGAETYGIGIEDVRQIIRVPKITRVPKMPDYVLGMTNLRGEVLPLVDLSMRLGYKHPCVHGEDTRVIVVDKQGILTGLIVESVNEVKSTEMHDIDKFPDILNAGVDKKYISGILKVGKGEDVSIIQLINTDEIIDIDSAGKYLEQNSALIKKEKKEDVVAGAIDEKRFISFNIKEQEYAIEIHKINEIIWMPEVTSVPGLPSYVLGIFSLRGEVIPLLSLHSRFGMTLNRDDETTRVVIVDIGNVMVAFAADKVNAVVSVDESLIELPPKVYEDQEGSEVSAVLKLEDGKRLVMALEPENLVDDAELEALKSVAEQSKGGTHMNYDVTNTADEEKQIVTFQIENEHYGIYIQKVQEINRYTNVTKIPKTPKFVEGIINLRGEVIPLIDLRSRFELETKPRDEFTRVIIINLQNMKVGFVVDWVDEVLRIRQEDIDPVPPVLGAAVNSEFIEGVINFDKNEKMILLLDVEELFSRAEIKKLENLQEG >NC_013943|2887422:2898959|2895143_2898959_-|WP_013011976.1|DBSCAN-SWA MATAKFRIAVISDLPDGLCSPEILDLSDIYQYKCVQNIQADKYDLILWDARGGTDLLCEALPELCRTVTVIIANDIDPSIRQELSLFHDVFFSIPPISKSEVENYSTMSAEMESALMDMQIYEEFVEDTDNIITRVDKDARFTYVNTACEGLYGVSRDVLIGQSAFDFTHVDDREITINAFNSWIKNKLKRTSFVNRQILSDGSVIHVLWTINLHYGSSGELLYINSIAKDITDGYLAEAALKKSESSLRAILDSSQDIVLLLDSDGTILDCNQQFCKEVEIDIASVLGCNLWNIRGMNTNGERRVIFDNVVRTGKPCRFEDYGADNWYSVYIAPIALEDMEQKRFVAFAKNITYRKEAEQFARMNEHRHKSLAILGQMYEADFDEILEYSLESSIEQTQSIGGYIVEYDASIGVSKLKAFKGHSNTEVTLCADQPLEVSRFHDLYTVLRNKEPVLNNRQRSVIPMPDTKTAEYNENSMLVPLMAQGEIRLILAVYGKSRNYNLSEAIGLTHFMEGVWRLRERKEVEKTISLLNQELERKVNVRTAQLKESEVRFRTAFESTVHGMLLIALSGEILQLNNSFAAMLGYDESELVGETVYSITYQDDIKLTTEAMRSIVSGEQNHYDITKRYVRKDGNLVIATANAALIRDNKSNPIYIVANVVNITEAEHTRKERDKIFELSRDIIGIADLDGNIHYLNSAFGELLSYSTADVINSNFRDILRPSDIEQLEIVFQSLQELDSLVDFESMHTLPDGSIKWISWSFTADRVNNRIYSIGRDATDRKVYENTLKDQKDKAEQAGRAKSEFMANISHEIRTPLNAVIGFSELLSARAQDSKAASYINSIKTSGKALLTLINDILDISKLEAAATEPVLAPASIKMLLEEMVRIFGYRTEHTDIKLGYFIAADTPKTMMLDISRLRQVLLNLIGNAVKFTERGEVSISVRCEAVNDERVDLYISVKDTGIGIPKEEMEDIFQAFRQRAGHNINKYGGTGLGLSISSKLVDMMGGEIRVESKVGIGSTFTVILPAILKSDVLVAEDISGGVRYVFQPARVLVADDEITRRVLREMLENTGLSVVEAHSAAAARHIAAEIEPELIICSDRLPDKGLYEAALWIRDGIADFSTKMIALVGTMPNKSHSEIFDDILIKPVFSGKLMITLGRFLEVKDRIVEDFAPAEKADWHTIDCLPAKEYFCGELKKLINSFEGAVDFDYLEEVIESLRCSAKKTSLNEFDKLAERLAYLADNLEIENIRKMLARLKECISDETGSVL >NC_013943|2887422:2898959|2891227_2892724_-|WP_013011972.1|DBSCAN-SWA MKYPVGIDFGTTNSMIAVYKEGSGIEVISSDSGKRFLPSVVYFKNASEAVTGDNARSMQLLESENTISNVKRYMGTDKIFDLYGREYTPPELAALFFRKLKTLYSDYTGEKDAEAVVTVPAYFDHLQREAVRASAEAAGFDVLSLLNEPTAAALYYNNIGKKEDELCLVFDLGGGTLDISLIQIKEDCLKVVATGGSTQIGGFDFDVAVADYFNNEFAKINEIDLRSDPIAFQQLLFQAEKAKMELSSLNETNLVIPYITITPKGPLHFKQTIDRELFTKITKHITDKIRKLVSDMLELNGINTKDISRVLPVGGASRICNVRSLVAEMFGDALSKDINPEEAVVSGAAVNAAMQTGVVTDKKFFDVTSHNMGIEDDNGDFEIIMKKNEPYPVEFSTRFKTTDNNLDKVTIHALQDMAGSALNISDSPADDPEYFVSLGKFDFKIDKNEEENLIDIGFAIDVSGIVSVWTKDVKTGAEHDFTLKAEIDSEKIKDIKIY >NC_013943|2887422:2898959|2893672_2894212_+|WP_013011974.1|DBSCAN-SWA MLKILFLDRDGIINVDKGYIHKPEDIELVDGLELFLKTAENMGYKLIVVTNQAGIARGFYTDNDVKNLHKHMYDTLAARGINITDFLFCPHHPDFTGECSCRKPAPGMLLLARDKYNVDMGKSIMIGDKRSDVLAGRNAGIGTCILVSSRYQSEKTAEADYFAKNLSDATEFIKKLNKN >NC_013943|2887422:2898959|2888965_2891206_-|WP_013011971.1|DBSCAN-SWA MKKLAKPSSLEGRTGIVRKDGEDLLKRRDDSKRQVAEKARARTLAKQQTNAERLATASEEMASAIEQASSASGQLNASMDEVSAASSQASTSAEGIKNDTIALEIDAKNVLTTSIEYEKSTAELISRVGATVDAANDLKESVQSTTDKVEESTQLVDQLKEKADSIGQIVQVVTKIADQTNLLALNAAIEAARAGEHGKGFAVVADEVRTLAEVSEKSAKNIKSVIDISLEQVTQVVGKVDSFLLLSRTNLFKADFISKQCTTVRSHTDEIGVEVEKVKLGSQSISDESSKSMDLVSRLASSAEQNAAASEEVGKFTGEQSKAFSELTIAAQELAEMSDELKHSTDIAKSSEEVAAAAEELSSTIEELNASADEVLKAIDQMDIGTSEIFEEIAGITREFNIISDYLSNGQESWDIIMKLGKLVDDALEEIKALDHIVFINQLEESLNNNKPFMGQLDPTKCAFGAWYETYKPGTGKEEKAYEFIREPHNHVHLGAAEIVELMKSGKMQDAREVFSHKVKPSVDQFKGHFRDFRHGIELVVKGFVGSINNLREVHDEVALLNKSFGNIRKIVDTITNVAIQTNMLAVSGNIEAARSGEYGRGFSVVAADIRALANESADNADRMKDILDEMYERVVNFQNELAEITALIRVQIEKSQSAVDNLVNVVRIRKHLIDLREKCANYVESGAVKVETVRVACQQGLEAAENLKSLSDEAKTAADEQVKGLQEIAAASEEVASLADEMQVF |
7 | Bacillus_thuringiensis_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2964232 : 2972932
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_013943|2964232:2972932|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_013943|2964232:2972932|2970973_2971714_+|WP_013012034.1|DBSCAN-SWA MKITIITTTKNSEKTVRDTIESVIAQKDVEIEYILLDAMSTDSTLDIISSYNKHISKLIIEEDKGFYYAINKGISMASGDLIAILNSDDVYAYDHCLKDVVEVFQNKRTELVYADIHIVDAKDTTRVVRRWISKQFNRRKISFGWCPPHPAFFAKREIYNRLGAFDTDYKIAADYDIMLRFMLNTKNDPEYLNKVIVNMRNGGLSSNKAFNLINKLLEDRSIIKKHNLPGIITLLGKRLIKIKQFL >NC_013943|2964232:2972932|2964232_2965412_+|WP_148214190.1|transposase|DBSCAN-SWA MERLPRSFYTHAFKEEAVSLVLNGGLSVAEVSRQLSLSEQTLRNWIKKHKEGSLKDKSGSRTVTELEAEVSRLKKELSQVRLERENLKKGYGVPCTRASERYAQVEALNRENSFPITAICKTLKVSRSSYYSWINRKASKRSQDDEKLKVFIRMAHKKGRGTYGVEKLQDELRDEHGIEVSLHRIKRLRKEMGLRCKQVKKFKATTNSKHNHPVAPNLLNQKFSVSGPCQVWVSDITYCATDEGWLYLAGIKDLWNKEIVGYAMSSRMTQDLVGRALFRAVSLKRPPAGIIHHSDRGSQYCSKSYRALLEQFGFEVSMSRKGNCYDNAPMESFFGTLKNELIYHQRYSTRQEAEAEIQEYIEIFYNRVRRHASLGNLSPTAYARLELTKRYAK >NC_013943|2964232:2972932|2965789_2966908_-|WP_013012030.1|DBSCAN-SWA MSKVALITGVTGQDGAYLAEFLLAKGYIVHGIKRRSSIIKTDRIDHLYQDPHEENVKFKLHYGDLTDSTNLIRIIQETQPDEIYNLAAMSHVKVSFDTPEYTANADGLGTLRILEAIRILGLKKKTKIYQASTSELYGLVQEVPQSEKTPFYPRSPYAVAKMYAYWITVNYREAYGMFACNGILFNHEGPTRGETFVTRKITRAVAKIVLGMQDKLYLGNMNAKRDWGHAKDYIEAMWLILQQDEPEDFVIATGVTTTVRDFVKFAFAEAGIELEFKGEGENEKGYVKSCSNKEFKLETGKEIVAVDPAYFRPTEVDLLIGDPTKSKTKLGWKPKYDLKSLVEEMVASDIVNMKREKYLKEGGYQVFDGIEL >NC_013943|2964232:2972932|2969795_2970875_-|WP_013012033.1|DBSCAN-SWA MKLCYDNIIYYLQNSGGISKYWYELTNRLITTEDISFIEYDKSCNNFFRNELNIPIGSVKYDKVRILKFARYLPVFNPIEKDCLFHSSYYRVPLDNKVKTIVTIHDFTYEYFFSGLRKQVHSWQKRKAIKRADRIICISKSTKQDLLMFYPDIDPDSIDVVYNGVNKEFSPISFEKEELKKAFGLNADVEYAVFVGSRSFYKNYNIAVEASALAGLGLIIVGGGSFSSAEKDLTERYLKGKYLHIDKAVSTDILNKIYNLSYCLLYPSSYEGFGIPAAEAINAECIPIVLNKSSLPEVVDDAGLLCDAPTAHCFAEKIGLLADNNNKVQILSKCHQQRNRFSWDKCCSETIKSYSRVYL >NC_013943|2964232:2972932|2971714_2972932_-|WP_013012035.1|DBSCAN-SWA MVKVAIFAIGSELLEGSIVDTNSAWLGKKLTKAGFDVTDIRLIPDHREKIVKLLREGMETYDIILTTGGLGPTFDDLTAETLGEAAGVGTEMNEEARRHMVEWLKKRNVSIKPSHERQALLPKGCMLFPNNSGTAMGFGVEKNSCTVVSMPGVPYEMYKMFDDFVMPFMLRKFSLNERFSLDLRIGGLPESDIDDVIRELHLPSSLECIINVSKGECFVKLRGFDKSLIDEYALKLKDSFPRNFIGFGDDGMAAVLLRLLRERDMTISVAESCTGGMIGADFTSVAGASDVFMGGIISYSNDVKERILRVPKNIMINHGAVSEETARAMAVGAANTLQTRCAISVTGVAGPDGGTDEKPVGTVCMGYCIDRDVVTKKHFFAGDRDAIRTRAVKTALREMTELLKK >NC_013943|2964232:2972932|2965427_2965790_-|WP_013012029.1|DBSCAN-SWA MNKDSKIFVAGGIGLVGSAIIRNLINRGYQNIVASYRNRKPSSDMLAGDKTRFVRLDMMDKNAVNSFFKHEKPEFVYLAAAKVGGIVANSKYRADFIYENLQIQNNTIYAAYKNDLGRVF >NC_013943|2964232:2972932|2966919_2968323_-|WP_013012031.1|DBSCAN-SWA MINVILCGGSGTRLWPISRKSYPKQFCKIINDRSFFQETILRNIESTSHLIVTSIDNYFIAADQAEAVNDENLNFKYILEPVGRNTAPAIAIACFAVDPEAVILVTPSDHLISNVENYDDVIKEAEKSANNGDLVTFGIKPEYAETGYGYLECSVVENSTVVDVLKFHEKPSKDVAEKYLLSGNYYWNSGMFCFKASTFLKELKKYSPDIYEKSKIAYLNAANKDMDKLDIDIRDMQAIPADSIDYAVMEKSNIVKAIKADIGWNDIGSFDALSKVLNVEESEDCCSLTSIAVDSDNNFIMADDKQVVTIDVSDLIIIDTPDALLISKKGSSQDVKKAVEIMSAKTETLCLLDTHKTVNRPWGTYCVIESGYGYKVKKIVVLPGRRLSLQSHKQRSEHWVVVSGEAKVTRGEEILNIKNNESIYISAGTKHRLECISNEPLIIIEVQVGAYLGEDDITRYSDDYNRK >NC_013943|2964232:2972932|2968340_2969693_-|WP_013012032.1|DBSCAN-SWA MNLKCFKAYDIRGKVPEEIDENLAYKIGRAFSEIICPSSVVVGKDIRLESNMLARELINGLLDSGVDVIDIGLCGTEEVYFATSFYNAGGGIMITASHNPKGYNGMKLVRENSKPISGDSGLQDIKKLIEKDSFLPCKSKGRIEYKYSKDAYIKFILGFINKEELTGLKLVVNAGNGCAGPVVDLLENELSVEFIKIHNKPDGNFPNGIPNPLLPDKRQATSQAVIKNHADMGIAWDGDFDRCFLFDENGEFIEGYYIVAIIAEALLKDKPESKIIHDPRLTWNTIKIVKSAGGIPVMTKTGHAFIKERMRQEDAVYGGEMSAHHYFRDFFYCDSGMIPWLLVAALVKNKKIKLSEMTREMMSNFPVSGEINRSVEDPEKTISMIIEKYRNDSLEIDHTDGVSMSFENWRFNLRMSNTEPVIRLNVEARNDIALMEAKRDELLRLIKHLN |
8 | Acinetobacter_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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